View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14096_high_3 (Length: 827)

Name: NF14096_high_3
Description: NF14096
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14096_high_3
NF14096_high_3
[»] chr6 (62 HSPs)
chr6 (19-762)||(30999838-31000582)
chr6 (58-817)||(24890090-24890851)
chr6 (62-817)||(29886695-29887452)
chr6 (58-817)||(24730249-24731010)
chr6 (58-817)||(29834609-29835370)
chr6 (58-817)||(29866043-29866804)
chr6 (58-738)||(29348522-29349203)
chr6 (58-817)||(29073157-29073918)
chr6 (58-817)||(29105730-29106491)
chr6 (82-817)||(29881853-29882590)
chr6 (82-817)||(29909009-29909746)
chr6 (65-738)||(24271871-24272545)
chr6 (60-738)||(29897478-29898152)
chr6 (58-817)||(29893947-29894708)
chr6 (58-614)||(24886565-24887126)
chr6 (62-817)||(24263596-24264353)
chr6 (62-817)||(29928671-29929428)
chr6 (372-817)||(28926391-28926837)
chr6 (58-738)||(29366345-29367026)
chr6 (212-817)||(29357823-29358429)
chr6 (58-817)||(29115655-29116416)
chr6 (82-817)||(29905071-29905794)
chr6 (58-766)||(29098737-29099446)
chr6 (500-817)||(29078364-29078682)
chr6 (502-817)||(30118585-30118901)
chr6 (501-816)||(30060007-30060323)
chr6 (483-817)||(30126899-30127234)
chr6 (104-817)||(29084458-29085173)
chr6 (489-769)||(29946263-29946543)
chr6 (58-268)||(24711532-24711743)
chr6 (612-817)||(29211237-29211443)
chr6 (382-732)||(29876544-29876894)
chr6 (58-409)||(29902650-29903002)
chr6 (548-816)||(30061840-30062109)
chr6 (372-726)||(25450827-25451181)
chr6 (478-738)||(29889545-29889805)
chr6 (212-412)||(29889069-29889269)
chr6 (58-307)||(29211433-29211683)
chr6 (62-300)||(28927344-28927583)
chr6 (666-814)||(24886413-24886561)
chr6 (657-817)||(29903240-29903401)
chr6 (478-564)||(21160723-21160809)
chr6 (83-360)||(25450327-25450605)
chr6 (58-157)||(21161130-21161230)
chr6 (58-190)||(24739667-24739800)
chr6 (481-564)||(15715084-15715167)
chr6 (372-438)||(24884849-24884915)
chr6 (23-60)||(24729829-24729866)
chr6 (500-564)||(30149364-30149428)
chr6 (500-564)||(30154337-30154401)
chr6 (481-564)||(24739293-24739376)
chr6 (478-541)||(30053242-30053305)
chr6 (504-553)||(16702255-16702304)
chr6 (23-60)||(24710809-24710846)
chr6 (82-158)||(29946050-29946127)
chr6 (501-564)||(24934505-24934568)
chr6 (513-544)||(29903110-29903141)
chr6 (660-738)||(30135122-30135200)
chr6 (376-438)||(30154213-30154275)
chr6 (58-158)||(24934061-24934162)
chr6 (58-158)||(24941594-24941695)
chr6 (500-553)||(24942037-24942090)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (62-817)||(21741-22498)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (58-769)||(15062769-15063481)
chr2 (434-567)||(21456376-21456509)
[»] scaffold0573 (1 HSPs)
scaffold0573 (372-817)||(3846-4292)
[»] chr3 (7 HSPs)
chr3 (62-769)||(24219128-24219836)
chr3 (504-640)||(33997781-33997917)
chr3 (478-761)||(11991127-11991410)
chr3 (489-671)||(16350876-16351058)
chr3 (500-564)||(24226657-24226721)
chr3 (372-439)||(24226529-24226596)
chr3 (256-361)||(16350643-16350748)
[»] scaffold0054 (2 HSPs)
scaffold0054 (282-726)||(53532-53976)
scaffold0054 (104-379)||(53984-54260)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (58-727)||(10129531-10130201)
chr1 (500-737)||(4260242-4260479)
chr1 (500-737)||(4263864-4264101)
chr1 (484-564)||(19490071-19490151)
chr1 (62-287)||(4260692-4260918)
chr1 (62-287)||(4264314-4264540)
chr1 (485-627)||(41316091-41316233)
chr1 (497-540)||(15591240-15591283)
chr1 (508-563)||(15612789-15612844)
chr1 (481-692)||(17251131-17251342)
chr1 (500-563)||(15998818-15998881)
[»] scaffold0014 (6 HSPs)
scaffold0014 (500-734)||(104666-104900)
scaffold0014 (485-734)||(137196-137445)
scaffold0014 (491-647)||(140126-140282)
scaffold0014 (478-685)||(121457-121655)
scaffold0014 (62-439)||(136772-137150)
scaffold0014 (256-313)||(105087-105144)
[»] scaffold0572 (1 HSPs)
scaffold0572 (489-761)||(3059-3331)
[»] scaffold0051 (3 HSPs)
scaffold0051 (485-748)||(43199-43462)
scaffold0051 (489-695)||(47870-48076)
scaffold0051 (60-359)||(43590-43890)
[»] scaffold0429 (2 HSPs)
scaffold0429 (485-743)||(6018-6276)
scaffold0429 (60-439)||(5592-5972)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (489-738)||(126047-126296)
scaffold0019 (256-361)||(126424-126529)
[»] scaffold0308 (2 HSPs)
scaffold0308 (502-685)||(8834-9017)
scaffold0308 (222-359)||(8554-8691)
[»] scaffold0654 (2 HSPs)
scaffold0654 (504-568)||(1314-1378)
scaffold0654 (256-361)||(1521-1626)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (481-685)||(27171-27375)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (481-564)||(13904695-13904778)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (501-671)||(3642875-3643045)
[»] chr4 (2 HSPs)
chr4 (501-553)||(44262702-44262754)
chr4 (58-111)||(44263145-44263198)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (501-564)||(43967-44030)
[»] scaffold0652 (1 HSPs)
scaffold0652 (504-553)||(1395-1444)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (504-553)||(31414-31463)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 645; Significance: 0; HSPs: 62)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 645; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 31000582 - 30999838
Alignment:
Q  19 tactccacccatcatccaatttaacaagattttatcttccctaatgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31000582 tactccacccatcatccaatttaacaagattttatcttccctaatgtgataatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacg 31000483  T
Q  119 atgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaattggccctgatgttttcacttacaatgctttaattagtggttttcccactgtttctaaatt 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  31000482 atgcttttgatttatattctgaaatggttgctaagagaattggccttgatgttttcacttacaatgctttaattagtggtttttctgctgtttctaaatt 31000383  T
Q  218 gaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcggaaaacatcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31000382 gaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcggaaaacatcaacccggatgtgtatacctttaatatactggttgatggtttttgtaaggatggt 31000283  T
Q  318 agggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatgaaagacgacataaagcctaatgttgttacttataactctttaatggatggatattgtttga 417  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31000282 agggtgaaagaagctaaaaatgtattagccatgatgatcaaagacgacataaagcctcgtgttgttacttatagctctttaatggatggatattgtttga 31000183  T
Q  418 ttaacgaagtgaacaaggccaaggaaatattcgatagtatggccgcgaggggagtcatggctaatgttcagagctatactaccatgattaatggattttg 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31000182 ttaacgaagtgaacaaggccaaggaaatattcgatagtatggccgcaaggggagtcatggctaatgttcagagctatactaccatgattaatggattttg 31000083  T
Q  518 taagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggt 617  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  31000082 caagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattcgtaatgtgttaatttacagtttccttattgatggt 30999983  T
Q  618 ttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagatacttacagttctatattgg 717  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  30999982 ttgtgtaaatcggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagttatttacagttctatattgg 30999883  T
Q  718 atgctttatgtaaaaaccatcgtgtttaccacgcaattgcattat 762  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  30999882 atgctttatgcaaaaaccatcgtgttgaccaggcaattgcattat 30999838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 58 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 24890851 - 24890090
Alignment:
Q  58 cctaatgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaa 156  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| | | ||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24890851 cctaatgcggtaatgtacaacatgattattgataatatgtgcaaagctaagcttgttaatgatgcttttgatttatattctcaaatggttgctaagagaa 24890752  T
Q  157 ttggccctgatgttttcacttacaatgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcgga 256  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||    
T  24890751 tttgccctgatgttttcacttacaatgctttaattagtggtttttccgctgtttctaaattgaactatgcaattgatttgttcaataaaatgaaaaagga 24890652  T
Q  257 aaacatcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatg 356  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || | |||||| || | ||||   || ||||| || ||||||    
T  24890651 aaacatcaacccaaatgtgtatacctttaatatactggttgatggcttttgtaaggaaggaaaggtgaatgatgctaaagtagtgttagctataatgatg 24890552  T
Q  357 aaagacgacataaagcctaatgttgttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaaggaaatattcgatagta 456  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  24890551 aaagacgacataaaacctgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgttcgataaacaaagtgaacaaggccaaggatatatttgatagta 24890452  T
Q  457 tggccgcgaggggagtcatggctaatgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttga 556  Q
    ||||| |  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24890451 tggcctcagggggagtcattgctaatgttcagatctatactaccatggttaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttga 24890352  T
Q  557 agaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagcta 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24890351 agaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtggtaacttacagttcccttattgatggtttgtgtaaattggggagaatcttttatgctttgaagcta 24890252  T
Q  657 gtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttaccacgcaattg 756  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || | |||||||    
T  24890251 gtcgatgagatgcatgatagaggtcagccacctaatatagttacttacagttctatattggatgctttatgcaaaaaccatcatgttgacaaggcaattg 24890152  T
Q  757 cattattaacaaatttgaaataccacggtatttgaccaaatatgtaca-atacactattctt 817  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  24890151 cattattaacaaatttgaaagaccagggtattcgaccagatatgtacacatacaccattctt 24890090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 62 - 817
Target Start/End: Original strand, 29886695 - 29887452
Alignment:
Q  62 atgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaattgg 160  Q
    |||||||||||||||  || ||||| ||| || | || ||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||      
T  29886695 atgtggtaatgtacaataccattatcgatggtatgtgtaaagataaacatgttaatgatgcttttgatttatattctgaaatggcttctaagagaatttt 29886794  T
Q  161 ccctgatgttttcacttacaatgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcggaaaac 260  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||  ||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||| || |||||    
T  29886795 ccccgatgttttcacttacaatgctttaattagtggcttttgcattgttggtaaattgaaagatgcaactgatttattcaataaaatgacatcgaaaaac 29886894  T
Q  261 atcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatgaaag 360  Q
    ||||||||   |||||| || ||||||||| |||||||||  ||||| ||||| || |  || ||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  29886895 atcaacccaactgtgtatacttttaatatattggttgatgcattttgtaaggaaggaaacgtaaaagaggctaaaaatgtgttagctatgatgatgaaac 29886994  T
Q  361 acgacataaagcctaatgttgttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaaggaaatattcgatagtatggc 460  Q
    | | ||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||| ||||||||||| |||||||  ||||||   | |||| |    
T  29886995 aaggcatcaatcctaatgctgttacttatagctctttaatggatggatattgcctagttaatgaagtgaacaatgccaagggtatattcagcactatgtc 29887094  T
Q  461 cgcgaggggagtcatggctaatgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaa 560  Q
        |||||||| |  |||||||||  |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||    
T  29887095 tcttaggggagtgactgctaatgtttggagctacaatatcatgattaatggattttgtaagattaaaatgaccgatgaagccatgaatctctttgaagaa 29887194  T
Q  561 atgcgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcg 660  Q
    |||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  29887195 atgcattgtagaaaactaattcctgatgtggtaacttacaattcccttatcaatggtttgtgcaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagtcg 29887294  T
Q  661 atgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttaccacgcaattgcatt 760  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||  ||| || | |||||||| ||    
T  29887295 atgagatgcatgatagaggtcaaccacctgatataattacttacagttctttattagatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaattgcgtt 29887394  T
Q  761 attaacaaatttgaaataccacggtatttgaccaaatatgtaca-atacactattctt 817  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29887395 attaacaaatttgaaagaccagggtattcgaccaaatatgtacacatacactattctt 29887452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 58 - 817
Target Start/End: Original strand, 24730249 - 24731010
Alignment:
Q  58 cctaatgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaa 156  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| | | ||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24730249 cctaatgcggtaatgtacaacatgattattgataatatgtgcaaagctaagcttgttaatgatgcttttgatttatattctcaaatggttgctaagagaa 24730348  T
Q  157 ttggccctgatgttttcacttacaatgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcgga 256  Q
    ||   ||||||| ||||||||  |||  |||||||  ||| ||   || | |   | ||||||| || ||| ||||||||||  | ||||||| |   ||    
T  24730349 tttctcctgatgatttcacttgtaatagtttaatttatggcttctgcattatgggtcaattgaaagaggcagttggtttgttacacaaaatgatattaga 24730448  T
Q  257 aaacatcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatg 356  Q
    ||||||||||||   | |||| || ||||  ||| ||||||||| |||||| ||||| || | ||||||||||| |||||   | ||||   ||| ||||    
T  24730449 aaacatcaaccctcgtatgtatacatttagcatattggttgatgctttttgtaaggaaggaaaggtgaaagaagctaaaatgatgttaggtgtgacgatg 24730548  T
Q  357 aaagacgacataaagcctaatgttgttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaaggaaatattcgatagta 456  Q
    ||| | ||||| |  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||| | ||||||||||| || |||||||||||||    
T  24730549 aaaaaagacattatacttgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcttagttaaagaaattaacaaggccaaagatatattcgatagta 24730648  T
Q  457 tggccgcgaggggagtcatggctaatgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttga 556  Q
    ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24730649 tggcctcaaggggagtcattgctaatgttcagagctataccaccatgattaatggattatgtaagattaaaatggtggatgaagctgtaaatctctttga 24730748  T
Q  557 agaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagcta 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||   ||||||||    
T  24730749 agaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgggtaaattggggaaaatctcttgtgtgttgaagcta 24730848  T
Q  657 gtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttaccacgcaattg 756  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || | |||||||    
T  24730849 gtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatataataacttacaattctatattggatgctttatgcaaaaaccatcatgttgacaaggcaattg 24730948  T
Q  757 cattattaacaaatttgaaataccacggtatttgaccaaatatgtaca-atacactattctt 817  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  24730949 cattattaacaaatttgaaagaccagggtattcgaccagatatgtacacatacactgttctt 24731010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 58 - 817
Target Start/End: Original strand, 29834609 - 29835370
Alignment:
Q  58 cctaatgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaa 156  Q
    |||| ||||||||||||||  || ||||| ||| || | || ||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  29834609 cctagtgtggtaatgtacaataccattatcgatggtatgtgtaaagataaacatgttaatgatgcttttgatttatattctgaaatggtttctaagagaa 29834708  T
Q  157 ttggccctgatgttttcacttacaatgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcgga 256  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  || ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  29834709 tttcccctgatgttttcacttacaatgctttgattagtggcttttgcattgttggtaaattgaaagatgcaattggtttgttcaataaaatgacattgga 29834808  T
Q  257 aaacatcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatg 356  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||  ||||| ||||| || |   ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  29834809 aaacatcaaccctgatatgtatacctttaatatattggttgatgcattttgtaaggaaggaaaaatgaaagaagctaaaaatgtgttagctatgatgatg 29834908  T
Q  357 aaagacgacataaagcctaatgttgttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaaggaaatattcgatagta 456  Q
    ||| | | ||| || || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |  ||||  ||||||| ||||| |||   |||||| | |  |    
T  29834909 aaacaaggcatgaaacccaatgttgttacttatagcgctttaatggatggatattgcctagttaaaaaagtgaataaggcgaagagtatattcaacacaa 29835008  T
Q  457 tggccgcgaggggagtcatggctaatgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttga 556  Q
    ||||   | ||||||| |   || || |||| || || | || | ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  29835009 tggctcaggggggagtgaatcctgatattcacagttacagtatcttgattaatgggctttgtaagattaaaatgacggatgaagccatgaatctctttga 29835108  T
Q  557 agaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagcta 656  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  29835109 agaaatgcattgcagaaaaattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaattggggaaaatctcttatgctttgaagcta 29835208  T
Q  657 gtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttaccacgcaattg 756  Q
    || ||||||||||||||| | |||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| || | |||||||    
T  29835209 gttgatgagatgcatgatcggggtgtaccacctgatataattacttacagttctatattggatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaattg 29835308  T
Q  757 cattattaacaaatttgaaataccacggtatttgaccaaatatgtaca-atacactattctt 817  Q
    | ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29835309 cgttattaacaaaattgaaagaccagggtattcgaccaaatatgtacacatacactattctt 29835370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 58 - 817
Target Start/End: Original strand, 29866043 - 29866804
Alignment:
Q  58 cctaatgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaa 156  Q
    |||| ||||||||||||||  || ||||| ||| || | || ||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  29866043 cctagtgtggtaatgtacaataccattatcgatggtatgtgtaaagataaacatgttaatgatgcttttgatttatattctgaaatggtttctaagagaa 29866142  T
Q  157 ttggccctgatgttttcacttacaatgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcgga 256  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  || ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  29866143 tttcccctgatgttttcacttacaatgctttgattagtggcttttgcattgttggtaaattgaaagatgcaattggtttgttcaataaaatgacattgga 29866242  T
Q  257 aaacatcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatg 356  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||  ||||| ||||| || |   ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  29866243 aaacatcaaccctgatatgtatacctttaatatattggttgatgcattttgtaaggaaggaaaaatgaaagaagctaaaaatgtgttagctatgatgatg 29866342  T
Q  357 aaagacgacataaagcctaatgttgttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaaggaaatattcgatagta 456  Q
    ||| | | ||| || || |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |  ||||  ||||||| ||||| |||   |||||| | |  |    
T  29866343 aaacaaggcatgaaacccaatgttgttacttatagcgctttaatggatggatattgcctagttaaaaaagtgaataaggcgaagagtatattcaacacaa 29866442  T
Q  457 tggccgcgaggggagtcatggctaatgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttga 556  Q
    ||||   | ||||||| |   || || |||| || || | || | ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  29866443 tggctcaggggggagtgaatcctgatattcacagttacagtatcttgattaatgggctttgtaagattaaaatgacggatgaagccatgaatctctttga 29866542  T
Q  557 agaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagcta 656  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  29866543 agaaatgcattgcagaaaaattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgcaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagcta 29866642  T
Q  657 gtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttaccacgcaattg 756  Q
    || ||||||||||||||| | |||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| || | |||||||    
T  29866643 gttgatgagatgcatgatcggggtgtaccacctgatataattacttacagttctatattggatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaattg 29866742  T
Q  757 cattattaacaaatttgaaataccacggtatttgaccaaatatgtaca-atacactattctt 817  Q
    | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29866743 cgttattaacaaatttgaaagaccagggtattcgaccaaatatgtacacatacactattctt 29866804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 58 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 29349203 - 29348522
Alignment:
Q  58 cctaatgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaa 156  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||||  ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |    
T  29349203 cctaatgtggtaatgtacaacaccattattgatagcatgtgcaaagttaaacttgttaatgaagcttttgatttatattctgaaatggtttctaagggga 29349104  T
Q  157 ttggccctgatgttttcacttacaatgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcgga 256  Q
    ||   || |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||  || | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  29349103 tttctcccgatgttgttacttacagtgctttaattagtggtttttgcattcttggtaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgatatcgga 29349004  T
Q  257 aaacatcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatg 356  Q
    | | |||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  29349003 agaaatcaaccctgatgtgtatacctttagtatattggttgatggattttgtaaggaaggaagggtgaaagaagctaaaaatgtgttagctatgatgatg 29348904  T
Q  357 aaagacgacataaagcctaatgttgttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaaggaaatattcgatagta 456  Q
    ||| | | ||| || ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |  ||||  ||||||| ||||| |||   |||||| | | ||    
T  29348903 aaacaaggcattaaacctgatgttgttacttattgctctttaatggatggatattgcctagttaaacaagtgaataaggctaagagtatattcaacacta 29348804  T
Q  457 tggccgcgaggggagtcatggctaatgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttga 556  Q
    ||||   | ||||||| |  ||||||||||||||||| | || ||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  29348803 tggctcaggggggagtgactgctaatgttcagagctacaatatcatgattaacgggttttgtaagattaaaaaggttgatgaagccatgaatctctttaa 29348704  T
Q  557 agaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagcta 656  Q
    |||||||| ||| | ||| ||||||||| ||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  29348703 agaaatgcattgcaaaaacattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcagggaaaatctcttatgctttgaagcta 29348604  T
Q  657 gtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatc 738  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29348603 gtcgatgagatgcatgatagaggtgtaccacatgataaaattacttacaattctatattggatgctttatgcaaaaaccatc 29348522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 58 - 817
Target Start/End: Original strand, 29073157 - 29073918
Alignment:
Q  58 cctaatgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaa 156  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||||  ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| || || |||    
T  29073157 cctaatgtggtaatgtacaacaccattattgatagcatgtgcaaagttaaacttgttaatgaagcttttgatttatattctgaaatggtttctgagggaa 29073256  T
Q  157 ttggccctgatgttttcacttacaatgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcgga 256  Q
    ||   ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||  || ||||  |||| |||| |||||||||| | |||| |||||||||| |  |||    
T  29073257 tttctcctgatgttgttacttacagtgctttaattagtgggtttttcattgttggtaaactgaaagatgcaattgatctgtttaataaaatgatattgga 29073356  T
Q  257 aaacatcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatg 356  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||||| ||||| ||| || || |||||||||    
T  29073357 aaacatcaaaccggatgtgtatacttttaatatattggttgatggattttgtaaggacggaaagatgaaagaaggtaaaactgtgtttgctatgatgatg 29073456  T
Q  357 aaagacgacataaagcctaatgttgttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaaggaaatattcgatagta 456  Q
    ||| | | ||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |  ||||  ||||||| ||||| ||    |||||| | | ||    
T  29073457 aaacaaggcattaaacctaatgttgttacttattgctctttaatggatggatattgcctagttaaacaagtgaataaggctaatagtatattcaacacta 29073556  T
Q  457 tggccgcgaggggagtcatggctaatgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttga 556  Q
    ||||   | ||||||| |   || ||  |||||| || | || ||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  29073557 tggctcaggggggagtgaatcctgatactcagagttacaatatcatgattaacgggttttgtaagattaaaaaggttgatgaagccatgaatctctttaa 29073656  T
Q  557 agaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagcta 656  Q
    | |||||| ||| | ||| ||||||||||||||| | ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  29073657 aaaaatgcattgcaaaaacattattcctaatgtggtgacttacacttctcttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagcta 29073756  T
Q  657 gtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttaccacgcaattg 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| || | |||||||    
T  29073757 gtcgatgagatgcatgatagaggtgtaccacctgatataattacttacagttctatattggatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaattg 29073856  T
Q  757 cattattaacaaatttgaaataccacggtatttgaccaaatatgtaca-atacactattctt 817  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  29073857 cattattaacaaaattgaaagaccaaggtattcgaccaactatgcacacatacactattctt 29073918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 58 - 817
Target Start/End: Original strand, 29105730 - 29106491
Alignment:
Q  58 cctaatgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaa 156  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||||  ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| || || |||    
T  29105730 cctaatgtggtaatgtacaacaccattattgatagcatgtgcaaagttaaacttgttaatgaagcttttgatttatattctgaaatggtttctgagggaa 29105829  T
Q  157 ttggccctgatgttttcacttacaatgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcgga 256  Q
    ||   ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||  || ||||  |||| |||| |||||||||| | |||| |||||||||| |  |||    
T  29105830 tttctcctgatgttgttacttacagtgctttaattagtgggtttttcattgttggtaaactgaaagatgcaattgatctgtttaataaaatgatattgga 29105929  T
Q  257 aaacatcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatg 356  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||||| ||||| ||| || || |||||||||    
T  29105930 aaacatcaaaccggatgtgtatacttttaatatattggttgatggattttgtaaggacggaaagatgaaagaaggtaaaactgtgtttgctatgatgatg 29106029  T
Q  357 aaagacgacataaagcctaatgttgttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaaggaaatattcgatagta 456  Q
    ||| | | ||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |  ||||  ||||||| ||||| ||    |||||| | | ||    
T  29106030 aaacaaggcattaaacctaatgttgttacttattgctctttaatggatggatattgcctagttaaacaagtgaataaggctaatagtatattcaacacta 29106129  T
Q  457 tggccgcgaggggagtcatggctaatgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttga 556  Q
    ||||   | ||||||| |   || ||  |||||| || | || ||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  29106130 tggctcaggggggagtgaatcctgatactcagagttacaatatcatgattaacgggttttgtaagattaaaaaggttgatgaagccatgaatctctttaa 29106229  T
Q  557 agaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagcta 656  Q
    | |||||| ||| | ||| ||||||||||||||| | ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  29106230 aaaaatgcattgcaaaaacattattcctaatgtggtgacttacacttctcttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagcta 29106329  T
Q  657 gtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttaccacgcaattg 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| || | |||||||    
T  29106330 gtcgatgagatgcatgatagaggtgtaccacctgatataattacttacagttctatattggatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaattg 29106429  T
Q  757 cattattaacaaatttgaaataccacggtatttgaccaaatatgtaca-atacactattctt 817  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  29106430 cattattaacaaaattgaaagaccaaggtattcgaccaactatgcacacatacactattctt 29106491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 82 - 817
Target Start/End: Original strand, 29881853 - 29882590
Alignment:
Q  82 attattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaattggccctgatgttttcacttaca 180  Q
    |||||||||||  | || ||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||   ||| ||||| ||||||| |    
T  29881853 attattgatagcatgtgtaaagataaacatgttaatgatgcttttgatttatattctgaaatggctgcaaagagaatttctcctaatgttgtcacttata 29881952  T
Q  181 atgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcggaaaacatcaacccggatgtgtacac 280  Q
     ||||||||||||||| |||  || ||||  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  29881953 gtgctttaattagtggattttgcattgttggtaaattgaaagatgcaattgatttgtttaataaaatgatattggaaaacatcaatccgaatgtgtatac 29882052  T
Q  281 ctttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatgaaagacgacataaagcctaatgtt 380  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| | | ||| || ||| |||||    
T  29882053 ctttagtatattggttgatggattttgtaaggaaggaagggtgaaagaagctaaaaatgtgttagctatgatgatgaaacaaggcattaaacctgatgtt 29882152  T
Q  381 gttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaaggaaatattcgatagtatggccgcgaggggagtcatggcta 480  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||| ||   |||||| | | |||| |    |||||||| |  ||||    
T  29882153 gttacttacagctctttaatggatggatattgtctggtaaatgaagtgaacaaggccgagagtatattcaacactatgtctcataggggagtgactgcta 29882252  T
Q  481 atgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattat 580  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||| |   | | ||||| |    
T  29882253 atgttcagagctacagtatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccatgaaacttttcaaagaaatgcatcacaaacaaatttt 29882352  T
Q  581 tcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggt 680  Q
    |||| ||||| ||||||| |||  |||||||||||| ||||| ||||  || ||||| || |||||| || | || |||||||||||||||||| ||||     
T  29882353 tcctgatgtgataacttatagtgcccttatcgatggattgtgcaaatctggaagaatatcatatgctttggaacttgtcgatgagatgcatgatcgaggg 29882452  T
Q  681 caaccacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttaccacgcaattgcattattaacaaatttgaaatacc 780  Q
    |||| |||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| || | |||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  29882453 caacaacctgatataattacctacaattctatattggatgctttatgcaaaaaacatcatgttgacaaagcaattgcattattaacaaaattgaaaggcc 29882552  T
Q  781 acggtatttgaccaaatatgtaca-atacactattctt 817  Q
    | |||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  29882553 aaggtattcgaccagatatgaacacatacactattctt 29882590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 82 - 817
Target Start/End: Original strand, 29909009 - 29909746
Alignment:
Q  82 attattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaattggccctgatgttttcacttaca 180  Q
    |||||||||||  | || ||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||   ||| ||||| ||||||| |    
T  29909009 attattgatagcatgtgtaaagataaacatgttaatgatgcttttgatttatattctgaaatggctgcaaagagaatttctcctaatgttgtcacttata 29909108  T
Q  181 atgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcggaaaacatcaacccggatgtgtacac 280  Q
     ||||||||||||||| |||  || ||||  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  29909109 gtgctttaattagtggattttgcattgttggtaaattgaaagatgcaattgatttgtttaataaaatgatattggaaaacatcaatccgaatgtgtatac 29909208  T
Q  281 ctttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatgaaagacgacataaagcctaatgtt 380  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| | | ||| || ||| |||||    
T  29909209 ctttagtatattggttgatggattttgtaaggaaggaagggtgaaagaagctaaaaatgtgttagctatgatgatgaaacaaggcattaaacctgatgtt 29909308  T
Q  381 gttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaaggaaatattcgatagtatggccgcgaggggagtcatggcta 480  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||| ||   |||||| | | |||| |    |||||||| |  ||||    
T  29909309 gttacttacagctctttaatggatggatattgtctggtaaatgaagtgaacaaggccgagagtatattcaacactatgtctcataggggagtgactgcta 29909408  T
Q  481 atgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattat 580  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||| |   | | ||||| |    
T  29909409 atgttcagagctacagtatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccatgaaacttttcaaagaaatgcatcacaaacaaatttt 29909508  T
Q  581 tcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggt 680  Q
    |||| ||||| ||||||| |||  |||||||||||| ||||| ||||  || ||||| || |||||| || | || |||||||||||||||||| ||||     
T  29909509 tcctgatgtgataacttatagtgcccttatcgatggattgtgcaaatctggaagaatatcatatgctttggaacttgtcgatgagatgcatgatcgaggg 29909608  T
Q  681 caaccacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttaccacgcaattgcattattaacaaatttgaaatacc 780  Q
    |||| |||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| || | |||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  29909609 caacaacctgatataattacctacaattctatattggatgctttatgcaaaaaacatcatgttgacaaagcaattgcattattaacaaaattgaaaggcc 29909708  T
Q  781 acggtatttgaccaaatatgtaca-atacactattctt 817  Q
    | |||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  29909709 aaggtattcgaccagatatgaacacatacactattctt 29909746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 65 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 24272545 - 24271871
Alignment:
Q  65 tggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaattggccc 163  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||  | |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||    
T  24272545 tggtaatgtacaacaccattattgatagcatgtgcaaagataaacttgataatgatgcttttgatttatattctgaaatggtttctaagagaattttccc 24272446  T
Q  164 tgatgttttcacttacaatgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcggaaaacatc 263  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||  || ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24272445 tgatgttaacacttataatgctttaattaatggtttttgcattgttggtaaattgaaagatgcaattggtttgttcaataaaatgacatcggaaaacatc 24272346  T
Q  264 aacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatgaaagacg 363  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||| | |    
T  24272345 aaccctgatgtgtatacttttaatatattggttgatgcattttgtaaggaaggaagggtgaaagaagctaaaaatgggttagctatgatgatgaaacaag 24272246  T
Q  364 acataaagcctaatgttgttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaaggaaatattcgatagtatggccgc 463  Q
     ||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | || ||||||||||||||||||   |||||| | | |||| |       
T  24272245 gcattaaacctgacgttgttacttataactctttaatggatcgatattgtctggtaaatgaagtgaacaaggccaagagtatattcaacactatgtctca 24272146  T
Q  464 gaggggagtcatggctaatgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatg 563  Q
     |||||||| |  |||||||||| |||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||  ||||||||    
T  24272145 taggggagtgaccgctaatgttcggagctacagtatcatgattaatagattttgtaagattaaaatggtggatcaagccatgaaacttttcaaagaaatg 24272046  T
Q  564 cgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatg 663  Q
    | |   | | ||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||  || ||||| || |||||| || | ||   |||||    
T  24272045 catcacaaacaaatttttcctaatgtgataacttatagttcccttattgatggattgtgcaaatctggaagaatatcatatgctttggaacttaacgatg 24271946  T
Q  664 agatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatc 738  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||| |||||   || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  24271945 agatgcatgatcgagggcaacaacctgatataatcacgtacagttctatattggatgatttatgcaaaaaccatc 24271871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 60 - 738
Target Start/End: Original strand, 29897478 - 29898152
Alignment:
Q  60 taatgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaatt 158  Q
    ||||| |||||||||||  ||  |||||||| || | || ||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  29897478 taatgcggtaatgtacaataccgttattgatggtatgtgtaaagataaacatgttaatgatgcttttgatttatattctgaaatggttgcaaagagaatt 29897577  T
Q  159 ggccctgatgttttcacttacaatgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcggaaa 258  Q
       || | |||| | ||||||| ||||||||||| ||| |||  || ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  | |||    
T  29897578 tatcccggtgttgttacttacagtgctttaattattggcttttgcattgttggtaaattgaaagatgcaattggtttgttcaataaaatgatattgaaaa 29897677  T
Q  259 acatcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatgaa 358  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||    ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||    
T  29897678 acatcatcccggatgtgtatacctttagtata-tggttgatggattttgtaagga----agggtgaaagaagctaaaaatgtgtttgctatgatgatgaa 29897772  T
Q  359 agacgacataaagcctaatgttgttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaaggaaatattcgatagtatg 458  Q
    | | ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||| |||||||| ||||| |||   |||||| | | ||||    
T  29897773 acaagacattaaacctaatgtttttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattcaacactatg 29897872  T
Q  459 gccgcgaggggagtcatggctaatgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaag 558  Q
    ||   | | ||||| |   || || |||| || || | || | |||||||||| |||||||||| |||||||   ||||||||||| |||||||||||||    
T  29897873 gctcagggaggagtgaatcctgatattcacagttacaatatcttgattaatgggttttgtaagagtaaaatgaccgatgaagccatgaatctctttgaag 29897972  T
Q  559 aaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagt 658  Q
    |||||| |||||||||  | |||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  ||||||||||    
T  29897973 aaatgcattgtagaaagctaattcctgatgtggtaacttacaattctcttatcgatggtttgtgtaaattggggaaattctcttacgcgttgaagctagt 29898072  T
Q  659 cgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatc 738  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  29898073 cgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatataattacgtacagttctatattgaatgctttatgcaaaaaccatc 29898152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 58 - 817
Target Start/End: Original strand, 29893947 - 29894708
Alignment:
Q  58 cctaatgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaa 156  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||| ||| || | || ||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  29893947 cctaatgtggtaatgtacagtaccattatcgatggtatgtgtaaagataaacatgttaatgatgcttttgatttatattctgaaatggtttctaagggaa 29894046  T
Q  157 ttggccctgatgttttcacttacaatgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcgga 256  Q
    ||   ||  ||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||  | || |||| |||||||||| | |||| |||||||||| |  |||    
T  29894047 tttctcccaatgttgttacttacagtgctttaattagtgggtttttcactgttggtcaactgaaagatgcaattgatctgtttaataaaatgatattgga 29894146  T
Q  257 aaacatcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatg 356  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || | | ||||||||| ||||| ||| || || |||||||||    
T  29894147 aaacatcaaaccggatgtgtatacttttaatatattggttgatggattttgtaaggacggaaagatgaaagaaggtaaaactgtgtttgctatgatgatg 29894246  T
Q  357 aaagacgacataaagcctaatgttgttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaaggaaatattcgatagta 456  Q
    ||| | | ||| || |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||  |  |||| |||||||| ||||| |||   |||||  | | ||    
T  29894247 aaacaaggcattaaacctaatgttgttacctattgctctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattatacacta 29894346  T
Q  457 tggccgcgaggggagtcatggctaatgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttga 556  Q
    || |   ||||||||| |   || || |||| || || | || | ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||| |    
T  29894347 tgtctcagaggggagtgaatcctgatattcaaagttacaatatcttgattgatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagctatgaatctctttaa 29894446  T
Q  557 agaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagcta 656  Q
    |||||||| |   | | | ||||||||| ||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  29894447 agaaatgcatcacaaacatattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaattggggaaaatctcttatgctttgaagcta 29894546  T
Q  657 gtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttaccacgcaattg 756  Q
    || ||||||||||||||| | |||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| || | |||||||    
T  29894547 gttgatgagatgcatgatcggggtgtaccacctgatataattacttacagttctatattggatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaattg 29894646  T
Q  757 cattattaacaaatttgaaataccacggtatttgaccaaatatgtaca-atacactattctt 817  Q
    | ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29894647 cgttattaacaaaattgaaagaccagggtattcgaccaaatatgtacacatacactattctt 29894708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 58 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 24887126 - 24886565
Alignment:
Q  58 cctaatgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaa 156  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || | ||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  24887126 cctaatgtgataatgtacagcaccattattgatggtatgtgcaaaggtaaacttgttaatgatgcttttgatttatattctgaaatggtcgcgaagagaa 24887027  T
Q  157 ttggccctgatgttttcacttacaatgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcgga 256  Q
    ||   ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24887026 tttctcctgatgttatcacttacagtgctttaattagtggtttttgcattgttggtaaattgaatgatacaattgggttgttcaataaaatgacagcgga 24886927  T
Q  257 aaacatcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatg 356  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||    
T  24886926 aaatatcaacccggatgtgtatacctttaatatatcggttgatgctttttgtaaggaaggtagggtgaaagaagctaaatatgtgttatctatgatgatg 24886827  T
Q  357 aaagacgacataaagcctaatgttgttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaaggaaatattcgatagta 456  Q
    ||| ||| ||| || |||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||  |||| ||| |||||| ||||||||| |||||| | | ||    
T  24886826 aaacacggcatcaaacctagtgttgtcacttataacactttaatgaatggatattgcttagttaaagaaatgaacatggccaaggatatattcaacacta 24886727  T
Q  457 tggccgcgaggggag----tcatggctaatgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctct 552  Q
    ||  |   || ||||    || |  |||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  24886726 tgaaccaaagtggagtggttcctacctaatgttcatagctacactatcttgattaatggattttgcaaggttaaaatgatagatgaagccataaatctct 24886627  T
Q  553 ttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgat 614  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  24886626 atgaagaaatgcattgtagaaaaaatattcctgatgtggtaacttacagttcccttgtcgat 24886565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 62 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 24264353 - 24263596
Alignment:
Q  62 atgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaattgg 160  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||| | || ||| |||||  ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||      
T  24264353 atgtggtaatgtacagtacgattattgatagtatgtgtaaagataaaaatgttaatgatgcttttgatttatattctgaaatggtttctaggagaatttc 24264254  T
Q  161 ccctgatgttttcacttacaatgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcggaaaac 260  Q
      |  || || ||||||| | ||||||||||||||| |||  || ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24264253 ttccaatattgtcacttatagtgctttaattagtggcttttgcattgttggtaaattgaaagatgcaattggtttgttcaataaaatgacatcggaaaac 24264154  T
Q  261 atcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatgaaag 360  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||     
T  24264153 atcaaccctgatgtgtatacttttaatatattggttgatgcattttgtaaggaaggaagggtgaaagaagctaaaaatgggttagctatgatgatgaaac 24264054  T
Q  361 acgacataaagcctaatgttgttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaaggaaatattcgatagtatggc 460  Q
    | | ||| || ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||| |||||||   |||||  | | |||| |    
T  24264053 aaggcattaaacctgacattgttacttataactctttaatggatggatattgtctggtaaatgaagtgaacatggccaagagtatattaaacactatgtc 24263954  T
Q  461 cgcgaggggagtcatggctaatgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaa 560  Q
        |||||||| |  |||| ||||| |||||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||  |||||    
T  24263953 tcataggggagtgactgctactgttcggagctacaatattgtgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatcaagccatgaaacttttcaaagaa 24263854  T
Q  561 atgcgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcg 660  Q
    |||| |   | | ||||| ||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||| ||||| ||||  || ||||| || |||||| || | ||  |||    
T  24263853 atgcatcacaaacaaatttttcctaatgtgataacttataattcccttattgatggattgtgcaaatctggaagaatatcatatgctttggaacttatcg 24263754  T
Q  661 atgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttaccacgcaattgcatt 760  Q
    ||  |||||||||| |||| |||| |||| |||||   || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||| || | |||||||||||    
T  24263753 atttgatgcatgatcgagggcaacaacctgatataatcacgtacagttctatattggatgccttatgcaaaaaccatctggttgacaaggcaattgcatt 24263654  T
Q  761 attaacaaatttgaaataccacggtatttgaccaaatatgtaca-atacactattctt 817  Q
    ||||| ||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24263653 attaataaaattgaaagaccagggtattcgaccaaatatgtacacatacactattctt 24263596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 62 - 817
Target Start/End: Original strand, 29928671 - 29929428
Alignment:
Q  62 atgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaattgg 160  Q
    |||||||||||||||  || ||||| ||| || | || ||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||      
T  29928671 atgtggtaatgtacaataccattatcgatggtatgtgtaaagataaacatgttaatgatgcttttgatttatattctgaaatggttgcaaagagaatttc 29928770  T
Q  161 ccctgatgttttcacttacaatgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcggaaaac 260  Q
     ||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||  || ||||  ||||||||| |||||| ||| ||| || |||||||||| |  | |||||    
T  29928771 tcctaatgttgtcacttatagtgctttaattagtggattttgcattgttggtaaattgaaagatgcatttgatttttttaataaaatgatattgtaaaac 29928870  T
Q  261 atcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatgaaag 360  Q
    ||||  ||| || |||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  29928871 atcattccgtatttgtatacctttagtatattggttgatggattttgtaaggaaggaagggtgaaagaagctaaaaatgtgttagctatgatgatgaaac 29928970  T
Q  361 acgacataaagcctaatgttgttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaaggaaatattcgatagtatggc 460  Q
    | | ||| || ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |  | || ||||||||||||||| ||   |||||| | | |||| |    
T  29928971 aaggcattaaacctgatgttgttacttacagctctttaatggatggatattgtcttgtaaatgaagtgaacaaggccgagagtatattcaacactatgtc 29929070  T
Q  461 cgcgaggggagtcatggctaatgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaa 560  Q
        |||||||| |  ||||||| | ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  |||||    
T  29929071 tcataggggagtgactgctaatgctaagagctacagtatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccatgaaacttttcaaagaa 29929170  T
Q  561 atgcgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcg 660  Q
    |||| |   | | ||||| ||||| ||||| ||||||| |||  |||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| |||||| || |||| ||||    
T  29929171 atgcatcacaaacaaatttttcctgatgtgataacttatagtgcccttatcgatggattgtgcaaatcagggagaatctcatatgctttgcagcttgtcg 29929270  T
Q  661 atgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttaccacgcaattgcatt 760  Q
    || |||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||| || | |||||||||||    
T  29929271 atcagatgcatgatagaggtgtagcacctaatatagttacttacaattctatattagatgctttatgcaaaacccatcaggttgacaaagcaattgcatt 29929370  T
Q  761 attaacaaatttgaaataccacggtatttgaccaaatatgtaca-atacactattctt 817  Q
     ||||| || || ||| |||| ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  29929371 gttaacgaaattcaaagaccagggtattcaaccaagtgtgtacacatacactattctt 29929428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 372 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 28926837 - 28926391
Alignment:
Q  372 cctaatgttgttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaaggaaatattcgatagtatggccgcgaggggag 471  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||| |||||||||||||| |||   |||||| | | ||||||   | ||||||    
T  28926837 cctaacgttgttacttatagctctttaatggatggatattgccttgttaaagaagtgaacaaggctaagagtatattcaacaatatggctcaggggggag 28926738  T
Q  472 tcatggctaatgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtag 571  Q
    | |   || || ||||||| || | || | |||||||||| ||||||||||||||||||   |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  28926737 tgaatcctgatattcagagttacaatatcttgattaatgggttttgtaagattaaaatgaccgatgcagccatgaatctctttgaagaaatgcattgcag 28926638  T
Q  572 aaaaattattcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcat 671  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28926637 aaaaattattcctaatgtggtaacttacaattcccttatcgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagtcgatgagatgcat 28926538  T
Q  672 gatagaggtcaaccacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttaccacgcaattgcattattaacaaatt 771  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||| |    
T  28926537 gatagaggtcaaccacctgatataattacttacagttctctattggatgctttatgcaaaaaccatcatgttgacaaggcaattgcattattaacaaaat 28926438  T
Q  772 tgaaataccacggtatttgaccaaatatgtaca-atacactattctt 817  Q
    ||||| |||| ||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28926437 tgaaagaccagggtcttcaaccaaatatgtacacatacactattctt 28926391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 58 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 29367026 - 29366345
Alignment:
Q  58 cctaatgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaa 156  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||||  ||| ||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |    
T  29367026 cctaatgtggtaatgtacaacaccattattgatagcatgtgcaaagttaagcttgttaatgaagcttttgatttatattctgaaatggtttctaagggga 29366927  T
Q  157 ttggccctgatgttttcacttacaatgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcgga 256  Q
    ||   || |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||  || |||   |||| |||| ||||||| || |||||| |||||||||| |   ||    
T  29366926 tttctcccgatgttgttacttacaatgctttaattagtggcttttgcattgtcggtaaaatgaaagatgcaactgatttgtttaataaaatgatattcga 29366827  T
Q  257 aaacatcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatg 356  Q
    ||||||||||||  ||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||||| |||||  | ||| ||||||||| |||||||||  |||| |||||||||    
T  29366826 aaacatcaacccaaatgtgtatacttttaacatattggttgatggattttgtaaggaaagaaggttgaaagaagctaaaaatgtgctagctatgatgatg 29366727  T
Q  357 aaagacgacataaagcctaatgttgttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaaggaaatattcgatagta 456  Q
    ||| | | ||| || ||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |  |||| ||||| || ||||| ||  | |||||| | | ||    
T  29366726 aaacaaggcattaaacctgacgtttttacttataactctttaatggatagatattgcctagttaaagaagtcaataaggctaaacatatattcaacacta 29366627  T
Q  457 tggccgcgaggggagtcatggctaatgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttga 556  Q
    |  |   ||||||||| |   ||||| |||| ||||| | || ||||||| | || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  29366626 tatctcagaggggagtgaatcctaatattcacagctacagtatcatgattcacgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagccatgaatctctttaa 29366527  T
Q  557 agaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagcta 656  Q
    |||||||| ||| |  || ||||||||| ||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  29366526 agaaatgcattgcaataacattattcctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaattggggaaaatctcttatgctttgaagcta 29366427  T
Q  657 gtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatc 738  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29366426 gtcgatgagatgcatgatagaggtgtaccacatgataaaattacttacaattctatattggatgctttatgcaaaaaccatc 29366345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 212 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 29358429 - 29357823
Alignment:
Q  212 taaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcggaaaacatcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttgcaag 311  Q
    |||| |||| |||||| ||| | |||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| |||    
T  29358429 taaactgaaagatgcagttgatctgtttaataaaatgatattggaaaacatcaacccggatgtgtatacctttactatattagttgatggattttgtaag 29358330  T
Q  312 gatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatgaaagacgacataaagcctaatgttgttacttataactctttaatggatggatatt 411  Q
    || || ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| | | | ||| || |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29358329 gaaggaagggtgaaagaagctaaaaatgtgttagctatgatgatgatacaaggcattaaacctggcgttgttacttataactctttaatggatggatatt 29358230  T
Q  412 gtttgattaacgaagtgaacaaggccaaggaaatattcgatagtatggccgcgaggggagtcatggctaatgttcagagctatactaccatgattaatgg 511  Q
       |  ||||  ||||||| ||||| |||   |||||| | | ||||||   |  |||||| |   || || ||||||| || | || | ||||||||||    
T  29358229 tcctagttaaacaagtgaataaggctaagagtatattcaacactatggctcagttgggagtgagtcctgatattcagagttacagtatcttgattaatgg 29358130  T
Q  512 attttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttacagtttccttatc 611  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||  |  ||||||||| |   | | ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||     
T  29358129 gttttgtaagattaaaatgatggatgaagccatggaactactcaaagaaatgcatcacaaacaaattattcctaacgtggtaacttacagttcccttatt 29358030  T
Q  612 gatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagatacttacagttcta 711  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29358029 gatggtttatgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagtggatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagttacttacagttcta 29357930  T
Q  712 tattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttaccacgcaattgcattattaacaaatttgaaataccacggtatttgaccaaatatgtaca-atacac 810  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||| || | |||||||| ||||||||| |  ||||| |||| ||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  29357929 tattggatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaatgcaattgcgttattaacacagatgaaaaaccagggtattcaaccaaatatgtacacatacac 29357830  T
Q  811 tattctt 817  Q
    |||||||    
T  29357829 tattctt 29357823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 58 - 817
Target Start/End: Original strand, 29115655 - 29116416
Alignment:
Q  58 cctaatgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaa 156  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||||  ||||||||| || || ||||||||||||| || ||||||| || ||||| | |    
T  29115655 cctaatgtggtaatgtacaacaccattattgatagcatgtgcaaagttaaacttgttaatgaagcttttgatttattttctgaaatgatttctaagggga 29115754  T
Q  157 ttggccctgatgttttcacttacaatgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcgga 256  Q
    ||   || |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||  || | ||  |||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||| |  |||    
T  29115755 tttctcccgatgttgttacttacagtgctttaattagtggtttttgcattcttggtaaactgaatgatgcaattgatctgtttaataaaatgatattgga 29115854  T
Q  257 aaacatcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatg 356  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||  ||||| ||||| || | | ||||||||| ||||| ||| || |  |||||||||    
T  29115855 aaacatcaaaccggatgtgtatacttttaatatattggttaatgcattttgtaaggacggaaagatgaaagaaggtaaaactgtgtttgatatgatgatg 29115954  T
Q  357 aaagacgacataaagcctaatgttgttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaaggaaatattcgatagta 456  Q
    ||| | | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||| |||||||| ||||| |||   |||||| | | ||    
T  29115955 aaacaaggcatcaaacctaattttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattcaacacta 29116054  T
Q  457 tggccgcgaggggagtcatggctaatgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttga 556  Q
    ||||   | ||||||| |   || || ||||||| || | || ||||||||| || |||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||| |    
T  29116055 tggctcaggggggagtgaatcctgatattcagagttacagtatcatgattaacgggttttgtaagattaaaaagtttgatgaagccatgaatctctttaa 29116154  T
Q  557 agaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagcta 656  Q
    |||||||| | | | ||| ||||||||| ||||  |||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||  ||||||||||| |||||| || ||||     
T  29116155 agaaatgcatcgcaaaaacattattcctgatgtcgtaacttacagttcccttattgatggtttaagcaaatcagggagaatctcatatgctttgcagctt 29116254  T
Q  657 gtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttaccacgcaattg 756  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||| || | |||||||    
T  29116255 gtcgatcagatgcatgatagaggtgtaccacctactatacgtacttacaattctatattagatgctttatgcaaaatccatcaagttgacaaagcaattg 29116354  T
Q  757 cattattaacaaatttgaaataccacggtatttgaccaaatatgtaca-atacactattctt 817  Q
    |||| ||||| || |||||| || | ||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  29116355 cattgttaacgaaattgaaagacaagggtattcaaccaaatatgtacacatacagtattctt 29116416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 82 - 817
Target Start/End: Original strand, 29905071 - 29905794
Alignment:
Q  82 attattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaattggccctgatgttttcacttaca 180  Q
    |||||||||||| | || ||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||||    
T  29905071 attattgatagtatgtgtaaagataaacatgttaatcatgcttttgatttatattctaaaatggtttctaagagaatttcccctgatattctcacttaca 29905170  T
Q  181 atgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcggaaaacatcaacccggatgtgtacac 280  Q
    |||||||||||||||  |||  || ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||              | ||    
T  29905171 atgctttaattagtgacttttgcattgttggtaaattgaaagatgcaattggttttttcaataaaatgacattggaaaacat--------------atac 29905256  T
Q  281 ctttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatgaaagacgacataaagcctaatgtt 380  Q
    |||||||||| | |||||||  ||||| ||||| || |  || ||||||| ||||||||| || |   | ||||||||| | |   | || |||||  ||    
T  29905257 ctttaatatattcgttgatgcattttgtaaggaaggaaaagtaaaagaagctaaaaatgtgtttgttgttatgatgaaaaaaggtttcaaacctaacttt 29905356  T
Q  381 gttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaaggaaatattcgatagtatggccgcgaggggagtcatggcta 480  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||| |||   |||||| | | ||||||   |  |||||| |   ||     
T  29905357 gttacttataactctttaatggatggatattgcttacttaaagaagtgaataaggctaagagtatattcaacactatggctcaggagggagtgaatcctg 29905456  T
Q  481 atgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattat 580  Q
     | |||| || || | || | |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  29905457 ctattcaaagttacaatatcttgattaatgggttttgtaagattaaaaaggttgatgaagccataaatctctttgaagaaatgcattgtagaaaattaat 29905556  T
Q  581 tcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggt 680  Q
    |||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29905557 tcctgatgtggtaacttacaattcccttatcgatggtttgtgtaaatctggaaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgcatgatagaggt 29905656  T
Q  681 caaccacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttaccacgcaattgcattattaacaaatttgaaatacc 780  Q
    || |||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| || | |||||  ||||||||||||| |||||| |||    
T  29905657 cagccacctgatataattacttagagttctatattggatgctttatgcaaaaactatcaggttgacaaggcaatcacattattaacaaaattgaaagacc 29905756  T
Q  781 acggtatttgaccaaatatgtaca-atacactattctt 817  Q
      ||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  29905757 tgggtattcaaccaaatatgtacacatacaccattctt 29905794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 58 - 766
Target Start/End: Original strand, 29098737 - 29099446
Alignment:
Q  58 cctaatgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaa 156  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  | ||||||  ||||||||| || || ||||||||||||| || |||||||||| ||||| | |    
T  29098737 cctaatgtggtaatgtacaacaccattattgatagcatgtgcaaagttaaacttgttaatgaagcttttgatttattttctgaaatggtttctaagggga 29098836  T
Q  157 ttggccctgatgttttcacttacaatgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcgga 256  Q
    ||   || |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||  || | ||  |||| |||| |||||||||| | |||| |||||||||| |  |||    
T  29098837 tttctcccgatgttgttacttacagtgctttaattagtggtttttgcattcttggtaaactgaaagatgcaattgatctgtttaataaaatgatattgga 29098936  T
Q  257 aaacatcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatg 356  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||  ||||| ||||| || | | ||||||||| ||||| ||| || |  |||||||||    
T  29098937 aaacatcaaaccggatgtgtatacttttaatatattggttaatgcattttgtaaggacggaaagatgaaagaaggtaaaactgtgtttgatatgatgatg 29099036  T
Q  357 aaagacgacataaagcctaatgttgttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaaggaaatattcgatagta 456  Q
    ||| | | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||| |||||||| ||||| |||   |||||| | | ||    
T  29099037 aaacaaggcatcaaacctaattttgttacttataactctttaatggatggatattgcctagttaaagaagtgaataaggctaagagtatattcaacacta 29099136  T
Q  457 tggccgcgaggggagtcatggctaatgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttga 556  Q
    ||||   | ||||||| |   || || ||||||| || | || ||||||||| || |||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||| |    
T  29099137 tggctcaggggggagtgaatcctgatattcagagttacagtatcatgattaacgggttttgtaagattaaaaagtttgatgaagccatgaatctctttaa 29099236  T
Q  557 agaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagcta 656  Q
    |||||||| | | | ||| ||||||||| ||||  |||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||  ||||||||||| |||||| || ||||     
T  29099237 agaaatgcatcgcaaaaacattattcctgatgtcgtaacttacagttcccttattgatggtttaagcaaatcagggagaatctcatatgctttgcagctt 29099336  T
Q  657 gtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttaccacgcaattg 756  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||| || | |||||||    
T  29099337 gtcgatcagatgcatgatagaggtgtaccacctaatatatgtacttacaattctatattagatgctttatgcaaaacccatcaagttgacaaagcaattg 29099436  T
Q  757 cattattaac 766  Q
    |||| |||||    
T  29099437 cattgttaac 29099446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 500 - 817
Target Start/End: Original strand, 29078364 - 29078682
Alignment:
Q  500 catgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttac 599  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||| | ||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  29078364 catgattaacgggttttgtaagattaaaaaggttgatgaagccatgaatctctttaaaaaaatgcattgcaaaaacattattcctaatgtggtgacttac 29078463  T
Q  600 agtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagata 699  Q
    | ||  ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||    
T  29078464 acttctcttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtgtaccacctgatataatta 29078563  T
Q  700 cttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttaccacgcaattgcattattaacaaatttgaaataccacggtatttgaccaaatat 799  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| || | |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||| |||    
T  29078564 cttacagttctatattggatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaattgcattattaacaaaattgaaagaccaaggtattcgaccaactat 29078663  T
Q  800 gtaca-atacactattctt 817  Q
    | ||| |||||||||||||    
T  29078664 gcacacatacactattctt 29078682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 502 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 30118901 - 30118585
Alignment:
Q  502 tgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttacag 601  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||| |||||||||     
T  30118901 tgattaatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagccataaatctctttgaagaaatgcattgtagaaaattaattcctgatgtggtaacttacaa 30118802  T
Q  602 tttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagatact 701  Q
    || |||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||    
T  30118801 ttcccttatcgatggtttgtgtaaatctggaaaaatctcttatgctttgaagctagttgatgagatgcatgatagaggtcagccacctgatataattact 30118702  T
Q  702 tacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttaccacgcaattgcattattaacaaatttgaaataccacggtatttgaccaaatatgt 801  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| || | |||||  ||||||||||||| |||||| |||  || |||  |||||||||||    
T  30118701 tagagttctatattggatgctttatgcaaaaactatcaggttgacaaggcaatcacattattaacaaaattgaaagacctgggaattcaaccaaatatgt 30118602  T
Q  802 aca-atacactattctt 817  Q
    ||| |||||| ||||||    
T  30118601 acacatacaccattctt 30118585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 501 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 30060323 - 30060007
Alignment:
Q  501 atgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttaca 600  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||| ||||| |||| ||||    
T  30060323 atgattaatgggttttgtaagattaaaaaggtcgatgaagccatgaatctctttgaagaaatgcattgcaaaaacattattcctgatgtggtaacataca 30060224  T
Q  601 gtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagatac 700  Q
     || |||||| |||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  |||    
T  30060223 attcccttattgatggtatctgtaaatcggggaaaatctcttatgctttaaagctagtcgatgagatgaatgatagaggtcaactacctgatataattac 30060124  T
Q  701 ttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttaccacgcaattgcattattaacaaatttgaaataccacggtatttgaccaaatatg 800  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||| || | |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||     
T  30060123 ttacaattctatattaaatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaaggcaattgcattattaacaaaattgaaagaccagggtatccgaccaaatatt 30060024  T
Q  801 taca-atacactattct 816  Q
    |||| | ||||||||||    
T  30060023 tacacacacactattct 30060007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 483 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 30127234 - 30126899
Alignment:
Q  483 gttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattc 582  Q
    ||||| ||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  || | |||||||||||    
T  30127234 gttcaaagctacaatatcatgattaatgggttttgtaagattaaaagggtgggtgaagccattaatctctttgaagaaatgcaatgcaaaaaaattattc 30127135  T
Q  583 ctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtca 682  Q
    || ||||| ||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| || || ||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30127134 ctgatgtggtaacttatagttcccttattgatggtttctgtaaatcggagaaaatctctcatgctttgaatctagtcaatgagatgcatgatagaggtca 30127035  T
Q  683 accacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttaccacgcaattgcattattaacaaatttgaaataccac 782  Q
    ||||||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| || | ||||||||||| ||||| || || ||| ||||     
T  30127034 accacctgatataattatttacaattctatattggatgctttatgcaaaaaccatcaggttgacaaagcaattgcattgttaacgaaatttaaaaaccag 30126935  T
Q  783 ggtatttgaccaaatatgtaca-atacactattctt 817  Q
    ||||||  ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  30126934 ggtattcaaccaagtgtgtacacatacactattctt 30126899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 104 - 817
Target Start/End: Original strand, 29084458 - 29085173
Alignment:
Q  104 ataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaattggccctgatgttttcacttacaatgctttaattagtggttttcc 202  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||   ||  ||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||      
T  29084458 ataaacatgttaatgatgcttttgatttatattctgaaatggtttctaagggaatttctcccaatgttgttacttacagtgctttaattagtgggttttt 29084557  T
Q  203 cactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcggaaaacatcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggt 302  Q
    |  ||||  |||| |||| |||||||||| | |||| |||||||| | |  |||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||     
T  29084558 cgttgttggtaaactgaaagatgcaattgatctgtttaataaaataatattggaaaacatcaaaccggatgggtatacttttaatatattggttgatgga 29084657  T
Q  303 ttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatgaaagacgacataaagcctaatgttgttacttataactctttaatgg 402  Q
    ||||| |||||  | | | ||||||||| ||||| ||| || || |||||||||||| | | ||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29084658 ttttgtaaggacagaaagatgaaagaaggtaaaactgtgtttgctatgatgatgaaacaaggcatcatacctgatgttgttacttataactctttaatgg 29084757  T
Q  403 atggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaaggaaatattcgatagtatggccgcgagg-ggagtcatggctaatgttcagagctatactacca 501  Q
    ||||||||||  |  |||| |||||||| | ||| |||   |||||| | | ||||||  | ||| ||||| |   || || |||  || || | || |     
T  29084758 atggatattgcctagttaaagaagtgaatacggctaagagtatattcaacactatggct-caaggcggagtgaatcctgatattcgcagttacaatatct 29084856  T
Q  502 tgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttacag 601  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||| | ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||| | |||||||     
T  29084857 tgattaatgggttttgtaagattaaaaaggtcgataaagctatgaatctctttaatgaaatgcattgcaaaaacattattcctaatgtggtgacttacaa 29084956  T
Q  602 tttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagatact 701  Q
    ||  ||||| ||||||||  | ||||  ||||||||||| |||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||    
T  29084957 ttctcttattgatggtttaagcaaatcagggagaatctcatatgctttgcagcttgtcgatcagatgcatgatagaggtgtaccacctaatatacttact 29085056  T
Q  702 tacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttaccacgcaattgcattattaacaaatttgaaataccacggtatttgaccaaatatgt 801  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||  |||| |||||  ||| || | |||||||||||  |||| || || ||| |||| ||||||  |||||  ||||    
T  29085057 tacaattctataatagatgctttattcaaaacccatcaagttgacaaagcaattgcattgataacgaaatttaaagaccagggtattcaaccaagcatgt 29085156  T
Q  802 aca-atacactattctt 817  Q
    ||| |||||||||||||    
T  29085157 acacatacactattctt 29085173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 489 - 769
Target Start/End: Original strand, 29946263 - 29946543
Alignment:
Q  489 agctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatg 588  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | | ||||| |||||||||    
T  29946263 agctatattatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccatgaatctctttgaagaaatgcattgcaaacaaatttttcctaatg 29946362  T
Q  589 tgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacc 688  Q
    || ||||||||| || ||||||  |||||||||| | || |||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29946363 tggtaacttacaattcccttattaatggtttgtgcagatcggggagaatctcatatgctttggagcttgtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccacc 29946462  T
Q  689 taatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttaccacgcaattgcattattaacaaa 769  Q
    |||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||| || ||| ||  |||| || | ||||||| ||| ||||||||    
T  29946463 taatataattacttacaactctatattggatgttttatgcaagaactatgatgttgacaaggcaattgtatttttaacaaa 29946543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 58 - 268
Target Start/End: Original strand, 24711532 - 24711743
Alignment:
Q  58 cctaatgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaa 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24711532 cctaatgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgttaatgatgcatttgatttatattctgaaatggctgctaagagaa 24711631  T
Q  157 ttggccctgatgttttcacttacaatgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcgga 256  Q
    || ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||  || ||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  24711632 tttgccctgatgttgtcacttatagtgctttaattagtggtgtttgcattgttggtaaattgaatgatgcaatttggttgttcaataaaatgacagcaga 24711731  T
Q  257 aaacatcaaccc 268  Q
     |||||||||||    
T  24711732 caacatcaaccc 24711743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 612 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 29211443 - 29211237
Alignment:
Q  612 gatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagatacttacagttcta 711  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29211443 gatgttttttgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagtggatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagttacttacagttcta 29211344  T
Q  712 tattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttaccacgcaattgcattattaacaaatttgaaataccacggtatttgaccaaatatgtaca-atacac 810  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| || | ||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  29211343 tattggatgctttatgcaaaacccatcgggttgacaaggcagttgcattattaacaaaattgaaagaccaaggtattcgaccaaatatgcacacatacac 29211244  T
Q  811 tattctt 817  Q
    |||||||    
T  29211243 tattctt 29211237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 382 - 732
Target Start/End: Original strand, 29876544 - 29876894
Alignment:
Q  382 ttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaaggaaatattcgatagtatggccgcgaggggagtcatggctaa 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||| ||| | |||||| | | |||||    ||||||||| |  || ||    
T  29876544 ttacttataactctttaatggatggatattgtctggttaaagaagtggacaaggctaagaatatattcaacactatggttcagaggggagtgactgcaaa 29876643  T
Q  482 tgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattatt 581  Q
    ||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||  ||||||||| ||||| | |||| |||    
T  29876644 tgttcggagctacagtatcatgattaatggattttgtaaggttaaaatgatggatgaagcaatgaatctcttccaagaaatgcattgtaaagaaataatt 29876743  T
Q  582 cctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtc 681  Q
    ||| ||  | || |||| |||| |||||| |||||||| || |||| |||||||||  |  | ||| || |||| || |||||||||||||||||||| |    
T  29876744 cctgatacgatagcttatagttcccttattgatggtttttgcaaatcggggagaattccacaggctttggagcttgttgatgagatgcatgatagaggcc 29876843  T
Q  682 aaccacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaa 732  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  29876844 aaccacctaatataattacttacaattctatattgtatgctttatgcaaaa 29876894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 58 - 409
Target Start/End: Original strand, 29902650 - 29903002
Alignment:
Q  58 cctaatgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatattt-gaaatggttgctaagagaa 156  Q
    ||||||||||||||||| |  || ||||||||| || | ||||||  |||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  29902650 cctaatgtggtaatgtataatacgattattgatggtatgtgcaaaggtaaatttgttaatgatgcttttgatttatattttgaaatggtttctaggagaa 29902749  T
Q  157 ttggccctgatgttttcacttacaatgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcgga 256  Q
     |   ||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||  || ||||  |||| |||  |||||||||| ||| || |||||||||| |   ||    
T  29902750 cttctcctaatgttgtcacttatagtgctttaattagtggattttgcattgttggtaaactgagagatgcaattgatttctttaataaaatgatattcga 29902849  T
Q  257 aaacatcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatg 356  Q
    ||||||||||||  ||||||| || |||| |||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  29902850 aaacatcaacccaaatgtgtatacttttactatattggttgatggtttttgtaaggaaggaagggtgaaagaagctaaaaatgtgttagctatgatgatg 29902949  T
Q  357 aaagacgacataaagcctaatgttgttacttataactctttaatggatggata 409  Q
    ||| | | ||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29902950 aaacaaggcatcaaacctgacgttgttacttataactctttaatggatggata 29903002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 548 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 30062109 - 30061840
Alignment:
Q  548 tctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgct 647  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||  ||||| || |||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  30062109 tctctttgaagaaatgcattgcaaaaacattattcccgatgtggtagcttacaattcccttattgatggtttttgtaaatcggggaaaatctcttatgct 30062010  T
Q  648 ctgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttacc 747  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||| | || ||     
T  30062009 ttgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatataattacttacaattctatattggatgctttatgcaaacgccatcatcttgaca 30061910  T
Q  748 acgcaattgcattattaacaaatttgaaataccacggtatttgaccaaatatgtaca-atacactattct 816  Q
    | |||||  |||||||| |||| |||||| | || ||||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  30061909 aggcaatcacattattatcaaaattgaaagatcagggtattcaaccgaatatttacacatacactattct 30061840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 372 - 726
Target Start/End: Original strand, 25450827 - 25451181
Alignment:
Q  372 cctaatgttgttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaaggaaatattcgatagtatggccgcgaggggag 471  Q
    ||||||||| | ||||||| || |||| || ||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||||||  ||||||| | |||||| |    |||||||    
T  25450827 cctaatgttatcacttatagctgtttattgtatggatattgtctagttaatgaagtgaacgaggccaagagaatattcaaaagtatgactcaaaggggag 25450926  T
Q  472 tcatggctaatgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtag 571  Q
    | |    | | ||||  ||||| |||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||  |  |     
T  25450927 tgacttttgacgttcttagctacactatcatgattagtaaattttgtaagattaaaatggtggatgaagccaggaaactttttgaagaaatgcagtccaa 25451026  T
Q  572 aaaaattattcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcat 671  Q
    | ||||  ||||| ||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||| |||| || ||||||  || ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25451027 acaaatatttcctgatgtggtaacttacagttcccttgttgatggtttgtgcaaatcggagagaattcctaatgctttgaagcttgtcgatgagatgcat 25451126  T
Q  672 gatagaggtcaaccacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttat 726  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25451127 gatagaggtcaaccaccaaatatatttacttacagttctatattggatgctttat 25451181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 478 - 738
Target Start/End: Original strand, 29889545 - 29889805
Alignment:
Q  478 ctaatgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaat 577  Q
    |||||||||  ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| | ||| ||    
T  29889545 ctaatgttccaagctacaatacaatgattaatgggttttgtaagattaaaaaagtcgatgaagccatgaatctctttaaagaaatgcattgcaaaaacat 29889644  T
Q  578 tattcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcatgataga 677  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||  ||||| ||||||||  | ||||  |||| |||||| |||| | || |||| |||||| ||||||||||||||    
T  29889645 tattcctaatgtggtgacttacaattctcttattgatggtttaagcaaatcagggataatctcatatgttttgcagcttgtcgatcagatgcatgataga 29889744  T
Q  678 ggtcaaccacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatc 738  Q
    |||  ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  29889745 ggtgtaccacctaatatagtcacttacaattctatattagatgctttatgcaaaacccatc 29889805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 212 - 412
Target Start/End: Original strand, 29889069 - 29889269
Alignment:
Q  212 taaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcggaaaacatcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttgcaag 311  Q
    |||| |||| |||||||||| ||  || |||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||    
T  29889069 taaaatgaaagatgcaattgattgttttaataaaatgatattggaaaacatcaatccgaatgtgtatacctttaacataatggttgatggattttgtaag 29889168  T
Q  312 gatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatgaaagacgacataaagcctaatgttgttacttataactctttaatggatggatatt 411  Q
    || || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||   ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29889169 gaaggaagggtgaaagaagctaaaaatgtgttagctatgatgatgaaacgagacatcaaacttaatgttgttacttataactctttaatggatggatatt 29889268  T
Q  412 g 412  Q
    |    
T  29889269 g 29889269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 58 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 29211683 - 29211433
Alignment:
Q  58 cctaatgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaa 156  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||| ||| || | || ||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  29211683 cctaatgtggtaatgtacagtaccattatcgatggtatgtgtaaagataaacatgttaatgatgcttttgatttatattctgaaatggtttctaagggaa 29211584  T
Q  157 ttggccctgatgttttcacttacaatgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcgga 256  Q
    ||   ||  ||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||  |||| |||| |||||| ||| | |||| |||||||||| | ||||    
T  29211583 tttctcccaatgttgttacttacagtgctttaattagtgggtttttcactgttggtaaactgaaagatgcagttgatctgtttaataaaatgatatcgga 29211484  T
Q  257 aaacatcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttg 307  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  29211483 aaacatcaaaccggatgtgtatacttttaatatattggttgatgttttttg 29211433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 62 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 28927583 - 28927344
Alignment:
Q  62 atgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaattgg 160  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||| | || ||| |||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||      
T  28927583 atgtggtaatgtacactatgattattgatagtatgtgtaaagataaacttgttaatgaagcttttgatttatattctgaaatggtttctaaggggatttc 28927484  T
Q  161 ccctgatgttttcacttacaatgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcggaaaac 260  Q
     || || ||| | ||||||| |||||||||||||||||||  || | ||  ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| | | |||||     
T  28927483 tcccgaagttgttacttacagtgctttaattagtggtttttgcattcttggtaaattgaatgattcaattggtttgtttcataaaatgatatcagaaaag 28927384  T
Q  261 atcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatg 300  Q
    ||||||||  || |||| |||||||||||| || ||||||    
T  28927383 atcaacccaaatatgtatacctttaatatattgattgatg 28927344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 666 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 24886561 - 24886413
Alignment:
Q  666 atgcatgatagaggtcaaccacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttaccacgcaattgcattattaa 765  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||     | ||||||||||||||||    
T  24886561 atgcatgatagaggtcagccacctgatataattacttacaattctatattggatgctttatg-aaaaaccatcatgtgacaaaggcaattgcattattaa 24886463  T
Q  766 caaatttgaaataccacggtatttgaccaaatatgtaca-atacactatt 814  Q
    |||| |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24886462 caaaattgaaagaccagggtattcgaccagatatgtacacatacactatt 24886413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 657 - 817
Target Start/End: Original strand, 29903240 - 29903401
Alignment:
Q  657 gtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttaccacgcaattg 756  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |  | | |||||||    
T  29903240 gtcgatgagatgcatgatcgagggcaacaacctgatataattacctacaattctatattggatgctttatgcaaaaaacatcatgctggcaaagcaattg 29903339  T
Q  757 cattattaacaaatttgaaataccacggtatttgaccaaatatgtaca-atacactattctt 817  Q
    | ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  29903340 cgttattaacaaaattgaaagaccagggtattcgaccaaatatgaacacatacaccattctt 29903401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 478 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 21160809 - 21160723
Alignment:
Q  478 ctaatgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgc 564  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  21160809 ctaatgttcatagctatactgtcatgattaatggactatgtaagaataaaatggtggatgaagccgttaatctctttaaagaaatgc 21160723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 360
Target Start/End: Original strand, 25450327 - 25450605
Alignment:
Q  83 ttattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaattggccctgatgttttcacttacaa 181  Q
    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||   ||| ||||| ||||||||||    
T  25450327 ttattgatagaatgtgtaaagataaacttgttaacgttgcttttgatttatattatgaaatgcttgctaagaggatttctcctaatgttatcacttacaa 25450426  T
Q  182 tgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcggaaaacatcaacccggatgtgtacacc 281  Q
    | || || ||  |||  ||  ||  |||    ||||||| ||||||||| ||||||| || | ||||  | ||||||||||||||||   |||||| |||    
T  25450427 tactctacttcatggcctttgcatcgttggacaattgaaagatgcaattagtttgtttaagataatggtatcggaaaacatcaacccaactgtgtatacc 25450526  T
Q  282 tttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatgaaag 360  Q
    || |||||| |||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||| | ||||   || |||||| ||||||||||||    
T  25450527 ttcaatatattggttgatggattttgtaaggaaggaaaggtgaaagatgctaaagtagtgttagccgtgatgatgaaag 25450605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 21161230 - 21161130
Alignment:
Q  58 cctaatgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaa 156  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||    
T  21161230 cctaatgtggtcatgtacagtacaattatttatagtttatgcaaggataaacttgtaattgatgcttttgatttatattctgaaatggttgccatgagaa 21161131  T
Q  157 t 157  Q
    |    
T  21161130 t 21161130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 24739800 - 24739667
Alignment:
Q  58 cctaatgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaa 156  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||| ||   |||||||    
T  24739800 cctaatgtggtcatgtacagtacaattatttatagtttatgcaaggataaacttgtaattgatgcttttgatttatattctcaaatgcttctcaagagaa 24739701  T
Q  157 ttggccctgatgttttcacttacaatgctttaat 190  Q
    ||   ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  24739700 tttctcctgatgtcatcacttacaatactttaat 24739667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 481 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 15715167 - 15715084
Alignment:
Q  481 atgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgc 564  Q
    ||||||| ||||| |||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||  |||||||||    
T  15715167 atgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttgaatctcttcaaagaaatgc 15715084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 438
Target Start/End: Original strand, 24884849 - 24884915
Alignment:
Q  372 cctaatgttgttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggcca 438  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||||    
T  24884849 cctaatgttgttacttatacttctttaatggatggttatttcttggttaaagaagtgaacaaggcca 24884915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 60
Target Start/End: Original strand, 24729829 - 24729866
Alignment:
Q  23 ccacccatcatccaatttaacaagattttatcttccct 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24729829 ccacccatcatccaatttaacaagattttatcttccct 24729866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 500 - 564
Target Start/End: Original strand, 30149364 - 30149428
Alignment:
Q  500 catgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgc 564  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||    
T  30149364 catgattaacggattatgtaagaataaaatggtggatgaagccgtaaatcttttcaaagaaatgc 30149428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 500 - 564
Target Start/End: Original strand, 30154337 - 30154401
Alignment:
Q  500 catgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgc 564  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||| |||||||||    
T  30154337 catgattaatggattatgtaaggttaaaatggtggatgaagctgtgattctctttaaagaaatgc 30154401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 481 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 24739376 - 24739293
Alignment:
Q  481 atgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgc 564  Q
    ||||||| ||||||| |  ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |  |||||||||    
T  24739376 atgttcatagctatagtgtcatgattaatggactatgtaagactaaaatggtggatgaagccgttaatctcctcaaagaaatgc 24739293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 478 - 541
Target Start/End: Original strand, 30053242 - 30053305
Alignment:
Q  478 ctaatgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagc 541  Q
    |||||||||| ||||| | |  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  30053242 ctaatgttcatagctacattgtcatgattaatggattatgtaagaataaaatggtggatgaagc 30053305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 504 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 16702304 - 16702255
Alignment:
Q  504 attaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctt 553  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  16702304 attaatggattatgtaagattaaaatggttgatgaagccttgaatctctt 16702255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 60
Target Start/End: Original strand, 24710809 - 24710846
Alignment:
Q  23 ccacccatcatccaatttaacaagattttatcttccct 60  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24710809 ccacccatcttccaatttaacaagattttatcttccct 24710846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 158
Target Start/End: Original strand, 29946050 - 29946127
Alignment:
Q  82 attattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaatt 158  Q
    ||||||||| || | |||||| |||||||||| || |||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  29946050 attattgatggtatgtgcaaagataaacttgttaatgatgttgttgatttatattctgaaatggttactaagagaatt 29946127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 564
Target Start/End: Original strand, 24934505 - 24934568
Alignment:
Q  501 atgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgc 564  Q
    |||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||    
T  24934505 atgattaatggactatgcaagactaaaatggtggatgaagccgttaatctcttcaaagaaatgc 24934568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 513 - 544
Target Start/End: Original strand, 29903110 - 29903141
Alignment:
Q  513 ttttgtaagattaaaatggtggatgaagccat 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29903110 ttttgtaagattaaaatggtggatgaagccat 29903141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 660 - 738
Target Start/End: Original strand, 30135122 - 30135200
Alignment:
Q  660 gatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagat-acttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatc 738  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||| | ||| ||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  30135122 gatgagatgcatgaaagaggtcaacctgctaatgt-gatcacttacaattctttattggatgctttgtgcaaaaaccatc 30135200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 376 - 438
Target Start/End: Original strand, 30154213 - 30154275
Alignment:
Q  376 atgttgttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggcca 438  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||| |||| |||||||| |||||||    
T  30154213 atgttgttacttataattctttgatggatgggtatttcttggttaaagaagtgaataaggcca 30154275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 158
Target Start/End: Original strand, 24934061 - 24934162
Alignment:
Q  58 cctaatgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaa 156  Q
    |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |   |||| | |||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  24934061 cctaatgtagtcatgtacaatacaattattgatagtttgtgcaaggataaacttgtaattcatgcctctgatttatgttctgaaatgattgttaagagaa 24934160  T
Q  157 tt 158  Q
    ||    
T  24934161 tt 24934162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 158
Target Start/End: Original strand, 24941594 - 24941695
Alignment:
Q  58 cctaatgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaa 156  Q
    |||||||| || |||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |   |||| | |||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  24941594 cctaatgtagtcatgtacaatacaattattgatagtttgtgcaaggataaacttgtaattcatgcctctgatttatgttctgaaatgattgttaagagaa 24941693  T
Q  157 tt 158  Q
    ||    
T  24941694 tt 24941695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 500 - 553
Target Start/End: Original strand, 24942037 - 24942090
Alignment:
Q  500 catgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctt 553  Q
    |||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  24942037 catgataactggattatgtaagaataaaatggtggatgaagccgtcaatctctt 24942090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 230; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 62 - 817
Target Start/End: Original strand, 21741 - 22498
Alignment:
Q  62 atgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaattgg 160  Q
    |||||||||||||||  || ||||| ||| || | || ||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||      
T  21741 atgtggtaatgtacaataccattatcgatggtatgtgtaaagataaacatgttaatgatgcttttgatttatattctgaaaaggtttctaagagaatttt 21840  T
Q  161 ccctgatgttttcacttacaatgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcggaaaac 260  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||  ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||    
T  21841 ccccgatgttttcacttacaatgctttaattagtggcttttgcattgttggtaaattgaaagatgcaattgatttattcaataaaatgacatcgaaaaac 21940  T
Q  261 atcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatgaaag 360  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||| || |   | ||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  21941 atcatcccagatgtgtatacctttagtatattggttgatggattttgtaaggacggaaacataaaagaggctaaaaatgtgttagctatgatgatgaaac 22040  T
Q  361 acgacataaagcctaatgttgttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaaggaaatattcgatagtatggc 460  Q
    |   ||| || ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||| ||   |||||| | | |||| |    
T  22041 aaagcattaaacctgatgttgttacttacagctctttaatggatggatattgtctggtaaatgaagtgaacaaggccgagagtatattcaacactatgtc 22140  T
Q  461 cgcgaggggagtcatggctaatgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaa 560  Q
        ||||| || |  ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  |||||    
T  22141 tcataggggtgtgactgctaatgttcagagctacaatatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccatgaaacttttcaaagaa 22240  T
Q  561 atgcgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcg 660  Q
    |||| |   | | ||||| ||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||  || ||||| || |||||| || | || ||||    
T  22241 atgcatcacaaacaaatttttcctgatgtgataacttatagttcccttatcgatggattgtgcaaatctggaagaatatcatatgctttggaacttgtcg 22340  T
Q  661 atgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttaccacgcaattgcatt 760  Q
    ||||||||||| || |||| |||| |||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||  || | |||||| ||||    
T  22341 atgagatgcattatcgagggcaacaacctgatataattacttacaattctatattggatgctttatgcaaaaaacatcatgtggacaaagcaattacatt 22440  T
Q  761 attaacaaatttgaaataccacggtatttgaccaaatatgtaca-atacactattctt 817  Q
    ||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||||    
T  22441 attaacaaaattgaaaggccaaggtattcgaccagatatgaacacatacaccattctt 22498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 58 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 15063481 - 15062769
Alignment:
Q  58 cctaatgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaa 156  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | || ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  15063481 cctaatgtggtaatgtatagcacgattattgatagtatgtgtaaggataaacttgttaacgatgcttttgatttatattgtgaaatggtttctaaaagaa 15063382  T
Q  157 ttggccctgatgttttcacttacaatgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcgga 256  Q
    ||   ||||||||  ||||||| | | ||||||||||||| |||  |  ||||  |||||||||  ||||  ||| |||||| |||| ||||| | ||||    
T  15063381 tttctcctgatgtagtcacttatagttctttaattagtggcttttgcgttgttggtaaattgaaatatgctgttgatttgtttaatagaatgatatcgga 15063282  T
Q  257 aaacatcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatg 356  Q
     ||||| || ||| ||||||| || |||| |||| || ||||||||||||| ||||| || | ||||| ||||| ||||||||| |||||  ||||||||    
T  15063281 caacattaatccgaatgtgtatacttttagtatattgattgatggtttttgtaaggaaggaaaggtgagagaagctaaaaatgtgttagctgtgatgatg 15063182  T
Q  357 aaagacgacataaagcctaatgttgttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaaggaaatattcgatagta 456  Q
    ||| |  || |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||    ||||| |   ||    
T  15063181 aaaaaaaacgtaaaacttgatgttgttacttataactctttaatggatggatattgcttagttaaacaagtgaacaaggccaagagtttattcaacgtta 15063082  T
Q  457 tggccgcgaggggagtcatggctaatgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttga 556  Q
    ||||    |||||||| |   || | |||  |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  15063081 tggctcaaaggggagtaactcctgacgtttggagctacagtatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtagatgaagccatgaagctctttga 15062982  T
Q  557 agaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagcta 656  Q
    |||||||| ||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||| || |||| | ||||||||||||||||  || |||| ||| | |||| || ||||     
T  15062981 agaaatgcattgtaaacaaatttttccaaatgtggtaacttacaattcccttgttgatggtttgtgtaaatctggaagaacctcgtgtgctttggagctt 15062882  T
Q  657 gtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttaccacgcaattg 756  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||| ||| |||| |  | |||||||    
T  15062881 gtcgatgaaatgcatgatagaggtcaaccatctaatataattacttacaattctatattagatgctatatgcaaaaacaatcatgttgataaggcaattg 15062782  T
Q  757 cattattaacaaa 769  Q
      |||||||||||    
T  15062781 tgttattaacaaa 15062769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 434 - 567
Target Start/End: Original strand, 21456376 - 21456509
Alignment:
Q  434 ggccaaggaaatattcgatagtatggccgcgaggggagtcatggctaatgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtg 533  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |    |||||||| |  ||||| |||| | ||||||||  |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  21456376 ggccaaggatatatttgatagtatggaccaacggggagtcgttcctaatattcataactatactatgatgattaaaggattatgtaagataaaaagggtg 21456475  T
Q  534 gatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgtt 567  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  21456476 gatgaagcattgaatctctttgaagaaatgcgtt 21456509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0573 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0573
Description:

Target: scaffold0573; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 372 - 817
Target Start/End: Original strand, 3846 - 4292
Alignment:
Q  372 cctaatgttgttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaaggaaatattcgatagtatggccgcgaggggag 471  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||| |||||||||||||| |||   |||||| | | ||||||   | ||||||    
T  3846 cctaacgttgttacttatagctctttaatggatggatattgccttgttaaagaagtgaacaaggctaagagtatattcaacaatatggctcaggggggag 3945  T
Q  472 tcatggctaatgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtag 571  Q
    | |   || || ||||||| || | || | |||||||||| ||||||||||||||||||   |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  3946 tgaatcctgatattcagagttacaatatcttgattaatgggttttgtaagattaaaatgaccgatgcagccatgaatctctttgaagaaatgcattgcag 4045  T
Q  572 aaaaattattcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcat 671  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4046 aaaaattattcctaatgtggtaacttacaattcccttatcgatggtttgtgtaaatcggggaaaatctcttatgctttgaagctagtcgatgagatgcat 4145  T
Q  672 gatagaggtcaaccacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttaccacgcaattgcattattaacaaatt 771  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | | || | |||||||||||||||||||| |    
T  4146 gatagaggtcaaccacctgatataattacttacagttctctattggatgctttatgcaaaaaccatccaggtgacaaggcaattgcattattaacaaaat 4245  T
Q  772 tgaaataccacggtatttgaccaaatatgtaca-atacactattctt 817  Q
    ||||| |||| ||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  4246 tgaaagaccagggtcttcaaccaaatatgtacacatacactattctt 4292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 7)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 62 - 769
Target Start/End: Complemental strand, 24219836 - 24219128
Alignment:
Q  62 atgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaattgg 160  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  24219836 atgtggtgatgtacaacacgattattgatggtgtgtgcaaagataaacttgttaacgatgcttttgatttctattctgaaatggttgctaagagaatttg 24219737  T
Q  161 ccctgatgttttcacttacaatgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcggaaaac 260  Q
     |||  |||| ||||||| ||| |||||||| |||||||   || | |   | ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||    
T  24219736 tcctactgttgtcacttataatactttaatttgtggtttatgcattatgggtcaattgaaagatgcaattggtttgttacataaaatgatattggaaaac 24219637  T
Q  261 atcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatgaaag 360  Q
    ||||||||   |||||| ||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| || |  |||||||||| ||||||||| || |   |||||||||||     
T  24219636 atcaacccaactgtgtatacctttagtatattggttgatgcattttgtaaggaaggaaaagtgaaagaagctaaaaatgtgtttgttgtgatgatgaaaa 24219537  T
Q  361 acgacataaagcctaatgttgttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaaggaaatattcgatagtatggc 460  Q
    | ||  |||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | || || |||||||||||| |    |||||| | | ||||||    
T  24219536 aagatgtaaaacctaacattgttacttataactctttaatgaatggatattgtctggtaaatgaggtgaacaaggccgaaagtatattcaacactatggc 24219437  T
Q  461 cgcgaggggagtcatggctaatgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaa 560  Q
        |  |||||     || | ||||| || || | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  24219436 tcaaattggagtggctcctgacgttcatagttacagtatcatgattagtggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccatgaaactctttgaagaa 24219337  T
Q  561 atgcgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcg 660  Q
    |||| ||| | | ||||| ||||  ||||| | || |||| || |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||| |||| ||  |||    
T  24219336 atgcattgcaaacaaatttttcccgatgtggtgacgtacaattcccttattgatggtttgtgcaaatcgggaagaatctcatatgctttgaaacttatcg 24219237  T
Q  661 atgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttaccacgcaattgcatt 760  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| || | ||||||| |||    
T  24219236 gagagatgcatgatagaggtcaaccacctaatataattacttacaattctttattggatgctttatgcaaaaaccatcatgttgacaaggcaattgaatt 24219137  T
Q  761 attaacaaa 769  Q
     ||||||||    
T  24219136 gttaacaaa 24219128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 504 - 640
Target Start/End: Original strand, 33997781 - 33997917
Alignment:
Q  504 attaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttacagtt 603  Q
    ||||||||||| || ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||| | ||| |||| |||| ||||| ||||||||| |     
T  33997781 attaatggattgtgcaagaaaaaaagggtggatgaagccatgaatctctttaaagagatgcattggaaaaagattaatcctgatgtggtaacttacaata 33997880  T
Q  604 tccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctc 640  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  33997881 tccttattgatggtttgtgcaaattagggaaaatctc 33997917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 478 - 761
Target Start/End: Original strand, 11991127 - 11991410
Alignment:
Q  478 ctaatgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaat 577  Q
    |||||| ||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| | || ||||  |  | |  |||    
T  11991127 ctaatgctcatagctattgtactatgattaatggattttgtaagattaaaatggttgatgaagccttgagtctctttaatgatatgcagttcaaaggaat 11991226  T
Q  578 tattcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcatgataga 677  Q
    |  |||| ||  | ||||||| | ||  || || ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||  | |||| || ||||| ||||||||||      
T  11991227 tgctcctgataaggtaacttataattctctcattgatggtttgtgcaaatcagggagaatctcctatgcttgggagcttgttgatgaaatgcatgataat 11991326  T
Q  678 ggtcaaccacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttaccacgcaattgcatta 761  Q
    ||||||||| | ||||||   |||||||  | | || | |||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||    
T  11991327 ggtcaaccagccaatatattcacttacaactgtttaatagatgctttatgtaaaaaccatcatgttgaccaggctattgcatta 11991410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 489 - 671
Target Start/End: Original strand, 16350876 - 16351058
Alignment:
Q  489 agctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatg 588  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||  ||||||| | |||||| |||| |||  ||||  |||| ||     
T  16350876 agctataatatcatgattaatggattctgtaagattaaaatggtcgacgaagccttatgtctctttcatgaaatgtgttgcagaggaattgctcctcata 16350975  T
Q  589 tgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcat 671  Q
     | ||||||||| ||  || || ||||||||||| |||   ||||||||| | ||||||  | |||| || ||||||||||||    
T  16350976 aggtaacttacaattctctcattgatggtttgtgcaaagcagggagaatcccctatgcttgggagcttgttgatgagatgcat 16351058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 500 - 564
Target Start/End: Original strand, 24226657 - 24226721
Alignment:
Q  500 catgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgc 564  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||  |||||||||    
T  24226657 catgattaatggattatgtaagaataaaatggtggatgaagccgcaaatcttttcaaagaaatgc 24226721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 439
Target Start/End: Original strand, 24226529 - 24226596
Alignment:
Q  372 cctaatgttgttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaa 439  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  24226529 cctaatattgttacttataattctttgatggatgggtatttcttggttaaagaagtcaacaaggccaa 24226596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 361
Target Start/End: Original strand, 16350643 - 16350748
Alignment:
Q  256 aaaacatcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgat 355  Q
    ||||||||||||| ||||  || || ||||||||| ||||||||| | |||| ||||| || | | | ||||||| |||||||||  ||||  |||||||    
T  16350643 aaaacatcaacccagatgcttatacttttaatatattggttgatgctctttgtaaggaaggaaagatcaaagaagctaaaaatgtgatagctgtgatgat 16350742  T
Q  356 gaaaga 361  Q
    ||||||    
T  16350743 gaaaga 16350748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 141; Significance: 2e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 282 - 726
Target Start/End: Complemental strand, 53976 - 53532
Alignment:
Q  282 tttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatgaaagacgacataaagcctaatgttg 381  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||| |||||  | | | ||||||||| ||||| ||| || || |||||||||||| | | ||| || ||||||||||    
T  53976 tttaatacattggttgatggattttgtaaggacagaaagatgaaagaaggtaaaactgtgtttgctatgatgatgaaacaaggcattaaacctaatgttg 53877  T
Q  382 ttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaaggaaatattcgatagtatggccgcgaggggagtcatggctaa 481  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||  |  ||||  ||||||| ||||| ||| | |||||| | | |||| |   ||||||||| |  |||||    
T  53876 ttacttattgctctttaatggatggatattgcctagttaaacaagtgaataaggctaagaagatattcaacactatgtctcagaggggagtgactgctaa 53777  T
Q  482 tgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattatt 581  Q
    |||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||   |||||||| |   | | | ||||||    
T  53776 tgttcatagctacaatatcatgattaatggattttgtaagattaaaaaggtggataaagccatgaaactcttcatagaaatgcatcacaaacatattatt 53677  T
Q  582 cctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtc 681  Q
    ||| ||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53676 cctgatgtggtaacttacaattcccttattgatggtttgtgtaaatcggggaaaatatcttatgctttccagctagtcaatgagatgcatgatagaggtc 53577  T
Q  682 aaccacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttat 726  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||||  |||||||||    
T  53576 aaccacctaatataattacttacaattctatattaaatgctttat 53532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 104 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 54260 - 53984
Alignment:
Q  104 ataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaattggccctgatgttttcacttacaatgctttaattagtggttttcc 202  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||   || |||||| | ||||||| |||||||||||| || |||      
T  54260 ataaacatgttaatgatgcttttgatttatattctgaaatggttgcaaagagaatttctcccgatgttgttacttacagtgctttaattagagggttttt 54161  T
Q  203 cactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcggaaaacatcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggt 302  Q
    || ||||  |||| |||| |||||||||| | |||| |||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||     
T  54160 cattgttggtaaactgaaagatgcaattgatctgtttaataaaatgatattggaaaacatcaaaccggatgtgtatacctttaatatattagttgatgga 54061  T
Q  303 ttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatgaaagacgacataaagcctaatgt 379  Q
    ||||| ||||| || ||| ||||| ||| ||||||||| ||||  |||||||||| | | ||||| || ||||||||    
T  54060 ttttgtaaggaaggaaggctgaaaaaagctaaaaatgtgttagatatgatgatgatacaagacattaaacctaatgt 53984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 727
Target Start/End: Original strand, 10129531 - 10130201
Alignment:
Q  58 cctaatgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaa 156  Q
    ||||||||||||||||| ||||  || |||||| || | |||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  10129531 cctaatgtggtaatgtataccatgatcattgatggtatgtgcaaagataaacttgttaatgatgcttttaatttatattctgaaatgatcgctaagagaa 10129630  T
Q  157 ttggccctgatgttttcacttacaatgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcgga 256  Q
    ||   ||||||||| ||||||| |||  |||||||||||| |||  |  |||   | ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |  |||    
T  10129631 tttttcctgatgttgtcacttataataatttaattagtggcttttgcgttgtgggtcaattgaaagatgcaattggtttgttgcataaaatgatattgga 10129730  T
Q  257 aaacatcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatg 356  Q
    |||||| |||||  |||| || ||| | | |||| ||||||||| |||||| |||||||| |    |||||||| ||||   ||  | ||| |  |||||    
T  10129731 aaacattaacccaaatgtttataccatgagtatattggttgatgctttttgtaaggatggaaaaccgaaagaagctaaagcagtggttgccgttttgatg 10129830  T
Q  357 aaagacgacataaagcctaatgttgttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaaggaaatattcgatagta 456  Q
    ||| ||| | |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||  |||||||||||||  |||  ||| || | |  |    
T  10129831 aaaaacggcgtaaaacctaacgttgttacttataattctttaatagatggatattgtcttgttaaacaagtgaacaaggctgaggttatactcaacacca 10129930  T
Q  457 tggccgcgaggggagtcatggctaatgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttga 556  Q
    |||||   |||||||| || ||  ||||||| || || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  |    
T  10129931 tggcccaaaggggagtgattgccgatgttcaaagttacagtatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagctattgatctcttcaa 10130030  T
Q  557 agaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagcta 656  Q
    ||||||||   | ||| || |  ||||| ||  | ||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||  |||||  | | ||     
T  10130031 agaaatgcaaggcagacaactcgttcctgatacgataacttatagttcccttattgatggcttgtgcaaatcagggagaatctcagatgcttgggaactt 10130130  T
Q  657 gtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatg 727  Q
    ||   |||||||  |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  10130131 gtaagtgagatgtctgatagaggtcaacaacctaatataattacttacaattctttattgaatgctttatg 10130201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 500 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 4260479 - 4260242
Alignment:
Q  500 catgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttac 599  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   | | ||||  ||||| | ||| ||||||||    
T  4260479 catgattaatgaattttgtaaaatgaaaatggtggatgaagccatcaaactctttgaagaaatgcctctcaaacaaatatttcctgacgtggtaacttac 4260380  T
Q  600 agtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagata 699  Q
      |  |||||| ||||||||||| ||||  |||||| | || |||||| || | || || ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  4260379 catacccttattgatggtttgtgcaaatccgggagattatcatatgctatggaacttgttgatgaaatggatgatagaggtgaaccacctaatataatta 4260280  T
Q  700 cttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccat 737  Q
    ||||  || ||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  4260279 cttattgtcctatagtggatgttttatgcaaaaaccat 4260242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 500 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 4264101 - 4263864
Alignment:
Q  500 catgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttac 599  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |   | | ||||  ||||| | ||| ||||||||    
T  4264101 catgattaatgaattttgtaaaatgaaaatggtggatgaagccatcaaactctttgaagaaatgcctctcaaacaaatatttcctgacgtggtaacttac 4264002  T
Q  600 agtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagata 699  Q
      |  |||||| ||||||||||| ||||  |||||| | || |||||| || | || || ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  4264001 catacccttattgatggtttgtgcaaatccgggagattatcatatgctatggaacttgttgatgaaatggatgatagaggtgaaccacctaatataatta 4263902  T
Q  700 cttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccat 737  Q
    ||||  || ||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  4263901 cttattgtcctatagtggatgttttatgcaaaaaccat 4263864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 484 - 564
Target Start/End: Original strand, 19490071 - 19490151
Alignment:
Q  484 ttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgc 564  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  19490071 ttcagagctatactatcatgattaatggattatgtaagatgaaaatgttggatgaagcggtaagtctctttgaagaaatgc 19490151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 4260918 - 4260692
Alignment:
Q  62 atgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaattgg 160  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||| | | | |||||| ||| | |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||      
T  4260918 atgtggtaatgtacactacggttattgacaatatgtgcaaagatacatttgttaatgatgcttttgatttatattatgaaatggttgctagcggaatttc 4260819  T
Q  161 ccctgatgttttcacttacaatgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcggaaaac 260  Q
     ||| ||||| ||||||| | ||||||||||  |||||||  |  ||||  ||||||| | || ||  | |||||||| || ||||||| | ||||||||    
T  4260818 tcctaatgttgtcacttatactgctttaattgatggtttttgcgttgttggtaaattggaagaagcgttgggtttgtttaaaaaaatgatatcggaaaac 4260719  T
Q  261 atcaacccggatgtgtacacctttaat 287  Q
    || |||||| ||||||| || ||||||    
T  4260718 attaacccgaatgtgtatacttttaat 4260692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 4264540 - 4264314
Alignment:
Q  62 atgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaattgg 160  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||| | | | |||||| ||| | |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||      
T  4264540 atgtggtaatgtacactacggttattgacaatatgtgcaaagatacatttgttaatgatgcttttgatttatattatgaaatggttgctagcggaatttc 4264441  T
Q  161 ccctgatgttttcacttacaatgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcggaaaac 260  Q
     ||| ||||| ||||||| | ||||||||||  |||||||  |  ||||  ||||||| | || ||  | |||||||| || ||||||| | ||||||||    
T  4264440 tcctaatgttgtcacttatactgctttaattgatggtttttgcgttgttggtaaattggaagaagcgttgggtttgtttaaaaaaatgatatcggaaaac 4264341  T
Q  261 atcaacccggatgtgtacacctttaat 287  Q
    || |||||| ||||||| || ||||||    
T  4264340 attaacccgaatgtgtatacttttaat 4264314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 485 - 627
Target Start/End: Original strand, 41316091 - 41316233
Alignment:
Q  485 tcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattcct 584  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||| | | ||||||| | |||||| ||||||||  |||| |||||    
T  41316091 tcagagctataatatcatgattaacggattctgtaagattaaaatagtcaatgaagccttgattctctttaaggaaatgtgttgtagaggaattgttcct 41316190  T
Q  585 aatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaat 627  Q
    | |    | ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||    
T  41316191 attacagttacttacagttctcttattgatggtttgtgcaaat 41316233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 497 - 540
Target Start/End: Original strand, 15591240 - 15591283
Alignment:
Q  497 taccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaag 540  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15591240 taccatgattaatggattatgtaagattaaaatagtggatgaag 15591283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 508 - 563
Target Start/End: Original strand, 15612789 - 15612844
Alignment:
Q  508 atggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatg 563  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  15612789 atggattatgtaagattaaaatggtatatgaaaccatgaatctctttgaagaaatg 15612844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 481 - 692
Target Start/End: Original strand, 17251131 - 17251342
Alignment:
Q  481 atgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattat 580  Q
    ||||||| ||||||| |  |||||||| |||||| | ||| || |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||  ||||||     |||  | ||    
T  17251131 atgttcatagctatagtgtcatgattagtggattatctaaaatgaaaatgttggatgaagctatggatctctttgaagggatgcgtaacgaaaatgtgat 17251230  T
Q  581 tcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggt 680  Q
    |||| ||||  || |||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||  || ||||||  |  |||| |||||   || |||||||||||||||||||||    
T  17251231 tcctgatgtagtagcttatagttctcttattgatggtttgtgcaaatcaggtagaatcaatagtgctttgaagtatgttgatgagatgcatgatagaggt 17251330  T
Q  681 caaccacctaat 692  Q
    ||||||||||||    
T  17251331 caaccacctaat 17251342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 500 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 15998881 - 15998818
Alignment:
Q  500 catgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatg 563  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||  | | ||| ||||||||||||||    
T  15998881 catgattaatgaattatgtaagattaaaatagtggatgaaatcgtgaatgtctttgaagaaatg 15998818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 6)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 500 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 104900 - 104666
Alignment:
Q  500 catgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttac 599  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| | | ||||||| | |||||||||||||||  ||||  |||||||  | ||||||||    
T  104900 catgattaatggattctgtaagattaaaatgatcgacgaagccttgagtctcttttatgaaatgcgttgtagaggaattgctcctaatacggtaacttac 104801  T
Q  600 agtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacctaatatagata 699  Q
    ||||  || || ||||||||||| ||||  |||||| |||||| ||||  | |||| || ||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||  ||    
T  104800 agttctctcattgatggtttgtgcaaatctgggagattctcttgtgcttgggagcttgtggatgagatgcatgttaatggtcaaccacctaacatattta 104701  T
Q  700 cttacagttctatattggatgctttatgtaaaaac 734  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||| ||||||    
T  104700 cttacagttctttaatagatgctttatgcaaaaac 104666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 485 - 734
Target Start/End: Original strand, 137196 - 137445
Alignment:
Q  485 tcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattcct 584  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||  | | ||||||| | ||||||||||||  || ||||  |||     
T  137196 tcagagctataatatcatgattaatggattctgtaagattaaaatggtcaatgaagctttgagtctctttaatgaaatgcgttgtcaaagaatttctccc 137295  T
Q  585 aatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcaac 684  Q
    |||  | ||||||||| ||  || || ||||||||||| ||||  || ||||||||  |||||  |||||| |||||||||||||||| ||  |||||||    
T  137296 aatacggtaacttacaattctctcattgatggtttgtgcaaatcaggtagaatctcccatgcttggaagcttgtcgatgagatgcatgttaatggtcaac 137395  T
Q  685 cacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaac 734  Q
    ||||| | |||  ||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||||    
T  137396 cacctgacatatttacctacagttctttaatagatgctttatgcaaaaac 137445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 491 - 647
Target Start/End: Original strand, 140126 - 140282
Alignment:
Q  491 ctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtg 590  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||| ||||||||| | |||  ||||  |||||||  |    
T  140126 ctatagtatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggttgatgaagccttgagtctctttgatgaaatgcgtcgcagaggaattgctcctaatacg 140225  T
Q  591 ttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgct 647  Q
     ||||||||| ||  || || |||||||| || ||||  ||||||||| | ||||||    
T  140226 gtaacttacaattctctcattgatggtttatgcaaatcagggagaatcccctatgct 140282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 478 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 121655 - 121457
Alignment:
Q  478 ctaatgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaat 577  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||| ||||||||| |||| |||        
T  121655 ctaatgttcacagctacactatcattattaatggtttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttgaatttctttaaagaaatgcattgt-gaa---- 121561  T
Q  578 tattcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcatgataga 677  Q
        ||||||  | ||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||  |||||||||||| ||||   | ||||  | ||| ||||||||||||||    
T  121560 ----cctaatacggtaacttacagttctcttattgatgctttgtgcaaatcagggagaatctctcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgataga 121465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 439
Target Start/End: Original strand, 136772 - 137150
Alignment:
Q  62 atgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaattgg 160  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||| || ||| |||||||||| |  ||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||| ||||      
T  136772 atgtggtaatgtatagcataattattgatagtttgtgtaaagataaacttgtaattgatgcttatgagttatattctgaaatgattgcaaagacaatttc 136871  T
Q  161 ccctgatgttttcacttacaatgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcggaaaac 260  Q
     ||||||||| |||||| |||| || ||||   ||| |||  || ||||  |  |||||| || ||| ||||||||||| || |||||  |  | |||||    
T  136872 tcctgatgttgtcactttcaattctctaatctatggattttgcattgttggtcgattgaaagaagcatttggtttgttccatcaaatggtattgaaaaac 136971  T
Q  261 atcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatgaaag 360  Q
    ||||||||  |||  || || ||||||||| ||||||||| | |||||||||| || |  ||||||| || ||| ||||  || || |||||||| ||||    
T  136972 atcaacccaaatgattatacttttaatatattggttgatgctctttgcaaggaaggaaatgtgaaaggagctaagaatgcgttggctatgatgatcaaag 137071  T
Q  361 acgacataaagcctaatgttgttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaa 439  Q
         ||||| ||  |||||||||| || || || ||||||||||| |||||  |  |||| |||||||| ||||||||    
T  137072 gaagtataaaaccagatgttgttacatacaattcattaatggatgggtattgcctagttaatgaagtgaataaggccaa 137150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 105144 - 105087
Alignment:
Q  256 aaaacatcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttgcaagga 313  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||| | |||| |||||    
T  105144 aaaacatcaacccagatgtgtatacttttaatatattggttgatgctctttgtaagga 105087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0572 (Bit Score: 65; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0572
Description:

Target: scaffold0572; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 489 - 761
Target Start/End: Original strand, 3059 - 3331
Alignment:
Q  489 agctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatg 588  Q
    ||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||| | | ||||||| | ||||||||||| |||| ||||  |||| ||     
T  3059 agctatagtatcgtgattaatggattctgtaagattaaaatggtcgacaaagccttgagtctcttttatgaaatgcgttgcagaagaattgctcctgata 3158  T
Q  589 tgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacc 688  Q
     | ||||||||| ||  || || ||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||  | |||| || |||||||||| |||||| ||||||||| |    
T  3159 cggtaacttacaattctctaattgatggtttgtgcaaatctgggagaatctcctatgcttgggagcttgttgatgagatgcgtgatagtggtcaaccagc 3258  T
Q  689 taatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttaccacgcaattgcatta 761  Q
    | |||||   ||||||| |||  || | ||||||||||| |||||||||| |||| || | || |||||||||    
T  3259 tgatataatcacttacaattcattaatagatgctttatgcaaaaaccatcatgttgacaaggctattgcatta 3331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 60; Significance: 4e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 485 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 43462 - 43199
Alignment:
Q  485 tcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattcct 584  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | | ||||||| | |||||||||||  ||  ||||  |||     
T  43462 tcagagctataatatcatgattaatggattttgtaagattaaaatggtcaatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgccgaggaatttctccc 43363  T
Q  585 aatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcaac 684  Q
    |||    ||||||||||||  || || ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||  | |||| || |||||||||| ||| |  |||||||    
T  43362 aatacagtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaattaggtagaatctcctatgcttgggagcttgttgatgagatgcgtgacaatggtcaac 43263  T
Q  685 cacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtttacca 748  Q
     |||| | |||   ||||||| |||| || | ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||    
T  43262 aacctgacatatgcacttacaattctttaatagatgcattatgcaaaaaccatcatgttgacca 43199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 489 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 48076 - 47870
Alignment:
Q  489 agctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatg 588  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| | | ||||||| | ||||||| ||| |||| | ||  |||||||     
T  48076 agctatagtatcatgattaatggattctgtaagattaaaatggtcgacgaagccttgagtctcttttatgaaatgcattgcagaagatttgctcctaata 47977  T
Q  589 tgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacc 688  Q
     | ||||||||||||  || || ||||||||||| |||   |||||| |||||| ||||  | |||| || ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  47976 cgataacttacagttcgctcattgatggtttgtgcaaagctgggagattctcttgtgcttgggagcttgttgatgagatgcatgataatggccaaccacc 47877  T
Q  689 taatata 695  Q
     ||||||    
T  47876 caatata 47870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 43890 - 43590
Alignment:
Q  60 taatgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaatt 158  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| | ||| | || | ||| |||| ||| ||||||| | ||||| |||  |||| ||||    
T  43890 taatgtgttaatgcacaacacaattattgatagtttgtgtaaagagaaattggtgaccgaggcttatgagttatattctcaaatgattgtaaagaaaatt 43791  T
Q  159 ggccctgatgttttcacttacaatgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcggaaa 258  Q
       ||||||||| |||||| |||| |||||||   ||| |||  |  ||||  | ||||||  || ||| ||||||||||| || |||||  |  | |||    
T  43790 tctcctgatgttgtcactttcaattctttaatctatggattttgctttgttggtcaattgatagaagcatttggtttgttccatgaaatggtattgaaaa 43691  T
Q  259 acatcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatgaa 358  Q
    ||||||||||  ||||||| || ||||||||| ||||||||| | |||| ||||| || |  ||||||| || ||| ||| | |||||||||||||||||    
T  43690 acatcaacccaaatgtgtatacttttaatatattggttgatgctctttgtaaggaaggaaatgtgaaaggagctaagaatctgttagccatgatgatgaa 43591  T
Q  359 a 359  Q
    |    
T  43590 a 43590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 55; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 485 - 743
Target Start/End: Original strand, 6018 - 6276
Alignment:
Q  485 tcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattcct 584  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||| |  |||||||| | | ||||||| | |||||||||||  ||  ||||  |||     
T  6018 tcagagctataatatcatgattaatgggttctgtaagattaaaatgatcaatgaagccttcagtctctttaatgaaatgcgttgccgaggaatttctccc 6117  T
Q  585 aatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcaac 684  Q
    |||    ||||||||||||  || || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||  | || | || |||||||||| |||||  |||||||    
T  6118 aatacagtaacttacagttctctcattgatggtttgtgtaaattaggtagaatctcctatgcttgggagtttgttgatgagatgcgtgataatggtcaac 6217  T
Q  685 cacctaatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatcgtgtt 743  Q
    ||||| | |||   ||||||| |||| || | ||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  6218 cacctgacatatgcacttacaattctttaatagatgcattatgcaaaaaccatcatgtt 6276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 439
Target Start/End: Original strand, 5592 - 5972
Alignment:
Q  60 taatgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaacttgtcaacgatgcttttgatttatatt-tgaaatggttgctaagagaatt 158  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| | ||| | || | ||| |||| ||| ||||||| | ||||| |||  |||| ||||    
T  5592 taatgtgataatgcacaacacaattattgatagtttgtgtaaagagaaattggtgaccgaggcttatgagttatattctcaaatgattgtaaagaaaatt 5691  T
Q  159 ggccctgatgttttcacttacaatgctttaattagtggttttcccactgtttctaaattgaatgatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcggaaa 258  Q
       ||||||||| |||||| |||| |||||||   ||| |||  || ||||  | ||||||  || ||| ||||||||||| || |||||  |  | |||    
T  5692 tctcctgatgttgtcactttcaattctttaatctatggattttgcattgttggtcaattgatagaagcatttggtttgttccatgaaatggtattgaaaa 5791  T
Q  259 acatcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatgaa 358  Q
    ||||||||||  ||||||| || ||||||||| ||||||||| | |||| ||||| || |   |||||| || ||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  5792 acatcaacccaaatgtgtatacttttaatatattggttgatgctctttgtaaggaaggaaatctgaaaggagctaagaatctgttagccgtgatgatgaa 5891  T
Q  359 agacgacataaagcctaatgttgttacttataactctttaatggatggatattgtttgattaacgaagtgaacaaggccaa 439  Q
    ||| |   |||  || ||||||||||| || |  ||  ||||||||||||||||  |  |||| |||||||| ||||||||    
T  5892 agaaggtgtaataccgaatgttgttacctacagttcaataatggatggatattgcctagttaatgaagtgaataaggccaa 5972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 489 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 126296 - 126047
Alignment:
Q  489 agctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatg 588  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||| | | ||||||| | ||||||||||| |||  ||||  |||||||     
T  126296 agctatagtatcatgattaatggattatgtaaggttaaaatggtcgacgaagccttgagtctcttttatgaaatgcgttgcagaggaattgctcctaata 126197  T
Q  589 tgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcaaccacc 688  Q
     | ||||||||||||  || || ||||||||||| ||||  ||||||  ||||||||||  | | || || |||||||||||||||   || || |||||    
T  126196 cggtaacttacagttcgctcattgatggtttgtgcaaatctgggagatactcttatgcttgggaccttgttgatgagatgcatgatcatggccatccacc 126097  T
Q  689 taatatagatacttacagttctatattggatgctttatgtaaaaaccatc 738  Q
     ||||||   ||||||| |||  || | ||||||||||| ||||||||||    
T  126096 caatatattcacttacaattccttaatagatgctttatgcaaaaaccatc 126047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 126529 - 126424
Alignment:
Q  256 aaaacatcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgat 355  Q
    ||||||||||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||| | | || ||||| || | | ||||||||| ||||| |||  ||||  |||||||    
T  126529 aaaacatcaacccagatgtttatacttttaatataatggttgatgctctatgtaaggaaggaaagatgaaagaagctaaaagtgtgatagctgtgatgat 126430  T
Q  356 gaaaga 361  Q
    ||||||    
T  126429 gaaaga 126424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 502 - 685
Target Start/End: Original strand, 8834 - 9017
Alignment:
Q  502 tgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttacag 601  Q
    |||||||||| || ||||||| |||| || | |||||||||||  || ||||| |||||||||   | | ||| ||||| ||||||  | ||||||||||    
T  8834 tgattaatgggttgtgtaagaataaattgatcgatgaagccatggatttctttaaagaaatgcaaagcaaaaagattatccctaatacggtaacttacag 8933  T
Q  602 tttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggtcaacc 685  Q
    ||  ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||| |||||  | || |  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  8934 ttctcttattgatggtttgtgcaaatcagggagaatttctcatgcttgggagttgcttgatgagatgcatgatagaggtcaacc 9017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 359
Target Start/End: Original strand, 8554 - 8691
Alignment:
Q  222 gatgcaattggtttgttcaataaaatgacagcggaaaacatcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtaggg 321  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||  |  | |||||||||||||  |||| || || ||||||||| ||||||||| | | || ||||| || |       
T  8554 gatgcatttcgtttgttcaatgaaatggtattgaaaaacatcaacccaaatgtttatacttttaatatattggttgatgctctctgtaaggaaggaaaaa 8653  T
Q  322 tgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgatgaaa 359  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  8654 tgaaagaagctaaaaatgtgttagctatgatggtgaaa 8691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0654 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0654
Description:

Target: scaffold0654; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 504 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 1378 - 1314
Alignment:
Q  504 attaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttg 568  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||    
T  1378 attaatggattctgtaagattaaaatggtcgatgaagccttaaatctctttaatgaaatgtgttg 1314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0654; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 1626 - 1521
Alignment:
Q  256 aaaacatcaacccggatgtgtacacctttaatatactggttgatggtttttgcaaggatggtagggtgaaagaagataaaaatgtattagccatgatgat 355  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||| |||| |||||| ||||| || |    |||||||| |||||||||  |||| ||||||||    
T  1626 aaaacatcaaccctgatgtgtatacttttaatatattggtcgatgctttttgtaaggaaggaaacacgaaagaagctaaaaatgtgatagctatgatgat 1527  T
Q  356 gaaaga 361  Q
    ||||||    
T  1526 gaaaga 1521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 481 - 685
Target Start/End: Original strand, 27171 - 27375
Alignment:
Q  481 atgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattat 580  Q
    ||||||| ||||| |||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| | ||||||||||| | |  |||||     
T  27171 atgttcacagctacactatcattattaagagattatgtaagattaaaatggtcgatgaagccttgagtctctttaatgaaatgcgttgcaaaggaattac 27270  T
Q  581 tcctaatgtgttaacttacagtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcatgatagaggt 680  Q
    |||  ||  | ||||||||||||  || || ||||||||||| ||||  | |||||||||| ||||   | ||||  | ||| ||||||||| |||||||    
T  27271 tcccgataaggtaacttacagttctctcattgatggtttgtgcaaatcagagagaatctctcatgcatgggagcttcttgatcagatgcatgctagaggt 27370  T
Q  681 caacc 685  Q
    |||||    
T  27371 caacc 27375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 481 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 13904778 - 13904695
Alignment:
Q  481 atgttcagagctatactaccatgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgc 564  Q
    ||||||| ||||| |||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||  |||||||||    
T  13904778 atgttcacagctacactatcattattaatggcttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttgaatctcttcaaagaaatgc 13904695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 501 - 671
Target Start/End: Original strand, 3642875 - 3643045
Alignment:
Q  501 atgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgcgttgtagaaaaattattcctaatgtgttaacttaca 600  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| | |||||| |||| | |  ||||  |||| ||  | |||||||||    
T  3642875 atgattaatggattgggtaagattaaaatggtcgatgaagccttaagtctctttaaggaaatgtgttgcaaaggaattgctcctgatacggtaacttaca 3642974  T
Q  601 gtttccttatcgatggtttgtgtaaattggggagaatctcttatgctctgaagctagtcgatgagatgcat 671  Q
     ||  || || ||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||  | |||| || ||||||||||||    
T  3642975 attctctcattgatggtttgtgcaaattaggaagaatatcctatgcttggcagcttgttgatgagatgcat 3643045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 501 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 44262754 - 44262702
Alignment:
Q  501 atgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctt 553  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  44262754 atgattaatggattgtgtaagaaaaaaatggtggatgaagccgtcaatctctt 44262702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 44263198 - 44263145
Alignment:
Q  58 cctaatgtggtaatgtacaccacaattattgatagtttatgcaaatataaactt 111  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  44263198 cctaatgtggtcatgtacaatacaattattcatagtttgtgcaaaaataaactt 44263145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 44030 - 43967
Alignment:
Q  501 atgattaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctttgaagaaatgc 564  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||    
T  44030 atgattaacggattttgcaagaataaaatggtggatgaagcagttaatctcttcaaagaaatgc 43967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0652 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0652
Description:

Target: scaffold0652; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 504 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 1444 - 1395
Alignment:
Q  504 attaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctt 553  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  1444 attaatggtttatgtaagattaaaatggttgatgaagccttgaatctctt 1395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 504 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 31463 - 31414
Alignment:
Q  504 attaatggattttgtaagattaaaatggtggatgaagccataaatctctt 553  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||    
T  31463 attaatggattatgtaagattaaaattgttgatgaagccttgaatctctt 31414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University