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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF14106_high_4 (Length: 206)
Name: NF14106_high_4
Description: NF14106
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF14106_high_4 |
 |  |
|
| [»] scaffold0494 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0116 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0201 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0169 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0794 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0219 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0513 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0057 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 159; Significance: 7e-85; HSPs: 23)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 7796904 - 7797086
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
7796904 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
7797003 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
7797004 |
attccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaagcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctc |
7797086 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 13563968 - 13564150
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
13563968 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggatcgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
13564067 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13564068 |
attccgaaacataaatccgacgtcgctatcatcgcaaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
13564150 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 33994897 - 33994713
Alignment:
| Q |
9 |
cataaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatc |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
33994897 |
cataaacaacacattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccacc |
33994798 |
T |
 |
| Q |
109 |
atattccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33994797 |
atattaagaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagtttgccgttgtccatgcgtattcatctc |
33994713 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 27863730 - 27863912
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
27863730 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcaaatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
27863829 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27863830 |
attccaaaacataaatccgacgtcgctgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgtttttcatgcgtattcatctc |
27863912 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 28882315 - 28882497
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
28882315 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccccacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
28882414 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28882415 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcaaataagcaaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
28882497 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 38856042 - 38856224
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
38856042 |
taaactactcattacacatcattaaattcaatccctacttacattcaacgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
38856141 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38856142 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
38856224 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 11029334 - 11029516
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
11029334 |
taaactactcatcacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattacatatgaaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
11029433 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11029434 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
11029516 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14280724 - 14280542
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
14280724 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccat |
14280625 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14280624 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
14280542 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 37814909 - 37815091
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
37814909 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttactttcaacgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
37815008 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37815009 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgtgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
37815091 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 34122865 - 34123047
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
34122865 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaattcatacttacattcaatgcaattgcatatggaacgaacatatatatataatatattatcttccaccat |
34122964 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34122965 |
attctgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatataacttaccgttttccatgcgtattcatctc |
34123047 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 25890321 - 25890503
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
25890321 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccat |
25890420 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25890421 |
attctgaaacataaatccgacgtcgacgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatcgcttgctgttttccacgcgtattcatctc |
25890503 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Original strand, 24050366 - 24050547
Alignment:
| Q |
14 |
acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatata--atatattatcttccatcata |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
24050366 |
acaactcattacacatcattaaattatatccctacttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatattatcttccaccata |
24050465 |
T |
 |
| Q |
112 |
ttccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24050466 |
ttctgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcttcaattcgccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
24050547 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Original strand, 24053493 - 24053672
Alignment:
| Q |
14 |
acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatatt |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
24053493 |
acaactcattacacatcattaaattatatccctaattacattcaacgcaattgcatatagaaagaacatacatatataatatattatcttccaccatatt |
24053592 |
T |
 |
| Q |
114 |
ccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24053593 |
ctgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcttcaattcgccaaggcatatagcttgtcgttttccatgcgtattcatctc |
24053672 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1039535 - 1039356
Alignment:
| Q |
13 |
aacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatat |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
1039535 |
aacaactcattacatatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaactgcatatggtacgaacatacatatataacatattattttccaccatat |
1039436 |
T |
 |
| Q |
113 |
tccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1039435 |
tcc-aaacataaatccgatgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
1039356 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 34079877 - 34079754
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
34079877 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccttacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
34079778 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtc |
134 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
34079777 |
attctgaaacataaatccgccgtc |
34079754 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 33 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 28387979 - 28387821
Alignment:
| Q |
33 |
taaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatattccgaaacataaatccgacg |
132 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
28387979 |
taaattaaatccctacttacaatcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacg |
28387880 |
T |
 |
| Q |
133 |
tcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatct |
192 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||||| || ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
28387879 |
tcgctatcgtcgtgaataa-caaaggcatataacttgtcgttttccatgtgtattcatct |
28387821 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 4196843 - 4197023
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||| |
|
|
| T |
4196843 |
taaacaactcattacatatgattatattaaatccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaa--tacatatataatatattattttcgaccat |
4196940 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
4196941 |
attccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatgtagcttgtcgttttccatgcatattcatctc |
4197023 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 114
Target Start/End: Original strand, 7017838 - 7017941
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
7017838 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
7017937 |
T |
 |
| Q |
111 |
attc |
114 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
7017938 |
attc |
7017941 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Original strand, 30352760 - 30352939
Alignment:
| Q |
14 |
acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatatt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
30352760 |
acaactcattacatatcaataaattaaatctttacttacattcaatgcaattgcatatggaaaaaacatacatatataatatattattttccacaatatt |
30352859 |
T |
 |
| Q |
114 |
ccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
30352860 |
ccgaaacataaatacgacgtcgctatcgtctttaacaagccaaggcatataacttgccgtttttcatgcatattcatctc |
30352939 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 43179559 - 43179429
Alignment:
| Q |
63 |
attgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatattccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcata |
162 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
43179559 |
attgcagatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatcaaacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcata |
43179460 |
T |
 |
| Q |
163 |
tagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
43179459 |
tagcttaccgttttccatgcgtgttcatctc |
43179429 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 143
Target Start/End: Original strand, 25877959 - 25878089
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
25877959 |
taaacaactcattacacgtgattatattaaatccctacttaca--catcacaattgcatatggaacaaacatacatatataatatattattttccaccat |
25878056 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtc |
143 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
25878057 |
attccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtc |
25878089 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 143
Target Start/End: Original strand, 6267801 - 6267932
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6267801 |
taaacaacacattacatatcattaaattaaatctctactgacattctacgcagttgcagatggaacaaaaatacatatataatatattatcttccatcat |
6267900 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtc |
143 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||||| | |||||| |
|
|
| T |
6267901 |
attccg-aacataaattcgacgtcgccatcgtc |
6267932 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Original strand, 7017953 - 7018007
Alignment:
| Q |
139 |
tcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
7017953 |
tcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccattttccatgtgtattcatctc |
7018007 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 43377025 - 43376843
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
43377025 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
43376926 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
43376925 |
attccgaaacataaatctgacgtcactatcgtcgcgaataaaccaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctc |
43376843 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 35962634 - 35962816
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
35962634 |
taaacaactcattgcacatcattaaattaaattcctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacgtatataatatattatcttccaccat |
35962733 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35962734 |
attccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgtcgttttccatgcgtattcatctc |
35962816 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 23924292 - 23924474
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
23924292 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaactgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccat |
23924391 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23924392 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
23924474 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31959793 - 31959611
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
31959793 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccatacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccat |
31959694 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31959693 |
attccaaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
31959611 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 7172060 - 7171881
Alignment:
| Q |
14 |
acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatatt |
113 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
7172060 |
acaactcagtacacatcattaaattaaatctctacttacattcaatgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatatt |
7171961 |
T |
 |
| Q |
114 |
ccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7171960 |
ccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattcatctc |
7171881 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 2124521 - 2124703
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
2124521 |
taaacaactcattacacatcattaaattaagtccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaaaatacatatataatatattatcttccaccat |
2124620 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||| |||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
2124621 |
attccgaaacataaatccaaagtcgctattgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctc |
2124703 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22588188 - 22588006
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
22588188 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
22588089 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22588088 |
atttcaaaacataaatccgacgtcgctatcgtcttcaattagccaagacatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
22588006 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 30301462 - 30301644
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
30301462 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccat |
30301561 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30301562 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
30301644 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 32375979 - 32376161
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
32375979 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccat |
32376078 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32376079 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccatcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgtttcccatgcgtattcatctc |
32376161 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 39784 - 39966
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
39784 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccat |
39883 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39884 |
attccgaaacataaatccgacatcgccgtcgttgcgaataagcaaagacatatagcttgtcgttttccatgcgtattcatctc |
39966 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 7344302 - 7344120
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
7344302 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccat |
7344203 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7344202 |
attccgaaacataaatccgacgttgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
7344120 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 8419732 - 8419914
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
8419732 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacgtacatatataatatattgtcttccaccat |
8419831 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8419832 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
8419914 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 193
Target Start/End: Original strand, 41744160 - 41744332
Alignment:
| Q |
21 |
attacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatattccgaaac |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
41744160 |
attacacatcattaaattaagtccctacttacattcaacgcaattgcatatggagcgaatatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaat |
41744259 |
T |
 |
| Q |
121 |
ataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41744260 |
ataaatccgacgtcgctatcgtcatgaataagccaaggcatataacttgtcgttttccatgcgtattcatctc |
41744332 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 43679723 - 43679905
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
43679723 |
taaacaactcattacacatcattatattaaatccctgcttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccat |
43679822 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
43679823 |
attccgaaacataaatctgacgtctctatcgtctttaataagtcaaggcatataacttgtcgttttccatgcgtgttcatctc |
43679905 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22661320 - 22661138
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
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| T |
22661320 |
taaacaacacattacatatcgttaaattaaatctctactgacattctgcgcagttgcatatggaacgaacatacatatataatatatcatcttccaccat |
22661221 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22661220 |
attccgaaacatagacccgacgtcgctatcgtcgtgaataagccaaggcatatggcttgccgttttccatgcatattcatctc |
22661138 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 4867536 - 4867380
Alignment:
| Q |
14 |
acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatatt |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| | |
|
|
| T |
4867536 |
acaactcattacttatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattggatatggaacgaacatacgtatataatatattattttccaccataat |
4867437 |
T |
 |
| Q |
114 |
ccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgc |
170 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
4867436 |
ccgaaacataaatccgacgtcgttatcatctcgaataagccaatgcacataggttgc |
4867380 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 39751387 - 39751473
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatat |
97 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39751387 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgtaattgcatatggaacgaacatacatatataatatat |
39751473 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 89 - 188
Target Start/End: Original strand, 39751659 - 39751758
Alignment:
| Q |
89 |
ataatatattatcttccatcatattccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattc |
188 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39751659 |
ataatatattatcttctaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaagacatatagtttgccgttttccatgcgtattc |
39751758 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 20549005 - 20548938
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacga |
78 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20549005 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccttacttacattcaacgcaattgcatatggaacga |
20548938 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 51 - 179
Target Start/End: Original strand, 31281179 - 31281305
Alignment:
| Q |
51 |
acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatattccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaata |
150 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
31281179 |
acattctacgcacgtgcagatggaacgaacataaagatataatatattatcttcaaccatattctgaaacataaatcctacgt--ctatcgtcacgaata |
31281276 |
T |
 |
| Q |
151 |
agtcaatgcatatagcttgccgttttcca |
179 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
31281277 |
agccaatgcttataaatcgccgttttcca |
31281305 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 30972620 - 30972479
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
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| T |
30972620 |
taaacaacacattacacatcattacataaaatatctatcgacattctacgcatgtgcaaatggaacaaacacacatatataatatattatcttcaaccat |
30972521 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataag |
152 |
Q |
| |
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|| | |||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |
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| T |
30972520 |
atgtctaaacataagtgaaacgtcactatcatcacggataag |
30972479 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 15)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 47742735 - 47742553
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
47742735 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
47742636 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47742635 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgtcgttttccatgcgtattcatctc |
47742553 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15070096 - 15069914
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
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|
|
| T |
15070096 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
15069997 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
15069996 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
15069914 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18109539 - 18109357
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18109539 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
18109440 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18109439 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
18109357 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 188
Target Start/End: Original strand, 34622825 - 34623002
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
34622825 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaacttctacttacattcaacgcaattgcatatgaaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
34622924 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattc |
188 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34622925 |
attccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattc |
34623002 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 604106 - 604288
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
604106 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattacatatggaacaaacatacatatataatatattatcttccaccat |
604205 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
604206 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
604288 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 42503584 - 42503402
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
42503584 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
42503485 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42503484 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatgtagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
42503402 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 193
Target Start/End: Original strand, 29592839 - 29593011
Alignment:
| Q |
21 |
attacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatattccgaaac |
120 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
29592839 |
attacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatgtattatcttccaccatattccgaaac |
29592938 |
T |
 |
| Q |
121 |
ataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
29592939 |
ataaatctgacgtcgctatcgttgcgaataagccaaggcatataacttgccgttttccatgcgtattcatctc |
29593011 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 19044633 - 19044815
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
19044633 |
taaacaaatcattacacatcattaaattaaatctctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
19044732 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
19044733 |
atttcgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatataacttgccgttttccatgcatattcttctc |
19044815 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20710003 - 20709821
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
20710003 |
taaacaaatcattacacatcattaaattaaatctctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
20709904 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
20709903 |
atttcgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatataacttgccgttttccatgcatattcttctc |
20709821 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 43620007 - 43620189
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
43620007 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccat |
43620106 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
43620107 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
43620189 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 45767606 - 45767424
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
45767606 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccat |
45767507 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45767506 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
45767424 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 30790752 - 30790570
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
30790752 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccat |
30790653 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30790652 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgctgttttccatgcgtattcatctc |
30790570 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Original strand, 10705587 - 10705765
Alignment:
| Q |
14 |
acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatatt |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
10705587 |
acaactcattacacatcaataaattaaatctctacttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatcatcttccaccatatt |
10705686 |
T |
 |
| Q |
114 |
ccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatct |
192 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10705687 |
ctgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcttcaattagccaaggcatatagcttgtcgttttccatgcgtattcatct |
10705765 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 47065040 - 47064858
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
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| T |
47065040 |
taaacaactcattacacatgattatattaaatccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccat |
47064941 |
T |
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| Q |
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attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
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atttcgaaacataaatttgacgtcgctatcatctttaataaaccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 12111555 - 12111729
Alignment:
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113 |
Q |
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acaactcattacatatcattaaattaaatccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatata--atattattttccaccatatt |
12111652 |
T |
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| Q |
114 |
ccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcat |
190 |
Q |
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ccgaaatataaatccgacgtcgctatcatctttaataaaccaaggcatatagcttgtcgttttccatgtgtattcat |
12111729 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 41181737 - 41181919
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110 |
Q |
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taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
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T |
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| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
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| T |
41181837 |
attccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgtataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Original strand, 43944031 - 43944210
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113 |
Q |
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acaattcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatatattatattatcttccaccatatt |
43944130 |
T |
 |
| Q |
114 |
ccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
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| T |
43944131 |
ccgaaacataaatctgacgtcgctatcatcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
43944210 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 3795677 - 3795859
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| Q |
11 |
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110 |
Q |
| |
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| T |
3795677 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
3795776 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
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|
| T |
3795777 |
attctgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcacgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
3795859 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Original strand, 12905859 - 12906037
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| Q |
14 |
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113 |
Q |
| |
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| T |
12905859 |
acaactcattacacatcattaaattaaatccgtacttacattcaacgcaattgcatatggaacaaacatacatatataatatattatcttccaccatatt |
12905958 |
T |
 |
| Q |
114 |
ccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatct |
192 |
Q |
| |
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|
| T |
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ccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgttgttttccatgcgtattcatct |
12906037 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 45479567 - 45479385
Alignment:
| Q |
11 |
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110 |
Q |
| |
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| T |
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taaacaacacattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
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T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
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attctgaaacataaatccgacgccgatatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 28342849 - 28343032
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11 |
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110 |
Q |
| |
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| T |
28342849 |
taaacaattcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
28342948 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccg-aaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
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28342949 |
attccgaaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttacatgtgtattcgtctc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 1096910 - 1097092
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110 |
Q |
| |
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| T |
1096910 |
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1097009 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
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1097010 |
attccgaaacataaattcgacgtcgctatcgtcgcaaataagcccaagcatataacttgccgttttccatgcgtattcgtctc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 39798186 - 39798004
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| Q |
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110 |
Q |
| |
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|
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taaactactcattacacatcattaaattaaatctctacttacattcaacgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
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T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
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|
| T |
39798086 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
39798004 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 24601980 - 24602160
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| Q |
11 |
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110 |
Q |
| |
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|
| T |
24601980 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacat--atatataatatattatcttccaccat |
24602077 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
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| T |
24602078 |
attccgaaaaataaatccgacgttgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatccgtattcgtctc |
24602160 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24612134 - 24611954
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| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
24612134 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacat--atatataatatattatcttccaccat |
24612037 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
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|
|
| T |
24612036 |
attccgaaaaataaatccgacgttgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatccgtattcgtctc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 5351477 - 5351295
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| Q |
11 |
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110 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccat |
5351378 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
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|
|
| T |
5351377 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
5351295 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 10620301 - 10620483
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| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
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| T |
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taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccat |
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T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
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attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
10620483 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 41564236 - 41564054
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| Q |
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110 |
Q |
| |
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|
|
| T |
41564236 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccat |
41564137 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
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|
| T |
41564136 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
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Q |
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T |
 |
| Q |
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atattccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
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|
| T |
9659688 |
atattccgaaacataaactcgacgtcgctatcgtcacgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
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Target Start/End: Original strand, 209312 - 209494
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110 |
Q |
| |
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T |
 |
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111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
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|
| T |
209412 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
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Target Start/End: Complemental strand, 7267190 - 7267008
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Q |
| |
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|
| T |
7267190 |
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7267091 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
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| T |
7267090 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggtatatagcttgtcgttttccatgcgtattcatctc |
7267008 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24753770 - 24753588
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Q |
| |
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taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacaaacatacatatataatatattattttccaccat |
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T |
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111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
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Q |
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| T |
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attccgaaacataaatacgatgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaagcatatagcttgccgttttccatacgtattcatctc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1150777 - 1150595
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1150777 |
taaacaattcattacacatcattaaattaaatcactacttacattcaatgaaattgcatatggaacgaacatacatatataatatagtatcttccatcat |
1150678 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1150677 |
attccaaaacataaatccgacgtcgctatcgtcacaaataaaccaaggcgtatagtttgccgttttccatgcgtatttatctc |
1150595 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 439556 - 439374
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
439556 |
taaacaactcattacacatgattatattaaatccctccttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattactttccaccat |
439457 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
439456 |
attccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccagggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
439374 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 81996 - 81814
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |
|
|
| T |
81996 |
taaacaactcattacacatgattatattaaatgcatacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttcaaccat |
81897 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
81896 |
attccgaaacataaatccgacgtcgttatcgtctttaataagtcaagggatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
81814 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 41052962 - 41053142
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatat--ggaacgaacatacatatataa-tatattatcttccat |
107 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
41052962 |
taaacaattcattacacatcattaaatt-----cctacttacattcaatgcaattgcatatatggaacgaacacacatatataaatatattatcttccac |
41053056 |
T |
 |
| Q |
108 |
catattccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
41053057 |
catattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttggcgttttcaatgcgtattcgtctc |
41053142 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Original strand, 41004866 - 41005045
Alignment:
| Q |
14 |
acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatatt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || || |||||| |
|
|
| T |
41004866 |
acaactcattacacatcattatattaaatcactacttacattcatcacaattgcatatggaatgaacatacatatataatatataatttttcaacatatt |
41004965 |
T |
 |
| Q |
114 |
ccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |||||| | |||||| |||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41004966 |
ctgaaacataaatctgacgtcccaatcgtctttaataagccagggcatgtagcttgtcgttttccatgcgtattcatctc |
41005045 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 88 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 38949855 - 38949750
Alignment:
| Q |
88 |
tataatatattatcttccatcatattccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtatt |
187 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38949855 |
tataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatataacttgccgttttccatgcgtatt |
38949756 |
T |
 |
| Q |
188 |
catctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
38949755 |
catctc |
38949750 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 38950312 - 38950232
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatata |
91 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38950312 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacacaattacatatggaacgaacatacatatata |
38950232 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 179
Target Start/End: Original strand, 25613533 - 25613697
Alignment:
| Q |
15 |
caactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatattc |
114 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||||| || ||||| ||| | |||||| | ||| |||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
25613533 |
caacacattacatatcattacataaaatctctattgacattctatgcacatgcagatggaacgaacacaaagatataatatattatctttaattatattc |
25613632 |
T |
 |
| Q |
115 |
cgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttcca |
179 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
25613633 |
ataaacataaatcctacgtcgctatcgtcacgaataagtcaaggcacatagctcgccgttttcca |
25613697 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Original strand, 18000560 - 18000607
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaa |
58 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18000560 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaa |
18000607 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 148
Target Start/End: Original strand, 43668499 - 43668560
Alignment:
| Q |
87 |
atataatatattatcttccatcatattccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaa |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43668499 |
atataatatattatcttcaaccatatgcctaaacataaatcctacgtcactatcgtcacgaa |
43668560 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 29667566 - 29667387
Alignment:
| Q |
14 |
acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatatt |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
29667566 |
acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattaacttccaccatatt |
29667467 |
T |
 |
| Q |
114 |
ccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29667466 |
ccgaaacataaatctgacatcgctatcgtcacgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
29667387 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25140852 - 25140669
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacat-atataatatattatcttccatca |
109 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
25140852 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacattatataatatattatctttcacca |
25140753 |
T |
 |
| Q |
110 |
tattccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
25140752 |
tattccgaaacataaatgcgacgtcgctatcgtcacgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcgtctc |
25140669 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 23959217 - 23959399
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
23959217 |
taaacaacacattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatcttacaccat |
23959316 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23959317 |
attccgaaacataaatccaacgtcgctatcgtcgtgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
23959399 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 188
Target Start/End: Original strand, 2051368 - 2051545
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
2051368 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
2051467 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattc |
188 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2051468 |
atttcgaaacataaatccgacgtcgccatcgtcgcgaataagccaagacatataacttgccgttttccatgcgtattc |
2051545 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 7537527 - 7537709
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
7537527 |
taaacaaatcattgcacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaaatgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
7537626 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
7537627 |
attccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatataacttgctgttttccatgcgtattcgtctc |
7537709 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 29286529 - 29286711
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
29286529 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaacctctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
29286628 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||| |
|
|
| T |
29286629 |
attccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagtttgccgttttctatgtgtattcgtctc |
29286711 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 1608621 - 1608803
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
1608621 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccat |
1608720 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1608721 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
1608803 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 13382968 - 13383150
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
13382968 |
taaactactcattgcacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
13383067 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13383068 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatataacttgacgttttccatgcgtattcatctc |
13383150 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31150811 - 31150629
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
31150811 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacatacattcaacgcaattgcatatcgatcaaacatacatatataatatattatcttccaccat |
31150712 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31150711 |
attctaaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccaagcgtattcatctc |
31150629 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28362463 - 28362281
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
28362463 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacatacattctacacaattgcatatcgatcgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
28362364 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||||||| ||||| || | |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
28362363 |
attctgaaacataaattcgacgtcgctatcatcgcaaataagccaaggcatatagcttgccattttccatgcttattcatctc |
28362281 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18609979 - 18609797
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |
|
|
| T |
18609979 |
taaacaactcattacacatgattatattaaatccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatataattttccaccat |
18609880 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
18609879 |
attccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatataacttgtcgttttccatgcatatttatctc |
18609797 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 2259412 - 2259593
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
2259412 |
taaacaacacattacaacttattaaattaaatccttacttacattcaacgta-ttgcatatggaacaaacatgcatatataatatattattttccaccat |
2259510 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
2259511 |
atttcgaaacataaatctgacgtcgctttcgtctttaataagccaatgcatatagcttgtcgttttctatgcgtattcatctc |
2259593 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 140
Target Start/End: Original strand, 34230807 - 34230936
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
34230807 |
taaacaacacattacacatcgttaaattaaatctctactaacattctacacagttgcagatggaacgaacatacatatataatatattatcttctaccat |
34230906 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatc |
140 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
34230907 |
attctaaaacataaatcggacgtcactatc |
34230936 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 20448493 - 20448393
Alignment:
| Q |
51 |
acattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatattccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaata |
150 |
Q |
| |
|
|||||| || || ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20448493 |
acattctacacatttgcaaatgtaacaaacacacatatataatatattatctt-caacatatacctaaacataaatgaaacgtcgctatcgtcacgaata |
20448395 |
T |
 |
| Q |
151 |
ag |
152 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
20448394 |
ag |
20448393 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 152
Target Start/End: Original strand, 19129549 - 19129637
Alignment:
| Q |
65 |
tgcatatggaac-gaacatacatatataatatattatcttccatcatattccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataag |
152 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19129549 |
tgcagatggaacagaacacacatatataatatattatattcaatcatatgcctaaacataaatgaaacgtcgcaatcgtcacgaataag |
19129637 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 18351389 - 18351348
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttac |
52 |
Q |
| |
|
||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18351389 |
taaactacttattacacatcattaaattaaatccctacttac |
18351348 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 151; Significance: 4e-80; HSPs: 28)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 44469757 - 44469575
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
44469757 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
44469658 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44469657 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
44469575 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 50113648 - 50113830
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
50113648 |
taaacaactcattacacattattaaattaaatccctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
50113747 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50113748 |
attccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
50113830 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1655823 - 1655644
Alignment:
| Q |
14 |
acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatatt |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1655823 |
acaactcattacacatcattaaattaaatcattacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatatt |
1655724 |
T |
 |
| Q |
114 |
ccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1655723 |
ccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaagacatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
1655644 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 37019142 - 37018960
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
37019142 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatctctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
37019043 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
37019042 |
attccgaaacataaatcctatgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctc |
37018960 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 6558228 - 6558410
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
6558228 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
6558327 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6558328 |
attctgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
6558410 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 9710904 - 9711086
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
9710904 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaaagaacatacatatataatatattatctttcaccat |
9711003 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
9711004 |
attccgaaacataaatccgacgtcgctgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgtttttcatgcgtattcatctc |
9711086 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 12643532 - 12643714
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
12643532 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccat |
12643631 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12643632 |
attctgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
12643714 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25039829 - 25039645
Alignment:
| Q |
9 |
cataaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatc |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
25039829 |
cataaacaacacattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgtatatggaacgaacatacacatataatatattatcttccacc |
25039730 |
T |
 |
| Q |
109 |
atattccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25039729 |
atattccgaaacataaatccgacgtcgttatcgacgcgaataagccaaggcgtatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
25039645 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 22 - 193
Target Start/End: Original strand, 7966327 - 7966497
Alignment:
| Q |
22 |
ttacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatattccgaaaca |
121 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
7966327 |
ttacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatgtaatatattatcttccaccatattccgaaaca |
7966426 |
T |
 |
| Q |
122 |
taaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7966427 |
taaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataag-caaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
7966497 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 29352560 - 29352742
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
29352560 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
29352659 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29352660 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
29352742 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 30909769 - 30909593
Alignment:
| Q |
17 |
actcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatattccg |
116 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
30909769 |
actcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatgaaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccg |
30909670 |
T |
 |
| Q |
117 |
aaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30909669 |
aaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgctgttttccatgcgtattcatctc |
30909593 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 3944302 - 3944484
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| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
3944302 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccat |
3944401 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3944402 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
3944484 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 38771958 - 38772140
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| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
38771958 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccat |
38772057 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38772058 |
attccgaaacataaatccgacgtcaccgtcgtcgcggataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
38772140 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Original strand, 19495382 - 19495562
Alignment:
| Q |
14 |
acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatatt |
113 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
19495382 |
acaagtcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatatt |
19495481 |
T |
 |
| Q |
114 |
ccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccg-ttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |
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|
| T |
19495482 |
ccgaaacataaatccaacgtcgctatcgtctcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttttcatacgtattcatctc |
19495562 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13177869 - 13177690
Alignment:
| Q |
14 |
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113 |
Q |
| |
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|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
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acaactcattacacattattaaattaaatccctacttactttcaatgcaattgcatatggaatgaacatacatatataatatattatcttccaccatatt |
13177770 |
T |
 |
| Q |
114 |
ccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13177769 |
ccgaaacataaatccgacgtcgctatcgttgcgattaagccaagccatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
13177690 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3993588 - 3993406
Alignment:
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11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
3993588 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccat |
3993489 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
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||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3993488 |
attccgaaacataaatctgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
3993406 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13633618 - 13633436
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| Q |
11 |
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110 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
13633618 |
taaactactcattacacatcaataaattaaatccctacttacattcaacgcaattacatatggaacaaacatacatatataatatattatcttccaccat |
13633519 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | || || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13633518 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcatcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
13633436 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
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Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 5141616 - 5141435
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5141616 |
taaacaacacattatatatcgttaaattaaatctctactgacattctacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
5141517 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatct |
192 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5141516 |
attccgaaacatacatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaacgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatct |
5141435 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 20353681 - 20353500
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
20353681 |
taaactactcattatacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccat |
20353582 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatct |
192 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20353581 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatct |
20353500 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Original strand, 36072702 - 36072879
Alignment:
| Q |
14 |
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113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
36072702 |
acaactcattacacatcattaaattaaatctctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatatt |
36072801 |
T |
 |
| Q |
114 |
ccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatc |
191 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
36072802 |
ccgaaacataaatccgacgtcgctatcatcttcaattagccaaggcatatagcttgttgttttccatgcgtattcatc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Original strand, 33168243 - 33168422
Alignment:
| Q |
14 |
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113 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
33168243 |
acaactcattacatatcattaaattaaatccctacttacactcaacgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatatt |
33168342 |
T |
 |
| Q |
114 |
ccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33168343 |
ccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtctaaaataagtcaaggcatatagcttgttgttttccatgcgtattcatctc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 8459284 - 8459466
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| Q |
11 |
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110 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
8459284 |
taaacaactcattacacatgattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattacatatagaacgaacatacatgtataatatattatcttctaccat |
8459383 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8459384 |
attttgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaagacatatagcttgtcgttttccatgcgtattcatctc |
8459466 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 5082104 - 5081928
Alignment:
| Q |
17 |
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116 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5082104 |
actccttacacatcattaaattaaatccatatttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccg |
5082005 |
T |
 |
| Q |
117 |
aaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5082004 |
aaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatataccttgtcgttttccatgcgtattcatctc |
5081928 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 51666412 - 51666230
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
51666412 |
taaacaactcattacacatcattatattaaatccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccat |
51666313 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
51666312 |
attccgaaacataaattcgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgtgttccatgtgtattcatctc |
51666230 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 38690236 - 38690417
Alignment:
| Q |
11 |
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110 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
38690236 |
taaacaacacattacacatcattatattaaatcc-tacttacattcatcacaattgcatatggaacaaacatacatatataatatattattttccaccat |
38690334 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38690335 |
attttgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
38690417 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 46978977 - 46978798
Alignment:
| Q |
14 |
acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatatt |
113 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
46978977 |
acaattcattacacatcattatattaaatccctacttacattcatcacaattgcattaggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatatt |
46978878 |
T |
 |
| Q |
114 |
ccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
46978877 |
tcgaaacataaatccgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgtcgttttccatgtgtattcatctc |
46978798 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 4518135 - 4517959
Alignment:
| Q |
14 |
acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatatt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |
|
|
| T |
4518135 |
acaactcattacacatcattatat--aatccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatttttcaccatatt |
4518038 |
T |
 |
| Q |
114 |
ccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatct |
192 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4518037 |
ccgaaacataaatccgacgttgctatagtctttaataagccaaggcatatagcttgccattttccatgcgtattcatct |
4517959 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 15051094 - 15051053
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttac |
52 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15051094 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttac |
15051053 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 17)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 37394949 - 37394768
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
37394949 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
37394850 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatct |
192 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37394849 |
attccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatacaacttgccgttttccatgcgtattcatct |
37394768 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 10374366 - 10374548
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
10374366 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
10374465 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
10374466 |
atttcgaaacataaatctgatgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctc |
10374548 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 4774347 - 4774168
Alignment:
| Q |
14 |
acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatatt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
4774347 |
acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatatt |
4774248 |
T |
 |
| Q |
114 |
ccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4774247 |
ccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
4774168 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3407985 - 3407803
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
3407985 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
3407886 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
3407885 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgtgtattcatctc |
3407803 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 44050825 - 44050650
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
44050825 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttgcattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
44050726 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtatt |
187 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
44050725 |
attccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaa-acatatagcttgttgttttccatgcgtatt |
44050650 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 19069527 - 19069709
Alignment:
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11 |
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110 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
19069527 |
taaactactcattgcacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatgtataatatattatcttccaccat |
19069626 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19069627 |
attccgaaacataaacccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
19069709 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 49564169 - 49564351
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
49564169 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccat |
49564268 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49564269 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
49564351 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10423154 - 10422972
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| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
10423154 |
taaacaactcattacatatcattagattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
10423055 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
10423054 |
attccgaaacataaatccgacgtcgcaatcgccgcgaataagccaagacatatagcttgtcgttttccatgtgtattcgtctc |
10422972 |
T |
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Target: chr4; HSP #9
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Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Original strand, 18578962 - 18579141
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| Q |
14 |
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113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
18578962 |
acaactcattacacatcattaaattaaatcacttcttacattcaacgcaattgcatatagaactaacatacatatataatatattatcttctaccatatt |
18579061 |
T |
 |
| Q |
114 |
ccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18579062 |
ccgaaacataaattcgacgtcgctatcgtcttcaattagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
18579141 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Original strand, 24415498 - 24415679
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| Q |
14 |
acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatatt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
24415498 |
acaactcattacatatcattaaattaaatccctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccatcatatt |
24415597 |
T |
 |
| Q |
114 |
ccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgc--atatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
24415598 |
ccgaaacataaatgcaacgtcgctatcgtcttcaataagtcaaggcatatatagcttgtcgttttccatgtgtattcatctc |
24415679 |
T |
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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
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Target Start/End: Complemental strand, 11506831 - 11506658
Alignment:
| Q |
20 |
cattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatattccgaaa |
119 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||| |
|
|
| T |
11506831 |
cattacacatcattatattaaatccatacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatatttcaaaa |
11506732 |
T |
 |
| Q |
120 |
cataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11506731 |
cataaatccgacgtcgctattgtctttaataagtcaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
11506658 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 38460752 - 38460934
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
38460752 |
taaacaactcattacacatgattatattaaatccctacttacattcatcacaattgcatatgcaacaaacatacatatataatatattattttccaccat |
38460851 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
38460852 |
attctgaaacataaatccaacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgcattcatctc |
38460934 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 152
Target Start/End: Original strand, 6186995 - 6187126
Alignment:
| Q |
21 |
attacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatattccgaaac |
120 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |
|
|
| T |
6186995 |
attacatatcattaaattaaatctctactgacattctacgcatttgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattgctaaac |
6187094 |
T |
 |
| Q |
121 |
ataaatccgacgtcactatcgtcacgaataag |
152 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
6187095 |
ataaatccaatgtcgctatcgtcgtgaataag |
6187126 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 50904909 - 50904819
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| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatc |
101 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
50904909 |
taaacaattcatttcacatcattaaattaaatccctacttacattcaacacaattgcatatggaacaaacatacaaatataatatattatc |
50904819 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 30043166 - 30043039
Alignment:
| Q |
14 |
acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatatt |
113 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||| |||||| ||||| || | |||||| | | | ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
30043166 |
acaacacattacatatcgttaaatgaaatctctggtgacattctatgaagttgcaaatggaacgaaaatacaaatataatatattatcttccaccatatt |
30043067 |
T |
 |
| Q |
114 |
ccgaaacataaatccgacgtcactatcg |
141 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
30043066 |
ctgaaacataaatccgacgtcattatcg |
30043039 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 91
Target Start/End: Original strand, 51642346 - 51642423
Alignment:
| Q |
14 |
acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatata |
91 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51642346 |
acaactcattacatatcattaagttaaatcccaacttacattcatcacaattacatatagaacgaacatacatatata |
51642423 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 148
Target Start/End: Original strand, 31598821 - 31598954
Alignment:
| Q |
15 |
caactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatattc |
114 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||| |||| | |||||| || | |||||||||||||||| ||| | ||||| |
|
|
| T |
31598821 |
caactcattacataacattatatgaaatctctactgacattctacgcacatgcagttagaacgaccacaaatatataatatattattttcaaccatatgt |
31598920 |
T |
 |
| Q |
115 |
cgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaa |
148 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| | ||| || |||||||||| |
|
|
| T |
31598921 |
ctaaacataaatcttatgtcgctgtcgtcacgaa |
31598954 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0494 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:
Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 5072 - 4890
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
5072 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
4973 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4972 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
4890 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 19)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 6489670 - 6489852
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
6489670 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaattcctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
6489769 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
6489770 |
attccgaaatataaatccgacgacgctatcgtcacgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctc |
6489852 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 2743782 - 2743964
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| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
2743782 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacgtatataatatattatcttccaccat |
2743881 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2743882 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
2743964 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 46989853 - 46990035
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| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
46989853 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacacaattgcatgtggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
46989952 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46989953 |
attccaaaacataaatccgacgtcgtcatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 9426932 - 9427114
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| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
9426932 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
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T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9427032 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagtttgccgttttccatgcgtattcatctc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
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11 |
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110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
14402751 |
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14402652 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14402651 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
48246738 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcagttgcatatggaacaaacatacatatataatatattatcttccaccat |
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T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48246838 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
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Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
50957425 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccat |
50957326 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50957325 |
attccgaaacaaaaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaagacatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
50957243 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 8156836 - 8157018
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
8156836 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccat |
8156935 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8156936 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
8157018 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 13743593 - 13743775
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| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
13743593 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccat |
13743692 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13743693 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
13743775 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 30943518 - 30943700
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
30943518 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccat |
30943617 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30943618 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
30943700 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 2857728 - 2857546
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| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
2857728 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattacatatggaatgaacatacatatataatatattattttccaccat |
2857629 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2857628 |
tttccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
2857546 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3952960 - 3952778
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| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
3952960 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccat |
3952861 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3952860 |
attccgaaacataaatccgacgttgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
3952778 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 4002237 - 4002055
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| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
4002237 |
taaataactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccat |
4002138 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4002137 |
tttccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgtcgttttccatgcgtattcatctc |
4002055 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 36813178 - 36813360
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
36813178 |
taaacaactcattacacatcattaaattatatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatattccaccat |
36813277 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
36813278 |
attccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaagacatatagcttgccgttttccacacgtattcatctc |
36813360 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 190
Target Start/End: Original strand, 21952126 - 21952305
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
| T |
21952126 |
taaacaactcattacacgtcattaaattaaatccctagttacattcaatgcaattgcatatggaacgaacatacaaatataatatatcatcttccaccat |
21952225 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcat |
190 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21952226 |
attccgaaacctaaatccgacgtcgctatcatcgcgaataagccaaggcacatagcttgccgttttccatgcgtattcat |
21952305 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6745072 - 6744890
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
6745072 |
taaactactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccat |
6744973 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6744972 |
attccgaaacataaatccgacgttgccgtcgtcgcgaataagcaaagacatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
6744890 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Original strand, 67213 - 67392
Alignment:
| Q |
14 |
acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatatt |
113 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
67213 |
acaactcattacacatcattaaatgaaatccctacttacattcaacgcaatcacatatggaacgaacatacatatataatgtattattttccaccatatt |
67312 |
T |
 |
| Q |
114 |
ccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
67313 |
ccgaaacataaatccgacgtcgctattgtctttaataagccaagacatatagcttgccgtttttcatgcgtattcatctc |
67392 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 63
Target Start/End: Original strand, 7841422 - 7841474
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaa |
63 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7841422 |
taaacaactcattgcacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaa |
7841474 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 14013716 - 14013652
Alignment:
| Q |
87 |
atataatatattatcttccatcatattccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | || |||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14013716 |
atataatatattatcttcaaccacgttcctaaacataaattctacgtcactatcatcacgaataa |
14013652 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0116 (Bit Score: 139; Significance: 6e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:
Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15701 - 15519
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| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
15701 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccat |
15602 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15601 |
attccgaaacataaatctgacgtccccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatacgtattcatctc |
15519 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0201 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:
Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 22741 - 22923
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |
|
|
| T |
22741 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcaaatggaacgaacatacatatataatataatattttccaccat |
22840 |
T |
 |
| Q |
111 |
attccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| | ||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22841 |
attctgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcaaataagcaaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
22923 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0169 (Bit Score: 119; Significance: 5e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0169
Description:
Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10978 - 10828
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| Q |
43 |
ccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatattccgaaacataaatccgacgtcactatcgt |
142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
10978 |
ccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacaaatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatctgacgtcgctatcgt |
10879 |
T |
 |
| Q |
143 |
cacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10878 |
cacgaataagccaaggcatatagcttgctgttttccatgcgtattcatctc |
10828 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0794 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0794
Description:
Target: scaffold0794; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1488 - 1315
Alignment:
| Q |
20 |
cattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatattccgaaa |
119 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||| |
|
|
| T |
1488 |
cattacacatcattatattaaatccatacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatatttcaaaa |
1389 |
T |
 |
| Q |
120 |
cataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1388 |
cataaatccgacgtcgctattgtctttaataagtcaaggcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
1315 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0219 (Bit Score: 89; Significance: 4e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0219
Description:
Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 19843 - 19743
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcat |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
19843 |
taaacaactcattgcacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgagcatacatatataatatattatcttccaccat |
19744 |
T |
 |
| Q |
111 |
a |
111 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
19743 |
a |
19743 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0219; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 109 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19582 - 19498
Alignment:
| Q |
109 |
atattccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcatctc |
193 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
19582 |
atattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaagcatatagcttgccgttttccatgcgtattcgtctc |
19498 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0513 (Bit Score: 77; Significance: 6e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:
Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Original strand, 8526 - 8602
Alignment:
| Q |
11 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacata |
87 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8526 |
taaacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacata |
8602 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0057 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:
Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 21977 - 22144
Alignment:
| Q |
14 |
acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatatt |
113 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |
|
|
| T |
21977 |
acaactcattacacatcattatattaaatccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatat---------ttttccaccatatt |
22067 |
T |
 |
| Q |
114 |
ccgaaacataaatccgacgtcactatcgtcacgaataagtcaatgcatatagcttgccgttttccatgcgtattcat |
190 |
Q |
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