View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14040_low_30 (Length: 313)

Name: NF14040_low_30
Description: NF14040
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14040_low_30
NF14040_low_30
[»] chr8 (86 HSPs)
chr8 (1-297)||(43036372-43036668)
chr8 (1-289)||(15212735-15213023)
chr8 (1-289)||(4731607-4731895)
chr8 (1-289)||(33352099-33352387)
chr8 (2-289)||(27811228-27811515)
chr8 (1-289)||(30143291-30143577)
chr8 (1-297)||(40321029-40321321)
chr8 (1-289)||(12702565-12702857)
chr8 (1-296)||(5689220-5689511)
chr8 (1-289)||(3303605-3303889)
chr8 (1-289)||(42498143-42498432)
chr8 (1-297)||(6598921-6599214)
chr8 (1-297)||(6674374-6674667)
chr8 (1-297)||(1345298-1345590)
chr8 (7-297)||(30291561-30291849)
chr8 (7-297)||(18141776-18142059)
chr8 (1-289)||(17982602-17982890)
chr8 (4-273)||(34254277-34254545)
chr8 (1-273)||(34256453-34256724)
chr8 (1-289)||(44303803-44304092)
chr8 (1-289)||(1292399-1292682)
chr8 (1-289)||(31218206-31218494)
chr8 (6-230)||(40221700-40221923)
chr8 (1-287)||(19945292-19945579)
chr8 (1-289)||(41366548-41366833)
chr8 (1-289)||(19491633-19491917)
chr8 (1-273)||(1746165-1746437)
chr8 (1-289)||(4743149-4743422)
chr8 (1-239)||(9765698-9765931)
chr8 (6-219)||(42434992-42435204)
chr8 (6-219)||(4283479-4283691)
chr8 (6-230)||(18655355-18655578)
chr8 (6-221)||(10930198-10930412)
chr8 (6-181)||(44353747-44353922)
chr8 (7-275)||(8965640-8965904)
chr8 (2-219)||(4162450-4162663)
chr8 (6-230)||(11383941-11384163)
chr8 (1-217)||(18106084-18106297)
chr8 (130-289)||(4733784-4733943)
chr8 (6-181)||(40328734-40328909)
chr8 (20-212)||(3772160-3772352)
chr8 (90-296)||(10015119-10015319)
chr8 (52-287)||(2627735-2627974)
chr8 (3-171)||(10929750-10929907)
chr8 (1-141)||(41364926-41365066)
chr8 (7-234)||(8153717-8153940)
chr8 (128-288)||(3073810-3073965)
chr8 (52-223)||(25689955-25690126)
chr8 (52-223)||(3439504-3439675)
chr8 (86-186)||(7597648-7597749)
chr8 (43-181)||(1822283-1822422)
chr8 (43-181)||(1856728-1856867)
chr8 (7-181)||(11712039-11712214)
chr8 (67-181)||(32902212-32902327)
chr8 (155-241)||(26403259-26403343)
chr8 (57-287)||(29796259-29796485)
chr8 (73-172)||(30909389-30909487)
chr8 (74-161)||(10240175-10240264)
chr8 (176-240)||(5702532-5702595)
chr8 (7-160)||(41266924-41267078)
chr8 (52-223)||(42575320-42575494)
chr8 (52-214)||(15290522-15290687)
chr8 (52-214)||(15470891-15471056)
chr8 (155-245)||(19175783-19175873)
chr8 (176-238)||(4696645-4696706)
chr8 (199-245)||(6813662-6813708)
chr8 (199-245)||(19752466-19752511)
chr8 (199-245)||(23799649-23799694)
chr8 (155-238)||(31071258-31071342)
chr8 (176-220)||(609025-609069)
chr8 (155-240)||(7412323-7412409)
chr8 (176-220)||(22684653-22684697)
chr8 (176-220)||(27827276-27827320)
chr8 (143-179)||(38863949-38863985)
chr8 (1-156)||(3231859-3232016)
chr8 (155-245)||(4456006-4456096)
chr8 (97-169)||(11137070-11137146)
chr8 (199-245)||(6127200-6127246)
chr8 (178-220)||(43530408-43530450)
chr8 (176-220)||(3874301-3874345)
chr8 (176-220)||(4424309-4424353)
chr8 (176-220)||(14419190-14419234)
chr8 (176-220)||(14808052-14808096)
chr8 (176-220)||(18810998-18811042)
chr8 (176-220)||(27829587-27829631)
chr8 (176-220)||(30480503-30480547)
[»] chr4 (119 HSPs)
chr4 (1-297)||(26175559-26175855)
chr4 (1-289)||(5429628-5429916)
chr4 (1-289)||(34570345-34570633)
chr4 (1-295)||(12739475-12739769)
chr4 (1-289)||(9927390-9927676)
chr4 (1-289)||(37740575-37740862)
chr4 (1-289)||(54199839-54200125)
chr4 (1-288)||(56178568-56178855)
chr4 (1-289)||(47038346-47038628)
chr4 (1-289)||(48893573-48893861)
chr4 (2-297)||(36994474-36994764)
chr4 (1-297)||(29254443-29254739)
chr4 (7-297)||(52467281-52467567)
chr4 (1-297)||(5871769-5872063)
chr4 (1-289)||(52095293-52095581)
chr4 (1-294)||(36463321-36463608)
chr4 (1-282)||(48142991-48143274)
chr4 (43-297)||(46147318-46147568)
chr4 (65-297)||(12743848-12744080)
chr4 (1-297)||(45687109-45687402)
chr4 (6-221)||(54882975-54883189)
chr4 (65-268)||(12745266-12745469)
chr4 (1-288)||(31474099-31474383)
chr4 (1-289)||(5370013-5370305)
chr4 (1-273)||(29999756-30000024)
chr4 (43-221)||(26364227-26364405)
chr4 (24-230)||(27416955-27417160)
chr4 (6-219)||(40632400-40632612)
chr4 (1-283)||(52082600-52082876)
chr4 (1-289)||(4587907-4588192)
chr4 (6-219)||(6655911-6656123)
chr4 (1-288)||(6542115-6542400)
chr4 (12-242)||(3913408-3913637)
chr4 (1-180)||(12745476-12745655)
chr4 (1-289)||(13992222-13992504)
chr4 (6-210)||(8665362-8665566)
chr4 (1-181)||(12747795-12747975)
chr4 (6-223)||(2209668-2209886)
chr4 (6-219)||(12073347-12073560)
chr4 (7-288)||(37229657-37229935)
chr4 (6-211)||(41639381-41639585)
chr4 (6-219)||(50673848-50674059)
chr4 (6-212)||(379333-379541)
chr4 (7-178)||(24969067-24969238)
chr4 (6-214)||(41964369-41964578)
chr4 (8-219)||(8648095-8648306)
chr4 (6-219)||(46703454-46703669)
chr4 (7-287)||(5207777-5208055)
chr4 (6-211)||(35662395-35662600)
chr4 (2-286)||(51337014-51337294)
chr4 (1-234)||(13009430-13009650)
chr4 (10-221)||(21688207-21688418)
chr4 (6-223)||(50262697-50262911)
chr4 (6-221)||(12119492-12119709)
chr4 (6-143)||(55085442-55085578)
chr4 (6-214)||(26699447-26699659)
chr4 (72-180)||(12744087-12744195)
chr4 (52-237)||(31495297-31495485)
chr4 (6-140)||(41639218-41639351)
chr4 (11-287)||(29056317-29056590)
chr4 (10-273)||(48142327-48142588)
chr4 (52-223)||(8393394-8393566)
chr4 (52-223)||(8395603-8395775)
chr4 (66-287)||(5349924-5350140)
chr4 (69-181)||(33989861-33989974)
chr4 (11-181)||(33089837-33090008)
chr4 (22-174)||(53345187-53345340)
chr4 (11-156)||(32091438-32091583)
chr4 (66-179)||(22882791-22882905)
chr4 (66-179)||(22934455-22934569)
chr4 (57-219)||(44967829-44967992)
chr4 (176-245)||(3796568-3796637)
chr4 (155-245)||(38152468-38152556)
chr4 (176-245)||(10047359-10047427)
chr4 (73-173)||(34112838-34112939)
chr4 (176-245)||(39245974-39246042)
chr4 (100-179)||(6677517-6677597)
chr4 (72-275)||(21703784-21703985)
chr4 (72-144)||(34788851-34788923)
chr4 (174-282)||(24969787-24969891)
chr4 (24-181)||(35369484-35369637)
chr4 (155-245)||(36315258-36315346)
chr4 (155-245)||(36329467-36329555)
chr4 (52-223)||(5136063-5136237)
chr4 (52-223)||(5138288-5138462)
chr4 (183-238)||(31985689-31985745)
chr4 (155-245)||(5396700-5396790)
chr4 (72-158)||(44570427-44570514)
chr4 (72-173)||(16422653-16422755)
chr4 (98-172)||(40975057-40975131)
chr4 (199-245)||(54867164-54867209)
chr4 (176-245)||(5269240-5269308)
chr4 (155-240)||(16623322-16623405)
chr4 (11-119)||(35370449-35370557)
chr4 (52-223)||(7124901-7125074)
chr4 (199-245)||(3777529-3777574)
chr4 (199-245)||(5147657-5147702)
chr4 (176-245)||(5143239-5143307)
chr4 (52-181)||(7122682-7122812)
chr4 (155-240)||(16630709-16630792)
chr4 (86-186)||(37754994-37755095)
chr4 (66-103)||(42234320-42234357)
chr4 (176-245)||(42599623-42599691)
chr4 (176-220)||(4215595-4215639)
chr4 (176-220)||(5635476-5635520)
chr4 (186-246)||(6743474-6743532)
chr4 (176-220)||(6765133-6765177)
chr4 (176-220)||(7941612-7941656)
chr4 (176-220)||(8631419-8631463)
chr4 (176-220)||(14789428-14789472)
chr4 (176-220)||(16455531-16455575)
chr4 (176-220)||(17662245-17662289)
chr4 (176-220)||(22800862-22800906)
chr4 (176-220)||(24879279-24879323)
chr4 (176-220)||(24880741-24880785)
chr4 (176-220)||(24889085-24889129)
chr4 (176-220)||(37089372-37089416)
chr4 (176-220)||(38928177-38928221)
chr4 (176-220)||(40637363-40637407)
[»] chr1 (120 HSPs)
chr1 (5-297)||(28220149-28220441)
chr1 (1-289)||(3156815-3157102)
chr1 (1-289)||(44455109-44455397)
chr1 (1-297)||(28223344-28223640)
chr1 (11-289)||(49918309-49918587)
chr1 (6-288)||(37503489-37503768)
chr1 (1-289)||(31659187-31659475)
chr1 (1-297)||(28265481-28265773)
chr1 (1-289)||(834100-834386)
chr1 (1-297)||(50169137-50169429)
chr1 (1-296)||(3847047-3847340)
chr1 (2-289)||(37559797-37560087)
chr1 (1-297)||(50167102-50167394)
chr1 (1-297)||(3189280-3189576)
chr1 (1-297)||(3198097-3198393)
chr1 (1-297)||(3206936-3207232)
chr1 (1-297)||(196832-197127)
chr1 (1-289)||(30476377-30476667)
chr1 (2-289)||(45644289-45644573)
chr1 (2-285)||(46064868-46065147)
chr1 (1-289)||(8550715-8551006)
chr1 (1-297)||(4552571-4552856)
chr1 (1-287)||(20762621-20762908)
chr1 (1-297)||(10925172-10925467)
chr1 (1-296)||(40122124-40122417)
chr1 (1-284)||(13659276-13659555)
chr1 (1-297)||(1833471-1833754)
chr1 (1-297)||(13137903-13138193)
chr1 (1-286)||(23555204-23555484)
chr1 (6-219)||(13547090-13547302)
chr1 (1-289)||(41360864-41361148)
chr1 (1-233)||(19754443-19754676)
chr1 (6-211)||(11348653-11348857)
chr1 (6-219)||(13549001-13549213)
chr1 (9-230)||(19752643-19752864)
chr1 (6-219)||(37168252-37168465)
chr1 (1-283)||(15820256-15820534)
chr1 (52-273)||(13316298-13316520)
chr1 (6-223)||(42297971-42298188)
chr1 (6-219)||(193566-193778)
chr1 (6-219)||(29136202-29136415)
chr1 (6-219)||(47255340-47255553)
chr1 (15-294)||(16455585-16455859)
chr1 (7-219)||(31925708-31925919)
chr1 (6-223)||(37033068-37033286)
chr1 (6-219)||(7482231-7482445)
chr1 (7-289)||(927911-928190)
chr1 (6-219)||(47115126-47115340)
chr1 (6-210)||(34603530-34603735)
chr1 (1-289)||(51765344-51765636)
chr1 (6-123)||(37879008-37879124)
chr1 (52-237)||(20622218-20622406)
chr1 (56-268)||(36683694-36683892)
chr1 (52-223)||(9987202-9987373)
chr1 (52-237)||(40282377-40282564)
chr1 (7-288)||(44650101-44650376)
chr1 (52-237)||(9036417-9036603)
chr1 (10-181)||(37282730-37282901)
chr1 (57-181)||(22079322-22079446)
chr1 (79-180)||(6808479-6808581)
chr1 (52-237)||(21053958-21054145)
chr1 (64-275)||(3460707-3460915)
chr1 (126-219)||(37876767-37876860)
chr1 (7-123)||(8871145-8871259)
chr1 (52-223)||(44203631-44203804)
chr1 (57-189)||(13938143-13938273)
chr1 (129-219)||(28242382-28242472)
chr1 (69-170)||(32471478-32471579)
chr1 (176-245)||(19072907-19072976)
chr1 (176-245)||(19120797-19120866)
chr1 (97-180)||(9109459-9109543)
chr1 (20-157)||(12318585-12318722)
chr1 (102-281)||(5459956-5460132)
chr1 (89-178)||(2263016-2263106)
chr1 (176-245)||(26644946-26645016)
chr1 (155-240)||(37069753-37069838)
chr1 (176-245)||(13598378-13598446)
chr1 (6-160)||(25652040-25652195)
chr1 (1-170)||(6398595-6398764)
chr1 (59-180)||(2926516-2926637)
chr1 (155-245)||(9476241-9476329)
chr1 (155-245)||(47703965-47704053)
chr1 (156-245)||(775652-775739)
chr1 (152-237)||(8871045-8871130)
chr1 (57-160)||(16914234-16914338)
chr1 (176-245)||(29651791-29651859)
chr1 (149-288)||(44646743-44646875)
chr1 (176-245)||(47098873-47098941)
chr1 (176-245)||(47102890-47102958)
chr1 (176-240)||(16124565-16124628)
chr1 (155-245)||(21536598-21536688)
chr1 (176-245)||(3281686-3281756)
chr1 (72-173)||(4535527-4535629)
chr1 (155-240)||(27104401-27104484)
chr1 (65-157)||(41135833-41135926)
chr1 (7-123)||(44646881-44646997)
chr1 (176-220)||(12302507-12302551)
chr1 (74-167)||(33775931-33776025)
chr1 (155-240)||(13604652-13604737)
chr1 (199-245)||(32889419-32889464)
chr1 (1-34)||(777192-777225)
chr1 (73-164)||(30670114-30670206)
chr1 (57-160)||(1050503-1050606)
chr1 (176-220)||(2510327-2510371)
chr1 (176-220)||(6823249-6823293)
chr1 (176-220)||(10399830-10399874)
chr1 (176-220)||(13358808-13358852)
chr1 (176-220)||(15294836-15294880)
chr1 (176-220)||(17324638-17324682)
chr1 (176-220)||(24325898-24325942)
chr1 (176-220)||(27336942-27336986)
chr1 (176-220)||(28207070-28207114)
chr1 (176-220)||(28840914-28840958)
chr1 (176-220)||(28998255-28998299)
chr1 (176-220)||(29003971-29004015)
chr1 (176-220)||(31735523-31735567)
chr1 (176-220)||(39462754-39462798)
chr1 (176-220)||(50307548-50307592)
chr1 (176-220)||(51750274-51750318)
chr1 (176-220)||(51752598-51752642)
[»] chr7 (110 HSPs)
chr7 (2-297)||(47673867-47674161)
chr7 (3-297)||(14069756-14070050)
chr7 (3-297)||(14379784-14380078)
chr7 (1-289)||(27347766-27348054)
chr7 (1-297)||(31732892-31733188)
chr7 (1-297)||(4586110-4586406)
chr7 (1-289)||(43864193-43864481)
chr7 (1-297)||(47676059-47676355)
chr7 (1-289)||(48489380-48489668)
chr7 (1-297)||(41317361-41317653)
chr7 (1-289)||(26417265-26417553)
chr7 (1-289)||(48491528-48491813)
chr7 (1-289)||(8153291-8153575)
chr7 (1-297)||(38671147-38671441)
chr7 (1-289)||(18126593-18126883)
chr7 (1-289)||(41648944-41649229)
chr7 (7-297)||(36146335-36146621)
chr7 (1-289)||(1113606-1113890)
chr7 (1-289)||(23554989-23555278)
chr7 (1-297)||(12097794-12098078)
chr7 (1-289)||(35853864-35854153)
chr7 (1-273)||(29991004-29991275)
chr7 (1-297)||(19502127-19502424)
chr7 (2-234)||(30024718-30024950)
chr7 (1-289)||(31105327-31105612)
chr7 (6-232)||(2360960-2361185)
chr7 (1-274)||(495933-496202)
chr7 (6-230)||(34310705-34310929)
chr7 (78-289)||(2759128-2759339)
chr7 (10-245)||(22269931-22270166)
chr7 (1-273)||(4178724-4178995)
chr7 (2-287)||(25615813-25616090)
chr7 (6-214)||(6431926-6432133)
chr7 (6-219)||(48599335-48599547)
chr7 (6-223)||(2390237-2390453)
chr7 (6-219)||(3258949-3259162)
chr7 (6-219)||(4508707-4508919)
chr7 (6-211)||(29608691-29608896)
chr7 (7-274)||(23565012-23565274)
chr7 (1-255)||(25766923-25767176)
chr7 (1-289)||(48408752-48409044)
chr7 (1-289)||(39731326-39731608)
chr7 (125-296)||(24525430-24525597)
chr7 (6-219)||(8359316-8359530)
chr7 (7-275)||(4253477-4253742)
chr7 (2-162)||(31518745-31518905)
chr7 (6-219)||(4510549-4510761)
chr7 (6-219)||(4512391-4512603)
chr7 (60-274)||(31518911-31519121)
chr7 (11-289)||(23343934-23344206)
chr7 (84-219)||(32358055-32358190)
chr7 (7-287)||(36574453-36574728)
chr7 (1-133)||(4538627-4538759)
chr7 (52-289)||(43504082-43504323)
chr7 (1-131)||(24525985-24526116)
chr7 (95-221)||(6359951-6360077)
chr7 (6-214)||(22328395-22328611)
chr7 (52-223)||(20343897-20344068)
chr7 (146-245)||(30814530-30814628)
chr7 (52-237)||(24789841-24790028)
chr7 (1-83)||(2761439-2761521)
chr7 (7-212)||(3904624-3904830)
chr7 (52-223)||(6592336-6592509)
chr7 (52-223)||(18388756-18388929)
chr7 (52-223)||(18392192-18392365)
chr7 (1-69)||(24514912-24514979)
chr7 (73-186)||(5116625-5116739)
chr7 (52-223)||(6594554-6594727)
chr7 (7-116)||(5514113-5514222)
chr7 (52-223)||(32060318-32060493)
chr7 (11-145)||(1360226-1360361)
chr7 (138-237)||(1560647-1560749)
chr7 (155-245)||(29159783-29159871)
chr7 (176-245)||(9190057-9190125)
chr7 (176-245)||(20284069-20284137)
chr7 (176-245)||(2580370-2580438)
chr7 (128-219)||(18396393-18396486)
chr7 (72-173)||(43363518-43363622)
chr7 (176-245)||(46516359-46516427)
chr7 (52-123)||(1562103-1562173)
chr7 (7-63)||(30843389-30843445)
chr7 (178-240)||(4796718-4796779)
chr7 (199-245)||(5817341-5817387)
chr7 (183-240)||(55933-55989)
chr7 (176-245)||(33332499-33332567)
chr7 (177-237)||(47263664-47263725)
chr7 (155-223)||(21983285-21983352)
chr7 (184-240)||(21988893-21988948)
chr7 (176-220)||(42330997-42331041)
chr7 (176-238)||(35960803-35960864)
chr7 (155-240)||(44848713-44848798)
chr7 (104-160)||(27073868-27073925)
chr7 (104-160)||(27204388-27204445)
chr7 (176-220)||(1049296-1049340)
chr7 (186-237)||(2479323-2479375)
chr7 (176-220)||(3035969-3036013)
chr7 (176-220)||(7471980-7472024)
chr7 (199-245)||(9185237-9185280)
chr7 (176-220)||(11759372-11759416)
chr7 (176-220)||(13099474-13099518)
chr7 (176-220)||(20299705-20299749)
chr7 (176-220)||(20626283-20626327)
chr7 (176-220)||(20630174-20630218)
chr7 (176-220)||(20642593-20642637)
chr7 (176-220)||(38394231-38394275)
chr7 (198-275)||(40808734-40808807)
chr7 (176-220)||(40836743-40836787)
chr7 (176-220)||(40946573-40946617)
chr7 (176-220)||(44724824-44724868)
chr7 (176-220)||(48457898-48457942)
[»] chr6 (67 HSPs)
chr6 (1-289)||(9182962-9183250)
chr6 (1-289)||(33211120-33211404)
chr6 (1-273)||(5406146-5406417)
chr6 (1-273)||(5410471-5410742)
chr6 (2-273)||(31404621-31404891)
chr6 (1-289)||(28137341-28137627)
chr6 (1-273)||(5413341-5413611)
chr6 (1-289)||(26954221-26954504)
chr6 (1-297)||(33160273-33160572)
chr6 (1-289)||(16452259-16452548)
chr6 (1-273)||(30834482-30834755)
chr6 (6-219)||(21593619-21593831)
chr6 (1-269)||(2171480-2171749)
chr6 (1-289)||(16568992-16569257)
chr6 (6-219)||(2972940-2973152)
chr6 (43-219)||(21588922-21589098)
chr6 (1-296)||(3038851-3039122)
chr6 (6-219)||(26830124-26830337)
chr6 (6-223)||(3808704-3808922)
chr6 (6-219)||(5043582-5043795)
chr6 (6-223)||(603085-603293)
chr6 (6-219)||(17762944-17763158)
chr6 (43-179)||(17758014-17758150)
chr6 (6-181)||(22424865-22425041)
chr6 (128-273)||(5409016-5409161)
chr6 (7-275)||(4045378-4045637)
chr6 (52-287)||(3072689-3072928)
chr6 (52-237)||(412101-412290)
chr6 (1-237)||(6097431-6097651)
chr6 (52-223)||(27647861-27648032)
chr6 (52-237)||(16554869-16555057)
chr6 (52-237)||(16578498-16578686)
chr6 (52-237)||(16616694-16616882)
chr6 (52-237)||(16631425-16631613)
chr6 (52-237)||(16653112-16653300)
chr6 (95-212)||(26800630-26800748)
chr6 (11-181)||(25073528-25073698)
chr6 (52-223)||(6027246-6027419)
chr6 (52-223)||(25421305-25421478)
chr6 (1-120)||(16567155-16567265)
chr6 (155-240)||(5757507-5757592)
chr6 (176-242)||(31979496-31979561)
chr6 (199-289)||(14521612-14521699)
chr6 (176-245)||(10077214-10077282)
chr6 (176-245)||(31936567-31936635)
chr6 (52-223)||(13153913-13154087)
chr6 (52-223)||(33342101-33342275)
chr6 (52-223)||(34164856-34165030)
chr6 (52-223)||(34167078-34167252)
chr6 (155-237)||(21356022-21356104)
chr6 (176-245)||(5017518-5017586)
chr6 (176-245)||(18232825-18232893)
chr6 (100-179)||(2908506-2908586)
chr6 (129-180)||(9572667-9572719)
chr6 (186-245)||(4629933-4629992)
chr6 (176-238)||(5572290-5572351)
chr6 (203-245)||(22963680-22963721)
chr6 (203-245)||(23824672-23824713)
chr6 (199-245)||(31086545-31086590)
chr6 (176-220)||(1230249-1230293)
chr6 (176-220)||(4816231-4816275)
chr6 (176-220)||(5273216-5273260)
chr6 (176-220)||(11983029-11983073)
chr6 (176-220)||(14458767-14458811)
chr6 (176-220)||(14507176-14507220)
chr6 (176-220)||(19704567-19704611)
chr6 (176-220)||(20915356-20915400)
[»] chr5 (94 HSPs)
chr5 (1-297)||(42428353-42428649)
chr5 (1-297)||(42426158-42426454)
chr5 (2-297)||(13488153-13488446)
chr5 (1-297)||(32636773-32637069)
chr5 (1-297)||(28750578-28750874)
chr5 (1-289)||(39468480-39468768)
chr5 (1-297)||(533718-534010)
chr5 (1-297)||(537974-538266)
chr5 (1-297)||(8565873-8566165)
chr5 (1-297)||(13239701-13239997)
chr5 (2-282)||(33831630-33831908)
chr5 (1-289)||(30682854-30683139)
chr5 (1-273)||(25412711-25412982)
chr5 (1-297)||(31182922-31183219)
chr5 (1-297)||(37439083-37439387)
chr5 (1-289)||(13343010-13343297)
chr5 (1-289)||(30182538-30182825)
chr5 (1-297)||(19806333-19806608)
chr5 (1-289)||(16452030-16452316)
chr5 (1-289)||(36073974-36074263)
chr5 (6-219)||(40147216-40147428)
chr5 (6-234)||(28278271-28278498)
chr5 (6-245)||(38746960-38747197)
chr5 (6-219)||(213420-213633)
chr5 (6-219)||(5058002-5058212)
chr5 (1-251)||(3075629-3075877)
chr5 (1-297)||(5887357-5887635)
chr5 (1-289)||(16409432-16409716)
chr5 (2-226)||(42309929-42310153)
chr5 (1-289)||(26177840-26178123)
chr5 (6-233)||(27015487-27015704)
chr5 (7-275)||(13695639-13695904)
chr5 (7-287)||(9049285-9049554)
chr5 (6-214)||(27637618-27637827)
chr5 (1-269)||(9789170-9789435)
chr5 (7-219)||(16640941-16641153)
chr5 (1-269)||(18441594-18441859)
chr5 (125-289)||(42926964-42927130)
chr5 (1-269)||(26170731-26170984)
chr5 (52-223)||(29751156-29751328)
chr5 (52-237)||(29720364-29720551)
chr5 (52-237)||(29722524-29722711)
chr5 (72-221)||(316782-316933)
chr5 (52-223)||(22536286-22536457)
chr5 (52-237)||(10593258-10593445)
chr5 (67-221)||(33906028-33906184)
chr5 (194-297)||(16649757-16649856)
chr5 (1-67)||(42926842-42926908)
chr5 (52-223)||(25078120-25078293)
chr5 (52-223)||(25136089-25136262)
chr5 (67-186)||(10054850-10054969)
chr5 (52-223)||(40380090-40380263)
chr5 (52-223)||(40382301-40382474)
chr5 (101-153)||(42926916-42926968)
chr5 (7-183)||(3325869-3326045)
chr5 (11-160)||(35616129-35616278)
chr5 (155-245)||(10281730-10281819)
chr5 (66-157)||(30802843-30802934)
chr5 (65-170)||(22097877-22097981)
chr5 (155-240)||(9353361-9353446)
chr5 (155-240)||(36932379-36932464)
chr5 (176-245)||(17004009-17004077)
chr5 (11-173)||(10700695-10700857)
chr5 (199-245)||(31300668-31300713)
chr5 (186-245)||(14520208-14520268)
chr5 (52-223)||(16546629-16546803)
chr5 (155-237)||(15464518-15464600)
chr5 (101-181)||(8445764-8445845)
chr5 (155-240)||(11917001-11917084)
chr5 (176-237)||(28832247-28832307)
chr5 (128-242)||(30793212-30793326)
chr5 (176-245)||(42127459-42127527)
chr5 (52-223)||(16544407-16544581)
chr5 (176-220)||(27910685-27910729)
chr5 (186-245)||(24553565-24553623)
chr5 (57-111)||(4160637-4160690)
chr5 (200-245)||(12084248-12084294)
chr5 (66-144)||(14689503-14689581)
chr5 (199-245)||(19588726-19588771)
chr5 (101-157)||(32609584-32609641)
chr5 (176-220)||(2175153-2175197)
chr5 (176-220)||(2724128-2724172)
chr5 (155-214)||(4160702-4160762)
chr5 (176-220)||(6747539-6747583)
chr5 (176-220)||(10529099-10529143)
chr5 (176-220)||(18466919-18466963)
chr5 (176-220)||(21684452-21684496)
chr5 (176-220)||(24127091-24127135)
chr5 (176-220)||(25921473-25921517)
chr5 (176-220)||(27912771-27912815)
chr5 (176-220)||(34477053-34477097)
chr5 (176-220)||(34479418-34479462)
chr5 (176-220)||(39798282-39798326)
chr5 (176-220)||(40221758-40221802)
[»] chr2 (90 HSPs)
chr2 (1-289)||(38312189-38312477)
chr2 (1-288)||(17057301-17057588)
chr2 (1-288)||(17085284-17085571)
chr2 (1-297)||(29867818-29868114)
chr2 (1-297)||(723669-723963)
chr2 (1-297)||(34139695-34139990)
chr2 (1-283)||(36773511-36773789)
chr2 (1-294)||(2334343-2334636)
chr2 (1-297)||(42362301-42362591)
chr2 (1-297)||(11151518-11151810)
chr2 (1-297)||(14633750-14634045)
chr2 (1-297)||(33162377-33162669)
chr2 (1-297)||(36317936-36318228)
chr2 (1-297)||(11067254-11067546)
chr2 (1-288)||(11690450-11690734)
chr2 (1-289)||(36988006-36988294)
chr2 (1-289)||(45099704-45099991)
chr2 (1-289)||(4503064-4503351)
chr2 (1-273)||(5723202-5723473)
chr2 (1-289)||(6594935-6595225)
chr2 (1-273)||(36205611-36205882)
chr2 (6-219)||(45726884-45727096)
chr2 (6-219)||(35446885-35447097)
chr2 (1-297)||(14202346-14202626)
chr2 (6-217)||(42288114-42288323)
chr2 (6-211)||(1631741-1631945)
chr2 (1-289)||(4484259-4484549)
chr2 (1-289)||(30833295-30833585)
chr2 (7-287)||(13121724-13121997)
chr2 (2-277)||(17490095-17490360)
chr2 (11-230)||(17450550-17450755)
chr2 (146-297)||(39284930-39285080)
chr2 (7-289)||(11049505-11049787)
chr2 (3-289)||(26353140-26353416)
chr2 (7-267)||(7815231-7815486)
chr2 (1-289)||(32289522-32289805)
chr2 (1-154)||(24885610-24885763)
chr2 (6-221)||(24398008-24398228)
chr2 (1-96)||(39284834-39284929)
chr2 (99-219)||(7451165-7451284)
chr2 (11-219)||(33648129-33648340)
chr2 (52-223)||(6266691-6266863)
chr2 (10-160)||(12123644-12123794)
chr2 (52-223)||(13656028-13656200)
chr2 (11-230)||(30218033-30218254)
chr2 (73-185)||(42261520-42261633)
chr2 (52-223)||(12647382-12647555)
chr2 (176-289)||(1345590-1345700)
chr2 (155-245)||(34682363-34682451)
chr2 (15-173)||(7597057-7597217)
chr2 (100-180)||(42019910-42019993)
chr2 (155-245)||(10445473-10445561)
chr2 (247-297)||(24885781-24885831)
chr2 (176-245)||(14699056-14699124)
chr2 (176-245)||(20522200-20522268)
chr2 (72-160)||(34811281-34811370)
chr2 (247-289)||(2838141-2838183)
chr2 (155-245)||(13569308-13569396)
chr2 (155-245)||(34388838-34388926)
chr2 (72-173)||(41454254-41454356)
chr2 (176-245)||(33528670-33528738)
chr2 (176-245)||(39482911-39482979)
chr2 (7-71)||(5700271-5700335)
chr2 (143-275)||(28672022-28672151)
chr2 (176-240)||(31056028-31056092)
chr2 (74-172)||(3897012-3897111)
chr2 (155-238)||(8390179-8390260)
chr2 (155-237)||(28259206-28259288)
chr2 (183-245)||(36757818-36757881)
chr2 (183-245)||(16940265-16940326)
chr2 (183-245)||(17010930-17010991)
chr2 (183-245)||(21629924-21629985)
chr2 (61-178)||(24197906-24198023)
chr2 (66-140)||(2869643-2869717)
chr2 (151-181)||(42412117-42412147)
chr2 (155-224)||(8040060-8040128)
chr2 (176-245)||(17865183-17865251)
chr2 (155-239)||(23078499-23078583)
chr2 (176-245)||(33118116-33118184)
chr2 (72-172)||(41446159-41446260)
chr2 (176-220)||(3022383-3022427)
chr2 (176-220)||(5375346-5375390)
chr2 (176-220)||(6264148-6264192)
chr2 (155-223)||(10707281-10707348)
chr2 (176-220)||(11739559-11739603)
chr2 (176-220)||(13910045-13910089)
chr2 (176-220)||(19502011-19502055)
chr2 (176-220)||(23452237-23452281)
chr2 (176-220)||(27105008-27105052)
chr2 (66-124)||(28770725-28770782)
[»] chr3 (136 HSPs)
chr3 (1-289)||(5236388-5236675)
chr3 (1-289)||(51398763-51399051)
chr3 (1-289)||(29810817-29811105)
chr3 (1-289)||(40734447-40734734)
chr3 (1-292)||(40735332-40735622)
chr3 (7-294)||(29196316-29196600)
chr3 (1-297)||(31314394-31314686)
chr3 (1-289)||(760796-761082)
chr3 (1-288)||(19683820-19684108)
chr3 (1-289)||(29682308-29682594)
chr3 (5-289)||(29813016-29813298)
chr3 (7-297)||(44700406-44700691)
chr3 (1-289)||(7762215-7762503)
chr3 (1-297)||(39153287-39153580)
chr3 (1-289)||(7764417-7764702)
chr3 (1-289)||(9581232-9581520)
chr3 (7-297)||(9666393-9666680)
chr3 (1-289)||(37408408-37408696)
chr3 (1-224)||(44331494-44331717)
chr3 (1-289)||(22834937-22835221)
chr3 (1-273)||(45095114-45095385)
chr3 (1-297)||(23391835-23392128)
chr3 (1-289)||(5258075-5258363)
chr3 (1-284)||(16498979-16499257)
chr3 (6-238)||(34491168-34491398)
chr3 (1-289)||(5260254-5260542)
chr3 (2-289)||(53921438-53921721)
chr3 (1-289)||(32891052-32891337)
chr3 (6-221)||(30236080-30236294)
chr3 (6-219)||(4569906-4570120)
chr3 (2-282)||(23410271-23410547)
chr3 (6-219)||(54593659-54593871)
chr3 (1-273)||(23197883-23198156)
chr3 (6-211)||(6095608-6095812)
chr3 (1-269)||(9636074-9636345)
chr3 (1-273)||(23200082-23200355)
chr3 (6-223)||(43401797-43402015)
chr3 (1-274)||(32744386-32744645)
chr3 (6-223)||(43403740-43403958)
chr3 (10-221)||(47304210-47304420)
chr3 (6-223)||(49199465-49199683)
chr3 (6-221)||(46173321-46173526)
chr3 (6-230)||(46860427-46860653)
chr3 (6-219)||(41819523-41819737)
chr3 (6-187)||(36018806-36018987)
chr3 (6-153)||(31340268-31340414)
chr3 (111-223)||(40913352-40913464)
chr3 (52-237)||(801091-801279)
chr3 (55-269)||(7779951-7780168)
chr3 (6-144)||(5433952-5434091)
chr3 (52-223)||(6716500-6716671)
chr3 (11-179)||(35138746-35138915)
chr3 (52-223)||(54635125-54635296)
chr3 (69-181)||(55302011-55302132)
chr3 (9-104)||(26386597-26386692)
chr3 (32-183)||(51352148-51352298)
chr3 (19-171)||(5373198-5373353)
chr3 (146-287)||(2075012-2075149)
chr3 (52-223)||(45282983-45283158)
chr3 (57-189)||(4055796-4055926)
chr3 (52-223)||(3617449-3617622)
chr3 (86-281)||(33191866-33192056)
chr3 (74-173)||(25491014-25491114)
chr3 (52-223)||(25637426-25637599)
chr3 (11-169)||(26323124-26323283)
chr3 (57-248)||(4075443-4075636)
chr3 (64-221)||(20937668-20937826)
chr3 (176-245)||(1417529-1417597)
chr3 (176-245)||(3716041-3716109)
chr3 (153-288)||(27305646-27305777)
chr3 (155-245)||(8370505-8370595)
chr3 (72-169)||(54739004-54739102)
chr3 (10-122)||(2075156-2075266)
chr3 (176-238)||(25795767-25795829)
chr3 (155-240)||(27974971-27975056)
chr3 (176-245)||(30709829-30709899)
chr3 (176-245)||(21711203-21711271)
chr3 (176-245)||(26298968-26299036)
chr3 (155-238)||(27986465-27986548)
chr3 (176-245)||(1736344-1736412)
chr3 (176-245)||(18552922-18552990)
chr3 (52-223)||(4598519-4598693)
chr3 (52-223)||(4600740-4600914)
chr3 (52-223)||(10056217-10056391)
chr3 (52-223)||(10058439-10058613)
chr3 (52-223)||(10060661-10060835)
chr3 (52-223)||(10062883-10063057)
chr3 (52-223)||(10065105-10065279)
chr3 (52-223)||(10211393-10211567)
chr3 (155-238)||(32143306-32143389)
chr3 (176-240)||(40592821-40592884)
chr3 (155-245)||(16264328-16264418)
chr3 (210-289)||(21350938-21351014)
chr3 (155-237)||(33386685-33386767)
chr3 (183-245)||(39040038-39040101)
chr3 (155-240)||(27452941-27453026)
chr3 (176-238)||(37466278-37466339)
chr3 (77-181)||(39127572-39127678)
chr3 (7-160)||(8166516-8166671)
chr3 (7-172)||(1313852-1314018)
chr3 (52-223)||(10209173-10209347)
chr3 (72-123)||(28253364-28253416)
chr3 (176-240)||(48438199-48438262)
chr3 (206-245)||(3328425-3328463)
chr3 (178-245)||(36029073-36029139)
chr3 (101-159)||(40519258-40519316)
chr3 (155-245)||(6794732-6794820)
chr3 (71-160)||(24635276-24635366)
chr3 (125-155)||(31340242-31340272)
chr3 (181-238)||(35925468-35925526)
chr3 (176-238)||(47923945-47924006)
chr3 (56-141)||(50432733-50432818)
chr3 (176-220)||(458499-458543)
chr3 (176-220)||(1313624-1313668)
chr3 (176-220)||(1321694-1321738)
chr3 (67-123)||(3148088-3148144)
chr3 (176-220)||(3859742-3859786)
chr3 (66-140)||(4386868-4386941)
chr3 (176-220)||(5886413-5886457)
chr3 (176-220)||(5899886-5899930)
chr3 (176-220)||(6484575-6484619)
chr3 (176-220)||(7606586-7606630)
chr3 (52-123)||(10067327-10067398)
chr3 (176-220)||(10958321-10958365)
chr3 (186-238)||(24695213-24695264)
chr3 (176-220)||(25389120-25389164)
chr3 (155-238)||(26928620-26928702)
chr3 (176-220)||(27635656-27635700)
chr3 (176-220)||(32219300-32219344)
chr3 (176-220)||(35919113-35919157)
chr3 (97-160)||(41510307-41510371)
chr3 (176-220)||(41849274-41849318)
chr3 (176-220)||(42990519-42990563)
chr3 (176-220)||(42992485-42992529)
chr3 (176-220)||(43421413-43421457)
chr3 (176-220)||(53894055-53894099)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (4-289)||(20346-20631)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-289)||(114552-114840)
[»] scaffold0006 (4 HSPs)
scaffold0006 (1-284)||(149037-149316)
scaffold0006 (176-245)||(5663-5731)
scaffold0006 (178-245)||(2472-2538)
scaffold0006 (155-240)||(133309-133394)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (1-269)||(11507-11777)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (2-289)||(434483-434771)
scaffold0002 (73-185)||(490355-490468)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (1-289)||(866-1153)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (6-219)||(7282-7494)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (1-273)||(11105-11380)
scaffold0491 (1-289)||(8664-8954)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (6-219)||(18004-18216)
scaffold0176 (176-245)||(17243-17311)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (6-165)||(80338-80496)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (100-287)||(27378-27563)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (30-219)||(10468-10656)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (52-225)||(2598-2773)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (52-223)||(3722-3895)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (52-223)||(6272-6445)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (155-237)||(8448-8530)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (63-173)||(25065-25175)
[»] scaffold1668 (1 HSPs)
scaffold1668 (216-288)||(1434-1502)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (176-245)||(10709-10777)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (186-245)||(36891-36951)
scaffold0087 (199-240)||(44033-44075)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (155-238)||(45238-45321)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (176-220)||(1453-1497)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (176-220)||(29414-29458)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (176-220)||(69292-69336)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 86)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 43036372 - 43036668
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43036372 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 43036471  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  43036472 ttgttgaaactaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatttgagagatcaatctctcctccagattaggtcaagtt 43036571  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43036572 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 43036668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 15212735 - 15213023
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15212735 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 15212834  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15212835 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgataatggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 15212934  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  15212935 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggctttgtgcttttcactttg 15213023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 4731607 - 4731895
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  4731607 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgctctttgtgagc 4731706  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  4731707 ttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcgatctctcccccagattcggtcaagtt 4731806  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4731807 ggaccgaattgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttg 4731895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 33352099 - 33352387
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33352099 gaaacattgtaaacaccttgggtgattgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggttgttctttgtgaac 33352198  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  33352199 ttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 33352298  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  33352299 ggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgtttgttcctctcttatctccttttatcttttgcttgtggatttgtgtttttcactttg 33352387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 27811228 - 27811515
Alignment:
Q  2 aaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaact 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27811228 aaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagct 27811327  T
Q  102 tgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  27811328 tgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaacccattgatagtggattgaagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttg 27811427  T
Q  202 gaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27811428 gaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgttttttcccctcttctcttgctttatcttttgcttgtgattttgtgcttttcactttg 27811515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 30143291 - 30143577
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30143291 gaaacattgtaaacacattgggtgagtgaaaatcatt--gtgtcttgttcattggccagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagc 30143388  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  30143389 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagataaggtcaagtt 30143488  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30143489 gaactgaactgagtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 30143577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 40321029 - 40321321
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  40321029 gaaacattgtaaacaccttgagtgactgaaaatcattgagtgtcttgttcataggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgagc 40321128  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  40321129 ttgttgaagttaatttcttgtaacccattagtatctctttgtaaaaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 40321228  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40321229 ggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttgattactag 40321321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 12702857 - 12702565
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaat-----gggtagaaattagggttgttctttg 95  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  12702857 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattaagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaaaagggtagaaattagggttgttctttg 12702759  T
Q  96 tgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtc 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||    
T  12702758 tgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtgtctctttgtaagaactcattgatattggattggagagatcaatctctcccctagattaggtc 12702659  T
Q  196 aagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  12702658 aagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtatgtttgtttctctcttctctccctttatcttgtgcttgtggttttgtgtttttcactttg 12702565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Original strand, 5689220 - 5689511
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||| |    
T  5689220 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattaatgagattggaaaaatgggtagaaattaaggtggtgctttgtgagc 5689319  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  5689320 ttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcaagtt 5689419  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttacta 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5689420 ggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatcttttacttgtggttttgagcttttcactttgattacta 5689511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 3303889 - 3303605
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  3303889 gaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgagtatcttgtttattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaagtttgttctttgtgagc 3303790  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | || ||||||||    
T  3303789 ttgtttaacctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcccccacagtaggtcaagtt 3303690  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  3303689 ggaccgaactgggtaaacaatctttggtgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatcttttgcttgtgattttgtacttttcactttg 3303605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 42498143 - 42498432
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctttgtgaa 99  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42498143 gaaacgttgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggttgttctttgtgaa 42498241  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag- 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||     
T  42498242 cttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagt 42498341  T
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  42498342 ttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtttccctcttctctccttttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcactttg 42498432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 6598921 - 6599214
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |    
T  6598921 gaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattaagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaagtttgttctttgcgagc 6599020  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  6599021 ttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatacttttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaagtt 6599120  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtg-tttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6599121 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgttttgtttctct----tctccctttatctttttcttgtggttttgtgcttttcactttgattactag 6599214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 6674374 - 6674667
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |    
T  6674374 gaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattaagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaagtttgttctttgcgagc 6674473  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  6674474 ttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatacttttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaagtt 6674573  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtg-tttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6674574 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgttttgtttctct----tctccctttatctttttcttgtggttttgtgcttttcactttgattactag 6674667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 1345590 - 1345298
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  1345590 gaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgtgtagaaattagggttgttctttgtgagt 1345491  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| || ||||||||    
T  1345490 ttattgaagctaatttcttgtaacccatatgtatctctttgaaagaactcattgatagtggattgaagagttcaatctctcccccagagtaggtcaagtt 1345391  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  1345390 agaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatcttttgcttgtgattttgagattttcactttgattactag 1345298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 297
Target Start/End: Original strand, 30291561 - 30291849
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  30291561 ttgtaaacaccttgggtgattgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtt 30291660  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctc-ccagattaagtcaagttggac 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||    
T  30291661 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatcactttgtaagaattctttgatagtggattggagagatcaatctctccctccagattatgccaagttggac 30291760  T
Q  205 cgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  30291761 cgaactgaatcaacaatctttggtgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgaactttccactttgattactag 30291849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 297
Target Start/End: Original strand, 18141776 - 18142059
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttg 106  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18141776 ttgtaaacaccttgggcgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgtgaaaatgggtagaaattagg-ttgttctttgtgagcttgttg 18141874  T
Q  107 aagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccg 206  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||     
T  18141875 aagctaatttcttgtaacccatttgtatcactttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaagttggacca 18141974  T
Q  207 aactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    ||||||| |||||  |||||||||| |||||  ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18141975 aactgggccaaca--ctttggtgtgcttgtt--tctctgctct--ctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttgattactag 18142059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 17982602 - 17982890
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagggttgttctttgtgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17982602 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaa 17982700  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag- 198  Q
    |||||  ||| |||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||||||     
T  17982701 cttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagt 17982800  T
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  17982801 ttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatattttgcttgtgg-tttgtgcttttcactttg 17982890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 34254545 - 34254277
Alignment:
Q  4 acattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttg 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34254545 acattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttgttctttgtgaacttg 34254448  T
Q  104 ttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttgg 202  Q
    |  ||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| || |||||| ||||    
T  34254447 tcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaacttattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttgg 34254348  T
Q  203 accgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttt 273  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34254347 accgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatcttttgcttgtggttt 34254277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 34256724 - 34256453
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34256724 gaaacattgtaaacaccttgg-tgtgtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaac 34256627  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-t 199  Q
    ||||  ||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| || |||||| |    
T  34256626 ttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtt 34256527  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttt 273  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34256526 tggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatcttttgcttgtggttt 34256453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 44303803 - 44304092
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttctttgtga 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||    
T  44303803 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaagggtagaaattaaggttgttctttgtga 44303901  T
Q  99 acttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag 198  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||||||    
T  44303902 acttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttttaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaag 44304001  T
Q  199 -ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
     ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  44304002 tttggatcgaactaggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatcttttgcttgtgg-tttgtgcttttcactttg 44304092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 1292682 - 1292399
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  1292682 gaaacactgtgaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttctttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaagtttgttctttgtgagc 1292583  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||| || ||||||||    
T  1292582 ttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatttgagaaataaatctctc-cccagagtaggtcaagtt 1292484  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||  |||| |  ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1292483 ggaccgaactgggcaaacatttcttggtgtgtttgtt--tctcttctctcc--ttatcttttgctcgtggttttgagcttttcactttg 1292399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 31218206 - 31218494
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctttgtgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31218206 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaa 31218304  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag- 198  Q
    |||||  |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||     
T  31218305 cttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagt 31218404  T
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  31218405 ttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatcttgtgcttat-gttttgtgcttttcactttg 31218494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 230
Target Start/End: Original strand, 40221700 - 40221923
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40221700 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttctttggtgagattggtaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 40221798  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  40221799 gaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggacc 40221898  T
Q  206 gaactgggtcaacaatctttggtgt 230  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  40221899 gaactgggtcaataatctttggtgt 40221923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 19945579 - 19945292
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagggttgttctttgtgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19945579 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattatggttgttctttgtgaa 19945481  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaatt-catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag 198  Q
    |||||  |||||||||||||||||   | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||| || ||||||    
T  19945480 cttgtcaaagctaatttcttgtaaccacttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctcgagagtaggtcaag 19945381  T
Q  199 ttgga-ccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactt 287  Q
    || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  19945380 tttgaaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatattttgcttgtgg-tttgtgcttttcactt 19945292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 41366833 - 41366548
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| | |    
T  41366833 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcaagactgagattgagaaaatgggtagaaattatgtttgttctttgtaagc 41366734  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||| ||||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  41366733 ttgtttaagctaatttcttttaacctatttgtatccctttgtaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctctc-cctagattaggtcaagtt 41366635  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtg-tttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  41366634 ggaccgaactgggacaacaatctttggtgtgttttgtt--tctcttctc-ccatttatcttttgtttgtggttttgtgcttttcactttg 41366548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 19491917 - 19491633
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  19491917 gaaacatcgtaaacatcttgggtgagtgaaaat-attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagc 19491819  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||| |||| | || ||||  ||    
T  19491818 ttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattaaagagatcaatatctcccccatagtaggtcatatt 19491719  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  19491718 ggaccgaactaggtcaacaatatcttggtgtgtttgtt----tcttttctcactttatcttttgtttgtggttttgagctttttactttg 19491633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1746437 - 1746165
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctttgtgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1746437 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgaaaaaaaaaggtagaaattagggttgttctttgtgaa 1746339  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagt 199  Q
    |||||  |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| | || |||||||    
T  1746338 cttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccatagtaggtcaagt 1746240  T
Q  200 t-ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttt 273  Q
    | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  1746239 ttggaccgaactgggtgaacaatcgttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatattttgcttgtggttt 1746165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 4743422 - 4743149
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||       
T  4743422 gaaacattgtaaacaccttgggtgagcgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaa-ttaggtttgttctttgtgtgt 4743324  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||  ||||||||  ||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||    
T  4743323 ttgttgaagctaaaatcttgtaacccatttgta----------agaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtcaagtt 4743234  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4743233 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatctttcgcttgtggttttgtgcttttcactttg 4743149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 9765698 - 9765931
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9765698 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaa----ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagc 9765793  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||| ||||||||| ||||  ||    
T  9765794 ttggcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagct-gctctctcccccagattaggtcatatt 9765892  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcc 239  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9765893 ggaccgaactgggtcaacaatcattggtgtgtttgttcc 9765931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 42435204 - 42434992
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42435204 attgtaaacactttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 42435106  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  42435105 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 42435006  T
Q  206 gaactgggtcaaca 219  Q
    ||||||||| ||||    
T  42435005 gaactgggtgaaca 42434992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 4283479 - 4283691
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4283479 attgtaaacaccttaggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttttttgtgagcttgtt 4283577  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||| || |||||||||||||    
T  4283578 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtaggtcaagttggacc 4283677  T
Q  206 gaactgggtcaaca 219  Q
    ||||||||| ||||    
T  4283678 gaactgggtgaaca 4283691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 230
Target Start/End: Original strand, 18655355 - 18655578
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18655355 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgttttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgtt 18655453  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | || |||||||||||||    
T  18655454 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaagttggacc 18655553  T
Q  206 gaactgggtcaacaatctttggtgt 230  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||    
T  18655554 gaactgggtgaacattttttggtgt 18655578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10930412 - 10930198
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  10930412 attgtaaacattttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcatcggtgagattgggaaaatggatagaaattagggttgctctttgtgagctcgtt 10930314  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  10930313 gaagctaatttcttgtaacccatttatatctctttgtaagaacacattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggacc 10930214  T
Q  206 gaactgggtcaacaat 221  Q
    ||||||||||||||||    
T  10930213 gaactgggtcaacaat 10930198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 181
Target Start/End: Original strand, 44353747 - 44353922
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44353747 attgtaaacacattgggtgagtaaaaatcattgagtatcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 44353846  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  44353847 gaagctaatttcttgtaacacatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgaaaagatcaatctctc 44353922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 8965904 - 8965640
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||  |||||    
T  8965904 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttctttatgagtttgtt 8965806  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    |||| ||||||||| |||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  8965805 gaagttaatttcttataacccttttatatctctttgtaagaactcattgatagtgcatcggagagataaatctctcccccatattaggtcaagttggacc 8965706  T
Q  206 gaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttg 275  Q
    ||||||||| |||| |  | ||||||||||||    |||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8965705 gaactgggtaaacatttatcggtgtgtttgtt----tcttttctctctttatcttttgtttgtggttttg 8965640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 4162450 - 4162663
Alignment:
Q  2 aaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaact 101  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  4162450 aaacattgtaaacaccttgagcgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattagtgaga---ggaaaatgggtagaagttaggtttgttctttgagaact 4162546  T
Q  102 tgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttg 201  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| || |||||||||    
T  4162547 tgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatag-ggattggagatatcaatctctccccaagagtaggtcaagttg 4162645  T
Q  202 gaccgaactgggtcaaca 219  Q
    ||||||| ||||| ||||    
T  4162646 gaccgaattgggtaaaca 4162663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 230
Target Start/End: Original strand, 11383941 - 11384163
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  11383941 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcatta-tgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 11384038  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||  ||||| || || ||||||||||    
T  11384039 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaacccattgatactggattggagacatcgatctctcctccagagtaggttaagttggacc 11384138  T
Q  206 gaactgggtcaacaatctttggtgt 230  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||    
T  11384139 gaactgggtgaacattttttggtgt 11384163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18106297 - 18106084
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||||| || |    
T  18106297 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaattgttgagtgtcttgttcatcggtgagattggaaaaatggatagaaactatagttgttctttgcgagc 18106198  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  18106197 ttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatct-tttgtaagaactcattgatagt-gtttggagagatcaatctctc-cccagaataggtcaagtt 18106101  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaa 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  18106100 ggaccgaactgggtcaa 18106084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 130 - 289
Target Start/End: Original strand, 4733784 - 4733943
Alignment:
Q  130 tgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtg 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4733784 tgtatctctttgtaagaattcattgatagtggattggagagatcgatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacagtctttggtg 4733883  T
Q  230 tgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  4733884 tgtttgttcctctcttctctacctttatcttttccttgtggttttgtgcttttcattttg 4733943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 181
Target Start/End: Original strand, 40328734 - 40328909
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  40328734 attgtaaacatcttgggagagtgaaaatcatgaa-tgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtt 40328832  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 181  Q
     || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40328833 taaactaatttcttgtaactcattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 40328909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 212
Target Start/End: Original strand, 3772160 - 3772352
Alignment:
Q  20 gggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttctt 119  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  3772160 gggtgagtgaaaatgattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaattgatagaaattaggtttgttctttgtgagcttatttaagctaatttctt 3772259  T
Q  120 gtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgg 212  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||| ||||||    
T  3772260 gtaactcatttgtatatctttgtaagaatttattgatagtggattggagagatcaatctatctctcagagtaggtcaagttggaccaaactgg 3772352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 90 - 296
Target Start/End: Original strand, 10015119 - 10015319
Alignment:
Q  90 tctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagat 189  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |     
T  10015119 tctttgtgtgcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-taggaactcattgatagtggattggagagataaatctctct-ccatag 10015216  T
Q  190 taagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    || |||||||||||||||||||||| | || |  ||||||| ||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10015217 taggtcaagttggaccgaactgggtaatcatttcttggtgtatttgtt--tctcttctctcc--ttatcttttgcttgtggttttgaacttttcactttg 10015312  T
Q  290 gttacta 296  Q
     ||||||    
T  10015313 attacta 10015319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 52 - 287
Target Start/End: Original strand, 2627735 - 2627974
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcattt-gtatctctt-tgtaagaact 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| || || ||| ||||||||| ||||||||||    
T  2627735 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaactctttttgtatctcttgtgtaagaact 2627833  T
Q  150 cattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttg--ttcctctctt 245  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||  |||||||       
T  2627834 cattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaataatctcttggtgtctttgttttcctcttcc 2627933  T
Q  246 ctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  2627934 ctctccttttatcttgtgcttgt-gttttatgcttttcactt 2627974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 171
Target Start/End: Original strand, 10929750 - 10929907
Alignment:
Q  3 aacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaactt 102  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  10929750 aacattgtaaacaccttggattagtgaaaatcattgagtgtcttgttctttggtgagatatggaaaatgggtagaaattatgtttgttctttgtgagctt 10929849  T
Q  103 gttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaga 171  Q
    |||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10929850 gttgaagctaatttcttgtaa-----------ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaga 10929907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 41365066 - 41364926
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||      
T  41365066 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcaagactgagattgggaaaattggtagaaattaggtttgttctttgtgagt 41364967  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttg 141  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  41364966 ttgtttaagctaatttcttgtaacacatttgtatccctttg 41364926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Original strand, 8153717 - 8153940
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatct--tgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaactt-g 103  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||      | ||| ||| |    
T  8153717 ttgtatacaccttggatgagtgaaaatcattgagtgtgtcatgttcattggtgagattgagaaaatgg-tagaaattagggtt------tctgagctttg 8153809  T
Q  104 ttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttgga 203  Q
    |||||||||| ||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||| || |||||||||||    
T  8153810 ttgaagctaaattcgtgtaactcttttgtatatctttgtaagaactcattgatagttgattggagagatcaatctcttcctcagagtaggtcaagttgga 8153909  T
Q  204 ccgaactgggtcaacaatctttggtgtgttt 234  Q
    ||||| ||| | || | | ||||||||||||    
T  8153910 ccgaaatggataaatattttttggtgtgttt 8153940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 128 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 3073965 - 3073810
Alignment:
Q  128 tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttgg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||| ||||||||||| |||| |  |  |    
T  3073965 tttgtatctctttgtaagaactcattgataatggcttggagagatcaatctctc-cccatagtaggtcaagttgggccgaactgggtaaacatttctatg 3073867  T
Q  228 tgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcacttt 288  Q
    ||||||||||  |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  3073866 tgtgtttgtt--tctcttatct--ctttatcttttgcttgtggttttgtactcttcacttt 3073810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 25689955 - 25690126
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaagaact 149  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||    
T  25689955 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 25690051  T
Q  150 cattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    | |||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  25690052 ctttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 25690126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 3439504 - 3439675
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaagaact 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||   |||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||    
T  3439504 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattatgaacttggc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 3439600  T
Q  150 cattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  3439601 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggatgaacaatct 3439675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Original strand, 7597648 - 7597749
Alignment:
Q  86 ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcc 184  Q
    |||||||| | || |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7597648 ttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttataatccttttgtatctctttgtaaagaatgcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 7597747  T
Q  185 ca 186  Q
    ||    
T  7597748 ca 7597749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 181
Target Start/End: Original strand, 1822283 - 1822422
Alignment:
Q  43 tcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttg 141  Q
    ||||||||||| | |||||||  |||| || ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| ||||    
T  1822283 tcttgttcatttgagagattgcaaaaa-ggatagaaattatggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatctatttg 1822381  T
Q  142 t-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 181  Q
    | || |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  1822382 taaataactcactaatagtgaattggagagatcaatctctc 1822422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 181
Target Start/End: Original strand, 1856728 - 1856867
Alignment:
Q  43 tcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttg 141  Q
    ||||||||||| | |||||||  |||| || ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| ||||    
T  1856728 tcttgttcatttgagagattgcaaaaa-ggatagaaattatggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatctatttg 1856826  T
Q  142 t-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 181  Q
    | || |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  1856827 taaataactcactaatagtgaattggagagatcaatctctc 1856867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 11712214 - 11712039
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggt-gagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgt 104  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||| | |||||| ||||  ||||||| ||||||   || |||||||| || |||| ||| || |||||    
T  11712214 ttgtaaacatcttggatgagtgaaa-tcattgagtcttttgttctttggaagagattgagaaaataa-tataaattaggttttgttccttgagagcttgt 11712117  T
Q  105 tgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaag-aactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 181  Q
    |||||||||||||||| ||  | ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11712116 tgaagctaatttcttgaaacccttttatatctctttgtaaataactcattgatagtggattgaagagatcaatctctc 11712039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 32902327 - 32902212
Alignment:
Q  67 aaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattg 165  Q
    |||||||||||||||| | |||||| | | ||   |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||     
T  32902327 aaatgggtagaaattatgtttgttcatggagactctgttgaagctaatttcttgtaacttttttgtatctctttctaaagaattcattgatagtgaattt 32902228  T
Q  166 gagagatcaatctctc 181  Q
    ||||||||||||||||    
T  32902227 gagagatcaatctctc 32902212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 241
Target Start/End: Original strand, 26403259 - 26403343
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctc 241  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26403259 atagtggattggagagctgc-tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctc 26403343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 29796485 - 29796259
Alignment:
Q  57 gagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaa--ctcatt 153  Q
    ||||||||||||| | |||||||| | |||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    |||||| || ||||||| ||  ||||||    
T  29796485 gagattgggaaaa-gagtagaaatcaaggtttgttcttggagaacttgttgaagctgatttcttgtaacatttttgtacctatttgtaaaaaaactcatt 29796387  T
Q  154 gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca-agttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccc 252  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||| ||||   || ||||  ||||||||||||| ||| ||| || ||||||||| |||||  | ||||||||       
T  29796386 tataatggattggagagatcaatctctcccccaatgtaggtcattgttggaccgaacttggtaaac-atttttggtgtg-ttgtt--tatcttctct--- 29796294  T
Q  253 tttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactt 287  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  29796293 tttatcttttgcttatgattttgtgctttacactt 29796259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 172
Target Start/End: Original strand, 30909389 - 30909487
Alignment:
Q  73 gtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 172  Q
    |||||||||||| ||  |||| | || |||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||    
T  30909389 gtagaaattaggtttactcttggagagcttgtttaaactaatttcttgtaactc-tttgtatctctttgtaatgactcgttgatagtgaattggagagat 30909487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 161
Target Start/End: Original strand, 10240175 - 10240264
Alignment:
Q  74 tagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcat-ttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtgg 161  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10240175 tagaaatttgggtttgttctttgtgagcttgttgaatctaatttcttgtaa-ccatgttggatctctttgtaaagaactcattgatagtgg 10240264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Original strand, 5702532 - 5702595
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 240  Q
    |||||| |||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5702532 tctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 5702595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Original strand, 41266924 - 41267078
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggt-gagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgt 104  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| |||||||| | ||  ||| ||| |||||||| ||||||||||| || |||||| | ||||||||    
T  41266924 ttgtaaatactttgggtgagtgaaa-tcattgagtctcttgttcttaggaagagtttgagaaaatgg-tagaaattaggttttgttcttagagaacttgt 41267021  T
Q  105 tgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 160  Q
    |||  |||||||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||  |||||||||    
T  41267022 tgagactaatttcttgtaactcttttgtatttctttctaaagaacttcttgatagtg 41267078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 42575494 - 42575320
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| | |||||| |  | |||||||||||||||||  |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  42575494 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggattgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 42575397  T
Q  149 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  42575396 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 42575320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 214
Target Start/End: Original strand, 15290522 - 15290687
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  | |||||||||||||||||  |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  15290522 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 15290619  T
Q  149 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggt 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  15290620 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 15290687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 214
Target Start/End: Original strand, 15470891 - 15471056
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  | |||||||||||||||||  |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  15470891 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 15470988  T
Q  149 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggt 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  15470989 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 15471056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 245
Target Start/End: Original strand, 19175783 - 19175873
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  19175783 atagtggattggagagttgc-tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctttttgtgtgtttgttcctttctt 19175873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 238
Target Start/End: Original strand, 4696645 - 4696706
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttc 238  Q
    |||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4696645 tctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttc 4696706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6813708 - 6813662
Alignment:
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6813708 ttggaccgaactgggttaacaatctttggtatgtttgttcctttctt 6813662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 245
Target Start/End: Original strand, 19752466 - 19752511
Alignment:
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19752466 ttggaccgaactaggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctctt 19752511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 245
Target Start/End: Original strand, 23799649 - 23799694
Alignment:
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23799649 ttggaccgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctttctt 23799694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 238
Target Start/End: Original strand, 31071258 - 31071342
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc--tttggtgtgtttgttc 238  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  31071258 atagtggattggagagctgc-tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaacaatctttttggtgtgtttgttc 31071342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 609025 - 609069
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  609025 tctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 609069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7412409 - 7412323
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctt--tggtgtgtttgttcct 240  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| |||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  7412409 atagtggattggagagctgc-tctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaattttcatggtgtgtttgttcct 7412323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22684697 - 22684653
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22684697 tctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 22684653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 27827276 - 27827320
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27827276 tctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 27827320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 179
Target Start/End: Original strand, 38863949 - 38863985
Alignment:
Q  143 aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctc 179  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38863949 aagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctc 38863985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 3232016 - 3231859
Alignment:
Q  1 gaaacatt-gtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggt-gagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtg 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||||||| | ||  ||||||| |||||  | ||||||||||| || |||||| |||    
T  3232016 gaaacattagtaaacaccttgggtgggtgaat-tcattgagtctcttgttcttaggaagagattgagaaaaatg-tagaaattaggctttgttcttcgtg 3231919  T
Q  98 aacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgat 156  Q
    | ||||||||||||||||| || |||    ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3231918 agcttgttgaagctaattttttttaaccattttgtatctctttgtaaagaacttattgat 3231859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4456096 - 4456006
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| ||||||||| | ||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  4456096 atagtggattggagagctgc-tctctcccccagattaggccatattggaccgaaccgggtcagcaatcttttggtgtgtttgttcctttctt 4456006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 169
Target Start/End: Original strand, 11137070 - 11137146
Alignment:
Q  97 gaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt----aagaactcattgatagtggattggaga 169  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||    || ||||||||||||||| ||||||||    
T  11137070 gaacttgttgaagctaatttcttataaccgttttgtatctctttgtaaaaaaaaactcattgatagtgaattggaga 11137146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6127246 - 6127200
Alignment:
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  6127246 ttggaccgaactgagtcaacaatatttgatgtgtttgttcatctctt 6127200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 220
Target Start/End: Original strand, 43530408 - 43530450
Alignment:
Q  178 tctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43530408 tctctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 43530450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 3874301 - 3874345
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3874301 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 3874345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 4424309 - 4424353
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4424309 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 4424353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14419234 - 14419190
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14419234 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 14419190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 14808052 - 14808096
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14808052 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 14808096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 18810998 - 18811042
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18810998 tctctcccccagattaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaa 18811042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 27829587 - 27829631
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27829587 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 27829631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 30480547 - 30480503
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30480547 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 30480503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 119)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 26175855 - 26175559
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  26175855 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggggagaaattagggttgttctttgtgagc 26175756  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  26175755 ttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 26175656  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26175655 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttgattactag 26175559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 5429628 - 5429916
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  5429628 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggttattcttcgtgagc 5429727  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  5429728 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctatttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggttaagtt 5429827  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5429828 ggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttacttgtggttttgagcttttcactttg 5429916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 34570633 - 34570345
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34570633 gaaacattgaaaacatcttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttctttgtgaac 34570534  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  34570533 ttgttgaagctaatttcttgtaacccaattgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggttaagtt 34570434  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34570433 ggatcgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccttttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttg 34570345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12739769 - 12739475
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12739769 gaaacattgtaaacaccttaggtgagtggaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgaac 12739670  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  12739669 ttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctatttgtatgaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 12739570  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttact 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  12739569 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccttttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttgattact 12739475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 9927676 - 9927390
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9927676 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcactgagtgtcttattcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 9927578  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  9927577 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 9927478  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  9927477 ggaccgaactgagtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctattctct-cctttatcttttgcttgtggatttgtgcttttcactttg 9927390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 37740575 - 37740862
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37740575 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggttgttctttgtgaac 37740673  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  37740674 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcaagtt 37740773  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37740774 ggaccgaactgtgtcaacaattttttgtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttg 37740862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 54200125 - 54199839
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54200125 gaaacattgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 54200026  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  54200025 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtgaattagagagatcattctctcccccagattaggtcaagtt 54199926  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  54199925 gga-cgaactgggtcaacaatttttggtgtgtttgttcctctcttctct-cctttatattttgcttgtggatttgtgcttttcactttg 54199839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 56178855 - 56178568
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56178855 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaac 56178757  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-t 199  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| |    
T  56178756 ttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 56178657  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcacttt 288  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  56178656 tggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcacttt 56178568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 47038628 - 47038346
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  47038628 gaaacattataaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgg-aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagc 47038530  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  47038529 ttgttgaagctaatttcttgtaat-catttgtatctgtttgtaaggactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaagtcaagtt 47038431  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47038430 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttg 47038346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 48893861 - 48893573
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttc----tttgt 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  48893861 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtttgt 48893762  T
Q  97 gaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca 196  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  48893761 gagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtca 48893662  T
Q  197 agttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  48893661 agttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatcttttgcttgtgattttgtgcttttcactttg 48893573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 297
Target Start/End: Original strand, 36994474 - 36994764
Alignment:
Q  2 aaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaact 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  36994474 aaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagct 36994573  T
Q  102 tgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||    
T  36994574 tgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattagatcaagttg 36994673  T
Q  202 gaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  36994674 gaccgaactgggtcaacaat-tttggcgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgagtttttcactttgattactag 36994764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 29254443 - 29254739
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||| |    
T  29254443 gaaacattgtaaacacattgggtgaatgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaattgggtagaaattagagttgttttttatgagc 29254542  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||||||| |||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  29254543 ttgttgaagttaatttcttgcaacccatttgtgtctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctctcccaaattaggtcaagtt 29254642  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  29254643 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctattctctccatttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcactttgattactag 29254739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 52467567 - 52467281
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  52467567 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgaggttgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgttg 52467468  T
Q  107 aagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccg 206  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  52467467 aagctaatatcttgtaacccatttgtatcactttgtaataactttttgatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggtcaagttggaccg 52467368  T
Q  207 aactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52467367 aactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttgattactag 52467281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 5871769 - 5872063
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  5871769 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagc 5871868  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  ||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  5871869 ttgtttaagcaaatttcttgtaacccatttttatcactttgcaagaactctttgatagtggattagagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 5871968  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5871969 tgaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgattctctcttctct--ctctatcttttgcttttggttttgagcttttcactttgattactag 5872063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 52095581 - 52095293
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52095581 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 52095482  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-t 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | || |||| |    
T  52095481 ttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaaatctttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt-aggcaagtt 52095383  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  52095382 tggaccgaactgggtgaacaatttttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatcttttccttgtggttttgtgcttttctctttg 52095293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 36463608 - 36463321
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |    
T  36463608 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaattcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggatagaaattagggctgttcattgtgagc 36463509  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  36463508 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgacagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 36463409  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttac 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  36463408 ggaccgaactgggtcaacaatctttg--gtgtttgtt--tctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgagtttttcgctttgattac 36463321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Original strand, 48142991 - 48143274
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctttgtgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48142991 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggttgttctttgtgaa 48143090  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag- 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||     
T  48143091 cttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttcataagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagt 48143190  T
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagctttt 282  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  48143191 ttggaccaaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatcttttgcttgtgattttgtgctttt 48143274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 43 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 46147568 - 46147318
Alignment:
Q  43 tcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46147568 tcttgttcatcggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgt 46147469  T
Q  143 aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctct 242  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  46147468 aagaactctttgatagtggattggagacatcaatctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt--tct 46147371  T
Q  243 cttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46147370 cttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttgattactag 46147318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 65 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12744080 - 12743848
Alignment:
Q  65 gaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatt 164  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12744080 gaaaataggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatt 12743981  T
Q  165 ggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgc 264  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12743980 ggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttttctccttttatcttttgc 12743881  T
Q  265 ttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  12743880 ttgtagttttgtgcttttcactttgattactag 12743848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 45687402 - 45687109
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  || | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||     
T  45687402 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaattttttgattgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggaagaaattaggttttgttctttgtgag 45687303  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagt 199  Q
    |||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||    
T  45687302 cttgtcaaagctaatttcttataactcatttgtatctatttgtaagaactcattgatagtggattggagagatctatctctcctccatattatgtcaagt 45687203  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45687202 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt----tcttttctctctttatctgttgcttgtggttttgagcttttcactttgattactag 45687109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Original strand, 54882975 - 54883189
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  54882975 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttttttgtgagcttgtt 54883073  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  54883074 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagggatcaatctctcctccagattaagtcaagttggacc 54883173  T
Q  206 gaactgggtcaacaat 221  Q
    ||||||||||||||||    
T  54883174 gaactgggtcaacaat 54883189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 65 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 12745469 - 12745266
Alignment:
Q  65 gaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatt 164  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12745469 gaaaataggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatt 12745370  T
Q  165 ggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgc 264  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12745369 ggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttttctccttttatcttttgc 12745270  T
Q  265 ttgt 268  Q
    ||||    
T  12745269 ttgt 12745266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 31474099 - 31474383
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaa 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||     
T  31474099 gaaacattgtaaacactttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggtcttgttctttttgag 31474198  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagt 199  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||| ||  ||||||    
T  31474199 tttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagttgattggagagataaatctctccaccagagtagatcaagt 31474298  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaaca-atctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcacttt 288  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||    
T  31474299 tggaccgaactgggtaaacatatc-ttggtgtgtttgtttctct----tctccctttatctttagcttttgattttgtgcttttcacttt 31474383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5370305 - 5370013
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatg---ggtagaaattagggttgttctttgtg 97  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||||||    
T  5370305 gaaacattgtaaacactttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaaaaagaggtagaaattagggttgttctttgtg 5370207  T
Q  98 aacttgttgaa-gctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca 196  Q
    |||||||  || |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||| || ||||    
T  5370206 aacttgtcaaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggactagagagatcaatctctcctccagagtaggtca 5370107  T
Q  197 agtt-ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5370106 agtttggaccgaactgagtgaacaatctttgatgtgtttgtttatctcttctctccttttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttg 5370013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 30000024 - 29999756
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30000024 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcgttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttgttctttgtgaac 29999927  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag- 198  Q
     |||  ||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||     
T  29999926 atgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatcttttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagt 29999827  T
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttt 273  Q
    |||||||||||||||| ||||    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  29999826 ttggaccgaactgggtgaaca----ttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttgtcttttgcttgtggttt 29999756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 43 - 221
Target Start/End: Original strand, 26364227 - 26364405
Alignment:
Q  43 tcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26364227 tcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgt 26364326  T
Q  143 aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaat 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  26364327 aagaactcattaatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtttgactgaactgggtcaacaat 26364405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 24 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27417160 - 27416955
Alignment:
Q  24 gagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaa 123  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27417160 gagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattggtaaaatgtgtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaa 27417062  T
Q  124 ttcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27417061 cccatttgtatctctttgtaaaaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgagtcaacaatct 27416962  T
Q  224 ttggtgt 230  Q
    |||||||    
T  27416961 ttggtgt 27416955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 40632400 - 40632612
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40632400 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgtt 40632498  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | | ||||||||||||||||    
T  40632499 gaagctaatttcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctaaagtaagtcaagttggacc 40632598  T
Q  206 gaactgggtcaaca 219  Q
    ||||||||| ||||    
T  40632599 gaactgggtaaaca 40632612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 52082876 - 52082600
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52082876 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgactgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaactagggttgttctttgtgaac 52082777  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-t 199  Q
    ||||  || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||       ||||||| ||||||  ||||| || |||||| |    
T  52082776 ttgtcaaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaaatctttgatagtg-------gagatcattctctcctccagagtaggtcaagtt 52082684  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttc 283  Q
    | ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  52082683 tagaccgatttgggtgaacaatctttggtgtgtttgtttatctcttctctccttttatcttttgcttgtggttttatgcttttc 52082600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 4587907 - 4588192
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| | || ||||||||| |     
T  4587907 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcatgttcattggtgaaattgggaaaaaaggtagaaattaagatttgttctttgtaag 4588006  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | || || ||||    
T  4588007 cttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagaacaatctctcccccataataggtgaagt 4588106  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||| |||||||| |||| |   |||||||||||||    ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  4588107 tggaccaaactgggtaaacatttcatggtgtgtttgtt----tctcctctctctttatcttttgcttgtgattttgtgcttttcactttg 4588192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 6655911 - 6656123
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6655911 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcacttgtgagattgaaaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgaacttgtt 6656009  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  6656010 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagttggacc 6656109  T
Q  206 gaactgggtcaaca 219  Q
    ||| ||||| ||||    
T  6656110 gaattgggtgaaca 6656123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 6542400 - 6542115
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggtt-gttctttgtga 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| || |||||||||||    
T  6542400 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggggagattgggaaaaaatggtagaaattaggatttgttctttgtga 6542301  T
Q  99 acttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag 198  Q
     ||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||    
T  6542300 gcttgttgaaactaatttcttgttagccttttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagggtaggtcaag 6542201  T
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcacttt 288  Q
    |||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||  |||||| |||  ||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||    
T  6542200 ttggaccgaactgggtaaacatttcttggtgtgtttgtt--tctcttatct--ctttatctttttcttgtgattttgtgtttttcacttt 6542115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 242
Target Start/End: Original strand, 3913408 - 3913637
Alignment:
Q  12 aacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagct 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||    
T  3913408 aacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgagtagaaattagagctgttctttgtgagtttgttgaagct 3913507  T
Q  112 aatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactg 211  Q
    |||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || || |||||| | |||||||    
T  3913508 aatttcttttaacccatttgtatatctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc-cctagagtatgtaaagttgtatcgaactg 3913606  T
Q  212 ggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctct 242  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  3913607 ggtcaacaatctttggtgtgttcgtttctct 3913637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 12745655 - 12745476
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12745655 gaaacaatgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggcgagattaggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 12745556  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctct 180  Q
    ||||  || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12745555 ttgtcaaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctct 12745476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 13992504 - 13992222
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagggttgttctttgtgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||       |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13992504 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaa 13992413  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag- 198  Q
    |||||  || |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||||||     
T  13992412 cttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctc-ttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagt 13992314  T
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccc-tttatc-ttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  13992313 ttggaccgaactaggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctcccttttatctttttgcttgt-gatttgtgcttttcactttg 13992222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 210
Target Start/End: Original strand, 8665362 - 8665566
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||   | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  8665362 attgtaaacaccttggaagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgagagcttgtt 8665461  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  8665462 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 8665561  T
Q  206 gaact 210  Q
     ||||    
T  8665562 aaact 8665566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 12747975 - 12747795
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12747975 gaaacattgtaaacaccttaggtgagtggaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgaac 12747876  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 181  Q
    ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12747875 ttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctatttgtatgaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 12747795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Original strand, 2209668 - 2209886
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2209668 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattgttgagattgggaaaatgggtagaaattagggtttttctttgtgagcttgtt 2209766  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca-agttgga 203  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||  ||||||    
T  2209767 gaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagattaatctctcctccagagtaggtcatggttgga 2209866  T
Q  204 ccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  2209867 ccgaactgggtgaacaatct 2209886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 12073347 - 12073560
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| | || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12073347 attgtaaacaccttgggagtgtgaaaatcatga-gtgtcttgcttattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtt 12073445  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca-agttggac 204  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||    
T  12073446 gaagctaatttattgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcttccagagtaggtcattgttggac 12073545  T
Q  205 cgaactgggtcaaca 219  Q
    |||||| ||| ||||    
T  12073546 cgaactaggtgaaca 12073560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 37229935 - 37229657
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggt-tgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  37229935 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcaatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggtgtgttctttgtgagcttgtt 37229837  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttg-tatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggac 204  Q
     |||| ||||| ||||||  | |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || | || ||||||||||||    
T  37229836 aaagcaaatttgttgtaaccctttttatatctctttgtaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctctccctcatagtaggtcaagttggac 37229737  T
Q  205 cgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcacttt 288  Q
    |||||| ||| |||| |  |||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  37229736 cgaactaggtaaacatttcttggcgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatcttttacttatggttttgtgcttttcacttt 37229657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 211
Target Start/End: Original strand, 41639381 - 41639585
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||  | || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41639381 attgtaaacaccttaggagagtgaaaatcacga-gtgtcttgtttattggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttttt 41639479  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  41639480 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctatttgtaagaactcatcgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 41639579  T
Q  206 gaactg 211  Q
    ||||||    
T  41639580 gaactg 41639585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 50674059 - 50673848
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || || |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  50674059 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcgtgttcatttgtgagattgagaaaatgagtagaaattaggattgt-ctttgtgagcttgtt 50673962  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  50673961 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 50673862  T
Q  206 gaactgggtcaaca 219  Q
    ||||| ||| ||||    
T  50673861 gaactaggtgaaca 50673848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 212
Target Start/End: Original strand, 379333 - 379541
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaat-cattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  379333 attgtaaacaccttgggagagtgaaaattcaattagtatcttgttcatttgtgagattgagaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgt 379432  T
Q  105 tgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca-agttgga 203  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||  ||||||    
T  379433 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcgctttgtaagaactaattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttgga 379532  T
Q  204 ccgaactgg 212  Q
    |||||||||    
T  379533 ccgaactgg 379541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 178
Target Start/End: Original strand, 24969067 - 24969238
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  24969067 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagagtcttgttctttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagatttgttctttgtgagcttgttg 24969166  T
Q  107 aagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatct 178  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24969167 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactaattgatagtggattggagagataaatct 24969238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Original strand, 41964369 - 41964578
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||   | ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41964369 attgtaaacaccttgggaaagtgaaaattcatgagtgtcttgttcgttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 41964468  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggac 204  Q
     |||||||||| ||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||    
T  41964469 taagctaatttattgtaacccattttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggac 41964568  T
Q  205 cgaactgggt 214  Q
    ||||||||||    
T  41964569 cgaactgggt 41964578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Original strand, 8648095 - 8648306
Alignment:
Q  8 tgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttga 107  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||   | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  8648095 tgtaaacaccttggaagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagaatgggaaaatggatagaaattagggttgttcattgtgagtttgttga 8648194  T
Q  108 agctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccga 207  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |    
T  8648195 agctaatttcttataacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatattggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccaa 8648294  T
Q  208 actgggtcaaca 219  Q
    ||||||| ||||    
T  8648295 actgggtgaaca 8648306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 46703454 - 46703669
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46703454 attgtaaacaccttgggagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 46703553  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca-agttgga 203  Q
     |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||  ||||||    
T  46703554 taagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttgga 46703653  T
Q  204 ccgaactgggtcaaca 219  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  46703654 ccgaattgggtgaaca 46703669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 5208055 - 5207777
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5208055 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcatttagtgacttgttcattggagtgattggaaaaa-gggtagaaattagggtttgttctttgtgaacttgtt 5207957  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||||||||||| ||| ||  | | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||     
T  5207956 gaagctaatttattgcaacccttgtatatctatttgtaagaactcattgatagtggattggaaagatcaatctctctcccagagtaggtcaatttggact 5207857  T
Q  206 gaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactt 287  Q
    ||| ||||| |||| |  ||||||||| | |   ||||||||||   ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  5207856 gaattgggtaaacatttattggtgtgtatttgtttctcttctct--atttatctgttgcatgtggttttgtgcttttcactt 5207777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 211
Target Start/End: Original strand, 35662395 - 35662600
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaa-tcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 104  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  35662395 attgtaaacaccttgagagtgtgaaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgaaaaaatgggtagaaattagggttgttctttatgagtttgt 35662493  T
Q  105 tgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggac 204  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||| || ||||||||||||    
T  35662494 tgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatatctcctcaagagtaggtcaagttggac 35662593  T
Q  205 cgaactg 211  Q
    |||||||    
T  35662594 cgaactg 35662600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 286
Target Start/End: Original strand, 51337014 - 51337294
Alignment:
Q  2 aaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg--ttgttctttgtgaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||     
T  51337014 aaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcctgttcattggtgagattgagaaaaagggtagaaattacggatttgttctttgtgag 51337113  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagt 199  Q
    ||| |  ||| |||||| || |||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | || |||| |||||||    
T  51337114 ctttt--aagataatttattataacccttttgtatctctttttaagaactcattgatagtgtattagagagatcaatctctcccacacattaggtcaagt 51337211  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcact 286  Q
    ||||||||||||||| |||| |   |||||||||||||  | ||||||||   ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  51337212 tggaccgaactgggtaaacatttcgtggtgtgtttgtt--tatcttctct--ttttatcttttgcttgtgattttgtgctcttcact 51337294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13009650 - 13009430
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  13009650 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgtgaaaatgggtagaaattaggtttgttcttcgtgagc 13009551  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||             ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||| ||||||||    
T  13009550 tt-------------tcttgtaaaacatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcgatctctcctccaaattaggtcaagtt 13009464  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgttt 234  Q
     |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13009463 agaccgaactgtgtcaacaatctttggcgtgttt 13009430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Original strand, 21688207 - 21688418
Alignment:
Q  10 taaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaa-tgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaa 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21688207 taaacaccttgggggagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcatcggtgagattgagaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaa 21688305  T
Q  109 gctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaa 208  Q
     ||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||| |||||||    
T  21688306 actaattttttgtaactcatttgtatctcttcggaagaactcattgataatgaattggagagatcaatccctcccctagattaggtcaagttagaccgaa 21688405  T
Q  209 ctgggtcaacaat 221  Q
     || |||||||||    
T  21688406 ttgagtcaacaat 21688418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 50262911 - 50262697
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| | || ||||||| ||||   ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  50262911 attgtaaataccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgtttattg---agattgggaaaatggatcgaaattacggttgttctttgtgagcttgtt 50262816  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca-agttggac 204  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||  ||||| || ||||  |||||||    
T  50262815 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagttgattggagatatcaatctttcctccagagtaggtcattgttggac 50262716  T
Q  205 cgaactgggtcaacaatct 223  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  50262715 cgaactgggtgaacaatct 50262697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Original strand, 12119492 - 12119709
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgt 104  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  12119492 attgtaaataccttgggagagtgaaaatcaatgagtgtcttgttcataggtgagattggaaaaaagagtagaaattatggtttgttctttgtgaactttt 12119591  T
Q  105 tgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca-agttgg 202  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||  |||||    
T  12119592 tgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctctc-ccaagagtaggtcattgttgg 12119690  T
Q  203 accgaactgggtcaacaat 221  Q
    |||||||| ||| ||||||    
T  12119691 accgaactaggtgaacaat 12119709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 55085578 - 55085442
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  55085578 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgactgtcttgttcattggtgagattgg-aaaataggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgtt 55085480  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgta 143  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  55085479 gaagctaatttcttgtaaaccatttgtatctctttgta 55085442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26699659 - 26699447
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaa-aatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||| ||| | ||||||  ||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26699659 attgtaaacactttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttgtttattagagagattcagaagaaagggtatagattagggtttgttctttgtgagcttg 26699560  T
Q  104 ttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca-agttg 201  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||    
T  26699559 ttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcatttataatggattggagagatcaatctctatcccagagtaggtcattgttg 26699460  T
Q  202 gaccgaactgggt 214  Q
    |||||||||||||    
T  26699459 gaccgaactgggt 26699447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 12744195 - 12744087
Alignment:
Q  72 ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaga 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12744195 ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaga 12744096  T
Q  172 tcaatctct 180  Q
    |||||||||    
T  12744095 tcaatctct 12744087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31495485 - 31495297
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcattt-gtatctcttt-gtaagaact 149  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||  || |||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||    
T  31495485 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattaggattgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaact 31495387  T
Q  150 cattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 237  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  31495386 cattgatagttgattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 31495297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 140
Target Start/End: Original strand, 41639218 - 41639351
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||  | || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  41639218 attgtaaacaccttaggagagtgaaaatcacga-gtgtcttgtttattggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtaaacttttt 41639316  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt 140  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  41639317 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 41639351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 287
Target Start/End: Original strand, 29056317 - 29056590
Alignment:
Q  11 aaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattag-ggttgttctttgtgaacttgttgaag 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||  ||||||  |     
T  29056317 aaacaccttgggtgagtaaaaatcattgagtgttttgttcattagagagattgggaaaat-ggtaggaattagagtttgttctttgtgtgcttgttagaa 29056415  T
Q  110 ctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaa-ctcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaa 208  Q
    ||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||| | ||||||| |||||  || ||| | || |||||||    
T  29056416 ctaatttcttgcaatccttttatatctctttgtaacaacctcattgataatggattagagagacctatctctcacccagtgtaggtccattttgaccgaa 29056515  T
Q  209 ctgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactt 287  Q
    ||| || |||| |  |||||||||||||| |||| ||||    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  29056516 ctgtgtaaacacttcttggtgtgtttgtttctcttttct----ctttatcttttgtttgtggttttgtgtttttcactt 29056590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 48142588 - 48142327
Alignment:
Q  10 taaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaa 108  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  48142588 taaacacttcgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgcccattgatgagattgggaacatga-tagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaa 48142490  T
Q  109 gctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattg--atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    |||| ||||||||||  | | | ||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||| || | | || ||||| |||||      
T  48142489 gctagtttcttgtaacccttgtatatctctttgtaaagaactcattgatatagtagatttgaaagatcaatctctc-cctacagtaggtcaatttggaga 48142391  T
Q  206 gaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttt 273  Q
    || || ||| |||| | |||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  48142390 gagctaggtaaacattttttggtgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatcttttgattgtggttt 48142327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 8393394 - 8393566
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaagaact 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||  |||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||    
T  8393394 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 8393490  T
Q  150 catt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  8393491 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 8393566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 8395603 - 8395775
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaagaact 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||  |||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||    
T  8395603 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 8395699  T
Q  150 catt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  8395700 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 8395775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 287
Target Start/End: Original strand, 5349924 - 5350140
Alignment:
Q  66 aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggatt 164  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  || ||||||||||||||| |||||||| |||||| || |      
T  5349924 aaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgaacttgtcgaagctaattccttgtagctcgtttgtatctctttgtaaagaactcgttgataatgaagc 5350023  T
Q  165 ggagagatcaatctctctcccagattaagtca-agttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttg 263  Q
    |||||||||  |||||| |||||| || ||||  ||||||| ||| ||||| |||| |  ||||||||||||||  ||||||||||  | ||||||||||    
T  5350024 ggagagatc--tctctc-cccagagtaggtcattgttggactgaattgggtaaacatttattggtgtgtttgtt--tctcttctct--cgttatcttttg 5350116  T
Q  264 cttgtggttttgagcttttcactt 287  Q
     |||| || ||| | |||||||||    
T  5350117 tttgtagtcttgtgtttttcactt 5350140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 69 - 181
Target Start/End: Original strand, 33989861 - 33989974
Alignment:
Q  69 atgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattgga 167  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  33989861 atgggaagaaactaggtttgttcttagagagtttgttgaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaataactcgttaatagtggattgga 33989960  T
Q  168 gagatcaatctctc 181  Q
    ||||||||||||||    
T  33989961 gagatcaatctctc 33989974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Original strand, 33089837 - 33090008
Alignment:
Q  11 aaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggt-gagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaag 109  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||| || | ||  ||||||||| | |||||||| | || ||||||||||    
T  33089837 aaacaccttggaagagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatgggaagagattgagaga-tgaatagaaattatgtttgttcttggagagcttgttgaag 33089935  T
Q  110 ctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 181  Q
    ||||||| || |||    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33089936 ctaatttattataaccattttgtatctctctgtaaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctc 33090008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 174
Target Start/End: Original strand, 53345187 - 53345340
Alignment:
Q  22 gtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttg-ttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttg 120  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| || || ||||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  53345187 gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgtttatcggagagattgagaaaatga-tagaaattaaggttgattctttgtgagcttgttgaaactaatttcttg 53345285  T
Q  121 taattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatca 174  Q
    |||  | ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||||    
T  53345286 taacccttttatatctttttgtaaagaactcattaatattggattgtagggatca 53345340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 156
Target Start/End: Original strand, 32091438 - 32091583
Alignment:
Q  11 aaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtga-gattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaag 109  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||| || || |||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | ||  ||||||||     
T  32091438 aaacacattgggtgagcgaaa-tcattgagtctcttgttcatgggagaagattgggaaaatgc-tagaaattaggtttgttcttggagagtttgttgaaa 32091535  T
Q  110 ctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgat 156  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32091536 ctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaacacattgat 32091583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 66 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22882905 - 22882791
Alignment:
Q  66 aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggatt 164  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  22882905 aaaatggataaaaattaggtttgttcttggagagtttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttcgtaaagaactcattggtagtggatt 22882806  T
Q  165 ggagagatcaatctc 179  Q
     |||| |||||||||    
T  22882805 agagaaatcaatctc 22882791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 66 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22934569 - 22934455
Alignment:
Q  66 aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggatt 164  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  22934569 aaaatggataaaaattaggtttgttcttggagagtttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttcgtaaagaactcattggtagtggatt 22934470  T
Q  165 ggagagatcaatctc 179  Q
     |||| |||||||||    
T  22934469 agagaaatcaatctc 22934455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 44967992 - 44967829
Alignment:
Q  57 gagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaa-ctcattg 154  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || | |||| | || |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  44967992 gagattgggaaaatgg-tagaaattaggttttgctcttggagagcttgctgaagccaatttcttgtaac-catttgtatctctttgtaaaaaactcgttg 44967895  T
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca-agttggaccgaactgggtcaaca 219  Q
    | ||| |||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||    
T  44967894 agagtagattagagggatcaatctctcccccagaataagtcactgttggaccgacctgggtaaaca 44967829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Original strand, 3796568 - 3796637
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| |||| |||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3796568 tctctcccccatattaggtcatattggacggaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 3796637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 245
Target Start/End: Original strand, 38152468 - 38152556
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  38152468 atagtggattggagagctgc-tctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctttctt 38152556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10047427 - 10047359
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10047427 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctttctt 10047359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 173
Target Start/End: Original strand, 34112838 - 34112939
Alignment:
Q  73 gtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagaga 171  Q
    |||||||||| | |||||||  | || |||||||||||||||||| |||||  | |||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  34112838 gtagaaattatgtttgttctaggagagcttgttgaagctaatttcatgtaacccttttgcatctctttgtaaagaactcattgatagtgaagtggagaga 34112937  T
Q  172 tc 173  Q
    ||    
T  34112938 tc 34112939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 39246042 - 39245974
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  39246042 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctttctt 39245974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 179
Target Start/End: Original strand, 6677517 - 6677597
Alignment:
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  6677517 cttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatatctttgtaaagaagtctttgataatggatttgagagatcaatctc 6677597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21703985 - 21703784
Alignment:
Q  72 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggaga 169  Q
    ||||||||||||| || |||||| |  | |||||||||| | ||||||||||     ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21703985 ggtagaaattaggttttgttcttagaaagcttgttgaagatgatttcttgtaccctttttgtatctttttgtaaagaactcattgacagtggattggaga 21703886  T
Q  170 gatcaatctctctcccagattaagtca-agttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgt 268  Q
     |||||||| || |||| | || ||||  ||| ||||||||||||| |||| |  ||| ||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  21703885 tatcaatctatc-cccatagtaggtcattgtttgaccgaactgggtaaacatttcttgatgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatattttgcttgt 21703791  T
Q  269 ggttttg 275  Q
    | |||||    
T  21703790 gattttg 21703784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 34788923 - 34788851
Alignment:
Q  72 ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaa 144  Q
    ||||||||||||| ||| |||| | || |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  34788923 ggtagaaattaggattgctcttggagagcttgttgaagttaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaa 34788851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 282
Target Start/End: Original strand, 24969787 - 24969891
Alignment:
Q  174 aatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttt 273  Q
    ||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||||    |||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  24969787 aatctatcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtaaacatttcttggtgtgtttgtttctct----tctcactttatcgtttgcttatggttt 24969882  T
Q  274 tgagctttt 282  Q
    |||| ||||    
T  24969883 tgagttttt 24969891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 35369637 - 35369484
Alignment:
Q  24 gagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggt-gagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgta 122  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||   || ||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||| |||| |||| ||||||||||  |    
T  35369637 gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgcaagacattgggaaa-tgagtagaaattaggtttgttcttggtgagcttgatgaaactaatttcttaaa 35369539  T
Q  123 attcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 181  Q
    | ||     ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||| || |||||||    
T  35369538 actc-----tatctctttgtaaagaactcattgatggtgaattgaagaggtcgatctctc 35369484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 245
Target Start/End: Original strand, 36315258 - 36315346
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  36315258 atagtggattggagagctgc-tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacattc-ttggtgtgtttgttcctttctt 36315346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 245
Target Start/End: Original strand, 36329467 - 36329555
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  36329467 atagtggattggagagctgc-tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacattc-ttggtgtgtttgttcctttctt 36329555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 5136063 - 5136237
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  | |||||||||||||||||  |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  5136063 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 5136160  T
Q  149 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  5136161 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 5136237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 5138288 - 5138462
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  | |||||||||||||||||  |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  5138288 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 5138385  T
Q  149 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  5138386 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 5138462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 238
Target Start/End: Original strand, 31985689 - 31985745
Alignment:
Q  183 cccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgttc 238  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31985689 cccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttc 31985745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 245
Target Start/End: Original strand, 5396700 - 5396790
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||||||||||||| |   ||||||  |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  5396700 atagtggattggagagctgc-tctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttcttcctttctt 5396790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 44570514 - 44570427
Alignment:
Q  72 ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatag 158  Q
    ||||||||||| | ||||| || | || ||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44570514 ggtagaaattatgtttgttgttggagagcttgttgaaactaatttcttgtaacatttttgtatctctttgtaaagaactcattgatag 44570427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 16422755 - 16422653
Alignment:
Q  72 ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagag 170  Q
    ||||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||||||||||||| | ||  | ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||    
T  16422755 ggtagaaattatgtttgttttttgagagctttttgaagctaatttctagaaacccttttgtatatctttgtaatgaactcatggatagtgaagtggagag 16422656  T
Q  171 atc 173  Q
    |||    
T  16422655 atc 16422653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 40975131 - 40975057
Alignment:
Q  98 aacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 172  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||  |||| |||||||| |||| |||||||    
T  40975131 aacttgttgaagttaatttctggtaactctattgtatctctttgtaatgactctttgatagtagattagagagat 40975057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 54867209 - 54867164
Alignment:
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  54867209 ttggaccgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctttctt 54867164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Original strand, 5269240 - 5269308
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  5269240 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatc-ttgttgtgtttgttcctttctt 5269308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 240
Target Start/End: Original strand, 16623322 - 16623405
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 240  Q
    |||||||||||||||| |   ||||||  |||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16623322 atagtggattggagagctgc-tctctcctccagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 16623405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 35370557 - 35370449
Alignment:
Q  11 aaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggt-gagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaag 109  Q
    ||||||||||   |||||||||| ||| ||| ||||||||||||   || ||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||     
T  35370557 aaacaccttgtaagagtgaaaattattgagtgtcttgttcattgcaagacattgggaaa-tgagtagaaattaggtttgttcttggtgagcttgatgaaa 35370459  T
Q  110 ctaatttctt 119  Q
    ||||||||||    
T  35370458 ctaatttctt 35370449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 7124901 - 7125074
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgta-tctctttgt-aagaac 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| | || ||||||||||||||  |  ||||| ||  ||||| ||||||    
T  7124901 ttggtgagattggg-aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaaactaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaac 7124997  T
Q  149 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||| |||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| || ||||||    ||||||||||||| ||||||||    
T  7124998 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagcaaagaccgaactgggtgaacaatct 7125074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3777574 - 3777529
Alignment:
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  3777574 ttggaccgaactgggtcaacaatc-tcggtgtgtttgttcctttctt 3777529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5147702 - 5147657
Alignment:
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  5147702 ttggaccgaactgggtcaacaatc-tcggtgtgtttgttcctttctt 5147657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5143307 - 5143239
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  5143307 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatc-tcagtgtgtttgttcctttctt 5143239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 181
Target Start/End: Original strand, 7122682 - 7122812
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgta-tctctttgt-aagaac 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| | || ||||||||||||||  |  ||||| ||  ||||| ||||||    
T  7122682 ttggtgagattggg-aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaaactaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaac 7122778  T
Q  149 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctc 181  Q
    ||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  7122779 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctc 7122812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 240
Target Start/End: Original strand, 16630709 - 16630792
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 240  Q
    |||||||||||||||| |   ||||||  |||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  16630709 atagtggattggagagctgt-tctctcctccagattatgtcatattggaccgaactaggtcaacaa-ccttggtgtgtttgttcct 16630792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 37755095 - 37754994
Alignment:
Q  86 ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaa-ctcattgatagtggattggagagatcaatctctctcc 184  Q
    |||||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||    ||| ||||||||| ||| || |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||    
T  37755095 ttgttcttagagaatttggtgaagataatttcttgtaacctttttttatctctttctaaaaaactcattgataatggtttgaagagatcaatctctcccc 37754996  T
Q  185 ca 186  Q
    ||    
T  37754995 ca 37754994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 103
Target Start/End: Original strand, 42234320 - 42234357
Alignment:
Q  66 aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttg 103  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42234320 aaaatgagtagaaattagagttgttctttgtgaacttg 42234357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Original strand, 42599623 - 42599691
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| |||| |||| ||||  |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  42599623 tctctcccccatattatgtcatattggactgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctttctt 42599691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 4215595 - 4215639
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4215595 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 4215639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5635520 - 5635476
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5635520 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 5635476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 246
Target Start/End: Original strand, 6743474 - 6743532
Alignment:
Q  186 agattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttc 246  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6743474 agattaggtcatattggaccgaactgggtcaac-atc-ttggtgtgtttgttcctttcttc 6743532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 6765133 - 6765177
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6765133 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 6765177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 7941612 - 7941656
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7941612 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 7941656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8631463 - 8631419
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8631463 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 8631419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14789472 - 14789428
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14789472 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 14789428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 16455531 - 16455575
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16455531 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 16455575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17662289 - 17662245
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17662289 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 17662245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22800906 - 22800862
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22800906 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 22800862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 24879279 - 24879323
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24879279 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 24879323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 24880741 - 24880785
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24880741 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 24880785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 24889085 - 24889129
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24889085 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 24889129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 37089416 - 37089372
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37089416 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 37089372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 38928221 - 38928177
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38928221 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 38928177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 40637363 - 40637407
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40637363 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 40637407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 120)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 5 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 28220441 - 28220149
Alignment:
Q  5 cattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28220441 cattgaaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattcggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 28220342  T
Q  105 tgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggac 204  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  28220341 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggac 28220242  T
Q  205 cgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28220241 cgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtccctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttgattactag 28220149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 3156815 - 3157102
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3156815 gaaacattgtaaacaccctgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 3156913  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  3156914 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagtt 3157013  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3157014 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttg 3157102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 44455109 - 44455397
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44455109 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaaccattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 44455208  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  44455209 ttgttgaaactaatttcttgtaactcatttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 44455308  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  44455309 tgaccgaactgggtcaacgatctttggtgtgtttgttcctctcttctcttcctttatcttttgcttttggttttgtgtttttcactttg 44455397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 28223640 - 28223344
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  28223640 gaaacattgaagacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggttgatctttctgaac 28223541  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  28223540 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagtt 28223441  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||    
T  28223440 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtccctctcttctctccctttatcttttgcttgtgattttgtgtttttcactttgattactag 28223344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 49918309 - 49918587
Alignment:
Q  11 aaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49918309 aaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagc 49918408  T
Q  111 taatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaact 210  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  49918409 taatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaagttggaccgaact 49918508  T
Q  211 gggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  49918509 aggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccttttatcttttgcttgtggatttgtgcttttcattttg 49918587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 37503768 - 37503489
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37503768 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 37503669  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  37503668 gaagctaatttcttgtaacc---ttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaagttggatc 37503572  T
Q  206 gaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcacttt 288  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  37503571 gaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgcggttttgtgcttttcacttt 37503489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 31659187 - 31659475
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  31659187 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggctgttctttgtgagc 31659286  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  31659287 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaacttattgatagtggattggagagatcaatctctccctcagattaggtcaagtt 31659386  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  31659387 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttattcctcttttctctccttttatcttttgcttatggttttgtgctttttactttg 31659475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 28265773 - 28265481
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  28265773 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggcgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttcattgtgagc 28265674  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  28265673 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 28265574  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  28265573 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatcttttggttgtggttttgagctttttactttgattactag 28265481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 834386 - 834100
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  834386 gaaacattgtaaacaccttgggtgcgtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagc 834287  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||    
T  834286 ttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatctatctctcccccagagtaggtcaagtt 834187  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  834186 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 834100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 50169429 - 50169137
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50169429 gaaacattgtaaataccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagc 50169330  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  50169329 ttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagtactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcccctagattaggtcaagtt 50169230  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50169229 ggaccgaactggatcaacaatctttggtgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttgattactag 50169137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 3847340 - 3847047
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  3847340 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagt 3847241  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||| ||||||| || ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||    
T  3847240 ttgtttaagctaaatttttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatccatctcttccccagattaggtcaagtt 3847141  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttacta 296  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3847140 ggaccgaacttggtcaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttgattacta 3847047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 37560087 - 37559797
Alignment:
Q  2 aaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaact 101  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37560087 aaacattgtaaacacattaggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattaggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaact 37559988  T
Q  102 tgttg-aagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctccc-agattaagtcaagt 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  37559987 tgttgaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtgaattggagagatcaatctctccccctagattaggtcaagt 37559888  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctct-ccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37559887 tggaccgaacttggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctcccctttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttg 37559797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 50167394 - 50167102
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  50167394 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattagtagaaattagggttgttatttgtgagc 50167295  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  50167294 ttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaaaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattagctcaagtt 50167195  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  50167194 ggaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgaacttttcactttgattactag 50167102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 3189280 - 3189576
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3189280 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggttgttctttgtgaac 3189378  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-t 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| |    
T  3189379 ttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtt 3189478  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3189479 tggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttgattactag 3189576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 3198097 - 3198393
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3198097 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggttgttctttgtgaac 3198195  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-t 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| |    
T  3198196 ttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtt 3198295  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3198296 tggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttgattactag 3198393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 3206936 - 3207232
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3206936 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggttgttctttgtgaac 3207034  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-t 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| |    
T  3207035 ttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtt 3207134  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3207135 tggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttgattactag 3207232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 197127 - 196832
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  197127 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagc 197028  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctct-ctcccagattaagtcaagt 199  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||| |||||||    
T  197027 ttgtttaagttaatttcttgtaactcatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatttatctctccccccagattaggtcaagt 196928  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  196927 tggaccgaactggatcaacaatctttggtgtgtttttttctctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgagcttctcactttgattactag 196832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 30476667 - 30476377
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttca---ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtg 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  30476667 gaaacattgtaaacaccttgggtgggtgaaaatcattgagt-tcttgttcaatattggtgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttctttatg 30476569  T
Q  98 aacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaa 197  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||| || | || ||    
T  30476568 aacttgttgaagataatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatactggattggacagatcaatctctaccccatatgaggttaa 30476469  T
Q  198 gttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30476468 gttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccttttatcttttacttgtggttttgagcttttcactttg 30476377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 45644573 - 45644289
Alignment:
Q  2 aaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaac 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| |    
T  45644573 aaacattgtaaacatcttgggtgagtgaaaatcattaagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatggatagaaattaagttttgttctttgtgagc 45644474  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  45644473 ttgtcaaagctaatttcttgcaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatatctcccccagattaggtcaagtt 45644374  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45644373 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgcttgtt--tctcttctct--ctttatcttttgtttgtggttttgagcttttcactttg 45644289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 285
Target Start/End: Original strand, 46064868 - 46065147
Alignment:
Q  2 aaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaact 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||    
T  46064868 aaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatggataaaaattaggtttgttctttgtgagct 46064967  T
Q  102 tgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttg 201  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  46064968 cgttgaagctaatttcttgtaactcatgtgtatctctttgtaagaactcattcatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaagttg 46065067  T
Q  202 gaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcac 285  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46065068 gatcgaactgggtaaacaatctttggtgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgagcctttcac 46065147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 8551006 - 8550715
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  8551006 gaaacattgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagc 8550907  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-t 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| |    
T  8550906 ttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 8550807  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttg-ttcctctcttc-tctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||    
T  8550806 tggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgttttctctcttcttctctctttatcttgtgcttgtgattttgtgtttttcactttg 8550715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 4552856 - 4552571
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  4552856 gaaacattgtaaacaccttgggtgagggaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggtttgtcctttgtgagc 4552757  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||    
T  4552756 ttgttgaagctaatttcttgtaacccctttgtatccctttgtaagaactcattgataatggattggagagatcaatctctccctcagagtaggtcaagtt 4552657  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4552656 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt-----------tctctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttgattactag 4552571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 20762621 - 20762908
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagggttgttctttgtgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20762621 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtatcttgttcattggtgagattgagaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaa 20762719  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag- 198  Q
    |||||  |||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||     
T  20762720 cttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttcgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctacagagtaggtcaagt 20762819  T
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactt 287  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20762820 ttggaccgaactaggtgaccaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactt 20762908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 10925172 - 10925467
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  10925172 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgaaaaaatggatagaaattatggttgttctttgtgagc 10925271  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt---aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| || ||    
T  10925272 ttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaagaattcattgatagtggattggagaaatcaatctctcccctagattaggtaaa 10925371  T
Q  198 gttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  10925372 gttggatcgaactgggtcaacaatctttgatgtgtttgtt--tatcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgagtttttccctttgattactag 10925467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 40122417 - 40122124
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |    
T  40122417 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtaaaaatcattgaatgtcttgttcatttgtgagattggaaaaatgggtcgaaattagatttgttctttgtgagc 40122318  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattg--atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag 198  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  40122317 ttgtttaagctaatttcttataactcatttgtatcactttgtaagaactctttgatatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag 40122218  T
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttacta 296  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40122217 ttggaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttgattacta 40122124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 13659555 - 13659276
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| | |    
T  13659555 gaaacattgtaaacaccttggggtagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaacggatagaaattagggttgttttttgtaagc 13659456  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||    
T  13659455 ttgttgaagctaatttcttgttacccatttatatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaagtt 13659356  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttca 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  13659355 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtatttgtt--tctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgtacttttca 13659276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 1833471 - 1833754
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1833471 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaat 1833570  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
     | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||    
T  1833571 ctattgaagctaaattcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccaccagattaggtcaaatt 1833670  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||          ||||||||||||||||||||||    | || |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  1833671 ggacc---------aaacaatctttggtgtgtttgtt----tattttctctctttatcttttgcttgtagttttgtgcttttcactttgattactag 1833754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13138193 - 13137903
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |    
T  13138193 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattga-aaaatggatagaaattagg-tcgttctttgtgagc 13138096  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||| || ||||  ||    
T  13138095 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgcatctctttgtaagaacacattgatagtggattgaagagagcaatctctcccctagagtaggtcatatt 13137996  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13137995 ggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgaggttttcactttgattactag 13137903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 23555484 - 23555204
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23555484 gaaacattgtaaacaccttgggtgaatgaaaattattgagtgtcttattctttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 23555385  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | || ||||||||    
T  23555384 ttgttgaaactaatttcttataactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctc-cccatagtaggtcaagtt 23555286  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcact 286  Q
    ||| ||||||| || |||| |  |||||| |||||||  ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23555285 ggatcgaactgagtaaacatttcttggtgcgtttgtt--tctcttctct--ctttatgttttgcttgtggttttgagcttttcact 23555204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13547302 - 13547090
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13547302 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 13547204  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  13547203 gaagctattttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 13547104  T
Q  206 gaactgggtcaaca 219  Q
    ||||||||| ||||    
T  13547103 gaactgggtgaaca 13547090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 41360864 - 41361148
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  41360864 gaaacatcgtaaacatcttgggtgagtgaaaat-attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagc 41360962  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||| |||| | || ||||  ||    
T  41360963 ttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattaaagagatcaatatctcccccatagtaggtcatatt 41361062  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  41361063 ggaccgaactaggtcaacaatatcttggtgtgtttgtt----tcttttctcactttatcttttgtttgtggttttgagctttttactttg 41361148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 19754443 - 19754676
Alignment:
Q  1 gaaacatt-gtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaa-tgggtagaaattagggttgttctttgtga 98  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19754443 gaaacattcgtaaacaccttgagagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgagaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtga 19754541  T
Q  99 acttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag 198  Q
     ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  19754542 gcttgttgaagctaatttcttgtaaccgatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccctcagattaggtcaag 19754641  T
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtt 233  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  19754642 ttggaccgaagtgggtcaacaatttttggtgtgtt 19754676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 211
Target Start/End: Original strand, 11348653 - 11348857
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11348653 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 11348751  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  11348752 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttctaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 11348851  T
Q  206 gaactg 211  Q
    ||||||    
T  11348852 gaactg 11348857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13549213 - 13549001
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13549213 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 13549115  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
     || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  13549114 aaacctaatttcatgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 13549015  T
Q  206 gaactgggtcaaca 219  Q
    ||||||||| ||||    
T  13549014 gaactgggtgaaca 13549001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 230
Target Start/End: Original strand, 19752643 - 19752864
Alignment:
Q  9 gtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattggg-aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttga 107  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19752643 gtaaacaccttgagagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgagtaaaatgggtagaaattagggttgttctttgcgagcttgttga 19752741  T
Q  108 agctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccga 207  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  19752742 agctaatttcttgtaaccgatttgtatctctttgtaagaactcattgatagaggattggagagatcaatctctctcccatattaggtcaagttggaccga 19752841  T
Q  208 actgggtcaacaatctttggtgt 230  Q
    ||| |||||||||||||| ||||    
T  19752842 actaggtcaacaatcttttgtgt 19752864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 37168252 - 37168465
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37168252 attgtaaacaccttgagagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 37168350  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggac 204  Q
     |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||    
T  37168351 taagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggac 37168450  T
Q  205 cgaactgggtcaaca 219  Q
    |||||||||| ||||    
T  37168451 cgaactgggtgaaca 37168465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 15820256 - 15820534
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  15820256 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttctttggtgatattggaaagatgggtaaaaattaggtttgttctttgtgagc 15820355  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||  ||||| || ||||||||    
T  15820356 ttgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatctctttttaagaactcattgatagtgcattgaagagataaatctctcatccagagtaggtcaagtt 15820455  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttc 283  Q
    ||| |||||| ||| |||| |  ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  15820456 ggatcgaactaggtaaacatttattggtgtgtttgtt--tctcttctctcc--ttatccattgcttgtgtttatgagcttttc 15820534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13316520 - 13316298
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactca 151  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||    
T  13316520 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 13316421  T
Q  152 ttgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctc 250  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  13316420 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttagtgagtttgtttctctcttctctc 13316321  T
Q  251 cctttatcttttgcttgtggttt 273  Q
    | ||||| |||||||||||||||    
T  13316320 cttttatattttgcttgtggttt 13316298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 42298188 - 42297971
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  42298188 attgtaaacaccttgggagagtaaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttttttgtgagcttgtt 42298090  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca-agttggac 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| || ||||  |||||||    
T  42298089 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcatggttggac 42297990  T
Q  205 cgaactgggtcaacaatct 223  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  42297989 cgaactgggtgaacaatct 42297971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 193566 - 193778
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||    
T  193566 attgtaaacaccttgggagggtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttattagcttgtt 193664  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||    
T  193665 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattggagagatcaatctcttctccagagtatgtcaagttggacc 193764  T
Q  206 gaactgggtcaaca 219  Q
    ||||||||| ||||    
T  193765 gaactgggtgaaca 193778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 29136202 - 29136415
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29136202 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 29136300  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggac 204  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| ||||||    
T  29136301 gaagctaatttcttggaacccatttgtatttctttgtaagaactcattgatcgtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 29136400  T
Q  205 cgaactgggtcaaca 219  Q
    |||||| ||| ||||    
T  29136401 cgaactaggtgaaca 29136415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 47255553 - 47255340
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47255553 attgtaaatgccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 47255455  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca-agttggac 204  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||  |||||||    
T  47255454 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggac 47255355  T
Q  205 cgaactgggtcaaca 219  Q
    |||||||||| ||||    
T  47255354 cgaactgggtgaaca 47255340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 16455585 - 16455859
Alignment:
Q  15 accttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  || ||||  |||| |||||||||||||||    
T  16455585 accttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggtaaaatggtgagaaattagattttttcta-gtgagcttgttgaagctaat 16455683  T
Q  115 ttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggt 214  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||| ||||||| ||||| ||    
T  16455684 ttcttgtaacccatttgtatctctgtgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccatagtcggtcaaattggaccaaactgtgt 16455783  T
Q  215 caacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttac 294  Q
     |||| |  ||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16455784 aaacatttcttggtgtatttgtt--tctcttctct--ctttatcttttacttgtggttttgagtttttcactttgattac 16455859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31925919 - 31925708
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttg 106  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  31925919 ttgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagagtggaaaaatgggtagaaattagggatgttcattgtgagcttgttg 31925821  T
Q  107 aagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccg 206  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| || ||||||||||||||    
T  31925820 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagttggaccg 31925721  T
Q  207 aactgggtcaaca 219  Q
    |||| ||| ||||    
T  31925720 aactaggtgaaca 31925708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37033286 - 37033068
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37033286 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 37033188  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca-agttgga 203  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||| | || ||||  ||||||    
T  37033187 gaagctaatttcttgtaatccattttgcatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagattaatctcttctccatagtaggtcatggttgga 37033088  T
Q  204 ccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  37033087 ccgaactgggtgaacaatct 37033068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7482445 - 7482231
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||   | ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7482445 attgtaaacaccttgggaaagtgaaaattcatgagtgtattgttcattggtgagattgggtaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 7482346  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggac 204  Q
     |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||    
T  7482345 taagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtgaattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcaagttggac 7482246  T
Q  205 cgaactgggtcaaca 219  Q
    |||||| ||| ||||    
T  7482245 cgaactaggtgaaca 7482231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 928190 - 927911
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||| ||||| ||||  | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  928190 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcaatgagtgtcttgttctttggtgatattggaaaaaatgatagaaattagggtttgttctttgtgagcttgtt 928091  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||  ||||   || |||||||| ||||    
T  928090 gaagctaatttcttgtaacccttttggatctctttgtaaaaactcattaatagtggattagagagaccaacctcttccccaaggtaggtcaagttagacc 927991  T
Q  206 gaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    ||||||||| |||| |  || |||||||||||  ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  927990 gaactgggtaaacatttctttgtgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatcttttgtttgtggttttgaacttttcactttg 927911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 47115126 - 47115340
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47115126 attgtaaacatcttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 47115224  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca-agttgga 203  Q
     |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| || ||||  ||||||    
T  47115225 taagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaaaaacccattgatagtggattggagagatcaatctctgctccagagtaggtcattgttgga 47115324  T
Q  204 ccgaactgggtcaaca 219  Q
    ||||||||||| ||||    
T  47115325 ccgaactgggtgaaca 47115340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 210
Target Start/End: Original strand, 34603530 - 34603735
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34603530 attgtaaacaccttgggaaagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgaaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 34603629  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggac 204  Q
     |||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||    
T  34603630 taagctaatttcttgtaacccattttttatctctttgtaagaactcattgatggtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggac 34603729  T
Q  205 cgaact 210  Q
    ||||||    
T  34603730 cgaact 34603735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 51765344 - 51765636
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattggga-aaatgggtagaaattagggttgttc-tttgtga 98  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| |||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  51765344 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgtaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtttgattgggagaaaagggtagaaattagggttgtacctttgtga 51765441  T
Q  99 acttgttgaagctaatttcttgtaattcattt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca 196  Q
    ||||||  |||||||||||||||||  | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || | ||    
T  51765442 acttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggaca 51765541  T
Q  197 ag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttg--ttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||   |||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  51765542 agtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtgg-tttgtgcttttcactttg 51765636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 37879124 - 37879008
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37879124 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 37879026  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaa 123  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37879025 gaagctaatttcttgtaa 37879008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20622406 - 20622218
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatc---tctttgtaagaac 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||  | ||||||||   | |||||||||||    
T  20622406 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttttgtaagaac 20622309  T
Q  149 tcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 237  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  20622308 tctttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 20622218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 56 - 268
Target Start/End: Original strand, 36683694 - 36683892
Alignment:
Q  56 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattga 155  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||          ||||||||||||||    
T  36683694 tgagattgggaaaataggtagaaattaggtttattctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttg----------taagaactcattga 36683783  T
Q  156 tagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttcctctcttctctccctt 254  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||  | ||||||||  |||    
T  36683784 tagtggattgtagaaatcaatctctcccccagagtaggtcaagttagaccgaactgagtaaac-atctcttggtgtgtttgtt--tgtcttctct--ctt 36683878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 9987202 - 9987373
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaagaactc 150  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||  | |||||||| |||| | ||||||||    
T  9987202 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgcaac-cttttgtatcccttttgcaagaactc 9987299  T
Q  151 attgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  9987300 attgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 9987373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 40282377 - 40282564
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaagaact 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||    
T  40282377 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 40282474  T
Q  150 cattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 237  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  40282475 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 40282564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 44650376 - 44650101
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaatta-gggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||   ||| |||||| || |||||||||||||  |||||    
T  44650376 ttgtaaacactttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggagagattgagaaaa-atgtaaaaattatggtttgttctttgtgagtttgtt 44650278  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggac 204  Q
     | |||||||| |||||| || ||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || | | || ||||| ||||||    
T  44650277 aacgctaatttattgtaaatcttttatatctctttgtaaataattcattaatagtggattgaagagatcaatctcttcccaaaagtaggtcaatttggac 44650178  T
Q  205 cgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcacttt 288  Q
    |||||| ||| || | | ||||||| ||||||       ||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  44650177 cgaactaggtaaatattttttggtgcgtttgt-------ttctctttctttatcttttgcttgtgattttgtgcttttcacttt 44650101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 9036417 - 9036603
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaagaact 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||    
T  9036417 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 9036513  T
Q  150 cattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 237  Q
    | |||||||||||||| ||||  |||||||||  | ||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  9036514 ctttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcgagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtatttgtt 9036603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 37282901 - 37282730
Alignment:
Q  10 taaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgttgaa 108  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||  |||||  |||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  37282901 taaacaccttgtatgagtgaaaaccattgagtgtcttgttcattggagagatt--gaaaaatggtataaattagggtttgttccttgtgagcttgttgaa 37282804  T
Q  109 gctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 181  Q
    |||||||| | ||||  | |||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  37282803 gctaatttatggtaacccttttgcatctctttgtaaagaactcattagtagtggattggagagataaatctctc 37282730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 57 - 181
Target Start/End: Original strand, 22079322 - 22079446
Alignment:
Q  57 gagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattga 155  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22079322 gagattggaaaaatgg-tagaaattatgtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaaccattttgtatctctttgtaaagaactcattga 22079420  T
Q  156 tagtggattggagagatcaatctctc 181  Q
    || |||||||||||||||||| ||||    
T  22079421 tattggattggagagatcaatttctc 22079446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 180
Target Start/End: Original strand, 6808479 - 6808581
Alignment:
Q  79 attagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatc 177  Q
    |||||| |||||||| | || |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6808479 attaggtttgttcttggagagcttgttgaagctaacttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcatttatagtggattggagagatcaatc 6808578  T
Q  178 tct 180  Q
    |||    
T  6808579 tct 6808581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 21053958 - 21054145
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaagaact 149  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||  | |||||||| |||| |||||||||    
T  21053958 ttggtgagattgggaaaa-gtgtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 21054055  T
Q  150 cattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 237  Q
    | |||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||    
T  21054056 ctttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 21054145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 275
Target Start/End: Original strand, 3460707 - 3460915
Alignment:
Q  64 ggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtgg 161  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  | ||||||| ||||||| ||||||  ||||||||| |    
T  3460707 ggaaaaagggtagaaattagagtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccttttgtatatctttgtaaagaacatattgatagtcg 3460806  T
Q  162 attggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttt 261  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||| || |||| || | ||| |||| |  ||  ||||||||||  ||||||||||  ||||||||||    
T  3460807 attggagagatcaatatct-tcctagagtaggtcaatttagaccaaattaggtaaacatttcttaatgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatcttt 3460901  T
Q  262 tgcttgtggttttg 275  Q
    || |||||||||||    
T  3460902 tgtttgtggttttg 3460915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 126 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 37876860 - 37876767
Alignment:
Q  126 catttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaaca 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||  |||||||| |||||||||||| ||||    
T  37876860 catttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattgcagagatcaatctctcctccagagtacatcaagttgaaccgaactgggtgaaca 37876767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 8871259 - 8871145
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| |||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |||    
T  8871259 ttgtaaacaccttggatgagcgaaaatcat--agtgtcttgttcttttgtgagatttggaaaatgg-tagaaattagggtttgttctttgtgagttcgtt 8871163  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaa 123  Q
    ||||||||||||||||||    
T  8871162 gaagctaatttcttgtaa 8871145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 44203631 - 44203804
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||| |||| |||| ||||    
T  44203631 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaaagaac 44203727  T
Q  149 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  44203728 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 44203804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 189
Target Start/End: Original strand, 13938143 - 13938273
Alignment:
Q  57 gagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaat-tcatttgtatctctttgtaagaa-ctcattg 154  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||  ||  |||||||||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13938143 gagattgggaaa-tgggtagaaattagg-ttgttcttggagaacttgtaaaatataatttcttgtaaccttttttgtatctctttgtaagaaactcattg 13938240  T
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagat 189  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  13938241 atagtggattggagagatc--tctctcccccagat 13938273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 129 - 219
Target Start/End: Original strand, 28242382 - 28242472
Alignment:
Q  129 ttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca-agttggaccgaactgggtcaaca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  28242382 ttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 28242472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 69 - 170
Target Start/End: Original strand, 32471478 - 32471579
Alignment:
Q  69 atgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaag-aactcattgatagtggattgga 167  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  32471478 atgggtataaattaggtttgttctttgagaact-gttgaagttaatttattgcaactcttttgtatctctttgtaagaaactcattgatagtggattcga 32471576  T
Q  168 gag 170  Q
    |||    
T  32471577 gag 32471579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19072976 - 19072907
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19072976 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctttctt 19072907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19120866 - 19120797
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19120866 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctttctt 19120797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 9109543 - 9109459
Alignment:
Q  97 gaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctct 180  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9109543 gaacttgttgaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaacacgttgatagtgtattggagagatcaatctct 9109459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 12318722 - 12318585
Alignment:
Q  20 gggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggt-gagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttct 118  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| | | || |||||||||||||||||||    
T  12318722 gggtgagtgaaa-tcattgagtttcttgttcatgggtagagatttggaaa-tgggtagaaattaggtttgttcatggagagcttgttgaagctaatttct 12318625  T
Q  119 tgtaattcatttgtatctctt-tgtaagaactcattgata 157  Q
    |||||    ||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  12318624 tgtaaccattttgtatgtcttctttaagaactcattgata 12318585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 281
Target Start/End: Original strand, 5459956 - 5460132
Alignment:
Q  102 tgttgaagctaatttcttgtaattcatttg-tatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca-ag 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||| ||  |||  |    
T  5459956 tgttgaagctaatttcttgtaa--cattttatatttctttgtaaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcatctagagtagatcattg 5460053  T
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttt 281  Q
    |||| | ||||| ||| |||| |  ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5460054 ttgggctgaactaggtaaacatttcttgttgtgtttgtt--tctattctct--ctttatcttttgcttgtggttttgtgcttt 5460132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 2263106 - 2263016
Alignment:
Q  89 ttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatct 178  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||  | ||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2263106 ttcttggtgagcttgttgaagataatttcttgtaacccttttatatctttttgtaaagaacttattgatagtggattgaagagatcaatct 2263016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Original strand, 26644946 - 26645016
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  26644946 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcctttctt 26645016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37069838 - 37069753
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgttcct 240  Q
    ||||||||| ||||||||   |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37069838 atagtggatcggagagatgc-tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcct 37069753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13598446 - 13598378
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  13598446 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctttctt 13598378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Original strand, 25652040 - 25652195
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgag-attgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 104  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| ||||||||  |  |  |||| |||| ||| ||||||||| |  |||| |||| ||  ||||    
T  25652040 attgtaaacaccttaagtgtgtgaaaatcattgagtattttgttcatgagaaaatattgagaaattgg-tagaaattaagtgtgttatttgagagtttgt 25652138  T
Q  105 tgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 160  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  25652139 tgaagctaatttcttgtaactctcttgtatctctttgtaaagaactctttgatagtg 25652195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 6398595 - 6398764
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggt-gagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  | ||| |||||||||| ||  |||||||||||| || |||||||||||| |||||||| | |||    
T  6398595 gaaacattgtaaacacctcacatgagtgaaaatctgtgagtttcttgttcatgggaagagattgggaaa-tgagtagaaattagg-ttgttcttggagaa 6398692  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaa-ctcattgatagtggattggagag 170  Q
    ||| |||| | ||||| ||| |   || || |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  6398693 cttattgaggttaattacttttttctctttagtatatctttgtaagaaactcattgatagtgaattggagag 6398764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 180
Target Start/End: Original strand, 2926516 - 2926637
Alignment:
Q  59 gattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaa-gaactcattgata 157  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||   ||||||||| ||| |||||| ||||||    |||| ||||||||| || ||| |||||| ||    
T  2926516 gattggaaaaatgg-tagaaattaggtttgtgcttgaagaacttgttaaagttaatttattgtaacctttttgcatctctttgaaacgaattcattggta 2926614  T
Q  158 gtggattggagagatcaatctct 180  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2926615 gtggattggagagatcaatctct 2926637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 9476329 - 9476241
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  9476329 atagtggattggagagctgc-tctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctttctt 9476241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 245
Target Start/End: Original strand, 47703965 - 47704053
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  47703965 atagtggattggagagctgc-tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgttttttcctttctt 47704053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 775739 - 775652
Alignment:
Q  156 tagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    ||||||||||||||| | | |||||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  775739 tagtggattggagagct-actctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatc-ttgatgtgtttgttcctttctt 775652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8871130 - 8871045
Alignment:
Q  152 ttgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || | |||||||||||||| || || |||| |  ||||| ||||||||    
T  8871130 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccatagtaggccaagttggaccgaattgagtaaacatttattggtatgtttgtt 8871045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16914338 - 16914234
Alignment:
Q  57 gagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaa-tttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattg 154  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| | |||||||| | || | |||||||||||| |||||| |||  | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16914338 gagattgggaaa-tgggtaaaaattatgtttgttcttggagagcctgttgaagctaagtttcttctaacccttttgtatctctttgtaaagaactcattg 16914240  T
Q  155 atagtg 160  Q
    ||||||    
T  16914239 atagtg 16914234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29651859 - 29651791
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  29651859 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaaaatc-ttggtgtgtttgttcctttctt 29651791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 44646875 - 44646743
Alignment:
Q  149 tcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctc 248  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  || | | || ||||| |||||||||||| ||| || | | ||||||| ||||||       |||||    
T  44646875 tcattaatagtggattgaagagatcaatctcttcccaaaagtaggtcaatttggaccgaactaggtaaatattttttggtgcgtttgt-------ttctc 44646783  T
Q  249 tccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcacttt 288  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  44646782 tttctttatcttttgcttgtgattttgtgcttttcacttt 44646743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Original strand, 47098873 - 47098941
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  47098873 tctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctttctt 47098941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Original strand, 47102890 - 47102958
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| || |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  47102890 tctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat-tttggtgtgtttgttcctttctt 47102958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Original strand, 16124565 - 16124628
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 240  Q
    |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  16124565 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 16124628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 245
Target Start/End: Original strand, 21536598 - 21536688
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| ||||||||| ||||  ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  21536598 atagtggattggagagctgc-tctctcccccagattaggtcattttttaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcctttctt 21536688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3281756 - 3281686
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  3281756 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatcttttgatgtgtttgttcctttctt 3281686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 4535629 - 4535527
Alignment:
Q  72 ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagag 170  Q
    ||||||||||| | |||||||| | || ||| ||||||  ||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||    
T  4535629 ggtagaaattaagtttgttcttggagagcttattgaagtcaatttcttgtaacatttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagttaagtggagag 4535530  T
Q  171 atc 173  Q
    |||    
T  4535529 atc 4535527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 240
Target Start/End: Original strand, 27104401 - 27104484
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 240  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| ||||||||| || |  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  27104401 atagtggattggagagctgc-tctctcccccagattaggttatattggaccgaactgtgtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 27104484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 157
Target Start/End: Original strand, 41135833 - 41135926
Alignment:
Q  65 gaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgata 157  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||   |||||| |||||| |||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  41135833 gaaaaagggtagaaattagatttgttcttgaagaactttttgaagttaatttcttgtaaaccttttgtatctatttgtaaagaactcgttgata 41135926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 44646997 - 44646881
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaatta-gggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||   ||| |||||| || |||||||||||||  |||||    
T  44646997 ttgtaaatactttggatgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggagagattgagaaaa-atgtaaaaattatggtttgttctttgtgagtttgtt 44646899  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaa 123  Q
     | |||||||| ||||||    
T  44646898 aacgctaatttattgtaa 44646881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12302551 - 12302507
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12302551 tctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 12302507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 167
Target Start/End: Original strand, 33775931 - 33776025
Alignment:
Q  74 tagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgt-atctctttgt-aagaactcattgatagtggattgga 167  Q
    ||||||||||| ||| |||| | |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||    
T  33775931 tagaaattaggattgctcttggagaacttcttgaagctaattttttgtaa-tcttttgtaatctctttgtaaagaacccatggataatggattgga 33776025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 240
Target Start/End: Original strand, 13604652 - 13604737
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgttcct 240  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| |||| |||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13604652 atagtggattggagagctgc-tctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcct 13604737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32889464 - 32889419
Alignment:
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32889464 ttggaccgaactagatcaacaatctt-ggtgtgtttgttcctctctt 32889419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Original strand, 777192 - 777225
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatc 34  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  777192 gaaacattgtaaacactttgggtgagtgaaaatc 777225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 164
Target Start/End: Original strand, 30670114 - 30670206
Alignment:
Q  73 gtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaat-tcatttgtatctctttgtaag-aactcattgatagtggatt 164  Q
    |||||||||||| ||||| || | ||| |||||||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  30670114 gtagaaattagg-ttgtttttggagaatttgttgaagctaattttttgtatcgtcttttgtatctctttgtaagaaagtcattgatactggatt 30670206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 1050606 - 1050503
Alignment:
Q  57 gagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattga 155  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||  ||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||| || ||||| ||||    
T  1050606 gagattgggaaa-tgggtgaaaattaggtgtgttcttcgagagcttattgaagctaatttcttgtaacatttttgtgtctctttgtaaataactcgttga 1050508  T
Q  156 tagtg 160  Q
    |||||    
T  1050507 tagtg 1050503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2510371 - 2510327
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2510371 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 2510327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 6823249 - 6823293
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6823249 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 6823293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10399874 - 10399830
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10399874 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 10399830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 13358808 - 13358852
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13358808 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 13358852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15294880 - 15294836
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15294880 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 15294836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17324682 - 17324638
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17324682 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 17324638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 24325898 - 24325942
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24325898 tctctcccccagactaagtcaattttgaccgaactgggtcaacaa 24325942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27336986 - 27336942
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27336986 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 27336942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28207114 - 28207070
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28207114 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 28207070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 28840914 - 28840958
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28840914 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 28840958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28998299 - 28998255
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28998299 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 28998255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29004015 - 29003971
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29004015 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 29003971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31735567 - 31735523
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31735567 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 31735523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 39462754 - 39462798
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39462754 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 39462798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 50307592 - 50307548
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50307592 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 50307548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 51750274 - 51750318
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51750274 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 51750318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 51752598 - 51752642
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51752598 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 51752642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 110)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 47674161 - 47673867
Alignment:
Q  2 aaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaact 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47674161 aaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaact 47674062  T
Q  102 tgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  47674061 tgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc-cccatattaagtcaagttg 47673963  T
Q  202 gaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  47673962 gaccgaactgaatcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgtacttttcactttgattactag 47673867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 3 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 14070050 - 14069756
Alignment:
Q  3 aacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaactt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14070050 aacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaactt 14069951  T
Q  103 gttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttgg 202  Q
    ||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  14069950 gtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaagttgg 14069851  T
Q  203 accgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14069850 accgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtccctctcttctctccctttatcttgtgcttgtggttttgagcttttcactttgattactag 14069756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 3 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 14380078 - 14379784
Alignment:
Q  3 aacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaactt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14380078 aacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaactt 14379979  T
Q  103 gttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttgg 202  Q
    ||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  14379978 gtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaagttgg 14379879  T
Q  203 accgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14379878 accgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtccctctcttctctccctttatcttgtgcttgtggttttgagcttttcactttgattactag 14379784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 27347766 - 27348054
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27347766 gaaacattgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggattgttctttgtgaac 27347865  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27347866 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgcagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 27347965  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  27347966 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctcactttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcactttg 27348054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 31733188 - 31732892
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31733188 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagactgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagc 31733089  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  31733088 ttggtgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatactggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaagtt 31732989  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  31732988 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgagtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttgattactag 31732892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 4586110 - 4586406
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4586110 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 4586209  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||    
T  4586210 ttgttgaagctaattttttgtaacccatttttatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattatgtcaactt 4586309  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4586310 ggaccgaactgggtcgacaatctttcgtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgtttgtggttttgtgcttttcactttgattactag 4586406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 43864193 - 43864481
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43864193 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaagtgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 43864292  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43864293 ttgttgaagctaatttcctgtaacccatttgtatctctttgtaaaaactaattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaggtcaagtt 43864392  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43864393 ggaccgaactgggtcaacaatagatggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttg 43864481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 47676355 - 47676059
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47676355 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcaatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaat 47676256  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  47676255 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcaatgatagtggaatggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagtt 47676156  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  47676155 ggaccgaactggatcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccatttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttgattactag 47676059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 48489380 - 48489668
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  48489380 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaaatgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgaaaac 48489479  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  48489480 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgcaataactcattcatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 48489579  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48489580 ggaccgaactgggtaaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctcgccctttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttg 48489668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 41317653 - 41317361
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41317653 gaaacattgtaaacaccttggatgagtgaaaatcattgagtctcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagc 41317554  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  41317553 ttgtcaaagctaatttcttgtaatccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 41317454  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41317453 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt----tctcctctctctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttgattactag 41317361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 26417265 - 26417553
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26417265 gaaacattgtaaacaccttgagcgggtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagc 26417364  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||    
T  26417365 ttgttgaagataatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctc-cccaggttaggtcaaatt 26417463  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26417464 ggaccaaactgggtcaacaatttcttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 26417553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 48491528 - 48491813
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48491528 gaaacattgtaaacactttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 48491627  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  48491628 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgaaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 48491727  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    || || |||| ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  48491728 gg-ccaaacttggtaaacaatctttgatgtgtttgttc--ctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcattttg 48491813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 8153291 - 8153575
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  8153291 gaaacattgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggttgttctttgtgaga 8153390  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  8153391 ttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 8153490  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8153491 ggactgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttatt--tctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 8153575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 38671441 - 38671147
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38671441 gaaacattgtaaacaccttgggtgagcgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagc 38671342  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||| |||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||| | || ||||||||    
T  38671341 ttgtttaagctaatttattgtaacacatttgtatcactttgtaagaactcattgatagtggattgaagagataaatctatcccccaaaataggtcaagtt 38671242  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38671241 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctcc--ttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttgattactag 38671147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 18126593 - 18126883
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18126593 gaaacattgtaaacaacttgggtgagtgaaaatcattgagtgttttgttcattggtgagattggaaaaatgtgtagaaattagggttgttctttgtgaac 18126692  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  18126693 ttgttcaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggaggaatcaatctctcccccagactaggtcaagtt 18126792  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctc--tcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18126793 tgaccgacctgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctattttctctccctttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttg 18126883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 41649229 - 41648944
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  41649229 gaaacattgtaaacaccttgggtaagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattggaaaaattggtagaaattaggtttgttctttgtgagc 41649130  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||| | |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  41649129 ttgttta-gctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaagtt 41649031  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41649030 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 41648944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 36146621 - 36146335
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||    
T  36146621 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtttgttatttgtgagcttgtt 36146522  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  36146521 gaagctaatttct-gtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatttgagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggacc 36146423  T
Q  206 gaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  36146422 gaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatcttttgcttgtggtttttagcttttcactttgattactag 36146335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 1113606 - 1113890
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  1113606 gaaacattgtaaacaacttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagc 1113705  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  1113706 ttgttgaagctaatttcttataacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagtt 1113805  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
     ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  1113806 tgaccgaattgagtcaacaatctttggtgtgtttgtttctct----tctccctttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcattttg 1113890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 23554989 - 23555278
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctttgtgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23554989 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaa 23555087  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag- 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||     
T  23555088 cttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtacctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagt 23555187  T
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||    
T  23555188 ttggaccgaactgggtgaacaatctttgatgtgtttgtttctctcttctctccttttatcttttgcttgtggtattgtgttttttactttg 23555278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 12098078 - 12097794
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  12098078 gaaacattgtaaacatcttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggttagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgagc 12097979  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||       ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  12097978 ttgttgaagttaatttcttgtaacccatttgtatctct-------aactctttg-tagtggattggagagatgaatctctcccccagattaggtcaagtt 12097887  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12097886 ggaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttgattactag 12097794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 35853864 - 35854153
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35853864 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaac 35853962  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-t 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||| |    
T  35853963 ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 35854062  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttcctctcttctctccc-tttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||    
T  35854063 tggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtgtttgtttctctcttctctcccttttatcttgtgcttgt-gttttatgcttttcactttg 35854153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 29991004 - 29991275
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  29991004 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa-ggatagaaattagggttgttatttgtgaac 29991101  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-t 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| |    
T  29991102 ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttctaataactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 29991201  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttt 273  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29991202 tggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatcttttgcttgtggttt 29991275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 19502127 - 19502424
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggt-agaaattagggttgttctttgtgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||||| ||||||| |||||||     
T  19502127 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgagaatcattgagtgtcttgttcagtggtgagattgcgaaaaaaggttagaaattaaggttgttttttgtgag 19502225  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag- 198  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||     
T  19502226 cttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaagtcaagt 19502325  T
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19502326 ttggaacgaagtgggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccctttattttgtgcttgtggttttgagtttttcactttgattactag 19502424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30024950 - 30024718
Alignment:
Q  2 aaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaact 101  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  30024950 aaacgttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgagct 30024851  T
Q  102 tgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||    
T  30024850 tgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatcactcccccagagtaggtcaagttg 30024751  T
Q  202 gaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgttt 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  30024750 gaccgaactggatcaacaatctttagtgtgttt 30024718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 31105612 - 31105327
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |    
T  31105612 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagattttttctttgtgagc 31105513  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||| ||  |||||||    
T  31105512 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctttttgtaagaactcattgatggtggattggagagataaatctctccccaagagtagatcaagtt 31105413  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatc-ttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||| |||| |  ||||| ||||||||  ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31105412 ggaccgaactgggtaaacatttcttggtctgtttgtt--tctcttctctcc--ttatctttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 31105327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2361185 - 2360960
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2361185 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 2361087  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  2361086 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatttgagatatcaatctctcccccagattaggtcaagttgaacc 2360987  T
Q  206 gaactgggtcaacaatctttggtgtgt 232  Q
    |||||||||||| || |||||||||||    
T  2360986 gaactgggtcaataacctttggtgtgt 2360960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 496202 - 495933
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  496202 gaaacattgtaaaaaccttgggtgagtgaaaatcatttagtgttttgttaatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtagttctttgtgagc 496103  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | || ||||||||    
T  496102 ttgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctctttataagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccctatagtaggtcaagtt 496003  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggtttt 274  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  496002 ggacagaaccgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt----tcttttctctctttatctcttgcttgtgatttt 495933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34310929 - 34310705
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34310929 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaaattgtt 34310831  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggac 204  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| ||||||    
T  34310830 gaagctaatttcttgtaacacatttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 34310731  T
Q  205 cgaactgggtcaacaatctttggtgt 230  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  34310730 cgaactgggtgaacaatctttggtgt 34310705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 78 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 2759339 - 2759128
Alignment:
Q  78 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatc 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2759339 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttatatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatc 2759240  T
Q  178 tctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgag 277  Q
    |||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  2759239 tcttccccagattaggtcaagttggaccgaacttggtcaacaatcattggtgtgtttctttctctcttctctccctttatcttttgcttatggttttgtg 2759140  T
Q  278 cttttcactttg 289  Q
    ||||| ||||||    
T  2759139 cttttaactttg 2759128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 22269931 - 22270166
Alignment:
Q  10 taaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaag 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22269931 taaacaccttgggagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaag 22270030  T
Q  110 ctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaac 209  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  22270031 ctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactgattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaac 22270130  T
Q  210 tgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22270131 tgggtgaac-atctcttggtgtgtttgttcctttctt 22270166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 4178724 - 4178995
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4178724 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaggtagaaattagggttgttctttgtgaac 4178822  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-t 199  Q
    |||   |||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||  |||||  | |||||| |    
T  4178823 ttgggaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattgaacagttcaatctctcctccagagcaggtcaagtt 4178921  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttt 273  Q
    || ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  4178922 tgaaccaaactaggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatattttgcttgtggttt 4178995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 287
Target Start/End: Original strand, 25615813 - 25616090
Alignment:
Q  2 aaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaact 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||    
T  25615813 aaacattgtaaacaccttgggtgagagaaaatcattgagtgtcttg----------agattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctatgtgcgct 25615902  T
Q  102 tgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-tt 200  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| || |||||| ||    
T  25615903 tgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcattttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttt 25616002  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttc-tctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactt 287  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  25616003 ggaccgaactgggcgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttcttctctctttatcttgtgcttgtggttttgtgcttttcactt 25616090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Original strand, 6431926 - 6432133
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  6431926 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggttagattgggaaaatgggtagaaattaggattgttctttgtgagcttgtt 6432024  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||    
T  6432025 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcaagttggacc 6432124  T
Q  206 gaactgggt 214  Q
    |||||||||    
T  6432125 gaactgggt 6432133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 48599547 - 48599335
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48599547 attgtaaacaccttggaggagtgaaaatcatgat-tgtcttgttcattggtgatattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 48599449  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |  ||||||||||||    
T  48599448 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttggaagagctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagcagatcaagttggacc 48599349  T
Q  206 gaactgggtcaaca 219  Q
    ||||||||| ||||    
T  48599348 gaactgggtgaaca 48599335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Original strand, 2390237 - 2390453
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2390237 attgtaaacaccttgggagagcgaaaatcat-aagtgtcttgttcattggtgaaattcgaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 2390335  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  2390336 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaataactcatatatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 2390435  T
Q  206 gaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||| ||| || |||||    
T  2390436 gaactaggtgaataatct 2390453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 3258949 - 3259162
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  3258949 attgtaaacaccttgggaaagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaactagggttgttctttgtgagcttgtt 3259048  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
     |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||| |||    
T  3259049 taagctaatttattgtaactcatttgtatctctttgtaaaaacccattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttgaacc 3259148  T
Q  206 gaactgggtcaaca 219  Q
    ||||||||| ||||    
T  3259149 gaactgggtgaaca 3259162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4508919 - 4508707
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  4508919 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttgattggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggttgttctttgtgagcttatt 4508821  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||| || || ||||||||||    
T  4508820 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgagagtggattggagagatcaatctcttcttcagagtaggttaagttggacc 4508721  T
Q  206 gaactgggtcaaca 219  Q
    ||||||||| ||||    
T  4508720 gaactgggtgaaca 4508707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 211
Target Start/End: Original strand, 29608691 - 29608896
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||| |   | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29608691 attgtaaacaccttgagagagcgaaacttcatgagtgtcttgttctttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 29608790  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||| || |||||||||||||    
T  29608791 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatcactcctccagagtaggtcaagttggacc 29608890  T
Q  206 gaactg 211  Q
    ||||||    
T  29608891 gaactg 29608896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23565274 - 23565012
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaa--tgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  23565274 ttgtaaacaccttgggtgagtgaa---catgaagtgtcttgttcattggtgagattaggaaaaaataggtagaaattaggtcttgttctttgtgagcttg 23565178  T
Q  104 ttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttgga 203  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  23565177 ttgaaactaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcctagagtaggtcaagttgga 23565078  T
Q  204 ccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggtttt 274  Q
    | ||||||| | | || |  ||||||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  23565077 ctgaactgg-taatcatttcttggtgtgtttgtt--tctcttctcta--tttatcttttgcttgtggtttt 23565012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 25767176 - 25766923
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25767176 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg---agattggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaac 25767081  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaa-ttcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag- 198  Q
    ||||  |||||||||||||||||   | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||||||     
T  25767080 ttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagt 25766981  T
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttcctctcttctctcccttt 255  Q
    || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25766980 ttagaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtgtttgtttctctattctctcccttt 25766923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 48408752 - 48409044
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  48408752 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattaatgttgttctttgtaaac 48408850  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaa-ttcatttgtatctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag 198  Q
    ||||  |||||||||||||||||   | |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| || ||||||    
T  48408851 ttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgaaataactcattgatagtggattggagagtttaatctctcctccagagtatgtcaag 48408950  T
Q  199 -ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttcctctcttctctccc-tttatc-ttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
     || ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  48408951 tttagaccgaactgggtgaacaatttcttggtgtgtttgtttctctcttctctcccttttatctttttgcttgt-gatttgtgcttttcactttg 48409044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 39731326 - 39731608
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||       |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39731326 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattggaaaaa-gggtagaaattagggttgttctttgtgaac 39731416  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag- 198  Q
    ||||   | |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||||||     
T  39731417 ttgtcagatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagt 39731516  T
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttg--ttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||   |||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  39731517 ttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtgg-tttgtgcttttcactttg 39731608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 125 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 24525597 - 24525430
Alignment:
Q  125 tcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  24525597 tcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaagttggacggaactgggtcaataatctt 24525498  T
Q  225 tggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttacta 296  Q
    |||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24525497 tggtgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttgattacta 24525430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8359530 - 8359316
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8359530 attgtaaacaccttgagagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggggagattgggaaaatgggtagaaattagggtttttctttgtgagcttgtt 8359432  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca-agttgga 203  Q
     || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||  ||||||    
T  8359431 taaactaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttgga 8359332  T
Q  204 ccgaactgggtcaaca 219  Q
    ||||||||||| ||||    
T  8359331 ccgaactgggtgaaca 8359316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 4253742 - 4253477
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4253742 ttgtaaacaccttaggtgagtgaaaatcattgagtttcttgttcattggtgaaattggtaaaatgg-tagaaattagggtttgttctttgtgagcttgtt 4253644  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggac 204  Q
    |||||||||||| |||||  | ||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||| ||||||    
T  4253643 gaagctaatttcatgtaacccttttatatctctttggaaagaactcattgataatggattagagagatcaatctctcccacagagtaggtcaatttggac 4253544  T
Q  205 cgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttg 275  Q
    |||||| ||| |||| |  ||||||||||||||  ||||||| ||  ||||||| |||||||||| |||||    
T  4253543 cgaactaggtaaacatttcttggtgtgtttgtt--tctcttcact--ctttatcgtttgcttgtgcttttg 4253477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 162
Target Start/End: Original strand, 31518745 - 31518905
Alignment:
Q  2 aaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaact 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  31518745 aaacatcgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcatcgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaataggtagaaattaggtttgttctttgtgagct 31518844  T
Q  102 tgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtgga 162  Q
    | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31518845 tattgaagctagtttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgacagtgga 31518905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4510761 - 4510549
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||    
T  4510761 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgccttgttgattggtgagatttggaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagtttatt 4510663  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    ||| || |||||||||||||    
T  4510662 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttataagaactcattgatagtggattgaagaaatcaatctctcctgtagagtaggtcaagttggacc 4510563  T
Q  206 gaactgggtcaaca 219  Q
    | ||||||| ||||    
T  4510562 gtactgggtgaaca 4510549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4512603 - 4512391
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||    
T  4512603 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgccttgttgattggtgagatttggaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagtttatt 4512505  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    ||| || |||||||||||||    
T  4512504 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttataagaactcattgatagtggattgaagaaatcaatctctcctgtagagtaggtcaagttggacc 4512405  T
Q  206 gaactgggtcaaca 219  Q
    | ||||||| ||||    
T  4512404 gtactgggtgaaca 4512391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 274
Target Start/End: Original strand, 31518911 - 31519121
Alignment:
Q  60 attgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagt 159  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31518911 attgggaaaataggtagaaattaggtttgttctctgtgagcttattgaagctagtt-cttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgacagt 31519009  T
Q  160 ggattggagagatcaatctctct-cccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatc 258  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| | |||| |  ||||||||||||||  |||||||| |  |||||||    
T  31519010 ggattggagagatcaatctctctccccagagtaggtcaagttggaccgaactggataaacatttcttggtgtgtttgtt--tctcttcttt--ctttatc 31519105  T
Q  259 ttttgcttgtggtttt 274  Q
    ||||||||||| ||||    
T  31519106 ttttgcttgtgctttt 31519121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 23343934 - 23344206
Alignment:
Q  11 aaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttg-ttctttgtgaacttgttgaag 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||    
T  23343934 aaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtctagttcattggtgagatttggaaaa-gggtagaaattaaggtttattctttgtgagcttgttgaag 23344032  T
Q  110 ctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaac 209  Q
    ||||||||||||||  | || |||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||  ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23344033 ctaatttcttgtaaccctttagtatatctttgtgagaactcattgataatagattggagaaattaa--tctctcccagagtaggtcaagttggaccgaac 23344130  T
Q  210 tgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
      ||| |||| |  ||||||||| ||||  ||||||||||  |||||||| || |||| ||||||| | |||||||||||    
T  23344131 aaggtaaacatttcttggtgtgtatgtt--tctcttctct--ctttatctctttcttgcggttttgtgtttttcactttg 23344206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 84 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 32358190 - 32358055
Alignment:
Q  84 ggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctc 183  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  32358190 ggttgtgctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcct 32358091  T
Q  184 ccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaaca 219  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  32358090 ccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 32358055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 36574728 - 36574453
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||| ||||||| ||||| ||||||||| |||  ||||||||||| | || |||||||||||  |||||    
T  36574728 ttgtaaacaccttaggtgagtgaaaattatcgagtgtcttgtttattggagagattggggaaa--ggtagaaattaagatttgttctttgtgagtttgtt 36574631  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggac 204  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || || ||| || ||||| ||||||    
T  36574630 gaagctaatttcttgtaacccttttatatctctttgtaaagaactcattgatagtggtttggagagatcaatccatc-cctagagtaggtcaatttggac 36574532  T
Q  205 cgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactt 287  Q
    | |||||||| |||| |  ||| ||||||||||  | ||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  36574531 caaactgggtaaacatttcttgatgtgtttgtt--tttcttctct--ctttatctttttcttgtggttttgtgtttttcactt 36574453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 4538759 - 4538627
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  4538759 gaaaaattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttatgaaa 4538660  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgta 133  Q
    || || |||||||||||||||||  ||||||||    
T  4538659 ttttttaagctaatttcttgtaacccatttgta 4538627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 43504323 - 43504082
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattc-atttgtatctc-tttgtaagaact 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  43504323 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaact 43504225  T
Q  150 cattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttg--ttcctctctt 245  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| | || |||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||  |||||||       
T  43504224 cattgatagtgaattggagagttcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcctcttcc 43504125  T
Q  246 ctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||    
T  43504124 ctctccttttatcttgtgcttgt-gttttatgcttttcactttg 43504082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 24526116 - 24525985
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-gttgttctttgtgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||     
T  24526116 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaaattgggaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgag 24526017  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttg 131  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  24526016 cttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttg 24525985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 95 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6360077 - 6359951
Alignment:
Q  95 gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagt 194  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||    
T  6360077 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagttgattggagagatcaatctcttccccatattaggt 6359978  T
Q  195 caagttggaccgaactgggtcaacaat 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6359977 caagttggatcgaactgggtcaacaat 6359951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22328611 - 22328395
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgtt----cattggtgagattgggaa-aatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaa 99  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||| ||| |||||||    |||| | ||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||||||||     
T  22328611 attgtaaacaccttgagggaatgaaaatcattgagtgtcttgtttgttcattagagagattgggaagaaaggttagaaattagagtttgttctttgtgag 22328512  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca-a 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||| || ||||      
T  22328511 cttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgcaaggaagtcattaatagtggatttgagagatcaatctctcccctagagtaggtcatt 22328412  T
Q  198 gttggaccgaactgggt 214  Q
    |||||||||||||||||    
T  22328411 gttggaccgaactgggt 22328395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 20343897 - 20344068
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaagaact 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||    
T  20343897 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 20343993  T
Q  150 catt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20343994 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaacaatct 20344068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 245
Target Start/End: Original strand, 30814530 - 30814628
Alignment:
Q  146 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  30814530 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaat-tttggtgtgtttgttcctttctt 30814628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 24789841 - 24790028
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcattt-gtatctcttt-gtaagaac 148  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||| |||| |||    
T  24789841 ttggtaagattgggaaaa-gggtaaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaa--cattttgtatcccttttgtaaaaac 24789937  T
Q  149 tcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 237  Q
    || |||||||||||||||||||  | |||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  24789938 tctttgatagtggattggagagtactatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 24790028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 2761521 - 2761439
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattag 83  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2761521 gaaacattgtaaacacattgggtgagtgaaaatcatcgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattag 2761439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3904830 - 3904624
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagg-gttgttctttgtgaacttgt 104  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||| | ||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| || | | |    
T  3904830 ttgtaaacaccttgggcgagtg-aaatcattgagtctcttgttcttaggaagagattgggaaaat-ggtagaaattaggttttgttctttgagagcctat 3904733  T
Q  105 tgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca-agttgg 202  Q
    ||||  |||||||||||||  | |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| | |||| || ||||  |||||    
T  3904732 tgaatgtaatttcttgtaacacttttgcatctctttgtaaagaactcattgatagt-gatcagagagatcaatctctccctcagagtaggtcattgttgg 3904634  T
Q  203 accgaactgg 212  Q
    ||||||||||    
T  3904633 accgaactgg 3904624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6592509 - 6592336
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctc-tttgt-aagaac 148  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||  |  ||||||| | ||||| ||||||    
T  6592509 ttggtgagattgggaaa-tgggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaaagaac 6592413  T
Q  149 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6592412 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 6592336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18388929 - 18388756
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||| |||| |||| ||||    
T  18388929 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaaagaac 18388833  T
Q  149 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  18388832 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 18388756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18392365 - 18392192
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||| |||| |||| ||||    
T  18392365 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaaagaac 18392269  T
Q  149 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  18392268 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 18392192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 24514979 - 24514912
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaa 69  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24514979 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa 24514912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 186
Target Start/End: Original strand, 5116625 - 5116739
Alignment:
Q  73 gtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagaga 171  Q
    |||||||||||| |||||||| |  |  ||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  5116625 gtagaaattaggtttgttcttggatagtttgttgaagataatttattgtaaaccttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtgaattggagaga 5116724  T
Q  172 tcaatctctctccca 186  Q
    | |||||||| ||||    
T  5116725 taaatctctccccca 5116739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6594727 - 6594554
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||| |||| |||| ||||    
T  6594727 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaaagaac 6594631  T
Q  149 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt-ggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6594630 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 6594554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 5514222 - 5514113
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaatta-gggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||| | |||| | |||||||||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  5514222 ttgtaaacaccttcgatgagtgaaaatcattgagtttcttgttcatttgagagatt-gaaaaaagagtagaaattatgttttgttctttgtgagcttgtt 5514124  T
Q  106 gaagctaattt 116  Q
    |||||||||||    
T  5514123 gaagctaattt 5514113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 32060493 - 32060318
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctc---tttgtaa-ga 146  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||| |   ||||||| ||    
T  32060493 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccctttttgtaaaga 32060397  T
Q  147 actcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  32060396 actcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaatct 32060318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 1360361 - 1360226
Alignment:
Q  11 aaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaag 109  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||| ||  |||| | |||||||||||||    
T  1360361 aaacacctttggtgagtgaaa-tcattgagtctcttgttcatggaatgagattgggaaaaagg-tagaaattaggttttgtcttggagaacttgttgaag 1360264  T
Q  110 ctaatttcttgtaa--ttcatttgtatctctttgtaag 145  Q
    | ||||||||||||   |  ||||||||||||||||||    
T  1360263 cgaatttcttgtaacccttttttgtatctctttgtaag 1360226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1560749 - 1560647
Alignment:
Q  138 tttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgttt 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||    
T  1560749 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtaaccaatctcttggtgtattt 1560650  T
Q  235 gtt 237  Q
    |||    
T  1560649 gtt 1560647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29159871 - 29159783
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29159871 atagtggattggagagctgc-tctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctctt 29159783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Original strand, 9190057 - 9190125
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| |||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9190057 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctctt 9190125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20284137 - 20284069
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20284137 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctttctt 20284069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2580438 - 2580370
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| |||||| || ||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2580438 tctctcccccagactaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctctt 2580370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 219
Target Start/End: Original strand, 18396393 - 18396486
Alignment:
Q  128 tttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaa-gttggaccgaactgggtcaaca 219  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  18396393 tttgtatctctttataaagaattcattgatagaggattggagagatcaatctctcctcaagagtaggtcaatggtggaccgaactgggtaaaca 18396486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 43363622 - 43363518
Alignment:
Q  72 ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctc--tttgt-aagaactcattgatagtggattggag 168  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| | ||||     
T  43363622 ggtagaaattaggtttgttcttggagagcttgttgaaactaatttattgtaactcttttgtatctctatttgtaaataactcattgatagtgaagtggat 43363523  T
Q  169 agatc 173  Q
    |||||    
T  43363522 agatc 43363518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Original strand, 46516359 - 46516427
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  46516359 tctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctttctt 46516427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 1562173 - 1562103
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaa 123  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1562173 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa 1562103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 30843445 - 30843389
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattg 63  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  30843445 ttgtaaacaccttagatgagttaaaatcattgagtatcttgttcattggagagattg 30843389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 240
Target Start/End: Original strand, 4796718 - 4796779
Alignment:
Q  178 tctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 240  Q
    |||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  4796718 tctcccccagattaggtcattttggaccgaactgggttaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 4796779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 245
Target Start/End: Original strand, 5817341 - 5817387
Alignment:
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5817341 ttggaccgaactgagttaacaatctttggtgtgtttgttcctttctt 5817387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 55989 - 55933
Alignment:
Q  183 cccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 240  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  55989 cccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatc-ttggtgtgtttgttcct 55933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Original strand, 33332499 - 33332567
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| ||||||||| ||||  || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  33332499 tctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctttctt 33332567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 47263725 - 47263664
Alignment:
Q  177 ctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgtt 237  Q
    ||||| |||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47263725 ctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgtt 47263664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21983352 - 21983285
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21983352 atagtggattggagagctgc-tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 21983285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21988948 - 21988893
Alignment:
Q  184 ccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 240  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21988948 ccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc-tcggtgtgtttgttcct 21988893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 42331041 - 42330997
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42331041 tctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 42330997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 35960864 - 35960803
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttc 238  Q
    |||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  35960864 tctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactcggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttc 35960803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 240
Target Start/End: Original strand, 44848713 - 44848798
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgttcct 240  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| ||||| ||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  44848713 atagtggattggagagctgc-tctctcccccaggttaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtatgttcct 44848798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 160
Target Start/End: Original strand, 27073868 - 27073925
Alignment:
Q  104 ttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 160  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  27073868 ttgaagttaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcgttgacagtg 27073925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 27204445 - 27204388
Alignment:
Q  104 ttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 160  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  27204445 ttgaagttaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcgttgacagtg 27204388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1049340 - 1049296
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1049340 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 1049296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2479375 - 2479323
Alignment:
Q  186 agattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgtt 237  Q
    |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2479375 agattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgtt 2479323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 3035969 - 3036013
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3035969 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 3036013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 7472024 - 7471980
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7472024 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 7471980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 245
Target Start/End: Original strand, 9185237 - 9185280
Alignment:
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  9185237 ttggaccgaactgggtcaacaatctt---ggtgtttgttcctctctt 9185280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 11759372 - 11759416
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11759372 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 11759416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13099518 - 13099474
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13099518 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 13099474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 20299705 - 20299749
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20299705 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 20299749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 20626283 - 20626327
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20626283 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 20626327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 20630174 - 20630218
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20630174 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 20630218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 20642593 - 20642637
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20642593 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 20642637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 38394231 - 38394275
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38394231 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 38394275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 275
Target Start/End: Original strand, 40808734 - 40808807
Alignment:
Q  198 gttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttg 275  Q
    |||||||||||||| || || | | |||||||||||||||    |||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  40808734 gttggaccgaactgagtaaatattttttggtgtgtttgtt----tcttttctctctatatcttttgcttgtggttttg 40808807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 40836787 - 40836743
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40836787 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 40836743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 40946573 - 40946617
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40946573 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 40946617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 44724824 - 44724868
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44724824 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 44724868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 48457898 - 48457942
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48457898 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 48457942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 67)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 9183250 - 9182962
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9183250 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaat 9183151  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  9183150 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagattatgtcaagtt 9183051  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9183050 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtccctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgtacttttcactttg 9182962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 33211404 - 33211120
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  33211404 gaaacattgtaaacaccttgggtcactgaaaatcattgagtgttttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattatggttgttctttgtgagc 33211305  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  33211304 ttgatgaagttaatttcttgtagctcatttgtatctctttgtaagaactcatttataatggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaagtt 33211205  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  33211204 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtatgtttgtt--tctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgtgattttcactttg 33211120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5406417 - 5406146
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5406417 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaac 5406320  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-t 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| |    
T  5406319 ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 5406220  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttt 273  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5406219 tgaaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatcttttgtttgtggttt 5406146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5410742 - 5410471
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5410742 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaac 5410645  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-t 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| |    
T  5410644 ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 5410545  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttt 273  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5410544 tgaaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatcttttgtttgtggttt 5410471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 31404891 - 31404621
Alignment:
Q  2 aaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaact 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31404891 aaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatcagtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaact 31404794  T
Q  102 tgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-tt 200  Q
    |||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || | |||| ||    
T  31404793 tgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggccaagttt 31404694  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttt 273  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31404693 ggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatcttttgcttgtggttt 31404621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 28137627 - 28137341
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28137627 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagc 28137528  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  28137527 ttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatttctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaagtt 28137428  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||| || || |||| |  ||||| |||||  |  | |||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28137427 ggaccgaattgtgtgaacatttcttggtatgttttgttttatct--tctccctttatcttttgcttgtggttatgtgcttttcactttg 28137341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5413611 - 5413341
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  5413611 gaaacattgtaaacacattgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggttgttctttgcgaac 5413514  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-t 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| |    
T  5413513 ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 5413414  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttt 273  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5413413 tggaccgaact-ggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatcttttgcttgtggttt 5413341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 26954504 - 26954221
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |    
T  26954504 gaaacattgtaaacacctttggggagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatatgtgagattgggaaattgg-tataaattagggttgttctttgtgagc 26954406  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||    
T  26954405 ttgttgaagctaatttcttgtaactcatctgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtcaagtt 26954306  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||  |||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  26954305 ggaccgaactaggtcaacaatctttggtgactttgtt--tctcttctct--ctttacatttttcttgtggttttgtgcttttcactttg 26954221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 33160572 - 33160273
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaa-tcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctttgtga 98  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||    
T  33160572 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagagttgttctttgtga 33160474  T
Q  99 acttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag 198  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  |||||    
T  33160473 acttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatggtggattggagagatcaatctctcctccagagtatttcaag 33160374  T
Q  199 -ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctcc-ctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttacta 296  Q
     ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  33160373 tttggaccaaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctcctttttatcttttgtttgtggttttgtgcttttcactttgattacta 33160274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16452548 - 16452259
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagggttgttctttgtgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16452548 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaa 16452450  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagt 199  Q
    |||||  |||||||||||||||||  | ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||||    
T  16452449 cttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttcatatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagt 16452350  T
Q  200 t-ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttat-cttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16452349 ttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatatttttgcttgtgg-tttgtgcttttcactttg 16452259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 30834755 - 30834482
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagggttgttctttgtgaa 99  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30834755 gaaacattgtaaacacctcgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaa 30834657  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag- 198  Q
    |||||  |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||||||     
T  30834656 cttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagt 30834557  T
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttt 273  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  30834556 ttggaccgaactgggtgaataatctttggtgtgtttgtttatctcttctctccttttatattttgcttgtggttt 30834482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 21593619 - 21593831
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21593619 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 21593717  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  21593718 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 21593817  T
Q  206 gaactgggtcaaca 219  Q
    ||||||||| ||||    
T  21593818 gaactgggtgaaca 21593831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 2171749 - 2171480
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2171749 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaac 2171651  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-t 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||| |    
T  2171650 ttgtcaaagctaatttcttgtaa-ccctttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 2171552  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttcctctcttctctccc-tttatcttttgcttgtg 269  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  2171551 tggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtatttgtttatctcttctctcccttttatcttgtgcttgtg 2171480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 16568992 - 16569257
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||          |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  16568992 gaaacattgtaaacaccttgggtaagtgaaaatcattgagtgtcttg----------agattgagaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgag 16569081  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagt 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  16569082 cttgtttaagctaatttcttgtaac------------ctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagattaggtcaagt 16569169  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16569170 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 16569257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 2973152 - 2972940
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2973152 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-aagtgtcgtgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtt 2973054  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| || |||||||| ||||    
T  2973053 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcaagagtaggtcaagttcgacc 2972954  T
Q  206 gaactgggtcaaca 219  Q
    ||||| ||| ||||    
T  2972953 gaactaggtgaaca 2972940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 43 - 219
Target Start/End: Original strand, 21588922 - 21589098
Alignment:
Q  43 tcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21588922 tcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt 21589021  T
Q  143 aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaaca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21589022 aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtgaaca 21589098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 3039122 - 3038851
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  3039122 gaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgaatgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcattgtgagc 3039023  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||             
T  3039022 tttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttaatagtggattggagagattaatctctcccccagatta--------- 3038932  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttacta 296  Q
               ||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  3038931 -----------ggtcaacaatctttggtgtgtttgtt----tcttttctctctttatcttttgcttgtggttttgaacttttcactttgattacta 3038851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26830337 - 26830124
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  26830337 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattgggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 26830239  T
Q  105 tgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggac 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | || |||||||| |||    
T  26830238 tgaagctaatttcttgtaatccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaagtttgac 26830139  T
Q  205 cgaactgggtcaaca 219  Q
     ||||||||| ||||    
T  26830138 tgaactgggtgaaca 26830124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3808922 - 3808704
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3808922 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcac-aagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 3808824  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttgga 203  Q
    ||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||| | |||||    
T  3808823 gaaactaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcatgattgga 3808724  T
Q  204 ccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||||| ||| ||||||||    
T  3808723 ccgaactaggtgaacaatct 3808704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 5043582 - 5043795
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5043582 attgtaaacaccttgtgagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattcgtgagattgagaaaatgagtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtt 5043680  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca-agttggac 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| | || ||||  |||||||    
T  5043681 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcattgttggac 5043780  T
Q  205 cgaactgggtcaaca 219  Q
    |||||||||| ||||    
T  5043781 cgaactgggtgaaca 5043795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 603293 - 603085
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||        |||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  603293 attgtaaacaccttgggatagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattggg--------tagaaatttgtgttgttctttgtgagcttgtt 603203  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  603202 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagaaatcaatctctccccaagattaggtcaagttggacc 603103  T
Q  206 gaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||||||||||||||||    
T  603102 gaactgggtcaacaatct 603085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 17762944 - 17763158
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17762944 attgtaaacactttgagagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 17763043  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggac 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||  ||||| ||||||    
T  17763044 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctttttggaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagatcaagtttggac 17763143  T
Q  205 cgaactgggtcaaca 219  Q
    |||||| ||| ||||    
T  17763144 cgaactaggtgaaca 17763158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 43 - 179
Target Start/End: Original strand, 17758014 - 17758150
Alignment:
Q  43 tcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt 142  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  17758014 tcttcttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgt 17758113  T
Q  143 aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17758114 aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctc 17758150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 22425041 - 22424865
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||   | ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22425041 attgtaaacactttgggagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcgttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 22424942  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattca--tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 181  Q
     |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22424941 taagctaatttcttgtaacccatttttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctc 22424865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 128 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5409161 - 5409016
Alignment:
Q  128 tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5409161 tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact-ggtgaacaatctttg 5409063  T
Q  227 gtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttt 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5409062 gtgtgtttgtttctctcttctctccttttatcttttgcttgtggttt 5409016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 275
Target Start/End: Original strand, 4045378 - 4045637
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  4045378 ttgtaaacacctagggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgtttattggagagattgggaaaat-ggtagaaattagggtttgttctttatgagcttgtt 4045476  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggac 204  Q
    |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    ||||  || |||||    
T  4045477 gaagctaatttcttgtaatcattttatatctctttgtaaataactcattgatagtggattggagagatcaatttctacccca----aagt--aggtggac 4045570  T
Q  205 cgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttg 275  Q
    |||||| ||| | || |  ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||    
T  4045571 cgaactaggtaagcatttcttggtgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatcttttactcgtggttttg 4045637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 52 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3072928 - 3072689
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcattt-gtatctcttt-gtaagaact 149  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||    
T  3072928 ttggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaact 3072830  T
Q  150 cattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttg--ttcctctctt 245  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||  |||||||       
T  3072829 cattgatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcctcttcc 3072730  T
Q  246 ctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactt 287  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  3072729 ctctccttttatcttgtgcttgt-gttttatgcttttcactt 3072689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 412101 - 412290
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcattt-gtatctcttt-gtaagaact 149  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |  || |||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||    
T  412101 ttggtgagattgggaaaaagg-tagaaattagggttgttcattgtgaacttatcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaact 412199  T
Q  150 cattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtgtgtttgtt 237  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  412200 cattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgtt 412290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6097651 - 6097431
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||     |||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  6097651 gaaacatggtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagt-----gtt--ttggtgagattggaaaaatgg-tagaaattaggattgttctttgtgaac 6097561  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-t 199  Q
    ||||  || |||||||||||||| || ||||||          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||| |    
T  6097560 ttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgta----------agaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 6097471  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtgtgtttgtt 237  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  6097470 tggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgtt 6097431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 27647861 - 27648032
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaagaact 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||    
T  27647861 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 27647957  T
Q  150 cattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    | |||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  27647958 ctttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtagatcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 27648032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 16554869 - 16555057
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaagaact 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||    
T  16554869 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 16554965  T
Q  150 catt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt-ggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtgtgtttgtt 237  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||| | || |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  16554966 catttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgtt 16555057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16578686 - 16578498
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaagaact 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||  |||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||    
T  16578686 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 16578590  T
Q  150 catt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt-ggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtgtgtttgtt 237  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  16578589 catttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgtt 16578498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 16616694 - 16616882
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaagaact 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||  |||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||    
T  16616694 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 16616790  T
Q  150 catt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtgtgtttgtt 237  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  16616791 catttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgtt 16616882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 16631425 - 16631613
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaagaact 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||    
T  16631425 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 16631521  T
Q  150 catt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt-ggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtgtgtttgtt 237  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||| | || |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  16631522 catttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgtt 16631613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 16653112 - 16653300
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaagaact 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||    
T  16653112 ttggtgagattgggaaaa-gggtaaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 16653208  T
Q  150 catt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtgtgtttgtt 237  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  16653209 catttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgtt 16653300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 95 - 212
Target Start/End: Original strand, 26800630 - 26800748
Alignment:
Q  95 gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcattt-gtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaag 193  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |    
T  26800630 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactaattttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 26800728  T
Q  194 tca-agttggaccgaactgg 212  Q
    |||  |||||||||||||||    
T  26800729 tcattgttggaccgaactgg 26800748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 181
Target Start/End: Original strand, 25073528 - 25073698
Alignment:
Q  11 aaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtg-agattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaag 109  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||  ||||||| ||||||||||  || ||||| |||| |||||| |||    
T  25073528 aaacatcttgggtgagtgaaa-tcattgagtatcttgttcatgggaggagattgaaaaaatgg-tagaaattagatttattcttcgtgagcttgttaaag 25073625  T
Q  110 ctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 181  Q
    ||| ||| ||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  25073626 ctattttattgtaacccttttgtatctctatgtaaagaactcattgatagtggattagagaaatcaatctctc 25073698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 6027246 - 6027419
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||| |||| |||| ||||    
T  6027246 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaaagaac 6027342  T
Q  149 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6027343 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtatgtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 6027419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 25421305 - 25421478
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||| |||| |||| ||||    
T  25421305 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaaagaac 25421401  T
Q  149 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  25421402 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 25421478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 16567155 - 16567265
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-gttgttctttgtgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||          ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||     
T  16567155 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtct----------tgagattgggaaaatggttagaaattaggttttgttttttgtgag 16567244  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttg 120  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  16567245 cttgtttaagctaatttcttg 16567265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 240
Target Start/End: Original strand, 5757507 - 5757592
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgttcct 240  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5757507 atagtggattggagagctgc-tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcct 5757592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31979561 - 31979496
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctct 242  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31979561 tctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctct 31979496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 199 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14521699 - 14521612
Alignment:
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||| |||||||| | | ||||||||||| ||    |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14521699 ttggaccgaactaggtcaacattttcttggtgtgtttatt----tcttttctcactttatcttatgcttgtggttttgagcttttcactttg 14521612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Original strand, 10077214 - 10077282
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  10077214 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctttctt 10077282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 31936635 - 31936567
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    ||||||||||||| || ||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  31936635 tctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctatctt 31936567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 13153913 - 13154087
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  | |||||||||||||||||  |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  13153913 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 13154010  T
Q  149 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  13154011 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 13154087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33342275 - 33342101
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgta-tctctttgtaa-gaac 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  | |||||||||||||||||  |  ||||| ||  ||||||| ||||    
T  33342275 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtactccttttgtaaagaac 33342178  T
Q  149 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  33342177 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 33342101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 34164856 - 34165030
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  | |||||||||||||||||  |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  34164856 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 34164953  T
Q  149 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  34164954 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 34165030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 34167078 - 34167252
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  | |||||||||||||||||  |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  34167078 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 34167175  T
Q  149 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    | ||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  34167176 ttatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 34167252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21356104 - 21356022
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgtt 237  Q
    |||||||||||||||| |   ||||||  |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21356104 atagtggattggagagctgc-tctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgtt 21356022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Original strand, 5017518 - 5017586
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| || |||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  5017518 tctctcccctagattaggtcatatttgaccgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctttctt 5017586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18232893 - 18232825
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18232893 tctctcccccagattaggtcatattggaccgatttgagtcaacaatctt-ggtgtgtttgttcctctctt 18232825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 179
Target Start/End: Original strand, 2908506 - 2908586
Alignment:
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctc 179  Q
    |||||||||| |||||| ||  || || |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2908506 cttgttgaagataattttttacaactcttttgtatcttattgtaaagaactcattgatagtggattgaagaaatcaatctc 2908586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 180
Target Start/End: Original strand, 9572667 - 9572719
Alignment:
Q  129 ttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctct 180  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9572667 ttgtaactctttgttaagaacccattgatagtggattgcagagatcaatctct 9572719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4629992 - 4629933
Alignment:
Q  186 agattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| ||||  |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  4629992 agattaggtcatattggactgaactgagtcaacaatctttgatgtgtttgttcctttctt 4629933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 238
Target Start/End: Original strand, 5572290 - 5572351
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttc 238  Q
    |||||| || |||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5572290 tctctcccctagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttc 5572351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22963721 - 22963680
Alignment:
Q  203 accgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22963721 accgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctttctt 22963680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 245
Target Start/End: Original strand, 23824672 - 23824713
Alignment:
Q  203 accgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23824672 accgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctttctt 23824713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 245
Target Start/End: Original strand, 31086545 - 31086590
Alignment:
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  31086545 ttggactgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctttctt 31086590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1230293 - 1230249
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1230293 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 1230249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4816275 - 4816231
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4816275 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 4816231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5273260 - 5273216
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5273260 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 5273216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11983073 - 11983029
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11983073 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 11983029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14458811 - 14458767
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14458811 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 14458767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14507220 - 14507176
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14507220 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 14507176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19704611 - 19704567
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19704611 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 19704567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20915400 - 20915356
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20915400 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 20915356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 94)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 42428649 - 42428353
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  42428649 gaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtttttctttgtgaac 42428550  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  42428549 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagtt 42428450  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42428449 ggaccgaactgggtcaacaatctttagtgtgtttgttcttcttttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttgattactag 42428353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 42426454 - 42426158
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42426454 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaaa 42426355  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  42426354 ttgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccctgattaggtcaagtt 42426255  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42426254 ggactgaactaggtcaacaatcttttgtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttgattactag 42426158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 2 - 297
Target Start/End: Original strand, 13488153 - 13488446
Alignment:
Q  2 aaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaact 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13488153 aaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaact 13488252  T
Q  102 tgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  13488253 tgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggtcaagttg 13488352  T
Q  202 gaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13488353 gaccgaactgggtcaataatcttttgtgtctttgttcctctcttctctccctt--tcttttgcttgtggttttgagtttttcactttgattactag 13488446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 32636773 - 32637069
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32636773 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggttgttctttgtgaac 32636872  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32636873 ttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 32636972  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  32636973 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttccctccctttatcttgtgcttgtgattttgagtttttcactttgattactag 32637069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 28750874 - 28750578
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  28750874 gaaacattgaaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttatgaaa 28750775  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  28750774 ttgttgaagttaatttcctgtaacccatttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 28750675  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  28750674 ggaccgaattgggtcaataatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatattttgcttgtggttttgtgcttttcacttggattactag 28750578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 39468768 - 39468480
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39468768 gaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattagtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 39468669  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || || ||    
T  39468668 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggttaaatt 39468569  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  39468568 ggactgaactgggtcaacaatctttagtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttgtgctcgtggttttgtgcttttcactttg 39468480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 533718 - 534010
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  533718 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgcgtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttggtctttgtgagc 533817  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  533818 ttgttgaagctaattttttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggaaagatcaatctctcccccatattaggtcaagtt 533917  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  533918 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtctttg--cttctcttctct--ttttatcttttgcttgtggttttgagattttcactttgattactag 534010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 537974 - 538266
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  537974 gaaacatcgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgcgtgtcttgttcattagtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggttgctctttgtgagc 538073  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  538074 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagtt 538173  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  538174 ggaccgaactggatcaacaatctttggtgtgtttctt--tctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttgattactag 538266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 8566165 - 8565873
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  8566165 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatgggtagaacttaggtttgttctttgtgagc 8566066  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  8566065 ttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctctgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcacccagattaggtcaagtt 8565966  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8565965 ggaccgaactaggtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt-ttctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttgattactag 8565873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 13239701 - 13239997
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13239701 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaaatggtagaaattagggtttttctttgtgaac 13239799  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtc-aagt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||| || |    
T  13239800 ttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaaatt 13239899  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  13239900 tggaccgaactgggtgaacaatttttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcactttgattactag 13239997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 282
Target Start/End: Original strand, 33831630 - 33831908
Alignment:
Q  2 aaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaact 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  33831630 aaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcatttgtgagattggaaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagct 33831729  T
Q  102 tgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttg 201  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  33831730 tgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcccccatattaggtcaagttg 33831829  T
Q  202 gaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagctttt 282  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33831830 gactgaactgggtcaacaatctttggtgtttttgtttctctcttctct--ctttatcttttgcttgtggctttgagctttt 33831908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 30683139 - 30682854
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||    
T  30683139 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt---ctttgtgaac 30683044  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaa--ctcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag 198  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  30683043 ttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttctttgtaagaatactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag 30682944  T
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  30682943 ttggaccgaactgg-tcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccttttatcttttgcttgtgaatttgtgcttttcactttg 30682854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 25412711 - 25412982
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25412711 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttgttctttgtgaac 25412808  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-t 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| |    
T  25412809 ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 25412908  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttt 273  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25412909 tggactgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatcttttgcttgtggttt 25412982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 31182922 - 31183219
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  31182922 gaaacattgtaaacaccttaggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgg-aaaatgggtagaaattaggattgttctttgtgagt 31183020  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||    
T  31183021 ttgtttaagttaatttcttgtaac-catttgtatccctttgtaagaactcattgatactggattggagagatctatctctcccccatattaggtcaagtt 31183119  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatctt-----ttgcttgtggttttgagcttttcactttggttact 295  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31183120 ggaccgaactgggtcaacattctttggtgtgtttgtttctctcttctct--ctttatcttttgaattgcttgtggttttgagcttttcactttgattact 31183217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 37439083 - 37439387
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaa--------aatgggtagaaattagggttgttct 92  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||        ||  |||||||||||||||||||||    
T  37439083 gaaacattgtaaacactttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattgggaaggaaaaataaaaggtagaaattagggttgttct 37439181  T
Q  93 ttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaa 192  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||     
T  37439182 ttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 37439281  T
Q  193 gtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggt 291  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  37439282 gtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccctttatcttatgcttgtggttttgtgcttttcattttgat 37439381  T
Q  292 tactag 297  Q
    ||||||    
T  37439382 tactag 37439387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 13343010 - 13343297
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagggttgttctttgtgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13343010 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaa 13343108  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag- 198  Q
    |||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||| |     
T  13343109 cttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcatgt 13343207  T
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  13343208 ttggaccgaactgggtgaacaatctttgatgtgtttgtttctctcttctctccttttatattttgcttgtgg-tttgtgcttttcactttg 13343297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 30182538 - 30182825
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30182538 gaaacattgcaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaac 30182636  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-t 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||  | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||| |    
T  30182637 ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttctatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtatgtcaagtt 30182736  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  30182737 tggaccgaactggatgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatcttgtgcttgt-gttttgtgcttttcactttg 30182825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 19806333 - 19806608
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  19806333 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaa-tcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagg-ttgttctttgtgagt 19806430  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||                   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19806431 ttgttgaagctaatttcttctaa-------------------aagaactccttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 19806511  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  19806512 ggaccgaactgggtcaacaatctttggggtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggtttttagcttttcactttgattactag 19806608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 16452030 - 16452316
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |    
T  16452030 gaaacattgtaaacaccttgg-taagtgacaatcattgagtgtcttgttcattgatgagattggaaaaatgggtagaaattaagtttgttctttctgagc 16452128  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||    
T  16452129 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattcatagtggattggagagataaatctctcccccagagtaggtcaagtt 16452228  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctcccttta-tcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||  | |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16452229 ggaccgaactgggtaaacatttcttggtgtgtttgtt--tatcttctcttcctttatttttttgcttgtggttttgagcttttcaatttg 16452316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 36074263 - 36073974
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaat---gggtagaaattagggttgttctttgtg 97  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| |    
T  36074263 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgcg 36074165  T
Q  98 aacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaa 197  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| | || |||||    
T  36074164 aacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccaaagtaggtcaa 36074066  T
Q  198 g-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  36074065 gtttggaccgaactggatgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatgttttgcttgt-gatttgtgcttttcactttg 36073974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 40147216 - 40147428
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  40147216 attgtaaacaccttgggagagtggaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttcgtgagcttgtt 40147314  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  40147315 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 40147414  T
Q  206 gaactgggtcaaca 219  Q
    ||||||||| ||||    
T  40147415 gaactgggtgaaca 40147428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Original strand, 28278271 - 28278498
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28278271 attgtaaacacattgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggttgttctttgtgagcttgtt 28278369  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  28278370 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaaaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 28278469  T
Q  206 gaactgggtcaacaatctttggtgtgttt 234  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  28278470 gaactgggtgaacaattcttggtgtgttt 28278498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 245
Target Start/End: Original strand, 38746960 - 38747197
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38746960 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtatcttgttcattaatgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 38747058  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||    
T  38747059 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttggaaaaactcattgatagaggattggagagatcaatctctccctcagatcaggtcaagttggacc 38747158  T
Q  206 gaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
     ||||||||||| |||| ||||||  ||||||||| ||||    
T  38747159 aaactgggtcaataatc-ttggtggatttgttcctttctt 38747197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 213420 - 213633
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  213420 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 213518  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggac 204  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | || |||||| ||||||    
T  213519 aaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggac 213618  T
Q  205 cgaactgggtcaaca 219  Q
    |||||||||| ||||    
T  213619 cgaactgggtgaaca 213633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 5058002 - 5058212
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  5058002 attgtaaacaccttggaagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct--gtgagcttgtt 5058098  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| || |||||||||||||    
T  5058099 gaagctattttcttgtatcccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagttggacc 5058198  T
Q  206 gaactgggtcaaca 219  Q
    ||||||||| ||||    
T  5058199 gaactgggtgaaca 5058212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 3075877 - 3075629
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  3075877 gaaacattgtaaacacctttgatgagtgaaaatcattgagtgtctcgttcatttgtgagattgagaaaataggtagaaattaggtttgttctttgtgagc 3075778  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| | || | || ||||||||    
T  3075777 ttgctgaatctaatttcttgtaacccatttgtatctttttgtaagaattcgttgatagtgaattggagagatcaatctctccctcatagtaggtcaagtt 3075678  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctcc 251  Q
    ||||| || ||||| |||| |  ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3075677 ggaccaaattgggtgaacatttcttggtgtgtttgtt--tctcttctctcc 3075629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5887635 - 5887357
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  5887635 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatggatagaaattagatttgttctttgtgagc 5887536  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||                  |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  5887535 ttgtttaagctaatttcttgcaacccatttgtatcactttgtaagaact------------------gagatctatctctcccccagattaggtcaagtt 5887454  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgc--ttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||| || |||||| |||| |||||||    
T  5887453 ggaccgaattggatcaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctct--ctttatcttttgcttttgtggttttaagtttttcattttgattactag 5887357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 16409432 - 16409716
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||       |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16409432 gaaacatggtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattggaaaaa-gggtagaaattagggttgttctttgtgaac 16409522  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag- 198  Q
    ||||  || |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||||||     
T  16409523 ttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagt 16409622  T
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtgtgtttg--ttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||  |||||||   |||||| |||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||    
T  16409623 ttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgt-gttttatgcttttcactttg 16409716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 42310153 - 42309929
Alignment:
Q  2 aaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaact 101  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| | | ||| ||||||||| ||    
T  42310153 aaacattgtaaacattttgggtaagtgaaaatcattgagtgtcttgctcattggtgagattgagaaattgggtagaaatcaagtttgatctttgtgagct 42310054  T
Q  102 tgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttg 201  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |||| | ||  | |||||     
T  42310053 tgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaacttattgatagtggattagcgagatcaatctctcccccatagtagattaagttt 42309954  T
Q  202 gaccgaactgggtcaacaatctttg 226  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||    
T  42309953 gaccgaattggataaacaatctttg 42309929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 26177840 - 26178123
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||       |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26177840 gaaacatggtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattggaaaa--gggtagaaattagggttgttctttgtgaac 26177929  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag- 198  Q
    ||||  || |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||||||     
T  26177930 ttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagt 26178029  T
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtgtgtttg--ttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||  |||||||   |||||| |||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||    
T  26178030 ttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgt-gttttatgcttttcactttg 26178123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 233
Target Start/End: Original strand, 27015487 - 27015704
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| | || | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27015487 attgtaaacatcttgggagagtgaaaatcatga-gtgt-ttggtcattggtgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 27015584  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    |||||||||        |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| | || |||||||||||||    
T  27015585 gaagctaat--------acccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgtacagatcaatctctcctccaaaataggtcaagttggacc 27015676  T
Q  206 gaactgggtcaacaatctttggtgtgtt 233  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||    
T  27015677 gaactgggtgaacattttttggtgtgtt 27015704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13695904 - 13695639
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  13695904 ttgtaaacaccttgtgtgagtgaaaatcattgagtatctttttctttggagagattgggaaaa-gggtacaaattagggtttgttctttgtgagcttgtt 13695806  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggac 204  Q
     |||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||  ||| | || ||||| ||||||    
T  13695805 aaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactcattaatagtggattagagagattattctctcctccatagtaggtcaacttggac 13695706  T
Q  205 cgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttg 275  Q
    | |||| ||| |||| |  ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||    
T  13695705 caaactaggtaaacatttcttggtgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatcctttgcttgttgttttg 13695639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 9049554 - 9049285
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttg 106  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| | ||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||  |||||||||| |||  | ||||||| |||||||    
T  9049554 ttgtaaacactttgggtgagtaaaaatcactgagtgtcttgttgattagtgagtttgggaaaatga-tagaaattagtgtttgtttttgtgagcttgttg 9049456  T
Q  107 aagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccg 206  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| | || || |||||||||||    
T  9049455 aagctaatttcttgtaaccattttgtatctctttgtaagaactcattgacagtggattggagagatcaatatctcccccaaagtaggtgaagttggaccg 9049356  T
Q  207 aactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactt 287  Q
    || ||| | |||| | |||||||||||||||  |||||||        ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  9049355 aaatggataaacattttttggtgtgtttgtt--tctcttc--------tatcttttgcttgtggttttgtgtttttcactt 9049285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27637827 - 27637618
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  27637827 attgtgaacaccttggaagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttatgagcttgtt 27637728  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca-agttgga 203  Q
     || ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||  ||||||    
T  27637727 taaactaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctcctgcagagtaggtcattgttgga 27637629  T
Q  204 ccgaactgggt 214  Q
    |||||||||||    
T  27637628 ccgaactgggt 27637618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 9789435 - 9789170
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||       |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  9789435 gaaacatgggaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattggaaaaa-gggtagaaattaaggttgttccttgtgaac 9789345  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag- 198  Q
    ||||  || |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||||||     
T  9789344 ttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagt 9789245  T
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtgtgtttg--ttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtg 269  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||  |||||||   |||||| |||||||| ||||||||    
T  9789244 ttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccctctccgtttatcttgtgcttgtg 9789170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16641153 - 16640941
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattggg--aaaatgggtagaaattag-ggttgttctttgtgaacttg 103  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |  ||||  |||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  16641153 ttgtaaacaccttgagtgagtgaaattcattaagtgtcttgttcattggcgagattgagaaaaaaatggtagaaattagtgtttgttctttgtgagcttg 16641054  T
Q  104 ttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttgga 203  Q
    |||||||| ||||||  ||| || |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||     
T  16641053 ttgaagctgatttctgataactcttttgtatctctttgtaagaac---ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtaggg 16640957  T
Q  204 ccgaactgggtcaaca 219  Q
    ||||||||||| ||||    
T  16640956 ccgaactgggtaaaca 16640941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18441859 - 18441594
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||       |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18441859 gaaacatgggaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattggaaaaa-gggtagaaattagggttgttccttgtgaac 18441769  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag- 198  Q
    ||||  || |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||| || ||||||     
T  18441768 ttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctctagagtaggtcaagt 18441669  T
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtgtgtttg--ttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtg 269  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||  |||||||   |||||| |||||||| ||||||||    
T  18441668 ttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccctctccgtttatcttgtgcttgtg 18441594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 125 - 289
Target Start/End: Original strand, 42926964 - 42927130
Alignment:
Q  125 tcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||| || | || |||||||||||||||||||||| |||| |  |    
T  42926964 tcatttgtatctctttgtaagaactcattgacagtggattgaagaaataaatctctctctcatagtaggtcaagttggaccgaactgggtaaacatttct 42927063  T
Q  225 tggtgtgtttgttcctctcttctctcc----ctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||    ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42927064 tggtgtgtttgtt--tctcttatctccttatcttttgcttttgcttgtggttttgagtttttcactttg 42927130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 26170731 - 26170984
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||       |||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26170731 gaaacatggtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattggaaaa--gggtagaaattaggattgttctttgtgaac 26170820  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-t 199  Q
    ||||  || |||||||||||||| || ||||          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||| |    
T  26170821 ttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttg----------taagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 26170910  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtgtgtttg--ttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtg 269  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||  |||||||   |||||| |||||||| ||||||||    
T  26170911 tggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtg 26170984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29751328 - 29751156
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaagaact 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||    
T  29751328 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 29751231  T
Q  150 cattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  29751230 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 29751156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 29720364 - 29720551
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaagaact 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||    
T  29720364 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 29720461  T
Q  150 cattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 237  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||  | ||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  29720462 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 29720551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 29722524 - 29722711
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaagaact 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||    
T  29722524 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 29722621  T
Q  150 cattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtc-aagttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 237  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| || ||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  29722622 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 29722711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 221
Target Start/End: Original strand, 316782 - 316933
Alignment:
Q  72 ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagag 170  Q
    ||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  316782 ggtagaaattaggtttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaagaactcattgataatggatcggaggg 316881  T
Q  171 atcaatctctctcccagattaagtca-agttggaccgaactgggtcaacaat 221  Q
    ||||||||||| || ||| || ||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  316882 atcaatctctcccctagagtaggtcattgttggaccgaacttggtaaacaat 316933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22536457 - 22536286
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaagaact 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||    
T  22536457 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 22536361  T
Q  150 cattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    | ||||||||||||||| |||  |||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22536360 ctttgatagtggattggggagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 22536286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 10593258 - 10593445
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaagaact 149  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||    
T  10593258 ttggtgagattgggagaa-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 10593354  T
Q  150 catt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 237  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  10593355 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtatttgtt 10593445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 67 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33906184 - 33906028
Alignment:
Q  67 aaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattg 165  Q
    ||||||||| |||||||| | || ||| | || ||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  33906184 aaatgggtataaattaggttagtgcttggagagcttgtcgaagctaacttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtagattg 33906085  T
Q  166 gagagatcaatctctctcccagattaagtcaa-gttggaccgaactgggtcaacaat 221  Q
    || ||||||||||||  || ||| || ||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  33906084 gaaagatcaatctcttccctagagtaggtcaatgttggaccgagctgggtaaacaat 33906028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 194 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16649856 - 16649757
Alignment:
Q  194 tcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggtta 293  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  16649856 tcaagttggaccaaactaggtcaacaatccttggtgtgtttgtttctcttttc----cgtttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttgatta 16649761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 42926842 - 42926908
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaa 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  42926842 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttctttggtgagattgggaa 42926908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 25078120 - 25078293
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||| |||| |||| ||||    
T  25078120 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaaagaac 25078216  T
Q  149 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  25078217 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 25078293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 25136089 - 25136262
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||| |||| |||| ||||    
T  25136089 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaaagaac 25136185  T
Q  149 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  25136186 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 25136262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 10054969 - 10054850
Alignment:
Q  67 aaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattg 165  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||   ||  ||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10054969 aaatgggtagaaattatgtttgttcttgaagagtttgttgaagctaatttcttataac-cttttgtatctctttgtaatgaactcattgatagtgtattg 10054871  T
Q  166 gagagatcaatctctctccca 186  Q
    |||| |||||| |||| ||||    
T  10054870 gagatatcaatatctccccca 10054850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 40380090 - 40380263
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  || ||||||||||||||  |  ||||||| |||| |||| ||||    
T  40380090 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaa-ctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaaagaac 40380186  T
Q  149 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  40380187 tcatttgatagtggattggagagttcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 40380263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 40382301 - 40382474
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 148  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||| |||| |||| ||||    
T  40382301 ttggtgagattgggaaag-gggtagaagttagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaaagaac 40382397  T
Q  149 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  40382398 tcatttgatagtggattggagagttcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 40382474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 153
Target Start/End: Original strand, 42926916 - 42926968
Alignment:
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcatt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42926916 ttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcatt 42926968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Original strand, 3325869 - 3326045
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggt-gagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| | ||  || ||||  |||| || ||||||||||  ||||||||   || ||||||    
T  3325869 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaac-cattgggtatcttgttcttaggaagaaattgaaaaaaagg-tagaaattagttttgttcttgaagagcttgtt 3325966  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatt-tgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctc 183  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3325967 gaagctaatttcttgtaa-ccattgtgtatctctttgtaaagaactcaatgatggtggattagagagatcaatatctctc 3326045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 160
Target Start/End: Original strand, 35616129 - 35616278
Alignment:
Q  11 aaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaag 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||  ||  ||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||| | || || ||| |||    
T  35616129 aaacaccttgggtgagtg-aaatcattgagtctcttgttcacgggaagagattgag-aaatgagtagaaattaggtttgttcttggagagctcgtttaag 35616226  T
Q  110 ctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 160  Q
     |||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  35616227 ttaatttcttgtaacccttttgtatttctttgtaaagaactcattgatagtg 35616278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10281819 - 10281730
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| ||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10281819 atagtggattggagagctgc-tctctcccccagatcaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctttctt 10281730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 157
Target Start/End: Original strand, 30802843 - 30802934
Alignment:
Q  66 aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgata 157  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  30802843 aaaatgggtagaa-ttaggtttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttattgtaatccttttgtatctatttgtaaagaactcgttgata 30802934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 65 - 170
Target Start/End: Original strand, 22097877 - 22097981
Alignment:
Q  65 gaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggat 163  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||| |||  |  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  22097877 gaaaaagggtagaaattagggttgttcttggagaatttgttgaagttaatttcttataa--cccttgtatctatttgtaaaaaactcattgatagtggat 22097974  T
Q  164 tggagag 170  Q
    | |||||    
T  22097975 tagagag 22097981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 240
Target Start/End: Original strand, 9353361 - 9353446
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgttcct 240  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9353361 atagtggattggagagctgc-tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcct 9353446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 240
Target Start/End: Original strand, 36932379 - 36932464
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgttcct 240  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36932379 atagtggattggagagctgc-tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcct 36932464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Original strand, 17004009 - 17004077
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  17004009 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctttctt 17004077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 10700857 - 10700695
Alignment:
Q  11 aaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtg-agattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaag 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||      ||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| | || ||||||||||    
T  10700857 aaacaccttgggtgcgtgaaaatcattgagtattttgttcatgaaaatagattggaaaaaagg-tagaaattaggtttgttcttagagagcttgttgaag 10700759  T
Q  110 ctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatc 173  Q
    |||||| ||| |||    |||||||||||||  || |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10700758 ctaatt-cttataacatttttgtatctctttaaaaagaactcattgatagtgaagtggagagatc 10700695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 199 - 245
Target Start/End: Original strand, 31300668 - 31300713
Alignment:
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31300668 ttggaccgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctctt 31300713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14520268 - 14520208
Alignment:
Q  186 agattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14520268 agattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcctttctt 14520208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 16546629 - 16546803
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 148  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  | |||||||||||||||||  |  ||||||| |||| |||| ||||    
T  16546629 ttggtgagattaggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaaagaac 16546726  T
Q  149 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  16546727 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 16546803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15464600 - 15464518
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgtt 237  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| |||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15464600 atagtggattggagagctgc-tctctcccccagattagatcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgtt 15464518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 181
Target Start/End: Original strand, 8445764 - 8445845
Alignment:
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 181  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||| | ||||||| ||||||||| |||| || |||| ||||||||    
T  8445764 ttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttctttataaagaactaattgatagtagattagaaagatgaatctctc 8445845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 240
Target Start/End: Original strand, 11917001 - 11917084
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 240  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| |||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  11917001 atagtggattggagagctgc-tctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc-tcggtgtgtttgttcct 11917084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28832307 - 28832247
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 237  Q
    |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28832307 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaaccgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 28832247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 242
Target Start/End: Original strand, 30793212 - 30793326
Alignment:
Q  128 tttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca-agttggaccgaactgggtcaacaatcttt 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||  |||||| || ||| |||||||  ||||||||||||  ||| |||| |  ||    
T  30793212 tttgtatctctttgtaaagaactaattgatagtgaagtggagagatc--tctctcccctagagtaagtcattgttggaccgaacaaggtaaacatttctt 30793309  T
Q  226 ggtgtgtttgttcctct 242  Q
    |||||||||||| ||||    
T  30793310 ggtgtgtttgtttctct 30793326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Original strand, 42127459 - 42127527
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| ||||||||| ||||  || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  42127459 tctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctttctt 42127527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 16544407 - 16544581
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  | ||||||||||||  |||  |  ||||||| |||| |||| ||||    
T  16544407 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttctcataac-ctcttgtatcccttttgtaaagaac 16544504  T
Q  149 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  16544505 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 16544581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 27910685 - 27910729
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27910685 tctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 27910729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 245
Target Start/End: Original strand, 24553565 - 24553623
Alignment:
Q  186 agattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  24553565 agattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctttctt 24553623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 111
Target Start/End: Original strand, 4160637 - 4160690
Alignment:
Q  57 gagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagct 111  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  4160637 gagatttggaaaatgg-tagaaattaggtttgttcttggagaacttgttgaagct 4160690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 245
Target Start/End: Original strand, 12084248 - 12084294
Alignment:
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaat-ctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  12084248 tggaccgaactgggtcaacaatattttggtgtgtttgttcctttctt 12084294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 14689581 - 14689503
Alignment:
Q  66 aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaa 144  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||| | | |  ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  14689581 aaaattggtagaaattatgtttgttcatggagtgcttgttgaagctaattttttgtaatatttttgtatctctttgtaa 14689503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19588771 - 19588726
Alignment:
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  19588771 ttggaccgaactgggtcaacaatcttt-gagtgtttgttcctttctt 19588726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 157
Target Start/End: Original strand, 32609584 - 32609641
Alignment:
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgata 157  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  32609584 ttgttgaagttaatttcttgtaactcttttgtatttctttgtaaagaacttattgata 32609641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 2175153 - 2175197
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2175153 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 2175197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 2724128 - 2724172
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2724128 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 2724172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Original strand, 4160702 - 4160762
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca-agttggaccgaactgggt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||  |||||||| ||||||||    
T  4160702 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccaaactgggt 4160762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 6747539 - 6747583
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6747539 tctctctctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 6747583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10529143 - 10529099
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10529143 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 10529099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 18466919 - 18466963
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18466919 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 18466963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21684496 - 21684452
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21684496 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 21684452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 24127091 - 24127135
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24127091 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 24127135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 25921517 - 25921473
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25921517 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 25921473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 27912771 - 27912815
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27912771 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 27912815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 34477097 - 34477053
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34477097 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 34477053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 34479462 - 34479418
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34479462 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 34479418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 39798282 - 39798326
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  39798282 tctctcccccagactaagtcaatttggatcgaactgggtcaacaa 39798326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 40221758 - 40221802
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40221758 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 40221802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 90)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 38312189 - 38312477
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38312189 gaaacattgtatacaccttgtgtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 38312288  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  38312289 ttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagatctcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaagtt 38312388  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38312389 ggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttg 38312477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 17057588 - 17057301
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  17057588 gaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgcaagc 17057489  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  17057488 ttgttgaagctaattttttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagactaggtcaagtt 17057389  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcacttt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17057388 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcgtctctccctttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcacttt 17057301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 17085571 - 17085284
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  17085571 gaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgcaagc 17085472  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  17085471 ttgttgaagctaattttttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagactaggtcaagtt 17085372  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcacttt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17085371 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcgtctctccctttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcacttt 17085284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 29867818 - 29868114
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29867818 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 29867917  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  29867918 ttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaagtt 29868017  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29868018 ggaccgaactgggtcaataatctttgatgtgtttgtttctctcttctctccgtttatcttgtgcttgtggttttgagtttttcactttgattactag 29868114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 723963 - 723669
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  723963 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattggaaaactgggtagaaattaggtttgttctttgtgagc 723864  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  723863 ttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 723764  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  723763 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttgattactag 723669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 34139990 - 34139695
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34139990 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagc 34139891  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagt 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  34139890 ttgtttaagctaatttcttgtaacccatatgtatcccttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagt 34139791  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34139790 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttgattactag 34139695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 36773511 - 36773789
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |    
T  36773511 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggaataaattagggttgttctttgtgagc 36773610  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  36773611 ttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaagtt 36773710  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttc 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36773711 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt--tctcttcttt--ctttatcttttgcttgtggttttgagcttttc 36773789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 2334636 - 2334343
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2334636 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaataagggttgttctttgtgaac 2334538  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-t 199  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| |    
T  2334537 ttgttgaagctaatttctagtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 2334438  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttac 294  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  2334437 tggaccgaactgggggaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccctttatcttgtgcttgtggttttgaagttttcactttgattac 2334343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 42362301 - 42362591
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  42362301 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagc 42362400  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  42362401 ttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatctatctctcccccagattaggtcaagtt 42362500  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  42362501 ggac----ctgggtcaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgagtttttcactttgattactag 42362591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 11151810 - 11151518
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  11151810 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtctcttgttcattggtgaaattgggaaaatgggtagaaattagatttgttctttgtgagc 11151711  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  11151710 ttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcactttgtaagaactcttagatagtggattggagagatcaacctctcccccagattaggtcaagtt 11151611  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11151610 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatcttttgtttgtggttttgagcttttcactttgattactag 11151518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 14634045 - 14633750
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  14634045 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattggtaaaatgggtagaaattaggattgttctttgtgagc 14633946  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagt 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  14633945 ttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttttgtaagaactcatagatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagt 14633846  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14633845 tggaccgaactgagtcaacaatctttggtgtgtttgtttctctattctct--ctttatcttttgattgtggttttgagcttttcactttgattactag 14633750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 33162669 - 33162377
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33162669 gaaacattgtaaacaccttgggtgattgaaaatcatcgagtgtcttgttcattggtgaaattaggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagc 33162570  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  33162569 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctctgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcccctagattaggtcaagtt 33162470  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33162469 ggaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgtt--tctcttctct--atttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttgattactag 33162377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 36318228 - 36317936
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36318228 gaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagc 36318129  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || ||||||||    
T  36318128 ttgttgaaactaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccttagagtaggtcaagtt 36318029  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  36318028 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt--tatcttcttt--ctttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttgattactag 36317936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 11067254 - 11067546
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  11067254 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgaaattggaaaaatgggtagaaattagtgttgtactttgtgagc 11067353  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11067354 ttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcatttataatggattgaagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 11067453  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11067454 ggaccgaactcggtcaacaatctttggtgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttgattactag 11067546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 11690450 - 11690734
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  11690450 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagc 11690549  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||    
T  11690550 ttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaaatcgttgatagtggattggagagatcaacctctcccccatattacgtcaagtt 11690649  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtg-tttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcacttt 288  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11690650 ggaccgaactggatcaacaatctttggtgtgttttgtttctct----tctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcacttt 11690734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 36988294 - 36988006
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  36988294 gaaacatagtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgggattggaaaaaagggtagaaattagggttgttctatgtgagc 36988196  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-t 199  Q
    ||||  || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| |    
T  36988195 ttgtcaaaactaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 36988096  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  36988095 tggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatcttttgcttgtggctttgtgcttttcactttg 36988006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 45099704 - 45099991
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagggttgttctttgtgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45099704 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaa 45099802  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag- 198  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||||||     
T  45099803 cttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagt 45099901  T
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  45099902 ttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatattttgcttgt-gatttgtgcttttcactttg 45099991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 4503351 - 4503064
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctttgtgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4503351 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggagagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaa 4503253  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagt 199  Q
    |||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||||    
T  4503252 cttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagt 4503154  T
Q  200 t-ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  4503153 ttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatcttgtgcttgt-gttttgtgcttttcactttg 4503064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5723473 - 5723202
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5723473 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaa-gggtagaaattaggcttgttctttgtgaac 5723376  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| || || |||||    
T  5723375 ttgtcaaagctaatttcttgtaacctttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggttaagtt 5723276  T
Q  201 -ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttt 273  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5723275 tggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctattctctccttttatcttttgcttgtggttt 5723202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 6595225 - 6594935
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatg-ggtagaaattagggttgttctttgtgaa 99  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6595225 gaaaaattgtaaacactttgga-gagtgagaatcattgggtgtcttgttcattggtgagattaggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaa 6595127  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag- 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||     
T  6595126 cttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgaatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagt 6595027  T
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccc-tttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6595026 ttggaccgaactgagtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctcccttttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttg 6594935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 36205882 - 36205611
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36205882 gaaacatggtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaac 36205784  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-t 199  Q
    ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||  ||||| || |||||| |    
T  36205783 ttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg-aagaactcattgacagcggattggagagttcaatctatcctccagagtaggtcaagtt 36205685  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttt 273  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  36205684 tggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatattttgcttgtggttt 36205611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 45726884 - 45727096
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45726884 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttattcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgtt 45726982  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  45726983 gaagctaatttcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 45727082  T
Q  206 gaactgggtcaaca 219  Q
    ||||||||| ||||    
T  45727083 gaactgggtgaaca 45727096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 35447097 - 35446885
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35447097 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattggtaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgatcttgtt 35446999  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  35446998 gaatctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcactctctcctccagagtaggtcaagttggacc 35446899  T
Q  206 gaactgggtcaaca 219  Q
    ||||||||| ||||    
T  35446898 gaactgggtgaaca 35446885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 14202626 - 14202346
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtat--cttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtga 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |  ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  14202626 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtgtctttttcatttctgagattgggaaaatgggtagaaattatgtttgttctttgtga 14202527  T
Q  99 acttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag 198  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||           
T  14202526 gcttgtttaagctaatttcttgtaactcat-------cctttgtaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctccccaagatta------- 14202441  T
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  14202440 --ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtttatctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttaagcttttcactttgattactag 14202346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 42288323 - 42288114
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  42288323 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcacga-gtgtcttgtgcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgtt 42288225  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  42288224 gaagctaatttattgtaacccatttgtatttctttgtaagagctcattgataatggattggagagatcaatctctc-cccagattaggtcaagttggacc 42288126  T
Q  206 gaactgggtcaa 217  Q
    ||||||||||||    
T  42288125 gaactgggtcaa 42288114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 1631945 - 1631741
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  1631945 attgtaaacaccttgagagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaggattgttctttgtgagcttgtt 1631847  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  1631846 gaagctaatatcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 1631747  T
Q  206 gaactg 211  Q
    ||||||    
T  1631746 gaactg 1631741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 4484549 - 4484259
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattggga-aaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4484549 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgtaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgaaattgggagaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaa 4484452  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag 198  Q
    |||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||||||    
T  4484451 cttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaag 4484352  T
Q  199 tt-ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttc--tctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    || |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||    |||||  ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  4484351 tttggacagaactgggtgaacaatctttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttgtgcttgtggtttt-tgcttttcactttg 4484259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 30833295 - 30833585
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattggga-aaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaa 99  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30833295 gaaacattgtaaacactttgg-tgagtgtaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaa 30833392  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag 198  Q
    |||||  ||| |||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||||||    
T  30833393 cttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaag 30833492  T
Q  199 -ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttg--ttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
     |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||   |||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  30833493 tttggactgaactgggtgaacaatctttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtgg-tttgtgcttttcactttg 30833585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 7 - 287
Target Start/End: Original strand, 13121724 - 13121997
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  13121724 ttgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagactgggaaaat-ggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgtt 13121822  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    |||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||| | || || |||||||| |    
T  13121823 gaagataatttcttgtaa--cctttgtatctctttgtagaaactcattgatagtggattgaagaaatcaatctctcctccaaactatgttaagttgga-c 13121919  T
Q  206 gaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactt 287  Q
      | ||||| |||| |  ||| ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  13121920 ttattgggtaaacatttattgttgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttatgtttttcactt 13121997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17490360 - 17490095
Alignment:
Q  2 aaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaact 101  Q
    |||||||| ||||||  |||||| |||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    || |||||||||| ||    
T  17490360 aaacattgcaaacacagtgggtgggtgaaaatcattgaatgtcttgttcattgttgagattgg-aaaatgg-tagaaatt----ttattctttgtgagct 17490267  T
Q  102 tgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttg 201  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| || ||||| |||    
T  17490266 tgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtaactctttgtaagaactcattgatagtggattgtagagatcaatctctcccctagagtaggtcaatttg 17490167  T
Q  202 gaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgag 277  Q
    ||||||||||||| |||| |  ||  | ||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  17490166 gaccgaactgggtaaacatttcttaatatgtttgtt--tctcttctct--ctttatcatttgcttgtggttttgag 17490095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Original strand, 17450550 - 17450755
Alignment:
Q  11 aaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  17450550 aaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagatttgaaaaatgggtagagattaggcttgttctttgtgagcttgttgaagc 17450649  T
Q  111 taatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaact 210  Q
    |||||| ||||||  |||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||    
T  17450650 taattt-ttgtaacccatttgt------------gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc-cacagagtaggtcaagttggaccgaact 17450735  T
Q  211 gggtcaacaatctttggtgt 230  Q
     ||| |||||||||||||||    
T  17450736 aggtgaacaatctttggtgt 17450755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 297
Target Start/End: Original strand, 39284930 - 39285080
Alignment:
Q  146 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctt---tggtgtgtttgttcctct 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||  |||    
T  39284930 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttaatggtgtgtttgtt--tct 39285027  T
Q  243 cttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39285028 cttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttgattactag 39285080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 289
Target Start/End: Original strand, 11049505 - 11049787
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttc---tttgtgaactt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||   ||||||| |||    
T  11049505 ttgtaaacaccttgggtaagtgaaaatcattgagtgtcttgttttttggtgagattaggaaaat-ggtataaattagggtttgttctaatttgtgagctt 11049603  T
Q  103 gttgaagctaatttcttgtaattcattt-gtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttg 201  Q
    ||||||||||||||||| |||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||   || | || ||||| |||    
T  11049604 gttgaagctaatttcttataacccttttagtatctctttgtaagaactcattgatagtagattgaaaagatcaatctctccttcataataggtcaaattg 11049703  T
Q  202 gaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    ||| ||||||||| |||| |  || |||||||||||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11049704 gactgaactgggtaaacatttctttgtgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatattttgcttgtggttttgtacttttcactttg 11049787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 289
Target Start/End: Original strand, 26353140 - 26353416
Alignment:
Q  3 aacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaatt-agggttgttctttgtgaact 101  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||| ||| ||     ||||| ||||||||||| | |||| | ||||||||| ||| |||||||||||||  |    
T  26353140 aacattgtaaacactctcggtgagtgaaaattattgag-----tgttctttggtgagatt-gaaaaaagtgtagaaattaaggtttgttctttgtgagtt 26353233  T
Q  102 tgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||| || |||||||||    
T  26353234 tgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtatctttttgtaagtactcattgatagtggattggagagatcactctctcccttagagtaggtcaagttg 26353333  T
Q  202 gaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||| |||| ||| || ||| |||||||||||  ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  26353334 gaccgaaccgggtaaac-attttttgtgtgtttgtt--tctctcctctcc--ttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcactttg 26353416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 7815486 - 7815231
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||| |||||||   | ||||||    
T  7815486 ttgtaaacaccttaggtgggtgaaaatcattgcgtgtcttgttcattggtgagattgagaaaaaggtt-gaaattagggtttgttctttagaagcttgtt 7815388  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | || | ||  |||| ||||||     
T  7815387 gaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcatttatagtggattggagagattaatctctc-cacatagtatatcaaattggact 7815289  T
Q  206 gaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttg 267  Q
    ||||||||| || | |  ||||||||||||||  |||||||| |  ||||||||||||||||    
T  7815288 gaactgggtaaatatttcttggtgtgtttgtt--tctcttcttt--ctttatcttttgcttg 7815231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 32289522 - 32289805
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||       |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32289522 gaaacatggtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattggaaaa--gggtagaaattagggttgttctttgtgaac 32289611  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag- 198  Q
    ||||  || |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||  ||||| || ||||||     
T  32289612 ttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtaaattagagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagt 32289711  T
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaa--tctttggtgtgtttg--ttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||  |||||||   |||||| |||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||    
T  32289712 ttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtccttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgt-gttttatgcttttcactttg 32289805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 24885610 - 24885763
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  24885610 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtaaaattgggaaaatgagtagaaattaggtttgttctttgtgagc 24885709  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattg 154  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||    
T  24885710 ttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtacccctctgtaagaactcattg 24885763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Original strand, 24398008 - 24398228
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggt-gagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaa-aatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaactt 102  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| |||| ||||||||||| |||    
T  24398008 attgtaaacacctttggaagagtgaaaatcaatgagtgtcttgttcattggtgagattgtgaagaaagggtagaagttaaggtttgttctttgtgagctt 24398107  T
Q  103 gttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca-agtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||  |||    
T  24398108 gttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactcattgataatggattggagagatcaatctctcccccatagtaggtcattgtt 24398207  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaat 221  Q
    |||||||||||| | ||||||    
T  24398208 ggaccgaactggctgaacaat 24398228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 39284834 - 39284929
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgt 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39284834 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtatcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgctctttgt 39284929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 99 - 219
Target Start/End: Original strand, 7451165 - 7451284
Alignment:
Q  99 acttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | | | || ||||||    
T  7451165 acttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattgcagagatcaatctctcctctacagtaggtcaag 7451264  T
Q  199 ttggaccgaactgggtcaaca 219  Q
    ||||| |||||||||| ||||    
T  7451265 ttgga-cgaactgggtgaaca 7451284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 219
Target Start/End: Original strand, 33648129 - 33648340
Alignment:
Q  11 aaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtg-agattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaa 108  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||| ||| |||||| |||  | | |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  33648129 aaacatcttgggagagtgaaaataattgagtgtcttgtacatgagaggagattgagaaaatgg-taaaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaa 33648227  T
Q  109 gctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca-agttggaccg 206  Q
    ||||||||| |||||  | ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||  |||||||||    
T  33648228 gctaatttcctgtaacccttttgtatttctttgtaaagaactcattgatagcggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccg 33648327  T
Q  207 aactgggtcaaca 219  Q
    |||||||| ||||    
T  33648328 aactgggtaaaca 33648340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 6266691 - 6266863
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaagaact 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||    
T  6266691 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 6266788  T
Q  150 cattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6266789 ctttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 6266863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 12123794 - 12123644
Alignment:
Q  10 taaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaag 109  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||| | |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||| |||  |||||||||    
T  12123794 taaacaccttggatgagtgaaaatcatcgagtgtcttgttcatttgagagattgg-aaaatgagtataaattagagttgttctttatgattttgttgaag 12123696  T
Q  110 ctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 160  Q
    || ||||||||||| || ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  12123695 cttatttcttgtaactcttttgtatcattttgtaaagaactcaatgatagtg 12123644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13656200 - 13656028
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctc-tttgtaagaact 149  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||| | ||||||||||||    
T  13656200 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cctcttgtatcccttttgtaagaact 13656104  T
Q  150 ca-ttgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  13656103 catttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 13656028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 30218254 - 30218033
Alignment:
Q  11 aaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtg-agattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaag 109  Q
    ||||||||||   ||||| |||||||| ||| |||||||||| |  | |||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| | || ||| ||||||    
T  30218254 aaacaccttgacagagtggaaatcattgagtgtcttgttcatggaaggagattgagaaa-tgggtagaagttaggtttgttcttggagagcttattgaag 30218156  T
Q  110 ctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca-agttggaccga 207  Q
    ||||||||||||||    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||| |||||| |||||||  ||||||| ||    
T  30218155 ctaatttcttgtaaccattttgtatctctttgtaaataattcattgatagtgggttgaaaagatcaatcactcccccagagtaagtcattgttggactga 30218056  T
Q  208 actgggtcaacaatctttggtgt 230  Q
    ||| ||| |||| | ||||||||    
T  30218055 actcggtaaacattttttggtgt 30218033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 42261633 - 42261520
Alignment:
Q  73 gtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagaga 171  Q
    |||||||||| | |||||||| | || |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||    
T  42261633 gtagaaattaagtttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatatctttgtaaagtactcattgatagtgaagcggagaga 42261534  T
Q  172 tcaatctctctccc 185  Q
    ||| ||||||||||    
T  42261533 tcattctctctccc 42261520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12647555 - 12647382
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||| |||| |||| ||||    
T  12647555 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaaagaac 12647459  T
Q  149 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  12647458 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 12647382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 176 - 289
Target Start/End: Original strand, 1345590 - 1345700
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggtttt 274  Q
    |||||| |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    |||| ||||||||| || ||||||||||    
T  1345590 tctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatttcttggtgtgtttgtttctct----tctcactttatcttatgattgtggtttt 1345685  T
Q  275 gagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||||    
T  1345686 gagcttttcactttg 1345700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 245
Target Start/End: Original strand, 34682363 - 34682451
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34682363 atagtggattggagagctgc-tctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctctt 34682451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 7597217 - 7597057
Alignment:
Q  15 accttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggt-gagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagcta 112  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||  ||||||| |||| ||  ||||||||||| || |||| || ||||||||| ||| |||    
T  7597217 accttaggtgagtgaaaatcactcagtgtcttgttcatgggaagagattgagaaa-tgaatagaaattaggttttgttccttatgaacttgtcgaaacta 7597119  T
Q  113 atttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatc 173  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||  |||||||||    
T  7597118 atttcttgtaagtcttttgtatctttttgtaaagaactcattgattgtagaacggagagatc 7597057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 42019993 - 42019910
Alignment:
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt---aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctct 180  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  42019993 cttgtagaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaaaaaaactcattgatagtgaatttgagagatcaatctct 42019910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 245
Target Start/End: Original strand, 10445473 - 10445561
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10445473 atagtggattggagagctgc-tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctctt 10445561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 297
Target Start/End: Original strand, 24885781 - 24885831
Alignment:
Q  247 tctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24885781 tctccctttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttgattactag 24885831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Original strand, 14699056 - 14699124
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  14699056 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctttctt 14699124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20522268 - 20522200
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20522268 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctttctt 20522200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 34811370 - 34811281
Alignment:
Q  72 ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaag-aactcattgatagtg 160  Q
    ||||||||||| | ||| |||| | || ||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34811370 ggtagaaattaagattgctcttagagagcttgttgaagctaatttattgtaactcttttatatctctttgtaagaaactcattgatagtg 34811281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 247 - 289
Target Start/End: Original strand, 2838141 - 2838183
Alignment:
Q  247 tctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2838141 tctcactttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 2838183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13569396 - 13569308
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  13569396 atagtggattggagagctgc-tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat-tttggtgtgtttattcctttctt 13569308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 34388926 - 34388838
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||||||||||||| | | |||||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  34388926 atagtggattggagagct-actctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatc-tcggtgtgtttgttcctttctt 34388838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 173
Target Start/End: Original strand, 41454254 - 41454356
Alignment:
Q  72 ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagag 170  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||||| | || || ||||||| | ||||| |||||||||||||||||| | |||| ||    
T  41454254 ggtagaaattagatttgttttttgagagcttgttgaagctaatttctagcaactcttttgtatatatttgtaaagaactcattgatagtgaagtggacag 41454353  T
Q  171 atc 173  Q
    |||    
T  41454354 atc 41454356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Original strand, 33528670 - 33528738
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    ||||| ||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  33528670 tctctttcccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctttctt 33528738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 39482979 - 39482911
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| |||| |||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39482979 tctctcccccatattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctctt 39482911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 5700335 - 5700271
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatg 71  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  5700335 ttgtaaacactttgggtgaatgaaaaacattgagtgtcttgttcattggagagattgagaaaatg 5700271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 275
Target Start/End: Original strand, 28672022 - 28672151
Alignment:
Q  143 aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca-agttggaccgaactgggtcaaca-atctttggtgtgtttgttcct 240  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||  ||||||||||| | ||| || | |||||| |||||||||||  |    
T  28672022 aagaactcactgacagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaattaggtaaatatatcttt-gtgtgtttgtt--t 28672118  T
Q  241 ctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttg 275  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||    
T  28672119 ctcttctct--ctttatcctttgcttgtgattttg 28672151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 31056092 - 31056028
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 240  Q
    |||||| || |||||| ||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31056092 tctctcccctagattaggtcatattgaaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 31056028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 172
Target Start/End: Original strand, 3897012 - 3897111
Alignment:
Q  74 tagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagat 172  Q
    ||||||||| | ||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||   ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  3897012 tagaaattaagattgttcttgaagaactcgttgaagctaattttttgtaactcttttgtataattttgtaaagaactcattgaaagtggattagagagat 3897111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 238
Target Start/End: Original strand, 8390179 - 8390260
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttc 238  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| |||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8390179 atagtggattggagagctgc-tctctcccccaaattaggtcattttggaccgaactgggtcaacaat-tttggtgtgtttgttc 8390260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 237
Target Start/End: Original strand, 28259206 - 28259288
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgtt 237  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| |||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28259206 atagtggattggagagctgc-tctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgtt 28259288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 245
Target Start/End: Original strand, 36757818 - 36757881
Alignment:
Q  183 cccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  36757818 cccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcctttctt 36757881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 245
Target Start/End: Original strand, 16940265 - 16940326
Alignment:
Q  183 cccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16940265 cccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctttctt 16940326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 245
Target Start/End: Original strand, 17010930 - 17010991
Alignment:
Q  183 cccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  17010930 cccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctttctt 17010991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21629985 - 21629924
Alignment:
Q  183 cccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    ||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21629985 cccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctttctt 21629924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 178
Target Start/End: Original strand, 24197906 - 24198023
Alignment:
Q  61 ttgggaaaatgggtagaaattagggttgtt-ctttgtgaacttgttgaag-ctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaa-ctcattgata 157  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||| || ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  24197906 ttgggaaaa-gggtagaaattaaagttttttcttggagaacttgttgaaggctaatttcttgtaaccc--ttgtatctctttgcaagaaactctttgata 24198002  T
Q  158 gtggattggagagatcaatct 178  Q
     ||||||||||||||| ||||    
T  24198003 atggattggagagatctatct 24198023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 140
Target Start/End: Original strand, 2869643 - 2869717
Alignment:
Q  66 aaaatgggtagaaattagggtt--gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt 140  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  2869643 aaaatgggtagaaattaggtttttgttctttgtgagctttt--aagctaatttcttgtaactcctttgtatcacttt 2869717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 181
Target Start/End: Original strand, 42412117 - 42412147
Alignment:
Q  151 attgatagtggattggagagatcaatctctc 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42412117 attgatagtggattggagagatcaatctctc 42412147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8040128 - 8040060
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctt 224  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| ||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  8040128 atagtggattggagagctgc-tctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatctt 8040060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17865251 - 17865183
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| ||||||||| ||||  || ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  17865251 tctctcccccagattaggtcatattcgactgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgattgttcctttctt 17865183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 239
Target Start/End: Original strand, 23078499 - 23078583
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgttcc 239  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| |||| |||| ||||  ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23078499 atagtggattggagagttgt-tctctcccccatattaggtcatattggatcgaactgggtcaacattcttttggtgtgtttgttcc 23078583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 33118184 - 33118116
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| |||| |||| ||||  ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  33118184 tctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagccaacaatc-ttggtgtgtttgttcctttctt 33118116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 172
Target Start/End: Original strand, 41446159 - 41446260
Alignment:
Q  72 ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagag 170  Q
    ||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||   ||||  | ||||||||||||| | |||||||  |||| |||| | |||||||    
T  41446159 ggtagaaattatgtttgttctttgagagcttgttgaagctaattttaagtaacccttttgtatctctttataaagaactggttgacagtgaagtggagag 41446258  T
Q  171 at 172  Q
    ||    
T  41446259 at 41446260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 3022383 - 3022427
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3022383 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 3022427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5375390 - 5375346
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5375390 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 5375346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6264192 - 6264148
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6264192 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 6264148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 223
Target Start/End: Original strand, 10707281 - 10707348
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| |||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  10707281 atagtggattggagagttgt-tctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 10707348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11739603 - 11739559
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11739603 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 11739559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13910089 - 13910045
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13910089 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 13910045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19502055 - 19502011
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19502055 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 19502011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23452281 - 23452237
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23452281 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 23452237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 27105008 - 27105052
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27105008 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 27105052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 124
Target Start/End: Original strand, 28770725 - 28770782
Alignment:
Q  66 aaaatgggtagaaattag-ggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaat 124  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||    
T  28770725 aaaatgggtagaaattagagtttgttctttgtgagct--tttaagctaatttcttgtaat 28770782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 136)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5236675 - 5236388
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5236675 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 5236576  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||    
T  5236575 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgataatggattcgagagatcaatctttc-cccagattaggtcaattt 5236477  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5236476 ggaccaaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccttttatcttttgcttgtggatttgtgcttttcactttg 5236388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 51398763 - 51399051
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51398763 gaaatattgtaaacaccttggatgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgatgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttcttagtgaac 51398862  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  51398863 ttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatttatctctcccccagattaggtcaagtt 51398962  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  51398963 ggaccgaacttggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgtacttttcactttg 51399051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 29810817 - 29811105
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29810817 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttattcattggtgagattaggaaaatatgtagaaattagagttgttctttgtgaac 29810916  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  29810917 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 29811016  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29811017 aaaccgaattgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcatctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 29811105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 40734447 - 40734734
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40734447 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagc 40734546  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  40734547 ttgttgaacctaatttcttgtaacacatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaagtt 40734646  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  40734647 ggaccgaactgggtcaacaatctttggagtgtttgttcctctcttctct-cctttatcttttgcttgtggatttgtgctttgcactttg 40734734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 40735332 - 40735622
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40735332 gaaacattgtaaacaccttggaaaagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagc 40735431  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  40735432 ttgttgaagctaatttattgtaaccagtttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 40735531  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggtt 292  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  40735532 ggaccgaactgggtcagcaatctttggtgtatttgttcctctcttctct-cctttatcttttgcttgtggatttgtgcttttcactttggtt 40735622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 7 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29196600 - 29196316
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  29196600 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgtc 29196501  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
     |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  29196500 aaagctaatttcttggaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaagttggacc 29196401  T
Q  206 gaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttac 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29196400 gaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttgattac 29196316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 31314394 - 31314686
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  31314394 gaaacattgtaaacactttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcataggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgatc 31314493  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  31314494 ttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctttttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatatctcccccatattaggtcaagtt 31314593  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31314594 ggaccgaactgagtcaacaatctttggtgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttgattactag 31314686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 760796 - 761082
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  760796 gaaacattataaacaccttggatgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtctgttctttgtgagc 760895  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  760896 ttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 760995  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  760996 ggactgaaatgggttaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 761082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 19684108 - 19683820
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19684108 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 19684009  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-t 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | || |||||| |    
T  19684008 ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcaagtt 19683909  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcacttt 288  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19683908 tggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcacttt 19683820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 29682308 - 29682594
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  29682308 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgtttatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattatgtttgttctttgtgagc 29682407  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||    
T  29682408 ttgtttaagctaatttcttgtcacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattagatcaagtt 29682507  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29682508 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtatgtttctctct--tctccctttatcttttgcttgtggttttgagtttttcactttg 29682594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 5 - 289
Target Start/End: Original strand, 29813016 - 29813298
Alignment:
Q  5 cattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29813016 cattgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgaggggcttgttaattggtgagattggaaaaataggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 29813115  T
Q  105 tgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggac 204  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||    
T  29813116 tgaagctaatttcttgtaacccatttgcatctctttgtaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcatgttggac 29813215  T
Q  205 cgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29813216 cgaactgggtcaacaatctttgatgtgtttgttcctctct--tctccctttatcttttggttgtggttttgagcttttcactttg 29813298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 44700691 - 44700406
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  44700691 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttg 44700592  T
Q  107 aagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccg 206  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  44700591 aagctaatttcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctc-cccacattaggtcaagttggaccg 44700493  T
Q  207 aactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  44700492 aactaggtcaacaatctttcgtgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatcctttgcttgtggttttgagtttttcactttgattactag 44700406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 7762215 - 7762503
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7762215 gaaatattgtgaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattgagaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaac 7762313  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-t 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| |    
T  7762314 ttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 7762413  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7762414 tggaccgaactgggtgaacaatctatgatgtgtttgtttctctcttctctccttttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttg 7762503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 39153580 - 39153287
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |    
T  39153580 gaaacattgtaaacaccttgggtgaatgaaaatcattgagtgtcttgttcatgtgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttcattgtgagc 39153481  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  39153480 ttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatccctttataagaactcattgatagtggattggagagaacaatctctcccccagattaggtcaagtt 39153381  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtg-tttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39153380 ggactgaactgggtcaacaatctttgttgtgttttgtttctct----tctccctttatcttgtgcttgtggttttgagcttttcactttgattactag 39153287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 7764417 - 7764702
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7764417 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga--gggaaaa-gggtagaaattagggttgttctttgtgaac 7764512  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtc-aagt 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||| || |    
T  7764513 ttgttaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatgaatctctcctccagagtaggtcaaatt 7764612  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  7764613 tagaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatcttttgtttgtggttttgtgcttttcactttg 7764702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 9581232 - 9581520
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  9581232 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgggattcggaaa-tgggtagaaattaggtttgttctttgtgagc 9581330  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-t 199  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| |    
T  9581331 ttgtttaagctaatttcttttaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 9581430  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  9581431 tggaccgaactgggtgaacaatctttgatgtgtttgtttctctcttctctccctttattttgtgcttgtggttttgtgcttttcactttg 9581520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 9666680 - 9666393
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||    
T  9666680 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattggaaaaatgggtagaaattagattttgttctttgtgagcttgtt 9666581  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  9666580 gaagctaatttcttgtaactcatttatacctctttgtaagaattctttgatagtggattggagagattgatctctcccccagattaggtaaagttggacc 9666481  T
Q  206 gaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttggttactag 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9666480 gaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt--tctcttatct--ctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttgattactag 9666393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 37408408 - 37408696
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37408408 gaaacattgtaaacaccttag-tgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaac 37408506  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-t 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| || |||||| |    
T  37408507 ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 37408606  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  37408607 tggatcgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatcttttgcttgtgatttagtgcttttcactttg 37408696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 44331494 - 44331717
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  44331494 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattaggaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgagc 44331593  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  44331594 ttgttgaagctaatttcttgtaagccatttgtatctctttgtaagaacttattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 44331693  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  44331694 ggaccgaactgggtcaacaatctt 44331717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 22835221 - 22834937
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  22835221 gaaacattgtaatcaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagc 22835122  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||    
T  22835121 ttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccgccatattaggtcaagtt 22835022  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||   || || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22835021 ggaccgaact-ggtcaacaatatttggtgtgt---tttctttctcttcttcctttatcttttgcttgtggttttgtgcttttcactttg 22834937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 45095114 - 45095385
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45095114 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgg-tagaaattagggttgttctttgtgaac 45095211  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-t 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| || |||||| |    
T  45095212 ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtt 45095311  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttt 273  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45095312 tggaccgaactgggtgaacaatctttggcgtatttgtttctctattctctccttttatcttttgcttgtggttt 45095385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23392128 - 23391835
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |    
T  23392128 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcatttagtgtctttttcattggtgagtttgggaaaatgagtagaaattaagtttgttctttgtgagc 23392029  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| ||||||||    
T  23392028 ttgtttaagataatttcttgtaacccatttgtatcactttgcaagaactctttgatagtggattgtagagataaatctctcccccaaattaggtcaagtt 23391929  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgag-cttttcactttggttactag 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  23391928 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgtgttttttcactttgattactag 23391835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5258363 - 5258075
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagggttgttctttgtgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5258363 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaa 5258265  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag- 198  Q
    |||||  |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||| || ||||||     
T  5258264 cttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctcttctccagagtaggtcaagt 5258165  T
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5258164 ttggaccgaacttggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatattttgcttgtgg-tttgtgcttttcactttg 5258075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 16498979 - 16499257
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| | |    
T  16498979 gaaacattgtaaacaccttggggtagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaacggatagaaattagggttgtt-tttgtaagc 16499077  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||    
T  16499078 ttgttgaagctaatttcttgttacccatttatatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaagtt 16499177  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttca 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16499178 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtatttgtt--tctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgtacttttca 16499257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 6 - 238
Target Start/End: Original strand, 34491168 - 34491398
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34491168 attgtaaacaccttgggagagtgaaattc--tgagtgtgttattcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 34491265  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  34491266 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 34491365  T
Q  206 gaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttc 238  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34491366 gaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgttc 34491398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5260542 - 5260254
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagggttgttctttgtgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5260542 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttggtcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaa 5260444  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag- 198  Q
    |||||  |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||| | || ||||||     
T  5260443 cttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctcttctccaaagtaggtcaagt 5260344  T
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5260343 ttggaccgaacttggtgaacaatctttggtgtgtttgtttctctcttctctccttttatattttgcttgtgg-tttgtgcttttcactttg 5260254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 53921721 - 53921438
Alignment:
Q  2 aaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaact 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  53921721 aaacattgtaaaaaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaggtttgttgtttgtgagct 53921622  T
Q  102 tgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttg 201  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||  |||||||     
T  53921621 tgttaaagctaatttcttgtaactcatttgtatcattttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccggagtagatcaagttt 53921522  T
Q  202 gaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    ||||||||||| | |||| |  || |||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53921521 gaccgaactggataaacatttcttagtgtgtttgtt--tctcttctct--ctttatattttgtttgtggttttgagcttttcactttg 53921438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 32891052 - 32891337
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||     
T  32891052 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtaaaaatcattgagtgtcttgttcttcggtgagattgagaaaatgggtagaaattaagttttgttctttgtgag 32891151  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || || |||| ||    
T  32891152 cttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagataaatctctcccccggagtaggtcatgt 32891251  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    ||||||||||||| | | || |  ||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32891252 tggaccgaactggataatcatttcttggtgtgtttgtt--tctcttctctcc--ttatcttttgcttgtggttttgagtttttcactttg 32891337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Original strand, 30236080 - 30236294
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30236080 attgtaaacaccttgggatagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattgatgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 30236178  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  30236179 gaagctaatttcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggacc 30236278  T
Q  206 gaactgggtcaacaat 221  Q
    ||||| ||||||||||    
T  30236279 gaactaggtcaacaat 30236294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 4569906 - 4570120
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  4569906 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgttttgttctttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgagcttatt 4570005  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggac 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| || || ||| ||||||    
T  4570006 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctactccagagtaggtgaagtttggac 4570105  T
Q  205 cgaactgggtcaaca 219  Q
    |||||||||||||||    
T  4570106 cgaactgggtcaaca 4570120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23410547 - 23410271
Alignment:
Q  2 aaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaact 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||    
T  23410547 aaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattagtgaaatttggaaaatgggtagaaattatgtttattctttgtgagct 23410448  T
Q  102 tgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttg 201  Q
    |||| ||||||||||| | |||  |||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||    
T  23410447 tgtttaagctaatttcgtataacccatttgtatcactttgtaagaactcttagataatggattggagagataaatctctcccccaaattaggtcaagttg 23410348  T
Q  202 gaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagctttt 282  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23410347 gaacgaattgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt--tatattctct--ctttatcttttgcttgtggttttgagttttt 23410271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 54593659 - 54593871
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54593659 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgtgcagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 54593757  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  54593758 gaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtatgtcaagttggacc 54593857  T
Q  206 gaactgggtcaaca 219  Q
     |||||||| ||||    
T  54593858 aaactgggtgaaca 54593871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23198156 - 23197883
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  23198156 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgagattgggaaaaatggtagaaattagagttgttttttgtgaac 23198059  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-t 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||| |    
T  23198058 ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 23197959  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttg--ttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttt 273  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23197958 tggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtctttgttttcctcttctctctccttttatcttgtgcttgtggttt 23197883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 6095812 - 6095608
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  6095812 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttattcattggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggttgttctttgtaaacttctt 6095714  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||    
T  6095713 gaagttaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggacc 6095614  T
Q  206 gaactg 211  Q
    ||||||    
T  6095613 gaactg 6095608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 9636345 - 9636074
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattggga-aaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9636345 gaaatattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttggtcattggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaa 9636247  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag- 198  Q
    |||||  || ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| | || ||||||     
T  9636246 cttgtcaaaactaatttcttgtaacccttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccaaagtaggtcaagt 9636147  T
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttcctctcttctctccc-tttatcttttgcttgtg 269  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  9636146 ttgaaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtgtttgtttctctctgctctcccttttatcttgtgcttgtg 9636074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23200355 - 23200082
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23200355 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgagattgggaaaaatggtagaaattagagttgttctttgtgaac 23200258  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||    
T  23200257 ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 23200158  T
Q  201 -ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttc--tctccctttatcttttgcttgtggttt 273  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    |||||  ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23200157 tggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtctttgttttcttcttccctctccttttatcttatgcttgtggttt 23200082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 43402015 - 43401797
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43402015 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 43401917  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca-agttgga 203  Q
    ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||| || ||||  ||||||    
T  43401916 gaagctaatttcttgtaacgcattttttatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaaattaatctctcctccagagtaggtcatggttgga 43401817  T
Q  204 ccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  43401816 ccgaactgggtgaacaatct 43401797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 32744645 - 32744386
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||        |||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  32744645 gaaacattgtaaacacattgg-tgagtgaaaatcattgagtattttgt--------gagattgaaaaaatgggtagaaattagt-ttgttctttgtgagc 32744556  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||| ||||||||    
T  32744555 ttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatcactttgtaagaactctttgatagtggattgaagagataaatctatcccccagattaggtcaagtt 32744456  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggtttt 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||  |||||||||||||||||||||||    
T  32744455 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt--tctcatatct--ctttatcttttgcttgtggtttt 32744386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 43403958 - 43403740
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  43403958 attgtaaacactttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggcttgttctttgtgagcttgtt 43403860  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcat-ttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca-agttgga 203  Q
    |||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||  ||||||    
T  43403859 gaagctcatttcttgtaactcatgttttatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagattaatctctcctccagagtaggtcatggttgga 43403760  T
Q  204 ccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  43403759 ccgaactgggtgaacaatct 43403740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Original strand, 47304210 - 47304420
Alignment:
Q  10 taaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaag 109  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  47304210 taaacaccctgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatgggtagaaattatggttgttctttgtgagcttgttgaag 47304308  T
Q  110 ctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaac 209  Q
     |||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||    
T  47304309 ttaatatcttgtaacccatctgtatctcttcgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaagtttgaccgaac 47304408  T
Q  210 tgggtcaacaat 221  Q
    ||||||||||||    
T  47304409 tgggtcaacaat 47304420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 49199683 - 49199465
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  49199683 attgtaaacactttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcgttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgtt 49199585  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca-agttgga 203  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||  ||||||    
T  49199584 gaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagattaatctctcctccagactaggtcatggttgga 49199485  T
Q  204 ccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  49199484 ccgaactgggtgaacaatct 49199465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Original strand, 46173321 - 46173526
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||         ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46173321 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggt---------aaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 46173410  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  46173411 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaattcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggacc 46173510  T
Q  206 gaactgggtcaacaat 221  Q
    ||||| | ||||||||    
T  46173511 gaactagatcaacaat 46173526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 230
Target Start/End: Original strand, 46860427 - 46860653
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaat-cattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  46860427 attgtaaacaccttgggagagtgaaaattcaatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgt 46860526  T
Q  105 tgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca-agttgga 203  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| || ||||  ||||||    
T  46860527 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattggagagatcaatctttcctccagagtaggtcattgttgga 46860626  T
Q  204 ccgaactgggtcaacaatctttggtgt 230  Q
    ||||| ||| | |||| | ||||||||    
T  46860627 ccgaattggatgaacattttttggtgt 46860653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 41819737 - 41819523
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||   | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  41819737 attgtaaacaccttgggagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttttttgtgagcttgtc 41819638  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca-agttgga 203  Q
     |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || ||||  ||||||    
T  41819637 taagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagacatcaatctctcctccagagtaggtcattgttgga 41819539  T
Q  204 ccgaactgggtcaaca 219  Q
    || |||||||| ||||    
T  41819538 ccaaactgggtgaaca 41819523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 187
Target Start/End: Original strand, 36018806 - 36018987
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |   |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36018806 attgtaaacaccttgggagagtgaaaattaacgagtgacttgttcattggtgaaattgggaaaatgggttgaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 36018905  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattca-tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccag 187  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  36018906 gaagttaatttcttgtaactcattttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagaggtcaatctctcccccag 36018987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31340414 - 31340268
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  31340414 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgttttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattgaggttgttctttgtgagcttgtt 31340316  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcatt 153  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31340315 gaagctaatttcatgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcatt 31340268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 111 - 223
Target Start/End: Original strand, 40913352 - 40913464
Alignment:
Q  111 taatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaact 210  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40913352 taatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcatcgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttggaccgaact 40913451  T
Q  211 gggtcaacaatct 223  Q
    |||||||||||||    
T  40913452 gggtcaacaatct 40913464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 801091 - 801279
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcattt-gtatctcttt-gtaagaact 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||    
T  801091 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaact 801189  T
Q  150 cattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgtt 237  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  801190 cattgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 801279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 7780168 - 7779951
Alignment:
Q  55 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaagaactcatt 153  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  7780168 gtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaac-cttttgtatctcttttgtaagaactcatt 7780071  T
Q  154 gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttg--ttcctctcttctct 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||||  |||||||   ||||    
T  7780070 gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaagtgggtgaacaatctcttggtgtctttgttttcctcttccctct 7779971  T
Q  250 ccctttatcttttgcttgtg 269  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  7779970 ccttttatcttgtgcttgtg 7779951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 6 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 5434091 - 5433952
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattggga-aaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttg 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  5434091 attgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggagaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttg 5433993  T
Q  104 ttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaa 144  Q
    || |||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  5433992 ttaaagctaatttcttgtaacccttttatatctctttgtaa 5433952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 6716500 - 6716671
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaagaact 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||    
T  6716500 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 6716596  T
Q  150 cattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    | |||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6716597 ctttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 6716671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 35138915 - 35138746
Alignment:
Q  11 aaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattg-gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaag 109  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |   ||||||| | |||||||||||||||| | |||||||| ||||  |||||||||    
T  35138915 aaacaccttgggagagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatggaaagagattgag-aaatgggtagaaattatgtttgttcttggtgagtttgttgaag 35138817  T
Q  110 ctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctc 179  Q
     |||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  35138816 ttaatttcttgcaactcttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtggatggaagagaacaatctc 35138746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 54635125 - 54635296
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaagaact 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||    
T  54635125 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatcccttttgtaagaact 54635221  T
Q  150 cattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    | |||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  54635222 ctttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 54635296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 69 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 55302132 - 55302011
Alignment:
Q  69 atgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattc---------atttgtatctctttgtaagaactcattgatagt 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||         ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55302132 atgggtagaaattagggttgttctttgtaagtttgttgaagctaatttcttgtatttcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaattcattgatagt 55302033  T
Q  160 ggattggagagatcaatctctc 181  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  55302032 ggattggagagatcaatctctc 55302011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 26386692 - 26386597
Alignment:
Q  9 gtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 104  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  26386692 gtaaatactttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgt 26386597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 51352298 - 51352148
Alignment:
Q  32 atcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcattt 130  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||| |||| |||||| ||| || ||| |||||||||||||  |||||    
T  51352298 atcattgagtgtcttgtttattggtgagattaggaaaatga-tagaagttagggtttgttcattgtgagctttttaaagttaatttcttgtaac-cattt 51352201  T
Q  131 gtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctc 183  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  51352200 gtatttctttgtaataactcattgagagtggatttgagagatcaatctctctc 51352148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 171
Target Start/End: Original strand, 5373198 - 5373353
Alignment:
Q  19 tgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaattt 116  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5373198 tgggtgagggaaaatcattgagtgtcttgttcattgaagagattgggaaaaaagggtagaaattaggctttgttctttttgagcttgttgaagctaattt 5373297  T
Q  117 cttgtaattcatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagaga 171  Q
     ||||||  | ||| ||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||    
T  5373298 attgtaacccttttatatctctttgtaaggaactcattgccaatggattggagaga 5373353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 146 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 2075149 - 2075012
Alignment:
Q  146 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| || ||||||||||| |||||||||| |||| |  | ||||||||| ||  ||||||    
T  2075149 aactaattgatagtggatttgagagatcaatctctccccgagagtaggtcaagttggatcgaactgggtaaacatttctgggtgtgtttatt--tctctt 2075052  T
Q  246 ctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactt 287  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  2075051 ctct--ctttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcactt 2075012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 45282983 - 45283158
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt----gtaaga 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||  | |||||||| ||||    ||||||    
T  45282983 ttggtgagattgggaaaa-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-cttttgtatccctttttttgtaaga 45283079  T
Q  147 actcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||  ||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  45283080 actcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatct 45283158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4055926 - 4055796
Alignment:
Q  57 gagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaat-tcatttgtatctctttgtaagaa-ctcattg 154  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||  ||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  4055926 gagattgggaaa-tgggtagaaattagg-ttgttcttggagaacttgtaaaagttaatttcttgtaacctcttttgtatctctttgtaagaaactcattg 4055829  T
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagat 189  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||    
T  4055828 atagtggattgaagagatc--tctctcccccagat 4055796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 3617449 - 3617622
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||| |||| |||| ||||    
T  3617449 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaaagaac 3617545  T
Q  149 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  3617546 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 3617622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 281
Target Start/End: Original strand, 33191866 - 33192056
Alignment:
Q  86 ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcc 184  Q
    |||||||| | || |||||||||||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  33191866 ttgttcttagagagcttgttgaagctaagttcttgtaac-cattt-tatgtctttgtaaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctct-c 33191962  T
Q  185 cagattaagtca-agttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttt 281  Q
    ||||  | ||||  |||||||  |||| ||| |||| | |||||||||||||||    |||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  33191963 cagaggaggtcattgttggacaaaacttggtaaacattttttggtgtgtttgtt----tcttttctcgatttatcttttgtttgtggttttgtgcttt 33192056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 25491114 - 25491014
Alignment:
Q  74 tagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagat 172  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||| || | | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  25491114 tagaaattaggtttgttctttgagagcttgttgaagctgatttcttatactccttttgtatctctttgtaaagaaatcattgatagtgaagtggagagat 25491015  T
Q  173 c 173  Q
    |    
T  25491014 c 25491014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 25637426 - 25637599
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||| |||| |||| ||||    
T  25637426 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaaagaac 25637522  T
Q  149 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  25637523 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 25637599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 26323283 - 26323124
Alignment:
Q  11 aaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaag 109  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||   ||  |||||||||    
T  26323283 aaacaccttgagtgagtgaacatcattaagtgtcttgttcatgggatgagattgagaaaa-gggtaaaaattaggtttgtttttgaagagtttgttgaag 26323185  T
Q  110 ctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggaga 169  Q
    ||||||||||||||    ||||||| |||| || || ||||||||||||||| | ||||||    
T  26323184 ctaatttcttgtaacctttttgtatatcttggtaaaaaactcattgatagtgaagtggaga 26323124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 57 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4075636 - 4075443
Alignment:
Q  57 gagattgggaaaatgggtagaaattag--ggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaat-tcatttgtatctctttgtaagaa-ctcat 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||| | ||||||||  ||| |||||||||||||  || |||||||| ||||||||||| ||| |    
T  4075636 gagattgggaaa-tgggtagaaattattaggctgttcttagagaacttgtaaaagttaatttcttgtaacctcttttgtatcactttgtaagaaactctt 4075538  T
Q  153 tgatagtggattggagagatcaatctctctcccagat-taagtca-agttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctc 248  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||  ||||| ||||||||||| | ||| |||| ||||||||||| |||| |||||    
T  4075537 tgatagtggattggagagatca--ctctcccccagatgtaggtcattgttgggccgaactgggtaaccaaacttt-gtgtgtttgtttctctattctc 4075443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 20937668 - 20937826
Alignment:
Q  64 ggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttg-taagaactcattgatagtgga 162  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||| || | || |||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  20937668 ggaaaataggtagaaattatgtttgtttttggagagcttgttgaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgaaaagaactcattgata-taga 20937766  T
Q  163 ttggagagatcaatctctctcccagattaagtca-agttggaccgaactgggtcaacaat 221  Q
    |||||||||||||||  || |||| | || |||| |||||||| ||||| ||| ||||||    
T  20937767 ttggagagatcaatcgttcccccaaagtatgtcatagttggacagaactaggtaaacaat 20937826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Original strand, 1417529 - 1417597
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1417529 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctctt 1417597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Original strand, 3716041 - 3716109
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    ||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3716041 tctctctcctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctctt 3716109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 27305777 - 27305646
Alignment:
Q  153 tgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccc 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| | || ||||| ||||||||||||| ||  ||| |  || |||||||||||  ||||||||||       
T  27305777 tgatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaatttggaccgaactgtgtatacatttctttgtgtgtttgtt--tctcttctct--a 27305682  T
Q  253 tttatcttttgcttgtggttttgagcttttcacttt 288  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  27305681 tttatcttttgtttgtggttttgtgtttttcacttt 27305646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 245
Target Start/End: Original strand, 8370505 - 8370595
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  8370505 atagtggattggagagctgc-tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcctttctt 8370595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 54739102 - 54739004
Alignment:
Q  72 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggaga 169  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||| || ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54739102 ggtagaaattagtgtttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttat-gtaactcttttatatctctctgtaaagaactcattgatagtggattggaga 54739004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 2075266 - 2075156
Alignment:
Q  10 taaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaa 108  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||| ||| ||||||||||| ||  || ||    
T  2075266 taaacaccttgc-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgatattgggaaaaatggtagtaattagagttggttctttgtgagct--tttaa 2075170  T
Q  109 gctaatttcttgta 122  Q
    |||||||| |||||    
T  2075169 gctaatttattgta 2075156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25795829 - 25795767
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttc 238  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25795829 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgttc 25795767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 240
Target Start/End: Original strand, 27974971 - 27975056
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgttcct 240  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27974971 atagtggattggagagctgc-tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcct 27975056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Original strand, 30709829 - 30709899
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  30709829 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcctttctt 30709899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21711271 - 21711203
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21711271 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctttctt 21711203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26299036 - 26298968
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26299036 tctctcccccagattatgtcatattgaaccgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctctctt 26298968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 238
Target Start/End: Original strand, 27986465 - 27986548
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgttc 238  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27986465 atagtggattggagagctgc-tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttc 27986548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Original strand, 1736344 - 1736412
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  1736344 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat-attggtgtgtttgttcctttctt 1736412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Original strand, 18552922 - 18552990
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  18552922 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc-ttggtgtatttgttcctttctt 18552990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4598693 - 4598519
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  | |||||||||||||||||  |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  4598693 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 4598596  T
Q  149 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  4598595 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 4598519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4600914 - 4600740
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgta-tctctttgt-aagaac 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  | |||||||||||||||||  | |||||| ||  ||||| ||||||    
T  4600914 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaa-ccttttgtattccttttgtaaagaac 4600817  T
Q  149 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||| |||||  | ||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  4600816 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 4600740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 10056217 - 10056391
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  | |||||||||||||||||  |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  10056217 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 10056314  T
Q  149 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  10056315 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 10056391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 10058439 - 10058613
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  | |||||||||||||||||  |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  10058439 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 10058536  T
Q  149 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  10058537 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 10058613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 10060661 - 10060835
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  | |||||||||||||||||  |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  10060661 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 10060758  T
Q  149 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  10060759 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 10060835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 10062883 - 10063057
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  | |||||||||||||||||  |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  10062883 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 10062980  T
Q  149 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  10062981 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 10063057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 10065105 - 10065279
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  | |||||||||||||||||  |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  10065105 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 10065202  T
Q  149 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  10065203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 10065279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 10211393 - 10211567
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |  | |||||||||||||||||  |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  10211393 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 10211490  T
Q  149 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  10211491 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 10211567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 32143389 - 32143306
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgttc 238  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32143389 atagtggattggagagctgc-tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttttggtgtgtttgttc 32143306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Original strand, 40592821 - 40592884
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 240  Q
    |||||| | ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40592821 tctctcccacagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcct 40592884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16264418 - 16264328
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  16264418 atagtggattggagagctgc-tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctttttgtgtgtttgttcctttctt 16264328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 210 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 21351014 - 21350938
Alignment:
Q  210 tgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21351014 tgggtcaacaatttcttggtgtgtttgtttctct----tctcactttatcttatgcttgtggttatgagcttttcactttg 21350938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 237
Target Start/End: Original strand, 33386685 - 33386767
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgtt 237  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  33386685 atagtggattggagagctgc-tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatcttttggtgtgtttgtt 33386767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 245
Target Start/End: Original strand, 39040038 - 39040101
Alignment:
Q  183 cccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  39040038 cccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcctttctt 39040101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27453026 - 27452941
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgttcct 240  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27453026 atagtggattggagagctgc-tctctcccccggattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatcttttggtgtgtttgttcct 27452941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 37466339 - 37466278
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttc 238  Q
    |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  37466339 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgtgtcaacaatc-ttggtgtgtttgttc 37466278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 181
Target Start/End: Original strand, 39127572 - 39127678
Alignment:
Q  77 aaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgat-agtggattggagagatca 174  Q
    |||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||  ||||||||| || || || ||||||||||| | |||||| || ||||||    
T  39127572 aaattatgtttgttcttggtgagcttgttgaagctaatttcttatagtttttttgtatcttttcgtaaataactcattgataaatggatttgaaagatca 39127671  T
Q  175 atctctc 181  Q
    |||||||    
T  39127672 atctctc 39127678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 8166671 - 8166516
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaa--gtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 104  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |  || |||||||||| |  |||||| |  ||||| |||||||||||| |||||||| | ||  ||||    
T  8166671 ttgtaaacacattgggtgggtgaaaatcattgagtgtgtcttgttcatggaagagatt-gataaatgagtagaaattaggtttgttcttggagagtttgt 8166573  T
Q  105 tgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 160  Q
    ||||| |||| |||| |||    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  8166572 tgaagttaatatcttataacctttttgtatctctttgtaaagaacttgttgatagtg 8166516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 1314018 - 1313852
Alignment:
Q  7 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggt-gagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||| ||| |  |  ||||||| ||||| ||||| |||||| | || |||||| | || |||||    
T  1314018 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaatt-attgagtctcttattcttgagaagagattgagaaaa-gggtaaaaattatgttttgttcttggagagcttgt 1313921  T
Q  105 tgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagat 172  Q
    | |||||||||||||| ||  | ||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1313920 taaagctaatttcttgcaagccttttgtatatctttgaaaagaactcattgatattggattagagagat 1313852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 10209173 - 10209347
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgta-tctctttgt-aagaac 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| | |||||| |  | |||||||||||||||||  |  ||||| ||  ||||| ||||||    
T  10209173 ttggtgagattggg-aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtagtccttttgtaaagaac 10209270  T
Q  149 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| || |||||| ||||||| |||||||| | ||||||    
T  10209271 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaactgggtgaccaatct 10209347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 28253416 - 28253364
Alignment:
Q  72 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaa 123  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  28253416 ggtagaaattagggttcgttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaa 28253364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 48438262 - 48438199
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcct 240  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  48438262 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaataatc-ttggtgtgtttgttcct 48438199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 206 - 245
Target Start/End: Original strand, 3328425 - 3328463
Alignment:
Q  206 gaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3328425 gaactgggtcaacaatctt-ggtgtgtttgttcctctctt 3328463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 178 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36029139 - 36029073
Alignment:
Q  178 tctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||| ||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  36029139 tctcccccagattaggtcatattggacagaactgggtcaacaatc-tcggtgtgtttgttcctttctt 36029073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 101 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 40519316 - 40519258
Alignment:
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagt 159  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40519316 ttgttgaagttaatttcttgtaa-tattttgtatctctttgtaaagaactcattgatagt 40519258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 245
Target Start/End: Original strand, 6794732 - 6794820
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| |||| |||| ||||  ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  6794732 atagtggattggagagctgc-tctctcccccatattaggtcatattggacctaaccgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctttctt 6794820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 160
Target Start/End: Original strand, 24635276 - 24635366
Alignment:
Q  71 gggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtg 160  Q
    |||||||||||| | |||||||| | ||  |||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||| |||  || ||||||||||||    
T  24635276 gggtagaaattaagtttgttcttggagagtttgttgaagctaattttttgtaactattttgtatctctttataatcaattcattgatagtg 24635366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 31340272 - 31340242
Alignment:
Q  125 tcatttgtatctctttgtaagaactcattga 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31340272 tcatttgtatctctttgtaagaactcattga 31340242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 35925526 - 35925468
Alignment:
Q  181 ctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgttc 238  Q
    |||||| |||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35925526 ctcccaaattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttttggtgtgtttgttc 35925468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 238
Target Start/End: Original strand, 47923945 - 47924006
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttc 238  Q
    |||||| || |||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47923945 tctctcccctagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttc 47924006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 50432818 - 50432733
Alignment:
Q  56 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttg 141  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||||  || |||| | || | |||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||    
T  50432818 tgagattcgggaaaagggtagaaattaggtctgctcttggagagcgtgttgaagttaatttcttgcaaatcttttgtatctctttg 50432733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 458499 - 458543
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  458499 tctctcccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaa 458543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 1313624 - 1313668
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1313624 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 1313668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 1321694 - 1321738
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1321694 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 1321738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 3148144 - 3148088
Alignment:
Q  67 aaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaa 123  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||   || ||||||||||||||||||||||||    
T  3148144 aaatggatagaaattaggtttcttcttgaagagcttgttgaagctaatttcttgtaa 3148088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 3859742 - 3859786
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3859742 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 3859786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 140
Target Start/End: Original strand, 4386868 - 4386941
Alignment:
Q  66 aaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt 140  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  4386868 aaaatgagtagaaattaggttttgttctttgtgagctttt--aagctaatttcttgtaacccatttgtatcacttt 4386941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 5886413 - 5886457
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5886413 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 5886457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 5899886 - 5899930
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5899886 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 5899930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 6484575 - 6484619
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6484575 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 6484619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 7606630 - 7606586
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7606630 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 7606586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 123
Target Start/End: Original strand, 10067327 - 10067398
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaa 123  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| | |||||| |  | |||||||||||||||||    
T  10067327 ttggtgagattggg-aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaa 10067398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10958365 - 10958321
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10958365 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 10958321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 238
Target Start/End: Original strand, 24695213 - 24695264
Alignment:
Q  186 agattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttc 238  Q
    |||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24695213 agattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttc 24695264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 25389120 - 25389164
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25389120 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 25389164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 238
Target Start/End: Original strand, 26928620 - 26928702
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgttc 238  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| ||||||||| ||||  |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26928620 atagtggattggagagttgc-tctctcccccagattaggtcatattgg-ctgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttc 26928702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27635700 - 27635656
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27635700 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 27635656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 32219300 - 32219344
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    ||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  32219300 tctctctcccagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaa 32219344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 35919157 - 35919113
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35919157 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 35919113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 160
Target Start/End: Original strand, 41510307 - 41510371
Alignment:
Q  97 gaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 160  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| | || |||| ||||||||||    
T  41510307 gaacatgttgaagctaatttcttgtaactcgtttgtatctttttataaataactaattgatagtg 41510371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 41849274 - 41849318
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41849274 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 41849318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 42990519 - 42990563
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42990519 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 42990563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 42992485 - 42992529
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42992485 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 42992529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 43421457 - 43421413
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43421457 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 43421413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 53894099 - 53894055
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53894099 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 53894055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 4 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 20631 - 20346
Alignment:
Q  4 acattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  20631 acattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtttattattcattggtgagattgggaaaatgagcagaaattaggtttgttttttgtgaacttg 20532  T
Q  104 ttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttgga 203  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  20531 ttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgatattggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttgga 20432  T
Q  204 ccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  20431 ccgaactgggtcaacaatttttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgtgtttttcactttg 20346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 114552 - 114840
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  114552 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattaaggttgttctttgtgaac 114650  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-t 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || || ||| |    
T  114651 ttgtcaaagctaatttcttgtaacgcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggttaagtt 114750  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    | ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  114751 tagaccgaactggatgaacaatctttggtgtgcttgtttctctcttctctccttttatctttttcttgttgttttgtgcttttcactttg 114840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 178; Significance: 5e-96; HSPs: 4)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 149316 - 149037
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| | |    
T  149316 gaaacattgtaaacaccttggggtagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaacggatagaaattagggttgttttttgtaagc 149217  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagtt 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||    
T  149216 ttgttgaagctaatttcttgttacccatttatatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaagtt 149117  T
Q  201 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttca 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  149116 ggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtatttgtt--tctcttctct--ctttatcttttgcttgtggttttgtacttttca 149037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5731 - 5663
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  5731 tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctttctt 5663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2538 - 2472
Alignment:
Q  178 tctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2538 tctcccccagattaggtcatattggagcgaactgggtcaacaatc-ttggtgtgtttgttcctttctt 2472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 240
Target Start/End: Original strand, 133309 - 133394
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgttcct 240  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| |||| |||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  133309 atagtggattggagagctgc-tctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcct 133394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 11507 - 11777
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11507 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaac 11605  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-t 199  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||| |    
T  11606 ttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 11705  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatct-ttggtgtgtttgttcctctcttctctccc-tttatcttttgcttgtg 269  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11706 tggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtatttgtttatctcttctctcccttttatcttgtgcttgtg 11777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 289
Target Start/End: Original strand, 434483 - 434771
Alignment:
Q  2 aaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattggg-aaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaac 100  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  434483 aaacatggtaaataccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaac 434581  T
Q  101 ttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-t 199  Q
    ||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||| |    
T  434582 ttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 434681  T
Q  200 tggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccc-tttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  434682 tggaccgaactgggtgaacaatatttggtgtgtttgtttctctcttctctcccttttatcttgtgcttgt-gttttgtgcttttcactttg 434771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 490468 - 490355
Alignment:
Q  73 gtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagaga 171  Q
    |||||||||| | |||||||| | || |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||    
T  490468 gtagaaattaagtttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatatctttgtaaagtactcattgatagtgaagcggagaga 490369  T
Q  172 tcaatctctctccc 185  Q
    ||| ||||||||||    
T  490368 tcattctctctccc 490355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 866 - 1153
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaat-gggtagaaattagggttgttctttgtgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  866 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaa 963  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag- 198  Q
    |||||  |||||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||||||     
T  964 cttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-aacaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagt 1062  T
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtg-tttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  1063 ttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgttttgtttctctcttctctccttttatactttgcttgtgg-tttgtgcttttcactttg 1153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Original strand, 7282 - 7494
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  7282 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgtt 7380  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggacc 205  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||| || || ||||||||||    
T  7381 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggaaagatcaatctctcctctagagtaggttaagttggacc 7480  T
Q  206 gaactgggtcaaca 219  Q
    ||||||||| ||||    
T  7481 gaactgggtgaaca 7494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11380 - 11105
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattggga-aaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11380 gaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgtaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaa 11283  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag 198  Q
    |||||  || ||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||||||    
T  11282 cttgtaaaatctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcgttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaag 11183  T
Q  199 -ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttg--ttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttt 273  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||   |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  11182 tttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtctttgttttcctcttccctctccttttatcttgtgcttgtggttt 11105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 8954 - 8664
Alignment:
Q  1 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattggga-aaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8954 gaaacattgtaaagaccttgg-tgagtgtaaaccattgagtgtcttgttc-ttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaa 8857  T
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctc-tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag 198  Q
    ||| |  || ||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || ||||||    
T  8856 cttataaaatctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcgttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaag 8757  T
Q  199 -ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttg--ttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactttg 289  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||   |||| | |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  8756 tttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtctttgttttcctcttccctcttcttttatcttgtgcttgtgg-tttgtgcttttcactttg 8664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18216 - 18004
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | || | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  18216 attgtaaacactttgggagagtgaaaatcatga-gtgttttgttcattggtgagagtgggaaaattggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgtt 18118  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggac 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  || |||||| |||||     
T  18117 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaa-aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagggtaggtcaagtttggat 18019  T
Q  205 cgaactgggtcaaca 219  Q
    |||||||||| ||||    
T  18018 cgaactgggtgaaca 18004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17311 - 17243
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    ||||| ||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  17311 tctctttcccatattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaat-tttggtgtgtttgctcctttctt 17243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 6 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 80496 - 80338
Alignment:
Q  6 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtt 105  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  80496 attgtgaacaccttgggagagtgaaaatcatga-gtgtcttgttcattgctgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 80398  T
Q  106 gaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattg 165  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  80397 gaagctaatttcttgcaacccatttgtatctttttgtaagaactcatagatagtgaattg 80338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27563 - 27378
Alignment:
Q  100 cttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtca-a 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||      
T  27563 cttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaaataacttattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatagtaggtcatt 27464  T
Q  198 gttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcactt 287  Q
    ||||||||||| | ||| |||| |  ||| ||||||| ||  ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  27463 gttggaccgaattaggtaaacatttattgatgtgtttatt--tctcttctct--ctttaccttttgcttgtggttttgtgtttttcactt 27378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 219
Target Start/End: Original strand, 10468 - 10656
Alignment:
Q  30 aaatcattaagtatcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcat 128  Q
    ||||| || ||| ||||||||||| |||||||||| ||||  | || ||||||||||| ||||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||    |    
T  10468 aaatctttgagtgtcttgttcatttgtgagattggaaaaaaagatataaattagggtttgttctttgtgagctc-ttgt-gctaatttattgtaaccatt 10565  T
Q  129 ttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaaca 219  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  10566 ttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtaaaca 10656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2773 - 2598
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||| |||| |||| ||||    
T  2773 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtatcccttttgtaaagaac 2677  T
Q  149 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatcttt 225  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  2676 tcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatcttt 2598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3895 - 3722
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 148  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||  |||||||||||||||||  |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  3895 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 3799  T
Q  149 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  3798 tcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 3722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 6272 - 6445
Alignment:
Q  52 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctc-tttgt-aagaac 148  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||  |  ||||||| | ||||| ||||||    
T  6272 ttggtgagattggg-aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-gcccttgtatcccttttgtaaagaac 6368  T
Q  149 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 223  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| || || ||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  6369 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggttaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 6445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 237
Target Start/End: Original strand, 8448 - 8530
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgtt 237  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8448 atagtggattggagagctgc-tctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgtt 8530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 173
Target Start/End: Original strand, 25065 - 25175
Alignment:
Q  63 gggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtgg 161  Q
    |||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  25065 gggaaaatgg-tagaaactagttttgttctttgagagtttgttgaaggtaatttcttgtaacctttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtga 25163  T
Q  162 attggagagatc 173  Q
    | | ||||||||    
T  25164 agtagagagatc 25175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1668 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1668
Description:

Target: scaffold1668; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 1502 - 1434
Alignment:
Q  216 aacaatctttggtgtgtttgttcctctcttctctccctttatcttttgcttgtggttttgagcttttcacttt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  1502 aacaatctttggtgtgtttgtt--tctcttctctc--tttatcttttgcttgtggttttatgtttttcacttt 1434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10777 - 10709
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| |||| |||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  10777 tctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatc-ttggtgtgtttgttcctctctt 10709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 245
Target Start/End: Original strand, 36891 - 36951
Alignment:
Q  186 agattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgttcctctctt 245  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  36891 agattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcctttctt 36951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 240
Target Start/End: Original strand, 44033 - 44075
Alignment:
Q  199 ttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgttcct 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44033 ttggaccgaactgggtcaacaatcttttggtgtgtttgttcct 44075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 45321 - 45238
Alignment:
Q  155 atagtggattggagagatcaatctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaatc-tttggtgtgtttgttc 238  Q
    |||||||||||||||| |   |||||| ||||||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  45321 atagtggattggagagctgc-tctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactgagtcaacaatcttttggtgtgtttgttc 45238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1497 - 1453
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1497 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 1453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Original strand, 29414 - 29458
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29414 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 29458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 69336 - 69292
Alignment:
Q  176 tctctctcccagattaagtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 220  Q
    |||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  69336 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 69292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University