View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF14184_low_1 (Length: 908)
Name: NF14184_low_1
Description: NF14184
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF14184_low_1 |
 |  |
|
| [»] scaffold0022 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0239 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0121 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0005 (3 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0493 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0194 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0349 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1999 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0648 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0271 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0072 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0067 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0841 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0325 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0009 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0045 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0301 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0017 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0008 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0667 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0131 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0460 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0432 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1319 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0308 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0059 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0190 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0125 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0394 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0625 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0113 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0604 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0077 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 319; Significance: 1e-179; HSPs: 151)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 227 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 45197212 - 45196801
Alignment:
| Q |
227 |
aggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattat |
326 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
45197212 |
aggcaaattctatggtacacccaataaatttggatgtatcggtacactaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattat |
45197113 |
T |
 |
| Q |
327 |
tttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaa |
426 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
45197112 |
tttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgacgaaataaaacttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaa |
45197013 |
T |
 |
| Q |
427 |
tattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
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|
|
| T |
45197012 |
tattgattattttttatgacaaaatgaaatttttttaatacgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
45196913 |
T |
 |
| Q |
527 |
aatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcata |
626 |
Q |
| |
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||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
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|
| T |
45196912 |
aatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtaccata |
45196813 |
T |
 |
| Q |
627 |
gaagttccctta |
638 |
Q |
| |
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|||||||||||| |
|
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| T |
45196812 |
gaagttccctta |
45196801 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 226 - 635
Target Start/End: Original strand, 1282183 - 1282592
Alignment:
| Q |
226 |
aaggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataatta |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
1282183 |
aaggcaaattctatggtacacccaataaatttgggtgtatcggtacactaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataatta |
1282282 |
T |
 |
| Q |
326 |
ttttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatga |
425 |
Q |
| |
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|
|
| T |
1282283 |
ttttctatcattgagaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgacgaaataaaacttaatttttaagaatttttattactcataacaatga |
1282382 |
T |
 |
| Q |
426 |
atattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatat |
525 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
1282383 |
atattgattattttttatgacaaaatgaaatttttttaatacgatccttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaatgatgttttctaaaatat |
1282482 |
T |
 |
| Q |
526 |
aaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcat |
625 |
Q |
| |
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|
| T |
1282483 |
aaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatgttttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtaccat |
1282582 |
T |
 |
| Q |
626 |
agaagttccc |
635 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
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| T |
1282583 |
agaagttccc |
1282592 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 228 - 637
Target Start/End: Original strand, 24505123 - 24505532
Alignment:
| Q |
228 |
ggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattatt |
327 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24505123 |
ggcaaattctatggtacacccaataaatttgggtgtatcggtacaccaagtcataaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattatt |
24505222 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaat |
427 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
24505223 |
ttctatcattgacaactaagataattaaattttatataccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaat |
24505322 |
T |
 |
| Q |
428 |
attgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataa |
527 |
Q |
| |
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|
|
| T |
24505323 |
attgattattttttatgacaaaatgtaaattttgtaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataa |
24505422 |
T |
 |
| Q |
528 |
atattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatag |
627 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
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|
| T |
24505423 |
atattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatctttaatttatatattttatgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtaccataa |
24505522 |
T |
 |
| Q |
628 |
aagttccctt |
637 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
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| T |
24505523 |
aagttccctt |
24505532 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 228 - 634
Target Start/End: Original strand, 25866905 - 25867311
Alignment:
| Q |
228 |
ggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattatt |
327 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25866905 |
ggcaaattctatggtacacccaataaatttgggtgtatcagtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattatt |
25867004 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaat |
427 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
25867005 |
ttttatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagctttgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaat |
25867104 |
T |
 |
| Q |
428 |
attgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataa |
527 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25867105 |
attgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttacaaacaatgaaatgatggttttttttatgaaatgatgttttctaaaatataa |
25867204 |
T |
 |
| Q |
528 |
atattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatag |
627 |
Q |
| |
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| T |
25867205 |
atattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtaccatag |
25867304 |
T |
 |
| Q |
628 |
aagttcc |
634 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
25867305 |
aagttcc |
25867311 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 228 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 32186832 - 32186421
Alignment:
| Q |
228 |
ggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattatt |
327 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32186832 |
ggcaaattctattgtacacccaataaatttggatgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgttttttagaagaaaaataattatt |
32186733 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaat |
427 |
Q |
| |
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|
|
| T |
32186732 |
ttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcgtaacaatgaat |
32186633 |
T |
 |
| Q |
428 |
attgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatgg--tttttcttatgagatgatgttttctaaaatat |
525 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
32186632 |
attgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttatgaacaatgaaatgatggttttttttttatgaaataatgttttctaaaatat |
32186533 |
T |
 |
| Q |
526 |
aaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcat |
625 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
32186532 |
aaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtactat |
32186433 |
T |
 |
| Q |
626 |
agaagttccctt |
637 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |
|
|
| T |
32186432 |
agaaattccctt |
32186421 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 226 - 637
Target Start/End: Original strand, 42039300 - 42039711
Alignment:
| Q |
226 |
aaggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataatta |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
42039300 |
aaggcaaattctacggtacatccaataaatttgggtgtatcgatacaccaagttgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataatta |
42039399 |
T |
 |
| Q |
326 |
ttttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatga |
425 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
42039400 |
ttttctatcattgacaactaagataattaaattttatataccaaaagttttgacgaaataaaatttaatttttaagaattttaattactcataacaatga |
42039499 |
T |
 |
| Q |
426 |
atattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatat |
525 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42039500 |
atattgattattttttatgacaaaatgtaaattttgtaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatggaatgatgttttctaaaatat |
42039599 |
T |
 |
| Q |
526 |
aaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcat |
625 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
42039600 |
aaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatctttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtaccat |
42039699 |
T |
 |
| Q |
626 |
agaagttccctt |
637 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
42039700 |
agaagttccctt |
42039711 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 228 - 621
Target Start/End: Original strand, 47219956 - 47220348
Alignment:
| Q |
228 |
ggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattatt |
327 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47219956 |
ggcaaattctatggtacacccaataaatttgggtgtatcggtacaccaaatcgtaaaattaataataaatgagtt-tttttttgaagaaaaataattatt |
47220054 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaat |
427 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
47220055 |
ttctatcattgacaactaagataattaaattttatataccaaaagtttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaat |
47220154 |
T |
 |
| Q |
428 |
attgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataa |
527 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47220155 |
attgattattttttatgacaaaatgtaaattttgtaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataa |
47220254 |
T |
 |
| Q |
528 |
atattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgta |
621 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
47220255 |
atattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatctttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtaagtgta |
47220348 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 228 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 41715548 - 41715153
Alignment:
| Q |
228 |
ggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattatt |
327 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41715548 |
ggcaaattctattgtacacccaataaatttggatgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgttttttagaagaaaaataattatt |
41715449 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaat |
427 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| || | ||||||||||| |
|
|
| T |
41715448 |
ttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcgtaacaatgaat |
41715349 |
T |
 |
| Q |
428 |
attgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatgg--tttttcttatgagatgatgttttctaaaatat |
525 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
41715348 |
attgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttttttttatgaaataatgttttctaaaatat |
41715249 |
T |
 |
| Q |
526 |
aaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgta |
621 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41715248 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
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Target Start/End: Original strand, 15090667 - 15091074
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Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 227 - 635
Target Start/End: Original strand, 18922575 - 18922983
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Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
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Target Start/End: Original strand, 9923120 - 9923479
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Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 227 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 2038503 - 2038094
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Q |
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Back To:
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Target: chr7; HSP #14
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Target Start/End: Original strand, 39444008 - 39444374
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 227 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 40947381 - 40946992
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 228 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 47069368 - 47068968
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Q |
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| T |
47068969 |
aa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
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526 |
Q |
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T |
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| Q |
527 |
aatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcata |
626 |
Q |
| |
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| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 228 - 636
Target Start/End: Original strand, 17334739 - 17335145
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ggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattatt |
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ggcaaattctatggtacacc-aatgaatttgggtgtaccggtacaccaagttgtaaaattaataataattcagttgtttttttgaagaaaaataataatt |
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T |
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328 |
ttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaat |
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ttctatcattgacaactaagataattaaattttctttaccaaaatctttgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaat |
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T |
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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 223 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 7574526 - 7574116
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Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 230 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 33704952 - 33704645
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Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 228 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 27130950 - 27130666
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ggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnn-gaagaaaaataattat |
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Q |
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T |
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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
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Target Start/End: Original strand, 1343104 - 1343347
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T |
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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 314 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 22904813 - 22904546
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| Q |
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Q |
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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
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Target Start/End: Complemental strand, 25411946 - 25411687
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Original strand, 11640381 - 11640646
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11640646 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 315 - 530
Target Start/End: Original strand, 19345698 - 19345915
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19345898 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 278 - 580
Target Start/End: Original strand, 31311395 - 31311694
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576 |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Original strand, 41311140 - 41311404
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aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacc |
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Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 314 - 580
Target Start/End: Original strand, 45442140 - 45442404
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 27427452 - 27427182
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27427252 |
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27427182 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 311 - 636
Target Start/End: Original strand, 31743385 - 31743709
Alignment:
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311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttat-gaattttta |
409 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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31743681 |
T |
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636 |
Q |
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| T |
31743682 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 315 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 40331378 - 40331152
Alignment:
| Q |
315 |
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414 |
Q |
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T |
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512 |
Q |
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| T |
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40331179 |
T |
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513 |
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539 |
Q |
| |
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| T |
40331178 |
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40331152 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 312 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 40856859 - 40856593
Alignment:
| Q |
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aagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatc |
411 |
Q |
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| T |
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40856762 |
T |
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| Q |
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Q |
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| T |
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580 |
Q |
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| T |
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40856593 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 348 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 45857762 - 45857506
Alignment:
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447 |
Q |
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| T |
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45857663 |
T |
 |
| Q |
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546 |
Q |
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| T |
45857662 |
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45857563 |
T |
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| Q |
547 |
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604 |
Q |
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| T |
45857562 |
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45857506 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 315 - 452
Target Start/End: Original strand, 49079339 - 49079476
Alignment:
| Q |
315 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacc |
414 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
415 |
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452 |
Q |
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| T |
49079439 |
cataatgaagaatattgattattttttatgagaaaatg |
49079476 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Original strand, 3228327 - 3228596
Alignment:
| Q |
315 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaactta-atttttatgaatttttatcac |
413 |
Q |
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| T |
3228327 |
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3228426 |
T |
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| Q |
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509 |
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| T |
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| Q |
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580 |
Q |
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| T |
3228527 |
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3228596 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 311 - 554
Target Start/End: Original strand, 13806445 - 13806687
Alignment:
| Q |
311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
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| T |
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13806543 |
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| Q |
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509 |
Q |
| |
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| T |
13806544 |
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| T |
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13806687 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 315 - 575
Target Start/End: Original strand, 43541868 - 43542127
Alignment:
| Q |
315 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacc |
414 |
Q |
| |
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| T |
43541868 |
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43541967 |
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514 |
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| T |
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43542067 |
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575 |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 45701355 - 45701085
Alignment:
| Q |
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aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacc |
414 |
Q |
| |
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| T |
45701355 |
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45701157 |
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580 |
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| T |
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45701085 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 315 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 9682345 - 9682019
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| Q |
315 |
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414 |
Q |
| |
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| T |
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514 |
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T |
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614 |
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| T |
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9682049 |
T |
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643 |
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| |
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| |||||| ||||||||||||||||||| |
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| T |
9682048 |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 312 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 27800351 - 27800083
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312 |
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411 |
Q |
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T |
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| Q |
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510 |
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| T |
27800251 |
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511 |
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580 |
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| T |
27800151 |
tgttttctaaaatataaatattgactaatagctttttatttca-taaaatgatctttaatttataaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 312 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 2932904 - 2932630
Alignment:
| Q |
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aagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaactta-----atttttatgaattt |
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Q |
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| T |
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2932805 |
T |
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| Q |
407 |
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504 |
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2932705 |
T |
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| Q |
505 |
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| T |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 27897541 - 27897278
Alignment:
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315 |
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Q |
| |
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aaaaataattatttt--atcattgacaattataataattaaatcttatttaccgaaagcatcgatgaaataaaatttactttttttgaatttttattgct |
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 |
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cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgt |
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| |
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cataatgaagaatattgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatataattcatataaacaatgaaatagtgtttttttctcatgagatggtgt |
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tttctgaaatataaataacaacaaataacaatttatttca-taaaatgatcattaatttataaattt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 348 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 44964109 - 44963823
Alignment:
| Q |
348 |
ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgaca |
447 |
Q |
| |
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|||||||||| ||||||| ||||| | |||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||| | |||| ||||| |||||||| | | |
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| T |
44964109 |
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44964010 |
T |
 |
| Q |
448 |
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547 |
Q |
| |
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| T |
44964009 |
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44963910 |
T |
 |
| Q |
548 |
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635 |
Q |
| |
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| T |
44963909 |
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44963823 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 314 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 8648358 - 8648092
Alignment:
| Q |
314 |
gaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaactta-atttttatgaatttttatca |
412 |
Q |
| |
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| T |
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8648259 |
T |
 |
| Q |
413 |
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507 |
Q |
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8648159 |
T |
 |
| Q |
508 |
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575 |
Q |
| |
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|| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |
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| T |
8648158 |
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8648092 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 22639688 - 22639420
Alignment:
| Q |
315 |
aaaaataattatttt-ctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcac |
413 |
Q |
| |
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| T |
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22639589 |
T |
 |
| Q |
414 |
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510 |
Q |
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| T |
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22639489 |
T |
 |
| Q |
511 |
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580 |
Q |
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| T |
22639488 |
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22639420 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 570 - 637
Target Start/End: Original strand, 9915500 - 9915567
Alignment:
| Q |
570 |
tttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttccctt |
637 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
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| T |
9915500 |
tttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtaccatagaagttccctt |
9915567 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 311 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 29689248 - 29688956
Alignment:
| Q |
311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
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| T |
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29689149 |
T |
 |
| Q |
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510 |
Q |
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| T |
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29689049 |
T |
 |
| Q |
511 |
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604 |
Q |
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| T |
29689048 |
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29688956 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 473 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 30936256 - 30936092
Alignment:
| Q |
473 |
ttataaacaatgaaatgatggttttt-cttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatt |
571 |
Q |
| |
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| T |
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30936157 |
T |
 |
| Q |
572 |
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637 |
Q |
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| T |
30936156 |
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30936092 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 311 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 34363937 - 34363711
Alignment:
| Q |
311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
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| T |
34363937 |
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34363839 |
T |
 |
| Q |
411 |
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510 |
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| |
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| T |
34363838 |
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34363740 |
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 |
| Q |
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539 |
Q |
| |
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| T |
34363739 |
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34363711 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 315 - 637
Target Start/End: Original strand, 42583850 - 42584170
Alignment:
| Q |
315 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacc |
414 |
Q |
| |
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| T |
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42583949 |
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| Q |
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514 |
Q |
| |
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| T |
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42584048 |
T |
 |
| Q |
515 |
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614 |
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| |
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| T |
42584049 |
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42584146 |
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 |
| Q |
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637 |
Q |
| |
|
|| ||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
42584147 |
gaggtgtaccgtagaagttccctt |
42584170 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 314 - 452
Target Start/End: Original strand, 32823023 - 32823161
Alignment:
| Q |
314 |
gaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcac |
413 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||| |||||| | || ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
32823023 |
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32823122 |
T |
 |
| Q |
414 |
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452 |
Q |
| |
|
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|
| T |
32823123 |
tcataacaaagaatattgattattttttattagaaaatg |
32823161 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 312 - 445
Target Start/End: Original strand, 1583733 - 1583866
Alignment:
| Q |
312 |
aagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatc |
411 |
Q |
| |
|
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| T |
1583733 |
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1583832 |
T |
 |
| Q |
412 |
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445 |
Q |
| |
|
|| |||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1583833 |
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1583866 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16200851 - 16200723
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| Q |
312 |
aagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatc |
411 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| | ||||||| |||| ||||| ||| ||||| ||| ||||||||||| |
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|
| T |
16200851 |
aagaaaaataattattttctatcattgacaattataaaaattaaatcttattaaccaaaagcatcgacgaaattaaatttaatgtttttgaatttttatt |
16200752 |
T |
 |
| Q |
412 |
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440 |
Q |
| |
|
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|
| T |
16200751 |
actcataacgaagaatattgagtattttt |
16200723 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 226 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 17307008 - 17306697
Alignment:
| Q |
226 |
aaggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataat-aaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataatt |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || | || | ||||||||| | |||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
17307008 |
aaggcaaattttatggtacacctaatatatttgagtgtatcggtatacttattctttaaattaatagttaaatgagttgttttt--gaagaaaaatattg |
17306911 |
T |
 |
| Q |
325 |
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424 |
Q |
| |
|
|||| ||||| | | || || |||||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||| | | |
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|
| T |
17306910 |
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17306811 |
T |
 |
| Q |
425 |
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524 |
Q |
| |
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|
| T |
17306810 |
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17306712 |
T |
 |
| Q |
525 |
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539 |
Q |
| |
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|||||||||| |||| |
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| T |
17306711 |
taaatattgaaaaat |
17306697 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 348 - 581
Target Start/End: Original strand, 42975013 - 42975248
Alignment:
| Q |
348 |
ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgaca |
447 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||| || |||||| |||||||||| || | ||| | |||| |||||||||||||| | | |
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|
| T |
42975013 |
ataattaaatcttatttatcaaaaacatcgacgaaataaaatttgatttttctgaatttttagtactcgtaatagagaattttgattattttttacaata |
42975112 |
T |
 |
| Q |
448 |
aaatg-aannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttt-tcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgccttt |
545 |
Q |
| |
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||||| || | |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |
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|
| T |
42975113 |
aaatgtaaaaaaaattagtatgatttttataaacaatgaaatgatgtttttttcttatgaaatgatattttctaaaatataaatatcaacaaatagtttt |
42975212 |
T |
 |
| Q |
546 |
ttatttcattaaagtgatcattaatttatatatttt |
581 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| | || |||||||||| ||||| |
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| T |
42975213 |
ttatttcataaaaataatagttaatttataaatttt |
42975248 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 348 - 604
Target Start/End: Original strand, 11486114 - 11486370
Alignment:
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348 |
ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgaca |
447 |
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| |
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|
|
| T |
11486114 |
ataatcaaatcttatttatcaaaaacgtcgacaaaataaaatttaatttttctgaatttttagtactcataatagagaattttgattattttttacaata |
11486213 |
T |
 |
| Q |
448 |
aaatg-aannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttt |
546 |
Q |
| |
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||||| || | ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| | |||| || || |
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| T |
11486214 |
aaatgtaaaaaaaattagtatgacttttataaacaatgaaattatgttttttcttatgaaatgatattttctaaaatacaaatatcaataaatagctctt |
11486313 |
T |
 |
| Q |
547 |
tatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
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|||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
11486314 |
tatttcataaaaaagatagttaatttatagatttt-tgaagtaagagtaccggtacac |
11486370 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 464 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 8770540 - 8770401
Alignment:
| Q |
464 |
atatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgat |
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
8770540 |
atatgatttttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgtaatgatattttctaaaatacaaatatcaacaaacaactctttatttcataaaaatgat |
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T |
 |
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cattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
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| |
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8770440 |
agttaatttatagatttt-tgaagcaagagtatcggtacac |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 348 - 552
Target Start/End: Original strand, 43069197 - 43069401
Alignment:
| Q |
348 |
ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgaca |
447 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| | ||||| ||| |||||||| | | | |
|
|
| T |
43069197 |
ataattaaatcttatttatcaaaaacgtcgacgaaataaactttaatttttctgaatttttagtactcataatattgaattttggttatttttaacaata |
43069296 |
T |
 |
| Q |
448 |
aaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgccttttt |
547 |
Q |
| |
|
||||| | | |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
43069297 |
aaatgtaaaaaaattactatgatttttataaccaatgaaatgatgttttttcttatgaaatgatattttctaaaatacaaatatcaacaaatagctcttt |
43069396 |
T |
 |
| Q |
548 |
atttc |
552 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
43069397 |
atttc |
43069401 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 311 - 604
Target Start/End: Original strand, 2088950 - 2089237
Alignment:
| Q |
311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| | ||||||| || | |||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
2088950 |
gaagaaaggtaattattttctgtaattgacatttatcaaaattaaatattatttaccaaaagcgtcgacaaaataaaatataatttttctgaatttttat |
2089049 |
T |
 |
| Q |
411 |
cacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatga |
510 |
Q |
| |
|
|| |||| || |||||||||||||||||||| | ||||| ||||| | ||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| |
|
|
| T |
2089050 |
tacttataataaagaatattgattattttttataa-aaaattttaaaaatttaatatttt---tataaacaatggaatgatgtttcttattatgagatga |
2089145 |
T |
 |
| Q |
511 |
tgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||| || |||| ||||||||||||| | ||| | || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2089146 |
tgttttctaaaatataaacattcataaatagctttttattttataaaag-aatcattaatttat-caatttataaagcaagagtaccggtacac |
2089237 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 311 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 46911860 - 46911603
Alignment:
| Q |
311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| || ||||| | | ||||||| |
|
|
| T |
46911860 |
gaagaaaaaaaattattttttatcattgacagttataataattaaatcttatttaacaaaagtttcgatgct-------ttttttttttttactttttat |
46911768 |
T |
 |
| Q |
411 |
cacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttctt---atgaga |
507 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |
|
|
| T |
46911767 |
tactcataacaaagaattttgattattttttatgagaaa-tgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaatgatattttttcttcttatgaaa |
46911669 |
T |
 |
| Q |
508 |
tgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttata |
575 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| | |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
46911668 |
tgatgttttctaaaatat-aatattgacaaatagctatttatttta-taaaatgatcattaatttata |
46911603 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 416 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 21919906 - 21919768
Alignment:
| Q |
416 |
ataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttt |
515 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| | |
|
|
| T |
21919906 |
ataacaaagaatatttattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaatgatgtttattcttataaaatgatgtat |
21919807 |
T |
 |
| Q |
516 |
tctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat |
554 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
21919806 |
tataaaatataaatattgataaataactctttatttcat |
21919768 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 23182711 - 23182470
Alignment:
| Q |
312 |
aagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatc |
411 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||||||| || | || ||||||| || ||| ||| | |||| |||| ||||||||| ||| |||| ||||||||| | |
|
|
| T |
23182711 |
aagaaaaagaattgttttctatcattaactattacaataattatatcttagttaccgaaagtgtcgacgaaataaaatttacattttttgaatttttgtt |
23182612 |
T |
 |
| Q |
412 |
acccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgat |
511 |
Q |
| |
|
|| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||| | | ||| |
|
|
| T |
23182611 |
acatataacaaagaatatttattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatat-attcttataaacaatgaaatgatgtttattcttataaaacgat |
23182513 |
T |
 |
| Q |
512 |
gttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat |
554 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
23182512 |
gtattataaaatataaatattgataaataactctttatttcat |
23182470 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 321 - 539
Target Start/End: Original strand, 35394900 - 35395117
Alignment:
| Q |
321 |
aattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataac |
420 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| || || || |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| | || |||||| || ||||| |
|
|
| T |
35394900 |
aattcttttctatcatagataattataataattaaatcttatttattaaaagcttcgacgaaatcaaatttacttttt-taaaattttattactcataat |
35394998 |
T |
 |
| Q |
421 |
aatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaa |
520 |
Q |
| |
|
|| | ||||| |||||||||| || ||||||| |||||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| | | |
|
|
| T |
35394999 |
aaaggatatttgttattttttacgagaaaatgatagaaatttaatatgattcctataactaattaaatgatgtattttcttatgaaatgatgttttttta |
35395098 |
T |
 |
| Q |
521 |
aatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35395099 |
aatataaatattgacaaat |
35395117 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 311 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 8159949 - 8159726
Alignment:
| Q |
311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||| ||||| ||||||| || | |||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||| | ||||||| | |
|
|
| T |
8159949 |
gaagaaaaagaagtattgtctatggttgacaattataaaaattaaatcttatttaccaaaagtgttgatgaaataaaatttaattttttt-aattttttt |
8159851 |
T |
 |
| Q |
411 |
cacccataacaatgaatattgattat-tttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatg |
509 |
Q |
| |
|
|| |||||| | |||||||||||| ||||||| | ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |
|
|
| T |
8159850 |
tactcataacgaacaatattgattatatttttataagaaaat-attaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaatgatattttttcttataaaatg |
8159752 |
T |
 |
| Q |
510 |
atgttttctaaaatataaatattgac |
535 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
8159751 |
atgttttctaaaatgtaaacattgac |
8159726 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 315 - 388
Target Start/End: Original strand, 12395280 - 12395353
Alignment:
| Q |
315 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaa |
388 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
12395280 |
aaaaataattattttctatcattaacaactataataattaaatcttatttaccaaaagcgtcgatgaaataaaa |
12395353 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 463 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 5583033 - 5582957
Alignment:
| Q |
463 |
aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
5583033 |
aatatgattcttataaacaatgaaatgatgttttttcttacgaaatgatgttctataaaatataaatattgaaaaat |
5582957 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 465 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 16087115 - 16086977
Alignment:
| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgat |
563 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| || || ||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
16087115 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgcgtttttcttctgaaatcatattttctaaaatataaatgtcgacaaataactatttatttcataaaattgat |
16087017 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
| ||| |||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16087016 |
cgttagtttataga-tttatgaagcaagagtaccggtacac |
16086977 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 463 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 40379142 - 40379054
Alignment:
| Q |
463 |
aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttattt |
551 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
40379142 |
aatatgattcttataaataataaaatgatagtttttcttataaaatgatattttctaaaatataaatattgataaataactttttattt |
40379054 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 465 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 43631224 - 43631086
Alignment:
| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgat |
563 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| || || ||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
43631224 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgcgtttttcttctgaaatcatattttctaaaatataaatgtcgacaaataactatttatttcataaaattgat |
43631126 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
| ||| |||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43631125 |
cgttagtttataga-tttatgaagcaagagtaccggtacac |
43631086 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 472 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 23406815 - 23406748
Alignment:
| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
23406815 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaataatgttttataaaatataaatattgaaaaat |
23406748 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 318 - 580
Target Start/End: Original strand, 24148856 - 24149119
Alignment:
| Q |
318 |
aataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccat |
417 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || | | ||||||||| | ||| |
|
|
| T |
24148856 |
aataattaaattctattattgacaattataataattaaattttatttaccaaaagcgtcgatgaaataaaaaaaaaaaaattt-aatttttattgctcat |
24148954 |
T |
 |
| Q |
418 |
aacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttctt---atgagatgatgtt |
514 |
Q |
| |
|
|| | ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||| |
|
|
| T |
24148955 |
aatgaagaatattaattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatataattcatataaacaatgaaatgatgtttttttttctcatgagataatgtt |
24149054 |
T |
 |
| Q |
515 |
ttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattt |
580 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||| | |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
24149055 |
ttctaaaatataaataatgacaaataacaacttatttca-taaaataatcattaatttataaattt |
24149119 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 541 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 33704576 - 33704505
Alignment:
| Q |
541 |
cctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaatt |
612 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
33704576 |
cctttttatttcattaaggtgatcgttcatttataaattttgtgaaacaagagtactcgtacactcaaaatt |
33704505 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 465 - 575
Target Start/End: Original strand, 35357939 - 35358050
Alignment:
| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat-taaagtgat |
563 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
35357939 |
tatgattcttataaacaatgaactgatgttttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattgataaatagttatttatttcataaaaaatgat |
35358038 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttata |
575 |
Q |
| |
|
| |||||||||| |
|
|
| T |
35358039 |
ctttaatttata |
35358050 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 465 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 11750589 - 11750515
Alignment:
| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11750589 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
11750515 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 465 - 539
Target Start/End: Original strand, 15716142 - 15716216
Alignment:
| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15716142 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
15716216 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 465 - 539
Target Start/End: Original strand, 15954367 - 15954441
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
15954367 |
tatgattcttataaacaatgaactgatgttttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattgataaat |
15954441 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 465 - 539
Target Start/End: Original strand, 24812318 - 24812392
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24812318 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
24812392 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #79
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Target Start/End: Complemental strand, 24953096 - 24953022
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24953096 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgctttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
24953022 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #80
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Target Start/End: Original strand, 41809319 - 41809552
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348 |
ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgaca |
447 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
41809319 |
ataactaaatcttatttatcaaaaacatcgacgaaataaaatttaatttttatgaatttttagtactcataatcgagaattttgattattttttacaata |
41809418 |
T |
 |
| Q |
448 |
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546 |
Q |
| |
|
||||| | | ||||| |||| ||||||||||||||| | |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | || |
|
|
| T |
41809419 |
aaatgtaaacaaaatagtatgaattttat-aacaatgaaatgatgttatttttttatgaaatgatattttctaaaatataaatatcaacaaataattctt |
41809517 |
T |
 |
| Q |
547 |
tatttcattaaagtgatcattaatttatatatttt |
581 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
41809518 |
tatttcataaaattgatagttaatttatagatttt |
41809552 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #81
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Target Start/End: Original strand, 5215104 - 5215351
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| Q |
311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaa---tttttatgaatttt |
407 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||||||| || ||| ||| | |||| |||| ||||||||| || | ||||| |||||||| |
|
|
| T |
5215104 |
gaagaaaaagaattgttttctatcattaacaattacaataattagatcttagttaccgaaagtgtcgacgaaataaaattttacattttttttgaatttt |
5215203 |
T |
 |
| Q |
408 |
tatcacccataacaatgaatattgattatttttt-atgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgag |
506 |
Q |
| |
|
| | || ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| | |
|
|
| T |
5215204 |
tgttacatataacaaagaatatttattatttttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaattgtgtttattcttataaa |
5215303 |
T |
 |
| Q |
507 |
atgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat |
554 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
5215304 |
atgatgtcttataaaatataaatattgataaataactctttatttcat |
5215351 |
T |
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Target: chr7; HSP #82
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563 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
32529350 |
tatgattcttataaacaatgaactgatgctttttcttatgaaataatgttctataaaatataaatattgataaatagttatttatttcataaaaaatgat |
32529251 |
T |
 |
| Q |
564 |
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575 |
Q |
| |
|
| |||||||||| |
|
|
| T |
32529250 |
cgttaatttata |
32529239 |
T |
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Target: chr7; HSP #83
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgat |
563 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| || | ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
41742813 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgcgtttttcttctgaaatcacattttctaaaatataaatgcagacaaataactatttatttcataaaattgat |
41742911 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtaca |
603 |
Q |
| |
|
| |||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
41742912 |
cgttaatttataga-tttatgaaacaagagtatcggtaca |
41742950 |
T |
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Target: chr7; HSP #84
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| Q |
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aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat |
554 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
48460422 |
aatatgattcttataaacaatgaaatgatgtttattcttataaaatgatgccttataaaatataaatattgataaataactctttatttcat |
48460331 |
T |
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494 |
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580 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
2291046 |
tttttcttatgaaataatattttctaaaatataaataccgacaaataactatttatttcataaaattgatcattaatttataaattt |
2291132 |
T |
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Target: chr7; HSP #86
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
7574721 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgataaat |
7574647 |
T |
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Target: chr7; HSP #87
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| | || | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23110600 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgtttttctataaaatataaatattgacaaat |
23110526 |
T |
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Target: chr7; HSP #88
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| Q |
473 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaattt |
572 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||| |||||||||| |||| | ||| ||||||| |
|
|
| T |
24204776 |
ttataaacaatggaatgatgtttcttattatgagatgatgttttctaaaatataaacaattataaatagctttttattttcataaaataatcgttaattt |
24204677 |
T |
 |
| Q |
573 |
atatattttgtgaaacaagagtaccggtaca |
603 |
Q |
| |
|
|| | ||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
24204676 |
at-caatttatgaagcaagagtaccggtaca |
24204647 |
T |
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Target: chr7; HSP #89
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
28264920 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgataaat |
28264846 |
T |
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Target: chr7; HSP #90
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30076877 |
tatgattcttataaacaattaaatgatattttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
30076951 |
T |
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Target: chr7; HSP #91
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
35291496 |
tatgattcttataaacaatgaactgatgttttttcttatgaaattatgttctataaaatataaatattgataaat |
35291422 |
T |
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aagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaact-ta-atttttatgaattttta |
409 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| | || |||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
35859408 |
aagaaaaataattattttttatcattgataattataataattaaatcttatttaccaaaagagtcgacgaaataaaaatatatatttttttgaaatttta |
35859309 |
T |
 |
| Q |
410 |
tcacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatg |
452 |
Q |
| |
|
| || ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
35859308 |
ttactcataagagataatatttattattttttatgaaaaaatg |
35859266 |
T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38666106 |
tatgattcttataaacagttaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
38666180 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #94
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47369388 |
tatgattcttataaacaatctaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
47369314 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #95
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311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaat-ttttatgaattttta |
409 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||| ||| || ||||||| || ||| ||| |||| |||| ||||||||| || | |||| ||||||||| |
|
|
| T |
17834014 |
gaagaaaaagaattgttttctatcattatcaattacaataattagatcttagttactgaaagtgtcgacgaaataaaattttacattttttgaatttttg |
17834113 |
T |
 |
| Q |
410 |
tcacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatg |
509 |
Q |
| |
|
| || ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| | ||| |
|
|
| T |
17834114 |
ttacatataacaaagaatatttattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaatgatgtttattcctataaaatg |
17834213 |
T |
 |
| Q |
510 |
atgttttctaaaatataaatat |
531 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
17834214 |
atgtcttataaaatataaatat |
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T |
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Target: chr7; HSP #96
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agaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatca |
412 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| | |||||||| || | |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
24205522 |
agaaaagtaattattttctgtaattgacaattatcaaaattaaatattatttaccaaaagtgtcgacaaaataaatat-aatttttctgaatttttatta |
24205424 |
T |
 |
| Q |
413 |
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442 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24205423 |
cttataacaaagaatattgattatttttta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #97
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313 |
agaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatca |
412 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| | |||||||| || | |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
24207040 |
agaaaagtaattattttctgtaattgacaattatcaaaattaaatattatttaccaaaagtgtcgacaaaataaatat-aatttttctgaatttttatta |
24206942 |
T |
 |
| Q |
413 |
cccataacaatgaatattgattatttttta |
442 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24206941 |
cttataacaaagaatattgattatttttta |
24206912 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #98
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat-taaagtgatcattaat |
570 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||| | ||||||||||||||||| |||| || |||||| || ||| | ||| ||||| |
|
|
| T |
26605219 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttctgataaaatgatgttctataaaatataaatattgataaataactatttattatataaaaaattatcgttaat |
26605120 |
T |
 |
| Q |
571 |
ttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttccct |
636 |
Q |
| |
|
||||| | || |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
26605119 |
ttata-aaattatgaagcaagagtaccggtacacctcattttgtgagtgtaccgtagaagttccct |
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T |
 |
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414 |
Q |
| |
|
||||| || |||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| ||| | ||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
46456372 |
aaaaaaaaatattttttatcattgacaattataataattaaatcttatttatcaaatgcatcaatgaaataaaatttactcttt-tgaatttttattgct |
46456274 |
T |
 |
| Q |
415 |
cataacaatgaatattgattattttt |
440 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46456273 |
cataatgaagaatattgattattttt |
46456248 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #100
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat-taaagtgat |
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Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||| | || |||||||||| ||| |||| |
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|
| T |
6791613 |
tatgattcttataaacaataaactgatgttttttcttgtgaaatgatgttctataaaatataaatattgataaaag-ctatttatttcataaaaaatgat |
6791515 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
| ||| |||||| | || ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
6791514 |
cgttactttata-aaattatgaaaaaagagtaccggtacac |
6791475 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #101
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Target Start/End: Complemental strand, 43958920 - 43958804
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tctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaata |
428 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || | |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| | || || |
|
|
| T |
43958920 |
tctatcatttacaattataaaaattaaatcttatttaccaaaagtgtcgacgaaataaaatttattttttttgaatttttattactcataatgaagatta |
43958821 |
T |
 |
| Q |
429 |
ttgattattttttatga |
445 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43958820 |
ttgattattttttatga |
43958804 |
T |
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Target: chr7; HSP #102
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351 |
attaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaa |
450 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| | |||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||||| || | || | |
|
|
| T |
15584824 |
attaaattttattcatcaaaagcgtcaacgaaataaaattgaattcttttgaattttgatcactcataatagagaactttgattattttatacaataata |
15584725 |
T |
 |
| Q |
451 |
tgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatga-tggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttat |
549 |
Q |
| |
|
|| | | |||||| |||||||||||| | |||| | ||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| || ||| | |
|
|
| T |
15584724 |
tgtaaaaaatttactatgattcttataaacaat-agatgacttgtttttcttatgaaattatattttctaaaatataaatgccgataaataactatttgt |
15584626 |
T |
 |
| Q |
550 |
ttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacact |
605 |
Q |
| |
|
|| || ||| ||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15584625 |
tttataaaattgatcgttaatttatagatttag-gaaacaagagtaccggtacact |
15584571 |
T |
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Target Start/End: Complemental strand, 22967582 - 22967507
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt-cttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22967582 |
tatgattcttataaacaatgaaatgatgtttttttcttatgaaatcatgttctataaaatataaatattaacaaat |
22967507 |
T |
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Target: chr7; HSP #104
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| Q |
463 |
aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat |
554 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| | | ||||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
31760223 |
aatatgattcttataaataatgaaatgatgtttattcttataaaaggatgtcttataaaatataaatattgataaataactctttatttcat |
31760314 |
T |
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Target: chr7; HSP #105
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
37118503 |
tatgattcttataaagaatgaaatgatgttttttcttatgaaataatattttctaaaatataaa |
37118440 |
T |
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Target: chr7; HSP #106
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Target Start/End: Complemental strand, 38883140 - 38882952
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| Q |
224 |
aaaaggcaaattttatggtacacctaataa-atttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataat-aaatgagttgnnnnnnngaagaaaaata |
321 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||| | | |||||| | || ||| ||||||| |||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
38883140 |
aaaaggcaaattatatggtacacctaaaaatatttgagtgtaccaatacaccaatttgttaaaataataattaaatgagttgattttttgaagaaaagta |
38883041 |
T |
 |
| Q |
322 |
attattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
|
|||||||| | | |||||||| || | |||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
38883040 |
attattttttgtaattgacaattatcaaaattaaatattatttaccaaaagcgtcgacaaaataaaatataatttttctgaatttttat |
38882952 |
T |
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Target: chr7; HSP #107
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Target Start/End: Complemental strand, 46575273 - 46575206
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatatt |
532 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
46575273 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatatt |
46575206 |
T |
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Target: chr7; HSP #108
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Query Start/End: Original strand, 465 - 602
Target Start/End: Original strand, 23561342 - 23561478
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgat |
563 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
23561342 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatatgtttttcttatgaaatgatattttctaaaatatcaatgcctacaaataactatttatttcataaaattgat |
23561440 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtac |
602 |
Q |
| |
|
| |||||||||| | ||| |||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
23561441 |
cgttaatttataga-tttatgaagcacgagtaccggtac |
23561478 |
T |
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Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 463 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 27567314 - 27567221
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| Q |
463 |
aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaga--tgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat |
554 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| || | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
27567314 |
aatatgattcttatcaacaatgaaatgatgtttttttttttaagaaatgatgtttcataaaatataaatattgacaaataactctttatttcat |
27567221 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #110
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Target Start/End: Original strand, 35925026 - 35925080
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| Q |
500 |
ttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat |
554 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
35925026 |
ttatgagatgatgttttctaaaatataaacattgataaatagctttttatttcat |
35925080 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #111
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Target Start/End: Complemental strand, 38665627 - 38665553
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| | || | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38665627 |
tatgattcttataaataattaaatgatgttttttcttatgaaatgttattctataaaatataaatattgacaaat |
38665553 |
T |
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Target: chr7; HSP #112
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| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttt-tcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat-taaagtgatcattaa |
569 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||| ||||| |||| |
|
|
| T |
3214763 |
cttataaacaatgaaatgatatttttttcttatgaaataatgttctataaaatataaatattgacaaatagctatttattacataaaaaatgatcgttaa |
3214862 |
T |
 |
| Q |
570 |
tttata |
575 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
3214863 |
tttata |
3214868 |
T |
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Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
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| Q |
474 |
tataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatg-ttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaattt |
572 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||| || ||||||| | |||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
16200543 |
tataaacaatgaaattatgttttttcttatgaaatgatgtttttctaaaatataaaccttgataaataactctttatttta-taaaatgatcgttaattt |
16200445 |
T |
 |
| Q |
573 |
at |
574 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
16200444 |
at |
16200443 |
T |
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Target: chr7; HSP #114
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Query Start/End: Original strand, 465 - 574
Target Start/End: Original strand, 24203104 - 24203213
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatc |
564 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| | |||||| || |||||| ||| ||| | ||| |
|
|
| T |
24203104 |
tatgattcttaaaaagaatgaaatgatgttttttcttatgaaataatattttctaaaatataaaagtcaacaaatatctctttattacataaaaataatc |
24203203 |
T |
 |
| Q |
565 |
attaatttat |
574 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
24203204 |
attaatttat |
24203213 |
T |
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Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
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| Q |
311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| ||||||| | || || |||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
41047165 |
gaagaaaaata-ttattttttatcatttataattataataactaaatcttattcatcaaaagtgtcaatgaaataaaataatttttttttgaatttttat |
41047067 |
T |
 |
| Q |
411 |
cacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatg-aannnnnnnnaatatgatccttataaacaat--gaaatgatggttttt-cttatgag |
506 |
Q |
| |
|
||| ||||| || |||||||||||||||||| || ||| || | |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
41047066 |
cactcataattgaaaacattgattattttttatgataatatgtaaaaaaaattattatgattcttataaacaatttgaaatgatgtttttttcttatgaa |
41046967 |
T |
 |
| Q |
507 |
atgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41046966 |
atgatgttctataaaatataaatattaacaaat |
41046934 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #116
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattga |
534 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41968601 |
tatgattcttataaacaataaactgatgttttttcttgtgaaatgatgttctataaaatataaatattga |
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T |
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Target: chr7; HSP #117
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |
|
|
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968661 |
cttataaaaaatgaaatgatgttttttcttatgggataatattttctaaaatataaa |
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T |
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Target: chr7; HSP #118
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
20883868 |
cttatgaaaaatgaaatgatgttttttcttatgagataatattttctaaaatataaa |
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T |
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Target: chr7; HSP #119
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| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
24189213 |
cttataaaaaatgaaatgatgttttttcttatgggataatattttctaaaatataaa |
24189157 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #120
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| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
38034885 |
cttataaaaaatgaaatgatgttttttcttatgggataatattttctaaaatataaa |
38034829 |
T |
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Target: chr7; HSP #121
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| Q |
494 |
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554 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
38882958 |
tttttattatgagatgatgttttctaaaatataaacattgataaatggattttaatttcat |
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T |
 |
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatatt |
532 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18520155 |
tatgattcttataaacaattaaatggtgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatatt |
18520222 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #123
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19503289 |
tatgattcttataaataatgaaatgatattttttcttatgaaataatattttctaaaatataaa |
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T |
 |
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Target: chr7; HSP #124
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| Q |
566 |
ttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgta |
621 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27426767 |
ttaatttataaattttgtgaaataagagaatcggtacactcaaatttgtgagtgta |
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T |
 |
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Target: chr7; HSP #125
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Target Start/End: Original strand, 34118715 - 34118845
Alignment:
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473 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaattt |
572 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||| ||| | || ||||||| |
|
|
| T |
34118715 |
ttataaacaataaaatgatattttttcttatgaaatgacattttctaaaatataaatatcaacaaatagcactttattccataaaaataatagttaattt |
34118814 |
T |
 |
| Q |
573 |
atatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
| || |||| ||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
34118815 |
aaat-ttttttgaaataagagtaccagtacac |
34118845 |
T |
 |
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| Q |
311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| | |||||||| || | |||||||| ||||||| ||||||| || | |||||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
35923790 |
gaagaaaagtaattattttctgtaattgacaattatcaaaattaaatattatttaccaaaagcgtcaacaaaataaaatataatttttctgaatttttat |
35923889 |
T |
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgaca |
536 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45232217 |
tatgattcttataaacagaaaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgaca |
45232146 |
T |
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | | ||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3602504 |
tatgattcttataaatagtaaaatgatattttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
3602578 |
T |
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Target: chr7; HSP #129
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| Q |
494 |
tttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattt |
580 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | |||| ||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
8578063 |
tttttcttatgaaatgatattttttaaaatat-aatattgacaaatacctatttatttta-taaaatgatcgttaatttataaattt |
8577979 |
T |
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Target: chr7; HSP #130
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| Q |
485 |
aaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29606418 |
aaatgatgttttttattatgaaatgttgttttataaaatataaatattgacaaat |
29606364 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #131
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| Q |
473 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatat |
531 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43750320 |
ttatagacaatgaaatgacgttttttcttatgaaatgacattttctaaaatataaatat |
43750378 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #132
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| Q |
324 |
tattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaat |
423 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || || ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||| |||| |||| |||| | ||||||||| || ||||| | | |
|
|
| T |
24189361 |
tattttctatcatttataattataataattatattttatttttcaaaagtgtcggcaaaacaaaatttaaatttttttaatttttattactcataatagt |
24189262 |
T |
 |
| Q |
424 |
gaatattgattatttttt |
441 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24189261 |
gaatattgattatttttt |
24189244 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #133
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| Q |
404 |
tttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatg-aannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttctta |
502 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
29982287 |
tttttattactcataataatgaatattgattatttttt-tgataaaatgtaaaacaaattagtatgattcttataaacaatgaaatgatgttttttcttt |
29982189 |
T |
 |
| Q |
503 |
tgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
29982188 |
gaaaataatattttctaaaatataaa |
29982163 |
T |
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Target: chr7; HSP #134
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| Q |
348 |
ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaattttta |
409 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||| || |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
30936380 |
ataattaaatcttatttatcaaaaacatcgacgaaataaaatttgatttttctgaattttta |
30936319 |
T |
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Target: chr7; HSP #135
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Query Start/End: Original strand, 348 - 409
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| Q |
348 |
ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaattttta |
409 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| | |||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31482492 |
ataattaaatcttatttaccaaaaacgtcgacggaataaaatttaatttttatgaattttta |
31482553 |
T |
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Target: chr7; HSP #136
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgtt |
514 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
46291269 |
tatgattcttataaacaatgaaatgatgttttttattatgaaatgatgtt |
46291220 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #137
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Query Start/End: Original strand, 463 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 46880041 - 46879977
Alignment:
| Q |
463 |
aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| || || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
46880041 |
aatatgattcttataaagaatgaaatgat-gtttttcttacgaaataatattttctaaaatataaa |
46879977 |
T |
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Target Start/End: Original strand, 12395410 - 12395477
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| Q |
474 |
tataaacaatgaaatgatggttttt--cttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
12395410 |
tataaacaatgaaatgatattttttttctcatgagatggtgttttttaaaatataaataatgacaaat |
12395477 |
T |
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Target: chr7; HSP #139
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| Q |
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cttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgat |
563 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| | ||| |||| | ||||||| ||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
15591629 |
cttataaacaatgaa-tgatgtgtttttcttatgaaatgatattttctgagataaaaatgtcgacaaataactttttatttcataaaattgat |
15591720 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #140
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatat |
525 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||| |
|
|
| T |
39558843 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatat |
39558903 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #141
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| Q |
325 |
attttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaattttta |
409 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| | | ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
46836895 |
attttctatcatctacaattataataattaaattttatttaccaaaaacgtcgacgaaataaaattaattttttctgaattttta |
46836811 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #142
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Query Start/End: Original strand, 465 - 537
Target Start/End: Original strand, 47642735 - 47642807
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaa |
537 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47642735 |
tatgattcttataaacaattgaatgatattttttcttatgaaatattgttctataaaatataaatattgacaa |
47642807 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #143
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || || || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
428007 |
tatgattcttataaacaatgaaattatgttttttcttatgaaataatattctcttaaatataaa |
427944 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #144
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| Q |
348 |
ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgaca |
447 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||| ||||| | |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| | |||| |||||||||||| | | | |
|
|
| T |
18990209 |
ataattaaatatcatttaccaaaaacatcgacaaaataaaatttaatttttctgaatttttagtactcataatagagaattttgattattttt-acaata |
18990307 |
T |
 |
| Q |
448 |
aaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatat |
531 |
Q |
| |
|
||||| | | |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18990308 |
aaatgtaaaaaaattagtatgatgtttataaacaatgaaataatgttttttcttaagaaatgacatttcctaaaatataaatat |
18990391 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #145
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| Q |
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tttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
46456195 |
tttctcatgcgatgatgttttctaaaatataaacattgacaaat |
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T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #146
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| Q |
485 |
aaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
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|||||||| |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1269158 |
aaatgatgttttttcttatgaaatattgttctataaaatataaatattgacaaat |
1269104 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #147
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taaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
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Q |
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|||| |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
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taaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
21699401 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #148
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Query Start/End: Original strand, 465 - 530
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaata |
530 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || || |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
30878553 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgtgtttttcttatgaaatcatattttttaaaatataaata |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #149
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| Q |
476 |
taaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
42711177 |
taaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 472 - 505
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Alignment:
| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatga |
505 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1806724 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatga |
1806757 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 43958787 - 43958727
Alignment:
| Q |
463 |
aatatgatccttataaacaatgaaatgatggttt--ttcttatgagatgatgttttctaaa |
521 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
43958787 |
aatatgattcttataaacaatgaaattatgtttttcttcttatgaaattatgttttctaaa |
43958727 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 299; Significance: 1e-167; HSPs: 142)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 227 - 638
Target Start/End: Original strand, 37725550 - 37725961
Alignment:
| Q |
227 |
aggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattat |
326 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
37725550 |
aggcaaattctatggtacacccaataaatttgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattat |
37725649 |
T |
 |
| Q |
327 |
tttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaa |
426 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
37725650 |
tttctatcattgacaactaagataattaaattttatataccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaa |
37725749 |
T |
 |
| Q |
427 |
tattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
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37725750 |
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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
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Target Start/End: Complemental strand, 2317246 - 2316838
Alignment:
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 226 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 13568621 - 13568209
Alignment:
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 228 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 36947889 - 36947482
Alignment:
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 227 - 638
Target Start/End: Original strand, 40533250 - 40533661
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426 |
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626 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 229 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 16815256 - 16814849
Alignment:
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 228 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 3724348 - 3723941
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Q |
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427 |
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527 |
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627 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 226 - 632
Target Start/End: Original strand, 45555380 - 45555786
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525 |
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625 |
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45555680 |
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45555779 |
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632 |
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45555780 |
agaagtt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 224 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 7504435 - 7504021
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T |
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T |
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621 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 226 - 635
Target Start/End: Original strand, 1859925 - 1860334
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T |
 |
| Q |
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ttttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatga |
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| T |
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ttttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatga |
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T |
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Target: chr2; HSP #11
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Target Start/End: Complemental strand, 36192356 - 36191969
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
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Target Start/End: Complemental strand, 5085243 - 5084838
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Target: chr2; HSP #13
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Query Start/End: Original strand, 228 - 636
Target Start/End: Original strand, 35292510 - 35292919
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Target: chr2; HSP #14
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Target Start/End: Original strand, 6657442 - 6657854
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Back To:
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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 228 - 636
Target Start/End: Original strand, 10711277 - 10711684
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Target: chr2; HSP #16
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 227 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 18576719 - 18576300
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 249 - 634
Target Start/End: Original strand, 28394089 - 28394474
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gataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgac |
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28394474 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 227 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 18009362 - 18008956
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Q |
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T |
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| T |
18008963 |
gaagttcc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 219 - 638
Target Start/End: Original strand, 41839645 - 41840064
Alignment:
| Q |
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ttacaaaaaggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaa |
318 |
Q |
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518 |
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| T |
41840045 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 231 - 626
Target Start/End: Complemental strand, 33424137 - 33423741
Alignment:
| Q |
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329 |
Q |
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33424038 |
T |
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| Q |
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429 |
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| T |
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33423838 |
T |
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| Q |
530 |
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626 |
Q |
| |
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| T |
33423837 |
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33423741 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 315 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 36049785 - 36049464
Alignment:
| Q |
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413 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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T |
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| Q |
414 |
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513 |
Q |
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| T |
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613 |
Q |
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| T |
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36049486 |
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| T |
36049485 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 254 - 635
Target Start/End: Original strand, 19635669 - 19636042
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| Q |
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353 |
Q |
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| Q |
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T |
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635 |
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| T |
19635961 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 254 - 635
Target Start/End: Original strand, 19834262 - 19834635
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| Q |
254 |
atttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataatt |
353 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
19834262 |
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19834355 |
T |
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| Q |
354 |
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453 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
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553 |
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19834553 |
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635 |
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|
| T |
19834554 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 226 - 638
Target Start/End: Original strand, 21425210 - 21425619
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| Q |
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aaggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataatta |
325 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
21425210 |
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21425309 |
T |
 |
| Q |
326 |
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425 |
Q |
| |
|
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|
| T |
21425310 |
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21425407 |
T |
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| Q |
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524 |
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21425505 |
T |
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624 |
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| T |
21425506 |
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21425605 |
T |
 |
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625 |
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638 |
Q |
| |
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|| ||||||||||| |
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| T |
21425606 |
taaaagttccctta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 463 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 16854303 - 16854129
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
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|
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aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatattttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtga |
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T |
 |
| Q |
563 |
tcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttccctt |
637 |
Q |
| |
|
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|
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tctttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttccctt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 463 - 633
Target Start/End: Original strand, 21836520 - 21836690
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Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
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aatatgatcattataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatattttctaaaatataaatattgaaaaatacatttttatttcattaaagtga |
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T |
 |
| Q |
563 |
tcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttc |
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Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
21836620 |
tcgttaatttatatattttgtgaaacaagagcaccggtacactcaaaattgtgagtgtaccatagaagttc |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 318 - 580
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||| |
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|
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2283480 |
aataattattttctatcattgacaattataataattaaattttatttattaaaagtgtcgaagaaataaaatttactttttttgaatttttattactcat |
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T |
 |
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517 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
518 |
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580 |
Q |
| |
|
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taaaatataaatattgacaaatagctatttatttca-taaaataatcgttaatttataaattt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 228 - 409
Target Start/End: Original strand, 21836336 - 21836520
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ggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataatta-- |
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Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ggcaaattctatggtacacccaataaattcgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattact |
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T |
 |
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326 |
-ttttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaattttta |
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| |
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|
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attttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacaaaataaaatttaatttttaagaattttta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
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Target Start/End: Complemental strand, 490140 - 489959
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327 |
Q |
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|||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
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490140 |
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490042 |
T |
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328 |
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410 |
Q |
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|
|
| T |
490041 |
ttctatcattgacaactaagataattaaattttatataccaaaaatttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttat |
489959 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 311 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 40288028 - 40287738
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
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40288028 |
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T |
 |
| Q |
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510 |
Q |
| |
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40287830 |
T |
 |
| Q |
511 |
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604 |
Q |
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tgttttttaaaatataaatattgaaaaatagctttttatttcatgaaa-tgatcgttaatttata-attttatggagcaagagtatcgatacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #33
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Query Start/End: Original strand, 312 - 605
Target Start/End: Original strand, 37989114 - 37989404
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411 |
Q |
| |
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|
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T |
 |
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412 |
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511 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
512 |
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605 |
Q |
| |
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|
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37989314 |
gttttataaaacataaatattgacaaatagttttttatttcat--aaattatcgttaatttata-attttatggtgcaagagtaccggtacact |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #34
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Target Start/End: Original strand, 14819916 - 14820092
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327 |
Q |
| |
|
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|
|
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14819916 |
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14820015 |
T |
 |
| Q |
328 |
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404 |
Q |
| |
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| T |
14820016 |
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T |
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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
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425 |
Q |
| |
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25740084 |
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T |
 |
| Q |
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524 |
Q |
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| T |
25740184 |
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25740283 |
T |
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| Q |
525 |
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604 |
Q |
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| T |
25740284 |
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T |
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Target: chr2; HSP #36
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Target Start/End: Original strand, 14820089 - 14820270
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Q |
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14820188 |
T |
 |
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524 |
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605 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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Target: chr2; HSP #37
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Q |
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|
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T |
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| Q |
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Q |
| |
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| T |
7069380 |
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7069479 |
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| Q |
513 |
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580 |
Q |
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| T |
7069480 |
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T |
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Back To:
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Target: chr2; HSP #38
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Q |
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12071238 |
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12071337 |
T |
 |
| Q |
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510 |
Q |
| |
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| T |
12071338 |
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12071437 |
T |
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| Q |
511 |
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539 |
Q |
| |
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| T |
12071438 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
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T |
 |
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399 |
Q |
| |
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|
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33716603 |
ttttctatcattgacaactataataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttaattttta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #40
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Q |
| |
|
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T |
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| Q |
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513 |
Q |
| |
|
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|
| T |
4108493 |
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4108592 |
T |
 |
| Q |
514 |
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580 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| | |||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
4108593 |
tttctgaaatataaataatgacaaataacaatttatttta-taaaatgatcattaatttataaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 463 - 636
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| |
|
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|
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T |
 |
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tcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttccct |
636 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||| ||| || |||||||| | |||||||||||| |
|
|
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tcgttaatttataaattttgtaaaacaagagtatcgatacactaaaatttctgagtgtaccgtagaagttccct |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #42
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | |
|
|
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T |
 |
| Q |
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cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatg--gtttttcttatgagatgatg |
512 |
Q |
| |
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||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
33429319 |
cataatgaagaatattgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatataattcatataaacaatgaaatgatgttttttttctcatgagatggtg |
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T |
 |
| Q |
513 |
ttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattt |
580 |
Q |
| |
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|
| T |
33429419 |
ttttctaaaatataaataatgataaataacaacttatttca-aaaaatgatcattaatttataaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #43
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Query Start/End: Original strand, 314 - 580
Target Start/End: Original strand, 43359189 - 43359455
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gaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcac |
413 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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gaaaaataattattttctatcattgacaattataataattaaatcttatttaccataagcgtcgatgaaataaaatttactttttttgaatttttattgc |
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T |
 |
| Q |
414 |
ccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatg |
512 |
Q |
| |
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43359289 |
tcataatgaagaatattgattattttttattagaaaatgttaaaaatttaatataattcacataaacaataaaatgatgtttttttctcatgagatggtg |
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T |
 |
| Q |
513 |
ttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattt |
580 |
Q |
| |
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|
| T |
43359389 |
ttttctaaaatataaataatgacaaataacaacttatttca-taaaatgatcattaatttataaattt |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #44
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| |
|
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|
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15426331 |
ttttctatcattgacaattacaataattaaatcgtatttaccaaaagcgtcgacgaaataaaatttacatttttt-aatttttgttacatataacaaaga |
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T |
 |
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Q |
| |
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| T |
15426232 |
atgttgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatataattcttataaacaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatgttttctaaaatat |
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T |
 |
| Q |
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aaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
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Q |
| |
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|
| T |
15426132 |
aaatattgataaataactctttatttcataaaag-aatcattaaattataaattttttaaagcaggagtaccggcacac |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 315 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 28318361 - 28318031
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 225 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 42641260 - 42640885
Alignment:
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225 |
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323 |
Q |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 316 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 2307596 - 2307372
Alignment:
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316 |
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415 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 312 - 551
Target Start/End: Original strand, 5615464 - 5615707
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408 |
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5615707 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 311 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 15206064 - 15205797
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410 |
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15205797 |
T |
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Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 315 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 36428827 - 36428600
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414 |
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| T |
36428627 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 8504346 - 8504082
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| Q |
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414 |
Q |
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| Q |
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513 |
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8504082 |
T |
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Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 315 - 530
Target Start/End: Original strand, 16718722 - 16718939
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414 |
Q |
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512 |
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16718922 |
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16718939 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 231 - 410
Target Start/End: Original strand, 44068052 - 44068229
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 311 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 38073430 - 38073138
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409 |
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604 |
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38073230 |
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38073138 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Original strand, 41184573 - 41184839
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| Q |
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aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatt-tttatgaatttttatcac |
413 |
Q |
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| T |
41184573 |
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41184672 |
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414 |
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| T |
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41184772 |
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41184773 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 311 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 19268887 - 19268566
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataat-taaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaattttta |
409 |
Q |
| |
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| T |
19268887 |
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19268788 |
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509 |
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| T |
19268787 |
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19268691 |
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510 |
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609 |
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| T |
19268690 |
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19268592 |
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635 |
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| |
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| T |
19268591 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 311 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 25713040 - 25712813
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
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411 |
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510 |
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25712941 |
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539 |
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25712841 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Original strand, 7366593 - 7366854
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415 |
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511 |
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580 |
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7366854 |
T |
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Target: chr2; HSP #59
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Target Start/End: Complemental strand, 45690823 - 45690554
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410 |
Q |
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T |
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| Q |
411 |
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509 |
Q |
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| T |
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T |
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580 |
Q |
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| T |
45690623 |
atattttctaaaatataaatattgactaatagctttttatttca-taaaatgatccttaatttataaattt |
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T |
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Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 311 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 11986514 - 11986291
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410 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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506 |
Q |
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11986315 |
T |
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530 |
Q |
| |
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| T |
11986314 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 229 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16854413 - 16854339
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303 |
Q |
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||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |
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T |
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Target: chr2; HSP #62
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Query Start/End: Original strand, 311 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 8362728 - 8362501
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409 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
410 |
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506 |
Q |
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| T |
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8362529 |
T |
 |
| Q |
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534 |
Q |
| |
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| T |
8362528 |
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8362501 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 311 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 38600134 - 38599890
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| Q |
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaat-ttttatgaattttta |
409 |
Q |
| |
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| T |
38600134 |
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T |
 |
| Q |
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509 |
Q |
| |
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| T |
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| T |
38599934 |
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T |
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Target: chr2; HSP #64
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Query Start/End: Original strand, 311 - 554
Target Start/End: Original strand, 12182643 - 12182885
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410 |
Q |
| |
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| T |
12182643 |
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12182742 |
T |
 |
| Q |
411 |
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510 |
Q |
| |
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| T |
12182743 |
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12182841 |
T |
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| Q |
511 |
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554 |
Q |
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| T |
12182842 |
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Target: chr2; HSP #65
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Q |
| |
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15334242 |
T |
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| Q |
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581 |
Q |
| |
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T |
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Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 322 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 37782159 - 37781988
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420 |
Q |
| |
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| T |
37782159 |
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37782060 |
T |
 |
| Q |
421 |
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492 |
Q |
| |
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|| ||||||||||||||||| || | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
37782059 |
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37781988 |
T |
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Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 348 - 554
Target Start/End: Original strand, 40810539 - 40810745
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447 |
Q |
| |
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||||||| || ||| ||||| |||| |||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| | || ||||||| ||||||| |||||||||||||| | |
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| T |
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40810638 |
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547 |
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| |
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| T |
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40810738 |
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554 |
Q |
| |
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40810739 |
atttcat |
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T |
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Target: chr2; HSP #68
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Query Start/End: Original strand, 315 - 452
Target Start/End: Original strand, 11088302 - 11088439
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Q |
| |
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11088302 |
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11088401 |
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452 |
Q |
| |
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| T |
11088402 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 315 - 453
Target Start/End: Original strand, 15176429 - 15176569
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aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacc |
414 |
Q |
| |
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15176528 |
T |
 |
| Q |
415 |
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453 |
Q |
| |
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| T |
15176529 |
cataatgaagaatattgattattatttttatgagaaaatga |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 348 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 6438463 - 6438203
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447 |
Q |
| |
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|||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||| || |||||| |||||||||| || | ||| | |||| |||||||||||||| | | |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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542 |
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| T |
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T |
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543 |
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604 |
Q |
| |
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|
| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #71
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Target Start/End: Original strand, 12002350 - 12002652
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||||| ||||| || | | ||| | || ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||| |
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T |
 |
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425 |
Q |
| |
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| | ||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||| | || | ||||||||| ||| ||||| | ||||||||| || ||||||| || |
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T |
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| Q |
426 |
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525 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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Q |
| |
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aaatattga |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 464 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 1580418 - 1580343
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Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 315 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 15362789 - 15362501
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aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaat-ttttatgaatttttatcac |
413 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||| |||| || ||||||| || ||| ||| | |||| |||| |||||||| || | |||| ||||||||| | || |
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|
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T |
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ccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgt |
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| |
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| T |
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T |
 |
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Q |
| |
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| T |
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cttataaaatataaatattgataaataactctttatttca-taaaataatcgttaaattataaatatt-tgaagcaggagtaccggtacac |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 315 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 2859657 - 2859521
Alignment:
| Q |
315 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacc |
414 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||||| ||| ||||| |||| ||||| || |
|
|
| T |
2859657 |
aaaaataattattttctatcattaataattataataattaaatcttatttaccaaaaacttcgacgaagtaaaatttactttttttgaa-atttattact |
2859559 |
T |
 |
| Q |
415 |
cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatg |
452 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
2859558 |
cataataaagaatattgattattttttataagaaaatg |
2859521 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 348 - 581
Target Start/End: Original strand, 12547482 - 12547720
Alignment:
| Q |
348 |
ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgaca |
447 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||| || |||||| |||||||||| || | ||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
12547482 |
ataattaaatcttatttatcaaaaacatcgaagaaataaaatttgatttttctgaatttttagtactcgtaatagagaattttgattattttttacaata |
12547581 |
T |
 |
| Q |
448 |
aaatg-aannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatg----gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcc |
542 |
Q |
| |
|
||||| || | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| | |
|
|
| T |
12547582 |
aaatgtaaaaaaaattagtatgatttttataaacaatgaaatgatgttttttttttcttatgaaatgatattttctaaaatataaatatcaataaatagc |
12547681 |
T |
 |
| Q |
543 |
tttttatttcattaaagtgatcattaatttatatatttt |
581 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| | || |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
12547682 |
tttttatttcataaaaataatagttaatttataaatttt |
12547720 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 463 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 22622590 - 22622498
Alignment:
| Q |
463 |
aatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt-cttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat |
554 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
22622590 |
aatatgattcttataaacaatgaaatgatgtttttttcttataaaatgatgttttataaaatataaatattgataaataactctttatttcat |
22622498 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 326 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 39089924 - 39089696
Alignment:
| Q |
326 |
ttttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatga |
425 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| || ||||||| || ||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||| ||||||||| | || |||| || || |
|
|
| T |
39089924 |
ttttcaatcattaacaattacaataattagatcttagttatcgaaagtatcgacgaaataaaatttacattttttgaatttttgttacatataataaaga |
39089825 |
T |
 |
| Q |
426 |
atattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatat |
525 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||| | ||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
39089824 |
atatttattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaataaaatgatatttattcttataaaatgatgtcttataaaatat |
39089725 |
T |
 |
| Q |
526 |
aaatattgacaaatgcctttttatttcat |
554 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
39089724 |
aaatattgataaataactctttatttcat |
39089696 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 463 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 713530 - 713439
Alignment:
| Q |
463 |
aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat |
554 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
713530 |
aatatgattcttataaacaatgaaatgatgtttattcttataaaatgatgtcttataaaatataaatattgataaataactctttatttcat |
713439 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 311 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 17809352 - 17809129
Alignment:
| Q |
311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||||||| || ||| ||| | |||| |||| ||||||||| ||| |||| ||||||||| | |
|
|
| T |
17809352 |
gaagaaaaagaattgttttctatcattaacaattacaataattagatcttagttaccgaaagtgtcgacgaaataaaatttacattttttgaatttttgt |
17809253 |
T |
 |
| Q |
411 |
cacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatga |
510 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | || | |
|
|
| T |
17809252 |
tatatataacaaagaatatttattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaatgatgtttattcttataaaataa |
17809153 |
T |
 |
| Q |
511 |
tgttttctaaaatataaatattga |
534 |
Q |
| |
|
| | || ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
17809152 |
tatcttataaaagataaatattga |
17809129 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 472 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 35895474 - 35895407
Alignment:
| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35895474 |
cttataaacaatgaaatgatattttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattgacaaat |
35895407 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 465 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 7673465 - 7673391
Alignment:
| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7673465 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
7673391 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 465 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 9122326 - 9122252
Alignment:
| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9122326 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
9122252 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 465 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 17451452 - 17451378
Alignment:
| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17451452 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttatataaaatataaatattgacaaat |
17451378 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 465 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 21404368 - 21404294
Alignment:
| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21404368 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
21404294 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 465 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 43440165 - 43440091
Alignment:
| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
43440165 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttttataaaatataaatattgataaat |
43440091 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 463 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 25332517 - 25332449
Alignment:
| Q |
463 |
aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatat |
531 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25332517 |
aatataattcttataaacaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatataaatat |
25332449 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 329 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 38030863 - 38030747
Alignment:
| Q |
329 |
tctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaata |
428 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || | |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| | || || |
|
|
| T |
38030863 |
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38030764 |
T |
 |
| Q |
429 |
ttgattattttttatga |
445 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38030763 |
ttgattattttttatga |
38030747 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 472 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 40946925 - 40946821
Alignment:
| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat-taaagtgatcattaat |
570 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||| |||| || |||||| ||| ||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
40946925 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaataatgttctataaaatataaatattgaaaaatagctatttattacataaaaaatgatcgttaat |
40946826 |
T |
 |
| Q |
571 |
ttata |
575 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
40946825 |
ttata |
40946821 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 465 - 575
Target Start/End: Original strand, 27400966 - 27401077
Alignment:
| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat-taaagtgat |
563 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
27400966 |
tatgattcttataaataatgaaatgatgttttttcttatgaaatggtgttctataaaatataaatatttacaaataattatttatttcataaaaaatgat |
27401065 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttata |
575 |
Q |
| |
|
| |||||||||| |
|
|
| T |
27401066 |
cgttaatttata |
27401077 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 465 - 539
Target Start/End: Original strand, 4740461 - 4740535
Alignment:
| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4740461 |
tatgattcttataaacaatctaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
4740535 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
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| Q |
329 |
tctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaata |
428 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || | |||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| | || || |
|
|
| T |
8334188 |
tctatcatttacaattataaaaattaaatcttatttaccaaaagc---gacgaaataaaatttaatttttttgaatttttattacccataatgaagatta |
8334092 |
T |
 |
| Q |
429 |
ttgattattttttatga |
445 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8334091 |
ttgattattttttatga |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9589351 |
tatgattcttataaacaattaaatgatg-tttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
9589424 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
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Alignment:
| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32401248 |
tatgattcttataaacagtaaaatgatgttttttcttatga-atgttgttttataaaatataaatattgacaaat |
32401175 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #94
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| Q |
348 |
ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattatttttta |
442 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| | |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
43690308 |
ataattaaattttatttaccaaaatcgtcgaagaaataaaatttaatttttctgaatttttagtactcataatagagaattttgattatttttta |
43690214 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #95
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Query Start/End: Original strand, 465 - 574
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatc |
564 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| | ||||||| |||||| || ||| ||| ||||| |
|
|
| T |
22594973 |
tatgattcttataaacaatgaaatgatattttttcttatgaaataatattttctaaaatataaaagtcgacaaatagcttttttttacataaaaatgatc |
22595072 |
T |
 |
| Q |
565 |
attaatttat |
574 |
Q |
| |
|
|||| |||| |
|
|
| T |
22595073 |
gttaacttat |
22595082 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 465 - 575
Target Start/End: Original strand, 30981120 - 30981233
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttt-tcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgac-aaatgcctttttatttcat-taaagtg |
561 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||| || |||| || |||||||||| ||| || |
|
|
| T |
30981120 |
tatgattcttataaacaatgaaatgatttttttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattaacaaaatagctatttatttcataaaaaatg |
30981219 |
T |
 |
| Q |
562 |
atcattaatttata |
575 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
30981220 |
atcattaatttata |
30981233 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
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| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatatt |
532 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
39620437 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaataatgttctataaaatataaatatt |
39620497 |
T |
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ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaattt |
572 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||| ||| | || |||||||| |
|
|
| T |
40370716 |
ttataaacaataaaatgatgatttttcttatgaaatgacattttctaaaatataaatatcaacaaataactctttattccataaaaataataattaattt |
40370815 |
T |
 |
| Q |
573 |
a |
573 |
Q |
| |
|
| |
|
|
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40370816 |
a |
40370816 |
T |
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442 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| | |||| |||||||||||||| |
|
|
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gataattaaatcttatttaccaaaaacgtcgacgaaataaaatttaatttttctgaatttttagtactcataatagagaattttgattatttttta |
6513458 |
T |
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447 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| | || | || ||||||||||| | | |
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|
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ataattaaatcttatttaccaaaaacatcgaggaaataaaatttaatttttctgaatttttagtactcataatagagagtttttattattttttacaata |
34438374 |
T |
 |
| Q |
448 |
aaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatat |
531 |
Q |
| |
|
||||| | | |||| | |||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34438373 |
aaatgtaaaataattagtatgctttttataaacaatgaaattatgtttttttttatgaaatgacattttctaaaatataaatat |
34438290 |
T |
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539 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| |||||| |
|
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tatgattcttataaacagtaaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattaacaaat |
6945652 |
T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||| || |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
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32602473 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttattatgaaatattgttctataaaatataaatattgacaaat |
32602399 |
T |
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40495683 |
tatgattcttttaaacaattaaattatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
40495757 |
T |
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507 |
atgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2859485 |
atgatgttttctaaaacataaatattgacaaatagctttttatttca-taaaatga-cgttaatttata-aatttatagaacaagagtaccggtacac |
2859391 |
T |
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| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
3911470 |
cttataaaaaatgaaatgatgttttttcttatgggataatattttctaaaatataaa |
3911526 |
T |
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Target: chr2; HSP #106
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465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgat |
563 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
10456216 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgtgtttttcttatgagaatatattttctaaaatataaatgccgataaataactatttatttcataaaattgat |
10456118 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttatatattt |
580 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |
|
|
| T |
10456117 |
agttaatttatagattt |
10456101 |
T |
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Target: chr2; HSP #107
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14840037 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatga---aatgttctataaaatataaatattgacaaat |
14840108 |
T |
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ttataaacaatgaaatgatggttttt-cttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatt |
571 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||| ||| | || |||||| |
|
|
| T |
20212315 |
ttataaacaatgaaatgacgtttttttcttatgaaatgacgttttctaaaatataaatatcaacaaatagctctttattccataaaaataatagttaatt |
20212216 |
T |
 |
| Q |
572 |
tatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
|| | ||||| |||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
20212215 |
taaagatttt-tgaagtaggagtaccggtacac |
20212184 |
T |
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473 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaattt |
572 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| | || |||||||| |
|
|
| T |
32499390 |
ttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaattacatttcttaaaatataaatatcaacaaatagctttttattccataaaaataataattaattt |
32499489 |
T |
 |
| Q |
573 |
a |
573 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
32499490 |
a |
32499490 |
T |
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Target: chr2; HSP #110
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
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|||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |
|
|
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cttataaaaaatgaaatgatgttttttcttatgagataatattttttaaaatataaa |
36023887 |
T |
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Target: chr2; HSP #111
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472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
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|
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|
|
| T |
39307255 |
cttataaaaaatgaaatgatgttttttcttatgggataatattttctaaaatataaa |
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T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
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|||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
5155863 |
tatgattcttaaaaagaatgaaatgatgttttttcttatgaaataatattttctaaaatataaa |
5155800 |
T |
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
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|
|||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
29943792 |
tatgattcttataaacgatgaaatgatattttttcttatgaaatgatattttttaaaatataaa |
29943855 |
T |
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ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
36430773 |
ttataaaaaatgaaatgatgttttttcttatgggataatattttctaaaatataaa |
36430718 |
T |
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aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat |
554 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||| | | ||||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
41555602 |
aatatgattcttataaccaatgaaatgatgtctattcttataaaacgatgtcttataaaatataaatattgataaataactctttatttcat |
41555511 |
T |
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Target: chr2; HSP #116
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ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
40370583 |
ataattaaatcttatttaccaaaaacgtcgacgaaataaaatttaatttttctgaatttttat |
40370645 |
T |
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ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3383354 |
ttataaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
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T |
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ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgaca |
447 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| | ||||| | || | ||||||||| ||||||||| ||| |||||| || ||||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
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ataattaaatcttattaaccaaaaacgtctacgaaataaaatttaatttttctgagtttttagtactcataatagagaattttgattattttttacaata |
11598332 |
T |
 |
| Q |
448 |
aaatg-aannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttt-tcttatgagatgatgttttctaaaatataaatat |
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Q |
| |
|
||||| || | |||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11598333 |
aaatgtaaaaaaaattagtatgatttttataaacaatgaaatgacgtttttttcttatgaaatgacattttctaaaatataaatat |
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T |
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Q |
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|
||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
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| |
|
|||||||||| | ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
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| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||| ||| ||||| |||||||||| |
|
|
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580 |
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| |
|
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|
|
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tttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
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tttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattgacaaat |
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| |
|
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|
|
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4114831 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgcgtttttcttctgaaattatattttctaaaatataaatgccgataaataactatttatttcataaaattgat |
4114733 |
T |
 |
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cattaatttatatattt |
580 |
Q |
| |
|
| ||| |||||| |||| |
|
|
| T |
4114732 |
cgttagtttatagattt |
4114716 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 330 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 6588538 - 6588426
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| Q |
330 |
ctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatat |
429 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||| | ||||||||| || ||||| | |||||| |
|
|
| T |
6588538 |
ctatcatttacaattataataataaaattttatttatcaaaaatgtcggtgaaataaaataaaatatttctaaatttttattactcataatagagaatat |
6588439 |
T |
 |
| Q |
430 |
tgattatttttta |
442 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
6588438 |
tgattatttttta |
6588426 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #126
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| Q |
380 |
gaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttt |
440 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
9220946 |
gaaataaaatttaatttttttgaatttttattactcataacgaagaatattgagtattttt |
9221006 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #127
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Query Start/End: Original strand, 472 - 528
Target Start/End: Original strand, 21985268 - 21985324
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| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
21985268 |
cttataaaaaattaaatgatgttttttcttatgaaataatattttctaaaatataaa |
21985324 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 472 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 28181452 - 28181396
Alignment:
| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
28181452 |
cttataaacaatgaaatgatatttttttttataaaatgatattttctaaaatataaa |
28181396 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 472 - 520
Target Start/End: Original strand, 44544290 - 44544338
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| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaa |
520 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
44544290 |
cttataaaaaatgaaatgatgttttttcttatgagataatattttctaa |
44544338 |
T |
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Target: chr2; HSP #130
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Query Start/End: Original strand, 463 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 38617898 - 38617832
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| Q |
463 |
aatatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaat |
529 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
38617898 |
aatatgattcgtataaacaatgaa-tgatgtgtttttcttatgaaatgatattttctaaaacataaat |
38617832 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #131
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Query Start/End: Original strand, 476 - 526
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| Q |
476 |
taaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
4673761 |
taaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
4673711 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 476 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 5389360 - 5389310
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| Q |
476 |
taaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
5389360 |
taaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
5389310 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 348 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 19636386 - 19636328
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| Q |
348 |
ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaattt |
406 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
19636386 |
ataattaaatcttatttagcaaaaatgtcgatgaaataaaatttaatttttctgaattt |
19636328 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 348 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 19834979 - 19834921
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| Q |
348 |
ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaattt |
406 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
19834979 |
ataattaaatcttatttagcaaaaatgtcgatgaaataaaatttaatttttctgaattt |
19834921 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 465 - 539
Target Start/End: Original strand, 33493708 - 33493782
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||| || |||| | |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
33493708 |
tatgattcttataaacagtaaaatgatattttttcttatgaaatattgttctataaaatataattattgacaaat |
33493782 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 315 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 34852655 - 34852517
Alignment:
| Q |
315 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaat-ttttatgaatttttatcac |
413 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||| || ||| ||| | |||| ||| ||||||||| || | |||| ||||||||| | || |
|
|
| T |
34852655 |
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34852556 |
T |
 |
| Q |
414 |
ccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatg |
452 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
34852555 |
atataacaaagaatatttattattttttatgagaaaatg |
34852517 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 476 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 38963227 - 38963177
Alignment:
| Q |
476 |
taaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
38963227 |
taaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
38963177 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 713672 - 713575
Alignment:
| Q |
311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaattttt |
408 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||||||| || ||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
713672 |
gaagaaaaagaattgttttctatcattaacaattacaataattagatcttagttatcgaaagtgtcgacgaaataaaatttacattttttgaattttt |
713575 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 494 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 4298038 - 4297993
Alignment:
| Q |
494 |
tttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4298038 |
tttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
4297993 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 472 - 580
Target Start/End: Original strand, 14947408 - 14947516
Alignment:
| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaat |
570 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||| ||||||||| ||| || || ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||| ||||| ||| | |
|
|
| T |
14947408 |
cttataaacaattaa-tgatgcgtttttcttttgaaattatattttctaaaatataaatgctgacaaataattatttatttcataaaattgatcgttagt |
14947506 |
T |
 |
| Q |
571 |
ttatatattt |
580 |
Q |
| |
|
||||| |||| |
|
|
| T |
14947507 |
ttataaattt |
14947516 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 465 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 18998887 - 18998811
Alignment:
| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt--cttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| |||| | |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18998887 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttttcttataaaatgttgttctataaattataaatattgacaaat |
18998811 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 34177533 - 34177469
Alignment:
| Q |
463 |
aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
34177533 |
aatatgatttttataaa-aataaaatgatgttttttattatgaaatgatattttctaaaatataaa |
34177469 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 292; Significance: 1e-163; HSPs: 174)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 227 - 635
Target Start/End: Original strand, 36569647 - 36570055
Alignment:
| Q |
227 |
aggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattat |
326 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
36569647 |
aggcaaattatatggtacacccaataaatttgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattat |
36569746 |
T |
 |
| Q |
327 |
tttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaa |
426 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
36569747 |
tttctatcattgacaactaagataattaaattttatataccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaa |
36569846 |
T |
 |
| Q |
427 |
tattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36569847 |
tattgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatgatttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
36569946 |
T |
 |
| Q |
527 |
aatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcata |
626 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
36569947 |
aatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatctttaatttatatattttgtgaaacaagagtactggtacactcaaaattgtgagtgtaccata |
36570046 |
T |
 |
| Q |
627 |
gaagttccc |
635 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
36570047 |
gaagttccc |
36570055 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 228 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 42244944 - 42244537
Alignment:
| Q |
228 |
ggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattatt |
327 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42244944 |
ggcaaattctatggtacacccaataaatttggatgtatcggtacatcaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattatt |
42244845 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaat |
427 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
42244844 |
ttctatcattgacaactaagagaattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaat |
42244745 |
T |
 |
| Q |
428 |
attgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataa |
527 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
42244744 |
attgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatgatttttcttatgaaatgatgttttataaaatataa |
42244645 |
T |
 |
| Q |
528 |
atattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatag |
627 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
42244644 |
atattgacaaatatctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtaaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtaccatag |
42244545 |
T |
 |
| Q |
628 |
aagttccc |
635 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
42244544 |
aagttccc |
42244537 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 227 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 10779399 - 10778990
Alignment:
| Q |
227 |
aggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattat |
326 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| | | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
10779399 |
aggcaaattctatggtatatccaataaatttgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattat |
10779300 |
T |
 |
| Q |
327 |
tttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaa |
426 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
10779299 |
tttctatcattgacaactaagataattaaattttatataccaaaagtttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaa |
10779200 |
T |
 |
| Q |
427 |
tattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
10779199 |
tattgattattttttatgacaaaatgtaaattttgtaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttacgaaatgatattttctaaaatata |
10779100 |
T |
 |
| Q |
527 |
aatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcata |
626 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
10779099 |
aatattgacaaatatctttttatttcattaaagtgatctttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtaccata |
10779000 |
T |
 |
| Q |
627 |
gaagttccct |
636 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
10778999 |
gaagttccct |
10778990 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 226 - 635
Target Start/End: Original strand, 33612521 - 33612930
Alignment:
| Q |
226 |
aaggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataatta |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
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|
| T |
33612521 |
aaggcaaattctatggtacacccaatgaatttgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaattagttgtttttttgaagaaaaataatta |
33612620 |
T |
 |
| Q |
326 |
ttttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatga |
425 |
Q |
| |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 226 - 635
Target Start/End: Original strand, 44998409 - 44998817
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 226 - 634
Target Start/End: Original strand, 21514987 - 21515395
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 228 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 48550073 - 48549662
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 226 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 46631055 - 46630643
Alignment:
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 228 - 633
Target Start/End: Original strand, 24291978 - 24292383
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 227 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 16004941 - 16004533
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 231 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 23639639 - 23639233
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 226 - 636
Target Start/End: Original strand, 27967507 - 27967918
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T |
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425 |
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524 |
Q |
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| T |
27967707 |
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T |
 |
| Q |
525 |
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Q |
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| T |
27967807 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 261 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 38955416 - 38955041
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Q |
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T |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 226 - 635
Target Start/End: Original strand, 54499573 - 54499981
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 227 - 632
Target Start/End: Original strand, 45629107 - 45629513
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326 |
Q |
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T |
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Target: chr4; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 228 - 636
Target Start/End: Original strand, 2526171 - 2526579
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| T |
2526570 |
gaagttccct |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 226 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 46222403 - 46221993
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Q |
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46222004 |
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Target: chr4; HSP #18
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Query Start/End: Original strand, 226 - 635
Target Start/End: Original strand, 52257130 - 52257539
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Q |
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425 |
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52257530 |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #19
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Target Start/End: Complemental strand, 46634009 - 46633623
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 226 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 42680999 - 42680619
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Q |
| |
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| T |
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42680900 |
T |
 |
| Q |
326 |
ttttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatga |
425 |
Q |
| |
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T |
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| Q |
426 |
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525 |
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| T |
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T |
 |
| Q |
526 |
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614 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 230 - 632
Target Start/End: Original strand, 27635741 - 27636144
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Q |
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 |
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429 |
Q |
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 |
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528 |
Q |
| |
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tgattattttgtatgacaaaatgtaaatttttttaatataatctttataaacaatgaaatcatgttttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaa |
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T |
 |
| Q |
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tattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcataga |
628 |
Q |
| |
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| T |
27636041 |
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| T |
27636141 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 636 - 897
Target Start/End: Complemental strand, 53215695 - 53215443
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T |
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agacggaataaacgtccaagaggatattctcggtgaaattctcttccgtcccaccccatgtctct |
897 |
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53215507 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
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Target Start/End: Complemental strand, 55130085 - 55129772
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417 |
Q |
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T |
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418 |
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517 |
Q |
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T |
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617 |
Q |
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55129787 |
T |
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618 |
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Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 312 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 42080650 - 42080330
Alignment:
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Q |
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42080551 |
T |
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| Q |
412 |
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511 |
Q |
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| T |
42080550 |
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42080451 |
T |
 |
| Q |
512 |
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611 |
Q |
| |
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| T |
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42080351 |
T |
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| Q |
612 |
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632 |
Q |
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42080350 |
tctaaatgtatcgtagaagtt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 228 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 54505973 - 54505604
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Q |
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T |
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| Q |
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426 |
Q |
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54505784 |
T |
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| Q |
427 |
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Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
526 |
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605 |
Q |
| |
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| T |
54505683 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 228 - 621
Target Start/End: Original strand, 56016796 - 56017179
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327 |
Q |
| |
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| T |
56016796 |
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56016895 |
T |
 |
| Q |
328 |
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427 |
Q |
| |
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|
| T |
56016896 |
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T |
 |
| Q |
428 |
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526 |
Q |
| |
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| T |
56016996 |
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56017093 |
T |
 |
| Q |
527 |
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621 |
Q |
| |
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|
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56017094 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 53216012 - 53215865
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53216012 |
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53215913 |
T |
 |
| Q |
118 |
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165 |
Q |
| |
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| T |
53215912 |
gtccttaaacaatgtcttgaagtatccgttagcattttccttattttg |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 311 - 554
Target Start/End: Original strand, 52940564 - 52940807
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| Q |
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410 |
Q |
| |
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| T |
52940564 |
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52940663 |
T |
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| Q |
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510 |
Q |
| |
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|| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |
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| T |
52940664 |
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T |
 |
| Q |
511 |
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Q |
| |
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| T |
52940764 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 224 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 38961374 - 38961027
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Q |
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|
| T |
38961374 |
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T |
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| Q |
323 |
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422 |
Q |
| |
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| T |
38961275 |
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38961176 |
T |
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| Q |
423 |
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522 |
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| |
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| T |
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T |
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523 |
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573 |
Q |
| |
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|
|
| T |
38961076 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 25684414 - 25684147
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Q |
| |
|
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|
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T |
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Q |
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|
| T |
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T |
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| Q |
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580 |
Q |
| |
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|
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 6882853 - 6882585
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|
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|
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T |
 |
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| |
|
||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| | |
|
|
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T |
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580 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Original strand, 48207164 - 48207430
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | |
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|
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T |
 |
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cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatg--gtttttcttatgagatgatg |
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Q |
| |
|
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T |
 |
| Q |
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580 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||| |||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
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cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgt |
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Q |
| |
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||||| | ||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |
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T |
 |
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tttctaaaatataaatattgacaa |
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Q |
| |
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|||| ||||||||||||||||||| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
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| |
|
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|
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 |
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cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatg--gtttttcttatgagatgatg |
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| |
|
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cataatgaagaatattgaatattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatttaattcatataaacaatgaaatgatgttttttttctcctgagatggtg |
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 |
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ttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattt |
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| |
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|||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||| |||| |||||||||||||||| |||| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #35
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315 |
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52324061 |
T |
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Target: chr4; HSP #36
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Target Start/End: Complemental strand, 1792147 - 1791881
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315 |
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414 |
Q |
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1791881 |
T |
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Target: chr4; HSP #37
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Target Start/End: Complemental strand, 18052244 - 18052036
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425 |
Q |
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18052044 |
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T |
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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 318 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 5474327 - 5474059
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417 |
Q |
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5474059 |
T |
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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 311 - 604
Target Start/End: Original strand, 32570450 - 32570742
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409 |
Q |
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32570742 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 312 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 39380722 - 39380436
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411 |
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604 |
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T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 311 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 45063559 - 45063292
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410 |
Q |
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580 |
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T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #42
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Query Start/End: Original strand, 311 - 539
Target Start/End: Original strand, 8749412 - 8749639
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410 |
Q |
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8749412 |
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8749610 |
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8749639 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 228 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 24566771 - 24566399
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326 |
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24566475 |
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604 |
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24566399 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 311 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 39412493 - 39412224
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410 |
Q |
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| T |
39412493 |
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39412395 |
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508 |
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| T |
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39412295 |
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580 |
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| T |
39412294 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 315 - 595
Target Start/End: Original strand, 52415059 - 52415338
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414 |
Q |
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415 |
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510 |
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| T |
52415159 |
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52415255 |
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511 |
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595 |
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| T |
52415256 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 315 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 30168418 - 30168193
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T |
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415 |
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512 |
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| T |
30168319 |
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30168220 |
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513 |
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539 |
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| T |
30168219 |
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30168193 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 315 - 421
Target Start/End: Original strand, 45754468 - 45754574
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| T |
45754468 |
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45754567 |
T |
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415 |
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421 |
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| T |
45754568 |
cataaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 315 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 13548723 - 13548397
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13548723 |
aaaaaaaattattttctatcatcgacaattataataattaaatcttatttatctaaagcatggacgaaataaaa-ttaatttttcaaattttttattact |
13548625 |
T |
 |
| Q |
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514 |
Q |
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T |
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Target: chr4; HSP #50
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423 |
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Target: chr4; HSP #51
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Target Start/End: Original strand, 3690596 - 3690823
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T |
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Target: chr4; HSP #52
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Target Start/End: Original strand, 21424227 - 21424515
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410 |
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Target: chr4; HSP #53
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Target Start/End: Complemental strand, 34584505 - 34584179
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Target: chr4; HSP #54
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T |
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Q |
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| T |
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410 |
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Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 465 - 539
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Q |
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Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
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Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 311 - 554
Target Start/End: Original strand, 19595014 - 19595258
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554 |
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| T |
19595214 |
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Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
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Target Start/End: Complemental strand, 27950578 - 27950256
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aagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatc |
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Q |
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510 |
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| T |
27950480 |
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| T |
27950380 |
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637 |
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Target: chr4; HSP #61
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| |
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Q |
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| T |
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tataaatttt-tgaagtaagagtaccggtacac |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
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gaagaaaaagaattgttttctatcattaacaattacaataattagatcttagttaccgaaagtgtcgacgaaataaaatttacattttttgaatttttgt |
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| T |
19526907 |
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19527006 |
T |
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554 |
Q |
| |
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|
|
| T |
19527007 |
tgtcttataaaatataaatatggataaataactctttatttcat |
19527050 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #63
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Target Start/End: Complemental strand, 36631205 - 36631094
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563 |
Q |
| |
|
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36631205 |
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36631106 |
T |
 |
| Q |
564 |
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575 |
Q |
| |
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| |||||||||| |
|
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| T |
36631105 |
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36631094 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Original strand, 48262648 - 48262913
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| Q |
315 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaa-tttttatgaatttttatcac |
413 |
Q |
| |
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||||| ||| ||||||||||||||| || || ||| |||||| |||||| ||||||| ||||| || | ||| || | ||||| ||||||||||| || |
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|
| T |
48262648 |
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48262747 |
T |
 |
| Q |
414 |
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512 |
Q |
| |
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||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| | |||||||| ||||| ||||||| |||||| |
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| T |
48262748 |
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48262847 |
T |
 |
| Q |
513 |
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580 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
48262848 |
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48262913 |
T |
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Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
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Target Start/End: Original strand, 16601859 - 16601932
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aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgaca |
536 |
Q |
| |
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|||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |
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| T |
16601859 |
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16601932 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 395 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 43349305 - 43349098
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494 |
Q |
| |
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|||| ||||||||| | || ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |
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43349206 |
T |
 |
| Q |
495 |
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594 |
Q |
| |
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| ||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| | ||| |||| ||||| || || |||| || |||| |
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| T |
43349205 |
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43349108 |
T |
 |
| Q |
595 |
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604 |
Q |
| |
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|||||||||| |
|
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| T |
43349107 |
accggtacac |
43349098 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 472 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 43959156 - 43959025
Alignment:
| Q |
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570 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||| |
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|
| T |
43959156 |
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43959058 |
T |
 |
| Q |
571 |
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604 |
Q |
| |
|
||||| |||| | ||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
43959057 |
ttatagatttag-gaagtaagagtaccggtacac |
43959025 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 472 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 5970862 - 5970731
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| Q |
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570 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
571 |
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603 |
Q |
| |
|
||||| | || |||| |||||||||||||||| |
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| T |
5970762 |
ttata-aaattatgaagcaagagtaccggtaca |
5970731 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #69
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Query Start/End: Original strand, 472 - 539
Target Start/End: Original strand, 423396 - 423463
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| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
423396 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgagatgatgttctataaaatataaattttgacaaat |
423463 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 465 - 575
Target Start/End: Original strand, 38008390 - 38008501
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat-taaagtgat |
563 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||| |
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| T |
38008390 |
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38008489 |
T |
 |
| Q |
564 |
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575 |
Q |
| |
|
| |||||||||| |
|
|
| T |
38008490 |
cgttaatttata |
38008501 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 311 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 39103862 - 39103632
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408 |
Q |
| |
|
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| T |
39103862 |
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39103763 |
T |
 |
| Q |
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508 |
Q |
| |
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| || ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | || |
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| T |
39103762 |
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39103663 |
T |
 |
| Q |
509 |
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Q |
| |
|
||||| || ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
39103662 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 311 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 39953907 - 39953665
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| Q |
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||||| |||||| |||| || ||||||| || ||| ||| | |||| |||| ||||||||| ||| |||| ||||||||| | |
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|
| T |
39953907 |
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39953809 |
T |
 |
| Q |
411 |
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510 |
Q |
| |
|
|| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||| | |||| |
|
|
| T |
39953808 |
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39953709 |
T |
 |
| Q |
511 |
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554 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
39953708 |
tgtcttataaaatataaatattgataaataactctttatttcat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 472 - 539
Target Start/End: Original strand, 56303081 - 56303148
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| Q |
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
56303081 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
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aaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataat-aaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagata |
350 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
16601633 |
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16601732 |
T |
 |
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450 |
Q |
| |
|
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|
| T |
16601733 |
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16601829 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 465 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 27761570 - 27761496
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27761570 |
tatgattcttataaacaatgaaataatgttttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattgacaaat |
27761496 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 465 - 575
Target Start/End: Original strand, 43363565 - 43363675
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatc |
564 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||| || |||||||||| ||| ||||| |
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|
| T |
43363565 |
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43363664 |
T |
 |
| Q |
565 |
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575 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
43363665 |
gttaatttata |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 416 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 53973674 - 53973536
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ataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttt |
515 |
Q |
| |
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53973674 |
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53973575 |
T |
 |
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516 |
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554 |
Q |
| |
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| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |
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|
| T |
53973574 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #78
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Query Start/End: Original strand, 395 - 604
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ttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggt |
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Q |
| |
|
|||| ||||||||| | || ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |
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| T |
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31296670 |
T |
 |
| Q |
495 |
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594 |
Q |
| |
|
| |||| || | ||||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| | |||||||| || || | | |||||| || |||| |
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| T |
31296669 |
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31296572 |
T |
 |
| Q |
595 |
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604 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
31296571 |
accggtacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #79
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Query Start/End: Original strand, 315 - 554
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315 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaat-ttttatgaatttttatcac |
413 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||| |||| || ||||||| || ||| ||| | |||| |||| ||||||||| || | |||| ||||||||| | || |
|
|
| T |
31975636 |
aaaaaaaattgttttctatcattaacaattacaataattagatcttagttaccgaaagtgtcgacgaaataaaattttacattttttgaatttttgttac |
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T |
 |
| Q |
414 |
ccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgt |
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Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| | ||||||| |
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|
| T |
31975736 |
atataacaaagaatatttattattttttatgagaaaatgttataaatttaatatgattcttataaacaatgaaattgtgtttattcttataaaatgatgt |
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T |
 |
| Q |
514 |
tttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat |
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Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
31975836 |
cttataaaatataaatattgataaataactctttatttcat |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #80
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Query Start/End: Original strand, 465 - 539
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #81
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Query Start/End: Original strand, 465 - 539
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #82
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Query Start/End: Original strand, 416 - 554
Target Start/End: Original strand, 12756191 - 12756329
Alignment:
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416 |
ataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttt |
515 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | | ||||| | |
|
|
| T |
12756191 |
ataacaaagaatatttattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaatgatgtttattcttataaaacgatgtct |
12756290 |
T |
 |
| Q |
516 |
tctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat |
554 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
12756291 |
tataaaatataaatattgataaataactctttatttcat |
12756329 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 350 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 24980226 - 24980037
Alignment:
| Q |
350 |
aattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaa |
449 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
24980226 |
aattaaatcttattcatcaaaagtgtcaacgaaataaaa-ttattttttttgaatttttatcactcataattgagaacattgattattttttacgataat |
24980128 |
T |
 |
| Q |
450 |
atg-aannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
||| || | ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24980127 |
atgtaaaaataattactataattcttataaacaatgaaatgatgttttttctaataaaatgatgttctataaaatataaatattgacaaat |
24980037 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 465 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 27990706 - 27990632
Alignment:
| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27990706 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttatataaaatataaatattgacaaat |
27990632 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 416 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 34927320 - 34927182
Alignment:
| Q |
416 |
ataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttt |
515 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| | |
|
|
| T |
34927320 |
ataacaaagaatatttattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaatgatatttattcttataaaatgatgtct |
34927221 |
T |
 |
| Q |
516 |
tctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat |
554 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
34927220 |
tataaaatataaatattgataaataactctttatttcat |
34927182 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 42177664 - 42177401
Alignment:
| Q |
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||| | | || |||| ||||| ||||| |||||||| | | ||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
42177664 |
gaagaaaaata-ttattttctatcatttatatttataataactaaatattattcatcaaaagtgttaacgaaataaaa-ttaatttttttgaatttttaa |
42177567 |
T |
 |
| Q |
411 |
cacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatga |
510 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||||||||||| ||||| || || ||| | | |||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
42177566 |
cactaataattgagaatattgattatattttaggataatatgtaaaaaaattactatgattcttataaacaacgaactgatgttttttcttatgaaatga |
42177467 |
T |
 |
| Q |
511 |
tgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat-taaagtgatcattaatttata |
575 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
42177466 |
tgttctataaaatataaatattgataaatagttatttatttcataaaaaatgatcgttaatttata |
42177401 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 466 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 50498496 - 50498423
Alignment:
| Q |
466 |
atgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || | |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
50498496 |
atgattcttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaatgatattctataaaatataaatgttgacaaat |
50498423 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 322 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 6807305 - 6807041
Alignment:
| Q |
322 |
attattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataaca |
421 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
6807305 |
attatttttcatcatcgacaattataataattaaatcttatttaccaaaagcgtcgatgaaataaaatttactcttt-tgaatttttattgctcataatg |
6807207 |
T |
 |
| Q |
422 |
atgaatattgatta---ttttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt-----cttatgagatgatgt |
513 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||| |
|
|
| T |
6807206 |
aagaatattgattatatttttttttgagaaaatgttaaaaatttaatataattcttataaacaatgaaattatgttttttttttcctcatgagatggtgt |
6807107 |
T |
 |
| Q |
514 |
tttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattt |
580 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||| |||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
6807106 |
tttctaaaatataaacattgacaaataactacttatttca-taaaatgattgttaatttataaattt |
6807041 |
T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 44957242 - 44956998
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| Q |
311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatt-tttatgaattttta |
409 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||||||| || ||| ||| | |||| || | ||||||||| || || ||| ||||||||| |
|
|
| T |
44957242 |
gaagaaaaagaattgttttctatcattaacaattacaataattagatcttagttaccgaaagtgtcaacgaaataaaattttataatttttgaatttttg |
44957143 |
T |
 |
| Q |
410 |
tcacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatg |
509 |
Q |
| |
|
| || ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||||| | || |
|
|
| T |
44957142 |
ttacatataacaaagaatatttattattttttatgagaaaatgttaacaatttaatatgattcttaaaaataatgaaatgatgtttattcttataaaata |
44957043 |
T |
 |
| Q |
510 |
atgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat |
554 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
44957042 |
atgtcttataaaatataaatattgataaataactctttatttcat |
44956998 |
T |
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Target: chr4; HSP #90
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Target Start/End: Original strand, 46663563 - 46663701
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| Q |
465 |
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563 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| || || || |||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
46663563 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgcgtttttcttcggaaatcatattttttaaaatataaatgccgacaaataactatttatttcataaaattgat |
46663661 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46663662 |
cattaatttataga-tttatgaagcaagagtaccggtacac |
46663701 |
T |
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Target: chr4; HSP #91
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| Q |
183 |
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227 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53215731 |
agtggcgaacgagaactactaatgttgtgtggttgtttacaaaaa |
53215687 |
T |
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Target: chr4; HSP #92
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| Q |
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aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat |
554 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| ||| |||| ||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
15033659 |
aatatgattcttataaataataaaattatgttttttcttataaaatgatgttttataaaatataaatattgataaataactctttatttcat |
15033750 |
T |
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Target: chr4; HSP #93
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| Q |
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
33491324 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaataatgttctataaaatataaatattgaaaaat |
33491257 |
T |
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Target: chr4; HSP #94
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| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
48647182 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcatatgaaatgatgttctataaaatataaatgttgacaaat |
48647115 |
T |
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| Q |
473 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaattt |
572 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||| |||| || ||| || ||| ||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
56104563 |
ttataaataatgaaatgatgttttttcttacgaaatgatgttctataaaatataaatattgaaaaatatctatttcttacatgaaaatgatcgttaattt |
56104464 |
T |
 |
| Q |
573 |
atatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
||| | || |||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
56104463 |
ata-aaattatgaaacgagagtatcggtacac |
56104433 |
T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
3763349 |
tatgattcttataaacaatgaactgatgttttttcttacgaaatgatgttctataaaatataaatattgataaat |
3763423 |
T |
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8256678 |
tatgattcttataaacaattaaatgatattttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
8256752 |
T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tatgattcttataaacaattaaatgatattttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
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T |
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tttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagag |
593 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | || |||||||||| ||||| |||| ||||| |
|
|
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tttttcttataaaatgatattttctaaaatataaatatcaacaaatagctttttatttcataaaaataatagttaatttataaatttt-tgaagtaagag |
9858613 |
T |
 |
| Q |
594 |
taccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
9858614 |
taccggtacac |
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T |
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ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
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|
|||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
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23058927 |
ttataaacaatgaaatgatgttttttcttacgaaatgatgttctataaaatataaatattgaaaaat |
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T |
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297 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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aaattctatggtacatccaataaatttgagtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaat |
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539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
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T |
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aatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt---cttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaag |
559 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| | |||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
25607863 |
aatatgattcttataaatattgaaatgaagttttttttccttatgaaatgatgttttctaaaatat-aatattgacaaatacctatttatttca-taaaa |
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T |
 |
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tgatcattaatttatatattt |
580 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||| |||| |
|
|
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taatcgttaatttataaattt |
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Target: chr4; HSP #104
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Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
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T |
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Q |
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29364418 |
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T |
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Q |
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32289066 |
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T |
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Q |
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|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||| |
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T |
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Q |
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|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| |||| |
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tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgataaat |
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T |
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447 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| | ||||| | |||| |||||||| ||||||||| ||| |||||| || ||||| | |||| |||||||||||||| || | |
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|
| T |
46216060 |
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46215961 |
T |
 |
| Q |
448 |
aaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt--cttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgccttt |
545 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||| | |||| |||| |||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
46215960 |
aaatgtaaaaaaattaatatgatttttataaacaatgaaatgacgtttttttccttataaaatgacattttttaaaatataaatatcaacaaatagcttt |
46215861 |
T |
 |
| Q |
546 |
ttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttccc |
635 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||| | || |||||||| | ||||| |||| | |||||||||||||| || ||| ||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
46215860 |
ttattccataaaaataatagttaatttaaagatttt-tgaagtaggagtaccggtacacattaatttgcgagtgtaccgtagaagttccc |
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T |
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539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||| ||||| |
|
|
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50733094 |
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50733168 |
T |
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539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
54506041 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattggcaaat |
54505967 |
T |
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ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatg-aatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgac |
446 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| | || | ||||||||| ||||||||| | ||||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
32737477 |
ataattaaattttatttaccaaaaacatcaacgaaataaaatttaattttttcgaaatttttattactcataatagagaatattgattagtttttacgat |
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T |
 |
| Q |
447 |
aaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttcta-aaatataaatattgacaaatgccttt |
545 |
Q |
| |
|
|||||| | | |||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||| || | |
|
|
| T |
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aaaatgta-aaaatttagtatgattcttacaaacaatgaaattatgttttttcttgtgaaatgatattttctacaaaaataaatgttgacaaatatctat |
32737279 |
T |
 |
| Q |
546 |
ttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
||||| || ||| | || |||||||||| | ||| |||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
32737278 |
ttattgcaaaaaaataattcttaatttatagaatttaagaaacaggagtactggtacac |
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T |
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Q |
| |
|
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|
| T |
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33491672 |
T |
 |
| Q |
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605 |
Q |
| |
|
| ||| |||||| | ||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33491671 |
cgttagtttataga-tttatgaagcaagagtaccggtacact |
33491631 |
T |
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatatt |
532 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |
|
|
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cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaataatgttctataaaatataaatatt |
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T |
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563 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
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42881209 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgtgtttttcttatgagaagatattttctaaaatataaatgccgataaataactatttatttcataaaattgat |
42881111 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttatatattt |
580 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| |
|
|
| T |
42881110 |
tgttaatttatagattt |
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T |
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tctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaata |
428 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || | |||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||| | || || |
|
|
| T |
22789888 |
tctatcatttacaattataaaaattaaatcttatttaccaaaagtgccgacgaaataaaatttaatttttttgaatttttattacttataatgaagatta |
22789789 |
T |
 |
| Q |
429 |
ttgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttt--ttcttatgagatgatgttttctaaa |
521 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22789788 |
ttgattattttttatga-gtaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaattatgtttttcttcttatgaaatgatgttttctaaa |
22789695 |
T |
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Q |
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|||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||| |
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|
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tatgattcttataaacaatgaaatgatgttttttcttacgaaatgatattctataaaatataaatatt |
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T |
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570 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| | |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
54178664 |
tataaacaatgaaatgatgtttttttttctcatgagatggtgttttctaaaatataaataatgacaaataacaacttattt-aataaaatgatcattaat |
54178762 |
T |
 |
| Q |
571 |
ttatatattt |
580 |
Q |
| |
|
||||| |||| |
|
|
| T |
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ttataaattt |
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T |
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492 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||| || |
|
|
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attttttttaatttttagtactcataacaaagaatattgattattttt-atgagaaaatgttaaaagtttaatatgattcttaaaaacaatgaaattctg |
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T |
 |
| Q |
493 |
gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataa |
527 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
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tttttccttatgaaatgatgttttctaaaatataa |
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T |
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||||||||||| | || || ||||||| || ||| ||| | |||| |||| ||||||||| ||| |||| ||||||||| | |
|
|
| T |
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gaagaaaaagaatcgttttctatcattaataattacaataattagatcttagttaccgaaagtgtcgacgaaataaaatttacattttttgaatttttgt |
40438859 |
T |
 |
| Q |
411 |
cacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatga |
510 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||| | | || |
|
|
| T |
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tat--ataacaaagaatatttattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaacgatgtttattcttataaaacga |
40438761 |
T |
 |
| Q |
511 |
tgttttctaaaatataaatatt |
532 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||| |
|
|
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tgtcttataaaatataaatatt |
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Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
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T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
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Q |
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|||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
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ttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaatgacatttcctaaaatataaatat |
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T |
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384 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
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337457 |
gaagaaaaagaattattttctatcattcacaattataataatcaaatcttatttaccaaaagcttcgacgaaat |
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| |
|
||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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tataaacaatgaaatgatgttttttttctcctgagatggtgttttctaaaatataaataatgacaaataacaacttatctca-taaaatgatcattaatt |
17281837 |
T |
 |
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tatatattt |
580 |
Q |
| |
|
|||| |||| |
|
|
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tataaattt |
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Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| |
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|
| T |
30348333 |
tatgattcttataaacaatgaactgatgttttttgttatgaaatgttgttctataaaatataaatattga |
30348264 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 472 - 528
Target Start/End: Original strand, 16917468 - 16917524
Alignment:
| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
16917468 |
cttataaaaaaggaaatgatgttttttcttatgagataatattttctaaaatataaa |
16917524 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #129
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Query Start/End: Original strand, 472 - 528
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Alignment:
| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
17616569 |
cttataaaaaatgaaatgatgttttttcttatgggataatattttctaaaatataaa |
17616513 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #130
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tctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaata |
428 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || | |||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| | || || |
|
|
| T |
21722274 |
tctatcatttacaattataaaaattaaatcttatttactaaaagtgtcgacgaaataaaatttaattttt-tgaatttttattactcataatgaagatta |
21722372 |
T |
 |
| Q |
429 |
ttgattattttttatga |
445 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21722373 |
ttgattattttttatga |
21722389 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #131
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Query Start/End: Original strand, 479 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 28835944 - 28835884
Alignment:
| Q |
479 |
acaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28835944 |
acaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
28835884 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #132
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Target Start/End: Complemental strand, 30060699 - 30060561
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgat |
563 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
30060699 |
tatgattcttataaacaatgaac-gatgagtttttcttctgaaatcatattttctaaaatataaatgccgacaaataactatttatttcataaaattgat |
30060601 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
| ||| |||||| | ||| |||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
30060600 |
cgttagtttataga-tttatgaagcaagagtatcggtacac |
30060561 |
T |
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Target: chr4; HSP #133
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Target Start/End: Original strand, 36188138 - 36188194
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| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
36188138 |
cttataaaaaatgaaatgatgttttttcttatgggataatattttctaaaatataaa |
36188194 |
T |
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Target: chr4; HSP #134
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Query Start/End: Original strand, 472 - 528
Target Start/End: Original strand, 45953896 - 45953952
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| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
45953896 |
cttataaaaaatgaaatgatgttttttcttatgggataatattttctaaaatataaa |
45953952 |
T |
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Target: chr4; HSP #135
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| Q |
315 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaattt |
406 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| || |||||||| ||||| |||| || |||||| ||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
19627686 |
aaaaataattattttctatcattaacaattataataattagatcttatttatgaaaagtgtcgacgacataaaaattactttttttgaattt |
19627777 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #136
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Query Start/End: Original strand, 463 - 574
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| Q |
463 |
aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtga |
562 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||| |||||||| || |||||||| ||| || || |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||| | | |
|
|
| T |
48018364 |
aatatgattcatataaataatgaaattatattttttcttctgaaattatattttctaaaatataaaaatcaacaaatagttttttatttcataaaaataa |
48018463 |
T |
 |
| Q |
563 |
tcattaatttat |
574 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
48018464 |
tcattaatttat |
48018475 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 463 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 49286859 - 49286768
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| Q |
463 |
aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat |
554 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||| | ||||||| || ||||| ||||||||| | |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
49286859 |
aatatgattcttataaataatgaaatgatgtttattcttataaaatgatgtcttataaaacataaatattaataaataactctttatttcat |
49286768 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 473 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 53695547 - 53695417
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| Q |
473 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaattt |
572 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||| ||| | || ||||||| |
|
|
| T |
53695547 |
ttataaacaatgaaatgacgttttttcttatgaaataacattttctaaaatataaatatcaacaaataactctttattccataaaaataatagttaattt |
53695448 |
T |
 |
| Q |
573 |
atatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
| | ||||| |||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
53695447 |
aaagatttt-tgaattaggagtaccggtacac |
53695417 |
T |
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Target: chr4; HSP #139
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Query Start/End: Original strand, 465 - 528
Target Start/End: Original strand, 56272815 - 56272878
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
56272815 |
tatgattcttataaataatgaaatgatattttttcttatgaaataatattttctaaaatataaa |
56272878 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
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| Q |
348 |
ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattatttt |
439 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
56361601 |
ataattaaatattatttaccaaaaacgtcgacgaaataaaatttaatttttctgaatttttagtactcataatagagaattttgattatttt |
56361510 |
T |
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Target: chr4; HSP #141
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||| | || |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
583006 |
tatgattcttataaacagttaaatgatgttttttcttataaaatattgttctataaaatataaatattgacaaat |
583080 |
T |
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Target: chr4; HSP #142
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| Q |
473 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatat |
531 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
29646864 |
ttataaacaatgaaataatgttttttcttatgaaatgacattttttaaaatataaatat |
29646922 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #143
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| Q |
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgtt |
514 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31998972 |
cttataaacaatgaaatggtgttttttcttatgagatgatgtt |
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T |
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Target: chr4; HSP #144
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
34828959 |
tatgattcttataaacagtaaaatgatattttttcttatgaaatgttgttctataaaatataagtattgacaaat |
34829033 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #145
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ctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagtt |
632 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||| |
|
|
| T |
51282249 |
ctttttatttcataaaaatgatagttaatttataaatttt-tgaagtaagagtaccggtacactttaaattgtgggtgtaccgtagaagtt |
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T |
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttctt--atgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| ||||| || |||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
126812 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgtttttttttttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
126888 |
T |
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Target: chr4; HSP #147
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tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgat |
563 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| || | |||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
37748664 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgcgtttttcttctgaaatcacattttttaaaatataaatgccgacaaataactatttatttcataaaattgat |
37748762 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttatatattttgtgaaacaagagtacc |
597 |
Q |
| |
|
| ||| |||||| | ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
37748763 |
cgttagtttataga-tttatgaaacaagagtacc |
37748795 |
T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttt--tcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | |||||||| |||| |||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tatgattcttataaacagtaaaatgatgttttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
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T |
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563 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| || ||| |||| |
|
|
| T |
408300 |
tatgattcttataaacaatgaac-gatgcatttttcttctgaaatcatattttctaaaatataaattccgacaaataactatttatttaataaaattgat |
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T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
| ||| |||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
408399 |
cgttagtttataga-tttatgaagcaagagtaccggtacac |
408438 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #150
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283 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
10973008 |
aggcaaattctatggtatatccaataaatttgggtgtatcggtacaccaagtcgtaa |
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T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgat |
563 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
27736757 |
tatgattcttataaacaatgaac-gatgtgtttttcttctgaaatcatattttctaaaatataaatgccgacaaataactatttatttcataaaattgat |
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T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttatatattt |
580 |
Q |
| |
|
| ||| |||||| |||| |
|
|
| T |
27736658 |
cgttagtttatagattt |
27736642 |
T |
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aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattt |
359 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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aaaaataattattttctatcattaacaactataataattaaattt |
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Target: chr4; HSP #153
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504 |
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580 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
32882536 |
gagatggtgttttctaaaatataaataatgacaaataacaacttatttca-taaaatgatcattaatttataaattt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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348 |
ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgaca |
447 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| | ||||| | |||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||| || ||||| | ||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
47302514 |
ataattaaatcttattaaccaaaaacgtcgacgaaataaaatttaatttttctgagtttttagtactcataatagagaaatttgattattttttacaata |
47302613 |
T |
 |
| Q |
448 |
aaatg-aannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttt-tcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgccttt |
545 |
Q |
| |
|
||||| || | |||||| ||||||||||| |||||| | |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || | |
|
|
| T |
47302614 |
aaatgtaaaaaaaattagtatgatttttataaacaataaaatgacgtttttttcttatgaaatgacattttctaaaatataaatatcaacaaataactct |
47302713 |
T |
 |
| Q |
546 |
ttatttcat |
554 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
47302714 |
ttatttcat |
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T |
 |
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tttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttat |
574 |
Q |
| |
|
|||||||||| | || || ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
47920541 |
tttttcttataaaataatattttctaaaatataaatatcgacatataactttttatttcataaaaatgatctttactttat |
47920621 |
T |
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Target: chr4; HSP #156
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgat |
563 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| || || || |||| |||||||||||| || |||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
51944665 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgcgtttttcttcggaaatcatattttttaaaatataaatgccgataaataactatttatttcataaaattgat |
51944763 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttatatattt |
580 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |
|
|
| T |
51944764 |
cattaatttataaattt |
51944780 |
T |
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465 |
tatgatccttataaacaatgaaatga-tggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || || | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
9356552 |
tatgattcttataaacaatgaaatgatttttttttcttatgaaataatattctataaaatataaatattaacaaat |
9356477 |
T |
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Target: chr4; HSP #158
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508 |
tgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19627868 |
tgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
19627899 |
T |
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Target: chr4; HSP #159
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ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
39512901 |
ttataaatgatgaaatgatgttttttcttatgaaatgatattttttaaaatataaa |
39512956 |
T |
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Target: chr4; HSP #160
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Target Start/End: Complemental strand, 46564882 - 46564819
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||| ||||||||| || |||||||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
46564882 |
tatgattcttaaaaagaatgaaatggtgttttttcttatgaaataatattttctaaaatataaa |
46564819 |
T |
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Target: chr4; HSP #161
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatatt |
532 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
53936676 |
tatgattcttataaacatt-aaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatatt |
53936610 |
T |
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Target: chr4; HSP #162
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Target Start/End: Complemental strand, 595595 - 595467
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| Q |
311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||| | || || ||||||| || |||||||||||| | || ||||||||| ||| ||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
595595 |
gaagaaaaagaattgttttctatcattaataattacaataattagatcttatttatcaaag---ttgacgaaataaaatttacttttt-tgaatttttgt |
595500 |
T |
 |
| Q |
411 |
cacccataacaatgaatattgattattttttat |
443 |
Q |
| |
|
|| |||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
595499 |
tacatataataaagaatattgattattttttat |
595467 |
T |
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Target: chr4; HSP #163
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Query Start/End: Original strand, 482 - 528
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| Q |
482 |
atgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
4540709 |
atgaaatgatgttttttcttatgaaatgatattttttaaaatataaa |
4540663 |
T |
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Target: chr4; HSP #164
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Query Start/End: Original strand, 473 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 32845815 - 32845752
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| Q |
473 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaa |
538 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || | |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
32845815 |
ttataaacaatgaaatgatg--tttttttatgaaatgatattctataaaatataactattgacaaa |
32845752 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #165
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Query Start/End: Original strand, 476 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 53389005 - 53388955
Alignment:
| Q |
476 |
taaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
53389005 |
taaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
53388955 |
T |
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Target: chr4; HSP #166
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Query Start/End: Original strand, 473 - 538
Target Start/End: Original strand, 54996344 - 54996412
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| Q |
473 |
ttataaacaatgaaatgatg---gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaa |
538 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
54996344 |
ttataaacaatgaaatgatgatttttttttttatgaaatgatgttctataaaatataactattgacaaa |
54996412 |
T |
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Target: chr4; HSP #167
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| Q |
324 |
tattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaat |
423 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || || ||||||| ||||||||| ||||||| ||| || ||||| | || |||| | ||||||||| || ||||| | | |
|
|
| T |
1182685 |
tattttctatcatttataattataataattatattttatttttcaaaagtgtcggaaaagtaaaattcaaatttttttaatttttattactcataatagt |
1182784 |
T |
 |
| Q |
424 |
gaatattgattatttttt |
441 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1182785 |
gaatattgattatttttt |
1182802 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #168
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Query Start/End: Original strand, 473 - 526
Target Start/End: Original strand, 3716569 - 3716622
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| Q |
473 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3716569 |
ttataaaaaatgaaatgatattttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
3716622 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr4; HSP #169
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Query Start/End: Original strand, 463 - 528
Target Start/End: Original strand, 10332870 - 10332935
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| Q |
463 |
aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| | || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
10332870 |
aatatgattcttataaagaatgaaatgaaattttttcttataaaataatattttctaaaatataaa |
10332935 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 521
Target Start/End: Original strand, 21722426 - 21722486
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| Q |
463 |
aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttt--tcttatgagatgatgttttctaaa |
521 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
21722426 |
aatatgattattataaacaatgaaattatgtttttcttcttatgaaatgatgttttctaaa |
21722486 |
T |
 |
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Target: chr4; HSP #171
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Query Start/End: Original strand, 324 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 27735229 - 27735112
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| Q |
324 |
tattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaat |
423 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || || ||||||| ||||||||| ||||||| |||| || |||| | ||||||| | || |||||| || ||||| | | |
|
|
| T |
27735229 |
tattttctatcatttataattataataattatattttatttttcaaaagtgtcgacaaagcaaaattcaattttttttaacttttattactcataatagt |
27735130 |
T |
 |
| Q |
424 |
gaatattgattatttttt |
441 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27735129 |
gaatattgattatttttt |
27735112 |
T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #172
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Query Start/End: Original strand, 465 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 30951293 - 30951184
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatc |
564 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| | || || |||||||||||||||| |||| |||| || |||||| ||| ||| ||||| |
|
|
| T |
30951293 |
tatgattcttataaaggatgaaatgacgttttttcttataaaataatattttctaaaatataaaagttgataaatatctctttattacataaaaatgatc |
30951194 |
T |
 |
| Q |
565 |
attaatttat |
574 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
30951193 |
gataatttat |
30951184 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 481 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 41759812 - 41759767
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| Q |
481 |
aatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
41759812 |
aatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
41759767 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 348 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 46004612 - 46004551
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| Q |
348 |
ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaattttta |
409 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
46004612 |
ataattaaatcttatttatcaaaaatatcgacgaaataaaattaaatttttctgaattttta |
46004551 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 207)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 228 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 43225052 - 43224645
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| Q |
228 |
ggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattatt |
327 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43225052 |
ggcaaattctatggtacacccaataaatttgggtgtatcggtacaccaagtcataaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattatt |
43224953 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaat |
427 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
43224952 |
ttctatcattgacaactaagataattaaattttatatatcaaaagcttcgacgaaataaaaattaatttttaagaatttttattactcataacaatgaat |
43224853 |
T |
 |
| Q |
428 |
attgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataa |
527 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43224852 |
attgattattttttatgacaaaatgtaaattttgtaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataa |
43224753 |
T |
 |
| Q |
528 |
atattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatag |
627 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43224752 |
atattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatctttaatttatatattttttgaaaaaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtaccatag |
43224653 |
T |
 |
| Q |
628 |
aagttccc |
635 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
43224652 |
aagttccc |
43224645 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 226 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 3150594 - 3150184
Alignment:
| Q |
226 |
aaggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataatta |
325 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
3150594 |
aaggtaaattctatggtacatccaataaatttgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataatta |
3150495 |
T |
 |
| Q |
326 |
ttttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatga |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||| |||||| |
|
|
| T |
3150494 |
ttttctatcattgacaactaagataattaaattttatataccaaaagtttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcatatcaatga |
3150395 |
T |
 |
| Q |
426 |
atattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatat |
525 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3150394 |
atattgattattttttatgacaaaatgtaaattttgtaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatat |
3150295 |
T |
 |
| Q |
526 |
aaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcat |
625 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
3150294 |
aaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatctttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccgatacactcaaaattgtgagtgtaccat |
3150195 |
T |
 |
| Q |
626 |
agaagttccct |
636 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
3150194 |
agaagttccct |
3150184 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 228 - 637
Target Start/End: Original strand, 10061157 - 10061566
Alignment:
| Q |
228 |
ggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattatt |
327 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10061157 |
ggcaaattctatggtacattcaataaatttgggtgtatcagtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattatt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 231 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 44647649 - 44647247
Alignment:
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 226 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 9260225 - 9259816
Alignment:
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 227 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 7427068 - 7426660
Alignment:
| Q |
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Q |
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| T |
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526 |
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| T |
7426668 |
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7426660 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 218 - 637
Target Start/End: Original strand, 14190880 - 14191303
Alignment:
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Q |
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14190979 |
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417 |
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14191280 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 228 - 637
Target Start/End: Original strand, 29171165 - 29171574
Alignment:
| Q |
228 |
ggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattatt |
327 |
Q |
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| T |
29171165 |
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29171264 |
T |
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328 |
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427 |
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| T |
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527 |
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627 |
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29171565 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 225 - 629
Target Start/End: Original strand, 17376352 - 17376756
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Q |
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424 |
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17376752 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 227 - 637
Target Start/End: Original strand, 40850022 - 40850430
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Q |
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T |
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| Q |
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426 |
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| T |
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T |
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| T |
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T |
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527 |
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626 |
Q |
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| T |
40850320 |
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40850419 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 227 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 37765662 - 37765253
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Q |
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T |
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aaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcat |
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| T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 226 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 33829274 - 33828862
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Q |
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Target: chr1; HSP #13
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Query Start/End: Original strand, 226 - 637
Target Start/End: Original strand, 33838692 - 33839104
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 228 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 48868470 - 48868059
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 237 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 52274117 - 52273718
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 228 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 9223262 - 9222856
Alignment:
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 228 - 632
Target Start/End: Original strand, 27038543 - 27038947
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 228 - 621
Target Start/End: Original strand, 27801810 - 27802205
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 227 - 635
Target Start/End: Original strand, 48480849 - 48481256
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Q |
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48481048 |
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526 |
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| T |
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T |
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| T |
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48481247 |
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48481248 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 228 - 638
Target Start/End: Original strand, 5057199 - 5057609
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Q |
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| T |
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ggcaaattctatggtacacccaatgaatttaggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatcagttatttttttgaagaaaaataattatt |
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T |
 |
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328 |
ttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaat |
427 |
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| T |
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T |
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528 |
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627 |
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| T |
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5057598 |
T |
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638 |
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| T |
5057599 |
aagttccctta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 230 - 637
Target Start/End: Original strand, 39852959 - 39853368
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caaattctatagtacacccaataaatttaggtgtatcgatacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattatttt |
39853058 |
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Target: chr1; HSP #22
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Target Start/End: Original strand, 41321008 - 41321413
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T |
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Target: chr1; HSP #23
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Query Start/End: Original strand, 227 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 50502756 - 50502344
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Target: chr1; HSP #24
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Query Start/End: Original strand, 228 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 24248209 - 24247839
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Q |
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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 223 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 14131761 - 14131350
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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 251 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 31571353 - 31570972
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 331 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 49289533 - 49289227
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ttccctt |
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426 |
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Q |
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| T |
1658557 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 228 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 33234461 - 33234052
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ggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattatt |
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ggcaaattctgtagtacacccaataaatttgggtgtatcggtacaccaatttattaaattaataataaattagttgtttttttgaagaaaaataattatt |
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ttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaat |
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ttctatcattgacaactataataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttacaaatttttactactcataacaatgaat |
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attgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataa |
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attgattattttttatgataaaatgtaaactttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatattttttcttatgatatgacgttttctaaaatataa |
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atattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatag |
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Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #31
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328 |
Q |
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20280321 |
T |
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428 |
Q |
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20280322 |
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20280421 |
T |
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528 |
Q |
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| T |
20280422 |
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20280521 |
T |
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628 |
Q |
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| T |
20280522 |
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20280621 |
T |
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20280622 |
agttccc |
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T |
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Target: chr1; HSP #32
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Q |
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T |
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424 |
Q |
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T |
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524 |
Q |
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T |
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624 |
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Target: chr1; HSP #33
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Target Start/End: Original strand, 22821249 - 22821646
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T |
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| Q |
329 |
tctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaata |
428 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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528 |
Q |
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T |
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| Q |
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626 |
Q |
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T |
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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
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Q |
| |
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T |
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| Q |
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448 |
Q |
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| T |
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T |
 |
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548 |
Q |
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| T |
41550332 |
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T |
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634 |
Q |
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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 312 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 33771967 - 33771643
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| Q |
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511 |
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| T |
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| Q |
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611 |
Q |
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T |
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Q |
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Target: chr1; HSP #36
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Target Start/End: Original strand, 49739141 - 49739507
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Q |
| |
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T |
 |
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T |
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Q |
| |
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|
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Target: chr1; HSP #37
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|
|||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |
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|
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T |
 |
| Q |
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480 |
Q |
| |
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|
|
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 |
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580 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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Q |
| |
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Target: chr1; HSP #38
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 |
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gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaaga |
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Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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T |
 |
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Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |
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|
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Target: chr1; HSP #39
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ttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaat |
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Q |
| |
|
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|
|
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ttctatcattgtcaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaat |
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T |
 |
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Q |
| |
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attgatta |
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Target: chr1; HSP #40
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ctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatat |
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Q |
| |
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ctatcatttataattaagataattaaattttatatatcaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaataatttttattactcataacaatgaatat |
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T |
 |
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Q |
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||||||||||||||||||||||| |
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tgattattttttatgacaaaatg |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #41
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|
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T |
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tattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttccc |
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Q |
| |
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Target: chr1; HSP #42
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| T |
10635802 |
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408 |
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10635623 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 227 - 393
Target Start/End: Original strand, 25493497 - 25493663
Alignment:
| Q |
227 |
aggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattat |
326 |
Q |
| |
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| T |
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25493596 |
T |
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393 |
Q |
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| T |
25493597 |
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25493663 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 226 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 28095156 - 28094778
Alignment:
| Q |
226 |
aaggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataatta |
325 |
Q |
| |
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| T |
28095156 |
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28095058 |
T |
 |
| Q |
326 |
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425 |
Q |
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| T |
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T |
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T |
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625 |
Q |
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| T |
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28094788 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 314 - 580
Target Start/End: Original strand, 41568530 - 41568796
Alignment:
| Q |
314 |
gaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcac |
413 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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512 |
Q |
| |
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||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |
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| T |
41568630 |
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41568729 |
T |
 |
| Q |
513 |
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580 |
Q |
| |
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| T |
41568730 |
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41568796 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 39085034 - 39084764
Alignment:
| Q |
315 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacc |
414 |
Q |
| |
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| T |
39085034 |
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39084935 |
T |
 |
| Q |
415 |
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508 |
Q |
| |
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||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |
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| T |
39084934 |
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39084835 |
T |
 |
| Q |
509 |
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580 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |
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| T |
39084834 |
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39084764 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 514 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 47860876 - 47860753
Alignment:
| Q |
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tttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattg |
613 |
Q |
| |
|
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|
| T |
47860876 |
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47860777 |
T |
 |
| Q |
614 |
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637 |
Q |
| |
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| T |
47860776 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 314 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 35534193 - 35533927
Alignment:
| Q |
314 |
gaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcac |
413 |
Q |
| |
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| T |
35534193 |
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35534094 |
T |
 |
| Q |
414 |
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512 |
Q |
| |
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||||| || |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |
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| T |
35534093 |
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35533994 |
T |
 |
| Q |
513 |
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580 |
Q |
| |
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|
| T |
35533993 |
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35533927 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 312 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 48313631 - 48313409
Alignment:
| Q |
312 |
aagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatc |
411 |
Q |
| |
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| T |
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48313532 |
T |
 |
| Q |
412 |
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509 |
Q |
| |
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| T |
48313531 |
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48313432 |
T |
 |
| Q |
510 |
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532 |
Q |
| |
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| T |
48313431 |
atgttttctaaaatataaatatt |
48313409 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 34411271 - 34411004
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| Q |
315 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacc |
414 |
Q |
| |
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| T |
34411271 |
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34411172 |
T |
 |
| Q |
415 |
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511 |
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| |
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| T |
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34411072 |
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580 |
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|
|
| T |
34411071 |
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34411004 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 510 - 635
Target Start/End: Original strand, 8085928 - 8086052
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510 |
atgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaa |
609 |
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| |
|
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|
|
| T |
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635 |
Q |
| |
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||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
8086027 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 51873594 - 51873328
Alignment:
| Q |
315 |
aaaaataattattttctatcattgacaact---aagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatc |
411 |
Q |
| |
|
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|
| T |
51873594 |
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51873496 |
T |
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511 |
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| |
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| T |
51873495 |
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51873396 |
T |
 |
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512 |
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580 |
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| |
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|
| T |
51873395 |
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51873328 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 311 - 581
Target Start/End: Original strand, 24451821 - 24452090
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
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| T |
24451821 |
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24451920 |
T |
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| Q |
411 |
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510 |
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| |
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| T |
24451921 |
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24452020 |
T |
 |
| Q |
511 |
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581 |
Q |
| |
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| T |
24452021 |
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24452090 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
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Target Start/End: Original strand, 46872368 - 46872503
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aggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattat |
326 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
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T |
 |
| Q |
327 |
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362 |
Q |
| |
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| T |
46872468 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #55
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Query Start/End: Original strand, 224 - 603
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aaaaggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataat-aaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataa |
322 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
323 |
ttattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaa |
422 |
Q |
| |
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46918579 |
T |
 |
| Q |
423 |
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521 |
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| |
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| T |
46918580 |
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46918677 |
T |
 |
| Q |
522 |
atataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtaca |
603 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||| | | |||||||| |||| ||||| |||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||| |
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| T |
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atataaatattgacaaatagc-tcttatttca-taaaatgatcgttaatttata-aatttatgaagcaagagtaccggtaca |
46918756 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 311 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 51005114 - 51004893
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311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
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|||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||| || ||||||| |||||| |||| | ||||||| || ||||| ||||||||| | |
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| T |
51005114 |
gaagaaaaataattgttttctatcattaacaattacaataattagatcttatttaccaaaagtgtcgacggaataaaattttttttttttgaatttttgt |
51005015 |
T |
 |
| Q |
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cacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatga |
510 |
Q |
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T |
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Target: chr1; HSP #57
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Target Start/End: Original strand, 14077416 - 14077681
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T |
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Target: chr1; HSP #58
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Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Original strand, 47458611 - 47458880
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414 |
Q |
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580 |
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T |
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Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 311 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 23540274 - 23539974
Alignment:
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408 |
Q |
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23539976 |
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Target: chr1; HSP #60
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Query Start/End: Original strand, 228 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 30547171 - 30546820
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Q |
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Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 314 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 13216417 - 13216154
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413 |
Q |
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T |
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Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 40868454 - 40868188
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Q |
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T |
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Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 315 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 5360522 - 5360296
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414 |
Q |
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512 |
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5360322 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 24677872 - 24677607
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Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #65
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gaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcac |
413 |
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T |
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Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 315 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 5957578 - 5957441
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aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacc |
414 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #67
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Target Start/End: Original strand, 46282894 - 46283125
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taattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgacaa |
448 |
Q |
| |
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| T |
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449 |
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547 |
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| T |
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46283093 |
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| T |
46283094 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 317 - 580
Target Start/End: Original strand, 17202831 - 17203100
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aaataattattttctatcattgacaactaagataattaa----attttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatca |
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Q |
| |
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509 |
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| |
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| T |
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T |
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580 |
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| T |
17203031 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 315 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 50534204 - 50534077
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| |
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cataatgaagaatattgattatttttta |
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Target: chr1; HSP #70
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Query Start/End: Original strand, 311 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 39871709 - 39871490
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Q |
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39871511 |
T |
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528 |
Q |
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| T |
39871510 |
tgatgttttctaaaatataaa |
39871490 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 323 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 49982766 - 49982511
Alignment:
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422 |
Q |
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| T |
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49982669 |
T |
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| Q |
423 |
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521 |
Q |
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| T |
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49982569 |
T |
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522 |
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580 |
Q |
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| T |
49982568 |
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49982511 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 311 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 26424163 - 26423873
Alignment:
| Q |
311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
411 |
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510 |
Q |
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| T |
26424063 |
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26423965 |
T |
 |
| Q |
511 |
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604 |
Q |
| |
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| T |
26423964 |
tgttttctaaaatataaatatcgatgaataactctttatttca-taaaataattattaaattataaatttt-tgaagtaggagtaccggtacac |
26423873 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 35912952 - 35912687
Alignment:
| Q |
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413 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
414 |
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511 |
Q |
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| T |
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35912754 |
T |
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| Q |
512 |
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580 |
Q |
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| T |
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35912687 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 312 - 492
Target Start/End: Original strand, 38862265 - 38862446
Alignment:
| Q |
312 |
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410 |
Q |
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| T |
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38862364 |
T |
 |
| Q |
411 |
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492 |
Q |
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| T |
38862365 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 311 - 554
Target Start/End: Original strand, 45650090 - 45650334
Alignment:
| Q |
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409 |
Q |
| |
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| T |
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509 |
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| T |
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45650289 |
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 |
| Q |
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554 |
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| T |
45650290 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 311 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 8096921 - 8096679
Alignment:
| Q |
311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
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| T |
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| T |
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| T |
8096722 |
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8096679 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 311 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 17644708 - 17644423
Alignment:
| Q |
311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
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| T |
17644708 |
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17644613 |
T |
 |
| Q |
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508 |
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| |
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| T |
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17644514 |
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 |
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603 |
Q |
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| T |
17644513 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 311 - 554
Target Start/End: Original strand, 47209128 - 47209370
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| Q |
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410 |
Q |
| |
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| T |
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| T |
47209228 |
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 |
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554 |
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| |
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| T |
47209327 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 322 - 554
Target Start/End: Original strand, 47601749 - 47601978
Alignment:
| Q |
322 |
attattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataaca |
421 |
Q |
| |
|
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| T |
47601749 |
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47601847 |
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521 |
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| |
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| T |
47601848 |
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47601945 |
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554 |
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| T |
47601946 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 348 - 635
Target Start/End: Original strand, 7122074 - 7122361
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447 |
Q |
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|||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||| | |||| |||||||||||||| | | |
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| T |
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7122173 |
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 |
| Q |
448 |
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546 |
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| |
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| T |
7122174 |
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7122273 |
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547 |
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635 |
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| |
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|
| T |
7122274 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 311 - 539
Target Start/End: Original strand, 40054671 - 40054899
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410 |
Q |
| |
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| T |
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40054770 |
T |
 |
| Q |
411 |
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510 |
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| T |
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40054870 |
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 |
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511 |
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539 |
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40054871 |
tgtcttataaaatataaatattgataaat |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 311 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 1845395 - 1845153
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311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
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| T |
1845395 |
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1845296 |
T |
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411 |
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510 |
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| T |
1845295 |
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1845197 |
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554 |
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| T |
1845196 |
tgtcttataaaatataaatattgataaataactctttatttcat |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 555 - 638
Target Start/End: Original strand, 29207585 - 29207668
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taaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttccctta |
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Q |
| |
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| T |
29207585 |
taaagtgatcattaatttataaattttgtgcaacaagagtatcggtatactcaaaattgtggatgtatcatagaagttccctta |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 348 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 42275623 - 42275366
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447 |
Q |
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| T |
42275623 |
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T |
 |
| Q |
448 |
aaatg-aannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttt |
546 |
Q |
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| T |
42275523 |
atatgtaaaaaaaattattataattcttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaatgatgttctataaaatattaatattaacaaataactatt |
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T |
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| Q |
547 |
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604 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| ||||| |||||||||| | || |||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
42275423 |
tatttcataaaaaatgatcgttaatttata-aaattatgaagcatgagtaccggtacac |
42275366 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 311 - 451
Target Start/End: Original strand, 45318158 - 45318298
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| Q |
311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| | |||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
45318158 |
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45318257 |
T |
 |
| Q |
411 |
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451 |
Q |
| |
|
| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
45318258 |
taatcataataaagaatattgattattttttatgagaaaat |
45318298 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #86
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Query Start/End: Original strand, 465 - 575
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465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaag-tgat |
563 |
Q |
| |
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| T |
9587880 |
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9587979 |
T |
 |
| Q |
564 |
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575 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
9587980 |
cattaatttata |
9587991 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
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Target Start/End: Complemental strand, 43916669 - 43916426
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| Q |
311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
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||||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||||||| || ||| ||| | |||| |||| ||||||||| ||| |||| ||||||||| | |
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| T |
43916669 |
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43916570 |
T |
 |
| Q |
411 |
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510 |
Q |
| |
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|| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||| | || | |
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| T |
43916569 |
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43916470 |
T |
 |
| Q |
511 |
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554 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||||| || |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
43916469 |
tgtcttataaaatataaatatggataaataactctttatttcat |
43916426 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 312 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 24594184 - 24593942
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| Q |
312 |
aagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatc |
411 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||| || ||| ||| | |||| |||| |||||||| ||| |||| ||||||||| | |
|
|
| T |
24594184 |
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24594085 |
T |
 |
| Q |
412 |
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511 |
Q |
| |
|
|| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | | ||| |
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|
| T |
24594084 |
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24593985 |
T |
 |
| Q |
512 |
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554 |
Q |
| |
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|| || ||||||||||||||| | |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
24593984 |
gtcttataaaatataaatattaataaataactctttatttcat |
24593942 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 402 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 48752280 - 48752102
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| Q |
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501 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| | || ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |
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|
| T |
48752280 |
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48752181 |
T |
 |
| Q |
502 |
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580 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||| | |||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
48752180 |
atgaaatgatattttctaaaacataaatattgacaaatatttctttatttcataaaaatactcattaatatataaattt |
48752102 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 472 - 580
Target Start/End: Original strand, 48796273 - 48796381
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570 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
48796273 |
cttataaacaatgaa-tgatgtgtttttcttatgaaatgatattttctaaaatataaatgtcgacaaataactatttatttcataaaattgatcattaat |
48796371 |
T |
 |
| Q |
571 |
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580 |
Q |
| |
|
||||| |||| |
|
|
| T |
48796372 |
ttatagattt |
48796381 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 50631989 - 50631673
Alignment:
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336 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||| |
|
|
| T |
50631989 |
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50631891 |
T |
 |
| Q |
337 |
tgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattat |
436 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || | |||| | ||||||||| || |||| || ||||||||||||| |
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|
| T |
50631890 |
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50631792 |
T |
 |
| Q |
437 |
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535 |
Q |
| |
|
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|
| T |
50631791 |
tttttatgataaaatgttaaaaatttaataagattcttataacgaatgaaataatatttttttcttatgaaatgaagttttctaaaatataattaatgac |
50631692 |
T |
 |
| Q |
536 |
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554 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| |
|
|
| T |
50631691 |
ggatagctttttatttcat |
50631673 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 465 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 24245651 - 24245536
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| Q |
465 |
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563 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| || ||| |||| |
|
|
| T |
24245651 |
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24245553 |
T |
 |
| Q |
564 |
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580 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |
|
|
| T |
24245552 |
cattaatttatagattt |
24245536 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 465 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 6329418 - 6329307
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat-taaagtgat |
563 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||| |||| |
|
|
| T |
6329418 |
tatgattcttataaacaataaaatgatgttttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattgacaaatagctatttattacataaaaaatgat |
6329319 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttata |
575 |
Q |
| |
|
| |||||||||| |
|
|
| T |
6329318 |
cgttaatttata |
6329307 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 311 - 529
Target Start/End: Original strand, 12222559 - 12222774
Alignment:
| Q |
311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| || ||||||| || | |||||||| ||||||| ||||||| | |||||||| ||| || ||||| ||| ||||| | |
|
|
| T |
12222559 |
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12222656 |
T |
 |
| Q |
411 |
cacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatga |
510 |
Q |
| |
|
|| |||||| | |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||| | |||| |
|
|
| T |
12222657 |
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12222755 |
T |
 |
| Q |
511 |
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529 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
12222756 |
tgttttctaaaatgtaaat |
12222774 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 231 - 554
Target Start/End: Original strand, 12837774 - 12838096
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aaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataat-aaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattatttt |
329 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||| | || ||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
12837774 |
aaattctatggtacac-taaaaaatttgagtgtatcggtccaccaatttgttaaaataataattaaatgagttgattttt-gaagaaaaagaattatttt |
12837871 |
T |
 |
| Q |
330 |
ctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatat |
429 |
Q |
| |
|
| | ||| | || || | |||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| | || | || |||||| |
|
|
| T |
12837872 |
ttctaattaaaaattatcaaaattaaatcttatttaccaaaagcgtcgacaaaataaaaattaatttttttgaatttttattcctgatgataaagaatat |
12837971 |
T |
 |
| Q |
430 |
tgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||| |||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
12837972 |
tgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgatttttataaacaatgaaatgatgtttttttattataaaatggtgttct-taaaatataaa |
12838070 |
T |
 |
| Q |
529 |
tattgacaaatgcctttttatttcat |
554 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12838071 |
cattgataaatcgctttttatttcat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #96
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Query Start/End: Original strand, 472 - 539
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
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24230665 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 402 - 580
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500 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| | |||||| | |
|
|
| T |
32912443 |
aatttttattactcataagaaagaatattgattattttttattaaaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaataatgaaatgacgttttttcct |
32912344 |
T |
 |
| Q |
501 |
tatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattt |
580 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
32912343 |
tatgaaatgatgttttctaaaatat-aatgttgacaaatagctatttatttc-ttaaaatgatcgttaatttataaattt |
32912266 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 472 - 539
Target Start/End: Original strand, 52180476 - 52180543
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| Q |
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
52180476 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgagatgatgttctataaaatataaattttgacaaat |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 472 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 52345762 - 52345597
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| Q |
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttca-ttaaagtgatcattaat |
570 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || | |||||||||||| |||| |||| | ||||||||| ||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
52345762 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaatgatattctataaaatataaatgttgataaatagttatttatttcacaaaaaatgatcgttaat |
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T |
 |
| Q |
571 |
ttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttccctt |
637 |
Q |
| |
|
||||| | || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
52345662 |
ttata-aaattatgaaacaagagtaccggtacacctcactttgtgagtgtaccgtagaagttccctt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 472 - 636
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| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat-taaagtgatcattaat |
570 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||| | ||| ||||| |
|
|
| T |
12105323 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttctgataaaatgatgttctataaaatataaatattgacaaataactatttattacataaaaaattatcgttaat |
12105224 |
T |
 |
| Q |
571 |
ttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttccct |
636 |
Q |
| |
|
||||| | || |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
12105223 |
ttata-aaattatgaagcaagagtaccggtacacctcattttgtgagtgtaccgtagaagttccct |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 348 - 531
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348 |
ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgaca |
447 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
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ataattaaatcttatttaccaaaaacgtcgacgaaataaaatttaatttttatgaatttttagtactcataatagagaattttgattattttttacaata |
52261030 |
T |
 |
| Q |
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aaatg-aannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatat |
531 |
Q |
| |
|
||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aaatgtaaaaaaaattcgtatgatttttataaacaatgaaatgatgtttttttcttatgaaatgacattttctaaaatataaatat |
52261116 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #102
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Target Start/End: Complemental strand, 29878008 - 29877892
Alignment:
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329 |
tctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaata |
428 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || | |||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| | || || |
|
|
| T |
29878008 |
tctatcatttacaattataaaaattaaatcttatttaccaaaagcgtcgacgaaataaaatttaatttttttgaatttttattactcataatgaagatta |
29877909 |
T |
 |
| Q |
429 |
ttgattattttttatga |
445 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29877908 |
ttgattattttttatga |
29877892 |
T |
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Target: chr1; HSP #103
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312 |
aagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatc |
411 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||| | | | ||||||||| ||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
41541725 |
aagaaaaagaattattttttatcattgacaattataataattaaatcttatttaccaaaggtatgaaagaaataaaatttattttttctgaatttttact |
41541626 |
T |
 |
| Q |
412 |
acccataacaatgaatattgattattttt |
440 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41541625 |
actcataacaaagaatattgattattttt |
41541597 |
T |
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Target: chr1; HSP #104
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571 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||| |||| |||||| |
|
|
| T |
50239439 |
ttataaacaatgaaatgatgcttttttcttatgaaatgatattttttaaaatataaatatcaataaatatttttttatttcataaaaatgatagttaatt |
50239340 |
T |
 |
| Q |
572 |
tatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
50239339 |
tataaatttt-tgaagtaagagtaccggtacac |
50239308 |
T |
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Target: chr1; HSP #105
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472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat-taaagtgatcattaat |
570 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
52441240 |
cttataaacaatgaaatgatattttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattgacaaataactatttattacataaaaaatgatcgttaat |
52441141 |
T |
 |
| Q |
571 |
ttata |
575 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
52441140 |
ttata |
52441136 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 329 - 521
Target Start/End: Original strand, 4155881 - 4156074
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| Q |
329 |
tctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaata |
428 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || | |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| | || || |
|
|
| T |
4155881 |
tctatcatttacaattataaaaattaaatcttatttaccaaaagtgtcgacgaaataaaatttaatttttttgaatttttattactcataatgaagatta |
4155980 |
T |
 |
| Q |
429 |
ttgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttt--ttcttatgagatgatgttttctaaa |
521 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
4155981 |
ttgattattttttatga-gtaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaattatgtttttcttcttatgaaatgatgttttctaaa |
4156074 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 463 - 554
Target Start/End: Original strand, 7435750 - 7435841
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| Q |
463 |
aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat |
554 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| || |||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7435750 |
aatatgattcttataaacaatgaaatgatgtttattcttataaaatgatgtcttataaaatataaatatggataaataactttttatttcat |
7435841 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 472 - 539
Target Start/End: Original strand, 38261047 - 38261114
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| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
38261047 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgagatgatattctataaaatataaatgttgacaaat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 465 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 2249757 - 2249683
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2249757 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
2249683 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 465 - 539
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
6526598 |
tatgattcttataaacaatgaaatgatgttttttcttacgaaatgatgttctataaaatataaatattgaaaaat |
6526524 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 465 - 539
Target Start/End: Original strand, 8396585 - 8396659
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8396585 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
8396659 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 465 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 13203106 - 13203032
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13203106 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
13203032 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 465 - 539
Target Start/End: Original strand, 24381556 - 24381630
Alignment:
| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
24381556 |
tatgattcttataaacaatgaaatgatgttttttcttacgaaatgatgttctataaaatataaatattgaaaaat |
24381630 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #114
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| Q |
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aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttc-ttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtg |
561 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||| || |
|
|
| T |
33986108 |
aatatgattattataaataatgaaatgacgttttttccttatgaaatgatgttttctaaaatat-aatattgacaaatagctatttatttca-taaaatg |
33986205 |
T |
 |
| Q |
562 |
atcattaatttatatattt |
580 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
33986206 |
atcgttaatttataaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #115
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45622650 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
45622576 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
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| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattga |
534 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48977038 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattga |
48976976 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 465 - 539
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52861467 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
52861393 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
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| Q |
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aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaa |
388 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
12227209 |
aaaaataattattttctatcattgataattataataattaaatcttatttaccaaaagcgtcgatgaaataaaa |
12227282 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatc |
564 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||| | || |
|
|
| T |
20487737 |
tatgattcttttaaacaatgaaatgatg-tttttcttatgaaataatggtttctaaaatataaatatcaacaaataactctttatttcataaaaatattc |
20487639 |
T |
 |
| Q |
565 |
attaatttat |
574 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
20487638 |
attaatttat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #120
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat-taaagtgatcattaat |
570 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||| | ||||| ||| |
|
|
| T |
30571252 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttctaataaaatgatgttctataaaatataaatattgacaaatagctatttattacataaaaaattatcatcaat |
30571351 |
T |
 |
| Q |
571 |
ttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
||||| | || |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30571352 |
ttata-aaattatgaagcaagagtaccggtacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #121
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| Q |
315 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaa |
388 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
33082075 |
aaaaataattattttctatcattgataattataataattaaatcttatttaccaaaagcgtcgatgaaataaaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #122
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tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgat |
563 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| || || ||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
34100882 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgcgtttttcttctgaaatcatattttctaaaatataaatgtcgacaaataactatttatttcataaaattgat |
34100784 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttccctt |
637 |
Q |
| |
|
| ||| |||||| | ||| |||| ||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
34100783 |
cgttagtttataga-tttatgaagcaatagtaccggtacacctcaatttacaagtgtaccatagaagttccctt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #123
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atgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattt |
580 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
38862441 |
atgatgttttctaaaatataaatattgacaaataactttttatttca-taaaatgatcgttaatttataaattt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #124
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||||||| || ||| ||| | |||| |||| ||||||||| ||| |||| ||||||||| | |
|
|
| T |
44808487 |
gaagaaaaagaattgttttctatcattaacaattacaataattagatcttagttaccgaaagtgtcgacgaaataaaatttacattttttgaatttttgt |
44808586 |
T |
 |
| Q |
411 |
cacccataacaatgaatattgatta-ttttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatg |
509 |
Q |
| |
|
|| ||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||| | || |
|
|
| T |
44808587 |
tacatataacaaagaatatttattatttttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaatgctgtttattcttataaaata |
44808686 |
T |
 |
| Q |
510 |
atgttttctaaaatataaatat |
531 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
44808687 |
atgtcttataaaatataaatat |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #125
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| |
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||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49685984 |
aggcaaattctatggtacacccaataaatttgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaatta |
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T |
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Target: chr1; HSP #126
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| |
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|
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ataattaaatcttattcatcaaaagtattaatgaaataaaagt-aatttttttgaatttttagcactcataattgagaatattgattatattttacgata |
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T |
 |
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547 |
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575 |
Q |
| |
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|
| T |
17553903 |
atttcataaaaaatgatcgttaatttata |
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T |
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563 |
Q |
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T |
 |
| Q |
564 |
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604 |
Q |
| |
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| ||| |||||| | ||| |||| |||||||||| |||||| |
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410 |
Q |
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T |
 |
| Q |
411 |
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505 |
Q |
| |
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| T |
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46368795 |
T |
 |
| Q |
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532 |
Q |
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||||||| |||||||||||||||||| |
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T |
 |
| Q |
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544 |
Q |
| |
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| T |
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Q |
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Q |
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T |
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441 |
Q |
| |
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T |
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Q |
| |
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| T |
44978973 |
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44979072 |
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 |
| Q |
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452 |
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| |
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| | || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |
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44979073 |
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Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
564 |
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575 |
Q |
| |
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| |||||||||| |
|
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| T |
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T |
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539 |
Q |
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||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||| |||| |
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T |
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Q |
| |
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| T |
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2620893 |
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Q |
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atg |
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|
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12907569 |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
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Q |
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|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| |||| |
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|
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|
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|
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ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
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||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
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ttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
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447 |
Q |
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|||||||||| ||||| | ||||| | |||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||| || ||||| | |||| |||||||||||||| | | |
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T |
 |
| Q |
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546 |
Q |
| |
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||||| || | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||| |||||| || || |
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| T |
48616636 |
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 |
| Q |
547 |
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Q |
| |
|
|||| ||| ||| | || ||||||||| |
|
|
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tattccataaaaataataattaattta |
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T |
 |
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Q |
| |
|
|| |||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||| |
|
|
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T |
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cattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttc |
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Q |
| |
|
| |||||||||| | || |||| || |||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |
|
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311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||||||| || ||| ||| | ||| |||| ||||||||| ||| |||| ||||||||| | |
|
|
| T |
51991614 |
gaagaaaaagaattgttttctatcattaacaattacaataattagatcttagttaccgaaaatgtcgacgaaataaaatttacattttttgaatttttgt |
51991713 |
T |
 |
| Q |
411 |
cacccataacaatgaatattgattatttttt-atgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatg |
509 |
Q |
| |
|
|| ||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||||| | || |
|
|
| T |
51991714 |
tacatataacaaagaatatttattatttttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaataaaatgctgcttattcttataaaata |
51991813 |
T |
 |
| Q |
510 |
atgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat |
554 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||||||||| || |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
51991814 |
atattttataaaatataaatatggataaataactctttatttcat |
51991858 |
T |
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563 |
Q |
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|
|||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||| | || |||||||||| ||| |||| |
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|
| T |
477611 |
tatgattcttataaacaataaactgatgttttttcttgtgaaatgatgttctataaaatataaatattgataaaag-ctatttatttcataaaaaatgat |
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T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttata |
575 |
Q |
| |
|
| |||||||||| |
|
|
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cgttaatttata |
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T |
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539 |
Q |
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|||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||| |||| |
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cttataaaaaatgaaatgatgttttttcttatgggataatattttctaaaatataaagattgataaat |
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T |
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
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|
|||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
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21883045 |
tatgattcttataaacaatgaaatgatgtttttttcttatgaaatcatgttctataaaatataaatattaacaaat |
21883120 |
T |
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aatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt--cttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagt |
560 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
23304641 |
aatatgatttttataaacaataaaatgatgttttttttcttattaaatgatattttctaaaatataaatatcaacaaatagc-ttttatttcataaaaat |
23304739 |
T |
 |
| Q |
561 |
gatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtaca |
603 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
23304740 |
aatagttaatttataaatttt-tgaagtaagagtaccggtaca |
23304781 |
T |
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604 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| |||||| ||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41541595 |
ctaaaatataaatattgacaaatagctctttatttcataaaaatgatcgttaattcata-aatttatgaagcaagagtaccggtacac |
41541509 |
T |
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539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| |||| |
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|
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10348194 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgtttttttttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgataaat |
10348120 |
T |
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31075778 |
tatgattcttataaacagtaaaatgatgttttttcttatgaaatattgttctataaaatataaatattgacaaat |
31075704 |
T |
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| || | | |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32805971 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgctttttcttatgaaatgttgctctataaactataaatattgacaaat |
32806045 |
T |
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| Q |
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ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatat |
531 |
Q |
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|
||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33098866 |
ttataaacaatgaaatgatattttttcttatgaaatgactttttctaaaatataaatat |
33098808 |
T |
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| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttctt--atgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
35874101 |
cttataaacaatgaaatgatgtttttttttttatgagatgatgttctataaaatataaattttgacaaat |
35874032 |
T |
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47544533 |
tatgattcttataaacaattaaattatgttttttcttatgaaatagtgttctataaaatataaatattgacaaat |
47544607 |
T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | || | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48760338 |
tatgattcttataaacaattaaatgatattttttcttatgaaatgttattctataaaatataaatattgacaaat |
48760412 |
T |
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442 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
51184160 |
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T |
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ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaattttta |
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Q |
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|
|||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
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441 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||| |
|
|
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31890365 |
ataactaaatcttatttaccaaaaacttcgacgaaataaaatttaatttttctgaatttttaatactcataatatagaattttgattatttttt |
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T |
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aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
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|
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|
|
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48354881 |
aatatgattcttataaagaatgaaatgacgttttttcttatgaaataatattttctaaaatataaa |
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T |
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aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
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Q |
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|
|||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
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aatatgattcttattaataatgaaatgatgttttttcttatgaaataatattttctaaaatataaa |
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|||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
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|||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||| |||| |
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T |
 |
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cattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
| ||| |||||| | ||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
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|
|||||| ||| |||||||| || || || |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
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tatgattcttttaaacaataaactggtgttttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattgataaatagttatttatttcataaaaaatgat |
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T |
 |
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cattaatttata |
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| |
|
| |||||||||| |
|
|
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cgttaatttata |
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447 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
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ataattaaatcttatttactaaaaacgtcgacgaaataaaatttaatttttctgaatttttattacttataatagagaattttgattattttttacaata |
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T |
 |
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448 |
aaatg-aannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttt-ttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgccttt |
545 |
Q |
| |
|
||||| || | |||||| ||||||||||||||||| | ||| || | |||| ||||| |||| ||||||| |||||| || ||| |||| |
|
|
| T |
11778824 |
aaatgtaaaaataattactatgatttttataaacaatgaaatgtttttttattttaatgaaatgatattttttaaaataaaaatatcaacgaataacttt |
11778725 |
T |
 |
| Q |
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ttatttcattaaagtgatcattaatttatatatttt |
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Q |
| |
|
||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
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Q |
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|
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Q |
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|
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|
|
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Q |
| |
|
|||||||||| | ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||| | |||| ||||||| |||||| | | |
|
|
| T |
51978145 |
ataattaaatatcatttatcaaaaacgtcgacgaaataaaatttaatttttctgaatttttagtaatcataatagagaattttgatta-tttttacaata |
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T |
 |
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aaatg--aannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
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Q |
| |
|
||||| || | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
51978046 |
aaatgtaaaaaaaaattagtatgattgttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaatgacatttcctaaaatataaa |
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Query Start/End: Original strand, 494 - 604
Target Start/End: Original strand, 12178865 - 12178974
Alignment:
| Q |
494 |
tttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagag |
593 |
Q |
| |
|
||||| |||||| || || ||||||||||||||||| | | ||||| || |||||||||| ||| | ||| |||||||||| |||| | ||| |||||| |
|
|
| T |
12178865 |
ttttttttatgaaataatattttctaaaatataaatgtcggcaaataactatttatttcataaaattaatcgttaatttatagatttag-gaagcaagag |
12178963 |
T |
 |
| Q |
594 |
taccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
12178964 |
taccggtacac |
12178974 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr1; HSP #175
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| Q |
542 |
ctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttccct |
636 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
51184353 |
ctttttatttcataaaaatgatagttaatttataaatttt-tgaagtaagagtaccggcacaccttaaattgtgggtgtaccatagaagttccct |
51184446 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #176
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Query Start/End: Original strand, 465 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 51787633 - 51787560
Alignment:
| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
51787633 |
tatgattcttataaacatt-aaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgataaat |
51787560 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #177
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Target Start/End: Complemental strand, 632936 - 632751
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| Q |
348 |
ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgaca |
447 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| | ||||| | || | ||||||||| ||||||||| ||| |||||| || ||||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
632936 |
ataattaaatcttattaaccaaaaacgtctacgaaataaaatttaatttttctgagtttttagtactcataatagagaattttgattattttttacaata |
632837 |
T |
 |
| Q |
448 |
aaatg-aannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt-cttatgagatgatgttttctaaaatataaatat |
531 |
Q |
| |
|
||||| || | |||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
632836 |
aaatgtaaaaaaaattagtatgatttttataaacaatgaaatgacgtttttttcttatgaaatgacattttctaaaatataaatat |
632751 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #178
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Target Start/End: Complemental strand, 5553924 - 5553867
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| Q |
476 |
taaacaatgaaatgatggttttt-cttatgagatgatgttttctaaaatataaatatt |
532 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5553924 |
taaacaatgaaatgatgtttttttcttatgaaatgatatattctaaaatataaatatt |
5553867 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #179
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Target Start/End: Complemental strand, 26102635 - 26102582
Alignment:
| Q |
473 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
26102635 |
ttataaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
26102582 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #180
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Query Start/End: Original strand, 467 - 635
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| Q |
467 |
tgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatca |
565 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||| || |||| |
|
|
| T |
32144836 |
tgattcttataaacaatgaa-tgatgtgtttttcttatgaaatgatattttctgagatataaatgccgacaaataactatttatttcataaagttgattg |
32144738 |
T |
 |
| Q |
566 |
ttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttccc |
635 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||| ||| || || ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
32144737 |
ttaatatataaattttg-gaagcaggaataccgatacaccttaatttatgagtgtaccatagaagttccc |
32144669 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr1; HSP #181
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 463 - 521
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Alignment:
| Q |
463 |
aatatgatccttataaacaatgaaatgatggttt--ttcttatgagatgatgttttctaaa |
521 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
36735685 |
aatatgattcttataaacaatgaaattatgtttttcttcttatgaaatgatgttttctaaa |
36735625 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr1; HSP #182
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Query Start/End: Original strand, 283 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 41757215 - 41757137
Alignment:
| Q |
283 |
aaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaatttta |
361 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
41757215 |
aaattaataataaataagttgtttttttgaataaaaataattattttatatgattgacaactataataattaaatttta |
41757137 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #183
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Query Start/End: Original strand, 513 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 42958962 - 42958839
Alignment:
| Q |
513 |
ttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtaca-ctcaaaat |
611 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| ||||| ||| |||||| | ||| |||| |||||||||||||||| ||| || | |
|
|
| T |
42958962 |
ttttctaaaatataaatgccgacaaataactatttatttcataaaattgatcgttagtttataga-tttatgaagcaagagtaccggtacatctc-aatt |
42958865 |
T |
 |
| Q |
612 |
tgtgagtgtatcatagaagttccctt |
637 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
42958864 |
tacgagtgtatcatagaaattccctt |
42958839 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #184
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Query Start/End: Original strand, 472 - 528
Target Start/End: Original strand, 5800160 - 5800215
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| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
5800160 |
cttataaaaaatgaaatgatg-tttttcttatgagataatattttctaagatataaa |
5800215 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr1; HSP #185
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Query Start/End: Original strand, 463 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 38207700 - 38207624
Alignment:
| Q |
463 |
aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||| || |||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
38207700 |
aatatgattcttataaacaatgaaatgatatttattcttataaaatgatgacttataaaatattaatattgataaat |
38207624 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #186
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Query Start/End: Original strand, 472 - 528
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Alignment:
| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
39627990 |
cttataaaaaatgaaatgatgttttttcttgtggaatgatattttctaaaatataaa |
39627934 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #187
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 348 - 531
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| Q |
348 |
ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgaca |
447 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| | ||||| | |||| ||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
42317122 |
ataattaaatcttattcaccaaaaacgtcgacgaaataaaataaaatttttctgaatttttagtactcataatagagaattttgattattttttacaata |
42317023 |
T |
 |
| Q |
448 |
aaatg-aannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatat |
531 |
Q |
| |
|
||||| || | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
42317022 |
aaatgtaaaaaaaattagtatgatttttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaatgacatttttaaaaataaaaatat |
42316938 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #188
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Query Start/End: Original strand, 472 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 46152340 - 46152284
Alignment:
| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
46152340 |
cttataaaaaatgaaatgatattttttcttatgggataatattttctaaaatataaa |
46152284 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr1; HSP #189
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 472 - 528
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Alignment:
| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
46153394 |
cttataaaaaatgaaatgatattttttcttatgggataatattttctaaaatataaa |
46153338 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #190
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||| | || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
11444440 |
tatgattcttaaaaagaatgaaatgatgttttttcttataaaataatattttctaaaatataaa |
11444377 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #191
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| Q |
473 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttctt-atgagatgatgttttctaaaatataaatat |
531 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36274879 |
ttataaacaatgaaatgatgttttttttttatgaaatgacattttctaaaatataaatat |
36274820 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #192
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| Q |
314 |
gaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaat |
357 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
46282027 |
gaaaaataattattttctatcattgacaattataataattaaat |
46282070 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #193
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| Q |
348 |
ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18992474 |
ataattaaattttatttagcaaaaatttcgacgaaataaaa-tttatttgtatgaatttttat |
18992535 |
T |
 |
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| Q |
312 |
aagaaaaataattattttctatcattgacaa |
342 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22864753 |
aagaaaaataattattttctatcattgacaa |
22864783 |
T |
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatat |
531 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | || || |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
27353083 |
tatgatttttataaacaatgaaatgatattttttcttataaaattatattttctaaaatacaaatat |
27353149 |
T |
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| Q |
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taaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28494018 |
taaaaaatgaaatgatgctttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
28494068 |
T |
 |
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| Q |
473 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatat |
531 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28791528 |
ttataaacaatgaaatgacgtttttttttataaaatgacattttctaaaatataaatat |
28791470 |
T |
 |
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aaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31084863 |
aaatgatgttttttcttatgaaatattgttctataaaatataaatattgacaaat |
31084917 |
T |
 |
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ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattatttttta |
442 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| | || | ||||||||| ||||||||| | |||||||| || ||||| | |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
36275005 |
ataattaaatcttatttaccaaaaacgtcaacgaaataaaatttaatttttctaaatttttagtactcataatagagaattttgattatttttta |
36274911 |
T |
 |
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500 |
ttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaag-tgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccg |
598 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||| || |||||| ||| ||| ||||| |||||||||| | || ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
44263928 |
ttatgaaatgatgttctataaaatataactattgacaaagagctatttattacataaaaaatgatcgttaatttataaaatta-tgaaacaggagtaccg |
44264026 |
T |
 |
| Q |
599 |
gtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttcccttacaaaaat |
645 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
44264027 |
gtacacctcactttgtgagtgtaccgtagatgttcccttaaaaaaat |
44264073 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #201
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatat |
531 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||| || | |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
46235068 |
tatgattcttatagacaatgaactggtattttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatat |
46235134 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #202
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 481 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 47719030 - 47718980
Alignment:
| Q |
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aatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatat |
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Q |
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|
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|
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| T |
47719030 |
aatgaaatgatgtttttccttatgaaatgatattttttaaaatataaatat |
47718980 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #203
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 476 - 526
Target Start/End: Original strand, 51369564 - 51369614
Alignment:
| Q |
476 |
taaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
51369564 |
taaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
51369614 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #204
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 473 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 8461689 - 8461636
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ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
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|
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|
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| T |
8461689 |
ttataaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaataatattttctaaaatata |
8461636 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #205
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 472 - 532
Target Start/End: Original strand, 21073007 - 21073068
Alignment:
| Q |
472 |
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532 |
Q |
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| T |
21073007 |
cttataaacaatgagatgatgtttttttcttatgaaataatgttctataaaatataaatatt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #206
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 348 - 409
Target Start/End: Original strand, 23304525 - 23304586
Alignment:
| Q |
348 |
ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaattttta |
409 |
Q |
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| T |
23304525 |
ataattaaatcttatttatcaaaaacatcgacaaaataaaatttgatttttctgaattttta |
23304586 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #207
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 472 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 46707506 - 46707375
Alignment:
| Q |
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cttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaat |
570 |
Q |
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| T |
46707506 |
cttataaacaatgaa-tgatgtgtttttcttatgaaatgatattttctgagatacaaatgccgacaaataactttttatttcataaaattgattgttaat |
46707408 |
T |
 |
| Q |
571 |
ttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
||| |||| | ||| || |||||||||||||| |
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|
| T |
46707407 |
gcataaatttag-gaagcaggagtaccggtacac |
46707375 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 176)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 226 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 52782568 - 52782156
Alignment:
| Q |
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325 |
Q |
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|
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|
|
| T |
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52782469 |
T |
 |
| Q |
326 |
ttttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatga |
425 |
Q |
| |
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| T |
52782468 |
ttttctatcattgacaactaagataattaaattttatataccaaaagtttcgacaaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcatatcaatga |
52782369 |
T |
 |
| Q |
426 |
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525 |
Q |
| |
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| T |
52782368 |
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52782269 |
T |
 |
| Q |
526 |
aaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcat |
625 |
Q |
| |
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| T |
52782268 |
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52782169 |
T |
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| Q |
626 |
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638 |
Q |
| |
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| T |
52782168 |
agaagttccctta |
52782156 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 228 - 637
Target Start/End: Original strand, 32719985 - 32720395
Alignment:
| Q |
228 |
ggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattatt |
327 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32719985 |
ggcaaattctatggtacacccaataaatttgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgttttttagaagaaaaataattatt |
32720084 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaat |
427 |
Q |
| |
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| T |
32720085 |
ttctatcattaacaattaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcgtaacaatgaat |
32720184 |
T |
 |
| Q |
428 |
attgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatgg-tttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
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| T |
32720185 |
attgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttttttatgaaatgatgttttctaaaatata |
32720284 |
T |
 |
| Q |
527 |
aatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcata |
626 |
Q |
| |
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| T |
32720285 |
aatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccgatacactcaaaattgtgagtgtaccata |
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T |
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| Q |
627 |
gaagttccctt |
637 |
Q |
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| T |
32720385 |
gaagttccctt |
32720395 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 227 - 635
Target Start/End: Original strand, 33830529 - 33830937
Alignment:
| Q |
227 |
aggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattat |
326 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |
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|
| T |
33830529 |
aggcaaattctatggtacacccaataaatttgggtgtatcggtacaccaagtcataaaattaataataaatgagttgtttttttgaaaaaaaataattat |
33830628 |
T |
 |
| Q |
327 |
tttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaa |
426 |
Q |
| |
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| T |
33830629 |
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33830728 |
T |
 |
| Q |
427 |
tattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
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|
| T |
33830729 |
tattgattattttttatgataaaatgtaaattttgtaatatgattcttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
33830828 |
T |
 |
| Q |
527 |
aatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcata |
626 |
Q |
| |
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| T |
33830829 |
aatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttatgaaacaagagtaccagtacactcaaaattgtgagtgtaccata |
33830928 |
T |
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| Q |
627 |
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635 |
Q |
| |
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| T |
33830929 |
gaagttccc |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 227 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 48925819 - 48925411
Alignment:
| Q |
227 |
aggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattat |
326 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
48925819 |
aggcaaattctatggtacacccaataaatttgaatgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattat |
48925720 |
T |
 |
| Q |
327 |
tttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaa |
426 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
48925719 |
tttctatcattgacaactaagataattaaattttataaaccaaaagtttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaa |
48925620 |
T |
 |
| Q |
427 |
tattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
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|
|
| T |
48925619 |
tattgattattttttatgacaaaatgtaaattttgtaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatata |
48925520 |
T |
 |
| Q |
527 |
aatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcata |
626 |
Q |
| |
|
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|
| T |
48925519 |
aatattgacaaatacctttttatttcattaaagtggtctttaatttatatattttatgaaacaagagtaccagtacactcaaaattgtgagtgtaccata |
48925420 |
T |
 |
| Q |
627 |
gaagttccc |
635 |
Q |
| |
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||| ||||| |
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| T |
48925419 |
gaaattccc |
48925411 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 228 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 49951332 - 49950924
Alignment:
| Q |
228 |
ggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattatt |
327 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
49951332 |
ggcaaattctatggtacacctaataaatttggatgtatcggcacatcaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattatt |
49951233 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaat |
427 |
Q |
| |
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|
| T |
49951232 |
ttctatcattgacaactaagataattaaattttatataccaaaagttttgacgaaataaaatttaatttttaacaatttttattactcataacaatgaat |
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T |
 |
| Q |
428 |
attgattatttttt-atgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
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|
| T |
49951132 |
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T |
 |
| Q |
527 |
aatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcata |
626 |
Q |
| |
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| T |
49951032 |
aatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatctttaatttatatattttgtgaaataagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtaccata |
49950933 |
T |
 |
| Q |
627 |
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635 |
Q |
| |
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| T |
49950932 |
gaagttccc |
49950924 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 228 - 635
Target Start/End: Original strand, 37567218 - 37567625
Alignment:
| Q |
228 |
ggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattatt |
327 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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ggcaaattctacggtacacccaataaatttggatgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattatt |
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T |
 |
| Q |
328 |
ttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaat |
427 |
Q |
| |
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| T |
37567318 |
ttctatcattgacaactaagataattaaattttatataccaaaaactttgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaat |
37567417 |
T |
 |
| Q |
428 |
attgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataa |
527 |
Q |
| |
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| T |
37567418 |
attgattattttttatgacaaaatataaattttgtaatatgatccttataaacaatgaaattatgatttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataa |
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T |
 |
| Q |
528 |
atattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatag |
627 |
Q |
| |
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atattgacaaatacatttttatttcattaaagtgatctttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccgatacactcaaaattatgagtgtaccatag |
37567617 |
T |
 |
| Q |
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| |
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| T |
37567618 |
aagttccc |
37567625 |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 230 - 636
Target Start/End: Original strand, 50465473 - 50465880
Alignment:
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329 |
Q |
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T |
 |
| Q |
330 |
ctatcatt-gacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaata |
428 |
Q |
| |
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| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |
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ccatcatttgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaata |
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T |
 |
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429 |
ttgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
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Q |
| |
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50465673 |
ttgattattttttatgacaaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaa |
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T |
 |
| Q |
529 |
tattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcataga |
628 |
Q |
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tattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttataaattttgtaaaacaagaataccggtacactcaaaattgtgagtgtaccataga |
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agttccct |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 225 - 632
Target Start/End: Original strand, 53186001 - 53186408
Alignment:
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Q |
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| T |
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T |
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 228 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 50560768 - 50560359
Alignment:
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327 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 228 - 636
Target Start/End: Original strand, 45927220 - 45927628
Alignment:
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Q |
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Q |
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527 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 227 - 635
Target Start/End: Original strand, 44962601 - 44963011
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Q |
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327 |
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425 |
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44963000 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 249 - 635
Target Start/End: Original strand, 53376612 - 53376997
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Q |
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448 |
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53376911 |
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635 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 223 - 637
Target Start/End: Original strand, 54008900 - 54009315
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T |
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ccatagaaattccctt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 228 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 48389166 - 48388762
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T |
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| T |
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| T |
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T |
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| T |
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48388768 |
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632 |
Q |
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| T |
48388767 |
gaagtt |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 227 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 55365783 - 55365380
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T |
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| Q |
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ttttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatga |
425 |
Q |
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| T |
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ttttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatga |
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T |
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| Q |
426 |
atattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatat |
525 |
Q |
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| T |
55365583 |
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T |
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526 |
aaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcat |
625 |
Q |
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| T |
55365483 |
aaatattaacaaatacttttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccagtacattcaaaattgtgagtgtaccat |
55365384 |
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626 |
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629 |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 271 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 36019780 - 36019413
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| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
371 |
agcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgat |
470 |
Q |
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| T |
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T |
 |
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ccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaat |
570 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
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Q |
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| T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 271 - 635
Target Start/End: Original strand, 51235562 - 51235928
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T |
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Target: chr3; HSP #18
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Query Start/End: Original strand, 227 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 9322841 - 9322429
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 228 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 7157445 - 7157036
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Target: chr3; HSP #20
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 226 - 605
Target Start/End: Original strand, 2667482 - 2667861
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Target: chr3; HSP #22
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Target Start/End: Original strand, 346689 - 347099
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 227 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 35320770 - 35320360
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Back To:
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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 261 - 636
Target Start/End: Original strand, 14460214 - 14460592
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 225 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 44500525 - 44500134
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 274 - 575
Target Start/End: Original strand, 7347136 - 7347437
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 312 - 637
Target Start/End: Original strand, 881808 - 882133
Alignment:
| Q |
312 |
aagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatc |
411 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
881808 |
aagaaaaataattattttctatcattgacaactataataattaaattttatttatcaaaagcttcgaagaaataaaatttaatttttataaatttttact |
881907 |
T |
 |
| Q |
412 |
acccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgat |
511 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
881908 |
actcataacaatgaatattgattattttttatgactaaatgtaaattttttaatatgatccttataaacaatgaaacgatgttttttcttatgatatgac |
882007 |
T |
 |
| Q |
512 |
gttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaat |
611 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
882008 |
gttttctaaaatataaatattgacaaataactttttattttataaaaatgatcgttaatttataaattttgtgaaacaaaagtatcggtacactaaaatt |
882107 |
T |
 |
| Q |
612 |
tgtgagtgtatcatagaagttccctt |
637 |
Q |
| |
|
| ||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
882108 |
tccgagtgtaccgtagaagttccctt |
882133 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 374 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 35352451 - 35352191
Alignment:
| Q |
374 |
ttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatcct |
473 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |
|
|
| T |
35352451 |
ttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttgtaatatgatact |
35352352 |
T |
 |
| Q |
474 |
tataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaattta |
573 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
35352351 |
tataaacaatgaaatgatagtttttcttatgaaatgacgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatctttaattta |
35352252 |
T |
 |
| Q |
574 |
tatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttcc |
634 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
35352251 |
tatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtaccatagaagttcc |
35352191 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 225 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 26410029 - 26409628
Alignment:
| Q |
225 |
aaaggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataatt |
324 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
26410029 |
aaaggcaaattttatggtacatccaataaatttgggtgtatcggtacaccaattcattaaattaataataaattagttgtttttttgaagaaaaataatt |
26409930 |
T |
 |
| Q |
325 |
attttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatg |
424 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| | | |||||||||| |
|
|
| T |
26409929 |
attttctatcattga-aactataataattaaattttatttaccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttactact----------cataacaatg |
26409841 |
T |
 |
| Q |
425 |
aatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt-cttatgagatgatgttttctaaaat |
523 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
26409840 |
aatattgattatttttaatgacaaaatttaaattttttaatatgatccttataaacaataaaatgatgtttttttcttatgatatgacgttttc-aaaat |
26409742 |
T |
 |
| Q |
524 |
ataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatc |
623 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| | |
|
|
| T |
26409741 |
ataaatattgacaaataactttttatttcataaaaatgatcgttaatttataaattttgtgaaacaagagtaccggtacactaaaatttctgagtgtacc |
26409642 |
T |
 |
| Q |
624 |
atagaagttccctt |
637 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
26409641 |
gtagaagttccctt |
26409628 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 271 - 630
Target Start/End: Original strand, 48990355 - 48990696
Alignment:
| Q |
271 |
caccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaa |
370 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
48990355 |
caccaagttgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatataccaaa |
48990454 |
T |
 |
| Q |
371 |
agcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgat |
470 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |
|
|
| T |
48990455 |
agtttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattattcataacaatgaatattgattattttttatgaaattttg---------taatatgat |
48990545 |
T |
 |
| Q |
471 |
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570 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || || |
|
|
| T |
48990546 |
---------caatgaaatgattgtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcattaaaatgatttttgat |
48990636 |
T |
 |
| Q |
571 |
ttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaag |
630 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
48990637 |
ttatatattttataaaacaagagtaccggtgcactcaaaattgtgagtgtaccatagaag |
48990696 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 227 - 604
Target Start/End: Original strand, 42622608 - 42622984
Alignment:
| Q |
227 |
aggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataa--taaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataatt |
324 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| || ||| ||| |||| | || |||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
42622608 |
aggcaaattctatggtacacccaaaaaaattgagtgtaccagtacaccaaatcgttaaattaataaattaaatgagttgtttttctgaagaaaattaatt |
42622707 |
T |
 |
| Q |
325 |
attttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatg |
424 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| || | |
|
|
| T |
42622708 |
attttctagcattgacaattataatatttaaatcttatttatcaaaagcttcgacgaaataaaatttactttttttgaatttttattactcataataaag |
42622807 |
T |
 |
| Q |
425 |
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524 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42622808 |
aatattgattattttttatgtgaaaatgttaaaaatttaatatgattcttgtaaacaatgaaattatgttttttcttatgcaatgatgttttctaaaata |
42622907 |
T |
 |
| Q |
525 |
taaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||| ||||||||| ||| |||| |||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
42622908 |
caaatactgacaaatagcttcttatttcataaaa--gatcgttaatttata-aatttatgaaaaaagagtaccggtacac |
42622984 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 315 - 539
Target Start/End: Original strand, 29815215 - 29815440
Alignment:
| Q |
315 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaactta-atttttatgaatttttatcac |
413 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
29815215 |
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29815314 |
T |
 |
| Q |
414 |
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513 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
29815315 |
tcataatgaagaatattgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatataattcttataaacaatgaaacaatgttttttctcatgagatgatgt |
29815414 |
T |
 |
| Q |
514 |
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539 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29815415 |
tttctaaaatataaatattgacaaat |
29815440 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 4521589 - 4521323
Alignment:
| Q |
315 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacc |
414 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
4521589 |
aaaaataattattttctatcattgacaattataataattaaatcttatttaccaaaagcgtcgatgaaataaaatttactttttttgaatttttattgct |
4521490 |
T |
 |
| Q |
415 |
cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatg--gtttttcttatgagatgatg |
512 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |
|
|
| T |
4521489 |
cataatgaagaatattgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatataattcatataaacaatgaaatgatgttttttttctcctgagatggtg |
4521390 |
T |
 |
| Q |
513 |
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580 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||| |||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
4521389 |
ttttctaaaatataaataatgacaaataacaacttatctca-taaaatgatcattaatttataaattt |
4521323 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 315 - 575
Target Start/End: Original strand, 39540757 - 39541019
Alignment:
| Q |
315 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacc |
414 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
39540757 |
aaaaataattattttttatcattgacaactataataattaaatcttatttaccaaaagcgtcgatgaaataaaatttactttttttgaatttttattgct |
39540856 |
T |
 |
| Q |
415 |
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511 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
39540857 |
cataatgaagaatattgattattttttataagaaaatgttaaaaatttaatataattcatataaacaatgaaatgatgtttttttttctcatgagatggt |
39540956 |
T |
 |
| Q |
512 |
gttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttata |
575 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
39540957 |
gttttttaaaatataaataatgacaaataacaacttatttca-taaaatgatcattaatttata |
39541019 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 311 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 52776771 - 52776481
Alignment:
| Q |
311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
52776771 |
gaagaaaaagaactattttctatcattgacaattacaataattaaatcgtatttaccaaaagcgtcgacgaaataaaatttacttttt-tgaatttttgt |
52776673 |
T |
 |
| Q |
411 |
cacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatga |
510 |
Q |
| |
|
|| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||| |
|
|
| T |
52776672 |
tacatataacaaagaatattgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatataattcttataaacaacgaaatgatgttttttcttataaaatga |
52776573 |
T |
 |
| Q |
511 |
tgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||| |||| | ||| |||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
52776572 |
tattttctaaaatataaatattaataaataattctttatttca-taaaataatcgttaaattataaatttt-tgaaatatgagtaccggtacac |
52776481 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Original strand, 20199433 - 20199700
Alignment:
| Q |
315 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacc |
414 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||| | |
|
|
| T |
20199433 |
aaaaataattattttctatcattgacaattataataattaaatcttatttatcaaaagcgtcgatgaaataaaatttactttttttgaacttttattgct |
20199532 |
T |
 |
| Q |
415 |
cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatg---gtttttcttatgagatgat |
511 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||| | |
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|
| T |
20199533 |
cataatgaagaatattgattattttttacgacaaaatgttaaaaatttaatataattcatataaacgatgaaatgatgtttttttttctcataagatggt |
20199632 |
T |
 |
| Q |
512 |
gttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattt |
580 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
20199633 |
gttttctaaaatataaataatgacaaataacaacttatttca-taaaatgatccttaatttataaattt |
20199700 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 36790207 - 36789941
Alignment:
| Q |
315 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacc |
414 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | |
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|
| T |
36790207 |
aaaaataattattttctatcattgacaattataataattaaatcttatttaccaaaagcgtcgatgaaataaaatttactttttttgaatttttattgct |
36790108 |
T |
 |
| Q |
415 |
cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt--cttatgagatgatg |
512 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| | |
|
|
| T |
36790107 |
cataatgaagaatattgattattttttatgataaaatgttaaaaatttaatataatttatataaacaatgaaatgatgtttttttcctcatgagatggta |
36790008 |
T |
 |
| Q |
513 |
ttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattt |
580 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
36790007 |
ttttctaaaatataaataatgataaataacaacttatttca-aaaaatgatcattaatttataaattt |
36789941 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 312 - 539
Target Start/End: Original strand, 39289330 - 39289556
Alignment:
| Q |
312 |
aagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatc |
411 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||| || |||||||||||| | ||||||| ||| ||||| | ||||||||| |
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|
| T |
39289330 |
aagaaaaagaattattttctattattgatagttataataattaaatcttatataccaaaagcttcgacgcaataaaatttacttttttt-aatttttatt |
39289428 |
T |
 |
| Q |
412 |
acccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgat |
511 |
Q |
| |
|
|| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39289429 |
actcataataaagaatattgattattttttatgtgaaaatattaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaatgat |
39289528 |
T |
 |
| Q |
512 |
gttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
39289529 |
gttctctaaaatataaatattgataaat |
39289556 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 315 - 573
Target Start/End: Original strand, 47175553 - 47175814
Alignment:
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315 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacc |
414 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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510 |
Q |
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| T |
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T |
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573 |
Q |
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| T |
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47175814 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Original strand, 26001281 - 26001547
Alignment:
| Q |
315 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacc |
414 |
Q |
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| T |
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26001380 |
T |
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512 |
Q |
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| T |
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26001480 |
T |
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| Q |
513 |
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580 |
Q |
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| T |
26001481 |
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26001547 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 314 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 3732580 - 3732295
Alignment:
| Q |
314 |
gaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcac |
413 |
Q |
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| T |
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510 |
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| T |
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3732386 |
T |
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| Q |
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604 |
Q |
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| T |
3732385 |
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3732295 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 31185751 - 31185484
Alignment:
| Q |
315 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacc |
414 |
Q |
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| T |
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31185652 |
T |
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| Q |
415 |
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511 |
Q |
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| T |
31185651 |
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31185552 |
T |
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| Q |
512 |
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580 |
Q |
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| T |
31185551 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 226 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 23043760 - 23043579
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325 |
Q |
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| T |
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| Q |
326 |
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408 |
Q |
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| T |
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23043579 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 311 - 539
Target Start/End: Original strand, 29384767 - 29384994
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410 |
Q |
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| T |
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29384964 |
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| T |
29384965 |
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29384994 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 327 - 534
Target Start/End: Original strand, 4393081 - 4393290
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327 |
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424 |
Q |
| |
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| T |
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4393280 |
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534 |
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| T |
4393281 |
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4393290 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 228 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 14998556 - 14998202
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326 |
Q |
| |
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| T |
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14998459 |
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| Q |
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423 |
Q |
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| T |
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| T |
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14998259 |
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580 |
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14998258 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 315 - 452
Target Start/End: Original strand, 24397460 - 24397598
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Q |
| |
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| T |
24397460 |
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24397559 |
T |
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| T |
24397560 |
tcataatgaagaatattgattattttttatgagaaaatg |
24397598 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 311 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 27102917 - 27102648
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
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| T |
27102917 |
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27102818 |
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510 |
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| T |
27102817 |
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27102718 |
T |
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| Q |
511 |
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581 |
Q |
| |
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|
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| T |
27102717 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 315 - 575
Target Start/End: Original strand, 31226683 - 31226942
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414 |
Q |
| |
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| T |
31226683 |
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31226782 |
T |
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| Q |
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514 |
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| T |
31226783 |
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31226882 |
T |
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515 |
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575 |
Q |
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| T |
31226883 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 315 - 554
Target Start/End: Original strand, 15804346 - 15804588
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Q |
| |
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T |
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| Q |
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510 |
Q |
| |
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| T |
15804445 |
cataatgaagaatattgattatcttttatgagaaaatgttaaaaatttaaaataattcttataaacaatgaaattatgttttttttttcttatgagatga |
15804544 |
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511 |
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554 |
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15804545 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 315 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 51996737 - 51996517
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Q |
| |
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||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||| | |
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| T |
51996737 |
aaaaagaattactttctatcattgacaattataataattaaattttatttaccaaaagcgtcgatgaaataaaatttactcttt-tgaatttttattgct |
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T |
 |
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cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgt |
513 |
Q |
| |
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||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||| |
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| T |
51996638 |
cataatgaagaatattgatta-tttttatgagaaaatgttaaaaatttaatataattcttataaacaatgaaattatgtttttttctcatgagatggtgt |
51996540 |
T |
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536 |
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| |
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51996539 |
tttcaaaaatataaacattgaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 348 - 551
Target Start/End: Original strand, 31479666 - 31479869
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447 |
Q |
| |
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| T |
31479666 |
ataattaaatcttatttatcaaaaccttcgacgaaataaactttactttttttgaatttttattactcataataaagaatattaattatttttaatgaga |
31479765 |
T |
 |
| Q |
448 |
aaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttt |
546 |
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| |
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| T |
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aaatg-ttaaaatttaatataattcatataaacaatgaaatgatgtttttttcttatgaaatgtagttttctaaaatataaatattgtcaaatagctttt |
31479864 |
T |
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547 |
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551 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
31479865 |
tattt |
31479869 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #53
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Query Start/End: Original strand, 311 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 32122223 - 32121979
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409 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||||||| || ||| |||||||||| || | ||||||||| || | |||| ||||||||| |
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| T |
32122223 |
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32122124 |
T |
 |
| Q |
410 |
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509 |
Q |
| |
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| || ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||| |
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| T |
32122123 |
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32122024 |
T |
 |
| Q |
510 |
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554 |
Q |
| |
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|||| || ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |
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| T |
32122023 |
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32121979 |
T |
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Target: chr3; HSP #54
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570 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
1129292 |
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1129193 |
T |
 |
| Q |
571 |
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636 |
Q |
| |
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||||| | || |||| || |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
1129192 |
ttata-aaattatgaagcaggagtaccggtacacctcactttgtgagtgtaccgtagaagttccct |
1129128 |
T |
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Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 315 - 452
Target Start/End: Original strand, 15670067 - 15670204
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aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacc |
414 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| || |
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|
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15670067 |
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15670166 |
T |
 |
| Q |
415 |
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452 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||||||||| | |||||| |
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|
| T |
15670167 |
cataataaagaatattgattattttttataagaaaatg |
15670204 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 312 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 48795742 - 48795608
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410 |
Q |
| |
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| T |
48795742 |
aagaaaaaaaattattttctatcatcgacaattataataattcaatcttatttatcaaaagcttcgacaaaataaaatttattttttttgtattttttat |
48795643 |
T |
 |
| Q |
411 |
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445 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||||||||||||| |||||||| |
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|
| T |
48795642 |
tactcataacaaagaatattgattatattttatga |
48795608 |
T |
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Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 226 - 303
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303 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
52788832 |
aaggcaaattctatggtacatccaataaatttgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttg |
52788755 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 311 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 29698646 - 29698402
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| Q |
311 |
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409 |
Q |
| |
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||||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||||||| || ||| ||| | |||| |||| ||||||||| || | |||| ||||||||| |
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|
| T |
29698646 |
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T |
 |
| Q |
410 |
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509 |
Q |
| |
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| T |
29698546 |
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29698447 |
T |
 |
| Q |
510 |
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554 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||| ||||| |||| || |||||||||| |
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|
| T |
29698446 |
atgtcttataaaatataaaaattgataaataactctttatttcat |
29698402 |
T |
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Target: chr3; HSP #59
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Query Start/End: Original strand, 312 - 539
Target Start/End: Original strand, 41982069 - 41982295
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312 |
aagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatg-aatttttat |
410 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||| ||||| ||||| |||||||| || | ||||||||| ||||||||| | ||||||||| |
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|
| T |
41982069 |
aagaaaaata-ttattttttatcatttgtaactataataactaaatcttattcatcaaaagtgtcaacgaaataaaa-ttaatttttttataatttttat |
41982166 |
T |
 |
| Q |
411 |
cacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatga |
510 |
Q |
| |
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||| ||||| ||| ||||||||||||||| || || ||| | | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |
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|
| T |
41982167 |
cactcataattgagaacattgattattttttacgataatatgtaaaaaaattattatgattcttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaatgt |
41982266 |
T |
 |
| Q |
511 |
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539 |
Q |
| |
|
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| T |
41982267 |
tgttttataaaatataaatattgacaaat |
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T |
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Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 227 - 303
Target Start/End: Original strand, 54011141 - 54011217
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| Q |
227 |
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303 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54011141 |
aggcaaattctatagtacacccaataaatttgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttg |
54011217 |
T |
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Target: chr3; HSP #61
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Query Start/End: Original strand, 311 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 8353385 - 8353142
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| Q |
311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaat-ttttatgaattttta |
409 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||||||| || ||| ||||||||| | || ||||||||| || || |||| |||||||||| |
|
|
| T |
8353385 |
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8353286 |
T |
 |
| Q |
410 |
tcacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatg |
509 |
Q |
| |
|
| || ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||| | ||| |
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|
| T |
8353285 |
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8353187 |
T |
 |
| Q |
510 |
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554 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
8353186 |
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Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
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Target Start/End: Complemental strand, 37627177 - 37626990
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Q |
| |
|
||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
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37627078 |
T |
 |
| Q |
493 |
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580 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||| || ||| ||||| |||||| ||| |||| |
|
|
| T |
37627077 |
tttttttttatgaaatgatgtttcctaaaatataaatattaacaaatagctctttatttaataaaaatgatcgttaattcataaattt |
37626990 |
T |
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Target: chr3; HSP #63
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||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
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39253053 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaatgatgttttataaaatataaatattgacaaat |
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T |
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Target: chr3; HSP #64
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Query Start/End: Original strand, 227 - 580
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325 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||| |||| |||||| ||| | ||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
46936658 |
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46936755 |
T |
 |
| Q |
326 |
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418 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||| || |||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||| | || ||||||| || ||| |
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|
| T |
46936756 |
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46936855 |
T |
 |
| Q |
419 |
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517 |
Q |
| |
|
| || |||||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||| | ||||| || |||||||| |
|
|
| T |
46936856 |
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46936955 |
T |
 |
| Q |
518 |
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580 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||| | ||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
46936956 |
taaaatataaatattaactaatagctttttatttca-taaaataatccttaatttataaattt |
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T |
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Target: chr3; HSP #65
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501 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |
|
|
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aatttttattactcataataaagagtattgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaacatgatccttataagcaatgaaatgatgttttttctt |
5335496 |
T |
 |
| Q |
502 |
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537 |
Q |
| |
|
|| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
5335495 |
ataaaatgttgttttctaaaatgtaaatattgacaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #66
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Q |
| |
|
|||| ||||| ||||| |||||||| || | ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||| | | ||| ||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
40021199 |
ataactaaatcttattcatcaaaagtgtcaacgaaataaaatttattttttttgaatttttatcactcatgattaagaacattgattattttttacgata |
40021298 |
T |
 |
| Q |
448 |
aaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
| ||| | | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
40021299 |
atatgtaaaaaaattactatgattcttataaacaatgaaatgatgttttttcttacgaaataatgttctataaaatataaatattgaaaaat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #67
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
41282693 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgagatgatgttctataaaatataaattttgacaaat |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #68
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
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Q |
| |
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||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
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Target: chr3; HSP #69
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| |
|
||||||||| |||| || | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| | || || |
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|
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52058721 |
T |
 |
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ttgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttt--ttcttatgagatgatgttttctaaa |
521 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #70
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Target: chr3; HSP #71
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412 |
acccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt |
498 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
35375745 |
actcgtgacaaagattattgattattttttatgaaaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaatgatgtttttt |
35375659 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #72
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Target Start/End: Original strand, 43903261 - 43903399
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416 |
ataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttt |
515 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| | |
|
|
| T |
43903261 |
ataacaaagaatatttattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaatgatgtttattcttataaaatgatgtct |
43903360 |
T |
 |
| Q |
516 |
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554 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
43903361 |
tataaaatataaatattgataaataactctttatttcat |
43903399 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
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472 |
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570 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||| |||| || |||||| ||| ||| ||||| ||||| |
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|
| T |
45538807 |
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45538709 |
T |
 |
| Q |
571 |
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609 |
Q |
| |
|
||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45538708 |
ttata-aaattatgaaacaggagtaccggtacactcaaa |
45538671 |
T |
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Target: chr3; HSP #74
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Query Start/End: Original strand, 311 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 6728931 - 6728802
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| | |||||||| || | |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |
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|
| T |
6728931 |
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6728832 |
T |
 |
| Q |
411 |
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440 |
Q |
| |
|
|| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6728831 |
tacttataacaaagaatattgattattttt |
6728802 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
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| Q |
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aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaa |
388 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
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28146647 |
aaaaataattattttctatcattgacaattataataattaaatcttatttaccaaaagcgtcgatgaaataaaa |
28146574 |
T |
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Target: chr3; HSP #76
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Query Start/End: Original strand, 315 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 28146536 - 28146456
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| Q |
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aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatt |
395 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
28146536 |
aaaaataattattttctatcattgacaattataataattaaatcttatttaccacaagcgtcgatgaaataaaatttaatt |
28146456 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
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Target Start/End: Complemental strand, 42622007 - 42621848
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| Q |
476 |
taaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat-taaagtgatcattaatttat |
574 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||| || || ||||||||| |
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|
| T |
42622007 |
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42621908 |
T |
 |
| Q |
575 |
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635 |
Q |
| |
|
| | || |||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||| | ||||||||||| |
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|
| T |
42621907 |
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42621848 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 394 - 534
Target Start/End: Original strand, 49079643 - 49079783
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| Q |
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tttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatgg |
493 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49079643 |
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49079742 |
T |
 |
| Q |
494 |
tttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattga |
534 |
Q |
| |
|
| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |
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|
| T |
49079743 |
tctttcttataaaatgatgttttctagaatataaatattga |
49079783 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 326 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 11511030 - 11510796
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| Q |
326 |
ttttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatga |
425 |
Q |
| |
|
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|
| T |
11511030 |
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11510931 |
T |
 |
| Q |
426 |
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519 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
11510930 |
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11510831 |
T |
 |
| Q |
520 |
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554 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
11510830 |
aaatataaatattgataaataacattttatttcat |
11510796 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 472 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 43745509 - 43745442
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| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43745509 |
cttataaacaatgaaatgatattttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattgacaaat |
43745442 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 329 - 521
Target Start/End: Original strand, 45633277 - 45633470
Alignment:
| Q |
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tctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaata |
428 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || | |||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| | || || |
|
|
| T |
45633277 |
tctatcatttacaattataaaaattaaatcttatttaccaaaagcgtcgacgaaataaaatttaatttttttgaatttttattactcataattaagatta |
45633376 |
T |
 |
| Q |
429 |
ttgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttt--ttcttatgagatgatgttttctaaa |
521 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
45633377 |
ttggttattttttatga-gtaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaattatgtttttcttcttatgaaatgatgttttctaaa |
45633470 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 465 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 7352336 - 7352262
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7352336 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
7352262 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 465 - 539
Target Start/End: Original strand, 26850162 - 26850236
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26850162 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
26850236 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 465 - 539
Target Start/End: Original strand, 32636863 - 32636937
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
32636863 |
tatgattcttataaacaatgaaatgatgttttttcttacgaaatgatgttctataaaatataaatattgaaaaat |
32636937 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 465 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 40784695 - 40784621
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40784695 |
tatgattcttataaacaatgaaatgatgttctttcttatgaaataatgttctataaaatataaatattgacaaat |
40784621 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 465 - 539
Target Start/End: Original strand, 41217291 - 41217365
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41217291 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
41217365 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 472 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 26457117 - 26457012
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| Q |
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cttataaacaatgaaatgatggttttt-cttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat-taaagtgatcattaa |
569 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||| ||||| |||| |
|
|
| T |
26457117 |
cttataaacaatgaaatgatgtttttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattgacaaatagctatttattacataaaaaatgatcgttaa |
26457018 |
T |
 |
| Q |
570 |
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575 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
26457017 |
tttata |
26457012 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 465 - 637
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563 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||| ||| | || |
|
|
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29806246 |
tatgattcgtataaacaatgaa-tgatgtgtttttcttatgaaatgatattttctaaaatataaatgctggcaaataattatttatttcataaaattaat |
29806344 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttccctt |
637 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
29806345 |
tgttaatttatagatttag-gaagcaagagtaccggtacacctcaatttgcgagtgtaccgtagaagttccctt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #89
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563 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| || | |||||||| ||| |||| |
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|
| T |
5528931 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgtgtttttattatgaaatgatattttataaaatataaatagcgacaaataactatctatttcataaaattgat |
5529029 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttatatattt |
580 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |
|
|
| T |
5529030 |
cattaatttatagattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #90
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563 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| |||| |
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|
| T |
19914271 |
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19914369 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
| |||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19914370 |
cgttaatttataga-tttatgaagcaagagtaccggtacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #91
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447 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||| | | |
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|
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ataattaaatgttatttaccaaaaacgtcaatgaaataaaatttaatttttctgaatttttagtcctcataatagagaattttgattattttttataata |
25592204 |
T |
 |
| Q |
448 |
aaatgaannnnnnnnaata---tgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatat |
531 |
Q |
| |
|
||| | | |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25592203 |
aaaagtaaaaaaaaaaatagtatgatttttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaataacattttctaaaatataaatat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #92
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Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||||| | | || || |||| ||||| ||||| |||||||| || | ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
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|
| T |
51756416 |
gaagaaaaatattgtttttctatcacttataattataataactaaatcttattcatcaaaagtatcaacgaaataaaa-ttaatttttttgaatttttat |
51756318 |
T |
 |
| Q |
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cacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatga |
510 |
Q |
| |
|
||| ||| | ||| ||||||||||||||| || | ||| | | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |
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|
| T |
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cactcatgatggagaacattgattattttttacgatattatgtaaaaatattactatgattcttataaacaatgaaatgatgttttttcttacgaaatga |
51756218 |
T |
 |
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511 |
tgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
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51756217 |
agttctataaaatataaatattgaaaaat |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #93
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465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt-cttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgat |
563 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||| || |||||| ||| ||| |||| |
|
|
| T |
4817246 |
tatgattcgtataaacaatgaaatgatgtttttttcttatgaattgatgttctataaaatataaatattgataaataactatttattacataaaaatgat |
4817147 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttata |
575 |
Q |
| |
|
| |||||||||| |
|
|
| T |
4817146 |
cgttaatttata |
4817135 |
T |
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570 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||| |||| || |||||| ||| ||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
40478002 |
cttataaacaatgaaataatgttttttcttatgaaataatgttctataaaatataaatattga-aaatagctatttattacataaaaaatgatcgttaat |
40478100 |
T |
 |
| Q |
571 |
ttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttccctta |
638 |
Q |
| |
|
||||| | || |||| || |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
40478101 |
ttata-aaattatgaagcaggagtaccggtacacctcactttgtgagtgtaccgtagaagttccctta |
40478167 |
T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26012367 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctagaaaatataaatattgacaaat |
26012293 |
T |
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465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
30349240 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgataaat |
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T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35501026 |
tatgattcttataaacaattaaattatgttttttcttatgaaatggtgttctataaaatataaatattgacaaat |
35501100 |
T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
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39987521 |
tatgattcttataaataattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
39987447 |
T |
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539 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
44522227 |
tatgattcttataaacaatgaacttatgttttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattgataaat |
44522301 |
T |
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378 |
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476 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| || || ||| || | ||| || ||||| |
|
|
| T |
47745978 |
atgaaataaaa-ttaatttttttgaatttttatcactcataattgagaacattgattattttttacgataatatgtaaaaataattactataattcttat |
47746076 |
T |
 |
| Q |
477 |
aaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| || || | |||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47746077 |
aaacaatgaaatgatgtttttcctaataaaatgatgttctataaaatataaatattgacaaat |
47746139 |
T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
50412240 |
tatgattcttataaacaatgaactgatgttttttcttatgaaatgatattctataaaatataaatattgataaat |
50412166 |
T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53289400 |
tatgattcttataaacaattaaataatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
53289326 |
T |
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tataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1021221 |
tataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
1021286 |
T |
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325 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||| || | ||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
26885379 |
aggcaaattttatggtacacccaatatatttgagtgtatcggtacaccaattctttaaattaatagttaaatgagttgtttttt-gaagaaaaata-tta |
26885282 |
T |
 |
| Q |
326 |
ttttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatga |
425 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| | || || |||| ||||| ||||| |||||||| || | ||||||| || || || |||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
26885281 |
ttttttatcatttataattataataactaaatcttattcatcaaaagtgtcaacgaaataattttt--ttgttttgaatttttatcactcataattgaga |
26885184 |
T |
 |
| Q |
426 |
atattgattattttttatgacaaaatg-aannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaata |
524 |
Q |
| |
|
| ||| ||||||||||| || || ||| || | |||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| || |||| | ||||||| |
|
|
| T |
26885183 |
aaatttattattttttacgataatatgtaaaaaaaagtactatgattcttataaacagtaaaatgatgttttttcttatgaaatattgttctataaaata |
26885084 |
T |
 |
| Q |
525 |
taaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
26885083 |
taaatattgacaaat |
26885069 |
T |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
32717897 |
ttataaacaatgaaatgaagttttttcttatgtaatgacattttctaaaatataaatatcaacaaataactttttatttcat |
32717978 |
T |
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534 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35137675 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattga |
35137744 |
T |
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428 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| | |||| ||||||||| ||| | |||| ||||||||| | || ||||||| ||||| |
|
|
| T |
15298542 |
tatcattgacaattacaataattaaatcgtatttaccaaaaacgtcgacgaaataaaatttactctttttttgaatttttgttacatataacaaagaata |
15298443 |
T |
 |
| Q |
429 |
ttgattattttttatgacaaaatg |
452 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
15298442 |
ttgattattttttatgagaaaatg |
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T |
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551 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || || ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
25480461 |
cttataaacaatgaaataatatttcttcttatgaaacgatgttttctaaaattataaatattgacaaataactttttattt |
25480381 |
T |
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatatt |
532 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
37127966 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaataatgttctataaaatataaatatt |
37127906 |
T |
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaa |
537 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51350802 |
tatgattcttataaacagtcaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaa |
51350730 |
T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatgg-tttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgat |
563 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
52024607 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgtatttttcttctgaaatcatattttctaaaatataaatgccgacaaataactatttatttcataaaattgat |
52024509 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
| ||| |||||| | ||| ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
52024508 |
cgttagtttataga-tttatgaaacaagagtacctgtacac |
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T |
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ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgaca |
536 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10279167 |
ttataaacaataaaatgatattttttcttatgaaatgatgttgtgtaaaatataaatattgaca |
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T |
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571 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||| | ||| |||||| |
|
|
| T |
24170175 |
cttataaataatgaaatgatattttttcttataaaatgatgttctataaaatataaatattgacaaaaagctatttattacataaaaataatccttaatt |
24170274 |
T |
 |
| Q |
572 |
tata |
575 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
24170275 |
tata |
24170278 |
T |
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |
|
|
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40474079 |
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T |
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
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cttataaacaatgaaattatgttttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatgttgataaat |
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T |
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aattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataac |
420 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||||| || ||| | |
|
|
| T |
53176892 |
aattattttctatcattgataattataataattaaatcttatttaccaaaaatttcgacaaaataaaatttacttttttttaatttttattactcatgat |
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T |
 |
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aatgaatattgattattttt |
440 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||||||||| |
|
|
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53176792 |
aaagaatatcgattattttt |
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T |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7862690 |
ttataaacaatgaaatgatt-tttttcttataaaatgatgttgtataaaatataaatattgacaaat |
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T |
 |
Back To:
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Target: chr3; HSP #118
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465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
13756476 |
tatgattcttataaataattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattaacaaat |
13756402 |
T |
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Target: chr3; HSP #119
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494 |
tttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagag |
593 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||| | ||| ||||| |
|
|
| T |
23796043 |
tttttcttatgacatgatattttctaaaatataaatgccgacaaataattatttatttcataaaattgatcgttaatttatagatttag-gaagtaagag |
23796141 |
T |
 |
| Q |
594 |
taccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
23796142 |
taccggtacac |
23796152 |
T |
 |
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29388865 |
tatgattcttatcaacaattaaatgatgtttttttttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
29388791 |
T |
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Target: chr3; HSP #121
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ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatat |
531 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
29629144 |
ttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaatgacattttttaaaatataaatat |
29629086 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #122
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgat |
563 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| || || || |||| |||||||||||| ||||||| || ||||||| || ||| |||| |
|
|
| T |
35749091 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgcgtttttcttcggaaatcatattttttaaaatataaatgccgacaaataactatttatttgataaaattgat |
35748993 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttccctta |
638 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||| |||| ||||||||||| ||||| | || ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
35748992 |
cattaatttataga-tttatgaagcaagagtaccgatacacctctatttacgagtgtatcgtagaagttccctta |
35748919 |
T |
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Target: chr3; HSP #123
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| Q |
329 |
tctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaata |
428 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || | |||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| | || || |
|
|
| T |
38296979 |
tctatcatttacaattataaaaattaaatcttatttaccaaaagc---gacgaaataaaatttaatttttttgaatttttattactcataatgaagatta |
38297075 |
T |
 |
| Q |
429 |
ttgattattttttatga |
445 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38297076 |
ttgattattttttatga |
38297092 |
T |
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Target: chr3; HSP #124
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| Q |
350 |
aattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaa |
449 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||| | || ||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
41982672 |
aattaaatcttatttaccaaaagtgtcgacaaaataaaatttattttttttgaatttttattactcataatgaagattattgattattttttatga-gta |
41982574 |
T |
 |
| Q |
450 |
atgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttt--ttcttatgagatgatgttttctaaa |
521 |
Q |
| |
|
||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
41982573 |
atgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaattatgtttttcttcttatgaaatgatgttttctaaa |
41982500 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #125
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| Q |
481 |
aatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44379568 |
aatgaaataatgttttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattgacaaat |
44379510 |
T |
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Target: chr3; HSP #126
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
50258037 |
tatgattcttataaacaattaaatgatattttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattaacaaat |
50258111 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #127
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| Q |
493 |
gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaaga |
592 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| || ||| ||| || ||| ||||| |||||||||| |||| | ||||||||| |
|
|
| T |
52162648 |
gtttttcttatgaaattatattttctaaaatataaatgccgataaataactatttgttttataaaattgatcgttaatttatagatttag-gaaacaaga |
52162746 |
T |
 |
| Q |
593 |
gtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagt |
631 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
52162747 |
gtaccggtacactgcaatttacgagtgtatcgtagaagt |
52162785 |
T |
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Target: chr3; HSP #128
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| Q |
473 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaa |
538 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
36099409 |
ttataaacaatgaaatgatttttttttttatgaaatgatgttctataaaatataactattgacaaa |
36099474 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #129
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttctt---atgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat-taaagt |
560 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| || |||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||| | |
|
|
| T |
37520875 |
tatgattcttataaacaatgaactgatgttttttttttttatgaaatgatgttctataaaatataaatattgataaatagttatttatttcataaaaaat |
37520776 |
T |
 |
| Q |
561 |
gatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttccct |
636 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
37520775 |
gatcgttaatttata-aaattatgaagaaagagtaccggtacacctcattttgtgagtgtaccgtagaagttccct |
37520701 |
T |
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Target: chr3; HSP #130
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ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttt |
440 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| |||| | | ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| | |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
4659874 |
ataattaaatcttatttaccaaaatcttcaacgcaataaaatttaatttttctgaatttttattactcataatagagaattttgattattttt |
4659966 |
T |
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Target: chr3; HSP #131
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| Q |
329 |
tctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaata |
428 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || | |||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| | || || |
|
|
| T |
5639759 |
tctatcatttacaattataaaaattaaatcttatttaccaaaaatatcgacgaaataaaatttaatttttttgaatttttattattcataatgaagatta |
5639858 |
T |
 |
| Q |
429 |
ttgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttt--ttcttatgagatgatgttttct |
518 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
5639859 |
ttgattattttttatgagtaa-tgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaattatgtttttcttcttatgaaatgatgttttct |
5639949 |
T |
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Target: chr3; HSP #132
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| Q |
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaata-taaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
14653946 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttctaataaaatgatgttctgtaaaatattaaatattgacaaat |
14653878 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #133
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395 |
ttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggt |
494 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| ||||| | ||| ||| |||||||||||||| || ||| | | ||| || |||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
25834397 |
ttttttgaatttttatcactcataatagagaacattcattattttttatgataatatgtaaaaaaattactataattcttataaacaatgaaatgatatt |
25834496 |
T |
 |
| Q |
495 |
ttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||| |||||| || ||||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25834497 |
ttttattatgaaataatgttctataaaatataaatattgaaaaat |
25834541 |
T |
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Target: chr3; HSP #134
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt-cttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat-taaagtga |
562 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||| | || |||||||||| ||| | | |
|
|
| T |
44653407 |
tatgattcttataaacaataaactgatgtttttttcttgtgaaatgatgttctataaaatataaatattgataaaag-ctatttatttcataaaaaataa |
44653505 |
T |
 |
| Q |
563 |
tcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttccc |
635 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| | || ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
44653506 |
tcgttaatttata-aaattatgaaaaaagagtaccggtacacctcattttgtgagtgtaccgtagaagttccc |
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T |
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
54910992 |
cttataaaaaatgaaatgatgttttttcttatgggataatattttctaaaatataaa |
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T |
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589 |
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636 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
2667986 |
aagagtaccggtacactcaaaattgcgagtgtaccgtagaagttccct |
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T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || || |||| ||||||||||| |
|
|
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tatgattcttataaacaatgaaattatgttttttcttatgaaataatattttttaaaatataaa |
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T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
35389461 |
tatgattcttataaacaatgaactgatgtttttttcttatga-atgatgttctataaaatataaatattgataaat |
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T |
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36220649 |
cttataaacaatgaaatgatattttttcttacaaattgatgttctataaaatataaatattgacaaat |
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T |
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gaagaaaaa-taattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttt |
407 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||| ||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
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gaagaaaaactaattattttctatcattgacaattataataattaaatcttatttaccaaaa---acgataaaataaaatttactttttttgaatttt |
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T |
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atgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaat |
529 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
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atgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttacgaaatgttgttctctaaaatataaat |
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T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
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tatgattcttataaatgatgaaatgatgttttttcttatgaaatgatattttttaaaatataaa |
52458054 |
T |
 |
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Target: chr3; HSP #143
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||| |||| ||| ||||| |||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34825504 |
tatgattcctataaacaattaaataatgttttttattatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
34825578 |
T |
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Target: chr3; HSP #144
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502 |
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601 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | || || ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
52082175 |
atgaaatgatattttctaaaatataaatatcaacaaataactttttatttcataaaaataatagttcatttataaatttt-tgaagtaagagtaccggta |
52082077 |
T |
 |
| Q |
602 |
cac |
604 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
52082076 |
cac |
52082074 |
T |
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Target: chr3; HSP #145
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348 |
ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattatttttta |
442 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||| || |||||| |||||||||| || | ||| | |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
52082310 |
ataattaaatcttatttatcaaaaacatcgacgaaataaaatttgatttttctgaatttttagtactcgtaatagagaattttgattatttttta |
52082216 |
T |
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Target: chr3; HSP #146
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| Q |
463 |
aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtga |
562 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||||| || |||||| ||| ||| | | |
|
|
| T |
788644 |
aatatgatttttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaataacatttcataaaatataaatatcaacaaatagctctttattccataaaaataa |
788545 |
T |
 |
| Q |
563 |
tcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
| |||||||| | ||||| |||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
788544 |
tagttaatttaaagatttt-tgaagtaggagtaccggtacac |
788504 |
T |
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Target: chr3; HSP #147
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572 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| | ||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||| |
|
|
| T |
8966177 |
tataaacaatgaa-tgatgtgtttttcttatgaaatgatattttctgagatacaaatgccgacaaataactttttatttcataaaattgattgttaatgc |
8966275 |
T |
 |
| Q |
573 |
atatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttccctta |
638 |
Q |
| |
|
||| |||| | ||| || |||||||||||||| || || |||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
8966276 |
ataaatttag-gaagcaggagtaccggtacaccttaatttatgagtgtaccgtagaagttccctta |
8966340 |
T |
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Target: chr3; HSP #148
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311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaattttt |
408 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||| || || ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
27525272 |
gaagaaaaataattgttttctatcattaacaattacaatagctagatcttatttaacaaaagtgtcgacgaaataaaatttattttttttgaattttt |
27525369 |
T |
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Target: chr3; HSP #149
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| Q |
473 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
31309123 |
ttataaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
31309176 |
T |
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Target: chr3; HSP #150
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attttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatg |
424 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||| || | |||||||| ||||| | |||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |
|
|
| T |
55417919 |
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55418018 |
T |
 |
| Q |
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430 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
55418019 |
aatatt |
55418024 |
T |
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Target: chr3; HSP #151
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| Q |
348 |
ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgaca |
447 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||| | ||||| | |||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||| || ||||| | |||| ||| |||||||||| | | |
|
|
| T |
7671919 |
ataataaaatcttattaaccaaaaacgtcgacgaaataaaatttaatttttctgagtttttagtactcataatagagaattttgtttattttttacaata |
7672018 |
T |
 |
| Q |
448 |
aaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatat |
531 |
Q |
| |
|
||||| | | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7672019 |
aaatgtaaaaaaattagtatgatttttataaacaatgaaatgatgtttttttcttataaaatgacattttctaaaatataaatat |
7672103 |
T |
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Target: chr3; HSP #152
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Query Start/End: Original strand, 472 - 528
Target Start/End: Original strand, 8324632 - 8324688
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| Q |
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |
|
|
| T |
8324632 |
cttataaaaaatgaaatgatgttttttcttatgggatattattttctaaaatataaa |
8324688 |
T |
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Target: chr3; HSP #153
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563 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| | || |
|
|
| T |
8433664 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgtgtttttattatgacatgaa-ttttctaaaatataaatgccgacaaataactatttatttcataaaattaat |
8433761 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8433762 |
tgttaatttata-aatttaagaagcaagagtaccggtacac |
8433801 |
T |
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Target: chr3; HSP #154
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| Q |
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atatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt-cttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| | |||||||| ||||| ||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25482423 |
atatgattcttataaacagtaaaatgatgcttttttcttatgaaatgttgtcctataaaatataaatattgacaaat |
25482347 |
T |
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Target: chr3; HSP #155
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348 |
ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttt |
440 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| |||| | ||||||||| ||||||||| ||||||| || || ||||| | |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
45518756 |
ataattaaatcttatttaccaaaaacttcaacgaaataaaatttaatttttctgaatttctaatactcataatagagaattttgattattttt |
45518848 |
T |
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Target: chr3; HSP #156
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| Q |
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ttataaacaatgaaatgatggttttt-cttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatt |
571 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||| ||| | || |||||| |
|
|
| T |
53516744 |
ttataaacaatgaaatgacgtttttttcttatgaaatgacattttctaaaatataaatatcaacaaatagctctttattccataaaaataatagttaatt |
53516645 |
T |
 |
| Q |
572 |
tatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
|| | ||||| | || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
53516644 |
ta-aaattttttaaagtaagagtaccggtacac |
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T |
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Target: chr3; HSP #157
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tcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatt |
550 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
55418049 |
tcttatgaaatgatgttttttaaaatataaacattgacaaatagctttttatt |
55418101 |
T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
41902187 |
tatgattcttataaa-aatgaaatgatattttttcttatgaaataatattttctaaaatataaa |
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T |
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat-taaagtgatcattaat |
570 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| | ||||||||||||||| |||||| | |||||| ||| ||| | ||| ||||| |
|
|
| T |
42478931 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttctaaa---atgatgttatataaaatataaatattaacaaatagttatttattacataaaaaattatcgttaat |
42479027 |
T |
 |
| Q |
571 |
ttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
||||| | || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42479028 |
ttata-aaattatgaaacaagagtaccggtacac |
42479060 |
T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
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|
|||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| || || |||| | ||||||||| |
|
|
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tatgattcttataaataatgaaatgatgttttttcttatgaaataatatttttttaaatataaa |
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T |
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ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatat |
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Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
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T |
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aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttt-tcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
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Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
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19608525 |
aatatgatttttataaacaatgaaatgatatttttttcttatgaaataatattttctaaaatataaa |
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taaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
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29786693 |
taaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
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taaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
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Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
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taaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
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554 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||| |
|
|
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taaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
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| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
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539 |
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| |
|
|||||| |||||||||| | | || ||| |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
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tataaacaatgaaatgatggttttt---cttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
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| |
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|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #169
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Target Start/End: Complemental strand, 876384 - 876331
Alignment:
| Q |
473 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
876384 |
ttataaaaaatgaaatgatgttttatcttataaaatgatattttctaaaatata |
876331 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #170
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Query Start/End: Original strand, 475 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 21288973 - 21288916
Alignment:
| Q |
475 |
ataaacaatgaaatgatggttttt-cttatgagatgatgttttctaaaatataaatat |
531 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21288973 |
ataaacaatgaaatgacgtttttttcttatgaaatgacattttctaaaatataaatat |
21288916 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #171
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Target Start/End: Complemental strand, 22830519 - 22830478
Alignment:
| Q |
229 |
gcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtg |
270 |
Q |
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||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |
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22830519 |
gcaaattctatggtatacctaataaatttgggtgtatcggtg |
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T |
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Target: chr3; HSP #172
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Target Start/End: Original strand, 24397668 - 24397736
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| Q |
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tgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattt |
580 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |
|
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24397668 |
tgttttctaaaatataaataatgacaaataacaacttatttca-taaaatgatcattaatttataaattt |
24397736 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 473 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 38785244 - 38785191
Alignment:
| Q |
473 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
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|
||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
38785244 |
ttataaaaaatgaaatgatattttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
38785191 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 473 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 42364090 - 42364037
Alignment:
| Q |
473 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
42364090 |
ttataaaaaatgaaatgatattttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
42364037 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 473 - 526
Target Start/End: Original strand, 46959796 - 46959849
Alignment:
| Q |
473 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
46959796 |
ttataaaaaatgaaattatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
46959849 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 467 - 528
Target Start/End: Original strand, 47244320 - 47244381
Alignment:
| Q |
467 |
tgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
47244320 |
tgattcttataaataattaaatgatattttttcttatgaaataatattttctaaaatataaa |
47244381 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 154)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 231 - 635
Target Start/End: Original strand, 36835345 - 36835749
Alignment:
| Q |
231 |
aaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttc |
330 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36835345 |
aaattctatggtacaccaaataaatttgggtgtatcggtacaccaagtcgtacaattaataataaataagttttttttttgaagaaaaataattattttc |
36835444 |
T |
 |
| Q |
331 |
tatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatatt |
430 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
36835445 |
tatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagattcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatatt |
36835544 |
T |
 |
| Q |
431 |
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530 |
Q |
| |
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|
|
| T |
36835545 |
gattattttttatgacaaaatgtaatttctttagtatgatccttataaacaatgaaatgatgatttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaata |
36835644 |
T |
 |
| Q |
531 |
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630 |
Q |
| |
|
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|
| T |
36835645 |
ttgacaaatacctttttatttcattaaagtgatcgttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtaccatagaag |
36835744 |
T |
 |
| Q |
631 |
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635 |
Q |
| |
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||||| |
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| T |
36835745 |
ttccc |
36835749 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 228 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 28897310 - 28896904
Alignment:
| Q |
228 |
ggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattatt |
327 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28897310 |
ggcaaattctatggtacacccaataaatttgggtgtattggtacaccaagtcataaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattatt |
28897211 |
T |
 |
| Q |
328 |
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427 |
Q |
| |
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|
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| T |
28897210 |
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28897111 |
T |
 |
| Q |
428 |
attgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataa |
527 |
Q |
| |
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|
| T |
28897110 |
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28897011 |
T |
 |
| Q |
528 |
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627 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
28897010 |
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28896913 |
T |
 |
| Q |
628 |
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636 |
Q |
| |
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|
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| T |
28896912 |
aagttccct |
28896904 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 231 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 37766706 - 37766301
Alignment:
| Q |
231 |
aaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttc |
330 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37766706 |
aaattctatggtacacctaataaatttggatgtatcggtataccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttc |
37766607 |
T |
 |
| Q |
331 |
tatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatatt |
430 |
Q |
| |
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|
| T |
37766606 |
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37766507 |
T |
 |
| Q |
431 |
gattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaata |
530 |
Q |
| |
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|
| T |
37766506 |
gattattttttatgacaaaatgtaaattttgtaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttttttatgaaatgatgttttctaatatttaaata |
37766407 |
T |
 |
| Q |
531 |
ttgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaag |
630 |
Q |
| |
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| T |
37766406 |
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37766307 |
T |
 |
| Q |
631 |
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636 |
Q |
| |
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| T |
37766306 |
ttccct |
37766301 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 226 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 45393855 - 45393443
Alignment:
| Q |
226 |
aaggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataatta |
325 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
45393855 |
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45393756 |
T |
 |
| Q |
326 |
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425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
45393755 |
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45393656 |
T |
 |
| Q |
426 |
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525 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
45393655 |
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45393556 |
T |
 |
| Q |
526 |
aaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcat |
625 |
Q |
| |
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| T |
45393555 |
aaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatatttaatttatatattttatgaaacaagagtaccagtacattcaaaattgtgagtgtaccat |
45393456 |
T |
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| Q |
626 |
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638 |
Q |
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| T |
45393455 |
atcagttccctta |
45393443 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 256 - 633
Target Start/End: Original strand, 7223511 - 7223888
Alignment:
| Q |
256 |
ttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaa |
355 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
7223511 |
ttggatgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaaaataattaa |
7223610 |
T |
 |
| Q |
356 |
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455 |
Q |
| |
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|
| T |
7223611 |
attttatataccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaattttcattactcatgacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaa |
7223710 |
T |
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| Q |
456 |
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555 |
Q |
| |
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|
| T |
7223711 |
attttgtaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatacctttttatttcatt |
7223810 |
T |
 |
| Q |
556 |
aaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttc |
633 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
7223811 |
aaagtgatctttaatttatatattttgtaaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtaccatagaagttc |
7223888 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 226 - 621
Target Start/End: Original strand, 45401146 - 45401541
Alignment:
| Q |
226 |
aaggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataatta |
325 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
45401146 |
aaggtaaattctatggtacatctaataaatttggatgtatcggtacatcaagttgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataatta |
45401245 |
T |
 |
| Q |
326 |
ttttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatga |
425 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
45401246 |
ttttctatcattgacaactaagataattaaattttatataccaaaagtttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatga |
45401345 |
T |
 |
| Q |
426 |
atattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatat |
525 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |
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|
| T |
45401346 |
atattgattattttttatgacaaaatgtaaattttgtaatatgatccttataaataatgaaatgatggtttttcttataaaatgatgttttctaaaatat |
45401445 |
T |
 |
| Q |
526 |
aaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgta |
621 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45401446 |
aaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatctttaatttatatattttgtgaaacaagagtagcggtacattcaaaattgtgagtgta |
45401541 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 271 - 634
Target Start/End: Original strand, 38627030 - 38627393
Alignment:
| Q |
271 |
caccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaa |
370 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
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caccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatataccaaa |
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T |
 |
| Q |
371 |
agcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgat |
470 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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agtttcgatgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattttgtaatatgat |
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T |
 |
| Q |
471 |
ccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaat |
570 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
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ccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttttaaaatataaatattgacaaatacttttttatttcattaaagtgatctttaat |
38627329 |
T |
 |
| Q |
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ttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttcc |
634 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
38627330 |
ttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacacttaaaattgtgagtgtaccatagaagttcc |
38627393 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 228 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 1426735 - 1426327
Alignment:
| Q |
228 |
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327 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
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Target Start/End: Original strand, 38971463 - 38971870
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 227 - 634
Target Start/End: Original strand, 39002561 - 39002968
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 230 - 633
Target Start/End: Original strand, 464250 - 464655
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 227 - 638
Target Start/End: Original strand, 21835430 - 21835841
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 228 - 635
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 228 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 311308 - 310903
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 230 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 12266481 - 12266073
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 228 - 636
Target Start/End: Original strand, 38803434 - 38803842
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T |
 |
| Q |
328 |
ttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaat |
427 |
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T |
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attgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataa |
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| T |
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38803733 |
T |
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528 |
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627 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 324 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 14914155 - 14913843
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324 |
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T |
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Target: chr8; HSP #18
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Target Start/End: Complemental strand, 43183109 - 43182724
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T |
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Target: chr8; HSP #19
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Target Start/End: Complemental strand, 27101222 - 27100815
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423 |
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523 |
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Target: chr8; HSP #20
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Target Start/End: Complemental strand, 29040019 - 29039619
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aa |
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Target: chr8; HSP #21
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Q |
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427 |
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527 |
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Q |
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35037856 |
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| |
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426 |
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37404811 |
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427 |
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502 |
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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 230 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 41572113 - 41571749
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Q |
| |
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T |
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429 |
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| |
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| |
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T |
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| |
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| |
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T |
 |
| Q |
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| |
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 |
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Q |
| |
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34520853 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
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Query Start/End: Original strand, 314 - 580
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gaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcac |
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Q |
| |
|
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T |
 |
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512 |
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| |
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| T |
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T |
 |
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513 |
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580 |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 315 - 539
Target Start/End: Original strand, 37218689 - 37218913
Alignment:
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315 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacc |
414 |
Q |
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| T |
37218689 |
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37218788 |
T |
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| Q |
415 |
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514 |
Q |
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| T |
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37218888 |
T |
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539 |
Q |
| |
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| T |
37218889 |
ttctaaaatataaatattgacaaat |
37218913 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 311 - 554
Target Start/End: Original strand, 27970095 - 27970338
Alignment:
| Q |
311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
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| T |
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27970194 |
T |
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| Q |
411 |
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510 |
Q |
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| T |
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27970294 |
T |
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| Q |
511 |
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554 |
Q |
| |
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| T |
27970295 |
tgttttctaaaatataaatatcgataaataactctttatttcat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 311 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 5982510 - 5982238
Alignment:
| Q |
311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaactta-atttttatgaattttta |
409 |
Q |
| |
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| T |
5982510 |
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5982411 |
T |
 |
| Q |
410 |
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506 |
Q |
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| T |
5982410 |
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5982311 |
T |
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| Q |
507 |
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580 |
Q |
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| T |
5982310 |
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5982238 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 315 - 575
Target Start/End: Original strand, 43331830 - 43332092
Alignment:
| Q |
315 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacc |
414 |
Q |
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T |
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| Q |
415 |
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511 |
Q |
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| T |
43331930 |
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43332029 |
T |
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| Q |
512 |
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575 |
Q |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 315 - 575
Target Start/End: Original strand, 44309652 - 44309914
Alignment:
| Q |
315 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacc |
414 |
Q |
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| T |
44309652 |
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T |
 |
| Q |
415 |
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511 |
Q |
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| T |
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44309851 |
T |
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| Q |
512 |
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575 |
Q |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Original strand, 41674570 - 41674836
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| Q |
315 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacc |
414 |
Q |
| |
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| T |
41674570 |
aaaaataattattttctatcattgacaattataataattaaatcttatttatcaaaagcgtcgatgaaataaaatttactttttttgaatttttattgct |
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T |
 |
| Q |
415 |
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512 |
Q |
| |
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| T |
41674670 |
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41674769 |
T |
 |
| Q |
513 |
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580 |
Q |
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| T |
41674770 |
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41674836 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 321 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 12633218 - 12633000
Alignment:
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aattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataac |
420 |
Q |
| |
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| T |
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12633120 |
T |
 |
| Q |
421 |
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519 |
Q |
| |
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| T |
12633119 |
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12633020 |
T |
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| Q |
520 |
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539 |
Q |
| |
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| T |
12633019 |
aaatataaacattgacaaat |
12633000 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 315 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 34058150 - 34057923
Alignment:
| Q |
315 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacc |
414 |
Q |
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| T |
34058150 |
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34058051 |
T |
 |
| Q |
415 |
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511 |
Q |
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| T |
34058050 |
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34057951 |
T |
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| Q |
512 |
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539 |
Q |
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| T |
34057950 |
gttttttaaaatataaataatgacaaat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 315 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 5215641 - 5215417
Alignment:
| Q |
315 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacc |
414 |
Q |
| |
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| T |
5215641 |
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5215542 |
T |
 |
| Q |
415 |
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514 |
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| T |
5215541 |
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5215442 |
T |
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539 |
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| T |
5215441 |
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5215417 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 11360488 - 11360223
Alignment:
| Q |
315 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacc |
414 |
Q |
| |
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| T |
11360488 |
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T |
 |
| Q |
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cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgt |
513 |
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| |
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| T |
11360388 |
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11360289 |
T |
 |
| Q |
514 |
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580 |
Q |
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| T |
11360288 |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 311 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 31893656 - 31893365
Alignment:
| Q |
311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
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| T |
31893656 |
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T |
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| Q |
411 |
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510 |
Q |
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| T |
31893556 |
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31893457 |
T |
 |
| Q |
511 |
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604 |
Q |
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| T |
31893456 |
tgttttataaaatataaatattgataaataactctttatttca-taaaatgatcgttaaattataaatttt-tgaaacaggagtatcggtacac |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 315 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 2880249 - 2880025
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2880151 |
T |
 |
| Q |
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cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatg--gtttttcttatgagatgatg |
512 |
Q |
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| T |
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2880052 |
T |
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513 |
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539 |
Q |
| |
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| T |
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 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 315 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 30777591 - 30777368
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Q |
| |
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T |
 |
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cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt-cttatgagatgatgt |
513 |
Q |
| |
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| T |
30777491 |
cataacgaagaatattaattattttttatgagaaaatattaaaaatttaatataattcttataaacaatgaaatgatgtttttttcttatgagatgatgt |
30777392 |
T |
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| Q |
514 |
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537 |
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30777391 |
tttctaaaatataaatattaacaa |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 311 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 32071564 - 32071351
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T |
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cacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgat-ggtttttcttatgagatg |
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32071365 |
T |
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510 |
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523 |
Q |
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|||||||||||||| |
|
|
| T |
32071364 |
atgttttctaaaat |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #42
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Target Start/End: Original strand, 40824550 - 40824809
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413 |
Q |
| |
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T |
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414 |
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511 |
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40824749 |
T |
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| Q |
512 |
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572 |
Q |
| |
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| T |
40824750 |
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T |
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Target: chr8; HSP #43
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Q |
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12801106 |
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T |
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326 |
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Q |
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12801301 |
T |
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523 |
Q |
| |
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12801401 |
T |
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580 |
Q |
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ataaatattgactaatagctttttatttca-taaaatgatctttaatttataaattt |
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T |
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Target: chr8; HSP #44
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Target Start/End: Original strand, 2666593 - 2666808
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409 |
Q |
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|
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T |
 |
| Q |
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Q |
| |
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2666792 |
T |
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525 |
Q |
| |
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2666793 |
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T |
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Target: chr8; HSP #45
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Q |
| |
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T |
 |
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Q |
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||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |
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17069453 |
cataatgaagaatattgattattttttatgagaaaatg |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 315 - 452
Target Start/End: Original strand, 17578720 - 17578857
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414 |
Q |
| |
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T |
 |
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452 |
Q |
| |
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17578820 |
cataatgaagaatattgattattttttatgagaaaatg |
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T |
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Target: chr8; HSP #47
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Target Start/End: Complemental strand, 42165227 - 42165002
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410 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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510 |
Q |
| |
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42165031 |
T |
 |
| Q |
511 |
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539 |
Q |
| |
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tgttttctaaaatataaatattgataaat |
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Target: chr8; HSP #48
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Query Start/End: Original strand, 314 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 464135 - 463997
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413 |
Q |
| |
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464036 |
T |
 |
| Q |
414 |
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452 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |
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tcataataaataatattgattattttttatgataaaatg |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 311 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 9008359 - 9008069
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410 |
Q |
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|
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T |
 |
| Q |
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510 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
511 |
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604 |
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| |
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9008160 |
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T |
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Target: chr8; HSP #50
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Target Start/End: Original strand, 17642192 - 17642448
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Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||| || |||||| |||||||||| || | ||| | |||| |||||||||||||| | | |
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17642291 |
T |
 |
| Q |
448 |
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545 |
Q |
| |
|
|| || | | |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |
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| T |
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17642390 |
T |
 |
| Q |
546 |
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604 |
Q |
| |
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||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
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ttatttcataaaaatgatagttaatttataaatttt-tgaagtaagagtaccggtacac |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 314 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 36569970 - 36569874
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gaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
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Q |
| |
|
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|
|
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36569970 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 311 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 35754780 - 35754538
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
|
||||||||| || | |||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||| | || ||||||||| ||| ||||| ||||||||| | |
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|
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T |
 |
| Q |
411 |
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510 |
Q |
| |
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| T |
35754680 |
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35754582 |
T |
 |
| Q |
511 |
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554 |
Q |
| |
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||| |||||||||||||||||| | |||| || |||||||||| |
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|
| T |
35754581 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #53
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Query Start/End: Original strand, 348 - 580
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Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| | ||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||| | |
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T |
 |
| Q |
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aaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt----cttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcct |
543 |
Q |
| |
|
||||| ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |
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| T |
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aaatgttaaaaatttaatataattcatataaacaatgaaatgatgtttttttttcctcatgagatggtgttttctaaaatataaataatgacaaataaca |
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T |
 |
| Q |
544 |
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580 |
Q |
| |
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|| ||||| |||| |||||||||||||||| |||| |
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|
| T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 311 - 554
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Q |
| |
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|||||||| |||||||||| | | |||||||| || | |||||||| ||||||| ||||||| || | |||||||| |||||||| ||||||||||| |
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|
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T |
 |
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510 |
Q |
| |
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|| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
511 |
tgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat |
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Q |
| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 311 - 539
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Q |
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|
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|
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gaagaaaaagaattgttttctatcattaacaattacaataattagatcttagttaccgaaagtgtcgacgaaataaaatttacattttttgaatttttgt |
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 |
| Q |
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cacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatga |
510 |
Q |
| |
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| T |
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tacatataataaagaatatttattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaatgatgtttattcttataaaacga |
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T |
 |
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tgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||||| |||| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 17838659 - 17838433
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acccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatga |
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Q |
| |
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| T |
17838560 |
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17838462 |
T |
 |
| Q |
511 |
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539 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
17838461 |
tgttttctaaaatataaaccttgacaaat |
17838433 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #57
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Target Start/End: Original strand, 5273145 - 5273240
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410 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
5273145 |
aaaaataattattttctatcattggcaattataataattaaatcttatttaccaaaagcgtcgatgaaataaaatttactttttttgaatttttat |
5273240 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #58
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228 |
ggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaat |
297 |
Q |
| |
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|||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29565756 |
ggcaaattctatggtacacccaataaatttgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaat |
29565687 |
T |
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Target: chr8; HSP #59
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| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
45452548 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgagatgatgttctataaaatataaattttgacaaat |
45452481 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
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Target Start/End: Complemental strand, 38765063 - 38764818
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311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaac--ttaatttttatgaattttt |
408 |
Q |
| |
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| T |
38765063 |
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38764964 |
T |
 |
| Q |
409 |
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508 |
Q |
| |
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| || ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | || |
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| T |
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38764864 |
T |
 |
| Q |
509 |
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554 |
Q |
| |
|
||| | || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
38764863 |
gatatattataaaatataaatattgataaataactctttatttcat |
38764818 |
T |
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Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 348 - 604
Target Start/End: Original strand, 2273128 - 2273384
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348 |
ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgaca |
447 |
Q |
| |
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|||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||| || |||||| |||||||||| || | ||| | |||| |||||||| |||| | | |
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|
| T |
2273128 |
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2273227 |
T |
 |
| Q |
448 |
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546 |
Q |
| |
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||||| | | |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||| |
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| T |
2273228 |
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2273327 |
T |
 |
| Q |
547 |
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604 |
Q |
| |
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|||||||| ||| ||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
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| T |
2273328 |
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2273384 |
T |
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Back To:
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Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 311 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 44578978 - 44578749
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311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaat-ttttatgaattttta |
409 |
Q |
| |
|
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| T |
44578978 |
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44578879 |
T |
 |
| Q |
410 |
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509 |
Q |
| |
|
| || ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||| |
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|
| T |
44578878 |
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44578779 |
T |
 |
| Q |
510 |
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539 |
Q |
| |
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| || || ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
44578778 |
acgtcttataaaatataaatattgataaat |
44578749 |
T |
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Target: chr8; HSP #63
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Query Start/End: Original strand, 329 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 23870574 - 23870458
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428 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || | |||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| | || || |
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| T |
23870574 |
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23870475 |
T |
 |
| Q |
429 |
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445 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23870474 |
ttgattattttttatga |
23870458 |
T |
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Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 472 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 29454306 - 29454143
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570 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
29454306 |
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29454207 |
T |
 |
| Q |
571 |
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635 |
Q |
| |
|
||||| | || |||| || |||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
29454206 |
ttata-aaattatgaagcaggagtaccggtacaccttactttgtgagtgtaccgtagaagttccc |
29454143 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 348 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 34166197 - 34166006
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446 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
34166197 |
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34166099 |
T |
 |
| Q |
447 |
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539 |
Q |
| |
|
|| ||| | | || || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
34166098 |
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34166006 |
T |
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Target: chr8; HSP #66
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Query Start/End: Original strand, 472 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 2749478 - 2749411
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
2749478 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattgataaat |
2749411 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 472 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 4214657 - 4214590
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472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4214657 |
cttataaacaatgaaatcatgttttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattgacaaat |
4214590 |
T |
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Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 315 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 40972385 - 40972314
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386 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
40972385 |
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40972314 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 228 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14914220 - 14914154
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ggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataata |
294 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14914220 |
ggcaaattctatggtacatccaataaatttgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataata |
14914154 |
T |
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Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
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ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatg-aatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgac |
446 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||| | |||| |||| || |||| | |||||||||| ||||||||||| |
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|
| T |
28885801 |
ataattaaatcttatttaccaaaag-ttcgacgaaataaaaattactttttttttaattcttattacttataatatagaatattgataattttttatgaa |
28885899 |
T |
 |
| Q |
447 |
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545 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||||||||| ||||| || |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |
|
|
| T |
28885900 |
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28885999 |
T |
 |
| Q |
546 |
ttatttcattaaagtgatcattaatttatatattt |
580 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| | ||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
28886000 |
ttatttca-taaaataatccttaatttataaattt |
28886033 |
T |
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Target: chr8; HSP #71
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
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38329621 |
tatgattcttataaacaatgaaatgatgttttttcttacgaaatgatgttctataaaatataaatattgaaaaat |
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T |
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Target: chr8; HSP #72
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39646807 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
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T |
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Target: chr8; HSP #73
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41720485 |
tatgattcttataaacaattaaacgatgttttttcttatgaaatgttgttttataaaatataaatattgacaaat |
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T |
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Target: chr8; HSP #74
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
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tatgattcttataaacaatgaactgatgttttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattgataaat |
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Target: chr8; HSP #75
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446 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| | |||| |||||||||||||| | |
|
|
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gataattaaatcttatttaccaaaaacgtcgacgaaataaaatttaatttttctgaatttttagtacttataatagagaattttgattattttttacaat |
16323775 |
T |
 |
| Q |
447 |
aaaatga-annnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatat |
531 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aaaatgtgaacaaaattaatatgattttgataaacaatgaaatgatattttttcttatgaaatgacattttctaaaatataaatat |
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Target: chr8; HSP #76
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570 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || | |||||||||||| |||| |||| | ||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
571 |
ttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
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||||| | || |||| ||||||||||||||||| |
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| T |
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| |
|
|||||||||||||| || | |||||||| ||||||| ||||| | ||||||||| ||| | |||| || ||||||||||| || ||||| | || || |
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| T |
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tctatcattgacaattataaaaattaaatcttatttaccaaaatgt-cgatgaaattaaattaaattcttttgaatttttattactcataatgaagatta |
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T |
 |
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ttgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatg---gtttttcttatgagatgatgttttctaaa |
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Q |
| |
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ttgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaattatgtttttttttcttatgaaatgatgttttctaaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #78
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Target Start/End: Complemental strand, 42194820 - 42194739
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473 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat |
554 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
42194820 |
ttataaacaatggaacgatgtttcttattatgagatgatgttttctaaaatataaacattgataaatagctttttatttcat |
42194739 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #79
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329 |
tctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaata |
428 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || | |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| | || || |
|
|
| T |
9509163 |
tctatcatttacaattataaaaattaaatcttatttaccaaaagtgtcgacgaaataaaatttaatttttttgaatttttattactcataatgaagatta |
9509064 |
T |
 |
| Q |
429 |
ttgattattttttatga |
445 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9509063 |
ttgattattttttatga |
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T |
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| Q |
329 |
tctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaata |
428 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || | |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| | || || |
|
|
| T |
32887972 |
tctatcatttacaattataaaaattaaatcttatttaccaaaagtgtcgacgaaataaaatttaatttttttgaatttttattactcataatgaagatta |
32887873 |
T |
 |
| Q |
429 |
ttgattattttttatga |
445 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32887872 |
ttgattattttttatga |
32887856 |
T |
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Target: chr8; HSP #81
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570 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || | |||||||||||| |||| |||| | ||||||||| ||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
36162436 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaatgatattctataaaatataaatgttgataaatagttatttatttcacaaaaaatgatcgttaat |
36162535 |
T |
 |
| Q |
571 |
ttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactca |
607 |
Q |
| |
|
||||| | || ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36162536 |
ttata-aaattatgaaataagagtaccggtacactca |
36162571 |
T |
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Target: chr8; HSP #82
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| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
1043303 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaataatgttctataaaatataaatattgaaaaat |
1043370 |
T |
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat-taaagtgat |
563 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||| | || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
34634091 |
tatgattcttataaacaataaactgatgttttttcttgtgaaatgatgttctataaaatataaatattgataaaag-ctatttatttcataaaaaatgat |
34634189 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtaca |
603 |
Q |
| |
|
| |||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
34634190 |
cgttaatttata-aaattatgaaaaaagagtaccggtaca |
34634228 |
T |
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572 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| | |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
36569821 |
tataaacaatgaaatgatgtttttttctcatgagatggtgttttctaaaatataaataatgacaaataacaacttatttta-taaaatgatcattaattt |
36569723 |
T |
 |
| Q |
573 |
atatattt |
580 |
Q |
| |
|
||| |||| |
|
|
| T |
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ataaattt |
36569715 |
T |
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| Q |
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ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaattt |
572 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||| ||| | || ||||||| |
|
|
| T |
43485212 |
ttataaacaatgaaatgatattttttcttatgaaatgacattttctaaaatataaatattaacaaatagcactttattccataaaaataatatttaattt |
43485113 |
T |
 |
| Q |
573 |
atatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
| || |||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
43485112 |
aaat-ttttttgaaataaaagtaccggtacac |
43485082 |
T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
118046 |
tatgatacttataaacaattaaattatgttttttcttatgaaatggtgttctataaaatataaatattgacaaat |
118120 |
T |
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
5328837 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgaaaaat |
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T |
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6982955 |
tatgattcttataaacaattaaatgatattttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
6982881 |
T |
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| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttca-ttaaagtgatcattaat |
570 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| |||| | ||||||||| ||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
10706718 |
cttataaacaatgaaatgatattttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatgttgataaatagttatttatttcacaaaaaatgatcgttaat |
10706619 |
T |
 |
| Q |
571 |
ttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttccctt |
637 |
Q |
| |
|
||||| | || |||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
10706618 |
ttata-aaattatgaagcaagagtaccagtacacctcactttgtgagtgtaccgtagaagttccctt |
10706553 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #90
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| Q |
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ataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaattta |
573 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||| | ||| ||| || |||||||||| ||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
36274723 |
ataaacaatgaa-tgatgtgtttttcttatgaaatcttattttctaaaatataaatgtcgacgaataactatttatttcataaaattgatcgttaattta |
36274625 |
T |
 |
| Q |
574 |
tatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
36274624 |
tatatttag-gaagcaagagtaccagtacac |
36274595 |
T |
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
38210556 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgataaat |
38210630 |
T |
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40267719 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataatatataaatattgacaaat |
40267793 |
T |
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Target: chr8; HSP #93
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40578932 |
tatgattcttataaacaattaaatgatattttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
40579006 |
T |
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgat |
563 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
17792441 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgtgtttttcttatgaaatgatattttctgagatataaatgccgacaaataactatttatttcataaaattgat |
17792539 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttccctt |
637 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||| | ||| || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
17792540 |
tgttaatgtataaatttag-gaagcaggagtaccgatacaccttaatttatgagtgtaccatagaagttccctt |
17792612 |
T |
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aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaa |
388 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
29604334 |
aaaaataattattttctatcattaacaattataataatttaatcttatttaccaaaagcgtcgatgaaataaaa |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
|
||||||||| || | ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| | |||| ||||||||| || ||||| ||||||||| | |
|
|
| T |
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gaagaaaaagaactgttttctatcattgacaattacaataattaaatcgtatttaccaaaaacgtcgacgaaataaaatctactttttttgaatttttgt |
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T |
 |
| Q |
411 |
cacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgat-ggtttttcttatgagatg |
509 |
Q |
| |
|
|| ||||||| || ||||||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| | | | |
|
|
| T |
34047639 |
tacatataacaaaaaagattgattattttttaccagaaaatattaaaaatataatataattcttataaacaatgaaatgatatttttttcttataaaacg |
34047540 |
T |
 |
| Q |
510 |
atgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttattt |
551 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||| |
|
|
| T |
34047539 |
atgttttc-aaaatataaatattaataaataactttttattt |
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T |
 |
Back To:
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Target: chr8; HSP #97
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agaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatca |
412 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||| ||| |||| || |||| || ||||||||||||||||| ||| ||| |||| | ||||||| | ||||||| | |
|
|
| T |
4471765 |
agaaaaaaaaatattttctattatttacaattataataactatattttatttatcaaaagtgtcgtcgaagcaaaattcaattttttaaattttttatta |
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T |
 |
| Q |
413 |
cccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatg-aannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgat |
511 |
Q |
| |
|
| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | || || |
|
|
| T |
4471665 |
ctcataataatgaatattgattatttttt-tgataaaatgtaaaacaaattagtatgattcttataaacaatgaaatgatgttttttctttgaaaataat |
4471567 |
T |
 |
| Q |
512 |
gttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
4471566 |
attttctaaaatataaa |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #98
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tgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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tgattcttataaacaattaaatgatg-tttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgaca |
447 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| | |||| |||||| || ||||||||| |||||||||| || ||||| | |||| |||||||| ||||| | | |
|
|
| T |
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ataattaaatcttatttaccaaaaacgtcgacgaaatacaatttaatttttctgaatttttagtactcataatagagaattttgattatattttacaata |
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T |
 |
| Q |
448 |
aaatg--aannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttct-aaaatataaatattgacaaatgcctt |
544 |
Q |
| |
|
||||| || | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | || || |||| | ||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
36886350 |
aaatgtaaaaaaaaattagtatgatttttataaacaatgaaatgatg-tttttcttataaaataatatttttttaaaatataaatatcaacaaatagctc |
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T |
 |
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tttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtaca |
603 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |
|
|
| T |
36886251 |
tttatttcaaaaaaatgatagttaatttatatatttt-taaattaagagtaccggtaca |
36886194 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #100
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ataattaaattttatttatcaaaagc-ttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgac |
446 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||||||||| || ||||| | |||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
37465802 |
ataattaaatcttatttatcaaaaacattcgacaaaataaaataaaatttttctgaatttttagtactcataatagagaattttgattattttttacaat |
37465901 |
T |
 |
| Q |
447 |
aaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttt |
546 |
Q |
| |
|
|||||| | | |||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||| || | ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
37465902 |
aaaatgtaaaaaaattagtatgatttttataaacaatgaaatgaggtttttttttatgaaataacattttctaaaatataaatatcaacaaatagctttt |
37466001 |
T |
 |
| Q |
547 |
tatt |
550 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
37466002 |
tatt |
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T |
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Target: chr8; HSP #101
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348 |
ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgaca |
447 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||||| | |||||| | || ||||| | |||| |||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
43049654 |
ataattaaatattatttaccaaaaacgtcgacgaaataaaatttaatttttctaaattttagt-actcataatagagaattttgattattttttacaaca |
43049752 |
T |
 |
| Q |
448 |
aaatg-aannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatgg-tttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgccttt |
545 |
Q |
| |
|
||||| || | |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||| || | |
|
|
| T |
43049753 |
aaatgtaaaaaaaattagtatgatttttataaacaatgaaatgatatattttttttataaaatgatattttctaaaatataaatatcaacaaatagctct |
43049852 |
T |
 |
| Q |
546 |
ttatttcattaaagtgatcattaatttatatatttt |
581 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| | || |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43049853 |
ttatttcataaaaataatagttaatttatagatttt |
43049888 |
T |
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Target: chr8; HSP #102
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
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|||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
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43460587 |
tatgattcttataaacaatgaaatgatattttttcttatgaaataatattttctaaaatataaa |
43460650 |
T |
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539 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| |||||| |
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7128260 |
tatgattcttataaacaattaaattatgttttttcttatgaaatggtgttctataaaatataaatattaacaaat |
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T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
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|||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15451591 |
tatgattcttataaacagtaaaatgatgttttttcttatgaaattttgttctataaaatataaatattgacaaat |
15451517 |
T |
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||| || |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36667472 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttattatgaaatattgttctataaaatataaatattgacaaat |
36667546 |
T |
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Target: chr8; HSP #106
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572 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
40972273 |
tataaacaatgaaatggtgtttttttctcatgagatggtgttttttaaaatataaataatgacaaataacaacttatttca-taaaatgatcattaattt |
40972175 |
T |
 |
| Q |
573 |
ata |
575 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
40972174 |
ata |
40972172 |
T |
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Target: chr8; HSP #107
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ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgaca |
447 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| | ||||| | |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
26439811 |
ataattaaatcttattaaccaaaaacgtcgacgaaataaaatttaatttttctgaatttttagtactcataatagagaattttgattattttttacaata |
26439712 |
T |
 |
| Q |
448 |
aaatg-aannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatat |
531 |
Q |
| |
|
||||| || | |||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26439711 |
aaatgtaaaaaaaattagtatgatttttataaacaatcaaatgacgtttttttcttatgaaatgacattttctaaaatataaatat |
26439626 |
T |
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Target: chr8; HSP #108
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570 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || | |||||||||||| |||| |||| | |||||||||| ||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
29265752 |
cttataaacaatgaaatgattttttttcttgtggaatgatattctataaaatataaatgttgataaatagttatttatttcataaaaaatgatcgttaat |
29265653 |
T |
 |
| Q |
571 |
ttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
||||| | || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29265652 |
ttata-aaattatgaaacaagagtaccggtacac |
29265620 |
T |
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Target: chr8; HSP #109
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554 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
39347293 |
ttataaacaatgaaatgatgttttttctaatgaaatgacatttcctaaaatataaatatcaacaaatagctctttatttcat |
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T |
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428 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || | ||| |||| ||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| | || || |
|
|
| T |
41898 |
tctatcatttacaattataaaaatcaaatcttatttaccaaaaatgtcgacgaaataaaatttaatttttttgaatttttattactcataatgaagatta |
41799 |
T |
 |
| Q |
429 |
ttgattattttttatga |
445 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41798 |
ttgattattttttatga |
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T |
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Target: chr8; HSP #111
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
2164997 |
cttataaaaaatgaaatgatgttttttcttatgggataatattttctaaaatataaa |
2165053 |
T |
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Target: chr8; HSP #112
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465 |
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563 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
6631350 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgcgtttttcttctgaaatcatattttctaaaatataaatgccgacaaataactaattatttcataaaattgat |
6631448 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
| ||| |||||| | ||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6631449 |
cgttagtttataga-tttatgaagcaagagtaccgatacac |
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T |
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
9178882 |
cttataaaaaatgaaatgatgttttttcttatgggataatattttctaaaatataaa |
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T |
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Target: chr8; HSP #114
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aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| || | ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
29107722 |
aatatgattcttataaacaatgaaatgatgtttattcttataaaatgatgtcttat-aaatataaatattgataaat |
29107647 |
T |
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522 |
atataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagta |
595 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37400265 |
atataaatattaacaaatacctttttattttattaaagtgatcctta----ataaattttgtgaaacaagagta |
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T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
3642911 |
tatgattcttaaaaaaaatgaaatgatgttttttcttatgaaataatattttctaaaatataaa |
3642974 |
T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
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|||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| |
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|
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tataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaattt |
572 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| | ||||| || |||||||||| ||| | ||| ||||||| |
|
|
| T |
31158800 |
tataaacaatgaa-tgatgtgtttttcttatgaaatgatattttttaaaatataaatgccggcaaataactatttatttcataaaattaatcgttaattt |
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T |
 |
| Q |
573 |
atatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttccct |
636 |
Q |
| |
|
||| |||| | ||| ||||||||| | ||||| || ||| ||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
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atagatttag-gaagcaagagtactgatacacctcaatttgcgagtgtaccgtagaagttccct |
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Q |
| |
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|||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |
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|
| T |
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tatgattcttataaatgatgaaatgatgttttttcttatgaaatgatattttttaaaatataaa |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
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|
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
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Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |
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|
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563 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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tatgattcttataaacaatgaa-tgatgcgtttttcttctgaaatcatattttctaaaatataaatgccgactagtaactatttatttcataaaattgat |
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T |
 |
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cattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttccc |
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Q |
| |
|
||| |||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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agttagtttataga-tttatgaagcaagagtaccggtacacctcaatttacgagtgtaccatagaagttccc |
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T |
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| T |
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ttataaacaataaaatgatattttttcttgtgaaatgatattttctaaaatataaatat |
2732094 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 474 - 539
Target Start/End: Original strand, 5273294 - 5273362
Alignment:
| Q |
474 |
tataaacaatgaaatgatggtttttctt---atgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
5273294 |
tataaacaatgaaatgatgtttttttttctcatgagatggtgttttctaaaatataaataatgataaat |
5273362 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 348 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 13483194 - 13483100
Alignment:
| Q |
348 |
ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattatttttta |
442 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||| | |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13483194 |
ataattaaatcttatttaccaaaaacgtcgacgaaataaaattaaatttttctgaatttttagtactcataatagagaattttgattatttttta |
13483100 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 465 - 539
Target Start/End: Original strand, 27847705 - 27847779
Alignment:
| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
27847705 |
tatgattcttataaacaattaaatgatattttttcttatgaaatattgttatataaaatataaatattgataaat |
27847779 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 481 - 531
Target Start/End: Original strand, 39029569 - 39029619
Alignment:
| Q |
481 |
aatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatat |
531 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39029569 |
aatgaaatgatgttttttcttatgaaataatattttctaaaatataaatat |
39029619 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 473 - 526
Target Start/End: Original strand, 946213 - 946266
Alignment:
| Q |
473 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
946213 |
ttataaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
946266 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 463 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 1221594 - 1221481
Alignment:
| Q |
463 |
aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat-taaagtg |
561 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| || |
|
|
| T |
1221594 |
aatatgattcttataagcaatgaaatgatgctttttcttatgatgccatattttcctaaatataaaagttgaaaaatatctttttatttcataaaaattg |
1221495 |
T |
 |
| Q |
562 |
atcattaatttata |
575 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |
|
|
| T |
1221494 |
atcgttaatttata |
1221481 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #130
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Query Start/End: Original strand, 321 - 442
Target Start/End: Original strand, 2731882 - 2732003
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| Q |
321 |
aattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataac |
420 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | || || |||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||| || |||||| |||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
2731882 |
aattattttctatcatctataattacaataattaaatcttatttaccaaaaatgtcgacgaaataaaattttatttttctgaatttttagtactcataat |
2731981 |
T |
 |
| Q |
421 |
aatgaatattgattatttttta |
442 |
Q |
| |
|
| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
2731982 |
agagaattttgattatttttta |
2732003 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 473 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 12163103 - 12163050
Alignment:
| Q |
473 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
12163103 |
ttataaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
12163050 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 473 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 12407531 - 12407478
Alignment:
| Q |
473 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
12407531 |
ttataaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
12407478 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 465 - 633
Target Start/End: Original strand, 27172151 - 27172318
Alignment:
| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgat |
563 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
27172151 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgtgtttttcttatgaaatgatattttctgagatataaatgccgacaaataactatttatttcataaaattgat |
27172249 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttc |
633 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||| | ||| || |||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27172250 |
tgttaatgtataaatttag-gaagcaggagtaccgatacaccttaatttattagtgtaccatagaagttc |
27172318 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 42444533 - 42444412
Alignment:
| Q |
321 |
aattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataac |
420 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | | || || |||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
42444533 |
aattattttctatcacttataattataataattaaatcttatttatcaaaaaggccgacggaataaaatttaatttttatgaatttttagtactcataat |
42444434 |
T |
 |
| Q |
421 |
aatgaatattgattatttttta |
442 |
Q |
| |
|
| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
42444433 |
agataattttgattatttttta |
42444412 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 465 - 528
Target Start/End: Original strand, 12980250 - 12980313
Alignment:
| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||| |||| ||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12980250 |
tatgattcttataaagaataaaattatgttttttcttatgaaataatattttctaaaatataaa |
12980313 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 463 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 41765 - 41708
Alignment:
| Q |
463 |
aatatgatccttataaacaatgaaatgatggttt--ttcttatgagatgatgttttct |
518 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
41765 |
aatatgattcttataaacaatgaaattatgtttttcttcttatgaaatgatgttttct |
41708 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 502 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 463967 - 463867
Alignment:
| Q |
502 |
atgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggta |
601 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| | |||| || || ||||||| || ||||| || || |||||||||| || |
|
|
| T |
463967 |
atgaaatgatgttttctaaaatatgaacattgacaaataactttttatttta-taaaatggtcgttaatttgta-attttatggaataagagtaccgata |
463870 |
T |
 |
| Q |
602 |
cac |
604 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
463869 |
cac |
463867 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 473 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 6799934 - 6799844
Alignment:
| Q |
473 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgat |
563 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||| | | |||||||||| |||||| | |||| || |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
6799934 |
ttataaacaatgatatgatgttttttcttataaaatggtatattctaaaatacaaatatcaagaaatagctctttatttcattaaaatgat |
6799844 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 465 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 26522136 - 26522062
Alignment:
| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||| ||| |||| ||| ||||| |||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26522136 |
tatgattcctataaataattaaataatgttttttattatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
26522062 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 476 - 526
Target Start/End: Original strand, 28090438 - 28090488
Alignment:
| Q |
476 |
taaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28090438 |
taaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
28090488 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 476 - 526
Target Start/End: Original strand, 29459881 - 29459931
Alignment:
| Q |
476 |
taaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
29459881 |
taaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
29459931 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 476 - 526
Target Start/End: Original strand, 29773692 - 29773742
Alignment:
| Q |
476 |
taaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
29773692 |
taaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
29773742 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 476 - 526
Target Start/End: Original strand, 34332359 - 34332409
Alignment:
| Q |
476 |
taaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
34332359 |
taaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
34332409 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 476 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 39171240 - 39171190
Alignment:
| Q |
476 |
taaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
39171240 |
taaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
39171190 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 482 - 548
Target Start/End: Original strand, 39722209 - 39722275
Alignment:
| Q |
482 |
atgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgccttttta |
548 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
39722209 |
atgaaattatgttttttcttatgaaataatgttttctacaatataaattttgataaataacttttta |
39722275 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 477 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 43842001 - 43841939
Alignment:
| Q |
477 |
aaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||| |||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
43842001 |
aaacaataaactgatgttttttcttatgaaatgatattctataaaatataaatattgataaat |
43841939 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 476 - 526
Target Start/End: Original strand, 44935146 - 44935196
Alignment:
| Q |
476 |
taaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
44935146 |
taaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
44935196 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #148
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Query Start/End: Original strand, 229 - 270
Target Start/End: Original strand, 5595545 - 5595586
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| Q |
229 |
gcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtg |
270 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
5595545 |
gcaaattctatggtatacctaataaatttgggtgtatcggtg |
5595586 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #149
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Query Start/End: Original strand, 463 - 521
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| Q |
463 |
aatatgatccttataaacaatgaaatgatggttt--ttcttatgagatgatgttttctaaa |
521 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
9509030 |
aatatgattcttataaacaatgaaattctgtttttcttcttatgaaatgatgttttctaaa |
9508970 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #150
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Query Start/End: Original strand, 472 - 529
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| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaat |
529 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12180166 |
cttataaa-aatgaaattatgttttttcttatgaaatgatactttctaaaatataaat |
12180222 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #151
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Target Start/End: Original strand, 12424594 - 12424650
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| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaat |
529 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12424594 |
cttataaa-aatgaaattatgttttttcttatgaaatgatactttctaaaatataaat |
12424650 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #152
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| Q |
473 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15726052 |
ttataaaaaatgaaatgatattttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
15725999 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
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| Q |
463 |
aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttt--tcttatgagatgatgttttctaaa |
521 |
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23870381 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
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Target Start/End: Original strand, 43921398 - 43921483
Alignment:
| Q |
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581 |
Q |
| |
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43921398 |
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43921483 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 79)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 228 - 638
Target Start/End: Original strand, 1338853 - 1339264
Alignment:
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Q |
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| T |
1339253 |
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1339264 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 225 - 635
Target Start/End: Original strand, 18870919 - 18871330
Alignment:
| Q |
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aaaggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnn-gaagaaaaataat |
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Q |
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| T |
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T |
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423 |
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T |
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623 |
Q |
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| T |
18871219 |
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18871318 |
T |
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635 |
Q |
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| T |
18871319 |
atagaagttccc |
18871330 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 229 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 35225236 - 35224827
Alignment:
| Q |
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gcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattattt |
328 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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428 |
Q |
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| T |
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527 |
Q |
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35224937 |
T |
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Q |
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35224837 |
T |
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| T |
35224836 |
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35224827 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 227 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 6016212 - 6015821
Alignment:
| Q |
227 |
aggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattat |
326 |
Q |
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| T |
6016212 |
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618 |
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| T |
6015912 |
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6015821 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 227 - 637
Target Start/End: Original strand, 9226199 - 9226610
Alignment:
| Q |
227 |
aggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattat |
326 |
Q |
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| T |
9226199 |
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9226298 |
T |
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| Q |
327 |
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426 |
Q |
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| T |
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9226398 |
T |
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| Q |
427 |
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525 |
Q |
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625 |
Q |
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| T |
9226599 |
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9226610 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 256 - 635
Target Start/End: Original strand, 33954480 - 33954859
Alignment:
| Q |
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355 |
Q |
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| T |
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455 |
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33954678 |
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33954778 |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 230 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 16989517 - 16989151
Alignment:
| Q |
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caaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattatttt |
329 |
Q |
| |
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| T |
16989517 |
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16989418 |
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429 |
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16989417 |
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16989318 |
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16989218 |
T |
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596 |
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| T |
16989217 |
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16989151 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 225 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 32519142 - 32518748
Alignment:
| Q |
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aaaggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataatt |
324 |
Q |
| |
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| T |
32519142 |
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32519043 |
T |
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| Q |
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424 |
Q |
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| T |
32519042 |
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32518943 |
T |
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| Q |
425 |
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524 |
Q |
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| T |
32518942 |
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32518858 |
T |
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| Q |
525 |
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624 |
Q |
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| T |
32518857 |
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32518758 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 261 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 29639108 - 29638734
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| Q |
261 |
tgtatcggtgca-ccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattt |
359 |
Q |
| |
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| T |
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tgtatcggtacatccaagtcataaaattaataataaatgagttgtttttt-gaagaaacataatcattttctatcattgacaactaagataattaaattt |
29639010 |
T |
 |
| Q |
360 |
tatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnn |
459 |
Q |
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| T |
29639009 |
tatttaccaaaagcttcgacgaaataaaatcaaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgtaaattt |
29638910 |
T |
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| Q |
460 |
nnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaag |
559 |
Q |
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| T |
29638909 |
tttaatatgatccttataaacaatgaaataatggattttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaatattggcaaatacctttttatttcattaaag |
29638810 |
T |
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| Q |
560 |
tgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttccc |
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Q |
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| T |
29638809 |
tgatttttaatttatatattttgtgaaacaagagtactggtacactcaaaattgtgagtgtaccatagaagttccc |
29638734 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 227 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 34315530 - 34315123
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326 |
Q |
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||||||||| ||||||||| | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |
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| T |
34315530 |
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T |
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| Q |
327 |
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426 |
Q |
| |
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| T |
34315432 |
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34315334 |
T |
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| Q |
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525 |
Q |
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| T |
34315333 |
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34315234 |
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625 |
Q |
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| T |
34315233 |
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34315134 |
T |
 |
| Q |
626 |
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636 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
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| T |
34315133 |
agaagttccct |
34315123 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 261 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 27719378 - 27719075
Alignment:
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360 |
Q |
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T |
 |
| Q |
361 |
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460 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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T |
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| Q |
461 |
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560 |
Q |
| |
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| T |
27719178 |
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27719079 |
T |
 |
| Q |
561 |
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564 |
Q |
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|||| |
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27719078 |
gatc |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 271 - 635
Target Start/End: Original strand, 34969495 - 34969839
Alignment:
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370 |
Q |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
371 |
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470 |
Q |
| |
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| T |
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34969694 |
T |
 |
| Q |
471 |
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570 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
571 |
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635 |
Q |
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|
|
| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 226 - 635
Target Start/End: Original strand, 26810775 - 26811165
Alignment:
| Q |
226 |
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325 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
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| T |
26810775 |
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26810874 |
T |
 |
| Q |
326 |
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425 |
Q |
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| T |
26810875 |
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26810974 |
T |
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| Q |
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525 |
Q |
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| T |
26810975 |
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26811055 |
T |
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| Q |
526 |
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625 |
Q |
| |
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| T |
26811056 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 228 - 433
Target Start/End: Original strand, 24025531 - 24025736
Alignment:
| Q |
228 |
ggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataatta-t |
326 |
Q |
| |
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| T |
24025531 |
ggcaaattctatggtacacc-aatgaatttgggtgtatcggtacaccaagttgtaaaattaataataattcagttgtttttttgaagaaaaataataaat |
24025629 |
T |
 |
| Q |
327 |
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426 |
Q |
| |
|
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| T |
24025630 |
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24025729 |
T |
 |
| Q |
427 |
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433 |
Q |
| |
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| T |
24025730 |
tattgat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 311 - 582
Target Start/End: Original strand, 1339457 - 1339727
Alignment:
| Q |
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410 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| | |
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|
| T |
1339457 |
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1339556 |
T |
 |
| Q |
411 |
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510 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
1339557 |
tacatataacaaagaatattaattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaatgaagttttttcttataaaatga |
1339656 |
T |
 |
| Q |
511 |
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582 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
1339657 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Original strand, 926627 - 926895
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
926627 |
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T |
 |
| Q |
415 |
cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatg----gtttttcttatgagatga |
510 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
926727 |
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926826 |
T |
 |
| Q |
511 |
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580 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
926827 |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 315 - 539
Target Start/End: Original strand, 6295464 - 6295691
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| Q |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
6295464 |
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6295563 |
T |
 |
| Q |
415 |
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511 |
Q |
| |
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|
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| T |
6295564 |
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6295663 |
T |
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539 |
Q |
| |
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|
| T |
6295664 |
gttttctaaaatataaataatgacaaat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 315 - 539
Target Start/End: Original strand, 14501112 - 14501337
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Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
14501112 |
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T |
 |
| Q |
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513 |
Q |
| |
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| T |
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14501311 |
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| Q |
514 |
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539 |
Q |
| |
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||||||||||||||||| |||||||| |
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| T |
14501312 |
tttctaaaatataaataatgacaaat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 315 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 24151445 - 24151218
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Q |
| |
|
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T |
 |
| Q |
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cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatg---gtttttcttatgagatgat |
511 |
Q |
| |
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|
| T |
24151345 |
cataatgaagaatattgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatataattcatataaacaatgaaatgatgtttttttttctcatgagatcgt |
24151246 |
T |
 |
| Q |
512 |
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539 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||| |
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| T |
24151245 |
gttttttaaaatataaataatgacaaat |
24151218 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 311 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 7344638 - 7344401
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |
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|
| T |
7344638 |
gaagaaaaataattgttttctatcattgacaa------taattaaatcgtatttaccaaaagcgtcgaagaaataaaatttactttttttgaatttttat |
7344545 |
T |
 |
| Q |
411 |
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510 |
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| |
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| T |
7344544 |
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T |
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554 |
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| |
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| T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 326 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 24081454 - 24081200
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Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||| || || ||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| || ||||| || || |
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|
| T |
24081454 |
ttttctatcattgacaattataataattaaatcttatttaccaaaagttttgaagaaataaaatttactttttttgaatttatattactcataataaaga |
24081355 |
T |
 |
| Q |
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atattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaata |
524 |
Q |
| |
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||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||| |
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| T |
24081354 |
atattgattatttttaatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaataaaatgaagtttttttcttatgaaatgatgtttactaaaata |
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T |
 |
| Q |
525 |
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580 |
Q |
| |
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||||||||||||||| | |||||||||| |||| | ||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
24081254 |
taaatattgacaaatagcattttatttca-taaaattatcgttaatttataaattt |
24081200 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
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Query Start/End: Original strand, 314 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 14872647 - 14872388
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14872548 |
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| Q |
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14872388 |
T |
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Target: chr6; HSP #23
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Target Start/End: Original strand, 21998700 - 21998966
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414 |
Q |
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T |
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Target: chr6; HSP #24
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Target Start/End: Complemental strand, 14715586 - 14715360
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414 |
Q |
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14715360 |
T |
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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 315 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 11273736 - 11273599
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414 |
Q |
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| T |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 311 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 10888133 - 10887841
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409 |
Q |
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| T |
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T |
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Target: chr6; HSP #27
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Target Start/End: Complemental strand, 24159786 - 24159605
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410 |
Q |
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| T |
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T |
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Target: chr6; HSP #28
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Target Start/End: Complemental strand, 6975023 - 6974882
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410 |
Q |
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| T |
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Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
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Target Start/End: Original strand, 24025749 - 24025842
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636 |
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T |
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Target: chr6; HSP #30
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Target Start/End: Original strand, 23290748 - 23290850
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449 |
Q |
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23290848 |
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T |
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Target: chr6; HSP #31
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408 |
Q |
| |
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508 |
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21181421 |
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| T |
21181422 |
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T |
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Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
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Target Start/End: Complemental strand, 3954224 - 3953996
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Q |
| |
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509 |
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3954025 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #33
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Target Start/End: Original strand, 21293873 - 21294116
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
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| T |
21294073 |
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Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
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Q |
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448 |
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531 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #35
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaac--ttaatttttatgaattttt |
408 |
Q |
| |
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| T |
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508 |
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| |
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| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #36
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| |
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1705888 |
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| T |
1705889 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #37
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Query Start/End: Original strand, 312 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 2994647 - 2994425
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| |
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| T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
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Target Start/End: Original strand, 6302337 - 6302501
Alignment:
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378 |
atgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttata |
477 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || | |||| |
|
|
| T |
6302337 |
atgaaataaaatttactttttttgaatttttattgctcataatgaagaatattgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatataattcatata |
6302436 |
T |
 |
| Q |
478 |
aacaatgaaatgatggtttttctt---atgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
6302437 |
aacaatgaaatgatgtttttttttctcatgagatggtgttttctaaaatataaataatgacaaat |
6302501 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 311 - 525
Target Start/End: Original strand, 32871971 - 32872184
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| Q |
311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| | | |||||||| || | |||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
32871971 |
gaagaaaagtaattattttatgtaattgacaattatcaaaattaaatattatttaccaaaagcgtcgacaaaataaaatataatttttctgaattttaat |
32872070 |
T |
 |
| Q |
411 |
cacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatga |
510 |
Q |
| |
|
|| ||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| |
|
|
| T |
32872071 |
tacttataacaaagaatattgattactttttat-aagaaatgttaaaaatttaatattatttttataaacaatggaatgatgtttcttattatgagatga |
32872169 |
T |
 |
| Q |
511 |
tgttttctaaaatat |
525 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
32872170 |
tgttttctaaaatat |
32872184 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 465 - 602
Target Start/End: Original strand, 14779140 - 14779276
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatc |
564 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
14779140 |
tatgattcttataaacaatgaactgatgttttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattgataaatagttatttatttcataaaaaatatc |
14779239 |
T |
 |
| Q |
565 |
attaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtac |
602 |
Q |
| |
|
|||||||||| | || ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
14779240 |
gttaatttata-aaattatgaaaaaagagtaccggtac |
14779276 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 315 - 452
Target Start/End: Original strand, 22084909 - 22085046
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| Q |
315 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacc |
414 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||| |||||| | ||| |||||||| ||| ||||| | ||||||||| | |
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|
| T |
22084909 |
aaaaataattattttctatcattgacaattataataattaaatctcatttaccaaaagtgttgataaaataaaatttactttttttaaatttttattgct |
22085008 |
T |
 |
| Q |
415 |
cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatg |
452 |
Q |
| |
|
||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22085009 |
cataatgaaaaatattgattattttttatgagaaaatg |
22085046 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #42
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Query Start/End: Original strand, 313 - 528
Target Start/End: Original strand, 2197867 - 2198082
Alignment:
| Q |
313 |
agaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaat-ttttatc |
411 |
Q |
| |
|
||||||| || |||||||||||||| |||| | |||| || ||||||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| |||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
2197867 |
agaaaaaaaaatattttctatcatttacaatgataataactatattttatttctcaaaagtgtcggtgaagcaaaatttaaatttt-tgaatcttttatt |
2197965 |
T |
 |
| Q |
412 |
acccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgat |
511 |
Q |
| |
|
|| ||||| | |||||||| |||||||||| ||| |||||| | | |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || || |
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| T |
2197966 |
actcataatagtgaatatttattattttttctgataaaatgtaaaaaaattagtatgattcttataaacaatgaaattatgttttttcttatgaaataat |
2198065 |
T |
 |
| Q |
512 |
gttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |
|
|
| T |
2198066 |
attttctaaaatataaa |
2198082 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 472 - 637
Target Start/End: Original strand, 4509674 - 4509837
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| Q |
472 |
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571 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||| |||| || |||||| ||| ||| ||| |||||| |
|
|
| T |
4509674 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaataatgttctataaaatataaatattga-aaatagctatttattacataaaaaatatcgttaatt |
4509772 |
T |
 |
| Q |
572 |
tatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttccctt |
637 |
Q |
| |
|
|||| | || |||| || |||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
4509773 |
tata-aaattatgaagcaggagtaccggtacacctcactttgtgagtgtaccgtagaagttccctt |
4509837 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 472 - 636
Target Start/End: Original strand, 33574596 - 33574760
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| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat-taaagtgatcattaat |
570 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||| || |||||| ||| ||| ||||| ||||| |
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|
| T |
33574596 |
cttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaataatgttctacaaaatataaatattgaaaaatagctatttattacataaaaaatgatcgttaat |
33574695 |
T |
 |
| Q |
571 |
ttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttccct |
636 |
Q |
| |
|
||||| | || |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
33574696 |
ttata-aaattatgaagcaagagtaccggtacacctcactttgtgagtgtaccgtagaagttccct |
33574760 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 554
Target Start/End: Original strand, 19473754 - 19473998
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| Q |
311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaat-ttttatgaattttta |
409 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||| ||| || ||||||| || ||| ||| | |||| |||| ||||||||| || | |||| ||||||||| |
|
|
| T |
19473754 |
gaagaaaaagaatttttttctatcattaccaattacaataattagatcttagttaccgaaagtgtcgacgaaataaaattttacattttttgaatttttg |
19473853 |
T |
 |
| Q |
410 |
tcacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatg |
509 |
Q |
| |
|
| || || |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| || | ||| |
|
|
| T |
19473854 |
ttacatattacaaagaatatttattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaatgatatttattctaataaaatg |
19473953 |
T |
 |
| Q |
510 |
atgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat |
554 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
19473954 |
atgtcttataaaatataaatattgataaataactctttatttcat |
19473998 |
T |
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Back To:
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Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 494 - 638
Target Start/End: Original strand, 21970573 - 21970716
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| Q |
494 |
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593 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||| | ||| ||||| |
|
|
| T |
21970573 |
tttttcttatgaaatgatattttgtaaaatataaatgccgacaaataactatttatttcataaaattgatcgttaatttatagatttag-gaagtaagag |
21970671 |
T |
 |
| Q |
594 |
taccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttccctta |
638 |
Q |
| |
|
||||||||||| || || |||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
21970672 |
taccggtacaccagaatttatgagtgtaccgtagaagttccctta |
21970716 |
T |
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Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
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| Q |
473 |
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571 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
2564971 |
ttataaataatgaaatgatgttttttcttaagaaatgatgttctataaaatataaatattaacaaataactatttatttcataaaaaatgatcgttaatt |
2565070 |
T |
 |
| Q |
572 |
tata |
575 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
2565071 |
tata |
2565074 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #48
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Query Start/End: Original strand, 465 - 575
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat-taaagtgat |
563 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
9687012 |
tatgattctgataaacaatgaattgatgttttttcttatgaaatgatattttataaaatataaatattgataaatagttatttatttcataaaaaatgat |
9687111 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttata |
575 |
Q |
| |
|
| |||||||||| |
|
|
| T |
9687112 |
cgttaatttata |
9687123 |
T |
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Back To:
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Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
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aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat |
554 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | || |||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
14507856 |
aatatgattcttataaacaatgaaatgatgtttattcttataaaattatgtcttataaaatataaatattgataaataactctttatttcat |
14507947 |
T |
 |
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Target: chr6; HSP #50
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| Q |
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23291152 |
cttataaacaatgaaattatgttttttcttatgaaattatgttttctaaaacataaacattgacaaat |
23291219 |
T |
 |
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Target: chr6; HSP #51
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3141210 |
tatgattcttataaacaatctaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
3141136 |
T |
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
8310036 |
tatgattcttataaacaatgaaatgatgttttttcttacgaaatgatattctataaaatataaatattgaaaaat |
8309962 |
T |
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| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat-taaagtgatcattaat |
570 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||| | || |||||||||| ||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
8549725 |
cttataaacaataaactgatgttttttcttgtgaaatgatgttctataaaatataaatattgataaaag-ctatttatttcataaaaaatgatcgttaat |
8549627 |
T |
 |
| Q |
571 |
ttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttccctt |
637 |
Q |
| |
|
||||| | || ||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
8549626 |
ttata-aaattatgaaaaaagagtatcggtacacctcattttgtgagtgtaccgtagaagttccctt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #54
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| Q |
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattga |
534 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11763336 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaataatgttctataaaatataaatattga |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #55
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aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttc-ttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttattt |
551 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| | |||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
16893133 |
aatatgattcttataaatattgaaatgacgttttttccttatgaaatgatgttttctaaaatat-aatattgacaaatacctatttattt |
16893221 |
T |
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ataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat-taaagtgatcattaattta |
573 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
26958637 |
ataatcaatgagatgatcttttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattgacaaatagctatttattacataaaaaatgatcattaattta |
26958736 |
T |
 |
| Q |
574 |
ta |
575 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
26958737 |
ta |
26958738 |
T |
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Target: chr6; HSP #57
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472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
4576628 |
cttataaataatgaactgatgttttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattgataaat |
4576695 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 473 - 604
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ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaattt |
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Q |
| |
|
|||||||| || |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| | |||| || |||||||||| ||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
20469197 |
ttataaactataaaattatgttttttcttatgaaatgatattttctaaaatacaaatatcaataaatagctctttatttcataaaaatgatagttaattt |
20469098 |
T |
 |
| Q |
573 |
atatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||| ||||||||| |||||| |
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|
| T |
20469097 |
atagatttt-tgaagtaagagtacccgtacac |
20469067 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #59
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Target Start/End: Original strand, 26315531 - 26315819
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311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
|
||||||||| || | ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||| ||| || |||||| | | |||| | |
|
|
| T |
26315531 |
gaagaaaaagaactgttttctatcattgacaattac-ataattaaatcgtatttaccaaaagcgtcgacgaaaaaaatct--atttttttttaattttgt |
26315627 |
T |
 |
| Q |
411 |
cacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt-----cttatga |
505 |
Q |
| |
|
|| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |
|
|
| T |
26315628 |
tacatataacaaagaatattgattattttttaccagaaaatgttaaaaatttaatataattcttataaacaatgaaatgatgttttttttcttcttataa |
26315727 |
T |
 |
| Q |
506 |
gatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccgg |
599 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||| |||| | ||| |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
26315728 |
aacgatgttttctaaaatacaaatattgataaataactctttatttca-taaaataatcgttaaattataaatttt-tgaagtaagagtaccgg |
26315819 |
T |
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Target: chr6; HSP #60
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563 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
29023788 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgcatttttcttctgaaatcatattttccaaaatataaatgccgacaaataactatttatttcataaaattgat |
29023690 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
| ||| |||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29023689 |
cgttagtttataga-tttatgaagcaagagtaccggtacac |
29023650 |
T |
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Target: chr6; HSP #61
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Query Start/End: Original strand, 352 - 440
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| Q |
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ttaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttt |
440 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| | |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
30020642 |
ttaaatcttatttatcaaaaacgtcgacgaaataaaaattaatttttctgaatttttagtactcataatagagaattttgattattttt |
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T |
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Target: chr6; HSP #62
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Query Start/End: Original strand, 465 - 575
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat-taaagtgat |
563 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| |||| | | |||| | ||| ||| |||| |
|
|
| T |
9661995 |
tatgattcttataaacatt-aaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgataaatacttatttactacataaaaaatgat |
9662093 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttata |
575 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
9662094 |
cattaatttata |
9662105 |
T |
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Target: chr6; HSP #63
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Target Start/End: Original strand, 23068590 - 23068692
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571 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||| | |||||||||||| |||| |||| || |||||| || ||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
23068590 |
cttataaacaacgaaatgatgttttttcttatgaaataatgttatataaaatataaattttga-aaatagctatttattatataaaaatgatcgttaatt |
23068688 |
T |
 |
| Q |
572 |
tata |
575 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
23068689 |
tata |
23068692 |
T |
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Target: chr6; HSP #64
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Target Start/End: Original strand, 23416741 - 23416807
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| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | | |||||||||||||||||||| |
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|
| T |
23416741 |
cttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctat-aaatataaatattgacaaat |
23416807 |
T |
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Target: chr6; HSP #65
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Target Start/End: Original strand, 32715840 - 32715903
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
32715840 |
tatgattcttataaatgatgaaatgatgttttttcttatgaaatgatattttttaaaatataaa |
32715903 |
T |
 |
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Target: chr6; HSP #66
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Query Start/End: Original strand, 465 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 33610870 - 33610807
Alignment:
| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
33610870 |
tatgattcttaaaaagaatgaaatgatgttttttcttatgaaataatattttctaaaatataaa |
33610807 |
T |
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Target: chr6; HSP #67
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Target Start/End: Complemental strand, 33574403 - 33574329
Alignment:
| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||| ||| ||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33574403 |
tatgattcttataaaaaattaaacgatattttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
33574329 |
T |
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Target: chr6; HSP #68
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Target Start/End: Complemental strand, 8376312 - 8376251
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| Q |
348 |
ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaattttta |
409 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
8376312 |
ataattaaatcttatttatcaaaaacgttgatgaaataaaatttaatttttctaaattttta |
8376251 |
T |
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Target: chr6; HSP #69
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Target Start/End: Original strand, 24213156 - 24213209
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| Q |
473 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24213156 |
ttataaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
24213209 |
T |
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Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 473 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 32833936 - 32833883
Alignment:
| Q |
473 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
32833936 |
ttataaaaaatgaaatgatgttttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
32833883 |
T |
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Target: chr6; HSP #71
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Target Start/End: Original strand, 6093895 - 6094025
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| Q |
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cttataaacaatgaaatgatgg-tttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaat |
570 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| || || |||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||| ||| ||||| ||| | |
|
|
| T |
6093895 |
cttataaacaatgaa-tgatgcatttttcttctgaaatcatattttctaagatataaatgccgacaaataactatttatttcataaaattgatcgttagt |
6093993 |
T |
 |
| Q |
571 |
ttatatattttgtgaaacaagagtaccggtaca |
603 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
6093994 |
ttatagattta-tgaaacaagagtaccgataca |
6094025 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 348 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 15383492 - 15383234
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| Q |
348 |
ataattaaattttatttatcaaaagc-ttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgac |
446 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||| ||||||||||| || ||||| | |||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
15383492 |
ataattaaatcttatttatcaaaaacattcgacaaaataaaataaaaattttctgaatttttattactcataatagagaattttgattattttttacaat |
15383393 |
T |
 |
| Q |
447 |
aaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttctt--atgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctt |
544 |
Q |
| |
|
|||||| | | |||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |
|
|
| T |
15383392 |
aaaatgtaaaaaaattagtatgatttgtataaacaatgaaatgatatttttttttttatgaaatgacattttctaaaatataaatatcaacaaatagctt |
15383293 |
T |
 |
| Q |
545 |
tttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||| | || |||||||| | ||||| |||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
15383292 |
tttattccataaaaataatagttaatttaaagatttt-tgaagtaggagtaccggtacac |
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T |
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Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 380 - 452
Target Start/End: Original strand, 24215168 - 24215240
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| Q |
380 |
gaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatg |
452 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24215168 |
gaaataaaatataatttttatgaatttttattactcataatagaaaatatttactattttttatgacaaaatg |
24215240 |
T |
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Target: chr6; HSP #74
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Query Start/End: Original strand, 465 - 539
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | | ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
1245055 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgtttttttcttatgaaatgttgttctatgaaatataaatattgataaat |
1245130 |
T |
 |
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Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
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| Q |
513 |
ttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattt |
580 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
4979220 |
ttttctaaaatataaataccgataaataactatttatttcataaaattgatcattaatttataaattt |
4979153 |
T |
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Target: chr6; HSP #76
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Query Start/End: Original strand, 502 - 580
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| Q |
502 |
atgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattt |
580 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
229942 |
atgaaatggtgttttctaaaatataaataatgacaaataacaacttatttca-taaaatgatcattaatttataaattt |
229865 |
T |
 |
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Target: chr6; HSP #77
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Query Start/End: Original strand, 473 - 531
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| Q |
473 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatat |
531 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||||||| | || | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17010607 |
ttataaacaatgaaatgacgttttttcttataaaattacattttctaaaatataaatat |
17010665 |
T |
 |
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Target: chr6; HSP #78
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| Q |
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ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattatttttta |
442 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||| | || | |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| | |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20469323 |
ataatcaaatcttatttatcaaaaacgtctacaaaataaaatttaatttttctgaatttttagtactcataatagagaattttgattatttttta |
20469229 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #79
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Target Start/End: Original strand, 22755486 - 22755552
Alignment:
| Q |
473 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||| | || ||||| | ||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
22755486 |
ttataaacaataaaatgatgttttttcttataaaataatgttctataaaacataaatattaacaaat |
22755552 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 277; Significance: 1e-154; HSPs: 144)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 231 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 23189471 - 23189066
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231 |
aaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattattttc |
330 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23189471 |
aaattctatggtacacccaataaatttgggtgtatcggtacatcaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattattttc |
23189372 |
T |
 |
| Q |
331 |
tatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatatt |
430 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
23189371 |
tatcattgacaactaagataattaaattttatataccaaaaacttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaatatt |
23189272 |
T |
 |
| Q |
431 |
gattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaata |
530 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23189271 |
gattattttttatgacaaaatgtaaattttataatatgatccttataaacaatgaaatgattgtttttcttatgaaatgatgttttctaaaatataaata |
23189172 |
T |
 |
| Q |
531 |
ttgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaag |
630 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
23189171 |
ttgacaaatacctttttatttcattaaagtgatctttaatttatatattttgtgaaacaatagtactggtacactcaaaattgtgagtgtaccatagaag |
23189072 |
T |
 |
| Q |
631 |
ttccct |
636 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
23189071 |
ttccct |
23189066 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 228 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 31236996 - 31236588
Alignment:
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228 |
ggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattatt |
327 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
31236996 |
ggcaaattctatggtacacccaataaatttggatgtatcggtacatcaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataactatt |
31236897 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaat |
427 |
Q |
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Target: chr5; HSP #3
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Target Start/End: Complemental strand, 28770352 - 28769947
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
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Query Start/End: Original strand, 228 - 636
Target Start/End: Original strand, 10453280 - 10453688
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Target: chr5; HSP #5
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Query Start/End: Original strand, 227 - 635
Target Start/End: Original strand, 10688392 - 10688800
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 230 - 633
Target Start/End: Original strand, 16729726 - 16730128
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 231 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 42534797 - 42534387
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
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Query Start/End: Original strand, 227 - 634
Target Start/End: Original strand, 3881831 - 3882237
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 227 - 637
Target Start/End: Original strand, 25684072 - 25684472
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Q |
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426 |
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| T |
25684172 |
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25684261 |
T |
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427 |
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526 |
Q |
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| T |
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T |
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527 |
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626 |
Q |
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| T |
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25684461 |
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| T |
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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 227 - 628
Target Start/End: Complemental strand, 22798478 - 22798074
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Q |
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T |
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| Q |
326 |
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423 |
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| |
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| T |
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523 |
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| T |
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623 |
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22798178 |
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22798079 |
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628 |
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| T |
22798078 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 224 - 636
Target Start/End: Original strand, 9530358 - 9530770
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Q |
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T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 227 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 39541127 - 39540719
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 228 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 13589271 - 13588862
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ggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattatt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 231 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 8068722 - 8068323
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 226 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 2148535 - 2148127
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 228 - 636
Target Start/End: Original strand, 41631218 - 41631626
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Q |
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427 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 231 - 637
Target Start/End: Original strand, 40340430 - 40340837
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Target: chr5; HSP #18
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Query Start/End: Original strand, 271 - 641
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Target: chr5; HSP #19
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Query Start/End: Original strand, 227 - 634
Target Start/End: Original strand, 4094657 - 4095064
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Q |
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T |
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426 |
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4094757 |
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T |
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Q |
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| T |
4094857 |
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T |
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| Q |
527 |
aatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcata |
626 |
Q |
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| T |
4094957 |
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4095056 |
T |
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627 |
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634 |
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| T |
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gaagttcc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 249 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 32063912 - 32063529
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| T |
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T |
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Target: chr5; HSP #21
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Target: chr5; HSP #22
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Target: chr5; HSP #23
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Target: chr5; HSP #24
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Target Start/End: Original strand, 19125912 - 19126318
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Target: chr5; HSP #25
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Target: chr5; HSP #26
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Target: chr5; HSP #27
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Target: chr5; HSP #28
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
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Query Start/End: Original strand, 228 - 537
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Q |
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Target: chr5; HSP #30
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10118297 |
T |
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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
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Target Start/End: Complemental strand, 2011378 - 2011109
Alignment:
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Q |
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2011109 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 13593601 - 13593335
Alignment:
| Q |
315 |
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414 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 29666140 - 29665874
Alignment:
| Q |
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414 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Original strand, 36409994 - 36410259
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| Q |
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Q |
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T |
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Back To:
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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 316 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 13956898 - 13956678
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| Q |
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415 |
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Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 315 - 539
Target Start/End: Original strand, 6335477 - 6335703
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| Q |
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414 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 315 - 539
Target Start/End: Original strand, 12336300 - 12336527
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aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacc |
414 |
Q |
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12336399 |
T |
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511 |
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12336499 |
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539 |
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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Original strand, 19238880 - 19239146
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414 |
Q |
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19238979 |
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19239079 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
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Target Start/End: Original strand, 4366887 - 4367162
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #40
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Query Start/End: Original strand, 312 - 532
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410 |
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532 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 312 - 580
Target Start/End: Original strand, 28204856 - 28205125
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aagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaattttta-tgaatttttat |
410 |
Q |
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509 |
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580 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Original strand, 328829 - 329093
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aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacc |
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Q |
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328928 |
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329028 |
T |
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329029 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 326 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 18002959 - 18002684
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| T |
18002759 |
aaatattgataaataactctttatttta-taaaataatcattaaattataaatttt-tgaagcaggagtaccggtaca |
18002684 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 326 - 581
Target Start/End: Original strand, 23408350 - 23408605
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326 |
ttttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatga |
425 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||| ||| ||||| |||| |||| | || ||||||| || |
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| T |
23408350 |
ttttctattattgacaattacaataattaaatcgtatttaccaaaagcgtcgacgaaataaaatttactttttttgaaattttgttacatataacaaaga |
23408449 |
T |
 |
| Q |
426 |
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524 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||| || |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23408450 |
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23408549 |
T |
 |
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581 |
Q |
| |
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| T |
23408550 |
taaatattgataaataactctttatttca-taaaatgatcgttaaattataaatttt |
23408605 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
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Target Start/End: Original strand, 9499474 - 9499610
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aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacc |
414 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | |
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| T |
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9499573 |
T |
 |
| Q |
415 |
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451 |
Q |
| |
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||||| | ||||||| ||||||||||| || ||||| |
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| T |
9499574 |
cataatgaagaatattaattattttttacgagaaaat |
9499610 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 315 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 16602682 - 16602414
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| Q |
315 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacc |
414 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| || || ||||||||||| | |
|
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| T |
16602682 |
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16602583 |
T |
 |
| Q |
415 |
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510 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || | ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |
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|
| T |
16602582 |
cataatgaagaatattgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatataattcatataaacaatgaaatgatgtttttttttcctcatgagatga |
16602483 |
T |
 |
| Q |
511 |
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580 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
16602482 |
tgttttctaaaatataaataatgacaaataacaacttatttca-taaaatgatcattaatttataaattt |
16602414 |
T |
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Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 464 - 604
Target Start/End: Original strand, 31588471 - 31588609
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| Q |
464 |
atatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgat |
563 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |
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| T |
31588471 |
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31588569 |
T |
 |
| Q |
564 |
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604 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31588570 |
cattaatttata-aatttatgaaacaaaagtaccggtacac |
31588609 |
T |
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Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 315 - 445
Target Start/End: Original strand, 18480154 - 18480284
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| Q |
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aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacc |
414 |
Q |
| |
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|
| T |
18480154 |
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18480253 |
T |
 |
| Q |
415 |
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445 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
18480254 |
cataatgaagaatattgattattttttatga |
18480284 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 331 - 580
Target Start/End: Original strand, 29996603 - 29996847
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| Q |
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tatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatatt |
430 |
Q |
| |
|
||||||||| || || |||||||||| ||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||| || ||||| || ||||||| |
|
|
| T |
29996603 |
tatcattgataattataataattaaatcttattgaacaaaaacttcgacgaaataaaaaaaaatt-----gaatttttattactcataataaagaatatt |
29996697 |
T |
 |
| Q |
431 |
gattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaata |
530 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29996698 |
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29996797 |
T |
 |
| Q |
531 |
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580 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
29996798 |
tggacaaatattttttttatttca-taaaatgatcgttaatttataaattt |
29996847 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 311 - 440
Target Start/End: Original strand, 35162433 - 35162562
Alignment:
| Q |
311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
35162433 |
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35162532 |
T |
 |
| Q |
411 |
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440 |
Q |
| |
|
|| ||||| || ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
35162533 |
tactcataataaagaataatgattattttt |
35162562 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 348 - 604
Target Start/End: Original strand, 13091032 - 13091288
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ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgaca |
447 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||| || |||||| |||||||||| || | ||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
13091032 |
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13091131 |
T |
 |
| Q |
448 |
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545 |
Q |
| |
|
|| || | | |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |
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| T |
13091132 |
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13091230 |
T |
 |
| Q |
546 |
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604 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
13091231 |
ttatttcataaaaatgatagttaatttataaatttt-tgaagtaagagtaccggtacac |
13091288 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 473 - 634
Target Start/End: Original strand, 29744147 - 29744307
Alignment:
| Q |
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ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaattt |
572 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||| ||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
29744147 |
ttataaataatgaaatgatgttttttcttatgaaatgatattttctaaaatataaatatcaataaatagctctttatttcataaaaatgatagttaattt |
29744246 |
T |
 |
| Q |
573 |
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634 |
Q |
| |
|
||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| | || ||||||| |
|
|
| T |
29744247 |
ataaatttt-tgaagcaaaagtaccggtacactttaatttgtgagtgtaccgtataagttcc |
29744307 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 311 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 23690824 - 23690581
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| Q |
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gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
|
||||||||| | || |||||||||||| |||| || ||||||| || ||| ||| |||| |||| ||||||||| ||| |||| ||||||||| | |
|
|
| T |
23690824 |
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23690725 |
T |
 |
| Q |
411 |
cacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatga |
510 |
Q |
| |
|
|| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | || | |
|
|
| T |
23690724 |
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23690625 |
T |
 |
| Q |
511 |
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554 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
23690624 |
tgtcttataaaatataaatattgataaataactctttatttcat |
23690581 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 312 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 16432971 - 16432746
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| Q |
312 |
aagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatc |
411 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||||| ||||||| || | |||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||| | | ||||| | |
|
|
| T |
16432971 |
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16432872 |
T |
 |
| Q |
412 |
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509 |
Q |
| |
|
|| |||||| | ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| | ||| |
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|
| T |
16432871 |
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16432772 |
T |
 |
| Q |
510 |
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535 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
16432771 |
atgttttctaaaatgtaaacattgac |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 465 - 603
Target Start/End: Original strand, 27980011 - 27980148
Alignment:
| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatc |
564 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||| ||||| |
|
|
| T |
27980011 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaattatgttctataaaatataaatattgacaaatagctaattattacataaaaatgatc |
27980110 |
T |
 |
| Q |
565 |
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603 |
Q |
| |
|
|||||||||| | || |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
27980111 |
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27980148 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 329 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 5512988 - 5512795
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| Q |
329 |
tctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaata |
428 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || | |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| | || || |
|
|
| T |
5512988 |
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5512889 |
T |
 |
| Q |
429 |
ttgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttt--ttcttatgagatgatgttttctaaa |
521 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
5512888 |
ttgattattttttatga-gtaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaattatgtttttcttcttatgaaatgatgttttctaaa |
5512795 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 348 - 604
Target Start/End: Original strand, 14967350 - 14967606
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348 |
ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgaca |
447 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||| || |||||| |||||||||| || | ||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
14967350 |
ataattaaatcttatttatcaaaaacatcgacgaaataaaatttgatttttctgaatttttagtactcgtaatagagaattttgattattttttacaata |
14967449 |
T |
 |
| Q |
448 |
aaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttt--tcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgccttt |
545 |
Q |
| |
|
|| | | | |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||| |
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| T |
14967450 |
aa-tctaaaaaaattagtatgatttttataaacaatgaaatgatgctttttttcttatgaaatgatattttctaaaatatagatatcaacaaatagcttt |
14967548 |
T |
 |
| Q |
546 |
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604 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
14967549 |
ttatttcataaaaatgatagttaatttataaatttt-tgaagtaagagtaccgatacac |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 472 - 539
Target Start/End: Original strand, 34259783 - 34259850
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472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34259783 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattgacaaat |
34259850 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 321 - 604
Target Start/End: Original strand, 41802197 - 41802482
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321 |
aattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaactt-aatttttatgaatttttatcacccataa |
419 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | || || |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||| |||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
41802197 |
aattattttctatcatctataattataataattaaatcttatttatcaaaaatgtcgactaaataaaattttaatttttctgaatttttagtactcataa |
41802296 |
T |
 |
| Q |
420 |
caatgaatattgattattttttatgacaaaatg--aannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttc |
517 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||||||||||| | |||||| || | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||| | ||||| |
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| T |
41802297 |
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41802396 |
T |
 |
| Q |
518 |
taaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
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||||||| |||||| |||||| || |||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |||||| |
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|
| T |
41802397 |
taaaatacaaatatcaacaaatagctctttatttcataaaaatgatagttaatttataaatttt-taaaataagagtaccagtacac |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #60
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Target Start/End: Original strand, 2851934 - 2852008
Alignment:
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465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2851934 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttttataaaatataaatattgacaaat |
2852008 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 311 - 604
Target Start/End: Original strand, 9589291 - 9589583
Alignment:
| Q |
311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| | || || |||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||| || |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
9589291 |
gaagaaaaa-aattattttctatcacctataattataataattaaatcttatttatcaaaaacatcgacgaaataaaatttgatttttctgaatttttag |
9589389 |
T |
 |
| Q |
411 |
cacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt-cttatgagatg |
509 |
Q |
| |
|
|| | | | |||| |||||||| ||||| | |||||| | | |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||| |
|
|
| T |
9589390 |
tactagtgatagagaattttgattatcttttacaataaaatgtaaaacaattagtatgatttttataaacaatgaaatgatgcttttttctcatgaaatg |
9589489 |
T |
 |
| Q |
510 |
atgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
9589490 |
atattttctaaagtataaatatcaacaaatagctttttatttcataaaaatgatagttaatttataaatttt-tgaagtaagagtaccgatacac |
9589583 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 534
Target Start/End: Original strand, 19189190 - 19189414
Alignment:
| Q |
312 |
aagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttat--gaattttta |
409 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||| ||| ||||| | |||||||| |
|
|
| T |
19189190 |
aagaaaaagaactagtttctatcattgacat-tacaataattaaatcgtatttatcaaaaacgtcgacgaaataaaatttactttttttttgaatttttg |
19189288 |
T |
 |
| Q |
410 |
tcacccataacaatgaatattgattatttttt-atgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagat |
508 |
Q |
| |
|
| || |||| || |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | | || |
|
|
| T |
19189289 |
ttacatataataaagaatattgattatttttttatgagaaaatgttaaaaatttaatataattcttataaacaatgaaatgatattttttcttgtaaaat |
19189388 |
T |
 |
| Q |
509 |
gatgttttctaaaatataaatattga |
534 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
19189389 |
gatgttttctaaaatatatatattga |
19189414 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 311 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 5204942 - 5204697
Alignment:
| Q |
311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaa-taaaacttaat-ttttatgaattttt |
408 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||| | |||| || ||||||| || ||| ||| | |||| |||| |||| ||||| || || |||| ||||||||| |
|
|
| T |
5204942 |
gaagaaaaagaattgttttctatcaataacaattacaataattagatcttagttaccgaaagtgtcgacgaaaataaaattttatattttttgaattttt |
5204843 |
T |
 |
| Q |
409 |
atcacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagat |
508 |
Q |
| |
|
| || ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | || |
|
|
| T |
5204842 |
gttacatataacaaagaatatttattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaatgatgtttattcttataaaat |
5204743 |
T |
 |
| Q |
509 |
gatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat |
554 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||| || |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
5204742 |
gatgtcttataaaatataaatatcgataaataactctttatttcat |
5204697 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 311 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 40756866 - 40756621
Alignment:
| Q |
311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaa-taaaacttaat-ttttatgaattttt |
408 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||| | |||| || ||||||| || ||| ||| | |||| |||| |||| ||||| || || |||| ||||||||| |
|
|
| T |
40756866 |
gaagaaaaagaattgttttctatcaataacaattacaataattagatcttagttaccgaaagtgtcgacgaaaataaaattttatattttttgaattttt |
40756767 |
T |
 |
| Q |
409 |
atcacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagat |
508 |
Q |
| |
|
| || ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | || |
|
|
| T |
40756766 |
gttacatataacaaagaatatttattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaatgatgtttattcttataaaat |
40756667 |
T |
 |
| Q |
509 |
gatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat |
554 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||| || |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
40756666 |
gatgtcttataaaatataaatatcgataaataactctttatttcat |
40756621 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 472 - 604
Target Start/End: Original strand, 13119043 - 13119174
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| Q |
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatt |
571 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||| |||| || |||||| || ||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
13119043 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaataatgttctataaaatataaatattgaaaaatagctatttattatataaaaatgatcgttaatt |
13119142 |
T |
 |
| Q |
572 |
tatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
|||| | || |||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
13119143 |
tata-aaattatgaagcaggagtaccggtacac |
13119174 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 329 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 34901963 - 34901847
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| Q |
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tctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaata |
428 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || | |||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| | || || |
|
|
| T |
34901963 |
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34901864 |
T |
 |
| Q |
429 |
ttgattattttttatga |
445 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34901863 |
ttgattattttttatga |
34901847 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 395 - 554
Target Start/End: Original strand, 4429587 - 4429746
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| Q |
395 |
ttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggt |
494 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| | || ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
4429587 |
ttttttgaatttttgttacatataacaaagaatatttattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaataaaatgatgtt |
4429686 |
T |
 |
| Q |
495 |
ttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat |
554 |
Q |
| |
|
| ||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
4429687 |
tattcttataaaatgatgtcttataaaatataaatattgataaataactctttatttcat |
4429746 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 329 - 521
Target Start/End: Original strand, 7080211 - 7080404
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| Q |
329 |
tctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaata |
428 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || | |||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| | || || |
|
|
| T |
7080211 |
tctatcatttacaattataaaaattaaatcttatttaccaaaagcgtcgacgaaataaaatttaatttttttgaatttttattactcataatgaagatta |
7080310 |
T |
 |
| Q |
429 |
ttgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttt--ttcttatgagatgatgttttctaaa |
521 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
7080311 |
ttggttattttttatga-gtaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaattatgtttttcttcttatgaaatgatgttttctaaa |
7080404 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 472 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 40563278 - 40563211
Alignment:
| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
40563278 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatgttgacaaat |
40563211 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 348 - 525
Target Start/End: Complemental strand, 3425375 - 3425197
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| Q |
348 |
ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgaca |
447 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
3425375 |
ataattaaatcttatttaccaaaaacgtcgacgaaataaaattaaatttttctgaatttttagtactcataatagagaattttgattattttttacaata |
3425276 |
T |
 |
| Q |
448 |
aaatg-aannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatat |
525 |
Q |
| |
|
||||| || | |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
3425275 |
aaatgtaaaaaaaattagtatgatttttataaacaatgaaatgaagttttttcttatgagatgacattttctaaaatat |
3425197 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 465 - 539
Target Start/End: Original strand, 9630145 - 9630219
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
9630145 |
tatgattcttataaacaatgaactgatgttttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattgataaat |
9630219 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 465 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 14434988 - 14434914
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14434988 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
14434914 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 465 - 539
Target Start/End: Original strand, 40803557 - 40803631
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40803557 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
40803631 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 472 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 42486767 - 42486705
Alignment:
| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattga |
534 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42486767 |
cttataaacaatgaaatgatgttttttcttatgaaataatgttttataaaatataaatattga |
42486705 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 465 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 42597643 - 42597569
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42597643 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttatataaaatataaatattgacaaat |
42597569 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #76
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Query Start/End: Original strand, 463 - 580
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aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtga |
562 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||| ||| |
|
|
| T |
777318 |
aatatgattcttataaacaataaaatgattttttttatt-tgaaattatgttttctaaaatataaatattgactaatagctttttattt-aataaaatga |
777221 |
T |
 |
| Q |
563 |
tcattaatttatatattt |
580 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
777220 |
tctttaatttataaattt |
777203 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 463 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 5140840 - 5140701
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| Q |
463 |
aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtga |
562 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||| |||| || || |||||| |||| | | |
|
|
| T |
5140840 |
aatatgattcttataaacaatgaaatgatgtttattcttataaaatgatgtcttataaaatataaatattgataaataactcttcatttca-taaaataa |
5140742 |
T |
 |
| Q |
563 |
tcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||| || || | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
5140741 |
tcgttaaattataaatatt-taaaacaggagtaccggtacac |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 539
Target Start/End: Original strand, 5359809 - 5360036
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311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttat |
410 |
Q |
| |
|
||||||||||| || |||| ||||||| | || || |||| ||||| ||||| | |||||| || | ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
5359809 |
gaagaaaaatatttttttt-tatcatttataattataataactaaatcttattcaacaaaagtgtcaacgaaataaaa-ttaatttttttgaatttttat |
5359906 |
T |
 |
| Q |
411 |
cacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatg-aannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatg |
509 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||| ||||||||||||||| || || ||| || | ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||| |
|
|
| T |
5359907 |
cactcataattgagaacattgattattttttacgataatatgtaaaaaaaattactataattcttataaacaatgaaatgatgttttttctaataaaatg |
5360006 |
T |
 |
| Q |
510 |
atgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5360007 |
atgttctataaaatataaatattgacaaat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 472 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 13645682 - 13645574
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cttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaat |
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Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||| |
|
|
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13645682 |
cttataaacaatgaa-tgatgtgtttttcttatgaaatgatgttttctaagatataaatgccgacaaataactatttatttcataaaattgatcgttaat |
13645584 |
T |
 |
| Q |
571 |
ttatatattt |
580 |
Q |
| |
|
||||| |||| |
|
|
| T |
13645583 |
ttatagattt |
13645574 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
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Target Start/End: Original strand, 39979455 - 39979658
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315 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacc |
414 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
39979455 |
aaaaataattattttctatcacttgcaattataataattaaatcttatttaccaaaaacgtcgatgaaataaaatttacttttt-tgaatttttattgct |
39979553 |
T |
 |
| Q |
415 |
cataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgtt |
514 |
Q |
| |
|
|| || | ||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| || |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
39979554 |
cacaatgaagaatattgatt-ttttttacgagaaaatgttaaaaatttaatataattcttataaacaatgaaacggtgttttttctcatgagatgatgtc |
39979652 |
T |
 |
| Q |
515 |
ttctaa |
520 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
39979653 |
ttctaa |
39979658 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #81
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| Q |
329 |
tctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaata |
428 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || | |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| | || || |
|
|
| T |
40524387 |
tctatcatttacaattataaaaattaaatcttatttaccaaaagtgtcgacgaaataaaatttaatttttttgaatttttattactcataatgaagatta |
40524288 |
T |
 |
| Q |
429 |
ttgattattttttatga |
445 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40524287 |
ttgattattttttatga |
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T |
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Target: chr5; HSP #82
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| Q |
315 |
aaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagct |
374 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
9499314 |
aaaaataattattttctatcattgacaattataataattaaatcttatttatcaaaagct |
9499373 |
T |
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Target: chr5; HSP #83
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| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
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|||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28318510 |
cttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
28318443 |
T |
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
479844 |
tatgattcttataaacaatgaaatgatgttttttcttacgaaacgatgttctataaaatataaatattgaaaaat |
479770 |
T |
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Target: chr5; HSP #85
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
3024321 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgataaat |
3024247 |
T |
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8258631 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttgttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
8258705 |
T |
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Target: chr5; HSP #87
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
13127217 |
tatgattcttataaacaatgaaccgatgttttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattgataaat |
13127291 |
T |
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Target: chr5; HSP #88
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348 |
ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgaca |
447 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||| |||| | |
|
|
| T |
37431636 |
ataattaaatcttatttaccaaaaacgtcgacgaaatcaaatttaatttttctgaatttttatgactcataatagagaattttgattattgtttacaatt |
37431537 |
T |
 |
| Q |
448 |
aaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgccttttt |
547 |
Q |
| |
|
|||| | | |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||| |
|
|
| T |
37431536 |
aaatataaaaaaattagtatgatttttataaacaaaaaaatgatgatttttcttatgaaatgacattttctaaaatataaatatcaacaaatagctcttt |
37431437 |
T |
 |
| Q |
548 |
atttcat |
554 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
37431436 |
atttcat |
37431430 |
T |
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Target: chr5; HSP #89
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||| | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
38293856 |
tatgattcttataaacaatgaaatgatgttttttcttacgaaatgaagttctataaaatataaatattgaaaaat |
38293930 |
T |
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Target: chr5; HSP #90
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| Q |
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatt |
571 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || | |||||||||||| |||| |||| | ||||||| | ||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
39816667 |
cttataaacaatgaaatgatattttttcttatgaaatgatattctataaaatataaatgttgataaatagttatttatttaacaaaaatgatcgttaatt |
39816568 |
T |
 |
| Q |
572 |
tatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttcc |
634 |
Q |
| |
|
|||| | || |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
39816567 |
tata-aaattatgaagcaagagtaccggtacacctcactttgtgagtgtaccgtagaagttcc |
39816506 |
T |
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aatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt-cttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
13544263 |
aatatgattcttataaacaatgaaattatgtttttttcttataaaatgatgttttataaaatataaatattgataaat |
13544186 |
T |
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Target: chr5; HSP #92
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| Q |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattga |
534 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16496005 |
tatgattcttataaacaatgaactgatgttttttcttatgaaataatgttctataaaatataaatattga |
16496074 |
T |
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570 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
39041468 |
cttatgaacaatgaa-tgatgtgtttttcttgtgaaatgatattttctaaaatataaatgccgacaaataactatttatttcataaaattgatcattaat |
39041370 |
T |
 |
| Q |
571 |
ttatatattt |
580 |
Q |
| |
|
||||| |||| |
|
|
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ttataaattt |
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T |
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430 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | ||||| |||| |||| |||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||| |
|
|
| T |
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tatcattgacaattataaaaattatatttaattttcaaaaagcgtcgacaaaataaaatttaatttttttgaatttttattattcataacgaagaatatt |
40110094 |
T |
 |
| Q |
431 |
gattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|| ||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
40110093 |
gagtattttt-atgaaaaaatattaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaattatgttttttcttattaaataatgtgttctaaaatataaa |
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T |
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Target: chr5; HSP #95
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tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgat |
563 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
2270953 |
tatgattcttataaacagtgaa-tgatgcgtttttcttctgaaatcatattttctaaaatataaatgccgacaaataattatttatttcataaaattgat |
2270855 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
| |||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2270854 |
cgttaatttataga-tttatgaagcaagagtaccggtacac |
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T |
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539 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9604598 |
tgattcttataaacaattaaatgatg-tttttcttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
9604527 |
T |
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| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
14575635 |
cttataaaaaatgaaatgatgttttttcttatgagataatattttctaaaatataaa |
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T |
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570 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| | |||||||||||| |||| |||| | ||||||||| ||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
36428068 |
cttataaacaatgcaatgatgttttttcttatgaaataatgttctataaaatataaatgttgataaatagttatttatttcacaaaaaatgatcgttaat |
36427969 |
T |
 |
| Q |
571 |
ttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttccctta |
638 |
Q |
| |
|
||||| | || || | ||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
36427968 |
ttataaaattattg-agcaagagtaccggtacacctcactttgtgagtgtaccgtagaagttccctta |
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T |
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419 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || | |||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
2021771 |
tctatcattgacaattataaaaattaaatcttatttaccaaaagcgtcgacgaaataaaatttaattttgttgaatttttattactcataa |
2021861 |
T |
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539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
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9910209 |
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T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9913358 |
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9913284 |
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aattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaa |
449 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| | ||||| | |||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||| || ||||| | |||| |||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
27117836 |
aattaaatcttattaaccaaaaacgtcgacgaaataaaatttaatttttctgagtttttagtactcataatagagaattttgattattttttacaataaa |
27117935 |
T |
 |
| Q |
450 |
atgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt-cttatgagatgatgttttctaaaatataaatat |
531 |
Q |
| |
|
||| | |||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27117936 |
atgtaaaaaaattaatatgatttttataaacaatgaaatgacgtttttttcttataaaatgacattttctaaaatataaatat |
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T |
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Q |
| |
|
|||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||| | ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
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33678394 |
tatgattcttataaataattaaatgatgttttttcttataaaatgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
33678468 |
T |
 |
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Target: chr5; HSP #104
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| | || | ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
35370568 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgttattctataaaatataaaaattgacaaat |
35370494 |
T |
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Target: chr5; HSP #105
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| Q |
463 |
aatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23258919 |
aatatgattcttataaccaatgaaattatgttttatcttatgaaataatgttttctaaaatataaa |
23258854 |
T |
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ttataaacaatgaaatgatggtttt--tcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaat |
570 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||| || || |||||||||| ||| |||| |||| |
|
|
| T |
35682337 |
ttataaacaatgaaatgatgttttttttcttatgaaatgatattttttaaaatataaatatcaacatatagctctttatttcataaaaatgataggtaat |
35682436 |
T |
 |
| Q |
571 |
ttatatattttgtgaaacaagagtaccggtaca |
603 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
35682437 |
ttattgatttt-tgaagcaagagtactggtaca |
35682468 |
T |
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324 |
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423 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| || | |||||||| ||||| |||||||||||| | || | |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| | | |
|
|
| T |
4839730 |
tattttatatcatttaccattaagataaataaatcttatttatcaaa-gtgtcaacaaaataaaatttcatttttatgaatttttactacccataatagt |
4839632 |
T |
 |
| Q |
424 |
gaatattgattattttt |
440 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |
|
|
| T |
4839631 |
gaatgttgattattttt |
4839615 |
T |
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563 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
10400870 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgcgtttttcttctgaaatcatattttctaaaatataaatgccgacaaataactatttatttcataaaattgat |
10400772 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttatatattt |
580 |
Q |
| |
|
| ||| |||||| |||| |
|
|
| T |
10400771 |
cgttagtttatagattt |
10400755 |
T |
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggttttt-cttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat-taaagtga |
562 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||| |||| || |||||| ||| ||| ||| |
|
|
| T |
30753618 |
tatgattcgtataaacaatgaaatgatgttttttacttatgaaatgttgttctataaaatataaatattgataaataactatttattacataaaaaatga |
30753519 |
T |
 |
| Q |
563 |
tcattaatttata |
575 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| |
|
|
| T |
30753518 |
tcgttaatttata |
30753506 |
T |
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Target: chr5; HSP #110
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tatgatccttataaacaatgaaatgatgg-tttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgat |
563 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
36156078 |
tatgattcttataaacaatgaa-tgatgcatttttcttctgaaatcatattttctaaaatataaatgccgacaaataactatttatttcataaaattgat |
36156176 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
| ||| |||||| | ||| | || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36156177 |
cgttagtttataga-tttataaagcaagagtaccggtacac |
36156216 |
T |
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477 |
aaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat-taaagtgatcattaatttata |
575 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12334556 |
aaacagtgaaatgatattttttcttatgaaatgatgttccataaaatataaatattgacaaatagctatttattacataaaaaatgatcgttaatttata |
12334655 |
T |
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ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
14721299 |
ttataaaaaatgaaatgatgttttttcttatgggataatattttctaaaatataaa |
14721354 |
T |
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gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattt |
580 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
43059626 |
gtttttcttatgaaatgatattttctaagatataaatgccgacaaataactaattatttcataaaattgatcattaatttataaattt |
43059539 |
T |
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Target: chr5; HSP #114
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| Q |
465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
43167179 |
tatgattcttataaacaatggaattatgttttttcttatgaaataatattttctaaaatataaa |
43167242 |
T |
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Target: chr5; HSP #115
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| Q |
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ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatat |
531 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
13795433 |
ttataaacaatgaaataatgttttttcttatgaaatgacatttcctaaaatataaatat |
13795375 |
T |
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Target: chr5; HSP #116
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tgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
8780269 |
tgattcttataaactatgaaattatgttttttcttatgaaataatattttctaaaatataaa |
8780330 |
T |
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Target: chr5; HSP #117
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gataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgac |
446 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| | |||| |||||||||||||| || |
|
|
| T |
21051593 |
gataactaaatcttatttaccaaaaacgtcgacgaaataaaatttaatttttcagaatttttagtactcataatagagaattttgattattttttacgat |
21051494 |
T |
 |
| Q |
447 |
aaaatg |
452 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
21051493 |
aaaatg |
21051488 |
T |
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Target: chr5; HSP #118
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ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattattttttatgaca |
447 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| | ||||| | || | ||||||||| ||||||||| ||| |||||| || ||||| | |||| |||||||||||||| | | |
|
|
| T |
28332239 |
ataattaaatcttattaaccaaaaacgtctacgaaataaaatttaatttttctgagtttttagtactcataatagagaattttgattattttttacaata |
28332338 |
T |
 |
| Q |
448 |
aaatg-aannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttt--tcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctt |
544 |
Q |
| |
|
||||| || | |||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||| || |
|
|
| T |
28332339 |
aaatgtaaaaaaaattagtatgatttttataaacaatgaaatgacgttttttttcttatgaaatgacattttctaaaatataaatataaaaaaatagctc |
28332438 |
T |
 |
| Q |
545 |
tttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcatagaagttccctt |
637 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||| | || |||||||| | ||||| ||||| | |||||||||||||| || ||| |||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
28332439 |
tttattccataaaaataatagttaatttaaagatttt-tgaaataggagtaccggtacaccttaatttgcaagtgtaccgtagaagttccctt |
28332530 |
T |
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Target: chr5; HSP #119
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattga |
534 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||||| || | |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33210606 |
tatgattcttatagacaatgaactggtattttttcttatgaaatgatgttctataaaatataaatattga |
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T |
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Target: chr5; HSP #120
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ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat |
554 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||| ||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
35817510 |
ttataatctatgaaataatgtttttccttatgaaatgatattttctaaaatataaatatcaacaaatagcattttatttcat |
35817429 |
T |
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563 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||| ||| |||| |
|
|
| T |
40585032 |
tatgattcttacaaaaaatgaa-tgatgtgtttttcttatgaaatgatattttctaaaatataaatgccgacaaataactatttatctcataaaattgat |
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T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacact |
605 |
Q |
| |
|
| | |||||||| |||| | ||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
40584933 |
cgtcaatttataaatttag-aaaataagagtatcggtacact |
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T |
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tattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaat |
423 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || || ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| || |||| | || |||| | ||||||||| || | ||| ||| |
|
|
| T |
41609181 |
tattttctatcatttataattataataattatattttatttttcaaaagtgtcgataaagcaaaattcaaatttttttaatttttattactcgtaataat |
41609280 |
T |
 |
| Q |
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gaatattgattatttttt |
441 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gaatattgattatttttt |
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Q |
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|
|||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |
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|
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cttataaaaaatgaaatgatattttttcttatgagataatattttctaagatataaa |
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Q |
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|
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T |
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539 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||| || | | |||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
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T |
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539 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| | | ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
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Q |
| |
|
|||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| || || |||||||||||||||| |
|
|
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Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || || ||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
17069222 |
tatgattcttataaacaatg-aatgatgcgtttttcttctggaatcatattttctataatataaatgccgacaaataactatttatttcataaaattgat |
17069320 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
| ||| |||||| | ||| |||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
17069321 |
cgttagtttataga-tttatgaagcaggagtaccggtacac |
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T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #129
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| Q |
473 |
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529 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22780757 |
ttataaaaaatgaaatgataatttttcttatgaaatgatattttctaaactataaat |
22780813 |
T |
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Target: chr5; HSP #130
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tatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgat |
563 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||| || || |||||||||||| |||| | ||||||| || |||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
24431969 |
tatgattcttataaacagtgaa-tgatgtgtttttcttctgaaatcatattttctaaaatagaaatgtcgacaaataactatttatttcataaaattgat |
24431871 |
T |
 |
| Q |
564 |
cattaatttatatattt |
580 |
Q |
| |
|
| ||| |||||| |||| |
|
|
| T |
24431870 |
cgttagtttataaattt |
24431854 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #131
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574 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| || ||||||| | ||||||| || ||||| ||||||||||| |||| || ||||||||| |||| | ||| |||| || | |
|
|
| T |
39939192 |
ataaataatgaaatgatgtttattcttataaaatgatgtcttataaaacataaatattgataaataactctttatttca-taaaataatcgttaaattgt |
39939094 |
T |
 |
| Q |
575 |
atattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtga-gtgtatcatagaagttccctta |
638 |
Q |
| |
|
| || || |||| || |||||||||||||| || |||||| ||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
39939093 |
aaatatt-tgaagcaggagtaccggtacacctcaatttgtgaggtgtaccgtagaagttccctta |
39939030 |
T |
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Target: chr5; HSP #132
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Query Start/End: Original strand, 472 - 528
Target Start/End: Original strand, 41609329 - 41609385
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| Q |
472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
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|||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||| ||||||||||| |
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| T |
41609329 |
cttataaaaaatgaaatgatgttttttcttatgggataatattttttaaaatataaa |
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T |
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Target: chr5; HSP #133
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573 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
1490847 |
tataaataatgaaacaatgttttttcttataaaatgatagtttttaaaatataaatgtcaacaaaaaactttttatttcataaaagtgatatttaattta |
1490748 |
T |
 |
| Q |
574 |
tatatttt |
581 |
Q |
| |
|
|| ||||| |
|
|
| T |
1490747 |
tagatttt |
1490740 |
T |
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Target: chr5; HSP #134
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aatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
35777534 |
aatgaaatgatgttttttcttatgggataatattttctaaaatataaa |
35777487 |
T |
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Target: chr5; HSP #135
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| Q |
311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaattttta |
409 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| ||||||| | || || || ||||||| ||||| | ||||||| || ||||||||||| | ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
10568793 |
gaagaaaaata-ttattttttatcatttataattataatgattaaatcttattcaccaaaagcgtcaatgaaataaaattgaatttttttgaattttta |
10568696 |
T |
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Target: chr5; HSP #136
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| Q |
348 |
ataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaatattgattatttttta |
442 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| | ||||| | |||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||| || ||||| | |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
12362646 |
ataattaaatcttattaaccaaaaacgtcgacgaaataaaatttaatttttctgagtttttagtactcataatagagaattttgattatttttta |
12362552 |
T |
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Target: chr5; HSP #137
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Query Start/End: Original strand, 311 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 39939389 - 39939247
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| Q |
311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaat-ttttatgaattttta |
409 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||||||| || ||| ||| | |||| |||| ||||||||| || | |||| ||||||||| |
|
|
| T |
39939389 |
gaagaaaaagaattgttttctatcattaacaattacaataattagatcttagttaccgaaagtgtcgacgaaataaaattttacattttttgaatttttg |
39939290 |
T |
 |
| Q |
410 |
tcacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatg |
452 |
Q |
| |
|
| || ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
39939289 |
ttacatataacaaagaatatatattattttttatgaaaaaatg |
39939247 |
T |
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Target: chr5; HSP #138
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Query Start/End: Original strand, 494 - 539
Target Start/End: Original strand, 6260283 - 6260328
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| Q |
494 |
tttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6260283 |
tttttcttataaaatgatgttctataaaatataaatattgacaaat |
6260328 |
T |
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Target: chr5; HSP #139
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Query Start/End: Original strand, 473 - 526
Target Start/End: Original strand, 6532824 - 6532877
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| Q |
473 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
6532824 |
ttataaaaaatgaaatgatgttttatcttataaaatgatattttctaaaatata |
6532877 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 473 - 526
Target Start/End: Original strand, 6561070 - 6561123
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| Q |
473 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
6561070 |
ttataaaaaatgaaatgatattttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
6561123 |
T |
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Target: chr5; HSP #141
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Query Start/End: Original strand, 312 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15725811 - 15725750
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| Q |
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aagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagc |
373 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
15725811 |
aagaaaaagaattattttttatcattgacaattataataattaaatcttattttccaaaagc |
15725750 |
T |
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Target: chr5; HSP #142
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Target Start/End: Original strand, 34302892 - 34302945
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| Q |
473 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
34302892 |
ttataaaaaatgaaatgatattttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
34302945 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 463 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 34901830 - 34901770
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| Q |
463 |
aatatgatccttataaacaatgaaatgatggttt--ttcttatgagatgatgttttctaaa |
521 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
34901830 |
aatatgattcttataaacaatgaaattatgtttttcttcttatgaaatgatattttctaaa |
34901770 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 473 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 43237517 - 43237464
Alignment:
| Q |
473 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
43237517 |
ttataaaaaatgaaatgatattttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
43237464 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:
Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
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Target Start/End: Complemental strand, 166828 - 166418
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| Q |
224 |
aaaaggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataat |
323 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
166828 |
aaaaggcaaattctatggtacattcaataaatttgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataat |
166729 |
T |
 |
| Q |
324 |
tattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaat |
423 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
166728 |
tattttctatcattgacaactaagataattaaattttatataccaaaagtttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaat |
166629 |
T |
 |
| Q |
424 |
gaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaat |
523 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
166628 |
gaatattgattattttttatgacaa--tgtaaattttgtaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaatgatgttttctaaaat |
166531 |
T |
 |
| Q |
524 |
ataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatc |
623 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
166530 |
ataaatattgacaaatacctttttatttcattaaagtgatctttaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgaatgtacc |
166431 |
T |
 |
| Q |
624 |
atagaagttccct |
636 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |
|
|
| T |
166430 |
atataagttccct |
166418 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0239 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:
Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 228 - 638
Target Start/End: Original strand, 15380 - 15791
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228 |
ggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattatt |
327 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15380 |
ggcaaattctatggtacacccaataaatttgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttatttttttgaaaaaaaataattatt |
15479 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttctatcattgacaactaagataattaaatttt-atttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaa |
426 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
15480 |
ttctatcattgacaactaagataattaaatttttatataccaaaagcttcgacgaaataaaatttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaa |
15579 |
T |
 |
| Q |
427 |
tattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
15580 |
tattgattattttttatgacaaaatataaattttgtaatatgattcttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgaaacgatgttttctatgatata |
15679 |
T |
 |
| Q |
527 |
aatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcata |
626 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
15680 |
aatattgacaaatatctttttatttcattaaagtgatctttaatttctatattttatgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtaccata |
15779 |
T |
 |
| Q |
627 |
gaagttccctta |
638 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
15780 |
gaagttccctta |
15791 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0121 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:
Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 227 - 638
Target Start/End: Original strand, 13602 - 14013
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| Q |
227 |
aggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattat |
326 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
13602 |
aggcaaattctatggtacacccaatgaatttgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatcagttgtttttttgaagaaaaataattat |
13701 |
T |
 |
| Q |
327 |
tttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaa |
426 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
13702 |
tttctatcattgacaactaagataattaaattttatttaccaaaagcttcgatgaaataaattttaatttttaagaatttttattactcataacaatgaa |
13801 |
T |
 |
| Q |
427 |
tattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatata |
526 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13802 |
tattgattattttttatgaaaaaatgtaatttttttaatataatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttataaaatgatattttctaaaatata |
13901 |
T |
 |
| Q |
527 |
aatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacactcaaaattgtgagtgtatcata |
626 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |
|
|
| T |
13902 |
aatattgacaaatacctttttatttgattaaagtaatcgttaattcataaattttgtgcaacaaaagtaccggtacactcaaaattatgggtgtaccata |
14001 |
T |
 |
| Q |
627 |
gaagttccctta |
638 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
14002 |
gaagttccctta |
14013 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0005 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:
Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 228 - 632
Target Start/End: Original strand, 291623 - 292027
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228 |
ggcaaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgnnnnnnngaagaaaaataattatt |
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Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
291623 |
ggcaaattctatggtacattcaataaatttgggtgtatcggtacaccaaatcgtaaaattaataataaataaataatttttttgaagaaaaataattatt |
291722 |
T |
 |
| Q |
328 |
ttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaatgaat |
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Q |
| |
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| T |
291723 |
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Q |
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Target: scaffold0005; HSP #3
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Target: scaffold0493; HSP #1
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Target: scaffold0194; HSP #1
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17702 |
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527 |
Q |
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627 |
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Target: scaffold0349; HSP #1
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560 |
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8500 |
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T |
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Q |
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T |
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Target: scaffold1999; HSP #1
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Q |
| |
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| T |
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Target: scaffold0648; HSP #1
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Q |
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T |
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Target: scaffold0271; HSP #1
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Q |
| |
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539 |
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|
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| T |
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15964 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0072 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
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Target: scaffold0072; HSP #1
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Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0067 (Bit Score: 71; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
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Target: scaffold0067; HSP #1
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0841 (Bit Score: 70; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
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Target: scaffold0841; HSP #1
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Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0325 (Bit Score: 68; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
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Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
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Q |
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aaaaataattattttctatcattgacaattataataattaaatcttatttaccaaaagcgt-gatgaaataaaatttactttttctttaatttttattgc |
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T |
 |
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ccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttctt-atgagatgatg |
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Q |
| |
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| T |
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tcataatgaagaatattgattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatataatttatataaacaatgaaatgatatttttttttcatgagatggtg |
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T |
 |
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ttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatcattaatttatatattt |
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Q |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0009; HSP #1
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311 |
gaagaaaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaat-ttttatgaattttta |
409 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||| |||| || ||||||| || ||| ||||| |||| |||| ||||||||| || | |||| ||||||||| |
|
|
| T |
214222 |
gaagaaaaaaaattgttttctatcattaacaattacaataattatatcttagttatcgaaagtgtcgacgaaataaaattttacattttttgaatttttg |
214321 |
T |
 |
| Q |
410 |
tcacccataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatg |
509 |
Q |
| |
|
| || ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||| | ||| |
|
|
| T |
214322 |
ttacatataacaaagaatatttattattttttatgaaaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaataaaatgatgtttattcttataaaatg |
214421 |
T |
 |
| Q |
510 |
atgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcat |
554 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
214422 |
atgtcttataaaatataaatattgataaataactctttatttcat |
214466 |
T |
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Target: scaffold0045; HSP #1
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494 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
38149 |
ttttttgaatttttattacatataacaaagaatatttattattttttatgagaaaatgttaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaatgatgtt |
38248 |
T |
 |
| Q |
495 |
ttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaa |
558 |
Q |
| |
|
| ||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
38249 |
tattcttataaaatgatgtcttataaaatataaatattgataaataactctttatttcattaaa |
38312 |
T |
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326 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
21459 |
aggcaaattctatg-tacacccaataaattggg-tgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttgtttttttgaagaaaaataattat |
21556 |
T |
 |
| Q |
327 |
tttctatcatt |
337 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
21557 |
tttctatcatt |
21567 |
T |
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caaattttatggtacacctaataaatttggatgtatcggtgcaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttg |
303 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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caaattctatggtacacccaataaatttgggtgtatcggtacaccaagtcgtaaaattaataataaatgagttg |
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T |
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Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
45317 |
cttataaacaatgaa-tgatgtgtttttcttatgaaatgatgttttctgaaatataaatgccgacaaataactatttatttcataaaattgatcgttaat |
45415 |
T |
 |
| Q |
571 |
ttatatattttgtgaaacaagagtaccggtacac |
604 |
Q |
| |
|
||||| |||| || || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
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ttatagatttagt-aagtaagagtaccggtacac |
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T |
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ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
262986 |
ttataaaaaatgaaatgatgttttttcttatgggataatattttctaaaatataaa |
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T |
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570 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
76 |
cttataaacaatgaaatgatgtttttttttatgaaatgatgttatataaaatataaatattgacaaatagctatttattacataaaaaatgatcgttaat |
175 |
T |
 |
| Q |
571 |
ttata |
575 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
176 |
ttata |
180 |
T |
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Target: scaffold0131; HSP #1
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ataacaatgaatattgattattttttatgacaaaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttt |
515 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| | |
|
|
| T |
10842 |
ataacaaagaatatttattattttttatgagaaaatgtcaaaaatttaatatgattcttataaacaatgaaatgatgtttattcttataaaatgatgtct |
10941 |
T |
 |
| Q |
516 |
tctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
10942 |
tataaaatataaatattgataaat |
10965 |
T |
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Target: scaffold0460; HSP #1
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465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaatgcctttttatttcattaaagtgatc |
564 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||| | || |
|
|
| T |
8726 |
tatgattcttttaaacaatgaaatgatg-tttttcttatgaaataatggtttctaaaatataaatatcaacaaataactctttatttcataaaaatattc |
8628 |
T |
 |
| Q |
565 |
attaatttat |
574 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
8627 |
attaatttat |
8618 |
T |
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Target: scaffold0432; HSP #1
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472 |
cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
3191 |
cttataaataatgaaattatgttttttcttatgagatgatgttctataaaatataaattttgacaaat |
3124 |
T |
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Target: scaffold1319; HSP #1
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
213 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttatttcttatgaattgttgttctataaaatataaatattgacaaat |
139 |
T |
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Target: scaffold0308; HSP #1
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465 |
tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgacaaat |
539 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
7440 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttcttatgaaatgtggttctataaaatataaatattaacaaat |
7514 |
T |
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cttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
70856 |
cttataaaaaatgaaatgatgttttttcttatgggataatattttctaaaatataaa |
70800 |
T |
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Target: scaffold0190; HSP #1
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473 |
ttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaa |
528 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
5859 |
ttataaaaaatgaaatgatgttttttcttatgggataatattttctaaaatataaa |
5804 |
T |
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tattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttatgaatttttatcacccataacaat |
423 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | || || ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||| |||| | || |||| | ||||||||| || ||||| | | |
|
|
| T |
6010 |
tattttctatcatttataattataataattatattttatttttcaaaagtgtcggcgaagcaaaattcaaatttttttaatttttattactcataatagt |
5911 |
T |
 |
| Q |
424 |
gaatattgattatttttt |
441 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5910 |
gaatattgattatttttt |
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T |
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Target: scaffold0125; HSP #1
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tatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatattgaca |
536 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32374 |
tatgattcttataaacaattaaatgatgttttttattatga---aatgttttataaaatataaatattgaca |
32306 |
T |
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aaaataattattttctatcattgacaactaagataattaaattttatttatcaaaagcttcgatgaaataaaacttaatttttat |
400 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
3823 |
aaaaaaattattttctat-atttacaattataataattatattttatttatcaaaaatgtcggtgaaataaaatttaatttttat |
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T |
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447 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||||| ||||| | |||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| | |||| |||||||||||| | | | |
|
|
| T |
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ataattaaatatcatttaccaaaaacatcgacaaaataaaatttaatttttctgaatttttagtactcataatagagaattttgattattttt-acaata |
6453 |
T |
 |
| Q |
448 |
aaatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatggtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatat |
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Q |
| |
|
||||| | | |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
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aaatgtaaaaaaattagtatgatgtttataaacaatgaaataatgttttttcttaagaaatgacatttcctaaaatataaatat |
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Q |
| |
|
||||||||| ||||| | ||||| | |||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||| || ||||| | |||| |||||||||||||| | || |
|
|
| T |
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taattaaatcttattaaccaaaaacgtcgacgaaataaaatttaatttttctgagtttttagtactcataatagagaattttgattattttttacaataa |
29463 |
T |
 |
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aatgaannnnnnnnaatatgatccttataaacaatgaaatgatg-gtttttcttatgagatgatgttttctaaaatataaatat |
531 |
Q |
| |
|
|||| | | |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29464 |
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Q |
| |
|
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|
|
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ataattaaatcttattaaccaaaaacgtcgacgaaataaaatttaatttttctgagtttttagtactcataatagagaattttgattatttttta |
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|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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