View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14209_low_1 (Length: 462)

Name: NF14209_low_1
Description: NF14209
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14209_low_1
NF14209_low_1
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (34-453)||(41394222-41394641)
chr1 (115-453)||(20931345-20931682)
chr1 (115-453)||(20913037-20913367)
chr1 (201-453)||(5072388-5072640)
chr1 (201-453)||(18601118-18601370)
chr1 (115-453)||(20893551-20893889)
chr1 (115-453)||(37844374-37844714)
chr1 (115-453)||(20445679-20446019)
chr1 (115-453)||(20531444-20531783)
chr1 (116-453)||(22227809-22228146)
chr1 (116-453)||(22232506-22232843)
chr1 (201-449)||(2116258-2116506)
chr1 (114-387)||(45051489-45051759)
chr1 (189-336)||(51452608-51452755)
chr1 (34-147)||(21860334-21860448)
chr1 (34-147)||(44034789-44034903)
chr1 (18-181)||(27675086-27675250)
chr1 (34-131)||(20177513-20177611)
chr1 (34-147)||(41218728-41218842)
chr1 (34-131)||(13376670-13376768)
chr1 (15-92)||(51627457-51627535)
chr1 (116-147)||(15861327-15861358)
chr1 (34-92)||(19603469-19603527)
chr1 (34-92)||(22829239-22829297)
chr1 (34-91)||(9783879-9783936)
chr1 (206-246)||(16646118-16646158)
chr1 (25-131)||(37233663-37233770)
chr1 (409-449)||(45051446-45051486)
chr1 (115-147)||(51452809-51452841)
[»] chr6 (37 HSPs)
chr6 (201-453)||(25175563-25175815)
chr6 (201-453)||(27653983-27654235)
chr6 (201-453)||(16825752-16826006)
chr6 (115-442)||(23153458-23153786)
chr6 (116-449)||(14626045-14626377)
chr6 (114-449)||(1650020-1650352)
chr6 (189-442)||(1657748-1657999)
chr6 (189-453)||(35009439-35009702)
chr6 (189-442)||(15862484-15862734)
chr6 (34-147)||(19983110-19983224)
chr6 (34-147)||(35014975-35015089)
chr6 (115-184)||(23148266-23148335)
chr6 (15-100)||(35135804-35135891)
chr6 (15-100)||(33325061-33325148)
chr6 (34-147)||(18583640-18583754)
chr6 (34-131)||(21623506-21623603)
chr6 (189-385)||(29665941-29666137)
chr6 (34-147)||(25919935-25920048)
chr6 (34-92)||(15079524-15079582)
chr6 (189-274)||(27751603-27751688)
chr6 (25-131)||(22361568-22361676)
chr6 (205-289)||(29605612-29605696)
chr6 (73-146)||(14152632-14152705)
chr6 (115-147)||(18002395-18002427)
chr6 (115-147)||(23995247-23995279)
chr6 (115-147)||(26090059-26090091)
chr6 (116-147)||(4991396-4991427)
chr6 (205-287)||(18629608-18629691)
chr6 (115-145)||(15742120-15742150)
chr6 (207-289)||(17083200-17083282)
chr6 (115-147)||(1657661-1657693)
chr6 (115-147)||(15862789-15862821)
chr6 (206-246)||(18399144-18399184)
chr6 (115-147)||(18823283-18823315)
chr6 (115-147)||(18839138-18839170)
chr6 (115-147)||(27751742-27751774)
chr6 (115-147)||(32276659-32276691)
[»] chr5 (48 HSPs)
chr5 (201-453)||(25426628-25426880)
chr5 (201-453)||(12374-12626)
chr5 (201-453)||(19499899-19500151)
chr5 (201-453)||(22366481-22366733)
chr5 (204-453)||(18777995-18778244)
chr5 (201-453)||(21073595-21073847)
chr5 (115-453)||(23506965-23507302)
chr5 (204-453)||(43443398-43443647)
chr5 (115-453)||(27182471-27182810)
chr5 (201-453)||(4199985-4200237)
chr5 (205-453)||(27009841-27010089)
chr5 (115-453)||(22053753-22054096)
chr5 (115-453)||(18530988-18531330)
chr5 (201-401)||(29188284-29188483)
chr5 (189-442)||(34939289-34939540)
chr5 (189-336)||(20623085-20623232)
chr5 (189-336)||(21233528-21233675)
chr5 (191-335)||(25900408-25900552)
chr5 (189-336)||(16536313-16536460)
chr5 (189-336)||(37052860-37053007)
chr5 (34-147)||(5450654-5450768)
chr5 (34-147)||(432783-432896)
chr5 (19-131)||(21222405-21222519)
chr5 (34-147)||(7728742-7728855)
chr5 (34-100)||(23494287-23494356)
chr5 (74-146)||(11584374-11584446)
chr5 (34-91)||(19405916-19405973)
chr5 (205-289)||(29918127-29918212)
chr5 (196-285)||(32950862-32950951)
chr5 (115-147)||(16105967-16105999)
chr5 (115-147)||(20623286-20623318)
chr5 (115-147)||(21233442-21233474)
chr5 (115-147)||(25900320-25900352)
chr5 (409-449)||(29190482-29190522)
chr5 (115-147)||(37053061-37053093)
chr5 (205-287)||(21310709-21310792)
chr5 (19-91)||(23466812-23466886)
chr5 (15-92)||(32965941-32966019)
chr5 (206-287)||(5450844-5450926)
chr5 (34-100)||(11336999-11337065)
chr5 (34-99)||(16595876-16595941)
chr5 (412-453)||(17471803-17471844)
chr5 (34-91)||(24182946-24183002)
chr5 (115-147)||(108728-108760)
chr5 (115-147)||(9730278-9730310)
chr5 (115-147)||(16536514-16536546)
chr5 (206-246)||(16595713-16595753)
chr5 (44-131)||(37983701-37983789)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (201-453)||(19886661-19886913)
chr2 (115-448)||(462743-463075)
chr2 (74-453)||(20627197-20627576)
chr2 (34-453)||(19794547-19794967)
chr2 (34-453)||(43642799-43643220)
chr2 (115-453)||(8891242-8891581)
chr2 (115-453)||(36982364-36982704)
chr2 (189-453)||(17396653-17396916)
chr2 (115-453)||(24341309-24341652)
chr2 (189-453)||(25265390-25265653)
chr2 (239-453)||(7507894-7508107)
chr2 (189-336)||(19689401-19689548)
chr2 (189-336)||(23820187-23820334)
chr2 (189-336)||(14906440-14906587)
chr2 (115-211)||(22863169-22863267)
chr2 (189-336)||(20015127-20015274)
chr2 (74-147)||(22275045-22275118)
chr2 (74-147)||(22284278-22284351)
chr2 (74-146)||(15633538-15633610)
chr2 (34-100)||(19668922-19668988)
chr2 (15-90)||(7321897-7321974)
chr2 (34-131)||(25305769-25305867)
chr2 (44-131)||(43646232-43646320)
chr2 (34-126)||(19660221-19660313)
chr2 (206-287)||(68156-68238)
chr2 (34-181)||(31145992-31146138)
chr2 (114-147)||(19689314-19689347)
chr2 (34-91)||(27262181-27262238)
chr2 (115-147)||(9652796-9652828)
chr2 (115-147)||(14906354-14906386)
chr2 (115-147)||(23820388-23820420)
chr2 (34-90)||(28974426-28974482)
chr2 (15-91)||(22579656-22579733)
chr2 (116-147)||(25213372-25213403)
chr2 (73-147)||(19666848-19666922)
chr2 (206-287)||(22775206-22775288)
chr2 (206-287)||(22780584-22780666)
chr2 (115-147)||(7507757-7507789)
chr2 (115-147)||(17396567-17396599)
chr2 (115-147)||(20015328-20015360)
chr2 (15-90)||(24571084-24571162)
chr2 (115-147)||(28031134-28031166)
chr2 (115-147)||(33128372-33128404)
chr2 (206-285)||(43646059-43646139)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (115-451)||(3508-3843)
scaffold0266 (115-453)||(1124-1462)
[»] chr7 (52 HSPs)
chr7 (34-453)||(3059966-3060385)
chr7 (201-453)||(10989410-10989661)
chr7 (200-453)||(2437457-2437710)
chr7 (115-451)||(16211768-16212103)
chr7 (115-453)||(13036938-13037277)
chr7 (201-453)||(13911024-13911277)
chr7 (115-448)||(11580661-11580997)
chr7 (115-453)||(36052667-36053003)
chr7 (205-453)||(13572676-13572924)
chr7 (196-453)||(18253842-18254098)
chr7 (189-447)||(25292338-25292595)
chr7 (189-453)||(47481031-47481294)
chr7 (226-453)||(16478987-16479213)
chr7 (189-453)||(7293017-7293279)
chr7 (190-453)||(13321014-13321278)
chr7 (189-336)||(11516343-11516490)
chr7 (189-336)||(15441564-15441711)
chr7 (189-336)||(30262129-30262276)
chr7 (34-181)||(13377819-13377965)
chr7 (74-147)||(32493905-32493978)
chr7 (34-147)||(126738-126852)
chr7 (15-92)||(49047467-49047546)
chr7 (34-147)||(111087-111201)
chr7 (34-147)||(1936835-1936949)
chr7 (18-89)||(13275155-13275228)
chr7 (34-131)||(13389693-13389790)
chr7 (117-310)||(295893-296087)
chr7 (34-146)||(7283874-7283987)
chr7 (115-221)||(36024372-36024485)
chr7 (19-91)||(16569802-16569876)
chr7 (19-91)||(16595786-16595860)
chr7 (206-287)||(13377693-13377775)
chr7 (30-130)||(16919870-16919972)
chr7 (34-131)||(17223748-17223846)
chr7 (115-147)||(2029244-2029276)
chr7 (115-147)||(7293333-7293365)
chr7 (115-147)||(11516544-11516576)
chr7 (115-147)||(14113903-14113935)
chr7 (115-147)||(15441478-15441510)
chr7 (115-184)||(15709428-15709501)
chr7 (115-147)||(30262043-30262075)
chr7 (115-147)||(42056188-42056220)
chr7 (205-287)||(16914928-16915011)
chr7 (44-125)||(14271721-14271803)
chr7 (115-147)||(371417-371449)
chr7 (115-147)||(3049905-3049937)
chr7 (115-147)||(13321334-13321366)
chr7 (189-221)||(14113989-14114021)
chr7 (189-221)||(14423639-14423671)
chr7 (119-147)||(15516765-15516793)
chr7 (115-147)||(25124450-25124482)
chr7 (115-147)||(47480944-47480976)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (201-453)||(47357654-47357906)
chr4 (77-453)||(54118130-54118507)
chr4 (115-453)||(13246430-13246769)
chr4 (205-453)||(10644219-10644467)
chr4 (115-353)||(121989-122226)
chr4 (189-445)||(13048221-13048477)
chr4 (115-453)||(15675009-15675352)
chr4 (115-385)||(10104170-10104445)
chr4 (189-453)||(26680201-26680463)
chr4 (216-453)||(31115629-31115865)
chr4 (189-336)||(10488678-10488825)
chr4 (189-336)||(16327926-16328073)
chr4 (115-252)||(33240900-33241043)
chr4 (34-147)||(25119025-25119139)
chr4 (356-453)||(111395-111492)
chr4 (34-100)||(34177461-34177528)
chr4 (34-147)||(5682346-5682460)
chr4 (21-100)||(15045196-15045277)
chr4 (21-100)||(15109147-15109228)
chr4 (34-147)||(19821589-19821702)
chr4 (38-147)||(41165772-41165881)
chr4 (115-221)||(31132545-31132657)
chr4 (205-385)||(40885570-40885749)
chr4 (15-100)||(13809303-13809390)
chr4 (25-131)||(47534882-47534990)
chr4 (34-100)||(27961339-27961405)
chr4 (34-91)||(52265321-52265378)
chr4 (206-287)||(15044992-15045074)
chr4 (409-453)||(10104450-10104494)
chr4 (115-147)||(14952085-14952117)
chr4 (115-147)||(15135907-15135939)
chr4 (115-147)||(15272211-15272243)
chr4 (115-147)||(16327840-16327872)
chr4 (115-147)||(16609013-16609045)
chr4 (115-147)||(26680517-26680549)
chr4 (206-287)||(15109350-15109432)
chr4 (115-147)||(8045272-8045304)
chr4 (115-147)||(16523146-16523178)
[»] chr3 (76 HSPs)
chr3 (115-453)||(14842487-14842824)
chr3 (201-453)||(55316219-55316471)
chr3 (201-453)||(41270075-41270327)
chr3 (115-453)||(2049810-2050147)
chr3 (115-453)||(12030073-12030410)
chr3 (34-453)||(16743959-16744377)
chr3 (115-442)||(13838905-13839232)
chr3 (226-453)||(16821139-16821366)
chr3 (189-453)||(13975722-13975985)
chr3 (152-453)||(15858986-15859287)
chr3 (189-453)||(45860805-45861068)
chr3 (179-454)||(51158008-51158282)
chr3 (189-453)||(13954890-13955153)
chr3 (196-453)||(15936634-15936890)
chr3 (196-450)||(15938476-15938729)
chr3 (34-252)||(19231981-19232203)
chr3 (114-449)||(15614838-15615170)
chr3 (189-453)||(17912483-17912744)
chr3 (115-235)||(19260749-19260869)
chr3 (189-336)||(2449238-2449385)
chr3 (34-147)||(55513193-55513307)
chr3 (34-150)||(15857081-15857198)
chr3 (34-147)||(2844514-2844628)
chr3 (74-147)||(3992873-3992946)
chr3 (34-147)||(7854305-7854419)
chr3 (15-147)||(38810805-38810941)
chr3 (74-147)||(54037983-54038056)
chr3 (74-147)||(17955839-17955916)
chr3 (34-100)||(48421945-48422011)
chr3 (15-92)||(17139884-17139963)
chr3 (25-131)||(3576240-3576347)
chr3 (34-147)||(45581954-45582068)
chr3 (34-100)||(12487590-12487656)
chr3 (15-82)||(14080879-14080948)
chr3 (44-131)||(17205019-17205107)
chr3 (25-129)||(12031849-12031955)
chr3 (15-180)||(16880414-16880579)
chr3 (44-131)||(17191879-17191967)
chr3 (34-147)||(11328778-11328891)
chr3 (38-146)||(15550922-15551030)
chr3 (340-453)||(47984650-47984763)
chr3 (340-453)||(47993937-47994050)
chr3 (340-453)||(48003224-48003337)
chr3 (340-453)||(48012510-48012623)
chr3 (19-91)||(14527876-14527950)
chr3 (36-91)||(55440673-55440728)
chr3 (34-147)||(11882032-11882145)
chr3 (73-147)||(13301322-13301396)
chr3 (73-147)||(13311978-13312052)
chr3 (196-285)||(11986173-11986262)
chr3 (205-246)||(14080715-14080756)
chr3 (19-89)||(14295817-14295889)
chr3 (19-89)||(14301444-14301516)
chr3 (412-453)||(15468555-15468596)
chr3 (115-147)||(2449152-2449184)
chr3 (205-289)||(4145814-4145898)
chr3 (19-92)||(12560032-12560107)
chr3 (115-147)||(16261777-16261809)
chr3 (115-147)||(16933869-16933901)
chr3 (115-147)||(17912398-17912430)
chr3 (115-147)||(23492696-23492728)
chr3 (115-147)||(38168237-38168269)
chr3 (115-147)||(53771365-53771397)
chr3 (206-287)||(30207380-30207462)
chr3 (205-289)||(6228625-6228710)
chr3 (34-91)||(8632165-8632222)
chr3 (412-453)||(22275209-22275250)
chr3 (115-147)||(11986080-11986112)
chr3 (115-147)||(13954804-13954836)
chr3 (206-246)||(14059214-14059254)
chr3 (115-147)||(14285289-14285321)
chr3 (115-147)||(19947026-19947058)
chr3 (115-147)||(30153265-30153297)
chr3 (115-147)||(33342204-33342236)
chr3 (115-147)||(45861122-45861154)
chr3 (115-147)||(51961031-51961063)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (115-453)||(48598-48935)
scaffold0023 (226-453)||(36093-36320)
scaffold0023 (115-147)||(61122-61154)
[»] chr8 (41 HSPs)
chr8 (115-454)||(16193643-16193980)
chr8 (201-453)||(30120722-30120974)
chr8 (115-453)||(43373392-43373731)
chr8 (263-453)||(222753-222943)
chr8 (263-453)||(736376-736566)
chr8 (263-453)||(860271-860461)
chr8 (201-453)||(16674392-16674644)
chr8 (34-453)||(16404818-16405235)
chr8 (115-442)||(24928716-24929043)
chr8 (205-453)||(21844576-21844824)
chr8 (205-453)||(21851969-21852217)
chr8 (201-449)||(6774258-6774505)
chr8 (201-449)||(24548986-24549233)
chr8 (189-453)||(22907214-22907476)
chr8 (189-442)||(17345581-17345832)
chr8 (189-336)||(5238203-5238350)
chr8 (189-336)||(24661248-24661395)
chr8 (189-336)||(43685662-43685809)
chr8 (34-147)||(24716680-24716794)
chr8 (263-325)||(691908-691970)
chr8 (74-147)||(274766-274839)
chr8 (74-147)||(641010-641083)
chr8 (74-147)||(826816-826889)
chr8 (34-147)||(38533971-38534084)
chr8 (15-100)||(39446558-39446645)
chr8 (18-92)||(21259292-21259368)
chr8 (18-131)||(17285543-17285659)
chr8 (34-131)||(21197965-21198062)
chr8 (34-147)||(39115598-39115712)
chr8 (34-131)||(23837536-23837634)
chr8 (34-98)||(22981639-22981703)
chr8 (115-147)||(5238404-5238436)
chr8 (115-147)||(22907128-22907160)
chr8 (115-147)||(24385652-24385684)
chr8 (115-147)||(24661162-24661194)
chr8 (115-147)||(43685863-43685895)
chr8 (205-287)||(26011658-26011741)
chr8 (34-91)||(20561445-20561501)
chr8 (115-147)||(2545265-2545297)
chr8 (115-147)||(3431176-3431208)
chr8 (115-147)||(22886654-22886686)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (115-453)||(5990-6326)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (115-453)||(882-1218)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (115-453)||(8878-9215)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (115-453)||(12115-12450)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (115-442)||(171916-172242)
scaffold0001 (115-442)||(177619-177945)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (226-453)||(42997-43224)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (115-449)||(41733-42066)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (114-453)||(36836-37176)
scaffold0077 (34-146)||(15285-15398)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (115-442)||(247366-247694)
scaffold0012 (115-147)||(34075-34107)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (118-453)||(19206-19543)
scaffold0195 (189-453)||(21290-21553)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (115-453)||(26340-26678)
scaffold0162 (189-336)||(8180-8327)
scaffold0162 (25-131)||(6826-6934)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (115-453)||(128095-128431)
scaffold0008 (226-453)||(31700-31928)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (125-453)||(4996-5324)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (115-453)||(123087-123427)
[»] scaffold0772 (2 HSPs)
scaffold0772 (196-429)||(5552-5785)
scaffold0772 (115-147)||(5846-5878)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (205-453)||(35-283)
scaffold0116 (34-147)||(30417-30531)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (115-447)||(272031-272362)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (196-453)||(48187-48443)
scaffold0049 (34-146)||(20493-20606)
[»] scaffold0026 (4 HSPs)
scaffold0026 (205-453)||(64527-64780)
scaffold0026 (196-453)||(107747-108003)
scaffold0026 (19-91)||(89661-89735)
scaffold0026 (204-246)||(89863-89905)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (117-335)||(51110-51328)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (200-453)||(21115-21367)
scaffold0139 (226-453)||(14086-14312)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (163-453)||(148721-149012)
scaffold0025 (115-453)||(8849-9192)
scaffold0025 (115-215)||(146838-146938)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (239-453)||(5254-5466)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (239-453)||(3722-3936)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (115-335)||(89378-89600)
scaffold0028 (115-240)||(107708-107835)
scaffold0028 (15-63)||(79944-79993)
scaffold0028 (116-147)||(130880-130911)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (226-449)||(9374-9596)
scaffold0215 (226-449)||(16272-16494)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (201-347)||(1304-1450)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (189-453)||(534-797)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (189-453)||(34460-34724)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (189-453)||(37066-37328)
scaffold0078 (34-147)||(41632-41746)
scaffold0078 (115-147)||(36980-37012)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (189-453)||(41648-41911)
scaffold0125 (115-155)||(41957-41997)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (200-449)||(2966-3215)
[»] scaffold0132 (3 HSPs)
scaffold0132 (189-453)||(13506-13769)
scaffold0132 (34-147)||(42677-42788)
scaffold0132 (115-147)||(13824-13856)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (347-453)||(9-115)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (347-453)||(48514-48620)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (201-357)||(13325-13480)
[»] scaffold0141 (4 HSPs)
scaffold0141 (189-336)||(26911-27058)
scaffold0141 (196-336)||(22656-22796)
scaffold0141 (115-147)||(22857-22889)
scaffold0141 (115-147)||(27112-27144)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (189-336)||(1582-1729)
scaffold0124 (115-147)||(1496-1528)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (34-131)||(442-539)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (34-147)||(5695-5809)
scaffold0686 (74-147)||(5942-6015)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (34-147)||(31098-31212)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (34-147)||(80187-80301)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (34-148)||(166082-166197)
scaffold0016 (74-148)||(162037-162111)
scaffold0016 (34-147)||(116370-116483)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (356-453)||(9382-9479)
[»] scaffold0456 (4 HSPs)
scaffold0456 (35-100)||(1360-1425)
scaffold0456 (35-100)||(8505-8570)
scaffold0456 (205-246)||(1546-1587)
scaffold0456 (205-246)||(8691-8732)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (15-100)||(11461-11548)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (34-92)||(1161-1219)
scaffold0409 (34-92)||(9416-9474)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (34-100)||(6036-6102)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (34-131)||(35816-35914)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (34-146)||(19768-19881)
scaffold0122 (34-146)||(24072-24185)
[»] scaffold0123 (3 HSPs)
scaffold0123 (15-92)||(8386-8465)
scaffold0123 (15-92)||(11252-11331)
scaffold0123 (205-287)||(8174-8257)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (15-100)||(33520-33607)
[»] scaffold0092 (2 HSPs)
scaffold0092 (15-92)||(3695-3774)
scaffold0092 (206-246)||(3525-3565)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (74-148)||(311-385)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (34-92)||(22242-22300)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (34-146)||(1701-1814)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (189-282)||(3360-3453)
scaffold0361 (397-451)||(3210-3264)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (38-147)||(2134-2243)
scaffold0243 (206-287)||(2317-2399)
[»] scaffold0589 (2 HSPs)
scaffold0589 (15-92)||(8181-8260)
scaffold0589 (206-246)||(8011-8051)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (15-147)||(10982-11116)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (76-146)||(94-164)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (34-131)||(6999-7097)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (34-96)||(93664-93726)
scaffold0032 (115-147)||(55904-55936)
scaffold0032 (115-147)||(108075-108107)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (47-100)||(1948-2001)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (74-146)||(6263-6335)
scaffold0310 (109-146)||(4-41)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (72-147)||(1361-1436)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (196-285)||(56106-56195)
[»] scaffold0058 (3 HSPs)
scaffold0058 (19-92)||(70102-70177)
scaffold0058 (115-147)||(57392-57424)
scaffold0058 (205-246)||(70307-70348)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (34-131)||(76658-76756)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (114-147)||(193396-193429)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (115-147)||(6443-6475)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (115-147)||(878-910)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (115-147)||(9882-9914)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (115-147)||(13285-13317)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (25-131)||(43603-43708)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (44-131)||(31357-31445)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (49-131)||(632-715)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (115-158)||(18015-18058)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (19-91)||(12066-12140)
scaffold0021 (34-91)||(16278-16335)
scaffold0021 (34-91)||(25809-25866)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (239-285)||(45198-45244)
scaffold0066 (115-147)||(45338-45370)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (34-91)||(2292-2349)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (34-91)||(34039-34096)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (115-147)||(17209-17241)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (115-147)||(5476-5508)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (115-147)||(4346-4378)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (115-147)||(17304-17336)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (115-147)||(5549-5581)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (115-147)||(34308-34340)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (115-147)||(12418-12450)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (44-131)||(197076-197163)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 34 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 41394641 - 41394222
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| || | |||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394641 agagaggaggagcttgaagaattcaagggtttggagaatcataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagt 41394542  T
Q  133 ctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatg 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  41394541 ctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatg 41394442  T
Q  233 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtga 332  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||    
T  41394441 tttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 41394342  T
Q  333 atttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatg 432  Q
    |||| | ||||||| ||||||  ||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | || |||||||||    
T  41394341 attt-tgctaagttattgttatgttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgattgggtatg 41394243  T
Q  433 catattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  41394242 catattcatggattgatgatg 41394222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 20931682 - 20931345
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 214  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20931682 taaggtaagggggttagcctttatcataatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaagtttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 20931583  T
Q  215 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 314  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  20931582 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20931483  T
Q  315 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 414  Q
    |||||||||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  20931482 attgtgctaaattggtgaattt-tgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatg 20931384  T
Q  415 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20931383 aataatttcttgggtatgcatattcatgaattaatgatg 20931345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 20913367 - 20913037
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  20913367 taaggtaagggggttagtctttatcgtaatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaattttgcttacggataattgttgctaaattcgtgc 20913268  T
Q  215 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 314  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  20913267 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20913168  T
Q  315 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 414  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | | |||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  20913167 attgtgctcaattggtgaattt-tgcaaagttgttgttaatt-------tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatcttgtggttgatg 20913076  T
Q  415 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20913075 aataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 20913037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 201 - 453
Target Start/End: Original strand, 5072388 - 5072640
Alignment:
Q  201 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 300  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5072388 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 5072487  T
Q  301 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 400  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5072488 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 5072587  T
Q  401 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5072588 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 5072640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 201 - 453
Target Start/End: Original strand, 18601118 - 18601370
Alignment:
Q  201 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 300  Q
    |||||||||| |||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18601118 tgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 18601217  T
Q  301 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 400  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18601218 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 18601317  T
Q  401 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18601318 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 18601370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Original strand, 20893551 - 20893889
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  20893551 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaa-ttttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattctt 20893649  T
Q  213 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 312  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||    
T  20893650 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 20893749  T
Q  313 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 412  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||    
T  20893750 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttga 20893848  T
Q  413 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20893849 tgaatcattgtttgggtatgcatattcataaattgatgatg 20893889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Original strand, 37844374 - 37844714
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  37844374 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 37844473  T
Q  213 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta-tg 311  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||  || ||    
T  37844474 gctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataaaatagtg 37844573  T
Q  312 aagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 411  Q
    || |||||||| ||    ||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||    
T  37844574 aaaattgtgctcaattaatgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttg 37844672  T
Q  412 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  37844673 atgagtcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 37844714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 20446019 - 20445679
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  20446019 taaggtaagggagttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 20445920  T
Q  212 tgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 311  Q
    |||||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||||  ||    
T  20445919 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtg 20445820  T
Q  312 aagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 411  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  |||    
T  20445819 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttg 20445721  T
Q  412 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20445720 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20445679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 20531783 - 20531444
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 212  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  20531783 taaggtaaggaaattagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 20531684  T
Q  213 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 312  Q
    ||||||| | || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||||  |||    
T  20531683 gctccaaatgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtga 20531584  T
Q  313 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 412  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||    
T  20531583 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttga 20531485  T
Q  413 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20531484 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20531444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 116 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 22228146 - 22227809
Alignment:
Q  116 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtgc 214  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||| |||||||||||||||    
T  22228146 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 22228047  T
Q  215 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 314  Q
    ||   || || |||||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  22228046 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaa 22227947  T
Q  315 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 414  Q
    ||||||   ||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22227946 attgtgtccaattgttgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatg 22227848  T
Q  415 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22227847 aataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22227809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 116 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 22232843 - 22232506
Alignment:
Q  116 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtgc 214  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||| |||||||||||||||    
T  22232843 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 22232744  T
Q  215 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 314  Q
    ||   || || |||||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  22232743 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaa 22232644  T
Q  315 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 414  Q
    ||||||   ||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22232643 attgtgtccaattgttgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatg 22232545  T
Q  415 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22232544 aataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22232506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 201 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 2116506 - 2116258
Alignment:
Q  201 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 300  Q
    ||||| |||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2116506 tgctagattcgtgcttttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 2116407  T
Q  301 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttga-gttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 399  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||    
T  2116406 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattg 2116308  T
Q  400 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 449  Q
    || || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2116307 atgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 2116258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 114 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 45051759 - 45051489
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||  ||||| ||||||    
T  45051759 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-tgattttgca--ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgt 45051663  T
Q  213 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 312  Q
    | ||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  45051662 gttcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 45051563  T
Q  313 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttat 387  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||    
T  45051562 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttat 45051489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 51452755 - 51452608
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  51452755 atggataattgttgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 51452656  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 336  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  51452655 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 51452608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 21860448 - 21860334
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21860448 agagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagt 21860349  T
Q  133 ctttatcataatcat 147  Q
     ||||||||||||||    
T  21860348 ttttatcataatcat 21860334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Original strand, 44034789 - 44034903
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44034789 agagaagaggaacttgaagaattcaagagtttgaagaattataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagt 44034888  T
Q  133 ctttatcataatcat 147  Q
     ||||||||||||||    
T  44034889 ttttatcataatcat 44034903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 27675250 - 27675086
Alignment:
Q  18 aaagaggaaaatgg-ttagagaagag--gagcttgaagattcaaggattggaagatagc-taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataa 113  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||    
T  27675250 aaagaggaaaatgggttagagaaaagaagagcttgaagattcaag-attggaagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggagataa 27675152  T
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaat 181  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |  |  |  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  27675151 ttaaggtaagggggttagaatttatcataatcgt--ttttagtgtaaattttcaattgttgtatgaat 27675086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 20177611 - 20177513
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagc-taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 131  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20177611 agagaagaagagcttgaagattcaagaattggaagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaatggggttag 20177513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 41218842 - 41218728
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41218842 agagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagt 41218743  T
Q  133 ctttatcataatcat 147  Q
     || ||||| |||||    
T  41218742 tttcatcatgatcat 41218728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 131
Target Start/End: Original strand, 13376670 - 13376768
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattgg--aagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 131  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||  |||||  |||||||||||||||||| | | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13376670 agagaagaagagcttgaagattcaacaattggtaaagatc-ctaggagctaaagtgaagtttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 13376768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 92
Target Start/End: Original strand, 51627457 - 51627535
Alignment:
Q  15 agcaaagaggaaaatggttagaga--agaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagct 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||    
T  51627457 agcaaagaggaaaatggttagagagaaggggaacttgaagattcaaggattgg-agggagctaggagctaaattgaagct 51627535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 147
Target Start/End: Original strand, 15861327 - 15861358
Alignment:
Q  116 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861327 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15861358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 19603527 - 19603469
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagct 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||  | | ||||||||||||||||||||    
T  19603527 agagaagaggagcttgaagattcaagaagaggagaaaacctaggagctaaagtgaagct 19603469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 92
Target Start/End: Original strand, 22829239 - 22829297
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagct 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||    ||||||||||||||||||||    
T  22829239 agagaagaggagcttgaagattcaagaagaggaaggatcctaggagctaaagtgaagct 22829297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 91
Target Start/End: Original strand, 9783879 - 9783936
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagc 91  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||| ||||||    
T  9783879 agagaagaggaacttgaagaatcaaggattgggtgagagctaggagcaaaattgaagc 9783936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16646158 - 16646118
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 246  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  16646158 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 16646118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 25 - 131
Target Start/End: Original strand, 37233663 - 37233770
Alignment:
Q  25 aaaatggttagagaagagga-gcttgaagattcaaggattggaagatagc-taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa 122  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| ||| | | |||||| |||||||||||| | ||||| | |||  | ||||||||||||    
T  37233663 aaaagggttagagaagaagaagcttgaagattcaagaagtggtagagatcctaggaggtaaagtgaagcttgggctaggaattgt-gctaattaaggtaa 37233761  T
Q  123 gggggttag 131  Q
    |||||||||    
T  37233762 gggggttag 37233770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 409 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 45051486 - 45051446
Alignment:
Q  409 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 449  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45051486 ttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 45051446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 51452841 - 51452809
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51452841 taaggtaagggggttagtctttatcttaatcat 51452809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 37)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 201 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 25175815 - 25175563
Alignment:
Q  201 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 300  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175815 tgctaaattcgtgctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25175716  T
Q  301 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175715 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25175616  T
Q  401 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175615 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25175563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 201 - 453
Target Start/End: Original strand, 27653983 - 27654235
Alignment:
Q  201 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 300  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27653983 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 27654082  T
Q  301 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27654083 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttga 27654182  T
Q  401 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27654183 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattaatgatg 27654235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 201 - 453
Target Start/End: Original strand, 16825752 - 16826006
Alignment:
Q  201 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgta--taattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaa 298  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825752 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaa 16825851  T
Q  299 atgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttattt 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16825852 atgataagttatgaagattgtgctaaattggtggatttctcctaatttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatct 16825951  T
Q  399 gatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16825952 gatattatgattgatgaataattgctttgttatgcatattcatggattgatgatg 16826006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 115 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 23153786 - 23153458
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||| ||||||||||    
T  23153786 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtttctaaattcgt 23153687  T
Q  213 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 312  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||    
T  23153686 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 23153587  T
Q  313 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 412  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||| || || ||||    
T  23153586 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaattgatgttgtggttga 23153488  T
Q  413 tgaataattgcttgggtatgcatattcatg 442  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  23153487 tgaatcattacttgggtatacatattcatg 23153458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 116 - 449
Target Start/End: Original strand, 14626045 - 14626377
Alignment:
Q  116 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgct 215  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14626045 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtttgaattgtgattatggataattattgctaaattcgtgct 14626144  T
Q  216 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 315  Q
    |   || || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  14626145 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaa 14626244  T
Q  316 ttgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 415  Q
    |||||   ||  |||||| || | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  |||||||    
T  14626245 ttgtgtgcaattggtgaa-ttatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatga 14626343  T
Q  416 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 449  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14626344 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 14626377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 114 - 449
Target Start/End: Original strand, 1650020 - 1650352
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||  ||||| ||||||    
T  1650020 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-taattttgca--ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgt 1650116  T
Q  213 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 312  Q
    ||||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  1650117 gctcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaatgataagttgtga 1650216  T
Q  313 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 412  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||||    
T  1650217 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttga 1650315  T
Q  413 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 449  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1650316 tgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 1650352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 189 - 442
Target Start/End: Original strand, 1657748 - 1657999
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  1657748 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 1657847  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 388  Q
     |||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||  |||||||||     
T  1657848 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatgttatt 1657945  T
Q  389 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 442  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1657946 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 1657999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 189 - 453
Target Start/End: Original strand, 35009439 - 35009702
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  35009439 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 35009538  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 388  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  35009539 ttatgtaaaaatgtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 35009637  T
Q  389 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35009638 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 35009702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 189 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 15862734 - 15862484
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  15862734 atggataattgttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 15862635  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 388  Q
     |||| | |||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||| | | |||||||     
T  15862634 ttatgtataaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttc-atttatgttatt 15862538  T
Q  389 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 442  Q
      || || ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15862537 gctgataattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 15862484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Original strand, 19983110 - 19983224
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19983110 agagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagt 19983209  T
Q  133 ctttatcataatcat 147  Q
     ||||||||||||||    
T  19983210 ttttatcataatcat 19983224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Original strand, 35014975 - 35015089
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35014975 agagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagt 35015074  T
Q  133 ctttatcataatcat 147  Q
     ||||||||||||||    
T  35015075 ttttatcataatcat 35015089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 23148335 - 23148266
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 184  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23148335 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 23148266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Original strand, 35135804 - 35135891
Alignment:
Q  15 agcaaagaggaaaatggttagaga--agaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctag 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35135804 agcaaagaagaaaagggttagagaggagaggaacttgaagattcaaggattggaagagagctaggagctaaagtgaagcttgagctag 35135891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 33325148 - 33325061
Alignment:
Q  15 agcaaagaggaaaatggttagaga--agaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctag 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33325148 agcaaagaagaaaagggttagagaggagaggaacttaaagattcaaggattggaagagagctaggagctaaagtgaagcttgagctag 33325061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18583754 - 18583640
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||    ||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18583754 agagaagaggaacttgaagaattcaagagtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagt 18583655  T
Q  133 ctttatcataatcat 147  Q
     || |||||||||||    
T  18583654 tttcatcataatcat 18583640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21623603 - 21623506
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattgga-agatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 131  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||  |||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21623603 agagaagaagagcttgaagattcaagaattgaagagatc-ctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 21623506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 29666137 - 29665941
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg-ttca 287  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| | || || |||||| ||  |||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  29666137 atggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttca 29666038  T
Q  288 ta-tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 385  Q
     | |||||| |||||  |||||||||| ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  29666037 aagtatgcataaatgtcaagttatgaa-attgtactcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgtt 29665941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25920048 - 25919935
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtc 133  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||| ||||    | ||  ||| |||||||||||||||||      
T  25920048 agagtagaggagcttgaagattcaaggattgggggagagctaggagctaaagtgaagttagaactagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaa 25919949  T
Q  134 tttatcataatcat 147  Q
    || |||||||||||    
T  25919948 ttcatcataatcat 25919935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 92
Target Start/End: Original strand, 15079524 - 15079582
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagct 92  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  15079524 agagaagaggaacttgaagaatcaaggattggaagagagctaggagcaaaagtgaagct 15079582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27751688 - 27751603
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtga 274  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||    
T  27751688 atggataaatgtagctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggtga 27751603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 131
Target Start/End: Original strand, 22361568 - 22361676
Alignment:
Q  25 aaaatggttagagaagagga-gcttgaagattcaaggattggaagatagc-taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa 122  Q
    |||| |||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||||| |  |||| | |||| ||||||||||||||    
T  22361568 aaaagggttagagaagaagaagcttggagattcaagaattgggagagatcctaggagctaaagtgaagcttggcctaggaattggtgataattaaggtaa 22361667  T
Q  123 gggggttag 131  Q
    |||||||||    
T  22361668 gggggttag 22361676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 29605696 - 29605612
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 289  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||||| |||||||||||  || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29605696 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcata 29605612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 73 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 14152705 - 14152632
Alignment:
Q  73 ctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 146  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| | || | | ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  14152705 ctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggcaagggggttattcttcatcataatca 14152632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 18002395 - 18002427
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002395 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 18002427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23995279 - 23995247
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995279 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23995247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 26090091 - 26090059
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090091 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26090059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 4991427 - 4991396
Alignment:
Q  116 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991427 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 4991396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 287
Target Start/End: Original strand, 18629608 - 18629691
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 287  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||| |||||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  18629608 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 18629691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 145
Target Start/End: Original strand, 15742120 - 15742150
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatc 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742120 taaggtaagggggttagtctttatcataatc 15742150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 289
Target Start/End: Original strand, 17083200 - 17083282
Alignment:
Q  207 attcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 289  Q
    |||||||||| || |||| || |||||||| |||||||||||| || || ||| ||  ||||||||||||||  |||||||||    
T  17083200 attcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcata 17083282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 1657661 - 1657693
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1657661 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 1657693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15862821 - 15862789
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15862821 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 15862789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18399184 - 18399144
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 246  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  18399184 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 18399144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 18823283 - 18823315
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18823283 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 18823315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 18839138 - 18839170
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18839138 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 18839170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27751774 - 27751742
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27751774 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 27751742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 32276659 - 32276691
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32276659 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 32276691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 48)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 201 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 25426880 - 25426628
Alignment:
Q  201 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 300  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426880 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25426781  T
Q  301 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426780 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25426681  T
Q  401 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426680 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25426628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 201 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 12626 - 12374
Alignment:
Q  201 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 300  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12626 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 12527  T
Q  301 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12526 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 12427  T
Q  401 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12426 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 201 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 19500151 - 19499899
Alignment:
Q  201 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 300  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500151 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 19500052  T
Q  301 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500051 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19499952  T
Q  401 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19499951 tattatgattgattaataattgctttggtatgcatattcatggattgatgatg 19499899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 201 - 453
Target Start/End: Original strand, 22366481 - 22366733
Alignment:
Q  201 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 300  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366481 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 22366580  T
Q  301 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366581 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 22366680  T
Q  401 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366681 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 22366733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 204 - 453
Target Start/End: Original strand, 18777995 - 18778244
Alignment:
Q  204 taaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 303  Q
    |||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18777995 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 18778094  T
Q  304 aagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 403  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18778095 aagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatat 18778194  T
Q  404 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778195 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 18778244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 201 - 453
Target Start/End: Original strand, 21073595 - 21073847
Alignment:
Q  201 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 300  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073595 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 21073694  T
Q  301 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21073695 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttga 21073794  T
Q  401 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073795 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 21073847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 23507302 - 23506965
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  23507302 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatctccattttgtaagatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 23507203  T
Q  215 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 314  Q
    ||||  | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  23507202 tccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 23507103  T
Q  315 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 414  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  23507102 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatg 23507004  T
Q  415 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23507003 aataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 23506965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 204 - 453
Target Start/End: Original strand, 43443398 - 43443647
Alignment:
Q  204 taaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 303  Q
    |||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443398 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 43443497  T
Q  304 aagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 403  Q
    |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443498 aagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 43443597  T
Q  404 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43443598 tatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 43443647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Original strand, 27182471 - 27182810
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  27182471 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 27182570  T
Q  213 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 312  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||    
T  27182571 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 27182670  T
Q  313 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 412  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||    
T  27182671 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttga 27182769  T
Q  413 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27182770 tgaatcattgcttgagtatgcatattcatgaattgatgatg 27182810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 201 - 453
Target Start/End: Original strand, 4199985 - 4200237
Alignment:
Q  201 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 300  Q
    ||||||||||||||||    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4199985 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 4200084  T
Q  301 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 400  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4200085 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttga 4200184  T
Q  401 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4200185 tattatgattgatgaatgattgcttgggtttgcatattcatgggttgatgatg 4200237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 205 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 27010089 - 27009841
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 304  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  27010089 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 27009990  T
Q  305 agttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 404  Q
    ||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27009989 agttatgaatattgtactcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 27009890  T
Q  405 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27009889 atgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 27009841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Original strand, 22053753 - 22054096
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 208  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  22053753 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgaaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 22053852  T
Q  209 tcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 308  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||    
T  22053853 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 22053952  T
Q  309 atgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 408  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |      
T  22053953 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttg 22054051  T
Q  409 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  22054052 ttgatgaatcattgcttgggtctacatattcatgaattgatgatg 22054096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Original strand, 18530988 - 18531330
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatc---atcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaat-tttgattat-ggatgattgttgctaaatt 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| || || |||| ||||||||||||||    
T  18530988 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcgtcatcatcattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatgtttcataattggataattgttgctaaatt 18531087  T
Q  210 cgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 309  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||     
T  18531088 cgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttg 18531187  T
Q  310 tgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 409  Q
    |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  |    
T  18531188 tgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgt 18531286  T
Q  410 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18531287 tgatgaatcattgctcgggtatacatattcatgaattgatgatg 18531330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 201 - 401
Target Start/End: Original strand, 29188284 - 29188483
Alignment:
Q  201 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 300  Q
    ||||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29188284 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 29188383  T
Q  301 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 400  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  29188384 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattga 29188482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 189 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 34939540 - 34939289
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  34939540 atggataactgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 34939441  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 388  Q
     |||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||  |||| || ||||||| |||||||||||||  |||||||||     
T  34939440 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagtcattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatgttatt 34939343  T
Q  389 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 442  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  34939342 gctgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 34939289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 189 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 20623232 - 20623085
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  20623232 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 20623133  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 336  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  20623132 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 20623085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 189 - 336
Target Start/End: Original strand, 21233528 - 21233675
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  21233528 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 21233627  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 336  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  21233628 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 21233675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 335
Target Start/End: Original strand, 25900408 - 25900552
Alignment:
Q  191 ggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatat 290  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||| |||||   ||    
T  25900408 ggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaat 25900507  T
Q  291 atgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatt 335  Q
    |||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  25900508 atgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatt 25900552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 189 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 16536460 - 16536313
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  16536460 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16536361  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 336  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  16536360 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 16536313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 189 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 37053007 - 37052860
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  37053007 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37052908  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 336  Q
    |||||   |||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  37052907 atatgtggaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 37052860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Original strand, 5450654 - 5450768
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagc-taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||| | ||||| | |||   ||||||||||||||||||||||     
T  5450654 agagaagaggagcttgaagattcaagaattggaagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattgataataattaaggtaagggggttaga 5450753  T
Q  133 ctttatcataatcat 147  Q
     || |||||||||||    
T  5450754 attcatcataatcat 5450768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 432896 - 432783
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtc 133  Q
    |||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    | ||  ||| |||||||||||||||||      
T  432896 agagaatagaagcttgaagattcaagaattggaagagagctaggagctaaagtgaagctagagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaa 432797  T
Q  134 tttatcataatcat 147  Q
    || |||||||||||    
T  432796 ttcatcataatcat 432783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 131
Target Start/End: Original strand, 21222405 - 21222519
Alignment:
Q  19 aagaggaaaatggttagagaagagga-gcttgaagattcaaggattggaagatagc-taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataatta 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||    
T  21222405 aagaggaaaagggttagagaagaagaagcttgaagattcaagaattggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataatta 21222504  T
Q  117 aggtaagggggttag 131  Q
    ||||| |||||||||    
T  21222505 aggtatgggggttag 21222519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 7728855 - 7728742
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtc 133  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    | ||  ||| |||||||||||||||||      
T  7728855 agagaagaggaacttgaagattcaaagattagaagagagctaggagctaaagtgaagctagagccagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaa 7728756  T
Q  134 tttatcataatcat 147  Q
    || |||||||||||    
T  7728755 ttcatcataatcat 7728742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 23494356 - 23494287
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatag---ctaggagctaaagtgaagctagagctag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23494356 agagaagaggaacttgaagattcaaggattggaagagagaacctaggagctaaagtgaagcttgagctag 23494287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 11584446 - 11584374
Alignment:
Q  74 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 146  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  11584446 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagaattcatcataatca 11584374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 19405973 - 19405916
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagc 91  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  19405973 agagaagaggaacttgaagaatcaaggattgggggagagctaggagctaaattgaagc 19405916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 205 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 29918212 - 29918127
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 289  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||| || |||| |||||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  29918212 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 29918127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 196 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 32950951 - 32950862
Alignment:
Q  196 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 285  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| || |||||| || || || |||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  32950951 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 32950862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16105999 - 16105967
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16105999 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16105967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 20623318 - 20623286
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623318 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 20623286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 21233442 - 21233474
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233442 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 21233474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 25900320 - 25900352
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25900320 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25900352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 409 - 449
Target Start/End: Original strand, 29190482 - 29190522
Alignment:
Q  409 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 449  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29190482 ttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 29190522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 37053093 - 37053061
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37053093 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37053061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 287
Target Start/End: Original strand, 21310709 - 21310792
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 287  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||| ||||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  21310709 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 21310792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 23466886 - 23466812
Alignment:
Q  19 aagaggaaaatggtta--gagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagc 91  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  23466886 aagaggaaaatggttagagagaaggggaatttgaagaatcaaggagtggaagagagctaggagcaaaattgaagc 23466812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 92
Target Start/End: Original strand, 32965941 - 32966019
Alignment:
Q  15 agcaaagaggaaaatggttagagaa-gaggagcttgaagattcaaggattgga-agatagctaggagctaaagtgaagct 92  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  32965941 agcaaagaggaaaagggttagagaaggaggaacttgaagattcaagaagaggagaga-acctaggagctaaagtgaagct 32966019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 287
Target Start/End: Original strand, 5450844 - 5450926
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 287  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  5450844 aattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 5450926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 34 - 100
Target Start/End: Original strand, 11336999 - 11337065
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctag 100  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  11336999 agagaagaggaaattgaagaatcaaggattgggggagagctaggagcaaaattgaagcttgagctag 11337065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 16595941 - 16595876
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagcta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||    | ||||||||||||||||| || ||||||    
T  16595941 agagaagaggagcttgaagattcaagagttggagaggacctaggagctaaagtgaaacttgagcta 16595876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 453
Target Start/End: Original strand, 17471803 - 17471844
Alignment:
Q  412 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17471803 atgaatcattgcttgggtacgcatattcatgaattgatgatg 17471844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 91
Target Start/End: Original strand, 24182946 - 24183002
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagc 91  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||    
T  24182946 agagaagagga-cttgaagaatcaaggattgggagagagctaggagcaaaattgaagc 24183002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 108728 - 108760
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  108728 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 108760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 9730278 - 9730310
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9730278 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 9730310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16536546 - 16536514
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16536546 taagataagggggttagtctttatcataatcat 16536514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16595753 - 16595713
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 246  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  16595753 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 16595713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 37983789 - 37983701
Alignment:
Q  44 agcttgaagattcaaggattggaagatagc-taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 131  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||| | ||||| | || | | ||| |||||||||||||||||    
T  37983789 agcttgaagattcaagaagtggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctagaaatttgtgctaactaaggtaagggggttag 37983701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 201 - 453
Target Start/End: Original strand, 19886661 - 19886913
Alignment:
Q  201 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 300  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19886661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 19886760  T
Q  301 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886761 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19886860  T
Q  401 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886861 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19886913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 115 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 463075 - 462743
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  463075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 462976  T
Q  215 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 314  Q
    ||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  462975 tccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 462876  T
Q  315 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 414  Q
    |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  |||||||||    
T  462875 attgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgtcgtgattgatg 462777  T
Q  415 aataattgcttgggtatgcatattcatggattga 448  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  462776 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattga 462743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 74 - 453
Target Start/End: Original strand, 20627197 - 20627576
Alignment:
Q  74 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaa-ttttcaaatgt 172  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  20627197 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaaattttcaaatat 20627296  T
Q  173 tgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 272  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||    
T  20627297 tgtatgaattatgattatggataattgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggt 20627396  T
Q  273 gaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttg 372  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  20627397 gaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttg 20627495  T
Q  373 ttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||||| |||| |||||  ||||| ||| | || || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  20627496 ttcaattgattttatggttgttaattggtgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatggatattcatgaattgaggatg 20627576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 34 - 453
Target Start/End: Original strand, 19794547 - 19794967
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||    || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19794547 agagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataagagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagt 19794646  T
Q  133 ctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgtta 230  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||| | |||||||||||||||||| || || ||    
T  19794647 cttcatcataatcatcattattttgtaaa-tttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtcgttaaattcgtgctccaactgtgatgata 19794745  T
Q  231 tgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggt 330  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||||| ||  |||    
T  19794746 tgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggt 19794845  T
Q  331 gaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggta 430  Q
    |||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||    |||| ||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  19794846 gaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatttccgttaattgatgttatagttgatgaatcattgcttgggta 19794944  T
Q  431 tgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19794945 tgcatattcatggattgatgatg 19794967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 34 - 453
Target Start/End: Original strand, 43642799 - 43643220
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||| || |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  43642799 agagaataggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaagggaaggaggttagt 43642898  T
Q  133 ctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgtta 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| | || || ||    
T  43642899 ctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcatagtggataattgttgctaaatttgtgctccaattgtgatgata 43642998  T
Q  231 tgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggt 330  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||| |||||| |||| |||||||| ||  |||    
T  43642999 tgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggt 43643098  T
Q  331 gaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggta 430  Q
    |||||| | || ||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||   ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||    
T  43643099 gaattt-ttcttagttgttattaatttgagatatgattcttgttcaattgatgctattgctgttaattgatgttgtagttgatgaatcactgcttgggta 43643197  T
Q  431 tgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  43643198 tgcatattcatgaattgatgatg 43643220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 8891581 - 8891242
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 212  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  8891581 taaggtaaaggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 8891482  T
Q  213 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 312  Q
    ||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||    
T  8891481 gctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 8891382  T
Q  313 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 412  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||| || || ||||    
T  8891381 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttga 8891283  T
Q  413 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8891282 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 8891242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Original strand, 36982364 - 36982704
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  36982364 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 36982463  T
Q  212 tgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 311  Q
    |||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  36982464 tgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 36982563  T
Q  312 aagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 411  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | | ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  |||    
T  36982564 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttg 36982662  T
Q  412 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36982663 atgaatcattgtttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36982704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 189 - 453
Target Start/End: Original strand, 17396653 - 17396916
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  17396653 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17396751  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 388  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17396752 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 17396851  T
Q  389 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17396852 aatgttatttgatattatgattaatggataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 17396916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Original strand, 24341309 - 24341652
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 208  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  24341309 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 24341408  T
Q  209 tcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 308  Q
    || |||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||  |||||    
T  24341409 tcatgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 24341508  T
Q  309 atgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 408  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| ||        
T  24341509 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttcctg 24341607  T
Q  409 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24341608 ttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 24341652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 189 - 453
Target Start/End: Original strand, 25265390 - 25265653
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  25265390 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 25265489  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 388  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  25265490 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 25265588  T
Q  389 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
      ||||| ||||| || |  || |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25265589 gttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 25265653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 239 - 453
Target Start/End: Original strand, 7507894 - 7508107
Alignment:
Q  239 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttct 338  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||| | ||  |||||||||      
T  7507894 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-g 7507992  T
Q  339 cctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatat 437  Q
     ||||||||||||||| ||||| | |||||| || || || |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  7507993 gctaagttgttgttaa-ttgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatat 7508091  T
Q  438 tcatggattgatgatg 453  Q
    ||||||||||||||||    
T  7508092 tcatggattgatgatg 7508107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 189 - 336
Target Start/End: Original strand, 19689401 - 19689548
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  19689401 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 19689500  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 336  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  19689501 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 19689548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 189 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 23820334 - 23820187
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  23820334 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 23820235  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 336  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  23820234 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 23820187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 336
Target Start/End: Original strand, 14906440 - 14906587
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  14906440 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 14906539  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 336  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  14906540 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 14906587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 22863267 - 22863169
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  22863267 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 22863169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 189 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 20015274 - 20015127
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||  || |||| | ||||||||| ||||||||||||       
T  20015274 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttga 20015175  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 336  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  20015174 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 20015127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 74 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22275118 - 22275045
Alignment:
Q  74 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22275118 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcctttatcataatcat 22275045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 74 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22284351 - 22284278
Alignment:
Q  74 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22284351 taggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22284278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 74 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 15633610 - 15633538
Alignment:
Q  74 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 146  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15633610 taggagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtctttatcataatca 15633538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 100
Target Start/End: Original strand, 19668922 - 19668988
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19668922 agagaagaggaacttgaagattcaaggattgaaagagagctaggagctaaagtgaagcttgagctag 19668988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 7321974 - 7321897
Alignment:
Q  15 agcaaagaggaaaatggttagaga--agaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaag 90  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  7321974 agcaaagaggaaaagggttagagagaagaggaacttgaagattcaaggattggaagagatctaggagctaaattgaag 7321897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 25305867 - 25305769
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagc-taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||| |||||||||||| | ||||  | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  25305867 agagaataggagcttgaagattcaagaattggaagagatcctaggagttaaagtgaagcttgggctatgaattggtgataattaaggtaagggggttag 25305769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 43646320 - 43646232
Alignment:
Q  44 agcttgaagattcaaggattggaagatagc-taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 131  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  43646320 agcttgaagattcaagaattggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 43646232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 19660313 - 19660221
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattgga-agatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 126  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||  ||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  19660313 agagaagaggatcatgaagattcaagagttggagagatc-ctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 19660221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 68238 - 68156
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 287  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  68238 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 68156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 181
Target Start/End: Original strand, 31145992 - 31146138
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattgga-agatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |  ||| ||| | |||||||||||||||||||| | |||||    | ||  ||| |||||||||||||||||     
T  31145992 agagaacaggagcttgaagattcaagaagaggagaga-acctaggagctaaagtgaagcttgggctagagaattgatctaactaaggtaagggggttaga 31146090  T
Q  133 ctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaa-tgttgtatgaat 181  Q
     || |||||||||||| |  || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  31146091 attcatcataatcatctt--ttgtgtaaattttcaaattgttgtatgaat 31146138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 147
Target Start/End: Original strand, 19689314 - 19689347
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689314 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 19689347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 27262238 - 27262181
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagc 91  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  27262238 agagaagaggaacttgaagaatcaaggattgggggaaagctaggagctaaattgaagc 27262181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 9652796 - 9652828
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9652796 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 9652828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 14906354 - 14906386
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14906354 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14906386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23820420 - 23820388
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23820420 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23820388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 28974482 - 28974426
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaag 90  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||    
T  28974482 agagaagaggaacttgaagaatcaaggattgggagagagctaggagcaaaattgaag 28974426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 91
Target Start/End: Original strand, 22579656 - 22579733
Alignment:
Q  15 agcaaagaggaaaatggttag--agaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagc 91  Q
    ||||||||||| || ||||||  ||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22579656 agcaaagaggagaaaggttagggagaaggggaacttgaagaatcaag-attggaagagagctaggagctaaattgaagc 22579733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25213403 - 25213372
Alignment:
Q  116 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25213403 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25213372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 73 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19666922 - 19666848
Alignment:
Q  73 ctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||| | || | | |||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  19666922 ctaggagctaaagtgaagtttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcatcataatcat 19666848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 287
Target Start/End: Original strand, 22775206 - 22775288
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 287  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||| | ||||||||    
T  22775206 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaacttcatgttca 22775288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 287
Target Start/End: Original strand, 22780584 - 22780666
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 287  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||| | ||||||||    
T  22780584 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaacttcatgttca 22780666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 7507757 - 7507789
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7507757 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 7507789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 17396567 - 17396599
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17396567 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 17396599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 20015360 - 20015328
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20015360 taaggtaagggggttagtctttatcatgatcat 20015328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Original strand, 24571084 - 24571162
Alignment:
Q  15 agcaaagaggaaaatggttagagaagaggag---cttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaag 90  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||| |   |||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  24571084 agcaaagaggaaaagggttagagagaagggggaacttgaagaatcaaaaattggaagagagctaggagctaaattgaag 24571162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 28031134 - 28031166
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28031134 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 28031166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 33128404 - 33128372
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33128404 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 33128372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 43646139 - 43646059
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 285  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  43646139 aattcgtgctctaattatgttgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattggattgttgttggtgaaatttcatgtt 43646059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 115 - 451
Target Start/End: Original strand, 3508 - 3843
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 214  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3508 taaggtaagggggttagtctttgtcataatcatcttcattttgtaaattttcaaaagttgtatgaattttgattatagataattgttgctaaattcgtgc 3607  T
Q  215 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 314  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  3608 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 3707  T
Q  315 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 414  Q
    |||||||| ||  ||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||| |    
T  3708 attgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgagg 3806  T
Q  415 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 451  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3807 aataattgcttgggtatgcatattgatggattgatga 3843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 1462 - 1124
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1462 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttcttatggataattgttgctaaattcgtg 1363  T
Q  214 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 313  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  1362 ctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 1263  T
Q  314 gattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 413  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| || |||||    
T  1262 aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatattgtggttgat 1164  T
Q  414 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1163 gaataattgcttgggtgtgcatattcatgaattgatgatg 1124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 52)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 34 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 3060385 - 3059966
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  3060385 agagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcgtaggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataatgaaggtaagggggtaagt 3060286  T
Q  133 ctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |  |||     
T  3060285 ctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttatatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgataatata 3060186  T
Q  233 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtga 332  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||| ||| |||| ||  |||||    
T  3060185 tttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaattatgctcaaatggtga 3060086  T
Q  333 atttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatg 432  Q
    |||| |  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||    
T  3060085 attt-tgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatg 3059987  T
Q  433 catattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||||||| ||||| ||||    
T  3059986 catattcatgaattgaggatg 3059966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 201 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 10989661 - 10989410
Alignment:
Q  201 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 300  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 10989562  T
Q  301 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 400  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989561 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttg-taatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 10989463  T
Q  401 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10989462 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10989410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 200 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 2437710 - 2437457
Alignment:
Q  200 ttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 299  Q
    |||||||||||||||||    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437710 ttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 2437611  T
Q  300 tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 399  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437610 tgataagttatgaagattgtgttcaattggtgaatttttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 2437511  T
Q  400 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2437510 atattatgattgatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 2437457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 115 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 16212103 - 16211768
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  16212103 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggacaattgttgctaaattcgtgc 16212004  T
Q  215 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 314  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  16212003 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16211904  T
Q  315 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 414  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  16211903 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatg 16211805  T
Q  415 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 451  Q
    | | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16211804 attcattgcttgggtatgcatattcatgaattaatga 16211768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Original strand, 13036938 - 13037277
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 212  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  13036938 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 13037037  T
Q  213 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 312  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||| |||    
T  13037038 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13037137  T
Q  313 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 412  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| || || ||||    
T  13037138 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaattgatgttgtggttga 13037236  T
Q  413 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13037237 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13037277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 201 - 453
Target Start/End: Original strand, 13911024 - 13911277
Alignment:
Q  201 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 300  Q
    ||||||||||||||||    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13911024 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 13911123  T
Q  301 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcct-aagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 399  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13911124 gataagttatgaatattatgctcaattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttg 13911223  T
Q  400 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13911224 atattatgattgatgaataatttcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 13911277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 115 - 448
Target Start/End: Original strand, 11580661 - 11580997
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg---attatggatgattgttgctaaattc 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    || |||||| ||| |||||||||||    
T  11580661 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttttgcataatggataattattgctaaattc 11580760  T
Q  211 gtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 310  Q
    ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |    
T  11580761 gtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgt 11580860  T
Q  311 gaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 410  Q
    ||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||    
T  11580861 gaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggtt 11580959  T
Q  411 gatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattga 448  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11580960 gatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattga 11580997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 36053003 - 36052667
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||  |    
T  36053003 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattgttgctaaatttat 36052904  T
Q  213 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 312  Q
     |||||||| || || || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  36052903 actccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 36052804  T
Q  313 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 412  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||   |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||| || || ||||    
T  36052803 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaattgatgttgtggttga 36052708  T
Q  413 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36052707 tgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36052667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 205 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 13572924 - 13572676
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 304  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  13572924 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 13572825  T
Q  305 agttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 404  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13572824 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 13572725  T
Q  405 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13572724 atgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13572676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 196 - 453
Target Start/End: Original strand, 18253842 - 18254098
Alignment:
Q  196 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 295  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  18253842 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 18253941  T
Q  296 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 395  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18253942 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 18254040  T
Q  396 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18254041 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 18254098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 189 - 447
Target Start/End: Original strand, 25292338 - 25292595
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| |||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  25292338 atggataattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 25292437  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 388  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||  |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25292438 atatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgctcaattggtgaatt-ctcctaggttgtcgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 25292536  T
Q  389 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattg 447  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25292537 aatgttatttgatattatgactaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattg 25292595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 189 - 453
Target Start/End: Original strand, 47481031 - 47481294
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  47481031 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaa 47481130  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 388  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  47481131 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatc 47481229  T
Q  389 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
      | ||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47481230 gctcttaattgatgtttttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 47481294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 226 - 453
Target Start/End: Original strand, 16478987 - 16479213
Alignment:
Q  226 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  16478987 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaa 16479086  T
Q  326 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 425  Q
      ||||||||| |  |||||| || |||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |||||    
T  16479087 ttggtgaattt-tgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgctt 16479185  T
Q  426 gggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16479186 gggtatgcatattcatggattgatgatg 16479213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 189 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 7293279 - 7293017
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  7293279 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 7293180  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 388  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||||||||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  7293179 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 7293082  T
Q  389 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7293081 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 7293017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 190 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 13321278 - 13321014
Alignment:
Q  190 tggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg-ttcat 288  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  13321278 tggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaa 13321179  T
Q  289 a-tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttg-ttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtta 386  Q
    | |||| | |||||  |||||||||| |||||||| ||  ||||||||| | |||||||| ||||| | ||||| | |||||| ||||||| ||||||||    
T  13321178 agtatgtataaatgtcaagttatgaa-attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtta 13321081  T
Q  387 tgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  13321080 ttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtttgcacattcatgaattgatgatg 13321014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 189 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 11516490 - 11516343
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  11516490 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 11516391  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 336  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  11516390 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 11516343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 189 - 336
Target Start/End: Original strand, 15441564 - 15441711
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  15441564 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 15441663  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 336  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  15441664 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 15441711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 189 - 336
Target Start/End: Original strand, 30262129 - 30262276
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  30262129 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 30262228  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 336  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  30262229 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 30262276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 13377965 - 13377819
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagct-aggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | || |||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||     
T  13377965 agagaagaggagcttgaagatttaagaattggaagagatcttaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttaga 13377866  T
Q  133 ctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaat 181  Q
     || |||||||||||  |  |  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  13377865 attcatcataatcat--ttttagtgtaaattttcaattgttgtatgaat 13377819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 74 - 147
Target Start/End: Original strand, 32493905 - 32493978
Alignment:
Q  74 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32493905 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 32493978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 126852 - 126738
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||    ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  126852 agagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaaatgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagt 126753  T
Q  133 ctttatcataatcat 147  Q
     ||||||||||||||    
T  126752 ttttatcataatcat 126738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 92
Target Start/End: Original strand, 49047467 - 49047546
Alignment:
Q  15 agcaaagaggaaaatggttagag--aagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagct 92  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  49047467 agcaaagaggaaaagggttagagagaagaggaacttgaagattcaaggattggaagagagctaggagctaaattgaagct 49047546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Original strand, 111087 - 111201
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||    ||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  111087 agagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaaaagttggtgataattaaggtaagggggttagt 111186  T
Q  133 ctttatcataatcat 147  Q
     || |||||||||||    
T  111187 tttcatcataatcat 111201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Original strand, 1936835 - 1936949
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||| || |||||    ||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1936835 agagaagaggaactcgaagaattcaagggtttgaagaatcatagaagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagt 1936934  T
Q  133 ctttatcataatcat 147  Q
     ||||||||||||||    
T  1936935 ttttatcataatcat 1936949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 13275228 - 13275155
Alignment:
Q  18 aaagaggaaaatggtt--agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaa 89  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13275228 aaagaggaaaagggttcgagagaagaggaacttgaagattcaaggattggaagagagctaggagctaaagtgaa 13275155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 13389790 - 13389693
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattgga-agatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 131  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13389790 agagaagaagagcttgaagattcaagaattggagagatc-ctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 13389693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 310
Target Start/End: Original strand, 295893 - 296087
Alignment:
Q  117 aggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa-ttttg-attatggatgattgttgctaaattcgtgc 214  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||||||| |  |||||||||  ||||||||| ||||| || ||| || ||||||||||||||||||     
T  295893 aggtaagggggtttgtcttcaacataattctcatcatttt-tgcattttcaaactttgtatgaaattttgcataatgaataattgttgctaaattcgtgt 295991  T
Q  215 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 310  Q
    || || |  | |||||||||||| ||||||||| |||| || |  ||| ||||||||||||||| |||||| |  |||| |||||||| |||||||    
T  295992 tctaattgaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttat 296087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 146
Target Start/End: Original strand, 7283874 - 7283987
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||    ||||||| ||||||||||| ||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7283874 agagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaagggggttagt 7283973  T
Q  133 ctttatcataatca 146  Q
     || ||||||||||    
T  7283974 tttcatcataatca 7283987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 36024485 - 36024372
Alignment:
Q  115 taaggtaaggggg-ttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaa 207  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    |||  || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||| |||||    
T  36024485 taaggtaaggggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgtttctaaa 36024386  T
Q  208 ttcgtgctccaact 221  Q
    ||||||||||||||    
T  36024385 ttcgtgctccaact 36024372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 91
Target Start/End: Original strand, 16569802 - 16569876
Alignment:
Q  19 aagaggaaaatggttagag--aagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagc 91  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  16569802 aagaggaaaagggttagagagaagaggaacttgaagaatcaaggattgggggagagctaggagctaaattgaagc 16569876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 16595860 - 16595786
Alignment:
Q  19 aagaggaaaatggttagaga--agaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagc 91  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  16595860 aagaggaaaagggttagagagaagaggaacttgaagaatcaaggattgggggagagctaggagctaaattgaagc 16595786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13377775 - 13377693
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 287  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  13377775 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 13377693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 16919972 - 16919870
Alignment:
Q  30 ggttagagaagagga-gcttgaagattcaaggattggaagatagc-taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaaggggg 127  Q
    |||||||||||| || | |||||||| |||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||| ||||||||    
T  16919972 ggttagagaagaagaagtttgaagatacaagaattggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataaggggg 16919873  T
Q  128 tta 130  Q
    |||    
T  16919872 tta 16919870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 131
Target Start/End: Original strand, 17223748 - 17223846
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagc-taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 131  Q
    |||||||| || |||||| ||||||| ||||||||| | | || ||| |||||||||||| | ||||  | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17223748 agagaagaagaacttgaaaattcaagaattggaagagatcctacgaggtaaagtgaagcttgggctaagaattggtgataattaaggtaagggggttag 17223846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 2029276 - 2029244
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029276 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2029244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 7293365 - 7293333
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293365 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 7293333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 11516576 - 11516544
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11516576 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 11516544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 14113903 - 14113935
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14113903 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14113935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 15441478 - 15441510
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441478 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15441510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15709501 - 15709428
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatc----attttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 184  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    |||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  15709501 taaggtaagaggattagtcttcatcataatcatcatcatcaattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttt 15709428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 30262043 - 30262075
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30262043 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 30262075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 42056188 - 42056220
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056188 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 42056220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 287
Target Start/End: Original strand, 16914928 - 16915011
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 287  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||| |||||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  16914928 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 16915011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 125
Target Start/End: Original strand, 14271721 - 14271803
Alignment:
Q  44 agcttgaagattcaaggattggaagata-gctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaaggg 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||||   | ||| | |||| |||||||||||||||||    
T  14271721 agcttgaagattcaagaattggaagatatcctatgagttaaagtgaagcttaggttaggaattggtgataattaaggtaaggg 14271803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 371449 - 371417
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  371449 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 371417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 3049937 - 3049905
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3049937 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 3049905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 13321366 - 13321334
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13321366 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 13321334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 221
Target Start/End: Original strand, 14113989 - 14114021
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaact 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14113989 atggataattgttgctaaattcgtgctccaact 14114021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 221
Target Start/End: Original strand, 14423639 - 14423671
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaact 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14423639 atggataattgttgctaaattcgtgctccaact 14423671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 147
Target Start/End: Original strand, 15516765 - 15516793
Alignment:
Q  119 gtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516765 gtaagggggttagtctttatcataatcat 15516793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25124482 - 25124450
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25124482 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 25124450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 47480944 - 47480976
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47480944 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 47480976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 201 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 47357906 - 47357654
Alignment:
Q  201 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 300  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357906 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 47357807  T
Q  301 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357806 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 47357707  T
Q  401 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47357706 tattatgattgatgaataattgattgggtatgtatattcatggattgatgatg 47357654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 77 - 453
Target Start/End: Original strand, 54118130 - 54118507
Alignment:
Q  77 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgta 176  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  54118130 gagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtgaattttcaaatgttgta 54118229  T
Q  177 tgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtga 274  Q
    ||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  54118230 tgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtga 54118329  T
Q  275 aattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgtt 374  Q
    ||||||||||||| ||| | | || ||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  || |||| |||||||||||    
T  54118330 aattacatgttcaaataggaacaattgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagatttagttatgattcttgtt 54118428  T
Q  375 caaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||| |||||||||   ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54118429 caattgatgttatagttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 54118507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 13246769 - 13246430
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |||||||||    
T  13246769 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcgt 13246670  T
Q  213 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 312  Q
    ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||    
T  13246669 gctacaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13246570  T
Q  313 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 412  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||    
T  13246569 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttga 13246471  T
Q  413 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13246470 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13246430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 205 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 10644467 - 10644219
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 304  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  10644467 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 10644368  T
Q  305 agttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 404  Q
    ||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10644367 agttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 10644268  T
Q  405 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10644267 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10644219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 115 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 122226 - 121989
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 214  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  122226 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaatttgtgc 122127  T
Q  215 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 314  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  122126 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 122027  T
Q  315 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgtta 353  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  122026 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtta 121989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 189 - 445
Target Start/End: Original strand, 13048221 - 13048477
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    || ||||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  13048221 atggataattgttgctaaattcatgctccaacttcaatgatatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 13048320  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 388  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13048321 atatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgttgttagtttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13048420  T
Q  389 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 445  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13048421 aatgttattagataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggat 13048477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Original strand, 15675009 - 15675352
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 208  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  15675009 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 15675108  T
Q  209 tcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 308  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||    
T  15675109 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 15675208  T
Q  309 atgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 408  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |      
T  15675209 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttg 15675307  T
Q  409 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15675308 ttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 15675352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 115 - 385
Target Start/End: Original strand, 10104170 - 10104445
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 208  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||  || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  10104170 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 10104269  T
Q  209 tcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 308  Q
     |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||    
T  10104270 ccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 10104369  T
Q  309 atgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 385  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  10104370 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 10104445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 189 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 26680463 - 26680201
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  26680463 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 26680364  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 388  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  26680363 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 26680266  T
Q  389 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26680265 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 26680201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 216 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 31115865 - 31115629
Alignment:
Q  216 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 315  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||  ||||| |||| |    
T  31115865 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaa 31115766  T
Q  316 ttgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 415  Q
    || |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  |||||||    
T  31115765 ttatgctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatga 31115667  T
Q  416 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31115666 atcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 31115629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 10488825 - 10488678
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  10488825 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 10488726  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 336  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  10488725 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 10488678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 336
Target Start/End: Original strand, 16327926 - 16328073
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  16327926 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16328025  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 336  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  16328026 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 16328073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 33241043 - 33240900
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 208  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  33241043 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 33240944  T
Q  209 tcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatg 252  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  33240943 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatg 33240900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Original strand, 25119025 - 25119139
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25119025 agagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggagttagt 25119124  T
Q  133 ctttatcataatcat 147  Q
     ||||||||||||||    
T  25119125 ttttatcataatcat 25119139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 356 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 111492 - 111395
Alignment:
Q  356 ttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  111492 ttgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 111395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 100
Target Start/End: Original strand, 34177461 - 34177528
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaagg-attggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctag 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34177461 agagaagaggagcttgaagatttaagggattggaagagagctaggagctaaagtgaagctagagctag 34177528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Original strand, 5682346 - 5682460
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||    ||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  5682346 agagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcatgagctaatagttggtgataattaaggtaagtgggttagt 5682445  T
Q  133 ctttatcataatcat 147  Q
     ||||||||||||||    
T  5682446 ttttatcataatcat 5682460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 15045277 - 15045196
Alignment:
Q  21 gaggaaaatggttagaga--agaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctag 100  Q
    |||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  15045277 gaggaaaagggttagagaggagaggaacttgaagattcaaggattggaagagagctaggagctaaggtgaagcttgagctag 15045196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 100
Target Start/End: Original strand, 15109147 - 15109228
Alignment:
Q  21 gaggaaaatggttagaga--agaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctag 100  Q
    |||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  15109147 gaggaaaagggttagagaggagaggaacttgaagattcaaggattggaagagagctaggagctaaggtgaagcttgagctag 15109228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Original strand, 19821589 - 19821702
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||| ||||    | ||  ||| |||||||||||||||||      
T  19821589 agagaagaggagcttgaagattcaaggattgggggagatctaggagctaaagtgaagctagaactagagaattgatctaactaaggtaagggggttagaa 19821688  T
Q  134 tttatcataatcat 147  Q
    || |||||||||||    
T  19821689 ttcatcataatcat 19821702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 41165772 - 41165881
Alignment:
Q  38 aagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtcttta 137  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||   |  |||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||  || |    
T  41165772 aagaggagcttgaagattcaagaattggagagttcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaacgtaagggggttagaattca 41165871  T
Q  138 tcataatcat 147  Q
    ||||||||||    
T  41165872 tcataatcat 41165881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31132657 - 31132545
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 208  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  31132657 taaggtaagggggttagtcttcatcataattatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 31132558  T
Q  209 tcgtgctccaact 221  Q
    |||||||||||||    
T  31132557 tcgtgctccaact 31132545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 205 - 385
Target Start/End: Original strand, 40885570 - 40885749
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata-tatgcaaaaatgat 303  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||  ||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||      
T  40885570 aaattcgtactccaactgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtc 40885669  T
Q  304 aagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 385  Q
    |||||||||| ||| |||| ||  |||||| || | ||||||| ||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  40885670 aagttatgaa-attatgctcaattggtgaactt-tgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 40885749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Original strand, 13809303 - 13809390
Alignment:
Q  15 agcaaagaggaaaatggttagag--aagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctag 100  Q
    |||||||||||||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  13809303 agcaaagaggaaaaggattagagagaagaggaacttgaagattcaaggattgggagagagctaggggctaaattgaagcttgagctag 13809390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 131
Target Start/End: Original strand, 47534882 - 47534990
Alignment:
Q  25 aaaatggttagagaagagga-gcttgaagattcaaggattggaagatagc-taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa 122  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||||| | || || | |||| ||||||||||||||    
T  47534882 aaaagggttagagaagaagaagcttgaagattcaagaattggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggcgaggaattggtgataattaaggtaa 47534981  T
Q  123 gggggttag 131  Q
    |||||||||    
T  47534982 gggggttag 47534990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 27961405 - 27961339
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctag 100  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27961405 agagaaggggaacttgaagattcaaggattgaaagagagctaggagcaaaagtgaagcttgagctag 27961339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 91
Target Start/End: Original strand, 52265321 - 52265378
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagc 91  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  52265321 agagaagaggaacttgaagaatcaaagattggaagagagctaggagctaaattgaagc 52265378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15045074 - 15044992
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 287  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  15045074 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 15044992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 409 - 453
Target Start/End: Original strand, 10104450 - 10104494
Alignment:
Q  409 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10104450 ttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 10104494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 14952117 - 14952085
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952117 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14952085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 15135907 - 15135939
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15135907 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15135939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 15272211 - 15272243
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272211 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15272243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 16327840 - 16327872
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16327840 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16327872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 16609013 - 16609045
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16609013 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16609045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 26680549 - 26680517
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680549 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26680517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 287
Target Start/End: Original strand, 15109350 - 15109432
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 287  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  15109350 aattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 15109432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 8045304 - 8045272
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8045304 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 8045272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16523178 - 16523146
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16523178 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 16523146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 76)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Original strand, 14842487 - 14842824
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14842487 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 14842586  T
Q  215 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 314  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||     
T  14842587 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaa 14842686  T
Q  315 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 414  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  14842687 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatg 14842785  T
Q  415 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14842786 aataattgattgggtttgcatattcatggattgatgatg 14842824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 201 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 55316471 - 55316219
Alignment:
Q  201 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 300  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55316471 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 55316372  T
Q  301 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 400  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55316371 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 55316272  T
Q  401 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55316271 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 55316219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 201 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 41270327 - 41270075
Alignment:
Q  201 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 300  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41270327 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaat 41270228  T
Q  301 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 400  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41270227 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 41270128  T
Q  401 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41270127 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 41270075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 2050147 - 2049810
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  2050147 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatcaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 2050048  T
Q  215 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 314  Q
    ||||||| ||  | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||     
T  2050047 tccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgataacttgtgaaa 2049948  T
Q  315 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 414  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  2049947 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgatg 2049849  T
Q  415 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2049848 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 2049810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Original strand, 12030073 - 12030410
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 214  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12030073 taaggtaagggggttaatcattatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgacttttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 12030172  T
Q  215 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 314  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||     
T  12030173 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgataagttgtgaaa 12030272  T
Q  315 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 414  Q
     ||||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  12030273 gttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttatggttgatg 12030371  T
Q  415 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12030372 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 12030410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 34 - 453
Target Start/End: Original strand, 16743959 - 16744377
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16743959 agagaggaggagcttgaagaattcaaggatttggagaatcataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacgaggttagt 16744058  T
Q  133 ctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatg 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||    
T  16744059 ctttaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgttaaattcgtgctccaactttgatgatatg 16744158  T
Q  233 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtga 332  Q
    ||||||| |||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||||| || | ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||    
T  16744159 tttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatga 16744258  T
Q  333 atttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatg 432  Q
    ||||  |  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || |  || || |  ||||||||| |||||||||||||     
T  16744259 atttgac--atgttatagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataaatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtata 16744356  T
Q  433 catattcatggattgatgatg 453  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  16744357 catgttcatggattgatgatg 16744377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 115 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 13839232 - 13838905
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 213  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13839232 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatgaataattgttgctaaattcgtg 13839133  T
Q  214 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 313  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||    
T  13839132 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 13839033  T
Q  314 gattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 413  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||||    
T  13839032 aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgat 13838934  T
Q  414 gaataattgcttgggtatgcatattcatg 442  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13838933 gaatcattgtttgggtatgcatattcatg 13838905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 226 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 16821366 - 16821139
Alignment:
Q  226 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 325  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||  |||||||||||    
T  16821366 tgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgctaaa 16821267  T
Q  326 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 425  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16821266 ttggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 16821167  T
Q  426 gggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16821166 gggtttgcatattcatggattaatgatg 16821139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 189 - 453
Target Start/End: Original strand, 13975722 - 13975985
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  13975722 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13975820  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 388  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13975821 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13975920  T
Q  389 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13975921 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13975985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 152 - 453
Target Start/End: Original strand, 15858986 - 15859287
Alignment:
Q  152 attttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattg 249  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  15858986 attttgtaaattt-caattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattg 15859084  T
Q  250 atgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgtt 349  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||    
T  15859085 atgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgtt 15859183  T
Q  350 gttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 449  Q
    ||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15859184 gttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 15859283  T
Q  450 gatg 453  Q
    ||||    
T  15859284 gatg 15859287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 189 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 45861068 - 45860805
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  45861068 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 45860970  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 388  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  45860969 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 45860870  T
Q  389 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  45860869 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 45860805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 179 - 454
Target Start/End: Original strand, 51158008 - 51158282
Alignment:
Q  179 aattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaatt 278  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  51158008 aattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatt 51158107  T
Q  279 acatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaa 378  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||     
T  51158108 acatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaat 51158206  T
Q  379 tgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgt 454  Q
    ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  51158207 tgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 51158282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 189 - 453
Target Start/End: Original strand, 13954890 - 13955153
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  13954890 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13954988  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 388  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13954989 ataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13955088  T
Q  389 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13955089 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13955153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 196 - 453
Target Start/End: Original strand, 15936634 - 15936890
Alignment:
Q  196 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 295  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  15936634 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15936733  T
Q  296 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 395  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15936734 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 15936832  T
Q  396 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15936833 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 15936890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 196 - 450
Target Start/End: Original strand, 15938476 - 15938729
Alignment:
Q  196 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 295  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |  || ||||||||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  15938476 attgttactaaatacgtgctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15938575  T
Q  296 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 395  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15938576 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 15938674  T
Q  396 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatg 450  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15938675 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatg 15938729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 34 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19232203 - 19231981
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19232203 agagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagt 19232104  T
Q  133 ctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgtt 229  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  19232103 ctttatcttaatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgat 19232004  T
Q  230 atgtttgtatgcatgaattgatg 252  Q
    |||||| ||| ||||||||||||    
T  19232003 atgtttatattcatgaattgatg 19231981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 114 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 15615170 - 15614838
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||  ||||| ||| ||    
T  15615170 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-taattttgca--ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagatttgt 15615074  T
Q  213 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 312  Q
    ||||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  15615073 gctcttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 15614974  T
Q  313 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 412  Q
    | || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||    
T  15614973 atatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttga 15614875  T
Q  413 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 449  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15614874 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 15614838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 189 - 453
Target Start/End: Original strand, 17912483 - 17912744
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  17912483 atggataattgttgctaaattcgtgctccaact-tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17912581  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 388  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||  | ||||||  |  || ||||| ||| | ||||| | |||||| |||||||  ||||||||     
T  17912582 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaatt--tgatatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttatt 17912679  T
Q  389 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17912680 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 17912744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Original strand, 19260749 - 19260869
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  19260749 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaagttttcaaatgttgtatgaattttttttatggataattgttgctaaattcgtgc 19260848  T
Q  215 tccaactatgttgttatgttt 235  Q
    || || |||| || |||||||    
T  19260849 tctaattatgatgatatgttt 19260869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 336
Target Start/End: Original strand, 2449238 - 2449385
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  2449238 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 2449337  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 336  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  2449338 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 2449385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 55513307 - 55513193
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55513307 agagaagaggagcttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagt 55513208  T
Q  133 ctttatcataatcat 147  Q
     ||||||||||||||    
T  55513207 ttttatcataatcat 55513193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 150
Target Start/End: Original strand, 15857081 - 15857198
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || || ||    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15857081 agagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgatgaatcataggagctaaagtgaagctagagctaatacttggagataattaaggtaagggggttagt 15857180  T
Q  133 ctttatcataatcatcat 150  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  15857181 cttcatcataatcatcat 15857198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 2844628 - 2844514
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2844628 agagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagtttgagataattaaggtaagggggttagt 2844529  T
Q  133 ctttatcataatcat 147  Q
     ||||||||||||||    
T  2844528 ttttatcataatcat 2844514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 74 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 3992946 - 3992873
Alignment:
Q  74 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3992946 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 3992873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 7854419 - 7854305
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7854419 agagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagt 7854320  T
Q  133 ctttatcataatcat 147  Q
     || |||||||||||    
T  7854319 tttcatcataatcat 7854305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 147
Target Start/End: Original strand, 38810805 - 38810941
Alignment:
Q  15 agcaaagaggaa-aatggttaga--gaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagc-taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggaga 110  Q
    |||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||| | | ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||    
T  38810805 agcaaagaggaacaagggttagatagaagaggagcttgaagattcaagaactggaagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtga 38810904  T
Q  111 taattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||| |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  38810905 taactaaggtaagggggttagaattcatcataatcat 38810941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 147
Target Start/End: Original strand, 54037983 - 54038056
Alignment:
Q  74 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54037983 taggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 54038056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 74 - 147
Target Start/End: Original strand, 17955839 - 17955916
Alignment:
Q  74 taggagctaaagtgaagctag----agctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||| |||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17955839 taggagcaaaagtgaagctaggtagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17955916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 48422011 - 48421945
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48422011 agagaaaaggagcttgaagattcaaggattggaagagggctaggagttaaagtgaagctagagctag 48421945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 17139963 - 17139884
Alignment:
Q  15 agcaaagaggaaaatggttagaga--agaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagct 92  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  17139963 agcaaagaggaaaagggttagagagaagaggaacttgaagattcaaggattggaagagagctaggaggtaaattgaagct 17139884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 131
Target Start/End: Original strand, 3576240 - 3576347
Alignment:
Q  25 aaaatggttagagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagc-taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaag 123  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| | | |||||| |||||||||||| | ||||| | || | |||||||||||||||    
T  3576240 aaaagggttagagaagaagagcttgaatattcaagaattggaagagatcctaggaggtaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgataattaaggtaag 3576339  T
Q  124 ggggttag 131  Q
    ||||||||    
T  3576340 ggggttag 3576347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 45582068 - 45581954
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaag-ggggttag 131  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||    ||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45582068 agagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagaaaaa-tgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaaggggggttag 45581970  T
Q  132 tctttatcataatcat 147  Q
    | ||||||||||||||    
T  45581969 tttttatcataatcat 45581954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 100
Target Start/End: Original strand, 12487590 - 12487656
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  12487590 agagaagaggaacttgaagattcaaggattggaagagagctaagagctaaaatgaagcttgagctag 12487656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 14080948 - 14080879
Alignment:
Q  15 agcaaagaggaaaatggtt--agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagcta 82  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14080948 agcaaagaggaaaagggttggagagaagaggaacttgaagattcaaggattggaagagagctaggagcta 14080879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 17205107 - 17205019
Alignment:
Q  44 agcttgaagattcaaggattggaagatagc-taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 131  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17205107 agcttgaagattcaagaattggtagaaatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 17205019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 12031955 - 12031849
Alignment:
Q  25 aaaatggttagagaagagga-gcttgaagattcaaggattggaagatagc-taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa 122  Q
    |||| |||||||||||| || | ||||||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||    
T  12031955 aaaagggttagagaagaagaagtttgaagattcaagaattggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaa 12031856  T
Q  123 gggggtt 129  Q
    |||||||    
T  12031855 gggggtt 12031849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 16880579 - 16880414
Alignment:
Q  15 agcaaagaggaaaatggttagaga--agaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagata 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||    | |||| ||||||||||||||| |||||||    | ||  ||    
T  16880579 agcaaagaggaaaagggttagagagaagaggagcttgaagattcaagagttggagaggacctagaagctaaagtgaagcttgagctagggaattgatcta 16880480  T
Q  113 attaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa 180  Q
    | |||||||||||||||||  || |||||||||||  |  |  ||||||||||||| |||||||||||    
T  16880479 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcat--ttttagtgtaaattttcaattgttgtatgaa 16880414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 17191967 - 17191879
Alignment:
Q  44 agcttgaagattcaaggattggaagatagc-taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 131  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| | | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17191967 agcttgaagattcaagaattggtagagatcctaggagctaaagtgaagtttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 17191879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Original strand, 11328778 - 11328891
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||    | |||||||||||||||||||| || |||| |  | ||  ||| |||||||||||||||||      
T  11328778 agagaagaggagcttgaagattcaagagttggagaggacctaggagctaaagtgaagcttgatctaggaaattgatctaactaaggtaagggggttagaa 11328877  T
Q  134 tttatcataatcat 147  Q
    || |||||||||||    
T  11328878 ttcatcataatcat 11328891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 15551030 - 15550922
Alignment:
Q  38 aagaggagcttgaagattcaaggattgga-agatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtcttt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||  ||| ||| |||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||  ||     
T  15551030 aagaggagcttgaagattcaagagttggagagatc-ctacgagttaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggggttagaattc 15550932  T
Q  137 atcataatca 146  Q
    ||||||||||    
T  15550931 atcataatca 15550922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 47984763 - 47984650
Alignment:
Q  340 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 439  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  47984763 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47984664  T
Q  440 atggattgatgatg 453  Q
    ||| ||||||||||    
T  47984663 atgaattgatgatg 47984650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 47994050 - 47993937
Alignment:
Q  340 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 439  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  47994050 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47993951  T
Q  440 atggattgatgatg 453  Q
    ||| ||||||||||    
T  47993950 atgaattgatgatg 47993937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 48003337 - 48003224
Alignment:
Q  340 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 439  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48003337 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48003238  T
Q  440 atggattgatgatg 453  Q
    ||| ||||||||||    
T  48003237 atgaattgatgatg 48003224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 48012623 - 48012510
Alignment:
Q  340 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 439  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48012623 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48012524  T
Q  440 atggattgatgatg 453  Q
    ||| ||||||||||    
T  48012523 atgaattgatgatg 48012510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 91
Target Start/End: Original strand, 14527876 - 14527950
Alignment:
Q  19 aagaggaaaatggttagag--aagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagc 91  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||| ||||||    
T  14527876 aagaggaaaatggttagagagaagaggaacttgaagaatcaaggattgggggagagctaggagcaaaattgaagc 14527950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 91
Target Start/End: Original strand, 55440673 - 55440728
Alignment:
Q  36 agaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagc 91  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  55440673 agaagaggaacttgaagaatcaaggattggaagagagctaggagcaaaattgaagc 55440728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Original strand, 11882032 - 11882145
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattgga-agatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||    | ||  ||| |||||||||||||||||     
T  11882032 agagaagaggagcttgaagattcaagagttggagagat-cctaggagctaaagtgaagcttgacctagggaattgatctaactaaggtaagggggttaga 11882130  T
Q  133 ctttatcataatcat 147  Q
     || |||||||||||    
T  11882131 attcatcataatcat 11882145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 147
Target Start/End: Original strand, 13301322 - 13301396
Alignment:
Q  73 ctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| | || | | |||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  13301322 ctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcatcataatcat 13301396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 147
Target Start/End: Original strand, 13311978 - 13312052
Alignment:
Q  73 ctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| | || | | |||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  13311978 ctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcatcataatcat 13312052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 196 - 285
Target Start/End: Original strand, 11986173 - 11986262
Alignment:
Q  196 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 285  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| || |||||| || || ||||||| || ||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  11986173 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 11986262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 205 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14080756 - 14080715
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 246  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14080756 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 14080715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 14295889 - 14295817
Alignment:
Q  19 aagaggaaaatggttagaga--agaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaa 89  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||||    
T  14295889 aagaggaaaagggttagagagaagaggaacttgaagaatcaaggattgggggagagctaggagctaaattgaa 14295817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 14301516 - 14301444
Alignment:
Q  19 aagaggaaaatggttagaga--agaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaa 89  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||||    
T  14301516 aagaggaaaagggttagagagaagaggaacttgaagaatcaaggattgggggagagctaggagctaaattgaa 14301444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 412 - 453
Target Start/End: Original strand, 15468555 - 15468596
Alignment:
Q  412 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15468555 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15468596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 2449152 - 2449184
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2449152 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2449184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 289
Target Start/End: Original strand, 4145814 - 4145898
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 289  Q
    |||||||| |||||| |||| || |||||||| || ||||||||| || || ||| ||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  4145814 aaattcgtactccaattatggtgatatgtttgaatacatgaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattacatgttcata 4145898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 92
Target Start/End: Original strand, 12560032 - 12560107
Alignment:
Q  19 aagaggaaaatggttagaga--agaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagct 92  Q
    |||||||||| |||||||||  || ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||    
T  12560032 aagaggaaaagggttagagagaaggggaacttgaagaatcaaggattggaagagaactatgagctaaattgaagct 12560107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16261809 - 16261777
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261809 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16261777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 16933869 - 16933901
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933869 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16933901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 17912398 - 17912430
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17912398 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17912430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23492728 - 23492696
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492728 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23492696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 38168269 - 38168237
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38168269 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 38168237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 53771397 - 53771365
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771397 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 53771365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 30207462 - 30207380
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 287  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||| | ||||||||    
T  30207462 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttca 30207380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 289
Target Start/End: Original strand, 6228625 - 6228710
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 289  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||||| || |||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  6228625 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcata 6228710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 8632222 - 8632165
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagc 91  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||| ||||||    
T  8632222 agagaagaggaacttgaagaatcaaggattgggtgagagctaggagcaaaattgaagc 8632165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 22275250 - 22275209
Alignment:
Q  412 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22275250 atgaatcattgcttaggtatgcatattcatgaattgatgatg 22275209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 11986080 - 11986112
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11986080 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 11986112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 13954804 - 13954836
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13954804 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 13954836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Original strand, 14059214 - 14059254
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 246  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  14059214 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 14059254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 14285321 - 14285289
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14285321 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 14285289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19947058 - 19947026
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19947058 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 19947026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 30153297 - 30153265
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30153297 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 30153265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 33342236 - 33342204
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33342236 taaggtaagagggttagtctttatcataatcat 33342204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 45861154 - 45861122
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45861154 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 45861122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 51961031 - 51961063
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51961031 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 51961063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 48935 - 48598
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  48935 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 48836  T
Q  215 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 314  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||     
T  48835 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgataagttgtgaaa 48736  T
Q  315 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 414  Q
    |||||||| |   ||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||| || || ||||||    
T  48735 attgtgctcagttggtgaattt-tgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatg 48637  T
Q  415 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48636 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 48598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 226 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 36320 - 36093
Alignment:
Q  226 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 325  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36320 tgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 36221  T
Q  326 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 425  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36220 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgttatgaatgttatttgataatatgattgatgaataattgctt 36121  T
Q  426 gggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36120 gggtttgcatattcatggattgatgatg 36093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 61122 - 61154
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  61122 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 61154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 41)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 115 - 454
Target Start/End: Original strand, 16193643 - 16193980
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 214  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16193643 taaggtaagggg-ttagtctttatcataatcatcatcatttggtaaattttcaaatattgtatgaattttgcttatggatgattgttgctaaattcgtgc 16193741  T
Q  215 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 314  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  16193742 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16193841  T
Q  315 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 414  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | | || |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  16193842 attgtgctcaattggtgaattt-tgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatg 16193940  T
Q  415 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgt 454  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16193941 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 16193980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 201 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 30120974 - 30120722
Alignment:
Q  201 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 300  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30120974 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 30120875  T
Q  301 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 400  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30120874 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttga 30120775  T
Q  401 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30120774 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatcgattgatgatg 30120722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Original strand, 43373392 - 43373731
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| |||  ||||||||||||    
T  43373392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattaatgctaaattcgt 43373491  T
Q  213 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 312  Q
    ||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  43373492 gctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 43373591  T
Q  313 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 412  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || || ||||    
T  43373592 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttga 43373690  T
Q  413 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43373691 tgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43373731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 263 - 453
Target Start/End: Original strand, 222753 - 222943
Alignment:
Q  263 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222753 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 222852  T
Q  363 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222853 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 222943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 263 - 453
Target Start/End: Original strand, 736376 - 736566
Alignment:
Q  263 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736376 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 736475  T
Q  363 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736476 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 736566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 263 - 453
Target Start/End: Original strand, 860271 - 860461
Alignment:
Q  263 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860271 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 860370  T
Q  363 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860371 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 860461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 201 - 453
Target Start/End: Original strand, 16674392 - 16674644
Alignment:
Q  201 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 300  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674392 tgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 16674491  T
Q  301 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 400  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674492 gataagttatgaatattgtgcttaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 16674591  T
Q  401 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16674592 taatatgattaatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 16674644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 34 - 453
Target Start/End: Original strand, 16404818 - 16405235
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||| || |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16404818 agagaataggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagt 16404917  T
Q  133 ctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgtta 230  Q
    ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| || || ||    
T  16404918 cttcatcataatcatcattattt-gtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcatgatggataattattgctaaattcgtgctccaactgtgatgata 16405016  T
Q  231 tgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggt 330  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||| |||||| |||| |||||||| ||  |||    
T  16405017 tgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggt 16405116  T
Q  331 gaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggta 430  Q
    |||||| | ||||   |||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||    
T  16405117 gaattt-tgctaa---gttgttaaattgacatatgattcttgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttttagttgatgaatcactgcttgggta 16405212  T
Q  431 tgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||| ||||||| ||||||||||    
T  16405213 tgcaaattcatgaattgatgatg 16405235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 115 - 442
Target Start/End: Original strand, 24928716 - 24929043
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24928716 taaggtaatggggttagtctttatcataatcatcgtcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 24928815  T
Q  214 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 313  Q
    |||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||    
T  24928816 ctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 24928915  T
Q  314 gattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 413  Q
     |||||||| ||  ||||||||||  ||||||||| |||   ||||||| ||  |||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| || ||||||||    
T  24928916 aattgtgctcaattggtgaatttc-gctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaattgatgttgtgattgat 24929014  T
Q  414 gaataattgcttgggtatgcatattcatg 442  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24929015 gaatcattgcttgggtatgcatattcatg 24929043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 205 - 453
Target Start/End: Original strand, 21844576 - 21844824
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 304  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  21844576 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 21844675  T
Q  305 agttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 404  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21844676 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatttttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 21844775  T
Q  405 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21844776 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcattgattgttgatg 21844824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 205 - 453
Target Start/End: Original strand, 21851969 - 21852217
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 304  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||    
T  21851969 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgata 21852068  T
Q  305 agttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 404  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21852069 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 21852168  T
Q  405 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21852169 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcattgattgttgatg 21852217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 201 - 449
Target Start/End: Original strand, 6774258 - 6774505
Alignment:
Q  201 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 300  Q
    ||||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6774258 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 6774357  T
Q  301 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 400  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||    
T  6774358 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttga 6774456  T
Q  401 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 449  Q
    | || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6774457 tgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 6774505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 201 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 24549233 - 24548986
Alignment:
Q  201 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 300  Q
    ||||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24549233 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 24549134  T
Q  301 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 400  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  24549133 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattga 24549035  T
Q  401 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 449  Q
    | || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24549034 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 24548986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 189 - 453
Target Start/End: Original strand, 22907214 - 22907476
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  22907214 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 22907313  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 388  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  22907314 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 22907411  T
Q  389 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22907412 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 22907476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 189 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 17345832 - 17345581
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  17345832 atggataattgttgcgaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 17345733  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 388  Q
     |||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||  |||| ||||     
T  17345732 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatattatt 17345635  T
Q  389 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 442  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17345634 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 17345581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 189 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 5238350 - 5238203
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  5238350 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 5238251  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 336  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  5238250 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 5238203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 189 - 336
Target Start/End: Original strand, 24661248 - 24661395
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  24661248 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 24661347  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 336  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  24661348 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 24661395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 189 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 43685809 - 43685662
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  43685809 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 43685710  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 336  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  43685709 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 43685662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Original strand, 24716680 - 24716794
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24716680 agagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagt 24716779  T
Q  133 ctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||    
T  24716780 ctttatcataatcat 24716794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 263 - 325
Target Start/End: Original strand, 691908 - 691970
Alignment:
Q  263 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  691908 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 691970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 74 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 274839 - 274766
Alignment:
Q  74 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  274839 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 274766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 74 - 147
Target Start/End: Original strand, 641010 - 641083
Alignment:
Q  74 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  641010 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 641083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 74 - 147
Target Start/End: Original strand, 826816 - 826889
Alignment:
Q  74 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  826816 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 826889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 38534084 - 38533971
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtc 133  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||  | | |||||||||||||||||      
T  38534084 agagaagaagaacttgaagattcaaagattggaagagagctaggagctaaagtgaagctagagctaggaaattgatttgactaaggtaagggggttagaa 38533985  T
Q  134 tttatcataatcat 147  Q
    || |||||||||||    
T  38533984 ttcatcataatcat 38533971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Original strand, 39446558 - 39446645
Alignment:
Q  15 agcaaagaggaaaatggttagag--aagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctag 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  39446558 agcaaagaggaaaagggttagagagaagaggaacttgaagattcaaggattggaagagagctatgagctaaattgaagcttgagctag 39446645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 92
Target Start/End: Original strand, 21259292 - 21259368
Alignment:
Q  18 aaagaggaaaatggttagag--aagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagct 92  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  21259292 aaagaggaaaagggttagagagaagaggaacttgaagattcaaggattggaagagagctaggagctaaattgaagct 21259368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 17285659 - 17285543
Alignment:
Q  18 aaagaggaaaatggtt---agagaagaggagcttgaagattcaaggattgga-agatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataa 113  Q
    ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||| | | ||| | |||| |||||    
T  17285659 aaagaggaaaaaggtttagagagaagaagagcttgaagattcaagaattggagagatc-ctaggagctaaagtgaagcttgggttaggaattggtgataa 17285561  T
Q  114 ttaaggtaagggggttag 131  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17285560 ttaaggtaagggggttag 17285543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 131
Target Start/End: Original strand, 21197965 - 21198062
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattgga-agatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | |||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21197965 agagaagaggagcttgaagattcaagagttggagaga-acctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggggttag 21198062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 39115712 - 39115598
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||| || |||||    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  39115712 agagaagagaaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtaataattaaggtaagggtgttagt 39115613  T
Q  133 ctttatcataatcat 147  Q
     || |||||||||||    
T  39115612 tttcatcataatcat 39115598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23837634 - 23837536
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagc-taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | | |||||| ||||||||| || | ||||| | | || |||||||||||||||||||||||    
T  23837634 agagaagagtagcttgaagattcaagaatttgaagagatcctaggagataaagtgaaccttgggctaggaatcggtgataattaaggtaagggggttag 23837536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 22981703 - 22981639
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagct 98  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||    
T  22981703 agagaagaggaacttgatgattcaaagattggaagagatctaggagctaaattgaagcttgagct 22981639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 5238436 - 5238404
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238436 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 5238404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 22907128 - 22907160
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907128 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22907160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 24385652 - 24385684
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385652 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24385684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 24661162 - 24661194
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661162 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24661194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 43685895 - 43685863
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43685895 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 43685863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26011741 - 26011658
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 287  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  26011741 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttca 26011658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 91
Target Start/End: Original strand, 20561445 - 20561501
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagc 91  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||    
T  20561445 agagaagagga-cttgaagaatcaaggattgggagagagctaggagcaaaattgaagc 20561501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 2545297 - 2545265
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2545297 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 2545265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 3431176 - 3431208
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3431176 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 3431208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22886686 - 22886654
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22886686 taaggtaagggggttagtcttaatcataatcat 22886654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Original strand, 5990 - 6326
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5990 taaggtaagggggttagtctttatcataatcattttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 6089  T
Q  215 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 314  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| | ||     
T  6090 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtaaaa 6189  T
Q  315 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 414  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||    
T  6190 attgtgctgaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttttgttatgattgatg 6287  T
Q  415 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6288 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 6326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Original strand, 882 - 1218
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 981  T
Q  215 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 314  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||     
T  982 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 1081  T
Q  315 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 414  Q
    |||||||| ||  | ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||||    
T  1082 attgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagattttattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatg 1179  T
Q  415 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1180 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 9215 - 8878
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  9215 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtacgaattttgcttatggaaaattgttgctaaattcgtgc 9116  T
Q  215 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 314  Q
    ||||  | || |||||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||| ||||     
T  9115 tccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtgaaa 9016  T
Q  315 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 414  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||    
T  9015 attgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatg 8917  T
Q  415 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8916 aataattgcttgggtatgcatattcatgtattgatgatg 8878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 12450 - 12115
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa-ttttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12450 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttaattttgtaacttt-caaatgctgtatgaaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 12352  T
Q  214 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 313  Q
    ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||| | || || |||||||||||||| ||||    
T  12351 ctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaa 12252  T
Q  314 gattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 413  Q
     |||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||  | ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  12251 aattgtgctaaattggtgaattt-tgttaagttgttgt--aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattcat 12155  T
Q  414 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12154 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 115 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 172242 - 171916
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  172242 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 172143  T
Q  215 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 314  Q
    ||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||     
T  172142 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 172043  T
Q  315 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 414  Q
    |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  172042 attgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatg 171944  T
Q  415 aataattgcttgggtatgcatattcatg 442  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  171943 aatcattgcttaggtatgcatattcatg 171916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 115 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 177945 - 177619
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  177945 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 177846  T
Q  215 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 314  Q
    ||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||     
T  177845 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 177746  T
Q  315 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 414  Q
    |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  177745 attgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatg 177647  T
Q  415 aataattgcttgggtatgcatattcatg 442  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  177646 aatcattgcttaggtatgcatattcatg 177619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 226 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 43224 - 42997
Alignment:
Q  226 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 325  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43224 tgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgctaaa 43125  T
Q  326 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 425  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43124 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 43025  T
Q  426 gggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  43024 gggtttgcatattcatggattgatgatg 42997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 115 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 42066 - 41733
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  42066 taaggtaagggggttggtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 41967  T
Q  215 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 314  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||     
T  41966 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgataatttgtgaaa 41867  T
Q  315 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 414  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||| | || |   |||||    
T  41866 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaattgttgttgtagatgatg 41768  T
Q  415 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 449  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  41767 aatcattggttgggtatgcatattcatgaattgat 41733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 114 - 453
Target Start/End: Original strand, 36836 - 37176
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| ||||||||    
T  36836 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcg 36935  T
Q  212 tgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 311  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  36936 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 37035  T
Q  312 aagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 411  Q
    || |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||   ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| || || |||    
T  37036 aaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaattgatgttgtggttg 37134  T
Q  412 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37135 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 37176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 146
Target Start/End: Original strand, 15285 - 15398
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||    ||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15285 agagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgggctaatagttggagataattaaggtaagggggttagc 15384  T
Q  133 ctttatcataatca 146  Q
     || ||||||||||    
T  15385 attcatcataatca 15398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 115 - 442
Target Start/End: Original strand, 247366 - 247694
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  247366 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 247465  T
Q  213 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 312  Q
    ||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||| |||    
T  247466 gctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 247565  T
Q  313 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 412  Q
    | |||||||| ||  ||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||    
T  247566 aaattgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttga 247664  T
Q  413 tgaataattgcttgggtatgcatattcatg 442  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  247665 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 247694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 34075 - 34107
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34075 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 34107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 118 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 19543 - 19206
Alignment:
Q  118 ggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgc 214  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||    
T  19543 ggtaagggggttagtcttcatcataatcatcataatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgc 19444  T
Q  215 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 314  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  19443 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 19344  T
Q  315 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 414  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||    
T  19343 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatg 19245  T
Q  415 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19244 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 19206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 189 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 21553 - 21290
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  21553 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 21454  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 388  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||     
T  21453 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttatt 21355  T
Q  389 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21354 gctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 21290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Original strand, 26340 - 26678
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaattcgtg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||    
T  26340 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatgatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatgtataattgttgctaaattcgtg 26439  T
Q  214 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 313  Q
    |||||||| || || ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  26440 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 26539  T
Q  314 gattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 413  Q
     ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||    
T  26540 aattgttctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgat 26638  T
Q  414 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  26639 gaatcattgcttgggtatgcatattgatgaattgaggatg 26678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 336
Target Start/End: Original strand, 8180 - 8327
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  8180 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaa 8279  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 336  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  |||||||||    
T  8280 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 8327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 131
Target Start/End: Original strand, 6826 - 6934
Alignment:
Q  25 aaaatggttagagaagagga-gcttgaagattcaaggattggaagatagc-taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa 122  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||| | | |||||| |||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||    
T  6826 aaaagggttagagaagaagaagcttgaagattcaagaattggtagagatcctaggagttaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaa 6925  T
Q  123 gggggttag 131  Q
    |||||||||    
T  6926 gggggttag 6934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Original strand, 128095 - 128431
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  128095 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 128194  T
Q  215 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 314  Q
    | ||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| || || |||  || |||||| ||||     
T  128195 ttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaa 128294  T
Q  315 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 414  Q
    |||||||| ||  || |||||| |  || ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||| || |||||||||    
T  128295 attgtgctcaattggcgaattt-tgttaggttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatggatgttgtgattgatg 128392  T
Q  415 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  128393 aataattgattgggtatgcatattcatgaattgatgatg 128431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 226 - 453
Target Start/End: Original strand, 31700 - 31928
Alignment:
Q  226 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 325  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  31700 tgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaa 31799  T
Q  326 ggggtgaatttctcct-aagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgct 424  Q
      |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31800 ttggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttaatattatgattgatgaataattgct 31899  T
Q  425 tgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  31900 tgggtttgcatattcatggattaatgatg 31928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 125 - 453
Target Start/End: Original strand, 4996 - 5324
Alignment:
Q  125 gggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactat 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  4996 gggttagtctttatcataatcattatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatggataattgttgctaaattcgtactccaactgt 5095  T
Q  224 gttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgcta 323  Q
    |  | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  5096 gacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 5195  T
Q  324 aaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgc 423  Q
    ||  ||||||||| | | ||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||| |||||    
T  5196 aattggtgaattt-tgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgc 5294  T
Q  424 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5295 ttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 5324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 163; Significance: 7e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Original strand, 123087 - 123427
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 211  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  123087 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcataatttttgtaaatttgcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 123186  T
Q  212 tgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 311  Q
    |||||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  123187 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 123286  T
Q  312 aagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 411  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||    
T  123287 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttg 123385  T
Q  412 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  123386 atgaataatggcttgggtatgcatattcatgaattgaagatg 123427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 196 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 5785 - 5552
Alignment:
Q  196 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  5785 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgta 5686  T
Q  296 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 395  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5685 aaaatgataagtcatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 5586  T
Q  396 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggt 429  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5585 tttgataatatgattaatgaataattgcttgggt 5552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 5878 - 5846
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5878 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 5846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 205 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 283 - 35
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 304  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  283 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 184  T
Q  305 agttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 404  Q
    ||||||| | |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183 agttatgtatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 84  T
Q  405 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  83 atgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatgaattgttgatg 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 30531 - 30417
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||    ||| ||| ||||||||||| ||| || || |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  30531 agagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcatagaagcaaaagtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaagggggttatt 30432  T
Q  133 ctttatcataatcat 147  Q
     || |||||||||||    
T  30431 tttcatcataatcat 30417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 115 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 272362 - 272031
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | | ||||||||| ||| |    
T  272362 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatattgtataaattttgattatggataaatattgctaaatacgtac 272263  T
Q  215 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 314  Q
    ||||||| |  || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||     
T  272262 tccaactgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 272163  T
Q  315 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 414  Q
    |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||| || ||||||   ||||| ||||| || || ||||||    
T  272162 attgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattgatgttgtggttgatg 272064  T
Q  415 aataattgcttgggtatgcatattcatggattg 447  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  272063 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattg 272031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 196 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 48443 - 48187
Alignment:
Q  196 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  48443 attgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 48344  T
Q  296 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 395  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  48343 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgtta 48245  T
Q  396 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48244 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgggtatgcatattcatggattgatgatg 48187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 20606 - 20493
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    ||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20606 agagaagaggagcttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaaatgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagt 20507  T
Q  133 ctttatcataatca 146  Q
     || ||||||||||    
T  20506 gttcatcataatca 20493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 4)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 205 - 453
Target Start/End: Original strand, 64527 - 64780
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaatt-----gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 299  Q
    ||||||||||||   || || |||||||||| ||||||||||||     |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  64527 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattatattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaa 64626  T
Q  300 tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 399  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64627 tgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 64726  T
Q  400 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  64727 atattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 64780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 196 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 108003 - 107747
Alignment:
Q  196 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 295  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  108003 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgca 107904  T
Q  296 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 395  Q
    ||||||||||||| | || |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  107903 aaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 107805  T
Q  396 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  107804 attgatgttgtgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 107747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 91
Target Start/End: Original strand, 89661 - 89735
Alignment:
Q  19 aagaggaaaatggttagaga--agaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagc 91  Q
    |||||||||| |||||||||  || ||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  89661 aagaggaaaagggttagagagaagtggaacttgaagaatcaaggattgaaagagagctaggagctaaattgaagc 89735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 246
Target Start/End: Original strand, 89863 - 89905
Alignment:
Q  204 taaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 246  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  89863 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 89905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 117 - 335
Target Start/End: Original strand, 51110 - 51328
Alignment:
Q  117 aggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctc 216  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51110 aggtaaggagattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctc 51209  T
Q  217 caactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagat 316  Q
    ||||| || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||| ||    
T  51210 caactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgataagttgtgaaaat 51309  T
Q  317 tgtgctaaaggggtgaatt 335  Q
    |||||| ||  ||||||||    
T  51310 tgtgctcaattggtgaatt 51328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 200 - 453
Target Start/End: Original strand, 21115 - 21367
Alignment:
Q  200 ttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 299  Q
    |||||||||||||||||    | || |||||||||||||| ||| |||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21115 ttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 21214  T
Q  300 tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 399  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21215 tgataagttatgaagattgagctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgttatgaatgttatttg 21313  T
Q  400 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  21314 atgttatgattgatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattaatgatg 21367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 226 - 453
Target Start/End: Original strand, 14086 - 14312
Alignment:
Q  226 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 325  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14086 tgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgctcaa 14185  T
Q  326 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 425  Q
      ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14186 ttggtgaattt-tcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaattaatgttatgaatgttgtttgatgttatgattgatgaataattgctt 14284  T
Q  426 gggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  14285 gagtttgcatattcatggattgatgatg 14312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 163 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 149012 - 148721
Alignment:
Q  163 tttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||   || || ||| ||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  149012 tttcaaatgttgtatgaatttttgcataattgataattgttgttaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgt 148913  T
Q  261 ataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgag 360  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  148912 aagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgag 148814  T
Q  361 ttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
     | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||  || || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  148813 atttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgaagttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgtatattcatgaattgatgatg 148721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 9192 - 8849
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 208  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| ||||| |||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  9192 taaggtaagtgtgttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgtatttttcataattggataattgttgctaaat 9093  T
Q  209 tcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 308  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||    
T  9092 tcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 8993  T
Q  309 atgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 408  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||  ||||||| |||||||||   | ||| ||||| || |      
T  8992 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaattgatgttgttg 8894  T
Q  409 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8893 ttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 8849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 115 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 146938 - 146838
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||    
T  146938 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttcctaaattcatgc 146839  T
Q  215 t 215  Q
    |    
T  146838 t 146838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 239 - 453
Target Start/End: Original strand, 5254 - 5466
Alignment:
Q  239 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttct 338  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||  ||||||||| |    
T  5254 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-t 5352  T
Q  339 cctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatatt 438  Q
     || |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5353 gctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatgaataattgcttgggt-tgcatatt 5451  T
Q  439 catggattgatgatg 453  Q
    |||||||||||||||    
T  5452 catggattgatgatg 5466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 239 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 3936 - 3722
Alignment:
Q  239 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa-tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttc 337  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | ||||||   ||  |||||||||     
T  3936 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaattt- 3838  T
Q  338 tcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatat 437  Q
    | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3837 tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattacttgggtttgcatat 3738  T
Q  438 tcatggattgatgatg 453  Q
    ||||||||||||||||    
T  3737 tcatggattgatgatg 3722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 115 - 335
Target Start/End: Original strand, 89378 - 89600
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  89378 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttctatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 89477  T
Q  213 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 312  Q
    ||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||| ||||||| |||    
T  89478 gctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattataagttgtga 89577  T
Q  313 agattgtgctaaaggggtgaatt 335  Q
    | |||||||| ||  ||||||||    
T  89578 aaattgtgctcaattggtgaatt 89600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 115 - 240
Target Start/End: Original strand, 107708 - 107835
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgt 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||||||    
T  107708 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataatttttgctaaattcgt 107807  T
Q  213 gctccaactatgttgttatgtttgtatg 240  Q
    ||||||||| || || ||| ||||||||    
T  107808 gctccaactgtgatgatatatttgtatg 107835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 79993 - 79944
Alignment:
Q  15 agcaaagaggaaaatggttagagaa-gaggagcttgaagattcaaggatt 63  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  79993 agcaaagaggaaaagggttagagaaggaggaacttgaagattcaaggatt 79944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 130911 - 130880
Alignment:
Q  116 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130911 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 130880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 116; Significance: 8e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 226 - 449
Target Start/End: Original strand, 9374 - 9596
Alignment:
Q  226 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  9374 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaa 9473  T
Q  326 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 425  Q
      ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||    
T  9474 ttggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgctt 9572  T
Q  426 gggtatgcatattcatggattgat 449  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  9573 gggtatgcatattcatgaattgat 9596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 226 - 449
Target Start/End: Original strand, 16272 - 16494
Alignment:
Q  226 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  16272 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaa 16371  T
Q  326 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 425  Q
      ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||    
T  16372 ttggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgctt 16470  T
Q  426 gggtatgcatattcatggattgat 449  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  16471 gggtatgcatattcatgaattgat 16494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 201 - 347
Target Start/End: Original strand, 1304 - 1450
Alignment:
Q  201 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 300  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1304 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 1403  T
Q  301 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttg 347  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  1404 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttg 1450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 189 - 453
Target Start/End: Original strand, 534 - 797
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  534 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 633  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 388  Q
    ||| | | ||||||| |||| |||| ||||| || ||  ||||||||| | |||||||  |||||  || |||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  634 ataggaacaaatgatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaattt-tgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatg 732  T
Q  389 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
      || || ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  733 gctgctaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcaggaattgaggatg 797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 189 - 453
Target Start/End: Original strand, 34460 - 34724
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  34460 atggataattattgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 34559  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttat 387  Q
     | || ||||||   ||||| |||| ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| || || || |||||||||    
T  34560 ttgtgtaaaaatatgaagttgtgaaaattgttctcaataggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttat 34658  T
Q  388 gaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
       ||||||||||| || |  ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34659 tgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactacttgggtatgcatattcatggattgatgatg 34724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 189 - 453
Target Start/End: Original strand, 37066 - 37328
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  37066 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37165  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 388  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||||| |||   ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  37166 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 37263  T
Q  389 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37264 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 37328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 41746 - 41632
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41746 agagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagt 41647  T
Q  133 ctttatcataatcat 147  Q
     ||||||| ||||||    
T  41646 ttttatcacaatcat 41632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 36980 - 37012
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36980 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 189 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 41911 - 41648
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  41911 atggataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 41812  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 388  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  41811 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 41713  T
Q  389 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
      |||||  |||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41712 gttgttaaatgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 41648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 41997 - 41957
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattt 155  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  41997 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcattt 41957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 200 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 3215 - 2966
Alignment:
Q  200 ttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 299  Q
    |||||||||||||||||   || || |||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  3215 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaa 3116  T
Q  300 tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttattt 398  Q
    ||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| || || || |||||||||   ||||||||    
T  3115 tgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttattt 3017  T
Q  399 gatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 449  Q
    ||| || |  ||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3016 gatgttgttgttgatgaatcactgcttgtgtatgcatattcatgaattgat 2966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 189 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 13769 - 13506
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  13769 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 13670  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 388  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  | ||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  13669 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 13571  T
Q  389 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13570 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatgaattgacgatg 13506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 42788 - 42677
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  42788 agagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagata---aaggtaagggggttagt 42692  T
Q  133 ctttatcataatcat 147  Q
     ||||||||||||||    
T  42691 ttttatcataatcat 42677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 13856 - 13824
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13856 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 13824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 347 - 453
Target Start/End: Original strand, 9 - 115
Alignment:
Q  347 gttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggatt 446  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9 gttgttaatttgatatttgattcttgttcaaatgatattatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 108  T
Q  447 gatgatg 453  Q
    |||||||    
T  109 gatgatg 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 347 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 48620 - 48514
Alignment:
Q  347 gttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggatt 446  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48620 gttgttaatttgagatttgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 48521  T
Q  447 gatgatg 453  Q
    |||||||    
T  48520 gatgatg 48514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 201 - 357
Target Start/End: Original strand, 13325 - 13480
Alignment:
Q  201 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 300  Q
    ||||| ||||||||||  | | || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13325 tgctagattcgtgctcttagtgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 13424  T
Q  301 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaattt 357  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  13425 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaattt 13480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 4)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 27058 - 26911
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  27058 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 26959  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 336  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  26958 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 26911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 196 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 22796 - 22656
Alignment:
Q  196 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||      
T  22796 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtg 22697  T
Q  296 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 336  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  22696 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 22656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22889 - 22857
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22889 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27144 - 27112
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27144 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 27112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 189 - 336
Target Start/End: Original strand, 1582 - 1729
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  1582 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 1681  T
Q  289 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 336  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  1682 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 1729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 1496 - 1528
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1496 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 1528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 539 - 442
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||| | |||||||||||||||    
T  539 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagagggctaggagctaaagtgaagcttgagctaggaattggtgataactgaggtaagggggttag 442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Original strand, 5695 - 5809
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5695 agagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaattataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagt 5794  T
Q  133 ctttatcataatcat 147  Q
     || |||||||||||    
T  5795 tttcatcataatcat 5809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 147
Target Start/End: Original strand, 5942 - 6015
Alignment:
Q  74 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  5942 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 6015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Original strand, 31098 - 31212
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31098 agagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagt 31197  T
Q  133 ctttatcataatcat 147  Q
     ||||||| ||||||    
T  31198 ttttatcacaatcat 31212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 80301 - 80187
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80301 agagaagaggaacttgaagaattcaagggtttaaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagt 80202  T
Q  133 ctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||    
T  80201 ctttatcataatcat 80187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 148
Target Start/End: Original strand, 166082 - 166197
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| | || |||||    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166082 agagaagaggaacttgaagaattcaatggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagt 166181  T
Q  133 ctttatcataatcatc 148  Q
     || ||||||||||||    
T  166182 tttcatcataatcatc 166197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 148
Target Start/End: Original strand, 162037 - 162111
Alignment:
Q  74 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatc 148  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  162037 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatc 162111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 147
Target Start/End: Original strand, 116370 - 116483
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattgga-agatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||     
T  116370 agagaagaagagcttgaagattcaataattggagagatc-ctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttaga 116468  T
Q  133 ctttatcataatcat 147  Q
     || |||||||||||    
T  116469 tttcatcataatcat 116483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 356 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 9479 - 9382
Alignment:
Q  356 ttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 453  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9479 ttgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 9382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 4)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Original strand, 1360 - 1425
Alignment:
Q  35 gagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1360 gagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagagagctaggagctaaagtgaagcttgagctag 1425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 100
Target Start/End: Original strand, 8505 - 8570
Alignment:
Q  35 gagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8505 gagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagagagctaggagctaaagtgaagcttgagctag 8570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 246
Target Start/End: Original strand, 1546 - 1587
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 246  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  1546 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 1587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 246
Target Start/End: Original strand, 8691 - 8732
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 246  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  8691 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 8732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 11548 - 11461
Alignment:
Q  15 agcaaagaggaaaatggttagaga--agaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctag 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11548 agcaaagaagaaaagggttagagagaagaagagcttgaagattcaaggattggaagagagctaggaggtaaagtgaagctagagctag 11461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 92
Target Start/End: Original strand, 1161 - 1219
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagct 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1161 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagagagctaggagctaaagtgaagct 1219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 92
Target Start/End: Original strand, 9416 - 9474
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagct 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9416 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagagagctaggagctaaagtgaagct 9474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 6102 - 6036
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctag 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6102 agagaaaaggagcttgaagattcaaggattggaagagagctaggagctaaagtgaagcttgagctag 6036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 35914 - 35816
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagc-taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 131  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35914 agagaagaagagcttgaagattcaagaattggaagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 35816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 146
Target Start/End: Original strand, 19768 - 19881
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    ||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19768 agagaagaggagcttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagt 19867  T
Q  133 ctttatcataatca 146  Q
     || ||||||||||    
T  19868 gttcatcataatca 19881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 146
Target Start/End: Original strand, 24072 - 24185
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    ||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24072 agagaagaggagcttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaaatgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagt 24171  T
Q  133 ctttatcataatca 146  Q
     || ||||||||||    
T  24172 gttcatcataatca 24185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 8465 - 8386
Alignment:
Q  15 agcaaagaggaaaatggttagaga--agaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagct 92  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8465 agcaaagaggaaaagggttagagagaagaggaacttgaatattcaaggattggaagagagctaggagctaaagtgaagct 8386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 11331 - 11252
Alignment:
Q  15 agcaaagaggaaaatggttagaga--agaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagct 92  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11331 agcaaggaggaaaagggttagagagaagaggaacttgaagattcaaggattggaagagagctaggagctaaagtgaagct 11252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 8174
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 287  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||  ||||||||||| || ||||||||    
T  8257 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttca 8174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Original strand, 33520 - 33607
Alignment:
Q  15 agcaaagaggaaaatggttagag--aagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctag 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  33520 agcaaagaggaaaagggttagagagaagaggaacttgaagattcaaggattggaagagagctatgagctaaattgaagcttgagctag 33607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 3774 - 3695
Alignment:
Q  15 agcaaagaggaaaatggttag--agaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagct 92  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  3774 agcaaagaggaaaagggttagtgagaagaggaacttgaagattcaaggattggaagagagctaggagctaaattgaagct 3695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 3565 - 3525
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 246  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  3565 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 3525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 74 - 148
Target Start/End: Original strand, 311 - 385
Alignment:
Q  74 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatc 148  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  311 taggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaacggggttattctttatcataatcatc 385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 92
Target Start/End: Original strand, 22242 - 22300
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagct 92  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22242 agaggagaggagcttgaagattcaaggattggaagagagctaggagctaaagtgaagct 22300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 1814 - 1701
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaaga-ttcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagt 132  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||    ||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1814 agagaagaggaacttgaagaattcaagggtttgaagaatcataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagt 1715  T
Q  133 ctttatcataatca 146  Q
     || ||||||||||    
T  1714 gttcatcataatca 1701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3360
Alignment:
Q  189 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacat 282  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| | || || ||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  3453 atggataattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacat 3360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 397 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 3264 - 3210
Alignment:
Q  397 ttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 451  Q
    ||||| || |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3264 ttgatgttgtgattgatgaatcattgtttgggtaggcatattcatgaattgatga 3210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 2134 - 2243
Alignment:
Q  38 aagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtcttta 137  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||    | ||  ||| |||||||||||||||||  || |    
T  2134 aagaggaacttgaagattcaaggattggaagagagctaggagctaaagtgaagcttgagcaagagaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca 2233  T
Q  138 tcataatcat 147  Q
    ||||||||||    
T  2234 tcataatcat 2243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 287
Target Start/End: Original strand, 2317 - 2399
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 287  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  2317 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 2399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 8260 - 8181
Alignment:
Q  15 agcaaagaggaaaatggttag--agaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagct 92  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  8260 agcaaagaggaaaagggttagtgagaagaggaacttgacgattcaaggattggaagagagctaggagctaaattgaagct 8181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8051 - 8011
Alignment:
Q  206 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 246  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  8051 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 8011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 11116 - 10982
Alignment:
Q  15 agcaaagaggaaaatggttagaga--agaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagata 112  Q
    |||||||  |||||||||||||||  |||||| |||||||  |||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||  | |  |  ||    
T  11116 agcaaaggagaaaatggttagagagaagaggaacttgaaggatcaaagattgggagagagctaggagcaaaagtgaagctagagctagaggattaatcta 11017  T
Q  113 attaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    | |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  11016 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcat 10982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 76 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 164 - 94
Alignment:
Q  76 ggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 146  Q
    ||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  164 ggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 94  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 7097 - 6999
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagc-taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||| | | ||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7097 agagaaaaggagcttgaagattcaagaattggtagagatcctaggagctaaagtgaaggttgggctaggaattggtgataattatggtaagggggttag 6999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 96
Target Start/End: Original strand, 93664 - 93726
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagag 96  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  93664 agagaagaggaacttgaagaatcaaggattgggagagagctaggagcaaaagtgaagctagag 93726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 55936 - 55904
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55936 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 55904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 108075 - 108107
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 108107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 100
Target Start/End: Original strand, 1948 - 2001
Alignment:
Q  47 ttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagctagagctag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  1948 ttgaagattcaaggattggaagagagctaggagctaaattgaagcttgagctag 2001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 146
Target Start/End: Original strand, 6263 - 6335
Alignment:
Q  74 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 146  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| || |||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  6263 taggagcaaaagtgaagcttgagttaatagtgggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 6335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 146
Target Start/End: Original strand, 4 - 41
Alignment:
Q  109 gataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 146  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 41  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 147
Target Start/End: Original strand, 1361 - 1436
Alignment:
Q  72 gctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||    
T  1361 gctaggaactaaagtgaagcttgagctaggaattggtgataattgaggtaagggggttagaattcatcataatcat 1436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 285
Target Start/End: Original strand, 56106 - 56195
Alignment:
Q  196 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 285  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| || |||||| || || ||||||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  56106 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgtt 56195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 92
Target Start/End: Original strand, 70102 - 70177
Alignment:
Q  19 aagaggaaaatggttagaga--agaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagct 92  Q
    |||||||||| || ||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  70102 aagaggaaaaggggtagagagtagaggaacttgaagaatcaaggattggaagagagctaggagcaaaaatgaagct 70177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 57392 - 57424
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 246
Target Start/End: Original strand, 70307 - 70348
Alignment:
Q  205 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 246  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  70307 aaattcgtactccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 70348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 131
Target Start/End: Original strand, 76658 - 76756
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattgg--aagatagctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 131  Q
    |||||||| |||||||||||| |||  |||||  |||||  |||||||||||||||||||| | ||||| | |||  |||||||||||||||||||||||    
T  76658 agagaagaagagcttgaagatacaacaattggtaaagatc-ctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattgctgataattaaggtaagggggttag 76756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 147
Target Start/End: Original strand, 193396 - 193429
Alignment:
Q  114 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193396 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 193429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 6443 - 6475
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6443 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 6475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 878 - 910
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  878 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 9882 - 9914
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 9914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 13285 - 13317
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13285 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 13317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 131
Target Start/End: Original strand, 43603 - 43708
Alignment:
Q  25 aaaatggttagagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagc-taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaag 123  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||| | ||||| | || | | |||||||||||||    
T  43603 aaaagggttagagaaga--agcttgaagatttaagaagtggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaag 43700  T
Q  124 ggggttag 131  Q
    ||||||||    
T  43701 ggggttag 43708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 31445 - 31357
Alignment:
Q  44 agcttgaagattcaaggattggaagatag-ctaggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 131  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||| |  |||||||||||||||||||| | ||||| | || | | |||||||||||||||||||||    
T  31445 agcttgaagattcaagaatttgtagaaatactaggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttag 31357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 715 - 632
Alignment:
Q  49 gaagattcaaggattggaagatagc-taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 131  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||||| | ||||| | || | |||||||| ||||||||||||||    
T  715 gaagattcaagaattggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattagtgataattatggtaagggggttag 632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 18058 - 18015
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt 158  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  18058 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcataattattttgt 18015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 12140 - 12066
Alignment:
Q  19 aagaggaaaatggttagaga--agaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagc 91  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||  | ||||||||| |||| ||||||    
T  12140 aagaggaaaagggttagagagaagaggaacttgaagaatcaaggattggagaagagctaggagttaaattgaagc 12066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 16335 - 16278
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagc 91  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  16335 agagaataggaacttgaagaatcaaggattgggggagagctaggagctaaattgaagc 16278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 25866 - 25809
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagc 91  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  25866 agagaataggaacttgaagaatcaaggattgggggagagctaggagctaaattgaagc 25809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 239 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 45244 - 45198
Alignment:
Q  239 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 285  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45244 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtt 45198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 45370 - 45338
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45370 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 45338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 2349 - 2292
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagc 91  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||  || | |||||||||||| ||||||    
T  2349 agagaagaggaacttgaagaatcaaggattgggggagaactaggagctaaattgaagc 2292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 34096 - 34039
Alignment:
Q  34 agagaagaggagcttgaagattcaaggattggaagatagctaggagctaaagtgaagc 91  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||||||    
T  34096 agagaaaaggaacttgaagaatcaaggattgggggaaagctaggagctaaattgaagc 34039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 17209 - 17241
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17209 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 17241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 5476 - 5508
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5476 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 5508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 4346 - 4378
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4346 taaggtaagggggttagactttatcataatcat 4378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 17304 - 17336
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17304 taaggtaagcgggttagtctttatcataatcat 17336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 5581 - 5549
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5581 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 5549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 34308 - 34340
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34308 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 34340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 147
Target Start/End: Original strand, 12418 - 12450
Alignment:
Q  115 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 147  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12418 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 12450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 131
Target Start/End: Original strand, 197076 - 197163
Alignment:
Q  44 agcttgaagattcaaggattggaagatagc-taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 131  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| | | ||||||||||||||||||| | ||||| | |||  | |||||||||||||||||||||    
T  197076 agcttgaagattcaagaagtggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattgt-gctaattaaggtaagggggttag 197163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University