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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14075_high_1 (Length: 759)

Name: NF14075_high_1
Description: NF14075
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14075_high_1
NF14075_high_1
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (16-753)||(48013558-48014299)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 570; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 570; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 48014299 - 48013558
Alignment:
Q  16 acaacaaatgtatttacaaattgctcactatagaagtcattatcctgactattgtagttgaatgcacagtcttacgagacacaagtaaatttcttttcaa 115  Q
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T  48014299 acaacaaatgtatttacaaatttctcactatagaagtcattatcctgattattgtagttgaatgcacagtcttacaagacacgagtaaatttcttatcaa 48014200  T
Q  116 tgaaatcaaccatcattgacacttctattgagccactaaaattctaaagnnnnnnnnn-ttatgctctacatttttcttcaagatcacattaaatcttaa 214  Q
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T  48014199 tgaaatcaaccatcattgacacttctattgagccactaaaattccaaagaaaaaaaaaattatgctctacatttttcttcaagatcacattaaatcttaa 48014100  T
Q  215 ttattannnnnnnaactcaacgcgttataaaatcatctgtgtatgtttgcttagcgttgtgtttatcaattccgccgtaagaaaccatgaaaattgtgat 314  Q
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T  48014099 ttattatttttttaactcaacgcgttataaaatcatctgtgtatgtttgcttagcgttgtgtttatcaattccgccgtaagaaaccatgaaaattgtgat 48014000  T
Q  315 gaactaacttatttgctattagataatttatccttatccacggtaaattcatctagtataaactcgccattgattagtttaaaatgattaattatatttt 414  Q
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T  48013999 gaactaa----tttgctattagataatttatccttatccacggtaaattcatctagtataaactcgccattgattagtttaaaatgattaat---atttt 48013907  T
Q  415 agcactaaaacaatgattgatatttcaaaagtagtaattataaataaattgtgaaatagaactgtatgctattacagcatgcatgtagattttgttagtt 514  Q
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T  48013906 agcactaaaacaatgattgatatttcaaaagtagtaattataaataaattgtgaaatagaactgtatgctattacagtatgcatgtagattttgttagtt 48013807  T
Q  515 tgatagagtcggttaaaacttagttggttaattgctttttatctggagagtttattgaatcagtttattatcttttcaatatgattatttcttttaagat 614  Q
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T  48013806 tgatagagtcggttaaaacttagttggttaattgctttttatctggagagtttattgaatcagttcattatcttttcaatatgattatttcttttaagat 48013707  T
Q  615 tctatctcattgatccaaaaatgttcgaacgagatgattgtt----------attaacgatcatgagtttgaattgaaactnnnnnnntatgattgttat 704  Q
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T  48013706 tctatctcattgatccaaaaatgttcgaacgagatgattgttatttcttttaattaacgatcatgagtttgaattcaaactaaaaaaatatgattgttat 48013607  T
Q  705 aaaatcctatttcgaattctatttggatagtgattattctaagaattat 753  Q
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T  48013606 aaaatcctatttcgaattctatttggatagtgattattctaagaattat 48013558  T

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