View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14126_low_2 (Length: 443)

Name: NF14126_low_2
Description: NF14126
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14126_low_2
NF14126_low_2
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (1-426)||(26878613-26879038)
chr2 (1-426)||(28722169-28722593)
chr2 (1-426)||(24415874-24416301)
chr2 (1-426)||(22773309-22773733)
chr2 (1-426)||(19303279-19303703)
chr2 (1-425)||(10276525-10276947)
chr2 (1-425)||(24328601-24329023)
chr2 (1-426)||(24802502-24802926)
chr2 (1-425)||(39170946-39171368)
chr2 (1-425)||(43353968-43354390)
chr2 (1-425)||(9898425-9898847)
chr2 (1-425)||(11396024-11396446)
chr2 (1-425)||(43092217-43092639)
chr2 (1-425)||(4219434-4219856)
chr2 (1-425)||(9763615-9764037)
chr2 (1-425)||(22915712-22916134)
chr2 (1-425)||(29253758-29254180)
chr2 (1-425)||(34791069-34791491)
chr2 (1-425)||(40250147-40250569)
chr2 (1-425)||(35262542-35262964)
chr2 (1-425)||(35273167-35273589)
chr2 (196-426)||(21162992-21163222)
chr2 (160-416)||(24842980-24843236)
chr2 (292-425)||(10899690-10899823)
chr2 (238-425)||(21916869-21917056)
chr2 (238-425)||(21919197-21919384)
chr2 (160-425)||(24303108-24303373)
chr2 (144-212)||(25828139-25828207)
chr2 (160-218)||(20567201-20567259)
chr2 (155-341)||(23185389-23185575)
chr2 (155-341)||(23596652-23596838)
chr2 (160-309)||(25119441-25119590)
chr2 (358-425)||(27230977-27231044)
chr2 (156-371)||(28702277-28702492)
chr2 (158-269)||(22257122-22257233)
[»] chr5 (53 HSPs)
chr5 (1-426)||(20552769-20553193)
chr5 (1-426)||(17456196-17456620)
chr5 (1-426)||(21704847-21705271)
chr5 (1-426)||(34052913-34053338)
chr5 (1-426)||(24982293-24982720)
chr5 (1-422)||(23393360-23393783)
chr5 (1-426)||(43620777-43621201)
chr5 (1-426)||(19464926-19465350)
chr5 (1-425)||(1120786-1121209)
chr5 (1-425)||(6976761-6977183)
chr5 (1-425)||(14030997-14031419)
chr5 (1-425)||(35216458-35216880)
chr5 (1-425)||(37739451-37739873)
chr5 (1-425)||(9336909-9337331)
chr5 (1-425)||(22677071-22677493)
chr5 (1-425)||(23363065-23363487)
chr5 (1-425)||(24568043-24568465)
chr5 (1-425)||(24826359-24826781)
chr5 (1-425)||(27461117-27461539)
chr5 (1-425)||(34772864-34773286)
chr5 (1-425)||(39353451-39353873)
chr5 (1-425)||(14456496-14456918)
chr5 (1-425)||(15740924-15741346)
chr5 (1-425)||(23297232-23297654)
chr5 (1-425)||(36592001-36592423)
chr5 (1-425)||(14567537-14567959)
chr5 (1-425)||(27621656-27622078)
chr5 (1-425)||(31834435-31834857)
chr5 (1-425)||(31419617-31420042)
chr5 (1-425)||(5300026-5300448)
chr5 (1-426)||(13532751-13533175)
chr5 (1-425)||(16002780-16003202)
chr5 (1-425)||(17608017-17608439)
chr5 (1-425)||(24808871-24809293)
chr5 (1-425)||(40391313-40391735)
chr5 (1-425)||(17719873-17720295)
chr5 (1-425)||(22147471-22147893)
chr5 (1-425)||(31349489-31349911)
chr5 (1-425)||(36688653-36689075)
chr5 (1-425)||(27051721-27052143)
chr5 (1-425)||(30236910-30237332)
chr5 (1-425)||(23697735-23698157)
chr5 (1-425)||(42043735-42044157)
chr5 (144-425)||(25112994-25113275)
chr5 (144-425)||(25172085-25172366)
chr5 (161-425)||(39500371-39500635)
chr5 (144-426)||(11209091-11209373)
chr5 (120-352)||(23487391-23487623)
chr5 (144-311)||(31144397-31144564)
chr5 (144-361)||(26783228-26783445)
chr5 (144-367)||(21200098-21200321)
chr5 (238-425)||(20966789-20966976)
chr5 (156-311)||(26764348-26764503)
[»] chr3 (69 HSPs)
chr3 (1-426)||(4432739-4433163)
chr3 (1-426)||(9381494-9381919)
chr3 (1-426)||(1784905-1785332)
chr3 (1-426)||(11206925-11207350)
chr3 (2-426)||(13262505-13262928)
chr3 (1-426)||(7795449-7795876)
chr3 (1-426)||(8996788-8997206)
chr3 (1-426)||(1063117-1063539)
chr3 (1-340)||(8740973-8741311)
chr3 (1-426)||(29934394-29934818)
chr3 (1-426)||(29983548-29983972)
chr3 (1-426)||(15651936-15652364)
chr3 (1-425)||(9982718-9983142)
chr3 (5-426)||(17016757-17017177)
chr3 (1-425)||(38204235-38204657)
chr3 (1-425)||(505002-505424)
chr3 (1-425)||(4753302-4753724)
chr3 (1-425)||(5580465-5580887)
chr3 (1-425)||(8784246-8784668)
chr3 (2-425)||(16391881-16392302)
chr3 (1-425)||(12287812-12288234)
chr3 (1-425)||(20674029-20674451)
chr3 (1-425)||(24669453-24669875)
chr3 (165-426)||(47541768-47542029)
chr3 (1-425)||(5519851-5520273)
chr3 (1-425)||(5866528-5866950)
chr3 (1-425)||(24384350-24384772)
chr3 (1-425)||(5537853-5538275)
chr3 (1-425)||(6491178-6491600)
chr3 (1-425)||(11273217-11273639)
chr3 (1-425)||(14475204-14475626)
chr3 (1-425)||(23766877-23767299)
chr3 (1-425)||(29462049-29462472)
chr3 (1-425)||(37884562-37884984)
chr3 (1-419)||(12238447-12238865)
chr3 (1-425)||(19788005-19788427)
chr3 (175-426)||(14312416-14312667)
chr3 (2-425)||(16396848-16397272)
chr3 (144-426)||(12753758-12754040)
chr3 (144-426)||(15847876-15848158)
chr3 (1-425)||(41693232-41693648)
chr3 (1-425)||(13373500-13373922)
chr3 (1-425)||(13384094-13384516)
chr3 (1-425)||(10627777-10628202)
chr3 (1-279)||(17282266-17282543)
chr3 (1-425)||(39381667-39382089)
chr3 (1-425)||(28315070-28315492)
chr3 (144-344)||(13147101-13147302)
chr3 (213-425)||(6183008-6183220)
chr3 (160-419)||(15960451-15960710)
chr3 (199-369)||(12410860-12411030)
chr3 (158-425)||(14078448-14078697)
chr3 (250-384)||(16881062-16881196)
chr3 (156-371)||(14954246-14954461)
chr3 (156-371)||(53057832-53058047)
chr3 (199-387)||(16306156-16306344)
chr3 (1-73)||(13131236-13131309)
chr3 (154-269)||(16031432-16031547)
chr3 (285-371)||(1463241-1463327)
chr3 (1-71)||(13147375-13147444)
chr3 (156-269)||(2560121-2560234)
chr3 (238-384)||(19658672-19658815)
chr3 (156-371)||(11188828-11189043)
chr3 (156-269)||(5211345-5211458)
chr3 (156-257)||(11221739-11221840)
chr3 (144-269)||(19886185-19886310)
chr3 (289-384)||(18696140-18696235)
chr3 (144-197)||(17240037-17240090)
chr3 (156-212)||(11222538-11222594)
[»] chr4 (36 HSPs)
chr4 (1-426)||(3389444-3389868)
chr4 (1-426)||(16316323-16316750)
chr4 (1-426)||(14836940-14837367)
chr4 (1-426)||(14711658-14712082)
chr4 (1-425)||(5021733-5022157)
chr4 (1-425)||(40455195-40455618)
chr4 (1-425)||(18131085-18131507)
chr4 (1-425)||(55746088-55746510)
chr4 (1-425)||(36027888-36028310)
chr4 (1-425)||(10741434-10741856)
chr4 (1-425)||(10955203-10955625)
chr4 (1-425)||(460160-460582)
chr4 (1-425)||(19945174-19945596)
chr4 (1-425)||(30927329-30927751)
chr4 (1-425)||(16265462-16265884)
chr4 (1-426)||(16820193-16820617)
chr4 (1-425)||(27815781-27816204)
chr4 (1-425)||(17927696-17928118)
chr4 (1-425)||(18753326-18753748)
chr4 (1-425)||(22006014-22006436)
chr4 (1-425)||(27175671-27176093)
chr4 (1-425)||(27666170-27666592)
chr4 (5-425)||(14844492-14844910)
chr4 (1-425)||(49517134-49517556)
chr4 (1-425)||(18065572-18065996)
chr4 (186-425)||(11470266-11470505)
chr4 (199-425)||(4988827-4989053)
chr4 (144-425)||(10662241-10662521)
chr4 (144-425)||(10876386-10876666)
chr4 (193-384)||(17527475-17527664)
chr4 (346-399)||(15194403-15194456)
chr4 (156-361)||(14905389-14905594)
chr4 (156-269)||(17246504-17246617)
chr4 (358-425)||(24649928-24649995)
chr4 (392-426)||(15195150-15195184)
chr4 (238-327)||(14903554-14903643)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (1-426)||(8639-9063)
[»] chr8 (36 HSPs)
chr8 (1-426)||(16745984-16746411)
chr8 (1-426)||(3842512-3842936)
chr8 (1-425)||(30315591-30316014)
chr8 (1-426)||(19427905-19428332)
chr8 (1-425)||(36087506-36087928)
chr8 (1-425)||(3349502-3349924)
chr8 (1-426)||(23792215-23792639)
chr8 (1-425)||(36302510-36302932)
chr8 (1-425)||(251392-251814)
chr8 (1-425)||(814493-814915)
chr8 (1-425)||(26119894-26120316)
chr8 (1-425)||(32078563-32078985)
chr8 (1-425)||(9367278-9367700)
chr8 (1-425)||(13689437-13689859)
chr8 (121-426)||(22148590-22148895)
chr8 (1-425)||(29075724-29076146)
chr8 (1-425)||(29085975-29086397)
chr8 (1-425)||(6160021-6160443)
chr8 (1-425)||(19138264-19138685)
chr8 (1-425)||(44490698-44491120)
chr8 (1-425)||(15781578-15782000)
chr8 (144-426)||(21297706-21297988)
chr8 (1-347)||(849842-850186)
chr8 (144-419)||(45569041-45569316)
chr8 (154-359)||(19942069-19942274)
chr8 (281-426)||(19234361-19234506)
chr8 (154-367)||(22462565-22462778)
chr8 (156-371)||(24834268-24834483)
chr8 (160-384)||(24679422-24679646)
chr8 (1-73)||(22148459-22148530)
chr8 (144-371)||(17015388-17015615)
chr8 (156-371)||(17287271-17287486)
chr8 (144-371)||(17541586-17541813)
chr8 (156-269)||(22672699-22672812)
chr8 (316-370)||(24667263-24667317)
chr8 (156-212)||(18676652-18676708)
[»] chr7 (41 HSPs)
chr7 (1-426)||(9169145-9169572)
chr7 (1-426)||(18440159-18440583)
chr7 (1-425)||(1997121-1997543)
chr7 (1-425)||(8002982-8003404)
chr7 (1-425)||(40043020-40043442)
chr7 (1-425)||(42875413-42875835)
chr7 (1-425)||(4221573-4221995)
chr7 (1-425)||(9093952-9094374)
chr7 (1-425)||(457902-458324)
chr7 (1-425)||(6868146-6868568)
chr7 (1-425)||(6878788-6879210)
chr7 (1-425)||(26391010-26391432)
chr7 (1-425)||(26654252-26654674)
chr7 (1-425)||(24743666-24744088)
chr7 (1-425)||(176455-176877)
chr7 (1-425)||(8626910-8627332)
chr7 (1-425)||(17951030-17951452)
chr7 (5-425)||(20988622-20989040)
chr7 (1-425)||(2706529-2706951)
chr7 (1-425)||(11014753-11015176)
chr7 (1-425)||(22098706-22099128)
chr7 (120-426)||(13175627-13175933)
chr7 (1-425)||(11004144-11004566)
chr7 (1-425)||(9442828-9443250)
chr7 (199-425)||(16106176-16106402)
chr7 (144-425)||(16408571-16408862)
chr7 (145-371)||(16311083-16311309)
chr7 (358-426)||(15879093-15879161)
chr7 (156-311)||(4413082-4413237)
chr7 (144-361)||(15466599-15466816)
chr7 (1-73)||(4412931-4413002)
chr7 (144-371)||(21211687-21211912)
chr7 (157-212)||(15705614-15705669)
chr7 (289-384)||(16308940-16309035)
chr7 (154-371)||(13028040-13028257)
chr7 (193-384)||(16463845-16464035)
chr7 (156-307)||(27870598-27870749)
chr7 (289-367)||(13681171-13681249)
chr7 (156-212)||(13879128-13879184)
chr7 (160-212)||(16546459-16546511)
chr7 (160-212)||(16619151-16619203)
[»] scaffold0047 (3 HSPs)
scaffold0047 (1-426)||(33774-34201)
scaffold0047 (5-425)||(41327-41745)
scaffold0047 (155-371)||(7484-7700)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (1-426)||(4256-4680)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-426)||(57657-58081)
[»] chr6 (40 HSPs)
chr6 (1-426)||(22307729-22308153)
chr6 (1-424)||(25725343-25725765)
chr6 (1-426)||(20030762-20031186)
chr6 (1-426)||(11204900-11205324)
chr6 (1-425)||(25985014-25985436)
chr6 (1-425)||(26034957-26035379)
chr6 (1-425)||(6157079-6157504)
chr6 (1-425)||(3670981-3671403)
chr6 (1-426)||(18554225-18554649)
chr6 (1-425)||(34808004-34808426)
chr6 (1-425)||(12717678-12718100)
chr6 (1-425)||(9113335-9113757)
chr6 (1-425)||(16958545-16958967)
chr6 (1-424)||(32962788-32963209)
chr6 (1-425)||(12864468-12864890)
chr6 (1-425)||(26874339-26874761)
chr6 (1-425)||(32301888-32302310)
chr6 (1-425)||(27412022-27412444)
chr6 (1-425)||(27503241-27503666)
chr6 (1-425)||(26043133-26043558)
chr6 (1-425)||(28252407-28252832)
chr6 (1-426)||(17063157-17063581)
chr6 (144-426)||(22385544-22385830)
chr6 (204-426)||(17609637-17609859)
chr6 (122-341)||(17609420-17609639)
chr6 (1-304)||(27504986-27505292)
chr6 (280-426)||(25804604-25804750)
chr6 (1-181)||(21127211-21127390)
chr6 (229-424)||(17926560-17926755)
chr6 (164-369)||(17446759-17446962)
chr6 (156-371)||(14054483-14054698)
chr6 (319-425)||(27383674-27383780)
chr6 (319-425)||(27474058-27474164)
chr6 (156-361)||(18434351-18434555)
chr6 (187-372)||(26941232-26941417)
chr6 (1-73)||(14052304-14052375)
chr6 (160-425)||(19874642-19874903)
chr6 (154-311)||(19469501-19469658)
chr6 (156-212)||(13434876-13434932)
chr6 (329-371)||(18092676-18092718)
[»] chr1 (25 HSPs)
chr1 (1-426)||(7690340-7690766)
chr1 (1-425)||(38104610-38105032)
chr1 (1-425)||(3181126-3181548)
chr1 (1-425)||(5842729-5843151)
chr1 (1-425)||(7516809-7517231)
chr1 (1-425)||(38093984-38094407)
chr1 (1-425)||(5640584-5641006)
chr1 (1-426)||(22018088-22018512)
chr1 (1-425)||(21876673-21877095)
chr1 (1-425)||(47608810-47609232)
chr1 (1-425)||(4176827-4177249)
chr1 (1-425)||(12615197-12615619)
chr1 (1-425)||(12740053-12740475)
chr1 (1-425)||(19186730-19187153)
chr1 (1-425)||(51630066-51630488)
chr1 (1-425)||(35638912-35639334)
chr1 (1-425)||(36237304-36237726)
chr1 (184-426)||(20874280-20874522)
chr1 (156-371)||(23023696-23023911)
chr1 (160-311)||(18613799-18613950)
chr1 (199-371)||(9345603-9345775)
chr1 (156-311)||(21125404-21125559)
chr1 (156-254)||(22431148-22431246)
chr1 (252-371)||(27857616-27857734)
chr1 (288-369)||(21195874-21195955)
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (1-425)||(37830-38252)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-426)||(11204-11628)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (1-425)||(44629-45052)
scaffold0022 (167-371)||(157964-158168)
scaffold0022 (156-361)||(36273-36478)
scaffold0022 (156-361)||(134333-134538)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (4-396)||(41267-41658)
scaffold0017 (160-395)||(9665-9900)
[»] scaffold0382 (1 HSPs)
scaffold0382 (1-426)||(2164-2588)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (1-384)||(1933-2315)
[»] scaffold1507 (1 HSPs)
scaffold1507 (122-426)||(374-678)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (144-426)||(165718-166000)
scaffold0011 (156-212)||(66481-66537)
[»] scaffold1820 (1 HSPs)
scaffold1820 (144-426)||(401-683)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (1-232)||(12992-13222)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-425)||(52607-53032)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (122-424)||(540-842)
scaffold0211 (1-72)||(431-502)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (1-388)||(17874-18290)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (154-426)||(76030-76302)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (155-357)||(11172-11374)
scaffold0161 (155-357)||(15845-16047)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (152-359)||(21997-22204)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (144-371)||(7494-7721)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (1-70)||(54-122)
[»] scaffold0439 (3 HSPs)
scaffold0439 (156-361)||(7766-7971)
scaffold0439 (289-361)||(39-111)
scaffold0439 (1-73)||(7624-7695)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (144-371)||(11444-11670)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (144-311)||(110652-110819)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (156-364)||(2029-2237)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (156-371)||(98631-98846)
[»] scaffold0498 (2 HSPs)
scaffold0498 (165-367)||(1264-1466)
scaffold0498 (199-425)||(4362-4588)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (156-359)||(6787-6990)
[»] scaffold0272 (1 HSPs)
scaffold0272 (379-426)||(24206-24253)
[»] scaffold0758 (1 HSPs)
scaffold0758 (199-425)||(3126-3352)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (156-311)||(210292-210447)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (144-269)||(19705-19830)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (199-423)||(2820-3044)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (156-311)||(26713-26868)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (156-269)||(17994-18107)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (144-197)||(14110-14163)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (200-304)||(4417-4521)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 378; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 26879038 - 26878613
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  26879038 attggtatcagagcttgctctgttatcataagctcttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtctgatggagaggaatcaactacatcta 26878939  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26878938 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactactgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 26878839  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26878838 gtggaaaatcaatatgtacagctatatcatgagattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttgatgatttggatttggatgaagaagga 26878739  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26878738 gctgctattgacagaaagatacacactcctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 26878639  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  26878638 aatatatgaagatgagtgataaatcc 26878613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 28722169 - 28722593
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28722169 attggtatcagagcttgctctgttatcata-gcacttaaccgtgtgacagatcaaaatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactacttcta 28722267  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28722268 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagcttcaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 28722367  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28722368 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatgggattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttgatgatttggatttggatgaagaagga 28722467  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||    
T  28722468 gctgctattgacagaaaaatacacactcctgctcagaagaagctttataaaaagcatcacaagatcagaggaattcttgttgcttctattcctcgtgctg 28722567  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  28722568 aatacatgaagatgagtgataaatcc 28722593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 24415874 - 24416301
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaa--gaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||    
T  24415874 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacaaatcaagatccaaaagaaaaacatgtctggaggagaggaatcaactacatc 24415973  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24415974 cttaaaatacactagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 24416073  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24416074 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatgggattagatgatgaactatgggatattcttgaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 24416173  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24416174 gagctgctatagacagaaaaatacacactcctgctcagaagaagacttacaaaaagcatcacaagatcagaggaattattgttgcttctattcctcgtac 24416273  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24416274 tgaatacatgaagatgagtgataaatcc 24416301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 22773733 - 22773309
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || || |   |||||  |||  ||||    
T  22773733 attggtatcagagcttgctctgttatca-aagcacttaaccttgtgacagatcaagatccgagaaaaacatgtctgctgaacctgaatcttctacatcta 22773635  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
     || ||||| || |||||   |||| |||| |||  |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22773634 caagatacactaatgtcagctatgattatggtacgtctgacaagaaatcagattctagaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcttg 22773535  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22773534 gtgaaaaactaacatgtacagctacatcatgggattagatgaagagctgtgggatattcttgaagatggagttgatgatttggtttttgatgaagaagga 22773435  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  22773434 gctgctattgacagaaagatacacactcatgctcagaagaagctatacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctataactcgcactg 22773335  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  22773334 aatatatgaagatgagtgataaatcc 22773309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 19303279 - 19303703
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| || || |   ||||| ||||  ||||    
T  19303279 attggtatcagagcttgctctgttatca-aagcacttaaccgtgtgacagttctagatccgagaaaaacatgtctgctgaacctgaatccactacatcta 19303377  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
     || ||||| || ||| |  ||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19303378 caagatacactaatgttagtcatgactatggcactgctgacaagaaatcagattctggaaaagctccgaagttcaatggagatccagaagagttttcttg 19303477  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  19303478 gtggaaaatcaacatgtacaactatatcatgggattagatgaggagttgtgggatattcttgaagatggagttgacgatttggacttggatgaagaagga 19303577  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  19303578 gctgctattgacagaaagattcacactcctgcttagaagaagctatacaaaaagcatgacaagatcagagggatcattgttgcttctataccacgcactg 19303677  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||    
T  19303678 aatatatgaaaatgagtgataaatcc 19303703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 10276947 - 10276525
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  10276947 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 10276852  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10276851 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 10276752  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  10276751 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatattggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 10276652  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  10276651 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacatcacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 10276552  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  10276551 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 10276525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 24328601 - 24329023
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  24328601 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 24328696  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24328697 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 24328796  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24328797 tggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 24328896  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  24328897 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 24328996  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  24328997 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 24329023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 24802502 - 24802926
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| || | ||||||||  ||||||||||||||| || |   ||||| | ||  ||||    
T  24802502 attggtatcagagcttgctctgttatcaaaa-cacttaatcgtgtaactgttcaagatctgagaaaaacatgtatgctgaacctgaatccagtacatcta 24802600  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
     || ||||| |  ||    | |||| |||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24802601 caagatacactgctgcggcatatgattatgttacagctgataagaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcttg 24802700  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  24802701 gtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattggatgaggagctgtgggatattcttgaagatggagttgatgatctggatctggatgaggaagga 24802800  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  24802801 gctgctattgacagaaagatacacactcctgctcaaaagaagttatacaaaaagcatcacaagattagagggatcattgttgcttctataccgcgcactg 24802900  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||    
T  24802901 aatatatgaaaatgagtgataaatcc 24802926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 39170946 - 39171368
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  ||||||||| |||   |    
T  39170946 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagcta---c 39171041  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  39171042 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggatatccagaagagttttca 39171141  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  39171142 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 39171241  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| |||  |||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  39171242 gagctgctatagacagaagaatacatactcatgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 39171341  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  39171342 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 39171368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 43354390 - 43353968
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  43354390 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 43354295  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43354294 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 43354195  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  43354194 tggtggaaaactaatatgtacagctttattatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 43354095  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  43354094 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 43353995  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  43353994 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 43353968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 9898425 - 9898847
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  9898425 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 9898520  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9898521 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 9898620  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9898621 tggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 9898720  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| ||    
T  9898721 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggagtcattgtggcttctatacctcgcac 9898820  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  9898821 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 9898847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 11396024 - 11396446
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  11396024 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatcttttagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 11396122  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11396123 ---aaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 11396219  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  11396220 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 11396319  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  11396320 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 11396419  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  11396420 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 11396446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 43092639 - 43092217
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  43092639 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 43092544  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43092543 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 43092444  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  43092443 tggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttagatgaagaag 43092344  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  43092343 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 43092244  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  43092243 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 43092217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 4219856 - 4219434
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  4219856 attggtatcagagcctgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 4219761  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4219760 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 4219661  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4219660 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 4219561  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  4219560 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 4219461  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  4219460 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 4219434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 9763615 - 9764037
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  9763615 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 9763710  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  9763711 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaacagttttca 9763810  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9763811 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 9763910  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  9763911 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 9764010  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  9764011 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 9764037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 22915712 - 22916134
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  22915712 attggtatcagagcctgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 22915807  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22915808 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 22915907  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| |||||||||| || | |||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22915908 tggtggaaaactaatatgtacaactttttcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 22916007  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  22916008 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 22916107  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  22916108 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 22916134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 29254180 - 29253758
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  29254180 attggtatcagagcatgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 29254085  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29254084 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 29253985  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  29253984 tggtggaaaacaaatatgtacaactttatcatgggattggatgaagagctatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttagatgaagaag 29253885  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  29253884 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 29253785  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  29253784 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 29253758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 34791069 - 34791491
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  34791069 attggtatcagagcctgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 34791164  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34791165 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttca 34791264  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||| || || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  34791265 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgagacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 34791364  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  34791365 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 34791464  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  34791465 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 34791491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 40250569 - 40250147
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  40250569 attggtatcagagcctgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 40250474  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40250473 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 40250374  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  40250373 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgagattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 40250274  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  40250273 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 40250174  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  40250173 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 40250147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 35262964 - 35262542
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  35262964 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 35262866  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  35262865 ---aaaatacacaagcgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttct 35262769  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  35262768 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgacctggatttagatgaagaag 35262669  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  35262668 gagctgctatagatagaaaaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 35262569  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  35262568 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 35262542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 35273589 - 35273167
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  35273589 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggcgatgaggaatcagttactcc 35273491  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  35273490 ---aaaatacacaagcgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttct 35273394  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  35273393 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgacctggatttagatgaagaag 35273294  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  35273293 gagctgctatagatagaaaaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 35273194  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  35273193 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 35273167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 196 - 426
Target Start/End: Original strand, 21162992 - 21163222
Alignment:
Q  196 tcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaag 295  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  21162992 tcatggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggacatactggaagatggagttgatgacttggatttagatgaag 21163091  T
Q  296 aaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcg 395  Q
    |||||| || | | ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  21163092 aaggagttgttgtggacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagatcagaggaatcattgtggcttctatacctcg 21163191  T
Q  396 tactgaatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
     || || ||||||||||||||||| ||||||    
T  21163192 caccgagtacatgaagatgagtgacaaatcc 21163222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 160 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 24843236 - 24842980
Alignment:
Q  160 aaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattc 259  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  24843236 aaagctccaaaattcaatggaaatcctgaagaattttcttggtggaaaaccaatatgtagagttacatcatgggattagatgatgaactgtgggatattc 24843137  T
Q  260 ttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatca 359  Q
    | |||||||| |||  ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||  ||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24843136 tagaagatggtgttggtgacttggcttttgatgaagaaggagcagctattgatagaaggaaacacactcctgctcaaaagaagctttacaacaagcatca 24843037  T
Q  360 caagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgag 416  Q
    |||||||| ||| ||| | ||||| ||| | ||||| || || ||||||||||||||    
T  24843036 caagatcaaaggaatcctggttgcatctctacctcgcacagagtacatgaagatgag 24842980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 292 - 425
Target Start/End: Original strand, 10899690 - 10899823
Alignment:
Q  292 gaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattc 391  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||| || |||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||| |    
T  10899690 gaagaaggagctgctattgatagaaagaaacatactcctactcataagaagctttacaagaaacatcacaatatcagaggaatccttgttgcttatatac 10899789  T
Q  392 ctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    || | |  || ||||||||||||||||| |||||    
T  10899790 cttgcatagagtacatgaagatgagtgacaaatc 10899823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 238 - 425
Target Start/End: Original strand, 21916869 - 21917056
Alignment:
Q  238 gatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcaga 337  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||  ||  |||||||||||| || | ||||  |||||| ||||| | ||||| |||    
T  21916869 gatgaagaactatgggatgttcttgaagatggtgttggtgacttggtgttacatgaagaaggagttgatgttgatagaaagaaacacattgctgcttaga 21916968  T
Q  338 agaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    |||| || ||||| || ||||||||||||| ||  ||  |||||||| || | |||| ||  || ||| |||||||||||||||||||    
T  21916969 agaaactgtacaagaaacatcacaagatcaaagacattcttgttgctgctttgcctcataaggagtacttgaagatgagtgataaatc 21917056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 425
Target Start/End: Original strand, 21919197 - 21919384
Alignment:
Q  238 gatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcaga 337  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||  ||| ||||  ||  |||||||||||| || | ||||  |||||| ||||| | ||||| |||    
T  21919197 gatgaagaactatgggatgtttttgaagatggtgttggtgacttggtgttacatgaagaaggagttgatgttgatagaaagaaacacattgctgcttaga 21919296  T
Q  338 agaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    |||| || ||||| || ||||||||||||| ||  ||  |||||||| || | |||| ||  || ||| |||||||||||||||||||    
T  21919297 agaatctgtacaagaaacatcacaagatcaaagacattcttgttgctgctttgcctcataaggagtacttgaagatgagtgataaatc 21919384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 425
Target Start/End: Original strand, 24303108 - 24303373
Alignment:
Q  160 aaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattc 259  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||  | ||  |    || ||||| ||||| | |||| | |    
T  24303108 aaagctccaaggtttagtggagatcctgaagatttctcttggtggaaaaccaaaatgtagagtcacattttttgtttagatgaggaactctaggatgtcc 24303207  T
Q  260 ttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatca 359  Q
    |||||||||| |||  ||| ||||   | |||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||| ||||| | |||||  | ||||| || |||||    
T  24303208 ttgaagatggtgttggtgacttggcccttgatgaagaaggagctgctatcgatagaaagaaacacactcctgcttaaaagaaaatgtacaagaaacatca 24303307  T
Q  360 caagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||| || | |||||| |||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  24303308 caagatgagaggaattcttgttgctgctttacctcgtgctgagtatttgaagatgagtaataaatc 24303373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25828207 - 25828139
Alignment:
Q  144 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaa 212  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  25828207 gaaatctgactctggaaaagttccaaagtttaatggagatccagaagaattttcctggtggaagaccaa 25828139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 160 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20567259 - 20567201
Alignment:
Q  160 aaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgta 218  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20567259 aaagctccaaagtttaatggaaatcctgaagaattttcgtggtggaaaaccaatatgta 20567201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 341
Target Start/End: Original strand, 23185389 - 23185575
Alignment:
Q  155 ctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatggga 254  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||||||  |||| || || ||||||||||||||  | || ||  || ||||||  || ||||||||||| |||||    
T  23185389 ctggtaaagttccaaagtttaatggagatcctaaagaattgtcttggtggaaaaccaacttctatagtcatgtcatgggtttagatgaagaactctggga 23185488  T
Q  255 tattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaa 341  Q
     || ||| ||||||| |||  ||| ||||   | |||||||||||||||||||||||  |||  | ||| ||| |||||||||||||    
T  23185489 catacttaaagatggtgttggtgacttggtcctagatgaagaaggagctgctattgagagaagaaaacatactcctgctcagaagaa 23185575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 341
Target Start/End: Original strand, 23596652 - 23596838
Alignment:
Q  155 ctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatggga 254  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||||||  |||| || || ||||||||||||||  | || ||  || ||||||  || ||||||||||| |||||    
T  23596652 ctggtaaagttccaaagtttaatggagatcctaaagaattgtcttggtggaaaaccaacttctatagtcatgtcatgggtttagatgaagaactctggga 23596751  T
Q  255 tattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaa 341  Q
     || ||| ||||||| |||  ||| ||||   | |||||||||||||||||||||||  |||  | ||| ||| |||||||||||||    
T  23596752 catacttaaagatggtgttggtgacttggtcctagatgaagaaggagctgctattgagagaagaaaacatactcctgctcagaagaa 23596838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 309
Target Start/End: Original strand, 25119441 - 25119590
Alignment:
Q  160 aaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattc 259  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||| | || || | |||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| |||||| |||    
T  25119441 aaagctccaaggtttaatggagatcctgaatacttctcttcgtggaaaaccaaaatgtatagttacatcatggatttagatgaggaactctgggatgttc 25119540  T
Q  260 ttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctatt 309  Q
    || ||||| | |||  ||| ||||   | |||||||||||| ||||||||    
T  25119541 ttcaagatagtgttggtgacttggcccttgatgaagaaggaactgctatt 25119590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 27231044 - 27230977
Alignment:
Q  358 cacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  27231044 cacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcaccgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 27230977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 371
Target Start/End: Original strand, 28702277 - 28702492
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggat 255  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||| ||| | ||||| |||||||| |||||  | || ||  || ||||||  || |||||||||||||| |||    
T  28702277 tggaaaagtttcaaagttcaatggatatcctgaataattttcttggtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggtttagatgaagaactatgtgat 28702376  T
Q  256 attcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagc 355  Q
    || || ||||||||  ||  ||| ||||   | |||||||||||||||| ||||||  |||  | ||| ||| ||||||| |||||  | ||||| ||||    
T  28702377 atactagaagatggtattggtgacttggtcgttgatgaagaaggagctggtattgatagaagaaaacatactcctgctcataagaaattctacaagaagc 28702476  T
Q  356 atcacaagatcagagg 371  Q
    ||||||  ||||||||    
T  28702477 atcacacaatcagagg 28702492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22257233 - 22257122
Alignment:
Q  158 gaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatat 257  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | || ||  || ||||||  || ||||||||||||||||| ||    
T  22257233 gaaaagttctaaagttcaatagagatcctgaagaattttcctggtggaagaccaacgtctatagtcatgtcatgggtttagatgaagaactatgggacat 22257134  T
Q  258 tcttgaagatgg 269  Q
     || ||||||||    
T  22257133 actagaagatgg 22257122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 53)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 20552769 - 20553193
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20552769 attggtatcagagcttgctctgttatcata-gcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtctgatggagaggaatcaactacttcta 20552867  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20552868 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatgagattctggaaaagctccgaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 20552967  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20552968 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatgggattggataaagaactatgggatattcttgaagatggagttgatgatttggatttggatgaagaagga 20553067  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20553068 gctgctattgacagaaaaatacacactcctgctcagaagaagctttataaaaagcatcacaagatcagagggattcttgttgcttctattcctcgtactg 20553167  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  20553168 aatacatgaagatgagtgataaatcc 20553193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 17456620 - 17456196
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  17456620 attggtatcagagcttgctctgttatcata-gcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtctgatggagaggaatcaactacttcta 17456522  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  17456521 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatgcagacccagaagagttttcatg 17456422  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17456421 gtagaaaaccaatatgtacagctatatcatgggattggatgaagaactatgggatattcttgaagatagagttgatgatttggatttggatgaagaagga 17456322  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
     || |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  17456321 actactattgacagaaaaatacacactcctgctcagaagaagctttataaaaagcatcacaagatcagagggattattgttgtttctattcctcgtactg 17456222  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  17456221 aatacatgaagatgagtgataaatcc 17456196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 21705271 - 21704847
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||      
T  21705271 attggtatcagagcttgctctgttatcata-gcacttaaccgtgtaacagatcaagatccaagaaaaacatgtctggaggagaggaatcaactacatcct 21705173  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21705172 taaaatacactagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 21705073  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21705072 gtggaaaacaaatatgtacaactatatcatgggattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaagga 21704973  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21704972 gctgctatggacagaaagatacacactcctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 21704873  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  21704872 aatacatgaagatgagtgataaatcc 21704847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 34052913 - 34053338
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||      
T  34052913 attggtatcagaacttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtctggaggagaggaatcaactacatcct 34053012  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34053013 taaaatacacaagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaagtcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 34053112  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  34053113 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatgggattggatgaagaactatgggatatacttgaagacggagttgatgatctggatttggatgaagaagga 34053212  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  34053213 gctgctattgacagaaaaatacacactcctgctcagaagaagacttacaaaaagcatcacaagatcagagggattattgttgcttctattcctcgtacta 34053312  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  34053313 aatacatgaagatgagtgataaatcc 34053338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 24982720 - 24982293
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaa--gaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||    
T  24982720 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaaaagaaaaacatgtctggaggagaggaatcaactacatc 24982621  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
      |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24982620 cttaaaatacacaagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagactctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 24982521  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24982520 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatgggattggatgaagaactatgggatatacttgaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 24982421  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24982420 gagctgctattgatagaaagatacacactcctgctcagaagaaaacttacaaaaagcatcacaagatcagagggattattgttgcttctattcctcgtac 24982321  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24982320 tgaatacatgaagatgagtgataaatcc 24982293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 422
Target Start/End: Original strand, 23393360 - 23393783
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaa--gaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||    
T  23393360 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagttcaagattcaaaagaaaaacatgtctggaggagaggaatcaactacatc 23393459  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
      |||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  23393460 cttaaaatacacaagtgtcaaacatgactatgatacaactgaaaggaaatcagactctggaaaagctctgaaattcaatggagatccagaagagttttca 23393559  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23393560 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatgggattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 23393659  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23393660 gagctgctatagacagaaaaatacacactcctgctcagaagaagacttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 23393759  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataa 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  23393760 tgaatacatgaagatgagtgataa 23393783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 43621201 - 43620777
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaa--gaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||   |    
T  43621201 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacaattcaagatccaaaagaaaaacatgtctggaggagaggaatcaacta---c 43621105  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43621104 tacaaaatacacaagtgtcaaacatgactatgataatgctgacaagaaaacagattctggaaaagctctaaagtttaatggagatccagaagagttttca 43621005  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  43621004 tggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggacatactggaagatggagttgatgacttggatttagatgaagaag 43620905  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||| | ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  43620904 gagctgctgtggacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagatcagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 43620805  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||    
T  43620804 cgaatacatgaagatgagtgacaaatcc 43620777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 19464926 - 19465350
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  19464926 attggtatcagagcttgctctgttatcata-gcgcttaaccgtgttacagaccaagatccgaggaaaacatgtctggtggagaggaatcaactacttcta 19465024  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
     ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19465025 caaaatacacaagtgtcaaatatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttcatg 19465124  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||| || || || |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  19465125 gtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggtttggatgaagagctatgtgacatactggaagatggagttgatgacttggatttagatgaagaagga 19465224  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    |||||| | ||| |||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |    
T  19465225 gctgctgtagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttacaagaagcaccacaaaatcagaggaatcattgtggcttctatacctcgcaccg 19465324  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||    
T  19465325 aatatatgaagatgagtgacaaatcc 19465350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 1121209 - 1120786
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaa--gaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||  ||||||||||| ||  ||||||||||||  ||   |    
T  1121209 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacatttcaagattaaaaagaaaaacatgtttggaggagaggaatcagtta---c 1121113  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1121112 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 1121013  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  1121012 tggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttagatgaagaag 1120913  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  1120912 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 1120813  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  1120812 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 1120786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 6976761 - 6977183
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  ||||||||| |||   |    
T  6976761 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagcta---c 6976856  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6976857 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 6976956  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  6976957 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 6977056  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  6977057 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 6977156  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  6977157 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 6977183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 14030997 - 14031419
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  14030997 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 14031092  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14031093 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 14031192  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14031193 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 14031292  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  14031293 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacatcacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 14031392  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  14031393 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 14031419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 35216458 - 35216880
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||||||   |    
T  35216458 attggtatcagagcctgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcaacta---c 35216553  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35216554 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 35216653  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  35216654 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 35216753  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  35216754 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 35216853  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  35216854 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 35216880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 37739873 - 37739451
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| | |||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||||||   |    
T  37739873 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttgaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcaacta---c 37739778  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37739777 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 37739678  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  37739677 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 37739578  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  37739577 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 37739478  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  37739477 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 37739451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 9336909 - 9337331
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  9336909 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 9337004  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9337005 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 9337104  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9337105 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 9337204  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  9337205 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 9337304  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  9337305 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 9337331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 22677071 - 22677493
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||||| ||  |  ||||||||| |||   |    
T  22677071 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatcttttagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagcta---c 22677166  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22677167 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 22677266  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22677267 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 22677366  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  22677367 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 22677466  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  22677467 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 22677493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 23363065 - 23363487
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  23363065 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 23363160  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23363161 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 23363260  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23363261 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 23363360  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  23363361 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 23363460  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  23363461 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 23363487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 24568043 - 24568465
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  24568043 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 24568138  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24568139 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 24568238  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  24568239 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttggtgatctggatttggatgaagaag 24568338  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  24568339 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacatcacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 24568438  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  24568439 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 24568465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 24826781 - 24826359
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  24826781 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 24826686  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24826685 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 24826586  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24826585 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 24826486  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  24826485 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaacaagctttataagaaacatcacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 24826386  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  24826385 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 24826359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 27461117 - 27461539
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  27461117 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 27461215  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27461216 ---aaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 27461312  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27461313 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 27461412  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  27461413 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacatcacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 27461512  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||    
T  27461513 tgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 27461539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 34772864 - 34773286
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  ||||||||||||  ||   |    
T  34772864 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggaggagaggaatcagtta---c 34772959  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34772960 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 34773059  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||     
T  34773060 tggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttagatgaagaaa 34773159  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  34773160 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 34773259  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||    
T  34773260 cgaatatatgaagatgagtgacaaatc 34773286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 39353451 - 39353873
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  39353451 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 39353546  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39353547 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 39353646  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  39353647 tggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 39353746  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  39353747 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 39353846  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  39353847 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 39353873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 14456918 - 14456496
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  14456918 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 14456820  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14456819 ---aaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 14456723  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14456722 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 14456623  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  14456622 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 14456523  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  14456522 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 14456496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 15740924 - 15741346
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  15740924 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 15741022  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15741023 ---aaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 15741119  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15741120 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 15741219  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15741220 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 15741319  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  15741320 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 15741346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 23297232 - 23297654
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  23297232 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatcttttagaaaaacatgtctggagatgaggaatcaggta---c 23297327  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23297328 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 23297427  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23297428 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 23297527  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  23297528 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 23297627  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  23297628 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 23297654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 36592423 - 36592001
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  ||||||| |||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  36592423 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaatatgtctggagatgaggaatcagtta---c 36592328  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36592327 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 36592228  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  36592227 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 36592128  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  36592127 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 36592028  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  36592027 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 36592001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 14567959 - 14567537
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| | |||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  14567959 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagtttaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 14567861  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14567860 ---aaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 14567764  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  14567763 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctgaatttggatgaagaag 14567664  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  14567663 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacatcacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 14567564  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  14567563 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 14567537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 27622078 - 27621656
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  27622078 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 27621983  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27621982 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 27621883  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||    
T  27621882 tggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttagatgaaaaag 27621783  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  27621782 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 27621683  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  27621682 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 27621656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 31834435 - 31834857
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  31834435 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 31834530  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31834531 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 31834630  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31834631 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 31834730  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  31834731 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 31834830  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  31834831 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 31834857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 31419617 - 31420042
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||    
T  31419617 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaatcgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggaggagaggaatcaactacatc 31419715  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
      |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||| ||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31419716 cttaaaatacacaagtgtcaaacatgactatgatacggctgacaagaaaacagactctagtaaagctcaaaagtttaatggagatccagaagagttttca 31419815  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  31419816 tggtggaaaacaaatatgtatagctttatcatgggattggatgaagagctatgggacatattggaagatggagttgatgacctggatttagatgaagaag 31419915  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||| | | ||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||    
T  31419916 gagctgatgtagacagaaaaatacatactcctgctcagaagaagctttacaagaagcaccacaaaatcagagggattattgtggcttctatacctcacac 31420015  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  31420016 tgaatacatgaagatgagtgacaaatc 31420042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 5300448 - 5300026
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  5300448 attggtatcagagcttgctctattatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 5300353  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5300352 tacaaaatacactagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 5300253  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||     
T  5300252 tggtggaaaataaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttagatgaagaat 5300153  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  5300152 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 5300053  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  5300052 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 5300026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 13533175 - 13532751
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |   | |   ||||| ||||  ||||    
T  13533175 attggtatcagagcttgctctgttatca-aagcacttaactgtgtgacagttcaagatccgagaaaaacatgtctaccgaacctgaatccactacatcta 13533077  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
     || ||||| || ||     ||||| |||| |||  |||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13533076 caagatacactaatgctggtcatgattatggtacatctgacaagaaatcagattctggaaaagcttcaaaattcaatggagatccagaagagttttcttg 13532977  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  13532976 gtggaaaaccaacatgtacaactacatcatgggattagatgaggagctgtgggatatccttgaagatggagttgatgatttgaacttggatgaagaagga 13532877  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  13532876 gctgctattgatagaaagattcacactcctgctcagaagaagctatacaaaaagcatcaaaagatcagagggatcattgttgcttctataccacgcactg 13532777  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||    
T  13532776 aatatatgaaaatgagtgataaatcc 13532751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16003202 - 16002780
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  16003202 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 16003107  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16003106 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 16003007  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16003006 tggtggaaaactaatatgtacaactttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatatggatttggatgaagaag 16002907  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||  ||    
T  16002906 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcacac 16002807  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  16002806 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 16002780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 17608017 - 17608439
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  17608017 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 17608115  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  17608116 ---aaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttct 17608212  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  17608213 tggtggaaaaccaatatgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgacctggatttagatgaagaag 17608312  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  17608313 gagctgctatagatagaaaaatacatactcctgctcagaagaagctttacaagaagcaccacaaaatcagagggattattgtggcttctatacctcgcac 17608412  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  17608413 tgaatacatgaagatgagtgacaaatc 17608439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 24808871 - 24809293
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  24808871 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 24808966  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24808967 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgacgatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 24809066  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24809067 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgagatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 24809166  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||| | ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  24809167 gagctgctatagacagaagaatatatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 24809266  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  24809267 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 24809293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 40391313 - 40391735
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| | |||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  40391313 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagtttaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 40391408  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40391409 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 40391508  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  40391509 tggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 40391608  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| |  || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  40391609 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttatacgaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 40391708  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  40391709 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 40391735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 17719873 - 17720295
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  17719873 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 17719971  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  17719972 ---aaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttct 17720068  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  17720069 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgacctggatttagatgaagaag 17720168  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  17720169 gagctgctatagatagaaaaatacatactcctgctcagaagaagctttacaagaagcaccacaaaatcagagggattattgtggcttctatacctcgcac 17720268  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  17720269 tgaatacatgaagatgagtgacaaatc 17720295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 22147471 - 22147893
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  22147471 attggtatcagagcctgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 22147566  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||| | |||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22147567 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatattgctgacaagaaaacagactctggaaaacctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 22147666  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22147667 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 22147766  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  22147767 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 22147866  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||    
T  22147867 tgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 22147893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 31349489 - 31349911
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  31349489 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 31349587  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  31349588 ---aaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttct 31349684  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  31349685 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgacctggatttagatgaagaag 31349784  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  31349785 gagctgctatagatagaaaaatacatactcctgctcagaagaagctttacaagaagcaccacaaaatcagagggattattgtggcttctatacctcgcac 31349884  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  31349885 tgaatacatgaagatgagtgacaaatc 31349911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 36688653 - 36689075
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  36688653 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 36688751  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  36688752 ---aaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttct 36688848  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  36688849 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgacctggatttagatgaagaag 36688948  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  36688949 gagctgctatagatagaaaaatacatactcctgctcagaagaagctttacaagaagcaccacaaaatcagagggattattgtggcttctatacctcgcac 36689048  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  36689049 tgaatacatgaagatgagtgacaaatc 36689075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 27052143 - 27051721
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  27052143 attggtatcagagcctgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 27052045  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  27052044 ---aaaatacacaagcgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttct 27051948  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  27051947 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgacctggatttagatgaagaag 27051848  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  27051847 gagctgctatagatagaaaaatacatactcctgctcagaagaagctttacaagaagcaccacaaaatcagagggattattgtggcttctatacctcgcac 27051748  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  27051747 tgaatacatgaagatgagtgacaaatc 27051721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 30237332 - 30236910
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  30237332 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 30237234  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  30237233 ---aaaatacacaagcgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttct 30237137  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  30237136 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgacctggatttagatgaagaag 30237037  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  30237036 gagctgctatagatagaaaaatacatactcctgctcagaagaagctttacaagaagcaccacaaaatcagagggattattgtggcttctatacctcgcac 30236937  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  30236936 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 30236910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 23697735 - 23698157
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  23697735 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 23697833  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  23697834 ---aaaatacacaagcgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttct 23697930  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  23697931 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgacctggatttagatgaagaag 23698030  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  23698031 gagctgctatagatagaaaaatacatactcctgcttagaagaagctttacaagaagcaccacaaaatcagagggattattgtggcttctatacctcgcac 23698130  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  23698131 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 23698157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 42043735 - 42044157
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  42043735 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 42043833  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  42043834 ---aaaatacacaagcgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttct 42043930  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  42043931 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgacctggatttagatgaagaag 42044030  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  42044031 gagctgctatagatagaaaaatacatactcctgctcagaagaagctttacaagaagcaccacaaaatcatagggattattgtggcttctatacctcgcac 42044130  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  42044131 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 42044157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 144 - 425
Target Start/End: Original strand, 25112994 - 25113275
Alignment:
Q  144 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaa 243  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  25112994 gaaatcagactctggaaaagctccaaagttcaatggagatcctgaagagttctcttggtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattggatgat 25113093  T
Q  244 gaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagc 343  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||     
T  25113094 gagctgtgggatattcttgaagatggagttgatgatctggacctggatgaggaaggaactgctattgacagaaagatacacactcctgctcaaaaaaagt 25113193  T
Q  344 tttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25113194 tatacaaaaagcatcacaagatcagaggaatcattgttgcttctataccgcgcactgaatatatgaagatgagtgataaatc 25113275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 144 - 425
Target Start/End: Original strand, 25172085 - 25172366
Alignment:
Q  144 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaa 243  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  25172085 gaaatcagactctggaaaagctccaaagttcaatggagatcctgaagagttctcttggtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattggatgat 25172184  T
Q  244 gaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagc 343  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||     
T  25172185 gagctgtgggatattcttgaagatggagttgatgatctggacctggatgaggaaggaactgctattgacagaaagatacacactcctgctcaaaaaaagt 25172284  T
Q  344 tttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25172285 tatacaaaaagcatcacaagatcagaggaatcattgttgcttctataccgcgcactgaatatatgaagatgagtgataaatc 25172366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 161 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 39500635 - 39500371
Alignment:
Q  161 aagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattct 260  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  39500635 aagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatact 39500536  T
Q  261 tgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcac 360  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||    
T  39500535 ggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaaggagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccac 39500436  T
Q  361 aagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  39500435 aagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcaccgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 39500371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 144 - 426
Target Start/End: Original strand, 11209091 - 11209373
Alignment:
Q  144 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaa 243  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  11209091 gaaatcagactctagaaaagctccaaagttcaatggagatcctgaagagttttcttggtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattggatgat 11209190  T
Q  244 gaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagc 343  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||   ||||||| ||| |||| ||||||||  ||||||  |||||  ||||||| ||||||     
T  11209191 gaactgtgggatattcttgaagatggagttggtgatctggccctggatgaggaaagagcagctattgatagaaagaagcacacccctgctcaaaagaaga 11209290  T
Q  344 tttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  11209291 tatacaaaaagcatcacaagatcagaggaatccttgttgcttccatacctcgcactgaatatatgaaaatgagtgataaatcc 11209373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 120 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 23487623 - 23487391
Alignment:
Q  120 acatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtac 219  Q
    |||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  23487623 acatgattatggtactgctgacaagaaatcagattctggaaaagcttcaaagttcaatggagatctagaagagttttcttgctggaaaaccaacatgtac 23487524  T
Q  220 agctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaaga 319  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23487523 agctacatcatgggattagatgaggagctgtgggatattcttgaagatggagttgatgatatggacttggatgaagaaggagctgctattgacagaaaga 23487424  T
Q  320 tacacacttctgctcagaagaagctttacaaaa 352  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  23487423 tacatactcctgctcaaaagaagctatacaaaa 23487391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 311
Target Start/End: Original strand, 31144397 - 31144564
Alignment:
Q  144 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaa 243  Q
    |||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||  || ||||||  || ||||||    
T  31144397 gaaatctgactctggaaaagttcctaagtttaatggagatcctgaagaattttcctggtggaaaaccaacttctacagtcatgtcatgggtttagatgaa 31144496  T
Q  244 gaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattga 311  Q
    ||||||||||| || || ||||||||  ||  ||| |||| | | ||||||||||||||||| |||||    
T  31144497 gaactatgggacatactagaagatggtattggtgacttggttattgatgaagaaggagctgccattga 31144564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 26783445 - 26783228
Alignment:
Q  144 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaa 243  Q
    |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  | || ||  || ||||||  || ||||||    
T  26783445 gaaatctgactctagaaaagttccaaagttcaatggagatcctgaagaattttcatggtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggtttagatgaa 26783346  T
Q  244 gaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagc 343  Q
    | ||||||||| || || ||||||||| ||  | | ||||   | |||||||| ||||||||| ||||  |||  | ||| ||| ||||||||||||| |    
T  26783345 gtactatgggacatactagaagatggaattggtaacttggtcgttgatgaagatggagctgctgttgatagaagaaaacatactcctgctcagaagaaac 26783246  T
Q  344 tttacaaaaagcatcaca 361  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  26783245 tctacaagaagcatcaca 26783228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 367
Target Start/End: Original strand, 21200098 - 21200321
Alignment:
Q  144 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaa 243  Q
    |||||| || ||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || ||  || ||||||  || | ||||    
T  21200098 gaaatctgactctggtaaagtcccaaagtttaatggagatcctgaagaattttcttggtggaaaaccaacttctatagtcatgtcatgggtttaggtgaa 21200197  T
Q  244 gaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagc 343  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||  ||| ||||   | ||||||||||||| ||||| |||  |||  | ||| ||| ||||||||||||| |    
T  21200198 gaactctgggacatacttgaagatggtgttggtgacttggtcgttgatgaagaaggagttgctaatgatagaagaaaacatactcctgctcagaagaaac 21200297  T
Q  344 tttacaaaaagcatcacaagatca 367  Q
    | ||||| |||||||||| |||||    
T  21200298 tctacaagaagcatcacacgatca 21200321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 20966976 - 20966789
Alignment:
Q  238 gatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcaga 337  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||  ||| ||||  || ||||||||| ||| || | ||||  ||| || ||||| | |||||||||    
T  20966976 gatgaagaactatgggatgtgcttgaagatggtgttggtgacttggtattagatgaagaatgagttgttgttgatagaacgaaacacattgctgctcaga 20966877  T
Q  338 agaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    |||| || ||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| | ||||  |  || ||  |||||||||||||||||||    
T  20966876 agaatctgtacaagaaacatcacaagattagaggaattcttgttgcttctttgcctcacaaggagtatttgaagatgagtgataaatc 20966789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26764503 - 26764348
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggat 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||  | |||||  || ||||    || |||||||| ||||||||     
T  26764503 tggaaaagttccaaagttcaatggagatcctgatgaattttcctggtggaaaaccaacttctacagtcatgtcatttgttttgatgaagagctatgggac 26764404  T
Q  256 attcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattga 311  Q
    || || ||||||||  ||  ||| ||||  || ||||||||||||| |||||||||    
T  26764403 atactagaagatggtattggtgacttggtctttgatgaagaaggagttgctattga 26764348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 362; Significance: 0; HSPs: 69)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 4433163 - 4432739
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  4433163 attggtatcagagcttgctctgttatcata-gcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtctaatggagaggaatcaactacttcta 4433065  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4433064 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaagaaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagacccagaagagttttcatg 4432965  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4432964 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatgggattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttgatgatttggatttggataaagaagga 4432865  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4432864 gctgctattgacaaaaaaatacacactcctgctcagaagaagctttataaaaagcatcacaagatcagagggattattgttgcttctattcctcgtactg 4432765  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  4432764 aatacatgaagatgagtgataaatcc 4432739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 9381494 - 9381919
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||      
T  9381494 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtctggaggagaggaatcaactacatcct 9381593  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9381594 taaaatacacaagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 9381693  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9381694 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatgggattggatgaagaactatgggatatacttgaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaagga 9381793  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9381794 gctgctattgatagaaagatacacactcctgctcagaagaaaacttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcatcgttgcttctattcctcgtactg 9381893  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9381894 aatacatgaagatgactgataaatcc 9381919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 1784905 - 1785332
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaa--gaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||    
T  1784905 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaaaagaaaaacatgtctggaggagaggaatcaactacatc 1785004  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1785005 cttaaaatacactagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcaaattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 1785104  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  1785105 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatgggattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttgatgatctggatttagatgaagaag 1785204  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1785205 gagctgctatagacagaaaaatacacactcctgctcagaagaagacttacaaaaagcatcacaagatcagagggattattgttgcttctattcctcgtac 1785304  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1785305 tgaatacatgaagatgagtgataaatcc 1785332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 11206925 - 11207350
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||      
T  11206925 attggtatcagagcttgctctattatcataagcacttaaccatgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtctggaggagaggaatcaactacatcct 11207024  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11207025 taaaatacactagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 11207124  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  11207125 gtggaaaaccaatatgtatagctatatcatgggattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaagga 11207224  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    | || ||| ||| |||  ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11207225 gttgttatagacagaagaatacacactcctgctcagaagaagacttacaaaaagcatcacaagatcagagggattattgttgcttctattcctcgtactg 11207324  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  11207325 aatacatgaagatgagtgataaatcc 11207350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 426
Target Start/End: Original strand, 13262505 - 13262928
Alignment:
Q  2 ttggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttctat 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||     
T  13262505 ttggtatcagagcttgctctgttatcata-gcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtctggtggagaggaatcaactacatctac 13262603  T
Q  102 aaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatgg 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13262604 aaaatacaatagtgtcaaacatgactacgatactgctgaaaggaaatcagattctgtaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatgg 13262703  T
Q  202 tggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggag 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  13262704 tggaaaaccaatatgtacagctatatcatgggattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttgatgatttggatttggataaagaaagag 13262803  T
Q  302 ctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactga 401  Q
     || ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  13262804 ttgttattgacagaaggatccacactcctgctcagaagaaactttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctatacctcacactga 13262903  T
Q  402 atacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  13262904 atatatgaagatgagtgataaatcc 13262928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 7795449 - 7795876
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaa--gaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||    
T  7795449 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtatgacagatcaagatccaaaagaaaaacatgtatggaggagaggaatcaactacatc 7795548  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
      |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7795549 cttaaaatacacaagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 7795648  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  7795649 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatgggattggatgaagaactatgggatatacttgaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaaa 7795748  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7795749 gagctgctattgatagaaaaatacacactcctgctcagaagaaaacttacaaaaagcatcacaagatcagagggattattgttgcttctattcctcgtac 7795848  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7795849 tgaatatatgaagatgagtgacaaatcc 7795876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 8996788 - 8997206
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||           
T  8996788 attggtataagagcttgttctgttatca-aagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtctgctgaagaggaatccactcc----- 8996881  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8996882 -aaaatacaatagtgtcaaacatgagaatgatactgctgacaagaaatcagattctggaaaagctccaaagttcagtggagatccagaagagttttcatg 8996980  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  8996981 gtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattggatgaggagctatgggatattcttgaagatggagttgatgatttggatttggatgaagaatga 8997080  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8997081 gctgttattgacagaaggatacacactcctgctcagaagaaactctacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctatacctcgcactg 8997180  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  8997181 aatatatgaagatgagtgataaatcc 8997206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 1063539 - 1063117
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |   | ||| ||||| | ||  || |    
T  1063539 attggtattagagtttgctctgttatca-aagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccgagaaaaatatgtctaccgaagatgaatccattacatcaa 1063441  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
     |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1063440 caaaatacaa--gtgtcaaacatgactatgatactgctgacaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 1063343  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1063342 gtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattggatgaggagctatgggacattcttgaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaagga 1063243  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  1063242 gctgctattgacagaaggatacacactcctgctcagaagaaactttacaaaaagcatcacaagatcagagggatctttgttgcttctatacctcgcactg 1063143  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  1063142 aatatatgaagatgagtgataaatcc 1063117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Original strand, 8740973 - 8741311
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  || ||||||||| ||||  ||||    
T  8740973 attggtatcagagcttgctttgttatca-aagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccgagaaaaacatgtctactgaagaggaatctactacatcta 8741071  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8741072 caaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatacagctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 8741171  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  8741172 gtggaaaaccaacatgtaaagctacatcatgggattggatgaagagctatgggatattcttgaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaatga 8741271  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaaga 340  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8741272 gctgctattgacagaatgatacacactcctgctcagaaga 8741311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 29934394 - 29934818
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |   ||||||| ||  ||||    
T  29934394 attggtatcagagcttgctctgttatca-aagcacttaaccgtgtgacagatcaacatccgggaaaaacatgtttgctgaacctgaatcaagtacatcta 29934492  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
     || |||||  |||||    ||||| |||||||||  ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  29934493 caagatacaccagtgttggtcatgattatgatactaatgacaagaaatctgattctggaaaagctccaaagttcaatggaaaaccagaagagttttcttg 29934592  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  29934593 gtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattagatgaagagctgtgggatattcttgaagatggagttgatgatttgattttggatgaagaagga 29934692  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29934693 gctgctattgacagaaatatacacactcctgctcagaagaagctatacaaaaagcatcacaatatcagagggatcattgttgcttctatacctcgcactg 29934792  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  29934793 aatatatgaagatgagtgataaatcc 29934818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 29983548 - 29983972
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| || || |   ||||||| ||  ||||    
T  29983548 attggtatcagagcttgctctgttatca-aagcacttaaccgtgtgacagatcaacatccgggaaaaacatgtttgctgaacctgaatcaagtacatcta 29983646  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
     || |||||  |||||    ||||| |||||||||  ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||    
T  29983647 caagatacaccagtgttggtcatgattatgatactaatgacaagaaatctgattctggaaaagctccaaagttcaatggaaaaccagaagagttttcttg 29983746  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  29983747 gtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattagatgaagagctgtgggatattcttgaagatggagttgatgatttgattttggatgaagaagga 29983846  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29983847 gctgctattgacagaaatatacacactcctgctcagaagaagctatacaaaaagcatcacaatatcagagggatcattgttgcttctatacctcgcactg 29983946  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  29983947 aatatatgaagatgagtgataaatcc 29983972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 15651936 - 15652364
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagag---gaatcaactattt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||  ||    |||||  |||  |    
T  15651936 attggtatcagagcttgctctgttatca-aagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccgagaaaaacatgtctattgaggaacctgaatcttctacat 15652034  T
Q  98 ctataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 197  Q
    |||  |  ||||||| ||| || |||||||||| |||  |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15652035 ctactaggtacaataatgttaatcatgactatggtacatctgacaagaaatcagactctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 15652134  T
Q  198 atg-gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaaga 296  Q
     || |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15652135 ttgtgtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattagatgaagaactgtgggatattcttgaagatggtgttgatgatttggttttggatgaaga 15652234  T
Q  297 aggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgt 396  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  15652235 aggagctgctattgacagaaagattcacactcctgctcagaaaaagatatacaaaaagcatgacaagatcagagggatcattgttgcttctatacctcgc 15652334  T
Q  397 actgaatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15652335 actgaatatattaagatgagtgataaatcc 15652364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 9982718 - 9983142
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca-agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttct 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||   |||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||     
T  9982718 attggtatcagagcttgctctgttatcacaa-cacttaaccgtgttacagttcaagatctttagaaaaacatgtctggaggagaggaatcaactacatcc 9982816  T
Q  100 ataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcat 199  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||   |||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  9982817 ataaaatacacaagtgtcaaacatgactatgatacggctgactagaaaacagactctggtaaagctccaaagtttaatggagacccagaagagttttcat 9982916  T
Q  200 ggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagg 299  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||    
T  9982917 ggtggaaaacaaatatgtatagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatattggaagatggagttgatgacctggatttagatgaagaagg 9983016  T
Q  300 agctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtact 399  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||    
T  9983017 agctgctatagacagaaaaatacatactcctgctcagaagaagctttacaagaagcatcacaaaatcagagggattattgtggcttctatacctcgcact 9983116  T
Q  400 gaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||    
T  9983117 gaatatatgaagatgagtgacaaatc 9983142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 5 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 17017177 - 17016757
Alignment:
Q  5 gtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttctataaa 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||| || |  |   ||||| | ||  |||| ||     
T  17017177 gtatcagagcttgctttgttatcaaaa-cacttaaccgtgtgatatttcaagatccgtgaaaaacatgtctgttaaacctgaatccagtacatctacaag 17017079  T
Q  105 atacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtgg 204  Q
    ||||| || |||   |||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17017078 atacactaatgttggacatgattatggtactgctgataagaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcttggtgg 17016979  T
Q  205 aaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctg 304  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| || || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17016978 aaaaccaacatgtacagctacatcatgggattagatgaggagctgtgggatattcttgaagattgagttgatgatttggttttggatgaagaaggagctg 17016879  T
Q  305 ctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaata 404  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  17016878 ctattgacagaaagatacacactcctgctcagaagaagctatacaaaaagcatcacaagatcagagtgatcattgttgcttctataccacgcactgaata 17016779  T
Q  405 catgaagatgagtgataaatcc 426  Q
     ||||| |||||||||||||||    
T  17016778 tatgaaaatgagtgataaatcc 17016757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 38204657 - 38204235
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||||||   |    
T  38204657 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcaacta---c 38204562  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38204561 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 38204462  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  38204461 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 38204362  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  38204361 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 38204262  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  38204261 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 38204235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 505002 - 505424
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  505002 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 505097  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  505098 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 505197  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  505198 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 505297  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  505298 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacatcacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 505397  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  505398 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 505424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 4753724 - 4753302
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  4753724 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 4753629  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4753628 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 4753529  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4753528 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 4753429  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  4753428 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacatcacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 4753329  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  4753328 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 4753302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 5580465 - 5580887
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  ||||||||| |||   |    
T  5580465 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagcta---c 5580560  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5580561 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 5580660  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5580661 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 5580760  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  5580761 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 5580860  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  5580861 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 5580887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 8784668 - 8784246
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||||||   |    
T  8784668 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcaacta---c 8784573  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8784572 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 8784473  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  8784472 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 8784373  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    ||||||| || ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  8784372 gagctgccatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 8784273  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  8784272 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 8784246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 2 - 425
Target Start/End: Original strand, 16391881 - 16392302
Alignment:
Q  2 ttggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttct 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  ||||||||| |||   ||    
T  16391881 ttggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagcta---ct 16391976  T
Q  100 ataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcat 199  Q
    | ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16391977 acaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttcat 16392076  T
Q  200 ggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagg 299  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16392077 ggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaagg 16392176  T
Q  300 agctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtact 399  Q
    ||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||     
T  16392177 agctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcacc 16392276  T
Q  400 gaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||    
T  16392277 gaatacatgaaaatgagtgacaaatc 16392302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 12287812 - 12288234
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||||| ||  |  ||||||||| |||   |    
T  12287812 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatcttttagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagcta---c 12287907  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12287908 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 12288007  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  12288008 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 12288107  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  12288108 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 12288207  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  12288208 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 12288234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 20674029 - 20674451
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  20674029 attggtatcagagcctgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 20674124  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20674125 tacaaaatacacaagtgtcaaacatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 20674224  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  20674225 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 20674324  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  20674325 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 20674424  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  20674425 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 20674451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 24669875 - 24669453
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  24669875 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 24669777  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24669776 ---aaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 24669680  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24669679 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 24669580  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  24669579 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacatcacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 24669480  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  24669479 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 24669453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 165 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 47542029 - 47541768
Alignment:
Q  165 tccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaa 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47542029 tccaaagttcaatggagacccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatgggattggatgaagaactatgggatattcttgaa 47541930  T
Q  265 gatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaaga 364  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47541929 gattgagttgatgatttggatttggatgaagaatgatcttctattgacagaaaaatacacactcttgctcagaagaagctttataaaaagcatcacaaga 47541830  T
Q  365 tcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47541829 tcagagggattattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatcc 47541768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 5520273 - 5519851
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  5520273 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 5520178  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5520177 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 5520078  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5520077 tggtggaaaactaatatgtacagctttattatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 5519978  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  5519977 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 5519878  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  5519877 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 5519851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 5866528 - 5866950
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  5866528 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 5866626  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5866627 ---aaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 5866723  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5866724 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 5866823  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  5866824 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 5866923  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  5866924 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 5866950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 24384350 - 24384772
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  24384350 attggtatcagagcctgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 24384448  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24384449 ---aaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 24384545  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24384546 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 24384645  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  24384646 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacatcacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 24384745  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  24384746 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 24384772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 5537853 - 5538275
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||     |||||||||  ||   |    
T  5537853 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggaaatgaggaatcagtta---c 5537948  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5537949 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 5538048  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5538049 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 5538148  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||  ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  5538149 gagctgctacagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 5538248  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  5538249 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 5538275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 6491178 - 6491600
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  6491178 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 6491273  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  6491274 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttctca 6491373  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  6491374 tggtggaaaactaatatgtacaactttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgacctggatttagatgaagaag 6491473  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||    
T  6491474 gagctgctatagacagaaaaatacatactcctgctcagaagaagctttacaagaagcatcacaaaatcagagggattgttgtggcttctatacctcgcac 6491573  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6491574 tgaatacatgaagatgagtgacaaatc 6491600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 11273217 - 11273639
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  11273217 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatcttttagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 11273315  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11273316 ---aaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 11273412  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  11273413 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgacctggatttagatgaagaag 11273512  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  11273513 gagctgctatagatagaaaaatacatactcctgctcagaagaagctttacaagaagcaccacaaaatcagagggattattgtggcttctatacctcgcac 11273612  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  11273613 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 11273639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 14475626 - 14475204
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  14475626 attggtatcagagcctggtctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 14475531  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14475530 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 14475431  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14475430 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 14475331  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  14475330 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 14475231  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  14475230 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 14475204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 23767299 - 23766877
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  23767299 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 23767204  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23767203 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 23767104  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23767103 tggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 23767004  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  23767003 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 23766904  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  23766903 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 23766877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 29462049 - 29462472
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaa--gaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||  ||   |    
T  29462049 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagttcaagatccaaaagaaaaacatgtgtggaggagaggaatcagtta---c 29462145  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  29462146 tacaaaatacacaagtgtcaaacatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggtaaagctcctaagtttaatggagacccagaagagttttca 29462245  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||| ||  | ||||||| |||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  29462246 tggtggaaaacaaatatgtatagctttatcatgggtttggatgaagagctatgggacatattggaagatgaagttgatgacctggatttagatgaagaag 29462345  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||| | ||| |||  ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  29462346 gagctgctgtagacagaagaatacatactcctgctcagaaaaagctttacaagaagcaccacaaaatcagagggattattgtggcttctatacctcgcac 29462445  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||    
T  29462446 cgaatatatgaagatgagtgacaaatc 29462472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 37884984 - 37884562
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  37884984 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 37884889  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37884888 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 37884789  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  37884788 tggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttagatgaagaag 37884689  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  37884688 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 37884589  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     || ||||||||||||||||| |||||    
T  37884588 cgagtacatgaagatgagtgacaaatc 37884562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 419
Target Start/End: Original strand, 12238447 - 12238865
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca-agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttct 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||   |||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||     
T  12238447 attggtatcagagcttgctctgttatcacaa-cacttaaccgtgttacagttcaagatctttagaaaaacatgtctggaggagaggaatcaactacatcc 12238545  T
Q  100 ataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcat 199  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  12238546 ataaaatacacaagtgtcaaacatgactatgatacggctgacaagaaaacagactctggtaaagctccaaagtttaatggagacccagaagagttttcat 12238645  T
Q  200 ggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagg 299  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||  | | |||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| |    
T  12238646 ggtggaaaacaaatatgtatagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatattgggagatggagttgatgacctggatttagatgaagaatg 12238745  T
Q  300 agctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtact 399  Q
    || || ||| ||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||    
T  12238746 agttgttatagacagaaaaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaagcaccacaaaatcagagggattattgtggcttctatacctcgcact 12238845  T
Q  400 gaatacatgaagatgagtga 419  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  12238846 gaatatatgaagatgagtga 12238865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 19788427 - 19788005
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  19788427 attggtatcagagcttgttctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 19788332  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19788331 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 19788232  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  19788231 tggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttagatgaagaag 19788132  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  19788131 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 19788032  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  19788031 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 19788005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 175 - 426
Target Start/End: Original strand, 14312416 - 14312667
Alignment:
Q  175 aatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  14312416 aatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctttatcatgggtttggatgaagaactatgggacattcttgaggatggagttg 14312515  T
Q  275 atgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggat 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14312516 atgatttggatttggatgaagaaggtgctgttattgacagaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggat 14312615  T
Q  375 cattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    ||||| || |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14312616 cattgatgattctatacctcgcactgaatatatgaagatgagtgataaatcc 14312667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 425
Target Start/End: Original strand, 16396848 - 16397272
Alignment:
Q  2 ttggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaa--gaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttct 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||| |  ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||   |     
T  16396848 ttggtatcagagcttgctctgttatcata-gcgcttaacagtgttacagatcaggatcctatagaaaaacatgtctggaggagaggaatcaaatacaacc 16396946  T
Q  100 ataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcat 199  Q
     |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16396947 ttaaaatacacaagtgtcaaacatgattatgatactgctgacaagaaaacagactctggtaaagctcttaagtttaatggagatccagaagagttttcat 16397046  T
Q  200 ggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagg 299  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||    
T  16397047 ggtggaaaacaaatatgtatagctttatcatgggtttggatgaagagctatgggacatattggaagatggagttgatgacctggatttagatgaagaagg 16397146  T
Q  300 agctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtact 399  Q
    ||||||| | ||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||    
T  16397147 agctgctgtagacagaaaaatacatactcctgctcagaagaagctttacaagaagcaccacaaaatcagagggattattgtggcttctatacctcgcact 16397246  T
Q  400 gaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  16397247 gaatacatgaagatgagtgagaaatc 16397272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 144 - 426
Target Start/End: Original strand, 12753758 - 12754040
Alignment:
Q  144 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  12753758 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatgaagatccagaagagttttcttggtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattagatgat 12753857  T
Q  244 gaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagc 343  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||     
T  12753858 gagctgtgggatattcttgaagatggagttgatgatttggacctagatgaggaaggagctgctattgacagaaaaatacacacttctgctcaaaagaagt 12753957  T
Q  344 tttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12753958 tatacaaaaatcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctatacctcgcactgaatatatgaagatgagtgataaatcc 12754040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 144 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 15848158 - 15847876
Alignment:
Q  144 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||     
T  15848158 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcttggtggaaaaccaacatgtacaactacatcatgggattggatgag 15848059  T
Q  244 gaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagc 343  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15848058 gagctgtgggatattcttgaagatggagttgatgatctggacttggatgaggaaggagctgctattgacagaaagatacacactcctgctcaaaagaagc 15847959  T
Q  344 tttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  15847958 tatacaaaaagtatcacaagatcagagggatcattgttgcttctataccacgcactaaatatatgaaaatgagtgataaatcc 15847876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 41693648 - 41693232
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  41693648 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 41693553  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||      ||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41693552 tacaaaatacacaagtgtcaagcatga------tactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 41693459  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  41693458 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 41693359  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  41693358 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacatcacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 41693259  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  41693258 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 41693232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 13373500 - 13373922
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  13373500 attggtatcagagcctgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 13373595  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  13373596 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatctggaagagttttca 13373695  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13373696 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 13373795  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  13373796 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 13373895  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  13373896 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 13373922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 13384094 - 13384516
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  13384094 attggtatcagagcctgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 13384189  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  13384190 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatctggaagagttttca 13384289  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13384290 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 13384389  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  13384390 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 13384489  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  13384490 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 13384516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 10627777 - 10628202
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaa--gaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||| |  ||||||||||| | | ||||| ||||||| || | |    
T  10627777 attggtatcagagcttgctctgttatcata-gcgcttaacagtgttacagatcaagatcctatagaaaaacatgtctaaaggagaagaatcaaatactac 10627875  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
     | ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10627876 cacaaaatacacaagtgtcaaacatgattatgatactgctgacaagaaaacagactctggtaaagctcctaagtttaatggagatccagaagagttttca 10627975  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  10627976 tggtggaaaacaaatatgtatagctttatcatgggtttggatgaagagctatgggacatattggaagatggagttgatgacctggatttagatgaagaag 10628075  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  10628076 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaaaaagctttacaagaagcaccacaaaattagagggattattgtggcttctatacctcgcac 10628175  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||    
T  10628176 cgaatatatgaagatgagtgacaaatc 10628202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 17282266 - 17282543
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |  ||| ||||| ||||  | ||    
T  17282266 attggtatcagagcttgctctgttatca-aagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccgagaaaaacatgtctactaaagatgaatccactacattta 17282364  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17282365 caaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgacaggaaatcagattctggaaaagcttcaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 17282464  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgat 279  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  17282465 gtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattggatgaagagttatgggacattcttgaagatggagttgatgat 17282543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 39382089 - 39381667
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  39382089 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 39381991  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  39381990 ---aaaatacacaagcgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttct 39381894  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||| ||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  39381893 tggtggaaaactaatatgtacaactttatcatgggattagatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgacctggatttagatgaagaag 39381794  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  39381793 gagctgctatagatagaaaaatacatactcctgctcagaagaagctttacaagaagcaccacaaaatcagagggattattgtggcttctatacctcgcac 39381694  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  39381693 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 39381667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 28315070 - 28315492
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  28315070 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 28315168  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  28315169 ---aaaatacacaagcgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttct 28315265  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  28315266 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgacctggatttagatgaagaag 28315365  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  28315366 gagctgctatagatagaaaaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 28315465  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  28315466 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 28315492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 144 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13147302 - 13147101
Alignment:
Q  144 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcat-ggaattggatga 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || | | |||||    
T  13147302 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcttggtgaaaaaccaacatgtacagctacatcatggggactagatga 13147203  T
Q  243 agaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaag 342  Q
     || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  13147202 ggagctgtgggatattcttgaagatggagttgatgatttggacttggaagaggaaggagctgctattgacagaaagatacacactcctacttagaagaag 13147103  T
Q  343 ct 344  Q
    ||    
T  13147102 ct 13147101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 213 - 425
Target Start/End: Original strand, 6183008 - 6183220
Alignment:
Q  213 tatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgac 312  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6183008 tatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaaggagctgctatagac 6183107  T
Q  313 tgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaaga 412  Q
     |||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  6183108 agaagaatacatactcctgctcagaagaagcattataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcaccgaatacatgaaga 6183207  T
Q  413 tgagtgataaatc 425  Q
    ||||||| |||||    
T  6183208 tgagtgacaaatc 6183220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 160 - 419
Target Start/End: Original strand, 15960451 - 15960710
Alignment:
Q  160 aaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattc 259  Q
    |||||||||||||| |||||| |||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  | |||||||  || ||||| ||||||||||||||||    
T  15960451 aaagctccaaagtttaatggaaatcttgaagaattttcctggtggaaaaccaatatgtatagtcacatcatgggtttagatgatgaactatgggatattc 15960550  T
Q  260 ttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatca 359  Q
    |||||||||| |||  ||| ||||   | |||||||||||||||| ||||||  ||||||  ||  || ||| ||| |||||||||||||| || |||||    
T  15960551 ttgaagatggtgttggtgacttggcccttgatgaagaaggagctgttattgatagaaagaagcattctcctggtcataagaagctttacaagaaacatca 15960650  T
Q  360 caagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtga 419  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | || || ||||||||||| |||||    
T  15960651 caagatcagaggaatccttgttgcttctatacctagcacagagtacatgaagattagtga 15960710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 199 - 369
Target Start/End: Original strand, 12410860 - 12411030
Alignment:
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||||| ||| ||| ||||||||||    
T  12410860 tggtggaaaaccaaaatgtatagttatatcatgggattagatgaagaattatgggatatccttgaagaaggtgttaatgatctggttttagatgaagaag 12410959  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcaga 369  Q
    | |||||| ||||   ||||| ||||||| || ||||||||||| |||| || || |||||||||||||||    
T  12410960 gtgctgctgttgataaaaagaaacacactgctactcagaagaagatttataagaaacatcacaagatcaga 12411030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 425
Target Start/End: Original strand, 14078448 - 14078697
Alignment:
Q  158 gaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatat 257  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  | ||||| | |||  |||| ||| ||||||||||    
T  14078448 gaaaagctccaaggtttaatggaaatcctgaagaattttcctggtggaaaaccaatatgtatagtcacatcatcggattaaatgatgaattatgggatat 14078547  T
Q  258 tcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcat 357  Q
    |||||||||||                  | ||||||||||||| || ||||||  |||||| ||| ||  || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  14078548 tcttgaagatg------------------ttgatgaagaaggagttgttattgatagaaagaaacataccccttctcagaagaagctttacaagaagcat 14078629  T
Q  358 cacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    |||||||||| ||| ||| || |||||||||| ||||| |  || ||||||||||||||||| |||||    
T  14078630 cacaagatcaaaggaatccttattgcttctatacctcgcatagagtacatgaagatgagtgacaaatc 14078697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 250 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16881196 - 16881062
Alignment:
Q  250 tgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttaca 349  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  |||  |||  || ||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16881196 tgggatgttcttgaagatggtgttggtgacctggccttagatgaagaaagagctgctattgatagaaagaaacacactactgctcagaagaagctttaca 16881097  T
Q  350 aaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgct 384  Q
    | || ||||||||||||| ||| ||  ||||||||    
T  16881096 agaaacatcacaagatcataggaattcttgttgct 16881062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 14954461 - 14954246
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggat 255  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | || || ||| ||||||  || |||||||||| |||||||    
T  14954461 tggaaaagttccaaatttcaaaggagatcctgaagaattttcctggtggaagaccaacttctatagttatgtcatgggtttagatgaagaacaatgggat 14954362  T
Q  256 attcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagc 355  Q
    || || ||||||||  || |||| |||| | | ||||||||||||||| |||||||  |||  |  || ||| ||||||||||||| || || || ||||    
T  14954361 atactagaagatggtattgatgacttggttgttgatgaagaaggagctcctattgatagaagaaagcatactcctgctcagaagaaactctaaaagaagc 14954262  T
Q  356 atcacaagatcagagg 371  Q
    ||||||  ||||||||    
T  14954261 atcacataatcagagg 14954246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 371
Target Start/End: Original strand, 53057832 - 53058047
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggat 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||  | |||||  || ||||||  || |||||| ||||||||||     
T  53057832 tggaaaagttccaaagttcaatggagatcctgtagaattttcctggtggaagaccaacttctacagtcatgtcatgggcttagatgaaaaactatgggac 53057931  T
Q  256 attcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagc 355  Q
    || || ||||||||  ||  ||| ||||   | |||||||||||| ||||||||||  | |  | ||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  53057932 atactagaagatggtattggtgacttggtcgttgatgaagaaggaactgctattgataggagaaaacatacttctgctcagaagaaattctacaagaagc 53058031  T
Q  356 atcacaagatcagagg 371  Q
    ||||||  ||||||||    
T  53058032 atcacacaatcagagg 53058047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 387
Target Start/End: Original strand, 16306156 - 16306344
Alignment:
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||  || ||||||||||||||| || | ||||||| ||  |||  ||||||||| || ||||||||||    
T  16306156 tggtggaaaaccaaaatgtatagctacattatgggtttagatgaagaactatggaatttccttgaagctgatgttggtgatttggagttagatgaagaag 16306255  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttct 387  Q
    ||| || | ||||  | |||| ||||||| |||| ||||||||| | || |  |  ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||    
T  16306256 gagttgttgttgataggaagaaacacactgctgcgcagaagaagatgtatacgagacatcacaggatcagaggcattcttgttgcttct 16306344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 13131309 - 13131236
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgt 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  13131309 attggtatcagagcttgctctgttatca-cagcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgt 13131236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16031547 - 16031432
Alignment:
Q  154 tctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatggg 253  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||  | ||||||||  |||| |  || ||||||||||||||||    
T  16031547 tctggtaaagttcctaagttcaatggagatcctgaagaattctcttggtggaaaaccaacttctacagctaggtcattggtttagatgaagaactatggg 16031448  T
Q  254 atattcttgaagatgg 269  Q
    | ||| | ||||||||    
T  16031447 acattatagaagatgg 16031432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 285 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1463327 - 1463241
Alignment:
Q  285 tttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagg 371  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||  |||||| ||||| |  ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  1463327 tttggatgaagaaggtgtagctattgatagaaagaaacacaatgttgctcagaagaagctctacaagaaacatcacaagatcagagg 1463241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 13147444 - 13147375
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacat 71  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  13147444 attggtatcagagcttgctccgttatgaaaa-cacttaaccgtgtaacagatcaagatctgagaaaaacat 13147375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 2560234 - 2560121
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggat 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | || ||  || ||||||  || |||||||||||||| ||     
T  2560234 tggaaaagttccaaagttcaatggagatcctgaagaattttcctggtggaagaccaacttttatagtcatgtcatgggcttagatgaagaactatgagac 2560135  T
Q  256 attcttgaagatgg 269  Q
    || || ||||||||    
T  2560134 atactagaagatgg 2560121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 384
Target Start/End: Original strand, 19658672 - 19658815
Alignment:
Q  238 gatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcaga 337  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||   |||| | | ||||||||||||||| |  | | ||||  |||||| ||||| | || ||||||    
T  19658672 gatgaagaattatgggatattcttgaagatggtgt---tgatcttgttttggatgaagaaggtgtagtttttgatagaaagaaacacaatgctactcaga 19658768  T
Q  338 agaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgct 384  Q
    |||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||  ||||||||    
T  19658769 agaatctctacaagaaccatcgcaagatcagaggaattcttgttgct 19658815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 11189043 - 11188828
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggat 255  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | || ||  || ||||||  || ||||||||||||| |||     
T  11189043 tggaagagttccaaagttcaatggagatcctgaagaattttcctggtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggtttagatgaagaactataggac 11188944  T
Q  256 attcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagc 355  Q
    || || |||||||   ||  ||| ||||   | |||||||||||||||| ||||||  |||  | ||| ||| |||||||||||||  | ||||| || |    
T  11188943 atactagaagatgatattggtgacttggtccttgatgaagaaggagctgttattgatagaagaaaacatactcctgctcagaagaaattctacaagaaac 11188844  T
Q  356 atcacaagatcagagg 371  Q
    ||||||  ||||||||    
T  11188843 atcacacaatcagagg 11188828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 5211458 - 5211345
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggat 255  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||  | |||||  || ||||    ||||||||||| ||||||||     
T  5211458 tggaaaagttccaaagttcaacggagatcctgaagaattttccttgtggaaaaccaacttctacagtcatgtcatttgtttggatgaagagctatgggac 5211359  T
Q  256 attcttgaagatgg 269  Q
    || || ||||||||    
T  5211358 atactagaagatgg 5211345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 11221840 - 11221739
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggat 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||  | || ||  || ||||||  || ||||||||| ||||||||    
T  11221840 tggaaaagttccaaagttcaatggagatgctgaagaattttcctggtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggcttagatgaagaattatgggat 11221741  T
Q  256 at 257  Q
    ||    
T  11221740 at 11221739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 269
Target Start/End: Original strand, 19886185 - 19886310
Alignment:
Q  144 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaa 243  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||  | || ||  || |||||   || ||||||    
T  19886185 gaaatctgactctggaaaagttccaaagtttaatggagatcctggagaattttcctggtggaataccaacttctatagtcatgtcatgagtttagatgaa 19886284  T
Q  244 gaactatgggatattcttgaagatgg 269  Q
    ||||||||||| || || ||||||||    
T  19886285 gaactatgggacatactagaagatgg 19886310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 384
Target Start/End: Original strand, 18696140 - 18696235
Alignment:
Q  289 gatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgct 384  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||  || | | |||||||||  ||| | ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  18696140 gatgaagaaggagctgctattgatagaaagaagcatagtcctgctcagacaaagttgtacaagaaacatcacaagatcagaggaattcttgttgct 18696235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Original strand, 17240037 - 17240090
Alignment:
Q  144 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 197  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  17240037 gaaatctgactctggaaaagttccaaagtttaatggagatcctgaagaattttc 17240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11222594 - 11222538
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaa 212  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  11222594 tggaaaagtttcaaagttcaatggagatgctgaagaattttcctggtggaagaccaa 11222538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 3389868 - 3389444
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  3389868 attggtatcagagcttgctctgttatcata-gcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtctgatggagaggaatcaacgacttcta 3389770  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3389769 tgaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatattgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagtttttatg 3389670  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3389669 gtggaaaaccaatatgtacaactatatcatgggattggatgaagaactatgagataatcttgaagatggagttgatgatttggatttggatgaagaagga 3389570  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3389569 gctgctattgacagaaagatacacactcttgctcagaagaagctttataaaaagcatcacaagatcagagggattattgttgcttctattcctcgtactg 3389470  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  3389469 aatacatgaagatgagtgataaatcc 3389444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 16316750 - 16316323
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaa--gaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactat-tt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||    
T  16316750 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaaaagaaaaacatgtgtggaggagaggaatcaactacatt 16316651  T
Q  98 ctataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 197  Q
    || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16316650 ct-taaaatacacaagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 16316552  T
Q  198 atggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaa 297  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16316551 gtggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatgggattggatgaagaactatgggatatacttgaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaa 16316452  T
Q  298 ggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgta 397  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16316451 ggagctgctattgatagaaagatacacactcctgctcagaagaaaacttacaaaaagcatcacaagatcagagggattattgttgcttctattcctcgta 16316352  T
Q  398 ctgaatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16316351 ctgaatacatgaagatgagtgataaatcc 16316323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 14836940 - 14837367
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaa--gaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||||   ||    
T  14836940 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaacatccaaaagaaaaacatgtctggaggagaggaatcaactgcatc 14837039  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14837040 cttaaaatacactagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatctagaagagttttca 14837139  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14837140 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatgggatttgatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 14837239  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14837240 gagctgctatagacagaaaaatacacactcctgctcagaagaagacttacaaaaagcatcacaagatcagagggattattgttgcttctattcctcgtac 14837339  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14837340 tgaatacatgaagatgagtgataaatcc 14837367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 14711658 - 14712082
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || || |   ||||| | ||  ||||    
T  14711658 attggtatcagagcttgctctgttatca-aagcacttaaccgtgtgacagttcaagatccgagaaaaacatgtctgctgaacctgaatccagtacatcta 14711756  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
     || ||||| || |||   ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14711757 caagatacactaatgttggacatgactatggtactgctgacaagaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcttg 14711856  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||    
T  14711857 gtggaaaaccaatatgtacagctacatcatgggattagatgaggagttgtgggatattcttgaagatggagttgatgatctgaacttggatgaagaagga 14711956  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14711957 gctgctattgacagaaagatacacactcctgctcagaagaaactatacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctatacctcgcactg 14712056  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||    
T  14712057 aatatatgaaaatgagtgataaatcc 14712082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 5022157 - 5021733
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca-agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttct 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||   |||||||||||| ||  ||||| ||||||||||  ||     
T  5022157 attggtatcagagcttgctctgttatcacaa-cacttaaccgtgttacagttcaagatctttagaaaaacatgtctggaggagaagaatcaactacatcc 5022059  T
Q  100 ataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcat 199  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  5022058 ataaaatacacaagtgtcaaacatgactatgatacggctgacaagaaaacagactctggtaaagctccaaagtttaatggagacccagaagagttttcat 5021959  T
Q  200 ggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagg 299  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||    
T  5021958 ggtggaaaacaaatatgtatagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatattggaagatggagttgatgacctggatttagatgaagaagg 5021859  T
Q  300 agctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtact 399  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||    
T  5021858 agctgctatagacagaaaaatacatactcctgctcagaagaagctttacaagaagcatcacaaaatcagagggattattgtggcttctatacctcgcact 5021759  T
Q  400 gaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||    
T  5021758 gaatatatgaagatgagtgacaaatc 5021733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 40455195 - 40455618
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaa--gaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||  ||   |    
T  40455195 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgaccgttcaagatccaaaagaaaaacatgtctggaggagaggaatcagtta---c 40455291  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  40455292 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggacatccagaagagttttca 40455391  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||| || || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  40455392 tggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctataggacatactggaagatggagttgatgatctggatttagatgaagaag 40455491  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  40455492 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 40455591  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  40455592 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 40455618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 18131085 - 18131507
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||||||   |    
T  18131085 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcaacta---c 18131180  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18131181 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 18131280  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18131281 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 18131380  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  18131381 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 18131480  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  18131481 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 18131507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 55746088 - 55746510
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||||||   |    
T  55746088 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcaacta---c 55746183  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55746184 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 55746283  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  55746284 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 55746383  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  55746384 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 55746483  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  55746484 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 55746510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 36028310 - 36027888
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  36028310 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 36028215  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36028214 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 36028115  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  36028114 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 36028015  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  36028014 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacatcacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 36027915  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  36027914 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 36027888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 10741434 - 10741856
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  10741434 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 10741532  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10741533 ---aaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 10741629  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  10741630 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 10741729  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  10741730 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacatcacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 10741829  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  10741830 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 10741856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 10955203 - 10955625
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  10955203 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 10955301  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10955302 ---aaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 10955398  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  10955399 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 10955498  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  10955499 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacatcacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 10955598  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  10955599 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 10955625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 460582 - 460160
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||||||  |  |||||||||  ||   |    
T  460582 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtatggagatgaggaatcagtta---c 460487  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  460486 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 460387  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  460386 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 460287  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  460286 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaaggtaagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 460187  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  460186 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 460160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 19945174 - 19945596
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  19945174 attggtatcagagcttgctctgttatcacaa-cacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 19945269  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19945270 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 19945369  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  19945370 tggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 19945469  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||  |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  19945470 gagctgctatagatagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 19945569  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  19945570 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 19945596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 30927329 - 30927751
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  30927329 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 30927424  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30927425 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 30927524  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  30927525 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 30927624  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  30927625 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 30927724  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  30927725 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 30927751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16265884 - 16265462
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  16265884 attggtatcagagcctgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 16265789  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16265788 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 16265689  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16265688 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgacgagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 16265589  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  16265588 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 16265489  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  16265488 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 16265462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 16820193 - 16820617
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || || |   |||||   ||  ||||    
T  16820193 attggtatcagagcttgctctgttatca-aagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccgagaaaaacacgtctgctgaacctgaatcttttacatcta 16820291  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
     ||  |||| || |||    ||||| |||| |||  |||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16820292 caagttacactaatgttggtcatgattatggtacatctgacaagaaattagattctggaaaagctctaaagttcaatggagatccagaagagttttcttg 16820391  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  16820392 gtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattagatgaggagctgtgggatattcttgaagatggagttgatgatatggacttggatgaagaagga 16820491  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    |||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||    
T  16820492 gctgctattgacagaaatattcacactcctgctcagaagaagctaaacaaaaagcattacaagatcagaaggatcattgttgcttctataccacgcactg 16820591  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||    
T  16820592 aatatatgaaaatgagtgataaatcc 16820617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 27815781 - 27816204
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaa-catgtatgatggagaggaatcaactattt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  ||||||| ||||| ||  |  |||||||||  ||       
T  27815781 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta--- 27815876  T
Q  98 ctataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 197  Q
    ||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27815877 ctacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 27815976  T
Q  198 atggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaa 297  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  27815977 atggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttagatgaagaa 27816076  T
Q  298 ggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgta 397  Q
    ||||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |    
T  27816077 ggagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgca 27816176  T
Q  398 ctgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||    
T  27816177 ccgaatacatgaagatgagtgacaaatc 27816204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 17928118 - 17927696
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  17928118 attggtatcagagcctgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 17928023  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17928022 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggacatccagaagagttttca 17927923  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17927922 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 17927823  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  17927822 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 17927723  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  17927722 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 17927696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 18753326 - 18753748
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  18753326 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcaattaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 18753424  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  18753425 ---aaaatacaagagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttct 18753521  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  18753522 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgacctggatttagatgaagaag 18753621  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  18753622 gagctgctatagatagaaaaatacatactcctgctcagaagaagctttacaagaagcatcacaaaatcagagggattattgtggcttctatacctcgcac 18753721  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  18753722 tgaatacatgaagatgagtgacaaatc 18753748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 22006436 - 22006014
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  22006436 attggtatcagagcctgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatcttttagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 22006341  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22006340 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 22006241  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22006240 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 22006141  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  22006140 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 22006041  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  22006040 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 22006014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 27176093 - 27175671
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  27176093 attggtatctgagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 27175998  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27175997 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 27175898  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  27175897 tggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttagatgaagaag 27175798  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  27175797 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 27175698  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  27175697 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 27175671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 27666592 - 27666170
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  27666592 attggtatcagagcatgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatcttttagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 27666494  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27666493 ---aaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 27666397  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  27666396 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgacctggatttagatgaagaag 27666297  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  27666296 gagctgctatagatagaaaaatacatactcctgctcagaagaagctttacaagaagcaccacaaaatcagagggattattgtggcttctatacctcgcac 27666197  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  27666196 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 27666170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 425
Target Start/End: Original strand, 14844492 - 14844910
Alignment:
Q  5 gtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttctata 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   ||| |    
T  14844492 gtatcagcgcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---ctaca 14844587  T
Q  103 aaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggt 202  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  14844588 aaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccaaaagagttttcatggt 14844687  T
Q  203 ggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagc 302  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14844688 ggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaaggagc 14844787  T
Q  303 tgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaa 402  Q
    |||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||    
T  14844788 tgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcaccgaa 14844887  T
Q  403 tacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  14844888 tacatgaagatgagtgacaaatc 14844910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 49517556 - 49517134
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  49517556 attggtatcagagcctgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 49517458  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  49517457 ---aaaatacacaagcgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttct 49517361  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  49517360 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgacctggatttagatgaagaag 49517261  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  49517260 gagctgctatagatagaaaaatacatactcctgctcagaagaagctttacaagaagcaccacaaaatcagagggattattgtggcttctatacctcgcac 49517161  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  49517160 tgaatacatgaagatgagtgacaaatc 49517134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 18065996 - 18065572
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaa--gaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||   |    
T  18065996 attggtatcagagcctgctctgttatcata-gcacttaacagtgttacagatcaagatcctatagaaaaacatgtctggaggagaggaatcaactacaac 18065898  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
      |||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18065897 cgtaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatacggctgacaagaaaacagactctggtaaagctcctaagtttaatggagatccagaagagttttca 18065798  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||  |||||||  ||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  18065797 tggtggaaaacaaatatgtatagcttcatcatgggtttggatgaagagctatgggacatattggaagatggagttgatgatctggatttagatgaagaag 18065698  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    ||||||| || ||| |||  ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||    
T  18065697 gagctgccatagacagaagaatacatactcctgctcagaaaaagctttacaagaagcaccacaa-atcagaggaattattgtggcttctatacctcgcac 18065599  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||    
T  18065598 cgaatatatgaagatgagtgacaaatc 18065572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 186 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 11470505 - 11470266
Alignment:
Q  186 agaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  11470505 agaagagttttcatggtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattggatgaagaactatgggacattcttgatgatggagttgatgatctggat 11470406  T
Q  286 ttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgctt 385  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11470405 tcggatgaagaaggagctgctattgacagaaggatacacactcctgctcagaagaaactttacaaaaagcatcacaagatcagagggatgattgttgctt 11470306  T
Q  386 ctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    |||| ||||  | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11470305 ctatacctcacattgaatatatgaagatgagtgataaatc 11470266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 199 - 425
Target Start/End: Original strand, 4988827 - 4989053
Alignment:
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  4988827 tggtggaaaacaaatatgtatagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatattggaagatggagttgatgacctggatttagatgaagaag 4988926  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  4988927 gagctgctatagacagaaaaatacatactcctgctcagaagaagctttacaagaagcatcacaaaatcagagggattattgtggcttctatacctcgcac 4989026  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||    
T  4989027 tgaatatatgaagatgagtgacaaatc 4989053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 144 - 425
Target Start/End: Original strand, 10662241 - 10662521
Alignment:
Q  144 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaa 243  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||  |||| || || |||||||||||||| |||||||| || ||| |||| || |||||     
T  10662241 gaaatctgactctggaaaagctccaaagtttaacggagatcctaaagaattctcttggtggaaaaccaacatgtacagttacatcttgga-ttagatgat 10662339  T
Q  244 gaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagc 343  Q
    ||||| |||||||||||| |||| || |||  ||| |||| | | |||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||| || |    
T  10662340 gaactgtgggatattcttaaagaaggtgttggtgacttggctcttgatgaagatggagctgctattgatagaaagaaacacacccctgctcagaaaaaac 10662439  T
Q  344 tttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||    
T  10662440 tttacaagaagcatcacaagatgagaggaatccttgttgcatctatacctcgcacagagtacatgaagatgagtgacaaatc 10662521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 144 - 425
Target Start/End: Original strand, 10876386 - 10876666
Alignment:
Q  144 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaa 243  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||  |||| || || |||||||||||||| |||||||| || ||| |||| || |||||     
T  10876386 gaaatctgactctggaaaagctccaaagtttaacggagatcctaaagaattctcttggtggaaaaccaacatgtacagttacatcttgga-ttagatgat 10876484  T
Q  244 gaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagc 343  Q
    ||||| |||||||||||| |||| || |||  ||| |||| | | |||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||| || |    
T  10876485 gaactgtgggatattcttaaagaaggtgttggtgacttggctcttgatgaagatggagctgctattgatagaaagaaacacacccctgctcagaaaaaac 10876584  T
Q  344 tttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||    
T  10876585 tttacaagaagcatcacaagatgagaggaatccttgttgcatctatacctcgcacagagtacatgaagatgagtgacaaatc 10876666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 193 - 384
Target Start/End: Original strand, 17527475 - 17527664
Alignment:
Q  193 ttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatg 292  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| ||  |||||||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||    
T  17527475 ttttcttggtggaaa-ccaaaatgtatagtcatatcatgggcatagatgaagaacaatgggatattcttgaagatggtgttgatgatctggttttggatg 17527573  T
Q  293 aagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgct 384  Q
    ||||| | || |||  | || |||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  17527574 aagaatgtgcagctgcttacagaaagaaacacactgctgctcataa-aagctttacaagaaatatcacaagatcagaggcattcttgttgct 17527664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 346 - 399
Target Start/End: Original strand, 15194403 - 15194456
Alignment:
Q  346 tacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtact 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15194403 tacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctatccctcgtact 15194456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 361
Target Start/End: Original strand, 14905389 - 14905594
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggat 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||  | |||||| |||||  | || ||  || ||||||  || ||||||||||||||||||    
T  14905389 tggaaaagttccaaagttcaatggagatcttgaagaatttttcttgtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggtttagatgaagaactatgggat 14905488  T
Q  256 attcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagc 355  Q
    || || |||||||||  |  ||| ||||   | |||||||||||||||||||||||  |||  | ||| ||| || ||||||||||| | ||||| ||||    
T  14905489 atactagaagatggaaatggtgacttggtcgttgatgaagaaggagctgctattgatagaagaaaacatactcctactcagaagaagttctacaagaagc 14905588  T
Q  356 atcaca 361  Q
     |||||    
T  14905589 gtcaca 14905594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 17246617 - 17246504
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggat 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||  | || ||  || ||||||  || ||||||||||||||| |     
T  17246617 tggaaaagttccaaagttcaatggagatcctgaagagttttcctggtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggcttagatgaagaactatggaac 17246518  T
Q  256 attcttgaagatgg 269  Q
    || || ||||||||    
T  17246517 atactggaagatgg 17246504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 24649995 - 24649928
Alignment:
Q  358 cacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  24649995 cacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcaccgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 24649928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 426
Target Start/End: Original strand, 15195150 - 15195184
Alignment:
Q  392 ctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15195150 ctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatcc 15195184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 327
Target Start/End: Original strand, 14903554 - 14903643
Alignment:
Q  238 gatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacact 327  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||  ||| ||||  || |||||||||||||||| | ||||  |||||| |||||||    
T  14903554 gatgaagaactatgggatgttcttcaagattgtgttggtgacttggtgttagatgaagaaggagctgatgttgatagaaagaaacacact 14903643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 350; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 8639 - 9063
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||      
T  8639 attggtatcagagcttgctctgttatcata-gcacttaaccgtgtaacagatcaagatccaagaaaaacatgtctggaggagaggaatcaactacatcct 8737  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8738 taaaatacactagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 8837  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8838 gtggaaaacaaatatgtacaactatatcatgggattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaagga 8937  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8938 gctgctatggacagaaagatacacactcctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 9037  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  9038 aatacatgaagatgagtgataaatcc 9063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 16746411 - 16745984
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaa--gaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||    
T  16746411 attggtaccagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaaaagaaaaacatgtctggaggagaggaatcaactacatc 16746312  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16746311 cttaaaatacactagtgtcaaacatgactatggtactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 16746212  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16746211 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatgggattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 16746112  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16746111 gagctgctatagacagaaaaatacacactcctgctcaaaagaagacttacaaaaagcatcacaagatcagagggattattgttgcttctattcctcgtac 16746012  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16746011 tgaatacatgaagatgagtgataaatcc 16745984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 3842936 - 3842512
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  || ||| ||||| ||||  ||||    
T  3842936 attggtatcagagcttgctctgttatca-aagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccgagaaaaacatgtctactgaagatgaatccactacatcta 3842838  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3842837 caaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgacaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 3842738  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3842737 gtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaagga 3842638  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3842637 gctgctattgacagaaggatacacactcctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctatacctcgcactg 3842538  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  3842537 aatatatgaagatgagtgataaatcc 3842512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 30315591 - 30316014
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaa--gaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||  ||   |    
T  30315591 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagttcaagatccaaaagaaaaacatgtctggaggagaggaatcagtta---c 30315687  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  30315688 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagattcagaagagttttca 30315787  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  30315788 tggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaaaagctatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttagatgaagaag 30315887  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  30315888 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 30315987  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  30315988 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 30316014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 19428332 - 19427905
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaa--gaaaaacatgtatgat-ggagaggaatcaactattt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||   ||||||||||||||||       
T  19428332 attggtatcagagcttgctctgttatcataagtacttaaccgtgtgacagttcaagatccaaaagaaaaacatgtctgggaggagaggaatcaacta--- 19428236  T
Q  98 ctataaaatacaatagtgtcaaacatgactat--gatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttt 195  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19428235 ctacaaaatacacaagtgtcaaacatgactatatgatactgctgacaagaaaacaaactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttt 19428136  T
Q  196 tcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaag 295  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  19428135 tcatggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggtttggatgaagagctatgggacatactggaagatggagttgatgacttggatttagatgaag 19428036  T
Q  296 aaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcg 395  Q
    ||||||||||| | ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  19428035 aaggagctgctgtggacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagatcagaggaatcattgtggcttctatacctcg 19427936  T
Q  396 tactgaatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  19427935 caccgaatacatgaagatgagtgacaaatcc 19427905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 36087928 - 36087506
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||||||   |    
T  36087928 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcaacta---c 36087833  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36087832 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 36087733  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  36087732 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 36087633  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    ||||||| || ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  36087632 gagctgccatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 36087533  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  36087532 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 36087506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 3349502 - 3349924
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  3349502 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 3349600  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3349601 ---aaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 3349697  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3349698 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 3349797  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  3349798 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacatcacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 3349897  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  3349898 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 3349924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 23792639 - 23792215
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |   ||||   |||  | ||    
T  23792639 attggtatcagagcttgctctgttatca-aagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccgagaaaaacatgtctgctgaacctgaatgctctacatgta 23792541  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
     ||  |||| || ||| || ||||| |||| |||  |||| | ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23792540 caaggtacactaatgttaatcatgattatggtacatctgacaagaaatcagatttttgaaaagctccaatgttcaatggagatccagaagagttttcttg 23792441  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||||  || |||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  23792440 gtggaaaaccaacatgtacatctacatcatgggtttagatgaagatctttgtgatattcttgaagatggagttgatgatttggacttggatgaagaagga 23792341  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  23792340 gctgctattgatagaaagattcacactcctgctcagaagaagctatagaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctataccacgcactg 23792241  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||    
T  23792240 aatatatgaaaatgagtgataaatcc 23792215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 36302932 - 36302510
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  36302932 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 36302834  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36302833 ---aaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 36302737  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  36302736 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 36302637  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  36302636 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacatcacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 36302537  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  36302536 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 36302510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 251814 - 251392
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  251814 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 251719  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  251718 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 251619  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  251618 tggtggaaaactaatatgtacagctttattatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 251519  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  251518 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 251419  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  251418 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 251392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 814915 - 814493
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  814915 attggtatcagagcttgctctgttatcacaa-cacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 814820  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  814819 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 814720  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  814719 tggtggaaaactaatatgtacagctttattatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 814620  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  814619 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 814520  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  814519 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 814493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 26120316 - 26119894
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||| |  |||||||||  ||   |    
T  26120316 attggtatcagagcttgctctgttatcata-gcacttaaccgtgttacagctcaagatctattagaaaaacatgtctgaagatgaggaatcagtta---c 26120221  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26120220 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgttgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttca 26120121  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26120120 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 26120021  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  26120020 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 26119921  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  26119920 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 26119894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 32078563 - 32078985
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  32078563 attggtatcagagcttgctctattatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 32078658  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32078659 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 32078758  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  32078759 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 32078858  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  32078859 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 32078958  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  32078959 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 32078985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 9367700 - 9367278
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  9367700 attggtatcagagcctgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 9367602  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9367601 ---aaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 9367505  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9367504 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 9367405  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||    
T  9367404 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacatcacaagataagaggaatcatcgtggcttctatacctcgcac 9367305  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  9367304 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 9367278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 13689437 - 13689859
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  13689437 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatcttttagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 13689535  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13689536 ---aaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 13689632  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  13689633 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgacctggatttagatgaagaag 13689732  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  13689733 gagctgctatagatagaaaaatacatactcctgctcagaagaagctttacaagaagcaccacaaaatcagagggattattgtggcttctatacctcgcac 13689832  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  13689833 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 13689859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 121 - 426
Target Start/End: Original strand, 22148590 - 22148895
Alignment:
Q  121 catgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtaca 220  Q
    |||||||||| |||  |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22148590 catgactatggtacatctgacaagaaatcagattctggaaaaggtccaaagttcaatggagatccagaagaattttcttggtggaaaaccaacatgtaca 22148689  T
Q  221 gctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagat 320  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  22148690 gctacatcatgggattagatgaagagctgtgggatattcttgaagatggagttgatgatttggttttggatgaagaaggagctgctgttgacaaaaagat 22148789  T
Q  321 acacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgat 420  Q
     |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||    
T  22148790 tcacactcctgctcagaagaagctatacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctataccacgcactgaatatatgaagatgagtgat 22148889  T
Q  421 aaatcc 426  Q
    ||||||    
T  22148890 aaatcc 22148895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 29076146 - 29075724
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  29076146 attggtatcagagcatgctttgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 29076051  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29076050 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 29075951  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29075950 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 29075851  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  29075850 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 29075751  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  29075750 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 29075724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 29086397 - 29085975
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  29086397 attggtatcagagcatgctttgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 29086302  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29086301 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 29086202  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29086201 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 29086102  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  29086101 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 29086002  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  29086001 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 29085975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 6160443 - 6160021
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  6160443 attggtatcagagcctgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 6160348  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  6160347 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccggaagagttttta 6160248  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  6160247 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 6160148  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    ||||||||||  || |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  6160147 gagctgctatatacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 6160048  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  6160047 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 6160021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 19138685 - 19138264
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  19138685 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 19138590  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19138589 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 19138490  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  19138489 tggtggaaaacaaatatgtacaact-tatcatgggattggatgaagagctatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttagatgaagaag 19138391  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| |  || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  19138390 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataggaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 19138291  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  19138290 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 19138264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 44491120 - 44490698
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  44491120 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 44491022  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  44491021 ---aaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttct 44490925  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  44490924 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgacctggatttagatgaagaag 44490825  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  44490824 gagctgctatagatagaaaaatacatactcctgctcagaagaagctttacaagaagcaccacaaaatcagagggattattgtggcttctatacctcgcac 44490725  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  44490724 tgaatacatgaagatgagtgacaaatc 44490698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 15781578 - 15782000
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  15781578 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatcttttagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 15781673  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15781674 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaggctccaaggtttaatggagatccagaagagttttca 15781773  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  15781774 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctcgatttggatgaagaag 15781873  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15781874 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 15781973  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  15781974 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 15782000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 144 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 21297988 - 21297706
Alignment:
Q  144 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  21297988 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagattctgaagagttttcttggtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattggatgat 21297889  T
Q  244 gaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagc 343  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  21297888 gagttgtgggatattcttgaagatggagttgatgatctggacctggatgaggaaggagctgctattgacagaaagatacacactcctgctcaaaagaagt 21297789  T
Q  344 tttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21297788 tattcaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctataccgcgcactgaatatatgaaaatgagtgataaatcc 21297706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 849842 - 850186
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  849842 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 849937  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  849938 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 850037  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  850038 tggtggaaaactaatatgtacagctttattatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 850137  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagcttta 347  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  850138 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagcttta 850186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 144 - 419
Target Start/End: Original strand, 45569041 - 45569316
Alignment:
Q  144 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||  ||||     
T  45569041 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatcctgaagagttttcttggtggaaaaccaacatgtacaactacatcatgggattaaatgat 45569140  T
Q  244 gaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagc 343  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  45569141 gagctgtgggatattcttgaagatggagttgatgatctggacctggatgaggaaggagctgctattgacagaaagatacacactcctgctcaaaagaagt 45569240  T
Q  344 tttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtga 419  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  45569241 tatacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctatacctcgcactgaatatatgaaaatgagtga 45569316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 154 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 19942274 - 19942069
Alignment:
Q  154 tctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatggg 253  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||  | |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  19942274 tctggaaaagttccaaagttcaatggagatcctgaataattttcttggtggaaaaccaacttctacaactatgtcatggatttagatgaagaactatggg 19942175  T
Q  254 atattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaa 353  Q
    | || |||||||| || |||  | | ||||   | ||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||| ||    
T  19942174 acatacttgaagagggtgttggtaacttggtccttgatgaagaaggagatgctattgatagaaagaaacacactcctgctcagaagaaactctacaagaa 19942075  T
Q  354 gcatca 359  Q
    ||||||    
T  19942074 gcatca 19942069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 281 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 19234506 - 19234361
Alignment:
Q  281 tggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgt 380  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||||| ||||||||    
T  19234506 tggatttagatgaagaaggagctgctgtggacagaagaatacacactcctgctcagaagaagctttatatgaaacaccacaagatcagaggaatcattgt 19234407  T
Q  381 tgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
     |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  19234406 ggcttctatacctcgcaccgaatacatgaagatgagtgacaaatcc 19234361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 154 - 367
Target Start/End: Original strand, 22462565 - 22462778
Alignment:
Q  154 tctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatggg 253  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||||| ||||||||  | ||||| ||| ||||||  || ||||||||||||||||    
T  22462565 tctggtaaagttccaaagtttaatagagatcctgaagaattctcttggtgaaaaaccaacttctacagttatgtcatgggtttagatgaagaactatggg 22462664  T
Q  254 atattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaa 353  Q
    |||||||||||||||| |||  ||| ||||   | |||||||||||||||||||||||  | | || ||| ||| ||||||| ||||| || ||||| ||    
T  22462665 atattcttgaagatggtgttggtgacttggtccttgatgaagaaggagctgctattgataggaggaaacatactcctgctcaaaagaaactctacaagaa 22462764  T
Q  354 gcatcacaagatca 367  Q
    |||||||| |||||    
T  22462765 gcatcacacgatca 22462778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 156 - 371
Target Start/End: Original strand, 24834268 - 24834483
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggat 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||  || ||||||  || ||||||||  |||||||     
T  24834268 tggaaaagttccaaagttcaatggagatcctgaagaattttcctggtggaaaaccaacttctacagtcatgtcatgggtttagatgaagagttatgggac 24834367  T
Q  256 attcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagc 355  Q
    || || ||||||||  ||  ||| ||||   | |||||||||||||||||||||||  |||  |  || ||| ||||||||||||| || ||||| ||||    
T  24834368 atactagaagatggtattggtgacttggtcgttgatgaagaaggagctgctattgaaagaagaaagcatactcctgctcagaagaaactctacaagaagc 24834467  T
Q  356 atcacaagatcagagg 371  Q
    ||||||  ||||||||    
T  24834468 atcacacaatcagagg 24834483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 384
Target Start/End: Original strand, 24679422 - 24679646
Alignment:
Q  160 aaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattc 259  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| |  ||||| |||||||| ||||| || || || ||||  || ||||| ||||| |||||| |||    
T  24679422 aaagctccaaggtttaatggagctcctgaagagttctgttggtgcaaaaccaaaatgtatagttacattatgggtttagatgaggaactctgggatgttc 24679521  T
Q  260 ttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatca 359  Q
    |||||||||| |||  ||| ||||   | |||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | | ||| ||| || ||| | ||||| || |||||    
T  24679522 ttgaagatggtgttgctgacttggcccttgatgaagaaggagctgctattgatagaaagaaacatattgctggtcaaaaaaagttgtacaagaaacatca 24679621  T
Q  360 caagatcagagggatcattgttgct 384  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||    
T  24679622 caagatcagaggaattcttgttgct 24679646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 22148459 - 22148530
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgt 73  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22148459 attggtattagagcttgctctgttatca-aagcacttaatcgtgtgacagatcaagatccgagaaaagcatgt 22148530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 17015615 - 17015388
Alignment:
Q  144 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaa 243  Q
    |||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| | ||||| | |||||| |||||  | || ||  || ||||||  || ||||||    
T  17015615 gaaatccgactctggaaaagtttcaaagttcaatggagatcctgaaaaattttcctagtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggtttagatgaa 17015516  T
Q  244 gaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagc 343  Q
    ||||||||||| || || ||||||||  ||  ||| ||||   | |||||||||||||||||  ||||  |||  | ||| ||||||||||||||||| |    
T  17015515 gaactatgggacatactagaagatggtattggtgacttggtcgttgatgaagaaggagctgccgttgatagaagaaaacatacttctgctcagaagaaac 17015416  T
Q  344 tttacaaaaagcatcacaagatcagagg 371  Q
    ||||| | || |||||||  ||||||||    
T  17015415 tttacgagaaacatcacacaatcagagg 17015388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 371
Target Start/End: Original strand, 17287271 - 17287486
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggat 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | || ||  || ||||||  || |||||||| ||||||||     
T  17287271 tggaaaagttccaaagttcaatggagatcctgaagaattttcctggtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggtttagatgaagatctatgggac 17287370  T
Q  256 attcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagc 355  Q
    || || ||||||||  ||  ||| || |   | ||||||||||||||| |||||||  |||  | ||| ||| |||||||||||||  | ||||| ||||    
T  17287371 atactagaagatggtattggtgacttagtcgttgatgaagaaggagcttctattgatagaagaaaacatactcctgctcagaagaaattctacaagaagc 17287470  T
Q  356 atcacaagatcagagg 371  Q
    ||||||  ||||||||    
T  17287471 atcacacaatcagagg 17287486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 371
Target Start/End: Original strand, 17541586 - 17541813
Alignment:
Q  144 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaa 243  Q
    |||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| | ||||| | |||||| |||||  | || ||  || ||||||  || ||||||    
T  17541586 gaaatccgactctggaaaagtttcaaagttcaatggagatcctgaaaaattttcctagtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggtttagatgaa 17541685  T
Q  244 gaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagc 343  Q
    ||||||||||| || || ||||||||  ||  ||| ||||   | |||||||||||||||||  ||||  |||  | ||| ||||||||||||||||| |    
T  17541686 gaactatgggacatactagaagatggtattggtgacttggtcgttgatgaagaaggagctgccgttgatagaagaaaacatacttctgctcagaagaaac 17541785  T
Q  344 tttacaaaaagcatcacaagatcagagg 371  Q
    ||||| | || |||||||  ||||||||    
T  17541786 tttacgagaaacatcacacaatcagagg 17541813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22672812 - 22672699
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggat 255  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||  || ||||||  || || ||||| ||||||||     
T  22672812 tggaaaagtttcaaagttcaatggagatcctgaagaattttcctggtggaaaaccaacttctacagtcatgtcatgggtttagacgaagagctatgggac 22672713  T
Q  256 attcttgaagatgg 269  Q
    || || ||||||||    
T  22672712 atactagaagatgg 22672699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 24667317 - 24667263
Alignment:
Q  316 aagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagag 370  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24667317 aagaaacacactgctactcagaagaagctttacaagaaacatcacaagatcagag 24667263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18676708 - 18676652
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaa 212  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  18676708 tggaaaagttccaaagttcaatgaagatcctgaagaattttcctggtggaagaccaa 18676652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 41)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 9169572 - 9169145
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaa--gaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||    
T  9169572 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtatgacagatcaagatccaaaagaaaaacatgtctggaggagaggaatcaactacatc 9169473  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
      |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9169472 cttaaaatacacaagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 9169373  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9169372 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatgggattggatgaagaactatgggatatacttgaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 9169273  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9169272 gagctgctattgatagaaagatacacactcctgctcagaagaaaacttacaaaaagcatcacaagatcagagggattattgttgcttctattcctcgtac 9169173  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9169172 tgaatacatgaagatgagtgataaatcc 9169145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 18440583 - 18440159
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  || ||| ||||| ||||  || |    
T  18440583 attggtatcagagcttgctctgttatca-aagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccgagaaaaacatgtctactgaagatgaatccactacatcca 18440485  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18440484 caaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgataggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 18440385  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18440384 gtggaaaaccaacatgtacaactacatcatgggattggatgaagaactatgggacattcttgaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaagga 18440285  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18440284 gcagctattgacagaaggatacacactcctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctatacctcgcactg 18440185  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  18440184 aatatatgaagatgagtgataaatcc 18440159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 1997543 - 1997121
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||||||   |    
T  1997543 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcaacta---c 1997448  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1997447 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 1997348  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1997347 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatggaattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 1997248  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  1997247 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 1997148  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  1997147 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 1997121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 8002982 - 8003404
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||  |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||||||   |    
T  8002982 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacatttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcaacta---c 8003077  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8003078 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 8003177  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  8003178 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 8003277  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  8003278 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 8003377  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  8003378 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 8003404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 40043020 - 40043442
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  40043020 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 40043115  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40043116 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 40043215  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  40043216 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 40043315  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  40043316 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacatcacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 40043415  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  40043416 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 40043442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 42875835 - 42875413
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||||||   |    
T  42875835 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcaacta---c 42875740  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42875739 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 42875640  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  42875639 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 42875540  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    ||||||| || ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  42875539 gagctgccatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 42875440  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  42875439 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 42875413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 4221995 - 4221573
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  4221995 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 4221900  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4221899 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 4221800  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4221799 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 4221700  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  4221699 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 4221600  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  4221599 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 4221573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 9094374 - 9093952
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  9094374 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 9094279  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9094278 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 9094179  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9094178 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 9094079  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  9094078 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 9093979  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  9093978 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 9093952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 457902 - 458324
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  457902 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 457997  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  457998 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 458097  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  458098 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 458197  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  458198 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 458297  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  458298 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 458324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 6868146 - 6868568
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  6868146 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 6868241  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6868242 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 6868341  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  6868342 tggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttagatgaagaag 6868441  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  6868442 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 6868541  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  6868542 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 6868568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 6878788 - 6879210
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  6878788 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 6878883  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6878884 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 6878983  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  6878984 tggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttagatgaagaag 6879083  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  6879084 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 6879183  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  6879184 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 6879210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 26391010 - 26391432
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  26391010 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatcttttagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 26391108  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26391109 ---aaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 26391205  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26391206 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 26391305  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  26391306 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacatcacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 26391405  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  26391406 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 26391432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 26654252 - 26654674
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  26654252 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 26654347  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26654348 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 26654447  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26654448 tggtggaaaactaatatgtacagctttattatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagtttatgatctggatttggatgaagaag 26654547  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  26654548 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 26654647  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  26654648 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 26654674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 24744088 - 24743666
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  24744088 attggtatcagagcctgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 24743990  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24743989 ---aaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 24743893  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24743892 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 24743793  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  24743792 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 24743693  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  24743692 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 24743666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 176877 - 176455
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  176877 attggtatcagagcctgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 176782  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  176781 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 176682  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  176681 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 176582  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  176581 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 176482  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  176481 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 176455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 8627332 - 8626910
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||||||  |  |||||||||  ||   |    
T  8627332 attggtatcagagcctgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtatggagatgaggaatcagtta---c 8627237  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8627236 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 8627137  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  8627136 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgagattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 8627037  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  8627036 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 8626937  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  8626936 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 8626910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 17951030 - 17951452
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  17951030 attggtatcagagcctgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 17951125  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17951126 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 17951225  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17951226 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 17951325  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  17951326 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 17951425  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17951426 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 17951452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 20989040 - 20988622
Alignment:
Q  5 gtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttctata 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   ||| |    
T  20989040 gtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---ctaca 20988945  T
Q  103 aaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggt 202  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20988944 aaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgttgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttcatggt 20988845  T
Q  203 ggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagc 302  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  20988844 ggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttagatgaagaaggagc 20988745  T
Q  303 tgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaa 402  Q
    |||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||    
T  20988744 tgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcaccgaa 20988645  T
Q  403 tacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  20988644 tacatgaagatgagtgacaaatc 20988622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 2706529 - 2706951
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||  ||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  2706529 attggtatcagagcctgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgtttcagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 2706624  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2706625 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 2706724  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  2706725 tggtggaagacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacattctggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 2706824  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||  |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  2706825 gagctgctatagatagaacaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 2706924  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  2706925 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 2706951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 11015176 - 11014753
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaa--gaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  11015176 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgttacagttcaagatccaaaagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 11015077  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  11015076 ---aaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttct 11014980  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  11014979 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgacctggatttagatgaagaag 11014880  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  11014879 gagctgctatagatagaaaaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 11014780  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  11014779 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 11014753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 22099128 - 22098706
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  22099128 attggtatcagagcctgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 22099033  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22099032 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaaactccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 22098933  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22098932 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 22098833  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  22098832 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 22098733  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  22098732 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 22098706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 120 - 426
Target Start/End: Original strand, 13175627 - 13175933
Alignment:
Q  120 acatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtac 219  Q
    |||||| |||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  13175627 acatgattatggtactgctgacaagaaaacagattctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttcttggtggaaaaccaacatgtat 13175726  T
Q  220 agctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaaga 319  Q
    | ||| ||||||| ||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13175727 aactacatcatgggattagatgaggagctgtgggatattcttgaagatggagttgatgatctggacttggatgaagaaggagctgctattgacagaaaga 13175826  T
Q  320 tacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtga 419  Q
    |||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||    
T  13175827 tacacactccagctcagaagaagccatacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctataccacgcactgaatatatgaaaatgagtga 13175926  T
Q  420 taaatcc 426  Q
    |||||||    
T  13175927 taaatcc 13175933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 11004566 - 11004144
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  11004566 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 11004468  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  11004467 ---aaaatacacaagcgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttct 11004371  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  11004370 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgacctggatttagatgaagaag 11004271  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  11004270 gagctgctatagatagaaaaatacatactcctgctcagaagaagctttacaagaagcaccacaaaatcagagggattattgtggcttctatacctcgcac 11004171  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  11004170 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 11004144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 9443250 - 9442828
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  9443250 attggtatcagagcttgctttgttatcacaa-cacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 9443155  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||| | |||| | || | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9443154 tacaaaatacacaagtatcaagcatgactacgatactgctgacaagaaaactgactttggaaaagctccaaagtttaatggagatccataagagttttca 9443055  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  9443054 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctctgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttagatgaagaag 9442955  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  9442954 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 9442855  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  9442854 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 9442828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 199 - 425
Target Start/End: Original strand, 16106176 - 16106402
Alignment:
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    |||||||||||||| ||||| || || || ||||  || |||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||  ||||||||  || |||||||||     
T  16106176 tggtggaaaaccaaaatgtatagttagattatgggtttagatgaagaactatgtgatgtccttgaagatggtgttggtgatttggtgttagatgaagaaa 16106275  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    || ||  |||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| | ||| ||  |||||||| || ||||||  |     
T  16106276 gatctattattgattgaaagaaacacactgctgctcagaacaagatttacaagaaacatcacaagataataggcattcttgttgctgcttttcctcacaa 16106375  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     || ||| |||||||||||||||||||    
T  16106376 ggagtacttgaagatgagtgataaatc 16106402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16408862 - 16408571
Alignment:
Q  144 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaa 243  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  ||| |||||| ||  ||||     
T  16408862 gaaatccgactctggcaaagctccaaagtttaatggaaaccctgaagagttttcttggtggaaaacaaatatgtatagtcataacatggatttaaatgat 16408763  T
Q  244 gaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagc 343  Q
    || || ||||| || ||||||||||| |||  ||| ||||   | ||| ||||| ||| || | ||||  |||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  16408762 gagctttgggacatacttgaagatggtgttggtgacttggtccttgattaagaaagagttgatgttgatagaaagaaacacattcctgctcagaagaagc 16408663  T
Q  344 ttta----------caaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    ||||          || ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||| |||| |||||||| |||||    
T  16408662 tttacatgaaacatcacaaaacatcacaagattagaggaatcattgttgcttctatacctcgcaccgagtacttgaatatgagtgacaaatc 16408571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 145 - 371
Target Start/End: Original strand, 16311083 - 16311309
Alignment:
Q  145 aaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaag 244  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | || ||  || ||||||  ||  ||||||    
T  16311083 aaatctgactctggaaaagttccaaagtttaatggagatcctgaagaattttcctggtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggtttaaatgaag 16311182  T
Q  245 aactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagct 344  Q
    ||||||| || || || ||||||||  ||  | | ||||   | |||||||||||||||||| ||||  ||| || ||| ||| ||||||||||||| ||    
T  16311183 aactatgagacatactagaagatggtattggtaacttggtcgttgatgaagaaggagctgctgttgatagaaggaaacatactcctgctcagaagaaact 16311282  T
Q  345 ttacaaaaagcatcacaagatcagagg 371  Q
     ||||| ||||||||||  ||||||||    
T  16311283 ctacaagaagcatcacacaatcagagg 16311309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 358 - 426
Target Start/End: Original strand, 15879093 - 15879161
Alignment:
Q  358 cacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  15879093 cacaagatcagaggaatcattgtggcttctatacctcgcaccgaatacatgaagatgagtgacaaatcc 15879161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 311
Target Start/End: Original strand, 4413082 - 4413237
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggat 255  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||  || |||||   || |||||||||||||||||     
T  4413082 tggaaatgttcctaagtttaatggagatcctgaagaattttcctggtggaaaaccaacttctacagtcatgtcatgagtttagatgaagaactatgggac 4413181  T
Q  256 attcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattga 311  Q
    || || ||||||||  ||  ||| |||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  4413182 atactagaagatggtattggtgacttggttgttgatgaagaaggagctgctattga 4413237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15466816 - 15466599
Alignment:
Q  144 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaa 243  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||  | || ||  || ||||||  || ||||||    
T  15466816 gaaatctgattatggaaaagttccaaagttcaatggagatcctaaagaattttcctggtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggcttagatgaa 15466717  T
Q  244 gaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagc 343  Q
    |||||||| || || || ||| ||||  ||  ||| ||||   | |||||||||||||||||||||||  |||  | ||| ||| ||| |||||||||      
T  15466716 gaactatgagacatactagaatatggtattggtgacttggtcgttgatgaagaaggagctgctattgatagaagaaaacatactcctgttcagaagaaat 15466617  T
Q  344 tttacaaaaagcatcaca 361  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  15466616 tctacaagaagcatcaca 15466599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 4412931 - 4413002
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgt 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||  ||||||||||||    
T  4412931 attggtatcagagcttgctctgttatca-aaacacttaaccgtgtaacaattcaagatctgagaaaaacatgt 4413002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 371
Target Start/End: Original strand, 21211687 - 21211912
Alignment:
Q  144 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaa 243  Q
    |||||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||||||  | ||  |  || ||||||| ||  |||||    
T  21211687 gaaatctgactctggtaaagttccaaagtttaatggagatcctgaagaattttcttgaaggaaaaccaacttcta--gtcatgtcatggacttaaatgaa 21211784  T
Q  244 gaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagc 343  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||| |||  ||| ||||   | |||||||||||||||||||||||  |||  | ||| ||| ||||| |||| || |    
T  21211785 gaagtatgggacatacttgaagatggtgttggtgaattggtcgttgatgaagaaggagctgctattgatagaagaaaacatactcctgcttagaataaac 21211884  T
Q  344 tttacaaaaagcatcacaagatcagagg 371  Q
    | ||||| |||||||||| ||| |||||    
T  21211885 tctacaagaagcatcacacgatgagagg 21211912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 212
Target Start/End: Original strand, 15705614 - 15705669
Alignment:
Q  157 ggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaa 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15705614 ggaaaagttccaaagttcaatggagatcctgaagaattttcctggtggaaaaccaa 15705669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 384
Target Start/End: Original strand, 16308940 - 16309035
Alignment:
Q  289 gatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgct 384  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||| | | ||||| |||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  16308940 gatgaagaaagagctgctattgatagaaataaatacactgctgctcagaagaagttgtacaagaaacatcacaagatcagaggcattcttgttgct 16309035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 371
Target Start/End: Original strand, 13028040 - 13028257
Alignment:
Q  154 tctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatggg 253  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||| ||||| | |||||| |||||  | || ||  || ||||||  || ||||||||||||||||    
T  13028040 tctggaaaagttccaaagtttaatggagatcctaaagaattttcctagtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggtttagatgaagaactatggg 13028139  T
Q  254 atattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaa 353  Q
    | || || | ||||||  ||  ||| ||||   | |||||||||||||||| | ||||  |||  | ||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||    
T  13028140 acatactagtagatggtattggtgacttggtcgttgatgaagaaggagctgttgttgatagaagaaaacatactcctgctcagaagaaactctacaagaa 13028239  T
Q  354 gcatcacaagatcagagg 371  Q
    ||||||||  ||||||||    
T  13028240 gcatcacacaatcagagg 13028257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16464035 - 16463845
Alignment:
Q  193 ttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatg 292  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| ||  |||||||||  ||  |||||||| |||||||  | ||||||||||| |||   | |||| | || ||||    
T  16464035 ttttcttggtggaaa-ccaagatgtatagtcatatcatgggcttaaatgaagaattatgggacgtccttgaagatggtgttggagttttgtagttagatg 16463937  T
Q  293 aagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgct 384  Q
    ||||||| | || | ||||  | |||| ||||||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||  ||||||||    
T  16463936 aagaaggtgttgttgttgataggaagaaacacactgctgctcagaagaagctttaaaagaaacaccacaagatcagaggcattcttgttgct 16463845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 27870749 - 27870598
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggat 255  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||  | |||||  || ||||||  || |||||||||||||  ||     
T  27870749 tggaaaagttcctaagtttaatggagatccggaagaatttttctggtggaaaaccaacttctacagtcatgtcatgggtttagatgaagaactatatgac 27870650  T
Q  256 attcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgcta 307  Q
    || || ||||||||  || |||| |||| | | ||||||||||||| |||||    
T  27870649 atactagaagatggtattaatgacttggttgttgatgaagaaggagatgcta 27870598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 13681249 - 13681171
Alignment:
Q  289 gatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatca 367  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||  | ||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  13681249 gatgaagaaggagctgctgttgatagaagaaaacatacttctgctcagaagaaactttacaagaaacatcacaaaatca 13681171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13879184 - 13879128
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaa 212  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||    
T  13879184 tggaaaagttccaaagttcaatggagatcctaaagaattttcctggtggaagaccaa 13879128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 212
Target Start/End: Original strand, 16546459 - 16546511
Alignment:
Q  160 aaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaa 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||    
T  16546459 aaagttccaaagttcaatggagatcctgaagaattttcttggtagaagaccaa 16546511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16619203 - 16619151
Alignment:
Q  160 aaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaa 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||    
T  16619203 aaagttccaaagttcaatggagatcctgaagaattttcttggtagaagaccaa 16619151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 33774 - 34201
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaa--gaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||||   ||    
T  33774 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaacatccaaaagaaaaacatgtctggaggagaggaatcaactgcatc 33873  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33874 cttaaaatacactagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatctagaagagttttca 33973  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  33974 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatgggatttgatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 34073  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34074 gagctgctatagacagaaaaatacacactcctgctcagaagaagacttacaaaaagcatcacaagatcagagggattattgttgcttctattcctcgtac 34173  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34174 tgaatacatgaagatgagtgataaatcc 34201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 425
Target Start/End: Original strand, 41327 - 41745
Alignment:
Q  5 gtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttctata 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   ||| |    
T  41327 gtatcagcgcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---ctaca 41422  T
Q  103 aaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggt 202  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  41423 aaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccaaaagagttttcatggt 41522  T
Q  203 ggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagc 302  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41523 ggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaaggagc 41622  T
Q  303 tgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaa 402  Q
    |||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||    
T  41623 tgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcaccgaa 41722  T
Q  403 tacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  41723 tacatgaagatgagtgacaaatc 41745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 7700 - 7484
Alignment:
Q  155 ctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatggga 254  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||||||  |||| || || |||||||||| |||  | || ||  || ||||||  || ||||||||||| | |||    
T  7700 ctggtaaagttccaaagtttaatggagatcctaaagaattctcttggtggaaaagcaacttctatagtcatgtcatgggcttagatgaagaacttttgga 7601  T
Q  255 tattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaag 354  Q
     || |||||||||||||||  ||| ||||   | |||||||||||||||| |||||   |||  | ||| ||||||||||||||||| || || || |||    
T  7600 catacttgaagatggagttggtgacttggtcctagatgaagaaggagctgttattggtagaagaaaacatacttctgctcagaagaaactctagaagaag 7501  T
Q  355 catcacaagatcagagg 371  Q
    ||||||| |||||||||    
T  7500 catcacacgatcagagg 7484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 4680 - 4256
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  || ||| ||||| ||||  ||||    
T  4680 attggtatcagagcttgctctgttatca-aagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccgagaaaaacatgtctactgaagatgaatccactacatcta 4582  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4581 caaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgacaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 4482  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4481 gtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaagga 4382  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4381 gctgctattgacagaaggatacacactcctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctatacctcgcactg 4282  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  4281 aatatatgaagatgagtgataaatcc 4256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 57657 - 58081
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  || ||| ||||  ||||  ||||    
T  57657 attggtatcagaggttgctctattatca-aagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccgagaaaaacatgtctactgaagatgaatacactacatcta 57755  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57756 caaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgacaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 57855  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  57856 gtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaagga 57955  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  57956 gctgctattgacagaaggatacacactcctactcagaagaagctttacaaaaagtatcacaagatcagagggatcattgttgcttctatacctcgcactg 58055  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  58056 aatatatgaagatgagtgataaatcc 58081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 22308153 - 22307729
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || ||| ||||| ||||  ||||    
T  22308153 attggtatcagagcttgcgccgttatca-aagcacttaaccgtgtgacagatcaagattcgagaaaaacatgtctactgaagatgaatccactacatcta 22308055  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22308054 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgacaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatctagaagagttttcatg 22307955  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22307954 gtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattggatgaagagctatgggacattcttgaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaagga 22307855  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22307854 gctgctattgatagaaggatacacactcctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcaaagggatcattgttgcttctatacctcgcactg 22307755  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  22307754 aatatatgaagatgagtgataaatcc 22307729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 424
Target Start/End: Original strand, 25725343 - 25725765
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |   |||||  |||  ||||    
T  25725343 attggtatcagagcttactctgttatca-aagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccgagaaaaacatgtctgctgaaccagaatcttctacatcta 25725441  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
     ||  |||| || ||||||  |||| |||| |||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25725442 caaggtacactaatgtcaactatgattatggtacgtctgacaagaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcttg 25725541  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  25725542 gttgaaaaccaatatgtacagctacatcataggattagatgaagagctgtgggatattcttgaagatggagttgatgatttggttttggatgaagaagga 25725641  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  25725642 gctgctattgatagaaagattcacactcctgctcagaagaagctatacaaaaagcatcacaagatcagagggatcactgttgcttctatacctcgcactg 25725741  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaat 424  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  25725742 aatatatgaagatgagtgataaat 25725765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 20030762 - 20031186
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaa--gaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||   |    
T  20030762 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagttcaagatccaaaagaaaaacatgtctggaggagaggaatcaacta---c 20030858  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20030859 tacaaaatacacaagcgtcaaacatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 20030958  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  20030959 tggtggaaaacaaatatgtacagttttatcatgggattggatgaagagctatgggacatactggaagatggagttgatgacttggatttagatgaagaag 20031058  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||| | ||| |||  ||||| |||  |||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  20031059 gagctgctgtggacagaagaatacatactcttgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagatcagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 20031158  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||    
T  20031159 cgaatacatgaagatgagtgacaaatcc 20031186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 11205324 - 11204900
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  || | | |||||  |||  ||||    
T  11205324 attggtatcagagcttgctttgttatca-aagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccgagaaaaacatgtctactgaacaagaatcttctacatcta 11205226  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
     || ||||| || | | ||| |||| |||| |||  |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11205225 caagatacactaatataaaaaatgattatggtacaactgacaagaaatcaaattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcttg 11205126  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| ||||| || || ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  11205125 gtggaaaaccaacatgtatagctacatcatgggattagatgaggagctgtggaatattcttgaagaaggagttgatgatttggacttggatgaagaagga 11205026  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  11205025 gctgctattgatagaaagattcacactcttgctcagaagaagctatacaaaaagcatcacaagatcaaagggatcattgttgcttctatacgtcgcactg 11204926  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  11204925 aatatatgaagatgagtgataaatcc 11204900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 25985436 - 25985014
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  25985436 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 25985341  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25985340 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 25985241  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  25985240 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 25985141  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  25985140 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 25985041  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  25985040 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 25985014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 26035379 - 26034957
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  26035379 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 26035281  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26035280 ---aaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 26035184  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26035183 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 26035084  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  26035083 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacatcacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 26034984  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  26034983 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 26034957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 6157504 - 6157079
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaa--gaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||    
T  6157504 attggtatcagagcttgctctgttatcata-gcgcttaacagtgttacagatcaagatcctatagaaaaacatgtctggaggagaggaatcaactacatc 6157406  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6157405 tttaaaatacacaagtgtcaaacatgactatgataatgctgacaagaaaacagactctggtaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 6157306  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||  ||  | |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  6157305 tggtggaaaacaaatatgtatagctttatcatgggtttggatgaagagctatggggcatattggaagatggagttgatgacttggatttagatgaagaag 6157206  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||| | ||| |||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  6157205 gagctgctgtagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttacaagaagcaccacaaaatcagagggattattgtggcttctatacctcgcac 6157106  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||    
T  6157105 cgaatatatgaagatgagtgacaaatc 6157079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 3671403 - 3670981
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  3671403 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 3671308  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3671307 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 3671208  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3671207 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 3671108  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    ||| |||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  3671107 gagttgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 3671008  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  3671007 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 3670981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 18554649 - 18554225
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |   |||||  |||  | ||    
T  18554649 attggtatcagagcttgctctgttatca-aagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccgagaaaaacatgtctgctgaacctgaatcctctacatgta 18554551  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
     ||  |||| || ||| || ||||| |||| |||  |||| | ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18554550 caaggtacactaatgttaatcatgattatggtacatctgacaagaaatcagatttttgaaaagctccaatgttcaatggagatccagaagagttttcttg 18554451  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  18554450 gtggaaaaccaacatgtacaactacatcatgggattagatgaggagctgtgggatattcttgaagatggagttgatgatttggacttagatgaagaagga 18554351  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    | |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| || || ||||    
T  18554350 gttgctattgacagaaagattcacactcctgctcagaagaagctatacaaaaagcatcacaagatcaacgggatcattgctgcttctataccacgcactg 18554251  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||    
T  18554250 aatatatgaaaatgagtgataaatcc 18554225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 34808004 - 34808426
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  34808004 attggtatcagagcctgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 34808099  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34808100 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 34808199  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  34808200 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 34808299  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  34808300 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 34808399  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  34808400 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 34808426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 12717678 - 12718100
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  12717678 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 12717776  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12717777 ---aaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatattgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 12717873  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  12717874 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 12717973  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  12717974 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 12718073  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  12718074 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 12718100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 9113335 - 9113757
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  9113335 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 9113430  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || |||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9113431 tacaaaatatacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 9113530  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  9113531 tggtagaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttagatgaagaag 9113630  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  9113631 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 9113730  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  9113731 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 9113757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16958967 - 16958545
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  16958967 attggtatcagagcttactctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 16958872  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16958871 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 16958772  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16958771 tggtggaaaactaatatgtacaactttatcatgggattggatgaagagctatgagatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 16958672  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  16958671 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 16958572  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  16958571 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 16958545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 424
Target Start/End: Original strand, 32962788 - 32963209
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  32962788 attggtatcagagcctgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 32962883  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32962884 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 32962983  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  32962984 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 32963083  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  32963084 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 32963183  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaat 424  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||    
T  32963184 cgaatacatgaaaatgagtgacaaat 32963209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 12864890 - 12864468
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  12864890 attggtatcagagcctgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatcttttagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 12864795  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12864794 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 12864695  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  12864694 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 12864595  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  12864594 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 12864495  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  12864494 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 12864468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 26874761 - 26874339
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  26874761 attggtatcagagcaggctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 26874666  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26874665 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 26874566  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26874565 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 26874466  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  26874465 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 26874366  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  26874365 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 26874339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 32301888 - 32302310
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  32301888 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 32301986  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  32301987 ---aaaatacacaagtgtcaagcatgactatgacactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttct 32302083  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  32302084 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgacctggatttagatgaagaag 32302183  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  32302184 gagctgctatagatagaaaaatacatactcctgctcagaagaagctttacaagaagcaccacaaaatcagagggattattgtggcttctatacctcgcac 32302283  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  32302284 tgaatacatgaagatgagtgacaaatc 32302310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 27412444 - 27412022
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  27412444 attggtatcagagcctgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 27412346  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  27412345 ---aaaatacacaagcgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttct 27412249  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  27412248 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgacctggatttagatgaagaag 27412149  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  27412148 gagctgctatagatagaaaaatacatactcctgctcagaagaagctttacaagaagcaccacaaaatcagagggattattgtggcttctatacctcgcac 27412049  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  27412048 tgaatacatgaagatgagtgacaaatc 27412022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 27503666 - 27503241
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaa--gaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||   |    
T  27503666 attggtatcagagcctgctctgttatcata-gcacttaacagtgttacagatcaagatcctatagaaaaacatgtctggaggagaggaatcaactacaac 27503568  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
      |||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27503567 cgtaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatacggctgacaagaaaacagactctggtaaagctcctaagtttaatggagatccagaagagttttca 27503468  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||  |||||||  ||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  27503467 tggtggaaaacaaatatgtatagcttcatcatgggtttggatgaagagctatgggacatattggaagatggagttgatgatctggatttagatgaagaag 27503368  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    ||||||| || ||| |||  ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||    
T  27503367 gagctgccatagacagaagaatacatactcctgctcagaaaaagctttacaagaagcaccacaaaatcagaggaattattgtggcttctatacctcgcac 27503268  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||    
T  27503267 cgaatatatgaagatgagtgacaaatc 27503241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 26043558 - 26043133
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaa--gaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||  ||||| |||||||| | |||    
T  26043558 attggtatcagagcttgctctgttatcata-gcacttaacagtgttacagatcaagatcctatagaaaaacatgtctggaggagaagaatcaacaacttc 26043460  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    |  |||||| |  ||||||||| |||||||||||| | |||| | |||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  26043459 ttcaaaatatacaagtgtcaaatatgactatgataattctgacaagaaaactgactctggaaaagctccaaaattcaatggagatccagaagagttctct 26043360  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  26043359 tggtggaaaacaaatatgtatagctttatcatgggtttggatgaagagctatgggacatattggaagatggagttgatgaattggatttagatgaagaag 26043260  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||  ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  26043259 gagctgctatagacagaagaatacttactcctggtcataagaagctttacaagaagcaccacaaaatcatagggattattgtggcttctatacctcgcac 26043160  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||    
T  26043159 cgaatatatgaagatgagtgacaaatc 26043133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 28252407 - 28252832
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaa--gaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||  ||||| |||||||||| | |    
T  28252407 attggtatcagagcttgctctgttatcata-gcgcttaacagtgttacagatcaagatcctatagaaaaacatgtctggaggagatgaatcaactactac 28252505  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
      |||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28252506 cttaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatacggctgacaagaaaacagactctggaaaagctcctaagtttaatggagatccagaagagttttca 28252605  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||  |||||||  ||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  28252606 tggtggaaaacaaatatgtatagcttcatcatgggtttggatgaagagctatgggacatattggaagatggagttgatgacctggatttagatgaagaag 28252705  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    ||||||| || | | |||  ||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||    
T  28252706 gagctgccatagtcagaagaatacatactcctggtcagaaaaagctttacaagaagcaccacaaaatcagaggaattattgtggcttctatacctcgcac 28252805  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||    
T  28252806 cgaatatatgaagatgagtgacaaatc 28252832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 17063581 - 17063157
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||| || || ||  ||||| ||||  ||||    
T  17063581 attggtatcagagcttgctctgttatcata-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctgagaaaaacatgtctgctgaagctgaatccactacatcta 17063483  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
     || |||||  |||||    ||| ||||||| |||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  17063482 caagatacacaagtgttggtcataactatgacactgctgaaaagaaaacagagtttggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttcttg 17063383  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    ||| ||||| |||||||||| ||| | ||||  ||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||  |||||||| | || ||| || |||||    
T  17063382 gtgaaaaacaaatatgtacaactacaacatgagattagatgaagagctgtgggacattcttgaagatggagtagatgatttgaaattagataaaaaagga 17063283  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    |||| | ||||| ||||||| || ||  ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  17063282 gctgatgttgacagaaagattcatacccctgctcaaaagaagttatacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcctctatacctcgcactg 17063183  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||    
T  17063182 aatatatgaaaatgagtgataaatcc 17063157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 144 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 22385830 - 22385544
Alignment:
Q  144 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtg----gaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattgga 239  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22385830 gaaatcagattctggaaaagttcaaaagttcaatggagatcctgaagagttttcttggtgcgtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattgga 22385731  T
Q  240 tgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaag 339  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||    
T  22385730 tgatgaactgtgggatattcttgaagatggagttgatgatctggatctggatgaggaaggagctgctattgacagaaagatacacattcctgctcaaaag 22385631  T
Q  340 aagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22385630 aagttatgcaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctatatctcgcactgaatatatgaagatgagtgataaatcc 22385544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 204 - 426
Target Start/End: Original strand, 17609637 - 17609859
Alignment:
Q  204 gaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagct 303  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||| |||||||||    
T  17609637 gaaaaccaacatgtacaactacatcatgggattggatgaggagctgtgggatattcttgaagatggagttgctgatctggacttggatgaggaaggagct 17609736  T
Q  304 gctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaat 403  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  17609737 gctattgacagaaagatacacactcctgctcaaaagaagctatacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctataccacgcactgaat 17609836  T
Q  404 acatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    | ||||| |||||||||||||||    
T  17609837 atatgaaaatgagtgataaatcc 17609859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 122 - 341
Target Start/End: Original strand, 17609420 - 17609639
Alignment:
Q  122 atgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacag 221  Q
    |||| |||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  17609420 atgattatggtacagctgataagaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcttggtggaaaaccaacatgtacaa 17609519  T
Q  222 ctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagata 321  Q
    ||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  17609520 ctacatcatgggattggatgaggagctgtgggatattcttgaaaatggagttgatgatctggacttggatgaggaaggagctgctattgacagaaagata 17609619  T
Q  322 cacacttctgctcagaagaa 341  Q
    |||||| ||||||| |||||    
T  17609620 cacactcctgctcaaaagaa 17609639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27505292 - 27504986
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaa--gaaaaacatgtat-gatggagaggaatcaactattt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||| |  ||||||||||| | |  ||||||||||||||||       
T  27505292 attggtatcagagcttgctctgttatcata-gcgcttaacagtgttacagatcaagatcctatagaaaaacatgtcttggaggagaggaatcaactacaa 27505194  T
Q  98 ctataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 197  Q
    |  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27505193 ccttaaaatacacaagtgtcaaacatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggtaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 27505094  T
Q  198 atggtggaaaaccaatatgtacagctatatcat-ggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaaga 296  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||  ||||||||||| |||||| | ||  | |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||    
T  27505093 atggtggaaaacaaatatgtatagctttatcatggggtttggatgaagagctatggtacatattggaagatggagttgatgacctggatttagatgaaga 27504994  T
Q  297 aggagctg 304  Q
    ||||||||    
T  27504993 aggagctg 27504986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 280 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 25804750 - 25804604
Alignment:
Q  280 ttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattg 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25804750 ttggatttggatgaagaaggagctgctatagacagaaaaatacacactcctgctcagaagaagctttataaaaagcatcacaagatcagagggattattg 25804651  T
Q  380 ttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804650 ttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatcc 25804604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 21127390 - 21127211
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || || |   ||||| | ||  ||||    
T  21127390 attggtatcagagcttgctctgttatca-aagcacttaaccgtgtgacagttcaagatccgagaaaaacatgtctgttgaacctgaatccagtacatcta 21127292  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggag 181  Q
     || ||||| || |||   ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21127291 caagatacactaatgttggacatgactatggtactgctgacaagaaatcagattctggaaaagctcaaaagttcaatggag 21127211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 229 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 17926755 - 17926560
Alignment:
Q  229 atggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacactt 328  Q
    |||| ||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||| || |||  ||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||   ||||| ||||||      
T  17926755 atgggattagatgatgaaatgtgggatatttttgaagaaggtgttggtgacttggctcttgattaagaaggagctgctattgataaaaagaaacacaccc 17926656  T
Q  329 ctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaat 424  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||||||| ||||    
T  17926655 ctgctcagaagaaactttacaagaagcatcacaagatgagaggaacccttgttgcttctatacctcgcacagagtacgtgaagatgagtgacaaat 17926560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 164 - 369
Target Start/End: Original strand, 17446759 - 17446962
Alignment:
Q  164 ctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttga 263  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||  | |||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17446759 ctccaaggtttaatggagatcctgaagaattctcttggtggaaaaccaagatgtatagtcacatcatgggtttagatgatgaactttgggatattcttga 17446858  T
Q  264 agatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaag 363  Q
    |||||| |||  ||||||||   | ||||||||||||| |||||||||  ||||||   | ||| ||||||   ||||||||||||| || |||||||||    
T  17446859 agatggtgttggtgatttggcccttgatgaagaaggagttgctattgatagaaagaagtatactcctgctc--tagaagctttacaagaaacatcacaag 17446956  T
Q  364 atcaga 369  Q
    ||||||    
T  17446957 atcaga 17446962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 371
Target Start/End: Original strand, 14054483 - 14054698
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggat 255  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||  || ||||||  || |||||||||||||||||     
T  14054483 tggaaaagttccaaaatttaatggagatcctgaagaattttcctggtggaaaaccaacttctacagtcatgtcatgggtttagatgaagaactatgggac 14054582  T
Q  256 attcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagc 355  Q
    || || ||||||||  ||  ||| |||    | |||||||||||||||||||||||  |||  |  || ||| ||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  14054583 atactggaagatggtattggtgacttgatagttgatgaagaaggagctgctattgatagaagaagtcatactcctgctcaaaagaaactctacaagaagc 14054682  T
Q  356 atcacaagatcagagg 371  Q
    ||||||  ||||||||    
T  14054683 atcacacaatcagagg 14054698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 319 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 27383780 - 27383674
Alignment:
Q  319 atacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtg 418  Q
    ||||| ||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||    
T  27383780 atacatactcctgctcagaaaaatctttacaagaagcaccacaaaatcagagggattattgtggcttctatacctcgcaccgaatatatgaagatgggtg 27383681  T
Q  419 ataaatc 425  Q
    | |||||    
T  27383680 aaaaatc 27383674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 319 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 27474164 - 27474058
Alignment:
Q  319 atacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtg 418  Q
    ||||| ||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||    
T  27474164 atacatactcctgctcagaaaaatctttacaagaagcaccacaaaatcagagggattattgtggcttctatacctcgcaccgaatatatgaagatgggtg 27474065  T
Q  419 ataaatc 425  Q
    | |||||    
T  27474064 aaaaatc 27474058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18434555 - 18434351
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggat 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||  | || ||  || ||||||  || |||||||||||||||||     
T  18434555 tggaaaagttccaaagttcaatggagatcttgaagaattttcctggtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggcttagatgaagaactatgggac 18434456  T
Q  256 attcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagc 355  Q
    || || ||||||| | ||  ||| ||||   | |||||||||||||||||||||||  |||  | ||| ||| ||||||| |||||  | ||||| ||||    
T  18434455 atactagaagatgta-ttagtgagttggccgttgatgaagaaggagctgctattgatagaagaaaacatactcctgctcataagaaattctacaagaagc 18434357  T
Q  356 atcaca 361  Q
    ||||||    
T  18434356 atcaca 18434351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26941417 - 26941232
Alignment:
Q  187 gaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatt 286  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||  | || ||  || ||||||  || |||||||||||||| || || ||| ||||||| |||  ||| || |       
T  26941417 gaagaattttcttggtggaaaaccaacttctatagtcatgtcatgggtttagatgaagaactatgagacatacttaaagatggtgttggtgaattagtcc 26941318  T
Q  287 tggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagaggg 372  Q
    | |||||||||||||||||||||||   || || ||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||    
T  26941317 ttgatgaagaaggagctgctattgataaaaggaaacacactcctgctcagaagaaactctacaagaagcatcacacaatcagaggg 26941232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 14052304 - 14052375
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgt 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||| | ||||||  ||||||||||||    
T  14052304 attggtatcagagcttgctctgttatca-gagcacttaacagtgtaacagttaaagatctgagaaaaacatgt 14052375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 19874903 - 19874642
Alignment:
Q  160 aaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattc 259  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| |   |||||||||  || ||||  ||||| |   ||||||    
T  19874903 aaagcttcaaggtttaatggagatcctgaagaattctcttggtggaaaaccaagatgtataatcatatcatgggtttagatgt-gaacttt---atattc 19874808  T
Q  260 ttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatca 359  Q
    |||||||||| |||  ||| ||||   | |||||||||||| || |||||||  ||||||   | |||  ||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  19874807 ttgaagatggtgttggtgacttggcccttgatgaagaaggaccttctattgatagaaagaagtatactcttgctcagaagaagctttacaagaaacataa 19874708  T
Q  360 caagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    |||||||| ||| ||  |||||| |  ||| ||||| || || ||  ||||||||||||| |||||    
T  19874707 caagatcaaaggaattcttgttgttgttatacctcgaacagagtatctgaagatgagtgacaaatc 19874642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19469658 - 19469501
Alignment:
Q  154 tctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatggg 253  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||  | || |   || ||||||  ||||||||||||||||| |    
T  19469658 tctggtaaagttccaaagtttaatggagatcctgaagaattctcttggtggaaaaccaacttttataatcatgtcatgggtttggatgaagaactatgag 19469559  T
Q  254 atattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattga 311  Q
    | ||  |||||||||| |||  ||| ||||   | ||||||||||||| || ||||||    
T  19469558 acataattgaagatggtgttggtgacttggtcctagatgaagaaggagatgttattga 19469501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13434932 - 13434876
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaa 212  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||    
T  13434932 tggaaaagttccaaagttcaatggagatcctaaagaattttcctggtggaagaccaa 13434876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 329 - 371
Target Start/End: Original strand, 18092676 - 18092718
Alignment:
Q  329 ctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagg 371  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  18092676 ctgctcagaagaagctctacaagaaacatcacaagatcagagg 18092718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 25)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 7690340 - 7690766
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaa--gaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||  ||    
T  7690340 attggtatcagagcttgctctgttatcata-gcacttaaccgtgttacagttcaagatccaaaagaaaaccatgtctggaggagaggaatcaactacatc 7690438  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
      |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7690439 cttaaaatacacaagtgtcaaacatgactatgatacagctgaaaggaaatcagactctggaaaagctccaaaattcaatggagatccagaagagttttca 7690538  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  7690539 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatgggattggatgaagaactatgggacatactggaagatggagttgatgacttggatttagatgaagaag 7690638  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||| | ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  7690639 gagctgctttagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagatcagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 7690738  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||    
T  7690739 cgaatacatgaagatgagtgacaaatcc 7690766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 38105032 - 38104610
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||||||   |    
T  38105032 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcaacta---c 38104937  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38104936 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 38104837  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  38104836 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 38104737  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  38104736 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 38104637  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  38104636 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 38104610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 3181548 - 3181126
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||||||   |    
T  3181548 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcaacta---c 3181453  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3181452 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 3181353  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3181352 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 3181253  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    ||||||| || ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  3181252 gagctgccatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 3181153  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  3181152 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 3181126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 5843151 - 5842729
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||||||   |    
T  5843151 attggtatcagagcctgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcaacta---c 5843056  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5843055 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 5842956  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5842955 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 5842856  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  5842855 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 5842756  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  5842755 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 5842729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 7517231 - 7516809
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  ||||||||| |||   |    
T  7517231 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagcta---c 7517136  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7517135 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 7517036  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  7517035 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 7516936  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  7516935 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 7516836  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  7516835 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 7516809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 38094407 - 38093984
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||||||   |    
T  38094407 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcaacta---c 38094312  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatact-gctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 197  Q
    || ||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38094311 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatacttgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 38094212  T
Q  198 atggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaa 297  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  38094211 atggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaa 38094112  T
Q  298 ggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgta 397  Q
    ||||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |    
T  38094111 ggagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgca 38094012  T
Q  398 ctgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  38094011 ccgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 38093984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 5640584 - 5641006
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  5640584 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 5640679  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5640680 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 5640779  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5640780 tggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 5640879  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  5640880 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 5640979  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  5640980 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 5641006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 22018512 - 22018088
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| || || |   ||||| | ||  ||||    
T  22018512 attggtatcagagcttgctctgttatcaaaa-cacttaaccgtgttacagttcaagatccgagaaaaacatgtctgctgaacctgaatccagtacatcta 22018414  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
     || ||||| || |||   |||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  22018413 caagatacactaatgttgcacatgattatggtactgctgacaagaaatcagattctggaaaagcttcaaagttcaatggagatctagaagagttttcttg 22018314  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  22018313 ttggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggatttgatgatgagctgtgggatattcttgaagatggagttgatgatctggacttggatgaggaagga 22018214  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   | ||||    
T  22018213 gctgctattgacagaaagatacacactcctgcttagaagaagctatacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctatactatgcactg 22018114  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||    
T  22018113 aatatatgaaaaagagtgataaatcc 22018088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 21877095 - 21876673
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  21877095 attggtatcagagcctgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 21877000  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
     | ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21876999 aacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 21876900  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  21876899 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgacctggatttggatgaagaag 21876800  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  21876799 gagctgctatagatagaaaaatacatactcctgctcagaagaagctttacaagaagcaccacaaaatcagagggattattgtggcttctatacctcgcac 21876700  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  21876699 tgaatacatgaagatgagtgacaaatc 21876673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 47608810 - 47609232
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  47608810 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 47608908  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47608909 ---aaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 47609005  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  47609006 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 47609105  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  47609106 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 47609205  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  47609206 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 47609232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 4177249 - 4176827
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  4177249 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 4177154  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4177153 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 4177054  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  4177053 tggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttagatgaagaag 4176954  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||    
T  4176953 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacatcgcac 4176854  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  4176853 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 4176827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 12615197 - 12615619
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  12615197 attggtatcagagcctgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 12615292  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12615293 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 12615392  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  12615393 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 12615492  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  12615493 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 12615592  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  12615593 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 12615619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 12740475 - 12740053
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  ||   |    
T  12740475 attggtatcagagcctgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagtta---c 12740380  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12740379 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatgcagaagagttttca 12740280  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  12740279 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 12740180  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  12740179 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 12740080  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  12740079 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 12740053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 19187153 - 19186730
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  ||||||| |  ||   |    
T  19187153 attggtttcagagcttgctctgttatcacat-cacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaattagtta---c 19187058  T
Q  99 tataaaata-caatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 197  Q
    || |||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19187057 tacaaaataacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttc 19186958  T
Q  198 atggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaa 297  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  19186957 atggtggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaatagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttagatgaagaa 19186858  T
Q  298 ggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgta 397  Q
    ||||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |    
T  19186857 ggagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgca 19186758  T
Q  398 ctgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||    
T  19186757 ccgaatacatgaagatgagtgacaaatc 19186730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 51630066 - 51630488
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  51630066 attggtatcagagcctgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 51630164  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  51630165 ---aaaatacacaagcgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttct 51630261  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  51630262 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 51630361  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  51630362 gagctgctatagatagaaaaatacatactcctgctcagaagaagctttacaagaagcaccacaaaatcagagggattattgtggcttctatacctcgcac 51630461  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  51630462 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 51630488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 35638912 - 35639334
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  35638912 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 35639010  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  35639011 ---aaaatacacaagggtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttct 35639107  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  35639108 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgacctggatttggatgaagaag 35639207  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  35639208 gagctgctatagatagaaaaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 35639307  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  35639308 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 35639334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 36237304 - 36237726
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||  || | |    
T  36237304 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcagttactcc 36237402  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
       ||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||     
T  36237403 ---aaaatacacaagcgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaggtttaatggagatccagaagagttttct 36237499  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||  ||||||| || || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  36237500 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattagatgaagagttatgggacatactggaagatggagttgatgacctggatttagatgaagaag 36237599  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||  |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  36237600 gagctgctatagatagaaaaatacatactcctgctcagaagaagctttacaagaagcaccacaaaatcagagggattattgtggcttctatacctcgcac 36237699  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  36237700 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 36237726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 184 - 426
Target Start/End: Original strand, 20874280 - 20874522
Alignment:
Q  184 ccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttgg 283  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20874280 ccagaagagttttcttggtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattagatgaagagctgtgagatattcttgaagatggagttgatgatttgg 20874379  T
Q  284 atttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgc 383  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20874380 acttggatgaagaaggagctgctattgacagaaagattcacactcctgctcagaataagctatacaaaaagcatcataagatcagagggatcattgttgc 20874479  T
Q  384 ttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    |||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20874480 ttctataccacgcactgaatatatgaagatgagtgataaatcc 20874522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 23023911 - 23023696
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggat 255  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||   || ||||||  || |||||||||||||||||     
T  23023911 tggaaaagttccaaagtttaatggagatcctgaagaattttcttggtggaaaaccaacttctacaatcatgtcatgggtttagatgaagaactatgggac 23023812  T
Q  256 attcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagc 355  Q
    || |||||||||||  ||  ||| ||||     |||||||||||||||||||||||  |||  |  || ||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23023811 atacttgaagatggtattggtgacttggtcggtgatgaagaaggagctgctattgatagaagaaagcatactcctgctcagaagaaactttacaagaagc 23023712  T
Q  356 atcacaagatcagagg 371  Q
    ||||||  ||||||||    
T  23023711 atcacataatcagagg 23023696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18613950 - 18613799
Alignment:
Q  160 aaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattc 259  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||  | ||||  ||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  18613950 aaagttccaaagtttaatggagatcctgaagaattctcttggtggaaaaccaacttctacaattatgtcatgggtttagatgaagaactatgggatattc 18613851  T
Q  260 ttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattga 311  Q
    |||||||||| |||  ||| |||||  |  ||||||||| ||||||||||||    
T  18613850 ttgaagatggtgttggtgacttggaccttcatgaagaagaagctgctattga 18613799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 199 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 9345775 - 9345603
Alignment:
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    |||||||||||||  ||||| || || || ||||  || ||||||||||| |||  | ||||||||||||| |||  ||| ||||  || ||||||||||    
T  9345775 tggtggaaaaccataatgtatagttacattatgggtttagatgaagaactttggagtgttcttgaagatggtgttggtgacttggccttagatgaagaag 9345676  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagg 371  Q
    |||||||||||||   ||||| ||||||| || |||||||| || | ||||| || |||||||||||||||||    
T  9345675 gagctgctattgataaaaagaaacacactgctactcagaagtagttgtacaagaaacatcacaagatcagagg 9345603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 311
Target Start/End: Original strand, 21125404 - 21125559
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggat 255  Q
    |||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||   || ||||||  || |||||||||||||||||     
T  21125404 tggaaaagttcataagtttaatggagatcctgaagaattttcctggtggaaaaccaacttctacaatcatgtcatgggtttagatgaagaactatgggac 21125503  T
Q  256 attcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattga 311  Q
    || || ||||||||  ||  ||| |||| | | ||||||||||||||||| |||||    
T  21125504 atactagaagatggtattggtgacttggttgttgatgaagaaggagctgccattga 21125559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 156 - 254
Target Start/End: Original strand, 22431148 - 22431246
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatggga 254  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | |||||  || ||||||  || |||||||||||||||||    
T  22431148 tggaaaagttccaaagttcaatgaagatcctgaagaattttcctggtggaagaccaacttctacagtcatgtcatgggcttagatgaagaactatggga 22431246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 27857734 - 27857616
Alignment:
Q  252 ggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaa 351  Q
    |||| |||||||||| || |||  ||| ||||  || ||||||||||||| || | || |  |||||| ||||||  |||||||||||||||| |||| |    
T  27857734 ggatgttcttgaagaaggtgttggtgacttggtattagatgaagaaggagatgttgttcatagaaagaaacacaccgctgctcagaagaagctgtacaga 27857635  T
Q  352 aagcatcacaagatcagagg 371  Q
    || |||||||||||||||||    
T  27857634 aa-catcacaagatcagagg 27857616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 369
Target Start/End: Original strand, 21195874 - 21195955
Alignment:
Q  288 ggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcaga 369  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  |||  | ||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||    
T  21195874 ggatgaagaagtagctgatattgatagaagaaaacatactcctgctcagaagaaactctacaagaagcatcacacgatcaga 21195955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 37830 - 38252
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatcca--agaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |  |||||||||||||   |    
T  37830 attggtatcagagcttgctctgttatcaca-gcacttaaccgtgttacagttcaagatctattagaaaaacatgtctggagatgaggaatcaacta---c 37925  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37926 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 38025  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  38026 tggtggaaaactaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgggatatactggaagatggagttgatgatctggatttggatgaagaag 38125  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  38126 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacatcacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 38225  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||    
T  38226 cgaatacatgaaaatgagtgacaaatc 38252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 11204 - 11628
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |   ||||| | ||  ||||    
T  11204 attggtatcagagcttgctctgttatca-aagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccgagaaaaacatgtctgctgaacctgaatccagtacatcta 11302  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
     || ||||| |  |||    ||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11303 caagatacactcatgttgggcatgattatggtactgctgacaagaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcttg 11402  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||    
T  11403 gtggaaaaccaacatgtacatctacatcatgggattagatgaggagctatgggatattcctgaagatggagttgatgatctgaacttggatgaagaagga 11502  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  11503 gctgctattgacagaaagatacatactcctgctcagaagaagctatacaaaaagcatcacaagatcagaggaatcattgttgcttctatacctcacactg 11602  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    |||| ||||   ||||||||||||||    
T  11603 aatatatgacagtgagtgataaatcc 11628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 44629 - 45052
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaa--gaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||  ||   |    
T  44629 attggtatcagagcttgctctgttatcatacgcacttaaccgtgtgacagttcaagatccaaaagaaaaacatgtctggaggagaggaatcagtta---c 44725  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
    || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44726 tacaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatactgctgacaagaaaacagactctggaaaagctccaaagtttaatggagatccagaagagttttca 44825  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    || |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| || || || |||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||    
T  44826 tgttggaaaacaaatatgtacagctttatcatgggattggatgaagagctatgagacatactggaagatggagttgatgatctggatttagatgcagaag 44925  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  44926 gagctgctatagacagaagaatacatactcctgctcagaagaagctttataagaaacaccacaagataagaggaatcattgtggcttctatacctcgcac 45025  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  45026 cgaatacatgaagatgagtgacaaatc 45052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 167 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 158168 - 157964
Alignment:
Q  167 caaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaaga 266  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||  | || ||  || ||||||  || ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  158168 caaagtttaatggagatcctgaagaattctcttggtggaaaaccaacttctatagtcatgtcatgggtttagatgaagaactatgggacatacttgaaga 158069  T
Q  267 tggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatc 366  Q
    ||| |||  ||| ||||   | |||||||||||||||||||||||  |||  | ||| ||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||||    
T  158068 tggtgttggtgacttggtccttgatgaagaaggagctgctattgatagaagaaaacatactcctgctcataagaaactctacaagaagcatcacacgatc 157969  T
Q  367 agagg 371  Q
    |||||    
T  157968 agagg 157964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 156 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 36478 - 36273
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggat 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | || ||  || ||||||  || |||||||||||||||||     
T  36478 tggaaaagttccaaagttcaatggatatcctgaagaattttcctggtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggcttagatgaagaactatgggac 36379  T
Q  256 attcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagc 355  Q
    || || ||||||||  ||  ||| ||||   | |||||||||||||||| | |||| ||||  | ||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  36378 atactagaagatggtattggtgacttggtcgttgatgaagaaggagctgttgttgattgaagaaaacatacttctgctcagaagaaattctacaacaagc 36279  T
Q  356 atcaca 361  Q
    ||||||    
T  36278 atcaca 36273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 156 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 134538 - 134333
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggat 255  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | || ||  || ||||||  || |||||||||||||||||     
T  134538 tggaaaagttccaaagttcaatggatatcctgaagaattttcctggtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggcttagatgaagaactatgggac 134439  T
Q  256 attcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagc 355  Q
    || || ||||||||  ||  ||| ||||   | |||||||||||||||| | |||| ||||  | ||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||    
T  134438 atactagaagatggtattggtgacttggtcgttgatgaagaaggagctgttgttgattgaagaaaacatacttctgctcagaagaaattctacaacaagc 134339  T
Q  356 atcaca 361  Q
    ||||||    
T  134338 atcaca 134333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 4 - 396
Target Start/End: Original strand, 41267 - 41658
Alignment:
Q  4 ggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttctataa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || || |   ||||| | |   |||| ||    
T  41267 ggtatcagagcttgctctgttatca-aagcacttaaccgtgtgacagttcaagatccgagaaaaacatgtctgctgaacctgaatccagttcatctacaa 41365  T
Q  104 aatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtg 203  Q
     ||||| || |||   ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  41366 gatacactaatgttggacatgactatggtactgctgacatgaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatacagaagagttttcttggtg 41465  T
Q  204 gaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagct 303  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||    
T  41466 gaaaaccaacatgtacaactacatcatgggattagatgaggagctgtgggatattcttgaagatggagttgatgatctgaacttggatgaagaaggagct 41565  T
Q  304 gctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgt 396  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41566 actattgacagaaagatacacactcctgctcaggagaagctatacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctatacctcgt 41658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 9900 - 9665
Alignment:
Q  160 aaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattc 259  Q
    |||||||||| ||| |||||| || | ||||| ||||  | |||||||| |||||| ||||| || |||||||  || ||||   |||| ||||||||||    
T  9900 aaagctccaaggtttaatggaaattctgaagaattttgctagtggaaaatcaatatatacagttacatcatggggttagatgggcaactttgggatattc 9801  T
Q  260 ttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatca 359  Q
    ||||||||||  ||  ||| ||||   | ||||||||||||||||||| |||  ||||||  || ||| ||||||| || |||||||||||||| |||      
T  9800 ttgaagatggtattggtgaattggcccttgatgaagaaggagctgctactgatagaaagaagcatactcctgctcataaaaagctttacaaaaaacattc 9701  T
Q  360 caagatcagagggatcattgttgcttctattcctcg 395  Q
    |||||| ||||| ||  ||||||| ||||| |||||    
T  9700 caagattagaggaattcttgttgcctctatacctcg 9665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0382
Description:

Target: scaffold0382; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 426
Target Start/End: Original strand, 2164 - 2588
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  || |   ||||| | ||  ||||    
T  2164 attggtatcagagcttgctctgttatca-aagcacttaaccgtgtgacagttcaagatccgagaaaaacatgtcttctgaacctgaatccagtacatcta 2262  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
     || |  || |  | |   | |||| |||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2263 caagaggcactgctattccatatgattatggtacagctgataagaaatcagattctagaaaatctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcttg 2362  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  2363 gtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattggatgatgagctgtgggatattcttgaagatggagttgatgatctggacttggatgaggaagga 2462  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactg 400  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || || ||||    
T  2463 gctgccattgacagaaagatacacactcctgcttaaaagaagctatacaaaaagcatcacaagatcagagagatcattgttgcttttataccacgcactg 2562  T
Q  401 aatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  2563 aatacatgaaaatgagtgataaatcc 2588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 1933 - 2315
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||||||||| || | | |||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||  || || |   ||||| | ||  ||||    
T  1933 attggtatcagagcctggttttttatca-aagcacttaacagtgtgacagttcaatatccgagaaaaacatgcctgctgaacctgaatccagtacatcta 2031  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
     || ||||| || |||   ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2032 caagatacactaatgttggacatgactatggtactgctgacaagaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcttg 2131  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagga 300  Q
    |||||||||||| || |||| ||| ||||||| ||| ||||| || || |||||||||| ||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||    
T  2132 gtggaaaaccaacatttacaactacatcatgggattagatgaggagctgtgggatattcctgaagatggagttgatgatctgaacttggatgaagaagga 2231  T
Q  301 gctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgct 384  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2232 gctgctattgacagaaagatatacactcctgctcagaagaagctatacaaaaagcatcagaagatcagagggatcattgttgct 2315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1507 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold1507
Description:

Target: scaffold1507; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 122 - 426
Target Start/End: Original strand, 374 - 678
Alignment:
Q  122 atgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacag 221  Q
    |||| |||| ||| ||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  374 atgattatggtacagctgataagaaatcagattctagcaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcttggtggaaaaccaacatgtacaa 473  T
Q  222 ctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagata 321  Q
    ||| ||||||| | | |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  474 ctacatcatgggaatagatgaagagctgtgggatattcttgaagatggagttgatgatctggacttggatgaagaaggagctgctattgacagaatgata 573  T
Q  322 cacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgata 421  Q
    ||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | |||||| ||||| ||||||||||    
T  574 cacactcttgctcagaaaaagctatacaaaaagcatcacaagatcagaggaatcattgttgcttctataccacgcattgaatatatgaaaatgagtgata 673  T
Q  422 aatcc 426  Q
    |||||    
T  674 aatcc 678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 144 - 426
Target Start/End: Original strand, 165718 - 166000
Alignment:
Q  144 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| ||||||| ||| |||||     
T  165718 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatcctgaagagttttcttggtggaaaaccgacatgtgcagctacatcatgggattagatgat 165817  T
Q  244 gaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagc 343  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  165818 gagctgtgggatattcttgaagatggagttgatgatctggacctggatgaggaaggagctgctattgacagaaagatacacactcctgctcaaaagaagt 165917  T
Q  344 tttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  165918 tatacaaaaagcatcacaagataagagggatcattgttgcttctataccacgcactgaatatatgaaaatgagtgataaatcc 166000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 212
Target Start/End: Original strand, 66481 - 66537
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaa 212  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  66481 tggagaagttccaaagtttaatggagatcctgaagaattttcctggtggaaaaccaa 66537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1820 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold1820
Description:

Target: scaffold1820; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 144 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 683 - 401
Alignment:
Q  144 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  683 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagattctgaagagttttcttggtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgggattggatgat 584  T
Q  244 gaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagc 343  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  583 gagttgtgggatattcttgaagatggagttgatgatctggacctggatgaggaagcggctgctattgacagaaagatacacactcctgctcaaaagaagt 484  T
Q  344 tttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  483 tattcaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctataccgcgcactgaatatatgaaaatgagtgataaatcc 401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 12992 - 13222
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttcta 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  || ||| ||||  ||||  ||||    
T  12992 attggtatcaaagcttgctctgttatca-aagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccgagaaaaacatgtctactgaagatgaatacactacatcta 13090  T
Q  101 taaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13091 caaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgacaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatg 13190  T
Q  201 gtggaaaaccaatatgtacagctatatcatgg 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13191 gtggaaaaccaacatgtacagctacatcatgg 13222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 425
Target Start/End: Original strand, 52607 - 53032
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaa--gaaaaacatgtatgatggagaggaatcaactatttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||| |  ||||||||||| ||  ||||| |||||||||| | |    
T  52607 attggtatcagagcttgctctgttatcata-gctcttaacagtgttacagatcaagatcctatagaaaaacatgtctggaggagatgaatcaactactac 52705  T
Q  99 tataaaatacaatagtgtcaaacatgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttca 198  Q
      |||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| |||| ||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52706 cttaaaatacacaagtgtcaagcatgactatgatacggctgacaagaaaacagactcttgtaaagctcttaagtttaatggagatccagaagagttttca 52805  T
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||  |||||||  ||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  52806 tggtggaaaacaaatatgtatagcttcatcatgggtttggatgaagagctatgggacatattggaagatggagttgatgacctggatttagatgaagaag 52905  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    ||||||| || | | |||  ||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||    
T  52906 gagctgccatagtcagaagaatacatactcctggtcagaaaaagctttacaagaagcaccacaaaattagaggtattattgtggcttctatacctcgcac 53005  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||    
T  53006 cgaatatatgaagatgagtgacaaatc 53032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 122 - 424
Target Start/End: Original strand, 540 - 842
Alignment:
Q  122 atgactatgatactgctgaaaggaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacag 221  Q
    |||| |||| ||| ||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  540 atgattatggtacagctgataagaaatcagactctagaaaagctccaaagttcaatggagatcttgaagagttttcttggtggaaaaccaacatgtacag 639  T
Q  222 ctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagata 321  Q
    ||| ||||||| | ||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||  |||| |||   ||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||    
T  640 ctacatcatgggactggatgatgagctgtgggatattattgaagatggagttggtgatctggccctggatgaggaaggagcagttattgacagaaagata 739  T
Q  322 cacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgata 421  Q
    ||||||  |||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  740 cacactcatgctcaaaaaaagttatacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctatacctcgcactgaatatatgaaaatgagtgata 839  T
Q  422 aat 424  Q
    |||    
T  840 aat 842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 431 - 502
Alignment:
Q  1 attggtatcagagctt-gctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatg 72  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||    
T  431 attggtatcagagctttggtttgttatcaaaa-cacttaaccgtgtaacagttcaagatctgagaaaaacatg 502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 388
Target Start/End: Original strand, 17874 - 18290
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaaga-tccaaga---aaaaca-tgtatgatggagaggaatcaactat 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   |||||| ||| ||  ||||||||||||||||     
T  17874 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagaatccaaaagaaaaaacaatgtctggaggagaggaatcaactac 17973  T
Q  96 tt--ctataaaataca-atagtgt-caaacatgactatgatactgct-gaaaggaaatcagattctgg--aaaagctcc---aaagttcaat-ggagat- 183  Q
     |  ||  |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||| |   |||||||||| ||||||     
T  17974 ataccttaaaaatacacaaagtgtacaaacatgactatgatactgctagaaaggaaatcagactctgggaaaaagctacccaaaagttcaattggagata 18073  T
Q  184 ccagaagagtttt-catggtggaaaaccaata-tgtacagctatatca-tggaatt-ggat-gaagaactatggga-tattcttgaagatggagttcatg 277  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  18074 ccagaagagtttttcatggtggaaaaccaataatgtacagctatatcaatgggattaggatagaagaactatgggaatatacttgaagatggagttgatg 18173  T
Q  278 atttggattt-ggat---gaagaagg--agctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagg 371  Q
    || ||||||| ||||    |||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  18174 atctggatttgggattggaaagaagggtagctgctattgatagaaagatacacactcctgctcagaagaaaacttacaaaaagcatcacaagatcagagg 18273  T
Q  372 gatcattgttgcttcta 388  Q
    ||| |||||||||||||    
T  18274 gattattgttgcttcta 18290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 154 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 76302 - 76030
Alignment:
Q  154 tctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatggg 253  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||||||  |||| || || |||||||||||||| |||||||  || ||| |||  || |||||| |||  ||||    
T  76302 tctggcaaacctccaaagtttaatggagatcctaaagaattctcttggtggaaaaccaacatgtacaattacatcgtgggtttagatgaaaaaccgtggg 76203  T
Q  254 atattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaa 353  Q
    ||||||||||||| || |||  ||| ||||   | |||||||||| |||| || ||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  76202 atattcttgaagaaggtgttattgacttggtcattgatgaagaagtagcttctgttgatagaaagaaacatacttctgctcagaagaagctttacaagaa 76103  T
Q  354 gcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    |||||||| ||| | ||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||  | || |||||||||||||| ||||||    
T  76102 gcatcacaggataataggaatccttgttgcatctatacctcgcacatagtatatgaagatgagtgacaaatcc 76030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 155 - 357
Target Start/End: Original strand, 11172 - 11374
Alignment:
Q  155 ctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatggga 254  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||    
T  11172 ctggaaaagttcctaagttcaatggagatcctgaagaattttcttggtggaaaaccaacttctacagctatgtcatggggttagatgaagaactatggga 11271  T
Q  255 tattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaag 354  Q
     || |||||||| || |||  ||| ||||   | ||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||| || |||||||||| || ||||| |||    
T  11272 catacttgaagagggtgtttgtgacttggtccttgatgaagaatgagctgctattgatagaaagaaacacactcctactcagaagaaactctacaagaag 11371  T
Q  355 cat 357  Q
    |||    
T  11372 cat 11374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 155 - 357
Target Start/End: Original strand, 15845 - 16047
Alignment:
Q  155 ctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatggga 254  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||    
T  15845 ctggaaaagttcctaagttcaatggagatcctgaagaattttcttggtggaaaaccaacttctacagctatgtcatggggttagatgaagaactatggga 15944  T
Q  255 tattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaag 354  Q
     || |||||||| || |||  ||| ||||   | ||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||| || |||||||||| || ||||| |||    
T  15945 catacttgaagagggtgtttgtgacttggtccttgatgaagaatgagctgctattgatagaaagaaacacactcctactcagaagaaactctacaagaag 16044  T
Q  355 cat 357  Q
    |||    
T  16045 cat 16047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 152 - 359
Target Start/End: Original strand, 21997 - 22204
Alignment:
Q  152 attctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatg 251  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | |||| |||| ||||||  || ||||||||||||||    
T  21997 attctggaaaagttcttaagttcaatggagatcctgaagaattttcttggtggaaaaccaacttctacatctatgtcatgggtttagatgaagaactatg 22096  T
Q  252 ggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaa 351  Q
     || || ||||||||||| |||  ||| ||||   | |||||||||||||||| | ||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||  |||||||     
T  22097 agacatacttgaagatggtgttggtgacttggtccttgatgaagaaggagctgttgttgatagaaagaaacatactcctgctcagaagaaaatttacaag 22196  T
Q  352 aagcatca 359  Q
    ||||||||    
T  22197 aagcatca 22204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 7721 - 7494
Alignment:
Q  144 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaa 243  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | || ||  || ||||||  || ||||||    
T  7721 gaaatctgactctggaaaagttccaaagtttaatggagatcctgaagaattttcctggtggaaaaccaacttctatagtcatgtcatgggtttagatgaa 7622  T
Q  244 gaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagc 343  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||  ||| | ||   | ||||| |||||||||||| ||||  |||  | ||| ||| ||||||||||||| |    
T  7621 gaactatgggacatacttgaagatggtgttggtgactaggtcattgatgacgaaggagctgctgttgatagaagaaaacatactcctgctcagaagaaac 7522  T
Q  344 tttacaaaaagcatcacaagatcagagg 371  Q
    | | ||| |||||||||| |||||||||    
T  7521 tcttcaagaagcatcacacgatcagagg 7494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 122 - 54
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaaca 70  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  122 attggtatcagagcttgctctgttatca-aagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccgagaaaaaca 54  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 361
Target Start/End: Original strand, 7766 - 7971
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggat 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | |||||  || ||||||  || |||||||||||||||||     
T  7766 tggaaaagttccaaagttcaatggagatcctgaagaattttcctggtggaagaccaacttctacagtcatgtcatgggtttagatgaagaactatgggac 7865  T
Q  256 attcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagc 355  Q
    || || ||||||||  ||  ||| ||||   | |||||||||||||||||||||||  |||  |  || ||| ||||||||||||| || ||||| ||||    
T  7866 atactagaagatggtattggtgacttggtcgttgatgaagaaggagctgctattgatagaagaaagcatactcctgctcagaagaaactctacaagaagc 7965  T
Q  356 atcaca 361  Q
    ||||||    
T  7966 atcaca 7971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 289 - 361
Target Start/End: Original strand, 39 - 111
Alignment:
Q  289 gatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcaca 361  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||  |  || ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  39 gatgaagaaggagctgctattgatagaagaaagcatactcctgctcagaagaaactctacaagaagcatcaca 111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 7624 - 7695
Alignment:
Q  1 attggtatcagagcttgctctgttatcataagcacttaaccgtgtgacagatcaagatccaagaaaaacatgt 73  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||| ||||   ||||||  ||||||||||||    
T  7624 attggtatcagagcttgctctgttgtca-aaacacttaacagtgtaacagtaaaagatctgagaaaaacatgt 7695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 11670 - 11444
Alignment:
Q  144 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaa 243  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | || ||  || ||||||  || ||||||    
T  11670 gaaatctgactctggaaaagttccaaagtttaatggagatcctgaagaattttcctggtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggcttagatgaa 11571  T
Q  244 gaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagc 343  Q
    ||||||||||| || || ||||||||  ||  ||| ||||   | |||||||||||||||||| ||||  |||  | ||| || |||||||||||||| |    
T  11570 gaactatgggacatgctagaagatggtattgttgagttggtcgttgatgaagaaggagctgctgttgatagaagaaaacatac-tctgctcagaagaaac 11472  T
Q  344 tttacaaaaagcatcacaagatcagagg 371  Q
    ||||||| || |||||||  ||||||||    
T  11471 tttacaagaaacatcacacaatcagagg 11444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 311
Target Start/End: Original strand, 110652 - 110819
Alignment:
Q  144 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaa 243  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||  | |||||  || ||||||  |||||||||    
T  110652 gaaatcagactatggaaaagttccaaagttcaatggagatcctgaagaatttttctggtggaaaaccaacttatacagtcatgtcatgggtttggatgaa 110751  T
Q  244 gaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattga 311  Q
    || |||||||| || || ||||||||  ||  ||| ||||   | ||||||||||||||||| |||||    
T  110752 gagctatgggacatactagaagatggtattggtgacttggtcgttgatgaagaaggagctgccattga 110819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 156 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 2237 - 2029
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggat 255  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||  | || ||  || ||||||  || |||||||||||||||||     
T  2237 tggaaaagttccaaagtttaatggagatcctgaagaattctcttggtggaaaaccaacttctatagtcatgtcatgggtttagatgaagaactatgggac 2138  T
Q  256 attcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagc 355  Q
    || ||||||||||  | |  ||| ||||   | |||||||||| || |||||||||  |||||| ||| ||| |||||||||| || ||  |||| ||||    
T  2137 atacttgaagatgatgctggtgacttggtcattgatgaagaagtagttgctattgatagaaagaaacatactcctgctcagaaaaaactccacaagaagc 2038  T
Q  356 atcacaaga 364  Q
    |||||||||    
T  2037 atcacaaga 2029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 371
Target Start/End: Original strand, 98631 - 98846
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggat 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | || ||  || ||||||  || |||||||||||||| ||     
T  98631 tggaaaagttccaaagttcaatggagatcctgaagaattttcctggtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggcttagatgaagaactatgagac 98730  T
Q  256 attcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagc 355  Q
    || || ||| ||||  ||  ||| ||||   | |||||||||||||||||||||||  |||  | ||| ||| |||||||||||||  | ||||| ||||    
T  98731 atactagaatatggtattggtgacttggtcgttgatgaagaaggagctgctattgatagaagaaaacatactcctgctcagaagaaattctacaagaagc 98830  T
Q  356 atcacaagatcagagg 371  Q
    ||||||  ||||||||    
T  98831 atcacacaatcagagg 98846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 367
Target Start/End: Original strand, 1264 - 1466
Alignment:
Q  165 tccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaa 264  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| |||| |  || ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  1264 tccaaagtttaatggagatcttgaagatttctcttggtggaaaaccaacttctacagttatgtcattggtttagatgaagaactttgggacattcttgaa 1363  T
Q  265 gatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaaga 364  Q
    || || |||  ||||||||   |  ||||||||||||||||| |||   |||||| | | ||| |||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  1364 gaaggtgttggtgatttggtcctttatgaagaaggagctgctgttggtagaaagaaaaatactcctgctcggaagaaaatctacaagaagcatcacaaga 1463  T
Q  365 tca 367  Q
    |||    
T  1464 tca 1466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 199 - 425
Target Start/End: Original strand, 4362 - 4588
Alignment:
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||  || |||||| || |||||||| | ||||||||||| |||   ||||| |  || ||||||||||    
T  4362 tggtggaaaaccaaaatgtatagtcatatcatgggcttagatgaataaatatgggatgtccttgaagatggtgttagagatttagggttagatgaagaag 4461  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    | | ||   ||||  | |||| ||||| | |||||||||||||| | ||||| || ||||||||| ||||||| ||  |||||||| || | ||||  |     
T  4462 gtgttgtcgttgataggaagaaacacattgctgctcagaagaagatgtacaagaaacatcacaagttcagaggcattcttgttgctgctctacctcacaa 4561  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     || ||| |||||||||||||||||||    
T  4562 agagtacttgaagatgagtgataaatc 4588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 359
Target Start/End: Original strand, 6787 - 6990
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggat 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||| |||||  | || ||  || ||||||  || |||||||||||||||||     
T  6787 tggaaaagttccaaagttcaatggagatcttgaagaatttttctggtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggtttagatgaagaactatgggac 6886  T
Q  256 attcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagc 355  Q
    || || ||||||||  ||  ||| ||||   | |||||||||||||||||||||||  |||  | ||| ||| |||||||||||||  | ||||| ||||    
T  6887 atactagaagatggtattgttgacttggtcgttgatgaagaaggagctgctattgatagaagaaaacatactcctgctcagaagaaattctacaagaagc 6986  T
Q  356 atca 359  Q
    ||||    
T  6987 atca 6990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0272
Description:

Target: scaffold0272; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 379 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 24253 - 24206
Alignment:
Q  379 gttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgagtgataaatcc 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24253 gttgcttctattcctcgtactgaatacatgaagatgattgataaatcc 24206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0758 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0758
Description:

Target: scaffold0758; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 3352 - 3126
Alignment:
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  | || ||||  || |||||||| ||||| ||| | |||||||| || |||   |||||||  || ||||||||||    
T  3352 tggtggaaaaccaaaatgtatagtcacattatgggtttagatgaagagctatgtgatgtccttgaagacggtgttggggatttggtgttagatgaagaag 3253  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    || || |||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||| |  |||| || ||||||||||| ||||| ||  |||||||| || | ||||  |     
T  3252 gaactactattgatagaaagaaacacactactgctcagaagaagatgcacaagaaacatcacaagattagaggcattcttgttgctgctttgcctcacaa 3153  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaatc 425  Q
     || ||| | |||||||||||||||||    
T  3152 ggagtactttaagatgagtgataaatc 3126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 210447 - 210292
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggat 255  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||  || ||||||  || |||||| | ||||||||     
T  210447 tggaaaagttccaaagttcaacggagatcttgaagaattttcctggtggaaaaccaacttctacagtcatgtcatgggtttagatgaaaagctatgggac 210348  T
Q  256 attcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattga 311  Q
    || || ||||||||  ||  ||| ||||   | |||||||||||||||||||||||    
T  210347 atactagaagatggtattggtgacttggtcgttgatgaagaaggagctgctattga 210292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 269
Target Start/End: Original strand, 19705 - 19830
Alignment:
Q  144 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaa 243  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| |||||  | || ||  || | ||||| || ||||||    
T  19705 gaaatctgactctggaaaagttccaaagttcaaaggagatcctgaagaatttttctggtggaagaccaacttctatagtcatgtaatggatttagatgaa 19804  T
Q  244 gaactatgggatattcttgaagatgg 269  Q
    ||||||||||| || || ||||||||    
T  19805 gaactatgggacatactagaagatgg 19830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 423
Target Start/End: Original strand, 2820 - 3044
Alignment:
Q  199 tggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaag 298  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| | || ||||  || |||||| | |||||| || | |||||| |||  |||  ||||||||| || ||||||||||    
T  2820 tggtggaaaaccaaaatgtatagcaacattatgggtttagatgaaaacctatggaatgtccttgaatatgatgttggtgatttggagttagatgaagaag 2919  T
Q  299 gagctgctattgactgaaagatacacacttctgctcagaagaagctttacaaaaagcatcacaagatcagagggatcattgttgcttctattcctcgtac 398  Q
    ||| || | ||||  |||||| ||||||| |||||||||||||  | ||||| || | | ||| ||||| ||| ||  ||||||||||| | ||||  |     
T  2920 gagttgttgttgatagaaagaaacacactactgctcagaagaaaatgtacaagaaacgtaacatgatcaaaggcattcttgttgcttctttacctcacaa 3019  T
Q  399 tgaatacatgaagatgagtgataaa 423  Q
     || ||| |||||||||||||||||    
T  3020 agagtacttgaagatgagtgataaa 3044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 311
Target Start/End: Original strand, 26713 - 26868
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggat 255  Q
    |||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||  || |||| |  || |||||||||||||||||     
T  26713 tggaaaagttcataagtttaatggagatcctgaagaattttcctggtggaaaaccaacttctacagtcatgtcataggtttagatgaagaactatgggac 26812  T
Q  256 attcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaaggagctgctattga 311  Q
    || || ||||||||  ||  ||| || | | | ||||||||||||||||| |||||    
T  26813 atactagaagatggtattggtgacttcgttgttgatgaagaaggagctgccattga 26868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18107 - 17994
Alignment:
Q  156 tggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttcatggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggat 255  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | || ||  || ||||||  || ||||| |||||||||||     
T  18107 tggaaaagttacaaagttgaatggagatcctgaagaattttcctggtggaagaccaacttctatagtcatgtcatgggcttagatgatgaactatgggac 18008  T
Q  256 attcttgaagatgg 269  Q
    || || ||||||||    
T  18007 atactagaagatgg 17994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14163 - 14110
Alignment:
Q  144 gaaatcagattctggaaaagctccaaagttcaatggagatccagaagagttttc 197  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  14163 gaaatctgactctggaaaagttccaaagtttaatggagatcctgaagaattttc 14110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 304
Target Start/End: Original strand, 4417 - 4521
Alignment:
Q  200 ggtggaaaaccaatatgtacagctatatcatggaattggatgaagaactatgggatattcttgaagatggagttcatgatttggatttggatgaagaagg 299  Q
    ||||||||||||| ||||| ||  |||| |||   || |||||||||||||||||| | ||||||||| | ||| |||| ||||  || ||||||||| |    
T  4417 ggtggaaaaccaaaatgtatagtcatattatgagtttagatgaagaactatgggatgtccttgaagattgtgttgatgacttggtgttagatgaagaaag 4516  T
Q  300 agctg 304  Q
    |||||    
T  4517 agctg 4521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University