View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14040_low_7 (Length: 564)

Name: NF14040_low_7
Description: NF14040
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14040_low_7
NF14040_low_7
[»] scaffold0386 (2 HSPs)
scaffold0386 (16-473)||(675-1131)
scaffold0386 (407-456)||(1284-1333)
[»] chr4 (3 HSPs)
chr4 (16-472)||(33878822-33879268)
chr4 (473-536)||(46550552-46550615)
chr4 (407-476)||(33878600-33878669)
[»] chr5 (5 HSPs)
chr5 (17-474)||(13869443-13869892)
chr5 (122-472)||(27641144-27641494)
chr5 (17-69)||(27641077-27641129)
chr5 (407-473)||(27640854-27640920)
chr5 (407-452)||(13869240-13869285)
[»] chr7 (3 HSPs)
chr7 (17-474)||(29735099-29735563)
chr7 (400-455)||(8721235-8721290)
chr7 (407-449)||(29735715-29735759)
[»] chr3 (2 HSPs)
chr3 (55-456)||(49850835-49851241)
chr3 (411-456)||(49851426-49851471)
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (273-478)||(38460745-38460951)
chr8 (17-89)||(38460630-38460702)
chr8 (136-185)||(38460700-38460749)
chr8 (414-456)||(38460427-38460469)


Alignment Details
Target: scaffold0386 (Bit Score: 392; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0386
Description:

Target: scaffold0386; HSP #1
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 1131 - 675
Alignment:
Q  16 actcattgcaacaccataattaacggatccaaatcatgcagagattgtttctaaaccatgctgtattgggtgttattgcaatccaatcgagcaatgggtc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1131 actcattgcaacaccataattaacggatccaaatcatgcagagattgtttctaaaccatgctgtattgggtgttattgcaatccaatcgagcaatgggtc 1032  T
Q  116 aaattatattaaaatagttagttttaataactttgcatttggaaattcaaatctcttgaaatgttgaaattttctcttccatgagttgagatatggtggc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1031 aaattatattaaaatagttagttttaataactttgcatttggaaattcaaatctcttgaaatgttgaaattttctcttccatgagttgagatatggtggc 932  T
Q  216 tgaatgnnnnnnnaaggttgatgaacatgttcctagattttcacaaacactattagagaaatataaaacaagaacatagattcagtttatgagcgattca 315  Q
    ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  931 tgaatgtttttttaaggttgatgaacatgttcctagattttcacaaacactattaaagaaatataaaacaagaacatagattcagtttatgagcgattca 832  T
Q  316 aaataaaacatgatctataccacgttgcaaaaggatgacgatggttctgtttctattttcatttgttttaaatnnnnnnntaataatgatatgtcatgat 415  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        |||||||||||||||||||    
T  831 aaataagacatgatctataccacgttgcaaaaggatgacgatggttctgtttctattttcattttttttaaataaaaaaa-aataatgatatgtcatgat 733  T
Q  416 tttattggatgtttgtaagtgccacatgttatgtacgtttccatgtaaaaatttctct 473  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  732 ttcattggatgtttgtaagtgccacatgttatgtacgtttccatgtaaaaatttctct 675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0386; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 407 - 456
Target Start/End: Original strand, 1284 - 1333
Alignment:
Q  407 tgtcatgattttattggatgtttgtaagtgccacatgttatgtacgtttc 456  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1284 tgtcatgattttattggatgtttgtaagtgtcacatgttatgtacgtttc 1333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 369; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 472
Target Start/End: Original strand, 33878822 - 33879268
Alignment:
Q  16 actcattgcaacaccataattaacggatccaaatcatgcagagattgtttctaaaccatgctgtattgggtgttattgcaatccaatcgagcaatgggtc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33878822 actcattgcaacaccataattaacggatccaaatcatgcggagattgtttctaaaccatgctgtattgggtgttattgcaatccaatcgagcaatgggtc 33878921  T
Q  116 aaattatattaaaatagttagttttaataactttgcatttggaaattcaaatctcttgaaatgttgaaattttctcttccatgagttgagatatggtggc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33878922 aaattatattaaaatagttagttttaataactttgcatttggaaattcaaatctcttgaaatgttgaaattttctcttccatgagttgagatatggtggc 33879021  T
Q  216 tgaatgnnnnnnnaaggttgatgaacatgttcctagattttcacaaacactattagagaaatataaaacaagaacatagattcagtttatgagcgattca 315  Q
    ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33879022 tgaatgtttttttaaggttgatgaacatgttcctagattttcacaaacactattaaagaaatataaaacaagaacatagattcagtttatgagcgattca 33879121  T
Q  316 aaataaaacatgatctataccacgttgcaaaaggatgacgatggttctgtttctattttcatttgttttaaatnnnnnnntaataatgatatgtcatgat 415  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |           |||||||||||||| |||    
T  33879122 aaataagacatgatctataccacgttgcaaaaggatgacgatggttctgtttctattttcattttttttta----------tataatgatatgtcacgat 33879211  T
Q  416 tttattggatgtttgtaagtgccacatgttatgtacgtttccatgtaaaaatttctc 472  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33879212 ttcattggatgtttgtaagtgccacatgttatgtacgtttccatgtaaaaatttctc 33879268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 473 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 46550615 - 46550552
Alignment:
Q  473 tagtttataaagataaacactacttaaaaacaaagtctaccttttaatgttgattgtgtaataa 536  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46550615 tagtttataaagataaacactacttaaaaacaaagtctaccttttaatgttgattgtgtaataa 46550552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 407 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 33878669 - 33878600
Alignment:
Q  407 tgtcatgattttattggatgtttgtaagtgccacatgttatgtacgtttccatgtaaaaatttctctagt 476  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||    
T  33878669 tgtcatgatttcattggatgtttgtaagtgccacatgttatgtacgtttctatgcaagtatttctctagt 33878600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 474
Target Start/End: Original strand, 13869443 - 13869892
Alignment:
Q  17 ctcattgcaacaccataattaacggatccaaatcatgcagagattgtttctaaaccatgctgtattgggtgttattgcaatccaatcgagcaatgggtca 116  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869443 ctcattgtaacaccataattaacggatccaaatcatgtagagattgtttctaaatcatgctgtattgggtgttattgcaatccaatcgagcaatgggtca 13869542  T
Q  117 aattatattaaaatagttagttttaataactttgcatttggaaattcaaatctcttgaaatgttgaaattttctcttccatgagttgagatatggtggct 216  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869543 aattctattaaaatagttagttttaataactttgcatttggaaattcagatctcttgaaaggttgaaattttctcttccatgagttgagatatggtggct 13869642  T
Q  217 gaatgnnnnnnnaaggttgatgaacatgttcctagattttcacaaacactattagagaaatataaaacaagaacatagattcagtttatgagcgattcaa 316  Q
    |||||       ||||||       ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869643 gaatgtttttttaaggtt-------atgttcctagattttcagaaacactaatagagaaatataaaacaagaacatagattcagtttatgagcgattcaa 13869735  T
Q  317 aataaaacatgatctataccacgttgcaaaaggatgacgatggttctgtttctattttcatttgttttaaatnnnnnnntaataatgatatgtcatgatt 416  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        ||||||||||||||||||||    
T  13869736 aataagacatgatctataccacgatgcaaaaggatgacgatggttctgtttctattttcattttttttaaattaaaaaa-aataatgatatgtcatgatt 13869834  T
Q  417 ttattggatgtttgtaagtgccacatgttatgtacgtttccatgtaaaaatttctcta 474  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13869835 tcattgaatgtttgtaagtgccacatgttatgtacgtttctatgtaaaaatttctcta 13869892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 122 - 472
Target Start/End: Original strand, 27641144 - 27641494
Alignment:
Q  122 tattaaaatagttagttttaataactttgcatttggaaattcaaatctcttgaaatgttgaaattttctcttccatgagttgagatatggtggctgaatg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  27641144 tattaaaatagttagttttaataactttgcatttggaaattcagatctcttgaaaggttgaaattttctcttccatgagttgacatatggtgggtgaatg 27641243  T
Q  222 nnnnnnnaaggttgatgaacatgttcctagattttcacaaacactattagagaaatataaaacaagaacatagattcagtttatgagcgattcaaaataa 321  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27641244 tttttttaaggttgatgaacatgttcctagattttcagaaacactaatagagaaatataaaacaagaacatagattcagtttatgagcgattcaaaataa 27641343  T
Q  322 aacatgatctataccacgttgcaaaaggatgacgatggttctgtttctattttcatttgttttaaatnnnnnnntaataatgatatgtcatgattttatt 421  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||         ||||||||||||||||||||| |||    
T  27641344 gacatgatctataccacgatgcaaaaggatgacgatggttctgtttctattttcatttttttttaaattaaaaaaaataatgatatgtcatgatttcatt 27641443  T
Q  422 ggatgtttgtaagtgccacatgttatgtacgtttccatgtaaaaatttctc 472  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  27641444 gaatgtttgtaagtgccacatgatatgtacgtttctatgtaaaaatttctc 27641494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 69
Target Start/End: Original strand, 27641077 - 27641129
Alignment:
Q  17 ctcattgcaacaccataattaacggatccaaatcatgcagagattgtttctaa 69  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27641077 ctcattgtaacaccataattaacggatccaaatcatgtagagattgtttctaa 27641129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 407 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 27640920 - 27640854
Alignment:
Q  407 tgtcatgattttattggatgtttgtaagtgccacatgttatgtacgtttccatgtaaaaatttctct 473  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||  ||||||||    
T  27640920 tgtcatgatttcattggatgtttgtaagtgccacatgttatgtacgcttctatgcaagtatttctct 27640854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 407 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 13869285 - 13869240
Alignment:
Q  407 tgtcatgattttattggatgtttgtaagtgccacatgttatgtacg 452  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869285 tgtcatgatttcattggatgtttgtaagtgccacatgttatgtacg 13869240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 3)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 17 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 29735563 - 29735099
Alignment:
Q  17 ctcattgcaacaccataattaacggatccaaatcatgcagagattgtttctaaaccatgctgtattgggtgttattgcaatccaatcgagcaatgggtca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29735563 ctcattgcaacaccataattaacggatccaaatcatgtagagattgtttctaaaccatactgtattgggtgttattgcaatccaatcgagcaatgggtta 29735464  T
Q  117 aattatattaaaatagttagttttaataacttt------gcatttggaaattcaaatctcttgaaatgttgaaattttctcttccatgagttgagatatg 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29735463 aattctattaaaatagttagttttaataactttttgtatgcatttggaaattcagatctcttaaaaggttgaaattttctcttccatgagttgagatatg 29735364  T
Q  211 gtggctgaatgnnnnnnnaaggttgatgaacatgttcctagattttcacaaacactattagagaaatataaaacaagaacatagattcagtttatgagcg 310  Q
    |||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29735363 gtggctgaatgtttttttaaggttgatgaacatgttcctagattttcataaacactattagagaaatattaaacaagaacatagattcagtttatgagcg 29735264  T
Q  311 attcaaaataaaacatgatctataccacgttgcaaaaggatgacgatggttctgtttctattttc--atttgttttaaatnnnnnnntaataatgatatg 408  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||        ||||||||||||    
T  29735263 attcaaaataagacatgatctataccacgatgcaaaagaatgacgatggttctgtttctattttcatattttttttaaattaaaaaa-aataatgatatg 29735165  T
Q  409 tcatgattttattggatgtttgtaagtgccacatgttatgtacgtttccatgtaaaaatttctcta 474  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  29735164 tcataattttattggatgtttgtaagtgccacatgttatgtaagtttctatgtaagaatttctcta 29735099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 455
Target Start/End: Original strand, 8721235 - 8721290
Alignment:
Q  400 aatgatatgtcatgattttattggatgtttgtaagtgccacatgttatgtacgttt 455  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||    
T  8721235 aatgacatgtcatgtttttattggatgtttctaaatgccacgtgttatgttcgttt 8721290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 407 - 449
Target Start/End: Original strand, 29735715 - 29735759
Alignment:
Q  407 tgtcatgattttattggat--gtttgtaagtgccacatgttatgt 449  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29735715 tgtcatgatttcattggatatgtttgtaagtgccacatgttatgt 29735759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 2)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 55 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 49851241 - 49850835
Alignment:
Q  55 agagattgtttctaaaccatgctgtattgggtgttatt---gcaatccaatcgagcaatgggtcaaattatattaaaatagttagttttaataactttgc 151  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49851241 agagattgtttctaaatcatgctgtattgggtgttattattgcaatccaattgagcaatgggtcaaattctattaaaatagttagttttaataactttgc 49851142  T
Q  152 atttggaaattcaaatctcttgaaatgttgaaattttctcttccatgagttgagatatggtggctgaatgnnnnnnnaaggttgat---gaacatgttcc 248  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||       |||||||||   |||||||||||    
T  49851141 atttggaaattcagatctcttaaaaggttgaaattttctcttccatgagttgagatatgatggccgaatgtttttttaaggttgatattgaacatgttcc 49851042  T
Q  249 tagattttcacaaacactattagagaaatataaaacaagaacatagattcagtttatgagcgattcaaaataaaacatgatctataccacgttgcaaaag 348  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  49851041 tagattttcagaaatactattagagaaatataaaacaagaacatagattcagtttatgagcgattcaaaataagacatgatctataccacgatgcaaaag 49850942  T
Q  349 gatgacgatggttctgtttctattttcatttgttttaaatnnnnnnntaataatgatatgtcatgattttattggatgtttgtaagtgccacatgttatg 448  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||        | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49850941 gatgacgatggttatgtttctattttcatttttttttaattaaaaaa-agtaatgatatgtcatgatttcattgaatgtttgtaagtgccacatgttatg 49850843  T
Q  449 tacgtttc 456  Q
    ||||||||    
T  49850842 tacgtttc 49850835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 411 - 456
Target Start/End: Original strand, 49851426 - 49851471
Alignment:
Q  411 atgattttattggatgtttgtaagtgccacatgttatgtacgtttc 456  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49851426 atgatttcattggatgtttgtaagtgccacatgttatgtatgtttc 49851471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 150; Significance: 5e-79; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 273 - 478
Target Start/End: Original strand, 38460745 - 38460951
Alignment:
Q  273 gaaatataaaacaagaacatagattcagtttatgagcgattcaaaataaaacatgatctataccacgttgcaaaaggatgacgatggttctgtttctatt 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38460745 gaaatataaaacaagaacatagatttagtttatgagcgattcaaaataagacatgatctataccacgttgcaaaaggatgacgatggttctgtttctatt 38460844  T
Q  373 ttca-tttgttttaaatnnnnnnntaataatgatatgtcatgattttattggatgtttgtaagtgccacatgttatgtacgtttccatgtaaaaatttct 471  Q
    |||| ||| ||||||||        ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38460845 ttcatttttttttaaattaaaaataaataatgatatgtcatgatttcattggatgtttgtaagtgccacatgttatgtacgtttctatgtaaaaatttct 38460944  T
Q  472 ctagttt 478  Q
    || ||||    
T  38460945 cttgttt 38460951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 89
Target Start/End: Original strand, 38460630 - 38460702
Alignment:
Q  17 ctcattgcaacaccataattaacggatccaaatcatgcagagattgtttctaaaccatgctgtattgggtgtt 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38460630 ctcattgcaacaccataattaacggatccaaatcatgcagagattgtttctaaaccatgttgtattgggtgtt 38460702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 185
Target Start/End: Original strand, 38460700 - 38460749
Alignment:
Q  136 gttttaataactttgcatttggaaattcaaatctcttgaaatgttgaaat 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38460700 gttttaataactttgcatttggaaattcaaatctcttgaaaggttgaaat 38460749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 414 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 38460469 - 38460427
Alignment:
Q  414 attttattggatgtttgtaagtgccacatgttatgtacgtttc 456  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38460469 atttcattggatgtttgtaagtgccacatgttatgtacgtttc 38460427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University