View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF14040_low_15 (Length: 457)
Name: NF14040_low_15
Description: NF14040
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF14040_low_15 |
 |  |
|
| [»] scaffold0298 (4 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0019 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0336 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0124 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0159 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0505 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0076 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0014 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0147 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0444 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0091 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0059 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0447 (4 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0383 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0160 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0859 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1494 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1832 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0458 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 336; Significance: 0; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 13510482 - 13510038
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
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| T |
13510482 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcggtaattctaagggatcgtttaaacattgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
13510383 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
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| T |
13510382 |
ttggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
13510283 |
T |
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| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
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| T |
13510282 |
gtgataacttaagatatattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
13510183 |
T |
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| Q |
301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa--------------------tagatgtagctaca |
380 |
Q |
| |
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| T |
13510182 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctaca |
13510083 |
T |
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| Q |
381 |
tatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
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||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
13510082 |
tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatt |
13510038 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 13600012 - 13599568
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
13600012 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcggtaattctaagggatcgtttaaacattgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
13599913 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
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||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
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| T |
13599912 |
ttggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
13599813 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13599812 |
gtgataacttaagatatattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
13599713 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa--------------------tagatgtagctaca |
380 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13599712 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctaca |
13599613 |
T |
 |
| Q |
381 |
tatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13599612 |
tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatt |
13599568 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 3299320 - 3298953
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3299320 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcatttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
3299221 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
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|||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
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|
| T |
3299220 |
ttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
3299121 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3299120 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaac |
3299021 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
3299020 |
aatattgaataaattgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaata |
3298953 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 9067810 - 9068254
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9067810 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgt |
9067909 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
9067910 |
ttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
9068009 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
9068010 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaac |
9068109 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctaca |
380 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
9068110 |
aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagtagatgtagctaca |
9068209 |
T |
 |
| Q |
381 |
tatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
9068210 |
tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
9068254 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 22242886 - 22243331
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22242886 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcttttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgattacaaagtcga |
22242985 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
22242986 |
ttggatagttcaatcgacgatttcccaaccgattaaattatccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
22243085 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22243086 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacatttaattcaagaataacaat |
22243185 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa--------------------tagatgtagctac |
379 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22243186 |
aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagaaattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaaaggtagatgtagctac |
22243285 |
T |
 |
| Q |
380 |
atatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22243286 |
atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatt |
22243331 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 8742926 - 8743370
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8742926 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgt |
8743025 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
8743026 |
ttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
8743125 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
8743126 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaac |
8743225 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctaca |
380 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
8743226 |
aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagtagatgtagctaca |
8743325 |
T |
 |
| Q |
381 |
tatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
8743326 |
tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
8743370 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 28925786 - 28926230
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28925786 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
28925885 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
28925886 |
ttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
28925985 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28925986 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatctttttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaac |
28926085 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctaca |
380 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28926086 |
aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaatatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagtagatgtagctaca |
28926185 |
T |
 |
| Q |
381 |
tatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
28926186 |
tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
28926230 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Original strand, 11308630 - 11308998
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11308630 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgt |
11308729 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
11308730 |
ttgggcagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
11308829 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
11308830 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacagtaaaagcaagaataacaac |
11308929 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
11308930 |
aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaata |
11308998 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 27348545 - 27348177
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
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| T |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 28370612 - 28370244
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 41576974 - 41577418
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Target: chr8; HSP #12
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Target Start/End: Complemental strand, 22181081 - 22180676
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Original strand, 22233493 - 22233949
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Target: chr8; HSP #15
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Target Start/End: Original strand, 4861594 - 4862037
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Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 16959070 - 16958611
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catatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcatccctagactc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 22222318 - 22222648
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22222418 |
ctggatcgtttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctaga |
22222517 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaa |
299 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22222518 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttcttaaatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaacacaagaataacaa |
22222617 |
T |
 |
| Q |
300 |
caatattgaataaatagctagaaccatatat |
330 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22222618 |
caatattgaataaatagctagaatcatatat |
22222648 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 22228660 - 22228990
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22228660 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaatgtcgatttcccgaacattaaaacaatcacaaagtcga |
22228759 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||| ||| | ||||||| |
|
|
| T |
22228760 |
ctggatcgtttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctagtttaaaaatgattatcaaatattaacatctatgtctaga |
22228859 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaa |
299 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22228860 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttcttaaatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaacacaagaataacaa |
22228959 |
T |
 |
| Q |
300 |
caatattgaataaatagctagaaccatatat |
330 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22228960 |
caatattgaataaatagctagaatcatatat |
22228990 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17993385 - 17993087
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| || ||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
17993385 |
caatcacttgacaacatcattcgtgtccaaatgatgtcgtgatttctaatggactattcaaaagtcgatttcccaaactattaaacaatcgcaaagtcga |
17993286 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
| |||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
17993285 |
tcggatcgtttaatcgacgattttccaagcgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
17993186 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaa |
299 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17993185 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaa |
17993087 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 21692964 - 21692669
Alignment:
| Q |
2 |
aatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgat |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21692964 |
aatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcattatttctaagggatcgtttaaatgtcgatttcccaaacatttaaacaatcacaaagtcgat |
21692865 |
T |
 |
| Q |
102 |
tggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctagag |
201 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| |
|
|
| T |
21692864 |
tggatcgtttaatcaaaaatttcccaacctattaaacgacccaaaagcattaaattctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagaa |
21692765 |
T |
 |
| Q |
202 |
tgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataa |
296 |
Q |
| |
|
||| || |||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
21692764 |
tgaaaatttaaaatagattgttattctatttcttggatccaaaagcatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataa |
21692669 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 36736849 - 36737117
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36736849 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaatatcgatttcacaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
36736948 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
||| || ||| ||||| |||||||||| | ||||||| || ||||||| | |||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| | ||||||| |
|
|
| T |
36736949 |
ttgcatcatttaatcgatgatttcccaatctattaaatgactcaaaagcttcaagttctagattaatagtgattatcaaagattaaaatctatgtctaga |
36737048 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatct |
270 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
36737049 |
gtgaaaactt-agatagattattattctattcctagattcaaaagtatttgtcaatatcattttgaatct |
36737117 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 201 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16580404 - 16580160
Alignment:
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16580404 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaac |
16580305 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctaca |
380 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16580304 |
aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagtagatgtagctaca |
16580205 |
T |
 |
| Q |
381 |
tatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
16580204 |
tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
16580160 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Original strand, 13848971 - 13849278
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaac-atttaaacgatcacaaagtcg |
99 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
13848971 |
caatcactcaacaataccattcatgttcaaatgatagcgttatttctaagggattgtttaaatgtcgattttccaaactatttaaatgatcacaaaatcg |
13849070 |
T |
 |
| Q |
100 |
attggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctag |
199 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||| |||||||||| | ||||| | | | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| | || ||| |
|
|
| T |
13849071 |
attggatcatttaatcgatgatttcccaatctattaattgatctaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaagattaacatctatgtatag |
13849170 |
T |
 |
| Q |
200 |
agtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaa |
299 |
Q |
| |
|
| ||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
13849171 |
aatgaaaactta-gatagattgttattctactcctagattcaaaagtatttgtcaatatcatttcaaatctcaataaagctttaaatacaagaataataa |
13849269 |
T |
 |
| Q |
300 |
caatattga |
308 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
13849270 |
caatattga |
13849278 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 22227151 - 22227297
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22227151 |
caatcactccacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaatgtcgattttccaaacattaaaacaatcacaaagtcga |
22227250 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaa |
147 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
22227251 |
ctggatcgtttaatcgacgatttcccaacagattaaatgacccaaaa |
22227297 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 17993027 - 17992969
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17993027 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatt |
17992969 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 367 - 436
Target Start/End: Original strand, 22222694 - 22222765
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaa--agatgaagatttcatccctaga |
436 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
22222694 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagagatgaagattccatgcctaga |
22222765 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 367 - 436
Target Start/End: Original strand, 22229036 - 22229107
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaa--agatgaagatttcatccctaga |
436 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
22229036 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagagatgaagattccatgcctaga |
22229107 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 297 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 24040937 - 24040867
Alignment:
| Q |
297 |
caacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24040937 |
caacaatattgaataaatagctaaaaccatatattaaat-atcaaaagattacataatagcttgtttgaata |
24040867 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 12538290 - 12538232
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
12538290 |
tagatgtacctacatatgtctaagatagctttgcaaatgatgaagaagagatgaagatt |
12538232 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 367 - 414
Target Start/End: Original strand, 11309016 - 11309063
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaa |
414 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11309016 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaa |
11309063 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 370 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 28370223 - 28370168
Alignment:
| Q |
370 |
atgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
28370223 |
atgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
28370168 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 3298935 - 3298877
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
3298935 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaatggatgaagaaagggtgaagatt |
3298877 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 27348159 - 27348101
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
27348159 |
tagatgtagctacatatgtctatgataactttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
27348101 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 412
Target Start/End: Original strand, 34006800 - 34006845
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaaga |
412 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
34006800 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga |
34006845 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 1607418 - 1607360
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| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1607418 |
tagatgtagctacatatgcctatgaaagctttgcaaaggatgaaagaaagatgaagatt |
1607360 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 1607594 - 1607437
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| Q |
212 |
agatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaat |
310 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||| | || ||| ||||| ||||| || |||| |||||| | ||||||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
1607594 |
agatagattattattctaactctagatccaaaattatttttcaataacatttcaaatcttaaataaagcattaagtacaagaataataacaatatttaat |
1607495 |
T |
 |
| Q |
311 |
aaata-gctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||||||||||||| | || || ||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
1607494 |
aaataaggtagaaccatatattaaataaataa-agattacataatagtttgtttgaata |
1607437 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
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Alignment:
| Q |
373 |
tagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
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|
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24040843 |
tagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaggaagaaatgaagatt |
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T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 17993085 - 17993046
Alignment:
| Q |
329 |
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368 |
Q |
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|
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attaaatgatcaaaagattacataatggcttgtttgaata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 22909636 - 22909192
Alignment:
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Q |
| |
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T |
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ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
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| T |
22909536 |
ttggataatttaatcgacgatttcccaaccgattaaattatccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
22909437 |
T |
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| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
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| T |
22909436 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
22909337 |
T |
 |
| Q |
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aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa--------------------tagatgtagctaca |
380 |
Q |
| |
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| T |
22909336 |
aatattgaatatatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagagtagatgtagctaca |
22909237 |
T |
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| Q |
381 |
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425 |
Q |
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22909236 |
tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatt |
22909192 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 1275106 - 1274739
Alignment:
| Q |
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Q |
| |
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| T |
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1275007 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
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| T |
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ttggatagtttaatcgacgatttcccaatcgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
1274907 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
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| T |
1274906 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtctatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
1274807 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
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| T |
1274806 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataataacttgtttgaata |
1274739 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 2797206 - 2797650
Alignment:
| Q |
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100 |
Q |
| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
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| T |
2797306 |
ttggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
2797405 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
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| T |
2797406 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaac |
2797505 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa--------------------tagatgtagctaca |
380 |
Q |
| |
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| T |
2797506 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaaaattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctaca |
2797605 |
T |
 |
| Q |
381 |
tatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
2797606 |
tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatt |
2797650 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 31157919 - 31158363
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
31157919 |
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T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
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| T |
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ttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
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T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
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| T |
31158119 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaac |
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T |
 |
| Q |
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aatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctaca |
380 |
Q |
| |
|
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|
| T |
31158219 |
aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaaggttacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagtagatgtagctaca |
31158318 |
T |
 |
| Q |
381 |
tatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
31158319 |
tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
31158363 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 10345948 - 10346392
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
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|
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T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
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|||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
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| T |
10346048 |
ttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
10346147 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaac |
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T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctaca |
380 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
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|
| T |
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aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagtagatgtagctaca |
10346347 |
T |
 |
| Q |
381 |
tatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
10346348 |
tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
10346392 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 2 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 6173033 - 6172667
Alignment:
| Q |
2 |
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101 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
102 |
tggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctagag |
201 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
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tggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacctaaaagcattaagtcctagattaaaactgattatcaaatattaacatccatgtctagag |
6172834 |
T |
 |
| Q |
202 |
tgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaaca |
301 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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tgataacttaagatagattgttattctatttctagattaaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaacgcaagaataacagca |
6172734 |
T |
 |
| Q |
302 |
atattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6172733 |
atattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaata |
6172667 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 32 - 424
Target Start/End: Original strand, 19471864 - 19472275
Alignment:
| Q |
32 |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttaatcgacgatttcccaaccg |
19471963 |
T |
 |
| Q |
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attaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatt |
231 |
Q |
| |
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|
| T |
19471964 |
attaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatt |
19472063 |
T |
 |
| Q |
232 |
tctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatatt |
331 |
Q |
| |
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| T |
19472064 |
tctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatatt |
19472163 |
T |
 |
| Q |
332 |
aaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaaga |
412 |
Q |
| |
|
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| T |
19472164 |
aaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttacaaaggatgaaga |
19472263 |
T |
 |
| Q |
413 |
aaagatgaagat |
424 |
Q |
| |
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|
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| T |
19472264 |
aaggatgaagat |
19472275 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 8107531 - 8107975
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8107531 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgt |
8107630 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |
|
|
| T |
8107731 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaatgaaaacaagaataacaac |
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T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctaca |
380 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
8107831 |
aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaattacaagagtagatgtagctaca |
8107930 |
T |
 |
| Q |
381 |
tatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
8107931 |
tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
8107975 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 9 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 31879110 - 31878751
Alignment:
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9 |
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Q |
| |
|
||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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31879011 |
T |
 |
| Q |
109 |
tttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctagagtgataac |
208 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
31879010 |
attaatcgacgatttcccaaccaattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatactaacatccatgtctagagtgataac |
31878911 |
T |
 |
| Q |
209 |
ttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattga |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31878910 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
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Target Start/End: Complemental strand, 23795613 - 23795245
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 22321444 - 22321887
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T |
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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 12184378 - 12183941
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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 12191360 - 12190918
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Target: chr7; HSP #14
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Target Start/End: Complemental strand, 2631915 - 2631547
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 12090102 - 12090547
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
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gtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaa |
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378 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 2478179 - 2477810
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 24483264 - 24482819
Alignment:
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1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24483264 |
caatcactcgacaatatcattcgggtccaaatgatatcgttatttctaatggattgtttaaatgtcgatttcccaaacatttaaacaatcacaaagtcga |
24483165 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||| | ||||||| |
|
|
| T |
24483164 |
ttggatcgtttaatcgacga-ttctcaaccgattaaatgacccaaaagcattaagt-ctagattaaaaatgattatcaaatattaacatctatgtctaga |
24483067 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaa |
299 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
24483066 |
gtgataacttaagataaattattattctagttcttagacccaaaagtaattgtcaatatcattttgaatctcaataaaacattaaacacaagaataacaa |
24482967 |
T |
 |
| Q |
300 |
caatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa---------------------tagatgtagct |
377 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
24482966 |
caatattgaataaataaactagaaccatattttaaaagatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctctaaaatccacaagggtagatgtagct |
24482867 |
T |
 |
| Q |
378 |
acatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
24482866 |
acatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagatt |
24482819 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Original strand, 31664155 - 31664505
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || | |||||||| |
|
|
| T |
31664155 |
caatcatttgacaatatcatttgtgtccaaatgatatcgttatttttaagaggtcgtttaaacatcgattctccaaacatttaaacaataaaaaagtcga |
31664254 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
31664255 |
ttgaatagtttaatcgacgatttccca-----------------aaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatactaacatccatgtctaga |
31664337 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
31664338 |
ttgataacttaagatagattgttattctagttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaac |
31664437 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||| ||||| |
|
|
| T |
31664438 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcctgttcgaata |
31664505 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22820623 - 22820401
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22820623 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacgaagtcga |
22820524 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
22820523 |
ttggataatttaatcgacgatttcccaaccgattaatttacccaaaagcattaagtcctagattaaaattgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
22820424 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgtt |
223 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22820423 |
gtgataacttaagatagattgtt |
22820401 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Original strand, 29032437 - 29032794
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||| | ||| || ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
29032437 |
caatcactcaacaacatcatccgtgtccaaatgatgtcgtgatttctaatggactattcaaaagtcgatttcccaaactattaaacaatcacaaagtcga |
29032536 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
| |||| ||| ||||| |||||| ||| | ||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
29032537 |
tcggatcatttaatcgatgatttctcaatcaattaattgatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaaaa------------ |
29032624 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaa |
299 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
29032625 |
gtgataacttaagatatatttttattctatttcttagattcaaaagtatttgtcaatatcattttgaatttcaataaagcattaaatacaagaataacaa |
29032724 |
T |
 |
| Q |
300 |
caatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
29032725 |
caatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagtttacataatgacttgtttgaata |
29032794 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 210 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 22818721 - 22818483
Alignment:
| Q |
210 |
taagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaa |
309 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22818721 |
taagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaa |
22818622 |
T |
 |
| Q |
310 |
taaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata-------------------gatgtagctacatatgtctatg |
390 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22818621 |
taaatagctagaaccatacattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagaatggatgtagctacatatgtctatg |
22818522 |
T |
 |
| Q |
391 |
atagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcat |
429 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22818521 |
atagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcat |
22818483 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 31882629 - 31882433
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
31882629 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatattgttatttccaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacaatcacaaattcga |
31882530 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtct |
197 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
31882529 |
ttggatagtttaatcaatgatttcccaaccgattaaatcacccaaaagtattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtct |
31882433 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 197 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 1954270 - 1954108
Alignment:
| Q |
197 |
tagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataa |
296 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||| |
|
|
| T |
1954270 |
tagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaagcaataaaagcaag----- |
1954176 |
T |
 |
| Q |
297 |
caacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
1954175 |
----aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttaaata |
1954108 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 1954445 - 1954285
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
1954445 |
caatcactcgacaa-atcattagtgtccaaatgatatcgttatttctatgggatcatttaaacatcgattttctaaacatttatacgatcacaaagtcga |
1954347 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctaga |
162 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1954346 |
ttggatcgtttaatcgacgatttcctaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctaga |
1954285 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 22825127 - 22825036
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcac |
92 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22825127 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcac |
22825036 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 4705021 - 4705116
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaag |
96 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4705021 |
caatcactcaacaataccatatgtgtccaaatgatatcgttagttctaagggatcgtttaaatatcgattttcaaaacatttaaacgatcacaaag |
4705116 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 2477791 - 2477733
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
2477791 |
tagatggagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaggaaaagatgaagatt |
2477733 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 1274720 - 1274662
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
1274720 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagaagagataaagatt |
1274662 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 2631529 - 2631471
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
2631529 |
tagatgtagctacatatgtttatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
2631471 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Original strand, 19472292 - 19472350
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19472292 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttacaaaggatgcagaaaggatgaagatt |
19472350 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 367 - 439
Target Start/End: Original strand, 29032813 - 29032885
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcatccctagactc |
439 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
29032813 |
tagatgtagctacatatgtctatgcaagcttggcaaatgatgaaagaaagatgaagattccatgtctagactc |
29032885 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 23795227 - 23795169
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
23795227 |
tagatggagctacatatgtctataatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Original strand, 31664523 - 31664581
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31664523 |
tagatgtagctagatatgtttatgatagctttgtaaaggattaagaaaagatgaagatt |
31664581 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 31878733 - 31878676
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| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
31878733 |
tagatgtagctacatatgtctttgatagttttgcaaaggatgaa-aaaagatgaagatt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 376 - 425
Target Start/End: Original strand, 45500748 - 45500797
Alignment:
| Q |
376 |
ctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
45500748 |
ctacatatgtctgtgatagctttgcaaatgatgaagaagaaatgaagatt |
45500797 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 6172643 - 6172604
Alignment:
| Q |
373 |
tagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaaga |
412 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 138
Target Start/End: Original strand, 27954283 - 27954410
Alignment:
| Q |
11 |
acaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggatagtt |
110 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| | | ||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||| | ||||||||| || ||| |
|
|
| T |
27954283 |
acaacatcattcgtgtccaaatgatgtcgtgatttctaatgaatcatttaaatgtcaatttcccaaactattaaacaatccaatagtcgattgcatcgtt |
27954382 |
T |
 |
| Q |
111 |
tcatcgacgatttcccaaccgattaaat |
138 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
27954383 |
atattgtcgatttcccaaactattaaat |
27954410 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 373 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 1954084 - 1954044
Alignment:
| Q |
373 |
tagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaa |
413 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
1954084 |
tagctacatatgtctatgatagcttttcaaaggatgaagaa |
1954044 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 19063646 - 19063588
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
19063646 |
tagatataactacatatgtctatgatagctttacatagaatgaagaagagatgaagatt |
19063588 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 20404079 - 20403987
Alignment:
| Q |
11 |
acaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattg |
103 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||| | ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
20404079 |
acaacatcattcgtgttcaaataatgtcgtgatttctattgaatcgtttaaatgttgatttcccaaactattaaacgatccaatagtcgattg |
20403987 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 25)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Original strand, 37251548 - 37251998
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37251548 |
caatcactcaacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
37251647 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||| |
|
|
| T |
37251648 |
ttggatagcttaatcgacgatttcccaaacgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctaga |
37251747 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37251748 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatttcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
37251847 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa--------------------tagatgtagctaca |
380 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
37251848 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctaca |
37251947 |
T |
 |
| Q |
381 |
tatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcatcc |
431 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
37251948 |
tatatctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatcc |
37251998 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 27166741 - 27167184
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27166741 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatattgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
27166840 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
27166841 |
ttggatagtttaatcgacgatttctcaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
27166940 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27166941 |
gtgataacttaagataaattgttattctatttctagattcaaaaatatatgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
27167040 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctacat |
381 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
27167041 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaaccacaagagtagatgtagctacat |
27167140 |
T |
 |
| Q |
382 |
atgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27167141 |
atgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatt |
27167184 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 16904252 - 16904696
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16904252 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcatttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
16904351 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
16904352 |
ttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
16904451 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16904452 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaac |
16904551 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctaca |
380 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16904552 |
aatattgaataaataggctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagtagatgtagctaca |
16904651 |
T |
 |
| Q |
381 |
tatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
16904652 |
tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
16904696 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 11767273 - 11766830
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
11767273 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaaggggtcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaaatcga |
11767174 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
11767173 |
ttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
11767074 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
11767073 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaataataaaagcaagaataacaac |
11766974 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctacat |
381 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
11766973 |
aatattgaataaattgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacat |
11766874 |
T |
 |
| Q |
382 |
atgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
11766873 |
atgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
11766830 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 33435121 - 33434678
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33435121 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
33435022 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
33435021 |
ttgggtagtttaatcgtcgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
33434922 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
33434921 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaac |
33434822 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaat-------------------agatgtagctacat |
381 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
33434821 |
aatattgaataaattgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgagtacctcaaaactacaagaggagatgtagctacat |
33434722 |
T |
 |
| Q |
382 |
atgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
33434721 |
atgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
33434678 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 11722919 - 11723363
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
11722919 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacaatcacaaagtcgt |
11723018 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
11723019 |
ttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
11723118 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
11723119 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaac |
11723218 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctaca |
380 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
11723219 |
aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagtagatgtagctaca |
11723318 |
T |
 |
| Q |
381 |
tatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
11723319 |
tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
11723363 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 9404943 - 9404499
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9404943 |
caatcactcaacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgt |
9404844 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
9404843 |
ttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
9404744 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
9404743 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaac |
9404644 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctaca |
380 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
9404643 |
aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagtagatgtagctaca |
9404544 |
T |
 |
| Q |
381 |
tatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
9404543 |
tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
9404499 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 30606719 - 30607163
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30606719 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagagatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgt |
30606818 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
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T |
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300 |
Q |
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| T |
30606919 |
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30607018 |
T |
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380 |
Q |
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T |
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425 |
Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 34456814 - 34456372
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T |
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200 |
Q |
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T |
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300 |
Q |
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T |
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380 |
Q |
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T |
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381 |
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425 |
Q |
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tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 7315723 - 7315358
Alignment:
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T |
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200 |
Q |
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T |
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| Q |
201 |
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300 |
Q |
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T |
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Original strand, 34869388 - 34869756
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T |
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| Q |
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Q |
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T |
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T |
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| Q |
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 6270409 - 6269965
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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199 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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Q |
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| T |
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T |
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380 |
Q |
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T |
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381 |
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Q |
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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14344980 - 14344646
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Q |
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T |
 |
| Q |
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ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
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T |
 |
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gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
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| T |
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gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaac |
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T |
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301 |
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Q |
| |
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aatattgaataaataagttagaaccatatattaaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 24836241 - 24835810
Alignment:
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T |
 |
| Q |
101 |
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200 |
Q |
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|||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |
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| T |
24836141 |
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24836047 |
T |
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| Q |
201 |
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300 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
301 |
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380 |
Q |
| |
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T |
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| Q |
381 |
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425 |
Q |
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| T |
24835854 |
tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
24835810 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 73 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 31846426 - 31846131
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Q |
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| T |
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ccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtga |
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T |
 |
| Q |
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Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
273 |
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Q |
| |
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|||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
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ataaaacaataaaagcaagaataacaacaatattgaataaattgctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 32227177 - 32226911
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| |
|
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|
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T |
 |
| Q |
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ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
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| T |
32227077 |
ttggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcactaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattgacattcatgtctaga |
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T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaa |
267 |
Q |
| |
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32226977 |
gtgataacttaagacagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 143 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 7315342 - 7315040
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Q |
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caaaagcattaagttctagattaaaaatgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaa |
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T |
 |
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243 |
aagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaa |
341 |
Q |
| |
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| T |
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aagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaaacaagaataacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaa |
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T |
 |
| Q |
342 |
gagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaag |
422 |
Q |
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7315142 |
aagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagtagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaag |
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T |
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| Q |
423 |
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425 |
Q |
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||| |
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| T |
7315042 |
att |
7315040 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 519530 - 519315
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attcgtgtccaaatgatatcgttatctctaagggatcgtttaattgtcgatttcccaaacatttaaacaatcacaaagttgatttgatcgtttaatcgac |
519431 |
T |
 |
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119 |
gatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctagagtgataacttaagataga |
218 |
Q |
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| T |
519430 |
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519331 |
T |
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| Q |
219 |
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234 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
519330 |
ttgttattctatttct |
519315 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Original strand, 39655679 - 39656048
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||| | ||| || ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||| | |
|
|
| T |
39655679 |
caatcactcaacaacatcatttgtgtccaaatgatgtcgtgatttctaatggactattcaaaagtcgatttcccaaactattaaacaatcagaaagtcaa |
39655778 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagatta-aaagtaattatcaaatattaatatcc-acgtcta |
198 |
Q |
| |
|
| |||| ||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| | ||||| |
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|
| T |
39655779 |
tcggatcgttcaatcgacgatttcccaatctattaaacgacccaaaaccattaagttcttgattacaaagtgattatcaaagattaa-atcctatgtcta |
39655877 |
T |
 |
| Q |
199 |
gagtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacattaaatgcaagaataac |
297 |
Q |
| |
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|| | | |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||| |
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| T |
39655878 |
gaattaaaactta-gatagattattattttaaccctagattcaaaagtatttgtcaataacatttcaaatctcaaataaagctttaaatgcaagaataat |
39655976 |
T |
 |
| Q |
298 |
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368 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
39655977 |
aagaagattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatgacttgtttgaata |
39656048 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 14344602 - 14344544
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
14344602 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
14344544 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 370 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 31846110 - 31846055
Alignment:
| Q |
370 |
atgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
31846110 |
atgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
31846055 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Original strand, 34869775 - 34869833
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
34869775 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaagaatgaataagagatgaagatt |
34869833 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 31846471 - 31846426
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttc |
46 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31846471 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaataatatcgttatttc |
31846426 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 436
Target Start/End: Original strand, 39656067 - 39656136
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcatccctaga |
436 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
39656067 |
tagatgtagctacatatgtctttgcaagcttgacaaaggatgaaagaaagatgaagatttcatgcctaga |
39656136 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 276 - 351
Target Start/End: Original strand, 5876679 - 5876755
Alignment:
| Q |
276 |
aaacattaaa-tgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacat |
351 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5876679 |
aaacattaaagtgcaagaataacatcaatatcaaatcaaatgctagaaccatatatttatagatcaaaagtttacat |
5876755 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 21160484 - 21160029
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
21160484 |
caatcactcggcaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
21160385 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
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||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
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| T |
21160384 |
ttgaatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
21160285 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
21160284 |
gtgataacttaagatatattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatattattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
21160185 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa--------------------tagatgtagctaca |
380 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21160184 |
aatattgaataaatagctagaatcatatattgaatgatcaagaaattacataatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctaca |
21160085 |
T |
 |
| Q |
381 |
tatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcatccctaga |
436 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21160084 |
tatgtctatgatagctttgcaaaagatgaagaagagatgaagatttcatgcctaga |
21160029 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 27257903 - 27257449
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27257903 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
27257804 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
27257803 |
ttggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattatccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
27257704 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
27257703 |
gtgataatttaagatagattgttattctatttctagatttaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatttaagaataacaac |
27257604 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctacat |
381 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
27257603 |
aatattgaataaatagctagaactatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagagtagatgtagctacat |
27257504 |
T |
 |
| Q |
382 |
atgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcatccctaga |
436 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
27257503 |
atgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctaga |
27257449 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 23924675 - 23925118
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23924675 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttttaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
23924774 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
23924775 |
ttggataatttaattgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaaaacctagattaaaagtgattatcaaaaattaacatccatgtctaga |
23924874 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23924875 |
gtgataacttaagatagattattattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
23924974 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctacat |
381 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
23924975 |
aatattgaataaatagctataaccatatattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacaacaagagtagatgtagatacat |
23925074 |
T |
 |
| Q |
382 |
atgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23925075 |
atgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatt |
23925118 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 29224233 - 29223790
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29224233 |
caatcactcgacaatatcatttgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
29224134 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | |
|
|
| T |
29224133 |
ttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccaattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaa |
29224034 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
29224033 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaac |
29223934 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa------------------tagatgtagctacat |
381 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
29223933 |
aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaactacaagagtagatgtagctacat |
29223834 |
T |
 |
| Q |
382 |
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425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
29223833 |
atgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
29223790 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 29337532 - 29337089
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29337532 |
caatcactcgacaatatcatttgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
29337433 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | |
|
|
| T |
29337432 |
ttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccaattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaa |
29337333 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
29337332 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaac |
29337233 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa------------------tagatgtagctacat |
381 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
29337232 |
aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaactacaagagtagatgtagctacat |
29337133 |
T |
 |
| Q |
382 |
atgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
29337132 |
atgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
29337089 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 13229985 - 13230428
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13229985 |
caatcactcaacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
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T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
13230085 |
ttggatcgtttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgaactaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
13230184 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13230185 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaac |
13230284 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctacat |
381 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
13230285 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcagaaccacaagagtagatgtagctacat |
13230384 |
T |
 |
| Q |
382 |
atgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
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Q |
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atgtctatgatagctttgtaaaggatgaagaaaagatgaagatt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 41978113 - 41977746
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Q |
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T |
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200 |
Q |
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T |
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41977814 |
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368 |
Q |
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41977813 |
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41977746 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 36039905 - 36040349
Alignment:
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Q |
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T |
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| Q |
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200 |
Q |
| |
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| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
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T |
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| Q |
201 |
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299 |
Q |
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T |
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300 |
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380 |
Q |
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36040304 |
T |
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| Q |
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425 |
Q |
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36040305 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Original strand, 42700616 - 42700949
Alignment:
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Q |
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T |
 |
| Q |
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200 |
Q |
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T |
 |
| Q |
201 |
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300 |
Q |
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42700915 |
T |
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334 |
Q |
| |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 43992033 - 43991607
Alignment:
| Q |
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Q |
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T |
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| Q |
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ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
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T |
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| Q |
201 |
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299 |
Q |
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| T |
43991844 |
gtgataacttaagatagattgttattctattttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaa |
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T |
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caatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctaca |
380 |
Q |
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tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagat |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 16 - 425
Target Start/End: Original strand, 36667533 - 36667956
Alignment:
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115 |
Q |
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|
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|
|
| T |
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T |
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| Q |
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215 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
216 |
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315 |
Q |
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| T |
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36667826 |
T |
 |
| Q |
316 |
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395 |
Q |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
396 |
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425 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
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| T |
36667927 |
tttgcaaaggatgaagaagagatgaagatt |
36667956 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 32523447 - 32523080
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| Q |
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100 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgttgaaacatcgatttcccaaatatttaaacgatcacaaagtcga |
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T |
 |
| Q |
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ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
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| T |
32523347 |
ttggatcgtttaatcgacgatttctcaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttttagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtttaga |
32523248 |
T |
 |
| Q |
201 |
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300 |
Q |
| |
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| T |
32523247 |
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T |
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| Q |
301 |
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368 |
Q |
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| T |
32523147 |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Original strand, 9786747 - 9787116
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T |
 |
| Q |
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Q |
| |
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| T |
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ttgaatcgtttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagtcttggattaaaagtgattatcaaatattgacatctatgtctaga |
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T |
 |
| Q |
201 |
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299 |
Q |
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gtgataacttaagatagattgttattctatttcttagatccaaaagtatttgttaatatcatattgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaa |
9787046 |
T |
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caatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
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| T |
9787047 |
caatattgaataaataagctataaccatatattaaatgatcaaaagtttacataatggcttgtttgaata |
9787116 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 14701162 - 14700793
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| |
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T |
 |
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200 |
Q |
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 |
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201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaa |
299 |
Q |
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| T |
14700962 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttcttagatccaaaagtatttctcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaatacaagaacaacaa |
14700863 |
T |
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300 |
caatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
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14700862 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 28457520 - 28457964
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gtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaa |
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378 |
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caatattaaataaataagctagaactatatattaaaagatcaagaaattacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagcta |
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catatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
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Q |
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28457918 |
catatgtctatgatagcattgcaaaggatgaagaaaagatgaagatt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 31758796 - 31758500
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| T |
31758696 |
ttggatcgtttaatcaacgatttcccaacctattaaacgacccaaaagcattaaattctagattaaaagtgattatcaaatattaacatttatgtctgga |
31758597 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataa |
296 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
31758596 |
atgaaaacttaagatagcttgttattctatttcttagatccaaaagcattggtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataa |
31758500 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 36557205 - 36557473
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||| ||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
36557205 |
caatcacttgataatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttataagggatcgtttaaatgtcaattttccaaacatttacacaatcacaaagtcga |
36557304 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
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||| || || | ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| |
|
|
| T |
36557305 |
ttgcattgtataatcgacgatttcccagccgtttgaatgacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctaga |
36557404 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaat |
268 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
36557405 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttcttagattcaaaagtatttgtcaatatcatattgaat |
36557473 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 368
Target Start/End: Original strand, 24662786 - 24663141
Alignment:
| Q |
16 |
atcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaac-atttaaacgatcacaaagtcgattggatagtttcat |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||| |||||| | |||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| ||| || |
|
|
| T |
24662786 |
atcattcgtgtccaaataatgtcgtgatttctaatggattatttaaaagtcgatttcccaaactatttaaataatcacaatgttgattggatcatttaat |
24662885 |
T |
 |
| Q |
115 |
cgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagatta-aaagtaattatcaaatattaatatcc-acgtctagagtgataacttaa |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| | ||||||| ||| |||||| |
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|
| T |
24662886 |
cgacgatttcccaacctattaaacgaccaaaaagcattaagttcttgattacaaagtgattatcaaagattaa-atcctatgtctagaatgaaaactta- |
24662983 |
T |
 |
| Q |
213 |
gatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaata |
311 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| || | ||||| ||||||||| |||| ||| ||||| ||||| || |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24662984 |
gatagattattattttaatcttagatccaaaagtatttgtcaataacatttcaaatcttaaataaagctttaaatgcaagaataataacaatattgaata |
24663083 |
T |
 |
| Q |
312 |
aata-gctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24663084 |
aataagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacgtaatagcttgtttgaata |
24663141 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 40200363 - 40200173
Alignment:
| Q |
96 |
gtcgattggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgt |
195 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | || |
|
|
| T |
40200363 |
gtcgattggatcgtttaatcgacgatttcccaacctattaaacgacccaaaagcattaaattctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgt |
40200264 |
T |
 |
| Q |
196 |
ctagagtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaa |
285 |
Q |
| |
|
|| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
40200263 |
ctggaatgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaa |
40200173 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 8679438 - 8679527
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| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatc |
90 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8679438 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatc |
8679527 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 302 - 425
Target Start/End: Original strand, 36557465 - 36557609
Alignment:
| Q |
302 |
atattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata--------------------gatgtagctaca |
380 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
36557465 |
atattgaataaataagttagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaatccacaagggtagatgtacctaca |
36557564 |
T |
 |
| Q |
381 |
tatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36557565 |
tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatt |
36557609 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Original strand, 42702235 - 42702293
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42702235 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggaggaagaaaagatgaagatt |
42702293 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 377 - 436
Target Start/End: Original strand, 9787145 - 9787204
Alignment:
| Q |
377 |
tacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcatccctaga |
436 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9787145 |
tacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagatttcatgcctaga |
9787204 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Original strand, 5784553 - 5784611
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
5784553 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
5784611 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 367 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 14700774 - 14700702
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcatccctagactc |
439 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | | ||||||||| |
|
|
| T |
14700774 |
tagatgtaactacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaatatgaagtttccttgcctagactc |
14700702 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 11651948 - 11651893
Alignment:
| Q |
310 |
taaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttga |
365 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11651948 |
taaatagctagaatcatatattagatgatcaaaagattacataatagcttgtttga |
11651893 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Original strand, 24663160 - 24663218
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24663160 |
tagatgtagctacatatgtctatgcaagcttcgcaaaggatgaaagaaagatgaagatt |
24663218 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 373 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 32523056 - 32523004
Alignment:
| Q |
373 |
tagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
32523056 |
tagctacatatgtccatgatagctttgcaaaggacgaagaagaaatgaagatt |
32523004 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0298 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 4)
Name: scaffold0298
Description:
Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Original strand, 15617 - 15984
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
15617 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagttga |
15716 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
15717 |
ttggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaacatccatttctaga |
15816 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15817 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
15916 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15917 |
aatattgaataaatagctagtaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaata |
15984 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Original strand, 11847 - 12214
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
11847 |
caatcactcgtcaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtaga |
11946 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
11947 |
ttggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaacatccatttctaga |
12046 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12047 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
12146 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12147 |
aatattgaataaatagctagtaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaata |
12214 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 380 - 425
Target Start/End: Original strand, 12244 - 12289
Alignment:
| Q |
380 |
atatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
12244 |
atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagatt |
12289 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0298; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 380 - 425
Target Start/End: Original strand, 16014 - 16059
Alignment:
| Q |
380 |
atatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16014 |
atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagatt |
16059 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 35)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 34914207 - 34913840
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34914207 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcatttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
34914108 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
34914107 |
ttggatagtttaatcgacgatttcccaactgattaaattacccaaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
34914008 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
34914007 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacagc |
34913908 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
34913907 |
aatattgaataaatagatagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatgacttgtttgaata |
34913840 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Original strand, 13173467 - 13173834
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13173467 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggattgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
13173566 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||| |
|
|
| T |
13173567 |
ttggatagttcaatcgaagatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctaga |
13173666 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13173667 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
13173766 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
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Target Start/End: Complemental strand, 3539566 - 3539122
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T |
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T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 34007021 - 34006577
Alignment:
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T |
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200 |
Q |
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T |
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300 |
Q |
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T |
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Q |
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T |
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Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 24160899 - 24161342
Alignment:
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T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 25977468 - 25977024
Alignment:
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T |
 |
| Q |
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gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Original strand, 13182000 - 13182367
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Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 26515071 - 26515515
Alignment:
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Q |
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 |
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T |
 |
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aatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctaca |
380 |
Q |
| |
|
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|
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tatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
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Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
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Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Original strand, 9932448 - 9932816
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 |
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Q |
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T |
 |
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Q |
| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 14271191 - 14270823
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| |
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T |
 |
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301 |
aatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
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| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 21596171 - 21596614
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| |
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ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
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| |
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gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
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aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctacat |
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| |
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 |
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atgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 24879384 - 24878929
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Q |
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T |
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ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
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ttggataatttaatcgacgatttcccaaccaattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaaa |
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T |
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gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
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| T |
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T |
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380 |
Q |
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24879084 |
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T |
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381 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 32806406 - 32806853
Alignment:
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T |
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ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
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T |
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201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
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T |
 |
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301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctacat |
381 |
Q |
| |
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32806706 |
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T |
 |
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382 |
atgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcat |
429 |
Q |
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| T |
32806806 |
atgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatttcat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16698428 - 16698088
Alignment:
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Q |
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T |
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Q |
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T |
 |
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Q |
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T |
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301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaa |
341 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 1455310 - 1454947
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Q |
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T |
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200 |
Q |
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| T |
1455210 |
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1455111 |
T |
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300 |
Q |
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 1467002 - 1466639
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Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
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| T |
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1466803 |
T |
 |
| Q |
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gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
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T |
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aatattgaataaa-tagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
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aatattgaataaacaagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 5988645 - 5989089
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T |
 |
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101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
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T |
 |
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201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttct-agattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaa |
299 |
Q |
| |
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| T |
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atgaaaacttaagatagattgttat-ctagttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataacaa |
5988943 |
T |
 |
| Q |
300 |
caatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaatag--------------------atgtagcta |
378 |
Q |
| |
|
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|
|
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T |
 |
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379 |
catatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
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Q |
| |
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|
|
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catatgtctatgatagctttgcaaatgatgaa-aaaagatgaagatt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 21631702 - 21631333
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Q |
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|
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T |
 |
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ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
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| T |
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ttagatcgtttaatcgacgatttctcaatctattaaacgacccaaaaacattaagttctagattataagtgattatcaaagattaacatctatgtctaga |
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T |
 |
| Q |
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gtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaa |
299 |
Q |
| |
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|
| T |
21631502 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttcttagattcaaaagcatttttcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaatacaagaataacaa |
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T |
 |
| Q |
300 |
caatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
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Q |
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caatattgaataaataagctagaaccatgtattaaaagatcaagagtttacgtaatagcttgtttgaata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15642923 - 15642568
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T |
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| Q |
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cgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagatta-aaagtaattatcaaatattaatatccacgtctagagtgataacttaag |
213 |
Q |
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| T |
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cgacgatttcctaacctattaaacgatccaaaagcattaagttcttgattacaaagtgattatgaaagattaaatactatgtctagaatgaaaacat-ag |
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T |
 |
| Q |
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atagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatc-tcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa |
312 |
Q |
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| T |
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atagattattattctaatcctagatccaaaagtatttgtcaataacatttcaaatcttaaataaagctttaaaggcaagaataataacaatattcaataa |
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T |
 |
| Q |
313 |
at-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
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| T |
15642624 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 368
Target Start/End: Original strand, 9518090 - 9518454
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2 |
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Q |
| |
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T |
 |
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tggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagatta-aaagtaattatcaaatattaatatcc-acgtctag |
199 |
Q |
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| T |
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agtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacattaaatgcaagaataaca |
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 |
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acaatattgaataaatag-ctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
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Query Start/End: Original strand, 201 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 32822119 - 32821951
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 26604757 - 26604491
Alignment:
| Q |
103 |
ggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagatta-aaagtaattatcaaatattaatatccacgtctagag |
201 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||||||||||| | |||||| | | || |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||||||| |
|
|
| T |
26604757 |
ggatcgtttaatcgacgatttcccaatctattaaacgatcaaatagcattaagttcttgattacaaagtgattatcaaaacttaaactctatgtctagaa |
26604658 |
T |
 |
| Q |
202 |
tgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
| | ||||| |||||||| |||||||| ||| || ||||||||| | || ||| ||||| ||||| || |||| ||||||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
26604657 |
taaaaacttt-gatagattattattctaaccctacatccaaaagtatttttcaataacatttcaaatcttaaataaagcattaaaaacaagaataataac |
26604559 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
26604558 |
aatattgaataaataagctagaatcttatattaaatgatcaa-agattacataatagcttttttgaata |
26604491 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 14479693 - 14479635
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14479693 |
tagatatagctacatatgtctatgatagatttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatt |
14479635 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 373 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 14270798 - 14270746
Alignment:
| Q |
373 |
tagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14270798 |
tagctacatatgtctatgatagttttgcaaaagatgaagaaaagatgaagatt |
14270746 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Original strand, 9932834 - 9932892
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
9932834 |
tagatgtagctacatatgtatatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
9932892 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 368
Target Start/End: Original strand, 6867907 - 6868063
Alignment:
| Q |
214 |
atagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataa |
312 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||||||| | || ||| ||||| ||||| || |||| ||||||| ||||| ||| || ||||| || || |
|
|
| T |
6867907 |
atagattattattctaaccctagattcaaaagtacctttcaataacatttcaaatcttaaataaagcattaaacacaagactaataaaaatatcaaaaaa |
6868006 |
T |
 |
| Q |
313 |
at-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6868007 |
atgagctagaaccatatattaaattatcaaaagattacataatagcttgtttgaata |
6868063 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 366 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 26604473 - 26604414
Alignment:
| Q |
366 |
atagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
26604473 |
atagatgtagctacatatgtctatgaaagctttgcaaaagatggaagaaagatgaagatt |
26604414 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 21631315 - 21631265
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaaga |
417 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21631315 |
tagatgtaactacatatgtctatgatagctttacaaaggatgaagaaaaga |
21631265 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 1454928 - 1454856
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcatccctagactc |
439 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
1454928 |
tagatgtagttacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaagattccatgcctagactc |
1454856 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 1466620 - 1466548
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcatccctagactc |
439 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
1466620 |
tagatgtagttacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaagattccatgcctagactc |
1466548 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 429
Target Start/End: Original strand, 9518473 - 9518535
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcat |
429 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9518473 |
tagatgtagctacatatgtctatgcaaacttggcaaaggatgaaagaaagatgaagatttcat |
9518535 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 32821934 - 32821876
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
32821934 |
tagatgtagctacatttgtctatgatagcttttaaaaggatggagaagagatgaagatt |
32821876 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 381 - 417
Target Start/End: Original strand, 13173859 - 13173895
Alignment:
| Q |
381 |
tatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaaga |
417 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13173859 |
tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaaga |
13173895 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 381 - 417
Target Start/End: Original strand, 13182392 - 13182428
Alignment:
| Q |
381 |
tatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaaga |
417 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13182392 |
tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaaga |
13182428 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 373 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 15642543 - 15642487
Alignment:
| Q |
373 |
tagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcat |
429 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15642543 |
tagctacatatgtctatgcaagcttagcaaaggatgaaagaaagatgaagatttcat |
15642487 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 19247471 - 19247914
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
19247471 |
caatcactcgacaatatcattcgtatccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagttga |
19247570 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
19247571 |
ttggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
19247670 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19247671 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtctatatcattttgaagctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
19247770 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctacat |
381 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19247771 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagtttgtttgaatacctcaaaaccacaagagtagatgtagctacat |
19247870 |
T |
 |
| Q |
382 |
atgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19247871 |
atgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatt |
19247914 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 52619021 - 52618654
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52619021 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
52618922 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
52618921 |
ttggatagtttaattgacgatttcccgatcgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
52618822 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52618821 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtttgtgtccatatcattttgaatctcaataaatcattaaatgcaagaataacaac |
52618722 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
52618721 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaata |
52618654 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 42532529 - 42532974
Alignment:
| Q |
1 |
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggattgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
42532628 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
42532629 |
ttggatagtttaatcgacgatttcccaaccaattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
42532728 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattc-aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaa |
299 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
42532729 |
gtgataacttaagatagattgttattctagttctagattcaaaaagtatgtgtccatatcattttgaatcttaataaaacaataaaagcaagaataacaa |
42532828 |
T |
 |
| Q |
300 |
caatattgaataaatagctagaa-ccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctac |
379 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
42532829 |
caatattgaataaatagctagaacccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagagtagatgtagctac |
42532928 |
T |
 |
| Q |
380 |
atatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42532929 |
atatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
42532974 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 4838779 - 4839223
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4838779 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgt |
4838878 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
4838879 |
ttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
4838978 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
4838979 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaac |
4839078 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctaca |
380 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
4839079 |
aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagtagatgtagctaca |
4839178 |
T |
 |
| Q |
381 |
tatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
4839179 |
tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
4839223 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 6 - 436
Target Start/End: Original strand, 21677315 - 21677765
Alignment:
| Q |
6 |
actcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgga |
105 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21677315 |
actcgacaatatcattcatgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattgga |
21677414 |
T |
 |
| Q |
106 |
tagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctagagtgat |
205 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21677415 |
tagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacctaaaagcattaagttatagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgat |
21677514 |
T |
 |
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206 |
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305 |
Q |
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T |
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385 |
Q |
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T |
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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
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Target Start/End: Complemental strand, 1188483 - 1188036
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atgcctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatttcat |
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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 22048200 - 22047756
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T |
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T |
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Q |
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T |
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Target Start/End: Complemental strand, 323957 - 323589
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Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
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catatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
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Q |
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catatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagatt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
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 |
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aatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctaca |
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Q |
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tatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcatccctaga |
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tatgtctatgatagctttggaatggatgaagaaaagatgaagatttcatgcctaga |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
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| |
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aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Original strand, 26373274 - 26373640
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caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaattatattgttatttctaagggattgtttaaacattgatttcccaaacgtttaaacgatcacaaagtcga |
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T |
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ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
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ttggatcgtttaatcgacgatttctcaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttatagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctaga |
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T |
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201 |
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300 |
Q |
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T |
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301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
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aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaata |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 439
Target Start/End: Original strand, 30218030 - 30218492
Alignment:
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T |
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ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
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T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaa |
299 |
Q |
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| T |
30218229 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttcttagaacaaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaatacaagaatagcaa |
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T |
 |
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caatattgaataaat----agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa--------------------tagatgtag |
375 |
Q |
| |
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| T |
30218329 |
caatattgaataaataataagctagaaccatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaatccacaagggtagatgtag |
30218428 |
T |
 |
| Q |
376 |
ctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcatccctagactc |
439 |
Q |
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| T |
30218429 |
ctacatatgtctatgatagctttgctaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctagactc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Original strand, 33110345 - 33110713
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
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| T |
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T |
 |
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201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
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| T |
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atgataacttaagatagactcttatgtttttcctagattcaaaagtatttgtcaatatcatttcaaatctcaataaagctttaaatacaagaataacaac |
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T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
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T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 53895897 - 53895443
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100 |
Q |
| |
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| T |
53895897 |
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53895798 |
T |
 |
| Q |
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ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
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53895797 |
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53895698 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaa |
299 |
Q |
| |
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| T |
53895697 |
atgaaaacttaagatagattgttattctatttcttagacccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataacaa |
53895598 |
T |
 |
| Q |
300 |
caatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa--------------------tagatgtagcta |
378 |
Q |
| |
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|
| T |
53895597 |
caatattgaataaataagctagaaccatatattaaa--at-aagagtttacataatagcttgtttgaatacctcaaaacccagaagggtagatgtagcta |
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T |
 |
| Q |
379 |
catatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcatccctaga |
436 |
Q |
| |
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|
|
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53895500 |
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T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 20949265 - 20948897
Alignment:
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Q |
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|
| T |
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20949166 |
T |
 |
| Q |
100 |
attggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctag |
199 |
Q |
| |
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| T |
20949165 |
attggatcatttaatcgatgattttccaatctattaattgatccaaaaacattaaattctagattaaaagtgattatcaaagattaacatctatgtctgg |
20949066 |
T |
 |
| Q |
200 |
agtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaa |
299 |
Q |
| |
|
| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| |
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| T |
20949065 |
aatgaaaactt-agatagattgttattctattcctagatccaaaagtatttgtcaatatcatttcaaatctcaataaagctataaatacaagaataacaa |
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T |
 |
| Q |
300 |
caatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
20948966 |
caatattgaataaataagctagaaccatatattaaaatatcaagagtttacataatagcttgtttgaata |
20948897 |
T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Original strand, 9417076 - 9417372
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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|
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9417076 |
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9417175 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||| | ||||||| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataa |
296 |
Q |
| |
|
||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |
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|
| T |
9417276 |
atgaaaacttacgatagattgttattctatttcttagatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataa |
9417372 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 21668548 - 21668703
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Q |
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|
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T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagt |
156 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21668648 |
ttggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacctaaaagcattaagt |
21668703 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 42271895 - 42271785
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Q |
| |
|
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|
|
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42271895 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcattatttctaaaaggccgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
42271796 |
T |
 |
| Q |
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ttggatagttt |
111 |
Q |
| |
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||||||||||| |
|
|
| T |
42271795 |
ttggatagttt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
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Query Start/End: Original strand, 1 - 62
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62 |
Q |
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|
|
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33239436 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggattgtttaaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 370 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 26069855 - 26069800
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atgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
26069855 |
atgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagttgaagatt |
26069800 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 323571 - 323513
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367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
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323571 |
tagatgtagctacatatgtttatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 413
Target Start/End: Original strand, 5273591 - 5273637
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| Q |
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tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaa |
413 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaa |
5273637 |
T |
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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
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Target Start/End: Complemental strand, 20948879 - 20948809
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| Q |
366 |
atagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcatccctaga |
436 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
20948879 |
atagatgtagctacatatatttatgatagcttgacaaaggatgaagaaaagatgaagattccatgcctaga |
20948809 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
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tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||| |
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|
| T |
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tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgtaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
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ctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcatcccta |
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| |
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|
|
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
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Q |
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|
|
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ctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaggaagaaatgaagatt |
46692123 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 369 - 425
Target Start/End: Original strand, 26373660 - 26373716
Alignment:
| Q |
369 |
gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
26373660 |
gatatagctatatatgtctatgatagctttgcaaaggataaagaagaaatgaagatt |
26373716 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 6640110 - 6640052
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgat-gaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6640110 |
tagatgtagctacatatgtctatgaaagctttggaaaagatagaagaaa-gatgaagatt |
6640052 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 412
Target Start/End: Original strand, 35416723 - 35416768
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaaga |
412 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |
|
|
| T |
35416723 |
tagatgtaactacatatgtctatgatagttgtgcaaaagatgaaga |
35416768 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0019 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:
Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 116211 - 116654
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
116211 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttttaagggattgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
116310 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
116311 |
ttggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattatccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
116410 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
116411 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaattcaagaataacaac |
116510 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgttt-------------------gaatagatgtagctacat |
381 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
116511 |
aatattgaattaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttaaatacctcaaaaccacaagagtagatgtagctacat |
116610 |
T |
 |
| Q |
382 |
atgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
116611 |
atgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaggatt |
116654 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 169051 - 169226
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
169051 |
caatcactcgataatatcgttcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcatttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcaaaaagtcga |
169150 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattat |
176 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
169151 |
ttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagatttaaagtgattat |
169226 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 32)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 11738441 - 11738884
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11738441 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacattgatttcccaaaaatttaaacgatcacaaagtcga |
11738540 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
11738541 |
ttggatagtttagtcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
11738640 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11738641 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaattatgtgtccatatcattttgaatctcagtaaaacattaaatgcaagaataacaac |
11738740 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctacat |
381 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
11738741 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattgcataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagagtagatgtagctacat |
11738840 |
T |
 |
| Q |
382 |
atgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11738841 |
atgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatt |
11738884 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 431984 - 432427
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
431984 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacaatcacgaagtcga |
432083 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
432084 |
ttggataatttaatcgacgatttcccaaccgattaattcacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
432183 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
432184 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaac |
432283 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata-------------------gatgtagctacat |
381 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
432284 |
aatattgaataaattgctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagaatggatgtagctacat |
432383 |
T |
 |
| Q |
382 |
atgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
432384 |
atgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatt |
432427 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 16832426 - 16832873
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16832426 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
16832525 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||| |
|
|
| T |
16832526 |
ttggataatttaatcgacgatttcctaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacattcatgtctaga |
16832625 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
16832626 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaaatatgtgtccatatcattttgaatctaaataacatattaaatgcaagaatagcaac |
16832725 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctacat |
381 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16832726 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagagtagatatagctacat |
16832825 |
T |
 |
| Q |
382 |
atgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcat |
429 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16832826 |
atatctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatttcat |
16832873 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 9667339 - 9667782
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
9667339 |
caatcactcaacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcctttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacgaagtcga |
9667438 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
9667439 |
ttggataatttaatcgacgatttaccaaccgattaatttacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
9667538 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
9667539 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaac |
9667638 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata-------------------gatgtagctacat |
381 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
9667639 |
aatattgaataaattgctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagaatgtatgtagctacat |
9667738 |
T |
 |
| Q |
382 |
atgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9667739 |
atgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatt |
9667782 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 38121575 - 38122019
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38121575 |
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38121674 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
38121675 |
ttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
38121774 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
38121775 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaac |
38121874 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctaca |
380 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
38121875 |
aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagtagatgtagctaca |
38121974 |
T |
 |
| Q |
381 |
tatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
38121975 |
tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
38122019 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 39000824 - 39001268
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| |
|
|
| T |
39000924 |
ttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattgacatccatgtctaga |
39001023 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
39001024 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaac |
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T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctaca |
380 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
39001124 |
aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaataccttaaaactacaagagtagatgtagctaca |
39001223 |
T |
 |
| Q |
381 |
tatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
39001224 |
tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
39001268 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 44504911 - 44505357
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
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| |
|
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|
|
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caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatgtcgttatttctaagaggtcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
44505010 |
T |
 |
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101 |
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Target: chr1; HSP #9
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T |
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Target: chr1; HSP #12
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Target Start/End: Complemental strand, 49249583 - 49249249
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300 |
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T |
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Q |
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T |
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381 |
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Q |
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tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatt |
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T |
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200 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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gtgataacttaagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaa |
299 |
Q |
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T |
 |
| Q |
300 |
caatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
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Q |
| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16131024 - 16130706
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Q |
| |
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ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
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ttggatcgtttaatcgacgattccctaaccgattaaatgacccaaaaacattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctaga |
16130825 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
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gtgataacttaagatagattgttattttatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcatttcaaatctcaataaaa--------gcaagaataacaac |
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T |
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aatattgaataaatagctagaaccata |
327 |
Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15161941 - 15161612
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T |
 |
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tagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctagagtgat |
205 |
Q |
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15161841 |
ccgtttaatcgactatttcccaaccgattaaatgacccaaaagcattaagttctatattaaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagagtgat |
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T |
 |
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aacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctc-aataaaacattaaatgcaagaataacaacaata |
304 |
Q |
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aacttaagatagattattattctaatcctggatccaaaagtatttgttaatatccttttcaatctcaaataaagcattaaatgcaagaataacaacaata |
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ttgaataaatagctagaaccatatattaaa |
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15161641 |
ttgaataaatagctagaaccatatattaaa |
15161612 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 2 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 9269153 - 9268787
Alignment:
| Q |
2 |
aatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgat |
101 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| | ||| |||||| || |||| |||||| |||||| |||| |||| |||| |
|
|
| T |
9269153 |
aatcactcgacaacatcattcgtgtctaaatgatgtcgtgatttctaatggactatttaaaagtcaattttccaaactattaaacaatca-aaagccgat |
9269055 |
T |
 |
| Q |
102 |
tggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaag-taattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||| || |||| ||| | ||||||||| ||||| || | ||||||| |
|
|
| T |
9269054 |
tggatcgtttaatcgacgatttcccaatcaattaaacgacctaaaagcattaagctcttgatttcaaggtgattatcaaagattaaattctatgtctaga |
9268955 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaa-taaaacattaaatgcaagaataacaa |
299 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| |||| ||| |||| |||||||| |||| | ||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
9268954 |
atgaacactta-gatagattattattctgatcctagatccaaaagtatttgtcaataaaatttcaaatctcaaataaagctttagatgcaagaataataa |
9268856 |
T |
 |
| Q |
300 |
caatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
9268855 |
caatattgaataaatagctagaaacatatattaaaagatcaagagtttacataatagcttggttgaata |
9268787 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 6244482 - 6244363
Alignment:
| Q |
233 |
ctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatatt |
331 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | || ||| ||||| |||||| || |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
6244482 |
ctagattcaaaagtacctttcaataacatttcgaatctaaaataaacattaaacacaagaatgataacaatattgaataaaagagctggaaccatatatt |
6244383 |
T |
 |
| Q |
332 |
aaatgatcaagagtttacat |
351 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6244382 |
aaatgatcaagagtttacat |
6244363 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16129792 - 16129734
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
16129792 |
tagatatagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaagaaatgaagatt |
16129734 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 49249205 - 49249147
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
49249205 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
49249147 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 15161235 - 15161177
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
15161235 |
tagatgtaactacatatgtctatgatagctttgcagaggatgaagaaaatatgaagatt |
15161177 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16130346 - 16130288
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
16130346 |
tagatatagctacatatgtctatgataactttgcaaatgatgaagaagaaatgaagatt |
16130288 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Original strand, 33492227 - 33492285
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
33492227 |
tagatgtggctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
33492285 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 13830515 - 13830439
Alignment:
| Q |
292 |
aataacaacaatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13830515 |
aataataacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaatgatcaag-taatacataatagcttgtttgaata |
13830439 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 39454236 - 39454178
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
39454236 |
tagatgtagctacatatgtctatgataactttgcaaaagatggaagaaagatgaagatt |
39454178 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 39454354 - 39454284
Alignment:
| Q |
272 |
aataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaa |
341 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
39454354 |
aataaagcattaaactcaagaataataacaatattgaataaataagctagaaccttaaattaaatgatcaa |
39454284 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 20226005 - 20226049
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttattt |
45 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20226005 |
caatcactcgacaatctcatccgtgtccaaatgatatcgttattt |
20226049 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 370 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 13830417 - 13830358
Alignment:
| Q |
370 |
atgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcat |
429 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13830417 |
atgtagctacatatgtctatgaaaactttgcaaaggatgaaagaaaaatgaagatttcat |
13830358 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16130195 - 16130156
Alignment:
| Q |
288 |
caagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccata |
327 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
16130195 |
caagaataacaacaatattgaataaatggctagaatcata |
16130156 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 326 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15161296 - 15161254
Alignment:
| Q |
326 |
tatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15161296 |
tatattaaaaaatcaagagtttacataatgacttgtttgaata |
15161254 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 40
Target Start/End: Original strand, 27048317 - 27048350
Alignment:
| Q |
7 |
ctcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgt |
40 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27048317 |
ctcgacaacatcattcgtgtccaaatgatatcgt |
27048350 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 376 - 425
Target Start/End: Original strand, 41000141 - 41000190
Alignment:
| Q |
376 |
ctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||| |
|
|
| T |
41000141 |
ctacatatgtctatgatagatttgcaaaggatgaggaagaaatgaagatt |
41000190 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 39)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 20837612 - 20837169
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
20837612 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacgtcgatttcccaaacattcaaacgatcacgaagtcga |
20837513 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
20837512 |
ttggataatttaatcgatgatttcccaaccgattaatttacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaatatccatgtctaga |
20837413 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
20837412 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaat |
20837313 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata-------------------gatgtagctacat |
381 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
20837312 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagaatggatgtagctacat |
20837213 |
T |
 |
| Q |
382 |
atgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20837212 |
atgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatt |
20837169 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Original strand, 48167837 - 48168204
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
48167837 |
caatcactcgacaatatcattcgtgttcaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgctcacaaattcga |
48167936 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
48167937 |
ttggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
48168036 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48168037 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatgtcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
48168136 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
48168137 |
aatattgaataaatagctaaaacaatatattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaata |
48168204 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 436
Target Start/End: Original strand, 1232134 - 1232589
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1232134 |
caatcactcggcaatatcattcgtgtccaaaggatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
1232233 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | |
|
|
| T |
1232234 |
ttgaatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctata |
1232333 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1232334 |
gtgataacttaagatatattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttaaatctcaataaaacattaaatgaaagaataacaac |
1232433 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa--------------------tagatgtagctaca |
380 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1232434 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagaaattacataatggtttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctaca |
1232533 |
T |
 |
| Q |
381 |
tatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcatccctaga |
436 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1232534 |
tatgtctataatagctttgcaaaggatgaagaagagataaagatttcatgcctaga |
1232589 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 22098185 - 22097742
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22098185 |
caatcattcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
22098086 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
22098085 |
ttggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattaaccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
22097986 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
22097985 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagtaagaataacaac |
22097886 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctacat |
381 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
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22097785 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 9989914 - 9989547
Alignment:
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T |
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Q |
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Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 10385713 - 10386157
Alignment:
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T |
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Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 4742646 - 4743091
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T |
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T |
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| |
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 27850194 - 27850637
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Q |
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Q |
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Q |
| |
|
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|
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27850593 |
T |
 |
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atgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
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Q |
| |
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atgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaatgatgaagatt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 37471330 - 37471773
Alignment:
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200 |
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 |
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gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
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|
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T |
 |
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381 |
Q |
| |
|
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|
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T |
 |
| Q |
382 |
atgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
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Q |
| |
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|
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37471730 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
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Target Start/End: Original strand, 7652865 - 7653233
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 |
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Q |
| |
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 |
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aatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
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| |
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|
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7653165 |
aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaata |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 36469079 - 36469522
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 |
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 |
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 |
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aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctacat |
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| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | || ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
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36469379 |
aatattgaataaattgctagaaccatgtattaaaagatctaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagagtagttgtagctacat |
36469478 |
T |
 |
| Q |
382 |
atgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
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Q |
| |
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|
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36469479 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 45528166 - 45527722
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| |
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 |
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caatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctaca |
380 |
Q |
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caatattgaataaatagctagaaccatgtattaaatgatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagagtagatgtagctaga |
45527767 |
T |
 |
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381 |
tatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
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Q |
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45527766 |
tatgtctatgatagctttgcaaaggatgatgaaaagatgaagatt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 37023209 - 37022867
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T |
 |
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| |
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T |
 |
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T |
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acaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaa |
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Q |
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Target: chr3; HSP #16
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Target Start/End: Original strand, 20962899 - 20963200
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Target: chr3; HSP #19
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Target: chr3; HSP #20
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Target: chr3; HSP #24
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||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
8615616 |
tatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
8615578 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 22098499 - 22098375
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22098499 |
caatcattcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
22098400 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcc |
125 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22098399 |
ttggatagtttaatcgacgatttcc |
22098375 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 27104510 - 27104326
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaac-atttaaacgatcacaaagtcg |
99 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27104510 |
caatcactcaacaacatcattcatgtccaaatcatatcgttatttcgaagggatcatttaaatgtcgatttcccaaactatttaaacgatcacaaagtcg |
27104411 |
T |
 |
| Q |
100 |
attggatagtttcatcgacgatttcccaaccga----ttaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaa |
180 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||||| ||| | | |||| | | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
27104410 |
attggatcatttaatcgacgatttctcaatctatatgttaattgatccaaaagcattaagttatagattaaaagtgattatcaaa |
27104326 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 294 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 23385622 - 23385547
Alignment:
| Q |
294 |
taacaacaatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23385622 |
taacaacaatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaaaattacataatagcttgtttgaata |
23385547 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Original strand, 27030712 - 27030770
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
27030712 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
27030770 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Original strand, 7653251 - 7653309
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
7653251 |
tagatgtagctacatatgtctaagatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
7653309 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 9989529 - 9989471
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
9989529 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggttgaagaaagggtgaagatt |
9989471 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 23194055 - 23193998
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23194055 |
tagatgtagctacatatgtctctgatag-tttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatt |
23193998 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 364 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 23385532 - 23385482
Alignment:
| Q |
364 |
gaatagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaa |
414 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23385532 |
gaatagatgtagctaaatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaa |
23385482 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 33248121 - 33248063
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
33248121 |
tagatgcagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaaaagagatgaagatt |
33248063 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Original strand, 52308114 - 52308172
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
52308114 |
tagatgtagctacatatgtctaagatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
52308172 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 26335239 - 26335194
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaaga |
412 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
26335239 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaaga |
26335194 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 367 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 2357293 - 2357221
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcatccctagactc |
439 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
2357293 |
tagatgtagctacatatgtctatacaagcttggcaaaggatgaaagaaagatgaagatttcatgcctagactc |
2357221 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Original strand, 48168222 - 48168280
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
48168222 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcataggatgaagtgaagatgcagatt |
48168280 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 276 - 338
Target Start/End: Original strand, 17405038 - 17405101
Alignment:
| Q |
276 |
aaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaat-aaatagctagaaccatatattaaatgat |
338 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17405038 |
aaacattaaacacaagaataataacaatattgaataaaagatctagaaccatatattaaatgat |
17405101 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 49434226 - 49434157
Alignment:
| Q |
370 |
atgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcatccctagactc |
439 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| |||||| ||| |||| |||| |
|
|
| T |
49434226 |
atgtagctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaagataaagattacatacctaaactc |
49434157 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0336 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:
Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 9261 - 8817
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9261 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcatttagacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
9162 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
9161 |
ttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
9062 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
9061 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaac |
8962 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctaca |
380 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
8961 |
aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagtagatgtagctaca |
8862 |
T |
 |
| Q |
381 |
tatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
8861 |
tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
8817 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0124 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:
Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 12713 - 12344
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
12713 |
caatcactcgtcaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagttga |
12614 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
12613 |
ttggatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaacatccatttctaga |
12514 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaac-attaaatgcaagaat-aaca |
298 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
12513 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaattaaatgcaagaataaaca |
12414 |
T |
 |
| Q |
299 |
acaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12413 |
acaatattgaataaatagctagtaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaata |
12344 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 380 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 12314 - 12269
Alignment:
| Q |
380 |
atatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
12314 |
atatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagatgaagatt |
12269 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0159 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:
Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 28542 - 28986
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28542 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgattttccaaacatttaaacgatcacaaagtcgt |
28641 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
28642 |
ttgggtagtttaatcgacgattttccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
28741 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28742 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaac |
28841 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa-------------------tagatgtagctaca |
380 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28842 |
aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaatacctcaaaactacaagagtagatgtagctaca |
28941 |
T |
 |
| Q |
381 |
tatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
28942 |
tatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
28986 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0505 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 2)
Name: scaffold0505
Description:
Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Original strand, 627 - 994
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
627 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaatgtcgatttcccaaacattaaaacaatcacaaagtcga |
726 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
727 |
ttggatcgtttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgacccaaaatcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
826 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
827 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatattattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
926 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
927 |
aatattgaataaataagcta-caccatatattaaaagatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
994 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0505; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 439
Target Start/End: Original strand, 1013 - 1085
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcatccctagactc |
439 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||| | ||||| ||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
1013 |
tagatgtagctacatatgtctgtgataactttgcaaaggacgaagaagatatgaaaattccatgcctagactc |
1085 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0076 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:
Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Original strand, 25293 - 25661
Alignment:
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100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
25293 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacgaagtcga |
25392 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
25393 |
ttggataatttaatcgacgatttccaaaccgattaatttacccaaaagcattaagtactagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
25492 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
25493 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacaataaaagcaagaataacaac |
25592 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25593 |
aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaaaagattacataatagcttgtttgaata |
25661 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Original strand, 25679 - 25737
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
25679 |
tagatgtagctacatatatctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
25737 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:
Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Original strand, 76095 - 76462
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
76095 |
caatcactagacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacaacgatttcccaatgatttaaacgatcacaaagtcga |
76194 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
76195 |
ttgaatagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcgtagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
76294 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
76295 |
gtgataacttaagatagattgttattttatttctagattcaaaagtatgtgttcatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
76394 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
76395 |
aatattgaataaatagctagaaccatacattaaatgatcaaaagattacataataacttgtttgaata |
76462 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 413
Target Start/End: Original strand, 76480 - 76526
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| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaa |
413 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
76480 |
tagatgtatctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaa |
76526 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0147 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: scaffold0147
Description:
Target: scaffold0147; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 7250 - 6807
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| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
7250 |
caatcactcgacaacatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaaagatcacaaagtcga |
7151 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
7150 |
ttggataacttaatcgacgattttccaaccaattaatttacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
7051 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
7050 |
gtgataacttaaaatatattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgttcatatcattttgaatctcaagaaaacaataaaagcaagaataacaac |
6951 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata-------------------gatgtagctacat |
381 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6950 |
aatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatcaaaatattacataatagcttgtttgaatacctcaaaaccacaagaatggatgtagctacat |
6851 |
T |
 |
| Q |
382 |
atgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6850 |
atgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaaagatgaagatt |
6807 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0444 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:
Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Original strand, 12131 - 12491
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12131 |
caatcacttgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaacatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
12230 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctaga |
200 |
Q |
| |
|
|||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
12231 |
ttgggtagtttaatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagttctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctaga |
12330 |
T |
 |
| Q |
201 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaac |
300 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
12331 |
gtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaa--------gcaagaataacaac |
12422 |
T |
 |
| Q |
301 |
aatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12423 |
aatattgaataaataagctagaaccatatattaaaatatcaaaagattacataatagcttgtttgaata |
12491 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0091 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:
Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 14698 - 14245
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| Q |
7 |
ctcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcgattggat |
106 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| | | ||| | |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14698 |
ctcgacaacatcattcgtgtccaaatgatgtcgtgatttataatggaccatttaaaagtcgatttcccaaactattaaacaatcacaaagtcgattggat |
14599 |
T |
 |
| Q |
107 |
agtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctagagtgata |
206 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||| | |||||| | |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| | |
|
|
| T |
14598 |
cgtttaatcgacgattttccaatctattaaacgatccaaaagcattaagctcttgatttaaagtgattatcaaatattaacatctatgtctagaatgaaa |
14499 |
T |
 |
| Q |
207 |
acttaagatagattgttattctatttc-tagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatat |
305 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
14498 |
acttaagatagattgttattctatttcttatatccaaaagtatttgtcaatatcattttgaatctcaataaagcattaaacacaagaataacaactatat |
14399 |
T |
 |
| Q |
306 |
tgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaa--------------------tagatgtagctacatatg |
384 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14398 |
tgaataaataaactagaaccatatattaaaagatcaagagtttac-taatggcttgtttgaatacctcaaaacccacaagggtagatgtagctacatatg |
14300 |
T |
 |
| Q |
385 |
tctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcatccctagactc |
439 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
14299 |
tatatgatagctttgcaaaggatgaaaaaaagatgaagattccatccctaaactc |
14245 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0059 (Bit Score: 178; Significance: 8e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0059
Description:
Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Original strand, 16115 - 16483
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| Q |
1 |
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99 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16115 |
caatcactcaacaatatcatttgtgtccaaatgatatcgttatttctaagggatcgtttaaatgtcgatttcccaaactatttaaacgatcacaaagtcg |
16214 |
T |
 |
| Q |
100 |
attggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctag |
199 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||||| |||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| ||| | |||||| |
|
|
| T |
16215 |
attggatcgtttaatcgatgatttcccaatctattaatcgatccaaaagcattaagttctagattaaaaatgattatcaaagattaacatctatgtctag |
16314 |
T |
 |
| Q |
200 |
agtgataacttaagatagattgttattctatttctagattcaaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaa |
299 |
Q |
| |
|
| ||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16315 |
aatgaaaactt-agatagattgttatataattcctagatccaaaagtattagttaatatcatttcaaatctcaataaagccttaaatacaagaataacaa |
16413 |
T |
 |
| Q |
300 |
caatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||| |||| |
|
|
| T |
16414 |
ccatattgaataaataagctagaaccatatattaaaagatcaagggtttacataatagcttatttaaata |
16483 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0059; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 370 - 436
Target Start/End: Original strand, 16505 - 16571
Alignment:
| Q |
370 |
atgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcatccctaga |
436 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16505 |
atgtagatacatatgtctaagatagcttggcaaaggatgaagaaaagatgaagatttcatgcctaga |
16571 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0447 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 4)
Name: scaffold0447
Description:
Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 241 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 7341 - 7214
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| Q |
241 |
aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatca |
340 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7341 |
aaaagtatgtgtccataacattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaatagatagctagaaccatatattaaatgatca |
7242 |
T |
 |
| Q |
341 |
agagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7241 |
agagtttacataatggcttgtttgaata |
7214 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 241 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 11955 - 11828
Alignment:
| Q |
241 |
aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatca |
340 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11955 |
aaaagtatgtgtccataacattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaatagatagctagaaccatatattaaatgatca |
11856 |
T |
 |
| Q |
341 |
agagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11855 |
agagtttacataatggcttgtttgaata |
11828 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0447; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7420 - 7340
Alignment:
| Q |
132 |
attaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctagagtgataacttaa |
212 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7420 |
attaagttactcaaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa |
7340 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0447; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12034 - 11954
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| Q |
132 |
attaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctagagtgataacttaa |
212 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12034 |
attaagttactcaaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa |
11954 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0383 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0383
Description:
Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 241 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 9950 - 9823
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| Q |
241 |
aaaagtatgtgtccatatcattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaatagctagaaccatatattaaatgatca |
340 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9950 |
aaaagtatgtgtccataacattttgaatctcaataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaatagatagctagaaccatatattaaatgatca |
9851 |
T |
 |
| Q |
341 |
agagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9850 |
agagtttacataatggcttgtttgaata |
9823 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10029 - 9949
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132 |
attaaattacccaaaagcattaagtcctagattaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctagagtgataacttaa |
212 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10029 |
attaagttactcaaaaacattaagtcctagattaaaagtgattatcaaatattaacatccatgtctagagtgataacttaa |
9949 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0160 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0160
Description:
Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 34966 - 35196
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1 |
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Q |
| |
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| T |
34966 |
caatcactaaacaacatcattcgtgtccaaatgatgttgtgatttctaatggactatttaaaagtcgatttcccaaactattaaataatcacaaagtcga |
35065 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgacgatttcccaaccgattaaattacccaaaagcattaagtcctaga-ttaaaagtaattatcaaatattaatatccacgtctag |
199 |
Q |
| |
|
| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||| |
|
|
| T |
35066 |
tcggatcgtttaatcgacgatttcccaaccgattaaatgaccaaaaagcattaagttctagatttaaaagtgattatcaaatattaacatc----tatag |
35161 |
T |
 |
| Q |
200 |
agtgataacttaagatagattgttattctatttct |
234 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35162 |
agtgataacttaaggtagattgttattctatttct |
35196 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 288 - 368
Target Start/End: Original strand, 35212 - 35293
Alignment:
| Q |
288 |
caagaataacaacaatattgaataaata-gctagaaccatatattaaatgatcaagagtttacataatggcttgtttgaata |
368 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35212 |
caagaataacaacaatattgaataaataagctataaccatatattaaaaaatcaagaaattacataatggcttgtttgaata |
35293 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0160; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 369 - 439
Target Start/End: Original strand, 35314 - 35384
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| Q |
369 |
gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatttcatccctagactc |
439 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
35314 |
gatgtacctacatatgtctatgcaagcttggcaaaggatgaaagaaaaatgaagatttcataccgagactc |
35384 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0859 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:
Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 4990 - 5107
Alignment:
| Q |
1 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttcttagggatcgtttaaatatcgatttcccaaacatttaaacgatcacaaagtcga |
100 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
4990 |
caatcactcgacaatatcattcgtgtccaaatgatatcgttatttctaagaggtcatttaaacatcgatttccttaacatttaaacgttcacaaagttga |
5089 |
T |
 |
| Q |
101 |
ttggatagtttcatcgac |
118 |
Q |
| |
|
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| T |
5090 |
ttggatagtttaatcgac |
5107 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1494 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1494
Description:
Target: scaffold1494; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 1697 - 1639
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |
|
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| T |
1697 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaaagggtgaagatt |
1639 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1832 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1832
Description:
Target: scaffold1832; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 369 - 425
Target Start/End: Original strand, 1 - 57
Alignment:
| Q |
369 |
gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
1 |
gatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaaggatgaagaagagaggaagatt |
57 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0458 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0458
Description:
Target: scaffold0458; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 341
Target Start/End: Original strand, 9364 - 9434
Alignment:
| Q |
272 |
aataaaacattaaatgcaagaataacaacaatattgaataaat-agctagaaccatatattaaatgatcaa |
341 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |
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| T |
9364 |
aataaagcattaaactcaagaataataacaatattgaataaataagctagaaccttaaattaaatgatcaa |
9434 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0458; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 367 - 425
Target Start/End: Original strand, 9482 - 9540
Alignment:
| Q |
367 |
tagatgtagctacatatgtctatgatagctttgcaaatgatgaagaaaagatgaagatt |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
9482 |
tagatgtagctacatatgtctatgataactttgcaaaagatggaagaaagatgaagatt |
9540 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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