View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14096_low_2 (Length: 850)

Name: NF14096_low_2
Description: NF14096
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14096_low_2
NF14096_low_2
[»] chr3 (66 HSPs)
chr3 (63-738)||(19868636-19869339)
chr3 (63-286)||(25492036-25492259)
chr3 (346-732)||(4250045-4250459)
chr3 (346-594)||(42354456-42354721)
chr3 (346-594)||(9157797-9158062)
chr3 (346-594)||(10963216-10963481)
chr3 (346-594)||(10966725-10966990)
chr3 (346-599)||(30158072-30158346)
chr3 (346-599)||(2783925-2784195)
chr3 (346-594)||(18883022-18883287)
chr3 (65-440)||(27054850-27055230)
chr3 (346-589)||(10959714-10959974)
chr3 (356-594)||(9154624-9154879)
chr3 (358-589)||(16314645-16314892)
chr3 (358-589)||(16414811-16415058)
chr3 (358-589)||(18495639-18495886)
chr3 (346-589)||(2279663-2279923)
chr3 (346-594)||(6173396-6173661)
chr3 (358-589)||(5887040-5887286)
chr3 (358-589)||(18515785-18516032)
chr3 (358-589)||(23374785-23375032)
chr3 (358-589)||(29233644-29233890)
chr3 (358-589)||(5897024-5897270)
chr3 (571-738)||(25491857-25492014)
chr3 (346-594)||(20536628-20536886)
chr3 (346-594)||(28327252-28327517)
chr3 (346-594)||(28330577-28330842)
chr3 (466-594)||(44508617-44508745)
chr3 (346-558)||(4225896-4226125)
chr3 (466-594)||(27054679-27054807)
chr3 (466-700)||(28327134-28327380)
chr3 (466-700)||(28330459-28330705)
chr3 (346-594)||(3305658-3305923)
chr3 (346-445)||(25888513-25888612)
chr3 (466-700)||(3305540-3305786)
chr3 (356-560)||(54736183-54736406)
chr3 (346-440)||(18551648-18551742)
chr3 (346-444)||(36037000-36037097)
chr3 (770-820)||(11270629-11270679)
chr3 (63-176)||(20536337-20536452)
chr3 (466-594)||(18551477-18551605)
chr3 (112-273)||(22032373-22032535)
chr3 (63-124)||(3306147-3306209)
chr3 (770-820)||(25491776-25491826)
chr3 (466-508)||(25888650-25888692)
chr3 (68-141)||(26822048-26822120)
chr3 (232-401)||(26822189-26822358)
chr3 (67-147)||(30157805-30157885)
chr3 (404-461)||(44508767-44508824)
chr3 (63-179)||(11138574-11138688)
chr3 (63-179)||(22626316-22626430)
chr3 (67-174)||(46731585-46731691)
chr3 (770-834)||(19868539-19868605)
chr3 (117-195)||(35366486-35366562)
chr3 (63-124)||(4225621-4225681)
chr3 (69-120)||(31549573-31549625)
chr3 (63-106)||(5886751-5886794)
chr3 (63-106)||(5896735-5896778)
chr3 (63-106)||(6173117-6173160)
chr3 (354-417)||(11271060-11271122)
chr3 (63-106)||(16314357-16314400)
chr3 (63-106)||(16414523-16414566)
chr3 (63-106)||(18495351-18495394)
chr3 (63-106)||(23374497-23374540)
chr3 (153-195)||(18551895-18551937)
chr3 (592-626)||(20536898-20536932)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (66-390)||(1810197-1810521)
chr5 (63-594)||(2499766-2500318)
chr5 (346-594)||(19685978-19686243)
chr5 (346-594)||(34652800-34653065)
chr5 (466-738)||(1810590-1810873)
chr5 (360-594)||(17944459-17944710)
chr5 (65-594)||(33320685-33321234)
chr5 (346-599)||(26547897-26548167)
chr5 (346-599)||(26551456-26551726)
chr5 (346-599)||(28562404-28562674)
chr5 (346-599)||(28565972-28566242)
chr5 (67-700)||(9690453-9691117)
chr5 (346-599)||(4731876-4732146)
chr5 (346-599)||(40799961-40800231)
chr5 (346-594)||(19689361-19689626)
chr5 (151-589)||(26337796-26338256)
chr5 (466-703)||(33920829-33921078)
chr5 (63-195)||(21680586-21680717)
chr5 (358-589)||(26726760-26727007)
chr5 (63-186)||(33921333-33921455)
chr5 (374-589)||(25185200-25185432)
chr5 (346-443)||(2453259-2453356)
chr5 (346-443)||(3195070-3195167)
chr5 (494-594)||(3194967-3195067)
chr5 (63-179)||(34405975-34406090)
chr5 (254-430)||(35432442-35432619)
chr5 (67-402)||(36330741-36331074)
chr5 (229-401)||(36335037-36335210)
chr5 (67-141)||(14616437-14616510)
chr5 (549-593)||(2453142-2453186)
chr5 (67-179)||(7649950-7650060)
chr5 (63-106)||(26727252-26727295)
chr5 (346-390)||(20077653-20077697)
chr5 (151-194)||(35432330-35432373)
chr5 (69-102)||(20056160-20056193)
[»] chr7 (54 HSPs)
chr7 (66-594)||(6964095-6964644)
chr7 (65-732)||(3540930-3541625)
chr7 (346-599)||(22257061-22257331)
chr7 (346-599)||(20100447-20100717)
chr7 (63-434)||(38431378-38431753)
chr7 (346-599)||(22232672-22232942)
chr7 (346-599)||(22253797-22254067)
chr7 (346-597)||(748086-748354)
chr7 (346-599)||(8397648-8397918)
chr7 (346-599)||(5826753-5827023)
chr7 (360-594)||(22083502-22083752)
chr7 (346-589)||(11825400-11825660)
chr7 (358-589)||(23598820-23599067)
chr7 (358-589)||(2251685-2251932)
chr7 (346-589)||(26182116-26182375)
chr7 (358-589)||(26460280-26460526)
chr7 (346-599)||(2349276-2349532)
chr7 (232-589)||(26152964-26153342)
chr7 (346-594)||(43549001-43549266)
chr7 (358-589)||(710074-710322)
chr7 (346-594)||(44017837-44018102)
chr7 (67-461)||(16546961-16547359)
chr7 (67-461)||(16618303-16618701)
chr7 (346-463)||(8257632-8257749)
chr7 (466-594)||(38431201-38431329)
chr7 (346-461)||(8257846-8257961)
chr7 (466-589)||(12803447-12803569)
chr7 (346-461)||(23467213-23467328)
chr7 (63-179)||(6967274-6967389)
chr7 (63-179)||(17866357-17866472)
chr7 (63-141)||(17857884-17857962)
chr7 (502-592)||(23467349-23467440)
chr7 (67-206)||(17152173-17152310)
chr7 (265-443)||(26808694-26808871)
chr7 (346-424)||(42606279-42606356)
chr7 (346-431)||(6214420-6214505)
chr7 (350-432)||(23775868-23775950)
chr7 (63-124)||(709787-709847)
chr7 (68-181)||(28577687-28577798)
chr7 (67-155)||(36842945-36843032)
chr7 (63-106)||(2252177-2252220)
chr7 (63-106)||(23598532-23598575)
chr7 (67-141)||(24783573-24783646)
chr7 (108-181)||(17601877-17601950)
chr7 (297-401)||(28577913-28578017)
chr7 (64-179)||(294987-295101)
chr7 (67-106)||(20100950-20100989)
chr7 (354-401)||(42859008-42859054)
chr7 (603-700)||(44018125-44018220)
chr7 (770-828)||(9765246-9765304)
chr7 (650-700)||(17601382-17601432)
chr7 (346-384)||(30058196-30058234)
chr7 (356-417)||(17601686-17601747)
chr7 (69-106)||(26460771-26460808)
[»] scaffold0401 (1 HSPs)
scaffold0401 (63-732)||(3918-4619)
[»] scaffold0043 (3 HSPs)
scaffold0043 (65-732)||(13251-13950)
scaffold0043 (65-206)||(11467-11607)
scaffold0043 (346-385)||(5631-5670)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (69-594)||(18392201-18392747)
chr1 (63-438)||(34552442-34552821)
chr1 (346-599)||(37641671-37641941)
chr1 (346-589)||(28918188-28918448)
chr1 (346-589)||(17902833-17903092)
chr1 (346-589)||(20981173-20981433)
chr1 (65-440)||(6205859-6206239)
chr1 (346-589)||(49719667-49719928)
chr1 (358-589)||(24200301-24200548)
chr1 (346-589)||(49716184-49716446)
chr1 (63-204)||(49716589-49716731)
chr1 (358-589)||(16838991-16839237)
chr1 (358-589)||(16848921-16849167)
chr1 (335-589)||(20964270-20964540)
chr1 (63-192)||(49720083-49720213)
chr1 (346-594)||(23441329-23441594)
chr1 (466-594)||(3087907-3088035)
chr1 (466-594)||(33898134-33898262)
chr1 (466-594)||(34552866-34552994)
chr1 (346-440)||(50197004-50197098)
chr1 (466-594)||(6195626-6195754)
chr1 (63-179)||(10765046-10765161)
chr1 (63-179)||(13493389-13493504)
chr1 (346-440)||(33898305-33898399)
chr1 (466-554)||(50197142-50197230)
chr1 (346-438)||(3087770-3087862)
chr1 (65-147)||(50196721-50196803)
chr1 (67-179)||(13496114-13496224)
chr1 (63-106)||(17902557-17902600)
chr1 (63-106)||(20981665-20981708)
chr1 (603-700)||(23441617-23441712)
chr1 (603-700)||(33898016-33898111)
chr1 (67-106)||(24200017-24200056)
chr1 (63-106)||(37642167-37642210)
chr1 (346-384)||(5317893-5317931)
chr1 (63-125)||(32505861-32505922)
chr1 (69-106)||(16838709-16838746)
chr1 (69-106)||(16848639-16848676)
[»] chr4 (41 HSPs)
chr4 (63-594)||(13978942-13979493)
chr4 (67-594)||(15850981-15851529)
chr4 (346-599)||(18859582-18859852)
chr4 (346-594)||(11702632-11702897)
chr4 (346-594)||(10247629-10247889)
chr4 (358-589)||(3719553-3719801)
chr4 (358-589)||(14701719-14701967)
chr4 (335-593)||(10385760-10386018)
chr4 (358-586)||(49636581-49636824)
chr4 (466-732)||(56089496-56089773)
chr4 (358-586)||(3734131-3734374)
chr4 (63-191)||(33400079-33400207)
chr4 (358-589)||(49639874-49640120)
chr4 (63-440)||(19928859-19929238)
chr4 (466-700)||(13978824-13979070)
chr4 (365-594)||(33400392-33400642)
chr4 (466-594)||(26703673-26703801)
chr4 (346-594)||(23653089-23653348)
chr4 (65-179)||(647209-647322)
chr4 (346-440)||(26703536-26703630)
chr4 (504-732)||(19928563-19928802)
chr4 (65-141)||(650481-650557)
chr4 (65-206)||(37176855-37176993)
chr4 (512-599)||(17670221-17670308)
chr4 (346-423)||(17670309-17670386)
chr4 (346-434)||(11560799-11560886)
chr4 (361-431)||(24605307-24605377)
chr4 (346-431)||(7394916-7395000)
chr4 (63-179)||(12172099-12172214)
chr4 (63-106)||(3719265-3719308)
chr4 (354-401)||(39050602-39050649)
chr4 (63-176)||(2542012-2542124)
chr4 (84-141)||(21217359-21217416)
chr4 (232-333)||(21217499-21217600)
chr4 (63-124)||(8871474-8871537)
chr4 (67-176)||(26062698-26062808)
chr4 (63-106)||(3734619-3734662)
chr4 (63-106)||(14702212-14702255)
chr4 (105-176)||(24605051-24605121)
chr4 (63-106)||(49639586-49639629)
chr4 (63-137)||(48013158-48013233)
[»] chr6 (60 HSPs)
chr6 (63-700)||(12746496-12747169)
chr6 (346-594)||(34502151-34502416)
chr6 (63-594)||(28894239-28894791)
chr6 (346-590)||(28117652-28117913)
chr6 (346-589)||(11410578-11410838)
chr6 (346-594)||(9313830-9314095)
chr6 (346-589)||(17231669-17231929)
chr6 (104-438)||(35026932-35027270)
chr6 (361-589)||(22920343-22920587)
chr6 (466-599)||(14969471-14969604)
chr6 (346-594)||(2331090-2331355)
chr6 (466-732)||(35027315-35027592)
chr6 (63-195)||(11410990-11411123)
chr6 (346-594)||(2330438-2330703)
chr6 (346-527)||(5618262-5618457)
chr6 (466-594)||(31262579-31262707)
chr6 (466-589)||(13095880-13096003)
chr6 (466-594)||(5618491-5618618)
chr6 (65-192)||(33678947-33679076)
chr6 (470-594)||(33679375-33679498)
chr6 (346-462)||(14966188-14966304)
chr6 (346-594)||(17696397-17696664)
chr6 (346-451)||(14969679-14969784)
chr6 (63-179)||(14790745-14790860)
chr6 (346-463)||(3826863-3826980)
chr6 (346-434)||(31123418-31123506)
chr6 (346-440)||(15578960-15579054)
chr6 (346-440)||(33679234-33679328)
chr6 (63-179)||(14795773-14795888)
chr6 (358-519)||(11296195-11296373)
chr6 (466-558)||(15579097-15579189)
chr6 (358-440)||(7560232-7560314)
chr6 (346-418)||(7560144-7560216)
chr6 (537-599)||(3827069-3827131)
chr6 (354-431)||(20189483-20189560)
chr6 (354-431)||(22146431-22146508)
chr6 (346-398)||(13095764-13095816)
chr6 (360-431)||(16731362-16731433)
chr6 (491-594)||(31123238-31123341)
chr6 (63-106)||(2331588-2331631)
chr6 (67-176)||(19664674-19664782)
chr6 (67-124)||(22221903-22221959)
chr6 (67-124)||(22247738-22247794)
chr6 (67-179)||(1838602-1838712)
chr6 (414-462)||(14969625-14969673)
chr6 (108-176)||(15535184-15535252)
chr6 (151-195)||(15578763-15578807)
chr6 (69-124)||(23842565-23842621)
chr6 (63-106)||(22920835-22920878)
chr6 (346-387)||(26390970-26391011)
chr6 (346-390)||(6856612-6856656)
chr6 (63-179)||(13017193-13017307)
chr6 (69-124)||(23848073-23848129)
chr6 (67-147)||(27649259-27649338)
chr6 (63-106)||(17232161-17232204)
chr6 (772-827)||(20527901-20527956)
chr6 (63-147)||(28974140-28974226)
chr6 (499-533)||(3827018-3827052)
chr6 (67-155)||(17696849-17696936)
chr6 (63-176)||(32427429-32427540)
[»] chr8 (37 HSPs)
chr8 (84-589)||(13331902-13332428)
chr8 (346-599)||(14187805-14188075)
chr8 (346-599)||(27863599-27863869)
chr8 (346-589)||(20262369-20262629)
chr8 (346-589)||(21048999-21049259)
chr8 (346-599)||(5964060-5964330)
chr8 (63-700)||(5827717-5828387)
chr8 (346-599)||(22654066-22654336)
chr8 (346-594)||(30645282-30645547)
chr8 (63-440)||(39659716-39660096)
chr8 (358-589)||(17013089-17013337)
chr8 (358-589)||(17543864-17544112)
chr8 (346-589)||(31981162-31981422)
chr8 (63-205)||(9467283-9467425)
chr8 (63-206)||(453803-453947)
chr8 (360-589)||(24434846-24435091)
chr8 (466-594)||(9466936-9467064)
chr8 (358-589)||(24903541-24903789)
chr8 (360-589)||(24444892-24445137)
chr8 (472-594)||(39660145-39660267)
chr8 (466-593)||(31984799-31984926)
chr8 (346-461)||(18696020-18696135)
chr8 (346-431)||(587302-587387)
chr8 (346-431)||(626535-626620)
chr8 (346-401)||(31986294-31986349)
chr8 (65-176)||(12575306-12575416)
chr8 (606-694)||(14627143-14627229)
chr8 (530-589)||(18696171-18696231)
chr8 (63-106)||(24903254-24903297)
chr8 (346-384)||(453624-453662)
chr8 (68-124)||(5980067-5980124)
chr8 (770-807)||(44007779-44007816)
chr8 (63-102)||(17012801-17012840)
chr8 (63-102)||(17544361-17544400)
chr8 (63-105)||(22654570-22654612)
chr8 (102-195)||(12820690-12820782)
chr8 (69-102)||(17931296-17931329)
[»] chr2 (32 HSPs)
chr2 (65-594)||(38315807-38316357)
chr2 (346-594)||(4577661-4577898)
chr2 (346-593)||(1503478-1503742)
chr2 (346-593)||(1506682-1506946)
chr2 (346-599)||(11059603-11059873)
chr2 (345-594)||(30719583-30719849)
chr2 (346-599)||(13518108-13518377)
chr2 (346-589)||(29435564-29435824)
chr2 (346-589)||(15704015-15704275)
chr2 (346-598)||(18011755-18012016)
chr2 (358-589)||(22592328-22592575)
chr2 (355-594)||(38326319-38326581)
chr2 (358-589)||(18938709-18938955)
chr2 (63-206)||(29435965-29436109)
chr2 (346-594)||(40677817-40678082)
chr2 (77-208)||(13572059-13572192)
chr2 (346-462)||(11056299-11056415)
chr2 (346-461)||(15719319-15719434)
chr2 (498-594)||(38326178-38326274)
chr2 (227-401)||(40139140-40139314)
chr2 (67-176)||(23673353-23673461)
chr2 (63-141)||(36327090-36327167)
chr2 (63-176)||(32575689-32575801)
chr2 (67-155)||(16295048-16295135)
chr2 (63-156)||(24384929-24385023)
chr2 (530-589)||(15719470-15719529)
chr2 (63-195)||(32074160-32074293)
chr2 (603-700)||(40678105-40678200)
chr2 (63-106)||(18939200-18939243)
chr2 (63-106)||(22592819-22592862)
chr2 (346-380)||(25925175-25925209)
chr2 (346-387)||(40778988-40779029)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (361-594)||(7046-7296)
[»] scaffold0273 (2 HSPs)
scaffold0273 (65-439)||(19515-19894)
scaffold0273 (603-732)||(20018-20144)
[»] scaffold0214 (3 HSPs)
scaffold0214 (346-594)||(19864-20129)
scaffold0214 (346-594)||(13415-13679)
scaffold0214 (346-594)||(27431-27695)
[»] scaffold0062 (3 HSPs)
scaffold0062 (346-589)||(52927-53187)
scaffold0062 (346-461)||(67876-67991)
scaffold0062 (530-589)||(68027-68086)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (358-589)||(26935-27184)
scaffold0012 (63-106)||(26647-26690)
[»] scaffold0083 (3 HSPs)
scaffold0083 (346-732)||(28981-29395)
scaffold0083 (346-732)||(52778-53192)
scaffold0083 (63-307)||(42716-42961)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (63-195)||(33734-33865)
[»] scaffold0067 (2 HSPs)
scaffold0067 (358-589)||(27176-27423)
scaffold0067 (69-106)||(27668-27705)
[»] scaffold1048 (1 HSPs)
scaffold1048 (358-589)||(1216-1463)
[»] scaffold0911 (2 HSPs)
scaffold0911 (466-594)||(4371-4499)
scaffold0911 (603-700)||(4255-4350)
[»] scaffold0360 (3 HSPs)
scaffold0360 (346-565)||(6123-6359)
scaffold0360 (346-443)||(2430-2527)
scaffold0360 (466-553)||(2298-2385)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (466-593)||(227157-227284)
scaffold0014 (346-401)||(228652-228707)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (466-589)||(28842-28965)
scaffold0175 (346-443)||(28704-28801)
scaffold0175 (63-106)||(28428-28471)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (254-429)||(92423-92601)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (473-571)||(2022-2120)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (67-194)||(90306-90432)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (67-176)||(2627-2734)
[»] scaffold0766 (1 HSPs)
scaffold0766 (98-176)||(3635-3713)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (254-382)||(468418-468544)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (67-141)||(24193-24266)
[»] scaffold1431 (1 HSPs)
scaffold1431 (346-389)||(475-518)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 427; Significance: 0; HSPs: 66)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 63 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 19869339 - 19868636
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19869339 agatatttggcaagtgtactaaaatctatcaaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 19869240  T
Q  163 ggatgtagtaaatttatgggttgctctaggcagctgaatttggtgcataaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatttataataaaacaga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19869239 ggatgtagtaaatttatgggttgccttaggcagctgaatttggtgcataaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatttataataaaacata 19869140  T
Q  263 taatcaagcctttgaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatgttcacctaactctatggcatattaactaaatagtttt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  19869139 taatcaagcctttgaatcctctattgttcacggtgaataattttctcatcttctctctcaatgttcacctaactctatgacggattaactaaatagtttt 19869040  T
Q  363 gatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttattc--a 460  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||  |    
T  19869039 gatcaatctcttgactcaaaactctttcctaagttataactttttaatctcttaaaccaattgaataaccgcggaagcaataacagaacgttaattcata 19868940  T
Q  461 tgtca---------------tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcct 545  Q
    |||||               |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19868939 tgtcataatcctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacataattactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcct 19868840  T
Q  546 aagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat---------------gaacacaaataatcttgaataaagactagga 630  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19868839 aagatcaatttatgtaattggaagaagctagggttaatagtcatgcaaagcaatcatatgaaaagcaacaaacacaaataattctgaataaagactagga 19868740  T
Q  631 ttccattgaattaaaaaagagagttcaaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgactctgattaatctaagagcttaactactc 730  Q
    ||||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  19868739 ttccattgaatt---aaggagagtttaaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgactc-gattaatctaggagcttagctactc 19868644  T
Q  731 atgttcat 738  Q
    ||||||||    
T  19868643 atgttcat 19868636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 63 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 25492259 - 25492036
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25492259 agataattgacaagtgtaccaaaagctatcaaaatagtaataaagttcgtatccacgaggatcgttgttaatttctacttagcaagttcattaaaataaa 25492160  T
Q  163 ggatgtagtaaatttatgggttgctctaggcagctgaatttggtgcataaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatttataataaaacaga 262  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25492159 agatgtagtaaatttatgggttgccctaggcacctgaatttggtgcataaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatttataataaaacaga 25492060  T
Q  263 taatcaagcctttgaatcctctat 286  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  25492059 taatcaagtctttgaatcctctat 25492036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 346 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 4250459 - 4250045
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||      
T  4250459 attaactaagtggttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttccgaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgtggaagctatgt 4250360  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcata---------------tctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    |||||| || ||||||  ||||||               |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4250359 cagaacgttaattcataagtcataactctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaagattaaaagctagggtta 4250260  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgc--------------aaagcaatgaacacaaataatct 614  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||      
T  4250259 gtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagttagggttaatagtcatgcaaacaatcatacgaaaagcaatgaacacaaataattc 4250160  T
Q  615 tgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttc-aaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgactctgattaatc 713  Q
    ||||||||||||||| || ||||||  |   ||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||    
T  4250159 tgaataaagactaggttttcattga--tgtcaaagagagtacttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatgact-taatcaatc 4250064  T
Q  714 taagagcttaactactcat 732  Q
    |||||| ||| ||||||||    
T  4250063 taagagtttagctactcat 4250045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 346 - 594
Target Start/End: Original strand, 42354456 - 42354721
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  42354456 attaactaattagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttaaaaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcagaagcgatgt 42354555  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcata---------------tctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    |||||  || ||||||  ||||||               |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42354556 cagaatgttaattcatatgtcataaccctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggtta 42354655  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42354656 gtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgcaagaagctagggttaatagtcatgcaaa 42354721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 346 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 9158062 - 9157797
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||      
T  9158062 attaactaattagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaatttataaccttttaatctcttaaactgattgaataaccgcggaagtgatgt 9157963  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcata---------------tctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    |||||  || ||||||  ||||||               |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9157962 cagaatgttaattcatatgtcataaccctcaattttctatctctaggttcctatgttgaattaaatagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 9157863  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9157862 gtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgcaagaagttagggttactagtcatgcaaa 9157797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 346 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 10963481 - 10963216
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10963481 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataatcttttaatctcttaaaccgattgaataactgcggaagcgataa 10963382  T
Q  446 cagaacatttattcatg-----------------tcatatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     || || || |||||||                 || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10963381 aagtacgttaattcatgagtcatgatcctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggtta 10963282  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  10963281 atagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcacgaagctagggttaatagtcatacaaa 10963216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 346 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 10966990 - 10966725
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10966990 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataatcttttaatctcttaaaccgattgaataactgcggaagcgataa 10966891  T
Q  446 cagaacatttattcatg-----------------tcatatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     || || || |||||||                 || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10966890 aagtacgttaattcatgagtcatgatcctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggtta 10966791  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  10966790 atagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcacgaagctagggttaatagtcatacaaa 10966725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 346 - 599
Target Start/End: Original strand, 30158072 - 30158346
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30158072 attaactaagtagatttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 30158171  T
Q  446 cagaacatttattcatg-----------------tc----atatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagg 524  Q
     ||||| || |||||||                 ||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30158172 aagaacgttaattcatgagtcatgatcctcaatttcctatatatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagg 30158271  T
Q  525 gttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 599  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  30158272 gttaatagtcattcaattcataatatcaattcatgtaattgcacgaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 30158346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 346 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 2784195 - 2783925
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2784195 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccacagaagcgataa 2784096  T
Q  446 cagaacatttattcatg-----------------tcatatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     ||||| || |||||||                 || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  2784095 aagaacgttaattcatgagtcatgatcctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatatcaggattaaaagctagtgtta 2783996  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 599  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  2783995 atagtcattcaattcctaatatcaattcatgtagttgcacgaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 2783925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 346 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 18883287 - 18883022
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||      
T  18883287 attaactaattaattttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccaattgaataaccgtggaagcgatgt 18883188  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcata---------------tctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    |||||| || ||||||  ||||||               |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18883187 cagaacgttaattcatatgtcataatcctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggtta 18883088  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     |||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18883087 gtagtcatttaatccctaagatcaatttatgtgattgtaagaagctagggttaatagtcatgcaaa 18883022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 27055230 - 27054850
Alignment:
Q  65 atatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaagg 164  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27055230 atatttggcaagcataccaaaa-ctatcgaagtagtaataaatttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaaag 27055132  T
Q  165 atgtagtaaa-tttat-gggttgctctaggcagctgaatttg-gtgcataaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatttataataaaacag 261  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| || |||||  |  |||||| |||||  | |  ||| |||| | |||||  | ||  | ||||||||    
T  27055131 atgtagtaaattttatggggttgccctaggcagttggatttgattttataaaacgtaaa-caaagtcaa-taaaatagtttgataattggattaaaacag 27055034  T
Q  262 ataatcaagccttt-gaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatg---ttcacctaactctatggcatattaactaaata 357  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||    |||||| ||| || |   || ||||| || || | || ||||||||| |     
T  27055033 atgatcaagcctttcgaatcctctattgctcaccgtgagtaatttggctctcttctctctcaaagaaattaacctagctttacgacaaattaactaagtg 27054934  T
Q  358 gttttgatcaatctcttgactc-aaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagc 440  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27054933 gttttgatcaatctcttgactcaaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagc 27054850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 346 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 10959974 - 10959714
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10959974 attaattaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataatcttttaatctcttaaaccgattgaataactgcggaagcgataa 10959875  T
Q  446 cagaacatttattcatg-----------------tcatatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     || || || |||||||                 || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10959874 aagtacgttaattcatgagtcatgatcctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcagaattaaaagctagggtta 10959775  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  10959774 atagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcacgaagctagggttgatagtcat 10959714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 356 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 9154879 - 9154624
Alignment:
Q  356 tagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacattt 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||  ||     
T  9154879 tagttttgatcaatctcttgactcaaaatcctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgttgaagcgatgtcagaatgtta 9154780  T
Q  456 attcat--gtcata---------------tctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattc 538  Q
    ||||||  ||||||               |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  9154779 attcatatgtcataaccctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaatataattactatttcatgattaaaagctagggttagtagtcattc 9154680  T
Q  539 aattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  9154679 aattcctaagatcaatttatgtgattgcaagaagttaggattactagtcatgcaaa 9154624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 358 - 589
Target Start/End: Original strand, 16314645 - 16314892
Alignment:
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttat 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  16314645 gttttgatcaatctcttgaatcaaaaccctatcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataaaagaacgttaat 16314744  T
Q  458 tcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaa 540  Q
    ||||  |||||               |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16314745 tcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcgaacagaattactaattcaggattaaaatctagggttaatagtcattcaa 16314844  T
Q  541 ttcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16314845 ttcctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaatagtcat 16314892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 358 - 589
Target Start/End: Original strand, 16414811 - 16415058
Alignment:
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttat 457  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  16414811 gtttttatcaatctcttgaatcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataaaagaacgttaat 16414910  T
Q  458 tcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaa 540  Q
    ||||  |||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  16414911 tcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaagattaaaagctagggttaatagtcatttaa 16415010  T
Q  541 ttcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16415011 ttcataatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaatagtcat 16415058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 358 - 589
Target Start/End: Original strand, 18495639 - 18495886
Alignment:
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttat 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  18495639 gttttgatcaatctcttgaatcaaaaccctatcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataaaagaacgttaat 18495738  T
Q  458 tcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaa 540  Q
    ||||  |||||               |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18495739 tcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcgaacagaattactaattcaggattaaaatctagggttaatagtcattcaa 18495838  T
Q  541 ttcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18495839 ttcctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaatagtcat 18495886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 346 - 589
Target Start/End: Original strand, 2279663 - 2279923
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||      
T  2279663 attaactaagtagttttgatcaatctcttgaatcaaaaccctttcctaagttataaccctttaatctcttaaaccgattgaataactgcggaagcgatgt 2279762  T
Q  446 cagaacatttattcatgt-----------------catatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    |||||| || |||||| |                 | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  2279763 cagaacgttaattcatatatcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacaaaattactaattcaggattaaaagttagggtta 2279862  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
     |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  2279863 gtagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaatttcaagaagctaaggttaatagtcat 2279923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 346 - 594
Target Start/End: Original strand, 6173396 - 6173661
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  6173396 attatctaagtagttttgatcaatctcttgaatcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgatgt 6173495  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    | |||| || ||||||  |||||               |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  6173496 ctgaacgttaattcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacatgattactaattcaggattaaaatctagggtta 6173595  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     | || ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6173596 gtggtcattcaattcctaatatcaattcatgtaatttcaagaagctagggttaatagtcatacaaa 6173661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 358 - 589
Target Start/End: Original strand, 5887040 - 5887286
Alignment:
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttat 457  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| || ||    
T  5887040 gttttgatcaatctcttgaatcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataactgcggaagcgataa-ataacgttaat 5887138  T
Q  458 tcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaa 540  Q
    ||||  |||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5887139 tcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaagagtcattcaa 5887238  T
Q  541 ttcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  5887239 ttcctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaatagtcat 5887286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 358 - 589
Target Start/End: Original strand, 18515785 - 18516032
Alignment:
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttat 457  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||    
T  18515785 gtttttatcaatctcttgaatcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataactgcggaagcgataaaagaacgttaat 18515884  T
Q  458 tcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaa 540  Q
    ||||  |||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  18515885 tcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaagattaaaagctagggttaatagtcatttaa 18515984  T
Q  541 ttcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18515985 ttcataatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaatagtcat 18516032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 358 - 589
Target Start/End: Original strand, 23374785 - 23375032
Alignment:
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttat 457  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| || ||    
T  23374785 gttttgatcaatctcttgaatcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataactgcggaagctataaaagaacgttaat 23374884  T
Q  458 tcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaa 540  Q
    ||||  |||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  23374885 tcatatgtcatgattctcaaattcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagatagggttaaaagtcattcaa 23374984  T
Q  541 ttcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23374985 ttcctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaatagtcat 23375032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 358 - 589
Target Start/End: Original strand, 29233644 - 29233890
Alignment:
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttat 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||| || ||    
T  29233644 gttttgatcaatctcttgagtcaaaaccctttct-aagttataaccttttaatctcttaaactgattgaataactgcagaagcgataaaagaacgttaat 29233742  T
Q  458 tcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaa 540  Q
    ||||  |||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29233743 tcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaa 29233842  T
Q  541 ttcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  29233843 ttcctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaatagtcat 29233890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 358 - 589
Target Start/End: Original strand, 5897024 - 5897270
Alignment:
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttat 457  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| || ||    
T  5897024 gttttgatcaatctcttgaatcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataactgcggaagcgataa-ataacgttaat 5897122  T
Q  458 tcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaa 540  Q
    ||||  |||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5897123 tcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaagagtcattcaa 5897222  T
Q  541 ttcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||||| ||||||| || |||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  5897223 ttcctaatatcaattcatataatt-taagaagctagggttaatagtcat 5897270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 571 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 25492014 - 25491857
Alignment:
Q  571 agttagggttaatagtcatgcaaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttcaaacaaattacatg 670  Q
    |||||||||||||||||||      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  25492014 agttagggttaatagtcat------caatgaacacaaataattttgaataaagactaggattccgttgaattaaata---gagttcaaacaaattacatg 25491924  T
Q  671 gttcatagatcacaatagattcatctcatgactctgattaatctaagagcttaactactcatgttcat 738  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25491923 gttcatagatcacaatagattcatctcatggctc-gattaatctaagagcttagctactcatgttcat 25491857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 346 - 594
Target Start/End: Original strand, 20536628 - 20536886
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||      
T  20536628 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataactgcgaaagcaattt 20536727  T
Q  446 cagaacatttattcatg-----------tcatatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagta 534  Q
    | |||| || |||| ||           || ||||||||| ||| |||||  | | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||     
T  20536728 ctgaacgttaattcctgagttcgtaacttcctatctctagtttcatatgtaaagttaaacagaattactatttcaggattaaaagatagggttaatagtc 20536827  T
Q  535 attcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
    | | ||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20536828 aattaattcctaagatcaattaatatgattg-aagaagttagggttaatagtcatacaaa 20536886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 346 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 28327517 - 28327252
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||         
T  28327517 attaactaagtggttttgatcaatctcttgacacaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataatcgcggaagcatggt 28327418  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     ||||| || ||||||  |||||               ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28327417 gagaacgttaattcataagtcataatcctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggtta 28327318  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     |||| ||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  28327317 gtagtcattcaattcctagcatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttagtagtcatacaaa 28327252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 346 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 28330842 - 28330577
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||         
T  28330842 attaactaagtggttttgatcaatctcttgacacaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataatcgcggaagcatggt 28330743  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     ||||| || ||||||  |||||               ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28330742 gagaacgttaattcataagtcataatcctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggtta 28330643  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     |||| ||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  28330642 gtagtcattcaattcctagcatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttagtagtcatacaaa 28330577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 466 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 44508745 - 44508617
Alignment:
Q  466 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 565  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  44508745 tatctctaggttcctgtgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctcgggttagtagtcattcaattcttaagatcaatttatgtgattg 44508646  T
Q  566 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44508645 caagaagctagggttaatagtcatgcaaa 44508617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 346 - 558
Target Start/End: Original strand, 4225896 - 4226125
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||      
T  4225896 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcaaaagctatgt 4225995  T
Q  446 cagaacatttattc--atgtca---------------tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    || ||| || ||||  ||||||               |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4225996 caaaacgttaattcatatgtcataaccctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacaaaattactatttcaggattaaaagctagggtta 4226095  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttat 558  Q
      | | |||||||| |||||||||||||||    
T  4226096 gcaatcattcaatttctaagatcaatttat 4226125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 466 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 27054807 - 27054679
Alignment:
Q  466 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 565  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  27054807 tatctctaggttcctatattgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcatttaattcctaagatcaatttatgtgattg 27054708  T
Q  566 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  27054707 aaagaagttagggttagtagtcatacaaa 27054679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 466 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 28327380 - 28327134
Alignment:
Q  466 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  28327380 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctagcatcaatttatgtgattg 28327281  T
Q  566 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa--------------gcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagag 651  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||              ||| | | ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  | |||  |||    
T  28327280 aaagaagctagggttagtagtcatacaaacaatcataagaaaagcattaagcacaaataattctgaataaagactaggttttcattgatgtcaaa--gag 28327183  T
Q  652 agttca-aacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 700  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  28327182 agttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatg 28327134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 466 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 28330705 - 28330459
Alignment:
Q  466 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  28330705 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctagcatcaatttatgtgattg 28330606  T
Q  566 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa--------------gcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagag 651  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||              ||| | | ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  | |||  |||    
T  28330605 aaagaagctagggttagtagtcatacaaacaatcataagaaaagcattaagcacaaataattctgaataaagactaggttttcattgatgtcaaa--gag 28330508  T
Q  652 agttca-aacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 700  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  28330507 agttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatg 28330459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 346 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 3305923 - 3305658
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||         
T  3305923 attaactaagtggttttgatcaatctcttgacacaaaaccctttccggagttataaccttttaatctcttaaatcgattgaataatcgcggaagcatggt 3305824  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     ||||| || ||||||  |||||               ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  3305823 aagaacgttaattcataagtcataatcctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcattattaaaagttagggtta 3305724  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     |||| |||||||| |||  |||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  3305723 gtagtcattcaatttctattatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttagtagtcatacaaa 3305658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 346 - 445
Target Start/End: Original strand, 25888513 - 25888612
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25888513 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaaccatttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 25888612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 466 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 3305786 - 3305540
Alignment:
Q  466 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||| |||  |||||||||||| ||||    
T  3305786 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcattattaaaagttagggttagtagtcattcaatttctattatcaatttatgtgattg 3305687  T
Q  566 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa--------------gcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagag 651  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||              ||| | | ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  | |||  |||    
T  3305686 aaagaagctagggttagtagtcatacaaacaatcataagaaaagcattaagcacaaataattctgaataaagactaggttttcattgatgtcaaa--gag 3305589  T
Q  652 agttca-aacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 700  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  3305588 agttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatg 3305540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 356 - 560
Target Start/End: Original strand, 54736183 - 54736406
Alignment:
Q  356 tagttttgatcaatctcttgactcaaaa-ccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccg-cggaagcgataacagaacat 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |    |||||  |||||| |    
T  54736183 tagttttgatcaatctcttgactcaaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgccttccgcgatgtcagaacgt 54736282  T
Q  454 ttattc--atgtcata---------------tctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaat 536  Q
    | ||||  ||||||||               ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||  ||    
T  54736283 taattcatatgtcataatccttaatttcctatctctaggttcctatattgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctaggattagtagcgat 54736382  T
Q  537 tcaattcctaagatcaatttatgt 560  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  54736383 tcaattcttaagatcaatttatgt 54736406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 346 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 18551742 - 18551648
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagc 440  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  18551742 attaactaagtggttttgatcaatctcttgtctcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataacagtggaagc 18551648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 346 - 444
Target Start/End: Original strand, 36037000 - 36037097
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgata 444  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||   ||||||||||    
T  36037000 attaacttattagctttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaggttataaccttttaatctcttaaaccga-tgaataactttggaagcgata 36037097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 770 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 11270679 - 11270629
Alignment:
Q  770 ccgagagtttcgtagttgccgatgttgctcctgaatttctttctgattggt 820  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11270679 ccgagagtttcgtagttgccgatcttgctcctgaatttctttctgattggt 11270629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 176
Target Start/End: Original strand, 20536337 - 20536452
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaat--aaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaata 160  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||   |||| |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||| || ||| |||  | |    
T  20536337 agatatttggaaagtgtaccaaaaactattgaagtagtaaataaaagatcgtatccacgaggactgtatttaacttctacttagaaatttcattattaaa 20536436  T
Q  161 aaggatgtagtaaatt 176  Q
    ||||||||||||||||    
T  20536437 aaggatgtagtaaatt 20536452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 466 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 18551605 - 18551477
Alignment:
Q  466 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 565  Q
    ||||||||| ||| |||||  | ||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| |||| | | || |||||||||||||| ||  |||||    
T  18551605 tatctctagtttcatatgtaaagtcaaacagaatcactatttcaggtttaatagctagggttagtagtcaattaactcctaagatcaattaatacaattg 18551506  T
Q  566 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     |||||| |||||||| ||| ||| ||||    
T  18551505 aaagaagctagggttagtagccatacaaa 18551477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 273
Target Start/End: Original strand, 22032373 - 22032535
Alignment:
Q  112 tatccacgaggaccgttgttaatttcta-cttagcaagttcgttaaaataaaggatgtagtaaattt-atgggttgctctaggcagctgaatttggtgca 209  Q
    |||||||||||||  ||||||| || || || | ||| ||||||||||||| |||| || ||||||| || | |||| ||||||||   |||||||||||    
T  22032373 tatccacgaggactattgttaagttttaactcaacaatttcgttaaaataa-ggatataataaattttatagtttgccctaggcagtcaaatttggtgca 22032471  T
Q  210 taaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatttataataaaacagataatcaagcct 273  Q
    ||||||||||||   | |||||||| |||||||| |||||||| ||||||| || || ||||||    
T  22032472 taaaatgtaaatagaacgcaattaacttggtttgaaatttatactaaaacatatgattaagcct 22032535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 3306209 - 3306147
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagt-aataaagttcgtatccacgaggac 124  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||    
T  3306209 agatatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtaataaattaagttcgtatccacgaggac 3306147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 770 - 820
Target Start/End: Complemental strand, 25491826 - 25491776
Alignment:
Q  770 ccgagagtttcgtagttgccgatgttgctcctgaatttctttctgattggt 820  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  25491826 ccgagagtttcgtagttgcggacgttgctcctgaatttctttccgattggt 25491776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 466 - 508
Target Start/End: Original strand, 25888650 - 25888692
Alignment:
Q  466 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttc 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25888650 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttc 25888692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 141
Target Start/End: Original strand, 26822048 - 26822120
Alignment:
Q  68 tttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctact 141  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  26822048 tttggaaagtgtaccaaaa-ctatcgaagtaataataaaattcgtatccacaaggaccgctgttaatttttact 26822120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 401
Target Start/End: Original strand, 26822189 - 26822358
Alignment:
Q  232 taaattggtttggaatttataataaaacagataatcaagcctttgaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatgttcacc 331  Q
    ||||||||||||  | ||| | ||||| | || ||||||||||  |||| |||||||  | | ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||    
T  26822189 taaattggtttgagaattagattaaaataaatgatcaagccttcaaatcatctattgcacactgtgaataatttgctcctcttctttctcaatgttcacc 26822288  T
Q  332 taactctatggcatattaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataa 401  Q
    ||  | ||   |  ||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  26822289 tagttttacaactgattaacctaatagttttgatcaatttcttgagtcaaaactctttcctaagttataa 26822358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 147
Target Start/End: Original strand, 30157805 - 30157885
Alignment:
Q  67 atttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagt-aataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaa 147  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||    
T  30157805 atttggcaagtgtaccaataactatcgaagtaataaattaagttcgtatccacgaggactg-tgttaatctcaacttagcaa 30157885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 44508824 - 44508767
Alignment:
Q  404 ttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttattcat 461  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||    
T  44508824 ttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgatgtcagaacgttaattcat 44508767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 179
Target Start/End: Original strand, 11138574 - 11138688
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    |||||||||||||||| ||||||  | |||||| || ||| ||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| ||| |||  | |||    
T  11138574 agatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataa-aaagttcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattattaaaaa 11138672  T
Q  163 ggatgtagtaaatttat 179  Q
    ||||||| |||||||||    
T  11138673 ggatgta-taaatttat 11138688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 179
Target Start/End: Original strand, 22626316 - 22626430
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    |||||||||||||||| ||||||  | |||||| || ||| ||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| ||| |||  | |||    
T  22626316 agatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataa-aaagttcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattattaaaaa 22626414  T
Q  163 ggatgtagtaaatttat 179  Q
    ||||||| |||||||||    
T  22626415 ggatgta-taaatttat 22626430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 46731691 - 46731585
Alignment:
Q  67 atttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagt-aataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaagga 165  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| || | |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||  | ||||||    
T  46731691 atttggcaagtgaac-aaaaactatcgaagtaatgaataaattt-gtatccacgaggaccgttgttaacttctactcagcaatttctttatcaaaaagga 46731594  T
Q  166 tgtagtaaa 174  Q
    |||| ||||    
T  46731593 tgtattaaa 46731585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 770 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 19868605 - 19868539
Alignment:
Q  770 ccgagagtttcgtagttgccgatgttgctcctgaatt--tctttctgattggtgttgttgtgtgcat 834  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  19868605 ccgagagtttcatagttgccgacgttgctcttgaatttctctttccgattgatgttgttgtgtgcat 19868539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 35366562 - 35366486
Alignment:
Q  117 acgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaaggatgtagtaaatttatgggttgctctaggcag 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| || |||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||    
T  35366562 acgaggaccgttgttaacttctacttagcaatttcattataa-aaaggatgtattaaattt-taggttgccctaggcag 35366486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 124
Target Start/End: Original strand, 4225621 - 4225681
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggac 124  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  4225621 agatatttggcaagtgtacc-aatactatcgaagtagtaataaagattgtatccatgaggac 4225681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 31549625 - 31549573
Alignment:
Q  69 ttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaata-aagttcgtatccacga 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  31549625 ttggcaagtgtaccaaaaactatcgaagtaataaaataagttcgtatccacga 31549573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 106
Target Start/End: Original strand, 5886751 - 5886794
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  5886751 agataattggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaa 5886794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 106
Target Start/End: Original strand, 5896735 - 5896778
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  5896735 agataattggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaa 5896778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 106
Target Start/End: Original strand, 6173117 - 6173160
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  6173117 agatagttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaa 6173160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 11271122 - 11271060
Alignment:
Q  354 aatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaa 417  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||    
T  11271122 aatagttttgatcaatct-ttaagtcaaaaccctttcctaagttataacctcttaatctcttaa 11271060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 106
Target Start/End: Original strand, 16314357 - 16314400
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  16314357 agatatttggcaagtgtaccaataactatggaagtagtaataaa 16314400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 106
Target Start/End: Original strand, 16414523 - 16414566
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  16414523 agatatttggcaagtgtaccaataactatggaagtagtaataaa 16414566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 106
Target Start/End: Original strand, 18495351 - 18495394
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  18495351 agatatttggcaagtgtaccaataactatggaagtagtaataaa 18495394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 106
Target Start/End: Original strand, 23374497 - 23374540
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23374497 agataattggcaagtgtaccaataactatcgaaatagtaataaa 23374540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 153 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18551937 - 18551895
Alignment:
Q  153 ttaaaataaaggatgtagtaaatttatgggttgctctaggcag 195  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18551937 ttaaaattaaggatgtgttaaatttatgggttgctctaggcag 18551895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 592 - 626
Target Start/End: Original strand, 20536898 - 20536932
Alignment:
Q  592 aaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagact 626  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20536898 aaagcaatgaacacaaataattttgaataaagact 20536932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 66 - 390
Target Start/End: Original strand, 1810197 - 1810521
Alignment:
Q  66 tatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaagga 165  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1810197 tatttgacaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtattcacgaggaccgttgttaatttctacttaacaagttcgttaaaataaagga 1810296  T
Q  166 tgtagtaaatttatgggttgctctaggcagctgaatttggtgcataaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatttataataaaacagataa 265  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1810297 tgtagtaaatttatgggttgccctaggcagctgaatttggtgcataaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatttataataaaacagataa 1810396  T
Q  266 tcaagcctttgaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatgttcacctaactctatggcatattaactaaatagttttgat 365  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||    
T  1810397 tcaagcctttgaatcctctatcgttcaccgtgaataatttgctccttttctatctcaatgttcacctaactctacgacggattaactaaatagttttgat 1810496  T
Q  366 caatctcttgactcaaaaccctttc 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  1810497 caatctcttgactcaaaaccctttc 1810521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 63 - 594
Target Start/End: Original strand, 2499766 - 2500318
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2499766 agatatttggcaagtgtaccaaaagatatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 2499865  T
Q  163 ggatgtagtaaatttatgggttgctctaggcagctgaatttgg-tgcataaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatttataataaaacag 261  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||| |||||||||  | |||   | | || |||| |||||||  | ||  | ||||| ||    
T  2499866 ggatgtagtaaatttatgggttgccctaagcagttggatttggttgcataaaa-cttaatacaaagtaaataaaatggtttgataattggattaaaatag 2499964  T
Q  262 ataatcaagccttt-gaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatg---ttcacctaactctatggcatattaactaaata 357  Q
    || |||||||||||  |||||||||||| || | |||| ||||||||   |||||| ||| || |   || |||||  |||| | || ||||||||| |     
T  2499965 atgatcaagcctttcaaatcctctattgctcacagtgagtaatttgcctctcttctctctcaaagaaattaacctaggtctacgacaaattaactaagtg 2500064  T
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttat 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||      ||||| || ||    
T  2500065 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcataagttataaccttttaatttcttaaactgattgaataaccgcggaagcatggtgagaacgttaat 2500164  T
Q  458 tcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaa 540  Q
    ||||  |||||               ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2500165 tcataagtcataatcctcaatttcctatcactaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaa 2500264  T
Q  541 ttcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2500265 ttcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagttagggttagtagtcatacaaa 2500318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 346 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 19686243 - 19685978
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  19686243 attaactaattagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgatgt 19686144  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcata---------------tctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    |||||| || ||||||  ||||||               |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19686143 cagaacgttaattcatatgtcataatcctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggtta 19686044  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19686043 ttagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgtaagaagctagggttaatagtcatgcaaa 19685978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 346 - 594
Target Start/End: Original strand, 34652800 - 34653065
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  34652800 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataacattttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgatgt 34652899  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcata---------------tctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    |||||| || ||||||  ||||||               |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  34652900 cagaacgttaattcatatgtcataaccctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacaaaattattatttcaggattaaaagctagggtta 34652999  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34653000 gtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 34653065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 466 - 738
Target Start/End: Original strand, 1810590 - 1810873
Alignment:
Q  466 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1810590 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattacaatttcaggattaaaagttagggttaatagtcattcaatttctaagatcaatttatgtaattg 1810689  T
Q  566 caagaagttagggttaatagtcatgc---------------aaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaaga 650  Q
     |||||||||||||||||||||||||               ||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||||   |||||    
T  1810690 taagaagttagggttaatagtcatgcaaaacaatcatatgaaaaacaatgaacacaaataattctcaataaagactaggaatccattgaatt---aaaga 1810786  T
Q  651 gagttcaaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgactctgattaatctaagagcttaactactcatgttcat 738  Q
    || |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  1810787 gacttcaaacaaatttcatgattcatagatcataatagattcatctcatgactc-gattaatctaggagcttaactactcatattcat 1810873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 360 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 17944710 - 17944459
Alignment:
Q  360 tttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttattc 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||    
T  17944710 tttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgatgtcagaacgttaattc 17944611  T
Q  460 at--gtcata---------------tctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaatt 542  Q
    ||  ||||||               |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  17944610 atatgtcataaccctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaatt 17944511  T
Q  543 cctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17944510 cctaagatcaatttatgtgattgcaagaagctagggttaatagtcatgcaaa 17944459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 65 - 594
Target Start/End: Original strand, 33320685 - 33321234
Alignment:
Q  65 atatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaagg 164  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  |||| | | | ||||||||||  ||||   ||||||||||||||    
T  33320685 atatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtaataataaagttcgtatccacagggactgct-tcaatttctactcggcaaaagcgttaaaataaagg 33320783  T
Q  165 atgtagtaaatttatgggttgctctaggcagctgaatttggt-gcataaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatttataataaaacagat 263  Q
    ||||| |||||||||||||  | ||||||| ||| ||||||| |||  ||| |||||| | | | || |||| |||||||  | ||  | ||||||  ||    
T  33320784 atgtattaaatttatgggtcaccctaggcaactggatttggttgcaataaaagtaaataaca-gaaaataaaatggtttgataattggattaaaactaat 33320882  T
Q  264 aatcaagccttt-gaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatg---ttcacctaactctatggcatattaactaaatagt 359  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||| ||||||||   |||||| ||| || |   || ||||| || || | |  ||||||||| | ||    
T  33320883 tatcaagcctttcgaatcctctattgctcattgtgagtaatttgcctctcttctctctcaaagaaattaacctagctttacgacggattaactaagtggt 33320982  T
Q  360 tttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttattc 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||| || ||||    
T  33320983 tttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcatggtgagaacgttaattc 33321082  T
Q  460 at--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaatt 542  Q
    ||  |||||               ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  33321083 ataagtcataatcctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagttagggctagtagtcattcaatt 33321182  T
Q  543 cctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  33321183 cctaagatcaatttatgtgattgaaagaagttagggttagtagtcatacaaa 33321234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 346 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 26548167 - 26547897
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26548167 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccatggaagcgataa 26548068  T
Q  446 cagaacatttattcatg-----------------tcatatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     ||||| || |||||||                 || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  26548067 aagaacgttaattcatgagtcatgatcctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatatcaggattaaaagctagtgtta 26547968  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 599  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  26547967 atagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcacgaagctagggttaatagtcatacaaaacaat 26547897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 346 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 26551726 - 26551456
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26551726 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccatggaagcgataa 26551627  T
Q  446 cagaacatttattcatg-----------------tcatatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     ||||| || |||||||                 || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  26551626 aagaacgttaattcatgagtcatgatcctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatatcaggattaaaagctagtgtta 26551527  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 599  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  26551526 atagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcacgaagctagggttaatagtcatacaaaacaat 26551456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 346 - 599
Target Start/End: Original strand, 28562404 - 28562674
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28562404 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccacggaagcgataa 28562503  T
Q  446 cagaacatttattcatg-----------------tcatatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     ||||| || |||||||                 || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  28562504 aagaacgttaattcatgagtcatgatcctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatatcaggattaaaagctagtgtta 28562603  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 599  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  28562604 atagtcattcaattcctaatatcaattcatgtagttgcacgaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 28562674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 346 - 599
Target Start/End: Original strand, 28565972 - 28566242
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28565972 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccacggaagcgataa 28566071  T
Q  446 cagaacatttattcatg-----------------tcatatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     ||||| || |||||||                 || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  28566072 aagaacgttaattcatgagtcatgatcctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatatcaggattaaaagctagtgtta 28566171  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 599  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  28566172 atagtcattcaattcctaatatcaattcatgtagttgcacgaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 28566242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 67 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 9691117 - 9690453
Alignment:
Q  67 atttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaaggat 166  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||   ||  ||| | ||||||||||  ||||   ||||||||||||||||    
T  9691117 atttggcaagtgtaccaaaacc-atcgaagtagtaataaagttcgtatccacagagattgtt-tcaatttctactcggcaaaagcgttaaaataaaggat 9691020  T
Q  167 gtagtaaatttatgggttgctctaggcagctgaatttggt-gca-taaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatttataataaaacagata 264  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| |  || || | ||| ||||| |||||| | | | || |||| |||||||  | ||  | ||||||||||     
T  9691019 gtattaaatttatgggttgccctaggcagtttgatctgattgcaataaaaagtaaataaca-gaaaataaaatggtttgataattggattaaaacagatg 9690921  T
Q  265 atcaagccttt-gaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatg---ttcacctaactctatggcatattaactaaatagtt 360  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||   |||||| ||| ||     || ||||| || || | |  ||||||||| | |||    
T  9690920 atcaagcctttcgaatcctctattgctcactgtgagtaatttgcctttcttctctctcaaataaattaacctagct-tacgacggattaactaagtggtt 9690822  T
Q  361 ttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttattca 460  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||| || |||||    
T  9690821 ttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgtggaagctatgtcagaacgttaattca 9690722  T
Q  461 -----------------tgtcatatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattc 543  Q
                     | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||  ||||||||    
T  9690721 caagttataactctcaatttcacatctctaggttcctatgttgaattaaacataattactatttcaggattaaaaactagggttagtagtcgttcaattc 9690622  T
Q  544 ctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgc--------------aaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactagg 629  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9690621 ctaagatcaatttatgtgattgaaataagctagggttaatagtcatgcaaacaatcgtacgaaaagcaatgaacacaaataattatgaataaagactagg 9690522  T
Q  630 attccattgaattaaaaaagagagttc-aaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 700  Q
     || ||||||  |   |||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  9690521 ttttcattga--tgtcaaagagagttcgtaacaaattatatggttcacaaatcacaa-agattcatctcatg 9690453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 346 - 599
Target Start/End: Original strand, 4731876 - 4732146
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4731876 attaattaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaactctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 4731975  T
Q  446 cagaacatttattcatgt-----------------catatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     || || ||  ||| |||                 | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4731976 aagtacgttagttcttgtgtcataatcctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacatgattactatttcatgattaaaagctagggtta 4732075  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 599  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  4732076 atagtcatccaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 4732146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 346 - 599
Target Start/End: Original strand, 40799961 - 40800231
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40799961 attaactaagtagttttgatcaatctcttaactcaaaaccctttcctaagttataactttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgatag 40800060  T
Q  446 cagaacatttattcatg-----------tca------tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     ||||| || |||||||           |||      ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  40800061 aagaacgttaattcatgagtcatgatcctcaattttctatttctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaaggtagtgtta 40800160  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 599  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  40800161 atagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcacgaagctagggttaatagtcatacaaaacaat 40800231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 346 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 19689626 - 19689361
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||      
T  19689626 attaactaattagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttactaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccatggaagcgatgt 19689527  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcata---------------tctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    |||||| || ||||||  ||||||               |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19689526 cagaacgttaattcatatgtcataatcctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagttagggtta 19689427  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  19689426 gtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgtaagaagctagggttaatagtcatgcaaa 19689361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 151 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 26338256 - 26337796
Alignment:
Q  151 cgttaaaataaaggatgtagtaaatttatgggttgctctaggcagctgaatttggt-gca-taaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatt 248  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||| | | | || |||| |||||||  | |    
T  26338256 cgttagaataaaggatgtattaaatttatgggttgccctaggcagttggatttggttgcaataaaaagtaaataaca-gaaaataaaatggtttgataat 26338158  T
Q  249 tataataaaacagataatcaagccttt-gaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatgt---tcacctaactctatggca 344  Q
    |  | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||   |||| | ||| || |    | |||||  | || | |     
T  26338157 tggattaaaacagatgatcaagcctttcgaatcctctattgctcactgtgagtaatttgcctctcttatctctcaaagaaaataacctaggtttacgacg 26338058  T
Q  345 tattaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgata 444  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||     
T  26338057 gattaactaagtggttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaagccgattgaataaccgtggaagttatg 26337958  T
Q  445 acagaacatttattcat--gtcata---------------tctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtt 527  Q
     |||||| || ||||||  ||||||               ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26337957 tcagaacgttaattcataagtcataactctcaatttcctatctctaggttcttatgttgaattaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtt 26337858  T
Q  528 aatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||    
T  26337857 agtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaaactagggttaatagtcat 26337796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 466 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 33921078 - 33920829
Alignment:
Q  466 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33921078 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 33920979  T
Q  566 caagaagttagggttaatagtcatgc--------------aaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagag 651  Q
     |||||| ||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  |   ||||||    
T  33920978 aaagaagctagggttaatagtcatgcaaacaatcatacgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactaggttttcattga--tgtcaaagag 33920881  T
Q  652 agttc-aaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgact 703  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  33920880 agttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatgact 33920829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 63 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 21680717 - 21680586
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680717 agatatttggcaagtgtaccaaaa-ctatcgaagtagtaataaagtttgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 21680619  T
Q  163 ggatgtagtaaatttatgggttgctctaggcag 195  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  21680618 ggatgtactaaatttatgggttgccctaggcag 21680586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 358 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 26727007 - 26726760
Alignment:
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttat 457  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || ||    
T  26727007 gttttaatcaatctcttgaatcaaaactctgtcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataattgcggaagcgataaaagaacgttaat 26726908  T
Q  458 tcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaa 540  Q
    ||||  |||||               ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26726907 tcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacagatttactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaa 26726808  T
Q  541 ttcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  26726807 ttcctaatatcaattcatataatt-caagaagctatggttaatagtcat 26726760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 63 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 33921455 - 33921333
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33921455 agatattcggcaagtgtaccaaaa-ctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgtgaatttctacttagcaagttcgttaaaattaa 33921357  T
Q  163 ggatgtagtaaatttatgggttgc 186  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  33921356 ggatgtattaaatttatgggttgc 33921333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 374 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 25185432 - 25185200
Alignment:
Q  374 tgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttattcatgt---------- 463  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |              
T  25185432 tgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaatcgaatgaataatcgcggaagcgacaacagaacgttaattcatatatcataagcc 25185333  T
Q  464 -------catatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaattt 556  Q
           | |||||||||||||||||| ||||| |||||||  || ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25185332 tcattttcctatctctaggttcctatgatgaattaaacagagctagtattttaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaaaatcaattt 25185233  T
Q  557 atgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  25185232 atgtgattgcaagaagctagggttattagtcat 25185200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 346 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 2453356 - 2453259
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgat 443  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2453356 attaactaattagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataactttttaatctcttaaaccgattgaataaccgtggaagcgat 2453259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 346 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 3195167 - 3195070
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgat 443  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3195167 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgat 3195070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 494 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 3195067 - 3194967
Alignment:
Q  494 cagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaa 593  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3195067 cagaattattatttcaggattaaaagctaaggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaa 3194968  T
Q  594 a 594  Q
    |    
T  3194967 a 3194967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 63 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 34406090 - 34405975
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||  | |||    
T  34406090 agatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacaaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatcaaaaa 34405991  T
Q  163 ggatgtagtaaatttat 179  Q
    ||||||| |||||||||    
T  34405990 ggatgta-taaatttat 34405975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 254 - 430
Target Start/End: Original strand, 35432442 - 35432619
Alignment:
Q  254 taaaacagataatcaagccttt-gaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatgttcacctaactctatggcatattaact 352  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||  ||||   ||| ||||| ||||||||| || | |  |||||||    
T  35432442 taaaacagatgatcaagcctttcgaatcatctattgctcaccgtgaataatttgctcctctttgctctcaatgtccacctaactttacgacggattaact 35432541  T
Q  353 aaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataa 430  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||    
T  35432542 tattagttttgatcaatctcttgactcaaaatcctttccaaggttataacctcttaatctcttaaatcgattgaataa 35432619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 36331074 - 36330741
Alignment:
Q  67 atttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaaggat 166  Q
    ||||| |||||||||| ||  |||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||  ||||||||    
T  36331074 atttgacaagtgtacctaat-ctatcgaagtaataataaaatttgcatccacgaggaccgttgttaatttctactcaacaattttgttaacttaaaggat 36330976  T
Q  167 gtagtaaatttatgggttgctctaggcagctgaatttggtgcataaaatgtaaatgaga-tgcaattaaattggtttggaatttataataaaacagataa 265  Q
     |  ||||||    |||||| |||||||| || ||  | ||||| |||  |  || | |  | ||||||||||||||| || ||| | |||||||||| |    
T  36330975 atgttaaattgggtggttgcactaggcagttggatcggttgcattaaactt--attacacggtaattaaattggtttgaaaattagattaaaacagatga 36330878  T
Q  266 tcaagcctttgaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatgttcacctaactctatggcatattaactaaatagttttgat 365  Q
     ||| | || ||||||||| |||  | | ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||| || | |  ||||||  ||||||||||||    
T  36330877 acaaactttcgaatcctctgttgcgcactgtgaataatttgctcctcttctctctcaatgttcacctaactttacgacggattaacctaatagttttgat 36330778  T
Q  366 caatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataac 402  Q
    |||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  36330777 caatcttttgactcaaaactatttcctaagttataac 36330741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 229 - 401
Target Start/End: Original strand, 36335037 - 36335210
Alignment:
Q  229 aattaaattggtttggaatttataataaaa-cagataatcaagcctttgaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatgtt 327  Q
    ||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||| |   ||||||||||| ||  |||||| ||| ||||||    
T  36335037 aattaaattggtttgaaaattagattaaaaacagatgatcaagccttcgaatcctcaagtgtgcattgtgaataattttctcatcttctctctcaatgtt 36335136  T
Q  328 cacctaactctatggcatattaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataa 401  Q
    |||||| || || |     |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36335137 cacctagctttacgatgatttaacctaatagttttgataaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataa 36335210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 141
Target Start/End: Original strand, 14616437 - 14616510
Alignment:
Q  67 atttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctact 141  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| || |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14616437 atttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaatttctact 14616510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 549 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 2453186 - 2453142
Alignment:
Q  549 atcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaa 593  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2453186 atcaatttatgtggttgcaagaagttagggttaatagtcatgcaa 2453142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 179
Target Start/End: Original strand, 7649950 - 7650060
Alignment:
Q  67 atttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaaggat 166  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||  | |||||||    
T  7649950 atttgacaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtaataaataaattcgtattcacgaggaccgttgttaatttctactcaacaatttctttatcaaaaaggat 7650048  T
Q  167 gtagtaaatttat 179  Q
    ||| |||||||||    
T  7650049 gta-taaatttat 7650060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 26727295 - 26727252
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  26727295 agatatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaa 26727252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 346 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 20077697 - 20077653
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttc 390  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20077697 attaacaaaatagttttgatcaatctcttgaatcaaaaccttttc 20077653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 194
Target Start/End: Original strand, 35432330 - 35432373
Alignment:
Q  151 cgttaaaataaaggatgtagtaaatttatgggttgctctaggca 194  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  35432330 cgttaaaataaatgatgtattaaatttatgggttgccctaggca 35432373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 20056193 - 20056160
Alignment:
Q  69 ttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20056193 ttggcaagtgtaccaaaaactatcgaagtagtaa 20056160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 54)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 66 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 6964644 - 6964095
Alignment:
Q  66 tatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaagga 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6964644 tatttggtaagtgtaccaaaaactatcgaagtagtaatgaagttcgtatccacgagggccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaagga 6964545  T
Q  166 tgtagtaaatttatgggttgctctaggcagctgaatttggt-gcataaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatttataataaaacagata 264  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||| ||||||||  | |||   | | || |||| |||||||  | ||  | ||||||||||     
T  6964544 tgtagtaaatttatgggttgccctaggtagttggatttggtcgcataaaa-cttaatacaaagtaaataaaatggtttgataattggattaaaacagatg 6964446  T
Q  265 atcaagccttt-gaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatg---ttcacctaactctatggcatattaactaaatagtt 360  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||   |||||| ||| || |   || ||||| || || | || | ||||||| | |||    
T  6964445 atcaagcctttcgaatcctctattgctcacagtgagtaatttgcctctcttctctctcaaagaaattaacctagctttacgacaaaataactaagtggtt 6964346  T
Q  361 ttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttattca 460  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||| || |||||    
T  6964345 ttgatcaatctcttgactcaaaatcctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcatggtgagaacgttaattca 6964246  T
Q  461 t--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattc 543  Q
    |  |||||               ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  6964245 taagtcataatcctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacaaaattactatttcaggattaaaagttagggttagtagtcattcaattc 6964146  T
Q  544 ctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  6964145 ctaagatcaatttatgtgattgaaagaaggtagggttagtagtcatacaaa 6964095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 65 - 732
Target Start/End: Original strand, 3540930 - 3541625
Alignment:
Q  65 atatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaagg 164  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3540930 atatttggcaagtgtaccaaaa-ctatcaaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgtgaacttctacttagcaagttcgttaaaataaagg 3541028  T
Q  165 atgtagtaaatttatgggttgctctaggcagctgaatttggt-gca-taaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatttataataaaacaga 262  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||| |||| || ||||||| ||| ||||| |||||| | |   ||| |||| ||||||  | ||  | ||||| |||    
T  3541029 atgtattaa-tttatgggttgccctaagcagttggatttggttgcaataaaaagtaaataacaaaaaataaaat-ggtttgataattggattaaaataga 3541126  T
Q  263 taatcaagcctttgaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatg---ttcacctaactctatggcatattaactaaatagt 359  Q
    | ||||||| || ||||||||||||| ||   |||| ||||||||   |||||| ||| || |   || ||||| || || | |  |||||| || | ||    
T  3541127 tgatcaagctttcgaatcctctattgctcattgtgagtaatttgcctctcttctctctcaaagaaattaacctagctttacgacggattaaccaagtggt 3541226  T
Q  360 tttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttattc 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||   ||||| || ||||    
T  3541227 tttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctctgaaactgattgaataaccgtggaagctatgttagaacgttaattc 3541326  T
Q  460 at--gtcata---------------tctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaatt 542  Q
    ||  ||||||               |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  3541327 ataagtcataactctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcatttaatt 3541426  T
Q  543 cctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat--------------gcaaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactag 628  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||              | |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  3541427 cctaagatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttaatagtcattcaaacaatcatacgaaaagcaatgaacacaaataattctgaatgaagactag 3541526  T
Q  629 gattccattgaattaaaaaagagagttcaaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgactctgattaatctaagagcttaactac 728  Q
    | || ||||||  |   |||||||||||   |||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| ||| ||||    
T  3541527 gttttcattga--tgttaaagagagttc-ttcaaattacatggtcaacagatcacaa-agattcatctcatgact-taatcaatctaagagtttagctac 3541621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 346 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 22257331 - 22257061
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22257331 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 22257232  T
Q  446 cagaacatttattcatgt-----------------catatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     || || || ||||||||                 | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22257231 aagtacgttaattcatgtgtcatgatcctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattgaaagctagggtta 22257132  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 599  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  22257131 atagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 22257061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 346 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 20100717 - 20100447
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20100717 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 20100618  T
Q  446 cagaacatttattcatgt-----------------catatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     || || || ||||||||                 | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20100617 aagtacgttaattcatgtgtcacaatcttcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggtta 20100518  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 599  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  20100517 atagtcattcaatttctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 20100447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 38431753 - 38431378
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38431753 agatatttggaaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccatgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttagttaaaataaa 38431654  T
Q  163 ggatgtagtaaatttatgggttgctctaggcagctgaatttgg-tgcataaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatttataataaaacag 261  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||  | |||   | | || |||| |||||||  | ||| | ||||||||    
T  38431653 ggatgtagtaaatttatgggttgccctaggcagttggatttggttgcataaaa-cttaatataaagtaaataaaatggtttgataattagattaaaacag 38431555  T
Q  262 ataatcaagccttt-gaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatg---ttcacctaactctatggcatattaactaaata 357  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||| || | |||  |||||| |   |||||| ||| || |   || ||||| || || | || ||||||||| |     
T  38431554 atgatcaagcctttcgaatcctctattgctcacagtgggtaattttcctctcttctctctcaaagaaattaacctagctttacgacaaattaactaagtg 38431455  T
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgc 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38431454 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccatttcctcagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgc 38431378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 346 - 599
Target Start/End: Original strand, 22232672 - 22232942
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22232672 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 22232771  T
Q  446 cagaacatttattcatgt-----------------catatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     || || || ||||||||                 | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22232772 aagtacgttaattcatgtgtcatgatcctcaatttcttatctctaggtttctatgttgaatcaaacagaattactatttcaggattgaaagctagggtta 22232871  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 599  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  22232872 atagtcatttaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctagggttaatagtcatacaaaacaat 22232942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 346 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 22254067 - 22253797
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22254067 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 22253968  T
Q  446 cagaacatttattcatgt-----------------catatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     || || || ||||||||                 | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22253967 aagtacgttaattcatgtgtcatgatcctcaatttcttatctctaggtttctatgttgaatcaaacagaattactatttcaggattgaaagctagggtta 22253868  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 599  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  22253867 atagtcatttaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctagggttaatagtcatacaaaacaat 22253797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 346 - 597
Target Start/End: Original strand, 748086 - 748354
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  748086 attaactaagtagttttgatcaatctcctgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 748185  T
Q  446 cagaacatttattcatgt-----------------catatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     ||||| || ||||||||                 | |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  748186 aagaacgttaattcatgtatcataatcctcaatttcctatctctaggtatctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggtta 748285  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagca 597  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  748286 atagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctagggttaaaagtcatacaaagca 748354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 346 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 8397918 - 8397648
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8397918 attaactaagtagatttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagctataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 8397819  T
Q  446 cagaacatttattcatg-----------------tcatatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     ||||| || |||||||                 || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8397818 aagaacgttaattcatgagtcatgatcctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacatgattactatttcaggattaaaagctagggtta 8397719  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 599  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| ||||    
T  8397718 atagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcacgaagctagggttaataatcatacaaaacaat 8397648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 346 - 599
Target Start/End: Original strand, 5826753 - 5827023
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5826753 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataatcttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcagaagcgataa 5826852  T
Q  446 cagaacatttattcatg-----------------tcatatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     || || || |||||||                 || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  5826853 aagtacgttaattcatgagtcatgatcctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagttagggtta 5826952  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 599  Q
    | ||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  5826953 acagtcattcaattcataatatcaattcatgtaattgcacgaagctatggttaatagtcatacaaagcaat 5827023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 360 - 594
Target Start/End: Original strand, 22083502 - 22083752
Alignment:
Q  360 tttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttattc 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||    
T  22083502 tttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataacattttaatctcttaagcagattgaataaccgcggaagcgatgtcagaacgttaattc 22083601  T
Q  460 at--gtcata---------------tctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaatt 542  Q
    ||  ||||||               |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||||    
T  22083602 atatgtcataaccctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctaga-ttagtagtcattcaatt 22083700  T
Q  543 cctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22083701 cctaagatcaatttatgtgattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 22083752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 346 - 589
Target Start/End: Original strand, 11825400 - 11825660
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11825400 attaactaagtagatttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 11825499  T
Q  446 cagaacatttattcatg-----------------tcatatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     ||||| || |||||||                 || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11825500 aagaacgttaattcatgggtcatgattctcaatttcctatctctaggtttctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagttagggtta 11825599  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||| ||||||||||| | ||| |   ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  11825600 atagtcattcaattcctgatatcgagacatgtaattgcacgaagctagggttaatagtcat 11825660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 358 - 589
Target Start/End: Original strand, 23598820 - 23599067
Alignment:
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttat 457  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||    
T  23598820 gttttgatcaatctcttgaatcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataactgcggaagcgataaaagaacgttaat 23598919  T
Q  458 tcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaa 540  Q
    ||||  |||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23598920 tcatatgtcatgattctcaaattcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaa 23599019  T
Q  541 ttcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  23599020 ttcctaatatcaattcatataatt-caagaagctatggttaatagtcat 23599067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 358 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 2251932 - 2251685
Alignment:
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttat 457  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||    
T  2251932 gttttgatcaatctcttgaatcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataactgcggaagcgataaaagaacgttaat 2251833  T
Q  458 tcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaa 540  Q
    ||||  |||||               ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2251832 tcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattagtaattcaggattaaaaactagggttaatagtcattcaa 2251733  T
Q  541 ttcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  2251732 ttcctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaatagtcat 2251685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 346 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 26182375 - 26182116
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  26182375 attaacaaattagttttgatcaatctcttgagtcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaactgattgaataactgcagaagcgataa 26182276  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     ||||| || ||||||  |||||               ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26182275 aagaacgttaattcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacaaaattactaattcaggattaaaagctagggtta 26182176  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  26182175 atagtcattcaattcttaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaatagtcat 26182116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 358 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 26460526 - 26460280
Alignment:
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttat 457  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| || ||    
T  26460526 gttttgatcaatctcttgaatcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataactgcggaagcgataa-ataacgttaat 26460428  T
Q  458 tcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaa 540  Q
    ||||  |||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26460427 tcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaagagtcattcaa 26460328  T
Q  541 ttcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  26460327 ttcctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaatagtcat 26460280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 346 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 2349532 - 2349276
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2349532 attaactaagtagttttgatcaatctctcgactcaaaaccctttcctaagttataactttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 2349433  T
Q  446 cagaacatttattcatg-----------------tcatatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     ||||| || |||||||                 || |||||||||||||||||||||||||||              ||| ||||||||||||||||||    
T  2349432 aagaacgttaattcatgtgtcataatcctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaa--------------tcaggattaaaagctagggtta 2349347  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 599  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  2349346 atagtcattcaatttctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctagggttaatagtcatacaaaacaat 2349276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 232 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 26153342 - 26152964
Alignment:
Q  232 taaattggtttggaatttataataaaacagataatcaagccttt-gaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatg---tt 327  Q
    |||| ||||||| || ||| | |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||   |||||| ||| || |   ||    
T  26153342 taaaatggtttgaaaattagattaaaacagatgatcaagccttttgaattctctattgctcaccgtgagtaatttgcctctcttctctctcaaagaaatt 26153243  T
Q  328 cacctaactctatggcatattaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaa 427  Q
     ||||| || || | |  ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  26153242 aacctagctttacgacggattaactaagtggttttgattaatctcttgactcaaaaccctttcctaagtcataaccttttaatctcttaaactgattgaa 26153143  T
Q  428 taaccgcggaagcgataacagaacatttattcat--gtcata---------------tctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcat 510  Q
    |||| |||||||    |  ||||| || ||||||  ||||||               |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  26153142 taactgcggaagtatgatgagaacgttaattcataagtcataatcctcaatttcctatctctaagttcctatgttgaataaaacagaattactatttcaa 26153043  T
Q  511 gattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  26153042 gattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagttagggttagtagtcat 26152964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 346 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 43549266 - 43549001
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||         
T  43549266 attaactaagtggttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataacattttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcatggt 43549167  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     ||||| || ||||||  |||||               |||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43549166 gagaacgttgattcataagtcataatcctcaatttcctatctttagattcctatgttgaattaaacataattactatttcatgattaaaagctagggtta 43549067  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     |||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  43549066 gtagtcaatcaattcctaagttcaatttatgtgattgaaagaagctagggttagtagtcatacaaa 43549001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 358 - 589
Target Start/End: Original strand, 710074 - 710322
Alignment:
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttat 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || || ||    
T  710074 gttttgatcaatctcttgaatcaaaaccttttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcaatgtcaggacgttaat 710173  T
Q  458 tcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaa 540  Q
    ||||  |||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  710174 tcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaatctagggttagtagtcattcaa 710273  T
Q  541 ttcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||||| ||||||| || ||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  710274 ttcctaatatcaattcatataaattcaagaagctagggttaatagtcat 710322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 346 - 594
Target Start/End: Original strand, 44017837 - 44018102
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||         
T  44017837 attaactaagtggttttgatcaatctcttgacacaaaaccctttcctaaattataaccttttaatctcttaaaccgattgaataatcgcggaagcatggt 44017936  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     ||||| || ||||||  |||||               ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44017937 gagaacgttaattcataagtcataatcctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggtta 44018036  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     |||| ||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  44018037 gtagtcattcaattcctagcatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttagtagtcatacaaa 44018102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 16547359 - 16546961
Alignment:
Q  67 atttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaaggat 166  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||  ||||   ||||||||||||||||    
T  16547359 atttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacaaggattgtt-tcaatttctactcggcaaaagcgttaaaataaaggat 16547261  T
Q  167 gtagtaaatttatgggttgctctaggcagctgaatttggt-gca-taaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatttataataaaacagata 264  Q
    ||| |||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||| | |   ||  |||| ||||||  | ||  | ||||| | ||     
T  16547260 gtattaaatttaagggttgccctaggcagttggatttggttgcaataaaaagtaaataacagagaacaaaat-ggtttgacaattggactaaaaaaaatg 16547162  T
Q  265 atcaagccttt-gaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatg---ttcacctaactctatggcatattaactaaatagtt 360  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || | ||||  |||||||   |||||| ||  || |   || ||||| || || | |  ||||||||| |||||    
T  16547161 atcaagcctttcgaatcctctattgctcactgtgaggaatttgcctctcttctctcacaaagaaattaacctagctttacgacggattaactaagtagtt 16547062  T
Q  361 ttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttattca 460  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||  |||||| || |||||    
T  16547061 ttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaactgattgaataaccgtggaagctatgtcagaacgttaattca 16546962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 461
Target Start/End: Original strand, 16618303 - 16618701
Alignment:
Q  67 atttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaaggat 166  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||  ||||   ||||||||||||||||    
T  16618303 atttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacaaggattgtt-tcaatttctactcggcaaaagcgttaaaataaaggat 16618401  T
Q  167 gtagtaaatttatgggttgctctaggcagctgaatttggt-gca-taaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatttataataaaacagata 264  Q
    ||| |||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||| | |   ||  |||| ||||||  | ||  | ||||| | ||     
T  16618402 gtattaaatttaagggttgccctaggcagttggatttggttgcaataaaaagtaaataacagagaacaaaat-ggtttgacaattggactaaaaaaaatg 16618500  T
Q  265 atcaagccttt-gaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatg---ttcacctaactctatggcatattaactaaatagtt 360  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || | ||||  |||||||   |||||| ||  || |   || ||||| || || | |  ||||||||| |||||    
T  16618501 atcaagcctttcgaatcctctattgctcactgtgaggaatttgcctctcttctctcacaaagaaattaacctagctttacgacggattaactaagtagtt 16618600  T
Q  361 ttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttattca 460  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||  |||||| || |||||    
T  16618601 ttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaactgattgaataaccgtggaagctatgtcagaacgttaattca 16618700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 346 - 463
Target Start/End: Original strand, 8257632 - 8257749
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8257632 attaactaagtggttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcaataa 8257731  T
Q  446 cagaacatttattcatgt 463  Q
    |||||||||  |||||||    
T  8257732 cagaacattatttcatgt 8257749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 466 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 38431329 - 38431201
Alignment:
Q  466 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  38431329 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttggtagtcattcaatttctaagatcaatttatgtgattg 38431230  T
Q  566 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  38431229 aaagaagctagggttagtagtcatacaaa 38431201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 346 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 8257961 - 8257846
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  8257961 attaactaattagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcagaagcgatgt 8257862  T
Q  446 cagaacatttattcat 461  Q
    ||||||||| ||||||    
T  8257861 cagaacattaattcat 8257846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 466 - 589
Target Start/End: Original strand, 12803447 - 12803569
Alignment:
Q  466 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12803447 tatctctaggttcctatgttgaattaaacaaaattactatttcaggattaaaagctaggg-tagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 12803545  T
Q  566 caagaagttagggttaatagtcat 589  Q
     |||||| |||||||| |||||||    
T  12803546 aaagaagctagggttagtagtcat 12803569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 346 - 461
Target Start/End: Original strand, 23467213 - 23467328
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||      
T  23467213 attaactaattagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcgaaagcgatgt 23467312  T
Q  446 cagaacatttattcat 461  Q
    |||||| || ||||||    
T  23467313 cagaaccttaattcat 23467328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 6967389 - 6967274
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||  | |||    
T  6967389 agatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatcaaaaa 6967290  T
Q  163 ggatgtagtaaatttat 179  Q
    ||||||| |||||||||    
T  6967289 ggatgta-taaatttat 6967274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 179
Target Start/End: Original strand, 17866357 - 17866472
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||  | |||    
T  17866357 agatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatcaaaaa 17866456  T
Q  163 ggatgtagtaaatttat 179  Q
    ||||||| |||||||||    
T  17866457 ggatgta-taaatttat 17866472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 141
Target Start/End: Original strand, 17857884 - 17857962
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctact 141  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17857884 agatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaaatagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctact 17857962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 502 - 592
Target Start/End: Original strand, 23467349 - 23467440
Alignment:
Q  502 ctatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaatt-cctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgca 592  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23467349 ctatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattaaatttcctaagatcaatttatgtgattgtaagaagttagggttaatagtcatgca 23467440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17152310 - 17152173
Alignment:
Q  67 atttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaaggat 166  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||   ||| ||| | ||||||||||  ||||   ||||||||||||||||    
T  17152310 atttgacaagtgtaccaaaa-ctatcgaagtagtaataaagtttgtatccacagagactgtt-tcaatttctactcggcaaaagcgttaaaataaaggat 17152213  T
Q  167 gtagtaaatttatgggttgctctaggcagctgaatttggt 206  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  17152212 gtattaaatttatgggttgccctaggcagttggatttggt 17152173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 443
Target Start/End: Original strand, 26808694 - 26808871
Alignment:
Q  265 atcaagcctttgaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatgttcacctaactctatggcatattaactaaatagttttga 364  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||  ||||   ||  ||||||||||||||| || | |  ||||||| | |||||||||    
T  26808694 atcaagccttcgaatcctctattgctcaccgtgcataatttgctcctctttgctcccaatgttcacctaactttacgacggattaacttattagttttga 26808793  T
Q  365 tcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgat 443  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||  || |||||||| | ||||||| || ||  ||||||||||| | |||||||||    
T  26808794 tcaatcttttgactcaaaatccttttctaggttataacctcttaatctctt-aagtgattgaataactgtggaagcgat 26808871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 346 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 42606356 - 42606279
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgatt 424  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||| |||||    
T  42606356 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaaattat-accttttaatctcttaaatcgatt 42606279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 346 - 431
Target Start/End: Original strand, 6214420 - 6214505
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataac 431  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6214420 attaacttattagctttgatcaatctcttgactcaaagtcctttcctaggttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataac 6214505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 23775950 - 23775868
Alignment:
Q  350 actaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataacc 432  Q
    ||||| || |||| ||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  23775950 actaattaattttcatctatctcttgacacaaaactctttcctaagttataacaatttaatctcttaaaccaattgaataacc 23775868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 124
Target Start/End: Original strand, 709787 - 709847
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggac 124  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||    
T  709787 agatatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaatatcgt-tccacgaggac 709847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 181
Target Start/End: Original strand, 28577687 - 28577798
Alignment:
Q  68 tttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaaggatg 167  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | |||| || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |  || ||| |||| ||||| ||||    
T  28577687 tttggcaagtgtaccaaaa-ctatcgaagcaataatcaaattcatatctacgaggaccgttgttaacttctactcaataatttcattaacataaa-gatg 28577784  T
Q  168 tagtaaatttatgg 181  Q
    || |||||||||||    
T  28577785 tattaaatttatgg 28577798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 155
Target Start/End: Original strand, 36842945 - 36843032
Alignment:
Q  67 atttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgtta 155  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||| || |||  ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  36842945 atttggcaagtgaaccaaaat-tatcgaagtaataaataagatcgaatccacaaggaccgttgttaatttctactcagcaatttcgtta 36843032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 2252220 - 2252177
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  2252220 agatatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaa 2252177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 106
Target Start/End: Original strand, 23598532 - 23598575
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23598532 agatatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaa 23598575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 24783646 - 24783573
Alignment:
Q  67 atttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctact 141  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24783646 atttgacaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtaataaataaatttgtatccacgaggaccgttgttaatttctact 24783573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 17601950 - 17601877
Alignment:
Q  108 ttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaaggatgtagtaaatttatgg 181  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||| | | ||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17601950 ttcgtatccacaaggactattgttaatttctaatcatcaattttgttaaactaaaggatgtattaaatttatgg 17601877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 297 - 401
Target Start/End: Original strand, 28577913 - 28578017
Alignment:
Q  297 gaataatttgctagtcttctatcttaatgttcacctaactctatggcatattaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagt 396  Q
    |||||||||||   |||||| ||| || ||| ||||| || |||| |  ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||    
T  28577913 gaataatttgcccctcttctctctcaaagttaacctagctttatgacggattaacctaatagttttgatcaatctcttgagtcaaaactctttcctaggt 28578012  T
Q  397 tataa 401  Q
    |||||    
T  28578013 tataa 28578017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 295101 - 294987
Alignment:
Q  64 gatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaag 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||  | |||||| || ||| ||| || || ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| ||| |||  | ||||    
T  295101 gatatttggcaagtgaaccaaattcaatcgaagtaataaaaaattt-gtgtccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattattaaaaag 295003  T
Q  164 gatgtagtaaatttat 179  Q
    |||||| |||||||||    
T  295002 gatgtaataaatttat 294987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 20100989 - 20100950
Alignment:
Q  67 atttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaa 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20100989 atttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaa 20100950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 42859054 - 42859008
Alignment:
Q  354 aatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataa 401  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  42859054 aatagttttgatcaatctcttgagtcaaaa-cctttcctaagttataa 42859008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 603 - 700
Target Start/End: Original strand, 44018125 - 44018220
Alignment:
Q  603 cacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttca-aacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 700  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||| || ||||||  | |||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  44018125 cacaaataattctgaataaagattaggttttcattgatgtcaaa--gagagttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatg 44018220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 770 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 9765304 - 9765246
Alignment:
Q  770 ccgagagtttcgtagttgccgatgttgctcctgaatttctttctgattggtgttgttgt 828  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||   ||||| |||||||||    
T  9765304 ccgagagtttcctagttgccgacgttgctcctgaatttattctcgattgatgttgttgt 9765246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 650 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 17601432 - 17601382
Alignment:
Q  650 agagttcaaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 700  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| | || |||||||||||||||||||    
T  17601432 agagttcaaacaagttacattgttcacatattacaatagattcatctcatg 17601382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 346 - 384
Target Start/End: Original strand, 30058196 - 30058234
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaac 384  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30058196 attaacaaaatagttttgatcaatcccttgactcaaaac 30058234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 356 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 17601747 - 17601686
Alignment:
Q  356 tagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaa 417  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| ||||    
T  17601747 tagttttgatcaatctcctaagtcaaaacccgttcctaagttataacctcttaatctcttaa 17601686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 26460808 - 26460771
Alignment:
Q  69 ttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaa 106  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  26460808 ttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaa 26460771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0401 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0401
Description:

Target: scaffold0401; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 63 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 4619 - 3918
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||| ||  | ||||||||||  | ||   ||||||||||||    
T  4619 agatatttggcaagtgtacaaaaaactatcgaagtagtaataaagtttgtatccacagggactgta-tcaatttctactcggaaaaagcgttaaaataaa 4521  T
Q  163 ggatgtagtaaatttatgggttgctctaggcagctgaatttggt-gca-taaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatttataataaaaca 260  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| |  || ||||||| ||| ||||| |||||| | ||  ||| |||| ||||||  | ||  | |||||||    
T  4520 ggatgtattaaatttatgggttgccctaggaaattggatttggttgcaataaaaagtaaataacataaaataaaat-ggtttgataattggattaaaaca 4422  T
Q  261 gataatcaagccttt-gaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatg---ttcacctaactctatggcatattaactaaat 356  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||| || | || | ||||||||  ||||||| ||| || |   || ||||| || |||| |  ||||||||| |    
T  4421 gatgatcaagcctttcgaatcctctattgctcactgtaagtaatttgcctgtcttctctctcaaagaaattaacctagctttatgacggattaactaagt 4322  T
Q  357 agttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacattta 456  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||| || |    
T  4321 ggttttgatcaatcttttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgtggaagctatgtcagaacgttaa 4222  T
Q  457 ttcat--gtcata---------------tctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattca 539  Q
    |||||  ||||||               |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  4221 ttcataagtcataactctcaatttccaatctctaggttcctatgttgaatgaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattca 4122  T
Q  540 attcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgc--------------aaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagac 625  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||              ||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4121 attcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttaatagtcatgcaaccaatcatacgaaaaccaatgaacacaaataattctgaataaagac 4022  T
Q  626 taggattccattgaattaaaaaagagagttc-aaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgactctgattaatctaagagcttaa 724  Q
    |||| || ||||||  |   |||||||||||  |||||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||||| || | ||||||||||||| |||     
T  4021 taggttttcattga--tgtcaaagagagttcttaacaaattacatggtttacatatcacaa-agattcttctcatggct-taattaatctaagagtttag 3926  T
Q  725 ctactcat 732  Q
    ||||||||    
T  3925 ctactcat 3918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 170; Significance: 9e-91; HSPs: 3)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 65 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 13950 - 13251
Alignment:
Q  65 atatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaagg 164  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||| | ||||||||||  ||||   ||||||||||||||    
T  13950 atatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacagggactgtt-tcaatttctactcggcaaaagcgttaaaataaagg 13852  T
Q  165 atgtagtaaatttatgggttgctctaggcagctgaatttggtgca--taaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatttataataaaacaga 262  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||||| || |||||||  |  ||||| |||||| | | | || |||| |||||||  | ||  | |||||||||    
T  13851 atgtattaaattgatgggttgccctaggcagttggatttggttaaaataaaaagtaaataaca-gaaaataaaatggtttgataattggattaaaacaga 13753  T
Q  263 taatcaagccttt-gaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatg---ttcacctaactctatggcatattaactaaatag 358  Q
    | ||||||||||  ||||||||||||| || |  ||| ||||||||   |||||| ||| || |   || ||||| || || | |  ||||||||| | |    
T  13752 tgatcaagccttccgaatcctctattgctcactatgagtaatttgcctctcttctctctcaaagaaattaacctagctttacgacggattaactaagtgg 13653  T
Q  359 ttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttatt 458  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||  | |||    
T  13652 ttttgatcaatctattgactcaaaaccctttcctaagttatacccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgtggaagctatgtcagaacgctaatt 13553  T
Q  459 cat--gtcata---------------tctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaat 541  Q
    |||  ||||||               |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  13552 cataagtcataactctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaatagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcatttaat 13453  T
Q  542 tcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgc--------------aaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagacta 627  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  13452 tcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagttagggttaatagtcatgcaaacaattatacaaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagacta 13353  T
Q  628 ggattccattgaattaaaaaagagagttc-aaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgactctgattaatctaagagcttaact 726  Q
    || || ||||||  |   |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || | || |||||||||| ||| ||    
T  13352 ggttttcattga--tgtcaaagagagttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatggct-taatcaatctaagagtttagct 13257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11607 - 11467
Alignment:
Q  65 atatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaagg 164  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||  |||| ||| | ||||| ||||  ||||   ||||||||||||||    
T  11607 atatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagcagtaataaagttcgtatccacagggactgtt-tcaatttatactcggcaaaagcgttaaaataaagg 11509  T
Q  165 atgtagtaaatttatgggttgctctaggcagctgaatttggt 206  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||| || |||||||    
T  11508 atgtattaaatttatgggtttccctaggcagttggatttggt 11467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 5670 - 5631
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaacc 385  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5670 attaactaagtggttttgatcaatctcttgactcaaaacc 5631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 168; Significance: 1e-89; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 69 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 18392747 - 18392201
Alignment:
Q  69 ttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaaggatgt 168  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  18392747 ttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagtttgttaaaataaaggatct 18392648  T
Q  169 agtaaa-tttat-gggttgctctaggcagctgaatttgg-tgcataaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatttataataaaacagataa 265  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||| ||| || |||||| |  |||||| |||||    | | || |||| |||||||  | ||  | |||||||||| |    
T  18392647 agtaaattttatggggttgccctagccagttggatttggttttataaaacgtaaa--caaagtaaataaaatggtttgataattggattaaaacagatga 18392550  T
Q  266 tcaagccttt-gaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatg---ttcacctaactctatggcatattaactaaatagttt 361  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || || ||| ||||||||   |||||| ||| || |   || ||||| || || | || ||||||||| | ||||    
T  18392549 tcaagcctttcgaatcctctattgctcaccatgagtaatttgcctatcttctctctcaaagaaattaacctagctttacgacaaattaactaagtggttt 18392450  T
Q  362 tgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttattcat 461  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||      ||||| || ||||||    
T  18392449 tgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaa-ctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcatggtgagaacgttaattcat 18392351  T
Q  462 --gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcc 544  Q
      |||||               ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||| |    
T  18392350 aagtcataatcctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagttagggttagtagtcattcaatttc 18392251  T
Q  545 taagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  18392250 taagatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttagtagtcatacaaa 18392201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 63 - 438
Target Start/End: Original strand, 34552442 - 34552821
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34552442 agatatttgacaagtgtaccaaaa-ctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagtttgttaaaataaa 34552540  T
Q  163 ggatgtagtaaa-tttat-gggttgctctaggcagctgaatttgg-tgcataaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatttataataaaac 259  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| || |||||| |  |||||| |||||    | | || |||| |||||||  | ||  | |||| |    
T  34552541 ggatgtagtaaattttatggggttgccctaggcagttggatttggttttataaaacgtaaa--caaagtaaataaaatggtttgataattggattaaagc 34552638  T
Q  260 agataatcaagccttt-gaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatg---ttcacctaactctatggcatattaactaaa 355  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||   |||||| |||||| |   || ||||| || || | || |||||||||     
T  34552639 agatgatcaagcctttcgaatcctctattgctcaccgtgagtaatttgcctctcttctctcttaaagaaattaacctagctttacgacaaattaactaag 34552738  T
Q  356 tagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaa 438  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34552739 tggttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttccaaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaa 34552821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 346 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 37641941 - 37641671
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37641941 attaactaagtagatttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaggttataaccttgtaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 37641842  T
Q  446 cagaacatttattcatg-----------------tcatatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     ||||| || |||||||                 || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  37641841 aagaacgttaattcatgagtcatgatcctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagttagggtta 37641742  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 599  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  37641741 atagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcacgaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 37641671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 346 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 28918448 - 28918188
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  28918448 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataatcttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaaacgatac 28918349  T
Q  446 cagaacatttattcatg-----------------tcatatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     ||||| || |||||||                 || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28918348 aagaacgttaattcatgagtcatgatcctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggtta 28918249  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| || || | ||||||||||||||||    
T  28918248 atagtcattcaattcctaatatcaatttatttaatttcatgatgctagggttaatagtcat 28918188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 346 - 589
Target Start/End: Original strand, 17902833 - 17903092
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  17902833 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgaata 17902932  T
Q  446 cagaacatttattcatg-----------------tcatatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     ||| | || |||||||                 || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  17902933 aaga-cgttaattcatgagtcatgattctcaatttcctatctctagattcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagttagggtta 17903031  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17903032 atagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaatttcaagaagctagggttaatagtcat 17903092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 346 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 20981433 - 20981173
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  20981433 attaactaagtagttttgatcaatctcttgaatcaaaatcctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcaatat 20981334  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    |||||| || ||||||  |||||               ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  20981333 cagaacgttaattcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacaaaattattaattcaggattaaaagctagggtta 20981234  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
     |||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20981233 gtagtcattcaattcttaatatcaattcatgtaatttcaagaagttagggttaatagtcat 20981173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 65 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 6206239 - 6205859
Alignment:
Q  65 atatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaagg 164  Q
    |||||| |||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6206239 atatttagcaagtgtactaaaat-tatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgagaaccgttgttaatttctacttaacaagttcgttaaaataaagg 6206141  T
Q  165 atgtagtaaattt--atgggttgctctaggcagctgaatttgg-tgcataaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatttataataaaacag 261  Q
    |||||||||||||    ||||||| ||||| || |  |||||| |  |||||| |||||    | | || |||| |||||||  | ||  | ||||||||    
T  6206140 atgtagtaaatttgacagggttgccctaggtagttcgatttggttttataaaacgtaaa--caaagtaaataaaatggtttgataattggattaaaacag 6206043  T
Q  262 ataatcaagcc-tttgaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatg---ttcacctaactctatggcatattaactaaata 357  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||    |||||| ||| || |   || ||||| || || | || ||||||||| |     
T  6206042 atgatcaagccttttgaatcctctattgctcaccgtgagtaatttggctctcttctctctcaaagaaattaacctagctttacgacaaattaactaagtg 6205943  T
Q  358 gttttgatcaatctcttgactc-aaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagc 440  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6205942 attttgatcaatctcttgactcaaaaaccctttcctaagttataactttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagc 6205859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 346 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 49719928 - 49719667
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  49719928 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataatcttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgatgt 49719829  T
Q  446 cagaacatttattc--atgtca---------------tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattac-tatttcatgattaaaagctagggtt 527  Q
    |||||  || ||||  ||||||               ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  49719828 cagaatgttaattcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacagtattacttttttcaagattaaaagctagggtt 49719729  T
Q  528 aatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    | |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  49719728 agtagtcaatcaattcctaatatcaattcatgtaatttcaagaagctagggttaatagtcat 49719667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 358 - 589
Target Start/End: Original strand, 24200301 - 24200548
Alignment:
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttat 457  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||    
T  24200301 gttttgatcaatctcttgaatcaaaaccctttcctaagttataatctttttatctcttaaaccgattgaataactgcggaagcgataaaagaacgttaat 24200400  T
Q  458 tcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaa 540  Q
    ||||  |||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24200401 tcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaa 24200500  T
Q  541 ttcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24200501 ttcctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaatagtcat 24200548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 346 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 49716446 - 49716184
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  49716446 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataatcttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgatgt 49716347  T
Q  446 cagaacatttattc--atgtca---------------tatctctaggttcc--tatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggt 526  Q
    |||||  || ||||  ||||||               |||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49716346 cagaatgttaattcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggtttctatatgttgaatcaaacagtattactatttcaagattaaaagctagggt 49716247  T
Q  527 taatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    || |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  49716246 tagtagtcaatcaattcctaatatcaattcatgtaatttcaagaagctagggttaatagtcat 49716184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 49716731 - 49716589
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49716731 agataattgacaagtgtaccaaaaactatcgaagtaataataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 49716632  T
Q  163 ggatgtagtaaa-tttatgggttgctctaggcagctgaatttg 204  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||    
T  49716631 ggatgtagtaaattttatgggttgccctaggcagttggatttg 49716589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 358 - 589
Target Start/End: Original strand, 16838991 - 16839237
Alignment:
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttat 457  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||| || ||    
T  16838991 gttttgatcaatctcttgaatcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataactgcggaagcaataa-ataacgttaat 16839089  T
Q  458 tcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaa 540  Q
    ||||  |||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16839090 tcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaagagtcattcaa 16839189  T
Q  541 ttcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16839190 ttcctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaatagtcat 16839237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 358 - 589
Target Start/End: Original strand, 16848921 - 16849167
Alignment:
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttat 457  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||| || ||    
T  16848921 gttttgatcaatctcttgaatcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataactgcggaagcaataa-ataacgttaat 16849019  T
Q  458 tcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaa 540  Q
    ||||  |||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16849020 tcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaagagtcattcaa 16849119  T
Q  541 ttcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16849120 ttcctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaatagtcat 16849167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 335 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 20964540 - 20964270
Alignment:
Q  335 ctctatggcatattaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgc 434  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  20964540 ctctatgacaaattaactaagtagttttgatcaatctcttgaatcaaa-ccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccaattgaataactgc 20964442  T
Q  435 ggaagcgataacagaacatttattcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaa 517  Q
    |||||| ||| |||||| || ||||||  |||||               || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  20964441 ggaagcaatatcagaacgttaattcatatgtcatgattctcaatttcctatatctaggttcctatgttgaatcaaacaaaattactaattcaggattaaa 20964342  T
Q  518 agctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  20964341 agctagggttagtagtcattcaattcctaatatcaatacatgtaatttcaagaagctatggttaatagtcat 20964270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 63 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 49720213 - 49720083
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49720213 agataattgacaagtgtaccaaaaactatcgaagtaataataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 49720114  T
Q  163 ggatgtagtaaa-tttatgggttgctctagg 192  Q
    || ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  49720113 gggtgtagtaaattttatgggttgccctagg 49720083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 346 - 594
Target Start/End: Original strand, 23441329 - 23441594
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||         
T  23441329 attaactaagtggttttgatcaatctcttgacacaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgaatgaataatcgcggaagcatggt 23441428  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     ||||| || ||||||  |||||               ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  23441429 gagaacgttaattcataagtcataatcctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggataaaaagctagggtta 23441528  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     |||| ||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  23441529 gtagtcattcaattcctagcatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttagtagtcatacaaa 23441594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 466 - 594
Target Start/End: Original strand, 3087907 - 3088035
Alignment:
Q  466 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  3087907 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagttattcaattcctaagatcaatttatatggttg 3088006  T
Q  566 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3088007 aaagaagttagggttattagtcatacaaa 3088035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 466 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 33898262 - 33898134
Alignment:
Q  466 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  33898262 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactaattcaagattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaacatcaatttatgtgattg 33898163  T
Q  566 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  33898162 aaagaagctagggttagtagtcatacaaa 33898134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 466 - 594
Target Start/End: Original strand, 34552866 - 34552994
Alignment:
Q  466 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  34552866 tatctctaggttcctatgttgaataaaacagaattactatttcaggattaaaagatagggttaatagtcattcaattactaagatcaatttatgtgattg 34552965  T
Q  566 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     |||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  34552966 aaagaaactagggttagtagtcatacaaa 34552994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 346 - 440
Target Start/End: Original strand, 50197004 - 50197098
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagc 440  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  50197004 attaactaaatggttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgtggaagc 50197098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 466 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 6195754 - 6195626
Alignment:
Q  466 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6195754 tatctctaggttcctatgttgaattaaacataattactatttcaagattaaaagttatggttggtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 6195655  T
Q  566 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     ||||||  ||||||| ||||||| ||||    
T  6195654 aaagaagccagggttagtagtcatacaaa 6195626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 10765161 - 10765046
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||  | |||    
T  10765161 agatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatcaaaaa 10765062  T
Q  163 ggatgtagtaaatttat 179  Q
    ||||||| |||||||||    
T  10765061 ggatgta-taaatttat 10765046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13493504 - 13493389
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||  | |||    
T  13493504 agatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatcaaaaa 13493405  T
Q  163 ggatgtagtaaatttat 179  Q
    ||||||| |||||||||    
T  13493404 ggatgta-taaatttat 13493389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 346 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 33898399 - 33898305
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagc 440  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  33898399 attaactaagtggttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataactgcggaagc 33898305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 466 - 554
Target Start/End: Original strand, 50197142 - 50197230
Alignment:
Q  466 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaat 554  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  50197142 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaataactatttcaagattaaaagctagagttagtagtcattcaattcctaagatcaat 50197230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 346 - 438
Target Start/End: Original strand, 3087770 - 3087862
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaa 438  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  3087770 attaactaagtggttttgatcaatctctcgactcaaaactctttactaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataactgcggaa 3087862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 147
Target Start/End: Original strand, 50196721 - 50196803
Alignment:
Q  65 atatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaa 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  50196721 atatttggcaagtgtaccaaaaactattgaagtaataataaaatttgtatccacgaggaccgttgttaatctcaacttagcaa 50196803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13496224 - 13496114
Alignment:
Q  67 atttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaaggat 166  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||| || |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||  | |||||||    
T  13496224 atttgacaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatcaaaaaggat 13496126  T
Q  167 gtagtaaatttat 179  Q
    ||| |||||||||    
T  13496125 gta-taaatttat 13496114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 106
Target Start/End: Original strand, 17902557 - 17902600
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17902557 agatatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaa 17902600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 20981708 - 20981665
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20981708 agatatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaa 20981665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 603 - 700
Target Start/End: Original strand, 23441617 - 23441712
Alignment:
Q  603 cacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttca-aacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 700  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||  |||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  23441617 cacaaataattctgaataaagactaggttttcattgaagtcaaaaagag--ttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatatcatg 23441712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 603 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 33898111 - 33898016
Alignment:
Q  603 cacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttca-aacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 700  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  | |||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  33898111 cacaaataattctgaataaagactaggttttcattgatgtcaaa--gagagttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatg 33898016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 106
Target Start/End: Original strand, 24200017 - 24200056
Alignment:
Q  67 atttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaa 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24200017 atttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaa 24200056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 37642210 - 37642167
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaa 106  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  37642210 agatatttgacaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaa 37642167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 346 - 384
Target Start/End: Original strand, 5317893 - 5317931
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaac 384  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5317893 attaacaaaatagttttgatcaatctcttgaatcaaaac 5317931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 125
Target Start/End: Original strand, 32505861 - 32505922
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggacc 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||  ||| |||||||||||||||||    
T  32505861 agatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtaataaataagatcgtatccacgaggacc 32505922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 106
Target Start/End: Original strand, 16838709 - 16838746
Alignment:
Q  69 ttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaa 106  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16838709 ttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaa 16838746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 106
Target Start/End: Original strand, 16848639 - 16848676
Alignment:
Q  69 ttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaa 106  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16848639 ttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaa 16848676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 166; Significance: 2e-88; HSPs: 41)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 63 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 13979493 - 13978942
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||  | || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  13979493 agatatttggcaagtgtactaataactaacgaagtagtaataaatattgt-tccacaaggaccgttgttaattcctacttagcaagttcgttgacataaa 13979395  T
Q  163 ggatgtagtaaatttatgggttgctctaggcagctgaatttgg-tgc-ataaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatttataataaaaca 260  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||| ||| |||||| |||||| | | | || |||| |||||||  | ||  | |||||||    
T  13979394 ggatgtagtaaatttatgggttaccctaggcagttggatttggttgcaataaaaagtaaataaca-gaaaataaaatggtttgataattggattaaaaca 13979296  T
Q  261 gataatcaagccttt-gaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatctta--atgttcacctaactctatggcatattaactaaata 357  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||   |||||| ||| |  |  || ||||| || || | |  ||||||||| |     
T  13979295 gatgatcaagcctttcgaatcctctattgttcactgtgagtaatttgcctctcttctctctcaagaaattaacctagctttacgacggattaactaagtg 13979196  T
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttat 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||      ||||| || ||    
T  13979195 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcagaagcatggtgagaacgttaat 13979096  T
Q  458 tcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaa 540  Q
    ||||  |||||               ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||    
T  13979095 tcataagtcataatcctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtggtcattcaa 13978996  T
Q  541 ttcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  13978995 ttcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttagtagtcatacaaa 13978942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 67 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 15851529 - 15850981
Alignment:
Q  67 atttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaaggat 166  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15851529 atttggcaagtgtaccaaaa-ctatcgaagtaatagtaaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaaggat 15851431  T
Q  167 gtagtaaa-tttat-gggttgctctaggcagctgaatttgg-tgcataaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatttataataaaacagat 263  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||| | || |||||| |  |||||| |||||    | | || |||| |||||||  | ||    ||||||||||    
T  15851430 gtagtaaattttatggggttgccctaggctgttggatttggttttataaaacgtaaa--caaagtaaataaaatggtttgataattgggttaaaacagat 15851333  T
Q  264 aatcaagcc-tttgaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatg---ttcacctaactctatggcatattaactaaatagt 359  Q
     |||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||    |||||| ||| || |   || ||||| || || | || ||||||||| | ||    
T  15851332 gatcaagccttttgaatcctctattgctctccgtgagtaatttggctctcttctctctcaaagaaattaacctagctttacgacaaattaactaagtggt 15851233  T
Q  360 tttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttattc 459  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||      ||||| || ||||    
T  15851232 tttgatcaatcttttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaacagattgaataatcgcggaagcatggtgagaacgttaattc 15851133  T
Q  460 at--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaatt 542  Q
    ||  |||||               ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  15851132 ataagtcataatcctcaatttcctatcactaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaatt 15851033  T
Q  543 cctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15851032 cctaagataaatttatgtgattgaaagaagttagggttattagtcatacaaa 15850981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 346 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 18859852 - 18859582
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18859852 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 18859753  T
Q  446 cagaacatttattcatg-----------tca------tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     ||| | || |||||||           |||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18859752 aagatcgttaattcatgagtcatgatcctcaattttctatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagtgtta 18859653  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 599  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  18859652 atagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcacgaagctagggttaatagtcatacaaatcaat 18859582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 346 - 594
Target Start/End: Original strand, 11702632 - 11702897
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||      
T  11702632 attaactaattagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttaaaaccttttaatctcttaaactgattgaataaccgcggaagcgatgt 11702731  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcata---------------tctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    |||||  || ||||||  ||||||               |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11702732 cagaatgttaattcatatgtcataaccctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggtta 11702831  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11702832 gtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgcaagaagctagggttaatagtcatgcaaa 11702897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 346 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 10247889 - 10247629
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||      
T  10247889 attaactaattagttttgatcaatctcttgactcaaaaccatttcctaagttataaccttttaatcttttaaactggttgaataaccgcggaagcgatgt 10247790  T
Q  446 cagaacatt--------tattc----atgtcatatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagt 533  Q
     ||||| ||        || ||    || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  10247789 tagaacgttatatgtcataatcctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattattatttcaggattaaaagttagggttagtagt 10247690  T
Q  534 aattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247689 cattcaattcctaagatcaatttatgtgattgtaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 10247629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 358 - 589
Target Start/End: Original strand, 3719553 - 3719801
Alignment:
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttat 457  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||    
T  3719553 gttttgatcaatctcttcaatcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataactgcggaagcgataaaagaacgttaat 3719652  T
Q  458 tcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaa 540  Q
    ||||  |||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3719653 tcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaa 3719752  T
Q  541 ttcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||||| ||||||| || ||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  3719753 ttcctaatatcaattcatataaattcaagaagctagggttaatagtcat 3719801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 358 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 14701967 - 14701719
Alignment:
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttat 457  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   || || || ||    
T  14701967 gttttgatcaatctcttgaatcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgatgttaggacgttaat 14701868  T
Q  458 tcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaa 540  Q
    ||||  |||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14701867 tcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaa 14701768  T
Q  541 ttcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||||| ||||||| || ||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  14701767 ttcctaatatcaattcatataaattcaagaagctagggttaatagtcat 14701719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 335 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 10386018 - 10385760
Alignment:
Q  335 ctctatggcatattaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgc 434  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10386018 ctctatgacaaattaactaattagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttc-------ataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgc 10385926  T
Q  435 ggaagcgataacagaacatttattcat--gtcata-----------tctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagct 521  Q
     ||||||||  |||||| || ||||||  ||||||           |||||||||||||||||||||| |||      |||||| ||| |||||||||||    
T  10385925 agaagcgatgtcagaacgttaattcatatgtcataacaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaa------tactatatcaggattaaaagct 10385832  T
Q  522 agggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaa 593  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10385831 agggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgcaagaagctagggttaatagtcatgcaa 10385760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 358 - 586
Target Start/End: Original strand, 49636581 - 49636824
Alignment:
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttat 457  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| || ||    
T  49636581 gttttgatcaatctcttgaatcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataactgcggaagcgataa-ataacgttaat 49636679  T
Q  458 tcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaa 540  Q
    ||||  |||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  49636680 tcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaagagtcattcaa 49636779  T
Q  541 ttcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagt 586  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  49636780 ttcctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaatagt 49636824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 56089496 - 56089773
Alignment:
Q  466 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  56089496 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaagattaaaagctagggttagtggtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 56089595  T
Q  566 caagaagttagggttaatagtcatgc--------------aaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagag 651  Q
     |||||| ||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  |   ||||||    
T  56089596 aaagaagctagggttaatagtcatgcaaacaatcatacgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagactaggttttcattga--tgtcaaagag 56089693  T
Q  652 agttc-aaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgactctgattaatctaagagcttaactactcat 732  Q
    |||||  ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| || | || |||||||||| ||| ||||||||    
T  56089694 agttcttaacaaattacatgattcacagatcacaa-agattcatttcatggct-taatcaatctaagagtttagctactcat 56089773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 358 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 3734374 - 3734131
Alignment:
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttat 457  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||| | ||| || ||    
T  3734374 gttttgatcaatctcttgaatcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaactgattgaataattgcggaagcgataa-ataacgttaat 3734276  T
Q  458 tcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaa 540  Q
    ||||  |||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3734275 tcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaa 3734176  T
Q  541 ttcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagt 586  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  3734175 ttcctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaatagt 3734131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 191
Target Start/End: Original strand, 33400079 - 33400207
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33400079 agatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaggtagtaataaagttcgtatccacgagaaccgttgttaatttctgcttagcaagttcgttaaaataaa 33400178  T
Q  163 ggatgtagtaaatttatgggttgctctag 191  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  33400179 ggatgtaataaatttatgggttgccctag 33400207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 358 - 589
Target Start/End: Original strand, 49639874 - 49640120
Alignment:
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttat 457  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||| | ||| || ||    
T  49639874 gttttgatcaatctcttgaatcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaactgattgaataattgcggaagcgataa-ataacgttaat 49639972  T
Q  458 tcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaa 540  Q
    ||||  |||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  49639973 tcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaagagtcattcaa 49640072  T
Q  541 ttcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  49640073 ttcctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaatagtcat 49640120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 63 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 19929238 - 19928859
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  19929238 agatatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaatatcgt-tccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttctttgacataaa 19929140  T
Q  163 ggatgtagtaaattt-atgggttgctctaggcagctgaatttggtgcataaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatttataat-aaaaca 260  Q
    |||||| |||||||| ||  ||  ||  ||||||  |  ||  ||||||||||  ||||| | | | || |||| |||||||  | ||  | | ||||||    
T  19929139 ggatgt-gtaaattttataagtgcctg-aggcagtaggtttgtgtgcataaaaattaaataaca-gaaaataaaatggtttgataattggatttaaaaca 19929043  T
Q  261 gataatcaagccttt-gaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatg---ttcacctaactctatggcatattaactaaat 356  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||   |||||| ||| || |   || |||||||| || | |  ||||||||| |    
T  19929042 gatgatcaagcctttcgaatcctctattgctcactgtgagtaatttgcctctcttctctctcaaagaaattaacctaactttacgacggattaactaagt 19928943  T
Q  357 agttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagc 440  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  19928942 ggttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatatcttaaaccgattgaataaccgcggaagc 19928859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 466 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 13979070 - 13978824
Alignment:
Q  466 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13979070 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtggtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 13978971  T
Q  566 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa--------------gcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagag 651  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||              ||| | | ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  | |||  |||    
T  13978970 aaagaagctagggttagtagtcatacaaacaatcagaagaaaagcattaagcacaaataattctgaataaagactaggttttcattgatgtcaaa--gag 13978873  T
Q  652 agttca-aacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 700  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  13978872 agttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatg 13978824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 365 - 594
Target Start/End: Original strand, 33400392 - 33400642
Alignment:
Q  365 tcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttattcatgtc 464  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||  |||||  || |||||||||    
T  33400392 tcaatctcttgactcaaaactctttcctaagttataaccttttaatctcttcaaccgattgaataatcgcggaagcgatgtcagaatgttaattcatgtc 33400491  T
Q  465 ata---------------tctctaggttcctatgttgaatcaaacagaa------ttactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattc 543  Q
    |||               || ||||||||||||||||||| ||||| ||      |||||||||||  |||||||| |||||||| |||| ||||||||     
T  33400492 ataaccatcaatttcctatccctaggttcctatgttgaattaaacaaaaacaaaattactatttcagaattaaaagttagggttagtagtcattcaatta 33400591  T
Q  544 ctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  33400592 ctaagatcaatttatgtgattgcaagaagctagggttaatagtcaagcaaa 33400642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 466 - 594
Target Start/End: Original strand, 26703673 - 26703801
Alignment:
Q  466 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  26703673 tatctctaggttcctatgttgaattaaacataattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatatgattg 26703772  T
Q  566 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     |||||| ||| |||| ||||||| ||||    
T  26703773 aaagaagctagagttagtagtcatacaaa 26703801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 346 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 23653348 - 23653089
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||      
T  23653348 attaactaattagttttgatcaattttttgactcaaaaccctttcctaagttataacattttaatctcttaaaccgattgaataaccgtggaagctatgt 23653249  T
Q  446 cagaacatttatt--------catgtcatatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagt-aat 536  Q
    | |||| || |||         |  |||||||||||| ||| |||||  | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||    
T  23653248 ctgaacgttaattactaaggcaacttcatatctctagtttcatatgtaaagttaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcaat 23653149  T
Q  537 t--caattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
    |   ||| ||| ||||||||| |  | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23653148 taataatacctgagatcaattaacatgattgaaagaagttaggtttaatagtcatgcaaa 23653089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 179
Target Start/End: Original strand, 647209 - 647322
Alignment:
Q  65 atatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaagg 164  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||  | |||||    
T  647209 atatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagtttgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatcaaaaagg 647308  T
Q  165 atgtagtaaatttat 179  Q
    ||||| |||||||||    
T  647309 atgta-taaatttat 647322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 440
Target Start/End: Original strand, 26703536 - 26703630
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagc 440  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  26703536 attaactaagtggttttgatcaatctcttgactcaaaactctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataactgcggaagc 26703630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 504 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 19928802 - 19928563
Alignment:
Q  504 atttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat-------------- 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||                  
T  19928802 atttcatgattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttagtagtcatacaaacaatcagaa 19928703  T
Q  590 gcaaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttc-aaacaaattacatggttcatagatcacaatag 688  Q
    | |||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  |   |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  19928702 gaaaagcattaagcacaaataattctgaataaagactaggttttcattga--tgtcaaagagagttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-ag 19928606  T
Q  689 attcatctcatgactctgattaatctaagagcttaactactcat 732  Q
    ||||||||||| ||| | || |||||||||| ||| ||||||||    
T  19928605 attcatctcattact-taatcaatctaagagtttagctactcat 19928563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 141
Target Start/End: Original strand, 650481 - 650557
Alignment:
Q  65 atatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctact 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  650481 atatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagtttgtatccacgaggaccgttgttaatttctact 650557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 37176993 - 37176855
Alignment:
Q  65 atatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaagg 164  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||  ||||   | ||||||||||||    
T  37176993 atatttggcaagtgtaccaaaagctatcga--tagtaataaagttcgtatccacaaggactgtt-tcaatttctactcggcaaaagctttaaaataaagg 37176897  T
Q  165 atgtagtaaatttatgggttgctctaggcagctgaatttggt 206  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||| || |||||||    
T  37176896 atgtattaaatttatgggttgccctagacagttggatttggt 37176855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 512 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 17670308 - 17670221
Alignment:
Q  512 attaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 599  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  17670308 attaaaaggtagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcacgaagctagggttaatagtcatacaaaacaat 17670221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 346 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 17670386 - 17670309
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgat 423  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||||||||||    
T  17670386 attaattaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataatcttttaatatcttaaaccgat 17670309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 346 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 11560886 - 11560799
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgc 434  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11560886 attaactaattagttt-gatcaatcttttgactcaaaactctttcctaagttataacctattaatctcttaaaccgattgaacaaccgc 11560799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 361 - 431
Target Start/End: Original strand, 24605307 - 24605377
Alignment:
Q  361 ttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataac 431  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24605307 ttgatcaatctcttgaatcaaagccctttcctaggttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataac 24605377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 346 - 431
Target Start/End: Original strand, 7394916 - 7395000
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataac 431  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  7394916 attaacttattagctttgatcaatctcttgactcaaagccctatctt-agttataaccttttaatctcttaaaccgattgattaac 7395000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 12172214 - 12172099
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    |||||||||||||||| ||||||  | |||||| || ||| |||| |||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| ||| |||  | |||    
T  12172214 agatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataaaaaagatcgtttccacgaggactgtatttaacttctacttagcaatttcattattaaaaa 12172115  T
Q  163 ggatgtagtaaatttat 179  Q
    ||||||| |||||||||    
T  12172114 ggatgta-taaatttat 12172099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 106
Target Start/End: Original strand, 3719265 - 3719308
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3719265 agatatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaa 3719308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 354 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 39050649 - 39050602
Alignment:
Q  354 aatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataa 401  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  39050649 aatagttttgatcaatcttttgagtcaaaaccctttcttaaattataa 39050602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2542124 - 2542012
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||| || |||  || ||||||||||||||||| ||  |||| ||||||| ||||| ||| |||  | |||    
T  2542124 agatatttggcaagtgtaccaaagtcaatcgaagtaataaataa-ttcgtatccacgaggactgtatttaacttctactgagcaatttcattattaaaaa 2542026  T
Q  163 ggatgtagtaaatt 176  Q
    ||||||| ||||||    
T  2542025 ggatgtattaaatt 2542012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 141
Target Start/End: Original strand, 21217359 - 21217416
Alignment:
Q  84 aaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctact 141  Q
    ||||||||| || || ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  21217359 aaaactatcaaagtaataataaaattcgtattcacgaggaccgttattaatttctact 21217416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 333
Target Start/End: Original strand, 21217499 - 21217600
Alignment:
Q  232 taaattggtttggaatttataataaaacagataatcaagcctttgaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatgttcacc 331  Q
    |||||||||||| || ||| | |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||  | | |||||||||||| |  |||||| ||| |||||| |||    
T  21217499 taaattggtttgaaaattagattaaaacagataatcaatccttcaaatcctctattgcgcactgtgaataatttgattttcttctctctcaatgttaacc 21217598  T
Q  332 ta 333  Q
    ||    
T  21217599 ta 21217600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 124
Target Start/End: Original strand, 8871474 - 8871537
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaa--taaagttcgtatccacgaggac 124  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||| |||| |||||||||||    
T  8871474 agatatctggcaagtgtaccaaaaactatcgaagtagtaaagaaaagatcgtctccacgaggac 8871537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 176
Target Start/End: Original strand, 26062698 - 26062808
Alignment:
Q  67 atttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgagga--ccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaagg 164  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| || |||  || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||| ||| |||  | |||||    
T  26062698 atttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaaataataaataaattcgtatccacgaggaccccgttgttaacttctactcaacaatttctttatcaaaaagg 26062796  T
Q  165 atgtagtaaatt 176  Q
    ||||| ||||||    
T  26062797 atgtattaaatt 26062808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 3734662 - 3734619
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3734662 agataattggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaa 3734619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 14702255 - 14702212
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaa 106  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14702255 agatatttggcaaatgtaccaataactatcgaagtagtaataaa 14702212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 176
Target Start/End: Original strand, 24605051 - 24605121
Alignment:
Q  105 aagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaaggatgtagtaaatt 176  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||||    
T  24605051 aagttcgtatccacaaggactgtt-tcaatttctacttggcaaaaacgttaaaataaaggatgtattaaatt 24605121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 106
Target Start/End: Original strand, 49639586 - 49639629
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  49639586 agataattggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaa 49639629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 137
Target Start/End: Original strand, 48013158 - 48013233
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaatta--gtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttc 137  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||   |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  48013158 agatgtttagcaagtgtactaaaaactatcgaagtaatataataaagtttgtttccacgaggaccg-tgttaatttc 48013233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 164; Significance: 3e-87; HSPs: 60)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 63 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 12747169 - 12746496
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||  ||||   ||||||||||||    
T  12747169 agatatttgacaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacaaggactgtt-tcaatttctactcggcaaaagcgttaaaataaa 12747071  T
Q  163 ggatgtagtaaatttatgggttgctctaggcagctgaatttggt-gca-taaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatttataataaaaca 260  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||| || ||| | | | || |||| |||||||  | ||  | |||||||    
T  12747070 ggatgtattaaatttatgggttgccctaggcagttggatttggttgcaataaaaagtgaataaca-gaaaataaaatggtttgataattggattaaaaca 12746972  T
Q  261 gataatcaagcctttgaa-tcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatg---ttcacctaactctatggcatattaactaaat 356  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||||| ||   |||| ||||||||   |||||| ||| || |   || ||||| || || | |  ||||||||| |    
T  12746971 gatgatcaagcctttcaaatcctctattgctcattgtgagtaatttgcctctcttctctctcaaagaaattaacctagctttacgacggattaactaagt 12746872  T
Q  357 agttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatctttta---aaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacat 453  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||| ||  |||||| |    
T  12746871 ggttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttattaaaccgattgaataaccgtggaagctatgtcagaacgt 12746772  T
Q  454 ttattcat--gtcata---------------tctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaat 536  Q
    | ||||||  ||||||               ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  12746771 taattcataagtcataactctcaatttcctatctctaggttcatatgttgaattaaacagaattactatttcacgattaaaagctagggttagtagtcat 12746672  T
Q  537 tcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgc--------------aaagcaatgaacacaaataatcttgaataaa 622  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12746671 tcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttaatagtcatgcaaacaatcatacgaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaa 12746572  T
Q  623 gactaggattccattgaattaaaaaagagagtt-caaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 700  Q
    ||||||| || ||||||  |   ||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  12746571 gactaggttttcattga--tgtcaaagagagttattaacaaattacatggttcacagatcacaa-agatccatctcatg 12746496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 346 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 34502416 - 34502151
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  34502416 attaactaattagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgatgt 34502317  T
Q  446 cagaacatttattcatgt-----------------catatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    |||||| || |||||| |                 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  34502316 cagaacgttaattcatatgccataatcctcaatttcatatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactacttcaagattaaaagctagggtta 34502217  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  34502216 gtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgtaagaagctagggttaatagtcatgcaaa 34502151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 63 - 594
Target Start/End: Original strand, 28894239 - 28894791
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||| | ||||||||||  ||||   ||||||||||||    
T  28894239 agatatttgacaagtgtaacaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacatggactgtt-tcaatttctactcggcaaaaacgttaaaataaa 28894337  T
Q  163 ggatgtagtaaatttatgggttgctctaggcagctgaatttgg-tgc-ataaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatttataataaaaca 260  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||| |||||| |||||| | | | || |||| |||||||  | ||  | |||||||    
T  28894338 ggatgtattaaatttatgggttgccctaggcagttagatttggttgcaataaaaagtaaataaca-gaaaataaaatggtttgataattggattaaaaca 28894436  T
Q  261 gataatcaagc-ctttgaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatg---ttcacctaactctatggcatattaactaaat 356  Q
    ||| |||||||  ||||||| |||||||| || | |||| ||||||||   |||||| ||| || |   || ||||| || || ||   ||||||||  |    
T  28894437 gatgatcaagcattttgaattctctattgctcactgtgagtaatttgcctctcttctctctcaaagaaattaacctagctttacggtggattaactatgt 28894536  T
Q  357 agttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacattta 456  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||      ||||| || |    
T  28894537 ggttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataacattttaatctcttaaaccaattgaataaccgcagaagcatggtgagaacgttaa 28894636  T
Q  457 ttcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattca 539  Q
    |||||  |||||               ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  28894637 ttcataagtcataatcctcaatttcctatctctaggtttctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagttagggttagtagtcattca 28894736  T
Q  540 attcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28894737 attcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagttagggttagtagtcatacaaa 28894791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 346 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 28117913 - 28117652
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  28117913 attaacttattagctttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcagaagcgatgt 28117814  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcata---------------tctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    |||||| || ||||||  ||||||               |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28117813 cagaacgttaattcatatgtcataaccctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacaaaattactatttcaggattaaaagctagggtta 28117714  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatg 590  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  28117713 gtagtcattcaattcctaaaatcaatttatgtgattgcaagaagctagggttaataatcatg 28117652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 346 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 11410838 - 11410578
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  11410838 attaactaaggagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgatgt 11410739  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    |||||  || ||||||  |||||               ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11410738 cagaatgttaattcatatgtcatgattcctaatttcctatctctaggatcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggtta 11410639  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
     |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  11410638 gtagtcaatcaattcctaatatcaattcatgtaatttcaagaagctagggttaatagtcat 11410578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 346 - 594
Target Start/End: Original strand, 9313830 - 9314095
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||      
T  9313830 attaacttattagctttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatatcttaaaccgattgaataactgcggaagcgatgt 9313929  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcata---------------tctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    | |||| || ||||||  ||||||               |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  9313930 cggaacgttaattcatatgtcataaccctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaagagctatggtta 9314029  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  9314030 gtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgcaataagctagggttaatagtcatgcaaa 9314095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 346 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 17231929 - 17231669
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||      
T  17231929 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagtcataaccttttaatctcttaaactaattgaataaccgcggaagcgatgt 17231830  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    |||||| || ||||||  |||||               |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||||    
T  17231829 cagaacgttaattcatatgtcatgattctcaattttctatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattacaatttcagaattaaaagatagggtta 17231730  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17231729 atagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaatttcaagaagatagggttaatagtcat 17231669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 104 - 438
Target Start/End: Original strand, 35026932 - 35027270
Alignment:
Q  104 aaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaaggatgtagtaaatttatgggttgctctaggcagctgaattt 203  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  35026932 aaagttcgtatccacaaggaacgttgttaatttctacttaacaagttcgttaaaataaaggatgtattaaatttatgggttgccctaggcagttggattt 35027031  T
Q  204 gg-tgc-ataaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatttataataaaacagataatcaagccttt-gaatcctctattgttcgccgtgaat 300  Q
    || ||| |||||| ||||   |   | || |||| |||||||  | ||  | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |  ||| |    
T  35027032 ggttgcaataaaaagtaa--taacggaaaataaaatggtttgataattggattaaaacagatgatcaagcctttcgaatcctctattgctcactatgagt 35027129  T
Q  301 aatttgctagtcttctatcttaatg---ttcacctaactctatggcatattaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagtt 397  Q
    |||||||   |||||| ||| || |   || ||||| || || | || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35027130 aatttgcctctcttctctctcaaagaaattaacctagctttacgacagattaactaagtggttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagtt 35027229  T
Q  398 ataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaa 438  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35027230 ataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaa 35027270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 361 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 22920587 - 22920343
Alignment:
Q  361 ttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttattca 460  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| || |||||    
T  22920587 ttgatcaatctcttgaatcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataactgcagaagcgataaaagaacgttaattca 22920488  T
Q  461 t--gtcata---------------tctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattc 543  Q
    |  ||||||               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22920487 tatgtcataattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggataaaaagctagggttaatagtcattcaattc 22920388  T
Q  544 ctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    |||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22920387 ctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaatagtcat 22920343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 466 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 14969604 - 14969471
Alignment:
Q  466 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14969604 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 14969505  T
Q  566 caagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 599  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  14969504 cacgaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 14969471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 346 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 2331355 - 2331090
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||      
T  2331355 attaactaagtacttttgatcaatctcttgactcaaaaccatttcctaagttataaccttttaatctcttaaatcgattgaataactgcggaagctatgt 2331256  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcata---------------tctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    |||||| || ||||||  ||||||               |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||    
T  2331255 cagaacgttaattcataggtcataaccctcaatttcttatctctaggttcctacgttgaattaaacagaattgatatttcatgattaaaagctggtgtta 2331156  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| | ||||||||||||||    
T  2331155 gtagtcattcaattcctaagatcaatttatgttattgaaagaagctaggatcaatagtcatgcaaa 2331090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 466 - 732
Target Start/End: Original strand, 35027315 - 35027592
Alignment:
Q  466 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35027315 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 35027414  T
Q  566 caagaagttagggttaatagtcat--------------gcaaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagag 651  Q
     |||||| |||||||| |||||||              | |||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  |   ||||||    
T  35027415 aaagaagctagggttagtagtcatataaacaatcataagaaaagcattaagcacaaataattctgaataaagactaggttttcattga--tgtcaaagag 35027512  T
Q  652 agttc-aaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgactctgattaatctaagagcttaactactcat 732  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || | || |||||||||||||| ||||||||    
T  35027513 agttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatggct-taatcaatctaagagcttagctactcat 35027592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 63 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 11411123 - 11410990
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11411123 agataattgacaagtgtaccaaaaactatcgaagtaataataaagttcgtatccacgagtaccattgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 11411024  T
Q  163 ggatgtagtaaa-tttatgggttgctctaggcag 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  11411023 ggatgtagtaaattttatgggttgccctaggcag 11410990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 346 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 2330703 - 2330438
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||      
T  2330703 attaactaagtacttttgattaatctcttgactgaaaaccatttcataagttataaccttttaatctattaaaccgattgaataactgcgaaagctatgt 2330604  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcata---------------tctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    |||||| || ||| ||  ||||||               |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2330603 cagaacgttaatttatatgtcataaccctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaatagaattactatttcaggattaaaagctagggtta 2330504  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||| |||||||||||||||||    
T  2330503 gtagtcattcaatttctaagatcaatttatgttattgaaagaatctagagttaatagtcatgcaaa 2330438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 346 - 527
Target Start/End: Original strand, 5618262 - 5618457
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  5618262 attaactaattagttttgatcaatctcttcactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcagaagcgatgt 5618361  T
Q  446 cagaacatttattcatgtca--------------tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtt 527  Q
    |||||| || |||||| |||              |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5618362 cagaacgttaattcatatcataacctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggtt 5618457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 466 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 31262707 - 31262579
Alignment:
Q  466 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31262707 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaactactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 31262608  T
Q  566 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  31262607 caagaagttagagttaataatcatgcaaa 31262579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 466 - 589
Target Start/End: Original strand, 13095880 - 13096003
Alignment:
Q  466 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  13095880 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcatgattaaaagttagggttagtagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattt 13095979  T
Q  566 caagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13095980 caagaagttagggttaatagtcat 13096003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 466 - 594
Target Start/End: Original strand, 5618491 - 5618618
Alignment:
Q  466 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  5618491 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagaagtcattcaattcttaa-atcaatttatgtgattg 5618589  T
Q  566 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5618590 caagaagctagggttaatagtcatgcaaa 5618618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 65 - 192
Target Start/End: Original strand, 33678947 - 33679076
Alignment:
Q  65 atatttggcaagtgtaccaaaa--actatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  33678947 atatttggcaagtgtaccaaaaaaactatcgaagtagtactaaagttcatatccacgaggaccgttgttaatttctacttaacaagttagttaaaataaa 33679046  T
Q  163 ggatgtagtaaatttatgggttgctctagg 192  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  33679047 ggatgtatgaaatttatgggttgccctagg 33679076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 470 - 594
Target Start/End: Original strand, 33679375 - 33679498
Alignment:
Q  470 tctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaag 569  Q
    |||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  33679375 tctaggttcctaggttgaattaa-cataattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagataaatttatgtgattgaaag 33679473  T
Q  570 aagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  33679474 aagttagggttaatagtcatgcaaa 33679498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 346 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 14966304 - 14966188
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14966304 attaactaagtagatttgatcaatctcttgactcaaacccctttcctaggttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 14966205  T
Q  446 cagaacatttattcatg 462  Q
     ||||| || |||||||    
T  14966204 aagaacgttaattcatg 14966188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 346 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 17696664 - 17696397
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataacttt-ttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgata 444  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||| | || | |||||||||||||||||||| |      
T  17696664 attaactaagtggctttgatcaatctcttgactcaaaaccctttactaagttataactctattaatctctaaatcagattgaataaccgcggaagcaaag 17696565  T
Q  445 acagaacatttattcat--gtcata---------------tctctaggttccta-tgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggt 526  Q
     |||||| || ||| ||  ||||||               |||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||     
T  17696564 tcagaacgttaatttatatgtcataaccctcaatttcctatctctaggttcctagtgttgagttaaacagaattacaatttcaggattaagagccagggc 17696465  T
Q  527 taatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17696464 tagtagtcattcaatttctaagatcaatttatgtgattgcaagaagttagggttaatagtcatacaaa 17696397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 346 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 14969784 - 14969679
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14969784 attaactaagtagatttgatcaatctcttgactcaaaatcctttcataggttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 14969685  T
Q  446 cagaac 451  Q
     |||||    
T  14969684 aagaac 14969679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14790860 - 14790745
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||  | |||    
T  14790860 agatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatcaaaaa 14790761  T
Q  163 ggatgtagtaaatttat 179  Q
    ||||||| |||||||||    
T  14790760 ggatgta-taaatttat 14790745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 346 - 463
Target Start/End: Original strand, 3826863 - 3826980
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  3826863 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataatcttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcaaaagggataa 3826962  T
Q  446 cagaacatttattcatgt 463  Q
     || || || ||||||||    
T  3826963 aagtacgttaattcatgt 3826980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 346 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 31123506 - 31123418
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgc 434  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31123506 attaactaattagttttgatcaatctcttaactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgc 31123418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 440
Target Start/End: Original strand, 15578960 - 15579054
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagc 440  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  15578960 attaactaagtggttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataatcttttaatctcttaaaccgattgaataaccacggaagc 15579054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 346 - 440
Target Start/End: Original strand, 33679234 - 33679328
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagc 440  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  33679234 attaactaagtggttttgatcaatctcttaactcaaaaccctttcgtaagttataacattttaatctcttaaaccgattgaataactgcggaagc 33679328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14795888 - 14795773
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||  | |||    
T  14795888 agatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtacctacgaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatcaaaaa 14795789  T
Q  163 ggatgtagtaaatttat 179  Q
    ||||||| |||||||||    
T  14795788 ggatgta-taaatttat 14795773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 358 - 519
Target Start/End: Original strand, 11296195 - 11296373
Alignment:
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttat 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||      |||||||| ||    
T  11296195 gttttgatcaatctcttgattcaaaaccctttctcaaattataacattttaatctctaaaaccgattgaataaccgcggaagcatggtgagaacattaat 11296294  T
Q  458 tcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaag 519  Q
    ||||  |||||               ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11296295 tcataagtcataatcttcaatttcccatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcatgattaaaag 11296373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 466 - 558
Target Start/End: Original strand, 15579097 - 15579189
Alignment:
Q  466 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttat 558  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15579097 tatctctaggttcatatgttgaattaaatagatttactatttcatgattaaaatatagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttat 15579189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 358 - 440
Target Start/End: Original strand, 7560232 - 7560314
Alignment:
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagc 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  7560232 gttttgatcaatctcttgactcaaaactctttcctaagctataaccttttaatctcttaaaccgattgaataactgcggaagc 7560314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 346 - 418
Target Start/End: Original strand, 7560144 - 7560216
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaa 418  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  7560144 attaactaattagttttgatcaatctcttgactcaaaactctttcctaagttataaccttttaatctcttaaa 7560216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 537 - 599
Target Start/End: Original strand, 3827069 - 3827131
Alignment:
Q  537 tcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 599  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3827069 tcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatacaaagcaat 3827131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 354 - 431
Target Start/End: Original strand, 20189483 - 20189560
Alignment:
Q  354 aatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataac 431  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20189483 aatagctttgatcaatcacttgactcaaatcactttcctaggttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataac 20189560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 354 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22146508 - 22146431
Alignment:
Q  354 aatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataac 431  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22146508 aatagctttgatcaatcacttgactcaaatcactttcctaggttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataac 22146431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 346 - 398
Target Start/End: Original strand, 13095764 - 13095816
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagtta 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  13095764 attaactaaatagttttgatcaatctcttaactcaaaaccctttcctaagtta 13095816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 360 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16731433 - 16731362
Alignment:
Q  360 tttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataac 431  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16731433 tttgatcaatctcttgactcaaagtcctttcctaggttataaccttttaatctcttaagccgattgaataac 16731362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 491 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 31123341 - 31123238
Alignment:
Q  491 aaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatg 590  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| | | ||| ||||||||||||| |  | |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  31123341 aaacacaattactatttcaggattaaaagctagggaaagtagtcaattaatacctaagatcaattaacatgattgaaagaagctagggttaatagtcatg 31123242  T
Q  591 caaa 594  Q
    ||||    
T  31123241 caaa 31123238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 2331631 - 2331588
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaa 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2331631 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaagtagtaataaa 2331588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 176
Target Start/End: Original strand, 19664674 - 19664782
Alignment:
Q  67 atttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaaggat 166  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| || |||  || || ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||| |||  | |||||||    
T  19664674 atttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtaataaataaatttgtatccacgaggaccgttgtttatttctactcaacaatttctttatcaaaaaggat 19664772  T
Q  167 gtagtaaatt 176  Q
    ||| ||||||    
T  19664773 gtattaaatt 19664782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22221959 - 22221903
Alignment:
Q  67 atttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggac 124  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22221959 atttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaa-ttcgtttccacgaggac 22221903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22247794 - 22247738
Alignment:
Q  67 atttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggac 124  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22247794 atttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaa-ttcgtttccacgaggac 22247738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 1838712 - 1838602
Alignment:
Q  67 atttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaaggat 166  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||| || |||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||  | |||||||    
T  1838712 atttggcaagtgaaccaaaat-tatcgaagtaataaataaattcgtatccacaaggaccgttgttaatttctactcggcaatttctttatcaaaaaggat 1838614  T
Q  167 gtagtaaatttat 179  Q
    ||| |||||||||    
T  1838613 gta-taaatttat 1838602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 14969673 - 14969625
Alignment:
Q  414 ttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttattcatg 462  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  14969673 ttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataaaagaacgttaattcatg 14969625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15535252 - 15535184
Alignment:
Q  108 ttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaaggatgtagtaaatt 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||| ||| || |||||||||| ||||||    
T  15535252 ttcgtatccacgaggaccgttgttaacttctactcagccatttctttataaaaaaggatgtattaaatt 15535184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 195
Target Start/End: Original strand, 15578763 - 15578807
Alignment:
Q  151 cgttaaaataaaggatgtagtaaatttatgggttgctctaggcag 195  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  15578763 cgttaaaataaaggatgtattaaatttatgggttgccctaggcag 15578807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Original strand, 23842565 - 23842621
Alignment:
Q  69 ttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaata-aagttcgtatccacgaggac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||    
T  23842565 ttggcaagtgtaccaaaaactatcgaaataataaaataagttcgtatccacgaggac 23842621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 22920878 - 22920835
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22920878 agatatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaa 22920835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 26391011 - 26390970
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccct 387  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26391011 attaacaaaatagttttgatcaatctcttgattcaaaaccct 26390970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 346 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 6856656 - 6856612
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttc 390  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6856656 attaacttaataattttgatcaatctcttgattcaaaaccctttc 6856612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 179
Target Start/End: Original strand, 13017193 - 13017307
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    |||||||||||||||| ||||||  | |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||  |  |||| ||||||||||||| ||| |||  | |||    
T  13017193 agatatttggcaagtgaaccaaattcgatcgaagtaataa-aaagttcgtttccacgaggactatatttaacttctacttagcaatttcattattaaaaa 13017291  T
Q  163 ggatgtagtaaatttat 179  Q
    ||||||| |||||||||    
T  13017292 ggatgta-taaatttat 13017307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 23848129 - 23848073
Alignment:
Q  69 ttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaata-aagttcgtatccacgaggac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||| | ||||||||||||||||||||    
T  23848129 ttggcaagtgtaccaaaaactatcgacataataaaataagttcgtatccacgaggac 23848073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27649338 - 27649259
Alignment:
Q  67 atttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaa 147  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||| || |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27649338 atttggcaagtgaactaaaa-ctatcgaagtaataaataagatcgaatccacgaggaccgttgttaattcctactcagcaa 27649259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 17232204 - 17232161
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaa 106  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17232204 agatatttgacaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaa 17232161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 772 - 827
Target Start/End: Original strand, 20527901 - 20527956
Alignment:
Q  772 gagagtttcgtagttgccgatgttgctcctgaatttctttctgattggtgttgttg 827  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||   |||||||||||||    
T  20527901 gagagtttcgtagttgccgacgttgctcctgaatctattttcaattggtgttgttg 20527956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 147
Target Start/End: Original strand, 28974140 - 28974226
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataa--agttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaa 147  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||  | |  |||||||||||||  ||||||||| || |||||||||    
T  28974140 agatatttggcaagtgtatccaaaactatcgaagtaataataataaatctgtatccacgaggattgttgttaatgtcaacttagcaa 28974226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 499 - 533
Target Start/End: Original strand, 3827018 - 3827052
Alignment:
Q  499 ttactatttcatgattaaaagctagggttaatagt 533  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3827018 ttactatttcaggattaaaagctagggttaatagt 3827052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17696936 - 17696849
Alignment:
Q  67 atttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctact-tagcaagttcgtta 155  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||  |||| ||||| ||||| | |||||||||| | | ||||||||||||||    
T  17696936 atttggcaagtgtaccaccaactatcgaagtagtaataaatatcgt-tccacaaggactg-tgttaatttcaattctagcaagttcgtta 17696849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 32427540 - 32427429
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| || |||  || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||  | |||    
T  32427540 agatatttggtaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtaataaataaatttgtatctacgaggaccgttgttaa-ttctactcagcaatttctttatcaaaaa 32427443  T
Q  163 ggatgtagtaaatt 176  Q
     |||||| ||||||    
T  32427442 agatgtattaaatt 32427429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 154; Significance: 3e-81; HSPs: 37)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 84 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 13332428 - 13331902
Alignment:
Q  84 aaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaaggatgtagtaaa-tttat-gg 181  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  13332428 aaaactatcgaagtagtaataaagtttgtatccatgaggaccgttgttaatttatacttagcaagttcgttaaaataaaggatgtagtaaattttatggg 13332329  T
Q  182 gttgctctaggcagctgaatttg-gtgcataaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatttataataaaacagataatcaagccttt-gaat 279  Q
    ||||| |||||||| || |||||  |  |||||| |||||    | | || |||| |||||||  | ||  | ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  13332328 gttgccctaggcagttggatttgattttataaaacgtaaa--caaagtaaataaaatggtttgataattgaattaaaacatatgatcaagcctttcgaat 13332231  T
Q  280 cctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatct--taatgttcacctaactctatggcatattaactaaatagttttgatcaatctcttgac 377  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||  |  |||||| |||   ||  || ||||| || || | || ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  13332230 cctctattgctcaccgtgagtaattttgttctcttctctctcaaaaaattaacctagctttacgacaaattaactaagtggttttgatcaatctcttgac 13332131  T
Q  378 tcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttattcat--gtcat--------- 466  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      ||||| || ||||||  |||||             
T  13332130 tcaaaaccctttcctaagttataacattttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcatggtgagaacgttaattcataagtcataatcctcaa 13332031  T
Q  467 ------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgt 560  Q
          ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13332030 tttcctatctctaggttcctatgatgaattaaacagaattactatttcagaattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgt 13331931  T
Q  561 aattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
     |||| |||||| |||||||| |||||||    
T  13331930 gattgaaagaagctagggttagtagtcat 13331902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 346 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 14188075 - 14187805
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14188075 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagccataa 14187976  T
Q  446 cagaacatttattcatgt-----------------catatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     || || || ||||||||                 | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  14187975 aagtacgttaattcatgtgtcatgatcctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactacttcaggattaaaagctagggtta 14187876  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 599  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  14187875 atagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagttagggtttatagtcatacaaagcaat 14187805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 346 - 599
Target Start/End: Original strand, 27863599 - 27863869
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  27863599 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataacattttaatctcttaaaccgattgaataatcgtggaagagataa 27863698  T
Q  446 cagaacatttattcatgt-----------------catatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     ||||| || ||||| ||                 |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27863699 aagaacgttaattcacgtgtcctaatcctcaatttcatatccctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcaggattaaaagttagggtta 27863798  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 599  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  27863799 atagtcattcaattcctaagatcaattcatgtaattgcaagaagctagggttaatagtcatacaaaacaat 27863869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 346 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 20262629 - 20262369
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||      
T  20262629 attaactaattagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataaccttttaatctcttaatccgattgaataaccgcggaagcgatgt 20262530  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    |||||| || ||||||  |||||               |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20262529 cagaacgttaattcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttctggattaaaagctagggtta 20262430  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20262429 atagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaatttcaagaagttagggttaatagtcat 20262369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 346 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 21049259 - 21048999
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||      
T  21049259 attaactaattagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataaccttttaatctcttaatccgattgaataaccgcggaagcgatgt 21049160  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    |||||| || ||||||  |||||               |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21049159 cagaacgttaattcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttctggattaaaagctagggtta 21049060  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21049059 atagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaatttcaagaagttagggttaatagtcat 21048999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 346 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 5964330 - 5964060
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5964330 attaactaagtagatttgatcaatctcttgactcaaaaccatttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 5964231  T
Q  446 cagaacatttattcatg-----------tca------tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     ||||| || |||||||           |||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  5964230 aagaacgttaattcatgagtcatgatcctcaattttctatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagtgtta 5964131  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 599  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5964130 atagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcacgaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 5964060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 63 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 5828387 - 5827717
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||| ||| | ||||||||||   |||   ||||||||||||    
T  5828387 agatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtagtaaagttcgtatccacatggactgtt-tcaatttctactcgtcaaaagcgttaaaataaa 5828289  T
Q  163 ggatgtagtaaatttatgggttgctctaggcagctgaatttggt-gca-taaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatttataataaaaca 260  Q
    ||||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||| | | | || |||| |||||||  | ||  | |||||||    
T  5828288 ggatgcattaaatttatgggttgccctaggcagttggatttggttgcaataaaaagtaaataaca-gaaaataaaatggtttgataattggattaaaaca 5828190  T
Q  261 gataatcaagccttt-gaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatg---ttcacctaactctatggcatattaactaaat 356  Q
     || ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||| ||||||||   |||||| ||| || |   || ||||| || ||      ||||||||| |    
T  5828189 tatcatcaagcctttcgaatcctctattgctcagtgtgagtaatttgcctctcttctctctcaaagaaattaacctagctttacaaaggattaactaagt 5828090  T
Q  357 agttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacattta 456  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| | ||  |||||| || |    
T  5828089 ggttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgtagaaactatgtcagaacgttaa 5827990  T
Q  457 ttcat--gtcatatctct---------------aggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattca 539  Q
    |||||  |||||| ||||               ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  5827989 ttcataagtcataactctcaatttcctatctcgaggttcctatgttgaattaaacagaattactctttcagaattaaaagctagggttagtagtcattca 5827890  T
Q  540 attcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgc--------------aaagcaatgaacacaaataatcttgaataaagac 625  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||              |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5827889 attcctaagattaatttatgtgattgaaagaagctagggttaatagtcaagcaaacaatcataagaaaagcaatgaacacaaataattctgaataaagac 5827790  T
Q  626 taggattccattgaattaaaaaagagagttc-aaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 700  Q
    |||| || | ||||  |  |||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  5827789 taggttttctttga--tgtaaaagagaattcttaacaaactacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatg 5827717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 346 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 22654336 - 22654066
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22654336 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaaattataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 22654237  T
Q  446 cagaacatttattcatgt-----------------catatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     || || || ||||||||                 | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  22654236 aagtacgttaattcatgtgtcaaaatcctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacaagattactatttcaggattaaaagttggggtta 22654137  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 599  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  22654136 atagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 22654066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 346 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 30645547 - 30645282
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  30645547 attaactaattagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttctaaccttttaatcttttaaaccgattgaataaccgtggaagcgatgt 30645448  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcata---------------tctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    |||||| || ||||||  ||||||               ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  30645447 cagaacgttaattcatatgtcataatcctcaatttcctatctctaggttcttatgttgaattaaacagaattactatttcaaaattaaaagttagggtta 30645348  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30645347 gtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgtaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 30645282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 63 - 440
Target Start/End: Original strand, 39659716 - 39660096
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39659716 agatatttggcaagtgtaccgaaa-ctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccattgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 39659814  T
Q  163 ggatgtagtaaa-tttat-gggttgctctaggcagctgaatttgg-tgcataaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatttataataaaac 259  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| || |||||| |  |||||| |||||    | | || |||| |||||||  | ||  | ||||||    
T  39659815 ggatgtagtaaattttatggggttgccctaggcagttggatttggttttataaaacgtaaa--caaagtaaataaaatggtttgataattggattaaaac 39659912  T
Q  260 agataatcaagccttt-gaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatg---ttcacctaactctatggcatattaactaaa 355  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||    |||||| ||| || |   || ||||| || || | || ||| ||| |     
T  39659913 agatgatctagcctttcgaatcctctattgctcaccgtgagtaatttggctctcttctctctcaaagaaattaacctagctttacgacaaatt-acttag 39660011  T
Q  356 tagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagc 440  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  39660012 tggttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcagaagc 39660096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 358 - 589
Target Start/End: Original strand, 17013089 - 17013337
Alignment:
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttat 457  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  17013089 gttttgatcaatctcttgaatcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataactgcggaagcgataaaagaacattaat 17013188  T
Q  458 tcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaa 540  Q
    ||||  |||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17013189 tcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaa 17013288  T
Q  541 ttcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||| ||| ||||||| || ||| | ||| ||| ||||||||||||||||    
T  17013289 ttcataatatcaattcatataaattcaataagctagggttaatagtcat 17013337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 358 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 17544112 - 17543864
Alignment:
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttat 457  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  17544112 gttttgatcaatatcttgaatcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataactgcggaagcgataaaagaacattaat 17544013  T
Q  458 tcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaa 540  Q
    ||||  |||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17544012 tcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaa 17543913  T
Q  541 ttcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||| ||| ||||||| || ||| | ||| ||| ||||||||||||||||    
T  17543912 ttcataatatcaattcatataaattcaataagctagggttaatagtcat 17543864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 346 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 31981422 - 31981162
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||      
T  31981422 attaactaattagttttgatcaatctcttgattcaaaaccctttcataagtaatgatcttttaatctcttaaaccgattgaataaccacgaaagcgatgt 31981323  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtca---------------tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    |||||| || ||||||  ||||               |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31981322 cagaacgttaattcatatgtcacaaccctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggtta 31981223  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
     |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||    
T  31981222 gtagtcattcaattcctaatatcaatttatgtgattgtaagaagctatggttaatagtcat 31981162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9467425 - 9467283
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9467425 agatatttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttcttcttagcaagttcgttaaaataaa 9467326  T
Q  163 ggatgtagtaaatttatgggttgctctaggcagctgaatttgg 205  Q
    |||||||||||||||||   |||| |||||||| || ||||||    
T  9467325 ggatgtagtaaatttatcaattgccctaggcagttggatttgg 9467283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 453947 - 453803
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  453947 agatatttgacaagtgtaccaaaaactatggaagtactaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 453848  T
Q  163 ggatgtagtaaa-tttatgggttgctctaggcagctgaatttggt 206  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | |||||| || |||||||    
T  453847 ggatttagtaaattttatgggttgccccaggcagttggatttggt 453803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 360 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 24435091 - 24434846
Alignment:
Q  360 tttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttattc 459  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||    
T  24435091 tttggtcaatctcttgaatcaaaaccttttcctaggttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataactgcggaagcgataaaagaacgttaattc 24434992  T
Q  460 --atgtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaatt 542  Q
      |||||||               |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24434991 ctatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaaccaaacagaattattaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaatt 24434892  T
Q  543 cctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24434891 cctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaatagtcat 24434846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 466 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 9467064 - 9466936
Alignment:
Q  466 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9467064 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 9466965  T
Q  566 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9466964 aaagaagttagggttagtagtcatacaaa 9466936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 358 - 589
Target Start/End: Original strand, 24903541 - 24903789
Alignment:
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttat 457  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   || |  || ||    
T  24903541 gttttgatcaatctcttgaatcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataatcgcggaagcgatgttaggatgttaat 24903640  T
Q  458 tcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaa 540  Q
    ||||  |||||               |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24903641 tcatatgtcatgattctcaatttcctatctctagcttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaa 24903740  T
Q  541 ttcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||||| ||||||| || ||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  24903741 ttcctaatatcaattcatataaattcaagaagctagggttaatagtcat 24903789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 360 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 24445137 - 24444892
Alignment:
Q  360 tttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttattc 459  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||    
T  24445137 tttggtcaatctcttgaatcaaaaccttttcctaggttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataactgcggaagcgataaaagaacgttaattc 24445038  T
Q  460 --atgtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaatt 542  Q
      |||||||               |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24445037 ctatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaaccaaacagaattattaattcaggattaaaagctaggattaatagtcattcaatt 24444938  T
Q  543 cctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24444937 cctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaatagtcat 24444892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 472 - 594
Target Start/End: Original strand, 39660145 - 39660267
Alignment:
Q  472 taggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaa 571  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  39660145 taggttcctatgttgaattaaacaaaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaa 39660244  T
Q  572 gttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
    |||||||||| ||||||| ||||    
T  39660245 gttagggttagtagtcatacaaa 39660267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 466 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 31984926 - 31984799
Alignment:
Q  466 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31984926 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattattatttcaggattaaaagctatgattagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 31984827  T
Q  566 caagaagttagggttaatagtcatgcaa 593  Q
     |||||| || |||||||||||||||||    
T  31984826 taagaagctatggttaatagtcatgcaa 31984799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 346 - 461
Target Start/End: Original strand, 18696020 - 18696135
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||      
T  18696020 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcgaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataactgcggaagagatgt 18696119  T
Q  446 cagaacatttattcat 461  Q
    ||||||||| ||||||    
T  18696120 cagaacattaattcat 18696135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 346 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 587387 - 587302
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataac 431  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  587387 attaacttattagctttgatcaatctcttgactcaaagccctttcctaggttataaccttttaatctcttaaatcgattgaataac 587302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 346 - 431
Target Start/End: Original strand, 626535 - 626620
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataac 431  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  626535 attaacttattagctttgatcaatctcttgactcaaagccctttcctaggttataaccttttaatctcttaaatcgattgaataac 626620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 31986349 - 31986294
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataa 401  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  31986349 attaactaattagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagtaataa 31986294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 176
Target Start/End: Original strand, 12575306 - 12575416
Alignment:
Q  65 atatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaagg 164  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||| || |||  || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||| |||  | |||||    
T  12575306 atatttggcaagtgtaccaaattcaatcgaagtaataaataa-ttcgtatccacgaggactgttgttaacttctactcaacaagttcattattaaaaagg 12575404  T
Q  165 atgtagtaaatt 176  Q
    ||||| ||||||    
T  12575405 atgtattaaatt 12575416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 606 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 14627229 - 14627143
Alignment:
Q  606 aaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttcaaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcat 694  Q
    |||||||  ||||||| ||||||| ||||| |||  ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  14627229 aaataattatgaataatgactaggtttccaatga--tatcaaagggagttcaaacaaattacatggttcacagattacaatagattcat 14627143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 530 - 589
Target Start/End: Original strand, 18696171 - 18696231
Alignment:
Q  530 tagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaa-gaagttagggttaatagtcat 589  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  18696171 tagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaatttcaaggaagttagggttaatagtcat 18696231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 106
Target Start/End: Original strand, 24903254 - 24903297
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24903254 agatatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaa 24903297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 453662 - 453624
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaac 384  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  453662 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaac 453624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 124
Target Start/End: Original strand, 5980067 - 5980124
Alignment:
Q  68 tttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaata-aagttcgtatccacgaggac 124  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||    
T  5980067 tttgacaagtgtaccaaaaactatcgaagtaataacataagttcgtatccacgaggac 5980124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 770 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 44007816 - 44007779
Alignment:
Q  770 ccgagagtttcgtagttgccgatgttgctcctgaattt 807  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44007816 ccgagagtttcgtagttgccaatgttgctcctgaattt 44007779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 102
Target Start/End: Original strand, 17012801 - 17012840
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17012801 agatatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaa 17012840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 17544400 - 17544361
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17544400 agatatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaa 17544361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 22654612 - 22654570
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataa 105  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  22654612 agatatttggcaagtgtatcaataactatcgaagtagtaataa 22654570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 195
Target Start/End: Original strand, 12820690 - 12820782
Alignment:
Q  102 ataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaaggatgtagtaaatttatgggttgctctaggcag 195  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| | ||||||||||  ||||    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||    
T  12820690 ataaagttcgtatccacatggactgtt-tcaatttctactcggcaaagatgttaaaataaaggatgtgttaagtttatgggttgccctaggcag 12820782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 17931329 - 17931296
Alignment:
Q  69 ttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17931329 ttggcaagtgtaccaaaaactatcgaagtagtaa 17931296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 144; Significance: 3e-75; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 65 - 594
Target Start/End: Original strand, 38315807 - 38316357
Alignment:
Q  65 atatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaagg 164  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38315807 atatttggtaagtgtatcaaaa-ctatcgaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaa-ttctacttagcaagttcgttaaaattaagg 38315904  T
Q  165 atgtagtaaattt--atgggttgctctaggcagctgaatttgg-tgcataaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatttataataaaacag 261  Q
    |||||||||||||    ||||||  |||||||| || |||||| |||||||||  | |||   | | || |||| |||||||  | ||  | ||||||||    
T  38315905 atgtagtaaattttacggggttgtcctaggcagttggatttggttgcataaaa-cttaatacaaagtaaataaaatggtttgataattggattaaaacag 38316003  T
Q  262 ataatcaagccttt-gaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatg---ttcacctaactctatggcatattaactaaata 357  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||   |||||| ||| || |   || || || || || | || ||||||||| |     
T  38316004 atgatcaagcctttcgaatcctctattgctcacagtgagtaatttgcctctcttctctctcaaagaaattaacttagctttacgacaaattaactaagtg 38316103  T
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttat 457  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||      ||||| || ||    
T  38316104 gtattgatcaatctcttcactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatatcttaaaccgattgaataactgcggaagcatggtgagaacgttaat 38316203  T
Q  458 tcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaa 540  Q
    ||||  |||||               ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  38316204 tcataagtcataatcctcaatttcctatctctaagttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaa 38316303  T
Q  541 ttcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||| ||||    
T  38316304 ttcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagctacggttagtagtcatacaaa 38316357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 346 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 4577898 - 4577661
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  4577898 attaactaattagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttataatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgatgt 4577799  T
Q  446 cagaacatttattcatgtcatatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcct 545  Q
    |||||          | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  4577798 cagaa----------tttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagg-ttagtagtcattcaattcct 4577710  T
Q  546 aagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  4577709 aagatcaatttatgtgattgtaagaagatagggttaatagtcatgcaaa 4577661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 346 - 593
Target Start/End: Original strand, 1503478 - 1503742
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  1503478 attaactaattagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttaaaaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgatgt 1503577  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcata---------------tctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    |||||  || ||||||  ||||||               |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1503578 cagaatgttaattcatatgtcataaccctcaattttctatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggtta 1503677  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaa 593  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1503678 gtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgcaagaagctagggttaatagtcatgcaa 1503742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 346 - 593
Target Start/End: Original strand, 1506682 - 1506946
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  1506682 attaactaattagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttaaaacattttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgatgt 1506781  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcata---------------tctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    |||||  || ||||||  ||||||               |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1506782 cagaatgttaattcatatgtcataaccctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggtta 1506881  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaa 593  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1506882 gtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgcaagaagctagggttaatagtcatgcaa 1506946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 346 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 11059873 - 11059603
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11059873 attaactaagtagatttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaagcgattgaataaccgcggaagcgataa 11059774  T
Q  446 cagaacatttattcatg-----------------tcatatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     ||||| || |||||||                 || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  11059773 aagaacgttaattcatgagtcatgatcctcaatttcctatctctaggttcttatgttgaatcaaacaggattactatttcatgattaaaagttagtgtta 11059674  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 599  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  11059673 atagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcacgaagctagggttaatagtcatacaaagcaat 11059603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 345 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 30719849 - 30719583
Alignment:
Q  345 tattaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgata 444  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30719849 tattaacttattagctttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataacattttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgatg 30719750  T
Q  445 acagaacatttattcat--gtcata---------------tctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtt 527  Q
     |||||| || ||||||  ||||||               |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||    
T  30719749 tcagaacgttaattcatatgtcataaccctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactattttaggattaaaagttagagtt 30719650  T
Q  528 aatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30719649 agtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 30719583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 346 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 13518377 - 13518108
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13518377 attaactaagtagatttgatcaatctcttgactcaaacccctttcctaagttataaccttttaatctcttaagccgattgaata-ccgcggaagcgataa 13518279  T
Q  446 cagaacatttattcatg-----------------tcatatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     ||||| || |||||||                 || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518278 aagaacgttaattcatgagtcatgatcctcaatttcctatctctaggttcttatgttgaatcaaacaggattactatttcatgattaaaagctagggtta 13518179  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaat 599  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  13518178 atagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcacgaagctagggttaatagtcatacaaatcaat 13518108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 346 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 29435824 - 29435564
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  29435824 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataacattttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgatgt 29435725  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    |||||  || ||||||  |||||               |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29435724 cagaatgttaattcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaaacaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggtta 29435625  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
     |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  29435624 gtagtcaatcaattcctaatatcaattcatgtaatttcaagaagctagggttaatagtcat 29435564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 346 - 589
Target Start/End: Original strand, 15704015 - 15704275
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||      
T  15704015 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcgaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataactgcggaagagatgt 15704114  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    ||||||||| ||||||  |||||               ||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15704115 cagaacattaattcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcccatattgaatcaaacactattactatttcaagattaaaagctagggtta 15704214  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  15704215 atagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaatttcaggaagttagggttaatagtcat 15704275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 346 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 18012016 - 18011755
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||    
T  18012016 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcaaa-ccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgat-------ccgcggaagcgataa 18011925  T
Q  446 cagaacatttattcatgt-----------ca------tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     ||||| || ||||||||           ||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18011924 aagaacgttaattcatgtgtcataatcctcaattttctatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagttagggtta 18011825  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaagcaa 598  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  18011824 atagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattgcaagaagctagggttaatagtcatacaaagcaa 18011755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 358 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 22592575 - 22592328
Alignment:
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttat 457  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||    
T  22592575 gttttgatcaatctcttgagtcaaaaccctttcctaagtcataaccttttaatctcttaaaccgattgaataactgcggaagcgataaaagaacgttaat 22592476  T
Q  458 tcat--gtcat--------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaat 541  Q
    ||||  |||||              ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22592475 tcatatgtcatgattctcaattcctatctctaagttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcatgattaaaagctagggttaatagtcattcaat 22592376  T
Q  542 tcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||||  |||||| || ||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  22592375 tcctaatctcaattcatataaattcaagaagctagggttaatagtcat 22592328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 355 - 594
Target Start/End: Original strand, 38326319 - 38326581
Alignment:
Q  355 atagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaacc------gattgaataaccgcggaagcgataacag 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||      |||||||||||||||||||||||  |||    
T  38326319 atagttttgatcaatctcttgactcaaaactctttcctaagttataaccttttaatctcttaaacctaaaccgattgaataaccgcggaagcgatgtcag 38326418  T
Q  449 aacatttattcat--gtcata---------------tctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaata 531  Q
    ||| |  ||||||  ||||||               |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  38326419 aacgtgaattcatatgtcataaccctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattattatttcaggattaaaagctagggttggta 38326518  T
Q  532 gtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38326519 gtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgcaagaagctagggttaatagtcatgcaaa 38326581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 358 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 18938955 - 18938709
Alignment:
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttat 457  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| || ||    
T  18938955 gttttgatcaatctcttgaatcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataactgcggaagcgataa-ataacgttaat 18938857  T
Q  458 tcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaa 540  Q
    ||||  |||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  18938856 tcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaagagtcattcaa 18938757  T
Q  541 ttcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18938756 ttcctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaatagtcat 18938709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 63 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 29436109 - 29435965
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29436109 agataattgacaagtgtatcaaaaactatcgaagtaataataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 29436010  T
Q  163 ggatgtagtaaa-tttatgggttgctctaggcagctgaatttggt 206  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  29436009 ggatgtagtaaattttatgggttgcactaggcagttggatttggt 29435965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 346 - 594
Target Start/End: Original strand, 40677817 - 40678082
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||         
T  40677817 attaactaagtggttttgatcaatctcttgacacaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataatcgcggaagcatggt 40677916  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
     ||||| || ||||||  |||||               ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40677917 gagaacgttaattcataagtcataatcctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggtta 40678016  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     |||| ||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  40678017 gtagtcattcaattcctagcatcaatttatgtgattgaaagaagctagggttagtagtcatacaaa 40678082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 77 - 208
Target Start/End: Original strand, 13572059 - 13572192
Alignment:
Q  77 tgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaattt--ctacttagcaagttcgttaaaataaaggatgtagtaaa 174  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  13572059 tgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaagttcgtatctacgaggaccgttgttaatttttctacttagcaaattcgttaaaataaaggatgtagtgaa 13572158  T
Q  175 tttatgggttgctctaggcagctgaatttggtgc 208  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  13572159 tttatgggttgcactaggcagttggattaggtgc 13572192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 346 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 11056415 - 11056299
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11056415 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaatcgattgaataaccgcggaagcgataa 11056316  T
Q  446 cagaacatttattcatg 462  Q
     ||||| || |||||||    
T  11056315 aagaacgttaattcatg 11056299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 346 - 461
Target Start/End: Original strand, 15719319 - 15719434
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||      
T  15719319 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcgaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttcaaccgattgaataactgcggaagcgatgt 15719418  T
Q  446 cagaacatttattcat 461  Q
    |||||| || ||||||    
T  15719419 cagaacgttaattcat 15719434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 498 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 38326274 - 38326178
Alignment:
Q  498 attactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38326274 attattatttcaggattaaaagctagggttggtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgcaagaagctagggttaatagtcatgcaaa 38326178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 227 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 40139314 - 40139140
Alignment:
Q  227 gcaattaaattggtttggaatttataataaaacagataatcaagcctttgaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatgt 326  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| |  ||||||  || |||||    
T  40139314 gcaattaagttggtttgaaaattatattaaaacaaatgatcaagccttcgaatcctctattgctcactgtgaataatttgttcctcttcttgctcaatgt 40139215  T
Q  327 tcacctaactctatggcatattaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataa 401  Q
    ||| |||  | || | || ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||    
T  40139214 tcatctagttttacgacagattaacacaatagttttgatcaatctcttgagtcaaaactcttttctaagttataa 40139140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 176
Target Start/End: Original strand, 23673353 - 23673461
Alignment:
Q  67 atttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaaggat 166  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||  | |||||||    
T  23673353 atttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaatttctactcaacaatttctttatcaaaaaggat 23673451  T
Q  167 gtagtaaatt 176  Q
    ||| ||||||    
T  23673452 gtattaaatt 23673461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 36327167 - 36327090
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctact 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36327167 agatatttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaacttctact 36327090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 176
Target Start/End: Original strand, 32575689 - 32575801
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||| ||| || |||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | | ||||||| ||||||    
T  32575689 agatatttggcaagtgaaccaaca-ctattgaagtaataaataaattcgtatccacgaggaccgttgttaacttctactcaacgatttcgttataataaa 32575787  T
Q  163 ggatgtagtaaatt 176  Q
     |||||| ||||||    
T  32575788 tgatgtattaaatt 32575801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16295135 - 16295048
Alignment:
Q  67 atttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgtta 155  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| || |||  ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16295135 atttggcaagtgaaccaaaa-ctatcgaagtaataaataagatcaaatccacgaggaccgttgttaatttctactcagcaatttcgtta 16295048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 156
Target Start/End: Original strand, 24384929 - 24385023
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaata--aagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaa 156  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |  || ||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24384929 agatatttggcaagtgtaccaaaa-ctatcgaagtaataaaattaaattcgtattcacgatgactgttattaatttctacttagcaatttctttaa 24385023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 530 - 589
Target Start/End: Original strand, 15719470 - 15719529
Alignment:
Q  530 tagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15719470 tagtcattcaactcctaatatcaattcatgtgatttcaagaagttagggttaatagtcat 15719529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 195
Target Start/End: Original strand, 32074160 - 32074293
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataa--agttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaata 160  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| || ||||||  | || |||||||||| |   ||||||||||||||||||| || ||| ||||  ||    
T  32074160 agatatttgacaagtataccaaaat-tatcgaagtaataataataaatttgtatccacgatggttgttgttaatttctacttagaaatttcattaatgta 32074258  T
Q  161 aaggatgtagtaaatttatgggttgctctaggcag 195  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| ||||||||    
T  32074259 aaggatgtattaaaattgtgggttgccctaggcag 32074293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 603 - 700
Target Start/End: Original strand, 40678105 - 40678200
Alignment:
Q  603 cacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttca-aacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 700  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  | |||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  40678105 cacaaataattctgaataaagactaggttttcattgatgtcaaa--gagagttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatg 40678200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 18939243 - 18939200
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18939243 agataattggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaa 18939200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 22592862 - 22592819
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaa 106  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22592862 agatatttggtaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaa 22592819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 346 - 380
Target Start/End: Original strand, 25925175 - 25925209
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactca 380  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25925175 attaacaaaatagttttgatcaatctcttgactca 25925209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 387
Target Start/End: Original strand, 40778988 - 40779029
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccct 387  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  40778988 attaacaaaatagatctgatcaatctcttgactcaaaaccct 40779029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 130; Significance: 6e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 361 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 7296 - 7046
Alignment:
Q  361 ttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttattca 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||    
T  7296 ttgatcaatctcttgactcaaaaccttttcctaagttataacattttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgatgtcagaacgttaattca 7197  T
Q  461 t--gtcata---------------tctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattc 543  Q
    |  ||||||               |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||     
T  7196 tatgtcataaccctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattt 7097  T
Q  544 ctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7096 ctaagatcaatttatgtgattgcaagaagctagggttaatagtcatgcaaa 7046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 125; Significance: 6e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 65 - 439
Target Start/End: Original strand, 19515 - 19894
Alignment:
Q  65 atatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaagg 164  Q
    |||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19515 atatttggcaagtgtaccaaaa-ctgtcaaagtagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaagg 19613  T
Q  165 atgtagtaaa-tttat-gggttgctctaggcagctgaatttgg-tgc-ataaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatttataataaaaca 260  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| || |||||| ||| |||||| || ||| | | | || |||| |||||||  | ||  | |||||||    
T  19614 atgtagtaaattttatggggttgccctaggcagttggatttggttgcaataaaaagt-aataaca-gaaaataaaatggtttgataattggattaaaaca 19711  T
Q  261 gataatcaagccttt-gaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatg---ttcacctaactctatggcatattaactaaat 356  Q
    ||| |||||| |||| |||| |||||||| || |  ||| ||||||||   |||||| ||| || |   || ||||| || || |    ||||||||| |    
T  19712 gatgatcaagactttcgaatactctattgctcacaatgagtaatttgcctctcttctctctcaaagaaattaacctagctttacgaagaattaactaagt 19811  T
Q  357 agttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaag 439  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19812 ggttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaag 19894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 603 - 732
Target Start/End: Original strand, 20018 - 20144
Alignment:
Q  603 cacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttca-aacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatga 701  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  | |||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  20018 cacaaataattctgaataaagactaggttttcattgatgtcaaa--gagagttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatgg 20114  T
Q  702 ctctgattaatctaagagcttaactactcat 732  Q
    || | || |||||||||| ||| ||||||||    
T  20115 ct-taatcaatctaagagtttagctactcat 20144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214 (Bit Score: 125; Significance: 6e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0214
Description:

Target: scaffold0214; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 346 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 20129 - 19864
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||      
T  20129 attaacaaattagttttgatcaatctcttgactcaaaactctttcctaagttataaccttttaatcgcttaaaccgattgaataaccgcagaagccatgt 20030  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcatatc---------------tctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    |||||| || ||||||  |||||| |               |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20029 cagaacgttaattcatatgtcataaccctcaatttcctacctctaggttcctatgttgaattaaacataattactatttcatgattaaaagctagggtta 19930  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19929 gtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgtaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 19864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 346 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 13679 - 13415
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  13679 attaactaattagtttc-atcaatctcttgactcaaaactctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgatgt 13581  T
Q  446 cagaacatttattcatgtca-----------------tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    |||||| || |||||| ||                  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  13580 cagaacgttaattcatatctcataaccctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacataattcctatttgaggattaaaagctagggtta 13481  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13480 gtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgtaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 13415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 346 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 27695 - 27431
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  27695 attaactaattagtttc-atcaatctcttgactcaaaactctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataaccgcggaagcgatgt 27597  T
Q  446 cagaacatttattcatgtca-----------------tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    |||||| || |||||| ||                  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27596 cagaacgttaattcatatctcataaccctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacataatttttattttatgattaaaagctagggtta 27497  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27496 gtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgtaagaagttagggttaatagtcatgcaaa 27431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 120; Significance: 6e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 346 - 589
Target Start/End: Original strand, 52927 - 53187
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||      
T  52927 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcgaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataactgcggaagagatgt 53026  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    ||||||||| ||||||  |||||               ||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53027 cagaacattaattcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcccatattgaatcaaacactattactatttcaagattaaaagctagggtta 53126  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  53127 atagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaatttcaggaagttagggttaatagtcat 53187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 346 - 461
Target Start/End: Original strand, 67876 - 67991
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||      
T  67876 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcgaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttcaaccgattgaataactgcggaagcgatgt 67975  T
Q  446 cagaacatttattcat 461  Q
    |||||| || ||||||    
T  67976 cagaacgttaattcat 67991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 530 - 589
Target Start/End: Original strand, 68027 - 68086
Alignment:
Q  530 tagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  68027 tagtcattcaactcctaatatcaattcatgtgatttcaagaagttagggttaatagtcat 68086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 117; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 358 - 589
Target Start/End: Original strand, 26935 - 27184
Alignment:
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataac-tttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacattta 456  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |    
T  26935 gttttgatcaatctcttgagtcaaaaccctttcctaagtcataacctttttaatctcttaaaccgattgaataactgcggaagcgataaaagaacgttaa 27034  T
Q  457 ttcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattca 539  Q
    |||||  |||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27035 ttcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattca 27134  T
Q  540 attcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    |||||||| ||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  27135 attcctaatatcaattcatataaattcaagaagttagggttaatagtcat 27184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 106
Target Start/End: Original strand, 26647 - 26690
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  26647 agatatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaa 26690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 112; Significance: 4e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 346 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 29395 - 28981
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||      
T  29395 attaactaagtggttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatttcctaaaccgattgaataaccgtggaagctatgt 29296  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcata---------------tctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    |||||| || ||||||  ||||||               |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  29295 cagaacgttaattcataagtcataattctcaatttcctatctctaggttcccaggttgaattaaacagaattactatttcaggaataaaagctagggtta 29196  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgc--------------aaagcaatgaacacaaataatct 614  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||              ||| |  ||||||||||||||      
T  29195 gtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagctaggtttaatagtcatgcaatcaatcatatgaaaatctttgaacacaaataattc 29096  T
Q  615 tgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttc-aaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgactctgattaatc 713  Q
    ||||||||||||||| || ||||||  |   |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || | || ||||    
T  29095 tgaataaagactaggttttcattga--tgtcaaagagagttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatggct-taatcaatc 29000  T
Q  714 taagagcttaactactcat 732  Q
    |||||| ||| ||||||||    
T  28999 taagagtttagctactcat 28981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 346 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 53192 - 52778
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||| | |||||| ||      
T  53192 attaactaagtggttttgatcaatctcttgactcaaaaccccttcttaagttataaccttttcatctctcaaaccgattgaataactgtggaagctatgt 53093  T
Q  446 cagaacatttattcat--gtcata---------------tctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    |||||| || ||||||  ||||||               |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  53092 cagaacgttaattcataagtcataactctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattattatttcaagattaaaagatagggtta 52993  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcatgc--------------aaagcaatgaacacaaataatct 614  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||              |||||  ||||||||||||||      
T  52992 gtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattgaaagaagctaggattaatagtcatgcaaacaatcatacgaaaagctttgaacacaaataattc 52893  T
Q  615 tgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttc-aaacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatgactctgattaatc 713  Q
    ||||||||||||||| || ||||||  |   |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || | || ||||    
T  52892 tgaataaagactaggttttcattga--tgtcaaagagagttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agatacatctcatgtct-taatcaatc 52797  T
Q  714 taagagcttaactactcat 732  Q
    |||||| ||| ||||||||    
T  52796 taagagtttagctactcat 52778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 63 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 42961 - 42716
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||  |||| ||| | || |||||||  ||||   ||||||||||||    
T  42961 agatatttgtcaagtgtaccaaaagctatcgaagtcgtaataaagttcgtattcacagggactgtt-tcaacttctactcggcaaaaacgttaaaataaa 42863  T
Q  163 ggatgtagtaaatttatgggttgctctaggcagctgaatttgg-tgc-ataaaatgtaaatgagatgcaattaaattggtttggaatttataataaaaca 260  Q
    ||||||| ||||||||||| || | |||||||  || |||||| ||| |||||| |||||| | | | || |||| |||||||  | ||  | |||||||    
T  42862 ggatgtattaaatttatggatttccctaggcatttggatttggttgcaataaaaagtaaataaca-gaaaataaaatggtttgataattggattaaaaca 42764  T
Q  261 gataatcaagccttt-gaatcctctattgttcgccgtgaataatttgc 307  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||| || | |||| ||||||||    
T  42763 gatgatcaagcctttcgaatcctctattgctcactgtgagtaatttgc 42716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 63 - 195
Target Start/End: Original strand, 33734 - 33865
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 162  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33734 agatatttggcaagtgtaccaaaa-ctatcgaagtagtaataaagtttgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaa 33832  T
Q  163 ggatgtagtaaatttatgggttgctctaggcag 195  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  33833 ggatgtactaaatttatgggttgccctaggcag 33865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 358 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 27423 - 27176
Alignment:
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttat 457  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| |||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||    
T  27423 gttttgttcaatctcttgaatcaaaaccttttcctaggttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataactgcggaagcgataaaagaacgttaat 27324  T
Q  458 tc--atgtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaa 540  Q
    ||  |||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27323 tcctatgtcatgattttcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactaattcaggattaaaagttagggttaatagtcattcaa 27224  T
Q  541 ttcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  27223 ttcctaatatcaattcatataatt-caagaagctagggttaatagtcat 27176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 27705 - 27668
Alignment:
Q  69 ttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaa 106  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27705 ttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaa 27668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1048 (Bit Score: 100; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1048
Description:

Target: scaffold1048; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 358 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 1463 - 1216
Alignment:
Q  358 gttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataacagaacatttat 457  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||  || ||    
T  1463 gttttgatcaatatcttgaatcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataactgcggaagcgatgtcagaaagttaat 1364  T
Q  458 tcat--gtcat---------------atctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaa 540  Q
    ||||  |||||               ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1363 tcatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacagatttactaattcaggattaaaagctagggttaatagtcattcaa 1264  T
Q  541 ttcctaagatcaatttatgtaattgcaagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  1263 ttcctaatatcaattcatataatt-caaaaagctagggttaatagtcat 1216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0911 (Bit Score: 93; Significance: 8e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0911
Description:

Target: scaffold0911; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 466 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 4499 - 4371
Alignment:
Q  466 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4499 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 4400  T
Q  566 caagaagttagggttaatagtcatgcaaa 594  Q
     |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  4399 aaagaagctagggttagtagtcatacaaa 4371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0911; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 603 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 4350 - 4255
Alignment:
Q  603 cacaaataatcttgaataaagactaggattccattgaattaaaaaagagagttca-aacaaattacatggttcatagatcacaatagattcatctcatg 700  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  | |||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  4350 cacaaataattctgaataaagactaggttttcattgatgtcaaa--gagagttcttaacaaattacatggttcacagatcacaa-agattcatctcatg 4255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360 (Bit Score: 87; Significance: 3e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 346 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 6359 - 6123
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgataa 445  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||      
T  6359 attaattaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaatcctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattaaataatcgcggaagcgatgt 6260  T
Q  446 cagaac----atttat---tcatg----------tcatatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggtta 528  Q
    || |||    ||||||   |||||          || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  6259 caaaacgttaatttatatgtcatgattctcaatttcctatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattcctatttcagaattaaaagctagagtta 6160  T
Q  529 atagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 565  Q
     |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  6159 gtagtcattcaattcctaatatcaattcatgtaattg 6123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 346 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 2527 - 2430
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgat 443  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2527 attaactaagtagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaataatcgcggaagcgat 2430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 466 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 2385 - 2298
Alignment:
Q  466 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaa 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  2385 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacaggattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaatatcaa 2298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 466 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 227284 - 227157
Alignment:
Q  466 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 565  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  227284 tatctctaggttcctatgttgaattaaacagaattattatttcaggattaaaagctatgattagtagtcattcaattcctaagatcaatttatgtgattg 227185  T
Q  566 caagaagttagggttaatagtcatgcaa 593  Q
     |||||| || |||||||||||||||||    
T  227184 taagaagctatggttaatagtcatgcaa 227157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 228707 - 228652
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataa 401  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  228707 attaactaattagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagtaataa 228652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 466 - 589
Target Start/End: Original strand, 28842 - 28965
Alignment:
Q  466 tatctctaggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattg 565  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || |||||     
T  28842 tatctttaggttcctatgttgaatcaaacaggattactaattcaagattaaaagctagggttagtagtcattcaattcctaatatcaattcatataattt 28941  T
Q  566 caagaagttagggttaatagtcat 589  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  28942 caagaagctagggttaatagtcat 28965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 346 - 443
Target Start/End: Original strand, 28704 - 28801
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaataaccgcggaagcgat 443  Q
    |||||| || || ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28704 attaacaaattaattttgataaatctcttgaatcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatgtcttaaacagattgaataaccgcggaagcgat 28801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 106
Target Start/End: Original strand, 28428 - 28471
Alignment:
Q  63 agatatttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaa 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  28428 agatatttggcaagtgtaccaataactatcgaagtagtaataaa 28471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 68; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 254 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 92601 - 92423
Alignment:
Q  254 taaaacagataatcaagccttt-gaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatg--ttcacctaactctatggcatattaa 350  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||   |||||| ||| ||    || ||||| || || | |  |||||    
T  92601 taaaacagatgatcaagcctttcgaatcctctattgttcactgtgagtaatttgcctctcttctctctcaagaaattaacctagctttacgacggattaa 92502  T
Q  351 ctaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcttaagttataactttttaatcttttaaaccgattgaata 429  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  92501 ctaagtggttttgatcaatctcttgactcaaaaccctttcctaagttataaccttttaatctcttaaaccgattgaata 92423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 67; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 473 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 2120 - 2022
Alignment:
Q  473 aggttcctatgttgaatcaaacagaattactatttcatgattaaaagctagggttaatagtaattcaattcctaagatcaatttatgtaattgcaagaa 571  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2120 aggttcttatgttgaattaaacagaattactatttcaggattaaaagctagggttagtagtcattcagttcctaagatcaatttatgtgattgaaagaa 2022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 64; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 194
Target Start/End: Original strand, 90306 - 90432
Alignment:
Q  67 atttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaaggat 166  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  |||| ||| | ||||||||||  ||||   ||||||||||||||||    
T  90306 atttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtactaataaagttcgtatccacatggactgtt-tcaatttctactcggcaaaagcgttaaaataaaggat 90404  T
Q  167 gtagtaaatttatgggttgctctaggca 194  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  90405 gtattaaatttatgggttgccctaggca 90432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 46; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 176
Target Start/End: Original strand, 2627 - 2734
Alignment:
Q  67 atttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaaggat 166  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| || |||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||  | |||||||    
T  2627 atttggcaagtggaccaaaa-ctatcgaagtaataaataagatcgtatccacgaggaccgttgttaacttctactcagcaatttcgttatca-aaaggat 2724  T
Q  167 gtagtaaatt 176  Q
    ||| ||||||    
T  2725 gtattaaatt 2734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0766 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0766
Description:

Target: scaffold0766; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3713 - 3635
Alignment:
Q  98 agtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctacttagcaagttcgttaaaataaaggatgtagtaaatt 176  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  |||| ||||| |||||| ||||||    
T  3713 agtaataaaatttgtatccacgaggaccgttgttaacttctactcagcaatttaattaagataaatgatgtattaaatt 3635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 382
Target Start/End: Original strand, 468418 - 468544
Alignment:
Q  254 taaaacagataatcaagcctttgaatcctctattgttcgccgtgaataatttgctagtcttctatcttaatgttcacctaactctatggcatattaacta 353  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||  ||||||| || | ||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||  | || | || ||||||      
T  468418 taaaacatatgatcaagccttcgaattgtctattgctcactgtgaataatttgctcctcttctctc--aatgttcacctagttttacgacagattaaccc 468515  T
Q  354 aatagttttgatcaatctcttgactcaaa 382  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  468516 aatagttttgatcaatctcttgaatcaaa 468544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 141
Target Start/End: Original strand, 24193 - 24266
Alignment:
Q  67 atttggcaagtgtaccaaaaactatcgaattagtaataaagttcgtatccacgaggaccgttgttaatttctact 141  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || || ||||||||||| ||  |||| |||||||    
T  24193 atttggcaagtgtaccaaaagctatcgaagtagtaataaa-tttgtttccacgaggactgtatttaacttctact 24266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1431 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1431
Description:

Target: scaffold1431; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 389
Target Start/End: Original strand, 475 - 518
Alignment:
Q  346 attaactaaatagttttgatcaatctcttgactcaaaacccttt 389  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  475 attaacaaaatagttttgatcaatctcttgagtcaaaatccttt 518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University