View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1406_low_30 (Length: 311)

Name: NF1406_low_30
Description: NF1406
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1406_low_30
NF1406_low_30
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (1-245)||(39548-39792)
scaffold0010 (15-245)||(44656-44886)
scaffold0010 (1-135)||(4870-5004)
scaffold0010 (71-243)||(14271-14443)
[»] chr7 (40 HSPs)
chr7 (1-245)||(26091997-26092241)
chr7 (1-242)||(26115789-26116030)
chr7 (1-245)||(13965867-13966111)
chr7 (1-245)||(40925016-40925260)
chr7 (1-245)||(49155107-49155351)
chr7 (1-245)||(21755218-21755462)
chr7 (1-245)||(12459434-12459678)
chr7 (13-245)||(14283585-14283817)
chr7 (1-245)||(16947671-16947915)
chr7 (1-245)||(13024151-13024395)
chr7 (1-245)||(14140485-14140729)
chr7 (1-245)||(15343237-15343481)
chr7 (1-245)||(11385628-11385872)
chr7 (12-245)||(13676257-13676490)
chr7 (1-245)||(12798700-12798944)
chr7 (1-245)||(15099802-15100046)
chr7 (1-245)||(18051152-18051396)
chr7 (1-245)||(19149817-19150061)
chr7 (1-245)||(20749216-20749460)
chr7 (1-245)||(14261445-14261688)
chr7 (1-245)||(12203999-12204243)
chr7 (1-243)||(14957361-14957603)
chr7 (1-243)||(44788572-44788814)
chr7 (1-243)||(11550323-11550565)
chr7 (1-243)||(14335203-14335445)
chr7 (1-243)||(15146144-15146386)
chr7 (1-243)||(18180550-18180792)
chr7 (1-243)||(8710412-8710654)
chr7 (1-243)||(13688848-13689090)
chr7 (1-243)||(18587392-18587634)
chr7 (71-243)||(8200855-8201027)
chr7 (1-243)||(11234434-11234676)
chr7 (1-240)||(17703676-17703915)
chr7 (89-243)||(10873497-10873651)
chr7 (89-243)||(12690309-12690463)
chr7 (1-243)||(15158278-15158520)
chr7 (71-191)||(9591223-9591343)
chr7 (1-135)||(14042610-14042744)
chr7 (1-135)||(14352640-14352774)
chr7 (2-34)||(13459049-13459081)
[»] chr4 (41 HSPs)
chr4 (1-245)||(3262006-3262250)
chr4 (1-242)||(44659078-44659319)
chr4 (1-245)||(29450749-29450993)
chr4 (1-245)||(11204444-11204688)
chr4 (1-245)||(20892847-20893091)
chr4 (1-170)||(16150527-16150696)
chr4 (1-170)||(16154673-16154842)
chr4 (1-245)||(51604004-51604248)
chr4 (1-245)||(15073175-15073419)
chr4 (1-245)||(27903201-27903445)
chr4 (32-245)||(15354283-15354496)
chr4 (1-141)||(14993579-14993719)
chr4 (1-134)||(53750682-53750815)
chr4 (1-243)||(14696919-14697161)
chr4 (1-243)||(18224398-18224640)
chr4 (1-243)||(8389230-8389472)
chr4 (1-243)||(12479418-12479660)
chr4 (1-243)||(16233944-16234186)
chr4 (1-243)||(14162288-14162530)
chr4 (1-243)||(14683385-14683627)
chr4 (1-243)||(17092101-17092343)
chr4 (1-101)||(15266736-15266836)
chr4 (1-243)||(19634954-19635196)
chr4 (1-243)||(23958565-23958807)
chr4 (97-245)||(15258743-15258891)
chr4 (1-243)||(8050575-8050817)
chr4 (1-243)||(14300931-14301173)
chr4 (1-195)||(15144844-15145038)
chr4 (1-243)||(19775745-19775987)
chr4 (1-243)||(40475858-40476100)
chr4 (71-243)||(16250872-16251044)
chr4 (1-135)||(15987-16121)
chr4 (1-243)||(27714154-27714396)
chr4 (1-48)||(7357280-7357327)
chr4 (157-237)||(8708731-8708811)
chr4 (1-216)||(16350506-16350721)
chr4 (107-243)||(16219048-16219184)
chr4 (1-61)||(16219188-16219248)
chr4 (107-243)||(16222368-16222504)
chr4 (1-61)||(16222508-16222568)
chr4 (71-117)||(13513294-13513340)
[»] chr1 (30 HSPs)
chr1 (1-245)||(48425735-48425979)
chr1 (1-245)||(52988603-52988847)
chr1 (1-242)||(37679914-37680155)
chr1 (1-245)||(31537281-31537525)
chr1 (1-245)||(38910110-38910354)
chr1 (1-245)||(20297243-20297487)
chr1 (69-245)||(12200380-12200556)
chr1 (1-245)||(24096899-24097143)
chr1 (1-134)||(20074993-20075126)
chr1 (1-245)||(19857136-19857380)
chr1 (1-245)||(20833184-20833428)
chr1 (1-245)||(22016029-22016273)
chr1 (1-245)||(21739320-21739564)
chr1 (11-176)||(18710316-18710481)
chr1 (1-245)||(20854044-20854288)
chr1 (1-245)||(21742836-21743080)
chr1 (1-243)||(16378927-16379169)
chr1 (1-216)||(20081660-20081875)
chr1 (1-243)||(16347879-16348121)
chr1 (1-243)||(51330776-51331018)
chr1 (1-243)||(17042299-17042541)
chr1 (1-243)||(21833135-21833377)
chr1 (1-243)||(24785141-24785383)
chr1 (1-243)||(33388313-33388555)
chr1 (1-166)||(22496540-22496705)
chr1 (71-243)||(19109201-19109373)
chr1 (1-216)||(21842072-21842287)
chr1 (1-135)||(21751988-21752122)
chr1 (1-243)||(41350952-41351194)
chr1 (1-35)||(22401633-22401667)
[»] chr5 (40 HSPs)
chr5 (1-245)||(25850802-25851046)
chr5 (1-245)||(14884385-14884629)
chr5 (1-245)||(20345012-20345256)
chr5 (1-245)||(22505409-22505653)
chr5 (1-245)||(23078299-23078543)
chr5 (1-245)||(23563562-23563806)
chr5 (1-245)||(17266728-17266972)
chr5 (1-245)||(28892336-28892580)
chr5 (1-243)||(22464682-22464924)
chr5 (1-245)||(21561419-21561663)
chr5 (1-245)||(21983571-21983815)
chr5 (1-245)||(20778643-20778887)
chr5 (1-245)||(20824183-20824427)
chr5 (1-243)||(21882524-21882766)
chr5 (1-243)||(16359252-16359494)
chr5 (1-243)||(18781864-18782106)
chr5 (1-243)||(25429171-25429413)
chr5 (1-243)||(27521156-27521398)
chr5 (1-243)||(27613106-27613348)
chr5 (1-243)||(29473467-29473709)
chr5 (1-243)||(34569244-34569486)
chr5 (1-243)||(40711530-40711772)
chr5 (1-243)||(41773592-41773834)
chr5 (1-243)||(14997133-14997375)
chr5 (1-243)||(19772710-19772952)
chr5 (1-243)||(22330281-22330523)
chr5 (1-243)||(26736121-26736363)
chr5 (1-243)||(27665884-27666126)
chr5 (1-132)||(21631793-21631924)
chr5 (1-243)||(20803347-20803589)
chr5 (1-243)||(22350669-22350911)
chr5 (1-243)||(37288890-37289132)
chr5 (71-243)||(21342878-21343050)
chr5 (71-243)||(22137418-22137590)
chr5 (1-243)||(23473945-23474187)
chr5 (1-216)||(27682794-27683009)
chr5 (1-61)||(21332380-21332440)
chr5 (1-132)||(23460832-23460963)
chr5 (88-176)||(20311667-20311755)
chr5 (1-81)||(23525963-23526043)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (1-245)||(11654-11898)
[»] chr8 (37 HSPs)
chr8 (1-245)||(27357418-27357662)
chr8 (1-245)||(28983793-28984037)
chr8 (1-245)||(28989012-28989256)
chr8 (1-245)||(16268879-16269123)
chr8 (1-245)||(22053745-22053989)
chr8 (1-245)||(31414187-31414431)
chr8 (1-245)||(22027935-22028179)
chr8 (1-245)||(29301081-29301325)
chr8 (1-245)||(19985062-19985306)
chr8 (1-245)||(22373751-22373995)
chr8 (1-245)||(21928310-21928554)
chr8 (1-245)||(20390968-20391212)
chr8 (1-216)||(19980878-19981093)
chr8 (1-243)||(19115284-19115526)
chr8 (1-243)||(22523430-22523672)
chr8 (1-243)||(32603029-32603271)
chr8 (1-216)||(21391516-21391731)
chr8 (1-216)||(21780842-21781057)
chr8 (1-216)||(21786010-21786225)
chr8 (1-243)||(17671677-17671919)
chr8 (1-243)||(20015918-20016160)
chr8 (1-243)||(22375109-22375350)
chr8 (1-193)||(22421547-22421739)
chr8 (1-243)||(30310799-30311041)
chr8 (1-240)||(22042714-22042953)
chr8 (1-195)||(18859509-18859703)
chr8 (1-195)||(21253877-21254071)
chr8 (1-243)||(22126614-22126856)
chr8 (1-243)||(22129272-22129514)
chr8 (1-195)||(22117830-22118024)
chr8 (1-243)||(22246088-22246330)
chr8 (1-243)||(22989929-22990171)
chr8 (1-216)||(21164193-21164408)
chr8 (1-243)||(15536267-15536509)
chr8 (1-193)||(22245670-22245862)
chr8 (1-243)||(22030987-22031229)
chr8 (1-243)||(19481727-19481969)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (1-245)||(10408413-10408657)
chr3 (1-245)||(28756764-28757008)
chr3 (1-245)||(47126389-47126633)
chr3 (1-245)||(12509923-12510167)
chr3 (1-245)||(11958621-11958865)
chr3 (1-245)||(16327149-16327393)
chr3 (1-245)||(16831968-16832212)
chr3 (11-245)||(16378384-16378618)
chr3 (1-245)||(12357967-12358211)
chr3 (12-245)||(18131797-18132030)
chr3 (1-245)||(12272783-12273027)
chr3 (1-245)||(8744830-8745074)
chr3 (1-245)||(17494091-17494336)
chr3 (1-245)||(12180789-12181033)
chr3 (1-245)||(13944469-13944713)
chr3 (1-245)||(24189749-24189993)
chr3 (1-245)||(31692625-31692869)
chr3 (1-245)||(14290972-14291216)
chr3 (37-245)||(14575431-14575639)
chr3 (1-245)||(16825721-16825965)
chr3 (1-245)||(31941348-31941592)
chr3 (1-245)||(17188819-17189063)
chr3 (1-136)||(11949365-11949500)
chr3 (1-245)||(10417485-10417729)
chr3 (1-245)||(12857935-12858179)
chr3 (1-243)||(15065508-15065750)
chr3 (1-245)||(15230048-15230292)
chr3 (1-245)||(15235916-15236160)
chr3 (1-113)||(13317974-13318086)
chr3 (1-243)||(12889146-12889388)
chr3 (1-243)||(13255127-13255369)
chr3 (1-243)||(15262067-15262309)
chr3 (1-216)||(15358547-15358762)
chr3 (1-243)||(10008037-10008279)
chr3 (1-243)||(15399968-15400210)
chr3 (1-243)||(16638210-16638452)
chr3 (1-243)||(24185627-24185869)
chr3 (1-243)||(43165112-43165354)
chr3 (1-243)||(48427884-48428126)
chr3 (1-243)||(10908647-10908889)
chr3 (1-243)||(15586843-15587085)
chr3 (1-243)||(15713507-15713749)
chr3 (1-243)||(20059505-20059747)
chr3 (1-135)||(12843554-12843688)
chr3 (1-195)||(16694649-16694843)
chr3 (1-243)||(16754152-16754394)
chr3 (1-243)||(3688380-3688622)
chr3 (1-243)||(5422381-5422623)
chr3 (1-243)||(14578859-14579101)
chr3 (1-195)||(14874019-14874213)
chr3 (1-195)||(15345696-15345890)
chr3 (1-243)||(26790864-26791106)
chr3 (1-243)||(53382469-53382711)
chr3 (1-216)||(6603199-6603414)
chr3 (155-245)||(13318096-13318186)
chr3 (1-243)||(16804398-16804640)
chr3 (76-170)||(15013284-15013378)
chr3 (71-243)||(17492288-17492460)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (1-245)||(41580-41824)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (1-241)||(514568-514808)
scaffold0001 (1-246)||(441497-441742)
scaffold0001 (1-243)||(495867-496109)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (1-245)||(29779-30023)
[»] chr6 (37 HSPs)
chr6 (1-242)||(24367083-24367324)
chr6 (1-245)||(10466205-10466449)
chr6 (1-245)||(19455703-19455947)
chr6 (1-245)||(21567348-21567592)
chr6 (1-245)||(18797370-18797614)
chr6 (1-245)||(14377273-14377517)
chr6 (1-245)||(24515771-24516015)
chr6 (1-245)||(15462016-15462260)
chr6 (1-245)||(19437682-19437926)
chr6 (1-245)||(21474280-21474524)
chr6 (1-122)||(19465971-19466092)
chr6 (1-245)||(34642943-34643187)
chr6 (1-245)||(25770524-25770768)
chr6 (1-243)||(5836585-5836827)
chr6 (1-245)||(19486651-19486893)
chr6 (1-243)||(18405301-18405543)
chr6 (1-243)||(23081105-23081347)
chr6 (11-135)||(20010821-20010945)
chr6 (1-243)||(16924997-16925239)
chr6 (1-243)||(29589796-29590038)
chr6 (1-243)||(2872159-2872401)
chr6 (1-193)||(23085182-23085374)
chr6 (1-243)||(16574572-16574814)
chr6 (1-243)||(16620566-16620808)
chr6 (1-243)||(22436551-22436793)
chr6 (1-243)||(27190118-27190360)
chr6 (1-243)||(27258880-27259122)
chr6 (1-243)||(27559326-27559568)
chr6 (1-243)||(28260554-28260796)
chr6 (1-243)||(28285120-28285362)
chr6 (1-243)||(28339303-28339545)
chr6 (71-243)||(28312312-28312484)
chr6 (1-216)||(19867396-19867611)
chr6 (71-243)||(25115234-25115406)
chr6 (1-243)||(24293139-24293381)
chr6 (1-245)||(30678381-30678625)
chr6 (1-139)||(18182724-18182862)
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (1-214)||(20848067-20848280)
chr2 (1-245)||(19716769-19717013)
chr2 (1-245)||(23097770-23098014)
chr2 (1-245)||(23274040-23274284)
chr2 (1-245)||(12576800-12577044)
chr2 (1-245)||(23113170-23113414)
chr2 (1-193)||(24817592-24817784)
chr2 (1-243)||(11351463-11351705)
chr2 (1-243)||(17001449-17001691)
chr2 (1-243)||(23074312-23074554)
chr2 (1-243)||(22323094-22323336)
chr2 (1-243)||(24712483-24712725)
chr2 (1-243)||(27220465-27220707)
chr2 (1-243)||(44383322-44383564)
chr2 (1-243)||(9338031-9338273)
chr2 (1-243)||(9486665-9486907)
chr2 (1-243)||(16983689-16983931)
chr2 (1-195)||(21323018-21323212)
chr2 (1-243)||(24677936-24678178)
chr2 (1-216)||(23105480-23105695)
chr2 (1-243)||(27373718-27373960)
chr2 (1-132)||(23064973-23065104)
chr2 (1-243)||(10871299-10871541)
chr2 (1-243)||(21142793-21143035)
chr2 (1-243)||(22733526-22733768)
chr2 (1-243)||(24657410-24657652)
chr2 (1-195)||(24705234-24705428)
chr2 (1-243)||(24874502-24874744)
chr2 (1-216)||(23029213-23029428)
chr2 (71-243)||(45673834-45674006)
chr2 (1-132)||(22742718-22742849)
chr2 (56-243)||(23204763-23204950)
chr2 (1-243)||(24264819-24265061)
chr2 (125-245)||(23279223-23279343)
chr2 (71-243)||(41606209-41606379)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (1-245)||(306-550)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (1-245)||(5360-5604)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (1-245)||(8459-8703)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (1-245)||(67323-67567)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-245)||(263071-263315)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (1-245)||(21967-22211)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (1-245)||(65513-65757)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (1-245)||(10822-11066)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (1-245)||(10001-10245)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-245)||(251467-251711)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (1-245)||(30541-30778)
[»] scaffold1530 (1 HSPs)
scaffold1530 (1-245)||(428-672)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (1-245)||(14968-15212)
scaffold0074 (1-242)||(5961-6202)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (1-245)||(965-1209)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (1-225)||(203246-203470)
scaffold0003 (71-132)||(424266-424327)
scaffold0003 (1-35)||(424363-424397)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (1-245)||(6883-7127)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (1-245)||(5064-5308)
scaffold0348 (13-245)||(17711-17943)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (1-245)||(9987-10231)
scaffold0243 (1-243)||(24160-24402)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (1-245)||(20659-20903)
scaffold0222 (1-245)||(702-946)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (1-245)||(64817-65061)
scaffold0067 (1-245)||(49395-49639)
scaffold0067 (1-245)||(58429-58673)
scaffold0067 (1-245)||(29469-29713)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (1-245)||(98798-99042)
scaffold0020 (1-241)||(175837-176077)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (1-245)||(151412-151656)
scaffold0011 (1-243)||(23748-23990)
scaffold0011 (2-33)||(73813-73844)
scaffold0011 (2-33)||(78194-78225)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (1-245)||(325552-325796)
scaffold0004 (1-245)||(200683-200927)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (1-245)||(49-293)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (1-245)||(760-1004)
scaffold0476 (1-243)||(10633-10875)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (1-245)||(36784-37028)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (1-245)||(42543-42787)
scaffold0102 (1-216)||(50560-50775)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (12-245)||(5435-5668)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (1-245)||(1526-1770)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (1-245)||(7589-7833)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (1-245)||(1069-1313)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (1-245)||(39903-40147)
scaffold0114 (72-192)||(17635-17754)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (1-245)||(2716-2960)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (1-245)||(11805-12049)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (1-245)||(1098-1342)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (1-245)||(63734-63978)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (1-245)||(115407-115651)
scaffold0029 (1-245)||(94109-94353)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (1-176)||(20743-20918)
scaffold0261 (1-176)||(12563-12738)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (1-245)||(2167-2412)
scaffold0034 (1-245)||(70217-70461)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (1-245)||(29372-29616)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (1-245)||(21696-21940)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (1-245)||(53638-53882)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (1-245)||(60584-60828)
scaffold0046 (1-119)||(70079-70197)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (1-216)||(12601-12816)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (1-171)||(9442-9612)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (3-245)||(110455-110697)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (1-245)||(70-314)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (1-245)||(49950-50194)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-245)||(49092-49336)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (1-176)||(1030-1205)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (1-243)||(34184-34426)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (1-245)||(1487-1731)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (1-245)||(28500-28744)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (1-245)||(43634-43878)
scaffold0104 (90-237)||(25069-25216)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (1-176)||(5719-5894)
scaffold0035 (155-245)||(5596-5686)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (1-245)||(5026-5270)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (1-245)||(53892-54136)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (1-245)||(164616-164860)
scaffold0023 (1-132)||(30789-30920)
scaffold0023 (71-193)||(151978-152100)
scaffold0023 (1-195)||(47198-47391)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (1-176)||(8677-8852)
scaffold0235 (1-176)||(18891-19066)
[»] scaffold1056 (1 HSPs)
scaffold1056 (1-245)||(1566-1810)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (41-245)||(25957-26161)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (1-245)||(5447-5691)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (67-245)||(3451-3629)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (1-245)||(4304-4548)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (1-132)||(4519-4650)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (1-135)||(6472-6606)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (13-245)||(11675-11905)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (1-193)||(9566-9758)
scaffold0018 (1-245)||(23513-23757)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (1-243)||(10373-10615)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (1-243)||(6720-6962)
scaffold0270 (1-243)||(13850-14092)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (1-245)||(4933-5177)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (1-243)||(17725-17967)
scaffold0040 (1-116)||(111122-111237)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (1-243)||(17281-17523)
scaffold0017 (75-177)||(24219-24321)
scaffold0017 (1-191)||(195053-195243)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (1-98)||(9236-9333)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (1-245)||(26197-26441)
scaffold0042 (1-216)||(37035-37250)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (41-245)||(1064-1260)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (1-243)||(13108-13350)
scaffold0080 (1-243)||(10453-10695)
scaffold0080 (73-243)||(31730-31900)
scaffold0080 (1-243)||(54484-54726)
scaffold0080 (73-243)||(37196-37366)
[»] scaffold0079 (2 HSPs)
scaffold0079 (1-243)||(36345-36587)
scaffold0079 (200-245)||(3563-3608)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (1-243)||(22094-22336)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (3-243)||(14483-14723)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (1-245)||(15194-15438)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (1-193)||(57829-58021)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (1-243)||(29143-29385)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (1-243)||(1247-1489)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (1-243)||(10215-10457)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (1-139)||(4104-4242)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (1-243)||(13931-14173)
scaffold0120 (1-61)||(11293-11353)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (1-193)||(4331-4523)
scaffold0621 (1-106)||(1-106)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (1-193)||(2478-2670)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (71-243)||(41002-41174)
scaffold0109 (1-243)||(13339-13581)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-243)||(216635-216877)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (1-195)||(11095-11289)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (1-243)||(8105-8347)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (1-79)||(19184-19262)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-243)||(8070-8312)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (1-243)||(3271-3513)
scaffold0044 (1-243)||(17007-17249)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (1-243)||(11316-11558)
scaffold0028 (1-243)||(17784-18026)
scaffold0028 (98-216)||(53601-53719)
scaffold0028 (1-35)||(55059-55093)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (1-195)||(34930-35124)
scaffold0022 (1-243)||(41479-41721)
scaffold0022 (1-243)||(75199-75441)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (1-242)||(695-936)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (1-193)||(24927-25119)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (1-164)||(8336-8499)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (1-243)||(829-1071)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (1-243)||(13694-13936)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (1-135)||(55685-55819)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (2-135)||(40723-40856)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (1-193)||(593-785)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (1-117)||(14884-15000)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (1-193)||(1886-2078)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (1-176)||(1913-2088)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (14-193)||(21413-21592)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (1-135)||(4538-4672)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (71-193)||(8847-8969)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (1-243)||(18497-18739)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (1-243)||(11571-11813)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (1-135)||(104182-104316)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (75-243)||(12510-12678)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (5-117)||(3524-3636)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (1-135)||(7954-8088)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (1-243)||(15269-15499)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (71-243)||(3448-3620)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (1-117)||(13-129)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (1-216)||(15-230)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (1-216)||(21478-21693)
scaffold0081 (1-216)||(36902-37117)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (1-132)||(7194-7325)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (1-42)||(11076-11117)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (200-245)||(51657-51702)
[»] scaffold2111 (1 HSPs)
scaffold2111 (201-245)||(2-46)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (1-64)||(2063-2126)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (1-35)||(48720-48754)
[»] scaffold0605 (1 HSPs)
scaffold0605 (157-245)||(1267-1355)


Alignment Details
Target: scaffold0010 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 39548 - 39792
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39548 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 39647  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  39648 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgt 39747  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39748 tgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtata 39792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 245
Target Start/End: Original strand, 44656 - 44886
Alignment:
Q  15 gtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggg 114  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44656 gtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccaactaaggg 44755  T
Q  115 ttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggat 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | ||||| |||||||||    
T  44756 ttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacaggtatggat 44855  T
Q  215 gttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||| ||||| ||||| | |||||||||||    
T  44856 gttatttttgggatgaactagttagagtata 44886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 5004 - 4870
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||| | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||    
T  5004 tattattgatactggtgctacacattgttttatttctattgattgtgcttctaagttgggttttgttatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaa 4905  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 135  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  4904 actccagctaagggtttagtaactacttctcttgt 4870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14443 - 14271
Alignment:
Q  71 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagag 170  Q
    |||| |||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | |||  |||||| | |||||||||||| | |    
T  14443 tctggtatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatttttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 14344  T
Q  171 attttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    ||||||  || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  14343 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 14271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 40)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 26091997 - 26092241
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26091997 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 26092096  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  26092097 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgt 26092196  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26092197 tgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtata 26092241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 26115789 - 26116030
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26115789 tattattgatattggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 26115888  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  26115889 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgt 26115988  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26115989 tgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 26116030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 13965867 - 13966111
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13965867 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 13965966  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  13965967 actccagctaagggttcaataaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtctgccgt 13966066  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  13966067 tgtcgggtatggatgttatttttggaatgaattagttagaatata 13966111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 40925016 - 40925260
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40925016 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 40925115  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  40925116 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatccatgtttggtagggattttgtgattgatttagtttgtctgccgt 40925215  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  40925216 tgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatata 40925260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 49155351 - 49155107
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49155351 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 49155252  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |    
T  49155251 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttggtttgcctgccgt 49155152  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  49155151 tgacgggtatggatgttatttttggtatgaattggttagagtata 49155107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21755462 - 21755218
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21755462 tattattgatattggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatggaaggggaaatggttgttgaa 21755363  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |    
T  21755362 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgaggtgtcctatatctatgtttggtagagatttcgtggttgatttagtttgtctgccgt 21755263  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    || ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  21755262 tgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaattggttagagtata 21755218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12459678 - 12459434
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12459678 tattatagatactgatgctactaattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 12459579  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |   ||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  | |    
T  12459578 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtccgttatctatgtttggtagagactttgtggttgatttagtttgtttaccgt 12459479  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12459478 tgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtata 12459434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 245
Target Start/End: Original strand, 14283585 - 14283817
Alignment:
Q  13 tggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaag 112  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  14283585 tggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactctagccaag 14283684  T
Q  113 ggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatgg 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| || | |||||||| ||||    
T  14283685 ggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatgg 14283784  T
Q  213 atgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14283785 atgttatttttgggatgaattggttagagtata 14283817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 16947671 - 16947915
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16947671 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 16947770  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||   |||||  | ||||||||||||||||| |||||  | || ||||||||  || | |    
T  16947771 actccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgtagtcgacttagtttgcttgccgt 16947870  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16947871 tgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtata 16947915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13024395 - 13024151
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13024395 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 13024296  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||  ||||||  | |||||||||||||| |||||| || | || ||||| |||||  | |    
T  13024295 actccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgaggtgtccgttgtctatgtttggtagggattttttggtcgacttagtgtgtctaccgt 13024196  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13024195 tgacgggtatggatgttatttttggtatgaattggttagagtata 13024151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14140729 - 14140485
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14140729 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgagtgtatctgatatgaagggagaaatggttgttgaa 14140630  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||| ||| || | |    
T  14140629 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttagtctgtttgccgt 14140530  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  14140529 tgacgggaatggatgttatttttgggatgaaatggttagagtata 14140485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15343481 - 15343237
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15343481 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 15343382  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| || | |    
T  15343381 actccagctaagggtaaagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgt 15343282  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15343281 tgacgggaatggacattatttttggaatgaattggttagagtata 15343237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 11385628 - 11385872
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||||||||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  11385628 tattatagacactgatgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatttgatatgaaaggagagatggttgttgaa 11385727  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| || | |    
T  11385728 actccagctaagggttcaggaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgt 11385827  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11385828 tgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtata 11385872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13676490 - 13676257
Alignment:
Q  12 ctggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaa 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13676490 ctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaa 13676391  T
Q  112 gggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatg 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||||||| ||||   | || ||||| ||| |  | |||||||| |||    
T  13676390 gggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatg 13676291  T
Q  212 gatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  13676290 gatgttatttttgggatgaactggttagagtata 13676257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 12798700 - 12798944
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12798700 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaaaaatggttgttgaa 12798799  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    ||||   | ||||||||||||||||| ||||   | ||| |||| ||| || | |    
T  12798800 actcaagctaagggttcagtaactacttctcttatttgtctaagttgtctgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgt 12798899  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  12798900 tgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtata 12798944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 15099802 - 15100046
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15099802 tattatagatactggtgatactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 15099901  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||   | ||||||||||||||||| ||||   | ||  |||||||| |  | |    
T  15099902 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacctagtttgtttaccgt 15100001  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||    
T  15100002 tgacgggtatggatgtgatttttgggatgaactagttagagtata 15100046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 18051152 - 18051396
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| |||| ||||||||||  ||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18051152 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggttgggtttgattgtgtctgatatgaagggagaaatggttgttgaa 18051251  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||  |||||| || ||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||| |  | |    
T  18051252 actccagctaagggttcagtgactacttctctggtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttgaagtagatttagtgtgtttaccgt 18051351  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18051352 tgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtata 18051396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19150061 - 19149817
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19150061 tattatagatactggttctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttaggtctggttgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaa 19149962  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | ||||||||||||||||| ||||   |  || |||| ||| || | |    
T  19149961 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcaatctagtatgtttgcctt 19149862  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  19149861 tgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtata 19149817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20749460 - 20749216
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20749460 tattatagatactggttctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttaggtctggttgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaa 20749361  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | ||||||||||||||||| ||||   |  || |||| ||| || | |    
T  20749360 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcaatctagtatgtttgcctt 20749261  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  20749260 tgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtata 20749216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 14261445 - 14261688
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| || || |||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14261445 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgagcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaa 14261544  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||||||||||||||  |||   | ||| |||| |||||| | |    
T  14261545 actccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagaga-attgaagtcgatctagtatgtctgccgt 14261643  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    || ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  14261644 tgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtata 14261688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 12203999 - 12204243
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| | | ||   |||||  || |||||||||||||||    
T  12203999 tattatagacactggtgctacacattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaa 12204098  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||   |||||  | ||||||||||||||||||||||    |||| | || ||| ||   |    
T  12204099 actctagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagattttgaagatgatcttgtgtgtttgctgt 12204198  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12204199 taacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtata 12204243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14957603 - 14957361
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  14957603 tattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaa 14957504  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  14957503 actccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 14957404  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||||||||| |||||    
T  14957403 tgagcggtatggatgtgattttgggtatgaattggttggagta 14957361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 44788572 - 44788814
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| ||||||||||||| || || |||||||| |||    
T  44788572 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 44788671  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  44788672 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 44788771  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  44788772 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 44788814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 11550323 - 11550565
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  11550323 tattattgatactggtgctactcattgctttattgcttttgattgtgtatctgccttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 11550422  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  11550423 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 11550522  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||| |||||    
T  11550523 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagta 11550565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14335445 - 14335203
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  14335445 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 14335346  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  14335345 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 14335246  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  14335245 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 14335203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 15146144 - 15146386
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||| | | | | || |||||||| || || |||||||| |||    
T  15146144 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttgctttgtcggatatgaatggagagatggttgtcgaa 15146243  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || |||  | | |||||| |||||||||||| |   ||||||| ||||||| | |||||| |  | |    
T  15146244 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgttcgaaatgtcctttatctatgtttgatcttgattttgagattgatatggtttgtttacctt 15146343  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||    
T  15146344 tgagtggtatggatgtaatagttggtatgaactggttagagta 15146386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18180792 - 18180550
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  ||||||||||||| || || |||||||| |||    
T  18180792 tattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 18180693  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  18180692 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctaccct 18180593  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  18180592 tgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 18180550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 8710654 - 8710412
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  8710654 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 8710555  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |  || ||||||||||||||  | |    
T  8710554 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctt 8710455  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  8710454 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 8710412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13689090 - 13688848
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  13689090 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtgtctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 13688991  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |  || ||||||||||||||  | |    
T  13688990 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctt 13688891  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  13688890 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 13688848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 18587392 - 18587634
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  18587392 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 18587491  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |  || ||||||||||||||  | |    
T  18587492 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctt 18587591  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  18587592 tgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 18587634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 71 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 8201027 - 8200855
Alignment:
Q  71 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagag 170  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |    
T  8201027 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 8200928  T
Q  171 attttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    ||||||  || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  8200927 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 8200855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 11234434 - 11234676
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  11234434 tattattaatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttttctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 11234533  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |  || ||||||||||||||  | |    
T  11234534 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctt 11234633  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  11234634 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 11234676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 17703676 - 17703915
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  17703676 tattattgatactagtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 17703775  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||| ||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  17703776 actccagttaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 17703875  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttaga 240  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||    
T  17703876 tgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 17703915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 89 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10873651 - 10873497
Alignment:
Q  89 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttag 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || |||||||    
T  10873651 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttag 10873552  T
Q  189 tttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  10873551 tttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 10873497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12690463 - 12690309
Alignment:
Q  89 atggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttag 188  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||  || |||||||    
T  12690463 atggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttag 12690364  T
Q  189 tttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||| |||||    
T  12690363 tttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagta 12690309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 15158278 - 15158520
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  15158278 tattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 15158377  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||    || ||||||||||||||  | |    
T  15158378 actccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcaaaatggatttagtttgtctacctt 15158477  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  15158478 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 15158520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9591343 - 9591223
Alignment:
Q  71 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagag 170  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| |||||||||||||| | |    
T  9591343 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcgtg 9591244  T
Q  171 attttgtgattgatttagttt 191  Q
    ||||||  || ||||||||||    
T  9591243 attttgaaatggatttagttt 9591223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 14042744 - 14042610
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||| | | | | ||  |||| || || || |||||||| |||    
T  14042744 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctattaagttgggtcttgctatgtcaaatataaatggagagatggttgtcgaa 14042645  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 135  Q
    |||| |||||||||||  || || |||||||||||    
T  14042644 actcaagctaagggttttgtgactacttctcttgt 14042610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 14352774 - 14352640
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||| | | | | ||  |||| || || || |||||||| |||    
T  14352774 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctattaagttgggtcttgctatgtcaaatataaatggagagatggttgtcgaa 14352675  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 135  Q
    |||| |||||||||||  || || |||||||||||    
T  14352674 actcaagctaagggttttgtgactacttctcttgt 14352640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 13459081 - 13459049
Alignment:
Q  2 attattgatactggtgctactcattgttttatt 34  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13459081 attattgatactggtgctactcattcttttatt 13459049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 41)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 3262006 - 3262250
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3262006 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 3262105  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  3262106 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgt 3262205  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3262206 tgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtata 3262250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 44659078 - 44659319
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44659078 tattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 44659177  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  44659178 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgt 44659277  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44659278 tgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 44659319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 29450749 - 29450993
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29450749 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 29450848  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  29450849 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgt 29450948  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  29450949 tgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtata 29450993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 11204444 - 11204688
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11204444 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttaggtttggatgtatctggtatgaaaggggaaatggttgttgaa 11204543  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  11204544 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctaaatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtctgccgt 11204643  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11204644 tgtcgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtata 11204688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20893091 - 20892847
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20893091 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 20892992  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  || | |    
T  20892991 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtatcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatctagtttgcttgccgt 20892892  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  20892891 tgtcgggtatggatgttatttttggaatgaactggttagagtata 20892847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 16150696 - 16150527
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16150696 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttgtttctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 16150597  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagag 170  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||  | ||||||||||||||||    
T  16150596 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 16150527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 16154842 - 16154673
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16154842 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttgtgtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 16154743  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagag 170  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||  | ||||||||||||||||    
T  16154742 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 16154673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 51604004 - 51604248
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||  ||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51604004 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaactgggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 51604103  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||  |||||| || ||||||||||||||||||||||   | || ||||||||| || |      
T  51604104 actccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttgaagtagacttagtttgtttgccgc 51604203  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  51604204 tgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtata 51604248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15073419 - 15073175
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  ||||||||| | ||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15073419 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcacataagttggctctggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaa 15073320  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||   |||||| | ||||||||||||||||| ||||   ||||| | || |||||| | |    
T  15073319 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtcagtttgagttgtcctttgtctatgtttggtagagactttgaagttgatcttgtatgtctgccgt 15073220  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15073219 tgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtata 15073175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27903445 - 27903201
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||||||||| ||  | |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27903445 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattatatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaa 27903346  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |   ||||||  | |||||||||||||||||||||| | | || ||||| |||||  | |    
T  27903345 actccagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgt 27903246  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||| ||| ||| ||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  27903245 tgatgggaatgaatgttattttagggatgaattggttagagtata 27903201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 245
Target Start/End: Original strand, 15354283 - 15354496
Alignment:
Q  32 attgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctc 131  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15354283 attgatattgattgtgtatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctacgggttcagtaactacttctc 15354382  T
Q  132 ttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaa 231  Q
    ||||||||||    ||||   | ||||||||||||||||| |||    | || ||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15354383 ttgtttgtctaagatgtctgttgtctatgtttggtagagactttaaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaa 15354482  T
Q  232 ttggttagagtata 245  Q
     || ||||||||||    
T  15354483 ctgattagagtata 15354496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 14993579 - 14993719
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| |||||| |||||  ||||| ||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14993579 tattatagatactagtgctcttcattatttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 14993678  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 141  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14993679 actccagctaagggttcactaactacttctcttgtttgtct 14993719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 53750682 - 53750815
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||  ||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53750682 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaactgggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 53750781  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttg 134  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  53750782 actccagctaagggttcagtgactacttctcttg 53750815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14697161 - 14696919
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||    
T  14697161 tattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaa 14697062  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcag-tgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtca 199  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||  || |||||  | |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |     
T  14697061 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtg-cttaagatgtcccttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgatttagtttgtttacct 14696963  T
Q  200 ttgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    ||||  || |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  14696962 ttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 14696919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 18224398 - 18224640
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  18224398 tattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 18224497  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  18224498 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 18224597  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  18224598 tgagcggtatggatgttattttgggtatgaattggttagagta 18224640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 8389472 - 8389230
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  8389472 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 8389373  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| || || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  8389372 actccagctaagggttcggtgactacttcactcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 8389273  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  8389272 tgagtggtatggatgtgattttgggaatgaactggttagagta 8389230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12479660 - 12479418
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  12479660 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 12479561  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  12479560 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 12479461  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  12479460 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 12479418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 16233944 - 16234186
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  16233944 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 16234043  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  16234044 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 16234143  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  16234144 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 16234186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14162530 - 14162288
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| | |||| ||||| | |||||||| | | | | | ||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  14162530 tattattgataccggtgctacgcatagttttattgctcttgattgtgcttctaagttggatcttgctatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaa 14162431  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |   ||||||| | ||||||| || | | |||||||  || |||||||||||| |  | |    
T  14162430 actccagctaagggttcggtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtcctttgtctatgtatgatcgtgattttgaaatggatttagtttgtttacctt 14162331  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  || |||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||    
T  14162330 tgagtggaatggatgtgattcttggcatgaactggttagagta 14162288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14683627 - 14683385
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  14683627 tattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaa 14683528  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  14683527 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 14683428  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||   |||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||    
T  14683427 tgagcagtatggatgtgattctgggaatgaattggttggagta 14683385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 17092101 - 17092343
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  17092101 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgccttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 17092200  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  17092201 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 17092300  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  17092301 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 17092343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 15266836 - 15266736
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15266836 tattatagacactggtactactcattgtttcattgatgttgattgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 15266737  T
Q  101 a 101  Q
    |    
T  15266736 a 15266736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19635196 - 19634954
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  19635196 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 19635097  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||| ||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  19635096 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgttcggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 19634997  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  19634996 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 19634954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23958807 - 23958565
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  23958807 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 23958708  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |  || ||||||||||||||  | |    
T  23958707 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctt 23958608  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  23958607 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 23958565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15258891 - 15258743
Alignment:
Q  97 tgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctg 196  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||||||| |||||  | ||  | |||||| |     
T  15258891 tgaaactccagctaagagttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgtagtcgaccttgtttgttta 15258792  T
Q  197 tcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
     | ||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||    
T  15258791 ccgttgacgggtatggatgtcattttttggatgaattggttagagtata 15258743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 8050575 - 8050817
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  8050575 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 8050674  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | | |||| | |||||||||||| | ||||| |  || ||||||||||||||  | |    
T  8050675 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctt 8050774  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  8050775 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 8050817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 14300931 - 14301173
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  14300931 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 14301030  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | ||||| |||||| | ||||| |  || ||||||||||||||  | |    
T  14301031 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctt 14301130  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  14301131 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 14301173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 15144844 - 15145038
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  15144844 tattattgatactggtgctaagcattgttttattgttttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 15144943  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtct 195  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||    
T  15144944 actccagctaagggttcggtgactacgtctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtct 15145038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 19775745 - 19775987
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  19775745 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 19775844  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||||||  | ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |  || ||||||||||||||  | |    
T  19775845 actccggctaagggttcggtgactacttctctcatatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctt 19775944  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  19775945 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 19775987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 40476100 - 40475858
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || ||||| || |||    
T  40476100 tattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtggtcgaa 40476001  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  40476000 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 40475901  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  40475900 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 40475858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 243
Target Start/End: Original strand, 16250872 - 16251044
Alignment:
Q  71 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagag 170  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |    
T  16250872 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 16250971  T
Q  171 attttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    ||||||  || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || || ||||||||||||||    
T  16250972 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtataaattggttagagta 16251044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 15987 - 16121
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||   |||||||||| |   | | ||| ||||||| || || |||||||| |||    
T  15987 tattattgatactggtgctacgcatttttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttactatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaa 16086  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 135  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  16087 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 16121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27714396 - 27714154
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  27714396 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 27714297  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||| | | |||||||||||| | ||||| |  || ||||||||||||||  | |    
T  27714296 actccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcttttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctt 27714197  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  27714196 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 27714154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 7357327 - 7357280
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgc 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7357327 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgc 7357280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8708811 - 8708731
Alignment:
Q  157 tatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggtt 237  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  8708811 tatgtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgtcgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggtt 8708731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 16350506 - 16350721
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| | | || ||||  | ||  |||||| | ||| | || |||||||| || || |||||||| |||    
T  16350506 tattattgatactagtgctatgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtcggatatgaatggagagatggttgtcgaa 16350605  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | ||||||| |||| | ||||| |  || ||| ||||||||||  | |    
T  16350606 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtctggtcgtgatttcgaaatggatctagtttgtctacctt 16350705  T
Q  201 tgacgggtatggatgt 216  Q
    |||  |||||||||||    
T  16350706 tgagcggtatggatgt 16350721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16219184 - 16219048
Alignment:
Q  107 gctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgg 206  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||||| | |||||||  |||||||| |||||| |  | ||||  |    
T  16219184 gctaagggttcaataactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtg 16219085  T
Q  207 gtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    | |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  16219084 gaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 16219048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 16219248 - 16219188
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggt 61  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||    
T  16219248 tattattgatattggtgctacacactgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggt 16219188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16222504 - 16222368
Alignment:
Q  107 gctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgg 206  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||||| | |||||||  |||||||| |||||| |  | ||||  |    
T  16222504 gctaagggttcaataactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtg 16222405  T
Q  207 gtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    | |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  16222404 gaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 16222368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 16222568 - 16222508
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggt 61  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||    
T  16222568 tattattgatattggtgctacacactgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggt 16222508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 13513340 - 13513294
Alignment:
Q  71 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 117  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13513340 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 13513294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 30)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 48425979 - 48425735
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48425979 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 48425880  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  48425879 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgt 48425780  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48425779 tgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtata 48425735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 52988847 - 52988603
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52988847 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 52988748  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  52988747 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgt 52988648  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52988647 tgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtata 52988603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 37680155 - 37679914
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37680155 tattattgatactggtgctattcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 37680056  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  37680055 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgt 37679956  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37679955 tgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 37679914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 31537281 - 31537525
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31537281 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtgtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 31537380  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  31537381 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctaccgt 31537480  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  31537481 tgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatata 31537525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 38910110 - 38910354
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38910110 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaagggaaaatggttgttgaa 38910209  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  38910210 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgt 38910309  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  38910310 tgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtata 38910354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20297487 - 20297243
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297487 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 20297388  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  20297387 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatttatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtctgccgt 20297288  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297287 tgacgggtatggatgtgatctttggaatgaattggttagagtata 20297243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 69 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12200556 - 12200380
Alignment:
Q  69 tatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtag 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12200556 tatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatctatgtttggtag 12200457  T
Q  169 agattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  12200456 agattttgtgattgatttagtgtgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtata 12200380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 24096899 - 24097143
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  24096899 tattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgaa 24096998  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||   |||||  | ||||||||||||||||| |||||  | || ||||||||| || | |    
T  24096999 actccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgtagtcgacttagtttgtttgccgt 24097098  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  24097099 tgacgggtatggatgttatttttagaatgaattggttagagtata 24097143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 20074993 - 20075126
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20074993 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 20075092  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttg 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20075093 actccagctaagggttcagtaactacttctcttg 20075126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19857380 - 19857136
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19857380 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgtgcttataagttgggtatggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 19857281  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||   ||||||  | ||||||||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |    
T  19857280 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgt 19857181  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||||    
T  19857180 tgactggtatggatgatatttttgggatgaacttgttagagtata 19857136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 20833184 - 20833428
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20833184 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgttcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 20833283  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |    
T  20833284 actccagataagggttcattaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgt 20833383  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  20833384 tgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtata 20833428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 22016029 - 22016273
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22016029 tattatagatactggtgatactcattgtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 22016128  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||||||| ||||   | ||  |||||||| |  | |    
T  22016129 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacctagtttgtttaccgt 22016228  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22016229 tgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtata 22016273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 21739320 - 21739564
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| | | | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21739320 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtcttgttttatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 21739419  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||   |||||  | ||||||||||||||||| ||||   | ||| |||| ||| || | |    
T  21739420 actccagctaagggttcagtaactacttttcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgt 21739519  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  21739520 tgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtata 21739564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18710481 - 18710316
Alignment:
Q  11 actggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagcta 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18710481 actggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgcgtctggttgtatctgatatgagaggggaaatggttgttgaaactccagcta 18710382  T
Q  111 agggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 176  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||||||| ||||    
T  18710381 agggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttg 18710316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 20854044 - 20854288
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| |||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20854044 tattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggcctaattgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 20854143  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |   ||||||  | |||||||||||||||||||||| | | || ||||| |||||  | |    
T  20854144 actccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgt 20854243  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||  ||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  20854244 tgttgggaatggatgttattttcgggatgaattggttagagtata 20854288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 21742836 - 21743080
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21742836 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaa 21742935  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||   ||||   | ||||||||||||||||| ||||   | ||| |||| ||| || | |    
T  21742936 actccagctaagggttcggtaactacgtctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgt 21743035  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    || ||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  21743036 tgtcgggtgtggatgtgatttttgggatgaactggttagagtata 21743080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16379169 - 16378927
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||   | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||    
T  16379169 tattattgatattggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcatgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaa 16379070  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |    |||||| | |||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||| |  | |    
T  16379069 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgtttgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagattgatttggtttgtttacctt 16378970  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  16378969 tgagcggaatggatgtaatcctgggtatgaattggttagagta 16378927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 20081660 - 20081875
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  20081660 tattattgatactggtactacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 20081759  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||  | |    
T  20081760 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctt 20081859  T
Q  201 tgacgggtatggatgt 216  Q
    |||  |||||||||||    
T  20081860 tgagtggtatggatgt 20081875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 16347879 - 16348121
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  16347879 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 16347978  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  16347979 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 16348078  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  16348079 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 16348121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 51330776 - 51331018
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  51330776 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 51330875  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  51330876 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 51330975  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  51330976 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 51331018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 17042299 - 17042541
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||  | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  17042299 tattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggccttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 17042398  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  17042399 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 17042498  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  17042499 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 17042541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21833377 - 21833135
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  21833377 tattattgatactggtgctacgcattgttttatggctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 21833278  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| |||||||||||||| | |||||    || ||||||||||||||  | |    
T  21833277 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtctgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgatttcaaaatggatttagtttgtctacctt 21833178  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  21833177 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 21833135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 24785141 - 24785383
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | |   |||||| | | | ||||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  24785141 tattattgatacttgtgctacacattgttttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttatctgatatgaatggagagatggtcgttgaa 24785240  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    | ||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||| | ||||||||  | |    
T  24785241 attccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatctggtttgtctacctt 24785340  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  24785341 tgagcggtatggatgtaattatgggtatgaattggttagagta 24785383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 33388313 - 33388555
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  33388313 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 33388412  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |  || ||||||||||||||  | |    
T  33388413 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctt 33388512  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  33388513 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 33388555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 22496540 - 22496705
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  22496540 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctacattgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 22496639  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggt 166  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | ||||||||||||    
T  22496640 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 22496705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19109373 - 19109201
Alignment:
Q  71 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagag 170  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | ||||||||||||   |    
T  19109373 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcatg 19109274  T
Q  171 attttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    ||||||  || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  19109273 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 19109201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21842287 - 21842072
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||  | |   || ||| | ||| | ||||||||||| || || || ||||| |||    
T  21842287 tattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgtttctgctttaggtcttgatttgtctgatatgaatggagagattgttgtcgaa 21842188  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||| | | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||| | |    
T  21842187 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcatttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctgcctt 21842088  T
Q  201 tgacgggtatggatgt 216  Q
    |||  |||||||||||    
T  21842087 tgagcggtatggatgt 21842072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 21752122 - 21751988
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||| | | | | ||| ||||||| |  || |||||||| |||    
T  21752122 tattattgatattggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatgaagagatggttgtcgaa 21752023  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 135  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  21752022 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 21751988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 41350952 - 41351194
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  41350952 tattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaa 41351051  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| ||    |||||||| || ||| || | |||||| | ||||||||| || | |||||||  || ||||||||||| ||  | |    
T  41351052 actccagctaagggttcggtgcttacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttagtcgtgattttgaaatggatttagtttgcctacctt 41351151  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  41351152 tgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 41351194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 22401667 - 22401633
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattg 35  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22401667 tattattgatactggtgctacgcattgttttattg 22401633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25851046 - 25850802
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25851046 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 25850947  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  25850946 actccagctaaaggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgt 25850847  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  25850846 tgacgggtatgaatgttatttttggaatgaattggttagaatata 25850802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 14884385 - 14884629
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14884385 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttagatgtgtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 14884484  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  14884485 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtcttccgt 14884584  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14884585 tgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatata 14884629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20345256 - 20345012
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20345256 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 20345157  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  20345156 actccagctaagggttcaataaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctttgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtctgccgt 20345057  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  20345056 tgtcgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagaatata 20345012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22505653 - 22505409
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22505653 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctaatatgaaaggggaaatggttgttgaa 22505554  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||| |  | |    
T  22505553 actccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttcatagagattttgtggtggatttagtttgtttaccgt 22505454  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22505453 tgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagagtata 22505409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 23078299 - 23078543
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23078299 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgcaattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaagggagaaatggttgttgaa 23078398  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||   |||||  | ||||||||||||||||| |||||  ||||| || ||||| || | |    
T  23078399 actccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgtagttgatctaatttgtttgccgt 23078498  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23078499 tgtcgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtata 23078543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 23563562 - 23563806
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23563562 tattatagaaactggtgctactcaatgtttaattgctattgaatgtgcatataagttgggtatggatatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 23563661  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||| |  | ||||||||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  |||    
T  23563662 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtacgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccat 23563761  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  23563762 tgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtata 23563806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 17266728 - 17266972
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| |||| ||||||||||  ||| ||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  17266728 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggttgggtttgtttgtgtctaacatgaaaggagaaatggttgttgaa 17266827  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||  |||||| || ||||||||||||||||||||||   | || ||||||||| || | |    
T  17266828 actccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttgaagtagacttagtttgtttgccgt 17266927  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17266928 tgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtata 17266972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 28892336 - 28892580
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28892336 tattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 28892435  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||   ||||||  | ||||||||||||||||||||||   | || ||||| |||||  | |    
T  28892436 actccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaagtcgacttagtgtgtctaccgt 28892535  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||  ||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  28892536 tgttggggatggatgtcatcttcgggatgaattggttagagtata 28892580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22464924 - 22464682
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| |||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22464924 tattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggcctaattgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 22464825  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |   ||||||  | |||||||||||||||||||||| | | || ||||| |||||  | |    
T  22464824 actccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtatgtctaccgt 22464725  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    ||  ||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  22464724 tgttgggaatggatgttattttcgggatgaattggttagagta 22464682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 21561419 - 21561663
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| ||| ||| | | ||   |||||  || |||||||||||||||    
T  21561419 tattattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttaggtatggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaa 21561518  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||   |||||  | ||||||||||||||||||||||   ||||| |||| ||| || |||    
T  21561519 actccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgccat 21561618  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  21561619 tgacgggtgtggatgtaatctttgggatgaactggttggagtata 21561663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 21983571 - 21983815
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| | | ||   |||||  || |||||||||||||||    
T  21983571 tattattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaa 21983670  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||   |||||  | | ||||||||||||||||||||   ||||| |||| ||| || | |    
T  21983671 actccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtttatgtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgccgt 21983770  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  21983771 tgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttggagtata 21983815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20778887 - 20778643
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| |||||||||||  |   |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20778887 tattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggcctaattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 20778788  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |   ||||||  | |||||||||||||||||||||| | | || ||||| |||||  | |    
T  20778787 actccagccaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgt 20778688  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||  ||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  20778687 tgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagagtata 20778643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20824427 - 20824183
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | || ||||| |||||||||||| ||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20824427 tattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcatataagttgggtctgattatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 20824328  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| |   ||||||  | |||||||||||||||||||| | | | |||||||| |||||  | |    
T  20824327 actccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagatttcgaggtcgatttagtgtgtctaccgt 20824228  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||  ||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  20824227 tgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagagtata 20824183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21882766 - 21882524
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  21882766 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 21882667  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||  | |    
T  21882666 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctt 21882567  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    | |  ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  21882566 taagcggtatggatgtgattcttggtatgaattggttagagta 21882524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16359494 - 16359252
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  16359494 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 16359395  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  16359394 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 16359295  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  16359294 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 16359252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18782106 - 18781864
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  18782106 tattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgttgaa 18782007  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||  || |||| |||||||||  | |    
T  18782006 actccagctaagggttccgtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggattaagtttgtctacctt 18781907  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  18781906 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 18781864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25429413 - 25429171
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| | |||   |||||||||| | | | | | ||||||||| || || |||||||| |||    
T  25429413 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattttgctactaagttgggtcttgttatgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaa 25429314  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||  | |||||||||| | | ||||||| ||||||||| ||||||||  | |    
T  25429313 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcccttgtctatgtttgatcgtgattttgagattgatttggtttgtctacctt 25429214  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||    
T  25429213 tgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagta 25429171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27521398 - 27521156
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  27521398 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttggtttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 27521299  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  27521298 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 27521199  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  27521198 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 27521156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27613348 - 27613106
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  27613348 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 27613249  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  27613248 actccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctaccct 27613149  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  27613148 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 27613106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 29473467 - 29473709
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  29473467 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaa 29473566  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |  || ||||||||||||||  | |    
T  29473567 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctt 29473666  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  29473667 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 29473709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 34569486 - 34569244
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  34569486 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 34569387  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  34569386 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 34569287  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  34569286 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 34569244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 40711772 - 40711530
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  40711772 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 40711673  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  40711672 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 40711573  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  40711572 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 40711530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 41773834 - 41773592
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  41773834 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 41773735  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | ||| || | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  41773734 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtactttgtctatgtttggtcgcgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 41773635  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  41773634 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 41773592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 14997133 - 14997375
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  14997133 tattattgatactggtgctacacattgttttattgcttttgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 14997232  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |  || ||||||||||||||  | |    
T  14997233 actccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctt 14997332  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  14997333 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 14997375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19772952 - 19772710
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  19772952 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 19772853  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |  || ||||||||||||||  | |    
T  19772852 actccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctt 19772753  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  19772752 tgagcggtatggatgtgatcctgggtatgaactggttagagta 19772710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 22330281 - 22330523
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  22330281 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 22330380  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |  || ||||||||||||||  | |    
T  22330381 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctt 22330480  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  22330481 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 22330523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 26736121 - 26736363
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| | || ||||||| | | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||    
T  26736121 tattattgatactggtgctacacattgttttatttctattgattgtgcttctatgttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaa 26736220  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||| |||||||||  || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | |||||||  |||||||| |||||| |  | |    
T  26736221 actccaactaagggtttggtgactacttctcttgtatgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctt 26736320  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  26736321 tgagtggtatggatgtgatccttggaatgaactggttagagta 26736363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 27665884 - 27666126
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  27665884 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 27665983  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||  |||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  27665984 actccgactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 27666083  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  27666084 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 27666126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 21631793 - 21631924
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  ||||||| |||||||||||||| |||    
T  21631793 tattattaatactggtgctacgcattgttttattgctgttgattgtgcttctaagttgggtcttgttatgtcgaatatgaatggggaaatggttgtcgaa 21631892  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctct 132  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  21631893 actccagctaagggttcggtgactacttctct 21631924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20803589 - 20803347
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | ||  |||||| | | | | ||||||||||| ||  | |||||||| |||    
T  20803589 tattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgggtctcgctttgtctgatatgaatggaaagatggttgtcgaa 20803490  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||  || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  20803489 actccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 20803390  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||    
T  20803389 tgagcggtatggatgtgattcttggtatgaagtggttagagta 20803347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22350911 - 22350669
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  22350911 tattattgatactagtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 22350812  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  22350811 actccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgcgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 22350712  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  22350711 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 22350669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 37288890 - 37289132
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  37288890 tattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttttctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 37288989  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | ||| |||||||| | ||||| |  || ||||||||||||||  | |    
T  37288990 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctttgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctt 37289089  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  37289090 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 37289132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 243
Target Start/End: Original strand, 21342878 - 21343050
Alignment:
Q  71 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagag 170  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||| | | |    
T  21342878 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttgatcgtg 21342977  T
Q  171 attttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    ||||||  || |||||||||||| |  ||||||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  21342978 attttgaaatggatttagtttgtataccattgaacggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 21343050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22137590 - 22137418
Alignment:
Q  71 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagag 170  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | | |||||||||| | |    
T  22137590 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtttatgtttggtcgtg 22137491  T
Q  171 attttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    ||||||  || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  22137490 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 22137418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23474187 - 23473945
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | | |||||||||| ||| | |  |  ||||||| || || |||||||| |||    
T  23474187 tattattgataccggtgctacacattgttttattgctattgattgtacttctaagttgggtctggctatgacgaatatgaatggagagatggttgtcgaa 23474088  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcag-tgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtca 199  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||| | | |  || |||||| | |||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||| |  |     
T  23474087 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtat-taaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgacttggtttgtttacct 23473989  T
Q  200 ttgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    ||||  || ||||| || ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  23473988 ttgagtggaatggacgtaatccttggtatgaactggttagagta 23473945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 27682794 - 27683009
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | | ||||||||| || || |||||||| |||    
T  27682794 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaa 27682893  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |  || |||||||| |||||  | |    
T  27682894 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtgtgtctacctt 27682993  T
Q  201 tgacgggtatggatgt 216  Q
    |||  |||||||||||    
T  27682994 tgagcggtatggatgt 27683009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 21332380 - 21332440
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggt 61  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||    
T  21332380 tattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggt 21332440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23460963 - 23460832
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | ||| | ||||||||||| |  || |||||||| |||    
T  23460963 tattattgatattggtgctacccatgtttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatgaagagatggttgtcgaa 23460864  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctct 132  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  23460863 actccagctaagggttcggtgactacttctct 23460832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 20311755 - 20311667
Alignment:
Q  88 aatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 176  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||| || || |||||||| || ||  || |||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  20311755 aatggttgtcgaaaccccaactaagggttcggtgactacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttg 20311667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 23526043 - 23525963
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaa 81  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| | | || ||||| | || ||||||| | ||| | |||||||||||    
T  23526043 tattattgatactggtgcaacacattgttttattgctttcgattgtgcttctacgttgggtcttgatatgtctgatatgaa 23525963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11898 - 11654
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11898 tattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 11799  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  11798 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgt 11699  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  11698 tgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtata 11654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 37)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 27357662 - 27357418
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27357662 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 27357563  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  27357562 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtctgccgt 27357463  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27357462 tgtcgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagattata 27357418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 28984037 - 28983793
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28984037 tattattgatactggtgctactcactgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 28983938  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |    
T  28983937 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgacttggtttgtctgccgt 28983838  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28983837 tgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtata 28983793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 28989256 - 28989012
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  28989256 tattattgatactggtgctactcactgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgat 28989157  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |    
T  28989156 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgacttggtttgtctgccgt 28989057  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28989056 tgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagtata 28989012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 16268879 - 16269123
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16268879 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 16268978  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |    
T  16268979 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgcttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagatttcgtggttgatttagtttgtctgccgt 16269078  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    || |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  16269079 tgtcgggtatggatgttattttcgggatgaattggttagagtata 16269123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22053989 - 22053745
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22053989 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 22053890  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  | |    
T  22053889 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctgaggtgtcctacatctatgtttggtagagactttgtggttgatttagtttgtttaccgt 22053790  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22053789 tgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtata 22053745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 31414187 - 31414431
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31414187 tattatagatattggtgctactcattgtttcattgctaatgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 31414286  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||   |||||  | ||||||||||||||||| |||||    || ||||||||| |||| |    
T  31414287 actccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgtagccgacttagtttgtttgtcgt 31414386  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31414387 tgacgagtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtata 31414431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 22027935 - 22028179
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  22027935 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttttatcttatatgaaaggagaaatggttgttgaa 22028034  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |   ||||||  | |||||||||||||||||||||| | | || ||||| ||| || | |    
T  22028035 actccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccattgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtatgtttgccgt 22028134  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22028135 tgacgggtatgaatgttatttttgggatgaattggttagagtata 22028179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 29301081 - 29301325
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29301081 tattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgcttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 29301180  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||  | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || | |    
T  29301181 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctgagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgtggttgatttagtttgtttgccgt 29301280  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |  ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  29301281 tatcgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtata 29301325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19985306 - 19985062
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19985306 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtttggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaa 19985207  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | ||||||||||||||||| ||||   | ||| |||| ||| |||| |    
T  19985206 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgtcgt 19985107  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||  ||||||||| |||||||| || || |||||||||||||    
T  19985106 tgacgaatatggatgtaatctttgggataaactggttagagtata 19985062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22373995 - 22373751
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| | | | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22373995 tattatagatactggtgctactcatagtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctagttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaa 22373896  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||||||| |||||| ||||   ||||| | || ||| || |||    
T  22373895 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttgatagagactttgaagttgatcttgtatgtttgccat 22373796  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
     ||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22373795 cgacaggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtata 22373751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21928554 - 21928310
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21928554 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaatggcgaaatggttgttgaa 21928455  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||| |  | ||||||||||||||||| ||||   | ||| |||| ||| || | |    
T  21928454 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagctgtgcgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgt 21928355  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||| | || ||||| ||||| ||| |||||||||    
T  21928354 tgacgggtatggatataatttttgggatgaactggatagagtata 21928310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20391212 - 20390968
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||| | || | ||||  |||||||||||| ||| | | ||   ||| |  || |||||||||||||||    
T  20391212 tattattgatactggtgctacacattgattcattgctgttaattgtgaatataagttgggtctggttatgtcaagtattagtggagaaatggttgttgaa 20391113  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||   ||||   | ||||||||||||||||||||||   ||||| | || ||| || | |    
T  20391112 actccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagattttgaagttgatcttgtatgtttgccgt 20391013  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  20391012 tgatgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttggagtata 20390968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19981093 - 19980878
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  19981093 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 19980994  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||  | |    
T  19980993 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctaccct 19980894  T
Q  201 tgacgggtatggatgt 216  Q
    |||  |||||||||||    
T  19980893 tgagcggtatggatgt 19980878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19115526 - 19115284
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || ||||||||  ||    
T  19115526 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcaaa 19115427  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  19115426 actccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 19115327  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  19115326 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 19115284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22523672 - 22523430
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||    
T  22523672 tattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaa 22523573  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    ||| || | ||||||||||||   |||||||  |||||||| |||||| |  | |    
T  22523572 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgttctttttctatgtttggtcttgattttgaaattgatttggtttgtttacctt 22523473  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  22523472 tgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 22523430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 32603271 - 32603029
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  32603271 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 32603172  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  32603171 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggttgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 32603072  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  32603071 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 32603029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 21391516 - 21391731
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |  ||| |||||   |||||||||| | |   | ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21391516 tattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaa 21391615  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | ||||||| ||| |||||||||| |||  | |    
T  21391616 actccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagtttttctacctt 21391715  T
Q  201 tgacgggtatggatgt 216  Q
    |||  |||||||||||    
T  21391716 tgagtggtatggatgt 21391731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 21780842 - 21781057
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |  ||| |||||   |||||||||| | |   | ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21780842 tattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaa 21780941  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | ||||||| ||| |||||||||| |||  | |    
T  21780942 actccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagtttttctacctt 21781041  T
Q  201 tgacgggtatggatgt 216  Q
    |||  |||||||||||    
T  21781042 tgagtggtatggatgt 21781057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 21786010 - 21786225
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |  ||| |||||   |||||||||| | |   | ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21786010 tattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaa 21786109  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | ||||||| ||| |||||||||| |||  | |    
T  21786110 actccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagtttttctacctt 21786209  T
Q  201 tgacgggtatggatgt 216  Q
    |||  |||||||||||    
T  21786210 tgagtggtatggatgt 21786225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 17671677 - 17671919
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  17671677 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 17671776  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  17671777 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 17671876  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  17671877 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 17671919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 20015918 - 20016160
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  20015918 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 20016017  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || | ||||||||||||  | |    
T  20016018 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatgggtttagtttgtctacctt 20016117  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  20016118 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 20016160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 22375109 - 22375350
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  ||||||| || || ||||| || |||    
T  22375109 tattattgatactggtgctacacattgttttattgatattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggtcgtcgaa 22375208  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||| |||||||||| || || |||||||  || ||| |    |||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |  | |    
T  22375209 actccaactaagggttcggtgactacttctc-cgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtagagattttgaaattgatttggtttgtttacctt 22375307  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  || |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  22375308 tgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 22375350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 22421547 - 22421739
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||    
T  22421547 tattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaa 22421646  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 193  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| |||||||||||| | | |||||||  ||||| || ||||||    
T  22421647 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttgatcgtgattttgaaattgacttggtttgt 22421739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 30310799 - 30311041
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||     
T  30310799 tattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgag 30310898  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  30310899 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 30310998  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  30310999 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 30311041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22042953 - 22042714
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  | |||| ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||  || || |||||||| |||    
T  22042953 tattattgatactggtgctacgcattgctttatttcttttgattgtgtttctgctttgggtcttgatttttctgatatgattggagagatggttgtcgaa 22042854  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  22042853 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 22042754  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttaga 240  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||    
T  22042753 tgaacggtatggatgtgattctaggtatgaattggttaga 22042714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18859703 - 18859509
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  18859703 tattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 18859604  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtct 195  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||    
T  18859603 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtct 18859509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 21254071 - 21253877
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |  ||| |||||   |||||||||| | |   | ||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  21254071 tattattgatactggtgctacgcattattttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaa 21253972  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtct 195  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | ||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  21253971 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttggtttgtct 21253877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 22126614 - 22126856
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  22126614 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 22126713  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || |  |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |  || ||||||||||||||  |      
T  22126714 actccagctaagggttcggtgattacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctc 22126813  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  22126814 tgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 22126856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 22129272 - 22129514
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||  | |||||||| |||    
T  22129272 tattattgatactggtgttacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggacagatggttgtcgaa 22129371  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  22129372 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 22129471  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  22129472 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 22129514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 22117830 - 22118024
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||  |||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  22117830 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatcgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 22117929  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtct 195  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |  || ||||||||||||||    
T  22117930 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtct 22118024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 22246088 - 22246330
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  ||||||| ||  | |||||||| |||    
T  22246088 tattattcatattagtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggatagatggttgtcgaa 22246187  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||  |    |||||| | |||||||||||| |||||||||  ||| |||| |||||| |  | |    
T  22246188 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgcttaatatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattaatttggtttgtttacctt 22246287  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  |  |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  22246288 tgagtgaaatggatgtaatccttggtatgaattggttagagta 22246330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22990171 - 22989929
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||| ||||| |  ||||||||| | | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||    
T  22990171 tattattgatactagtgctaaacattgttttattgctattgattgtgcttcaaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaa 22990072  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||  | |||||||||||| | |||||||  ||||| || |||||| |  | |    
T  22990071 actccagcgaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttaagatgtcccttgtctatgtttggtcgtgattttgaaattgacttggtttgtttacctt 22989972  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  22989971 tgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 22989929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 21164193 - 21164408
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  | ||||| | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  21164193 tattattgatactgatgctacgcattgttttattgctttcaattgtgcttcttctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 21164292  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||||| | ||| || |||||||||||  | |    
T  21164293 actccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggacttagtttgtctacctt 21164392  T
Q  201 tgacgggtatggatgt 216  Q
    |||  |||||||||||    
T  21164393 tgagtggtatggatgt 21164408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15536509 - 15536267
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || | ||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  15536509 tattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattatgtttctgccttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 15536410  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| | |  |||||| | ||||| |||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  15536409 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttacgttgtcctttgtctatatttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 15536310  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  |||||| |||| || || || | |||||||||||||||    
T  15536309 tgagcggtatgaatgtgattttgggtacgaattggttagagta 15536267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 22245670 - 22245862
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  ||||||| ||  | |||||||| |||    
T  22245670 tattattcatattagtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggatagatggttgtcgaa 22245769  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 193  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||  |    |||||| | |||||||||||| |||||||||  ||| |||| ||||||    
T  22245770 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgcttaatatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattaatttggtttgt 22245862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22031229 - 22030987
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  22031229 tattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 22031130  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||| |||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | ||||||||||||   ||||| |  || ||||||||||||||  |||    
T  22031129 actccaactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcatgatttcgaaatggatttagtttgtct-acat 22031031  T
Q  201 tgacg-ggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    | | | ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  22031030 ttaagcggtatggatgtaattctgggtatgaattggttagagta 22030987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 19481727 - 19481969
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  19481727 tattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaa 19481826  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| ||    |||||||| || ||| || | |||||| | ||||||||| || | |||||||  || ||||||||||| ||  | |    
T  19481827 actccagctaagggttcggtgcttacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttagtcgtgattttgaaatggatttagtttgcctacctt 19481926  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  19481927 tgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 19481969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10408657 - 10408413
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10408657 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 10408558  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  10408557 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtgtgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgt 10408458  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  10408457 tgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtata 10408413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 28757008 - 28756764
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28757008 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 28756909  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  28756908 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctacggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctaccgt 28756809  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28756808 tgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatata 28756764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 47126633 - 47126389
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47126633 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 47126534  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  47126533 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtaattgatttagtttgtctgccgt 47126434  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  47126433 tgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagtata 47126389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 12509923 - 12510167
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12509923 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 12510022  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  | |    
T  12510023 actccagctaagatttcagcaaccacttctctggtttgtttggggtgtcttatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtttaccgt 12510122  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  12510123 tgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagagtata 12510167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 11958621 - 11958865
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11958621 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 11958720  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |    
T  11958721 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagactttgtggttgatttagtttgtttgtcgt 11958820  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    || |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  11958821 tgtcgggtatggatgttattttcggtatgaattggttagagtata 11958865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 16327149 - 16327393
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16327149 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 16327248  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  || | |    
T  16327249 actccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctatgtttggtagagatttcgtggttgatttagtttgcttgccgt 16327348  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    || |||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  16327349 tgtcgggaatggatgttattttcgggatgaattggttagagtata 16327393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 16831968 - 16832212
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16831968 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaagaagaaatggttgttgaa 16832067  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| || | |    
T  16832068 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgt 16832167  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16832168 tgacgggaatggacgttatttttggaatgaattggttagagtata 16832212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Original strand, 16378384 - 16378618
Alignment:
Q  11 actggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagcta 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16378384 actggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatattaaaggagaaatggttgttgaaactccagcta 16378483  T
Q  111 agggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtat 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| || | |||||||| ||    
T  16378484 agggttcagtaactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaat 16378583  T
Q  211 ggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16378584 ggatgttatttttgggatgaattggttagagtata 16378618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 12357967 - 12358211
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12357967 tattatagacactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggaaaaatggttgttgaa 12358066  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |    
T  12358067 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttagcgt 12358166  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||    
T  12358167 tgacgggtatggatgttatttttgcgatgaactggttagagtata 12358211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Original strand, 18131797 - 18132030
Alignment:
Q  12 ctggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaa 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18131797 ctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaacggttgttgaaactccagctaa 18131896  T
Q  112 gggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatg 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||   |||||   | ||||||||||||||||| | ||   | || ||||| ||| |  | ||||||||||||    
T  18131897 gggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagactatgaagtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggtatg 18131996  T
Q  212 gatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  18131997 gatgttattttttggatgaattggttagagtata 18132030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12273027 - 12272783
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| | ||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12273027 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgactatgcatttaagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 12272928  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||||||| ||||   | ||| |||||||| |  | |    
T  12272927 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtttgtttaccgt 12272828  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  12272827 tgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtata 12272783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 8744830 - 8745074
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8744830 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggttgggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 8744929  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||  |||||| || ||||||||||||||||||||||   | || ||||||||| || |      
T  8744930 actccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttgaagtagacttagtttgtttgccgc 8745029  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8745030 tgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtata 8745074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17494336 - 17494091
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttg-a 99  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  17494336 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataaattgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 17494237  T
Q  100 aactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtca 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    |||||  | ||||||||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  |     
T  17494236 aactccagctaagggttcagtaactaattctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccg 17494137  T
Q  200 ttgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  17494136 ttgacgggtatgtatgttatttttgggatgaactggttagagtata 17494091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12181033 - 12180789
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||     
T  12181033 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctgtttgtatctaatatgaaaggagaaatggttgttgac 12180934  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     |||||  | ||||||||||||||||| ||||   | || ||||||| | |  | |    
T  12180933 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtccaagatgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttctttaccgt 12180834  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12180833 tgacgggtatggttgttatctttgggatgaactggttagagtata 12180789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13944713 - 13944469
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||  ||||||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  13944713 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaactgggtttgattgtgtctgatatggaaggagaaatggttgttgaa 13944614  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||  |||||| || ||||||||||||||||||||||   | || |||||||||||  | |    
T  13944613 actccagctaagggttcagtgactacttctctagtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttgaagtagacttagtttgtctaccgt 13944514  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13944513 tgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagtata 13944469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24189993 - 24189749
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||| || || |||||||||||     
T  24189993 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataaattgggtttgattgtatctgatatgaagggagagatggttgttgag 24189894  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||| | |  |      
T  24189893 actccagctaagggttcagtgactacttttctcgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttagtttttttaccgc 24189794  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  24189793 tgacgggaatggatgttatttttggaatgaattggttagaatata 24189749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 31692625 - 31692869
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31692625 tattatagatattggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagtcgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 31692724  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||  | ||||||||||||||||| ||||   | || ||||| ||| |  | |    
T  31692725 acttcagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtgtgtttaccgt 31692824  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  31692825 tgacgggaatggatgttatttttgggatgaactgattagagtata 31692869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 14290972 - 14291216
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || ||| |||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14290972 tattatagacactagtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 14291071  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | ||||||||||||||||| ||||   | ||| | || ||| || | |    
T  14291072 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatcttgtatgtttgccgt 14291171  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    || ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  14291172 tgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtata 14291216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 14575639 - 14575431
Alignment:
Q  37 tattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtt 136  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14575639 tattgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtt 14575540  T
Q  137 tgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggt 236  Q
    |||||   ||||||  | ||||||||||||||||| ||||   | ||  |||||||| |  | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  14575539 tgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttggaatgaactggt 14575440  T
Q  237 tagagtata 245  Q
    |||| ||||    
T  14575439 tagattata 14575431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 16825721 - 16825965
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16825721 tattatagatactagtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggataaatggttgttgaa 16825820  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||  | |||||  |||||||||| ||||   | ||| | |||||| |  | |    
T  16825821 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctataattggtagagactttgaagtcgatcttgtttgtttaccgt 16825920  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  16825921 tgacgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtata 16825965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 31941592 - 31941348
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31941592 tattatagatactgatgctactcattttttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 31941493  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||   ||| ||  | ||||||||||| ||||| ||||   | || ||||| ||| |  | |    
T  31941492 actccagctaagggtctagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgcccgttgtctatgtttggcagagactttgaagtcgacttagtgtgtttaccgt 31941393  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  31941392 tgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtata 31941348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17189063 - 17188819
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||| | || || ||||||||||||    
T  17189063 tattatagacacgggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataaattgggtttgattgtatctgatatggagggagagatggttgttgaa 17188964  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   | || ||||||||| |         
T  17188963 actccagctaagggttcagtgactacttctctcgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaagtagacttagtttgtttactgc 17188864  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  17188863 tgacgggaatagatgttatttttagaatgaattggttagaatata 17188819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 11949365 - 11949500
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11949365 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtggttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 11949464  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  11949465 actccagctaagggttcagtaactacttttcttgtt 11949500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 10417485 - 10417729
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || || |||||||| |||||||| |||| | | || ||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10417485 tattatagacaccggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 10417584  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||   ||||||  | |||||||||||||||||||| | | | || ||||| |||||  | |    
T  10417585 actccagccaagggttcagtgactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagatttcgaggtcgacttagtgtgtctaccgt 10417684  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||  ||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  10417685 tgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagagtata 10417729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 12857935 - 12858179
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||| |||| | | |  ||||| |||||||||| | ||| | ||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  12857935 tattatagatactggtgctagttattgtttcattgctgtggtttgtgcatataagttggttctggttatatctgatatgaatggagaaacggttgttgaa 12858034  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | |||||||||||||| || ||||   ||||| | || ||| || | |    
T  12858035 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagtgactttgaagttgatcttgtatgtttgccgt 12858134  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12858135 tgatgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtata 12858179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15065750 - 15065508
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  15065750 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttcttctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 15065651  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
     |||||||||||||||| || || |||||||| |||||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||  | |    
T  15065650 tctccagctaagggttcggtgactacttctctcgtttgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctt 15065551  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  15065550 tgagcggtatggatgtgattcttggtatgaattggttagagta 15065508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15230292 - 15230048
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | |||| | ||| |||||||||||| ||| | | ||   |||||  || |||||||||||||||    
T  15230292 tattatagacactggtgctacacattgtttcattgctgttgattttgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaa 15230193  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||   |||||  | ||||||||| ||||||||||||   ||||| | || ||| || | |    
T  15230192 actccagctaagggttcattaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgttttgtagagattttgaagttgatcttgtatgtttgccgt 15230093  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||    
T  15230092 taacgggtatggatgtaatctttgggatgaactagttagagtata 15230048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15236160 - 15235916
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | |||| | ||| |||||||||||| ||| | | ||   |||||  || |||||||||||||||    
T  15236160 tattatagacactggtgctacacattgtttcattgctgttgattttgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaa 15236061  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||   |||||  | ||||||||| ||||||||||||   ||||| | || ||| || | |    
T  15236060 actccagctaagggttcattaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgttttgtagagattttgaagttgatcttgtatgtttgccgt 15235961  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||    
T  15235960 taacgggtatggatgtaatctttgggatgaactagttagagtata 15235916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 13317974 - 13318086
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13317974 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggcttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 13318073  T
Q  101 actccagctaagg 113  Q
    |||||||||||||    
T  13318074 actccagctaagg 13318086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12889388 - 12889146
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  12889388 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 12889289  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  12889288 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 12889189  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  12889188 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 12889146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13255369 - 13255127
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  13255369 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 13255270  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  13255269 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 13255170  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  13255169 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 13255127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15262309 - 15262067
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||    
T  15262309 tattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaa 15262210  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||| |  | |    
T  15262209 actccagctaatggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgatttggtttgtttacctt 15262110  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  || |||||||| ||| ||||  |||| |||||||||||    
T  15262109 tgagtggaatggatgtaatccttggtgtgaactggttagagta 15262067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15358762 - 15358547
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  15358762 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 15358663  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||| | |    
T  15358662 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctgcctt 15358563  T
Q  201 tgacgggtatggatgt 216  Q
    |||  |||||||||||    
T  15358562 tgagcggtatggatgt 15358547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10008279 - 10008037
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  10008279 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 10008180  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |  || ||||||||||||||  | |    
T  10008179 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgcgatttcgaaatggatttagtttgtctacctt 10008080  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  10008079 tgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 10008037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 15399968 - 15400210
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  15399968 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 15400067  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||| ||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||| | |    
T  15400068 actccagcttagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctgcctt 15400167  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  15400168 tgagcggtatggatgtaattctgggtatgaactggttagagta 15400210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16638452 - 16638210
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||| ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  16638452 tattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttttgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 16638353  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  16638352 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 16638253  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  16638252 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 16638210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24185869 - 24185627
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  24185869 tattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaa 24185770  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||  || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  24185769 actccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 24185670  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||| |||||    
T  24185669 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagta 24185627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 43165354 - 43165112
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  43165354 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 43165255  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  43165254 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 43165155  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  43165154 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 43165112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 48428126 - 48427884
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  48428126 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 48428027  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  48428026 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 48427927  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  48427926 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 48427884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10908889 - 10908647
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  10908889 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 10908790  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| |  |||| |  || ||||||||||||||  | |    
T  10908789 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtcatttcgaaatggatttagtttgtctacctt 10908690  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  10908689 tgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 10908647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 15586843 - 15587085
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  15586843 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 15586942  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  15586943 actccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 15587042  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  15587043 tgaatggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 15587085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 15713507 - 15713749
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  15713507 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 15713606  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |  || ||||||||||||||  | |    
T  15713607 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctt 15713706  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  15713707 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 15713749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 20059505 - 20059747
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  20059505 tattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 20059604  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  20059605 actccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 20059704  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  20059705 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 20059747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 12843554 - 12843688
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||| | | | | | ||  ||||||| || || ||| ||||||||    
T  12843554 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttggatcttgctatgtcaaatatgaatggagagatgattgttgaa 12843653  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 135  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  12843654 actccagctaatggttcagtgactacttctcttgt 12843688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16694843 - 16694649
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |  ||||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| ||     
T  16694843 tattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgcgttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgag 16694744  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtct 195  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||    
T  16694743 actccagctaagggttctgtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtct 16694649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 16754152 - 16754394
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  16754152 tattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 16754251  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  16754252 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctctgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 16754351  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  16754352 tgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 16754394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3688622 - 3688380
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |   || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  3688622 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttccgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 3688523  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  3688522 actccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 3688423  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||| ||||    
T  3688422 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttacagta 3688380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 5422381 - 5422623
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || || |  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  5422381 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgcgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 5422480  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||  |||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||| | | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  5422481 actccgactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcttttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 5422580  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  5422581 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 5422623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 14578859 - 14579101
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||| |     | ||  ||||||| || || |||||||| |||    
T  14578859 tattattgatcctagtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttcccatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaa 14578958  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||| |    |||||| | |||||||||| | | |||||||  |||||||| |||||| || | |    
T  14578959 actccagctaagggttcagtaactacttctatagtatgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgatttggtttgtttgcctt 14579058  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  14579059 tgagtggtatggatgtgattctaggtatgaactggttagagta 14579101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 14874019 - 14874213
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | ||| | ||| ||||||| || || |||||||| |||    
T  14874019 tattattgatattggtgcaacacattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgatatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaa 14874118  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtct 195  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || |  || || | |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  14874119 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaaagttctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtct 14874213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 15345696 - 15345890
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  15345696 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 15345795  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtct 195  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |  || ||||||||||||||    
T  15345796 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtct 15345890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 26790864 - 26791106
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  |     |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  26790864 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgttttcgattgtgtttccgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 26790963  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |  || ||||||||||||||  | |    
T  26790964 actccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctt 26791063  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  26791064 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 26791106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 53382469 - 53382711
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||||| || || ||| |||| |||    
T  53382469 tattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatgattgtcgaa 53382568  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  53382569 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 53382668  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||    
T  53382669 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttggagta 53382711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6603414 - 6603199
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||||| || || ||||||||  ||    
T  6603414 tattattgatactggtgctacccattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcaaa 6603315  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  6603314 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 6603215  T
Q  201 tgacgggtatggatgt 216  Q
    |||  |||||||||||    
T  6603214 tgagtggtatggatgt 6603199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 245
Target Start/End: Original strand, 13318096 - 13318186
Alignment:
Q  155 tctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| | || |||||  | |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13318096 tctatgtttggtagagattttgaggttgatcttgtatgtctaccgttgatgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtata 13318186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 16804398 - 16804640
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | | ||||||||| || || |||||||| |||    
T  16804398 tattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaa 16804497  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||  || || |||||||| || ||  |||  |||| | | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  16804498 actccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgcttgcgatgtcttctgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 16804597  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  16804598 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 16804640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 170
Target Start/End: Original strand, 15013284 - 15013378
Alignment:
Q  76 tatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagag 170  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||| || ||  || |||||||| | || |||||||||||||    
T  15013284 tatgaatggggaaatggttgtcgaaaccccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagag 15013378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17492460 - 17492288
Alignment:
Q  71 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagag 170  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||| |||| || || ||||||||||| ||| |    |||||  | | |||||||| | | |    
T  17492460 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcgaagagttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcccttgtttatgtttgatcgtg 17492361  T
Q  171 attttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||    
T  17492360 attttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagta 17492288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 41824 - 41580
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41824 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 41725  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  41724 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatccatgtttggtagggattttgtgattgatttagtttgtctgccgt 41625  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  41624 tgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagaatata 41580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 514568 - 514808
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  514568 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 514667  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  | |    
T  514668 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtttaccgt 514767  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagag 241  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  514768 tgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagag 514808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 441742 - 441497
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||| ||||| | ||| |||||| |   | | ||  ||||||| || ||||||||||| |||    
T  441742 tattattgatactggtgctacggattgttttattgctcttgattgtgcttctaaattgggtcttactatgtcaaatatgaatggagaaatggttgtcgaa 441643  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| || | |    
T  441642 actccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagatttttagattgatttggtttgtttgcctt 441543  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtatac 246  Q
     ||  || |||||||| ||  |||| ||||||||||  ||||||||    
T  441542 agagtggaatggatgtaattcttggtatgaattggtaggagtatac 441497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 496109 - 495867
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |  ||||||||| | | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||    
T  496109 tattattgatactagtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttcgaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaa 496010  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||| | | |    ||| || | |||||||||||| ||||||||   |||||||| |||||| |  | |    
T  496009 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtttttaagatgttctttgtctatgtttggtcgagatttttaaattgatttggtttgtttacctt 495910  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  || |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  495909 tgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 495867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 30023 - 29779
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30023 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 29924  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  29923 actccagctaagggttcaagaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtctgccgt 29824  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||  |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  29823 tgttgggtatggatgtgatttttggaatgaattggtcagagtata 29779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 37)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 24367324 - 24367083
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367324 tattattaatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatatcagttgggtccggatatatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 24367225  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  24367224 actccagctaaggattcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatctttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgt 24367125  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagt 242  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24367124 tcacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 24367083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 10466205 - 10466449
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10466205 tattatagatactgttgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 10466304  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |   |||||   |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |  | |    
T  10466305 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtctgttatctatgtttggtagggactttgtggttgatttagtttgtttaccgt 10466404  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  10466405 tgacgggtatggatgttatttttgggataaattggttagagtata 10466449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19455947 - 19455703
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19455947 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggtgaaatggttgttgaa 19455848  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||| |  | ||||||||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |    
T  19455847 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgttcgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgt 19455748  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  19455747 tgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtata 19455703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 21567348 - 21567592
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||| ||| |||||||||||  |||| |||| |||||||| || ||||||||||||    
T  21567348 tattatagacactggtactactcattgtttcattgctttagaatgtgcatattagttgggtttgattgtaactgacatgaaaggagagatggttgttgaa 21567447  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||  | |    
T  21567448 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggtcgacttagtgtgtctaccgt 21567547  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||    
T  21567548 tgacgggtatggatgtcatttttggaatgaactagttagagtata 21567592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18797614 - 18797370
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  18797614 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctgacatgaaaggagagatggttgttgaa 18797515  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||| ||||||| | | || ||||| ||| |  |      
T  18797514 actctagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtttcctatatctatgtttggtagggattttgaggtagacttagtgtgtttaccgc 18797415  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18797414 tgacgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtata 18797370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 14377273 - 14377517
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14377273 tattatagacactggtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 14377372  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||   |||||   | ||||||||||||||||| || |   | || ||||||||| |||| |    
T  14377373 actccagcaaagggtttagtagctacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagacttcgaagtcgacttagtttgtttgtcgt 14377472  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  14377473 tgatgggtatggatgttatttttggaatgaactagttagagtata 14377517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 24515771 - 24516015
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24515771 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 24515870  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||||||| ||||   | ||| |||| ||| |  | |    
T  24515871 actccagttaagtgttcattaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtgtgtttaccgt 24515970  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  24515971 tgacgggaatggacattatttttgggatgaactggttagagtata 24516015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15462260 - 15462016
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15462260 tattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 15462161  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||   ||||||  |||||||||||||||||||||||| | | || ||||| |||||  | |    
T  15462160 actccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttatctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgt 15462061  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||  ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  15462060 tgttggggatggatgttatcttcgggatgaattggttagaatata 15462016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19437926 - 19437682
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| || | | ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19437926 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgagtctagttgtatctgatatgaagggagaaatggttgttgaa 19437827  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||  | | |||||||| |||||| ||||   | || ||||||||| |  | |    
T  19437826 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtttatgtttgttagagactttgaagtcgacttagtttgttttcctt 19437727  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||    
T  19437726 tgactggtatggatgttatttttgggatgaacttgttagagtata 19437682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21474524 - 21474280
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| | | |||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  21474524 tattatagatactggtgctactcattgtttgattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatagaaaaatggttgttgaa 21474425  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||   |||||  | ||||||||||||||||| ||||   ||||| | || ||| |||| |    
T  21474424 actccagctaagggttcagtaactacttctcatgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagttgatcttgtatgtttgtcgt 21474325  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21474324 tgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtata 21474280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 19466092 - 19465971
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19466092 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 19465993  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19465992 actccagctaagggttcagtaa 19465971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 34642943 - 34643187
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | || ||||| |||||  ||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  34642943 tattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcttataaactgggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaa 34643042  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||  |||||||  |  | |    
T  34643043 actccggctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagatgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagacctagtttgcttacctt 34643142  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  34643143 tgacggggatggatgttatatttgggatgaattggttagagtata 34643187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25770768 - 25770524
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| | | ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25770768 tattatagatattggtgctattcattgtttcattgttgttgattgtgcttataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaa 25770669  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
     ||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||| ||   |||||  | ||||||||||||||||| ||||   ||||  | || ||| || |||    
T  25770668 tctccagcaaagggttcaatcactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagttgaccttgtatgtttgccat 25770569  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25770568 tgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtata 25770524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 5836585 - 5836827
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| ||||  |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  5836585 tattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgcttatactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 5836684  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||  |||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  5836685 actccagctaagggttcggtaactaccactctagtatgtttgaaatgtcctttttctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctccctt 5836784  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||    
T  5836785 tgagcggtatggatgttattcttggtaggaattggttagagta 5836827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 19486651 - 19486893
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| |||   | ||   |||||   | |||||||||||||||    
T  19486651 tattattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggtcatgtcaagtatgagtagagaaatggttgttgaa 19486750  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||   ||||   | ||||||||||||||||||||||   ||||| |||| ||| || |      
T  19486751 actccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgcc-- 19486848  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  19486849 tgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttggagtata 19486893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 18405301 - 18405543
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||   |||||||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  18405301 tattattgatactggtgctatgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 18405400  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| ||   |||||  | |||||||||| | | |||||||  ||| |||| ||||||||| | |    
T  18405401 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttgagatgtcccttgtctatgtttgattgtgattttgaaattaatttggtttgtctgcctt 18405500  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||    
T  18405501 tgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagta 18405543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23081347 - 23081105
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | | | ||  |||| || || || |||||||| |||    
T  23081347 tattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggttttgctatgtcaaatattaatggagagatggttgtcgaa 23081248  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | |||| ||  ||||| || |||||| |  | |    
T  23081247 actccagctaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattatgaaattgacttggtttgtttacctt 23081148  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  23081147 tgattggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 23081105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 135
Target Start/End: Original strand, 20010821 - 20010945
Alignment:
Q  11 actggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagcta 110  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| |||||||||||  |    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20010821 actggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcttataagttgggcctaatcgtatctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagcca 20010920  T
Q  111 agggttcagtaaccacttctcttgt 135  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  20010921 agggttcagtaactacttctcttgt 20010945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 16924997 - 16925239
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||||| || || ||||| || |||    
T  16924997 tattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgtcgaa 16925096  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | |||||||  || |||||||||||| || | |    
T  16925097 actccagctaagggatcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttttctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtttgcctt 16925196  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  |||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||    
T  16925197 tgagtggtatggacgtcatccttggtatgaattggttagagta 16925239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 29589796 - 29590038
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  29589796 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 29589895  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  29589896 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 29589995  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  29589996 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 29590038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 2872159 - 2872401
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  2872159 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 2872258  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |  || ||||||||||||||  | |    
T  2872259 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctt 2872358  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  2872359 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 2872401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 23085182 - 23085374
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||| | ||| | |||||||||| |   | | ||   |||||| || ||||||||||| |||    
T  23085182 tattattgaaactggtgctacacattgttttattgttgttgattatgcttctaagttgggtcttactatgtcaagtatgaatggagaaatggttgtcgaa 23085281  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 193  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |    |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  23085282 actccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttgaaattgatttggtttgt 23085374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16574814 - 16574572
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  16574814 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 16574715  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |  || ||||||||||| ||  | |    
T  16574714 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgcctacctt 16574615  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  16574614 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 16574572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 16620566 - 16620808
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  16620566 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 16620665  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |  || ||||||||||| ||  | |    
T  16620666 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgcctacctt 16620765  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  16620766 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 16620808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22436793 - 22436551
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  22436793 tattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 22436694  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | ||| || | |||||||||||| | ||||||| ||||||| | |||||  || | |    
T  22436693 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgttctttgtctatgtttggtcgtgattttgagattgatatggtttgcttgcctt 22436594  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  |||||||  || ||  |||| |||||||||||||||||    
T  22436593 tgagtggtatgggcgtcattcttggtatgaattggttagagta 22436551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27190360 - 27190118
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||    
T  27190360 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtcttgagttgtcagatatgaatggggagatggttgtcgaa 27190261  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | ||||| |||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  27190260 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 27190161  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  27190160 tgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 27190118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 27258880 - 27259122
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||    
T  27258880 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtcttgagttgtcagatatgaatggggagatggttgtcgaa 27258979  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | ||||| |||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  27258980 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 27259079  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  27259080 tgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 27259122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 27559326 - 27559568
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  27559326 tattattgataatggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 27559425  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||    |    
T  27559426 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacttt 27559525  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  27559526 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 27559568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 28260554 - 28260796
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  28260554 tattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 28260653  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  28260654 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 28260753  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||| ||||    
T  28260754 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttaaagta 28260796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 28285362 - 28285120
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  28285362 tattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 28285263  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  28285262 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 28285163  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||| ||||    
T  28285162 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttaaagta 28285120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 28339303 - 28339545
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  28339303 tattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 28339402  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  28339403 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 28339502  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||| ||||    
T  28339503 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttaaagta 28339545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 71 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 28312484 - 28312312
Alignment:
Q  71 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagag 170  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | || | |||||| | |||||||||||| | |    
T  28312484 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatttttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 28312385  T
Q  171 attttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    ||||||  || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  28312384 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 28312312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19867611 - 19867396
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||  | | | | ||| ||||||| |  || |||||||| |||    
T  19867611 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctaccttgggccttgttatgtcttatatgaatgaagagatggttgtcgaa 19867512  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| | ||| ||||||||||||||  | |    
T  19867511 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggatttagtttgtctacctt 19867412  T
Q  201 tgacgggtatggatgt 216  Q
    |||  |||||||||||    
T  19867411 tgagcggtatggatgt 19867396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25115406 - 25115234
Alignment:
Q  71 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagag 170  Q
    ||||||||||| || || ||| |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |    
T  25115406 tctgatatgaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 25115307  T
Q  171 attttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    ||||||  || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  25115306 attttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 25115234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 24293139 - 24293381
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  24293139 tattattgatactggtgctacgcacggttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 24293238  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||    || ||||||||||||||  | |    
T  24293239 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcaaaatggatttagtttgtctacctt 24293338  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  24293339 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 24293381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 30678381 - 30678625
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||| | ||||||| | ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||| | | | | ||   |||| | |||||||||||||| |||    
T  30678381 tattattgatatttgtgctacgcgttgttttattgctactgattgtgcttctaagttgggtcttgttatgtcatgtatggatggggaaatggttgtcgaa 30678480  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||  || || |||||||| || |||||| ||||| |  | || ||||||||| |||| ||||   |||||||||| ||| |  | |    
T  30678481 actccagctaagggtttggttactacttctctagtgtgtctgaagtgttcgttgtcgatgtttggtcgagactttgaagttgatttagtctgttttcctt 30678580  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||  || |||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||    
T  30678581 tgagtggaatggatgtaatacttggtatgaattggttggagtata 30678625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 18182724 - 18182862
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||   |||||| |||||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  ||||||| || || ||||| || |||    
T  18182724 tattattgatattggtgctacacatttccttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggtagtcgaa 18182823  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 139  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  18182824 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgtttgt 18182862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20848280 - 20848067
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20848280 tattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 20848181  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  20848180 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgccgt 20848081  T
Q  201 tgacgggtatggat 214  Q
    ||| ||||||||||    
T  20848080 tgatgggtatggat 20848067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 19716769 - 19717013
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19716769 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatttgaaaggagaaatggttgttgaa 19716868  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||   |||||  | ||||||||||||||||| ||||   | || ||||||||| || | |    
T  19716869 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttgccgt 19716968  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19716969 tgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtata 19717013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 23097770 - 23098014
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| | |||||||||| ||| |||| |||| |||||||| || ||||||||||||    
T  23097770 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatttaagttgggtctggttgtaactgacatgaaaggagagatggttgttgaa 23097869  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||  | |    
T  23097870 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggtcgacttagtgtgtctaccgt 23097969  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||| |||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||    
T  23097970 tgatgggtatggatgtcatttttggaatgaactgggtagagtata 23098014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23274284 - 23274040
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23274284 tattatagacaccggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 23274185  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |    
T  23274184 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgt 23274085  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||    
T  23274084 tgacgggaatggatgttatttttgggatggactggttagagtata 23274040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12577044 - 12576800
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||  ||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12577044 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcctataaactgggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 12576945  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||| |||||  ||  |||||| || ||||||||||||||||||||||   | || ||||| ||| |  | |    
T  12576944 actccagctaagggttcaatgactacttctctggtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttgaagtagacttagtgtgtttaccgt 12576845  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12576844 tgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagtata 12576800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23113414 - 23113170
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| ||||| |||||| ||| | | ||   |||||  || |||||||||||||||    
T  23113414 tattattgatactggtgctacacattgtttcattgttgttgattgtgcatataaattgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaa 23113315  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||   |||||  | ||||||||||||||||||||||   ||||| |||| ||| || | |    
T  23113314 actccaactaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgccgt 23113215  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  23113214 tgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtata 23113170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 24817592 - 24817784
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||| |     | ||  ||||||| || ||||||||||| |||    
T  24817592 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttacaatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaa 24817691  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 193  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24817692 actccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttgagattgatttggtttgt 24817784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 11351463 - 11351705
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  11351463 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtctagatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 11351562  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  11351563 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 11351662  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  | ||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  11351663 tgagcgatatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 11351705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17001691 - 17001449
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| ||||||||||||| || || |||||||| |||    
T  17001691 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 17001592  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  17001591 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 17001492  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  17001491 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 17001449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23074554 - 23074312
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||   |||||||||| | | | | ||||||||||| || || |||||| | |||    
T  23074554 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctattaagttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttatcgaa 23074455  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| |   ||||||| ||||||||| ||||||||  | |    
T  23074454 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcttgattttgagattgatttggtttgtctacctt 23074355  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  23074354 tgagtggtatggatgtaattcttggtatgaattggttagagta 23074312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 22323094 - 22323336
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  22323094 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 22323193  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  22323194 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 22323293  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  22323294 tgagtggtatggatgtgattttaggtatgaactggttagagta 22323336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24712725 - 24712483
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  24712725 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 24712626  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  24712625 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 24712526  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  24712525 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 24712483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27220707 - 27220465
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  27220707 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 27220608  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  27220607 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 27220508  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  27220507 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 27220465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 44383322 - 44383564
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  44383322 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgttttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 44383421  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  44383422 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 44383521  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  44383522 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 44383564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 9338273 - 9338031
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  9338273 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 9338174  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  9338173 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 9338074  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  9338073 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 9338031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 9486907 - 9486665
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  9486907 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 9486808  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  9486807 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 9486708  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  9486707 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 9486665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16983931 - 16983689
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  16983931 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 16983832  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  16983831 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 16983732  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  16983731 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 16983689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 21323018 - 21323212
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||  || || |||||||| |||    
T  21323018 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgattggagagatggttgtcgaa 21323117  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtct 195  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| | ||| ||||||||||||||    
T  21323118 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggatttagtttgtct 21323212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24678178 - 24677936
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  24678178 tattaatgatactggtgctaggcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtctagatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 24678079  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||| ||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||  | |    
T  24678078 acttcagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctt 24677979  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  24677978 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 24677936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 23105480 - 23105695
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |  ||| |||||   |||||||||| | |   | ||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  23105480 tattattgttactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaa 23105579  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | ||||||| ||| ||||||||||||||  | |    
T  23105580 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctt 23105679  T
Q  201 tgacgggtatggatgt 216  Q
    |||  |||||||||||    
T  23105680 tgatcggtatggatgt 23105695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27373960 - 27373718
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  27373960 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 27373861  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |  || ||||||||||| ||  | |    
T  27373860 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgcctacctt 27373761  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  27373760 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 27373718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23065104 - 23064973
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||   |||||||||| | | | | ||||||||||| || || |||||| | |||    
T  23065104 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctattaagttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttatcgaa 23065005  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctct 132  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  23065004 actccagctaagggttcggtgactacttctct 23064973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10871541 - 10871299
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  10871541 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 10871442  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||| | | |||||||||||| | ||||| |  || ||||||||||||||  | |    
T  10871441 actccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcgtttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctt 10871342  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  10871341 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 10871299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 21142793 - 21143035
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  21142793 tattattgatattggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgttttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 21142892  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||||  | || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  21142893 actccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 21142992  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  21142993 tgagcggtatggatgtgattctaggtatgaactggttagagta 21143035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 22733526 - 22733768
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| | |||| |||||   |||||||||| | |   | ||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  22733526 tattattgatactggtgctacgcgttgatttattgcttttgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaa 22733625  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||| |||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||  | |||||||||| | | ||||||  ||||||||| ||||||||  | |    
T  22733626 actccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtataagatgtcccttgtctatgtttgatcgtgattttcagattgatttggtttgtctagctt 22733725  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  |||| ||||  |||||||||||    
T  22733726 tgagtggtatggatgtaattcttggtatgacctggttagagta 22733768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 24657410 - 24657652
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||||||| | | || ||||  | ||  |||| | | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  24657410 tattattgatacagctgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttggatcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 24657509  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  24657510 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 24657609  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  |||  ||||||||| |||||||    
T  24657610 tgagcggtatggatgtgattcttgatatgaattgggtagagta 24657652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 24705234 - 24705428
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||||| |  || |||||||| |||    
T  24705234 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatgcagagatggttgtcgaa 24705333  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtct 195  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||| ||   || ||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||    
T  24705334 actccagctaagggtttggtaactacttctctcgtatgtttgagatgccctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtct 24705428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 24874502 - 24874744
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  24874502 tattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 24874601  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||| ||| || || |||||||| || ||| |  | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  24874602 actccagctaaggtttcggtgactacttctctcgtatgtttcaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 24874701  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  24874702 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 24874744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 23029213 - 23029428
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | |   |||||| | | | | ||||||||||| || |  |||||||| |||    
T  23029213 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagtgatggttgtcgaa 23029312  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    | ||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | ||||| | ||| ||||||||||||||  | |    
T  23029313 aatccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggatttagtttgtctacctt 23029412  T
Q  201 tgacgggtatggatgt 216  Q
    |||  |||||||||||    
T  23029413 tgagcggtatggatgt 23029428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 243
Target Start/End: Original strand, 45673834 - 45674006
Alignment:
Q  71 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagag 170  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||| | | |||||||||||| | |    
T  45673834 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcttttgtctatgtttggtcgtg 45673933  T
Q  171 attttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    ||||||  ||  |||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  45673934 attttgaaatgaatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 45674006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 22742718 - 22742849
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  22742718 tattattggtactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 22742817  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctct 132  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  22742818 actccagctaagggttcggtgactacttctct 22742849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23204950 - 23204763
Alignment:
Q  56 ttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatat 155  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||   ||  |||||| | |    
T  23204950 ttgggtcttgatgtgtctgatatgaatggagagatggttgtcgatactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgctcgcgatgtcctttgt 23204851  T
Q  156 ctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||||  |||| | |||||||| || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  23204850 ctatggatggtcgtgattttgtaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 23204763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24265061 - 24264819
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||  ||  | |||||||| |||    
T  24265061 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgagtggatagatggttgtcgaa 24264962  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | | |||||||||| | ||||| |  || ||||||||||||||  | |    
T  24264961 actccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtttatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctt 24264862  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  24264861 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 24264819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 125 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23279343 - 23279223
Alignment:
Q  125 acttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttg 224  Q
    |||||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |||||||| ||||||||||| ||||    
T  23279343 acttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttg 23279244  T
Q  225 gaatgaattggttagagtata 245  Q
    | ||| | |||||||||||||    
T  23279243 ggatggactggttagagtata 23279223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 243
Target Start/End: Original strand, 41606209 - 41606379
Alignment:
Q  71 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagag 170  Q
    ||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |    
T  41606209 tctgatatgaatggagagatggt-gtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcct-tgtctatgtttggtcgtg 41606306  T
Q  171 attttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||| |  || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  41606307 atttcgaaatggatttagtttgtctatctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 41606379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 550 - 306
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  550 tattattgatactggtgctagtcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggtcgttgaa 451  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  | |    
T  450 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtttaccgt 351  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  350 tgacgggtatggaggtgatttttggaatgaattggttagagtata 306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 5360 - 5604
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  5360 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtatggatgtatctgatatgaaaagagaaatggttgttgaa 5459  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||  ||||||  | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |    
T  5460 actccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgaggtgtccattgtttatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtttgccgt 5559  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    || || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5560 tgtcgcgtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtata 5604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8703 - 8459
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  8703 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttgtatctgatataaaaggagaaatggttgttgaa 8604  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||||||||||||||||||| | | || ||||| ||| || | |    
T  8603 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtatgtttgccgt 8504  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8503 tgacgtgtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtata 8459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 67323 - 67567
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| |||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  67323 tattattgatactggtgctactcattgttttattgccttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatccgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 67422  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  || | |    
T  67423 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatctagtttgcttgccgt 67522  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    || |||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  67523 tgtcgggtatggacgttattttcgggatgaattggttagagtata 67567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 263315 - 263071
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  263315 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 263216  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| || | |    
T  263215 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgt 263116  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  263115 tgacgggaatggacgttatttttggaatgaattggttagagtata 263071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 22211 - 21967
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22211 tattatagatactggtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcatatatgttgggtttggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 22112  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| || |      
T  22111 actttagctaagtgttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagagattttgaggtcgatttagtttgtttgccgc 22012  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22011 tgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtata 21967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 65513 - 65757
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  65513 tattatagacactggtgctactcattgtttccttgctttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 65612  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   |||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||| ||| || | |    
T  65613 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtcctatatccatgtttggtagagattttgaagttgacttagtatgtttgccgt 65712  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  65713 tgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtata 65757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11066 - 10822
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  | | ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  11066 tattatagatactggtgctactcattgtttcatttttttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatacttgttgaa 10967  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||  || | |    
T  10966 actccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctatgtttggtagggactttgtggttgatttagtttgcttgccgt 10867  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10866 tgtcgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtata 10822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 10001 - 10245
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10001 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 10100  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| || | |    
T  10101 actccagctaagggtacagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgt 10200  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  10201 tgacgggaatggacgttattttttgaatgaattggttagagtata 10245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 251711 - 251467
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  251711 tattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 251612  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||   |||||  | ||||||||||||||||| |||||  | ||| |||||||| || | |    
T  251611 actccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgtagtcgatctagtttgtttgccgt 251512  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  251511 tgtcgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtata 251467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 30541 - 30778
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30541 tattatagatattggtgctactcattgtttcattgatattgaatgtgcatataagttgggtttggttgtatctgatatgaaaggggtaatggttgttgaa 30640  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || | |    
T  30641 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgtggttgatttagtttgtttgccgt 30740  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    || ||||||       ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30741 tgtcgggta-------tatttttggaatgaattggttagagtata 30778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 672 - 428
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  672 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 573  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |    
T  572 actccatctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgt 473  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  472 tgacaggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtata 428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15212 - 14968
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  15212 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttgattgtatttgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 15113  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||   ||||||  | ||||||||| ||||||||||||   | || ||||||||| || | |    
T  15112 actccagctaagggttcagcaactacttctctagtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttcgtagagattttgaagtcgacttagtttgtttgccgt 15013  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15012 tgatgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtata 14968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 6202 - 5961
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||| | ||||| | |||||||||| |   | | ||  |||||||||| || ||| |||| |||    
T  6202 tattattgatactgatgctacgcattgttttaatgctatttattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcgaatatgaaaggagagatgattgtcgaa 6103  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |    |||||| | || ||||||||| ||||| |||  |||||||| |||||| |  | |    
T  6102 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtcaatgtttggtcgagatgttgaaattgatttggtttgtttacctt 6003  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagt 242  Q
    |||  || |||||||| ||| | || ||||| ||||||||||    
T  6002 tgagtggaatggatgtaatcctgggtatgaactggttagagt 5961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1209 - 965
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1209 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaattgttgttgaa 1110  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||   | ||||||||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |    
T  1109 actccagttaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgt 1010  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  1009 tgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtata 965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 203470 - 203246
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  203470 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 203371  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| || | |    
T  203370 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgaggtagacttagtttgtttgccgt 203271  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttgg 225  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  203270 tgacgggaatggacgttatttttgg 203246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 424327 - 424266
Alignment:
Q  71 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctct 132  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  424327 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 424266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 424397 - 424363
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattg 35  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  424397 tattattgatactggtgctacgcattgttttattg 424363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 7127 - 6883
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7127 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgtttctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 7028  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||  | ||||||||||||||||| |||    | || ||||| ||| |  | |    
T  7027 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttaaagtcgacttagtgtgtttaccgt 6928  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  6927 tgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtata 6883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 5064 - 5308
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5064 tattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 5163  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | | |   ||||||  | |||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||  | |    
T  5164 actccagccaagggttcagtaactacttctcttgtctctttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgtggtcgacttagtgtgtctaccgt 5263  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5264 tgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtata 5308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 245
Target Start/End: Original strand, 17711 - 17943
Alignment:
Q  13 tggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaag 112  Q
    |||||||||| ||||||| |||| | | ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17711 tggtgctacttattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaag 17810  T
Q  113 ggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatgg 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |   | |||   |  ||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||  | |||||||||||||    
T  17811 ggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggagtcagttgactatgtttggtagagattttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatgg 17910  T
Q  213 atgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  17911 atgttatttttggaataaattggttagagtata 17943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 9987 - 10231
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9987 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatttgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 10086  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    |||||  | ||||||||| ||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |    
T  10087 actccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttagtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgt 10186  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  10187 tgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtata 10231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 24160 - 24402
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||| ||| | | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||    
T  24160 tattattgatactagtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttaggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaa 24259  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||  || ||   |||||| | |||||||||| | | ||||||  ||||||||| |||||| |  | |    
T  24260 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgcgtttgagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttaggattgatttggtttgtttacctt 24359  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||    
T  24360 tgagtggtatggatgtgattcttggcatgaactggttagagta 24402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20903 - 20659
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20903 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggtcgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 20804  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||  | ||||||||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |    
T  20803 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgt 20704  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||    
T  20703 tgacgggaatggatgttatttttgggatgaactagttagagtata 20659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 702 - 946
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||| |||| ||| |||||||| |||||| ||||| |  |  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  702 tattatagaaactggtgctacacaatgtttaattgctatagaatgtgcatataagatgggtataaaaatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 801  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  | |||||  | ||||||||| ||||||| ||||   | || |||||| || |  | |    
T  802 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaaatgtccgttgtctatgtttagtagagactttgaagtcgacttagttggttttccgt 901  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  902 tgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagtata 946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 64817 - 65061
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  64817 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcgtataagttgaatttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggctgttgaa 64916  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||  | |||||||||||||||||||||| | | || ||||| |||||  |||    
T  64917 actccagcaaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccat 65016  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  65017 tgacgggtatggatgctatttttggaatgaattggttagagtata 65061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 49395 - 49639
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  49395 tattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagaatgtgcgtataagttgaatttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggctgttgaa 49494  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||  | |||||||||||||||||||||| | | || ||||| |||||  |||    
T  49495 actccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccat 49594  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49595 tgacgggtatggatgctatttttggaatgaattggttagagtata 49639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 58429 - 58673
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||| | | |||||||| |||||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  58429 tattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagaatgtgcgtataagttgaatttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggctgttgaa 58528  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||  | |||||||||||||||||||||| | | || ||||| |||||  |||    
T  58529 actccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccat 58628  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  58629 tgacgggtatggatgctatttttggaatgaattggttagagtata 58673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29713 - 29469
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29713 tattatagatactggtgctactcaatgtttgattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 29614  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||||||| ||||   | ||  ||| |||| |  | |    
T  29613 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacctagcttgtttaccgt 29514  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  29513 tgacgggtatggaggtgatttttgggatgaactggttagagtata 29469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 98798 - 99042
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  98798 tattatagatactggtgctactcattgtttcattactattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctaatatgaagggagaaatggttgttgaa 98897  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   |||| |  | ||||||||||||||||| ||||   | || ||||||||| || | |    
T  98898 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgttcgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttgccgt 98997  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  98998 tgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtata 99042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 176077 - 175837
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  176077 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaa 175978  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||   |||||  | ||||||||||||||||||||||   | ||| | || ||| || | |    
T  175977 actccagctaagggttcactaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagattttgaagtcgatcttgtatgtttgccgt 175878  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagag 241  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  175877 tgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagag 175837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 151656 - 151412
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  151656 tattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgtatcttatatgaaaggagaaatggttgttgaa 151557  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||  | |||||||||||||||||  |||   | || ||||||||| |    |    
T  151556 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagagacattgaagtcgacttagtttgtttacagt 151457  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  151456 tgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtata 151412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 23748 - 23990
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||    
T  23748 tattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaa 23847  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    ||| || | |||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||| |  | |    
T  23848 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgttctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgatttggtttgtttacctt 23947  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  || |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  23948 tgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 23990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 33
Target Start/End: Original strand, 73813 - 73844
Alignment:
Q  2 attattgatactggtgctactcattgttttat 33  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73813 attattgatactggtgctactcattgttttat 73844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 33
Target Start/End: Original strand, 78194 - 78225
Alignment:
Q  2 attattgatactggtgctactcattgttttat 33  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78194 attattgatactggtgctactcattgttttat 78225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 325796 - 325552
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  325796 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 325697  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||   | ||||||||||||||||| ||||   | || ||||| ||| |  | |    
T  325696 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtctgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtgtgtttaccgt 325597  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  325596 tgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtata 325552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 200683 - 200927
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| | | ||   |||||  || |||||||||||||||    
T  200683 tattattgatactagtgctacacattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaa 200782  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||   ||||   | ||||||||||||||||||||||   ||||| |||| ||| || | |    
T  200783 actccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgatttgtctgttgtctatgtttggtagagattttgaagttgatctagtatgtttgccgt 200882  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  200883 tgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttggagtata 200927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 49 - 293
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||||| |||| | | ||| |||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49 tattatagatactagtgctattcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgagtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 148  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||| || |||||| | |||||||||||| || | |    
T  149 actccaactaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctatgtttgttagggactttgtggtggatttagtttgtttgccgt 248  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    || |||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  249 tgtcgggtatgaatgtgatttttggtatgaattggttagagtata 293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 760 - 1004
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  760 tattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagagatggttgttgaa 859  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||| | | || |||||||||||  | |    
T  860 acttcagctaagggttcagtgactacttcccttgtttgtttgaggtgtcctctatctatgtttggtagggattttgaggtagacttagtttgtctaccgt 959  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  960 tgacgggaatggatgtcatttttgggatgaattggttagagtata 1004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10875 - 10633
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||| | | | | ||| ||||||| || || |||||||| |||    
T  10875 tattattgatattggtgctacgcattgttttattgttattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaa 10776  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||  | |||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |  | |    
T  10775 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtccattgtctatgtttggtcgtgattttgaaattgatttagtttgtttacctt 10676  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  || |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  10675 tgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 10633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 37028 - 36784
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37028 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgatgttgattgtgcatacaagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 36929  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |    
T  36928 actccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgt 36829  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  36828 tgacgggtatggatgatatttttgggatgaactgtttagagtata 36784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 42787 - 42543
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42787 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgtagttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 42688  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  |||    
T  42687 actccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccat 42588  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  42587 tgacaggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtata 42543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 50560 - 50775
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  50560 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctaccttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 50659  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||  | |    
T  50660 actccagctaagggttcagtgactacttctctcatatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctt 50759  T
Q  201 tgacgggtatggatgt 216  Q
    |||  |||||||||||    
T  50760 tgagcggtatggatgt 50775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 114; Significance: 8e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Original strand, 5435 - 5668
Alignment:
Q  12 ctggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaa 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5435 ctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaa 5534  T
Q  112 gggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatg 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||   |||||   | ||||||||||||||||| |||    | || ||||| ||| |  | ||||||||||||    
T  5535 gggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagactttaaagtcgacttagtctgtttaccgttgacgggtatg 5634  T
Q  212 gatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  5635 gatattatttttgggatgaactggttagagtata 5668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 1526 - 1770
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1526 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgactgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatacgaaaggagaaatggttgttgaa 1625  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||||||| ||||   | ||| | |||||| |  | |    
T  1626 actccagctaagggttcggtaattacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatcttgtttgtttaccgt 1725  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  1726 tgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtata 1770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 7833 - 7589
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  7833 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgactgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatacgaaaggagaaatggttgttgaa 7734  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||||||| ||||   | ||| | |||||| |  | |    
T  7733 actccagctaagggttcggtaattacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatcttgtttgtttaccgt 7634  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  7633 tgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtata 7589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 1069 - 1313
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  1069 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatatgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 1168  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||  | ||||||||||||||||| ||||   | || ||||| ||| |  | |    
T  1169 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtgtgtttaccgt 1268  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  1269 tgacgagaatggatgttatttttgggatgaactggttagagtata 1313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 40147 - 39903
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||| | | ||| |||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40147 tattatagacacaggtgctactcattgttttattgctttagaaagtgcatataagttggggttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 40048  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||| |   ||||||  | |||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||  | |    
T  40047 actccagccaagggtttagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgtggtcgacttagtgtgtctaccgt 39948  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  39947 tgacaggtatggatgttagttttggaatgaattggttagagtata 39903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 192
Target Start/End: Original strand, 17635 - 17754
Alignment:
Q  72 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagaga 171  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | ||    
T  17635 ctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggctcgctgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcct-tgtctatgtttgatcgtga 17733  T
Q  172 ttttgtgattgatttagtttg 192  Q
    ||||| ||| |||||||||||    
T  17734 ttttgagatggatttagtttg 17754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2960 - 2716
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| | |||  ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2960 tattatagatactggggctactcattgtttcattgttgttgcttgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 2861  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | ||||||||||||||||| ||||   | ||| |||| ||| || | |    
T  2860 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgt 2761  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  2760 tgacgggtatagatgtaatttttgggatgaactggttagagtata 2716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12049 - 11805
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| | | ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12049 tattatagatactggcgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaa 11950  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | ||||||||||||||| | |||| | ||||| | |||||| || | |    
T  11949 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagatactttgaggttgatcttgtttgtttgccgt 11850  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  11849 tgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtata 11805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 1098 - 1342
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1098 tattatagctactggtgctactcattatttcattgttgttgattgtgcgcataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 1197  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||  | ||||||||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |    
T  1198 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtggacttagtttgtttaccgt 1297  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  1298 tgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagtata 1342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 63734 - 63978
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  63734 tattatagatactggtgttactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 63833  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | ||||||||||||||||| ||||   | ||| |||| ||| || | |    
T  63834 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgt 63933  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||  |||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  63934 tgttgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtata 63978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 115651 - 115407
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | | || ||||| |||||  | ||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  115651 tattatagatactggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcatataaactaggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaa 115552  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||  |  ||     
T  115551 actccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgatatgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagatttagtttgcttaccac 115452  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  115451 tgacggggatggatgttatatttgggatgaattggttagagtata 115407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 94109 - 94353
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | | |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  94109 tattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgcttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 94208  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||   ||||||  | ||||||||||||||||||||||   | |||||||| |||||  | |    
T  94209 actccagctaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaagtcgatttagtgtgtctaccgt 94308  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||  ||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  94309 tgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagaatata 94353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 20743 - 20918
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20743 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataaattgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 20842  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||||||| ||||    
T  20843 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttg 20918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 12563 - 12738
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||| |||| | ||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  12563 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataaattggatctggttgtatcaaatatgaaaggagaaatggttgttgaa 12662  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 176  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||||||| ||||    
T  12663 actccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttg 12738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 2167 - 2412
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2167 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgttcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggatatggttgttgaa 2266  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||| |  | ||||||||||||||||| ||||   | || ||||||||| |    |    
T  2267 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgttcgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttactgt 2366  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttg-gaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||| | |||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||    
T  2367 tgaccgctatggatgttatttttgaggatgaactggttagagtata 2412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 70461 - 70217
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||||||  ||| | | |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  70461 tattatagacactggtgttactcattgtttctttgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaattgttgttgaa 70362  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |   ||||||  | |||||||||||||||||||||| | | || ||||| |||||  | |    
T  70361 actctagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgt 70262  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  70261 tgatgggaatgtatgttatttttgggatgaattggttagagtata 70217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29616 - 29372
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||| ||| | | ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  29616 tattatagatactagtgctactcattgtttcattgcagttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaa 29517  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||   |||||  | ||||||||||||||||| |||| | ||||| | || ||| || | |    
T  29516 actccagctaagggttcagtaactacttcacttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaggttgatcttgtatgtttgccgt 29417  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  29416 tgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtata 29372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21940 - 21696
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||| | | || ||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21940 tattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagagtgtgcatataaattgggtttgattatatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaa 21841  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||||||| |  |      
T  21840 actccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgttcggtagggattttgaggtagacttagtttgtttaccgc 21741  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  21740 tgacgggaatggatgttatttttgggattaattggttagagtata 21696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 53638 - 53882
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| | || ||| ||| |||| |||||||| |||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  53638 tattatagaaactggtgctactcattgtttcaatgctatagaaagtgcatataagttaggtttaattgtatctgaaatgaaaggagaaatggttgttgaa 53737  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||   |||||  | ||||||||||||||||| ||||   | || ||||||||| || | |    
T  53738 actccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttgccgt 53837  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  53838 tgacgggtatggatgttatttttggaatgaattagttagagtata 53882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 60828 - 60584
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| | | | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  60828 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaa 60729  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | ||||||||||||||||| ||||   | ||| |||| ||| || | |    
T  60728 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgt 60629  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    || ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  60628 tgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagtata 60584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 70197 - 70079
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| | | | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  70197 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaa 70098  T
Q  101 actccagctaagggttcag 119  Q
    |||||||||||||||||||    
T  70097 actccagctaagggttcag 70079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12816 - 12601
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12816 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 12717  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    |||||  | ||||||||||||||||| ||||  ||  || | |||||| || | |    
T  12716 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaaatcaatcttgtttgtttgccgt 12617  T
Q  201 tgacgggtatggatgt 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  12616 tgacgggtatggatgt 12601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 9442 - 9612
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  9442 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtacttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaacgggaaatagttgttgaa 9541  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagaga 171  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | |||||||||||||||||    
T  9542 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagaga 9612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 110697 - 110455
Alignment:
Q  3 ttattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaac 102  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  110697 ttatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttaaaac 110598  T
Q  103 tccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattg 202  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||||||| ||||   |  |  |||||||| |  | |||    
T  110597 tccggctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcaacctagtttgtttacctttg 110498  T
Q  203 acgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  110497 acgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtata 110455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 70 - 314
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  70 tattatagatacgggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 169  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    ||| |  | ||||||||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |    
T  170 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtataagatgtacgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgt 269  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||    
T  270 tgacgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagggtata 314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 50194 - 49950
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||  | | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  50194 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttggggctagttgtatctgatatgaaaggagaaattgttgttgaa 50095  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||  | ||||||||||||||||| ||||   | ||| | |||||  |  | |    
T  50094 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatcttgtttgcttaccgt 49995  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  49994 tgacgggtatggatgtaatttttgggatgaaatggttagagtata 49950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 49092 - 49336
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49092 tattatagatactagtgctactcattgtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 49191  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||||   | ||||||||||||||||| ||||   | ||| |||| | | || | |    
T  49192 aatcaagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtctgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatatttgccgt 49291  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    || ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  49292 tgtcgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtata 49336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 1030 - 1205
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1030 tattatagacactagtgctactcattgttttattgctattgattgtgcatataagttgggtctggctgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 1129  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    |||||  | ||||||||||||||||| ||||    
T  1130 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttttctaagatgtccgttgtctatgtttggtagagactttg 1205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 34426 - 34184
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||  ||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34426 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgaatatgtatataagttgggtccggttgtatctgatatgaaagtggaaatggttgttgaa 34327  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    | ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||   ||||||  | ||||||||||||| ||| ||||   | ||  |||||||| | || |    
T  34326 attccagctaagggttcagtagctatttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtaaagactttgaagtcgacctagtttgtttatcgt 34227  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  34226 tgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagta 34184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 1487 - 1731
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | || | ||||| |||||||||||| ||  | | ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1487 tattatagatactggtgctacacattgtttcattgttgttaattgtgcatataagttgggtctgattatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaa 1586  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||   |||||  | ||||||||||||||||| ||||   ||||| | || ||| || | |    
T  1587 actccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagttgatcttgtatgtttgccgt 1686  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1687 tgacgggtatggatgtaatctttgggatgaattggttagaatata 1731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 28500 - 28744
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | || | ||||| |||||||||||| ||  | | ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  28500 tattatagatactggtgctacacattgtttcattgttgttaattgtgcatataagttgggtctgattatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaa 28599  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||   |||||  | ||||||||||||||||| ||||   ||||| | || ||| || | |    
T  28600 actccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagttgatcttgtatgtttgccgt 28699  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28700 tgacgggtatggatgtaatctttgggatgaattggttagaatata 28744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 43634 - 43878
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| | | ||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  43634 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggaaaaatggttgttgaa 43733  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||   |||||  | ||||||||||||||| | ||||   | ||| |||| ||| || |||    
T  43734 actccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagatactttgaactcgatctagtatgtttgccat 43833  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||| |||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  43834 tgacgggtatgaatgtaatttttgggatgaactggttagagtata 43878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 90 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25216 - 25069
Alignment:
Q  90 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagt 189  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||| |||||| | |||||| ||   |||||  | ||||||| |||||||||||||| | || | || ||    
T  25216 tggttgtcgaaactcgagctaagggttcgataactacttctttggtttgtttgagttgtccgttgtctatgtatggtagagattttgaggttaacttggt 25117  T
Q  190 ttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggtt 237  Q
    |||| |  | |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||||    
T  25116 ttgtttaccgttgacgggaatggatgtaatccttggtatgaactggtt 25069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5894 - 5719
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5894 tattatagatactagtgctactcattgtttcattgctatttaatgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagaagaaatggttgttgaa 5795  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 176  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    |||||  | ||||||||||||||||| ||||    
T  5794 actccagctatgggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagagactttg 5719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5686 - 5596
Alignment:
Q  155 tctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5686 tctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagtata 5596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5270 - 5026
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5270 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 5171  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||    |||||  | || |||||||||||||| ||||   | ||| | |||||| |  | |    
T  5170 actccagctgaggtttcagtaactatttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtcaatgtttggtagagactttgaagtcgatcttgtttgtttaccgt 5071  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  5070 tgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtata 5026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 54136 - 53892
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  54136 tattatagacactggtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgtgtctggttgtatctgatatgaatgtagaaatggttgttgaa 54037  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||   ||||||  | ||||||||||||||||| |||    | || ||||| ||| |  | |    
T  54036 actccagctaagggttcattaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagacttttaagtcgacttagtgtgtttaccgt 53937  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||    
T  53936 tgacgggaatggatgttatttttgggatgaactagttagagtata 53892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 164616 - 164860
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  164616 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgccattgaatgtgcttataagttgggtctggttatatctgataagaaaggggaaatggttgttgaa 164715  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||| || |||||| |||| ||||||||||||| |||   |||||   | |||||||||||||| || |||  | | |||||||| ||| |  | |    
T  164716 actccagcaaatggttcaataactacttctcttgtttatctaaggtgtctattgtctatgtttggtagggactttcaggtcgatttagtgtgtttaccgt 164815  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  164816 tgacgggaatagatgttatttttgggatgaactggttagagtata 164860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 30789 - 30920
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  30789 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 30888  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctct 132  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  30889 actccagctaagggttcggtgactacttctct 30920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 152100 - 151978
Alignment:
Q  71 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagag 170  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | |    
T  152100 tctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtg 152001  T
Q  171 attttgtgattgatttagtttgt 193  Q
    |||||| ||||||||| ||||||    
T  152000 attttgagattgatttggtttgt 151978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 47198 - 47391
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||| |   | | ||| ||||||| || || |||||||| |||    
T  47198 tattattgattctggtgctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtctttctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaa 47297  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtct 195  Q
    |||||| |||| ||||| || || ||||||||||| ||| |   ||||| | | |||||||||| | | |||||||  |||||||| ||||||||    
T  47298 actccatctaa-ggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaaggtgtcttttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgatttggtttgtct 47391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 8677 - 8852
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8677 tattatagacactagtgctactcaatgtttcattgctatcgaatgtgcttataagttaggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 8776  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||  | ||||||||||||||||| ||||    
T  8777 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttg 8852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 18891 - 19066
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || ||| |||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18891 tattatagacactagtgctactcaatgtttcattgctatcgaatgtgcttataagttaggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 18990  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||  | ||||||||||||||||| ||||    
T  18991 actccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttg 19066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1056 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1056
Description:

Target: scaffold1056; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1810 - 1566
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| | | ||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  1810 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttcttgaa 1711  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||   | |||  | ||||||||||||||||| ||||   | ||| |||| ||| || | |    
T  1710 actccagctaagggttcagtaactacttcttttctttgtttgagttttccactgtctatgtttggtagagactttgaagtcgatctagtatgtttgccgt 1611  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  1610 taacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtata 1566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26161 - 25957
Alignment:
Q  41 gaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtc 140  Q
    |||||||| |||||||||||  ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  26161 gaatgtgcatataagttgggcctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtt 26062  T
Q  141 tgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttaga 240  Q
    |   ||||||  | |||||||||||||||||||||| | | || ||||| |||||  | |||| ||| ||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  26061 taaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatggatgttattttcgggatgaattggttaga 25962  T
Q  241 gtata 245  Q
    |||||    
T  25961 gtata 25957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5691 - 5447
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||  | ||| |||||||||||| ||| | | ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5691 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgtttatgcatataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaa 5592  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||   |||||  | ||||||||||||||||| ||||   |  || |||| ||| || | |    
T  5591 actccagctaagggtttagtaactacttctcttatttgtttgacttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcaatctagtatgtttgccgt 5492  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    || |||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  5491 tgtcgggcatggatgtaatttttgggatgaattggttagagtata 5447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 245
Target Start/End: Original strand, 3451 - 3629
Alignment:
Q  67 tgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggt 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||    
T  3451 tgtatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagatgtcctatatctatgtttggt 3550  T
Q  167 agagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    || |||||||   | || ||||||||  |  || |||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  3551 agggattttgaagtagacttagtttgcttaccactgacagggatggatgtgatatttgggatgaattggttagagtata 3629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 4304 - 4548
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| |   | | ||   |||||  || |||||||||||||||    
T  4304 tattattgatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctacttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaa 4403  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||   |||||| | ||||||||||||||||| ||||   ||||| | || ||| || | |    
T  4404 actccagctaagggttcagtaactacttcttttgtttgtttgagttgtcctttgtctatgtttggtagagactttgaagttgatcttgtatgtttgccgt 4503  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||| ||||    
T  4504 tgacgggtttggatgtaatccttgggatgaactggttagaatata 4548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 4519 - 4650
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||||||||||  || | ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4519 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtcgggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaa 4618  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctct 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4619 actccagctaagggttcagtaactacttctct 4650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 6472 - 6606
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6472 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaa 6571  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 135  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  6572 actccggctaagggttcagtgactacttctcttgt 6606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11905 - 11675
Alignment:
Q  13 tggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaag 112  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| ||  |||  | | |||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  11905 tggtgctacacattgtttcattgctattgattgtgcatataagttgggtctgattgt--caggtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaag 11808  T
Q  113 ggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatgg 212  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||   |||||| | ||||||||||||||||||||||   ||||| | || ||| ||   ||| |||||||||    
T  11807 ggttcaataactacttctcttgtttgtttgagttgtcctttgtctatgtttggtagagattttgaagttgatcttgtatgtttgctgttgtcgggtatgg 11708  T
Q  213 atgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||| || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  11707 atgtaatttttgggatgaactggttggagtata 11675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 9566 - 9758
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||| |     | ||  ||||||| || ||||||||||| |||    
T  9566 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttacaatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaa 9665  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 193  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9666 actccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttgagattgatttggtttgt 9758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 23513 - 23757
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||  |||| | |||||||||| | | | | ||| ||||||| || ||||||||||| |||    
T  23513 tattattgataatagtgctacgcattgttttattgctcttgatagtgcttctaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagaaatggttgtcgaa 23612  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||| |    |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || | |    
T  23613 actccagctaagggttcggcgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcatttatctatgtttggtagagattttgagattgatttggtttgtttgcctt 23712  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||  || |||||||| ||  |||| ||||| ||||| |||||||    
T  23713 tgagtggaatggatgtaattcttggtatgaactggttggagtata 23757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 10373 - 10615
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| |  || | |||| |||||| || || |||||||| |||    
T  10373 tattattgatactggtgccacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtctacatatgtctggtatgaatggagagatggttgtcgaa 10472  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||  | |    
T  10473 actccagctaagggttcggtaactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctt 10572  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  10573 tgagcggtatggatgtaattctgggtatgaattggttagagta 10615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6962 - 6720
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  ||||||| || ||||||||||| |||    
T  6962 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaa 6863  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||  || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||| |  | |    
T  6862 actccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgacttggtttgtttacctt 6763  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  || |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  6762 tgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 6720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14092 - 13850
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  ||||||| || ||||||||||| |||    
T  14092 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaa 13993  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||  || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||| |  | |    
T  13992 actccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgacttggtttgtttacctt 13893  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  || |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  13892 tgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 13850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 5177 - 4933
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||| | | | | |   ||||||| || || ||||| || |||    
T  5177 tattattgatactggtgctacgcattgttttattggtgttgattgtgcttctaagttgggtcttgttatgttaaatatgaatggagatatggtcgtcgaa 5078  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||   ||||||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| |||| |    
T  5077 actccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaaggtgtcctttgtcgatgtttggtcgagactttgaaattgatttagtttgtttgtctt 4978  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||  || |||||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||||    
T  4977 tgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttggagtata 4933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17967 - 17725
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||| |   | | ||  ||||||| |||||||||||||| |||    
T  17967 tattattgatactggtgctacacattgttttattgctgttgattgtgcgtctaagttgggtcttactatgtcgaatatgaatggggaaatggttgtcgaa 17868  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||  || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||||| |||| ||||  |||||||| |||||| |  | |    
T  17867 actccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagactttgaaattgatttggtttgtttacctt 17768  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  || |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  17767 tgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 17725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 111122 - 111237
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||| | | | | ||  ||||||| || |  |||||||| |||    
T  111122 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagtgatggttgtcgaa 111221  T
Q  101 actccagctaagggtt 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  111222 actccagctaagggtt 111237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 17281 - 17523
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  17281 tattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 17380  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| |||||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  17381 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 17480  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  | ||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  17481 tgagcgatatggatgtgattcttggtatgaattggttagagta 17523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24321 - 24219
Alignment:
Q  75 atatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattt 174  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||| || || ||| |||||||| | || |||||||||||||||||    
T  24321 atatgaatggagaaatggttgtcgaaaccccggctaagggttcagtgactacttctctagtatgcctgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattt 24222  T
Q  175 tgt 177  Q
    |||    
T  24221 tgt 24219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 195053 - 195243
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||  || || || ||||| |||    
T  195053 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgattggagagatagttgtcgaa 195152  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagttt 191  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||  | ||||| | ||| ||||||||||    
T  195153 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggacgtgatttcgagatggatttagttt 195243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 9236 - 9333
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttg 98  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9236 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtcaggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttg 9333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26441 - 26197
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | |||| ||||| | |||||||||| |   | | ||  ||||||| || ||||||||||| |||    
T  26441 tattattgatattggtgctacgcaatgttttattgttgttgattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaa 26342  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||    |||||| |||||||||||||| |||| ||||  |||||||| |||||| || | |    
T  26341 actccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtcgagactttgaaattgatttggtttgtttgcctt 26242  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||  || |||||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||||    
T  26241 tgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttggagtata 26197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 37035 - 37250
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| ||||||||||||| || || |||||||| |||    
T  37035 tattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 37134  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | |||||   ||| || |||||||||||  | |    
T  37135 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgatatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcaagatggacttagtttgtctacctt 37234  T
Q  201 tgacgggtatggatgt 216  Q
    |||  |||||||||||    
T  37235 tgagcggtatggatgt 37250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1260 - 1064
Alignment:
Q  41 gaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtc 140  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||    
T  1260 gaatgtgcatataagttgggtctggttgtatccgatatgaaaggataaatggttgttgaaactccagctaagggtt--------acttctcttgtttgtc 1169  T
Q  141 tgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttaga 240  Q
    |    ||||   | ||||||||||||||||| ||||   | || ||||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||    
T  1168 taagatgtctgttgtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactagttaga 1069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 13108 - 13350
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||| || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  13108 tattattgatactggtgctacgcattgatttataaatatcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 13207  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| || ||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  13208 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttaactatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 13307  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  13308 tgagcggtatggatgtgattatgggtatgaattggttagagta 13350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 10453 - 10695
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  10453 tattattgatactggtgctacgcattgctttattactttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 10552  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| || ||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  10553 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttaactatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 10652  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  10653 tgagcggtatggatgtgattatgggtatgaattggttagagta 10695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 31900 - 31730
Alignment:
Q  73 tgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagat 172  Q
    ||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||    
T  31900 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 31801  T
Q  173 tttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    ||||  || ||||||||||||||  | ||||  ||| ||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  31800 tttgatatggatttagtttgtctacctttgagcggtttggatgtgattctaggtatgaattggttagagta 31730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 54726 - 54484
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||   |||||||||| |     | ||| ||||||| || ||||||||||| |||    
T  54726 tattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttttcatgtctaatatgaatggagaaatggttgtcgaa 54627  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | ||||||| ||| |||||||||||| |  | |    
T  54626 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttttctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagtttgtttacctt 54527  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||    
T  54526 tgagtggtatggatgtgattcttggcatgaactggttagagta 54484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 37366 - 37196
Alignment:
Q  73 tgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagat 172  Q
    ||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||  | ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||    
T  37366 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttctgttactacttctctcttatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 37267  T
Q  173 tttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    ||||  || ||||||||||||||  | ||||  ||| ||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  37266 tttgatatggatttagtttgtctacctttgagcggtttggatgtgattctaggtatgaattggttagagta 37196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 36587 - 36345
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  36587 tattattgatactggtgctacgcattgtttcattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 36488  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||| ||||||||||  | |    
T  36487 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatctagtttgtctacctt 36388  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  36387 tgagcggtatggatgtgattcttggtatgaattggttagagta 36345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3608 - 3563
Alignment:
Q  200 ttgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||    
T  3608 ttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagtata 3563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22336 - 22094
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  22336 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 22237  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  22236 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 22137  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  22136 tgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 22094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 243
Target Start/End: Original strand, 14483 - 14723
Alignment:
Q  3 ttattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||   |||||||||| | | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||||    
T  14483 ttattgatactggtgctacacattgttttatttctattgattgtgctcctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaac 14582  T
Q  103 tccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattg 202  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||| | | |    |||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||| |  | |||    
T  14583 tccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtatttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttg 14682  T
Q  203 acgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |  || ||||| || ||| |||||||||| |||||||||||    
T  14683 agtggaatggaagtaatccttggaatgaactggttagagta 14723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 245
Target Start/End: Original strand, 15194 - 15438
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||| |   | | ||  ||||||| || ||||||||||| |||    
T  15194 tattattaatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcaaatatgaatggagaaatggttgtcgaa 15293  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| | || ||| |    | |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| || | |    
T  15294 actccagctaagggttcggtgactacttctttagtgtgtttaagatatcctttatctatgtttggtagatattttgagattgatttggtttgtttgcctt 15393  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||  || |||||||| ||  |||| ||||| ||||| |||||||    
T  15394 tgagtggaatggatgtaattcttggtatgaactggttggagtata 15438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 57829 - 58021
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||| ||| | | | | ||  ||||||| ||  | |||||||| |||    
T  57829 tattattgatactggtgctacacattgttttattgttattgattgtgcttctaagttaggtcttgctatgtcgaatatgaatggaaagatggttgtcgaa 57928  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 193  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||    
T  57929 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgatttggtttgt 58021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 29143 - 29385
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | ||  |||||| | ||| ||||||||||||| || || |||||||| |||    
T  29143 tattattgataatggtgctacgcattgatttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 29242  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| ||   |||||| |||||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||    |    
T  29243 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacatt 29342  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttgga-atgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||    
T  29343 tgagcggtatggatgtgat-tctggatatgaattggttagagta 29385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 1247 - 1489
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||| | | || | ||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  1247 tattattgatactggtgctacgtattgctttattgctttcgactttgtttctactttgggtcttgatttttctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 1346  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||  | |    
T  1347 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctt 1446  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||| ||||    
T  1447 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttacagta 1489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10457 - 10215
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  10457 tattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 10358  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  10357 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 10258  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  10257 tgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 10215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 4104 - 4242
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| ||| | | ||   |||||  || |||||||||||||||    
T  4104 tattattgacactggtgctacactttgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaa 4203  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4204 actccagctaagggttcagtaactacttatcttgtttgt 4242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14173 - 13931
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||   |||||||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  14173 tattattgatagtggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 14074  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    ||| || | ||||| |||| | | || |||| ||||||||| ||||||||  | |    
T  14073 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttaagatgttctttgtctatttttgatcgtgactttgagattgatttggtttgtctacctt 13974  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||    
T  13973 tgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagta 13931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 11353 - 11293
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggt 61  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||   ||||||||||    
T  11353 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgggt 11293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 4523 - 4331
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||| | | | | ||| ||||||| || || |||||||| |||    
T  4523 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaa 4424  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 193  Q
    |||||| |||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | ||||||| ||| ||||| ||||||    
T  4423 actccatctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatcgatttggtttgt 4331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 106 - 1
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||| | | | | ||| ||||||| || || |||||||| |||    
T  106 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaa 7  T
Q  101 actcca 106  Q
    ||||||    
T  6 actcca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 2478 - 2670
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||   |||||||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  2478 tattattgatactggtgctacgcattcttttattgcttatgaatgtgctactaagttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagacatggttgtcgaa 2577  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 193  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | ||||||| ||| ||||| ||||||    
T  2578 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatagatttggtttgt 2670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 71 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 41174 - 41002
Alignment:
Q  71 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagag 170  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |    
T  41174 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 41075  T
Q  171 attttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    ||||||  || ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  41074 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagta 41002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 13339 - 13581
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| |  || |||||||| |||    
T  13339 tattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtcttgatttgtctgatatgaatgaagagatggttgtcgaa 13438  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||  |||||| |||| ||| ||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  13439 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttatcaatggttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 13538  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  | ||||||||| || || || |||||||||||||||||    
T  13539 tgagcgttatggatgtgattttgggtatgaattggttagagta 13581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 216635 - 216877
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | |  ||||| ||| | | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||    
T  216635 tattattgatactggtgctacacattgttttattgttattgattgtacttcaaagttaggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtagaa 216734  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcag-tgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtca 199  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| | ||| |||||| | |||||| ||||| ||||||||   |||||||| |||||| |  |     
T  216735 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgt-ttcagatgtcctttgtctatgattggtcgagattttaaaattgatttggtttgtttacct 216833  T
Q  200 ttgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    ||||  || |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  216834 ttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 216877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 11095 - 11289
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||   |||||||||| | |   | ||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  11095 tattattgatactagtgctacacattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaa 11194  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtct 195  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | ||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  11195 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttggtttgtct 11289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 8347 - 8105
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || ||||  | |   || ||| | ||  | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  8347 tattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtatctgctttaggtcttgaattgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 8248  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |||| |||||  | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  8247 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcattgtccgttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 8148  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||| |||||    
T  8147 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagta 8105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 19184 - 19262
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatg 79  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19184 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgtatctgttatg 19262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 8312 - 8070
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||| |||||   | ||| |||  | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  8312 tattattgatactagtgctacacattgttttattgcttttgattgtgctacttagtcgggacttgatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 8213  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | ||||||| |||| |||| ||||||||  | |    
T  8212 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagattcatttggtttgtctaccgt 8113  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  | ||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||    
T  8112 tgagtgctatggatgtaattcttggtatgaactggttagagta 8070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3513 - 3271
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  3513 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgccttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 3414  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||||  | || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | ||||| |  || ||||||||||||||  | |    
T  3413 actccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctt 3314  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  3313 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17249 - 17007
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  17249 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 17150  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||||||||  | || |||||||| || ||| |    || ||| ||||||||||| || | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  17149 actccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttaagatgccctttatctatgtttagtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 17050  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  17049 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 17007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 11558 - 11316
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||| ||||  | |   ||| || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  11558 tattattgatactggtgctactcattgctttattgcctatgattgtgtttctgctttgagtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 11459  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||| ||||||||  | |    
T  11458 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttggtttgtctacctt 11359  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  11358 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 11316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18026 - 17784
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||| ||||  | |   ||| || | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  18026 tattattgatactggtgctactcattgctttattgcctatgattgtgtttctgctttgagtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 17927  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||| ||||||||  | |    
T  17926 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttggtttgtctacctt 17827  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  17826 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagta 17784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 53719 - 53601
Alignment:
Q  98 gaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||| ||||||||      
T  53719 gaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttggtttgtctac 53620  T
Q  198 cattgacgggtatggatgt 216  Q
    | ||||  |||||||||||    
T  53619 ctttgagcggtatggatgt 53601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 55093 - 55059
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattg 35  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55093 tattattgatactggtgctactcattgctttattg 55059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 34930 - 35124
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  34930 tattattgatactggtgctaagcattgttttattgttttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 35029  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtct 195  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||    
T  35030 actccagctaagggttcggtgactacgtctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtct 35124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 41721 - 41479
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||| | | | | |   |||||||  | || ||||||||  ||    
T  41721 tattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtaaaatatgaatagagagatggttgtcaaa 41622  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |    |||||| | |||||||||| | | |||||||  ||||| ||||||||| |  | |    
T  41621 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgacttagtttgtttacctt 41522  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||| |||  ||||||| |||||||||    
T  41521 tgagtggtatggatgtaatccttgatatgaatttgttagagta 41479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 75441 - 75199
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||| | | | | |   |||||||  | || ||||||||  ||    
T  75441 tattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtaaaatatgaatagagagatggttgtcaaa 75342  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |    |||||| | |||||||||| | | |||||||  ||||| ||||||||| |  | |    
T  75341 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgacttagtttgtttacctt 75242  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||| |||  ||||||| |||||||||    
T  75241 tgagtggtatggatgtaatccttgatatgaatttgttagagta 75199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 242
Target Start/End: Original strand, 695 - 936
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  695 tattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 794  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||   | | |||||| ||| |||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  795 actccagctaagggttaggtaactacttctctcgtatgatagaaatgtcctttatatatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 894  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagt 242  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||    
T  895 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagt 936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 24927 - 25119
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||   |||||  ||| | |   | ||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  24927 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagtcaggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaa 25026  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 193  Q
    ||||||||||||||||| || || || |||||||| ||| |    |||||| |||||||||||| | | ||||||| ||| ||||||||||||    
T  25027 actccagctaagggttcggtgactacatctcttgtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagtttgt 25119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 8499 - 8336
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||   |||||||||| | |   | ||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  8499 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaa 8400  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttg 164  Q
    ||||||| ||||||||| || || ||||||||||| ||| ||   |||||| | ||||||||||    
T  8399 actccagttaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttgagatgtcctttgtctatgtttg 8336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1071 - 829
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  1071 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgtttcttttttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 972  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| | || ||  |  |||||||| | |||||||||| | | ||||||| |||||| || |||||| |    |    
T  971 actccagctaagggttcggtgactacttctgtcgtatgcttaaagtgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagattgaattggtttgtttacgtt 872  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  871 tgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 13694 - 13936
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||| | | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||    
T  13694 tattattgatattgatgctacacattgttctattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaa 13793  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||  |    |||||  | |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||| |  | |    
T  13794 actccagctaagagttcggtgactacttctcttgtgtgattaagatgtccattgtctatgtttggtcgagattttaaaattgatttagtttgtttacctt 13893  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  || |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  13894 tgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 13936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 55685 - 55819
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||   |||||||||| |   | | ||| ||||||| || || |||||||| |||    
T  55685 tattattgatactggtgctacgcatttttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttactatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaa 55784  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 135  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  55785 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 55819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 135
Target Start/End: Original strand, 40723 - 40856
Alignment:
Q  2 attattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||   |||||||||| | | | | ||| ||||||| || || |||||||| ||||    
T  40723 attattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgggtcttgttatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaa 40822  T
Q  102 ctccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 135  Q
    ||||| |||||||||| || || |||||||||||    
T  40823 ctccaactaagggttcggtgactacttctcttgt 40856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 593 - 785
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||   ||| |||||| | |   | ||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  593 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaaattgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaa 692  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 193  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | ||||||| ||||||| | ||||||    
T  693 actccagctaagggttctgtgactacttcacttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagattgatatggtttgt 785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 15000 - 14884
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||   |||||||||| | |   | ||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  15000 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaa 14901  T
Q  101 actccagctaagggttc 117  Q
    |||||||||||||||||    
T  14900 actccagctaagggttc 14884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 2078 - 1886
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||||   |||||||||| |   | | ||| ||||||| || || |||||||| |||    
T  2078 tattattgatactggtgctacgcatttttttattgcttttgattgtgctactaagttgggtctttctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaa 1979  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 193  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | ||||||| ||||||| | ||||||    
T  1978 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagattgatatggtttgt 1886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2088 - 1913
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||   |||||||||| |   | | ||  ||||||| |||||||||||||| |||    
T  2088 tattatagatactggtgctacgcattgttttattgttgctgattgtgctactaagttgggtcttattatgtcatatatgaatggggaaatggttgtcgaa 1989  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttg 176  Q
    || |||||||||||||| || || |||||| | || ||  || |||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  1988 accccagctaagggttcggtgactacttctttagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttg 1913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Original strand, 21413 - 21592
Alignment:
Q  14 ggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagg 113  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||  | | | | ||   |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21413 ggtgctacgcattgttttattgctactgattgtgcttctaagttgggccttgttatgtcatgtatggatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagg 21512  T
Q  114 gttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgt 193  Q
    |||| || || |||||||| || |||||| |||||||  | || ||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||    
T  21513 gttcggtgactacttctctagtgtgtctgaagtgtccgttctcgatgtttggtcgagactttgaagttgatttagtttgt 21592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 4672 - 4538
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||| | | | | ||| ||||||| || || |||||||| |||    
T  4672 tattattgatattggtgctacgcattgttttattgttattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaa 4573  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 135  Q
    ||||||||| ||||||| || || ||||| |||||    
T  4572 actccagctgagggttcggtgactacttcccttgt 4538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 8969 - 8847
Alignment:
Q  71 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagag 170  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | |    
T  8969 tctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagccaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgattgtg 8870  T
Q  171 attttgtgattgatttagtttgt 193  Q
    |||||| ||| ||||||||||||    
T  8869 attttgagatggatttagtttgt 8847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18739 - 18497
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||  | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  18739 tattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaa 18640  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| |    |||||| | |||||||||| | | |||||||  |||||||| |||||| |  | |    
T  18639 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgattgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctt 18540  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  18539 tgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 18497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Original strand, 11571 - 11813
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||| || ||    
T  11571 tattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagatatggttttttaa 11670  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| ||   |||||| ||||||||||| || | |||||||  ||  |||||||||||||  | |    
T  11671 actccagctaagggttcggtgactacttgtctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttagtcgtgattttgaaatgaatttagtttgtctaccct 11770  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  ||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  11771 tgagcggtatggatgtgattatgggtatgaattggttagagta 11813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 104316 - 104182
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||| ||||||   | | | ||  ||||||| || || |||||||| |||    
T  104316 tattattgataatggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaatttgggtcctgttatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaa 104217  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 135  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  104216 actccagctaagggttaggtaactacttctcttgt 104182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12678 - 12510
Alignment:
Q  75 atatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattt 174  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || ||| || | |||||| | |||||||||||| | |||||    
T  12678 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 12579  T
Q  175 tgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    || ||||||| | |||||  || | ||||  |||||||| || ||  ||||  ||||||||||||||||    
T  12578 tgagattgatatggtttgcttgcctttgagtggtatggacgtcattcttggtctgaattggttagagta 12510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 3636 - 3524
Alignment:
Q  5 attgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactc 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||| | | | | ||| ||||||| || || |||||||| |||||||    
T  3636 attgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactc 3537  T
Q  105 cagctaagggttc 117  Q
     ||||||||||||    
T  3536 tagctaagggttc 3524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 7954 - 8088
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||   |||| ||||| | | | | ||| |||| || || || |||||||| |||    
T  7954 tattattgatactggtgctacacattgctttattgctattgattgtgctactaaggtgggtcttgctatgtctaatattaatggagagatggttgtcgaa 8053  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgt 135  Q
    ||||||||||||||||| || |  |||||||||||    
T  8054 actccagctaagggttcggtgaaaacttctcttgt 8088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15499 - 15269
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||            ||  |||||||||| || |||||||| |||    
T  15499 tattattgatattggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttg------------tcaaatatgaaaggagagatggttgtcgaa 15412  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    |||||| |||||||||| || || ||||||||||| ||| |    |||||| | |||| | ||||| |||||||||  |||||||| |||||| |  | |    
T  15411 actccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctacgattggtcgagattttgaaattgatttggtttgtttacctt 15312  T
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    |||  || |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  15311 tgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagta 15269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3620 - 3448
Alignment:
Q  71 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagag 170  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||| |    |||||| | |||||||||| | | |    
T  3620 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactgcagctaaggtttcggtaactatttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtg 3521  T
Q  171 attttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagta 243  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||  | ||||  ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||    
T  3520 attttgaaattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagta 3448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 129 - 13
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || | ||| | ||  |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  129 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattatgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 30  T
Q  101 actccagctaagggttc 117  Q
    |||||||||||||||||    
T  29 actccagctaagggttc 13  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 230 - 15
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | | || ||||  | |   |||||| | ||| | ||||||||||| || || ||||| || |||    
T  230 tattattgatactggtgctacgcattgtttttttgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgtcgaa 131  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||| ||||||||||||  || || |||||||| || ||| ||   |||||| ||||||||||||||   |||||||  || ||||||||||||||  | |    
T  130 acttcagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcatgattttgaaatggatttagtttgtctacctt 31  T
Q  201 tgacgggtatggatgt 216  Q
    |||  |||||||||||    
T  30 tgagcggtatggatgt 15  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21693 - 21478
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||| |||| |||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | |||||| |||| || || |||||||| |||    
T  21693 tattattgatatcggtgctacgcattattttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatttgaatggagagatggttgtcgaa 21594  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| || | | |||| | |||||||||||| | ||||| | ||| ||||||||||||||  | |    
T  21593 actccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggatttagtttgtctacctt 21494  T
Q  201 tgacgggtatggatgt 216  Q
    |||  |||||||||||    
T  21493 tgagcggtatggatgt 21478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 37117 - 36902
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||| |||| |||||||| | | || ||||| | ||  |||||| | | | | |||||| |||| || || |||||||| |||    
T  37117 tattattgatatcggtgctacgcattattttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatttgaatggagagatggttgtcgaa 37018  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcagtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcat 200  Q
    ||||||||||||||||| || || |||| ||| || ||| || | | |||| | |||||||||||| | ||||| | ||| ||||||||||||||  | |    
T  37017 actccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgagatggatttagtttgtctacctt 36918  T
Q  201 tgacgggtatggatgt 216  Q
    |||  |||||||||||    
T  36917 tgagcggtatggatgt 36902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 7325 - 7194
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  7325 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 7226  T
Q  101 actccagctaagggttcagtaaccacttctct 132  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  7225 actccagctaagggttcggtgactacttctct 7194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 11117 - 11076
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattga 42  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  11117 tattattgatactggtactactcattgttttattgctattga 11076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 51702 - 51657
Alignment:
Q  200 ttgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  51702 ttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagtata 51657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2111 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold2111
Description:

Target: scaffold2111; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 245
Target Start/End: Original strand, 2 - 46
Alignment:
Q  201 tgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2 tgacggggatggatgttatatttgggatgaattggttagagtata 46  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 2063 - 2126
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattgatattgaatgtgcctataagttgggtttg 64  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||| | | || ||||| |||||||||||||||    
T  2063 tattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagagtgtgcatataagttgggtttg 2126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 48754 - 48720
Alignment:
Q  1 tattattgatactggtgctactcattgttttattg 35  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48754 tattattgatactggtgctactcattgctttattg 48720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0605
Description:

Target: scaffold0605; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1355 - 1267
Alignment:
Q  157 tatgtttggtagagattttgtgattgatttagtttgtctgtcattgacgggtatggatgttatctttggaatgaattggttagagtata 245  Q
    |||||||||||||||||||| | | || ||||| |||||  | |||  ||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  1355 tatgtttggtagagattttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttgggaatggatgttattttcgggatgaattggttagattata 1267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University