View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14117_low_2 (Length: 715)

Name: NF14117_low_2
Description: NF14117
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14117_low_2
NF14117_low_2
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (1-715)||(8054249-8054963)
chr2 (1-715)||(36673908-36674622)
chr2 (1-715)||(35951024-35951738)
[»] chr8 (10 HSPs)
chr8 (1-715)||(43808069-43808783)
chr8 (1-715)||(198270-198984)
chr8 (1-715)||(313107-313821)
chr8 (1-715)||(30406389-30407103)
chr8 (2-715)||(41948666-41949381)
chr8 (1-715)||(1290181-1290895)
chr8 (2-715)||(31473741-31474455)
chr8 (1-692)||(27435790-27436482)
chr8 (15-608)||(17782848-17783434)
chr8 (25-74)||(32528040-32528089)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (1-715)||(44150415-44151129)
chr4 (1-715)||(50628516-50629231)
chr4 (1-715)||(31358018-31358723)
chr4 (462-715)||(8893207-8893460)
chr4 (333-689)||(29257883-29258239)
chr4 (25-134)||(18217902-18218011)
chr4 (520-605)||(23428367-23428452)
chr4 (25-74)||(28393828-28393877)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (1-715)||(45451-46165)
[»] chr3 (6 HSPs)
chr3 (31-715)||(21849086-21849770)
chr3 (1-715)||(54167930-54168644)
chr3 (1-715)||(43553151-43553863)
chr3 (214-715)||(53353568-53354068)
chr3 (2-204)||(53355300-53355502)
chr3 (20-94)||(27236087-27236161)
[»] chr5 (11 HSPs)
chr5 (1-715)||(12022146-12022860)
chr5 (1-715)||(37680893-37681607)
chr5 (1-715)||(7099960-7100674)
chr5 (1-715)||(16797526-16798240)
chr5 (1-447)||(40368102-40368548)
chr5 (1-713)||(26454845-26455554)
chr5 (474-570)||(10276578-10276674)
chr5 (333-636)||(25631917-25632220)
chr5 (613-715)||(10276673-10276775)
chr5 (13-216)||(15063438-15063640)
chr5 (13-110)||(30064958-30065055)
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (1-715)||(6363-7077)
[»] chr7 (5 HSPs)
chr7 (1-715)||(7940669-7941383)
chr7 (1-715)||(27760254-27760968)
chr7 (2-713)||(13828693-13829404)
chr7 (446-683)||(22580229-22580466)
chr7 (16-74)||(5242616-5242674)
[»] chr6 (8 HSPs)
chr6 (1-715)||(8316090-8316804)
chr6 (1-715)||(27568769-27569483)
chr6 (1-391)||(17887539-17887929)
chr6 (3-438)||(17162955-17163382)
chr6 (185-685)||(3595760-3596259)
chr6 (475-713)||(23255807-23256045)
chr6 (608-715)||(17887431-17887538)
chr6 (12-134)||(15566068-15566190)
[»] chr1 (5 HSPs)
chr1 (1-715)||(26314870-26315584)
chr1 (258-715)||(43592407-43592863)
chr1 (1-148)||(43592862-43593011)
chr1 (51-715)||(30646273-30646936)
chr1 (25-74)||(6832219-6832268)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 655; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 655; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 715
Target Start/End: Original strand, 8054249 - 8054963
Alignment:
Q  1 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8054249 gatatggtgtacagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgaagcaagaatttg 8054348  T
Q  101 tcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtag 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8054349 ttaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatttgatagtgactggtag 8054448  T
Q  201 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8054449 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacagatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 8054548  T
Q  301 gaagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8054549 gaagttgcagagggattggtgatgcatcaaaagaagtatgcatctgatatattgaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccagctg 8054648  T
Q  401 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtag 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8054649 agacaaatgtaaaactggtgatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgcaatagtag 8054748  T
Q  501 acctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 600  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8054749 gcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 8054848  T
Q  601 ggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 700  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8054849 ggaacactgcagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 8054948  T
Q  701 atagaaagagcactt 715  Q
    |||||||||||||||    
T  8054949 atagaaagagcactt 8054963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 599; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 715
Target Start/End: Original strand, 36673908 - 36674622
Alignment:
Q  1 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36673908 gatatggtgtacagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgaagcaagaatttg 36674007  T
Q  101 tcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtag 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36674008 ttaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatttgatagtgactggtag 36674107  T
Q  201 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36674108 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacagatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 36674207  T
Q  301 gaagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36674208 gaagttgcagagggattggtgatgcatcaaaagaagtatgcatctgatatattgaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccagctg 36674307  T
Q  401 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtag 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36674308 agacaaatgtaaaactggtgatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgcaatagtag 36674407  T
Q  501 acctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 600  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36674408 gcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 36674507  T
Q  601 ggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 700  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||| || || ||||| |   |||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36674508 ggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtgcttaaatgaaaacactattgagctgacagcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 36674607  T
Q  701 atagaaagagcactt 715  Q
    |||||||||||||||    
T  36674608 atagaaagagcactt 36674622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 563; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 35951738 - 35951024
Alignment:
Q  1 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35951738 gatatggtgtatagattacacaaagctctctgtggattgaaacagccgccaagagcttggagcaagagaattgacagttttcttgtgcagcaagaatttg 35951639  T
Q  101 tcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35951638 tcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaagttaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatttgatagtgactggtag 35951539  T
Q  201 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35951538 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacagatgatgagtgagtttgaaatgttagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 35951439  T
Q  301 gaagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  35951438 gaagttgcagagggattggtgatgcaccaaatgaagtatgcatctgacatattgaagaggttcaatatgatgagctggaatccatcatcatcactagctg 35951339  T
Q  401 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtag 500  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35951338 agacaaatgtaaaactggtgatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtag 35951239  T
Q  501 acctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  35951238 acctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctactagcagccaaaagaatgatgagatatatcaaa 35951139  T
Q  601 ggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 700  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||| || || ||||| | |||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  35951138 ggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtgcttaaatgaaaattctattgatctgatagcatattctgatgttgattggtgtggagacattcaag 35951039  T
Q  701 atagaaagagcactt 715  Q
    |||||||||| ||||    
T  35951038 atagaaagagtactt 35951024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 643; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 643; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 43808783 - 43808069
Alignment:
Q  1 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43808783 gatatggtgtacagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgaagcaagaatttg 43808684  T
Q  101 tcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtag 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43808683 ttaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatttgatagtgactggtag 43808584  T
Q  201 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43808583 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacagatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 43808484  T
Q  301 gaagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43808483 gaagttgcagagggattggtgatgcatcaaaagaagtatgcatctgacatattgaaaaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccagctg 43808384  T
Q  401 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtag 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43808383 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgcaatagtag 43808284  T
Q  501 acctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 600  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43808283 gcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 43808184  T
Q  601 ggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 700  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43808183 ggaacactgcagtatggtattctatttcctaaatgcttgaatgatagttctatggaactgatggtatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 43808084  T
Q  701 atagaaagagcactt 715  Q
    |||||||||||||||    
T  43808083 atagaaagagcactt 43808069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 635; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 198984 - 198270
Alignment:
Q  1 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  198984 gatatggtgtacagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgaagcaagaatttg 198885  T
Q  101 tcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtag 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  198884 ttaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatttgatagtgactggtag 198785  T
Q  201 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  198784 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacatatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 198685  T
Q  301 gaagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  198684 gaagttgcagagggattggtgatgcatcaaaagaagtatgcatctgacatattgaaaaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccagctg 198585  T
Q  401 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtag 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  198584 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgtaatagtaa 198485  T
Q  501 acctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 600  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  198484 gcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 198385  T
Q  601 ggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 700  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  198384 ggaacaatgcagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggtatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 198285  T
Q  701 atagaaagagcactt 715  Q
    |||||||||||||||    
T  198284 atagaaagagcactt 198270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 635; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 313821 - 313107
Alignment:
Q  1 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  313821 gatatggtgtacagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgaagcaagaatttg 313722  T
Q  101 tcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtag 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  313721 ttaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatttgatagtgactggtag 313622  T
Q  201 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  313621 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacatatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 313522  T
Q  301 gaagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  313521 gaagttgcagagggattggtgatgcatcaaaagaagtatgcatctgacatattgaaaaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccagctg 313422  T
Q  401 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtag 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  313421 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgtaatagtaa 313322  T
Q  501 acctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 600  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  313321 gcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 313222  T
Q  601 ggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 700  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  313221 ggaacaatgcagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggtatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 313122  T
Q  701 atagaaagagcactt 715  Q
    |||||||||||||||    
T  313121 atagaaagagcactt 313107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 619; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 30407103 - 30406389
Alignment:
Q  1 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30407103 gatatggtgtacagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgaagcaagaatttg 30407004  T
Q  101 tcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtag 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30407003 ttaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatttgatagtgactggtag 30406904  T
Q  201 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30406903 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacagatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 30406804  T
Q  301 gaagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30406803 gaagttgcagagggattggtgatgcatcaaaagaagtatgcatctgatatattgaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccagctg 30406704  T
Q  401 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtag 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30406703 agacaaatgtaaaactggtgatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgcaatagtag 30406604  T
Q  501 acctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30406603 acctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 30406504  T
Q  601 ggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 700  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||| || || ||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30406503 ggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtgcttaaatgaaaattctattgaactgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 30406404  T
Q  701 atagaaagagcactt 715  Q
    |||||||||||||||    
T  30406403 atagaaagagcactt 30406389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 557; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 715
Target Start/End: Original strand, 41948666 - 41949381
Alignment:
Q  2 atatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  41948666 atatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaagcaccaagagcttggaacaagagaattgacagttttcttgtgcaacaagaatttat 41948765  T
Q  102 caaatgcaagtctgagtat--ggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggta 199  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  41948766 caaatgcaagtctgggtatatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatatgtctttatgttgatgatttgatagttactggta 41948865  T
Q  200 gtgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttac 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41948866 gtgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgataagggagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttccaggcatggaatttac 41948965  T
Q  300 tgaagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaact 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  41948966 tgaagttgcagagggattggtgatgcaccaaatgaagtatgcatctgacatattgaagaggttcaatatgatgatctgcaatccatcatcatcaccagct 41949065  T
Q  400 gagacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagta 499  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41949066 gagacaaatgtaaaactgttgatgaatgaagatgaagaacttgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgcaatagta 41949165  T
Q  500 gacctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaa 599  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41949166 gtcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaa 41949265  T
Q  600 aggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaa 699  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||| || || ||||| | |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41949266 aggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtgcttaaatgaaaattctattgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaa 41949365  T
Q  700 gatagaaagagcactt 715  Q
    ||||||||||||||||    
T  41949366 gatagaaagagcactt 41949381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 555; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 715
Target Start/End: Original strand, 1290181 - 1290895
Alignment:
Q  1 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1290181 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaagcaccaagagcttggaataagagaattgacaattttcttgtgcagcaagaatttg 1290280  T
Q  101 tcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtag 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1290281 tcaaatgcaagtctgaatatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtcattatgttgatgatttgatagtgactggtag 1290380  T
Q  201 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1290381 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacagatgatgagtgaggttgaaatgtcagaattagaaaaattgacacactttctaggcatggaatttact 1290480  T
Q  301 gaagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactg 400  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  1290481 gaagttgcaaagggattggtgatgcaccaaatgaagtatgcatctgacatattgaagagggtcaatatgatgaactgcaatccatcatcatcaccagctg 1290580  T
Q  401 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtag 500  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  1290581 agacaaatgtaaaactgatgatgaataaagatgaagaacatgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcacaaaggtatctatgcaatagtag 1290680  T
Q  501 acctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 600  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1290681 gcctgatattgcatatgcagttggtataatcagcagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagggtgatgagatacatcaaa 1290780  T
Q  601 ggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 700  Q
     |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1290781 tgaacactgcagtatggcattttatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctaatgttgattggtgtggagacaaacaag 1290880  T
Q  701 atagaaagagcactt 715  Q
    |||||||||||||||    
T  1290881 atagaaagagcactt 1290895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 31474455 - 31473741
Alignment:
Q  2 atatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttgt 101  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||  | |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  31474455 atatagtgtatagattacacaaagccctatatggattgaagcatgcaccaagagtctagaacaaaagaattgacagttttcttgtgcatcaaaaatttgt 31474356  T
Q  102 caaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtagt 201  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| || ||||| ||||||||| |  | ||||||||||| |||    
T  31474355 caaatacaagtttgaatatggtgtatatgtgaagaaaggaattgaaggtaaccaattacttatatgtctctatgttgattacttaatagtgactggaagt 31474256  T
Q  202 gatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttactg 301  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||||| |  | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  31474255 gatgtgaaagagatagaagtattcaaaacttatatgatgaatgagtttgaaatgtcaaatttaggaaacttgacttattttctaggcatggaatttactg 31474156  T
Q  302 aagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactga 401  Q
    ||| ||||||||||   || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||   ||||    
T  31474155 aaggtgcagagggacaagtaatgcatcaaatgaagtatgcatctgacatattgaagatgttcaatatgatgaattgcaatccatcatcatcacatgctga 31474056  T
Q  402 gacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctaca-ttgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtag 500  Q
    ||||||| | ||||| || ||||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  31474055 gacaaatatgaaactagtgatgaatgaagaagaagaatctatggatcctacatttgttcaagcaaatagttggatcactaaggtatctatgcaatagtag 31473956  T
Q  501 acctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 600  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| || ||||||||  ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31473955 gcctgatattgcatatgcaattggtataatcagtatattcatgaatgaaccaagagcatctcattttctagcaaccaaaagagtgatgagatacatcaaa 31473856  T
Q  601 ggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 700  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||  |||| ||||| | || |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||  || |    
T  31473855 ggaacactgcagtatggcatcctatttcctaagggtttcaatgaaaattttatgaaactgattgcatattctgatgttgattggtatggagacaagcagg 31473756  T
Q  701 atagaaagagcactt 715  Q
    ||||||| |||||||    
T  31473755 atagaaaaagcactt 31473741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 27436482 - 27435790
Alignment:
Q  1 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  27436482 gatatggtgtatagattacacaaaacactatatggattaaagcagacaccaagagcttggaacaaaagaattgacaattttcttgtgcaacaagaatttg 27436383  T
Q  101 tcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtag 200  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  27436382 ttaaatgcaagtctgaatatggtgtatagatgaagaaaggaattgaaggtagtcaattactcatctgtctctatgttgatgacttgatagtgactggtag 27436283  T
Q  201 tgatatgaatgagatagaa-gcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttac 299  Q
    | || |||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  27436282 taatgtgaatgagatagaaagaattcaaatctcagatgatgagtgagtttgaaatgacagatttaggatacttgacatattttctaggcatggaattcac 27436183  T
Q  300 tgaagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaact 399  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |  ||    
T  27436182 tgaagttgcagaaggattggtaatgcatcaaatgaagtatgcatctgatatattgaagaggttcaacatgatgaactgcaatccatcatcatcaactgct 27436083  T
Q  400 gagacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagta 499  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||   ||| |||||||| | ||||| ||||| || || ||||| |||||||||| ||| ||||    
T  27436082 gagactaatgtaaaactggcgatgaatgaagaagaagaattagtggatcctacactattcaaacaaattgtgggatcactaaggtatctatacaatagta 27435983  T
Q  500 gacctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaa 599  Q
    | || ||||||||||||||||| || || || || || |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27435982 ggccagatattgcatatgcagtaggaatcataagcaggttcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaa 27435883  T
Q  600 aggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggaga 692  Q
    |||||||||  ||| ||  |||||||||||||  ||| || |||| |  ||||||||| | || || || ||| |||| ||||||||||||||    
T  27435882 aggaacactagagtttggcattctatttcctaggtgtctggatgaaaactctatggaattaatagcttactctaatgcagattggtgtggaga 27435790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 15 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 17783434 - 17782848
Alignment:
Q  15 attacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttgtcaaatgcaagtct 114  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  17783434 attacacaagcctctctatggcttgaaacatgctccaagagcatggaataagaggattgacagttttcttgttcagcaagaatttttgaaatgcaagtct 17783335  T
Q  115 gagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtagtgatatgaatgaga 214  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||  | |||||||||  ||||||||||  | |||||||||||||| || ||| || ||||  |  |||||||||    
T  17783334 gagtatggtgtctatgtgacgaaaggaaaagcaggtaatcagatactcatctgcttatatgttgatgatctaattgtgcctagtagcaacgtgaatgaga 17783235  T
Q  215 tagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttactgaagttgcagaggg 314  Q
    ||||||||||||||    |||||||||  |||||||| ||| || ||||| | ||  |||||||||| ||  ||||||||||||||| |||  | || ||    
T  17783234 tagaagcattcaaagggaaaatgatgaaagagtttgagatggcatattta-gcaagctgacatacttcctttgcatggaatttactg-agt--ctgaagg 17783139  T
Q  315 attggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactgagacaaatgtaaaa 414  Q
     || || ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||   | |||||||||||||||   ||| | |||    
T  17783138 cttagttatgcatcagatgaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatggtaagctgcaatcttgcctcatcaccaactgaggtcaatttgaaa 17783039  T
Q  415 ctggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtagacctgatattgcat 514  Q
     |||| || ||||||||||||||||  ||  ||| ||||||| ||||| ||||  |  | ||||| |||||| | ||||| ||||| ||| ||||||  |    
T  17783038 ttggtgattaatgaagatgaagaactggttgatcgtacattgatcaagaaaattttgagatcactaaggtatttgtgcaatagtaggcctaatattgttt 17782939  T
Q  515 atgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacact 608  Q
    |||||||| ||   |||| ||| ||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17782938 atgcagttagc---atcaataggttcatgactgaaccaagagcttctcacttgctagcagctaaaagagtgatgagatacattaagggaacact 17782848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Original strand, 32528040 - 32528089
Alignment:
Q  25 gctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattga 74  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  32528040 gctctttatggattgaagcaggcaccaagagcttggtacagcagaattga 32528089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 639; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 639; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 715
Target Start/End: Original strand, 44150415 - 44151129
Alignment:
Q  1 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44150415 gatatggtgtacagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgaagcaagaatttg 44150514  T
Q  101 tcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtag 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44150515 ttaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatttgatagtgactggtag 44150614  T
Q  201 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44150615 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacatatgatgggtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 44150714  T
Q  301 gaagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44150715 gaagttgcagagggattggtgatgcatcaaaagaagtatgcatctgacatattgaaaaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccagctg 44150814  T
Q  401 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtag 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  44150815 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgtaatagtag 44150914  T
Q  501 acctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 600  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44150915 gcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 44151014  T
Q  601 ggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 700  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44151015 ggaacactgcagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggtatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 44151114  T
Q  701 atagaaagagcactt 715  Q
    |||||||||||||||    
T  44151115 atagaaagagcactt 44151129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 532; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 50629231 - 50628516
Alignment:
Q  1 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50629231 gatatggtgtatagattacacaaagtcctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagttttcttgtgcagcaagaatttg 50629132  T
Q  101 tcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  50629131 tcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagagaggaagtaaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgataatttgatagtgactggtag 50629032  T
Q  201 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50629031 tgatatgaatgagataaaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgttagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 50628932  T
Q  301 gaagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactg 400  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  50628931 gaagttgcagagggattcgtgatgcaccaaatgaagtatgcatctgacatattgaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccagctt 50628832  T
Q  401 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtag 500  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||| |    
T  50628831 atacaaatgtaaaactggtgatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacacttttcaagcaaatagttggttcactgaagtatctatgtagtagttg 50628732  T
Q  501 acctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 600  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50628731 acctgatattgtatatgcaattggcataatcagtagattcatgagtgaaccaaaagtatctcacctactagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 50628632  T
Q  601 ggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcata-ttctgatgctgattggtgtggagacagacaa 699  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| || || ||||| | |||||| || |||||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50628631 ggaacactgcagtatgacattttatttcctaagtggttaaatgaaaattctattgagctgataacatatttttgatgctgattggtgtggagacaaacaa 50628532  T
Q  700 gatagaaagagcactt 715  Q
    ||||||||||||||||    
T  50628531 gatagaaagagcactt 50628516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 526; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 715
Target Start/End: Original strand, 31358018 - 31358723
Alignment:
Q  1 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  31358018 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcatggaacaagagaattaacagttttcttgtgcagcaagaatttg 31358117  T
Q  101 tcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtag 200  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  31358118 tcaaatgcaagtctaactatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatttgatagtaactggtag 31358217  T
Q  201 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31358218 tgatatgaatgagatataagcattcaaatcacagatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttaat 31358317  T
Q  301 gaagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  31358318 gaagttgcagagggattggtgatgcaccaaatgaaatatgcatctgacatattgaagagggtcaatatga-gaactgcaatccatcatcatcaccagctg 31358416  T
Q  401 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtag 500  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||     
T  31358417 agacaaatgtaaaactgatgatgaatgaagatgaagaacctgtgaatccaacattgttcaagcaaatagttggttcactaaggtatctatacaatagtat 31358516  T
Q  501 acctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 600  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31358517 gcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattc--------accaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 31358608  T
Q  601 ggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 700  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| || || ||||| | |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31358609 ggaacactgcagtatgacattttatttcctaagtgcttaaatgaaaattctattgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaag 31358708  T
Q  701 atagaaagagcactt 715  Q
    |||||||||||||||    
T  31358709 atagaaagagcactt 31358723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 462 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 8893460 - 8893207
Alignment:
Q  462 gcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtagacctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctct 561  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  8893460 gcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtagacctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatct 8893361  T
Q  562 cacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactga 661  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||| || || ||| | | |||||| || ||||    
T  8893360 cacctgccagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttattttctaagtgcttaaataaaaattctattgagctga 8893261  T
Q  662 tggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcactt 715  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8893260 tagcatattctgatgttgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcactt 8893207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 333 - 689
Target Start/End: Original strand, 29257883 - 29258239
Alignment:
Q  333 gaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactgagacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagat 432  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     ||||   ||| |||||  ||| |||||||||||     
T  29257883 gaagtatgtatttgatatattgaagaggttcaatacggtgagctgcaatccatcatcatcatttgttgaggttaatttaaaataggtgatgaatgaagaa 29257982  T
Q  433 gaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtagacctgatattgcatatgcagttggcataatca 532  Q
    |||||||  ||  ||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||  ||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29257983 gaagaactagtagatcatacattgttcaagcaaattgtgggatcactaaggtatcagtgcaatagtaaaccttatattgcttatgcagttggtataatca 29258082  T
Q  533 gtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatgatattctatttcctaa 632  Q
    |||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||| | ||||||||    
T  29258083 gtaggttcatgagtgaaccaagagcttctcacttgctagcagctaaaagagtgatgagatacatcaagggaacactatagtatggcattttgtttcctaa 29258182  T
Q  633 atgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtgg 689  Q
    |||| |||||||    ||| ||||| |||| || |||||| |||| |||| ||||||    
T  29258183 atgtctgaatgaagactctgtggaattgatagcttattctaatgcagattagtgtgg 29258239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18218011 - 18217902
Alignment:
Q  25 gctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttgtcaaatgcaagtctgagtatggtg 124  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| |||||||    
T  18218011 gctctatatggattgaatcatgctccaagagtctagaacaagagaattgatagctttcttgtgcagcaagaatttgtaaagtgcaaacctgaatatggtg 18217912  T
Q  125 tatatgtgaa 134  Q
    | ||||||||    
T  18217911 tctatgtgaa 18217902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 520 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 23428452 - 23428367
Alignment:
Q  520 gttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaac 605  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||| ||| |||  |||||||||||| ||||| |||| | ||||||||| |||||| |||||    
T  23428452 gttggtataatcagcaggttcatgagtgaacctagaagctctcacttgcttgcagctaaaacaatgatgagatgcatcaagggaac 23428367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Original strand, 28393828 - 28393877
Alignment:
Q  25 gctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattga 74  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  28393828 gctctttatggattgaagcaggcaccaagagcttggtacagcagaattga 28393877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 635; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 635; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 46165 - 45451
Alignment:
Q  1 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttg 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  46165 gatatggtgtacagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttttgaagcaagaatttg 46066  T
Q  101 tcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtag 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46065 ttaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatttgatagtgactggtag 45966  T
Q  201 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45965 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacatatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcagggaatttact 45866  T
Q  301 gaagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45865 gaagttgcagagggattggtgatgcatcaaaagaagtatgcatctgacatattgaaaaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccagctg 45766  T
Q  401 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtag 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  45765 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgtaatagtag 45666  T
Q  501 acctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 600  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45665 gcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 45566  T
Q  601 ggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 700  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45565 ggaacactgcagtatggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggtatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 45466  T
Q  701 atagaaagagcactt 715  Q
    |||||||||||||||    
T  45465 atagaaagagcactt 45451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 629; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 629; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 715
Target Start/End: Original strand, 21849086 - 21849770
Alignment:
Q  31 tatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttgtcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatg 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21849086 tatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagatttcttgtacagcaagaatttgtcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatg 21849185  T
Q  131 tgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtagtgatatgaatgagatagaagcattcaaatc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21849186 tgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgcctttatgttgatgatctgatagtgactggtagtgatatgaatgagatagaagcattcaaatc 21849285  T
Q  231 acaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttactgaagttgcagagggattggtgatgcaccaa 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21849286 acaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttactgaagttgcagagggattgataatgcaccaa 21849385  T
Q  331 aagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactgagacaaatgtaaaactggtaatgaatgaag 430  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21849386 aagaagtatgcatctgatatattgaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccagctgagacaaatgtaaaactggtaatgaatgaag 21849485  T
Q  431 atgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtagacctgatattgcatatgcagttggcataat 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21849486 atgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcctgatattgcatatgcagttggcataat 21849585  T
Q  531 cagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatgatattctatttcct 630  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21849586 cagtagattcatgagtgaaccaagagtctctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggtattctatttcct 21849685  T
Q  631 aaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcactt 715  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21849686 aaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagtactt 21849770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 599; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 54168644 - 54167930
Alignment:
Q  1 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54168644 gatatggtgtacagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgaagcaagaatttg 54168545  T
Q  101 tcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtag 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54168544 ttaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatttgatagtgactggtag 54168445  T
Q  201 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54168444 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacagatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 54168345  T
Q  301 gaagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54168344 gaagttgcagagggattggtgatgcatcaaaagaagtatgcatctgatatattgaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccagctg 54168245  T
Q  401 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtag 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54168244 agacaaatgtaaaactggtgatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgcaatagtag 54168145  T
Q  501 acctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 600  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54168144 gcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 54168045  T
Q  601 ggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 700  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||| || || ||||| |   |||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54168044 ggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtgcttaaatgaaaacactattgagctgacagcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 54167945  T
Q  701 atagaaagagcactt 715  Q
    |||||||||||||||    
T  54167944 atagaaagagcactt 54167930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 536; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 715
Target Start/End: Original strand, 43553151 - 43553863
Alignment:
Q  1 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttg 100  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  43553151 gatatggtgtatagattactaaaatctctctatggattaaaacatgcaccaagagcttggaacaagagaattgacaatttttttgtgcagcaagaatttg 43553250  T
Q  101 tcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtag 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43553251 tcaaatgcaagtctgaatatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaattaactactcatctgtctttatgttgatgacttgatagtgactggtag 43553350  T
Q  201 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43553351 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcatagatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatgtaatttact 43553450  T
Q  301 gaagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  43553451 gaagttgcagagggattggtgatgcagcaaatgaagtatgcatctgacatattgaagaggttcaatatgatgaactgcaatccatcatcatcaccagctg 43553550  T
Q  401 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtag 500  Q
    |||||||||||||  || | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  43553551 agacaaatgtaaagttgatgatgaatgaagatgaagaacatgtgagtcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatttatgcaatagtag 43553650  T
Q  501 acctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 600  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43553651 gcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtggattcatgagtgaacca--agtatctcacctgctagtagccaaaagagtggtgagatacatcaaa 43553748  T
Q  601 ggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 700  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |    
T  43553749 ggaacactgcaatatggtatcctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacaaatagg 43553848  T
Q  701 atagaaagagcactt 715  Q
    |||||||||||||||    
T  43553849 atagaaagagcactt 43553863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 53354068 - 53353568
Alignment:
Q  214 atagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttactgaagttgcagagg 313  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  53354068 atagaagcattcaaaactcagatgatgaatgaatttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatattttctaggaatggaatttactgaagttgcaaagg 53353969  T
Q  314 gattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactgagacaaatgtaaa 413  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||  ||||||||  |||| |||||| | ||    
T  53353968 gattggtgatacatcaaaagaagtatgcat-tgacatattgaagaggttcaatatgatgaattgcaattcatattcatcacctgctgaaacaaatatgaa 53353870  T
Q  414 actggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtagacctgatattgca 513  Q
    ||||||  | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  53353869 actggtgttaaatgaagatgaagaatcagtggatcctacattgttcaagcaaattgtaggttcactgaggtatctatgcaatagtaggcttgatattgca 53353770  T
Q  514 tatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagt 613  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53353769 tatgcagttggtataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagggtgatgagatacatcaaaggaacactacagt 53353670  T
Q  614 atgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcac 713  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  53353669 atggtattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacaagcaggatagaaagagcac 53353570  T
Q  714 tt 715  Q
    ||    
T  53353569 tt 53353568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 53355502 - 53355300
Alignment:
Q  2 atatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  53355502 atatggtgtatagattacacaaagcactctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagttttcttatgcagcaagaatttgt 53355403  T
Q  102 caaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtagt 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  53355402 caaatgcaagtctgaatatggtgtatatgtgaagaaaggaattgaaggtaatcaactactcatctgtctatatgttgatgatttgatagtaactggtcgt 53355303  T
Q  202 gat 204  Q
    |||    
T  53355302 gat 53355300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 94
Target Start/End: Original strand, 27236087 - 27236161
Alignment:
Q  20 acaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaag 94  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| |||| ||| || || |||||||| |||||||    
T  27236087 acaaagctctgtatggtttgaagcaagctccaagagcttggaataagaaaatagatagttttcttgttcagcaag 27236161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 615; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 615; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 715
Target Start/End: Original strand, 12022146 - 12022860
Alignment:
Q  1 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12022146 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagttttcttgtacagcaagaatttg 12022245  T
Q  101 tcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12022246 tcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatttgatagtgactggtag 12022345  T
Q  201 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12022346 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacagatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttgggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 12022445  T
Q  301 gaagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactg 400  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12022446 gaagttgcagagggattgttgatgcatcaaaagaagtatgcatctgatatattgaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccagctg 12022545  T
Q  401 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtag 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12022546 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgtcggttcactgaggtatctatgcaatagtag 12022645  T
Q  501 acctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12022646 acctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 12022745  T
Q  601 ggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 700  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||| || || ||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12022746 ggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtgcttaaatgaaaattctattgaactgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 12022845  T
Q  701 atagaaagagcactt 715  Q
    |||||||||||||||    
T  12022846 atagaaagagcactt 12022860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 615; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 715
Target Start/End: Original strand, 37680893 - 37681607
Alignment:
Q  1 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37680893 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagaacttggaacaagagaattgacagttttcttgtacagcaagaatttg 37680992  T
Q  101 tcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37680993 tcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatttgatagtgactggtag 37681092  T
Q  201 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37681093 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacagatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttgggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 37681192  T
Q  301 gaagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactg 400  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37681193 gaagttgcagagggattgatgatgcatcaaaagaagtatgcatctgatatattgaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccagctg 37681292  T
Q  401 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtag 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37681293 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgcaatagtag 37681392  T
Q  501 acctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37681393 acctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 37681492  T
Q  601 ggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 700  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||| || || ||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37681493 ggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtgcttaaatgaaaattctattgaactgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 37681592  T
Q  701 atagaaagagcactt 715  Q
    |||||||||||||||    
T  37681593 atagaaagagcactt 37681607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 599; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 7100674 - 7099960
Alignment:
Q  1 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7100674 gatatggtgtacagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgaagcaagaatttg 7100575  T
Q  101 tcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtag 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7100574 ttaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatttgatagtgactggtag 7100475  T
Q  201 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7100474 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacagatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 7100375  T
Q  301 gaagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7100374 gaagttgcagagggattggtgatgcatcaaaagaagtatgcatctgatatattgaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccagctg 7100275  T
Q  401 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtag 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7100274 agacaaatgtaaaactggtgatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgcaatagtag 7100175  T
Q  501 acctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 600  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7100174 gcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 7100075  T
Q  601 ggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 700  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||| || || ||||| |   |||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7100074 ggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtgcttaaatgaaaacactattgagctgacagcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 7099975  T
Q  701 atagaaagagcactt 715  Q
    |||||||||||||||    
T  7099974 atagaaagagcactt 7099960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 591; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 715
Target Start/End: Original strand, 16797526 - 16798240
Alignment:
Q  1 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  16797526 gatatggtgtacagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgaagtaggaatttg 16797625  T
Q  101 tcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtag 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16797626 ttaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatttgatagtgactggtag 16797725  T
Q  201 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16797726 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacagatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 16797825  T
Q  301 gaagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16797826 gaagttgcagagggattggtgatgcatcaaaagaagtatgcatctgatatattgaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccagctg 16797925  T
Q  401 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtag 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16797926 agacaaatgtaaaactggtgatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgcaatagtag 16798025  T
Q  501 acctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 600  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16798026 gcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 16798125  T
Q  601 ggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 700  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||| || || ||||| |   |||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16798126 ggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtgcttaaatgaaaacactattgagctgacagcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 16798225  T
Q  701 atagaaagagcactt 715  Q
    |||||||||||||||    
T  16798226 atagaaagagcactt 16798240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 40368548 - 40368102
Alignment:
Q  1 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40368548 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttg 40368449  T
Q  101 tcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtag 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  40368448 ttaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatttgatagtgattggtag 40368349  T
Q  201 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40368348 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacagatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 40368249  T
Q  301 gaagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactg 400  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  40368248 gaagttgtagaggtattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgacatattgaagaggttcaatatgatgagttgcaatccatcatcatcaccagctg 40368149  T
Q  401 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaat 447  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40368148 agacaaatgtaaaattggtgatgaatgaagatgaagaacctgtgaat 40368102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 26455554 - 26454845
Alignment:
Q  1 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttg 100  Q
    ||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||| || || || |||| ||| || ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26455554 gatatggtgtacaagttacacaaggctctttatggtttaaagcaagcactaagggcatggaataagataattgacagcttccttgtgcagcaagaatttg 26455455  T
Q  101 tcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtag 200  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||     |||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||| || || ||||||||    
T  26455454 taaaatgtaagtctgagtatggcgtgtatgtgaagaaaggagaaagaggtaatcaaatactcatgtgtctacatgttgatgatctaattgtaactggtag 26455355  T
Q  201 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 300  Q
      |  ||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||   ||||||||||| | |||||||| ||| | ||||| |||| |||||||||||| |||    
T  26455354 caacttgattgagatagaatcattcaaaactcaaatgatgaagaagtttgaaatgactgatttaggtaaacttacatattttcaaggcatggaattcact 26455255  T
Q  301 gaagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactg 400  Q
    ||||||   || || || |  ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||    ||    
T  26455254 gaagttcatgaaggttttgctatgcatcaaatgaagtatgcatctgatatattgaagaggttcaatatggtgaactgcaaccaatcatcatcacatgttg 26455155  T
Q  401 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtag 500  Q
    |||| | | | ||||| || ||||||||||| |||  |   ||| |||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  26455154 agactagtttgaaactagtgatgaatgaagaagaatta---gtggatcctacattattcaagcagattgttggatcactaaggtatctatgcaatagtag 26455058  T
Q  501 acctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 600  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  26455057 acctgatattgcatattcagttggtataattagtaggttcatgagtgaaccaagagtttctcatttgctagctgctaaaagagtgatgagatacatcaaa 26454958  T
Q  601 ggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 700  Q
    ||||||||  ||||||  ||| | |||||||||||| || |||| |  ||||||||| ||||  | ||||||||||| |||| |||||| || |  ||||    
T  26454957 ggaacactagagtatgtcattttgtttcctaaatgtctggatgaaaactctatggaattgatatcttattctgatgcagattagtgtggggataagcaag 26454858  T
Q  701 atagaaagagcac 713  Q
    |||| ||||||||    
T  26454857 ataggaagagcac 26454845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 474 - 570
Target Start/End: Original strand, 10276578 - 10276674
Alignment:
Q  474 ttcactgaggtatctatgcaacagtagacctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgcta 570  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  10276578 ttcactgaggtatctatgcaatagtagacctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgcta 10276674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 333 - 636
Target Start/End: Original strand, 25631917 - 25632220
Alignment:
Q  333 gaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactgagacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagat 432  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||| | | |||||   ||| | ||| |||| || |||||||||    
T  25631917 gaagtatgcatatgatatacttaagaggttcaatatgttaagctgcaatcctgcatcatcgctagctgaggtgaatttgaaattggtgattaatgaagat 25632016  T
Q  433 gaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtagacctgatattgcatatgcagttggcataatca 532  Q
    |||||||  ||  ||||||||||||||||| | || || || |||||||||||| | ||||| | ||| | ||||||||| ||||||  ||| ||||| |    
T  25632017 gaagaactagttgatcctacattgttcaagaagatggtgggatcactgaggtatttgtgcaatattaggcgtgatattgcttatgcacatggtataatta 25632116  T
Q  533 gtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatgatattctatttcctaa 632  Q
    |||| |||||||||| |||||||   ||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||| || |||| |||  ||||||| ||  | ||||||||    
T  25632117 gtaggttcatgagtgaaccaagaacttctcacttgctagcagctaaaagggtcacgagatacattaagggaatactagagtatgacatattgtttcctaa 25632216  T
Q  633 atgt 636  Q
    ||||    
T  25632217 atgt 25632220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 613 - 715
Target Start/End: Original strand, 10276673 - 10276775
Alignment:
Q  613 tatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagca 712  Q
    ||||| ||| |||||||||| || || ||||| | |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  10276673 tatgacattttatttcctaagtgcttaaatgaaaattctattgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagatca 10276772  T
Q  713 ctt 715  Q
    |||    
T  10276773 ctt 10276775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15063640 - 15063438
Alignment:
Q  13 agattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttgtcaaatgcaagt 112  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| || | ||||||||| ||||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  15063640 agattacataaggctctttatggcttgaagcaagtaccaagagcatggaataagaggcttggcagttttcttgtgcagcaagaatttgtgaaatgtaaat 15063541  T
Q  113 ctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtagtgatatgaatga 212  Q
    || | |||||| | |||||||||||||| |     ||||||||  ||||||| ||  | |||||||||||||| ||  |||||||||| ||| |||||||    
T  15063540 ct-aatatggtttgtatgtgaagaaagggaaaactggtaatcagatactcatgtgcttatatgttgatgatctaattttgactggtagcgatgtgaatga 15063442  T
Q  213 gata 216  Q
    ||||    
T  15063441 gata 15063438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 110
Target Start/End: Original strand, 30064958 - 30065055
Alignment:
Q  13 agattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttgtcaaatgcaa 110  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||  | | |||||| ||||| ||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30064958 agattacataaggctctatatggtttgaagcaatctctaagagcatggaataagaggattgtcaactttctagtgcagcaagaatttgtcaaatgcaa 30065055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 603; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 603; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 715
Target Start/End: Original strand, 6363 - 7077
Alignment:
Q  1 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  6363 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagaacttggaacaagagaattgacagatttcttgtacagcaagaatttg 6462  T
Q  101 tcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6463 tcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttaggttgatgatctgatagtgactggtag 6562  T
Q  201 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6563 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgaatttgaaatgtcagatttgggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 6662  T
Q  301 gaagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactg 400  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6663 gaagttgcagagggattgataatgcaacaaaagaagtatgcatctgaaatattgaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccagctg 6762  T
Q  401 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtag 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6763 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattattcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgcaatagtag 6862  T
Q  501 acctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6863 acctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 6962  T
Q  601 ggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 700  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||| || || ||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6963 ggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtgcttaaatgaaaattctattgaactgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 7062  T
Q  701 atagaaagagcactt 715  Q
    |||||||||||||||    
T  7063 atagaaagagcactt 7077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 599; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 599; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 7941383 - 7940669
Alignment:
Q  1 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7941383 gatatggtgtacagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgaagcaagaatttg 7941284  T
Q  101 tcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtag 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7941283 ttaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatttgatagtgactggtag 7941184  T
Q  201 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941183 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacagatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 7941084  T
Q  301 gaagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7941083 gaagttgcagagggattggtgatgcatcaaaagaagtatgcatctgatatattgaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccagctg 7940984  T
Q  401 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtag 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7940983 agacaaatgtaaaactggtgatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgcaatagtag 7940884  T
Q  501 acctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 600  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7940883 gcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 7940784  T
Q  601 ggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 700  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||| || || ||||| |   |||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7940783 ggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtgcttaaatgaaaacactattgagctgacagcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 7940684  T
Q  701 atagaaagagcactt 715  Q
    |||||||||||||||    
T  7940683 atagaaagagcactt 7940669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 599; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 715
Target Start/End: Original strand, 27760254 - 27760968
Alignment:
Q  1 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27760254 gatatggtgtacagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgaagcaagaatttg 27760353  T
Q  101 tcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtag 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27760354 ttaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatttgatagtgactggtag 27760453  T
Q  201 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27760454 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacagatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 27760553  T
Q  301 gaagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27760554 gaagttgcagagggattggtgatgcatcaaaagaagtatgcatctgacatattgaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccagctg 27760653  T
Q  401 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtag 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27760654 agacaaatgtaaaactggtgatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcattgaggtatctatgcaatagtag 27760753  T
Q  501 acctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27760754 acctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 27760853  T
Q  601 ggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 700  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||| || || ||||| |  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27760854 ggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtgcttaaatgaaaactctattgagctgatagcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaag 27760953  T
Q  701 atagaaagagcactt 715  Q
    |||||||||||||||    
T  27760954 atagaaagagcactt 27760968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 13829404 - 13828693
Alignment:
Q  2 atatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttgt 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| || |||||||||||    
T  13829404 atatggtgtatagatcacacaagacactatatggattgaagcaggcaccaagagcttggaacaaaagaattgacaattttcttgtccaacaagaatttgt 13829305  T
Q  102 caaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtagt 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  13829304 caaatgcaagtctgaatatggtgtatatgtgaagaaaggaattgaaggtaatcaactactcatctgtttatatgttgatgacttgatagtgactcgtagt 13829205  T
Q  202 gatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttactg 301  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13829204 gatgtgaatgagatagaagcattcaaaactcagatgatgaatgagtttgaaatgtcagatttaggaaacttgacatattttctaggcatggaatttactg 13829105  T
Q  302 aagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactga 401  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||    
T  13829104 aagttacagagggaatggtaatgcatcaaatgaagtatgcatctgacatattgaagaggttcaatatgatgaactgcaatccatcatcatcacctgcaga 13829005  T
Q  402 gacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtaga 501  Q
    ||||||||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||| || |||||     
T  13829004 gacaaatgtgaaaccggtgataaatgaagaggaagaacctgtggatcttacattgttcaaagaaattgtgggttcactgaggtatctatgaaatagtagg 13828905  T
Q  502 cctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaag 601  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13828904 cctgatattgcatatgcagttggtataatcagtagattaatgagtgaaccaagagtatctcatctgctagtagccaaaagagtgatgagatatatcaaag 13828805  T
Q  602 gaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaaga 701  Q
    ||||||| || ||||  ||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||||||| ||| |  || ||    
T  13828804 gaacactacattatggcatcttatttcctaaatgtttgaatgaaaattctatggaactaatatcatattatgatgttgattggtgtgtagataagcagga 13828705  T
Q  702 tagaaagagcac 713  Q
    ||| ||||||||    
T  13828704 taggaagagcac 13828693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 446 - 683
Target Start/End: Original strand, 22580229 - 22580466
Alignment:
Q  446 atcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtagacctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgag 545  Q
    ||||||||||||||||| |||| || || ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||||    
T  22580229 atcctacattgttcaagaaaattgtgggatcactaaggtatttatgcaatagtaggcctgatattgcttatgcagttggtgtaattagtaggttcatgag 22580328  T
Q  546 tggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgat 645  Q
    || ||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||  | ||||  ||| | |||||||||||| ||| |||     
T  22580329 tgaaccaagagcttctcacttgctagaagctaaaagagtgatgagatacatcaaggggacactagaatatggcattttgtttcctaaatgtctgactgaa 22580428  T
Q  646 agttctatggaactgatggcatattctgatgctgattg 683  Q
      |||||||||| |||| || ||||||||||| |||||    
T  22580429 gattctatggaattgatagcttattctgatgcagattg 22580466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 74
Target Start/End: Original strand, 5242616 - 5242674
Alignment:
Q  16 ttacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattga 74  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||    
T  5242616 ttacacaaagctctctatggcttgaaacaagcatctagagcatggaacaagaggattga 5242674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 599; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 599; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 8316804 - 8316090
Alignment:
Q  1 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8316804 gatatggtgtacagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgaagcaagaatttg 8316705  T
Q  101 tcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtag 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8316704 ttaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatttgatagtgactggtag 8316605  T
Q  201 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8316604 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacagatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 8316505  T
Q  301 gaagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8316504 gaagttgcagagggattggtgatgcatcaaaagaagtatgcatctgatatattgaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccagctg 8316405  T
Q  401 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtag 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8316404 agacaaatgtaaaactggtgatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgcaatagtag 8316305  T
Q  501 acctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 600  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8316304 gcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 8316205  T
Q  601 ggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 700  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||| || || ||||| |   |||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8316204 ggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtgcttaaatgaaaacactattgagctgacagcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 8316105  T
Q  701 atagaaagagcactt 715  Q
    |||||||||||||||    
T  8316104 atagaaagagcactt 8316090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 591; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 27569483 - 27568769
Alignment:
Q  1 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27569483 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcacgaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttg 27569384  T
Q  101 tcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtag 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27569383 ttaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaagataatcaactactcagctgtctttatgttgatgatttgatagtgtctggtag 27569284  T
Q  201 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27569283 tgatatgaatgagatagaagcatttaaatcacagatgatgagtgagcttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggagtttact 27569184  T
Q  301 gaagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27569183 gaagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgacatattgaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactg 27569084  T
Q  401 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtag 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27569083 agacaaatgtaaaactggtgatgaatgaagatgaagaacgtgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaatagtag 27568984  T
Q  501 acctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27568983 acctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 27568884  T
Q  601 ggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 700  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||| || || ||||| | |||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27568883 ggaacactacagtatgacattttatttcctaagtgcttaaatgaaaattctattgagctgatagcatattatgatgctgattggtgtggagacaaacaag 27568784  T
Q  701 atagaaagagcactt 715  Q
    |||||||||||||||    
T  27568783 atagaaagagcactt 27568769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 17887929 - 17887539
Alignment:
Q  1 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17887929 gatatggtgtatagattacacaaagccctctatggattgaaacaggcaccaagagcttgaaacaagagaattgacagttttcttgtgcagcaagaatttg 17887830  T
Q  101 tcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtag 200  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17887829 ttaaatgcaagtttgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaaatgatggtaatcaactactcatttttctttatgttgatgatttgatagtgactggtag 17887730  T
Q  201 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17887729 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacagatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattggcatactttcaaggcatggaatttact 17887630  T
Q  301 gaagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcat 391  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17887629 gaagttggagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgacatattgaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcat 17887539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 438
Target Start/End: Original strand, 17162955 - 17163382
Alignment:
Q  3 tatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttgtc 102  Q
    |||||||||||||| |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  17162955 tatggtgtatagatcacacaaggcactatatggtttgaagcaagcaccaagagcctggaacaagagaattgacaattttcttgtgcggcaagaatttgtc 17163054  T
Q  103 aaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtagtg 202  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||        || || |||||    
T  17163055 aaatgcaagtctgaatatggtgtatatgtgaagaaaggaattgaagataatcaactactcatttgtctatatgttgataat--------gattgttagtg 17163146  T
Q  203 atatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttactga 302  Q
     | ||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17163147 ttgtgaatgagatagaagcattcaaaactcagatgatgaatgagtttgaaatgtcagatttaggaaacttgacatattttctaggcatggaatttactga 17163246  T
Q  303 agttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactgag 402  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |  |||||    
T  17163247 agttgcagtgggactggtgatgcatcaattgaagtatgtatctgatatattgaagaggttcaatatgatgaactacaattcatcatcatcatctgctgag 17163346  T
Q  403 acaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaa 438  Q
    || ||| | ||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  17163347 actaatatgaaattggtgatgaatgaagaagaagaa 17163382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 185 - 685
Target Start/End: Original strand, 3595760 - 3596259
Alignment:
Q  185 tgatagtgactggtagtgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttct 284  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||    |||||||||  |||| ||||||| ||||||||  |||  | |||||  ||||    
T  3595760 tgattgtgaccggtagtgatgtgaatgagatagaaacgttcaaaggcaaaatgatgaaagagtgtgaaatgacagatttattaaagctaacatatgttct 3595859  T
Q  285 aggcatggaatttactgaagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatcca 384  Q
     ||||||||||| |||||  ||   || ||||  || ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3595860 tggcatggaattcactgagatttttgaaggatgtgttatgcatcaaatgaagtatgcatctgatatattgaagaggttcaaaatggtgagctgcaatcca 3595959  T
Q  385 tcatcatcaccaactgagacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggt 484  Q
    | ||||||||| ||||| || ||| | ||| ||||  |||||||||| |||||||  ||  ||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||    
T  3595960 ttatcatcacctactgaaactaattttaaaatggtggtgaatgaagaagaagaactagtagatcctacattgttcaagcatattgtgggatcactaaggt 3596059  T
Q  485 atctatgcaacagtagacctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagt 584  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||    
T  3596060 atatgtgcaatagtagacctgatattgcatatgcagttggtataatcagacgattcatgagtgaaccaagagcatctcacctgctagcagctaaaagagt 3596159  T
Q  585 gatgagatacatcaaaggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattgg 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||| | |||||||||||| | ||||| |  |||| |||| | ||  | ||||||||||| ||||||    
T  3596160 gatgagatacatcaaaggaacactagagtatg-cattttgtttcctaaatgtataaatgaaaactctacggaatttataacttattctgatgcagattgg 3596258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 475 - 713
Target Start/End: Original strand, 23255807 - 23256045
Alignment:
Q  475 tcactgaggtatctatgcaacagtagacctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcag 574  Q
    |||||||||||| | ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||| || |  ||| |||||| ||||||||  |||||||||| |||||    
T  23255807 tcactgaggtatttgtgcaatagaaggcctgatattgcttatgcacttggcataattagcatgttcgtgagtgaaccaagagcttctcacttgcaagcag 23255906  T
Q  575 ccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctga 674  Q
    | ||||| |||||||||||||||||  ||| |||  |||| | ||| || |||||||||||| ||| | |   |||||||||  |||| || ||||||||    
T  23255907 ctaaaagggtgatgagatacatcaattgaatactagagtaaggtatactgtttcctaaatgtctgacttaagattctatggagttgatagcttattctga 23256006  T
Q  675 tgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcac 713  Q
    |||  ||| |||||| || |  ||||||| |||||||||    
T  23256007 tgcatattagtgtggggataagcaagatataaagagcac 23256045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 608 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 17887538 - 17887431
Alignment:
Q  608 tgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaa 707  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| || || ||||| | |||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17887538 tgcagtatggcattttatttcctaagtgcttaaatgaaaattctattgagctgatatcatattctgatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaa 17887439  T
Q  708 gagcactt 715  Q
    ||||||||    
T  17887438 gagcactt 17887431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 15566190 - 15566068
Alignment:
Q  12 tagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttgtcaaatgcaag 111  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||     
T  15566190 tagattacataaggctctatatggtttgaagcaagctccaagagcctggaataagaggattgacaactttcttgtgcagcaatactttgtcaaatgcaaa 15566091  T
Q  112 tctgagtatggtgtatatgtgaa 134  Q
     |||| |||||||| ||||||||    
T  15566090 gctgaatatggtgtctatgtgaa 15566068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 599; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 599; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 715
Target Start/End: Original strand, 26314870 - 26315584
Alignment:
Q  1 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26314870 gatatggtgtacagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgaagcaagaatttg 26314969  T
Q  101 tcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtag 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26314970 ttaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggtaatcaactactcatctgtctttatgttgatgatttgatagtgactggtag 26315069  T
Q  201 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26315070 tgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacagatgatgagtgagtttgaaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttact 26315169  T
Q  301 gaagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26315170 gaagttgcagagggattggtgatgcatcaaaagaagtatgcatctgatatattgaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccagctg 26315269  T
Q  401 agacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtag 500  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26315270 agacaaatgtaaaactggtgatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgttcaagcaaattgttggttcactgaggtatctatgcaatagtag 26315369  T
Q  501 acctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 600  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26315370 gcctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagtatctcacctgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaa 26315469  T
Q  601 ggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 700  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||| || || ||||| |   |||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26315470 ggaacactgcagtatggcattttatttcctaagtgcttaaatgaaaacactattgagctgacagcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaag 26315569  T
Q  701 atagaaagagcactt 715  Q
    |||||||||||||||    
T  26315570 atagaaagagcactt 26315584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 258 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 43592863 - 43592407
Alignment:
Q  258 agatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttactgaagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatatattaaag 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||| |||    
T  43592863 agatttaggaaaattgacatactttctaggcatgaaatttactgaagttgcagagggattggtgatgcaccaaatggagtatacatctgacatattgaag 43592764  T
Q  358 aggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactgagacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgt 457  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592763 atgttcaatatgatgaactgcaatccatcatcatcactatccgagacaaatgtaaaactgatgatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcctacattgt 43592664  T
Q  458 tcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtagacctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggaccaagagt 557  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43592663 tcaagcaaatagttggttcaccgaggtatttatgcaatagtcgacctgctattgcatatgcagttagcataatcagtagattcatgagtgaaccaagagt 43592564  T
Q  558 ctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttctatggaa 657  Q
     |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||| || || ||||| | || ||| ||     
T  43592563 atctcacctgctagcagacaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatggcattttattt-ctaagtgcttaaatgaaaattatattgag 43592465  T
Q  658 ctgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcactt 715  Q
     |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43592464 ttgatagcatattataatgctgattggtgtggagacaaacaagatagaaagagcactt 43592407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 43593011 - 43592862
Alignment:
Q  1 gatatggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttg 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  43593011 gataaggtgtatagattacacaaagctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagataattggcagttttcttgtgcagcaagagtttg 43592912  T
Q  101 tcaaatgcaagtctgagtatg--gtgtatatgtgaagaaaggaagtgaag 148  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  43592911 tcaaatgcaaatctgagtatggtgtgtatatgtgaagaaaggaagtgaag 43592862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 51 - 715
Target Start/End: Original strand, 30646273 - 30646936
Alignment:
Q  51 aagagcttggaacaagagaattgacagctttcttgtgcagcaagaatttgtcaaatgcaagtctgagtatggtgtatatgtgaagaaaggaagtgaaggt 150  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||   ||    
T  30646273 aagagcctgaaaaaagagaattgacagctttcttgtgcaacaagaatttataaaatgcaaagctgaatattgtgtatatgtgaagaaaggaaatgccagt 30646372  T
Q  151 aatcaactactcatctgtctttatgttgatgatctgatagtgactggtagtgatatgaatgagatagaagcattcaaatcacaaatgatgagtgagtttg 250  Q
    |||    ||| ||| ||  | ||||||||| |||||||||| ||||||||  |  ||| |||||||||||| |||||     | |||||||  |||||||    
T  30646373 aatatgatacccatatgcttatatgttgattatctgatagtaactggtagcaacttgactgagatagaagctttcaaggtttagatgatgaaagagtttg 30646472  T
Q  251 aaatgtcagatttaggaaaattgacatactttctaggcatggaatttactgaagttgcagagggattggtgatgcaccaaaagaagtatgcatctgatat 350  Q
    | ||| | ||  | |||||  |  | ||||| || |||||| |||| ||||||    | || |  ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  30646473 atatgactgaccttggaaagctagcgtacttccttggcatgtaattcactgaaacctctgaagttttggttatgcatcaaaagaagtatgcttttgatat 30646572  T
Q  351 attaaagaggttcaatatgatgagctgcaatccatcatcatcaccaactgagacaaatgtaaaactggtaatgaatgaagatgaagaacctgtgaatcct 450  Q
      | || ||||| |||||| | |||||||||||  ||||  ||||||||||   || | | ||||| || |  ||||||||||| ||||  ||  |||||    
T  30646573 tcttaaaaggtttaatatgctaagctgcaatcctacatctacaccaactgatgtaagtttgaaactagtgaataatgaagatgaggaactagttgatcct 30646672  T
Q  451 acattgttcaagcaaatagttggttcactgaggtatctatgcaacagtagacctgatattgcatatgcagttggcataatcagtagattcatgagtggac 550  Q
    || ||||||||| |||| || |||||| | |||||| | || || || |||||  | |||   |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  30646673 actttgttcaagaaaattgtgggttcattaaggtatttgtgtaatagcagaccatacattagttatgcaattggcat-atcagtagatttatgagtgaac 30646771  T
Q  551 caagagtctctcacttgctagcagccaaaagagtgatgagatacatcaaaggaacactgcagtatgatattctatttcctaaatgtttgaatgatagttc 650  Q
    ||||||  |||||| |  | ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||  || ||||||  ||  | || ||||||||| | |||||     |    
T  30646772 caagagcttctcacctaattgcagctaaaagggtgataagatacatcaagggaactatggagtatggcatatttttccctaaatgtataaatgaagcaac 30646871  T
Q  651 tatggaactgatggcatattctgatgctgattggtgtggagacagacaagatagaaagagcactt 715  Q
    ||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  30646872 tatggaattgatggcatactcatatgctgattggtgtggagataggcaagatagaaagagtactt 30646936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 6832268 - 6832219
Alignment:
Q  25 gctctctatggattgaaacaggcaccaagagcttggaacaagagaattga 74  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  6832268 gctctttatggattgaagcaggcaccaagagcttggtacaacagaattga 6832219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University