View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1415_high_1 (Length: 583)

Name: NF1415_high_1
Description: NF1415
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1415_high_1
NF1415_high_1
[»] chr3 (48 HSPs)
chr3 (134-567)||(6421635-6422068)
chr3 (134-567)||(6432075-6432508)
chr3 (135-567)||(16335743-16336175)
chr3 (135-567)||(10012529-10012960)
chr3 (134-567)||(25432193-25432625)
chr3 (134-567)||(12289-12722)
chr3 (135-567)||(20491389-20491820)
chr3 (152-567)||(55478345-55478759)
chr3 (134-567)||(4024694-4025125)
chr3 (134-368)||(8982656-8982890)
chr3 (133-368)||(1685815-1686050)
chr3 (135-368)||(8972074-8972307)
chr3 (135-361)||(12804794-12805020)
chr3 (377-567)||(8972423-8972612)
chr3 (377-567)||(8982978-8983167)
chr3 (377-567)||(9536712-9536901)
chr3 (377-567)||(9547038-9547227)
chr3 (377-567)||(1685553-1685742)
chr3 (381-567)||(5655928-5656113)
chr3 (377-567)||(4370954-4371143)
chr3 (377-567)||(4380673-4380862)
chr3 (135-348)||(4783540-4783754)
chr3 (135-348)||(2490119-2490333)
chr3 (134-348)||(4380084-4380299)
chr3 (135-348)||(4370339-4370553)
chr3 (134-348)||(51979290-51979503)
chr3 (134-348)||(9536235-9536450)
chr3 (134-348)||(9546657-9546872)
chr3 (135-299)||(17732229-17732393)
chr3 (135-348)||(18560251-18560466)
chr3 (135-299)||(19033460-19033624)
chr3 (134-348)||(19828803-19829018)
chr3 (135-348)||(5656411-5656625)
chr3 (135-348)||(13120498-13120712)
chr3 (135-348)||(20292463-20292677)
chr3 (135-348)||(20745592-20745806)
chr3 (134-348)||(13113369-13113585)
chr3 (135-299)||(49387932-49388096)
chr3 (135-348)||(24762868-24763082)
chr3 (134-299)||(24873836-24874001)
chr3 (134-299)||(24792776-24792941)
chr3 (356-559)||(10508468-10508668)
chr3 (180-279)||(11459426-11459524)
chr3 (135-282)||(11044776-11044924)
chr3 (136-296)||(21542838-21542998)
chr3 (137-174)||(12375926-12375963)
chr3 (459-523)||(19828594-19828659)
chr3 (531-559)||(24873577-24873605)
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (134-567)||(24922295-24922728)
chr6 (135-567)||(24931331-24931763)
chr6 (133-567)||(14790935-14791369)
chr6 (134-567)||(3285179-3285611)
chr6 (135-567)||(29539792-29540223)
chr6 (135-567)||(20911635-20912048)
chr6 (135-368)||(26425888-26426121)
chr6 (134-567)||(27787863-27788294)
chr6 (134-368)||(12454295-12454529)
chr6 (135-393)||(23777803-23778061)
chr6 (135-368)||(18159061-18159294)
chr6 (134-368)||(31366530-31366764)
chr6 (137-368)||(31356805-31357036)
chr6 (134-382)||(18200605-18200853)
chr6 (134-368)||(18168878-18169106)
chr6 (377-567)||(12454630-12454819)
chr6 (377-567)||(16897523-16897712)
chr6 (377-567)||(16908176-16908365)
chr6 (135-307)||(20926083-20926255)
chr6 (377-567)||(18159638-18159827)
chr6 (377-567)||(18169450-18169639)
chr6 (377-567)||(31357137-31357326)
chr6 (377-567)||(31366865-31367054)
chr6 (134-348)||(16907660-16907875)
chr6 (134-348)||(16897007-16897222)
chr6 (134-348)||(1595763-1595978)
chr6 (135-348)||(12991086-12991301)
chr6 (134-348)||(26021714-26021929)
chr6 (132-279)||(7756036-7756184)
chr6 (135-325)||(17823419-17823609)
chr6 (135-348)||(24505938-24506152)
chr6 (134-348)||(30658673-30658887)
chr6 (134-300)||(18712766-18712933)
chr6 (135-325)||(16320618-16320808)
chr6 (457-567)||(18200873-18200983)
chr6 (134-299)||(34764655-34764820)
chr6 (135-348)||(16922896-16923110)
chr6 (143-279)||(24370897-24371033)
chr6 (134-300)||(26161231-26161391)
chr6 (135-299)||(8563801-8563965)
chr6 (137-299)||(24692168-24692330)
chr6 (473-567)||(14044986-14045080)
chr6 (158-300)||(9762040-9762182)
chr6 (181-348)||(791762-791924)
chr6 (213-300)||(26019101-26019188)
chr6 (459-523)||(26021465-26021530)
chr6 (454-502)||(16923220-16923267)
chr6 (444-484)||(17823733-17823773)
chr6 (454-502)||(30658516-30658563)
[»] chr7 (70 HSPs)
chr7 (135-567)||(9545819-9546251)
chr7 (134-567)||(9535536-9535969)
chr7 (134-567)||(32097713-32098146)
chr7 (134-567)||(32108150-32108583)
chr7 (134-567)||(42620512-42620945)
chr7 (133-567)||(14943643-14944073)
chr7 (133-567)||(15371236-15371666)
chr7 (153-464)||(22964652-22964962)
chr7 (134-368)||(16132556-16132790)
chr7 (134-368)||(46496225-46496459)
chr7 (134-368)||(46506837-46507071)
chr7 (135-368)||(16143120-16143353)
chr7 (134-567)||(2992211-2992643)
chr7 (134-567)||(14248836-14249268)
chr7 (377-567)||(5382111-5382300)
chr7 (377-567)||(5391749-5391938)
chr7 (377-567)||(5926712-5926901)
chr7 (377-567)||(6544382-6544571)
chr7 (377-567)||(8500626-8500815)
chr7 (377-567)||(8511096-8511285)
chr7 (377-567)||(43983054-43983243)
chr7 (377-567)||(46496691-46496880)
chr7 (377-567)||(46507303-46507492)
chr7 (379-567)||(26348445-26348632)
chr7 (379-567)||(26363480-26363667)
chr7 (377-567)||(6534083-6534272)
chr7 (377-567)||(44896894-44897083)
chr7 (377-567)||(44907297-44907486)
chr7 (377-567)||(11626660-11626848)
chr7 (377-567)||(16132210-16132399)
chr7 (377-567)||(16142759-16142948)
chr7 (134-348)||(6543965-6544180)
chr7 (135-348)||(5926016-5926230)
chr7 (135-348)||(6533667-6533881)
chr7 (134-351)||(5382500-5382718)
chr7 (135-351)||(5392154-5392371)
chr7 (135-351)||(26363901-26364118)
chr7 (134-351)||(26348881-26349099)
chr7 (134-348)||(24541408-24541623)
chr7 (134-348)||(43982434-43982649)
chr7 (134-351)||(11627150-11627368)
chr7 (135-263)||(19799035-19799164)
chr7 (134-348)||(8510535-8510750)
chr7 (135-348)||(8500066-8500280)
chr7 (185-557)||(9006291-9006661)
chr7 (135-348)||(27987822-27988037)
chr7 (134-348)||(44906856-44907071)
chr7 (135-348)||(44896506-44896720)
chr7 (137-317)||(14114628-14114808)
chr7 (137-317)||(14424278-14424458)
chr7 (135-348)||(19585084-19585298)
chr7 (134-299)||(31824048-31824213)
chr7 (134-261)||(25441479-25441606)
chr7 (134-279)||(10414788-10414933)
chr7 (135-254)||(45552530-45552650)
chr7 (135-299)||(5616073-5616237)
chr7 (134-347)||(12769448-12769663)
chr7 (135-299)||(41026870-41027034)
chr7 (156-299)||(13286360-13286503)
chr7 (135-299)||(12827937-12828098)
chr7 (134-299)||(42594681-42594846)
chr7 (134-299)||(33090511-33090675)
chr7 (134-300)||(40701275-40701442)
chr7 (213-285)||(17220204-17220276)
chr7 (445-504)||(12769740-12769799)
chr7 (459-559)||(19585410-19585510)
chr7 (459-523)||(19799368-19799433)
chr7 (459-523)||(24541183-24541248)
chr7 (459-504)||(27988149-27988194)
chr7 (459-523)||(45552831-45552896)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (134-567)||(19678-20110)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (134-567)||(310321-310753)
scaffold0005 (135-567)||(215950-216373)
[»] chr2 (53 HSPs)
chr2 (135-567)||(45014066-45014498)
chr2 (135-567)||(38958031-38958463)
chr2 (134-567)||(38930695-38931128)
chr2 (135-567)||(17488024-17488456)
chr2 (135-567)||(24696798-24697229)
chr2 (134-567)||(45024142-45024575)
chr2 (134-501)||(44639277-44639643)
chr2 (133-368)||(2999200-2999435)
chr2 (135-330)||(29131521-29131716)
chr2 (377-567)||(2998910-2999099)
chr2 (377-567)||(5337348-5337537)
chr2 (377-567)||(5347201-5347390)
chr2 (377-567)||(18650795-18650984)
chr2 (377-567)||(18662913-18663102)
chr2 (377-567)||(4457772-4457961)
chr2 (377-567)||(4467397-4467586)
chr2 (377-567)||(9502974-9503163)
chr2 (377-567)||(9514340-9514529)
chr2 (134-348)||(9503518-9503733)
chr2 (134-348)||(9514884-9515099)
chr2 (160-416)||(24239591-24239852)
chr2 (135-416)||(15940024-15940311)
chr2 (130-348)||(32937933-32938152)
chr2 (134-351)||(18660679-18660897)
chr2 (133-348)||(5347795-5348011)
chr2 (134-348)||(5337899-5338114)
chr2 (134-348)||(22688205-22688420)
chr2 (133-334)||(16934825-16935027)
chr2 (133-334)||(17005485-17005687)
chr2 (134-325)||(4457219-4457410)
chr2 (134-325)||(4466844-4467035)
chr2 (134-348)||(18662420-18662635)
chr2 (134-325)||(4456155-4456346)
chr2 (135-299)||(15479323-15479487)
chr2 (135-348)||(573568-573782)
chr2 (134-300)||(12569892-12570059)
chr2 (135-300)||(3606492-3606657)
chr2 (135-348)||(18650351-18650565)
chr2 (232-557)||(72439-72743)
chr2 (134-299)||(22909363-22909528)
chr2 (134-261)||(27160547-27160674)
chr2 (134-261)||(27170916-27171043)
chr2 (137-299)||(22901414-22901576)
chr2 (135-244)||(45190096-45190205)
chr2 (134-299)||(23721267-23721432)
chr2 (156-234)||(28460989-28461067)
chr2 (213-348)||(45190235-45190371)
chr2 (144-300)||(40409606-40409761)
chr2 (135-299)||(19341624-19341785)
chr2 (319-410)||(28460903-28460990)
chr2 (180-299)||(16135701-16135820)
chr2 (134-210)||(18495835-18495911)
chr2 (457-504)||(24239516-24239564)
[»] chr5 (61 HSPs)
chr5 (135-567)||(27411482-27411914)
chr5 (134-567)||(32069773-32070206)
chr5 (134-368)||(26192704-26192938)
chr5 (135-368)||(26203264-26203497)
chr5 (134-368)||(11411665-11411899)
chr5 (135-377)||(22240346-22240588)
chr5 (137-559)||(23378886-23379311)
chr5 (377-567)||(18360854-18361043)
chr5 (377-567)||(18389811-18390000)
chr5 (377-567)||(21753020-21753209)
chr5 (377-567)||(21762307-21762496)
chr5 (377-567)||(33938894-33939083)
chr5 (377-567)||(33949294-33949483)
chr5 (377-567)||(8765660-8765849)
chr5 (377-567)||(26192296-26192485)
chr5 (377-567)||(26202900-26203089)
chr5 (377-564)||(11411406-11411592)
chr5 (134-348)||(33948807-33949021)
chr5 (135-348)||(33938408-33938621)
chr5 (134-348)||(8766230-8766445)
chr5 (373-567)||(22244287-22244480)
chr5 (134-351)||(18389405-18389623)
chr5 (135-348)||(22174035-22174249)
chr5 (135-351)||(18360406-18360623)
chr5 (135-316)||(20905301-20905481)
chr5 (134-348)||(21680846-21681061)
chr5 (134-348)||(31916119-31916334)
chr5 (135-348)||(27274914-27275128)
chr5 (134-348)||(18210608-18210823)
chr5 (134-348)||(20763667-20763882)
chr5 (134-348)||(21761797-21762012)
chr5 (135-348)||(21752375-21752589)
chr5 (135-348)||(37549354-37549568)
chr5 (135-348)||(37652152-37652366)
chr5 (134-348)||(30944579-30944794)
chr5 (134-325)||(37816886-37817077)
chr5 (135-348)||(4038713-4038927)
chr5 (135-348)||(13572445-13572659)
chr5 (135-348)||(18219958-18220172)
chr5 (135-348)||(19889075-19889289)
chr5 (135-348)||(30954001-30954215)
chr5 (135-348)||(20896260-20896473)
chr5 (135-348)||(37299564-37299778)
chr5 (227-561)||(31104835-31105172)
chr5 (135-348)||(42091253-42091469)
chr5 (134-299)||(20957508-20957673)
chr5 (135-299)||(20947120-20947284)
chr5 (199-325)||(206236-206362)
chr5 (133-260)||(34131268-34131396)
chr5 (376-567)||(21484329-21484518)
chr5 (135-299)||(19549047-19549212)
chr5 (457-557)||(20896585-20896684)
chr5 (457-555)||(20905058-20905155)
chr5 (133-202)||(15240546-15240615)
chr5 (133-175)||(15240712-15240754)
chr5 (459-523)||(13572236-13572301)
chr5 (459-523)||(30944342-30944407)
chr5 (459-523)||(30953764-30953829)
chr5 (459-523)||(37299371-37299436)
chr5 (459-523)||(37549161-37549226)
chr5 (531-559)||(19548788-19548816)
[»] chr1 (54 HSPs)
chr1 (132-567)||(25018800-25019234)
chr1 (134-567)||(16154216-16154649)
chr1 (133-567)||(2115332-2115766)
chr1 (135-567)||(30549900-30550332)
chr1 (134-567)||(42033525-42033957)
chr1 (153-567)||(21885666-21886079)
chr1 (135-567)||(8539585-8540017)
chr1 (135-567)||(8604824-8605256)
chr1 (134-567)||(13964230-13964661)
chr1 (135-483)||(22406646-22406994)
chr1 (134-567)||(2370702-2371134)
chr1 (135-567)||(1968679-1969103)
chr1 (137-567)||(41544435-41544846)
chr1 (218-567)||(18382780-18383127)
chr1 (134-368)||(21457870-21458104)
chr1 (135-567)||(1186714-1187144)
chr1 (377-567)||(21458205-21458394)
chr1 (134-559)||(34822356-34822783)
chr1 (135-334)||(22960214-22960413)
chr1 (135-348)||(21782030-21782243)
chr1 (135-325)||(21821997-21822186)
chr1 (134-348)||(20328905-20329120)
chr1 (135-348)||(25867587-25867800)
chr1 (135-348)||(26193965-26194179)
chr1 (135-348)||(27065408-27065622)
chr1 (135-348)||(18097459-18097672)
chr1 (134-303)||(20311620-20311790)
chr1 (134-300)||(37011345-37011511)
chr1 (135-348)||(20308142-20308356)
chr1 (256-567)||(18062515-18062829)
chr1 (134-325)||(12418170-12418361)
chr1 (134-299)||(1975282-1975447)
chr1 (134-299)||(1982648-1982813)
chr1 (135-299)||(1990066-1990230)
chr1 (359-567)||(22956116-22956322)
chr1 (135-244)||(4950355-4950464)
chr1 (134-222)||(18381418-18381506)
chr1 (137-293)||(50940496-50940651)
chr1 (181-299)||(41207882-41208000)
chr1 (134-270)||(2371533-2371669)
chr1 (135-300)||(30209518-30209683)
chr1 (457-557)||(21782346-21782445)
chr1 (181-416)||(25823892-25824128)
chr1 (134-211)||(20585212-20585289)
chr1 (457-555)||(21821764-21821861)
chr1 (180-293)||(2653041-2653154)
chr1 (234-348)||(49332764-49332878)
chr1 (181-285)||(13404219-13404321)
chr1 (459-559)||(22960527-22960626)
chr1 (456-492)||(18097324-18097360)
chr1 (459-513)||(26193811-26193865)
chr1 (457-502)||(25823832-25823877)
chr1 (191-294)||(19869174-19869275)
chr1 (454-502)||(49332977-49333024)
[»] chr4 (70 HSPs)
chr4 (134-567)||(17985167-17985600)
chr4 (135-567)||(16252746-16253178)
chr4 (134-567)||(52498464-52498897)
chr4 (134-567)||(15668521-15668953)
chr4 (134-567)||(26330559-26330991)
chr4 (135-567)||(17160573-17161004)
chr4 (135-368)||(40921027-40921260)
chr4 (156-567)||(9836362-9836752)
chr4 (133-360)||(18106016-18106243)
chr4 (134-567)||(6406125-6406556)
chr4 (135-567)||(13403339-13403751)
chr4 (134-510)||(1292686-1293065)
chr4 (377-567)||(21845680-21845869)
chr4 (377-567)||(21855272-21855461)
chr4 (377-567)||(21901543-21901732)
chr4 (377-567)||(21911135-21911324)
chr4 (377-567)||(40921420-40921609)
chr4 (377-567)||(18105718-18105908)
chr4 (377-567)||(5293391-5293580)
chr4 (377-567)||(5303050-5303239)
chr4 (377-567)||(6691795-6691984)
chr4 (377-567)||(6702201-6702390)
chr4 (377-567)||(27681054-27681243)
chr4 (377-567)||(27690709-27690898)
chr4 (134-348)||(16248385-16248600)
chr4 (377-567)||(3487925-3488114)
chr4 (377-567)||(3497248-3497437)
chr4 (377-567)||(16249023-16249212)
chr4 (135-356)||(11476422-11476644)
chr4 (134-348)||(6691316-6691531)
chr4 (134-348)||(6701722-6701937)
chr4 (134-348)||(3488446-3488661)
chr4 (135-348)||(7847290-7847504)
chr4 (134-325)||(44888075-44888265)
chr4 (135-325)||(16471979-16472168)
chr4 (134-348)||(5293954-5294169)
chr4 (435-567)||(16241695-16241827)
chr4 (134-348)||(21845294-21845509)
chr4 (134-348)||(21854723-21854938)
chr4 (134-348)||(21901157-21901372)
chr4 (134-348)||(21910586-21910801)
chr4 (134-348)||(27681616-27681831)
chr4 (134-348)||(27691227-27691442)
chr4 (135-348)||(3497713-3497927)
chr4 (135-348)||(5303568-5303782)
chr4 (133-348)||(17838484-17838700)
chr4 (134-325)||(2828879-2829070)
chr4 (134-348)||(17829093-17829308)
chr4 (135-348)||(12865667-12865881)
chr4 (135-567)||(14601005-14601428)
chr4 (135-348)||(16628840-16629055)
chr4 (135-348)||(3606559-3606773)
chr4 (134-299)||(522795-522960)
chr4 (134-371)||(4417027-4417271)
chr4 (135-299)||(26457675-26457839)
chr4 (135-299)||(17421899-17422062)
chr4 (65-137)||(27567058-27567130)
chr4 (75-137)||(27422200-27422263)
chr4 (135-199)||(16241630-16241695)
chr4 (232-348)||(16211708-16211824)
chr4 (75-137)||(27414552-27414615)
chr4 (65-132)||(27419339-27419406)
chr4 (454-502)||(53946667-53946714)
chr4 (459-514)||(7847122-7847177)
chr4 (262-348)||(53946823-53946909)
chr4 (459-523)||(17828856-17828921)
chr4 (459-523)||(17838247-17838312)
chr4 (65-106)||(27571452-27571493)
chr4 (535-567)||(13793362-13793394)
chr4 (454-502)||(44888386-44888433)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (134-567)||(75020-75453)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (134-567)||(7703-8136)
[»] scaffold0690 (1 HSPs)
scaffold0690 (134-567)||(4513-4946)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (135-567)||(791070-791502)
chr8 (135-567)||(17268176-17268607)
chr8 (136-567)||(7757106-7757529)
chr8 (134-368)||(21988511-21988745)
chr8 (135-368)||(21998029-21998262)
chr8 (134-547)||(20098148-20098559)
chr8 (134-567)||(2690584-2691022)
chr8 (135-335)||(25034631-25034831)
chr8 (129-306)||(21446758-21446935)
chr8 (377-567)||(9325329-9325518)
chr8 (377-567)||(21203107-21203296)
chr8 (377-567)||(21213523-21213712)
chr8 (377-567)||(21333875-21334064)
chr8 (377-567)||(21988233-21988422)
chr8 (377-567)||(21997767-21997956)
chr8 (134-348)||(9325775-9325990)
chr8 (134-348)||(21203608-21203823)
chr8 (135-348)||(21214024-21214238)
chr8 (134-348)||(21333276-21333491)
chr8 (134-348)||(14894646-14894861)
chr8 (134-348)||(20531856-20532071)
chr8 (134-348)||(14882280-14882495)
chr8 (135-348)||(32008333-32008547)
chr8 (137-348)||(5758713-5758925)
chr8 (135-348)||(13673490-13673704)
chr8 (134-348)||(31991965-31992180)
chr8 (135-348)||(33774656-33774870)
chr8 (135-279)||(3967328-3967473)
chr8 (134-325)||(25506809-25506999)
chr8 (132-415)||(5867840-5868123)
chr8 (135-299)||(26362918-26363082)
chr8 (137-300)||(12842073-12842235)
chr8 (135-279)||(14436701-14436845)
chr8 (134-316)||(20707481-20707662)
chr8 (135-299)||(37295289-37295453)
chr8 (459-523)||(13673888-13673953)
chr8 (459-523)||(14882047-14882112)
chr8 (459-523)||(14894397-14894462)
chr8 (531-559)||(5867693-5867721)
chr8 (531-559)||(26362679-26362707)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (134-567)||(93155-93588)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (135-563)||(15183-15610)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (135-368)||(52300-52533)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (134-368)||(87298-87534)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (135-368)||(12709-12942)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (134-561)||(29068-29498)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (137-559)||(13154-13579)
[»] scaffold0014 (6 HSPs)
scaffold0014 (377-567)||(234291-234480)
scaffold0014 (134-348)||(234930-235145)
scaffold0014 (135-348)||(115046-115260)
scaffold0014 (134-371)||(167451-167688)
scaffold0014 (134-300)||(146033-146202)
scaffold0014 (134-325)||(154063-154254)
[»] scaffold0254 (2 HSPs)
scaffold0254 (377-567)||(8145-8334)
scaffold0254 (134-348)||(8598-8813)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (135-559)||(65023-65444)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (135-265)||(132327-132457)
scaffold0004 (145-300)||(242249-242404)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (133-279)||(22116-22263)
[»] scaffold0015 (2 HSPs)
scaffold0015 (135-567)||(198994-199415)
scaffold0015 (135-175)||(188941-188981)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (431-567)||(56126-56262)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (134-348)||(112314-112529)
scaffold0031 (134-244)||(103163-103273)
[»] scaffold0265 (2 HSPs)
scaffold0265 (135-325)||(10623-10812)
scaffold0265 (457-555)||(10948-11045)
[»] scaffold1705 (2 HSPs)
scaffold1705 (368-513)||(417-561)
scaffold1705 (180-325)||(16-161)
[»] scaffold0590 (1 HSPs)
scaffold0590 (134-348)||(9604-9819)
[»] scaffold0553 (1 HSPs)
scaffold0553 (134-348)||(1389-1605)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (134-348)||(33390-33605)
[»] scaffold0234 (3 HSPs)
scaffold0234 (412-567)||(21458-21612)
scaffold0234 (139-265)||(22915-23041)
scaffold0234 (266-318)||(21621-21673)
[»] scaffold0058 (4 HSPs)
scaffold0058 (135-348)||(58815-59029)
scaffold0058 (135-348)||(57697-57911)
scaffold0058 (135-325)||(67082-67272)
scaffold0058 (134-334)||(24338-24539)
[»] scaffold0809 (1 HSPs)
scaffold0809 (137-348)||(204-416)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (135-348)||(12407-12621)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (137-300)||(53957-54121)
scaffold0018 (137-300)||(57909-58073)
[»] scaffold1411 (1 HSPs)
scaffold1411 (134-348)||(159-375)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (138-299)||(267494-267655)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (135-348)||(18069-18283)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (135-342)||(22694-22903)
[»] scaffold0764 (1 HSPs)
scaffold0764 (134-299)||(1377-1542)
[»] scaffold0313 (2 HSPs)
scaffold0313 (134-299)||(5067-5232)
scaffold0313 (134-299)||(19224-19389)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (134-297)||(41171-41335)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (137-279)||(13870-14012)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (256-511)||(1186-1431)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (135-235)||(396616-396716)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (498-567)||(17589-17658)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (134-207)||(13951-14024)
[»] scaffold0406 (1 HSPs)
scaffold0406 (445-557)||(15025-15136)
[»] scaffold0756 (1 HSPs)
scaffold0756 (134-175)||(4014-4055)
[»] scaffold1468 (2 HSPs)
scaffold1468 (234-348)||(745-859)
scaffold1468 (454-502)||(958-1005)
[»] scaffold0713 (1 HSPs)
scaffold0713 (213-284)||(5580-5651)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 410; Significance: 0; HSPs: 48)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 134 - 567
Target Start/End: Original strand, 6421635 - 6422068
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6421635 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 6421734  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6421735 ttgagtgttttactaagataggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaatgt 6421834  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6421835 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatg 6421934  T
Q  434 caaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 533  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6421935 caagacacatgtgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 6422034  T
Q  534 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6422035 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 6422068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 134 - 567
Target Start/End: Original strand, 6432075 - 6432508
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  6432075 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaatttcttggtattcagcttgtgctc 6432174  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6432175 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaatgt 6432274  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6432275 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatg 6432374  T
Q  434 caaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 533  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6432375 caaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 6432474  T
Q  534 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6432475 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 6432508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 135 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 16336175 - 16335743
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16336175 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctat 16336076  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16336075 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaatgtt 16335976  T
Q  335 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16335975 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgc 16335876  T
Q  435 aaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattca 534  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16335875 aaggcacatgtgacatgggtatatgtcctggaaagtacatttgcatgaatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattca 16335776  T
Q  535 atgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16335775 atgttcatttaagactatgaacattgatgtact 16335743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 135 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 10012960 - 10012529
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10012960 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtactct 10012861  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  10012860 tgagtgttttactaagacaggaacaatgtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagtt 10012761  T
Q  335 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgc 434  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10012760 agatcagaatgttgcttgaagatcagaatgttcaagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatc-aaggtcatgc 10012662  T
Q  435 aaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattca 534  Q
    | | ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10012661 acgacacatgtgacatgtgaatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatatcaaagaaggcattca 10012562  T
Q  535 atgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10012561 atgttcatttaagactatgaacattgatgtact 10012529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 134 - 567
Target Start/End: Original strand, 25432193 - 25432625
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25432193 ttgttgaggcaaaatcccaaattaattttaaagataataaacaaatatgattatagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 25432292  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  25432293 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagt 25432392  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatg 433  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25432393 tagatcagaatgttgctcgaatatcagaatgttcaagcatagatcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactttgatc-aaggtcatg 25432491  T
Q  434 caaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 533  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  || |    
T  25432492 caatgcacatgtgacatggatatatgtccaggaaagtacatttgcatggattaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaatgatatcc 25432591  T
Q  534 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25432592 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 25432625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 134 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 12722 - 12289
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccat-aattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 232  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12722 ttgttgaggcaaaatcccttaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 12623  T
Q  233 cttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatg 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |    
T  12622 cttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaaaaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactaaggtcaaaaag 12523  T
Q  333 ttagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcat 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12522 ttagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagcagagatcagaatgttgttcttatacaagccgagagtctcaagaactttgatc-aagatcat 12424  T
Q  433 gcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcatt 532  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12423 gcaagacacatgtgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaacaaataaaagcatatacaaggattatgtcaaagaaggtatt 12324  T
Q  533 caatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12323 caatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 12289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 135 - 567
Target Start/End: Original strand, 20491389 - 20491820
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20491389 tgttgagacaaaatccgtaattaattttaaagataatgaaccaatatgattaaagaattaatgggctttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 20491488  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  20491489 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaataaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagtt 20491588  T
Q  335 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgc 434  Q
    |||||||||||||||||  | || |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20491589 agatcagaatgttgctcttatattagaatgttcaagcatagattagaaggttgttcttatataagccaagaatctcaagaactttgatc-aaggtcatgc 20491687  T
Q  435 aaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattca 534  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  | |||    
T  20491688 aaggcacatgtgacatggatatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatctagcaataaaagcatatacaaggattatgtcaaaaaggatactca 20491787  T
Q  535 atgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20491788 atgttcatttaagactatgaacattgatgtact 20491820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 152 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 55478759 - 55478345
Alignment:
Q  152 taattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttgagtgttttactaaga 251  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55478759 taattaattttaaagataataaaccaatatgattagagaattaatggactttgattaatttcttggtatttaacttgtgctattgagtgttttactaaga 55478660  T
Q  252 caggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgttagatcagaatgttgctc 351  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55478659 cgggaacaaggtttaaatcataccaagattcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagttagatcagaatgttgctc 55478560  T
Q  352 gaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatg 451  Q
    ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  55478559 gaatatcagaatgttcaagcatagatcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactttgatc-aaggtcatgcaaggcacatgtgacatg 55478461  T
Q  452 ggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagacta 551  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  55478460 gatatatgtccaggaaagtacttttgcatggatcaatcaagcaataaagacatatacaaagattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagacta 55478361  T
Q  552 tgaacattgatgtact 567  Q
    |||| |||||| ||||    
T  55478360 tgaatattgatatact 55478345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 134 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 4025125 - 4024694
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4025125 ttgttgaggcaatatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattcattggtatttaacttctgctc 4025026  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  4025025 ttgagtgttttactaagactggaacaatgtttaaatcataccaagaatcaagaaattaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtc-gaaagt 4024927  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  4024926 tagatcagaatgttgctcgaagatcataatgttcaagcagagatcagaaggttgttcttatacaaaacaagaatctcaagaacattgatc-aagttcatg 4024828  T
Q  434 caaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 533  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |  | ||    
T  4024827 caaggcacatgtgacattgatatatgttcaggaaagtagatttacatggatcaatcaagcaataaaggcatatgcaaggattatgtcaaaaaggatactc 4024728  T
Q  534 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4024727 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 4024694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 134 - 368
Target Start/End: Original strand, 8982656 - 8982890
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8982656 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 8982755  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  8982756 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagt 8982855  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8982856 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 8982890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 133 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 1686050 - 1685815
Alignment:
Q  133 cttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 232  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1686050 cttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 1685951  T
Q  233 cttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatg 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  1685950 cttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaag 1685851  T
Q  333 ttagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1685850 ttagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 1685815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 135 - 368
Target Start/End: Original strand, 8972074 - 8972307
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8972074 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 8972173  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  8972174 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagtt 8972273  T
Q  335 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8972274 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 8972307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 135 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 12805020 - 12804794
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12805020 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 12804921  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  12804920 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagtt 12804821  T
Q  335 agatcagaatgttgctcgaagatcaga 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12804820 agatcagaatgttgctcgaagatcaga 12804794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 8972423 - 8972612
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8972423 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 8972521  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8972522 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 8972612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 8982978 - 8983167
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8982978 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 8983076  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8983077 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 8983167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 9536712 - 9536901
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9536712 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 9536810  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9536811 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 9536901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 9547038 - 9547227
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9547038 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 9547136  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9547137 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 9547227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 1685742 - 1685553
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1685742 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatcgcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 1685644  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1685643 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 1685553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 381 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 5656113 - 5655928
Alignment:
Q  381 aaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcat 480  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  5656113 aaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttgcat 5656015  T
Q  481 ggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5656014 ggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 5655928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 4370954 - 4371143
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  4370954 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacactt 4371052  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4371053 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatatccaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 4371143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 4380673 - 4380862
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  4380673 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacactt 4380771  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4380772 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatatccaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 4380862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4783754 - 4783540
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4783754 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 4783655  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||| |||||| |    
T  4783654 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaactctgaagttcagaaag 4783556  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  4783555 ttagttcagaatgttg 4783540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2490333 - 2490119
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2490333 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 2490234  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| |||||| |    
T  2490233 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaag 2490135  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  2490134 ttagttcagaatgttg 2490119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Original strand, 4380084 - 4380299
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4380084 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 4380183  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  |||||||||||| ||||||| ||||| ||||  |||||| ||||||     
T  4380184 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggac-tttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaa 4380282  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
     |||| |||||||||||    
T  4380283 attagttcagaatgttg 4380299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Original strand, 4370339 - 4370553
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4370339 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 4370438  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  |||||||||||| ||||||| ||||| ||||  |||||| ||||||      
T  4370439 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggac-tttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaaa 4370537  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  4370538 ttagttcagaatgttg 4370553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 51979503 - 51979290
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51979503 ttgttgatgcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttgatatttaacttgtgctc 51979404  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| |||||| |    
T  51979403 ttgaatgttttactaagacaggaacaatgtttaaataataccaagatacaag-aatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaag 51979306  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||||||||||||||    
T  51979305 ttagatcagaatgttg 51979290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Original strand, 9536235 - 9536450
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9536235 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 9536334  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  || ||| ||||||     
T  9536335 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctaaagttcagaaa 9536433  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  9536434 gttagttcagaatgttg 9536450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Original strand, 9546657 - 9546872
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9546657 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 9546756  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  || ||| ||||||     
T  9546757 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctaaagttcagaaa 9546855  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  9546856 gttagttcagaatgttg 9546872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 135 - 299
Target Start/End: Original strand, 17732229 - 17732393
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |   |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  17732229 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataacaaatattgatgattaaggaattaatggactttgtttaatttgttggtatttaacttgtgctct 17732328  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  17732329 tgagtgtttaactaagacaggaacaaggtttaattcataccaagaaataagaaatcaaaggacat 17732393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Original strand, 18560251 - 18560466
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgatt-aattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18560251 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaaattccttggtatttaacttgtgctc 18560350  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||     
T  18560351 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaa 18560449  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  18560450 gttagttcagaatgttg 18560466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 135 - 299
Target Start/End: Original strand, 19033460 - 19033624
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |   |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  19033460 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataacaaatattgatgattaaggaattaatggactttgtttaatttgttggtatttaacttgtgctct 19033559  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19033560 tgagtgtttaactaagacaggaacaaggtttaattcataccaagaaataagaaatcaaaggacat 19033624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19829018 - 19828803
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19829018 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 19828919  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  || ||| ||||||     
T  19828918 ttaagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctaaagttcagaaa 19828820  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  19828819 gttagttcagaatgttg 19828803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 5656625 - 5656411
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5656625 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 5656526  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  || ||| |||||| |    
T  5656525 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctaaagttcagaaag 5656427  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  5656426 ttagttcagaatgttg 5656411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 13120712 - 13120498
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13120712 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggattttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 13120613  T
Q  235 tgagtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| |||||| |    
T  13120612 tgagtgtttttactaagacaagaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaag 13120514  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  13120513 ttagttcagaatgttg 13120498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Original strand, 20292463 - 20292677
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20292463 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatagactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 20292562  T
Q  235 tgagtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||| || |    
T  20292563 tgagtgtttttactaagacaggaacaaggtttgaatcatactaagatgcatgaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcaaaaag 20292661  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  20292662 ttagttcagaatgttg 20292677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 20745806 - 20745592
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20745806 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttcattaattccttggtatttaacttgtgatct 20745707  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| |||||| |    
T  20745706 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaag 20745608  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  20745607 ttagttcagaatgttg 20745592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 13113585 - 13113369
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13113585 ttgttgaggataaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggattttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 13113486  T
Q  234 ttga-gtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaa 330  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||    
T  13113485 ttgaggtgtttttactaagacaagaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaa 13113387  T
Q  331 tgttagatcagaatgttg 348  Q
     ||||| | |||||||||    
T  13113386 agttagttaagaatgttg 13113369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 135 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 49388096 - 49387932
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  49388096 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 49387997  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    |||||| || |||||||||||||||||  | || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  49387996 tgagtggttaactaagacaggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 49387932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Original strand, 24762868 - 24763082
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  24762868 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatgaactttgattaattctttggtatttaacttgcgcttt 24762967  T
Q  235 tgagtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    ||| || ||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||| ||||   ||||| |||||| |    
T  24762968 tgaatgtttttactcagacagaaacaatgtttgaatcataccaagatgcatgaaatcaaaggaca-ttgaattcatgaactaattttgaagttcagaaag 24763066  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    || | |||||||||||    
T  24763067 ttcgttcagaatgttg 24763082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24874001 - 24873836
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   ||| | ||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24874001 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataacaaacctttattaatagggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 24873902  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| || || | |||||||||  |||  |||||||||||||    
T  24873901 ttgagtggttaactaagacaggaacaagtttcaatttataccaagatacaaagaatcaaaggacat 24873836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 134 - 299
Target Start/End: Original strand, 24792776 - 24792941
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||   |||||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24792776 ttgttgatgcgaaatccctaattaattttaaagataacaaacattgatgattaaggaattaatgaaatttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 24792875  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||| || || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  24792876 ttgagtggttaactaagacagaaacaagtttcaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 24792941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 356 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 10508668 - 10508468
Alignment:
Q  356 atcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggta 455  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| | |||||||| || |||||  | ||| |||| ||||  |||||||  ||    
T  10508668 atcataatgttcaagcagagttcagaaggttgtctttacacaagccaagagtttcaagaacatt-atcaagag-cattcaagtcacacgtgacatgaata 10508571  T
Q  456 tatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaa 555  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| | |||||||| | |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  10508570 aatgtccagaaaagtacattttcatggatcaatcaagcaatgaagacatttacaaggttaatgtcaaaaaggatattcaatgttca-ttaagactatgaa 10508472  T
Q  556 catt 559  Q
    ||||    
T  10508471 catt 10508468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 180 - 279
Target Start/End: Original strand, 11459426 - 11459524
Alignment:
Q  180 atgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaaga 279  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  11459426 atgattaaggaattaatggactttgattaatttcttgatatttaacttgtgct-ttgagtgtttaagtaagagaggaacaatgtttaaatcatatcaaga 11459524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 11044924 - 11044776
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaa-gaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    |||||||||||||| | | || |||||||| ||||| |||||   ||||||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||| ||| ||||| ||    
T  11044924 tgttgaggcaaaattcctgatgaattttaaggataacaaacattgatgattaaaagaattaatgaattttgattagtttcttggtatctaatttgtgttc 11044825  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatc 282  Q
    |||||||||| ||||| |||  ||||| || ||||||| ||||||||||    
T  11044824 ttgagtgtttaactaaaacataaacaaagtataaatcaaaccaagaatc 11044776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 21542998 - 21542838
Alignment:
Q  136 gttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctctt 235  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||||    |||||||||| ||||||| ||||| |||| || |   |||||||| ||||  ||||    
T  21542998 gttgaggcaaaatcattaattactttttaagataacaaaccttgatgattaaaggattaatgaactttaattagtttcactgtatttaatttgtattctt 21542899  T
Q  236 gagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaagga 296  Q
    |||||||| |||||||||  ||||| || |||||||| ||||||| |||| ||| ||||||    
T  21542898 gagtgtttaactaagacataaacaaagtataaatcattccaagaagcaagcaattaaagga 21542838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 174
Target Start/End: Original strand, 12375926 - 12375963
Alignment:
Q  137 ttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaa 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12375926 ttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaa 12375963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 459 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 19828659 - 19828594
Alignment:
Q  459 gtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaa 523  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  19828659 gtccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaa 19828594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 24873605 - 24873577
Alignment:
Q  531 ttcaatgttcatttaagactatgaacatt 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24873605 ttcaatgttcatttaagactatgaacatt 24873577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 402; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 134 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 24922728 - 24922295
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24922728 ttgttgagacaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 24922629  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24922628 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaatgt 24922529  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24922528 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggacatg 24922429  T
Q  434 caaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 533  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24922428 caaggcacatgtgacatagatatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 24922329  T
Q  534 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24922328 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 24922295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 135 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 24931763 - 24931331
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24931763 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 24931664  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24931663 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaatgtt 24931564  T
Q  335 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24931563 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaatagtctcaagaactttgatcaaaggacatgc 24931464  T
Q  435 aaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattca 534  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24931463 aaggcacatgtgacatagatatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattca 24931364  T
Q  535 atgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24931363 atgttcatttaagactatgaacattgatgtact 24931331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 391; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 133 - 567
Target Start/End: Original strand, 14790935 - 14791369
Alignment:
Q  133 cttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 232  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14790935 cttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 14791034  T
Q  233 cttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatg 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  14791035 cttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttagatcatgccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgatttcatgatctaacactgaggtcagaaag 14791134  T
Q  333 ttagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcat 432  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14791135 ttagatcagaatgttgcttgaagatcagaatgttcaagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcat 14791234  T
Q  433 gcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcatt 532  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14791235 gcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcatt 14791334  T
Q  533 caatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14791335 caatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 14791369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 134 - 567
Target Start/End: Original strand, 3285179 - 3285611
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3285179 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaactccttgttatttaacttgtgctc 3285278  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3285279 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttatatcataccaataatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaatgt 3285378  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagct--gagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  3285379 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgtt---gctcgaagatcagaaggttgttcttaaaaaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaagtca 3285475  T
Q  432 tgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcat 531  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3285476 tgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagaaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggaat 3285575  T
Q  532 tcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3285576 tcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 3285611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 135 - 567
Target Start/End: Original strand, 29539792 - 29540223
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29539792 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaatcaatatgattaaagaattaatgagctttgattaattacttggtatttaacttgtgctct 29539891  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  29539892 tgagtgttatactaagacaggaacaaagtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagtt 29539991  T
Q  335 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgc 434  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29539992 agatcagaatcttgctcgaagatcagaatgttcaagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactttgatc-aaggtcatgc 29540090  T
Q  435 aaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattca 534  Q
    || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |  |||||    
T  29540091 aaagcacatgtgacatggatatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaagacatatacaagaattatgtcaaaaaggatattca 29540190  T
Q  535 atgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29540191 atgttcatttaagactatgaacattgatgtact 29540223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 135 - 567
Target Start/End: Original strand, 20911635 - 20912048
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20911635 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 20911734  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  20911735 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttagatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaatttatgatctaacactgaggtcagaaagtt 20911834  T
Q  335 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgc 434  Q
    ||||||                   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20911835 agatca-------------------gaatgttcaagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgc 20911915  T
Q  435 aaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattca 534  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20911916 aaggcacatgtgacatgggtatatgtccagaagagtacatttgcatgaatcaatcaagcaataaaggcatatacaagggttatgtcaaagaaggcattca 20912015  T
Q  535 atgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20912016 atgttcatttaagactatgaacattgatgtact 20912048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 135 - 368
Target Start/End: Original strand, 26425888 - 26426121
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26425888 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 26425987  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  26425988 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagtt 26426087  T
Q  335 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26426088 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 26426121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 134 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 27788294 - 27787863
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27788294 ttgttgaggtaaaatccctaaataattttaaagataataaacctttatgattaaagaattaatggattttgattaatttcttggtatttaacttgtgctc 27788195  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| || ||    
T  27788194 ttgagtgtttaactaagacatgaacaatgtttaaatcataccaagatacaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaactctgagttcataaagt 27788095  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatg 433  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||  |||||||||| || ||| ||||||   ||| || |||||| || ||| |||  ||||    
T  27788094 tagatcagaatgttgctcaaagattagaatgttcaagaagatttcagaaggttattattatacaagctcggaaacttaagaacatt-atc-aagagcatg 27787997  T
Q  434 caaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 533  Q
    ||||||||| ||||||||  || |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| | |  ||||    
T  27787996 caaggcacacatgacatgaataaatgttcaggaaagtacacttgtatggatcaatcaagcaataaaggcatttacaaggttaatgtcaaaaaggatattc 27787897  T
Q  534 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27787896 aatgttcatttaagactatgaacattgaagtact 27787863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 134 - 368
Target Start/End: Original strand, 12454295 - 12454529
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12454295 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 12454394  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  12454395 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagt 12454494  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12454495 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 12454529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 135 - 393
Target Start/End: Original strand, 23777803 - 23778061
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23777803 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 23777902  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  23777903 tgagtgttttactaagacaggaacaagttttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattaatgatctaacactgaggtcagaaagtt 23778002  T
Q  335 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttctta 393  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23778003 agatcacaacgttgcttgaagatcagaatgttcaagcagagatcagaaggttgttctta 23778061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 135 - 368
Target Start/End: Original strand, 18159061 - 18159294
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18159061 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattacttggtatttaacttgtgctct 18159160  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  18159161 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagtt 18159260  T
Q  335 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18159261 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 18159294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 134 - 368
Target Start/End: Original strand, 31366530 - 31366764
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31366530 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgcta 31366629  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  31366630 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaagggcatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagt 31366729  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31366730 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 31366764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 137 - 368
Target Start/End: Original strand, 31356805 - 31357036
Alignment:
Q  137 ttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttg 236  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31356805 ttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctattg 31356904  T
Q  237 agtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgttag 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  31356905 agtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaagggcatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagttag 31357004  T
Q  337 atcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31357005 atcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 31357036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 134 - 382
Target Start/End: Original strand, 18200605 - 18200853
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  18200605 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattagagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgtta 18200704  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18200705 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcatgaattcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagt 18200804  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaa 382  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  18200805 tagatcagaatgttgctcaaagattagaatgttcaagcaaagatcagaa 18200853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 134 - 368
Target Start/End: Original strand, 18168878 - 18169106
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18168878 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattacttggtatttaacttgtgctc 18168977  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||      | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18168978 ttgagtgttttactaagacaggaac------tgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagt 18169071  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18169072 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 18169106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 12454630 - 12454819
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12454630 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 12454728  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12454729 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 12454819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 16897523 - 16897712
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16897523 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 16897621  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16897622 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 16897712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 16908176 - 16908365
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16908176 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 16908274  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16908275 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 16908365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 135 - 307
Target Start/End: Original strand, 20926083 - 20926255
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  20926083 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggaatttgattaatacattggtatttaacttgtgctct 20926182  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattc 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20926183 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttagatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattc 20926255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 18159638 - 18159827
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18159638 tcagaaggttattcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 18159736  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18159737 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaatactatgaacattgatgtact 18159827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 18169450 - 18169639
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18169450 tcagaaggttattcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 18169548  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18169549 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaatactatgaacattgatgtact 18169639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 31357137 - 31357326
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  31357137 tcagaaggtagttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacataaatatatgtccaggaaagtacattt 31357235  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31357236 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 31357326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 31366865 - 31367054
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  31366865 tcagaaggtagttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacataaatatatgtccaggaaagtacattt 31366963  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31366964 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 31367054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Original strand, 16907660 - 16907875
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16907660 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 16907759  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  || ||| ||||||     
T  16907760 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctaaagttcagaaa 16907858  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  16907859 gttagttcagaatgttg 16907875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Original strand, 16897007 - 16897222
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16897007 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattcattggtatttaacttgtgctc 16897106  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  || ||| ||||||     
T  16897107 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctaaagttcagaaa 16897205  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  16897206 gttagttcagaatgttg 16897222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Original strand, 1595763 - 1595978
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1595763 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 1595862  T
Q  234 ttgagtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||     
T  1595863 ttgagtgtttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaa 1595961  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  1595962 gttagttcagaatgttg 1595978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 12991301 - 12991086
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaa-atatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12991301 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 12991202  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||     
T  12991201 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaactctgaagttcagaaa 12991103  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  12991102 gttagttcagaatgttg 12991086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 26021929 - 26021714
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26021929 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattcattccttggtatttaacttgtgctc 26021830  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||     
T  26021829 ttgagtgttttcactaagataggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaactctgaagttcagaaa 26021731  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  26021730 gttagttcagaatgttg 26021714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 132 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 7756184 - 7756036
Alignment:
Q  132 acttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgc 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7756184 acttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattgaagattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgc 7756085  T
Q  232 tcttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaaga 279  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7756084 tcttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaaga 7756036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 135 - 325
Target Start/End: Original strand, 17823419 - 17823609
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17823419 tgttgaggcaaaacccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 17823518  T
Q  235 tgagtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagt 325  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||||    
T  17823519 tgagtgtttttactacgacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcatgaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagt 17823609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 24506152 - 24505938
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24506152 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttgatatttaacttgtgctct 24506053  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| | ||  |||||| |||||| |    
T  24506052 tgagtgttttcactatgacaggaacaaggtttgaatcatactaagatacataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaaccaattctgaagttcagaaag 24505954  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  24505953 ttagttcagaatgttg 24505938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30658887 - 30658673
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     |||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30658887 ttgttgaggcaaaattcctaattaattttaaagataataaaatttaatgattaaggattaaagggactttgattaattccttggtatttaatttgtgctc 30658788  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| |||||| |    
T  30658787 ttgagtgttttactaagacagaaacaaggtttgaataataccaagatacatgaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaag 30658689  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||| ||||    
T  30658688 ttagttcagaaagttg 30658673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 134 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18712933 - 18712766
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    || ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18712933 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaattattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaagttgtgctc 18712834  T
Q  234 ttgagtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatt 300  Q
    |||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  18712833 ttgaatgtttttactaaggcaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcatgaaatcaaaggacatt 18712766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 135 - 325
Target Start/End: Original strand, 16320618 - 16320808
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    |||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  16320618 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataacctttaatgattaaggattaaatggactttgattaattcctttgtatttagctggtgctct 16320717  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagt 325  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||||    
T  16320718 tgaatgtttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcattaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagt 16320808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 457 - 567
Target Start/End: Original strand, 18200873 - 18200983
Alignment:
Q  457 atgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaac 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  || |||||||||||||||||||||||     
T  18200873 atgtccaggaaagtacatttgcatggatcaataaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatatccaatgttcatttaagactatgaag 18200972  T
Q  557 attgatgtact 567  Q
    |||||||||||    
T  18200973 attgatgtact 18200983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 299
Target Start/End: Original strand, 34764655 - 34764820
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34764655 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 34764754  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  | || |||||| ||||  |||  |||||||||||||    
T  34764755 ttgagtggttaactaagacaggaacaagtgtaaattcatacgaagatacaaagaatcaaaggacat 34764820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Original strand, 16922896 - 16923110
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||     |||||||| || | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16922896 tgttgaggcaacatccctaattaattttaaagataataaattttaatgattaaggattaaatggactttgattaagtccttagtatttaacttgtgctct 16922995  T
Q  235 tgag-tgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    | || | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| || ||| ||||| ||||  |||||| |||||| |    
T  16922996 taagtttttttactaagatagaaacaaggtttaaatcataccaagatacatgaaatcaaatgaca-ttaaatccatgaactaattctgaagttcagaaag 16923094  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||| ||||    
T  16923095 ttagttcagaaagttg 16923110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 143 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 24371033 - 24370897
Alignment:
Q  143 caaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttgagtgtt 242  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24371033 caaaatccctaattaattttaaaaataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttgagtggt 24370934  T
Q  243 ttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaaga 279  Q
    | ||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  24370933 taactaagacaggaacaagtttcaattcataccaaga 24370897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 134 - 300
Target Start/End: Original strand, 26161231 - 26161391
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| ||     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26161231 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaagga-----tgaactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 26161325  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatt 300  Q
      ||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  26161326 --gagtgtttttactaagacagaaaaaaggtttgaatcataccaagatgcatgaaatcaaaggacatt 26161391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 135 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 8563965 - 8563801
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||    |||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8563965 tgttgaggccaaatccctaattaattttaaagttaacaaaccttgatgattaaggaagtaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 8563866  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||| || || | |||||||||  |||  |||||||||||||    
T  8563865 tgagtggttaactaagacaggaaaaagtttcaatttataccaagatacaaagaatcaaaggacat 8563801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 137 - 299
Target Start/End: Original strand, 24692168 - 24692330
Alignment:
Q  137 ttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttg 236  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||| | | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24692168 ttgaggcaaaattcctaattaattttaaagataacaaaccttaatgattaaggaattaacgaaatttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttg 24692267  T
Q  237 agtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    |||| || ||||||||| ||||||| || || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  24692268 agtggttaactaagacatgaacaagtttcaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 24692330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 473 - 567
Target Start/End: Original strand, 14044986 - 14045080
Alignment:
Q  473 atttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044986 atttgcatcgatcaatcaagcaataaagacatatataagaattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 14045080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 9762182 - 9762040
Alignment:
Q  158 attttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttgagtgttttactaagacaggaa 257  Q
    ||||||||||||| ||||    |||||||||  |||||||||||||||||| ||  |||||||||||  |||| |||||| || || |||||||||| ||    
T  9762182 attttaaagataacaaactttgatgattaaaagattaatggactttgattagtttattggtatttaatatgtgttcttgattgattaactaagacagaaa 9762083  T
Q  258 caaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatt 300  Q
    ||  || ||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||    
T  9762082 catagtataaatcaaaccaagaagcaagcaatcaaagaacatt 9762040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 791924 - 791762
Alignment:
Q  181 tgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaa 280  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  | | ||||||||||    || | ||||||||| || || ||||||  |||||||||||||| || ||||||     
T  791924 tgattaaaggattaatggactttgat--agttcttggtatttg---tgcgttcttgagtgattaaccaagacacaaacaaggtttaaataatcccaagat 791830  T
Q  281 tcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatgttagatcagaatgttg 348  Q
     |||||||||||| || | |||||| ||||| ||||  |||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  791829 acaagaaatcaaaagata-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaagttagttcagaatgttg 791762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 300
Target Start/End: Original strand, 26019101 - 26019188
Alignment:
Q  213 cttggtatttaacttgtgctcttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatt 300  Q
    ||||||||||||| | || |||| |||| || ||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||    
T  26019101 cttggtatttaacatatgttcttaagtgattaactcagacatgaacaaggtataaatcaaaccaagattcaagtgatcaaagaacatt 26019188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 459 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 26021530 - 26021465
Alignment:
Q  459 gtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaa 523  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  26021530 gtccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaa 26021465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 454 - 502
Target Start/End: Original strand, 16923220 - 16923267
Alignment:
Q  454 tatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggc 502  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  16923220 tatatgtccaggaaagtacaattgcatggatgtatc-agcaataaaggc 16923267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 444 - 484
Target Start/End: Original strand, 17823733 - 17823773
Alignment:
Q  444 atgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggat 484  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17823733 atgacataagtatatgtccaggaaagtacaattgcatggat 17823773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 454 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 30658563 - 30658516
Alignment:
Q  454 tatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggc 502  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  30658563 tatatgtccaggaaagtacaattgcatggatgtatc-agcaataaaggc 30658516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 393; Significance: 0; HSPs: 70)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 135 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 9546251 - 9545819
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9546251 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 9546152  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  9546151 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagtt 9546052  T
Q  335 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgc 434  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9546051 agatcagaatgttgcttgaagatcagaatgttcaagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgc 9545952  T
Q  435 aaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattca 534  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9545951 aaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagaaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattca 9545852  T
Q  535 atgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9545851 ttgttcatttaagactatgaacattgatgtact 9545819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 134 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 9535969 - 9535536
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9535969 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattctttggtatttaacttgtgctc 9535870  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  9535869 ttgagtgttttactaagacaggaacaatgtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagt 9535770  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatg 433  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  9535769 tagatcagaatgttgcttgaagatcagaatgttcaagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaatagtctcaagaactttgatcaaaggtcatg 9535670  T
Q  434 caaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 533  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9535669 caaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 9535570  T
Q  534 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9535569 attgttcatttaagactatgaacattgatgtact 9535536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 134 - 567
Target Start/End: Original strand, 32097713 - 32098146
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32097713 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 32097812  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  32097813 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgatttcatgatctaacactgaggtcagaaagt 32097912  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatg 433  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32097913 tagatcacaacgttgcttgaagatcagaatgttcaagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatg 32098012  T
Q  434 caaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 533  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32098013 caaggcacatgtgacatgggtatacgtccagaagagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagggttatgtcaaagaaggcattc 32098112  T
Q  534 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32098113 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 32098146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 134 - 567
Target Start/End: Original strand, 32108150 - 32108583
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32108150 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 32108249  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  32108250 ttgagtgttttactaagacagaaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgatttcatgatctaacactgaggtcagaaagt 32108349  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatg 433  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32108350 tagatcacaacgttgcttgaagatcagaatgttcaagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatg 32108449  T
Q  434 caaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 533  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32108450 caaggcacatgtgacatgggtatacgtccagaagagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagggttatgtcaaagaaggcattc 32108549  T
Q  534 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32108550 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 32108583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 134 - 567
Target Start/End: Original strand, 42620512 - 42620945
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccat-aattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 232  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  42620512 ttgttgaggcaaaatcccttaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattctttggtatttaatctgtgct 42620611  T
Q  233 cttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatg 332  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  42620612 cttaagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaag 42620711  T
Q  333 ttagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcat 432  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  42620712 ttagatcagaatgttgctagaagatcagaatgttcaagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagagtctcaagaactttgatc-aagatcat 42620810  T
Q  433 gcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcatt 532  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||    
T  42620811 gcaaggcacatgtgacatgagaatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatataaaaggattatgtaaaaaaagaaatt 42620910  T
Q  533 caatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||    
T  42620911 caatgttcatataagaatataaacattaatgtact 42620945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 133 - 567
Target Start/End: Original strand, 14943643 - 14944073
Alignment:
Q  133 cttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 232  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14943643 cttgttgaggcaaaatcgctaattaattttaaagataatagaccgatatgattaaagaattaatggactttgattatttcctttgtatttaacttgtgct 14943742  T
Q  233 cttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatg 332  Q
    |||||||||| || |||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||| |    
T  14943743 cttgagtgttatagtaagacaggaa---ggtttaaatcatactaagaatcaagaaattaaaggacatttcaattcatgatcgaacattgaggtcagaaag 14943839  T
Q  333 ttagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcat 432  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  14943840 atagatcagaatgttgctcagagatcagaatgttcaagcagagatcggaaggtttttcctatacaggccaagaatctcaagaacattgatc-aaggtcat 14943938  T
Q  433 gcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcatt 532  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |    
T  14943939 gcaaggcacatgtgacatggatatctgtccaggaaagtacatttgcatggatcaattaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatact 14944038  T
Q  533 caatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14944039 caatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 14944073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 133 - 567
Target Start/End: Original strand, 15371236 - 15371666
Alignment:
Q  133 cttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 232  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15371236 cttgttgaggcaaaatcgctaattaattttaaagataatagaccgatatgattaaagaattaatggactttgattatttcctttgtatttaacttgtgct 15371335  T
Q  233 cttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatg 332  Q
    |||||||||| || |||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||| |    
T  15371336 cttgagtgttatagtaagacaggaa---ggtttaaatcatactaagaatcaagaaattaaaggacatttcaattcatgatcgaacattgaggtcagaaag 15371432  T
Q  333 ttagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcat 432  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  15371433 atagatcagaatgttgctcagagatcagaatgttcaagcagagatcggaaggtttttcctatacaggccaagaatctcaagaacattgatc-aaggtcat 15371531  T
Q  433 gcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcatt 532  Q
    ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |    
T  15371532 gcaaggcacatgtgacatgtatatttgtccaggaaagtacatttgcatggatcaattaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatact 15371631  T
Q  533 caatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15371632 caatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 15371666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 153 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 22964962 - 22964652
Alignment:
Q  153 aattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttgagtgttttactaagac 252  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22964962 aattaattttaaagataataaatcaatatgattagaaaattaatggactttgattaattctttggtatttaacttgtgctcttgagtgttttacttagac 22964863  T
Q  253 aggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgttagatcagaatgttgctcg 352  Q
    || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22964862 agaaacaaagtttaaatcatagcaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagttagatcagaatgttgctcg 22964763  T
Q  353 aagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgg 452  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22964762 aagatcagaatgttcaagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagagtctcaagaactttgatc-aagatcatgcaaggcacatgtgacatgg 22964664  T
Q  453 gtatatgtccag 464  Q
    ||||||||||||    
T  22964663 gtatatgtccag 22964652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 134 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 16132790 - 16132556
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16132790 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 16132691  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16132690 ttgagtgttttattaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagt 16132591  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16132590 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 16132556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 134 - 368
Target Start/End: Original strand, 46496225 - 46496459
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46496225 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 46496324  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  46496325 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactaaggtcagaaagt 46496424  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46496425 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 46496459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 134 - 368
Target Start/End: Original strand, 46506837 - 46507071
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46506837 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 46506936  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  46506937 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactaaggtcagaaagt 46507036  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46507037 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 46507071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 135 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 16143353 - 16143120
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16143353 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 16143254  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  16143253 tgagtgttttattaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagtt 16143154  T
Q  335 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16143153 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 16143120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 134 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 2992643 - 2992211
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  2992643 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacctttatgattaaagaattaatggactttgattaatttcttggtagttaacttgttctc 2992544  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||| ||    
T  2992543 ttgagggtttaactaagacagaaacatgtttcaaatcatatcaagattcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgaactaactatgaggtcagaaagt 2992444  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatg 433  Q
    ||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| | |||| ||||||||| || |||||  || |||    
T  2992443 tagttcagaatgttgcgcagagatcagaatgttcaagcagagttcagaatgttgttcttatacaagtccagaaactcaagaacatt-atcaagagt-atg 2992346  T
Q  434 caaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggatt--atgtcaaagaaggcat 531  Q
    |||||||||  |||||||  || |||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||  |||| | |  ||    
T  2992345 caaggcacacgtgacatgaataaatgcgcaggaaagtaaacttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatttacaa-gattaaattgcaaaaaggatat 2992247  T
Q  532 tcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  2992246 tcaatgttcatttaagactatagacattgaagtact 2992211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 134 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 14249268 - 14248836
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||   |||| |||||||||||||| ||| ||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  14249268 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttgaagataatgaacctttatgcttaaagaattaatgaactatgattaatgtctcggtatttaacttgtgctc 14249169  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||  |||| | ||    
T  14249168 ttgagtgtttaactaagaaaggaacaaagattaaatcattccaagatacaagaaatcaaaggatatttgaattcatgaactatctctgagttcaggaagt 14249069  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatg 433  Q
    ||| |||||||||||||   |||| ||||||||||||| ||| |||||||| | |||||| | ||||| |||| ||||||||| |||||| ||| |||||    
T  14249068 tagttcagaatgttgctaagagataagaatgttcaagcagagttcagaaggctattcttatataagcccagaaactcaagaacattgatc-aagatcatg 14248970  T
Q  434 caaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 533  Q
    |||||||||  ||| ||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| | |  | ||    
T  14248969 caaggcacacgtgaaattaataaatgtccaagaaagtacatttgcatggatcaatcaagaaataaaggcatatacaagatttatgtcaaaaatgatactc 14248870  T
Q  534 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14248869 aatgttcatttaagactatgaacattgaagtact 14248836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 5382300 - 5382111
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5382300 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 5382202  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5382201 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 5382111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 5391938 - 5391749
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5391938 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 5391840  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5391839 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 5391749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 5926712 - 5926901
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5926712 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 5926810  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5926811 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 5926901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 6544382 - 6544571
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6544382 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 6544480  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6544481 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 6544571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 8500626 - 8500815
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8500626 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 8500724  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8500725 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 8500815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 8511096 - 8511285
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8511096 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 8511194  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8511195 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 8511285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 43983054 - 43983243
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  43983054 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 43983152  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43983153 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 43983243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 46496691 - 46496880
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  46496691 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 46496789  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46496790 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 46496880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 46507303 - 46507492
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  46507303 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 46507401  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46507402 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 46507492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 379 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 26348632 - 26348445
Alignment:
Q  379 agaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgc 478  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  26348632 agaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttgc 26348534  T
Q  479 atggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26348533 atggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 26348445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 379 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 26363667 - 26363480
Alignment:
Q  379 agaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgc 478  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  26363667 agaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacatttgc 26363569  T
Q  479 atggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26363568 atggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 26363480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 6534083 - 6534272
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6534083 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 6534181  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6534182 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactataaacattgatgtact 6534272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 44896894 - 44897083
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  44896894 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtggtcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 44896992  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44896993 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 44897083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 44907297 - 44907486
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  44907297 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtggtcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 44907395  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44907396 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 44907486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 11626848 - 11626660
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11626848 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 11626750  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11626749 gcatg-atcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 11626660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 16132399 - 16132210
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  16132399 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacataaatatatgtccaggaaagtacattt 16132301  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16132300 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgacgtact 16132210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 16142948 - 16142759
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  16142948 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacataaatatatgtccaggaaagtacattt 16142850  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16142849 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgacgtact 16142759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Original strand, 6543965 - 6544180
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6543965 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttgatatttaacttgtgctc 6544064  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  || ||| ||||||     
T  6544065 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctaaagttcagaaa 6544163  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  6544164 gttagttcagaatgttg 6544180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Original strand, 5926016 - 5926230
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5926016 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 5926115  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  || ||| |||||| |    
T  5926116 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcatacaaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctaaagttcagaaag 5926214  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  5926215 ttagttcagaatgttg 5926230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Original strand, 6533667 - 6533881
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6533667 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttgatatttaacttgtgctct 6533766  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  || ||| |||||| |    
T  6533767 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcatacaaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctaaagttcagaaag 6533865  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  6533866 ttagttcagaatgttg 6533881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 134 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 5382718 - 5382500
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5382718 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 5382619  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||     
T  5382618 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaa 5382520  T
Q  332 gttagatcagaatgttgctc 351  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5382519 gttagatcagaatgttgctc 5382500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 135 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 5392371 - 5392154
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5392371 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 5392272  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| |||||| |    
T  5392271 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaag 5392173  T
Q  333 ttagatcagaatgttgctc 351  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5392172 ttagatcagaatgttgctc 5392154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 135 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 26364118 - 26363901
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26364118 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 26364019  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| |||||| |    
T  26364018 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaag 26363920  T
Q  333 ttagatcagaatgttgctc 351  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26363919 ttagatcagaatgttgctc 26363901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 134 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 26349099 - 26348881
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26349099 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 26349000  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||     
T  26348999 ttgagtgttttcactaagacagaaacaaggtctgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaa 26348901  T
Q  332 gttagatcagaatgttgctc 351  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26348900 gttagatcagaatgttgctc 26348881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 24541623 - 24541408
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24541623 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 24541524  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||     
T  24541523 ttgagtgttttcactaagacagaaacaaggtttgaatcttaccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaactctgaagttcagaaa 24541425  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  24541424 gttagttcagaatgttg 24541408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Original strand, 43982434 - 43982649
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43982434 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 43982533  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||     
T  43982534 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaa 43982632  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
     |||| |||||||||||    
T  43982633 attagttcagaatgttg 43982649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 134 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 11627368 - 11627150
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11627368 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 11627269  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||  ||||||||||||| || ||| ||||| ||||  |||||| ||||||     
T  11627268 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttaaatccatgaactaattctgaagttcagaaa 11627170  T
Q  332 gttagatcagaatgttgctc 351  Q
     |||||||||||||||||||    
T  11627169 cttagatcagaatgttgctc 11627150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 135 - 263
Target Start/End: Original strand, 19799035 - 19799164
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19799035 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaaaatgattaaagaataaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 19799134  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggt 263  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19799135 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggt 19799164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Original strand, 8510535 - 8510750
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8510535 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 8510634  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  || ||| ||||||     
T  8510635 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctaaagttcagaaa 8510733  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  8510734 gttagttcagaatgttg 8510750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Original strand, 8500066 - 8500280
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8500066 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 8500165  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  || ||| |||||| |    
T  8500166 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctaaagttcagaaag 8500264  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  8500265 ttagttcagaatgttg 8500280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 185 - 557
Target Start/End: Original strand, 9006291 - 9006661
Alignment:
Q  185 taaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaa 284  Q
    ||||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||||||   ||| | ||||||||| || || ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||  |||    
T  9006291 taaaggattaatgcactttgat--atttcttggtattt---ttgcgttcttgagtgattaacgaagacaaaaacaaagttcaaatcataccaagatacaa 9006385  T
Q  285 gaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgttagatcagaatgttgctcgaa-----gatcagaatgttcaagctgagatca 379  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||||   |||  |||||| ||||| | |||||||||||| ||     ||||||||||||||||| ||| |||    
T  9006386 gaaatcaaaggatatttgaattaatgaactaagtttgagttcagaaagttagtttagaatgttgctcaaaaagttgatcagaatgttcaagcagagttca 9006485  T
Q  380 gaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgca 479  Q
    |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| || ||||| |  ||||||||| ||| ||||||||  || |||||||  |||||||||| |||    
T  9006486 gaagattgttcttataaaagcccagaatctcaagaacatt-atcaa-gaacatgcaaggtacacatgacatgaataaatgtccattaaagtacattggca 9006583  T
Q  480 tggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaaca 557  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||  | |||||||| | |  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  9006584 tggatcaatcaagcaataaaggtatttacaagattaatgtcaaaaaggatattcaatgttcattcaagactatgaaca 9006661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Original strand, 27987822 - 27988037
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaa-atatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   | |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27987822 tgttgaggaaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 27987921  T
Q  234 ttgagtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||     
T  27987922 ttgagtgtttttactaagataggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaa 27988020  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  27988021 gttagttcagaatgttg 27988037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Original strand, 44906856 - 44907071
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44906856 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgttc 44906955  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  || ||| ||||||     
T  44906956 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctaaagttcagaaa 44907054  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  44907055 gttagttcagaatgttg 44907071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Original strand, 44896506 - 44896720
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44896506 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgttct 44896605  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  || ||| |||||| |    
T  44896606 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctaaagttcagaaag 44896704  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  44896705 ttagttcagaatgttg 44896720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14114808 - 14114628
Alignment:
Q  137 ttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttg 236  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14114808 ttgaggcaaaatcgttaattaactttaaagataacaaaccttgatgattaacgaattaatggactttgattaatttcttggtatttaacttgtgctcttg 14114709  T
Q  237 agtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaac 317  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||  ||| || ||||||||||||||| || |||| |||||    
T  14114708 agtgtttaactaagacaggagcaaagtttaagtcataccaagatacaaaaattcaaaggacatttgactttatgaactaac 14114628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 137 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14424458 - 14424278
Alignment:
Q  137 ttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttg 236  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14424458 ttgaggcaaaatcgttaattaactttaaagataacaaaccttgatgattaacgaattaatggactttgattaatttcttggtatttaacttgtgctcttg 14424359  T
Q  237 agtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaac 317  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||  ||| || ||||||||||||||| || |||| |||||    
T  14424358 agtgtttaactaagacaggagcaaagtttaagtcataccaagatacaaaaattcaaaggacatttgactttatgaactaac 14424278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Original strand, 19585084 - 19585298
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19585084 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggattttgattaattccttagtatttaacttgtgctct 19585183  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||  |||||||| |||| |||||| ||||| ||||  |||||| |||||| |    
T  19585184 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcatactaagatgcataaaatcaaatgaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaag 19585282  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| ||| |||||||    
T  19585283 ttagttcaaaatgttg 19585298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 299
Target Start/End: Original strand, 31824048 - 31824213
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    |||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31824048 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatagactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 31824147  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  31824148 ttgagtggttaactaagacaggaacaagtttcaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 31824213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 134 - 261
Target Start/End: Original strand, 25441479 - 25441606
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25441479 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 25441578  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaag 261  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||    
T  25441579 ttgagtggttaactaagacaggaacaag 25441606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 279
Target Start/End: Original strand, 10414788 - 10414933
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  10414788 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattatttttttggtatttaacttgtgctc 10414887  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaaga 279  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||| ||| |||||||||    
T  10414888 ttgagtgttttactaagatcgaaacaaggtttgaataataccaaga 10414933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 135 - 254
Target Start/End: Original strand, 45552530 - 45552650
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45552530 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 45552629  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacag 254  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  45552630 tgagtgttttcactaagacag 45552650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 135 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5616237 - 5616073
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5616237 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggaatttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 5616138  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    |||||| || |||||||||||||||||  | || | |||||||||  |||  |||||||||||||    
T  5616137 tgagtggttaactaagacaggaacaagtataaattaataccaagatacaaagaatcaaaggacat 5616073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 134 - 347
Target Start/End: Original strand, 12769448 - 12769663
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaa-atatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 232  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||   | || ||||| || |||||||||||| |||  || ||||||||||||||||| ||    
T  12769448 ttgttgaggcaaaattcctaattaattttagagataataaactttaaattattaaggatttaatggactttaattgttttcttggtatttaacttgtact 12769547  T
Q  233 cttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaa 330  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||  |||||| ||| ||    
T  12769548 cttgagtctttttactaagacagaaacaaggtttaaatcacaccaacatacaagaaatcaaagga-aattgaattcatgaactaattctgaagttcataa 12769646  T
Q  331 tgttagatcagaatgtt 347  Q
     ||||| ||||||||||    
T  12769647 agttagttcagaatgtt 12769663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 135 - 299
Target Start/End: Original strand, 41026870 - 41027034
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41026870 tgttgaggcaaaatccctgattaattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 41026969  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    |||||| || ||| ||||||||| ||| || |  |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  41026970 tgagtggttcactgagacaggaaaaagtttcacttcataccaagacacaaagaatcaaaggacat 41027034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 156 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 13286503 - 13286360
Alignment:
Q  156 taattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttgagtgttttactaagacagg 255  Q
    ||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13286503 taattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatgaactttgattaatttcttggtatttaacttgtgctcttgagtggttaactaagacagg 13286404  T
Q  256 aacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    |||||| || || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  13286403 aacaagtttcaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 13286360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 135 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12828098 - 12827937
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |   ||||||||||||||| ||||    ||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12828098 tgttgaggcaaaatccct---taattttaaagataacaaaccttgatgatgaaagaattaatgcactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 12828002  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  12828001 tgagtggttaactaagacaggaacaagtttcaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 12827937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 134 - 299
Target Start/End: Original strand, 42594681 - 42594846
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||     |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  42594681 ttgttgatgcaaaatccctaattaattttaaagataacaaaacttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgttc 42594780  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||| || || | |||||||||  |||  |||||||||||||    
T  42594781 ttgagtggttaactaagaaaggaacaagtttcaatttataccaagatacaaagaatcaaaggacat 42594846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 134 - 299
Target Start/End: Original strand, 33090511 - 33090675
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| |     
T  33090511 ttgttgaggcaaaattcctaattaattttgaagataataaacgtcgatgattaaggaattgatgaactttgattaatttattggtatttaatttgtgtta 33090610  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    |||| || ||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||    
T  33090611 ttgaatg-tttactaagtcaagaacaacgtttaaatcatacaaagataaaagaaatcaaagaacat 33090675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 300
Target Start/End: Original strand, 40701275 - 40701442
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaa-gataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 232  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||  |||    |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||| |    
T  40701275 ttgttgaggcaaaattcctaattaattttaaaagataacgaaccttgatgattaaagaattaataaactttgattaattttttggtatttaaattgtgtt 40701374  T
Q  233 cttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatt 300  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||||  || || |||||||    ||||| |||| ||||||||||||||    
T  40701375 ctttagtgtttaactaaaacaggagtaaagtataaatcaatttaagaagcaagcaatcaaaggacatt 40701442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 17220276 - 17220204
Alignment:
Q  213 cttggtatttaacttgtgctcttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaag 285  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||| || ||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||    
T  17220276 cttggtatttaatatgtgttcttgagtgattaactaagacatgaacaaagtataaattaaaccaagaatcaag 17220204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 445 - 504
Target Start/End: Original strand, 12769740 - 12769799
Alignment:
Q  445 tgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcat 504  Q
    ||||||| ||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12769740 tgacatgagtaaatgtcgaataaagtacatctgcatggatcaatcaagaaataaaggcat 12769799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 459 - 559
Target Start/End: Original strand, 19585410 - 19585510
Alignment:
Q  459 gtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagg-attatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaaca 557  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||  |||||| | ||||||||| |||   || |||||||||  |||||||||||||    
T  19585410 gtccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatgaacaaggaactatgtcaaa-aagatctttaatgttcatccaagactatgaaca 19585508  T
Q  558 tt 559  Q
    ||    
T  19585509 tt 19585510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 459 - 523
Target Start/End: Original strand, 19799368 - 19799433
Alignment:
Q  459 gtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaa 523  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  19799368 gtccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaa 19799433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 459 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 24541248 - 24541183
Alignment:
Q  459 gtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaa 523  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  24541248 gtccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaa 24541183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 459 - 504
Target Start/End: Original strand, 27988149 - 27988194
Alignment:
Q  459 gtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcat 504  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||    
T  27988149 gtccaggaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcat 27988194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 459 - 523
Target Start/End: Original strand, 45552831 - 45552896
Alignment:
Q  459 gtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaa 523  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  45552831 gtccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaa 45552896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 390; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 134 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 20110 - 19678
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20110 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacctgtgctc 20011  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20010 ttgagtgatttactaagacaggaacaaggtttaatt-ataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaatgt 19912  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19911 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgtttttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatg 19812  T
Q  434 caaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19811 caaggcacatatgacatgggtatatgtccagaaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcacatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 19712  T
Q  534 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19711 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 19678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 390; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 134 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 310753 - 310321
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  310753 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 310654  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  310653 ttgagtgttttactaa-acaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaatgt 310555  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatg 433  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  310554 tagatcagaatgttgcttgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatg 310455  T
Q  434 caaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 533  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  310454 caaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 310355  T
Q  534 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  310354 aatgttcatgtaagactatgagcattgatgtact 310321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 135 - 567
Target Start/End: Original strand, 215950 - 216373
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  215950 tgttgaggcaaaattcctaattaattttaaagataatacaccttaatgattaaggaattaatgaactttgattaattcctaggtatttaacttgtgctct 216049  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||             |||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||| ||||| |||| ||||||| |||    
T  216050 tgagtattttactaagacatgaac-------------taccaagattcaagaaatcaaaggacatttggttttatgaactaactctgaggtcagaaagtt 216136  T
Q  335 agatcagaatgttgct-----cgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggt 429  Q
    || ||| ||| |||||      |  ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||| |||      
T  216137 agttcataatattgcttagtgagttgatcagaatgttcaagtagaggtcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaagaacatt-atc-aagaa 216234  T
Q  430 catgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatc-aagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaagaag 527  Q
    |||||||| ||  | ||| |||   | |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| || || | |  |||||||| | |    
T  216235 catgcaagtcatttgtgatatgaacaaatgtccagaaaagtacgtttgcatggatcaatcaaagcaataaagacatttataaagttaaatgtcaaaaagg 216334  T
Q  528 gcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
      |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  216335 atattcaatgttca-ttaagactataaacattgaagtact 216373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 53)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 135 - 567
Target Start/End: Original strand, 45014066 - 45014498
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45014066 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 45014165  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  45014166 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttagatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagtt 45014265  T
Q  335 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgc 434  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45014266 agatcagaatgttgcttgaagatcagaatgttcaggcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgc 45014365  T
Q  435 aaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattca 534  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45014366 aaggcacatgtgacatgggtatatgtccagtagagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattca 45014465  T
Q  535 atgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45014466 atgttcatttaagactatgaacattgatgtact 45014498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 135 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 38958463 - 38958031
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38958463 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 38958364  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38958363 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaataaatcaaaggacgtttgaattcatgatctaacactgaggtcagaatgtt 38958264  T
Q  335 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  38958263 agatcagaatgttgctcgaagatcttaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgt 38958164  T
Q  435 aaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattca 534  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  38958163 aaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatgtacgaggattatgtcaaagaagacattca 38958064  T
Q  535 atgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38958063 atgttcatttaagactatgaacattgatgtact 38958031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 134 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 38931128 - 38930695
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38931128 ttgttgaggcaaaatccctaatgagttttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 38931029  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  38931028 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcacaccaagaatcaataaatcaaaggacatttgaatt-atgatctaacactgaggtcagaatgt 38930930  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaa-gaatctcaagaactttgatcaaaggtcat 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  38930929 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcat 38930830  T
Q  433 gcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcatt 532  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  38930829 gcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatgtacaaggattttgtcaaagaaggcatt 38930730  T
Q  533 caatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38930729 caatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 38930695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 135 - 567
Target Start/End: Original strand, 17488024 - 17488456
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17488024 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaactccttggtatttaacttgtgctct 17488123  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  17488124 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagtt 17488223  T
Q  335 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgc 434  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17488224 agatcagaacgttgcttgaagatcagaatgttcaagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaattttgatcaaaggtcatgc 17488323  T
Q  435 aaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattca 534  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17488324 aaggcacatgtgacatgggtatacgtccagaagagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagggttatgtcaaagaaggcattca 17488423  T
Q  535 atgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17488424 atgttcatttaagactatgaacattgatgtact 17488456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 135 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 24697229 - 24696798
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24697229 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 24697130  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  24697129 tgagtgttttactaagataggaacaaggtttagatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagtt 24697030  T
Q  335 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgc 434  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  24697029 agatcagaatgttgcttgaagatcagaatgttcaagtagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatc-aagatcatgc 24696931  T
Q  435 aaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattca 534  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24696930 aaggcacatgtgacatgggaatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggtattca 24696831  T
Q  535 atgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24696830 atgttcatttaagactatgaacattgatgtact 24696798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 134 - 567
Target Start/End: Original strand, 45024142 - 45024575
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45024142 ttgttgatgcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattcattggtatttaacttgtgctc 45024241  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  45024242 ttgagtgttttactaagacaagaacaaggtttagatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagt 45024341  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatg 433  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  45024342 tagatcagaatgttgcttgaagatcaaaatgttcaggcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaaatttgatcaaaggtcatg 45024441  T
Q  434 caaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 533  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45024442 caaggcacatgtgacatgggtatatgtccagtagagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaagacatatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 45024541  T
Q  534 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45024542 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 45024575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 134 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 44639643 - 44639277
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  44639643 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataataaaccattatgattaaagaattaatggactttgattaattctttggtatttaatttgtgctc 44639544  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||    
T  44639543 ttgagtgttttactaagacaggaacaagatttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggttagaaagt 44639444  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatg 433  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||     
T  44639443 tagatcagaatgttgctcagagatcataatgttcaagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagattctcaagaacattgatc-aaggtcatc 44639345  T
Q  434 caaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaagg 501  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44639344 caaggcacatgtgatatggatatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaagg 44639277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 133 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 2999435 - 2999200
Alignment:
Q  133 cttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 232  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2999435 cttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 2999336  T
Q  233 cttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatg 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  2999335 cttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaag 2999236  T
Q  333 ttagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2999235 ttagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 2999200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 135 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 29131716 - 29131521
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29131716 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaatttcttggtatttatcttgtgctct 29131617  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaa 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29131616 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaa 29131521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 2999099 - 2998910
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2999099 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 2999001  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2999000 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 2998910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 5337537 - 5337348
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5337537 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 5337439  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5337438 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 5337348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 5347390 - 5347201
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5347390 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 5347292  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5347291 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 5347201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 18650795 - 18650984
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18650795 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 18650893  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18650894 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 18650984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 18662913 - 18663102
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18662913 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 18663011  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18663012 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 18663102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 4457772 - 4457961
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  4457772 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacataaatatatgtccaggaaagtacattt 4457870  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4457871 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 4457961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 4467397 - 4467586
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  4467397 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacataaatatatgtccaggaaagtacattt 4467495  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4467496 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 4467586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 9503163 - 9502974
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9503163 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 9503065  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9503064 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatattcatttaagactatgaacattgatgtact 9502974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 9514529 - 9514340
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9514529 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 9514431  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9514430 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatattcatttaagactatgaacattgatgtact 9514340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 9503733 - 9503518
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9503733 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 9503634  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  || ||| ||||||     
T  9503633 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctaaagttcagaaa 9503535  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  9503534 gttagttcagaatgttg 9503518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 9515099 - 9514884
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9515099 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 9515000  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  || ||| ||||||     
T  9514999 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctaaagttcagaaa 9514901  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  9514900 gttagttcagaatgttg 9514884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 160 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 24239852 - 24239591
Alignment:
Q  160 tttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttgagtgttttactaagacaggaaca 259  Q
    ||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  24239852 tttaaagataataaactttgatgattaaggaattaatggactttgattattttcttggtatttaacttgtgctcttaagtgttttactaagacatgaata 24239753  T
Q  260 aggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgttagatcagaatgttgctc-----gaa 354  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||     |      
T  24239752 aggtttaaattataccaagattcaagaaatcaaaggacatttggttttatgaactaactctgaggtcagaaagttagttcagaatgttgctcagcgagtt 24239653  T
Q  355 gatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaac 416  Q
     |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24239652 aatcagaatgttcaagcagaggtcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaac 24239591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 135 - 416
Target Start/End: Original strand, 15940024 - 15940311
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaa-tccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  15940024 tgttgaggcaaaaattcctaattaattttaaagataataaactttgatgattaaggaattaatggactttgattattttcttggtatttaaattgtgctc 15940123  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||  || |||| ||||| |||| ||||||| ||    
T  15940124 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaatttataccaagattcaagaaatcaaaggatatttggttttatgaactaactctgaggtcagaaagt 15940223  T
Q  334 tagatcagaatgttgctc-----gaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaac 416  Q
    ||| ||||||| ||||||     |  ||| |||||||||||   ||| ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||    
T  15940224 tagttcagaatattgctcagcgagttgattagaatgttcaaagagaggtcagaaggttgttctaatacaagccagaaatctcaagaac 15940311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 130 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 32938152 - 32937933
Alignment:
Q  130 agacttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgt 229  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32938152 agacgtgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgt 32938053  T
Q  230 gctcttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tca 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| |||    
T  32938052 gctcttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttca 32937954  T
Q  328 gaatgttagatcagaatgttg 348  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  32937953 gaaagttagttcagaatgttg 32937933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 134 - 351
Target Start/End: Original strand, 18660679 - 18660897
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18660679 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 18660778  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||     
T  18660779 ttgagtgttttcactaagacagaaacaaggtctgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaa 18660877  T
Q  332 gttagatcagaatgttgctc 351  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18660878 gttagatcagaatgttgctc 18660897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 133 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 5348011 - 5347795
Alignment:
Q  133 cttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348011 cttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 5347912  T
Q  233 cttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaa 330  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||    
T  5347911 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaa 5347813  T
Q  331 tgttagatcagaatgttg 348  Q
      |||| |||||||||||    
T  5347812 aattagttcagaatgttg 5347795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 5338114 - 5337899
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5338114 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 5338015  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||     
T  5338014 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaa 5337916  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
     |||| |||||||||||    
T  5337915 attagttcagaatgttg 5337899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22688420 - 22688205
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22688420 ttgttgaggcaaaatacctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 22688321  T
Q  234 ttgagtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||| ||     
T  22688320 ttgagtgtttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcatgaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcataaa 22688222  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  22688221 gttagttcagaatgttg 22688205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 133 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16935027 - 16934825
Alignment:
Q  133 cttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16935027 cttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 16934928  T
Q  233 cttgagtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaa 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||    
T  16934927 cttgagtgtttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaa 16934829  T
Q  331 tgtt 334  Q
    ||||    
T  16934828 tgtt 16934825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 133 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17005687 - 17005485
Alignment:
Q  133 cttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17005687 cttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 17005588  T
Q  233 cttgagtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaa 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||    
T  17005587 cttgagtgtttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaa 17005489  T
Q  331 tgtt 334  Q
    ||||    
T  17005488 tgtt 17005485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 134 - 325
Target Start/End: Original strand, 4457219 - 4457410
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4457219 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 4457318  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagt 325  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||||    
T  4457319 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagt 4457410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 134 - 325
Target Start/End: Original strand, 4466844 - 4467035
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4466844 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 4466943  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagt 325  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||||    
T  4466944 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagt 4467035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Original strand, 18662420 - 18662635
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18662420 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 18662519  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  || ||| ||||||     
T  18662520 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctaaagttcagaaa 18662618  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  18662619 gttagttcagaatgttg 18662635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 134 - 325
Target Start/End: Original strand, 4456155 - 4456346
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4456155 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 4456254  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagt 325  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||||    
T  4456255 ttgagtgttttcactaagataggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagt 4456346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 135 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15479487 - 15479323
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15479487 tgttgaggcaaaatccctaattaatttgaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 15479388  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  15479387 tgagtgtttaactaagacaggaacaaagtttaattcgtaccaagaaacaagaaataaaaggacat 15479323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Original strand, 573568 - 573782
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  573568 tgttgaggcaaaatccctaaataattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttgatatttaacttgtgctct 573667  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||  |||||||||||||  ||||| ||||| ||||  |||||| |||||| |    
T  573668 tgagtgttttcactaagacaagaacaaggtttgaatcatatcaagatgcataaaatcaaaggaca-atgaatccatgaactaattctgaagttcagaaag 573766  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  573767 ttagttcagaatgttg 573782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 134 - 300
Target Start/End: Original strand, 12569892 - 12570059
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    |||||| | || | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12569892 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataatatactttaatgattgaggattaaatgaactttgattaattccttagtatttaacttgtgctc 12569991  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatt 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  12569992 ttgagtgtttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcatgaaatcaaaggacatt 12570059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 135 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 3606657 - 3606492
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3606657 tgttgaggaaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaatgattaaatgaactttgattaattctttgttatttaacttgtgctct 3606558  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  3606557 tgagtgttttactaagacatgaacaaggtttgaataataccaagatacatgaaatcaaaggacatt 3606492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Original strand, 18650351 - 18650565
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||    
T  18650351 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgatttattcctttgtatttaatttgtgttct 18650450  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  || ||| |||||| |    
T  18650451 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctaaagttcagaaag 18650549  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  18650550 ttagttcagaatgttg 18650565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 232 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 72743 - 72439
Alignment:
Q  232 tcttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaat 331  Q
    ||||||||| || || ||||||  ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||     
T  72743 tcttgagtgattaaccaagacacaaacaaagtttaaatcataccaagatacaagaaatcaaaggacatttgaattcatgaactaacactgcattcagaaa 72644  T
Q  332 gttagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtca 431  Q
    ||||| ||| ||||||                   ||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  | ||||| |  ||    
T  72643 gttagttcataatgtt-------------------caagcagagttcaaaaggttgttcttatacaagcccagaatctcaagaacaat-atcaa-gaaca 72565  T
Q  432 tgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggatta-tgtcaaagaaggca 530  Q
    ||||||| ||| ||||||||  || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||   |    
T  72564 tgcaaggtacacatgacatgaataaatgtccagtaaagtacattggcatggatcaatcaagcaataaagacatttaca-ggattaatgtcaaagaaaata 72466  T
Q  531 ttcaatgttcatttaagactatgaaca 557  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  72465 ttcaatgttcatttaagattatgaaca 72439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22909528 - 22909363
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22909528 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactatgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 22909429  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    ||||||| || ||| ||| ||||||||| || || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  22909428 ttgagtggttaactgagataggaacaagtttcaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 22909363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 134 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27160674 - 27160547
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27160674 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 27160575  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaag 261  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||    
T  27160574 ttgagtggttaactaagacaggaacaag 27160547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 134 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27171043 - 27170916
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27171043 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 27170944  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaag 261  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||    
T  27170943 ttgagtggttaactaagacaggaacaag 27170916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 137 - 299
Target Start/End: Original strand, 22901414 - 22901576
Alignment:
Q  137 ttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttg 236  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22901414 ttgagacaaaatccctaattaattttaaagataacaaaccttgatgattaaagaattaatggactatgattaatttattggtatttaacttgtgctcttg 22901513  T
Q  237 agtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    |||| || |||||||||| | |||| || || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  22901514 agtggttaactaagacagaatcaagtttcaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 22901576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 135 - 244
Target Start/End: Original strand, 45190096 - 45190205
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45190096 tgttgaggcaaaatccttaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 45190195  T
Q  235 tgagtgtttt 244  Q
    ||||||||||    
T  45190196 tgagtgtttt 45190205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 134 - 299
Target Start/End: Original strand, 23721267 - 23721432
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23721267 ttgttaaggcaaaatccctaattaattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 23721366  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    ||| ||| || ||  ||||||||||||  || || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  23721367 ttgggtggttaaccgagacaggaacaaatttcaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 23721432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 156 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28461067 - 28460989
Alignment:
Q  156 taattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28461067 taattttaaagataataaaccaatatgattagagaattaatgaactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 28460989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 348
Target Start/End: Original strand, 45190235 - 45190371
Alignment:
Q  213 cttggtatttaacttgtgctcttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  |||||||| |||| |||||| |||||    
T  45190235 cttggtatttaacttgtgctcttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaagaca-ttgaatccatga 45190333  T
Q  312 tctaacactgaag-tcagaatgttagatcagaatgttg 348  Q
     ||||  |||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  45190334 actaattctgaagttcagaaagttagttcagaatgttg 45190371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 40409761 - 40409606
Alignment:
Q  144 aaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttgagtgttt 243  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||||    |||||||||| |||||||||| |||| || || |||||||||||| || || ||||||||||||    
T  40409761 aaaatccctaattaattttaaatataacaaaccttaatgattaaaggattaatggacattgaatagtttcttggtatttaattt-tgttcttgagtgttt 40409663  T
Q  244 tactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatt 300  Q
     ||||||||| |||||| |  |||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  40409662 aactaagacaagaacaaagaataaatcaatccaagaagcaagcaatcaaaggacatt 40409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 299
Target Start/End: Original strand, 19341624 - 19341785
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||    
T  19341624 tgttgaggcaaaatatctaattaattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttgg---ttaacttgtgctct 19341720  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    |||||| || | ||||||||||| ||| ||  | ||||| |||||  |||  |||||||||||||    
T  19341721 tgagtggttaattaagacaggaataagtttcgattcatagcaagatacaaacaatcaaaggacat 19341785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 319 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 28460990 - 28460903
Alignment:
Q  319 ctgaagtcagaatgttagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctc 410  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28460990 ctgaggtcagaaagttagatcagaatgttgctcaaaaatcagaatgttcaagcagagat----aggttgttcttatacaagccaagaatctc 28460903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16135820 - 16135701
Alignment:
Q  180 atgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaaga 279  Q
    |||||||| | ||||||| || ||||||| || | |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||  || || ||||||||||||||||||    
T  16135820 atgattaatggattaatgaacattgattagtttcatggtatttaatttgtgttcttgagtgtttaactaagacaataaaaaagtttaaatcataccaaga 16135721  T
Q  280 atcaagaaatcaaaggacat 299  Q
      | |||||| |||||||||    
T  16135720 taccagaaattaaaggacat 16135701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 210
Target Start/End: Original strand, 18495835 - 18495911
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaat 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18495835 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataacaaaccttaataattaaggaattaatggactttgattaat 18495911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 457 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 24239564 - 24239516
Alignment:
Q  457 atgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatc-aagcaataaaggcat 504  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24239564 atgtccagaaaagaacatttgcatggatcaatcaaagcaataaaggcat 24239516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 381; Significance: 0; HSPs: 61)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 135 - 567
Target Start/End: Original strand, 27411482 - 27411914
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27411482 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctat 27411581  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  27411582 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttagatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagtt 27411681  T
Q  335 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgc 434  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27411682 agatcagaatgttgcttgaagatcagaatgttcaagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatgc 27411781  T
Q  435 aaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattca 534  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27411782 aaggcacatgtgacatgggtatatgtccagaagagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagggttatgtcaaagaaggcattca 27411881  T
Q  535 atgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27411882 atgttcatttaagactatgaacattgatgtact 27411914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 134 - 567
Target Start/End: Original strand, 32069773 - 32070206
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32069773 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 32069872  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  32069873 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttagatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagt 32069972  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatg 433  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32069973 tagatcagaatgttgcttgaagatcagaatgttcaagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatg 32070072  T
Q  434 caaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 533  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32070073 caaggcacatgtgacatgggtatatgtccagaagagtacatttgcatggaacaatcaaacaataaaggcatatacaagggttatgtcaaagaaggcattc 32070172  T
Q  534 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32070173 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 32070206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 134 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 26192938 - 26192704
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26192938 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 26192839  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  26192838 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagt 26192739  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26192738 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 26192704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 135 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 26203497 - 26203264
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26203497 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 26203398  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  26203397 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagtt 26203298  T
Q  335 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26203297 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 26203264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 134 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 11411899 - 11411665
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11411899 ttgttgaggcaaaatctctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 11411800  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  11411799 ttgagtgttttactaagacaggaacgaggtttgaatcataccaaaaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagt 11411700  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11411699 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 11411665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 135 - 377
Target Start/End: Original strand, 22240346 - 22240588
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22240346 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaacgaattaatggactttgattaattccttgatatttaacttgtgctct 22240445  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  22240446 tgagtgttttactaagataagaacaaggtttaaatcataccaagaattaagaaatcaaaggacatttgaattcttgatctaacactgaggtcagaaagtt 22240545  T
Q  335 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagat 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22240546 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagcagagat 22240588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 137 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 23379311 - 23378886
Alignment:
Q  137 ttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttg 236  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23379311 ttgaggcaaaatccttaattaattttaaagataataaaacttgatgattaaggaatcaatggactttgattaatttcttggtatttaacttgtgctcttg 23379212  T
Q  237 agtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgttag 336  Q
    | ||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||||    
T  23379211 aatgttttactaagacatgaaaaatgtttaaatcattccaagatacaagaaatcaaaggacatttgaattcatgaactaactctgagttcagaaagttag 23379112  T
Q  337 atcagaatgttgct-----cgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtca 431  Q
     | |||||||||||      |  ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||| || ||| |||  ||    
T  23379111 tttagaatgttgctaagggagttgatcaaaatgttcaagtagagctcagaaggttgtccttatacaagcctagaaactcaagaacatt-atc-aagaaca 23379014  T
Q  432 tgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcat 531  Q
    |||||| |||| ||||| ||  || || ||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||| | |  ||    
T  23379013 tgcaagacacacatgacttgaataaatttcaggtaaagtacatttgcatcgatcaatcaagcaataaagacaattacaaggttaatgtcaaaaaggatat 23378914  T
Q  532 tcaatgttcatttaagactatgaacatt 559  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  23378913 tcgatgttcatttaagactatgaacatt 23378886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 18360854 - 18361043
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18360854 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 18360952  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18360953 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 18361043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 18389811 - 18390000
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18389811 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 18389909  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18389910 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 18390000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 21753020 - 21753209
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21753020 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 21753118  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21753119 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 21753209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 21762307 - 21762496
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21762307 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 21762405  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21762406 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 21762496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 33938894 - 33939083
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  33938894 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 33938992  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33938993 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 33939083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 33949294 - 33949483
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  33949294 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 33949392  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33949393 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 33949483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 8765849 - 8765660
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8765849 tcagaaggttgctcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 8765751  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8765750 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttcagactatgaacattgatgtact 8765660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 26192485 - 26192296
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26192485 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaaactcaagaactgtgatcaa-ggccatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 26192387  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26192386 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 26192296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 26203089 - 26202900
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26203089 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaaactcaagaactgtgatcaa-ggccatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 26202991  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26202990 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 26202900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 377 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 11411592 - 11411406
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  11411592 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccagaaaagtacattt 11411494  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgt 564  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11411493 acatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgt 11411406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Original strand, 33948807 - 33949021
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33948807 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 33948906  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  || ||| |||||| |    
T  33948907 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctaaagttcagaaag 33949005  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  33949006 ttagttcagaatgttg 33949021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Original strand, 33938408 - 33938621
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33938408 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 33938507  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatgt 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  || ||| |||||| ||    
T  33938508 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctaaagttcagaaagt 33938606  T
Q  334 tagatcagaatgttg 348  Q
    ||| |||||||||||    
T  33938607 tagttcagaatgttg 33938621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8766445 - 8766230
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8766445 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 8766346  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  || ||| ||||||     
T  8766345 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctaaagttcagaaa 8766247  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  8766246 gttagttcagaatgttg 8766230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 373 - 567
Target Start/End: Original strand, 22244287 - 22244480
Alignment:
Q  373 gagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtac 472  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||| |||    
T  22244287 gagatcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaacactgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgatatgaatatatgtccaggaaattac 22244385  T
Q  473 atttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22244386 atttgcatggatcaatcaatcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatactcaatgttcatttaagactatggacattgatgtact 22244480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 134 - 351
Target Start/End: Original strand, 18389405 - 18389623
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18389405 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 18389504  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||     
T  18389505 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaa 18389603  T
Q  332 gttagatcagaatgttgctc 351  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18389604 gttagatcagaatgttgctc 18389623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 22174249 - 22174035
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22174249 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 22174150  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||| |||||| |    
T  22174149 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatacataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaactctgaagttcagaaag 22174051  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  22174050 ttagttcagaatgttg 22174035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 135 - 351
Target Start/End: Original strand, 18360406 - 18360623
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18360406 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 18360505  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| |||||| |    
T  18360506 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaag 18360604  T
Q  333 ttagatcagaatgttgctc 351  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18360605 ttagatcagaatgttgctc 18360623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 135 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20905481 - 20905301
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20905481 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactataatgattaaggactaaatggactttgattaattccttgatatttaacttgtgctct 20905382  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaa 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  20905381 tgagtgttttactaagacgggaacaatgtttaaatcataccaagatacaagaaatcaaaggaca-atgaattcatgaactaa 20905301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Original strand, 21680846 - 21681061
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680846 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 21680945  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||     
T  21680946 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaa 21681044  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  21681045 gttagttcagaatgttg 21681061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Original strand, 31916119 - 31916334
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31916119 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacattaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgttc 31916218  T
Q  234 ttgagtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||     
T  31916219 ttgagtgtttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaa 31916317  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  31916318 gttagttcagaatgttg 31916334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27275128 - 27274914
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27275128 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 27275029  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| |||||| |    
T  27275028 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaag 27274930  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  27274929 ttagttcagaatgttg 27274914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18210823 - 18210608
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18210823 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaagtttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 18210724  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||     
T  18210723 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaa 18210625  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  18210624 gttagttcagaatgttg 18210608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Original strand, 20763667 - 20763882
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20763667 ttgttaaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggaataaatggactttgattaatttcttggtatttaacttgtgctc 20763766  T
Q  234 ttgagtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||     
T  20763767 ttgagtgtttttactaagacatgaacaaggtttgaatcataccaagatgcatgaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaa 20763865  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  20763866 gttagttcagaatgttg 20763882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Original strand, 21761797 - 21762012
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21761797 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 21761896  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||     
T  21761897 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaa 21761995  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
     |||| |||||||||||    
T  21761996 attagttcagaatgttg 21762012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Original strand, 21752375 - 21752589
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21752375 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 21752474  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||      
T  21752475 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaaa 21752573  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  21752574 ttagttcagaatgttg 21752589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 37549568 - 37549354
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37549568 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 37549469  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| |||||| |    
T  37549468 tgagtgttttcactaagacaagaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaag 37549370  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  37549369 ttagttcagaatgttg 37549354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 37652366 - 37652152
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37652366 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 37652267  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| |||||| |    
T  37652266 tgagtgttttcactaagacaagaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaag 37652168  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  37652167 ttagttcagaatgttg 37652152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30944794 - 30944579
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30944794 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 30944695  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||| ||     
T  30944694 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcaaaaa 30944596  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  30944595 gttagttcagaatgttg 30944579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 134 - 325
Target Start/End: Original strand, 37816886 - 37817077
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37816886 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 37816985  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagt 325  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||||    
T  37816986 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagt 37817077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4038927 - 4038713
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4038927 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 4038828  T
Q  235 tgagtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||   |||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| |||||| |    
T  4038827 tgagtgctttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcatataatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaag 4038729  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  4038728 ttagttcagaatgttg 4038713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 13572659 - 13572445
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13572659 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattgattccttggtatttaacttgtgctct 13572560  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||   ||||| |||||| |    
T  13572559 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattatgaagttcagaaag 13572461  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  13572460 ttagttcagaatgttg 13572445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18220172 - 18219958
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18220172 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaagtttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 18220073  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| |||||| |    
T  18220072 tgagtgttttcactaagacaagaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaag 18219974  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  18219973 ttagttcagaatgttg 18219958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19889289 - 19889075
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19889289 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttaattaattccttggtatttaacttgtgctct 19889190  T
Q  235 tgagtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| |||||| |    
T  19889189 tgagtgtttttactaagacaggaataaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaag 19889091  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  19889090 ttagttcagaatgttg 19889075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30954215 - 30954001
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30954215 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 30954116  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||| || |    
T  30954115 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcaaaaag 30954017  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  30954016 ttagttcagaatgttg 30954001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Original strand, 20896260 - 20896473
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20896260 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggactaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 20896359  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatgt 333  Q
    |||||||||||| || | | ||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||| ||| || ||    
T  20896360 tgagtgttttacaaatataagaacaaggtttaagtcataccaagatagaagaaatcaaaggac-gttgaattcatgaactaattctgaagttcaaaaagt 20896458  T
Q  334 tagatcagaatgttg 348  Q
    ||| |||||||||||    
T  20896459 tagttcagaatgttg 20896473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 37299778 - 37299564
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37299778 tgttgaggcaaaatacctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacatgtgctct 37299679  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| |||||| |    
T  37299678 tgagtgttttcactaagacaggaacaaagtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaag 37299580  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  37299579 ttagttcagaatgttg 37299564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 227 - 561
Target Start/End: Original strand, 31104835 - 31105172
Alignment:
Q  227 tgtgctcttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtc 326  Q
    |||| ||||||||| || || ||||||  ||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||  ||    
T  31104835 tgtgttcttgagtgattaaccaagacacaaacaaagtttaaatcataccatgatacaagaaatcaaatgacatttaaattcatgaactaactctgagttc 31104934  T
Q  327 agaatgttagatcagaatgttgctc-gaa----gatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttga 421  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||    ||  ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| || |    
T  31104935 agaaagttagttcagaatgttgctcagaaagttgagtagaatgttcaagcagagttcataaggttgttcttatgcaagcctagaatctgaagaacatt-a 31105033  T
Q  422 tcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtca 521  Q
    | ||||  ||||||||| |||  |||||||  || |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||| ||    
T  31105034 t-aaagaacatgcaaggtacacgtgacatgaataaatgtccagtaaagtacattggtatggatcaatcaagcaataaagtcatttacaagattaatgcca 31105132  T
Q  522 aagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattga 561  Q
    || | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31105133 aaaaggatattcaatgttcatttaagactatgaacattga 31105172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 42091469 - 42091253
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42091469 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 42091370  T
Q  235 tga--gtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaa 330  Q
    | |  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||| ||||  || ||| ||||||    
T  42091369 ttatagtgtttttactaagacaggaacaatgtttaaatcataccaagatgcatgaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctaaagttcagaa 42091271  T
Q  331 tgttagatcagaatgttg 348  Q
     ||||| |||||||||||    
T  42091270 agttagttcagaatgttg 42091253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 299
Target Start/End: Original strand, 20957508 - 20957673
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20957508 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 20957607  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  | || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  20957608 ttgagtggttaactaagacaggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 20957673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 135 - 299
Target Start/End: Original strand, 20947120 - 20947284
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20947120 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 20947219  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    |||||| || |||||||||||||||||  | || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  20947220 tgagtggttaactaagacaggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 20947284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 199 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 206362 - 206236
Alignment:
Q  199 actttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttgagtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggac 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  206362 actttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttgagtgtttttactaagacaggaataaggtttaaatcataccaagatacatgaaatcaaaggac 206263  T
Q  298 atttgaattcatgatctaacactgaagt 325  Q
    | |||||| ||||| ||||  |||||||    
T  206262 a-ttgaatccatgaactaattctgaagt 206236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 133 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 34131396 - 34131268
Alignment:
Q  133 cttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34131396 cttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatgaactttgattaattccttgatatttaacttgtgct 34131297  T
Q  233 cttgagtgtttt-actaagacaggaacaa 260  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  34131296 cttgagtgttttcactaagacatgaacaa 34131268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 376 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 21484518 - 21484329
Alignment:
Q  376 atcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatt 475  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||  ||| |||  ||| | |||||||  || ||||| || ||||||| ||    
T  21484518 atcagaaggttgttcttaaataagccaagaatctcaagaacatt-at-aaagaacatacaactcacttgtgacatgaataaatgtctagaaaagtacgtt 21484421  T
Q  476 tgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||| | |  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21484420 tgcatggatcaatcaagcaataaaggcatttacaaggttaatgtaaaaaaggatatgcaatgttcatttaagactatgaacattgaagtact 21484329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 19549212 - 19549047
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||     |||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  19549212 tgttgagggaaaatccctaattaattttaaagataacaaaccttgttgattaagaaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacctgtgctct 19549113  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaaga-atcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| | |||  |||||||||||||    
T  19549112 tgagtggttaactaaaacaggaacaagtttcaattcataccaagataacaaagaatcaaaggacat 19549047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 457 - 557
Target Start/End: Original strand, 20896585 - 20896684
Alignment:
Q  457 atgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaac 556  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  20896585 atgtccagtaaagtacatctacatggatcaatcaagcaataaagacatttacaagaataatgtcaaaaaagtc-ttcaaggttcattcaagactatgaac 20896683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 457 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 20905155 - 20905058
Alignment:
Q  457 atgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaa 555  Q
    |||| ||| ||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||    
T  20905155 atgttcagtaaattacatctacatggatcaataaagcaataaaggcatttacaagaataatgtcaaaaaagtc-ttcaaggttcattcaagactatgaa 20905058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15240615 - 15240546
Alignment:
Q  133 cttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactt 202  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |  ||  |||||| ||||||||||||    
T  15240615 cttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagatgataaaccatgatagttaaaggattaatggactt 15240546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 15240754 - 15240712
Alignment:
Q  133 cttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaac 175  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15240754 cttgttgaggcaaaatcccaaattaattttaaagataataaac 15240712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 459 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 13572301 - 13572236
Alignment:
Q  459 gtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaa 523  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  13572301 gtccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaa 13572236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 459 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 30944407 - 30944342
Alignment:
Q  459 gtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaa 523  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  30944407 gtccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaa 30944342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 459 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 30953829 - 30953764
Alignment:
Q  459 gtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaa 523  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  30953829 gtccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaa 30953764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 459 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 37299436 - 37299371
Alignment:
Q  459 gtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaa 523  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  37299436 gtccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaa 37299371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 459 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 37549226 - 37549161
Alignment:
Q  459 gtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaa 523  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  37549226 gtccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaa 37549161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 19548816 - 19548788
Alignment:
Q  531 ttcaatgttcatttaagactatgaacatt 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19548816 ttcaatgttcatttaagactatgaacatt 19548788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 380; Significance: 0; HSPs: 54)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 132 - 567
Target Start/End: Original strand, 25018800 - 25019234
Alignment:
Q  132 acttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgc 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25018800 acttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgc 25018899  T
Q  232 tcttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaat 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  25018900 tcttgagtgttttactaagacagga-caatatttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaa 25018998  T
Q  332 gttagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtca 431  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25018999 gttagatcagaatgttgcttgaagatcagaatgttcaagcagagattagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtca 25019098  T
Q  432 tgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcat 531  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25019099 tgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcat 25019198  T
Q  532 tcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25019199 tcaatgttcatttaagactatgaacattgaagtact 25019234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 134 - 567
Target Start/End: Original strand, 16154216 - 16154649
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16154216 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 16154315  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16154316 ttgagtgttttactaagacatgaacaaggtttagatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaactcatgatctaacactgaggtcagaaagt 16154415  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatg 433  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16154416 tagatcagaatgttgcttgaagatcagaatgttcaagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatg 16154515  T
Q  434 caaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 533  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16154516 caaggcacatgtgacatgggtatatgtccagaagagtatatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagggttatgtcaaagaaggcattc 16154615  T
Q  534 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16154616 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 16154649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 133 - 567
Target Start/End: Original strand, 2115332 - 2115766
Alignment:
Q  133 cttgttgaggcaaaatccat-aattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgc 231  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2115332 cttgttgaggcaaaatcccttaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgc 2115431  T
Q  232 tcttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaat 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2115432 tcttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaaa 2115531  T
Q  332 gttagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  2115532 gttagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagagtctcaagaactttgatc-aagatca 2115630  T
Q  432 tgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcat 531  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  2115631 tgcaaggcacatgtgacatgggaatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatataaaaggattatgttaaagaaggtat 2115730  T
Q  532 tcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2115731 tcaatgttcatttaagactatcaacattgatgtact 2115766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 135 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 30550332 - 30549900
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccat-aattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30550332 tgttgaggcaaaatcccttaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 30550233  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  30550232 ttgagtgttttactaagacatgaacaatgtttttatcattccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagt 30550133  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  30550132 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagagtctcaagaactttgatc-aagatcatg 30550034  T
Q  434 caaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 533  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30550033 caagtcacatgtgacatgtgtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggtattc 30549934  T
Q  534 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30549933 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 30549900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 134 - 567
Target Start/End: Original strand, 42033525 - 42033957
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42033525 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattagagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 42033624  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  42033625 ttgagtgttttactaagataggaacaaggtttaaatcataccaaaaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacattgaggtcagaaagt 42033724  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  42033725 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagcagagatcagaaggttgttcttatgcaagccaagaatctcaagaactttgatc-aagatcatg 42033823  T
Q  434 caaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 533  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||    
T  42033824 caaggcacatgtgacatggatatatgtccaggaaagtacatttgcatagatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattc 42033923  T
Q  534 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42033924 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 42033957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 153 - 567
Target Start/End: Original strand, 21885666 - 21886079
Alignment:
Q  153 aattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttgagtgttttactaagac 252  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21885666 aattaattttaaagataataaatcaatatgattagaaaattaatggactttgattaattctttggtatttaacttgtgctcttgagtgttttacttagac 21885765  T
Q  253 aggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgttagatcagaatgttgctcg 352  Q
    || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21885766 agaaacaaagtttaaatcatagcaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagttagatcagaatgttgctcg 21885865  T
Q  353 aagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgg 452  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  21885866 aagatcagaatgttcaagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagagtctcaagaactttgatc-aagatcatgcaaggcacatgtgacatgg 21885964  T
Q  453 gtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactat 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21885965 gtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggtattcaatgttcatttaagactat 21886064  T
Q  553 gaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||    
T  21886065 gaacattgatgtact 21886079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 135 - 567
Target Start/End: Original strand, 8539585 - 8540017
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8539585 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaggataataaacgaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 8539684  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  8539685 tgagtgtttcactaagacaggagcaaggtttaaatcatatcaggaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagtt 8539784  T
Q  335 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgc 434  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8539785 agatcaaaatgttgctcgaagattagaatgttcaagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaataatctcaagaactttgatc-aaggtcatgc 8539883  T
Q  435 aaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaagg-cattc 533  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||  ||||    
T  8539884 aaggcatatgtgacatggatatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatataaggattatgtaaaaaaaggatattc 8539983  T
Q  534 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  8539984 aatgttaatttaagaccatgaacattgatgtact 8540017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 135 - 567
Target Start/End: Original strand, 8604824 - 8605256
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8604824 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaggataataaacgaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 8604923  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  8604924 tgagtgtttcactaagacaggagcaaggtttaaatcatatcaggaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagtt 8605023  T
Q  335 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgc 434  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8605024 agatcaaaatgttgctcgaagattagaatgttcaagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaataatctcaagaactttgatc-aaggtcatgc 8605122  T
Q  435 aaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaagg-cattc 533  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||  ||||    
T  8605123 aaggcatatgtgacatggatatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatataaggattatgtaaaaaaaggatattc 8605222  T
Q  534 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  8605223 aatgttaatttaagaccatgaacattgatgtact 8605256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 134 - 567
Target Start/End: Original strand, 13964230 - 13964661
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  13964230 ttgttgaggcaaaatctctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattcattggtatttaacttctgctc 13964329  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
     ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  13964330 gtgagtattttactaagactggaacaaggtttaaatcataccatgaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtc-gaaagt 13964428  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  13964429 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagcagagatcagaaggttgttcttatacaaaacaagaatctcaagaacattgatc-aaggtcatg 13964527  T
Q  434 caaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 533  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |  | ||    
T  13964528 caaggcacatgtgacattgatatatgtttaggaaagtagatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatgcaaggattatgtcaaaaaggatactc 13964627  T
Q  534 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13964628 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 13964661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 135 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 22406994 - 22406646
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22406994 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaactccttggtatttaacttgtgctct 22406895  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  22406894 taagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgatttcatgatctaacactgaggtcagaaagtt 22406795  T
Q  335 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgc 434  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22406794 agatcagaacgttgcttgaagatcagaatgttcaagcagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgaccaaaggtcatgc 22406695  T
Q  435 aaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatgga 483  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  22406694 aaggcacatgtgacatgggtatacgtccagaagagtacatttgcatgga 22406646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 134 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 2371134 - 2370702
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2371134 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacctttatgattaaagaattaatggactctgattaattccttggtatttaacttgtactc 2371035  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||    
T  2371034 ttgagtgttttagtaagacatgaacaaggtttaaatcataccaagattcaagaaatcaaaagacatttggattcatgatctaacactgaggtcataaagt 2370935  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatg 433  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  2370934 tagatcagaatgttgctcagagatcaaaatgttcaagcatagatcaaaaggttgttcttatacaagcccaaaatctcaagaacattgatc-aaggtcatg 2370836  T
Q  434 caaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 533  Q
     || |||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |  | ||    
T  2370835 gaatgcacatgtgacatgaataaatgtcaaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataatggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatactc 2370736  T
Q  534 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2370735 aatgttcatttaagactatgaacattgaagtact 2370702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 135 - 567
Target Start/End: Original strand, 1968679 - 1969103
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1968679 tgttgaagcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaagattaaatggactttgattaattccttgatatttaacttgtgctct 1968778  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||    
T  1968779 tgagtgttttactaagacagaaacaaagtttaaatcataccaag-------aaatcaaaggacatttgaattcatgatcttacacagaggtcagaaagtt 1968871  T
Q  335 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgc 434  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  1968872 agatcagaatgttgctcagagatcagaatgttcaagcagagatcagaaggttattcttatacaagccaagaatctcaagaacattgat-taaggtcatgc 1968970  T
Q  435 aaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattca 534  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  | | |    
T  1968971 aaggcacatgtgatatggatatatgtctaggaaagtacaaattcatggatcaatcaagcaataaaggaatatacaaggattatgtcaaaaaagatactta 1969070  T
Q  535 atgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  1969071 atgttcatttaagattatggacattgatgtact 1969103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 137 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 41544846 - 41544435
Alignment:
Q  137 ttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttg 236  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41544846 ttgaggtaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattacttggtatttaacttgtgctcttg 41544747  T
Q  237 agtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgttag 336  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  41544746 agtgttttactaagacaggaacaaagtttaaatcataccaaaaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagttag 41544647  T
Q  337 atcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaa 436  Q
    |||||||                   |||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  41544646 atcagaa-------------------tgttcaagcaaagattagaaggttgttcttacacaaaccaagaatctcaagaacattgatc-aaggtcatgcaa 41544567  T
Q  437 ggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatc-aagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaa 535  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |    ||||    
T  41544566 gacacatgtgacatggatatatgtccacgaaagtacatttgcatggatctatcaaagcaacaaaggcatatacaaggactatgtcaaaaaggatgctcaa 41544467  T
Q  536 tgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41544466 tgttcatttaagactatgaacgttgatgtact 41544435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 218 - 567
Target Start/End: Original strand, 18382780 - 18383127
Alignment:
Q  218 tatttaacttgtgctcttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaac 317  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18382780 tatttaaattgtgctcttgagtattttactaagacagaaatcaggtttaaatcataccaagattcaagaaatcaaaggacatttgaatacatgatctaac 18382879  T
Q  318 actgaagtcagaatgttagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaact 417  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  18382880 actgaggtcagaaagttagatcaaaatgttggtcagagatcagaatgttcaagcagagatcagaaagttgttcttacacaagccaagaatctcaagaaca 18382979  T
Q  418 ttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattat 517  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18382980 ttgatc-aaggtcatgcaaggcacatgtgacatggttaaatgtccaggaaaataca-ttgcatagatcaatcaagcaataatggcatatacaaggattat 18383077  T
Q  518 gtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18383078 gtcaaaaaagatattcaatgttcatttaagacaatgaacattgaagtact 18383127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 134 - 368
Target Start/End: Original strand, 21457870 - 21458104
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21457870 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 21457969  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  21457970 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaaccataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagt 21458069  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21458070 tagatcagaatgttgctcgaagatcataatgttca 21458104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 135 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 1187144 - 1186714
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    ||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1187144 tgttgaggcaaaatttctaattagttttaaagataataaacctcaatgattaagaaattgatggactttgattaatttcttggtatttaacttgtgctct 1187045  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||  |||||| |||    
T  1187044 tgagtgtttaactaagacagaaacaaggtttaaatcataccaagatacaagaaatcaaaggacatttggattcatgaactaactttgagttcagaaagtt 1186945  T
Q  335 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgc 434  Q
    || ||| ||||||||||  || ||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||  |||||| |||| ||||||||| || ||| |||  ||| |    
T  1186944 agttcaaaatgttgctcatagttcagaatgttcaagcagatttcataaggttgttcttatgcaagcccagaaactcaagaacatt-atc-aagaacatac 1186847  T
Q  435 aaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattca 534  Q
    ||||||||| | |||||  || |||| ||| ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||| ||| |||||| || |||||||| | |  |||||    
T  1186846 aaggcacatgtaacatgaataaatgttcagtaaagtacattatcatgtatcaatcaaacaataaagacatttacaagaataatgtcaaaaaggatattca 1186747  T
Q  535 atgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1186746 atgttcatttaagactatgaacattgaagtact 1186714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 21458205 - 21458394
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21458205 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 21458303  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21458304 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 21458394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 134 - 559
Target Start/End: Original strand, 34822356 - 34822783
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34822356 ttgttgaagcaaaattcctaattagttttaaagataataaaccttgatgattaaagaattaatggactttgattaatttattggtatttaacttgtgctc 34822455  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaaga-at---caagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcaga 329  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||  | |||    
T  34822456 ttgagtgtttaactaagacaggaacaatgtttaattcataccaagatatatacaagaaatcaaaggacatttgactttatgaactaactctgagttgaga 34822555  T
Q  330 atgttagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggt 429  Q
    | ||||| ||||||  ||||||  || |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  ||| | | ||| |||      
T  34822556 aagttagttcagaaacttgctcatagttcagaatgttcaagcataattcagaaggttgttcttatacaagcccagaagctcgtgaa-tattatc-aagaa 34822653  T
Q  430 catgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggc 529  Q
    |||||||||||||| |||||||  || | || ||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || ||||||  | |||||||| |||      
T  34822654 catgcaaggcacatgtgacatgaataaaggttcagtaaagtacattgtcttggatcaatcaagcaataaaggaatttacaagattaatgtcaaaaaagat 34822753  T
Q  530 attcaatgttcatttaagactatgaacatt 559  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34822754 cttcattgttcatttaagactatgaacatt 34822783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 135 - 334
Target Start/End: Original strand, 22960214 - 22960413
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22960214 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatgaactttgattaattccttgatatttaacttgtgctct 22960313  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatgt 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  22960314 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagatacaagaaatcaaaggaca-ttgaattcatgaactaactctgaagttcagaatgt 22960412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Original strand, 21782030 - 21782243
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21782030 tgttgaggaaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggactaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 21782129  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatgt 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||  |||||||||||| ||||   ||||| |||||| ||    
T  21782130 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcagaccaagatagaagaaatcaaaggac-gttgaattcatgaactaattatgaagttcagaaagt 21782228  T
Q  334 tagatcagaatgttg 348  Q
    ||| |||||||||||    
T  21782229 tagttcagaatgttg 21782243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 135 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21822186 - 21821997
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || | |||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21822186 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactataatgattaaggactaaatgggttttgattaattccccggtatttaacttgtgctct 21822087  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  |||||||    
T  21822086 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagatacaagaaatcaaaggaca-atgaattcatgaactaattctgaagt 21821997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 20329120 - 20328905
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20329120 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttcgtatttaacttgtgctc 20329021  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||     
T  20329020 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggcttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaa 20328922  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  20328921 gttagttcagaatgttg 20328905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Original strand, 25867587 - 25867800
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25867587 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaagattaaattgactttgattaattccttggtatttaaattgtgctct 25867686  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||||    
T  25867687 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaatg 25867785  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    || |||||||| ||||    
T  25867786 tt-gatcagaaagttg 25867800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 26194179 - 26193965
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26194179 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 26194080  T
Q  235 tgagtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| |||||| |    
T  26194079 tgactgtttttactaagacatgaacaaggtttgaatcataccaagatgcatgaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaag 26193981  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||| ||||    
T  26193980 ttagttcagaaagttg 26193965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Original strand, 27065408 - 27065622
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27065408 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattcattccttggtatttaacttgtgctct 27065507  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  |||||||| |||| |||||| ||||| ||||  |||||| |||||| |    
T  27065508 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaagaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaag 27065606  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  27065607 ttagttcagaatgttg 27065622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 18097672 - 18097459
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  18097672 tgttgaggtaaaatccctaattaattttaaggataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattcctttgtatttaacttgtgttct 18097573  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatgt 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||  |||||| |||||| ||    
T  18097572 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaataataccaagatacaagaaatcaaagaaca-ttgaatccattaactaattctgaagttcagaaagt 18097474  T
Q  334 tagatcagaatgttg 348  Q
    ||| |||||| ||||    
T  18097473 tagttcagaaagttg 18097459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 134 - 303
Target Start/End: Original strand, 20311620 - 20311790
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20311620 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaaatccttggtatttaacttgtgctc 20311719  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttga 303  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  |||||||| |||||||||    
T  20311720 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaagacatttga 20311790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 134 - 300
Target Start/End: Original strand, 37011345 - 37011511
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37011345 ttgttgaggcaaaatccatgattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 37011444  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatt 300  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||  ||  ||| |||||||||||    
T  37011445 ttgagtgttttactaagacatgaacaaggtttgaataataccaagatacattaaaacaaaggacatt 37011511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Original strand, 20308142 - 20308356
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  20308142 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaaatcattggtatttaacttgtgctct 20308241  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| ||  |||| ||||  |||||| |||||| |    
T  20308242 tgagtgttttcactaagacatgaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggacatttg-atcaatgaactaattctgaagttcagaaag 20308340  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  20308341 ttagttcagaatgttg 20308356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 256 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 18062829 - 18062515
Alignment:
Q  256 aacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgttagatcagaatgttgctcgaa- 354  Q
    ||||| |||||||||| |||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||  ||| || | ||| ||||||||||||||  |     
T  18062829 aacaaagtttaaatcaaaccaagatacaagaaataaaaggacacttgaattcatgaactaactctgagttcaaaaagatagttcagaatgttgctcataa 18062730  T
Q  355 ----gatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacat 450  Q
        ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| |  ||||||||  | |  ||||||    
T  18062729 agttgatcagaatgttcaagcagagttcaaaaggttgttcttatacaagcctagaatctcaagaacatt-atcaa-gaacatgcaagctatacgtgacat 18062632  T
Q  451 gggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagact 550  Q
    |   | |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||| | |||||||| | |  |||||||||||||||||||||    
T  18062631 gaacaaatgtccaggaaagtacatctccatggatcaatgaagcaataaagacatttataaggttaatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagact 18062532  T
Q  551 atgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||| |||||    
T  18062531 atgaacattgaagtact 18062515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 134 - 325
Target Start/End: Original strand, 12418170 - 12418361
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12418170 ttgttgaggcaaaattcctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaatttcttggtatttaacttgtgctc 12418269  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagt 325  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || || | |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||||    
T  12418270 ttgagtgttttaactaagacaggaaaaaagtatgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagt 12418361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1975447 - 1975282
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1975447 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 1975348  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  | || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  1975347 ttgagtggttaactaagacaggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 1975282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1982813 - 1982648
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  1982813 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgttc 1982714  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  | || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  1982713 ttgagtggttaactaagacaggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 1982648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 135 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1990230 - 1990066
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  1990230 tgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgttct 1990131  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    |||||| || |||||||||||||||||  | || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  1990130 tgagtggttaactaagacaggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 1990066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 359 - 567
Target Start/End: Original strand, 22956116 - 22956322
Alignment:
Q  359 agaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatat 458  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||| ||||  |||||||  || ||    
T  22956116 agaatgttcaagcagagttcagaagggttctcttatacaagccaagaatctcaagaacatt-atcaa-gatcatgcaagtcacacgtgacatgaataaat 22956213  T
Q  459 gtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacat 558  Q
    ||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||| | |  ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  22956214 gtctaggaaagtacattttcatgaatcaatcaaacaatagaggcatttacaaggttaatgtcaaaaaggatatttaaggttcatttaagactatgaacat 22956313  T
Q  559 tgatgtact 567  Q
    ||| |||||    
T  22956314 tgaagtact 22956322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 244
Target Start/End: Original strand, 4950355 - 4950464
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4950355 tgttgagacaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattctttggtatttaacttgtgctct 4950454  T
Q  235 tgagtgtttt 244  Q
    ||||||||||    
T  4950455 tgagtgtttt 4950464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 222
Target Start/End: Original strand, 18381418 - 18381506
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtattt 222  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18381418 ttgttgaagcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccattattattaaataattaatggactttgattaattccttggtattt 18381506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 137 - 293
Target Start/End: Original strand, 50940496 - 50940651
Alignment:
Q  137 ttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttg 236  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||   |||||||||    
T  50940496 ttgaggcaaaatccttaaataattttaaagataacaaactttgatgattaaagaattaatggactttgattagtttcttggt-tttaatacgtgctcttg 50940594  T
Q  237 agtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaa 293  Q
    |||| || ||||||||| ||||||  | ||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  50940595 agtgattaactaagacaagaacaatatataaatcaaaccaagaagcaagtaatcaaa 50940651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 181 - 299
Target Start/End: Original strand, 41207882 - 41208000
Alignment:
Q  181 tgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaa 280  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| || || |||||||||||     
T  41207882 tgattaaatgattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttgagtggttaactaagacagaaacaagtttcaattcataccaagat 41207981  T
Q  281 tcaagaaatcaaaggacat 299  Q
     |||  |||||||||||||    
T  41207982 acaaagaatcaaaggacat 41208000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 270
Target Start/End: Original strand, 2371533 - 2371669
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |   ||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  2371533 ttgttgaggcaaaatccttaattatttttaaaaataataaccctttatgattaaggaattaaggaactctgattaattccttggtatttaccttgaactc 2371632  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatc 270  Q
    | |||||||| |||||||||  |  ||||||||||||    
T  2371633 tagagtgtttaactaagacataacgaaggtttaaatc 2371669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 300
Target Start/End: Original strand, 30209518 - 30209683
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||  ||| || |||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||  || ||||||||| |||| |||    
T  30209518 tgttgaggcaaaatctctaaatagttttaaagataacaaactttgatgattaaaggattaatggattttgattagttttttagtatttaacatgtgttct 30209617  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatt 300  Q
    |||||  || ||||||||| ||| || || ||||||| ||||| || |||| |||||||| |||||    
T  30209618 tgagttattaactaagacacgaaaaacgtataaatcaaaccaaaaagcaagtaatcaaagaacatt 30209683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 457 - 557
Target Start/End: Original strand, 21782346 - 21782445
Alignment:
Q  457 atgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaac 556  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||| |||    
T  21782346 atgtccagtaaagtacatctacatggatcaatcaagcaataaaggcatttacaagaataatgtcaaa-aaggtcttcaaggttcattcaagactataaac 21782444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 25824128 - 25823892
Alignment:
Q  181 tgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaa 280  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  | | ||| ||||||    |||| ||||||||| || || ||||||  |||||  |||||||||||||||||     
T  25824128 tgattaaaggattaatggactttgat--agttctttgtatttg---tgtgttcttgagtgattaaccaagacacaaacaaattttaaatcataccaagat 25824034  T
Q  281 tcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgttagatcagaatgttgctc-gaa----gatcagaatgttc-aagctga 374  Q
     |||||||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||  ||| || ||| | ||| | |||||||| |||    ||||||||||||| | || ||    
T  25824033 acaagaaatcaaaggatgtttgaattcatgaattaactctgagttcataaagttggttcatagtgttgctcagaaagttgatcagaatgttcgaggcaga 25823934  T
Q  375 gatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaac 416  Q
    | || |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  25823933 ggtcggaaggttgttcttatacaaacaaagaatctcaagaac 25823892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 211
Target Start/End: Original strand, 20585212 - 20585289
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaatt 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||| |||    
T  20585212 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattnatt 20585289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 457 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 21821861 - 21821764
Alignment:
Q  457 atgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaa 555  Q
    |||||||| ||||||||| | | || |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||    
T  21821861 atgtccagtaaagtacatctacttgaatcaatcaagcaataaaggcatttacaagaataatgtcaaaaaagtc-ttcaaagttcattcaagactatgaa 21821764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 2653154 - 2653041
Alignment:
Q  180 atgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaaga 279  Q
    |||||||||  ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||||  |||||||| || | ||||| |||||||| ||  |||||| |||||||    
T  2653154 atgattaaaagattaatgaagtttgattaatttcttggtatttaatatgtgtgcttgagtgattaaataagagaggaacaaagtacaaatcagaccaaga 2653055  T
Q  280 atcaagaaatcaaa 293  Q
    |||||| |||||||    
T  2653054 atcaagtaatcaaa 2653041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 348
Target Start/End: Original strand, 49332764 - 49332878
Alignment:
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    ||||||| || || ||||||  ||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| |||||| |    
T  49332764 ttgagtgattaaccaagacacaaacaaagtttaaataataccaagatgcaagaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaag 49332862  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  49332863 ttagttcagaatgttg 49332878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 13404321 - 13404219
Alignment:
Q  181 tgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaa 280  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||  | | |||||||||||| |||||  ||| | || || ||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||    
T  13404321 tgattaaaggattaatgaactttgat--agttcttggtatttaatttgtgtccttcaatgattaactaagacaggaacaaaatataaatcaaaccaagaa 13404224  T
Q  281 tcaag 285  Q
    |||||    
T  13404223 tcaag 13404219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 459 - 559
Target Start/End: Original strand, 22960527 - 22960626
Alignment:
Q  459 gtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaaca 557  Q
    |||||| || |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||| ||||  || ||||||||| ||||||||||||||    
T  22960527 gtccagaaaggtacatctgcatggatctatcaa-caataaaggcatggacaaggaactatgtcaaa-aaggtctttaatgttcatctaagactatgaaca 22960624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 456 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 18097360 - 18097324
Alignment:
Q  456 tatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaag 492  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18097360 tatgtccaggaaagtacagttgcatggatcaatcaag 18097324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 459 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 26193865 - 26193811
Alignment:
Q  459 gtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagga 513  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||    
T  26193865 gtccagtaaagtacatttgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaagga 26193811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 457 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 25823877 - 25823832
Alignment:
Q  457 atgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggc 502  Q
    |||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25823877 atgtccataaaaatacgtttgcatggatcaatcaagcaataaaggc 25823832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 191 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19869275 - 19869174
Alignment:
Q  191 attaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatc 290  Q
    ||||||||||||||||  | | |||||||||||   |||| | ||||||  || |||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||  |||    
T  19869275 attaatggactttgat--agttcttggtatttattatgtgtttttgagttattaactaagacaggaacaacgtacaaatcaaaccaagaatcaagcgatc 19869178  T
Q  291 aaag 294  Q
    ||||    
T  19869177 aaag 19869174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 454 - 502
Target Start/End: Original strand, 49332977 - 49333024
Alignment:
Q  454 tatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggc 502  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  49332977 tatatgtccaggaaagtacagttgcatggatgtatcaa-caataaaggc 49333024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 374; Significance: 0; HSPs: 70)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 134 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 17985600 - 17985167
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17985600 ttgttgagacaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 17985501  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17985500 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttagatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagt 17985401  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatg 433  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17985400 tagatcagaatgttgcttgaagatcagaatgttcaagtagagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaaggtcatg 17985301  T
Q  434 caaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 533  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17985300 caaggcacatgtgacatgggtatatgtccagaagagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagggttatgtcaaagaaggcattc 17985201  T
Q  534 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17985200 aatgttcatttaagactataaacattgatgtact 17985167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 135 - 567
Target Start/End: Original strand, 16252746 - 16253178
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataa-ttaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16252746 tgttgaggcaaaatccctaaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 16252845  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16252846 ttgagtgttttaataagacaggaacaatgtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagt 16252945  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16252946 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagagtctcaagaactttgatc-aaggtcatg 16253044  T
Q  434 caaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 533  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||    
T  16253045 caaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaggctattc 16253144  T
Q  534 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16253145 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 16253178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 134 - 567
Target Start/End: Original strand, 52498464 - 52498897
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52498464 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataatgaaccaatattattaaagaattaatgaactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 52498563  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  52498564 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaaacataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagt 52498663  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatg 433  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||| || || ||||||    
T  52498664 tagatcagaatgttgctcagagatcagaatgttcaagcagagatcagaaggttgttcttatgcaagccaataatctcaagaacattggtcgaa-gtcatg 52498762  T
Q  434 caaggcacatatgacatgggtatatgtcca-ggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcatt 532  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  52498763 caaggcacatgtgacatggatatatgtccagggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcatt 52498862  T
Q  533 caatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52498863 caatgttcatttaagactatgaacattaatgtact 52498897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 134 - 567
Target Start/End: Original strand, 15668521 - 15668953
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15668521 ttgttgaggctaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattatagaattaatggactttgattaattccttggtatgtaacttgtgctc 15668620  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15668621 ttgagtgttttaccaagacaggaacaaagttcaaatcataccaggaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagt 15668720  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatg 433  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  15668721 tagattagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagcagatatcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactttgatc-aaggttatg 15668819  T
Q  434 caaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 533  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||    
T  15668820 taaggcacatgtgacatggatatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagtaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattc 15668919  T
Q  534 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15668920 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 15668953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 134 - 567
Target Start/End: Original strand, 26330559 - 26330991
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26330559 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattagagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgatc 26330658  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  26330659 ttgcgtgttttactaagacatgaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaagaaaatttgaattcatgatctaacacggaggtcagaaagt 26330758  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26330759 tagatcagaatgttgctcgaagatcacaatgttcaagcagagatcagaaggatgttcttatacaagccaagaatctcaagaactttgatc-aaggtcatg 26330857  T
Q  434 caaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 533  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |  ||||    
T  26330858 caaggcacatgtgacatggatatatgtacaggaaagtacatctgcatggatcaattaagcaataaagacatatacaaggattatgtcaaaaaggatattc 26330957  T
Q  534 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26330958 aatgttcatttaagaccatgaacattgatgtact 26330991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 135 - 567
Target Start/End: Original strand, 17160573 - 17161004
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  17160573 tgttaaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattcattggtatttaacttgcgctct 17160672  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17160673 tgagtatttcactaagacatgaacaaggtttcaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaatgtt 17160772  T
Q  335 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  17160773 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaaacagagattagaaggttgttcttatacaagtcaagaatgtaaagaactttgatc-aaggtcatgc 17160871  T
Q  435 aaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattca 534  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| | |  ||||     
T  17160872 aaggcacatgtgacacggatatatatctaggaaagtacatttgcatggatcaatcaatcaataaaggcatatacaataattatgtcaaaaaggatattcg 17160971  T
Q  535 atgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17160972 atgttcatttaagactatgaacattgatgtact 17161004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 135 - 368
Target Start/End: Original strand, 40921027 - 40921260
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40921027 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 40921126  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  40921127 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactaaggtcagaaagtt 40921226  T
Q  335 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40921227 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 40921260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 156 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 9836752 - 9836362
Alignment:
Q  156 taattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttgagtgttttactaagacagg 255  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  9836752 taattttaaagataataaacctttatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttgagtgttttactaaaacaag 9836653  T
Q  256 aacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgttagatcagaatgttgctcgaag 355  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||          
T  9836652 aacaaggttttaatcataccaagattcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgacgtcagaaagttagatcagaatgttgc------ 9836559  T
Q  356 atcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggta 455  Q
               | ||   |||||||||||||||||||| ||||||  | ||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||  ||    
T  9836558 -----------ctag---agatcagaaggttgttcttatacaagcacataatcttaagaacattgatcaaa-gtcatgcaagacacacatgtcatgaata 9836474  T
Q  456 tatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaa 555  Q
     |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |  | ||||||||||||||||||||||||    
T  9836473 aatgttcaggaaaatacatttgcatggatcaatcaagcaataaagacatatacaaggattatgtcaaaaaggatactcaatgttcatttaagactatgaa 9836374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 133 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18106243 - 18106016
Alignment:
Q  133 cttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 232  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106243 cttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 18106144  T
Q  233 cttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatg 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  18106143 cttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaag 18106044  T
Q  333 ttagatcagaatgttgctcgaagatcag 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106043 ttagatcagaatgttgctcgaagatcag 18106016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 134 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 6406556 - 6406125
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6406556 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccttgatgataaaggaattaatgggctttgattaatttcttggtatttaacttgtgctc 6406457  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||  ||| || ||    
T  6406456 ttgagtgtttaactaagacaggaacaatgtttaaatcataccaagatacaagaaatcaaaggacatttgaattcatgaactaactatgagttcaaaaagt 6406357  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatg 433  Q
    ||| ||||||||||||||  | |||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||  | ||| |||  ||||    
T  6406356 tagttcagaatgttgctcagatatcataatgtttaagcagagttcagaaggttgttcttatacaagcccagaaactaaagaacaat-atc-aagaacatg 6406259  T
Q  434 caaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 533  Q
    |||||||||  |||||||  || |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||| | |||||||| | |  ||||    
T  6406258 caaggcacacttgacatgaataaatgtccaggaaaatacattttcatggatcaattaagcaattaagacatttacaaggttaatgtcaaaaatgatattc 6406159  T
Q  534 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6406158 aatgttcattaaagactatgaacattgaagtact 6406125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 135 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 13403751 - 13403339
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaa-atatgattaaag-aattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 232  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13403751 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaattttaaatgattaaaggaattaatcgactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 13403652  T
Q  233 cttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatg 332  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  13403651 cttgagtgttttattaagacagaaataaaagataaatcatatcaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactcatgtcagaaag 13403552  T
Q  333 ttagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcat 432  Q
    ||||||||||||||||||                    | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  13403551 ttagatcagaatgttgct--------------------cagagatcaggaggttgttcttgcacaagccaagaatctcaagaacattgatc-aaggtcat 13403473  T
Q  433 gcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcatt 532  Q
    ||||||||||| |||||||  || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| | |  |||    
T  13403472 gcaaggcacatgtgacatgattaaatgtcctggaaagtaca-ttgcatggatcaatcaagcaataaagacatatataaggattatggcaaaaaggatatt 13403374  T
Q  533 caatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13403373 caatgttcatttaagactatgaacattgaagtact 13403339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 134 - 510
Target Start/End: Original strand, 1292686 - 1293065
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  1292686 ttgttgaggaaaaatccctaattaattttaaagataataaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgata 1292785  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |  |||| ||||| |||||||||||| ||    
T  1292786 ttgagtgttttattaagacatgaacaaggtttaaattataccaagattcaagaaatcaaatgacatttggttctatgaactaactctgaagtcagaaagt 1292885  T
Q  334 tagatcagaatgttgctc--gaag---atcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaagg 428  Q
    ||| ||| ||||||||||   |||   ||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||  |||| ||| |||||||||||| || ||| |||     
T  1292886 tagttcataatgttgctcagtaagtttatcagaatgttcaagcaaaggtcagaaagttgttcttatgcaagtcaataatctcaagaacatt-atc-aaga 1292983  T
Q  429 tcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaa 510  Q
     |||||||| ||| |||||||||   | |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  1292984 acatgcaagtcacttatgacatgaacaaatgtccataaaagtacatttgcatggatcaatcaaacaataaagacatttacaa 1293065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 21845680 - 21845869
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21845680 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 21845778  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21845779 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 21845869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 21855272 - 21855461
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21855272 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 21855370  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21855371 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 21855461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 21901543 - 21901732
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21901543 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 21901641  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21901642 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 21901732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 21911135 - 21911324
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21911135 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 21911233  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21911234 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 21911324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 40921420 - 40921609
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  40921420 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 40921518  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40921519 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 40921609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 18105908 - 18105718
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18105908 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 18105810  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagga-ttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18105809 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 18105718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 5293580 - 5293391
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5293580 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtggtcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 5293482  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5293481 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 5293391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 5303239 - 5303050
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5303239 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtggtcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 5303141  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5303140 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 5303050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 6691795 - 6691984
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6691795 tcagaaggttattcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 6691893  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6691894 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 6691984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 6702201 - 6702390
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6702201 tcagaaggttattcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 6702299  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6702300 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 6702390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 27681243 - 27681054
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  27681243 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacataaatatatgtccaggaaagtacattt 27681145  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27681144 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 27681054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 27690898 - 27690709
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  27690898 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacataaatatatgtccaggaaagtacattt 27690800  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27690799 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 27690709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Original strand, 16248385 - 16248600
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16248385 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 16248484  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  || ||| ||||||     
T  16248485 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctaaagttcagaaa 16248583  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  16248584 gttagttcagaatgttg 16248600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 3488114 - 3487925
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  3488114 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacactt 3488016  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3488015 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatatccaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 3487925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 3497437 - 3497248
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  3497437 tcagaagattgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacactt 3497339  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3497338 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatatccaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 3497248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 16249023 - 16249212
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  16249023 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacactt 16249121  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16249122 gcatggataaattaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 16249212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 135 - 356
Target Start/End: Original strand, 11476422 - 11476644
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaa-caaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||    
T  11476422 tgttgaggcaaaatccttaatttattttaatgataataaaacccttatgattaaagaattaatggactttgatgaatttcttggtatttaacttgcactc 11476521  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| ||    
T  11476522 ttgagtgttttactaagataggaacaaggtataaattataccaagatacaagaaatcaaaggacatttgaattcatgaactaactctgagttcagaaagt 11476621  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaaga 356  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  11476622 tagttcagaatgttgctcgaaga 11476644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Original strand, 6691316 - 6691531
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6691316 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaatcccttggtatttaacttgtgctc 6691415  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  || ||| ||||||     
T  6691416 ttgagtgttttcactaagacaggatcaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctaaagttcagaaa 6691514  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  6691515 gttagttcagaatgttg 6691531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Original strand, 6701722 - 6701937
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6701722 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaatcccttggtatttaacttgtgctc 6701821  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  || ||| ||||||     
T  6701822 ttgagtgttttcactaagacaggatcaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctaaagttcagaaa 6701920  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  6701921 gttagttcagaatgttg 6701937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3488661 - 3488446
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3488661 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 3488562  T
Q  234 ttgagtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||     
T  3488561 ttgagtgtttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaa 3488463  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  3488462 gttagttcagaatgttg 3488446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 7847504 - 7847290
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7847504 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 7847405  T
Q  235 tgagtgttt-tactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| |||||| |    
T  7847404 tgagtgtttatactaagacaggaacaaggattaaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaattcatgaactaattctgaagttcagaaag 7847306  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| ||| |||||||    
T  7847305 ttagttcaaaatgttg 7847290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 134 - 325
Target Start/End: Original strand, 44888075 - 44888265
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44888075 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 44888174  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||||    
T  44888175 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaataataccaagatacatgaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagt 44888265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 135 - 325
Target Start/End: Original strand, 16471979 - 16472168
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16471979 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 16472078  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagt 325  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||||    
T  16472079 taagtattttactaagacaggaacaaggtttaaataataccaagacacaagaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagt 16472168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 5294169 - 5293954
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5294169 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 5294070  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||     
T  5294069 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaa 5293971  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
     |||| |||||||||||    
T  5293970 attagttcagaatgttg 5293954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 435 - 567
Target Start/End: Original strand, 16241695 - 16241827
Alignment:
Q  435 aaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattca 534  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  16241695 aaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaggttattca 16241794  T
Q  535 atgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16241795 atgttcatttaagactatgaacattgatatact 16241827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Original strand, 21845294 - 21845509
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21845294 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 21845393  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||     
T  21845394 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaa 21845492  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
     |||| |||||||||||    
T  21845493 attagttcagaatgttg 21845509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Original strand, 21854723 - 21854938
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21854723 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 21854822  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||     
T  21854823 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaa 21854921  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
     |||| |||||||||||    
T  21854922 attagttcagaatgttg 21854938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Original strand, 21901157 - 21901372
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21901157 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 21901256  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||     
T  21901257 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaa 21901355  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
     |||| |||||||||||    
T  21901356 attagttcagaatgttg 21901372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Original strand, 21910586 - 21910801
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21910586 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 21910685  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||     
T  21910686 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaa 21910784  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
     |||| |||||||||||    
T  21910785 attagttcagaatgttg 21910801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27681831 - 27681616
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27681831 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 27681732  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||     
T  27681731 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaa 27681633  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
     |||| |||||||||||    
T  27681632 attagttcagaatgttg 27681616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 27691442 - 27691227
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27691442 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 27691343  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||     
T  27691342 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaa 27691244  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
     |||| |||||||||||    
T  27691243 attagttcagaatgttg 27691227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3497927 - 3497713
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3497927 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 3497828  T
Q  235 tgagtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| |||||| |    
T  3497827 tgagtgtttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataacaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaag 3497729  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  3497728 ttagttcagaatgttg 3497713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 5303782 - 5303568
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5303782 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 5303683  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||      
T  5303682 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaaa 5303584  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  5303583 ttagttcagaatgttg 5303568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 133 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 17838700 - 17838484
Alignment:
Q  133 cttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17838700 cttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 17838601  T
Q  233 cttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaa 330  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||| ||    
T  17838600 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcaaaa 17838502  T
Q  331 tgttagatcagaatgttg 348  Q
     ||||| |||||||||||    
T  17838501 agttagttcagaatgttg 17838484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 134 - 325
Target Start/End: Original strand, 2828879 - 2829070
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2828879 ttgttgaggcaaaatctctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttgatatttaacttgtgctc 2828978  T
Q  234 ttgagtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagt 325  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||||    
T  2828979 ttgagtgtttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagatacatgaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagt 2829070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 17829308 - 17829093
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17829308 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 17829209  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||| ||     
T  17829208 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcaaaaa 17829110  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  17829109 gttagttcagaatgttg 17829093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Original strand, 12865667 - 12865881
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12865667 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 12865766  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| |||||| |    
T  12865767 tgagtgttttcactaagacaggaacaaaatttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaag 12865865  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  12865866 ttagttcagaatgttg 12865881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 135 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 14601428 - 14601005
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14601428 tgttgaggcaaaattcctaattaattttaaagataatacaccttaatgattaaggaattaatgaactttgattaattcctaggtatttaacttgtgctct 14601329  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||             |||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||| ||||| |||| ||||||| |||    
T  14601328 tgagtattttactaagacatgaac-------------taccaagattcaagaaatcaaaggacatttggttttatgaactaactctgaggtcagaaagtt 14601242  T
Q  335 agatcagaatgttgct-----cgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggt 429  Q
    || ||| ||| |||||      |  ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||| |||      
T  14601241 agttcataatattgcttagtgagttgatcagaatgttcaagtagaggtcagaaggttgttcttatacaagtcaagaatctcaagaacatt-atc-aagaa 14601144  T
Q  430 catgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatc-aagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaagaag 527  Q
    |||||||| ||  | ||| |||   | |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| || || | |  |||||||| | |    
T  14601143 catgcaagtcatttgtgatatgaacaaatgtccagaaaagtacgtttgcatggatcaatcaaagcaataaagacatttataaagttaaatgtcaaaaagg 14601044  T
Q  528 gcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
      |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  14601043 atattcaatgttca-ttaagactataaacattgaagtact 14601005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Original strand, 16628840 - 16629055
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16628840 tgttgaggcaaaatccctaagtaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 16628939  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatca-agaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || | ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||     
T  16628940 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagctcagaaa 16629038  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||| ||||    
T  16629039 gttagttcagaaggttg 16629055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3606773 - 3606559
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3606773 tgttgaggcaaaatccctgattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttaattaattccttggtatttaacttgtgctct 3606674  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||| |||||| |    
T  3606673 tgagtgttttaactaagacagaaaaaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaactctgaagttcagaaag 3606575  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  3606574 ttagttcagaatgttg 3606559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 522960 - 522795
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  522960 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 522861  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  | || | |||||||||  |||  |||||||||||||    
T  522860 ttgagtggttaactaagacaggaacaagtgtaaatttataccaagatacaaagaatcaaaggacat 522795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 134 - 371
Target Start/End: Original strand, 4417027 - 4417271
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttg-------gtatttaact 226  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||| || |||||||  ||  ||        |||||||| |    
T  4417027 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttgatgattaaggaattaatagattttgattttttattttattttttgtatttaaat 4417126  T
Q  227 tgtgctcttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtc 326  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||    
T  4417127 tgtactcttgagtgtttaactaagacaataacaaagtttacatcataccaagatacaaaaaatcaaaggacatttggattcatgaactaacactgagttc 4417226  T
Q  327 agaatgttagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagc 371  Q
    |||| ||||| | ||||||||| ||  |||| |||||| ||||||    
T  4417227 agaaagttagtttagaatgttgttcagagatgagaatgatcaagc 4417271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 135 - 299
Target Start/End: Original strand, 26457675 - 26457839
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26457675 tgttgaggcaaattccctaattaattttaaagataacaaaccttgatgattaaagaattaatagacttcgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 26457774  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    || ||| || ||||||||||||||||| || || ||||||| |||  |||  |||||||||||||    
T  26457775 tgggtggttaactaagacaggaacaagtttcaattcatacccagatacaaagaatcaaaggacat 26457839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 135 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17422062 - 17421899
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  17422062 tgttgaggcaaaatctttaatttattttaaagataacaaactttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 17421963  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||| || || ||||| |||||  |||  |||||||||||||    
T  17421962 tgagtgattaactaagaca-gaacaagtttcaattcatatcaagatacaaagaatcaaaggacat 17421899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 27567130 - 27567058
Alignment:
Q  65 tactgattatgttagaggattggatgagaaagaaatatttgaattctgatgatttatgatgcaaaagacttgt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27567130 tactgattatgttagaggattggatgagaaagaaatatttgaattctgatgatttatgatgcaaaagacttgt 27567058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 137
Target Start/End: Original strand, 27422200 - 27422263
Alignment:
Q  75 gttagaggatt-ggatgagaaagaaatatttgaattctgatgatttatgatgcaaaagacttgt 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27422200 gttagaggatttggatgagaaagaaatatttgaattctgataatttatgatgcaaaagacttgt 27422263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 199
Target Start/End: Original strand, 16241630 - 16241695
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataa-ttaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatgga 199  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16241630 tgttgaggcaaaatccctaaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatgga 16241695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 16211824 - 16211708
Alignment:
Q  232 tcttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaa 330  Q
    ||||||||| || || ||||||  ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||   ||||| ||||||    
T  16211824 tcttgagtgattaaccaagacacaaacaaagtttaaatcataccaagatacaagaaatcaaaggaca-ttaaattcatgaactaattatgaagttcagaa 16211726  T
Q  331 tgttagatcagaatgttg 348  Q
     ||||| |||||||||||    
T  16211725 agttagttcagaatgttg 16211708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 75 - 137
Target Start/End: Original strand, 27414552 - 27414615
Alignment:
Q  75 gttagaggatt-ggatgagaaagaaatatttgaattctgatgatttatgatgcaaaagacttgt 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27414552 gttagaggatttggatgagaaagatttatttgaattatgataatttaggatgcaaaagacttgt 27414615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 132
Target Start/End: Original strand, 27419339 - 27419406
Alignment:
Q  65 tactgattatgttagaggattggatgagaaagaaatatttgaattctgatgatttatgatgcaaaaga 132  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |  ||||||||||    
T  27419339 tactgatgatggcagaggattggatgagaaagaaatatttgaattcttataattcagaatgcaaaaga 27419406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 454 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 53946714 - 53946667
Alignment:
Q  454 tatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggc 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  53946714 tatatgtccaggaaagtacatttgcatggatgtatc-agcaataaaggc 53946667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 459 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 7847177 - 7847122
Alignment:
Q  459 gtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggat 514  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||    
T  7847177 gtccagaaaagtacatttgcatggatctatcaacaaataaaggcatgaacaaggat 7847122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 53946909 - 53946823
Alignment:
Q  262 gtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatgttagatcagaatgttg 348  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||  |||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  53946909 gtttaaataataccaagatacaagaaatcaaaagaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaagttagttcagaatgttg 53946823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 459 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 17828921 - 17828856
Alignment:
Q  459 gtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaa 523  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  17828921 gtccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaa 17828856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 459 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 17838312 - 17838247
Alignment:
Q  459 gtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaa 523  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  17838312 gtccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaa 17838247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 27571493 - 27571452
Alignment:
Q  65 tactgattatgttagaggattggatgagaaagaaatatttga 106  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27571493 tactgatgatggcagaggattggatgagaaagaaatatttga 27571452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 535 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 13793394 - 13793362
Alignment:
Q  535 atgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13793394 atgttcatttaagactatgaacattgaagtact 13793362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 454 - 502
Target Start/End: Original strand, 44888386 - 44888433
Alignment:
Q  454 tatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggc 502  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  44888386 tatatgtccaggaaagtacaattgcatggatgtatc-agcaataaaggc 44888433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 363; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 134 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 75453 - 75020
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataa-ttaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 232  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75453 ttgttgaggcaaaatccctaaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 75354  T
Q  233 cttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatg 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  75353 cttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaag 75254  T
Q  333 ttagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcat 432  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  75253 ttagatcagaatgttgctctaagatcagaatgttcaagcacagatcataagcttgttcttatacaagccaagagtctcaagaactttgatc-aagatcat 75155  T
Q  433 gcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcatt 532  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  75154 gcaaggcacatgtgacatgggaatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggtatt 75055  T
Q  533 caatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75054 caatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 75020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 134 - 567
Target Start/End: Original strand, 7703 - 8136
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataa-ttaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 232  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7703 ttgttgaggcaaaatccctaaattaaatttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 7802  T
Q  233 cttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatg 332  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  7803 cttgagtgttttaataagacaggaacaaagtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcaagatctaacactgaggtcagaaag 7902  T
Q  333 ttagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcat 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7903 ttagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagagtctcaagaactttgatc-aaggtcat 8001  T
Q  433 gcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcatt 532  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||    
T  8002 gcaagacacatgtgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcataaacaaggattatgtcaaagaggttatt 8101  T
Q  533 caatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8102 caatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 8136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0690 (Bit Score: 347; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0690
Description:

Target: scaffold0690; HSP #1
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 134 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 4946 - 4513
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataa-ttaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 232  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4946 ttgttgaggcaaaatccctaaattaattttaaagataataaaccaatatgattagagaattaatggattttgattaattccttggtatttaacttgtgct 4847  T
Q  233 cttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatg 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  4846 cttgagtgttttactaagacaggaacaaagtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaag 4747  T
Q  333 ttagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcat 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4746 ttagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagaatcacaagaactttgatc-aaggtcat 4648  T
Q  433 gcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcatt 532  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||    
T  4647 gcaaggcacatgtgacatggatatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaaaaggatatt 4548  T
Q  533 caatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4547 caatgtgcatttgagactatgaacattgatgtact 4513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 135 - 567
Target Start/End: Original strand, 791070 - 791502
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataa-ttaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  791070 tgttgaggcaaaatccctaaattaattttaaagataataaaccaatatgattagagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 791169  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||    
T  791170 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcatactaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcattatctaacacttatgtcagaaagt 791269  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatg 433  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  791270 tagatcataatgttgctcgaagatcagaatgttcaagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagagtctcaagaactttgatcaaa-atcatg 791368  T
Q  434 caaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 533  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  791369 caaggcacatgtgatacgggaatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggtattc 791468  T
Q  534 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  791469 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 791502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 135 - 567
Target Start/End: Original strand, 17268176 - 17268607
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  17268176 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccattatgattaaagaattaatggactttgatttattcattggtatttaacttgttctct 17268275  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  17268276 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcatactaagattcaagaaatcaaaggacattggaattcatgatctaacactgatgtcagaaagtt 17268375  T
Q  335 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgc 434  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  17268376 agatcagaatgttgctcagagatcagaatgttcaagcagagatcagaaaattgttcttatacaagtcaagaatctcaagaacattgatc-aagatcatgc 17268474  T
Q  435 aaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattca 534  Q
    ||||||||| ||| |||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |  | |||    
T  17268475 aaggcacatgtgatatggataaatttccaggaaggtacatttgcatggatcaatcaagcaacaaaggcatatacaaagattatgtcaaaaaggatactca 17268574  T
Q  535 atgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17268575 atgttcatttaagactatgaacattgaagtact 17268607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 136 - 567
Target Start/End: Original strand, 7757106 - 7757529
Alignment:
Q  136 gttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctctt 235  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||  |       | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7757106 gttgaagcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccattatgcct-------ttatgaactttgattaattccttggtatttaacttgtgctctt 7757198  T
Q  236 gagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtta 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  7757199 gagtgttttactaagacatgaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaactctgaggtcagaaagtta 7757298  T
Q  336 gatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgca 435  Q
     |||||||||||||||  |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  7757299 tatcagaatgttgctcagagatcataatgttcaattagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaacattgatc-aaggtcatgca 7757397  T
Q  436 aggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaa 535  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |  | ||||    
T  7757398 aggcacatgagacatggatatatgtctaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaagacatatacaagaattatgtcaaaaaggatactcaa 7757497  T
Q  536 tgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7757498 tgttcatttaagactatgaactttgatgtact 7757529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 134 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 21988745 - 21988511
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21988745 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgaataaagaattaatggactttgattaatttcttggtatttaacttgtgctc 21988646  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  21988645 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagt 21988546  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21988545 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 21988511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 135 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 21998262 - 21998029
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21998262 tgttgaggtaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgaataaagaattaatggactttgattaatttcttggtatttaacttgtgctct 21998163  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  21998162 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagtt 21998063  T
Q  335 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21998062 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 21998029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 134 - 547
Target Start/End: Original strand, 20098148 - 20098559
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  20098148 ttgttgaggcaaaatctctaattaattttaaggataataaaccttgatggttaaggaattaatggactttgattaatttcttagtttttaacttgtgctc 20098247  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| ||    
T  20098248 ttgagtgtttaactaaaacaagaacaaggtttaaatcataccaagattcaagaaatcaatggacatttgaattcatgaactaactctgagttcagaaagt 20098347  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatg 433  Q
    ||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||||||  | ||| |||  ||||    
T  20098348 tagttcaaaatgttgctcagagatcagaatattcaagcagagttaagaaggttgttcttatacaagcccataaaatcaagaac-atcatc-aagagcatg 20098445  T
Q  434 caaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 533  Q
    ||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  | |||||||| |||  ||||    
T  20098446 caaggcacacatgacatgaataaatgtccaggaaagtacacttgcatggatcaatcaagcaataaaagcatttacaagattaatgtcaaaaaagatattc 20098545  T
Q  534 aatgttcatttaag 547  Q
    ||||||||||||||    
T  20098546 aatgttcatttaag 20098559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 134 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 2691022 - 2690584
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2691022 ttgttgaggcaaaatccttaattaattttaaagacaataaactttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttcttggtatttaacttgtgctc 2690923  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatg 332  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||  |||  |||||| |    
T  2690922 ttgagtgtttttactaagacaggaacaaagtttaaattataccaagattcaagaaatcaaaggacatttgattttatgaactaactttgagttcagaaag 2690823  T
Q  333 ttagatcagaatgttgctc---gaa--gatcagaatg-ttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaa 426  Q
    |||| ||||||||||||||   |||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| || || |||    
T  2690822 ttagttcagaatgttgctcagtgaattgatcagaatgtttcaagcagagttcagaaggttggtcttatacaagccaagaaactcaagaacatt-at-aaa 2690725  T
Q  427 ggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaa 526  Q
       |||||||| ||||  |||||||  ||  | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| | | ||||||||||     
T  2690724 aaacatgcaagtcacacgtgacatgaataagtatccagaaaagtacaattgcatggatcaatcaagcaatagaggtatttacaaagttaatgtcaaagag 2690625  T
Q  527 ggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  2690624 gatattcaatgttcattttagactatgaacattgaagtact 2690584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 135 - 335
Target Start/End: Original strand, 25034631 - 25034831
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25034631 tgttgagacaaaattcctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 25034730  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  25034731 tgagtgttttagtaagacaggaacaagttttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagtt 25034830  T
Q  335 a 335  Q
    |    
T  25034831 a 25034831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 129 - 306
Target Start/End: Original strand, 21446758 - 21446935
Alignment:
Q  129 aagacttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttg 228  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21446758 aagagttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttg 21446857  T
Q  229 tgctcttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaatt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21446858 tgctcttgagtgttttactaagacaggaacaaagtttagatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaatt 21446935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 9325518 - 9325329
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9325518 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 9325420  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9325419 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 9325329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 21203296 - 21203107
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21203296 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 21203198  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21203197 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 21203107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 21213712 - 21213523
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21213712 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 21213614  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21213613 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 21213523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Original strand, 21333875 - 21334064
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21333875 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 21333973  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21333974 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 21334064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 21988422 - 21988233
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21988422 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-gatcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 21988324  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21988323 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 21988233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 21997956 - 21997767
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21997956 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-gatcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 21997858  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21997857 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 21997767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 9325990 - 9325775
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9325990 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 9325891  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  || ||| ||||||     
T  9325890 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctaaagttcagaaa 9325792  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  9325791 gttagttcagaatgttg 9325775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21203823 - 21203608
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21203823 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 21203724  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  || ||| ||||||     
T  21203723 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctaaagttcagaaa 21203625  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  21203624 gttagttcagaatgttg 21203608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21214238 - 21214024
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21214238 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 21214139  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  || ||| |||||| |    
T  21214138 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctaaagttcagaaag 21214040  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  21214039 ttagttcagaatgttg 21214024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Original strand, 21333276 - 21333491
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21333276 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 21333375  T
Q  234 ttgagtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  || ||| ||||||     
T  21333376 ttgagtgctttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctaaagttcagaaa 21333474  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  21333475 gttagttcagaatgttg 21333491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 14894861 - 14894646
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14894861 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 14894762  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||     
T  14894761 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaactctgaagttcagaaa 14894663  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  14894662 gttagttcagaatgttg 14894646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 20532071 - 20531856
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20532071 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 20531972  T
Q  234 ttgagtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||     
T  20531971 ttgagtgtttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcatgaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaa 20531873  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  20531872 gttagttcagaatgttg 20531856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 14882495 - 14882280
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14882495 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 14882396  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||     
T  14882395 ttgagtgttttcactaagacagaaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaactctgaagttcagaaa 14882297  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  14882296 gttagttcagaatgttg 14882280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 32008547 - 32008333
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32008547 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 32008448  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| |||||| |    
T  32008447 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaag 32008349  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  32008348 ttagttcagaatgttg 32008333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 137 - 348
Target Start/End: Original strand, 5758713 - 5758925
Alignment:
Q  137 ttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttg 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5758713 ttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattctttggtatttaacttgtgctcttg 5758812  T
Q  237 agtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatgtt 334  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||| | ||  |||||| |||||| |||    
T  5758813 agtgtttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagatacatgaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaaccaattctgaagttcagaaagtt 5758911  T
Q  335 agatcagaatgttg 348  Q
    || |||||||||||    
T  5758912 agttcagaatgttg 5758925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Original strand, 13673490 - 13673704
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13673490 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 13673589  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||| || |    
T  13673590 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcaaaaag 13673688  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  13673689 ttagttcagaatgttg 13673704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 31992180 - 31991965
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31992180 ttgttgaggaaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 31992081  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  || ||| ||||||     
T  31992080 ttgagtgttttcactaagactggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctaaagttcagaaa 31991982  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  31991981 gttagttcagaatgttg 31991965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 33774870 - 33774656
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33774870 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggatcaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 33774771  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| |||||| |    
T  33774770 tgagtgttttcactaagacatgaacaaagtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaag 33774672  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  33774671 ttagttcagaatgttg 33774656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 135 - 279
Target Start/End: Original strand, 3967328 - 3967473
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3967328 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 3967427  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaaga 279  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3967428 tgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaaga 3967473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 134 - 325
Target Start/End: Original strand, 25506809 - 25506999
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25506809 ttgttgaggcaaa-tccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 25506907  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagt 325  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||||    
T  25506908 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagt 25506999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 132 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 5868123 - 5867840
Alignment:
Q  132 acttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgc 231  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||    || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5868123 acttgttgaggataaatccttaattaattttaaagataacaaaccttgattattaaggaattaatggactttgattaatttcttggtatttaacttgtgc 5868024  T
Q  232 tcttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaat 331  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||  || |||| ||||| | ||  |  |||     
T  5868023 tcttaagtgtttaactaagaccggaacaaagtttaaatcataccaatttacaagaaatcaaaggacatttggttttatgaactaactcagagtttggaaa 5867924  T
Q  332 gttagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaa 415  Q
    ||||| |||||| |||||||  || ||| ||| ||||| | ||| ||| || |||||||||| |||| || |||| ||||||||    
T  5867923 gttagttcagaaagttgctcatagttcaaaatattcaaacagagttcataaagttgttcttatacaatcccagaagctcaagaa 5867840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 135 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26363082 - 26362918
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26363082 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 26362983  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||  |||  |||||||||||||    
T  26362982 tgagtggttaactaagacaggaacaagttttaatttataccaagatacaaagaatcaaaggacat 26362918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 137 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12842235 - 12842073
Alignment:
Q  137 ttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttg 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||| |||||||| || |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  12842235 ttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataacaaactttgatgattaaggaattaatagaatttgattaatttgttggtatttaatttgtgctcttg 12842136  T
Q  237 agtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatt 300  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  12842135 agtatttaactaagacaggaacaaagtttaaatcataccaagatacaa-aaatcaaaggacatt 12842073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 135 - 279
Target Start/End: Original strand, 14436701 - 14436845
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  14436701 tgttaaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaacattgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctct 14436800  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaaga 279  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||  | ||||||||||||||    
T  14436801 tgagtgattaactaagacaagaacaagtgtaaaatcataccaaga 14436845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 134 - 316
Target Start/End: Original strand, 20707481 - 20707662
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaac-aaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 232  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | |||||||| || |||||  |||||||||| || ||||||||||||||  ||||    
T  20707481 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaaatgattaaggacttaattaactttgattattttcttggtatttaact--tgct 20707578  T
Q  233 cttgagtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaa 316  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  20707579 catgagtgtttttactaagacagaaacaaagtttaaatcgcaccaagatacaagaaatcaaaggaca-ttgaattcatgaactaa 20707662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 135 - 299
Target Start/End: Original strand, 37295289 - 37295453
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||     |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  37295289 tgttgagacaaaatccctaattaattttaaaaataacaaatcttgatgattaaggaattaatggacctcgattaatttcttggtatttaatttgtactct 37295388  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||    
T  37295389 tgagtgtttaactaagacatgaacaaattttaaatcataccaagatacaaaaaatcaaatgacat 37295453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 459 - 523
Target Start/End: Original strand, 13673888 - 13673953
Alignment:
Q  459 gtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaa 523  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  13673888 gtccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaa 13673953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 459 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 14882112 - 14882047
Alignment:
Q  459 gtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaa 523  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  14882112 gtccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaa 14882047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 459 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 14894462 - 14894397
Alignment:
Q  459 gtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggat-tatgtcaaa 523  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  14894462 gtccagaaaagtacatctgcatggatctatcaacaaataaaggcatggacaaggatctatgtcaaa 14894397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 5867721 - 5867693
Alignment:
Q  531 ttcaatgttcatttaagactatgaacatt 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5867721 ttcaatgttcatttaagactatgaacatt 5867693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 531 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 26362707 - 26362679
Alignment:
Q  531 ttcaatgttcatttaagactatgaacatt 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26362707 ttcaatgttcatttaagactatgaacatt 26362679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 134 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 93588 - 93155
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataa-ttaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 232  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  93588 ttgttgaggcaaaatccctaaattcattttaaagataataaaccaatatgattagagaattaatggacttcgattaattccttggtatttaacttgtgct 93489  T
Q  233 cttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatg 332  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  93488 cttgagtgttttactaaaacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaag 93389  T
Q  333 ttagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcat 432  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  93388 ttagatcataatgttgctcgaagatcagaatgttcaagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagagtctaaagaactttgatc-aaggtcat 93290  T
Q  433 gcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcatt 532  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  93289 gcaaggcacatgtgacatgggtatatgtctaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacagggattatgtcaaagaggttatt 93190  T
Q  533 caatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  93189 caatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 93155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 135 - 563
Target Start/End: Original strand, 15183 - 15610
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15183 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatagactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 15282  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  15283 tgagtgttttactaagacaggaacaatgtttaaatcatacgaagaatcaagaaatcaaaggacaattgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagtt 15382  T
Q  335 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgc 434  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15383 agatcagaatgttgcttgaagatcaaaatgttcaagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagagtctcaagaactttgatc-aaggtcatgc 15481  T
Q  435 aaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattca 534  Q
    | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||    
T  15482 acggcatatgtgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggataaatcaagcaataaaggcatatacaaggaatatgtcaaagaggttattca 15581  T
Q  535 atgttcatttaagactatgaacattgatg 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15582 atgttcatttaagactatgaacattgatg 15610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 135 - 368
Target Start/End: Original strand, 52300 - 52533
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52300 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 52399  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  52400 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagtt 52499  T
Q  335 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52500 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 52533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 134 - 368
Target Start/End: Original strand, 87298 - 87534
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  87298 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 87397  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaag--gacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaat 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  87398 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggagacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaa 87497  T
Q  332 gttagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  87498 gttagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 87534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 135 - 368
Target Start/End: Original strand, 12709 - 12942
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  12709 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaaatcattggtatttaaattgtgctct 12808  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  12809 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaggtcagaaagtt 12908  T
Q  335 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttca 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12909 agatcagaatgttactcgaagatcagaatgttca 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 134 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 29498 - 29068
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29498 ttgttgaggtaaaatccctaattagttttaaagataataaaccttaatgattaaggaattaatagactttgattaatttcttggtatttaacttgtgctc 29399  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcag-aatg 332  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| || | ||||| ||      
T  29398 ttgagtgttttactaagacatgaacaaggtttaaattataccaagattcaagtaatcaaaggacatttgattttatgaactaactctaaggtcagaaaaa 29299  T
Q  333 ttagatcagaatgttgctc-----gaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaag 427  Q
    |||| || |||||||||||     |  |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||| |||    
T  29298 ttagttccgaatgttgctcaatgagttgatcagaatgttcaactagagatcagaaggttgttcttaaacaagcaaagaatctcaataacatt-atc-aag 29201  T
Q  428 gtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaag 527  Q
      |||||||| ||| | ||||||   || || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||| | |    
T  29200 aacatgcaagtcacttgtgacataaataaatttccataaaagtacatttgcatgg-tcaatcaagcaataaatgcatttacaaggttaatgtcaaaaagg 29102  T
Q  528 gcattcaatgttcatttaagactatgaacattga 561  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29101 atattcaatgttcatttaagactatgaacattga 29068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 160; Significance: 5e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 137 - 559
Target Start/End: Original strand, 13154 - 13579
Alignment:
Q  137 ttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttg 236  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13154 ttgaggcaaaatccttaattaattttaaagataataaaacttgatgattaaggaatcaatggactttgattaatttcttggtatttaacttgtgctcttg 13253  T
Q  237 agtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgttag 336  Q
    | ||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||||    
T  13254 aatgttttactaagacatgaaaaatgtttaaatcattccaagatacaagaaatcaaaggacatttgaattcatgaactaactctgagttcagaaagttag 13353  T
Q  337 atcagaatgttgct-----cgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtca 431  Q
     | |||||||||||      |  ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||| || ||| |||  ||    
T  13354 tttagaatgttgctaagggagttgatcaaaatgttcaagtagagctcagaaggttgtccttatacaagcctagaaactcaagaacatt-atc-aagaaca 13451  T
Q  432 tgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcat 531  Q
    |||||| |||| ||||| ||  || || ||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||| | |  ||    
T  13452 tgcaagacacacatgacttgaataaatttcaggtaaagtacatttgcatcgatcaatcaagcaataaagacaattacaaggttaatgtcaaaaaggatat 13551  T
Q  532 tcaatgttcatttaagactatgaacatt 559  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  13552 tcgatgttcatttaagactatgaacatt 13579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 6)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 234480 - 234291
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  234480 tcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 234382  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  234381 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 234291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 235145 - 234930
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  235145 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 235046  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||     
T  235045 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaa 234947  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  234946 gttagttcagaatgttg 234930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 115260 - 115046
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  115260 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaactcgtgttct 115161  T
Q  235 tgagtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| |||||| |    
T  115160 tgagtgtttttactaagacatgaacaaggattaaatcataccaagatgcatgaaatcaaaggaca-ttgaattcatgaactaattctgaagatcagaaag 115062  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  115061 ttagttcagaatgttg 115046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 134 - 371
Target Start/End: Original strand, 167451 - 167688
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  167451 ttgttgaggcaaaattcctaattaattttaaagataatagaccttgatgattaaggaattaatggacttggattaatttcttggtatttaacttgtgctc 167550  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||||   |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||  |||||| ||    
T  167551 ttgtgtgtttatctaagacaggaacaaatgttaaatcatacatagatacaagaaatcaaaggacatttggatttatgaactaactctgagttcagaaagt 167650  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagc 371  Q
    ||  ||| ||||||||||  || |||||||||||||||    
T  167651 taattcaaaatgttgctcatagttcagaatgttcaagc 167688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 134 - 300
Target Start/End: Original strand, 146033 - 146202
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaaga--taataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgc 231  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146033 ttgttgaggaaaaatccctaattaattttaaagagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgc 146132  T
Q  232 tcttgagtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatt 300  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  146133 tcttgagtgtttttactaagacaggaacaacgtttgaatcataccaagatgcatgaaatcaaaggacatt 146202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 134 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 154254 - 154063
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  154254 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttaattaattccttggtatttaacatgttcgc 154155  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagt 325  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||||    
T  154154 tttagtgtttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagatgcatgaaaacaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagt 154063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 377 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 8334 - 8145
Alignment:
Q  377 tcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacattt 476  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8334 tcagaaggttattcttatacaagccaagaatctcaagaactgtgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtgacatgaatatatgtccaggaaagtacattt 8236  T
Q  477 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8235 gcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagagttatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 8145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8813 - 8598
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8813 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaatcccttggtatttaacttgtgctc 8714  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  || ||| ||||||     
T  8713 ttgagtgttttcactaagacaggatcaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctaaagttcagaaa 8615  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  8614 gttagttcagaatgttg 8598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 135 - 559
Target Start/End: Original strand, 65023 - 65444
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||| |||||  | || ||||||||||||||||||    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  65023 tgttgaggcagaatccccatttcattttaaagataataaaccttgatgattaaggaattaatagactttgattaatttcttgatatttaacttgtgctct 65122  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgtt 334  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||  |  |||| ||||| ||||  ||| || |||    
T  65123 tgagtgtttaactaagacaagaacaaggtttaaatcataccaagatacaagaaatcaaa-gacatttggttatatgaactaactctgagttcaaaaagtt 65221  T
Q  335 agatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgc 434  Q
     | |||||| |||||||  || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| || ||| |||  ||||     
T  65222 ggttcagaaagttgctcatagttcagaatgttcaagcagagttcagaaggttgttcttatacaagcccagaagctcatgaacatt-atc-aagaacatga 65319  T
Q  435 aaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattca 534  Q
     |||||||  | ||||| ||| |||||||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||||  ||| ||||||  | |||||||| |||   ||||    
T  65320 gaggcacacgtaacatgagtaaatgtccaataaagtacattgacatggaacaatcaagcaataaatacatttacaagattaatgtcaaaaaagatcttca 65419  T
Q  535 atgttcatttaagactatgaacatt 559  Q
     |||||||| |||||||||||||||    
T  65420 gtgttcattcaagactatgaacatt 65444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 135 - 265
Target Start/End: Original strand, 132327 - 132457
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  132327 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 132426  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggttt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  132427 tgagtgttttactaagacaggaacaaggttt 132457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 242404 - 242249
Alignment:
Q  145 aaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttgagtgtttt 244  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||    || ||||||| |||| ||| ||||||||| || || ||||||||| ||||| ||||| ||||||     
T  242404 aaatccctaattaattttaaggataacaaaccttgataattaaaggattattgggctttgattagtttctaggtatttaatttgtgttcttgggtgttta 242305  T
Q  245 actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatt 300  Q
    |||||||||  |||||  | ||||||| || || || |||| |||||||| |||||    
T  242304 actaagacaaaaacaaaatataaatcaaactaaaaagcaagcaatcaaagaacatt 242249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 133 - 279
Target Start/End: Original strand, 22116 - 22263
Alignment:
Q  133 cttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 232  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22116 cttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaccaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgct 22215  T
Q  233 cttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaaga 279  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22216 cttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtctgaatcataccaaga 22263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 135 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 199415 - 198994
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||| ||||| |||  |||| ||||||||||||||||||    ||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  199415 tgttgaagcaaagtcccaaatttattttaaagataataaaccttaatgataaagaaattaatggactttgattaatgtcttggtatttaacttgttctct 199316  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcatacc-aagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgt 333  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  | |  ||| || ||    
T  199315 tgagtgtttaactaagacaggaacaaggttaaaatattaccaaagatacaagaaatcaaaggacatttgcattcatgaactaactttaagttcaaaaagt 199216  T
Q  334 tagatcagaatgttgctcgaagatcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatg 433  Q
    ||| |  ||  |||       ||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||    
T  199215 tag-tttga--gtt-------gatcagaatgttcaagcagagttcagaaggtttctcttatataagccaagaatctcaagaacatt-atc-aagatcatg 199128  T
Q  434 caaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattc 533  Q
    |||| ||||  |||||||  ||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||| | |||||||| | |  |||     
T  199127 caagtcacacgtgacatgaataagtatccaggaaagtacatttgcatgaatcaatcaaacaatagaggcatttacaaggttaatgtcaaaaaggatattt 199028  T
Q  534 aatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  199027 aaggttcatttaagactatgaacattgaagtact 198994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 188981 - 188941
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaac 175  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  188981 tgttgaagcaaaatccctaattaattttaaagataataaac 188941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 117; Significance: 3e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 431 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 56262 - 56126
Alignment:
Q  431 atgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggca 530  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  56262 atgcaaggcacatgtgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaattaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaggtta 56163  T
Q  531 ttcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56162 ttcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 56126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 117; Significance: 3e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 112529 - 112314
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  112529 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 112430  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||     
T  112429 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaa 112331  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  112330 gttagttcagaatgttg 112314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 134 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 103273 - 103163
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  103273 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 103174  T
Q  234 ttgagtgtttt 244  Q
    |||||||||||    
T  103173 ttgagtgtttt 103163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0265
Description:

Target: scaffold0265; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 135 - 325
Target Start/End: Original strand, 10623 - 10812
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || | |||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  10623 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactataatgattaaggactaaatgggttttgattaattccccggtatttaacttgtgctct 10722  T
Q  235 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagt 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  |||||||    
T  10723 tgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagatacaagaaatcaaaggaca-atgaattcatgaactaattctgaagt 10812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 457 - 555
Target Start/End: Original strand, 10948 - 11045
Alignment:
Q  457 atgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaa 555  Q
    |||||||| ||||||||| | | || |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||    
T  10948 atgtccagtaaagtacatctacttgaatcaatcaagcaataaaggcatttacaagaataatgtcaaaaaagtc-ttcaaagttcattcaagactatgaa 11045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1705 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold1705
Description:

Target: scaffold1705; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 368 - 513
Target Start/End: Original strand, 417 - 561
Alignment:
Q  368 aagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaa 467  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  417 aagcagagatcagaaggttgttcttatacaagccaagaatctcaagaactttgatcaa-ggtcatgcaaggcacatgtaacatggatatatgtccaggaa 515  T
Q  468 agtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaagga 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  516 agtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatataagga 561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1705; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 180 - 325
Target Start/End: Original strand, 16 - 161
Alignment:
Q  180 atgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttgagtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaag 278  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16 atgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttgagtgctttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaag 115  T
Q  279 aatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagt 325  Q
    |  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||||    
T  116 atgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagt 161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0590 (Bit Score: 113; Significance: 6e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0590
Description:

Target: scaffold0590; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Original strand, 9604 - 9819
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9604 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattcattggtatttaacttgtgctc 9703  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||     
T  9704 ttgagtgttttcactaagacagaaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaactctgaagttcagaaa 9802  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  9803 gttagttcagaatgttg 9819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 110; Significance: 4e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 1605 - 1389
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1605 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 1506  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatca-agaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaa 330  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || | ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||| | ||||||    
T  1505 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaggttcagaa 1407  T
Q  331 tgttagatcagaatgttg 348  Q
     ||||| |||||||||||    
T  1406 agttagttcagaatgttg 1389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 33605 - 33390
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33605 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataatttttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 33506  T
Q  234 ttgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||     
T  33505 ttgagtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaa 33407  T
Q  332 gttagatcagaatgttg 348  Q
    ||||| |||||||||||    
T  33406 gttagttcagaatgttg 33390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 108; Significance: 6e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 412 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 21612 - 21458
Alignment:
Q  412 agaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaag 511  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21612 agaactttgatcaa-ggtcgtgcaaggcacatgtgacatggatatatgtctaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaag 21514  T
Q  512 gattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  21513 gattatgtcaaaaaggatattcaatgttcatttaagaatatgaacattgttgtact 21458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 139 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23041 - 22915
Alignment:
Q  139 gaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttgag 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23041 gaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaaacaatatgattatagaattaatggacattgattaattccttggtatttaacttgtgctcttgag 22942  T
Q  239 tgttttactaagacaggaacaaggttt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  22941 tgttttactaagacaggaacaaggttt 22915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 266 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 21673 - 21621
Alignment:
Q  266 aaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaaca 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21673 aaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaaca 21621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 59029 - 58815
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  59029 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattcattggtatttaacttgtgctct 58930  T
Q  235 tgagtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| |||||| |    
T  58929 tgagtgtttttactaagacagaaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaag 58831  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| | |||||||||    
T  58830 ttagtttagaatgttg 58815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 57911 - 57697
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  57911 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattcattggtatttaacttgtgctct 57812  T
Q  235 tgagtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||| ||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| |||||| |    
T  57811 taagtgtttttactaagataggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaagcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaag 57713  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  57712 ttagttcagaatgttg 57697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 135 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 67272 - 67082
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67272 tgttgatgcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 67173  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagt 325  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||||    
T  67172 tgagtgttttcactaagacatgaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagt 67082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 134 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 24539 - 24338
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24539 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtggtc 24440  T
Q  234 ttgagtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||  ||| ||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| |||||||    
T  24439 ttgagtgtttttactaagacaagaacaaggttttaatcataccaagatgcataaaagcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaat 24341  T
Q  332 gtt 334  Q
    |||    
T  24340 gtt 24338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0809 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0809
Description:

Target: scaffold0809; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 137 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 416 - 204
Alignment:
Q  137 ttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttg 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  416 ttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaatttgtgctcttg 317  T
Q  237 agtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatgtt 334  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||  ||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| |||||| |||    
T  316 agtgttttcactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaatccaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaagtt 218  T
Q  335 agatcagaatgttg 348  Q
    || |||||||||||    
T  217 agttcagaatgttg 204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 12621 - 12407
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12621 tgttgaggcaaaatccctaattaattttgaatataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 12522  T
Q  235 tgagtgtttt-actaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |  ||||||||||||| |||||| |||||  |||  |||||| |||||| |    
T  12521 tgagtgttttgactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaagatggataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaagtaattctgaagttcagaaag 12423  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  12422 ttagttcagaatgttg 12407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 137 - 300
Target Start/End: Original strand, 53957 - 54121
Alignment:
Q  137 ttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttg 236  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||    
T  53957 ttgaggcaaaatcactaattaattttaaagataataaacttaaatgattaaggacttaatggactttgattattttcttggtatttaacttgtactattg 54056  T
Q  237 agtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||    
T  54057 agtgtttttactaagacaggaacaaggtttaaatctcaccaagatacaagaaatcaaaggacatt 54121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 137 - 300
Target Start/End: Original strand, 57909 - 58073
Alignment:
Q  137 ttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttg 236  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||    
T  57909 ttgaggcaaaatcactaattaattttaaagataataaacttaaatgattaaggacttaatggactttgattattttcttggtatttaacttgtactattg 58008  T
Q  237 agtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||    
T  58009 agtgtttttactaagacaggaacaaggtttaaatctcaccaagatacaagaaatcaaaggacatt 58073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1411 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1411
Description:

Target: scaffold1411; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 134 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 375 - 159
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  375 ttgttgaggttaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggattttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 276  T
Q  234 ttga-gtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaa 330  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||    
T  275 ttgaggtgtttttactaagacaagaacaaggtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaa 177  T
Q  331 tgttagatcagaatgttg 348  Q
     ||||| |||||||||||    
T  176 agttagttcagaatgttg 159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 138 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 267655 - 267494
Alignment:
Q  138 tgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttga 237  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  267655 tgaggtaaaatccctaattaattttaaagataacaaacattgatgattaaggaattaatggactttgattaattttttggtatttaacttgtcctcttga 267556  T
Q  238 gtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  267555 gtgtttaactaagacagaaacaaagtttaactcataccaagaaacaggaaatcaaaagacat 267494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 135 - 348
Target Start/End: Original strand, 18069 - 18283
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18069 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattcattggtatttaacttgtgctct 18168  T
Q  235 tgagtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||| || ||| ||||| ||||  ||| || |||||| |    
T  18169 ttagtgtttttactaagacagaaacaatgtttgaatcataccaagatgcataaaatcaaaggaca-ttaaatccatgaactaattctggagttcagaaag 18267  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  18268 ttagttcagaatgttg 18283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 91; Significance: 8e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 135 - 342
Target Start/End: Original strand, 22694 - 22903
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaa-atatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||   | ||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22694 tgttgaggcaaaattcctaattaattttaaagataataaactttaaatgattaagcattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 22793  T
Q  234 ttgagtg-ttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaat 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||  ||| ||||||||| |||||| ||||| ||||  |||||| ||||||     
T  22794 ttgagtgtttttactaagacaggaacaaggtttgaatcataccaaaatgcataaaaacaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctgaagttcagaaa 22892  T
Q  332 gttagatcaga 342  Q
    ||||| |||||    
T  22893 gttagttcaga 22903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0764 (Bit Score: 86; Significance: 8e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0764
Description:

Target: scaffold0764; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 1542 - 1377
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1542 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 1443  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  | || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  1442 ttgagtggttaactaagacaggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 1377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313 (Bit Score: 86; Significance: 8e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0313
Description:

Target: scaffold0313; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 299
Target Start/End: Original strand, 5067 - 5232
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5067 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 5166  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  | || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  5167 ttgagtggttaactaagacaggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 5232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 299
Target Start/End: Original strand, 19224 - 19389
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  19224 ttgttgaggcaaaatccctaatttattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaatttgttggtatttaacttgtgctc 19323  T
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacat 299  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  | || |||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  19324 ttgagtggttaactaagacaggaacaagtgtaaattcataccaagatacaaagaatcaaaggacat 19389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 134 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 41335 - 41171
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctc 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||     
T  41335 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggactttgattaattttttggtatttaacttgtgctt 41236  T
Q  234 ttgagtgttt-tactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggac 297  Q
    ||||||||||  | ||||| | |||||| |||||| ||||||  |||  ||||||||||||||||    
T  41235 ttgagtgtttaaattaagatatgaacaaagtttaattcatacgtagatgcaagaaatcaaaggac 41171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 137 - 279
Target Start/End: Original strand, 13870 - 14012
Alignment:
Q  137 ttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctcttg 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13870 ttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataacaaaccttgatgattaaggaattaatggattttgattaatttgttggtatttaacttgtgctcttg 13969  T
Q  237 agtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaaga 279  Q
    |||| |  ||||||||||||||||| || || | |||||||||    
T  13970 agtggtcaactaagacaggaacaagtttcaatttataccaaga 14012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 256 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 1431 - 1186
Alignment:
Q  256 aacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaagtcagaatgttagatcagaatgttgctcgaag 355  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||  |||  ||| |||||| | |||||| ||||           
T  1431 aacaaagtttaaatcataccaagatacaagaaatcaatggacatttgaattcatgaaccaactttgagttcaaaatgtt-gctcagaaagttg------- 1340  T
Q  356 atcagaatgttcaagctgagatcagaaggttgttcttaaacaagccaagaatctcaagaactttgatcaaaggtcatgcaaggcacatatgacatgggta 455  Q
    || | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||| || ||||| |  ||||||||| |||| |||||||  ||    
T  1339 attaaaatgttcaagcagagttcagaaggttgttcttatagaagcccataatctcaagaacatt-atcaa-gaacatgcaaggtacatgtgacatgaata 1242  T
Q  456 tatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaag 511  Q
     |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1241 aatgtccagcaaagtacattggaatggatcaatcaagcaataaaggcatttacaag 1186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 396716 - 396616
Alignment:
Q  135 tgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  396716 tgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgattaattccttggtatttaacttgtgctct 396617  T
Q  235 t 235  Q
    |    
T  396616 t 396616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 498 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 17658 - 17589
Alignment:
Q  498 aaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17658 aaggcatatacaaggattatgtcaaaaatgatattcaatgttcatttaagactatgaacattgatgtact 17589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14024 - 13951
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaacaaatatgattaaagaattaatggactttgatt 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||| || | ||||||||||||||    
T  14024 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaactttaatgattaaggattaaatggactttgatt 13951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 445 - 557
Target Start/End: Original strand, 15025 - 15136
Alignment:
Q  445 tgacatgggtatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggcatatacaaggattatgtcaaagaaggcattcaatgttcattt 544  Q
    ||||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||  | |||||||| |||   ||||| |||||||     
T  15025 tgacatgagtaaatgtccaataaagtacatctgcatggatcaatcaagaaataaagacatttacaagactaatgtcaaa-aagatcttcaaggttcattc 15123  T
Q  545 aagactatgaaca 557  Q
    |||||||||||||    
T  15124 aagactatgaaca 15136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0756 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0756
Description:

Target: scaffold0756; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 4055 - 4014
Alignment:
Q  134 ttgttgaggcaaaatccataattaattttaaagataataaac 175  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4055 ttgttgaggcaaaatccctaattaattttaaagataataaac 4014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1468 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold1468
Description:

Target: scaffold1468; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 348
Target Start/End: Original strand, 745 - 859
Alignment:
Q  234 ttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaagaaatcaaaggacatttgaattcatgatctaacactgaag-tcagaatg 332  Q
    ||||||| || || ||||||  ||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||  || ||| |||||| |    
T  745 ttgagtgattaaccaagacacaaacaaagtttaaataataccaagatgcaagaaatcaaaggaca-ttgaatccatgaactaattctaaagttcagaaag 843  T
Q  333 ttagatcagaatgttg 348  Q
    |||| |||||||||||    
T  844 ttagttcagaatgttg 859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1468; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 454 - 502
Target Start/End: Original strand, 958 - 1005
Alignment:
Q  454 tatatgtccaggaaagtacatttgcatggatcaatcaagcaataaaggc 502  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  958 tatatgtccaggaaagtacagttgcatggatgtatcaa-caataaaggc 1005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0713 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0713
Description:

Target: scaffold0713; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 5651 - 5580
Alignment:
Q  213 cttggtatttaacttgtgctcttgagtgttttactaagacaggaacaaggtttaaatcataccaagaatcaa 284  Q
    ||||||||||||| | || |||| |||| || |||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||    
T  5651 cttggtatttaacatatgttcttaagtgattaactaagacaggaacaaagtataaatcaaaccaagattcaa 5580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University