View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14214_high_7 (Length: 310)

Name: NF14214_high_7
Description: NF14214
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14214_high_7
NF14214_high_7
[»] chr3 (53 HSPs)
chr3 (1-201)||(6110064-6110264)
chr3 (1-201)||(10572599-10572799)
chr3 (1-201)||(15600891-15601091)
chr3 (1-201)||(15607436-15607636)
chr3 (1-198)||(13211305-13211502)
chr3 (1-201)||(13248607-13248807)
chr3 (1-199)||(16482490-16482688)
chr3 (1-195)||(17781125-17781319)
chr3 (1-195)||(10579362-10579556)
chr3 (1-199)||(18522665-18522863)
chr3 (1-201)||(15357593-15357793)
chr3 (15-201)||(8490488-8490674)
chr3 (1-199)||(18519980-18520175)
chr3 (1-195)||(19089752-19089946)
chr3 (1-199)||(17200191-17200389)
chr3 (1-182)||(15342226-15342407)
chr3 (1-199)||(13516813-13517011)
chr3 (40-201)||(18640792-18640953)
chr3 (1-195)||(32056907-32057101)
chr3 (9-195)||(1647536-1647726)
chr3 (13-199)||(16200128-16200313)
chr3 (9-201)||(29924971-29925163)
chr3 (9-201)||(29974124-29974316)
chr3 (13-199)||(16200434-16200619)
chr3 (1-194)||(24253395-24253589)
chr3 (1-95)||(17136465-17136559)
chr3 (137-199)||(18534758-18534820)
chr3 (237-293)||(6109972-6110028)
chr3 (237-293)||(8490396-8490452)
chr3 (237-293)||(13248515-13248571)
chr3 (237-293)||(13211211-13211267)
chr3 (237-293)||(18640989-18641045)
chr3 (237-293)||(17136137-17136193)
chr3 (243-293)||(10579603-10579653)
chr3 (237-293)||(15607672-15607729)
chr3 (154-199)||(18510924-18510969)
chr3 (237-293)||(15351237-15351293)
chr3 (237-293)||(15357829-15357885)
chr3 (237-293)||(16482727-16482782)
chr3 (237-293)||(17200427-17200483)
chr3 (237-293)||(18519885-18519941)
chr3 (243-293)||(10572840-10572890)
chr3 (237-294)||(1647768-1647825)
chr3 (237-293)||(15601127-15601184)
chr3 (237-293)||(13516719-13516775)
chr3 (237-293)||(17781358-17781414)
chr3 (237-293)||(19089985-19090041)
chr3 (237-293)||(32057144-32057200)
chr3 (237-293)||(18510829-18510885)
chr3 (237-293)||(18522570-18522626)
chr3 (237-285)||(18534671-18534719)
chr3 (237-293)||(29924879-29924935)
chr3 (237-293)||(29974032-29974088)
[»] scaffold0234 (4 HSPs)
scaffold0234 (1-201)||(2328-2528)
scaffold0234 (1-201)||(11219-11419)
scaffold0234 (237-293)||(2564-2620)
scaffold0234 (237-293)||(11455-11511)
[»] chr4 (47 HSPs)
chr4 (1-201)||(19926767-19926967)
chr4 (1-201)||(26970463-26970663)
chr4 (1-201)||(55612683-55612883)
chr4 (1-201)||(868597-868797)
chr4 (1-201)||(5707320-5707520)
chr4 (1-201)||(26963640-26963840)
chr4 (1-199)||(18262214-18262412)
chr4 (1-201)||(5713948-5714148)
chr4 (1-201)||(10621340-10621540)
chr4 (1-201)||(10628419-10628619)
chr4 (1-199)||(18269070-18269273)
chr4 (1-199)||(28393141-28393339)
chr4 (1-199)||(4426611-4426808)
chr4 (3-189)||(8845215-8845401)
chr4 (3-189)||(8858179-8858365)
chr4 (86-201)||(12357136-12357251)
chr4 (2-193)||(20311299-20311491)
chr4 (9-195)||(5668140-5668327)
chr4 (1-195)||(10677562-10677753)
chr4 (1-195)||(10891202-10891393)
chr4 (2-199)||(5616215-5616414)
chr4 (1-195)||(35223576-35223760)
chr4 (237-297)||(19927003-19927063)
chr4 (237-293)||(5713856-5713912)
chr4 (237-293)||(26963548-26963604)
chr4 (237-293)||(26970371-26970427)
chr4 (237-293)||(5707228-5707284)
chr4 (237-293)||(10621576-10621632)
chr4 (237-293)||(12357044-12357100)
chr4 (237-291)||(868507-868561)
chr4 (237-295)||(17142372-17142430)
chr4 (237-293)||(10628655-10628711)
chr4 (237-293)||(55612594-55612650)
chr4 (239-293)||(28393380-28393434)
chr4 (237-294)||(4426847-4426904)
chr4 (237-293)||(18268976-18269032)
chr4 (85-152)||(39074278-39074346)
chr4 (237-286)||(55992680-55992729)
chr4 (9-175)||(21454152-21454319)
chr4 (237-278)||(5668371-5668412)
chr4 (237-285)||(8845118-8845166)
chr4 (237-285)||(8858082-8858130)
chr4 (237-277)||(18262136-18262176)
chr4 (92-151)||(11161913-11161972)
chr4 (237-291)||(20311207-20311261)
chr4 (237-285)||(24699958-24700006)
chr4 (12-64)||(39074218-39074270)
[»] chr1 (26 HSPs)
chr1 (1-201)||(18252030-18252230)
chr1 (1-201)||(18532521-18532721)
chr1 (1-201)||(27131416-27131616)
chr1 (1-199)||(21171240-21171438)
chr1 (1-199)||(27310584-27310782)
chr1 (1-199)||(16359042-16359240)
chr1 (9-195)||(36816648-36816834)
chr1 (1-201)||(3855926-3856126)
chr1 (9-201)||(22657236-22657429)
chr1 (1-195)||(27277564-27277756)
chr1 (237-296)||(18532757-18532816)
chr1 (9-167)||(12006554-12006712)
chr1 (2-167)||(12014292-12014457)
chr1 (237-294)||(18251935-18251992)
chr1 (237-293)||(27310821-27310877)
chr1 (3-189)||(9917927-9918106)
chr1 (237-293)||(16359280-16359336)
chr1 (237-293)||(21171479-21171535)
chr1 (126-195)||(30720625-30720694)
chr1 (240-285)||(36816881-36816926)
chr1 (237-293)||(3856164-3856220)
chr1 (241-293)||(22657469-22657521)
chr1 (237-293)||(27131652-27131704)
chr1 (94-171)||(3403248-3403325)
chr1 (94-171)||(3443494-3443571)
chr1 (237-293)||(27277800-27277856)
[»] scaffold0220 (2 HSPs)
scaffold0220 (1-201)||(18288-18488)
scaffold0220 (237-293)||(18196-18252)
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (1-201)||(29327784-29327984)
chr7 (1-201)||(11536069-11536269)
chr7 (1-201)||(11542987-11543187)
chr7 (1-199)||(15152445-15152643)
chr7 (1-199)||(15148144-15148342)
chr7 (1-199)||(18561009-18561207)
chr7 (9-199)||(12750828-12751018)
chr7 (1-195)||(12738542-12738736)
chr7 (9-199)||(18257857-18258047)
chr7 (13-195)||(13392157-13392338)
chr7 (9-179)||(2364917-2365086)
chr7 (237-295)||(12738441-12738499)
chr7 (237-294)||(2653275-2653332)
chr7 (237-293)||(11543223-11543279)
chr7 (108-195)||(39111819-39111905)
chr7 (9-168)||(7396221-7396381)
chr7 (237-293)||(11536305-11536361)
chr7 (237-293)||(12750733-12750789)
chr7 (237-293)||(15152350-15152406)
chr7 (238-293)||(29327690-29327745)
chr7 (237-293)||(15148049-15148105)
chr7 (84-127)||(3132748-3132791)
chr7 (238-293)||(13392030-13392085)
chr7 (86-151)||(10234179-10234244)
chr7 (237-293)||(18258087-18258143)
chr7 (169-201)||(2653207-2653239)
chr7 (237-293)||(18560913-18560969)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (1-201)||(27381259-27381459)
chr6 (1-201)||(27471642-27471842)
chr6 (1-199)||(17684476-17684674)
chr6 (1-201)||(29308890-29309090)
chr6 (1-201)||(29315850-29316050)
chr6 (1-199)||(16566327-16566525)
chr6 (1-201)||(17691447-17691647)
chr6 (1-199)||(188984-189182)
chr6 (1-199)||(25537166-25537364)
chr6 (1-199)||(11651725-11651923)
chr6 (11-199)||(13359286-13359474)
chr6 (237-291)||(17691683-17691737)
chr6 (1-162)||(20553594-20553755)
chr6 (237-293)||(27381495-27381551)
chr6 (237-293)||(27471878-27471934)
chr6 (237-293)||(29308798-29308854)
chr6 (237-293)||(29315758-29315814)
chr6 (237-293)||(17684712-17684768)
chr6 (9-182)||(8509941-8510115)
chr6 (239-293)||(11651630-11651684)
chr6 (9-178)||(27925772-27925946)
chr6 (237-293)||(25537405-25537461)
chr6 (1-163)||(17850502-17850663)
chr6 (139-194)||(31258065-31258120)
chr6 (237-285)||(13359512-13359560)
chr6 (237-285)||(16566563-16566611)
chr6 (237-294)||(189221-189281)
chr6 (237-279)||(16394484-16394526)
chr6 (120-185)||(22259925-22259990)
[»] scaffold0390 (4 HSPs)
scaffold0390 (1-201)||(6941-7141)
scaffold0390 (1-201)||(13957-14157)
scaffold0390 (237-293)||(7177-7233)
scaffold0390 (237-293)||(14193-14249)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (1-201)||(21940665-21940865)
chr8 (1-199)||(28554885-28555083)
chr8 (1-199)||(22171491-22171687)
chr8 (2-195)||(6094129-6094322)
chr8 (1-195)||(24642655-24642849)
chr8 (68-195)||(24636860-24636987)
chr8 (237-296)||(22070105-22070164)
chr8 (237-293)||(21940573-21940629)
chr8 (237-293)||(6094031-6094087)
chr8 (237-293)||(22171396-22171452)
chr8 (241-293)||(24642556-24642608)
chr8 (237-293)||(28554791-28554847)
chr8 (1-189)||(38232384-38232570)
chr8 (10-171)||(32872857-32873019)
chr8 (122-180)||(2375027-2375085)
chr8 (100-163)||(10920234-10920297)
chr8 (240-293)||(2374947-2375000)
chr8 (256-293)||(24636605-24636642)
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (5-201)||(21330259-21330455)
chr2 (1-201)||(18796506-18796706)
chr2 (3-199)||(18619807-18620002)
chr2 (56-195)||(19692598-19692737)
chr2 (9-136)||(20977957-20978084)
chr2 (237-295)||(21330493-21330551)
chr2 (1-167)||(36270199-36270366)
chr2 (9-167)||(18822115-18822275)
chr2 (237-293)||(19692773-19692829)
chr2 (10-165)||(36802664-36802820)
[»] scaffold0433 (2 HSPs)
scaffold0433 (1-201)||(7107-7307)
scaffold0433 (237-293)||(7015-7071)
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (1-201)||(24695473-24695673)
chr5 (1-201)||(18569870-18570070)
chr5 (1-199)||(19714505-19714703)
chr5 (1-195)||(19707225-19707419)
chr5 (13-196)||(27347497-27347679)
chr5 (9-195)||(22547031-22547217)
chr5 (92-201)||(39537962-39538071)
chr5 (16-197)||(17285754-17285935)
chr5 (237-293)||(24695709-24695765)
chr5 (92-195)||(31886537-31886640)
chr5 (16-197)||(17298907-17299088)
chr5 (237-293)||(19714742-19714798)
chr5 (237-293)||(19707462-19707518)
chr5 (237-293)||(27347722-27347778)
chr5 (1-135)||(18807041-18807175)
chr5 (1-88)||(39538701-39538788)
chr5 (85-175)||(33477389-33477479)
chr5 (237-285)||(18570108-18570156)
chr5 (238-293)||(39537870-39537925)
chr5 (83-151)||(11479420-11479489)
[»] scaffold0657 (2 HSPs)
scaffold0657 (1-201)||(993-1193)
scaffold0657 (237-294)||(900-957)
[»] scaffold0186 (2 HSPs)
scaffold0186 (1-201)||(25997-26197)
scaffold0186 (238-293)||(26231-26286)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (1-199)||(5531-5729)
scaffold0063 (237-285)||(5444-5492)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (18-199)||(230365-230545)
scaffold0008 (237-293)||(230584-230640)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (137-201)||(8446-8510)
scaffold0176 (237-293)||(8546-8602)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (237-293)||(23769-23825)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (237-293)||(16523-16579)
scaffold0326 (168-201)||(16615-16648)
[»] scaffold0705 (1 HSPs)
scaffold0705 (237-293)||(41-97)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (237-293)||(8944-9000)
[»] scaffold0565 (2 HSPs)
scaffold0565 (237-291)||(10202-10256)
scaffold0565 (151-182)||(10127-10158)
[»] scaffold0767 (1 HSPs)
scaffold0767 (257-293)||(1-37)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (241-293)||(5878-5930)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (100-172)||(92194-92267)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 53)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6110264 - 6110064
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110264 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 6110165  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110164 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 6110065  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  6110064 t 6110064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 10572599 - 10572799
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572599 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 10572698  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572699 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 10572798  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  10572799 t 10572799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 15600891 - 15601091
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600891 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 15600990  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15600991 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttg 15601090  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  15601091 t 15601091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 15607436 - 15607636
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607436 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 15607535  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15607536 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttg 15607635  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  15607636 t 15607636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13211502 - 13211305
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211502 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 13211403  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211402 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 13211305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13248807 - 13248607
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248807 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgttatcccacttctcaacaaagcttgactacgaatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 13248708  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248707 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 13248608  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  13248607 t 13248607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 16482490 - 16482688
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16482490 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagagtagtttccttatgtttaatgggg 16482589  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482590 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 16482688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 17781125 - 17781319
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781125 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 17781224  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781225 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 17781319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 10579362 - 10579556
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579362 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 10579461  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579462 tctcacaattaagttatacttaatgttccatttaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 10579556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18522863 - 18522665
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18522863 gtctacctacataatagtctctatgcttaaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaatgggg 18522764  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522763 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18522665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 15357593 - 15357793
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15357593 gtctacctacataatagtctctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgtttaatgggg 15357692  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15357693 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactaatctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttg 15357792  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  15357793 t 15357793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8490674 - 8490488
Alignment:
Q  15 tagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490674 tagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagt 8490575  T
Q  115 tatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490574 tatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 8490488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18520175 - 18519980
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18520175 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggat---ttaagaatagtttccttatgtttaacgggg 18520079  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520078 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18519980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 19089752 - 19089946
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19089752 gtctacctacataatagtctctatgatttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttcattatgtttaaagggg 19089851  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089852 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactaatctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 19089946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 17200191 - 17200389
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  17200191 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcacacatctcaataaagcttaactacggatactttaagaatagtttcattatgtttaaagggg 17200290  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200291 tatcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 17200389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 15342226 - 15342407
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15342226 gtctacctacataatagtctctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgtttaatgggg 15342325  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342326 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgaacaaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 15342407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 13517011 - 13516813
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13517011 gtctacccacataatagtctctgtgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatcgtttccttatgtttaacgggg 13516912  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13516911 tctcacaattaagttatacttaatgttccatgaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 13516813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 201
Target Start/End: Original strand, 18640792 - 18640953
Alignment:
Q  40 cacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgga 139  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18640792 cacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatgga 18640891  T
Q  140 ctaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640892 ctaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 18640953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 32056907 - 32057101
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  32056907 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagtttgactacggacactttaagaatagtttctttatgtttaacgggg 32057006  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32057007 tcttacaataaagttatacttgatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 32057101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Original strand, 1647536 - 1647726
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1647536 acataatagtctctatgctttaattatatcccttttctcaataaagcttgattacggatactttaaaaatagtttccttatgtttaacggggtctcacaa 1647635  T
Q  109 ttaagtta----tacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    ||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1647636 ttaagttaattatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 1647726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16200313 - 16200128
Alignment:
Q  13 aatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaa 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16200313 aatagtctccatgctttaatgatatcccacttcacaataaatcttgactacgaatactttaagaataatgtccttatgtttaatggggtctcacaattaa 16200214  T
Q  113 gttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  16200213 gttatacataatgttccattaaacgaactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaataaaa-caacgaagaaatgcctt 16200128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29925163 - 29924971
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||  ||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  29925163 acataatagcctccatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgactacatatattttaagaataatgtccttatatttaatggggtctcacaa 29925064  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29925063 ttaaattatacttaataatccattaaacggactaactattttaggggctttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 29924971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29974316 - 29974124
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||  ||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  29974316 acataatagcctccatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgactacatatattttaagaataatgtccttatatttaatggggtctcacaa 29974217  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29974216 ttaaattatacttaataatccattaaacggactaactattttaggggctttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 29974124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16200619 - 16200434
Alignment:
Q  13 aatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaa 112  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16200619 aatagtcttcatgctttaatgacatcccacttcacaataaatcttgactacgaatactttaagaataatgtccttatgtttattggagtctcacaattaa 16200520  T
Q  113 gttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  16200519 gttatacataatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaataaaa-caacgaagaaatgcctt 16200434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 24253395 - 24253589
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||  ||| |||  ||||| ||  ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24253395 gtctaccgacataatagtctctatgctttaatgttacctcactttacaataaattttgaccacatatactttaagaatagtgtccttatgtttgatgggg 24253494  T
Q  101 -tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaat 194  Q
     |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24253495 atctcacgattaagtcatacttaatgttccatcaaacgaacgagctattctaaggactttattattttgaagtaaaacaaaatcaataaagaaat 24253589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 17136559 - 17136465
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaa 95  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17136559 gtctacccacataatagtctctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaa 17136465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 137 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18534820 - 18534758
Alignment:
Q  137 ggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18534820 ggactaactattctatggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18534758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 6110028 - 6109972
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110028 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 6109972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 8490452 - 8490396
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490452 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 8490396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13248571 - 13248515
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248571 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 13248515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13211267 - 13211211
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211267 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 13211211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 18640989 - 18641045
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640989 catgatacaaagccaaacacaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 18641045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 17136193 - 17136137
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17136193 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 17136137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 243 - 293
Target Start/End: Original strand, 10579603 - 10579653
Alignment:
Q  243 acaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579603 acaaagtcaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 10579653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 15607672 - 15607729
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaa-tatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607672 catgatacaaagccaaacccaataaaatatagattggctattagggcttattccaaca 15607729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18510969 - 18510924
Alignment:
Q  154 gactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18510969 gactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18510924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 15351237 - 15351293
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15351237 catgatacaaagccaaaatcaatcattatagattggctattagggcttattccaaca 15351293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 15357829 - 15357885
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357829 catgatacaaagccaaaatcaatcattatagattggctattagggcttattccaaca 15357885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 16482727 - 16482782
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16482727 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattgg-tattagggcttattctaaca 16482782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 17200427 - 17200483
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17200427 catgctacaaagccaaacccaatcaacatagattggctattagggcttactccaaca 17200483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18519941 - 18519885
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18519941 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattaggacttactccaaca 18519885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 293
Target Start/End: Original strand, 10572840 - 10572890
Alignment:
Q  243 acaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10572840 acaaagtcaaacccaatcaatataggttggctattagggcttattccaaca 10572890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Original strand, 1647768 - 1647825
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||    
T  1647768 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagaccagctattagggcttactccaacat 1647825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 15601127 - 15601184
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaa-tatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15601127 catgatacaaatccaaacccaataaaatatagattggctattagggcttattccaaca 15601184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13516775 - 13516719
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13516775 catgatacacagccaaactcaatcaacatagattggctattagggcttactccaaca 13516719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 17781358 - 17781414
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17781358 catgatataaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 17781414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 19089985 - 19090041
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19089985 catgatataaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 19090041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 32057144 - 32057200
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32057144 catgatacaaagtcaaacccaatcaacatagattggctattagagcttactccaaca 32057200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18510885 - 18510829
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18510885 catgatacaaaatcaaactcaatcaatatagattggatattagggcttactccaaca 18510829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18522626 - 18522570
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18522626 catgatacaaaatcaaactcaatcaatatagattggatattagggcttactccaaca 18522570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 18534719 - 18534671
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18534719 catgatacaaaaccaaactcaatcaatatagattgactattagggctta 18534671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29924935 - 29924879
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  29924935 catgatacaatgtcaaactcaatcaatatagatcgactattagggcttactccaaca 29924879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29974088 - 29974032
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  29974088 catgatacaatgtcaaactcaatcaatatagatcgactattagggcttactccaaca 29974032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 4)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 2328 - 2528
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2328 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 2427  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2428 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 2527  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  2528 t 2528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 11219 - 11419
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11219 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 11318  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11319 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 11418  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  11419 t 11419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 2564 - 2620
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2564 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 2620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 11455 - 11511
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11455 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 11511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 47)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 19926767 - 19926967
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926767 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 19926866  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926867 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 19926966  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  19926967 t 19926967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26970663 - 26970463
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970663 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 26970564  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970563 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 26970464  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  26970463 t 26970463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 55612883 - 55612683
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55612883 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagagtagtttccttatgtttaatgggg 55612784  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612783 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 55612684  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  55612683 t 55612683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 868797 - 868597
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  868797 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaacgggg 868698  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  868697 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttg 868598  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  868597 t 868597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5707520 - 5707320
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707520 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 5707421  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707420 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 5707321  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  5707320 t 5707320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26963840 - 26963640
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963840 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 26963741  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963740 tctcacaattaagttatatttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 26963641  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  26963640 t 26963640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18262412 - 18262214
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18262412 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaacgggg 18262313  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18262312 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacgaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18262214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5714148 - 5713948
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714148 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 5714049  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714048 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatgggctaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 5713949  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  5713948 t 5713948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 10621340 - 10621540
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10621340 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggc 10621439  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621440 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattccagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 10621539  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  10621540 t 10621540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 10628419 - 10628619
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10628419 gtctacctacataatagtctctatgctttaataatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggc 10628518  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628519 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattccagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 10628618  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  10628619 t 10628619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18269273 - 18269070
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18269273 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaacgggg 18269174  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaac-----aaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  18269173 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 18269074  T
Q  196 cctt 199  Q
    ||||    
T  18269073 cctt 18269070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 28393141 - 28393339
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28393141 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttccttatgtttaatgggg 28393240  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28393241 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattttagggactttattattttgaaacaaatcaaaatcaataaagaaatgcctt 28393339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 4426611 - 4426808
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  4426611 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtt-ccttatgtttaacgggg 4426709  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426710 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 4426808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8845401 - 8845215
Alignment:
Q  3 ctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtc 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  8845401 ctacccacataatagtctctatgctttaatgatatccgacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaacgggatc 8845302  T
Q  103 tcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845301 tcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 8845215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8858365 - 8858179
Alignment:
Q  3 ctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtc 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  8858365 ctacccacataatagtctctatgctttaatgatatccgacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaacgggatc 8858266  T
Q  103 tcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858265 tcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 8858179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12357251 - 12357136
Alignment:
Q  86 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaa 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12357251 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaa 12357152  T
Q  186 taaagaaatgccttgt 201  Q
    ||||||||||||||||    
T  12357151 taaagaaatgccttgt 12357136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20311491 - 20311299
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||  ||||||| | || ||| |||||||||||||||||||    
T  20311491 tctacccacaaaatagtctctatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgacaacaaatactttaaaaacagtgtccttatgtttaatggggt 20311392  T
Q  102 ctcacaattaagttata-cttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||  | |||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20311391 ctcacaattaagttataccttaatgctccattgaacatattaactattataagtactttattattttaaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 20311299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Original strand, 5668140 - 5668327
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggata--ctttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcac 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||| ||| |||||||||||||  |||  |||| |||||| | |||||   ||||||||| ||||||    
T  5668140 acataatagtctctatgatttaatgttatctcttttcacaataaagcttgactacaaatatactttaagaataatgtcctttcatttaatggg-tctcac 5668238  T
Q  107 aattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
     ||||| | | |||||||| |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5668239 gattaaatcacacttaatgctccattaaatagactaattattctagagactttattattttgaaacaaaacaaaatcaacaaagaaatg 5668327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 10677562 - 10677753
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||| || ||| | |  ||||||||||||||||||||| |||||| | || ||  ||||||||||     
T  10677562 gtctacccacataatagtctatatactttaatgttatctcatttcacta--aagcttgactacggatactttaagaataatatcatttcgtttaatggg- 10677658  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||| | ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||| |||| ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10677659 tctcgcgattaagtcatacttaatgctccattatacagactaattattttaggggctttattttattgaaacaaaagaaaatcaataaaaaaatg 10677753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 10891202 - 10891393
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||| || ||| | |  ||||||||||||||||||||| |||||| | || ||  ||||||||||     
T  10891202 gtctacccacataatagtctatatactttaatgttatctcatttcacta--aagcttgactacggatactttaagaataatatcatttcgtttaatggg- 10891298  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||| | ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||| |||| ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10891299 tctcgcgattaagtcatacttaatgctccattatacagactaattattttaggggctttattttattgaaacaaaagaaaatcaataaaaaaatg 10891393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5616414 - 5616215
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagc--ttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 99  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||  || ||| |  ||||| ||||||||||| |||||| | ||||   |||||| |||    
T  5616414 tctacatacataatagtctcaatgctttattaatatcccaattcataataaaacctttgacaacggatactttaagaataatgtcctctagtttaacggg 5616315  T
Q  100 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
     |||||  ||| ||| | |||||||||||||  |||  |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5616314 atctcatgatttagtcagacttaatgttccaagaaatagactaattattttaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatgaataaagaaatgcctt 5616215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 35223760 - 35223576
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||   ||  ||| |||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||  |||| | |       
T  35223760 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgttatccttttttacaataaagcttgactacgaatactttaagaataatgtcctttcgttttacg--- 35223664  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
           ||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  35223663 -------attaagtcacacttaatgctccattaaacagactaattattctagggactttattattttaaaacaaaacaaaatcaacaaagaaatg 35223576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 237 - 297
Target Start/End: Original strand, 19927003 - 19927063
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacatatt 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19927003 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacatatt 19927063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5713912 - 5713856
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713912 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 5713856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 26963604 - 26963548
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963604 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 26963548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 26970427 - 26970371
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970427 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 26970371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5707284 - 5707228
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707284 catgatacaaagccaaacacaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 5707228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 10621576 - 10621632
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621576 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 10621632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 12357100 - 12357044
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12357100 catgatacaaagccaaatccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 12357044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 237 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 868561 - 868507
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  868561 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggtttattccaa 868507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 237 - 295
Target Start/End: Original strand, 17142372 - 17142430
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacata 295  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17142372 catgatacaaagtcaaacccaatcaatatagattggctattagggctttttccaacata 17142430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 10628655 - 10628711
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628655 catgatacaaagtcaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 10628711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 55612650 - 55612594
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  55612650 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggttattagggcttattctaaca 55612594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 239 - 293
Target Start/End: Original strand, 28393380 - 28393434
Alignment:
Q  239 tgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28393380 tgatacaaagtcaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 28393434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Original strand, 4426847 - 4426904
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  4426847 catgatacagagccaaacccaatcaatatagattggctattaggacttactccaacat 4426904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18269032 - 18268976
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18269032 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctatttgggcttattccaaca 18268976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 152
Target Start/End: Original strand, 39074278 - 39074346
Alignment:
Q  85 cttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttcca-ttaaacggactaactattctag 152  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  39074278 cttatgtttaatggggtctcatgattaagtcatacttaatgttcaatttaaacggactaattattctag 39074346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 55992729 - 55992680
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttat 286  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  55992729 catgatacaaagtcaaacccaatcaatacaaattggctattagggcttat 55992680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 175
Target Start/End: Original strand, 21454152 - 21454319
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    |||||||| ||| ||||| ||| || |||| || ||| ||| |||| |||||||  |||| ||| | |||| | || ||||  ||||||||||||||  |    
T  21454152 acataataatctttatgcattattgttatctcatttcacaataaagtttgactatagatattttaaaaataatgtcattataattaatggggtctcaata 21454251  T
Q  109 ttaagttatactt-aatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaa 175  Q
    |||||| | | || ||||||||||||| |  ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  21454252 ttaagtcacattttaatgttccattaatcaaactaactattctaagaactttattactttgaaacaaa 21454319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 5668371 - 5668412
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctatta 278  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5668371 catgatacaaaaccaaacacaatcaatatagattggctatta 5668412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8845166 - 8845118
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8845166 catgatacaaagtcaaactcaatcaacatagattggctattaggactta 8845118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8858130 - 8858082
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8858130 catgatacaaagtcaaactcaatcaacatagattggctattaggactta 8858082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18262176 - 18262136
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctatt 277  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18262176 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctatt 18262136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Original strand, 11161913 - 11161972
Alignment:
Q  92 ttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattcta 151  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  11161913 ttaatggagtctcacaattaagtcacactttgtgttccattaaactgattaactattcta 11161972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 20311261 - 20311207
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 291  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||  ||||| |||||    
T  20311261 catgatacaaagccaaatccaatgaatacagattggctattacagcttactccaa 20311207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 24700006 - 24699958
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24700006 catgatacaaaaccaaattcaatcaatatagattggttattcgggctta 24699958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 64
Target Start/End: Original strand, 39074218 - 39074270
Alignment:
Q  12 taatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacg 64  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||  ||||||||    
T  39074218 taatagtctccatgctttaatgatatctcacttcacaataaagtatgactacg 39074270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 26)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18252230 - 18252030
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252230 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 18252131  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252130 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 18252031  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  18252030 t 18252030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 18532521 - 18532721
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532521 gtctatctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 18532620  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532621 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgaactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 18532720  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  18532721 t 18532721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 27131416 - 27131616
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131416 gtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacaaatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 27131515  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131516 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 27131615  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  27131616 t 27131616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 21171240 - 21171438
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||    
T  21171240 gtctacccacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgttcaacgggg 21171339  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171340 tctcacaattaagttatatttaatgttccatgaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 21171438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 27310584 - 27310782
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || | ||    
T  27310584 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactactgatactttaagaatagtttccttatgttcaacgtgg 27310683  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310684 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 27310782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 16359042 - 16359240
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16359042 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatattccatttctcaataaagcttgactagggttactttaagaatagtttccttatgtttaacgggg 16359141  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359142 tctcacaattaagttattcttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 16359240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Original strand, 36816648 - 36816834
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||| || |||||||||    
T  36816648 acataatagtctctatgctttaatggtatcccacttctcaataaagcttgactatggatactttaagaataatgtccttatgtttaacggagtctcacaa 36816747  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816748 ttaatttatacttaatgttccattaaacagacgaactattctagggacttcattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 36816834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 3855926 - 3856126
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||  ||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  3855926 gtctacccacgtaatagtctccatgctttaataatatcccacttcacaataaagtttgactacaaatattttaagaataatgtccttatgtttaatgggg 3856025  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  3856026 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgggctaactattctagggactttgttattttgaaacaaaacaaaataaacaaagaaatgccttg 3856125  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  3856126 t 3856126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 22657236 - 22657429
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||||  || ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22657236 acatgatagtctctatgctttaatgatatctcatttcagaataaagcttgactagagacactttaagaattgtgtccttatgtttaaaggggtctcacaa 22657335  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaac-aaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  22657336 ttaagttatatttaatgttccattaaacagactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaaatcaataaagaaatgtcttgt 22657429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 27277564 - 27277756
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||| | || ||  | ||||   ||    
T  27277564 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgttatcccttttcacaataaagcctgactacggatactttaagaataatgtcatttcggttaa-aagg 27277662  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||| | ||||||| | || ||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27277663 tctcgcgattaagtcacac-taatgctccgttaaatggactaattattctagggacgttattattttgaaacaaaacaaaaacaacaaagaaatg 27277756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 237 - 296
Target Start/End: Original strand, 18532757 - 18532816
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacatat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532757 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacatat 18532816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 12006554 - 12006712
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    |||||| | |||||| | ||||||| |||||| |||| ||  || ||||||||||| ||  ||| | |||| | ||||||||||| |||||||||||| |    
T  12006554 acataacaatctctaagttttaatgttatccctcttcacactaaggcttgactacgaatgttttaataataatgtccttatgtttcatggggtctcacga 12006653  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattatttt 167  Q
    |||||  | ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12006654 ttaaggcacacttaatattccattaaatagactaactattctagggactttattatttt 12006712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 167
Target Start/End: Original strand, 12014292 - 12014457
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||| ||||||| |||| || ||||||||  |||||| |||| ||  ||||||| |||||||||  ||| ||||||   || |||||||||||||| |    
T  12014292 tctacccacataatggtctttacgctttaatcgtatccctcttcacactaaagcttaactacggatgttttaagaataacatcattatgtttaatgggat 12014391  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattatttt 167  Q
    || || ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  12014392 ctaacgattaatttacacttaatattccattaaacggactatgtattctagtgactttattatttt 12014457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18251992 - 18251935
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18251992 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 18251935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 27310821 - 27310877
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27310821 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 27310877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 9917927 - 9918106
Alignment:
Q  3 ctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtc 102  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||  |||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||  ||    
T  9917927 ctaccgacatagtattctctatgcttcaatgctatcccacttaacaataaagcttaactatagatattttaagaataatgtccttatatttaatgga-tc 9918025  T
Q  103 tcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 189  Q
    ||   || |||||||||||||||||| |||||||  |||||       || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9918026 tcgtgatcaagttatacttaatgttcgattaaacaaactaa------aagtgactttattattttgtaacaaaacaaaatcaataaa 9918106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 16359280 - 16359336
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16359280 catgatacaaatcctaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 16359336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 21171479 - 21171535
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21171479 catgatacaaagccaaactcaatccatatagattggctattagagcttactccaaca 21171535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 195
Target Start/End: Original strand, 30720625 - 30720694
Alignment:
Q  126 ttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||    
T  30720625 ttccattaaacgaactaattattccaggaactttattattttaaaacaaaataaaaccaataaaaaaatg 30720694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 285
Target Start/End: Original strand, 36816881 - 36816926
Alignment:
Q  240 gatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36816881 gatacaaagccaaacccaatcaatatagattgaatattagggctta 36816926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 3856164 - 3856220
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||    
T  3856164 catgatacaaagtcaaacccaatcaagatggattggctattagggcctactccaaca 3856220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 241 - 293
Target Start/End: Original strand, 22657469 - 22657521
Alignment:
Q  241 atacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  22657469 atacaaagccaaactcaatcaatatatattggctattaaggcttactccaaca 22657521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 27131652 - 27131704
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131652 catgatacaaagccaaacccaac----atagattggctattagggcttattccaaca 27131704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 3403325 - 3403248
Alignment:
Q  94 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaa 171  Q
    |||| ||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  3403325 aatgtggtctcacatttaagtcacacttaatattccattaatcagactaactattttatagactttattactttgaaa 3403248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 171
Target Start/End: Original strand, 3443494 - 3443571
Alignment:
Q  94 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaa 171  Q
    |||| ||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  3443494 aatgtggtctcacatttaagtcacacttaatattccattaatcagactaactattttatagactttattactttgaaa 3443571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 27277800 - 27277856
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27277800 catgatacaaagtcaaacataattaacatagattggctattagggcttactccaaca 27277856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18488 - 18288
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18488 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 18389  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388 tctcacaattaagttatacttaatgttcaattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 18289  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  18288 t 18288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18252 - 18196
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 18196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29327984 - 29327784
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327984 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 29327885  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327884 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaactgactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 29327785  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  29327784 t 29327784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 11536069 - 11536269
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11536069 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgtttaatgggg 11536168  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11536169 tctcacaattaagttgtacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 11536268  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  11536269 t 11536269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 11542987 - 11543187
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11542987 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgtttaatgggg 11543086  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11543087 tctgacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcattg 11543186  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  11543187 t 11543187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15152643 - 15152445
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15152643 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccgtatgtttaacgggg 15152544  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15152543 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaactcaataaagaaatgcctt 15152445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15148342 - 15148144
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15148342 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttccttatgtttaacgggg 15148243  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15148242 tctcacaattaagttatacttaatgttcaatcaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaactcaataaagaaatgcctt 15148144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18561207 - 18561009
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18561207 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacctctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttcctaatgtttaacgggg 18561108  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561107 tctcacagttaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18561009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12751018 - 12750828
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  12751018 acataatagtctctatgctttaatgatatccaacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttctttatgtttaacgaggtctcacaa 12750919  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12750918 ttaagttatacttaatgtttcattaaacggactaactattctagggactttattactttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 12750828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 12738736 - 12738542
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||   ||    
T  12738736 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttccttatgtttaacaagg 12738637  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12738636 tctcacaattaagttataattaatgtttcattaaacaaactaactattctagggactttattattttgaaacaaaataaaatcaataaagaaatg 12738542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 199
Target Start/End: Original strand, 18257857 - 18258047
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||  ||| ||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18257857 acataatagtctttatgcattattgttatcctacttaacaaaaaaacttgactacggatactttaagaataatgtccttgtgtttaatggggtctcacaa 18257956  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18257957 ttaagtcatacttaatgttccattaaacagactaattattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18258047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13392338 - 13392157
Alignment:
Q  13 aatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaa 112  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||| |||| |||||||  |||||||| |||||| | |||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  13392338 aatagtctctatgttttaatgttatcccttttcacaataaagtttgactattgatactttaagaataatgtcctttcatttaatggg-tctcacgattaa 13392240  T
Q  113 gttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    || | |||||||| |||||||| | |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  13392239 gtcacacttaatgctccattaagcagactaattgttctaggaactttattattttgaaacaaaacaaagtcaacaaagaaatg 13392157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 2365086 - 2364917
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||| || ||| ||| || | ||||||||| ||| ||| |||||| | || ||  |||||||||| |||||| |    
T  2365086 acatgatagtctctatgttttaatgttatctcatttcacaataagg-ttgactacgaatattttaagaataatgtcatttagtttaatgggttctcacga 2364988  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 179  Q
    |||||  | |||||||||||||||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  2364987 ttaagccacacttaatgttccattagaaagactaattattctagagactttattattttgaaacataacaa 2364917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12738499 - 12738441
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacata 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12738499 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaacata 12738441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Original strand, 2653275 - 2653332
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 294  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2653275 catgatacaaagccaatcccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 2653332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 11543223 - 11543279
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11543223 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 11543279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 39111905 - 39111819
Alignment:
Q  108 attaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  39111905 attaagtcgtacttaatgtttcattaaacggactcgctattctagggactttatt-ttttgaaataaaacaaaattaataaagaaatg 39111819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 7396381 - 7396221
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||  | ||| ||  || ||||||||||  ||  ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||  |    
T  7396381 acataatagtctctatgctttaatatcatcgtatttcacactaaggcttgactacatatgttttaagaataattttcttatgtttaatagggtctcaaga 7396282  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttcca-ttaaacggactaactattctagggactttattattttg 168  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  7396281 ttaagtcatacttaatgttccatttaaatgaactaactattctagcgacatttttattttg 7396221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 11536305 - 11536361
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11536305 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagagtggctattagggcttattccaaca 11536361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 12750789 - 12750733
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12750789 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattagctattagggcttactccaaca 12750733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 15152406 - 15152350
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15152406 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 15152350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29327745 - 29327690
Alignment:
Q  238 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29327745 atgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 29327690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 15148105 - 15148049
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15148105 catgatacaaaaccaaacccaattaatatagattggctattagggcttactccaaca 15148049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 3132791 - 3132748
Alignment:
Q  84 ccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgtt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3132791 ccttatgtttaatggggtctcacaattaagttacacttaatgtt 3132748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13392085 - 13392030
Alignment:
Q  238 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  13392085 atgatacaaagtcaaacacaatcaatatagattggatattagggcttactccaaca 13392030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 10234244 - 10234179
Alignment:
Q  86 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattcta 151  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  10234244 ttatgtttaatggaatctcatgattaagttatatttaatggttcattaaacggactaactattcta 10234179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 18258087 - 18258143
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18258087 catgatacaaggccaaaaccaatcaatctagattggctatcagggcttactccaaca 18258143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 201
Target Start/End: Original strand, 2653207 - 2653239
Alignment:
Q  169 aaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2653207 aaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 2653239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18560969 - 18560913
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | |||||||| |||||||    
T  18560969 catgatacaaagccaagcccaatcaacatagattgcctttaagggcttactccaaca 18560913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 27381259 - 27381459
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27381259 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactatggatactttgagaatagtttccatatgtttaatgggg 27381358  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381359 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 27381458  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  27381459 t 27381459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 27471642 - 27471842
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27471642 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactatggatactttgagaatagtttccatatgtttaatgggg 27471741  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471742 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 27471841  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  27471842 t 27471842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 17684476 - 17684674
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17684476 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaacgggg 17684575  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684576 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 17684674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29309090 - 29308890
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29309090 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggc 29308991  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29308990 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 29308891  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  29308890 t 29308890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29316050 - 29315850
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29316050 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggc 29315951  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29315950 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 29315851  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  29315850 t 29315850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 16566327 - 16566525
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16566327 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaacgggg 16566426  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566427 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 16566525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 17691447 - 17691647
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17691447 gtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcactaaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaatgggg 17691546  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691547 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaagaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 17691646  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  17691647 t 17691647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 188984 - 189182
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  188984 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacaaatactttaagaatagtttccttatgtttaatgggg 189083  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189084 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 189182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 25537166 - 25537364
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25537166 gtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaatagtttccttatgtttaacgggg 25537265  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537266 tctcacaataaagttatacttaatgttccattaaacggactaattattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 25537364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 11651923 - 11651725
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11651923 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactactgatacttttagaatagtttccttatttttaatgggg 11651824  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11651823 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattttagggactttattattttgaaacaaatcaaaatcaataaagaaatgcctt 11651725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 199
Target Start/End: Original strand, 13359286 - 13359474
Alignment:
Q  11 ataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaatt 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||| | |||| | |  ||||||||||||| || |||| |||    
T  13359286 ataatagtctctacgctttaatgttgtcccatttcacaataaaggttgactacggatactttaaaaataatgtttttatgtttaatggagtttcacgatt 13359385  T
Q  111 aagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  13359386 aagttatacttaatgctccattaagcgaactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaataaataaataaatgcctt 13359474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 291
Target Start/End: Original strand, 17691683 - 17691737
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691683 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 17691737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 20553594 - 20553755
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||||||||  |||| |||||| ||| |||  || ||||||||| |||| |||||| | | ||||| |||||||||     
T  20553594 gtctaccaacataaaaatctttatgctttaattttatctcacttcacaataaaaattcactacggatgctttaagaataatattcttatatttaatggga 20553693  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttatt 162  Q
    |||||| |||||||  |||||||| || |||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  20553694 tctcacgattaagtcgtacttaatatttcattaaacggactagctatcctagagactttatt 20553755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 27381495 - 27381551
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381495 catgaaacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 27381551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 27471878 - 27471934
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471878 catgaaacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 27471934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29308854 - 29308798
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29308854 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 29308798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29315814 - 29315758
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29315814 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 29315758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 17684712 - 17684768
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684712 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctattagggcttattccaaca 17684768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 8510115 - 8509941
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg-tctcaca 107  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||| || |||  || ||||||| |||||  ||||||| | ||||   |||| || |||||||||| ||||| |    
T  8510115 acataatagtctttatgttttaatgctatctcatttcataataaagcttaactacatatactttaataatatcatcctcatatttaatgggggtctcata 8510016  T
Q  108 attaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 182  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8510015 attaagtcgtacataatgttccatcaaatagactaattattctatagactttattattttaaaacaaaataaaat 8509941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 239 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11651684 - 11651630
Alignment:
Q  239 tgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11651684 tgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 11651630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 27925946 - 27925772
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    |||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||  || |||| |||||||  |||||||| |||||| ||| |||  ||||||||| ||||||| |    
T  27925946 acataatagtctttgtgcttcaatgctataccacttccaaataaagtttgactagagatactttaagaataattttctttagtttaatggagtctcacga 27925847  T
Q  109 ttaagt--tatactta---atgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaaca 178  Q
    ||||||   | |||||   ||||||| ||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27925846 ttaagtcacacacttaattatgttccgttaaacatactagttattctaaggactttattattttgaaacaaaaca 27925772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 25537405 - 25537461
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25537405 catgatacaaagccaaactcagtcaatatagattggctattagggcttaatccaaca 25537461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 17850502 - 17850663
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| | |||||||||| ||| ||| |||| |||   ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| | |||||| ||     
T  17850502 gtctacccatataatagtctatatacttgaatgttatttgacttcacaa-aaagcttgactatggataatttaagaatagtgtccttgtttttaattgga 17850600  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttatta 163  Q
    | ||||||||||||  ||| ||||||||||  ||||  |||| ||||| ||||||||||||||    
T  17850601 tatcacaattaagtcttacataatgttccaacaaacaaactagctattatagggactttatta 17850663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 194
Target Start/End: Original strand, 31258065 - 31258120
Alignment:
Q  139 actaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaat 194  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31258065 actaattattttagagactttattattttgaaacaaaacaaaagcaataaagaaat 31258120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Original strand, 13359512 - 13359560
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  13359512 catgatacaaagtcaaacccaatgaatatagattggctattaggactta 13359560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Original strand, 16566563 - 16566611
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16566563 catgatacaaagtcaaactcaatcaacatagattggctattagggctta 16566611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Original strand, 189221 - 189281
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaata---tagattggctattagggcttattccaacat 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  189221 catgatacaaagccaaacccaatcaatatactagattgattattagggcttactccaacat 189281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 279
Target Start/End: Original strand, 16394484 - 16394526
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattag 279  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16394484 catgatacaaagtcaaactcaatcaatatagattgtctattag 16394526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 185
Target Start/End: Original strand, 22259925 - 22259990
Alignment:
Q  120 ttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaa 185  Q
    ||||||||  |||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22259925 ttaatgttatattaaatggactagttattttagggagtttattattttgcaacataacaaaatcaa 22259990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 4)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 6941 - 7141
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6941 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaataggg 7040  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7041 tctcacagttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 7140  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  7141 t 7141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 13957 - 14157
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13957 gtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 14056  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14057 tctcacagttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattgtagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 14156  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  14157 t 14157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 7177 - 7233
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7177 catgatacaaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 7233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 14193 - 14249
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14193 catgatacaaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 14249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21940865 - 21940665
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940865 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 21940766  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21940765 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcattg 21940666  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  21940665 t 21940665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 28555083 - 28554885
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  28555083 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 28554984  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28554983 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattttaggtattttattattttgaaactaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 28554885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22171687 - 22171491
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22171687 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttc--tatgtttaatgggg 22171590  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22171589 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaataaaacaaaatcaataaggaaatgcctt 22171491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6094322 - 6094129
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggt 101  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  6094322 tctacccatataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaaaaatagtttccttatgtttaacggggt 6094223  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094222 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 6094129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24642849 - 24642655
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24642849 gtctacccacataatagtctctatactttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaatagtttccttatgtttaacgggg 24642750  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642749 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaacaattctagggactttatgattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 24642655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 68 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24636987 - 24636860
Alignment:
Q  68 actttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattatttt 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24636987 actttaagaatagtttccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaaaggactaactattctagggactttattatttt 24636888  T
Q  168 gaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24636887 gaaacaaaacaaaatcaagaaagaaatg 24636860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 237 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 22070164 - 22070105
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacatat 296  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22070164 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacatat 22070105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 21940629 - 21940573
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940629 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 21940573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 6094087 - 6094031
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6094087 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 6094031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22171452 - 22171396
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171452 catgatacaaaatcaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 22171396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 241 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 24642608 - 24642556
Alignment:
Q  241 atacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24642608 atacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 24642556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 28554847 - 28554791
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28554847 catgatacaaagccaaacccaatcaacaaagattggctattagggcttactccaaca 28554791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 38232384 - 38232570
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| ||| |||||| | ||||||||||   |||| |||||  ||| |||| ||||||||  ||||||| |||||| | |  ||| ||||||||| |    
T  38232384 gtctacccacaaaatagtttttatgctttaagactatctcactttacaataaagtttgactacaaatactttaagaatactatt-ttacgtttaatggag 38232482  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 189  Q
    | |||  |||||||||||| |||   |  ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38232483 tgtcatgattaagttatacctaaaaatttattaaacagactaactattctagaga-tttattattttgaaataaaacaaaatcaataaa 38232570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 171
Target Start/End: Original strand, 32872857 - 32873019
Alignment:
Q  10 cataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaat 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| ||| |||||  ||| ||| | | || | ||  | | || |||| | |||||||||    
T  32872857 cataatagtctctatgctttgatgttatcccacttcacaataaatcttaactacaaatattttaatagtattgtcactcttttcaatgagatctcacaat 32872956  T
Q  110 taagttatacttaatgttccat-taaacggactaactattctagggactttattattttgaaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||| |||  ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  32872957 taagtcatacttaatgttctatataaatggatgaactattataaggactttattattttgaaa 32873019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 2375085 - 2375027
Alignment:
Q  122 aatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaa 180  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2375085 aatgttccattaaattgactaattattatagggagtttattattttgaaacaaaacaaa 2375027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 10920297 - 10920234
Alignment:
Q  100 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttatta 163  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||    
T  10920297 gtctcacgattaactcatacttaatgttccattaaacagactaattattctaggaattttatta 10920234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 2375000 - 2374947
Alignment:
Q  240 gatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||   ||||||||||||||||||||    
T  2375000 gatacaaagccaaatccaatcaatacatatttattattagggcttattccaaca 2374947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 24636642 - 24636605
Alignment:
Q  256 caatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24636642 caatcaatatagattggctattatggcttactccaaca 24636605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Original strand, 21330259 - 21330455
Alignment:
Q  5 acctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330259 acctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctc 21330358  T
Q  105 acaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21330359 acaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 21330455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18796706 - 18796506
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||| |||||| | |||||||||| || | ||    
T  18796706 gtctacccacataatagtctcaatgctttaatgatataccacttcacaataaagcttgactacagataatttaagaataatatccttatgttaaaagagg 18796607  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||    
T  18796606 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttgttattttgaaacaaaacaaaataaacaaataaattccttg 18796507  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  18796506 t 18796506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18620002 - 18619807
Alignment:
Q  3 ctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtc 102  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||  ||| ||| |||| ||||| || |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||| ||    
T  18620002 ctacccacataatagtctatatgctttaatattatcccttttcacaataaagtttgaccacagatactttaagaataatatccttttgtttaatggg-tc 18619904  T
Q  103 tcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||| |||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18619903 tcataattaagtcacacttaatgctccattaaacagactaattattatagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaacaaagaaattcctt 18619807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 56 - 195
Target Start/End: Original strand, 19692598 - 19692737
Alignment:
Q  56 ttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggga 155  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||  |||||||| | |||||  ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19692598 ttgactaaggatactttaagaataatttcctttagtttaatgagatctcatgattaagtcaggcttaatgttccattaaacagactaattattctaggga 19692697  T
Q  156 ctttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19692698 cttcattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 19692737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 20978084 - 20977957
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||  |    
T  20978084 acataatagtctctatgctttagtgatatctcacttcacattaaagcttgactacggatgttttaagaataatttccttatttttaatgggatctcatga 20977985  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttccattaaac 136  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  20977984 ttaaattattcttaatgttccattaaac 20977957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 237 - 295
Target Start/End: Original strand, 21330493 - 21330551
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacata 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330493 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacata 21330551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 36270366 - 36270199
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||| |||||||| |||||| |||| ||  ||||||||| |||||||  ||| |||||||| || || |||||||||  |    
T  36270366 gtctacccacacaatagtctttatactttaatgttatccctcttcacactaaagcttgattacggatgttttaagaatagtgtcattgtgtttaatgatg 36270267  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgga-ctaactattctagggactttattatttt 167  Q
    |||||| ||||||| | ||||||  || |||| ||   | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36270266 tctcacgattaagtcacacttaacatttcatttaagtaaactaactattctagggactttattatttt 36270199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18822275 - 18822115
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||  ||  ||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |    
T  18822275 acataataatctatctgctttaatgatatcccacttcaaactaaagcttgattacatatgttttaagaatagtgtccttgtgtttaatggtgtctcacga 18822176  T
Q  109 ttaagttatacttaa-tgttcca-ttaaacggactaactattctagggactttattatttt 167  Q
    |||||  | |||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  18822175 ttaagccacacttaatttttccatttaaacgaactaacaattctatagactttattatttt 18822115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 19692773 - 19692829
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19692773 catgatacaaaaccaaacctaataaatacagattggctattaaggcttactccaaca 19692829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 165
Target Start/End: Original strand, 36802664 - 36802820
Alignment:
Q  10 cataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaat 109  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||  ||   || ||||| |||||||  ||| |||||| | || || |||||||||   |||  ||||    
T  36802664 cataataatctatatgctttaatgttatcccactttacactgaatcttgattacggatgttttaagaataatgtcattgtgtttaatgatatcttgcaat 36802763  T
Q  110 taagttatacttaatgttcca-ttaaacggactaactattctagggactttattatt 165  Q
    ||||| | | ||||| ||||| ||||||| | ||||||||| | |||||||||||||    
T  36802764 taagtaacatttaatattccatttaaacgaattaactattcaaaggactttattatt 36802820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7307 - 7107
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  7307 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 7208  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7207 tctcacaattaagttatacttaatgttctattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaataccttg 7108  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  7107 t 7107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 7071 - 7015
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7071 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 7015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 24695473 - 24695673
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24695473 gtctacctacataatagtctctatgctttattgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 24695572  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695573 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 24695672  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  24695673 t 24695673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 18569870 - 18570070
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18569870 gtctaccaacataatagtctttatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagagtagtttccttatgtttaacgggg 18569969  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18569970 tctcacaattaagttatacttaatgttcaattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttg 18570069  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  18570070 t 18570070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 19714505 - 19714703
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19714505 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgacttcggatattttaagaatagattccttatgtttaacgggg 19714604  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19714605 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattactttgaaataaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 19714703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 19707225 - 19707419
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19707225 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgacttcggatattttaagaatagattccttatgtttaacgggg 19707324  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19707325 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaactgactaactattctagggactttattactttgaaataaaacaaaatcaataaagaaatg 19707419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 27347497 - 27347679
Alignment:
Q  13 aatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| |||||||||||||  ||||||| |||||| | |||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  27347497 aatagtctctatgctttaatgttatcccttttcacaataaagcttgactacatatactttaagaataatgtcctttcgtttaatggg-tctcacgattaa 27347595  T
Q  113 gttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgc 196  Q
    || | |||||||| |||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27347596 gtcacacttaatgctccattaaacagattaattattctaaggactttattattttgaatcaaaacaaaatcaacaaagaaatgc 27347679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Original strand, 22547031 - 22547217
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| ||| |||| |||||| || ||||||| | |||| | ||| ||| ||||||| | |||||| |    
T  22547031 acataatagtctctatattttaatgttatctcacttcacaataaagtttgactgcgaatactttaaaaataatgtccatatatttaatgagatctcacga 22547130  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  22547131 ttaagttatacttaatgttccattaaaccgactaactattatagcggttttattattttaaaataaaacaaaatgaataaataaatg 22547217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39538071 - 39537962
Alignment:
Q  92 ttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaaga 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39538071 ttaatgaggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgaaccaactattctaaggacttaaccattttgaaacaaaacaaaatcattaaaga 39537972  T
Q  192 aatgccttgt 201  Q
    |||| |||||    
T  39537971 aatggcttgt 39537962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 197
Target Start/End: Original strand, 17285754 - 17285935
Alignment:
Q  16 agtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagtt 115  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||| |||| | ||||| | ||||||| |||||| | || ||  ||||| | |||| |||| |||||||     
T  17285754 agtctatatgctttaatactatcccaattcacaataaagatcgactatgaatactttaagaataatgtcatttagtttactagggtttcacgattaagtc 17285853  T
Q  116 atacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 197  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17285854 acacttaatgttccattaaacagactaactattctctggagattattattttgaaacataacaaaatcaataaataaatgcc 17285935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 24695709 - 24695765
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695709 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 24695765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 92 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 31886640 - 31886537
Alignment:
Q  92 ttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaaga 191  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||| |||||| |||||| | ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  31886640 ttaatggagtctcacgattaagtcgtacttgatgttcaattaaatgaactaattattctaaggactttattaatttgaaacaaaacaaaatcactaaaga 31886541  T
Q  192 aatg 195  Q
    ||||    
T  31886540 aatg 31886537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 197
Target Start/End: Original strand, 17298907 - 17299088
Alignment:
Q  16 agtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagtt 115  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||  ||| |||| | ||||| | ||||||| |||||| | || ||  ||||| | |||| |||| |||||||     
T  17298907 agtctatatgctttaatactatcccacttaacaataaagatcgactatgaatactttaagaataatgtcatttagtttactagggtttcacgattaagtc 17299006  T
Q  116 atacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 197  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17299007 gcacttaatgttccattaatcggactaactattctctggatattattatttataaacataacaaaatcaataaataaatgcc 17299088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 19714742 - 19714798
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19714742 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 19714798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 19707462 - 19707518
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19707462 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 19707518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 27347722 - 27347778
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27347722 catgatacaaagccaaacgcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 27347778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 18807041 - 18807175
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttcc-ttatgtttaatggg 99  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||| || |||||||||  |||||||| |||||| | ||| |||| ||||||||     
T  18807041 gtctacccgcataatagtctctatgctttattgttatcttacttcacaataacgcttgactatagatactttaagaataatgtccattat-tttaatggt 18807139  T
Q  100 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaa 135  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18807140 gtctcacgattaagtcacacttaatgttccattaaa 18807175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 39538788 - 39538701
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttcctta 88  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  39538788 gtctacccacataatagtcttcatgctttaatgatatcccacttcacaataaagcttaactatggatattttaagaatagtgtcctta 39538701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 175
Target Start/End: Original strand, 33477389 - 33477479
Alignment:
Q  85 cttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaa 175  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||  | | |||||||| |||||||| | | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  33477389 cttatgattaatgaggtctcacgattagatcacacttaatgatccattaatcagcctaactattgtaaggactttattattttgaaacaaa 33477479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Original strand, 18570108 - 18570156
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  18570108 catgatacaaagccaaacccaattaatatagattagctattagagctta 18570156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 39537925 - 39537870
Alignment:
Q  238 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39537925 atgatacaaagctaaactcagtcaacatagattggctattagggcttaatccaaca 39537870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 11479489 - 11479420
Alignment:
Q  83 tccttatgtttaatg-gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattcta 151  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||| || ||||||||  ||||| |||||||    
T  11479489 tccttatgtttaatgagggtctcacaatcaagtcacacttaatatttcattaaacacactaattattcta 11479420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1193 - 993
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1193 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttctttatgtttaatgggg 1094  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1093 tctcacaattaagttatacttaatgtttcattaaacggactaactattttagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttg 994  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  993 t 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 957 - 900
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  957 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 25997 - 26197
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25997 gtctacctacataatagtcgctatgctttaatgatatcccacttttcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 26096  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26097 tctcacaattaagttatatttaatgttccattaaatggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttg 26196  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  26197 t 26197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Original strand, 26231 - 26286
Alignment:
Q  238 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26231 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattgactattagggcttattccaaca 26286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5729 - 5531
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5729 gtctacccacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacatatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 5630  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5629 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaaataaatcaataaagaaatgcctt 5531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 5492 - 5444
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5492 catgatacaaagccaaacccaaacaatatagattggctattagggctta 5444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 199
Target Start/End: Original strand, 230365 - 230545
Alignment:
Q  18 tctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttat 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  230365 tctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacaaatactttaagaatggtttccttatgtttaa-ggggtctcacaattaagttat 230463  T
Q  118 acttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230464 acttaatgttccattaaacggactaactattataagaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 230545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 230584 - 230640
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  230584 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattattgcttactccaaca 230640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 137 - 201
Target Start/End: Original strand, 8446 - 8510
Alignment:
Q  137 ggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8446 ggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 8510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 8546 - 8602
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8546 catgatacaaagccgaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 8602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 23769 - 23825
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23769 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 23825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16579 - 16523
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16579 catgatataaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 16523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16648 - 16615
Alignment:
Q  168 gaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16648 gaancaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 16615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0705 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0705
Description:

Target: scaffold0705; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 41 - 97
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41 catgatacaaagccaaaatcaatcattatagattggctattagggcttattccaaca 97  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 9000 - 8944
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9000 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctatttgggcttattccaaca 8944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 237 - 291
Target Start/End: Original strand, 10202 - 10256
Alignment:
Q  237 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 291  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10202 catgatacaaagtcaaactcaatcaatatagattggctattagagcttactccaa 10256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 182
Target Start/End: Original strand, 10127 - 10158
Alignment:
Q  151 agggactttattattttgaaacaaaacaaaat 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10127 agggactttattattttgaaacaaaacaaaat 10158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0767 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0767
Description:

Target: scaffold0767; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 257 - 293
Target Start/End: Original strand, 1 - 37
Alignment:
Q  257 aatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 aatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 37  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5930 - 5878
Alignment:
Q  241 atacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  5930 atacaaagtcaaactcaatcaatatagattggctattatgacttactccaaca 5878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 92267 - 92194
Alignment:
Q  100 gtctcacaattaagttatacttaatgttcca-ttaaacggactaactattctagggactttattattttgaaac 172  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   ||||  |||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  92267 gtctcacgattaagttatacttaatgttccatttaaaataactagatattctagagactttattactttaaaac 92194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University