View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14177_low_26 (Length: 453)

Name: NF14177_low_26
Description: NF14177
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14177_low_26
NF14177_low_26
[»] chr8 (61 HSPs)
chr8 (52-310)||(3467428-3467686)
chr8 (159-310)||(41981052-41981203)
chr8 (50-304)||(28425426-28425680)
chr8 (50-261)||(22936747-22936958)
chr8 (52-226)||(3097162-3097336)
chr8 (48-226)||(25697912-25698089)
chr8 (105-261)||(43550835-43550991)
chr8 (54-231)||(41289016-41289193)
chr8 (54-258)||(27649693-27649896)
chr8 (50-232)||(33626988-33627170)
chr8 (54-254)||(4941739-4941939)
chr8 (55-218)||(42143323-42143486)
chr8 (78-265)||(44926781-44926967)
chr8 (95-261)||(40742068-40742234)
chr8 (77-282)||(40742276-40742479)
chr8 (55-219)||(24897547-24897710)
chr8 (80-260)||(6399092-6399272)
chr8 (58-261)||(38152137-38152339)
chr8 (54-226)||(36113999-36114170)
chr8 (80-261)||(8124915-8125095)
chr8 (80-261)||(30081635-30081815)
chr8 (115-308)||(34342873-34343063)
chr8 (50-254)||(440143-440347)
chr8 (95-232)||(42148978-42149115)
chr8 (51-231)||(15206670-15206850)
chr8 (55-191)||(26243138-26243274)
chr8 (50-261)||(38114389-38114599)
chr8 (48-150)||(30759257-30759359)
chr8 (52-180)||(25497717-25497845)
chr8 (195-310)||(26242986-26243101)
chr8 (49-245)||(29023199-29023379)
chr8 (53-258)||(36121502-36121695)
chr8 (143-261)||(26125516-26125634)
chr8 (54-231)||(31246273-31246450)
chr8 (80-232)||(3619053-3619204)
chr8 (53-131)||(30085596-30085674)
chr8 (77-222)||(11126499-11126644)
chr8 (53-185)||(26490953-26491085)
chr8 (71-231)||(35615683-35615843)
chr8 (95-226)||(45147249-45147380)
chr8 (52-134)||(3465396-3465478)
chr8 (170-256)||(16915010-16915096)
chr8 (80-138)||(40792188-40792246)
chr8 (80-161)||(29970846-29970926)
chr8 (77-162)||(36779434-36779518)
chr8 (93-162)||(39219764-39219833)
chr8 (110-161)||(19649230-19649281)
chr8 (95-202)||(23018099-23018206)
chr8 (110-156)||(10552923-10552969)
chr8 (110-232)||(37458313-37458439)
chr8 (80-220)||(8702392-8702531)
chr8 (195-232)||(24297690-24297727)
chr8 (52-120)||(26125842-26125910)
chr8 (80-160)||(31201671-31201750)
chr8 (110-161)||(1373083-1373134)
chr8 (108-158)||(20190186-20190236)
chr8 (95-157)||(35239546-35239608)
chr8 (112-220)||(14382178-14382285)
chr8 (393-422)||(41980939-41980968)
chr8 (93-165)||(37667055-37667126)
chr8 (110-150)||(42600976-42601016)
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (53-289)||(10825999-10826235)
chr6 (51-282)||(33898960-33899191)
chr6 (44-265)||(13739138-13739358)
chr6 (44-252)||(13744651-13744858)
chr6 (52-258)||(6208019-6208224)
chr6 (110-261)||(16548075-16548226)
chr6 (95-257)||(16442349-16442511)
chr6 (55-249)||(17829957-17830151)
chr6 (47-232)||(29409202-29409387)
chr6 (80-260)||(31132401-31132580)
chr6 (79-261)||(21455818-21455998)
chr6 (79-226)||(699529-699674)
chr6 (47-226)||(21254830-21255008)
chr6 (52-231)||(1312395-1312574)
chr6 (55-226)||(16121960-16122131)
chr6 (78-258)||(7215514-7215692)
chr6 (77-180)||(5584030-5584132)
chr6 (53-138)||(29399750-29399835)
chr6 (52-134)||(15151461-15151543)
chr6 (77-138)||(32599443-32599504)
chr6 (77-138)||(26274608-26274669)
chr6 (51-90)||(16548216-16548255)
chr6 (52-136)||(3605708-3605791)
chr6 (108-178)||(10874220-10874290)
chr6 (52-161)||(29682203-29682312)
chr6 (110-178)||(1499975-1500043)
[»] chr7 (50 HSPs)
chr7 (50-308)||(3622401-3622659)
chr7 (51-261)||(37639387-37639597)
chr7 (52-308)||(48459620-48459876)
chr7 (50-257)||(37562531-37562738)
chr7 (53-256)||(3342752-3342955)
chr7 (54-261)||(38230025-38230232)
chr7 (89-308)||(42740302-42740521)
chr7 (51-310)||(43737881-43738140)
chr7 (77-310)||(3750598-3750827)
chr7 (55-275)||(47021862-47022082)
chr7 (51-282)||(3375426-3375657)
chr7 (51-253)||(10371900-10372102)
chr7 (59-258)||(44967349-44967548)
chr7 (55-224)||(43631642-43631810)
chr7 (55-303)||(39391083-39391331)
chr7 (54-276)||(9456047-9456268)
chr7 (46-284)||(34365919-34366156)
chr7 (56-255)||(386428-386627)
chr7 (52-226)||(34010332-34010504)
chr7 (57-274)||(12632031-12632248)
chr7 (56-254)||(46541564-46541762)
chr7 (55-258)||(47217487-47217690)
chr7 (55-240)||(48134558-48134742)
chr7 (48-226)||(41715649-41715827)
chr7 (51-232)||(39977538-39977719)
chr7 (77-224)||(36920146-36920293)
chr7 (52-226)||(32186932-32187106)
chr7 (52-224)||(24770854-24771026)
chr7 (99-288)||(32205855-32206044)
chr7 (52-231)||(42904540-42904719)
chr7 (50-231)||(39634106-39634287)
chr7 (174-284)||(47301622-47301732)
chr7 (50-261)||(34010902-34011114)
chr7 (50-161)||(42752132-42752243)
chr7 (80-157)||(12964659-12964736)
chr7 (53-132)||(19097483-19097562)
chr7 (80-226)||(40903139-40903284)
chr7 (52-206)||(37008296-37008447)
chr7 (110-226)||(1766417-1766533)
chr7 (78-158)||(20088929-20089009)
chr7 (110-158)||(33746449-33746497)
chr7 (195-230)||(37886856-37886891)
chr7 (152-226)||(19095929-19096002)
chr7 (78-130)||(12212438-12212490)
chr7 (110-158)||(38494276-38494324)
chr7 (108-158)||(44274698-44274748)
chr7 (108-161)||(4228604-4228657)
chr7 (110-138)||(7169020-7169048)
chr7 (110-226)||(41625514-41625630)
chr7 (189-233)||(43581620-43581664)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (52-289)||(20813054-20813290)
chr3 (49-276)||(10334059-10334286)
chr3 (53-253)||(10853224-10853424)
chr3 (50-261)||(23496260-23496464)
chr3 (52-256)||(38172263-38172467)
chr3 (53-232)||(26519629-26519808)
chr3 (95-308)||(31084097-31084309)
chr3 (51-288)||(52966764-52967001)
chr3 (52-254)||(35425277-35425477)
chr3 (52-284)||(15511332-15511563)
chr3 (52-260)||(44224699-44224907)
chr3 (51-258)||(30811487-30811693)
chr3 (53-309)||(42318216-42318473)
chr3 (50-257)||(50664699-50664905)
chr3 (48-307)||(16246048-16246305)
chr3 (52-309)||(38125398-38125656)
chr3 (71-282)||(35930653-35930864)
chr3 (53-254)||(38340749-38340949)
chr3 (49-258)||(44939369-44939576)
chr3 (52-276)||(48189398-48189620)
chr3 (51-261)||(3348179-3348389)
chr3 (53-281)||(53074819-53075046)
chr3 (55-252)||(8424689-8424885)
chr3 (71-304)||(23207043-23207274)
chr3 (49-186)||(4984592-4984729)
chr3 (87-258)||(53179788-53179958)
chr3 (95-284)||(25847946-25848134)
chr3 (51-232)||(42475674-42475855)
chr3 (52-149)||(55154549-55154646)
chr3 (49-224)||(21224963-21225138)
chr3 (79-219)||(14651085-14651224)
chr3 (80-231)||(34561074-34561225)
chr3 (84-150)||(29716674-29716740)
chr3 (55-226)||(45423728-45423898)
chr3 (80-166)||(19877448-19877534)
chr3 (95-229)||(30809944-30810078)
chr3 (78-244)||(49526651-49526817)
chr3 (140-232)||(31618931-31619023)
chr3 (142-261)||(32357447-32357566)
chr3 (170-261)||(22736917-22737008)
chr3 (48-105)||(30809912-30809969)
chr3 (79-282)||(14959634-14959829)
chr3 (76-164)||(40415276-40415364)
chr3 (50-134)||(52813278-52813362)
chr3 (52-106)||(31618368-31618422)
chr3 (93-158)||(10852710-10852775)
chr3 (52-161)||(44225601-44225709)
chr3 (56-108)||(35930877-35930929)
chr3 (110-161)||(7012676-7012727)
chr3 (90-156)||(22737055-22737121)
chr3 (80-161)||(21023201-21023280)
chr3 (195-232)||(37698488-37698525)
chr3 (77-162)||(42644297-42644382)
chr3 (192-232)||(40244079-40244119)
chr3 (188-224)||(55087594-55087630)
chr3 (110-158)||(23918881-23918929)
chr3 (93-157)||(41459255-41459319)
chr3 (78-118)||(45488498-45488538)
[»] chr4 (77 HSPs)
chr4 (49-261)||(16566226-16566438)
chr4 (59-308)||(42944861-42945110)
chr4 (50-289)||(43772077-43772316)
chr4 (54-308)||(39636657-39636913)
chr4 (49-254)||(51922868-51923073)
chr4 (52-308)||(49519604-49519863)
chr4 (53-257)||(6138577-6138780)
chr4 (52-275)||(19592187-19592410)
chr4 (50-232)||(29149261-29149443)
chr4 (53-258)||(14072427-14072631)
chr4 (53-253)||(26651805-26652005)
chr4 (54-265)||(43781477-43781687)
chr4 (52-261)||(46830025-46830234)
chr4 (51-310)||(9889290-9889549)
chr4 (56-310)||(9893582-9893837)
chr4 (55-309)||(30842003-30842258)
chr4 (52-231)||(13167476-13167655)
chr4 (56-276)||(13183010-13183230)
chr4 (52-288)||(15603254-15603490)
chr4 (53-224)||(26426072-26426242)
chr4 (52-258)||(32238015-32238220)
chr4 (77-309)||(48407679-48407912)
chr4 (56-258)||(54152969-54153170)
chr4 (50-226)||(14564100-14564276)
chr4 (95-256)||(48550426-48550587)
chr4 (50-261)||(28986942-28987150)
chr4 (93-288)||(4954048-4954243)
chr4 (80-260)||(49136444-49136624)
chr4 (48-232)||(54150476-54150660)
chr4 (49-212)||(39187704-39187867)
chr4 (49-259)||(6505124-6505334)
chr4 (52-226)||(48550173-48550347)
chr4 (105-282)||(56241844-56242021)
chr4 (53-232)||(25312665-25312844)
chr4 (53-240)||(31520328-31520514)
chr4 (95-261)||(15619538-15619701)
chr4 (48-258)||(54735603-54735812)
chr4 (49-258)||(14075939-14076147)
chr4 (170-310)||(55638861-55639001)
chr4 (71-230)||(46926000-46926159)
chr4 (51-160)||(41866176-41866285)
chr4 (110-258)||(2175161-2175309)
chr4 (59-175)||(55638718-55638834)
chr4 (53-226)||(48908231-48908402)
chr4 (50-135)||(53532024-53532109)
chr4 (54-226)||(14054807-14054979)
chr4 (52-231)||(54488556-54488735)
chr4 (77-163)||(33574197-33574283)
chr4 (142-256)||(30887199-30887313)
chr4 (71-231)||(38305962-38306122)
chr4 (52-134)||(4649885-4649967)
chr4 (80-186)||(38263895-38264001)
chr4 (80-160)||(523172-523252)
chr4 (77-309)||(38693921-38694153)
chr4 (87-226)||(19599487-19599624)
chr4 (56-182)||(45779970-45780095)
chr4 (93-161)||(16492948-16493016)
chr4 (95-162)||(36150624-36150691)
chr4 (93-161)||(54487217-54487285)
chr4 (53-148)||(54655266-54655361)
chr4 (78-118)||(16202532-16202572)
chr4 (93-161)||(22699763-22699831)
chr4 (93-161)||(22980699-22980767)
chr4 (93-161)||(22994286-22994354)
chr4 (93-137)||(46958068-46958112)
chr4 (195-226)||(5025485-5025516)
chr4 (110-161)||(38740316-38740367)
chr4 (50-93)||(48550396-48550439)
chr4 (78-155)||(22694579-22694656)
chr4 (55-93)||(26402916-26402954)
chr4 (116-230)||(26402960-26403074)
chr4 (197-283)||(45780923-45781009)
chr4 (80-149)||(48556585-48556655)
chr4 (95-161)||(53914920-53914985)
chr4 (52-93)||(26459852-26459893)
chr4 (110-158)||(28947763-28947811)
chr4 (204-232)||(43628685-43628713)
[»] chr5 (43 HSPs)
chr5 (52-261)||(22482139-22482348)
chr5 (50-289)||(32030638-32030875)
chr5 (53-275)||(41834828-41835050)
chr5 (53-232)||(3667833-3668012)
chr5 (46-232)||(35760168-35760354)
chr5 (49-261)||(10058024-10058236)
chr5 (51-265)||(32454483-32454697)
chr5 (52-252)||(2430250-2430449)
chr5 (48-258)||(40885163-40885374)
chr5 (54-226)||(13253038-13253209)
chr5 (54-261)||(9275439-9275646)
chr5 (51-258)||(40495310-40495516)
chr5 (52-224)||(42146295-42146466)
chr5 (50-224)||(40791021-40791194)
chr5 (56-310)||(7714840-7715095)
chr5 (49-283)||(24045759-24045992)
chr5 (53-258)||(33953856-33954060)
chr5 (52-229)||(39987920-39988097)
chr5 (78-253)||(3060203-3060376)
chr5 (50-229)||(8049002-8049181)
chr5 (56-241)||(4292119-4292304)
chr5 (52-225)||(5710339-5710511)
chr5 (51-254)||(27021085-27021288)
chr5 (71-245)||(41740565-41740739)
chr5 (48-229)||(7385881-7386062)
chr5 (80-258)||(16158446-16158624)
chr5 (80-226)||(7178763-7178908)
chr5 (126-276)||(28869530-28869679)
chr5 (80-187)||(23914235-23914342)
chr5 (80-220)||(34106928-34107068)
chr5 (77-226)||(2694738-2694887)
chr5 (48-134)||(35847839-35847925)
chr5 (110-161)||(2483725-2483776)
chr5 (78-161)||(33467971-33468054)
chr5 (95-183)||(20068942-20069030)
chr5 (110-161)||(22811076-22811127)
chr5 (95-185)||(2861667-2861756)
chr5 (79-131)||(16843609-16843661)
chr5 (71-129)||(18850986-18851043)
chr5 (110-160)||(19784864-19784914)
chr5 (195-232)||(3747686-3747723)
chr5 (77-126)||(38265061-38265109)
chr5 (110-178)||(6988195-6988263)
[»] chr1 (64 HSPs)
chr1 (50-261)||(35569157-35569368)
chr1 (47-308)||(48510821-48511082)
chr1 (52-261)||(20800234-20800443)
chr1 (52-256)||(31223339-31223543)
chr1 (52-261)||(1199787-1199996)
chr1 (49-308)||(5410553-5410811)
chr1 (52-261)||(42850176-42850385)
chr1 (45-284)||(13055935-13056173)
chr1 (52-261)||(43728835-43729043)
chr1 (52-284)||(50977297-50977528)
chr1 (51-258)||(12468176-12468381)
chr1 (54-265)||(25229963-25230173)
chr1 (52-261)||(6166070-6166278)
chr1 (52-261)||(7826311-7826520)
chr1 (50-276)||(10470536-10470760)
chr1 (58-258)||(45710012-45710211)
chr1 (47-258)||(6464571-6464781)
chr1 (93-261)||(4369801-4369968)
chr1 (54-261)||(11023289-11023495)
chr1 (55-310)||(36205102-36205357)
chr1 (58-304)||(40229433-40229679)
chr1 (49-232)||(47123375-47123558)
chr1 (52-232)||(50406119-50406299)
chr1 (50-261)||(12247380-12247590)
chr1 (50-226)||(26058236-26058412)
chr1 (48-261)||(35536032-35536244)
chr1 (50-239)||(13931605-13931792)
chr1 (52-220)||(34718452-34718620)
chr1 (77-231)||(15884216-15884371)
chr1 (51-206)||(27801608-27801763)
chr1 (80-229)||(25061218-25061367)
chr1 (56-221)||(9447533-9447696)
chr1 (93-217)||(11561826-11561950)
chr1 (123-258)||(40821788-40821922)
chr1 (71-157)||(49242958-49243044)
chr1 (95-220)||(23628706-23628830)
chr1 (123-284)||(11051339-11051499)
chr1 (50-162)||(40352450-40352561)
chr1 (176-261)||(31933687-31933772)
chr1 (53-226)||(43730002-43730175)
chr1 (52-109)||(291704-291762)
chr1 (77-138)||(43134533-43134594)
chr1 (48-161)||(47981749-47981861)
chr1 (49-157)||(41989-42097)
chr1 (78-134)||(29441271-29441327)
chr1 (110-191)||(291732-291813)
chr1 (80-161)||(4347034-4347114)
chr1 (55-150)||(6061214-6061308)
chr1 (95-161)||(16556295-16556360)
chr1 (87-157)||(32365143-32365213)
chr1 (95-185)||(47085869-47085959)
chr1 (80-221)||(15576454-15576595)
chr1 (69-138)||(34661946-34662014)
chr1 (85-126)||(43134454-43134495)
chr1 (93-161)||(6219964-6220032)
chr1 (50-158)||(13344836-13344943)
chr1 (110-161)||(29759711-29759762)
chr1 (189-228)||(36118118-36118157)
chr1 (52-161)||(7765241-7765349)
chr1 (110-147)||(11019003-11019040)
chr1 (71-140)||(29438664-29438732)
chr1 (71-131)||(30557624-30557683)
chr1 (78-118)||(42137088-42137128)
chr1 (110-178)||(47978376-47978444)
[»] chr2 (55 HSPs)
chr2 (51-254)||(9988454-9988657)
chr2 (51-261)||(36312222-36312431)
chr2 (52-261)||(5916196-5916404)
chr2 (53-265)||(7472629-7472840)
chr2 (53-232)||(2213480-2213659)
chr2 (52-225)||(1944993-1945166)
chr2 (53-245)||(28127242-28127434)
chr2 (53-226)||(39141425-39141597)
chr2 (53-308)||(26207884-26208139)
chr2 (52-276)||(8170244-8170466)
chr2 (51-233)||(31562640-31562819)
chr2 (56-258)||(14821111-14821312)
chr2 (52-276)||(36548130-36548353)
chr2 (54-261)||(32501931-32502137)
chr2 (52-254)||(28261246-28261448)
chr2 (52-245)||(23358219-23358411)
chr2 (52-245)||(44619015-44619208)
chr2 (58-258)||(42515936-42516135)
chr2 (53-193)||(2213660-2213800)
chr2 (50-261)||(28641587-28641798)
chr2 (49-259)||(7296102-7296312)
chr2 (47-245)||(2215215-2215411)
chr2 (49-232)||(42089479-42089666)
chr2 (78-226)||(16467066-16467214)
chr2 (71-231)||(18511077-18511237)
chr2 (54-158)||(30007509-30007613)
chr2 (53-193)||(31224693-31224833)
chr2 (53-226)||(25747837-25748009)
chr2 (50-233)||(3853873-3854056)
chr2 (80-259)||(7295330-7295507)
chr2 (77-161)||(34433285-34433369)
chr2 (95-232)||(27911380-27911517)
chr2 (78-161)||(45714648-45714731)
chr2 (79-186)||(41580691-41580798)
chr2 (121-259)||(25940264-25940402)
chr2 (80-161)||(12110919-12110999)
chr2 (52-161)||(30599858-30599967)
chr2 (68-185)||(38600413-38600530)
chr2 (169-232)||(2234901-2234963)
chr2 (95-226)||(3602457-3602587)
chr2 (80-163)||(34997218-34997301)
chr2 (77-161)||(1763265-1763348)
chr2 (87-226)||(8041260-8041397)
chr2 (79-134)||(23267345-23267400)
chr2 (110-261)||(39106681-39106831)
chr2 (71-226)||(43858185-43858340)
chr2 (213-282)||(2212745-2212814)
chr2 (93-161)||(23359925-23359993)
chr2 (110-226)||(43436293-43436409)
chr2 (192-233)||(3552940-3552981)
chr2 (51-92)||(43436264-43436305)
chr2 (110-177)||(10918632-10918699)
chr2 (80-134)||(18970272-18970324)
chr2 (110-161)||(23377549-23377600)
chr2 (72-157)||(11240720-11240804)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (52-258)||(8388-8594)
[»] scaffold0381 (1 HSPs)
scaffold0381 (51-310)||(8997-9256)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (53-252)||(29080-29278)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (50-253)||(5784-5988)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (50-226)||(253099-253275)
[»] scaffold0983 (1 HSPs)
scaffold0983 (53-258)||(2225-2430)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (49-259)||(1980-2190)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (52-186)||(118366-118500)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (51-161)||(15213-15322)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (80-226)||(46734-46879)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (110-233)||(138522-138645)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (95-160)||(301562-301627)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (79-162)||(65535-65617)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (195-232)||(9257-9294)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (72-117)||(32058-32103)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (94-158)||(99701-99765)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (110-158)||(199383-199431)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 61)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 52 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3467686 - 3467428
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3467686 agtgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttc 3467587  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcct 251  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3467586 tgtttggatatatttatttaaaagtgattcttatgaattgatgttggttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatatggaatgaccaaactatcct 3467487  T
Q  252 tttaattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaacttatca 310  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  3467486 tttaattataattagaaataaatatttcattctcattagataattatttcaacttatca 3467428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 159 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41981203 - 41981052
Alignment:
Q  159 atatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaatt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  41981203 atatacttatctaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatactttgaatcaaaattgattttaaatatggaatgaccaaactatctttttaatt 41981104  T
Q  259 gtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaacttatca 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41981103 gtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaacttatca 41981052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 50 - 304
Target Start/End: Original strand, 28425426 - 28425680
Alignment:
Q  50 ttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt 149  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| |||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||    
T  28425426 ttagtgtgtgtttggtatgacggtggcgaaaattgattttgatagaattgattttgttagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatt 28425525  T
Q  150 tctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatc 249  Q
    | |||||||||| ||||   || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||    
T  28425526 tatgtttggatacactttcttacaagtgattcttatgagttgacgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaacgtgtaatgaccaaactatc 28425625  T
Q  250 cttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaac 304  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||    
T  28425626 cttttaattgtatttaaaagtaaatatcttattctcattagataattatttcaac 28425680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Original strand, 22936747 - 22936958
Alignment:
Q  50 ttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22936747 ttagtgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattaagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatt 22936846  T
Q  150 tctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatc 249  Q
    | |||||||||| ||||   || ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |  |||||||||||||||    
T  22936847 tatgtttggatacactttattagaagtgattcttgtggattgatgttgtttggatagtttgaatcaaatttggttttgaatatataatgactaaactatc 22936946  T
Q  250 cttttaattgta 261  Q
    |||||| |||||    
T  22936947 cttttagttgta 22936958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 226
Target Start/End: Original strand, 3097162 - 3097336
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  3097162 agtgtgtgtttggtatagcagtggtgagaattaattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgatatgaattgattta 3097261  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 226  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3097262 tgtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 3097336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Original strand, 25697912 - 25698089
Alignment:
Q  48 atttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattga 147  Q
    |||| ||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  25697912 attttgtgtgtgcttggtatagcggtggagagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgcttaaaagtgagttggatgtgaattga 25698011  T
Q  148 tttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 226  Q
     || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25698012 -ttatgtttggataaacttatttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 25698089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 105 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 43550991 - 43550835
Alignment:
Q  105 gagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggat 204  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  43550991 gagaaaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttattaaaagtgattcttgtgggttgatgttgtttggat 43550892  T
Q  205 agtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgta 261  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  43550891 aatttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaaagactaaactatccttttaattgta 43550835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 231
Target Start/End: Original strand, 41289016 - 41289193
Alignment:
Q  54 tgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctg 153  Q
    |||| ||||||| ||| || || ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  41289016 tgtgggtttggtttggcggcggcgagaattgattttgacagaattgagtttgagagaattgattttaattaaaagtgagttgattgtgaattgatttatg 41289115  T
Q  154 tttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatg 231  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41289116 tttggatacactttactaaaagtgattcttataggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatg 41289193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27649896 - 27649693
Alignment:
Q  54 tgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctg 153  Q
    ||||||||||||  || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||    
T  27649896 tgtgtgtttggttgggcggtgacgagaattgattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgatttggatatgaattgaata-tg 27649798  T
Q  154 tttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttt 253  Q
    ||| |||| ||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||| ||| || |||||    
T  27649797 tttagatacactcatttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaacattgaatgaccaaattacccttt 27649698  T
Q  254 taatt 258  Q
    |||||    
T  27649697 taatt 27649693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Original strand, 33626988 - 33627170
Alignment:
Q  50 ttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt 149  Q
    ||||||||||||||||  || ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  33626988 ttagtgtgtgtttggttcggcggtggagggaattgattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttatttaaaactgagttggataagaattgatt 33627087  T
Q  150 tctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 232  Q
    | |||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  33627088 tatgtttggatacactttactaaaagtgattcttatgagttaatgttgtttggatagtttgaatcaaaatcgattttgaatgt 33627170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 254
Target Start/End: Original strand, 4941739 - 4941939
Alignment:
Q  54 tgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctg 153  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||| ||    
T  4941739 tgtgtgtttggtatggcggtggctagaattgattctgatataattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagtttgaggtgaattgatttatg 4941838  T
Q  154 tttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttt 253  Q
    |||||||| | |||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||  |||||| ||| ||| ||||    
T  4941839 tttggataaaattatttaaaagcgattcttatgagttgatgttgtttgaataatttgaattaaaattgattttgaatgtaaaatgaccaaattattcttt 4941938  T
Q  254 t 254  Q
    |    
T  4941939 t 4941939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 55 - 218
Target Start/End: Original strand, 42143323 - 42143486
Alignment:
Q  55 gtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgt 154  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |  ||||||||||| |||    
T  42143323 gtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattatgatataattgagtttgagaaaattgattttagttaaaagtgagtttgaggtgaattgatttatgt 42143422  T
Q  155 ttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaa 218  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| |||||    
T  42143423 ttggataaacttatttaaaagtgattcttatgagttgacgttgtttggataatttgaaacaaaa 42143486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 78 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 44926967 - 44926781
Alignment:
Q  78 agaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtg 177  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||  |||||||||| |||| | ||||||||    
T  44926967 agaattgagtttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatta-tgtttggatacacttgtttaaaagtg 44926869  T
Q  178 attcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgtaatta 265  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||| ||| |||| || ||||||||||||    
T  44926868 attcttatgagttgatgttatttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtaaaatgaccaaattatctttgtaattgtaatta 44926781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 95 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 40742234 - 40742068
Alignment:
Q  95 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgata 194  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||   ||||| ||||||||||| |||||||    
T  40742234 aattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacactttaataaaattgattcttatgagttgata 40742135  T
Q  195 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgta 261  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| |||||||| |||||| |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  40742134 ttgtttggatgatttgaatgaaacttgattttgaatgtgtaatgatcaaattatccttttaattgta 40742068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 77 - 282
Target Start/End: Original strand, 40742276 - 40742479
Alignment:
Q  77 gagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagt 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||| ||| || |||  ||    
T  40742276 gagaattgattttgatagaattgagtttaaaagaattgattttcgttaaaagtgagtttgatctgaattgatttatgtttggatacactaatgtaa--gt 40742373  T
Q  177 gattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgtaattagaaataaatat 276  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| || ||||||||||||  ||| || |||||||    
T  40742374 gattcttatgagttgatgatgtttggatattttaaatcaaaattgattttaaatgtgtagtgaccaaattacccttttaattgtgtttaaaattaaatat 40742473  T
Q  277 ttcatt 282  Q
    ||||||    
T  40742474 ttcatt 40742479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 219
Target Start/End: Original strand, 24897547 - 24897710
Alignment:
Q  55 gtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgt 154  Q
    ||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||    
T  24897547 gtgtgtttggtatggcggcggtaagaattgattttgataaaattgagtttatgagaattgattttggttaaaagtgagttggatatgaa-tgaattatgt 24897645  T
Q  155 ttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaat 219  Q
    ||||||| | |||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24897646 ttggatacatttatttaaaattgattcttatgagttgatgttgtttggataatttgaatcaaaat 24897710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 260
Target Start/End: Original strand, 6399092 - 6399272
Alignment:
Q  80 aattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgat 179  Q
    |||||||| || || |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| ||| |  ||||||||||    
T  6399092 aattgattctggtagaattgagtttgatagaattgattatggttaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgtttcgatacactcacttaaaagtgat 6399191  T
Q  180 tcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgt 260  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| ||||||||||    
T  6399192 tcttatgagttgatgttgtttggataattttaatcaaaattgattttgaatgtgcaatgaccaaattatctttttaattgt 6399272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 58 - 261
Target Start/End: Original strand, 38152137 - 38152339
Alignment:
Q  58 tgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttg 157  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||  || | ||||||||| ||||||    
T  38152137 tgtttggtttggtggcggtgagaattgattttgatagaattaagtttgagaaaattgattttagttaaa-gtgagtttgatgtaaattgatttatgtttg 38152235  T
Q  158 gatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaat 257  Q
    || ||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||||| ||| ||||| ||||||    
T  38152236 gaaatatttacttaaaaatgattcttatgagttgatgtggtttggatactttaaatcaaaattgattttgaacgtgtaatgaccaaagtatccctttaat 38152335  T
Q  258 tgta 261  Q
    ||||    
T  38152336 tgta 38152339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 54 - 226
Target Start/End: Original strand, 36113999 - 36114170
Alignment:
Q  54 tgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctg 153  Q
    |||||||||||||||  || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  || |  |||| ||  ||    
T  36113999 tgtgtgtttggtatgacggcggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtaagtttgatgtagattggtta-tg 36114097  T
Q  154 tttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 226  Q
    |||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36114098 tttggatacactcgtttaaaagtgattcttatgagttgatattgtttggataatttgaatcaaaattgatttt 36114170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 8125095 - 8124915
Alignment:
Q  80 aattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgat 179  Q
    ||||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||  |||||||||| ||| || ||||||||||    
T  8125095 aattgattttggttgaatcgagtttgagagaattgattttggttagaagtgagtttgatgtgaattgatta-tgtttggatacactcatttaaaagtgat 8124997  T
Q  180 tcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgta 261  Q
    ||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||  || |||||||||||||    
T  8124996 tcttaggagttgaagttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatggataatgaccaacttacccttttaattgta 8124915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 261
Target Start/End: Original strand, 30081635 - 30081815
Alignment:
Q  80 aattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgat 179  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||  || |   |||||  ||    
T  30081635 aattgattttgataaaattgattttgtgaaaattgattttagttaaaagtgagttaaag-tgaattgatttatgtttggataagctgacacaaaagcaat 30081733  T
Q  180 tcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgta 261  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  30081734 tcttatgggctgatgttgtttggatagtttgtttcaaaattgattttagatgtgtaatgaccaaattatccttttaattgta 30081815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 115 - 308
Target Start/End: Original strand, 34342873 - 34343063
Alignment:
Q  115 attttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatc 214  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||    
T  34342873 attttggttaaaagtgagtaga-tatgaattgatttttgtttggataaatttatttaaaagtgattcttat-agtggatgttgtttggataatttgaatc 34342970  T
Q  215 aaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaacttat 308  Q
    |||||||||||| || ||| |||||| ||| ||  |||||||||||| ||  ||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  34342971 aaaattgattttgaa-gtgtaatgaccaaattaatcttttaattgtattttaaaataaacacctcattctcattagataattatttcaacttat 34343063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 50 - 254
Target Start/End: Original strand, 440143 - 440347
Alignment:
Q  50 ttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt 149  Q
    ||||||||||||||||  |  || || || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  440143 ttagtgtgtgtttggttggacggcggagataattgattttgatagaattgagtctgagagaattgattttggttaaatgtgagttggatgtgaattgatt 440242  T
Q  150 tctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatc 249  Q
    | |||||||||| | | |  ||||| ||||||||||| ||| |  |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||  |||||| ||  ||||    
T  440243 tatgtttggatacattcagttaaaaatgattcttatgagttaacgttgtttggatagattgaatcaaaactgattttgaatgtataatgaccaacttatc 440342  T
Q  250 ctttt 254  Q
    |||||    
T  440343 ctttt 440347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 95 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42149115 - 42148978
Alignment:
Q  95 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgata 194  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||     
T  42149115 aattgattctgatataattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatttatgtttggatagacttatttaaaagtgattcgtatgagttgatg 42149016  T
Q  195 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 232  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  42149015 ttgtttagataatttgaatcaaaattgattttgaatgt 42148978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 51 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15206850 - 15206670
Alignment:
Q  51 tagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgattt 150  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15206850 tagtgtgtgtttggttcagtggtggagagaattaattttgatagaattgagtttgacaaaattgattttgggtaaaagtgagttgaatgtgaattgattt 15206751  T
Q  151 ctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatg 231  Q
     |||||||||| | | |  || ||||||||||||    || || ||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  15206750 atgtttggatacattgacttagaagtgattcttaaaaattcatgttgtttggatagtttggcccaaaattgattttgaatg 15206670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26243274 - 26243138
Alignment:
Q  55 gtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgt 154  Q
    ||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  26243274 gtgtgtttggtatagcggcagtgagaattgattttgatagaattgagtttaagagaattgatttttgttaaaagtgagtttgatatgaattgatttatgt 26243175  T
Q  155 ttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttg 191  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||    
T  26243174 ttggatataattgtttaaaagtgattcttatgagttg 26243138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 38114599 - 38114389
Alignment:
Q  50 ttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt 149  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  38114599 ttagtgtgtgtttggtttggcggtggtgagaatttattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtaagttggatgtgaattga-t 38114501  T
Q  150 tctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatc 249  Q
    | |||||||||| |||    |  |||||||||||||| |||||  ||||||| ||| || |||  |||||||||||| ||  |  |||||| ||| || |    
T  38114500 tatgtttggatacactcggtttcaagtgattcttatgagttgaggttgtttgaatatttcgaacaaaaattgattttgaacattcaatgaccaaattacc 38114401  T
Q  250 cttttaattgta 261  Q
    ||||||||||||    
T  38114400 cttttaattgta 38114389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 150
Target Start/End: Original strand, 30759257 - 30759359
Alignment:
Q  48 atttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattga 147  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  30759257 atttagtgtgtgtttggtttggcgatgggaagaattgattttaatataattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattga 30759356  T
Q  148 ttt 150  Q
    |||    
T  30759357 ttt 30759359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 25497845 - 25497717
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtgggga-gaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgattt 150  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  25497845 agtgtgtgtttggtatggccgagggtaagaattgattttgataaaattgagtttaggagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattga-tt 25497747  T
Q  151 ctgtttggatatacttatctaaaagtgatt 180  Q
     |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  25497746 atgtttggatacacttatttaaaagtgatt 25497717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26243101 - 26242986
Alignment:
Q  195 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatac 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||  || ||||||| |||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||| |||     
T  26243101 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgcgtaaaaaccaaactattcttttaattgtatttaaaagtaaatatctcattctcattagataa 26243002  T
Q  295 ttatttcaacttatca 310  Q
    ||||||||||||||||    
T  26243001 ttatttcaacttatca 26242986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29023379 - 29023199
Alignment:
Q  49 tttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgat 148  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||                | |||||||| |    
T  29023379 tttagtgtgtgttcggtatggtggtggcgaaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttg----------------agatgaattggt 29023296  T
Q  149 ttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaac 245  Q
    || | |||||||| |||| | ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||    
T  29023295 ttatatttggatacacttgtttaaaattgattgttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgaccaaac 29023199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 53 - 258
Target Start/End: Original strand, 36121502 - 36121695
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttct 152  Q
    ||||||||||||||  | ||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |    
T  36121502 gtgtgtgtttggtacagcggtgtcgagaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaataga-ttat 36121600  T
Q  153 gtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcctt 252  Q
    ||||||||| ||||  ||| |||||||||| |           |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| |||||| |||||||    
T  36121601 gtttggatacactttactataagtgattctca-----------tgtttgaatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtctaataactaaattatcctt 36121689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 26125634 - 26125516
Alignment:
Q  143 attgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgacta 242  Q
    |||||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |    
T  26125634 attgatttatgtttggatacactaatgtaaaaatgattcttatgagttgataatgtttggacggtttaaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgacga 26125535  T
Q  243 aactatccttttaattgta 261  Q
    || |||| |||||||||||    
T  26125534 aaatatctttttaattgta 26125516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 231
Target Start/End: Original strand, 31246273 - 31246450
Alignment:
Q  54 tgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctg 153  Q
    ||||||||||||   | ||||| || |||||||||||| | |||||| ||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  31246273 tgtgtgtttggttctgcggtggagataattgattttgacagaattgattttgttagaattgatttttgttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatg 31246372  T
Q  154 tttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatg 231  Q
    ||||||||   | |   |||||||||||||||   || || |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  31246373 tttggataccttaaagcaaaagtgattcttataaattcatgttgtttggataacttggatcaaaattgattttaaatg 31246450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 232
Target Start/End: Original strand, 3619053 - 3619204
Alignment:
Q  80 aattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgat 179  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||   |||||||| || | ||||||||||||| |   ||||||||| |||||||||| | | || | ||||||||    
T  3619053 aattgattttgatagaattgattttgaatgaattgattctgatcaaaagtgagttgagtga-aattgatttgtgtttggatacattaatatgaaagtgat 3619151  T
Q  180 tcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 232  Q
    ||||||   |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3619152 tcttatcaatgtatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 3619204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 53 - 131
Target Start/End: Original strand, 30085596 - 30085674
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtga 131  Q
    ||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  30085596 gtgtgtgtttggtatagcggcggtgagaattgattttgatataattgagtttaagagaattgattttggttaaaagtga 30085674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11126644 - 11126499
Alignment:
Q  77 gagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagt 176  Q
    |||||||||||||| || |||| | || |||| |||||||||| ||||||||  ||||||  ||  |||||||| |||||||||| ||||||  | ||||    
T  11126644 gagaattgattttgttagaatttatttcgagagaattgattttagttaaaagaaagttgatcatagattgatttatgtttggatacacttataaataagt 11126545  T
Q  177 gattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattga 222  Q
    |||| | ||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11126544 gattttcatgagtttgtgttgtttggatagtttgaatcaaaattga 11126499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 26491085 - 26490953
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttct 152  Q
    ||||||||||||| ||| ||||   |||||||||| ||  |||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |    
T  26491085 gtgtgtgtttggtgtggcggtgactagaattgattctgtcaaaattgattttggtagaattgattttggttaaaagtgagttgagtgtaaattgatttgt 26490986  T
Q  153 gtttggatatacttatctaaaagtgattcttat 185  Q
    |||||||||   |||| || |||||||||||||    
T  26490985 gtttggatacctttatatagaagtgattcttat 26490953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 35615843 - 35615683
Alignment:
Q  71 ggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatct 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||  | |||||||||||||  |||||||||| ||||| |||| | | |  |    
T  35615843 ggtggagagaattgattttgatagaattgagtttgacaagattgattttggaaagaagtgagttgaatgggaattgatttatgtttagatacattcactt 35615744  T
Q  171 aaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatg 231  Q
    |||| |||||| ||  | ||  | ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  35615743 aaaattgattcctaaatattcttgttgtttggatagtttggctcaaaattgattttgaatg 35615683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 226
Target Start/End: Original strand, 45147249 - 45147380
Alignment:
Q  95 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgata 194  Q
    |||||| ||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||   ||||   || |||||||| |  || || ||||||||||||||||  |||||||    
T  45147249 aattgattttgatagaatcgaatttggttaaaagtgagttgaatgcaaatttggttatgtttggacactctcatttaaaagtgattcttataagttgata 45147348  T
Q  195 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 226  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  45147349 ttgtttgaataacttgaatcaaaattgatttt 45147380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Original strand, 3465396 - 3465478
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtt 134  Q
    ||||||||||||||   | |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  3465396 agtgtgtgtttggttctgcggtgagtagaattgattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttggttagaagtgagtt 3465478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16915096 - 16915010
Alignment:
Q  170 taaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaa 256  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||    
T  16915096 taaaagtgattcttatgagttaatgatgtttggttggtttgtatcaaaattgattttgaatgtgtaatgactaaattaaccttttaa 16915010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 138
Target Start/End: Original strand, 40792188 - 40792246
Alignment:
Q  80 aattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaat 138  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40792188 aattgattttaataaaattgattttgatataattgattttgattaaaagtgagttgaat 40792246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 29970926 - 29970846
Alignment:
Q  80 aattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggata 161  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | | || |||||| ||||||||||    
T  29970926 aattgattttgatagaattgaatttgt-ataattgattttagttaaaagtgagttgagtttaaagtgatttatgtttggata 29970846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 36779518 - 36779434
Alignment:
Q  77 gagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatat 162  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| | || | |||| |||||||||||    
T  36779518 gagaattgattttgatataattgattttgt-agaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtaaagtaatttatgtttggatat 36779434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 39219833 - 39219764
Alignment:
Q  93 aaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatat 162  Q
    |||||| | ||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  39219833 aaaattaattttgatagaattgattttcgttaaaagtgagtttaatatgaagtgatttatgtttggatat 39219764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 19649281 - 19649230
Alignment:
Q  110 aattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggata 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||    
T  19649281 aattgattttggttaaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatgtttggata 19649230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 23018206 - 23018099
Alignment:
Q  95 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgata 194  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| ||  ||  |||||||||||||||   |||||     
T  23018206 aattgagtttgatcgaattgattttgatcaaaagtgagttgagtataaatttatttatgtttggatacacgaatgcaaaagtgattcttattaattgatt 23018107  T
Q  195 ttgtttgg 202  Q
    ||||||||    
T  23018106 ttgtttgg 23018099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 156
Target Start/End: Original strand, 10552923 - 10552969
Alignment:
Q  110 aattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgttt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  10552923 aattgattttggttaaaagtgagttgaatgtaaattgatttatgttt 10552969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 232
Target Start/End: Original strand, 37458313 - 37458439
Alignment:
Q  110 aattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgat-at----tgtttggat 204  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||  | ||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||   || || ||    |||||||||    
T  37458313 aattgattttggtaaaaa-tgtgttgaagctaaattgatttatgtttggatatattgacataaaagtgattcttatcaattcatgatgtgatgtttggat 37458411  T
Q  205 agtttgaatcaaaattgattttaaatgt 232  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  37458412 agtttgaatcaaaattgattttgaatgt 37458439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 220
Target Start/End: Original strand, 8702392 - 8702531
Alignment:
Q  80 aattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttat-ctaaaagtga 178  Q
    |||||||||||||| |||||| |||   | |||||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||||| | |||| || |||||||    
T  8702392 aattgattttgatagaattgactttagcaaaattgattttagttaaaaatgatttgaagat-aattgatttatgtttggataca-ttatccttaaagtga 8702489  T
Q  179 ttcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaatt 220  Q
    |||||||   || || |||||||||||| |||  ||||||||    
T  8702490 ttcttatcaattcatgttgtttggatagcttgggtcaaaatt 8702531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 195 - 232
Target Start/End: Original strand, 24297690 - 24297727
Alignment:
Q  195 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24297690 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttacatgt 24297727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 26125910 - 26125842
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttg 120  Q
    ||||||| |||||||  | ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  26125910 agtgtgtctttggtacagcggtggtgagaattaattttgatagaattgagtttaagagaattgattttg 26125842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 31201750 - 31201671
Alignment:
Q  80 aattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggat 160  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||| || || || |||||||||||| |||||||||    
T  31201750 aattgagttttataaaattgagtttgacagaattgattttaattaaaagcgaatt-aagatgaattgatttatgtttggat 31201671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 1373134 - 1373083
Alignment:
Q  110 aattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggata 161  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||    
T  1373134 aattgattttggataaaagtgagttgaagttgaagtgatttatgtttggata 1373083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 20190236 - 20190186
Alignment:
Q  108 ataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttgg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||| |||||||    
T  20190236 ataattgattttggttaaaagtgagtttaagataaaatgatttatgtttgg 20190186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 35239608 - 35239546
Alignment:
Q  95 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttg 157  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||||    
T  35239608 aattgattttgataaaattgattttggttaaaagtgaattgaatataaaataatttatgtttg 35239546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14382285 - 14382178
Alignment:
Q  112 ttgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttat-ctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttg 210  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| | |||| || ||||||||||||||   || || || |||||||||||||    
T  14382285 ttgattttagttaaaagtgatttgaacat-aattgatttatgtttggataca-ttatccttaaagtgattcttatcaattcatgttatttggatagtttg 14382188  T
Q  211 aatcaaaatt 220  Q
      ||||||||    
T  14382187 ggtcaaaatt 14382178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 41980968 - 41980939
Alignment:
Q  393 aatacaatataagcttaaaaagatgtcact 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41980968 aatacaatataagcttaaaaagatgtcact 41980939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 165
Target Start/End: Original strand, 37667055 - 37667126
Alignment:
Q  93 aaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatact 165  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| | |||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  37667055 aaaattgattttgatagaattgattttcgttaaaa-taagtttaatgtgaattgatttatatttggatatact 37667126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 42601016 - 42600976
Alignment:
Q  110 aattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgattt 150  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  42601016 aattgatttttgttcaaagtgagttgaatgtgaattgattt 42600976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 53 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 10826235 - 10825999
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttct 152  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  10826235 gtgtgtgtttggtttggcggcggtgagaattaattttgataaaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatttgaattgattttt 10826136  T
Q  153 gtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcctt 252  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  10826135 gtttggatatacttatttaaaagtgattcttatgagttgattttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttaaatatggaatgaccaaactatcctt 10826036  T
Q  253 ttaattgtaattagaaataaatatttcattctcatta 289  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10826035 ttaattataattagaaataaatatttcattctcatta 10825999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 51 - 282
Target Start/End: Original strand, 33898960 - 33899191
Alignment:
Q  51 tagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgattt 150  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  33898960 tagtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagtttgatatgaattgattt 33899059  T
Q  151 ctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcc 250  Q
     |||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||    
T  33899060 atgtttggatacactaatgtaaaagtgattcttatgagttaataatgtttggatggtttaaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgaccaaaatatcc 33899159  T
Q  251 ttttaattgtaattagaaataaatatttcatt 282  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||| |||||    
T  33899160 ttttaattgtatttaaaattaaatatctcatt 33899191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13739358 - 13739138
Alignment:
Q  44 atttatttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaa 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||    
T  13739358 atttattaagtgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaa 13739259  T
Q  144 ttgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaa 243  Q
    |||| || |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||| ||    
T  13739258 ttga-ttatgtttggatacacttgtttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtaaaatgaccaa 13739160  T
Q  244 actatccttttaattgtaatta 265  Q
    | ||||||| ||||||||||||    
T  13739159 attatccttgtaattgtaatta 13739138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 44 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 13744858 - 13744651
Alignment:
Q  44 atttatttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaa 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||    
T  13744858 atttattaagtgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaa 13744759  T
Q  144 ttgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaa 243  Q
    |||| || |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||| ||    
T  13744758 ttga-ttatgtttggatacacttgtttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtaaaatgaccaa 13744660  T
Q  244 actatcctt 252  Q
    | |||||||    
T  13744659 attatcctt 13744651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 258
Target Start/End: Original strand, 6208019 - 6208224
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||      
T  6208019 agtgtgtgtttggtatagcggtggcgataattgattttgatagaattgattttgagtgaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtgaattgatta- 6208117  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcct 251  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  6208118 tgtttggatacactttactaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttagatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtctaatgactaaattatcct 6208217  T
Q  252 tttaatt 258  Q
    | |||||    
T  6208218 tataatt 6208224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 110 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16548226 - 16548075
Alignment:
Q  110 aattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagttt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||    
T  16548226 aattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagttt 16548127  T
Q  210 gaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgta 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16548126 gaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgactaaactatccttttaattgta 16548075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 95 - 257
Target Start/End: Original strand, 16442349 - 16442511
Alignment:
Q  95 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgata 194  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  16442349 aattgattttgagagaattgattttagttacaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacacttatttaaaagtgattcatatgagttgata 16442448  T
Q  195 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaat 257  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16442449 ttgtttggataatttgaatgaaaattgattttgaatgtgtaatgaccaaactatccttttaat 16442511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 55 - 249
Target Start/End: Original strand, 17829957 - 17830151
Alignment:
Q  55 gtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgt 154  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  17829957 gtgtgtttggtatagctgtggggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgt 17830056  T
Q  155 ttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatc 249  Q
    || | || | ||   || ||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  17830057 ttagttacagtttattagaagtcgttcttgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgactgaactatc 17830151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 232
Target Start/End: Original strand, 29409202 - 29409387
Alignment:
Q  47 tatttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattg 146  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  29409202 tatttagtgtgtttttggtatgacggtggcgaaaattgattttaatagaattgagtttgaaagaattgattttgattaaaagtgagtttgatgtgaattg 29409301  T
Q  147 atttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 232  Q
    |||| |||||||||| | || | ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  29409302 atttatgtttggatacagttttttaaaaatgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgt 29409387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 80 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31132580 - 31132401
Alignment:
Q  80 aattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgat 179  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| || | ||||  ||  | |||||||| |||||| ||||||||||    
T  31132580 aattgattttgatagaattgagtttgagataatttattttggctaaaaatgagttggatgttaattcgttatt-tttggatacacttatttaaaagtgat 31132482  T
Q  180 tcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgt 260  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |  |||||| ||| || ||||||||||||    
T  31132481 tcttatgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaactttaaatgaccaaattacccttttaattgt 31132401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 21455998 - 21455818
Alignment:
Q  79 gaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtga 178  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||| ||||||||| ||||| || |||||  |||  |||||| ||| |||||| |||||||||    
T  21455998 gaattgattttgatataattgagtttgtaagaattgattttagttaaaagtaagttggatgtgaatcaattg-tgtttgtatacacttat-taaaagtga 21455901  T
Q  179 ttcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgta 261  Q
    |||| ||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||    
T  21455900 ttctcatgagttaatgttgtttgcatagtttgaatcaaaattaattttaaatgtgtaatgattaaattatctttttaattgta 21455818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 699674 - 699529
Alignment:
Q  79 gaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtga 178  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||  ||||  |||||||| |    
T  699674 gaattgattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttagtt-aaagtgagttggataagaattgatttatgtttggatgcactttactaaaagtaa 699576  T
Q  179 ttcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 226  Q
    |||||||  ||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  699575 ttcttataagttaatgttg-ttggatagtttgaatcaaaatcgatttt 699529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 226
Target Start/End: Original strand, 21254830 - 21255008
Alignment:
Q  47 tatttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattg 146  Q
    |||||||||||||||||||     ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  21254830 tatttagtgtgtgtttggttccacggtggtgataattgagtttgatagaattgagtttgagagaattgaatttgattaaaagtgagttgaatgt-aattg 21254928  T
Q  147 atttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 226  Q
    |||| |||||||||| | | | |||||| ||||||||||   || || |||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  21254929 atttatgtttggatacaataacctaaaattgattcttatcaatttatgttgtttcggtagtttgaatcaaaattgctttt 21255008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Original strand, 1312395 - 1312574
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    ||||||||||||||   | ||||| || |||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||     
T  1312395 agtgtgtgtttggttcagcggtggagaaaattgattttgatagaatcgagtttgataaaattgattttggttaaaagtgagttgaatgcgaattgattta 1312494  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatg 231  Q
    |||| ||||| | | |  || || |||||||||    || || |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  1312495 tgttcggatacattgacttagaattgattcttaaaaattaatgttgtttggatagtttgacccaaaattgattttgaatg 1312574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 55 - 226
Target Start/End: Original strand, 16121960 - 16122131
Alignment:
Q  55 gtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgt 154  Q
    |||| |||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||| | | | ||||||| |||    
T  16121960 gtgtctttggtatggcggtggttataattgattttgataaaattgattttgatagaattgattttggttaaaagtgatttgagtgtaagttgatttgtgt 16122059  T
Q  155 ttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 226  Q
    ||| |||   |||| || |||||||||||||   || || ||||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  16122060 ttgaatacctttatgtataagtgattcttattaatttattttgtttggatagttgagatcaaaattgctttt 16122131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 7215692 - 7215514
Alignment:
Q  78 agaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtg 177  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||   | | |||||||| ||||||||||| ||| |  |||||  |||  |||||| ||| |||||| ||||||||    
T  7215692 agaattgattttgatataattgagtttttaagacttgattttagttaaaagtgaattggacgtgaatcaatta-tgtttgtatacacttat-taaaagtg 7215595  T
Q  178 attcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaatt 258  Q
    ||||| ||| ||| || ||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||| |||||||| ||||    
T  7215594 attctcatgagttaatgttgtttgcataaattgaatcaaaattaattttaaatatgtaatgattaaattatcctttaaatt 7215514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 180
Target Start/End: Original strand, 5584030 - 5584132
Alignment:
Q  77 gagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagt 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| |||| || ||||    
T  5584030 gagaattgattttgatagaattgattttgacagaattgattttgactaaaagtgagtttaatgt-aattgatttatgtttggatatatttatatagaagt 5584128  T
Q  177 gatt 180  Q
    ||||    
T  5584129 gatt 5584132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 138
Target Start/End: Original strand, 29399750 - 29399835
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaat 138  Q
    |||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  29399750 gtgtatgtttggtttggcggtggagagaattgattttgatagaattgagtttgatagaattgattttggtaaagagtaagttgaat 29399835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Original strand, 15151461 - 15151543
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtt 134  Q
    ||||||||||||||   | |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  15151461 agtgtgtgtttggttctgcggtgagtagaattgattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttggttagaagtgagtt 15151543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 138
Target Start/End: Original strand, 32599443 - 32599504
Alignment:
Q  77 gagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaat 138  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32599443 gagaattgattttgatagaattgaatttaagagaattgattttgattaaaagtgagttgaat 32599504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 138
Target Start/End: Original strand, 26274608 - 26274669
Alignment:
Q  77 gagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaat 138  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  26274608 gagaattgattttgatagaattgattttgacataattgattctgactaaaagtgagttgaat 26274669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 16548255 - 16548216
Alignment:
Q  51 tagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttg 90  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16548255 tagtgtgtgtttggtatggcggtggggagaattgattttg 16548216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 136
Target Start/End: Original strand, 3605708 - 3605791
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttga 136  Q
    ||||||||||||||   |||||||  | |||||||||||||| |||||| ||||  | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3605708 agtgtgtgtttggttgtgtggtggacaaaattgattttgatataattgattttgt-agaattgattttgattaaaagtgagttga 3605791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 178
Target Start/End: Original strand, 10874220 - 10874290
Alignment:
Q  108 ataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtga 178  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||| |||| || ||| |||||||||||| |||  |||||||||    
T  10874220 ataattgattttaggtaaatgtgagttgaatgtgaagtggtttatgtttggatatatttaggtaaaagtga 10874290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 29682312 - 29682203
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    ||||| |||| ||| ||| |||||  ||||| |||| | | |||||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||||||  | | |||||||||     
T  29682312 agtgtatgttgggtttggcggtggctagaatagattctaacaaaattaattttgatagaattgattttggttaaaattgagttgcgtgtaaattgatttg 29682213  T
Q  152 tgtttggata 161  Q
    ||||||||||    
T  29682212 tgtttggata 29682203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 1500043 - 1499975
Alignment:
Q  110 aattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtga 178  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| | | ||||||||| |||||| ||| | |||| |||||||||    
T  1500043 aattgattttggctaaaagcgagttgagtgtaaattgatttatgtttgaatacatttatgtaaaagtga 1499975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 50)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 50 - 308
Target Start/End: Original strand, 3622401 - 3622659
Alignment:
Q  50 ttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt 149  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3622401 ttagtgtgtgtttgttatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatt 3622500  T
Q  150 tctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatc 249  Q
    | |||||||||| |||||  ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||  ||| ||||    
T  3622501 tatgtttggatacacttacttaaaagtgattcttacgagttgatgttgtttggatagtataaatcaaaattgattttaaatgtgtaacgatcaaagtatc 3622600  T
Q  250 cttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaacttat 308  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| ||| |||||||| |||||    
T  3622601 cttttaattgtatttagaagtaaatatctcattcacattagataattatttcagcttat 3622659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 51 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 37639597 - 37639387
Alignment:
Q  51 tagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgattt 150  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  37639597 tagtgtgtgtttggtatggcggcggggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgaattgaatgtgaattgattt 37639498  T
Q  151 ctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcc 250  Q
     |||||||| | ||||   |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37639497 atgtttggagaaactttattaaaagtgattcttgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttaaatgtgtaatgactaaactatcc 37639398  T
Q  251 ttttaattgta 261  Q
    |||||||||||    
T  37639397 ttttaattgta 37639387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 52 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 48459876 - 48459620
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  48459876 agtgtgtgtttggtatgacgttggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgattta 48459777  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcct 251  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  48459776 tgtttggatacacttacttaaaagtgattcttatgaatggatgttgtttggatagtatgtattaaaattgattttaagtgtgtaatgaccaaactatcct 48459677  T
Q  252 tttaattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaacttat 308  Q
    ||||||| || ||| || |||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  48459676 tttaattatatttaaaattaaatatcccattctcattagataattatttcatcttat 48459620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 50 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 37562738 - 37562531
Alignment:
Q  50 ttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt 149  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  37562738 ttagtgtgtgtttggtttggcggtggggagaattgattttgatagaattgagtttaagagaattgatttttgttaaaagtgagttggatgtgaattgatt 37562639  T
Q  150 tctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatc 249  Q
    | |||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  37562638 tatgtttggatacacttatttaaaagtgattcatatgagttgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttgtatgtgtaatgaccaaactatc 37562539  T
Q  250 cttttaat 257  Q
    ||||||||    
T  37562538 cttttaat 37562531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 53 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 3342955 - 3342752
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttct 152  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  3342955 gtgtgtgtttggtttggcggtggggagaattaattttgatagaattgagtttgagagaattgattttagttaaaagtgagttggatatgaattgatttat 3342856  T
Q  153 gtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcctt 252  Q
    ||||||||| ||||   || |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||    
T  3342855 gtttggatacactttaatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgattttgaatatgtaatgaccaaactatcctt 3342756  T
Q  253 ttaa 256  Q
    ||||    
T  3342755 ttaa 3342752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 54 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 38230232 - 38230025
Alignment:
Q  54 tgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctg 153  Q
    |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  38230232 tgtgtgtttggtatggcggccgagagaattgattttgatagaattgaatttaagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatg 38230133  T
Q  154 tttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttt 253  Q
    |||||||| | ||   |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  38230132 tttggatacattttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtgtaatgactaaactatccatt 38230033  T
Q  254 taattgta 261  Q
    ||||||||    
T  38230032 taattgta 38230025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 89 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 42740521 - 42740302
Alignment:
Q  89 tgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtg 188  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  42740521 tgatataattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtaagttgaatgttaattgatttatgtttagatatacttacttaaaagtgattcttatgtg 42740422  T
Q  189 ttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcatt 288  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||| |||||||| || ||| || ||||||| |||||||||||    
T  42740421 ttgatattgtttggatagtatgtatcaaaattgattttaagtgtgtaatgaccaaagtatcattttaattatatttaaaagtaaatatctcattctcatt 42740322  T
Q  289 aaatacttatttcaacttat 308  Q
    | ||| |||||||| |||||    
T  42740321 agataattatttcagcttat 42740302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 51 - 310
Target Start/End: Original strand, 43737881 - 43738140
Alignment:
Q  51 tagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgattt 150  Q
    |||||||||||| |||||| |  || ||||||||||||| | | |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  43737881 tagtgtgtgtttagtatggcgacggtgagaattgattttaacataattgagtttaagagaattgattttgattaaaagttagttagatatgaattgattt 43737980  T
Q  151 ctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcc 250  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| || ||    
T  43737981 ttgtttggataaacttatttaaaagtgattcttatgagtggatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgaaatgaccaaattaacc 43738080  T
Q  251 ttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaacttatca 310  Q
    ||||||||||| ||  || |||| |  || || |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  43738081 ttttaattgtattttaaagtaaacacctctttttcattagataattatttcaacttatca 43738140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 77 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3750827 - 3750598
Alignment:
Q  77 gagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagt 176  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||   || || |    
T  3750827 gagaatagattttaataaaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacactttaatataatt 3750728  T
Q  177 gattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgtaattagaaataaatat 276  Q
    || |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||    
T  3750727 gaatcttatgaattgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattaatttt-aatgtgtaatgaccaaactatccttttaattgt-attaaaaataa--at 3750632  T
Q  277 ttcattctcattaaatacttatttcaacttatca 310  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  3750631 ttcattctcattagataattatttcaacttatca 3750598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 55 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 47022082 - 47021862
Alignment:
Q  55 gtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgt 154  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||    
T  47022082 gtgtgtttggtatgatggtggggataattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtaagttgaaagtgaattgatttatgt 47021983  T
Q  155 ttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcctttt 254  Q
    ||||||| ||||  ||| | |||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| ||||    
T  47021982 ttggatacactttactagatgtgattcttacgaattgatgttgtttggataatttgaatgaaaattgattttgaatgtgcaatgaccaaattatcatttt 47021883  T
Q  255 aattgtaattagaaataaata 275  Q
    ||||||| ||| || ||||||    
T  47021882 aattgtatttaaaagtaaata 47021862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 51 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3375657 - 3375426
Alignment:
Q  51 tagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgattt 150  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||   | |||||||||||    
T  3375657 tagtatgtgtttggtacggtgatggagagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattaattttggttaaaagtgagtttggtgtgaattgattt 3375558  T
Q  151 ctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcc 250  Q
     |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||    
T  3375557 gtgtttggatacactcacttaaaagtgattcttatgagtcgatgttgtttggatgatttggatcaaaattgattttgaatgtgcaatgaccaaattatcc 3375458  T
Q  251 ttttaattgtaattagaaataaatatttcatt 282  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||| |||||    
T  3375457 ttttaattgtatttaaaattaaatatctcatt 3375426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 51 - 253
Target Start/End: Original strand, 10371900 - 10372102
Alignment:
Q  51 tagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgattt 150  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10371900 tagtgtgtgtttggtaaaacggtggggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgattt 10371999  T
Q  151 ctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcc 250  Q
     ||||||| || | ||   || ||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||    
T  10372000 atgtttggttacagtttattagaagtgattcttgtgggttgatgttgttcggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgcgtaatgactaaaccatcc 10372099  T
Q  251 ttt 253  Q
    |||    
T  10372100 ttt 10372102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 59 - 258
Target Start/End: Original strand, 44967349 - 44967548
Alignment:
Q  59 gtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttgg 158  Q
    ||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  44967349 gtttggtatgacggtagcgagaattgattttgatataattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttga 44967448  T
Q  159 atatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaatt 258  Q
    ||| ||||   || |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | | || |||||| ||| |||||||||||||    
T  44967449 atacactttaatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggataatttgaatcaaaattgattttgagtttgtaatgaccaaattatccttttaatt 44967548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 55 - 224
Target Start/End: Original strand, 43631642 - 43631810
Alignment:
Q  55 gtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgt 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||    
T  43631642 gtgtgtttggtatggcggtggggataattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttagatatgaattga-ttatgt 43631740  T
Q  155 ttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatt 224  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43631741 ttggatatgcttaattaaaagtgattcttttgagttgatattgtttggatatattgaatcaaaattgatt 43631810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 303
Target Start/End: Original strand, 39391083 - 39391331
Alignment:
Q  55 gtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgt 154  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| |||   | |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| |||    
T  39391083 gtgtgtttggtatggcggtggcgaaaattgattttgatagaattgatttttttagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatttatgt 39391182  T
Q  155 ttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcctttt 254  Q
    ||||||| ||||   || ||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||  ||||||||||||    
T  39391183 ttggatacactttcttacaagtgattcttatgaattgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgattttgaacgtgtaatgacctaactatcctttt 39391282  T
Q  255 aattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaa 303  Q
    ||||||| ||| || ||||||| | |||||||||| ||| ||| |||||    
T  39391283 aattgtatttaaaagtaaatatcttattctcattagataattaattcaa 39391331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 9456268 - 9456047
Alignment:
Q  54 tgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctg 153  Q
    ||||| ||||||| || ||| | ||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |  | ||||||||  ||    
T  9456268 tgtgtctttggtacggcggtagtgagaattgattttgatagaattaagttcgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtaaattgatta-tg 9456170  T
Q  154 tttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttt 253  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||| |||| |||    
T  9456169 tttggatacacttgtttaaaagtgattcttatgagttgatcttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgaccaaattatctttt 9456070  T
Q  254 taattgtaattagaaataaatat 276  Q
    |||||||| ||| || |||||||    
T  9456069 taattgtatttaaaactaaatat 9456047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 46 - 284
Target Start/End: Original strand, 34365919 - 34366156
Alignment:
Q  46 ttatttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaatt 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||  | ||||||    
T  34365919 ttatgtagtgtgtgtttggtatggcggtggctagaattgattttgatataatggagtttgaaagaattgattttagttaaaagttagttgggtgtgaatt 34366018  T
Q  146 gatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaac 245  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||||| |||     
T  34366019 gatttatgtttggatacgcttat-taaaagtgatttttatgagttgatgttgtttggatagtttgaataaaaattgattttgaaggcgtaatgaccaaat 34366117  T
Q  246 tatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattct 284  Q
    || |||||||| |||  ||| || ||||||| |||||||    
T  34366118 tacccttttaactgtgtttaaaattaaatatctcattct 34366156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 56 - 255
Target Start/End: Original strand, 386428 - 386627
Alignment:
Q  56 tgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtt 155  Q
    |||||||||| ||| |||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  386428 tgtgtttggtttggcggtggttaaaattgattttgatataattgagtttgagagtattgattttggttaaaagttagctgaatgtgaattgatttatgtt 386527  T
Q  156 tggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattga-ttttaaatgtggaatgactaaactatcctttt 254  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||    
T  386528 tggatatactaaccgaaaagtgattcttatg-attgatgttgtttggatagattgaatcaaaattgatttttaaatgtataatgaccaaattatcctttt 386626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 52 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 34010504 - 34010332
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||     
T  34010504 agtgtgtgtttggt-tggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttggatatgaactga-tta 34010407  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 226  Q
    |||||| ||| ||| || |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34010406 tgtttgaatacactcatttaaaagtggttcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaatttt 34010332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 57 - 274
Target Start/End: Original strand, 12632031 - 12632248
Alignment:
Q  57 gtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgttt 156  Q
    ||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||    
T  12632031 gtgtttggtttcgcggtggagagaattgattttgatagaattttgtttgagagaatagattttggttaaaagtgagttagatgtgaattgatttatgttt 12632130  T
Q  157 ggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaa 256  Q
    |  | ||||    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  12632131 gagtgtactcgcttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttgaattgtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgaccaaaatatccttttaa 12632230  T
Q  257 ttgtaattagaaataaat 274  Q
    ||||| ||| || |||||    
T  12632231 ttgtatttaaaactaaat 12632248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 56 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 46541762 - 46541564
Alignment:
Q  56 tgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtt 155  Q
    |||||||||| ||| |||||  | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  46541762 tgtgtttggtttggcggtggttaaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttagaagtgagttgaatgtgaattggtttatgtt 46541663  T
Q  156 tggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattga-ttttaaatgtggaatgactaaactatcctttt 254  Q
    ||  |||| | | | ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||    
T  46541662 tgagtatattcaccgaaaagtgattcttatg-attgatattgttttgatagattgaatcaaaattgatttttaaatgtataatgaccaaattatcctttt 46541564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 258
Target Start/End: Original strand, 47217487 - 47217690
Alignment:
Q  55 gtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgt 154  Q
    |||||||||||  || || || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||| |||    
T  47217487 gtgtgtttggttcggcggcggtgaaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgt 47217586  T
Q  155 ttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcctttt 254  Q
    ||||||  |||    ||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  47217587 ttggatgcactcgcttaaaagtgattttgatgggttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaacgtacaatgactaaattatcctttt 47217686  T
Q  255 aatt 258  Q
    ||||    
T  47217687 aatt 47217690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 48134742 - 48134558
Alignment:
Q  55 gtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgt 154  Q
    ||||||||||||||| ||| | || |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||  |   |||||||||  |||    
T  48134742 gtgtgtttggtatggcggttgcgaaaattaattttgatagaattgagtttgagagaattgatttttgttaaaagtgggtttgaggagaattgatta-tgt 48134644  T
Q  155 ttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgac 240  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  48134643 ttggataaacttgtttaaaagtgatttttataagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgac 48134558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41715827 - 41715649
Alignment:
Q  48 atttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattga 147  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||  || | ||||||    
T  41715827 attttgtgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgattttaagagaattgattttgattaaaagtgagttagatgtaaattga 41715728  T
Q  148 tttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 226  Q
    ||| |||||||||  ||| || ||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  41715727 tttatgtttggatgcactcatttaaaagtaattcatatgaattgatgttgtttggatagattggattaaaattgatttt 41715649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 51 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39977719 - 39977538
Alignment:
Q  51 tagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgattt 150  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||    
T  39977719 tagtgtgtgtttggtatggcggtggcgataattgattttgatagaatttagtttgaaagaattgattttagtcaaaagtgagtttgatatgaattgattt 39977620  T
Q  151 ctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 232  Q
     | |||||||| ||| || ||||||| ||| ||    |||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  39977619 atttttggataaactcatataaaagttattatttcaagttgatgttgtttggatactttaaattaaaattgattttagatgt 39977538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 224
Target Start/End: Original strand, 36920146 - 36920293
Alignment:
Q  77 gagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagt 176  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||| |||   |||  |||| ||    
T  36920146 gagaattaattttgataaaattgagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttagatataaattgatttatgtttgaatacgtttaattaaaggt 36920245  T
Q  177 gattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatt 224  Q
    ||||||| || |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  36920246 gattcttttgagttgatgttgtttgggtacattgaatcaaaattgatt 36920293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32187106 - 32186932
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    ||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||| | ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||  || | |||||||||     
T  32187106 agtgtatgtttggtatgacggtggcgagaattgattttgatagaattaattttaagagaattgattttgattaaaagtgagttagatgtaaattgattta 32187007  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 226  Q
    |||||||||  ||| || ||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  32187006 tgtttggatgcactcatttaaaagtaattcatatgaattgatgttgtttggatagattggattaaaattgatttt 32186932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Original strand, 24770854 - 24771026
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||| ||||||||||  ||||  ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||     
T  24770854 agtgtgcgtttggtatgacggtgacgagaattaattttgatagaattaagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttggatgtaaattgattta 24770953  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatt 224  Q
    | ||| |||||||  | |||||||||||| ||||   || || ||||||||||| |||   ||||||||||||    
T  24770954 tatttagatatacaaaactaaaagtgatttttatcaatttatgttgtttggataatttttgtcaaaattgatt 24771026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 32206044 - 32205855
Alignment:
Q  99 gagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgt 198  Q
    |||||||| | ||||||||||  ||||||||| |||  || ||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  32206044 gagtttgaaagaattgattttaattaaaagtgggtttgatgtgaattgatttatgtttggatacacttacttaaaagtgattcttatgagtt-atgttgt 32205946  T
Q  199 ttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg-gaatgactaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttc-attctcatt 288  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| || ||||| |||| || ||| || |||||||||| |||||||||    
T  32205945 tt-gatagtatgaatcaaaattgattttaaatgtgcaaatgaccaaattaacctttaaattttatttaaaactaaatatttcaattctcatt 32205855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 42904719 - 42904540
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| | |||  ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||  || |||||||||||     
T  42904719 agtgtgtgtttggtatggcagtgggaaaaatgaattttgatagaattgagtttgagagaattgtttttggataaaaatgagttagatgtgaattgattta 42904620  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatg 231  Q
    ||||| |||| |||  | |||||||||||||||||  || || ||||||| ||| ||| ||||||||||  |||||||||    
T  42904619 tgttttgatacactcgtttaaaagtgattcttatgaattaattttgtttgtatattttaaatcaaaattacttttaaatg 42904540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Original strand, 39634106 - 39634287
Alignment:
Q  50 ttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt 149  Q
    ||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||| || | |||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39634106 ttagtgtgtgtttggttctgcggtggagagaattgatttggacagaattgattttgttagaattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt 39634205  T
Q  150 tctgtttggatatactt-atctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatg 231  Q
    | |||||||||| |||| |   |||||||||||||||   ||  | |||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||    
T  39634206 tatgtttggata-acttaaaacaaaagtgattcttataaattcttgttgtttggataacttggatcaaaattgattttgaatg 39634287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 174 - 284
Target Start/End: Original strand, 47301622 - 47301732
Alignment:
Q  174 agtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgtaattagaaataaa 273  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||| || ||| || ||||    
T  47301622 agtgattcttatgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgactaaattatccttttaattatatttaaaactaaa 47301721  T
Q  274 tatttcattct 284  Q
     || |||||||    
T  47301722 catctcattct 47301732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Original strand, 34010902 - 34011114
Alignment:
Q  50 ttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtt-gaatatgaattgat 148  Q
    ||||| |||||||||| |||  | || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || | | |||| ||    
T  34010902 ttagtatgtgtttggtttggcagcggtgataattgattttgatagaattgagtttgagaaaattgattttggttaaa-gtgagtttgagtgtaaattaat 34011000  T
Q  149 ttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgttt-ggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaacta 247  Q
    || |||||||| | | | |  ||||||||||||||||| |||||| |||||| || || ||| |||||||||||||||| || ||| |||||| | | ||    
T  34011001 ttatgtttggaaacattcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggggtactttaaatcaaaattgattttgaacgtgtaatgaccacaata 34011100  T
Q  248 tccttttaattgta 261  Q
    ||| ||||||||||    
T  34011101 tccctttaattgta 34011114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 161
Target Start/End: Original strand, 42752132 - 42752243
Alignment:
Q  50 ttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt 149  Q
    ||||||||||||||||   | ||||| || |||||||||||| | |||||| ||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42752132 ttagtgtgtgtttggttctgcggtggagataattgattttgacagaattgattttgttagaattgatttttgttaaaagtgagttgaatgtgaattgatt 42752231  T
Q  150 tctgtttggata 161  Q
    | ||||||||||    
T  42752232 tatgtttggata 42752243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 12964736 - 12964659
Alignment:
Q  80 aattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttg 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |  |||||||| ||||||    
T  12964736 aattgattttgatagaattgagtttgagataattgattttcgttataagtgagttgaatgtagattgatttatgtttg 12964659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 19097562 - 19097483
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgag 132  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  19097562 gtgtgtgtttggtatggcggcggtgagaattaattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttgattaaaagtgag 19097483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 226
Target Start/End: Original strand, 40903139 - 40903284
Alignment:
Q  80 aattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgat 179  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||| | |||||||||||  |||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  40903139 aattgattttgacataattgattttgatagaattgattttgcctaaaagtgagttgaa-cttaattggtttatgtttggatatattaaagtaaaagtgat 40903237  T
Q  180 tcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 226  Q
    | ||||   || || ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  40903238 ttttatcaattcatgttgtttggatagttcaaatcaaaattgatttt 40903284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 206
Target Start/End: Original strand, 37008296 - 37008447
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||||| |  |||| || || ||||||| ||| |||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||  |  || ||||||||     
T  37008296 agtgtgtgtttggtatcg--gtggcgaaaactgatttttatagaattgattttgttggaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtg-attgattta 37008392  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatag 206  Q
    |||||||| | ||||   || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  37008393 tgtttggagacactttcttataagtgattcttatgagttgatgttgtttggatag 37008447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1766533 - 1766417
Alignment:
Q  110 aattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatc-taaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtt 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||| | ||||||||  |||| | ||||||||||||||||   |||||  |||||| ||| ||    
T  1766533 aattgattttgattaaaagtgagttgaacctaaattgatttatatttggata-ccttaacataaaagtgattcttatcaattgatgatgtttgaataatt 1766435  T
Q  209 tgaatcaaaattgatttt 226  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  1766434 tgaattaaaattgatttt 1766417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 20089009 - 20088929
Alignment:
Q  78 agaattgattttgataaaattgagtttgag-ataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttgg 158  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||| |||||||    
T  20089009 agaattgattttgatagaattga-tttaagtataattgattttggttaaaagtgagttgaacgtaaagtgatttatgtttgg 20088929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 33746497 - 33746449
Alignment:
Q  110 aattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttgg 158  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  33746497 aattgattttgattaaaagtgagttgaatataaattgatttttgtttgg 33746449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 230
Target Start/End: Original strand, 37886856 - 37886891
Alignment:
Q  195 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaat 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37886856 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaat 37886891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19096002 - 19095929
Alignment:
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 226  Q
    |||||||||| |||  | ||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19096002 tgtttggatacactcgtttaaaaatgattcttatgagtt-atgttgtttggataatttgaatcaaaattgatttt 19095929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 130
Target Start/End: Original strand, 12212438 - 12212490
Alignment:
Q  78 agaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtg 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||    
T  12212438 agaattgattttgatagaattgagcttgagtgaattgattttggttagaagtg 12212490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 38494324 - 38494276
Alignment:
Q  110 aattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttgg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||    
T  38494324 aattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaagtggtttatgtttgg 38494276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 44274748 - 44274698
Alignment:
Q  108 ataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttgg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||| |||||||    
T  44274748 ataattgattttggttaaaagtgagtttaagataaaatgatttatgtttgg 44274698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 4228657 - 4228604
Alignment:
Q  108 ataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggata 161  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||    
T  4228657 ataattgattttgattaaaagtgagttgaatgaaaagtgatttatgtttggata 4228604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 7169048 - 7169020
Alignment:
Q  110 aattgattttggttaaaagtgagttgaat 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7169048 aattgattttggttaaaagtgagttgaat 7169020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 226
Target Start/End: Original strand, 41625514 - 41625630
Alignment:
Q  110 aattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagttt 209  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||| |||| ||||||||||   |||  || |||||||||||||   || || ||||||||||||||     
T  41625514 aattgattttgattaaaagtgacttgagtgtaaattaatttgtgtttggatacttttaagtagaagtgattcttattaatttattttgtttggatagttg 41625613  T
Q  210 gaatcaaaattgatttt 226  Q
      |||||||||| ||||    
T  41625614 agatcaaaattgctttt 41625630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 43581664 - 43581620
Alignment:
Q  189 ttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 233  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  43581664 ttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgcttttagatgtg 43581620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 52 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 20813290 - 20813054
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  20813290 agtgtgtgtttggtatatcggtggagagaattgattttgatagaat-gagtttgagagaattgtgtttggttaaaagtgagttggatttgaattgatttt 20813192  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcct 251  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20813191 tgtttggatatacttattcaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgactaaactatcct 20813092  T
Q  252 tttaattgtaattagaaataaatatttcattctcatta 289  Q
    |||||||||| ||| || ||||| | ||||||||||||    
T  20813091 tttaattgtatttaaaagtaaatttctcattctcatta 20813054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 49 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 10334286 - 10334059
Alignment:
Q  49 tttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgat 148  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10334286 tttagtgtgtgtttgatatggcggtgacgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtcagttgaatatgaattgat 10334187  T
Q  149 ttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactat 248  Q
    || |||||||||| ||||  |||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||| |||||||    
T  10334186 ttatgtttggatacactttactaaaagtaattcttatgagttgacgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatttataatgaccaaactat 10334087  T
Q  249 ccttttaattgtaattagaaataaatat 276  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||    
T  10334086 ccttttaattgtatttaaaagtaaatat 10334059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 53 - 253
Target Start/End: Original strand, 10853224 - 10853424
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttct 152  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  10853224 gtgtgtgtttggtatagcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttaatataaattgatttat 10853323  T
Q  153 gtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcctt 252  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||| |||||||    
T  10853324 gtttggatatactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcctt 10853423  T
Q  253 t 253  Q
    |    
T  10853424 t 10853424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 23496464 - 23496260
Alignment:
Q  50 ttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt 149  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23496464 ttagtgtgtgtttggtatggcggcgaggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatt 23496365  T
Q  150 tctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatc 249  Q
    | ||||||||||       |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  23496364 tatgtttggata-------ctaaaagtgattcttgcgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtataatgactaaactatc 23496272  T
Q  250 cttttaattgta 261  Q
     |||||||||||    
T  23496271 attttaattgta 23496260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 52 - 256
Target Start/End: Original strand, 38172263 - 38172467
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||     
T  38172263 agtgtgtgtttggtttggcggtggggagaattgattttaatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtgggatgtgaattgattta 38172362  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcct 251  Q
    |||||||||| ||||   || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  38172363 tgtttggatacactttaatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtgtaatgaccaaactatcct 38172462  T
Q  252 tttaa 256  Q
    |||||    
T  38172463 tttaa 38172467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 53 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26519808 - 26519629
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttct 152  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  26519808 gtgtgtgtttggtatagcggtggggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgctaaaaagtgagttgaatgtgaattgatttat 26519709  T
Q  153 gtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 232  Q
    ||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26519708 gtttggatacactcaattaaaagtgatttttattagttgatattgtttggatagtttgaaacaaaattgattttaaatgt 26519629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 95 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 31084309 - 31084097
Alignment:
Q  95 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgata 194  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||    
T  31084309 aattgattttgaaagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggatacacttct-taaaagtgattcttatgacttgata 31084211  T
Q  195 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatac 294  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||| |||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||| |||     
T  31084210 ttatttggatagtttgaatcataattgattttgaatatgtaatgaccaaactatcattttaattgtatttaaaagtaaatatctcattctcattatataa 31084111  T
Q  295 ttatttcaacttat 308  Q
    ||||||||||||||    
T  31084110 ttatttcaacttat 31084097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 51 - 288
Target Start/End: Original strand, 52966764 - 52967001
Alignment:
Q  51 tagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgattt 150  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||    
T  52966764 tagtgtgtgtttggtttggaggtggagaaaattgattttgatagaattgattttgagagaattgattttggttaaaagtgactttgatgtgaattgattt 52966863  T
Q  151 ctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcc 250  Q
     ||||||| ||  || |  ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  52966864 atgtttgggtaccctcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttagataggttgaatcaaaattgattttaaatgtgtaatgaccaaattatcc 52966963  T
Q  251 ttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcatt 288  Q
    ||||||||||| ||| || || |||| |||||| ||||    
T  52966964 ttttaattgtatttaaaattatatatctcattcccatt 52967001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 52 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 35425477 - 35425277
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||| || || ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||      
T  35425477 agtgtgtgtttg-tagggcggtgacgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtgaattgatta- 35425380  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcct 251  Q
    |||||||||| ||||    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  35425379 tgtttggatacactttaacagaagtgattcttatgagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgactaaattatcct 35425280  T
Q  252 ttt 254  Q
    |||    
T  35425279 ttt 35425277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 284
Target Start/End: Original strand, 15511332 - 15511563
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||     
T  15511332 agtgtgtgtttggtatggcggtggcgataattgattttgatagaacggagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttgggtgtgaattgattta 15511431  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcct 251  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||| ||| ||  ||    
T  15511432 tgtttggatacgcttat-taaaagtgatttttatgagttgatattgtttggatagtttgaataaaaattgattttgaatgcgtaatgacgaaattactct 15511530  T
Q  252 tttaattgtaattagaaataaatatttcattct 284  Q
    |||||||||  ||| || ||||||| |||||||    
T  15511531 tttaattgtgtttaaaattaaatatctcattct 15511563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 44224907 - 44224699
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    ||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  44224907 agtgtttgtttggtttggcggcggggagaattgattccggtagaattgagtttgagataattgattatggttaaaagtgagtttgatatgaattgattta 44224808  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcct 251  Q
    |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||    
T  44224807 tgtttggatacactcacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggataattttagtcaaaattgattttgaatgtgcaatgaccaaattatcct 44224708  T
Q  252 tttaattgt 260  Q
    |||||||||    
T  44224707 tttaattgt 44224699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 51 - 258
Target Start/End: Original strand, 30811487 - 30811693
Alignment:
Q  51 tagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgattt 150  Q
    |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  30811487 tagtgtgtgtttggtagggcggtgacgagaattgattttgatataattgaatttgagagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtgaattga-tt 30811585  T
Q  151 ctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcc 250  Q
     |||||||||| ||||    | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||| |    
T  30811586 atgtttggatacactttaacagaagtgattcttatgacttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgattaaattattc 30811685  T
Q  251 ttttaatt 258  Q
    ||||||||    
T  30811686 ttttaatt 30811693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 53 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 42318473 - 42318216
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttct 152  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||  |    
T  42318473 gtgtgtgtttggtatagcggtgacgataattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatta-t 42318375  T
Q  153 gtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcctt 252  Q
    ||||||||| |||| | | ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||| |||||||    
T  42318374 gtttggatacacttgtttgaaagtgattcttatgagttgatttcgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgacaaaattatcctt 42318275  T
Q  253 ttaattgtaattagaaataaatatttcattctca--ttaaatacttatttcaacttatc 309  Q
    ||||||||| ||| || |||| ||  |||||| |  ||| |||||||||| ||||||||    
T  42318274 ttaattgtatttaaaactaaacatcccattcttattttagatacttatttgaacttatc 42318216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 50 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 50664905 - 50664699
Alignment:
Q  50 ttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50664905 ttagtgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatt 50664806  T
Q  150 tctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatc 249  Q
    | |||||||||| ||  |  || |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||  ||| ||||    
T  50664805 tatgtttggatacacacacttagaagtgattcttaagagtt-atgttgtttagatagtttaaattaaaattgattttgaatgtgtaatgatcaaattatc 50664707  T
Q  250 cttttaat 257  Q
    ||||||||    
T  50664706 cttttaat 50664699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 307
Target Start/End: Original strand, 16246048 - 16246305
Alignment:
Q  48 atttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattga 147  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||| | |||||||||| || ||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  || | ||||||    
T  16246048 atttactgtgtgtttggtttggcggtagcgagaattgatattaatagaattgagtttgaga--attgattttagttaaaagtgagttagatgtaaattga 16246145  T
Q  148 tttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaacta 247  Q
    ||| |||||||| | ||||   || |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||    
T  16246146 tttatgtttggaaacactttaatagaagtgattcttaggagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgatcaaacta 16246245  T
Q  248 tccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaactta 307  Q
    ||||||||||||||  || || ||||||   ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16246246 tccttttaattgtatgtaaaagtaaataccacattctcattagataattatttcaactta 16246305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 309
Target Start/End: Original strand, 38125398 - 38125656
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |  ||||||||||      
T  38125398 agtgtgtgtttggtatggcggtgacgagaattgattttgatagaattgaatttgagagaattgattttggttaaaagtgggtttgaggtgaattgatta- 38125496  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcct 251  Q
    |||||||||| |||| | | ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||| ||| ||||||    
T  38125497 tgtttggatacacttgtttgaaagtgattcttatgagttgatttcgtttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtaaaatgacaaaattatcct 38125596  T
Q  252 tttaattgtaattagaaataaatatttcattctca--ttaaatacttatttcaacttatc 309  Q
    |||||||||| ||| || |||| ||  |||||| |  ||| |||||||||| ||||||||    
T  38125597 tttaattgtatttaaaactaaacatcccattcttattttagatacttatttgaacttatc 38125656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 71 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 35930864 - 35930653
Alignment:
Q  71 ggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatct 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||| ||| || |    
T  35930864 ggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgatttttattaaaagtgagtttgatatgaattgatttatgcttggatacactaatgt 35930765  T
Q  171 aaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgtaattagaaat 270  Q
    | |||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| ||| || |    
T  35930764 ataagtcattcttatgagttgataatgtttggatggtttaaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgaccaaaatatcattttaattgtatttaaaatt 35930665  T
Q  271 aaatatttcatt 282  Q
    |||||| |||||    
T  35930664 aaatatctcatt 35930653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 53 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 38340949 - 38340749
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttct 152  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  38340949 gtgtgtgtttggtatggcgttggtgagaattgattttgatagaatgaagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttat 38340850  T
Q  153 gtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcctt 252  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||  |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||    
T  38340849 gtttggatatgcttat-taaaagtaatttttataagttgacgttgtttggatagtttgaataaaaattgattttaaatgtgtagtgaccaaattatcctt 38340751  T
Q  253 tt 254  Q
    ||    
T  38340750 tt 38340749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 258
Target Start/End: Original strand, 44939369 - 44939576
Alignment:
Q  49 tttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgat 148  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  44939369 tttagtgtgtgtttggtatagcggtggcgataattgattttgatagaattgaatttgagtgaattgattttgattaaaagtgagttgaatatgaattga- 44939467  T
Q  149 ttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactat 248  Q
    || |||||||||| | ||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||  |||||||||| |||    
T  44939468 ttatgtttggatacattta-ctataagtgattcttatgagttgatgttgtttgaatagttttaatcaaaattaattttgaatgtctaatgactaaattat 44939566  T
Q  249 ccttttaatt 258  Q
    |||| |||||    
T  44939567 ccttataatt 44939576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 52 - 276
Target Start/End: Original strand, 48189398 - 48189620
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    ||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||     
T  48189398 agtgtgtgtttggtagggcggtggcgataattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtaaattga-tta 48189496  T
Q  152 tgtttggatatac-ttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcc 250  Q
    |||||||||| || ||| | | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||| |||||    
T  48189497 tgtttggatacacgttaac-agaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtataatgactaaattatcc 48189595  T
Q  251 ttttaattgtaattagaaataaatat 276  Q
    || ||| ||| |||| ||||||||||    
T  48189596 ttctaa-tgttattaaaaataaatat 48189620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 51 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 3348389 - 3348179
Alignment:
Q  51 tagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgattt 150  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||    
T  3348389 tagtgtgtgtttggcatagcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttagaagtgagttggatgtaaattgattt 3348290  T
Q  151 ctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcc 250  Q
     |||||||||| ||||   ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| | |||| ||| |||||    
T  3348289 atgtttggatacacttccttaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatattttatatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcc 3348190  T
Q  251 ttttaattgta 261  Q
    |||||||||||    
T  3348189 ttttaattgta 3348179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 53 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 53075046 - 53074819
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttct 152  Q
    ||||||||||| || || || || || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||  |    
T  53075046 gtgtgtgtttgatacggcggcggtgaaaattgattttgatataattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatta-t 53074948  T
Q  153 gtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcctt 252  Q
    ||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||  || ||||    
T  53074947 gtttggatacactcacttaaaagtgattcttatgagtggatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgcgtaaagaccaacttaccctt 53074848  T
Q  253 ttaattgtaattagaaataaatatttcat 281  Q
    ||||||||| ||| || ||||||| ||||    
T  53074847 ttaattgtatttataactaaatatctcat 53074819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 252
Target Start/End: Original strand, 8424689 - 8424885
Alignment:
Q  55 gtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgt 154  Q
    |||||||| |||| | |||||  | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||    
T  8424689 gtgtgtttagtatagcggtggtcataattgaatttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaacgtgaattgatta-tgt 8424787  T
Q  155 ttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcctt 252  Q
    ||||||| ||||   || |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||    
T  8424788 ttggatacacttcaatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgtaatgactaaattatcctt 8424885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 304
Target Start/End: Original strand, 23207043 - 23207274
Alignment:
Q  71 ggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatct 170  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| |||||||||| |||| | |    
T  23207043 ggtggcgaaaattgattttgatataattgattttgttataattgattttggttaaaaatgagtttgatgtgaattgatttatgtttggatacactttttt 23207142  T
Q  171 aaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgtaattagaaat 270  Q
    | |||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||  || |||||| |||| ||||||||||||||| ||| || |    
T  23207143 acaagtgatt-ttatgagttgatgttgttt-gatagtttgaatcaaaattaattttgaacttgtaatgaccaaaccatccttttaattgtatttaaaagt 23207240  T
Q  271 aaatatttcattctcattaaatacttatttcaac 304  Q
    |||||| | |||||||||| ||| ||||||||||    
T  23207241 aaatatcttattctcattagataattatttcaac 23207274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 4984729 - 4984592
Alignment:
Q  49 tttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgat 148  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  4984729 tttagtgtgtgtttggtatggcggtggggagaattgattttgatataattgaatttgagaaaattgattttggttaaaagtgagttagatgtgaattgat 4984630  T
Q  149 ttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatg 186  Q
    || |||||||||| |||  | |||||||||||||||||    
T  4984629 ttatgtttggatacactcgtttaaaagtgattcttatg 4984592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 87 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 53179958 - 53179788
Alignment:
Q  87 tttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatg 186  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||| |||||    
T  53179958 tttgatagaattgagttttatataattgattttggttaaaagtgagtttgatgtaaattgatttatgtttggatacacttttttaaaagtgatttttatg 53179859  T
Q  187 tgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaatt 258  Q
     |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||| ||| |||||||||||||    
T  53179858 agttgat-ttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtacaatgaccaaattatccttttaatt 53179788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 95 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 25848134 - 25847946
Alignment:
Q  95 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgata 194  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   | |  ||||| ||||||||||| |||  |     
T  25848134 aattgagtttgagaaaattaattttggtaaaaagtgagtttaatatgaattgatttatgtttggataccttcacttaaaaatgattcttatgagtttgtg 25848035  T
Q  195 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattct 284  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||| ||||||| | | || |||||||||||||||    
T  25848034 ttgtttggatagtt-gaataaaaattgattttaaatgtgtaatgaccaaattatactttaaattgtattaaaaactaaatatttcattct 25847946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 51 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42475855 - 42475674
Alignment:
Q  51 tagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgattt 150  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||    
T  42475855 tagtgtgcgtttggtttggcggtgacgagaattgatttttatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttagatgtgaattgattt 42475756  T
Q  151 ctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 232  Q
     |||||| ||| ||||   |||||| ||||||||||  ||| | |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||    
T  42475755 ttgtttgaatacactttgttaaaagcgattcttatgaattgttgttgtttggatacattgaatcaaaattgcttttagatgt 42475674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 55154646 - 55154549
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt 149  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55154646 agtgtgtgtttggtatggcagtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttagttaaaagtgagttgaatgtgaattgatt 55154549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21225138 - 21224963
Alignment:
Q  49 tttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgat 148  Q
    |||| |||||||||||| | | || || |||||||||| |  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | |||||||    
T  21225138 tttaatgtgtgtttggtttagcggcggcgagaattgatctctatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgatgtaaattgat 21225039  T
Q  149 ttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatt 224  Q
     | |||||||||| ||||   |||||| |||||||| | |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21225038 atatgtttggatacactttcttaaaagcgattcttacgagttgatgtcgttttgatagtttgaatcaaaattgatt 21224963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 219
Target Start/End: Original strand, 14651085 - 14651224
Alignment:
Q  79 gaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtga 178  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  || ||||||    
T  14651085 gaattgattttaataaaattgattttgatagaattgattttgattaaaagtgagttgaatat-aattgatttgtgttttgatatacttacatagaagtga 14651183  T
Q  179 ttcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaat 219  Q
    || |||    || |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  14651184 tttttaccaattcaagttgtttggataatttgaatcaaaat 14651224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34561225 - 34561074
Alignment:
Q  80 aattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgat 179  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| | | |  || || ||||    
T  34561225 aattgattttgatagaattaagtttgataaaattgattttggttaaaagtgagttgaatgcgaattgatttatgtttggatacattgacttagaattgat 34561126  T
Q  180 tcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatg 231  Q
    |||||    || || ||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  34561125 tcttaaaaattaatgttggttggatagtttgacccaaaattgattttgaatg 34561074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 150
Target Start/End: Original strand, 29716674 - 29716740
Alignment:
Q  84 gattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgattt 150  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29716674 gattttgataaaattgaatttgagagaattgattttggttaaaagtgagttaaatatgaattgattt 29716740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 55 - 226
Target Start/End: Original strand, 45423728 - 45423898
Alignment:
Q  55 gtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgt 154  Q
    |||||||||||   ||||||| || |||||||||||  | |||||| | ||| | |||||||||||  |||||||||||||||  | ||||| ||| |||    
T  45423728 gtgtgtttggttctgtggtggcgaaaattgattttggcataattgattctgatagaattgattttgcctaaaagtgagttgaactt-aattggtttatgt 45423826  T
Q  155 ttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 226  Q
    ||||||||| | |  ||||||||||||||||   || || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45423827 ttggatatattaaagtaaaagtgattcttatcaattcatgttgtttggatagcttgaatcaaaattgatttt 45423898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 19877534 - 19877448
Alignment:
Q  80 aattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatactt 166  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  19877534 aatttattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtaaattgatttatgtttagatatactt 19877448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 229
Target Start/End: Original strand, 30809944 - 30810078
Alignment:
Q  95 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgata 194  Q
    |||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||  ||  ||||  ||||||||||||||||   |||||     
T  30809944 aattgattttgataaaattgagtttggttaaaagtgagttaaatgtgaattgatttatgattgattacgcttacttaaaagtgattcttataaattgatg 30810043  T
Q  195 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaa 229  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  30810044 atgtttggatagtttgaatcaaaattacttttaaa 30810078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 78 - 244
Target Start/End: Original strand, 49526651 - 49526817
Alignment:
Q  78 agaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtg 177  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||| |||||||||| | | || ||||| ||    
T  49526651 agaattgagtttgatgaaattgattttgatagaattgattttgattaaaagtgaattgattgtaaattgatttatgtttggatacattcatgtaaaattg 49526750  T
Q  178 attcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaa 244  Q
    ||||||||   || || ||||||  ||||| | ||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||    
T  49526751 attcttatcaatttatgttgtttaaatagtctaaatcaaaattgcttttgaatgtgtaattactaaa 49526817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 232
Target Start/End: Original strand, 31618931 - 31619023
Alignment:
Q  140 tgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || |  || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  31618931 tgaattgatttatgtttggatactctcacttagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgt 31619023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 32357566 - 32357447
Alignment:
Q  142 aattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgact 241  Q
    ||||||||| |||||| | | ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| || |||  ||||      
T  32357566 aattgatttatgtttgaaaacactcatttaaaagtgattcttatgtgttgatgttgtttgggtactttgaattaaaattgattttgaacgtgtgatgatc 32357467  T
Q  242 aaactatccttttaattgta 261  Q
    ||| ||||| ||||||||||    
T  32357466 aaaatatccctttaattgta 32357447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22737008 - 22736917
Alignment:
Q  170 taaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgta 261  Q
    ||||||||||| ||||| ||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||| ||||||||||||    
T  22737008 taaaagtgattattatgagttaatgttgttgggatggtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgaacaaattatacttttaattgta 22736917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 105
Target Start/End: Original strand, 30809912 - 30809969
Alignment:
Q  48 atttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttg 105  Q
    |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30809912 attttgtgtatgtttggtatggcggcggggagaattgattttgataaaattgagtttg 30809969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14959829 - 14959634
Alignment:
Q  79 gaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtga 178  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||| || | |||| | |||||||| | ||   |||    ||    
T  14959829 gaattgattttgataaact-gaatttgaaataattgattttaattaaaagtgagtttgatattaactcatttatttttggatacattt---taa----ga 14959738  T
Q  179 ttcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgtaattagaaataaatattt 278  Q
    || ||||| |||||| |||||| |||  ||||||||||| |||||||| |||||| || || |||| |||| ||||||||||| ||| || |||||| ||    
T  14959737 tttttatgagttgatgttgtttagatgatttgaatcaaacttgattttgaatgtgtaacgattaaattatctttttaattgtatttaaaattaaatagtt 14959638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 164
Target Start/End: Original strand, 40415276 - 40415364
Alignment:
Q  76 ggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatac 164  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |   ||| |||||| ||||||||||||||| || | |||| |||| |||||||||||||    
T  40415276 ggagaattgattttgatagaattgagtttaaaggaatcgattttagttaaaagtgagttggatgtaaattaatttatgtttggatatac 40415364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 52813362 - 52813278
Alignment:
Q  50 ttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtt 134  Q
    ||||||||||||||||   | |||| | | |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  52813362 ttagtgtgtgtttggttctgcggtgagtaaaattgattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttggttagaagtgagtt 52813278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 106
Target Start/End: Original strand, 31618368 - 31618422
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttga 106  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31618368 agtgtgtgtttggtatgacggtgggaagaattgattttgatagaattgagtttga 31618422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 158
Target Start/End: Original strand, 10852710 - 10852775
Alignment:
Q  93 aaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttgg 158  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||    
T  10852710 aaaattgattttggtataattgattttggttaaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatgtttgg 10852775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 44225709 - 44225601
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    ||||||||||||||   ||||||| || |||||||||| ||| |||||| ||||  | |||||||||| |||||||||||||| ||| | || ||||||     
T  44225709 agtgtgtgtttggttgtgtggtggagaaaattgattttaatataattgattttgt-agaattgattttcgttaaaagtgagtttaatgtaaagtgattta 44225611  T
Q  152 tgtttggata 161  Q
    ||||||||||    
T  44225610 tgtttggata 44225601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 35930929 - 35930877
Alignment:
Q  56 tgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgaga 108  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35930929 tgtgtttggtatactggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgaga 35930877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 7012727 - 7012676
Alignment:
Q  110 aattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggata 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||    
T  7012727 aattgattttggttaaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatgtttggata 7012676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22737121 - 22737055
Alignment:
Q  90 gataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgttt 156  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||| |||||    
T  22737121 gatagaattgagtttgaaaaaattgattttggttaaaagtaagtagaatgtaaattgatttatgttt 22737055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 161
Target Start/End: Original strand, 21023201 - 21023280
Alignment:
Q  80 aattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggata 161  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||    
T  21023201 aattgattttgatagaattga-tttgtaa-aattgattttggttaaatgtgagttgaatttgaagtgatttatgtttagata 21023280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 195 - 232
Target Start/End: Original strand, 37698488 - 37698525
Alignment:
Q  195 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37698488 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttacatgt 37698525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 77 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 42644382 - 42644297
Alignment:
Q  77 gagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatat 162  Q
    |||||||||||||||   |||||| |||   | |||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||    
T  42644382 gagaattgattttgagtgaattgattttataaaaattgattttagttaaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatgtttggatat 42644297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40244119 - 40244079
Alignment:
Q  192 atattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  40244119 atattgtttggatagttttaatcaaaattgtttttaaatgt 40244079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 224
Target Start/End: Original strand, 55087594 - 55087630
Alignment:
Q  188 gttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatt 224  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55087594 gttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatt 55087630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 23918929 - 23918881
Alignment:
Q  110 aattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttgg 158  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||    
T  23918929 aattaattttggttaaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatgtttgg 23918881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 41459319 - 41459255
Alignment:
Q  93 aaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttg 157  Q
    |||||||| |||||   |||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||    
T  41459319 aaaattgattttgattgaattgactttggttaaaagtgatttgaagataaattgatttatgtttg 41459255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 118
Target Start/End: Original strand, 45488498 - 45488538
Alignment:
Q  78 agaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattt 118  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  45488498 agaattgattttgaaagaattgattttgagataattgattt 45488538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 77)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 49 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16566438 - 16566226
Alignment:
Q  49 tttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgat 148  Q
    |||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16566438 tttagtgtgtgtttggtatggcagcagggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgat 16566339  T
Q  149 ttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactat 248  Q
    || |||||||||| ||||   |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  16566338 ttatgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgactaaactat 16566239  T
Q  249 ccttttaattgta 261  Q
    |||||||||||||    
T  16566238 ccttttaattgta 16566226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 59 - 308
Target Start/End: Original strand, 42944861 - 42945110
Alignment:
Q  59 gtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttgg 158  Q
    |||||||| || |||||  |||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  42944861 gtttggtacggcggtggcaagaatttattttgatagaattgattttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttag 42944960  T
Q  159 atatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaatt 258  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  42944961 atatacttacttaaaagtgattcttatgtgttgatgttgtttggatagtatgtatcaaaattgattttaaatgtataatgaccaaactatccttttaatt 42945060  T
Q  259 gtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaacttat 308  Q
     || ||| || |||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  42945061 atatttaaaagtaaatatcccattctcattagataattatttcagcttat 42945110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 50 - 289
Target Start/End: Original strand, 43772077 - 43772316
Alignment:
Q  50 ttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt 149  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  43772077 ttagtgtgtgtttggtttggtggtgacgataattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaatcgatt 43772176  T
Q  150 tctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatc 249  Q
    | |||||||||| |||| | || |||||||||||| | |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  43772177 tatgtttggatacacttttttagaagtgattcttacgagttgatgttgtttggataatatgaatcaaaattgattttaagtgtgtaatgaccaaactatc 43772276  T
Q  250 cttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcatta 289  Q
    ||||||||| || ||| || ||||||| ||||||||||||    
T  43772277 cttttaattatatttaaaagtaaatatctcattctcatta 43772316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 54 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 39636913 - 39636657
Alignment:
Q  54 tgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctg 153  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  39636913 tgtgtgtttggtatgacggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttggatgtgaattgatttatg 39636814  T
Q  154 tttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttt 253  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||    
T  39636813 tttggatacacttacttaaaagtgattcttacgagttgatgttgtttggatagtatgaatcaaaattgattttaaatgtgtaacgaccaaaatatccttt 39636714  T
Q  254 taattgtaattagaaataaata--tttcattctcattaaatacttatttcaacttat 308  Q
    ||||| || ||| || ||||||  | |||||| ||||| ||| |||||||| |||||    
T  39636713 taattatatttacaagtaaatatctctcattcacattagataattatttcagcttat 39636657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 49 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 51923073 - 51922868
Alignment:
Q  49 tttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgat 148  Q
    ||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51923073 tttagtgtgtgtttggtatggcggcgacgagaattgattttgttagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatctgaattgat 51922974  T
Q  149 ttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactat 248  Q
    || |||||||||| ||||  |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||    
T  51922973 ttatgtttggatacactttactaaaagtaattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtataatgaccaaactat 51922874  T
Q  249 cctttt 254  Q
    ||||||    
T  51922873 cctttt 51922868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 52 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 49519863 - 49519604
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatgg---tggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgat 148  Q
    ||||||||||||||||||   |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  49519863 agtgtgtgtttggtatggcggtggtggtgagaattggttttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaatttat 49519764  T
Q  149 ttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactat 248  Q
    || |||||||||| ||||   ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  49519763 ttatgtttggatacacttgcttaaaaatgattcttatgaattgatattgtttggatagtatgtattaaaattgattttaagtgtgtaatgaccaaactat 49519664  T
Q  249 ccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaacttat 308  Q
    | |||||||| || ||| || ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  49519663 cattttaattatatttaaaagtaaatatctcattctcattagataattatttcagcttat 49519604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 53 - 257
Target Start/End: Original strand, 6138577 - 6138780
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttct 152  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  6138577 gtgtgtgtttggtttggcggtggggagaattgattttgatagaattgagtttgaaataattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttat 6138676  T
Q  153 gtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcctt 252  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||| |||||||| ||    
T  6138677 gtttggatacacttatttaaaaatgattcatatgagttgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattga-tttgaatgtgtaatgaccaaactatcatt 6138775  T
Q  253 ttaat 257  Q
    |||||    
T  6138776 ttaat 6138780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 52 - 275
Target Start/End: Original strand, 19592187 - 19592410
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||     
T  19592187 agtgtgtgtttgatatggcggtggggagaattgattttgatagaattgagttttagagaattgattttggttaaaagtgagttggaagtgaattgattta 19592286  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcct 251  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||| ||| ||| ||    
T  19592287 tgtttggatacactttactaaaagtgattcttacgaattgacgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttgaatgtacaatgaccaaattattct 19592386  T
Q  252 tttaattgtaattagaaataaata 275  Q
    |||||||||| |||||| ||||||    
T  19592387 tttaattgtatttagaagtaaata 19592410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Original strand, 29149261 - 29149443
Alignment:
Q  50 ttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt 149  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  29149261 ttagtgtgtatttggtatagcggtggggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgctaaaaagtgagttgaatgtgaattgatt 29149360  T
Q  150 tctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 232  Q
    | |||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29149361 tatgtttggatacactcaattaaaagtgatttttattagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 29149443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 53 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 14072631 - 14072427
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttct 152  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||| || |    
T  14072631 gtgtgtgtttggtatggcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgtttaaaagtgagttgaaggtaaattga-ttat 14072533  T
Q  153 gtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcctt 252  Q
    ||||||||| ||||   || |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  14072532 gtttggatacactttaatagaagtgattctaatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgactaaattatcctt 14072433  T
Q  253 ttaatt 258  Q
    ||||||    
T  14072432 ttaatt 14072427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 53 - 253
Target Start/End: Original strand, 26651805 - 26652005
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttct 152  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  26651805 gtgtgtgtttggtatggcggcggcgagaattgattttgatagaattaagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttat 26651904  T
Q  153 gtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcctt 252  Q
    |||| |||| ||||  |||||||| ||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||    
T  26651905 gtttagatacactttactaaaagtaattcttatgagtcgatgttatttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtataatgaccaaactatcctt 26652004  T
Q  253 t 253  Q
    |    
T  26652005 t 26652005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 265
Target Start/End: Original strand, 43781477 - 43781687
Alignment:
Q  54 tgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctg 153  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| || ||    
T  43781477 tgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattga-ttatg 43781575  T
Q  154 tttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttt 253  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||| ||| |||||||     
T  43781576 tttggatacacttgtttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtaaaatgaccaaattatccttg 43781675  T
Q  254 taattgtaatta 265  Q
     |||||||||||    
T  43781676 caattgtaatta 43781687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 261
Target Start/End: Original strand, 46830025 - 46830234
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  46830025 agtgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgattta 46830124  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcct 251  Q
    |||||||||| ||||   ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||    
T  46830125 tgtttggatacactttcttaaaattgattcttatgagttgatgttgtttggatattctacatcaaaattgattttaaatgtgtattgaccaaattatcct 46830224  T
Q  252 tttaattgta 261  Q
    ||||||||||    
T  46830225 tttaattgta 46830234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 51 - 310
Target Start/End: Original strand, 9889290 - 9889549
Alignment:
Q  51 tagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgattt 150  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| | |    
T  9889290 tagtatgtgtttggtatggcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttagatatgaattg-tat 9889388  T
Q  151 ctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcc 250  Q
     |||||||||| ||| |  | ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||| |||||    
T  9889389 atgtttggatacactcacttgaaagtgattcttatgagtagatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtataatgactaaattatcc 9889488  T
Q  251 ttttaattgtaattagaaataaatatttcattctca--ttaaatacttatttcaacttatca 310  Q
    |||||| ||| |||| | |||||||| ||||| |||  ||| ||| |||||| |||||||||    
T  9889489 ttttaa-tgttattaaatataaatatctcattttcattttagataattatttgaacttatca 9889549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 56 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9893837 - 9893582
Alignment:
Q  56 tgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtt 155  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||  |||||||||||| | ||||    
T  9893837 tgtgtttggtatggcggtggtgagaattgattttgatagaattgaatttgagagaattgatttttgtcaaaagtgagttagatatgaattgatatatgtt 9893738  T
Q  156 tggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcctttta 255  Q
    |||||| ||  |  | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  9893737 tggatacacccacttgaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttaaattaaaattgattttgaatgtataatgattaaattatcctttta 9893638  T
Q  256 attgtaattagaaataaatatttcattctca--ttaaatacttatttcaacttatca 310  Q
    | ||| |||| |||||||||| ||||| |||  ||| ||| |||||| |||||||||    
T  9893637 a-tgttattaaaaataaatatctcattttcattttagataattatttgaacttatca 9893582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 55 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 30842258 - 30842003
Alignment:
Q  55 gtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgt 154  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |  ||||||||||  |||    
T  30842258 gtgtgtttggtatggcggtgacgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagtttgaggtgaattgatta-tgt 30842160  T
Q  155 ttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcctttt 254  Q
    ||||||| |||| | | ||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||| |||||||||    
T  30842159 ttggatacacttgtttgaaagtgattcttatgagttgatttcatttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgacaaaattatcctttt 30842060  T
Q  255 aattgtaattagaaataaatatttcattctca--ttaaatacttatttcaacttatc 309  Q
    ||||||| ||| || |||| ||  |||||| |  ||| |||||||||| ||||||||    
T  30842059 aattgtatttaaaactaaacatcccattcttattttagatacttatttgaacttatc 30842003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13167655 - 13167476
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  13167655 agtgtgtgtttggtatggcggtaggaaaaattgattttgatataattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgattta 13167556  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatg 231  Q
    | |||||||| ||  || |||||||||||||||||| || ||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13167555 tatttggatacacccatttaaaagtgattcttatgtattaatgatgtttggatagattgaatcaaaattgcttttaaatg 13167476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 56 - 276
Target Start/End: Original strand, 13183010 - 13183230
Alignment:
Q  56 tgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtt 155  Q
    |||||||||||||  ||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||  ||||||||||| ||||    
T  13183010 tgtgtttggtatgacggtgacgataattgattttgataaaattgagtctgagataattgattttggttaaaagcaagtttaaggtgaattgatttatgtt 13183109  T
Q  156 tggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcctttta 255  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||| ||||  |||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||| |    
T  13183110 tggatacacttatttaaaaatgatttttataagttgatgttttttggataatttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgaccaaactatcctttaa 13183209  T
Q  256 attgtaattagaaataaatat 276  Q
    |||||| ||| || |||||||    
T  13183210 attgtatttaaaagtaaatat 13183230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 52 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 15603490 - 15603254
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  || |||||||||||     
T  15603490 agtgtgtgtttggtttgacggtggggagaattgattttgatagaattgagtttgagataattgattatggtaaaaagtgagtttgatgtgaattgatttg 15603391  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcct 251  Q
    ||||| |||||||||   ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||   |||||  ||| ||||||    
T  15603390 tgtttagatatacttgcttaaaaatgattcttatgagttgatgttgtttggataatttaagtcaaaattgattttgaatgcacaatgatcaaattatcct 15603291  T
Q  252 tttaattgtaattagaaataaatatttcattctcatt 288  Q
    ||| |||||  ||| || ||||||| ||||| |||||    
T  15603290 tttgattgtttttaaaactaaatatctcattatcatt 15603254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 53 - 224
Target Start/End: Original strand, 26426072 - 26426242
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttct 152  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| || |    
T  26426072 gtgtgtgtttggtatgacggtggggagaattgattttgatagaattgagtttgagaaaattgattttggttaaaagtgagttagatataaattga-ttat 26426170  T
Q  153 gtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatt 224  Q
    |||||||||  ||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26426171 gtttggatacgcttaattaaaagtgattcttttgagttgatattgtttggatacattgaatcaaaattgatt 26426242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 52 - 258
Target Start/End: Original strand, 32238015 - 32238220
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||     
T  32238015 agtgtgtgtttggtatagcggtggcgataattgattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattg-gtta 32238113  T
Q  152 tgtttggatatact-tatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcc 250  Q
    |||||||||| ||| ||| || ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||| |||||    
T  32238114 tgtttggatacactatat-tagaagtgattcatatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaactgattttgaatgtctaatgactaaattatcc 32238212  T
Q  251 ttttaatt 258  Q
    || |||||    
T  32238213 ttataatt 32238220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 77 - 309
Target Start/End: Original strand, 48407679 - 48407912
Alignment:
Q  77 gagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagt 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||  |||||||||| |||| | | |||||    
T  48407679 gagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatta-tgtttggatacacttgtttgaaagt 48407777  T
Q  177 gattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgtaattagaaataaatat 276  Q
    |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||| |||||||||||||||| ||| || |||| ||    
T  48407778 gattcttatgagttgatttcatttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgacaaaattatccttttaattgtatttaaaactaaacat 48407877  T
Q  277 ttcattctca--ttaaatacttatttcaacttatc 309  Q
      |||||| |  ||| |||||||||| ||||||||    
T  48407878 cccattcttattttagatacttatttgaacttatc 48407912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 56 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 54153170 - 54152969
Alignment:
Q  56 tgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtt 155  Q
    |||||||||||| | ||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  54153170 tgtgtttggtatagcggtggcgataattgattttaatataattgagtttgagtgaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattga-ttatgtt 54153072  T
Q  156 tggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcctttta 255  Q
    || ||| ||||  ||| |||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| ||    
T  54153071 tgaatacactttactagaagtgattctcatgagttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtctaatgactaaattatccttata 54152972  T
Q  256 att 258  Q
    |||    
T  54152971 att 54152969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 14564100 - 14564276
Alignment:
Q  50 ttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt 149  Q
    ||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14564100 ttagtgtgtgtttggttgggcggcggagagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaatgtgagttggatatgaattgatt 14564199  T
Q  150 tctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 226  Q
    | ||||||||||   | |  ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14564200 tatgtttggataccttcagttaaaagtgattcttatgagttaatgttgtttggatagattgaatcaaaattgatttt 14564276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 95 - 256
Target Start/End: Original strand, 48550426 - 48550587
Alignment:
Q  95 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgata 194  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||   || |||||||||||||| ||||||     
T  48550426 aattgattttgatagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggataaactttaatagaagtgattcttatgagttgatg 48550525  T
Q  195 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaa 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  48550526 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtgtaatgatcaaactatcattttaa 48550587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 28987150 - 28986942
Alignment:
Q  50 ttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| |    
T  28987150 ttagtgtgtgtttggtatggcggtggtgaaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattga-t 28987052  T
Q  150 tctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatc 249  Q
    | |||||| ||| ||| |  |  |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  || |    
T  28987051 tatgtttgaatacactcactt--aagtgatttttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgggtaatgaccaacttacc 28986954  T
Q  250 cttttaattgta 261  Q
     |||||||||||    
T  28986953 attttaattgta 28986942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 93 - 288
Target Start/End: Original strand, 4954048 - 4954243
Alignment:
Q  93 aaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttga 192  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| ||  || |  ||||||||||||||||| |||||    
T  4954048 aaaattgattttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgtttgggtaccctcacttaaaagtgattcttatgagttga 4954147  T
Q  193 tattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcatt 288  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||| ||| || || |||| |||||| ||||    
T  4954148 tgttgtttggataggttgaatcaaaattaattttaaatgtgtaatgacctaattatccttttaattgtatttaaaattatatatctcattcccatt 4954243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 80 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 49136624 - 49136444
Alignment:
Q  80 aattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgat 179  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||||||    
T  49136624 aattgattctggtataattgagtttgagagaattgattatggttaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgtttggatacactcacttaaaagtgat 49136525  T
Q  180 tcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgt 260  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||  |||||| ||| |||||||||||||||    
T  49136524 tcttatgagttgatgttgtttgaataattttaatcaaaattgattttgaatgtacaatgaccaaattatccttttaattgt 49136444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 54150660 - 54150476
Alignment:
Q  48 atttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattga 147  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  54150660 atttagtgtgtgtttggtatggcggtggcaagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttagatgtgaattga 54150561  T
Q  148 tttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 232  Q
    ||| |||||||||| ||||   ||||| ||||||||||  |||| | |||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||    
T  54150560 tttttgtttggatacacttcgttaaaaatgattcttataagttggtgttgtttggatacattaaatcaaaattgcttttagatgt 54150476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 39187867 - 39187704
Alignment:
Q  49 tttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgat 148  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  39187867 tttagtgtgtgtttggtttggcggtggagagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtaatttgaatgtgaattgat 39187768  T
Q  149 ttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaa 212  Q
    || |||||||||| ||||  ||| ||||||||||| |  |||||| ||||||| ||| ||||||    
T  39187767 ttatgtttggatacactttactagaagtgattcttgttagttgatgttgtttgaataatttgaa 39187704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 49 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6505334 - 6505124
Alignment:
Q  49 tttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgat 148  Q
    ||||||||||||||||  ||| || |  || |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||    
T  6505334 tttagtgtgtgtttggattggcggcgtcgataattgactttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaaatgagtttgatgtgaattgat 6505235  T
Q  149 ttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactat 248  Q
    || ||||| |||| ||| || ||||||||||| | |||  ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |  ||||||| || |||    
T  6505234 ttatgtttagatacactcatataaaagtgattatcatgacttgatgttgtttggatagtttaagtcaaaattgattttgaatatataatgactgaattat 6505135  T
Q  249 ccttttaattg 259  Q
    |||||||||||    
T  6505134 ccttttaattg 6505124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 48550347 - 48550173
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||  || | |||||||||     
T  48550347 agtgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgattttaagagaattgattttgattaaaagtgagttagatgtaaattgattta 48550248  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 226  Q
    |||||||||  ||| || ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  48550247 tgtttggatgcactcatttaaaagtaattcatatgaattgatattgtttggatagattggattaaaattgatttt 48550173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 105 - 282
Target Start/End: Original strand, 56241844 - 56242021
Alignment:
Q  105 gagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggat 204  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| | | || ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  56241844 gagagaattgattttgattaaaagtgagtttgatatgaattgatttatgtttggatacattaatgtaaaagtgattcttatgagttgataatgtttagat 56241943  T
Q  205 agtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcatt 282  Q
      ||| |||||||||||||||| |||||  |||||| ||| |||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||    
T  56241944 gatttaaatcaaaattgattttgaatgtataatgaccaaaatatccttttaattgtatttaaaattaaatatctcatt 56242021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 53 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25312844 - 25312665
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttct 152  Q
    ||||||||||||| ||| |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||| |    
T  25312844 gtgtgtgtttggtttggcggtaacgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttagatgtgaattgattttt 25312745  T
Q  153 gtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 232  Q
    ||||||||| ||||   |||||| ||||||||||  ||| | |||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||    
T  25312744 gtttggatacactttgttaaaagcgattcttatgaattgttgttgtttggatacattgaatcaaaattgcttttagatgt 25312665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 53 - 240
Target Start/End: Original strand, 31520328 - 31520514
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttct 152  Q
    ||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||| || |||  ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |    
T  31520328 gtgtgtgtttggtatagcgatggcgagaattgattttggtagaatgaagtttgaaagaattaattttggttaaaagtgagttgggtgtgaatggatttat 31520427  T
Q  153 gtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgac 240  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  31520428 gtttagatatgcttat-taaaagtgatttttatgagttgatgttttttgggtagtttgaataaaaattgattttaaatgtgtaatgac 31520514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 95 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 15619701 - 15619538
Alignment:
Q  95 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgata 194  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| | |||||||||| | ||| ||| ||||||||| | || ||||||     
T  15619701 aattgagtttgagagaattgattttggtaaaaagtgagttggatgtgaattgatgtatgtttggataca-tta-ctataagtgattcatgtgggttgatg 15619604  T
Q  195 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgta 261  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  15619603 ttgtttggatagtttgaatcaaaa-tgatcttgaatgtgtaatgactaaattatcattttaattgta 15619538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 258
Target Start/End: Original strand, 54735603 - 54735812
Alignment:
Q  48 atttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattga 147  Q
    ||||||| |||| ||||| ||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||  || | |||||     
T  54735603 atttagtatgtgcttggtttggcggcggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagaaaattgattttggttaaat-tgagtttgatgtaaattgg 54735701  T
Q  148 tttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaacta 247  Q
    ||| |||||||| | |  ||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||  || ||| ||||||||||||| || |||||| |||||| ||| ||    
T  54735702 tttatgtttggaaacatatacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttgagtattttaaatcaaaattgatcttgaatgtgtaatgaccaaagta 54735801  T
Q  248 tccttttaatt 258  Q
    ||| |||||||    
T  54735802 tccctttaatt 54735812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 14076147 - 14075939
Alignment:
Q  49 tttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgat 148  Q
    |||||| ||||||| || ||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  || | |||||||    
T  14076147 tttagtatgtgtttagtttggcggcggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagaaaattgattttggtt-aaagtgagtttgatgtaaattgat 14076049  T
Q  149 ttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactat 248  Q
    || |||||||| | |  ||  |||||||||||||||||  ||||| |||||||  || ||| |||||||||| || || |||||| |||||| ||| |||    
T  14076048 ttatgtttggaaacatatacttaaaagtgattcttatgaattgatgttgtttgagtactttaaatcaaaattaatcttgaatgtgtaatgaccaaagtat 14075949  T
Q  249 ccttttaatt 258  Q
    || |||||||    
T  14075948 ccctttaatt 14075939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 170 - 310
Target Start/End: Original strand, 55638861 - 55639001
Alignment:
Q  170 taaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgtaattagaaa 269  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||     
T  55638861 taaaagggattcttatgagttgatattgtttggataatatgaatcaaaattgattttgaatatgtaatgaccaaactatcattttaattgtatttaaaag 55638960  T
Q  270 taaatatttcattctcattaaatacttatttcaacttatca 310  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||| |||||| | |||||||    
T  55638961 taaatatatcattctcgttagataattattttagcttatca 55639001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 71 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 46926159 - 46926000
Alignment:
Q  71 ggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatct 170  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||| |||  | |    
T  46926159 ggtggggataattgattttgatagaattgagtttgagaaaattgtttttggttaaaagtgagttagatgtgaattgatttatgtttggatacactcgttt 46926060  T
Q  171 aaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaat 230  Q
    |||||||||| |||||  || || || |||  ||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  46926059 aaaagtgatttttatgaattaattttatttatatattttgaatcaaaattacttttaaat 46926000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 51 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 41866285 - 41866176
Alignment:
Q  51 tagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgattt 150  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  41866285 tagtgtgtgtttggtttggcggtggcgataattgattttgataaaattgagtttgagggaattgagtttagttaaaagtgagttggatgtgaattgattt 41866186  T
Q  151 ctgtttggat 160  Q
     |||||||||    
T  41866185 atgtttggat 41866176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 258
Target Start/End: Original strand, 2175161 - 2175309
Alignment:
Q  110 aattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagttt 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||  |||    ||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||    
T  2175161 aattgattttgattaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgtttggatgcactcgcttaaaagtgattttgatgggttgatgttgtttggatagttt 2175260  T
Q  210 gaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaatt 258  Q
    |||| |||||||||||| || ||  |||||||||| |||||||||||||    
T  2175261 gaattaaaattgattttgaacgtacaatgactaaattatccttttaatt 2175309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 175
Target Start/End: Original strand, 55638718 - 55638834
Alignment:
Q  59 gtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttgg 158  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| |    
T  55638718 gtttggtttggtggcggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgatttttgttaaaagtgagttaaatgtaaattgatttatgtttag 55638817  T
Q  159 atatacttatctaaaag 175  Q
    ||| |||||| ||||||    
T  55638818 atacacttatttaaaag 55638834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 48908402 - 48908231
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttct 152  Q
    ||||||||||||| ||| || || || |||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||||  || |    
T  48908402 gtgtgtgtttggtttggcggcggtgaaaattgattttaatattattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgatgtgaattg-gttat 48908304  T
Q  153 gtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 226  Q
    |||||||||  ||    ||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48908303 gtttggata-cctcgcttaaaagtaattcatataagttgatgttgtttggatagcttgaatcaaaattgatttt 48908231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 53532109 - 53532024
Alignment:
Q  50 ttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttg 135  Q
    ||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  53532109 ttagtatgtgtttggttcggcggtggtgagaattgattttgataaaattgagtttgacataattgattttagttaaaagtgagttg 53532024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14054979 - 14054807
Alignment:
Q  54 tgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctg 153  Q
    ||||||||||||| ||  |||  | ||||||||||||| | |||||||||||| | |||||| ||| || |||||||||||  || ||||||||||| ||    
T  14054979 tgtgtgtttggtacggcagtgacgggaattgattttgacataattgagtttgaaagaattgagtttagtcaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatg 14054880  T
Q  154 tttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 226  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| ||    |||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||    
T  14054879 tttggataaacttatataaaagtgattatttcaagttgatgttgtttgaatactttaaattaaaattgatttt 14054807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 54488735 - 54488556
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    ||||||||||||||   | ||||| || |||||||||||| | |||||| ||||  | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  54488735 agtgtgtgtttggttctgcggtggagataattgattttgacagaattgattttgttagaattgatttttgttaaaagtgagttgaatgtgaattgattta 54488636  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatg 231  Q
    |||||| |||   | |   |||||||||||||||   || || |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  54488635 tgtttgaataccttaaagcaaaagtgattcttataaattcattttgtttggataacttggatcaaaattgattttaaatg 54488556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 33574283 - 33574197
Alignment:
Q  77 gagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatata 163  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  33574283 gagaattatttttgatagaattgagtttgagagaattaattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttgaatata 33574197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 256
Target Start/End: Original strand, 30887199 - 30887313
Alignment:
Q  142 aattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgact 241  Q
    ||||||||| |||||||||| ||  || ||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||     
T  30887199 aattgatttatgtttggatacaccaatataaaagtgattcttatgagttaatgatgtttggatggtttgtatcaaaattgattttgaatgtgtaatgacc 30887298  T
Q  242 aaactatccttttaa 256  Q
    ||| || ||||||||    
T  30887299 aaattaaccttttaa 30887313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 71 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38306122 - 38305962
Alignment:
Q  71 ggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatct 170  Q
    ||||| || |||||||||||| | |||||| ||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||   | |       
T  38306122 ggtggagataattgattttgacagaattgattttgttagaattgatttttgttaaaagtgagttgaatgcgaattgatttatgtttggataccttaaagc 38306023  T
Q  171 aaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatg 231  Q
    |||||||||||||||   || || |||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||    
T  38306022 aaaagtgattcttataaattcatgttgtttggataacttggatcaaaattgattttgaatg 38305962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 134
Target Start/End: Original strand, 4649885 - 4649967
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtt 134  Q
    ||||||||||||||   |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||    
T  4649885 agtgtgtgtttggttctgtggtgagtagaattgattttgataaaattgagtttgagtgaattgattttggttagaagcgagtt 4649967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 38264001 - 38263895
Alignment:
Q  80 aattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgat 179  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||  || |||||| |||| |||||| ||||||| |  ||||||||||    
T  38264001 aattgattttgatataattgagtttgagaaaattaattttgcttaaaattgagtttgatgtgaattaatttatgtttgaatatactcacttaaaagtgat 38263902  T
Q  180 tcttatg 186  Q
     ||||||    
T  38263901 acttatg 38263895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 523252 - 523172
Alignment:
Q  80 aattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggat 160  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||| | ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  523252 aattgattttgatttaattgagcttgacaaaattgattttgggaaaaagtgagttcaatatgaattgatttatgtttggat 523172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 38694153 - 38693921
Alignment:
Q  77 gagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagt 176  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||| | | |||||||||||  ||||||| |||||| |   ||||  ||| |||||||||| |||    |||||||    
T  38694153 gagaattaattttgatatgattgagtttaaaagaattgattttgtctaaaagtaagttgagtgcaaattagtttatgtttggatacactcgcttaaaagt 38694054  T
Q  177 gattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgtaattagaaataaatat 276  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||| ||| ||| |||||||||| ||||| |||||  |||||| ||| ||| ||||||||| ||  || || |||| ||    
T  38694053 gattcttatgggttgatcttgcttgaataatttaaatcaaaattaattttgaatgt--aatgaccaaattatacttttaattatatataaaactaaacat 38693956  T
Q  277 ttcattctca--ttaaatacttatttcaacttatc 309  Q
     ||| |||||  ||||||  |||||||||||||||    
T  38693955 ctcaatctcattttaaatgattatttcaacttatc 38693921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 226
Target Start/End: Original strand, 19599487 - 19599624
Alignment:
Q  87 tttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatg 186  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  | |||  ||||| ||||||||||     
T  19599487 tttgatagaattgagtttgagagaattgattttgaataaaagtgagttgaatgt-aattgatttatgtttggatgcaattacttaaaattgattcttatc 19599585  T
Q  187 tgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 226  Q
      || || |||||||| || || |||||||||||| ||||    
T  19599586 aatttatgttgtttgg-tatttagaatcaaaattgctttt 19599624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 182
Target Start/End: Original strand, 45779970 - 45780095
Alignment:
Q  56 tgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtt 155  Q
    |||||||||| ||| || |  |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||   |||||||| |||| ||||    
T  45779970 tgtgtttggtttggcggcgatgagaattgatttcgatagaattgagtttgaga-aattgattttggtaaaaagtgagtttggtatgaattaatttttgtt 45780068  T
Q  156 tggatatacttatctaaaagtgattct 182  Q
    | |||| | | |  |||||||||||||    
T  45780069 tagatacattcacttaaaagtgattct 45780095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 16493016 - 16492948
Alignment:
Q  93 aaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggata 161  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  16493016 aaaattgattttgaaataattgagtttgattaaaagtgagttgaatgtgaatttatttatgtttggata 16492948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 36150691 - 36150624
Alignment:
Q  95 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatat 162  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||    
T  36150691 aattgattttgatataattgattttgattaaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatgtttggatat 36150624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 161
Target Start/End: Original strand, 54487217 - 54487285
Alignment:
Q  93 aaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggata 161  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| | | ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  54487217 aaaattgagtttgatagaattgatttcgatcaaaagtgagttgaatgtaaattgatttatgtttggata 54487285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 54655361 - 54655266
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgat 148  Q
    |||||||||||||| || ||||  || |||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||| || ||||||| |||  || |||||||||    
T  54655361 gtgtgtgtttggtacggcggtgacgataattgattttgacataattgagtttaaaataattgattttagtcaaaagtgtgtttgatgtgaattgat 54655266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 118
Target Start/End: Original strand, 16202532 - 16202572
Alignment:
Q  78 agaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattt 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16202532 agaattgattttgataaaattgattttgagagaattgattt 16202572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22699831 - 22699763
Alignment:
Q  93 aaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggata 161  Q
    |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||| ||||||||||    
T  22699831 aaaattgattttggtagaattgattttggttaaaagtaagttgaatgtaaagtgatttatgtttggata 22699763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 161
Target Start/End: Original strand, 22980699 - 22980767
Alignment:
Q  93 aaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggata 161  Q
    |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||| ||||||||||    
T  22980699 aaaattgattttggtagaattgattttggttaaaagtaagttgaatgtaaagtgatttatgtttggata 22980767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 161
Target Start/End: Original strand, 22994286 - 22994354
Alignment:
Q  93 aaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggata 161  Q
    |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||| ||||||||||    
T  22994286 aaaattgattttggtagaattgattttggttaaaagtaagttgaatgtaaagtgatttatgtttggata 22994354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 46958112 - 46958068
Alignment:
Q  93 aaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaa 137  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46958112 aaaattgattttgatagaattgattttggttaaaagtgagttgaa 46958068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5025516 - 5025485
Alignment:
Q  195 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5025516 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 5025485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 161
Target Start/End: Original strand, 38740316 - 38740367
Alignment:
Q  110 aattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggata 161  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||    
T  38740316 aattgattttggataaaagtgagttgaagttgaagtgatttatgtttggata 38740367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 93
Target Start/End: Original strand, 48550396 - 48550439
Alignment:
Q  50 ttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgata 93  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  48550396 ttagtgtgtgtttggtttggcggtgggaagaattgattttgata 48550439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 155
Target Start/End: Original strand, 22694579 - 22694656
Alignment:
Q  78 agaattgattttgataaaattgagtttgag-ataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtt 155  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||    
T  22694579 agaattgattttggtagaattga-tttaagtagaattgattttggttaaaagtgagttgaacataaagtgatttatgtt 22694656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 93
Target Start/End: Original strand, 26402916 - 26402954
Alignment:
Q  55 gtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgata 93  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26402916 gtgtgtttgatatggtggtgggaagaattgattttgata 26402954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 230
Target Start/End: Original strand, 26402960 - 26403074
Alignment:
Q  116 ttttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatca 215  Q
    ||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||| |||||| ||  | || | ||||||| |||||||||  || || ||||||| ||| |||||||||    
T  26402960 ttttgattagaagtgatttagatatgaattgatttatgtttgaatccatttctttaaaagtaattcttatgaattaattttgtttgtatattttgaatca 26403059  T
Q  216 aaattgattttaaat 230  Q
     ||||| ||||||||    
T  26403060 taattgtttttaaat 26403074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 283
Target Start/End: Original strand, 45780923 - 45781009
Alignment:
Q  197 gtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattc 283  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| |||| |||| || | | || ||||||| ||||||    
T  45780923 gtttggatgatttgaatcaaaattgattttagatgtgcaatgaccaaattattctttaaattatactaaaaactaaatatctcattc 45781009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 48556655 - 48556585
Alignment:
Q  80 aattgattttgataaaattgagtttgagataattga-ttttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt 149  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||   |||||||| |||||| ||||||||||    
T  48556655 aattgattttgatagaattgagtttgataaaattgatttttgaaaaaaagtgacttgaatgtgaattgatt 48556585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 53914985 - 53914920
Alignment:
Q  95 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggata 161  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||  |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  53914985 aattgagtttcagagaatcgattttgactaaaagtgagttgaatgt-aattgatttatgtttggata 53914920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 93
Target Start/End: Original strand, 26459852 - 26459893
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgata 93  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  26459852 agtgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattaattttgata 26459893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 158
Target Start/End: Original strand, 28947763 - 28947811
Alignment:
Q  110 aattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttgg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||| |||||||    
T  28947763 aattgattttggttaaaagtgagttgaacgtaaagtgatttatgtttgg 28947811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43628713 - 43628685
Alignment:
Q  204 tagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43628713 tagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 43628685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 43)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 52 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22482348 - 22482139
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  22482348 agtgtgtgtttggtatggcggcggggagaattgattttgatagaattgattttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgattta 22482249  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcct 251  Q
    |||||||||| ||||   |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  22482248 tgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtataatgactaaactatcct 22482149  T
Q  252 tttaattgta 261  Q
    ||||||||||    
T  22482148 tttaattgta 22482139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 50 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 32030875 - 32030638
Alignment:
Q  50 ttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||    
T  32030875 ttagtgtgtgtttggtatagtggtggagagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtaagttagatgtgaattgatt 32030776  T
Q  150 tctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatc 249  Q
    | ||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  32030775 tttgttttgatatacttattcaaaagtgattctta--tgttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgattttgaaggtgtaatgactaaactatc 32030678  T
Q  250 cttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcatta 289  Q
    |||||| ||||| ||| || ||||| | ||||||||||||    
T  32030677 cttttagttgtatttaaaagtaaatgtctcattctcatta 32030638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 53 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 41835050 - 41834828
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttct 152  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |    
T  41835050 gtgtgtgtttggtatggcggtggggagaattgattttgatagaattcagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttggaagtgaattgatttat 41834951  T
Q  153 gtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcctt 252  Q
    ||||||||| ||||  ||| |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||    
T  41834950 gtttggatacactttactagaagtgattcttacgaattgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttgaatgtgcaatgaccaaattatcctt 41834851  T
Q  253 ttaattgtaattagaaataaata 275  Q
    ||||||||| ||| || ||||||    
T  41834850 ttaattgtatttaaaagtaaata 41834828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 53 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3668012 - 3667833
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttct 152  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  3668012 gtgtgtgtttggtatagtggtggagagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgttaaaaagtgagttgaatgtgaattgatttat 3667913  T
Q  153 gtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 232  Q
    ||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3667912 gtttggatacactcaattaaaagtgatttttattagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 3667833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 46 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 35760354 - 35760168
Alignment:
Q  46 ttatttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaatt 145  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  35760354 ttattcagtgtgtgtttggtatagcggtggggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgctaaaaagtgagttgaatgtgaatt 35760255  T
Q  146 gatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 232  Q
    ||||| |||||||||| ||| |  ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35760254 gatttatgtttggatacactcaattaaaactgatttttattagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 35760168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 10058236 - 10058024
Alignment:
Q  49 tttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgat 148  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10058236 tttagtgtgtgtttagtatggcggtggggagaattgattttgatataattgagtttgagagtattgattttggttaaaagtgagttggaaatgaattgat 10058137  T
Q  149 ttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactat 248  Q
    || |||||||||| ||||  ||| |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| || ||| ||| |||    
T  10058136 ttatgtttggatacactttactagaagtgattcttacgaattgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttgaacgtgcaacgaccaaattat 10058037  T
Q  249 ccttttaattgta 261  Q
    | |||||||||||    
T  10058036 cattttaattgta 10058024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 51 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 32454697 - 32454483
Alignment:
Q  51 tagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataa-aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt 149  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||    
T  32454697 tagtgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgattagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatt 32454598  T
Q  150 tctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatc 249  Q
      |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||| ||| ||||    
T  32454597 a-tgtttggatacacttgtttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtaaaatgaccaaattatc 32454499  T
Q  250 cttttaattgtaatta 265  Q
    ||| ||||||||||||    
T  32454498 cttgtaattgtaatta 32454483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 252
Target Start/End: Original strand, 2430250 - 2430449
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  2430250 agtgtgtatttggtatggcggtggcgagaattcattttgatggaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaacatgaattga-tta 2430348  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcct 251  Q
    |||||||||| ||||   || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||    
T  2430349 tgtttggatacacttcaatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgagtgtgtaatgactaaattatcct 2430448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 48 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 40885374 - 40885163
Alignment:
Q  48 atttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattga 147  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  40885374 atttagtgtgtgtttggtatggcggtggtgaaaattgattttgttagaattgagtttaagagaattgattttgattaaaagtgagttggatgtgaattga 40885275  T
Q  148 tttctgtttggatatacttatctaaaagtga-ttcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaact 246  Q
    ||| |||||||| | |||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||  ||| |    
T  40885274 tttatgtttggacacacttgtttaaaagtgagtttttatgagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatatgtaatgatcaaatt 40885175  T
Q  247 atccttttaatt 258  Q
    ||||||||||||    
T  40885174 atccttttaatt 40885163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 54 - 226
Target Start/End: Original strand, 13253038 - 13253209
Alignment:
Q  54 tgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctg 153  Q
    ||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  13253038 tgtgtgtttggttgggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattga-ttatg 13253136  T
Q  154 tttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 226  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13253137 tttggatacactcatttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattgatttt 13253209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 54 - 261
Target Start/End: Original strand, 9275439 - 9275646
Alignment:
Q  54 tgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctg 153  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||| ||    
T  9275439 tgtgtgtttggtttggcggtggggaaaattgattttgataaaattgagtttaagagaattgattttggttaaaagtgagttagatgttaattgatttatg 9275538  T
Q  154 tttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttt 253  Q
    |||||||| ||||   ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||||||| |||||| |||||| ||| |||| |||    
T  9275539 tttggatacactttaataaaattgattcttatgagttgatgttgtttggatgatttgaatgaaacttgattttgaatgtgtaatgaccaaattatctttt 9275638  T
Q  254 taattgta 261  Q
    ||||||||    
T  9275639 taattgta 9275646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 51 - 258
Target Start/End: Original strand, 40495310 - 40495516
Alignment:
Q  51 tagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgattt 150  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||    
T  40495310 tagtgtgtgtttggtatggcggcgggaagaattgattttgatagaattgagtttgatataattgattttggttaaaagtgagtttgatgtaaattgattt 40495409  T
Q  151 ctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcc 250  Q
     |||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||  |||||  ||| |||||    
T  40495410 atgtttggatacacttttttaaaagtgatttttatgagttgat-ttgtttgaatagtttaaatcaaaattgatttggaatgtacaatgatcaaattatcc 40495508  T
Q  251 ttttaatt 258  Q
    ||||||||    
T  40495509 ttttaatt 40495516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 52 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 42146466 - 42146295
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||     
T  42146466 agtgtgtgtttggtatgacggcggggagaattgattttgatagaattgagtttgagaaaattgattttggttaaaagtgagttagatatgaattga-tta 42146368  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatt 224  Q
    ||||||||||  ||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42146367 tgtttggatacgcttaattaaaagtgattcttttgagttgatattgtttggatacattgaatcaaaattgatt 42146295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 50 - 224
Target Start/End: Original strand, 40791021 - 40791194
Alignment:
Q  50 ttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt 149  Q
    ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  40791021 ttagtgtgtgtttggtatcacggcggggagaattgattttgatagaattgagtttgagaaaattgattttggttaaaagtgagttagatatgaattga-t 40791119  T
Q  150 tctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatt 224  Q
    | ||||||||||  ||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40791120 tatgtttggatacgcttaattaaaagtgattcttttgagttgatattgtttggatacattgaatcaaaattgatt 40791194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 56 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7715095 - 7714840
Alignment:
Q  56 tgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtt 155  Q
    ||||||| |||||| |||||  | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||    
T  7715095 tgtgttttgtatggcggtggtaaaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttagatatgaattgatatatgtt 7714996  T
Q  156 tggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcctttta 255  Q
    | || | ||| |  | ||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||    
T  7714995 ttgacacactcacttgaaattgattcttataagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaaagtataatgactaaattatcctttta 7714896  T
Q  256 attgtaattagaaataaatatttcattctca--ttaaatacttatttcaacttatca 310  Q
    | ||| |||| |||||||||| ||||| |||  ||| ||| |||||| |||||||||    
T  7714895 a-tgttattaaaaataaatatctcattttcattttagataattatttgaacttatca 7714840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 24045992 - 24045759
Alignment:
Q  49 tttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgat 148  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||    
T  24045992 tttagtatgtgtttggtatggcggtggtgagaattgattttgatagaattgaatttgagagaattgattttggttaaaagtgagtctgatgtgaattgat 24045893  T
Q  149 ttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactat 248  Q
    || |||||||||   || | || ||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||  |||||||||| |||    
T  24045892 ttatgtttggatgctctca-cttaaaatgatttttatgggttgatgttgtttggataatttgaattaaaattgattttgaacgtacaatgactaaattat 24045794  T
Q  249 ccttttaattgtaattagaaataaatatttcattc 283  Q
    ||||||||||  | ||| || ||||||| ||||||    
T  24045793 ccttttaattagatttaaaactaaatatctcattc 24045759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 53 - 258
Target Start/End: Original strand, 33953856 - 33954060
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttct 152  Q
    |||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||  |    
T  33953856 gtgtgtgtttggtatggcagtggtgaaaattgattttggtagaattgagtttgagagaattgattttatttaaaagtgagttgaacgtaaattgatta-t 33953954  T
Q  153 gtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcctt 252  Q
    ||||||||| ||||   || |||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  33953955 gtttggatacactttaatagaagtgattctgatgagttgatgttgttcggatagtttgaatcaaaattaattttgaatgtgtaatgactaaattatcctt 33954054  T
Q  253 ttaatt 258  Q
    ||||||    
T  33954055 ttaatt 33954060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 229
Target Start/End: Original strand, 39987920 - 39988097
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||     
T  39987920 agtgtgtgtttggtataccggcggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgattta 39988019  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaa 229  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||| ||||||||||  |||||||    
T  39988020 tgtttggatacacttatttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatgatttaaatcaaaatttcttttaaa 39988097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 78 - 253
Target Start/End: Original strand, 3060203 - 3060376
Alignment:
Q  78 agaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtg 177  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| | || ||||||    
T  3060203 agaattgattttgatagaattaagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttttatatgaattaatttatgtttggatatactca-cttaaagtg 3060301  T
Q  178 attcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttt 253  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||| ||||||||    
T  3060302 attcttatgagtt-atgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttt 3060376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 229
Target Start/End: Original strand, 8049002 - 8049181
Alignment:
Q  50 ttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt 149  Q
    ||||||||| |||||||| | || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  | ||||||||    
T  8049002 ttagtgtgtctttggtatagcggcggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggttaattgatt 8049101  T
Q  150 tctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaa 229  Q
    | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||    
T  8049102 tatgtttggatacacttatttaaaagtgattcttatgagttgttgttgtttggatgatttaaatcaaaattgcttttaaa 8049181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 56 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4292304 - 4292119
Alignment:
Q  56 tgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtt 155  Q
    ||||||||| |||| ||  || |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||| ||||    
T  4292304 tgtgtttgggatggcggcaggaagaattgattttgatagaattaagtttgagagaattgattttgattaaaaataagttgaatgtgaattgatttatgtt 4292205  T
Q  156 tggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgact 241  Q
    |||||| |||||  || ||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  4292204 tggatacacttaattagaagtgattcttgttggttgatattgtttggataatttgaatcaaaattaattttgaatgtgtaatgact 4292119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 225
Target Start/End: Original strand, 5710339 - 5710511
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||   | ||||||| |||     
T  5710339 agtgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaatggagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagtttggtgtgaattgcttta 5710438  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattt 225  Q
    ||||||||||  ||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5710439 tgtttggatacgcttat-tacaagtgatttttatgagtagatattgtttggatagtttgaataaaaattgattt 5710511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 51 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27021288 - 27021085
Alignment:
Q  51 tagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgattt 150  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  27021288 tagtatgtgtttggtttggcggtggttagaactgattttgatataattgagtttgagaaaattgattttggttaaaaatgagttaaatgtgaattgattt 27021189  T
Q  151 ctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggat-agtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatc 249  Q
     ||||||| |||||| |  |||||||||||||||   |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||| ||||    
T  27021188 atgtttgg-tatactcacttaaaagtgattcttagaagttgatgttgtttggataagattgaatcaaaattgattttgaatgtataatgacgaaattatc 27021090  T
Q  250 ctttt 254  Q
    |||||    
T  27021089 ctttt 27021085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 71 - 245
Target Start/End: Original strand, 41740565 - 41740739
Alignment:
Q  71 ggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatct 170  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||  | |||||||| ||| |||||| ||| |||| | |    
T  41740565 ggtggggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattataggtgagtttgagatgaattggtttatgtttgaatacacttgttt 41740664  T
Q  171 aaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaac 245  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||| ||||    
T  41740665 aaaagtgattgttatgagttgatgttgtttggatagtttaaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgaccaaac 41740739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 48 - 229
Target Start/End: Original strand, 7385881 - 7386062
Alignment:
Q  48 atttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattga 147  Q
    ||||||||||||||| |||| | || || ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||  |  ||||||||    
T  7385881 atttagtgtgtgtttagtatagcggcggtgagaattgattttgatagaattaagttttagagaattgattttggttaaaagtgggtttgaggtgaattga 7385980  T
Q  148 tttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaa 229  Q
    ||| |||||  ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  7385981 tttatgtttaaatacacttatttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggataatttaaatcaaaattgcttttaaa 7386062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 80 - 258
Target Start/End: Original strand, 16158446 - 16158624
Alignment:
Q  80 aattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgat 179  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||  || |||||| |||| | |||||||  |||| | ||||||||||    
T  16158446 aattgatttttatagatttgagtttgaaagaattgattttgattaaaagtgagtttgatgtgaattaatttatatttggatgcacttttttaaaagtgat 16158545  T
Q  180 tcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaatt 258  Q
    ||||| |  ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||| |||||||||    
T  16158546 tcttaggaattgatgttctttggatgatttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgatcaaaatattcttttaatt 16158624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7178908 - 7178763
Alignment:
Q  80 aattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgat 179  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| | | | |||||| ||||    
T  7178908 aattgagtttgatagaattgagtttgagagaattaattttgactaaaagtgagttgaatgt-aattgatttatgtttggatacaataacctaaaattgat 7178810  T
Q  180 tcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 226  Q
    ||||||   || || |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  7178809 tcttatcaatttatgttgtttgggtagtttgaatcaaaattgctttt 7178763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 276
Target Start/End: Original strand, 28869530 - 28869679
Alignment:
Q  126 aagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattt 225  Q
    |||| ||||| || || |||||||| |||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  28869530 aagttagttggatgtggattgatttatgtttgaatacacttacttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgagt-aaaatagattt 28869628  T
Q  226 taaatgtggaatgactaaactatccttttaattgtaattagaaataaatat 276  Q
      | |||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  28869629 cgagtgtgtaatgaccaaattatccttttaattgtatttaaaactaaatat 28869679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 187
Target Start/End: Original strand, 23914235 - 23914342
Alignment:
Q  80 aattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgat 179  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||  || ||||||||||    
T  23914235 aattgattttgatagaattgattttgagagaattgattatacttaaaattgagttggatatgaattgatttacgtttggatacacccatttaaaagtgat 23914334  T
Q  180 tcttatgt 187  Q
    ||||||||    
T  23914335 tcttatgt 23914342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 220
Target Start/End: Original strand, 34106928 - 34107068
Alignment:
Q  80 aattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgat 179  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||  |||||  ||| | | || ||||||| ||    
T  34106928 aattgattttgatagaattgagtttaaaagaattgtttttggttaaaagtgagttagatgtgaattgattaatgtttaaatacattcatttaaaagtaat 34107027  T
Q  180 tcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaatt 220  Q
    |||||||  || || ||||||| |||| |||||||||||||    
T  34107028 tcttatgaattaatgttgtttgaataggttgaatcaaaatt 34107068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 226
Target Start/End: Original strand, 2694738 - 2694887
Alignment:
Q  77 gagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatc-taaaag 175  Q
    ||||||||||||||  | |||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||| | ||| |||| ||||| | ||||||    
T  2694738 gagaattgattttgtcagaattgattttgattgaattgattttggttaaaagtgagttgatcataaattaatttatttttagata-acttaacataaaag 2694836  T
Q  176 tgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 226  Q
    ||||||||||   |||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  2694837 tgattcttatcaattgatgatgtttgtataatttgaatcaaaattgatttt 2694887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 48 - 134
Target Start/End: Original strand, 35847839 - 35847925
Alignment:
Q  48 atttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtt 134  Q
    ||||||||||||||||||   | |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  35847839 atttagtgtgtgtttggttctgcggtgagtagaattgattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttggttagaagtgagtt 35847925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 161
Target Start/End: Original strand, 2483725 - 2483776
Alignment:
Q  110 aattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggata 161  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2483725 aattgattttagttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggata 2483776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 161
Target Start/End: Original strand, 33467971 - 33468054
Alignment:
Q  78 agaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggata 161  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||| | |  |||||||| ||||||||||    
T  33467971 agaattgattttaacaaaattgattttgatagaactgattttggttaaaagtgagttgagtgtatattgatttgtgtttggata 33468054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20069030 - 20068942
Alignment:
Q  95 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattctt 183  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| | | |||| |||| |||||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  20069030 aattgagtttgatcgaattgattttggtcaaaagtgagttgagtttaaatttatttatgtttggatacactaatgcaaaagtgattctt 20068942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22811127 - 22811076
Alignment:
Q  110 aattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggata 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||    
T  22811127 aattgattttggttaaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatgtttggata 22811076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 2861756 - 2861667
Alignment:
Q  95 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttat 185  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||| || | ||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  2861756 aattgattttgatataattgatttgagttaaaaatgacttgcatgtaaattgatttatgtttggatata-atatgtaaaagtgattcttat 2861667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 16843661 - 16843609
Alignment:
Q  79 gaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtga 131  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||    
T  16843661 gaattgattttgatataattgagtttgaacgaatagattttggttaaaagtga 16843609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 71 - 129
Target Start/End: Original strand, 18850986 - 18851043
Alignment:
Q  71 ggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagt 129  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| | | | ||||||||||||||||||||||    
T  18850986 ggtggggagagttgattttgatagaattgattctca-ataattgattttggttaaaagt 18851043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 19784914 - 19784864
Alignment:
Q  110 aattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||| |||||||||    
T  19784914 aattgattttggttaaaagtgagttgaatgtaaagtggtttatgtttggat 19784864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 232
Target Start/End: Original strand, 3747686 - 3747723
Alignment:
Q  195 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  3747686 ttgtttggatagttttaatcaaaattgattttacatgt 3747723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 38265109 - 38265061
Alignment:
Q  77 gagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaa 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||    
T  38265109 gagaattgattttgataaaattgattttg-tagaattgattttggttaaa 38265061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 6988263 - 6988195
Alignment:
Q  110 aattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtga 178  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||| | || |||||| ||||| ||| || ||||||||||||||    
T  6988263 aattgattttaattaaaagtaagttgaatttaaaatgatttatgtttagatgtatttatctaaaagtga 6988195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 136; Significance: 9e-71; HSPs: 64)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Original strand, 35569157 - 35569368
Alignment:
Q  50 ttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt 149  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35569157 ttagtgtgtgtttggtatggcggcggggagaattgattttgatagaattgattttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatt 35569256  T
Q  150 tctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatc 249  Q
    | |||||||||| ||||   |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  35569257 tatgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtataatgactaaactatc 35569356  T
Q  250 cttttaattgta 261  Q
     |||||||||||    
T  35569357 attttaattgta 35569368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 47 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 48511082 - 48510821
Alignment:
Q  47 tatttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattg 146  Q
    |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48511082 tattaagtgtgtgtttggtatggcggcggcgagaattgattttgattgaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattg 48510983  T
Q  147 atttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaact 246  Q
    |||| |||||||||| ||||   |||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||  |||||    
T  48510982 atttatgtttggatacacttgcttaaaagtgattcttatgaattgatgttgtttgaatagtatgtatcaaaattgattttaagtgtgtaatgatcaaact 48510883  T
Q  247 atccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaacttat 308  Q
    |||||||| ||| || ||| || ||||||| ||||||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  48510882 atccttttgattatatttaaaagtaaatatctcattctgattagataattatttcagcttat 48510821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 52 - 261
Target Start/End: Original strand, 20800234 - 20800443
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  20800234 agtgtgtgtttggtatggcggcggggagaattgattttgatagaattgattttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgattta 20800333  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcct 251  Q
    |||||||||| ||||   |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||    
T  20800334 tgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaatattgattttgaatgtataatgactaaattatcct 20800433  T
Q  252 tttaattgta 261  Q
    ||||||||||    
T  20800434 tttaattgta 20800443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 52 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 31223543 - 31223339
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  31223543 agtgtgtgtttggtttggcggtggggagaattgattttaatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgattta 31223444  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcct 251  Q
    |||||||||| ||||   || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  31223443 tgtttggatacactttaatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtgtaatgaccaaactatcct 31223344  T
Q  252 tttaa 256  Q
    |||||    
T  31223343 tttaa 31223339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 52 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 1199996 - 1199787
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  1199996 agtgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattaattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgattta 1199897  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcct 251  Q
    |||||||||| ||||   || ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |    
T  1199896 tgtttggatacactttattagaagtgattcttgtggattgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaacgtgtaatgactaaactatctt 1199797  T
Q  252 tttaattgta 261  Q
    |||| |||||    
T  1199796 tttagttgta 1199787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 49 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 5410811 - 5410553
Alignment:
Q  49 tttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgat 148  Q
    |||| |||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||    
T  5410811 tttaatgtgtgtttggtttggcggcggcgagaattgattttgatataattgaatttgaaagaattgattttgattaaaagtgagttggatgtaaattgat 5410712  T
Q  149 ttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactat 248  Q
    || |||||| ||| |||  | |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||| |||||||    
T  5410711 ttatgtttgaatacactact-taaaagtgattcttatgacttgatgttgtttggatagtttgaatcataattgattttgaatatgtaatgaccaaactat 5410613  T
Q  249 ccttttaattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaacttat 308  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  5410612 ccttttaattgtatttaaaagtaaatatctcattctcattatataattatttcaacttat 5410553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 52 - 261
Target Start/End: Original strand, 42850176 - 42850385
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  42850176 agtgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttaagtgaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgattta 42850275  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcct 251  Q
    |||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| | |||| ||| ||||||    
T  42850276 tgtttggatacacttccttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatcct 42850375  T
Q  252 tttaattgta 261  Q
    ||||||||||    
T  42850376 tttaattgta 42850385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 45 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 13056173 - 13055935
Alignment:
Q  45 tttatttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaat 144  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  13056173 tttaattagtgtgtgtttggtatggcggtggcgataattgattttgatagaatggagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttgagtgtgaat 13056074  T
Q  145 tgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaa 244  Q
    |||||| |||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||| |||    
T  13056073 tgatttatgtttgaatacgcttat-taaaagtgatttttatgagttgatattgtttggatagtttgaataaaaattgattttgaatgcgtaatgacgaaa 13055975  T
Q  245 ctatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattct 284  Q
     || |||||||| |||  ||| || ||||||| |||||||    
T  13055974 ttacccttttaactgtgtttaaaattaaatatctcattct 13055935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 261
Target Start/End: Original strand, 43728835 - 43729043
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||     
T  43728835 agtgtgtgtttggtatagcgatggagagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgcttaaaagtgagttggatgtgaattga-tta 43728933  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcct 251  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||| ||| || |||    
T  43728934 tgtttggataaacttatttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatattaaatgaccaaattaccct 43729033  T
Q  252 tttaattgta 261  Q
    |||| |||||    
T  43729034 tttatttgta 43729043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 284
Target Start/End: Original strand, 50977297 - 50977528
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||   | ||||||| |||     
T  50977297 agtgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaatggagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagtttggtgtgaattgtttta 50977396  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcct 251  Q
    ||||||||||  ||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| || |||    
T  50977397 tgtttggatacgcttat-tacaagtgatttttatgagtagatattgtttggatagtttgaataaaaattgattttgaatgtgtaatgactaaattaccct 50977495  T
Q  252 tttaattgtaattagaaataaatatttcattct 284  Q
    ||||| |||  ||| || ||||||| |||||||    
T  50977496 tttaactgtgtttaaaattaaatatctcattct 50977528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 51 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 12468381 - 12468176
Alignment:
Q  51 tagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgattt 150  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||    
T  12468381 tagtgtgtgtttggtatggcggcgggaagaattgattt-gatagaattgagtttgatataattgattttggttaaaagtgagtttgatgtaaattgattt 12468283  T
Q  151 ctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcc 250  Q
     | |||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||| |||||    
T  12468282 atatttggatacacttttttaaaagtgatttttatgagttgat-ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtacaatgaccaaattatcc 12468184  T
Q  251 ttttaatt 258  Q
    ||||||||    
T  12468183 ttttaatt 12468176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 54 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25230173 - 25229963
Alignment:
Q  54 tgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctg 153  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  25230173 tgtgtgtttggtatgacggtggcgagaattgattttgatagaactgagtttgagagaattgattttagttaaaagtgagttgaatgtgaattga-ttatg 25230075  T
Q  154 tttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttt 253  Q
    |||||||| ||||   || |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| ||| ||||||||    
T  25230074 tttggatacactttaatagaagtgattcttattagttgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttgagtgtgtaatgaccaaattatccttt 25229975  T
Q  254 taattgtaatta 265  Q
    ||||| ||||||    
T  25229974 taattttaatta 25229963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 6166278 - 6166070
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||      
T  6166278 agtgtgtgtttggtatcgcggtggtgagaattgattttgatagaattgaatttgagagaattgattttggttagaagtgagtttgatctgaattgatta- 6166180  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcct 251  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  || |||    
T  6166179 tgtttggatacactcatttaaaagtgattcttaggagttgatgttgtttgggtagtttgaatcaaaattgattttaaatgggtaatgaccaacttaccct 6166080  T
Q  252 tttaattgta 261  Q
    ||||||||||    
T  6166079 tttaattgta 6166070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 261
Target Start/End: Original strand, 7826311 - 7826520
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||     
T  7826311 agtgtgtgtttggtttggcggtggagaaaattgattttgatagaattgattttgagagaattgattttggttaaaagtgagcttgatgtgaattgattta 7826410  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcct 251  Q
    ||||||| ||  || |  |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||    
T  7826411 tgtttgggtaccctcacttaaaagtgattcttatgaattgatgttgtttggataggttgaatcaaaattgattttaaatgtgtaatgaccaagttatcct 7826510  T
Q  252 tttaattgta 261  Q
    ||||||||||    
T  7826511 tttaattgta 7826520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 50 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 10470760 - 10470536
Alignment:
Q  50 ttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt 149  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |    
T  10470760 ttagtgtgtgtttggtagggcggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtaaattga-t 10470662  T
Q  150 tctgtttggatatac-ttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactat 248  Q
    | |||||||||| || ||| | | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  | |||||||| |||    
T  10470661 tatgtttggatacacgttaac-agaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtatagtgactaaattat 10470563  T
Q  249 ccttttaattgtaattagaaataaatat 276  Q
    |||| ||| ||| |||| ||||||||||    
T  10470562 ccttctaa-tgttattaaaaataaatat 10470536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 58 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 45710211 - 45710012
Alignment:
Q  58 tgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttg 157  Q
    |||||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||  ||||||    
T  45710211 tgtttggtatagcggtggcgataattgattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttgattaaaagtgagttgtatgtgaattgatta-tgtttg 45710113  T
Q  158 gatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaat 257  Q
     ||| ||||  ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| ||||    
T  45710112 aatacactttactagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtctaatgactaaattatccttataat 45710013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 6464781 - 6464571
Alignment:
Q  47 tatttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattg 146  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  6464781 tattttgtgtttgtttggtatagtggtgacgagaattgattttgatataattgagtttgagtgagttcattttggttaaaagtgagtttaatgtgaattg 6464682  T
Q  147 atttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaact 246  Q
    |||  |||||  ||| ||||  ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |    
T  6464681 atta-tgtttttatacactttactagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtctaatgactaaatt 6464583  T
Q  247 atccttttaatt 258  Q
    |||||| |||||    
T  6464582 atccttataatt 6464571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 93 - 261
Target Start/End: Original strand, 4369801 - 4369968
Alignment:
Q  93 aaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttga 192  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||  || |  ||||||||||||||||| |||||    
T  4369801 aaaattgattttgagagaattgattttggttaaaagtgagttga-tgtgaattgatttatgtttgggtaccctcacttaaaagtgattcttatgagttga 4369899  T
Q  193 tattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgta 261  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4369900 tgttgtttggataggttgaatcaaaattgattttaaatgtgtaatgaccaaattatccttttaattgta 4369968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 261
Target Start/End: Original strand, 11023289 - 11023495
Alignment:
Q  54 tgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctg 153  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| || ||    
T  11023289 tgtgtgtttggtatggcggtggtgaaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttttaggtgaattga-ttatg 11023387  T
Q  154 tttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttt 253  Q
    |||||||| | | |  ||||||| ||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  || |||||    
T  11023388 tttggatacattcaattaaaagtaatttttacgagttgatattgtttgggtagtttgaatcaaaattgattttaaatgggtaatgaccaacttacccttt 11023487  T
Q  254 taattgta 261  Q
    ||||||||    
T  11023488 taattgta 11023495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 55 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 36205357 - 36205102
Alignment:
Q  55 gtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgt 154  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| ||| ||     
T  36205357 gtgtgtttggtatgacggtggtgagaattgattttaacggaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgggttagatatgaattggtttttga 36205258  T
Q  155 ttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcctttt 254  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||| || ||||||    
T  36205257 ttggataaacttatttaaaagtgattcttacgagtgaatgttgcttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtttaatgaccaaattaacctttt 36205158  T
Q  255 aattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaacttatca 310  Q
    ||||||| ||  || |||| |  ||||| |||||| |||  ||||| |||||||||    
T  36205157 aattgtattttaaagtaaacacctcattttcattagataagtattttaacttatca 36205102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 58 - 304
Target Start/End: Original strand, 40229433 - 40229679
Alignment:
Q  58 tgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttg 157  Q
    |||||||||||  ||||  || |||||||||||||| |||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| ||||||    
T  40229433 tgtttggtatgacggtgatgaaaattgattttgatagaattgattttgttggaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatttatgtttg 40229532  T
Q  158 gatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaat 257  Q
    |||| ||||   || | ||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  40229533 gatacactttcttacaggtgattcttctgagttgatgttgtttggataatttgaatcaaaattgattttgaacgtgtaatgaccaaactatccttttaat 40229632  T
Q  258 tgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaac 304  Q
     ||| ||  || ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||    
T  40229633 agtatttgaaagtaaatatcttattctcattagataattatttcaac 40229679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 47123558 - 47123375
Alignment:
Q  49 tttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgat 148  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||    
T  47123558 tttagtgtgtgtttggtatggcggtggcaaaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttagatgtgaattgat 47123459  T
Q  149 ttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 232  Q
    || |||||||||| ||||   ||||||||||||||||  |||| | |||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||    
T  47123458 ttttgtttggatacacttcgttaaaagtgattcttataagttggtgttgtttggatacattaaatcaaaattgcttttagatgt 47123375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 50406299 - 50406119
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||     
T  50406299 agtgtgtgtttggtatagcggtggcgagaattgattttgataaaattgagtttgaaagatttgattttgattaaaagtgagttagatgtgaattgatttt 50406200  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 232  Q
    |||||||||  ||||   ||||| ||||||||||  |||| | |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  50406199 tgtttggatgcacttcgttaaaaatgattcttataagttgttgttgtttggatacattgaatcaaaattgtttttaaatgt 50406119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 12247590 - 12247380
Alignment:
Q  50 ttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt 149  Q
    |||||||||||||||||| | ||||  || |||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| || | |||| | |    
T  12247590 ttagtgtgtgtttggtatagcggtgatgaaaattgattttaatagaattgagtttaagagaattgattctggttaaaagtgagttggatgtaaatt-aat 12247492  T
Q  150 tctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatc 249  Q
    | |||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||  |  |||||| ||| || |    
T  12247491 tatgtttggatacacttgtttaaaagtgatttttatgagttgatgttgtttggagaatttgaatcaaaattgattttgaacattaaatgaccaaattacc 12247392  T
Q  250 cttttaattgta 261  Q
    ||||||||||||    
T  12247391 cttttaattgta 12247380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26058412 - 26058236
Alignment:
Q  50 ttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||  || | ||||||||    
T  26058412 ttagtgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgatagaattgattttaagagaattgattttgattaaaagtgaattagatgtaaattgatt 26058313  T
Q  150 tctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 226  Q
    | |||||||||  ||| || ||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  26058312 tatgtttggatgcactcatttaaaagtaattcatatgaattgatgttgtttggatagattggattaaaattgatttt 26058236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 35536244 - 35536032
Alignment:
Q  48 atttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattga 147  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||  |  |||||||     
T  35536244 atttagtgtgtgtttggtatggcggtgatgaaaattaattttaatagaattgagtttgagagaattaattttgattaaaagtgactttgacgtgaattgg 35536145  T
Q  148 tttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaacta 247  Q
    ||  ||||| |||| |||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |  |||||| ||| ||    
T  35536144 tta-tgtttagatacactcgtttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggataatttgaatcaaaattgattttgaacattaaatgaccaaatta 35536046  T
Q  248 tccttttaattgta 261  Q
     |||||||||||||    
T  35536045 cccttttaattgta 35536032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13931792 - 13931605
Alignment:
Q  50 ttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||| ||||||||||   | ||||||||||| |||||| ||||||  || ||||||||||    
T  13931792 ttagtgtgtgtttggtatggcggtggtggga-ttgattttgatagaattgagtttccaaaaattgattttgtttaaaaatgagtttgatgtgaattgatt 13931694  T
Q  150 tctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatga 239  Q
      |||||||||||||| |  ||||  |||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  13931693 a-tgtttggatatactcacttaaacatgattcttacaagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatatgtaatga 13931605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 34718620 - 34718452
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||| ||  |||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||     
T  34718620 agtgtgtgtttggtttgacggtggaaaaaattgattttgatagaattgagtttgagataattaattttggttaaaagtgagtttgatataaattgattta 34718521  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgata-ttgtttggatagtttgaatcaaaatt 220  Q
    |||||| ||| |||| |  ||||||||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  34718520 tgtttgaatacacttgtacaaaagtgattcttatgaatt-atagttgtttggatactttgaattaaaatt 34718452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 77 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15884371 - 15884216
Alignment:
Q  77 gagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatct-aaaag 175  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| | | |  | |||||    
T  15884371 gagaattgattttgatagagttgagtttgacagaattgattttggttaaaagtgagttggatgtgaattgatttatgtttggatacaataaagtaaaaag 15884272  T
Q  176 tgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatg 231  Q
    ||||| ||||   || || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15884271 tgatttttataaattcatgttgtttggatagtttggatcaaaattgattttgaatg 15884216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 51 - 206
Target Start/End: Original strand, 27801608 - 27801763
Alignment:
Q  51 tagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgattt 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||  || | |||||||||    
T  27801608 tagtgtgtgtttggtatgacggtggcgagaattgattttgatagaattgattttaagagaattgattttgattaaaagtgagttagatgtaaattgattt 27801707  T
Q  151 ctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatag 206  Q
     |||||||||  ||| || ||||||| |||| ||||  ||||| ||||||||||||    
T  27801708 atgtttggatgcactcatttaaaagtaattcatatgaattgatgttgtttggatag 27801763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 80 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25061367 - 25061218
Alignment:
Q  80 aattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatc-taaaagtga 178  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  |||| | |||||||||    
T  25061367 aattgattttgttaaaattgattttggttgaattgattttggttaaaagtgagttgaacataaattgatttatgtttggata-ccttaacataaaagtga 25061269  T
Q  179 ttcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaa 229  Q
    |||||||   |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25061268 ttcttatcaattgatgatgtttggataatttgaatcaaaattgattttaaa 25061218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 56 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9447696 - 9447533
Alignment:
Q  56 tgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtt 155  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||| || || ||| |||||||||||||||  || ||||| ||||  ||||    
T  9447696 tgtgtttggtatggcggtgaagagaattgattttaataaaattgaatttgagagaaatggttt-ggttaaaagtgagtttgatgtgaatggatta-tgtt 9447599  T
Q  156 tggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattg 221  Q
    | |||||||| || ||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  9447598 tagatatactcatttaaaagtgattctttcgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattg 9447533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 11561950 - 11561826
Alignment:
Q  93 aaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttga 192  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||  | ||||||||||||||||| ||| |    
T  11561950 aaaattgagtttgaaagaattaattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatatttgaatatactattttaaaagtgattcttatgagttca 11561851  T
Q  193 tattgtttggatagtttgaatcaaa 217  Q
    | |  |||||||||||||| |||||    
T  11561850 tttaatttggatagtttgactcaaa 11561826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 123 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 40821922 - 40821788
Alignment:
Q  123 taaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattga 222  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||  |||| ||||| ||||    | ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  40821922 taaaaatgagttgaatgtgaattgatta-tgttaggatacactttaacataagtgattcttatttgttgatgttatttggataatttgaatcaaaattga 40821824  T
Q  223 ttttaaatgtggaatgactaaactatccttttaatt 258  Q
     ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  40821823 gtttgaatgtgcaatgactaaattatccttttaatt 40821788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 157
Target Start/End: Original strand, 49242958 - 49243044
Alignment:
Q  71 ggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttg 157  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  49242958 ggtggtgagaattaattttgatataattgagtttgagagaattgattttggttaaaaatgagttggatgtgaattgatttatgtttg 49243044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 220
Target Start/End: Original strand, 23628706 - 23628830
Alignment:
Q  95 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgata 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| | | | |||||| ||||||||||   || ||     
T  23628706 aattgagtttgagataattgattttgactaaaagtgagttgaatgt-aattgatttatgtttggatacaataacctaaaattgattcttatcaatttatg 23628804  T
Q  195 ttgtttggatagtttgaatcaaaatt 220  Q
    |||||||| | |||||||||||||||    
T  23628805 ttgtttgggtggtttgaatcaaaatt 23628830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 284
Target Start/End: Original strand, 11051339 - 11051499
Alignment:
Q  123 taaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattga 222  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||| |||||| ||| ||  |  ||||| || |||||| | ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11051339 taaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgtttgaatacacacacttaaaaatggttcttaagagtt-atgttgtttggatagtttgaataaaaattga 11051437  T
Q  223 ttttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcattct 284  Q
    |||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||| || ||| ||  |||||| |||||||    
T  11051438 ttttgaatgtgtaatgaccaaattatccttttaattatatttaaaacaaaatatctcattct 11051499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 40352561 - 40352450
Alignment:
Q  50 ttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt 149  Q
    ||||||||||||||||   | |||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||    
T  40352561 ttagtgtgtgtttggttgtgcggtgaggagaattgattttgatagaattgattttgtgg-aattgattttggttaaaagtgagtttaatgtaaagtgatt 40352463  T
Q  150 tctgtttggatat 162  Q
    | |||||||||||    
T  40352462 tatgtttggatat 40352450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 31933772 - 31933687
Alignment:
Q  176 tgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgta 261  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| | |||| ||| ||||||||||||||||    
T  31933772 tgattcttatgagttgatgttgtttggatattttacatcaaaattgattttgaatgtgtattgaccaaattatccttttaattgta 31933687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 226
Target Start/End: Original strand, 43730002 - 43730175
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttct 152  Q
    |||| |||||||| |||  ||||  |||||||||| | | |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |    
T  43730002 gtgtatgtttggtttggcagtggctagaattgattctaacaaaattaattttgatataattgattttggttaaaagtgagttgagtgtcaattgatttgt 43730101  T
Q  153 gtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 226  Q
    |||||||||   ||||  | |||||||||||||   || || |||||||||| |||   |||||||||| ||||    
T  43730102 gtttggatacctttatgcataagtgattcttattaatttattttgtttggatggttgagatcaaaattgttttt 43730175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 109
Target Start/End: Original strand, 291704 - 291762
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttga-taaaattgagtttgagat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  291704 agtgtgtgtttggtatggtggtggcgagaattgattttgattaaaagtgagtttgagat 291762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 43134594 - 43134533
Alignment:
Q  77 gagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaat 138  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43134594 gagaatttatttggatagaattgagtttaagagaattgattttggttaaaagtgagttgaat 43134533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 161
Target Start/End: Original strand, 47981749 - 47981861
Alignment:
Q  48 atttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattga 147  Q
    |||||| |||||||||||   ||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||  | |||| ||||||||||||| |||||||||| | || |||    
T  47981749 atttagcgtgtgtttggttgtgtggtgacgagaattgattttaataaaattgattttgtaa-aattaattttggttaaaattgagttgaatttaaagtga 47981847  T
Q  148 tttctgtttggata 161  Q
    ||| ||||||||||    
T  47981848 tttatgtttggata 47981861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 42097 - 41989
Alignment:
Q  49 tttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgat 148  Q
    ||||||||||||||| |   | ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||| || ||| ||||||||||  |||||||||    
T  42097 tttagtgtgtgtttgattctgcggtggagaaaattgattttgataaaattgattttgttagaattgattttagtaaaaggtgagttgaacgtgaattgat 41998  T
Q  149 ttctgtttg 157  Q
    || ||||||    
T  41997 ttatgtttg 41989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 29441327 - 29441271
Alignment:
Q  78 agaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtt 134  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  29441327 agaattgattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttggttagaagtgagtt 29441271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 191
Target Start/End: Original strand, 291732 - 291813
Alignment:
Q  110 aattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttg 191  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||    
T  291732 aattgattttgattaaaagtgagtttgagatgaattggtttatgtttggatacacttgtttaaaagtgattgttatgagttg 291813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 4347114 - 4347034
Alignment:
Q  80 aattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggata 161  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||    
T  4347114 aattgattttggtagaattgattttgt-agaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatgtttggata 4347034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 6061308 - 6061214
Alignment:
Q  55 gtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgattt 150  Q
    ||||||||||| ||  ||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | | | ||||||| ||| |||||| |||||||    
T  6061308 gtgtgtttggtttgacggtggtgaaaattgattttgatagaattgaatttgagataattgattataggt-aaagtgaattggatatgagttgattt 6061214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 16556360 - 16556295
Alignment:
Q  95 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggata 161  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||| ||||||||||    
T  16556360 aattgaatttgacataattgattttggttaaaagtgaattg-agatgaagtgatttatgtttggata 16556295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 32365213 - 32365143
Alignment:
Q  87 tttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttg 157  Q
    |||||| ||||||| ||| | |||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  32365213 tttgatcaaattgattttaaaataattgattttagtcaaaagtgagttgaatgtaaattgatttatgtttg 32365143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 47085959 - 47085869
Alignment:
Q  95 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttat 185  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||   || ||||||| ||||||||    
T  47085959 aattgattttgatagaattgattttaattaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttagatttataaatgtaaaagttattcttat 47085869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15576595 - 15576454
Alignment:
Q  80 aattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgat 179  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||| ||| ||||| ||| |||  |  ||||||||||    
T  15576595 aattgattttaattaaattgagtttaagagaattgattttaattaaaagtgagttagatattaattgttttatgttttgatttacaaaattaaaagtgat 15576496  T
Q  180 tcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattg 221  Q
    | |||    || |||||| |||| |||||||  |||||||||    
T  15576495 ttttaccaatttatattgattggttagtttgtgtcaaaattg 15576454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 34662014 - 34661946
Alignment:
Q  69 gtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaat 138  Q
    ||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  34662014 gtggtggtgaaaattaagtttgataaaattgagtttgagagaattga-tttgattaaaaatgagttgaat 34661946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 43134495 - 43134454
Alignment:
Q  85 attttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaa 126  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43134495 attttaatagaattgagtttgagataattgattttggttaaa 43134454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 161
Target Start/End: Original strand, 6219964 - 6220032
Alignment:
Q  93 aaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggata 161  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| || | |||||||   ||||||||||    
T  6219964 aaaattgagtttgatataattgattttgattaaaagtgtgttggatttaaattgatacatgtttggata 6220032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 13344943 - 13344836
Alignment:
Q  50 ttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt 149  Q
    |||| |||||||||||  || ||||  || |||||||||||||  |||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||    
T  13344943 ttagcgtgtgtttggttgggcggtgaagataattgattttgattgaattgattttgt-agaattgattttggttaaaagtgagttgaacgtaaagtgatt 13344845  T
Q  150 tctgtttgg 158  Q
    | |||||||    
T  13344844 tatgtttgg 13344836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 29759762 - 29759711
Alignment:
Q  110 aattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggata 161  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||    
T  29759762 aattgattatggttaaaagtgagttgaatgtaaaatgatttatgtttggata 29759711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36118157 - 36118118
Alignment:
Q  189 ttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaa 228  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  36118157 ttgatattgtttggatagtttaaaccaaaattgattttaa 36118118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 161
Target Start/End: Original strand, 7765241 - 7765349
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    ||||||||||||||   | ||||  ||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||| ||  ||||||||||||| ||   || ||||||     
T  7765241 agtgtgtgtttggttatgcggtgacgagaattgattttgatagaattga-ttttacataattgattatgaataaaagtgagttggatgaaaagtgatttt 7765339  T
Q  152 tgtttggata 161  Q
    ||||||||||    
T  7765340 tgtttggata 7765349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 11019040 - 11019003
Alignment:
Q  110 aattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattga 147  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  11019040 aattgattttggttaaaattgagttgaatataaattga 11019003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 29438732 - 29438664
Alignment:
Q  71 ggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatat 140  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  | ||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  29438732 ggtggagagaattgattctgataaaattgattttg-cagaattgattttgatgaaaagtgagttcaatat 29438664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 30557683 - 30557624
Alignment:
Q  71 ggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtga 131  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  30557683 ggtgaggagaattgattttgatagaattgattctgt-agaattgattttggttaaaagtga 30557624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 118
Target Start/End: Original strand, 42137088 - 42137128
Alignment:
Q  78 agaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattt 118  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  42137088 agaattgattttgacaaaattgattttgagagaattgattt 42137128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 178
Target Start/End: Original strand, 47978376 - 47978444
Alignment:
Q  110 aattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtga 178  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||| || |||||| || |||| | |||||||    
T  47978376 aattgattttgggtaaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatggttggatgtatttatgtcaaagtga 47978444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 55)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 51 - 254
Target Start/End: Original strand, 9988454 - 9988657
Alignment:
Q  51 tagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgattt 150  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  9988454 tagtgtgtgtttggtttggcggtggggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgatttttgttaaaagtgagttggatgtgaattgattt 9988553  T
Q  151 ctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcc 250  Q
     |||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||     
T  9988554 atgtttggatacacttatttaaaagtgattcatatgagttgatgttgtttggatagtttgaatgaaaattgattttgaatgtgtaatgaccaaactatca 9988653  T
Q  251 tttt 254  Q
    ||||    
T  9988654 tttt 9988657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 51 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 36312431 - 36312222
Alignment:
Q  51 tagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgattt 150  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  36312431 tagtgtgtgtttggtatggcggcggggagaattgattttgatagaattaattttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattga-tt 36312333  T
Q  151 ctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcc 250  Q
     |||||||||| ||||   |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  36312332 atgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgactaaactatcc 36312233  T
Q  251 ttttaattgta 261  Q
    |||||||||||    
T  36312232 ttttaattgta 36312222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 52 - 261
Target Start/End: Original strand, 5916196 - 5916404
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  5916196 agtgtgtgtttggtatggcggcggggagaattgattttgatagaattaattttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattga-tta 5916294  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcct 251  Q
    |||||||||| ||||   |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  5916295 tgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgactaaactatcct 5916394  T
Q  252 tttaattgta 261  Q
    ||||||||||    
T  5916395 tttaattgta 5916404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 53 - 265
Target Start/End: Original strand, 7472629 - 7472840
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttct 152  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||  |    
T  7472629 gtgtgtgtttggtatgacggtggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgatgtgaattgatta-t 7472727  T
Q  153 gtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcctt 252  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||| |||||||    
T  7472728 gtttggatacacttatttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgaccaaattatcctt 7472827  T
Q  253 ttaattgtaatta 265  Q
     ||||||||||||    
T  7472828 gtaattgtaatta 7472840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 53 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2213659 - 2213480
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttct 152  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  2213659 gtgtgtgtttggtatagcggtggggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgctaaaaagtgagttgaatgtgaattgatttat 2213560  T
Q  153 gtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 232  Q
    ||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2213559 gtttggatacactcaattaaaagtgatttttattagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 2213480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 52 - 225
Target Start/End: Original strand, 1944993 - 1945166
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  1944993 agtgtgtgtttggtatggcggcggggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgattta 1945092  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattt 225  Q
    |||||||||| ||||   |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1945093 tgtttggatacactttattaaaagtgattcatgtgggttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattt 1945166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 53 - 245
Target Start/End: Original strand, 28127242 - 28127434
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttct 152  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  28127242 gtgtgtgtttggtatagcggtggggagaattgattttgatagaatttagtttgagagaattgattttgctaaaaagtgagttgaatgtgaattgatttat 28127341  T
Q  153 gtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaac 245  Q
    ||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  28127342 gtttggatacactcaattaaaagtgatttttattagttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtaaaatgaccaaac 28127434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 53 - 226
Target Start/End: Original strand, 39141425 - 39141597
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttct 152  Q
    |||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  39141425 gtgtgtgtttggttgggcggtggcgagaattgattttgatataattgagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttggatatgaattga-ttat 39141523  T
Q  153 gtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 226  Q
    ||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39141524 gtttggatacactcatttaaaaatgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 39141597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 53 - 308
Target Start/End: Original strand, 26207884 - 26208139
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttct 152  Q
    ||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  26207884 gtgtgtgtttggtatgacggtgacgaaaattgattttgatagaattaattttgagagaattggttttggttaaaagtcagttggatgtgaattgatttat 26207983  T
Q  153 gtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcctt 252  Q
    |||| |||| |||||  ||||| |||||||||   |||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  26207984 gttttgatacacttaattaaaattgattcttacaagttgatgttgtttggattatatgaatcaaaattgattttaaatgtacaatgaccaaactatcctt 26208083  T
Q  253 ttaattgtaattagaaataaatatttcattctcattaaatacttatttcaacttat 308  Q
    || |||||| ||| ||  |||||| |||||| ||||| ||| |||||||| |||||    
T  26208084 ttgattgtatttaaaagcaaatatctcattcacattagataattatttcagcttat 26208139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 8170466 - 8170244
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||     
T  8170466 agtgtgtgtttggtagggcggtggcgagaattaattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtaaattga-tta 8170368  T
Q  152 tgtttggatatac-ttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcc 250  Q
    |||||||||| || ||| | | | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||| |||||    
T  8170367 tgtttggatacacgttaac-agatgtgattcttatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtataatgactaaattatcc 8170269  T
Q  251 ttttaattgtaattagaaataaatat 276  Q
    || ||| ||| |||| ||||||||||    
T  8170268 ttctaa-tgttattaaaaataaatat 8170244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 51 - 233
Target Start/End: Original strand, 31562640 - 31562819
Alignment:
Q  51 tagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgattt 150  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |  |||||||| ||    
T  31562640 tagtgcgtgtttggtatggtggtggcgagaattgattttgataaaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgaatttgaggtgaattga-tt 31562738  T
Q  151 ctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 233  Q
     |||||||  | |||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  31562739 atgtttgg--acactcgtttaaaagtgattcttatgagtttatattgtttggataatttgaatcaaaattgattttgaatgtg 31562819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 56 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 14821312 - 14821111
Alignment:
Q  56 tgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtt 155  Q
    |||||||||||| | ||||  || |||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||    
T  14821312 tgtgtttggtatagcggtgacgataattaattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttagttaaaagtgagtttaatgtgaattgatta-tgtt 14821214  T
Q  156 tggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcctttta 255  Q
    |||||| ||||  ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| ||    
T  14821213 tggatacactttactagaagtgattcttatgagttgatgttgtttggatattttgaatcaaaattgattttgaatgtctaatgactaaattatccttata 14821114  T
Q  256 att 258  Q
    |||    
T  14821113 att 14821111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 36548353 - 36548130
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   || |||||||||||     
T  36548353 agtgtgtgtttggtatggcggtggtgaaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagtctgatgtgaattgattta 36548254  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcct 251  Q
    ||||||||||  || | || ||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||    
T  36548253 tgtttggatactctca-cttaaaatgatttttatgggttgatgttgtttggataatttaaattaaaattgattttgaacgtacaatgactaaattatcct 36548155  T
Q  252 tttaattgtaattagaaataaatat 276  Q
    ||||||| || ||| || |||||||    
T  36548154 tttaattatatttaaaactaaatat 36548130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 54 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 32502137 - 32501931
Alignment:
Q  54 tgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctg 153  Q
    |||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||||| || ||    
T  32502137 tgtgtgtttggtatggcggtcgtgaaaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttttaggtgaattga-ttatg 32502039  T
Q  154 tttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttt 253  Q
    |||||||| | | |  ||||||| ||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  || |||||    
T  32502038 tttggatacattcaattaaaagtaatttttacgagttgatattgtttgggtagtttgaatcaaaattgattttaaatgggtaatgaccaacttacccttt 32501939  T
Q  254 taattgta 261  Q
    ||||||||    
T  32501938 taattgta 32501931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28261448 - 28261246
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||   || ||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||     
T  28261448 agtgtgtgtttgggtgggcggtggagagaattaattttaatacaattgagtttgagagaattgattttgcttaaaagtgagttggatgtgaattgattta 28261349  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcct 251  Q
    | ||||||||  || |  || |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||  ||||||    
T  28261348 tatttggatactctcacatagaagtgattcttatgagttgatgttgtttgaatagtttgaatcaaaattaattttaaatgtataatgaccaacttatcct 28261249  T
Q  252 ttt 254  Q
    |||    
T  28261248 ttt 28261246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 23358411 - 23358219
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  | ||||| |  |||     
T  23358411 agtgtgtgtttggtatggtgttggcgagaattgattta-atagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagtttgagatgaaatagttta 23358313  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaac 245  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||| | ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||    
T  23358312 tgtttggatacacttgtttaaaagtgattgtgatgagttaatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtaaaatgaccaaac 23358219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 245
Target Start/End: Original strand, 44619015 - 44619208
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||| |||   | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||     
T  44619015 agtgtgtgtttgatataccgatggcgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggggaattgattta 44619114  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaac 245  Q
    |||||||||| |||| | ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||  |||||| ||||    
T  44619115 tgtttggatacacttgtttaaaaatgattattatgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaatcgattttgaatgtaaaatgaccaaac 44619208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 58 - 258
Target Start/End: Original strand, 42515936 - 42516135
Alignment:
Q  58 tgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttg 157  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  || |||||||| || ||||||    
T  42515936 tgtttggtatggcggtggagaaaattgattttgatataattgagtttgagagaattgattttagttaaaagtgagtttgatgtgaattga-ttatgtttg 42516034  T
Q  158 gatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaat 257  Q
     ||||||| ||  |||| ||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||| || ||| |||| |||||||    
T  42516035 aatatactcattaaaaaatgattctttcgagttgatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtataataaccaaattatctttttaat 42516134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 53 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 2213800 - 2213660
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttct 152  Q
    |||||||||||||||||  |  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |    
T  2213800 gtgtgtgtttggtatggcagatgagagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgatgtgaattgatttgt 2213701  T
Q  153 gtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgat 193  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  2213700 ctttggatacacttatttaaaagtgattcttatgagttgat 2213660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 28641798 - 28641587
Alignment:
Q  50 ttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt 149  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||  | |||||||||| ||  |||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  28641798 ttagtgtgtgtttggtttggcgatggataaaattgattttaattgaattgattctgagagaattgattttggttaaatgtgagttggatgtgaattgatt 28641699  T
Q  150 tctgtttggatatactt-atctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactat 248  Q
    | | ||||| || |||| || ||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  28641698 tatatttgggta-acttcatttaaaagtgattattataagttgatgttgtttggatatgttgaattaaaattgattttaaatgtgtaatgaccaaattat 28641600  T
Q  249 ccttttaattgta 261  Q
    |||||||||||||    
T  28641599 ccttttaattgta 28641587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 7296312 - 7296102
Alignment:
Q  49 tttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgat 148  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |  || |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||    
T  7296312 tttagtgtgtgtttggattggtggcgccgataattgactttgatataattgagtttgagagaattgattttggttaaaaatgagtttgatgtgaattgat 7296213  T
Q  149 ttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactat 248  Q
    || |||||||||| ||| || ||||||||||| | |||  ||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| ||| |  ||||||  || |||    
T  7296212 ttatgtttggatacactcatataaaagtgattatcatgacttgatgttatttggatagtttaagtcaaaattgattttgaatatataatgaccgaattat 7296113  T
Q  249 ccttttaattg 259  Q
    |||||| ||||    
T  7296112 ccttttgattg 7296102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2215411 - 2215215
Alignment:
Q  47 tatttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattg 146  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||||    
T  2215411 tatttagtgtgtgtttggtatagcggttgtgagaattgattttgatagaattgagcttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattg 2215312  T
Q  147 atttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaac 245  Q
    |||| |||||||||| |||| | ||||| | ||  || || |||||| ||||||||||| ||| ||| | |||||||||| |||||  |||||| ||||    
T  2215311 atttatgtttggatacacttgtttaaaaataat--ttttgagttgatgttgtttggataatttaaattagaattgattttgaatgtaaaatgaccaaac 2215215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 49 - 232
Target Start/End: Original strand, 42089479 - 42089666
Alignment:
Q  49 tttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgat 148  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||  || |||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  42089479 tttagtgtgtgtttgatttggcggtgatgaaaattgattttgatagaattaagttcaagagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtgaattgat 42089578  T
Q  149 ttctgtttg----gatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 232  Q
    || ||||||    |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  | ||||||||| || ||||| ||||    
T  42089579 ttatgtttggatagatacacttatttaaaagtgattcttatgagttgatgttgtttggataaatcgaatcaaaactgcttttagatgt 42089666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 78 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16467214 - 16467066
Alignment:
Q  78 agaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtg 177  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||| |||||||||||  | || ||||||||    
T  16467214 agaattgattttgatagaattgattttggcataattgattttggttaaaagtgagttagatgtaaattgatttatgtttggatatgataatgtaaaagtg 16467115  T
Q  178 attcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 226  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  16467114 attcttatgggttgatgtagtttggatagtttagatcaaaattaatttt 16467066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18511237 - 18511077
Alignment:
Q  71 ggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatct 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||| |||||||||| |   || |    
T  18511237 ggtggagagaattgattttgataaaattgattttgatataattgattttggttaaaagtgatttaaatgttaattgatttatgtttggatacatcaatgt 18511138  T
Q  171 aaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatg 231  Q
    |||| ||||||||||    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  18511137 aaaaatgattcttataaagtgatgttgtttggataatttaaatcaaaattgattttgaatg 18511077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 158
Target Start/End: Original strand, 30007509 - 30007613
Alignment:
Q  54 tgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctg 153  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  30007509 tgtgtgtatggtatggctgtggggagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattaattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatg 30007608  T
Q  154 tttgg 158  Q
    |||||    
T  30007609 tttgg 30007613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 53 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31224833 - 31224693
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttct 152  Q
    |||||| |||||| ||| ||||  || |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  31224833 gtgtgtatttggtttggcggtgacgaaaattgattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttagttaaaagtgagttggatgtgaattgatttat 31224734  T
Q  153 gtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgat 193  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  31224733 gtttggatatattttactaaaagtgattcttatgagttgat 31224693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 53 - 226
Target Start/End: Original strand, 25747837 - 25748009
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttct 152  Q
    |||||||||||||   | ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  25747837 gtgtgtgtttggttccgcggtggtgataattgagtttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgt-aattgatttat 25747935  T
Q  153 gtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 226  Q
    ||||||||| | | | |||||| ||||||||||   || || |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  25747936 gtttggatacaataacctaaaattgattcttatcaatttatgttgtttgggtagtttgaatcaaaattgctttt 25748009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3854056 - 3853873
Alignment:
Q  50 ttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt 149  Q
    ||||||||||||||||   | ||| | ||||||||| ||||||  |||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  3854056 ttagtgtgtgtttggttgtgcggtagcgagaattgagtttgatggaattgattttgatagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtaaattgatt 3853957  T
Q  150 tctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 233  Q
    | |||||||||| | | || ||||| ||||||||||   |  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3853956 tatgtttggatacattcatgtaaaattgattcttatcaatctatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgcttttgaatgtg 3853873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 80 - 259
Target Start/End: Original strand, 7295330 - 7295507
Alignment:
Q  80 aattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgat 179  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||  |  | ||||||||| |||||||||| ||  || ||||||||||    
T  7295330 aattaattttgatagaattgagtttgagagaattgattctggttaaaaatgagtttgacgtaaattgatttatgtttggatacac--atataaaagtgat 7295427  T
Q  180 tcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattg 259  Q
    | | ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| |  ||||||  || ||||||||||||||    
T  7295428 tatcatgagttgatgttgtttggatagtttaagtcaaacttgattttgaatatataatgaccgaattatccttttaattg 7295507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 77 - 161
Target Start/End: Original strand, 34433285 - 34433369
Alignment:
Q  77 gagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggata 161  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34433285 gagaattgattttgatagaattgagtttgacagaattgattttgattaaaagtgagttgaatgtgaattgatttatgtttggata 34433369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27911517 - 27911380
Alignment:
Q  95 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgata 194  Q
    |||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||    ||||||     
T  27911517 aattgattttgatagaattgagtttggttaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatgtttggatatactcatttaaaagtgattatttcaagttgatg 27911418  T
Q  195 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 232  Q
    || |||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  27911417 ttatttggatactttaaattaaaattgattttagatgt 27911380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 78 - 161
Target Start/End: Original strand, 45714648 - 45714731
Alignment:
Q  78 agaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggata 161  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||  || ||||||||||| ||||||||||    
T  45714648 agaattgattttgatataattgagtttgagagaattgattttgattaaaaatgagttcgatgtgaattgatttatgtttggata 45714731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 186
Target Start/End: Original strand, 41580691 - 41580798
Alignment:
Q  79 gaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtga 178  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | |||| |||| |||||||||| || | |  |||| |||    
T  41580691 gaattgattttgatcgaattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgatgtaaattaatttatgtttggatacacatgtacaaaaatga 41580790  T
Q  179 ttcttatg 186  Q
    ||||||||    
T  41580791 ttcttatg 41580798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 259
Target Start/End: Original strand, 25940264 - 25940402
Alignment:
Q  121 gttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaatt 220  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| ||| |||  | || |||||||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  25940264 gttaaaagtgagtttgatgtgaattgatttatatttgaatacactcgtatagaagtgattattatgagatgatgttgtttggacagtttgaatcaaaatt 25940363  T
Q  221 gattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattg 259  Q
    |||||| ||| |  |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  25940364 gattttgaatatataatgaccaaattatccttctaattg 25940402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 12110999 - 12110919
Alignment:
Q  80 aattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggata 161  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  12110999 aattgattttgatagaattgattttgtca-aattgattttggttaaaagtgagttgaatataaagtgatttatgtttggata 12110919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 161
Target Start/End: Original strand, 30599858 - 30599967
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||  |||||||||| | | |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||     
T  30599858 agtgtatgtttggtttggcggtggttagaattgattctaacaaaattaattttgatagaattgattttggttaaaagtgagttgagtgtcaattgatttg 30599957  T
Q  152 tgtttggata 161  Q
    ||||||||||    
T  30599958 tgtttggata 30599967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 185
Target Start/End: Original strand, 38600413 - 38600530
Alignment:
Q  68 ggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatactta 167  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||| |||||| ||| ||||     
T  38600413 ggtggtgggaggaattaattttgatcgaattaagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagtttgatgtaaattgatttatgtttgaatacacttg 38600512  T
Q  168 tctaaaagtgattcttat 185  Q
    |  |||||||||| ||||    
T  38600513 tacaaaagtgattattat 38600530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2234963 - 2234901
Alignment:
Q  169 ctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 232  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2234963 ctaaaagtgattcttatgagtt-atgttgtttggatagtttgaatcaaaattaattttaaatgt 2234901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 226
Target Start/End: Original strand, 3602457 - 3602587
Alignment:
Q  95 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgata 194  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||  |||||||||||||||  | |||||| || |||||||||||| | |  ||||||||||| ||||   || ||     
T  3602457 aattgattttgatagaattgattttgtctaaaagtgagttgaactt-aattgaattatgtttggatatattaaaataaaagtgatttttattaattcatg 3602555  T
Q  195 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3602556 ttgtttggatagtttgaattaaaattgatttt 3602587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 163
Target Start/End: Original strand, 34997218 - 34997301
Alignment:
Q  80 aattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatata 163  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||| || ||||||||||| |||||| |||||    
T  34997218 aattgattttgataaaatttagtttgacaaaattgatttttgttaaaaatgaattggatgtgaattgatttatgtttgaatata 34997301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 1763348 - 1763265
Alignment:
Q  77 gagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggata 161  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||| ||||| ||||    
T  1763348 gagaattgattttgataaaattgattttgtaa-aattgattttggttaaaattgagttgaatttaaagtgatttatgtttagata 1763265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8041397 - 8041260
Alignment:
Q  87 tttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatg 186  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||  | |||  ||||| | ||| ||||     
T  8041397 tttgatagaattgagtttgagagaattgattttgaataaaagtgaattgaatgt-aattgatttatgtttggatgcaattacttaaaatttatttttatc 8041299  T
Q  187 tgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 226  Q
      || || |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  8041298 aatttatgttgtttgg-tagtttgaatcaaaattgttttt 8041260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 134
Target Start/End: Original strand, 23267345 - 23267400
Alignment:
Q  79 gaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtt 134  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  23267345 gaattgattttgatagaattgagtttgagtgaattgattttggttagaagtgagtt 23267400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 261
Target Start/End: Original strand, 39106681 - 39106831
Alignment:
Q  110 aattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagttt 209  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||  |||||||||| | | |  ||||||||||||| | |  || |  |||||| |||| |||    
T  39106681 aattgattttggtaaaaagtgagtttgatataaattgtttaatgtttggatacattcacttaaaagtgattct-acgaatttaagttgtttagataattt 39106779  T
Q  210 gaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgta 261  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  39106780 gaatcaaaattgattttaaatatacaatgaccaaattatcctttaaattgta 39106831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 226
Target Start/End: Original strand, 43858185 - 43858340
Alignment:
Q  71 ggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatct 170  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||| ||| |   ||||||||||||  |||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||  | |  | |    
T  43858185 ggtgggtataattgattttgatagaattgattttaattgaattgattttgggcaaaagtgagttgatgaataattgatttatgtttggatgcattattgt 43858284  T
Q  171 aaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 226  Q
     ||||||||||||||   || |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  43858285 gaaagtgattcttatcaattcatattgtttggatagttttaactaaaattgatttt 43858340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 2212814 - 2212745
Alignment:
Q  213 tcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatccttttaattgtaattagaaataaatatttcatt 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| || ||| || ||||||| |||||    
T  2212814 tcaaaattgattttaaatgtgcaatgaccaaattatccttttaattttatttaaaattaaatatctcatt 2212745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 161
Target Start/End: Original strand, 23359925 - 23359993
Alignment:
Q  93 aaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggata 161  Q
    |||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||    
T  23359925 aaaattgattttggtagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatgtttggata 23359993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 226
Target Start/End: Original strand, 43436293 - 43436409
Alignment:
Q  110 aattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagttt 209  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||  || | ||||||||| ||||| |||  ||| || ||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||| ||    
T  43436293 aattgattttgattaaaagtgaattagatgtaaattgatttatgttttgatgcactcatttaaaagtaattcatatgaattgatgttgtttggatagatt 43436392  T
Q  210 gaatcaaaattgatttt 226  Q
    | || ||||||||||||    
T  43436393 ggattaaaattgatttt 43436409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 233
Target Start/End: Original strand, 3552940 - 3552981
Alignment:
Q  192 atattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtg 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3552940 atattgtttggataatttgaatcaaaattgatcttaaatgtg 3552981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 51 - 92
Target Start/End: Original strand, 43436264 - 43436305
Alignment:
Q  51 tagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgat 92  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43436264 tagtgtgtgtttggtatggcggtggcgagaattgattttgat 43436305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10918699 - 10918632
Alignment:
Q  110 aattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtg 177  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||| ||||||||| || || | ||||||||    
T  10918699 aattgattttggataaaagtgagttgaatgtaaagtgatttatgtttggatgtatttgtgtaaaagtg 10918632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 134
Target Start/End: Original strand, 18970272 - 18970324
Alignment:
Q  80 aattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagtt 134  Q
    |||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18970272 aattgattttgatagaattgagga--agataattgattttggttaaaagtgagtt 18970324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 23377600 - 23377549
Alignment:
Q  110 aattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggata 161  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||    
T  23377600 aattaattttggttaaaagtgagttgaatgtaagttgatttatgtttggata 23377549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 11240804 - 11240720
Alignment:
Q  72 gtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttg 157  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||| |||| | | ||||||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  11240804 gtggagagaattgattttgatttaattgggtttaacaaaattgattt-ggaaaaaagcgagttgaatgtgaattgatttatgtttg 11240720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 52 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8594 - 8388
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||     
T  8594 agtgtgtgtttggtatggcggtgggaataattgattttgatagaattgagtttgatataattgattttggttaaaagtgagtttgatgtgaattgattta 8495  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcct 251  Q
    |||||||||| |||| | ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||| ||||||    
T  8494 tgtttggatacacttttttaaaaatgatttttatgagttgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtacaatgaccaaattatcct 8395  T
Q  252 tttaatt 258  Q
    |||||||    
T  8394 tttaatt 8388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 51 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9256 - 8997
Alignment:
Q  51 tagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgattt 150  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| | |    
T  9256 tagtatgtgtttggtatggcggtggtgagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttgattaaaagtgagttagatatgaattg-tat 9158  T
Q  151 ctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcc 250  Q
     |||||||||| ||| |  | ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||| |||||    
T  9157 atgtttggatacactcacttgaaagtgattcttatgagtagatgttgtttggatagtttgaattaaaattgattttgaatgtataatgactaaattatcc 9058  T
Q  251 ttttaattgtaattagaaataaatatttcattctca--ttaaatacttatttcaacttatca 310  Q
    |||||| ||| |||| | |||||||| ||||| |||  ||| ||| |||||| |||||||||    
T  9057 ttttaa-tgttattaaatataaatatctcattttcattttagataattatttgaacttatca 8997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 53 - 252
Target Start/End: Original strand, 29080 - 29278
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttct 152  Q
    ||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  29080 gtgtgtgtttggtttggtggtggtaataattgattttgatagaattaagtttgaaagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattga-ttat 29178  T
Q  153 gtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcctt 252  Q
    ||||||||| ||||   || |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  29179 gtttggatacactttaatagaagttattcttatgaattgatgttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgactaaattatcctt 29278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 253
Target Start/End: Original strand, 5784 - 5988
Alignment:
Q  50 ttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  5784 ttagtgtgtgtttggtatggtggtagggagaattgattttgatataattgagtttgagagaattgattttggttaaaagtgagttgaatgtgaattga-- 5881  T
Q  150 tctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatag-----tttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaa 244  Q
      ||||||  ||   ||   || ||||||||||| || |||||| ||||||||||||     |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  5882 --tgtttgattaccgtttattagaagtgattcttgtgggttgatgttgtttggatagtttaatttgaatcaaaattgattttgaatgtgtaatgactaaa 5979  T
Q  245 ctatccttt 253  Q
    |||||||||    
T  5980 ctatccttt 5988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 253275 - 253099
Alignment:
Q  50 ttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatt 149  Q
    ||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  253275 ttagtgtgtgtttggttgggcggcggagagaattgattttgatagaattgagtttgagagaattgattttggttaaatgtgagttggatatgaattgatt 253176  T
Q  150 tctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 226  Q
    | ||||||||||   | |  ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  253175 tatgtttggataccttcagttaaaagtgattcttatgagttaatgttgtttggatagattgaatcaaaattgatttt 253099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0983 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0983
Description:

Target: scaffold0983; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 258
Target Start/End: Original strand, 2225 - 2430
Alignment:
Q  53 gtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttct 152  Q
    |||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| |    
T  2225 gtgtctgtttggtatggcggtggcgaaaattgattttgacagaattgagtttgacataattgattttggttaaaagtgagtttgaggtgaattgatttat 2324  T
Q  153 gtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactatcctt 252  Q
    ||||||| | |||| | |||||||| || |||   |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||  || || |||||| ||| |||||||    
T  2325 gtttggacacacttgtttaaaagtggtttttacaagttgacgttgtttagatagtttgaatcaaaattgattttggatatgtaatgaccaaattatcctt 2424  T
Q  253 ttaatt 258  Q
    ||||||    
T  2425 ttaatt 2430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 259
Target Start/End: Original strand, 1980 - 2190
Alignment:
Q  49 tttagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgat 148  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||  || |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||    
T  1980 tttagtgtgtgtttggattggcggtgtcgataattgattttgatagaattgagtttgaaagaattgattttggttcaaaatgagtttgatatgaattgat 2079  T
Q  149 ttctgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgtggaatgactaaactat 248  Q
    || |||||||||  ||| || ||||||||||| | |||  ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |  || |||  || |||    
T  2080 ttatgtttggatgcactcatataaaagtgattatcatggcttgatgttgtttggatagtttaagtcaaaattgattttgaatatataaagaccgaattat 2179  T
Q  249 ccttttaattg 259  Q
    |||||||||||    
T  2180 ccttttaattg 2190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 186
Target Start/End: Original strand, 118366 - 118500
Alignment:
Q  52 agtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttc 151  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||  || | |||||||||     
T  118366 agtgtgtgtttggattggcggtgggaggaattgattttgatcgaattgagtttgatagaatagatttttgttaaaagtgagtttgatgtaaattgattta 118465  T
Q  152 tgtttggatatacttatctaaaagtgattcttatg 186  Q
    |||||||||| |||| |  ||||||||||||||||    
T  118466 tgtttggatacacttgtacaaaagtgattcttatg 118500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 161
Target Start/End: Original strand, 15213 - 15322
Alignment:
Q  51 tagtgtgtgtttggtatggtggtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgattt 150  Q
    |||||||||||||||   | ||||  || |||||||||||||| |||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15213 tagtgtgtgtttggttgtgcggtgacgaaaattgattttgatagaattgattttgtca-aattgattttggttaaaagtgagttgaatataaagtgattt 15311  T
Q  151 ctgtttggata 161  Q
     ||||||||||    
T  15312 atgtttggata 15322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 46879 - 46734
Alignment:
Q  80 aattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatctaaaagtgat 179  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||| | |||||||||||  |||||||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||| | |  ||||||||||    
T  46879 aattgattttgacataattgattttgatagaattgattttgcctaaaagtgagttgaa-cttaattggtttatgtttggatatattaaagtaaaagtgat 46781  T
Q  180 tcttatgtgttgatattgtttggatagtttgaatcaaaattgatttt 226  Q
    | ||||   || || ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  46780 ttttatcaattcatgttgtttggatagttcaaatcaaaattgatttt 46734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 233
Target Start/End: Original strand, 138522 - 138645
Alignment:
Q  110 aattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatatacttatc-taaaagtgattcttatgtgttgatattgtttggatagtt 208  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||   |  |||  |||| |||| ||    
T  138522 aattaattttagttaaaagtgagctgaacataaattgatttatgtttggata-ccttaacataaaagtgattcttatcaatccataaagtttagataatt 138620  T
Q  209 tgaatcaaaattgattttaaatgtg 233  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  138621 taaatcaaaattgattttaaatgtg 138645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 301627 - 301562
Alignment:
Q  95 aattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggat 160  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  301627 aattgagtttgatcgaattgattttggtcaaaagtgagttgagtataaatttatttatgtttggat 301562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 65617 - 65535
Alignment:
Q  79 gaattgattttgataaaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttggatat 162  Q
    ||||| ||||||||| |||||| | || || |||||||||||||||||| |||||| ||| | || |||||| |||||||||||    
T  65617 gaattaattttgatagaattgattctgtga-aattgattttggttaaaaatgagtttaatgtaaagtgatttatgtttggatat 65535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 232
Target Start/End: Original strand, 9257 - 9294
Alignment:
Q  195 ttgtttggatagtttgaatcaaaattgattttaaatgt 232  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  9257 ttgtttggatagttttgatcaaaattgattttaaatgt 9294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 32103 - 32058
Alignment:
Q  72 gtggggagaattgattttgataaaattgagtttgagataattgatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  32103 gtggggagaattgattttgatagaattgattttgatagaattgatt 32058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 99765 - 99701
Alignment:
Q  94 aaattgagtttgagataattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttgg 158  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||    
T  99765 aaattgattttaacataattgattttaattaaaagtgagttgaatgtaaattaatttatgtttgg 99701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 158
Target Start/End: Original strand, 199383 - 199431
Alignment:
Q  110 aattgattttggttaaaagtgagttgaatatgaattgatttctgtttgg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||| |||||||    
T  199383 aattgattttggttaaaagtgagttgaacgtaaagtgatttatgtttgg 199431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University