View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14131_low_3 (Length: 770)

Name: NF14131_low_3
Description: NF14131
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14131_low_3
NF14131_low_3
[»] chr3 (161 HSPs)
chr3 (19-759)||(51942916-51943657)
chr3 (145-758)||(1313082-1313695)
chr3 (145-758)||(53917635-53918250)
chr3 (144-758)||(53915467-53916083)
chr3 (145-746)||(25533107-25533716)
chr3 (141-746)||(746418-747031)
chr3 (144-746)||(457949-458558)
chr3 (145-746)||(455573-456181)
chr3 (145-746)||(4103879-4104483)
chr3 (143-746)||(10621513-10622129)
chr3 (144-762)||(42991952-42992560)
chr3 (404-753)||(4308257-4308609)
chr3 (400-759)||(45882864-45883227)
chr3 (400-758)||(43423434-43423795)
chr3 (145-529)||(27635830-27636212)
chr3 (400-746)||(18099153-18099502)
chr3 (400-746)||(10956010-10956359)
chr3 (400-752)||(1626660-1627015)
chr3 (438-753)||(30005804-30006122)
chr3 (400-759)||(48361641-48362002)
chr3 (400-758)||(43421386-43421747)
chr3 (400-752)||(3314609-3314965)
chr3 (400-747)||(11170329-11170679)
chr3 (400-746)||(10958306-10958655)
chr3 (400-753)||(18096876-18097233)
chr3 (400-752)||(28101979-28102334)
chr3 (438-762)||(42990267-42990594)
chr3 (400-758)||(880422-880784)
chr3 (438-746)||(38890003-38890314)
chr3 (404-752)||(43228220-43228571)
chr3 (145-555)||(41848804-41849232)
chr3 (400-746)||(3859453-3859801)
chr3 (404-753)||(24979636-24979989)
chr3 (404-746)||(51726990-51727334)
chr3 (404-737)||(43226015-43226350)
chr3 (404-752)||(27101158-27101513)
chr3 (400-753)||(18162589-18162944)
chr3 (400-746)||(26720473-26720821)
chr3 (400-746)||(10084372-10084725)
chr3 (359-688)||(6561694-6562028)
chr3 (400-746)||(5191578-5191925)
chr3 (400-738)||(5926755-5927096)
chr3 (400-753)||(12267951-12268298)
chr3 (400-746)||(22114288-22114637)
chr3 (438-753)||(9604583-9604900)
chr3 (400-752)||(53468430-53468787)
chr3 (400-752)||(47148872-47149232)
chr3 (400-753)||(36011752-36012108)
chr3 (400-752)||(32264015-32264375)
chr3 (400-746)||(6065779-6066129)
chr3 (400-744)||(54691559-54691905)
chr3 (400-746)||(6063429-6063780)
chr3 (404-746)||(50493928-50494273)
chr3 (400-746)||(5522610-5522947)
chr3 (400-746)||(28761410-28761760)
chr3 (400-758)||(51674737-51675087)
chr3 (438-746)||(25388869-25389179)
chr3 (479-746)||(1321483-1321753)
chr3 (400-734)||(10191305-10191645)
chr3 (400-751)||(39715395-39715744)
chr3 (150-427)||(42989957-42990234)
chr3 (438-746)||(38210333-38210644)
chr3 (400-758)||(15780785-15781165)
chr3 (438-693)||(29956649-29956907)
chr3 (406-753)||(32219026-32219366)
chr3 (400-723)||(889779-890103)
chr3 (404-729)||(35917944-35918277)
chr3 (488-751)||(6484372-6484639)
chr3 (400-627)||(28100143-28100373)
chr3 (465-746)||(28413014-28413299)
chr3 (497-746)||(7606571-7606822)
chr3 (400-731)||(53591120-53591442)
chr3 (592-759)||(27635628-27635795)
chr3 (400-637)||(35777346-35777587)
chr3 (526-752)||(25688137-25688367)
chr3 (400-751)||(23633385-23633732)
chr3 (400-758)||(31151272-31151631)
chr3 (400-635)||(28180949-28181185)
chr3 (496-758)||(4666535-4666800)
chr3 (563-746)||(5886290-5886472)
chr3 (563-746)||(5899763-5899945)
chr3 (523-753)||(6231849-6232081)
chr3 (482-751)||(17795269-17795538)
chr3 (482-751)||(19103709-19103978)
chr3 (539-746)||(11168165-11168375)
chr3 (400-725)||(53597166-53597491)
chr3 (400-543)||(11163075-11163218)
chr3 (400-620)||(28137415-28137627)
chr3 (599-746)||(47701654-47701801)
chr3 (482-725)||(13420189-13420432)
chr3 (556-752)||(3306845-3307040)
chr3 (405-734)||(36871295-36871624)
chr3 (482-734)||(561769-562024)
chr3 (399-649)||(23636951-23637200)
chr3 (482-734)||(25635391-25635644)
chr3 (400-684)||(54884082-54884367)
chr3 (400-529)||(47701798-47701927)
chr3 (399-528)||(6231373-6231502)
chr3 (656-753)||(41849243-41849340)
chr3 (19-142)||(5156031-5156154)
chr3 (400-518)||(3306724-3306842)
chr3 (665-746)||(35919098-35919179)
chr3 (19-143)||(5160061-5160185)
chr3 (586-734)||(24181494-24181644)
chr3 (475-734)||(1673975-1674227)
chr3 (144-219)||(6561612-6561687)
chr3 (404-612)||(4560401-4560593)
chr3 (677-746)||(53894040-53894109)
chr3 (567-732)||(1620457-1620624)
chr3 (615-734)||(25634030-25634150)
chr3 (561-707)||(11007545-11007683)
chr3 (155-228)||(53974124-53974197)
chr3 (400-576)||(24177204-24177380)
chr3 (155-311)||(11066255-11066429)
chr3 (155-228)||(11072644-11072717)
chr3 (400-475)||(1321366-1321441)
chr3 (177-300)||(54287487-54287627)
chr3 (19-126)||(45883967-45884074)
chr3 (230-295)||(53974011-53974077)
chr3 (697-762)||(42992611-42992676)
chr3 (677-731)||(1736334-1736388)
chr3 (225-295)||(11072731-11072801)
chr3 (677-731)||(18552912-18552966)
chr3 (669-723)||(28181185-28181238)
chr3 (677-731)||(30709819-30709873)
chr3 (400-460)||(6484310-6484370)
chr3 (666-737)||(10612772-10612844)
chr3 (666-737)||(47878165-47878237)
chr3 (679-731)||(47923937-47923989)
chr3 (19-58)||(46479576-46479615)
chr3 (677-731)||(1417519-1417573)
chr3 (677-731)||(3716031-3716085)
chr3 (677-731)||(8370515-8370569)
chr3 (677-731)||(27974981-27975035)
chr3 (677-731)||(27986475-27986529)
chr3 (682-731)||(21711227-21711276)
chr3 (666-737)||(10595028-10595100)
chr3 (666-737)||(10897121-10897193)
chr3 (454-556)||(13419864-13419960)
chr3 (623-737)||(15823641-15823756)
chr3 (145-185)||(27000083-27000123)
chr3 (687-731)||(29682483-29682527)
chr3 (687-731)||(40913417-40913461)
chr3 (687-731)||(44331669-44331713)
chr3 (666-737)||(48390296-48390368)
chr3 (404-471)||(1618916-1618986)
chr3 (482-583)||(25633930-25634031)
chr3 (677-728)||(48438221-48438272)
chr3 (709-751)||(8183112-8183154)
chr3 (677-731)||(16264354-16264408)
chr3 (677-731)||(25795785-25795839)
chr3 (677-731)||(26298992-26299046)
chr3 (556-737)||(29913949-29914128)
chr3 (687-737)||(30236249-30236299)
chr3 (677-731)||(32143325-32143379)
chr3 (677-731)||(33386695-33386749)
chr3 (677-731)||(37466295-37466349)
chr3 (537-611)||(11073007-11073084)
chr3 (666-707)||(11079633-11079674)
chr3 (678-731)||(24695194-24695247)
chr3 (404-453)||(53896475-53896524)
[»] chr1 (136 HSPs)
chr1 (145-759)||(17324610-17325227)
chr1 (143-758)||(47905954-47906576)
chr1 (145-759)||(28998227-28998844)
chr1 (145-759)||(29003943-29004560)
chr1 (144-746)||(31735508-31736116)
chr1 (145-752)||(2949213-2949815)
chr1 (145-746)||(39931762-39932368)
chr1 (145-746)||(15294821-15295439)
chr1 (145-743)||(24325347-24325954)
chr1 (145-752)||(27339112-27339730)
chr1 (144-752)||(27336921-27337533)
chr1 (172-695)||(21948226-21948756)
chr1 (144-746)||(9463231-9463841)
chr1 (145-746)||(9459404-9460013)
chr1 (373-759)||(6995674-6996064)
chr1 (267-746)||(2510312-2510801)
chr1 (400-758)||(12302480-12302846)
chr1 (400-751)||(50307527-50307883)
chr1 (400-746)||(51749984-51750333)
chr1 (400-753)||(15823491-15823847)
chr1 (400-752)||(18307054-18307409)
chr1 (400-758)||(38925456-38925814)
chr1 (400-758)||(11457450-11457811)
chr1 (400-753)||(28207048-28207402)
chr1 (400-752)||(41646865-41647220)
chr1 (400-746)||(10399815-10400164)
chr1 (400-741)||(13215026-13215375)
chr1 (400-744)||(6822960-6823306)
chr1 (404-753)||(39462468-39462820)
chr1 (257-746)||(46431693-46432207)
chr1 (400-751)||(9241067-9241422)
chr1 (404-752)||(14097950-14098302)
chr1 (400-746)||(28840623-28840973)
chr1 (400-758)||(18839532-18839894)
chr1 (400-758)||(17318838-17319193)
chr1 (400-746)||(13761782-13762130)
chr1 (400-729)||(47451593-47451919)
chr1 (400-752)||(25251255-25251611)
chr1 (404-744)||(2617465-2617808)
chr1 (400-758)||(16428598-16428960)
chr1 (400-746)||(20302404-20302752)
chr1 (400-753)||(50076652-50077008)
chr1 (400-744)||(3579606-3579954)
chr1 (400-752)||(50248551-50248908)
chr1 (400-746)||(28842438-28842788)
chr1 (400-746)||(51752310-51752657)
chr1 (430-758)||(31424990-31425325)
chr1 (400-753)||(50078800-50079157)
chr1 (400-753)||(6756472-6756829)
chr1 (400-751)||(17186109-17186464)
chr1 (400-751)||(31489860-31490211)
chr1 (359-678)||(48665074-48665404)
chr1 (438-752)||(25127855-25128173)
chr1 (400-746)||(16226112-16226461)
chr1 (400-746)||(20291402-20291750)
chr1 (400-746)||(47179654-47180006)
chr1 (425-746)||(4131362-4131692)
chr1 (400-742)||(31422851-31423210)
chr1 (145-343)||(48664852-48665050)
chr1 (400-737)||(17324010-17324349)
chr1 (400-746)||(47177303-47177655)
chr1 (400-746)||(40133880-40134239)
chr1 (145-337)||(4131690-4131882)
chr1 (153-335)||(45693834-45694016)
chr1 (400-742)||(14183581-14183922)
chr1 (144-328)||(6115534-6115719)
chr1 (379-734)||(42922157-42922514)
chr1 (446-758)||(16432396-16432702)
chr1 (556-758)||(16429061-16429264)
chr1 (400-651)||(6823829-6824091)
chr1 (522-752)||(25248532-25248766)
chr1 (400-737)||(49495206-49495535)
chr1 (400-720)||(8347284-8347605)
chr1 (144-333)||(6997213-6997395)
chr1 (400-734)||(18800570-18800905)
chr1 (400-751)||(15669374-15669727)
chr1 (595-751)||(23816029-23816185)
chr1 (556-758)||(6115077-6115280)
chr1 (145-260)||(46432521-46432636)
chr1 (183-343)||(6996067-6996221)
chr1 (399-751)||(8349033-8349386)
chr1 (565-734)||(23785953-23786121)
chr1 (152-298)||(16561138-16561284)
chr1 (522-746)||(16231630-16231856)
chr1 (556-746)||(51757635-51757824)
chr1 (279-639)||(26520207-26520580)
chr1 (405-734)||(13125455-13125787)
chr1 (657-746)||(13358778-13358867)
chr1 (225-311)||(11693580-11693666)
chr1 (400-494)||(25248756-25248850)
chr1 (155-311)||(13785662-13785835)
chr1 (400-732)||(30790401-30790730)
chr1 (624-734)||(15916562-15916674)
chr1 (155-274)||(32260746-32260882)
chr1 (400-495)||(16231546-16231641)
chr1 (455-734)||(27916500-27916780)
chr1 (228-311)||(14352759-14352842)
chr1 (537-751)||(26613221-26613440)
chr1 (556-734)||(30738625-30738808)
chr1 (534-734)||(16561545-16561751)
chr1 (287-346)||(6115479-6115538)
chr1 (572-746)||(28279385-28279563)
chr1 (182-311)||(10115509-10115653)
chr1 (212-265)||(13112046-13112099)
chr1 (705-746)||(13447260-13447301)
chr1 (537-709)||(155788-155963)
chr1 (155-222)||(11693686-11693753)
chr1 (641-734)||(13127685-13127780)
chr1 (677-731)||(9476265-9476319)
chr1 (405-558)||(13127811-13127959)
chr1 (556-737)||(21353342-21353521)
chr1 (681-731)||(47102884-47102934)
chr1 (679-731)||(13598402-13598454)
chr1 (620-690)||(43104329-43104400)
chr1 (677-731)||(16124555-16124609)
chr1 (677-731)||(19072932-19072986)
chr1 (677-731)||(19120822-19120876)
chr1 (400-470)||(26613503-26613576)
chr1 (677-731)||(26644936-26644990)
chr1 (677-731)||(47098863-47098917)
chr1 (677-731)||(47703975-47704029)
chr1 (400-437)||(43104104-43104141)
chr1 (687-731)||(834167-834211)
chr1 (431-471)||(6115344-6115384)
chr1 (666-733)||(9526582-9526650)
chr1 (687-731)||(13137976-13138020)
chr1 (687-731)||(28220226-28220270)
chr1 (687-731)||(28265554-28265598)
chr1 (667-731)||(37069774-37069838)
chr1 (687-731)||(50169210-50169254)
chr1 (677-728)||(3281715-3281766)
chr1 (145-184)||(6997388-6997427)
chr1 (192-223)||(16855265-16855296)
chr1 (677-728)||(29651818-29651869)
chr1 (677-731)||(21536608-21536662)
chr1 (689-731)||(45644354-45644396)
[»] chr7 (126 HSPs)
chr7 (145-752)||(21989853-21990460)
chr7 (145-759)||(37412097-37412716)
chr7 (145-746)||(20625734-20626342)
chr7 (145-746)||(20629625-20630233)
chr7 (145-746)||(20642044-20642652)
chr7 (144-746)||(7471965-7472575)
chr7 (145-746)||(38393683-38394290)
chr7 (144-746)||(7470007-7470622)
chr7 (144-746)||(20299154-20299764)
chr7 (145-745)||(3035415-3036027)
chr7 (214-752)||(13099453-13099996)
chr7 (144-746)||(28487248-28487857)
chr7 (145-746)||(18345237-18345845)
chr7 (145-751)||(42330977-42331593)
chr7 (145-744)||(28485261-28485867)
chr7 (144-746)||(31155896-31156501)
chr7 (144-746)||(1849664-1850285)
chr7 (145-746)||(7351637-7352246)
chr7 (145-672)||(11756925-11757460)
chr7 (144-746)||(7349262-7349868)
chr7 (153-753)||(24258166-24258779)
chr7 (249-746)||(20297163-20297666)
chr7 (400-752)||(44724534-44724889)
chr7 (359-752)||(443508-443906)
chr7 (225-746)||(43253502-43254035)
chr7 (400-758)||(20137082-20137443)
chr7 (400-758)||(4295907-4296270)
chr7 (400-758)||(27306205-27306563)
chr7 (404-746)||(48457608-48457957)
chr7 (400-746)||(44519-44868)
chr7 (424-758)||(21592116-21592453)
chr7 (400-751)||(11355213-11355567)
chr7 (400-746)||(35584-35933)
chr7 (400-758)||(31435019-31435381)
chr7 (400-752)||(9680769-9681130)
chr7 (400-746)||(40836728-40837076)
chr7 (144-494)||(7092414-7092769)
chr7 (400-744)||(1049283-1049629)
chr7 (144-494)||(7094662-7095016)
chr7 (400-751)||(24748549-24748904)
chr7 (400-758)||(21678021-21678380)
chr7 (400-752)||(39145965-39146321)
chr7 (400-758)||(21679982-21680346)
chr7 (410-746)||(3878540-3878881)
chr7 (400-744)||(25542486-25542830)
chr7 (400-758)||(42223111-42223474)
chr7 (438-744)||(1046912-1047220)
chr7 (400-744)||(9679009-9679361)
chr7 (444-746)||(40946327-40946632)
chr7 (144-428)||(38395985-38396269)
chr7 (145-447)||(1606171-1606472)
chr7 (145-345)||(47865328-47865528)
chr7 (144-415)||(21470614-21470884)
chr7 (515-746)||(7092198-7092431)
chr7 (400-751)||(25276096-25276439)
chr7 (400-737)||(27832631-27832968)
chr7 (400-666)||(22251611-22251876)
chr7 (515-746)||(7094445-7094678)
chr7 (145-467)||(3676997-3677301)
chr7 (401-721)||(24817362-24817682)
chr7 (400-691)||(22828672-22828967)
chr7 (400-632)||(26804528-26804762)
chr7 (144-293)||(443325-443474)
chr7 (400-734)||(7188498-7188833)
chr7 (400-556)||(18567568-18567724)
chr7 (400-695)||(20091583-20091875)
chr7 (523-746)||(38396713-38396938)
chr7 (474-752)||(24813477-24813755)
chr7 (596-751)||(22393876-22394032)
chr7 (565-734)||(2935392-2935560)
chr7 (400-734)||(24465503-24465829)
chr7 (565-746)||(22137202-22137381)
chr7 (565-746)||(40552229-40552408)
chr7 (565-746)||(22108191-22108370)
chr7 (150-311)||(40281824-40281987)
chr7 (565-746)||(40549951-40550130)
chr7 (565-734)||(1606504-1606671)
chr7 (565-734)||(9027191-9027358)
chr7 (582-737)||(26295587-26295743)
chr7 (400-734)||(6332181-6332514)
chr7 (400-589)||(22392428-22392608)
chr7 (155-311)||(10690684-10690845)
chr7 (679-746)||(11759364-11759431)
chr7 (455-751)||(11081522-11081819)
chr7 (155-208)||(20297108-20297161)
chr7 (445-506)||(38396316-38396377)
chr7 (572-666)||(6348912-6349006)
chr7 (697-758)||(26804765-26804826)
chr7 (556-734)||(16297018-16297200)
chr7 (225-311)||(12310442-12310528)
chr7 (162-228)||(12310542-12310608)
chr7 (153-199)||(43254023-43254069)
chr7 (677-731)||(46516349-46516403)
chr7 (666-746)||(6067183-6067264)
chr7 (711-752)||(22251564-22251605)
chr7 (578-719)||(6046629-6046772)
chr7 (677-731)||(9190047-9190101)
chr7 (677-731)||(20284093-20284147)
chr7 (677-731)||(29159807-29159861)
chr7 (380-457)||(30906327-30906405)
chr7 (687-731)||(14379861-14379905)
chr7 (666-737)||(25410246-25410318)
chr7 (666-737)||(34546874-34546946)
chr7 (405-530)||(6348778-6348903)
chr7 (677-731)||(2580394-2580448)
chr7 (677-731)||(21983288-21983342)
chr7 (678-731)||(4796707-4796760)
chr7 (666-737)||(2075231-2075303)
chr7 (666-737)||(7464513-7464585)
chr7 (687-731)||(14069833-14069877)
chr7 (687-731)||(27347941-27347985)
chr7 (687-731)||(41317434-41317478)
chr7 (677-728)||(55955-56005)
chr7 (192-223)||(6628853-6628884)
chr7 (225-272)||(12484976-12485023)
chr7 (225-272)||(12506407-12506454)
chr7 (192-223)||(12657667-12657698)
chr7 (677-731)||(2647735-2647789)
chr7 (677-731)||(9185204-9185258)
chr7 (192-222)||(12485044-12485074)
chr7 (192-222)||(12506475-12506505)
chr7 (556-737)||(25351360-25351539)
chr7 (677-731)||(28617264-28617318)
chr7 (677-731)||(33332489-33332543)
chr7 (677-731)||(35960820-35960874)
chr7 (666-707)||(44010775-44010816)
[»] chr5 (113 HSPs)
chr5 (150-758)||(18511185-18511797)
chr5 (145-746)||(25803707-25804318)
chr5 (150-758)||(18509291-18509902)
chr5 (145-752)||(26097421-26098031)
chr5 (144-746)||(27912218-27912830)
chr5 (144-746)||(18468697-18469303)
chr5 (144-746)||(27910134-27910744)
chr5 (153-745)||(18596334-18596939)
chr5 (145-746)||(15551925-15552539)
chr5 (225-746)||(18466453-18466978)
chr5 (165-746)||(10586549-10587126)
chr5 (144-603)||(26098379-26098842)
chr5 (400-753)||(2818313-2818670)
chr5 (278-752)||(40221340-40221823)
chr5 (400-752)||(21947972-21948326)
chr5 (404-739)||(10529091-10529429)
chr5 (400-752)||(25904048-25904403)
chr5 (400-746)||(25921458-25921807)
chr5 (400-740)||(17072828-17073172)
chr5 (404-752)||(39854433-39854783)
chr5 (400-746)||(2174864-2175212)
chr5 (400-746)||(4236574-4236922)
chr5 (402-752)||(10474302-10474655)
chr5 (400-751)||(24126801-24127155)
chr5 (400-746)||(38882050-38882399)
chr5 (400-752)||(1189586-1189948)
chr5 (401-758)||(16092172-16092537)
chr5 (400-746)||(16776102-16776451)
chr5 (400-753)||(31472590-31472947)
chr5 (438-746)||(6745052-6745362)
chr5 (400-758)||(6756439-6756798)
chr5 (400-758)||(12555896-12556257)
chr5 (406-746)||(17818477-17818817)
chr5 (400-737)||(37705774-37706114)
chr5 (400-746)||(31545025-31545374)
chr5 (438-746)||(34477038-34477350)
chr5 (404-746)||(6747253-6747598)
chr5 (400-753)||(36402306-36402662)
chr5 (400-746)||(31542680-31543028)
chr5 (438-746)||(34479403-34479715)
chr5 (438-746)||(21684437-21684747)
chr5 (400-751)||(695834-696177)
chr5 (400-734)||(31179368-31179705)
chr5 (477-758)||(658329-658610)
chr5 (400-746)||(39397978-39398326)
chr5 (145-427)||(3373348-3373630)
chr5 (407-758)||(2954368-2954722)
chr5 (406-751)||(21288715-21289060)
chr5 (400-758)||(31465962-31466312)
chr5 (400-666)||(34530731-34531000)
chr5 (522-746)||(41585729-41585956)
chr5 (533-751)||(20505823-20506042)
chr5 (361-734)||(6661181-6661555)
chr5 (145-328)||(21288529-21288713)
chr5 (517-752)||(2723964-2724193)
chr5 (400-614)||(20044955-20045172)
chr5 (400-610)||(20042995-20043208)
chr5 (534-746)||(39798126-39798341)
chr5 (522-746)||(4410090-4410316)
chr5 (400-741)||(36208525-36208865)
chr5 (152-297)||(17415748-17415893)
chr5 (565-738)||(10749814-10749986)
chr5 (400-746)||(9020167-9020514)
chr5 (565-738)||(10757291-10757462)
chr5 (565-746)||(15354560-15354739)
chr5 (565-746)||(23665158-23665337)
chr5 (565-746)||(23741844-23742023)
chr5 (565-746)||(23793250-23793429)
chr5 (565-746)||(15356836-15357015)
chr5 (400-537)||(20507659-20507796)
chr5 (566-746)||(3373122-3373301)
chr5 (565-746)||(38960117-38960296)
chr5 (442-751)||(20053834-20054136)
chr5 (145-249)||(6661929-6662033)
chr5 (641-752)||(26098267-26098379)
chr5 (359-494)||(41585946-41586082)
chr5 (225-442)||(15143262-15143475)
chr5 (561-734)||(15143574-15143750)
chr5 (144-224)||(40221281-40221361)
chr5 (404-495)||(4410006-4410101)
chr5 (455-720)||(17413176-17413441)
chr5 (668-751)||(20043206-20043289)
chr5 (145-199)||(15143220-15143274)
chr5 (155-228)||(5779144-5779217)
chr5 (582-667)||(42770940-42771025)
chr5 (144-199)||(18466410-18466465)
chr5 (400-620)||(42770719-42770934)
chr5 (623-734)||(15445263-15445375)
chr5 (561-745)||(4897837-4898023)
chr5 (647-735)||(23667513-23667601)
chr5 (666-737)||(42238376-42238448)
chr5 (677-731)||(9353371-9353425)
chr5 (677-731)||(28832263-28832317)
chr5 (677-731)||(36932389-36932443)
chr5 (400-449)||(2723912-2723961)
chr5 (682-731)||(14520234-14520283)
chr5 (682-731)||(17004004-17004053)
chr5 (647-694)||(2144599-2144647)
chr5 (687-731)||(19806487-19806531)
chr5 (666-737)||(22672950-22673022)
chr5 (666-737)||(25445612-25445684)
chr5 (225-298)||(32520241-32520316)
chr5 (687-731)||(32636948-32636992)
chr5 (192-226)||(2532750-2532784)
chr5 (677-731)||(10281755-10281809)
chr5 (677-731)||(11917011-11917065)
chr5 (677-731)||(15464536-15464590)
chr5 (677-731)||(19588750-19588804)
chr5 (681-731)||(24553549-24553599)
chr5 (666-707)||(10627482-10627523)
chr5 (687-728)||(13488327-13488368)
chr5 (666-734)||(17841246-17841315)
chr5 (686-731)||(31300644-31300689)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (145-753)||(11451-12061)
[»] chr2 (109 HSPs)
chr2 (145-758)||(42923482-42924094)
chr2 (145-746)||(23452222-23452829)
chr2 (145-746)||(42452449-42453050)
chr2 (144-746)||(35215571-35216185)
chr2 (145-746)||(35217948-35218565)
chr2 (400-746)||(19007561-19007910)
chr2 (400-752)||(22287315-22287670)
chr2 (400-752)||(6264127-6264479)
chr2 (400-746)||(19504331-19504679)
chr2 (400-752)||(40032032-40032392)
chr2 (399-746)||(19501996-19502346)
chr2 (400-752)||(21520672-21521029)
chr2 (400-758)||(28196558-28196917)
chr2 (404-746)||(45279969-45280315)
chr2 (400-746)||(13910030-13910378)
chr2 (400-746)||(27104720-27105067)
chr2 (400-752)||(6258796-6259149)
chr2 (400-746)||(42064436-42064785)
chr2 (400-758)||(43623553-43623902)
chr2 (400-753)||(11739537-11739894)
chr2 (400-758)||(17848366-17848722)
chr2 (400-752)||(17849038-17849393)
chr2 (400-752)||(14837194-14837544)
chr2 (400-746)||(24162208-24162546)
chr2 (407-746)||(34979562-34979906)
chr2 (402-752)||(3022086-3022448)
chr2 (400-708)||(45239000-45239315)
chr2 (400-735)||(31732772-31733099)
chr2 (400-752)||(44289046-44289402)
chr2 (400-734)||(11578104-11578438)
chr2 (400-761)||(18800283-18800636)
chr2 (400-653)||(15539553-15539809)
chr2 (529-758)||(5375319-5375550)
chr2 (400-751)||(22874063-22874406)
chr2 (144-429)||(27583631-27583908)
chr2 (589-752)||(22407433-22407596)
chr2 (489-751)||(28459170-28459435)
chr2 (400-552)||(22407591-22407743)
chr2 (400-734)||(20146604-20146941)
chr2 (565-746)||(36558849-36559029)
chr2 (565-746)||(36561126-36561306)
chr2 (155-311)||(28568584-28568740)
chr2 (400-556)||(22163125-22163281)
chr2 (400-734)||(17897242-17897576)
chr2 (565-746)||(45332166-45332346)
chr2 (642-758)||(22162995-22163111)
chr2 (612-752)||(22707730-22707872)
chr2 (437-632)||(38020160-38020348)
chr2 (145-274)||(27136368-27136505)
chr2 (602-728)||(7462950-7463077)
chr2 (404-534)||(5377629-5377763)
chr2 (379-734)||(37962938-37963283)
chr2 (611-752)||(23870951-23871092)
chr2 (152-240)||(34575608-34575696)
chr2 (155-311)||(15693583-15693755)
chr2 (535-734)||(40699429-40699634)
chr2 (19-134)||(20144403-20144518)
chr2 (19-134)||(20358915-20359030)
chr2 (400-751)||(35107221-35107571)
chr2 (19-134)||(20169256-20169371)
chr2 (400-493)||(38020064-38020157)
chr2 (155-303)||(41303457-41303623)
chr2 (155-220)||(28568346-28568411)
chr2 (561-680)||(20589775-20589896)
chr2 (489-661)||(27136195-27136368)
chr2 (225-296)||(39286971-39287042)
chr2 (400-460)||(12342684-12342744)
chr2 (226-311)||(7502638-7502723)
chr2 (250-346)||(34575528-34575617)
chr2 (568-734)||(13828338-13828507)
chr2 (707-752)||(15539508-15539553)
chr2 (522-618)||(38414194-38414291)
chr2 (159-223)||(39286892-39286952)
chr2 (225-304)||(41304806-41304884)
chr2 (677-731)||(14699046-14699100)
chr2 (429-494)||(38414281-38414340)
chr2 (687-731)||(17057369-17057413)
chr2 (687-731)||(17085352-17085396)
chr2 (666-737)||(38191128-38191200)
chr2 (158-209)||(7502582-7502633)
chr2 (687-730)||(17490149-17490192)
chr2 (400-447)||(40699231-40699278)
chr2 (677-731)||(8390189-8390243)
chr2 (677-731)||(13569332-13569386)
chr2 (677-731)||(20522224-20522278)
chr2 (155-228)||(41304898-41304964)
chr2 (684-737)||(1345587-1345640)
chr2 (684-737)||(2838076-2838129)
chr2 (647-744)||(10942497-10942597)
chr2 (647-744)||(10948366-10948466)
chr2 (687-731)||(723744-723788)
chr2 (666-737)||(27517633-27517705)
chr2 (687-731)||(33162450-33162494)
chr2 (687-731)||(34139770-34139814)
chr2 (687-731)||(36318009-36318053)
chr2 (687-731)||(39284960-39285004)
chr2 (666-733)||(39680160-39680228)
chr2 (666-733)||(39687098-39687166)
chr2 (688-731)||(11151591-11151634)
chr2 (677-731)||(2869732-2869786)
chr2 (677-731)||(8040064-8040118)
chr2 (677-731)||(10445483-10445537)
chr2 (400-442)||(20147040-20147082)
chr2 (677-731)||(28259216-28259270)
chr2 (676-737)||(30479120-30479182)
chr2 (677-731)||(31056048-31056102)
chr2 (677-731)||(34682373-34682427)
chr2 (455-611)||(43139356-43139509)
chr2 (666-707)||(12781246-12781287)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (145-753)||(78883-79495)
[»] scaffold0005 (5 HSPs)
scaffold0005 (144-737)||(51708-52307)
scaffold0005 (404-746)||(183626-183969)
scaffold0005 (137-216)||(50151-50230)
scaffold0005 (666-737)||(50235-50308)
scaffold0005 (225-267)||(170076-170118)
[»] chr4 (148 HSPs)
chr4 (144-737)||(14787423-14788022)
chr4 (145-727)||(56030189-56030770)
chr4 (145-746)||(24347959-24348566)
chr4 (145-753)||(17662223-17662826)
chr4 (145-746)||(44599823-44600428)
chr4 (144-734)||(22132389-22132988)
chr4 (145-734)||(22134615-22135219)
chr4 (144-537)||(5100742-5101133)
chr4 (400-753)||(38928155-38928512)
chr4 (400-744)||(48486318-48486665)
chr4 (404-753)||(40637077-40637429)
chr4 (400-753)||(24888795-24889151)
chr4 (400-753)||(22802712-22803068)
chr4 (400-746)||(5198419-5198768)
chr4 (404-746)||(14633323-14633666)
chr4 (400-758)||(33415461-33415821)
chr4 (400-758)||(40091388-40091749)
chr4 (400-753)||(22800840-22801196)
chr4 (400-752)||(24878988-24879344)
chr4 (400-752)||(24880450-24880806)
chr4 (400-746)||(47274726-47275073)
chr4 (400-751)||(19095881-19096236)
chr4 (400-746)||(11434954-11435302)
chr4 (400-746)||(37089357-37089708)
chr4 (252-751)||(19322547-19323048)
chr4 (404-746)||(8631404-8631753)
chr4 (400-752)||(12400786-12401141)
chr4 (400-746)||(22044376-22044724)
chr4 (400-746)||(22046671-22047019)
chr4 (400-758)||(36921466-36921829)
chr4 (400-746)||(9148250-9148600)
chr4 (400-752)||(12395824-12396179)
chr4 (400-752)||(36919563-36919921)
chr4 (400-758)||(16453308-16453670)
chr4 (400-758)||(36378291-36378653)
chr4 (400-751)||(619428-619781)
chr4 (404-746)||(6764842-6765192)
chr4 (400-746)||(51015245-51015593)
chr4 (404-744)||(47868404-47868747)
chr4 (400-746)||(7941318-7941671)
chr4 (161-751)||(30136331-30136903)
chr4 (400-746)||(18847152-18847500)
chr4 (400-746)||(38409198-38409552)
chr4 (404-746)||(2484858-2485203)
chr4 (273-746)||(53404998-53405481)
chr4 (359-746)||(18709149-18709547)
chr4 (400-746)||(11006222-11006575)
chr4 (400-746)||(9174131-9174480)
chr4 (400-746)||(31849584-31849933)
chr4 (400-746)||(37313050-37313400)
chr4 (401-744)||(9176461-9176807)
chr4 (438-746)||(11008553-11008862)
chr4 (400-746)||(16934128-16934477)
chr4 (474-746)||(26085962-26086236)
chr4 (400-746)||(16931774-16932123)
chr4 (438-746)||(22780358-22780669)
chr4 (438-746)||(22782723-22783034)
chr4 (403-734)||(41997494-41997828)
chr4 (400-711)||(13543953-13544272)
chr4 (400-672)||(5637524-5637803)
chr4 (359-727)||(47210756-47211122)
chr4 (400-672)||(3824629-3824907)
chr4 (477-758)||(36380425-36380710)
chr4 (400-734)||(18409344-18409680)
chr4 (514-737)||(16455354-16455581)
chr4 (400-734)||(18537470-18537805)
chr4 (484-752)||(27499128-27499396)
chr4 (400-751)||(8756231-8756584)
chr4 (400-626)||(3937314-3937542)
chr4 (400-734)||(18534828-18535163)
chr4 (556-752)||(13547312-13547508)
chr4 (575-746)||(4215483-4215654)
chr4 (145-295)||(47211158-47211308)
chr4 (145-725)||(10112626-10113198)
chr4 (595-746)||(5635461-5635612)
chr4 (404-653)||(52942537-52942777)
chr4 (595-746)||(11437560-11437710)
chr4 (556-752)||(2891449-2891646)
chr4 (400-616)||(6132872-6133090)
chr4 (481-734)||(38890221-38890476)
chr4 (400-556)||(38270164-38270320)
chr4 (145-311)||(9022060-9022225)
chr4 (400-721)||(15032557-15032870)
chr4 (400-556)||(24446762-24446913)
chr4 (599-746)||(5101130-5101276)
chr4 (145-346)||(38890517-38890701)
chr4 (400-518)||(2891315-2891434)
chr4 (646-752)||(47563009-47563115)
chr4 (400-734)||(28453686-28454020)
chr4 (153-299)||(9863507-9863650)
chr4 (536-734)||(12102221-12102425)
chr4 (150-246)||(19322413-19322510)
chr4 (623-738)||(49088794-49088911)
chr4 (395-734)||(9863702-9864049)
chr4 (561-734)||(16185831-16186006)
chr4 (634-758)||(24446627-24446738)
chr4 (137-216)||(14789500-14789579)
chr4 (616-753)||(25357859-25357998)
chr4 (155-311)||(38209098-38209259)
chr4 (400-690)||(40998990-40999281)
chr4 (666-737)||(14789422-14789495)
chr4 (225-311)||(54929094-54929180)
chr4 (666-758)||(6133105-6133197)
chr4 (536-694)||(31983564-31983727)
chr4 (556-720)||(3982186-3982354)
chr4 (225-304)||(10979676-10979755)
chr4 (161-223)||(5516771-5516833)
chr4 (537-751)||(47150873-47151092)
chr4 (692-762)||(52942457-52942527)
chr4 (697-751)||(3937254-3937308)
chr4 (666-746)||(5336765-5336846)
chr4 (159-228)||(29609914-29609983)
chr4 (400-471)||(16186099-16186171)
chr4 (677-731)||(10047383-10047437)
chr4 (677-731)||(39245998-39246052)
chr4 (677-730)||(6743454-6743507)
chr4 (647-734)||(26557833-26557922)
chr4 (228-285)||(29609840-29609897)
chr4 (19-124)||(35162225-35162330)
chr4 (666-737)||(4884990-4885062)
chr4 (666-737)||(8529383-8529455)
chr4 (19-139)||(15555798-15555918)
chr4 (679-731)||(54867188-54867239)
chr4 (155-226)||(54929198-54929267)
chr4 (711-746)||(3824595-3824630)
chr4 (677-731)||(5269230-5269284)
chr4 (225-267)||(14647172-14647214)
chr4 (400-470)||(16455286-16455356)
chr4 (400-471)||(12102089-12102162)
chr4 (666-734)||(31300540-31300608)
chr4 (677-730)||(36315268-36315321)
chr4 (677-730)||(36329477-36329530)
chr4 (666-737)||(4556054-4556126)
chr4 (687-731)||(12739550-12739594)
chr4 (666-737)||(18587082-18587154)
chr4 (687-731)||(26175636-26175680)
chr4 (687-731)||(36463389-36463433)
chr4 (666-737)||(36769595-36769667)
chr4 (583-623)||(38270118-38270158)
chr4 (687-731)||(48893638-48893682)
chr4 (687-731)||(52467354-52467398)
chr4 (400-447)||(25357636-25357683)
chr4 (677-731)||(5143263-5143317)
chr4 (677-731)||(5396710-5396764)
chr4 (677-731)||(31985673-31985726)
chr4 (677-731)||(38152478-38152532)
chr4 (647-734)||(3578668-3578756)
chr4 (666-707)||(15831257-15831298)
[»] chr8 (92 HSPs)
chr8 (150-752)||(41382424-41383018)
chr8 (144-752)||(41384492-41385100)
chr8 (145-746)||(15808962-15809568)
chr8 (145-746)||(28283206-28283813)
chr8 (145-746)||(3873750-3874360)
chr8 (145-739)||(608470-609077)
chr8 (145-746)||(43529871-43530465)
chr8 (359-746)||(32339264-32339659)
chr8 (400-758)||(1225167-1225529)
chr8 (400-758)||(30480476-30480837)
chr8 (400-758)||(15072711-15073073)
chr8 (400-758)||(14807752-14808123)
chr8 (400-758)||(14419163-14419525)
chr8 (400-744)||(27106884-27107231)
chr8 (400-746)||(27829298-27829646)
chr8 (400-745)||(15067982-15068330)
chr8 (400-753)||(28251545-28251901)
chr8 (400-746)||(4424019-4424368)
chr8 (400-746)||(27826987-27827335)
chr8 (400-742)||(27911016-27911359)
chr8 (400-742)||(27957435-27957778)
chr8 (400-738)||(13858477-13858818)
chr8 (400-746)||(18810709-18811057)
chr8 (438-746)||(22684638-22684952)
chr8 (400-751)||(25952522-25952876)
chr8 (400-751)||(36865538-36865892)
chr8 (400-746)||(44720844-44721193)
chr8 (359-734)||(24873178-24873563)
chr8 (400-751)||(5372156-5372511)
chr8 (400-752)||(33541389-33541722)
chr8 (438-746)||(43079642-43079952)
chr8 (438-746)||(43082012-43082323)
chr8 (400-746)||(18812894-18813231)
chr8 (400-751)||(15185694-15186044)
chr8 (400-631)||(14477277-14477511)
chr8 (400-734)||(21482323-21482649)
chr8 (489-758)||(15956051-15956320)
chr8 (145-303)||(32339094-32339252)
chr8 (427-725)||(21480542-21480832)
chr8 (400-734)||(31162214-31162551)
chr8 (400-592)||(5622877-5623072)
chr8 (400-556)||(26775202-26775358)
chr8 (144-262)||(3265635-3265753)
chr8 (430-737)||(3005624-3005931)
chr8 (400-556)||(35872561-35872712)
chr8 (296-494)||(181434-181632)
chr8 (430-614)||(37214317-37214514)
chr8 (400-510)||(12517248-12517360)
chr8 (400-499)||(3886153-3886252)
chr8 (537-734)||(31578273-31578476)
chr8 (602-734)||(2468126-2468259)
chr8 (534-734)||(31035252-31035459)
chr8 (522-695)||(181622-181798)
chr8 (634-758)||(35872426-35872537)
chr8 (676-744)||(37214251-37214319)
chr8 (665-758)||(14477519-14477613)
chr8 (19-124)||(9692952-9693057)
chr8 (400-556)||(31035068-31035223)
chr8 (455-663)||(31573794-31574000)
chr8 (155-226)||(13986304-13986374)
chr8 (400-471)||(2468361-2468432)
chr8 (225-311)||(11701364-11701447)
chr8 (155-226)||(30679186-30679256)
chr8 (677-731)||(19752433-19752487)
chr8 (557-734)||(6376149-6376328)
chr8 (687-731)||(12702634-12702678)
chr8 (715-758)||(181798-181841)
chr8 (228-299)||(13986214-13986285)
chr8 (677-731)||(4696635-4696689)
chr8 (677-731)||(9765858-9765912)
chr8 (687-737)||(10930193-10930243)
chr8 (556-724)||(17847685-17847848)
chr8 (677-731)||(26403269-26403323)
chr8 (636-732)||(16833789-16833886)
chr8 (666-733)||(4812486-4812554)
chr8 (641-692)||(14419734-14419786)
chr8 (687-731)||(15212910-15212954)
chr8 (666-737)||(17799418-17799490)
chr8 (666-737)||(23179555-23179627)
chr8 (687-731)||(27811402-27811446)
chr8 (666-733)||(28328023-28328091)
chr8 (687-731)||(33352274-33352318)
chr8 (687-731)||(40321204-40321248)
chr8 (687-730)||(4733830-4733873)
chr8 (400-435)||(6375990-6376025)
chr8 (623-695)||(3896048-3896122)
chr8 (677-731)||(5702522-5702576)
chr8 (677-731)||(7412345-7412399)
chr8 (677-731)||(23799616-23799670)
chr8 (677-731)||(31071268-31071322)
chr8 (197-226)||(27820149-27820178)
chr8 (687-728)||(40221869-40221910)
[»] chr6 (92 HSPs)
chr6 (145-746)||(2628871-2629479)
chr6 (145-746)||(19704552-19705165)
chr6 (145-746)||(30966923-30967530)
chr6 (145-744)||(30034590-30035196)
chr6 (145-746)||(12195500-12196104)
chr6 (145-746)||(26932546-26933158)
chr6 (400-753)||(11983007-11983363)
chr6 (400-752)||(9019906-9020261)
chr6 (404-746)||(28241306-28241651)
chr6 (400-751)||(13057174-13057529)
chr6 (400-758)||(3629838-3630198)
chr6 (400-742)||(3390359-3390705)
chr6 (404-746)||(1230234-1230579)
chr6 (400-751)||(15541120-15541474)
chr6 (400-746)||(14507161-14507509)
chr6 (406-746)||(14458752-14459093)
chr6 (400-751)||(13039734-13040089)
chr6 (400-752)||(3233704-3234064)
chr6 (400-751)||(25477254-25477616)
chr6 (150-664)||(17011784-17012287)
chr6 (153-528)||(17852275-17852650)
chr6 (401-744)||(3631926-3632271)
chr6 (438-746)||(4816216-4816527)
chr6 (400-739)||(15532674-15533015)
chr6 (400-744)||(30728811-30729162)
chr6 (400-752)||(32279977-32280332)
chr6 (400-736)||(20915351-20915692)
chr6 (400-688)||(15530166-15530456)
chr6 (438-746)||(26065004-26065310)
chr6 (438-746)||(26084973-26085279)
chr6 (400-758)||(24338421-24338782)
chr6 (145-346)||(5275727-5275928)
chr6 (145-422)||(18317751-18318028)
chr6 (400-752)||(12161537-12161888)
chr6 (145-734)||(22857949-22858536)
chr6 (400-666)||(22490619-22490889)
chr6 (400-621)||(19227518-19227742)
chr6 (400-734)||(3027848-3028184)
chr6 (400-751)||(14466313-14466658)
chr6 (519-734)||(5273213-5273431)
chr6 (540-758)||(1069691-1069913)
chr6 (565-746)||(26066109-26066289)
chr6 (431-734)||(15719665-15719961)
chr6 (565-746)||(26068380-26068560)
chr6 (400-547)||(32447502-32447650)
chr6 (565-746)||(29754694-29754874)
chr6 (565-746)||(33309006-33309185)
chr6 (400-544)||(1072067-1072211)
chr6 (150-311)||(20526551-20526708)
chr6 (401-734)||(16455421-16455757)
chr6 (565-746)||(33311275-33311454)
chr6 (536-751)||(12186051-12186271)
chr6 (486-751)||(15367101-15367365)
chr6 (400-519)||(8995459-8995578)
chr6 (406-547)||(13870609-13870749)
chr6 (595-734)||(15346525-15346664)
chr6 (649-752)||(10584227-10584331)
chr6 (400-734)||(19696421-19696759)
chr6 (535-734)||(26945258-26945463)
chr6 (167-311)||(30445243-30445404)
chr6 (400-511)||(10584106-10584212)
chr6 (400-556)||(15346371-15346515)
chr6 (155-228)||(30443022-30443097)
chr6 (647-751)||(12911426-12911531)
chr6 (612-751)||(25465571-25465710)
chr6 (537-753)||(25078536-25078755)
chr6 (647-751)||(12937174-12937278)
chr6 (666-737)||(17694846-17694918)
chr6 (225-311)||(30443111-30443195)
chr6 (666-744)||(30443537-30443616)
chr6 (595-723)||(30445701-30445832)
chr6 (677-731)||(5572280-5572334)
chr6 (666-737)||(22342795-22342867)
chr6 (666-737)||(25941785-25941857)
chr6 (677-731)||(5017508-5017562)
chr6 (677-731)||(5757517-5757571)
chr6 (677-731)||(10077204-10077258)
chr6 (677-731)||(31979517-31979571)
chr6 (400-471)||(12186330-12186403)
chr6 (676-725)||(24436009-24436058)
chr6 (687-731)||(603088-603132)
chr6 (666-737)||(3577484-3577555)
chr6 (666-737)||(12166140-12166212)
chr6 (687-731)||(33211185-33211229)
chr6 (666-733)||(35201325-35201393)
chr6 (159-202)||(12158532-12158575)
chr6 (658-734)||(11262699-11262777)
chr6 (677-731)||(21356040-21356094)
chr6 (677-731)||(31936591-31936645)
chr6 (666-750)||(13883590-13883674)
chr6 (474-530)||(17904566-17904619)
chr6 (666-734)||(25465896-25465965)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (145-695)||(1735-2293)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (404-746)||(41468-41813)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (400-746)||(3951-4298)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (400-746)||(69277-69629)
scaffold0025 (400-547)||(73210-73361)
scaffold0025 (511-556)||(73165-73210)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (400-752)||(79813-80168)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (438-737)||(14376-14678)
scaffold0131 (400-753)||(14973-15327)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (400-746)||(6153-6502)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (400-746)||(2834-3182)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (438-746)||(29163-29473)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (438-746)||(33-344)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (400-758)||(85185-85546)
[»] scaffold0468 (2 HSPs)
scaffold0468 (288-734)||(1638-2080)
scaffold0468 (150-260)||(2070-2180)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (513-746)||(1438-1673)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (379-734)||(15817-16174)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (400-621)||(35594-35817)
scaffold0011 (666-758)||(35817-35909)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (399-734)||(16646-16982)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (565-746)||(22239-22418)
scaffold0140 (565-746)||(24514-24693)
scaffold0140 (677-731)||(8458-8512)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (359-725)||(4727-5095)
scaffold0133 (151-293)||(4552-4694)
[»] scaffold1674 (2 HSPs)
scaffold1674 (144-239)||(1-96)
scaffold1674 (693-743)||(1439-1489)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (404-547)||(1013-1161)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (677-744)||(4666-4733)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (228-298)||(57836-57905)
scaffold0008 (623-707)||(57452-57537)
scaffold0008 (155-226)||(57926-57995)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (679-731)||(5687-5739)
scaffold0006 (677-731)||(2496-2550)
[»] scaffold0533 (1 HSPs)
scaffold0533 (182-223)||(2232-2273)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (682-731)||(36876-36925)
scaffold0087 (677-731)||(44000-44054)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (666-737)||(16980-17052)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (687-731)||(20415-20459)
[»] scaffold0474 (1 HSPs)
scaffold0474 (155-205)||(10443-10493)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 582; Significance: 0; HSPs: 161)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 582; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 759
Target Start/End: Original strand, 51942916 - 51943657
Alignment:
Q  19 gaaaaagagacaaatggccttattaaagaacttattcctccaggataagttgatagcttaactagcctcatctttgctaatgcgttgtactttagaggag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51942916 gaaaaagagacaaatggccttattaaagaacttattcctccaggatcagttgatagcttaactagcctcatctttgctaatgcgttgtactttagaggag 51943015  T
Q  119 catggaatgagaagtttgatgtttcatgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51943016 catggaatgagaagtttgatgtttcgtgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatat 51943115  T
Q  219 attttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51943116 attttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttt 51943215  T
Q  319 tgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatataga 417  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||            ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51943216 tgatgtaaatattctttcattgaaggagaaagaaaaac--gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgatttatacttttactataaatataga 51943313  T
Q  418 ccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaac 517  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51943314 ccttgaatcagagtaaacctggagatagagggtgctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaac 51943413  T
Q  518 aaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgg 614  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51943414 aaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggcgg 51943513  T
Q  615 gagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttgga 714  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  51943514 gagac-ttttcttgtaactcattgacgtctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccatactaggtcaatttgga 51943612  T
Q  715 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttctt 759  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  51943613 ccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctcttctcttctt 51943657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 758
Target Start/End: Original strand, 1313082 - 1313695
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1313082 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaatgatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatgg 1313181  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1313182 acaataaatatatttctgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 1313281  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 443  Q
    ||            ||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1313282 agaaaaaaaaa---gtatctttagtgtgatattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagat 1313378  T
Q  444 agagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 543  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1313379 agagggggctgaaacaa-ggtttacaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattc 1313477  T
Q  544 acctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 640  Q
    |||| ||||||||   ||| |||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||     
T  1313478 accttgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgat 1313577  T
Q  641 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 740  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1313578 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 1313677  T
Q  741 tgttctatcttctcttct 758  Q
    |||||| |||||| ||||    
T  1313678 tgttctctcttcttttct 1313695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 53918250 - 53917635
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  53918250 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaacatatatttatgg 53918151  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  53918150 acaataaatatatttttttaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaagg 53918051  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 443  Q
    ||            ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  53918050 agaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtggtattcgtttcaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagattaaaccttgagat 53917953  T
Q  444 agagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 543  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917952 ggagggggctgaaacaatggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattc 53917853  T
Q  544 acctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 640  Q
    |||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||     
T  53917852 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 53917753  T
Q  641 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 740  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917752 atctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 53917653  T
Q  741 tgttctatcttctcttct 758  Q
    |||||| |||||| ||||    
T  53917652 tgttctctcttcttttct 53917635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 144 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 53916083 - 53915467
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53916083 atgttgtagtatgactcaaaatttgagggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 53915984  T
Q  244 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53915983 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 53915884  T
Q  344 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagaga 442  Q
    |||            ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  53915883 gagaaaaaaaaac--gtatcttgagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaaga 53915786  T
Q  443 tagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatt 542  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53915785 tagagggggctgaaacaagggtttaggatgacaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatt 53915686  T
Q  543 cacctcgggaaacattaa---gattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattga 639  Q
     |||| | |||||||||    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  53915685 taccttgtgaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 53915586  T
Q  640 catctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 739  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  53915585 tatctcttttgtaatgttactcatcatttagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttgactgaactgggtcaacaaattctttt 53915486  T
Q  740 gtgttctatcttctcttct 758  Q
    ||||||| |||||| ||||    
T  53915485 gtgttctctcttcttttct 53915467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 746
Target Start/End: Original strand, 25533107 - 25533716
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25533107 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttttgctgaaaatatatttatgg 25533206  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25533207 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 25533306  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct------ 437  Q
    ||            |||||||||||||  |||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |          
T  25533307 agaaaaaaac----gtatcttcagtgtgatatttgttctaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagag 25533402  T
Q  438 --agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagg 535  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25533403 agagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagg 25533502  T
Q  536 gttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaac 632  Q
    |||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25533503 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 25533602  T
Q  633 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 732  Q
     ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25533603 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaa 25533702  T
Q  733 ttcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||    
T  25533703 ttcttttgtgttct 25533716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 141 - 746
Target Start/End: Original strand, 746418 - 747031
Alignment:
Q  141 ttcatgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatattt 240  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746418 ttcatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatattt 746517  T
Q  241 atggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactg 340  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  746518 atggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactg 746617  T
Q  341 aaggagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct-- 437  Q
    ||||||            ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |      
T  746618 aaggagaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttg 746715  T
Q  438 ----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttga 533  Q
        ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  746716 agagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgt 746815  T
Q  534 gggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgt 629  Q
    |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  746816 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 746915  T
Q  630 aactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 729  Q
    ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  746916 aacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaac 747014  T
Q  730 aaattcttttgtgttct 746  Q
    |||||  ||||||||||    
T  747015 aaatttctttgtgttct 747031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 144 - 746
Target Start/End: Original strand, 457949 - 458558
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  457949 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggggaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttgtg 458048  T
Q  244 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 343  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  458049 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 458148  T
Q  344 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----a 438  Q
    |||           | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    |    
T  458149 gagaaaaaaaaaacg-tatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgaga 458247  T
Q  439 gagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 538  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  458248 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 458347  T
Q  539 gattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 634  Q
    ||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  458348 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 458447  T
Q  635 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    |||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  458448 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaaata 458546  T
Q  735 cttttgtgttct 746  Q
      ||||||||||    
T  458547 tctttgtgttct 458558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 746
Target Start/End: Original strand, 455573 - 456181
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  455573 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggggaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttgtgg 455672  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  455673 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 455772  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----ag 439  Q
    ||           | |||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    ||    
T  455773 agaaaaaaaaaacg-tatcttcagtgcggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagag 455871  T
Q  440 agatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 539  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  455872 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttg 455971  T
Q  540 attcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactca 635  Q
    |||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  455972 attcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 456071  T
Q  636 ttgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 735  Q
    ||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||      
T  456072 ttgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcgggttggaccgaactgggtcaacaaatat 456170  T
Q  736 ttttgtgttct 746  Q
     ||||||||||    
T  456171 ctttgtgttct 456181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 4104483 - 4103879
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  4104483 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatactttatgctgaaaatatatttatgg 4104384  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4104383 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaagg 4104284  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----ag 439  Q
    ||           | ||||   ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |    ||    
T  4104283 agaaaaaaaaaacg-tatc---agtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagag 4104188  T
Q  440 agatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 539  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4104187 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 4104088  T
Q  540 attcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcat 636  Q
    |||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  4104087 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 4103988  T
Q  637 tgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 736  Q
    |||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4103987 tgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctatctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 4103889  T
Q  737 tttgtgttct 746  Q
    ||||||||||    
T  4103888 tttgtgttct 4103879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 143 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 10622129 - 10621513
Alignment:
Q  143 catgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttat 242  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10622129 catgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaagatatatttat 10622030  T
Q  243 ggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaa 342  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10622029 ggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaa 10621930  T
Q  343 ggagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct---- 437  Q
    ||||            ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |        
T  10621929 ggagaaaaaaaac---gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgag 10621833  T
Q  438 --------agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 529  Q
            |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  10621832 agagagagagagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggt 10621733  T
Q  530 ttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttc 625  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10621732 ttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 10621633  T
Q  626 ttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggt 725  Q
    ||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  10621632 ttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactagctcagattggaccgaactgggt 10621534  T
Q  726 caacaaattcttttgtgttct 746  Q
    |||||||||  ||||||||||    
T  10621533 caacaaatttctttgtgttct 10621513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 144 - 762
Target Start/End: Original strand, 42991952 - 42992560
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42991952 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgttaaaaatataaaaggtttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 42992051  T
Q  244 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 343  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42992052 gacaataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 42992151  T
Q  344 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----a 438  Q
    |||            |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||   ||||| |    |    
T  42992152 gagaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtaatattaattccaaatttatgagttatacttttactataaatatataccttgtatcatgctaaactttaaga 42992249  T
Q  439 gagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 538  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  42992250 gagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggtt 42992349  T
Q  539 gattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactca 635  Q
    ||||||||| | |||||   |||| |||||||||| ||||||| | ||||||| | || ||||||||||               || |||||||||||||    
T  42992350 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagagt-ggactttgggtag---------------ttattcttgtaactca 42992433  T
Q  636 ttgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 735  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42992434 ttgatttctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaatcggggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattt 42992533  T
Q  736 ttttgtgttctatcttctcttcttctc 762  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||    
T  42992534 ttttgtgttctctctccttttcttctc 42992560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 404 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 4308609 - 4308257
Alignment:
Q  404 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 503  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308609 actataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 4308510  T
Q  504 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  4308509 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgg 4308410  T
Q  601 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 700  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4308409 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagac 4308310  T
Q  701 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 753  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4308309 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 4308257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 400 - 759
Target Start/End: Original strand, 45882864 - 45883227
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45882864 ttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactatgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 45882963  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||    
T  45882964 attttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggact 45883063  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct-cccc 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  45883064 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccc 45883163  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttctt 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45883164 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctcttctt 45883227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 43423795 - 43423434
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43423795 ttttactataaatatagacattgtatcactgtaaaccttgagaaagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 43423696  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  43423695 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggct 43423596  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||      
T  43423595 ttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaactgagagctgctctctccctg 43423496  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  43423495 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 43423434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 145 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 27636212 - 27635830
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27636212 tgttgtagtatgatttaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaatattagtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 27636113  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27636112 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 27636013  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata--ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagaga 442  Q
    ||            ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27636012 agaaaaaaat----gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatattttttactacaaatatagaccttgaattagagtaaaccttgaga 27635917  T
Q  443 tagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 529  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27635916 tagagggggctgaaacaagggtttagaatgcaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggt 27635830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 18099502 - 18099153
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct-agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 498  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18099502 ttttactataa-tatagaccttgtatcagagtaaacttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtata 18099404  T
Q  499 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |    
T  18099403 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 18099304  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18099303 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccc 18099204  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099203 tagactaggtcaatatggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 18099153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 10956359 - 10956010
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956359 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacatgaagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 10956260  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaa---gattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    |||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||    
T  10956259 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 10956160  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |     
T  10956159 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccacc 10956060  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956059 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 10956010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 1627015 - 1626660
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1627015 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 1626916  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||   ||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||    
T  1626915 agtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggggagagattgggact 1626816  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  1626815 ttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcgccc 1626716  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1626715 agactaggtcgatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 1626660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 438 - 753
Target Start/End: Original strand, 30005804 - 30006122
Alignment:
Q  438 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 537  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30005804 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 30005903  T
Q  538 tgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 634  Q
    |||||||||| ||||||||   ||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30005904 tgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc 30006003  T
Q  635 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30006004 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagattagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 30006103  T
Q  735 cttttgtgttctatcttct 753  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  30006104 cttttgtgttctctcttct 30006122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 400 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 48362002 - 48361641
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  48362002 ttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatacagggggctgaaacaa-ggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatag 48361904  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||   ||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  48361903 agtttgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattggggct 48361804  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  48361803 tttggtagaattaggcggaagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcataatatagtaaaacggagagctgctctctccccc 48361704  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttctt 759  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48361703 agactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctcttctt 48361641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 43421747 - 43421386
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43421747 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 43421648  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
     ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |    
T  43421647 tgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaaaagattggggat 43421548  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||     
T  43421547 ttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatggctgctctctccccc 43421448  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  43421447 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 43421386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Original strand, 3314609 - 3314965
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3314609 ttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatag 3314708  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  3314709 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggct 3314808  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3314809 ttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccc 3314908  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3314909 caaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 3314965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 400 - 747
Target Start/End: Original strand, 11170329 - 11170679
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11170329 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 11170428  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||   ||| |||||||| | ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  11170429 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggact 11170528  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  11170529 ttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccc 11170628  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcta 747  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11170629 agactaggtcaatttgggccgaactgggtcaacaaattcttttgttttcta 11170679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 10958655 - 10958306
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10958655 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacataaagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 10958556  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||| | ||||||  ||   ||    
T  10958555 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgacact 10958456  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  10958455 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcttcatatagtggaacggagggctgctctctccccc 10958356  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10958355 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttatgttct 10958306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 400 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 18097233 - 18096876
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct-agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 498  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18097233 ttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaacttgagagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtata 18097134  T
Q  499 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |    
T  18097133 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 18097034  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18097033 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttcccttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctctctcccc 18096934  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 753  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18096933 tagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacgaattcttttgtgttctctcttct 18096876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 28102334 - 28101979
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||  | ||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28102334 ttttactataaatataagcgttgtattagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 28102235  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  28102234 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggct 28102135  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||     
T  28102134 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttacttatcatatagtggaacggatggctgctctctcccca 28102035  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    |  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28102034 aagctaggtcaatttggaccaaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 28101979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 438 - 762
Target Start/End: Original strand, 42990267 - 42990594
Alignment:
Q  438 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 537  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  42990267 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggt 42990366  T
Q  538 tgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 634  Q
    |||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42990367 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc 42990466  T
Q  635 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990467 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatggtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 42990566  T
Q  735 cttttgtgttctatcttctcttcttctc 762  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||    
T  42990567 cttttgtgttctctctccttttcttctc 42990594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 880784 - 880422
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  880784 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggtctgaaacaagagtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 880685  T
Q  500 agtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||  ||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  880684 agttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagcattgagtctcttggttacggaaagagattggggc 880585  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  880584 tttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtaaaatggagggctgctctctcccc 880485  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  880484 tagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 880422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 438 - 746
Target Start/End: Original strand, 38890003 - 38890314
Alignment:
Q  438 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 537  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  38890003 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 38890102  T
Q  538 tgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 634  Q
    |||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  38890103 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 38890202  T
Q  635 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890203 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 38890302  T
Q  735 cttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||    
T  38890303 cttttgtgttct 38890314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 404 - 752
Target Start/End: Original strand, 43228220 - 43228571
Alignment:
Q  404 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 503  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43228220 actataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagcgtttgtatagagtt 43228319  T
Q  504 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||    
T  43228320 tgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgg 43228419  T
Q  601 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 700  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  43228420 gtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagac 43228519  T
Q  701 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  43228520 taggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 43228571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 145 - 555
Target Start/End: Original strand, 41848804 - 41849232
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41848804 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 41848903  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |    
T  41848904 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaaggaatattatatttttgatgcaaatattctttaactgaaag 41849003  T
Q  345 ag-------nnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacc 436  Q
    ||                   ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||     
T  41849004 agaaaaaaaaaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagacattgtatcaggctaaact 41849103  T
Q  437 t----------agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 526  Q
    |          | ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41849104 ttgagagagagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaataacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactag 41849203  T
Q  527 ggtttgagggttgattcacctcgggaaac 555  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41849204 ggtttgagggttgattcaccttgggaaac 41849232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 3859453 - 3859801
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859453 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 3859552  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||    
T  3859553 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 3859652  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||     
T  3859653 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcgtagggctgctctctccccc 3859751  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859752 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3859801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 404 - 753
Target Start/End: Original strand, 24979636 - 24979989
Alignment:
Q  404 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 503  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24979636 actataaatatataccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 24979735  T
Q  504 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaa---cattaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| | ||||||    
T  24979736 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgagactttgg 24979835  T
Q  601 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgt-aacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctaga 699  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  24979836 gtagaattaggcaggagacttattcttgtaacaaattaatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaa 24979935  T
Q  700 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 753  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24979936 ctaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 24979989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 404 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 51727334 - 51726990
Alignment:
Q  404 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 503  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51727334 actataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtatgtatagagtt 51727235  T
Q  504 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 600  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| |||||||||  |||||  || | ||||||    
T  51727234 tgtctctttggaacaaacact-gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggtaagaggctgagactttgg 51727136  T
Q  601 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 700  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  51727135 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagac 51727036  T
Q  701 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51727035 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 51726990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 404 - 737
Target Start/End: Original strand, 43226015 - 43226350
Alignment:
Q  404 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 503  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  43226015 actataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactacg-tttgtatagagtt 43226113  T
Q  504 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 600  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||    
T  43226114 tgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgg 43226213  T
Q  601 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 700  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  43226214 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctagac 43226313  T
Q  701 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43226314 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 43226350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 404 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 27101513 - 27101158
Alignment:
Q  404 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacc----tagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||      |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101513 actataaatatagaccttgtatcagagcaaattgagatagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 27101414  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||  ||||||| |||| ||    
T  27101413 agtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagaatgggact 27101314  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||     
T  27101313 ttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgcaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctccccc 27101214  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  27101213 agaataggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctcttc 27101158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 400 - 753
Target Start/End: Original strand, 18162589 - 18162944
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatca-gagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 498  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18162589 ttttactataaatatagaccttgtatcatgagtaaacttggagatagaggga--tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 18162686  T
Q  499 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  18162687 gagtttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 18162786  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgt-aacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 694  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18162787 tttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatttattttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 18162886  T
Q  695 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 753  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18162887 ccagactaggtcaatttgga-cgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttctctcttct 18162944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 26720473 - 26720821
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26720473 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 26720572  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcggg--aaacattaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctt 597  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||  |||| |||||||| | ||||||||| ||||||  |||| |||    
T  26720573 agtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggttaactattaggattgagtttcttggttacgggaagaggctgggactt 26720672  T
Q  598 tgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccta 697  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  26720673 tgggtagaattaggcgggagacttattcttttaaccctttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatgactgctctctccccta 26720772  T
Q  698 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26720773 gattaggtcaatttggaccgaactgggtcaccaaattcttttgtgttct 26720821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 10084725 - 10084372
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 495  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10084725 ttttactataaatatagaccttgtatcggagcaaactttgagagagatagagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgt 10084626  T
Q  496 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgg 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| ||| |||||| ||||||||| ||||||  |||    
T  10084625 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgg 10084526  T
Q  593 ggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 692  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  10084525 gactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 10084426  T
Q  693 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10084425 cccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 10084372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 359 - 688
Target Start/End: Original strand, 6561694 - 6562028
Alignment:
Q  359 gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatattttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaac 458  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6561694 gtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatgagttatatttctctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaac 6561793  T
Q  459 aatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac--- 555  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||       
T  6561794 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 6561893  T
Q  556 attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctc-ttttgtaac 654  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||||||     
T  6561894 attaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctttttgtaag 6561993  T
Q  655 gttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctc 688  Q
    || |||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  6561994 gtaactcatcattatagtggagcggagggctgctc 6562028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 5191578 - 5191925
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  || |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191578 ttttactataaatatagaccttgtatctaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 5191677  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  5191678 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 5191777  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||     
T  5191778 ttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcagagggctgttctctcccc- 5191875  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191876 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5191925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 400 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 5927096 - 5926755
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  5927096 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttgtatag 5926997  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  5926996 agtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggact 5926897  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||      
T  5926896 tttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatatcttttgtaaggttactcatcatataatgaaacggatgactgctctctcccgc 5926797  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 738  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5926796 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 5926755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 400 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 12268298 - 12267951
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaa-ctagggtttgtata 498  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12268298 ttttactataaatatagaacttgtatcagagtaaactttgagatagagggagctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaaactagggtttgtata 12268199  T
Q  499 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 594  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  12268198 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 12268099  T
Q  595 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 694  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12268098 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-----------ctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctccc 12268010  T
Q  695 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 753  Q
    | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12268009 ccaaactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 12267951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 22114637 - 22114288
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22114637 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtatag 22114538  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||  |    
T  22114537 agtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggatt 22114438  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||     
T  22114437 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcggagggatgatctctccccc 22114338  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    | || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114337 aaacaaagtaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22114288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 438 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 9604900 - 9604583
Alignment:
Q  438 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 537  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  9604900 agagatagagggggctgaaacaa-ggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggt 9604802  T
Q  538 tgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 634  Q
    |||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  9604801 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 9604702  T
Q  635 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  9604701 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactaggtcaacaaatt 9604602  T
Q  735 cttttgtgttctatcttct 753  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  9604601 cttttgtgttctctcttct 9604583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 53468787 - 53468430
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  53468787 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctttagataaagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaaccagg-tttgtatag 53468689  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||   ||| |||||| ||| ||||||||| | |||||||||| ||    
T  53468688 agtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacggggagagattgggact 53468589  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  53468588 ttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctaccccc 53468489  T
Q  696 tag--actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
     ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53468488 cagacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 53468430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 47149232 - 47148872
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagag----atagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 494  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| |||    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47149232 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaggccttgagggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 47149133  T
Q  495 tatagagtttgtctctttggaa-caaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaa-ac-attaagattgagtcttttggttacgagaagagattg 591  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| || || || |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  47149132 tatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggttgattcaccttggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattg 47149033  T
Q  592 gggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 691  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  47149032 ggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtatcgttactcatcatatagtgaaacagaggactgctctct 47148933  T
Q  692 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||    
T  47148932 cccccagactatgtcaatttggcccgaactaggtcaacaaattattctgtgttctctcttc 47148872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 400 - 753
Target Start/End: Original strand, 36011752 - 36012108
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || || |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  36011752 ttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacgaaactaaggtttgtatag 36011851  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||   ||| |||||| | | ||||||||| |||||||||| | ||    
T  36011852 agtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgttgggaaacactattaggattgaatatcttggttacgggaagagattgtgact 36011951  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |       
T  36011952 ttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctcttcttc 36012051  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 753  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36012052 agactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctcttct 36012108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 32264375 - 32264015
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaa----cctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 495  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    | | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  32264375 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattaactttgagatagagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgt 32264276  T
Q  496 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattgg 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||| | ||||||  |||    
T  32264275 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgg 32264176  T
Q  593 ggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctc 690  Q
      ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  32264175 aactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctc 32264076  T
Q  691 tcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  32264075 tcccccagactaggtctatttggaccaaactggatcaac-aattcttttgtgttctctcttc 32264015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 6066129 - 6065779
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagaggggg-ctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 498  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6066129 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 6066030  T
Q  499 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattgggg 594  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  6066029 gattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggga 6065930  T
Q  595 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 694  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  6065929 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggatggctgctctctccc 6065831  T
Q  695 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6065830 ctagactaggtcagattggacagaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 6065779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 400 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 54691905 - 54691559
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54691905 ttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggg-taaaacaaggttttagaaaggcgacaacaaaactagggtttgtatag 54691807  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||| | ||||||||| | ||||||||| |||||    
T  54691806 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaattttttggttatgggaagagattagggct 54691707  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54691706 ttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctcttttgtaacgttacccatcatatagttaaacggagggctgctctctcccct 54691607  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 744  Q
    |||||| ||||||||| || ||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  54691606 agactatgtcaatttgaactgaactaggtcgacaaattcttttatgtt 54691559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 6063780 - 6063429
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 497  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6063780 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6063681  T
Q  498 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggg 593  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  6063680 agagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 6063581  T
Q  594 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 693  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  6063580 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 6063482  T
Q  694 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  6063481 cccagactaggtcagattggaccgaactgggtccacaaatttctttgtgttct 6063429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 404 - 746
Target Start/End: Original strand, 50493928 - 50494273
Alignment:
Q  404 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 503  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50493928 actataaatatagaccttgtatcaaagcaaactgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 50494027  T
Q  504 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttg 599  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  50494028 tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagggattgggactttg 50494127  T
Q  600 ggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctaga 699  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||    
T  50494128 ggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccaga 50494226  T
Q  700 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  50494227 ctaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 50494273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 5522947 - 5522610
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  5522947 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt---- 5522852  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
           ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  5522851 -------ctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 5522759  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||      
T  5522758 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccgc 5522660  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522659 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5522610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 28761760 - 28761410
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  28761760 ttttactataaatatagactttgcatcagagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatat 28761661  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||   |||| |||||||||| ||||||||  ||||| |||| | ||    
T  28761660 agtttg-ctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagatattgagact 28761562  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    || ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28761561 ttaggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaggactgctctctcccc 28761462  T
Q  696 tagactaggtcaa-tttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
     |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  28761461 cagactaggtcaattttggatcgaactgggtaaacaaattcttttgttttct 28761410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 51675087 - 51674737
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||        
T  51675087 ttttactataaatatagacgttgtatcaatgtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgt---- 51674992  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
           | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  51674991 -------ccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggatt 51674899  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  51674898 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatactgaaatggagggctgctctctccccc 51674799  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  51674798 ataccaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 51674737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 438 - 746
Target Start/End: Original strand, 25388869 - 25389179
Alignment:
Q  438 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 537  Q
    ||||| |||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  25388869 agagagagagagagctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 25388968  T
Q  538 tgattcacctcgggaa-ac-attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 634  Q
    |||||||||| || || || |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  25388969 tgattcaccttggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaaccc 25389068  T
Q  635 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25389069 attgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 25389167  T
Q  735 cttttgtgttct 746  Q
      ||||||||||    
T  25389168 tctttgtgttct 25389179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 479 - 746
Target Start/End: Original strand, 1321483 - 1321753
Alignment:
Q  479 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttgg 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||    
T  1321483 acaaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 1321582  T
Q  576 ttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaa 675  Q
    ||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  1321583 ttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 1321682  T
Q  676 cggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321683 cggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1321753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 400 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 10191645 - 10191305
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 495  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  10191645 ttttactataaatatagaccttgtatcggagcaaactttgagagagataaagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggttttt 10191546  T
Q  496 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgg 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| ||| |||||| ||||||||  ||||||  |||    
T  10191545 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacaggaagaggctgg 10191446  T
Q  593 ggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 692  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  10191445 a-ctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttcatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 10191347  T
Q  693 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10191346 cctaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 10191305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 400 - 751
Target Start/End: Original strand, 39715395 - 39715744
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39715395 ttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagagaggcaacaccaaaactagggtttgtatag 39715493  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  39715494 agtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggact 39715593  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || || ||  ||||||||     
T  39715594 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc--atagtgaaacagatggttg--ctctccccc 39715689  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
    | ||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39715690 atactagatcattttggaccaaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 39715744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 150 - 427
Target Start/End: Original strand, 42989957 - 42990234
Alignment:
Q  150 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  42989957 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaaaatttgtttcaaatatattttttgctgaaagtatatttatggacaat 42990056  T
Q  250 aaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnn 349  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       
T  42990057 aaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 42990156  T
Q  350 nnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatca 427  Q
             ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42990157 aaaaaaat-gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatca 42990234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 438 - 746
Target Start/End: Original strand, 38210333 - 38210644
Alignment:
Q  438 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 537  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38210333 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggt 38210432  T
Q  538 tgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaact 633  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38210433 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaact 38210532  T
Q  634 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 733  Q
    ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38210533 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 38210631  T
Q  734 tcttttgtgttct 746  Q
       ||||||||||    
T  38210632 atctttgtgttct 38210644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Original strand, 15780785 - 15781165
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15780785 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 15780884  T
Q  500 agtt-----------tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaag 585  Q
    ||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  15780885 agtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaag 15780984  T
Q  586 agattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgaca----tctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggag 680  Q
    ||  || | |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |    |||||||||||| |||| | |||| ||||||| |||| ||    
T  15780985 aggctgagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatatttctcttttgtaaagttatttatcattatagtggaacgaag 15781084  T
Q  681 gg---ctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    ||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  15781085 ggcgcctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttctctcttcttttct 15781165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 438 - 693
Target Start/End: Original strand, 29956649 - 29956907
Alignment:
Q  438 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 537  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  29956649 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaattcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggt 29956748  T
Q  538 tgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 634  Q
    |||||||||| ||||||||   ||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29956749 tgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc 29956848  T
Q  635 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 693  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29956849 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcc 29956907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 406 - 753
Target Start/End: Original strand, 32219026 - 32219366
Alignment:
Q  406 tataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 505  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||           ||||||    
T  32219026 tataaatatagaccttgtatctgactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactag-----------agtttg 32219114  T
Q  506 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaa---gattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggt 602  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    |||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||     
T  32219115 tctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttgcgggaagagattgggactttgggc 32219214  T
Q  603 agaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaa-cgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagact 701  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  32219215 agaattaggcggaagacttatttttgtaacccattgatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctctcccagact 32219314  T
Q  702 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 753  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32219315 atgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 32219366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 400 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 890103 - 889779
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||    
T  890103 ttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggaagctgaaacaagggtttagaatggcaacaa--aacctagggtttgtatag 890006  T
Q  500 agtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  890005 agtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-ttggggc 889907  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||     
T  889906 tttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgatttctcccg 889807  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgg 723  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  889806 cagactaggtcaatttggaccgaactgg 889779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 404 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 35918277 - 35917944
Alignment:
Q  404 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 503  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35918277 actataaatatagaccttgtatcatagcaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 35918178  T
Q  504 tgtctctttggaacaaacac------tagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 594  Q
    ||||||||||||||||||||      ||| |||||||||||||||||||| | ||||||   |||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  35918177 tgtctctttggaacaaacacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgcgaaacactattagaattgagtctcttggttacgagaagagactggga 35918078  T
Q  595 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 694  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  35918077 atttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcattatatagtggaacggagagctgctctctccc 35917978  T
Q  695 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 729  Q
      ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  35917977 tcagact-ggtcaatttagaccgaactggatcaac 35917944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 488 - 751
Target Start/End: Original strand, 6484372 - 6484639
Alignment:
Q  488 gggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgaga 583  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| | |||||||| ||||||||| ||    
T  6484372 gggtttgtgtagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacggga 6484471  T
Q  584 agagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggc 683  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6484472 agagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatatcttttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggc 6484571  T
Q  684 tgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6484572 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 6484639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 400 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 28100373 - 28100143
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28100373 ttttactataaatataagcgttgtatcagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 28100274  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28100273 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacgctattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggct 28100174  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttctt 627  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28100173 ttgggtagaattaggcgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 465 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 28413299 - 28413014
Alignment:
Q  465 ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaag 561  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |    
T  28413299 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 28413200  T
Q  562 attg-agtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttact 660  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  |||    
T  28413199 attgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaact 28413101  T
Q  661 catcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa-ttcttttgtgttct 746  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  28413100 catcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaattaggtcaacaaatttcttttgtgttct 28413014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 497 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 7606822 - 7606571
Alignment:
Q  497 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggg 593  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||    
T  7606822 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 7606723  T
Q  594 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 693  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| ||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  7606722 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctattt-gtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctcc 7606624  T
Q  694 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606623 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7606571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 400 - 731
Target Start/End: Original strand, 53591120 - 53591442
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || || |||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||        
T  53591120 ttttactataaatatagacattgtataagtgtaaaccttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt---- 53591215  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaag---attgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
           |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||     ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||  |    
T  53591216 -------ctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctcttggttacgagaatagatttggatt 53591308  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||     
T  53591309 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttctaatccattgatatctcatttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggatgctctctcccc- 53591407  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  53591408 agactaggtcaatttggatcgaactaggtcaacaa 53591442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 592 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 27635795 - 27635628
Alignment:
Q  592 gggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 691  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27635795 gggctttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 27635696  T
Q  692 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttctt 759  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27635695 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctcttctt 27635628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 400 - 637
Target Start/End: Original strand, 35777346 - 35777587
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35777346 ttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 35777445  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  35777446 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggac 35777545  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcatt 637  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35777546 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 35777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 526 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688137
Alignment:
Q  526 gggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttt 622  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 25688268  T
Q  623 ttcttgtaactcattgacatctcttttgtaa-cgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaact 721  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25688267 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 25688168  T
Q  722 gggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  25688167 gggtcaaaaagttcttttgtgttctctcttc 25688137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 400 - 751
Target Start/End: Original strand, 23633385 - 23633732
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  23633385 ttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaaggatttagaa-gccaacaagaaaactagggtttgtatag 23633483  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
     ||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||| |||  ||||||||   ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||    
T  23633484 tgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgatttacc--gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagact 23633578  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |  ||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23633579 ttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtgaaaaggagggctgctctctcccc 23633677  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  23633678 -agactaggtcaatttagaccgaaatgggtaaacaaattcttttgtgttctctctt 23633732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Original strand, 31151272 - 31151631
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagagatagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 497  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  31151272 ttttactataaatatagactttgtatcagatgtaaacctcgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaat-caacaagaaaactagggtttgtat 31151370  T
Q  498 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 594  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |  ||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||     
T  31151371 agagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattggga 31151467  T
Q  595 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactca-tcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 693  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31151468 ctttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaaccc--tgatatctcttttgtaaagttactcattgttatagtggaacggagggctgctctctcc 31151565  T
Q  694 cctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    || |||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||| ||||    
T  31151566 cccagactaggtcagttttgggctgaactgggtaaacaaattctcatgtgttctctcttcttttct 31151631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 400 - 635
Target Start/End: Original strand, 28180949 - 28181185
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28180949 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaata--ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatag 28181046  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaa---cattaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||   ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  28181047 agtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccattaggattgagtctattggttacgggaagagattgggact 28181146  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactca 635  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  28181147 ttggatagaattaggcgggagacgtattcttataactca 28181185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 496 - 758
Target Start/End: Original strand, 4666535 - 4666800
Alignment:
Q  496 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgg 592  Q
    |||| |||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||   ||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||     
T  4666535 atagggtttgtctcttgacaacagacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattga 4666634  T
Q  593 ggctttgggtagaattaggcgggaga--ctttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctct 689  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4666635 gactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctct 4666734  T
Q  690 ctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    | ||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4666735 cccc---agactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 4666800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 563 - 746
Target Start/End: Original strand, 5886290 - 5886472
Alignment:
Q  563 ttgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactca 662  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||| | |||||||||||    
T  5886290 ttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttgtcttt-gaaacgttactca 5886388  T
Q  663 tcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886389 tcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5886472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 563 - 746
Target Start/End: Original strand, 5899763 - 5899945
Alignment:
Q  563 ttgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactca 662  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| | |||||||||||    
T  5899763 ttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gcaacgttactca 5899861  T
Q  663 tcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5899862 tcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5899945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 523 - 753
Target Start/End: Original strand, 6231849 - 6232081
Alignment:
Q  523 ctagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaaga---ttgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagac 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |   |||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6231849 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattaggcgggagac 6231947  T
Q  620 tttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccga 718  Q
    || |||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||    
T  6231948 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagctactcatcattacagtgaa-cggagggctgctgtctccccccgattaggtcaatttggaccga 6232046  T
Q  719 actgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 753  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6232047 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 6232081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 482 - 751
Target Start/End: Original strand, 17795269 - 17795538
Alignment:
Q  482 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggtta 578  Q
    ||||||| || ||||||||||||| || || | ||||||||||||||||   |||||||||||| | |||||| |   ||| |||||||||| ||||| |    
T  17795269 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtca 17795364  T
Q  579 cgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacg 677  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  17795365 cggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacg 17795464  T
Q  678 gagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  17795465 gaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgttctctctt 17795538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 482 - 751
Target Start/End: Original strand, 19103709 - 19103978
Alignment:
Q  482 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggtta 578  Q
    ||||||| || ||||||||||||| || || | ||||||||||||||||   |||||||||||| | |||||| |   ||| |||||||||| ||||| |    
T  19103709 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtca 19103804  T
Q  579 cgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacg 677  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  19103805 cggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacg 19103904  T
Q  678 gagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  19103905 gaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgttctctctt 19103978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 539 - 746
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168375
Alignment:
Q  539 gattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactca 635  Q
    ||||||||| ||||||||   ||| |||||||| | ||||||||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccca 11168264  T
Q  636 ttgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 735  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  11168265 ttgatttctcttttgtaacgttacttatcatatattggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaacttggtcaacaaattc 11168364  T
Q  736 ttttgtgttct 746  Q
    |||||||||||    
T  11168365 ttttgtgttct 11168375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 400 - 725
Target Start/End: Original strand, 53597166 - 53597491
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  53597166 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagataga-ggggatgaaacaagggttta-taagtcaacaagaaaactaggggttgtatag 53597263  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||  |  |||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||| | ||||| |||||| |  |    
T  53597264 agttt-tctcttggcaacaaacactagggttgaa--gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaatagattgagatt 53597360  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||| | |||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||     
T  53597361 ttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagggttgctctctccca 53597460  T
Q  696 tagactaggtcaat-ttggaccgaactgggt 725  Q
     | ||||||||| | |||||||||| |||||    
T  53597461 caaactaggtcagtattggaccgaattgggt 53597491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 400 - 543
Target Start/End: Original strand, 11163075 - 11163218
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11163075 ttttacgataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 11163174  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 543  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11163175 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtggattgattc 11163218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 400 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 28137627 - 28137415
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||               
T  28137627 ttttactataaatatatgcgttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag----------- 28137539  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   |||| |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  28137538 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattggggct 28137439  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagact 620  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  28137438 ttgggtagaattaggcggaagact 28137415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 599 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 47701801 - 47701654
Alignment:
Q  599 gggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctag 698  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47701801 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccag 47701702  T
Q  699 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  47701701 attaggtcaatttggatcgaactggatcaacaaattcttttgcgttct 47701654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 482 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 13420432 - 13420189
Alignment:
Q  482 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggtta 578  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||   | |||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||| |    
T  13420432 aaactagggtttgtatagagttt-tctctaggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtca 13420337  T
Q  579 cgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacg 677  Q
    || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||| || ||||    
T  13420336 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcattattataatggaacg 13420237  T
Q  678 gagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggt 725  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  13420236 gagagctgctctctcacc-agactaggtcagttttggaccgaaatgggt 13420189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 556 - 752
Target Start/End: Original strand, 3306845 - 3307040
Alignment:
Q  556 attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacg 655  Q
    |||| |||||||||| ||||||||   |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  3306845 attaggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaag 3306944  T
Q  656 ttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  3306945 ttactcatcattatagtgaaaaggatggttgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttctctcttc 3307040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 405 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 36871624 - 36871295
Alignment:
Q  405 ctataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 504  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |  || |||||||||||||| |||||| || | |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  36871624 ctataaatataaaccttgtatcatagtaaacctagggggag-gggggctgaaacaagggtttacaa-gccaacaagaaaactagggcttgtatagagttt 36871527  T
Q  505 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttggg 601  Q
    | ||||| | ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| || |||||   |||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| |||||||    
T  36871526 g-ctcttggcaacaaacaccagggtt--aggattgattcaccttggaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttggg 36871430  T
Q  602 tagaattagg-cgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctaga 699  Q
    ||||||||||   | |||||| |||||| ||| | |||  ||||| ||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  36871429 tagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttatctc-tttgtaaagttaatcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccaga 36871331  T
Q  700 ctaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||    
T  36871330 ctaggtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatt 36871295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 482 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 562024 - 561769
Alignment:
Q  482 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggtta 578  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||   ||| |||| ||||| ||||| |    
T  562024 aaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttca--ggttgattcacattgggaaacactattaggatttagtctcttggtca 561928  T
Q  579 cgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacg 677  Q
    || |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  561927 cgtgaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgatatcttttttgtaaagttactcatcattatagtggaacg 561828  T
Q  678 gagggctgctctctccc-ctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
     |||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||    
T  561827 aagggctgctctctccctccagactaggtcagttttggaccgaaccgggtaaacaaatt 561769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 399 - 649
Target Start/End: Original strand, 23636951 - 23637200
Alignment:
Q  399 attttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 498  Q
    |||||| |||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  23636951 attttaatataaatatatactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctaaaacaagggtttagaa-gccaacaagaaaactagggtttgtata 23637049  T
Q  499 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    |||| || ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||| |||| | ||||||   ||| |||||||||| ||| | | | ||||| ||| || |    
T  23637050 gagtctg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgatttaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgttcatgggaagatattaggac 23637146  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctctttt 649  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  23637147 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 23637200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 482 - 734
Target Start/End: Original strand, 25635391 - 25635644
Alignment:
Q  482 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggtta 578  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||| ||||||| ||||||||   ||| |||| ||||| ||||| |    
T  25635391 aaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtca 25635487  T
Q  579 cgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacg 677  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||     
T  25635488 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcattatggtgaaaca 25635587  T
Q  678 gagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  25635588 gagggttgctctctcccctcggctaggccaatttggaccaaactgcgtaaacaaatt 25635644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 400 - 684
Target Start/End: Original strand, 54884082 - 54884367
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||| ||||||||| || ||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||    
T  54884082 ttttaccataaatataaacattggatcattgtaaaccttgagatagagggagctcgaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagaatttg--tag 54884179  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||   |||| |||||||||| ||||||||   |||||||||   ||    
T  54884180 agtttgtttctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcatcttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaaact 54884279  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggct 684  Q
    |||  |||||||||| ||||||||| || ||||||   ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  54884280 ttgaatagaattaggagggagacttatt-ttgtaatctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggct 54884367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 400 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 47701927 - 47701798
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47701927 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 47701828  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggt 529  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  47701827 agtttgtctatttggaacaaacaccagggt 47701798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 399 - 528
Target Start/End: Original strand, 6231373 - 6231502
Alignment:
Q  399 attttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 498  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6231373 attttactataaatatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagcgggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 6231472  T
Q  499 gagtttgtctctttggaacaaacactaggg 528  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  6231473 gagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 6231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 656 - 753
Target Start/End: Original strand, 41849243 - 41849340
Alignment:
Q  656 ttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 753  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41849243 ttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 41849340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 142
Target Start/End: Original strand, 5156031 - 5156154
Alignment:
Q  19 gaaaaagagacaaatggccttattaaagaacttattcctccaggataagttgatagcttaactagcctcatctttgctaatgcgttgtactttagaggag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | ||||||| |||||    
T  5156031 gaaaaagagacaaatggccttattaaagaacttcttcctccaagatcagttgatagcttaacccgcctcatctttgctaatgcactctactttaaaggag 5156130  T
Q  119 catggaatgagaagtttgatgttt 142  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  5156131 catggagtgagaagtttgatgttt 5156154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 400 - 518
Target Start/End: Original strand, 3306724 - 3306842
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||    
T  3306724 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctagagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatacaacaacaaaactaggatttgaatag 3306823  T
Q  500 agtttgtctctttggaaca 518  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3306824 agtttgtctctttggaaca 3306842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 665 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 35919179 - 35919098
Alignment:
Q  665 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35919179 atatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 35919098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 143
Target Start/End: Original strand, 5160061 - 5160185
Alignment:
Q  19 gaaaaagagacaaatggccttattaaagaacttattcctccaggataagttgatagcttaactagcctcatctttgctaatgcgttgtactttagaggag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  | ||||||| |||||    
T  5160061 gaaaaagagacaaatggccttattaaagaacttcttcctctaagatcagttgataggttaaccagactcatctttgctaatgcactctactttaaaggag 5160160  T
Q  119 catggaatgagaagtttgatgtttc 143  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||    
T  5160161 catggagtgataagtttgatgtttc 5160185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 586 - 734
Target Start/End: Original strand, 24181494 - 24181644
Alignment:
Q  586 agattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggct 684  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| | ||    
T  24181494 agattgggactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgact 24181593  T
Q  685 gctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    ||||||||| | | |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24181594 gctctctcctccaaactaggtcagttttggaccgaattgggtaaacaaatt 24181644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 475 - 734
Target Start/End: Original strand, 1673975 - 1674227
Alignment:
Q  475 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtctt 571  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||  ||| ||||||||||  ||||||||   ||| ||||||||||     
T  1673975 aacaagaaaactagtgtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--aggattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctc 1674071  T
Q  572 ttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagt 671  Q
    ||| | ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||| | |||| || |||||||||| |||||        |  |    
T  1674072 ttgatcacgggaagagattgggactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgatatgtcttttgtaaagttac--------tttt 1674163  T
Q  672 gaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    | |||||| ||||||||||||| | ||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||    
T  1674164 ggaacggatggctgctctctccaccagactaggtcagtattagaccgaactgggtaaacaaatt 1674227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Original strand, 6561612 - 6561687
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatata 219  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6561612 atgttgtagtatgactcgaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatata 6561687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 404 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 4560593 - 4560401
Alignment:
Q  404 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 503  Q
    ||||||| |||||||  || |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||           |||||||    
T  4560593 actataagtatagactatgtatcatagtaaacattgagatagagggggctgaaacaatggtttataaaggtaacaacaaaac-----------tagagtt 4560505  T
Q  504 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 600  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||| ||||||| || ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  4560504 tgtctct--------aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagcctgttggttaccggaagagattggagctttgg 4560413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 677 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 53894109 - 53894040
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53894109 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 53894040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 567 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 1620624 - 1620457
Alignment:
Q  567 gtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca 665  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||   || | ||  |||||||||| | |||| |||||||| ||||  ||||||||||    
T  1620624 gtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaaccctttgatatctcttt-gtaaacttactcatca 1620526  T
Q  666 t-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaa 732  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||| ||||||    
T  1620525 ttatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcagtattggaccaaactaggtgaacaaa 1620457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 615 - 734
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634150
Alignment:
Q  615 gagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttgg 713  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||| |||||||     
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaatggctgctctctccaccagactaggacaatttgc 25634129  T
Q  714 accgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    |||||||| ||| ||||||||    
T  25634130 accgaactaggtaaacaaatt 25634150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 561 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 11007683 - 11007545
Alignment:
Q  561 gattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttact 660  Q
    |||||||||| ||||| ||  |||||||||| | |||||||||||||||||         |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  11007683 gattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttgggtagaattagg---------ttttcttgtaactctttgacatctcttttgtaaagttact 11007593  T
Q  661 catca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca 707  Q
    ||||| ||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11007592 catcattatagtggaatggggggctcctctctcccctagactaggtca 11007545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 53974197 - 53974124
Alignment:
Q  155 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 228  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53974197 tgactcaaaatttgatggatgaagaatgttgttgttaaaaatataaaagatttgtttcaattatattttgtgct 53974124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 400 - 576
Target Start/End: Original strand, 24177204 - 24177380
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctg-aaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 498  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||| |||||||||||| ||||||  |||||| | | |||||| ||||||||||||||||||    
T  24177204 ttttattataaatatagaccttgtatcatagtaaacattgagctagagggggctgaaaacaagagtttag-atgtcaacaagaaaactagggtttgtata 24177302  T
Q  499 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggt 576  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   |||||||||||||| || ||||   |||| |||||||||| |||||    
T  24177303 gagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt--ggggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 155 - 311
Target Start/End: Original strand, 11066255 - 11066429
Alignment:
Q  155 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaat-ataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct-----------------gaaaatat 236  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||                 |||||||     
T  11066255 tgactcataatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaaagataaatgatttgtttcaaatatatcttgtgctttcggaagattgttgttgaaaatac 11066354  T
Q  237 atttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatatt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  11066355 atttatggacaataaatatatttttttaccatatgaaggaatatttgatgcaaatatatttttaaagagaatatt 11066429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Original strand, 11072644 - 11072717
Alignment:
Q  155 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 228  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  11072644 tgactcaaaatttgatggatgaagaagattgttgcaaaaaatataaatgatttgtttcaaatatatcttgtgct 11072717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 400 - 475
Target Start/End: Original strand, 1321366 - 1321441
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggca 475  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1321366 ttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggca 1321441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 54287627 - 54287487
Alignment:
Q  177 agaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct-----------------gaaaatatatttatggacaataaatatattt 259  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||                 ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  54287627 agaagattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatttcgtgcttccaaaagattgctgttgaaaatatatttatggataataaatacattt 54287528  T
Q  260 ttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttga 300  Q
    |||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||    
T  54287527 ttgtactgtatgaaggaatatttgatgcaaatatattttga 54287487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 45884074 - 45883967
Alignment:
Q  19 gaaaaagagacaaatggccttattaaagaacttattcctccaggataagttgatagcttaactagcctcatctttgctaatgcgttgtactttagaggag 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||| | |||| | | |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  45884074 gaaaaagagacaaatggtcttattaaagaaattctttctccagggtcagttaacaacttaaccagactcatatttgctaatgcattgtactttaagggag 45883975  T
Q  119 catggaat 126  Q
    ||||||||    
T  45883974 catggaat 45883967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 53974077 - 53974011
Alignment:
Q  230 aaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatg-aagaatgatttgatacaaatatat 295  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||    
T  53974077 aaaatatatttatagacaataaatatatttttgtaccgtatgaaaggaagatttgatgcaaatatat 53974011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 697 - 762
Target Start/End: Original strand, 42992611 - 42992676
Alignment:
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttcttctc 762  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||| || ||||||||    
T  42992611 agactaggtcaatttggaccgaactgagtcaaaaaattcttttgtattctctctccttttcttctc 42992676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 1736334 - 1736388
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1736334 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1736388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 295
Target Start/End: Original strand, 11072731 - 11072801
Alignment:
Q  225 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatat 295  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | | | |||||||| |||||||||    
T  11072731 tgctgaaaatacatttatggacaacaaatagatttttgtaccgtattacggaagatttgatgcaaatatat 11072801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 18552912 - 18552966
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18552912 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 18552966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 669 - 723
Target Start/End: Original strand, 28181185 - 28181238
Alignment:
Q  669 agtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgg 723  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28181185 agtgaaacggaaggctgctctctccc-tagactaggtcaatttggactgaactgg 28181238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 30709819 - 30709873
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30709819 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 30709873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 400 - 460
Target Start/End: Original strand, 6484310 - 6484370
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaa 460  Q
    |||| |||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6484310 ttttgctataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaa 6484370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 666 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 10612844 - 10612772
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  10612844 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 10612772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 666 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 47878237 - 47878165
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||    
T  47878237 tatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaattctt 47878165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 679 - 731
Target Start/End: Original strand, 47923937 - 47923989
Alignment:
Q  679 agggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  47923937 agggctgctctctcccctagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaa 47923989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 58
Target Start/End: Original strand, 46479576 - 46479615
Alignment:
Q  19 gaaaaagagacaaatggccttattaaagaacttattcctc 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46479576 gaaaaagagacaaatggccttattaaagaacttcttcctc 46479615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 1417519 - 1417573
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1417519 ggagggatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1417573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 3716031 - 3716085
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3716031 ggagagctgctctctctcctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 3716085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 8370515 - 8370569
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8370515 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 8370569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 27974981 - 27975035
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27974981 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 27975035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 27986475 - 27986529
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27986475 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 27986529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 682 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 21711276 - 21711227
Alignment:
Q  682 gctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21711276 gctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21711227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 666 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 10595100 - 10595028
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  10595100 tatagtggaacggagagctgctctctcccccatactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 10595028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 666 - 737
Target Start/End: Original strand, 10897121 - 10897193
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  10897121 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 10897193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 454 - 556
Target Start/End: Original strand, 13419864 - 13419960
Alignment:
Q  454 gaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaa 553  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   || ||||||||||| |||||    
T  13419864 gaaacaaaggttta-aaagccaacaagaaaactagggtttg--tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--gggattgattcaccttgggaa 13419957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 623 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 15823756 - 15823641
Alignment:
Q  623 ttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaac 720  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||| |  |||| |||| |||||| |||| || ||||||||||| || ||| || |||||| ||||||||||     
T  15823756 ttcttgtaaccctttgacatctcttt-gtaaagaaactcttcattatagtggaacgtagagctgctctctctccaagagtaagtcaatattggaccgaat 15823658  T
Q  721 tgggtcaacaaattctt 737  Q
    ||||| |||||||||||    
T  15823657 tgggtaaacaaattctt 15823641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 185
Target Start/End: Original strand, 27000083 - 27000123
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattg 185  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27000083 tgttgtagtatgactgaaaatttgatggatggagaatattg 27000123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Original strand, 29682483 - 29682527
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  29682483 tctctcccctagattagatcaagttggaccgaactgggtcaacaa 29682527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Original strand, 40913417 - 40913461
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40913417 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40913461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Original strand, 44331669 - 44331713
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44331669 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 44331713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 666 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 48390368 - 48390296
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||  |||||||||||| |||||||||||    
T  48390368 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattaaaccgaactgggtaaacaaattctt 48390296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 1618986 - 1618916
Alignment:
Q  404 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--agagatagagggggctg-aaacaatggtttagaaa 471  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1618986 actataaatatagaccttgtaccatagtaaaccttgagagacagagggggctgaaaacaagggtttagaaa 1618916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 583
Target Start/End: Original strand, 25633930 - 25634031
Alignment:
Q  482 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggtta 578  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |   || ||||||||||| |||| ||   |||| |||||||||| ||||| |    
T  25633930 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggct--gggattgattcaccttgggagacattattaggattgagtctcttggtca 25634026  T
Q  579 cgaga 583  Q
    |||||    
T  25634027 cgaga 25634031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 677 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 48438272 - 48438221
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 728  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| ||||||    
T  48438272 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaa 48438221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 709 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 8183154 - 8183112
Alignment:
Q  709 tttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8183154 tttgggccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 8183112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 16264408 - 16264354
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  16264408 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 16264354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 25795839 - 25795785
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  25795839 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 25795785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 26299046 - 26298992
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  26299046 ggagggctgctctctcccccagattatgtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 26298992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 556 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 29914128 - 29913949
Alignment:
Q  556 attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaac 654  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||   || ||||  ||||||||||||| |   |||||||| ||||     
T  29914128 attaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactcaat---atctcttt-gtaaa 29914034  T
Q  655 gttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    |  ||||||||| |||||| | || || |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  29914033 gaaactcatcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 29913949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 687 - 737
Target Start/End: Original strand, 30236249 - 30236299
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  30236249 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaatttctt 30236299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 32143379 - 32143325
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  32143379 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 32143325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 33386695 - 33386749
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  33386695 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 33386749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 37466349 - 37466295
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  37466349 ggagggctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgtgtcaacaa 37466295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 537 - 611
Target Start/End: Original strand, 11073007 - 11073084
Alignment:
Q  537 ttgattcacct-cgggaaaca-ttaagattgagtcttttggttacgagaagaga-ttggggctttgggtagaattagg 611  Q
    ||||||||||| || |||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  11073007 ttgattcaccttcgagaaacacttatgattgagtctcttggtcacgagaagagatttgggactttaggtagaattagg 11073084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 666 - 707
Target Start/End: Original strand, 11079633 - 11079674
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca 707  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  11079633 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 11079674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 678 - 731
Target Start/End: Original strand, 24695194 - 24695247
Alignment:
Q  678 gagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  24695194 gagggttgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 24695247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 53896524 - 53896475
Alignment:
Q  404 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggct 453  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||||||||||||    
T  53896524 actataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct 53896475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 432; Significance: 0; HSPs: 136)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 17325227 - 17324610
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  17325227 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgagttgaaaatatatttatgg 17325128  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17325127 acaataaatatatttttgtaccgtatgaaaaacgatttgatgcaaatatattttgcaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaagg 17325028  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 443  Q
    ||           | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  17325027 agaaaaaaaaaacg-tatcttcagggtgatattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaaccagagtaaacctgaagat 17324929  T
Q  444 agagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 543  Q
    | |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324928 acagggggctaaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactggggtttgtatagagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattc 17324829  T
Q  544 acctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 640  Q
    |||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  17324828 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgat 17324729  T
Q  641 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 740  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324728 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 17324629  T
Q  741 tgttctatcttctcttctt 759  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  17324628 tgttctctcttctcttctt 17324610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 143 - 758
Target Start/End: Original strand, 47905954 - 47906576
Alignment:
Q  143 catgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttat 242  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47905954 catgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttat 47906053  T
Q  243 ggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaa 342  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  47906054 ggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaa 47906153  T
Q  343 ggagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct---- 437  Q
    ||||            ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |        
T  47906154 ggagaaaaaaaaa---gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgag 47906250  T
Q  438 --agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagg 535  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47906251 agagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagg 47906350  T
Q  536 gttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaac 632  Q
    |||||||||||| | ||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47906351 gttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 47906450  T
Q  633 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 732  Q
     ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906451 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagacttggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 47906550  T
Q  733 ttcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||    
T  47906551 ttcttttgtgttctctcttcttttct 47906576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 28998844 - 28998227
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998844 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaactataaaagatttgtttaaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 28998745  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28998744 acaataaatacatttttgtaccgtacgaagaaatatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 28998645  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 443  Q
    ||           | ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  28998644 agaaaaaaaaaccg-tatatttagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagat 28998546  T
Q  444 agagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 543  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28998545 agaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattc 28998446  T
Q  544 acctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 640  Q
    |||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998445 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 28998346  T
Q  641 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 740  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998345 atctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 28998246  T
Q  741 tgttctatcttctcttctt 759  Q
    |||||| |||| |||||||    
T  28998245 tgttctctcttttcttctt 28998227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 29004560 - 29003943
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004560 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaactataaaagatttgtttaaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 29004461  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29004460 acaataaatacatttttgtaccgtacgaagaaatatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 29004361  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 443  Q
    ||           | ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  29004360 agaaaaaaaaaccg-tatatttagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagat 29004262  T
Q  444 agagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 543  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29004261 agaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattc 29004162  T
Q  544 acctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 640  Q
    |||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004161 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 29004062  T
Q  641 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 740  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004061 atctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaaactgagggttgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 29003962  T
Q  741 tgttctatcttctcttctt 759  Q
    |||||| |||| |||||||    
T  29003961 tgttctctcttttcttctt 29003943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 144 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 31736116 - 31735508
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31736116 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggaaggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 31736017  T
Q  244 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 343  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31736016 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 31735917  T
Q  344 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctaga-- 440  Q
    |||            ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| | ||      
T  31735916 gagaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaat 31735819  T
Q  441 --gatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 538  Q
      ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  31735818 gagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 31735719  T
Q  539 gattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactca 635  Q
    ||||||||| ||||||||   ||||| |||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  31735718 gattcaccttgggaaacactattaaggttgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatcca 31735619  T
Q  636 ttgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 735  Q
    ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31735618 ttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 31735519  T
Q  736 ttttgtgttct 746  Q
    |||||||||||    
T  31735518 ttttgtgttct 31735508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 2949815 - 2949213
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2949815 tgttatagtatgactcaaaatttcatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 2949716  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  2949715 acaataaatatatttttgtattgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatacaaatattctttcactgaag- 2949617  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 443  Q
    ||           | ||||||       ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||||| |||||    
T  2949616 agaaaaaaaaaacg-tatcttg------gtattcgttccaaatttatgagttatacttttacaataaatatagatattgaatccgagaaaaccttgagat 2949524  T
Q  444 agagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 543  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2949523 agagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattc 2949424  T
Q  544 acctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 640  Q
    |||| ||||||||   ||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2949423 accttgggaaacactattaggattgagtctcttgtttacgagaatagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 2949324  T
Q  641 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 740  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2949323 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccc-cgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 2949225  T
Q  741 tgttctatcttc 752  Q
    |||||| |||||    
T  2949224 tgttctctcttc 2949213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 746
Target Start/End: Original strand, 39931762 - 39932368
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39931762 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 39931861  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  39931862 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatacttttgatgcaaatattcttttattgaagg 39931961  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatat-tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--agag 441  Q
    ||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||  |||| |  ||||    
T  39931962 agaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatgagacaaaactttgagag 39932059  T
Q  442 atagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 541  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39932060 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgat 39932159  T
Q  542 tcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattg 638  Q
    | |||| |||||||   |||| |||||| ||| ||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  39932160 taaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagactgagactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattg 39932259  T
Q  639 acatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc-tcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    |  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39932260 atttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggagggctgctctcttcccccatactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattctt 39932359  T
Q  738 ttgtgttct 746  Q
    |||||||||    
T  39932360 ttgtgttct 39932368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 15295439 - 15294821
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15295439 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 15295340  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15295339 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagcgaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 15295240  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatat-tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct------ 437  Q
    ||           | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |          
T  15295239 agaaaaaaaaaatg-tatcttcagtgtggtattcgttcctaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagag 15295141  T
Q  438 --------agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 529  Q
            |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  15295140 agagagagagagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggtt 15295041  T
Q  530 ttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttct 626  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  15295040 ttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattct 15294941  T
Q  627 tgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtc 726  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15294940 tgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtc 15294841  T
Q  727 aacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15294840 aacaaattcttttgtgttct 15294821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 743
Target Start/End: Original strand, 24325347 - 24325954
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24325347 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatgg 24325446  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24325447 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagtgaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 24325546  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct------ 437  Q
    ||            ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |          
T  24325547 agaaaaaaaaat--gtatctttagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagag 24325644  T
Q  438 --agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagg 535  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24325645 agagagatagagggggctgaaacaagggtt-agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgg 24325743  T
Q  536 gttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaac 632  Q
    ||||||||||||  |||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24325744 gttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 24325843  T
Q  633 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 732  Q
     ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24325844 ccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcgaatggctgctctctcccccagactaagtcaattttgaccgaactgggtcaacaaa 24325943  T
Q  733 ttcttttgtgt 743  Q
    |||||||||||    
T  24325944 ttcttttgtgt 24325954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 27339730 - 27339112
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatat----tt 240  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  27339730 tgttgtagtatgactccaaatttgacggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatatattt 27339631  T
Q  241 atggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactg 340  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27339630 atggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactg 27339531  T
Q  341 aaggagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct-- 437  Q
    |||||             ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||| |      
T  27339530 aaggaaaaaaaaaagaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttg 27339431  T
Q  438 --agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagg 535  Q
      ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  27339430 agagagatagagggggctgaaacaagggcttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgg 27339331  T
Q  536 gttgattcacctcgggaaa---cattaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaac 632  Q
    |||||||||||| ||||||    |||| |||||||||| || |||||| ||||||  || | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27339330 gttgattcaccttgggaaatactattacgattgagtctcttagttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaac 27339231  T
Q  633 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 732  Q
     ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27339230 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgatctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaa 27339132  T
Q  733 ttcttttgtgttctatcttc 752  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  27339131 ttcttttgtgttctctcttc 27339112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 144 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 27337533 - 27336921
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 243  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337533 atgttgtagtatgactccaaatttgatggatggggaatattgttgctaaaaatatataagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 27337434  T
Q  244 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 343  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27337433 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttaactgaag 27337334  T
Q  344 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----a 438  Q
    ||             ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||| |    |    
T  27337333 gaaaaaaaaaaac--gtatcttcgatgtggtatttgttccaaatttatgcgttatacttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgaga 27337236  T
Q  439 gagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 538  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  27337235 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttataga-tttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggtt 27337137  T
Q  539 gattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactca 635  Q
    ||||||||| ||||||||   ||| ||||| |||| ||||||||| ||||||  || | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  27337136 gattcaccttgggaaacactattaggattgggtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 27337037  T
Q  636 ttgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 735  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337036 ttgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 27336938  T
Q  736 ttttgtgttctatcttc 752  Q
    ||||||||||| |||||    
T  27336937 ttttgtgttctctcttc 27336921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 172 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 21948756 - 21948226
Alignment:
Q  172 gatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatg 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21948756 gatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatg 21948657  T
Q  272 aagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgt 371  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||            |||||||||||||    
T  21948656 aagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcacagaaggaggaaaaaaaaaacgtatcttcagtgt 21948557  T
Q  372 agtattcgttccaaatttatgatttatat-tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggttt 466  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21948556 ggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggttt 21948457  T
Q  467 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaa-ac-attaagatt 564  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||| ||||    
T  21948456 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaacactattaggatt 21948357  T
Q  565 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 664  Q
    |||||| ||||||||| |||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21948356 gagtctcttggttacgggaagacgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatc 21948257  T
Q  665 atatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21948256 atatagtggaacggagggctgctctctcccc 21948226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 144 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 9463841 - 9463231
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9463841 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 9463742  T
Q  244 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 343  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9463741 gacaataaatatatttttatatcgtatgaagaacaatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaag 9463642  T
Q  344 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----- 437  Q
    |||            ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |         
T  9463641 gagaaaaaaaaac--gtatcttcattgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 9463544  T
Q  438 -agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaggg 536  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||    
T  9463543 gagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtggg 9463444  T
Q  537 ttgattcacctcgggaaac---attaagattg-agtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaac 632  Q
    ||||||||||| |||||||   |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9463443 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaac 9463344  T
Q  633 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 732  Q
     ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9463343 ccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 9463245  T
Q  733 ttcttttgtgttct 746  Q
    ||  ||||||||||    
T  9463244 tttctttgtgttct 9463231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 9460013 - 9459404
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9460013 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 9459914  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9459913 acaataaatatatttttataccgtatgaagaacaatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaagg 9459814  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct------ 437  Q
    ||            ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |          
T  9459813 agaaaaaaaaac--gtatcttcattgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagag 9459716  T
Q  438 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 537  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||    
T  9459715 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagtcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggt 9459616  T
Q  538 tgattcacctcgggaaac---attaagattg-agtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaact 633  Q
    |||||||||| |||||||   |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  9459615 tgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacc 9459516  T
Q  634 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 733  Q
    ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9459515 cattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 9459417  T
Q  734 tcttttgtgttct 746  Q
    |  ||||||||||    
T  9459416 ttctttgtgttct 9459404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 373 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 6996064 - 6995674
Alignment:
Q  373 gtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaa 471  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  6996064 gtattcgttccaaatttatgagttatacttttattataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggggccgaaacaacggtttagaaa 6995965  T
Q  472 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagt 568  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  6995964 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagt 6995865  T
Q  569 cttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatat 668  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6995864 ctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactcattgacatctcttttataacgttactcatcatat 6995765  T
Q  669 agtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttctt 759  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6995764 agtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctcttctt 6995674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 267 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 2510801 - 2510312
Alignment:
Q  267 gtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnnnnnnnnnng---gtatc 363  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||               ||||     
T  2510801 gtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagggaaagaaaaaaaacgtatt 2510702  T
Q  364 ttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagatagagggggctgaaac 458  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |    |||||||||||||||||||||    
T  2510701 ttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaac 2510602  T
Q  459 aatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac--- 555  Q
    || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||       
T  2510601 aagggtttataaaggcaaccacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaaacact 2510502  T
Q  556 attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacg 655  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||| |    
T  2510501 attaggattgagtcttttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggc-agagacttattcttgtaacccattgatttctctcttgtaaag 2510403  T
Q  656 ttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2510402 ttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2510312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 12302846 - 12302480
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 494  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12302846 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttg 12302747  T
Q  495 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattg 591  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  12302746 tatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 12302647  T
Q  592 gggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 691  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302646 ggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 12302547  T
Q  692 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12302546 cccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 12302480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 400 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 50307883 - 50307527
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||| ||||||||| |||||| | |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50307883 ttttactataaatataagctttgtatcaaagtaaaccttgagatatatggggctgaaaaaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatag 50307784  T
Q  500 agtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  50307783 agtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggc 50307684  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50307683 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 50307584  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc-ttttgtgttctatctt 751  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  50307583 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttttgtgttctctctt 50307527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 51749984 - 51750333
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51749984 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 51750083  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  51750084 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 51750183  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  51750184 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 51750283  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750284 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 51750333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 400 - 753
Target Start/End: Original strand, 15823491 - 15823847
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15823491 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttagagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 15823590  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||| ||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||    
T  15823591 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaatattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 15823690  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  15823691 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctccccc 15823790  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 753  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15823791 agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 15823847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Original strand, 18307054 - 18307409
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18307054 ttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataa 18307153  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  18307154 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggct 18307253  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18307254 ttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctcccc 18307353  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
     |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18307354 -agactaggtcaatttggaccgaacggagtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 18307409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 38925814 - 38925456
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38925814 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 38925715  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||    
T  38925714 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 38925615  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  38925614 ttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtaaaacggagggctgctctctcccc- 38925518  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  38925517 agactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 38925456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 11457811 - 11457450
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11457811 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatag 11457712  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||  |||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |    
T  11457711 agtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgcgaagagattgggggt 11457612  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  11457611 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatgtctgctctctccccc 11457512  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  11457511 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 11457450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 400 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 28207402 - 28207048
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||     
T  28207402 ttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtaa 28207303  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||   |||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  28207302 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggttacaggaagagattggggct 28207203  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    |||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  28207202 ttgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacggagggctgctctctccccc 28207105  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 753  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28207104 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 28207048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Original strand, 41646865 - 41647220
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41646865 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 41646964  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| | ||    
T  41646965 agtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgcgact 41647064  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  41647065 ttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccatc 41647164  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  41647165 agactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctcttc 41647220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 10400164 - 10399815
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10400164 tttttctataaatatagaccttgtatcagagcaaactgggagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatag 10400065  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  10400064 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggact 10399965  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  10399964 ttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 10399865  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399864 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 10399815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 400 - 741
Target Start/End: Original strand, 13215026 - 13215375
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13215026 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 13215125  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  13215126 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggact 13215225  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgaca----tctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    ||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  13215226 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatttttctcttttgtaaatttactcatcattatagtggaacggagggctgctctct 13215325  T
Q  692 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 741  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13215326 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgcgtcaacaaattcttttgt 13215375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 400 - 744
Target Start/End: Original strand, 6822960 - 6823306
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6822960 ttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 6823059  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |   ||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  6823060 agtttgtctcttaggaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggct 6823158  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  6823159 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 6823258  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 744  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823259 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 6823306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 404 - 753
Target Start/End: Original strand, 39462468 - 39462820
Alignment:
Q  404 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 503  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39462468 actataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagaaggctgaaacaaaggtttagaaatgcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtt 39462567  T
Q  504 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 600  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  39462568 tgtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgg 39462667  T
Q  601 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 700  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| | |||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  39462668 gtagaattaggcgggagaattattcttgtaaccctttgatatctcttttgaaaagttattcatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagac 39462767  T
Q  701 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 753  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39462768 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 39462820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 257 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 46432207 - 46431693
Alignment:
Q  257 tttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnnnnnnnnn 356  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||              
T  46432207 tttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaaaaa 46432108  T
Q  357 nggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagag-------- 447  Q
     | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| | |||| ||||            
T  46432107 cg-tatcttcactgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagagag 46432009  T
Q  448 -------------ggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgag 534  Q
                 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  46432008 agagagagagatgggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg 46431909  T
Q  535 ggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaa 631  Q
    ||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46431908 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 46431809  T
Q  632 ctcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct--cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 729  Q
    | ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431808 cccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 46431710  T
Q  730 aaattcttttgtgttct 746  Q
    |||||||||||||||||    
T  46431709 aaattcttttgtgttct 46431693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 400 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 9241422 - 9241067
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagaggggg-ctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 498  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9241422 ttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggggctgaaacaa-ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 9241324  T
Q  499 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaa---gattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9241323 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacattattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggc 9241224  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 694  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9241223 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 9241124  T
Q  695 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||    
T  9241123 ccatactaggtcaatttggaccgaactggggaaacaaattcttttttgttctctctt 9241067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 404 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 14098302 - 14097950
Alignment:
Q  404 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 503  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14098302 actataaatatagaccttgtatcaaactaaactttgagatagaggggactgaaacaatggtttaaaaaggcaactacaaaactagggtttgtatagagtt 14098203  T
Q  504 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 600  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  14098202 tgtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagagctttgg 14098103  T
Q  601 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgt-aacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctaga 699  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  14098102 gtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccacaaa 14098003  T
Q  700 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14098002 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 14097950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 28840623 - 28840973
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 497  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28840623 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatacagggggatgaaacaagggtttagaaaggaaacaacaaaactagggtttgtat 28840722  T
Q  498 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 594  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||     
T  28840723 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 28840822  T
Q  595 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 694  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  28840823 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 28840921  T
Q  695 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840922 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28840973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Original strand, 18839532 - 18839894
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |  |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18839532 ttttactataaatatagacattgtattattgtaaaccatgagatagagggggctgaaacaagggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtatag 18839631  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||||||||||| || | ||    
T  18839632 agtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagaatgagact 18839731  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18839732 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctttcccc 18839831  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  18839832 catactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttcgtgttctctcttcttttct 18839894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Original strand, 17318838 - 17319193
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||||||||||||   ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17318838 ttttactataaatataggttttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtttag 17318937  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttg 599  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||   | |||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  17318938 agtttgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcaccttgggaaac---aggattgagtctcttggttacgggaacagattgggactttg 17319034  T
Q  600 ggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctag 698  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17319035 ggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacttattgatatctcttttgttaagttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctct-ccctag 17319133  T
Q  699 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17319134 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 17319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 13761782 - 13762130
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13761782 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacataactagggtttgtatag 13761881  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||    
T  13761882 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtctgtgact 13761981  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||     
T  13761982 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaccggagggcttctctctccccc 13762080  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13762081 agactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13762130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 400 - 729
Target Start/End: Original strand, 47451593 - 47451919
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47451593 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggcttaaacaagggtttggaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 47451692  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttg 599  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |      ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47451693 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattagtgt---ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttg 47451789  T
Q  600 ggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctaga 699  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| | |    
T  47451790 ggtaaaattaggcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaatgactgctctctcccccata 47451889  T
Q  700 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47451890 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 47451919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 25251611 - 25251255
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  25251611 ttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataa 25251512  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
     ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   |||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||    
T  25251511 cgtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagagattgggact 25251412  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  25251411 ttgggtagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcattatagtgaaacagagggttgctctctcccc 25251312  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25251311 aatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 25251255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 404 - 744
Target Start/End: Original strand, 2617465 - 2617808
Alignment:
Q  404 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 503  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2617465 actataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 2617564  T
Q  504 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 600  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||    
T  2617565 tgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgg 2617664  T
Q  601 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 700  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||    
T  2617665 gtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctcagac 2617764  T
Q  701 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 744  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  2617765 taggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattattttgtgtt 2617808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Original strand, 16428598 - 16428960
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||||||||||||   ||  ||||||| |||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16428598 ttttactataaatataggttttatatcagagcaaaccattagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 16428697  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  16428698 agtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggact 16428797  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16428798 ttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattttagtgaaacggagggctgctctctcccc 16428897  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
     | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16428898 caaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 16428960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 20302404 - 20302752
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20302404 ttttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 20302503  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||| | ||||||| | || ||    
T  20302504 agtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagactaggact 20302603  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||||||| |||||| | |||||| || ||||||||||     
T  20302604 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcagatagtggatcggaggactactctctccccc 20302702  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20302703 agactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 20302752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 400 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 50077008 - 50076652
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  50077008 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaagggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataa 50076909  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |    
T  50076908 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggaat 50076809  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  50076808 ttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 50076709  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 753  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50076708 -agactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 50076652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 400 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 3579954 - 3579606
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagaggggg--ctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 497  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3579954 ttttactttaaatatagaccttgtatcagcgtaaaatttgagatagagggggggctgaaacaagggttcagaaaggcagcaacaaaactagggtttgtat 3579855  T
Q  498 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 594  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   |||| |||||||||| ||| |||||  ||||||||||||    
T  3579854 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacacaattaggattgagtctcttgattacggaaagagattgggg 3579755  T
Q  595 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 694  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||    
T  3579754 ctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat-tagtgaaacggatgattgctctctccc 3579656  T
Q  695 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 744  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3579655 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 3579606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 50248908 - 50248551
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||| |||||    
T  50248908 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaaaggtttaaaaagacaacaacaaaactatgatttatatag 50248809  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||| |||||||||| ||||||||  |||||||| | | ||    
T  50248808 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcgagact 50248709  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctg--ctctctccc 694  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||  |||||||||    
T  50248708 ttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagatggttgttctctctccc 50248609  T
Q  695 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50248608 ctagactaggtcaatttggtccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 50248551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 28842438 - 28842788
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 497  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28842438 ttttactataaatataaaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 28842537  T
Q  498 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 594  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || |     
T  28842538 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgaga 28842637  T
Q  595 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 694  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  28842638 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctaatctctccc 28842736  T
Q  695 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28842737 ccagactaggtcaatttggacagaactaggtcaacaaattctattgtgttct 28842788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 51752310 - 51752657
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  51752310 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggtaacaacaaaattagggcttgtatag 51752409  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacatta--agattgagtcttttggttacgagaagagattggggctt 597  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||  ||||||||||| ||||||||| ||||||  || | |||    
T  51752410 agtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaaacactattagattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactt 51752509  T
Q  598 tgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccta 697  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  51752510 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctccccca 51752608  T
Q  698 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51752609 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 51752657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 430 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 31425325 - 31424990
Alignment:
Q  430 gtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactaggg 528  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  31425325 gtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaacaaacactaggg 31425226  T
Q  529 tttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgag---tcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttt 622  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||   |||| |||||||   ||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||     
T  31425225 tttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaggctta 31425126  T
Q  623 ttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaact 721  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  31425125 ttcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaaggctgctctctcccc-atactaggtcaatttggaccgaact 31425027  T
Q  722 gggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  31425026 gggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 31424990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 400 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 50079157 - 50078800
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  50079157 ttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgcatag 50079058  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||| || ||    
T  50079057 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagatttggact 50078958  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  50078957 ttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatggctgctctctcccc 50078858  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 753  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  50078857 cagactaggtcaatttggaccgaatttggtaaacaaattcttttgtgttctctcttct 50078800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 400 - 753
Target Start/End: Original strand, 6756472 - 6756829
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||| | |||||||| || ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6756472 ttttgctataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaaatagaggggactgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 6756571  T
Q  500 agtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||| |    
T  6756572 agtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc--ttgattacgagaagagattgggac 6756669  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct-cc 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  6756670 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaagactgctctctccc 6756769  T
Q  694 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 753  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  6756770 cccagactaggtcagtttggaccgaactggatcaacaaattcttttctgttctctcttct 6756829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 400 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 17186464 - 17186109
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||| ||||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17186464 ttttaatataaatatagattttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 17186365  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   || | |||||||||| ||||||||| ||||||||| |  ||    
T  17186364 agtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgaact 17186265  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  17186264 ttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattataatggaacggagtgctgctctctcccc 17186165  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  17186164 cagactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattcttttgtgttctctctt 17186109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 400 - 751
Target Start/End: Original strand, 31489860 - 31490211
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || || |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31489860 ttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatag 31489959  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||||| | | ||||||||| |||||||||| | ||    
T  31489960 --tttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatttcttggttacgggaagagattgagact 31490057  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  31490058 ttggatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcatatggtgaaacggagggctgctctc-ccccc 31490156  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  31490157 agactaggtcaatttggactgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctctt 31490211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 359 - 678
Target Start/End: Original strand, 48665074 - 48665404
Alignment:
Q  359 gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggc----- 452  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||          
T  48665074 gtatcttcagtgtagtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggaggggg 48665173  T
Q  453 -tgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcggg 551  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  48665174 ttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgag 48665273  T
Q  552 aaac---attaagattgagtcttttggtta-cgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctctt 647  Q
    ||||   |||| |||||||||| ||||||| || ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  48665274 aaacactattaggattgagtctcttggttaccgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 48665373  T
Q  648 ttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgg 678  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48665374 ttgtaacgttactcatcatatagtggaacgg 48665404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 438 - 752
Target Start/End: Original strand, 25127855 - 25128173
Alignment:
Q  438 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 537  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  25127855 agagatagaggggcctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggt 25127954  T
Q  538 tgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 634  Q
    |||||||||| | |||||   |||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  25127955 tgattcaccttgtgaaacactatttggattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaattc 25128054  T
Q  635 attgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 733  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25128055 attgatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacggagggctgctctctctcccatactaggtcaattaggaccgaactgggtcaacaaat 25128154  T
Q  734 tcttttgtgttctatcttc 752  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  25128155 tcttttgtgttctctcttc 25128173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 16226112 - 16226461
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16226112 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggtctaaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 16226211  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  16226212 agtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggac 16226311  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  16226312 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 16226410  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  16226411 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 16226461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 20291402 - 20291750
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||  | ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20291402 ttttactataaatatagaccttgtattagagcaaattttgagatagagggagatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 20291501  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||| ||| ||||||| | || ||    
T  20291502 agtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactaggact 20291601  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| | |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||     
T  20291602 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgattctcatcatatagtggatcggagggttgttctctccccc 20291700  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20291701 acactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttttgttct 20291750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 47179654 - 47180006
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 495  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47179654 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 47179753  T
Q  496 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattg 591  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  47179754 atagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattg 47179853  T
Q  592 gggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 691  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  47179854 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 47179952  T
Q  692 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  47179953 cccc-agactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 47180006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 425 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 4131692 - 4131362
Alignment:
Q  425 tcagagtaaacct--agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaaca 522  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4131692 tcagagtaaaccttgagagatagagggggctgaaacaaggatttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaaca 4131593  T
Q  523 ctagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagac 619  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||  ||||||  | || ||||||||||||||||||| || ||    
T  4131592 ctagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgagaaac 4131494  T
Q  620 tttttcttgtaactcattgaca----tctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttgga 714  Q
    || |||||||||| |||||| |    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4131493 ttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 4131394  T
Q  715 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    | |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4131393 ctgaactatgtcaacaaattcttttgtgttct 4131362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 400 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 31423210 - 31422851
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31423210 ttttactataaatataagcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatag 31423111  T
Q  500 agtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||   ||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| | |    
T  31423110 agtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 31423011  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tata------------gtgaaacggaggg 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||            ||||||| |||||    
T  31423010 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaagagagggtgaaacagaggg 31422911  T
Q  683 ctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 742  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  31422910 ctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgagctgggtgaacaaattcttttgtg 31422851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 145 - 343
Target Start/End: Original strand, 48664852 - 48665050
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48664852 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 48664951  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  48664952 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcacatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaag 48665050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 400 - 737
Target Start/End: Original strand, 17324010 - 17324349
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||  | ||| |||||    
T  17324010 ttttattataaatatagactttgtattagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaagggttcagaaaggccacaacaaaact--gatttttatag 17324107  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| |||  || | |||||||||||  ||    
T  17324108 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattggaact 17324207  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17324208 ttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaacggaaggctggtctctcccc 17324307  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17324308 atgactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 17324349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 47177303 - 47177655
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 495  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47177303 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 47177402  T
Q  496 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagat-tgagtcttttggttacgagaagagattg 591  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||  |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  47177403 atagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatgggagtctcttggttacgggaagagattg 47177502  T
Q  592 gggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 691  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  47177503 ggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctct 47177601  T
Q  692 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    |||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  47177602 cccc-agactaggtcagattggatcgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 47177655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 40133880 - 40134239
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggg---------gctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactaggg 490  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||| |||||         |||||||||| ||||||||| | |||||||||||| | ||    
T  40133880 ttttactataaatataggctttgtatcagagtaaatcttgagatataggggctgaaaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacgaagg 40133979  T
Q  491 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaa---gattgagtcttttggttacgagaagag 587  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    |||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  40133980 tttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactactaggattgagtctcttggtcacgggaagag 40134079  T
Q  588 attggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgc 686  Q
    |||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40134080 attgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgc 40134179  T
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  40134180 tctctcccccaaactaggtcaatttggaccggactaggtaaacaaattcttttgtgttct 40134239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 145 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 4131882 - 4131690
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4131882 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaacatatatttatgg 4131783  T
Q  245 ac-aataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttca 337  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4131782 acaaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattata-ttttgatgcaaatattctttca 4131690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 153 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 45694016 - 45693834
Alignment:
Q  153 tatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaa 252  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45694016 tatgattcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctaaaaatatatttatggacaataaa 45693917  T
Q  253 tatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttcttt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  45693916 tatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaataatatattttttatgcaaatattcttt 45693834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 400 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 14183922 - 14183581
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||   ||||||||||||||||||    
T  14183922 ttttactataaatatagaccatgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaatg-caacac--aaactagggtttgtatag 14183826  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    || ||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||| || |||||   |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||| |   |    
T  14183825 aggttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattataattgagtctcttggttacgggaagagattagaatt 14183729  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  14183728 ttgggtagaattaggcggaagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccc 14183629  T
Q  696 tagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 742  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  14183628 cagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatttttttgtg 14183581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 144 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 6115719 - 6115534
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaa-tttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttat 242  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115719 atgttgtaggatgactcaaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttat 6115620  T
Q  243 ggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaat 328  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6115619 ggacaataaatatatttttgtatcgtatgaatgacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaat 6115534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 379 - 734
Target Start/End: Original strand, 42922157 - 42922514
Alignment:
Q  379 gttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaac 477  Q
    |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||    
T  42922157 gttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaa-gtcaac 42922255  T
Q  478 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttg 574  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| |   ||| |||||||||| |||    
T  42922256 aagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttg 42922352  T
Q  575 gttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtga 673  Q
    || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||     
T  42922353 gtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtgg 42922452  T
Q  674 aacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    |||||||| ||||||||| |||  |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  42922453 aacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaatt 42922514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 446 - 758
Target Start/End: Original strand, 16432396 - 16432702
Alignment:
Q  446 agggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 545  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16432396 agggggcagaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt-----------ctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcac 16432484  T
Q  546 ctcgggaaacattaa---gattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacat 642  Q
    || |||||||||||    |||||| ||| ||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||| |||||| | || |||||||||| |||||| ||    
T  16432485 cttgggaaacattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactttgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgatat 16432584  T
Q  643 ctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct-cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 740  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16432585 ctcttttgtaatgttactcatcattatagtgaaacggcggactgctctctcccccaagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttg 16432684  T
Q  741 tgttctatcttctcttct 758  Q
    |||||| |||||| ||||    
T  16432685 tgttctctcttcttttct 16432702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 556 - 758
Target Start/End: Original strand, 16429061 - 16429264
Alignment:
Q  556 attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacg 655  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  16429061 attaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagg 16429160  T
Q  656 ttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctc 754  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  16429161 ttactcatcattatagcgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttctt 16429260  T
Q  755 ttct 758  Q
    ||||    
T  16429261 ttct 16429264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 400 - 651
Target Start/End: Original strand, 6823829 - 6824091
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggg-gctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 498  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823829 ttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 6823928  T
Q  499 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtctttt-------ggttacgagaagaga 588  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||| ||| ||       ||||||| |||||||    
T  6823929 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattacgattgaatctcttggttacgggttacgggaagaga 6824028  T
Q  589 ttggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgt 651  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  6824029 ttggggctttgggtagaattaggcggcagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 6824091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 522 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248532
Alignment:
Q  522 actagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggaga 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||| |||| ||||| | ||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggaga 25248667  T
Q  619 ctttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccg 717  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25248666 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctccctcccctagactaggtcaatttggaccg 25248567  T
Q  718 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25248566 aactgggtcaacaaattcttttgtgttttatcttc 25248532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 400 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 49495535 - 49495206
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||          ||||||||||||| |||     
T  49495535 ttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaatc--------aaactagggtttgcatat 49495444  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaaga---ttgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| ||||   | |||||||||||| |||||||| ||| |   |||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  49495443 agtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gagttgattcaccttgggaaacactaataaaattgagtcttttggtcacggtaagagattggggct 49495348  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  49495347 ttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaagggcttatctctcccc 49495248  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
     |||||| |||||||| ||||||||| ||| || ||||||||    
T  49495247 aagactatgtcaatttagaccgaactaggtaaagaaattctt 49495206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 400 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 8347605 - 8347284
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 498  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  8347605 ttttactataaa-atagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtata 8347508  T
Q  499 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    ||| ||| ||||| | ||||||||| | ||||  |||||||||||||||  |||||||   ||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||| | |    
T  8347507 gagattg-ctcttggcaacaaacaccaaggtt--agggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttgatcacgggaagagattgagac 8347411  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 694  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  8347410 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtggaacggagggatgctctttccc 8347311  T
Q  695 ctagactaggtca-atttggaccgaac 720  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||    
T  8347310 ctagactaggtcagttttggaccgaac 8347284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 144 - 333
Target Start/End: Original strand, 6997213 - 6997395
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6997213 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattattgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctaaaaatata-ttatg 6997311  T
Q  244 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttct 333  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||      ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6997312 gacaataaatatatttttataccgtatgaagaacgatttgatgcaaa------ttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattct 6997395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 400 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 18800905 - 18800570
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||    
T  18800905 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatacaaggggctgaaacaaaggtttagaa-gtcaacaagaaaactacggtttgtatag 18800807  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||| ||||| |  ||||| ||||||||| |  ||||||||||||  | ||||||   ||| |||||||||| | ||| ||| | ||||||| |  ||    
T  18800806 agtttg-ctcttggccacaaatactagggttgg--ggttgattcaccctgagaaacactattaggattgagtctctaggtcacgggtagagatttgaact 18800710  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  18800709 ttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtatcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaagcggagaactgctctctcccc 18800610  T
Q  696 tagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
     | ||||||| |  |||||||| ||| |||| ||||||||    
T  18800609 caaactaggttagttttggaccaaacagggtaaacaaatt 18800570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 400 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 15669727 - 15669374
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagagatagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 497  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| | | ||||||||||||||||| | | ||||| | | |||| || ||||| ||||||||||||    
T  15669727 ttttactataaatacagaccttgtagcagatgtaaacattgggatagagggggctgaaaactagggtttggga-ggcagca-caaaagtagggtttgtat 15669630  T
Q  498 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 594  Q
    | |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||| |     
T  15669629 aaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaga 15669533  T
Q  595 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 693  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| | |||| | ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15669532 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcc 15669433  T
Q  694 cctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
    || |||||||||||  ||| ||| |||||| || |||||||| | ||||||||| ||||    
T  15669432 ccgagactaggtcagttttagactgaactgtgtaaacaaattttgttgtgttctctctt 15669374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 595 - 751
Target Start/End: Original strand, 23816029 - 23816185
Alignment:
Q  595 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 694  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||    
T  23816029 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatggatcggagggatgctctctccc 23816128  T
Q  695 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23816129 ccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 23816185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 556 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 6115280 - 6115077
Alignment:
Q  556 attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacg 655  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||      
T  6115280 attaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgtaaccaattgatatctcttttgtaaaa 6115181  T
Q  656 ttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctc 754  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||     
T  6115180 ttactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattattttgtgttctctcttctt 6115081  T
Q  755 ttct 758  Q
    ||||    
T  6115080 ttct 6115077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 145 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 46432636 - 46432521
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46432636 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 46432537  T
Q  245 acaataaatatatttt 260  Q
    ||||||||||||||||    
T  46432536 acaataaatatatttt 46432521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 183 - 343
Target Start/End: Original strand, 6996067 - 6996221
Alignment:
Q  183 ttgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgattt 282  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6996067 ttgttgctaaaaatataaaagacttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaatacatatatttttgtaccgtatgaagaacgattt 6996166  T
Q  283 gatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 343  Q
    |||  |||      |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  6996167 gatgtaaa------ttgaaagggaatattatatttttgttgcaaatattctttcactgaag 6996221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 399 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 8349386 - 8349033
Alignment:
Q  399 attttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 497  Q
    |||||| |||||||||||| |||| || ||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||| |||| || |||||||||    
T  8349386 attttattataaatatagatcttgtattagatgcaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattaaggtttgtat 8349288  T
Q  498 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 594  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||| |||||||| ||||||||   ||| |||||||| |  |||| ||| ||||||||| ||     
T  8349287 agagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggtttattcaccttgggaaacactattaggattgagtttgatggtcacgggaagagattagga 8349191  T
Q  595 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 693  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||  ||||| || |||||||    
T  8349190 ctttaggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaactcattggtatctcttttgttaagttactcatcattatagtggaatagagggttgttctctcc 8349091  T
Q  694 cctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
    || |||||| ||||  ||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  8349090 ccaagactatgtcagttttagaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctctt 8349033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 565 - 734
Target Start/End: Original strand, 23785953 - 23786121
Alignment:
Q  565 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 664  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  23785953 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 23786051  T
Q  665 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23786052 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 23786121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 152 - 298
Target Start/End: Original strand, 16561138 - 16561284
Alignment:
Q  152 gtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataa 251  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16561138 gtatgattcaaaatttgttggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttattgacaataa 16561237  T
Q  252 atatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatatttt 298  Q
    |||| |||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||    
T  16561238 atatctttttgtaccgtatgaaggaatatttgaaacaaatatatttt 16561284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 522 - 746
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231856
Alignment:
Q  522 actagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattg-agtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggag 617  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggag 16231729  T
Q  618 actttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccg 717  Q
    |||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  16231730 acttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccg 16231828  T
Q  718 aactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    |||| |||||||||||   ||||||||||    
T  16231829 aact-ggtcaacaaatatctttgtgttct 16231856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 556 - 746
Target Start/End: Original strand, 51757635 - 51757824
Alignment:
Q  556 attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacg 655  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||  ||||||| ||||||    
T  51757635 attaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgatttctcttt-gtaacg 51757733  T
Q  656 ttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
     |||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51757734 atactcaccatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 51757824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 279 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 26520580 - 26520207
Alignment:
Q  279 atttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnnnnnnnnnngg-----tatcttcagtgtag 373  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||            |     ||||||||||||      
T  26520580 atttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcaccgaagaagaaaaaaacaaaagaaatgtatcttcagtgtga 26520481  T
Q  374 tattcgttccaaatttatgatttatattttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagag-ggggctg-aaacaatggtttagaaa 471  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||    
T  26520480 tattcgttccaaatttataagttatatttctctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaacggtttag-aa 26520382  T
Q  472 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagt 568  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||   |||| ||||||||    
T  26520381 gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacacta-agattga-ggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagt 26520285  T
Q  569 cttttg------gttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaactcattga 639  Q
    || |||      || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||| ||||||    
T  26520284 ctcttggtcacagtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggaaacttattcttgtaacccattga 26520207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 405 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 13125787 - 13125455
Alignment:
Q  405 ctataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg-tatagagtt 503  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||| |||| |||| | ||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  13125787 ctataaatagaaaccttgtatcagagtaaaacttgagagaaagggggctgaaacaagggttaagaa-gccaacaaggaaactagggtttggtatagagtt 13125689  T
Q  504 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 600  Q
    || ||||| |  ||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||    ||| ||||||| || ||||| | | |||||||||||| ||||||    
T  13125688 tg-ctcttggcgacaaacactagggtt-gagg-ttgattcacattgggaaacgctgttaggattgaggctcttggtcaagggaagagattgggactttgg 13125592  T
Q  601 gtagaattaggcggga-gactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctag 698  Q
    |||||||||||   || ||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||| ||||       
T  13125591 gtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagttgctctccccccctt 13125492  T
Q  699 actaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    ||||||||| | | |||||||||| ||| ||||||||    
T  13125491 actaggtcagtataggaccgaactaggtaaacaaatt 13125455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 657 - 746
Target Start/End: Original strand, 13358778 - 13358867
Alignment:
Q  657 tactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13358778 tactcttcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13358867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 225 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11693666 - 11693580
Alignment:
Q  225 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatatt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  11693666 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagggaatatt 11693580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 400 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 25248850 - 25248756
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 494  Q
    |||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25248850 tttttctagaaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 25248756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 155 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 13785835 - 13785662
Alignment:
Q  155 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttg-----------------tgctgaaaatata 237  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                 |||||||||||||    
T  13785835 tgactcaaaaattgatggatggagaatattgtcgctaaaaatatgaaagatttgtttcaaatatattttgtgtttctagaatattgttgctgaaaatata 13785736  T
Q  238 tttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatatt 311  Q
    ||||| || | |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  13785735 tttatagatagtaaatatatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaaaggaatatt 13785662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 400 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 30790730 - 30790401
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 498  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||  |||||||||  |||  |  ||||||||||||   ||    
T  30790730 ttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt---ta 30790636  T
Q  499 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    ||| || |||||  |    | |||||||||||    |||||||| |||| ||||||||   ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| | | |    
T  30790635 gagatt-tctctaagagggagacactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagac 30790540  T
Q  596 tttgggtagaattaggcg-ggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 693  Q
    |||| |||||||||||   |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||| |    
T  30790539 tttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctctcttc 30790440  T
Q  694 cctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaa 732  Q
    || |||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  30790439 cc-agactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaa 30790401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 624 - 734
Target Start/End: Original strand, 15916562 - 15916674
Alignment:
Q  624 tcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaa-tttggaccgaact 721  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  15916562 tcttgtaacccattgatatctcttttataaagttactcgtcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaact 15916661  T
Q  722 gggtcaacaaatt 734  Q
    |||| ||||||||    
T  15916662 gggtaaacaaatt 15916674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 155 - 274
Target Start/End: Original strand, 32260746 - 32260882
Alignment:
Q  155 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttg-----------------tgctgaaaatata 237  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||                 |||||||||||||    
T  32260746 tgactcaaaatttgatggatgaagaagattgttgctaaaaatataaaagaattgtttaaaatatattttgtgttttcagaagattgttgctgaaaatata 32260845  T
Q  238 tttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaag 274  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32260846 tttatgaacaataaatatatttttgtaccgtatgaag 32260882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 400 - 495
Target Start/End: Original strand, 16231546 - 16231641
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 495  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16231546 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtctagaaaagcaacaagaaaactagggtttgt 16231641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 455 - 734
Target Start/End: Original strand, 27916500 - 27916780
Alignment:
Q  455 aaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaa 554  Q
    |||||| ||||||||| | || ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||   ||||||||||| || |||    
T  27916500 aaacaagggtttagaa-gccagcaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggaa--ttgattcaccttggaaaa 27916593  T
Q  555 ca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaac--tcattgacatctcttt 648  Q
    ||   |||  ||||||||| ||||| ||  |||||||||| | |||||||| ||||||||   || ||||  ||||| ||||  || |||| ||||||||    
T  27916594 cactattagaattgagtctcttggtcacatgaagagattgtgactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttttaaccttctttgatatctcttt 27916693  T
Q  649 tgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
     |||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||    
T  27916694 -gtaaagttactcatcgttatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaattgggtaaacaaatt 27916780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 228 - 311
Target Start/End: Original strand, 14352759 - 14352842
Alignment:
Q  228 tgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatatt 311  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  14352759 tgaaaatatatttatgaatagtaaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagggaatatt 14352842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 537 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 26613440 - 26613221
Alignment:
Q  537 ttgattcacctcgggaaacattaa---gattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaac 632  Q
    ||||||||||| |||||||| ||    |||||||||  ||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||| ||||||||||    
T  26613440 ttgattcaccttgggaaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 26613341  T
Q  633 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 730  Q
     | |||| |||||||||| || |||||| |||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||||| ||| ||||||| | || ||||||||||||| ||||    
T  26613340 cctttgatatctcttttggaaagttactaatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagattaggtcagtatttgaccgaactgggtaaaca 26613241  T
Q  731 aattcttttgtgttctatctt 751  Q
    |||| || |||||||| ||||    
T  26613240 aatt-ttgtgtgttctctctt 26613221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 556 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 30738808 - 30738625
Alignment:
Q  556 attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaac 654  Q
    |||| |||||||||| ||||| |   ||||||||||||  ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||| | ||||  ||||||||||||     
T  30738808 attaggattgagtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatgtctcttttgtaaa 30738709  T
Q  655 gttactcatca---tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| | ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  30738708 gttactcatcatattatagtgaaacggagggatgctctctcacccatactaggtcagtattggaccaaacttggtaaacaaatt 30738625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 534 - 734
Target Start/End: Original strand, 16561545 - 16561751
Alignment:
Q  534 gggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgt 629  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||| |||| ||||| ||||  |||  || |||||| | |||||||||||| ||||   || ||||| |||||||    
T  16561545 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttgt 16561644  T
Q  630 aactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtca 727  Q
    ||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||  |||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| || |    
T  16561645 aaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacaaagggttgctctctcccatagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaa 16561744  T
Q  728 acaaatt 734  Q
    |||||||    
T  16561745 acaaatt 16561751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 287 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 6115538 - 6115479
Alignment:
Q  287 caaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggag 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  6115538 caaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaaggag 6115479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 572 - 746
Target Start/End: Original strand, 28279385 - 28279563
Alignment:
Q  572 ttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tata 669  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||   || ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28279385 ttggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctcttttgtaaagttactcatcattata 28279484  T
Q  670 gtgaaacggagggctgctctct-cccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||| ||  ||| | || ||| | |||||||||||||||| | || || |||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  28279485 gtggaattgagagttgttctttccccctagactaggtcagtattagatcgaactgggtaaacaaatttttgtgtgttct 28279563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 311
Target Start/End: Original strand, 10115509 - 10115653
Alignment:
Q  182 attgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgc-----------------tgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgta 264  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |     
T  10115509 attgttgttaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgcttccataagattgttgttgaaaatatatttatggacaataa--atatttttatc 10115606  T
Q  265 ccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatatt 311  Q
    |||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  10115607 ccgtatgaaggaatatttgatgcaaatatatttttaaacggaatatt 10115653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13112099 - 13112046
Alignment:
Q  212 caaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtac 265  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13112099 caaatgtattttatgctgaaaatatattcatggacaataaatatatttttgtac 13112046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 705 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 13447301 - 13447260
Alignment:
Q  705 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13447301 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13447260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 537 - 709
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155963
Alignment:
Q  537 ttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaac 632  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||| |||||| ||| ||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||   | ||| |  ||||||||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaagagtaattcttgtaac 155887  T
Q  633 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat 709  Q
       |||  ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  155888 cttttgttatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccc-aaactaggtcaat 155963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11693753 - 11693686
Alignment:
Q  155 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattt 222  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||    
T  11693753 tgactcaaaatttgatggatgaagaagattattgctaaaattataaaaattttgttttaaatatattt 11693686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 641 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 13127780 - 13127685
Alignment:
Q  641 atctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||| | | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  13127780 atctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcctccagactaggttagtattggaccgaaccgggtaaacaaatt 13127685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 9476319 - 9476265
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9476319 ggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9476265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 405 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 13127959 - 13127811
Alignment:
Q  405 ctataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 504  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||  ||| ||| |||| |||||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  13127959 ctataaatataaaccttgtatcggagtaaacctttagagaga-ggggttgaaacaagggtttag-aagccaacaagaaaagtagggtttatatagagttt 13127862  T
Q  505 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacatt 558  Q
      || || | ||||||||||||||||   || | ||||||||| ||||||||||    
T  13127861 -ccttttggcaacaaacactagggtt--gggatagattcaccttgggaaacatt 13127811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 556 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 21353521 - 21353342
Alignment:
Q  556 attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaac 654  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||   || ||||  ||||||||||||| |   |||||||| ||||     
T  21353521 attaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactcaat---atctcttt-gtaaa 21353427  T
Q  655 gttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    |  ||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  21353426 gaaactcatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatctttagaccgaactgggtaaacaaattctt 21353342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 681 - 731
Target Start/End: Original strand, 47102884 - 47102934
Alignment:
Q  681 ggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  47102884 ggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47102934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 679 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 13598454 - 13598402
Alignment:
Q  679 agggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13598454 agggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13598402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 620 - 690
Target Start/End: Original strand, 43104329 - 43104400
Alignment:
Q  620 tttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctc 690  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||    
T  43104329 tttttcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagatgctctc 43104400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 16124555 - 16124609
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  16124555 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaa 16124609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 19072986 - 19072932
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19072986 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 19072932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 19120876 - 19120822
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19120876 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 19120822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 400 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 26613576 - 26613503
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--agagatagagggggctg-aaacaatggtttagaa 470  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  26613576 ttttgctataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagagatagagggggctgaaaacaagggtttagaa 26613503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 26644936 - 26644990
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26644936 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 26644990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 47098863 - 47098917
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  47098863 ggagggctgctctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47098917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 47703975 - 47704029
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  47703975 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47704029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 437
Target Start/End: Original strand, 43104104 - 43104141
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct 437  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43104104 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacct 43104141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 834211 - 834167
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  834211 tctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 834167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 431 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 6115384 - 6115344
Alignment:
Q  431 taaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaa 471  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6115384 taaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 6115344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 666 - 733
Target Start/End: Original strand, 9526582 - 9526650
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 733  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  9526582 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 9526650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 13138020 - 13137976
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13138020 tctctcccctagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13137976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 28220270 - 28220226
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28220270 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28220226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 28265598 - 28265554
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28265598 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 28265554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 667 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 37069838 - 37069774
Alignment:
Q  667 atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||||| | ||||| | |||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  37069838 atagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 37069774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 50169254 - 50169210
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  50169254 tctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactggatcaacaa 50169210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 677 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 3281766 - 3281715
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 728  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  3281766 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 3281715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 6997427 - 6997388
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatatt 184  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6997427 tgttgtagtatgactcaaaatatgatggatggagaatatt 6997388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16855296 - 16855265
Alignment:
Q  192 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16855296 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 16855265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 677 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 29651869 - 29651818
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 728  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  29651869 ggagtgctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 29651818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 21536608 - 21536662
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  21536608 ggagagctgctctctcccccagattaggtcattttttaccgaactgggtcaacaa 21536662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 689 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 45644396 - 45644354
Alignment:
Q  689 tctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45644396 tctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 45644354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 418; Significance: 0; HSPs: 126)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 752
Target Start/End: Original strand, 21989853 - 21990460
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  21989853 tgttgtagtatgacccaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattgtgt--tgaaaatatatttatgg 21989950  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21989951 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 21990050  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 443  Q
    ||           | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21990051 aggaaaaaaaaacg-tatcttctgtgtggtattcgttccaaatttatgagttataattttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagat 21990149  T
Q  444 agagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 543  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21990150 agagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactatgatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 21990248  T
Q  544 acctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 640  Q
    |||| | ||||||   |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21990249 accttgagaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgat 21990348  T
Q  641 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 740  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21990349 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 21990448  T
Q  741 tgttctatcttc 752  Q
    |||||| |||||    
T  21990449 tgttctctcttc 21990460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 37412716 - 37412097
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37412716 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 37412617  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  37412616 acaataaatataattatgtaacgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattcttccactgaagg 37412517  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatatttt-actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 443  Q
    ||            |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37412516 agaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtgttattcgttccaaatttatgagttatatttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagat 37412419  T
Q  444 agagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttt-ggaacaaacactagggtttgagggttgatt 542  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37412418 atagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgatt 37412319  T
Q  543 cacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattga 639  Q
    ||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37412318 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattga 37412219  T
Q  640 catctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  37412218 tatctctttttgtaaggttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccctagactgggtcaatttggaccgaactggatcaataaattctt 37412119  T
Q  738 ttgtgttctatcttctcttctt 759  Q
    |||||||||  |||||||||||    
T  37412118 ttgtgttctcccttctcttctt 37412097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 746
Target Start/End: Original strand, 20625734 - 20626342
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20625734 tgttctagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 20625833  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20625834 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattttttcactgaagg 20625933  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatat-tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----ag 439  Q
    ||           | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| |    ||    
T  20625934 agcaaaaaaaaacg-tatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagag 20626032  T
Q  440 agatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 539  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20626033 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttg 20626132  T
Q  540 attcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcat 636  Q
    |||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||    
T  20626133 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccat 20626232  T
Q  637 tgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 736  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20626233 tgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 20626332  T
Q  737 tttgtgttct 746  Q
    ||||||||||    
T  20626333 tttgtgttct 20626342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 746
Target Start/End: Original strand, 20629625 - 20630233
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629625 tgttctagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 20629724  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20629725 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattttttcactgaagg 20629824  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatat-tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----ag 439  Q
    ||           | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| |    ||    
T  20629825 agcaaaaaaaaacg-tatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagag 20629923  T
Q  440 agatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 539  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20629924 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttg 20630023  T
Q  540 attcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcat 636  Q
    |||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||    
T  20630024 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccat 20630123  T
Q  637 tgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 736  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630124 tgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 20630223  T
Q  737 tttgtgttct 746  Q
    ||||||||||    
T  20630224 tttgtgttct 20630233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 746
Target Start/End: Original strand, 20642044 - 20642652
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642044 tgttctagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 20642143  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20642144 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattttttcactgaagg 20642243  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatat-tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----ag 439  Q
    ||           | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| |    ||    
T  20642244 agcaaaaaaaaacg-tatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagag 20642342  T
Q  440 agatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 539  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20642343 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttg 20642442  T
Q  540 attcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcat 636  Q
    |||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||    
T  20642443 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccat 20642542  T
Q  637 tgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 736  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642543 tgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 20642642  T
Q  737 tttgtgttct 746  Q
    ||||||||||    
T  20642643 tttgtgttct 20642652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 144 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 7472575 - 7471965
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472575 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 7472476  T
Q  244 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 343  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7472475 gacaataaatatattattgtatcatatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaag 7472376  T
Q  344 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatat-tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----a 438  Q
    |||            ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    |    
T  7472375 gagaaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgaga 7472276  T
Q  439 gagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 538  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7472275 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 7472176  T
Q  539 gattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactca 635  Q
    ||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  7472175 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaaccca 7472076  T
Q  636 ttgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 735  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472075 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 7471976  T
Q  736 ttttgtgttct 746  Q
    |||||||||||    
T  7471975 ttttgtgttct 7471965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 746
Target Start/End: Original strand, 38393683 - 38394290
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38393683 tgttgtagtatgattctaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatatataagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatttatttatgg 38393782  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38393783 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatgttatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 38393882  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----ag 439  Q
     |            ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |    ||    
T  38393883 tgaaaaaataac--gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagag 38393980  T
Q  440 agatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 539  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38393981 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttg 38394080  T
Q  540 attcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcat 636  Q
    |||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  38394081 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 38394180  T
Q  637 tgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 736  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394181 tgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 38394280  T
Q  737 tttgtgttct 746  Q
    ||||||||||    
T  38394281 tttgtgttct 38394290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 144 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 7470622 - 7470007
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470622 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattattgctaaaaatataaaacatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 7470523  T
Q  244 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 343  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7470522 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaag 7470423  T
Q  344 gagnnnnnnnnnnng-----gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatat-tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct 437  Q
    |||                 ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  7470422 gagaaaagaaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagactaaactt 7470323  T
Q  438 ----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttga 533  Q
        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7470322 tgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgt 7470223  T
Q  534 gggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgta 630  Q
    |||||||||||||| | ||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7470222 gggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 7470123  T
Q  631 actcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 730  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470122 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctccctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 7470023  T
Q  731 aattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||    
T  7470022 aattcttttgtgttct 7470007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 144 - 746
Target Start/End: Original strand, 20299154 - 20299764
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299154 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttatttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 20299253  T
Q  244 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 343  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20299254 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 20299353  T
Q  344 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----a 438  Q
    |||            ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |    |    
T  20299354 gagaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtggtatttgttccatatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 20299451  T
Q  439 gagatagagggggctgaaacaa-tggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggg-tttgaggg 536  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  20299452 gagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgaggg 20299551  T
Q  537 ttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaact 633  Q
    ||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  20299552 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 20299651  T
Q  634 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 733  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299652 cattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 20299751  T
Q  734 tcttttgtgttct 746  Q
    |||||||||||||    
T  20299752 tcttttgtgttct 20299764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 745
Target Start/End: Original strand, 3035415 - 3036027
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035415 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 3035514  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3035515 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 3035614  T
Q  345 agnnnnnnnnnnng-gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----a 438  Q
    ||             ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |    |    
T  3035615 agaaagaaaaaaaacgtatcttcagtatggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 3035714  T
Q  439 gagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 538  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  3035715 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 3035814  T
Q  539 gattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacg---agaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaac 632  Q
    ||||||||| |||||||   |||| |||||||||| |||||||||   |||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3035815 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaac 3035914  T
Q  633 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 732  Q
     ||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035915 ccattgatttctcttttgcaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 3036014  T
Q  733 ttcttttgtgttc 745  Q
    |||||||||||||    
T  3036015 ttcttttgtgttc 3036027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 214 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 13099996 - 13099453
Alignment:
Q  214 aatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099996 aatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatattttcgtaccgtatgaagaacgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattat 13099897  T
Q  314 atttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaat 412  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||           | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13099896 atttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaaaaacg-tatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaat 13099798  T
Q  413 atagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttt 512  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099797 atagaccttgaatcaaagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttt 13099698  T
Q  513 ggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaatta 609  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099697 ggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaatta 13099598  T
Q  610 ggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca 707  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13099597 ggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 13099498  T
Q  708 atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13099497 atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 13099453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 144 - 746
Target Start/End: Original strand, 28487248 - 28487857
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28487248 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgcttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 28487347  T
Q  244 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 343  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28487348 gacaataaatataattttgtatcgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 28487447  T
Q  344 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----a 438  Q
    |||           | |||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| || |||||  ||||| |    |    
T  28487448 gagaaaaaaaaaacg-tatcttcagtgtggtatttgttctaaatttatgagttatacttttcctataaatatagaccatgtatcaggctaaactttgaga 28487546  T
Q  439 gagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 538  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | |||||    
T  28487547 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggtt 28487646  T
Q  539 gattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactca 635  Q
    |||||||||  ||||||   |||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  28487647 gattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 28487746  T
Q  636 ttgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 735  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28487747 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcagagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattc 28487846  T
Q  736 ttttgtgttct 746  Q
    |||||||||||    
T  28487847 ttttgtgttct 28487857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 746
Target Start/End: Original strand, 18345237 - 18345845
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  18345237 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctaaaaatatatttattg 18345336  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18345337 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaatggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 18345436  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagag-- 441  Q
    ||           | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | ||| | |||      
T  18345437 agaaaaaaaaaacg-tatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctgaactttgaggg 18345535  T
Q  442 --atagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 539  Q
      |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  18345536 agatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttg 18345635  T
Q  540 attcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcat 636  Q
    |||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  18345636 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 18345735  T
Q  637 tgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 736  Q
    |||  |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18345736 tgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattct 18345835  T
Q  737 tttgtgttct 746  Q
    ||||||||||    
T  18345836 tttgtgttct 18345845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 42331593 - 42330977
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42331593 tgttgtagtatgacttaaaatttgatgaatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 42331494  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  42331493 acaataagtatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcattgaagg 42331394  T
Q  345 agnnnnnnnnnnng----gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctag 439  Q
    ||                ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | |    
T  42331393 agaaagaaaaaaaaaaacgtatctttagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttg 42331294  T
Q  440 agatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 539  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42331293 agatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttg 42331194  T
Q  540 attcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttac--gagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 634  Q
    |||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||  | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  42331193 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 42331094  T
Q  635 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42331093 attgatatctcttttgtaaagttactcattatatagtgaaacggagggctattctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 42330994  T
Q  735 cttttgtgttctatctt 751  Q
    |||||||||||| ||||    
T  42330993 cttttgtgttctctctt 42330977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 744
Target Start/End: Original strand, 28485261 - 28485867
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485261 tgttgtagtatgattcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 28485360  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  28485361 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcaccgaagg 28485460  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----ag 439  Q
    ||            ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |    ||    
T  28485461 aggaaaaaaaacacgtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagag 28485560  T
Q  440 agatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 539  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  28485561 agatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttg 28485660  T
Q  540 attcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcat 636  Q
    ||||||||  ||||||   |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||  |||    
T  28485661 attcacctttggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccat 28485760  T
Q  637 tgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 736  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485761 tgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcagagggttgctctctcctc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 28485859  T
Q  737 tttgtgtt 744  Q
    ||||||||    
T  28485860 tttgtgtt 28485867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 144 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 31156501 - 31155896
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 243  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31156501 atgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatg 31156402  T
Q  244 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 343  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31156401 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 31156302  T
Q  344 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagaga 442  Q
    |||           |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||| ||||  | |||| | ||||    
T  31156301 gagaaaaaaaaaacga-atcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagctatacttttactataaatatagagcttgtatcaaggcaaactttgaga 31156203  T
Q  443 tagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatt 542  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  31156202 tagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgatt 31156103  T
Q  543 cacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattg 638  Q
    ||||| |||||||   |||| |||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  31156102 caccttgggaaacactattaggattggagtctcttgggtacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 31156003  T
Q  639 acatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 738  Q
    |  |||| ||||||||| |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  31156002 atttctc-tttgtaacggtactcatcctatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctt 31155904  T
Q  739 tgtgttct 746  Q
    ||||||||    
T  31155903 tgtgttct 31155896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 144 - 746
Target Start/End: Original strand, 1849664 - 1850285
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1849664 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 1849763  T
Q  244 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 343  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1849764 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcagatattctttcactgaag 1849863  T
Q  344 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----- 437  Q
    |||           |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| || |||| |         
T  1849864 gagaaaaaaaaaacga-atcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgaga 1849962  T
Q  438 -----------agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 526  Q
               ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1849963 gagagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactag 1850062  T
Q  527 ggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttt 623  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||   ||| |||||||| | ||| ||||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  1850063 ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttat 1850162  T
Q  624 tcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgg 723  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  1850163 tcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgg 1850262  T
Q  724 gtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1850263 gtcaacaaattcttttgtgttct 1850285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 7352246 - 7351637
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7352246 tgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatgg 7352147  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  7352146 acaataaatatatttttgtatcgcatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgaggcaaatattctttcactgaatg 7352047  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct------ 437  Q
    ||            |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| |          
T  7352046 agaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtgatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatataaaccttgtatcaggctaaactttgagag 7351949  T
Q  438 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 537  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  7351948 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggctttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggt 7351849  T
Q  538 tgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaact 633  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  7351848 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 7351749  T
Q  634 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 733  Q
    ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7351748 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 7351650  T
Q  734 tcttttgtgttct 746  Q
    |  ||||||||||    
T  7351649 ttctttgtgttct 7351637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 672
Target Start/End: Original strand, 11756925 - 11757460
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11756925 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 11757024  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11757025 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaactatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 11757124  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----ag 439  Q
    ||            ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |    ||    
T  11757125 agaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagag 11757222  T
Q  440 agatagagggggctgaaacaa-tggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggg-tttgagggt 537  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  11757223 agatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggt 11757322  T
Q  538 tgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 634  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  11757323 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 11757422  T
Q  635 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 672  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757423 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 11757460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 144 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 7349868 - 7349262
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 243  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7349868 atgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatg 7349769  T
Q  244 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 343  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  7349768 gacaataaatatatttttgtatcgcatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgaggcaaatattctttcactgaat 7349669  T
Q  344 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----- 437  Q
    |||            |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |         
T  7349668 gagaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtgatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 7349571  T
Q  438 -agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaggg 536  Q
     ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  7349570 gagagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtggg 7349471  T
Q  537 ttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaac 632  Q
    ||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7349470 ttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 7349371  T
Q  633 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 732  Q
     ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    |||||||||    
T  7349370 ccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa----gtcaacaaa 7349276  T
Q  733 ttcttttgtgttct 746  Q
    ||  ||||||||||    
T  7349275 tttctttgtgttct 7349262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 153 - 753
Target Start/End: Original strand, 24258166 - 24258779
Alignment:
Q  153 tatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24258166 tatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaa 24258265  T
Q  253 tatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnnnnn 352  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||          
T  24258266 tatatttttgtacagtatgaaggacgatt-gatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgtaaatattctttcactgaaggagaaaaaa 24258364  T
Q  353 nnnnng----gtatcttcagtgtag--tattcgttccaaatttatgatttatattttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagataga 446  Q
         |    |||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||   ||| |||||||||||| | ||||||||    
T  24258365 ataaagaaatgtatcttcagtgtgtgatattcgttccaaatttatgagttatatttctctataaatataggttttgtatcagagtaaacattgagataga 24258464  T
Q  447 gggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 546  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24258465 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactatggtttgagggttgattcacc 24258564  T
Q  547 tcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatc 643  Q
    | || ||||   |||| |||||||||| ||||| ||| ||| |||||| | |||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||| |||    
T  24258565 ttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttggatagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatc 24258664  T
Q  644 tcttttgtaacgttactcatca----tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac-aaattcttt 738  Q
    |||||||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| | | | ||| |||||||||    
T  24258665 tcttttgtaaagttactcatcattattatagtggaacggagggctgctctctctttcagactaggtcaatttggaccgaattagatgaacaaaattcttt 24258764  T
Q  739 tgtgttctatcttct 753  Q
    |||||||| ||||||    
T  24258765 tgtgttctctcttct 24258779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 249 - 746
Target Start/End: Original strand, 20297163 - 20297666
Alignment:
Q  249 taaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnn 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||      
T  20297163 taaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcaccgaaggagaa 20297262  T
Q  349 nnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagat 443  Q
              ||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||  ||||| |    ||||||    
T  20297263 aaaaaaac--gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttacgagttatacttttactaaaaatatggaccttgtatcaggctaaactttgagagagat 20297360  T
Q  444 agagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 543  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20297361 agagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgattc 20297460  T
Q  544 acctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 640  Q
    |||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||     
T  20297461 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaacccattgat 20297560  T
Q  641 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 740  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20297561 ttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttg 20297660  T
Q  741 tgttct 746  Q
    ||||||    
T  20297661 tgttct 20297666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Original strand, 44724534 - 44724889
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724534 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 44724633  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||    
T  44724634 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggact 44724733  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  44724734 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccc 44724833  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44724834 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 44724889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 359 - 752
Target Start/End: Original strand, 443508 - 443906
Alignment:
Q  359 gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaa 457  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||    
T  443508 gtatcttcagtgtggaattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggagctaaaa 443607  T
Q  458 caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac-- 555  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  443608 caatggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacac 443707  T
Q  556 -attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaac 654  Q
     |||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  443708 tattaggattgagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctcttttataac 443807  T
Q  655 gttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct-cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  443808 gttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctcccccccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 443906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 225 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 43254035 - 43253502
Alignment:
Q  225 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgc 324  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43254035 tgctaaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgc 43253936  T
Q  325 aaatgttctttcactgaaggagnnnnnnnnnnng-gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttg 422  Q
    |||| |||||||||||||||||             |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43253935 aaatattctttcactgaaggagaaaaaataagaaagtatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttg 43253836  T
Q  423 aatcagagtaaacctagagatagaggg--------ggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgg 514  Q
     |||||  ||||| | |||| |||| |        ||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43253835 tatcaggctaaactttgagagagagagagaaagagggctgaaacaaggttttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgg 43253736  T
Q  515 aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg 611  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||| |||||  |||||  || | |||||| ||||||||||    
T  43253735 aacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacggaaagaggctgagactttggatagaattagg 43253637  T
Q  612 cgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaattt 711  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  43253636 cgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccctcagactaggtcaattt 43253537  T
Q  712 ggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43253536 agaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 43253502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 20137443 - 20137082
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20137443 ttttactataaatattggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatag 20137344  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||    
T  20137343 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttgattacgggaagagattgggact 20137244  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20137243 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccc 20137144  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20137143 -agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 20137082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 4296270 - 4295907
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagacctt-gaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 498  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  4296270 ttttactataaatatagacatttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtata 4296171  T
Q  499 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 594  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  4296170 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 4296071  T
Q  595 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 694  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4296070 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctatctccc 4295971  T
Q  695 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4295970 ccatactaggtcaatttggaccgaactgggtgaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 4295907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 27306563 - 27306205
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27306563 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-tatag 27306465  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  27306464 agtttgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 27306365  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27306364 ttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccct 27306265  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||    
T  27306264 agactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattc--ttgtgttctctcttcttttct 27306205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 404 - 746
Target Start/End: Original strand, 48457608 - 48457957
Alignment:
Q  404 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||| |    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457608 actataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 48457707  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  48457708 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacctagggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 48457807  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  48457808 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccc 48457907  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457908 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 48457957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 44519 - 44868
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44519 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtag 44618  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  44619 agtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtcttttggttacgggaagaggttgggact 44718  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||     
T  44719 ttgggtagaattatgtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatagctgctttctccccc 44818  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44819 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 44868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 424 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 21592453 - 21592116
Alignment:
Q  424 atcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacac 523  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21592453 atcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaatgcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacac 21592354  T
Q  524 tagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagact 620  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||   ||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21592353 tagggtttgagggttgattcaccttggcaagcactattaggatttagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagact 21592254  T
Q  621 ttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaac 720  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  21592253 tattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaac 21592154  T
Q  721 tgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21592153 tgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 21592116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 400 - 751
Target Start/End: Original strand, 11355213 - 11355567
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11355213 ttttactataaatataggctttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 11355312  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| | ||    
T  11355313 agtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagact 11355412  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  11355413 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaacgtttctcatcatatagtggaacagagagctgctctctcccct 11355512  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  11355513 agactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttatgttctctctt 11355567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 35584 - 35933
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  35584 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtag 35683  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  35684 agtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 35783  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  35784 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctttctcccct 35883  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  35884 agactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaatttttttgtgttct 35933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 31435381 - 31435019
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435381 ttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 31435282  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||  ||    
T  31435281 agtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaact 31435182  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31435181 ttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccc 31435082  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
     | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  31435081 caaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 31435019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Original strand, 9680769 - 9681130
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 494  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  9680769 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggttgaaacaagggtttagaagggcaacaacaaaactatggtttg 9680868  T
Q  495 tatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagatt 590  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  9680869 tatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 9680968  T
Q  591 ggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc 690  Q
    | | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9680969 gagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctc 9681068  T
Q  691 tcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  9681069 tcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgttctctcttc 9681130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 40837076 - 40836728
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40837076 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaatttggagattgagggggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 40836977  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||    
T  40836976 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 40836877  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  40836876 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 40836778  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40836777 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 40836728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 144 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 7092769 - 7092414
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7092769 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaagatatatttatg 7092670  T
Q  244 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 343  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7092669 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 7092570  T
Q  344 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatat-tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----a 438  Q
    |||            ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |    |    
T  7092569 gaggaaaaaaaatt-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgaga 7092471  T
Q  439 gagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaa-actagggtttg 494  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  7092470 gagatggagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaacactagggtttg 7092414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 400 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 1049629 - 1049283
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049629 ttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 1049530  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   || | |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  1049529 agtttgtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 1049430  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||     
T  1049429 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 1049331  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 744  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049330 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 1049283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 144 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 7095016 - 7094662
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7095016 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 7094917  T
Q  244 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 343  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7094916 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaag 7094817  T
Q  344 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatat-tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----a 438  Q
    |||            ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |    |    
T  7094816 gaggaaaaaaaaac-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgaga 7094718  T
Q  439 gagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 494  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  7094717 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaacatagggtttg 7094662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 400 - 751
Target Start/End: Original strand, 24748549 - 24748904
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  24748549 ttttattataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgacttagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatag 24748648  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   |||| |||||||||| |||||| || |||||||||||| ||    
T  24748649 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattacgattgagtctcttggttccgggaagagattgggact 24748748  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24748749 ttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctc 24748848  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
     ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24748849 cagattaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctctt 24748904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Original strand, 21678021 - 21678380
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21678021 ttttactataaatatagatattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttgtatag 21678120  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  21678121 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagatattgggact 21678220  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21678221 ttgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcatatagtgaaacagtgggctgctctctcccct 21678320  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||| ||||    
T  21678321 agactaggttaatttggaccgaactgggacaacaaattc--ttgtgttctctcttcttttct 21678380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 39146321 - 39145965
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  39146321 ttttactataaatatagacactgtatcagtgtaaaccttgagatggagggggctgaaacaagggtttagatagacaacaacaaaactagggtttgtatag 39146222  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||    
T  39146221 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggaact 39146122  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  39146121 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggggggctgctcttttccc 39146022  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39146021 taaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 39145965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Original strand, 21679982 - 21680346
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21679982 ttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 21680081  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||   |||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||    
T  21680082 agtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgggact 21680181  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  21680182 ttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaacccaatgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagagctgctctctccccc 21680281  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaa---ctgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    ||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||    
T  21680282 agactaggtgaatttggaccgaactgctgggtcaacaaatacttttttgttctctcttcttttct 21680346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 410 - 746
Target Start/End: Original strand, 3878540 - 3878881
Alignment:
Q  410 aatatagaccttgaatcagagtaaacct--agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtc 507  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3878540 aatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtc 3878639  T
Q  508 tctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtag 604  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| || |||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||||||||||    
T  3878640 tctttggaacaaacgctagggcttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtag 3878739  T
Q  605 aattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactagg 704  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  3878740 aattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactatg 3878839  T
Q  705 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3878840 ttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3878881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 400 - 744
Target Start/End: Original strand, 25542486 - 25542830
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25542486 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatag 25542584  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaa-ac-attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctt 597  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||| |||||||||| ||||||||  ||||||| |||| |||    
T  25542585 agtttgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaagactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactt 25542684  T
Q  598 tgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccta 697  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  25542685 tgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctccccta 25542783  T
Q  698 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 744  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25542784 gactaggttaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 25542830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Original strand, 42223111 - 42223474
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagg-gggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 498  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42223111 ttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagatgtgggatgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtata 42223210  T
Q  499 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 594  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  42223211 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggag 42223310  T
Q  595 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 694  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  42223311 ctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggatggctgctctctccc 42223410  T
Q  695 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    | | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  42223411 ccatactaggtcaattttgatcgaactgggtcaacaaattcttttgttttctctcttcttttct 42223474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 438 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 1047220 - 1046912
Alignment:
Q  438 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 537  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  1047220 agagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 1047121  T
Q  538 tgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 634  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  1047120 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 1047021  T
Q  635 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    |||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047020 attgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 1046922  T
Q  735 cttttgtgtt 744  Q
    ||||||||||    
T  1046921 cttttgtgtt 1046912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 400 - 744
Target Start/End: Original strand, 9679009 - 9679361
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 494  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |    ||||||||||||||||||||||| | | ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  9679009 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttg 9679108  T
Q  495 tatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagatt 590  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  9679109 tatagagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 9679207  T
Q  591 ggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc 690  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9679208 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctctc 9679307  T
Q  691 tcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 744  Q
    |  || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  9679308 tttcccagactaggtcaatttggaccagactgggtcaacaaattcttttgtgtt 9679361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 444 - 746
Target Start/End: Original strand, 40946327 - 40946632
Alignment:
Q  444 agagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 543  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||     
T  40946327 agagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgattt 40946426  T
Q  544 acctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 640  Q
    || | || |||||   ||| |||||||||| || |||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||     
T  40946427 actttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgat 40946526  T
Q  641 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 740  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40946527 ttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcgaagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 40946626  T
Q  741 tgttct 746  Q
    ||||||    
T  40946627 tgttct 40946632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 144 - 428
Target Start/End: Original strand, 38395985 - 38396269
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 243  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38395985 atgttgtagtatgactccaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 38396084  T
Q  244 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 343  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38396085 tacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 38396184  T
Q  344 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcag 428  Q
    |||            |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38396185 gagaaaaaaaaaac-gtatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcag 38396269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 145 - 447
Target Start/End: Original strand, 1606171 - 1606472
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1606171 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatgg 1606270  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1606271 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 1606370  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 443  Q
    ||            | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||    
T  1606371 agaaaaaaaaac--gaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 1606468  T
Q  444 agag 447  Q
    ||||    
T  1606469 agag 1606472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 145 - 345
Target Start/End: Original strand, 47865328 - 47865528
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47865328 tgttgtagtatgactccaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 47865427  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47865428 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 47865527  T
Q  345 a 345  Q
    |    
T  47865528 a 47865528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 144 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 21470884 - 21470614
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 243  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21470884 atgttgtagtttgactccaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 21470785  T
Q  244 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 343  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21470784 gacaataaatatatttttatatcgtatgaagaacgatttgatgcgaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 21470685  T
Q  344 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatata 415  Q
    |||            |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21470684 gagaaaaaaaaac--gtatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatata 21470614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 515 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 7092431 - 7092198
Alignment:
Q  515 aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg 611  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7092431 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7092332  T
Q  612 cgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaattt 711  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7092331 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaattt 7092233  T
Q  712 ggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7092232 ggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7092198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 400 - 751
Target Start/End: Original strand, 25276096 - 25276439
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25276096 ttttactataaatatatgctttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaataatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 25276195  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||    
T  25276196 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 25276295  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||           ||||||    
T  25276296 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgg-----------ctcccc 25276384  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
     |||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  25276385 -agactaagtcaatatggaccgaactggttaaacaaattcttttgtgttctctctt 25276439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 400 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 27832968 - 27832631
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggg-gctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 498  Q
    |||||||||||||||||    || ||||||| |||||| | ||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27832968 ttttactataaatataggttgtgtatcagagcaaaccttgtgatagagtggagctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacagaactaaggtttgtata 27832869  T
Q  499 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | |    
T  27832868 gagtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 27832769  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 694  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  27832768 tttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttctgtaaagttactcatcattatagtgaaatggagggcttctctctccc 27832669  T
Q  695 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    | |||||||||||||||     ||||||||| |||||||||||    
T  27832668 ccagactaggtcaattt-----gaactgggtaaacaaattctt 27832631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 400 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 22251876 - 22251611
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22251876 ttttactataaatataaaccttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatag 22251777  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttg 599  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     || |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22251776 agtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggga-----taggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttg 22251682  T
Q  600 ggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgaca----tctcttttgtaacgttactcatcat 666  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    |||||||||||| ||||||||||||    
T  22251681 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcat 22251611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 515 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 7094678 - 7094445
Alignment:
Q  515 aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg 611  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7094678 aacaaaca-tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7094580  T
Q  612 cgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaattt 711  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7094579 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaattt 7094480  T
Q  712 ggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7094479 ggactgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 7094445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 145 - 467
Target Start/End: Original strand, 3676997 - 3677301
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  3676997 tgttgtagtatgactcaaaatttgatagatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaa----------- 3677085  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
            |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3677086 --------tatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 3677177  T
Q  345 ag-nnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttat-attttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagaga 442  Q
    ||             |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  3677178 agagaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtgatattcgttccaaatttatgagttatgtttttactataaatatagatcttgaatcagagtaaacttggaga 3677277  T
Q  443 tagagggggctgaaacaatggttta 467  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||    
T  3677278 taga-ggggctgaaacaagggttta 3677301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 401 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 24817682 - 24817362
Alignment:
Q  401 tttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||    
T  24817682 tttaatataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagagaactagggtttgtatag 24817585  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| || || ||   ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||    
T  24817584 agtttg-ctctttgcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttggaaagcagtattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagact 24817489  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  24817488 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccc 24817389  T
Q  696 tagactaggtca-atttggaccgaact 721  Q
     | |||||||||  |||||||||||||    
T  24817388 catactaggtcagttttggaccgaact 24817362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 400 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 22828967 - 22828672
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22828967 ttttactataaatataggctttgtatccgagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatag 22828868  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||| ||||||   |||||||||||| |||||| ||||||||||  |  | ||||   |||| |||||||||| ||||||| | |||||||||| | ||    
T  22828867 agtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagattagaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgagact 22828768  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22828767 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcattattatagtgaaacagagggctgctctct 22828672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 400 - 632
Target Start/End: Original strand, 26804528 - 26804762
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||||||||||||||||||     |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804528 ttttactataaatatagaccttgt----gagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 26804623  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacac---tagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggg 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||| ||||| ||||||||| ||||||  || |    
T  26804624 agtttgtctctttggaacaaacactagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgag 26804723  T
Q  594 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaac 632  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26804724 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 26804762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 144 - 293
Target Start/End: Original strand, 443325 - 443474
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  443325 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 443424  T
Q  244 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatat 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||    
T  443425 gacaataaatatatttttgtaccgtctgaagaacaatttgatgcaaatat 443474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 400 - 734
Target Start/End: Original strand, 7188498 - 7188833
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  7188498 ttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttag-aagtcaacaataaaaatagggtttgtatag 7188596  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
     ||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||| || ||||   |||| |||||||||| ||||| ||| ||| |||||| | ||    
T  7188597 ggtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagattgagact 7188693  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || |||| |||||| || |||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||    
T  7188694 ttgggtagaattaagcgggagacttatttttataacccattgatatttcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacggaaggctgctctcttccc 7188793  T
Q  696 tagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
     || ||| ||||  ||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  7188794 cagtctatgtcagttttggactgaactaggtaaacaaatt 7188833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 400 - 556
Target Start/End: Original strand, 18567568 - 18567724
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18567568 ttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 18567667  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca 556  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18567668 agtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaaca 18567724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 400 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 20091875 - 20091583
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 498  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20091875 ttttactataaatatagactttttatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttcgga-ggcaaca-caaaactagggtttgtata 20091778  T
Q  499 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    ||||||| || || | |||||| | ||||||| |  ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| | ||| ||||| ||| |||||||||| | |    
T  20091777 gagtttg-ctattggcaacaaagattagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaatctcttggtcacgggaagagattgagac 20091681  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20091680 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc--atagtggaacggagggctgctctctcccc 20091583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 523 - 746
Target Start/End: Original strand, 38396713 - 38396938
Alignment:
Q  523 ctagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagac 619  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||   ||| ||| |||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38396713 ctaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagac 38396812  T
Q  620 tttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaa 719  Q
    || || ||||||| ||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  38396813 ttatttttgtaacccattgatttctcttt-gtaactttactcatcatatagtggatcggagggcttctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaa 38396911  T
Q  720 ctgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  38396912 ctgggtcaacaaattcttttgtgttct 38396938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 474 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 24813755 - 24813477
Alignment:
Q  474 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtct 570  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||   ||| ||||||||||    
T  24813755 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtct 24813660  T
Q  571 tttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tata 669  Q
     ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  24813659 cttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttactcatcattata 24813560  T
Q  670 gtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    ||| | |||| ||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  24813559 gtggagcggatggctgctttctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctcttc 24813477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 596 - 751
Target Start/End: Original strand, 22393876 - 22394032
Alignment:
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctccc 694  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  22393876 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgttctctccc 22393975  T
Q  695 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22393976 ctagactaggtcaatttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctctt 22394032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 565 - 734
Target Start/End: Original strand, 2935392 - 2935560
Alignment:
Q  565 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 664  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  2935392 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 2935490  T
Q  665 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  2935491 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 2935560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 400 - 734
Target Start/End: Original strand, 24465503 - 24465829
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 498  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||          |||||||||||||||||    
T  24465503 ttttactatagatatagactttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtata 24465594  T
Q  499 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    | ||||| ||||| | ||||||||||||||||  |   ||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||| | | |||||||||||| |    
T  24465595 gcgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgaa---ttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggac 24465690  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 694  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||  | ||||||||||||    
T  24465691 tttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaactcattgatatgtcttttgtaaag-tactcatcattataatgaaacgggtgactgctctctccc 24465789  T
Q  695 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    | ||||||| ||||| || ||||||||| || ||||||||    
T  24465790 ccagactagatcaatatgaaccgaactgagtaaacaaatt 24465829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 565 - 746
Target Start/End: Original strand, 22137202 - 22137381
Alignment:
Q  565 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 664  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  22137202 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagactatt-cttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 22137299  T
Q  665 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22137300 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 22137381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 565 - 746
Target Start/End: Original strand, 40552229 - 40552408
Alignment:
Q  565 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 664  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  40552229 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagactatt-cttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 40552326  T
Q  665 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40552327 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 40552408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 565 - 746
Target Start/End: Original strand, 22108191 - 22108370
Alignment:
Q  565 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 664  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  22108191 gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagactatt-cttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 22108288  T
Q  665 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22108289 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 22108370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 150 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 40281987 - 40281824
Alignment:
Q  150 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaata--ttgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggaca 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  40281987 tagtatgactcaaaatttgatggatgaagaagaatttgttgctaaaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatggaaa 40281888  T
Q  248 ataaatatatttttgtaccgtatg-aagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatatt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||| ||| ||||||||    
T  40281887 ataaatatatttttgtaccgtatgaaagaat-atttgatacggatatatttttaaaaggaatatt 40281824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 565 - 746
Target Start/End: Original strand, 40549951 - 40550130
Alignment:
Q  565 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 664  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  40549951 gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagactatt-cttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 40550048  T
Q  665 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40550049 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 40550130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 565 - 734
Target Start/End: Original strand, 1606504 - 1606671
Alignment:
Q  565 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 664  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  1606504 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagactatt-cttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 1606601  T
Q  665 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1606602 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 1606671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 565 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 9027358 - 9027191
Alignment:
Q  565 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 664  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  9027358 gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagactatt-cttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 9027261  T
Q  665 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    | |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9027260 aaatagtggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 9027191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 582 - 737
Target Start/End: Original strand, 26295587 - 26295743
Alignment:
Q  582 gaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggag 680  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  26295587 gaagcgattgtgactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagat 26295686  T
Q  681 ggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  26295687 gactgctctctcctccagactaggtcaatttggactgaactggataaacaaattctt 26295743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 400 - 734
Target Start/End: Original strand, 6332181 - 6332514
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctg-aaacaatggtttagaaaggca-acaacaaaactagggtttgtat 497  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||| |||||| |||  || |||||| | |||||||||  ||    
T  6332181 ttttactataaatataaaacttgtatcagagtaa-ccttgagagagagggggctggaaacaagggtttataaa--catacaacaga-ctagggttt--at 6332274  T
Q  498 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 594  Q
    |||||||  ||||| | ||||||||||||| || |||  ||||||||  | || |||||   |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |     
T  6332275 agagttta-ctcttggcaacaaacactaggatt-gaga-ttgattcagtttggaaaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagattgaga 6332371  T
Q  595 ctttgggtagaattaggc-gggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc 692  Q
    |||| |||||||||||||  | |||||| |||||||||| | || | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||    
T  6332372 ctttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaagactgttctctc 6332471  T
Q  693 ccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  6332472 ccctagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 6332514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 400 - 589
Target Start/End: Original strand, 22392428 - 22392608
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |        ||  ||||||||||||||||||    
T  22392428 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttata--------aatcaaactagggtttgtatag 22392519  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagat 589  Q
    | |||| || || | ||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  22392520 aatttg-ctattggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagat 22392608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 155 - 311
Target Start/End: Original strand, 10690684 - 10690845
Alignment:
Q  155 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatat------ttatggacaa 248  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||   || | ||      ||||| ||||    
T  10690684 tgactcaaaatttgatggagggagaagattgttgctaaaaatataaaag-tatgtttcaaatatattttgtgctttcaaaaaattgttgcttatgtacaa 10690782  T
Q  249 taaatatatttttgtaccgtatga-agaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatatt 311  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  10690783 taaatatatttttgtaccatgtgacagaat-atttgatgcaaatatatttttaaaaggaatatt 10690845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 679 - 746
Target Start/End: Original strand, 11759364 - 11759431
Alignment:
Q  679 agggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11759364 agggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11759431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 455 - 751
Target Start/End: Original strand, 11081522 - 11081819
Alignment:
Q  455 aaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaa 554  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||| | |||||||||||||||| |||  ||||||||| | ||||||    
T  11081522 aaacaagggtttagaa-gccaacaacaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcactttgggaaa 11081615  T
Q  555 ca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaactcatt--gacatctcttt 648  Q
    ||   ||| |||||||||| ||| | ||| ||||||||| ||  |||| ||| |||||||   || ||||  |||||||||| | ||  || |||||||     
T  11081616 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttttgatatctcttg 11081715  T
Q  649 tgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||| |||||||||| | | | || |||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  11081716 tgtaaagttactcatctttaaaatggaacggatggttgctctctcccccagactaggtcaatattggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttct 11081814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 208
Target Start/End: Original strand, 20297108 - 20297161
Alignment:
Q  155 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297108 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttg 20297161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 445 - 506
Target Start/End: Original strand, 38396316 - 38396377
Alignment:
Q  445 gagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 506  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38396316 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgt 38396377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 572 - 666
Target Start/End: Original strand, 6348912 - 6349006
Alignment:
Q  572 ttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat 666  Q
    ||||| ||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  6348912 ttggtcacgggaaaagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcat 6349006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 697 - 758
Target Start/End: Original strand, 26804765 - 26804826
Alignment:
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26804765 agactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 26804826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 556 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 16297200 - 16297018
Alignment:
Q  556 attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaactcattgac-atctcttttgtaa 653  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||    || || |  |||||||||| | || |  |||||||||| ||    
T  16297200 attaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagatttgaagattgattcttgtaacccttttaatatctcttttgcaa 16297101  T
Q  654 cgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
     |||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| || ||||||||    
T  16297100 agttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcccctagactatgtcagtattggaccgaactgtgtaaacaaatt 16297018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12310528 - 12310442
Alignment:
Q  225 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatatt 311  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||    
T  12310528 tgctgaaattatacttaaggacagttaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgtaaatatatttttaaaaggaatatt 12310442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12310608 - 12310542
Alignment:
Q  162 aaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 228  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12310608 aaatttaatggatgaagaagattgttgctactgatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 12310542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 43254069 - 43254023
Alignment:
Q  153 tatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43254069 tatgtctcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 43254023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 46516349 - 46516403
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  46516349 ggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 46516403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 666 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 6067264 - 6067183
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||    
T  6067264 tatagtgaaacggagagctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccggactgggtaaacaaattctctcgtgttct 6067183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 711 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 22251605 - 22251564
Alignment:
Q  711 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251605 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 22251564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 578 - 719
Target Start/End: Original strand, 6046629 - 6046772
Alignment:
Q  578 acgagaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaa 675  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||   | |||||| |||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  6046629 acgagaaaagaatgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaacctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaa 6046727  T
Q  676 cggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaa 719  Q
     | || |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  6046728 tgaagagctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaa 6046772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 9190047 - 9190101
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9190047 ggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9190101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 20284147 - 20284093
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20284147 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20284093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 29159861 - 29159807
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29159861 ggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 29159807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 30906405 - 30906327
Alignment:
Q  380 ttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaa 457  Q
    |||||| ||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  30906405 ttccaattttatgatggatacttttgctataaatatagaccttgtataagagtaaatcttgagatagagggggctgaaa 30906327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 14379905 - 14379861
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14379905 tctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 14379861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 666 - 737
Target Start/End: Original strand, 25410246 - 25410318
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  25410246 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25410318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 666 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 34546946 - 34546874
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  34546946 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 34546874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 405 - 530
Target Start/End: Original strand, 6348778 - 6348903
Alignment:
Q  405 ctataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagagatagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 502  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||| | ||||||||| || |||||| ||| ||||||||| |  || || ||||||||||||||||| ||||    
T  6348778 ctataaatataaaccttgtatcagatgtaaacattgagatagagaggactgaaaacaagggtttagaa-gtaaaaaagaaaactagggtttgtatcgagt 6348876  T
Q  503 ttgtctctttggaacaaacactagggtt 530  Q
    ||| ||||| | |||||||| |||||||    
T  6348877 ttg-ctcttggcaacaaacattagggtt 6348903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 2580448 - 2580394
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  2580448 ggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 2580394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 21983342 - 21983288
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21983342 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21983288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 678 - 731
Target Start/End: Original strand, 4796707 - 4796760
Alignment:
Q  678 gagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4796707 gagggctgctttctcccccagattaggtcattttggaccgaactgggttaacaa 4796760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 666 - 737
Target Start/End: Original strand, 2075231 - 2075303
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  2075231 tatagtggaacggaaagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 2075303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 666 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 7464585 - 7464513
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  7464585 tatagtggaacggagagctgctctcttccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 7464513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 14069877 - 14069833
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14069877 tctctccccaagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 14069833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Original strand, 27347941 - 27347985
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27347941 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 27347985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 41317478 - 41317434
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41317478 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 41317434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 677 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 56005 - 55955
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 728  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  56005 ggagggctgctctctcccc-agattaggtcatattggaccgaactgggtcaa 55955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 223
Target Start/End: Original strand, 6628853 - 6628884
Alignment:
Q  192 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6628853 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 6628884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12485023 - 12484976
Alignment:
Q  225 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatga 272  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||    
T  12485023 tgctgaaaatatatttatggatagcaaatatatttttgtatcgtatga 12484976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12506454 - 12506407
Alignment:
Q  225 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatga 272  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||    
T  12506454 tgctgaaaatatatttatggatagcaaatatatttttgtatcgtatga 12506407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12657698 - 12657667
Alignment:
Q  192 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12657698 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 12657667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 2647735 - 2647789
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||| ||||| |||||||||||    
T  2647735 ggagggctgctctctcccccagaataggtcatattgggccgaattgggtcaacaa 2647789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 9185204 - 9185258
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  9185204 ggagagcttctctctcccccagactaggttatattggaccgaactgggtcaacaa 9185258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12485074 - 12485044
Alignment:
Q  192 aaaatataaaagatttgtttcaaatatattt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12485074 aaaatataaaagatttgtttcaaatatattt 12485044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12506505 - 12506475
Alignment:
Q  192 aaaatataaaagatttgtttcaaatatattt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12506505 aaaatataaaagatttgtttcaaatatattt 12506475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 556 - 737
Target Start/End: Original strand, 25351360 - 25351539
Alignment:
Q  556 attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaac 654  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||   || ||||  ||||||||||||| |   |||||||| ||||     
T  25351360 attaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt-gggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactcaat---atctcttt-gtaaa 25351454  T
Q  655 gttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    |  ||||||||| |||||| | ||||| |||| ||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  25351455 gaaactcatcattatagtggatcggagagctgttctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25351539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 28617264 - 28617318
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  28617264 ggagagctgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaa 28617318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 33332489 - 33332543
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  || || ||||||||||||||||    
T  33332489 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaa 33332543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 35960874 - 35960820
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  35960874 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactcggtcaacaa 35960820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 666 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 44010816 - 44010775
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca 707  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  44010816 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 44010775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 417; Significance: 0; HSPs: 113)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 150 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 18511797 - 18511185
Alignment:
Q  150 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511797 tagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcgaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 18511698  T
Q  250 aaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnn 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       
T  18511697 aaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 18511598  T
Q  350 nnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatat-tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--agagataga 446  Q
             ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |  |||||||||    
T  18511597 aaaaaac--gtatctttagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatatgtttaatataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagataga 18511500  T
Q  447 gggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 546  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511499 gggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 18511400  T
Q  547 tcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatc 643  Q
    | ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||    
T  18511399 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatc 18511300  T
Q  644 tcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 743  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18511299 tcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 18511200  T
Q  744 tctatcttctcttct 758  Q
    ||| |||||| ||||    
T  18511199 tctctcttcttttct 18511185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 746
Target Start/End: Original strand, 25803707 - 25804318
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25803707 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 25803806  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25803807 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 25803906  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct------ 437  Q
    ||            |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  |          
T  25803907 agaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtaatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaatttgagaga 25804004  T
Q  438 ---agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgag 534  Q
       |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25804005 gagagagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgag 25804104  T
Q  535 ggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaa 631  Q
    ||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25804105 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 25804204  T
Q  632 ctcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25804205 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataa 25804303  T
Q  732 attcttttgtgttct 746  Q
    |||||||||||||||    
T  25804304 attcttttgtgttct 25804318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 150 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 18509902 - 18509291
Alignment:
Q  150 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18509902 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttatttcgaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 18509803  T
Q  250 aaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnn 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       
T  18509802 aaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaa 18509703  T
Q  350 nnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatat-tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--agagataga 446  Q
             ||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  |||||||||    
T  18509702 aaaaaac--gtatcttcagtgtggtattcatcccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagataga 18509605  T
Q  447 gggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 546  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18509604 gggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacc 18509506  T
Q  547 tcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatc 643  Q
    | ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||    
T  18509505 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagaatgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgatatc 18509406  T
Q  644 tcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 743  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18509405 tattttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggtgggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 18509306  T
Q  744 tctatcttctcttct 758  Q
    ||| |||||| ||||    
T  18509305 tctctcttcttttct 18509291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 752
Target Start/End: Original strand, 26097421 - 26098031
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26097421 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaaaatttgtttcaaatatattttgtactgaaaatatatttatgg 26097520  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaa--agggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaa 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26097521 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaagaaggaaatgttatatttttgatgcaaatattctttcactgaa 26097620  T
Q  343 ggagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagag 441  Q
    ||||           | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  26097621 ggaggaaaaaaaaatg-tatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaactttgag 26097719  T
Q  442 atagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 541  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26097720 atagagggggctgaaataaaggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgat 26097819  T
Q  542 tcacctcgggaa-ac-attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattga 639  Q
    |||||| || || || |||| || ||||||| ||||||||| ||| |   |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26097820 tcaccttggaaacactattaggaatgagtctcttggttacgggaaaatgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattga 26097919  T
Q  640 catctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 739  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26097920 tatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacaga-ggctgctctctcctccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattctttt 26098018  T
Q  740 gtgttctatcttc 752  Q
    ||||||| |||||    
T  26098019 gtgttctctcttc 26098031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 144 - 746
Target Start/End: Original strand, 27912218 - 27912830
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912218 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 27912317  T
Q  244 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 343  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27912318 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaaaaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 27912417  T
Q  344 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----- 437  Q
    |||            |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |         
T  27912418 gagaaaaaaaaaaacgtatcttcagtgtgatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 27912517  T
Q  438 -agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaggg 536  Q
     |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  27912518 gagagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgaggg 27912617  T
Q  537 ttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaact 633  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  27912618 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 27912717  T
Q  634 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 733  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912718 cattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacagagaactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 27912817  T
Q  734 tcttttgtgttct 746  Q
    |||||||||||||    
T  27912818 tcttttgtgttct 27912830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 144 - 746
Target Start/End: Original strand, 18468697 - 18469303
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18468697 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatatttttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 18468796  T
Q  244 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 343  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18468797 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 18468896  T
Q  344 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----a 438  Q
    |||            ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||||| |    |    
T  18468897 gagaaaataaaaa--gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatgataaactttgaga 18468994  T
Q  439 gagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 538  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18468995 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggtt 18469094  T
Q  539 gattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactca 635  Q
    ||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18469095 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaaccca 18469194  T
Q  636 ttgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 735  Q
    ||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18469195 ttgatttctcttttgtaacgatactcatcatctagtggaacgaagagctgctctctccc--agactaggtcaatttggaccgaactggattaacaaattc 18469292  T
Q  736 ttttgtgttct 746  Q
    ||||| |||||    
T  18469293 ttttgcgttct 18469303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 144 - 746
Target Start/End: Original strand, 27910134 - 27910744
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910134 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattattgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 27910233  T
Q  244 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 343  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27910234 gacaataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 27910333  T
Q  344 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----- 437  Q
    |||           | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |         
T  27910334 gagaaaaaaaaaaag-tatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggttaaactttgaga 27910432  T
Q  438 -agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaggg 536  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27910433 gagagatagcgggggctgaaacaa-ggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaggg 27910531  T
Q  537 ttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaact 633  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||| |||||| ||| ||||||||| ||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  27910532 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 27910631  T
Q  634 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 733  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910632 cattgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 27910731  T
Q  734 tcttttgtgttct 746  Q
    |||||||||||||    
T  27910732 tcttttgtgttct 27910744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 153 - 745
Target Start/End: Original strand, 18596334 - 18596939
Alignment:
Q  153 tatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaa 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18596334 tatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatggacaataaa 18596433  T
Q  253 tata-----------tttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactga 341  Q
    ||||           |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  18596434 tataccataaatatatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatacaaatattctatcactga 18596533  T
Q  342 aggagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctaga 440  Q
    |||||           | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  18596534 aggagaaaaaaaaaacg-tatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgg 18596632  T
Q  441 gatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttga 540  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18596633 gatagagggggctgaaacaagggtata--aagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttga 18596730  T
Q  541 ttcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcatt 637  Q
    ||||||| || |||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  18596731 ttcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcatt 18596830  T
Q  638 gacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 736  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18596831 gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacagattct 18596930  T
Q  737 tttgtgttc 745  Q
    |||||||||    
T  18596931 tttgtgttc 18596939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 746
Target Start/End: Original strand, 15551925 - 15552539
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  15551925 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaagatatatttatgg 15552024  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15552025 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatgacatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 15552124  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct------ 437  Q
    ||           | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |          
T  15552125 agaaaaaaaaaacg-tatcttcagcgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagag 15552223  T
Q  438 ----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttga 533  Q
        ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||     
T  15552224 agagagagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgt 15552323  T
Q  534 gggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgt 629  Q
    |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15552324 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 15552423  T
Q  630 aactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 729  Q
    ||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15552424 aacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaac 15552522  T
Q  730 aaattcttttgtgttct 746  Q
    |||||  ||||||||||    
T  15552523 aaatttctttgtgttct 15552539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 225 - 746
Target Start/End: Original strand, 18466453 - 18466978
Alignment:
Q  225 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgc 324  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466453 tgctaaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgc 18466552  T
Q  325 aaatgttctttcactgaaggagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttga 423  Q
    |||| |||||||||| ||||||            ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  18466553 aaatattctttcactaaaggagaaaaaaaa----gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatatttttactataaatatagaccttgt 18466648  T
Q  424 atcagagtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 519  Q
    |||||  ||||| |    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18466649 atcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttgaaacaa 18466748  T
Q  520 acactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga 616  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| |||||||||  |||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18466749 acactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga 18466848  T
Q  617 gactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggacc 716  Q
    ||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18466849 gacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatataatggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggacc 18466948  T
Q  717 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18466949 gaactgggtcaacaaattcttttgttttct 18466978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 165 - 746
Target Start/End: Original strand, 10586549 - 10587126
Alignment:
Q  165 tttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgta 264  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10586549 tttgatggatggggaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgta 10586648  T
Q  265 ccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnnnnnnnnnnggtatct 364  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||            ||||||    
T  10586649 tcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaaaaac-gtatct 10586747  T
Q  365 tcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagatagagggggctgaaaca 459  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |    ||||||||| ||||||||||||    
T  10586748 tcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagataga-ggggctgaaaca 10586846  T
Q  460 atggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttt-ggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac--- 555  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||           |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||       
T  10586847 agggtttagaatggcaacaacaaaac-----------tagagtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 10586935  T
Q  556 attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacg 655  Q
    |||| |||| ||||| ||| |||||  ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||  |||| |||||||||    
T  10586936 attaggattcagtctcttgcttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccattgatttctc-tttgtaacg 10587034  T
Q  656 ttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct-cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10587035 ttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 10587126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 144 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 26098842 - 26098379
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26098842 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattattgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 26098743  T
Q  244 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||    
T  26098742 gacaataaatatatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatacaaaaattctttcattgaag 26098643  T
Q  344 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagaga 442  Q
    |||            ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26098642 gagaaataaaaaaacgtatcttcaatgtggtattcgttccaattttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggaga 26098543  T
Q  443 tagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatt 542  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26098542 tagagggggctgaaataagggtttagaatggcaacaagaagactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgatt 26098443  T
Q  543 cacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggta 603  Q
    ||||| |  ||||   |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  26098442 caccttgacaaacactattatgattgagtctcttggttacggaaagagattggggttttgggta 26098379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 400 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 2818670 - 2818313
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2818670 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactatggtttgtatag 2818571  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt-gattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||| ||  |||| |    
T  2818570 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcaccttggaaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggac 2818471  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2818470 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggaggactgctctctcccc 2818371  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 753  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2818370 cagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 2818313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 278 - 752
Target Start/End: Original strand, 40221340 - 40221823
Alignment:
Q  278 gatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnnnnnnnnnng------gtatcttcagtgt 371  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||                  |||||||||||||    
T  40221340 gatttgtttcaaatatattttgaaaaggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgcaggagaaggaaaaaacaaaaaacgtatcttcagtgt 40221439  T
Q  372 agtattcgttccaaatttatgatttatattttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaa 471  Q
      ||| ||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  40221440 gatatccgttctaaatttatgagttac-ttttactataaatatagacattgactcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaat 40221538  T
Q  472 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagt 568  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||   |||| ||||||||    
T  40221539 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagt 40221638  T
Q  569 cttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-ta 667  Q
    || ||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  40221639 ctcttggttacaggaagagattgggacttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 40221738  T
Q  668 tagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  40221739 tagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgctctctcttc 40221823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Original strand, 21947972 - 21948326
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21947972 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatag 21948070  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||| | ||||||  |||| ||    
T  21948071 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggact 21948170  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21948171 ttgggtggaattaggcgggagacttattcttgtaaccccttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccc 21948270  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21948271 agactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 21948326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 404 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 10529429 - 10529091
Alignment:
Q  404 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 503  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  10529429 actataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttttatagagtt 10529330  T
Q  504 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10529329 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgg 10529230  T
Q  601 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 700  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  10529229 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggaaggctgctctctcccccagac 10529130  T
Q  701 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 739  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10529129 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 10529091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Original strand, 25904048 - 25904403
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  25904048 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtatag 25904147  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  25904148 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagggct 25904247  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  25904248 ttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctattgtaacgttacttatcatatagtgaaacggatgactgctctctccccc 25904347  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  25904348 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattattttgtgttctctcttc 25904403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 25921807 - 25921458
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25921807 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatag 25921708  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  25921707 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 25921608  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
     ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  25921607 ctgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctctctccccc 25921508  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921507 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 25921458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 400 - 740
Target Start/End: Original strand, 17072828 - 17073172
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17072828 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatag 17072927  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  17072928 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttaggggaagagattggggct 17073027  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    || | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17073028 ttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctcccc 17073127  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 740  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17073128 cagactcggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 17073172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 404 - 752
Target Start/End: Original strand, 39854433 - 39854783
Alignment:
Q  404 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 503  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854433 actataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 39854531  T
Q  504 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 600  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||  ||||||    
T  39854532 tgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcatggttacgggaagagactggaactttgg 39854631  T
Q  601 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 700  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  39854632 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagac 39854731  T
Q  701 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39854732 tagatcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 39854783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 2174864 - 2175212
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2174864 ttttactataaatacaggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 2174963  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  2174964 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 2175063  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  2175064 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 2175162  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2175163 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2175212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 4236574 - 4236922
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4236574 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 4236673  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  4236674 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 4236773  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  4236774 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 4236873  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  4236874 aaactaggtcaatttggaccgaact-ggtcaataaattcttttgtgttct 4236922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 402 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 10474655 - 10474302
Alignment:
Q  402 ttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 501  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10474655 ttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgaaatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagag 10474556  T
Q  502 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggcttt 598  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  10474555 tttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaaacactattaagattgaatctcttggttacaggaagagattgggacttt 10474456  T
Q  599 gggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctag 698  Q
    | ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  10474455 gagtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttctaaggttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccat 10474356  T
Q  699 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10474355 actaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 10474302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 400 - 751
Target Start/End: Original strand, 24126801 - 24127155
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24126801 ttttactataaatatagacattatatcagtgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatag 24126900  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||||||||   |||||| |||||||||||| | |||||| |||| ||||||||   ||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  24126901 agtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggact 24127000  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24127001 ttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccc 24127100  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24127101 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 24127155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 38882050 - 38882399
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggg-gctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 498  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882050 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 38882149  T
Q  499 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |    
T  38882150 gagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 38882249  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  38882250 tttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcctc 38882348  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882349 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 38882399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 1189948 - 1189586
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 494  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1189948 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactacggtttg 1189849  T
Q  495 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattg 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  1189848 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacaggaagagattg 1189749  T
Q  592 gggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctc 690  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||    
T  1189748 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtggaacggagggatgctctc 1189649  T
Q  691 tcc-cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1189648 tcctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 1189586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 401 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 16092537 - 16092172
Alignment:
Q  401 tttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacct---agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 496  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||| |   |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16092537 tttactagaaatatagactttgtatcagatgtaaacttgtgagagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 16092438  T
Q  497 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggg 593  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  16092437 tagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgag 16092338  T
Q  594 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc 692  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16092337 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgagatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctc 16092238  T
Q  693 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    | ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16092237 ctctagactaggtcaatttagactgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 16092172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 16776102 - 16776451
Alignment:
Q  400 ttttactataaa-tatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 498  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16776102 ttttactataaaatatagaccttgtatctgagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttacaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 16776201  T
Q  499 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |    
T  16776202 gagtttgtctctttggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 16776301  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  16776302 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac-cattgatttctcttttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctatctcccc 16776400  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16776401 cagactatgccaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 16776451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 400 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 31472947 - 31472590
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31472947 ttttactataaatatggacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 31472848  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||    
T  31472847 agtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggact 31472748  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    || |||||||||||||||||  | | ||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31472747 tttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcccc 31472648  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 753  Q
     | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31472647 catactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 31472590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 438 - 746
Target Start/End: Original strand, 6745052 - 6745362
Alignment:
Q  438 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 537  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6745052 agagataaagggggctgaaacaagtgtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggt 6745150  T
Q  538 tgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 634  Q
    |||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  6745151 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 6745250  T
Q  635 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745251 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 6745350  T
Q  735 cttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||    
T  6745351 cttttgtgttct 6745362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Original strand, 6756439 - 6756798
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||| | ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6756439 ttttactattaatatagatcttgtatcatattaaactttgagatagagggagctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatag 6756538  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||   |||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| | ||    
T  6756539 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattctccttgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgagact 6756638  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6756639 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa--cattgatatcttttttgtaaggttacacatcattatagtgaaac-gagggctgctctctcccc 6756735  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
     | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  6756736 caaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaatcttttgtgttctctcttcttttct 6756798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 12556257 - 12555896
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12556257 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatag 12556158  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||   |||| ||||| |||| |||| |||| ||||||||||| | |    
T  12556157 agtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggctacgggaagagattggag-t 12556059  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||    
T  12556058 tttggtagaattagacaagagactttttcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcttaaagcgaaacggagggctgctatctcccc 12555959  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
     | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12555958 catactagttcaatttggactgaactgggtcaataaattcttttgtgttctctcttctcttct 12555896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 406 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 17818817 - 17818477
Alignment:
Q  406 tataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 505  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  17818817 tataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagaaagagggg-ctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttcg 17818719  T
Q  506 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggt 602  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||   |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17818718 tctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaaacactattaagactgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggt 17818619  T
Q  603 agaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagacta 702  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||  ||||||||| | ||||    
T  17818618 agaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatacagtggaacagagggct--tctctcccccaaacta 17818521  T
Q  703 ggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17818520 ggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 17818477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 400 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 37706114 - 37705774
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  37706114 ttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaaggcaacgacaaatctagggtttgtatag 37706015  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |    
T  37706014 actttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggtt 37705915  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||     
T  37705914 ttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatggctattctctccccc 37705815  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37705814 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 37705774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 31545025 - 31545374
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31545025 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 31545124  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| ||||| |||||| |    
T  31545125 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattagagtctcttggttacgggaagaaattgggac 31545224  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  31545225 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacagtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 31545323  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
     |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31545324 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 31545374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 438 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 34477350 - 34477038
Alignment:
Q  438 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 537  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  34477350 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 34477251  T
Q  538 tgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaac 632  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||    
T  34477250 tgattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 34477151  T
Q  633 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 732  Q
     ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477150 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 34477052  T
Q  733 ttcttttgtgttct 746  Q
    |||| |||||||||    
T  34477051 ttctcttgtgttct 34477038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 404 - 746
Target Start/End: Original strand, 6747253 - 6747598
Alignment:
Q  404 actataaatatagaccttgaatcagagtaaaccta--gagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 501  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||   |  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |     
T  6747253 actataaatatagaccttgtatcagagcaaagagaaagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagagtttgtataaaa 6747352  T
Q  502 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggcttt 598  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  6747353 tttgtctctttgaaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactgggacttt 6747451  T
Q  599 gggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctag 698  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |  ||    
T  6747452 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttct-ttttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctctctcag 6747550  T
Q  699 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6747551 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6747598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 400 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 36402662 - 36402306
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||  || ||||||||||||||||||    
T  36402662 ttttactataaatatagaccttatatcagagtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaatcacgaaactagggtttgtatag 36402563  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |   ||| |||||| ||| ||||||||| || ||||||||  ||    
T  36402562 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggattgaatctcttggttacgggaggagattggaact 36402463  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||     
T  36402462 ttgggtaaaattaggctggagacttattattgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatgtctgctctctccccc 36402363  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 753  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36402362 agactaggtcaatttagatcgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 36402306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 31542680 - 31543028
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31542680 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 31542779  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  31542780 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggac 31542879  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  31542880 tttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattgatttctc-tttgtaacagtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 31542977  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
     |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31542978 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 31543028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 438 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 34479715 - 34479403
Alignment:
Q  438 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 537  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  34479715 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 34479616  T
Q  538 tgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaac 632  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||    
T  34479615 tgattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaac 34479516  T
Q  633 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 732  Q
     ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34479515 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 34479417  T
Q  733 ttcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||    
T  34479416 ttcttttgtgttct 34479403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 438 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 21684747 - 21684437
Alignment:
Q  438 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 537  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  21684747 agagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggt 21684648  T
Q  538 tgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 634  Q
    |||||| ||| |||| ||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21684647 tgattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactc 21684548  T
Q  635 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    |||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21684547 attgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 21684449  T
Q  735 cttttgtgttct 746  Q
    | ||||||||||    
T  21684448 cgtttgtgttct 21684437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 400 - 751
Target Start/End: Original strand, 695834 - 696177
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| || || |||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  695834 ttttactatgaatatagacattgtatgagtgtaaaccttgagataaagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat-- 695931  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaa-ac-attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctt 597  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||    
T  695932 ---------ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactt 696022  T
Q  598 tgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  696023 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctccccc 696122  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  696123 agacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctctt 696177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 400 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 31179705 - 31179368
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31179705 ttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 31179606  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  31179605 agtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggac 31179506  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  31179505 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 31179407  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
     |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  31179406 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 31179368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 477 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 658610 - 658329
Alignment:
Q  477 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtctttt 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||   ||| ||| |||||| ||    
T  658610 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctctt 658511  T
Q  574 ggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtga 673  Q
    ||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  658510 ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtga 658411  T
Q  674 aacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    |||||| |||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  658410 aacggatggctgctct---ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 658329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 39398326 - 39397978
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||||||||||| || ||| | | | |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39398326 ttttactataaatataaacattgtaccggtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 39398228  T
Q  500 agtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||  |    
T  39398227 agtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggaac 39398129  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  39398128 tttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtgacgttaccaattatatagtaaaacggatggctgctctctccca 39398029  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  39398028 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaaacattcttttgtgttct 39397978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 145 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 3373630 - 3373348
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3373630 tgttgtagtatgactcagaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatgg 3373531  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  3373530 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattttttcactgaagg 3373431  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatca 427  Q
    ||            ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3373430 agaaaaaaaaaac-gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatca 3373348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 407 - 758
Target Start/End: Original strand, 2954368 - 2954722
Alignment:
Q  407 ataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 506  Q
    |||||||||| | ||| ||||| |||||| | |||||||||| |  |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || | |||||    
T  2954368 ataaatataggctttgtatcagtgtaaactttgagatagaggagtatgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgtgtataatttgt 2954467  T
Q  507 ctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggt 602  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||   ||| |||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  2954468 ctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactttgggt 2954567  T
Q  603 agaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagacta 702  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||    
T  2954568 agaattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttt-gtaaagttactcatcatatagtgaagcggagggatgctctctcccccaaacta 2954666  T
Q  703 ggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  2954667 ggtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 2954722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 406 - 751
Target Start/End: Original strand, 21288715 - 21289060
Alignment:
Q  406 tataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 505  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21288715 tataaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggttgaaataagggtttagaatagcaacaataaaaatagggtttgtatagagtttg 21288814  T
Q  506 tctctttggaacaaacac------tagggtttgagggttgattcacctcgggaa-ac-attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctt 597  Q
    ||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||| |  || || |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||| || |||    
T  21288815 tctctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcaccttgaaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattaggactt 21288914  T
Q  598 tgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccccta 697  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21288915 tggatagaattaagcgggagattttttcttgtaactca--------tcttttgtaacgttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctccccca 21289006  T
Q  698 gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21289007 gactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttctctctt 21289060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 31466312 - 31465962
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||| | ||||||||||||| |||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  31466312 ttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagataaaaggggctgaaacaaaggtttaaaaaagtaacgacaaaactagggtttgtatag 31466213  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||    
T  31466212 agtttgtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggact 31466113  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||          |||||||||||| ||||     
T  31466112 ttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcatat----------agggctgctctcaccccc 31466024  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  31466023 agactagttcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtattctctcttcttttct 31465962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 400 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 34531000 - 34530731
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34531000 ttttactgtaaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatag 34530901  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||| || ||    
T  34530900 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggctacgggaagagattaggact 34530801  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat 666  Q
    ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  34530800 ttgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttgctcatcat 34530731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 522 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585729
Alignment:
Q  522 actagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaa---gattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggaga 618  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggaga 41585857  T
Q  619 ctttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccga 718  Q
    ||| || |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  41585856 cttatttttgtaagtcattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccga 41585757  T
Q  719 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41585756 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 41585729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 533 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 20506042 - 20505823
Alignment:
Q  533 agggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgt 629  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20506042 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 20505943  T
Q  630 aactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 729  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20505942 aacacattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgc--tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 20505845  T
Q  730 aaattcttttgtgttctatctt 751  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  20505844 aaattcttttgtgttctctctt 20505823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 361 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 6661555 - 6661181
Alignment:
Q  361 atcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatattttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaa 460  Q
    |||||||||||  ||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  6661555 atcttcagtgttatatccgtttcaaatttatgagttatatttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggttgaaacaa 6661456  T
Q  461 tggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---at 557  Q
     ||||||| ||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||   |||||||||||||  |||||||   ||    
T  6661455 gggtttag-aagtcaacaagaaaattagggtatgtatagagtttgt-tcttggcaacaaacactagagtt--ggggttgattcaccatgggaaacactat 6661360  T
Q  558 taagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgtt 657  Q
    || |||||||||| ||||| ||| ||||| |||| |  |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  6661359 taggattgagtctcttggtcacgggaagaaattgagattttgggtacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtt 6661260  T
Q  658 actcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
     ||||| | ||||||| |||||| | ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  6661259 gctcataattatagtggaacggatgactgctctctccctcagactaggtcagatttggaccgaactggataaacaaatt 6661181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 145 - 328
Target Start/End: Original strand, 21288529 - 21288713
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21288529 tgttgtagtataactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaataaaaaagatttgtttaaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 21288628  T
Q  245 acaataaatatatttt-tgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaat 328  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21288629 acaataaatatattttcggtaccgtatgaagaacgattttatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaat 21288713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 517 - 752
Target Start/End: Original strand, 2723964 - 2724193
Alignment:
Q  517 caaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcg 613  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||         ||||||||||||    
T  2723964 caaacactagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg---------tagaattaggcg 2724054  T
Q  614 ggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttgg 713  Q
    || || || |||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2724055 ggtgatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgg 2724154  T
Q  714 accgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2724155 accgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 2724193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 400 - 614
Target Start/End: Original strand, 20044955 - 20045172
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  20044955 ttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagacagagggggctgaaacaagggtttaggaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 20045054  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| |||||| || |||||||||||| ||    
T  20045055 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttccgggaagagattgggact 20045154  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgg 614  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20045155 ttgggtagaattaggcgg 20045172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 400 - 610
Target Start/End: Original strand, 20042995 - 20043208
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20042995 ttttactataaatataggctttgtatcatagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 20043094  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||    
T  20043095 agtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 20043194  T
Q  597 ttgggtagaattag 610  Q
    |||| |||||||||    
T  20043195 ttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 534 - 746
Target Start/End: Original strand, 39798126 - 39798341
Alignment:
Q  534 gggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgta 630  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39798126 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 39798225  T
Q  631 actcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 730  Q
    || ||||||  |||||||| ||| | |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  39798226 acccattgatttctcttttataatgatactcatcgtatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggatcgaactgggtcaaca 39798325  T
Q  731 aattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||    
T  39798326 aattcttttgtgttct 39798341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 522 - 746
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410316
Alignment:
Q  522 actagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggaga 618  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 4410189  T
Q  619 ctttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccga 718  Q
    ||| ||||||||||  |||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  4410190 cttattcttgtaacctattgatttctcttt-gtaacgatactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccga 4410288  T
Q  719 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410289 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 4410316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 400 - 741
Target Start/End: Original strand, 36208525 - 36208865
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 498  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||| || |    
T  36208525 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggttt-taga 36208621  T
Q  499 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacatta---agattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    ||| || |||||  |    | | |||||||||   |  ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | |    
T  36208622 gagatt-tctctaagcgggagaaactagggttgttg--ttgattcaccttgggaaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagattgagac 36208718  T
Q  596 tttgggtagaattaggcggg-agactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcc 693  Q
    ||||||||||||||||   | |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  36208719 tttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggcgggctgctctttcc 36208818  T
Q  694 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 741  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36208819 cc-atactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattcttttgt 36208865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 152 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 17415893 - 17415748
Alignment:
Q  152 gtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataa 251  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17415893 gtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttttgctgaaaatatatttatggacaataa 17415794  T
Q  252 atatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattt 297  Q
    |||||||||||||| |||||||| |  ||||||| |||||||||||    
T  17415793 atatatttttgtactgtatgaaggaaaatttgatgcaaatatattt 17415748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 565 - 738
Target Start/End: Original strand, 10749814 - 10749986
Alignment:
Q  565 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 664  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  10749814 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 10749912  T
Q  665 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 738  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749913 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttt 10749986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 9020167 - 9020514
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagagatagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 497  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||| | | ||||||| ||||||| ||| ||||| | | ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9020167 ttttactataaatacataccttgtatcagatgtaaaccttgtgctagagggagctgaaaacaagggtttggga-ggcaaca-caaaagtagggtttgtat 9020264  T
Q  498 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 594  Q
    ||||||   ||||| | ||||||||||||||||  ||  ||||||||||| || |||||   |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| |    
T  9020265 agagttg--ctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttggaaaacactattaagattgagtttcttggtcacgggaagagattggag 9020360  T
Q  595 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 693  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||    
T  9020361 ctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggatcggatggctgctctctcc 9020460  T
Q  694 cctagactaggtc-aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
     | | | ||||||   ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  9020461 tccaaattaggtctgttttggaccgaactggataaaccaattcttttgtgttct 9020514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 565 - 738
Target Start/End: Original strand, 10757291 - 10757462
Alignment:
Q  565 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 664  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  10757291 gagtctcttggttacg-gaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttcttt-gtaacgttactcatc 10757388  T
Q  665 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 738  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10757389 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattagaccgaactgggtcaacaaattcttt 10757462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 565 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 15354739 - 15354560
Alignment:
Q  565 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 664  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||     
T  15354739 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagactatt-cttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatt 15354642  T
Q  665 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15354641 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 15354560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 565 - 746
Target Start/End: Original strand, 23665158 - 23665337
Alignment:
Q  565 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 664  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  23665158 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagactatt-cttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 23665255  T
Q  665 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    | |||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23665256 aaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 23665337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 565 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 23742023 - 23741844
Alignment:
Q  565 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 664  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  23742023 gagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagactatt-cttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 23741926  T
Q  665 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    | |||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23741925 aaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 23741844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 565 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 23793429 - 23793250
Alignment:
Q  565 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 664  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  23793429 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagactatt-cttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 23793332  T
Q  665 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    | |||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23793331 aaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 23793250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 565 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 15357015 - 15356836
Alignment:
Q  565 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 664  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||     
T  15357015 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagactatt-cttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatt 15356918  T
Q  665 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    | |||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15356917 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccggactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 15356836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 400 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 20507796 - 20507659
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  20507796 ttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaattaaggtttgtatag 20507697  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 537  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  20507696 agtttgtctctttggaacaaacacaagggtttaagggt 20507659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 566 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 3373301 - 3373122
Alignment:
Q  566 agtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca 665  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| ||||||  ||||||||    
T  3373301 agtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatca 3373203  T
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3373202 tatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 3373122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 565 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 38960296 - 38960117
Alignment:
Q  565 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 664  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  38960296 gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagactatt-cttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 38960199  T
Q  665 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  38960198 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 38960117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 442 - 751
Target Start/End: Original strand, 20053834 - 20054136
Alignment:
Q  442 atagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 541  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |||| |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |||| |||||    
T  20053834 atagagggcgctgaaacaagggtttagaa-ggcaacacaaaaactagagtttatataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gagg-ttgat 20053929  T
Q  542 tcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattg 638  Q
    |||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||  ||||     ||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |   |    
T  20053930 tcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtttggaga-----ttgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc---g 20054021  T
Q  639 acatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaattt-ggaccgaactgggtcaacaaattct 736  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| | | ||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  20054022 atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggaaggctgctctctcctccatactaggtcagttttggaccgaactgcgtaaacaaattct 20054121  T
Q  737 tttgtgttctatctt 751  Q
    |||||||||| ||||    
T  20054122 tttgtgttctctctt 20054136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 145 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6662033 - 6661929
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6662033 tgttgtagtatgacttaaaacttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatgg 6661934  T
Q  245 acaat 249  Q
    |||||    
T  6661933 acaat 6661929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 641 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 26098379 - 26098267
Alignment:
Q  641 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct-cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 739  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26098379 atctcttttgtaacgttactcatcatatggtgaaacggagggctgctctctccccccatactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattctttt 26098280  T
Q  740 gtgttctatcttc 752  Q
     |||||| |||||    
T  26098279 atgttctctcttc 26098267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 359 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 41586082 - 41585946
Alignment:
Q  359 gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaa 457  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  41586082 gtatcttcagtctggtattcgttccaaatctatgagttatacttttactataaatataggttttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaa 41585983  T
Q  458 caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 494  Q
    ||| |||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  41585982 caagggtttagaataacaagaacaaaactagggtttg 41585946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 225 - 442
Target Start/End: Original strand, 15143262 - 15143475
Alignment:
Q  225 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgc 324  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||       ||||||||    
T  15143262 tgctaaaaatatatttatggacaataaatacatttttgtaccatatgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaata-------tttgatgc 15143354  T
Q  325 aaatgttctttcactgaag--gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatattttactataaatatagaccttg 422  Q
    |||| ||||||||||||||  | |            |||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15143355 aaatattctttcactgaagaaggggaaaaaagaaacgtatcttcagcgtgatatccgttacaaatttatgagttatatttctctataaatatagaccttg 15143454  T
Q  423 aatcaga-gtaaacctagaga 442  Q
     |||||| |||||||| ||||    
T  15143455 tatcagatgtaaaccttgaga 15143475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 561 - 734
Target Start/End: Original strand, 15143574 - 15143750
Alignment:
Q  561 gattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 659  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||    
T  15143574 gattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttac 15143673  T
Q  660 tcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    |||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||| ||||||||    
T  15143674 tcatcattatagtggaacggggagctgctttctcccctagactaggtcagtatttgaccgaaatgggtaaacaaatt 15143750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 144 - 224
Target Start/End: Original strand, 40221281 - 40221361
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttg 224  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40221281 atgttgtagtatgactcaaaatttaattgatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttg 40221361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 404 - 495
Target Start/End: Original strand, 4410006 - 4410101
Alignment:
Q  404 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 495  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410006 actataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 4410101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 455 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 17413441 - 17413176
Alignment:
Q  455 aaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaa 554  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||||| ||||||    
T  17413441 aaacaagggtttagaa-ggcagcactaaaactatggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaa 17413348  T
Q  555 ca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggaga-ctttttcttgtaactcattgacatctcttttg 650  Q
    ||   ||| |||||||||| ||||| | | |||||||||| | |||| ||||||||||||   || | ||| |||||||||| | |||| ||||||||||    
T  17413347 cactattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctcttttg 17413248  T
Q  651 taacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaac 720  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||| | ||||| | |||||||||||    
T  17413247 taaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctctcccccagagttggtcagtgttggaccgaac 17413176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 668 - 751
Target Start/End: Original strand, 20043206 - 20043289
Alignment:
Q  668 tagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
    |||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  20043206 tagtgaaacgaatggttgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctctt 20043289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 199
Target Start/End: Original strand, 15143220 - 15143274
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15143220 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 15143274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5779217 - 5779144
Alignment:
Q  155 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 228  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5779217 tgacttaaaatttgatagatgaagaagattattgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 5779144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 582 - 667
Target Start/End: Original strand, 42770940 - 42771025
Alignment:
Q  582 gaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcata 667  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  42770940 gaagagattgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 42771025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 199
Target Start/End: Original strand, 18466410 - 18466465
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466410 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatata 18466465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 400 - 620
Target Start/End: Original strand, 42770719 - 42770934
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 498  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||| ||| ||||    
T  42770719 ttttactataaatataaactttgtatc-gagtaaaccttgagatagaggggactgaaaacaagggtttggaa-ggcaaca-caaaattagg-tttatata 42770814  T
Q  499 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac-attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctt 597  Q
    || |||| ||||| | ||||||||||| |||| |  |||| |||||||  ||||||| |||| || ||||||| ||||| ||| |||||||||| | |||    
T  42770815 gaatttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttcattcaccatgggaaactattaggactgagtctcttggtcacgggaagagattgagactt 42770911  T
Q  598 tgggtagaattaggcgggagact 620  Q
    ||||||||||||| || ||||||    
T  42770912 tgggtagaattagacgagagact 42770934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 623 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 15445375 - 15445263
Alignment:
Q  623 ttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaac 720  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||| ||||    
T  15445375 ttcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctcttccc-agactaggtcagtattggactgaac 15445277  T
Q  721 tgggtcaacaaatt 734  Q
    ||||| ||||||||    
T  15445276 tgggtaaacaaatt 15445263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 561 - 745
Target Start/End: Original strand, 4897837 - 4898023
Alignment:
Q  561 gattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggc-gggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 659  Q
    |||||||| | ||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  | |||||  ||||||||||   |||| |||||| |||||| |||||    
T  4897837 gattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctattgtaaagttac 4897936  T
Q  660 tcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 745  Q
    |||||| ||||| | ||| | |||||||| ||||||| | ||||||||| | || ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4897937 tcatcattatagcggaacagtgggctgctttctcccccatactaggtcagtattcgactgaactgggtaaacaaatt-ttttgtgttc 4898023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 647 - 735
Target Start/End: Original strand, 23667513 - 23667601
Alignment:
Q  647 tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 735  Q
    |||||||||| |||||||| ||| || | |||||||||||||||| ||| |||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23667513 tttgtaacgtcactcatcaaataatggatcggagggctgctctcttccccagactaggacagattggaccgaactgggccaacaaattc 23667601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 666 - 737
Target Start/End: Original strand, 42238376 - 42238448
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  42238376 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 42238448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 9353371 - 9353425
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9353371 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9353425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 28832317 - 28832263
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  28832317 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaaccgggtcaacaa 28832263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 36932389 - 36932443
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36932389 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 36932443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 449
Target Start/End: Original strand, 2723912 - 2723961
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagaggg 449  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  2723912 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg 2723961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 682 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 14520283 - 14520234
Alignment:
Q  682 gctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14520283 gctgctctcccccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 14520234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 682 - 731
Target Start/End: Original strand, 17004004 - 17004053
Alignment:
Q  682 gctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17004004 gctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 17004053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 647 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 2144647 - 2144599
Alignment:
Q  647 tttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctccc 694  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2144647 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 2144599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Original strand, 19806487 - 19806531
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19806487 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 19806531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 666 - 737
Target Start/End: Original strand, 22672950 - 22673022
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  22672950 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 22673022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 666 - 737
Target Start/End: Original strand, 25445612 - 25445684
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  25445612 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25445684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 298
Target Start/End: Original strand, 32520241 - 32520316
Alignment:
Q  225 tgctgaaaatatatttatggacaataaa--tatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatatttt 298  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  32520241 tgctgaaaatatatttatgtagagtaaaaatatatttttgtaccgtacgaagaaaaatttgatgcaaacatatttt 32520316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Original strand, 32636948 - 32636992
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32636948 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 32636992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2532784 - 2532750
Alignment:
Q  192 aaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2532784 aaaatataaaagatttgtttcaaatatatcttgtg 2532750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 10281809 - 10281755
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10281809 ggagagctgctctctcccccagatcaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10281755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 11917011 - 11917065
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11917011 ggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 11917065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 15464590 - 15464536
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  15464590 ggagagctgctctctcccccagattagatcatattggaccgaactgggtcaacaa 15464536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 19588804 - 19588750
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  19588804 ggagggctgctctctccctaagattagttcatattggaccgaactgggtcaacaa 19588750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 681 - 731
Target Start/End: Original strand, 24553549 - 24553599
Alignment:
Q  681 ggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  24553549 ggctgctctctcccatagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 24553599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 666 - 707
Target Start/End: Original strand, 10627482 - 10627523
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca 707  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  10627482 tatagtggaacggagagctgctctctcccctagagtaggtca 10627523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 687 - 728
Target Start/End: Original strand, 13488327 - 13488368
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 728  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  13488327 tctctccccgagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaa 13488368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 666 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 17841315 - 17841246
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| ||||||||    
T  17841315 tatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 17841246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 686 - 731
Target Start/End: Original strand, 31300644 - 31300689
Alignment:
Q  686 ctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31300644 ctctctccctcagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31300689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 414; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 12061 - 11451
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12061 tgttgtagtatgattcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaaaatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 11962  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11961 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 11862  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 443  Q
    ||            ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11861 agaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagat 11764  T
Q  444 agagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 543  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  11763 agagggggctgaaacagggatttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattt 11664  T
Q  544 acctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 640  Q
     ||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||     
T  11663 tccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgat 11564  T
Q  641 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 740  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11563 ttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttg 11464  T
Q  741 tgttctatcttct 753  Q
    |||||| ||||||    
T  11463 tgttctctcttct 11451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 413; Significance: 0; HSPs: 109)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 42924094 - 42923482
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42924094 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 42923995  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42923994 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaaagaaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 42923895  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--agag 441  Q
    ||            ||||||||||    || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  42923894 agaacaaataa---gtatcttcag----gtgttcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcatagtaaaccttgagag 42923802  T
Q  442 atagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgat 541  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42923801 atagaggaggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgat 42923702  T
Q  542 tcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattg 638  Q
    |||||| || |||||   ||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  42923701 tcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattg 42923602  T
Q  639 acatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 738  Q
    | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42923601 atatctcttttgtaaagttactcgtcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 42923502  T
Q  739 tgtgttctatcttctcttct 758  Q
    |||||||| |||||| ||||    
T  42923501 tgtgttctctcttcttttct 42923482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 23452829 - 23452222
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23452829 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttatgctgaaaataaatttatgg 23452730  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23452729 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 23452630  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----ag 439  Q
    ||            ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |    ||    
T  23452629 agaaaaaaaaaa--gtaccttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagag 23452532  T
Q  440 agatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 539  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23452531 agacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttg 23452432  T
Q  540 attcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcat 636  Q
    |||||||| | |||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  23452431 attcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccat 23452332  T
Q  637 tgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 736  Q
    |||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452331 tgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 23452232  T
Q  737 tttgtgttct 746  Q
    ||||||||||    
T  23452231 tttgtgttct 23452222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 746
Target Start/End: Original strand, 42452449 - 42453050
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452449 tgttgtagtatgacttaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 42452548  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42452549 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 42452648  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 443  Q
    ||           | ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||    
T  42452649 agaaaaaaaaaatg-tatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttattataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagat 42452747  T
Q  444 agagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 543  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  42452748 agagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtataaagtttgtctctgt--aacaaacactagagtttgtgggttgattc 42452845  T
Q  544 acctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 640  Q
    |||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||     
T  42452846 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 42452945  T
Q  641 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 740  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452946 ttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 42453044  T
Q  741 tgttct 746  Q
    ||||||    
T  42453045 tgttct 42453050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 144 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 35216185 - 35215571
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35216185 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 35216086  T
Q  244 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 343  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  35216085 gacaataaatatatttttgtatcgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcagatattctttcactgaag 35215986  T
Q  344 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----- 437  Q
    |||            | |||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |         
T  35215985 gagaaaaaaaaat--gaatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 35215888  T
Q  438 -----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttg 532  Q
         ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  35215887 gagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttg 35215788  T
Q  533 agggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttg 628  Q
     |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  35215787 tgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttg 35215688  T
Q  629 taactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 728  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  35215687 taactcattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaa 35215589  T
Q  729 caaattcttttgtgttct 746  Q
    |||||   ||||||||||    
T  35215588 caaatatctttgtgttct 35215571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 145 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 35218565 - 35217948
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35218565 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 35218466  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35218465 acaataaatatatttttgtatcgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 35218366  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct------ 437  Q
    ||            | ||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||| |          
T  35218365 agaaaaaaaaac--gaatcttcagtgtggtatttgctccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtataaggctaaactttgagag 35218268  T
Q  438 --------agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggt 529  Q
            ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  35218267 agagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggt 35218168  T
Q  530 ttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttc 625  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  35218167 ttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattc 35218068  T
Q  626 ttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggt 725  Q
    ||||||| | ||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  35218067 ttgtaacccgttgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggt 35217969  T
Q  726 caacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||   ||||||||||    
T  35217968 caacaaatatctttgtgttct 35217948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 19007561 - 19007910
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19007561 ttttactataaatataggctttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattatggtttgtatag 19007660  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||   |||  ||||||| | ||||||| | |||||||||||||||    
T  19007661 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtttcttggttatgggaagagattggggct 19007760  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  19007761 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctccccc 19007860  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19007861 agactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 19007910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 22287670 - 22287315
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22287670 ttttactataaatatagaccttgtattaaagtaaactttgagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 22287571  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| || |||||| ||||||||||   ||    
T  22287570 agtctgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacggtattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgacact 22287471  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    | |||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22287470 tcgggtagaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccct 22287371  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22287370 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 22287315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 6264479 - 6264127
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  6264479 ttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatag 6264384  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||| ||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  6264383 agtttgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgataaaagattggggct 6264284  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6264283 ttggatagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccc 6264184  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6264183 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 6264127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 19504679 - 19504331
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504679 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 19504580  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  19504579 agtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg-gaagaggctgggact 19504481  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||     
T  19504480 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctatctccccc 19504381  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504380 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 19504331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 40032392 - 40032032
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40032392 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 40032293  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||  |||||| || || ||    
T  40032292 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggttaggact 40032193  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgaca----tctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct 691  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  40032192 ttgggtagaattaggcgtgagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgcaaagttactcatcattatagtgaaacggagggccgctctct 40032093  T
Q  692 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  40032092 ccctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtattctctcttc 40032032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 399 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 19502346 - 19501996
Alignment:
Q  399 attttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 498  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19502346 attttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgta 19502247  T
Q  499 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || | |    
T  19502246 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagac 19502147  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  19502146 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcgaagggctgctctctcccc 19502047  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19502046 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 19501996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 21521029 - 21520672
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 497  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21521029 ttttactataaatataaaccttgtatcagactaaactttgagagatagatggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtat 21520930  T
Q  498 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 594  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||| |||||||||| ||||||||  ||||||  | ||     
T  21520929 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctagga 21520830  T
Q  595 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 694  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21520829 ctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctccc 21520730  T
Q  695 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21520729 ccagactaggtcaatttggaccgaactttgtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 21520672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Original strand, 28196558 - 28196917
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28196558 ttttactataaatatatgctttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 28196657  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||    
T  28196658 agtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgaggct 28196757  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||     
T  28196758 ttgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacgaatggctgctctctccccc 28196857  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28196858 agactaggtcaatt--gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 28196917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 404 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 45280315 - 45279969
Alignment:
Q  404 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaag-gcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 502  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45280315 actataaatatataccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 45280216  T
Q  503 ttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttg 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||    
T  45280215 ttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttg 45280116  T
Q  600 ggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctaga 699  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  45280115 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaga 45280016  T
Q  700 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45280015 ctaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 45279969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 13910378 - 13910030
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910378 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 13910279  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||  ||    
T  13910278 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagagactggaact 13910179  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||| | | || |||||||||||||||     
T  13910178 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcagatggctgctctctccccc 13910080  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910079 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13910030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 27104720 - 27105067
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104720 ttttactataaatatagaccttgtatcagagaaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 27104819  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  27104820 agtttgtctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 27104918  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  27104919 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacattactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 27105017  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27105018 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27105067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 6259149 - 6258796
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6259149 ttttactataaatatagaccttgtattagactaaactttgagatagaggaggatgaaacaagagtttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatag 6259050  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||    
T  6259049 agtttgtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga--agattggggct 6258952  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6258951 ttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtgaaacggagggctgctctctcccc 6258852  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6258851 -atactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 6258796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 42064436 - 42064785
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064436 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 42064535  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||    
T  42064536 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 42064635  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  42064636 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 42064734  T
Q  697 agactaggtc-aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064735 agactaggtcaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 42064785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 43623902 - 43623553
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43623902 ttttactataaaaatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagaggggggtgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 43623803  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||||||            |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  43623802 agtttgtctc------------actaggttttgagggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 43623715  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  43623714 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccc 43623615  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  43623614 aaactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 43623553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 400 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 11739894 - 11739537
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || || |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  11739894 ttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctggaacaagggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttgtatgg 11739795  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||| ||| |||||||   |||||||||||| ||    
T  11739794 agtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttataggaagagattgggact 11739695  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| ||  |||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  11739694 ttgggtagaattaggcgggagaattattcttggaatccattgatatctcttttgaaaggttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 11739595  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 753  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11739594 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 11739537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Original strand, 17848366 - 17848722
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17848366 ttttactataaatataggctttgtatcag--taatccttgagatagagggggctcaaacgagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatag 17848463  T
Q  500 agtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  17848464 agtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggc 17848563  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||||||   |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  17848564 tttgggtagaa---ggcgggagacttattcttgtaac-cattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctctcccc 17848659  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
     | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17848660 catactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 17848722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Original strand, 17849038 - 17849393
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||    
T  17849038 ttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagataacaacaaaactagagttcgtatag 17849137  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| | ||    
T  17849138 agtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggtaagagattgagact 17849237  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  17849238 ttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacgg-gggctgctctctccca 17849336  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
     | |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17849337 catactaggtcaatttggacaagactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 17849393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Original strand, 14837194 - 14837544
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |     
T  14837194 ttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggttaaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtacat 14837293  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||      |||||||||| | ||    
T  14837294 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg------gaagagattgagact 14837387  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  14837388 ttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggatggatgctctctcccc 14837487  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14837488 cagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 14837544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 24162546 - 24162208
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24162546 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 24162447  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||| |          |||| ||    
T  24162446 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttgc----------tgggact 24162357  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||| | |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||     
T  24162356 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaatgctactcatcatatagtggattggatggctgctctctccccc 24162258  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24162257 ggactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 24162208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 407 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 34979906 - 34979562
Alignment:
Q  407 ataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 506  Q
    |||||||||||| ||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  34979906 ataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagcgtttagaaaggtaacaaaaaaactagggtttgtataaagtttgt 34979807  T
Q  507 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggta 603  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||| ||||    
T  34979806 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattcggactttcggta 34979707  T
Q  604 gaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctct-ctcccctagact 701  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||| | ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||||| |||| | |||| | |||    
T  34979706 gaattaggcgggagacttattcttgtaatccatttatatctcttttgtaaggttcctcatcattatagtggaacgaagggctactctccccccccaaact 34979607  T
Q  702 aggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34979606 aggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 34979562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 402 - 752
Target Start/End: Original strand, 3022086 - 3022448
Alignment:
Q  402 ttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 501  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3022086 ttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttataaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagag 3022185  T
Q  502 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggcttt 598  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||   |||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| || |||    
T  3022186 tttgtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgaggtttt 3022285  T
Q  599 gggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca----------tatagtgaaacggagggctgctc 688  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| ||| ||| |||||||||||          |||| |||||| || ||||||||    
T  3022286 aggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctc-tttataaagttactcatcattatcatcgttataatgaaacagatggctgctc 3022384  T
Q  689 tctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3022385 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 3022448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 400 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 45239315 - 45239000
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 494  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  45239315 ttttactataaatatagaccattcatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaatgatttagaaagacaaaaacaaaactagggtttg 45239216  T
Q  495 tatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagatt 590  Q
    |||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  45239215 tatagacttt--ctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 45239118  T
Q  591 ggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc 690  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45239117 ggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc 45239018  T
Q  691 tcccctagactaggtcaa 708  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  45239017 tcccccagactaggtcaa 45239000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 400 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 31733099 - 31732772
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31733099 ttttactataaatatagactttgtaacagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatag 31733000  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||   ||| |||||||||| |||||            ||||| ||    
T  31732999 agtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgttgggaaacactgttaggattgagtctcttggt------------ttgggact 31732912  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  31732911 ttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattgtgaaacggaggactgctctctcccc 31732812  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 735  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  31732811 cagactaggtcaatttggaccgagctgggtaaacaaattc 31732772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 44289402 - 44289046
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||||||||||||   ||| |||| || |||||| || ||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44289402 ttttactataaatataggttttgtatcatagcaaaccttgatatagaggggactaaaacaaaggtttaggaaggcaacaacaaaactagagtttgtatag 44289303  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||    
T  44289302 agtctgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgggact 44289203  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    | ||||||||||| | || | |||| |||||||||| | |||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || || |||||| |||||    
T  44289202 tagggtagaattaagtggaaaacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaagattactcatcattatagtgaaacagatggttgctctttcccc 44289103  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44289102 caaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 44289046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 400 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 11578438 - 11578104
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  11578438 ttttactataaatatagaccttatatcagggtaaatcttgagatagagtgggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaaaaaaactagggtttgtatag 11578340  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    | ||| |||||| | |||||||  ||||||| |  ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||    
T  11578339 aatttttctcttggcaacaaac--tagggttgg--ggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggact 11578244  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  11578243 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtcgaacggagggctgctctttcccc 11578144  T
Q  696 tagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
     ||||||| |||  ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  11578143 cagactagatcagttttagaccgaactaggtaaacaaatt 11578104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 400 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 18800636 - 18800283
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||          || |||||||||||||||    
T  18800636 ttttactataaatatagaccttgtatcagggtaaacatggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aagctagggtttgtatag 18800545  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    || ||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||    
T  18800544 aggttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattggggct 18800449  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18800448 ttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcattatagtgaaacggagggctactctctcccc 18800349  T
Q  696 tagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttcttct 761  Q
     |||| ||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18800348 -agaccaggtcagttttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctcttcttttcttct 18800283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 400 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 15539809 - 15539553
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15539809 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatatagggggttgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatag 15539710  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||| | ||    
T  15539709 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttacgggaagagattgagact 15539610  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaa 653  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  15539609 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaa 15539553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 529 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 5375550 - 5375319
Alignment:
Q  529 tttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttc 625  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  5375550 tttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgg-agacttattc 5375452  T
Q  626 ttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggt 725  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5375451 ttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 5375352  T
Q  726 caacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5375351 caacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 5375319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 400 - 751
Target Start/End: Original strand, 22874063 - 22874406
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||| ||||||||| || | ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||    
T  22874063 ttttgctataaatacaggctttgtatcagagcaaacctggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatag 22874154  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| ||||   |||||||||||||| || |||||   ||| |||||||||| || || ||| |||||||||| ||||    
T  22874155 agtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gggttgattcaccttggaaaacagtattaggattgagtctcttagtcacgggaagagattgaggct 22874250  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    || |||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  22874251 ttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaactgagagctgctctctccct 22874350  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  22874351 catactaggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattctcttgtgttctctctt 22874406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 144 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 27583908 - 27583631
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 243  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27583908 atgttgtagtatgactcaaattttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaagatatatttatg 27583809  T
Q  244 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 343  Q
     ||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| ||||||       |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27583808 aacaataaatatatttttataccatatgaaggaatatttgatgcaaatatattttgaaaaggaata-------tttgatgcaaatattctttcactgaag 27583716  T
Q  344 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatattttactataaatatagaccttgaatcaga 429  Q
    |||            |||||||||| ||  ||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||    
T  27583715 gagaaaaaagaaat-gtatcttcagcgtgatatccgttccaaatttatgagttatatttctctataaatatagatcttgtatcaga 27583631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 589 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 22407596 - 22407433
Alignment:
Q  589 ttggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc 688  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22407596 ttgggacttttggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc 22407497  T
Q  689 tctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22407496 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 22407433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 489 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 28459435 - 28459170
Alignment:
Q  489 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaag 585  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || |||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  28459435 ggtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 28459336  T
Q  586 agattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggct 684  Q
    || |||||||||  |||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28459335 agtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttttaaagttactcatcattatagtgaaacggagggct 28459236  T
Q  685 gctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
     ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||| ||||    
T  28459235 tctctct-acctagactaggtcaatttggatcgaactagataaacaaattcttttgtgttctctctt 28459170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 400 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 22407743 - 22407591
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22407743 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgtgagatatagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 22407644  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcggga 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22407643 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 22407591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 400 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 20146941 - 20146604
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 497  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||| |     |||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  20146941 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttaagaggtagagagtttgaaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtat 20146843  T
Q  498 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaa---gattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 594  Q
    |||||||| | ||| | ||||||||||| |||| |  | ||||||||||| |||||||| ||    |||||||||| ||||| ||| ||| |||||| |     
T  20146842 agagtttgcc-cttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacaatagtaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgaga 20146746  T
Q  595 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 693  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20146745 ttttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcc 20146646  T
Q  694 cctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    |  |||||| |||| | |||||||||||||||| ||| ||||    
T  20146645 ctcagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacgaatt 20146604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 565 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 36559029 - 36558849
Alignment:
Q  565 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 664  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  36559029 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 36558931  T
Q  665 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36558930 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 36558849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 565 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 36561306 - 36561126
Alignment:
Q  565 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 664  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  36561306 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 36561208  T
Q  665 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36561207 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 36561126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 155 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 28568740 - 28568584
Alignment:
Q  155 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaata 254  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  28568740 tgactcaaaatttgatagatgaagaatattgttgctaaaactataaaagatttgtttcaaatatattttgttttgaaaatatatttatggacaataaata 28568641  T
Q  255 tatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatatt 311  Q
    |||||||||| ||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28568640 tatttttgtatcgtgtgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaatatt 28568584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 400 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 22163281 - 22163125
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22163281 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaacactagggtttgtatag 22163182  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca 556  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22163181 agtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaaca 22163125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 400 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 17897576 - 17897242
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagagatagagggggctga-aacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 497  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||| |  |||| ||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  17897576 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaacttgaggtagagagt-ctgagaacaagggtttagaa-gtcaacaataaaactagggtttgtat 17897479  T
Q  498 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 594  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||  |||||  ||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||| | ||||| |||||| |     
T  17897478 agagtttg-ctcttcgcaacaaacactagg--ttgaga-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaaaagattgaga 17897383  T
Q  595 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 693  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||    
T  17897382 ttttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatggctgctctctcc 17897283  T
Q  694 cctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    || ||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||    
T  17897282 cc-agactaggtcagtattggtccgaactgggtaaacaaatt 17897242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 565 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 45332346 - 45332166
Alignment:
Q  565 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 664  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  ||||||| |||| | ||||||||    
T  45332346 gagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctcttt-gtaaaggtactcatc 45332248  T
Q  665 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  45332247 atatagtgaattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 45332166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 642 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 22163111 - 22162995
Alignment:
Q  642 tctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 741  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22163111 tctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgt 22163012  T
Q  742 gttctatcttctcttct 758  Q
    ||||| |||||| ||||    
T  22163011 gttctctcttcttttct 22162995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 612 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 22707872 - 22707730
Alignment:
Q  612 cgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct--agactaggtcaat 709  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  22707872 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctctcctccagactaggtcaat 22707773  T
Q  710 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22707772 ttggactgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 22707730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 437 - 632
Target Start/End: Original strand, 38020160 - 38020348
Alignment:
Q  437 tagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaggg 536  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  38020160 tagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgaggg 38020259  T
Q  537 ttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagatt-ggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaac 632  Q
    ||||||||||  || ||||   |||| |||||||||| |||||           ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  38020260 ttgattcaccatggtaaacactattaggattgagtctcttggt-----------attgggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaac 38020348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 145 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27136505 - 27136368
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaat--------at 236  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        ||    
T  27136505 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattggtgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatataaatat 27136406  T
Q  237 atttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaag 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27136405 atttatggaaaataaatatatttttgtaccgtatgaag 27136368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 602 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7462950
Alignment:
Q  602 tagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagact 701  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccattatatagtggatcggagggctgctctctcccccagact 7462978  T
Q  702 aggtcaa-tttggaccgaactgggtcaa 728  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7462977 aggtcaattttggaccgaactgggtcaa 7462950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 404 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 5377763 - 5377629
Alignment:
Q  404 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||| |    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5377763 actataaatatagaccttgtttcagagcaaactttgagagagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatag 5377664  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgag 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5377663 agtttgtctctttggaacaaacactaggttttgag 5377629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 379 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 37963283 - 37962938
Alignment:
Q  379 gttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaac 477  Q
    ||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||            
T  37963283 gttccaattttatgatggatacttttactataaatatagactttgtataagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttaga-------- 37963192  T
Q  478 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacatta---agattgagtcttttg 574  Q
    ||  |||||||||||||| || |||||| |||||   ||||||||| | ||||   | |||||||| |||  | ||||||||   ||||||||||| |||    
T  37963191 aatcaaactagggtttgtgtatagtttg-ctcttgacaacaaacaccatggtt---gtgttgattccccttagaaaacattattgagattgagtctcttg 37963096  T
Q  575 gttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtga 673  Q
    || ||  |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||  ||||||    | |||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  37963095 gtcacctgaagagattgaggctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaatccattga---tttttttgtaaagttattcatcattatagtga 37962999  T
Q  674 aacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    ||| | || ||| |||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37962998 aacagtggactgatctctctcccacactaggttaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 37962938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 611 - 752
Target Start/End: Original strand, 23870951 - 23871092
Alignment:
Q  611 gcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatt 710  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23870951 gcggcagacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctctcccttagattaggtcaatt 23871050  T
Q  711 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23871051 tggatcaaactaggtcaacaaattcttttgagttctctcttc 23871092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 34575696 - 34575608
Alignment:
Q  152 gtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatattt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34575696 gtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgttctaaatatattttgtgctgaaaatatattt 34575608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 155 - 311
Target Start/End: Original strand, 15693583 - 15693755
Alignment:
Q  155 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct-----------------gaaaatata 237  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||                 |||||||||    
T  15693583 tgacttaaaatttgatggatgaataatattgttgctaaaaatataaa-gatttgtttcaaatatattttgtgcttccaaaaacttgttgctgaaaatata 15693681  T
Q  238 tttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatatt 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  15693682 tttatgggcaataaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaaggggatatt 15693755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 535 - 734
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699634
Alignment:
Q  535 ggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgta 630  Q
    ||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   | |||||| || |||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 40699528  T
Q  631 actcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaa 728  Q
    |  | |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||| | || ||||||||| ||| ||    
T  40699529 atcctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggtcagtattagaccgaactaggtaaa 40699628  T
Q  729 caaatt 734  Q
    ||||||    
T  40699629 caaatt 40699634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 134
Target Start/End: Original strand, 20144403 - 20144518
Alignment:
Q  19 gaaaaagagacaaatggccttattaaagaacttattcctccaggataagttgatagcttaactagcctcatctttgctaatgcgttgtactttagaggag 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||| | | | ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  20144403 gaaaaagagacaattggccttattaaagaacttcttcctcgaggaccagttgatagatcagccagcgtcatctttgctaatgcattgtactttataggag 20144502  T
Q  119 catggaatgagaagtt 134  Q
    ||||||||||||||||    
T  20144503 catggaatgagaagtt 20144518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 134
Target Start/End: Original strand, 20358915 - 20359030
Alignment:
Q  19 gaaaaagagacaaatggccttattaaagaacttattcctccaggataagttgatagcttaactagcctcatctttgctaatgcgttgtactttagaggag 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||| | | | ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  20358915 gaaaaagagacaattggccttattaaagaacttcttcctcgaggaccagttgatagatcagccagcgtcatctttgctaatgcattgtactttataggag 20359014  T
Q  119 catggaatgagaagtt 134  Q
    ||||||||||||||||    
T  20359015 catggaatgagaagtt 20359030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 400 - 751
Target Start/End: Original strand, 35107221 - 35107571
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatg-gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 498  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||| ||||| |  || |||| | | |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  35107221 ttttactataaatatagacattgtatcatagtaaaccttgaggtagagagt-ctaaaaccaagagtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtata 35107318  T
Q  499 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaa---gattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||    || ||| || ||||||||||| | |||||||||    |||||||||| ||||| ||| |||||||||| | |    
T  35107319 gagtttg-ctcttggcaacaaaca----gggttg-ggattgattcaccttgagaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgtgac 35107412  T
Q  596 tttgggtagaattaggcg--ggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc 692  Q
    |||||||||||||||     | |||||| |||||||||| | |||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| || || |||||     
T  35107413 tttgggtagaattagattttgaagacttattcttgtaac-ctttgttatctcttttgtaatgttactcatcattatagtggaacggatggttgttctctt 35107511  T
Q  693 ccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
     || ||||||||||| | |||||||||| | ||| |||||||  ||||||||||| ||||    
T  35107512 tcccagactaggtcagtattggaccgaaataggtaaacaaatatttttgtgttctctctt 35107571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 20169371 - 20169256
Alignment:
Q  19 gaaaaagagacaaatggccttattaaagaacttattcctccaggataagttgatagcttaactagcctcatctttgctaatgcgttgtactttagaggag 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||| | | | ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  20169371 gaaaaagagacaattggccttattaaagaacttcttcctcgaggaccggttgatagatcagccagcgtcatctttgctaatgcattgtactttataggag 20169272  T
Q  119 catggaatgagaagtt 134  Q
    ||||||||||||||||    
T  20169271 catggaatgagaagtt 20169256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 400 - 493
Target Start/End: Original strand, 38020064 - 38020157
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 493  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38020064 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacctggagatagagggggttggaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38020157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 155 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 41303623 - 41303457
Alignment:
Q  155 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaa-tataaaagatttgtttcaaatatattttg-----------------tgctgaaaatat 236  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||    
T  41303623 tgactcagaatttgatggatgaagaagattgttgctaaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgcttccataagattgttgctgaaaatat 41303524  T
Q  237 atttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaag 303  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | || ||||| |||||||||||| ||||    
T  41303523 atttatggacagtaaatataattttgtaccgtgtgaaggaagaattgattcaaatatatttttaaag 41303457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 155 - 220
Target Start/End: Original strand, 28568346 - 28568411
Alignment:
Q  155 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatat 220  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28568346 tgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgttaaaaatataaaagatttgtttcaaatatat 28568411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 561 - 680
Target Start/End: Original strand, 20589775 - 20589896
Alignment:
Q  561 gattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 659  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||   |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| | |||||    
T  20589775 gattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctcttttgtgaagttac 20589874  T
Q  660 tcatca-tatagtgaaacggag 680  Q
    |||||| ||||||| |||||||    
T  20589875 tcatcattatagtgtaacggag 20589896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 489 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 27136368 - 27136195
Alignment:
Q  489 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaag 585  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||| || || |||||   ||| |||||| ||| ||||| |||  |||    
T  27136368 ggtttatatagagcttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaag 27136272  T
Q  586 agattggggctttgggtagaattaggcg-ggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactc 661  Q
    | |||||| ||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27136271 aaattgggactttgagtagaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactc 27136195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 225 - 296
Target Start/End: Original strand, 39286971 - 39287042
Alignment:
Q  225 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatatt 296  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||||    
T  39286971 tgcttaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccatatgaatgaagatttgatgcaaatatatt 39287042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 400 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 12342744 - 12342684
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaa 460  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12342744 ttttactataaatatacacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaa 12342684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 311
Target Start/End: Original strand, 7502638 - 7502723
Alignment:
Q  226 gctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatga-agaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatatt 311  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  7502638 gctgaaaatatatttatgaacaataaaaatatttttgtattgtatgacagaa-gatttgatgcaaatatatttttaaaggaaatatt 7502723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 34575617 - 34575528
Alignment:
Q  250 aaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggag 346  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||       |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34575617 aaatatatttttgtaccatataaaggaaaatttgatgcaaatatattttgaaagggaata-------tttgatgcaaatattctttcactgaaggag 34575528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 568 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 13828507 - 13828338
Alignment:
Q  568 tcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat 666  Q
    ||||||||| ||| |||||||||  | ||||||||||||||| |   || ||||| |||||||| | | |||| |||||||||||||  |||||||| ||    
T  13828507 tcttttggtcacgggaagagattcagactttgggtagaattatgtttgaagacttattcttgtagccctttgatatctcttttgtaaaattactcataat 13828408  T
Q  667 -atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatt-tggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
     |||||| ||| |   ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||    
T  13828407 tatagtggaacagttagctactctctcccctagactaggtcagttctggaccgaactggataaacaaatt 13828338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 707 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 15539553 - 15539508
Alignment:
Q  707 aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15539553 aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 15539508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 522 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414194
Alignment:
Q  522 actagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggaga 618  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  38414291 actagggtttgagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacg-gaaaagattgggacttttggtagaattaggcgggaga 38414194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 223
Target Start/End: Original strand, 39286892 - 39286952
Alignment:
Q  159 tcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 223  Q
    |||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39286892 tcaaaatttgatggatg----agattgttgctaaaaatataaatgatttgtttcaaatatatttt 39286952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 41304884 - 41304806
Alignment:
Q  225 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagg 304  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||    
T  41304884 tgctgacaatatatttatggatagtaaatatatttttgta-catatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagg 41304806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 14699046 - 14699100
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14699046 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 14699100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 429 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 38414340 - 38414281
Alignment:
Q  429 agtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 494  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38414340 agtaaaccttgagatagagggggctgaaac------ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 38414281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 17057413 - 17057369
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17057413 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17057369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 17085396 - 17085352
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17085396 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17085352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 666 - 737
Target Start/End: Original strand, 38191128 - 38191200
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  38191128 tatagtggaacgaagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 38191200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 158 - 209
Target Start/End: Original strand, 7502582 - 7502633
Alignment:
Q  158 ctcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgt 209  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7502582 ctcaaaatttgatggatgaagaagattgttgctcaaagtataaaagatttgt 7502633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 687 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 17490192 - 17490149
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 730  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17490192 tctctcccctagagtaggtcaatttggaccgaactgggtaaaca 17490149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 400 - 447
Target Start/End: Original strand, 40699231 - 40699278
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagag 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  40699231 ttttactataaatatagaccttgcatcagagtaaaccttgagagagag 40699278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 8390189 - 8390243
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8390189 ggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaactgggtcaacaa 8390243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 13569386 - 13569332
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13569386 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13569332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 20522278 - 20522224
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20522278 ggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20522224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41304964 - 41304898
Alignment:
Q  155 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 228  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||     |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41304964 tgactcaaaatttgatggatgaagaagatt-----taaaaatataaaagatttg--tcaaatatattttgtgct 41304898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 684 - 737
Target Start/End: Original strand, 1345587 - 1345640
Alignment:
Q  684 tgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1345587 tgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatttctt 1345640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 684 - 737
Target Start/End: Original strand, 2838076 - 2838129
Alignment:
Q  684 tgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  2838076 tgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatttctt 2838129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 647 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 10942597 - 10942497
Alignment:
Q  647 tttgtaacgttactcatca--tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 743  Q
    |||||||  ||||||||||  ||||||| |||| || |||| | ||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  10942597 tttgtaaaattactcatcaattatagtggaacgaagagctggtgtctcccctagagtaggtcagtattggaccgaactaggtaaacaaattctcttgtgt 10942498  T
Q  744 t 744  Q
    |    
T  10942497 t 10942497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 647 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 10948466 - 10948366
Alignment:
Q  647 tttgtaacgttactcatca--tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 743  Q
    |||||||  ||||||||||  ||||||| |||| || |||| | ||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  10948466 tttgtaaaattactcatcaattatagtggaacgaagagctggtgtctcccctagagtaggtcagtattggaccgaactaggtaaacaaattctcttgtgt 10948367  T
Q  744 t 744  Q
    |    
T  10948366 t 10948366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 723788 - 723744
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  723788 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 723744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 666 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 27517705 - 27517633
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||| ||| |||||||||||    
T  27517705 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaacttggtaaacaaattctt 27517633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 33162494 - 33162450
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33162494 tctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactaggtcaacaa 33162450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 34139814 - 34139770
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34139814 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 34139770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 36318053 - 36318009
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36318053 tctctcccttagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 36318009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Original strand, 39284960 - 39285004
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39284960 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 39285004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 666 - 733
Target Start/End: Original strand, 39680160 - 39680228
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 733  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  39680160 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 39680228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 666 - 733
Target Start/End: Original strand, 39687098 - 39687166
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 733  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  39687098 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 39687166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 688 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 11151634 - 11151591
Alignment:
Q  688 ctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11151634 ctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 11151591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 2869732 - 2869786
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  2869732 ggagagctactctctcccctagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaa 2869786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 8040118 - 8040064
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  8040118 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaa 8040064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 10445483 - 10445537
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  10445483 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaa 10445537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 400 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 20147082 - 20147040
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagaga 442  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  20147082 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgaga 20147040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 28259216 - 28259270
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28259216 ggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 28259270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 676 - 737
Target Start/End: Original strand, 30479120 - 30479182
Alignment:
Q  676 cggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  30479120 cggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 30479182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 31056102 - 31056048
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  31056102 ggagagctgctctctcccctagattaggtcatattgaaccgaactaggtcaacaa 31056048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 34682373 - 34682427
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  34682373 ggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 34682427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 455 - 611
Target Start/End: Original strand, 43139356 - 43139509
Alignment:
Q  455 aaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaa 554  Q
    |||||| ||||||||| | |||||  |||||| |||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||  |||||||| || ||||||    
T  43139356 aaacaagggtttagaa-gccaacacaaaaacttgggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcatcttgggaaa 43139449  T
Q  555 cattaa---gattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg 611  Q
    |||||    |||||||||| ||||| ||| ||||| |||| | |||| ||||||||||||    
T  43139450 cattattaggattgagtctcttggtcacgggaagatattgagactttaggtagaattagg 43139509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 666 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 12781287 - 12781246
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca 707  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12781287 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 12781246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 410; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 753
Target Start/End: Original strand, 78883 - 79495
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  78883 tgttgtagtatgacttaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtctcaaatatattttctgctaaaaatatatttatgg 78982  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  78983 ataataaatatatttttgtactgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 79082  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatat-tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 443  Q
    ||            ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  79083 aggaaaaaaaaaatgtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacctttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaacttgagat 79182  T
Q  444 agagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 543  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  79183 agagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattc 79282  T
Q  544 acctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 640  Q
    |||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||     
T  79283 accttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagaatttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 79382  T
Q  641 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttg 740  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  79383 ttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttg 79482  T
Q  741 tgttctatcttct 753  Q
    |||||| ||||||    
T  79483 tgttctctcttct 79495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 409; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 144 - 737
Target Start/End: Original strand, 51708 - 52307
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51708 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaataatgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtggtgaaaatatatttatg 51807  T
Q  244 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51808 gacaataaatatatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 51907  T
Q  344 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--aga 440  Q
    |||            ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |  |||    
T  51908 gagaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgaga 52005  T
Q  441 gatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttga 540  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52006 gatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattga 52105  T
Q  541 ttcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcatt 637  Q
    ||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52106 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcatt 52205  T
Q  638 gacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctg--ctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 735  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52206 gacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattc 52305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 404 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 183969 - 183626
Alignment:
Q  404 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 503  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  183969 actataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtt 183871  T
Q  504 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  183870 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg-gaagagattgggactttgg 183772  T
Q  601 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 700  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  183771 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccctcagac 183672  T
Q  701 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183671 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 183626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 137 - 216
Target Start/End: Original strand, 50151 - 50230
Alignment:
Q  137 atgtttcatgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaat 216  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50151 atgttacatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaataatgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaat 50230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 666 - 737
Target Start/End: Original strand, 50235 - 50308
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctc--ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50235 tatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggacctaactgggtcaacaaattctt 50308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 267
Target Start/End: Original strand, 170076 - 170118
Alignment:
Q  225 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccg 267  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  170076 tgctgaaaatatattcatggacaacaaatatatttttgtaccg 170118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 409; Significance: 0; HSPs: 148)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 144 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 14788022 - 14787423
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14788022 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaataatgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtggtgaaaatatatttatg 14787923  T
Q  244 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14787922 gacaataaatatatttttgtaccgtataaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 14787823  T
Q  344 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--aga 440  Q
    |||            ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |  |||    
T  14787822 gagaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgaga 14787725  T
Q  441 gatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttga 540  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14787724 gatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattga 14787625  T
Q  541 ttcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcatt 637  Q
    ||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14787624 ttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcatt 14787525  T
Q  638 gacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc--tctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 735  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14787524 gacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattc 14787425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 727
Target Start/End: Original strand, 56030189 - 56030770
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56030189 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 56030288  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  56030289 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttggtgcaaatattctttcactgaagg 56030388  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatatttt-actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 443  Q
    ||            |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||    
T  56030389 agaaaaaaaaaa--gtatcttcggtgtggtattctttccaaatttatgagttatatttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagat 56030486  T
Q  444 agagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 543  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56030487 agaaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattc 56030586  T
Q  544 acctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 640  Q
    |||| |||||||   |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56030587 accttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgac 56030686  T
Q  641 atctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 727  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56030687 atttcttttgtaacgttattcatcata---tgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 56030770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 746
Target Start/End: Original strand, 24347959 - 24348566
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24347959 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgc-gaaaatatatttatgg 24348057  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24348058 acaataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 24348157  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----ag 439  Q
    ||           | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||||| |    ||    
T  24348158 agaaaaaaaaaaag-tatcttcaatgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaagctaaactttgagag 24348256  T
Q  440 agatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 539  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  24348257 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttg 24348356  T
Q  540 attcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcat 636  Q
    |||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  24348357 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaacccat 24348456  T
Q  637 tgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 736  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348457 tgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 24348556  T
Q  737 tttgtgttct 746  Q
    ||||||||||    
T  24348557 tttgtgttct 24348566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 17662826 - 17662223
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662826 tgttgtagtatgactacaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 17662727  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17662726 acaataaatatatttttgtaccgtacgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 17662627  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----ag 439  Q
    ||            ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |    ||    
T  17662626 agaaaaaaaaaa--gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagag 17662529  T
Q  440 agatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 539  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  17662528 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt-----------ctctttgaaacaaacactaggttttgagggttg 17662440  T
Q  540 attcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcat 636  Q
    |||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  17662439 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 17662340  T
Q  637 tgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 736  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662339 tgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 17662240  T
Q  737 tttgtgttctatcttct 753  Q
    |||||||||| ||||||    
T  17662239 tttgtgttctctcttct 17662223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 44600428 - 44599823
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44600428 tgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatgg 44600329  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44600328 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttaaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 44600229  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 443  Q
    ||            | ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || | || |||| | |||||    
T  44600228 aggaaaaaaaaaacgaatcttcagtgtggtatttgtttcaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtattaaagcaaactttgagat 44600129  T
Q  444 agagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 543  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44600128 agagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattc 44600029  T
Q  544 acctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattga 639  Q
    |||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44600028 accttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattga 44599929  T
Q  640 catctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 739  Q
      |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   |||    
T  44599928 tttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatcttt 44599830  T
Q  740 gtgttct 746  Q
    |||||||    
T  44599829 gtgttct 44599823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 144 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 22132988 - 22132389
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 243  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132988 atgttgtagtatgattcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 22132889  T
Q  244 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 343  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22132888 gacaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 22132789  T
Q  344 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagaga 442  Q
    |||            ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| | ||||    
T  22132788 gagaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaga 22132691  T
Q  443 tagag---------ggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttga 533  Q
     ||||         ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  22132690 gagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgt 22132592  T
Q  534 gggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgta 630  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22132591 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 22132492  T
Q  631 actcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 730  Q
    || ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132491 acccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 22132393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 145 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 22135219 - 22134615
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22135219 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 22135120  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22135119 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgattcaaatattctttcactgaagg 22135020  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 443  Q
    ||            ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||||| | ||||     
T  22135019 agaaaaaaaaaac-gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaagctaaactttgagag 22134921  T
Q  444 agag---------------ggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggg 528  Q
    ||||               ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  22134920 agagagagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc-ttcaaacaaacactaggg 22134822  T
Q  529 tttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttc 625  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||| | ||| ||  |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22134821 tttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattc 22134722  T
Q  626 ttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggt 725  Q
    ||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134721 ttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggt 22134624  T
Q  726 caacaaatt 734  Q
    |||||||||    
T  22134623 caacaaatt 22134615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 144 - 537
Target Start/End: Original strand, 5100742 - 5101133
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5100742 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 5100841  T
Q  244 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 343  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5100842 gacaacaaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 5100941  T
Q  344 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagaga 442  Q
    |||            ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  5100942 gagaaaaaaaac---gtatcttcaatctggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagggtaaaccttgaga 5101038  T
Q  443 tagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 537  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5101039 tagaggggactgaaacaaaggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcactttggaacaaacactagggtttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 400 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 38928512 - 38928155
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38928512 ttttactataaatataggctttgtattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 38928413  T
Q  500 agtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  38928412 agtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggggc 38928313  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38928312 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtaaaacggagggctgctctctcccc 38928213  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 753  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38928212 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 38928155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 400 - 744
Target Start/End: Original strand, 48486318 - 48486665
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48486318 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 48486417  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  48486418 agtttatctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggact 48486517  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  48486518 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgaaatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctccccc 48486617  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  48486618 agactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattattttgtgtt 48486665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 404 - 753
Target Start/End: Original strand, 40637077 - 40637429
Alignment:
Q  404 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 503  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637077 actataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 40637176  T
Q  504 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  40637177 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgg 40637276  T
Q  601 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 700  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  40637277 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagac 40637376  T
Q  701 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 753  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40637377 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 40637429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 400 - 753
Target Start/End: Original strand, 24888795 - 24889151
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24888795 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggattgtatag 24888894  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | || ||    
T  24888895 agtttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactaggact 24888994  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  24888995 ttgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtggaacggagggctgctctctccccc 24889094  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 753  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  24889095 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctcttct 24889151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 400 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 22803068 - 22802712
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22803068 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 22802969  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  22802968 agtttgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 22802869  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||     
T  22802868 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtggaacggagggtttctctctccccc 22802769  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 753  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22802768 agactaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 22802712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 5198419 - 5198768
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5198419 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatag 5198518  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5198519 agtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggct 5198618  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||     
T  5198619 ttgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 5198718  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5198719 agactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgttct 5198768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 404 - 746
Target Start/End: Original strand, 14633323 - 14633666
Alignment:
Q  404 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 503  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14633323 actataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtt 14633421  T
Q  504 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  14633422 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacg-gaagagattgggactttgg 14633520  T
Q  601 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 700  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  14633521 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccctcagac 14633620  T
Q  701 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14633621 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14633666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 33415821 - 33415461
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33415821 ttttactacaaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatag 33415722  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  33415721 agtttgtctctt-ggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatcgagtctcttggttacgggaagagattgaggct 33415623  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  33415622 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccctc 33415523  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  33415522 aggctaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttctctcttcttttct 33415461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 40091749 - 40091388
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  40091749 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtttag 40091650  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  40091649 agtttgtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 40091550  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  40091549 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctccccc 40091450  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  40091449 atactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 40091388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 400 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 22801196 - 22800840
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22801196 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatag 22801097  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||| |||||||||| ||| ||||| ||||||  || | ||    
T  22801096 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgagact 22800997  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  22800996 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctccccc 22800897  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 753  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22800896 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 22800840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Original strand, 24878988 - 24879344
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24878988 ttttactataaatatagaccttgtatccgagtaaacttggagatagagggggctgaaactagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatag 24879087  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||    
T  24879088 agtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 24879187  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgt-aacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24879188 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgatacacatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 24879287  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24879288 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctcttc 24879344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Original strand, 24880450 - 24880806
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24880450 ttttactataaatatagaccttgtatcggagtaaacttggagatagagggggcgtaaactagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 24880549  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||    
T  24880550 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 24880649  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgt-aacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24880650 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 24880749  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24880750 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctcttc 24880806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 47274726 - 47275073
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47274726 ttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata- 47274824  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||   |||| ||    
T  47274825 agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggact 47274924  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47274925 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc- 47275023  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47275024 agactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttct 47275073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 400 - 751
Target Start/End: Original strand, 19095881 - 19096236
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19095881 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatag 19095980  T
Q  500 agtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||    
T  19095981 agtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagagc 19096080  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19096081 tttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccc 19096180  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19096181 cagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 19096236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 11434954 - 11435302
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11434954 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 11435053  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| ||||||||||  |||||||  ||||||  | || ||    
T  11435054 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcctggttaccggaagagtctaggact 11435153  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  11435154 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccct 11435252  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11435253 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11435302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 37089708 - 37089357
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct---agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 496  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37089708 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaacttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 37089609  T
Q  497 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggg 593  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||    
T  37089608 tagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctggg 37089509  T
Q  594 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 693  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37089508 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcc 37089410  T
Q  694 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089409 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 37089357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 252 - 751
Target Start/End: Original strand, 19322547 - 19323048
Alignment:
Q  252 atatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnnnn 351  Q
    |||||||||||||| |||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||         
T  19322547 atatatttttgtactgtataaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaa 19322646  T
Q  352 nnnnnng-gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatattttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggg 450  Q
            ||||||||| |||  ||||| |||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  19322647 aaagaaatgtatcttcaatgtgatattcattccaaatttatgagttatattcatctataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggg 19322746  T
Q  451 gctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgg 550  Q
    | |||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  19322747 gatgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgattcaccttgg 19322842  T
Q  551 gaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctctt 647  Q
    ||||||   ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||    
T  19322843 gaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctctt 19322942  T
Q  648 ttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 745  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  19322943 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggatgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactggataaacaaattctttagtgttc 19323042  T
Q  746 tatctt 751  Q
    | ||||    
T  19323043 tctctt 19323048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 404 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 8631753 - 8631404
Alignment:
Q  404 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || |||| |    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631753 actataaatatagactttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 8631654  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  8631653 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 8631554  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  8631553 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 8631454  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631453 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 8631404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 12401141 - 12400786
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |  |||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12401141 ttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 12401042  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||    
T  12401041 agtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgtgact 12400942  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  12400941 ttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctccccc 12400842  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  12400841 agactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttctctcttc 12400786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 22044724 - 22044376
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044724 ttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 22044625  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  22044624 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 22044525  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||      
T  22044524 ttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctc 22044426  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044425 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22044376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 22047019 - 22046671
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22047019 ttttactataaatataggccttgtatcggagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 22046920  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  22046919 agtttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 22046820  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||      
T  22046819 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctc 22046721  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046720 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22046671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 36921829 - 36921466
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 497  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36921829 ttttacaataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagagatagaggggg-tgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 36921731  T
Q  498 agagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggg 593  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||    
T  36921730 atagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 36921631  T
Q  594 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 693  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  36921630 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcc 36921531  T
Q  694 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  36921530 cccagactagttaaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 36921466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 9148250 - 9148600
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 497  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9148250 ttttactataaatataggccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaagcaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtat 9148349  T
Q  498 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||     
T  9148350 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggga 9148449  T
Q  595 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 694  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9148450 ctttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccc 9148548  T
Q  695 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148549 ccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 9148600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 12396179 - 12395824
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |  |||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396179 ttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 12396080  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||    
T  12396079 agtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgact 12395980  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  12395979 ttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctccccc 12395880  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  12395879 agactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttctctcttc 12395824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 36919921 - 36919563
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctaga--gatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 497  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36919921 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgatagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggat 36919822  T
Q  498 agagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggg 593  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||    
T  36919821 aaagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 36919722  T
Q  594 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 693  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  || |||||||||||||    
T  36919721 acttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttattcatcatatagtggaatagatggctgctctctcc 36919622  T
Q  694 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36919621 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 36919563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Original strand, 16453308 - 16453670
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||| |||||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |     
T  16453308 ttttgctataaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagagtttgtacaa 16453407  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  16453408 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggact 16453507  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||    
T  16453508 ttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggttgctctctcccc 16453607  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16453608 cagactaggtcaatttggaccgaactgcgccaaaaaattcttttgtgttctctcttcttttct 16453670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Original strand, 36378291 - 36378653
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36378291 ttttactataaatatagactttgtatcagaataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 36378390  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||   |||| |||| ||||| || |||||| |||||||||||| ||    
T  36378391 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttagttacgggaagagattgggact 36378490  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36378491 ttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctcttgtgaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccc 36378590  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  36378591 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattattttgtgttctctcttcttttct 36378653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 400 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 619781 - 619428
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  619781 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaagacaacaacaaaactagggtttgcatag 619682  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   |||| |||||| | | ||||||| | |||||||||||| ||    
T  619681 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgactgtcttggttaagggaagagattgggtct 619582  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  619581 ttgggtagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctctcccct 619482  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  619481 a-actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctctt 619428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 404 - 746
Target Start/End: Original strand, 6764842 - 6765192
Alignment:
Q  404 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 503  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6764842 actataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 6764941  T
Q  504 tgtctcttt-----ggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    |||||||||     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||| | ||||||  |||| |    
T  6764942 tgtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggac 6765041  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  6765042 tttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 6765141  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6765142 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6765192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 51015245 - 51015593
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015245 ttttactataaatatagactttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 51015344  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  51015345 tgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 51015444  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||      
T  51015445 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggaggtctgctctctccctc 51015543  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015544 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 51015593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 404 - 744
Target Start/End: Original strand, 47868404 - 47868747
Alignment:
Q  404 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 503  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47868404 actataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 47868503  T
Q  504 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 600  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||||||    
T  47868504 tgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgg 47868603  T
Q  601 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 700  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||    
T  47868604 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccatac 47868703  T
Q  701 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 744  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47868704 taggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgtt 47868747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 7941318 - 7941671
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 497  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941318 ttttactataaatatagacgttgtatcagagcaaaccgggagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 7941417  T
Q  498 agagtttgtctctttggaacaaa--cactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgg 592  Q
    ||||||||||||||  || ||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||  ||||||  |||    
T  7941418 agagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgg 7941517  T
Q  593 ggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 692  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  7941518 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctc 7941617  T
Q  693 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941618 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7941671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 161 - 751
Target Start/End: Original strand, 30136331 - 30136903
Alignment:
Q  161 aaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttt 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30136331 aaaatttgatgaatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttt 30136430  T
Q  261 tgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnnnnnnnnnnggt 360  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||            ||    
T  30136431 tgtactgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttaaaagagaatattatatttttgattcaaatattctttcattgaaggagaaaaaaaaaac-gt 30136529  T
Q  361 atcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatattttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagagatagagggggctgaaaca 459  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||||||||  ||||||||||| |||| | |||| | ||||| || ||||||||       ||||||    
T  30136530 atcttcagtgtgatattcgttctaaatttattagttatatttctctataaatatatacctagtatcaaatgtaaatcttgagataga-------gaaaca 30136622  T
Q  460 atggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---a 556  Q
    | ||||| |  |||||||           ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||   |    
T  30136623 aaggttt-gggaggcaac-----------ggtttgtatagagttt-actcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgattcaccttgggaaacacta 30136707  T
Q  557 ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgt 656  Q
     || ||||| |||| ||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||| ||    
T  30136708 ctatgattgggtctcttggtcacgagaagaaattgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagt 30136807  T
Q  657 tactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
    || |||||| ||||||||||| || ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  30136808 taatcatcattatagtgaaacagatggctgctctctcctcaatactaggtcaatttggaccgaattggataaacaaattcttttgtgttctctctt 30136903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 18847152 - 18847500
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18847152 ttttactataaatatagaccttgtatcaaaacaaactttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 18847251  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattg-agtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||   |||  |||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  18847252 agtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagcattggagtctcttggttacgggaagagattgggac 18847351  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  18847352 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 18847450  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18847451 -agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 18847500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 38409198 - 38409552
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagaga------tagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 493  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38409198 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaatggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggttt 38409297  T
Q  494 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagatt 590  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  38409298 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggct 38409397  T
Q  591 ggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc 690  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  38409398 gggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctc 38409496  T
Q  691 tcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38409497 tcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgagttct 38409552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 404 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 2485203 - 2484858
Alignment:
Q  404 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagataga-gggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 502  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2485203 actataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagctagaagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 2485104  T
Q  503 ttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttg 599  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||    
T  2485103 ttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttg 2485004  T
Q  600 ggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctaga 699  Q
    ||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  2485003 ggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaga 2484905  T
Q  700 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2484904 ctaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgttct 2484858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 273 - 746
Target Start/End: Original strand, 53404998 - 53405481
Alignment:
Q  273 agaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgta 372  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||            |||| ||||||||     
T  53404998 agaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaaaattatatttttgatgcaaatattctttcactaaaggagaaaaaaaaaaacgtattttcagtgtg 53405097  T
Q  373 gtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggttta 467  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |    ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  53405098 gtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagataga-ggggctgaaacaagggttta 53405196  T
Q  468 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||   |||||||||    
T  53405197 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagatt 53405295  T
Q  565 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggaga------ctttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgtta 658  Q
    |||||| |||||||||  |||||  || | |||| |||||||||| ||||||||      ||| |||||||||| ||||||  ||||||||| |||| ||    
T  53405296 gagtctcttggttacggaaagaggctgagactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgtaacccattgatttctcttttgaaacgata 53405395  T
Q  659 ctcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  53405396 ctcatcatatagtggaacagagagctg--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttttgttct 53405481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 359 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 18709547 - 18709149
Alignment:
Q  359 gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--------agagatagaggg 449  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||| |        ||||||||||||    
T  18709547 gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagagagatagaggg 18709448  T
Q  450 ggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcg 549  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |    
T  18709447 ggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagttgattcaccttg 18709348  T
Q  550 ggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctct 646  Q
    ||||||   |||| | |||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||     
T  18709347 ggaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc- 18709249  T
Q  647 tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18709248 tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 18709149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 11006575 - 11006222
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaa----acctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 495  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||     |   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006575 ttttactataaatatagaccttgtatcagactattttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 11006476  T
Q  496 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattg 591  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| ||||||  ||    
T  11006475 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctg 11006376  T
Q  592 gggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct 691  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  11006375 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaatggtactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 11006277  T
Q  692 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11006276 cccccagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttct 11006222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 9174480 - 9174131
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9174480 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 9174381  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattg-agtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||   |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| | |    
T  9174380 agtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagac 9174281  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||    
T  9174280 tttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgttctctgccc 9174182  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9174181 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 9174131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 31849933 - 31849584
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31849933 ttttactagaaatataggtcttgtatcagagcaaactaggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 31849834  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacact-agggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||| ||||| ||||||  || | |    
T  31849833 agtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgcttacgggaagaggctgagac 31849734  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  31849733 tttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc 31849635  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31849634 cagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 31849584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 37313400 - 37313050
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||||||||||||   ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  37313400 ttttactataaatataggttttgtatcaaagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 37313301  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||   |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||  |    
T  37313300 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggatt 37313201  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  37313200 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttcccc 37313101  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
     |||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  37313100 cagactatgtcaatttggaccaaattggatcaacaaattcttttgttttct 37313050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 401 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 9176807 - 9176461
Alignment:
Q  401 tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 500  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  9176807 tttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaa 9176708  T
Q  501 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||    
T  9176707 gtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagact 9176608  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||     
T  9176607 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 9176509  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 744  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||    
T  9176508 agactaggtcaatttggaccgaacagagtcaacaaatttctttgtgtt 9176461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 438 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 11008862 - 11008553
Alignment:
Q  438 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 537  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11008862 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 11008763  T
Q  538 tgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaact 633  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  11008762 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 11008663  T
Q  634 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 733  Q
    ||||||  ||   ||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11008662 cattgatttc---tttgtaatggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaat 11008566  T
Q  734 tcttttgtgttct 746  Q
    |||||||||||||    
T  11008565 tcttttgtgttct 11008553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 16934477 - 16934128
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16934477 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 16934378  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| | |    
T  16934377 agtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagac 16934278  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  16934277 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 16934179  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
     |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16934178 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 16934128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 474 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 26086236 - 26085962
Alignment:
Q  474 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtct 570  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| ||||||||||    
T  26086236 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 26086137  T
Q  571 tttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatag 670  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  26086136 cttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgttttctc-tttgtaacgatactcatcatatag 26086038  T
Q  671 tgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    || | |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26086037 tggatcggaaggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgttct 26085962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 16932123 - 16931774
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| || |||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16932123 ttttactataaatataaaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 16932024  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| | |    
T  16932023 agtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagac 16931924  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  16931923 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccc 16931825  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
     |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16931824 cagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 16931774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 438 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 22780669 - 22780358
Alignment:
Q  438 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 537  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  22780669 agagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggt 22780570  T
Q  538 tgattcacctcgggaaaca---ttaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaact 633  Q
    |||||||||| ||||||||   ||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  22780569 tgattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 22780470  T
Q  634 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 733  Q
    ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22780469 cattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 22780371  T
Q  734 tcttttgtgttct 746  Q
       ||||||||||    
T  22780370 atctttgtgttct 22780358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 438 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 22783034 - 22782723
Alignment:
Q  438 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 537  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  22783034 agagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggt 22782935  T
Q  538 tgattcacctcgggaaaca---ttaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaact 633  Q
    |||||||||| ||||||||   ||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  22782934 tgattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 22782835  T
Q  634 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 733  Q
    ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  22782834 cattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactggatcaacaaat 22782736  T
Q  734 tcttttgtgttct 746  Q
       ||||||||||    
T  22782735 atctttgtgttct 22782723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 403 - 734
Target Start/End: Original strand, 41997494 - 41997828
Alignment:
Q  403 tactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 502  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  41997494 tactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagtgttcagaaaggaaacaacaaaactagagtttgtatagagt 41997593  T
Q  503 ttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttg 599  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||| |||||||||| || |||||| ||| |||||| |  ||||    
T  41997594 ttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaaaagattgagattttg 41997693  T
Q  600 ggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctag 698  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||| | || | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  41997694 ggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcatcatagtgaaacggagggccgctctctcccc-ag 41997792  T
Q  699 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  41997793 actaggttaatttggaccgaactggataaacaaatt 41997828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 400 - 711
Target Start/End: Original strand, 13543953 - 13544272
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 494  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |    ||||||||||||||||||||||| | | ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13543953 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttg 13544052  T
Q  495 tatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagatt 590  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  13544053 tatagagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagatt 13544151  T
Q  591 ggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctc 690  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13544152 gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctctc 13544251  T
Q  691 tcccctagactaggtcaattt 711  Q
    |  || |||||||||||||||    
T  13544252 tttcccagactaggtcaattt 13544272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 400 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 5637803 - 5637524
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 495  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637803 ttttactataaatatagaccttgtataagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 5637704  T
Q  496 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattgg 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||    
T  5637703 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 5637604  T
Q  593 ggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 672  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637603 gactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 5637524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 359 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 47211122 - 47210756
Alignment:
Q  359 gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagaga------tagaggggg 451  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| | ||||      |||||||||    
T  47211122 gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagggagatagaggggg 47211023  T
Q  452 ctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcggg 551  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |            | |||    
T  47211022 ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg------------ttggg 47210935  T
Q  552 aaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttt 648  Q
    |||||   ||| |||||||||| || |||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||    
T  47210934 aaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 47210835  T
Q  649 tgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 727  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  47210834 tgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgagtca 47210756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 400 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 3824907 - 3824629
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct-----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 494  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||     ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3824907 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtatttctttgagagagatagagggggctgaaaca--ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 3824810  T
Q  495 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattg 591  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||    
T  3824809 tatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctg 3824710  T
Q  592 gggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 672  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824709 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 3824629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 477 - 758
Target Start/End: Original strand, 36380425 - 36380710
Alignment:
Q  477 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtctttt 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||| | ||    
T  36380425 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatctt 36380524  T
Q  574 ggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtg 672  Q
    ||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  36380525 ggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattatagtg 36380624  T
Q  673 aaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
     ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  36380625 gaactgagtgctgctctctcccccagactaggtcaatttggagcgaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 36380710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 400 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 18409680 - 18409344
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||   ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18409680 ttttactataaatatagaatttgtatcagtgtaaacaatgagatagagagg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 18409582  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacc-tcgggaa-ac-attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||| |||||||||| || ||||   |||||||||| | ||    
T  18409581 agtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttcgggaacactattaggattgagtctcttagttataggaagagattgagact 18409482  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    || ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||     
T  18409481 tttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa-gttacccatcattatagtgaaacagagagttgctctctccct 18409383  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
     ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  18409382 cagactaggtcaatttggattgaactgggtaaacaaatt 18409344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 514 - 737
Target Start/End: Original strand, 16455354 - 16455581
Alignment:
Q  514 gaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattag 610  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  16455354 gaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattag 16455453  T
Q  611 gcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat 709  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16455454 gcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcattatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaat 16455553  T
Q  710 ttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16455554 ttggaccgaactgggtcaacaaattctt 16455581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 400 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 18537805 - 18537470
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 498  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||    
T  18537805 ttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggtttgtata 18537708  T
Q  499 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    ||||||| ||||| | ||||| |||||||||| |  |||||||||||||  |||||||   ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||| | |    
T  18537707 gagtttg-ctcttggcaacaaccactagggttgg--ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagac 18537611  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 694  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18537610 ttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 18537511  T
Q  695 ctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    | | | |||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18537510 ccataataggtcattttttgaccgaactgggtaaacaaatt 18537470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 484 - 752
Target Start/End: Original strand, 27499128 - 27499396
Alignment:
Q  484 actagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacg 580  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||   |||| |||||||||| |||||||||    
T  27499128 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggattgagtctattggttacg 27499227  T
Q  581 agaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacgga 679  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    | | ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |    
T  27499228 ataagagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaac---ctaatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacgaa 27499324  T
Q  680 gggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27499325 gggctgctctttcccc-agactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 27499396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 400 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 8756584 - 8756231
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 498  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||| |||| ||||||||    
T  8756584 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattaggatttgtata 8756486  T
Q  499 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaa---gattgagtct-tttggttacgagaagagattgggg 594  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||    |||||||||| |||||| ||| |||||||||| |     
T  8756485 gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactaggattgagtctctttggtcacgggaagagattgaga 8756389  T
Q  595 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 693  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||| || ||||||||||    
T  8756388 ctttgagtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactaatcattatagtggaacggatggttgctctctcc 8756289  T
Q  694 cctagactaggtc-aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
     | ||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  8756288 tccagactaggtcggttttggagcgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctctt 8756231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 400 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 3937542 - 3937314
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  3937542 ttttactataaatatagactttta-tcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagagtttgtatag 3937444  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||   ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||    
T  3937443 agtttgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattggaattgagtctcttggttacaggaagagattgaggct 3937344  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttct 626  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3937343 ttgggtagaattaggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 400 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 18535163 - 18534828
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 498  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||   ||||||||| ||||||||||||||    
T  18535163 ttttacaataaatatagacctcgattcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagtgtttaaaaaca-aacaacaaa-ctagggtttgtata 18535066  T
Q  499 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||| | ||||||   ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| | |    
T  18535065 gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgagac 18534969  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 694  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||   ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  18534968 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaactactcataattatagtggaacggaggggtgctctccccc 18534869  T
Q  695 ctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    | ||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||    
T  18534868 ccagactaggtaagttttggaccgaacagggtaaacaaatt 18534828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 556 - 752
Target Start/End: Original strand, 13547312 - 13547508
Alignment:
Q  556 attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacg 655  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  13547312 attaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaag 13547411  T
Q  656 ttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  13547412 ttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgttctctcttc 13547508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 575 - 746
Target Start/End: Original strand, 4215483 - 4215654
Alignment:
Q  575 gttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaa 674  Q
    |||||| |||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4215483 gttacgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 4215582  T
Q  675 acggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4215583 acggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4215654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 145 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 47211308 - 47211158
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47211308 tgttgtagtatgacttaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctcaaaatatatttatgg 47211209  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatat 295  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  47211208 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatat 47211158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 145 - 725
Target Start/End: Original strand, 10112626 - 10113198
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10112626 tgttgtagtatgacttaaaatttgttgaatgaagaatattgttgctaaaaatataaaag----gtttcaaatatattttgtgctgaaactatatttatgg 10112721  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||  ||||||| |||||||| |||||       |||||||||||| || ||||||| ||||    
T  10112722 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgtaaatata-tttgaaagagaata-------tttgatgcaaatattatttcactaaagg 10112813  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata--ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagag 441  Q
    ||            |||||||||| ||   || |||||||||||||||| |||||  ||||  ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||    
T  10112814 agaaaaaaaaaat-gtatcttcagcgtgaaatccgttccaaatttatgagttatatttttttttataaatatagacattgtatcagatgtaaacctcgag 10112912  T
Q  442 atagagggggctg-aaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttga 540  Q
    | |||||| | || |||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||| | ||||    
T  10112913 agagagggagttgaaaacaagggtttag-aagccaacacaaaaactagggtttg--tagagtttg-ctcttggcaacaaacactaggg-ttga-gattga 10113006  T
Q  541 ttcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttac-gagaagagattggggctttgggtagaattag-gcgggagactttttcttgtaa-ctc 634  Q
    |||||||  ||||||   |||| |||||||||| ||||| || | ||||||||| || ||||||||||||||||    | |||||  ||||||||| ||     
T  10113007 ttcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttggtcacggggaagagattaggactttgggtagaattagatttgaagactaattcttgtaacctt 10113106  T
Q  635 attgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggt 725  Q
     |||| ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  10113107 tttgatatctc-tttgtaatgttactaatcattatagtggaatggagagctgctctctccccaagactaggttagtattggaccgaactgggt 10113198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 595 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 5635612 - 5635461
Alignment:
Q  595 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 694  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5635612 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 5635513  T
Q  695 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5635512 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5635461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 404 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 52942777 - 52942537
Alignment:
Q  404 actataaatatagaccttgaat--cagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 501  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942777 actataaatatagaccttgtatatcagactaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 52942679  T
Q  502 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggcttt 598  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||             || |||    
T  52942678 tttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-------------gggttt 52942592  T
Q  599 gggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaa 653  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  52942591 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 52942537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 595 - 746
Target Start/End: Original strand, 11437560 - 11437710
Alignment:
Q  595 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 694  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11437560 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccc 11437658  T
Q  695 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11437659 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11437710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 556 - 752
Target Start/End: Original strand, 2891449 - 2891646
Alignment:
Q  556 attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacg 655  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  2891449 attaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattgatatctcttttgtaagg 2891548  T
Q  656 ttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    |||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2891549 ttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcccccagactagtacaacttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 2891646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 400 - 616
Target Start/End: Original strand, 6132872 - 6133090
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6132872 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacattgagatagaggaggctgaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtatag 6132970  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||    
T  6132971 agtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 6133070  T
Q  597 ttgggtagaattaggcggga 616  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6133071 ttgggtagaattaggcggga 6133090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 481 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 38890476 - 38890221
Alignment:
Q  481 aaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggtt 577  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| |  ||||||||||  | ||||||||   ||| |||||||||| ||| |     
T  38890476 aaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggttgg--ggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatc 38890380  T
Q  578 acgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaac 676  Q
    ||| |||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  38890379 acgggaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 38890280  T
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
     |||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  38890279 agagggctgctctctccccaagattaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 38890221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 400 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 38270320 - 38270164
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38270320 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaagaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtag 38270221  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca 556  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  38270220 agtttgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaaca 38270164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 311
Target Start/End: Original strand, 9022060 - 9022225
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||   |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  9022060 tgttgtagtatgattcaaaattttatggatgagaaatattgttgttgaaaatataaatgatttgtttcaaatatattttttgctgaaaatatatttat-g 9022158  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatatt 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  9022159 acaataaatatatttttctaccgtatgaagaaagatttgatgcaaatatattttaaaagggaatatt 9022225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 400 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 15032870 - 15032557
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| | | | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  15032870 ttttactataaatatagacttggtaccagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatag 15032772  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||| ||||||| ||||||          ||||| ||||||||  |  |||||||   ||| |||||||||| ||||  ||||||| ||||| || ||    
T  15032771 agtttg-ctctttgcaacaaa----------tgagg-ttgattcatatttggaaacactattaggattgagtctcttggacacgagaaaagatttggact 15032684  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    || ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||| || ||||||||||||||    
T  15032683 tttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacgaagagctgctctctcccc 15032584  T
Q  696 tagactaggtcaat-ttggaccgaact 721  Q
     | ||||||||| | ||||||||||||    
T  15032583 caaactaggtcagtattggaccgaact 15032557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 400 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 24446913 - 24446762
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     |||||||||||||||||    
T  24446913 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaac-----aactagggtttgtatag 24446819  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca 556  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24446818 agtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaaca 24446762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 599 - 746
Target Start/End: Original strand, 5101130 - 5101276
Alignment:
Q  599 gggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctag 698  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  5101130 gggtagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatcatatagtaaaacggagggctgctatctcccc-ag 5101228  T
Q  699 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5101229 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5101276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 145 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 38890701 - 38890517
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  |||||    
T  38890701 tgttgtagcatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatt------------------tatgg 38890620  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaaggg-aatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 343  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  38890619 acaataaatatatttttgtattgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaaatattatatttttgatgcaaatattctttcactaaag 38890520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 400 - 518
Target Start/End: Original strand, 2891315 - 2891434
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttg-aatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 498  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2891315 ttttactataaatatagacattgtaatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 2891414  T
Q  499 gagtttgtctctttggaaca 518  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2891415 gagtttgtctctttggaaca 2891434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 646 - 752
Target Start/End: Original strand, 47563009 - 47563115
Alignment:
Q  646 ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 745  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47563009 ttttgtaaggttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctccccttgactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttc 47563108  T
Q  746 tatcttc 752  Q
    | |||||    
T  47563109 tctcttc 47563115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 400 - 734
Target Start/End: Original strand, 28453686 - 28454020
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagagatagagggggctg-aaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 497  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||| |||| | | ||| |||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||       
T  28453686 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtgaaccttgaggtaga-gagtctgaaaacaagggtttag-aagccaacactaaaactagggtttg--c 28453781  T
Q  498 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 594  Q
    |||||||| ||||| | || |||||||||||||   || ||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||     
T  28453782 agagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt--gggattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgga 28453878  T
Q  595 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 693  Q
    | |||||||||||||||  | |||||  |||||||||    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||  || ||||||||    
T  28453879 ccttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaacttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactactctctcc 28453978  T
Q  694 cctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    || ||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||    
T  28453979 cccagactaggttagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 28454020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 153 - 299
Target Start/End: Original strand, 9863507 - 9863650
Alignment:
Q  153 tatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaataaa 252  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  9863507 tatgactcaaaatttgttggatgaaatatattgttactaaaaatataaatgatttgtttcaaacatattttgtgctaaaaatatatttatgaacaataaa 9863606  T
Q  253 tatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttg 299  Q
    |||||||||||   | |||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  9863607 tatatttttgt---gcatgaaggaagatttgatgcaaatatattttg 9863650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 536 - 734
Target Start/End: Original strand, 12102221 - 12102425
Alignment:
Q  536 gttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcg-ggagactttttcttgtaa 631  Q
    |||||||||||| ||||||||   ||| |||||||| | ||||| | | ||| |||||||  |||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  12102221 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 12102320  T
Q  632 ctcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaac 729  Q
    | || ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||| ||| |||    
T  12102321 cccactgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaactaggtaaac 12102420  T
Q  730 aaatt 734  Q
    |||||    
T  12102421 aaatt 12102425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 150 - 246
Target Start/End: Original strand, 19322413 - 19322510
Alignment:
Q  150 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgtt-gctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggac 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  19322413 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattttttgctaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttatactgaaaatatatttatggac 19322510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 623 - 738
Target Start/End: Original strand, 49088794 - 49088911
Alignment:
Q  623 ttcttgtaactcattgacatct-cttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct-agactaggtcaatttggaccgaac 720  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||  || ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  49088794 ttcttgtaactcattgacatcttcttttgtaatgttagtcatcatatagtgaaacagagaactactctctccccccagactaggtcaatttgggccgaac 49088893  T
Q  721 tgggtcaacaaattcttt 738  Q
    ||||||||||||||||||    
T  49088894 tgggtcaacaaattcttt 49088911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 395 - 734
Target Start/End: Original strand, 9863702 - 9864049
Alignment:
Q  395 ttatattttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatag-agggggctg--aaacaatggtttagaaaggcaacaac-aaaactaggg 490  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| || | ||||  |||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||    
T  9863702 ttatatttctctataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagatagtagagagctgaaaaacaagggtttag-aagccaaaaacaaaaactaggg 9863800  T
Q  491 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagag 587  Q
    ||||  |||||||||| |||| | ||||||||||| ||||   || ||||||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  9863801 tttg--tagagtttgt-tcttggcaacaaacactaaggtt--gggtttgattcaccttgggaaaccctattaggattgagtcttttggtcacgggaagag 9863895  T
Q  588 attggggctttgggtagaatt-aggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca----tatagtgaaacggaggg 682  Q
    |||| | |||||||||||||| ||   | |||||  ||||||||||   |||| ||||| ||||||| |||||||||||    ||||||| ||||||| |    
T  9863896 attgagactttgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcatcattatagtggaacggagag 9863994  T
Q  683 ctgctctct--cccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  9863995 ctgctctctcccccccagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 9864049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 561 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 16186006 - 16185831
Alignment:
Q  561 gattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 659  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||   | |||||| |||||| ||| | |||| || || ||||||| |||||    
T  16186006 gattgagtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgatatatc-tttgtaaagttac 16185908  T
Q  660 tcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16185907 tcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 16185831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 634 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 24446738 - 24446627
Alignment:
Q  634 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 733  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||    
T  24446738 cattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc-------------atttggaccgaactgggtcaacaaat 24446652  T
Q  734 tcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||    
T  24446651 tcttttgtgttctctcttcttttct 24446627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 137 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14789579 - 14789500
Alignment:
Q  137 atgtttcatgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaat 216  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14789579 atgttacatgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaataatgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaat 14789500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 616 - 753
Target Start/End: Original strand, 25357859 - 25357998
Alignment:
Q  616 agactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttgg 713  Q
    |||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  25357859 agacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatagctgctctctcccctagactaggtcagtattgg 25357958  T
Q  714 accgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 753  Q
    ||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||    
T  25357959 acctaactgggtaaacaaatttttgtgtgttctctcttct 25357998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 155 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 38209259 - 38209098
Alignment:
Q  155 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct--gaaaatatatttatggaca--ata 250  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   | || ||  || | || |  |||    
T  38209259 tgactcaaaatttgatggatgaaaaatattgttgttaaaaatataaaagatttgttttaaatatattttgtgcttcaagaagattgttgttgaaaatata 38209160  T
Q  251 aatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatat-tttgaaagggaatatt 311  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  38209159 aatatatttttgtactgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatatttgaaaaggaatatt 38209098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 400 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 40999281 - 40998990
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 498  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||| ||||| |  |||||| ||| ||||||||  | |||||| |||||||||| |||||||    
T  40999281 ttttactataaatataaaccttatatcagagtaaaccttgaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttagac-gtcaacaagaaaactaggggttgtata 40999184  T
Q  499 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaa---gattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    ||||||| |||||   ||||||||||||| || |||  ||||||||||| || ||||||||    |||||||||| ||||| ||| |||||||| | | |    
T  40999183 gagtttg-ctcttgacaacaaacactaggatt-gaga-ttgattcacctaggaaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatcgagac 40999087  T
Q  596 tttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc-atatagtgaaacggagggctgctctc 690  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| | | ||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  40999086 tttgggtagaattaggtttggagactgtgttttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagtggaacagagggatgctctc 40998990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 666 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 14789495 - 14789422
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctc--ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14789495 tatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 14789422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 54929180 - 54929094
Alignment:
Q  225 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatatt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||  ||||||||    
T  54929180 tgctgaaaatatatttatggacaaaaaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaataggaatatt 54929094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 666 - 758
Target Start/End: Original strand, 6133105 - 6133197
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  6133105 tatagtggaacggatgactgctctctcacccagactaggtcaatttggatcgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 6133197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 536 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983564
Alignment:
Q  536 gttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaa 631  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||||||| ||||| ||||| | | |||||||||| | |||||||||||||||||   | |||||| || ||||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaa 31983628  T
Q  632 ctcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 694  Q
    | | |||| |||| ||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31983627 ccctttgatatcttttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 31983564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 556 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 3982354 - 3982186
Alignment:
Q  556 attaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg-ctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaa 653  Q
    |||| |||||||| | ||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |   || ||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  3982354 attaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaacactttgatatctcttttgtaa 3982255  T
Q  654 cgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaac 720  Q
     ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||||||||||    
T  3982254 agttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcatactaggtcactattggaccgaac 3982186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 225 - 304
Target Start/End: Original strand, 10979676 - 10979755
Alignment:
Q  225 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||    
T  10979676 tgctgaaaatatatttatggacaacaaatatatttttgtgctgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttaaagg 10979755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5516833 - 5516771
Alignment:
Q  161 aaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 223  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  5516833 aaaatttgatgaatggagaatattgttgctaaaaatataaatgaattgtttcaaatatatttt 5516771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 537 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 47151092 - 47150873
Alignment:
Q  537 ttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaac 632  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||| ||  |||||||||| |  ||||||||||||||||   | |||||| ||||||||||    
T  47151092 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 47150993  T
Q  633 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 730  Q
     | |||| ||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||| ||| ||  | || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||     
T  47150992 cctttgatatctcttttctaaagttgctcatcattatagtggaacagatagatgttatctcccctagactaggtcaatattggaccgaattgggtaaact 47150893  T
Q  731 aattcttttgtgttctatctt 751  Q
    |||| | ||||||||| ||||    
T  47150892 aatt-tcttgtgttctctctt 47150873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 692 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 52942527 - 52942457
Alignment:
Q  692 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttcttctc 762  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  52942527 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttcctctc 52942457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 697 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 3937308 - 3937254
Alignment:
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  3937308 agactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcatttgtgttctctctt 3937254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 666 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 5336846 - 5336765
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  5336846 tatagtggaacggagagctgctctctcccctatagtaggtcaatattggactgaactgattaaacaaattcttttgtgttct 5336765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29609983 - 29609914
Alignment:
Q  159 tcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 228  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29609983 tcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaagtattcttgatttttttcaaatatattttgtgct 29609914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 400 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 16186171 - 16186099
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggct-gaaacaatggtttagaaa 471  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  16186171 ttttactataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagagagagggggctaaaaacaagggtttagaaa 16186099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 10047437 - 10047383
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10047437 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10047383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 39246052 - 39245998
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  39246052 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 39245998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 677 - 730
Target Start/End: Original strand, 6743454 - 6743507
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 730  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6743454 ggagggctgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 6743507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 647 - 734
Target Start/End: Original strand, 26557833 - 26557922
Alignment:
Q  647 tttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  26557833 tttgtaaagttactcatcgttatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaagtcagtattggaccgaactaggtaaacaaatt 26557922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 228 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 29609897 - 29609840
Alignment:
Q  228 tgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgat 285  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  29609897 tgaaaatatatttatgaagagtaaatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgat 29609840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 124
Target Start/End: Original strand, 35162225 - 35162330
Alignment:
Q  19 gaaaaagagacaaatggccttattaaagaacttattcctccaggataagttgatagcttaactagcctcatctttgctaatgcgttgtactttagaggag 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||| || | | |||| || || ||||||||||| ||  |||| |||| |||||    
T  35162225 gaaaaagaaacaaatggccttattaaagaacttcttcctcaagggtcagtcgacaacctaaccagacttatctttgctaacgcactgtattttaaaggag 35162324  T
Q  119 catgga 124  Q
    ||||||    
T  35162325 catgga 35162330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 666 - 737
Target Start/End: Original strand, 4884990 - 4885062
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  4884990 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 4885062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 666 - 737
Target Start/End: Original strand, 8529383 - 8529455
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  8529383 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 8529455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 139
Target Start/End: Original strand, 15555798 - 15555918
Alignment:
Q  19 gaaaaagagacaaatggccttattaaagaacttattcctccaggataagttgatagcttaactagcctcatctttgctaatgcgttgtactttagaggag 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||| |  ||  | |||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||| ||||     
T  15555798 gaaaaggagacaaatggccttattaaaggagttattcaaccagggtcggtcaacagcttaaccagactcatctttgcaaatgcactgtactttaaaggac 15555897  T
Q  119 catggaatgagaagtttgatg 139  Q
     |||| || ||||||||||||    
T  15555898 tatggtatcagaagtttgatg 15555918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 679 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 54867239 - 54867188
Alignment:
Q  679 agggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  54867239 agggctgctctctcccc-agactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 54867188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 54929267 - 54929198
Alignment:
Q  155 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 226  Q
    ||||| |||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  54929267 tgacttaaaatttgatggaa--ataatattgttgctaaaaatataaaagatttgatttaaatgtattttgtg 54929198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 711 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 3824630 - 3824595
Alignment:
Q  711 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824630 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3824595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 5269230 - 5269284
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  5269230 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5269284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14647214 - 14647172
Alignment:
Q  225 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccg 267  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  14647214 tgctgaaaatatattcatggacaacaaatatatttttgtaccg 14647172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 400 - 470
Target Start/End: Original strand, 16455286 - 16455356
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaa 470  Q
    |||| |||| ||||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16455286 ttttgctattaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagataaagggggctgaaacaagggtttagaa 16455356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 471
Target Start/End: Original strand, 12102089 - 12102162
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagataga-gggggctg-aaacaatggtttagaaa 471  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  12102089 ttttactataaatatagatcttgtatcagataaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaagggtttagaaa 12102162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 666 - 734
Target Start/End: Original strand, 31300540 - 31300608
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| ||||||||    
T  31300540 tatagtggaacggagggctgctctctcccc-agactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 31300608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 677 - 730
Target Start/End: Original strand, 36315268 - 36315321
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 730  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  36315268 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 36315321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 677 - 730
Target Start/End: Original strand, 36329477 - 36329530
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 730  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  36329477 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 36329530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 666 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 4556126 - 4556054
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||  |||||||||||| |||||||||||    
T  4556126 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattaaaccgaactgggtaaacaaattctt 4556054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 12739594 - 12739550
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12739594 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12739550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 666 - 737
Target Start/End: Original strand, 18587082 - 18587154
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  18587082 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 18587154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 26175680 - 26175636
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26175680 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 26175636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 36463433 - 36463389
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36463433 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 36463389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 666 - 737
Target Start/End: Original strand, 36769595 - 36769667
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||| | |||||||||||    
T  36769595 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactggataaacaaattctt 36769667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 583 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 38270158 - 38270118
Alignment:
Q  583 aagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttt 623  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270158 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagactttt 38270118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 48893682 - 48893638
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48893682 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 48893638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 52467398 - 52467354
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52467398 tctctccccgagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 52467354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 400 - 447
Target Start/End: Original strand, 25357636 - 25357683
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagag 447  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||    
T  25357636 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgagagagag 25357683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 5143317 - 5143263
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  5143317 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5143263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 5396710 - 5396764
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||| | ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5396710 ggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5396764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 31985673 - 31985726
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31985673 ggagagctgctctctcccc-agattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31985726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 38152478 - 38152532
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  38152478 ggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 38152532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 647 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 3578756 - 3578668
Alignment:
Q  647 tttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| || |||| |||| ||||||||| |||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||    
T  3578756 tttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagagctg-tctctcccccagactaggccagtattagaccgaactgggtaaacaaatt 3578668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 666 - 707
Target Start/End: Original strand, 15831257 - 15831298
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca 707  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  15831257 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 15831298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 406; Significance: 0; HSPs: 92)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 150 - 752
Target Start/End: Original strand, 41382424 - 41383018
Alignment:
Q  150 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  41382424 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgttaaaaatataaaagatttgtttcgaatatattttatactgaaaatatatttatggacaat 41382523  T
Q  250 aaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnn 349  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||       
T  41382524 aaatatatttttgtaccgtatgaacaacgatttgatgcaaatatattttgaaaggaaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaatgagaaa 41382623  T
Q  350 nnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagg 448  Q
            | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  41382624 aaaaaaacg-tatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagatg 41382722  T
Q  449 gggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctc 548  Q
    ||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  41382723 gggctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagaatttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacct- 41382821  T
Q  549 gggaaacattaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttt 648  Q
           |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41382822 -------attatgattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttt 41382914  T
Q  649 tgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctat 748  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  41382915 tgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctct 41383014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 144 - 752
Target Start/End: Original strand, 41384492 - 41385100
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  41384492 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcgaatatattttatactgaaaatatatttatg 41384591  T
Q  244 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  41384592 gacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttt-atgcaaatattctttcattgaag 41384690  T
Q  344 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagaga 442  Q
    ||             ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||    
T  41384691 gaaaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaaattgaga 41384788  T
Q  443 tagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatt 542  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41384789 tagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgatt 41384887  T
Q  543 cacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattga 639  Q
    ||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  41384888 caccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattga 41384987  T
Q  640 catctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 739  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41384988 catctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 41385087  T
Q  740 gtgttctatcttc 752  Q
     |||||| |||||    
T  41385088 ctgttctctcttc 41385100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 746
Target Start/End: Original strand, 15808962 - 15809568
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15808962 tgttttagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgttgaaaatatatttatgg 15809061  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15809062 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 15809161  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----ag 439  Q
    ||            ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |    ||    
T  15809162 agaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagag 15809259  T
Q  440 agatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 539  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15809260 agataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct-tttggaacaaacactagggtttgtgggttg 15809358  T
Q  540 attcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcat 636  Q
    |||||||| || ||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  15809359 attcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 15809458  T
Q  637 tgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 736  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809459 tgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctcttccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 15809558  T
Q  737 tttgtgttct 746  Q
    ||||||||||    
T  15809559 tttgtgttct 15809568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 28283813 - 28283206
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283813 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatatttttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 28283714  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28283713 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagtgaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 28283614  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct------ 437  Q
    ||            |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |          
T  28283613 agaaaaaaaaac--gtatcttcagtgtaatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagag 28283516  T
Q  438 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 537  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283515 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggt 28283416  T
Q  538 tgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 634  Q
    |||||||| | |||||||   |||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||| |    
T  28283415 tgattcacattgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaaccc 28283316  T
Q  635 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283315 attgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 28283218  T
Q  735 cttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||    
T  28283217 cttttgtgttct 28283206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 746
Target Start/End: Original strand, 3873750 - 3874360
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3873750 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 3873849  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaat-gatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaag 343  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3873850 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaaacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaag 3873949  T
Q  344 gagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----a 438  Q
    |||             ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| |    |    
T  3873950 gagaaaaaaaaaaacatatcttcggtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgtatcaggctaaactttgaga 3874049  T
Q  439 gagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 538  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3874050 gagatagcgggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggtt 3874149  T
Q  539 gattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactca 635  Q
    ||||||||| |||||||   |||| |||| ||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  3874150 gattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 3874249  T
Q  636 ttgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 735  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3874250 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 3874349  T
Q  736 ttttgtgttct 746  Q
    |||||||||||    
T  3874350 ttttgtgttct 3874360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 739
Target Start/End: Original strand, 608470 - 609077
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608470 tgttgtagtatcactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 608569  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  608570 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagagaatattatatattttatgcaaatattctttcactgaagg 608669  T
Q  345 agnnnnnnnnnnng--gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatattttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----- 437  Q
    ||              |||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||  |||| || |||| |         
T  608670 agaaaaaaaaaagaacgtatcttcggtgtgatatttgttccaaatttatgagttatatttcactgtaaatatagaccttatatcatagcaaactttgaga 608769  T
Q  438 ---agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgag 534  Q
       ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608770 gagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgag 608869  T
Q  535 ggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaa 631  Q
    |||||||||||||  |||||||   ||| |||||||||| ||||||| | ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  608870 ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 608969  T
Q  632 ctcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  608970 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 609069  T
Q  732 attctttt 739  Q
    ||||||||    
T  609070 attctttt 609077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 746
Target Start/End: Original strand, 43529871 - 43530465
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43529871 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 43529970  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  43529971 acaataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgctaatattctttcactgaagg 43530070  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----ag 439  Q
    ||            ||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |    ||    
T  43530071 agaaaaaaaaaa--gtatcttcagtgtggtatttattccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagag 43530168  T
Q  440 agatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 539  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||             || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  43530169 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaac-------------gtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttg 43530255  T
Q  540 attcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcat 636  Q
    |||||||| |||||||   |||| |||||||||| | ||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  43530256 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccat 43530355  T
Q  637 tgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 736  Q
    |||  |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43530356 tgatttctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctgtctctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 43530455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 359 - 746
Target Start/End: Original strand, 32339264 - 32339659
Alignment:
Q  359 gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagatagagggggct 453  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |    ||||||||||||||||    
T  32339264 gtatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggct 32339363  T
Q  454 gaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaa 553  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  32339364 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggtaa 32339463  T
Q  554 ac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttg 650  Q
    ||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  32339464 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 32339563  T
Q  651 taacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32339564 taacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggttaacaaattcttttgtgttct 32339659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Original strand, 1225167 - 1225529
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  1225167 ttttactataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaag 1225266  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1225267 agtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggct 1225366  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctc-ttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  1225367 ttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggccgctctctccct 1225466  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
     | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1225467 catactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 1225529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 30480837 - 30480476
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || || |||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30480837 ttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatag 30480738  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||    
T  30480737 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggct 30480638  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  30480637 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaaatggatggctgctctctccccc 30480538  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  30480537 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 30480476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Original strand, 15072711 - 15073073
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15072711 ttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatggtttgtatag 15072810  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagaga-ttggggc 595  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||   ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |    
T  15072811 agtttgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagggttgggac 15072910  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15072911 tttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatacagtggaacggagggctgctctctcccc 15073010  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  15073011 cagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctcttcttttct 15073073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Original strand, 14807752 - 14808123
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807752 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 14807851  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  14807852 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 14807951  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctg----------c 686  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||          |    
T  14807952 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccc 14808051  T
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14808052 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 14808123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 14419525 - 14419163
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14419525 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatag 14419426  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  14419425 agtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgggact 14419326  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14419325 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatgtcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggctgctctctcccc 14419226  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14419225 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 14419163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 400 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 27107231 - 27106884
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27107231 ttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 27107132  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||    
T  27107131 agtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgact 27107032  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  27107031 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatagatatctcttttgtagggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctatctcctcc 27106932  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 744  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27106931 agactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgtt 27106884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 27829298 - 27829646
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829298 ttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 27829397  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |     
T  27829398 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggacc 27829497  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  27829498 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 27829596  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829597 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27829646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 400 - 745
Target Start/End: Original strand, 15067982 - 15068330
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||   ||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15067982 ttttactataaatataaaccttgtatcaacctaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaaccagggtttgtatag 15068081  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |   ||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||| | ||    
T  15068082 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaatactattaggattgagtcttttggttacggaaagaggttgagact 15068181  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  15068182 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatataatggaacggagggctgctctctccccc 15068281  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 745  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15068282 agactaggtcaatttggactgaactgggccaacaaattcttttgtgttc 15068330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 400 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 28251901 - 28251545
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251901 ttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 28251802  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  28251801 agtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 28251702  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  28251701 ttgggtaaaattaggcgggagacttattcttataacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 28251602  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 753  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28251601 atactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 28251545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 4424019 - 4424368
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4424019 ttttactataaatacagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 4424118  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  4424119 agtttgtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagct 4424218  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||     
T  4424219 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttatcttttgtaacattactcatcatatagtggatcagagggctgctctctccccc 4424318  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4424319 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4424368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 27826987 - 27827335
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27826987 ttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 27827086  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||  ||||||  |||| |     
T  27827087 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggacc 27827186  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  27827187 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 27827285  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827286 agactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27827335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 400 - 742
Target Start/End: Original strand, 27911016 - 27911359
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27911016 ttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa-ggcaacaacaaaactagggtttgtatag 27911114  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  27911115 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggact 27911214  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  27911215 ttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctctcccc- 27911313  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 742  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27911314 agactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattcttttgtg 27911359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 400 - 742
Target Start/End: Original strand, 27957435 - 27957778
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27957435 ttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa-ggcaacaacaaaactagggtttgtatag 27957533  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  27957534 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggact 27957633  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  27957634 ttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctctcccc- 27957732  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 742  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27957733 agactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattcttttgtg 27957778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 400 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 13858818 - 13858477
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13858818 ttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 13858719  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  13858718 agtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggggct 13858619  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | | |||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13858618 ttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagcccatt-atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccc 13858520  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 738  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13858519 cagactaggtcaatttggacagaactgggtaaacaaattcttt 13858477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 18810709 - 18811057
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18810709 ttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 18810808  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||| ||  |||| ||    
T  18810809 agtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaataggctgggact 18810908  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||     
T  18810909 ttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 18811007  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18811008 agattaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 18811057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 438 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 22684952 - 22684638
Alignment:
Q  438 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 537  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  22684952 agagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggt 22684853  T
Q  538 tgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 634  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  22684852 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 22684753  T
Q  635 ---attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
       |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22684752 aatattgatttctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 22684653  T
Q  732 attcttttgtgttct 746  Q
    |||||||||||||||    
T  22684652 attcttttgtgttct 22684638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 400 - 751
Target Start/End: Original strand, 25952522 - 25952876
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||     
T  25952522 ttttactataaatataagctttgtatcagaggaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaataaaattagggtt-gtatat 25952620  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| | |     
T  25952621 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacaatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaattgagaca 25952720  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25952721 ttgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccc 25952820  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25952821 cagactaggtaaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 25952876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 400 - 751
Target Start/End: Original strand, 36865538 - 36865892
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 498  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36865538 ttttactataaatatagacattgtatcagatgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 36865637  T
Q  499 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||    ||| |||||||||||  |    
T  36865638 gagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttc---acgggaagagattggaac 36865734  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct-cc 693  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  36865735 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctccc 36865834  T
Q  694 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  36865835 ccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattctcttgtgttctgtctt 36865892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 44720844 - 44721193
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| || |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  44720844 ttttactataaatatagaccttatatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatgttttgtatag 44720943  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac----attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||     |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |    
T  44720944 agtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 44721043  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||     
T  44721044 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacggtactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccg 44721142  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  44721143 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 44721193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 359 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 24873563 - 24873178
Alignment:
Q  359 gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct------agagatagaggggg 451  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |      ||||||||||||||    
T  24873563 gtatcttcagtgttgtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagaggggg 24873464  T
Q  452 ctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcggg 551  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  24873463 ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttgg 24873364  T
Q  552 aaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctctt 647  Q
    ||||   |||| |||| |||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||| |    
T  24873363 aaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccgattgatttctc-t 24873265  T
Q  648 ttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||| || |||||||||||    
T  24873264 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaattgagtcaacaaatt 24873178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 400 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 5372511 - 5372156
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  5372511 ttttactataattatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttatatag 5372413  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||    
T  5372412 agtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgggact 5372313  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct-ccc 694  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  5372312 ttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttactctctcccc 5372213  T
Q  695 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  5372212 ccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattattttctgttctttctt 5372156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 33541722 - 33541389
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33541722 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 33541623  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||    
T  33541622 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgggact 33541523  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    || ||||||||||||                      |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  33541522 tttggtagaattagg----------------------cattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggaaggctgctctctccccc 33541445  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  33541444 agactaggtcaatttggaccgaattgggtcaaaaatttcttttgtgttctctcttc 33541389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 438 - 746
Target Start/End: Original strand, 43079642 - 43079952
Alignment:
Q  438 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 537  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  43079642 agagatag-gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 43079740  T
Q  538 tgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaact 633  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  43079741 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 43079840  T
Q  634 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 733  Q
    ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  43079841 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 43079939  T
Q  734 tcttttgtgttct 746  Q
    |  ||||||||||    
T  43079940 ttctttgtgttct 43079952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 438 - 746
Target Start/End: Original strand, 43082012 - 43082323
Alignment:
Q  438 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 537  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  43082012 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 43082111  T
Q  538 tgattcacctcgggaaacattaa---gattg-agtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaact 633  Q
    |||||||||| |||||||| ||    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||     
T  43082112 tgattcaccttgggaaacactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacc 43082211  T
Q  634 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 733  Q
    ||||||  ||||||| ||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  43082212 cattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 43082310  T
Q  734 tcttttgtgttct 746  Q
    |  ||||||||||    
T  43082311 ttctttgtgttct 43082323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 18812894 - 18813231
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||               
T  18812894 ttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag----------- 18812982  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| |||| |||| ||||||  || | ||    
T  18812983 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgggtacgggaagaggctgtgact 18813082  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||     
T  18813083 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacaatactcatcatatagtggattggagggctgctctctccccc 18813181  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18813182 atattaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 18813231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 400 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 15186044 - 15185694
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||||| ||||     
T  15186044 ttttactataaatataaactttgtatcagagtaaaccttgagataaaggtgactgaaacaagggtttagaaagaaaataacaaaactatggtttatataa 15185945  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttt--tggttacgagaagagattgggg 594  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||   |||  ||||||||| |  |||||||| |||||||||        
T  15185944 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtaaaacactattagaattgagtctctcttggttacgggaagagatt---- 15185849  T
Q  595 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcc 693  Q
       |||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15185848 ---tgggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctcttttttaaggttactcatcattatagtgaaacggaggactgttctctcc 15185752  T
Q  694 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15185751 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttttgttctctctt 15185694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 400 - 631
Target Start/End: Original strand, 14477277 - 14477511
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14477277 ttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataa 14477376  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||    
T  14477377 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 14477476  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaa 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14477477 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 14477511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 400 - 734
Target Start/End: Original strand, 21482323 - 21482649
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||||||||| || ||||||||| ||||||||||          |||||||||||||||||     
T  21482323 ttttactataaatatagaatttgtatcagagtaaactttgagatagagtggactgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtataa 21482414  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  21482415 agtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttatgggaagagattggggct 21482510  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21482511 ttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataaagaaacggagggctgctctctcccc 21482610  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21482611 caaactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 21482649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 489 - 758
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956320
Alignment:
Q  489 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaag 585  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||| ||||||||| ||| ||||    
T  15956051 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaag 15956146  T
Q  586 agattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggct 684  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  15956147 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggtt 15956246  T
Q  685 gctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
     |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  15956247 tctctctccctcagattaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtattctctcttcttttct 15956320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 145 - 303
Target Start/End: Original strand, 32339094 - 32339252
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339094 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 32339193  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaag 303  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  32339194 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaag 32339252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 427 - 725
Target Start/End: Original strand, 21480542 - 21480832
Alignment:
Q  427 agagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactag 526  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||          |||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  21480542 agagtaaaccttgagatagatggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatggagtttg-ctcttggcaacaaacactag 21480632  T
Q  527 ggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttt 623  Q
    | ||   |||||||||||||| ||||||||   |||  ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |    
T  21480633 gttt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttat 21480729  T
Q  624 tcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactg 722  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  21480730 tcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaacgaactg 21480829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 400 - 734
Target Start/End: Original strand, 31162214 - 31162551
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaa-caacaaaactagggtttgtat 497  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||  ||| |||||||  ||| ||||||||    
T  31162214 ttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaaccttgagaaagagggggctaaaaacaaaggtttagaaa--caagcaacaaat-tagtgtttgtat 31162310  T
Q  498 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 594  Q
    | |||||| ||||| | |||||||||||  |||  ||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||| ||  ||||||||||||     
T  31162311 aaagtttg-ctcttggcaacaaacactaacgtt--agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaccggaagagattggga 31162407  T
Q  595 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct-- 691  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||      
T  31162408 ctttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcc 31162507  T
Q  692 cccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  31162508 cccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 31162551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 400 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 5623072 - 5622877
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||||||||||||   ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5623072 ttttactataaatataggttttgtatcagaataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 5622973  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacatta---agattgagtcttttggttacgagaagagattgg 592  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  5622972 agtttgtctattgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctttggaaacattatttggattgagtctcttgattacgggaagagattgg 5622877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 400 - 556
Target Start/End: Original strand, 26775202 - 26775358
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  26775202 ttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaatactagggtttgtatat 26775301  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  26775302 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttggaaaaca 26775358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 144 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 3265753 - 3265635
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3265753 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatg 3265654  T
Q  244 gacaataaatatatttttg 262  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  3265653 gacaataaatatatgtttg 3265635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 430 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 3005931 - 3005624
Alignment:
Q  430 gtaaacctagagatagagggggctg-aaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggg 528  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||  |  ||||||| |||||||||||||||| |||||   |||||||| |||||    
T  3005931 gtaaaccttgagatagagggggctggaaacaagggtttagaaa--caaataacaaactagagtttgtatagagtttg-ctcttaacaacaaacaataggg 3005835  T
Q  529 tttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttc 625  Q
    || ||   ||||||||| | || |||||   |||  ||||||||| ||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3005834 ttgga---ttgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 3005738  T
Q  626 ttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgg 723  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||    
T  3005737 ttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaacggaggggtgctctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactgg 3005638  T
Q  724 gtcaacaaattctt 737  Q
    || |||||||||||    
T  3005637 gtaaacaaattctt 3005624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 400 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 35872712 - 35872561
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     |||||||||||||||||    
T  35872712 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaac-----aactagggtttgtatag 35872618  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca 556  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35872617 agtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaaca 35872561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 296 - 494
Target Start/End: Original strand, 181434 - 181632
Alignment:
Q  296 tttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||           | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  181434 tttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactaaaggagaagaaaaaaacg-tatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagt 181532  T
Q  396 tata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 494  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  181533 tatacttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggcttagaatggcaacaataaaactagggtttg 181632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 430 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 37214514 - 37214317
Alignment:
Q  430 gtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaact-------------------agggtttgtatagagtttgtctct 510  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||||||||||||||    
T  37214514 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttggttacgggaagagattgagggtttgtatagagtttgtctct 37214415  T
Q  511 ttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattag 610  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      ||||||||| ||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  37214414 ttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaac------attgagtctcttggttacgggaagcgattggaactttgggtagaattag 37214321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 400 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 12517360 - 12517248
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct--agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 497  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12517360 ttttactatatatatataccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 12517261  T
Q  498 agagtttgtctct 510  Q
    |||||||||||||    
T  12517260 agagtttgtctct 12517248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 400 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 3886252 - 3886153
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3886252 ttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 3886153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 537 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578273
Alignment:
Q  537 ttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaac 632  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||   || ||||  ||||||||||    
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 31578377  T
Q  633 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 730  Q
       |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||    
T  31578376 cttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctcccctagactaggtcagtataggaccgaactgggtaaaca 31578277  T
Q  731 aatt 734  Q
    ||||    
T  31578276 aatt 31578273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 602 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 2468259 - 2468126
Alignment:
Q  602 tagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 700  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| || |||     
T  2468259 tagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctctctctcccagat 2468160  T
Q  701 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  2468159 taggtcaatttggacagaactaggtaaacaaatt 2468126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 534 - 734
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035459
Alignment:
Q  534 gggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgt 629  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||| ||  |||||||||| | |||| ||||||||||||   || ||||| |||||||    
T  31035252 gggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttgt 31035351  T
Q  630 aactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagac--taggtcaat-ttggaccgaactgggt 725  Q
    ||| | |||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||||||||    
T  31035352 aaccctttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactataggtcagtattggaccgaactgggt 31035450  T
Q  726 caacaaatt 734  Q
     ||||||||    
T  31035451 aaacaaatt 31035459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 522 - 695
Target Start/End: Original strand, 181622 - 181798
Alignment:
Q  522 actagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca----ttaagattgagtcttttggttacgag--aagagattggggctttgggtagaattaggcggg 615  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    ||| |||| ||||| || |||||| |  |||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  181622 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcgga 181721  T
Q  616 agactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| || | |||||||||||||    
T  181722 agacttattcttgtaacccattgatatctc-tttgtaaagttactcatc--atagtgaaacagatgactgctctctcccc 181798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 634 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 35872537 - 35872426
Alignment:
Q  634 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 733  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||    
T  35872537 cattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc-------------atttggaccgaactgggtcaacaaat 35872451  T
Q  734 tcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||    
T  35872450 tcttttgtgttctctcttcttttct 35872426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 676 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 37214319 - 37214251
Alignment:
Q  676 cggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 744  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37214319 cggatggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 37214251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 665 - 758
Target Start/End: Original strand, 14477519 - 14477613
Alignment:
Q  665 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactg-ggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14477519 atatagtgaaacggatggctactctttaccccagactaggtcaatttggatcgaactgcggtcaacaaattcttttgtgttctttcttcttttct 14477613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 9693057 - 9692952
Alignment:
Q  19 gaaaaagagacaaatggccttattaaagaacttattcctccaggataagttgatagcttaactagcctcatctttgctaatgcgttgtactttagaggag 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||  | |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  9693057 gaaaaagagacatatggccttattaaagaaattcttcctcaagcgtcagttgacagcttaaccagactcatctttgctaatgcattgtattttaaaggag 9692958  T
Q  119 catgga 124  Q
    ||||||    
T  9692957 catgga 9692952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 400 - 556
Target Start/End: Original strand, 31035068 - 31035223
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagaga--tagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 495  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||  ||||| |  |||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  31035068 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaactttgagaggtagagagt-ctgaaaacaatggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgt 31035165  T
Q  496 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca 556  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   || ||||||||||| ||||||||    
T  31035166 atagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--gggattgattcaccttgggaaaca 31035223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 455 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 31574000 - 31573794
Alignment:
Q  455 aaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaa 554  Q
    |||||| ||||||||| | |||||  ||||||||| ||||||  |||||| |||||| | ||||||||||| |||| |  | ||||||||||| ||||||    
T  31574000 aaacaaaggtttagaa-gccaacacgaaaactaggatttgta--gagttt-tctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaa 31573907  T
Q  555 ca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttg 650  Q
    ||   ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||   | |||||  ||||||||| || |||| ||||||||||    
T  31573906 cactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaattctttgatatctcttttg 31573807  T
Q  651 taacgttactcat 663  Q
    ||| |||||||||    
T  31573806 taaagttactcat 31573794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13986374 - 13986304
Alignment:
Q  155 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 226  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13986374 tgactcaaaattttatggatgaagaagattgttgctaaaaatat-aaagatttgttttaaatatattttgtg 13986304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 2468432 - 2468361
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaa 471  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  2468432 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggagctgaaacaaggatttagaaa 2468361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11701447 - 11701364
Alignment:
Q  225 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatatt 311  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| || |||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  11701447 tgctgaaaatatatttatggtcagtaaatatatttttgtaccgtatg--gaa-gaattgatgtaaatatatttttaaagggaatatt 11701364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30679256 - 30679186
Alignment:
Q  155 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  30679256 tgactcaaaatttgatggatgaagaatat-gttggtaaaaataaaaaagatttgttttagatatattttgtg 30679186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 19752433 - 19752487
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  19752433 ggagagctgctctctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 19752487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 557 - 734
Target Start/End: Original strand, 6376149 - 6376328
Alignment:
Q  557 ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacg 655  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| | ||||  |||||||||||   || ||||  ||||||| ||   |||| |||||||| |||| |    
T  6376149 ttaagattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttatgtagaattaggtttgaagactaattcttgttaccttttgatatctcttt-gtaaag 6376247  T
Q  656 ttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    ||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||  || ||||||||    
T  6376248 ttactcatcattatagtggaacagaaggctgctctctccctcagactaggtcagtattggaccgaacttagtaaacaaatt 6376328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 12702678 - 12702634
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12702678 tctctcccctagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 12702634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 715 - 758
Target Start/End: Original strand, 181798 - 181841
Alignment:
Q  715 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  181798 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 181841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 228 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13986285 - 13986214
Alignment:
Q  228 tgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttg 299  Q
    |||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||||||    
T  13986285 tgaaaatatatttatggatagttaataaatttttgtaccgcatgaaagaagatttgatgcaaatatattttg 13986214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 4696635 - 4696689
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  4696635 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaa 4696689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 9765858 - 9765912
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9765858 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9765912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 687 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 10930243 - 10930193
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  10930243 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaatttctt 10930193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 556 - 724
Target Start/End: Original strand, 17847685 - 17847848
Alignment:
Q  556 attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaac 654  Q
    |||| |||||| ||| ||| | ||| |||||||||| | |||||||||||||||||   || ||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||     
T  17847685 attaggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac-ctttgatatctcttttgtaa- 17847782  T
Q  655 gttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactggg 724  Q
       | ||||  ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  17847783 ---aatcat--tatagtggaatggagggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccaaactggg 17847848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 26403269 - 26403323
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26403269 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 26403323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 636 - 732
Target Start/End: Original strand, 16833789 - 16833886
Alignment:
Q  636 ttgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 732  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| | ||||||||||||||  |||||| |||| ||| |  |||||||||| ||||||    
T  16833789 ttgatatctcttttgtaaagttactcaacattatagtggaacgaaaggctgctctctcccacagactaagtcacttttggacgaactgggtaaacaaa 16833886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 666 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 4812554 - 4812486
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 733  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||    
T  4812554 tatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcataattagaccgaactgggtaaacaaat 4812486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 641 - 692
Target Start/End: Original strand, 14419734 - 14419786
Alignment:
Q  641 atctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc 692  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  14419734 atctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggatggctgctctctc 14419786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Original strand, 15212910 - 15212954
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15212910 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 15212954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 666 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 17799490 - 17799418
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  17799490 tatagtggaacggagagctgctctctctcccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 17799418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 666 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 23179627 - 23179555
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  23179627 tatagtggaacggatagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 23179555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Original strand, 27811402 - 27811446
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27811402 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 27811446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 666 - 733
Target Start/End: Original strand, 28328023 - 28328091
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaat 733  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||    
T  28328023 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaat 28328091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Original strand, 33352274 - 33352318
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33352274 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 33352318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Original strand, 40321204 - 40321248
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40321204 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 40321248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 687 - 730
Target Start/End: Original strand, 4733830 - 4733873
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 730  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4733830 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaaca 4733873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 400 - 435
Target Start/End: Original strand, 6375990 - 6376025
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaac 435  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6375990 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaac 6376025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 623 - 695
Target Start/End: Original strand, 3896048 - 3896122
Alignment:
Q  623 ttcttgtaactcat-tgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||  |||||| |||||||||||||||    
T  3896048 ttcttgtaactcttatgatatctcttttgtaaagttactcatcattaaagtagaacggatggctgctctctcccc 3896122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 5702522 - 5702576
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||||| |||||||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5702522 ggagggatgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5702576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 7412399 - 7412345
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  7412399 ggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 7412345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 23799616 - 23799670
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||||||||| | | | |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23799616 ggagggctgctctctcctccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 23799670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 31071268 - 31071322
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  31071268 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaacaa 31071322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27820178 - 27820149
Alignment:
Q  197 ataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27820178 ataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 27820149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 687 - 728
Target Start/End: Original strand, 40221869 - 40221910
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaa 728  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  40221869 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaa 40221910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 365; Significance: 0; HSPs: 92)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 2629479 - 2628871
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629479 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 2629380  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2629379 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 2629280  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 443  Q
    ||           | |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||||| | ||||     
T  2629279 aggaaaaaaaaacg-tatcttcagtgtagtatttgttccaaatttattagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatgttaaactttgagag 2629181  T
Q  444 agag-----ggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 538  Q
    ||||     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2629180 agagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggtt 2629081  T
Q  539 gattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttt-ttcttgtaactc 634  Q
    ||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |    
T  2629080 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggc-ggagaatttattcttgtaaccc 2628982  T
Q  635 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    |||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2628981 attgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaatt 2628883  T
Q  735 cttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||    
T  2628882 cttttgtgttct 2628871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 19705165 - 19704552
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19705165 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaagatattttgtgctgaaaatatatttatgg 19705066  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  19705065 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaagg 19704966  T
Q  345 agnnnnnnnnnnng-gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatattttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct------ 437  Q
    ||             ||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |          
T  19704965 agaaaaaaaagaaacgtatcttaagtgtgatattcgttccaaatttatgagttatatttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagag 19704866  T
Q  438 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 537  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||    
T  19704865 agagatggagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggt 19704766  T
Q  538 tgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaact 633  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  19704765 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 19704666  T
Q  634 cattgacatctct-tttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 732  Q
    ||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19704665 cattgatttctctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 19704566  T
Q  733 ttcttttgtgttct 746  Q
    || |||||||||||    
T  19704565 ttattttgtgttct 19704552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 746
Target Start/End: Original strand, 30966923 - 30967530
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30966923 tgttgtagtatgactccaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttatttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 30967022  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30967023 acaataaatatatttttgtattgtatgaagaacgatttaatgcaaatatattttgaaagcgaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 30967122  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----ag 439  Q
    ||           |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  ||||| |    ||    
T  30967123 agaaaaaaaaaacga-atcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtat-aggctaaactttgagag 30967220  T
Q  440 agatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 539  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30967221 agatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttg 30967320  T
Q  540 attcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcat 636  Q
    |||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||   ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  30967321 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccat 30967420  T
Q  637 tgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 736  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30967421 tgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 30967520  T
Q  737 tttgtgttct 746  Q
    ||||||||||    
T  30967521 tttgtgttct 30967530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 30035196 - 30034590
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  30035196 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctaaaaatatatttatag 30035097  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  30035096 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttaatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcagatattctttcactgaagg 30034997  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----ag 439  Q
    ||           | |||||||| |||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |    ||    
T  30034996 agaaaataaaaacg-tatcttcaatgtgatatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttaagag 30034898  T
Q  440 agatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttg 539  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  30034897 agatagagggagctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagagtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttg 30034798  T
Q  540 attcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcat 636  Q
    |||||||| ||||||||   ||| |||||||||  ||||||| | ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  30034797 attcaccttgggaaacactattaggattgagtcaattggttaagggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 30034698  T
Q  637 tgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 736  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30034697 tgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagcggatcggagggctgctctctcccccagactgggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 30034598  T
Q  737 tttgtgtt 744  Q
    ||||||||    
T  30034597 tttgtgtt 30034590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 12196104 - 12195500
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12196104 tgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatatatttatgg 12196005  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12196004 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 12195905  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagat 443  Q
    ||           |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||    
T  12195904 agaaaaaaaaaacga-atcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 12195806  T
Q  444 agagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattc 543  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12195805 agagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattc 12195706  T
Q  544 acctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattga 639  Q
    |||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12195705 accttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattga 12195606  T
Q  640 catctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 739  Q
      |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  12195605 tttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaagtttcttt 12195507  T
Q  740 gtgttct 746  Q
    |||||||    
T  12195506 gtgttct 12195500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 145 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 26933158 - 26932546
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  26933158 tgttgtagtatgactcaaaaattgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatattgtgctgaaaatattattatgg 26933059  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26933058 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 26932959  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct------ 437  Q
    ||            | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||  ||| || |||| |          
T  26932958 agaaaaaaaaac--gaatcttcagtgtggtatttgttccaaatttatgggttatactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagag 26932861  T
Q  438 --agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagg 535  Q
      |||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||    
T  26932860 agagagatagagggggttgaaacaagggcttagaaaagcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgg 26932761  T
Q  536 gttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaa 631  Q
    |||||||||||| | |||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26932760 gttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 26932661  T
Q  632 ctcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    | ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26932660 cccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 26932562  T
Q  732 a-ttcttttgtgttct 746  Q
    | ||||||||||||||    
T  26932561 atttcttttgtgttct 26932546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 400 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 11983363 - 11983007
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983363 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaaaggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 11983264  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  11983263 agtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 11983164  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  11983163 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccc 11983064  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 753  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11983063 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttct 11983007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Original strand, 9019906 - 9020261
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9019906 ttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 9020005  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| |||||||   |||||||||||| ||    
T  9020006 agtttgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttataggaagagattgggact 9020105  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  9020106 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctccccc 9020205  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9020206 aaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 9020261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 404 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 28241651 - 28241306
Alignment:
Q  404 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 503  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241651 actataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 28241552  T
Q  504 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||| |    
T  28241551 tgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttcg 28241452  T
Q  601 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 700  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28241451 gtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagac 28241352  T
Q  701 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241351 taggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28241306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 400 - 751
Target Start/End: Original strand, 13057174 - 13057529
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13057174 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaactagggtttgtatag 13057273  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  13057274 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggact 13057373  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13057374 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctactctctcccc 13057473  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
     | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13057474 caaactaggtcaatttggaccgaactcggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 13057529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 3630198 - 3629838
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3630198 ttttactataaatatagacattgtatcaatgtaaaacttgagatagagggggctgaaacatcggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 3630099  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  3630098 agtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggct 3629999  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  3629998 ttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactaataatatagtgaaactgagggctgctctctcccc- 3629900  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  3629899 atactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 3629838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 400 - 742
Target Start/End: Original strand, 3390359 - 3390705
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390359 ttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 3390458  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||   ||||||||||||||    
T  3390459 agtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattggggct 3390558  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  3390559 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtgaaacggagggctgctctctcccc 3390658  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtg 742  Q
     | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  3390659 catactaggtcaatttggaccaaattgggtcaacaaattcttttgtg 3390705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 404 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 1230579 - 1230234
Alignment:
Q  404 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 503  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||| | ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230579 actataaatatagaccttgtatcatagcaaactttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 1230480  T
Q  504 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 600  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||| ||| |||||||   ||||||  |||| ||||||    
T  1230479 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttattggaagaggctgggactttgg 1230380  T
Q  601 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 700  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  1230379 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagac 1230280  T
Q  701 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230279 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1230234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 400 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 15541474 - 15541120
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15541474 ttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtatag 15541375  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  15541374 agtttgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggtcacgagaagagattgggact 15541275  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |     
T  15541274 ttgggtaggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatatagtgaaacagaaagctgctctctcctcc 15541175  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15541174 agactaggttaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 15541120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 14507509 - 14507161
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507509 ttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 14507410  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  14507409 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggact 14507310  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  14507309 ttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatacttatcatatagtgaatcggagggctgctctctccccc 14507211  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507210 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14507161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 406 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 14459093 - 14458752
Alignment:
Q  406 tataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 505  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14459093 tataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 14458994  T
Q  506 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggt 602  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||    
T  14458993 tctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgattc--cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 14458896  T
Q  603 agaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagacta 702  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||    
T  14458895 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagacta 14458796  T
Q  703 ggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14458795 ggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14458752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 400 - 751
Target Start/End: Original strand, 13039734 - 13040089
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13039734 ttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttgtatag 13039833  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||| | ||    
T  13039834 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgagact 13039933  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13039934 ttgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccc 13040033  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13040034 tagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctctt 13040089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 3234064 - 3233704
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||     
T  3234064 ttttactataaatatagac-ttgtatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgtatat 3233966  T
Q  500 agtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  3233965 agtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggc 3233866  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3233865 tttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcaccgtatagtgaaacggagggctgctctctcccc 3233766  T
Q  696 tagactaggtcaatttggacc-----gaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
     | ||||||||||||| ||||     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3233765 cacactaggtcaattttgaccgaactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctcttc 3233704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 400 - 751
Target Start/End: Original strand, 25477254 - 25477616
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25477254 ttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatag 25477353  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||    
T  25477354 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattggggct 25477453  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaa-------cgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctc 688  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||       |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25477454 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcgttactcatcattatagtgaaacagagggctgctc 25477553  T
Q  689 tctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25477554 tctcccccatactaggtcaatttggaccgaaatgggtcaacaaattcttttgtattctctctt 25477616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 150 - 664
Target Start/End: Original strand, 17011784 - 17012287
Alignment:
Q  150 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  17011784 tagtatgacttaaaatttgatggatgaagaatattattgctaaaaatataaaag-tttgttttaaatat--tttgtgtagaaaatatatttatggacaat 17011880  T
Q  250 aaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnn 349  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |        
T  17011881 aaatatatttttgtaccgtatgatggacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaaaa---- 17011976  T
Q  350 nnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatattttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagaggg 449  Q
             |||||||||| ||  | |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  17011977 ---aaaaacgtatcttcagagtgatgttcgttccaaatttatgagttatatttctctataaatatagaccttgtatcggagtaaaccttgagatagaggg 17012073  T
Q  450 ggctgaa-acaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctc 548  Q
    | ||||| | || ||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||     
T  17012074 gtctgaataaaagggtttag-aagtaaacaac-aaactagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactaggg-ttga-ggttgattcacctt 17012168  T
Q  549 gggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctc 645  Q
      |||||   |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17012169 ctgaaacaatattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgatgcttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctc 17012268  T
Q  646 ttttgtaacgttactcatc 664  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  17012269 ttttgtaaagttactcatc 17012287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 153 - 528
Target Start/End: Original strand, 17852275 - 17852650
Alignment:
Q  153 tatgactcaaaatttgatggatggagaatattgt--tgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaata 250  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17852275 tatgactcaaaatttgatg-atggagaatattgtgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatat--tttatgctgaaaatatatttatggacaata 17852371  T
Q  251 aatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggag-nnn 349  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||        
T  17852372 aatatatttttgtaccttatgaagaactatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattatttcactgaaagagaaga 17852471  T
Q  350 nnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagg 448  Q
             |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17852472 aaaaaaaaagtatcttc-gtgtggtattcgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagg 17852570  T
Q  449 gggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggg 528  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17852571 gggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactaggg 17852650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 401 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 3632271 - 3631926
Alignment:
Q  401 tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 500  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3632271 tttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 3632172  T
Q  501 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctt 597  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||   |||| |||||||||| || ||||||  ||||||||||| |||    
T  3632171 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctttgttacggaaagagattgggactt 3632072  T
Q  598 tgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||      
T  3632071 tgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctgtccc-- 3631974  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 744  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3631973 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 3631926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 438 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 4816527 - 4816216
Alignment:
Q  438 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 537  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  4816527 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 4816428  T
Q  538 tgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 634  Q
    |||||||||| || |||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  4816427 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 4816328  T
Q  635 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816327 attgatttctcttttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 4816228  T
Q  735 cttttgtgttct 746  Q
    ||||||||||||    
T  4816227 cttttgtgttct 4816216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 400 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 15533015 - 15532674
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  15533015 ttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtataa 15532916  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||   |||| |||||||||| ||||| | | |||||||||||| ||    
T  15532915 agtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggact 15532816  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  15532815 tttggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctat-ccct 15532717  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 739  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15532716 agactaggtcaattttgactgaactaggtcaacaaattctttt 15532674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 400 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 30729162 - 30728811
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  30729162 ttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtatcgaaagacaacaacaaaacttgggtttgtatag 30729063  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||| ||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  30729062 agtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttacgggaagaggctggggct 30728963  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgaca----tctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 692  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |    |||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  30728962 ttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctttctcttttgtaaagttactcatattatagtggaacggaaggctgctctctc 30728863  T
Q  693 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 744  Q
    ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30728862 ccgcagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 30728811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Original strand, 32279977 - 32280332
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32279977 ttttcctatatatatagaccttgtatcatagtaaacttggagatagagggg-ctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatag 32280075  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  32280076 agtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggact 32280175  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc-atatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32280176 tcaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagtaaaacggagggctgctctctcccc 32280275  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  32280276 cagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaaaaaattctcttgtgttctctcttc 32280332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 400 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 20915692 - 20915351
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaa--cctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 497  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20915692 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaattgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtat 20915593  T
Q  498 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggg 593  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20915592 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgagaagagattggg 20915493  T
Q  594 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 693  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  20915492 acttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcc 20915394  T
Q  694 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 736  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915393 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 20915351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 400 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 15530456 - 15530166
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15530456 ttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagagggggctgaagcaagggcttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 15530357  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  15530356 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggct 15530257  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc 688  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15530256 ttgggttgaattaggcgggagacttattcttgtaac-cattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctc 15530166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 438 - 746
Target Start/End: Original strand, 26065004 - 26065310
Alignment:
Q  438 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 537  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  26065004 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttgg---aaacactagggtttgagggt 26065100  T
Q  538 tgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 634  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  26065101 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 26065200  T
Q  635 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26065201 attgacttctc-tttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 26065298  T
Q  735 cttttgtgttct 746  Q
     |||||||||||    
T  26065299 attttgtgttct 26065310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 438 - 746
Target Start/End: Original strand, 26084973 - 26085279
Alignment:
Q  438 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 537  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  26084973 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttgg---aaacactagggtttgagggt 26085069  T
Q  538 tgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 634  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  26085070 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 26085169  T
Q  635 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26085170 attgacttctc-tttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctctctcccc-agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 26085267  T
Q  735 cttttgtgttct 746  Q
     |||||||||||    
T  26085268 attttgtgttct 26085279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 24338782 - 24338421
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24338782 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgcataa 24338683  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacacta-gggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||   ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  | |    
T  24338682 agtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaaaacactattaagattgagtcttttggttatggaaagagattaagac 24338583  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 694  Q
    ||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  24338582 tttgggtagaattagtcagaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctg--ctctccc 24338485  T
Q  695 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    | |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||| | |||||| ||||    
T  24338484 ccagactatgtcaatttggaccgaactaggtaaacaaatatttttgtgttatctcttcttttct 24338421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 145 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 5275928 - 5275727
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5275928 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttatttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 5275829  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5275828 acaataaatatatttttgtatcgtatgaagaacgatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaagg 5275729  T
Q  345 ag 346  Q
    ||    
T  5275728 ag 5275727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 145 - 422
Target Start/End: Original strand, 18317751 - 18318028
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18317751 tgttgtagtatgactcaaaatttgaaggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 18317850  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  18317851 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaagg 18317950  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttg 422  Q
    ||            ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18317951 agaaaaaaaaaac-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttatgagttatactttcactataaatatagaccttg 18318028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 12161888 - 12161537
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||  |||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12161888 ttttactttaaatatagacattgtatcattgtaaaccttgagataaagggg-ctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatag 12161790  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||   ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||    
T  12161789 agtttgtctct--ggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacgttgggaaacactattaagatcgagtctattggttacgggaagagattgagact 12161692  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    || |||| ||||| | |||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||    
T  12161691 ttaggtataattaagtgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtaaaatggatggctgttctct-ccct 12161593  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12161592 aaactaggttaatttggaccgaactgaatcaacaaattattttgtgttctctcttc 12161537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 145 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 22858536 - 22857949
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22858536 tgttgtagtatgactcaaaatttgatggatgaagaatattgttaataaaaatataaaagatttgttttaaatatactttgtgctgaaaatatatttatgg 22858437  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||| |||||||||||||||||||||        ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22858436 acaataaatatatttttgtaccgtatgaaagaagattagatgcaaatatattttgaaagggaa--------ttttgatgcaaatattctttcattgaagg 22858345  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatattttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct-----ag 439  Q
    ||            |||||||||  ||  ||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| | ||  |     ||    
T  22858344 agaaaaaaagaaacgtatcttcaacgtgatatacgttccaaatttatgagttatatttctctataaatataaaccttgtatcaga-tgaatttgtgagag 22858246  T
Q  440 agatagagggggc--tgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 537  Q
    |||||||| |  |    |||||| ||||||| |||  ||||  ||||||||||||||  |||| ||| |||||| | |||||||||||||| |||| | |    
T  22858245 agatagagagaaccagaaaacaagggtttag-aagctaacacaaaaactagggtttg--tagaattt-tctcttggtaacaaacactaggg-ttga-gat 22858152  T
Q  538 tgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagg-cgggagactttttcttgtaact 633  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||| |||||| |||||   | |||||  ||||||||||     
T  22858151 tgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagatttaggtttgaagactaattcttgtaacc 22858052  T
Q  634 c-attgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 730  Q
    |  |||| || || ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| || ||||    
T  22858051 cttttgatatatc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaactgtgtaaaca 22857953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 400 - 666
Target Start/End: Original strand, 22490619 - 22490889
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggttta-gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 498  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22490619 ttttaccataaatatagacattgaattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttttgaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 22490718  T
Q  499 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    || ||||| | |||||   |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |    
T  22490719 tagtttgcctctttggaacaaacactagggtttgaggaggtatacaccttgcgaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggac 22490818  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat 666  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  22490819 tttgggtagaattatgcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcat 22490889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 400 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 19227742 - 19227518
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| | |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227742 ttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 19227643  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||||||  || | ||    
T  19227642 agtttgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 19227543  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactt 621  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  19227542 ttgggtagaattaggcgggagactt 19227518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 400 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 3028184 - 3027848
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 498  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||| | |||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  3028184 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccatgagataaaaggggctgaaaacaagggtttggaa-ggcaaca-caaaactagggtttgtata 3028087  T
Q  499 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||| | |    
T  3028086 gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgtgaagagattgagac 3027990  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct-cc 693  Q
    |||| |||||||||||| ||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  3027989 tttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttccc 3027890  T
Q  694 cctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    || |||||||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||    
T  3027889 cccagactaggtcagtttttgaccgaactggataaacaaatt 3027848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 400 - 751
Target Start/End: Original strand, 14466313 - 14466658
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||||| |||||||| ||| || ||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||               
T  14466313 ttttactatagatatagactttgtattagaataaaccttgagatagagagggttgaaacaagagtttagaaagacaacagcaaaactag----------- 14466401  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggttt-gagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||   ||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||      
T  14466402 agtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggag 14466501  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctccc 694  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||| | ||||| | ||||    
T  14466502 tttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaccggatgactgctgtttccc 14466601  T
Q  695 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  14466602 ccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcagcaaattctcttgtgttctctctt 14466658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 519 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273213
Alignment:
Q  519 aacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattg-agtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgg 614  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 5273332  T
Q  615 gagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttgga 714  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| ||||||  ||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5273331 gagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgaaactcatcttatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 5273233  T
Q  715 ccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5273232 ccgaactgggtcaacaaatt 5273213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 540 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069691
Alignment:
Q  540 attcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcat 636  Q
    |||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 1069814  T
Q  637 tgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 735  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1069813 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagagaaacggagggctgctctcttccccatactaggtcaatttggaccgaactgaatcaacaaattc 1069714  T
Q  736 ttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    |||| |||||| |||||| ||||    
T  1069713 ttttatgttctctcttcttttct 1069691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 565 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 26066289 - 26066109
Alignment:
Q  565 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 664  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| |||    
T  26066289 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttacttatc 26066191  T
Q  665 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26066190 aaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 26066109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 431 - 734
Target Start/End: Original strand, 15719665 - 15719961
Alignment:
Q  431 taaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtt 530  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||          |||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||    
T  15719665 taaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt 15719755  T
Q  531 tgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttctt 627  Q
       | |||||||||||| || |||||   ||| |||||||||| ||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15719756 ---gagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 15719852  T
Q  628 gtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct-cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggt 725  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15719853 gtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagagttgctctttccccccatactaggtcaatttggaccgaacttggt 15719952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 565 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 26068560 - 26068380
Alignment:
Q  565 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 664  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||||||    
T  26068560 gagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttgctcatc 26068462  T
Q  665 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26068461 aaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 26068380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 400 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 32447650 - 32447502
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32447650 ttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 32447551  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactag-ggtttgagggttgattcacct 547  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  32447550 agtttgtctcttggcaacaaacactagagttttgagggttgattcacct 32447502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 565 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 29754874 - 29754694
Alignment:
Q  565 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 664  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  29754874 gagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 29754776  T
Q  665 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29754775 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 29754694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 565 - 746
Target Start/End: Original strand, 33309006 - 33309185
Alignment:
Q  565 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 664  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  33309006 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagactatt-cttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 33309103  T
Q  665 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33309104 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 33309185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 400 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 1072211 - 1072067
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1072211 ttttactataaatatagacattgtatcagagtaaactttgagatagaaggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatag 1072112  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattca 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1072111 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgagttgattca 1072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 150 - 311
Target Start/End: Original strand, 20526551 - 20526708
Alignment:
Q  150 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     |    
T  20526551 tagtatgactcaaaatttgatgggtgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttatgctgaaaatatatttatg-----t 20526645  T
Q  250 aaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatata-ttttgaaagggaatatt 311  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  20526646 acatatatttttgtaccgtatgaaggaagatttgatgcaaatatatttttgaaagagaatatt 20526708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 401 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 16455757 - 16455421
Alignment:
Q  401 tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagaga--tagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 497  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||| ||||  ||||| |  |||||| ||| ||||||||| | |||||  ||||||||||||||||     
T  16455757 tttactataaatatataccttgtatcggtgtaaaccttgagaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtac 16455660  T
Q  498 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 594  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||   ||| |||| ||||| ||| | |||  |||||||||||     
T  16455659 agagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaacactgttaggattaagtctcttgctcacggaaagagattggga 16455563  T
Q  595 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 693  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16455562 ctttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcc 16455463  T
Q  694 cctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    || | ||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||    
T  16455462 cccatactaggtcagtattggaccgaactgagtaaacaaatt 16455421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 565 - 746
Target Start/End: Original strand, 33311275 - 33311454
Alignment:
Q  565 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 664  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  33311275 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagactatt-cttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 33311372  T
Q  665 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    | |||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33311373 aaatagtggatcggagggctgctttctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 33311454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 536 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 12186271 - 12186051
Alignment:
Q  536 gttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcg-ggagactttttcttgtaa 631  Q
    |||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||| | ||| |||||||||| | ||||||||| |||||||   |||||||| |||||||||    
T  12186271 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaa 12186172  T
Q  632 ctcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaaca 730  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  12186171 ctcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctgcctcggactaggtcaatttgaaccgaactgggtaaaca 12186072  T
Q  731 aattcttttgtgttctatctt 751  Q
    |||| ||||||||||| ||||    
T  12186071 aattattttgtgttctctctt 12186051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 486 - 751
Target Start/End: Original strand, 15367101 - 15367365
Alignment:
Q  486 tagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgag 582  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| || ||  || |    
T  15367101 taggggttgtattgtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcggg 15367196  T
Q  583 aagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggaggg 682  Q
    |||||||||   ||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  15367197 aagagattgaaactttgggtaaaattaatcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaagg 15367296  T
Q  683 ctgctctctc-ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  15367297 ctgctctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctctt 15367365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 400 - 519
Target Start/End: Original strand, 8995459 - 8995578
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8995459 ttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 8995558  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaa 519  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8995559 agtttgtctctttggaacaa 8995578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 406 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 13870749 - 13870609
Alignment:
Q  406 tataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 505  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  13870749 tataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatataaagtttg 13870651  T
Q  506 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 547  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13870650 tctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcacct 13870609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 595 - 734
Target Start/End: Original strand, 15346525 - 15346664
Alignment:
Q  595 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 694  Q
    ||||| ||| ||||| |||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15346525 ctttgagtaaaattaagcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaagctgctctctccc 15346624  T
Q  695 ctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15346625 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 15346664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 649 - 752
Target Start/End: Original strand, 10584227 - 10584331
Alignment:
Q  649 tgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttcta 747  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  10584227 tgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttctc 10584326  T
Q  748 tcttc 752  Q
    |||||    
T  10584327 tcttc 10584331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 400 - 734
Target Start/End: Original strand, 19696421 - 19696759
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagaggg--ggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 496  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||  |||||| |||| ||||||  |||||||| ||| ||||||||||   |||||||||  |||||||||||    
T  19696421 ttttactataaatatagaccttgtatatgatgaaaccttgagagagagggagggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaat-tagggtttgta 19696518  T
Q  497 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggg 593  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||  |   ||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| || || ||   ||||||||| |    
T  19696519 tagagtttg-ctcttggcaacaatcactagggttcaaa--ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctctttgtcactgaaagagattgag 19696615  T
Q  594 gctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctct 691  Q
     |||||| ||||||||||   || ||||| |||||||||  | |||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||  ||||||||||    
T  19696616 actttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaatcctttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatagctgctctct 19696715  T
Q  692 cccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    | || ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  19696716 ctcccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 19696759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 535 - 734
Target Start/End: Original strand, 26945258 - 26945463
Alignment:
Q  535 ggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggg-agactttttcttgta 630  Q
    |||||| |||||| ||||||||   ||| |||| ||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||   | |||||| || |||||    
T  26945258 ggttgagtcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgta 26945357  T
Q  631 actcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaa 728  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| ||||| |||||| |||| ||| || ||||  ||||||||||||||||| ||    
T  26945358 actcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacgaagggcagctctcccccccagattatgtcaggtttggaccgaactgggtaaa 26945457  T
Q  729 caaatt 734  Q
    ||||||    
T  26945458 caaatt 26945463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 167 - 311
Target Start/End: Original strand, 30445243 - 30445404
Alignment:
Q  167 tgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct-----------------gaaaatatatttatggacaat 249  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||||| |||||    
T  30445243 tgatggatgaagaatattgttgctagaaatataaaatatttgtttcaaatatattttgtgcttccagaatattgttgctgaaaatatatttatgaacaat 30445342  T
Q  250 aaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatatt 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  30445343 aaatatatttttgtaccatatgaaggaagatttgatgcaaatatattttaaaaaggaatatt 30445404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 400 - 511
Target Start/End: Original strand, 10584106 - 10584212
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||| |||||||||||     |||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  10584106 ttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg-----aaacaaaggtttataaaagcaacaacaaaactagagtttgtatag 10584200  T
Q  500 agtttgtctctt 511  Q
    ||||||||||||    
T  10584201 agtttgtctctt 10584212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 400 - 556
Target Start/End: Original strand, 15346371 - 15346515
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||        |   |||||||||||||||||     
T  15346371 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaccaagggtttaga--------attcaaactagggtttgtataa 15346462  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca 556  Q
    | |||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||    
T  15346463 aatttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaaca 15346515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Original strand, 30443022 - 30443097
Alignment:
Q  155 tgactcaaaattt--gatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgct 228  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  30443022 tgactcaaaatttatgatggatgaagaatattgttgttaaaaatataagagatttgtttcaaatatattttttgct 30443097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 647 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 12911531 - 12911426
Alignment:
Q  647 tttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtc-aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 744  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| ||||| |||| |||||||| || ||||||    
T  12911531 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtctgttttggaacgaaccgggtaaacaaatt-ttgtgtgtt 12911433  T
Q  745 ctatctt 751  Q
    |||||||    
T  12911432 ctatctt 12911426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 612 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 25465710 - 25465571
Alignment:
Q  612 cgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat- 709  Q
    |||||||||| |||||||| | | |||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| || | |||| |||| |     
T  25465710 cgggagacttattcttgtacccctttgatatctcttt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctctcccatactatgtcagta 25465612  T
Q  710 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatctt 751  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  25465611 ttggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctctt 25465571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 537 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 25078755 - 25078536
Alignment:
Q  537 ttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaac 632  Q
    ||||||||||| || |||||   |||||||||||||| ||||| |||  ||||||||| |  |||  |||||||||||   || ||||| ||||||||||    
T  25078755 ttgattcaccttggtaaacaccgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgaga-tttaagtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 25078657  T
Q  633 tcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaaca 730  Q
     | |||| ||||||||||||| ||||||| ||| || |||| |||||||| ||||| ||| ||| || |||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  25078656 cctttgatatctcttttgtaaagttactcgtcattacagtggaacggaggactgctttcttccc-agtctaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 25078558  T
Q  731 aattcttttgtgttctatcttct 753  Q
    |||| || |||||||| ||||||    
T  25078557 aatt-ttgtgtgttctctcttct 25078536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 647 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 12937278 - 12937174
Alignment:
Q  647 tttgtaacgttactcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtc-aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 744  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||| ||||| |||| |||||||| || ||||||    
T  12937278 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccc-agactaggtctgttttggaacgaaccgggtaaacaaatt-ttgtgtgtt 12937181  T
Q  745 ctatctt 751  Q
    |||||||    
T  12937180 ctatctt 12937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 666 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 17694918 - 17694846
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  17694918 tatagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 17694846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 311
Target Start/End: Original strand, 30443111 - 30443195
Alignment:
Q  225 tgctgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatatt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| ||||| |||||| ||| | ||||||    
T  30443111 tgctgaaaatatatttatggacaa--aatatatgtttgtaccgtataaaggaagatttgatgcaaatgtatttttaaaagaaatatt 30443195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 666 - 744
Target Start/End: Original strand, 30443537 - 30443616
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 744  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  30443537 tatagtgtaacggagagctgctctctccccgagactaggtaagtattggaccgaactgggtaaacaaatttttgtgtgtt 30443616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 595 - 723
Target Start/End: Original strand, 30445701 - 30445832
Alignment:
Q  595 ctttgggtagaattaggcggga-gactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctc 692  Q
    |||||||||||||||||   || ||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||    
T  30445701 ctttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctc 30445800  T
Q  693 ccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgg 723  Q
    | | | ||||||||| | |||||| |||||||    
T  30445801 caccatactaggtcagtattggactgaactgg 30445832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 5572280 - 5572334
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  5572280 ggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 5572334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 666 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 22342867 - 22342795
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  22342867 tatagtggaacagagagctgctctctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 22342795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 666 - 737
Target Start/End: Original strand, 25941785 - 25941857
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  25941785 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 25941857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 5017508 - 5017562
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  5017508 ggagggttgctctctcccctagattaggtcatatttgaccgaactgggtcaacaa 5017562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 5757517 - 5757571
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5757517 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5757571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 10077204 - 10077258
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  10077204 ggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaa 10077258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 31979571 - 31979517
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  31979571 ggagggctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31979517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 12186403 - 12186330
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagagatagagggggctg-aaacaatggtttagaaa 471  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  12186403 ttttactataaatataaaccttgtatcacatgtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaaa 12186330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 676 - 725
Target Start/End: Original strand, 24436009 - 24436058
Alignment:
Q  676 cggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggt 725  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||    
T  24436009 cggagggctgctctctcccctagagtaggtcatattggatcgaactgggt 24436058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 603132 - 603088
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  603132 tctctccccaagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 603088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 666 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 3577555 - 3577484
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  3577555 tatagtggaacggagagctgctctctcccc-agactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 3577484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 666 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 12166212 - 12166140
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  12166212 tatagtgaagcagagagctgctatctcccctagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 12166140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 33211229 - 33211185
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33211229 tctctcccccagagtaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 33211185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 666 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 35201393 - 35201325
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaat 733  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||    
T  35201393 tatagtggatcggagagctgctctctccccaagactaggtcattattagaccgaactgggtaaacaaat 35201325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 202
Target Start/End: Original strand, 12158532 - 12158575
Alignment:
Q  159 tcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaa 202  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  12158532 tcaaaatttgatgaatgaagaagattgttgctaaaaatataaaa 12158575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 658 - 734
Target Start/End: Original strand, 11262699 - 11262777
Alignment:
Q  658 actcatcat-atagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    ||||||||| ||| || |||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||    
T  11262699 actcatcattatattgtaacggagaactgctctctcccccagactaggtcagtattggaccgaacggggtaaacaaatt 11262777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 21356094 - 21356040
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||| | ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21356094 ggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21356040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 31936645 - 31936591
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  31936645 ggagagctgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 31936591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 666 - 750
Target Start/End: Original strand, 13883590 - 13883674
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatct 750  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||    
T  13883590 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaa-tatcttgtgttctatct 13883674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 474 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 17904619 - 17904566
Alignment:
Q  474 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtt 530  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  17904619 caacaacaaaactagggtttg--tagagttt-tctctttgcaacaaacactaaggtt 17904566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 666 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 25465965 - 25465896
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||   || ||||||||||||| ||||||||    
T  25465965 tatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggccatcattagaccgaactgggtaaacaaatt 25465896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 145 - 695
Target Start/End: Original strand, 1735 - 2293
Alignment:
Q  145 tgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1735 tgttgtagtatgactcaaaatttgaaggaagaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatgg 1834  T
Q  245 acaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaagg 344  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1835 acaataaatatatttttgtatcgtatgaaggaagatttgatgcaaatatattttgaaagggaatattatattttttatgcaaatattctttcactgaagg 1934  T
Q  345 agnnnnnnnnnnnggtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct------ 437  Q
    ||            ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||  ||| || |||| |          
T  1935 agaaaaaaaaaac-gtatcttcagtgtggtattcgttccaaatttataagttatactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagag 2033  T
Q  438 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 537  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||    
T  2034 aaagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggt 2132  T
Q  538 tgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 634  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |    
T  2133 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaaccc 2232  T
Q  635 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2233 attaatttctcttttgtaacgttcctcatcatatagtgaatcggagggctactctctcccc 2293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 404 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 41813 - 41468
Alignment:
Q  404 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 503  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41813 actataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 41714  T
Q  504 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgg 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||| |    
T  41713 tgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttcg 41614  T
Q  601 gtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 700  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  41613 gtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagac 41514  T
Q  701 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41513 taggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 41468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 240; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 3951 - 4298
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3951 ttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata- 4049  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||   |||| ||    
T  4050 agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggact 4149  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4150 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc- 4248  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4249 agactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttct 4298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 235; Significance: 1e-129; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 69629 - 69277
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 495  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||| |||| |    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69629 ttttacaataaatatagaccttatatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 69530  T
Q  496 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattgg 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  69529 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgg 69430  T
Q  593 ggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 692  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  69429 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctc 69331  T
Q  693 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69330 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 69277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 400 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 73361 - 73210
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacct----agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 495  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| || |||| |    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  73361 ttttactataaatatagaccgtgtatcaaaggaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgt 73262  T
Q  496 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 547  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73261 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 73210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 511 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 73210 - 73165
Alignment:
Q  511 ttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca 556  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  73210 ttggaaaaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaaca 73165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 400 - 752
Target Start/End: Original strand, 79813 - 80168
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  79813 ttttactataaatatagtttttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatag 79912  T
Q  500 agtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  79913 agtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattggggc 80012  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80013 tttgggtaga-ttaggcaggagacttattcctgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 80111  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttc 752  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  80112 cagactaggtcaatttggattgaactgggtcaacaaattcttttgtgatctctcttc 80168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 225; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 438 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 14678 - 14376
Alignment:
Q  438 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 537  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14678 agagatagagggggatgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgagggt 14579  T
Q  538 tgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 634  Q
    |||||||||| ||||||||   ||| |||| ||||| ||||||||| ||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  14578 tgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 14479  T
Q  635 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14478 attgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 14379  T
Q  735 ctt 737  Q
    |||    
T  14378 ctt 14376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 400 - 753
Target Start/End: Original strand, 14973 - 15327
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  14973 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaatgatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttataa 15072  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||| |||||||||  ||||||||  | ||    
T  15073 agtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattcagact 15172  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||     
T  15173 ttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtggaacggaaggctgctgtctccccc 15272  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttct 753  Q
    |  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  15273 atgctaggtcaatttggaccgaactgactcaacaaattc--ttgtgttctctcttct 15327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 205; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 6153 - 6502
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  6153 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaataaaactagggtttgtatag 6252  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattg-agtcttttggttacgagaagagattggggc 595  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  6253 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgggac 6352  T
Q  596 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  6353 tttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccc 6451  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
     |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  6452 cagactaggtcagattggaccgaactgagtcaacaaatttctttgtgttct 6502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 200; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 400 - 746
Target Start/End: Original strand, 2834 - 3182
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2834 ttttactataaatatagaacttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 2933  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||   |||| |||||||||| ||||||| | ||||||  | || ||    
T  2934 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggcttggact 3033  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccct 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||     
T  3034 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctatctccccg 3132  T
Q  697 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  3133 agactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaaatattttgtgttct 3182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 438 - 746
Target Start/End: Original strand, 29163 - 29473
Alignment:
Q  438 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 537  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  29163 agagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggt 29262  T
Q  538 tgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactc 634  Q
    |||||| ||| |||| ||   |||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29263 tgattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactc 29362  T
Q  635 attgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    |||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29363 attgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 29461  T
Q  735 cttttgtgttct 746  Q
    | ||||||||||    
T  29462 cgtttgtgttct 29473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 438 - 746
Target Start/End: Original strand, 33 - 344
Alignment:
Q  438 agagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 537  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  33 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggt 132  T
Q  538 tgattcacctcgggaaac---attaagatt-gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaact 633  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||     
T  133 tgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacc 232  T
Q  634 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 733  Q
    ||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  233 cattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaat 331  T
Q  734 tcttttgtgttct 746  Q
    |  ||||||||||    
T  332 ttctttgtgttct 344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 169; Significance: 3e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 400 - 758
Target Start/End: Original strand, 85185 - 85546
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||| |||||||| | ||  ||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  85185 ttttactataaatataggctttgtatcaaagtaaaccttgagatagaagagga-gaaacaaggatttaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtatag 85283  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacattaa---gattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    |||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  85284 agtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaaaacactactaggattgagtcttttggttacgagaagagattgtgact 85383  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccc 695  Q
    ||| ||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  85384 ttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttcgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctcccc 85483  T
Q  696 tagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
     |||||||||||||||| || ||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  85484 cagactaggtcaatttgaactgaaccaggtaaacaaattcttttgtgttctctcttcttttct 85546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 151; Significance: 2e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 288 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 2080 - 1638
Alignment:
Q  288 aaatatattttgaaagggaatattatatttttgatgcaaatgttctttcactgaaggagnnnnnnnnnnngg----tatcttcagtgtagtattcgttcc 383  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||           |     ||||||||| ||  ||| | ||||    
T  2080 aaatatattttgaaagagaatattatatttttgatgcaaatattctttcactgaaggagaaaaaaaaaaggaaacctatcttcagcgtgatatccattcc 1981  T
Q  384 aaatttatgatttatattttactataaatatagaccttgaatcaga-gtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaa 482  Q
    ||||||| || ||| ||||  || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||| ||    
T  1980 aaatttacgagttacattt--ctctaaatatagaccttgtatcagatgtaaacctagagatagaggtggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaa 1884  T
Q  483 aactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttac 579  Q
    ||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||| | ||||| ||    
T  1883 aactagggtttgtatagagtttc---------aacaaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaacacaattaggattgagtttcttggtcac 1795  T
Q  580 gagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacgg 678  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||     
T  1794 gggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgt 1695  T
Q  679 agggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1694 agggctgctctctcccccatactaggtcagtttttgaccgaactgggtaaacaaatt 1638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 150 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 2180 - 2070
Alignment:
Q  150 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2180 tagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaat 2081  T
Q  250 aaatatatttt 260  Q
    |||||||||||    
T  2080 aaatatatttt 2070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 151; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 513 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 1673 - 1438
Alignment:
Q  513 ggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaatta 609  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||    
T  1673 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 1574  T
Q  610 ggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat 709  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1573 ggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat 1475  T
Q  710 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1474 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 144; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 379 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 16174 - 15817
Alignment:
Q  379 gttccaaatttatgatttata-ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaac 477  Q
    |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||    
T  16174 gttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaa-gtcaac 16076  T
Q  478 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttg 574  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| |   ||| |||||||||| |||    
T  16075 aagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttg 15979  T
Q  575 gttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtga 673  Q
    || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||     
T  15978 gtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattagagtgg 15879  T
Q  674 aacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    |||||||| ||||||||| |||  |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  15878 aacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaatt 15817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 127; Significance: 4e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 400 - 621
Target Start/End: Original strand, 35594 - 35817
Alignment:
Q  400 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 499  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||  | |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35594 ttttactataaatatagacattgtatcagtacaaaccgggtgatagaggcg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 35692  T
Q  500 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac---attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggct 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   |||| |||| ||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  35693 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagaggctgggact 35792  T
Q  597 ttgggtagaattaggcgggagactt 621  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  35793 ttgggtagaattaggcgggagactt 35817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 666 - 758
Target Start/End: Original strand, 35817 - 35909
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctatcttctcttct 758  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  35817 tatagtggaacggagggctgctctcttccttagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattattttgtgttctctcttcttttct 35909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 399 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 16982 - 16646
Alignment:
Q  399 attttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaa-caatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 497  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16982 attttaatataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctgaaaacaagggttt-gaaagacaaca-caaaactagggtttgtat 16885  T
Q  498 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaaca---ttaagattgagtcttttggttacgagaagagattgggg 594  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||||||  |||||||   ||| |||||||||  ||||| ||| |||||||||| |     
T  16884 agagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttaggaaacactattaggattgagtcacttggtgacgggaagagattgaga 16788  T
Q  595 ctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcc 693  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||  |||| |  |||||||    
T  16787 ctttgggtagaattaggccagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgggacaaagggtttatctctcc 16688  T
Q  694 cctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaatt 734  Q
    || |||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16687 cccagaccaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 16646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 110; Significance: 5e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 565 - 746
Target Start/End: Original strand, 22239 - 22418
Alignment:
Q  565 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 664  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  22239 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagactatt-cttgtaactcattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 22336  T
Q  665 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22337 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 22418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 565 - 746
Target Start/End: Original strand, 24514 - 24693
Alignment:
Q  565 gagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc 664  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  24514 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagactatt-cttgtaactcattgatttctcttt-gtaacgttactcatc 24611  T
Q  665 atatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 746  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24612 aaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 24693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 8458 - 8512
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8458 ggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 8512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 359 - 725
Target Start/End: Original strand, 4727 - 5095
Alignment:
Q  359 gtatcttcagtgtagtattcgttccaaatttatgatttatattttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaac 458  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  4727 gtatcttcagtgtgatattcgtttcaaatttatgagttatatttctctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggtctgaaaa 4826  T
Q  459 aatgg-tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaac-- 555  Q
    || || ||||| |||  | |||| |||||||||||| ||||| |||| |||||  | |||||||||||| | |||| | ||||||||  | |||||||      
T  4827 aaaggatttag-aagtaagcaac-aaactagggtttatatagcgttt-tctctcagcaacaaacactagag-ttga-gtttgattcatgttgggaaacac 4921  T
Q  556 -attaagattgagtcttttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctc-ttttgtaa 653  Q
     |||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  4922 tattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagcttttggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctctttttgtaa 5021  T
Q  654 cgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaat-ttggaccgaactgggt 725  Q
     | ||||||||| ||||||| |||  ||  ||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  5022 agatactcatcattatagtggaacatagaactgctctctgccccagactaggtcagtattggaccgaattgggt 5095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 151 - 293
Target Start/End: Original strand, 4552 - 4694
Alignment:
Q  151 agtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatttatggacaata 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4552 agtataactcaaaatttgatggatgaagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcgaatatatttcgtgctgaaaatatatttatggacaata 4651  T
Q  251 aatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatat 293  Q
     |||||||||||||| |||||||| |  ||||||| |||||||    
T  4652 tatatatttttgtactgtatgaaggacaatttgatgcaaatat 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 92; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 144 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 96 - 1
Alignment:
Q  144 atgttatagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatt 239  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  96 atgttgtagtatgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtgctgaaaatatatt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 693 - 743
Target Start/End: Complemental strand, 1489 - 1439
Alignment:
Q  693 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1489 ccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 1439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 404 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 1161 - 1013
Alignment:
Q  404 actataaatatagaccttgaatcagagtaaacctagagatagagggggctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 503  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1161 actataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 1062  T
Q  504 tgtctc-----tttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 547  Q
    ||||||     |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||    
T  1061 tgtctctttagtttggaacaaacactacgtttggagggttgatccacct 1013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 677 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 4733 - 4666
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 744  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4733 ggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgtt 4666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 228 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 57905 - 57836
Alignment:
Q  228 tgaaaatatatttatggacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaatgatttgatacaaatatatttt 298  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  57905 tgaaaatatatgtatgaacaataaatatatttttgtaccgtatgaagaa-aatttgatgcaaatatatttt 57836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 623 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 57537 - 57452
Alignment:
Q  623 ttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca 707  Q
    |||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||||||| | |||| || ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  57537 ttcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcattaatataatggaacagagagctgctctctcccccagactaggtca 57452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 57995 - 57926
Alignment:
Q  155 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatattttgtg 226  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||  |||| |||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  57995 tgactcaaaatttgatggatgatgaat--tgtttctaaaagtataaaagatttgttttatatattttttgtg 57926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 679 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 5739 - 5687
Alignment:
Q  679 agggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5739 agggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 2550 - 2496
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  2550 ggagggctgctgtctcccccagattaggtcatattggagcgaactgggtcaacaa 2496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0533 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0533
Description:

Target: scaffold0533; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2273 - 2232
Alignment:
Q  182 attgttgctaaaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 223  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2273 attgttgcagaaaatataaaagatttgtttcaaatatatttt 2232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 682 - 731
Target Start/End: Original strand, 36876 - 36925
Alignment:
Q  682 gctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36876 gctgctctcttccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 36925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 677 - 731
Target Start/End: Original strand, 44000 - 44054
Alignment:
Q  677 ggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  44000 ggagagctgctctctcccccagaatagatcatattggaccgaactgggtcaacaa 44054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 666 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 17052 - 16980
Alignment:
Q  666 tatagtgaaacggagggctgctctctcccctagactaggtca-atttggaccgaactgggtcaacaaattctt 737  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| |||||||||||    
T  17052 tatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaactgggtaaacaaattctt 16980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 20459 - 20415
Alignment:
Q  687 tctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 731  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20459 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 20415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0474 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0474
Description:

Target: scaffold0474; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 205
Target Start/End: Original strand, 10443 - 10493
Alignment:
Q  155 tgactcaaaatttgatggatggagaatattgttgctaaaaatataaaagat 205  Q
    ||||||||||||||||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||    
T  10443 tgactcaaaatttgatggataaaaaagattgttgttaaaaatataaaagat 10493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University