View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14196_low_11 (Length: 452)

Name: NF14196_low_11
Description: NF14196
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14196_low_11
NF14196_low_11
[»] chr1 (99 HSPs)
chr1 (14-440)||(36211912-36212345)
chr1 (20-311)||(28556533-28556826)
chr1 (14-311)||(6740303-6740602)
chr1 (14-311)||(3652730-3653029)
chr1 (20-311)||(18417916-18418208)
chr1 (14-311)||(20277283-20277595)
chr1 (20-311)||(18026783-18027073)
chr1 (68-311)||(37675234-37675477)
chr1 (68-311)||(37681927-37682170)
chr1 (68-311)||(38908085-38908329)
chr1 (243-439)||(20396735-20396932)
chr1 (14-311)||(48427629-48427937)
chr1 (153-311)||(39094247-39094405)
chr1 (39-311)||(20570554-20570825)
chr1 (287-436)||(20277118-20277267)
chr1 (136-311)||(22185635-22185809)
chr1 (39-308)||(20396911-20397179)
chr1 (287-436)||(28556368-28556517)
chr1 (16-311)||(31535331-31535640)
chr1 (16-311)||(31564048-31564357)
chr1 (160-311)||(39189712-39189864)
chr1 (287-439)||(18026614-18026767)
chr1 (150-311)||(17146179-17146341)
chr1 (287-440)||(18418224-18418379)
chr1 (153-311)||(4231112-4231272)
chr1 (153-311)||(42626124-42626284)
chr1 (150-311)||(21962926-21963089)
chr1 (287-411)||(6740618-6740742)
chr1 (287-411)||(48427953-48428077)
chr1 (161-311)||(9269865-9270017)
chr1 (153-302)||(24850025-24850175)
chr1 (287-388)||(39189595-39189696)
chr1 (287-407)||(31535195-31535315)
chr1 (287-407)||(31563912-31564032)
chr1 (287-386)||(39094421-39094520)
chr1 (153-308)||(52990639-52990796)
chr1 (287-388)||(38907968-38908069)
chr1 (161-424)||(20299290-20299547)
chr1 (161-308)||(20292612-20292761)
chr1 (287-388)||(37682186-37682288)
chr1 (287-388)||(37675493-37675595)
chr1 (217-310)||(49328023-49328117)
chr1 (287-372)||(22185534-22185619)
chr1 (225-310)||(29596888-29596973)
chr1 (304-424)||(20292797-20292918)
chr1 (217-310)||(47484097-47484191)
chr1 (299-406)||(20570853-20570961)
chr1 (239-310)||(29602323-29602394)
chr1 (225-310)||(21920795-21920880)
chr1 (163-308)||(24079486-24079637)
chr1 (163-308)||(24109117-24109268)
chr1 (311-414)||(42626323-42626426)
chr1 (323-424)||(17149454-17149555)
chr1 (163-308)||(23195568-23195718)
chr1 (217-310)||(36614925-36615020)
chr1 (217-310)||(43088381-43088476)
chr1 (299-388)||(4231300-4231390)
chr1 (14-76)||(52400025-52400087)
chr1 (299-388)||(21963117-21963207)
chr1 (306-416)||(20076837-20076947)
chr1 (260-311)||(20076982-20077033)
chr1 (224-305)||(10813614-10813697)
chr1 (226-286)||(3706877-3706939)
chr1 (163-308)||(21541991-21542142)
chr1 (287-356)||(19961275-19961342)
chr1 (16-102)||(27693767-27693853)
chr1 (311-356)||(29602239-29602284)
chr1 (311-356)||(36615058-36615103)
chr1 (311-356)||(49328155-49328200)
chr1 (226-308)||(21410771-21410857)
chr1 (226-286)||(955157-955219)
chr1 (226-286)||(22448378-22448440)
chr1 (163-308)||(42095994-42096145)
chr1 (311-354)||(43088514-43088557)
chr1 (226-308)||(20941947-20942034)
chr1 (311-356)||(21920919-21920964)
chr1 (226-286)||(20824467-20824530)
chr1 (250-305)||(22030793-22030849)
chr1 (226-305)||(30491535-30491617)
chr1 (287-322)||(3652679-3652714)
chr1 (226-286)||(23066816-23066878)
chr1 (266-308)||(15316599-15316641)
chr1 (310-356)||(20242693-20242739)
chr1 (266-304)||(21664203-21664241)
chr1 (225-308)||(19664220-19664307)
chr1 (226-308)||(19666826-19666913)
chr1 (217-284)||(20852183-20852252)
chr1 (217-284)||(20858809-20858878)
chr1 (226-305)||(21698132-21698215)
chr1 (217-284)||(21705212-21705281)
chr1 (310-355)||(23066673-23066718)
chr1 (311-356)||(29596804-29596849)
chr1 (264-305)||(31927515-31927556)
chr1 (311-356)||(47484229-47484274)
chr1 (312-356)||(20824329-20824373)
chr1 (226-286)||(20838286-20838349)
chr1 (313-356)||(21698261-21698305)
chr1 (226-304)||(23630954-23631035)
chr1 (226-286)||(29554560-29554623)
[»] chr4 (127 HSPs)
chr4 (20-439)||(50081998-50082422)
chr4 (14-311)||(3260040-3260339)
chr4 (14-311)||(52500285-52500584)
chr4 (14-311)||(390859-391159)
chr4 (14-311)||(23436031-23436338)
chr4 (22-311)||(29382813-29383104)
chr4 (14-311)||(39266286-39266583)
chr4 (14-311)||(26395415-26395718)
chr4 (68-311)||(29448725-29448969)
chr4 (68-311)||(29455409-29455653)
chr4 (68-311)||(11936948-11937191)
chr4 (14-311)||(3266668-3266976)
chr4 (14-311)||(49240893-49241201)
chr4 (14-311)||(49749607-49749915)
chr4 (98-259)||(15470652-15470813)
chr4 (287-436)||(39266121-39266270)
chr4 (287-424)||(391215-391352)
chr4 (150-308)||(5938795-5938955)
chr4 (287-440)||(52500600-52500754)
chr4 (150-311)||(1583780-1583943)
chr4 (150-311)||(21396686-21396850)
chr4 (287-424)||(3259887-3260024)
chr4 (287-439)||(21396866-21397019)
chr4 (287-439)||(29382644-29382797)
chr4 (155-311)||(42956070-42956228)
chr4 (150-311)||(7359119-7359281)
chr4 (153-311)||(34772041-34772201)
chr4 (153-311)||(45959790-45959950)
chr4 (153-311)||(54844996-54845156)
chr4 (287-411)||(3266528-3266652)
chr4 (287-386)||(29448610-29448709)
chr4 (150-311)||(7356126-7356288)
chr4 (161-311)||(47872470-47872622)
chr4 (287-408)||(49240756-49240877)
chr4 (287-408)||(49749470-49749591)
chr4 (287-386)||(23435916-23436015)
chr4 (287-386)||(26395734-26395833)
chr4 (153-311)||(45142598-45142757)
chr4 (287-386)||(29455294-29455393)
chr4 (161-310)||(35462660-35462810)
chr4 (153-306)||(45151372-45151526)
chr4 (161-311)||(11202479-11202630)
chr4 (287-388)||(11937207-11937309)
chr4 (225-310)||(21881541-21881626)
chr4 (224-310)||(19128391-19128477)
chr4 (224-310)||(33097042-33097128)
chr4 (304-424)||(1583976-1584096)
chr4 (225-310)||(2972781-2972866)
chr4 (225-310)||(20889324-20889409)
chr4 (225-310)||(20894943-20895028)
chr4 (225-310)||(49548632-49548717)
chr4 (223-310)||(33221317-33221404)
chr4 (299-424)||(7359309-7359434)
chr4 (217-310)||(42220372-42220466)
chr4 (148-223)||(3096682-3096757)
chr4 (299-424)||(5938986-5939111)
chr4 (217-310)||(36037503-36037597)
chr4 (225-310)||(31665009-31665094)
chr4 (299-406)||(11202343-11202451)
chr4 (217-310)||(46044918-46045013)
chr4 (224-310)||(30396146-30396231)
chr4 (217-310)||(41404754-41404849)
chr4 (217-310)||(899534-899628)
chr4 (226-310)||(49548417-49548502)
chr4 (163-292)||(37881331-37881466)
chr4 (299-388)||(45959672-45959762)
chr4 (163-292)||(13452162-13452295)
chr4 (299-356)||(34772229-34772286)
chr4 (299-356)||(45142513-45142570)
chr4 (311-356)||(2972697-2972742)
chr4 (311-356)||(19128307-19128352)
chr4 (311-356)||(20889448-20889493)
chr4 (311-356)||(20895067-20895112)
chr4 (311-356)||(36037636-36037681)
chr4 (311-356)||(47872386-47872431)
chr4 (311-356)||(49548548-49548593)
chr4 (311-412)||(31665133-31665235)
chr4 (311-356)||(899666-899711)
chr4 (311-356)||(21881665-21881710)
chr4 (311-356)||(30396269-30396314)
chr4 (311-356)||(33097166-33097211)
chr4 (311-356)||(42955986-42956031)
chr4 (311-356)||(54844912-54844957)
chr4 (226-305)||(18271262-18271344)
chr4 (312-356)||(41404672-41404716)
chr4 (226-286)||(23121599-23121661)
chr4 (287-356)||(14910725-14910792)
chr4 (311-356)||(35462576-35462621)
chr4 (311-356)||(42220504-42220549)
chr4 (311-356)||(46044835-46044880)
chr4 (311-356)||(49548333-49548378)
chr4 (226-308)||(13899711-13899797)
chr4 (226-308)||(15360917-15361003)
chr4 (226-308)||(16484596-16484682)
chr4 (226-305)||(18261297-18261379)
chr4 (225-292)||(10977129-10977199)
chr4 (226-286)||(20940260-20940322)
chr4 (226-284)||(27905211-27905270)
chr4 (226-284)||(40908583-40908642)
chr4 (226-290)||(15005081-15005149)
chr4 (226-305)||(13444207-13444290)
chr4 (225-308)||(13886665-13886752)
chr4 (225-285)||(14821355-14821418)
chr4 (225-308)||(15244098-15244185)
chr4 (225-308)||(15307000-15307087)
chr4 (288-356)||(27905352-27905418)
chr4 (311-356)||(33221443-33221488)
chr4 (224-290)||(53905429-53905499)
chr4 (226-284)||(1651177-1651236)
chr4 (226-308)||(2585260-2585346)
chr4 (226-286)||(4831203-4831265)
chr4 (226-286)||(4834498-4834560)
chr4 (226-305)||(8833771-8833855)
chr4 (217-284)||(14910575-14910645)
chr4 (266-308)||(12931881-12931923)
chr4 (310-356)||(14485671-14485717)
chr4 (229-305)||(16229217-16229297)
chr4 (310-356)||(18212297-18212343)
chr4 (310-356)||(26077682-26077728)
chr4 (310-355)||(17000139-17000184)
chr4 (264-305)||(22725968-22726008)
chr4 (296-356)||(30237898-30237958)
chr4 (313-356)||(10972873-10972917)
chr4 (229-286)||(14484432-14484491)
chr4 (225-286)||(15406911-15406973)
chr4 (264-308)||(15546609-15546653)
chr4 (266-306)||(18166382-18166422)
[»] chr2 (88 HSPs)
chr2 (14-408)||(71423-71821)
chr2 (14-311)||(27729295-27729594)
chr2 (14-311)||(4077207-4077506)
chr2 (14-311)||(44091135-44091437)
chr2 (14-311)||(21604547-21604850)
chr2 (84-311)||(20850046-20850275)
chr2 (68-311)||(11360286-11360530)
chr2 (87-311)||(24481646-24481870)
chr2 (68-311)||(30196561-30196804)
chr2 (68-311)||(1061555-1061799)
chr2 (68-311)||(1066938-1067182)
chr2 (153-311)||(4071591-4071749)
chr2 (98-306)||(35585234-35585438)
chr2 (287-440)||(4077522-4077676)
chr2 (160-311)||(36984612-36984764)
chr2 (160-311)||(31828547-31828698)
chr2 (160-311)||(31833899-31834050)
chr2 (150-311)||(22013159-22013322)
chr2 (150-311)||(27037167-27037330)
chr2 (150-311)||(24426887-24427051)
chr2 (150-311)||(33973-34136)
chr2 (287-424)||(44090982-44091119)
chr2 (150-311)||(2385968-2386132)
chr2 (153-311)||(35244081-35244241)
chr2 (287-439)||(24426718-24426871)
chr2 (292-424)||(27729615-27729747)
chr2 (287-440)||(31828714-31828868)
chr2 (287-440)||(31834066-31834220)
chr2 (287-440)||(36984442-36984596)
chr2 (163-311)||(11466008-11466157)
chr2 (153-311)||(28292645-28292805)
chr2 (287-407)||(2385832-2385952)
chr2 (287-386)||(1067198-1067297)
chr2 (287-386)||(21604866-21604965)
chr2 (287-386)||(24481531-24481630)
chr2 (287-406)||(4071455-4071575)
chr2 (287-386)||(1061815-1061914)
chr2 (287-386)||(30196446-30196545)
chr2 (287-388)||(20850291-20850393)
chr2 (299-424)||(27037358-27037484)
chr2 (225-310)||(14563832-14563917)
chr2 (225-310)||(27272251-27272336)
chr2 (224-310)||(13101227-13101313)
chr2 (224-310)||(36800556-36800642)
chr2 (217-310)||(32911535-32911630)
chr2 (287-386)||(11360175-11360270)
chr2 (217-310)||(15643342-15643436)
chr2 (225-310)||(25590254-25590339)
chr2 (299-406)||(34164-34272)
chr2 (217-306)||(45028499-45028590)
chr2 (224-310)||(17592586-17592674)
chr2 (163-292)||(28971387-28971521)
chr2 (299-381)||(22013048-22013131)
chr2 (163-308)||(21133345-21133496)
chr2 (301-356)||(28292835-28292890)
chr2 (299-388)||(35243963-35244053)
chr2 (311-412)||(27272376-27272478)
chr2 (311-391)||(17592466-17592547)
chr2 (311-356)||(11466196-11466241)
chr2 (311-356)||(14563956-14564001)
chr2 (311-356)||(36800680-36800725)
chr2 (311-356)||(45028632-45028677)
chr2 (311-356)||(13101143-13101188)
chr2 (311-356)||(15643259-15643304)
chr2 (311-356)||(25590171-25590216)
chr2 (226-308)||(38931652-38931738)
chr2 (163-308)||(43693336-43693487)
chr2 (163-284)||(19649660-19649787)
chr2 (225-306)||(23062500-23062585)
chr2 (226-286)||(2105577-2105640)
chr2 (226-305)||(20914430-20914513)
chr2 (311-356)||(32911452-32911497)
chr2 (226-286)||(20724032-20724095)
chr2 (226-308)||(25267199-25267285)
chr2 (163-308)||(6744415-6744566)
chr2 (250-308)||(8890062-8890121)
chr2 (226-286)||(22809882-22809944)
chr2 (310-356)||(9241492-9241538)
chr2 (310-356)||(22810042-22810088)
chr2 (266-308)||(23062590-23062632)
chr2 (266-308)||(24660500-24660542)
chr2 (217-284)||(9512-9581)
chr2 (226-305)||(19035478-19035561)
chr2 (226-305)||(20648069-20648152)
chr2 (226-280)||(22703489-22703545)
chr2 (226-305)||(22860301-22860384)
chr2 (255-310)||(22796720-22796776)
chr2 (226-286)||(24658773-24658836)
[»] chr6 (92 HSPs)
chr6 (14-439)||(24362398-24362821)
chr6 (14-311)||(24368973-24369271)
chr6 (16-311)||(25315710-25316007)
chr6 (16-311)||(26203204-26203501)
chr6 (20-311)||(30799502-30799792)
chr6 (14-311)||(15332187-15332490)
chr6 (14-311)||(17309455-17309758)
chr6 (14-311)||(25463625-25463925)
chr6 (54-311)||(1070441-1070702)
chr6 (14-311)||(16223723-16224031)
chr6 (98-312)||(22406493-22406707)
chr6 (287-436)||(25315545-25315694)
chr6 (287-436)||(26203039-26203188)
chr6 (287-436)||(30799337-30799486)
chr6 (158-311)||(34134035-34134189)
chr6 (20-311)||(4106491-4106781)
chr6 (287-439)||(24369287-24369440)
chr6 (161-311)||(94559-94711)
chr6 (150-311)||(29158989-29159153)
chr6 (153-310)||(14582730-14582888)
chr6 (285-437)||(19096685-19096838)
chr6 (150-311)||(8069759-8069921)
chr6 (287-411)||(16223583-16223707)
chr6 (287-411)||(34133895-34134019)
chr6 (287-437)||(29159169-29159320)
chr6 (287-424)||(1070718-1070855)
chr6 (287-407)||(25463941-25464061)
chr6 (287-386)||(15332072-15332171)
chr6 (287-386)||(17309774-17309873)
chr6 (224-310)||(27767357-27767443)
chr6 (225-310)||(10464279-10464364)
chr6 (225-310)||(10470801-10470886)
chr6 (287-406)||(22406723-22406842)
chr6 (217-310)||(12447265-12447360)
chr6 (223-310)||(29925692-29925779)
chr6 (299-388)||(8069641-8069731)
chr6 (225-310)||(13940432-13940518)
chr6 (225-306)||(17207811-17207893)
chr6 (150-264)||(19096815-19096931)
chr6 (163-308)||(26418758-26418909)
chr6 (225-290)||(17894611-17894676)
chr6 (217-310)||(23021418-23021513)
chr6 (98-204)||(17702011-17702113)
chr6 (296-406)||(4106806-4106913)
chr6 (163-292)||(23235037-23235171)
chr6 (256-310)||(13128336-13128390)
chr6 (163-289)||(5290254-5290384)
chr6 (217-308)||(25347072-25347167)
chr6 (311-356)||(94475-94520)
chr6 (311-356)||(27767482-27767527)
chr6 (311-412)||(10470660-10470762)
chr6 (311-356)||(14582927-14582972)
chr6 (225-286)||(1592758-1592821)
chr6 (290-356)||(19300639-19300703)
chr6 (226-284)||(19300787-19300846)
chr6 (163-308)||(24562217-24562368)
chr6 (311-356)||(10464195-10464240)
chr6 (311-356)||(12447182-12447227)
chr6 (304-356)||(14133011-14133064)
chr6 (311-356)||(17207724-17207769)
chr6 (311-356)||(23021335-23021380)
chr6 (225-308)||(25395999-25396086)
chr6 (311-356)||(29925817-29925862)
chr6 (229-286)||(21724875-21724934)
chr6 (225-260)||(13135929-13135964)
chr6 (226-284)||(14581975-14582034)
chr6 (226-286)||(19726606-19726668)
chr6 (217-284)||(24513944-24514014)
chr6 (266-308)||(23233502-23233544)
chr6 (311-356)||(13128252-13128297)
chr6 (217-284)||(15457455-15457524)
chr6 (217-284)||(15464050-15464119)
chr6 (226-308)||(10582933-10583019)
chr6 (266-306)||(19449332-19449372)
chr6 (226-305)||(22798616-22798698)
chr6 (243-286)||(22906984-22907027)
chr6 (226-284)||(8760544-8760605)
chr6 (310-356)||(8768145-8768191)
chr6 (266-308)||(17414038-17414080)
chr6 (266-308)||(19451326-19451368)
chr6 (266-308)||(19472418-19472460)
chr6 (311-363)||(13940556-13940609)
chr6 (217-308)||(18786052-18786148)
chr6 (310-355)||(19726765-19726810)
chr6 (226-305)||(24412383-24412466)
chr6 (266-306)||(14133140-14133180)
chr6 (226-286)||(14375426-14375489)
chr6 (311-358)||(17027156-17027204)
chr6 (313-356)||(18786230-18786274)
chr6 (266-306)||(19467858-19467898)
chr6 (225-284)||(20008998-20009058)
chr6 (226-308)||(24720594-24720680)
[»] chr7 (142 HSPs)
chr7 (14-440)||(30602778-30603202)
chr7 (14-311)||(11878853-11879152)
chr7 (28-311)||(32627197-32627482)
chr7 (20-311)||(11899396-11899689)
chr7 (39-311)||(26113842-26114115)
chr7 (20-311)||(18437253-18437543)
chr7 (20-311)||(642342-642635)
chr7 (14-311)||(26090037-26090339)
chr7 (42-311)||(17726419-17726688)
chr7 (39-311)||(26120455-26120728)
chr7 (14-311)||(2026311-2026618)
chr7 (42-311)||(11339587-11339856)
chr7 (16-311)||(11299740-11300034)
chr7 (111-311)||(11308104-11308300)
chr7 (68-311)||(5187330-5187574)
chr7 (16-311)||(749622-749928)
chr7 (153-311)||(42058476-42058634)
chr7 (16-311)||(40684849-40685157)
chr7 (98-311)||(1317640-1317851)
chr7 (287-436)||(26113677-26113826)
chr7 (291-436)||(32627502-32627647)
chr7 (98-311)||(40923009-40923218)
chr7 (20-311)||(33404447-33404738)
chr7 (153-311)||(8197286-8197444)
chr7 (153-311)||(8213357-8213515)
chr7 (287-436)||(26120290-26120439)
chr7 (160-311)||(2281019-2281171)
chr7 (16-311)||(48988007-48988323)
chr7 (160-311)||(49150517-49150670)
chr7 (160-311)||(49157207-49157360)
chr7 (287-440)||(11879168-11879322)
chr7 (288-439)||(33404755-33404907)
chr7 (150-311)||(2438806-2438969)
chr7 (150-311)||(13964089-13964252)
chr7 (287-439)||(17726250-17726403)
chr7 (287-439)||(18437084-18437237)
chr7 (287-439)||(11899226-11899380)
chr7 (287-439)||(11339872-11340025)
chr7 (287-439)||(642651-642803)
chr7 (150-310)||(46649692-46649854)
chr7 (111-311)||(37285090-37285294)
chr7 (287-411)||(8197146-8197270)
chr7 (287-439)||(2438985-2439139)
chr7 (287-407)||(749944-750064)
chr7 (287-411)||(1317867-1317991)
chr7 (287-411)||(26089897-26090021)
chr7 (163-311)||(46174260-46174410)
chr7 (153-311)||(20019758-20019917)
chr7 (287-440)||(2281187-2281341)
chr7 (287-407)||(40684713-40684833)
chr7 (287-407)||(48987871-48987991)
chr7 (287-386)||(40922894-40922993)
chr7 (287-385)||(11299626-11299724)
chr7 (287-385)||(11307990-11308088)
chr7 (287-411)||(5187189-5187314)
chr7 (161-311)||(2388644-2388795)
chr7 (299-424)||(13963935-13964061)
chr7 (217-310)||(16843958-16844051)
chr7 (287-406)||(49150686-49150806)
chr7 (287-406)||(49157376-49157496)
chr7 (150-311)||(17468339-17468501)
chr7 (150-311)||(17584713-17584875)
chr7 (287-414)||(20019614-20019742)
chr7 (287-386)||(42058650-42058750)
chr7 (184-311)||(49158702-49158827)
chr7 (287-386)||(2026196-2026295)
chr7 (217-310)||(19439302-19439396)
chr7 (224-310)||(23521000-23521086)
chr7 (304-424)||(37285327-37285448)
chr7 (64-223)||(12404086-12404250)
chr7 (225-310)||(12461517-12461602)
chr7 (217-310)||(13019698-13019792)
chr7 (150-269)||(15622091-15622212)
chr7 (163-308)||(15086013-15086163)
chr7 (299-371)||(49158855-49158927)
chr7 (223-388)||(21757334-21757494)
chr7 (161-385)||(37379869-37380089)
chr7 (223-403)||(13453756-13453931)
chr7 (163-308)||(32771430-32771580)
chr7 (163-306)||(37244400-37244549)
chr7 (163-308)||(16952327-16952477)
chr7 (163-308)||(18958519-18958670)
chr7 (311-385)||(17468226-17468300)
chr7 (311-385)||(17584914-17584988)
chr7 (311-363)||(2388553-2388605)
chr7 (223-308)||(3327797-3327885)
chr7 (311-363)||(46174449-46174502)
chr7 (287-329)||(8213299-8213341)
chr7 (311-356)||(15838736-15838781)
chr7 (311-356)||(16843875-16843920)
chr7 (184-306)||(26289860-26289986)
chr7 (311-356)||(46649893-46649938)
chr7 (163-308)||(4279898-4280049)
chr7 (226-286)||(14431989-14432051)
chr7 (226-286)||(15338826-15338888)
chr7 (226-286)||(15723330-15723392)
chr7 (163-308)||(19616230-19616381)
chr7 (226-286)||(35962852-35962914)
chr7 (311-356)||(12461640-12461685)
chr7 (311-356)||(19439434-19439479)
chr7 (311-356)||(23521124-23521169)
chr7 (311-356)||(30271786-30271831)
chr7 (226-286)||(11220227-11220290)
chr7 (226-308)||(14179099-14179185)
chr7 (226-308)||(15098057-15098143)
chr7 (226-308)||(15104434-15104520)
chr7 (226-308)||(46682284-46682370)
chr7 (226-286)||(15711106-15711168)
chr7 (226-286)||(16109181-16109243)
chr7 (225-264)||(30271871-30271910)
chr7 (226-305)||(11308991-11309073)
chr7 (226-305)||(11312299-11312381)
chr7 (311-356)||(13019830-13019875)
chr7 (225-308)||(46624841-46624928)
chr7 (226-308)||(82168-82254)
chr7 (226-308)||(15437697-15437783)
chr7 (297-356)||(16073934-16073993)
chr7 (226-286)||(1612623-1612685)
chr7 (226-286)||(6411821-6411883)
chr7 (226-286)||(14281760-14281822)
chr7 (217-286)||(13678272-13678345)
chr7 (310-356)||(18607025-18607071)
chr7 (225-286)||(19145565-19145629)
chr7 (228-283)||(19599844-19599901)
chr7 (225-284)||(20328365-20328426)
chr7 (225-286)||(20744964-20745028)
chr7 (226-290)||(45185447-45185515)
chr7 (217-284)||(147057-147126)
chr7 (217-284)||(2965921-2965990)
chr7 (310-355)||(14281617-14281662)
chr7 (217-284)||(14320683-14320752)
chr7 (217-284)||(14565698-14565767)
chr7 (217-286)||(21232149-21232220)
chr7 (217-284)||(31154357-31154426)
chr7 (310-355)||(35962709-35962754)
chr7 (226-308)||(10519836-10519922)
chr7 (226-308)||(12547171-12547257)
chr7 (226-285)||(16575546-16575608)
chr7 (226-285)||(16590054-16590116)
chr7 (226-285)||(23442259-23442321)
chr7 (225-284)||(29182169-29182229)
chr7 (313-356)||(32771662-32771706)
[»] chr5 (132 HSPs)
chr5 (14-311)||(10685880-10686179)
chr5 (14-311)||(5582352-5582651)
chr5 (14-311)||(40011047-40011346)
chr5 (28-311)||(43028790-43029075)
chr5 (16-311)||(18895070-18895367)
chr5 (20-311)||(25852717-25853010)
chr5 (14-311)||(14615025-14615326)
chr5 (20-311)||(25846082-25846378)
chr5 (14-311)||(11994870-11995171)
chr5 (82-311)||(5454293-5454523)
chr5 (14-311)||(22248316-22248608)
chr5 (54-311)||(15461246-15461506)
chr5 (84-311)||(38013539-38013768)
chr5 (68-311)||(17938959-17939202)
chr5 (287-436)||(18894905-18895054)
chr5 (98-311)||(37540033-37540243)
chr5 (98-311)||(37547577-37547787)
chr5 (287-440)||(5582182-5582336)
chr5 (287-436)||(5454539-5454688)
chr5 (99-311)||(1111753-1111961)
chr5 (153-311)||(30780942-30781099)
chr5 (287-436)||(15461522-15461672)
chr5 (160-311)||(7508090-7508242)
chr5 (101-311)||(19507986-19508197)
chr5 (160-311)||(14889067-14889219)
chr5 (160-311)||(24795091-24795243)
chr5 (160-311)||(24800458-24800610)
chr5 (287-436)||(30781115-30781265)
chr5 (160-311)||(14882390-14882542)
chr5 (287-440)||(43029091-43029245)
chr5 (287-440)||(40010877-40011031)
chr5 (153-311)||(597150-597308)
chr5 (153-311)||(22507434-22507594)
chr5 (150-424)||(20347059-20347332)
chr5 (287-411)||(1111613-1111737)
chr5 (287-440)||(7507920-7508074)
chr5 (287-440)||(10686195-10686348)
chr5 (153-311)||(19800415-19800574)
chr5 (287-408)||(14614888-14615009)
chr5 (150-424)||(20340455-20340728)
chr5 (287-388)||(24794974-24795075)
chr5 (287-388)||(24800341-24800442)
chr5 (287-439)||(25846394-25846549)
chr5 (287-386)||(22248201-22248300)
chr5 (287-386)||(37539918-37540017)
chr5 (287-386)||(37547462-37547561)
chr5 (287-386)||(38013784-38013883)
chr5 (287-388)||(24008102-24008203)
chr5 (287-406)||(14882254-14882374)
chr5 (287-406)||(14888931-14889051)
chr5 (153-311)||(22500856-22501013)
chr5 (288-386)||(11995188-11995286)
chr5 (287-409)||(25853026-25853150)
chr5 (287-386)||(17938843-17938943)
chr5 (225-310)||(5341793-5341878)
chr5 (225-310)||(20990300-20990385)
chr5 (225-310)||(41878079-41878164)
chr5 (217-310)||(24057590-24057684)
chr5 (224-310)||(26650400-26650486)
chr5 (224-310)||(26921985-26922071)
chr5 (225-310)||(28259948-28260033)
chr5 (150-356)||(29746583-29746787)
chr5 (217-310)||(23081813-23081908)
chr5 (225-310)||(7773723-7773807)
chr5 (225-306)||(16775121-16775202)
chr5 (225-306)||(37566037-37566118)
chr5 (217-310)||(23076365-23076460)
chr5 (225-310)||(25419819-25419905)
chr5 (225-310)||(18941288-18941373)
chr5 (217-310)||(23544935-23545030)
chr5 (14-137)||(24007959-24008085)
chr5 (153-388)||(18566509-18566740)
chr5 (217-310)||(39608947-39609041)
chr5 (299-406)||(19508225-19508333)
chr5 (217-310)||(19362588-19362683)
chr5 (217-310)||(19801959-19802054)
chr5 (299-439)||(597336-597477)
chr5 (163-308)||(27635969-27636119)
chr5 (311-414)||(22501052-22501155)
chr5 (311-414)||(22507633-22507736)
chr5 (163-289)||(24751642-24751772)
chr5 (163-289)||(24669104-24669234)
chr5 (163-289)||(24738873-24739003)
chr5 (311-410)||(16774978-16775078)
chr5 (307-356)||(19800330-19800379)
chr5 (311-356)||(37566161-37566206)
chr5 (311-356)||(41877995-41878040)
chr5 (311-356)||(5341710-5341755)
chr5 (311-356)||(19362721-19362766)
chr5 (311-356)||(23076282-23076327)
chr5 (311-356)||(23081730-23081775)
chr5 (311-356)||(23544852-23544897)
chr5 (226-264)||(41877911-41877949)
chr5 (311-356)||(18941205-18941250)
chr5 (311-356)||(19801876-19801921)
chr5 (311-356)||(20990424-20990469)
chr5 (311-356)||(22379604-22379649)
chr5 (311-356)||(28259864-28259909)
chr5 (311-356)||(41877825-41877870)
chr5 (224-264)||(22379524-22379564)
chr5 (226-308)||(23444294-23444380)
chr5 (226-286)||(758365-758427)
chr5 (226-286)||(22312943-22313005)
chr5 (226-286)||(22509284-22509346)
chr5 (287-356)||(23112708-23112775)
chr5 (287-356)||(34829169-34829236)
chr5 (311-356)||(25419943-25419988)
chr5 (226-308)||(427215-427301)
chr5 (226-308)||(23561702-23561788)
chr5 (311-433)||(26650524-26650650)
chr5 (311-433)||(26922109-26922235)
chr5 (226-286)||(20937594-20937656)
chr5 (226-307)||(21574110-21574195)
chr5 (313-356)||(24057724-24057767)
chr5 (266-308)||(21829546-21829588)
chr5 (229-305)||(21888550-21888630)
chr5 (311-356)||(7773639-7773684)
chr5 (217-284)||(19235837-19235906)
chr5 (310-355)||(20937754-20937799)
chr5 (310-355)||(22312801-22312846)
chr5 (217-284)||(22466716-22466785)
chr5 (264-305)||(24617806-24617846)
chr5 (264-305)||(24714037-24714077)
chr5 (264-305)||(24747065-24747105)
chr5 (217-284)||(28371543-28371612)
chr5 (217-284)||(38145870-38145939)
chr5 (311-356)||(39608864-39608909)
chr5 (217-284)||(42960072-42960141)
chr5 (295-356)||(10035266-10035325)
chr5 (226-308)||(20843142-20843228)
chr5 (313-356)||(23444167-23444211)
chr5 (250-305)||(25013621-25013677)
[»] chr8 (102 HSPs)
chr8 (14-311)||(16887343-16887642)
chr8 (14-311)||(14736866-14737167)
chr8 (14-311)||(35540835-35541134)
chr8 (16-388)||(799900-800270)
chr8 (16-388)||(851293-851663)
chr8 (16-388)||(213776-214146)
chr8 (16-388)||(238108-238478)
chr8 (16-388)||(727399-727769)
chr8 (16-311)||(27909629-27909928)
chr8 (16-311)||(27956048-27956347)
chr8 (14-311)||(36800487-36800790)
chr8 (16-223)||(13362098-13362305)
chr8 (20-311)||(23224792-23225081)
chr8 (104-311)||(14765470-14765673)
chr8 (68-311)||(4520779-4521022)
chr8 (14-311)||(9205395-9205703)
chr8 (155-311)||(14563472-14563627)
chr8 (160-311)||(28980658-28980810)
chr8 (160-311)||(28985878-28986030)
chr8 (150-311)||(23117132-23117295)
chr8 (150-311)||(10956730-10956893)
chr8 (287-423)||(16887191-16887327)
chr8 (150-311)||(14746565-14746727)
chr8 (287-439)||(23224623-23224776)
chr8 (150-311)||(26486065-26486228)
chr8 (150-311)||(27345639-27345802)
chr8 (287-439)||(35541150-35541303)
chr8 (287-424)||(14736712-14736850)
chr8 (287-411)||(9205255-9205379)
chr8 (287-386)||(27909514-27909613)
chr8 (287-386)||(27955933-27956032)
chr8 (287-386)||(28980826-28980925)
chr8 (287-386)||(28986046-28986145)
chr8 (287-386)||(36800372-36800471)
chr8 (287-385)||(14563643-14563741)
chr8 (287-386)||(14765689-14765788)
chr8 (161-311)||(40144339-40144490)
chr8 (163-311)||(3697580-3697729)
chr8 (287-386)||(4520663-4520763)
chr8 (150-311)||(3224728-3224891)
chr8 (153-414)||(6588040-6588298)
chr8 (299-424)||(3224574-3224700)
chr8 (161-311)||(16266915-16267066)
chr8 (217-310)||(14416619-14416713)
chr8 (307-439)||(26485895-26486029)
chr8 (224-310)||(11392651-11392737)
chr8 (299-406)||(3697757-3697865)
chr8 (299-406)||(23117323-23117431)
chr8 (311-406)||(10948513-10948608)
chr8 (299-406)||(10956595-10956702)
chr8 (224-310)||(29328194-29328280)
chr8 (224-310)||(43687398-43687484)
chr8 (225-310)||(29299123-29299207)
chr8 (225-310)||(29305669-29305753)
chr8 (226-310)||(25701613-25701697)
chr8 (311-414)||(27345841-27345944)
chr8 (310-406)||(14746428-14746525)
chr8 (163-292)||(31418800-31418935)
chr8 (163-292)||(31412618-31412753)
chr8 (311-388)||(40144223-40144300)
chr8 (16-76)||(14563388-14563448)
chr8 (311-388)||(16266797-16266876)
chr8 (311-416)||(11392506-11392612)
chr8 (311-412)||(27873877-27873979)
chr8 (311-412)||(27948665-27948767)
chr8 (20-68)||(41242452-41242500)
chr8 (311-354)||(27890007-27890050)
chr8 (226-308)||(39363480-39363565)
chr8 (311-356)||(14416535-14416580)
chr8 (311-356)||(25701529-25701574)
chr8 (311-356)||(29299040-29299085)
chr8 (311-356)||(29305586-29305631)
chr8 (226-305)||(21690529-21690611)
chr8 (217-308)||(23653079-23653174)
chr8 (346-388)||(807966-808008)
chr8 (163-240)||(5240015-5240094)
chr8 (216-308)||(23653828-23653924)
chr8 (311-356)||(29328319-29328364)
chr8 (226-308)||(19859506-19859592)
chr8 (226-286)||(22025700-22025762)
chr8 (226-286)||(22050201-22050263)
chr8 (226-286)||(22055719-22055781)
chr8 (226-286)||(22177586-22177648)
chr8 (217-308)||(14057698-14057794)
chr8 (226-305)||(14594850-14594933)
chr8 (226-290)||(21686220-21686287)
chr8 (225-262)||(27873797-27873834)
chr8 (225-262)||(27889927-27889964)
chr8 (225-262)||(27948585-27948622)
chr8 (163-308)||(23825059-23825210)
chr8 (265-308)||(38186053-38186096)
chr8 (266-308)||(20783965-20784006)
chr8 (310-356)||(22063558-22063604)
chr8 (310-356)||(22176030-22176076)
chr8 (295-356)||(39363631-39363692)
chr8 (223-284)||(21282055-21282119)
chr8 (249-286)||(22063703-22063740)
chr8 (217-284)||(24321720-24321789)
chr8 (226-305)||(36445849-36445932)
chr8 (313-356)||(20006386-20006430)
chr8 (226-286)||(21300291-21300354)
chr8 (226-286)||(41009574-41009637)
[»] chr3 (130 HSPs)
chr3 (14-311)||(10767524-10767823)
chr3 (16-311)||(21151539-21151838)
chr3 (14-311)||(45611434-45611733)
chr3 (14-311)||(43724146-43724447)
chr3 (20-311)||(54833269-54833565)
chr3 (14-311)||(2499126-2499438)
chr3 (84-311)||(10381777-10382006)
chr3 (84-311)||(10410430-10410659)
chr3 (68-311)||(53571316-53571559)
chr3 (101-311)||(29493413-29493620)
chr3 (14-311)||(28758658-28758966)
chr3 (14-311)||(50142851-50143159)
chr3 (136-311)||(14845250-14845423)
chr3 (98-311)||(50656070-50656279)
chr3 (14-311)||(47120911-47121214)
chr3 (14-311)||(47128279-47128582)
chr3 (160-311)||(3782834-3782986)
chr3 (287-424)||(21151386-21151523)
chr3 (287-440)||(2498955-2499110)
chr3 (287-439)||(10767839-10767992)
chr3 (287-439)||(54833100-54833253)
chr3 (287-440)||(45611749-45611893)
chr3 (150-311)||(38742839-38743001)
chr3 (153-311)||(48774700-48774859)
chr3 (298-440)||(6927452-6927596)
chr3 (287-440)||(3782664-3782818)
chr3 (150-311)||(12271477-12271639)
chr3 (39-311)||(9771998-9772268)
chr3 (287-408)||(28758982-28759103)
chr3 (287-408)||(50142714-50142835)
chr3 (287-411)||(43724006-43724130)
chr3 (287-386)||(50655955-50656054)
chr3 (163-308)||(20187628-20187775)
chr3 (287-408)||(47121230-47121351)
chr3 (287-408)||(47128598-47128719)
chr3 (287-386)||(53571201-53571300)
chr3 (287-388)||(10382022-10382124)
chr3 (287-388)||(10410675-10410777)
chr3 (287-388)||(29493636-29493738)
chr3 (217-310)||(30596941-30597035)
chr3 (223-310)||(8374007-8374094)
chr3 (217-310)||(29545245-29545339)
chr3 (217-310)||(32388099-32388193)
chr3 (225-310)||(9691490-9691575)
chr3 (225-310)||(19344235-19344320)
chr3 (225-310)||(29550918-29551003)
chr3 (225-310)||(54520041-54520126)
chr3 (225-308)||(16331678-16331761)
chr3 (224-310)||(11956678-11956764)
chr3 (224-310)||(12725206-12725292)
chr3 (225-310)||(16833216-16833301)
chr3 (225-310)||(46071193-46071278)
chr3 (301-408)||(12271339-12271447)
chr3 (299-405)||(9771863-9771970)
chr3 (291-383)||(14845137-14845230)
chr3 (299-406)||(38743029-38743137)
chr3 (225-310)||(20377323-20377408)
chr3 (225-310)||(49163149-49163234)
chr3 (243-310)||(20187754-20187821)
chr3 (226-310)||(54520256-54520341)
chr3 (163-308)||(12419326-12419476)
chr3 (217-277)||(18957753-18957814)
chr3 (163-308)||(18757055-18757206)
chr3 (14-69)||(21457328-21457383)
chr3 (307-388)||(48774582-48774664)
chr3 (163-308)||(10597826-10597976)
chr3 (311-412)||(16331535-16331637)
chr3 (311-412)||(16833340-16833442)
chr3 (225-412)||(54091678-54091860)
chr3 (217-356)||(3802527-3802661)
chr3 (311-363)||(15374759-15374812)
chr3 (225-270)||(27029558-27029603)
chr3 (225-270)||(27031726-27031771)
chr3 (311-356)||(29545161-29545206)
chr3 (311-356)||(54520165-54520210)
chr3 (243-308)||(17512558-17512624)
chr3 (311-356)||(8373924-8373969)
chr3 (311-356)||(11956595-11956640)
chr3 (311-356)||(19344151-19344196)
chr3 (311-356)||(30596858-30596903)
chr3 (163-308)||(8583385-8583536)
chr3 (163-308)||(14084466-14084617)
chr3 (163-308)||(14089867-14090018)
chr3 (226-286)||(16382994-16383056)
chr3 (163-263)||(31943376-31943480)
chr3 (226-264)||(3802699-3802737)
chr3 (187-289)||(11850775-11850879)
chr3 (311-356)||(9691406-9691451)
chr3 (226-305)||(12274221-12274304)
chr3 (311-356)||(18961077-18961122)
chr3 (311-356)||(20187860-20187905)
chr3 (311-356)||(20377239-20377284)
chr3 (163-284)||(31690713-31690839)
chr3 (311-356)||(32388016-32388061)
chr3 (311-356)||(49163272-49163317)
chr3 (311-356)||(54520380-54520425)
chr3 (224-264)||(15374678-15374718)
chr3 (226-305)||(15955111-15955193)
chr3 (226-286)||(13203653-13203715)
chr3 (294-356)||(13313907-13313967)
chr3 (226-286)||(14652830-14652892)
chr3 (226-289)||(17496119-17496185)
chr3 (226-284)||(19443469-19443528)
chr3 (163-308)||(49399408-49399559)
chr3 (266-308)||(11305863-11305905)
chr3 (311-356)||(3802778-3802823)
chr3 (311-356)||(12725123-12725168)
chr3 (311-363)||(29551042-29551095)
chr3 (311-356)||(46071109-46071154)
chr3 (229-286)||(14292706-14292765)
chr3 (250-305)||(16823843-16823899)
chr3 (294-356)||(13324819-13324879)
chr3 (266-308)||(11644911-11644953)
chr3 (255-308)||(12356050-12356104)
chr3 (255-308)||(12362599-12362653)
chr3 (226-284)||(18719251-18719312)
chr3 (217-286)||(18913996-18914069)
chr3 (310-356)||(23173921-23173967)
chr3 (287-356)||(38312118-38312185)
chr3 (226-308)||(11964993-11965080)
chr3 (296-356)||(12274375-12274435)
chr3 (226-308)||(12363445-12363532)
chr3 (251-308)||(14289064-14289120)
chr3 (226-284)||(14544308-14544368)
chr3 (226-305)||(14569795-14569878)
chr3 (217-284)||(17130687-17130756)
chr3 (304-356)||(17512698-17512751)
chr3 (226-286)||(12961517-12961580)
chr3 (313-356)||(15934960-15935004)
chr3 (226-305)||(15935090-15935172)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (14-311)||(104073-104372)
scaffold0022 (287-439)||(104388-104541)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (14-311)||(18598-18896)
scaffold0089 (287-436)||(18433-18582)
scaffold0089 (217-308)||(1885-1981)
[»] scaffold0457 (2 HSPs)
scaffold0457 (14-311)||(12302-12602)
scaffold0457 (287-440)||(12132-12286)
[»] scaffold0154 (2 HSPs)
scaffold0154 (39-311)||(18494-18769)
scaffold0154 (287-440)||(18324-18478)
[»] scaffold0443 (2 HSPs)
scaffold0443 (84-311)||(13262-13491)
scaffold0443 (287-388)||(13507-13609)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (20-311)||(16099-16389)
[»] scaffold0041 (2 HSPs)
scaffold0041 (98-311)||(49877-50086)
scaffold0041 (287-386)||(50102-50201)
[»] scaffold0560 (2 HSPs)
scaffold0560 (153-311)||(1093-1253)
scaffold0560 (299-388)||(975-1065)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (101-311)||(14973-15187)
scaffold0266 (311-356)||(15226-15271)
[»] scaffold0279 (2 HSPs)
scaffold0279 (150-311)||(5797-5959)
scaffold0279 (299-406)||(5661-5769)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (144-311)||(31556-31725)
scaffold0088 (299-356)||(31753-31810)
[»] scaffold0001 (6 HSPs)
scaffold0001 (153-311)||(512609-512768)
scaffold0001 (217-310)||(178993-179088)
scaffold0001 (311-388)||(512493-512570)
scaffold0001 (311-356)||(179126-179171)
scaffold0001 (313-356)||(488350-488394)
scaffold0001 (226-285)||(524649-524711)
[»] scaffold0103 (4 HSPs)
scaffold0103 (153-311)||(19533-19693)
scaffold0103 (153-311)||(23892-24052)
scaffold0103 (311-388)||(19732-19809)
scaffold0103 (311-356)||(23808-23853)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (153-308)||(24967-25122)
scaffold0075 (299-387)||(25153-25240)
[»] scaffold0320 (2 HSPs)
scaffold0320 (153-311)||(817-977)
scaffold0320 (299-356)||(1005-1062)
[»] scaffold0214 (2 HSPs)
scaffold0214 (163-311)||(15273-15423)
scaffold0214 (311-356)||(15189-15234)
[»] scaffold1427 (3 HSPs)
scaffold1427 (225-308)||(623-706)
scaffold1427 (311-356)||(747-792)
scaffold1427 (287-356)||(978-1045)
[»] scaffold0188 (3 HSPs)
scaffold0188 (161-311)||(4713-4864)
scaffold0188 (311-406)||(4579-4674)
scaffold0188 (163-308)||(31666-31816)
[»] scaffold0363 (2 HSPs)
scaffold0363 (225-310)||(2013-2098)
scaffold0363 (311-356)||(2137-2182)
[»] scaffold0031 (4 HSPs)
scaffold0031 (225-310)||(74205-74290)
scaffold0031 (311-356)||(74122-74167)
scaffold0031 (226-305)||(120787-120870)
scaffold0031 (226-305)||(131664-131747)
[»] scaffold0310 (3 HSPs)
scaffold0310 (225-306)||(7712-7793)
scaffold0310 (311-354)||(12983-13026)
scaffold0310 (225-264)||(12903-12942)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (225-310)||(101738-101823)
scaffold0037 (311-363)||(101647-101699)
[»] scaffold0113 (6 HSPs)
scaffold0113 (225-308)||(19169-19252)
scaffold0113 (243-310)||(19231-19298)
scaffold0113 (311-412)||(19337-19439)
scaffold0113 (311-412)||(15239-15341)
scaffold0113 (226-308)||(26870-26956)
scaffold0113 (225-264)||(15159-15198)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (229-306)||(65382-65459)
scaffold0068 (311-356)||(65294-65339)
[»] scaffold0060 (2 HSPs)
scaffold0060 (225-306)||(41230-41311)
scaffold0060 (311-356)||(41353-41398)
[»] scaffold0155 (2 HSPs)
scaffold0155 (238-310)||(30845-30917)
scaffold0155 (311-356)||(30955-31000)
[»] scaffold0093 (2 HSPs)
scaffold0093 (227-310)||(24648-24731)
scaffold0093 (311-356)||(24770-24815)
[»] scaffold0076 (6 HSPs)
scaffold0076 (217-310)||(51-146)
scaffold0076 (311-356)||(184-229)
scaffold0076 (163-308)||(30236-30387)
scaffold0076 (163-308)||(35637-35788)
scaffold0076 (310-356)||(51672-51718)
scaffold0076 (248-308)||(51791-51854)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (217-292)||(143952-144028)
scaffold0019 (311-356)||(137199-137244)
[»] scaffold0276 (1 HSPs)
scaffold0276 (330-440)||(21991-22101)
[»] scaffold0009 (4 HSPs)
scaffold0009 (225-310)||(247018-247104)
scaffold0009 (225-310)||(253532-253618)
scaffold0009 (311-356)||(247142-247187)
scaffold0009 (311-356)||(253656-253701)
[»] scaffold1726 (1 HSPs)
scaffold1726 (163-308)||(159-310)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (163-308)||(26026-26176)
scaffold0104 (163-308)||(27408-27558)
[»] scaffold0034 (7 HSPs)
scaffold0034 (153-284)||(10223-10359)
scaffold0034 (226-284)||(72229-72288)
scaffold0034 (255-308)||(566-620)
scaffold0034 (255-308)||(6725-6779)
scaffold0034 (310-356)||(10076-10122)
scaffold0034 (287-356)||(72369-72436)
scaffold0034 (217-308)||(35816-35912)
[»] scaffold0326 (3 HSPs)
scaffold0326 (163-289)||(504-634)
scaffold0326 (250-305)||(5510-5566)
scaffold0326 (319-356)||(5377-5415)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (217-308)||(4217-4312)
scaffold0395 (313-356)||(4091-4135)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (226-286)||(3658-3720)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (163-308)||(38336-38487)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (226-286)||(141326-141388)
scaffold0021 (226-286)||(146566-146629)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (163-308)||(174652-174803)
scaffold0011 (226-308)||(56861-56947)
scaffold0011 (266-308)||(147050-147092)
scaffold0011 (250-308)||(75156-75215)
scaffold0011 (226-286)||(197555-197618)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (287-356)||(11912-11979)
[»] scaffold0261 (5 HSPs)
scaffold0261 (287-356)||(24472-24539)
scaffold0261 (226-305)||(10756-10839)
scaffold0261 (226-305)||(18935-19019)
scaffold0261 (313-356)||(10626-10670)
scaffold0261 (313-356)||(18805-18849)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (226-305)||(1452-1535)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (252-308)||(3391-3448)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (311-356)||(9877-9922)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (311-356)||(20112-20157)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (223-292)||(5237-5309)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (226-308)||(5101-5187)
scaffold0556 (264-305)||(10946-10987)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (226-308)||(18505-18591)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (226-308)||(105-191)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (226-308)||(47915-48001)
scaffold0114 (226-286)||(41931-41993)
scaffold0114 (310-355)||(42090-42135)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (226-308)||(64965-65051)
scaffold0028 (163-308)||(52475-52626)
scaffold0028 (266-308)||(999-1041)
[»] scaffold0535 (1 HSPs)
scaffold0535 (226-286)||(6146-6208)
[»] scaffold0516 (2 HSPs)
scaffold0516 (218-308)||(6117-6211)
scaffold0516 (313-356)||(6293-6337)
[»] scaffold0239 (2 HSPs)
scaffold0239 (226-286)||(14611-14673)
scaffold0239 (310-355)||(14469-14514)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (226-286)||(5122-5184)
[»] scaffold0026 (6 HSPs)
scaffold0026 (226-286)||(63308-63370)
scaffold0026 (226-305)||(28016-28099)
scaffold0026 (226-305)||(38853-38936)
scaffold0026 (226-284)||(124588-124649)
scaffold0026 (225-286)||(142630-142694)
scaffold0026 (313-356)||(38723-38767)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (225-306)||(129788-129873)
scaffold0004 (226-286)||(321062-321125)
[»] scaffold1584 (1 HSPs)
scaffold1584 (163-284)||(254-381)
[»] scaffold0298 (2 HSPs)
scaffold0298 (266-308)||(8280-8322)
scaffold0298 (266-308)||(18364-18406)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (266-308)||(9268-9310)
scaffold0124 (266-308)||(44938-44980)
scaffold0124 (310-356)||(36789-36835)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (266-308)||(9281-9323)
[»] scaffold1426 (1 HSPs)
scaffold1426 (150-196)||(9-57)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (217-284)||(14915-14984)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (226-305)||(11713-11796)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (217-308)||(16137-16233)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (225-304)||(51130-51213)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (226-305)||(56041-56124)
scaffold0081 (313-356)||(55912-55956)
[»] scaffold0071 (2 HSPs)
scaffold0071 (226-284)||(51088-51148)
scaffold0071 (310-351)||(50948-50989)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (226-305)||(207881-207964)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (225-285)||(18291-18354)
scaffold0005 (226-286)||(258674-258736)
scaffold0005 (226-286)||(265100-265162)
[»] scaffold2016 (1 HSPs)
scaffold2016 (251-356)||(800-902)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (226-308)||(1285-1371)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (217-308)||(39-134)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (226-286)||(1841-1904)
scaffold0348 (226-286)||(15579-15641)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (226-308)||(8474-8560)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (226-304)||(19794-19876)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (250-305)||(45527-45583)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (226-308)||(29801-29887)
scaffold0102 (226-292)||(44580-44651)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (226-286)||(27861-27924)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (226-308)||(2868-2954)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (226-286)||(10341-10403)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (310-356)||(139-185)
[»] scaffold1290 (1 HSPs)
scaffold1290 (226-290)||(1379-1447)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (229-305)||(2252-2332)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (252-305)||(4841-4895)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (226-290)||(1022-1090)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (310-356)||(7409-7455)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (217-286)||(165-238)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (266-308)||(9372-9414)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (310-356)||(41588-41634)
scaffold0107 (217-286)||(41732-41803)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (226-290)||(22821-22889)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (310-356)||(20489-20535)
[»] scaffold1853 (1 HSPs)
scaffold1853 (226-287)||(921-987)
[»] scaffold1615 (1 HSPs)
scaffold1615 (217-286)||(532-603)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (226-289)||(9523-9590)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (217-286)||(17054-17125)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (226-284)||(47529-47589)
scaffold0067 (226-284)||(56563-56623)
scaffold0067 (226-284)||(62949-63009)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (310-355)||(17637-17682)
[»] scaffold0661 (1 HSPs)
scaffold0661 (250-305)||(4188-4244)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (226-286)||(5513-5576)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (311-358)||(19439-19487)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (226-286)||(6593-6656)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (226-308)||(25583-25669)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (224-284)||(52753-52816)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (226-308)||(76714-76800)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (226-286)||(44231-44294)
scaffold0010 (226-286)||(49297-49360)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (226-286)||(370396-370459)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 359; Significance: 0; HSPs: 99)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 36212345 - 36211912
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatata------a 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |    
T  36212345 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatgtgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatatatatataa 36212246  T
Q  108 atgcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagac 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36212245 atgcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagac 36212146  T
Q  208 ttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgc 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36212145 ttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccttcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgc 36212046  T
Q  308 tgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||    
T  36212045 tgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattc 36211946  T
Q  408 aataaataacataca-ttcaaccatcatcagtat 440  Q
    ||||| ||||||||| || || ||||||||||||    
T  36211945 aataattaacatacatttaaatcatcatcagtat 36211912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 20 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 28556826 - 28556533
Alignment:
Q  20 aacacatcatcttgtaaacatatatatgt--ataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatgcatattc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28556826 aacacatcatcttgtaaacatatatatgtgtataagttacaagcaacaacaacatcaacaatacaccatgatcacaatgaatatatataaatgcatattc 28556727  T
Q  118 aacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatga 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28556726 aacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatga 28556627  T
Q  218 aatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28556626 aatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 28556533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 6740303 - 6740602
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatga--atatatataaatgc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6740303 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatacatgtataagtcacaagcagcaacaacatcaacaatacaccatgatcacaatgattatatatataaatgc 6740402  T
Q  112 atattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6740403 atattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaacaaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttca 6740502  T
Q  212 taatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6740503 taatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 6740602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3653029 - 3652730
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatata--aatgc 111  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  3653029 atcaacaacactttatcttgtaaacaaatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccatgatcacaatgaatatatatataaatgc 3652930  T
Q  112 atattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3652929 atattcaacaccaacatcatccatcaggaaataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 3652830  T
Q  212 taatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3652829 taatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 3652730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 20 - 311
Target Start/End: Original strand, 18417916 - 18418208
Alignment:
Q  20 aacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaa-catcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatgcatattca 118  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18417916 aacacattatcttgtaagcatatatatgtataaatcacaagcaaccacaagcatcagcaacacaccatgatcacaatgaatatatataaatgcatattca 18418015  T
Q  119 acaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaa 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18418016 acaccaacatcatccatcaggtaataactgaaatcaacacccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaa 18418115  T
Q  219 atgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18418116 atgcaatatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgttgtt 18418208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20277595 - 20277283
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatata------- 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||           
T  20277595 atcaacaacacattatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatataccatgatcacaatgaatatatatatatatat 20277496  T
Q  107 ---------aatgcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacac 197  Q
             ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20277495 atatatataaatgcatattcaacaccaacaccatccatcagata-taactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacac 20277397  T
Q  198 catcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaag 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20277396 catcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaag 20277297  T
Q  298 ccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||    
T  20277296 ccctcaccgctgtt 20277283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 20 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18027073 - 18026783
Alignment:
Q  20 aacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatgcatattcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  18027073 aacacatcatcttgtaaacatatatatgtacaagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccaccatcacaatgaacatata--aatgcatattcaa 18026976  T
Q  120 caccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatga 217  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18026975 catcaacatcaaccatcagataataactgtaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaccatcttagacttctcaatga 18026876  T
Q  218 aatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18026875 g-tgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 18026783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 68 - 311
Target Start/End: Original strand, 37675234 - 37675477
Alignment:
Q  68 aacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaat----gcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaag 163  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||    | |||||||| | |||||||| | ||||||||| ||| |||  |||||||||||    
T  37675234 aacatcaacaacacatcaagatcacaatgaatatatataaataaatgtatattcaatatcaacatcaac-atcagataa-aaccgaa--caacaaccaag 37675329  T
Q  164 actcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37675330 actcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgc 37675429  T
Q  264 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37675430 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 37675477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 68 - 311
Target Start/End: Original strand, 37681927 - 37682170
Alignment:
Q  68 aacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaat----gcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaag 163  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||    | |||||||| | |||||||| | ||||||||| ||| |||  |||||||||||    
T  37681927 aacatcaacaacacatcaagatcacaatgaatatatataaataaatgtatattcaatatcaacatcaac-atcagataa-aaccgaa--caacaaccaag 37682022  T
Q  164 actcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37682023 actcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgc 37682122  T
Q  264 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37682123 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 37682170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 68 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 38908329 - 38908085
Alignment:
Q  68 aacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataa----atgcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaag 163  Q
    ||||||||| ||| | || |||| ||||||||||||||||    ||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  38908329 aacatcaacaacacatcaagatcgcaatgaatatatataagtaaatgtatattcaacatcaacatcaac-atcagataa-acctgaaa-caacaaccaag 38908233  T
Q  164 actcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgc 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38908232 actcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttaaacttcttaatgaaatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgc 38908133  T
Q  264 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38908132 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 38908085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 243 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 20396932 - 20396735
Alignment:
Q  243 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtat 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20396932 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtat 20396833  T
Q  343 atctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcagta 439  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  20396832 atctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaataattagcatacatttcaatcatcatcagta 20396735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 48427629 - 48427937
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatat-atataaatgca 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||| ||| ||||| ||| |    
T  48427629 atcaacaacacattatcttgtaaacatataaaggtataagtcacaagcatcaacaacatcaacaacacaccataatcaccttgagtatcatatatatgta 48427728  T
Q  113 tat---------tcaacaccaacatcatcc-atcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatct 202  Q
    |||         ||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48427729 tatatcacctattcaacaccaaattcatcttatcagataacaactgaat--aaccactaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatct 48427826  T
Q  203 tagacttcttaa-tgaaatgcaata-tgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccc 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48427827 tagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccc 48427926  T
Q  301 tcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||    
T  48427927 tcaccgctgtt 48427937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 153 - 311
Target Start/End: Original strand, 39094247 - 39094405
Alignment:
Q  153 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39094247 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaa 39094346  T
Q  253 gccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39094347 gccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 39094405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 20570554 - 20570825
Alignment:
Q  39 atatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatgcatattcaacaccaacatcatccatcag 138  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||   |||||||||| ||||||  ||| |||||||| || ||||||||  |||||     
T  20570554 atatatatatataattcacaagcaacaacaacatcatcaatatacctccatcacaatgagtatata--aatacatattcatcaacaacatcaatcatcaa 20570651  T
Q  139 ataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggt 236  Q
     ||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  20570652 gtaacaaccgcaatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacacttctaagacaccaccttagacttctcaatgga-tgcaatatgcatgtggt 20570750  T
Q  237 accaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20570751 accaaacaggaccgaagccctctccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 20570825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 287 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 20277267 - 20277118
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20277267 caggaccaaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 20277168  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatca 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20277167 ctataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatca 20277118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 136 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22185809 - 22185635
Alignment:
Q  136 cagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtgg 235  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  22185809 cagataataactgaaat-aacaaccgagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagataccatcttagacttctgaatgagatgcattatgcatgtgg 22185711  T
Q  236 taccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22185710 taccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 22185635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 39 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 20397179 - 20396911
Alignment:
Q  39 atatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatgcatattcaacaccaacatcatccatcag 138  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||  ||||||| |||||||||  ||| |||||||| || ||||||||  |||||     
T  20397179 atatatatatataattcacaagcaacaacaacatcatcaatataccaccatcacaaagaatatata--aatacatattcatcaacaacatcaatcatcaa 20397082  T
Q  139 ataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggt 236  Q
     || || | | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  20397081 gtagtagccgcaatcaacaactaagacttatgcaaatgacatgacaacactactaagacaccatcttagacttctcaatgga-tgcaatatgcatgtggt 20396983  T
Q  237 accaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20396982 accaaacagggccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcgttcatcaggaccgaagccctcaccgct 20396911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 287 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 28556517 - 28556368
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  28556517 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgcgactcca 28556418  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatca 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28556417 ctataataatatgtatgattcaataaataacatacatgcaaccatcatca 28556368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 31535640 - 31535331
Alignment:
Q  16 caacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacca-cataccatgatcacaatgaatata-tataaatg--- 110  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| ||| |||| |||| |||       
T  31535640 caacaacacattatcttgtagacatatataggtataagccacaagcaacaacaacatcaaacaacacaccataatcacagtgagtataatatatatgtat 31535541  T
Q  111 --------catattcaacaccaacatcatcc-atcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatc 201  Q
            ||||||||||||||  | |||   ||||||||| |||||||   | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31535540 atatatcacatattcaacaccagaaccattttatcagataacaactgaat--atccactaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatc 31535443  T
Q  202 ttagacttcttaa-tgaaatgcaata-tgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagcc 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31535442 ttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagcc 31535343  T
Q  300 ctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||    
T  31535342 ctcaccgctgtt 31535331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 31564357 - 31564048
Alignment:
Q  16 caacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacca-cataccatgatcacaatgaatata-tataaatg--- 110  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| ||| |||| |||| |||       
T  31564357 caacaacacattatcttgtagacatatataggtataagccacaagcaacaacaacatcaaacaacacaccataatcacagtgagtataatatatatgtat 31564258  T
Q  111 --------catattcaacaccaacatcatcc-atcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatc 201  Q
            ||||||||||||||  | |||   ||||||||| |||||||   | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31564257 atatatcacatattcaacaccagaaccattttatcagataacaactgaat--atccactaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatc 31564160  T
Q  202 ttagacttcttaa-tgaaatgcaata-tgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagcc 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31564159 ttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagcc 31564060  T
Q  300 ctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||    
T  31564059 ctcaccgctgtt 31564048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 160 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 39189864 - 39189712
Alignment:
Q  160 caagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  39189864 caagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggtcctc 39189765  T
Q  259 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39189764 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 39189712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 287 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 18026767 - 18026614
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18026767 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgactcca 18026668  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcagta 439  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  18026667 ctttaacaatatgtatgattcaataattagcatacatttcaaccatcatcagta 18026614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 150 - 311
Target Start/End: Original strand, 17146179 - 17146341
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacagg 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  17146179 aatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatgga-tgcaaatatgcatgtggtaccaa-cagg 17146276  T
Q  247 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17146277 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 17146341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 287 - 440
Target Start/End: Original strand, 18418224 - 18418379
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18418224 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaacgcaactccatgtgactcca 18418323  T
Q  387 c-tataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcagtat 440  Q
    | || || || |||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||    
T  18418324 cttaaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttaaatcatcatcagtat 18418379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 153 - 311
Target Start/End: Original strand, 4231112 - 4231272
Alignment:
Q  153 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || |||||||| ||  || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4231112 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactactaagacaacaccttagactcctccat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggacc 4231210  T
Q  250 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4231211 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 4231272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 153 - 311
Target Start/End: Original strand, 42626124 - 42626284
Alignment:
Q  153 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggacc 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42626124 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaat-agatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggacc 42626222  T
Q  250 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42626223 gaagccctcaccacttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccactgtt 42626284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 150 - 311
Target Start/End: Original strand, 21962926 - 21963089
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgc-aatatgcatgtggtaccaaacagg 246  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |  ||| | |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21962926 aatcaacagctaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactccccaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacagg 21963024  T
Q  247 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21963025 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 21963089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 287 - 411
Target Start/End: Original strand, 6740618 - 6740742
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  6740618 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaa 6740717  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaata 411  Q
    ||  || || |||||||||||||||    
T  6740718 cttaaacaacatgtatgattcaata 6740742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 287 - 411
Target Start/End: Original strand, 48427953 - 48428077
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  48427953 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaa 48428052  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaata 411  Q
    ||  || || |||||||||||||||    
T  48428053 cttaaacaacatgtatgattcaata 48428077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 161 - 311
Target Start/End: Original strand, 9269865 - 9270017
Alignment:
Q  161 aagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9269865 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaataccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagaaccgaagccct 9269963  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9269964 caccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggactgaagccctcaccgctgtt 9270017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 153 - 302
Target Start/End: Original strand, 24850025 - 24850175
Alignment:
Q  153 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 249  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24850025 caacaaccaagactcatgcaa-tgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 24850122  T
Q  250 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctc 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24850123 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctc 24850175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 287 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 39189696 - 39189595
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39189696 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 39189597  T
Q  387 ct 388  Q
    ||    
T  39189596 ct 39189595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 31535315 - 31535195
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  31535315 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaa 31535216  T
Q  387 ctataataatatgtatgattc 407  Q
    ||  || || |||||||||||    
T  31535215 cttaaacaacatgtatgattc 31535195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 31564032 - 31563912
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  31564032 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaa 31563933  T
Q  387 ctataataatatgtatgattc 407  Q
    ||  || || |||||||||||    
T  31563932 cttaaacaacatgtatgattc 31563912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 386
Target Start/End: Original strand, 39094421 - 39094520
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39094421 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 39094520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 153 - 308
Target Start/End: Original strand, 52990639 - 52990796
Alignment:
Q  153 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccac--tgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggacc 249  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||| || ||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  52990639 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacattgctaagacaacaccttagactcctcaat-agatgcaattatgcatgtggtaccagacaggacc 52990737  T
Q  250 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52990738 gaaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 52990796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 287 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 38908069 - 38907968
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  38908069 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaacttcatgtgactcca 38907970  T
Q  387 ct 388  Q
    ||    
T  38907969 ct 38907968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 161 - 424
Target Start/End: Original strand, 20299290 - 20299547
Alignment:
Q  161 aagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299290 aagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccct 20299388  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactg 357  Q
    ||||||||||||     ||  | | ||  ||||||   || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299389 caccgcttttgagcaacta--gtactc--caggacatgagtcatctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactg 20299484  T
Q  358 accatggaatgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacatt 424  Q
    |||||| ||||    |||||||||| |||||  || || |||||||||||||||| || ||||||||    
T  20299485 accatgcaatg----tccatgtgacaccacttaaacaacatgtatgattcaataattagcatacatt 20299547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 161 - 308
Target Start/End: Original strand, 20292612 - 20292761
Alignment:
Q  161 aagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccct 257  Q
    |||| ||||||||  ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20292612 aagaatcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccct 20292710  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20292711 caccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggatcgaagccctcaccgct 20292761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 287 - 388
Target Start/End: Original strand, 37682186 - 37682288
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcc 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37682186 caggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcc 37682285  T
Q  386 act 388  Q
    |||    
T  37682286 act 37682288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 287 - 388
Target Start/End: Original strand, 37675493 - 37675595
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcc 385  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37675493 caggaccgaagccttcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcc 37675592  T
Q  386 act 388  Q
    |||    
T  37675593 act 37675595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Original strand, 49328023 - 49328117
Alignment:
Q  217 aaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49328023 aaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 49328117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 287 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 22185619 - 22185534
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaac 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22185619 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaac 22185534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29596973 - 29596888
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29596973 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgatgccctcaccgctgt 29596888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 304 - 424
Target Start/End: Original strand, 20292797 - 20292918
Alignment:
Q  304 ccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgc-aactccatgtgactccactataataatatgtat 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||  || || ||||||    
T  20292797 ccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtaacaccacttaaacaacatgtat 20292896  T
Q  403 gattcaataaataacatacatt 424  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  20292897 gattcaataattagcatacatt 20292918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Original strand, 47484097 - 47484191
Alignment:
Q  217 aaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  47484097 aaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagccctcaccgctgt 47484191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 299 - 406
Target Start/End: Original strand, 20570853 - 20570961
Alignment:
Q  299 cctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgc-aactccatgtgactccactataataata 397  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || || |    
T  20570853 cctctccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgactccacttaaacaaca 20570952  T
Q  398 tgtatgatt 406  Q
    |||||||||    
T  20570953 tgtatgatt 20570961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 239 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29602394 - 29602323
Alignment:
Q  239 caaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29602394 caaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 29602323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 21920795 - 21920880
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21920795 tatgcatgtggtaccaaaaaagaccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 21920880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Original strand, 24079486 - 24079637
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||    
T  24079486 gactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaaagaa-tgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccct 24079584  T
Q  258 caccgct--tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  24079585 caccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgct 24079637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 24109268 - 24109117
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||    
T  24109268 gactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaaagaa-tgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccct 24109170  T
Q  258 caccgct--tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  24109169 caccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgct 24109117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 311 - 414
Target Start/End: Original strand, 42626323 - 42626426
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaat 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||  || || || |||||||||||    
T  42626323 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcatacaaactccatgtgactccacttaaacaacatctatgattcaat 42626422  T
Q  411 aaat 414  Q
    ||||    
T  42626423 aaat 42626426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 323 - 424
Target Start/End: Original strand, 17149454 - 17149555
Alignment:
Q  323 caatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgc-aactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatac 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| |||| |||||    
T  17149454 caatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgacaccact-taacaacatgtatgattcaatcaatagcatac 17149552  T
Q  422 att 424  Q
    |||    
T  17149553 att 17149555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 23195718 - 23195568
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || |||||||| || ||  |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||    
T  23195718 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccttagactcctcaac-aaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccct 23195620  T
Q  258 caccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  23195619 caccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgct 23195568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Original strand, 36614925 - 36615020
Alignment:
Q  217 aaatgcaat-atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  36614925 aaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacagggccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctgt 36615020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Original strand, 43088381 - 43088476
Alignment:
Q  217 aaatgcaat-atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  43088381 aaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagtattcattaggacataagtcctcaccgctgt 43088476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 299 - 388
Target Start/End: Original strand, 4231300 - 4231390
Alignment:
Q  299 cctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatggaatgcaactccatgtgactccact 388  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    |||||||| ||||||||||    
T  4231300 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacaaactccatatgactccact 4231390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 76
Target Start/End: Original strand, 52400025 - 52400087
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaac 76  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52400025 atcaacaacacattatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaaggaacaacaacatcaac 52400087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 299 - 388
Target Start/End: Original strand, 21963117 - 21963207
Alignment:
Q  299 cctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatggaatgcaactccatgtgactccact 388  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    |||||||| ||||||||||    
T  21963117 cctctccgctgttttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacaaactccatatgactccact 21963207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 306 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 20076947 - 20076837
Alignment:
Q  306 gctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatggaatgca-actccatgtgactccactataataatatgtatg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | || || ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||    
T  20076947 gctgttttatgcatatgcaatggacttacttgtgtatatctacatacaacatgaccat-gcatacatactccatatgactccacttaaataacatgtatg 20076849  T
Q  404 attcaataaataa 416  Q
     || |||||||||    
T  20076848 gtt-aataaataa 20076837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 260 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20077033 - 20076982
Alignment:
Q  260 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20077033 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcatcgctgtt 20076982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 10813697 - 10813614
Alignment:
Q  224 atatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10813697 atatgcatgtggtaccatattcaggaccgaagtcctcaccggagtttgaatggttaaagcattca-caggaccgaagccctcacc 10813614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 3706939 - 3706877
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3706939 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 3706877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Original strand, 21541991 - 21542142
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   |||     
T  21541991 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgaccca 21542089  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21542090 caccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 21542142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 356
Target Start/End: Original strand, 19961275 - 19961342
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19961275 caggaccgaggccctcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 19961342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 27693853 - 27693767
Alignment:
Q  16 caacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatata 102  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||| ||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  27693853 caacaacacgttatcttgtaaacatatataggtataagccacaagcattgacaacatcaacaacacaccataatcacattgagtata 27693767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 29602284 - 29602239
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  29602284 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 29602239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 36615058 - 36615103
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  36615058 tttatgcatatgcaatggacccccttgtgtatatctacatacaact 36615103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 49328155 - 49328200
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49328155 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaact 49328200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21410857 - 21410771
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  21410857 atgcatgtggtaccaatttacaggtcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 21410771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 955219 - 955157
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  955219 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccactgtagaatggttaaagcattcat 955157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22448440 - 22448378
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22448440 atgcatgtggtaccataatcagggccgtagccctcaccgctgttgaatggttaaagcattcat 22448378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 42096145 - 42095994
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || | |||||| || | | |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   |||     
T  42096145 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcagt-aaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgaccca 42096047  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  42096046 caccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 42095994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 354
Target Start/End: Original strand, 43088514 - 43088557
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa 354  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  43088514 tttatgcatatgcaatggacccccttgtgtatatctacatacaa 43088557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 20942034 - 20941947
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattca--tcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||    
T  20942034 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctatttgaatggttaaagcattcatttcaggacataagtcctcaccgct 20941947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 21920919 - 21920964
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  21920919 tttatgcatatgcaatgaaccaactcgtgtatatctacatacaact 21920964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 20824530 - 20824467
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctttt-gaatggttaaagcattcat 286  Q
    |||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  20824530 atgcatgtggtaccaaattcaggaccagagccctcaccgctattagaatggttaaagcattcat 20824467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22030849 - 22030793
Alignment:
Q  250 gaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22030849 gaagccctcaccgaattttgaatggtcaaagcattcatcagggcctaagccctcacc 22030793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 30491617 - 30491535
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  30491617 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcactgagtttgaatggttaaagtattcatcagggcataagccctcacc 30491535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 3652714 - 3652679
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatg 322  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3652714 caggaccgaagccctcaccgttgttttatgcatatg 3652679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 23066878 - 23066816
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  23066878 atgcatgtggtaccaaaatcaggatcgtagccctctccgctgtagaatggttaaagcattcat 23066816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15316641 - 15316599
Alignment:
Q  266 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  15316641 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 15316599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 356
Target Start/End: Original strand, 20242693 - 20242739
Alignment:
Q  310 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20242693 ttttatgcttatgcaaatgacccacttgtgtatatctacatacaact 20242739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 304
Target Start/End: Original strand, 21664203 - 21664241
Alignment:
Q  266 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcac 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21664203 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcac 21664241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 19664307 - 19664220
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc--atcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||    
T  19664307 tatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcactgctatcgaatggttaaagcattcttatcaggacataagtcctcaccgct 19664220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 19666913 - 19666826
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattca-tcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  19666913 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcattcagggcctaagccctcaccgct 19666826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20852252 - 20852183
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  20852252 aaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 20852183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20858878 - 20858809
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  20858878 aaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 20858809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Original strand, 21698132 - 21698215
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    |||||||||||| |||   ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  21698132 atgcatgtggtatcaatttacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatcatggcataagccctcacc 21698215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 284
Target Start/End: Original strand, 21705212 - 21705281
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  21705212 aaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 21705281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 23066718 - 23066673
Alignment:
Q  310 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 355  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23066718 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 23066673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 29596849 - 29596804
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  29596849 tttatgcatatgtaatggacccactcgtgtatttctacatacaact 29596804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 31927556 - 31927515
Alignment:
Q  264 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  31927556 ttttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 31927515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 47484229 - 47484274
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  47484229 tttatgcatatgctatagacccactagtgtatatctacatacaact 47484274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20824373 - 20824329
Alignment:
Q  312 ttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20824373 ttatgcttatgcaactaacctacttgtgtatatctacatacaact 20824329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 20838349 - 20838286
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  20838349 atgcatgtggtaccaaattcagggccggagccctcaccgctattagaatggttaaagtattcat 20838286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 356
Target Start/End: Original strand, 21698261 - 21698305
Alignment:
Q  313 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  21698261 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 21698305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 304
Target Start/End: Original strand, 23630954 - 23631035
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcacc-gcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcac 304  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  23630954 atgcatgtggtaccaatttacagg-cagaagccctcaccagatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcac 23631035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 29554623 - 29554560
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  29554623 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcactgctaattgaatggttaaagcattcat 29554560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 127)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 439
Target Start/End: Original strand, 50081998 - 50082422
Alignment:
Q  20 aacacatcatcttgtaaacatatatatgt--ataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatat--atataaatgcatat 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| || | | ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  50081998 aacacatcatcttgtaaacatatatatgtgtataagttacaagcaacaacaacatccacaatacaccatgatcgcaatgaatatatatataaatgcatat 50082097  T
Q  116 tcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaat 215  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50082098 tcaacaccaacaacatccatcagataataactgaaaccaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaat 50082197  T
Q  216 gaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttttat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50082198 gaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttttat 50082297  T
Q  316 gcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaata 415  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| || |     
T  50082298 gcatatgccacggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactcaatatgactccactttaataatatgtatgattcaacaattg 50082397  T
Q  416 acataca-ttcaaccatcatcagta 439  Q
     |||||| |||||||||||||||||    
T  50082398 gcatacatttcaaccatcatcagta 50082422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3260339 - 3260040
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatata--aatgc 111  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  3260339 atcaacaacactttatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccatgatcacaatgaatatatatataaatgc 3260240  T
Q  112 atattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3260239 atattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 3260140  T
Q  212 taatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3260139 taatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 3260040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 52500285 - 52500584
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatat--atataaatgc 111  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  52500285 atcaacaacactttatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccatgatcacaatgaatatatatataaatgc 52500384  T
Q  112 atattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52500385 atattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 52500484  T
Q  212 taatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52500485 taatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 52500584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 390859 - 391159
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatata--aatgc 111  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  390859 atcaacaacactttatcttgtaaacaaatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccatgatcacaatgaatatatatataaatgc 390958  T
Q  112 atattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaa-tcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  390959 atattcaacaccaacatcatccatcagaaaataactgaaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttc 391058  T
Q  211 ttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  391059 ttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 391158  T
Q  311 t 311  Q
    |    
T  391159 t 391159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23436338 - 23436031
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatata------- 106  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||           
T  23436338 atcaacaacacaaaatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccataatcacaatgaatatatatatacattt 23436239  T
Q  107 ---aatgcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatctt 203  Q
       ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23436238 ataaacacatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccgctgctaagacaccatctt 23436139  T
Q  204 agacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23436138 agacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 23436039  T
Q  304 ccgctgtt 311  Q
    ||||||||    
T  23436038 ccgctgtt 23436031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 22 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 29383104 - 29382813
Alignment:
Q  22 cacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatgcatattcaaca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || | | | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29383104 cacatcatcttgtaaacatatatatgtataagccacaagcagcaacaacaacatcaatacaccaccatcacaatgaatatatataaatgcatattcaaca 29383005  T
Q  122 ccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaa 219  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29383004 tcaacatcaaccatcagataataactgcaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaccatcttagacttctcaatgaaa 29382905  T
Q  220 tgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29382904 tgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 29382813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 39266583 - 39266286
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaa-catcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatgca 112  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39266583 atcaacaacacaaaatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaaacatcaacaattcaccatgatcacaatgaatatatataaatgca 39266484  T
Q  113 tattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttctt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39266483 tattcaacaccaacatcatccatcaggtaataaatgaaatcaacaactaagactcatgcacatgacatgacaactgctaagacacaatcttagacttctt 39266384  T
Q  213 aatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39266383 aatgaaatgaattatgcatgtggtacc-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 39266286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 26395415 - 26395718
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatg--- 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| || ||  |||||||| ||| ||        
T  26395415 atcaacaacacattatcttgtaaacatatatttgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccataattacggtgaatataaatatatataa 26395514  T
Q  111 --catattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagact 208  Q
      |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26395515 cacatattcaacaccaacatcatctatcaaataacaactgaaaccaacaaccaaaactcatgcaaatgacatgaccactgctaaaacaccatcttagact 26395614  T
Q  209 tcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgc 307  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26395615 tcttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgc 26395714  T
Q  308 tgtt 311  Q
    ||||    
T  26395715 tgtt 26395718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 68 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 29448969 - 29448725
Alignment:
Q  68 aacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaat----gcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaag 163  Q
    ||||||||| ||| | || |||| ||||||||||||||||||    | |||||||||| |||||||| | ||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  29448969 aacatcaacaacacatcaagatcgcaatgaatatatataaataaatgtatattcaacatcaacatcaac-atcagataa-acctgaaa-caacaaccaag 29448873  T
Q  164 actcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29448872 actcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgc 29448773  T
Q  264 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29448772 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 29448725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 68 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 29455653 - 29455409
Alignment:
Q  68 aacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaat----gcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaag 163  Q
    ||||||||| ||| | || |||| ||||||||||||||||||    | |||||||||| |||||||| | ||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  29455653 aacatcaacaacacatcaagatcgcaatgaatatatataaataaatgtatattcaacatcaacatcaac-atcagataa-acctgaaa-caacaaccaag 29455557  T
Q  164 actcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29455556 actcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgc 29455457  T
Q  264 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29455456 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 29455409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 68 - 311
Target Start/End: Original strand, 11936948 - 11937191
Alignment:
Q  68 aacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaat----gcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaag 163  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||    | |||||||| | |||||||| | ||||||||| ||| |||  |||||||||||    
T  11936948 aacatcaacaacacatcaagatcacaatgaatatatataaataaatgtatattcaatatcaacatcaac-atcagataa-aaccgaa--caacaaccaag 11937043  T
Q  164 actcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11937044 actcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgc 11937143  T
Q  264 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11937144 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 11937191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3266976 - 3266668
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatat-atataaatgca 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||| ||| ||||| ||| |    
T  3266976 atcaacaacacattatcttgtaaacatataaaggtataagtcacaagcatcaacaacatcaacaacacaccataatcaccttgagtatcatatatatgta 3266877  T
Q  113 tat---------tcaacaccaacatcatcc-atcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatct 202  Q
    |||         |||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3266876 tatatcacctattcaacaccaaaatcatcttatcagataacaactgaat--aaccactaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatct 3266779  T
Q  203 tagacttcttaa-tgaaatgcaata-tgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccc 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3266778 tagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccc 3266679  T
Q  301 tcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||    
T  3266678 tcaccgctgtt 3266668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 49241201 - 49240893
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatat-atataaatgca 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||| ||| ||||| ||| |    
T  49241201 atcaacaacacattatcttgtaaacatataaaggtataagtcacaagcatcaacaacatcaacaacacaccataatcaccttgagtatcatatatatgta 49241102  T
Q  113 tat---------tcaacaccaacatcatcc-atcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatct 202  Q
    |||         ||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49241101 tatatcacctattcaacaccaaattcatcttatcagataacaactgaat--aaccactaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatct 49241004  T
Q  203 tagacttcttaa-tgaaatgcaata-tgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccc 300  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49241003 tagacttcttaaatgaaatgcagtaatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccc 49240904  T
Q  301 tcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||    
T  49240903 tcaccgctgtt 49240893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 49749915 - 49749607
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatat-atataaatgca 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||| ||| ||||| ||| |    
T  49749915 atcaacaacacattatcttgtaaacatataaaggtataagtcacaagcatcaacaacatcaacaacacaccataatcaccttgagtatcatatatatgta 49749816  T
Q  113 tat---------tcaacaccaacatcatcc-atcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatct 202  Q
    |||         ||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49749815 tatatcacctattcaacaccaaattcatcttatcagataacaactgaat--aaccactaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatct 49749718  T
Q  203 tagacttcttaa-tgaaatgcaata-tgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccc 300  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49749717 tagacttcttaaatgaaatgcagtaatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccc 49749618  T
Q  301 tcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||    
T  49749617 tcaccgctgtt 49749607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 98 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15470813 - 15470652
Alignment:
Q  98 atatatataaatgcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacac 197  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470813 atatgtataaatgtatattcaacatcaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacac 15470714  T
Q  198 catcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470713 catcttagacttcttaatgaaatgcattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 15470652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 287 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 39266270 - 39266121
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39266270 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 39266171  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatca 436  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39266170 ccataataatatgtatgattcactaaataacatacattcaaccatcatca 39266121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 287 - 424
Target Start/End: Original strand, 391215 - 391352
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  391215 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 391314  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacatacatt 424  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  391315 ctttaataatatgtatgattcaataattaacatacatt 391352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 150 - 308
Target Start/End: Original strand, 5938795 - 5938955
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacagg 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5938795 aatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagg 5938893  T
Q  247 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5938894 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 5938955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 287 - 440
Target Start/End: Original strand, 52500600 - 52500754
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52500600 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 52500699  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacatacatt-caaccatcatcagtat 440  Q
    ||  || || |||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||    
T  52500700 cttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacattaaaatcatcatcagtat 52500754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 150 - 311
Target Start/End: Original strand, 1583780 - 1583943
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacagg 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1583780 aatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatgga-tgcaaatatgcatgtggtaccaaacagg 1583878  T
Q  247 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1583879 actgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 1583943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 150 - 311
Target Start/End: Original strand, 21396686 - 21396850
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacagg 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21396686 aatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatgga-tgcaaatatgcatgtggtaccaaacagg 21396784  T
Q  247 accgaagccctcaccgctttt-gaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21396785 accgaagccctcaccgctttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 21396850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 287 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 3260024 - 3259887
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  3260024 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatataactgaccatgcaatgcaacttcatgtgactcca 3259925  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacatacatt 424  Q
    || ||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  3259924 ctttaacaacatgtatgattcaataattaacatacatt 3259887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 287 - 439
Target Start/End: Original strand, 21396866 - 21397019
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21396866 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 21396965  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcagta 439  Q
    ||  || || ||||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  21396966 cttaaacaacatgtatgattcgataattagcatacatttcaatcatcatcagta 21397019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 287 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 29382797 - 29382644
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  29382797 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcacatgcaatggatctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactcaatatgactcca 29382698  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcagta 439  Q
    || |||||||||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||    
T  29382697 ctttaataatatgtatgattcaacaattggcatacatttcaaccatcatcagta 29382644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 155 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 42956228 - 42956070
Alignment:
Q  155 acaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccga 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  42956228 acaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccga 42956130  T
Q  252 agccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42956129 agccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgtagccctcaccgctgtt 42956070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 150 - 311
Target Start/End: Original strand, 7359119 - 7359281
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacagg 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| || |||||||  || ||  | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7359119 aatcaacaactaagactcatgcaaacgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacacctcaa--atatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagg 7359216  T
Q  247 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7359217 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 7359281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 153 - 311
Target Start/End: Original strand, 34772041 - 34772201
Alignment:
Q  153 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggacc 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |  ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34772041 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactccccaat-agatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggacc 34772139  T
Q  250 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34772140 gaagccctcaccgcttttgattggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 34772201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 153 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 45959950 - 45959790
Alignment:
Q  153 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| ||  || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  45959950 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctccat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggacc 45959852  T
Q  250 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45959851 gaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 45959790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 153 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 54845156 - 54844996
Alignment:
Q  153 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  54845156 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaataccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggacc 54845058  T
Q  250 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54845057 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagacctcaccgctgtt 54844996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 287 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 3266652 - 3266528
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  3266652 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaa 3266553  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaata 411  Q
    ||  || || |||||||||||||||    
T  3266552 cttaaacaacatgtatgattcaata 3266528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 287 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 29448709 - 29448610
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29448709 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 29448610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 150 - 311
Target Start/End: Original strand, 7356126 - 7356288
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacagg 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| || |||||||  || ||  | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7356126 aatcaacaactaagactcatgcaaacgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacacctcaa--atatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagg 7356223  T
Q  247 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7356224 accgaagccctcaccgctttttaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 7356288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 161 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 47872622 - 47872470
Alignment:
Q  161 aagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47872622 aagactcatgtaaatgatatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccct 47872524  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47872523 caccgcttttgaatgattaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 47872470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 287 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 49240877 - 49240756
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  49240877 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaa 49240778  T
Q  387 ctataataatatgtatgattca 408  Q
    ||  || || ||||||||||||    
T  49240777 cttaaacaacatgtatgattca 49240756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 287 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 49749591 - 49749470
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  49749591 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaa 49749492  T
Q  387 ctataataatatgtatgattca 408  Q
    ||  || || ||||||||||||    
T  49749491 cttaaacaacatgtatgattca 49749470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 23436015 - 23435916
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23436015 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 23435916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 386
Target Start/End: Original strand, 26395734 - 26395833
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26395734 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 26395833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 153 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 45142757 - 45142598
Alignment:
Q  153 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||  | ||| || |||| ||||||||||| ||||||||    
T  45142757 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaa--atatgtaaatatgtatgtggtaccagacaggacc 45142660  T
Q  250 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45142659 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 45142598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 287 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 29455393 - 29455294
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  29455393 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgactcca 29455294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 161 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 35462810 - 35462660
Alignment:
Q  161 aagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |  ||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35462810 aagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttagactccgcaa--atatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccct 35462713  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35462712 caccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 35462660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 153 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 45151526 - 45151372
Alignment:
Q  153 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||  | ||| || |||| ||||||||||| ||||||||    
T  45151526 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaa--atatgtaaatatgtatgtggtaccagacaggacc 45151429  T
Q  250 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45151428 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccg 45151372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 161 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11202630 - 11202479
Alignment:
Q  161 aagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |  ||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11202630 aagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttagactccgcaa--atatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccct 11202533  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11202532 caccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaacccctcaccgctgtt 11202479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 287 - 388
Target Start/End: Original strand, 11937207 - 11937309
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcc 385  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11937207 caggaccgaagccttcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcc 11937306  T
Q  386 act 388  Q
    |||    
T  11937307 act 11937309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 21881541 - 21881626
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21881541 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 21881626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 224 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19128477 - 19128391
Alignment:
Q  224 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19128477 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgagtggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 19128391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 224 - 310
Target Start/End: Original strand, 33097042 - 33097128
Alignment:
Q  224 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33097042 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcgccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 33097128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 304 - 424
Target Start/End: Original strand, 1583976 - 1584096
Alignment:
Q  304 ccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgc-aactccatgtgactccactataataatatgtat 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||    
T  1583976 ccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgacaccact-taacaacatgtat 1584074  T
Q  403 gattcaataaataacatacatt 424  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  1584075 gattcaatcaatagcatacatt 1584096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2972866 - 2972781
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2972866 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagcactcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 2972781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 20889324 - 20889409
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20889324 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcgccgctgt 20889409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 20894943 - 20895028
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20894943 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 20895028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 49548717 - 49548632
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49548717 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 49548632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 223 - 310
Target Start/End: Original strand, 33221317 - 33221404
Alignment:
Q  223 aatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  33221317 aatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatttatcatgaccgaagccctcaccgctgt 33221404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 299 - 424
Target Start/End: Original strand, 7359309 - 7359434
Alignment:
Q  299 cctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgc-aactccatgtgactccactataataata 397  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |    
T  7359309 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgacaccact-taacaaca 7359407  T
Q  398 tgtatgattcaataaataacatacatt 424  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||    
T  7359408 tgtatgattcaatagttagcatacatt 7359434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Original strand, 42220372 - 42220466
Alignment:
Q  217 aaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42220372 aaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagtcctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggactgaagccctcaccgctgt 42220466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 148 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3096757 - 3096682
Alignment:
Q  148 gaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3096757 gaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgca 3096682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 299 - 424
Target Start/End: Original strand, 5938986 - 5939111
Alignment:
Q  299 cctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgc-aactccatgtgactccactataataata 397  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| |  |    
T  5938986 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgacaccact-taacagca 5939084  T
Q  398 tgtatgattcaataaataacatacatt 424  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||    
T  5939085 tgtatgattcaatagttagcatacatt 5939111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Original strand, 36037503 - 36037597
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36037503 aaatgcaactatgcatgcggtaccaaccaggaccgaagtcctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 36037597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 31665009 - 31665094
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31665009 tatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatagttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgt 31665094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 299 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 11202451 - 11202343
Alignment:
Q  299 cctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgc-aactccatgtgactccactataataata 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || || |    
T  11202451 cctcaccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacagctgaccatgcaatgcaaactccatgtgactccacttaaacaaca 11202352  T
Q  398 tgtatgatt 406  Q
    |||||||||    
T  11202351 tgtatgatt 11202343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 46045013 - 46044918
Alignment:
Q  217 aaatgcaat-atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  46045013 aaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacattagccctcaccgctgt 46044918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 224 - 310
Target Start/End: Original strand, 30396146 - 30396231
Alignment:
Q  224 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30396146 atatgcatgtggtaccaaataggaccgaagccctcaccgc-tttgaatggttaaagtattcatcaggaccgaagccctcaacgctgt 30396231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41404849 - 41404754
Alignment:
Q  217 aaatgcaat-atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  41404849 aaatgcaattatgcatgtggtaccaaaactggaccgaagccctcaccacttttgaatggttaaagcattcatcatgaccaaagccctcaccgctgt 41404754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Original strand, 899534 - 899628
Alignment:
Q  217 aaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||    
T  899534 aaatgcaattatgcatgcggtaccaaacaggactgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagaacataagccatcaccgctgt 899628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 226 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 49548502 - 49548417
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49548502 atgcatgtggtaccatatcagggccggagccctcaccgcttttaaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 49548417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 163 - 292
Target Start/End: Original strand, 37881331 - 37881466
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| |  |||  ||||||||||    
T  37881331 gactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaaagaa-tgcaaatatgcatgtggtaccataatcagagccgaagccct 37881429  T
Q  258 caccgct--tttgaatggttaaagcattcatcaggac 292  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37881430 caccgctattttgaatggttaaagcattcatcaggac 37881466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 299 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 45959762 - 45959672
Alignment:
Q  299 cctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatggaatgcaactccatgtgactccact 388  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    |||||||| ||||||||||    
T  45959762 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacaaactccatatgactccact 45959672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 292
Target Start/End: Original strand, 13452162 - 13452295
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||||| || ||  |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||    
T  13452162 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacac-accttagactcctcaac-aaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccct 13452259  T
Q  258 caccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggac 292  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13452260 caccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggac 13452295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 299 - 356
Target Start/End: Original strand, 34772229 - 34772286
Alignment:
Q  299 cctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34772229 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 34772286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 299 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 45142570 - 45142513
Alignment:
Q  299 cctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45142570 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 45142513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2972742 - 2972697
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2972742 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 2972697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19128352 - 19128307
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19128352 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 19128307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 20889448 - 20889493
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20889448 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 20889493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 20895067 - 20895112
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20895067 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 20895112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 36037636 - 36037681
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36037636 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 36037681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 47872431 - 47872386
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47872431 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 47872386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 49548593 - 49548548
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49548593 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 49548548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 412
Target Start/End: Original strand, 31665133 - 31665235
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatggaatgca-actccatgtgactccactataataatatgtatgattca 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | | || ||||||| |||||||| |  || || ||||||||||||    
T  31665133 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctatatacaacttgaccatgca-tacatactccatatgactccatttaaacaacatgtatgattca 31665231  T
Q  409 ataa 412  Q
    ||||    
T  31665232 ataa 31665235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 899666 - 899711
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  899666 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaact 899711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 21881665 - 21881710
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21881665 tttatgcatatgcaatggacctactcgtgtatatctacatacaact 21881710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 30396269 - 30396314
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30396269 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaact 30396314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 33097166 - 33097211
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33097166 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaact 33097211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 42956031 - 42955986
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42956031 tttatgcatatgcaacggacctacttgtgtatatctacatacaact 42955986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 54844957 - 54844912
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54844957 tttatgcatatacaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 54844912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Original strand, 18271262 - 18271344
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  18271262 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 18271344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 41404716 - 41404672
Alignment:
Q  312 ttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41404716 ttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaact 41404672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Original strand, 23121599 - 23121661
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  23121599 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 23121661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 356
Target Start/End: Original strand, 14910725 - 14910792
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14910725 caggaccgaggccctcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 14910792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 35462621 - 35462576
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  35462621 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 35462576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 42220504 - 42220549
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  42220504 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 42220549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 46044880 - 46044835
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46044880 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaact 46044835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 49548378 - 49548333
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  49548378 tttatgcatatgcaatggaccaactcgtgtatatctacatacaact 49548333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 13899797 - 13899711
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  13899797 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 13899711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15361003 - 15360917
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15361003 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgct 15360917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Original strand, 16484596 - 16484682
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  16484596 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 16484682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Original strand, 18261297 - 18261379
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    ||||||||||||||||   |||||   |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  18261297 atgcatgtggtaccaatttacagggtagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 18261379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 10977199 - 10977129
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggac 292  Q
    |||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10977199 tatgcatgtggtaccatattcagagccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcatcaggac 10977129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Original strand, 20940260 - 20940322
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  20940260 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgttgtagaatggttaaagcattcat 20940322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 284
Target Start/End: Original strand, 27905211 - 27905270
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  27905211 atgcatgtggtaccatatcaggactgaagccctcaccgctatagaatggttaaagcattc 27905270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 284
Target Start/End: Original strand, 40908583 - 40908642
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  40908583 atgcatgtggtaccataacagggccggagccctcaccgctatagaatggttaaagcattc 40908642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15005149 - 15005081
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa---caggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcagg 290  Q
    |||||||||||||||||   |||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15005149 atgcatgtggtaccaaattacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatcagg 15005081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Original strand, 13444207 - 13444290
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    |||| |||||||||||   ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  13444207 atgcctgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 13444290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 308
Target Start/End: Original strand, 13886665 - 13886752
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  13886665 tatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcattagggcttaagccctcaccgct 13886752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 285
Target Start/End: Original strand, 14821355 - 14821418
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattca 285  Q
    |||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  14821355 tatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattca 14821418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 308
Target Start/End: Original strand, 15244098 - 15244185
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||||| ||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  15244098 tatgcatgtgttaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 15244185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 308
Target Start/End: Original strand, 15307000 - 15307087
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||||||||||||   ||||| |  ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  15307000 tatgcatgtggtaccaatttacagggcaaaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 15307087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Original strand, 27905352 - 27905418
Alignment:
Q  288 aggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27905352 aggaccgaggccctcaccgct--tttatgcttattcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 27905418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 33221443 - 33221488
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  33221443 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctatatacaact 33221488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 53905499 - 53905429
Alignment:
Q  224 atatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcagg 290  Q
    ||||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  53905499 atatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagg 53905429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 1651236 - 1651177
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  1651236 atgcatgtggtaccataacagggtcggagccctcaccgctatagaatggttaaagcattc 1651177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 2585346 - 2585260
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattca-tcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||    
T  2585346 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatgattaaagcattcattcaggacataagtcctcaccgct 2585260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 4831265 - 4831203
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  4831265 atgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 4831203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 4834560 - 4834498
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  4834560 atgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 4834498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Original strand, 8833771 - 8833855
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa----acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    ||||||||||||||||    ||||| | ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  8833771 atgcatgtggtaccaattttacagggcagaagccctcgccgaattttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagtcctcacc 8833855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 284
Target Start/End: Original strand, 14910575 - 14910645
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14910575 aaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccggagccctcaccgctatagaatggttaaagcattc 14910645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 308
Target Start/End: Original strand, 12931881 - 12931923
Alignment:
Q  266 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  12931881 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 12931923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 356
Target Start/End: Original strand, 14485671 - 14485717
Alignment:
Q  310 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14485671 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 14485717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16229297 - 16229217
Alignment:
Q  229 catgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    |||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  16229297 catgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 16229217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 356
Target Start/End: Original strand, 18212297 - 18212343
Alignment:
Q  310 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18212297 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 18212343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 26077728 - 26077682
Alignment:
Q  310 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26077728 ttttatgcttatgtaattgacccacttgtgtatatctacatacaact 26077682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 17000184 - 17000139
Alignment:
Q  310 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 355  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17000184 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 17000139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22726008 - 22725968
Alignment:
Q  264 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22726008 ttttgaatggttaaagcattca-caggaccgaagtcctcacc 22725968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 356
Target Start/End: Original strand, 30237898 - 30237958
Alignment:
Q  296 agccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  30237898 agccctcaccgct-ttatatgcttatgaaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 30237958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10972917 - 10972873
Alignment:
Q  313 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10972917 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 10972873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 229 - 286
Target Start/End: Original strand, 14484432 - 14484491
Alignment:
Q  229 catgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    |||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  14484432 catgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaaacattcat 14484491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 286
Target Start/End: Original strand, 15406911 - 15406973
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  15406911 tatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc-ccgctaatgaatggttaaagcattcat 15406973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 264 - 308
Target Start/End: Original strand, 15546609 - 15546653
Alignment:
Q  264 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  15546609 ttttgaatggttaaagcattcatcagagcataagccctcaccgct 15546653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 266 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18166422 - 18166382
Alignment:
Q  266 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  18166422 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccg 18166382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 88)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 14 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 71821 - 71423
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatg--- 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||| ||||| ||| ||        
T  71821 atcaacaacacattatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccttaatcacaatggatataaatatataaca 71722  T
Q  111 catattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttc 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  71721 catattcaacaccaacatcatctatcagataataaccgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactactaagacaccatcttagacttc 71622  T
Q  211 ttaatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  71621 ttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg 71522  T
Q  310 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattca 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||    
T  71521 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattca 71423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 27729295 - 27729594
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatat--atataaatgc 111  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27729295 atcaacaatactttatcttgtaaacatatatatgtatgagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccatgatcacaatgaatatatatataaatgc 27729394  T
Q  112 atattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27729395 atattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 27729494  T
Q  212 taatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27729495 taatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 27729594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 4077207 - 4077506
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatat--atataaatgc 111  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  4077207 atcaacaacactttatcttgtaaacaaatatatgtataagtcacaggcaacaacaacatcaacaatacaccatgatcacaatgaatatatatataaatgc 4077306  T
Q  112 atattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4077307 atattcaacaccaacatcatccatcagaaaataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 4077406  T
Q  212 taatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4077407 taatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagtcctcaccgctgtt 4077506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 44091437 - 44091135
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatata-----aa 108  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||     ||    
T  44091437 atcaacaatactttatcttgtaaacatataaatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccatgatcacaatgaatatatatatatataa 44091338  T
Q  109 tgcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagact 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44091337 tgcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagact 44091238  T
Q  209 tcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44091237 tcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcattgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 44091138  T
Q  309 gtt 311  Q
    |||    
T  44091137 gtt 44091135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 21604547 - 21604850
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatat--gtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatg- 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||| || ||| |||||||| ||| ||      
T  21604547 atcaacaacacattatcttgtaaacatatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcatcaatacaccataattacagtgaatataaatatataa 21604646  T
Q  111 --catattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagact 208  Q
      |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21604647 cacatattcaacaccaacatcatctatcagataacaactgaaatcaaccaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagact 21604746  T
Q  209 tcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgc 307  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21604747 tcttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgc 21604846  T
Q  308 tgtt 311  Q
    ||||    
T  21604847 tgtt 21604850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 84 - 311
Target Start/End: Original strand, 20850046 - 20850275
Alignment:
Q  84 catgatcacaatgaatatatataaat----gcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgaca 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20850046 catgatcacaatgaatatatataaatatatgtatattcaacatcaacatcatccatcagataa-aactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgaca 20850143  T
Q  180 tgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaag 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20850144 tgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaag 20850243  T
Q  280 cattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20850244 cattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 20850275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 68 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11360530 - 11360286
Alignment:
Q  68 aacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaat----gcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaag 163  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    | |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  11360530 aacatcaacaacacaccaagatcacaatgaatatatataaataaatgtatattcaacatcaacatcaac-atcagataa-aaccgaaa-caacaaccaag 11360434  T
Q  164 actcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11360433 actcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgc 11360334  T
Q  264 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11360333 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 11360286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 87 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 24481870 - 24481646
Alignment:
Q  87 gatcacaatgaatatatataaat----gcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatga 182  Q
    |||||||||||||||||||||||    | |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24481870 gatcacaatgaatatatataaataaatgtatattcaacatcaacatcaac-atcagataa-aaccgaa--caacaaccaagactcatgcaaatgacatga 24481775  T
Q  183 ccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24481774 ccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat 24481675  T
Q  283 tcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24481674 tcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 24481646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 68 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30196804 - 30196561
Alignment:
Q  68 aacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaat----gcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaag 163  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||    | |||||||||  |||||||| | ||||||||| ||| |||  |||||||||||    
T  30196804 aacatcaacaacacatcaagatcacaatgaatatatataaataaatgtatattcaacgtcaacatcaac-atcagataa-aaccgaa--caacaaccaag 30196709  T
Q  164 actcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30196708 actcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgc 30196609  T
Q  264 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30196608 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaggccctcaccgctgtt 30196561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 68 - 311
Target Start/End: Original strand, 1061555 - 1061799
Alignment:
Q  68 aacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaat----gcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaag 163  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||    | |||||||||| | |||||| | ||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  1061555 aacatcaacaacacatcaagatcacaatgaatatatataaataaatgtatattcaacatcgacatcaac-atcagataa-acctgaaa-caacaaccaag 1061651  T
Q  164 actcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  1061652 actcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgc 1061751  T
Q  264 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1061752 tttggaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 1061799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 68 - 311
Target Start/End: Original strand, 1066938 - 1067182
Alignment:
Q  68 aacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaat----gcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaag 163  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||    | |||||||||| | |||||| | ||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  1066938 aacatcaacaacacatcaagatcacaatgaatatatataaataaatgtatattcaacatcgacatcaac-atcagataa-acctgaaa-caacaaccaag 1067034  T
Q  164 actcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  1067035 actcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgc 1067134  T
Q  264 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1067135 tttggaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 1067182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 153 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4071749 - 4071591
Alignment:
Q  153 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4071749 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaa 4071650  T
Q  253 gccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4071649 gccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 4071591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 98 - 306
Target Start/End: Original strand, 35585234 - 35585438
Alignment:
Q  98 atatatataaatgcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacac 197  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35585234 atatatatgaatgcatatccaacatcaacatcaacca---gataataactgaaat-aacaaccgagactcatgcaaatgacatgaccaatgctaagacac 35585329  T
Q  198 catcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaag 297  Q
    ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35585330 catattagacttctgaatgagatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaag 35585429  T
Q  298 ccctcaccg 306  Q
    |||||||||    
T  35585430 ccctcaccg 35585438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 287 - 440
Target Start/End: Original strand, 4077522 - 4077676
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4077522 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 4077621  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcagtat 440  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4077622 ctataataatacgtatgagtcaataaataacatacatttcaaccatcatcagtat 4077676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 160 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 36984764 - 36984612
Alignment:
Q  160 caagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  36984764 caagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctc 36984665  T
Q  259 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36984664 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 36984612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 160 - 311
Target Start/End: Original strand, 31828547 - 31828698
Alignment:
Q  160 caagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  31828547 caagactcatgcaa-tgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctc 31828645  T
Q  259 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31828646 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 31828698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 160 - 311
Target Start/End: Original strand, 31833899 - 31834050
Alignment:
Q  160 caagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  31833899 caagactcatgcaa-tgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctc 31833997  T
Q  259 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31833998 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 31834050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 150 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22013322 - 22013159
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacagg 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22013322 aatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagg 22013224  T
Q  247 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22013223 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 22013159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 150 - 311
Target Start/End: Original strand, 27037167 - 27037330
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacagg 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27037167 aatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatgga-tgcaaatatgcatgtggtaccaaacagg 27037265  T
Q  247 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27037266 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 27037330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 150 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 24427051 - 24426887
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgc-aatatgcatgtggtaccaaacagg 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24427051 aatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacagcttagacttctcaatgga-tgcgaatatgcatgtggtaccaaacagg 24426953  T
Q  247 accgaagccctcaccgctttt-gaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24426952 accgaagccctcaccgctttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 24426887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 150 - 311
Target Start/End: Original strand, 33973 - 34136
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacagg 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33973 aatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatgga-tgcaaatatgcatgtggtaccaaacagg 34071  T
Q  247 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34072 accgaagccttcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggactgaagccctcaccgctgtt 34136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 287 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 44091119 - 44090982
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44091119 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 44091020  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacatacatt 424  Q
    ||  || || |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  44091019 cttaaacaacatgtatgattcactaattaacatacatt 44090982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 150 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2386132 - 2385968
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacagg 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2386132 aatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatgga-tgcaaatatgcatgtggtaccaaacagg 2386034  T
Q  247 accgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2386033 accgaagccctcaccgctttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgtt 2385968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 35244241 - 35244081
Alignment:
Q  153 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggacc 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35244241 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaat-agatacaattatgcatgtggtaccaaacaggacc 35244143  T
Q  250 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35244142 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 35244081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 287 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 24426871 - 24426718
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24426871 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgactcca 24426772  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcagta 439  Q
    ||  || || ||||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  24426771 cttaaacaacatgtatgattcgataattagcatacatttcaatcatcatcagta 24426718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 292 - 424
Target Start/End: Original strand, 27729615 - 27729747
Alignment:
Q  292 ccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccactata 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  27729615 ccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttatgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 27729714  T
Q  392 ataatatgtatgattcaataaataacatacatt 424  Q
    | || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  27729715 acaacatgtatgattcaataattaacatacatt 27729747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 287 - 440
Target Start/End: Original strand, 31828714 - 31828868
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcc 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||    
T  31828714 caggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgacacc 31828813  T
Q  386 actataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcagtat 440  Q
    |||  ||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  31828814 acttaaatgacatgtatgactcaataaatagcatacaatcaaccatcatcagtat 31828868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 287 - 440
Target Start/End: Original strand, 31834066 - 31834220
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcc 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||    
T  31834066 caggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgacacc 31834165  T
Q  386 actataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcagtat 440  Q
    |||  ||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  31834166 acttaaatgacatgtatgactcaataaatagcatacaatcaaccatcatcagtat 31834220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 287 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 36984596 - 36984442
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcc 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||    
T  36984596 caggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgacacc 36984497  T
Q  386 actataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcagtat 440  Q
    |||  ||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  36984496 acttaaatgacatgtatgactcaataaatagcatacaatcaaccatcatcagtat 36984442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 163 - 311
Target Start/End: Original strand, 11466008 - 11466157
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 260  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || |||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11466008 gactcatgcaaatgacatgacaacacagctaagacaacaccttagactcctcaac-aaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggatcgaagccctcac 11466106  T
Q  261 cgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11466107 cgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcatcgctgtt 11466157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 153 - 311
Target Start/End: Original strand, 28292645 - 28292805
Alignment:
Q  153 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || |||||||| ||  || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28292645 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactactaagacaacaccttagactcctccat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggacc 28292743  T
Q  250 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28292744 gaagccatcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 28292805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 2385952 - 2385832
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  2385952 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgactcca 2385853  T
Q  387 ctataataatatgtatgattc 407  Q
    ||  || || |||||||||||    
T  2385852 cttaaacaacatgtatgattc 2385832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 386
Target Start/End: Original strand, 1067198 - 1067297
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1067198 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 1067297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 386
Target Start/End: Original strand, 21604866 - 21604965
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21604866 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 21604965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 24481630 - 24481531
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24481630 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 24481531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 287 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 4071575 - 4071455
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcc 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  4071575 caggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccaagtgactcc 4071476  T
Q  386 actataataatatgtatgatt 406  Q
    |||  ||||| ||||||||||    
T  4071475 acttaaataacatgtatgatt 4071455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 287 - 386
Target Start/End: Original strand, 1061815 - 1061914
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1061815 caggaccgaagccctcatcgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 1061914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 287 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 30196545 - 30196446
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30196545 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 30196446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 287 - 388
Target Start/End: Original strand, 20850291 - 20850393
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcc 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20850291 caggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcc 20850390  T
Q  386 act 388  Q
    |||    
T  20850391 act 20850393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 299 - 424
Target Start/End: Original strand, 27037358 - 27037484
Alignment:
Q  299 cctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgc-aactccatgtgactccactataataata 397  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||  || || |    
T  27037358 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgacaccacttaaacaaca 27037457  T
Q  398 tgtatgattcaataaataacatacatt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  27037458 tgtatgattcaataaataacatacatt 27037484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 14563832 - 14563917
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14563832 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 14563917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 27272251 - 27272336
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27272251 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 27272336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 224 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13101313 - 13101227
Alignment:
Q  224 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13101313 atatgcatgtggtaccaaacatgaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 13101227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 224 - 310
Target Start/End: Original strand, 36800556 - 36800642
Alignment:
Q  224 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36800556 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaggcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 36800642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 32911630 - 32911535
Alignment:
Q  217 aaatgcaat-atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32911630 aaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgtttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 32911535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 287 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 11360270 - 11360175
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11360270 caggaccgaagccctcaccgctgttttat----atgcaatggacctacttgtgtatatctatatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 11360175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15643436 - 15643342
Alignment:
Q  217 aaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15643436 aaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcacctcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcgccgctgt 15643342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25590339 - 25590254
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  25590339 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacaaaagcactcaccgctgt 25590254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 299 - 406
Target Start/End: Original strand, 34164 - 34272
Alignment:
Q  299 cctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgc-aactccatgtgactccactataataata 397  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || || |    
T  34164 cctctccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgactccacttaaacaaca 34263  T
Q  398 tgtatgatt 406  Q
    |||||||||    
T  34264 tgtatgatt 34272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 217 - 306
Target Start/End: Original strand, 45028499 - 45028590
Alignment:
Q  217 aaatgcaat-atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccg 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45028499 aaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagtcctcaccg 45028590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 224 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17592674 - 17592586
Alignment:
Q  224 atatgcatgtggtaccaaacaggac--cgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17592674 atatgcatgtggtaccagacaggacaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaaaccctcaccgctgt 17592586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 163 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 28971521 - 28971387
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  28971521 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcaggaccgaagccct 28971423  T
Q  258 caccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggac 292  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28971422 caccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggac 28971387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 299 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 22013131 - 22013048
Alignment:
Q  299 cctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgc-aactccatgtga 381  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22013131 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggaactacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtga 22013048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21133496 - 21133345
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| || ||  |||||||| ||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||    
T  21133496 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacatcttagactcctcaac-aaatgcaaatatgcatgtagtaccatattcagggccgaagccct 21133398  T
Q  258 caccgct--tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  21133397 caccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgct 21133345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 301 - 356
Target Start/End: Original strand, 28292835 - 28292890
Alignment:
Q  301 tcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28292835 tcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 28292890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 299 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 35244053 - 35243963
Alignment:
Q  299 cctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatggaatgcaactccatgtgactccact 388  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    |||||||| ||||||||||    
T  35244053 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacaaactccatatgactccact 35243963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 311 - 412
Target Start/End: Original strand, 27272376 - 27272478
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatggaatgca-actccatgtgactccactataataatatgtatgattca 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || ||||||| ||||||||||  || || || |||||||||    
T  27272376 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca-tacatactccatatgactccacttaaacaacatatatgattca 27272474  T
Q  409 ataa 412  Q
    ||||    
T  27272475 ataa 27272478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 17592547 - 17592466
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatggaatgca-actccatgtgactccactata 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || ||||||| |||||||||||||    
T  17592547 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca-tacatactccatatgactccactata 17592466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 11466196 - 11466241
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11466196 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 11466241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 14563956 - 14564001
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14563956 tttatgcatatgcaatgaacctacttgtgtatatctacatacaact 14564001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 36800680 - 36800725
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36800680 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaact 36800725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 45028632 - 45028677
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45028632 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaact 45028677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 13101188 - 13101143
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  13101188 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 13101143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15643304 - 15643259
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15643304 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 15643259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25590216 - 25590171
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25590216 tttatgcatatgaaatggacccacttgtgtatatctacatacaact 25590171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 38931738 - 38931652
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  38931738 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 38931652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Original strand, 43693336 - 43693487
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgc-aatatgcatgtggtacc--aaacaggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || | |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||  || |||| |||   |||     
T  43693336 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgaccca 43693434  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||| | | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  43693435 caccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 43693487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19649787 - 19649660
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacacca-tcttagacttcttaatgaaatgca-atatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccc 256  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||| || || |||||| || ||  ||||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||    
T  19649787 gactcatgcaaatgacatgtcaacaccgctaagacaacactcctagactcctcaac-aaatgcagatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccc 19649689  T
Q  257 tcaccgctt-ttgaatggttaaagcattc 284  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19649688 tcaccgctaattgaatggttaaagcattc 19649660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 306
Target Start/End: Original strand, 23062500 - 23062585
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattca-tcaggaccgaagccctcaccg 306  Q
    |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||    
T  23062500 tatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattcaggacataagtcctcaccg 23062585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Original strand, 2105577 - 2105640
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa---caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |   |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2105577 atgcatgtggtaccataattcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 2105640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 20914513 - 20914430
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  20914513 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcttcagggcataagccctcacc 20914430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 32911497 - 32911452
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32911497 tttatgcatatgctatgcacccacttgtgtatatctacatacaact 32911452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Original strand, 20724032 - 20724095
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20724032 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 20724095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Original strand, 25267199 - 25267285
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  25267199 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 25267285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6744566 - 6744415
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || | |||| | || ||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   |||     
T  6744566 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagattcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgaccca 6744468  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcattc--atcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||  ||||||||| ||| ||||||||||    
T  6744467 caccgctgtcgaatggttaaaacattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 6744415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 8890121 - 8890062
Alignment:
Q  250 gaagccctcacc-gcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  8890121 gaagccctcaccagatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 8890062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Original strand, 22809882 - 22809944
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22809882 atgcatgtggtaccatatccagggccgaggccctcaccgctatagaatggttaaagcattcat 22809944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 356
Target Start/End: Original strand, 9241492 - 9241538
Alignment:
Q  310 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9241492 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 9241538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 356
Target Start/End: Original strand, 22810042 - 22810088
Alignment:
Q  310 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22810042 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 22810088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 308
Target Start/End: Original strand, 23062590 - 23062632
Alignment:
Q  266 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  23062590 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 23062632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 308
Target Start/End: Original strand, 24660500 - 24660542
Alignment:
Q  266 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  24660500 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 24660542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 284
Target Start/End: Original strand, 9512 - 9581
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  9512 aaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 9581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Original strand, 19035478 - 19035561
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    ||||||||||||||||   |||||   |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  19035478 atgcatgtggtaccaatttacagggtagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 19035561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Original strand, 20648069 - 20648152
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  20648069 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcactggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 20648152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 280
Target Start/End: Original strand, 22703489 - 22703545
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagc 280  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22703489 atgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctttagaatggttaaagc 22703545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Original strand, 22860301 - 22860384
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  22860301 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatgttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 22860384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 255 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22796776 - 22796720
Alignment:
Q  255 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattca-tcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||| ||||||||||||    
T  22796776 cctcaccgctattgaatggttaaagcattcattccggacataagtcctcaccgctgt 22796720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Original strand, 24658773 - 24658836
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24658773 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 24658836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 92)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 14 - 439
Target Start/End: Original strand, 24362398 - 24362821
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatat--atataaatgc 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24362398 atcaacaacacatcatcttgcaaacatatatgtgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatatataaatgc 24362497  T
Q  112 atattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24362498 atattcaacaccgacatcatccatcagataataactgaaatcaactattaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 24362597  T
Q  212 taatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |     || | ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24362598 taatgaaatgcaatatgcatgtggtacc-aacaggaccgaagccctcaccgctgttga--gcaactagtactc--caggaccgaagccctcaccgctgtt 24362692  T
Q  312 ttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaata 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  24362693 ttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactcaatatgactccactttaataatatgtatgattcaaca 24362792  T
Q  412 aataacataca-ttcaaccatcatcagta 439  Q
    | || |||||| |||||||||||||||||    
T  24362793 attagcatacatttcaaccatcatcagta 24362821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 24368973 - 24369271
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatat--atataaatgc 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24368973 atcaacaacacatcatcttgcaaacatatatgtgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatatataaatgc 24369072  T
Q  112 atattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24369073 atattcaacaccgacatcatccatcagataataactgaaatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 24369172  T
Q  212 taatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24369173 taatgaaatgcaatatgcatgtggtacc-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 24369271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25316007 - 25315710
Alignment:
Q  16 caacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatat--aaatgcat 113  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  25316007 caacaacactttatcttgtaaacaaatatatgtataagtcacaagtaacaacaacatcaacaatacaccatgaacacaatgaatatatatgtaaatgcat 25315908  T
Q  114 attcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttctta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25315907 attcaacaccaacatcatccatcagaaaataactgacatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttctta 25315808  T
Q  214 atgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25315807 atgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacatgaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 25315710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26203501 - 26203204
Alignment:
Q  16 caacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatat--aaatgcat 113  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  26203501 caacaacactttatcttgtaaacaaatatatgtataagtcacaagtaacaacaacatcaacaatacaccatgaacacaatgaatatatatgtaaatgcat 26203402  T
Q  114 attcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttctta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26203401 attcaacaccaacatcatccatcagaaaataactgacatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttctta 26203302  T
Q  214 atgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26203301 atgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacatgaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 26203204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 20 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30799792 - 30799502
Alignment:
Q  20 aacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatgcatattcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||| |||||||  || | | | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30799792 aacacatcatcttgtaaacatatacaagtttaagccacaagcagcaacaacgacatcaatacaccaccatcacaatgaatatatataaatgcatattcaa 30799693  T
Q  120 caccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaa 219  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30799692 catcaacatcaaccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaa 30799593  T
Q  220 tgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30799592 tgcaatatgcatgtggtacc-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 30799502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15332490 - 15332187
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatg--- 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| || ||| |||||||| ||| ||        
T  15332490 atcaacaacacattatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccataattacagtgaatataaatatatataa 15332391  T
Q  111 --catattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagact 208  Q
      |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15332390 cacatattcaacaccaacatcatctatcagataacaactgaaaccaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagataccatcttagact 15332291  T
Q  209 tcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgc 307  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15332290 tcttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgc 15332191  T
Q  308 tgtt 311  Q
    ||||    
T  15332190 tgtt 15332187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 17309455 - 17309758
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatg--- 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||  | ||| |||||||| ||| ||        
T  17309455 atcaacaacacattatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccatagttacagtgaatataaatatatataa 17309554  T
Q  111 --catattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagact 208  Q
      |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17309555 cacatattcaacaccaacatcatctatcagataacaactgaaaccaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagact 17309654  T
Q  209 tcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgc 307  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17309655 tcttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgc 17309754  T
Q  308 tgtt 311  Q
    ||||    
T  17309755 tgtt 17309758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 25463625 - 25463925
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatata-tata-aatgc 111  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||  || ||||| | ||||||||  ||| |||| ||  |    
T  25463625 atcaacaacaaattatcttgtaa-catataaatgtatgagtcacaagtaacaacaacatcaacatcacaccataaccacaatgagaataatatataacac 25463723  T
Q  112 atattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25463724 atattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgctaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 25463823  T
Q  212 ta-atgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg 309  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25463824 tatatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg 25463923  T
Q  310 tt 311  Q
    ||    
T  25463924 tt 25463925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 54 - 311
Target Start/End: Original strand, 1070441 - 1070702
Alignment:
Q  54 tcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatg---catattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaa 150  Q
    |||||||| |||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||| ||| ||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  1070441 tcacaagccacaacaacatcaacaatacaccataatcacaatgaatataaatatataacacatattcaacaccaacatcatctatcagataataaccgaa 1070540  T
Q  151 atcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  1070541 atcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggacc 1070640  T
Q  250 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1070641 gaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 1070702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16224031 - 16223723
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatat-atataaatgca 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||| ||| ||||| ||| |    
T  16224031 atcaacaacacattatcttgtaaacatataaaggtataagtcacaagcatcaacaacatcaacaacacaccataatcaccttgagtatcatatatatgta 16223932  T
Q  113 tat---------tcaacaccaacatcatcc-atcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatct 202  Q
    |||         |||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16223931 tatatcacctattcaacaccaaaatcatcttatcagataacaactgaat--aaccactaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatct 16223834  T
Q  203 tagacttcttaa-tgaaatgcaata-tgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccc 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16223833 tagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccc 16223734  T
Q  301 tcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||    
T  16223733 tcaccgctgtt 16223723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 98 - 312
Target Start/End: Original strand, 22406493 - 22406707
Alignment:
Q  98 atatatataaatgcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacac 197  Q
    ||||||||||||| | || |  || |||| ||||| |||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22406493 atatatataaatgtacatacttcatcaacctcatcaatcagatagtaactgaaatga-caaccacgactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacac 22406591  T
Q  198 catcttagacttcttaatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22406592 catcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaa 22406691  T
Q  297 gccctcaccgctgttt 312  Q
    ||||||||||||||||    
T  22406692 gccctcaccgctgttt 22406707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 287 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 25315694 - 25315545
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25315694 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 25315595  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatca 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25315594 ctataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatca 25315545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 287 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 26203188 - 26203039
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26203188 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 26203089  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatca 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26203088 ctataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatca 26203039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 287 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 30799486 - 30799337
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30799486 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgcgactcca 30799387  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatca 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30799386 ctataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatca 30799337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 158 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 34134189 - 34134035
Alignment:
Q  158 accaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccc 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  34134189 accaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccc 34134090  T
Q  257 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34134089 tcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 34134035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 20 - 311
Target Start/End: Original strand, 4106491 - 4106781
Alignment:
Q  20 aacacatcatcttgtaaacatatatatgtat--aagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatgcatattc 117  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||     |||||   |||||||| | |||||  | |  |||||||    
T  4106491 aacacatcatcttgcaaacatgtatatgtatgtaattcacaagcaacaacaacatcatt---atacctccatcacaataagtatatggata--catattc 4106585  T
Q  118 aacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaat 215  Q
    | || ||||||||  |||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  4106586 atcaacaacatcaatcatcagataacaaccgcaatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaat 4106685  T
Q  216 gaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
     | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4106686 -agatgcaaatatgaatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 4106781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 287 - 439
Target Start/End: Original strand, 24369287 - 24369440
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  24369287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactcaatatgactcca 24369386  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcagta 439  Q
    || |||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||    
T  24369387 ctttaataatatgtatgattcaacaattagcatacatttcaaccatcatcagta 24369440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 161 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 94711 - 94559
Alignment:
Q  161 aagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94711 aagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccct 94613  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94612 caccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 94559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 150 - 311
Target Start/End: Original strand, 29158989 - 29159153
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacagg 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29158989 aatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatgga-tgcaaatatgcatgtggtaccaaacagg 29159087  T
Q  247 accgaagccctcaccgctttt-gaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29159088 accgaagccctcaccgctttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 29159153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Original strand, 14582730 - 14582888
Alignment:
Q  153 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgc-aatatgcatgtggtaccaaacaggacc 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14582730 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacgacactgctaagacaacaccttagactcctcaa--atatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 14582827  T
Q  250 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14582828 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 14582888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 285 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 19096838 - 19096685
Alignment:
Q  285 atcaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  19096838 atcaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgactc 19096739  T
Q  385 cactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcag 437  Q
    ||||  || || ||||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||    
T  19096738 cacttaaacaacatgtatgattcgataattagcatacacttcaatcatcatcag 19096685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 150 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8069921 - 8069759
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgc-aatatgcatgtggtaccaaacagg 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||  | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8069921 aatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaa--atatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagg 8069824  T
Q  247 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8069823 actgaagccctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 8069759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 287 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16223707 - 16223583
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  16223707 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaa 16223608  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaata 411  Q
    ||  || || |||||||||||||||    
T  16223607 cttaaacaacatgtatgattcaata 16223583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 287 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 34134019 - 34133895
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  34134019 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaa 34133920  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaata 411  Q
    ||  || || |||||||||||||||    
T  34133919 cttaaacaacatgtatgattcaata 34133895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 287 - 437
Target Start/End: Original strand, 29159169 - 29159320
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  29159169 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgattcca 29159268  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcag 437  Q
    ||  || || ||||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||    
T  29159269 cttaaacaacatgtatgattcgataattagcatacacttcaatcatcatcag 29159320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 287 - 424
Target Start/End: Original strand, 1070718 - 1070855
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  1070718 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactaaatgtgactcca 1070817  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacatacatt 424  Q
    ||  || || |||||||||||||||  || ||||||||    
T  1070818 cttaaacaacatgtatgattcaatatttagcatacatt 1070855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 407
Target Start/End: Original strand, 25463941 - 25464061
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  25463941 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaa 25464040  T
Q  387 ctataataatatgtatgattc 407  Q
    ||  || || |||||||||||    
T  25464041 cttaaacaacatgtatgattc 25464061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 15332171 - 15332072
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15332171 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 15332072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 386
Target Start/End: Original strand, 17309774 - 17309873
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17309774 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 17309873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 224 - 310
Target Start/End: Original strand, 27767357 - 27767443
Alignment:
Q  224 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27767357 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 27767443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10464364 - 10464279
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10464364 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 10464279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10470886 - 10470801
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10470886 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 10470801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 287 - 406
Target Start/End: Original strand, 22406723 - 22406842
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcc 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22406723 caggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctact-gtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgactcc 22406821  T
Q  386 actataataatatgtatgatt 406  Q
    |||  | ||| ||||||||||    
T  22406822 acttaactaacatgtatgatt 22406842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12447360 - 12447265
Alignment:
Q  217 aaatgcaat-atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12447360 aaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgtagccctcaccgctgt 12447265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 223 - 310
Target Start/End: Original strand, 29925692 - 29925779
Alignment:
Q  223 aatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29925692 aatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagtcctcaccccttttgaatggttaaagcattcatcaggactgaagccctcaccgctgt 29925779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 299 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 8069731 - 8069641
Alignment:
Q  299 cctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgc-aactccatgtgactccact 388  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8069731 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgactccact 8069641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 13940432 - 13940518
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13940432 tatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagtcctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 13940518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 225 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17207893 - 17207811
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccg 306  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17207893 tatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccg 17207811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 150 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19096931 - 19096815
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacagg 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  19096931 aatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacgacactgctaagacaacaccttagacttctcaatgga-tgcaaatatgcatgtggtaccaatcagg 19096833  T
Q  247 accgaagccctcaccgct 264  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19096832 accgaagccctcaccgct 19096815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 26418909 - 26418758
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| || |  |||| ||||||||||    
T  26418909 gactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtatcataatcagggccgaagccct 26418811  T
Q  258 caccgct--tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  26418810 caccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgct 26418758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 225 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 17894676 - 17894611
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagg 290  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17894676 tatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagg 17894611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23021513 - 23021418
Alignment:
Q  217 aaatgcaat-atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  23021513 aaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgctttagaatggttaaagaattcatcaggacataagtcctcaccgctgt 23021418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 98 - 204
Target Start/End: Original strand, 17702011 - 17702113
Alignment:
Q  98 atatatataaatgcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacac 197  Q
    |||||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||   ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17702011 atatatatgaatgtatatccaacatcaacatcaacca---gataataactgaaag-aacaaccgagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacac 17702106  T
Q  198 catctta 204  Q
    |||||||    
T  17702107 catctta 17702113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 296 - 406
Target Start/End: Original strand, 4106806 - 4106913
Alignment:
Q  296 agccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgc-aactccatgtgactccactataata 394  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || |    
T  4106806 agccctctccgctgttttatgcatatgccatggacc----tgtgtatgtctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgactccacttaaaca 4106901  T
Q  395 atatgtatgatt 406  Q
    | ||||||||||    
T  4106902 acatgtatgatt 4106913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23235171 - 23235037
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctc 258  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||  ||    |||||||||||||||||| |  || | |||||||||||    
T  23235171 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaaaaaataaaaatatgcatgtggtaccatattcaaggccgaagccctc 23235072  T
Q  259 accgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggac 292  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23235071 accgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggac 23235037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13128390 - 13128336
Alignment:
Q  256 ctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13128390 ctcaccacttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 13128336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 163 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5290384 - 5290254
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||| |  ||||  || ||||||    
T  5290384 gactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggacgtagccct 5290286  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcattcatcag 289  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  5290285 caccgctgtagaatggttaaagcattcatcag 5290254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 217 - 308
Target Start/End: Original strand, 25347072 - 25347167
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |  ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  25347072 aaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggtcgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacctaggccctcaccgct 25347167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 94520 - 94475
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94520 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 94475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 27767482 - 27767527
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27767482 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 27767527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 10470762 - 10470660
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatggaatgca-actccatgtgactccactataataatatgtatgattca 408  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || ||||||| ||||||||||   | || ||||||||||||    
T  10470762 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca-tacatactccatatgactccacttatacaacatgtatgattca 10470664  T
Q  409 ataa 412  Q
    ||||    
T  10470663 ataa 10470660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 14582927 - 14582972
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14582927 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaact 14582972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 286
Target Start/End: Original strand, 1592758 - 1592821
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  1592758 tatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtcgaatggttaaagcattcat 1592821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19300703 - 19300639
Alignment:
Q  290 gaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  19300703 gaccgaagccctcaccgct--tttatgcttatgcaattgacccacttatgtatatctacatacaact 19300639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19300846 - 19300787
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  19300846 atgcatgtggtaccatatcaggaccgaagccctcaccgctatagaatggttaaagcattc 19300787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Original strand, 24562217 - 24562368
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   |||     
T  24562217 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgaccca 24562315  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24562316 caccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 24562368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10464240 - 10464195
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  10464240 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 10464195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12447227 - 12447182
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12447227 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaact 12447182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 14133064 - 14133011
Alignment:
Q  304 ccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  14133064 ccgctgttttatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 14133011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17207769 - 17207724
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17207769 tttatgcatatgcaatggaccaactagtgtatatctacatacaact 17207724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23021380 - 23021335
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23021380 tttatgcatatgcaatggacccccttgtgtatatctacatacaact 23021335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 308
Target Start/End: Original strand, 25395999 - 25396086
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcacc-gcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  25395999 tatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccagatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 25396086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 29925817 - 29925862
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  29925817 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 29925862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 21724934 - 21724875
Alignment:
Q  229 catgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  21724934 catgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctatagaatggttaaagcattcat 21724875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13135964 - 13135929
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13135964 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 13135929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 14582034 - 14581975
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14582034 atgcatgtggtaccataacagggccgaggccctcaccgctatagaatggttaaagcattc 14581975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Original strand, 19726606 - 19726668
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19726606 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 19726668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24514014 - 24513944
Alignment:
Q  217 aaatgcaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 284  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24514014 aaatgcaatatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctattcgaatggttaaagcattc 24513944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 23233544 - 23233502
Alignment:
Q  266 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23233544 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgct 23233502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 13128297 - 13128252
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  13128297 tttatggatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 13128252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 284
Target Start/End: Original strand, 15457455 - 15457524
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  15457455 aaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 15457524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 284
Target Start/End: Original strand, 15464050 - 15464119
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  15464050 aaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 15464119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 10583019 - 10582933
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  10583019 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 10582933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 306
Target Start/End: Original strand, 19449332 - 19449372
Alignment:
Q  266 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  19449332 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccg 19449372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 22798698 - 22798616
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  22798698 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcactgagtttgaatggttaaagtattcatcagggcataagccctcacc 22798616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 286
Target Start/End: Original strand, 22906984 - 22907027
Alignment:
Q  243 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22906984 caggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22907027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 8760605 - 8760544
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattc 284  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  8760605 atgcatgtggtaccataatcaggaccgaagccctcaccacttatcgaatggttaaagcattc 8760544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 8768191 - 8768145
Alignment:
Q  310 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8768191 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 8768145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 308
Target Start/End: Original strand, 17414038 - 17414080
Alignment:
Q  266 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  17414038 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 17414080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 308
Target Start/End: Original strand, 19451326 - 19451368
Alignment:
Q  266 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  19451326 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 19451368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 19472460 - 19472418
Alignment:
Q  266 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  19472460 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 19472418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 363
Target Start/End: Original strand, 13940556 - 13940609
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatg 363  Q
    ||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13940556 tttatgcatatgttatggacccaattgtgtatatctacatacaacatgaccatg 13940609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 308
Target Start/End: Original strand, 18786052 - 18786148
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattca-tcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||  ||| ||||||||||    
T  18786052 aaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggcagaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcatttattcaggacataagtcctcaccgct 18786148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 355
Target Start/End: Original strand, 19726765 - 19726810
Alignment:
Q  310 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 355  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19726765 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 19726810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 24412466 - 24412383
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  |  |||||||||||    
T  24412466 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcttcagagcataagccctcacc 24412383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 266 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14133180 - 14133140
Alignment:
Q  266 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccg 306  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  14133180 ttgaatgattaaagcattcatcagggcagaagccctcaccg 14133140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 14375489 - 14375426
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  14375489 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaaggattcat 14375426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 311 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 17027204 - 17027156
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaactga 358  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17027204 tttatgcttatgcaatgaactccacttgtgtatatctacatacaactga 17027156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 356
Target Start/End: Original strand, 18786230 - 18786274
Alignment:
Q  313 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18786230 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 18786274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 266 - 306
Target Start/End: Original strand, 19467858 - 19467898
Alignment:
Q  266 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccg 306  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  19467858 ttgaatggttaaagcattcattagggcctaagccctcaccg 19467898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20009058 - 20008998
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  20009058 tatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 20008998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Original strand, 24720594 - 24720680
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||    
T  24720594 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcatggcataagccctcaccgct 24720680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 142)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 14 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 30603202 - 30602778
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaa-catcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatgca 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30603202 atcaacaacacattatcttgtaatcatatatatgtataagtcacaaacaaccacaagcatcaacaacacaccatgatcacaatgaatatatataaatgca 30603103  T
Q  113 tattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttctt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30603102 tattcaacaccaacatcatccatcaggtaataactgaaatcaacacccaagactcatgcaaatgtcatgaccactgctaagacaccatcttagacttctt 30603003  T
Q  213 aatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttt 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |     || | ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  30603002 aatgaaatgtaatatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgctgttga--gcaactagtactc--caggaccgaagccctcaccgctgttt 30602907  T
Q  313 tatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataa 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||  || || ||||||||||||||||    
T  30602906 tatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactctatgtgactcaacttaaacaacatgtatgattcaataa 30602807  T
Q  413 ataacataca-ttcaaccatcatcagtat 440  Q
     || |||||| ||||||||||||||||||    
T  30602806 ttagcatacatttcaaccatcatcagtat 30602778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 11878853 - 11879152
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatat--atataaatgc 111  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11878853 atcaacaacactttatcttgtaaacaaatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccatgatcacaatgaatatatatataaatgc 11878952  T
Q  112 atattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 211  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11878953 atattcaacaccaacatcatccttcagaaaataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 11879052  T
Q  212 taatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11879053 taatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 11879152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 28 - 311
Target Start/End: Original strand, 32627197 - 32627482
Alignment:
Q  28 atcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatat--atataaatgcatattcaacaccaa 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  32627197 atcttgtaaacaaatatatgtataagtcacaagtaacaacaacatcaacaatacatcatgatcacaatgaatatatatataaatgcttattcaacaccaa 32627296  T
Q  126 catcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaat 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32627297 catcatccatcagaaaataactgacatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgttaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaat 32627396  T
Q  226 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32627397 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 32627482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 20 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11899689 - 11899396
Alignment:
Q  20 aacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatgcatattcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || | | | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11899689 aacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagccacaagcaacaacaacgacatcaatacaccaccatcacaatgaatatatataaatgcatattcaa 11899590  T
Q  120 caccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatga 217  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11899589 catcaacatcaaccatcagataataactgcaatcaacaaccaagactcatgcaaatgatatgacaacactgctaagacaccatcttagacttctcaatga 11899490  T
Q  218 aatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11899489 aatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 11899396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26114115 - 26113842
Alignment:
Q  39 atatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatgcatattcaacaccaacatcatccatcag 138  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  26114115 atatatatatataagttacaagcaacaacaacaacaacaatacaccatgatcacaatgaacatatataaatgtatattcaacaccaacatcatccatcaa 26114016  T
Q  139 ataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttctt-aatgaaatgcaatatgcatgtggta 237  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26114015 ttaataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaattgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaatatgcatgtggta 26113916  T
Q  238 ccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26113915 ccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 26113842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 20 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18437543 - 18437253
Alignment:
Q  20 aacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatgcatattcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  18437543 aacacatcatcttgtaaacatatatatgtacaagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccaccatcacaatgaacatata--aatgcatattcaa 18437446  T
Q  120 caccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatga 217  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18437445 catcaacatcaaccatcagataataactgtaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaccatcttagacttctcaatga 18437346  T
Q  218 aatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18437345 a-tgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcttcaggaccgaagccctcaccgctgtt 18437253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 20 - 311
Target Start/End: Original strand, 642342 - 642635
Alignment:
Q  20 aacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatgcatattcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | || | | | ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  642342 aacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagccacaagtaacaacaaaaacatcaatacaccaccattacaatgaatatatataaatgcatattcaa 642441  T
Q  120 caccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatga 217  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  642442 catcaacatcaaccatcagataataactgcaatcaacaaccaagactcatgcaaataacatgacaacactgctaagacaccatcttagacttctcaatga 642541  T
Q  218 aatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  642542 aatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgttgtt 642635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26090339 - 26090037
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatg--- 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| || ||| |||||||| ||| ||        
T  26090339 atcaacaacacattatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccataattacagtgaatataaatatataaca 26090240  T
Q  111 catattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttc 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090239 catattcaacaccaacatcatctatcagataacaactgaaatcaaccaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttc 26090140  T
Q  211 tt-aatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090139 ttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 26090040  T
Q  309 gtt 311  Q
    |||    
T  26090039 gtt 26090037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 42 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 17726688 - 17726419
Alignment:
Q  42 tatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatgcatattcaacaccaacatcatccatcagata 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17726688 tatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccaccatcacaatgaatatata--aatgcatattcaacatcaacatcaaccatcagata 17726591  T
Q  142 ataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtacc 239  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17726590 ataactgcaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaccatcttagacttctcaatgaaatgcaatatgcatgtggtacc 17726491  T
Q  240 aaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17726490 aaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcactgctgtt 17726419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26120728 - 26120455
Alignment:
Q  39 atatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatgcatattcaacaccaacatcatccatcag 138  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  26120728 atatatatatataagttacaagcagcaacaacaacaacaatacaccatgatcacaatgaacatatataaatgtatattcaacaccaacatcatccatcaa 26120629  T
Q  139 ataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttctt-aatgaaatgcaatatgcatgtggta 237  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26120628 ttaataactgaaatcaacaaccaagattcatgcaattgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaatatgcatgtggta 26120529  T
Q  238 ccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26120528 ccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcacgaccgaagccctcaccgctgtt 26120455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2026618 - 2026311
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatata------- 106  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||| |||||||||||||||           
T  2026618 atcaacaacacaaaatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccataatcccaatgaatatatatatacattt 2026519  T
Q  107 ---aatgcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatctt 203  Q
       ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2026518 ataaacacatattcagcaccaacatcatccatcagataataactgaaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccgctgctaagacaccatctt 2026419  T
Q  204 agacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 303  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2026418 agacttcttaatgaaatgcattatgcatgtggtaccaatcgggaccgaagccctcgccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 2026319  T
Q  304 ccgctgtt 311  Q
    ||||||||    
T  2026318 ccgctgtt 2026311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 42 - 311
Target Start/End: Original strand, 11339587 - 11339856
Alignment:
Q  42 tatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatgcatattcaacaccaacatcatccatcagata 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11339587 tatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccaccatcacaatgaatatata--aatgcatattcaacatcaacatcaaccatcagata 11339684  T
Q  142 ataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtacc 239  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  11339685 ataactgcaatcaacaactaagactcatgcacatgacatgacaacactgctaagacaccatcttagactcctcaatgaaatgcaatatgcatgtggtacc 11339784  T
Q  240 aaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11339785 aaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 11339856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11300034 - 11299740
Alignment:
Q  16 caacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatg---ca 112  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||| ||||||| | ||||| ||| ||    ||    
T  11300034 caacaacacattgtcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaaccacaacatcaacaatacaccataatcacaaggtatataaatatataacaca 11299935  T
Q  113 tattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttctt 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11299934 tattcaacaccaacatcatccaccagataa-aactgaaac--acaaccgagactcatgcaa-tgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttctt 11299839  T
Q  213 aatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11299838 aatgaaatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 11299740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 111 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11308300 - 11308104
Alignment:
Q  111 catattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11308300 catattcaacaccaacatcatccaccagataa-aactgaaac--acaaccgagactcatgcaa-tgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttc 11308205  T
Q  211 ttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11308204 ttaatgaaatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 11308105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 68 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5187574 - 5187330
Alignment:
Q  68 aacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatat----aaatgcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaag 163  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||    ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||| |||  |||||||||||    
T  5187574 aacatcaacaacacatcaagatcacaatgaatatatatgaataaatggatattcaacatcaacatcaac-atcagataa-aaccgaa--caacaaccaag 5187479  T
Q  164 actcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccg 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5187478 actcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttctaaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccg 5187379  T
Q  263 cttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5187378 cttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 5187330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 749622 - 749928
Alignment:
Q  16 caacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatga---------atatatata 106  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||         |||||||||    
T  749622 caacaacacattatcttgtagacatatataggtataagccacaagcaacaacaacatcaacaacacaccataatcacaatgagtataatatatatatata 749721  T
Q  107 aatg-catattcaacaccaacatcatcc-atcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatctta 204  Q
     ||  ||||||||||||||  | |||   ||||||||| |||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  749722 tatcacatattcaacaccagaaccattttatcagataacaactgaat--aaccactaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatctta 749819  T
Q  205 gacttcttaa-tgaaatgcaata-tgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctc 302  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  749820 gacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagccctc 749919  T
Q  303 accgctgtt 311  Q
    |||||||||    
T  749920 accgctgtt 749928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 153 - 311
Target Start/End: Original strand, 42058476 - 42058634
Alignment:
Q  153 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  42058476 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccgga 42058575  T
Q  253 gccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42058576 gccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 42058634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 40685157 - 40684849
Alignment:
Q  16 caacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatga-----------atatata 104  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||           |||||||    
T  40685157 caacaacacattatcttgtagacatatataggtataagccacaagcaacaacaacatcaacaacacaccataatcacaatgagtataatatatatatata 40685058  T
Q  105 taaatg-catattcaacaccaacatcatcc-atcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatct 202  Q
    || ||  ||||||||||||||  | |||   ||||||||| |||||||   | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40685057 tatatcacatattcaacaccagaaccattttatcagataacaactgaat--atccactaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatct 40684960  T
Q  203 tagacttcttaa-tgaaatgcaata-tgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccc 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40684959 tagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccc 40684860  T
Q  301 tcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||    
T  40684859 tcaccgctgtt 40684849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 98 - 311
Target Start/End: Original strand, 1317640 - 1317851
Alignment:
Q  98 atatatataaatgcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacac 197  Q
    |||||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||   ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1317640 atatatatgaatgtatatccaacatcaacatcaacca---gataataactgaaag-aacaaccgagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacac 1317735  T
Q  198 catcttagacttcttaa-tgaaatgcaata-tgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccga 295  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1317736 catcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccga 1317835  T
Q  296 agccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||    
T  1317836 agccctcaccgctgtt 1317851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 287 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 26113826 - 26113677
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26113826 caggaccgaagccctcaccgctgtttaatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 26113727  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatca 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26113726 ctataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatca 26113677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 291 - 436
Target Start/End: Original strand, 32627502 - 32627647
Alignment:
Q  291 accgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccactat 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32627502 accgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactat 32627601  T
Q  391 aataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatca 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32627602 aataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatca 32627647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 98 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 40923218 - 40923009
Alignment:
Q  98 atatatataaatgcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacac 197  Q
    |||||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40923218 atatatatgaatgtatatccaacatcaacatcaacca---gataataactgaaat-aacaaccgagactcatgcaaatgacatgaccattgctaagacac 40923123  T
Q  198 catcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaag 297  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40923122 catcttagacttctgaatgagatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaag 40923023  T
Q  298 ccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||| ||||    
T  40923022 ccctcaccgatgtt 40923009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 20 - 311
Target Start/End: Original strand, 33404447 - 33404738
Alignment:
Q  20 aacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatgcatattcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   ||  |   |||||||| | ||||||  ||| ||||||||     
T  33404447 aacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacaacatcagtatctctccatcacaataagtatata--aatacatattcat 33404544  T
Q  120 caccaacatca-tccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatg 216  Q
    || |||||||| |  ||||  ||| ||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33404545 caacaacatcaattaatcacgtaacaaccgcaatcaacaactaagactcatgcaagtgacatgactacactgctaagacaccatcttagacttctcaatg 33404644  T
Q  217 aaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
     | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33404645 ga-tgcaatatgcatgtggtaccaaataggaccgaagccgtcatcgcttttgaatggttaaagcattcataaggaccgaagccctcaccgctgtt 33404738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 153 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8197444 - 8197286
Alignment:
Q  153 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaa 252  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  8197444 caacaatcaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttctaaatgagatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccgga 8197345  T
Q  253 gccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8197344 gccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 8197286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 153 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8213515 - 8213357
Alignment:
Q  153 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaa 252  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  8213515 caacaatcaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttctaaatgagatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccgga 8213416  T
Q  253 gccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8213415 gccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 8213357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 287 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 26120439 - 26120290
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  26120439 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtggatatctacatacaactgaccatgcaatgcaacaacatgtgactcca 26120340  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatca 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26120339 ctataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatca 26120290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 160 - 311
Target Start/End: Original strand, 2281019 - 2281171
Alignment:
Q  160 caagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2281019 caagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctc 2281118  T
Q  259 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2281119 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 2281171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 48988323 - 48988007
Alignment:
Q  16 caacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatga------------------ 97  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||                      
T  48988323 caacaacacattatcttgtagacatatataggtataagccacaagcaacaacaacatcaacaacacaccataatcacaatgagtataatatatatatata 48988224  T
Q  98 -atatatataaatg-catattcaacaccaacatcatcc-atcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaaga 194  Q
     ||||||||| ||  ||||||||||||||  | |||   ||||||||| |||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48988223 tatatatatatatcacatattcaacaccagaaccattttatcagataacaactgaat--aaccactaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaaga 48988126  T
Q  195 caccatcttagacttcttaa-tgaaatgcaata-tgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggac 292  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48988125 caccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagggc 48988026  T
Q  293 cgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||    
T  48988025 cgaagccctcaccgctgtt 48988007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 160 - 311
Target Start/End: Original strand, 49150517 - 49150670
Alignment:
Q  160 caagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaa-tgaaatgcaata-tgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccct 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  49150517 caagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccct 49150616  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49150617 caccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 49150670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 160 - 311
Target Start/End: Original strand, 49157207 - 49157360
Alignment:
Q  160 caagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaa-tgaaatgcaata-tgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccct 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  49157207 caagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccct 49157306  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49157307 caccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 49157360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 287 - 440
Target Start/End: Original strand, 11879168 - 11879322
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11879168 caggaccgaagccctcaccgctgtttcatgcatatgcaatggacctacttgtttatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 11879267  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcagtat 440  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11879268 ctataataatatgtatgattatataagtaacatacatttcaaccatcatcagtat 11879322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 288 - 439
Target Start/End: Original strand, 33404755 - 33404907
Alignment:
Q  288 aggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccac 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  33404755 aggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgactccac 33404854  T
Q  388 tataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcagta 439  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  33404855 tttaacaatatgtatgattcaataattagcatacatttcaaccatcatcagta 33404907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 150 - 311
Target Start/End: Original strand, 2438806 - 2438969
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacagg 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2438806 aatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatgga-tgcaaatatgcatgtggtaccaaacagg 2438904  T
Q  247 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2438905 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 2438969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 150 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 13964252 - 13964089
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacagg 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13964252 aatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatgga-tgcaaatatgcatgtggtaccaaacagg 13964154  T
Q  247 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13964153 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 13964089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 287 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 17726403 - 17726250
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  17726403 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgattcca 17726304  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcagta 439  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  17726303 ctttaacaatatgtatgattcaataattagcatacatttcaaccatcatcagta 17726250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 287 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 18437237 - 18437084
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18437237 caggactgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgactcca 18437138  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcagta 439  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  18437137 ctttaacaatatgtatgattcaataattagcatacatttcaaccatcatcagta 18437084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 287 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 11899380 - 11899226
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  11899380 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgactcca 11899281  T
Q  387 ctataataatatgtatga-ttcaataaataacataca-ttcaaccatcatcagta 439  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  11899280 ctttaacaatatgtatgatttcaataattagcatacatttcaaccatcatcagta 11899226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 287 - 439
Target Start/End: Original strand, 11339872 - 11340025
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  11339872 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactcaatatgactcca 11339971  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcagta 439  Q
    || |||||||||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||    
T  11339972 ctttaataatatgtatgattcaacaattggcatacatttcaaccatcatcagta 11340025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 287 - 439
Target Start/End: Original strand, 642651 - 642803
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  642651 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaaatgaccatgcaatgcaactcaatatgactcca 642750  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcagta 439  Q
    || ||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  642751 ctttaacaatatgtatgattcaacaattgacatacattcaactatcatcagta 642803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 150 - 310
Target Start/End: Original strand, 46649692 - 46649854
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacagg 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46649692 aatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatgga-tgcaaatatgcatgtggtaccaaacagg 46649790  T
Q  247 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46649791 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccactgt 46649854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 111 - 311
Target Start/End: Original strand, 37285090 - 37285294
Alignment:
Q  111 catattcaacaccaacatcatc--catcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttaga 206  Q
    |||||||| || ||||||||||  |||||  ||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||    
T  37285090 catattcaccaacaacatcatcatcatcaagtaacaaccaaaatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttaga 37285189  T
Q  207 cttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  37285190 cttctcaatgga-tgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagggccgaagctctcacc 37285288  T
Q  306 gctgtt 311  Q
    ||||||    
T  37285289 gctgtt 37285294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 287 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 8197270 - 8197146
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8197270 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 8197171  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaata 411  Q
    ||  || || |||||||||||||||    
T  8197170 cttaaacaacatgtatgattcaata 8197146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 287 - 439
Target Start/End: Original strand, 2438985 - 2439139
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||    
T  2438985 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctatatacaactgaccatgcaatgcaactcattatgactcca 2439084  T
Q  387 ctataataa-tatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcagta 439  Q
    || |||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||    
T  2439085 ctttaataattatgtatgattcaatgattagcatacatttcaaccatcatcagta 2439139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 287 - 407
Target Start/End: Original strand, 749944 - 750064
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  749944 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaa 750043  T
Q  387 ctataataatatgtatgattc 407  Q
    || ||| || |||||||||||    
T  750044 ctttaacaacatgtatgattc 750064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 287 - 411
Target Start/End: Original strand, 1317867 - 1317991
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  1317867 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaa 1317966  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaata 411  Q
    ||  || || |||||||||||||||    
T  1317967 cttaaacaacatgtatgattcaata 1317991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 287 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 26090021 - 26089897
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  26090021 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaa 26089922  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaata 411  Q
    ||  || || |||||||||||||||    
T  26089921 cttaaacaacatgtatgattcaata 26089897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 163 - 311
Target Start/End: Original strand, 46174260 - 46174410
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 259  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46174260 gactcatgcaaatgatatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaaaccctca 46174358  T
Q  260 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46174359 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 46174410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 153 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20019917 - 20019758
Alignment:
Q  153 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||  | ||  | |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  20019917 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcgtcaa--atatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggacc 20019820  T
Q  250 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20019819 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 20019758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 287 - 440
Target Start/End: Original strand, 2281187 - 2281341
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcc 385  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||    
T  2281187 caggaccgaagccctcaccgctatttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgacacc 2281286  T
Q  386 actataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcagtat 440  Q
    |||  ||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  2281287 acttaaatgacatgtatgactcaataaatagcatacaatcaaccatcatcagtat 2281341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 40684833 - 40684713
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  40684833 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaa 40684734  T
Q  387 ctataataatatgtatgattc 407  Q
    ||  || || |||||||||||    
T  40684733 cttaaacaacatgtatgattc 40684713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 48987991 - 48987871
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  48987991 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaa 48987892  T
Q  387 ctataataatatgtatgattc 407  Q
    ||  || || |||||||||||    
T  48987891 cttaaacaacatgtatgattc 48987871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 40922993 - 40922894
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40922993 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 40922894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 287 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 11299724 - 11299626
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcc 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11299724 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcc 11299626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 287 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 11308088 - 11307990
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcc 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11308088 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcc 11307990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 287 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 5187314 - 5187189
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcc 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5187314 caggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgcgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcc 5187215  T
Q  386 actataataatatgtatgattcaata 411  Q
    |||  || || |||||||||||||||    
T  5187214 acttaaacaacatgtatgattcaata 5187189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 161 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2388795 - 2388644
Alignment:
Q  161 aagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgc-aatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||  | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2388795 aagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaa--atatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccct 2388698  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2388697 caccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 2388644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 299 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 13964061 - 13963935
Alignment:
Q  299 cctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgc-aactccatgtgactccactataataata 397  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||  || || |    
T  13964061 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgacaccacttaaacaaca 13963962  T
Q  398 tgtatgattcaataaataacatacatt 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  13963961 tgtatgattcaataaataacatacatt 13963935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16844051 - 16843958
Alignment:
Q  217 aaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16844051 aaatgcattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 16843958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 287 - 406
Target Start/End: Original strand, 49150686 - 49150806
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcc 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  49150686 caggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgacccc 49150785  T
Q  386 actataataatatgtatgatt 406  Q
    |||  | ||| ||||||||||    
T  49150786 acttaactaacatgtatgatt 49150806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 287 - 406
Target Start/End: Original strand, 49157376 - 49157496
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcc 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  49157376 caggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgacccc 49157475  T
Q  386 actataataatatgtatgatt 406  Q
    |||  | ||| ||||||||||    
T  49157476 acttaactaacatgtatgatt 49157496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 150 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 17468501 - 17468339
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgc-aatatgcatgtggtaccaaacagg 246  Q
    |||||||||  |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| || |||| ||| || ||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  17468501 aatcaacaaataagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttaaactcctcaa--atatgcaaatatgcatgtggtaccaaccagg 17468404  T
Q  247 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17468403 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcattaggaccgaagccctcaccgctgtt 17468339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 150 - 311
Target Start/End: Original strand, 17584713 - 17584875
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgc-aatatgcatgtggtaccaaacagg 246  Q
    |||||||||  |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| || |||| ||| || ||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  17584713 aatcaacaaataagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttaaactcctcaa--atatgcaaatatgcatgtggtaccaaccagg 17584810  T
Q  247 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17584811 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcattaggaccgaagccctcaccgctgtt 17584875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 287 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 20019742 - 20019614
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcc 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||    
T  20019742 caggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcatacaaactccatgtgactcc 20019643  T
Q  386 actataataatatgtatgattcaataaat 414  Q
    |||  || || ||||||||||||||||||    
T  20019642 acttaaaaaacatgtatgattcaataaat 20019614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 287 - 386
Target Start/End: Original strand, 42058650 - 42058750
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcc 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42058650 caggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcc 42058749  T
Q  386 a 386  Q
    |    
T  42058750 a 42058750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 184 - 311
Target Start/End: Original strand, 49158702 - 49158827
Alignment:
Q  184 cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 283  Q
    ||||||||||||| || |||||||| || ||  | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49158702 cactgctaagacaacaccttagactcctcaa--atatgcaatatgcatgtggtaccaaacatgaccaaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 49158799  T
Q  284 catcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49158800 catcatgaccgaagccctcaccgctgtt 49158827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 287 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 2026295 - 2026196
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2026295 caggaccgaagctctcaccgttgttttatgcatatggaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 2026196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Original strand, 19439302 - 19439396
Alignment:
Q  217 aaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19439302 aaatgcaattatgcatgtggtatcaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 19439396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 224 - 310
Target Start/End: Original strand, 23521000 - 23521086
Alignment:
Q  224 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23521000 atatgcatgtggtaccaaataggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 23521086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 304 - 424
Target Start/End: Original strand, 37285327 - 37285448
Alignment:
Q  304 ccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgc-aactccatgtgactccactataataatatgtat 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||  || || |||| |    
T  37285327 ccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaacttcatgtgacaccacttaaacaacatgtgt 37285426  T
Q  403 gattcaataaataacatacatt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  37285427 gattcaataaataacatacatt 37285448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12404250 - 12404086
Alignment:
Q  64 caacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatata------aatgcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaaca 157  Q
    ||||||||||||| | | |||| || ||||||||||| |||||      |||| |||| ||||| |||||||| | | ||||||||||||| ||| ||||    
T  12404250 caacaacatcaacaatacaccaagaccacaatgaatacatatatataagaatgtatatccaacatcaacatcaacaaccagataataactggaat-aaca 12404152  T
Q  158 accaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgca 223  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12404151 accgagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgca 12404086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 12461517 - 12461602
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12461517 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcatttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagcattcaccgctgt 12461602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Original strand, 13019698 - 13019792
Alignment:
Q  217 aaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  13019698 aaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcatgatcgaagtcctcaccgctgt 13019792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 15622091 - 15622212
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacagg 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  15622091 aatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatgga-tgcaaatatgcatgtggtaccaaatagg 15622189  T
Q  247 accgaagccctcaccgcttttga 269  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  15622190 accgaagccctcaccgctgttga 15622212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15086163 - 15086013
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| | ||||||||    
T  15086163 gactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggctgaagccct 15086065  T
Q  258 caccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  15086064 caccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgct 15086013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 299 - 371
Target Start/End: Original strand, 49158855 - 49158927
Alignment:
Q  299 cctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaa 371  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49158855 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaa 49158927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 223 - 388
Target Start/End: Original strand, 21757334 - 21757494
Alignment:
Q  223 aatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatg 322  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    ||  ||  ||  ||||||   || |||| ||||||||| |||||||||    
T  21757334 aatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctcaccgctgttgaacaactagtgc--tc--caggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatg 21757428  T
Q  323 caatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccact 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||    
T  21757429 caatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcatacaaactccatgtgactccact 21757494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 161 - 385
Target Start/End: Original strand, 37379869 - 37380089
Alignment:
Q  161 aagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||  | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37379869 aagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaa--atatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccct 37379966  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactg 357  Q
    ||||||| ||||     ||  ||  ||  ||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37379967 caccgctgttgagcaactagtgc--tc--caggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactg 37380061  T
Q  358 accatggaatgcaactccatgtgactcc 385  Q
    |||||| |    ||||||||||||||||    
T  37380062 accatgcatacaaactccatgtgactcc 37380089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 223 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 13453931 - 13453756
Alignment:
Q  223 aatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatg 322  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    ||  ||  ||  ||||||   || |||| ||||||||| |||||||||    
T  13453931 aatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctcaccgctgttgaacaactagtgc--tc--caggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatg 13453837  T
Q  323 caatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccactataataatatgtatg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  13453836 caatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcatacaaacttcatgtgactccacttaaataacatgtatg 13453756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Original strand, 32771430 - 32771580
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  |||||||| || |||||||| || ||  |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||    
T  32771430 gactcatgcaaatgacatgacaacaccactaagacaacaccttagactcctcaac-aaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccct 32771528  T
Q  258 caccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  32771529 caccgctgtttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 32771580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 163 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37244549 - 37244400
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgaccac--tgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||    
T  37244549 gactcatgcaactgacatgacaacattgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccct 37244451  T
Q  258 caccgct--tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccg 306  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  37244450 caccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccg 37244400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16952477 - 16952327
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctc 258  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||   |||||||||| ||||||| |  |||| |||||| ||||    
T  16952477 gactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaataaaagcaaatatgcatgcggtaccatattcagggccgaagacctc 16952378  T
Q  259 accgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||    
T  16952377 accgctgtttgaatggttaaagcattcttcaggacataagtcctcaccgct 16952327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 18958670 - 18958519
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    ||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| ||  |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||    
T  18958670 gactcatgcaactgacataacaacactgctaagacaacacattagacttctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccct 18958572  T
Q  258 caccgct--tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||    
T  18958571 caccgctgttttgaatggttaaagcattcatcatgacataagtcctcaccgct 18958519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 311 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 17468300 - 17468226
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcc 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||    
T  17468300 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcatacaaactccatgtgactcc 17468226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 311 - 385
Target Start/End: Original strand, 17584914 - 17584988
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcc 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||    
T  17584914 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcatacaaactccatgtgactcc 17584988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 311 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 2388605 - 2388553
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatg 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2388605 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatg 2388553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 223 - 308
Target Start/End: Original strand, 3327797 - 3327885
Alignment:
Q  223 aatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctttt-gaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  3327797 aatatgcatgtggtaccatattcagggccaaagccctcaccgctttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgct 3327885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 363
Target Start/End: Original strand, 46174449 - 46174502
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatg 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46174449 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacatgaccatg 46174502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 8213341 - 8213299
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatgga 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8213341 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatgga 8213299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 15838736 - 15838781
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15838736 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaact 15838781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16843920 - 16843875
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16843920 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaact 16843875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26289986 - 26289860
Alignment:
Q  184 cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaa 278  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||| |  || | || |||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  26289986 cactgctaagacaacaccttagacttctcaaggaa-tgcaattatgcatgtggtaccataatcaaggccaaagccctcaccgttgttttgaatggttaaa 26289888  T
Q  279 gcattcatcaggaccgaagccctcaccg 306  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  26289887 gcattcatcaggacataagtcctcaccg 26289860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 46649893 - 46649938
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46649893 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaact 46649938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Original strand, 4279898 - 4280049
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   |||     
T  4279898 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgaccca 4279996  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4279997 caccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 4280049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Original strand, 14431989 - 14432051
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14431989 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 14432051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Original strand, 15338826 - 15338888
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15338826 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 15338888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 15723392 - 15723330
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15723392 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 15723330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Original strand, 19616230 - 19616381
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   |||     
T  19616230 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgaccca 19616328  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19616329 caccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 19616381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 35962914 - 35962852
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  35962914 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 35962852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 12461640 - 12461685
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  12461640 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 12461685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 19439434 - 19439479
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19439434 tttatgcatattctatggacctacttgtgtatatctacatacaact 19439479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 23521124 - 23521169
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23521124 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 23521169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 30271831 - 30271786
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30271831 tttatgcatatgctgtggacctacttgtgtatatctacatacaact 30271786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 11220290 - 11220227
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11220290 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctatttgaatggttaaagcattcat 11220227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 14179185 - 14179099
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  14179185 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 14179099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15098143 - 15098057
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  15098143 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 15098057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15104520 - 15104434
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  15104520 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 15104434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 46682370 - 46682284
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  46682370 atgcatttggtaccaatttacaggacagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 46682284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 15711168 - 15711106
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  15711168 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaatcattcat 15711106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 16109243 - 16109181
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16109243 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 16109181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 30271910 - 30271871
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 264  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30271910 tatgcatgtggtatcaaacaggaccgaagccctcaccgct 30271871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Original strand, 11308991 - 11309073
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    |||||||||||||||    |||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11308991 atgcatgtggtaccattttacaggacataagccctcaccggattttgaatggttaaagcattca-caggaccgaagtcctcacc 11309073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Original strand, 11312299 - 11312381
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    |||||||||||||||    |||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11312299 atgcatgtggtaccattttacaggacataagccctcaccggattttgaatggttaaagcattca-caggaccgaagtcctcacc 11312381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 13019830 - 13019875
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13019830 tttatgcatatgttatggacccacttgtgtatatctacatacaact 13019875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 308
Target Start/End: Original strand, 46624841 - 46624928
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||| |   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  46624841 tatgcatgtggtaccgatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 46624928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 82254 - 82168
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||    
T  82254 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcactcatcagggcataagccctcaccgct 82168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15437783 - 15437697
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||    
T  15437783 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagctctcaccgct 15437697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 297 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16073993 - 16073934
Alignment:
Q  297 gccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16073993 gccctcaccgct-ttatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 16073934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Original strand, 1612623 - 1612685
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  1612623 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagcccccaccgctgtagaatggttaaagcattcat 1612685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Original strand, 6411821 - 6411883
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  6411821 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgtagaattgttaaagcattcat 6411883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 14281822 - 14281760
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14281822 atgcatgtggtaccataatcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 14281760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 286
Target Start/End: Original strand, 13678272 - 13678345
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  13678272 aaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcacctctaattgaatggttaaagcattcat 13678345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 356
Target Start/End: Original strand, 18607025 - 18607071
Alignment:
Q  310 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18607025 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 18607071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 286
Target Start/End: Original strand, 19145565 - 19145629
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19145565 tatgcatgtggtaccattttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcat 19145629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 283
Target Start/End: Original strand, 19599844 - 19599901
Alignment:
Q  228 gcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 283  Q
    ||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19599844 gcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcatt 19599901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20328426 - 20328365
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  20328426 tatgcatgtggtaccatatacaggaccgtagcccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 20328365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 286
Target Start/End: Original strand, 20744964 - 20745028
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20744964 tatgcatgtggtaccattttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcat 20745028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 290
Target Start/End: Original strand, 45185447 - 45185515
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcagg 290  Q
    |||||||||| |||||   ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  45185447 atgcatgtgggaccaatttacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatcagg 45185515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 284
Target Start/End: Original strand, 147057 - 147126
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  147057 aaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 147126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 284
Target Start/End: Original strand, 2965921 - 2965990
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  2965921 aaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 2965990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 14281662 - 14281617
Alignment:
Q  310 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 355  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14281662 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 14281617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 14320752 - 14320683
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  14320752 aaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccggagccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 14320683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 284
Target Start/End: Original strand, 14565698 - 14565767
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  14565698 aaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 14565767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 21232220 - 21232149
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  21232220 aaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc-ccgctaatgaatggttaaagcattcat 21232149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 284
Target Start/End: Original strand, 31154357 - 31154426
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  31154357 aaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccgaggccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 31154426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 35962754 - 35962709
Alignment:
Q  310 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 355  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35962754 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 35962709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Original strand, 10519836 - 10519922
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   |||||   |||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  10519836 atgcatgtggtaccaatttacagggaagaagccctcaccggatattaaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 10519922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Original strand, 12547171 - 12547257
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | ||| |||||||||  | |||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||    
T  12547171 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaatccctcaccggatattgaatggttaaagcatttatcagggcataagccctcaccgct 12547257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 16575608 - 16575546
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattca 285  Q
    |||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16575608 atgcatgtggtaccattttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattca 16575546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Original strand, 16590054 - 16590116
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattca 285  Q
    |||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16590054 atgcatgtggtaccattttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattca 16590116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Original strand, 23442259 - 23442321
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattca 285  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  23442259 atgcatgtggtaccaatttacagggcataagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattca 23442321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 29182229 - 29182169
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |  | | |||||||||||||||||    
T  29182229 tatgcatgtggtaccataacagggccgaagccctcatctttatagaatggttaaagcattc 29182169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 356
Target Start/End: Original strand, 32771662 - 32771706
Alignment:
Q  313 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  32771662 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 32771706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 132)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 10685880 - 10686179
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatat--atataaatgc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10685880 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatgtgtataagtcgcaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatatataaatgc 10685979  T
Q  112 atattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10685980 atattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 10686079  T
Q  212 taatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10686080 taatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 10686179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5582651 - 5582352
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatata--aatgc 111  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  5582651 atcaacaacactttatcttctaaacaaatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccatgatcacaatgaatatatatataaatgc 5582552  T
Q  112 atattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5582551 atattcaacaccaacatcatccatcagaaaataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 5582452  T
Q  212 taatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5582451 taatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 5582352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 40011346 - 40011047
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatata--aatgc 111  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  40011346 atcaacaatactttatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcagcaacaacatcaacaatacaccatgatcacaatgaatatatatacaaatgc 40011247  T
Q  112 atattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40011246 atattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcatcaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 40011147  T
Q  212 taatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40011146 taatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 40011047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 28 - 311
Target Start/End: Original strand, 43028790 - 43029075
Alignment:
Q  28 atcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatat--atataaatgcatattcaacaccaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  43028790 atcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccatgattacaatgaatatatatataaatgcatattcaacaccaa 43028889  T
Q  126 catcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43028890 catcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccattgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaat 43028989  T
Q  226 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43028990 atgcatgtggtaccaatcaagaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 43029075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18895367 - 18895070
Alignment:
Q  16 caacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatata--aatgcat 113  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18895367 caacaacactttatcttgtaaacaaatatatgtataagtcacaagtaacaacaatatcaacaatacaccatgatcacaatgaatatatatataaatgcat 18895268  T
Q  114 attcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttctta 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18895267 attcaacaccaacatcatccatcagaaaataactgacatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttctta 18895168  T
Q  214 atgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18895167 atgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagggctgaagccctcaccgctgtt 18895070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 20 - 311
Target Start/End: Original strand, 25852717 - 25853010
Alignment:
Q  20 aacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatgcatattcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | | | ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25852717 aacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagccacaagcaacaacaacaacatcaatacaccaccatcacaatgaatatatataaatgcacattcaa 25852816  T
Q  120 caccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatga 217  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25852817 catcaacatcaaccatcagataataactgcaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaccatcttagacttctcaatga 25852916  T
Q  218 aatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25852917 aatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 25853010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14615326 - 14615025
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatg--- 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||| ||||| ||| ||        
T  14615326 atcaacaacacattatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccataatcacaatggatataaatatataaca 14615227  T
Q  111 catattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttc 210  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14615226 catattcaacaccaatatcatctatcagataataaccgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttc 14615127  T
Q  211 ttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg 309  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14615126 ttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg 14615027  T
Q  310 tt 311  Q
    ||    
T  14615026 tt 14615025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 311
Target Start/End: Original strand, 25846082 - 25846378
Alignment:
Q  20 aacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacat---accatgatcacaatgaatatatataaatgcatatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||    ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25846082 aacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagccacaagcaacaacaacaacaacatcaatacaccaccatcacaatgaatatatataaatgcacatt 25846181  T
Q  117 caacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaa 214  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25846182 caacatcaacatcaaccatcagataataactgcaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaccatcttagacttctcaa 25846281  T
Q  215 tgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25846282 tgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgttgtt 25846378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 11994870 - 11995171
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatg--- 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| || ||| |||||||| ||| ||        
T  11994870 atcaacaacacattatcttgtaaacatatgtatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccataattacagtgaatataaatatataaca 11994969  T
Q  111 catattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttc 210  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11994970 catattcaacaccaacatcatttatcagataacaactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttc 11995069  T
Q  211 ttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg 309  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11995070 ttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg 11995169  T
Q  310 tt 311  Q
    ||    
T  11995170 tt 11995171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 82 - 311
Target Start/End: Original strand, 5454293 - 5454523
Alignment:
Q  82 accatgatcacaatgaatatatataaatgcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatg 181  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5454293 accatgatcacaatgaacatatataaatgtatattcaacaccaacatcatccatcaattaataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaattgacatg 5454392  T
Q  182 accactgctaagacaccatcttagacttctt-aatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagc 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5454393 accactgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagc 5454492  T
Q  281 attcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5454493 attcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 5454523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22248608 - 22248316
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatg--- 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |          ||||| ||||||||| ||||| ||| ||        
T  22248608 atcaacaacacattatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaatac---------accataatcacaatggatataaatatataaca 22248518  T
Q  111 catattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttc 210  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22248517 catattcaacaccaatatcatctatcagataataaccgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttc 22248418  T
Q  211 ttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg 309  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22248417 ttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg 22248318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 54 - 311
Target Start/End: Original strand, 15461246 - 15461506
Alignment:
Q  54 tcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaata----tatataaatgcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactga 149  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    |||||||||| || ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15461246 tcacaaggcacaacaacatcaacaacacaccatgatcataatgaatacatatatataaatgtatgttcaacatcaacctcatcaatcagataataactga 15461345  T
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 249  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  15461346 aa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcatcatgcatgtggtaccaatcaggacc 15461444  T
Q  250 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15461445 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 15461506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 84 - 311
Target Start/End: Original strand, 38013539 - 38013768
Alignment:
Q  84 catgatcacaatgaatatatataaat----gcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgaca 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38013539 catgatcacaatgaatatatataaataaatgtatattcaacatcaacatcatccatcagataa-aacggaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgaca 38013636  T
Q  180 tgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaag 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38013637 tgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaag 38013736  T
Q  280 cattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38013737 cattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 38013768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 68 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 17939202 - 17938959
Alignment:
Q  68 aacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatat----aaatgcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaag 163  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||    ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||| |||  |||||||||||    
T  17939202 aacatcaacaacacatcaagatcacaatgaatatatatgaataaatgtatattcaacatcaacatcaac-atcagataa-aaccgaa--caacaaccaag 17939107  T
Q  164 actcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  17939106 actcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgc 17939007  T
Q  264 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17939006 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 17938959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 287 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 18895054 - 18894905
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18895054 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 18894955  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatca 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18894954 ctataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatca 18894905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 98 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 37540243 - 37540033
Alignment:
Q  98 atatatataaatgcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacac 197  Q
    |||||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||   | ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37540243 atatatatgaatgtatatccaacatcaacatcaacca---ggtaataactgaaat-aacaaccgagacccatgcaaatgacatgaccactgctaagacac 37540148  T
Q  198 catcttagacttcttaatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37540147 catcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaa 37540048  T
Q  297 gccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||    
T  37540047 gccctcaccgctgtt 37540033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 98 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 37547787 - 37547577
Alignment:
Q  98 atatatataaatgcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacac 197  Q
    |||||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||   | ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37547787 atatatatgaatgtatatccaacatcaacatcaacca---ggtaataactgaaat-aacaaccgagacccatgcaaatgacatgaccactgctaagacac 37547692  T
Q  198 catcttagacttcttaatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaa 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37547691 catcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaa 37547592  T
Q  297 gccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||    
T  37547591 gccctcaccgctgtt 37547577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 287 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 5582336 - 5582182
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5582336 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 5582237  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcagtat 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5582236 ctataataatatgtatgattcaataaataacatacatttcaaccatcatcagtat 5582182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 287 - 436
Target Start/End: Original strand, 5454539 - 5454688
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  5454539 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgacttca 5454638  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatca 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5454639 ctataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatca 5454688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 99 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1111961 - 1111753
Alignment:
Q  99 tatatataaatgcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacacc 198  Q
    ||||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||   |||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1111961 tatatatgaatgtatatccaacatcaacatcaacca---gataataactaaaag-aacaaccgagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacacc 1111866  T
Q  199 atcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagc 298  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1111865 atcttagacttctgaatgagatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagc 1111766  T
Q  299 cctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||    
T  1111765 cctcaccgctgtt 1111753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 153 - 311
Target Start/End: Original strand, 30780942 - 30781099
Alignment:
Q  153 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaa 252  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30780942 caacaactaaaactcatgcaa-tgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaa 30781040  T
Q  253 gccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30781041 gccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaggccctcaccgctgtt 30781099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 287 - 436
Target Start/End: Original strand, 15461522 - 15461672
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15461522 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaacggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 15461621  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatca 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15461622 ctataataatatgtatgattcaataaataacatacatttcaaccatcatca 15461672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 160 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7508242 - 7508090
Alignment:
Q  160 caagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  7508242 caagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctc 7508143  T
Q  259 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7508142 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 7508090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 101 - 311
Target Start/End: Original strand, 19507986 - 19508197
Alignment:
Q  101 tatataaatgcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacacc 198  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||  |||||  ||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  19507986 tatataaatacatattcatcaacaacatcaatcatcaagtaacaaccgcaatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaac 19508085  T
Q  199 atcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagc 298  Q
    | ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19508086 accttagacttctcaatgga-tgcaatatacatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagc 19508184  T
Q  299 cctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||    
T  19508185 cctcaccgctgtt 19508197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 160 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14889219 - 14889067
Alignment:
Q  160 caagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  14889219 caagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttctgaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctc 14889120  T
Q  259 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14889119 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 14889067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 160 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 24795243 - 24795091
Alignment:
Q  160 caagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  24795243 caagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggtcctc 24795144  T
Q  259 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24795143 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 24795091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 160 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 24800610 - 24800458
Alignment:
Q  160 caagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  24800610 caagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggtcctc 24800511  T
Q  259 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24800510 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 24800458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 287 - 436
Target Start/End: Original strand, 30781115 - 30781265
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30781115 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 30781214  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatca 436  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  30781215 ctttaacaatatgtatgattcaataattaacatacatttcaaccatcatca 30781265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 160 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14882542 - 14882390
Alignment:
Q  160 caagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  14882542 caagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttctgaatgagatgcaattatgcatgcggtaccaatcaggaccgaggccctc 14882443  T
Q  259 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14882442 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 14882390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 287 - 440
Target Start/End: Original strand, 43029091 - 43029245
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43029091 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 43029190  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcagtat 440  Q
    ||  || || |||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||    
T  43029191 cttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttaaatcatcatcagtat 43029245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 287 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 40011031 - 40010877
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40011031 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatgaacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 40010932  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcagtat 440  Q
    ||  || || |||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||    
T  40010931 cttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttaaatcatcatcagtat 40010877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 311
Target Start/End: Original strand, 597150 - 597308
Alignment:
Q  153 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 250  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||  ||||||||||||| || |||||||| || ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  597150 caacaaccaagactcatgcaaacgatacgacgacactgctaagacaacaccttagactcctcaa--atatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 597247  T
Q  251 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  597248 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 597308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 311
Target Start/End: Original strand, 22507434 - 22507594
Alignment:
Q  153 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggacc 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22507434 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaat-agatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggacc 22507532  T
Q  250 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22507533 aaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 22507594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 150 - 424
Target Start/End: Original strand, 20347059 - 20347332
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacagg 246  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  20347059 aatcaacaactaagactcatgcaaatgacaagacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatgga-tgcaaatatgcatgtggtaccaaacaag 20347157  T
Q  247 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatct 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||     ||  | | ||  ||||||   |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20347158 accgaagccctcaccgctgttgagcaacta--gtactc--caggacatgaatcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatct 20347253  T
Q  347 acatacaactgaccatggaatgc-aactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacatt 424  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||  || || |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20347254 acatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgacaccacttaaacaacatgtgtgattcaataaataacatccatt 20347332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 287 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 1111737 - 1111613
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1111737 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 1111638  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaata 411  Q
    ||  || || |||||||||||||||    
T  1111637 cttaaacaacatgtatgattcaata 1111613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 287 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 7508074 - 7507920
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcc 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||    
T  7508074 caggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgacacc 7507975  T
Q  386 actataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcagtat 440  Q
    |||  ||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  7507974 acttaaatgacatgtatgactcaataaatagcatacaatcaaccatcatcagtat 7507920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 287 - 440
Target Start/End: Original strand, 10686195 - 10686348
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||    
T  10686195 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatacaatgcaacttcatgtgattcca 10686294  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcagtat 440  Q
    || ||| || |||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||    
T  10686295 ct-taacaacatgtatgattcaataattaacatacatttaaatcatcatcagtat 10686348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 153 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19800574 - 19800415
Alignment:
Q  153 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 249  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19800574 caacaaccaagactcatgcaa-tgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 19800477  T
Q  250 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19800476 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagccctcaccgctgtt 19800415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 287 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 14615009 - 14614888
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14615009 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 14614910  T
Q  387 ctataataatatgtatgattca 408  Q
    ||  || || ||||||||||||    
T  14614909 cttaaacaacatgtatgattca 14614888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 150 - 424
Target Start/End: Original strand, 20340455 - 20340728
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacagg 246  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  20340455 aatcaacaactaagactcatgcaaatgacaagacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatgga-tgcaaatatgcatgtggtaccaaacaag 20340553  T
Q  247 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatct 346  Q
    ||||||||| |||||||| ||||     ||  | | ||  ||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20340554 accgaagccatcaccgctgttgagcaacta--gtactc--caggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatgaacctacttgtgtatatct 20340649  T
Q  347 acatacaactgaccatggaatgc-aactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacatt 424  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||  || || |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20340650 acatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgacaccacttaaacaacatgtgtgattcaataaataacatccatt 20340728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 287 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 24795075 - 24794974
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24795075 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 24794976  T
Q  387 ct 388  Q
    ||    
T  24794975 ct 24794974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 287 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 24800442 - 24800341
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24800442 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 24800343  T
Q  387 ct 388  Q
    ||    
T  24800342 ct 24800341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 439
Target Start/End: Original strand, 25846394 - 25846549
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactc--catgtgactc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   || ||||||    
T  25846394 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactcaatatatgactc 25846493  T
Q  385 cactataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcagta 439  Q
    |||| ||| || ||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||    
T  25846494 cactttaacaacatgtatgattcaacaattggcatacatttcaaccatcatcagta 25846549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 22248300 - 22248201
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22248300 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 22248201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 37540017 - 37539918
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37540017 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 37539918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 37547561 - 37547462
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37547561 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 37547462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 386
Target Start/End: Original strand, 38013784 - 38013883
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38013784 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 38013883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 287 - 388
Target Start/End: Original strand, 24008102 - 24008203
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24008102 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacatgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 24008201  T
Q  387 ct 388  Q
    ||    
T  24008202 ct 24008203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 287 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 14882374 - 14882254
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcc 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14882374 caggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcc 14882275  T
Q  386 actataataatatgtatgatt 406  Q
    |||  | ||| ||||||||||    
T  14882274 acttaactaacatgtatgatt 14882254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 287 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 14889051 - 14888931
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcc 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14889051 caggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcc 14888952  T
Q  386 actataataatatgtatgatt 406  Q
    |||  | ||| ||||||||||    
T  14888951 acttaactaacatgtatgatt 14888931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 153 - 311
Target Start/End: Original strand, 22500856 - 22501013
Alignment:
Q  153 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggacc 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||    ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22500856 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactc---aat-agatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggacc 22500951  T
Q  250 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22500952 aaaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 22501013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 288 - 386
Target Start/End: Original strand, 11995188 - 11995286
Alignment:
Q  288 aggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11995188 aggaccgaagccctcaccgcagttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 11995286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 287 - 409
Target Start/End: Original strand, 25853026 - 25853150
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactc--catgtgactc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   || ||||||    
T  25853026 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactcaatatatgactc 25853125  T
Q  385 cactataataatatgtatgattcaa 409  Q
    |||| ||| || |||||||||||||    
T  25853126 cactttaacaacatgtatgattcaa 25853150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 287 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 17938943 - 17938843
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcc 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17938943 caggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcc 17938844  T
Q  386 a 386  Q
    |    
T  17938843 a 17938843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5341878 - 5341793
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5341878 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 5341793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 20990300 - 20990385
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20990300 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 20990385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41878164 - 41878079
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41878164 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 41878079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Original strand, 24057590 - 24057684
Alignment:
Q  217 aaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24057590 aaatgcaattatgcatgtggtaccaaataggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 24057684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 224 - 310
Target Start/End: Original strand, 26650400 - 26650486
Alignment:
Q  224 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26650400 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 26650486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 224 - 310
Target Start/End: Original strand, 26921985 - 26922071
Alignment:
Q  224 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26921985 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 26922071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 28260033 - 28259948
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28260033 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 28259948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 150 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 29746787 - 29746583
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacagg 246  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29746787 aatcaacaattaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagg 29746689  T
Q  247 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatct 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||     ||  ||  ||  ||||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29746688 accgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgc--tc--caggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatct 29746593  T
Q  347 acatacaact 356  Q
    ||||||||||    
T  29746592 acatacaact 29746583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23081908 - 23081813
Alignment:
Q  217 aaatgcaat-atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23081908 aaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 23081813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7773807 - 7773723
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7773807 tatgcatgtggtaccaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 7773723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 225 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16775202 - 16775121
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccg 306  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16775202 tatgcatgtggcaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccg 16775121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 225 - 306
Target Start/End: Original strand, 37566037 - 37566118
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccg 306  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37566037 tatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccg 37566118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23076460 - 23076365
Alignment:
Q  217 aaatgcaat-atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076460 aaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgtttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 23076365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 25419819 - 25419905
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25419819 tatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccaaagccctcaccgctgt 25419905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18941373 - 18941288
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  18941373 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagccctcgccgctgt 18941288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23545030 - 23544935
Alignment:
Q  217 aaatgcaat-atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23545030 aaatgcaattatgcatgcggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgt 23544935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 137
Target Start/End: Original strand, 24007959 - 24008085
Alignment:
Q  14 atcaacaac-acatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatat--aaatg 110  Q
    ||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  24007959 atcaacaaccacttcatctggcaaacatatatatgtataagtcactagcaacaacaacatcaacagtacaccatgatcacaatgaatatatatacaattg 24008058  T
Q  111 catattcaacaccaacatcatccatca 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  24008059 catattcaacaccaacatcatccatca 24008085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 153 - 388
Target Start/End: Original strand, 18566509 - 18566740
Alignment:
Q  153 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||  | |||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  18566509 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaa--atatgcaaatatgcatgtggtaccagacatgacc 18566606  T
Q  250 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctaca 349  Q
    ||||||||||||||| ||||     ||  ||  ||  ||||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18566607 gaagccctcaccgctgttgagcaactagtgc--tc--caggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctaca 18566701  T
Q  350 tacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccact 388  Q
    ||||| |||||||| |    |||||| ||||||||||||    
T  18566702 tacaattgaccatgcatacaaactccttgtgactccact 18566740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 39609041 - 39608947
Alignment:
Q  217 aaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  39609041 aaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcatgatcgaagtcctcaccgctgt 39608947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 299 - 406
Target Start/End: Original strand, 19508225 - 19508333
Alignment:
Q  299 cctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgc-aactccatgtgactccactataataata 397  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || || |    
T  19508225 cctctccgctgttttatgcatatgccatagacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgactccacttaaacaaca 19508324  T
Q  398 tgtatgatt 406  Q
    |||||||||    
T  19508325 tgtatgatt 19508333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Original strand, 19362588 - 19362683
Alignment:
Q  217 aaatgcaat-atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  19362588 aaatgcaatcatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctgt 19362683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19802054 - 19801959
Alignment:
Q  217 aaatgcaat-atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  19802054 aaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctgt 19801959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 299 - 439
Target Start/End: Original strand, 597336 - 597477
Alignment:
Q  299 cctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgc-aactccatgt-gactccactataataat 396  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||| ||| ||     
T  597336 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatataaactccactttaacaac 597435  T
Q  397 atgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcagta 439  Q
    ||||||| || |||||  | ||||||||||  |||||||||||    
T  597436 atgtatggtt-aataataagcatacattcagtcatcatcagta 597477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 27636119 - 27635969
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||| || ||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||    
T  27636119 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aagtgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccct 27636021  T
Q  258 caccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  27636020 caccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgct 27635969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 311 - 414
Target Start/End: Original strand, 22501052 - 22501155
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaat 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||  || || || |||||||||||    
T  22501052 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcatacaaactccatgtgactccacttaaacaacatatatgattcaat 22501151  T
Q  411 aaat 414  Q
    ||||    
T  22501152 aaat 22501155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 311 - 414
Target Start/End: Original strand, 22507633 - 22507736
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaat 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||  || || || |||||||||||    
T  22507633 tttatgcatatgcaatggacctacttgtatatatctacatacaactgaccatgcatacaaactccatgtgactccacttaaacaacatctatgattcaat 22507732  T
Q  411 aaat 414  Q
    ||||    
T  22507733 aaat 22507736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 163 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 24751772 - 24751642
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||    
T  24751772 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgtagccct 24751674  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcattcatcag 289  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24751673 caccgctgtagaatggttaaagcattcatcag 24751642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 24669234 - 24669104
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||| |  ||||  || ||||||    
T  24669234 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggtcgtagccct 24669136  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcattcatcag 289  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24669135 caccgctgtagaatggttaaagcattcatcag 24669104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 24739003 - 24738873
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||| |  ||||  || ||||||    
T  24739003 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggtcgtagccct 24738905  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcattcatcag 289  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24738904 caccgctgtagaatggttaaagcattcatcag 24738873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 311 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 16775078 - 16774978
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatggaatgca-actccatgtgactccactataataatatgtatgattca 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || || ||||||| ||||||||||  ||||| |||||| |||||    
T  16775078 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccat-gcatacatactccatatgactccacttaaataacatgtataattca 16774980  T
Q  409 at 410  Q
    ||    
T  16774979 at 16774978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 307 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19800379 - 19800330
Alignment:
Q  307 ctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19800379 ctgttttatgcatatgcagtggacctacttgtgtatatctacatacaact 19800330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 37566161 - 37566206
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37566161 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 37566206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 41878040 - 41877995
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41878040 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 41877995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5341755 - 5341710
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5341755 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaact 5341710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 19362721 - 19362766
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19362721 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaact 19362766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23076327 - 23076282
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23076327 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaact 23076282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23081775 - 23081730
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23081775 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaact 23081730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23544897 - 23544852
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23544897 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaact 23544852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 41877949 - 41877911
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41877949 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 41877911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18941250 - 18941205
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18941250 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaact 18941205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19801921 - 19801876
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19801921 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaact 19801876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 20990424 - 20990469
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  20990424 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 20990469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 22379604 - 22379649
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22379604 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 22379649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 28259909 - 28259864
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  28259909 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 28259864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 41877870 - 41877825
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  41877870 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 41877825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 264
Target Start/End: Original strand, 22379524 - 22379564
Alignment:
Q  224 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22379524 atatgcatgtggtaccaaacaggaccaaagccctcaccgct 22379564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 23444380 - 23444294
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  23444380 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 23444294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 758427 - 758365
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  758427 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 758365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22313005 - 22312943
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22313005 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22312943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22509346 - 22509284
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    |||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22509346 atgcatgtggtaccaaaatcaagaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22509284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23112775 - 23112708
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||| ||| ||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23112775 caggaccgaggccatcaccgct--tttatgcttatgcaaatgacccacttgtgtatatctacatacaact 23112708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 356
Target Start/End: Original strand, 34829169 - 34829236
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||| | ||||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34829169 caggaccgaggtcctcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 34829236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 25419943 - 25419988
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25419943 tttatgcatatgttatggacccacttgtgtatatctacatacaact 25419988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Original strand, 427215 - 427301
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||    
T  427215 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcatggcataagccctcaccgct 427301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 23561788 - 23561702
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  23561788 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 23561702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 433
Target Start/End: Original strand, 26650524 - 26650650
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatggaatgca-actccatgtgactccactata-ataatatgtatgattc 407  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||| | || ||  || ||| |||||||| | || | || |||||||||||    
T  26650524 tttatgcatatgctatggactcactcgtgtatatctacatacaacttgaccat-gcatacattcttcatatgactccaatttacacaacatgtatgattc 26650622  T
Q  408 aataaat--aacatacattcaaccatca 433  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||    
T  26650623 aataaataaaacatacattcaaccatca 26650650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 433
Target Start/End: Original strand, 26922109 - 26922235
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatggaatgca-actccatgtgactccactata-ataatatgtatgattc 407  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||| | || ||  || ||| |||||||| | || | || |||||||||||    
T  26922109 tttatgcatatgctatggactcactcgtgtatatctacatacaacttgaccat-gcatacattcttcatatgactccaatttacacaacatgtatgattc 26922207  T
Q  408 aataaat--aacatacattcaaccatca 433  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||    
T  26922208 aataaataaaacatacattcaaccatca 26922235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Original strand, 20937594 - 20937656
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  20937594 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgatgtagaatggttaaagcattcat 20937656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 21574195 - 21574110
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgc 307  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  21574195 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatagttaaagcattcatcagggcctaagccatcaccgc 21574110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 356
Target Start/End: Original strand, 24057724 - 24057767
Alignment:
Q  313 tatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  24057724 tatgcatatgctatggacccacttgtgtatatcaacatacaact 24057767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 308
Target Start/End: Original strand, 21829546 - 21829588
Alignment:
Q  266 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  21829546 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 21829588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 305
Target Start/End: Original strand, 21888550 - 21888630
Alignment:
Q  229 catgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    |||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  21888550 catgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcttcagggcataagccctcacc 21888630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 7773684 - 7773639
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  7773684 tttatgcatatgaaatggacccactcgtgtatttctacatacaact 7773639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 284
Target Start/End: Original strand, 19235837 - 19235906
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  19235837 aaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 19235906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 355
Target Start/End: Original strand, 20937754 - 20937799
Alignment:
Q  310 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 355  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20937754 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 20937799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22312846 - 22312801
Alignment:
Q  310 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 355  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22312846 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 22312801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 284
Target Start/End: Original strand, 22466716 - 22466785
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  22466716 aaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 22466785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 24617846 - 24617806
Alignment:
Q  264 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24617846 ttttgaatggttaaagcattca-caggaccgaagtcctcacc 24617806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 24714077 - 24714037
Alignment:
Q  264 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24714077 ttttgaatggttaaagcattca-caggaccgaagtcctcacc 24714037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 24747105 - 24747065
Alignment:
Q  264 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24747105 ttttgaatggttaaagcattca-caggaccgaagtcctcacc 24747065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28371612 - 28371543
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  28371612 aaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 28371543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 38145939 - 38145870
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  38145939 aaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 38145870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 39608909 - 39608864
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  39608909 tttatgcatatgttatggactcacttgtgtatatctacatacaact 39608864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 284
Target Start/End: Original strand, 42960072 - 42960141
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  42960072 aaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 42960141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 356
Target Start/End: Original strand, 10035266 - 10035325
Alignment:
Q  295 aagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||   |||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10035266 aagccctcaccgct---ttatgtttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 10035325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Original strand, 20843142 - 20843228
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||    
T  20843142 atgcatgtggtaccaatttacagggcaggagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataggccctcaccgct 20843228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23444211 - 23444167
Alignment:
Q  313 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23444211 tatgcttatgcaatggactctacttgtgtatatctacataaaact 23444167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 305
Target Start/End: Original strand, 25013621 - 25013677
Alignment:
Q  250 gaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  25013621 gaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcttcagggcataagccctcacc 25013677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 102)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16887642 - 16887343
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatata--aatgc 111  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16887642 atcaacaatactttatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccatgatcacaatgaatatatatatgaatgc 16887543  T
Q  112 atattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16887542 atattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagacacatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 16887443  T
Q  212 taatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16887442 taatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 16887343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14737167 - 14736866
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatat--gtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatata--aat 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  14737167 atcaacaacacattatcttgtaaacatatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccatgatcacaatgaatatatatataaat 14737068  T
Q  110 gcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagactt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737067 gcatattcaacaccaacatcatccatcagataattactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagactt 14736968  T
Q  210 cttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14736967 cttaatgaaatgcaatatgcatggggtaccaaacaggaccgacgccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg 14736868  T
Q  310 tt 311  Q
    ||    
T  14736867 tt 14736866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 35540835 - 35541134
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatat--atataaatgc 111  Q
    |||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  35540835 atcaacaatactttatcttgtaaacatacatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccatgatcacaatgaatatatatataaatgc 35540934  T
Q  112 atattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35540935 atattcaacaccaacatcatccatcatataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaagcgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 35541034  T
Q  212 taatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35541035 taatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccaaagccctcatcgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 35541134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 16 - 388
Target Start/End: Original strand, 799900 - 800270
Alignment:
Q  16 caacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatg---ca 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||| ||||| ||| ||    ||    
T  799900 caacaacacattatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccataatcacaatgtatataaatatataacaca 799999  T
Q  113 tattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttctt 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  800000 tattcaacaccaacatcatccaccagataa-aactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttctt 800097  T
Q  213 aatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tt 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |     || | ||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  800098 aatgaaatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgctgttga--gcaactagtactc--caggaccgaagccctcaccgctgttt 800193  T
Q  312 ttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccact 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  800194 ttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccact 800270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 16 - 388
Target Start/End: Original strand, 851293 - 851663
Alignment:
Q  16 caacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatg---ca 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||| ||||| ||| ||    ||    
T  851293 caacaacacattatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccataatcacaatgtatataaatatataacaca 851392  T
Q  113 tattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttctt 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  851393 tattcaacaccaacatcatccaccagataa-aactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttctt 851490  T
Q  213 aatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tt 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |     || | ||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  851491 aatgaaatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgctgttga--gcaactagtactc--caggaccgaagccctcaccgctgttt 851586  T
Q  312 ttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccact 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  851587 ttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccact 851663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 16 - 388
Target Start/End: Original strand, 213776 - 214146
Alignment:
Q  16 caacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatg---ca 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||| ||||| ||| ||    ||    
T  213776 caacaacacattatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccataatcacaatgtatataaatatataacaca 213875  T
Q  113 tattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttctt 212  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  213876 tattcaacaccaatatcatccaccagataa-aactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttctt 213973  T
Q  213 aatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tt 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |     || | ||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  213974 aatgaaatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgctgttga--gcaactagtactc--caggaccgaagccctcaccgctgttt 214069  T
Q  312 ttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccact 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  214070 ttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccact 214146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 16 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 238478 - 238108
Alignment:
Q  16 caacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatg---ca 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||| ||||| ||| ||    ||    
T  238478 caacaacacattatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccataatcacaatgtatataaatatataacaca 238379  T
Q  113 tattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttctt 212  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  238378 tattcaacaccaatatcatccaccagataa-aactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttctt 238281  T
Q  213 aatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tt 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |     || | ||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  238280 aatgaaatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgctgttga--gcaactagtactc--caggaccgaagccctcaccgctgttt 238185  T
Q  312 ttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccact 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  238184 ttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccact 238108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 16 - 388
Target Start/End: Original strand, 727399 - 727769
Alignment:
Q  16 caacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatg---ca 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||| ||||| ||| ||    ||    
T  727399 caacaacacattatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccataatcacaatgtatataaatatataacaca 727498  T
Q  113 tattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttctt 212  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  727499 tattcaacaccaatatcatccaccagataa-aactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttctt 727596  T
Q  213 aatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg-tt 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |     || | ||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  727597 aatgaaatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgctgttga--gcaactagtactc--caggaccgaagccctcaccgctgttt 727692  T
Q  312 ttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccact 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  727693 ttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccact 727769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27909928 - 27909629
Alignment:
Q  16 caacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatg---ca 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| || ||| |||||||| ||  ||    ||    
T  27909928 caacaacacattatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccataattacagtgaatataaatttataacaca 27909829  T
Q  113 tattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttctt 212  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27909828 tattcaacaccaacatcatctatcagataacaactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttctt 27909729  T
Q  213 aatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27909728 aatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 27909629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27956347 - 27956048
Alignment:
Q  16 caacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatg---ca 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| || ||| |||||||| ||  ||    ||    
T  27956347 caacaacacattatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccataattacagtgaatataaatttataacaca 27956248  T
Q  113 tattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttctt 212  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27956247 tattcaacaccaacatcatctatcagataacaactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttctt 27956148  T
Q  213 aatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27956147 aatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 27956048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 36800790 - 36800487
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatg--- 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| || ||| |||||||| ||| ||        
T  36800790 atcaacaacacattatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatccaccataattacagtgaatataaatatatataa 36800691  T
Q  111 --catattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagact 208  Q
      |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36800690 cacatattcaacaccaacatcatctatcagataacaactgaaaccaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagact 36800591  T
Q  209 tcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgc 307  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36800590 tcttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgc 36800491  T
Q  308 tgtt 311  Q
    ||||    
T  36800490 tgtt 36800487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13362305 - 13362098
Alignment:
Q  16 caacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatgcatat 115  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13362305 caacaacacattgtcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaaccacaacatcaaccatacaccatgatcacaatgaatatatataaatgcatat 13362206  T
Q  116 tcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13362205 tcaacaccaacatcatccatcagttaataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaat 13362106  T
Q  216 gaaatgca 223  Q
    ||||||||    
T  13362105 gaaatgca 13362098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23225081 - 23224792
Alignment:
Q  20 aacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatgcatattcaa 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||   ||||||||  |  ||||||||| ||||||||     
T  23225081 aacacatcatcttgcaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcatcaatatacctccatcacaat--aagtatataaatacatattcat 23224984  T
Q  120 caccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatga 217  Q
    || ||||||||  |||||  ||| ||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  23224983 catcaacatcaatcatcaagtaacaaccgcaatcaacaactacgactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaccatcttagacttctcaatg- 23224885  T
Q  218 aatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23224884 gatgcaatatgcatgtggtacc-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagcactcaccgctgtt 23224792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 104 - 311
Target Start/End: Original strand, 14765470 - 14765673
Alignment:
Q  104 ataaatgcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatctt 203  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14765470 ataaatgtatattcaacatcaacatcaac-atcagataa-aaccgaa--caacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatctt 14765565  T
Q  204 agacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 303  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14765566 agacttcttaatgaaatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatctggaccgaagccctca 14765665  T
Q  304 ccgctgtt 311  Q
    ||||||||    
T  14765666 ccgctgtt 14765673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 68 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4521022 - 4520779
Alignment:
Q  68 aacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatat----aaatgcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaag 163  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||    ||||| |||||||||| |||||||| | || |||||| ||| |||  |||||||||||    
T  4521022 aacatcaacaacacatcaagatcacaatgaatatatatgaataaatgtatattcaacatcaacatcaac-ataagataa-aaccgaa--caacaaccaag 4520927  T
Q  164 actcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgc 263  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4520926 actcatgcagatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgc 4520827  T
Q  264 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4520826 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 4520779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9205703 - 9205395
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatat-atataaatgca 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||  ||| ||| ||||| ||| |    
T  9205703 atcaacaacacattatcttgtaaacatataaaggtataagtcacaagcatcaacaacatcaacaacacaccataatcaccttgagtatcatatatatgta 9205604  T
Q  113 tat---------tcaacaccaacatcatcc-atcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatct 202  Q
    |||         ||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9205603 tatatcacctattcaacaccaaattcatcttatcagataacaactgaat--aaccactaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatct 9205506  T
Q  203 tagacttcttaa-tgaaatgcaata-tgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccc 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9205505 tagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccc 9205406  T
Q  301 tcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||    
T  9205405 tcaccgctgtt 9205395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 155 - 311
Target Start/End: Original strand, 14563472 - 14563627
Alignment:
Q  155 acaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagc 254  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14563472 acaaccgagactcatgcaa-tgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagc 14563570  T
Q  255 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14563571 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 14563627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 160 - 311
Target Start/End: Original strand, 28980658 - 28980810
Alignment:
Q  160 caagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  28980658 caagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctc 28980757  T
Q  259 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28980758 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaaaccctcaccgctgtt 28980810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 160 - 311
Target Start/End: Original strand, 28985878 - 28986030
Alignment:
Q  160 caagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  28985878 caagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctc 28985977  T
Q  259 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28985978 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaaaccctcaccgctgtt 28986030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 150 - 311
Target Start/End: Original strand, 23117132 - 23117295
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacagg 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23117132 aatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatgga-tgcaaatatgcatgtggtaccaaacagg 23117230  T
Q  247 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23117231 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 23117295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 150 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10956893 - 10956730
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacagg 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10956893 aatcaacaactaagactcatgcaaatgtcatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatgga-tgcaaatatgcatgtggtaccaaacagg 10956795  T
Q  247 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956794 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 10956730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 287 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 16887327 - 16887191
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16887327 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 16887228  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacatacat 423  Q
    ||  || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16887227 cttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacat 16887191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 150 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14746727 - 14746565
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacagg 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||  | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14746727 aatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaa--atatgcaagtatgcatgtggtaccaaacagg 14746630  T
Q  247 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14746629 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccttcaccgctgtt 14746565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 287 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 23224776 - 23224623
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23224776 caggaacgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 23224677  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcagta 439  Q
    ||  || || |||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  23224676 cttaaacaacatgtatgattcaataattagcatacatttcaatcatcatcagta 23224623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 150 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26486228 - 26486065
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacagg 246  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26486228 aatcaataactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatgga-tgcaaatatgcatgtggtaccaaacagg 26486130  T
Q  247 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26486129 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcatgaccgaagccctcaccgctgtt 26486065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 150 - 311
Target Start/End: Original strand, 27345639 - 27345802
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacagg 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27345639 aatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacagg 27345737  T
Q  247 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27345738 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 27345802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 287 - 439
Target Start/End: Original strand, 35541150 - 35541303
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||     
T  35541150 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactcaatatgactccc 35541249  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcagta 439  Q
    || |||||||||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||    
T  35541250 ctttaataatatgtatgattcaacaattggcatacatttcaaccatcatcagta 35541303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 287 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 14736850 - 14736712
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14736850 caggaccgaagccctcaccgctattttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 14736751  T
Q  387 c-tataataatatgtatgattcaataaataacatacatt 424  Q
    | || || || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14736750 cttaaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatt 14736712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 287 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 9205379 - 9205255
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  9205379 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaa 9205280  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaata 411  Q
    ||  || || |||||||||||||||    
T  9205279 cttaaacaacatgtatgattcaata 9205255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 27909613 - 27909514
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27909613 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 27909514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 27956032 - 27955933
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27956032 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 27955933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 386
Target Start/End: Original strand, 28980826 - 28980925
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28980826 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 28980925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 386
Target Start/End: Original strand, 28986046 - 28986145
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28986046 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 28986145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 36800471 - 36800372
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36800471 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 36800372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 287 - 385
Target Start/End: Original strand, 14563643 - 14563741
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcc 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14563643 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcc 14563741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 287 - 386
Target Start/End: Original strand, 14765689 - 14765788
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14765689 caggaccgaagccctcaccactgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 14765788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 161 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 40144490 - 40144339
Alignment:
Q  161 aagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgc-aatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||  | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40144490 aagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaa--atatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccct 40144393  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40144392 caccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 40144339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 163 - 311
Target Start/End: Original strand, 3697580 - 3697729
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 259  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| || ||||||||||| ||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3697580 gactcatgcaaatgacattacaacaccgctaagacaacaccttagacttctcaa--atatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctca 3697677  T
Q  260 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3697678 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggtccgaagccctcaccgctgtt 3697729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 287 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 4520763 - 4520663
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcc 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4520763 caggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcc 4520664  T
Q  386 a 386  Q
    |    
T  4520663 a 4520663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 150 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3224891 - 3224728
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaa-tgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacag 245  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| || |||  ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3224891 aatccacaactacgactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaaatga--tgcaaatatacatgtggtaccaaacag 3224794  T
Q  246 gaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3224793 gaccgaagtcctcatcgcttttgaatagttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 3224728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 153 - 414
Target Start/End: Original strand, 6588040 - 6588298
Alignment:
Q  153 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggacc 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  6588040 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaat-agatgcaattatgcatgtggtaccaaccaggacc 6588138  T
Q  250 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctaca 349  Q
    ||||||||||||||| ||||     ||  ||  ||  ||||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6588139 gaagccctcaccgctgttgagcaactagtgc--tc--caggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctaca 6588233  T
Q  350 tacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaat 414  Q
    |||||||||||||| |    |||||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||    
T  6588234 tacaactgaccatgcatacaaactccatgtgactccacttaaacaacatctatgattcaataaat 6588298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 299 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 3224700 - 3224574
Alignment:
Q  299 cctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgc-aactccatgtgactccactataataata 397  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||  || || |    
T  3224700 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgacaccacttgaacaaca 3224601  T
Q  398 tgtatgattcaataaataacatacatt 424  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  3224600 tgtatgattcaataaatagcatacatt 3224574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 161 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16267066 - 16266915
Alignment:
Q  161 aagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| | || |||||||| || ||  | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16267066 aagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagaaaacaccttagactcctcaa--atatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccct 16266969  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16266968 caccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgtt 16266915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14416713 - 14416619
Alignment:
Q  217 aaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14416713 aaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 14416619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 307 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 26486029 - 26485895
Alignment:
Q  307 ctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgc-aactccatgtgactccactataataatatgtatgat 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||  || || |||||||||    
T  26486029 ctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaattgaccatgcaatgcaaactccatgtgacaccacttaaacaacatgtatgat 26485930  T
Q  406 tcaataaataacataca-ttcaaccatcatcagta 439  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  26485929 tcaataaataacatacacttcagtcatcatcagta 26485895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 224 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11392737 - 11392651
Alignment:
Q  224 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11392737 atatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagaattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 11392651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 299 - 406
Target Start/End: Original strand, 3697757 - 3697865
Alignment:
Q  299 cctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgc-aactccatgtgactccactataataata 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || || |    
T  3697757 cctcaccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgactccacttaaacaaca 3697856  T
Q  398 tgtatgatt 406  Q
    |||||||||    
T  3697857 tgtatgatt 3697865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 299 - 406
Target Start/End: Original strand, 23117323 - 23117431
Alignment:
Q  299 cctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgc-aactccatgtgactccactataataata 397  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || || |    
T  23117323 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgactccacttaaacaaca 23117422  T
Q  398 tgtatgatt 406  Q
    |||||||||    
T  23117423 tgtatgatt 23117431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 10948608 - 10948513
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgatt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||    
T  10948608 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 10948513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 299 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 10956702 - 10956595
Alignment:
Q  299 cctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccactataataatat 398  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || || ||    
T  10956702 cctctccgttgttttatgcatatgcaatggatctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaacaacat 10956603  T
Q  399 gtatgatt 406  Q
    ||||||||    
T  10956602 gtatgatt 10956595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 224 - 310
Target Start/End: Original strand, 29328194 - 29328280
Alignment:
Q  224 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29328194 atatgcatgtcgtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaagaccgaagccctcaccgctgt 29328280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 224 - 310
Target Start/End: Original strand, 43687398 - 43687484
Alignment:
Q  224 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43687398 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagtcctcaccgcttttgaacggttaaagtattcatcaggaccgaaaccctcaccgctgt 43687484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29299207 - 29299123
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29299207 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccgtc-ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaatccctcaccgctgt 29299123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29305753 - 29305669
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29305753 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc-ccgcttttgaatggtttaagcattcatcaggaccgaatccctcaccgctgt 29305669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 226 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25701697 - 25701613
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25701697 atgcatgtggtaccaaacaagaccgaagccctcaccgcttctgaatggttaaagcattcatcaggatcgtagccctcaccgctgt 25701613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 311 - 414
Target Start/End: Original strand, 27345841 - 27345944
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaat 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||    
T  27345841 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcatacaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgattcaat 27345940  T
Q  411 aaat 414  Q
    ||||    
T  27345941 aaat 27345944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 310 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 14746525 - 14746428
Alignment:
Q  310 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgc-aactccatgtgactccactataataatatgtatgatt 406  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || || ||||||||||    
T  14746525 ttttatgcatatgcaatcgacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatgtatgatt 14746428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 163 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 31418935 - 31418800
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||    
T  31418935 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccct 31418837  T
Q  258 caccgct--tttgaatggttaaagcattcatcaggac 292  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31418836 caccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggac 31418800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 163 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 31412753 - 31412618
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||    
T  31412753 gactcatgcaaatgacatgacaacactactaagacagcaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccct 31412655  T
Q  258 caccgct--tttgaatggttaaagcattcatcaggac 292  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31412654 caccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggac 31412618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 311 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 40144300 - 40144223
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccact 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||    
T  40144300 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcatacaaactccatgtgactccact 40144223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Original strand, 14563388 - 14563448
Alignment:
Q  16 caacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaac 76  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14563388 caacaacacattgtcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaaccacaacatcaac 14563448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 311 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 16266876 - 16266797
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgt--atatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccact 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||    
T  16266876 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatatctacatacaactgaccatgcatacaaactccatgtgactccact 16266797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 311 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 11392612 - 11392506
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatggaatgca-actccatgtgactccactataataatatgtatgattca 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || ||||||| ||||||||||   | || ||||||| ||||    
T  11392612 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca-tacatactccatatgactccacttatacaacatgtatggttca 11392514  T
Q  409 ataaataa 416  Q
    ||||||||    
T  11392513 ataaataa 11392506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 311 - 412
Target Start/End: Original strand, 27873877 - 27873979
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatggaatgca-actccatgtgactccactataataatatgtatgattca 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || ||||||| ||||||||||   | || ||||||||||||    
T  27873877 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca-tacatactccatatgactccacttatacaacatgtatgattca 27873975  T
Q  409 ataa 412  Q
    ||||    
T  27873976 ataa 27873979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 311 - 412
Target Start/End: Original strand, 27948665 - 27948767
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatggaatgca-actccatgtgactccactataataatatgtatgattca 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || ||||||| ||||||||||   | || ||||||||||||    
T  27948665 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca-tacatactccatatgactccacttatacaacatgtatgattca 27948763  T
Q  409 ataa 412  Q
    ||||    
T  27948764 ataa 27948767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 41242500 - 41242452
Alignment:
Q  20 aacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaaca 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41242500 aacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagccacaagcaacaaca 41242452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 354
Target Start/End: Original strand, 27890007 - 27890050
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27890007 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa 27890050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Original strand, 39363480 - 39363565
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||    
T  39363480 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaaacattcatcaggacccaggtcctcaccgct 39363565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 14416580 - 14416535
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14416580 tttatgcatatgcaatggacctactcgtgtatatctacatacaact 14416535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25701574 - 25701529
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25701574 tttatgcttatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 25701529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 29299085 - 29299040
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29299085 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaact 29299040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 29305631 - 29305586
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29305631 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaact 29305586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 21690611 - 21690529
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  21690611 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 21690529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 23653174 - 23653079
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||    
T  23653174 aaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcatttatcaggacataagtcctcaccgct 23653079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 346 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 808008 - 807966
Alignment:
Q  346 tacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccact 388  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  808008 tacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccact 807966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 240
Target Start/End: Original strand, 5240015 - 5240094
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgc-aatatgcatgtggtacca 240  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  5240015 gactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtacca 5240094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 216 - 308
Target Start/End: Original strand, 23653828 - 23653924
Alignment:
Q  216 gaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctttt-gaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||    
T  23653828 gaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattcattaggacataagtcctcaccgct 23653924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 29328319 - 29328364
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  29328319 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 29328364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Original strand, 19859506 - 19859592
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  19859506 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 19859592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22025762 - 22025700
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22025762 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22025700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Original strand, 22050201 - 22050263
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22050201 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22050263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Original strand, 22055719 - 22055781
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22055719 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22055781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Original strand, 22177586 - 22177648
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22177586 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22177648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 14057794 - 14057698
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc--atcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||    
T  14057794 aaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctatcgaatggttaaagcattcttatcaggacataagtcctcaccgct 14057698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 14594933 - 14594850
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcacc-gcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  14594933 atgcatgtggtaccaatctacagggcagaagccctcaccagatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 14594850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 21686287 - 21686220
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagg 290  Q
    ||||||||||||||||   | ||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21686287 atgcatgtggtaccaatttatagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcatcagg 21686220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 262
Target Start/End: Original strand, 27873797 - 27873834
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccg 262  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27873797 tatgcatgtggtaccaaacatgaccgaagccctcaccg 27873834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 262
Target Start/End: Original strand, 27889927 - 27889964
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccg 262  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27889927 tatgcatgtggtaccaaacatgaccgaagccctcaccg 27889964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 262
Target Start/End: Original strand, 27948585 - 27948622
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccg 262  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27948585 tatgcatgtggtaccaaacatgaccgaagccctcaccg 27948622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Original strand, 23825059 - 23825210
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| |  |||||||| || ||  |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   |||     
T  23825059 gactcatgcaaacgacatgacaacaccgctaagacaaccccttagactcctcaac-aaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgaccca 23825157  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  23825158 caccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 23825210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 38186096 - 38186053
Alignment:
Q  265 tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  38186096 tttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 38186053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 20784006 - 20783965
Alignment:
Q  266 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20784006 ttgaatggttaaagcattcatcaggacctaag-cctcaccgct 20783965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22063604 - 22063558
Alignment:
Q  310 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22063604 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 22063558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22176076 - 22176030
Alignment:
Q  310 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22176076 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 22176030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 356
Target Start/End: Original strand, 39363631 - 39363692
Alignment:
Q  295 aagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||||| ||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  39363631 aagccctcac-gcttttatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 39363692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 284
Target Start/End: Original strand, 21282055 - 21282119
Alignment:
Q  223 aatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 284  Q
    |||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  21282055 aatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattc 21282119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22063740 - 22063703
Alignment:
Q  249 cgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22063740 cgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22063703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 24321789 - 24321720
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  24321789 aaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 24321720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 36445932 - 36445849
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  36445932 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 36445849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 356
Target Start/End: Original strand, 20006386 - 20006430
Alignment:
Q  313 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  20006386 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 20006430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 21300354 - 21300291
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21300354 atgcatgtggtaccatattcagggtcgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 21300291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 41009637 - 41009574
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41009637 atgcatgtggtaccataatcagggccgaaaccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 41009574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 130)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 10767524 - 10767823
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatat--atataaatgc 111  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10767524 atcaacaacactttatcttgtaaacaaatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccatgatcacaatgaatatatatataaatgc 10767623  T
Q  112 atattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10767624 atattcaacaccaacatcatccatcagaaaataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 10767723  T
Q  212 taatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10767724 taatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 10767823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21151838 - 21151539
Alignment:
Q  16 caacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatata----aatgc 111  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  21151838 caacaacactttatcttgtaaacaaatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccatgatcacaatgaatatatatatataaatgc 21151739  T
Q  112 atattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21151738 atattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 21151639  T
Q  212 taatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21151638 taatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagggccgaagccctcaccgctgtt 21151539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 45611434 - 45611733
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatat--atataaatgc 111  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  45611434 atcaacaacactttatcttgtaaacaaatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccatgatcacaatgaatatatatataaatgc 45611533  T
Q  112 atattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45611534 atattcaacaccaacatcatccatcagaaagtaactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgccaagacaccatcttagacttct 45611633  T
Q  212 taatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45611634 taatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 45611733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 43724447 - 43724146
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatg--- 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| || ||| |||||||| ||  ||        
T  43724447 atcaacaacacattatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccataattacagtgaatataaatttataaca 43724348  T
Q  111 catattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttc 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43724347 catattcaacaccaacatcatctatcagataacaactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttc 43724248  T
Q  211 ttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg 309  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43724247 ttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctg 43724148  T
Q  310 tt 311  Q
    ||    
T  43724147 tt 43724146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 20 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 54833565 - 54833269
Alignment:
Q  20 aacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacat---accatgatcacaatgaatatatataaatgcatatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54833565 aacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagccacaagcaacaacaacaacaacatcaatacaccaccatcacaatgaatatatataaatgcatatt 54833466  T
Q  117 caacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaa 214  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  54833465 caacatcaacatcaaccatcagataataactgcaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacacttctaagacaccatcttagacttctcaa 54833366  T
Q  215 tgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54833365 tgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggactgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccttcaccgctgtt 54833269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2499438 - 2499126
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaa-catcaaccacataccatgatcacaatgaatatatata------ 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||          
T  2499438 atcaacaacacattatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaacaaaccacaaacatcaacaatacaccataatcacaatgaatatatatatatata 2499339  T
Q  107 ------aatgcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaa-tcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacacca 199  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2499338 tatataaatgcatattcaacaccaacatcatccatcaggtaataactgaaaatcaacaacccagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacacca 2499239  T
Q  200 tcttagacttcttaa-tgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagc 298  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2499238 tcttagacttcttaaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagc 2499139  T
Q  299 cctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||    
T  2499138 cctcaccgctgtt 2499126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 84 - 311
Target Start/End: Original strand, 10381777 - 10382006
Alignment:
Q  84 catgatcacaatgaatatatataaat----gcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgaca 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10381777 catgatcacaatgaatatatataaataaatgtatattcaacatcaacatcatccatcagataa-aactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgaca 10381874  T
Q  180 tgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaag 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10381875 tgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcattatgcatgtgataccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaag 10381974  T
Q  280 cattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10381975 cattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 10382006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 84 - 311
Target Start/End: Original strand, 10410430 - 10410659
Alignment:
Q  84 catgatcacaatgaatatatataaat----gcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgaca 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10410430 catgatcacaatgaatatatataaataaatgtatattcaacatcaacatcatccatcagataa-aactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgaca 10410527  T
Q  180 tgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaag 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10410528 tgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcattatgcatgtgataccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaag 10410627  T
Q  280 cattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10410628 cattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 10410659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 68 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 53571559 - 53571316
Alignment:
Q  68 aacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaat----gcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaag 163  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||    | |||||||||  |||||||| | ||||||||| ||| |||  |||||||||||    
T  53571559 aacatcaacaacacatcaagatcacaatgaatatatataaataaatgtatattcaacgtcaacatcaac-atcagataa-aaccgaa--caacaaccaag 53571464  T
Q  164 actcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgc 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53571463 actcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgc 53571364  T
Q  264 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53571363 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaggccctcaccgctgtt 53571316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 101 - 311
Target Start/End: Original strand, 29493413 - 29493620
Alignment:
Q  101 tatataaatgcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccat 200  Q
    ||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||   | ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29493413 tatatgaatgtatatccaacatcaacatcaacca---ggtaataaccgaaat-aacaaccgagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccat 29493508  T
Q  201 cttagacttcttaatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagcc 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29493509 cttagacttcttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagcc 29493608  T
Q  300 ctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||    
T  29493609 ctcaccgctgtt 29493620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 28758658 - 28758966
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatat-atataaatgca 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||   ||||||| ||||| ||| |    
T  28758658 atcaacaacacattatcttgtaaacatatgaaggtataagtcacaagcatcaacaacatcaacaacacaccataatcatcctgaatatcatatatatgta 28758757  T
Q  113 tat---------tcaacaccaacatcatcc-atcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatct 202  Q
    |||         ||||||||||  ||| |  ||||||||| |||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28758758 tatatcacctattcaacaccaaattcaccttatcagataacaactgaat--aaccactaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatct 28758855  T
Q  203 tagacttcttaa-tgaaatgcaata-tgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccc 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28758856 tagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccc 28758955  T
Q  301 tcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||    
T  28758956 tcaccgctgtt 28758966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 50143159 - 50142851
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatat-atataaatgca 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||   ||||||| ||||| ||| |    
T  50143159 atcaacaacacattatcttgtaaacatatgaaggtataagtcacaagcatcaacaacatcaacaacacaccataatcatcctgaatatcatatatatgta 50143060  T
Q  113 tat---------tcaacaccaacatcatcc-atcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatct 202  Q
    |||         ||||||||||  ||| |  ||||||||| |||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50143059 tatatcacctattcaacaccaaattcaccttatcagataacaactgaat--aaccactaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatct 50142962  T
Q  203 tagacttcttaa-tgaaatgcaata-tgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccc 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50142961 tagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccc 50142862  T
Q  301 tcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||    
T  50142861 tcaccgctgtt 50142851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 136 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14845423 - 14845250
Alignment:
Q  136 cagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaat-atgcatgtg 234  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14845423 cagataataactgaaatcaac---caagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcatgtg 14845327  T
Q  235 gtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14845326 gtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgttgtt 14845250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 98 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 50656279 - 50656070
Alignment:
Q  98 atatatataaatgcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacac 197  Q
    |||||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50656279 atatatatgaatgtatatccaacatcaacatcaacca---gataataactgaaat-aacaaccgagactcatgcaaatgacatgaccattgctaagacac 50656184  T
Q  198 catcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaag 297  Q
    ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50656183 cattttagacttctgaatgagatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaag 50656084  T
Q  298 ccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||    
T  50656083 ccctcaccgctgtt 50656070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 47120911 - 47121214
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatat-atataaatgca 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||| ||| ||| ||||| ||| |    
T  47120911 atcaacaacacattatcttgtaa-catataaaggtataagccacaagcatcaacaacatcaaccaca--ccataatcacattgagtattatatatatgta 47121007  T
Q  113 tat---------tcaacaccaacatcatcc-atcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatct 202  Q
    |||         |||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||   ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47121008 tatatcacctattcaacaccaa-atcatcttatcagataacaactgaat--aaccactaagactcatgcaa-tgacatgaccactgctaagacaccatct 47121103  T
Q  203 tagacttcttaa-tgaaatgcaata-tgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccc 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47121104 tagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccc 47121203  T
Q  301 tcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||    
T  47121204 tcaccgctgtt 47121214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 47128279 - 47128582
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatat-atataaatgca 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||| ||| ||| ||||| ||| |    
T  47128279 atcaacaacacattatcttgtaa-catataaaggtataagccacaagcatcaacaacatcaaccaca--ccataatcacattgagtattatatatatgta 47128375  T
Q  113 tat---------tcaacaccaacatcatcc-atcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatct 202  Q
    |||         |||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||   ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47128376 tatatcacctattcaacaccaa-atcatcttatcagataacaactgaat--aaccactaagactcatgcaa-tgacatgaccactgctaagacaccatct 47128471  T
Q  203 tagacttcttaa-tgaaatgcaata-tgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccc 300  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47128472 tagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccc 47128571  T
Q  301 tcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||    
T  47128572 tcaccgctgtt 47128582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 160 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3782986 - 3782834
Alignment:
Q  160 caagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  3782986 caagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttctgaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctc 3782887  T
Q  259 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3782886 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 3782834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 287 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 21151523 - 21151386
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21151523 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 21151424  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacatacatt 424  Q
    ||  || || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21151423 cttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatt 21151386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 287 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 2499110 - 2498955
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2499110 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 2499011  T
Q  387 c-tataataatatgtatgattcaataaataacatacattca-accatcatcagtat 440  Q
    | || || || |||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||    
T  2499010 cttaaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttacatcatcatcagtat 2498955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 287 - 439
Target Start/End: Original strand, 10767839 - 10767992
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  10767839 caggaccgaagccctcaccgttgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactcaatatgactcca 10767938  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcagta 439  Q
    || || ||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||    
T  10767939 ctttattaatatgtatgattcaacaattgacatacatttcaaccatcatcagta 10767992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 287 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 54833253 - 54833100
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  54833253 caggaccgaagccctcaccgttgttttatgcacatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactcaatatgactcca 54833154  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcagta 439  Q
    || |||||||||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||    
T  54833153 ctttaataatatgtatgattcaacaattggcatacatttcaaccatcatcagta 54833100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 287 - 440
Target Start/End: Original strand, 45611749 - 45611893
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||          ||||||    
T  45611749 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgca----------actcca 45611838  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcagtat 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  45611839 ctataataatatgtatgattcaataaatagcatacatttcaaccatcatcagtat 45611893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 150 - 311
Target Start/End: Original strand, 38742839 - 38743001
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacagg 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||  | |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  38742839 aatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaa--atatgcaaatttgcatgtggtaccaaacagg 38742936  T
Q  247 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38742937 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagccctcaccgctgtt 38743001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 153 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 48774859 - 48774700
Alignment:
Q  153 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 249  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48774859 caacaaccaagactcatgcaa-tgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 48774762  T
Q  250 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48774761 gaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 48774700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 298 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 6927596 - 6927452
Alignment:
Q  298 ccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccac-tataataat 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||     
T  6927596 ccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaaacaac 6927497  T
Q  397 atgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcagtat 440  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||    
T  6927496 atgtatgattcaataattaacatacatttaaatcatcatcagtat 6927452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 287 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 3782818 - 3782664
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcc 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||    
T  3782818 caggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgacacc 3782719  T
Q  386 actataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatcagtat 440  Q
    |||  ||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  3782718 acttaaatgacatgtatgactcaataaatagcatacaatcaatcatcatcagtat 3782664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 150 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12271639 - 12271477
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacagg 246  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| || ||||||||||| ||  | |||||| ||||||||| |||||||| |||    
T  12271639 aatcaacaactacgactcatgcaaatgacatgacaacactgctaaaacaacaccttagacttctcaa--atatgcaaatatgcatgttgtaccaaagagg 12271542  T
Q  247 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12271541 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 12271477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9772268 - 9771998
Alignment:
Q  39 atatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatgcatattcaacaccaacatcatccatcag 138  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||    |||||||| | ||||||  ||| |||||||| || ||||||||  |||||     
T  9772268 atataaatatataattcacaagcaacaacaacatcatcaatatacatccatcacaataagtatata--aatacatattcatcaacaacatcaatcatcaa 9772171  T
Q  139 ataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggt 236  Q
     |   ||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| || || ||||| || ||  | ||||||||||||||||||    
T  9772170 gtggcaactacaaccaacaaccaagactcatgcaaacgacatgacgacactactaagacaacacctcagactcctcaa--atatgcaatatgcatgtggt 9772073  T
Q  237 accaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  9772072 accaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcagggccgaagccctcatcgctgtt 9771998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 287 - 408
Target Start/End: Original strand, 28758982 - 28759103
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  28758982 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaa 28759081  T
Q  387 ctataataatatgtatgattca 408  Q
    ||  || || ||||||||||||    
T  28759082 cttaaacaacatgtatgattca 28759103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 287 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 50142835 - 50142714
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  50142835 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaa 50142736  T
Q  387 ctataataatatgtatgattca 408  Q
    ||  || || ||||||||||||    
T  50142735 cttaaacaacatgtatgattca 50142714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 43724130 - 43724006
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  43724130 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgagactcaa 43724031  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaata 411  Q
    ||  || || |||||||||||||||    
T  43724030 cttaaacaacatgtatgattcaata 43724006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 50656054 - 50655955
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50656054 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 50655955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Original strand, 20187628 - 20187775
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 259  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  20187628 gactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccttca 20187726  T
Q  260 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20187727 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 20187775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 287 - 408
Target Start/End: Original strand, 47121230 - 47121351
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  47121230 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatccacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcga 47121329  T
Q  387 ctataataatatgtatgattca 408  Q
    ||  || || ||||||||||||    
T  47121330 cttaaacaacatgtatgattca 47121351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 287 - 408
Target Start/End: Original strand, 47128598 - 47128719
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  47128598 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatccacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcga 47128697  T
Q  387 ctataataatatgtatgattca 408  Q
    ||  || || ||||||||||||    
T  47128698 cttaaacaacatgtatgattca 47128719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 287 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 53571300 - 53571201
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53571300 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 53571201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 287 - 388
Target Start/End: Original strand, 10382022 - 10382124
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcc 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10382022 caggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcc 10382121  T
Q  386 act 388  Q
    |||    
T  10382122 act 10382124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 287 - 388
Target Start/End: Original strand, 10410675 - 10410777
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcc 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10410675 caggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcc 10410774  T
Q  386 act 388  Q
    |||    
T  10410775 act 10410777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 287 - 388
Target Start/End: Original strand, 29493636 - 29493738
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcc 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29493636 caggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcc 29493735  T
Q  386 act 388  Q
    |||    
T  29493736 act 29493738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 30597035 - 30596941
Alignment:
Q  217 aaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30597035 aaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 30596941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 223 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 8374094 - 8374007
Alignment:
Q  223 aatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8374094 aatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccaaagccctcaccgctgt 8374007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29545339 - 29545245
Alignment:
Q  217 aaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29545339 aaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccttcaccgctgt 29545245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 32388193 - 32388099
Alignment:
Q  217 aaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32388193 aaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccaaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 32388099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9691575 - 9691490
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9691575 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 9691490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19344320 - 19344235
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19344320 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatagttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 19344235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 29550918 - 29551003
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29550918 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggactgaagccctcaccgctgt 29551003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 54520041 - 54520126
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54520041 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgtttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 54520126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 225 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16331761 - 16331678
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16331761 tatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 16331678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 224 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11956764 - 11956678
Alignment:
Q  224 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11956764 atatgcatgtggtaacaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctccccgctgt 11956678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 224 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12725292 - 12725206
Alignment:
Q  224 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12725292 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagtcctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacctctgt 12725206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 16833216 - 16833301
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16833216 tatgcatgtggtgccaaacaggaccgaagccctcaccgtttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 16833301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 46071278 - 46071193
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46071278 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagcccttatcgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 46071193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 301 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 12271447 - 12271339
Alignment:
Q  301 tcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgc-aactccatgtgactccactataataatatg 399  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || || |||    
T  12271447 tcaccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgactccacttaaacaacatg 12271348  T
Q  400 tatgattca 408  Q
    |||||||||    
T  12271347 tatgattca 12271339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 299 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 9771970 - 9771863
Alignment:
Q  299 cctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgc-aactccatgtgactccactataataata 397  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || || |    
T  9771970 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgactccacttaaacaaca 9771871  T
Q  398 tgtatgat 405  Q
    ||||||||    
T  9771870 tgtatgat 9771863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 291 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 14845230 - 14845137
Alignment:
Q  291 accgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgact 383  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14845230 accgaagccctcactgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgagact 14845137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 299 - 406
Target Start/End: Original strand, 38743029 - 38743137
Alignment:
Q  299 cctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgc-aactccatgtgactccactataataata 397  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || || |    
T  38743029 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacgtacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgactccacttaaacaaca 38743128  T
Q  398 tgtatgatt 406  Q
    |||||||||    
T  38743129 tgtatgatt 38743137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20377408 - 20377323
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20377408 tatgcatgtggtaccaaataagaccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 20377323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 49163149 - 49163234
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  49163149 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttcaagcattcatcaggacataagccctcaccgctgt 49163234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 243 - 310
Target Start/End: Original strand, 20187754 - 20187821
Alignment:
Q  243 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20187754 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 20187821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 226 - 310
Target Start/End: Original strand, 54520256 - 54520341
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54520256 atgcatgtggtaccatatcagggccggagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 54520341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Original strand, 12419326 - 12419476
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||  || |||||||| ||||||| |||||||| |  |||| ||||||||||    
T  12419326 gactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcgat-aaatgcaaatatgcatatggtaccataatcagggccgaagccct 12419424  T
Q  258 caccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  12419425 cactgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgct 12419476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 217 - 277
Target Start/End: Original strand, 18957753 - 18957814
Alignment:
Q  217 aaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaa 277  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18957753 aaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaa 18957814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 18757206 - 18757055
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgaccac--tgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||    
T  18757206 gactcatgcaactgacatgacaacattgctaagacaacaccttaaacttctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccct 18757108  T
Q  258 caccgct--tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||  ||| ||||||||||    
T  18757107 caccgctgttttgaatggttaaagcaatcattaggacaaaagtcctcaccgct 18757055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 21457383 - 21457328
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaa 69  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21457383 atcaacaacacattatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaa 21457328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 307 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 48774664 - 48774582
Alignment:
Q  307 ctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatggaatgcaactccatgtgactccact 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    |||||||| ||||||||||    
T  48774664 ctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacaaactccatatgactccact 48774582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 10597976 - 10597826
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  |||||||| || |||||||| || ||  |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||| |    
T  10597976 gactcatgcaaatgacatgacaacaccactaagacaacaccttagactcctcaac-aaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccgt 10597878  T
Q  258 caccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  10597877 caccactgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgct 10597826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 311 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 16331637 - 16331535
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatggaatgca-actccatgtgactccactataat-aatatgtatgattc 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || ||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||    
T  16331637 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca-tacatactccatatgactccact-taatcaacatgtatgattc 16331540  T
Q  408 aataa 412  Q
    |||||    
T  16331539 aataa 16331535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 311 - 412
Target Start/End: Original strand, 16833340 - 16833442
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatggaatgca-actccatgtgactccactataataatatgtatgattca 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || ||||||| ||||||||||   | || ||||||||||||    
T  16833340 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca-tacatactccatatgactccacttatacaacatgtatgattca 16833438  T
Q  409 ataa 412  Q
    ||||    
T  16833439 ataa 16833442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 225 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 54091860 - 54091678
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    ||  ||  ||  ||||||   || |||| |||||| ||||||||||||||    
T  54091860 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgc-tgtgaacaactagtgc--tc--caggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgca 54091767  T
Q  325 atggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatggaatgca-actccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataa 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || || ||||||| ||||||||||   | || ||||||||||||||||    
T  54091766 atggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccat-gcatacatactccatatgactccacttatacaacatgtatgattcaataa 54091678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 217 - 356
Target Start/End: Original strand, 3802527 - 3802661
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttttat 315  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    ||  ||  ||  ||||||   || |||| ||||||||| ||    
T  3802527 aaatgcaactatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgctgt-gaacaactagtgc--tc--caggacatgagtcctctccgctgttt-at 3802620  T
Q  316 gcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802621 gcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 3802661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 363
Target Start/End: Original strand, 15374759 - 15374812
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatg 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15374759 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacatgaccatg 15374812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 27029603 - 27029558
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27029603 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 27029558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 27031771 - 27031726
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27031771 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 27031726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 29545206 - 29545161
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29545206 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 29545161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 54520165 - 54520210
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54520165 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 54520210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 308
Target Start/End: Original strand, 17512558 - 17512624
Alignment:
Q  243 caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  17512558 cagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacctaggtcctcaccgct 17512624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 8373969 - 8373924
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8373969 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaact 8373924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 11956640 - 11956595
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11956640 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaact 11956595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19344196 - 19344151
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19344196 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaact 19344151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 30596903 - 30596858
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30596903 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaact 30596858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 8583536 - 8583385
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   |||     
T  8583536 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgaccca 8583438  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8583437 caccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 8583385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Original strand, 14084466 - 14084617
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   |||     
T  14084466 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgaccca 14084564  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14084565 caccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 14084617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Original strand, 14089867 - 14090018
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   |||     
T  14089867 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgaccca 14089965  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  14089966 caccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 14090018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 16383056 - 16382994
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16383056 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 16382994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 263
Target Start/End: Original strand, 31943376 - 31943480
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgc-aatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | | ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||    
T  31943376 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaataccctagacttctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccct 31943474  T
Q  258 caccgc 263  Q
    ||||||    
T  31943475 caccgc 31943480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 264
Target Start/End: Original strand, 3802699 - 3802737
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802699 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 3802737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 11850879 - 11850775
Alignment:
Q  187 tgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 283  Q
    |||||||||| || |||| ||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  11850879 tgctaagacaacaccttaaactcctcaat-aaatgcaattatgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcatt 11850781  T
Q  284 catcag 289  Q
    ||||||    
T  11850780 catcag 11850775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 9691451 - 9691406
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  9691451 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 9691406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Original strand, 12274221 - 12274304
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  12274221 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 12274304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 18961077 - 18961122
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18961077 tttatgcatatgcaatggactcacttgtgtatatctacatacaact 18961122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 20187860 - 20187905
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  20187860 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 20187905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20377284 - 20377239
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  20377284 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 20377239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 31690839 - 31690713
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgc-aatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||  | | |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||    
T  31690839 gactcatgcaaatgacatgacaacacagctaagacaataccctagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccct 31690741  T
Q  258 caccgct-tttgaatggttaaagcattc 284  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||    
T  31690740 caccgctaatcgaatggttaaagcattc 31690713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 32388061 - 32388016
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32388061 tttatgcatatgttatggacctacttgtgtatatctacatacaact 32388016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 49163272 - 49163317
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49163272 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaact 49163317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 54520380 - 54520425
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  54520380 tttatgcatatgcaatggaccaactcgtgtatatctacatacaact 54520425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 264
Target Start/End: Original strand, 15374678 - 15374718
Alignment:
Q  224 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15374678 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagtcctcaccgct 15374718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15955193 - 15955111
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  15955193 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccaaatttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 15955111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 13203715 - 13203653
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtacca--aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  13203715 atgcatgtggtaccataaacaggaccgtagccctcaccgctgtagaatagttaaagcattcat 13203653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 294 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 13313967 - 13313907
Alignment:
Q  294 gaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13313967 gaagccctcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 13313907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 14652892 - 14652830
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14652892 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 14652830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 289
Target Start/End: Original strand, 17496119 - 17496185
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcag 289  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17496119 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcatcag 17496185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 284
Target Start/End: Original strand, 19443469 - 19443528
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  19443469 atgcatgtggtaccataacagggccggagccctcaccgctatagaatggttaaagcattc 19443528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Original strand, 49399408 - 49399559
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   |||     
T  49399408 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgaccca 49399506  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  49399507 caccgctgtcgaatggttaaagcattctcaccaggacctaagtcctcaccgct 49399559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11305905 - 11305863
Alignment:
Q  266 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  11305905 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgct 11305863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 3802778 - 3802823
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  3802778 tttatgcatatgcaatggactcactcgtgtatatctacatacaact 3802823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12725168 - 12725123
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  12725168 tttatgcatatgaaatggacccactagtgtatatctacatacaact 12725123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 363
Target Start/End: Original strand, 29551042 - 29551095
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatg 363  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  29551042 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatttacatacaacatgaccatg 29551095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 46071154 - 46071109
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  46071154 tttatgcatatgcaatggacccactcgtatatatctacatacaact 46071109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 286
Target Start/End: Original strand, 14292706 - 14292765
Alignment:
Q  229 catgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    |||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14292706 catgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 14292765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 16823899 - 16823843
Alignment:
Q  250 gaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  16823899 gaagccctcaccgagttttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 16823843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 13324879 - 13324819
Alignment:
Q  294 gaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||||||||||  ||||| | |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13324879 gaagccctcaccgct--tttatacttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 13324819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11644953 - 11644911
Alignment:
Q  266 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  11644953 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaggccctcaccgct 11644911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 12356104 - 12356050
Alignment:
Q  255 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattca-tcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||    
T  12356104 cctcaccgctattgaatggttaaagcattcattcaggacataagtcctcaccgct 12356050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 12362653 - 12362599
Alignment:
Q  255 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattca-tcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||    
T  12362653 cctcaccgctattgaatggttaaagcattcattcaggacataagtcctcaccgct 12362599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18719312 - 18719251
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattc 284  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18719312 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgcttatcgaatggttaaagcattc 18719251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 286
Target Start/End: Original strand, 18913996 - 18914069
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |  || | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18913996 aaatgcaactatgcatgtggtaccatattcaaggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 18914069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 356
Target Start/End: Original strand, 23173921 - 23173967
Alignment:
Q  310 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23173921 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 23173967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 38312185 - 38312118
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||| | ||||||||||  ||||||| |||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  38312185 caggaccgaggtcctcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatttacatacaact 38312118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11965080 - 11964993
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctttt-gaatggttaaagcattca--tcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||    
T  11965080 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattcatttcaggacctaagtcctcaccgct 11964993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 356
Target Start/End: Original strand, 12274375 - 12274435
Alignment:
Q  296 agccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  12274375 agccctccccgct-ttatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 12274435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Original strand, 12363445 - 12363532
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattca--tcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||    
T  12363445 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcatttcaggacataagtcctcaccgct 12363532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 14289120 - 14289064
Alignment:
Q  251 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||    
T  14289120 aagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattca-cagggcataagccctcaccgct 14289064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 14544368 - 14544308
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  14544368 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattc 14544308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Original strand, 14569795 - 14569878
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttg-aatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  14569795 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatatggaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 14569878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 284
Target Start/End: Original strand, 17130687 - 17130756
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  17130687 aaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 17130756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 356
Target Start/End: Original strand, 17512698 - 17512751
Alignment:
Q  304 ccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17512698 ccgcttttatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 17512751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 12961580 - 12961517
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12961580 atgcatgtggtaccataatcagggccgaaaccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 12961517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15935004 - 15934960
Alignment:
Q  313 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15935004 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 15934960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15935172 - 15935090
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||    
T  15935172 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcactgaatttgaatggttaaagcattcatcagagcataagccctcacc 15935090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 104073 - 104372
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatat--atataaatgc 111  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  104073 atcaacaacactttatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaacaatacaccatgatcacaatgaatatatatataaatgc 104172  T
Q  112 atattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  104173 atattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaaacaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttct 104272  T
Q  212 taatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  104273 taatgaaatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 104372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 287 - 439
Target Start/End: Original strand, 104388 - 104541
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  104388 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactcaatatgactcca 104487  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcagta 439  Q
    || |||||||||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||    
T  104488 ctttaataatatgtatgattcaacaattggcatacatttcaaccatcatcagta 104541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18896 - 18598
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaa-catcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatgca 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18896 atcaacaacacattatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaaacatcaacaatacaccatgatcacaatgaatatatataaatgca 18797  T
Q  113 tattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttctt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18796 tattcaacaccaacatcatccatcaggtaataaatgaaatcaacaaccaagactcatgcacatgacatgaccactgctaagacaccttcttagacttctt 18697  T
Q  213 aatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18696 aatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 18598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 287 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 18582 - 18433
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18582 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccttgcaatgcaactccatgtgactcca 18483  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatca 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18482 ctataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaaccatcatca 18433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 308
Target Start/End: Original strand, 1885 - 1981
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattca-tcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||    
T  1885 aaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattcaggacataagtcctcaccgct 1981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 2)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12602 - 12302
Alignment:
Q  14 atcaacaacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaa-catcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatgca 112  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12602 atcaataacacattatcttgtaagcatatatatgtataagtcacaagcaaccacaaacatcaacaatacaccatgatcacaatgaatatatataaatgca 12503  T
Q  113 tattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttc 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  12502 tattcaacaccaacatcctccatcaggtaataactgaaatcaacacccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaccatcttagacttc 12403  T
Q  211 ttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12402 ttaatgaaatgcagtatgcatgtggtaccaaacaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 12303  T
Q  311 t 311  Q
    |    
T  12302 t 12302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 287 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 12286 - 12132
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  12286 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactctatgtgactcca 12187  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacatac-attcaaccatcatcagtat 440  Q
    ||  || || |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  12186 cttaaacaacatgtatgattcaataattagcatacaattcaaccatcatcagtat 12132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18769 - 18494
Alignment:
Q  39 atatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgat-cacaatgaatatatataaatgcatattcaacaccaacatcatccatca 137  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||| | || | | |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18769 atatatataaataagttacaagcaacaacaacaaccacaatacaccatgattcacaatgaacatatataaatgtatattcaacaccaacatcatccatca 18670  T
Q  138 gataataactgaaa-tcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaa-tgaaatgcaatatgcatgtgg 235  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18669 attaataactgaaaatcaacaaccaagactcatgcaattgacatgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaatatgcatgtgg 18570  T
Q  236 taccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569 taccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 18494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 287 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 18478 - 18324
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18478 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgccatgcaactccatgtgactcca 18379  T
Q  387 ctataataatatgtatgattcaataaataacataca-ttcaaccatcatcagtat 440  Q
    ||  || || |||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||    
T  18378 cttaaacaacatgtatgattcaataattaacatacatttaaatcatcatcagtat 18324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 84 - 311
Target Start/End: Original strand, 13262 - 13491
Alignment:
Q  84 catgatcacaatgaatatatataaat----gcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgaca 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13262 catgatcacaatgaatatatataaatatatgtatattcaacatcaacatcatccatcagataa-aactgaaa-caacaaccaagactcatgcaaatgaca 13359  T
Q  180 tgaccactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaag 279  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13360 tgaccactgctaagataccatcttagacttcttaatgaaatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaag 13459  T
Q  280 cattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13460 cattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 13491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 287 - 388
Target Start/End: Original strand, 13507 - 13609
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgtttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcc 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13507 caggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatccaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcc 13606  T
Q  386 act 388  Q
    |||    
T  13607 act 13609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 20 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16389 - 16099
Alignment:
Q  20 aacacatcatcttgtaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacatcaaccacataccatgatcacaatgaatatatataaatgcatattcaa 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||  |   |||||||| | || |||  ||| ||||||||     
T  16389 aacacatcatcttgaaaacatatatatgtataagtcacaagcaacaacaacaacatcaatatctctccatcacaataagtacata--aatacatattcat 16292  T
Q  120 caccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatga 217  Q
    || ||||||||    |||  ||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  16291 caacaacatcaatactcaagtaacaaccgcaatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgaaaacactgctaagacaccatcttagacttctcaatgg 16192  T
Q  218 aatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16191 a-tgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccaaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 16099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 98 - 311
Target Start/End: Original strand, 49877 - 50086
Alignment:
Q  98 atatatataaatgcatattcaacaccaacatcatccatcagataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccactgctaagacac 197  Q
    |||||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||   ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49877 atatatatgaatgtatatccaacatcaacatcaacca---gataataactgaaat-aacaaccgagactcatgcaaatgacatgaccattgctaagacac 49972  T
Q  198 catcttagacttcttaatgaaatgcaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaag 297  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49973 catcttagacttctgaatgagatgcattatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaag 50072  T
Q  298 ccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||| ||||    
T  50073 ccctcaccgatgtt 50086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 386
Target Start/End: Original strand, 50102 - 50201
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactcca 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50102 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 50201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1253 - 1093
Alignment:
Q  153 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  1253 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggacc 1155  T
Q  250 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1154 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 1093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 299 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 1065 - 975
Alignment:
Q  299 cctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatggaatgcaactccatgtgactccact 388  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    |||||||| ||||||||||    
T  1065 cctctccgctgttctatgcatatgcaatcgacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacaaactccatatgactccact 975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 101 - 311
Target Start/End: Original strand, 14973 - 15187
Alignment:
Q  101 tatataaatgcatattcaacaccaacatcatc--catcag-ataataactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagac 195  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||||  |||||  |||| ||||  || |||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  14973 tatataaatatatattcaacaacaacatcatcatcatcaatataacaactacaaccaacaatcaagactcatgcaa-tgacatgacaacactgctaagac 15071  T
Q  196 accatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccg 294  Q
    | || |||||||| || ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15072 aacaccttagactcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccg 15170  T
Q  295 aagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||    
T  15171 aagccctcaccgctgtt 15187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 15226 - 15271
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15226 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 15271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0279 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0279
Description:

Target: scaffold0279; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 150 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5959 - 5797
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacagg 246  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||  | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5959 aatcaacaactacgactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaa--atatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagg 5862  T
Q  247 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5861 accgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagggccgaagccctcaccgctgtt 5797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0279; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 299 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 5769 - 5661
Alignment:
Q  299 cctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgc-aactccatgtgactccactataataata 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  || || |    
T  5769 cctcaccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgactccacttaaacaaca 5670  T
Q  398 tgtatgatt 406  Q
    |||||||||    
T  5669 tgtatgatt 5661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 144 - 311
Target Start/End: Original strand, 31556 - 31725
Alignment:
Q  144 aactgaaatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtacca 240  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||| || ||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  31556 aactgcaaccaacaactaagactcatgcaaacgacatgacaacactgctatgacaacaccttagacttctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtacca 31654  T
Q  241 aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31655 gacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 31725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 299 - 356
Target Start/End: Original strand, 31753 - 31810
Alignment:
Q  299 cctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31753 cctcaccgctgtttaatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 31810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 6)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 153 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 512768 - 512609
Alignment:
Q  153 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgc-aatatgcatgtggtaccaaacaggacc 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||| || ||  | |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  512768 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgttaagacaacaccttagactactcaa--atatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggacc 512671  T
Q  250 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  512670 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 512609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Original strand, 178993 - 179088
Alignment:
Q  217 aaatgcaat-atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  178993 aaatgcaatcatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctgt 179088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 311 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 512570 - 512493
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccact 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||| ||||||||||||    
T  512570 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcatacaaactccttgtgactccact 512493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 179126 - 179171
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  179126 tttatgcatatgcaatggacccacttttgtatatctacatacaact 179171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 488394 - 488350
Alignment:
Q  313 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  488394 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 488350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Original strand, 524649 - 524711
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattca 285  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  524649 atgcatgtggtaccaatttacagggcataagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattca 524711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 153 - 311
Target Start/End: Original strand, 19533 - 19693
Alignment:
Q  153 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggacc 249  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  19533 caacaactaagactcatacaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaat-agatgcaattatgcatgtggtaccagacaggacc 19631  T
Q  250 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19632 gaagcccttaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 19693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 153 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 24052 - 23892
Alignment:
Q  153 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggacc 249  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||| | ||||||| ||||||||||||||  | ||||||    
T  24052 caacaactaagactcatacaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaat-agatgcaattatgcatgtggtaccttataggacc 23954  T
Q  250 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23953 gaagcccttaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaatccctcaccgctgtt 23892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 311 - 388
Target Start/End: Original strand, 19732 - 19809
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccact 388  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||| ||||||||||    
T  19732 tttattcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcatacaaactccatatgactccact 19809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23853 - 23808
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23853 tttattcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 23808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 153 - 308
Target Start/End: Original strand, 24967 - 25122
Alignment:
Q  153 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||  | |||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  24967 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaa--atatgcaaatatgcatgtggtaacaa-caggacc 25063  T
Q  250 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25064 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 25122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 299 - 387
Target Start/End: Original strand, 25153 - 25240
Alignment:
Q  299 cctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccac 387  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  25153 cctctccgctgttttatgcatatgtaatggatcaacttgtgtatatctacatacaactgaccat-gcatacaactccatgtgactccac 25240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0320
Description:

Target: scaffold0320; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 153 - 311
Target Start/End: Original strand, 817 - 977
Alignment:
Q  153 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccac--tgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 249  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| || |||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  817 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaaccctgctaagacaacaccttagactcctcaat-agatgcaaatatgcatgtggtaccagataggacc 915  T
Q  250 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  916 gaagccctcaccacttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 299 - 356
Target Start/End: Original strand, 1005 - 1062
Alignment:
Q  299 cctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1005 cctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 1062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0214
Description:

Target: scaffold0214; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 163 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15423 - 15273
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 259  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15423 gactcatgcaaatgttatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtactaaacaggaccgaagccctca 15325  T
Q  260 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15324 ccgcttttgaatggttaaaggattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 15273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15234 - 15189
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15234 tttatgcatatgcaatggacctatttgtgtatatctacatacaact 15189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 225 - 308
Target Start/End: Original strand, 623 - 706
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  623 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 747 - 792
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  747 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 356
Target Start/End: Original strand, 978 - 1045
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||| || |||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  978 caggaccgaggcactcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 1045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 161 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4864 - 4713
Alignment:
Q  161 aagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  4864 aagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaa--atatgcaattatgcatgtggtaccagacaggaccgaagctct 4767  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4766 caccgcttttgaatggttaaagcattcatcagaaccgaagccctcaccgctgtt 4713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 4674 - 4579
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgatt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  4674 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcatacaaactccttgtgactccacttaaataacatgtatgatt 4579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 31816 - 31666
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| || |||| ||    
T  31816 gactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacc-cttagacttctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccaaagcact 31719  T
Q  258 caccgct--tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  31718 caccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgct 31666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 2013 - 2098
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2013 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 2098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 2137 - 2182
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  2137 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 2182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 4)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 74290 - 74205
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  74290 tatgcatgtggtatcaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 74205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 74167 - 74122
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  74167 tttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaact 74122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Original strand, 120787 - 120870
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  120787 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaaatttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 120870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Original strand, 131664 - 131747
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  131664 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaaatttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 131747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 225 - 306
Target Start/End: Original strand, 7712 - 7793
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7712 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccaaagccctcaccg 7793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 354
Target Start/End: Original strand, 12983 - 13026
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12983 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa 13026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 264
Target Start/End: Original strand, 12903 - 12942
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12903 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 101823 - 101738
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  101823 tatgcatctggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcactgctgt 101738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 101699 - 101647
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatg 363  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  101699 tttatgcatatgcaatggacccactcgtg-atatctacatacaacatgaccatg 101647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 6)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 225 - 308
Target Start/End: Original strand, 19169 - 19252
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19169 tatgcatgtggtaccagacaggacggaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 19252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 243 - 310
Target Start/End: Original strand, 19231 - 19298
Alignment:
Q  243 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19231 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 19298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 311 - 412
Target Start/End: Original strand, 19337 - 19439
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatggaatgca-actccatgtgactccactataataatatgtatgattca 408  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || |||||||||||||||| |  || || ||||||||||||    
T  19337 tttatgcatatgaaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca-tacatactccatgtgactccatttaaacaacatgtatgattca 19435  T
Q  409 ataa 412  Q
    ||||    
T  19436 ataa 19439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 412
Target Start/End: Original strand, 15239 - 15341
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatggaatgca-actccatgtgactccactataataatatgtatgattca 408  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | || || |||||||||||||||| |  || || ||||||||||||    
T  15239 tttacgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgatcat-gcatacatactccatgtgactccatttaaacaacatgtatgattca 15337  T
Q  409 ataa 412  Q
    ||||    
T  15338 ataa 15341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 26956 - 26870
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  26956 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 26870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 264
Target Start/End: Original strand, 15159 - 15198
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 264  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15159 tatgcatgtggtactagacaggaccgaagccctcaccgct 15198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 229 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 65459 - 65382
Alignment:
Q  229 catgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65459 catgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgtttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccg 65382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 65339 - 65294
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  65339 tttatgcatatgcaatgaaactacttgtgtatatctacatacaact 65294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 225 - 306
Target Start/End: Original strand, 41230 - 41311
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41230 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagccctcaccg 41311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 41353 - 41398
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41353 tttatgcatatgatatggacccacttgtgtatatctacatacaact 41398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 238 - 310
Target Start/End: Original strand, 30845 - 30917
Alignment:
Q  238 ccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30845 ccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 30917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 30955 - 31000
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  30955 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 31000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 227 - 310
Target Start/End: Original strand, 24648 - 24731
Alignment:
Q  227 tgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24648 tgcatgtggtaccagacaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagtattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 24731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 24770 - 24815
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24770 tttatgcatatgcaatggacctacttgtttatatctacatagaact 24815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 6)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 217 - 310
Target Start/End: Original strand, 51 - 146
Alignment:
Q  217 aaatgcaat-atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51 aaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaaaccctcaccgctgt 146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 184 - 229
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  184 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaact 229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 30387 - 30236
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   |||     
T  30387 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgaccca 30289  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  30288 caccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 30236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 35788 - 35637
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   |||     
T  35788 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgaccca 35690  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  35689 caccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 35637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 51718 - 51672
Alignment:
Q  310 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51718 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 51672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 51854 - 51791
Alignment:
Q  248 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattca---tcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||    
T  51854 ccgaggccctcaccgctatagaatggttaaagcattcattttcaggacataagccctcaccgct 51791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 217 - 292
Target Start/End: Original strand, 143952 - 144028
Alignment:
Q  217 aaatgcaat-atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggac 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  143952 aaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggac 144028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 137199 - 137244
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  137199 tttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaact 137244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0276 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0276
Description:

Target: scaffold0276; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 330 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 22101 - 21991
Alignment:
Q  330 cctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccactataataatatgtatgattcaataaataacatacattcaacc 429  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||  ||| | |||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  22101 cctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgacaccacttaaatgacatgtatgactcaataaatagcatacaatcaacc 22002  T
Q  430 atcatcagtat 440  Q
    |||||||||||    
T  22001 atcatcagtat 21991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 4)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 247018 - 247104
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  247018 tatgcatgtggtacgaaaacaggatcgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagccctcaccgctgt 247104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 253532 - 253618
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 310  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  253532 tatgcatgtggtacgaaaacaggatcgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagccctcaccgctgt 253618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 247142 - 247187
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  247142 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaact 247187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 253656 - 253701
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  253656 tttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaact 253701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1726 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1726
Description:

Target: scaffold1726; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Original strand, 159 - 310
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |  || | ||||||||||    
T  159 gactcatgcaactgacatgacaacactactaagacaacaccttagacttctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcaaggccgaagccct 257  T
Q  258 caccgct--tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  258 caccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgct 310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Original strand, 26026 - 26176
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  |||||||| || |||||||| || ||  |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||    
T  26026 gactcatgcaaatgacatgacaacaccactaagacaacaccttagactcctcaac-aaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccct 26124  T
Q  258 caccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  26125 caccgctgtttgaatggttaaagcattcattagggcataagccctcaccgct 26176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Original strand, 27408 - 27558
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  |||||||| || |||||||| || ||  |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||    
T  27408 gactcatgcaaatgacatgacaacaccactaagacaacaccttagactcctcaac-aaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccct 27506  T
Q  258 caccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||    
T  27507 caccgctgtttgaatggttaaagcattcattagggcataagccctcaccgct 27558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 7)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 10359 - 10223
Alignment:
Q  153 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgc-aatatgcatgtggtaccaaa--cagga 247  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || | |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||| |  ||||     
T  10359 caacaacacagactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcaggg 10261  T
Q  248 ccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 284  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  10260 ccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattc 10223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 284
Target Start/End: Original strand, 72229 - 72288
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    ||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  72229 atgcatgtggtaccatatcaaggccgaagccctcaccgctatagaatggttaaagcattc 72288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 620 - 566
Alignment:
Q  255 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattca-tcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||    
T  620 cctcaccgctattgaatggttaaagcattcattcaggacataagtcctcaccgct 566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6779 - 6725
Alignment:
Q  255 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattca-tcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||    
T  6779 cctcaccgctattgaatggttaaagcattcattcaggacataagtcctcaccgct 6725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10122 - 10076
Alignment:
Q  310 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10122 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 10076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 356
Target Start/End: Original strand, 72369 - 72436
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  72369 caggaccgaggccctcaccgct--tttatgcttatgaaactaacccacttgtgtatatctacatacaact 72436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 35912 - 35816
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattca-tcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||    
T  35912 aaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagagccgaagccctcaccgctaattgaaaggttaaagcattcattcaggacataagtcctcaccgct 35816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 634 - 504
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || |||||||| || ||| |||| ||| |||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||    
T  634 gactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatacaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgtagccct 536  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcattcatcag 289  Q
    |||| || | ||||| ||||||||||||||||    
T  535 caccactgtagaatgattaaagcattcatcag 504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 5566 - 5510
Alignment:
Q  250 gaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  5566 gaagccctcaccgagttttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 5510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 319 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5415 - 5377
Alignment:
Q  319 tatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5415 tatgcaatggactctacttgtgtatatctacatacaact 5377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 4312 - 4217
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  4312 aaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcacctctaattgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgct 4217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4135 - 4091
Alignment:
Q  313 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  4135 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 4091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Original strand, 3658 - 3720
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3658 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 3720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Original strand, 38336 - 38487
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   |||     
T  38336 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgaccca 38434  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38435 caccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 38487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Original strand, 141326 - 141388
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  141326 atgcatgtggtaccataatcaggaccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 141388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Original strand, 146566 - 146629
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  146566 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagtcctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 146629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 174803 - 174652
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   |||     
T  174803 gactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgaccca 174705  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  174704 caccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 174652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 56947 - 56861
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  56947 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 56861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 308
Target Start/End: Original strand, 147050 - 147092
Alignment:
Q  266 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  147050 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgct 147092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 308
Target Start/End: Original strand, 75156 - 75215
Alignment:
Q  250 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  75156 gaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 75215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 197618 - 197555
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  197618 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 197555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 11979 - 11912
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11979 caggaccgaggccctcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 11912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 5)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 287 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 24539 - 24472
Alignment:
Q  287 caggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24539 caggaccgaggccctcaccgct--tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 24472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 10839 - 10756
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa--acaggaccgaagccctcaccgc--ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||    
T  10839 atgcatgtggtaccaattacagggcagaagccctcaccgaatttttgaatggttaaaacattcatcagggcataagccctcacc 10756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 19019 - 18935
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc--ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||    
T  19019 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatttttgaatggttaaaacattcatcagggcataagccctcacc 18935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10670 - 10626
Alignment:
Q  313 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10670 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 10626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18849 - 18805
Alignment:
Q  313 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18849 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 18805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 1535 - 1452
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  1535 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 1452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 3448 - 3391
Alignment:
Q  252 agccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  3448 agccctcaccggattttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgct 3391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Original strand, 9877 - 9922
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  9877 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 9922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20157 - 20112
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  20157 tttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaact 20112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 5309 - 5237
Alignment:
Q  223 aatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggac 292  Q
    |||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  5309 aatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccactaattgaatggttaaagcattcatcaggac 5237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 5187 - 5101
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  5187 atgcatgtggtaccaatttacagggccgtagccctcaccggatattgaatggttaaatcattcatcagggcctaagccctcaccgct 5101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 305
Target Start/End: Original strand, 10946 - 10987
Alignment:
Q  264 ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  10946 ttttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 10987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Original strand, 18505 - 18591
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcacc-gcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  18505 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccagatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 18591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 191 - 105
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  191 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 48001 - 47915
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  48001 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgct 47915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Original strand, 41931 - 41993
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  41931 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 41993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 355
Target Start/End: Original strand, 42090 - 42135
Alignment:
Q  310 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 355  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  42090 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 42135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Original strand, 64965 - 65051
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  64965 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 65051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 52626 - 52475
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 257  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   |||     
T  52626 gactcatgcaaaggacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgaccca 52528  T
Q  258 caccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  52527 caccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgct 52475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 308
Target Start/End: Original strand, 999 - 1041
Alignment:
Q  266 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  999 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 1041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0535 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0535
Description:

Target: scaffold0535; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 6208 - 6146
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  6208 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 6146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 308
Target Start/End: Original strand, 6117 - 6211
Alignment:
Q  218 aatgcaata-tgcatgtggtaccaa--acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  ||||| | ||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  6117 aatgcaataatgcatgtggtaccaattacagggcagaaaccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 6211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 356
Target Start/End: Original strand, 6293 - 6337
Alignment:
Q  313 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  6293 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 6337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 14673 - 14611
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14673 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 14611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 14514 - 14469
Alignment:
Q  310 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 355  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14514 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 14469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 5184 - 5122
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5184 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 5122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 6)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 63370 - 63308
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  63370 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 63308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 28099 - 28016
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  28099 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 28016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 38936 - 38853
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  38936 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 38853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 124649 - 124588
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattc 284  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  124649 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgcttatcgaatggttaaagcattc 124588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 286
Target Start/End: Original strand, 142630 - 142694
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  142630 tatgcatgtggtaccattatacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcat 142694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 38767 - 38723
Alignment:
Q  313 tatgcatatgcaatggacct-acttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  38767 tatgcttatgcaatggacttcacttgtgtatatctacatacaact 38723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 129873 - 129788
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccg 306  Q
    |||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  129873 tatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccg 129788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Original strand, 321062 - 321125
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  321062 atgcatgtggtaccataatcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 321125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1584 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1584
Description:

Target: scaffold1584; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 284
Target Start/End: Original strand, 254 - 381
Alignment:
Q  163 gactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagacacca-tcttagacttcttaatgaaatgca-atatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccc 256  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||| || || |||||| || ||  ||||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||    
T  254 gactcatgcaaatgacatgtcaacaccgctaagacaacactcctagactcctcaac-aaatgcagatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccc 352  T
Q  257 tcaccgctt-ttgaatggttaaagcattc 284  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  353 tcaccgctaattgaatggttaaagcattc 381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 308
Target Start/End: Original strand, 8280 - 8322
Alignment:
Q  266 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8280 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgct 8322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 308
Target Start/End: Original strand, 18364 - 18406
Alignment:
Q  266 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18364 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgct 18406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 308
Target Start/End: Original strand, 9268 - 9310
Alignment:
Q  266 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  9268 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgct 9310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 308
Target Start/End: Original strand, 44938 - 44980
Alignment:
Q  266 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  44938 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgct 44980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 36835 - 36789
Alignment:
Q  310 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36835 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 36789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 308
Target Start/End: Original strand, 9281 - 9323
Alignment:
Q  266 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  9281 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgct 9323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1426 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1426
Description:

Target: scaffold1426; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 150 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 57 - 9
Alignment:
Q  150 aatcaacaaccaagactcatgcaaatgacatgac--cactgctaagaca 196  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  57 aatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagaca 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 14984 - 14915
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  14984 aaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 14915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 11796 - 11713
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  11796 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 11713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16233 - 16137
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattca-tcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||  ||| ||||||||||    
T  16233 aaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaaacattcattcaggacataagtcctcaccgct 16137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 304
Target Start/End: Original strand, 51130 - 51213
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcac 304  Q
    |||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  51130 tatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcac 51213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 56124 - 56041
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  56124 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcgccgaattttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 56041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 55956 - 55912
Alignment:
Q  313 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  55956 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 55912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 51148 - 51088
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  51148 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattc 51088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 50989 - 50948
Alignment:
Q  310 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacata 351  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  50989 ttttatgcttatgcaactgacctacttgtgtatatctacata 50948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 207964 - 207881
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    ||||||||||||||||   | ||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  207964 atgcatgtggtaccaatttatagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 207881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 18354 - 18291
Alignment:
Q  225 tatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattca 285  Q
    |||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18354 tatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattca 18291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Original strand, 258674 - 258736
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  258674 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccttcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 258736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Original strand, 265100 - 265162
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  265100 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccttcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 265162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2016 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold2016
Description:

Target: scaffold2016; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 251 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 902 - 800
Alignment:
Q  251 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctaca 349  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| |  |||||||||   ||| ||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||     
T  902 aagccctcaccgaatttgaatggttaaagcagtca-cagggcataagccctca---ctgctttatgtttatgcaatggactcaacttgtgtatatctact 807  T
Q  350 tacaact 356  Q
    |||||||    
T  806 tacaact 800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Original strand, 1285 - 1371
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   ||| | | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  1285 atgcatgtggtaccaatttacaaggcagaagccctcaccgtatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 1371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 134 - 39
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  134 aaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaacggttaaagcattcatcgagacataagtcctcaccgct 39  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 1904 - 1841
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1904 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 1841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 15641 - 15579
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  15641 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaagcattcat 15579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Original strand, 8474 - 8560
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcacc-gcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  8474 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccagatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 8560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 304
Target Start/End: Original strand, 19794 - 19876
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcac 304  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  19794 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcac 19876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 305
Target Start/End: Original strand, 45527 - 45583
Alignment:
Q  250 gaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  45527 gaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 45583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Original strand, 29801 - 29887
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  29801 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcaggttataagccctcaccgct 29887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 292
Target Start/End: Original strand, 44580 - 44651
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaagcattcatcaggac 292  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | ||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44580 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcgccactattttgaatggttaaagcattcatcaggac 44651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Original strand, 27861 - 27924
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27861 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 27924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Original strand, 2868 - 2954
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   | ||||| | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  2868 atgcatgtggtaccaatttataggacagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccttcaccgct 2954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Original strand, 10341 - 10403
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10341 atgcatgtggtaccataatcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 10403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 185 - 139
Alignment:
Q  310 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  185 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1290 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1290
Description:

Target: scaffold1290; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 1447 - 1379
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcagg 290  Q
    ||||||||||||||||   | ||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1447 atgcatgtggtaccaatttatagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatcagg 1379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 305
Target Start/End: Original strand, 2252 - 2332
Alignment:
Q  229 catgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    |||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  2252 catgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatattgaatggttaaggcattcatcagggcctaagccctcacc 2332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 4895 - 4841
Alignment:
Q  252 agccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  4895 agccctcaccgagttttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 4841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 1090 - 1022
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcagg 290  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  1090 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagg 1022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 356
Target Start/End: Original strand, 7409 - 7455
Alignment:
Q  310 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7409 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 7455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 286
Target Start/End: Original strand, 165 - 238
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  165 aaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccactaattgaatggttaaagcattcat 238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 308
Target Start/End: Original strand, 9372 - 9414
Alignment:
Q  266 ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  9372 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgct 9414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 41634 - 41588
Alignment:
Q  310 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41634 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 41588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 41803 - 41732
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  41803 aaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc-ccgctaatgaatggttaaagcattcat 41732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 22889 - 22821
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcagg 290  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22889 atgcatgtggtaccaatttacagggcaaaagccctcaccgagttttgaatggttaaagcattcatcagg 22821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20535 - 20489
Alignment:
Q  310 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 356  Q
    |||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20535 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 20489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1853 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1853
Description:

Target: scaffold1853; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 987 - 921
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc--ttttgaatggttaaagcattcatc 287  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  987 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatttttgaatggttaaagcattcatc 921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1615 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1615
Description:

Target: scaffold1615; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 603 - 532
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  603 aaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc-ccgctaatgaatggttaaagcattcat 532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 289
Target Start/End: Original strand, 9523 - 9590
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcag 289  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  9523 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcttcag 9590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 17125 - 17054
Alignment:
Q  217 aaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  17125 aaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc-ccgctaatgaatggttaaagcattcat 17054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 47589 - 47529
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  47589 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattc 47529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 56623 - 56563
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  56623 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattc 56563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 63009 - 62949
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 284  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  63009 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattc 62949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 355
Target Start/End: Original strand, 17637 - 17682
Alignment:
Q  310 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 355  Q
    |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17637 ttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 17682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0661 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0661
Description:

Target: scaffold0661; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 4244 - 4188
Alignment:
Q  250 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 305  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  4244 gaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacc 4188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Original strand, 5513 - 5576
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  5513 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaattgttaaagcattcat 5576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 311 - 358
Target Start/End: Original strand, 19439 - 19487
Alignment:
Q  311 tttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaactga 358  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  19439 tttatgcttatgcaatgaactccacttgtgtatatctacatacaactga 19487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Original strand, 6593 - 6656
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6593 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 6656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Original strand, 25583 - 25669
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||    
T  25583 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccgaatattgaatggttaaagcattcatcacggcataagccctcaccgct 25669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 224 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 52816 - 52753
Alignment:
Q  224 atatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 284  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  52816 atatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattc 52753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Original strand, 76714 - 76800
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 308  Q
    ||||||||||||||||   ||| | | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  76714 atgcatgtggtaccaatttacaaggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagagcataagccctcaccgct 76800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 44294 - 44231
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  44294 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 44231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 49360 - 49297
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  49360 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 49297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 286
Target Start/End: Original strand, 370396 - 370459
Alignment:
Q  226 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 286  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  370396 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 370459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University