View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1408_low_14 (Length: 543)

Name: NF1408_low_14
Description: NF1408
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1408_low_14
NF1408_low_14
[»] chr3 (84 HSPs)
chr3 (86-443)||(39203439-39203797)
chr3 (137-317)||(1217065-1217245)
chr3 (142-316)||(22122918-22123092)
chr3 (136-317)||(40272812-40272995)
chr3 (137-316)||(7696893-7697067)
chr3 (138-317)||(13730602-13730785)
chr3 (137-317)||(13628790-13628975)
chr3 (138-317)||(46421034-46421218)
chr3 (139-317)||(29366720-29366902)
chr3 (137-316)||(22609742-22609921)
chr3 (137-315)||(8247688-8247871)
chr3 (137-317)||(16735416-16735597)
chr3 (138-317)||(52926219-52926391)
chr3 (151-317)||(26869696-26869863)
chr3 (138-317)||(12914035-12914216)
chr3 (191-317)||(31592878-31593004)
chr3 (138-306)||(6411833-6412002)
chr3 (137-315)||(26573103-26573282)
chr3 (211-317)||(15797271-15797377)
chr3 (137-317)||(5173719-5173903)
chr3 (138-317)||(4495676-4495845)
chr3 (137-300)||(9607178-9607345)
chr3 (161-317)||(34420643-34420802)
chr3 (170-317)||(516417-516569)
chr3 (220-317)||(34771364-34771461)
chr3 (202-317)||(54484730-54484848)
chr3 (138-244)||(10870025-10870132)
chr3 (190-318)||(10795422-10795554)
chr3 (147-317)||(53996565-53996737)
chr3 (194-317)||(14986989-14987116)
chr3 (139-317)||(25517170-25517353)
chr3 (164-295)||(30928169-30928302)
chr3 (173-301)||(33926094-33926224)
chr3 (147-307)||(45948848-45949012)
chr3 (165-313)||(7942993-7943143)
chr3 (208-317)||(49013473-49013586)
chr3 (207-318)||(45786213-45786328)
chr3 (161-317)||(25944468-25944627)
chr3 (137-264)||(45620881-45621010)
chr3 (177-305)||(54374357-54374488)
chr3 (224-315)||(353351-353444)
chr3 (212-317)||(26292382-26292487)
chr3 (207-281)||(47624087-47624162)
chr3 (160-313)||(44403559-44403715)
chr3 (173-316)||(45139479-45139624)
chr3 (160-313)||(19731000-19731155)
chr3 (173-317)||(54032571-54032705)
chr3 (137-317)||(12525385-12525564)
chr3 (211-320)||(9276313-9276422)
chr3 (257-317)||(30452892-30452952)
chr3 (208-318)||(31831245-31831344)
chr3 (158-316)||(33235526-33235687)
chr3 (168-295)||(8410889-8411016)
chr3 (251-317)||(24851301-24851367)
chr3 (181-318)||(55401195-55401335)
chr3 (160-318)||(28904941-28905101)
chr3 (160-313)||(19751576-19751731)
chr3 (242-317)||(24577917-24577992)
chr3 (242-317)||(24578007-24578082)
chr3 (195-303)||(43114882-43114994)
chr3 (184-308)||(52428479-52428613)
chr3 (160-234)||(53062036-53062112)
chr3 (208-317)||(50624953-50625064)
chr3 (160-307)||(829452-829601)
chr3 (168-270)||(29106555-29106659)
chr3 (262-322)||(10484611-10484671)
chr3 (147-314)||(35417902-35418058)
chr3 (141-257)||(21874999-21875111)
chr3 (201-316)||(31904857-31904975)
chr3 (271-317)||(6242285-6242331)
chr3 (164-251)||(39211992-39212081)
chr3 (141-258)||(26782345-26782464)
chr3 (269-317)||(47624208-47624256)
chr3 (246-295)||(46169989-46170038)
chr3 (276-317)||(40390357-40390398)
chr3 (137-177)||(9276249-9276289)
chr3 (257-317)||(14266372-14266431)
chr3 (138-267)||(43956510-43956640)
chr3 (254-317)||(40968612-40968675)
chr3 (224-290)||(21330273-21330339)
chr3 (162-256)||(1121286-1121382)
chr3 (141-178)||(23871418-23871455)
chr3 (138-186)||(39430465-39430513)
chr3 (160-188)||(55400996-55401024)
[»] chr1 (105 HSPs)
chr1 (136-317)||(34725098-34725279)
chr1 (138-317)||(38478282-38478461)
chr1 (138-313)||(45812541-45812716)
chr1 (138-305)||(47214488-47214655)
chr1 (138-317)||(32632557-32632737)
chr1 (137-317)||(14617014-14617196)
chr1 (142-317)||(19414420-19414595)
chr1 (138-317)||(46247953-46248134)
chr1 (144-317)||(30395726-30395903)
chr1 (138-317)||(18944620-18944804)
chr1 (138-314)||(46991781-46991959)
chr1 (175-317)||(35253187-35253329)
chr1 (144-317)||(12126837-12127010)
chr1 (138-317)||(20004090-20004273)
chr1 (138-317)||(10668197-10668385)
chr1 (137-317)||(27474257-27474438)
chr1 (137-317)||(41319806-41319988)
chr1 (137-317)||(27201623-27201807)
chr1 (141-312)||(23768325-23768498)
chr1 (143-314)||(45402077-45402251)
chr1 (157-313)||(6925096-6925254)
chr1 (160-295)||(18724567-18724704)
chr1 (137-317)||(8197019-8197201)
chr1 (177-317)||(35005139-35005283)
chr1 (138-282)||(22930104-22930248)
chr1 (143-317)||(18741957-18742137)
chr1 (159-317)||(6983811-6983969)
chr1 (160-295)||(11596512-11596648)
chr1 (160-317)||(35117765-35117927)
chr1 (224-318)||(4349703-4349797)
chr1 (161-296)||(25468284-25468421)
chr1 (144-317)||(9939443-9939622)
chr1 (137-315)||(19932755-19932934)
chr1 (147-307)||(2435796-2435958)
chr1 (202-317)||(31382214-31382330)
chr1 (160-314)||(10378738-10378884)
chr1 (161-305)||(19701570-19701717)
chr1 (135-308)||(44485119-44485292)
chr1 (159-293)||(20036218-20036355)
chr1 (138-263)||(4430080-4430207)
chr1 (147-317)||(50811926-50812098)
chr1 (148-320)||(33222971-33223152)
chr1 (203-317)||(23796507-23796623)
chr1 (147-313)||(35019217-35019383)
chr1 (159-315)||(15511150-15511311)
chr1 (160-255)||(50760288-50760385)
chr1 (160-272)||(17470390-17470505)
chr1 (224-317)||(1517311-1517404)
chr1 (161-314)||(39214961-39215117)
chr1 (184-305)||(45264411-45264535)
chr1 (141-287)||(25290143-25290300)
chr1 (224-317)||(42304207-42304302)
chr1 (225-317)||(43768205-43768297)
chr1 (254-317)||(50606498-50606561)
chr1 (193-315)||(22324925-22325049)
chr1 (163-313)||(22327101-22327250)
chr1 (227-295)||(15505632-15505700)
chr1 (161-308)||(23371124-23371271)
chr1 (171-317)||(31272381-31272522)
chr1 (203-308)||(34148969-34149076)
chr1 (137-213)||(34714599-34714675)
chr1 (172-317)||(19974074-19974221)
chr1 (160-307)||(27136661-27136811)
chr1 (224-317)||(20999850-20999943)
chr1 (139-317)||(24564322-24564492)
chr1 (140-205)||(40424721-40424786)
chr1 (192-295)||(30682845-30682948)
chr1 (162-317)||(19656105-19656263)
chr1 (224-310)||(31442396-31442483)
chr1 (250-312)||(4587568-4587630)
chr1 (142-272)||(18335333-18335465)
chr1 (201-295)||(20169111-20169207)
chr1 (160-227)||(2435985-2436052)
chr1 (160-314)||(52910216-52910379)
chr1 (157-247)||(14987989-14988081)
chr1 (224-280)||(21910686-21910742)
chr1 (159-240)||(25554800-25554882)
chr1 (138-227)||(10163736-10163825)
chr1 (139-249)||(18335914-18336026)
chr1 (160-315)||(34679217-34679378)
chr1 (208-287)||(21723731-21723811)
chr1 (254-317)||(30555210-30555273)
chr1 (236-302)||(4430014-4430080)
chr1 (228-301)||(6358190-6358264)
chr1 (267-317)||(19386576-19386626)
chr1 (224-294)||(20982773-20982843)
chr1 (139-225)||(21723642-21723727)
chr1 (240-305)||(4249455-4249520)
chr1 (240-305)||(4249779-4249844)
chr1 (240-305)||(4250103-4250168)
chr1 (233-314)||(28894561-28894642)
chr1 (252-317)||(33594131-33594196)
chr1 (231-305)||(7074588-7074663)
chr1 (262-317)||(16120819-16120874)
chr1 (147-303)||(43207476-43207640)
chr1 (202-248)||(44745854-44745900)
chr1 (152-225)||(22151495-22151568)
chr1 (276-315)||(42432228-42432267)
chr1 (243-303)||(43921804-43921866)
chr1 (224-317)||(5549582-5549677)
chr1 (263-317)||(25554742-25554796)
chr1 (224-265)||(46859131-46859173)
chr1 (165-249)||(49722641-49722726)
chr1 (226-270)||(10158266-10158310)
chr1 (142-202)||(21006125-21006185)
[»] chr8 (66 HSPs)
chr8 (138-317)||(12670250-12670429)
chr8 (137-317)||(30454097-30454277)
chr8 (137-322)||(13160655-13160841)
chr8 (137-317)||(28817626-28817808)
chr8 (137-317)||(36720749-36720931)
chr8 (138-322)||(44530103-44530289)
chr8 (138-317)||(35261633-35261814)
chr8 (137-317)||(39460994-39461178)
chr8 (138-316)||(45071219-45071398)
chr8 (138-317)||(7136527-7136710)
chr8 (137-318)||(17823529-17823712)
chr8 (137-317)||(6760776-6760959)
chr8 (138-294)||(20869523-20869677)
chr8 (138-317)||(29521685-29521866)
chr8 (137-317)||(2626472-2626657)
chr8 (137-313)||(18164764-18164941)
chr8 (138-317)||(26954086-26954270)
chr8 (142-311)||(20284075-20284250)
chr8 (143-317)||(8897764-8897940)
chr8 (142-311)||(21070703-21070879)
chr8 (137-317)||(25250475-25250659)
chr8 (157-317)||(12625862-12626025)
chr8 (161-295)||(24365081-24365218)
chr8 (166-317)||(31457155-31457307)
chr8 (147-317)||(28407379-28407538)
chr8 (208-317)||(19729366-19729475)
chr8 (147-304)||(44781517-44781677)
chr8 (190-317)||(5135290-5135418)
chr8 (138-295)||(24245405-24245562)
chr8 (202-317)||(20869941-20870060)
chr8 (201-315)||(29877111-29877227)
chr8 (147-308)||(8483947-8484109)
chr8 (160-305)||(22598133-22598279)
chr8 (184-307)||(389643-389770)
chr8 (193-312)||(5689640-5689761)
chr8 (170-318)||(23000227-23000365)
chr8 (243-317)||(26102578-26102652)
chr8 (147-316)||(42083699-42083870)
chr8 (208-317)||(10857852-10857964)
chr8 (210-318)||(16225045-16225157)
chr8 (163-280)||(35105902-35106022)
chr8 (139-288)||(11748254-11748407)
chr8 (160-295)||(11000971-11001109)
chr8 (147-295)||(14017990-14018140)
chr8 (210-318)||(23286336-23286432)
chr8 (139-314)||(44742521-44742698)
chr8 (195-314)||(17250879-17251001)
chr8 (137-317)||(40604906-40605087)
chr8 (229-310)||(26457776-26457855)
chr8 (239-317)||(16013511-16013591)
chr8 (163-227)||(30962865-30962929)
chr8 (207-273)||(43942347-43942417)
chr8 (257-316)||(27507985-27508044)
chr8 (254-317)||(35107311-35107374)
chr8 (268-317)||(27468092-27468141)
chr8 (192-318)||(33866957-33867088)
chr8 (137-181)||(23286431-23286475)
chr8 (256-316)||(36486567-36486627)
chr8 (228-303)||(30231344-30231420)
chr8 (140-212)||(31454144-31454216)
chr8 (262-313)||(18595918-18595969)
chr8 (162-257)||(36918102-36918199)
chr8 (273-318)||(30962770-30962815)
chr8 (138-175)||(42840863-42840900)
chr8 (256-288)||(12483584-12483616)
chr8 (261-317)||(40444845-40444901)
[»] chr7 (85 HSPs)
chr7 (138-317)||(21172009-21172188)
chr7 (137-317)||(32758214-32758394)
chr7 (137-318)||(48735121-48735303)
chr7 (145-319)||(10693071-10693245)
chr7 (166-317)||(42391100-42391251)
chr7 (137-319)||(2541017-2541202)
chr7 (138-317)||(42798623-42798804)
chr7 (137-317)||(42805477-42805661)
chr7 (135-316)||(42476824-42477005)
chr7 (138-313)||(47077859-47078034)
chr7 (138-318)||(47716413-47716597)
chr7 (146-317)||(27629596-27629769)
chr7 (163-316)||(11741774-11741927)
chr7 (145-316)||(11617589-11617762)
chr7 (138-317)||(43557426-43557610)
chr7 (137-317)||(34626208-34626389)
chr7 (149-317)||(19426890-19427059)
chr7 (137-315)||(35334818-35334996)
chr7 (144-317)||(40463837-40464011)
chr7 (184-317)||(31591109-31591242)
chr7 (158-318)||(33871909-33872070)
chr7 (138-288)||(46354148-46354302)
chr7 (138-318)||(22698966-22699151)
chr7 (138-307)||(2662946-2663112)
chr7 (160-317)||(19265791-19265948)
chr7 (185-317)||(7879639-7879773)
chr7 (138-295)||(13805057-13805214)
chr7 (147-318)||(23419673-23419845)
chr7 (160-295)||(19266426-19266563)
chr7 (184-315)||(18512455-18512587)
chr7 (160-316)||(29907393-29907552)
chr7 (147-308)||(28362155-28362316)
chr7 (170-316)||(18747472-18747621)
chr7 (142-317)||(14732821-14732999)
chr7 (147-293)||(48123508-48123655)
chr7 (136-295)||(28078154-28078314)
chr7 (139-273)||(8148989-8149126)
chr7 (160-293)||(14099030-14099165)
chr7 (160-293)||(14409047-14409182)
chr7 (167-317)||(32233135-32233286)
chr7 (139-240)||(18326989-18327091)
chr7 (175-317)||(38262196-38262340)
chr7 (137-237)||(42495916-42496017)
chr7 (160-316)||(16341254-16341413)
chr7 (203-309)||(38604546-38604654)
chr7 (137-256)||(12473257-12473378)
chr7 (209-317)||(35787269-35787378)
chr7 (159-305)||(39123865-39124018)
chr7 (139-256)||(5180218-5180337)
chr7 (234-317)||(27889316-27889399)
chr7 (159-292)||(7644931-7645066)
chr7 (188-308)||(21566439-21566562)
chr7 (147-316)||(3469176-3469350)
chr7 (161-262)||(6736867-6736969)
chr7 (196-313)||(1408469-1408588)
chr7 (138-226)||(7193039-7193127)
chr7 (200-318)||(23231573-23231693)
chr7 (143-227)||(7794598-7794682)
chr7 (138-227)||(21447544-21447633)
chr7 (160-295)||(44123644-44123780)
chr7 (144-255)||(1423972-1424085)
chr7 (141-317)||(25198679-25198861)
chr7 (160-302)||(42101899-42102044)
chr7 (234-317)||(45018923-45019010)
chr7 (184-295)||(35203439-35203554)
chr7 (225-317)||(39093439-39093532)
chr7 (188-273)||(15108441-15108527)
chr7 (223-317)||(23618977-23619071)
chr7 (225-292)||(33500556-33500625)
chr7 (159-315)||(22065563-22065720)
chr7 (224-317)||(23065925-23066018)
chr7 (235-307)||(36267827-36267900)
chr7 (215-304)||(21139761-21139851)
chr7 (162-314)||(11458267-11458421)
chr7 (231-317)||(13792150-13792237)
chr7 (141-192)||(29140487-29140538)
chr7 (270-317)||(36602535-36602582)
chr7 (224-301)||(17048831-17048909)
chr7 (135-251)||(43852002-43852111)
chr7 (266-314)||(42495865-42495913)
chr7 (254-317)||(45811919-45811981)
chr7 (259-320)||(11888414-11888475)
chr7 (199-315)||(27697452-27697572)
chr7 (160-224)||(1524281-1524345)
chr7 (135-227)||(5814422-5814514)
[»] chr6 (59 HSPs)
chr6 (138-317)||(1346918-1347097)
chr6 (138-317)||(1354757-1354936)
chr6 (135-317)||(29355855-29356042)
chr6 (148-317)||(12221914-12222088)
chr6 (137-317)||(9161076-9161259)
chr6 (202-317)||(26097178-26097293)
chr6 (143-317)||(2166410-2166587)
chr6 (143-317)||(2178043-2178220)
chr6 (202-317)||(25557743-25557858)
chr6 (140-310)||(3815084-3815256)
chr6 (162-317)||(28007604-28007760)
chr6 (138-315)||(15866041-15866218)
chr6 (138-317)||(1941809-1941990)
chr6 (137-250)||(8409196-8409311)
chr6 (139-282)||(13905015-13905158)
chr6 (170-315)||(23240826-23240971)
chr6 (137-313)||(14975094-14975262)
chr6 (169-317)||(18277193-18277343)
chr6 (142-317)||(23930127-23930303)
chr6 (147-318)||(7947370-7947543)
chr6 (160-318)||(12889402-12889563)
chr6 (148-317)||(24097545-24097712)
chr6 (138-285)||(6024187-6024338)
chr6 (157-295)||(14553485-14553626)
chr6 (194-300)||(32579436-32579543)
chr6 (189-306)||(33138838-33138957)
chr6 (142-306)||(20400625-20400791)
chr6 (239-317)||(12892064-12892144)
chr6 (245-317)||(13267788-13267860)
chr6 (137-293)||(22967124-22967287)
chr6 (137-293)||(23821106-23821269)
chr6 (161-317)||(32728157-32728314)
chr6 (184-315)||(15865859-15865991)
chr6 (240-320)||(383757-383837)
chr6 (142-290)||(24734591-24734752)
chr6 (255-317)||(6808468-6808530)
chr6 (238-317)||(12885967-12886048)
chr6 (160-316)||(2755422-2755583)
chr6 (176-319)||(17432332-17432485)
chr6 (150-317)||(3116129-3116299)
chr6 (141-227)||(12063424-12063510)
chr6 (249-319)||(10734903-10734974)
chr6 (138-205)||(33922942-33923009)
chr6 (207-317)||(9671084-9671197)
chr6 (157-254)||(27855500-27855600)
chr6 (166-244)||(4136590-4136670)
chr6 (211-308)||(19340855-19340954)
chr6 (249-307)||(11395827-11395886)
chr6 (148-231)||(19649255-19649338)
chr6 (282-317)||(25997749-25997784)
chr6 (184-247)||(17448324-17448389)
chr6 (162-270)||(32068074-32068182)
chr6 (194-287)||(11849063-11849159)
chr6 (264-313)||(30786378-30786427)
chr6 (157-213)||(8417445-8417501)
chr6 (258-317)||(33922857-33922916)
chr6 (27-61)||(913229-913263)
chr6 (254-318)||(16895695-16895761)
chr6 (224-253)||(14341134-14341163)
[»] chr4 (102 HSPs)
chr4 (137-317)||(20224937-20225117)
chr4 (137-317)||(48598825-48599005)
chr4 (138-317)||(11054148-11054327)
chr4 (138-317)||(47528530-47528709)
chr4 (137-317)||(5648212-5648393)
chr4 (137-316)||(6430627-6430807)
chr4 (135-317)||(30639331-30639514)
chr4 (162-317)||(9832313-9832468)
chr4 (137-317)||(5306660-5306845)
chr4 (176-315)||(29207900-29208039)
chr4 (145-317)||(16408601-16408777)
chr4 (138-317)||(23501747-23501924)
chr4 (157-316)||(40915802-40915962)
chr4 (141-317)||(16911519-16911699)
chr4 (138-314)||(21646918-21647098)
chr4 (165-313)||(39077800-39077948)
chr4 (157-318)||(44363129-44363294)
chr4 (149-316)||(8473621-8473790)
chr4 (164-317)||(54175043-54175200)
chr4 (184-317)||(47443957-47444092)
chr4 (164-295)||(17043416-17043549)
chr4 (138-317)||(13256399-13256578)
chr4 (160-317)||(35567146-35567305)
chr4 (138-303)||(37494805-37494972)
chr4 (143-317)||(30352580-30352767)
chr4 (162-318)||(30690175-30690340)
chr4 (141-306)||(54730206-54730376)
chr4 (201-317)||(20639658-20639777)
chr4 (170-295)||(25463108-25463235)
chr4 (141-317)||(14983791-14983969)
chr4 (159-307)||(19027823-19027973)
chr4 (138-317)||(55766466-55766647)
chr4 (136-266)||(14590789-14590922)
chr4 (148-306)||(30496333-30496491)
chr4 (139-314)||(54966977-54967151)
chr4 (188-317)||(10277757-10277886)
chr4 (138-317)||(20405047-20405224)
chr4 (208-317)||(25629073-25629184)
chr4 (160-295)||(39029082-39029220)
chr4 (162-318)||(32478791-32478942)
chr4 (138-317)||(55830721-55830902)
chr4 (138-314)||(10660358-10660538)
chr4 (138-314)||(10874503-10874683)
chr4 (167-294)||(7385499-7385628)
chr4 (227-318)||(20225119-20225212)
chr4 (167-304)||(41018807-41018945)
chr4 (162-301)||(30581481-30581624)
chr4 (202-316)||(7909281-7909397)
chr4 (160-281)||(47441566-47441689)
chr4 (163-295)||(49938615-49938746)
chr4 (208-317)||(51865038-51865149)
chr4 (246-317)||(38786673-38786744)
chr4 (196-313)||(9987838-9987957)
chr4 (208-295)||(49796822-49796910)
chr4 (160-317)||(20908636-20908797)
chr4 (160-308)||(487135-487294)
chr4 (161-295)||(3580862-3580994)
chr4 (172-317)||(7038041-7038187)
chr4 (141-241)||(17315375-17315476)
chr4 (196-312)||(21489099-21489218)
chr4 (159-314)||(25343162-25343321)
chr4 (256-317)||(32484307-32484368)
chr4 (255-319)||(38755906-38755970)
chr4 (160-242)||(42164224-42164307)
chr4 (253-319)||(11394923-11394989)
chr4 (253-319)||(11404650-11404716)
chr4 (169-293)||(32629293-32629418)
chr4 (141-214)||(5313099-5313172)
chr4 (243-317)||(33836487-33836563)
chr4 (256-320)||(40553934-40553998)
chr4 (162-317)||(23580208-23580365)
chr4 (224-317)||(36816384-36816478)
chr4 (253-313)||(28494222-28494282)
chr4 (160-241)||(43035224-43035307)
chr4 (255-318)||(25388249-25388312)
chr4 (147-314)||(36589708-36589876)
chr4 (224-318)||(48327762-48327858)
chr4 (147-227)||(54640431-54640510)
chr4 (267-317)||(35532077-35532127)
chr4 (256-318)||(44718641-44718703)
chr4 (224-316)||(12711450-12711542)
chr4 (223-308)||(16494258-16494345)
chr4 (163-265)||(49938490-49938594)
chr4 (226-317)||(2813169-2813263)
chr4 (254-317)||(47482850-47482913)
chr4 (147-254)||(51420537-51420646)
chr4 (266-317)||(56322984-56323035)
chr4 (255-317)||(50555656-50555718)
chr4 (160-224)||(12257688-12257752)
chr4 (141-181)||(18969698-18969738)
chr4 (257-317)||(19027986-19028046)
chr4 (193-277)||(17079691-17079777)
chr4 (137-192)||(29879624-29879679)
chr4 (160-230)||(41549358-41549428)
chr4 (175-263)||(10379997-10380086)
chr4 (224-276)||(35894502-35894555)
chr4 (159-280)||(44357195-44357319)
chr4 (224-294)||(46082785-46082856)
chr4 (232-274)||(4222071-4222113)
chr4 (147-205)||(50856350-50856407)
chr4 (255-303)||(8820581-8820629)
chr4 (260-316)||(12666858-12666914)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (138-317)||(30533-30712)
[»] chr2 (81 HSPs)
chr2 (137-317)||(21779261-21779441)
chr2 (137-318)||(23397719-23397900)
chr2 (138-317)||(8455316-8455497)
chr2 (138-317)||(9671134-9671314)
chr2 (137-318)||(14530271-14530456)
chr2 (139-317)||(10543653-10543835)
chr2 (138-307)||(12023929-12024099)
chr2 (141-317)||(25249738-25249915)
chr2 (140-317)||(11514392-11514570)
chr2 (137-317)||(25079717-25079900)
chr2 (139-317)||(24200623-24200805)
chr2 (175-317)||(10546153-10546298)
chr2 (137-281)||(22371010-22371153)
chr2 (175-317)||(14444720-14444863)
chr2 (157-317)||(17667975-17668137)
chr2 (140-317)||(17896215-17896395)
chr2 (138-317)||(5840982-5841165)
chr2 (157-317)||(17623537-17623699)
chr2 (144-317)||(27573581-27573755)
chr2 (200-317)||(36871509-36871626)
chr2 (140-305)||(19977726-19977893)
chr2 (158-317)||(39914306-39914467)
chr2 (159-318)||(40416870-40417031)
chr2 (138-313)||(7214488-7214667)
chr2 (138-317)||(26684620-26684803)
chr2 (161-301)||(99281-99421)
chr2 (139-318)||(14544018-14544202)
chr2 (148-313)||(24859992-24860157)
chr2 (169-317)||(25641487-25641636)
chr2 (160-317)||(21377074-21377232)
chr2 (162-280)||(5450263-5450384)
chr2 (138-254)||(17705449-17705567)
chr2 (147-314)||(4516354-4516522)
chr2 (164-318)||(17380237-17380391)
chr2 (139-295)||(32781310-32781467)
chr2 (159-317)||(44643497-44643658)
chr2 (160-279)||(23145736-23145857)
chr2 (160-279)||(23557526-23557647)
chr2 (208-317)||(40762234-40762345)
chr2 (162-305)||(31158451-31158598)
chr2 (160-295)||(33795261-33795398)
chr2 (185-321)||(13245091-13245220)
chr2 (224-317)||(25632551-25632644)
chr2 (199-305)||(30826052-30826158)
chr2 (173-305)||(19614981-19615116)
chr2 (224-304)||(24890453-24890533)
chr2 (160-295)||(44521395-44521532)
chr2 (161-314)||(45235820-45235976)
chr2 (173-282)||(44449418-44449529)
chr2 (257-317)||(34080176-34080236)
chr2 (256-315)||(41409936-41409995)
chr2 (160-256)||(29419946-29420048)
chr2 (193-317)||(15296406-15296533)
chr2 (169-305)||(31821355-31821491)
chr2 (256-316)||(40579750-40579810)
chr2 (157-236)||(44604827-44604907)
chr2 (254-317)||(23488555-23488618)
chr2 (251-304)||(4794871-4794924)
chr2 (208-307)||(17471572-17471675)
chr2 (178-261)||(2003592-2003678)
chr2 (262-322)||(8575975-8576035)
chr2 (257-317)||(34766330-34766390)
chr2 (266-313)||(39189508-39189555)
chr2 (263-317)||(3633708-3633762)
chr2 (161-317)||(4795730-4795890)
chr2 (147-215)||(35017781-35017849)
chr2 (137-182)||(39189558-39189603)
chr2 (224-305)||(39499242-39499323)
chr2 (269-317)||(22371199-22371247)
chr2 (255-317)||(1289095-1289158)
chr2 (247-314)||(31525771-31525838)
chr2 (247-309)||(31523296-31523358)
chr2 (199-295)||(30864439-30864536)
chr2 (269-313)||(124918-124962)
chr2 (246-301)||(24059012-24059067)
chr2 (184-272)||(12315697-12315786)
chr2 (138-187)||(27466262-27466311)
chr2 (139-227)||(17472926-17473014)
chr2 (254-318)||(19185742-19185806)
chr2 (142-227)||(4852306-4852388)
chr2 (248-276)||(4252656-4252684)
[»] chr5 (80 HSPs)
chr5 (138-317)||(35710267-35710446)
chr5 (137-317)||(41014272-41014453)
chr5 (138-317)||(8169984-8170163)
chr5 (171-317)||(32703411-32703557)
chr5 (137-317)||(38879534-38879718)
chr5 (138-317)||(24448844-24449025)
chr5 (141-317)||(4619104-4619284)
chr5 (141-317)||(43334159-43334339)
chr5 (138-318)||(1565385-1565567)
chr5 (199-314)||(7368413-7368528)
chr5 (136-313)||(27328704-27328885)
chr5 (141-317)||(22861669-22861844)
chr5 (137-247)||(37024626-37024736)
chr5 (159-317)||(19142943-19143102)
chr5 (139-294)||(2838733-2838890)
chr5 (193-318)||(13801766-13801895)
chr5 (223-318)||(34154813-34154908)
chr5 (167-317)||(1405170-1405322)
chr5 (137-295)||(22600407-22600567)
chr5 (160-308)||(208936-209086)
chr5 (187-308)||(43574609-43574732)
chr5 (149-316)||(12006329-12006500)
chr5 (144-318)||(30006285-30006461)
chr5 (209-318)||(16880646-16880757)
chr5 (137-318)||(22187238-22187423)
chr5 (206-318)||(7097759-7097872)
chr5 (160-317)||(28516433-28516593)
chr5 (168-307)||(1850624-1850764)
chr5 (203-316)||(20135623-20135740)
chr5 (147-308)||(39301087-39301249)
chr5 (242-317)||(16957374-16957449)
chr5 (137-242)||(23974734-23974840)
chr5 (208-317)||(29334419-29334531)
chr5 (161-317)||(3771318-3771474)
chr5 (160-317)||(24903696-24903855)
chr5 (258-317)||(16028624-16028683)
chr5 (176-317)||(42924830-42924977)
chr5 (169-269)||(22907913-22908014)
chr5 (258-319)||(30877562-30877623)
chr5 (199-318)||(5873321-5873441)
chr5 (162-295)||(24323727-24323862)
chr5 (162-295)||(24360351-24360486)
chr5 (202-318)||(12575659-12575779)
chr5 (143-256)||(31299591-31299705)
chr5 (164-308)||(34074573-34074717)
chr5 (182-282)||(41425946-41426048)
chr5 (255-317)||(25622533-25622595)
chr5 (232-317)||(11657699-11657785)
chr5 (161-319)||(31694106-31694266)
chr5 (138-194)||(19438703-19438759)
chr5 (224-307)||(9794388-9794471)
chr5 (247-317)||(10943845-10943914)
chr5 (238-308)||(13774921-13774991)
chr5 (159-280)||(18698586-18698707)
chr5 (233-305)||(12477132-12477205)
chr5 (244-295)||(10306496-10306548)
chr5 (254-314)||(21784335-21784395)
chr5 (179-240)||(22025538-22025601)
chr5 (257-313)||(39801591-39801647)
chr5 (273-316)||(19438757-19438800)
chr5 (266-317)||(32354211-32354262)
chr5 (167-213)||(9794465-9794511)
chr5 (270-315)||(11462913-11462958)
chr5 (162-317)||(24313572-24313732)
chr5 (162-317)||(24355909-24356069)
chr5 (147-252)||(10634211-10634317)
chr5 (147-203)||(39079882-39079937)
chr5 (254-305)||(4654427-4654478)
chr5 (252-295)||(21542489-21542532)
chr5 (157-214)||(17419887-17419944)
chr5 (162-303)||(18426017-18426160)
chr5 (242-313)||(39079755-39079827)
chr5 (254-317)||(19093885-19093948)
chr5 (137-176)||(41956885-41956924)
chr5 (232-304)||(3176770-3176839)
chr5 (161-267)||(4809986-4810094)
chr5 (231-300)||(15141929-15141998)
chr5 (275-316)||(29184062-29184103)
chr5 (159-200)||(31362454-31362495)
chr5 (242-317)||(37225961-37226037)
[»] scaffold0187 (4 HSPs)
scaffold0187 (141-315)||(10052-10226)
scaffold0187 (141-315)||(20380-20554)
scaffold0187 (137-203)||(8898-8964)
scaffold0187 (137-203)||(19226-19292)
[»] scaffold0223 (1 HSPs)
scaffold0223 (145-318)||(11093-11265)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (140-317)||(13024-13202)
[»] scaffold0057 (5 HSPs)
scaffold0057 (147-317)||(46794-46966)
scaffold0057 (137-317)||(24772-24949)
scaffold0057 (197-317)||(43672-43793)
scaffold0057 (229-295)||(46729-46796)
scaffold0057 (161-206)||(46996-47041)
[»] scaffold1176 (1 HSPs)
scaffold1176 (146-318)||(1586-1758)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (193-317)||(48634-48758)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (147-317)||(10773-10945)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (143-318)||(58936-59115)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (230-317)||(24133-24220)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (136-266)||(226456-226589)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (138-272)||(35062-35200)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (146-317)||(72867-73034)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (143-280)||(4117-4258)
[»] scaffold0954 (1 HSPs)
scaffold0954 (200-318)||(3560-3680)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (137-212)||(83828-83903)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (175-295)||(23590-23712)
[»] scaffold0194 (1 HSPs)
scaffold0194 (139-317)||(24619-24783)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (142-227)||(43085-43172)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (138-227)||(8848-8934)
[»] scaffold0867 (1 HSPs)
scaffold0867 (188-301)||(3685-3798)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (247-318)||(58629-58699)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (160-267)||(32906-33016)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 84)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 86 - 443
Target Start/End: Original strand, 39203439 - 39203797
Alignment:
Q  86 aacctgtgtttaattcacttcattatttgacaataataatgtatagtt-ctctgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaa 184  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |    
T  39203439 aacctgtgttcaattcacttcattatttgacaataataatgtatagtttctctgaggggtaaccttggcacaacttgtaaagttgttgtcatgtgactga 39203538  T
Q  185 aaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcat 284  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39203539 aaggtcacaggttcaagtccttgaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccttgcat 39203638  T
Q  285 atgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaatgtatagtttctctctagagttccgaaacagttaattttggttgaaattctcaatgaattagttt 384  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39203639 atgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttaatgtatagtttctctctagagttccgaaacagttaattttggttgaaattctcaatgaattagttt 39203738  T
Q  385 atcttcatgaaaacttatagaaacaaacagcttatgcaaaagttatttatgtttaccct 443  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39203739 atcttcatgaaaacttatagaaacaaacagcttatacaaaagttatttatgtttaccct 39203797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Original strand, 1217065 - 1217245
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1217065 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgtagtcatgtcactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 1217164  T
Q  237 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1217165 gctgcgtacaatacaccaaatggcgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 1217245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 142 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 22123092 - 22122918
Alignment:
Q  142 ggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgc 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22123092 ggtaaccttggcgccactggtaaatttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaacagggtaaggctgc 22122993  T
Q  242 gtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22122992 gtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgagagctctagtgcaccgggttgccctt 22122918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 136 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 40272995 - 40272812
Alignment:
Q  136 ctgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggt 233  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  40272995 ctgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 40272896  T
Q  234 aaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40272895 aaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 40272812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 137 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7697067 - 7696893
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7697067 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaacagggtaag 7696968  T
Q  237 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||     ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  7696967 gctgcgtacaatacaccaaatgg-----ccccttcccggacactgcatatgtgggagctctagtgcaccgggtttccctt 7696893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 13730785 - 13730602
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13730785 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 13730686  T
Q  236 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13730685 ggctgtgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 13730602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 13628975 - 13628790
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaa-gttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaa--aacagggt 233  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13628975 tgaggggtaaccttggcacaactggtaaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaagaaacagggt 13628876  T
Q  234 aaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13628875 aaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 13628790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 46421218 - 46421034
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 235  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  46421218 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 46421119  T
Q  236 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctct-agtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  46421118 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttaagtgcaccggtttgcccttt 46421034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 139 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 29366902 - 29366720
Alignment:
Q  139 aggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaag 236  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  29366902 aggggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaag 29366803  T
Q  237 gctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29366802 gctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcactgggttgcccttt 29366720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 137 - 316
Target Start/End: Original strand, 22609742 - 22609921
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaa 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22609742 tgaggggtaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtaacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaa 22609840  T
Q  236 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22609841 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgccctt 22609921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 137 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8247871 - 8247688
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 234  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8247871 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 8247772  T
Q  235 aggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctct-agtgcaccgggttgccct 315  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  8247771 aggttgcgtacaatacaccaataatggtgggactccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttaagtgcactgggttgccct 8247688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Original strand, 16735416 - 16735597
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtaa 235  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  16735416 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtagaaaaacagggtaa 16735515  T
Q  236 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||    
T  16735516 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggacactgcgtatgcggtagcttcagtgcactgggttgcccttt 16735597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 52926391 - 52926219
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 237  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       ||||||    
T  52926391 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-------gtaagg 52926299  T
Q  238 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  52926298 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggacaccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagcgcaccgggttgcccttt 52926219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 151 - 317
Target Start/End: Original strand, 26869696 - 26869863
Alignment:
Q  151 ggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaata 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26869696 ggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctctggtgtaaaaacagggtaaggctgcgtacaata 26869795  T
Q  250 caccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26869796 caccaaatggtgggaccccttgccggaccatgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgcccttt 26869863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12914216 - 12914035
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaa 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12914216 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtaatgtgaccgaaaggtcacaagttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 12914117  T
Q  236 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  12914116 ggcggcgtacaatacaccaaatggtgagaccccttcccagaccctgcatatgcgggagcttcaatgcaccgggttgcccttt 12914035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 191 - 317
Target Start/End: Original strand, 31592878 - 31593004
Alignment:
Q  191 acgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgg 290  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31592878 acgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggactccttcccggaccctgcatatgcgg 31592977  T
Q  291 gagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  31592978 gagctctagtgcaccgggttgcccttt 31593004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 138 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 6412002 - 6411833
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaag 236  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6412002 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgataggtcatgggttcaagtcttgtaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaag 6411903  T
Q  237 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccg 306  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  6411902 gctgcgtacaatacaccaaatgatgggaccccttcccagaccttgcgtatgcgggagctttagtgcaccg 6411833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 137 - 315
Target Start/End: Original strand, 26573103 - 26573282
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggta 234  Q
    ||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||    
T  26573103 tgagggggacccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaaacagggta 26573201  T
Q  235 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 315  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| || ||||||    
T  26573202 aggctgcgtacaatacaccaattggtgggaccccatcccggaccctgcgtatgcgtgagctttagtgcaccaggctgccct 26573282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 211 - 317
Target Start/End: Original strand, 15797271 - 15797377
Alignment:
Q  211 cagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggtt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15797271 cagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctctagtgcaccgggtt 15797370  T
Q  311 gcccttt 317  Q
    |||||||    
T  15797371 gcccttt 15797377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 5173903 - 5173719
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaa-gttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggta 234  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||    
T  5173903 tgaggggtaaccttggcgcaactcgtaaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacaaagta 5173804  T
Q  235 aggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||| ||| | |||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5173803 aggttgcatgcaatacaccaaaaatggtggggccccttcccggaccttgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 5173719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4495845 - 4495676
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 235  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||    
T  4495845 gaggggtaaccttcgcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctgaaaatagcctattgtgtaaaaaacagggtaa 4495746  T
Q  236 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||            ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4495745 ggctgcgtacaatacaccaaatggtg------------ggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 4495676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 137 - 300
Target Start/End: Original strand, 9607178 - 9607345
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 234  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  9607178 tgaggggtaaccttggcgcaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatcggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggta 9607277  T
Q  235 aggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagt 300  Q
    |||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  9607278 aggctgcgtagaatacaccaataatgttgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagt 9607345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 161 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 34420802 - 34420643
Alignment:
Q  161 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaat 257  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  34420802 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtaccatacaccaaaat 34420703  T
Q  258 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  34420702 ggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgtgggagctttagtgcacatggctgcccttt 34420643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 170 - 317
Target Start/End: Original strand, 516417 - 516569
Alignment:
Q  170 ttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc---aaatggtggga 264  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||   |||||| ||||    
T  516417 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgcacaataaaccaaaaaatggcggga 516516  T
Q  265 ccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  516517 ccccttccccgaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 516569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 220 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 34771461 - 34771364
Alignment:
Q  220 gtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34771461 gtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggctgcccttt 34771364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 54484730 - 54484848
Alignment:
Q  202 tcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctcta 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  54484730 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttta 54484829  T
Q  299 gtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||    
T  54484830 gtgcaccgggttgcccttt 54484848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 138 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10870132 - 10870025
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaag 236  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10870132 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaag 10870033  T
Q  237 gctgcgta 244  Q
    ||||||||    
T  10870032 gctgcgta 10870025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 190 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 10795554 - 10795422
Alignment:
Q  190 cacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggaccccttcccggaccctgcata 285  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  10795554 cacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaagacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgta 10795455  T
Q  286 tgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  10795454 tgcgggagcttcagtgcaccaggttgcccttta 10795422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 147 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 53996737 - 53996565
Alignment:
Q  147 ccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgta 244  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  53996737 ccttggcgctac-ggtaaatttgttgtcatttgactgaaaggtcacgtgttcaagtcgtggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgctta 53996639  T
Q  245 caatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  53996638 caatacaccaaaatggtgggaccccttccctgacactgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggctgcccttt 53996565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 194 - 317
Target Start/End: Original strand, 14986989 - 14987116
Alignment:
Q  194 ggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcg 289  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14986989 ggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggacccattcccggaccttgcatatgcg 14987088  T
Q  290 ggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14987089 ggagctttagtgcaccgggtttcccttt 14987116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 139 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25517353 - 25517170
Alignment:
Q  139 aggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagt--cctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggt 233  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || | | |   |||| ||||| ||||||||||||||   || | |    
T  25517353 agggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggatgatgggacctggaaacatcctcttgtgtaaaaaaacaagat 25517254  T
Q  234 aaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  25517253 atggctgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccggatcctgcgtatgctggagctttagtgcaccgggttgcccttt 25517170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 164 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 30928302 - 30928169
Alignment:
Q  164 aagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtg 261  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||| || ||| |||||||||| ||| |    
T  30928302 aagttcttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggttgtgtaaaatacaccaattggcg 30928203  T
Q  262 ggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30928202 ggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagct 30928169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Original strand, 33926094 - 33926224
Alignment:
Q  173 tcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca-aatggtgggacccctt 270  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33926094 tcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacaccataatggtgggacccctt 33926193  T
Q  271 cccggaccctgcatatgcgggagctctagtg 301  Q
    || |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  33926194 cctggaccctgcatatgcgagagctttagtg 33926224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 147 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 45949012 - 45948848
Alignment:
Q  147 ccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaa---aggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaggctgc 241  Q
    ||||||||| || ||| |||||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  45949012 ccttggcgcaac-ggtgaagttgttttcatgtgactgaaggaaggtcacgggttcaattcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgc 45948914  T
Q  242 gtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 307  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  45948913 atacaatacaccaattggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgg 45948848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 165 - 313
Target Start/End: Original strand, 7942993 - 7943143
Alignment:
Q  165 agttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgg 262  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  7942993 agttgttgtcatgtgactggaaggtcacggattcaagtcctggaaacagcatcttgtctaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacatcaaatggtgg 7943092  T
Q  263 gaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 313  Q
    || ||||| || |||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  7943093 gatccctttccagaccatgcgtatgcgggagctttagtgcactgggttgcc 7943143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 208 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 49013586 - 49013473
Alignment:
Q  208 aaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgca 303  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  49013586 aaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatacgcgggagctttagtgca 49013487  T
Q  304 ccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||    
T  49013486 ccgggttgcccttt 49013473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 207 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 45786328 - 45786213
Alignment:
Q  207 aaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgc 302  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||    
T  45786328 aaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgaatgctggagctttagtgc 45786229  T
Q  303 accgggttgcccttta 318  Q
    ||||||||||||||||    
T  45786228 accgggttgcccttta 45786213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 161 - 317
Target Start/End: Original strand, 25944468 - 25944627
Alignment:
Q  161 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaat 257  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||  ||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  25944468 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaaccgcctctcgtgtaaaaaactgggcaaggctgagtacaatacaccaaaat 25944567  T
Q  258 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  25944568 ggtgggaccccttccctgaccctgcgtatgtgggagctttagcgcaccaggctgcccttt 25944627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 137 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 45621010 - 45620881
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt---aaaacagggt 233  Q
    ||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||    
T  45621010 tgagggggagccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggt 45620912  T
Q  234 aaggctgcgtacaatacaccaaatggtggga 264  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45620911 aaggctgcgtacaatacaccaattggtggga 45620881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 177 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 54374488 - 54374357
Alignment:
Q  177 gtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttccc 273  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  54374488 gtgactgaaaggtcacaggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcgtacaatccaccaaaatggtgggaccccttccc 54374389  T
Q  274 ggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 305  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  54374388 ggaccctgcatatgcgggagctttagttcacc 54374357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 224 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 353444 - 353351
Alignment:
Q  224 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  353444 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccct 353351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 212 - 317
Target Start/End: Original strand, 26292382 - 26292487
Alignment:
Q  212 agcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttg 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26292382 agcctcttgtgtaaaacagggtaagaccgcgtacgatacaccaaatgatgggatcccttcccgaaccctgcatatgcgggaactctagtgcaccgggttg 26292481  T
Q  312 cccttt 317  Q
     |||||    
T  26292482 tccttt 26292487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 207 - 281
Target Start/End: Original strand, 47624087 - 47624162
Alignment:
Q  207 aaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctg 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47624087 aaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctg 47624162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 160 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 44403715 - 44403559
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatac-accaaa 256  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||  || ||||||||||||||||  || |||||||||||| | ||||| || |||    
T  44403715 ggtaaagttattgtcacgtggctaaaaggtcacaggttaaagtcctgggaatagcctcttgtgtaaaagacaaggtaaggctgcggagaataccacaaaa 44403616  T
Q  257 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||| ||||    
T  44403615 tggtgggaccccttcccggaccctacgtatgctgaagctttagtgcaccgggctgcc 44403559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 173 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 45139624 - 45139479
Alignment:
Q  173 tcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggacccc 268  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  45139624 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagttttggaaacaacctcttgtgtaaaacacagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtgggacccc 45139525  T
Q  269 ttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 316  Q
    ||||| || ||||| ||||||||| || | |||||||||| |||||||    
T  45139524 ttcccaga-cctgcgtatgcgggaact-ttgtgcaccgggctgccctt 45139479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 313
Target Start/End: Original strand, 19731000 - 19731155
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 257  Q
    |||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||| | |    
T  19731000 ggtaaatttgttgtcacgtgattgaaaggtcacggatgcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggttgcgtacaatacacctatt 19731099  T
Q  258 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 313  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||  ||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  19731100 ggtgggaccctttcccagactctgtgtatgcaggagctttagtgcaccgggctgcc 19731155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 173 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 54032705 - 54032571
Alignment:
Q  173 tcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacccctt 270  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||             
T  54032705 tcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccgaatggtg--------- 54032615  T
Q  271 cccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
       ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54032614 ---ggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 54032571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Original strand, 12525385 - 12525564
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggta 234  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12525385 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgt---catatgactgaaaggtcacaggttcgagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaatcagggta 12525481  T
Q  235 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||| |  | ||   |||||||||||| ||||||  |||||||  ||| ||||||||  | |||||| |||||| ||||    
T  12525482 aggctgcgaagtacaccaaaaatggtgggacaccttcctagaccctgtgtatacgggagcttcactgcaccaggttgctcttt 12525564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 211 - 320
Target Start/End: Original strand, 9276313 - 9276422
Alignment:
Q  211 cagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 308  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| || || ||| | |||    
T  9276313 cagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggt-ggaccctttcccggaccctgcgtatgcgggaacttta-tgcgcaggg 9276410  T
Q  309 ttgccctttaat 320  Q
    ||||||||||||    
T  9276411 ttgccctttaat 9276422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 257 - 317
Target Start/End: Original strand, 30452892 - 30452952
Alignment:
Q  257 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30452892 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 30452952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 318
Target Start/End: Original strand, 31831245 - 31831344
Alignment:
Q  208 aaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 307  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31831245 aaacagcctcttgtgtaaaatagggtaaggctgcatacaatacaccaaatggt-----------ccggaccctgcatatgcgggtgctctagtgcaccgg 31831333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 316
Target Start/End: Original strand, 33235526 - 33235687
Alignment:
Q  158 ctggtaaagttgttgtcatgtgac-taaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcgtacaatacacc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||| || || ||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||||||||||     
T  33235526 ctggtaaagttgttgtcatgtgacatgaaaggtcacaagttcaaatcgtgtaaagagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaagactgtgtacaatacact 33235625  T
Q  254 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 316  Q
    ||||||||||||||| || | |||| | | ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  33235626 aaatggtgggacccc-tcgcagaccttacgtatgcggaagctttagtgcaccaggttgccctt 33235687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 168 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8411016 - 8410889
Alignment:
Q  168 tgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccc 267  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||     
T  8411016 tgttgtcatgggactgaaaggtcaccggttcaggtcctggaaactgcctcgtgtaaaaaacagggtaaggctgctcacaatacaccaactggtgggacct 8410917  T
Q  268 cttcccggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
    |||| | ||||||||||| |||| ||||    
T  8410916 cttctcagaccctgcataggcggaagct 8410889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 251 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 24851367 - 24851301
Alignment:
Q  251 accaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24851367 accaaatggtgggaccccttcccggatcctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 24851301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 318
Target Start/End: Original strand, 55401195 - 55401335
Alignment:
Q  181 ctaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaatggtgggaccccttcccggac 277  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  55401195 ctaaaaggccatcggttcaagtcctgtaaacagcctcttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtataatacaccaaaatggtgggaccccttctcggac 55401294  T
Q  278 cctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    | | | |||||||||||| |  ||||||||| |||| ||||    
T  55401295 cttccgtatgcgggagcttttttgcaccgggctgcctttta 55401335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 318
Target Start/End: Original strand, 28904941 - 28905101
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaa---aacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| |  ||||| |||||||||||   |||| |||||| ||| ||||| |||||||||    
T  28904941 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaagtcacatgtttaagtccagggaacagtctcttgtgtaaaataacaaggtaagactgtgtacattacaccaaa 28905040  T
Q  257 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    |  |||||||| |||||||||||||| || |||||| || ||||| | |||| |||||||||    
T  28905041 t-atgggaccctttcccggaccctgcgtaagcgggaactttagtgtaacgggctgcccttta 28905101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 313
Target Start/End: Original strand, 19751576 - 19751731
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 257  Q
    |||||| || |||||| |||| | ||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||| | |    
T  19751576 ggtaaattttttgtcacgtgattgaaaggtcacggatgcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaatcaaggtaaggttgcgtacaatacacctatt 19751675  T
Q  258 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 313  Q
    |||||||||| ||||| |||  ||  |||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  19751676 ggtgggaccctttcccagactttgtgtatgcatgagctttagtgcaccgggctgcc 19751731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 242 - 317
Target Start/End: Original strand, 24577917 - 24577992
Alignment:
Q  242 gtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24577917 gtacaatacactaaatggtgggatcctttcccagaccctgcatatacgggagctctagtgcaccggattgcccttt 24577992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 242 - 317
Target Start/End: Original strand, 24578007 - 24578082
Alignment:
Q  242 gtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24578007 gtacaatacactaaatggtgggactctttcccagaccctacatatgcgggaactctagtgcaccgggttgcccttt 24578082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 195 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 43114994 - 43114882
Alignment:
Q  195 gttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaa-ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgga-ccctgcatatgcg 289  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||    
T  43114994 gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaagggctacctacaatacaccaaatggtggga-cccttcctggacccctgcgtatgcg 43114896  T
Q  290 ggagctctagtgca 303  Q
    |||||| |||||||    
T  43114895 ggagctttagtgca 43114882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 52428613 - 52428479
Alignment:
Q  184 aaaggtcacgggttcaagtc-ctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgg-------gaccccttccc 273  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||        |||||||| |    
T  52428613 aaaggtcacgggtttaagtctctggaagcagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatagtggaaccccaaaccccttctc 52428514  T
Q  274 ggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 308  Q
    ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||    
T  52428513 ggaccctacgtatgtgggagctttagtgcaccggg 52428479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 234
Target Start/End: Original strand, 53062036 - 53062112
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 234  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||    
T  53062036 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtcaaaaacagggta 53062112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 208 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 50625064 - 50624953
Alignment:
Q  208 aaacagcctcttgtgta--aaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 305  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| |||||| || |||||| || | ||||||| |||||||||    
T  50625064 aaacagcctcttgtgtataaaaaagggtaaggtagcgtacaatacaccatttggtgggacgccttcctgggccctgcgtaagtgggagctttagtgcacc 50624965  T
Q  306 gggttgcccttt 317  Q
    ||| ||||||||    
T  50624964 gggctgcccttt 50624953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 829601 - 829452
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa- 256  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||  | || |||||||| ||  ||||| |||||||| ||||  |||  |||| | ||||||||||||||||||     
T  829601 ggtaaagttgttgtcacgtgattgaaagacc-cgagttcaagttctagaaacaacctcttgtctaaagaacatagtaaagttgcgtacaatacaccaaaa 829503  T
Q  257 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 307  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  829502 tggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgg 829452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 270
Target Start/End: Original strand, 29106555 - 29106659
Alignment:
Q  168 tgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggac 265  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||  |||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||     
T  29106555 tgttgtcatgtggctcaaagatcacgggtacaagtcttgaaaacaacctcttgtgtaaaaaataggataaggttacgtacaatacaccaaattgtgggat 29106654  T
Q  266 ccctt 270  Q
    |||||    
T  29106655 ccctt 29106659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 10484671 - 10484611
Alignment:
Q  262 ggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaatgt 322  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10484671 ggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttatgt 10484611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 314
Target Start/End: Original strand, 35417902 - 35418058
Alignment:
Q  147 ccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgta 244  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||| | ||       
T  35417902 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttatcatgtgactgagaggtcacgagttcaaatcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaggg-aagaccgc--- 35417996  T
Q  245 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 314  Q
            ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||| |||| |||||    
T  35417997 --------caaatggtgggaccccttcccggaccccgcaaatgcgagagctttagtgcatcgggctgccc 35418058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 257
Target Start/End: Original strand, 21874999 - 21875111
Alignment:
Q  141 gggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaagg 237  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||       | |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||   |||| |||||||||    
T  21874999 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgac-------tgacgggttcaaattctggaaacaacctcttgtgttaaaaaagagggtaagg 21875091  T
Q  238 ctgcgtacaatacaccaaat 257  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  21875092 ctgcgtacaatacactaaat 21875111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31904975 - 31904857
Alignment:
Q  201 gtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtggga-ccccttcccggaccctgcatatgcgggagctct 297  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | | | | |||||||||| |    
T  31904975 gtcctggaaacagcctattatgtaaaaaacagggtatgactgcgtacaatacaccaaatggtgggacccccttcccagatcttacgtgtgcgggagcttt 31904876  T
Q  298 agtgcaccgggttgccctt 316  Q
    |||||||| || |||||||    
T  31904875 agtgcaccaggctgccctt 31904857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 6242331 - 6242285
Alignment:
Q  271 cccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6242331 cccggaccctgcatatgcaggagctctagtgcaccgggttgcccttt 6242285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 251
Target Start/End: Original strand, 39211992 - 39212081
Alignment:
Q  164 aagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaa--aacagggtaaggctgcgtacaataca 251  Q
    ||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||    
T  39211992 aagttgtcgttatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctggaaataacctcttgtgtaaataacaaggtaagactgcgtacaataca 39212081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 258
Target Start/End: Original strand, 26782345 - 26782464
Alignment:
Q  141 gggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggc 238  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||| || | ||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||  |||| ||||||| ||    
T  26782345 gggtaaccttgacgcaattggtaaagttattgtcatgcgattgaaaggtcacggattcaagtccttgaaacaatctcttgtgtaaaaaatagggtaatgc 26782444  T
Q  239 tgcgtacaatacaccaaatg 258  Q
    ||  || |||||||||||||    
T  26782445 tgtataaaatacaccaaatg 26782464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 317
Target Start/End: Original strand, 47624208 - 47624256
Alignment:
Q  269 ttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47624208 ttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 47624256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 46170038 - 46169989
Alignment:
Q  246 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46170038 aataaaccaaatggtaggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagct 46169989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 276 - 317
Target Start/End: Original strand, 40390357 - 40390398
Alignment:
Q  276 accctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40390357 accctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 40390398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Original strand, 9276249 - 9276289
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatg 177  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9276249 tgaggggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgtcatg 9276289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 257 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14266431 - 14266372
Alignment:
Q  257 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14266431 tggtgggaccc-ttcctgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcactgggttgcccttt 14266372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 43956640 - 43956510
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 235  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||| ||| |||  ||||||| || ||| |||||||||| |||||  |||| |    ||    
T  43956640 gagggggaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgttacttgactgaaaagtccggggttcatgttctggaaacagcctcatgtgtaaaaaaaaacacaa 43956542  T
Q  236 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccc 267  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  43956541 ggctacgcacaatacaccaaatggtgggaccc 43956510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 317
Target Start/End: Original strand, 40968612 - 40968675
Alignment:
Q  254 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||| || | ||||||||    
T  40968612 aaatggtgagaccccttcctagaccctacatatgcgggagctttagtgcatcgagctgcccttt 40968675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21330339 - 21330273
Alignment:
Q  224 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgg 290  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||| ||||  |||| |||||||||||    
T  21330339 aaaatagggtaaggccgcatacaatacaccaaattgcgggaccctttcctagaccatgcatatgcgg 21330273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 1121382 - 1121286
Alignment:
Q  162 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaa--aacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 256  Q
    |||| ||||||||  ||| || |||||||||| ||| |||||||| ||||| | ||||||||||  || | ||| || |||||||||||||||||||    
T  1121382 taaatttgttgtccggtggctgaaaggtcacgtgtttaagtcctggaaacaacttcttgtgtaagaaataaggtgagactgcgtacaatacaccaaa 1121286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 178
Target Start/End: Original strand, 23871418 - 23871455
Alignment:
Q  141 gggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgt 178  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23871418 gggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgtcatgt 23871455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 186
Target Start/End: Original strand, 39430465 - 39430513
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaa 186  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  39430465 gaggggtaactttgacgcaactggtaaagttgctgtcatctgactaaaa 39430513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 188
Target Start/End: Original strand, 55400996 - 55401024
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagg 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55400996 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagg 55401024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 105)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 136 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 34725279 - 34725098
Alignment:
Q  136 ctgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaa 235  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34725279 ctgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaa 34725180  T
Q  236 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34725179 ggctgcgtacaatacactaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 34725098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 38478461 - 38478282
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 237  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38478461 gaggggtaaccttggcgcaactagtaaacttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 38478362  T
Q  238 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38478361 ctgcgtacaatacaccaaatggtggaaccccttctcggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 38478282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 138 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 45812716 - 45812541
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 237  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  45812716 gaggggtaaccttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgtaaaagagggtaagg 45812617  T
Q  238 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 313  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45812616 ctgcatacaatacaccaaatggtgggaccccttcccaaaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 45812541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 138 - 305
Target Start/End: Original strand, 47214488 - 47214655
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 237  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  47214488 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtttaaaacagggtaagg 47214587  T
Q  238 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 305  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47214588 ttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccagaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 47214655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 32632737 - 32632557
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaag 236  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32632737 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaag 32632638  T
Q  237 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||    
T  32632637 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccaaaccctgcatatgcgggagcttgagtgcaccaggtttcccttt 32632557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Original strand, 14617014 - 14617196
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa--acagggta 234  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  14617014 tgaggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaataacaaggta 14617113  T
Q  235 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14617114 aggttgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttacccttt 14617196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 142 - 317
Target Start/End: Original strand, 19414420 - 19414595
Alignment:
Q  142 ggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgc 241  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19414420 ggtaaccttggcgtaattggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaagagcctcttatgtaaaacaggttaaggctgc 19414519  T
Q  242 gtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19414520 gtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 19414595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 46248134 - 46247953
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaa 235  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  46248134 gaggggtaaccttggctcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 46248035  T
Q  236 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  46248034 gactgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgtaccgggttgcccttt 46247953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 144 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 30395903 - 30395726
Alignment:
Q  144 taaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgc 241  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30395903 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactttaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgc 30395804  T
Q  242 gtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  30395803 gtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgagttgcccttt 30395726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Original strand, 18944620 - 18944804
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 235  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18944620 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaaggcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 18944719  T
Q  236 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagc-tctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18944720 ggctgcgtacaatacaccaacaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccgggttgcccttt 18944804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Original strand, 46991781 - 46991959
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaa 235  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  46991781 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 46991880  T
Q  236 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 314  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  46991881 ggctgtgtacaatacaccgaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggttgccc 46991959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 175 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 35253329 - 35253187
Alignment:
Q  175 atgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccg 274  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35253329 atgtgactgaaagatcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccg 35253230  T
Q  275 gaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35253229 gaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggattgcccttt 35253187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 144 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12127010 - 12126837
Alignment:
Q  144 taaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgt 243  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12127010 taaccttggcgcaactcgtaaagttgttgtcatgtaattgaaaggtcacgggtttaagttctggaaacagcttcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgt 12126911  T
Q  244 acaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  12126910 acaatacaccaaattgtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctgtagtgcactgcgttgcccttt 12126837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20004273 - 20004090
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 235  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||| |||||    
T  20004273 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctctcgtgtaaaaaacaaggtaa 20004174  T
Q  236 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20004173 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 20004090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Original strand, 10668197 - 10668385
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtga-----ctaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cag 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||     
T  10668197 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaa 10668296  T
Q  231 ggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10668297 ggtaaggttgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 10668385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Original strand, 27474257 - 27474438
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaa 235  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  27474257 tgaggggtaaccttagctcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaacagggcaa 27474356  T
Q  236 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
     ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27474357 agctgcgtacaatacactgaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgcccttt 27474438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 41319988 - 41319806
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggta 234  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||    
T  41319988 tgaggggtaaccttgacacaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggta 41319889  T
Q  235 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||    
T  41319888 aggctgcgtacaatacaccaaatgatgggaccccttcccgaacccttcatatgcgggagtttcagtgcactgggttgcccttt 41319806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Original strand, 27201623 - 27201807
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 234  Q
    |||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||    
T  27201623 tgaggggtaaccttagcgtaaatggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtcagaaacagggta 27201722  T
Q  235 aggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  27201723 aggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagctttagtgcattgggttgcccttt 27201807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 141 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 23768498 - 23768325
Alignment:
Q  141 gggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggc 238  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23768498 gggtaacctcgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacaggttcaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 23768399  T
Q  239 tgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  23768398 tgcgtacaatacaccaaatggtgggacaccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcagcggattgc 23768325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 314
Target Start/End: Original strand, 45402077 - 45402251
Alignment:
Q  143 gtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggt--aagg-c 238  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||  |    
T  45402077 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtga-tggaaggtaacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggttcaagttc 45402175  T
Q  239 tgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45402176 tgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 45402251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 157 - 313
Target Start/End: Original strand, 6925096 - 6925254
Alignment:
Q  157 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaggctgcgtacaatacacca 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||     
T  6925096 actggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcggacaatacaccg 6925195  T
Q  255 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 313  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  6925196 aatggtgggaccccttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgagttgcc 6925254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 160 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18724704 - 18724567
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 257  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18724704 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaat 18724605  T
Q  258 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18724604 cttgggaccccttcccggaccctacatatgcgggagct 18724567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Original strand, 8197019 - 8197201
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 234  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||  |||||| ||||    
T  8197019 tgaggggtaaccttggtgcaactggtcaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggtaattgcctcttgtgtaaaaaacatggta 8197118  T
Q  235 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  8197119 aggctacgtacagtacaccaaatggtaggaccccttctcggaccctgcgtatgttggagctttagtgtaccgggttgcccttt 8197201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 177 - 317
Target Start/End: Original strand, 35005139 - 35005283
Alignment:
Q  177 gtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggaccccttcc 272  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  35005139 gtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcc 35005238  T
Q  273 cggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  35005239 cggaccctgcgtatgcgggcgctttagtgcaccgggttgcccttt 35005283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 138 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22930248 - 22930104
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaag 236  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22930248 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaaacagggtaag 22930149  T
Q  237 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgc 282  Q
    | || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22930148 gttgtg-acaatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgc 22930104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 143 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18742137 - 18741957
Alignment:
Q  143 gtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcct-gaaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaaggc 238  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || | | |||||| || |||| |   |||||||||||||||    
T  18742137 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttcaaatcttgggaaacagtcttttgtataaaaaaacagggtaaggc 18742038  T
Q  239 tgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18742037 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggtttcccttt 18741957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 6983969 - 6983811
Alignment:
Q  159 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatg 258  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  6983969 tggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcgtataaaaaacagggtaagtatgcgtacaatacaccaaatg 6983870  T
Q  259 gtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || || |||||| | |||||||||| ||||||||    
T  6983869 gtgggacccctttccggaccctgcgtaggcaggagctttggtgcaccgggctgcccttt 6983811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 160 - 295
Target Start/End: Original strand, 11596512 - 11596648
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatg 258  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11596512 ggtaaagtggctgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctagaaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtataatacaccaaatg 11596611  T
Q  259 gtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  11596612 gtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagct 11596648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 160 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 35117927 - 35117765
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaaggctgcgtacaatacacc--aa 255  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  35117927 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaaa 35117828  T
Q  256 atggtgggaccccttcccggaccctgcat-atgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||| | ||||||    
T  35117827 atgatgggaccccttcccggaccctgcgtaatgcaggagctttagtgcaccgggcttcccttt 35117765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 224 - 318
Target Start/End: Original strand, 4349703 - 4349797
Alignment:
Q  224 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4349703 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttta 4349797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 161 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 25468421 - 25468284
Alignment:
Q  161 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatg 258  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25468421 gtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatg 25468322  T
Q  259 gtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctc 296  Q
    || ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  25468321 gttggacctcttcccagaccctgcgtatgcgggagctc 25468284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 144 - 317
Target Start/End: Original strand, 9939443 - 9939622
Alignment:
Q  144 taaccttggcgccactggtaaa-gttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgta--aaacagggtaaggctg 240  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||| ||||||| ||    
T  9939443 taaccttggcgcaaccggtaaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtttaagaaacatggtaaggttg 9939542  T
Q  241 cgtacaatacacc--aaatggtggga-ccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  9939543 cgtgcaatacaccaaaaatggtgggacccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttacccttt 9939622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 137 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19932934 - 19932755
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggta 234  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  || | ||| ||| ||||||||||  |||||||    
T  19932934 tgaggggttaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagt--tggatacaacct-ttgtgtaaaaaacagggta 19932838  T
Q  235 aggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 315  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |  ||||||||| |||||||||    
T  19932837 aggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaagatcattagtgcaccaggttgccct 19932755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 147 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 2435958 - 2435796
Alignment:
Q  147 ccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgta 244  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||||    
T  2435958 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtgaaaaatagggtaagcctgcgta 2435860  T
Q  245 caatacacc-aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||    
T  2435859 caatacaccaaaatggtgggacccctttccgtaccctccgcatgcgggagctttagtgcaccgg 2435796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 31382330 - 31382214
Alignment:
Q  202 tcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagt 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |    
T  31382330 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaggataaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcatatgcgggagctttact 31382231  T
Q  301 gcaccgggttgcccttt 317  Q
    | |||||||||||||||    
T  31382230 gtaccgggttgcccttt 31382214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 160 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 10378884 - 10378738
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatgg 259  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||        || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10378884 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggttacgggttcaagtcctggaaag-------tgag-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatgg 10378793  T
Q  260 tgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 314  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10378792 tgggaccccttcttggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggctgccc 10378738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 161 - 305
Target Start/End: Original strand, 19701570 - 19701717
Alignment:
Q  161 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaat 257  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||  ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  19701570 gtaaagttgttgtcgtgtgactgaaatgtcacgggtttaagtcatgaaaacagcctcttgtgtaaaaaacttggtaaggatgggtacaatacaccaaaat 19701669  T
Q  258 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  19701670 ggtggggccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcacc 19701717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 135 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 44485292 - 44485119
Alignment:
Q  135 tctgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--caggg 232  Q
    ||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||||||  || ||    
T  44485292 tctgagggggagccttggcgcaacag-taaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttatagtcctggaaacaaccacttgtgtaaaagacatgg 44485194  T
Q  233 taaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||| | ||||||||||    
T  44485193 taaggctgcgtacaatacaccaaatggttggaccccttcccggatcctacgtatgcgggagct-ttgtgcaccggg 44485119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 159 - 293
Target Start/End: Original strand, 20036218 - 20036355
Alignment:
Q  159 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa---acagggtaaggctgcgtacaatacaccaa 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||   | ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  20036218 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaaactcttgtgtaaagagaaagggtaagattgcgttcaatacaccaa 20036317  T
Q  256 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggag 293  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20036318 atggtggaaccccttcccggaccctgcgtatgcaggag 20036355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 138 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4430207 - 4430080
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 235  Q
    ||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  4430207 gagggttaatcttggcgcagctggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggtttaagtcttgaaaacagtatcttgtgtaaaaaacagggtaa 4430108  T
Q  236 ggctgcgtacaatacaccaaatggtggg 263  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  4430107 gactgcgtacaatacaccaaatggtggg 4430080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 147 - 317
Target Start/End: Original strand, 50811926 - 50812098
Alignment:
Q  147 ccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcgt 243  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||| ||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  50811926 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacggaatcatgtcctggaaacagcttcttgtgtaaaaaaacagggtaaggttgcgt 50812024  T
Q  244 acaatacacc-aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||| || ||||| ||| ||||||||    
T  50812025 acaatacaccaaaatggt-ggaccccttcccgcgccctgcgtatgcgggagctttaatgcactgggctgcccttt 50812098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 148 - 320
Target Start/End: Original strand, 33222971 - 33223152
Alignment:
Q  148 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtaca 246  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  33222971 cttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggatttaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggaaaggttgcgtaca 33223070  T
Q  247 atacacc-aaatggtg-------ggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaat 320  Q
    ||||||| ||||||||       |||||||||||||||| |||| ||||  | |||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  33223071 atacaccaaaatggtgggaccccggaccccttcccggactctgcctatgtagaagctctagtgcaccagattgtcctttaat 33223152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 203 - 317
Target Start/End: Original strand, 23796507 - 23796623
Alignment:
Q  203 cctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  23796507 cctggaaacagcctcttgtgtaaaaatcaatgtaaggttgcgtacaatacaccaaatggtgagaccccttcccagaccctgcatatgctggagctttagt 23796606  T
Q  301 gcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||| ||||||||    
T  23796607 gcaccgggctgcccttt 23796623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 147 - 313
Target Start/End: Original strand, 35019217 - 35019383
Alignment:
Q  147 ccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgta 244  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||  ||||||||| ||    
T  35019217 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacagattcaagtcctgtaaacaacctcttgtataaaaatcagtataaggctgcata 35019315  T
Q  245 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 313  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  35019316 caatacaccaattggtgggacccc-tcccagaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggctgcc 35019383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 159 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15511311 - 15511150
Alignment:
Q  159 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcg--tacaatacacca 254  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||   || |||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15511311 tggtaaagttgttgtaatgtggctgaaaggtcacatattgaagtcctggaaaccgcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcggatacaatacacca 15511212  T
Q  255 aa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 315  Q
    || |||||| ||||||||| ||||||||| |||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  15511211 aaatggtggtaccccttcctggaccctgcgtatgtgtgagctttagtgcaccgggctgccct 15511150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 160 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 50760385 - 50760288
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtg--taaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa 255  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  50760385 ggtaaagtagttgtcatgtgactgagaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtataaaactgggtaaggctgcgtataatacaccaa 50760288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17470505 - 17470390
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaa 256  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17470505 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaatggtcatgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaa 17470406  T
Q  257 tggtgggaccccttcc 272  Q
    | ||||||||| ||||    
T  17470405 tagtgggacccgttcc 17470390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 224 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 1517404 - 1517311
Alignment:
Q  224 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1517404 aaaacatgataaggctgcgtacaatacaccaattggtgggaccccttctcagaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgggttgcccttt 1517311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 39215117 - 39214961
Alignment:
Q  161 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaat 257  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| |  |||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  || ||||    
T  39215117 gtaaagttattgtcacgtgactaaaaggtcccaagttcaagtactggaaacaacctcttgtgtaaaaaactgggtaaggctgcgtacaatattccaaaat 39215018  T
Q  258 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 314  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| |||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  39215017 ggtgggtccccttcccaaaccctgcgtatgtggaagctttagtgcaccgggctgccc 39214961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 184 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 45264535 - 45264411
Alignment:
Q  184 aaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccct 280  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  45264535 aaaggtcacatgttcaagtcctggaaacaacctcttgtgcaaaaaacagagtaaggctgtgtgcaatacaccaaaatggtgggaccccttctcagaccct 45264436  T
Q  281 gcatatgcgggagctctagtgcacc 305  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  45264435 gcatatgcgggagctttagtgcacc 45264411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 141 - 287
Target Start/End: Original strand, 25290143 - 25290300
Alignment:
Q  141 gggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaaca--gcctcttgtgtaaaa--cagggtaag 236  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||  |||||||||||||||  |||||||||    
T  25290143 gggtaaccttggcgcaacaggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcttggaaacacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaag 25290242  T
Q  237 gc-----tgcgtacaatacaccaaa--tggtgggaccccttcccggaccctgcatatg 287  Q
    ||     || |||||||||||||||  || | |||||||||||| ||| |||||||||    
T  25290243 gcaaggttgtgtacaatacaccaaaaatgataggaccccttcccagactctgcatatg 25290300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 224 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 42304302 - 42304207
Alignment:
Q  224 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  42304302 aaaacagggtaaggttgcgtacaatacacaaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccggattgcccttt 42304207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 225 - 317
Target Start/End: Original strand, 43768205 - 43768297
Alignment:
Q  225 aaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  43768205 aaacagggtaaggctgcctacaatacaccaattggtgggaccccttcccagaccctgcgtatacgggagctttaatgcaccgggctgcccttt 43768297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 254 - 317
Target Start/End: Original strand, 50606498 - 50606561
Alignment:
Q  254 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50606498 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 50606561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 193 - 315
Target Start/End: Original strand, 22324925 - 22325049
Alignment:
Q  193 gggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcg 289  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||  |||| |||| |||||||| ||||||    
T  22324925 gggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtggagccccgtccc-gaccctgcgtatgcg 22325023  T
Q  290 ggagctctagtgcaccgggttgccct 315  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||    
T  22325024 ggagctttagtgcaccaggctgccct 22325049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 163 - 313
Target Start/End: Original strand, 22327101 - 22327250
Alignment:
Q  163 aaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaatgg 259  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||    
T  22327101 aaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacgatgcaccaaaatgg 22327200  T
Q  260 tgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 313  Q
    ||||     |||||| || |||  |||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  22327201 tggg----gttcccgaactctgtgtatgcgggagctttggtgcaccgggctgcc 22327250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 295
Target Start/End: Original strand, 15505632 - 15505700
Alignment:
Q  227 acagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15505632 acagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagct 15505700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 308
Target Start/End: Original strand, 23371124 - 23371271
Alignment:
Q  161 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca-gggtaaggctgcgtacaatacaccaaatgg 259  Q
    ||||||||||| ||   ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||     
T  23371124 gtaaagttgttttcgcatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagccacttgggtaaaaaacgggcaaggttgtgtacaatacaccaaatgc 23371223  T
Q  260 tgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 308  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||| || |||| ||||||||||||    
T  23371224 tgggacccctt-ccagaccctgcgtatgtggtagctttagtgcaccggg 23371271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 171 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 31272522 - 31272381
Alignment:
Q  171 tgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacccct 269  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||          
T  31272522 tgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacatggtaaggctgcgtacagcacatcaaatggtggg------ 31272429  T
Q  270 tcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    | ||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||| ||||||||    
T  31272428 ttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtggactgggctgcccttt 31272381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 203 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 34149076 - 34148969
Alignment:
Q  203 cctgaaaacagcctcttgtgta--aaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagt 300  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  34149076 cctggaaacagcctcttgtgtagaaaatagggtaaggttgcgtacaaaagaccaaatggtgagaccccttcctggaccctgcatatgcaggagcgctagt 34148977  T
Q  301 gcaccggg 308  Q
    ||| ||||    
T  34148976 gcaacggg 34148969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 137 - 213
Target Start/End: Original strand, 34714599 - 34714675
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacag 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  34714599 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcatggaaacag 34714675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 19974221 - 19974074
Alignment:
Q  172 gtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaac-agggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggacccct 269  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  19974221 gtcacgtgactgaaagatcacgggttcaagtcttggaaacagcctcaagtgtaaaaatagggcaaggttgcgtacaatacaccaaaatgatgggacccat 19974122  T
Q  270 tcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||| ||   |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  19974121 tcccggactctatgtatgcgggagctttagtgcacggggctgcccttt 19974074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 27136811 - 27136661
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaa 256  Q
    |||||||||||||||| |||| |  |||| |||| |||||||| |||  |||| ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  27136811 ggtaaagttgttgtcacgtgattggaaggacacgagttcaagttctgggaacaacctcttgtgtaaaaaacatggtaaggttgcgtacaatacaccaaaa 27136712  T
Q  257 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 307  Q
    ||||||||||||||||  || | ||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  27136711 tggtgggaccccttcctagatcatgtgtatgcgggagctccagtgcaccgg 27136661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 224 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20999943 - 20999850
Alignment:
Q  224 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  20999943 aaaacaaggcaaggctgcgtacaatacaccaaatgatggggccccttccggcaccctgcgtacgcgggagctttagtgcaccgggctgcccttt 20999850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 139 - 317
Target Start/End: Original strand, 24564322 - 24564492
Alignment:
Q  139 aggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaag 236  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||| ||||| | ||||||| | | |||||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  24564322 aggggtaaccttggcgcaaccagtaaagttgatgtcttgtgattgaaaggtcgcagattcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 24564421  T
Q  237 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    | |||||||||| |||||||||||       |||   ||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  24564422 ggtgcgtacaattcaccaaatggt-------ctt---ggaccctgcctatgcaggagcgttagtgcaccgggttgcccttt 24564492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 205
Target Start/End: Original strand, 40424721 - 40424786
Alignment:
Q  140 ggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcct 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40424721 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggccacgggttcaagtcct 40424786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 295
Target Start/End: Original strand, 30682845 - 30682948
Alignment:
Q  192 cgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgg 290  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  30682845 cgggttcaaatcctgaaaatagcctcttgtgtaaaaacaaggtaagattgtgtaca-tacaacaaatggtgggaccccttcccggaccgtgcgtatgcgg 30682943  T
Q  291 gagct 295  Q
    |||||    
T  30682944 gagct 30682948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 19656263 - 19656105
Alignment:
Q  162 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaatg 258  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||  | ||||| | || ||||||||||||||||  |||||| ||||| |||  |||||||||||| |||||    
T  19656263 taaagttgttgtcgcgtgactcaaaggtcactagctcaaggcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaacgctatgtacaatacaccaaaatg 19656164  T
Q  259 gtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    || |||||| |||  |||||||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||||||    
T  19656163 gtaggaccctttcttggaccctgcatatgcaagagctttaatgcaccgggctgcccttt 19656105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 224 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31442483 - 31442396
Alignment:
Q  224 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggtt 310  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||| | ||||||||||||    
T  31442483 aaaacagggtaaggatgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccggacactgtgtatgtgggagctttggtgcaccgggtt 31442396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 4587630 - 4587568
Alignment:
Q  250 caccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4587630 caccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcctatgcgggagcttcagtgcaccgggttgc 4587568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18335465 - 18335333
Alignment:
Q  142 ggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggct 239  Q
    |||||||||||||| | || ||||||| |||||||||| || |||||||||  ||| |||||||| |||||| ||||||| |||||   ||||||| | |    
T  18335465 ggtaaccttggcgcaagtgataaagtttttgtcatgtgtctgaaaggtcacaagttaaagtcctggaaacagtctcttgtttaaaaattagggtaaagtt 18335366  T
Q  240 gcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcc 272  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  18335365 gcgtacaatacatcaaatgatgggaccctttcc 18335333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 201 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 20169207 - 20169111
Alignment:
Q  201 gtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacag--ggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |   |||||| ||| ||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20169207 gtcctgaaaacaccctcttgtgtaaaaaaaaaggtaagactgtgtacaataccccaatcggtgggactccttcccggaccctgcatatgcgggagct 20169111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2436052 - 2435985
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa 227  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  2436052 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcctgtgtaaaa 2435985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 160 - 314
Target Start/End: Original strand, 52910216 - 52910379
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa- 255  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || || ||||||||||||  ||   ||||||||||| | ||| |||||||||||| |     
T  52910216 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaactcttggaaacagcctcttaggtaaaaaaacagggtaggactgtgtacaatacacctaa 52910315  T
Q  256 -----atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 314  Q
         ||||||||||||||||| ||| ||| | |||| |||| || ||||||||| || |||||    
T  52910316 tggttatggtgggaccccttcctggaacctccgtatgtgggaactttagtgcaccaggctgccc 52910379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14988081 - 14987989
Alignment:
Q  157 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaaggctgcgtacaa 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||||||||||||||||  |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  14988081 actggtaaagttgttgtcatatgactagaaagtcacaagttcaagtcctgaaaacagtatcttatgtaaaatacaggataaggctgcgtacaa 14987989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 224 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21910742 - 21910686
Alignment:
Q  224 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccct 280  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21910742 aaaatagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgaaccct 21910686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 25554882 - 25554800
Alignment:
Q  159 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgta-aaacagggtaaggctg 240  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  25554882 tggtaaagttgttgtcacgtgactaaaaggccacgtgtttaagtcctggaaacaacctcttgtgtagaaacacggtagggctg 25554800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 227
Target Start/End: Original strand, 10163736 - 10163825
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa 227  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| || ||  ||| |||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  10163736 gaggggtaacattggcgcaactgataaagttgttgtcatgtggctaaaatgttacaagtttaagttctgaaaacaacctcttatgtaaaa 10163825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18336026 - 18335914
Alignment:
Q  139 aggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaa--aacagggtaag 236  Q
    |||||||| |||||||| | || ||||||||||| |||||| || |||||||||  |||||||| ||||||| |  || |||| |||  |||||||||||    
T  18336026 aggggtaatcttggcgcaagtgataaagttgttgccatgtgtctgaaaggtcacatgttcaagttctgaaaataatctattgtttaaagaacagggtaag 18335927  T
Q  237 gctgcgtacaata 249  Q
    |||||||||||||    
T  18335926 gctgcgtacaata 18335914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 34679378 - 34679217
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||  ||||  |||| | ||||  ||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  34679378 ggtaaagttattgtcatgtgactgaaatatcacatgttccattcctagaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtactatacatcaaat 34679279  T
Q  258 ggtgggaccccttcccggac----cctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 315  Q
    |||||  |||| | || |||    ||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  34679278 ggtggagccccgttccagacccggcctgcgtatgcgggagctttagtacaccgggctgccct 34679217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 287
Target Start/End: Original strand, 21723731 - 21723811
Alignment:
Q  208 aaacagcctcttgtgtaaaac-agggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatg 287  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||| ||||    
T  21723731 aaacagcctcttgtataaaaatagggtaaggctgagtacaatacaccaaatggtagaaccttttcccggaccctgcgtatg 21723811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 317
Target Start/End: Original strand, 30555210 - 30555273
Alignment:
Q  254 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| || |||||    
T  30555210 aaatggtgggaccccttcacggaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggctgaccttt 30555273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 236 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 4430080 - 4430014
Alignment:
Q  236 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgc 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||  |||||||||||| ||||||    
T  4430080 ggctgcgtacaatacaccaaatggtggaacccctttctggatcctgtgtatgcgggagctttagtgc 4430014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 228 - 301
Target Start/End: Original strand, 6358190 - 6358264
Alignment:
Q  228 cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtg 301  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| || |||||    
T  6358190 cagggtaaagctgcgtacaaaacaccaaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcaggatctttagtg 6358264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 267 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 19386626 - 19386576
Alignment:
Q  267 ccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  19386626 ccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgaaccaggttgctcttt 19386576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20982843 - 20982773
Alignment:
Q  224 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagc 294  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||    
T  20982843 aaaatagggtaaggctgccaacaatacacctaatggtgggatctcttctcggaccctgcgtatgcgggagc 20982773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 225
Target Start/End: Original strand, 21723642 - 21723727
Alignment:
Q  139 aggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaa 225  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21723642 aggggtaaccttcgcacaactggtaaagttgttgtcatgtgactggatggttacaagttc-agtcctggaaacagcctcttgtgtaa 21723727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 4249520 - 4249455
Alignment:
Q  240 gcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||||| || ||||||    
T  4249520 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagctttaatgcacc 4249455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 4249844 - 4249779
Alignment:
Q  240 gcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||||| || ||||||    
T  4249844 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagctttaatgcacc 4249779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 4250168 - 4250103
Alignment:
Q  240 gcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||||| || ||||||    
T  4250168 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagctttaatgcacc 4250103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 28894642 - 28894561
Alignment:
Q  233 taaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 314  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||   |||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||    
T  28894642 taaggttgcgtacaatacatcaaatggtaaaaccccttcctagaccctgcatatgcgagagctttagtgcaccaggctgccc 28894561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 33594196 - 33594131
Alignment:
Q  252 ccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||| | ||||||    
T  33594196 ccaattggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcactgggctacccttt 33594131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 305
Target Start/End: Original strand, 7074588 - 7074663
Alignment:
Q  231 ggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 305  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  7074588 ggtatggctgcgtacaatacaccaaaattgtgggacctctttctagaccctgcatatccgggagctttagtgcacc 7074663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 317
Target Start/End: Original strand, 16120819 - 16120874
Alignment:
Q  262 ggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||    
T  16120819 ggaccccttcccggcccctgcatatgcgggagctttaatgcaccaggctgcccttt 16120874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 303
Target Start/End: Original strand, 43207476 - 43207640
Alignment:
Q  147 ccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaagg------tcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggc 238  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||| || ||      |||| |||| ||||| || ||||| |||||| |||  ||||||||||||| |    
T  43207476 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaatggacacactcacaggtttaagtcttggaaacaacctcttatgtgaaaaacagggtaagac 43207574  T
Q  239 tgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgca 303  Q
     || |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||   |||||| ||||| |||||||    
T  43207575 ggcatacaatacaccaaattggtgggacctcttcccagaccctatgtatgcgagagctttagtgca 43207640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 44745900 - 44745854
Alignment:
Q  202 tcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaat 248  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  44745900 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaacaaggtaaagctgcgtacaat 44745854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 225
Target Start/End: Original strand, 22151495 - 22151568
Alignment:
Q  152 gcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaa 225  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||  |||||||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  22151495 gcgcaactgataaagttgttgtcatctgactgtaaggtcataggttcaagttctggaaacagcctcttatgtaa 22151568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 315
Target Start/End: Original strand, 42432228 - 42432267
Alignment:
Q  276 accctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 315  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  42432228 accctgcatatgctggagctctagtgcaccggattgccct 42432267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 43921866 - 43921804
Alignment:
Q  243 tacaatacaccaaatggtgggacccc--ttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgca 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  43921866 tacaatacaccaaatggtaggacccctattctcggaccctgcacatgcgagagctttagtgca 43921804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 317
Target Start/End: Original strand, 5549582 - 5549677
Alignment:
Q  224 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc---aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||   ||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||| |||||| |||| || | |||||||||||    
T  5549582 aaaacagggtaaagctgcgcacaatacaccaaaaaatgatgggacccctttctggactctgcctatgcaggagctttagtaca-caggttgcccttt 5549677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25554796 - 25554742
Alignment:
Q  263 gaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  25554796 gaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcattagtgcaccggactgcccttt 25554742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 265
Target Start/End: Original strand, 46859131 - 46859173
Alignment:
Q  224 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaatggtgggac 265  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46859131 aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaatggtgggac 46859173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 49722726 - 49722641
Alignment:
Q  165 agttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaa-aacagggtaaggctgcgtacaata 249  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||  || || ||||||||  |||||||||||    
T  49722726 agttgttgtcacgtgaatgaaaggtcacgggtttaagtcatgtaaacaacctcttgtaaaataatagggtaagattgcgtacaata 49722641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 270
Target Start/End: Original strand, 10158266 - 10158310
Alignment:
Q  226 aacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacccctt 270  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10158266 aacagagtaatgctacgtacaatacaccaaatggtggcacccctt 10158310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 202
Target Start/End: Original strand, 21006125 - 21006185
Alignment:
Q  142 ggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagt 202  Q
    |||||||||| ||| || |||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||    
T  21006125 ggtaaccttgacgcaaccggtaaaattgttgtcatgcgactgaaaggtcaaaggttcaagt 21006185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 66)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12670429 - 12670250
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 237  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12670429 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 12670330  T
Q  238 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12670329 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttacccttt 12670250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 30454277 - 30454097
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30454277 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacaaggtaag 30454178  T
Q  237 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30454177 gctgcgtacgatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 30454097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 137 - 322
Target Start/End: Original strand, 13160655 - 13160841
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaa 235  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13160655 tgaggggtaacctcggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaa 13160754  T
Q  236 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaatgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  13160755 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcgccgggttgccctttaatgt 13160841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 28817808 - 28817626
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggta 234  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  28817808 tgaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 28817709  T
Q  235 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  28817708 aggctgcgtacaatacacccaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcccttt 28817626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Original strand, 36720749 - 36720931
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggta 234  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  36720749 tgaggggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 36720848  T
Q  235 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  36720849 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggaagctttagtgcacccggttgcccttt 36720931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 138 - 322
Target Start/End: Original strand, 44530103 - 44530289
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaa 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  44530103 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgctgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 44530202  T
Q  236 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaatgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  44530203 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgaccttttatgt 44530289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Original strand, 35261633 - 35261814
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaa 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  35261633 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagccctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 35261732  T
Q  236 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35261733 ggttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 35261814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 39461178 - 39460994
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 234  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  39461178 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgagactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagagta 39461079  T
Q  235 aggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39461078 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgagaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 39460994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 138 - 316
Target Start/End: Original strand, 45071219 - 45071398
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaag 236  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45071219 gaggggtaaccttggcgatactggtaaagttgttgtcatgtgattgtaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaag 45071318  T
Q  237 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  45071319 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgccctt 45071398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 7136710 - 7136527
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaa 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  7136710 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaccagggtaa 7136611  T
Q  236 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7136610 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttacccttt 7136527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 137 - 318
Target Start/End: Original strand, 17823529 - 17823712
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggta 234  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  17823529 tgaggggtaatcttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaccaggata 17823628  T
Q  235 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17823629 agactgcgtaaaatacaccaaatggtggaaccccttcccgaaccctgcatatgcaggagctttagtgcaccgggttgcccttta 17823712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Original strand, 6760776 - 6760959
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 234  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6760776 tgaggggtaac-ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 6760874  T
Q  235 aggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6760875 aggcttcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttctcggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 6760959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 138 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20869677 - 20869523
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 237  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20869677 gagggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 20869578  T
Q  238 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagc 294  Q
    ||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20869577 ctgtgtacaatacaccaa--ggtgagaccccttcccggaccctgcatatgcgggagc 20869523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 29521866 - 29521685
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaa 235  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  29521866 gaggggtaaccttggcgcaactgataaagttgttgtcgtgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtttaaaaaacagggtaa 29521767  T
Q  236 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  29521766 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaacccatcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgctcttt 29521685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Original strand, 2626472 - 2626657
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-----aaaacagg 231  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     ||||||||    
T  2626472 tgaggggtaaccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaaaacagg 2626571  T
Q  232 gtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||    
T  2626572 gtaagactgcgtacaatacaccaaatgatgggaccccttcccagaccctgcatatgcgggagcttcagtgcaccagattgcccttt 2626657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 137 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18164941 - 18164764
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaa 235  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18164941 tgaggggtaatcttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaa 18164842  T
Q  236 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 313  Q
    || |||||||||||||||||| | || ||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18164841 ggttgcgtacaatacaccaaaggatgtgaccatttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 18164764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Original strand, 26954086 - 26954270
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt---aaaacagggta 234  Q
    |||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||    
T  26954086 gaggggtaactttggcgtaattggtaaagttgttgtcatgtgattagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggta 26954185  T
Q  235 aggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  26954186 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacctcgcatatgcgggagctttagtgcactgggttgcccttt 26954270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 142 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20284250 - 20284075
Alignment:
Q  142 ggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt----aaaacagggtaagg 237  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    |||| |||||||||    
T  20284250 ggtaaccttgacgcaacgggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaaaaaagggtaagg 20284151  T
Q  238 ctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttg 311  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  20284150 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagttttagtgcaccgggttg 20284075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 143 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 8897940 - 8897764
Alignment:
Q  143 gtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaggctg 240  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||     
T  8897940 gtaaccctggcacaactggtaaagttgttgtcatgtgacagcaaggtcacgggttgaagtcctggaaacaaccgcttgtgtaaaaaatagggtaaggcta 8897841  T
Q  241 cgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  8897840 cgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttactgcacccggttgcccttt 8897764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 142 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21070879 - 21070703
Alignment:
Q  142 ggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca-----gggtaag 236  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |     |||||||    
T  21070879 ggtaaccttgacgcaacgggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaaaaaaagggtaag 21070780  T
Q  237 gctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttg 311  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  21070779 gctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagttttagtgcaccgggttg 21070703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Original strand, 25250475 - 25250659
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 234  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||    
T  25250475 tgagaggtaaccttggcacaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacatgttcaagtcctggaaacagcctattgtgtaaaaaatagggta 25250574  T
Q  235 aggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  25250575 tggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccccgcatatgcgggagatttagtgcaccgggttgcccttt 25250659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 157 - 317
Target Start/End: Original strand, 12625862 - 12626025
Alignment:
Q  157 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcgtacaatacacc 253  Q
    |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||    
T  12625862 actggtaaagttgttgtcgtgtgacttgtaggtcacgggctcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaagactgcatacaatacacc 12625961  T
Q  254 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12625962 aaatggtgggaccccctcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 12626025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 161 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 24365218 - 24365081
Alignment:
Q  161 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24365218 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaatgtcacgggttcaagccctagaaacagcctcttgtgtaaaaaatcagggtaaggctgcgaacaatacaccaaat 24365119  T
Q  258 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24365118 ggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagct 24365081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 317
Target Start/End: Original strand, 31457155 - 31457307
Alignment:
Q  166 gttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaac-agggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtggga 264  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  31457155 gttgttgtcatgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcctgtaaacaacctcttgtgtaaaaataggaaaaggctgcgtacaatacatcaaatggtagga 31457254  T
Q  265 ccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31457255 ccccttcccaaaccctgcgtatgcgggagctctagtgcaccggattgcccttt 31457307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 147 - 317
Target Start/End: Original strand, 28407379 - 28407538
Alignment:
Q  147 ccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtac 245  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||            
T  28407379 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaagg-------- 28407470  T
Q  246 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  28407471 ----caccaaatggtgggaccccttcccggaccctacgtatgcgggagctttactgcaccgggttgcccttt 28407538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 208 - 317
Target Start/End: Original strand, 19729366 - 19729475
Alignment:
Q  208 aaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 307  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  19729366 aaacagtctcttatgtaaaacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatacgggagctctagtgcactgg 19729465  T
Q  308 gttgcccttt 317  Q
     |||||||||    
T  19729466 attgcccttt 19729475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 147 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 44781677 - 44781517
Alignment:
Q  147 ccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaaggctgcgta 244  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  44781677 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaagttcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaaggctgtgta 44781579  T
Q  245 caatacacc--aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcac 304  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  44781578 caatacaccaaaaatgttgggaccccgtcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcac 44781517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 190 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 5135418 - 5135290
Alignment:
Q  190 cacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacag--ggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatg 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5135418 cacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaagagggtaaggctgtgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatg 5135319  T
Q  288 cgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    | |||||| | |||||||||| ||||||||    
T  5135318 caggagct-ttgtgcaccgggctgcccttt 5135290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 138 - 295
Target Start/End: Original strand, 24245405 - 24245562
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 237  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||  |||||||||||     
T  24245405 gaggggtaaccttggggcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaac-gtctcttatgt--aacagggtaaga 24245501  T
Q  238 ctgcgtacaatacacc---aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
    || |||||||| ||||   |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24245502 ctacgtacaatgcaccaaaaaattgtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagct 24245562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 20869941 - 20870060
Alignment:
Q  202 tcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctct 297  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |    
T  20869941 tcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttccaggaccccgcatatgcgggagcttt 20870040  T
Q  298 agtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20870041 agtgcaccgggttgcccttt 20870060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 201 - 315
Target Start/End: Original strand, 29877111 - 29877227
Alignment:
Q  201 gtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctcta 298  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  29877111 gtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcgtta 29877210  T
Q  299 gtgcaccgggttgccct 315  Q
    ||||||| || ||||||    
T  29877211 gtgcaccaggctgccct 29877227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 147 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 8484109 - 8483947
Alignment:
Q  147 ccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgta 244  Q
    ||||||||| || |||||||  |||| || |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  8484109 ccttggcgcaac-ggtaaagcggttgccacgtgacttaaatgtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggcaaggctgcgta 8484011  T
Q  245 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 308  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  8484010 caatacaccaattggtgggaccccatcccagaccctgcgtatgcgggagctttagggcaccggg 8483947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 160 - 305
Target Start/End: Original strand, 22598133 - 22598279
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 257  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  22598133 ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacgggttcaaatcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctatgtacaatacaccaatt 22598232  T
Q  258 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 305  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||    
T  22598233 ggtgagaccctttcccggaccttgcgtatgcggga-ctttagtgcacc 22598279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 184 - 307
Target Start/End: Original strand, 389643 - 389770
Alignment:
Q  184 aaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt----aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  389643 aaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaccctcttgtgtcaaaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatgatgggatccctttcctgaccc 389742  T
Q  280 tgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 307  Q
    ||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  389743 tgcgtatgcgagagctttagtgcaccgg 389770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 193 - 312
Target Start/End: Original strand, 5689640 - 5689761
Alignment:
Q  193 gggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgg 290  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||    
T  5689640 gggttcaagtcttgtaaatagcctcttgtgtaaaaagcagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtggaaccccttcccgaaccatgcgtatgtgg 5689739  T
Q  291 gagctctagtgcaccgggttgc 312  Q
    ||||| ||||||||||| ||||    
T  5689740 gagctttagtgcaccggtttgc 5689761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 23000365 - 23000227
Alignment:
Q  170 ttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacccc 268  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  23000365 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggt--aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacacggtaaggttccatacaatacaccaaatggtgggacccc 23000268  T
Q  269 ttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    |||||||         ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23000267 ttcccgg---------atgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttta 23000227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 243 - 317
Target Start/End: Original strand, 26102578 - 26102652
Alignment:
Q  243 tacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26102578 tacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcttatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 26102652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 147 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 42083870 - 42083699
Alignment:
Q  147 ccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaggctgcgta 244  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||    
T  42083870 ccttggcgcaac-ggtaaaattgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaatggggcaaggctgcgta 42083772  T
Q  245 caatacacc-aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 316  Q
    || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||||||| |||||||  ||| |||||||    
T  42083771 cagtataccaaaatggtgggaccccttcccgaaccctgtgtacgtgggagctttagtgcattgggctgccctt 42083699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 208 - 317
Target Start/End: Original strand, 10857852 - 10857964
Alignment:
Q  208 aaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcac 304  Q
    |||| |||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  10857852 aaaccgcctcttgtgtaaaaaaacagggtaaggctgcgcacaatacaccaattggtgggaccacttcctggaccttgcgtatgcgggagctttagtgcac 10857951  T
Q  305 cgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||    
T  10857952 cgggttgcccttt 10857964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 210 - 318
Target Start/End: Original strand, 16225045 - 16225157
Alignment:
Q  210 acagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 305  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16225045 acagcctcttatgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaataatggtgggatcccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 16225144  T
Q  306 gggttgcccttta 318  Q
    |||||| ||||||    
T  16225145 gggttgtccttta 16225157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 163 - 280
Target Start/End: Original strand, 35105902 - 35106022
Alignment:
Q  163 aaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaaggctgcgtacaatacacca-aatgg 259  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35105902 aaagttgttgtcacgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaagagagtgtaaggctgcgtacaatacaccagaatgg 35106001  T
Q  260 tgggaccccttcccggaccct 280  Q
    ||||||| ||||| |||||||    
T  35106002 tgggacctcttcctggaccct 35106022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 288
Target Start/End: Original strand, 11748254 - 11748407
Alignment:
Q  139 aggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaag 236  Q
    ||||||||| |||| || |||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  11748254 aggggtaactttggtgcaactggtgaaattgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttttgtaaaaagcagggtaag 11748353  T
Q  237 gctgcgtaca--atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgc 288  Q
     | |||||||  |||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  11748354 acagcgtacaatatacaaaaaatggtaggaccccttcccgaatcctgcatatgc 11748407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 160 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11001109 - 11000971
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 256  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||  |||||||||   || | |||||||| |||||||||||||||    
T  11001109 ggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcgcgggttcaaattctgaaaacaacctactgtgtaaaaaaacaagataaggctgtgtacaatacaccaaa 11001010  T
Q  257 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||    
T  11001009 tggtgggacccctacccgaaccctgtttatgcaggagct 11000971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 14018140 - 14017990
Alignment:
Q  147 ccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgta 244  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||  |||||||||| || |||||||    
T  14018140 ccttggcgcaac-ggtaatgttgttgtcacgtgattgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtgagactgcgta 14018042  T
Q  245 caatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  14018041 caatacactaaattggtgggaccacttcctggaccctgcagatgcggtagct 14017990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 210 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 23286432 - 23286336
Alignment:
Q  210 acagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23286432 acagcctcttgtgtaaaacagggtaaagctgcgtacaatacaccaaatggtggg------------accctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggc 23286345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 44742698 - 44742521
Alignment:
Q  139 aggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaag 236  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||||||||||  |||| |  ||||||| | |||||||| ||| |||||  ||| |||||||||  |||||||||    
T  44742698 agggggaaccttggtgcaac-ggtaaagttgttgtcgcgtgattgtaaggtcatgagttcaagttctggaaacaatctcctgtgtaaaaaacagggtaag 44742600  T
Q  237 gctgcgtacaatacacc-aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 314  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |  ||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  44742599 gctgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcttggaccctacggatgcgggagcattagtgcaccggggtgccc 44742521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17251001 - 17250879
Alignment:
Q  195 gttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgg 290  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||| ||||  |    
T  17251001 gttcaagtcctggaagcagcctcttgtgtaaaaaacaggttaaggcagcgtacaatacaccaataatggtgggaccctttcccgaaccctgcgtatgaag 17250902  T
Q  291 gagctctagtgcaccgggttgccc 314  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||    
T  17250901 gagctttagtgca-cgggttgccc 17250879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 40605087 - 40604906
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggta 234  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | | | | ||||||||||| || |||||  || |||||||||| |  || ||    
T  40605087 tgaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattggatgattatgggttcaagtcatggaaacaatcttttgtgtaaaaaattggata 40604988  T
Q  235 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| | ||| |||||||   ||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  40604987 aggttgcgtacaatacactaaatgat-ggatcccttccgaaaccctacgtatgcgggagctttagtgcaccgaattgcccttt 40604906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Original strand, 26457776 - 26457855
Alignment:
Q  229 agggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggtt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  26457776 agggtaaggctgcgtacaatacaccaattggtgggacccct--cctgaccttgcgtatgagggagctttagtgcaccgggtt 26457855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 239 - 317
Target Start/End: Original strand, 16013511 - 16013591
Alignment:
Q  239 tgcgtacaatacaccaaa--tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16013511 tgcgtacaatacactaaaaatggtgcgaccccttcccagaccctgcctatgcgggagctttagtgcaccgggttgtccttt 16013591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 30962929 - 30962865
Alignment:
Q  163 aaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa 227  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30962929 aaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgacttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa 30962865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 273
Target Start/End: Original strand, 43942347 - 43942417
Alignment:
Q  207 aaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccccttccc 273  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  43942347 aaaacagcctcttatgtcaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttccc 43942417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 257 - 316
Target Start/End: Original strand, 27507985 - 27508044
Alignment:
Q  257 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  27507985 tggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgtcctt 27508044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 254 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 35107374 - 35107311
Alignment:
Q  254 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  35107374 aaatggtgggaccccttcccggacgctgtgtatgcggaagctttagtgcaccgggttgcccttt 35107311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 27468141 - 27468092
Alignment:
Q  268 cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27468141 cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 27468092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 318
Target Start/End: Original strand, 33866957 - 33867088
Alignment:
Q  192 cgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggaccccttcccggaccctgcatat 286  Q
    |||||||||||||| |||||| | | ||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||  |||  |||||  ||  ||||||| ||||||| |||    
T  33866957 cgggttcaagtcctaaaaacaactttttgtgtaaaaaagcagggtaagactgcatacaatacataaaaaatggtgacacttcttcccgaaccctgcgtat 33867056  T
Q  287 gcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    || | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  33867057 gcagaagctttagtgcaccgggttgcccttta 33867088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 23286475 - 23286431
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgac 181  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23286475 tgaggggtaaccttgtcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgac 23286431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 36486627 - 36486567
Alignment:
Q  256 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 316  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  36486627 atggtgggacctcttcccggaccttgcgtatgcaggagctttagtgccccgggttgccctt 36486567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 30231420 - 30231344
Alignment:
Q  228 cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgca 303  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||| ||||| |||| | ||||||| |||||||    
T  30231420 caggataaggctgcgtacaatataccaaaatggtgggacccttacccgaaccctccatacgtgggagctttagtgca 30231344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 212
Target Start/End: Original strand, 31454144 - 31454216
Alignment:
Q  140 ggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaaca 212  Q
    ||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  31454144 ggggtaatcttggcgcaaccggtatagttgttgtcatgtggttgaaaggtcacatgttcatgtcctgaaaaca 31454216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 313
Target Start/End: Original strand, 18595918 - 18595969
Alignment:
Q  262 ggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 313  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  18595918 ggaccccttcccggaccctgtgtatgcgggagttttagtgcatcgggttgcc 18595969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 257
Target Start/End: Original strand, 36918102 - 36918199
Alignment:
Q  162 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 257  Q
    |||| ||||||| |||  ||| |||||||||  |||||||| ||| |||||   |||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36918102 taaaattgttgttatggaactgaaaggtcacatgttcaagttctggaaacaatttcttatgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaat 36918199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30962815 - 30962770
Alignment:
Q  273 cggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  30962815 cggaccctgcgtatgcgggagatttagtgaaccgggttgcccttta 30962770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 175
Target Start/End: Original strand, 42840863 - 42840900
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtca 175  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  42840863 gaggggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgtca 42840900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 288
Target Start/End: Original strand, 12483584 - 12483616
Alignment:
Q  256 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgc 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12483584 atggtgggaccccttcccggaccctacatatgc 12483616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 261 - 317
Target Start/End: Original strand, 40444845 - 40444901
Alignment:
Q  261 gggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||  |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  40444845 gggaccccttgccggaccctgcgtatgttggagctttagtgcaccgagctgcccttt 40444901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 85)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21172188 - 21172009
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 237  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21172188 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 21172089  T
Q  238 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21172088 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 21172009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Original strand, 32758214 - 32758394
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32758214 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 32758313  T
Q  237 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32758314 gctgtgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 32758394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 137 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 48735303 - 48735121
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcct-gaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaa 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  48735303 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccttggaaacaacctcttgtgtaaaacacggtaa 48735204  T
Q  236 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48735203 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 48735121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 145 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 10693245 - 10693071
Alignment:
Q  145 aaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgta 244  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10693245 aaccttggcgcaactagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaagagggtaaggctgcgta 10693146  T
Q  245 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaa 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10693145 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcactgggttgccctttaa 10693071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 166 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 42391251 - 42391100
Alignment:
Q  166 gttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggac 265  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42391251 gttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcttcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggac 42391152  T
Q  266 cccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42391151 cccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 42391100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 137 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 2541202 - 2541017
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgacta-aaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggt 233  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  2541202 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggt 2541103  T
Q  234 aaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaa 319  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  2541102 aaggctgcgtactatacaccaaatggtgggaccccttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggtttccctttaa 2541017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Original strand, 42798623 - 42798804
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaa 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||  || |||||    
T  42798623 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaa 42798722  T
Q  236 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  42798723 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccctttcccggaccctgcatatgcgggagctatagtgcatcgggttgcccttt 42798804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Original strand, 42805477 - 42805661
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 234  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  42805477 tgaggggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 42805576  T
Q  235 aggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42805577 aggctgtgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 42805661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 135 - 316
Target Start/End: Original strand, 42476824 - 42477005
Alignment:
Q  135 tctgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggta 234  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  42476824 tctgaggggtaacattggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacggattcaagttctggaaacagtctcttgtgtaaaacaaggta 42476923  T
Q  235 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42476924 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcctaggctctgcatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 42477005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 138 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 47078034 - 47077859
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 237  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||| |    
T  47078034 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaatagagtaaag 47077935  T
Q  238 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 313  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47077934 ttgcgtacaatacacaaaatggtgggaccccttcccaaaccctacatatgcgggagctctagtgcaccggattgcc 47077859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 138 - 318
Target Start/End: Original strand, 47716413 - 47716597
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 235  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  47716413 gaggggtaaccttggcacaactggaaaagttgttgccatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 47716512  T
Q  236 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  47716513 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttggtgcaccgggttgcccttta 47716597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 146 - 317
Target Start/End: Original strand, 27629596 - 27629769
Alignment:
Q  146 accttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgt 243  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  27629596 accttggcgcaactggtaaagttgttgtcatttgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgt 27629695  T
Q  244 acaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  27629696 aaaatacaccaaatggtgggaccccttcccgggccctgcatatgcggtagcttcagtgcaccgggttgcccttt 27629769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 163 - 316
Target Start/End: Original strand, 11741774 - 11741927
Alignment:
Q  163 aaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgg 262  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11741774 aaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctgaaaacagcttctagtgtaaaatagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgg 11741873  T
Q  263 gaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 316  Q
    || |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11741874 gatcccttcccggattctgcacatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 11741927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 145 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11617762 - 11617589
Alignment:
Q  145 aaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcg 242  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  11617762 aacctcggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcg 11617663  T
Q  243 tacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  11617662 tacaatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcaggacctttagtgcaccgggttgccctt 11617589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Original strand, 43557426 - 43557610
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 235  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  43557426 gaggggtaaccttgccgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagagtaa 43557525  T
Q  236 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagc-tctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  43557526 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccctcccggactctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccgggttgcccttt 43557610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 34626389 - 34626208
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaa 235  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  34626389 tgaggggtaaccttagcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggccacagattcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaacagggtaa 34626290  T
Q  236 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  34626289 ggctgcgttcaatacaccaaatggtgggatcccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagttcatcgggttgcccttt 34626208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 149 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 19427059 - 19426890
Alignment:
Q  149 ttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtaca 246  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||    
T  19427059 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaagactgcgtaca 19426960  T
Q  247 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  19426959 atacaccaaatggtggga-cccttctcggaccctgcatatgcgagagcttcagtgcaccgggttgcccttt 19426890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 137 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 35334996 - 35334818
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 236  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  35334996 tgagggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgagttcaagtcctggaaacagtctcgtgtaaaaaacagggtaag 35334897  T
Q  237 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 315  Q
     ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  35334896 actgtgtacaatacaccgaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgggtttccct 35334818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 144 - 317
Target Start/End: Original strand, 40463837 - 40464011
Alignment:
Q  144 taaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcg 242  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  40463837 taaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcatagaaacagtctcttgtgtaaaaactgggtaaggctgcg 40463936  T
Q  243 tacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  40463937 tataatacaccaaatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgagttgcccttt 40464011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 184 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 31591242 - 31591109
Alignment:
Q  184 aaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgca 283  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31591242 aaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaacagagtaaggctgcgtacaatacaataaatggtgggaccccttcccggaccttgca 31591143  T
Q  284 tatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31591142 tatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 31591109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 158 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 33872070 - 33871909
Alignment:
Q  158 ctggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33872070 ctggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacaggataaggctgcgtacaatacaccaaa 33871971  T
Q  257 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  33871970 tggtgggaccccttcccagaccctgtgtatgcgagagctttagtgcaccaggttgcctttta 33871909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 138 - 288
Target Start/End: Original strand, 46354148 - 46354302
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 235  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  46354148 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 46354247  T
Q  236 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgc 288  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46354248 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgc 46354302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 138 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 22699151 - 22698966
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 235  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||| || |||||||||  ||||||||||||    
T  22699151 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttatgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 22699052  T
Q  236 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22699051 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccggaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 22698966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 138 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 2663112 - 2662946
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 237  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  |  ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2663112 gaggggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgga--gtcataggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaatagggtaagg 2663015  T
Q  238 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2663014 ctgcgtacaatacaccaaatggtggga-cccttttcagaccctgcatatgcgggagctctagcgcaccgg 2662946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 160 - 317
Target Start/End: Original strand, 19265791 - 19265948
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaac-agggtaaggctgcgtacaatacaccaaatg 258  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19265791 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggatacagccgcttgtgtaaaaagagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatg 19265890  T
Q  259 gtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19265891 gtgggaccccttcccgga-cctacatatgtgggagctttagtgcaccgggctgcccttt 19265948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 185 - 317
Target Start/End: Original strand, 7879639 - 7879773
Alignment:
Q  185 aaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgc 282  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7879639 aaggtcacgggttcaagtcctggaaacaatctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgc 7879738  T
Q  283 atatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
     ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  7879739 gtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgcccttt 7879773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 138 - 295
Target Start/End: Original strand, 13805057 - 13805214
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca-gggtaag 236  Q
    |||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  13805057 gagggggagccttggcgcaa-tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtaacgggttcaagtcctggaaatagcctctggtgtaaaacaggggtaag 13805155  T
Q  237 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13805156 gctgtgtacaatacaccaaatggtgggaccacttcctggaccctgcgtatgcgggagct 13805214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 147 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 23419845 - 23419673
Alignment:
Q  147 ccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgta 244  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  23419845 ccttggcgcaac-ggtaaagttgctgtcatgtgactaaaaggtcacaggttcaagttctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgta 23419747  T
Q  245 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| | |||||| ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  23419746 caatacaccaaatggtgggaccccttcctagaccttgcgtgtgcgggggctttagtgcatcgggctgcccttta 23419673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 160 - 295
Target Start/End: Original strand, 19266426 - 19266563
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 257  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19266426 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgtgggttcaagtcctgaaaatagccacttgcgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 19266525  T
Q  258 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
     |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19266526 tgtgggatcccttcccggaccctgcgtatgcgggagct 19266563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 184 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18512587 - 18512455
Alignment:
Q  184 aaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaac-agggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgc 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18512587 aaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaatagggtaaggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttcccggaccctgc 18512488  T
Q  283 atatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 315  Q
     |||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  18512487 gtatgcgggagctttggtgcactgggttgccct 18512455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 160 - 316
Target Start/End: Original strand, 29907393 - 29907552
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgt--catgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-a 254  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||||| |    
T  29907393 ggtaaagttgttgtatcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaatagtgtaaggctgcgttcaatacaccaa 29907492  T
Q  255 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 316  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29907493 aatggtgggaccccatcccggaccctg--tatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 29907552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 147 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 28362316 - 28362155
Alignment:
Q  147 ccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacag--ggtaaggctgcgta 244  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  28362316 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtggctgaaaggtcacaggttcaagtcctagaaactgcctcttgtgtaaaaaacttggtaaggctgcgta 28362218  T
Q  245 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  28362217 caatacaccaaatggtgggaccccttcccagaccttgcatatgtgggagct-ttgtgcaccggg 28362155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 170 - 316
Target Start/End: Original strand, 18747472 - 18747621
Alignment:
Q  170 ttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacc 266  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18747472 ttgtcacgtgactgaaaggtcacgggatcaagtcttggaaacagccttttgtgtaaaaaagcagggtaaggctgcgtataatacaccaattggtgggacc 18747571  T
Q  267 ccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 316  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18747572 ccttcctgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggctgccctt 18747621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 142 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14732999 - 14732821
Alignment:
Q  142 ggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcct--cttgtgtaaaacagggtaaggct 239  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||  | |||  ||||||||||||||||    
T  14732999 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcccatgtaaaaaacagggtaaggct 14732900  T
Q  240 gcgtacaatacacc--aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||| |||||||||  ||||||||  || |||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  14732899 gcgt-caatacaccaaaaatggtgaaactccttcccgaaccctgtttatgcgggagctttagtgcaccggattgtccttt 14732821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 147 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 48123655 - 48123508
Alignment:
Q  147 ccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaa--aacagggtaaggctgcgta 244  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| ||    
T  48123655 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttatcatgtgtctgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaataacagggtaaaactgcata 48123557  T
Q  245 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggag 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  48123556 caatacaccaaatggtgggacccctttctggaccatgcatatgcgggag 48123508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 136 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28078314 - 28078154
Alignment:
Q  136 ctgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggta 234  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||  |||| |||||||    
T  28078314 ctgaggggtaaccctggcgcaactcgtgaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagtctcgtgtaaaaaaacagggta 28078215  T
Q  235 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  28078214 aggttgcatgcaatacaccaaatggtgggaccccttcccgaatcctgcatatgcgagagct 28078154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 139 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8149126 - 8148989
Alignment:
Q  139 aggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaa 235  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||   |||| |||||||    
T  8149126 aggggtaaccttggcacaactggtaatgttgttgtcatgtgactgcaaagtcacgagttcaagtcctgaaaactacctcttgtgttaaaaaatagggtaa 8149027  T
Q  236 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttccc 273  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8149026 ggttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttccc 8148989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 160 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 14099165 - 14099030
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 257  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  14099165 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttgaagtcctggaaatagccttttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtacaatacaccaaat 14099066  T
Q  258 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggag 293  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  14099065 ggtgggaccccttcccgaaccctacgtatgcaggag 14099030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 160 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 14409182 - 14409047
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 257  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  14409182 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttgaagtcctggaaatagccttttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtacaatacaccaaat 14409083  T
Q  258 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggag 293  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  14409082 ggtgggaccccttcccgaaccctacgtatgcaggag 14409047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 167 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 32233286 - 32233135
Alignment:
Q  167 ttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggac 265  Q
    |||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||     
T  32233286 ttgttgtcacctgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaaggcagcgtatattacaccaaatggtgggat 32233187  T
Q  266 cccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
     |||||||  |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  32233186 tccttcccaaaccctgcatatgagggagcttcagtgcaccgggctgcccttt 32233135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 139 - 240
Target Start/End: Original strand, 18326989 - 18327091
Alignment:
Q  139 aggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaagg 237  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18326989 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttgaaggtcacgggttcaagtcccggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaagg 18327088  T
Q  238 ctg 240  Q
    |||    
T  18327089 ctg 18327091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 175 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 38262340 - 38262196
Alignment:
Q  175 atgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacag--ggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcc 272  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |   ||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38262340 atgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaatatggtaatgttgcatacaatacaccaaatgatgggaccccttcc 38262241  T
Q  273 cggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38262240 cgaacactgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgcccttt 38262196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 137 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 42496017 - 42495916
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaa 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  42496017 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaacagggtaa 42495918  T
Q  236 gg 237  Q
    ||    
T  42495917 gg 42495916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 160 - 316
Target Start/End: Original strand, 16341254 - 16341413
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaa 256  Q
    |||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  16341254 ggtaaagttgttatcatgtatttgaaaggtcacgggttcaagttctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctacgtacaatacaccaaaa 16341353  T
Q  257 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 316  Q
    ||||||| || |||||||||||   |||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  16341354 tggtgggccctcttcccggacctatcatatgcgggagctttggtgcaccgggctgccctt 16341413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 203 - 309
Target Start/End: Original strand, 38604546 - 38604654
Alignment:
Q  203 cctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctct-agt 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  38604546 cctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgagacccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttaagt 38604645  T
Q  301 gcaccgggt 309  Q
    |||||||||    
T  38604646 gcaccgggt 38604654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 137 - 256
Target Start/End: Original strand, 12473257 - 12473378
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 234  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  12473257 tgaggggtagccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtatctgaaaggtcatgggttcaagtcctgcaaacaacctcttgtgtcaaaaacagggta 12473356  T
Q  235 aggctgcgtacaatacaccaaa 256  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  12473357 aggatgcgtacaatacaccaaa 12473378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 209 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 35787378 - 35787269
Alignment:
Q  209 aacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 307  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  | ||||||||    
T  35787378 aacagcctcttgtgtaaaaacatggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggcgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcaatgcaccgg 35787279  T
Q  308 gttgcccttt 317  Q
    ||||||||||    
T  35787278 gttgcccttt 35787269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 159 - 305
Target Start/End: Original strand, 39123865 - 39124018
Alignment:
Q  159 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggt----aaggctgcgtacaatacacc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||  |||| | ||||||||| ||||||||||    ||||||||||| ||||||||    
T  39123865 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaacgacacgggttcaagtcctagaaacggtctcttgtgtaaaaacagggtagggaaggctgcgtaaaatacacc 39123964  T
Q  254 --aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 305  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||    
T  39123965 aaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgagggagctttggtgcacc 39124018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 139 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 5180337 - 5180218
Alignment:
Q  139 aggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaag 236  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  5180337 aggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttcaacttctggaaacagcctcttgtgtcaaaaacagggtaag 5180238  T
Q  237 gctgcgtacaatacaccaaa 256  Q
     ||| |||||| ||||||||    
T  5180237 actgtgtacaacacaccaaa 5180218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 234 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 27889399 - 27889316
Alignment:
Q  234 aaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  27889399 aaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttggtacaccgggttgcccttt 27889316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 159 - 292
Target Start/End: Original strand, 7644931 - 7645066
Alignment:
Q  159 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aa 255  Q
    ||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||   |||||||||||||| ||    
T  7644931 tggtaaatttgttgtaacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagatagcgtacaatacaccaaa 7645030  T
Q  256 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcggga 292  Q
    || |||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  7645031 attgtgggacccctt-cctgaccctgcgtatgcggga 7645066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 188 - 308
Target Start/End: Original strand, 21566439 - 21566562
Alignment:
Q  188 gtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcat 284  Q
    ||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||  ||| | ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21566439 gtcacaggttcaagtcttggaaaccgcctcttgtgtaaaaaacagaggaagactgcgtacaatacaccaaaatggtaggaccccttcccgaaccctgcat 21566538  T
Q  285 atgcgggagctctagtgcaccggg 308  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  21566539 atgcgggagctttagtgcaccggg 21566562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 147 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3469350 - 3469176
Alignment:
Q  147 ccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt----aaaacagggtaaggctgcg 242  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||  |||||  |||||||||    ||||||||||| || ||||    
T  3469350 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacagactcaagtcctagaaacattctcttgtgtaaaaaaaacagggtacggttgcg 3469252  T
Q  243 tacaatacacc--aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 316  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||||  |||||||  |||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  3469251 tacaatacaccaaaaatggcgggaccccttcctagaccctgtgtatgcgggagctttagtgcgctgggttgccctt 3469176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 161 - 262
Target Start/End: Original strand, 6736867 - 6736969
Alignment:
Q  161 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatgg 259  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  6736867 gtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcacgggttcaagtcctcaaaacaacctcttgtataaaaacaaggtaagactgcatacaatacaccaaatgg 6736966  T
Q  260 tgg 262  Q
    |||    
T  6736967 tgg 6736969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 196 - 313
Target Start/End: Original strand, 1408469 - 1408588
Alignment:
Q  196 ttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggag 293  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |     
T  1408469 ttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgtgtacaatacagcaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcagaat 1408568  T
Q  294 ctctagtgcaccgggttgcc 313  Q
    || |||| |||||| |||||    
T  1408569 ctttagttcaccggattgcc 1408588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 138 - 226
Target Start/End: Original strand, 7193039 - 7193127
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa 226  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  7193039 gaggggtaaccttggcgtaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctcgaaacaacctcttgtgtaaa 7193127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 200 - 318
Target Start/End: Original strand, 23231573 - 23231693
Alignment:
Q  200 agtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacag--ggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctct 297  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |    
T  23231573 agtcctggaaagagcctcttgtgtaaaatataaggtaaggctgcgtataatacaccgaatgatgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggcagcttt 23231672  T
Q  298 agtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    ||||||||| ||| |||||||    
T  23231673 agtgcaccgagtttcccttta 23231693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7794682 - 7794598
Alignment:
Q  143 gtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa 227  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  7794682 gtaaccttagcgcaactggtaaagttgttgttatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttatgtaaaa 7794598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 138 - 227
Target Start/End: Original strand, 21447544 - 21447633
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa 227  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| | |  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21447544 gaggggtaaccttggcgcaactgataaatttgttgtcatgtaattggaaggtcacggattcaagtcttgaaaacagcctcttgtgtaaaa 21447633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 44123780 - 44123644
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatg 258  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |  ||||||||| ||     
T  44123780 ggtaaagttggtgtcatgtgactgaaagattacgggttcaagtactggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggttgcatgaaatacaccatata 44123681  T
Q  259 gtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
     |||||||| ||| ||||| |||| ||||| ||||||    
T  44123680 atgggacccgttctcggacactgcgtatgcaggagct 44123644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1424085 - 1423972
Alignment:
Q  144 taaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgc 241  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| ||||| |||||| || ||||||  |||||||||||| |||||    
T  1424085 taactttggcgcaactggtaaagttgttgttatgtgactggaaggtcacggattcaaatcctggaaacagtctgttgtgtaaaaaacagggtaatgctgc 1423986  T
Q  242 gtacaatacaccaa 255  Q
     |||| ||||||||    
T  1423985 atacactacaccaa 1423972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 141 - 317
Target Start/End: Original strand, 25198679 - 25198861
Alignment:
Q  141 gggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaa---gtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggta 234  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||   ||| || |||||| || ||||||||||   || ||||    
T  25198679 gggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaagatcatgggatcaaaaagtcttggaaacagtcttttgtgtaaaaaaacaaggta 25198778  T
Q  235 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    || | ||||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||| | |||| | ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25198779 agaccgcgtataatgcactaaatggtaggatcccttcccagacccttcgtatgtgagagctttagtgcaccgggttgcacttt 25198861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 42102044 - 42101899
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctctt--gtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa- 256  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||   |||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||||||  ||||||||| ||| | |||     
T  42102044 ggtaaagttgttgtcacgtgactggaaggtcaaaagttcaagtcctggaaacagcctcttccgtaaaaaacagggtaacactgcgtacagtactctaaag 42101945  T
Q  257 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgc 302  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||    
T  42101944 tggtgggaccctttcccggaccctgcgtatccggcagctttagtgc 42101899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 234 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 45019010 - 45018923
Alignment:
Q  234 aaggctgcgtacaatacaccaaa----tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||| ||||||    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  45019010 aaggctgcgtacaatataccaaaaaactggtggaaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgcccttt 45018923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 295
Target Start/End: Original strand, 35203439 - 35203554
Alignment:
Q  184 aaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccccttcccggaccc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  |||||||| |||| |||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| | || |    
T  35203439 aaaggtcacgggttcaagtcctggaaacattctcttgtgtaaaaaacaggataagactgcgtacaatataccaaaaatggtgggatcccttcctgaactc 35203538  T
Q  280 tgcatatgcgggagct 295  Q
    | | ||||||||||||    
T  35203539 tacgtatgcgggagct 35203554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 39093532 - 39093439
Alignment:
Q  225 aaacagggtaaggctgcgtacaatacacca-aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| | ||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||    
T  39093532 aaacagggtaagactgtgtacaatacaccataatagtgggaacccttcccggaacttgcatatgcagaagctttagtgcaccgggctgcccttt 39093439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15108527 - 15108441
Alignment:
Q  188 gtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttccc 273  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  15108527 gtcacgagttcaagtcctggaaacagtttcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgtgtacaatacatcaaatagtgggatcccttccc 15108441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23619071 - 23618977
Alignment:
Q  223 taaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||| |||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  23619071 taaaacagagtaagcttgtgtacaatacatcaaatggtgggaccccttcgcagaccttgcgtttgcaggagctttagtgcagcgggttgcccttt 23618977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 292
Target Start/End: Original strand, 33500556 - 33500625
Alignment:
Q  225 aaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcggga 292  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33500556 aaacagggtaagactgcgtactatacacaaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggga 33500625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 315
Target Start/End: Original strand, 22065563 - 22065720
Alignment:
Q  159 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 257  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||| |||| | ||||||||  || ||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| | |||||    
T  22065563 tggtaaagttgttgtcacgtgattgaaaagtcatgagttcaagttttggaaacaacctcttgtgtaaaaatagggtaaagctgcatacaataaagcaaat 22065662  T
Q  258 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 315  Q
     ||| |||||||||||| ||  ||  ||||| |||| | ||||| |||||| ||||||    
T  22065663 agtgagaccccttcccgaactatgtgtatgcaggagttttagtgtaccgggctgccct 22065720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23066018 - 23065925
Alignment:
Q  224 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| | |||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  23066018 aaaacaggataaagttgcgtacaatacaccatatgatgggatccctttccgaatcctgcatatgtgggagctttggtgcaccggattgcccttt 23065925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 36267900 - 36267827
Alignment:
Q  235 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  36267900 aggctgcgtacaatacaccaaatggttggacccatttcccgaaccctgtgtatgcgggagctttagtgcaccgg 36267827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 215 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 21139851 - 21139761
Alignment:
Q  215 ctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcac 304  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||| |||| ||||||||    
T  21139851 ctcttgtgtaaaaacagagtaaggttggatacagtacaccaaatggtgggaccccttcccgaactctgtgtatgcggaagctttagtgcac 21139761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11458421 - 11458267
Alignment:
Q  162 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaatg 258  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||| |||||  | |||  ||||||  |||||||| |||| || ||||| |||||    
T  11458421 taaagttattgtcatgtgactaaaaggtcacgagttcaagt-ctagaaatagcctactatgttgaaaacaaagtaaggcttcgtaaaacacaccaaaatg 11458323  T
Q  259 gtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 314  Q
    ||||| || |||  | |||||||| |||||  ||||| |||||||||||| |||||    
T  11458322 gtggggcctctttgcagaccctgcgtatgcaagagctttagtgcaccgggctgccc 11458267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 13792237 - 13792150
Alignment:
Q  231 ggtaaggctgcgtacaatacacc-aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||| ||||| |||||| | |||||||| | ||||||||    
T  13792237 ggtaagactgcatacaatacacccaaatggcgggaccccttctcgaaccctgcgtatgctggagcttttgtgcaccgagctgcccttt 13792150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 29140538 - 29140487
Alignment:
Q  141 gggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcac 192  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  29140538 gggtaatcttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcac 29140487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 317
Target Start/End: Original strand, 36602535 - 36602582
Alignment:
Q  270 tcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36602535 tcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 36602582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 17048909 - 17048831
Alignment:
Q  224 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtg 301  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||  |||||| |||||    
T  17048909 aaaacagggtaaggttacgtacaatacaccaaaatggtggaaccccttcccggaacttgcttatgtaggagctttagtg 17048831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 251
Target Start/End: Original strand, 43852002 - 43852111
Alignment:
Q  135 tctgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacaggg 232  Q
    ||||||||| | |||||| || || |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||  |||||||||    
T  43852002 tctgagggggagccttggtgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtga-------gtcacgggttcaagtcctgaaaa-aacctcttctgtaaaaaacaggg 43852092  T
Q  233 taaggctgcgtacaataca 251  Q
    |||||||  ||||||||||    
T  43852093 taaggctatgtacaataca 43852111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 42495913 - 42495865
Alignment:
Q  266 cccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 314  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  42495913 cccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccccgttgccc 42495865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 317
Target Start/End: Original strand, 45811919 - 45811981
Alignment:
Q  254 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  45811919 aaatggtgggatccctttccagaccctgcttatgcaggagctttagtgca-cgggttgcccttt 45811981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 320
Target Start/End: Original strand, 11888414 - 11888475
Alignment:
Q  259 gtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaat 320  Q
    |||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  11888414 gtgggacccctttctggaccctgtgtatgcaggagcttcagtgcactgggttgccctttaat 11888475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 315
Target Start/End: Original strand, 27697452 - 27697572
Alignment:
Q  199 aagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaatggt--gggacccctt-cccggaccctgcatatgcggga 292  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| ||  |||||||| |||||||  ||||||| || ||| |||||||| |||||||||    
T  27697452 aagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggcaaggctgtgt--aatacaccaaaatggtgggggaccctttccccagaccctgcgtatgcggga 27697549  T
Q  293 gctctagtgcaccgggttgccct 315  Q
    |||  | ||||||||| ||||||    
T  27697550 gcttaaatgcaccgggatgccct 27697572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 1524345 - 1524281
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgta 224  Q
    |||||||| ||||||| | |||| |||||||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  1524345 ggtaaagtggttgtcacgagactgaaaggtcacaagttcaagtcttataaacagcctcttgtgta 1524281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 227
Target Start/End: Original strand, 5814422 - 5814514
Alignment:
Q  135 tctgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa 227  Q
    |||||| ||| |||||||||| |  |||||||||||||| |||||| |  || |||||||||||||||  || ||| | |||||| |||||||    
T  5814422 tctgagaggttaccttggcgcaatcggtaaagttgttgttatgtgattggaaagtcacgggttcaagttttggaaagaacctcttatgtaaaa 5814514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 59)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Original strand, 1346918 - 1347097
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 237  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1346918 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccacttgtgtaaaacagggtaagg 1347017  T
Q  238 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1347018 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 1347097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 1354936 - 1354757
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 237  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1354936 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcactggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 1354837  T
Q  238 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1354836 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 1354757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 135 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 29356042 - 29355855
Alignment:
Q  135 tctgaggggtaaccttggcgccactggtaaag-ttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaa--aacagg 231  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  29356042 tctgaggggtaaccttggcacaactggtaaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaagaaacagg 29355943  T
Q  232 gtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29355942 gtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 29355855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 148 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12222088 - 12221914
Alignment:
Q  148 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac 245  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12222088 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtac 12221989  T
Q  246 aatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagc-tctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  12221988 aatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccgggttgcccttt 12221914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Original strand, 9161076 - 9161259
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaa 235  Q
    ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9161076 tgaggggtaaccttgacgcaatcggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagagtaa 9161175  T
Q  236 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  9161176 ggctgcgtacaatacatcaataatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcggaagctttagtgcaccaggttgcccttt 9161259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 26097178 - 26097293
Alignment:
Q  202 tcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtg 301  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26097178 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatgaagggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtg 26097277  T
Q  302 caccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  26097278 caccgggttgcccttt 26097293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 2166587 - 2166410
Alignment:
Q  143 gtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaaggctg 240  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  2166587 gtaaccttg-cgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttg 2166489  T
Q  241 cgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2166488 cgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctatatattcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 2166410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 2178220 - 2178043
Alignment:
Q  143 gtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaaggctg 240  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  2178220 gtaaccttg-cgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttg 2178122  T
Q  241 cgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2178121 cgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctatatattcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 2178043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 202 - 317
Target Start/End: Original strand, 25557743 - 25557858
Alignment:
Q  202 tcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtg 301  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25557743 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatgaaggaaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtg 25557842  T
Q  302 caccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||    
T  25557843 caccgggttgcccttt 25557858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 140 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3815256 - 3815084
Alignment:
Q  140 ggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagg 237  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||  |||| | |||| |     
T  3815256 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctggaaacagactattgtgtaaaaaatatggtacga 3815157  T
Q  238 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggtt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  3815156 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccctttcccgaaccctacgtatgcggaagctttagtgcaccgggtt 3815084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 162 - 317
Target Start/End: Original strand, 28007604 - 28007760
Alignment:
Q  162 taaagttgttgtcatgtgact--aaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatgg 259  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  28007604 taaagttgttgtcatgtgacatgaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaagagcctcttgtgtaaaacagggtcaggctgcgtacaatacaccaaatgc 28007703  T
Q  260 tgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  28007704 tgggaccccttccc-taacctccatatgcggaagctctagtgcaccggattacccttt 28007760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 138 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15866218 - 15866041
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctctt--gtgtaaaacagggtaa 235  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  ||  ||||||||||||    
T  15866218 gaggggtaaccttggcccaactggtaaagttgttggcatgtgattgaaaggtcatgggttcaattcctggaaacagcctcttaagtaaaaaacagggtaa 15866119  T
Q  236 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 315  Q
     |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||| | ||||||||    
T  15866118 agctgcgt--aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtttgcgggatctatagtgcactgagttgccct 15866041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Original strand, 1941809 - 1941990
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaa 235  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  1941809 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatctgactggaaggtcgcggattgaagtcatgtaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 1941908  T
Q  236 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| | ||  |||||||||| | | |||||||| ||||||||||    
T  1941909 ggctgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccatcctggatcttgtgtatgcgggagtttttgtgcaccgtgttgcccttt 1941990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 137 - 250
Target Start/End: Original strand, 8409196 - 8409311
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 234  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||    
T  8409196 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtaatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctggaaactgcctcttgtgtaaaaaacagggta 8409295  T
Q  235 aggctgcgtacaatac 250  Q
    ||||||||||||||||    
T  8409296 aggctgcgtacaatac 8409311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 139 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13905158 - 13905015
Alignment:
Q  139 aggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaag 236  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||    
T  13905158 agggggaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggctcaagtcctgaaaacgacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 13905060  T
Q  237 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgc 282  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  13905059 gctgcatacaattcaccaaatggt-ggaccctttcccgaaccctgc 13905015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 170 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23240971 - 23240826
Alignment:
Q  170 ttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacccct 269  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  23240971 ttgtcacgtgactgaaaggtcacaggtgcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagtttgcgtacaatataccaattggtgggacccct 23240872  T
Q  270 tcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 315  Q
    ||  ||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  23240871 tctaggacaatgcgtatgcgggagctttagtgcactgggctgccct 23240826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 137 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 14975262 - 14975094
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 236  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    |||    
T  14975262 tgagggataaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacggattcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaa---caag 14975166  T
Q  237 gctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 313  Q
    |       ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14975165 g-------caatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccccgcatatgcgggagttttagtgcaccgggttgcc 14975094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 169 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18277343 - 18277193
Alignment:
Q  169 gttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacc 266  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||    
T  18277343 gttgtcctgtgactaaaaggtcacgggttcaaatcttggaaacagcctcttgtgtaaaaatcagggtaaggttgagtacagaacaccaaatggtgggacc 18277244  T
Q  267 ccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||  ||| || | |||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  18277243 ccttcctagactctacgtatgcgggagctttactgcaccgggttgtccttt 18277193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 142 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23930303 - 23930127
Alignment:
Q  142 ggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttc-aagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctg 240  Q
    |||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||| || |||||||||| |||| ||||| || |||||| ||| ||||||||| |    |  | ||    
T  23930303 ggtaaccttggcgcaactcataaagatgttgtcatgtgtctcaaaggtcacgagttccaagtcatggaaacagtctcatgtgtaaaaaacaagatagttg 23930204  T
Q  241 cgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23930203 cgtacaatacaccagatggtgggaccccttcacggaccctgcttatgcgggagctttagtgcaccgagttgcccttt 23930127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 147 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 7947543 - 7947370
Alignment:
Q  147 ccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgta 244  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||   |||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  7947543 ccttggcgcaac-ggtaaagttggtgttgcgtgactgaaaggtcaccggttcaactcctggaaacaacctcctgtgtaaaaaccagggtaaggctgcgta 7947445  T
Q  245 caatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||  || |||||||||    
T  7947444 caatacaccaaaatggtgggcccccttcccggaccttgcgtatgtgggagctttagtgcacttggctgcccttta 7947370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 160 - 318
Target Start/End: Original strand, 12889402 - 12889563
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaa 256  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  12889402 ggtaaagttgttgtcacgtgagtgaaaggtcacaggttcaagtcttgaaaacagcctcttgtgttaaaaacagggcaaggctgcatacaatacacctaaa 12889501  T
Q  257 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
     | ||||||||||| |||||||||   | || ||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  12889502 cgatgggacccctttccggaccctctgtgtgtgggagctttagtgcatcgggctgcccttta 12889563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 148 - 317
Target Start/End: Original strand, 24097545 - 24097712
Alignment:
Q  148 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtac 245  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||  || ||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||    
T  24097545 cttggcacaactggtaaaattgatgtcatgttactgaaaggtcacgagtttaagtcctcgaaccagcctcttgtataaaaaacagggtaaggctgcttac 24097644  T
Q  246 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||  || |||||||||||    
T  24097645 aa----ccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggaagctttagtgtcccaggttgcccttt 24097712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 138 - 285
Target Start/End: Original strand, 6024187 - 6024338
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 235  Q
    |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  6024187 gaggggtaattttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacggtttcaaatcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaa 6024286  T
Q  236 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcata 285  Q
    | |||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  6024287 gactgcgtacaatacaccaataatgatgggacctcttcccggaccccgcata 6024338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 157 - 295
Target Start/End: Original strand, 14553485 - 14553626
Alignment:
Q  157 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||  |||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  14553485 actggtaaagttgttgtcatgtgact-aaaggtcacaggttcaagtcctggaaatagcttcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgtgtataatacacca 14553583  T
Q  255 aa--tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
    ||  |||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||    
T  14553584 aaactggtgggaccccttcgtagaccctgtgtatgcgggagct 14553626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 194 - 300
Target Start/End: Original strand, 32579436 - 32579543
Alignment:
Q  194 ggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaac-agggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcggga 292  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||||  | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32579436 ggttcaagtcctggaaacagcctctggtataaaaatacggtaagcctgcgtacaataccccaaatggtgggaccccttcccagaccctgcatatgcggga 32579535  T
Q  293 gctctagt 300  Q
    ||| ||||    
T  32579536 gctttagt 32579543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 189 - 306
Target Start/End: Original strand, 33138838 - 33138957
Alignment:
Q  189 tcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatat 286  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||    
T  33138838 tcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtataaaaaacagagtaaggccgcgtacaatacaccaaatggtgggacccttttccggaccctgtgtat 33138937  T
Q  287 gcgggagctctagtgcaccg 306  Q
    || | |||| ||||||||||    
T  33138938 gcagtagctttagtgcaccg 33138957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 306
Target Start/End: Original strand, 20400625 - 20400791
Alignment:
Q  142 ggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggct 239  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  || |||||  |||||||||  ||||||||||||| ||    
T  20400625 ggtaaccttggcgcaattggtatagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagttatggaaacaatctcttgtgtaaaaaacagggtaagact 20400724  T
Q  240 gcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccg 306  Q
    ||||||| ||||| |||| | ||||||| || ||| ||||| | ||||| | | || ||||||||||    
T  20400725 gcgtacagtacactaaatagcgggacccttttccgaaccctacgtatgcagaaactttagtgcaccg 20400791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 239 - 317
Target Start/End: Original strand, 12892064 - 12892144
Alignment:
Q  239 tgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12892064 tgcgtataatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 12892144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Original strand, 13267788 - 13267860
Alignment:
Q  245 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13267788 caatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgcccttt 13267860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 137 - 293
Target Start/End: Original strand, 22967124 - 22967287
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaa 235  Q
    |||||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||||| || ||||| | |||||||| |||| ||| |||    
T  22967124 tgaggggtaaccttcgcgcatctgataaagttattgtcatgtgactgtaaggtcactagttcaagtcatggaaacaacttcttgtgtaaaaataggataa 22967223  T
Q  236 ggctgc------gtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggag 293  Q
    ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  22967224 ggctgcatacaaatacaatacaccaaatggtgggaccccttcttggaccctgcctatgcgggag 22967287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 137 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23821269 - 23821106
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaa 235  Q
    |||||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||||| || ||||| | |||||||| |||| ||| |||    
T  23821269 tgaggggtaaccttcgcgcatctgataaagttattgtcatgtgactgtaaggtcactagttcaagtcatggaaacaacttcttgtgtaaaaataggataa 23821170  T
Q  236 ggctgc------gtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggag 293  Q
    ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  23821169 ggctgcatacaaatacaatacaccaaatggtgggaccccttcttggaccctgcctatgcgggag 23821106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 32728314 - 32728157
Alignment:
Q  161 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatg 258  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  || ||||| |||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||     
T  32728314 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacagattcaagttttggaaacaacctcttatgtaaaaaacagggtaagactgtgtacaatataccaaata 32728215  T
Q  259 gtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    || || ||| ||||| |||||| | ||||||||| || |||||||||  ||||||||||    
T  32728214 gt-ggtccctttcccagaccctacgtatgcgggaactttagtgcaccatgttgcccttt 32728157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 15865991 - 15865859
Alignment:
Q  184 aaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccct 280  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||   |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15865991 aaaggtcatgggttcaattcctggaaacagcctcttacgtaaaaaaacagggtaaagctgcgta--atacaccaaatggtgggaccccttcctggaccct 15865894  T
Q  281 gcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 315  Q
    || | |||| || || |||||||| | ||||||||    
T  15865893 gcgtttgcgtgatctatagtgcactgagttgccct 15865859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 240 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 383837 - 383757
Alignment:
Q  240 gcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaat 320  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  383837 gcgtacaatacaccaaattgtgggaccccttctcagaccctgcgtatgcgggagcttcagtccaccgggttgccctttaat 383757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 290
Target Start/End: Original strand, 24734591 - 24734752
Alignment:
Q  142 ggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-----------aaaacag 230  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||| ||||  ||||| ||||||||||           |||||||    
T  24734591 ggtaacattggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaaaagttcaaatccttgaaacaacctcttgtgtaaaaaaaaaaaaaaacag 24734690  T
Q  231 ggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgg 290  Q
    ||||||| ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  24734691 ggtaaggttgcgtacaatacaacaaaaaaggtgggaccccttcccggatcctgcgtatgcgg 24734752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 255 - 317
Target Start/End: Original strand, 6808468 - 6808530
Alignment:
Q  255 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6808468 aatggtgggaccccttcccggaccctgtgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 6808530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 238 - 317
Target Start/End: Original strand, 12885967 - 12886048
Alignment:
Q  238 ctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12885967 ctgcgtacaatacacaaaaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 12886048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2755583 - 2755422
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||| || ||||| |||||| |    |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  2755583 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgtaggttcaagtcttgcaaacatcctcttataccaaaaataggctaaggctgcgtacaatacaccaaaa 2755484  T
Q  256 atggtgggaccccttcccggaccctgcatat--gcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 316  Q
    |||||||||  |||||||  | |||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2755483 atggtgggagtccttcccaaatcctgcatatgcgcgggagctttagtgcacc-ggttgccctt 2755422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 176 - 319
Target Start/End: Original strand, 17432332 - 17432485
Alignment:
Q  176 tgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--------gggtaaggctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggac 265  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |        ||||||||||| ||||||||||| |||  ||||| |||    
T  17432332 tgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaagggtaaggctgtgtacaatacactaaaaatggtgagac 17432431  T
Q  266 cccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaa 319  Q
    |  |||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17432432 cttttcccggatcctgtgcatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttaa 17432485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 3116299 - 3116129
Alignment:
Q  150 tggcgccactggtaaagttgttgtcatgtga-------ctaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcg 242  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||       || |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||      | | |||||    
T  3116299 tggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgagttgcgactgaaaggtcatgggttcaagtcatggaaacaacctcttgtataaaa------atgactgcg 3116206  T
Q  243 tacaatacaccaaa--tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
     |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  3116205 cacaatacaccaaaaatggtgggaccccttctcggaccttgcgtatgcgggagctttagtacaccggattgcccttt 3116129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 141 - 227
Target Start/End: Original strand, 12063424 - 12063510
Alignment:
Q  141 gggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa 227  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||    
T  12063424 gggtaaccttggtgcaactgataaagttgttatcatgagactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaatagcctcttgtataaaa 12063510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 249 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 10734974 - 10734903
Alignment:
Q  249 acaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaa 319  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  10734974 acaccaaagtggtgggcccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtccaccgggctgccctttaa 10734903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 33923009 - 33922942
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcct 205  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  33923009 gaggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatttgactgaaaagtcacaggttcaagtcct 33922942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 9671197 - 9671084
Alignment:
Q  207 aaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaataca-ccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgca 303  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||  |||| | ||||||| ||||||||| ||| |||||||| || |||||||| || ||||    
T  9671197 aaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcctactttacatcaaaatggtaggacccctttccgaaccctgcaaatacgggagctttaatgca 9671098  T
Q  304 ccgggttgcccttt 317  Q
     |||| ||||||||    
T  9671097 tcgggctgcccttt 9671084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27855600 - 27855500
Alignment:
Q  157 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| || ||| |||||| ||||||||| || |||||   |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  27855600 actggtaaagtttttgtcatgtgactgaaatgtcgcgagtttaagtcccgaaaacagcttcctgtgtaaaaaaatagggtaaggctgcgtataatacacc 27855501  T
Q  254 a 254  Q
    |    
T  27855500 a 27855500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4136670 - 4136590
Alignment:
Q  166 gttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaaggctgcgta 244  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  4136670 gttgttgccacgtgactaaaatgtcacgggttcaagtcctaaaaacaacatcttgtgtaaaatacagggtaaggttgcgta 4136590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 308
Target Start/End: Original strand, 19340855 - 19340954
Alignment:
Q  211 cagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 307  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||  ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| || ||||||| |||| ||||||| |||    
T  19340855 cagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgca-acaatacaccaaaatgatgggaccccttcctggacccggcgtatgcggaagctttagtgcaacgg 19340953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 307
Target Start/End: Original strand, 11395827 - 11395886
Alignment:
Q  249 acaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 307  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  11395827 acaccaaagtggtgggaccccttcccggatcctgcgtatgcgggagctttagtccaccgg 11395886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19649338 - 19649255
Alignment:
Q  148 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagg 231  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| || || | ||||||| |||| ||| | |||||||||    
T  19649338 cttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaagatcacggatttaaattctgaaaatagccccttatctaaaacagg 19649255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 317
Target Start/End: Original strand, 25997749 - 25997784
Alignment:
Q  282 catatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25997749 catatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 25997784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 247
Target Start/End: Original strand, 17448324 - 17448389
Alignment:
Q  184 aaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaa 247  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17448324 aaaggtcacgggttcaagttttgaaaacaacattttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaa 17448389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 270
Target Start/End: Original strand, 32068074 - 32068182
Alignment:
Q  162 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaatg 258  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||| || |||   ||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||| |||||    
T  32068074 taaagttgttgtcacgtgaccgaaaggtcacatgttcaagtcttggaaa---cctcttgtgtaaaaaacaggataatgctgtttacaatacaccaaaatg 32068170  T
Q  259 gtgggacccctt 270  Q
    ||||||||||||    
T  32068171 gtgggacccctt 32068182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 194 - 287
Target Start/End: Original strand, 11849063 - 11849159
Alignment:
Q  194 ggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatg 287  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||  |||||||| ||| | |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  11849063 ggttcaagtccaggaaacaacctcttgtgttaaaaacaggataaagttgcccacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccgaactctgcgtatg 11849159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 264 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 30786427 - 30786378
Alignment:
Q  264 accccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 313  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30786427 accccttcctggaccgtgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 30786378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 213
Target Start/End: Original strand, 8417445 - 8417501
Alignment:
Q  157 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| || ||||||    
T  8417445 actggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgagttcaggtcatggaaacag 8417501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 33922916 - 33922857
Alignment:
Q  258 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||  |||||||||||    
T  33922916 ggtggcaccccttcccggaccctgcttatgttggagctttagtgcacatggttgcccttt 33922857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 61
Target Start/End: Original strand, 913229 - 913263
Alignment:
Q  27 gttgttatatactctcatcaatgcctttcttcttg 61  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  913229 gttgttatatactatcatcaatgcctttcttcttg 913263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16895761 - 16895695
Alignment:
Q  254 aaatggtgggacccc-ttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg-ttgcccttta 318  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || || | |||||||||||| ||||||||||    
T  16895761 aaatggtgggacccccttcccggaccctacatatgtggaagttttagtgcaccgggtttgcccttta 16895695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14341163 - 14341134
Alignment:
Q  224 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14341163 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 14341134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 102)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Original strand, 20224937 - 20225117
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20224937 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaacagggtaag 20225036  T
Q  237 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20225037 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 20225117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 48599005 - 48598825
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48599005 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 48598906  T
Q  237 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48598905 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccatgcatatgccggagctctagtgcaccgggttgcccttt 48598825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 11054327 - 11054148
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 237  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  11054327 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgtaaaacagggtaaga 11054228  T
Q  238 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11054227 ctgcgtacaatacaccaaatggcggaaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 11054148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 47528709 - 47528530
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 237  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47528709 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 47528610  T
Q  238 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47528609 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgaatatgtgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 47528530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Original strand, 5648212 - 5648393
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaa 235  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5648212 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaa 5648311  T
Q  236 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  5648312 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcactgggttgcccttt 5648393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 137 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6430807 - 6430627
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaa 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6430807 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaa 6430708  T
Q  236 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  6430707 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccacttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagcgcaccgggttgccctt 6430627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 135 - 317
Target Start/End: Original strand, 30639331 - 30639514
Alignment:
Q  135 tctgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggt 233  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  30639331 tctgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcttgtgactgaaaggtcactggttcaagtcctggaaacagactcttgtgtaaaaacagggt 30639430  T
Q  234 aaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  30639431 aaggctgcgtacaatacaccaaatggtgagaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcactgggttgcccttt 30639514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 162 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 9832468 - 9832313
Alignment:
Q  162 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtg 261  Q
    |||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9832468 taaaattgttgtgatctgactgaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtg 9832369  T
Q  262 ggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9832368 ggaccccttcccggaccctgcatatgcaggaactctagtgcaccgggttgcccttt 9832313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 5306845 - 5306660
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaa 235  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5306845 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgatgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaatcagggtaa 5306746  T
Q  236 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatg----cgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  5306745 ggttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtggacgggagctttaatgcaccgggttgcccttt 5306660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 176 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 29208039 - 29207900
Alignment:
Q  176 tgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgg 275  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29208039 tgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaattgcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgg 29207940  T
Q  276 accctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29207939 accctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 29207900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 145 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 16408777 - 16408601
Alignment:
Q  145 aaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcg 242  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  16408777 aaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcg 16408678  T
Q  243 tacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16408677 tacaatacaccaataatggtggaaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 16408601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Original strand, 23501747 - 23501924
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaa 235  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23501747 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtc------acagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 23501840  T
Q  236 ggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23501841 ggttgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 23501924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 157 - 316
Target Start/End: Original strand, 40915802 - 40915962
Alignment:
Q  157 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  40915802 actggtaaagttgttgtcatgtgactataaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaa 40915901  T
Q  256 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 316  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  40915902 atggtgggagcccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccggattgccctt 40915962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 141 - 317
Target Start/End: Original strand, 16911519 - 16911699
Alignment:
Q  141 gggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggc 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  16911519 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtacaaatcagggtaaggc 16911618  T
Q  239 tgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  16911619 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtacgcgggagctttagtttaccgggttgcccttt 16911699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Original strand, 21646918 - 21647098
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 235  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  21646918 gagggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaa 21647017  T
Q  236 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 314  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21647018 ggctgcgtacaatataccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 21647098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 165 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 39077948 - 39077800
Alignment:
Q  165 agttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtggga 264  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  39077948 agttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggttgcgtacaatataccaaatggtgaga 39077849  T
Q  265 ccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 313  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39077848 catctttccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 39077800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 157 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 44363294 - 44363129
Alignment:
Q  157 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc- 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||  ||||     
T  44363294 actggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctgaaaacagcctcgtgtgtaaaaaacagggtagggctgcgtacaacgcacca 44363195  T
Q  254 -aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44363194 aaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttta 44363129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 149 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 8473790 - 8473621
Alignment:
Q  149 ttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaat 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  8473790 ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgaccggaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtttaacagggtaaggctgcatacaat 8473691  T
Q  249 acaccaaatggtgggacccctt-cccgga-ccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 316  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8473690 acaccaaatggtgggaccccttccccggacccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 8473621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 164 - 317
Target Start/End: Original strand, 54175043 - 54175200
Alignment:
Q  164 aagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctg-aaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggt 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54175043 aagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacggattcaagtcctggaaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaatggt 54175142  T
Q  261 gggaccccttccc-ggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  54175143 gggaccccttccccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggctgcccttt 54175200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 184 - 317
Target Start/End: Original strand, 47443957 - 47444092
Alignment:
Q  184 aaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctg 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47443957 aaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctg 47444056  T
Q  282 catatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  47444057 catatgcaggagcttcagtgcactgggttgcccttt 47444092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 164 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 17043549 - 17043416
Alignment:
Q  164 aagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtg 261  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17043549 aagttgttgtcaagtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtg 17043450  T
Q  262 ggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17043449 ggaccccttcccagaccctgcatatgctggagct 17043416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 13256578 - 13256399
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 235  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||     ||||||||||||  ||||||||||||    
T  13256578 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcataggttcaagtcctg----gagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 13256483  T
Q  236 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13256482 ggctgcgtacaatacaccaataatagtgggaccccttcccgaaccccgcatctgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 13256399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 160 - 317
Target Start/End: Original strand, 35567146 - 35567305
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 257  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  35567146 ggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagccacttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaacacaccaaat 35567245  T
Q  258 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  35567246 ggtgggaccccttcccgaaccctgcgtctgcgggagctttagtgcaccgggctgcccttt 35567305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 138 - 303
Target Start/End: Original strand, 37494805 - 37494972
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 235  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  37494805 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgccatgcgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 37494904  T
Q  236 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgca 303  Q
    || ||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  37494905 ggttgcatacaatataccaaatggtgggacccctttcgggaccctgcgtatgcaggagctttagtgca 37494972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 143 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 30352767 - 30352580
Alignment:
Q  143 gtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-------cagggtaa 235  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||       ||||||||    
T  30352767 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcaagtgaccgaaaggtcacgggttagagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaaaaaacagggtaa 30352668  T
Q  236 g----gctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  30352667 gtaaagctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgtgttgcccttt 30352580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 162 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30690340 - 30690175
Alignment:
Q  162 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---------cagggtaaggctgcgtacaatacac 252  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||         |||||||||||||| ||||||||||    
T  30690340 taaagtggttgtcaagtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaaaagcctcttgtgtaaaaaataaaaaacagggtaaggctgcatacaatacac 30690241  T
Q  253 caaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  30690240 caattggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggctgcccttta 30690175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 141 - 306
Target Start/End: Original strand, 54730206 - 54730376
Alignment:
Q  141 gggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaagg 237  Q
    ||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||| ||| |||||    
T  54730206 gggtaactttggcgcaatcggtaaagttgttgtcatgtgaccaaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaaataggataagg 54730305  T
Q  238 ctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccg 306  Q
    ||||||| |||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  54730306 ctgcgtataatacaccaataatgatggaaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccg 54730376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 201 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20639777 - 20639658
Alignment:
Q  201 gtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctct 297  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  20639777 gtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttt 20639678  T
Q  298 agtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20639677 agtgcaccgggttgcccttt 20639658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 170 - 295
Target Start/End: Original strand, 25463108 - 25463235
Alignment:
Q  170 ttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccc 267  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25463108 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaactgggaaaggttgcgtacaacacaccaaatggtgggaccc 25463207  T
Q  268 cttcccggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25463208 cttcccggaccctgcatatgcgggagct 25463235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 141 - 317
Target Start/End: Original strand, 14983791 - 14983969
Alignment:
Q  141 gggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaggc 238  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||| |  ||||||||     
T  14983791 gggtaaccttggcagaactggtaaagttgttgtcatatgattggaaggtcacggattcaagtctttgaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaaggt 14983890  T
Q  239 tgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||  ||||||||||    
T  14983891 tgcctacaatacactaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgtaccatgttgcccttt 14983969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 307
Target Start/End: Original strand, 19027823 - 19027973
Alignment:
Q  159 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 256  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  19027823 tggtagagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaat 19027922  T
Q  257 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 307  Q
    |||||||||||||| || ||| |||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  19027923 tggtgggacccctttccagactctgcgtatgtgggagctttagtgcaccgg 19027973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 55766647 - 55766466
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacggg-ttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgta-aaacagggtaa 235  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  || ||||||  ||||||||  |||||||||||    
T  55766647 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccggaaggtcacggggttcaagttttggaaacagtttcttgtgtgtaaacagggtaa 55766548  T
Q  236 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  55766547 ggctgcgtacaatacactgaatggtggaaccccatcccggaccttgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggatgcccttt 55766466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 136 - 266
Target Start/End: Original strand, 14590789 - 14590922
Alignment:
Q  136 ctgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt---aaaacaggg 232  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |   |||||||||    
T  14590789 ctgagtggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacagcctcttgtctaaaaaaacaggg 14590888  T
Q  233 taaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacc 266  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  14590889 taaggctgcatacaatacatcaaatggtgggacc 14590922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 148 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 30496491 - 30496333
Alignment:
Q  148 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaa 247  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  30496491 cttggcgcaactgtaaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaacacgggtaaggctgcatacaa 30496392  T
Q  248 tacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccg 306  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||  |||||| ||||||||||    
T  30496391 tacaccaaatggggggactccttcccggaccgtgcttatgatggagctttagtgcaccg 30496333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 139 - 314
Target Start/End: Original strand, 54966977 - 54967151
Alignment:
Q  139 aggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaag 236  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||  |||||||||    
T  54966977 agggggaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacatgttcaagttctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 54967075  T
Q  237 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 314  Q
    | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  54967076 gttgc-tacaatataccaaatggtgggaccccttcccgtaccctacatatgcgggagct-ttgtgcaccgggctgccc 54967151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 188 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 10277886 - 10277757
Alignment:
Q  188 gtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatg 287  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  10277886 gtcacgggttcaaatccttgaaacagcctcttgtataaaataggataaggctgcgtacaatacaccaaatggtgaaaccccttcccagaccctgcatatg 10277787  T
Q  288 cgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  10277786 cgggagttctagtgaaccggattgcccttt 10277757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Original strand, 20405047 - 20405224
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggta 234  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||       |||  ||||||||||||||||||||   |||||||    
T  20405047 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacggg-------cctagaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggta 20405139  T
Q  235 aggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||  |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  20405140 agattgcgtacaatacactaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcattgggttgcccttt 20405224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 208 - 317
Target Start/End: Original strand, 25629073 - 25629184
Alignment:
Q  208 aaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 305  Q
    |||||| ||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25629073 aaacagtctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgtgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctacatatgcgggagctttagtgcacc 25629172  T
Q  306 gggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||    
T  25629173 gggttgcccttt 25629184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 160 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 39029220 - 39029082
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacac-caaa 256  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  39029220 ggtaaagttgttgtcgtgtgactaaaaggtcataggttcaagccttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacacgaaaa 39029121  T
Q  257 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39029120 tggtgggaccactttccggaccctgcatatgcgggagct 39029082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 162 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 32478942 - 32478791
Alignment:
Q  162 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggt 260  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||     |||||||||||||||    
T  32478942 taaagttgttgtcatgtgaccgagaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctctagtgtaaaaacagggtaaggctg-----aatacaccaaatggt 32478848  T
Q  261 gggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  32478847 gggaccccttcccggacccagcgtatgcgggagct-ttgtgcaccgggtggcccttta 32478791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 55830902 - 55830721
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgg-gttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgta-aaacagggtaa 235  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||||  || |||||| |||||||||  |||||||||||    
T  55830902 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgatcggaaggtcacggagttcaagttttggaaacagtctcttgtgtgtaaacagggtaa 55830803  T
Q  236 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
     ||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||| || ||||||||    
T  55830802 tgctgcgtacaatacactgaatggtggaaccccatcccggaccttgcgtatgcgagagctttagtgcaccaggatgcccttt 55830721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Original strand, 10660358 - 10660538
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 235  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||| ||||| |||||| |||  |||| ||||||     
T  10660358 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacatgttcaagtcctggaaacaacctcttatgtaaaaaatagggtat 10660457  T
Q  236 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctct-agtgcaccgggttgccc 314  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  10660458 ggctgcatacaatacaccaataatggtgagaccccttccaaga-cctgcgtatgcgggagctttaagtgcatcgggttgccc 10660538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 138 - 314
Target Start/End: Original strand, 10874503 - 10874683
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 235  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||| ||||| |||||| |||  |||| ||||||     
T  10874503 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacatgttcaagtcctggaaacaacctcttatgtaaaaaatagggtat 10874602  T
Q  236 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctct-agtgcaccgggttgccc 314  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  10874603 ggctgcatacaatacaccaataatggtgagaccccttccaaga-cctgcgtatgcgggagctttaagtgcatcgggttgccc 10874683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 167 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7385628 - 7385499
Alignment:
Q  167 ttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtggga 264  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  |||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  7385628 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagccctggaaacagcctcatgtgtaaaaaatagggtaaggttgtgtgcaatacaccaaatggtggga 7385529  T
Q  265 ccccttcccggaccctgcatatgcgggagc 294  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  7385528 ccctttcccggaccctgtgtatgcgggagc 7385499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 227 - 318
Target Start/End: Original strand, 20225119 - 20225212
Alignment:
Q  227 acagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20225119 acagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttta 20225212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 167 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 41018945 - 41018807
Alignment:
Q  167 ttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggac 265  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  41018945 ttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaattagggtaaggctacgtacaatacaccaaatagtgggac 41018846  T
Q  266 cccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcac 304  Q
    |||||||| |||| ||| ||||  || ||| ||||||||    
T  41018845 cccttcccagaccttgcgtatggaggggctttagtgcac 41018807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 162 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 30581624 - 30581481
Alignment:
Q  162 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaat 257  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||   |||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  30581624 taaagttgttgtcacatcactaaaaggtcaagggttcaagtcgtggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaagggtgtgtacaatacaccaaaat 30581525  T
Q  258 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtg 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  30581524 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtaggagctttagtg 30581481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 202 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7909397 - 7909281
Alignment:
Q  202 tcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgc-gggagctctag 299  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||    
T  7909397 tcctggaaacagtctcttgtgtaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggggagctttag 7909298  T
Q  300 tgcaccgggttgccctt 316  Q
    |||| ||||||||||||    
T  7909297 tgcatcgggttgccctt 7909281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 160 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 47441689 - 47441566
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 257  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||   |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47441689 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtccaagaaacagtctcttttgtaaaaatcagggtaaggctgtgtacaatacaccaaat 47441590  T
Q  258 ggtgggaccccttcccggaccctg 281  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  47441589 ggttggaccccttcccggaccctg 47441566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 163 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 49938746 - 49938615
Alignment:
Q  163 aaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaatggt 260  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||   | |||||||||||| |||||||    
T  49938746 aaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacggggtaag---gtgtacaatacaccaaaatggt 49938650  T
Q  261 gggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  49938649 gggaccccttcccataccctgcatatgcgggagct 49938615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 208 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 51865149 - 51865038
Alignment:
Q  208 aaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 305  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  51865149 aaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtggggccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttattgcacc 51865050  T
Q  306 gggttgcccttt 317  Q
    ||  ||||||||    
T  51865049 ggactgcccttt 51865038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 246 - 317
Target Start/End: Original strand, 38786673 - 38786744
Alignment:
Q  246 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38786673 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 38786744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 196 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 9987957 - 9987838
Alignment:
Q  196 ttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggag 293  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  9987957 ttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaacaatagggtaaggctgcatacaatacaccaaatggtgggaccccttccttgaccttgcatatgcgggag 9987858  T
Q  294 ctctagtgcaccgggttgcc 313  Q
    || || ||||||||| ||||    
T  9987857 ctttaatgcaccgggctgcc 9987838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 208 - 295
Target Start/End: Original strand, 49796822 - 49796910
Alignment:
Q  208 aaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  49796822 aaacagcctcttgtgttaaaacatggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagct 49796910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 160 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20908797 - 20908636
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgact-aaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacag--ggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 256  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || ||  ||||||||| || ||||| | |||| | ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20908797 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaatgttacatgttcaagtcatggaaacatcgtcttttctaaaaaagaaggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 20908698  T
Q  257 -tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  20908697 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcacaaggctgcccttt 20908636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 487294 - 487135
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtg--taaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa-- 255  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||      
T  487294 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtataaaacaaggtaaagctgcgtacaatacactaaaa 487195  T
Q  256 -------atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 308  Q
           |||| ||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  487194 tggtgggatggcgggaccccttcccggattctgcgaatgcgggagctttagtgcaccggg 487135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 161 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3580994 - 3580862
Alignment:
Q  161 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatg 258  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  ||||    ||||||||||||||  || |||||||||| || ||||||||||||||    
T  3580994 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcacgagttcaagtctggaaa----cctcttgtgtaaaaaccatggtaaggctgtgtgcaatacaccaaatg 3580899  T
Q  259 gtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3580898 ctaggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagct 3580862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 172 - 317
Target Start/End: Original strand, 7038041 - 7038187
Alignment:
Q  172 gtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaatggtgggacccc 268  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  7038041 gtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctg-aaacagcttcttgtgtaaaaaatagggtaagacttcgtacaatacaccaaaatggtggggcacc 7038139  T
Q  269 ttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    | |||||||||||| ||| | |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  7038140 tacccggaccctgcgtatac-ggagctttagtgcactgggttgcccttt 7038187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 141 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17315476 - 17315375
Alignment:
Q  141 gggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggct 239  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  17315476 gggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaattcctcgaaacaacctcttgtgtaaaaacaaggtaaggct 17315377  T
Q  240 gc 241  Q
    ||    
T  17315376 gc 17315375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 196 - 312
Target Start/End: Original strand, 21489099 - 21489218
Alignment:
Q  196 ttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcggga 292  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21489099 ttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagagtaagactgcgtacaatgcaccaaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggga 21489198  T
Q  293 gctctagtgcaccgggttgc 312  Q
    ||| | |||||| |||||||    
T  21489199 gctttcgtgcactgggttgc 21489218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 314
Target Start/End: Original strand, 25343162 - 25343321
Alignment:
Q  159 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--a 254  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||| ||| ||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  25343162 tggtaaagttgttgtcacgtgactgataggtcacaggttcaagttctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 25343261  T
Q  255 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 314  Q
    || ||| |||||||||||  || ||||| |||| | ||||| ||| ||||| || |||||    
T  25343262 aagggttggaccccttcctagatcctgcgtatgtgagagctttagagcacccggctgccc 25343321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 256 - 317
Target Start/End: Original strand, 32484307 - 32484368
Alignment:
Q  256 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32484307 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 32484368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 255 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 38755970 - 38755906
Alignment:
Q  255 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaa 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38755970 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttaa 38755906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 42164307 - 42164224
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcg 242  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42164307 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcg 42164224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 253 - 319
Target Start/End: Original strand, 11394923 - 11394989
Alignment:
Q  253 caaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaa 319  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11394923 caaatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttaa 11394989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 253 - 319
Target Start/End: Original strand, 11404650 - 11404716
Alignment:
Q  253 caaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaa 319  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11404650 caaatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttaa 11404716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 32629418 - 32629293
Alignment:
Q  169 gttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggacc 266  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||   ||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||| ||||||    
T  32629418 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaaatcctcgaaacagcctcttgtaaaaaaacagggtaaggccgcctac-atacaccaaattggcgggacc 32629320  T
Q  267 ccttcccggaccctgcatatgcgggag 293  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||    
T  32629319 ccttcccggaccttgcgtatgtgggag 32629293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 141 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5313172 - 5313099
Alignment:
Q  141 gggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagc 214  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5313172 gggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaattcctgaaaacagc 5313099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 243 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 33836563 - 33836487
Alignment:
Q  243 tacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  33836563 tacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaacgggttgcccttt 33836487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 40553998 - 40553934
Alignment:
Q  256 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaat 320  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40553998 atggtgtgaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttaat 40553934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23580365 - 23580208
Alignment:
Q  162 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaatg 258  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||    
T  23580365 taaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagttctagaaagagcctcttgtgtaaaaaacaggggaagactgcgtaggatacaccaaaatg 23580266  T
Q  259 gtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    | | |||||||||  ||| ||||  |||| ||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  23580265 gcgagaccccttcttgga-cctgtgtatgtgggagctttagtgcaccgagctgcccttt 23580208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 224 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 36816478 - 36816384
Alignment:
Q  224 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat-ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  36816478 aaaacagggcagggctgcgtacaatacaccaaaaaggtgggactccttcctggaccctgtgtatgcgggagctttagtgtaccgggttgcccttt 36816384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 253 - 313
Target Start/End: Original strand, 28494222 - 28494282
Alignment:
Q  253 caaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 313  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28494222 caaatggtgggaccccttcccagatcctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggctgcc 28494282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 241
Target Start/End: Original strand, 43035224 - 43035307
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgta--aaacagggtaaggctgc 241  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  43035224 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccaggaaacaacctcttgtgtaagaaacacggtaaggctgc 43035307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 255 - 318
Target Start/End: Original strand, 25388249 - 25388312
Alignment:
Q  255 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25388249 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcatgagctttagtgcaccgggttgcccttta 25388312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 314
Target Start/End: Original strand, 36589708 - 36589876
Alignment:
Q  147 ccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgta 244  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||  ||||| ||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||   |    
T  36589708 ccttggcgcaac-ggtaaagttgatgtcacatgactgaaacgtc-caggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaatgctgttga 36589805  T
Q  245 caatacacc-aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 314  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||| | |||||   |||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  36589806 cagtacaccaaaatggtgggaccccttcctgaaccctatgtatgcgggagctttggtgcaccgggctgccc 36589876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 224 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 48327858 - 48327762
Alignment:
Q  224 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||| || | |||||||||||||| |||||||    
T  48327858 aaaacagggtaagactgcatacaatacaccaataatggtgggacctcttcccgaaccccacatatgcggaagttttagtgcaccgggttacccttta 48327762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 54640510 - 54640431
Alignment:
Q  147 ccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa 227  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  54640510 ccttggcgcaac-ggtaaaattgttgtcacgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaa 54640431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 317
Target Start/End: Original strand, 35532077 - 35532127
Alignment:
Q  267 ccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35532077 ccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 35532127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 318
Target Start/End: Original strand, 44718641 - 44718703
Alignment:
Q  256 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  44718641 atggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagcacaccgggttgcccttta 44718703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12711542 - 12711450
Alignment:
Q  224 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 316  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||  || ||||||| | || |||||||||  |||||||||    
T  12711542 aaaatagggtaagactgcgtacaatacaccaaatggcgggaccccttctcagacctagcgtatgcggaaactttagtgcacccagttgccctt 12711450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 308
Target Start/End: Original strand, 16494258 - 16494345
Alignment:
Q  223 taaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 308  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  16494258 taaaacagggtaaagctgcatacaatacaccaaaaatggtgggaccctttcccagaccctgtgtatgcggaagctttagtgtaccggg 16494345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 49938594 - 49938490
Alignment:
Q  163 aaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtacaataca-ccaaatggt 260  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||| || || |||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  49938594 aaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacagattcaagtcttggaagcagcgtattgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtccaattcatcaaaatggt 49938495  T
Q  261 gggac 265  Q
    |||||    
T  49938494 gggac 49938490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 317
Target Start/End: Original strand, 2813169 - 2813263
Alignment:
Q  226 aacagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctct-agtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||| ||  ||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  2813169 aacagggtaagactgcgtacaatacatcaataatggtgggaccctttcccgaacgatgcgtatgcgggagctttaagtgcaccggattgcccttt 2813263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 47482913 - 47482850
Alignment:
Q  254 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| || | ||||||||    
T  47482913 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgcaacgagctgcccttt 47482850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 254
Target Start/End: Original strand, 51420537 - 51420646
Alignment:
Q  147 ccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacggg-ttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgta--aaacagggtaaggctgcgt 243  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||| |||||| ||||||||   | |||||||| || ||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  51420537 ccttggcgcaac-ggtgaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcagttgattcaagtcatggaaacaacctcttgtgtagaaaacagggtaaggctgggt 51420635  T
Q  244 acaatacacca 254  Q
    |||||||||||    
T  51420636 acaatacacca 51420646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 317
Target Start/End: Original strand, 56322984 - 56323035
Alignment:
Q  266 cccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  56322984 cccttcccggaccccggatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 56323035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 255 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 50555718 - 50555656
Alignment:
Q  255 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||| ||||||||    
T  50555718 aatggtggaaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagttttagtgcaccgggctgcccttt 50555656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12257752 - 12257688
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgta 224  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  12257752 ggtaaagttgttgtcacgtgattgaaaggtcacgggttcaaatcctagaaacagcgtcttgtgta 12257688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 181
Target Start/End: Original strand, 18969698 - 18969738
Alignment:
Q  141 gggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgac 181  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18969698 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgac 18969738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 317
Target Start/End: Original strand, 19027986 - 19028046
Alignment:
Q  257 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19027986 tggtgggactccttcccggaccccacttatgcgggagctttagtgcaccgggctgcccttt 19028046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17079777 - 17079691
Alignment:
Q  193 gggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgta--aaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggac 277  Q
    ||||||||||| || |||||   |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||| ||||    
T  17079777 gggttcaagtcttggaaacaatatcttgtgtataaaacagggtaaggctgcatacaatacgctaaatggtgggaccctttcctggac 17079691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 29879679 - 29879624
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcac 192  Q
    ||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29879679 tgaggggtaacattggtgcaactgataaagttgttgtcatgtgactagaaggtcac 29879624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 230
Target Start/End: Original strand, 41549358 - 41549428
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacag 230  Q
    ||||||||||||| ||  ||| | ||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41549358 ggtaaagttgttgacacatgattgaaatgtcacgggttcaagttctggaaacaacctcttgtgtaaaacag 41549428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 10380086 - 10379997
Alignment:
Q  175 atgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaac-agggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtggg 263  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||||||  ||| |||   ||||||||||||||||||| |||||    
T  10380086 atgtgactgaaaggtcacttgttcaagtcctacaaacaacctcttgtgtaaaaataggataaaattgcgtacaatacaccaaatagtggg 10379997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 35894555 - 35894502
Alignment:
Q  224 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccgga 276  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35894555 aaaacacggtaagtgtgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccgga 35894502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 280
Target Start/End: Original strand, 44357195 - 44357319
Alignment:
Q  159 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgta--aaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aa 255  Q
    |||||||||| |||| |||| ||| |||||||| | |||||||||||  ||||| ||| |||||||  ||| || ||||| |  ||||||||||||| ||    
T  44357195 tggtaaagttattgttatgtaactgaaaggtcatgagttcaagtcctagaaacaaccttttgtgtaataaatagagtaagacgacgtacaatacaccaaa 44357294  T
Q  256 atggtgggaccccttcccggaccct 280  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||    
T  44357295 atggcgggacctcttcccagaccct 44357319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 294
Target Start/End: Original strand, 46082785 - 46082856
Alignment:
Q  224 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca-aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagc 294  Q
    |||| ||| ||||||||||||  |||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46082785 aaaataggttaaggctgcgtattatacacaataatggtgagactccttctcggaccctgcatatgcgggagc 46082856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4222113 - 4222071
Alignment:
Q  232 gtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccg 274  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  4222113 gtaaggctgcgtagaatacacaaattggtgggaccccttcccg 4222071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 50856407 - 50856350
Alignment:
Q  147 ccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcct 205  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  50856407 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacatgattgaaaggtcacgggttcaagtcct 50856350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 255 - 303
Target Start/End: Original strand, 8820581 - 8820629
Alignment:
Q  255 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgca 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| | |||||||    
T  8820581 aatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgagagttttagtgca 8820629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 260 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12666914 - 12666858
Alignment:
Q  260 tgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 316  Q
    |||||||||||  |||||| ||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  12666914 tgggaccccttgtcggaccatgcgtatgcaggagctttagtacaccgggttgccctt 12666858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 160; Significance: 5e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Original strand, 30533 - 30712
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 237  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30533 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaccggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaggg 30632  T
Q  238 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30633 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 30712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 81)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21779441 - 21779261
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 236  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  21779441 tgaggggtaaccttggcgcaactggtgaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggagacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 21779342  T
Q  237 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21779341 gttgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 21779261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 137 - 318
Target Start/End: Original strand, 23397719 - 23397900
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 236  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23397719 tgaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaatagggtaag 23397818  T
Q  237 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23397819 gctacgtacaatacaccaaatggtgggaccccttctcggaccctacatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 23397900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 8455497 - 8455316
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaa 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  8455497 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacacagggtaa 8455398  T
Q  236 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8455397 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgccggagctttagtgcaccgggttgcccttt 8455316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Original strand, 9671134 - 9671314
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgacta-aaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 236  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9671134 gaggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactggaaatgtcacgggttcaaatcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 9671233  T
Q  237 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9671234 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 9671314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 137 - 318
Target Start/End: Original strand, 14530271 - 14530456
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 234  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  14530271 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggta 14530370  T
Q  235 aggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14530371 aggctacgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttta 14530456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 139 - 317
Target Start/End: Original strand, 10543653 - 10543835
Alignment:
Q  139 aggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaag 236  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  10543653 aggggtaaccttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacggcctcttgtgtaaaaaacagggtaag 10543752  T
Q  237 gctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10543753 gctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 10543835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 138 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 12024099 - 12023929
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaag 236  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12024099 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaag 12024000  T
Q  237 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || |||| || ||||||||    
T  12023999 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccctcccggaccctgcgtatttggaagctttaatgcaccgg 12023929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 141 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25249915 - 25249738
Alignment:
Q  141 gggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgta-aaacagggtaaggct 239  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  25249915 gggtaaccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcatggaaacagtctcttgtgtacaaacagggtaaggct 25249816  T
Q  240 gcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25249815 gcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccctgcgtatgcgtgagctttagtgcaccgggttgcccttt 25249738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 140 - 317
Target Start/End: Original strand, 11514392 - 11514570
Alignment:
Q  140 ggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagg 237  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||  ||||||    
T  11514392 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaactcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaagtaagg 11514491  T
Q  238 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11514492 ctgcgtacaatacaccaaatggtggga-cccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgcccttt 11514570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25079900 - 25079717
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggt 233  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||   || |||    
T  25079900 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcttagaaacaacctcttgtgtaaaaaaacaaggt 25079801  T
Q  234 aaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25079800 aaggatgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaagagctttagtgcaccgggttgcccttt 25079717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 139 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 24200805 - 24200623
Alignment:
Q  139 aggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaag 236  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24200805 aggggtaaccttgatgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaag 24200706  T
Q  237 gctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  |||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24200705 gctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaacccttcccggaccctgagtatgtgagagctttagtgcaccgggttgcccttt 24200623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 175 - 317
Target Start/End: Original strand, 10546153 - 10546298
Alignment:
Q  175 atgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttc 271  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10546153 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacatcctcttgtataaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttc 10546252  T
Q  272 ccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10546253 ccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 10546298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 137 - 281
Target Start/End: Original strand, 22371010 - 22371153
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 236  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||    
T  22371010 tgaggggtaaccttggcccaactggtaaagttgttgtcatgtgactgggaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcgtgta-aaaacagggtaag 22371108  T
Q  237 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctg 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22371109 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctg 22371153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 175 - 317
Target Start/End: Original strand, 14444720 - 14444863
Alignment:
Q  175 atgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttccc 273  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14444720 atgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgtgtacgatacaccaaatggtgggaccccttccc 14444819  T
Q  274 ggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  14444820 ggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgcccttt 14444863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 157 - 317
Target Start/End: Original strand, 17667975 - 17668137
Alignment:
Q  157 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacacca 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17667975 actggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggctgcgtacaatacacca 17668074  T
Q  255 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17668075 aatggtggaaccccttctcgaaccctgcgtatatgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 17668137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 140 - 317
Target Start/End: Original strand, 17896215 - 17896395
Alignment:
Q  140 ggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca---gggtaag 236  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| |   |||||||    
T  17896215 ggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacaacctcttgtgtaaaaaaatagggtaag 17896314  T
Q  237 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  17896315 gctgcgtacaatataccaaatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcatcgagttgcccttt 17896395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Original strand, 5840982 - 5841165
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 235  Q
    ||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||  |||| |||||||    
T  5840982 gaggggtaaccttggtgcaaatgataaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaa 5841081  T
Q  236 ggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    || ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  5841082 ggatgcgtacaatacatcaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgagttgcccttt 5841165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 157 - 317
Target Start/End: Original strand, 17623537 - 17623699
Alignment:
Q  157 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacacca 254  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17623537 actggtaaagttgttgtcatgcgactggaaggtcacgggttcaagtcctcgaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggctgcgtacaatacacca 17623636  T
Q  255 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||| |||| || |||| |||||||| ||||||||||||    
T  17623637 aatggtggaaccccttcccgaatcctgcgtatgtggaagctttagtgcactgggttgcccttt 17623699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 144 - 317
Target Start/End: Original strand, 27573581 - 27573755
Alignment:
Q  144 taaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgta-aaacagggtaaggctgcg 242  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27573581 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcattggttcaagtccgggcaacagcctcttgtgtataaacatggtaaggctgcg 27573680  T
Q  243 tacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||  ||||||  |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27573681 tacaatacaccaaatggtggaaccatttcccaaaccctgtgtatgtgggagctttagtgcatcgggttgcccttt 27573755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 317
Target Start/End: Original strand, 36871509 - 36871626
Alignment:
Q  200 agtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctcta 298  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  36871509 agtcctggaaacagcctcttgtgtgaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccgga-cctgcgtatgcgggagcttta 36871607  T
Q  299 gtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||    
T  36871608 gtgcaccgggttgcccttt 36871626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 140 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 19977893 - 19977726
Alignment:
Q  140 ggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagg 237  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||  |||| ||| |||||    
T  19977893 ggggtaaccttggcggaactggtgaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttttgtaaaaaataggataagg 19977794  T
Q  238 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 305  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||||| |||||||||    
T  19977793 ttgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagctttagtgcacc 19977726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 158 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 39914467 - 39914306
Alignment:
Q  158 ctggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||| || ||||||||||||     
T  39914467 ctggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggatcaagtactggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaaggatgtgtacaatacaccg 39914368  T
Q  255 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  39914367 aatggtgggacccctt-cctgaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcccttt 39914306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 159 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 40417031 - 40416870
Alignment:
Q  159 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  40417031 tggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcatggaaacaacctcttgtataaaaaacagggaaaggctgtgtacaatacaccaat 40416932  T
Q  257 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    || |||||||| ||   |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40416931 tgatgggacccttttttggaccctgcatatgcgagagctttagtgcaccgggttgcccttta 40416870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 138 - 313
Target Start/End: Original strand, 7214488 - 7214667
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaa 235  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  7214488 gaggggtaactttggcacaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaatacagggtaa 7214587  T
Q  236 ggctgcgtacaatacac--caaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 313  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| || |||||| ||||| |||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||    
T  7214588 ggctgcgtacaatacacaaaaaatggtgagatcccttctcggacactgcgtatgcgagagttttagtgcaccaggttgcc 7214667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 26684803 - 26684620
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacag-cctcttgtgtaaaacag---ggt 233  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |    |||    
T  26684803 gaggggtaactttagcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcaaaggtttaagtcctgaaaacagacctcttgtgtaaaaaaatatggt 26684704  T
Q  234 aaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||| |||||    
T  26684703 aaggctgcgtacaatatactaaatggtgggacctcttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttaatgcaccggattgtccttt 26684620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 161 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 99421 - 99281
Alignment:
Q  161 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggt 260  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  99421 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtaaaaaacatggcaaggctgcgtacaatacaccaaatggt 99322  T
Q  261 gggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtg 301  Q
    || |||||||| | |||||||  |||||||||||| |||||    
T  99321 ggaaccccttctcagaccctgtgtatgcgggagctttagtg 99281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 139 - 318
Target Start/End: Original strand, 14544018 - 14544202
Alignment:
Q  139 aggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaa 235  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| || || ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  14544018 aggggtaaccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacaggtccaggtactggaaacagcctcttgtgtagaaaaacagggtaa 14544117  T
Q  236 ggctgcgtacaata--caccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    | |||||| |||||  ||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  14544118 gactgcgtgcaataaccaaaaaatggtcggaccccttccgggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaagttgcccttta 14544202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24860157 - 24859992
Alignment:
Q  148 cttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtaca 246  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||||| || |||| |||||||||||    
T  24860157 cttggcgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactggaaggttacgggtttaagccctggaaacaacctctggtgtaaaaacatggta-ggctgcgtaca 24860059  T
Q  247 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 313  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24860058 atacaccaaatggtagaaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgcc 24859992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 169 - 317
Target Start/End: Original strand, 25641487 - 25641636
Alignment:
Q  169 gttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccc 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25641487 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcattttgtgtgaaaacagggtaaagttgcgtacaatacaccaaattgtgggaccc 25641586  T
Q  268 cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||| | ||||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||    
T  25641587 cttcccgaatcctgcgtatgcgagagctttagtgaaccggattgtccttt 25641636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 160 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21377232 - 21377074
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 257  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |  ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21377232 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacgagttcaagtcatagaaacatcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgggtacaatgcaccaaat 21377133  T
Q  258 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | |||||||| | ||||||||    
T  21377132 ggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgtgggagct-ttgtgcaccgagctgcccttt 21377074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 162 - 280
Target Start/End: Original strand, 5450263 - 5450384
Alignment:
Q  162 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatg 258  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  5450263 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaattcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacatggtaaggctgcgtacaatacaccaaagg 5450362  T
Q  259 gtgggaccccttcccggaccct 280  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  5450363 gtgggaccccttcctggaccct 5450384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 138 - 254
Target Start/End: Original strand, 17705449 - 17705567
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaa--aacagggtaa 235  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||| ||||    
T  17705449 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaaccgcctcttgtgtaaacaacagagtaa 17705548  T
Q  236 ggctgcgtacaatacacca 254  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  17705549 ggctgtgtacaatacacca 17705567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 147 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4516522 - 4516354
Alignment:
Q  147 ccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgta 244  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||   ||||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||    
T  4516522 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacatattcaagttctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggcaacgctgcgta 4516424  T
Q  245 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 314  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||| |||||| |||||    
T  4516423 caatacaccaattggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtggaagctttagtgtaccgggctgccc 4516354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 17380391 - 17380237
Alignment:
Q  164 aagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgta-aaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgg 262  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||| |||    
T  17380391 aagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtataaacagggtaaggttgtgtgcaatacaccaaatgatgg 17380292  T
Q  263 gaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
     ||||||||| |||||||||  ||||||||||| | |||||||||| | |||||||    
T  17380291 aaccccttcctggaccctgcggatgcgggagct-ttgtgcaccgggcttcccttta 17380237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 32781467 - 32781310
Alignment:
Q  139 aggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaag 236  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||  ||||  || |||||||||| |||||||||  | ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  32781467 agggggaaccttggcgcaa-tggtaaagttgttgcaatgttgctgaaaggtcacgagttcaagtctcggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 32781369  T
Q  237 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  32781368 actgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccagaccctgtgtatgcgggagct 32781310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 159 - 317
Target Start/End: Original strand, 44643497 - 44643658
Alignment:
Q  159 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa 255  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||| ||  ||| ||||||||  ||||||   ||| |||||||||||||||||  |||||    
T  44643497 tggtaaagttgtcatcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagttctagaaagagcctcttccgtaaaaaaacagagtaaggctgcgtacaatgtaccaa 44643596  T
Q  256 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  44643597 atggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagccttagtgcaccgggctgcccttt 44643658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23145857 - 23145736
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 257  Q
    ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  23145857 ggtaaagttgttgtagcgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagactcttgtgtaaaaaacagtgtaaggctgcgtacaatacaccaatt 23145758  T
Q  258 ggtgggaccccttcccggaccc 279  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  23145757 ggtgggaccctttcccggaccc 23145736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 160 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23557647 - 23557526
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 257  Q
    ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  23557647 ggtaaagttgttgtagcgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagactcttgtgtaaaaaacagtgtaaggctgcgtacaatacaccaatt 23557548  T
Q  258 ggtgggaccccttcccggaccc 279  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  23557547 ggtgggaccctttcccggaccc 23557526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 208 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 40762345 - 40762234
Alignment:
Q  208 aaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 305  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  40762345 aaacagcctcttgtgtaaaaaactgggtaaggctacgtacaatacaccaaatggtgggaccctttcctggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcacc 40762246  T
Q  306 gggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||    
T  40762245 gggttgcccttt 40762234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 162 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 31158598 - 31158451
Alignment:
Q  162 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaat 257  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||| ||  |||||||||||||  ||| ||||||| |||  ||||    
T  31158598 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttaaagtcttcaaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggtaagattgcatacaataaaccaaaaat 31158499  T
Q  258 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  31158498 ggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtacacc 31158451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 160 - 295
Target Start/End: Original strand, 33795261 - 33795398
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtac-aatacaccaaa 256  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  33795261 ggtaaagttgttgtcacgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcccggaaacaacctcttgggtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaaatacacc-ta 33795359  T
Q  257 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  33795360 tggtgggaccccttcccagaccctgtgtatgcgggagct 33795398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 185 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 13245220 - 13245091
Alignment:
Q  185 aaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcat 284  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||       |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13245220 aaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtgt-------ggtaaggctgcgtacattacactaaatggtgggaccccttcccggaccatgcat 13245128  T
Q  285 atgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaatg 321  Q
    || |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||    
T  13245127 atacgggagctttagtgtatcgggttgcccttgaatg 13245091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 224 - 317
Target Start/End: Original strand, 25632551 - 25632644
Alignment:
Q  224 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25632551 aaaacaggataaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggattccttcccgaaccttacgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 25632644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 199 - 305
Target Start/End: Original strand, 30826052 - 30826158
Alignment:
Q  199 aagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaac-agggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctct 297  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  30826052 aagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaatagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggt-ggaacccttcccagaccctacatatgcgggagcttt 30826150  T
Q  298 agtgcacc 305  Q
    ||||||||    
T  30826151 agtgcacc 30826158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 173 - 305
Target Start/End: Original strand, 19614981 - 19615116
Alignment:
Q  173 tcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggacccc 268  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| || |||||||    
T  19614981 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccttgaaacatcctcttgtataaaaaacagggtaagactgcgtacaatataccaataatagt-ggacccc 19615079  T
Q  269 ttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 305  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  19615080 ttcccgaaccctgcgtatgcaggagctttagtgcacc 19615116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 224 - 304
Target Start/End: Original strand, 24890453 - 24890533
Alignment:
Q  224 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcac 304  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  24890453 aaaacaaggtaaggctgcatacaatacaccaattggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcac 24890533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 160 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 44521532 - 44521395
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 257  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||| || || |||||  |||||||||||||  || ||||||||||| || ||||||||||||    
T  44521532 ggtaaagttgttatcacgtgactgaaaggtcacgcgttcaaatcttggaaacaatctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcatataatacaccaaat 44521433  T
Q  258 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
    || |||| |||||||| |||  ||||||| ||||||||    
T  44521432 ggcgggagcccttcccagacattgcatatacgggagct 44521395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 45235976 - 45235820
Alignment:
Q  161 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaa---aacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 257  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||  |||||| ||||| |||||   || ||||||||||| |||  ||||||| ||||    
T  45235976 gtaaagttgttctcatgtgactgaaagatcacgagttcaagtcctagaaacagtctcttctgtaaaataatagggtaaggctacgtgtaatacacaaaat 45235877  T
Q  258 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 314  Q
    ||||||||||||| || |||||| | ||||| |||||| ||||| |||  |||||||    
T  45235876 ggtgggaccccttaccagaccctacgtatgcaggagctttagtgtaccaagttgccc 45235820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 173 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 44449529 - 44449418
Alignment:
Q  173 tcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttg--tgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaatggtgggacccct 269  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  44449529 tcatgtaactgaaaggtcacgagttcaa-tcctaaaaacaacctcttgaatgaaaaacaggataaggctgcgtacaatacaccaaaatagtgggacccct 44449431  T
Q  270 tcccggaccctgc 282  Q
    |||||||||||||    
T  44449430 tcccggaccctgc 44449418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 257 - 317
Target Start/End: Original strand, 34080176 - 34080236
Alignment:
Q  257 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  34080176 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagttttagtgcaccgggttgcccttt 34080236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 315
Target Start/End: Original strand, 41409936 - 41409995
Alignment:
Q  256 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41409936 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagcttcagtgcaccgggttgccct 41409995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 29420048 - 29419946
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagg----gtaaggctgcgtacaatacacc 253  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  29420048 ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagtaaggctgcgtacaatacacc 29419949  T
Q  254 aaa 256  Q
    |||    
T  29419948 aaa 29419946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 15296533 - 15296406
Alignment:
Q  193 gggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcg 289  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||| |||||||||| |||| |    
T  15296533 gggttcaagtcccggaaacagcctgttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatataccaaaatagtgggatcccttctcggaccctgcgtatgtg 15296434  T
Q  290 ggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    | |||| | |||| || || ||||||||    
T  15296433 gaagctttggtgcgccaggctgcccttt 15296406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 169 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 31821491 - 31821355
Alignment:
Q  169 gttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacccc 268  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |  ||||||||   |||  |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31821491 gttgttatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcgtagaaacagccgtgtgtaaaaaatagggtaaggttgtgtacaatacaccaaatgatgggacccc 31821392  T
Q  269 ttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 305  Q
    || ||| | ||||  |||||||||||| || ||||||    
T  31821391 tttccgaaacctgtgtatgcgggagctttaatgcacc 31821355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 40579810 - 40579750
Alignment:
Q  256 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40579810 atggtgggaccccttcccggaccctgagtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 40579750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 236
Target Start/End: Original strand, 44604827 - 44604907
Alignment:
Q  157 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaag 236  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  44604827 actgctaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaag 44604907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 254 - 317
Target Start/End: Original strand, 23488555 - 23488618
Alignment:
Q  254 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  23488555 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggttgctcttt 23488618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 251 - 304
Target Start/End: Original strand, 4794871 - 4794924
Alignment:
Q  251 accaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcac 304  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4794871 accaaatgatgggaccccttcccggatcctgcatatgcgggagctctagtgcac 4794924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 208 - 307
Target Start/End: Original strand, 17471572 - 17471675
Alignment:
Q  208 aaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgca 303  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| |||| |||||||||||| |||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||    
T  17471572 aaacagcctcttgtgtaaaaaaacaggataagactgcgtacaatataccaaaatgatgagaccccttccctgaccctgcctatgcgggagttttagtgca 17471671  T
Q  304 ccgg 307  Q
    ||||    
T  17471672 ccgg 17471675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 178 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 2003678 - 2003592
Alignment:
Q  178 tgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtg 261  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||   |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2003678 tgactgaaaggtcacgggtacaagtcctggaaacagccccttgcgtaaaaaaacagggtaaggatgcgtacaatacaacaaatggtg 2003592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 322
Target Start/End: Original strand, 8575975 - 8576035
Alignment:
Q  262 ggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaatgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  8575975 ggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccaggttgccctttaatgt 8576035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 257 - 317
Target Start/End: Original strand, 34766330 - 34766390
Alignment:
Q  257 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  34766330 tggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaacgggtttcccttt 34766390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 266 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 39189555 - 39189508
Alignment:
Q  266 cccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 313  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39189555 cccttcccggaccccgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 39189508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 3633762 - 3633708
Alignment:
Q  263 gaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3633762 gaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgagttgcccttt 3633708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 317
Target Start/End: Original strand, 4795730 - 4795890
Alignment:
Q  161 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa- 256  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||  ||| ||||| ||||||||||||| || ||||||   || | | || |||||| ||||||||||||     
T  4795730 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaagtcacttgttgaagtcttgaaaacagcctcatgcgtaaaaaaacaagattagactgcgtgcaatacaccaaaa 4795829  T
Q  257 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||  ||||| | |||| |||||||  ||||||||||||    
T  4795830 tggtgggaccttttcccggaccttgtgtatgccgaagctttagtgcagtgggttgcccttt 4795890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 215
Target Start/End: Original strand, 35017781 - 35017849
Alignment:
Q  147 ccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgacta-aaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcc 215  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35017781 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgacttgaaaggtcacgggtttaagtcctgaaaacagcc 35017849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 39189603 - 39189558
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgact 182  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39189603 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgact 39189558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 39499323 - 39499242
Alignment:
Q  224 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 305  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||  || | ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  39499323 aaaatagggtaaagctgcgtacaatacatcaaatggtgggatcccttttcgaatcctgcgtatgcgggagctttagtgcacc 39499242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 317
Target Start/End: Original strand, 22371199 - 22371247
Alignment:
Q  269 ttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22371199 ttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 22371247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 317
Target Start/End: Original strand, 1289095 - 1289158
Alignment:
Q  255 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagc-tctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  1289095 aatggtgggaccccttcccggatcatgcatatgcgggagcttttagtgcaccggattgcccttt 1289158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 314
Target Start/End: Original strand, 31525771 - 31525838
Alignment:
Q  247 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 314  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  31525771 atacaccaaatgatgggaccctttgccagaccctgcatatgcgggagctttagtgtaccggattgccc 31525838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 247 - 309
Target Start/End: Original strand, 31523296 - 31523358
Alignment:
Q  247 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggt 309  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31523296 atacaccaaatggtggaaccctttcccaaaccctgcatatgcgggagctttagtgcactgggt 31523358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 30864536 - 30864439
Alignment:
Q  199 aagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaac-agggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || || |||||  ||||||| ||||||| ||||    
T  30864536 aagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaaatagggtaagggtgcgtacaatataccaaatggtaagatcctttcccaaaccctgcgtatgcggaagct 30864439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 124962 - 124918
Alignment:
Q  269 ttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 313  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  124962 ttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 124918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 246 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 24059067 - 24059012
Alignment:
Q  246 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtg 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  24059067 aatacaccatatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgtgggagctttagtg 24059012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12315786 - 12315697
Alignment:
Q  184 aaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcc 272  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||| |||| |  |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  12315786 aaaggtcacgagttcaagtcatggaaacagcttcttattaaaaaacagggtaagactgtgtacaatacaccaaatagtgagactccttcc 12315697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 138 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 27466311 - 27466262
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaag 187  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27466311 gaggcgtaacattggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaag 27466262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 227
Target Start/End: Original strand, 17472926 - 17473014
Alignment:
Q  139 aggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa 227  Q
    ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||| ||| |  ||| ||||| ||||||||||    
T  17472926 aggggtaaccttgacgcaactaataaagttgttgtcaaatgattgaaaggtcacgggttcaggtcttagaaatagcctattgtgtaaaa 17473014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 19185806 - 19185742
Alignment:
Q  254 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| || || ||| |||||||    
T  19185806 aaatggtggaaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtacatcgagttacccttta 19185742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4852388 - 4852306
Alignment:
Q  142 ggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa 227  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||   ||||||||  ||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  4852388 ggtaaccttggtgcaactggcaaagttgt---catgtgaccgaaaagtcaggggttcaagtcctgcaaacagtctcttgtgaaaaa 4852306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 276
Target Start/End: Original strand, 4252656 - 4252684
Alignment:
Q  248 tacaccaaatggtgggaccccttcccgga 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4252656 tacaccaaatggtgggaccccttcccgga 4252684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 148; Significance: 7e-78; HSPs: 80)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Original strand, 35710267 - 35710446
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 237  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35710267 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaatagggtaagg 35710366  T
Q  238 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35710367 ctgcgttcaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaacatgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 35710446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Original strand, 41014272 - 41014453
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaa 235  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41014272 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaa 41014371  T
Q  236 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41014372 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcctggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 41014453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 8170163 - 8169984
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaagg 237  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8170163 gagggctaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaacagggtaagg 8170064  T
Q  238 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  8170063 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagtttcagtgcaccgggttgcccttt 8169984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 171 - 317
Target Start/End: Original strand, 32703411 - 32703557
Alignment:
Q  171 tgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacccctt 270  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32703411 tgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacccctt 32703510  T
Q  271 cccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32703511 cccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 32703557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Original strand, 38879534 - 38879718
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 234  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  38879534 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggta 38879633  T
Q  235 aggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38879634 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 38879718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 138 - 317
Target Start/End: Original strand, 24448844 - 24449025
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaa 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||    
T  24448844 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaa 24448943  T
Q  236 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24448944 ggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgggttgcccttt 24449025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 141 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 4619284 - 4619104
Alignment:
Q  141 gggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggc 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4619284 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 4619185  T
Q  239 tgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  4619184 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgagagctttagtgcaccgggttgcccttt 4619104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 141 - 317
Target Start/End: Original strand, 43334159 - 43334339
Alignment:
Q  141 gggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt---aaaacagggtaagg 237  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||||||||    
T  43334159 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaaaacagggtaagg 43334258  T
Q  238 ctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43334259 ctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgc-gatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 43334339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 138 - 318
Target Start/End: Original strand, 1565385 - 1565567
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa---cagggta 234  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||   ||   ||    
T  1565385 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgagtaaaaaaacatatta 1565484  T
Q  235 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1565485 aggctgcgtacaatgcaccaaatggcgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagct-tagtgcaccgggttgcccttta 1565567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 199 - 314
Target Start/End: Original strand, 7368413 - 7368528
Alignment:
Q  199 aagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctcta 298  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7368413 aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaattggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctcta 7368512  T
Q  299 gtgcaccgggttgccc 314  Q
    ||||||||||||||||    
T  7368513 gtgcaccgggttgccc 7368528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 136 - 313
Target Start/End: Original strand, 27328704 - 27328885
Alignment:
Q  136 ctgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggt 233  Q
    |||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||    
T  27328704 ctgaagggtaaccttgacgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggt 27328803  T
Q  234 aaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 313  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||| ||| |||||    
T  27328804 aaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttaatgcatcggattgcc 27328885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 141 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22861844 - 22861669
Alignment:
Q  141 gggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctg 240  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||||||||| | |||| |||    
T  22861844 gggtaaccttggcacaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaagcagtctcttgtgtaaaacaag-taagactg 22861746  T
Q  241 cgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22861745 ctcacaatacatcaaatggtgggaccccttctcgaaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgaattgcccttt 22861669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 137 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 37024736 - 37024626
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 236  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37024736 tgaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaag 37024637  T
Q  237 gctgcgtacaa 247  Q
    |||||||||||    
T  37024636 gctgcgtacaa 37024626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 159 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 19143102 - 19142943
Alignment:
Q  159 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 257  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19143102 tggtaaaattgttgtcacgtgactaaaatgccacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcgtacagtacaccaaat 19143003  T
Q  258 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||| ||  ||||||||    
T  19143002 ggtgggaccccttcccggaccatgcgtatgcgggagatttagtgcactggcctgcccttt 19142943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 139 - 294
Target Start/End: Original strand, 2838733 - 2838890
Alignment:
Q  139 aggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgacta-aaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaag 236  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||    ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  2838733 aggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaaggtcacgaggtcaagtctcagaaacagcatcttgtgtaaaaacagggtaag 2838832  T
Q  237 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  2838833 gctgcgtacaatacaccaaatggtgggatcccttctcggaccctgcgtatgcgggagc 2838890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 193 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 13801895 - 13801766
Alignment:
Q  193 gggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgc 288  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13801895 gggttcaagtcctggaagcagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgc 13801796  T
Q  289 gggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13801795 gagagctttagtgcaccgggttgcccttta 13801766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 223 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 34154908 - 34154813
Alignment:
Q  223 taaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34154908 taaatcagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcggtagctctagtgcaccgggttgcccttta 34154813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 167 - 317
Target Start/End: Original strand, 1405170 - 1405322
Alignment:
Q  167 ttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtggga 264  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| |  | |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1405170 ttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttatataaaaaatagagtaagtttgcgtacaatacaccaaatggtggga 1405269  T
Q  265 ccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  1405270 ccctttcctgaaccctgcatatgcgggagctctagtacaccggattgcccttt 1405322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Original strand, 22600407 - 22600567
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggta 234  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||   | ||||||||||||  |||||    
T  22600407 tgaggggtaaccttgacgtaactggtaaagttgttatcatgtgactggaaggttacgggttcaagtcctggaaacaatattttgtgtaaaacacagggta 22600506  T
Q  235 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22600507 aggctgtgtacaatacaccaaatggtgggatcccttcccggatcctgcgtatgcgggagct 22600567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 160 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 209086 - 208936
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaat 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  209086 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacaagttcaagtcctggcaacaacctcttgtgtaaaaacagggtaaggctgcattcaatacaccaaaat 208987  T
Q  258 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 308  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||    
T  208986 ggtgggaccccttcctggaccctgggtatgcaagagctttagtgcaccggg 208936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 187 - 308
Target Start/End: Original strand, 43574609 - 43574732
Alignment:
Q  187 ggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgta--aaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcat 284  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43574609 ggtcacgtgttcaagtcctggaaacaatctcttgtgtagaaaacagggtaaggctgcgtacaatataccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgt 43574708  T
Q  285 atgcgggagctctagtgcaccggg 308  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||    
T  43574709 atgcgggagctttagagcaccggg 43574732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 149 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12006500 - 12006329
Alignment:
Q  149 ttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacggg-ttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaggctgcgtac 245  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||| |||||| ||||||| |  |||||||||| | |||    
T  12006500 ttggcgcaactgctcaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggggttcaagtc-tggaaacaacctcttatgtaaaaaatagggtaaggctccatac 12006402  T
Q  246 aatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 316  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12006401 aatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccctgcctatgcgggagctttagtgcaccgtgttgccctt 12006329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 144 - 318
Target Start/End: Original strand, 30006285 - 30006461
Alignment:
Q  144 taaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaaggctgc 241  Q
    |||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||| |||||| | ||||  ||||||||||||||     
T  30006285 taacattggcgcaactgataaatttgttgtcatgtgactgaaaggtcatagattcaagtccggaaaacaacctcttatataaacaacagggtaaggctgt 30006384  T
Q  242 gtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||   |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  30006385 gtacattacactaaatggtgggaccccttcccggggcctatgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcctttta 30006461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 209 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16880757 - 16880646
Alignment:
Q  209 aacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccg 306  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16880757 aacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgtgaccacttcccggaccatgcgtatgcgggagctttagtgcaccg 16880658  T
Q  307 ggttgcccttta 318  Q
    |||| |||||||    
T  16880657 ggtttcccttta 16880646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 137 - 318
Target Start/End: Original strand, 22187238 - 22187423
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 234  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| | ||    
T  22187238 tgaggggtaactttggcgcaactagtaaagttgttgtcatttgactgaaaggtcaccggtttaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacatgata 22187337  T
Q  235 aggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    || ||||||||||||||||  |||   || |||||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  22187338 agactgcgtacaatacaccaaaaacaatgagaccccttcccaaaccctacatatgcaggagctttagtgcatcaggttgcccttta 22187423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 206 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 7097872 - 7097759
Alignment:
Q  206 gaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcac 304  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  7097872 gaaaacagcctcttgtgtaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaatggtgagaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcac 7097773  T
Q  305 cgggttgcccttta 318  Q
    |  | |||||||||    
T  7097772 catgctgcccttta 7097759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 160 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 28516593 - 28516433
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaataca-ccaaa 256  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||| | |||    
T  28516593 ggtaaagttgttgtcaggtggctgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacatcctcttgtgtaaaaaacaggctagggctgcgtacaatacatcaaaa 28516494  T
Q  257 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  28516493 tggtgggacccattcccagaccctgcgcatgcaggagctttagtggaccaggttgcccttt 28516433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 168 - 307
Target Start/End: Original strand, 1850624 - 1850764
Alignment:
Q  168 tgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacc 266  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1850624 tgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcccggaaataacctcttgtgtaaaaacagaataagggtgcgtacaatacatcaaatggtgggacc 1850723  T
Q  267 ccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 307  Q
     ||||| |||||||||  |||||| |||| |||||||||||    
T  1850724 acttcctggaccctgcggatgcggaagctttagtgcaccgg 1850764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 203 - 316
Target Start/End: Original strand, 20135623 - 20135740
Alignment:
Q  203 cctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctcta 298  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |    
T  20135623 cctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcaggagcttca 20135722  T
Q  299 gtgcaccgggttgccctt 316  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20135723 gtgcaccgggttgccctt 20135740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 147 - 308
Target Start/End: Original strand, 39301087 - 39301249
Alignment:
Q  147 ccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtg--taaaacagggtaaggctgcgta 244  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  39301087 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgttactgaaaggtcacgggttcaagtcttgggaacaacctcttgtgtataaaacagggtaaggatgcgta 39301185  T
Q  245 caatacacc-aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 308  Q
     ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | ||||||||||||    
T  39301186 taatgcaccaaaaaggtgggaccccttcccggaccctccgtatgtgggag-tttagtgcaccggg 39301249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 242 - 317
Target Start/End: Original strand, 16957374 - 16957449
Alignment:
Q  242 gtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16957374 gtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 16957449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 137 - 242
Target Start/End: Original strand, 23974734 - 23974840
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 234  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||    
T  23974734 tgaggggtaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaagagggta 23974832  T
Q  235 aggctgcg 242  Q
    ||||||||    
T  23974833 aggctgcg 23974840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 317
Target Start/End: Original strand, 29334419 - 29334531
Alignment:
Q  208 aaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacacca-aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcac 304  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| || || |||||    
T  29334419 aaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccagaatggtgggacccattcccggaccctgcgtatgtgggatctttaatgcac 29334518  T
Q  305 cgggttgcccttt 317  Q
    |||| ||||||||    
T  29334519 cgggctgcccttt 29334531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 317
Target Start/End: Original strand, 3771318 - 3771474
Alignment:
Q  161 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggt 260  Q
    |||| |||||| ||| |||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||| || |     ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  3771318 gtaatgttgttctcacgtgactgaaaggtcacaggtttaagtcatgtaaacagtctgtgtaaaaaaacagggtaaggctgtgaacaatacaccaattggt 3771417  T
Q  261 gggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  3771418 gggaccccttcccggactctgtgtatgtgggagctttagtgcaccgggctgcccttt 3771474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 160 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 24903855 - 24903696
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaggctgcgtacaatacaccaaat 257  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||| |||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||  || ||||||| |||||| |    
T  24903855 ggtaaatttgttgtcacgtgactgaaaagtcatgggcacaagtcctgaaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaagattgtgtacaatccaccaatt 24903756  T
Q  258 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || | |||||||||| || |||||    
T  24903755 ggtgagaccccttcccggacactgcatacgcgggaactttggtgcaccgggctgtccttt 24903696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 16028683 - 16028624
Alignment:
Q  258 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16028683 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 16028624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 176 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 42924977 - 42924830
Alignment:
Q  176 tgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccccttc 271  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||| | ||||||    
T  42924977 tgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctgaaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaaaatgatggaatcccttc 42924878  T
Q  272 ccgg--accctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    || |  ||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||    
T  42924877 ccagacaccctgcgtatgcggaagctttagtgcaccggattgtccttt 42924830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 169 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22908014 - 22907913
Alignment:
Q  169 gttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt-aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccc 267  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22908014 gttgttatgtgactgaaaggtcaagggttcaagtccaagaaacagcctcttgtgtaaaaacagagtaaggttgcatacaatacaccaaatggtgggaccc 22907915  T
Q  268 ct 269  Q
    ||    
T  22907914 ct 22907913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 258 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 30877623 - 30877562
Alignment:
Q  258 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaa 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30877623 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctctagtgcaccgggttgccctttaa 30877562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 199 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 5873441 - 5873321
Alignment:
Q  199 aagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaac-agggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctct 297  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||| |    
T  5873441 aagtcgtggaaacagcctcttgtgtaaaaatagggtaaggctaagtacactacaccaattggtgggactcctccccggacactgcgtatgcgggagcttt 5873342  T
Q  298 agtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    |||||| |||| |||||||||    
T  5873341 agtgcatcgggatgcccttta 5873321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 162 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 24323862 - 24323727
Alignment:
Q  162 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatgg 259  Q
    |||||||||| || ||||||| ||| ||||   |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||  |||||| ||||| |||||| |    
T  24323862 taaagttgttatcgtgtgactgaaatgtcaaatgttcaagttctggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaagcttgcgtataatactccaaatag 24323763  T
Q  260 tgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24323762 tgggaccccttcccagaccctgtatatgcgggagct 24323727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 162 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 24360486 - 24360351
Alignment:
Q  162 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatgg 259  Q
    |||||||||| || ||||||| ||| ||||   |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||  |||||| ||||| |||||| |    
T  24360486 taaagttgttatcgtgtgactgaaatgtcaaatgttcaagttctggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaagcttgcgtataatactccaaatag 24360387  T
Q  260 tgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24360386 tgggaccccttcccagaccctgtatatgcgggagct 24360351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 202 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 12575779 - 12575659
Alignment:
Q  202 tcctgaaaacagcctcttgtgtaaa---acagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctct 297  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||   ||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |    
T  12575779 tcctggaaacagcctcttgcgtaaataaacaggctaaagttgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcaggagcttt 12575680  T
Q  298 agtgcaccgggttgcccttta 318  Q
     |||||||||| |||||||||    
T  12575679 ggtgcaccgggctgcccttta 12575659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 143 - 256
Target Start/End: Original strand, 31299591 - 31299705
Alignment:
Q  143 gtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgt-gtaaaacagggtaaggctgc 241  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||    
T  31299591 gtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttacaggtcactagttcaagtcctagaaacagcctcttgtattaaaacagtgtaaaactgc 31299690  T
Q  242 gtacaatacaccaaa 256  Q
    |||||||||| ||||    
T  31299691 gtacaatacatcaaa 31299705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 34074717 - 34074573
Alignment:
Q  164 aagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtg 261  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||      
T  34074717 aagttgttgtcacatgactgaaaggtcacaagttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacacagtaaggttgcgttcaatacaccaaatggca 34074618  T
Q  262 ggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 308  Q
    || |||||||||  ||||||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  34074617 gggccccttcccaaaccctgcgtatgggggag--ctagtgcaccggg 34074573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 182 - 282
Target Start/End: Original strand, 41425946 - 41426048
Alignment:
Q  182 taaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccc 279  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | | ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  41425946 taaaatgtcacgggttcaagttctggaaacaacttattgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaattggtgggaccccttcccagactc 41426045  T
Q  280 tgc 282  Q
    |||    
T  41426046 tgc 41426048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 255 - 317
Target Start/End: Original strand, 25622533 - 25622595
Alignment:
Q  255 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25622533 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgcccttt 25622595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 232 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 11657785 - 11657699
Alignment:
Q  232 gtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||| || |||| ||||||| ||||||||    
T  11657785 gtaaggctgcatacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcacacgcgggaactttagttcaccgggctgcccttt 11657699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 31694266 - 31694106
Alignment:
Q  161 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaggctgcgtacaatacaccaaatg 258  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||  |||||||||| |||||| || | || |||||||| |  || ||| ||||| ||||||||||| | ||    
T  31694266 gtaaagttgttgtcacgtgactgataggtcataggttcaagtcttgaaaaaagtcactcgtgtaaaaaataggctaaagctgcatacaatacacctattg 31694167  T
Q  259 gtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttaa 319  Q
     |||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| | ||||||||| |  ||||||||||    
T  31694166 atgggactccttcccagaccttgcgtatgcgggagatttagtgcaccagactgccctttaa 31694106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 194
Target Start/End: Original strand, 19438703 - 19438759
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgg 194  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19438703 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactaaaagatcacgg 19438759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 224 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 9794471 - 9794388
Alignment:
Q  224 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgg 307  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||| |||||||| | |||| |||||||||||    
T  9794471 aaaacagggtaagactgcatacaatacaccaaatagtgggatcccttcacagacccagcatatgcagaagctttagtgcaccgg 9794388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 10943914 - 10943845
Alignment:
Q  247 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  10943914 atacaccaaataacgggaccccttcccggaccctgca-atgcgggagctttagtgcaccgggctgcccttt 10943845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 308
Target Start/End: Original strand, 13774921 - 13774991
Alignment:
Q  238 ctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggg 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  13774921 ctgcgcacaatacaccaaatggcaggatccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 13774991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 280
Target Start/End: Original strand, 18698586 - 18698707
Alignment:
Q  159 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaata-caccaaat 257  Q
    ||||||| | ||||||| |||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| |||||||   | ||||    
T  18698586 tggtaaaatggttgtcacgtgattgaacggtcacgggttcaagtactgaaaacagcctcttgt-aaaaacaaggtacggctgcatacaatatgtcaaaat 18698684  T
Q  258 ggtgggaccccttcccggaccct 280  Q
    || ||||| ||||||||||||||    
T  18698685 ggcgggactccttcccggaccct 18698707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12477205 - 12477132
Alignment:
Q  233 taaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||  ||||| |||||||||    
T  12477205 taaggctgcgtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccggattctgcgtatgcaagagctttagtgcacc 12477132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10306548 - 10306496
Alignment:
Q  244 acaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10306548 acaatacaccaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagct 10306496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21784395 - 21784335
Alignment:
Q  254 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccc 314  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  21784395 aaatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgcgggaggtttagtgcaccgagttgccc 21784335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 240
Target Start/End: Original strand, 22025538 - 22025601
Alignment:
Q  179 gactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctg 240  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22025538 gactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctg 22025601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 313
Target Start/End: Original strand, 39801591 - 39801647
Alignment:
Q  257 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 313  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39801591 tggtgggaccccttcccagaccctacgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 39801647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 316
Target Start/End: Original strand, 19438757 - 19438800
Alignment:
Q  273 cggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19438757 cggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccaggttgccctt 19438800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 317
Target Start/End: Original strand, 32354211 - 32354262
Alignment:
Q  266 cccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32354211 cccttcccggaccctgtgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 32354262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 167 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 9794511 - 9794465
Alignment:
Q  167 ttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacag 213  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9794511 ttgttgtcatgtgatcaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacag 9794465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 270 - 315
Target Start/End: Original strand, 11462913 - 11462958
Alignment:
Q  270 tcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 315  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11462913 tcccgaactctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 11462958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 24313732 - 24313572
Alignment:
Q  162 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctc-ttgtgta--aaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-t 257  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||||| || ||||| || | || ||||  ||||| | ||||| ||||| |||||||||||| |    
T  24313732 taaagttgttgtcacatgactgaaaggtcatgtgttcaagtcttggaaacaacccccttctgtagaaaacaagataaggttgcgttcaatacaccaaaat 24313633  T
Q  258 ggtgggaccccttcccgg-accctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||  || ||  ||||| | |||| |||||||||||| ||||||||    
T  24313632 ggtgggaccccttcccggcgccatgtgtatgctgtagctttagtgcaccgggctgcccttt 24313572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 24356069 - 24355909
Alignment:
Q  162 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctc-ttgtgta--aaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-t 257  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||||| || ||||| || | || ||||  ||||| | ||||| ||||| |||||||||||| |    
T  24356069 taaagttgttgtcacatgactgaaaggtcatgtgttcaagtcttggaaacaacccccttctgtagaaaacaagataaggttgcgttcaatacaccaaaat 24355970  T
Q  258 ggtgggaccccttcccgg-accctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||||||  || ||  ||||| | |||| |||||||||||| ||||||||    
T  24355969 ggtgggaccccttcccggcgccatgtgtatgctgtagctttagtgcaccgggctgcccttt 24355909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 10634317 - 10634211
Alignment:
Q  147 ccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgta 244  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| |||| |||| ||||  ||||||||||||  |||    
T  10634317 ccttggcgcaac-ggtgaagttgttgtcaagtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctagaaacaacctcgtgtgcaaaaatcagggtaaggctcggta 10634219  T
Q  245 caatacac 252  Q
     |||||||    
T  10634218 aaatacac 10634211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 39079937 - 39079882
Alignment:
Q  147 ccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtc 203  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39079937 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgacagaaaggtcacgggttcaagtc 39079882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 4654478 - 4654427
Alignment:
Q  254 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcacc 305  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4654478 aaatggtgggatcccttctcgaaccctgcatatgcgggagctttagtgcacc 4654427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21542532 - 21542489
Alignment:
Q  252 ccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21542532 ccaaatggtgggaccccttcccggactctgcgtatgcgggagct 21542489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 214
Target Start/End: Original strand, 17419887 - 17419944
Alignment:
Q  157 actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagc 214  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  17419887 actggtaaaattgttgtaatgtgactgaaaggttacgagttcaagtcctggaaacagc 17419944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 303
Target Start/End: Original strand, 18426017 - 18426160
Alignment:
Q  162 taaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatgg 259  Q
    |||||||||| | | |||||| ||| ||||| |||| ||||| ||||||||  |||||||||  |||| || | |||| || |||||||||| | |||||    
T  18426017 taaagttgttattacgtgactgaaatgtcacaggtttaagtcttgaaaacaatctcttgtgtaaaaaatagagaaaggttgtgtacaatacatcgaatgg 18426116  T
Q  260 tgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgca 303  Q
    || ||||||||  || || |||| |||||| ||||| |||||||    
T  18426117 tgagaccccttttcgaactctgcgtatgcgagagctttagtgca 18426160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 242 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 39079827 - 39079755
Alignment:
Q  242 gtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||| | |||||||| ||| ||||    
T  39079827 gtacaatacaccaaaatggtgggaccccttcccggaccatgtgtatacgggagttttagtgcacagggctgcc 39079755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 317
Target Start/End: Original strand, 19093885 - 19093948
Alignment:
Q  254 aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19093885 aaatggtatgacccctacccggaccctgcgtatgttggagctttagtgcaccgggctgcccttt 19093948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 176
Target Start/End: Original strand, 41956885 - 41956924
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcat 176  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41956885 tgaggggtaacattggcgcaactggtaaagttgttgtcat 41956924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 3176839 - 3176770
Alignment:
Q  232 gtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcac 304  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||| |||  ||||| |||||| ||||||||    
T  3176839 gtaaggttgcgtacaatacaccaactggtgggaccc---cccggactctgtgtatgccggagctttagtgcac 3176770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 267
Target Start/End: Original strand, 4809986 - 4810094
Alignment:
Q  161 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatg 258  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||| ||| || ||||||||||  |||||  |||||||||  |||| ||| |||| |||| ||||||| | ||||||    
T  4809986 gtaaagttgttgtcacatgagtaaaagatcatggattcaagtccttgaaacaatctcttgtgtcaaaaataggttaagactgcatacaatagatcaaatg 4810085  T
Q  259 gtgggaccc 267  Q
     ||||||||    
T  4810086 atgggaccc 4810094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 300
Target Start/End: Original strand, 15141929 - 15141998
Alignment:
Q  231 ggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagt 300  Q
    |||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  15141929 ggtagggctgtgtgcaatacatcaaatggtgggaccccttcttgaaccctgcttatacgggagctttagt 15141998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 29184103 - 29184062
Alignment:
Q  275 gaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 316  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29184103 gaccatgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 29184062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 31362495 - 31362454
Alignment:
Q  159 tggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaa 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  31362495 tggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacgggttcaa 31362454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 242 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 37226037 - 37225961
Alignment:
Q  242 gtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| | |||||||| || |||||||||    
T  37226037 gtacaatacaacaaaatggtgggaccccttcccgaaccatgcgtatgccagaggtttagtgcactggattgcccttt 37225961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 4)
Name: scaffold0187
Description:

Target: scaffold0187; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 141 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10226 - 10052
Alignment:
Q  141 gggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctg 240  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  10226 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagagtaagactg 10127  T
Q  241 cgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 315  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10126 cgtacaatacaccaaatagtgggaccccttcccggaccctgcatatgcaggagctccagtgcaccgggttgccct 10052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 141 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 20554 - 20380
Alignment:
Q  141 gggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctg 240  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  20554 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacagagtaagactg 20455  T
Q  241 cgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 315  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20454 cgtacaatacaccaaatagtgggaccccttcccggaccctgcatatgcaggagctccagtgcaccgggttgccct 20380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 203
Target Start/End: Original strand, 8898 - 8964
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtc 203  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  8898 tgaggggtaaccttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacaggttcaagtc 8964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 203
Target Start/End: Original strand, 19226 - 19292
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtc 203  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  19226 tgaggggtaaccttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacaggttcaagtc 19292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0223
Description:

Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 145 - 318
Target Start/End: Original strand, 11093 - 11265
Alignment:
Q  145 aaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgta 244  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  11093 aaccttggcgcaactggtaaagttgttct-atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacaaagtaaggctgctta 11191  T
Q  245 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11192 caatacaccaaatggtgggacaccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttta 11265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 140 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 13202 - 13024
Alignment:
Q  140 ggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa-cagggtaaggc 238  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  13202 ggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaccggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaacaaggtaaggc 13103  T
Q  239 tgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  13102 tgcgtacaatacaccgaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggggctttagtgcaccgggttgcccttt 13024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 5)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 147 - 317
Target Start/End: Original strand, 46794 - 46966
Alignment:
Q  147 ccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaaca--gggtaaggctgcgta 244  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||| ||||||    
T  46794 ccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtgctggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggttgcgta 46893  T
Q  245 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46894 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 46966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 24949 - 24772
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggta 234  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||     |||||||||||||||||||  |||||||    
T  24949 tgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtc-----aacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 24855  T
Q  235 aggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  24854 aggctgcgtacaacacaccaaatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcagccggttgcccttt 24772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 197 - 317
Target Start/End: Original strand, 43672 - 43793
Alignment:
Q  197 tcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacccc-ttcccggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  43672 tcaagttctggaaacagcgtcttgtgtaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacccctttctcggaccctgcatatgcgggagct 43771  T
Q  296 ctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    ||||||||| | ||||||||||    
T  43772 ctagtgcactgagttgcccttt 43793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 46796 - 46729
Alignment:
Q  229 agggtaaggctgcgtacaatacaccaaa-tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  46796 agggtaaggatgcatacaatataccaaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagct 46729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 47041 - 46996
Alignment:
Q  161 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctg 206  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  47041 gtaaagttgttgtcaggtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctg 46996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1176 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold1176
Description:

Target: scaffold1176; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 146 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 1758 - 1586
Alignment:
Q  146 accttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtac 245  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  1758 accttgacgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctgaaaacaacctcttgtgtaaaacaggataaggctgcatac 1659  T
Q  246 aatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  1658 aatacaccaaatgatgggaccccttcccggacccggcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgcctttta 1586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 113; Significance: 6e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 193 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 48758 - 48634
Alignment:
Q  193 gggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcggga 292  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48758 gggttcaagtggtggaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcggga 48659  T
Q  293 gctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  48658 gctctagtgcaccgggttgcccttt 48634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 147 - 317
Target Start/End: Original strand, 10773 - 10945
Alignment:
Q  147 ccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgta 244  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||     
T  10773 ccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaaggtctgaaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtagggctgcgtc 10872  T
Q  245 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  10873 caatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcactgggttgctcttt 10945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 106; Significance: 9e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 143 - 318
Target Start/End: Original strand, 58936 - 59115
Alignment:
Q  143 gtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctg 240  Q
    |||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||| |||    
T  58936 gtaaccttggagcaactggtaaacttattgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaagactg 59035  T
Q  241 cgtacaatacacc--aaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  59036 cgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccagactctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcccttta 59115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 230 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 24220 - 24133
Alignment:
Q  230 gggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24220 gggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggattgcccttt 24133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 136 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 226589 - 226456
Alignment:
Q  136 ctgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt---aaaacaggg 232  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |   |||||||||    
T  226589 ctgagtggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacagcctcttgtctaaaaaaacaggg 226490  T
Q  233 taaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggacc 266  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  226489 taaggctgcatacaatacatcaaatggtgggacc 226456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 138 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 35200 - 35062
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttg-ttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt---aaaacagggt 233  Q
    ||||| |||| |||| || ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||    
T  35200 gagggataactttggtgcaactggtaaagtttattgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgtgtgaaaacagggt 35101  T
Q  234 aaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcc 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35100 aaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccctttcc 35062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 146 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 73034 - 72867
Alignment:
Q  146 accttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaaca-gcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcg 242  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||  || |||||||||||     
T  73034 accttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgt-------gtcacgggttcaagtcctagaaacaagtctcttgtgtaaaaaacacggtaaggctgcc 72942  T
Q  243 tacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  72941 tacaatacaccaaatggtagtaccccttcccggaacctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgcccttt 72867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 143 - 280
Target Start/End: Original strand, 4117 - 4258
Alignment:
Q  143 gtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa--acagggtaaggctg 240  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  4117 gtaaccttg-cgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttg 4215  T
Q  241 cgtacaatacacc---aaatggtgggaccccttcccggaccct 280  Q
    |||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||    
T  4216 cgtacaatacaccaataattggtgggaccccttcccggaccct 4258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0954 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0954
Description:

Target: scaffold0954; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 200 - 318
Target Start/End: Original strand, 3560 - 3680
Alignment:
Q  200 agtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacag--ggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctct 297  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |    
T  3560 agtcctggaaagagcctcttgtgtaaaatataaggtaaggctgcgtataatacaccgaatgatgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggcagcttt 3659  T
Q  298 agtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    ||||||||| ||| |||||||    
T  3660 agtgcaccgagtttcccttta 3680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 137 - 212
Target Start/End: Original strand, 83828 - 83903
Alignment:
Q  137 tgaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaaca 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  83828 tgaggggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaaca 83903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 175 - 295
Target Start/End: Original strand, 23590 - 23712
Alignment:
Q  175 atgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcc 272  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  23590 atgtgactgaaagggtacgggttcaagtcttgcaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtgaggctgcgtacaatgtagcaaatggtgggaccccttcc 23689  T
Q  273 cggaccctgcatatgcgggagct 295  Q
    | |||| ||  |||| |||||||    
T  23690 cagaccttgagtatgtgggagct 23712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0194 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0194
Description:

Target: scaffold0194; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 317
Target Start/End: Original strand, 24619 - 24783
Alignment:
Q  139 aggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaacagggtaaggc 238  Q
    ||||||||||||||| | | || |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||              ||||||| |    
T  24619 aggggtaaccttggcacaattgataaagttgttgtcaagtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcc--------------gggtaagac 24704  T
Q  239 tgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 317  Q
    |||||| |||||||||||| ||||  |||||| || |||||||| ||| ||||||||  |||||||| | |||||||||    
T  24705 tgcgtataatacaccaaatagtggaccccctttccagaccctgcgtatacgggagcttcagtgcacctgattgcccttt 24783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 227
Target Start/End: Original strand, 43085 - 43172
Alignment:
Q  142 ggtaaccttggcgcc--actggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa 227  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  43085 ggtaaccttggcgcgcaactggtaaagttattgtcatgtgattgaaaggtcacgagttcaggtcctagaaacagcctcttgtgtaaaa 43172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 227
Target Start/End: Original strand, 8848 - 8934
Alignment:
Q  138 gaggggtaaccttggcgccactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa 227  Q
    |||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  8848 gaggggtaaccttgacgc---tggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacaggttcaattcctggaaacaacttcttgtgtaaaa 8934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0867 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0867
Description:

Target: scaffold0867; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 3798 - 3685
Alignment:
Q  188 gtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaa-acagggtaaggctgcgtacaatacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatat 286  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |  || | || ||||    
T  3798 gtcatgggttcaagttctgaaaacaacc-cttgtgtaaatacaaggtaacgttgcgtacaatacaccaaatggtgggacccttttctcgatcttgtatat 3700  T
Q  287 gcgggagctctagtg 301  Q
    ||||||||| |||||    
T  3699 gcgggagctttagtg 3685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 247 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 58699 - 58629
Alignment:
Q  247 atacaccaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttta 318  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  58699 atacaccgaatggtgagaccccttctcggaccctgtgtatgcgggagctct-gtgcaccaggctgcccttta 58629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 267
Target Start/End: Original strand, 32906 - 33016
Alignment:
Q  160 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa- 256  Q
    |||| |||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||   ||| | |||||| |||  ||||||| ||||| |||  ||||||||||||||     
T  32906 ggtatagttgttgccacgtgacttaaaggtcatgggttcaagtccgcgaaaaaacctcttctgtaaaaaacagagtaagactgtatacaatacaccaaat 33005  T
Q  257 tggtgggaccc 267  Q
    |||||||||||    
T  33006 tggtgggaccc 33016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University