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 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1411_low_14 (Length: 254)

Name: NF1411_low_14
Description: NF1411
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1411_low_14
NF1411_low_14
[»] chr6 (6 HSPs)
chr6 (1-237)||(32450192-32450428)
chr6 (8-237)||(23260515-23260743)
chr6 (34-237)||(25005229-25005432)
chr6 (37-237)||(34636272-34636457)
chr6 (38-149)||(10751527-10751637)
chr6 (18-56)||(26182570-26182608)
[»] chr1 (5 HSPs)
chr1 (1-237)||(35761979-35762217)
chr1 (93-233)||(9537377-9537517)
chr1 (37-165)||(37667144-37667271)
chr1 (11-233)||(16074800-16075014)
chr1 (187-237)||(37667265-37667315)
[»] chr3 (7 HSPs)
chr3 (38-237)||(5004687-5004885)
chr3 (37-237)||(46404537-46404727)
chr3 (43-235)||(11967862-11968053)
chr3 (126-237)||(16975339-16975450)
chr3 (8-99)||(16975453-16975544)
chr3 (155-207)||(8730913-8730966)
chr3 (155-207)||(9082800-9082853)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (37-237)||(8925-9125)
[»] chr7 (5 HSPs)
chr7 (1-235)||(21491423-21491659)
chr7 (37-237)||(15873911-15874102)
chr7 (1-225)||(18367257-18367476)
chr7 (93-233)||(22077720-22077860)
chr7 (112-225)||(48576426-48576540)
[»] chr5 (3 HSPs)
chr5 (1-233)||(4557899-4558133)
chr5 (37-237)||(536899-537090)
chr5 (161-237)||(536815-536891)
[»] chr4 (2 HSPs)
chr4 (1-243)||(49499091-49499333)
chr4 (93-233)||(28969204-28969344)
[»] scaffold1838 (1 HSPs)
scaffold1838 (99-225)||(271-397)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (171-237)||(32735391-32735457)
chr2 (129-233)||(29270722-29270827)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 221; Significance: 1e-122; HSPs: 6)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 32450192 - 32450428
Alignment:
Q  1 accataatgaaatattttcataaaactcatatttctatattttcatttatttagtttatcaacaaagtctaacacttatttaacaataccacaaaaacat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32450192 accaaaatgaaatattttcataaaactcatatttctatattttcatttatttagtttatcaacaaagtctaacacttctttaacaataccacaaaaacat 32450291  T
Q  101 atatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacataacattatcatacacacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32450292 atatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacataacattatcatacacacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaagttaaa 32450391  T
Q  201 ttttaccatatgaattcatattttagttgttttgttc 237  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32450392 atttaccatatgaattcatattttagttgttttgttc 32450428  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 8 - 237
Target Start/End: Original strand, 23260515 - 23260743
Alignment:
Q  8 tgaaatattttcataaaactcatatttctatattttcatttatttagtttatcaacaaagtctaacacttatttaacaataccacaaaaacatatatgca 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23260515 tgaaatattttcataaaactcatatttctatattttcatttatttagtttatcagcaaa-tctaacacttctttaacaataccacaaaaacatatatgaa 23260613  T
Q  108 tagaaaaataaaataaatgtcattccacataacattatcatacacacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttacc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23260614 tagaaaaataaaataaatgtcattccacataacattatcatacaaacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggctaaattttacc 23260713  T
Q  208 atatgaattcatattttagttgttttgttc 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23260714 atatgaattcatattttagttgttttgttc 23260743  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 34 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25005432 - 25005229
Alignment:
Q  34 tctatattttcatttatttagtttatcaacaaagtctaacacttatttaacaataccacaaaaacatatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattcc 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25005432 tctatattttcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttctttaacaataccacaaaaacatatatgaatagaaaaataaaataaatgtcattcc 25005333  T
Q  134 acataacattatcatacacacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgtttt 233  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25005332 acataaaattatcatacagacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcttattttagttgtttt 25005233  T
Q  234 gttc 237  Q
    ||||    
T  25005232 gttc 25005229  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34636457 - 34636272
Alignment:
Q  37 atattttcatttatttagtttatcaacaaagtctaacacttatttaacaataccacaaaaacatatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccaca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||| |||||    
T  34636457 atattttcatttatttagtttatcagcaaagtctaacactta-------ataccacaaaaacatatatgaatagaaaaa--------atgtcatgccaca 34636373  T
Q  137 taacattatcatacacacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgtt 236  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34636372 taacattatcatacagacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgtt 34636273  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 149
Target Start/End: Original strand, 10751527 - 10751637
Alignment:
Q  38 tattttcatttatttagtttatcaacaaagtctaacacttatttaacaataccacaaaaacatatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10751527 tattttcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttcttta-caataccacaaaaacatatatgaatagaaaaataaaataaatgtcattccacat 10751625  T
Q  138 aacattatcata 149  Q
    ||||||||||||    
T  10751626 aacattatcata 10751637  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 56
Target Start/End: Original strand, 26182570 - 26182608
Alignment:
Q  18 tcataaaactcatatttctatattttcatttatttagtt 56  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26182570 tcatagaactcatatttctatattttcatttatttagtt 26182608  T

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Target: chr1 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 35761979 - 35762217
Alignment:
Q  1 accataatgaaatattttcataaaactcatatttctatattttcatttatttagtttatcaacaaagtctaacacttatttaacaataccacaaaaacat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  35761979 accaaaatgaaatattttcataaaacacatatttctatattttcatttatttagtttatctacaaagtctaacacttcattaacaataccacaaaaacat 35762078  T
Q  101 atatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacataacattatcatacacacatcatataaaatataattaaactaataac--ttttataaaaggtta 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  35762079 atatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacataacattatcatacacacatcatataaaatatagttaaactaataacttttttataaaaggtta 35762178  T
Q  199 aattttaccatatgaattcatattttagttgttttgttc 237  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35762179 aattttaccatataaattcatattttagttgttttgttc 35762217  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Original strand, 9537377 - 9537517
Alignment:
Q  93 aaaaacatatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacataacattatcatacacacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaa 192  Q
    ||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9537377 aaaaacatatacgcatagcaacatgaaataaatgtcattctacataacattatcatacaaacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaa 9537476  T
Q  193 aggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgtttt 233  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||    
T  9537477 aggttaaattttacaatataaatttatattttacttgtttt 9537517  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 165
Target Start/End: Original strand, 37667144 - 37667271
Alignment:
Q  37 atattttcatttatttagtttatcaacaaagtctaacacttatttaacaataccacaaaaacatatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccaca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37667144 atattttcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttcttta-caataccacaaaaacatatatgaatagaaaaataaaataaaagtcattccaca 37667242  T
Q  137 taacattatcatacacacatcatataaaa 165  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37667243 taacattatcatacagacatcatataaaa 37667271  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16075014 - 16074800
Alignment:
Q  11 aatattttcataaaactcatatttctatatttt-catttatttagtttatcaacaaagtctaacacttatttaacaataccacaaaaa-catatatgcat 108  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||||| || ||| |||||||||| |||  |||||  | ||||| | ||||   ||    
T  16075014 aatattttcatgaaactcacattttcatatttttcatttctttagtttataaaaaaaatctaacacttctttcccaatataaaaaaaaacctataaagat 16074915  T
Q  109 agaaaaataaaataaatgtcattccacataacattatcatacacacatcatataaaatataattaaa-ctaataacttttataaaaggttaaattttacc 207  Q
    ||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||           ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  16074914 agccaaataaaataaatgtcattctacattacattatcata-----------taaaatataattaaatctaataacttttataaaagattaaattttaac 16074826  T
Q  208 atatgaattcatattttagttgtttt 233  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  16074825 atatgaattcatattttaattgtttt 16074800  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Original strand, 37667265 - 37667315
Alignment:
Q  187 tataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgttc 237  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37667265 tataaaaggttaaattttatcatatgaattcatattttagttgttttgttc 37667315  T

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Target: chr3 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 7)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 38 - 237
Target Start/End: Original strand, 5004687 - 5004885
Alignment:
Q  38 tattttcatttatttagtttatcaacaaagtctaacacttatttaacaataccacaaaaacatatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5004687 tattttcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttcttta-caataccacaaaaacatatatgaatagaaaaataaaataaatgtcattccacat 5004785  T
Q  138 aacattatcatacacacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgttc 237  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5004786 aacattatcatacagacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaatttcaccatataaattcatattttagttgttttgttc 5004885  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 237
Target Start/End: Original strand, 46404537 - 46404727
Alignment:
Q  37 atattttcatttatttagtttatcaacaaagtctaacacttatttaacaataccacaaaaacatatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccaca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||         | |||||||||    
T  46404537 atattttcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttcttta-caataccacaaaaacatatatgaatagaaaaat---------gccattccaca 46404626  T
Q  137 taacattatcatacacacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgtt 236  Q
     |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46404627 aaacattatcatacagatatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgtt 46404726  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Original strand, 11967862 - 11968053
Alignment:
Q  43 tcatttatttagtttatcaacaaagtctaacacttatttaacaataccacaaaaa--catatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacataac 140  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  ||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  11967862 tcatttctttagtttatcaacaaaat--aacacttctttcccaataccacaaaaaaacatatatgcatatcaaaataaaataaatgtcattctacggaac 11967959  T
Q  141 attatcatacacacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgt 235  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  11967960 atttt-atacacacatcgtataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatataaattcatattttagattttttgt 11968053  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 126 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16975450 - 16975339
Alignment:
Q  126 gtcattccacataacattatcatacacacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatatttta 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16975450 gtcattccacataaaattatcatacagacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatatttta 16975351  T
Q  226 gttgttttgttc 237  Q
    ||||||||||||    
T  16975350 gttgttttgttc 16975339  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16975544 - 16975453
Alignment:
Q  8 tgaaatattttcataaaactcatatttctatattttcatttatttagtttatcaacaaagtctaacacttatttaacaataccacaaaaaca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16975544 tgaaatattttcataaaactcatatttctatattttcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttctttaacaataccacaaaaaca 16975453  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8730966 - 8730913
Alignment:
Q  155 atcatataaaatataatta-aactaataacttttataaaaggttaaattttacc 207  Q
    ||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8730966 atcatataaaacataatgagaattaataacttttataaaagattaaattttacc 8730913  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 9082853 - 9082800
Alignment:
Q  155 atcatataaaatataatta-aactaataacttttataaaaggttaaattttacc 207  Q
    ||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9082853 atcatataaaacataatgagaattaataacttttataaaagattaaattttacc 9082800  T

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Target: scaffold0413 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 37 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9125 - 8925
Alignment:
Q  37 atattttcatttatttagtttatcaacaaagtctaacacttatttaacaataccacaaaaacatatatgcatagaaaaa-taaaataaatgtcattccac 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9125 atattttcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttcttta-caataccacaaaaacatatatgaatagaaaaaataaaataaatgtcattccac 9027  T
Q  136 ataacattatcatacacacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgt 235  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9026 ataacattatcatacagacatcatataaaatataattaaactaataactgttataaaaggttaaattttaccatgtgaattcatattttagttgttttgt 8927  T
Q  236 tc 237  Q
    ||    
T  8926 tc 8925  T

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Target: chr7 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 5)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 21491423 - 21491659
Alignment:
Q  1 accataatgaaatattttcataaaactcatatttctatattttcatttatttagtttatcaacaaagtctaacacttatttaacaataccacaaaaa--- 97  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||  ||||||||||||||       
T  21491423 accaaaatgaaatattttcataaaactcatattactatattttcatttctttagtttatcaacaaaatccaacacttctttcccaataccacaaaaaaaa 21491522  T
Q  98 catatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacataacattatcatacacacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggtt 197  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21491523 catatatgcatatcaaaataaaataaatgtcattctacataacatttt-atgcacacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggtt 21491621  T
Q  198 aaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgt 235  Q
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T  21491622 aaattttaccatataaattcatattttagtttttttgt 21491659  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 237
Target Start/End: Original strand, 15873911 - 15874102
Alignment:
Q  37 atattttcatttatttagtttatcaacaaagtctaacacttatttaacaataccacaaaaacatatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccaca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||        ||| |||||||||    
T  15873911 atattttcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttcttta-caataccacaaaaacatatatgaatagaaaaa--------atgccattccaca 15874001  T
Q  137 taacattatcatacacacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgtt 236  Q
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T  15874002 aaacattatcatacagatatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgtt 15874101  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 18367257 - 18367476
Alignment:
Q  1 accataatgaaatattttcataaaactcatatttctatattttcatttatttagtttatcaacaaagtctaacacttatttaacaataccac--aaaaac 98  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||  |||||||||  ||||||    
T  18367257 accaaaatgaaatatttttataaatctcatatttctatattttcatttctttagtttatcaacaaaatccaacacttctttcccaataccacaaaaaaac 18367356  T
Q  99 atatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacataacattatcatacacacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggtta 198  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||| |   ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18367357 atatatgcatatcaaaataaaataaatgtcattctacgtaacattttaatata---at----taaaatataattaaactaataacttttataaaaggtta 18367449  T
Q  199 aattttaccatatgaattcatatttta 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18367450 aattttaccatataaattcatatttta 18367476  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22077860 - 22077720
Alignment:
Q  93 aaaaacatatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacataacattatcatacacacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaa 192  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  22077860 aaaaacatatatgcataggaaaataaagcaaatgtcattctacataacattatcatacacacatcatataaaatataattaaactaataactttttgaaa 22077761  T
Q  193 aggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgtttt 233  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22077760 tggttaaattttaccatataaatttatattttagttgtttt 22077720  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 48576540 - 48576426
Alignment:
Q  112 aaaataaaataaatgtcattccacataacattatcatacacacatcatataaaatataatt-aaactaataacttttataaaaggttaaattttaccata 210  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||    
T  48576540 aaaatagaataaatgtcattctgcatcacattatcatacacacatcatataatatataattaaaactaataactttaataagatattaaattttaccata 48576441  T
Q  211 tgaattcatatttta 225  Q
    | |||||||||||||    
T  48576440 taaattcatatttta 48576426  T

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Target: chr5 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 4557899 - 4558133
Alignment:
Q  1 accataatgaaatattttcataaaactcatatttctatattttcatttatttagtttatcaacaaagtctaacacttatttaacaataccacaaaa--ac 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||  |||||||||||||  ||    
T  4557899 accaaaatgaaatattttcataaaactcatatttatatattttcatttctttagtttatcaacaaaatccaacacttctttctcaataccacaaaaaaac 4557998  T
Q  99 atatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacataacattatcatacacacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggtta 198  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4557999 atatatgcatatcaaaataaaataaaagtcattctacgtaacattattatacacacattatataaaatatgattaaactaataacttttataaaaggtta 4558098  T
Q  199 aattttaccatatgaattcatattttagttgtttt 233  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4558099 aattttaccatataaattcatattttagttttttt 4558133  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 37 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 537090 - 536899
Alignment:
Q  37 atattttcatttatttagtttatcaacaaagtctaacacttatttaacaataccacaaaaacatatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccaca 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||        ||| |||||||||    
T  537090 atattttcatttatttagtttatcagcaaagtctaacacttcttta-caataccacaaaaacatatatgaatagaaaaa--------atgccattccaca 537000  T
Q  137 taacattatcatacacacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgtt 236  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  536999 taacattatcatacagacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgtt 536900  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 161 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 536891 - 536815
Alignment:
Q  161 taaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgttc 237  Q
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T  536891 taaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgttc 536815  T

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Target: chr4 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 49499333 - 49499091
Alignment:
Q  1 accataatgaaatattttcataaaactcatatttctatattttcatttatttagtttatcaacaaagtctaacacttatttaacaataccacaaaaa-ca 99  Q
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T  49499333 accaaaatgaaatattttcataaaactcatatttctatattttcatttctttagtttatcaacaaaatccaacacttctttcccaataccacaaaaaaca 49499234  T
Q  100 tatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacataacattatcatacacacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaa 199  Q
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T  49499233 tatatgcatatcaaaataaaataaatgtcattctacgtaacatctt-atacacacattatataaaatataattaaactaataatttttataaaaggttaa 49499135  T
Q  200 attttaccatatgaattcatattttagttgttttgttcatctca 243  Q
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T  49499134 attttactatataaattcatattttagttttttttttcttctca 49499091  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Original strand, 28969204 - 28969344
Alignment:
Q  93 aaaaacatatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacataacattatcatacacacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaa 192  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28969204 aaaaacatatatgcatagcaaaataaaataaatgtcattctacataaaattatcatacacacatcatatagaatataattaaactaataacttttataaa 28969303  T
Q  193 aggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgtttt 233  Q
    | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  28969304 atgttaaattttaccatataaattaatattttagttgtttt 28969344  T

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Target: scaffold1838 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1838
Description:

Target: scaffold1838; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 397 - 271
Alignment:
Q  99 atatatgcatagaaaaataaaataaatgtcattccacataacattatcatacacacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggtta 198  Q
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T  397 atatatgcatggcaaaataaaataaatggcattctacataacattatcatacacacatcatataaaatataattaaactaataacttttataaaaggtta 298  T
Q  199 aattttaccatatgaattcatatttta 225  Q
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T  297 aattttaccatatagatttatatttta 271  T

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Target: chr2 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 171 - 237
Target Start/End: Original strand, 32735391 - 32735457
Alignment:
Q  171 ttaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttagttgttttgttc 237  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32735391 ttaaactaatatcttttataaaaggttaaatttcaccatatgaatgcatattttagttgttttgttc 32735457  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 129 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29270827 - 29270722
Alignment:
Q  129 attccacataacattatcatacacacat--catataaaatataattaaactaataacttttataaaaggttaaattttaccatatgaattcatattttag 226  Q
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T  29270827 attccacatcacattctcatacacaaatatcaaataaa-tataattaaaataataatttttataaaatattaaattttactatgtaactacatattttaa 29270729  T
Q  227 ttgtttt 233  Q
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T  29270728 ttgtttt 29270722  T

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