View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14210_high_29 (Length: 306)

Name: NF14210_high_29
Description: NF14210
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14210_high_29
NF14210_high_29
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (12-306)||(33970-34264)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (12-306)||(7341240-7341534)
chr8 (12-306)||(32377514-32377808)
chr8 (12-306)||(32431471-32431765)
chr8 (15-306)||(30304216-30304507)
chr8 (12-306)||(8422462-8422756)
chr8 (15-301)||(35965356-35965642)
chr8 (15-306)||(43370931-43371222)
chr8 (15-306)||(43688777-43689068)
chr8 (19-306)||(2145605-2145897)
chr8 (17-299)||(45455542-45455824)
chr8 (15-306)||(7169064-7169346)
chr8 (15-187)||(1115936-1116108)
chr8 (84-306)||(22581061-22581283)
chr8 (15-168)||(39751772-39751925)
chr8 (186-298)||(45116582-45116694)
chr8 (152-301)||(14401384-14401532)
chr8 (181-297)||(17316787-17316903)
chr8 (186-274)||(44321173-44321261)
[»] chr7 (22 HSPs)
chr7 (12-306)||(43622741-43623035)
chr7 (12-306)||(617355-617649)
chr7 (15-306)||(18106552-18106843)
chr7 (15-306)||(42500571-42500862)
chr7 (12-306)||(30787700-30787994)
chr7 (12-306)||(45764540-45764834)
chr7 (15-306)||(47062047-47062338)
chr7 (15-306)||(43827213-43827503)
chr7 (124-306)||(15067162-15067344)
chr7 (15-271)||(8400750-8401006)
chr7 (15-128)||(15060777-15060890)
chr7 (186-298)||(1297321-1297433)
chr7 (161-289)||(16795719-16795847)
chr7 (186-298)||(40445179-40445291)
chr7 (186-298)||(43378922-43379034)
chr7 (243-306)||(12116975-12117038)
chr7 (186-298)||(16794227-16794339)
chr7 (186-298)||(46791660-46791772)
chr7 (186-298)||(47867113-47867225)
chr7 (186-281)||(45172540-45172635)
chr7 (173-289)||(8193903-8194019)
chr7 (186-287)||(40794258-40794359)
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (12-306)||(49565070-49565364)
chr4 (15-306)||(19072263-19072554)
chr4 (15-306)||(3404954-3405245)
chr4 (15-306)||(9891186-9891477)
chr4 (15-306)||(41024363-41024654)
chr4 (15-306)||(4769298-4769589)
chr4 (15-306)||(44049774-44050065)
chr4 (15-306)||(4976919-4977210)
chr4 (15-298)||(38463451-38463734)
chr4 (15-306)||(11502670-11502961)
chr4 (15-306)||(4978564-4978851)
chr4 (15-306)||(21471958-21472249)
chr4 (15-199)||(51643211-51643395)
chr4 (48-301)||(6182875-6183128)
chr4 (15-119)||(18580124-18580225)
chr4 (186-298)||(32716628-32716740)
chr4 (186-298)||(1591168-1591280)
chr4 (210-298)||(4617916-4618004)
chr4 (186-298)||(17916521-17916633)
[»] chr3 (29 HSPs)
chr3 (12-306)||(3949904-3950198)
chr3 (12-306)||(8159589-8159883)
chr3 (15-306)||(6742051-6742342)
chr3 (15-306)||(13746327-13746618)
chr3 (12-306)||(30946248-30946542)
chr3 (15-306)||(16445784-16446075)
chr3 (15-306)||(36816122-36816413)
chr3 (15-300)||(14399719-14400004)
chr3 (15-300)||(48249479-48249764)
chr3 (15-235)||(9428510-9428730)
chr3 (15-306)||(7841622-7841912)
chr3 (17-306)||(46991852-46992141)
chr3 (15-306)||(6504561-6504852)
chr3 (17-306)||(77626-77915)
chr3 (15-306)||(7838760-7839051)
chr3 (15-306)||(21954845-21955135)
chr3 (59-306)||(29908027-29908273)
chr3 (59-306)||(29949193-29949439)
chr3 (59-306)||(29998347-29998593)
chr3 (215-298)||(28610533-28610616)
chr3 (15-63)||(29930532-29930580)
chr3 (15-63)||(29979686-29979734)
chr3 (193-298)||(9556378-9556483)
chr3 (186-298)||(2284671-2284783)
chr3 (186-274)||(4120432-4120520)
chr3 (186-298)||(12491422-12491534)
chr3 (186-298)||(40467822-40467934)
chr3 (186-298)||(51548147-51548259)
chr3 (186-298)||(33940190-33940302)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (12-306)||(212047-212341)
chr2 (12-306)||(5348328-5348622)
chr2 (12-306)||(41561173-41561467)
chr2 (15-306)||(27274966-27275257)
chr2 (12-306)||(10623060-10623354)
chr2 (13-306)||(38946925-38947218)
chr2 (15-306)||(39795134-39795425)
chr2 (15-299)||(3802178-3802463)
chr2 (15-306)||(24750822-24751114)
chr2 (15-301)||(1098437-1098723)
chr2 (15-306)||(24604695-24604986)
chr2 (17-306)||(45476524-45476812)
chr2 (15-306)||(43948888-43949179)
chr2 (15-306)||(12907098-12907389)
chr2 (15-306)||(34920388-34920679)
chr2 (15-306)||(41007586-41007877)
chr2 (15-301)||(9655320-9655606)
chr2 (15-306)||(436475-436767)
chr2 (15-265)||(28354549-28354799)
chr2 (15-261)||(11692466-11692712)
chr2 (100-306)||(7264229-7264435)
chr2 (15-301)||(17996783-17997069)
chr2 (208-306)||(24941256-24941354)
chr2 (161-298)||(28423088-28423225)
chr2 (169-301)||(21535507-21535633)
chr2 (208-299)||(3353894-3353985)
chr2 (15-53)||(7264196-7264234)
[»] chr1 (30 HSPs)
chr1 (12-306)||(3947067-3947361)
chr1 (12-306)||(3984274-3984568)
chr1 (12-306)||(44466743-44467037)
chr1 (15-306)||(29355294-29355585)
chr1 (12-306)||(20350617-20350911)
chr1 (12-306)||(38774721-38775015)
chr1 (15-306)||(5079099-5079390)
chr1 (15-306)||(13630580-13630871)
chr1 (15-306)||(41455001-41455292)
chr1 (15-301)||(37016078-37016364)
chr1 (15-306)||(50116369-50116660)
chr1 (15-306)||(12649185-12649476)
chr1 (15-306)||(38691545-38691836)
chr1 (15-306)||(46974328-46974619)
chr1 (15-306)||(13174945-13175236)
chr1 (15-306)||(51663422-51663713)
chr1 (15-299)||(21942977-21943261)
chr1 (98-306)||(19498070-19498277)
chr1 (22-301)||(32106265-32106533)
chr1 (15-110)||(44619905-44620000)
chr1 (22-176)||(26466006-26466160)
chr1 (186-289)||(36360143-36360246)
chr1 (15-56)||(7980068-7980109)
chr1 (186-281)||(7403953-7404048)
chr1 (186-298)||(45472687-45472799)
chr1 (210-298)||(20240034-20240122)
chr1 (186-298)||(28863225-28863337)
chr1 (107-216)||(25231558-25231667)
chr1 (188-301)||(31445866-31445979)
chr1 (186-298)||(18887408-18887520)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (15-306)||(2045-2336)
[»] chr5 (21 HSPs)
chr5 (15-306)||(37819483-37819774)
chr5 (15-306)||(28885014-28885305)
chr5 (15-306)||(7020486-7020777)
chr5 (15-306)||(11032058-11032349)
chr5 (15-306)||(38858796-38859087)
chr5 (15-306)||(34078944-34079235)
chr5 (15-306)||(27866451-27866742)
chr5 (15-306)||(7799612-7799903)
chr5 (15-306)||(4202545-4202836)
chr5 (15-306)||(18536942-18537233)
chr5 (15-306)||(1036515-1036806)
chr5 (15-306)||(25895703-25895998)
chr5 (15-306)||(13566713-13566988)
chr5 (22-301)||(20287439-20287719)
chr5 (22-252)||(20286180-20286409)
chr5 (186-298)||(11819551-11819663)
chr5 (186-298)||(27013283-27013395)
chr5 (161-266)||(25053043-25053148)
chr5 (186-298)||(42343826-42343937)
chr5 (186-274)||(43295549-43295637)
chr5 (186-289)||(6553124-6553227)
[»] chr6 (12 HSPs)
chr6 (12-306)||(1611357-1611651)
chr6 (15-297)||(31147486-31147768)
chr6 (15-306)||(29287559-29287845)
chr6 (15-306)||(18607160-18607451)
chr6 (90-306)||(28357557-28357773)
chr6 (15-306)||(21357956-21358244)
chr6 (15-306)||(23961938-23962226)
chr6 (15-89)||(28251060-28251134)
chr6 (15-91)||(24220332-24220408)
chr6 (186-298)||(9095463-9095575)
chr6 (148-239)||(31176265-31176356)
chr6 (186-239)||(31196905-31196958)
[»] scaffold0341 (1 HSPs)
scaffold0341 (15-306)||(15963-16254)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (15-306)||(17233-17524)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (15-168)||(12426-12580)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (255-306)||(25552-25603)
[»] scaffold0340 (1 HSPs)
scaffold0340 (262-306)||(56-100)


Alignment Details
Target: scaffold0101 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Original strand, 33970 - 34264
Alignment:
Q  12 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33970 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 34069  T
Q  112 tctcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34070 tctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 34169  T
Q  212 gttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34170 attgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 34264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Original strand, 7341240 - 7341534
Alignment:
Q  12 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341240 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 7341339  T
Q  112 tctcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341340 tctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 7341439  T
Q  212 gttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341440 attgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 7341534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 32377808 - 32377514
Alignment:
Q  12 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377808 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 32377709  T
Q  112 tctcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377708 tctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 32377609  T
Q  212 gttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377608 attgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 32377514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 32431765 - 32431471
Alignment:
Q  12 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431765 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 32431666  T
Q  112 tctcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431665 tctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 32431566  T
Q  212 gttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431565 attgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 32431471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 30304507 - 30304216
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304507 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 30304408  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30304407 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 30304308  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304307 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 30304216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8422756 - 8422462
Alignment:
Q  12 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422756 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 8422657  T
Q  112 tctcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 211  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8422656 tctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattat 8422557  T
Q  212 gttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422556 attgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 8422462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 35965642 - 35965356
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35965642 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 35965543  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35965542 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacagttgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 35965443  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35965442 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatatttgaggtagttggggt 35965356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 43370931 - 43371222
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  43370931 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagagctgacaagaagtcgttgcaatatctaatct 43371030  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43371031 cgaagttggaggagcacagctatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 43371130  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  43371131 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgtcaacgtttgaggtagttggggtcactt 43371222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 43689068 - 43688777
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  43689068 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgataagaagccgttgcaatttctaattt 43688969  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  || |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  43688968 cgaagttgggggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactataatcgaagatatcttttgggctcatccaaaatccgttaagtt 43688869  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43688868 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 43688777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 2145897 - 2145605
Alignment:
Q  19 cacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaata-----ggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatc 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     | ||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  2145897 cacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatataatagaggtgacaagaagttgttgcaatatctaatc 2145798  T
Q  114 tcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagt 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  2145797 tcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacattcgttaagt 2145698  T
Q  214 tgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2145697 tgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 2145605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 299
Target Start/End: Original strand, 45455542 - 45455824
Alignment:
Q  17 accacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcg 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  45455542 accatattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatcaacgtcaacaaatatgaaaggcaaatagaggtgacaaaaagccgttgcaatatctaatctcg 45455641  T
Q  117 aagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgt 216  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||  || ||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45455642 aagttggaggagcacaactattcttattactcaagagcacaaagtgaaagtaccacaatcaaatatattttttgggctcatccaacatccgttaagttgt 45455741  T
Q  217 ttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggg 299  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45455742 ttaaaatttttccaacggttttggttatggactccaccaacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggg 45455824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 7169064 - 7169346
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||||| | ||||||    
T  7169064 agaccacattccatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtg---------cgttgcaatatataatct 7169154  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7169155 caaagttggatgagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 7169254  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  7169255 gtttaacaattttccaacgattttggttatgaactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttagggtcactt 7169346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 15 - 187
Target Start/End: Original strand, 1115936 - 1116108
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1115936 agaccacattgcatgacaaatgtgaaacaaatgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 1116035  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatttt 187  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1116036 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatgtttt 1116108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 84 - 306
Target Start/End: Original strand, 22581061 - 22581283
Alignment:
Q  84 ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagata 183  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || ||| |||    
T  22581061 ggtgacaagaatccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaaaata 22581160  T
Q  184 ttttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaat 283  Q
    | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||| | |||| ||||    
T  22581161 tcttttgggctcatccaacatctgttaagttgtttaacaattttctaacggttttggttatggactccacctgcaaaaccaacatgtacaagatgtcaat 22581260  T
Q  284 gtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  22581261 gtttgaggtagttggggtcactt 22581283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 39751925 - 39751772
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  39751925 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaaaccattgcaatatctaatct 39751826  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagta 168  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  39751825 cgaagttggaggagcacaacttcacttattactcaagaacacaaagtgaaagta 39751772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 186 - 298
Target Start/End: Original strand, 45116582 - 45116694
Alignment:
Q  186 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 285  Q
    |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| |||| |||||| |||||| ||||||| |||||| |||    
T  45116582 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 45116681  T
Q  286 ttgaggtagttgg 298  Q
    ||||  |||||||    
T  45116682 ttgaaatagttgg 45116694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 14401532 - 14401384
Alignment:
Q  152 aacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactcc 251  Q
    |||||||  |||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||   |||  ||||||||||||| |||||| | |  |||||| | || |||| |    
T  14401532 aacacaatgtgaaagta-tactattcatgatatattttgggctcatcctgaatctgttaagttgtttaataatttttcgatagttttgttcatcgacttc 14401434  T
Q  252 aagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggt 301  Q
    |  || || ||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  14401433 acctataaaaccaacacgtataggatgtcattgtttgagatagttggggt 14401384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 297
Target Start/End: Original strand, 17316787 - 17316903
Alignment:
Q  181 atattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgcc 280  Q
    |||||||||| ||||| |||  |||  |||||||||||||||||||||| || |||||| | ||| | | ||  ||||| |||||| |||| | ||||||    
T  17316787 atattttttgagctcacccacaatcatttaagttgtttaacaattttccgactgttttgatcatgaatttcacatacaaaaccaacttgtacatgatgcc 17316886  T
Q  281 aatgtttgaggtagttg 297  Q
    | |||||||| ||||||    
T  17316887 attgtttgagatagttg 17316903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 274
Target Start/End: Original strand, 44321173 - 44321261
Alignment:
Q  186 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtatag 274  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||| | || |||||| | ||||| |||| |||||| |||||| |||||||    
T  44321173 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacactttttcgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatag 44321261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 22)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 43623035 - 43622741
Alignment:
Q  12 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43623035 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 43622936  T
Q  112 tctcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622935 tctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 43622836  T
Q  212 gttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622835 attgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 43622741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 617649 - 617355
Alignment:
Q  12 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  617649 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaaaccgttgcaatttctaa 617550  T
Q  112 tctcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617549 tctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 617450  T
Q  212 gttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617449 gttgtttaacaattttccaacgattttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 617355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 18106552 - 18106843
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106552 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 18106651  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106652 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 18106751  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18106752 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgctaatgtttgaggtagttggggtgactt 18106843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 42500571 - 42500862
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42500571 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 42500670  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42500671 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 42500770  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42500771 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 42500862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Original strand, 30787700 - 30787994
Alignment:
Q  12 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 111  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787700 cagataccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaagcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 30787799  T
Q  112 tctcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787800 tctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 30787899  T
Q  212 gttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787900 attgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 30787994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Original strand, 45764540 - 45764834
Alignment:
Q  12 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45764540 cagagaccacattgcatgacaaatgcgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 45764639  T
Q  112 tctcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45764640 tctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 45764739  T
Q  212 gttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45764740 attgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccagcatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 45764834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 47062047 - 47062338
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggt-gacaagaagccgttgcaatttctaatc 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  47062047 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacgatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggttgacaagaagccgttgcaatatctaatc 47062146  T
Q  114 tcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagt 213  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  47062147 tcgaagttggaagagcacaactatacttattactcaa-aacacaaagtgaaagtactacaattgaagatatctttcgggctcatccaacatccgttaagt 47062245  T
Q  214 tgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47062246 tgtttaaaaaatttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaaaatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 47062338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 43827503 - 43827213
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  43827503 agaccacattgcatgacaaatatcaagcaagtgtacaatgaacgtcagcaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatcta-tct 43827405  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43827404 cgaagttgaatgagcacaactatacttatttcacaagaacacaaagtgaaagtactacaattgaaaatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 43827305  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  43827304 gtttaacaattttccaatggttttggttatggactccacctacaaaaccaacgtgtacaagatgccaatgtttgaggtagtttgggtcactt 43827213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 124 - 306
Target Start/End: Original strand, 15067162 - 15067344
Alignment:
Q  124 aggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15067162 aggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaa 15067261  T
Q  224 ttttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15067262 ttttccaacggttttggttatggactccacatacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 15067344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 15 - 271
Target Start/End: Original strand, 8400750 - 8401006
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  8400750 agaccacattggatgacaaatatcaagcaagtgtacattgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagacggcgttgcaatatctaatct 8400849  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  8400850 cgaagttggaggagcacaactatacttatttctcaagaacacaaagtgaaagtactacaattaaagatattttttgggctcatccaacatctgttaagtt 8400949  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgta 271  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  ||||| |||||||||||    
T  8400950 gtttaacaattttctaacggttttggttatggatttcacctacaaaaccaacatgta 8401006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 128
Target Start/End: Original strand, 15060777 - 15060890
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15060777 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 15060876  T
Q  115 cgaagatggaggag 128  Q
    ||||| ||||||||    
T  15060877 cgaagttggaggag 15060890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 186 - 298
Target Start/End: Original strand, 1297321 - 1297433
Alignment:
Q  186 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 285  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||| |||| |||||| |||||| ||||||| |||||| | |    
T  1297321 ttttggactcatccaacatcgataaagttgtttaacatttttccaactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccatttt 1297420  T
Q  286 ttgaggtagttgg 298  Q
    ||||  |||||||    
T  1297421 ttgaaatagttgg 1297433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16795847 - 16795719
Alignment:
Q  161 tgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaag 260  Q
    ||||||||| ||| || ||||  | |||||| |||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| ||||||     
T  16795847 tgaaagtaaaactgttcaagacttattttggactcatccaacatcggtaaaattgtttaacaattttccaactgttttgataatggattccatgtacaaa 16795748  T
Q  261 accaacatgtataggatgccaatgtttga 289  Q
    || ||| |||| | ||||||| |||||||    
T  16795747 acaaacttgtacatgatgccattgtttga 16795719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 40445291 - 40445179
Alignment:
Q  186 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 285  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||  || |||||| | ||||| |||| |||||| |||||| ||||||| |||||| |||    
T  40445291 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttctgactgttttgataatggattccatgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 40445192  T
Q  286 ttgaggtagttgg 298  Q
    ||||  |||||||    
T  40445191 ttgaaatagttgg 40445179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 43379034 - 43378922
Alignment:
Q  186 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 285  Q
    |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| ||||  ||||| |||||| |||||||||| | | |||    
T  43379034 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggattccacatacaaaaccaacttgtataggattctattgt 43378935  T
Q  286 ttgaggtagttgg 298  Q
    ||||  |||||||    
T  43378934 ttgaaatagttgg 43378922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12117038 - 12116975
Alignment:
Q  243 atggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12117038 atggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 12116975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16794339 - 16794227
Alignment:
Q  186 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 285  Q
    |||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| |||| |||||| || ||| |||| | ||||||| |||    
T  16794339 ttttggactcatcaaacatcagtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaacaaacttgtacatgatgccattgt 16794240  T
Q  286 ttgaggtagttgg 298  Q
    ||||  |||||||    
T  16794239 ttgaaatagttgg 16794227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 298
Target Start/End: Original strand, 46791660 - 46791772
Alignment:
Q  186 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 285  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||| || |||||| | ||||| |||| |||||| || ||| ||||||| |||||| |||    
T  46791660 ttttggactcatccaacatcagtaaagttatttaacacttttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaactaacttgtatagaatgccattgt 46791759  T
Q  286 ttgaggtagttgg 298  Q
    ||||  |||||||    
T  46791760 ttgaaatagttgg 46791772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 47867225 - 47867113
Alignment:
Q  186 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 285  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||  || | |||| | |||||||||| |||||| | |||| ||||||| |||||| |||    
T  47867225 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttctgactgctttgataatggactccacgtacaaaatcaacttgtatagaatgccattgt 47867126  T
Q  286 ttgaggtagttgg 298  Q
    ||||  |||||||    
T  47867125 ttgaaatagttgg 47867113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 45172635 - 45172540
Alignment:
Q  186 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgcca 281  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| || |||||| | || || |||| |||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  45172635 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataattgattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgcca 45172540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 8194019 - 8193903
Alignment:
Q  173 tattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtat 272  Q
    |||| |||| || |||||| ||||||||||||   | ||||||||||| |||||||| || |||||| | ||| | |||| |||||| |||||| ||||     
T  8194019 tattcaagacatattttggactcatccaacattggtaaagttgtttaataattttccgactgttttgataatgcattccacgtacaaaaccaacttgtac 8193920  T
Q  273 aggatgccaatgtttga 289  Q
    | ||||||| |||||||    
T  8193919 atgatgccattgtttga 8193903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 287
Target Start/End: Original strand, 40794258 - 40794359
Alignment:
Q  186 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 285  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||  |||||   ||||| |||| |||||| | |||| ||||||| |||||| |||    
T  40794258 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactattttgagaatggattccacgtacaaaatcaacttgtatagaatgccattgt 40794357  T
Q  286 tt 287  Q
    ||    
T  40794358 tt 40794359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 49565364 - 49565070
Alignment:
Q  12 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565364 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 49565265  T
Q  112 tctcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565264 tctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 49565165  T
Q  212 gttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565164 attgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 49565070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19072554 - 19072263
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072554 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 19072455  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19072454 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 19072355  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072354 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 19072263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 3404954 - 3405245
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3404954 agaccacattgcatgataaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 3405053  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3405054 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 3405153  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3405154 gtttaacaattttcaaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 3405245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 9891186 - 9891477
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9891186 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 9891285  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9891286 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttggactcatccaacatccattaagtt 9891385  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891386 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 9891477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 41024363 - 41024654
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  41024363 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaaaaagtcgttgcaatttctaatct 41024462  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41024463 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 41024562  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  41024563 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggaggccaatgtttgaggtggttggggtcactt 41024654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 4769298 - 4769589
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |    
T  4769298 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaatgtctacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttctgattt 4769397  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4769398 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 4769497  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4769498 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgtcaatgtttgaggtagttggggtcactt 4769589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 44049774 - 44050065
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  44049774 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaacgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagctgttgcaatatctaatct 44049873  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||  ||||| || ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44049874 cgaagttggaggagcgcagctatacttattactcaataacacaaagtgaaactactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 44049973  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44049974 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 44050065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 4976919 - 4977210
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  4976919 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaatgcaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatct 4977018  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4977019 caaagttggaggagcacaactatacttattactaaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatctgttaagtt 4977118  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4977119 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 4977210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 38463734 - 38463451
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  38463734 agaccacactgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatacggaaggcaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatct 38463635  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  38463634 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacattcgttaagtt 38463535  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttgg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  38463534 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgctaatgtttgaggtagttgg 38463451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 11502670 - 11502961
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11502670 agaccacattgcatgataaatgtgaagcaagtaaacaatgaacgtcaacaaatatggaagacaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 11502769  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11502770 cgaagttggaagagcacaactatacttattactcaagaacacaaagagaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatcaaacatccgttaagtt 11502869  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11502870 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 11502961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4978851 - 4978564
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4978851 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaa----ggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 4978756  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||    
T  4978755 caaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcttccaacgtctgttaagtt 4978656  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  4978655 gtttaacaattttcgaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgtcaatgtttgaggtagttagggtcactt 4978564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 21471958 - 21472249
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  21471958 agaccacattggataa-aaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatttaatct 21472056  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||  ||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21472057 cgaagttggaggagcacaactatacttattacttaagaacacaaagtgaaagtactaaaatcaaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 21472156  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtac-aagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21472157 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaacaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 21472249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 51643395 - 51643211
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  51643395 agaccacattgcatgacaaatgtaaagcaagtgtacgatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagagttgacaagacgccgttgcaatatctaatct 51643296  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatcc 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||    
T  51643295 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcaaagatatcttttgggctcatcc 51643211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 48 - 301
Target Start/End: Original strand, 6182875 - 6183128
Alignment:
Q  48 tacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagatggaggagcacaactatacttattact 147  Q
    |||||||||| |||| ||||||  ||| |||| || |||||||||| |  | |||||| ||||||||| ||  ||||||| |||||||||  ||||| |     
T  6182875 tacaatgaacatcaaaaaatattcaagtcaaacagaggtgacaagacggtgatgcaatatctaatctcaaaattggaggaacacaactatgtttatttca 6182974  T
Q  148 caagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 247  Q
    | | ||||||| ||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  6182975 ccataacacaaattgaaagtactactattcaagacatattttgggctcatccaacatctgttaagttgtttaacaattttccaacagttttgattatgaa 6183074  T
Q  248 ctccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggt 301  Q
    |||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6183075 ctccatctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatgtttgagatagttggggt 6183128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 18580225 - 18580124
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18580225 agacctcattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatgga---caaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatttaatct 18580129  T
Q  115 cgaag 119  Q
    |||||    
T  18580128 cgaag 18580124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 298
Target Start/End: Original strand, 32716628 - 32716740
Alignment:
Q  186 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 285  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| || |||||| | ||||| |||| |||||| |||||| ||||||| |||||| |||    
T  32716628 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 32716727  T
Q  286 ttgaggtagttgg 298  Q
    ||||  |||||||    
T  32716728 ttgaaatagttgg 32716740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 298
Target Start/End: Original strand, 1591168 - 1591280
Alignment:
Q  186 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 285  Q
    |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||| | || |||||| | ||||| |||| ||| || |||||| ||||||| |||||| |||    
T  1591168 ttttggactcatccaacatcagtaaagttgtttaacaatttttcgactgttttgataatggattccacgtagaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 1591267  T
Q  286 ttgaggtagttgg 298  Q
    ||||  |||||||    
T  1591268 ttgaaatagttgg 1591280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 210 - 298
Target Start/End: Original strand, 4617916 - 4618004
Alignment:
Q  210 aagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttgg 298  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||  |||||||    
T  4617916 aagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtataggacgccattgtttgaaatagttgg 4618004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 298
Target Start/End: Original strand, 17916521 - 17916633
Alignment:
Q  186 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 285  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| || |||||| | ||||| | || |||||| ||||   ||||||| |||||| |||    
T  17916521 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataatggatttcacgtacaaaaccattttgtatagaatgccattgt 17916620  T
Q  286 ttgaggtagttgg 298  Q
    ||||  |||||||    
T  17916621 ttgaaatagttgg 17916633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 29)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Original strand, 3949904 - 3950198
Alignment:
Q  12 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3949904 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 3950003  T
Q  112 tctcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950004 tctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 3950103  T
Q  212 gttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950104 attgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 3950198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8159883 - 8159589
Alignment:
Q  12 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159883 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 8159784  T
Q  112 tctcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159783 tctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 8159684  T
Q  212 gttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159683 attgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 8159589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 6742051 - 6742342
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742051 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 6742150  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6742151 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 6742250  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742251 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 6742342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13746618 - 13746327
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746618 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 13746519  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746518 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 13746419  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746418 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 13746327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 30946542 - 30946248
Alignment:
Q  12 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946542 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaaagtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 30946443  T
Q  112 tctcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946442 tctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 30946343  T
Q  212 gttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946342 attgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 30946248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 16445784 - 16446075
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16445784 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 16445883  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16445884 cgaagttggaggagcacaagtatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatattttgggctcatccaacatccattaagtt 16445983  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16445984 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactcgacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 16446075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 36816413 - 36816122
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816413 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 36816314  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816313 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtaatacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagtt 36816214  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36816213 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 36816122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 15 - 300
Target Start/End: Original strand, 14399719 - 14400004
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14399719 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 14399818  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14399819 cgaatttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagtt 14399918  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttgggg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14399919 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttgggg 14400004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 48249764 - 48249479
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48249764 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 48249665  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    | | | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48249664 ctatgttggatgagcacaactatacttatcactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 48249565  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttgggg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48249564 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttgggg 48249479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 15 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9428730 - 9428510
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9428730 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 9428631  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9428630 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 9428531  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggt 235  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9428530 gtttaacaattttccaacggt 9428510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7841912 - 7841622
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7841912 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 7841813  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7841812 cgaagttggaggagcacaacta-acttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggttcatccaacatccgttaagtt 7841714  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7841713 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtagaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 7841622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 46992141 - 46991852
Alignment:
Q  17 accacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcg 116  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  46992141 accacattgcatgacaaatatgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaagacaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttt 46992042  T
Q  117 aagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgt 216  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46992041 atgttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgt 46991942  T
Q  217 ttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46991941 ttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 46991852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 6504852 - 6504561
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  6504852 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcacatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaacct 6504753  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6504752 cgaagttggaggagcacaactattcttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 6504653  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  6504652 ttttaacaattttccaaccgttttggttatggactccacctacataaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttgaggtcactt 6504561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 77915 - 77626
Alignment:
Q  17 accacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcg 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  77915 accacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatgaaaggcaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcg 77816  T
Q  117 aagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgt 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||    
T  77815 aagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactaccatcgaagatatcttttgggctcatccaacatttgttaagttgt 77716  T
Q  217 ttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  77715 ttaacaatttttcaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgtcaatgtttgaggtagttggggtcactt 77626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 7838760 - 7839051
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7838760 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtggcaagaagccgttgcaatatctaatct 7838859  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||    
T  7838860 tgaagttggaggagcacaactatacttattacttaagaacataaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccgacatctgttaagtt 7838959  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7838960 gtttaacaattttccaacggttttggtcatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 7839051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21955135 - 21954845
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21955135 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatat-taatct 21955037  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||  || || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21955036 cgaagttggaggaccacaactatacttatttctcaagaaaacaaagtgaaagtaccacaatcgaagataccttttgggctcatccaacatccattaagtt 21954937  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21954936 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaacgaacatgtacaggatgccaatatttgaggtagttggggtcactt 21954845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 59 - 306
Target Start/End: Original strand, 29908027 - 29908273
Alignment:
Q  59 tcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaa 158  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29908027 tcaacaaatatggaaggcaaataaaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttagag-agcacaactatacttattactcaagaacacaa 29908125  T
Q  159 cttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtaca 258  Q
      |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  29908126 agtgaaagtagtacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctaca 29908225  T
Q  259 agaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29908226 aaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 29908273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 59 - 306
Target Start/End: Original strand, 29949193 - 29949439
Alignment:
Q  59 tcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaa 158  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29949193 tcaacaaatatggaaggcaaataaaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttagag-agcacaactatacttattactcaagaacacaa 29949291  T
Q  159 cttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtaca 258  Q
      |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  29949292 agtgaaagtagtacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctaca 29949391  T
Q  259 agaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29949392 aaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 29949439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 59 - 306
Target Start/End: Original strand, 29998347 - 29998593
Alignment:
Q  59 tcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaa 158  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29998347 tcaacaaatatggaaggcaaataaaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttagag-agcacaactatacttattactcaagaacacaa 29998445  T
Q  159 cttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtaca 258  Q
      |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  29998446 agtgaaagtagtacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctaca 29998545  T
Q  259 agaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29998546 aaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 29998593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 215 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 28610616 - 28610533
Alignment:
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttgg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  28610616 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtagaagatgtcaatgtttgaggtagttgg 28610533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 63
Target Start/End: Original strand, 29930532 - 29930580
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaac 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29930532 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaaatgtacaatgaacgtcaac 29930580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 63
Target Start/End: Original strand, 29979686 - 29979734
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaac 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29979686 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaaatgtacaatgaacgtcaac 29979734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 9556483 - 9556378
Alignment:
Q  193 ctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggt 292  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| | || |||||| |||||| |||| |||||| || |||||||  |    
T  9556483 ctcatccaacatccgtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggatttcacgtacaaaaccaacttgtacaggatgtcattgtttgaaat 9556384  T
Q  293 agttgg 298  Q
    ||||||    
T  9556383 agttgg 9556378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 2284783 - 2284671
Alignment:
Q  186 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 285  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||  ||||| | ||||| |||| |||||| |||||| ||||||| |||||| |||    
T  2284783 ttttggactcatccaacatcagtaaagttgtttaacacttttccgactattttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 2284684  T
Q  286 ttgaggtagttgg 298  Q
    ||||  |||||||    
T  2284683 ttgaaatagttgg 2284671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4120520 - 4120432
Alignment:
Q  186 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtatag 274  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| || |||||| | ||||| |||| |||||| |||||| |||||||    
T  4120520 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgaccgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatag 4120432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 298
Target Start/End: Original strand, 12491422 - 12491534
Alignment:
Q  186 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 285  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||| |||  |||||| | |||| ||||||| ||| || |||    
T  12491422 ttttggactcatccaacatcagtaaagttgtttaacacttttccaactgttttgataatggattccgcgtacaaaatcaacttgtatagaatgtcattgt 12491521  T
Q  286 ttgaggtagttgg 298  Q
    ||||  |||||||    
T  12491522 ttgaaatagttgg 12491534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 40467934 - 40467822
Alignment:
Q  186 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 285  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| || |||||| | ||||| |||| |||||| |||||| ||||||  ||| || |||    
T  40467934 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtataaaatgtcattgt 40467835  T
Q  286 ttgaggtagttgg 298  Q
    ||||  |||||||    
T  40467834 ttgaaatagttgg 40467822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 51548259 - 51548147
Alignment:
Q  186 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 285  Q
    |||||| || ||||||||||  | ||||||||||||| |||| | || |||||| | ||||| |||| |||||| |||||| ||||||| |||||| |||    
T  51548259 ttttggacttatccaacatcggtaaagttgtttaacactttttcgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 51548160  T
Q  286 ttgaggtagttgg 298  Q
    ||||  |||||||    
T  51548159 ttgaaatagttgg 51548147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 298
Target Start/End: Original strand, 33940190 - 33940302
Alignment:
Q  186 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 285  Q
    |||||| |||||||||||||  | |||| |||||||| |||  | || |||||| | ||||| |||| |||||| |||||| ||||||| |||||| |||    
T  33940190 ttttggactcatccaacatcggtaaagtcgtttaacactttctcgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 33940289  T
Q  286 ttgaggtagttgg 298  Q
    ||||  |||||||    
T  33940290 ttgaaatagttgg 33940302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 212341 - 212047
Alignment:
Q  12 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212341 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 212242  T
Q  112 tctcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212241 tctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 212142  T
Q  212 gttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212141 attgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 212047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Original strand, 5348328 - 5348622
Alignment:
Q  12 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348328 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 5348427  T
Q  112 tctcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348428 tctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 5348527  T
Q  212 gttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348528 attgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 5348622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Original strand, 41561173 - 41561467
Alignment:
Q  12 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561173 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 41561272  T
Q  112 tctcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561273 tctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 41561372  T
Q  212 gttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561373 attgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 41561467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27275257 - 27274966
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27275257 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 27275158  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27275157 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 27275058  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27275057 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 27274966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10623354 - 10623060
Alignment:
Q  12 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623354 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 10623255  T
Q  112 tctcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10623254 tctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatctaacatccattaa 10623155  T
Q  212 gttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623154 attgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 10623060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 13 - 306
Target Start/End: Original strand, 38946925 - 38947218
Alignment:
Q  13 agagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaat 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38946925 agagaccacatttcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaaaccgttgcaatttctaat 38947024  T
Q  113 ctcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaag 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38947025 ctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaag 38947124  T
Q  213 ttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38947125 ttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataagatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 38947218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 39795134 - 39795425
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39795134 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 39795233  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795234 cgaagttggaggagcacaagtatacttattactcaagaacacaacttgatagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 39795333  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795334 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactcgacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 39795425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3802463 - 3802178
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802463 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacttcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 3802364  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3802363 cgaagttgaaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacttccattaagtt 3802264  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatg-tttgaggtagttggg 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3802263 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgttttgaggtagttggg 3802178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 24750822 - 24751114
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24750822 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 24750921  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24750922 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaatacaaagtgaaagtaatacgatcaaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagtt 24751021  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatg-tataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24751022 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgttataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 24751114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 1098723 - 1098437
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1098723 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 1098624  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1098623 cgaagttggaggagcacaactatacttattattcaagaacacaaagtgaaagtactacaaccgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 1098524  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  1098523 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatgtttgaggtagttggggt 1098437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24604986 - 24604695
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24604986 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatagggaagacaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 24604887  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  24604886 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcaaagatatcttttgggctcatccaacatctgttaagtt 24604787  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24604786 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 24604695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 45476524 - 45476812
Alignment:
Q  17 accacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45476524 accacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaa-tatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcg 45476622  T
Q  117 aagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgt 216  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  45476623 aagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatctgttaagttgt 45476722  T
Q  217 ttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45476723 ttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 45476812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 43949179 - 43948888
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  43949179 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaagacaaatataggtgacaagaagccgttgcgttatctaatct 43949080  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43949079 cgaagttagaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 43948980  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43948979 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 43948888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12907389 - 12907098
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  12907389 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaaagtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttcaaattt 12907290  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || ||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12907289 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaaaatatcttttggactcatccaacatccgttaagtt 12907190  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12907189 gtttaacaattttccaacggatttggttatggacttcacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 12907098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 34920679 - 34920388
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  34920679 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaaattcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaattt 34920580  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  34920579 cgaagttggaggagcacacttatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatctgttaagtt 34920480  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34920479 gtttaacaatattccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 34920388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 41007877 - 41007586
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41007877 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtctaaaatgaacgtcaacaaatatgtaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 41007778  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  41007777 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatctgttaagtt 41007678  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41007677 gtttaacaatttctcaacggttttgattatggactccacctacaaaactaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 41007586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Original strand, 9655320 - 9655606
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  9655320 agaccacattgcatgaaaaatgtgaagtaagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatgt 9655419  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9655420 cgaagttgaaggagcacaactatatttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 9655519  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  9655520 gtttaacaattttccaacggttttgattatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatgtttgaggtagttggggt 9655606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 436475 - 436767
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  436475 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaattgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 436574  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||   |||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  436575 cgaagttggaggagcacatctatacttattattcaagaacacatagtgaaagtactacaatctaagatatcttttgggctcatctaacatcttttaagtt 436674  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaat-gtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  436675 gtttaacaattttccaacggttttgattatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatggtttgaggtagttggggtcactt 436767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 28354799 - 28354549
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  28354799 agaccacatttcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaagtcaaatataggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatct 28354700  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28354699 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 28354600  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaa 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  28354599 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaa 28354549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 11692712 - 11692466
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11692712 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagagttgacaagaagccgttgcaatatttaatct 11692613  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  11692612 cgaaattggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaattactacaatagaagatatattttgggcccatccaacatccgttaagtt 11692513  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaaga 261  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11692512 gtttaagaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaga 11692466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 100 - 306
Target Start/End: Original strand, 7264229 - 7264435
Alignment:
Q  100 tgcaatttctaatctcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatcc 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  7264229 tgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaataccattgaagatattttttaggctcatcc 7264328  T
Q  200 aacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggg 299  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7264329 aacatccattaagtagttaaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaattaacatgtataggatgccaatgtttgatgtagttggg 7264428  T
Q  300 gtgactt 306  Q
    |||||||    
T  7264429 gtgactt 7264435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 17997069 - 17996783
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||| |||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |  |||| | ||||||||||    
T  17997069 agacaacattgcatgccaaatatcaagcaagtatacaatgaacgtcaacaaatatggaagtcaaatagaggtgacaagacgatgttgtagtttctaatct 17996970  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    | ||| ||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  17996969 caaagttggaggagcacaactgtgtttatttctcaagaacacaaagtgaaagtactactattgaagatatcttttaggctcatccaacatccgttacgtt 17996870  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggt 301  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17996869 gtttaacaatattccaatggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgagatagttggggt 17996783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 208 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24941354 - 24941256
Alignment:
Q  208 ttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24941354 ttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 24941256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 28423225 - 28423088
Alignment:
Q  161 tgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaag 260  Q
    ||||||| | |||||| |||| || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| || || |||||| | ||||  |||| ||||||     
T  28423225 tgaaagtcaaactattcaagacatattttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaatttcccgactgttttgataatgggttccacgtacaaa 28423126  T
Q  261 accaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttgg 298  Q
    |||||| |||| | ||||||| |||||||  |||||||    
T  28423125 accaacttgtacatgatgccattgtttgaaatagttgg 28423088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 301
Target Start/End: Original strand, 21535507 - 21535633
Alignment:
Q  169 atactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacat 268  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||||   |||  ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||      || || ||||||||    
T  21535507 atactattcaagacatattttgggctcatcctcaatcagttaggttggttaacaattttccaacagttttggttatggac------tataaaaccaacat 21535600  T
Q  269 gtataggatgccaatgtttgaggtagttggggt 301  Q
    ||| | ||||||| | |||||| ||||||||||    
T  21535601 gtacatgatgccactatttgagatagttggggt 21535633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3353985 - 3353894
Alignment:
Q  208 ttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggg 299  Q
    |||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||  || || ||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||    
T  3353985 ttaaattgtttaacaatttttcgactgttttgatcatggactccacctataaaaccaacatgtacaggatgttattgtttgagatagttggg 3353894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 53
Target Start/End: Original strand, 7264196 - 7264234
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaat 53  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7264196 agaccacattgcatgacaattgtgaagcaagtgtgcaat 7264234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 30)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 3947361 - 3947067
Alignment:
Q  12 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947361 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 3947262  T
Q  112 tctcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947261 tctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 3947162  T
Q  212 gttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947161 attgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 3947067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Original strand, 3984274 - 3984568
Alignment:
Q  12 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984274 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 3984373  T
Q  112 tctcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984374 tctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 3984473  T
Q  212 gttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984474 attgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 3984568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Original strand, 44466743 - 44467037
Alignment:
Q  12 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44466743 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 44466842  T
Q  112 tctcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44466843 tctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 44466942  T
Q  212 gttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44466943 attgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 44467037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29355585 - 29355294
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355585 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 29355486  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355485 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 29355386  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355385 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 29355294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Original strand, 20350617 - 20350911
Alignment:
Q  12 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350617 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 20350716  T
Q  112 tctcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350717 tctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 20350816  T
Q  212 gttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20350817 attgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagtttgggtgactt 20350911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 38775015 - 38774721
Alignment:
Q  12 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38775015 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatatgggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 38774916  T
Q  112 tctcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774915 tctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 38774816  T
Q  212 gttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774815 attgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 38774721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 5079099 - 5079390
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079099 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcagataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 5079198  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079199 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 5079298  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079299 gtttaacaattttcaaacggttttggttacggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 5079390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 13630580 - 13630871
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13630580 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 13630679  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13630680 cgaagttggaggagcacaagtatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatattttgggctcatccaacatccattaagtt 13630779  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13630780 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactcgacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 13630871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 41455001 - 41455292
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41455001 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 41455100  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41455101 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatattttgggctcatccaacatccattaagtt 41455200  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41455201 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtaaaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 41455292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 15 - 301
Target Start/End: Original strand, 37016078 - 37016364
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37016078 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 37016177  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37016178 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 37016277  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  37016278 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggt 37016364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 50116660 - 50116369
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  50116660 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatgt 50116561  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  50116560 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatctaacatccgttaagtt 50116461  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50116460 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 50116369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12649476 - 12649185
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  12649476 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaagacaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatat 12649377  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12649376 ctatgttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagtt 12649277  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12649276 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 12649185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 38691836 - 38691545
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38691836 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatagagatgacaagaagccgttgcaatatctaatct 38691737  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  38691736 cgatgttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatctgttaagtt 38691637  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38691636 gtttaacaatttttcaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 38691545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 46974328 - 46974619
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  46974328 agaccacattgcatgacaaatgtgaaacaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataaaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatct 46974427  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46974428 caaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 46974527  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46974528 gtttaacaatcttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacaggtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 46974619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 13174945 - 13175236
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13174945 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaaaatcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttctaattt 13175044  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  13175045 caaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgtgctcatccaacatccgctaagtt 13175144  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13175145 gtttaacaaatttccagcggttttggttatggactccacctacaaaaccatcatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 13175236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 51663422 - 51663713
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  51663422 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacattgaacgtcaacaaaaatggaaggcaaatagaggtgacaataagtcgttgcaatatctaatct 51663521  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51663522 cgaagttggaggagcacaactatacttattagtcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatcctttaagtt 51663621  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  51663622 gtttaacaattttccaacggttttgattatggactctacctacaaaaccaacatgtataaaatgccagtgtttgaggtagttggggtcactt 51663713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21943261 - 21942977
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||| ||||||||    
T  21943261 agaccacattgcatgacaaatgtcaaacaagtgtacaataaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggcgacaagaaactgttgcaatatctaatct 21943162  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  21943161 cgaagttggaggagcacaactatgcttatttctcaaaaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccatcattcgttaagtt 21943062  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggg 299  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  21943061 gtttaacaaattttcaacggttttggttatggattccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggg 21942977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 98 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19498277 - 19498070
Alignment:
Q  98 gttgcaatttctaatctcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcat 197  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||  |||||||| ||| ||  |||||| |||| ||||||||    
T  19498277 gttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttatttctaaaaaacacaaagtgaaagtactacaatcaaagatactttt-gggctcat 19498179  T
Q  198 ccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttg 297  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  19498178 ccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacccacaaaacaaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttg 19498079  T
Q  298 gggtgactt 306  Q
    |||| ||||    
T  19498078 gggtcactt 19498070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 32106533 - 32106265
Alignment:
Q  22 attgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagat 121  Q
    |||||| ||||||| | |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| | || || |||||||||| |  | |||| | | ||||||| ||| |    
T  32106533 attgcaagacaaatatcaagcaagtatgcaattaacatcaacaaatatggaagtcgaacagaggtgacaagacgatgatgcattatataatctcaaagtt 32106434  T
Q  122 ggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaac 221  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | | |||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32106433 ggaggagcacaactatgtttatttcaccagaacacaaagtgaaagtactactattgaagacatattttaagctcatccaacatccattaagttgtttaac 32106334  T
Q  222 aattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggt 301  Q
    ||           ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32106333 aa-----------ttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatgtttgagatagttggggt 32106265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 44620000 - 44619905
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttcta 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44620000 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtgcaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatcta 44619905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 26466160 - 26466006
Alignment:
Q  22 attgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagat 121  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || | || ||| | || | |  |||||| ||||||||||| ||| |    
T  26466160 attgcatgacaaatatcaagcaagtatacaatgaacgtcaataaatatggaagtcatacagaggttaaaaaacggtgttgcagtttctaatctcaaagtt 26466061  T
Q  122 ggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactatt 176  Q
    | ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  26466060 gaaggagcacaactatgtttatttctcaagaacacaaaatgaaagtactactatt 26466006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 186 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 36360246 - 36360143
Alignment:
Q  186 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 285  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| |||||| |||||| ||||||| ||| || |||    
T  36360246 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaattttccaactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgtcactgt 36360147  T
Q  286 ttga 289  Q
    ||||    
T  36360146 ttga 36360143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 7980109 - 7980068
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaa 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7980109 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaa 7980068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 281
Target Start/End: Original strand, 7403953 - 7404048
Alignment:
Q  186 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgcca 281  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| || |||||| | ||||| |||| |||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  7403953 ttttggactcatccaacatcagtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgcca 7404048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 298
Target Start/End: Original strand, 45472687 - 45472799
Alignment:
Q  186 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 285  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| || |||||| | |||||  ||| |||||| |||||| ||||||| ||| || |||    
T  45472687 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataatggatcccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgtcattgt 45472786  T
Q  286 ttgaggtagttgg 298  Q
    ||||  |||||||    
T  45472787 ttgaaatagttgg 45472799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 298
Target Start/End: Original strand, 20240034 - 20240122
Alignment:
Q  210 aagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttgg 298  Q
    |||||||||||||||||||  || | |||| | ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||| || |||||||  |||||||    
T  20240034 aagttgtttaacaattttctgactgctttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtataggatgtcattgtttgaaatagttgg 20240122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 298
Target Start/End: Original strand, 28863225 - 28863337
Alignment:
Q  186 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 285  Q
    |||||| |||||||||||| | | || |||||||||| |||| | || |||||| | ||||| || | |||||| |||||| ||||||| |||||| |||    
T  28863225 ttttggactcatccaacattcgtaaaattgtttaacactttttcgactgttttgataatggattctacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 28863324  T
Q  286 ttgaggtagttgg 298  Q
    ||||  |||||||    
T  28863325 ttgaaatagttgg 28863337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 216
Target Start/End: Original strand, 25231558 - 25231667
Alignment:
Q  107 tctaatctcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 206  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||||| | | | |||| ||  |||||||| ||| ||| |||| || ||||||| ||||||||||| |    
T  25231558 tctaatctcaaaattggaggagcacaactatgtttatttcaccataacaaaaagtgaaagtactacaattaaagacatattttgggttcatccaacatac 25231657  T
Q  207 attaagttgt 216  Q
     |||||||||    
T  25231658 gttaagttgt 25231667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 301
Target Start/End: Original strand, 31445866 - 31445979
Alignment:
Q  188 ttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgttt 287  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||| | || ||||||| | | || |||||  ||||| | ||| || |||||    
T  31445866 ttgggctcatccaaaatctataaagttgtttaacactttttcaacagttttgatcatagactccacgcataaaaccaatgtgtattgaatgtcattgttt 31445965  T
Q  288 gaggtagttggggt 301  Q
     |||||||| ||||    
T  31445966 aaggtagttagggt 31445979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18887520 - 18887408
Alignment:
Q  186 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 285  Q
    |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |   ||||| | ||||| |||| |||||  || ||| |||||| |||| || |||    
T  18887520 ttttggtctcatccaacatcggtaaagttgtttaacaattttccgatttttttgataatggattccacgtacagaactaacttgtataagatgtcattgt 18887421  T
Q  286 ttgaggtagttgg 298  Q
    ||||  |||||||    
T  18887420 ttgaaatagttgg 18887408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 2045 - 2336
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2045 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 2144  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2145 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaatt 2244  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2245 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 2336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 21)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37819774 - 37819483
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819774 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 37819675  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819674 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 37819575  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819574 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 37819483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28885305 - 28885014
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885305 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 28885206  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885205 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 28885106  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885105 gtttaacaattttccaacggttttggttatggattccacgtacgaaaccaacatgtattggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 28885014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7020777 - 7020486
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7020777 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 7020678  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7020677 cgaagttggaggagcacatctatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagtt 7020578  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7020577 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 7020486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11032349 - 11032058
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  11032349 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaaaccgttgcaatatctaatct 11032250  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11032249 cgaagttggaggagcacaagtatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 11032150  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11032149 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactcgacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 11032058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 38859087 - 38858796
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38859087 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 38858988  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38858987 cgaagttggaggagcacaagtatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 38858888  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38858887 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactcgacgtacaaaaccaacatatataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 38858796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 34078944 - 34079235
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34078944 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 34079043  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34079044 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacgtgaaagtaatacaattgaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagtt 34079143  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34079144 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 34079235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27866742 - 27866451
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27866742 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggaaaatagaggtgacaagaaacctttgcaatttctaatct 27866643  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27866642 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacgtgaaagtaatacaattgaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagtt 27866543  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27866542 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggaggccaatgtttgaggtggttggggtcactt 27866451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7799903 - 7799612
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7799903 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggaaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 7799804  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7799803 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 7799704  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7799703 gtttaacaattttccaacggttttggttaaggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 7799612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4202836 - 4202545
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4202836 agaccacattgcatgataaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 4202737  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4202736 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 4202637  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4202636 gtttaacaattttccaacagttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatgtttgaggtagttgaggtcactt 4202545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18537233 - 18536942
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18537233 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 18537134  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18537133 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagtt 18537034  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18537033 gtttaacaattttccaatggttttggttatggactccacctacaaaactaacatgtacaagatgctaatgtttgaggtagttggggtcactt 18536942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 1036515 - 1036806
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1036515 agaccacattgcatgacaaatgtgacacaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggaaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 1036614  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1036615 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatctaacatccattaagtt 1036714  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1036715 gtttaacaattttccaacggttttggttacggactcaacctacaaaatcaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 1036806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 25895998 - 25895703
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  25895998 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatat 25895899  T
Q  115 cgaa----gatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccatta 210  Q
    | |     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25895898 ctatatatgttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgagagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccatta 25895799  T
Q  211 agttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25895798 agttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgcttgaggtagttggggtcactt 25895703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13566988 - 13566713
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13566988 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 13566889  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  13566888 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatacaattgaagatatcttttgggatcattcaacatccattaagtt 13566789  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||                ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13566788 gt----------------ggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtctaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 13566713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 301
Target Start/End: Original strand, 20287439 - 20287719
Alignment:
Q  22 attgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagat 121  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| || |||||||||||| ||||||| ||| |||| || |||||||||| |  ||| || ||||||||||| ||| |    
T  20287439 attgtatgacaaatatcaagcaagtatataatgaacgtcaataaatatgaaagtcaaacagaggtgacaagacggggttccagtttctaatctcaaagtt 20287538  T
Q  122 ggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaag-ttgtttaa 220  Q
    |||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |   | |||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  20287539 ggaggagcacaattatgtttatttctcaagaacaaatggtcaaagtactactattgaagacatattttgcgctcatccaacatccgttaagtttttttaa 20287638  T
Q  221 caattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggt 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| | ||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20287639 caattttccaacggttctggttatggactccacctaccaaaccaacatgtacaagatgcctatgtttgagatagttggggt 20287719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 252
Target Start/End: Original strand, 20286180 - 20286409
Alignment:
Q  22 attgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagat 121  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||    | |||| ||||||||||| ||| |    
T  20286180 attgcatgacaaatatcaagcaagtatacaatgaacatcaacaaatatggaagtcaaacagaggtgacaagactgtggtgcagtttctaatctcaaagtt 20286279  T
Q  122 ggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaac 221  Q
    |||||||||||| |||  ||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||  | ||||| |||      
T  20286280 ggaggagcacaattatctttatttctcaataacacaaaatgaaagtactactattgaagacatattttgggctcatccaacatccgcttagttg-ttatg 20286378  T
Q  222 aattttccaacggttttggttatggactcca 252  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20286379 aattttccaacagttttggttatggactcca 20286409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 186 - 298
Target Start/End: Original strand, 11819551 - 11819663
Alignment:
Q  186 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 285  Q
    |||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| | |||    
T  11819551 ttttggactcatccaaaatcggtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtataggatgctattgt 11819650  T
Q  286 ttgaggtagttgg 298  Q
    ||||  |||||||    
T  11819651 ttgaaatagttgg 11819663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27013395 - 27013283
Alignment:
Q  186 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 285  Q
    |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| || |||||| | || || |||| |||||| |||||| ||||||| ||| || |||    
T  27013395 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatagattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgtcattgt 27013296  T
Q  286 ttgaggtagttgg 298  Q
    ||||  |||||||    
T  27013295 ttgaaatagttgg 27013283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 266
Target Start/End: Original strand, 25053043 - 25053148
Alignment:
Q  161 tgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaag 260  Q
    ||||||| | |||||| |||| || |||||| ||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||  | |||||| | ||||| |||| ||||||     
T  25053043 tgaaagtcaaactattcaagacatattttggactcatccaatatcgataaagctgtttaacaattttccggctgttttgataatggattccacgtacaaa 25053142  T
Q  261 accaac 266  Q
    ||||||    
T  25053143 accaac 25053148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 298
Target Start/End: Original strand, 42343826 - 42343937
Alignment:
Q  186 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 285  Q
    |||||| |||||||||||| || ||  |||||||||| |||||| || |||||| | ||||| ||||  ||||| |||||| ||||||| |||||| |||    
T  42343826 ttttggactcatccaacat-cagtatattgtttaacacttttccgactgttttgataatggattccacatacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 42343924  T
Q  286 ttgaggtagttgg 298  Q
    ||||  |||||||    
T  42343925 ttgaaatagttgg 42343937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 274
Target Start/End: Original strand, 43295549 - 43295637
Alignment:
Q  186 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtatag 274  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||| | || |||||| | ||||| |||| |||||| |||||| |||||||    
T  43295549 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacactttttcgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatag 43295637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 289
Target Start/End: Original strand, 6553124 - 6553227
Alignment:
Q  186 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 285  Q
    |||||| |||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| | || |||||| | ||||| |||| |||||| |||||  ||||||| |||||| |||    
T  6553124 ttttggactcatccaacttcggtaaagttgtttaacactttttcgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaatttgtatagaatgccattgt 6553223  T
Q  286 ttga 289  Q
    ||||    
T  6553224 ttga 6553227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 12)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 1611651 - 1611357
Alignment:
Q  12 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611651 cagagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaa 1611552  T
Q  112 tctcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611551 tctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaa 1611452  T
Q  212 gttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611451 attgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaagaccaacatttataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 1611357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 297
Target Start/End: Original strand, 31147486 - 31147768
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31147486 agaccacattgcatgataaatttgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 31147585  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  31147586 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatacaacatccgttaagtt 31147685  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  31147686 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatgtttgaggtagttg 31147768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29287845 - 29287559
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    |||||| |    
T  29287845 agaccacattgcatgaaaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagtcgttgc----tctaatat 29287750  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  29287749 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaattt 29287650  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29287649 gtttaa-aattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 29287559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 18607160 - 18607451
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  18607160 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgataagaagccgttgcaatatctaattt 18607259  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
      ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18607260 ttaagttggaggagcacaacaatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacattcgttaagtt 18607359  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  18607360 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatatttgaagtagttggggtcactt 18607451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 90 - 306
Target Start/End: Original strand, 28357557 - 28357773
Alignment:
Q  90 aagaagccgttgcaatttctaatctcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatttttt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28357557 aagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatacaattgaagatatctttt 28357656  T
Q  190 gggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttga 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28357657 gggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaagaccaacatgtataggatgcaaatgtttga 28357756  T
Q  290 ggtagttggggtgactt 306  Q
    |||||||||||| ||||    
T  28357757 ggtagttggggtcactt 28357773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21358244 - 21357956
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||  |   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21358244 agaccacattgcatgacaaaggtcaagcaagcgtaaaatgatag---acaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 21358148  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21358147 cgaagttcgaggagcacaactatacttatttgtcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatattttgggctcatccaacatccgttaagtt 21358048  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21358047 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttcgggtcactt 21357956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23962226 - 23961938
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||  |   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23962226 agaccacattgcatgacaaaggtcaagcaagcgtaaaatgatag---acaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatct 23962130  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23962129 cgaagttcgaggagcacaactatacttatttgtcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatattttgggctcatccaacatccgttaagtt 23962030  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23962029 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttcgggtcactt 23961938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 89
Target Start/End: Original strand, 28251060 - 28251134
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgac 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28251060 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgac 28251134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 91
Target Start/End: Original strand, 24220332 - 24220408
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaa 91  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24220332 agaccacattgcatgacaaatatcaagtaagtgtaaaataaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 24220408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 298
Target Start/End: Original strand, 9095463 - 9095575
Alignment:
Q  186 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgt 285  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| || |||||| | ||||| |||| ||||||  ||||| ||||||| ||| || |||    
T  9095463 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgatcatggattccacgtacaaagccaacttgtatagaatgtcattgt 9095562  T
Q  286 ttgaggtagttgg 298  Q
    ||||  |||||||    
T  9095563 ttgaaatagttgg 9095575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 239
Target Start/End: Original strand, 31176265 - 31176356
Alignment:
Q  148 caagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttg 239  Q
    |||||||||||  ||| |||  || |||| |||| || |||||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31176265 caagaacacaatatgagagtgctattattcaagacatattttgggctcatctcgaatcgattaagttgtttaacaattttccaacagttttg 31176356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 239
Target Start/End: Original strand, 31196905 - 31196958
Alignment:
Q  186 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttg 239  Q
    |||||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31196905 ttttgggctcatctcgaatcgattaagttgtttaacaattttccaacagttttg 31196958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0341 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0341
Description:

Target: scaffold0341; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16254 - 15963
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16254 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaacgcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 16155  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16154 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacttccattaagtt 16055  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16054 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 15963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 306
Target Start/End: Original strand, 17233 - 17524
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatct 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17233 agaccacattgcatgaaaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgaaatatctaatct 17332  T
Q  115 cgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagtt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||    
T  17333 cgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttaggctcatccaacatctgttaagtt 17432  T
Q  215 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccaagtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17433 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 17524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 168
Target Start/End: Original strand, 12426 - 12580
Alignment:
Q  15 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaa-ggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatc 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12426 agaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatcgaaaggcaaatagaggtgacaagaagctgttgcaatatctaatc 12525  T
Q  114 tcgaagatggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagta 168  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12526 tcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagta 12580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 255 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 25603 - 25552
Alignment:
Q  255 tacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25603 tacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 25552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 100 - 56
Alignment:
Q  262 ccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 306  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  100 ccaagatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 56  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University