View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF14232_low_1 (Length: 876)
Name: NF14232_low_1
Description: NF14232
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF14232_low_1 |
 | |
|
| [»] scaffold0491 (2 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 816; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 816; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 861
Target Start/End: Original strand, 1541210 - 1542045
Alignment:
| Q |
26 |
caaaataagaaagaaagaatatcaaagattaatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaagga |
125 |
Q |
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| T |
1541210 |
caaaataagaaagaaagaatatcaaagattaatttaccaggagctatatatccaatagttccagaaactatagttcgattggatgaatcatattgaagga |
1541309 |
T |
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| Q |
126 |
gtcgagcagtgccaaagtcagacacactagcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtgcaatc |
225 |
Q |
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| T |
1541310 |
gtcgagctgtgccaaagtcagacacactagcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctcaatgcactattggagcagtgcaatc |
1541409 |
T |
|
| Q |
226 |
atgatgaagatatgaaagagcaaatgcaactcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagag |
325 |
Q |
| |
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| T |
1541410 |
atgatgaagatatgaaagagcaaatgcaactcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagag |
1541509 |
T |
|
| Q |
326 |
aataagcttcctctctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctg |
425 |
Q |
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| T |
1541510 |
aataagcttcctctctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctg |
1541609 |
T |
|
| Q |
426 |
ataatattctcacttcatttctgaaactctcatcaaaagatggaacctcggcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacatggtaa |
525 |
Q |
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|
| T |
1541610 |
ataatattctcacttcatttctgaaactctcatcaaaagatggaacctcggcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaacctttccacatggtaa |
1541709 |
T |
|
| Q |
526 |
ttgtgccttgtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatctcatgtcgaagtcttctgttgctttgatgatgtcatcatatgctatcttccca |
625 |
Q |
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| T |
1541710 |
ttgtgccttgtaaacacttccatatgctccggttccaatgcaatatctcatgtcgaagtcttctgttgctttgatgatgtcatcatatgctatcttccca |
1541809 |
T |
|
| Q |
626 |
tcataattccatatacaaaacatatctccattctttgtttttgttgagtttccatgcaacttctcagaagaatcatgatgacgatttaaacatacgagaa |
725 |
Q |
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| T |
1541810 |
tcataattccatatacaaaacatatctccattctttgtttttgttgagtttccatgcaacttctcagaagaatcatgatgacgatttaaacatacgagaa |
1541909 |
T |
|
| Q |
726 |
gtaagaagactatgactagaataataagtatcggaataacaatgacaacaatgtgctttaatttattatttttcttgtgtggtgaccaaggctggaattg |
825 |
Q |
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| T |
1541910 |
gtaagaagactatgactagaataataagtatcggaataacaatgacaacaatgtgctttaatttattatttttcttgtgtggtgaccaaggctggaattg |
1542009 |
T |
|
| Q |
826 |
gttaaatggacatacatcatagttttcgctgtttgt |
861 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1542010 |
gttaaatggacatacatcatagttttcgctgtttgt |
1542045 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 660; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 844
Target Start/End: Original strand, 1557149 - 1557972
Alignment:
| Q |
26 |
caaaataagaaagaaagaatatcaaagattaat-----ttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattg |
120 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1557149 |
caaaataagaaagaaagaatatcaaagattaatataatttaccaggagcaatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattg |
1557248 |
T |
|
| Q |
121 |
aaggagtcgagcagtgccaaagtcagacacactagcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtg |
220 |
Q |
| |
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| T |
1557249 |
aaggagtcgagctgtgccaaagtcacaaacactagcctgccactcagagttaacaaatatattgctactagatacatctctatgcactattggagcattg |
1557348 |
T |
|
| Q |
221 |
caatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgcaactcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaaga |
320 |
Q |
| |
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||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
1557349 |
caatcatgatgaagataagatagagcaaatgcaactcctttaacagtgttaaccctttttctccaattgaattccacagcttccacatcatcatacaaga |
1557448 |
T |
|
| Q |
321 |
cagagaataagcttcctctctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttat |
420 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1557449 |
cagagaacaagcttcctttctccatgtattgatatatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcagaatccataaagcttcacgatatgtttgtgctttat |
1557548 |
T |
|
| Q |
421 |
ttctgataatattctcacttcatttctgaaactctcatcaaaagatggaacctcggcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacat |
520 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |
|
|
| T |
1557549 |
ttctgataatattctcacttcatttctgaaactctcatcaaaagatggaacctcagcttcatagccgtgaagtttctttaaagcaacaacattaccacat |
1557648 |
T |
|
| Q |
521 |
ggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatctcatgtcgaagtcttctgttgctttgatgatgtcatcatatgctatct |
620 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
1557649 |
ggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcttctgttgctttgatgatgtcatcatatgctattt |
1557748 |
T |
|
| Q |
621 |
tcccatcataattccatatacaaaacatatctccattctttgtttttgttgagtttccatgcaacttctcagaagaatcatgatgacgatttaaacatac |
720 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
1557749 |
tcccatcataattccatatacaaaacatatctccattctttgtttttgttgagtttccatgcaacttctcagaagaatgatgatgacgatttaaacatat |
1557848 |
T |
|
| Q |
721 |
gagaagtaagaagactatgactagaataataagtatcggaataacaatgacaacaatgtgctttaatttattatttttcttgtgtggtgaccaaggctgg |
820 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1557849 |
gagaagtaagaagactatgactagaataataaggatcggaagaacaatgacaacaatgtgctttaatttattatttttcttgtgtggtgaccaaggctgg |
1557948 |
T |
|
| Q |
821 |
aattggttaaatggacatacatca |
844 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
1557949 |
aatttgttaaatgaacatacatca |
1557972 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 604; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 45 - 844
Target Start/End: Complemental strand, 1596457 - 1595658
Alignment:
| Q |
45 |
tatcaaagattaatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagcagtgccaaagtc |
144 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
1596457 |
tatcaatgactaatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgatttgatgaatcatattgaaggagtcgggatgtgccaaagtc |
1596358 |
T |
|
| Q |
145 |
agacacactagcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaaga |
244 |
Q |
| |
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| | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1596357 |
acaaacactagcatgccattcagagtttagtaagatattgctactagatacatctctatgcactattggagtagtgcattcatgatgaagatatgaaaga |
1596258 |
T |
|
| Q |
245 |
gcaaatgcaactcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctcca |
344 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |
|
|
| T |
1596257 |
gcaaatgcaattcctttaacagtgttaacccttgttctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaacaggcttcctttctcca |
1596158 |
T |
|
| Q |
345 |
tgtattgatagatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatt |
444 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1596157 |
tgtactgatagatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcagaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatt |
1596058 |
T |
|
| Q |
445 |
tctgaaactctcatcaaaagatggaacctcggcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacatggtaattgtgccttgtaaacactt |
544 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
1596057 |
tttgaaactctcatcaaaagatggaacctcggcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaacctttccacttggtaattgtgccctgtaaacactt |
1595958 |
T |
|
| Q |
545 |
ccatatgctcctgttccaatgcaatatctcatgtcgaagtcttctgttgctttgatgatgtcatcatatgctatcttcccatcataattccatatacaaa |
644 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1595957 |
ccatatgctcccgttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcttctgttgctttgattatgtcatcatatgctatcttcccatcataattccatatacaaa |
1595858 |
T |
|
| Q |
645 |
acatatctccattctttgtttttgttgagtttccatgcaacttctcagaagaatcatgatgacgatttaaacatacgagaagtaagaagactatgactag |
744 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||| | || || ||| ||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1595857 |
acatatctccattctttgtttttgttatgtttccatgcaacttattagtagaattatgatgatgtttcaagtatatgagaagtgagaagactaggactag |
1595758 |
T |
|
| Q |
745 |
aataataagtatcggaataacaatgacaacaatgtgctttaatttattatttttcttgtgtggtgaccaaggctggaattggttaaatggacatacatca |
844 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
1595757 |
aataataaggatcggaagaacaatgacaacaatgtgctttaatttattatttttcttgtgtggtgaccaaggctggaatttgctaaatgaacatacatca |
1595658 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 596; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 1604776 - 1604001
Alignment:
| Q |
56 |
aatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagcagtgccaaagtcagacacactag |
155 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
1604776 |
aatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaattatattgaaggagtcgagctgtgccaaagtcacaaacactag |
1604677 |
T |
|
| Q |
156 |
cctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgcaac |
255 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1604676 |
cctgccactcatagtttagcaatatattgctactagatacatctctatgcatgattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgcaac |
1604577 |
T |
|
| Q |
256 |
tcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatag |
355 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1604576 |
tcctttaatagtgttaaccctttttctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaacaagcttcctttctccatgtattgatag |
1604477 |
T |
|
| Q |
356 |
atcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactct |
455 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1604476 |
atcaaaaacatgattcttttgtgcaagcagaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattttcacttcatttttgaaactct |
1604377 |
T |
|
| Q |
456 |
catcaaaagatggaacctcggcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacatggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcc |
555 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1604376 |
catcaaaagatggaacctcttcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcc |
1604277 |
T |
|
| Q |
556 |
tgttccaatgcaatatctcatgtcgaagtcttctgttgctttgatgatgtcatcatatgctatcttcccatcataattccatatacaaaacatatctcca |
655 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1604276 |
tgttccaatgcaatatctcatgtcgaagtcttccgttgctctaacgatgtcatcatatgctatcttcccatcataattccatatacaaaacatatctcca |
1604177 |
T |
|
| Q |
656 |
ttctttgtttttgttgagtttccatgcaacttctcagaagaatcatgatgacgatttaaacatacgagaagtaagaagactatgactagaataataagta |
755 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | | | ||| ||||||| |||| || |||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | |
|
|
| T |
1604176 |
ttctttgtttttgttgagtttccatccaacttgttacgaaaattatgatgaagattcaagcatatgagaagtgagaagactaggactagaagaataagga |
1604077 |
T |
|
| Q |
756 |
tcggaataacaatgacaacaatgtgctttaatttattatttttcttgtgtggtgaccaaggctggaattggttaaa |
831 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1604076 |
tcggaagaacaatgacaacaatgtgctttaattttttatttttcttgtgtattggccaaggatggaattggttaaa |
1604001 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 592; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 1106389 - 1105618
Alignment:
| Q |
56 |
aatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagcagtgccaaagtcagacacactag |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
1106389 |
aatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactattgttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagctgtgccaaagtcagcgacactgg |
1106290 |
T |
|
| Q |
156 |
cctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgcaac |
255 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1106289 |
cctgccactcagagtttagcaagatattgctactagatacatctctatgcacgattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgcaac |
1106190 |
T |
|
| Q |
256 |
tcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatag |
355 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1106189 |
tcctttaatagtgttaacccttgttctccaattgaattccacggcttctacatcatcatacaagatagagaacaggcttcctttctccatgtactgatag |
1106090 |
T |
|
| Q |
356 |
atcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactct |
455 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1106089 |
atcaaaaacatgattcttttgtgcaagcagaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttttgaaactct |
1105990 |
T |
|
| Q |
456 |
catcaaaagatggaacctcggcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacatggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcc |
555 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1105989 |
catcaaaagatggaacctcgacttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcc |
1105890 |
T |
|
| Q |
556 |
tgttccaatgcaatatctcatgtcgaagtcttctgttgctttgatgatgtcatcatatgctatcttcccatcataattccatatacaaaacatatctcca |
655 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1105889 |
agttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcttccgttgctttgattatgtcatcatatgctatcttcccatcataattccatatacaaaacatatctcca |
1105790 |
T |
|
| Q |
656 |
ttctttgtttttgttgagtttccatgcaacttctcagaagaatcatgatgacgatttaaacatacgagaagtaagaagactatgactagaataataagta |
755 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
1105789 |
ttctttgtttttgttaagtttgcatgcaacttcttagttgaattatgatgacgatacaagcatatgagaagtgagaagactaggactagaataataagga |
1105690 |
T |
|
| Q |
756 |
tcggaataacaatgacaacaatgtgctttaatttattatttttcttgtgtggtgaccaaggctggaattggt |
827 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
1105689 |
tcggaagaacaatgacaacaatatgctttaatttaatatttttcttgtgtgttggccaaggatggagttggt |
1105618 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 477; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 1089042 - 1088414
Alignment:
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54 |
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153 |
Q |
| |
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|
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| T |
1089042 |
ttaatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactattgttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagctgtgccaaagtccgcgacact |
1088943 |
T |
|
| Q |
154 |
agcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgca |
253 |
Q |
| |
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|
|
| T |
1088942 |
ggcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctcgatgcactattggagcggtgcaatcaggatgaagataagatagagcaaatgca |
1088843 |
T |
|
| Q |
254 |
actcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgat |
353 |
Q |
| |
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| T |
1088842 |
actcctttaacagtgttaaccctttttctccaattgaattccacagcttctacatcatcatacaagacagagaacaagcttcctttctccatgtattgat |
1088743 |
T |
|
| Q |
354 |
agatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaact |
453 |
Q |
| |
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|
|
| T |
1088742 |
agatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcagaatccataaagcttcacaatatgtttgtgctttatttctgataatattctcacttcatttttgaaact |
1088643 |
T |
|
| Q |
454 |
ctcatcaaaagatggaacctcggcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacatggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgct |
553 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
1088642 |
ctcatcaaaagatggaacctcggcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttctatatgct |
1088543 |
T |
|
| Q |
554 |
cctgttccaatgcaatatctcatgtcgaagtcttctgttgctttgatgatgtcatcatatgctatcttcccatcataattccatatacaaaacatatctc |
653 |
Q |
| |
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| T |
1088542 |
cctgttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcctctgttgctttaataatgtcatcgaatgctatttttccgtcataattccatacacaaaacatatcta |
1088443 |
T |
|
| Q |
654 |
cattctttgtttttgttgagtttccatgc |
682 |
Q |
| |
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| T |
1088442 |
cattctttgttgtcgttgtgttttcatgc |
1088414 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 453; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 671
Target Start/End: Original strand, 1550473 - 1551089
Alignment:
| Q |
55 |
taatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagcagtgccaaagtcagacacacta |
154 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
1550473 |
taatttaccgggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggaatcgagctgtgccaaagtcagagacacta |
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T |
|
| Q |
155 |
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254 |
Q |
| |
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|
|
| T |
1550573 |
gccttccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtacaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgcaa |
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T |
|
| Q |
255 |
ctcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgata |
354 |
Q |
| |
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| T |
1550673 |
ttcctttaacagtgctaatcctttttctccaattgaattccacagcttctacatcgtcatacaagacagtgaacaagcttcctctctccatgtactgata |
1550772 |
T |
|
| Q |
355 |
gatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactc |
454 |
Q |
| |
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| T |
1550773 |
gatcaaaaacatgattctcttgtgcaagcagaatccatgaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgtcaatattctcacttcatttctgaaactc |
1550872 |
T |
|
| Q |
455 |
tcatcaaaagatggaacctcggcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacatggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctc |
554 |
Q |
| |
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| T |
1550873 |
tcatcaaaagatggaacgtctgcttcatagccatgaagtttctttaaggcgacaaccttgccacatggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctc |
1550972 |
T |
|
| Q |
555 |
ctgttccaatgcaatatctcatgtcgaagtcttctgttgctttgatgatgtcatcatatgctatcttcccatcataattccatatacaaaacatatctcc |
654 |
Q |
| |
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| T |
1550973 |
cggttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcttctgttgctttaataatgtcatcaaatgctatttttccgtcatagttccatacacaaaacaaatcccc |
1551072 |
T |
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| Q |
655 |
attctttgtttttgttg |
671 |
Q |
| |
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| T |
1551073 |
atttgttgttgttgttg |
1551089 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 2321582 - 2320977
Alignment:
| Q |
56 |
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155 |
Q |
| |
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|
|
| T |
2321582 |
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T |
|
| Q |
156 |
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255 |
Q |
| |
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| T |
2321482 |
gatgccactcagagtttagcaagatattgctggtagatacatctctgtgcactattggaggggtacaatcatgatgaagatatgataggccaaaggcaac |
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T |
|
| Q |
256 |
tcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatag |
355 |
Q |
| |
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| T |
2321382 |
ccctttaacaacattaagcctttttctccaattgaattccatggcctctgcatcatcatacaagacggagaacaaacttcctctctccatgtaatggtag |
2321283 |
T |
|
| Q |
356 |
atcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactct |
455 |
Q |
| |
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|
| T |
2321282 |
atcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatttcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctaaaacttt |
2321183 |
T |
|
| Q |
456 |
catcaaaagatggaacctcggcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacatggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcc |
555 |
Q |
| |
|
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| T |
2321182 |
catcaaaagctggcagctctgcttcatagccgtgaagtttcttcaaggcaacaacttttccacatggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcc |
2321083 |
T |
|
| Q |
556 |
tgttccaatgcaatatctcatgtcgaagtcttctgttgctttgatgatgtcatcatatgctatcttcccatcataattccatatacaaaacatatctcca |
655 |
Q |
| |
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| T |
2321082 |
tgttccaatgcaatatctaatgtcaaaatcttccgttgctctaatgatgtcatcatatgctatttgtccatcgtaattccatatagaaaagaaatcccca |
2320983 |
T |
|
| Q |
656 |
ttcttt |
661 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
2320982 |
ttcttt |
2320977 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 2330080 - 2329472
Alignment:
| Q |
56 |
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155 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
2330080 |
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2329981 |
T |
|
| Q |
156 |
cctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgcaac |
255 |
Q |
| |
|
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|
| T |
2329980 |
gcttccactcagagtttagcaagatattgcccgtagatacatctctatgcacaatggcaggggtgcaatcatgatgaagatatgatagaccaaatgcaac |
2329881 |
T |
|
| Q |
256 |
tcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatag |
355 |
Q |
| |
|
||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||| |
|
|
| T |
2329880 |
acctttaataacattaaccctttttctccaattgaattccacggcttcaccttcatcatacaagacagagaacaagctacctttctccatgtactcgtag |
2329781 |
T |
|
| Q |
356 |
atcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactct |
455 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
2329780 |
atcaaaaacatgattcttctgtggagacagaatccataaagcttcacgatatgccggtgctttatatctgataatattctcacttcatttctgaaactct |
2329681 |
T |
|
| Q |
456 |
catcaaaagatggaacctcggcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacatggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcc |
555 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
2329680 |
catcaaaagatggaacctctgcttcatagccgtgaagtttctttattgcaacaacttttccacatggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcc |
2329581 |
T |
|
| Q |
556 |
tgttccaatgcaatatctcatgtcgaagtcttctgttgctttgatgatgtcatcatatgctatcttcccatcataattccatatacaaaacatatctcca |
655 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |
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|
| T |
2329580 |
tgttccaatacaatatctaatgtcaaagtcttctgttgctttaatgatgtcatcgtgtgctatttttccatcaaaattccatatacaaaacaaatcccca |
2329481 |
T |
|
| Q |
656 |
ttctttgtt |
664 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
2329480 |
ttctttgtt |
2329472 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 56 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 2337979 - 2337371
Alignment:
| Q |
56 |
aatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagcagtgccaaagtcagacacactag |
155 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
2337979 |
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2337880 |
T |
|
| Q |
156 |
cctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgcaac |
255 |
Q |
| |
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|
|
| T |
2337879 |
gcttccactccgagtttagcaagatattgccagtagatacatctctatgcacaatggcaggggtgcaatcatgatgaagatatgatagaccaaatgcaac |
2337780 |
T |
|
| Q |
256 |
tcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatag |
355 |
Q |
| |
|
||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||| |
|
|
| T |
2337779 |
acctttaataacattaaccctttttctccaattgaattccacggcttcaacttcatcatacaagccagagaacaagctacctttctccatgtactcgtag |
2337680 |
T |
|
| Q |
356 |
atcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactct |
455 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
2337679 |
atcaaaaacatgattcttctgtggagacagaatccataaagcttcacgatatgtcggtgctttatatctgataatattttcacttcatttctgaaactct |
2337580 |
T |
|
| Q |
456 |
catcaaaagatggaacctcggcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacatggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcc |
555 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
2337579 |
catcaaaagatggaacctctgcttcatagccgtgaagtttctttattgcaacaacttttccacatggtaattgtgccttataaacacttccatatgctcc |
2337480 |
T |
|
| Q |
556 |
tgttccaatgcaatatctcatgtcgaagtcttctgttgctttgatgatgtcatcatatgctatcttcccatcataattccatatacaaaacatatctcca |
655 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| | |||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |
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| T |
2337479 |
tgtcccaatgcaatatctaatgtcaaagtcttctgttgctttaataatgtcatcgtgtgctatttttccatcaaaattccatatacaaaacaaatcccca |
2337380 |
T |
|
| Q |
656 |
ttctttgtt |
664 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
2337379 |
ttctttgtt |
2337371 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 55 - 645
Target Start/End: Original strand, 3955231 - 3955821
Alignment:
| Q |
55 |
taatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagcagtgccaaagtcagacacacta |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
3955231 |
taatttaccaggagctatatatccaatagttccaccaactattgtttgattagatgaatcatattgaaggagtcgagctatgccaaagtcagaaacacta |
3955330 |
T |
|
| Q |
155 |
gcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgcaa |
254 |
Q |
| |
|
| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
3955331 |
ggctgccattctgagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagaggtgaaatcatgatgaagatatgatagagcagatgcaa |
3955430 |
T |
|
| Q |
255 |
ctcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgata |
354 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||| | ||||| || ||||| |
|
|
| T |
3955431 |
ctcctttaatggtgttaacccttttcctccaatcgaattttatggcttcgacatcatcatgcaagacggagaacaagcttcctttttccatatactgata |
3955530 |
T |
|
| Q |
355 |
gatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactc |
454 |
Q |
| |
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|
| T |
3955531 |
gatcaaaaacataactcttttatgcaaacaaaatccataaagcttcacaatatttctgtgctttatttctgataatattttcacttcatttctaaaactt |
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T |
|
| Q |
455 |
tcatcaaaagatggaacctcggcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacatggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctc |
554 |
Q |
| |
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| T |
3955631 |
tcatcaagagatggcacctctgcttcgtagctatgaagtttttttagtgcaacaaatttaccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctc |
3955730 |
T |
|
| Q |
555 |
ctgttccaatgcaatatctcatgtcgaagtcttctgttgctttgatgatgtcatcatatgctatcttcccatcataattccatatacaaaa |
645 |
Q |
| |
|
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| T |
3955731 |
cttttccaatgcaatatttaatgtcaaagtcttttgttgctctaatgatgtcattgtatgctattttgccatcataattccatatacaaaa |
3955821 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 275 - 647
Target Start/End: Original strand, 9532045 - 9532415
Alignment:
| Q |
275 |
cttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttt |
374 |
Q |
| |
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|
| T |
9532045 |
ctttttctccaattgaattccacaacttctacatcatcatacaaaaacgagaacaaacttcctttctc-acgtattgatagatcaaaaacatgattcttt |
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T |
|
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375 |
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| |
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| T |
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tgtacaatcataatccataaagcttaacaatatttatgtgatttattttttataatattctcgcttcatttttgaaactcgcatcaaaagatggcacctc |
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|
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ggcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacatggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatctc |
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Q |
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| T |
9532244 |
tgcttcatagatgtgaagtttctttaaggcgacaactttgtcacatggtaattgagtcttgtatacacttccatatgctcctgtccatatgcaatatcta |
9532343 |
T |
|
| Q |
575 |
atgtcgaagtcttctgttgctttgatgatgtcatcatatgctatcttcccatcataattccatatacaaaaca |
647 |
Q |
| |
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||||| |||| || | ||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |
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| T |
9532344 |
atgtcaaagtgttgtattgctttaataatgtcaaaatatgctat-ttcccatcataatttcatatgcaaaaca |
9532415 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 55 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 3852893 - 3852663
Alignment:
| Q |
55 |
taatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagcagtgccaaagtcagacacacta |
154 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |
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|
| T |
3852893 |
taatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactattgttcgattggatgaatcacattgaaggagtcgagctataccaaagtcagaaacacta |
3852794 |
T |
|
| Q |
155 |
gcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgcaa |
254 |
Q |
| |
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| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |
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| T |
3852793 |
ggctgccattccgagtttagaaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggaaaggtgaaatcatgatgaagatatgatagagcagatgcaa |
3852694 |
T |
|
| Q |
255 |
ctcctttaacagtgttgacccttttcctcca |
285 |
Q |
| |
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| T |
3852693 |
ctcctttaacaatgttaatcctttttctcca |
3852663 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 275 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 30792477 - 30792133
Alignment:
| Q |
275 |
cttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttt |
374 |
Q |
| |
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||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |
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|
| T |
30792477 |
ctttttctccaattgaatttcacaacttctacatcatcatacaaaacaaagaactagcttcttttctctacgtattgatagatcaaaaacacgattcttt |
30792378 |
T |
|
| Q |
375 |
t-gtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactctcatcaaaagatggaacct |
473 |
Q |
| |
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| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| || | |
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| T |
30792377 |
ttgtgcaagcagaatctataaagcttaacaatatttatgtgctttatttatgataatattctcacttcatttatgaaacttgtaacaaaagatgacacat |
30792278 |
T |
|
| Q |
474 |
cggcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacatggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatct |
573 |
Q |
| |
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| T |
30792277 |
ttgtttcatagttgtgaagtttctataaggcaacaactttgccacatgataaatgagtcttgtatacactttcatgtcctcatgtctcgatgtaatatct |
30792178 |
T |
|
| Q |
574 |
catgtcgaagtcttctgttgctttgatgatgtcatcatatgctat |
618 |
Q |
| |
|
||||| |||| || ||||||||| || |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
30792177 |
aatgtcaaagtgttatgttgctttaataatgtcaacatatgctat |
30792133 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 659; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 659; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 853
Target Start/End: Original strand, 18723263 - 18724081
Alignment:
| Q |
35 |
aaagaaagaatatcaaagattaatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagcag |
134 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18723263 |
aaagaaaaaatatcaatggttaatttacccggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagctg |
18723362 |
T |
|
| Q |
135 |
tgccaaagtcagacacactagcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaag |
234 |
Q |
| |
|
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|
| T |
18723363 |
tgccgaagtcacaaacactggcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctcgatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaag |
18723462 |
T |
|
| Q |
235 |
atatgaaagagcaaatgcaactcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagctt |
334 |
Q |
| |
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|
|
| T |
18723463 |
atatgaaagagcaaatgcaactcctttaatagtgttaactctttttctccacttgaatttcatggcttctacatcatcatacaagacagagaataagctt |
18723562 |
T |
|
| Q |
335 |
cctctctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattc |
434 |
Q |
| |
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| T |
18723563 |
cctctatccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcagaatccataaagcttcactatatgtttgtgctttatttctgttaaaattc |
18723662 |
T |
|
| Q |
435 |
tcacttcatttctgaaactctcatcaaaagatggaacctcggcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacatggtaattgtgcctt |
534 |
Q |
| |
|
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|
| T |
18723663 |
tcacttcatttctgaaactctcatcaaaagatggaacctctgcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgcctt |
18723762 |
T |
|
| Q |
535 |
gtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatctcatgtcgaagtcttctgttgctttgatgatgtcatcatatgctatcttcccatcataattc |
634 |
Q |
| |
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| T |
18723763 |
gtaaacacttccatatgctcctgttccaatacaatatctcatgtcaaagtcttctgtcgctttgattatgtcatcatatgctatcattccatcataattc |
18723862 |
T |
|
| Q |
635 |
catatacaaaacatatctccattctttgtttttgttgagtttccatgcaacttctcagaagaatcatgatgacgatttaaacatacgagaagtaagaaga |
734 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18723863 |
catatacaaaacatatctccattctttgtttttgttgagtttccatgcaacttcttagaagaattatgatgaagatttaaacatatgagaagtaagaaga |
18723962 |
T |
|
| Q |
735 |
ctatgactagaataataagtatcggaataacaatgacaacaatgtgctttaatttattatttttcttgtgtggtgaccaaggctggaattggttaaatgg |
834 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18723963 |
ctatgactagaataataagtatcggaataacaatgacaacaatgtgctttaatttattatttttcttgtgtggtgaccaaggttggaactggttaaatga |
18724062 |
T |
|
| Q |
835 |
acatacatcatagttttcg |
853 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||| |
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| T |
18724063 |
acatacatcagaattttcg |
18724081 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 650; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 844
Target Start/End: Original strand, 18748915 - 18749724
Alignment:
| Q |
35 |
aaagaaagaatatcaaagattaatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagcag |
134 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
18748915 |
aaagaaaaaatatcaatggttaatttacccggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagctg |
18749014 |
T |
|
| Q |
135 |
tgccaaagtcagacacactagcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaag |
234 |
Q |
| |
|
|||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18749015 |
tgccgaagtcacaaacactggcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctcgatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaag |
18749114 |
T |
|
| Q |
235 |
atatgaaagagcaaatgcaactcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagctt |
334 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18749115 |
atatgaaagagcaaatgcaactcctttaatagtgttaactctttttctccacttgaattccatggcttctacatcatcatacaagacagagaataagctt |
18749214 |
T |
|
| Q |
335 |
cctctctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattc |
434 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
18749215 |
cctctatccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcagaatccataaagcttcacaatatgtttgtgctttatttctgttaaaattc |
18749314 |
T |
|
| Q |
435 |
tcacttcatttctgaaactctcatcaaaagatggaacctcggcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacatggtaattgtgcctt |
534 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18749315 |
tcacttcatttctgaaactctcatcaaaagatggaacctctgcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgcctt |
18749414 |
T |
|
| Q |
535 |
gtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatctcatgtcgaagtcttctgttgctttgatgatgtcatcatatgctatcttcccatcataattc |
634 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18749415 |
gtaaacacttccatatgctcctgttccaatacaatatctcatgtcaaagtcttctgtcgctttgattatgtcatcatatgctatcattccatcataattc |
18749514 |
T |
|
| Q |
635 |
catatacaaaacatatctccattctttgtttttgttgagtttccatgcaacttctcagaagaatcatgatgacgatttaaacatacgagaagtaagaaga |
734 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18749515 |
catatacaaaacatatctccattctttatttttgttgagtttccatgcaacttcttagaagaattatgatgaagattaaaacatatgagaagtaagaaga |
18749614 |
T |
|
| Q |
735 |
ctatgactagaataataagtatcggaataacaatgacaacaatgtgctttaatttattatttttcttgtgtggtgaccaaggctggaattggttaaatgg |
834 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18749615 |
ctatgactagaataataagcatcggaataacaatgacaacaatgtgctttaatttattatttttcttgtgtggtgaccaaggttggaactggttaaatga |
18749714 |
T |
|
| Q |
835 |
acatacatca |
844 |
Q |
| |
|
||||| |||| |
|
|
| T |
18749715 |
acatatatca |
18749724 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 593; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 827
Target Start/End: Original strand, 18738990 - 18739782
Alignment:
| Q |
35 |
aaagaaagaatatcaaagattaatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagcag |
134 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18738990 |
aaagaaaaaatagcaatggttaatttacctggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagccgagcta |
18739089 |
T |
|
| Q |
135 |
tgccaaagtcagacacactagcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaag |
234 |
Q |
| |
|
|||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18739090 |
tgccgaagtcacaaacactggcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctcgatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaag |
18739189 |
T |
|
| Q |
235 |
atatgaaagagcaaatgcaactcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagctt |
334 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
18739190 |
atatgaaaaagcaaatgcaactcctttaatagtgttaacccttttcctccacttgaattccacgacttttacatcatcatacaagacagagaacaagctt |
18739289 |
T |
|
| Q |
335 |
cctctctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattc |
434 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18739290 |
cctttctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcagaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattc |
18739389 |
T |
|
| Q |
435 |
tcacttcatttctgaaactctcatcaaaagatggaacctcggcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacatggtaattgtgcctt |
534 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18739390 |
tcacttcatttctgaaactatcatcaaaagatggaacctctgcttcatagcggtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgcctt |
18739489 |
T |
|
| Q |
535 |
gtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatctcatgtcgaagtcttctgttgctttgatgatgtcatcatatgctatcttcccatcataattc |
634 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18739490 |
gtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcttctgttgctttgatgatgtcatcatatgctatcttcccatcaaaattc |
18739589 |
T |
|
| Q |
635 |
catatacaaaacatatctccattctttgtttttgttgagtttccatgcaacttctcagaagaatcatgatgacgatttaaacatacgagaagtaagaaga |
734 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| || ||||| ||||||||||| || |||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
18739590 |
catatacaaaacatatctccattctttgtttttgttgagtttccttgcgatttcttagtagaattatgatgacgatacaagcatatgagaagtgagaaga |
18739689 |
T |
|
| Q |
735 |
ctatgactagaataataagtatcggaataacaatgacaacaatgtgctttaatttattatttttcttgtgtggtgaccaaggctggaattggt |
827 |
Q |
| |
|
||| || |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18739690 |
ctaggattagagcaataaggatcggaagaacaatgatgacaatgtgctttaattttttatttttcttgtgtgttggccaaggatggaattggt |
18739782 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 593; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 827
Target Start/End: Original strand, 18743954 - 18744746
Alignment:
| Q |
35 |
aaagaaagaatatcaaagattaatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagcag |
134 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18743954 |
aaagaaaaaatagcaatggttaatttacctggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagccgagcta |
18744053 |
T |
|
| Q |
135 |
tgccaaagtcagacacactagcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaag |
234 |
Q |
| |
|
|||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
18744054 |
tgccgaagtcacaaacactggcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctcgatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaag |
18744153 |
T |
|
| Q |
235 |
atatgaaagagcaaatgcaactcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagctt |
334 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |
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| T |
18744154 |
atatgaaaaagcaaatgcaactcctttaatagtgttaacccttttcctccacttgaattccacgacttttacatcatcatacaagacagagaacaagctt |
18744253 |
T |
|
| Q |
335 |
cctctctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattc |
434 |
Q |
| |
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| T |
18744254 |
cctttctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcagaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattc |
18744353 |
T |
|
| Q |
435 |
tcacttcatttctgaaactctcatcaaaagatggaacctcggcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacatggtaattgtgcctt |
534 |
Q |
| |
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| T |
18744354 |
tcacttcatttctgaaactatcatcaaaagatggaacctctgcttcatagcggtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgcctt |
18744453 |
T |
|
| Q |
535 |
gtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatctcatgtcgaagtcttctgttgctttgatgatgtcatcatatgctatcttcccatcataattc |
634 |
Q |
| |
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| T |
18744454 |
gtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcttctgttgctttgatgatgtcatcatatgctatcttcccatcaaaattc |
18744553 |
T |
|
| Q |
635 |
catatacaaaacatatctccattctttgtttttgttgagtttccatgcaacttctcagaagaatcatgatgacgatttaaacatacgagaagtaagaaga |
734 |
Q |
| |
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| T |
18744554 |
catatacaaaacatatctccattctttgtttttgttgagtttccttgcgatttcttagtagaattatgatgacgatacaagcatatgagaagtgagaaga |
18744653 |
T |
|
| Q |
735 |
ctatgactagaataataagtatcggaataacaatgacaacaatgtgctttaatttattatttttcttgtgtggtgaccaaggctggaattggt |
827 |
Q |
| |
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| T |
18744654 |
ctaggattagagcaataaggatcggaagaacaatgatgacaatgtgctttaattttttatttttcttgtgtgttggccaaggatggaattggt |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 464
Target Start/End: Original strand, 18732996 - 18733045
Alignment:
| Q |
415 |
ctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactctcatcaaaag |
464 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
18732996 |
ctttatttctgataatattctcacttcatttctaaaactctaatcaaaag |
18733045 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0491 (Bit Score: 655; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:
Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 655; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 853
Target Start/End: Original strand, 5756 - 6574
Alignment:
| Q |
35 |
aaagaaagaatatcaaagattaatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagcag |
134 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
5756 |
aaagaaaaaatatcaatggttaatttacccggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagctg |
5855 |
T |
|
| Q |
135 |
tgccaaagtcagacacactagcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaag |
234 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
5856 |
tgccgaagtcacaaacactggcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctcgatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaag |
5955 |
T |
|
| Q |
235 |
atatgaaagagcaaatgcaactcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagctt |
334 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
5956 |
atatgaaagagcaaatgcaactcctttaatagtgttaactctttttctccacttgaattgcagggcttctacatcatcatacaagacagagaataagctt |
6055 |
T |
|
| Q |
335 |
cctctctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattc |
434 |
Q |
| |
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||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
6056 |
cctctatccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcagaaaccataaagcttcacgatatgtttgtgctttatttctgttaaaattc |
6155 |
T |
|
| Q |
435 |
tcacttcatttctgaaactctcatcaaaagatggaacctcggcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacatggtaattgtgcctt |
534 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
6156 |
tcacttcatttctgaaactctcatcaaaagatggaacctctgcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgcctt |
6255 |
T |
|
| Q |
535 |
gtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatctcatgtcgaagtcttctgttgctttgatgatgtcatcatatgctatcttcccatcataattc |
634 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
6256 |
gtaaacacttccatatgctcctgttccaatacaatatctcatgtcaaagtcttctgtcgctttgattatgtcatcatatgctatcattccatcataattc |
6355 |
T |
|
| Q |
635 |
catatacaaaacatatctccattctttgtttttgttgagtttccatgcaacttctcagaagaatcatgatgacgatttaaacatacgagaagtaagaaga |
734 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
6356 |
catatacaaaacatatctccattctttgtttttgttgagtttccatgcaacttcttagaagaattatgatgaagatttaaacatatgagaagtaagaaga |
6455 |
T |
|
| Q |
735 |
ctatgactagaataataagtatcggaataacaatgacaacaatgtgctttaatttattatttttcttgtgtggtgaccaaggctggaattggttaaatgg |
834 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6456 |
ctatgactagaataataagtatcggaataacaatgacaacaatgtgctttaatttattatttttcttgtgtggtgaccaaggttggaactggttaaatga |
6555 |
T |
|
| Q |
835 |
acatacatcatagttttcg |
853 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
6556 |
acatacatcagaattttcg |
6574 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 590; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 54 - 827
Target Start/End: Original strand, 888 - 1661
Alignment:
| Q |
54 |
ttaatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagcagtgccaaagtcagacacact |
153 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| | ||||| |
|
|
| T |
888 |
ttaatttacctggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagccgagctatgccgaagtcacaaacact |
987 |
T |
|
| Q |
154 |
agcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgca |
253 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
988 |
ggcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctcgatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaaaagcaaatgca |
1087 |
T |
|
| Q |
254 |
actcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgat |
353 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
1088 |
actcctttaatagtgttaacccttttcctccacttgaattccacgacttttacatcatcatacaagacagagaacaagcttcctttctccatgtattgat |
1187 |
T |
|
| Q |
354 |
agatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaact |
453 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
1188 |
agatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcagaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaact |
1287 |
T |
|
| Q |
454 |
ctcatcaaaagatggaacctcggcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacatggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgct |
553 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1288 |
atcatcaaaagatggaacctctgcttcatagcggtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgct |
1387 |
T |
|
| Q |
554 |
cctgttccaatgcaatatctcatgtcgaagtcttctgttgctttgatgatgtcatcatatgctatcttcccatcataattccatatacaaaacatatctc |
653 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
1388 |
cctgttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcttctgttgctttgatgatgtcatcatatgctatcttcccatcaaaattccatatacaaaacatatctc |
1487 |
T |
|
| Q |
654 |
cattctttgtttttgttgagtttccatgcaacttctcagaagaatcatgatgacgatttaaacatacgagaagtaagaagactatgactagaataataag |
753 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
1488 |
cattctttgtttttgttgagtttccttgcgatttcttagtagaattatgatgacgatacaagcatatgagaagtgagaagactaggattagagcaataag |
1587 |
T |
|
| Q |
754 |
tatcggaataacaatgacaacaatgtgctttaatttattatttttcttgtgtggtgaccaaggctggaattggt |
827 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
1588 |
gatcggaagaacaatgatgacaatgtgctttaattttttatttttcttgtgtgttggccaaggatggaattggt |
1661 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 146; Significance: 2e-76; HSPs: 2)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 275 - 632
Target Start/End: Complemental strand, 19250577 - 19250221
Alignment:
| Q |
275 |
cttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttt |
374 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19250577 |
ctttttctccaattgaattccacaacttctacatcatcatacaaaaccgagaacaagcttcatttttc-atgtattgatagatcaaaaacatgattcttt |
19250479 |
T |
|
| Q |
375 |
tgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactctcatcaaaagatggaacctc |
474 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || || || |
|
|
| T |
19250478 |
tgtgcaagcagaatccataaagcttaacaatatttatgtgttttatatatgataatattctcacttcaattctgaaactcgcatcaaaagacggcacatc |
19250379 |
T |
|
| Q |
475 |
ggcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacatggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatctc |
574 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
19250378 |
tacttcatagttgtgaaatttctttaaagcgacaactttaccacatggtaatcgagtcttgtatacactttcatatgatcctgtcatgatgcaatatcta |
19250279 |
T |
|
| Q |
575 |
atgtcgaagtcttctgttgctttgatgatgtcatcatatgctatcttcccatcataat |
632 |
Q |
| |
|
||||| |||| || ||||||||| || |||||| |||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
19250278 |
atgtcaaagtgttgtgttgctttaataatgtcaacatatgctatttttccatcataat |
19250221 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 287 - 584
Target Start/End: Original strand, 41668796 - 41669093
Alignment:
| Q |
287 |
ttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaa |
386 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||| || ||| || | | ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41668796 |
ttgaattccacagcttctaaatcctcatacaaaactgagaacaaactttcttttttcatgtatcgatagattaaaaacattattcttttgtgcaagcaaa |
41668895 |
T |
|
| Q |
387 |
atccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactctcatcaaaagatggaacctcggcttcatagcc |
486 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| | |||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||| |
|
|
| T |
41668896 |
atccataaagcttaacaatatttatctgctttattttttataatattttcacttcaattctgaaactcacatcaaaagatgacacatctgcttcatagtt |
41668995 |
T |
|
| Q |
487 |
gtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacatggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatctcatgtcgaagt |
584 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
41668996 |
gtgaagtttctttaaggtggcaaatttgccacatgataattgagtcttgtatacacttccatatgcttatgtcacgatgcaatatctaatgtcaaagt |
41669093 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 127; Significance: 4e-65; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 287 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 36620768 - 36620425
Alignment:
| Q |
287 |
ttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaa |
386 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||| || ||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36620768 |
ttgaattccacagcttctaaatcctcatacaaaaccgagaacaaactttctcttttcatgtattgatagattaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaa |
36620669 |
T |
|
| Q |
387 |
atccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactctcatcaaaagatggaacctcggcttcatagcc |
486 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || || |||| |||| |
|
|
| T |
36620668 |
atccataaagcttaacaatatttatctgctttatttttgataatattctcacttcaattctgaaactcgcatcaaaagat---acatctgcttaatagtt |
36620572 |
T |
|
| Q |
487 |
gtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacatggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatctcatgtcgaagtct |
586 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||| | ||||||||||||| ||| | |||| |||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
36620571 |
gtgaagtttctttaaggtggcaaatttgccacatgataattgagtcttgtataaacttccatatgcttatgtcacgatgc-atatctaatgtcaaag--- |
36620476 |
T |
|
| Q |
587 |
tctgttgctttgatgatgtcatcatatgctatcttcccatcataattccatat |
639 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36620475 |
--tgttgctttaataatgtcatcatatgttatttttccatcataattccatat |
36620425 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 287 - 639
Target Start/End: Original strand, 8873042 - 8873390
Alignment:
| Q |
287 |
ttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaa |
386 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||| |||||||| | ||||| || ||| || | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8873042 |
ttgaattccacatcttctaaatcctcatacaaaatcgagaacaaactttcttttttcatgtattgatagattaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaa |
8873141 |
T |
|
| Q |
387 |
a-tccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactctcatcaaaagatggaacctcggcttcatagc |
485 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| | ||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| || || ||||||||| |
|
|
| T |
8873142 |
aatccataaagcttaataatatttatctgctttattttttataatattctcacttcaattctgaaactggcatcaaacgatgacacatctgcttcatagt |
8873241 |
T |
|
| Q |
486 |
cgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacatggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatctcatgtcgaagtc |
585 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
8873242 |
tgtgaagtttctttaaggtcgcaaatttgccacatgataattgagtcttgtatacacttccatatgcttatgtcacgatgcaatatctaatgtcaaag-- |
8873339 |
T |
|
| Q |
586 |
ttctgttgctttgatgatgtcatcatatgctatcttcccatcataattccatat |
639 |
Q |
| |
|
||||||||| || ||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8873340 |
---tgttgctttaataatgtcatcatatgttatttttccatcataatttcatat |
8873390 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 287 - 639
Target Start/End: Original strand, 39102236 - 39102581
Alignment:
| Q |
287 |
ttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaa |
386 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||| |||||||| || ||||| || ||| |||| | |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39102236 |
ttgaattccacaacttctaaatcctcatacaaaaccgagaacaaactttctcttttcatgtattgatatattaaaaacatgcttcttttgtgcaagcaaa |
39102335 |
T |
|
| Q |
387 |
atccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactctcatcaaaagatggaacctcggcttcatagcc |
486 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| || || |||| |||| |
|
|
| T |
39102336 |
atccataaagcttaacaatatttatctgctttatttttgataatattctcacttcaattctaaaactcgcatcaaaagatgacacatctgcttaatagtt |
39102435 |
T |
|
| Q |
487 |
gtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacatggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatctcatgtcgaagtct |
586 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||| | ||||||||||||| ||| | |||| |||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
39102436 |
gtgaag-ttctttaaggaggcaaatttgccacatgataattgagtcttgtataaacttccatatgcttatgtcacgatgc-atatctaatgtcaaag--- |
39102530 |
T |
|
| Q |
587 |
tctgttgctttgatgatgtcatcatatgctatcttcccatcataattccatat |
639 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
39102531 |
--tgttgctttaataatgtcatcatatgttatttttccatcataattccatat |
39102581 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 126; Significance: 2e-64; HSPs: 4)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 290 - 639
Target Start/End: Original strand, 42977725 - 42978069
Alignment:
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290 |
aattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatc |
389 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||| || ||| || | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42977725 |
aattccacagcttctaaatcctcatacaaaaccgagaacaaactttcttttttcatgtattgatagattaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatc |
42977824 |
T |
|
| Q |
390 |
cataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactctcatcaaaagatggaacctcggcttcatagccgtg |
489 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| || || ||||||||| ||| |
|
|
| T |
42977825 |
cataaagcttaacaatatttatctgctttatttttgataatattctcacttcaattctgaaattcgcatcaaaagatgacacatctgcttcatagttgtg |
42977924 |
T |
|
| Q |
490 |
aagtttctttaaggcaacaaccttgccacatggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatctcatgtcgaagtcttct |
589 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
42977925 |
aagtttctttaaggtggcaaatttgccacatgataattgagtcttgtatacacttccatatgcttatgtcacgatgcaatatctaatgtcaaagt----- |
42978019 |
T |
|
| Q |
590 |
gttgctttgatgatgtcatcatatgctatcttcccatcataattccatat |
639 |
Q |
| |
|
|||||||| || | |||||||||| ||| || |||||||||||||||| |
|
|
| T |
42978020 |
gttgctttaataacatcatcatatgttatttttacatcataattccatat |
42978069 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 275 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 54123093 - 54122734
Alignment:
| Q |
275 |
cttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttt |
374 |
Q |
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| T |
54123093 |
cttttcctgcaattgaattccacatcttctaaatccgcatacaaaactgagaacaaactttcttttttcatgtattgatagattaaaaacatgattcttt |
54122994 |
T |
|
| Q |
375 |
tgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactctcatcaaaagatggaacctc |
474 |
Q |
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| T |
54122993 |
tgtgcaagcaaaatatataaagcttaaagatatttatctgctttattttttataatattctcacttcaattgtgaaactcacatcaaaagatgacacatc |
54122894 |
T |
|
| Q |
475 |
ggcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacatggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatctc |
574 |
Q |
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| T |
54122893 |
tgcttcatagttgtgaagtttctttaaggtggcaaatttgccacatgataattgagtcttgtatacacttccatatgcttatgtcacgatgcaatatcta |
54122794 |
T |
|
| Q |
575 |
atgtcgaagtcttctgttgctttgatgatgtcatcatatgctatcttcccatcataattccatat |
639 |
Q |
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| T |
54122793 |
atgtcaaag-----tgttgctttaataatgtcatcatatgttatttttccatcataattccatat |
54122734 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 287 - 639
Target Start/End: Original strand, 48712381 - 48712727
Alignment:
| Q |
287 |
ttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaa |
386 |
Q |
| |
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| T |
48712381 |
ttgaattccacaacttctaaatcctcatacaaaatcgagaacaaactttcttttttcatgtattgatagattgaaaatatgattcttttgtgcaagcaaa |
48712480 |
T |
|
| Q |
387 |
atccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactctcatcaaaagatggaacctcggcttcatagcc |
486 |
Q |
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| T |
48712481 |
atccataaagcttaacaatatttatctg-tttatttttgataatattctcacttcaattctgaaaatcgcatcaaaagaagacacatctgcttaatagtt |
48712579 |
T |
|
| Q |
487 |
gtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacatggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatctcatgtcgaagtct |
586 |
Q |
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| T |
48712580 |
gtgaagtttctttaaggtggcaaatttgccacatgataattgagtcttgtatacacttccatatgcttatgtcacgatgcaatatctaatgtcaaag--- |
48712676 |
T |
|
| Q |
587 |
tctgttgctttgatgatgtcatcatatgctatcttcccatcataattccatat |
639 |
Q |
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| T |
48712677 |
--tgttgctttaataaagtcatcatatgttatttttccatcataattccatat |
48712727 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 412 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 16880331 - 16880078
Alignment:
| Q |
412 |
gtgctttatttctgataatattctcac-ttcatttctgaaactctcatcaaaagatggaacctcggcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaac |
510 |
Q |
| |
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| T |
16880331 |
gtgctttatttctgataatattctcacattcatttctgaaactcgcatcaaaagatgacacttttacttcatagttgtgaaatttctttaaggcggcaac |
16880232 |
T |
|
| Q |
511 |
cttgccacatggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatctcatgtcgaagtcttctgttgctttgatgatgtcatca |
610 |
Q |
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| T |
16880231 |
tttgcaagatggtaatcgagtcttgtatacacttccatatgctcttgtgccgatgcaatatctaatgtcaaagtgttgtgtttctttaataatgtccaca |
16880132 |
T |
|
| Q |
611 |
tatgctatcttcccatcataattccatatacaaaacatatctccattctttgtt |
664 |
Q |
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| T |
16880131 |
tatgctatttttccatcataattccatatgcaaaacaaattcccattctttgtt |
16880078 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 290 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 31658177 - 31657833
Alignment:
| Q |
290 |
aattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatc |
389 |
Q |
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| T |
31658177 |
aattctacagcttctaaatcctcatataaaaccgagaacaaactttcttttttcatgtattgatagattaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatc |
31658078 |
T |
|
| Q |
390 |
cataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactctcatcaaaagatggaacctcggcttcatagccgtg |
489 |
Q |
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| T |
31658077 |
cataaagcttaacaatatttatctgctttatttttgataatattctcacttcaattctgaaattcgcatcaaaagatgacacatctatttcgtagttgtg |
31657978 |
T |
|
| Q |
490 |
aagtttctttaaggcaacaaccttgccacatggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatctcatgtcgaagtcttct |
589 |
Q |
| |
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| T |
31657977 |
aagtttctttaaggtgacaaatttgccacatgataattgagtcttgtatacacttccatgtgcttatgtcacgatgcaatatctaatgtcaaag-----t |
31657883 |
T |
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| Q |
590 |
gttgctttgatgatgtcatcatatgctatcttcccatcataattccatat |
639 |
Q |
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| T |
31657882 |
gttgctttaataacgtcatcatatgttatttttccatcataattccatat |
31657833 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 113; Significance: 9e-57; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 287 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 1257974 - 1257627
Alignment:
| Q |
287 |
ttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaa |
386 |
Q |
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| T |
1257974 |
ttgaattcctcagcttctaaatcctcatacaaaaccgagaacaaactttcttttttcatgtattgatagattaaaaacatgattcttttgtgcaaacaaa |
1257875 |
T |
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| Q |
387 |
atccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactctcatcaaaagatggaacctcggcttcatagcc |
486 |
Q |
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| T |
1257874 |
attcataaagtttaacaatatttatctgctttatttttgataatattctcacttcaattctgaaactcgcatcaaaaaatgacacatctgcttcatattt |
1257775 |
T |
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| Q |
487 |
gtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacatggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatctcatgtcgaagtct |
586 |
Q |
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| T |
1257774 |
gtgaagtttctttaaggtggcaaattggccacatgataattgagtcttgtatacactttcatatgcttatgtcacgatgcaatatctaatgtcaaag--- |
1257678 |
T |
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| Q |
587 |
tctgttgctttgatgatgtcatcatatgctatcttcccatcataattccatat |
639 |
Q |
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| T |
1257677 |
--tgttgctttaataatgtcatcatatgttatttttccatcataattccatat |
1257627 |
T |
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