View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14234_low_5 (Length: 566)

Name: NF14234_low_5
Description: NF14234
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14234_low_5
NF14234_low_5
[»] chr4 (68 HSPs)
chr4 (14-133)||(4739430-4739549)
chr4 (1-169)||(22129966-22130135)
chr4 (10-190)||(7061672-7061852)
chr4 (14-169)||(16821360-16821516)
chr4 (10-190)||(49428350-49428529)
chr4 (10-190)||(5841435-5841616)
chr4 (9-167)||(49175965-49176124)
chr4 (10-190)||(47773027-47773207)
chr4 (312-386)||(4730521-4730595)
chr4 (10-190)||(38405110-38405291)
chr4 (10-203)||(52859794-52859982)
chr4 (14-184)||(17512353-17512524)
chr4 (10-169)||(42616932-42617091)
chr4 (10-128)||(35311293-35311413)
chr4 (10-190)||(11907607-11907787)
chr4 (58-176)||(4744758-4744876)
chr4 (9-187)||(36985718-36985896)
chr4 (12-184)||(49746895-49747068)
chr4 (14-190)||(34360592-34360768)
chr4 (10-169)||(35380362-35380522)
chr4 (10-190)||(21240712-21240888)
chr4 (10-169)||(26147644-26147806)
chr4 (10-203)||(2066724-2066915)
chr4 (14-190)||(17114377-17114553)
chr4 (14-170)||(53412044-53412201)
chr4 (311-386)||(4734294-4734367)
chr4 (33-169)||(54506744-54506880)
chr4 (14-169)||(2653357-2653512)
chr4 (40-203)||(3689525-3689688)
chr4 (10-201)||(25233115-25233305)
chr4 (15-169)||(35998750-35998903)
chr4 (10-120)||(51624719-51624829)
chr4 (14-190)||(2942653-2942831)
chr4 (312-383)||(4751112-4751182)
chr4 (97-203)||(6609781-6609887)
chr4 (14-72)||(9301469-9301527)
chr4 (11-190)||(6643668-6643846)
chr4 (14-190)||(47464373-47464550)
chr4 (97-166)||(52247460-52247529)
chr4 (15-166)||(30682228-30682380)
chr4 (181-284)||(4751187-4751290)
chr4 (15-169)||(7986914-7987066)
chr4 (33-80)||(17121200-17121247)
chr4 (47-190)||(17237304-17237447)
chr4 (2-184)||(20612185-20612365)
chr4 (39-203)||(43237203-43237369)
chr4 (104-203)||(44536191-44536290)
chr4 (97-195)||(461978-462076)
chr4 (97-203)||(11288625-11288730)
chr4 (97-190)||(40122862-40122955)
chr4 (10-203)||(33790726-33790921)
chr4 (11-67)||(39139868-39139923)
chr4 (97-169)||(47358978-47359050)
chr4 (31-166)||(18532133-18532268)
chr4 (14-61)||(28911293-28911340)
chr4 (104-190)||(23915438-23915524)
chr4 (16-62)||(30471794-30471840)
chr4 (16-90)||(31096234-31096308)
chr4 (8-114)||(35251830-35251936)
chr4 (2-79)||(8175709-8175785)
chr4 (97-170)||(18741502-18741575)
chr4 (10-63)||(28501020-28501073)
chr4 (112-229)||(32469917-32470034)
chr4 (97-190)||(32884821-32884914)
chr4 (97-190)||(38502490-38502583)
chr4 (97-169)||(43902271-43902346)
chr4 (139-179)||(2158019-2158059)
chr4 (14-62)||(21698645-21698693)
[»] chr5 (39 HSPs)
chr5 (10-190)||(1248604-1248784)
chr5 (10-166)||(6315801-6315957)
chr5 (14-190)||(7827926-7828102)
chr5 (10-190)||(40899851-40900031)
chr5 (15-166)||(21060569-21060719)
chr5 (1-184)||(41496004-41496187)
chr5 (12-166)||(6753682-6753836)
chr5 (10-190)||(8725009-8725189)
chr5 (10-184)||(6615886-6616060)
chr5 (12-200)||(31654987-31655176)
chr5 (8-184)||(7330439-7330614)
chr5 (13-169)||(19929882-19930038)
chr5 (12-190)||(40530224-40530403)
chr5 (43-184)||(4440987-4441128)
chr5 (10-190)||(4818483-4818664)
chr5 (10-169)||(41062181-41062339)
chr5 (10-190)||(8698241-8698422)
chr5 (10-128)||(6753962-6754080)
chr5 (10-184)||(26285484-26285658)
chr5 (97-187)||(27580620-27580710)
chr5 (31-89)||(41480103-41480163)
chr5 (97-169)||(11796188-11796260)
chr5 (10-190)||(27542728-27542908)
chr5 (53-169)||(29374318-29374434)
chr5 (10-61)||(3348259-3348310)
chr5 (18-169)||(24454982-24455130)
chr5 (31-89)||(41478737-41478797)
chr5 (10-62)||(2588192-2588243)
chr5 (99-190)||(5129232-5129323)
chr5 (2-97)||(30118310-30118404)
chr5 (8-62)||(41478637-41478691)
chr5 (8-62)||(41492189-41492243)
chr5 (139-184)||(29412049-29412094)
chr5 (140-184)||(176731-176775)
chr5 (10-62)||(2232200-2232252)
chr5 (130-190)||(18890555-18890615)
chr5 (28-75)||(29424432-29424480)
chr5 (97-169)||(29856067-29856139)
chr5 (97-161)||(38161441-38161505)
[»] scaffold0095 (2 HSPs)
scaffold0095 (12-190)||(50139-50317)
scaffold0095 (8-166)||(22279-22437)
[»] chr8 (45 HSPs)
chr8 (12-190)||(39405697-39405875)
chr8 (14-190)||(10179950-10180126)
chr8 (10-168)||(17719283-17719441)
chr8 (1-203)||(22771825-22772027)
chr8 (14-190)||(396614-396790)
chr8 (12-190)||(45425669-45425848)
chr8 (10-203)||(26626102-26626295)
chr8 (9-183)||(36006897-36007073)
chr8 (1-129)||(39301020-39301148)
chr8 (1-190)||(4428354-4428541)
chr8 (97-190)||(31331428-31331521)
chr8 (47-166)||(4924094-4924214)
chr8 (10-197)||(34948683-34948868)
chr8 (10-203)||(13335150-13335342)
chr8 (14-167)||(31231667-31231820)
chr8 (106-190)||(2767294-2767378)
chr8 (1-169)||(17823846-17824013)
chr8 (10-169)||(32476221-32476379)
chr8 (14-190)||(21216104-21216279)
chr8 (10-72)||(40109646-40109707)
chr8 (10-187)||(44761500-44761675)
chr8 (10-190)||(10097994-10098175)
chr8 (97-190)||(31082639-31082732)
chr8 (8-166)||(39466064-39466222)
chr8 (10-190)||(39482545-39482728)
chr8 (1-89)||(41091921-41092007)
chr8 (46-190)||(7172883-7173027)
chr8 (12-128)||(29226593-29226708)
chr8 (14-89)||(50753-50828)
chr8 (33-184)||(44648541-44648686)
chr8 (10-169)||(9300137-9300298)
chr8 (1-62)||(13831703-13831764)
chr8 (97-166)||(27294086-27294155)
chr8 (2-90)||(42182033-42182119)
chr8 (10-53)||(5053292-5053335)
chr8 (39-169)||(31270985-31271113)
chr8 (10-89)||(36967307-36967385)
chr8 (109-203)||(40996355-40996449)
chr8 (97-187)||(5356620-5356709)
chr8 (97-190)||(51133-51225)
chr8 (109-190)||(1875595-1875676)
chr8 (16-89)||(1875843-1875916)
chr8 (14-58)||(32678353-32678397)
chr8 (97-149)||(32678423-32678475)
chr8 (16-56)||(34455812-34455852)
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (10-190)||(14523372-14523552)
chr2 (10-190)||(17695261-17695443)
chr2 (14-190)||(43410363-43410539)
chr2 (10-203)||(36354430-36354622)
chr2 (12-195)||(8947047-8947232)
chr2 (14-170)||(34225527-34225683)
chr2 (10-190)||(16463620-16463802)
chr2 (1-203)||(35242284-35242486)
chr2 (8-165)||(19444077-19444234)
chr2 (12-190)||(16377656-16377833)
chr2 (10-190)||(5789648-5789827)
chr2 (31-190)||(16805836-16805994)
chr2 (31-190)||(16845117-16845275)
chr2 (10-190)||(35313820-35314000)
chr2 (10-169)||(37322362-37322520)
chr2 (10-169)||(15359108-15359269)
chr2 (44-190)||(39691457-39691603)
chr2 (12-169)||(38187904-38188060)
chr2 (10-190)||(9458271-9458445)
chr2 (10-189)||(25637413-25637593)
chr2 (10-190)||(36794217-36794397)
chr2 (10-128)||(19937317-19937436)
chr2 (33-190)||(43115802-43115959)
chr2 (10-62)||(45235512-45235564)
chr2 (10-119)||(7494909-7495019)
chr2 (1-51)||(34451471-34451521)
chr2 (12-61)||(11366719-11366768)
chr2 (112-169)||(27866527-27866583)
chr2 (31-107)||(16028270-16028345)
chr2 (67-174)||(12872762-12872869)
chr2 (12-63)||(25904722-25904773)
chr2 (1-50)||(7491079-7491128)
chr2 (10-63)||(11742656-11742709)
chr2 (9-169)||(28186146-28186306)
chr2 (97-169)||(41220967-41221039)
[»] chr1 (57 HSPs)
chr1 (11-190)||(39864045-39864224)
chr1 (10-190)||(31042730-31042910)
chr1 (10-190)||(37506057-37506240)
chr1 (10-169)||(49224012-49224171)
chr1 (8-190)||(27896886-27897068)
chr1 (1-187)||(41121833-41122017)
chr1 (1-203)||(9379156-9379358)
chr1 (10-190)||(12039015-12039195)
chr1 (10-123)||(37177769-37177882)
chr1 (10-169)||(7351572-7351728)
chr1 (10-169)||(20209866-20210025)
chr1 (12-239)||(40144803-40145030)
chr1 (14-136)||(52429279-52429403)
chr1 (8-200)||(6160454-6160637)
chr1 (12-184)||(7759150-7759322)
chr1 (1-64)||(6268375-6268438)
chr1 (10-129)||(35367735-35367854)
chr1 (10-136)||(6785189-6785315)
chr1 (1-190)||(23168998-23169185)
chr1 (97-190)||(26093414-26093507)
chr1 (15-190)||(9307564-9307740)
chr1 (31-169)||(8896358-8896497)
chr1 (10-123)||(24991725-24991839)
chr1 (10-203)||(16395039-16395230)
chr1 (33-157)||(22856275-22856399)
chr1 (12-169)||(12151123-12151268)
chr1 (14-190)||(13579626-13579801)
chr1 (9-73)||(17988867-17988931)
chr1 (10-190)||(33733268-33733447)
chr1 (10-117)||(4659710-4659816)
chr1 (10-89)||(35682900-35682978)
chr1 (1-56)||(37238951-37239006)
chr1 (100-198)||(978854-978952)
chr1 (10-89)||(26252565-26252646)
chr1 (10-203)||(38787271-38787467)
chr1 (95-184)||(44426746-44426838)
chr1 (12-166)||(44761560-44761710)
chr1 (97-169)||(15699142-15699214)
chr1 (10-62)||(21910141-21910193)
chr1 (38-170)||(44707785-44707917)
chr1 (14-73)||(3312056-3312115)
chr1 (112-203)||(35538678-35538769)
chr1 (107-190)||(36701951-36702034)
chr1 (107-190)||(36718055-36718138)
chr1 (145-200)||(37177913-37177968)
chr1 (10-61)||(43500874-43500925)
chr1 (1-123)||(2137441-2137562)
chr1 (16-122)||(31879177-31879281)
chr1 (12-50)||(37275536-37275574)
chr1 (104-169)||(3312138-3312203)
chr1 (10-51)||(15699073-15699114)
chr1 (8-61)||(44426840-44426893)
chr1 (97-169)||(917044-917116)
chr1 (96-136)||(15904770-15904810)
chr1 (110-166)||(29778425-29778481)
chr1 (107-203)||(37276491-37276587)
chr1 (37-73)||(39395249-39395285)
[»] chr7 (61 HSPs)
chr7 (10-203)||(759087-759280)
chr7 (10-190)||(34947440-34947620)
chr7 (10-190)||(7463152-7463333)
chr7 (10-190)||(9785928-9786108)
chr7 (10-169)||(24516319-24516478)
chr7 (10-203)||(83324-83518)
chr7 (10-131)||(23745399-23745521)
chr7 (1-136)||(38032668-38032804)
chr7 (10-190)||(21759993-21760173)
chr7 (10-190)||(28202318-28202498)
chr7 (11-203)||(41506061-41506253)
chr7 (1-176)||(17610561-17610736)
chr7 (12-129)||(2459413-2459530)
chr7 (97-190)||(13961986-13962079)
chr7 (10-190)||(11373437-11373617)
chr7 (10-129)||(21350695-21350815)
chr7 (10-190)||(32346061-32346241)
chr7 (12-201)||(33819154-33819345)
chr7 (10-190)||(43873863-43874043)
chr7 (10-149)||(25571360-25571498)
chr7 (10-203)||(21390234-21390428)
chr7 (16-190)||(21937796-21937970)
chr7 (33-167)||(22738665-22738798)
chr7 (14-190)||(34100556-34100732)
chr7 (1-89)||(37245621-37245709)
chr7 (97-185)||(39005448-39005536)
chr7 (10-169)||(6494964-6495122)
chr7 (12-179)||(10042223-10042389)
chr7 (1-190)||(32769725-32769914)
chr7 (10-129)||(36790678-36790799)
chr7 (10-203)||(38391692-38391881)
chr7 (12-169)||(7457451-7457607)
chr7 (9-123)||(16904316-16904432)
chr7 (10-190)||(8592449-8592629)
chr7 (110-190)||(12631345-12631425)
chr7 (1-129)||(44424076-44424203)
chr7 (10-61)||(27920926-27920977)
chr7 (10-61)||(31930640-31930691)
chr7 (1-123)||(36425106-36425228)
chr7 (97-203)||(16560566-16560672)
chr7 (97-203)||(16604990-16605096)
chr7 (10-123)||(19271809-19271921)
chr7 (10-60)||(37850864-37850914)
chr7 (17-169)||(17828381-17828533)
chr7 (1-50)||(49101602-49101651)
chr7 (33-117)||(37490338-37490422)
chr7 (141-184)||(40614658-40614701)
chr7 (14-169)||(3178234-3178391)
chr7 (8-50)||(30546499-30546540)
chr7 (10-56)||(42935598-42935644)
chr7 (139-184)||(6855254-6855299)
chr7 (139-180)||(17609349-17609390)
chr7 (139-180)||(17609592-17609633)
chr7 (139-180)||(17609835-17609876)
chr7 (139-180)||(17610078-17610119)
chr7 (139-180)||(17610321-17610362)
chr7 (104-169)||(31930527-31930592)
chr7 (97-169)||(27921015-27921087)
chr7 (97-169)||(35333070-35333142)
chr7 (111-179)||(41499069-41499137)
chr7 (106-190)||(42935697-42935781)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (8-169)||(34299925-34300087)
chr6 (11-179)||(181491-181658)
chr6 (10-203)||(29363237-29363432)
chr6 (10-190)||(24983450-24983628)
chr6 (2-203)||(1063591-1063791)
chr6 (10-190)||(11655947-11656128)
chr6 (10-190)||(31894211-31894388)
chr6 (10-169)||(7920174-7920330)
chr6 (10-187)||(32440649-32440828)
chr6 (10-190)||(30716832-30717013)
chr6 (10-169)||(5302284-5302443)
chr6 (10-169)||(6801863-6802023)
chr6 (15-190)||(13909361-13909537)
chr6 (10-64)||(27367226-27367280)
chr6 (10-64)||(27457573-27457627)
chr6 (97-190)||(3291769-3291862)
chr6 (14-166)||(15058055-15058206)
chr6 (10-169)||(11143609-11143767)
chr6 (12-55)||(23397753-23397796)
chr6 (2-56)||(12307729-12307783)
chr6 (9-63)||(13207220-13207274)
chr6 (12-62)||(21425688-21425738)
chr6 (97-169)||(13087550-13087622)
chr6 (10-62)||(21478224-21478276)
chr6 (21-72)||(8694989-8695040)
chr6 (97-156)||(17828960-17829019)
chr6 (14-56)||(15582222-15582264)
chr6 (10-52)||(23142601-23142643)
[»] chr3 (44 HSPs)
chr3 (10-188)||(30190664-30190842)
chr3 (10-190)||(44301494-44301675)
chr3 (1-190)||(43253865-43254055)
chr3 (10-190)||(19822944-19823124)
chr3 (8-190)||(30711005-30711186)
chr3 (2-190)||(12736574-12736761)
chr3 (10-156)||(36460452-36460598)
chr3 (14-203)||(37311886-37312076)
chr3 (6-62)||(30710578-30710634)
chr3 (15-150)||(39043799-39043932)
chr3 (1-203)||(37497415-37497618)
chr3 (14-203)||(11905760-11905948)
chr3 (22-190)||(37695668-37695837)
chr3 (10-190)||(51837961-51838142)
chr3 (10-193)||(3901148-3901331)
chr3 (10-123)||(10366718-10366831)
chr3 (9-169)||(12904796-12904957)
chr3 (39-203)||(8679043-8679206)
chr3 (10-190)||(36476517-36476697)
chr3 (1-56)||(33458973-33459028)
chr3 (10-190)||(37772966-37773148)
chr3 (97-203)||(24569089-24569195)
chr3 (99-169)||(34750518-34750588)
chr3 (8-190)||(38795275-38795457)
chr3 (10-203)||(34957437-34957629)
chr3 (17-190)||(52290834-52291006)
chr3 (97-169)||(19611929-19612000)
chr3 (97-169)||(29023989-29024060)
chr3 (14-62)||(48541122-48541170)
chr3 (3-149)||(42469724-42469868)
chr3 (10-61)||(43715239-43715290)
chr3 (7-53)||(37804668-37804714)
chr3 (52-169)||(14194531-14194647)
chr3 (97-190)||(30682068-30682161)
chr3 (97-170)||(36462968-36463041)
chr3 (97-169)||(54477482-54477554)
chr3 (10-113)||(27471268-27471371)
chr3 (97-190)||(23004384-23004477)
chr3 (8-113)||(33634267-33634372)
chr3 (12-89)||(38137549-38137626)
chr3 (10-67)||(51065139-51065195)
chr3 (14-89)||(27549388-27549464)
chr3 (99-187)||(30861417-30861505)
chr3 (97-169)||(54726505-54726577)
[»] scaffold0330 (1 HSPs)
scaffold0330 (10-161)||(5325-5474)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (10-190)||(34021-34200)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (10-190)||(7983-8164)
[»] scaffold2146 (1 HSPs)
scaffold2146 (61-176)||(389-504)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (1-190)||(42802-42990)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (1-149)||(252848-252994)
[»] scaffold0583 (1 HSPs)
scaffold0583 (100-166)||(2048-2114)
[»] scaffold0182 (1 HSPs)
scaffold0182 (97-169)||(20376-20448)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (8-70)||(5976-6037)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (1-50)||(16884-16933)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 68)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 4739549 - 4739430
Alignment:
Q  14 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 113  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4739549 aaaataattgtcttttcagaatatcgatgcaacatttattattatttttcactaatatacccttattaatttaattataatccacttaattactccacta 4739450  T
Q  114 actacaattattaaggatat 133  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4739449 actacaattattaaggatat 4739430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 22129966 - 22130135
Alignment:
Q  1 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccact 99  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||| ||| ||||  |  | |||    
T  22129966 ttttttttttctcaaaataattgtcattttacaataccaatgcaacatttattattttttttccattattatacctttatttattgaatttcatccaact 22130065  T
Q  100 taattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| || |||| |||||||    
T  22130066 taattactccactaactacaattaataaggatgtttttgtaaatgatactaattataccattgaaatcaa 22130135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 7061852 - 7061672
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||| | || | ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||| ||| ||||  | || ||||||||| |||    
T  7061852 tctcaaaataattgttactttaaaatatcaatacaacatttattatttattttcactattatacccttatttattgaatttcattcaacttaattaatcc 7061753  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |  ||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  7061752 actaactacaattaataaagatattatagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaa 7061672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 16821516 - 16821360
Alignment:
Q  14 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccact 112  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  | || |||||| |||||||||    
T  16821516 aaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattattatttttgcactattatacccttatttattgaatttcattcaacttaaatactccact 16821417  T
Q  113 aactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  16821416 aactataattaataaggatattatagtaaatgatactaattttatcattgaaatcaa 16821360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 49428529 - 49428350
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| | |||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||||||||||    
T  49428529 tctcaaaataattgtcactttagaa-atcaatgcaacatttattacttttttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaattactcc 49428431  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||| |||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  49428430 actaactacaattaataagggtattttagtaaattatattaattttaccattgaaatcaacacaaataatcatttccttaa 49428350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 5841616 - 5841435
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt-aattactc 108  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||| || || |||||||||||| ||| ||||  |  | |||| || |||||    
T  5841616 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcatcatttattattaatttccattattatacctttatttattgaatttcatccaacttaaactactc 5841517  T
Q  109 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  5841516 cactaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattaaaatcaacgcaatcaatcatttccttaa 5841435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 49176124 - 49175965
Alignment:
Q  9 gtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 107  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||| | |||| |||||| ||||| ||| |||| ||  | |||||| ||||    
T  49176124 gtctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacaattattatttttttcccactattatacccttatttattgaattttatccaacttaactact 49176025  T
Q  108 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatc 167  Q
    || ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  49176024 ccgctaactacaattaataaggttattttagtaaatgatactaattttatcattgaaatc 49175965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 47773207 - 47773027
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| |||| || ||  ||||| ||||| ||| || |  |  | |||||| ||||||    
T  47773207 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattatttttttccattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactactcc 47773108  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  47773107 actaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaattatttccttaa 47773027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 312 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 4730595 - 4730521
Alignment:
Q  312 tttattttataatgttgttacgtttatgacttgtcacacactttaatttaaataattttgttctttaaacttcct 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  4730595 tttattttataatgttgttacgtttatgacttgtctcacactttaatttaaataatgttgtcctttgaacttcct 4730521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 38405291 - 38405110
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 108  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||||| ||| ||||  |  | |||||| ||| |    
T  38405291 tctcaaaataattgtcactttagaatagcaatgcaacatttattactttttttccattattatacctttatttattgaatttcatccaacttaactacac 38405192  T
Q  109 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||   || |||| ||||||||||    
T  38405191 cactaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccatttaaatcaacagaattaatcatttccttaa 38405110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 52859982 - 52859794
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||  || || |||||| |  | ||||| |||| |||     ||| ||||||    
T  52859982 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattattttttcccattattataccctattgaatttcattcaact-----taactactcc 52859888  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 203  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||||||||| ||| || |||||    
T  52859887 actaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataa 52859794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17512524 - 17512353
Alignment:
Q  14 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttat-taatttaattctactccacttaattactccact 112  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||| || |||||||||| |||| ||||||||| |  |||| | ||| ||||| |||| ||||||||| || ||     
T  17512524 aaaataattgtcattttaaaatatgaatgtaatatttattatttttttccactaatatgcacttatattattgaattcaactctacttaattattcgaca 17512425  T
Q  113 aactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 184  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||  ||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||    
T  17512424 aactacaattaataatggtattttagtaaattatattaattttacctttaaaatcaactcaactaatcattt 17512353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 42617091 - 42616932
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||||  ||||| ||| ||||  | || |||||| ||||||    
T  42617091 tctcaaaataattgtcactttagaatacaaatgcaacatttattattattttccattattatacacttatttattgaatttcattcgacttaactactcc 42616992  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    ||| |||||||||| |||  |||||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||    
T  42616991 acttactacaattaataaaaatattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaa 42616932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 35311413 - 35311293
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt--cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 107  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||| ||| ||||  |  | |||||||||||    
T  35311413 tctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaacatttattattattttttccaatattatacctttatttattgaatttcatccaacttaattact 35311314  T
Q  108 ccactaactacaattattaag 128  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  35311313 ccactaactacaattaataag 35311293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 11907787 - 11907607
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| |||| || ||  |||| |||||| ||| || |  |  | |||||| ||||||    
T  11907787 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattatttttttccattataatacatttatttattgaacttcatccaacttaactactcc 11907688  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    | |||||||||||| ||||| | ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  11907687 aataactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaa 11907607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 58 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4744876 - 4744758
Alignment:
Q  58 tttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttat 157  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||| | ||||||| |||| | |  |||||||| |||||||||||||||||      
T  4744876 tttttcattaatataacattatttatttaattccacttcacttaactactcgattaactacgattaattaatatatttttgtaaattatactaatttttc 4744777  T
Q  158 cattaaaatcaattcaact 176  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4744776 cattaaaatcaattcaact 4744758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 187
Target Start/End: Original strand, 36985718 - 36985896
Alignment:
Q  9 gtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 108  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||| | || |||| ||| | |||||| ||||| ||| ||||  |  | ||||||||| ||    
T  36985718 gtctcaaaataattgtcagtttagaatatcaatgaagcatttactgtttttttccaccattatacccttatttattgaatttcatccaacttaattattc 36985817  T
Q  109 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttcct 187  Q
     |||||||||||||| || || ||||||  ||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||||||    
T  36985818 tactaactacaattaatacgggtattttagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttcct 36985896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 184
Target Start/End: Original strand, 49746895 - 49747068
Alignment:
Q  12 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcca 110  Q
    ||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||| |    
T  49746895 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaacatttattattatttttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactcaa 49746994  T
Q  111 ctaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 184  Q
    ||||||| ||||| | | | ||||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||    
T  49746995 ctaactataattaatgaaggtattttagtaaatactactaattttatcattgaaatcaacacaattaattattt 49747068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 34360592 - 34360768
Alignment:
Q  14 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 113  Q
    ||||||||||||| || | |||| ||||  ||||||| || || |||| ||||| |||||| ||||| ||| |||| || || |||||| ||||||||||    
T  34360592 aaaataattgtcactttacaataccaatttaacattttttttttttttccactattatacccttatttattgaattttattcaacttaactactccacta 34360691  T
Q  114 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||| ||||  | ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  34360692 actacaattaataagagtgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaatacaattaatcatttctttaa 34360768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 35380522 - 35380362
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 108  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||| ||||| || || |||||  ||||| ||| ||||  |  | ||||||  ||||    
T  35380522 tctcaaaataattgtcactttataataccaatgcaacatttattattttttttccattattatactcttatttattgaatttcatccaacttaaccactc 35380423  T
Q  109 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||  |||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  35380422 cactaactacaattaataatgatgttttagtaaatgctactaattttaccattaaaatcaa 35380362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 21240888 - 21240712
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||    ||||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||||     
T  21240888 tctcaaaataaatgtcactttagaatatcaatgcaacatttat----attttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactca 21240793  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||  |||| ||||||||||    
T  21240792 actaactacaattaataaggatgtgttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacagttaatcatttccttaa 21240712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 26147806 - 26147644
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttatt--attatttttcactaatatacctttattaatttaattctactcca-cttaattac 106  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||  ||| |||| || || |||||| ||||| ||| ||   |  |||| |||||||||    
T  26147806 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatacaacatttattttatttttttccattattatacccttatttattgaaaattcatccaacttaattac 26147707  T
Q  107 tccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  26147706 tccactaactacaattaataagaatgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaa 26147644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 203
Target Start/End: Original strand, 2066724 - 2066915
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||  ||||||| || |||||||||||| ||| ||||  |    |||||| ||| ||    
T  2066724 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgaagcatttattat--tttttcattattatacctttatttattgaatttcatctaacttaactacccc 2066821  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 203  Q
    |||||||| ||||| ||||| | ||||  ||||| ||||||| |||| ||| ||||||||  ||| |||| |||||||||| ||| || |||||    
T  2066822 actaactaaaattaataagggtgttttaataaataatactaactttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataa 2066915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 17114377 - 17114553
Alignment:
Q  14 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccac-ttaattactccact 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||   ||||| | ||||||||| |||| || ||  ||||||||||| ||| || | | |||||  |||| |||||||||    
T  17114377 aaaataattgtcattttagaatacttatgcagcgtttattatttttttccattataatacctttatttattgaact-tcctccaaattaactactccact 17114475  T
Q  113 aactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  17114476 aactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaa 17114553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Original strand, 53412044 - 53412201
Alignment:
Q  14 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttatta-ttatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccact 112  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||| ||||| |||||| ||| ||||  |  | |||||| || |||||     
T  53412044 aaaataattgtcattttagaataccaatgtaacatctattatttttttttcactattatacttttatttattgaatttcatccaacttaactattccaca 53412143  T
Q  113 aactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaat 170  Q
    ||||| ||||| |||  |||||||  ||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  53412144 aactataattaataaaaatattttagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaat 53412201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 4734367 - 4734294
Alignment:
Q  311 gtttattttataatgttgttacgtttatgacttgtcacacactttaatttaaataattttgttctttaaacttcct 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  4734367 gtttattttataatgttgttacgtttatgatttgt--ctcactttaatttaaataatgttgtcctttgaacttcct 4734294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 169
Target Start/End: Original strand, 54506744 - 54506880
Alignment:
Q  33 aatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggata 132  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||| ||||  |    |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  54506744 aatatcgatgcaacatttattattatttttcattattatattcttattaattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattgataatgata 54506843  T
Q  133 tttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    ||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||    
T  54506844 ttttaataaatgatattaattttaccattgaaatcaa 54506880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 169
Target Start/End: Original strand, 2653357 - 2653512
Alignment:
Q  14 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 113  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||| || || |||||||||||| ||| ||||  |  | | |||| ||||||  ||    
T  2653357 aaaatagttgtcactttagaatatcaatgcaacatttattatctttttccattattatacctttatttattaaatttcatccaatttaactactccttta 2653456  T
Q  114 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||||||| ||||  ||||||  ||||| ||||||||||||  ||| |||||||    
T  2653457 actacaattaataagagtattttaataaatgatactaattttacaattgaaatcaa 2653512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 203
Target Start/End: Original strand, 3689525 - 3689688
Alignment:
Q  40 atgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttct 139  Q
    |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||  |    ||||||  |||| |||||||| ||||| ||||  | ||||  |    
T  3689525 atgcaacatttattattattttccattattatacccttattaatttaatttcatctaacttaacaactcaactaactataattaataagagtgttttagt 3689624  T
Q  140 aaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 203  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||| ||||| |||| ||  ||||||||    
T  3689625 aaatgatactaattttaccatcaaaatcaatacaattaatcatttctttaataaccgtacataa 3689688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 201
Target Start/End: Original strand, 25233115 - 25233305
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||| ||||||| ||| || |  |  | |||||| |||| |    
T  25233115 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattatt-tttttcattataatatctttatttattgaacttcatccaacttaactacttc 25233213  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacat 201  Q
    |||||||| ||||| ||    | ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||| ||  ||| |||||||||| |||| || |||||||    
T  25233214 actaactataattaatactagtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaattaacacaattaattatttctttaataactgtacat 25233305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 169
Target Start/End: Original strand, 35998750 - 35998903
Alignment:
Q  15 aaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaa 114  Q
    |||||||||||| || | |||||||||  | ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||| ||||| |  | |||||| |||||||  ||    
T  35998750 aaataattgtcaatttacaatatcaatatagcatttattattctttttcactattatatctttatttattgaattc-atccaacttaactactccatcaa 35998848  T
Q  115 ctacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    ||||||||| ||| ||||||||  |||||  |||||||||||   ||||||||||    
T  35998849 ctacaattaataatgatattttaataaatgttactaattttactgttaaaatcaa 35998903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 120
Target Start/End: Original strand, 51624719 - 51624829
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  51624719 tctcaaaataattgtcactttacaatatcaatgtaacatttattatttttttccactatcatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactcc 51624818  T
Q  110 actaactacaa 120  Q
    |||||||||||    
T  51624819 actaactacaa 51624829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 2942831 - 2942653
Alignment:
Q  14 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt---cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcca 110  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||   ||||| |||| |||| || ||| || |  | || ||||||  ||||||    
T  2942831 aaaataattgtcattttacaatatcaatgaaatatttattattatttttttccactattatatctttgtttattgaaattcattcaacttaaccactcca 2942732  T
Q  111 ctaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||  |||||  |||||||||||||||  |||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  2942731 ctaactacaattaataagg-tgttttagtaaatgctactaattttatcatcgaaatcaacacaattaatcatttctttaa 2942653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 4751182 - 4751112
Alignment:
Q  312 tttattttataatgttgttacgtttatgacttgtcacacactttaatttaaataattttgttctttaaactt 383  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4751182 tttattttataatgttattacgtttatgaccattcgcacactttaatttaaataa-tttgtcctttaaactt 4751112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 203
Target Start/End: Original strand, 6609781 - 6609887
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattg 196  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||| ||| ||| ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||||||||| ||| |    
T  6609781 acttaactactccaataattacaattaataaagatgtttttgtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcg 6609880  T
Q  197 tacataa 203  Q
    | |||||    
T  6609881 tgcataa 6609887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 72
Target Start/End: Original strand, 9301469 - 9301527
Alignment:
Q  14 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatata 72  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||    
T  9301469 aaaataattgtcattttagaatatcaatgtattgtttattattatttttcactaatata 9301527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 6643846 - 6643668
Alignment:
Q  11 ctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    |||||||||||||||| || | ||| |||| ||| ||||||||  |||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||  ||    
T  6643846 ctcaaaataattgtcactttacaatttcaacgcagcatttatt--tatttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactatacc 6643749  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  6643748 actaactacaattaataaagatgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaa 6643668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 47464550 - 47464373
Alignment:
Q  14 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccact 112  Q
    ||||||||| || ||| | |||| |||||||  |||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||||     
T  47464550 aaaataattatcgttttacaataccaatgcattatttattattttttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactccacc 47464451  T
Q  113 aactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||||||||||| ||||  | ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  47464450 aactacaattaataagagttttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaa 47464373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 52247529 - 52247460
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 166  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| || |||||||| |||| ||||    
T  52247529 acttaactactccactaactacaattaataaggatattttagtaaattgtattaattttaccattgaaat 52247460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 30682380 - 30682228
Alignment:
Q  15 aaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattat-ttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 113  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||| | ||||||||||||| |||||| || ||| | |||||| ||| ||||  | || | |||| ||||| ||||    
T  30682380 aaataattgtcactttagaaaatcaatgtagcatttattattattttttcattattatgcttttatttattgaatttcattcaaattaactactctacta 30682281  T
Q  114 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 166  Q
    ||||||| || |||||||||| |  ||||| ||| |||||||| || ||||||    
T  30682280 actacaactaataaggatattatagtaaatgatattaattttaccaataaaat 30682228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 4751290 - 4751187
Alignment:
Q  181 atttccttaacaattgtacataactctataacaactattagtttgagatggtgggagtaattttatttgcttttaaacctaaaattttatttgcatgtct 280  Q
    |||||||||| ||| | ||| ||||||| ||| || ||||   ||||| || ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||     
T  4751290 atttccttaataatcgcacacaactctaaaacgaccattaaaatgagacggagggaggaattttatttgctcttaagcctaaaatttaatttgcatgtca 4751191  T
Q  281 taac 284  Q
    ||||    
T  4751190 taac 4751187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 169
Target Start/End: Original strand, 7986914 - 7987066
Alignment:
Q  15 aaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaa 114  Q
    |||||||| ||| || | |||||||||| |||| |||||||   ||||| ||| ||||| |||||| ||||||||  | |  |||||| ||||| |||||    
T  7986914 aaataattatcactttaaaatatcaatgtaacacttattata--ttttccctattatacttttatttatttaatttcattaaacttaactactctactaa 7987011  T
Q  115 ctacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    | | ||||| |||  |||||||  || || |||||||||||||||||||||||||    
T  7987012 caataattaataataatattttagtagatgatactaattttatcattaaaatcaa 7987066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 80
Target Start/End: Original strand, 17121200 - 17121247
Alignment:
Q  33 aatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttatt 80  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17121200 aataccaatgcaacatttattattatttttcactaacataccattatt 17121247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 17237447 - 17237304
Alignment:
Q  47 atttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattat 146  Q
    |||||||| | |||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||  |||||  |    
T  17237447 atttattagttttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataaggttgttttagtaaatgtt 17237348  T
Q  147 actaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||| ||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  17237347 actaattttaccattgcaatcaacacaattaattattttcttaa 17237304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 20612365 - 20612185
Alignment:
Q  2 tttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactta 101  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    |||||| ||  |||| || ||||||||  ||||| ||| ||||  | | ||||||    
T  20612365 tttttatgtctctaaataattatcattttagaatatcaatgttgtatttatcat--ttttccattaatatactattatttattgaatttcaattcactta 20612268  T
Q  102 attactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 184  Q
    | |||| || || ||||||||| ||| | | ||||  ||||||||||||| |||| || | ||||||| ||||||||| ||||    
T  20612267 actacttcattatctacaattaataatggtgttttagtaaattatactaactttagcaatgaaatcaactcaactaatcattt 20612185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 203
Target Start/End: Original strand, 43237203 - 43237369
Alignment:
Q  39 aatgcaacatttattattattttt--cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||  ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||| ||||||||| ||||| ||| ||| ||||    
T  43237203 aatgcaacatttattattatttttttcactattatacacttatttattgaatttcatccaacttaactacttcactaactataattaataatgatttttt 43237302  T
Q  137 tctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 203  Q
      |||||  ||||||||||| |||| |||| ||  ||| |||| |||||||||| ||| || |||||    
T  43237303 agtaaatattactaattttaccattgaaataaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataa 43237369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 44536290 - 44536191
Alignment:
Q  104 tactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 203  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||  |||||  | ||||||||| ||||||||||||  ||| |||| |||||||||| ||| || |||||    
T  44536290 tactccactaactacaattaataagggtgttttaataaatcctgctaattttaccattaaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataa 44536191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 195
Target Start/End: Original strand, 461978 - 462076
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaatt 195  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||  ||||| ||| || ||||| |||| |||||||| ||| |||| |||| ||||| ||||    
T  461978 acttaactactccgctaattacaattaataaggatattttagtaaataatattacttttaccattgaaatcaatacaattaatcattttcttaaaaatt 462076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 11288730 - 11288625
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattg 196  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||| |||||||  |||| |||||||| ||| |||| |||| ||||| ||| |    
T  11288730 acttaactactccaccaactacaattaataa-gatattttagtaaatgatattaattttgccattgaaatcaatacaattaatcattttcttaataatcg 11288632  T
Q  197 tacataa 203  Q
    |||||||    
T  11288631 tacataa 11288625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 40122955 - 40122862
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||| | |||||||||||||||| | ||||| | ||||  |||||  ||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  40122955 acttaactgctccactaactacaatcaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaacattaaaatcaacgcaattaatcatttccttaa 40122862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 33790921 - 33790726
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt--cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 107  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  ||| ||| |||||||| || || ||  || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||    
T  33790921 tctcaaaataattgtcactttagaattccaacgcagcatttattttttttctttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactact 33790822  T
Q  108 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 203  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||   |||| | |||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||| ||||| ||| || |||||    
T  33790821 ccactaactacaattaataagggtgttttagcaaatgaaactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcattttcttaataatcgtgcataa 33790726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 39139923 - 39139868
Alignment:
Q  11 ctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcacta 67  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  39139923 ctcataataattgtcattt-agaataacaatgcaacattcattattattttccacta 39139868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 47359050 - 47358978
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||   ||||||   ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  47359050 acttaattactccactgactacaattaataaaagtattttagaaaattattctaattttatcattgaaatcaa 47358978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 166
Target Start/End: Original strand, 18532133 - 18532268
Alignment:
Q  31 agaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaagga 130  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| | | ||| ||| ||||  |  | | ||||  |||||||| |||| ||||| |||       
T  18532133 agaatatcaatgtaatatttattattatttttcactattatatcataatttattgaatttcatcctagttaaccactccacttactataattaataaaac 18532232  T
Q  131 tatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 166  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  18532233 tattttaataaatcatactaattttaccattaaaat 18532268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 28911340 - 28911293
Alignment:
Q  14 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt 61  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28911340 aaaataattgtcgatttagaatatcaatgcaacatttattattttttt 28911293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 23915524 - 23915438
Alignment:
Q  104 tactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||  ||||||| ||  |||||| ||||||||||||  | |||||| ||||||||||    
T  23915524 tactccactaactataattaataatgatgttttagtaaattaaacatattttaccattaaaatcaacactactaatcatttccttaa 23915438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 62
Target Start/End: Original strand, 30471794 - 30471840
Alignment:
Q  16 aataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 62  Q
    ||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30471794 aataattgtctctttaaaatatcaatgcaacatttattattattttt 30471840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 31096308 - 31096234
Alignment:
Q  16 aataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattc 90  Q
    |||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||| ||||  ||| ||||| ||||||| ||| |||||    
T  31096308 aataattgtcattttataatatcaaaacaacatttattatttttttctactgatatatctttatttattgaattc 31096234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 114
Target Start/End: Original strand, 35251830 - 35251936
Alignment:
Q  8 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 107  Q
    |||||| |||||||| ||| || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||||| ||| ||||  |    |||||||||||    
T  35251830 tgtctccaaataattatcaatttagaataccaaaacaacatttattattatttttcattattatatccttatttattgaatttcatctaacttaattact 35251929  T
Q  108 ccactaa 114  Q
    |||||||    
T  35251930 ccactaa 35251936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 8175785 - 8175709
Alignment:
Q  2 tttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttat 79  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||| | ||||  |||  |||||||||||    
T  8175785 tttttctgtctcaaaata-ttgtcactttagaatattaatgcaacatttattaattttttctactgttatacctttat 8175709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 18741575 - 18741502
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaat 170  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||||| | |||||||||| | || ||||||||    
T  18741575 acttaactactccattaactacaattaataaagatattttaataaatgacactaattttaccgttgaaatcaat 18741502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 28501073 - 28501020
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc 63  Q
    ||||||||||||||||  || |||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  28501073 tctcaaaataattgtctctttagaataccaatacaacatttattattttttttc 28501020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32470034 - 32469917
Alignment:
Q  112 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataactctataa 211  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| |||| ||| | |||| | ||||| |||  ||    
T  32470034 taactacagttaataagaatgttttaataaatgatactaattttaccattaaaatcaacacaattaatcattttctttaaaattatgcataaatcttaaa 32469935  T
Q  212 caactattagtttgagat 229  Q
    ||| ||||| ||||||||    
T  32469934 caaatattattttgagat 32469917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 190
Target Start/End: Original strand, 32884821 - 32884914
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||  | |||| ||||||  |||||||| || |||| |||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  32884821 acttaactactccactaactacaattaataagagtgttttactaaatgctactaattctaccattgaaatcaacacaattaatcattttcttaa 32884914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 38502583 - 38502490
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||| |||| || |||||| ||||| |||   ||||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  38502583 acttaactactacattaactataattaataaaagtattttaataaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaattatttccttaa 38502490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 169
Target Start/End: Original strand, 43902271 - 43902346
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttcta---aattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||  ||   ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  43902271 acttaattactccactaactatgattaataagaatattttaataaataataatattaattttatcattaaaatcaa 43902346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 2158059 - 2158019
Alignment:
Q  139 taaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaat 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  2158059 taaatgatactaattttatcattgaaatcaattcaattaat 2158019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 21698693 - 21698645
Alignment:
Q  14 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 62  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21698693 aaaataattgtcactttaaaatatcaatgcaatatttattattaatttt 21698645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 39)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 1248784 - 1248604
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||| || || |||||| |||| |    
T  1248784 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattattatttttcattattatacccttattaattgaattttattcaacttaactacttc 1248685  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||   || |||| ||||||||||    
T  1248684 actaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacataattaataatttccttaa 1248604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 6315957 - 6315801
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||| |    
T  6315957 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattattattttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactacttc 6315858  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 166  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  6315857 actaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttatcattgaaat 6315801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 7828102 - 7827926
Alignment:
Q  14 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 113  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||  ||||||| || |||| | ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||||||    
T  7828102 aaaaaaattatcattttaaaatatcaatgcaatatttattatcttttttcattattatatccttatttattaaatttcatccaacttaactactccacta 7828003  T
Q  114 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  ||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  7828002 actacaattaataagggtattttaataaatgatactaattttaccattgaaatcaacacaattaattattttcttaa 7827926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Original strand, 40899851 - 40900031
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| || |||| |||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |    |||||| ||||||    
T  40899851 tctcaaaataattgtcactttagaataacattgcagcatttattattattttccattattatacccttatttattgaatttcatctaacttaactactcc 40899950  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| |||||||||||  ||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  40899951 actaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttgccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaa 40900031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 166
Target Start/End: Original strand, 21060569 - 21060719
Alignment:
Q  15 aaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaa 114  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||| || || |||||| ||||| ||| |||| ||  | |||||| |||||||||||    
T  21060569 aaataattgtcactttagaatatcaatgcatcatttatt-ttattttccattattataccattatttattgaattttatccaacttaactactccactaa 21060667  T
Q  115 ctacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 166  Q
    ||||||||| ||||  ||||||  ||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  21060668 ctacaattaataagagtattttagtaaataatactaattttaccatcaaaat 21060719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 41496004 - 41496187
Alignment:
Q  1 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 100  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| || | ||||  |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||  |||  |  | | ||    
T  41496004 ttttttttttctcaaaataattgtcactttacaatactaatgcaacatttattattcttttccactattatacctttatttattgcatttcatccaattt 41496103  T
Q  101 aattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 184  Q
    || |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||   |||||||||| |||| |||||||  ||| |||||||||    
T  41496104 aactactccactaactacaattaataatgatgttttactaaatgcaactaattttaccattgaaatcaacacaattaattattt 41496187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 6753836 - 6753682
Alignment:
Q  12 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 111  Q
    ||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||  |||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||||    
T  6753836 tcaaaataattatcactttagaataccaatgcaacatttattatctttttccattattatacccttatttattaaatttcatccaacttaactactccac 6753737  T
Q  112 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 166  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||  ||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  6753736 taactacaattaataagggtattttagtaaatgatactaattttaccattgaaat 6753682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8725189 - 8725009
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || || ||||||||||||| || |||||  ||||| ||| ||||  | || | |||| ||||||    
T  8725189 tctcaaaataattgtcattttagaataacaatgcagcagtttttattatttttcattattatactattatttattgaatttcattcaagttaactactcc 8725090  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||||||| ||||  | ||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  8725089 actaactacaattaataagtgtgttttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttctttaa 8725009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 6616060 - 6615886
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 108  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||| |||||  | | ||||||  ||||    
T  6616060 tctcaaaataattgtcactttacaatacctatgcaacatttattattttttttccactattatacccttatttattgaattcatc-caacttaaccactc 6615962  T
Q  109 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 184  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||||||||    
T  6615961 cactaactaaaattaataaggatgttttggtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaattattt 6615886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Original strand, 31654987 - 31655176
Alignment:
Q  12 tcaaaataattgtca-tttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcca 110  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||| |||| ||| | ||||||||  ||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  | || || |||||||||||    
T  31654987 tcaaaataattgtcactttaaaaataccaatacaataattattatttatttccactattatacccttatttattgaatttcattcaacataattactcca 31655086  T
Q  111 ctaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtaca 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||| |||| ||| |||||    
T  31655087 ctaactacaattaataaggatattatagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttctttaataatcgtaca 31655176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 184
Target Start/End: Original strand, 7330439 - 7330614
Alignment:
Q  8 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 107  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||  | ||||||||||||||  ||| |||| || |||| |||| ||||    
T  7330439 tgtctcaaaataattatcattttaaaatatcaatgcaacattaattatttttttctagtaatatacctttatgtattaaatttta-tccaattaactact 7330537  T
Q  108 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 184  Q
    ||||||| || ||||| ||||  | |||| || ||| ||| ||||||||  ||||||| | ||||| | ||||||||    
T  7330538 ccactaattagaattaataagagtgttttactgaatgatattaattttacgattaaaaccgattcaccaaattattt 7330614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 169
Target Start/End: Original strand, 19929882 - 19930038
Alignment:
Q  13 caaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccact 112  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| || | ||||    
T  19929882 caaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattattattttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactatttcact 19929981  T
Q  113 aactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |  ||| ||||| ||| ||||||||    
T  19929982 aactacaattaataaggatgttttagtaaatgacgctagttttaccatcaaaatcaa 19930038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 40530403 - 40530224
Alignment:
Q  12 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattatt-atttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcca 110  Q
    ||||||||||||||| || | |||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||| ||||| ||||||||  |  | ||||||  ||||||    
T  40530403 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcagcatttattatttatttcccactattatacccttatttatttaatttcatccaacttaaccactcca 40530304  T
Q  111 ctaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  40530303 ctaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattttcttaa 40530224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 184
Target Start/End: Original strand, 4440987 - 4441128
Alignment:
Q  43 caacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaa 142  Q
    |||||||||||||| ||||  |||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | | |||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||    
T  4440987 caacatttattatttttttctactattataccgttatttattgaatttcatccaatttaactactccactaactacaattaataaaaatattttagtaaa 4441086  T
Q  143 ttatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 184  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  4441087 taatattaattttatcattaaaatcaacacaattaattattt 4441128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Original strand, 4818483 - 4818664
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 108  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||||| | ||||||||||| |||| | |||| |||||| ||||| ||| ||||  |    ||||||| ||||    
T  4818483 tctcaaaataattgtcactttataataccaatgtagcatttattatttttttcccactattatacccttatttattgaatttcatctaacttaatcactc 4818582  T
Q  109 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||  |||||  |||||||||||  ||| |||||||  ||| |||||||||||||||    
T  4818583 cactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttacaattgaaatcaacacaattaattatttccttaa 4818664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 41062339 - 41062181
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactcca-cttaattactc 108  Q
    ||||||||||||| | | || |||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||  ||||| ||||| ||| || || | |||| |||||||| ||    
T  41062339 tctcaaaataattataactttagaataccaatgcaacatttattatt-ttttccattataatacccttatttattgaactcca-tccagcttaattattc 41062242  T
Q  109 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
     |||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  41062241 tactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttatcatcaaaatcaa 41062181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Original strand, 8698241 - 8698422
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 108  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||| |  |||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | ||||||  ||||    
T  8698241 tctcaaaataattgtcactttacaatatcaatgtagtatttattattttttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaaccactc 8698340  T
Q  109 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||  |||||   |||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  8698341 cactaactacaattaataagggtgttttggtaaatgcaactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttctttaa 8698422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 128
Target Start/End: Original strand, 6753962 - 6754080
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||| || || |||| ||  |||||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  6753962 tctcaaaataattgtcactttataataccaatgcaacattttttttttttttccatcaatatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactcc 6754061  T
Q  110 actaactacaattattaag 128  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  6754062 actaactacaattaataag 6754080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 26285658 - 26285484
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |||| |  |||||||  | |||  |||||| |||| |||||| ||| |||| ||  | |||||| |||| |    
T  26285658 tctcaaaataattgtcaattgagaatattaatgtagtatttattgatttttcccactaacatacatttatttattgaattttatacaacttaactacttc 26285559  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 184  Q
    | |||||||||||| || |  | ||||  ||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||    
T  26285558 attaactacaattaatacgtgtgttttcataaatgatactaattttaccgttaaaatcaagtcaactaatcattt 26285484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 187
Target Start/End: Original strand, 27580620 - 27580710
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttcct 187  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||||||    
T  27580620 acttaactactccactaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttcct 27580710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 89
Target Start/End: Original strand, 41480103 - 41480163
Alignment:
Q  31 agaatatcaatgcaacatttattatta--tttttcactaatatacctttattaatttaatt 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  41480103 agaatatcaatgcaacatttattattatttttttcactattatacctttatttattgaatt 41480163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 11796260 - 11796188
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| |||  |||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  11796260 acttaactactacactaactacaattaataataatattttagtaaataatattaattttatcattaaaatcaa 11796188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Original strand, 27542728 - 27542908
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||  |||||| ||| ||||| | |||| || || |||||  ||||| ||| |||| ||  | |||||| ||||||    
T  27542728 tctcaaaataattgtgactttagaatactaatgcagcatgtattacttttttccattattatactcttatttattgaattttatccaacttaactactcc 27542827  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||  |||||  || |||||||| |||| |||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  27542828 actaactacaattaataagagtattttagtaaatggtattaattttaccattgaaatcaacacaatcaatcatttccttaa 27542908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 169
Target Start/End: Original strand, 29374318 - 29374434
Alignment:
Q  53 tattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaat 152  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||| ||| |||| || || | |||| |||||||||||||||||||| ||| | | ||||  |||||  || ||||    
T  29374318 tattttttttcactattatacccttatttattgaattttattcaatttaactactccactaactacaattaataaaggtcttttagtaaatgctattaat 29374417  T
Q  153 tttatcattaaaatcaa 169  Q
    ||||||||| |||||||    
T  29374418 tttatcattgaaatcaa 29374434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 3348310 - 3348259
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt 61  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  3348310 tctcaaaataattgtcattttagaataccaatgcagcatttattattttttt 3348259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 24455130 - 24454982
Alignment:
Q  18 taattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaacta 117  Q
    |||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||   ||  |||||||||   ||||| ||| ||||  |||||  ||| ||||||||| |||||    
T  24455130 taattgtcacattagaatatcaatacaacatttattatt---ttcgactaatatagtcttatttattaaatttcactccgtttagttactccacaaacta 24455034  T
Q  118 caattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||| |||   ||||||  ||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  24455033 caattaataaaagtattttaataagttatactagttttataattaaaatcaa 24454982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 89
Target Start/End: Original strand, 41478737 - 41478797
Alignment:
Q  31 agaatatcaatgcaacatttattattattttt--cactaatatacctttattaatttaatt 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  41478737 agaatatcaatgcaacatttattattattttttctactattatacctttatttattgaatt 41478797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 2588243 - 2588192
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 62  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  2588243 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcatttatt-ttattttt 2588192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 5129323 - 5129232
Alignment:
Q  99 ttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||| ||||| | |||||||||||| |||| || || |  ||||||||| |||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  5129323 ttaactactctaataactacaattaataagaatgttatagtaaattatattaattttaccattcaaaccaatgcaactaattattttcttaa 5129232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 30118404 - 30118310
Alignment:
Q  2 tttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactcca 97  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| | || |||||||  |||||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||| ||| |||| |||||||    
T  30118404 tttttatatcttaaaataattgtaactttagaatattcatgcaacatttattttta-ttttcattagtatacatttatttattgaattttactcca 30118310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 62
Target Start/End: Original strand, 41478637 - 41478691
Alignment:
Q  8 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 62  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  41478637 tgtctcaaaataattatcactttagaatattaatgcagcacttattattattttt 41478691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 62
Target Start/End: Original strand, 41492189 - 41492243
Alignment:
Q  8 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 62  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||  | || ||||||||||||||    
T  41492189 tgtctcaaaataattgtcactttagaatatcaataaagcacttattattattttt 41492243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 29412094 - 29412049
Alignment:
Q  139 taaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 184  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  29412094 taaatcatactaattttaccattaaaatcaatcgaactaattattt 29412049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 140 - 184
Target Start/End: Original strand, 176731 - 176775
Alignment:
Q  140 aaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 184  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  176731 aaatgatactagttttaacattaaaatcaattcaactatttattt 176775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 2232252 - 2232200
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 62  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  2232252 tctctaaataattgtcattttacaataccaatgtagcatttattattattttt 2232200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 18890615 - 18890555
Alignment:
Q  130 atatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||| |||||    
T  18890615 atattttaataaatgatactaattttaccattaaaaacaactcaactaatcattttcttaa 18890555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 75
Target Start/End: Original strand, 29424432 - 29424480
Alignment:
Q  28 ttcagaatatcaatgcaaca-tttattattatttttcactaatatacct 75  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||    
T  29424432 ttcagaatatcaatgcaacattttattaattcttttcactaatatacct 29424480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 169
Target Start/End: Original strand, 29856067 - 29856139
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||   || | ||| ||||||||||||| |||||||    
T  29856067 acttaactactccactaactacaattaataagagtattttagcaagtgatattaattttatcattgaaatcaa 29856139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 38161505 - 38161441
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcatt 161  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||| |||  ||||||| ||||    
T  38161505 acttaactactccactaactacgattaataaggatattttagtaaatgatatgaattttaccatt 38161441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 190
Target Start/End: Original strand, 50139 - 50317
Alignment:
Q  12 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 111  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  | || |||||||||||||||    
T  50139 tcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcatttattattatttttcactattatacccttatttatttaatttcattcaacttaattactccac 50238  T
Q  112 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||  ||||| ||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||| ||||||||||    
T  50239 taactgtaattaataaagatattatagtaaatgatactaattttatcattgaaattaacacaattaatcatttccttaa 50317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Original strand, 22279 - 22437
Alignment:
Q  8 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactcca--cttaatta 105  Q
    ||||||||||||||| ||| || | |||| | || |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| ||| |||| || ||||   |||| ||    
T  22279 tgtctcaaaataattatcactttacaataccgatacaacatttattatt-tttttcactattatatccttatttattgaatttta-tccaattttaacta 22376  T
Q  106 ctccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 166  Q
    || ||||||| || |||| ||| ||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  22377 ctgcactaaccacgattaataaagatattttagtaaatgatactaattttagcattaaaat 22437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 45)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 190
Target Start/End: Original strand, 39405697 - 39405875
Alignment:
Q  12 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 111  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  | || |||||||||||||||    
T  39405697 tcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcatttattattatttttcactattatacccttatttatttaatttcattcaacttaattactccac 39405796  T
Q  112 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||  ||||| ||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||| ||||||||||    
T  39405797 taactgtaattaataaagatattatagtaaatgatactaattttatcattgaaattaacacaattaatcatttccttaa 39405875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 10180126 - 10179950
Alignment:
Q  14 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 113  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  | || |||||  ||||||||| ||||  | || |||||| ||||||||||    
T  10180126 aaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattattattttctattattatacacttattaattgaatttcattcaacttaactactccacta 10180027  T
Q  114 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||| ||||  ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | |||| |||||    
T  10180026 actacaattaataagtgtattttagtaaattatactaattttaccattgaaatcaatacaactactcattttcttaa 10179950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 17719441 - 17719283
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    |||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||  |||| || || |||||||||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  17719441 tctctaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattatctttttccattattatacctttatttattaaatttcatccaacttaactactcc 17719342  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatca 168  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  17719341 actaactataattaataaggatattttagtaaataatactaactttaccattaaaatca 17719283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22772027 - 22771825
Alignment:
Q  1 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 100  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||| ||| ||||  |  | || |    
T  22772027 ttttttttttctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattattacttttcattattatacccttatttattgaatttcatccaacat 22771928  T
Q  101 aattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtaca 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| | |||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| | |||||||| || ||| ||    
T  22771927 aattacttcactaactacaattaataagggtgttttaataaatgacactaattttaccatcaaaatcaacccaattaatcaattccttaataactgtgca 22771828  T
Q  201 taa 203  Q
    |||    
T  22771827 taa 22771825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 396790 - 396614
Alignment:
Q  14 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccact-taattactccact 112  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||| || |||| | ||| |||| || |    
T  396790 aaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattattatttttcattattatacccttattaattgaatttta-tccaatataactacttcatt 396692  T
Q  113 aactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||||||||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||| | || |||||||   || |||| ||||||||||    
T  396691 aactacaattaataaggatattgtagtaaatgatactaattttaccgttgaaatcaacataattaatcatttccttaa 396614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 45425848 - 45425669
Alignment:
Q  12 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcca 110  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | ||||||||||||||    
T  45425848 tcaaaataattgtcactttacaatatcaatgtaacatttattattttttttccactattatacccttatttattgaatttcatacaacttaattactcca 45425749  T
Q  111 ctaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||  |||||  || |||||||| ||||||||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  45425748 ctaactacaattaataagaatgttttaataaatgttattaattttaccattaaaatcaacacaattaatcattttcttaa 45425669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 26626295 - 26626102
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||  || || |||||| ||||| ||| ||||  | || ||   | ||||||    
T  26626295 tctcaaaataattgtcactttaaaatatcaatgcagcatttattattttttcccattattatacccttatttattgaatttcattcaaccggactactcc 26626196  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 203  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||| ||| ||||  ||| |||| |||||||||| ||| || |||||    
T  26626195 actaactacaattaataaggatattttaataaattatacaaattttaccatcaaattcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataa 26626102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 36007073 - 36006897
Alignment:
Q  9 gtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt--cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattac 106  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| ||||| ||||||||  ||||| ||| |  ||||| ||| ||||  |    ||||||||||    
T  36007073 gtctcaaaataattgtcactttagaatactaatgcaacaattatttttatttttttcactattatgctcttatttattgaatttcatcaaacttaattac 36006974  T
Q  107 tccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatt 183  Q
     |||||||||||||||| || |||||||||  | ||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36006973 cccactaactacaattaatagggatattttagtcaataatattaattttatcattaaaatcaacacaactaattatt 36006897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 39301148 - 39301020
Alignment:
Q  1 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 100  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| || || ||||| |||||| ||| ||||  | || |||     
T  39301148 ttttttttctctcaaaataattgtcattttagaatatcaatgaatcgtttattattattttccattattatacttttatttattgaatttcattcaactg 39301049  T
Q  101 aattactccactaactacaattattaagg 129  Q
    || |||| ||||||||||||||| |||||    
T  39301048 aactacttcactaactacaattaataagg 39301020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 4428541 - 4428354
Alignment:
Q  1 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 100  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||  |||| ||||| ||||| |||||| ||| ||||  |    ||||    
T  4428541 ttttctatgcctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgtaacaattattat--ttttccactattatacttttatttattgaatttcatctaactt 4428444  T
Q  101 aattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    || || | ||||||||||||||| |||   ||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  4428443 aactaattcactaactacaattaataattgtattttagtaaatgataataattttatcattaaaatcaacacaaataatcattttcttaa 4428354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 190
Target Start/End: Original strand, 31331428 - 31331521
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  31331428 acttaattacttcactaactacaattaataatgatattttagtaaataataataattttataattgaaatcaatacaattaatcatttccttaa 31331521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 4924214 - 4924094
Alignment:
Q  47 atttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaatta 145  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| | ||  | || |||||| ||||| | |||||||||||| ||| ||||||||  ||||| |    
T  4924214 atttattattattttttcactaatatacccttatttattaagtttcattcaacttaactactctattaactacaattaataaagatattttagtaaataa 4924115  T
Q  146 tactaattttatcattaaaat 166  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  4924114 tactaattttaccattaaaat 4924094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34948868 - 34948683
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |  |||||||| ||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  34948868 tctcaaaataattgttactttagaataccaatgcaatatttattatt-tttttcattgttatacctt-atttattgaatttcatccaacttaactactcc 34948771  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgt 197  Q
    |||||||||||||| |||   | ||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||  ||| |||| |||||||||| ||||||    
T  34948770 actaactacaattaataaatgtgtttctgtaaatgatactaattttactatttaaatcaacacaattaatcatttccttaataattgt 34948683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 203
Target Start/End: Original strand, 13335150 - 13335342
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||| | ||| ||| ||||  |    |||||| |||||     
T  13335150 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattatt-ttttccattattataccctgatttattgaatttcatcaaacttaactactct 13335248  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 203  Q
    ||||||| |||||| |||   | |||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||  |||||||||| ||| || |||||    
T  13335249 actaactgcaattaataaatgtgttttactaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaaccatttccttaataatcgtgcataa 13335342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 167
Target Start/End: Original strand, 31231667 - 31231820
Alignment:
Q  14 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 113  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||| |||| || ||  ||||| ||||| ||| || | ||  | |||||| ||||||||||    
T  31231667 aaaataattgtcattttataataccaatgcatcatttattatttttttccattataatacccttatttattgaactttatccaacttaactactccacta 31231766  T
Q  114 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatc 167  Q
    |||||||||| ||||| | |||   ||||| ||| |||||||| ||| ||||||    
T  31231767 actacaattaataagggtgtttcagtaaatgatattaattttaccatcaaaatc 31231820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 2767378 - 2767294
Alignment:
Q  106 ctccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  2767378 ctccactaactacaaataataaggatgttttaataaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaattatttccttaa 2767294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 17823846 - 17824013
Alignment:
Q  1 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || | |||| |||| ||| |||||||||| |  | ||||| |||||  ||||| ||||||||  |  | ||||    
T  17823846 ttttttctgtctcaaaataattgtcaatttataataacaatacaatatttattatt-tcctccactattatactattatttatttaatttcatccaactt 17823944  T
Q  101 aattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    || |||| ||||||||||||||| ||| | |||| |  ||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  17823945 aactacttcactaactacaattaataaaggtattctagtaaaagatactaattttatcattgaaatcaa 17824013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 32476221 - 32476379
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| | | ||||||| ||||||| |  |||||| ||||| ||| ||||  |    |||||| |||| |    
T  32476221 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcgtatattatt-tttttcattgttatacccttatttattgaatttcatcaaacttaactacttc 32476319  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  32476320 attaactacaattaataagggtattttaataaatgatattaattttatcattgaaatcaa 32476379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 21216279 - 21216104
Alignment:
Q  14 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccact 112  Q
    ||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||  | |||||| |||| |||||| || |  ||| ||||  |  | |||||| |||||||||    
T  21216279 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaacatttatttatttttttctactattataccatttt--attgaatttcatccaacttaactactccact 21216182  T
Q  113 aactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  |||||   |||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  21216181 aactacaattaataaggatgttttagtaaatgcaactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaa 21216104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 72
Target Start/End: Original strand, 40109646 - 40109707
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatata 72  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  40109646 tctcaaaataattgtcattttagaatat-aatgcaacatttattatatttttccactaatata 40109707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 44761675 - 44761500
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||||||| |||  |||| | |||| ||||| |||||| | ||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  44761675 tctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcagcat--attagttttttccactattataccctcatttattgaatttcatccaacttaactactcc 44761578  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttcct 187  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||||||    
T  44761577 actaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttcct 44761500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 10098175 - 10097994
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaata-tacctttattaatttaattctactccacttaattactc 108  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| |||| || ||||||||||| ||||||  | ||| || ||||||| ||| || |  |  | |||||| |||||    
T  10098175 tctcaaaataattgttactttagaataccaatacatcatttattattttttttccattataatatctttatttattgaacttcatccaacttaactactc 10098076  T
Q  109 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||||||||||||||| ||||| | || |  ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| ||| |||| |||| |||||    
T  10098075 cactaactacaattaataagggtgttatagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaatacaattaatcattttcttaa 10097994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 190
Target Start/End: Original strand, 31082639 - 31082732
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||  |||||   |||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  31082639 acttaactactccactaactataattaataagggtgttttagtaaataccactaattttatcattaaaatcaagacaattaatcatttccttaa 31082732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 39466222 - 39466064
Alignment:
Q  8 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactcca--cttaatta 105  Q
    ||||||||||||||| ||| || | |||| | || |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| ||| |||| || ||||   |||| ||    
T  39466222 tgtctcaaaataattatcactttacaataccgatacaacatttattatt-tttttcactattatatccttatttattgaatttta-tccaattttaacta 39466125  T
Q  106 ctccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 166  Q
    || ||||||| || |||| ||| ||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  39466124 ctgcactaaccacgattaataaagatattttagtaaatgatactaattttagcattaaaat 39466064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Original strand, 39482545 - 39482728
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatat---acctttattaatttaattctactccacttaattac 106  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| |||||||  |||||||||| |||  ||||| |||   ||| ||||| ||| ||||  | ||||||||| ||     
T  39482545 tctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcagtatttattattttttcccactattattatacccttatttattgaatttcattccacttaactag 39482644  T
Q  107 tccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| | ||||  |||||| ||||||||||| | || |||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  39482645 tccactaactataattaataagggtgttttagtaaattctactaattttacccttgaaatcaacacaattaatcattttcttaa 39482728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 41091921 - 41092007
Alignment:
Q  1 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaatt 89  Q
    |||||| |||||||| ||||||| || || |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||    
T  41091921 ttttttttgtctcaacataattgccaatttagaatatcaatgcagcatttat--ttatttttcactattatacccttatttattgaatt 41092007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 190
Target Start/End: Original strand, 7172883 - 7173027
Alignment:
Q  46 catttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaatta 145  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  | || |||||| |||| || |||||||||||| |||  || ||||  |||||      
T  7172883 catttattatttttttccactattatacccttatttattgaatttcattcaacttaactacttcattaactacaattaataaatatgttttagtaaatgc 7172982  T
Q  146 tactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  7172983 tactaattttatcattgaaatcaacacaattaatcatttctttaa 7173027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 29226708 - 29226593
Alignment:
Q  12 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 111  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||| || | |||| ||||| ||| ||||  |    |||||| ||||||||    
T  29226708 tcaaaataattgtcactttaaaatatcaatgcagcatttatta-tatttttcattattgtacccttatttattgaatttcatctaacttaactactccac 29226610  T
Q  112 taactacaattattaag 128  Q
    |||||||||||| ||||    
T  29226609 taactacaattaataag 29226593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 89
Target Start/End: Original strand, 50753 - 50828
Alignment:
Q  14 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaatt 89  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  |||| || || |||||||||||| ||| ||||    
T  50753 aaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcatttattatctttttccattattatacctttatttattaaatt 50828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 44648686 - 44648541
Alignment:
Q  33 aatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggata 132  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || |||| |||||| |||| |||||||| |     || || || ||||||||||||| |||||||| |||| ||     
T  44648686 aatatcaatacaacatttattaattttgttcattaatatccctt-attaatttca-----ctacattttattactccactaattacaattagtaagtatg 44648593  T
Q  133 tttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 184  Q
    ||||  ||||| |||||||||||| |||| ||||||| | ||||||| ||||    
T  44648592 ttttagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaactaaactaatcattt 44648541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 9300298 - 9300137
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc--actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 107  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| |||||||  ||||||||||  ||| |  |||| |||| | ||||| ||| ||||  | || |||||| ||||    
T  9300298 tctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcagtatttattatttctttccccactattatatccttatttattgaatttcattcaacttaactact 9300199  T
Q  108 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||||||| ||||| ||||| | ||||  |||||  || |||||||| ||||||||||||    
T  9300198 ccactaactaaaattaataagggtgttttagtaaatgctattaattttaccattaaaatcaa 9300137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 13831764 - 13831703
Alignment:
Q  1 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 62  Q
    ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13831764 tttttcatatctcaaaagaactgtcactttagaatatcaatgcaacatttatcattattttt 13831703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 27294155 - 27294086
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 166  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  27294155 acttaattactccactaactgcaattaataaatatattttagtaaaagatactaattttatcattcaaat 27294086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 42182119 - 42182033
Alignment:
Q  2 tttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattc 90  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||| ||||| ||| |||||    
T  42182119 tttttttgtcttaaaataattgtcgttttagaata-caatgcaacatttataatta-ttttcaccaatgtacccttatttattgaattc 42182033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 5053335 - 5053292
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttatt 53  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  5053335 tctcaaaataattgtcactttaaaatatcaatgcaacatttatt 5053292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 169
Target Start/End: Original strand, 31270985 - 31271113
Alignment:
Q  39 aatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttc 138  Q
    ||||||| |||||||||| ||||  | || |||||| ||||| ||| |||| ||  | |||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||||      
T  31270985 aatgcaatatttattattttttt--attactatacccttatttattgaattttatccaacttaactactccactaactataattaataagagtattttag 31271082  T
Q  139 taaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    || || ||| |||||||| ||||||||||||    
T  31271083 tatatgatattaattttaccattaaaatcaa 31271113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 89
Target Start/End: Original strand, 36967307 - 36967385
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaatt 89  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||| ||||    
T  36967307 tctcaaaataattgttactttagaatatcaatgcataatttattatt-tttttcattattatacccttatttattgaatt 36967385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 40996449 - 40996355
Alignment:
Q  109 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcatt-aaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 203  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| | |||||||||| |||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  40996449 cactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgaaactaatttta-cattcaaaatcaacacaattaatcatttccttaacaattgtgcataa 40996355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 187
Target Start/End: Original strand, 5356620 - 5356709
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttcct 187  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| | ||  ||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  5356620 acttaattattccattaactacaattaataaag-tacattagtaaatgatattaattttatcattaaaatcaacacaactaatcatttcct 5356709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 190
Target Start/End: Original strand, 51133 - 51225
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||   | ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  51133 acttaattaatccactaactacaattaataaatgtgtttttgtaaatgatacttatttta-cattaaaatcaacacaattaatcattttcttaa 51225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 1875676 - 1875595
Alignment:
Q  109 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  1875676 cactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaa 1875595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 1875916 - 1875843
Alignment:
Q  16 aataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaatt 89  Q
    ||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||    
T  1875916 aataattgtcactttacaataccaatgcaacatttattacttttttccactagtatacccttatttattaaatt 1875843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 58
Target Start/End: Original strand, 32678353 - 32678397
Alignment:
Q  14 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattat 58  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  32678353 aaaataattgtcactttaaaatatcaatgcatcatttattattat 32678397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 149
Target Start/End: Original strand, 32678423 - 32678475
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatact 149  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||||    
T  32678423 acttaactactccactaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatact 32678475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 34455852 - 34455812
Alignment:
Q  16 aataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattatt 56  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  34455852 aataattgtcaatttaaaatatcaatgcaacatttattatt 34455812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 14523552 - 14523372
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| | ||||||||| ||||  |    |||||| ||||||    
T  14523552 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattattattttccattattatatccttattaattgaatttcatctaacttaactactcc 14523453  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  14523452 actaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaaaaaatcatttccttaa 14523372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Original strand, 17695261 - 17695443
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt--cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 107  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||    
T  17695261 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcatttattattattttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactact 17695360  T
Q  108 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    | |||||||| ||||| |||| |||||||| ||||| |||  ||||||| |||| |||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  17695361 ctactaactataattaataagaatatttttgtaaatgatatcaattttaccattgaaatcaatacaattaatcatttccttaa 17695443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 43410363 - 43410539
Alignment:
Q  14 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 113  Q
    ||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| || || |||||  | ||| ||| ||||  | || |||||| ||||||| ||    
T  43410363 aaaataattgtcactttagaatactaatgcaacatttattatttttttccattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccatta 43410462  T
Q  114 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| | |||||  ||| |||| ||||||||||    
T  43410463 actacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatatcaacacaattaataatttccttaa 43410539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 36354622 - 36354430
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||  |||||||||| |||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  36354622 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagaatttattatt-ttttccattattataccattatttattgaatttcatccaacttaactactcc 36354524  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 203  Q
    |||||||||||||| ||||  | |||   ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  |||||| | |||||||||| ||| ||||||||    
T  36354523 actaactacaattaataagagtgtttcaataaataatactaattttaccatcaaaatcaacacaactagtcatttccttaataatcgtacataa 36354430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8947232 - 8947047
Alignment:
Q  12 tcaaaataattgtcattt---cagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 108  Q
    ||||||||||||||||||    | |||| |||||||| |||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||||    
T  8947232 tcaaaataattgtcattttacaacaataccaatgcaatatttattatt-tttttcattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactc 8947134  T
Q  109 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaatt 195  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||||| ||||    
T  8947133 cactaactataattaataaggatgttttagtaaatattactaattttatcattgaaatcaacacaattaatcatttccttaataatt 8947047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Original strand, 34225527 - 34225683
Alignment:
Q  14 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 113  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| |||||||  |||||||||| ||||||| || |||||| ||||| ||| ||||  | || |||||| ||||||| ||    
T  34225527 aaaataattgtcactttggaataccaatgcagtatttattattttttttcattattatacccttatttattaaatttcattcaacttaaatactccatta 34225626  T
Q  114 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaat 170  Q
    |||||||||| ||||| | ||||  ||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  34225627 actacaattaataagggtgttttagtaaataatactaagtttaccattaaaatcaat 34225683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Original strand, 16463620 - 16463802
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt--cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 107  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||  || || | |||| ||||| ||| ||||  |    |||| | ||||    
T  16463620 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattattattttttccattattttaccattatttattaaatttcatcaaactttactact 16463719  T
Q  108 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  16463720 ccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaa 16463802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 35242486 - 35242284
Alignment:
Q  1 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 100  Q
    |||| ||||||| |||||| || | | || |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||| ||||  |  | ||||    
T  35242486 ttttctatgtctgaaaatagttataactttagaataccaatgcaatatttattattagttttcactattatacttttatttattgaatttcatccaactt 35242387  T
Q  101 aattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtaca 200  Q
    || ||||| |||||||||||||| |||  ||||| |  ||||| || ||||||||| ||||||||||||  ||| |||  || ||||||| |||||| ||    
T  35242386 aactactcaactaactacaattaataaatatattctagtaaatgattctaattttaacattaaaatcaacacaattaaacatctccttaaaaattgtgca 35242287  T
Q  201 taa 203  Q
    |||    
T  35242286 taa 35242284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 165
Target Start/End: Original strand, 19444077 - 19444234
Alignment:
Q  8 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactcca-cttaattac 106  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||| || || ||| || | || |||| ||||| |||    
T  19444077 tgtcttaaaataattgtcacttcaaaatatcaatgcaacatttattatttttttacattattatacccttgtttattgaaattta-tccatcttaactac 19444175  T
Q  107 tccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaa 165  Q
    || ||||| |||||||| |||  | |||||  ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  19444176 tcgactaattacaattaataataacattttagtaaataatattaattttatcattaaaa 19444234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16377833 - 16377656
Alignment:
Q  12 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaat----tact 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     || |||||||||| ||||| |||||| ||| ||||  |  | |||||||    ||||    
T  16377833 tcaaaataattgtcattttagaatatcaatgcaacatt-----ttttttttcactattatacttttatttattgaatttcatccaacttaattaactact 16377739  T
Q  108 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||| ||||  ||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  16377738 ccactaactacaattaataaggttattttggtaaatgatattaattttaccattgtaatcaacacaattaatcatttctttaa 16377656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 5789827 - 5789648
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| || | |    
T  5789827 tctcaaaataattgtcactttacaatatcaatgcatcatttattatt-ttttccactattataccattatttattgaatttcatccaacttaactatttc 5789729  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  |||||   ||||||||||  ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||    
T  5789728 actaactacaattaataagggtgttttagtaaatgccactaattttactattgaattcaatacaattaatcatttccttaa 5789648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 190
Target Start/End: Original strand, 16805836 - 16805994
Alignment:
Q  31 agaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactcca-cttaattactccactaactacaattattaagg 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || ||| |||| ||  ||| |||| || |||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  16805836 agaatatcaatgcatcatttattatcttttttcattattatccctt-atctattaaatt-taatccaacttaacaactccactaactacaattaataagg 16805933  T
Q  130 atatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  16805934 atattttagtaaatgatactaattttactattaaaatcaacacaattaatcatttctttaa 16805994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 190
Target Start/End: Original strand, 16845117 - 16845275
Alignment:
Q  31 agaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactcca-cttaattactccactaactacaattattaagg 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| || ||| |||| ||  ||| |||| || |||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  16845117 agaatatcaatgcatcatttattatcttttttcattattatccctt-atctattaaatt-taatccaacttaacaactccactaactacaattaataagg 16845214  T
Q  130 atatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||  |||||||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  16845215 atattttagtaaatgatactaattttactattaaaatcaacacaattaatcatttctttaa 16845275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Original strand, 35313820 - 35314000
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||  |||||||||||||||| | |||| ||||| |||||  ||||| ||| ||||  |    |||||| ||||||    
T  35313820 tctcaaaataattgtcactttacaataataatgcaacatttattacttttttccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc 35313919  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||||||| ||||| |  |||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  35313920 actaactacaattaataaggttgctttaataaatactactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaa 35314000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 37322362 - 37322520
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| | ||| | ||||||||||| |||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |    |||||| ||||||    
T  37322362 tctcaaaataattgtcactttagaatacctatgtagcatttattatt-ttttccattattatacccttatttattgaatttcatctaacttaactactcc 37322460  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||    
T  37322461 actaactacaattaataagggtattttaataaatgatattaattttaccattgaaatcaa 37322520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 15359269 - 15359108
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt--cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 107  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||| |||||||  || ||  ||||| ||||| ||| || |  |  | |||||| ||||    
T  15359269 tctcaaaataattgttactttagaatatcaatgcagtatttattagtatttttttcattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactact 15359170  T
Q  108 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  15359169 ccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatattaattttatcatcaaaatcaa 15359108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 190
Target Start/End: Original strand, 39691457 - 39691603
Alignment:
Q  44 aacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaat 143  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||| ||||  | || |||| | ||||||||||||| |||||| ||||  ||||||  |||||    
T  39691457 aacatttattattattttccattattatacccttatttattgaatttcattcaactttactactccactaactgcaattaataagagtattttagtaaat 39691556  T
Q  144 tatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  39691557 gatattaattttatcattgaaatcaacacaattaatcattttcttaa 39691603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 38188060 - 38187904
Alignment:
Q  12 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 111  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||| |||  |||||||||||| | |||| |||| ||||||| ||||| ||| ||||  ||| ||||||  ||||| ||    
T  38188060 tcaaactaaatgtcattttagaataccaaatcaacatttattaat-ttttccactcatataccattatttattgaatttcacttcacttacatactcgac 38187962  T
Q  112 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||||||||| || || | ||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  38187961 taactacaattaataggggtgttttagtaaattaaactaattttaccattaaagtcaa 38187904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 9458445 - 9458271
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| |||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||| | ||||||    
T  9458445 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattatt-ttttccattattatacccttatttattaaatttcatccaactttactactcc 9458347  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||     | || |||||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  9458346 actaactacaattaataagggtgtttt-----aatacactaattttaccatcaaaatcaacacaattaattattttcttaa 9458271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 189
Target Start/End: Original strand, 25637413 - 25637593
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 108  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||||    
T  25637413 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattattttttttccattattacacccttatttattaaatttcatccaacttaactactc 25637512  T
Q  109 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttcctta 189  Q
    |  |||||||||||| ||| | | ||||  ||||| | |||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||||||||    
T  25637513 ctataactacaattaataaaggtgttttagtaaatgacactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttcctta 25637593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Original strand, 36794217 - 36794397
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||| ||| || | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||| ||| || |  |  | |||||| ||||||    
T  36794217 tctcaaaataattatcactttaaaataccaatgcagcatttattattttttttcattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactactcc 36794316  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||| ||| |||||   ||||  ||||  |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  36794317 actaactacagttaataagggcgttttagtaaaagatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaa 36794397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 128
Target Start/End: Original strand, 19937317 - 19937436
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 108  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||| |||||||||||||| | || |||| | | || |||||||||||| ||| |||| || || |||||| |||||    
T  19937317 tctcataataattgtcactttagtataacaatgcaacatttaatttttttttcccattattatacctttatttattgaattttattcaacttaactactc 19937416  T
Q  109 cactaactacaattattaag 128  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  19937417 cactaactacaattaataag 19937436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 43115959 - 43115802
Alignment:
Q  33 aatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggata 132  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||| || || |||||| |||||  || ||||  | || |||||| |||||||||||||||||| | ||||  ||    
T  43115959 aatatcaatgtagcatttattatttttttccattattataccattattcgttgaatttcattcaacttaactactccactaactacaataaataagagta 43115860  T
Q  133 tttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||||  |||||  |||||| ||||||||| |||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  43115859 ttttagtaaatgctactaactttatcattgaaatcaacacaattaatcatttctttaa 43115802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 62
Target Start/End: Original strand, 45235512 - 45235564
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 62  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45235512 tctcaaaataattgtcactttataataccaatgcaacatttattattattttt 45235564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 7495019 - 7494909
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttatta-ttatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 108  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||| || ||||||| || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||||    
T  7495019 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattatttttttttcattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactc 7494920  T
Q  109 cactaactaca 119  Q
    | |||||||||    
T  7494919 cgctaactaca 7494909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 34451521 - 34451471
Alignment:
Q  1 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacattta 51  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  34451521 ttttttctatctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacattta 34451471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 61
Target Start/End: Original strand, 11366719 - 11366768
Alignment:
Q  12 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt 61  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11366719 tcaaaatatttgtcattttacaatatcaatgcaacatttattattttttt 11366768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 169
Target Start/End: Original strand, 27866527 - 27866583
Alignment:
Q  112 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  27866527 taactacaattaataaggatattttactaaa-gatattaattttatcattaaaatcaa 27866583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Original strand, 16028270 - 16028345
Alignment:
Q  31 agaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 107  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||    
T  16028270 agaatattaatgcaacatttataatt-tttttcactattatacatttatttattgaatttcactccacttaactact 16028345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 174
Target Start/End: Original strand, 12872762 - 12872869
Alignment:
Q  67 aatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 166  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  |||||| ||||||||| || | ||||| |||| ||| |||  | |  ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12872762 aatattcctttattaattgaatttcactccatttaattactacattcactacgattaataatgatggtgtagtaaattatattaattttaccattaaaat 12872861  T
Q  167 caattcaa 174  Q
    ||| ||||    
T  12872862 caactcaa 12872869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 63
Target Start/End: Original strand, 25904722 - 25904773
Alignment:
Q  12 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc 63  Q
    ||||||||||||||| || | ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  25904722 tcaaaataattgtcactttaaaatattaatgcatcatttattattatttttc 25904773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 7491079 - 7491128
Alignment:
Q  1 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacattt 50  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||    
T  7491079 ttttctatgtctcaaaataattgtcactttaaaatatcaatgaaacattt 7491128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 11742709 - 11742656
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc 63  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  |||| ||||||||||||| ||||||    
T  11742709 tctcaaaataattgtcactttagaatacgaatgaaacatttattattttttttc 11742656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 169
Target Start/End: Original strand, 28186146 - 28186306
Alignment:
Q  9 gtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 108  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||| ||||||  ||| |||||  |||| ||||| |||   |||||| ||| ||||  | || |||||| |||||    
T  28186146 gtctcaaaataattgtcactttataatataaatgcagtattaattatatttttccactattatttttttatttattgaatttcattcaacttaactactc 28186245  T
Q  109 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
      ||||||| ||| | ||||||||||||  ||||| ||  |||||||| |||||| |||||    
T  28186246 tgctaactaaaatgaataaggatattttaataaatgattataattttaccattaatatcaa 28186306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 41221039 - 41220967
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||| |||| || |||||||||||| |||  |||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  41221039 acttaactacttcattaactacaattaataaaaatattttaataaatgatactaattttataattgaaatcaa 41220967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 57)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 190
Target Start/End: Original strand, 39864045 - 39864224
Alignment:
Q  11 ctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcca 110  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||||||    
T  39864045 ctcaaaataattgtcactttacaatatcaatgcaacatttattatttttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactcca 39864144  T
Q  111 ctaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  39864145 ctaactacaattaataagagtattttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaa 39864224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Original strand, 31042730 - 31042910
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||  ||| ||||||| ||| ||||  | || ||||||||||| |    
T  31042730 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatacatcatttattatttttttccactatgatatctttatttattgaatttcattcaacttaattacttc 31042829  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||    ||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  31042830 actacctacaattaataagggtattacagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaa 31042910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Original strand, 37506057 - 37506240
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||  ||||| ||||| ||| ||||  | || |||||| ||||||    
T  37506057 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattatttttttccattataatacccttatttattgaatttcattcaacttaactactcc 37506156  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaatta---tactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||||||| |||   | ||||  ||||| |   ||||||||||||||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  37506157 actaactacaattaataaaagtgttttagtaaatgatagtactaattttatcatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaa 37506240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 49224171 - 49224012
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||| ||| || |  |  | |||||| ||||||    
T  49224171 tctcaaaataattgtcactttagaatactaatgcaacatttattattttttttcattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactactcc 49224072  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  49224071 actaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaa 49224012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 190
Target Start/End: Original strand, 27896886 - 27897068
Alignment:
Q  8 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 107  Q
    |||||| ||||| || ||| || |||||||| || ||  || ||||||| ||||  |||| |||||||||||| ||| ||||  |  | ||| |||||||    
T  27896886 tgtctccaaatatttatcactttagaatatctattcagtatatattatttttttcgactattatacctttatttattaaatttcatccaactaaattact 27896985  T
Q  108 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |   |||||||||||||||    
T  27896986 ccactaactataattaataagaatattttgataaattatactaattttatcattaaaatcaacacgtttaattatttccttaa 27897068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 41122017 - 41121833
Alignment:
Q  1 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 100  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||| |||| |||||| ||  | | ||       
T  41122017 ttttttttttctcaaaataattgtcactttaaaatatcaatacaacatttattattttttttcattattatacccttat-aattta-ttaaatttcatca 41121920  T
Q  101 aattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttcct 187  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||||||    
T  41121919 aactactccactaactacaattaataagggtattttagtaaattatgctaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttcct 41121833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 9379156 - 9379358
Alignment:
Q  1 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccact 99  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||| | || ||||||| |||| ||| ||||  |    |||    
T  9379156 ttttttctttcttaaaataattgtcattttagaatatcaatgcaatatttatt--tatttttccattattatacctatatttattaaatttcatcaaact 9379253  T
Q  100 taattactcc-actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgta 198  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| |||  |||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||| |||| ||||||     
T  9379254 taactactcccactaactacaattaataaatatattttaataaatgatattaattttatcattaaaatcattacaattaatcatttctttaaaaattgtg 9379353  T
Q  199 cataa 203  Q
    |||||    
T  9379354 cataa 9379358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Original strand, 12039015 - 12039195
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  12039015 tctcaaaataattgtcactttacaatactaatgcaacatttattattattttccactattatacccttatttattgaattacatccaacttaaatactcc 12039114  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    | |||||||||||| ||||  | | ||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  12039115 attaactacaattaataagagtgtattagtaaatgttactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaa 12039195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 37177769 - 37177882
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||  | |||||| ||||      
T  37177769 tctcaaaataattgtcattttagaatgtcaatgtaacacttattattatttttcactattatactcttatttatttaattttatccaacttaactactat 37177868  T
Q  110 actaactacaatta 123  Q
    ||||||||| ||||    
T  37177869 actaactaccatta 37177882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 7351572 - 7351728
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||| |||  |||||| || |||||  ||||| ||| |||| |   | ||||||||| |||    
T  7351572 tctcaaaataattgtcattttagaatactaatgcaac-tttatcatt--ttttcattattatactcttatttattgaattttgtccaacttaattattcc 7351668  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7351669 actaactagaattaataaggttattttagtaaataatattaattttatcattaaaatcaa 7351728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 20210025 - 20209866
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| |||  || ||  ||||| ||||| ||| || |  |  | |||||| ||||||    
T  20210025 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattattttttcccattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactactcc 20209926  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||||||  || ||||||||    
T  20209925 actaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactaattttactatcaaaatcaa 20209866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 40145030 - 40144803
Alignment:
Q  12 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 111  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||  || ||  ||||| ||||| ||| || |  |  | |||||| |||||||     
T  40145030 tcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattattttttcccattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactactccat 40144931  T
Q  112 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataactctataa 211  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||  ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||| ||||| || ||| ||| | |||  ||    
T  40144930 taactacaattaataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcattttcttaataactgtgcatcaatcttgaa 40144831  T
Q  212 caactattagtttgagatggtgggagta 239  Q
    | ||||||| || ||||| | |||||||    
T  40144830 cgactattatttagagattgagggagta 40144803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Original strand, 52429279 - 52429403
Alignment:
Q  14 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcac--taatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 111  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| |  || |||||| ||||| | | ||||  | || |||||| ||||||||    
T  52429279 aaaataattgtcactttacaatatcaatgcaacatttattattttttttctcattattatacccttatttaatgaatttcattcaacttaactactccac 52429378  T
Q  112 taactacaattattaaggatatttt 136  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||    
T  52429379 taactacaattaataagggtatttt 52429403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 6160637 - 6160454
Alignment:
Q  8 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 107  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||         | || || |||||| || || ||| ||||  | || |||||| || |    
T  6160637 tgtctcaaaataattgtcattttagaatatcaatgcaacattta---------tgcattattatacccttgtttattgaattacattcaacttaactatt 6160547  T
Q  108 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtaca 200  Q
    ||| |||||||||||| ||||  ||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||| |||| |||| ||||| ||| |||||    
T  6160546 ccattaactacaattaataagagtattttagtaaataatactaattttatcattgaaatcaacacaattaatcattttcttaaaaatcgtaca 6160454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 184
Target Start/End: Original strand, 7759150 - 7759322
Alignment:
Q  12 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 111  Q
    ||||||||||||||| || | ||||  |||||| ||||||||||| |||| || || |||||| ||||| ||| ||||  | || |||||| || |||||    
T  7759150 tcaaaataattgtcactttacaataataatgcatcatttattatttttttccattattatacccttatttattgaatttcattcaacttaactattccac 7759249  T
Q  112 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 184  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||  ||||| ||| |||||| | |||| |||||||  ||| |||||||||    
T  7759250 taactacaattaataagagtattttagtaaatgatattaatttcaccattgaaatcaacacaattaattattt 7759322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 6268438 - 6268375
Alignment:
Q  1 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttca 64  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6268438 ttttttctgtctccaaataattgtcattttagaatatcaatgtaacatttattaatatttttca 6268375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 35367735 - 35367854
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||| ||| ||||  |    |||||| ||||||    
T  35367735 tctcaaaataattgtcactttacaataccaatgaaacatttattagtctttttcactattatacccttatttattgaatttcatctaacttaactactcc 35367834  T
Q  110 actaactacaattattaagg 129  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  35367835 actaactacaattaataagg 35367854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 6785189 - 6785315
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |    |||||| ||||||    
T  6785189 tctcaaaataattgtcactttacaatacctatgcaacatttattatttttttccactattatacccttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc 6785288  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttt 136  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||    
T  6785289 actaactacaattaatgaagatatttt 6785315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 23169185 - 23168998
Alignment:
Q  1 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 100  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||   |||| ||||| |||||  ||||| ||| ||||  ||  |||||    
T  23169185 ttttttttttctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaacatttatta--cttttccactattatactcttatttattgaatttcacctcactt 23169088  T
Q  101 aattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    || || |  |||||||| ||||| ||||||| ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  23169087 aactatttaactaactataattaataaggatgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaattattttcttaa 23168998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 190
Target Start/End: Original strand, 26093414 - 26093507
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  26093414 acttaattacttcactaactacaattaataaggatattttaataaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattttcttaa 26093507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 9307564 - 9307740
Alignment:
Q  15 aaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 113  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||| |  |||||||||| |||| | |||| |||||||||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||||||    
T  9307564 aaataattgtcattttacgatatcaatgtagtatttattatttttttcccactattatacctttatttattgaatttcatccaacttaactactccacta 9307663  T
Q  114 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||||||||||  |||| | ||||  |||||  || ||||||||||||| |||||||  ||  |||| ||||||||||    
T  9307664 actacaattaacaagggtgttttagtaaatgctattaattttatcattgaaatcaacacagttaatcatttccttaa 9307740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 8896497 - 8896358
Alignment:
Q  31 agaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaat-atacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaagg 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |  | || ||||||||||| ||| ||||  |  | ||||||  ||||||||||||||||||| |||      
T  8896497 agaatatcaatgcaacatttattatttttttcccatgattatacctttatttattgaatttcatccaacttaaccactccactaactacaattaataaat 8896398  T
Q  130 atatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||    
T  8896397 atattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaa 8896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 24991839 - 24991725
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt-tcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 108  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||  |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||  |  | |||||| || ||    
T  24991839 tctcaaaataattgtcactttacaatactaatgcaacatttattatttttttcccactattatacctttatttattgaatttcatccaacttaactattc 24991740  T
Q  109 cactaactacaatta 123  Q
    |||||||||||||||    
T  24991739 cactaactacaatta 24991725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16395230 - 16395039
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||| |  |||||||||| ||||||| || |||| | ||||| ||| ||||  |    |||||| ||||||    
T  16395230 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgtaggatttattatt-tttttcattattatatcattatttattgaatttcatctaacttaactactcc 16395132  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 203  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||  ||||| ||||||||||||  || ||||||||  ||| |||| |||| ||||| ||| || |||||    
T  16395131 actaactacaattaaaaagg-tattttagtaaatgatactaattttactatcaaaatcaacacaattaatcattttcttaataatcgtgcataa 16395039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22856399 - 22856275
Alignment:
Q  33 aatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactcca-cttaattactccactaactacaattattaaggat 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||| ||| |||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  22856399 aatatcaattcaacatttattatttttttgcactattatacttttatttattgaatt-tcatccagcttaactactccactaactacaattaattagggt 22856301  T
Q  132 atttttctaaattatactaattttat 157  Q
    |||||  |||||  || |||||||||    
T  22856300 attttagtaaatggtattaattttat 22856275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 169
Target Start/End: Original strand, 12151123 - 12151268
Alignment:
Q  12 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 111  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||             ||||| || | |||||| | ||||||    
T  12151123 tcaaaataattgtcactttataatatcaatgcagcatttattattatttttcattattatag------------aattccacccaacttaactgctccac 12151210  T
Q  112 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||||||||| | |  |||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  12151211 taactacaattaattacaatattttagtaaatgatactaattttatcattgaaatcaa 12151268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 13579801 - 13579626
Alignment:
Q  14 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 113  Q
    ||||||||||||| || | |||| | |||||| |||||||||||||||| | || |||||| ||||| ||| ||||  |    |||||| ||||||||||    
T  13579801 aaaataattgtcactttaaaataccgatgcaatatttattattattttt-attattatacccttatttattgaatttcatcaaacttaaatactccacta 13579703  T
Q  114 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||| || || | ||||| ||||| ||| |||| || |||| ||||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  13579702 actacaattaatatgggtgtttttgtaaatgatattaatattgtcatcaaaatcaacacaattaatcatttctttaa 13579626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 17988931 - 17988867
Alignment:
Q  9 gtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatac 73  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||    
T  17988931 gtctcaaaataattgtcattttaaaatattaatgcaacatttattatttctttccactattatac 17988867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 33733447 - 33733268
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||| |||| || || |||||| ||||| ||| ||||  | || || |||  ||||     
T  33733447 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgaagcatttattattcttttccattattatacccttatttattgaatttcattctacctaaccactct 33733348  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||||||| |||   ||||||  |||||  || |||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  33733347 actaactacaattaataaaagtattttagtaaatgttaataattttaccattgaaatcaacacaa-taatcatttccttaa 33733268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 117
Target Start/End: Original strand, 4659710 - 4659816
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||  ||||| |||| ||||| |||| | ||||| ||| ||||  | || |||||||||||||    
T  4659710 tctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaacattatttatt-ttttccactattatatccttatttattgaatttcattcaacttaattactcc 4659808  T
Q  110 actaacta 117  Q
    ||||||||    
T  4659809 actaacta 4659816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 35682978 - 35682900
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaatt 89  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||    
T  35682978 tctcaaaataattgccaatttagaatatcaatgcaatatttattatt-ttttccactattatacccttatttattgaatt 35682900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Original strand, 37238951 - 37239006
Alignment:
Q  1 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattatt 56  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||    
T  37238951 ttttttctgtctcaaaataattgtcattttaaaatattaatgcagcatttattatt 37239006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 978952 - 978854
Alignment:
Q  100 taattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgta 198  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||   ||||| | ||  ||||||||||| |||||||  |||||||| |||| ||||| |||||||    
T  978952 taattgctccactaactactattaataaggatatttcattaaatgaaacacattttatcattgaaatcaacacaactaatcattttcttaagaattgta 978854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 26252646 - 26252565
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacattta--ttattatttttcactaatatacctttattaatttaatt 89  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||    
T  26252646 tctcaaaataattgtcattttacaatttcaaagcaacatttattttattttttttcattaatatacccttatttattgaatt 26252565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 203
Target Start/End: Original strand, 38787271 - 38787467
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt---cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattac 106  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | |||||||| ||||||| || |||||   || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | | |||| |||    
T  38787271 tctcaaaataattgtcactttagaaaagcaatgcaaaatttattttttttttttcccattattatacccttatttattgaatttcatccaatttaactac 38787370  T
Q  107 tccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 203  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||   |||| |||||| ||||| ||| ||||||||  |||  ||| |||||||||| ||| || |||||    
T  38787371 tccactaactataattaataaggatgttttggcaaatgatactagttttaccatcaaaatcaacacaatcaatcatttccttaataatcgtgcataa 38787467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 44426838 - 44426746
Alignment:
Q  95 ccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatacta---attttatcattaaaatcaattcaactaattattt 184  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||| ||||  ||||| ||||||   |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  44426838 ccacttaattgctccactaattacaattaataaagatgttttagtaaatgatactacaaattttaccattgaaatcaactcaactaattattt 44426746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 44761710 - 44761560
Alignment:
Q  12 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 111  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||  || ||||| ||    | |||||| ||||| ||| ||||  | || ||||||  | |||||    
T  44761710 tcaaaataattgtcactttagaatattaacgcaacattattttttattatt----attatacccttatttattgaatttcattcaacttaaccattccac 44761615  T
Q  112 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 166  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  44761614 taactataattaataaagatattttagtaaatgatattaattttatcattaaaat 44761560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 169
Target Start/End: Original strand, 15699142 - 15699214
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||    
T  15699142 acttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaa 15699214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 21910193 - 21910141
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 62  Q
    ||||| ||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21910193 tctcagaataattgtcactttaaaatatcaatgccacatttattattattttt 21910141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 44707917 - 44707785
Alignment:
Q  38 caatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatattttt 137  Q
    |||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||||||| ||| ||||  |  | |||||| | || ||||||||||||||| |||   | ||||     
T  44707917 caatgcaatatttattatttgtttccactattatacctttatttattgaatttcatccaacttaactgcttcactaactacaattaataaatgtgtttta 44707818  T
Q  138 ctaaattatactaattttatcattaaaatcaat 170  Q
     |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  44707817 gtaaatactactaattttatcattgaaatcaat 44707785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 73
Target Start/End: Original strand, 3312056 - 3312115
Alignment:
Q  14 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatac 73  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  3312056 aaaataattgtcactttataatatcaatacaacatttattattatattccactattatac 3312115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 203
Target Start/End: Original strand, 35538678 - 35538769
Alignment:
Q  112 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||   ||||||||||| |||||||  ||| |||| |||| ||||| ||||||| ||||    
T  35538678 taactacaattaataaggatattttagtaaataatatccattttatcattgaaatcaacacaattaataattttcttaaaaattgtaaataa 35538769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 190
Target Start/End: Original strand, 36701951 - 36702034
Alignment:
Q  107 tccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||  ||||| |||||||||||| |||| |||||||   || |||| ||||||||||    
T  36701951 tccactaactacaattaataagggcattttagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaacataattaatcatttccttaa 36702034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 190
Target Start/End: Original strand, 36718055 - 36718138
Alignment:
Q  107 tccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||  ||||| |||||||||||| |||| |||||||   || |||| ||||||||||    
T  36718055 tccactaactacaattaataagggcattttagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaacataattaatcatttccttaa 36718138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 200
Target Start/End: Original strand, 37177913 - 37177968
Alignment:
Q  145 atactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||| |||||    
T  37177913 atactaattttatcattaaaatcaatgcaattaattgttttcttaaaaatcgtaca 37177968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 43500925 - 43500874
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt 61  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  43500925 tctcaaaataattgtcactttagaatactaatgcagcatttattattatttt 43500874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 2137562 - 2137441
Alignment:
Q  1 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 100  Q
    |||||| | ||| |||||||||  ||| | |||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||| ||| |||| ||  | ||||    
T  2137562 ttttttttctcttaaaataattaacatattagaatatttatgcaacatttattatt-tttttcattattatatctttatttattgaattttatccaactt 2137464  T
Q  101 aattactccactaactacaatta 123  Q
    || ||||||| |||| |||||||    
T  2137463 aaatactccaataacaacaatta 2137441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Original strand, 31879177 - 31879281
Alignment:
Q  16 aataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaac 115  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||   ||||| ||| |||| |||||||| | |||||||| |||||    
T  31879177 aataattgtcattttgaaatatcaatgcaatattt-ttatt-tttttcattaatatattattatttattgaattttactccacgttattactcctctaac 31879274  T
Q  116 tacaatt 122  Q
    || ||||    
T  31879275 tataatt 31879281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 50
Target Start/End: Original strand, 37275536 - 37275574
Alignment:
Q  12 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacattt 50  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  37275536 tcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacattt 37275574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 169
Target Start/End: Original strand, 3312138 - 3312203
Alignment:
Q  104 tactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||||||||||||||||| ||   ||||| |  ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  3312138 tactccactaactacaattaatatcaatattatagtaaatgatactaatttaatcattaaaatcaa 3312203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Original strand, 15699073 - 15699114
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacattta 51  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  15699073 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcattta 15699114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 44426893 - 44426840
Alignment:
Q  8 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt 61  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  44426893 tgtctcaaaattattgtcactttagaatataaatacaacatttattattttttt 44426840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 169
Target Start/End: Original strand, 917044 - 917116
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||    
T  917044 acttaactaatctactaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccatttaaatcaa 917116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 136
Target Start/End: Original strand, 15904770 - 15904810
Alignment:
Q  96 cacttaattactccactaactacaattattaaggatatttt 136  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15904770 cacttaactacttcactaactacaattaataaggatatttt 15904810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 29778481 - 29778425
Alignment:
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 166  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  29778481 actaactacaattaataatgatattttagtaaatgatactaattttaccattgaaat 29778425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 203
Target Start/End: Original strand, 37276491 - 37276587
Alignment:
Q  107 tccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 203  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||  |||||||||||| ||| ||||||||  ||  |||| |||||||||| ||| || |||||    
T  37276491 tccactaactacaattaataagggtgttttagtaaacgatactaattttaccatcaaaatcaacacagttaatcatttccttaataatcgtgcataa 37276587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 39395285 - 39395249
Alignment:
Q  37 tcaatgcaacatttattattatttttcactaatatac 73  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39395285 tcaatacaacatttattattctttttcactaatatac 39395249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 61)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 759280 - 759087
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| |||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  759280 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattatttttttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactcc 759181  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 203  Q
     ||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||||||||| |||||| |||||    
T  759180 gctaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactagttttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataattgtgcataa 759087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Original strand, 34947440 - 34947620
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||| | ||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  34947440 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattatttttttccattattataccctcatttattgaatttcatccaacttaactactcc 34947539  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  34947540 actaactacaattaataagggtgttttagtaaatgataataattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttctttaa 34947620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Original strand, 7463152 - 7463333
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaa-tgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 108  Q
    |||||||||||| |||| || | |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||| ||||  |  | |||||| |||||    
T  7463152 tctcaaaataatcgtcactttacaataacaaatgcatcatttattattatttttcactattctatctttatttattgaatttcatccaacttaactactc 7463251  T
Q  109 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||   |||||  |||||||||||||||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  7463252 cactaactacaattaatgagggtatttaagtaaatgctactaattttatcattgaaatcaacacaattaatcatttccttaa 7463333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Original strand, 9785928 - 9786108
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||||| ||||||||||||||||||  || |||||| ||||| ||| |||| ||  | |||||| |||| |    
T  9785928 tctcaaaataattgtcactttaaaatattaatgcagcatttattattatttttctttattatacccttatttattgaattttatccaacttaactacttc 9786027  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||||||| ||||  | ||||  ||||| | | |||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  9786028 actaactacaattaataagcgtgttttagtaaatgaaattaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaa 9786108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 24516478 - 24516319
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||  ||||| | || ||||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  24516478 tctcgaaataattgtcattttacaatatcaatgcaacatttattatcttttcccactattttatctttatttattgaatttcatccaacttaactactcc 24516379  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||    
T  24516378 actaactacaattaataaggtttttttagtaaatgttactaattttaccattgaaatcaa 24516319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 203
Target Start/End: Original strand, 83324 - 83518
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaat-atacctttattaatttaattctactccacttaattactc 108  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  | || ||||  ||||| ||| ||||  |    |||||| |||||    
T  83324 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattattttttttccattatcatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactc 83423  T
Q  109 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 203  Q
    | ||||||||||||| |||| || ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||||||||| |||||| |||||    
T  83424 cgctaactacaattaataagaatgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataattgtgcataa 83518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23745521 - 23745399
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattat-tatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 108  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||| ||| |||| || ||||||||| |||||    
T  23745521 tctcaaaataattgttattttagaatattaatgcaacatttattatatttttttcactaatatacacttatttattgaattatattccacttaactactc 23745422  T
Q  109 cactaactacaattattaaggat 131  Q
     |  || |||||||| |||||||    
T  23745421 taagaagtacaattaataaggat 23745399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 38032668 - 38032804
Alignment:
Q  1 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatata---cctttattaatttaattctactcca 97  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| |||||||||  ||||||| |||||||   || ||||| ||||||||  ||||||    
T  38032668 ttttctatgtctcaaaataactgtcattttaaaatatcattgcaaaatttattat--tttttcattaatatataccccttatttatttaattgcactcca 38032765  T
Q  98 cttaattactccactaactacaattattaaggatatttt 136  Q
    ||||| || | ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  38032766 cttaactaatacactaactacaattaataagaatatttt 38032804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 21760173 - 21759993
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||| |  || |||||| | | | ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  21760173 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattatatttttcctttattataccctcaattattgaatttcatccaacttaactactcc 21760074  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    | |||||||||||| ||||| | ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  21760073 attaactacaattagtaagggtgttttattaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcattttcttaa 21759993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 28202498 - 28202318
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||| || ||||||||||| |||| || || |||||  ||||| ||| ||||  |  | |||| | ||||||    
T  28202498 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatacagcatttattatttttttccattattatactcttatttattgaatttcatccaactttactactcc 28202399  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| | | |||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  28202398 actaactacaattaataaggatgttttagtaaatgacattaattttaccatcaaaatcaacacaattaattattttcttaa 28202318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 41506253 - 41506061
Alignment:
Q  11 ctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcca 110  Q
    |||||||||||| ||| || | ||||||||||||| |||||||| | ||||||| || |||||  ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||||||    
T  41506253 ctcaaaataattatcactttacaatatcaatgcaatatttattaatttttttcaatattatactcttatttattgaatttcatccaacttaactactcca 41506154  T
Q  111 ctaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 203  Q
    ||||||||||||| ||||  | ||||  |||||  ||||||||||| ||||||||| ||  ||| |||| |||||||||| ||| || |||||    
T  41506153 ctaactacaattaataagagtgttttagtaaatgctactaattttaccattaaaattaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataa 41506061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 17610736 - 17610561
Alignment:
Q  1 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 100  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| | || |||||||||||  ||||||||||  | |||| |||||||||| |  |||| ||| ||||  |||| | ||    
T  17610736 ttttttatgtcttcaaataactgtgactttagaatatcaatataacatttatttattttttccactaatatatccctatttattgaatttcactctaatt 17610637  T
Q  101 aattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaact 176  Q
    || || | |||||| || ||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  17610636 aactatttcactaattaaaattaataagaatattttaataaattatactaattttaccattaaaatcaactcaact 17610561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 129
Target Start/End: Original strand, 2459413 - 2459530
Alignment:
Q  12 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 111  Q
    |||||||||||| || || | |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||||    
T  2459413 tcaaaataattgacactttacaataccaatgcagcatttattattttttttcactattatacccttatttattgaatttcatcctacttaactactccac 2459512  T
Q  112 taactacaattattaagg 129  Q
    |||||||||||| |||||    
T  2459513 taactacaattaataagg 2459530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 190
Target Start/End: Original strand, 13961986 - 13962079
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| | ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  13961986 acttaactactccactaactacacttaataaggatattttattaagtgatattaattttatcattaaaatcaacacaattaatcatttccttaa 13962079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 11373617 - 11373437
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||| | || | |||||||||||| ||||||||||| |||  ||||| |||||  ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  11373617 tctcaaaataattgttactttacaatatcaatgcagcatttattattttttcccactattatactcttatttattgaatttcatccaacttaactactcc 11373518  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  |||||  ||||||||||| |||  |||||||  ||| |||  ||||||||||    
T  11373517 actaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccatcgaaatcaacacaattaaacatttccttaa 11373437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 21350815 - 21350695
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 108  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||||    
T  21350815 tctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcagcatttattattttttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactc 21350716  T
Q  109 cactaactacaattattaagg 129  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  21350715 cactaactacaattaataagg 21350695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 32346241 - 32346061
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||  |||| || || |||||| ||||| ||| ||||  | || |||||| ||||||    
T  32346241 tctcaaaataattatcattttagaatactaatgcagcatttattatctttttccattattatacccttatttattgaatttcattcaacttaactactcc 32346142  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||||| || ||||| ||||  ||||||  || || ||| |||||||| |||| |||||||  |||  ||||||||||||||    
T  32346141 actaattataattaataagagtattttagtagatgatattaattttaccattgaaatcaacacaatcaattatttccttaa 32346061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 201
Target Start/End: Original strand, 33819154 - 33819345
Alignment:
Q  12 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattat--ttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||| || | |||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||| | | ||||  | || |||| | ||||||    
T  33819154 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcagcatttattattattattttcactattatacccttatttaatgaatttcattcaacttcactactcc 33819253  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacat 201  Q
    || ||| ||||||| ||||  |  |||| |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||||||||| ||| ||||||    
T  33819254 acaaacaacaattaataagagtgattttgtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtacat 33819345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Original strand, 43873863 - 43874043
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||  || ||  |||| |||||| ||| || |  |  | |||||| ||||||    
T  43873863 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcatttattattttttcccattataatacatttatttattaaacttcatccaacttaactactcc 43873962  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||| ||| ||||| | ||||  ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  43873963 actaactacatttaataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttctttaa 43874043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 149
Target Start/End: Original strand, 25571360 - 25571498
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| || |||    
T  25571360 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattatt-tttttaattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactattcc 25571458  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatact 149  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||  ||||| |||||    
T  25571459 actaactacaactaataagggtattttagtaaatgatact 25571498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 203
Target Start/End: Original strand, 21390234 - 21390428
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 108  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||||||||| ||||||||| |||||| | || |||||| ||||| ||| ||||  |    |||||| |||||    
T  21390234 tctcaaaataattgtcactttataataccaatgcaacgtttattattttttttccattattatacccttatttattgaatttcatctaacttaactactc 21390333  T
Q  109 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 203  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||  ||||| ||| || ||||| ||| ||||| ||  ||| |||| |||||||||| ||| || |||||    
T  21390334 cactaactacaatcaataaggatgttttagtaaatgatattagttttaccatcaaaattaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataa 21390428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 21937970 - 21937796
Alignment:
Q  16 aataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaac 115  Q
    ||||||||||| || |||||  ||||||| ||||||||||| |    |||||||| ||| || || ||| ||||| ||  || |||| ||||||||||||    
T  21937970 aataattgtcaatttagaatgccaatgcagcatttattattttcccccactaatacacccttgtttattaaattccacctcaattaactactccactaac 21937871  T
Q  116 tacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||| ||||  |  |||  ||||| | |||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||    
T  21937870 tacaattaataagagtgctttagtaaatgacactaattttatcattaaaataaagttaactaatcatttccttaa 21937796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 167
Target Start/End: Original strand, 22738665 - 22738798
Alignment:
Q  33 aatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggata 132  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||| ||||  |  | |||||| || || |||||||||||||| | ||||||    
T  22738665 aataccaatggaacatttattatt-ttttccactattatacctttatttattaaatttcatccaacttaactaatctactaactacaattaatgaggata 22738763  T
Q  133 tttttctaaattatactaattttatcattaaaatc 167  Q
    ||||  ||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  22738764 ttttagtaaatgatactaattttaccattgaaatc 22738798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 34100732 - 34100556
Alignment:
Q  14 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 113  Q
    ||||||||||||| || | ||||  |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||| |||   |  | |||||| |||| || ||    
T  34100732 aaaataattgtcactttacaatactaatgcaacatttattatgttttttcactattatacccttatttattgaatgtcatccaacttaactacttcagta 34100633  T
Q  114 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||  |||||||||||  ||| |||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  34100632 actacaattaataaagatattttagtaaatgctactaattttactattgaaatcaacacaattaatcattttcttaa 34100556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 37245621 - 37245709
Alignment:
Q  1 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaatt 89  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||    
T  37245621 ttttttttttctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaacatttattattttttctcactattatacccttatttattgaatt 37245709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 185
Target Start/End: Original strand, 39005448 - 39005536
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttc 185  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||  ||||| |||||||||||| ||||  |||||| ||||||||| |||||    
T  39005448 acttaattaatctactaactacaattattaaaggtattttagtaaatgatactaattttaccattttaatcaactcaactaataatttc 39005536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 6495122 - 6494964
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||| || ||||||| || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||| | ||||||    
T  6495122 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgtagcatttatt-ttttttttcattattatacccttatttattaaatttcatccaactttactactcc 6495024  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||||||||||| |||   | ||||  ||||| | |||||||||| ||| ||||||||    
T  6495023 actaactacaattaataaaagtgttttagtaaataacactaattttaccatcaaaatcaa 6494964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Original strand, 10042223 - 10042389
Alignment:
Q  12 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 111  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||| ||| | ||||| |  |||||| |||||||     
T  10042223 tcaaaataatcttcattttagaatatcaatgcatcgtttattattttttctcactgatatactcttatttattgagttctattttacttaactactccaa 10042322  T
Q  112 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaat 179  Q
    ||| || ||||| |||| |||||||  ||||| ||| ||| |||| || |||||| |||| |||||||    
T  10042323 taattataattaataagaatattttaataaatgatattaagtttacca-taaaataaatttaactaat 10042389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 32769914 - 32769725
Alignment:
Q  1 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||   ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| | | ||||  | | || ||    
T  32769914 ttttttctgtctcagaataattgtcattctaaaatatcaatgttgcatttattattcttttccactaacataccattattcaatgaatttcatttcattt 32769815  T
Q  101 aattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcatt-aaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    || |||||||  ||||||||||| |||| ||  |||  ||||||||||| |||| | |||| |||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  32769814 aactactccatcaactacaattaataagaat-gtttagtaaattatacttatttaaccattaaaaatcaatctaactaatcatttccttaa 32769725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 129
Target Start/End: Original strand, 36790678 - 36790799
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt--cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 107  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||  || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | || ||| ||||    
T  36790678 tctcaaaataattgtcactttagaatagcaatgcagcatttattattattttttccattattatacccttatttattgaatttcatccgacataactact 36790777  T
Q  108 ccactaactacaattattaagg 129  Q
    | |||||||||||||| |||||    
T  36790778 caactaactacaattaataagg 36790799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 203
Target Start/End: Original strand, 38391692 - 38391881
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 108  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||     |||||||||| ||||| || || ||||| |||||| ||| ||||  |  | ||||||||| ||    
T  38391692 tctcaaaataattgtcactttataatatcaat-----atttattatttttttttcattattatacttttatttattgaatttcatccaacttaattattc 38391786  T
Q  109 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 203  Q
    |||||||||||||||  |||  | ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||| ||||| |||||| |||||    
T  38391787 cactaactacaattaacaagagtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcattttcttaataattgtgcataa 38391881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 7457607 - 7457451
Alignment:
Q  12 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 111  Q
    ||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||  ||||| ||| ||||  | |  ||||||||| ||| |    
T  7457607 tcaaaataattatcactttacaatatcaatgcaacatttattatt-ttttccactattatactcttatttattgaatttaatttaacttaattattccgc 7457509  T
Q  112 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||||| ||| ||||| | ||||  |||||   |||||||||| |||| |||||||    
T  7457508 taactacatttaataagggtcttttagtaaatgtaactaattttaccattgaaatcaa 7457451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 123
Target Start/End: Original strand, 16904316 - 16904432
Alignment:
Q  9 gtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt--cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattac 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||||||     
T  16904316 gtctcaaaataattgtctttttagaatatcaatgtagtatttattattattttttccactattatacccttatttattgaatttgatccaacttaattat 16904415  T
Q  107 tccactaactacaatta 123  Q
    | ||||||||| |||||    
T  16904416 ttcactaactataatta 16904432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8592629 - 8592449
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||   |||| |||||  ||||| ||| ||||  |    |||| | ||||||    
T  8592629 tctcaaaataattttcattttacaatatcaatgcagcatttattattttttcctactattatactcttatttattaaatttcatctaactttactactcc 8592530  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  |||||  ||||||||| | |||| |||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  8592529 actaactacaattaataagggtgttttattaaatactactaatttaaccattgaaatcaacacaattaatcatttctttaa 8592449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 190
Target Start/End: Original strand, 12631345 - 12631425
Alignment:
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  |||||  |||||||||||  ||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  12631345 actaactacaattaataaggatgttttgataaatactactaattttactattgaaatcaatacaattaattatttccttaa 12631425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 44424076 - 44424203
Alignment:
Q  1 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 100  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||| ||| || |  |  | ||||    
T  44424076 ttttttttttctcaaaataattatcactttaaaatatcaatgcagcatttattatt-tttttcattataatacccttatttattgaacttcatccaactt 44424174  T
Q  101 aattactccactaactacaattattaagg 129  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  44424175 aattactccactaactacatttaataagg 44424203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 61
Target Start/End: Original strand, 27920926 - 27920977
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt 61  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  27920926 tctcaaaataattgtcactttagaatattaatgcaacatttattattttttt 27920977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 31930691 - 31930640
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt 61  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  31930691 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgaaacatttattattttttt 31930640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 36425228 - 36425106
Alignment:
Q  1 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatt-taattctactccact 99  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||| |||| || |||| |||| ||||| ||| || ||| ||| |||     
T  36425228 ttttttatttctaaaaataattgtcatttcaaaatattaatttaacatttattatt-ttttgcaataatgtacccttatttattatacttcaacttcacg 36425130  T
Q  100 taattactccactaactacaatta 123  Q
    ||| || | |||||||||||||||    
T  36425129 taactatttcactaactacaatta 36425106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16560672 - 16560566
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattg 196  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||  ||| |||| |||||||||| ||| |    
T  16560672 acttaactaccccactaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactagttttaccatcaaaataaacacaattaatcatttccttaataatcg 16560573  T
Q  197 tacataa 203  Q
    | |||||    
T  16560572 tgcataa 16560566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 203
Target Start/End: Original strand, 16604990 - 16605096
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattg 196  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||  ||| |||| |||||||||| ||| |    
T  16604990 acttaactaccccactaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactagttttaccatcaaaataaacacaattaatcatttccttaataatcg 16605089  T
Q  197 tacataa 203  Q
    | |||||    
T  16605090 tgcataa 16605096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 19271921 - 19271809
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactcc-acttaattactc 108  Q
    ||||||||||||||| | || | |||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||| ||||| | |||||| |  ||| |||||| |||||    
T  19271921 tctcaaaataattgttactttacaataccaatgcaacatttattatt-ttttccaatattatacccttattta-ttaattttcatccaacttaactactc 19271824  T
Q  109 cactaactacaatta 123  Q
    |||||||||||||||    
T  19271823 cactaactacaatta 19271809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 37850914 - 37850864
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattt 60  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  37850914 tctcaaaataattgtcattttagaatattaattcatcatttattattattt 37850864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 17828533 - 17828381
Alignment:
Q  17 ataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaac 115  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||   ||||||||||| ||||| || || |||| | ||||| ||| |||||  | | |||||||||||||||||||    
T  17828533 ataattgtcattttcgaataccaatgttgcatttattatttttttttcattattatatcattatttattgaattcatc-caacttaattactccactaac 17828435  T
Q  116 tacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||||  ||||  || |||| ||||| ||| |||||||| |||| |||||||    
T  17828434 tacaattgataagagtaattttgtaaatgatattaattttaccattgaaatcaa 17828381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 49101602 - 49101651
Alignment:
Q  1 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacattt 50  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49101602 ttttttttgtcttaaactaattgtcattttagaatatcaatgcaacattt 49101651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 117
Target Start/End: Original strand, 37490338 - 37490422
Alignment:
Q  33 aatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaacta 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||| ||| ||||  | || | |||||||||||||||||||    
T  37490338 aataccaatgcaacatttattattattttttactagtatgctcttatttattgaatttcattcaatttaattactccactaacta 37490422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 40614701 - 40614658
Alignment:
Q  141 aattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 184  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  40614701 aattatattaattttatcattgaaatcaattcaattaattattt 40614658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 3178391 - 3178234
Alignment:
Q  14 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacat--ttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccac 111  Q
    ||||||||||| | || ||||||  ||||||||||  |||||||  |||  || ||||||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||||    
T  3178391 aaaataattgttactttagaatactaatgcaacatatttattatgttttcccattaatatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactccac 3178292  T
Q  112 taactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||  ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||    
T  3178291 taactacaattaataaaggtgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaa 3178234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 30546540 - 30546499
Alignment:
Q  8 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacattt 50  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30546540 tgtctcaaaataattgtcattt-ggaatatcaatgcaacattt 30546499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 56
Target Start/End: Original strand, 42935598 - 42935644
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattatt 56  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||    
T  42935598 tctcaaaataattgtcactttagaatacaaatgcaacatttattatt 42935644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 184
Target Start/End: Original strand, 6855254 - 6855299
Alignment:
Q  139 taaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattattt 184  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  6855254 taaataatactaattttaccattaaaataaattcaactaatcattt 6855299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17609390 - 17609349
Alignment:
Q  139 taaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaatt 180  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  17609390 taaattatactaattttaccattaaaatcaactcaattaatt 17609349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17609633 - 17609592
Alignment:
Q  139 taaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaatt 180  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  17609633 taaattatactaattttaccattaaaatcaactcaattaatt 17609592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17609876 - 17609835
Alignment:
Q  139 taaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaatt 180  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  17609876 taaattatactaattttaccattaaaatcaactcaattaatt 17609835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17610119 - 17610078
Alignment:
Q  139 taaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaatt 180  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  17610119 taaattatactaattttaccattaaaatcaactcaattaatt 17610078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17610362 - 17610321
Alignment:
Q  139 taaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaatt 180  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  17610362 taaattatactaattttaccattaaaatcaactcaattaatt 17610321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 31930592 - 31930527
Alignment:
Q  104 tactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||| | || ||||| ||||||||||||    
T  31930592 tactccactaactacaattaataagggtattttaaaaaattagattagttttaccattaaaatcaa 31930527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 169
Target Start/End: Original strand, 27921015 - 27921087
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||| || | ||||||||||||||| ||||  | ||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  27921015 acttaactaatgcactaactacaattaataagagtgttttaataaatgatactaattttaccattaaaatcaa 27921087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 169
Target Start/End: Original strand, 35333070 - 35333142
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||| |||||||    
T  35333070 acttaactactccactaactacaattaataataatattttaataaataatattaattatataattgaaatcaa 35333142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 41499137 - 41499069
Alignment:
Q  111 ctaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaat 179  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||  ||||| | ||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41499137 ctaactgctattaataaggatattttcgtaaataaaactcattttatcattaaaatcaacacaactaat 41499069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 190
Target Start/End: Original strand, 42935697 - 42935781
Alignment:
Q  106 ctccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  42935697 ctccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcattttcttaa 42935781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 169
Target Start/End: Original strand, 34299925 - 34300087
Alignment:
Q  8 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattac 106  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||| | ||||| ||| ||| | |  | |||||| |||    
T  34299925 tgtcttaaaataattgtcactttagaatatcaatacaacatttattattttctttccactaatatatccttatttattgaataccatccaacttaactac 34300024  T
Q  107 tccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    | ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  34300025 ttcactaaccacaattaataaggatattttagtaaataatactaattttatcattcaaatcaa 34300087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 179
Target Start/End: Original strand, 181491 - 181658
Alignment:
Q  11 ctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcca 110  Q
    |||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||||||    
T  181491 ctcaaaataattgtcactttacaata-caatgcaacatttattattatttttcactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactcca 181589  T
Q  111 ctaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaat 179  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| ||||  |||||  |||||||||||  ||| |||||||| ||| ||||    
T  181590 ctaactataattaataatgatgttttagtaaatactactaattttactattgaaatcaatacaattaat 181658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 203
Target Start/End: Original strand, 29363237 - 29363432
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt--cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  || || |||||  ||||| ||| ||||  |  | |||||| || |    
T  29363237 tctcaaaataattgtcacttcagaataccaatgcagcatttattattattttttccattattatactcttatttattgaatttcatccaacttaactaat 29363336  T
Q  108 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 203  Q
    || ||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||| ||||| |||||| |||||    
T  29363337 ccgctaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactagttttaccatcaaaatcaacacaattaatcattttcttaataattgtgcataa 29363432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 24983628 - 24983450
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || ||| || ||| || ||||| ||| || || | |||||||||||| ||||| ||| ||||  || | |||||| ||||||    
T  24983628 tctcaaaataattgtcactttagattaccaacgccacatt-attttt-ttatccactaatatacccttatttattgaatttcacccaacttaactactcc 24983531  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| | |||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24983530 actaactacaattaataagggtgttttagtaaatgacactaattttaccattgaaatcaactcaactaatcatttccttaa 24983450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 1063791 - 1063591
Alignment:
Q  2 tttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactta 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | |||| | ||| | ||||||||||| |||| ||  | |||||| ||| | ||| ||||  | |  |||||    
T  1063791 tttttctgtctcaaaataattgtcattttaaaataccgatgtagcatttattatt-ttttccatcattatacccttacttattaaatttcatttaactta 1063693  T
Q  102 attactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacat 201  Q
    | |||||||||||||||||||| | ||  ||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||| |||| |||| ||||| |||| |||||    
T  1063692 actactccactaactacaattactcagagtattttagtaaataatactaattttatcattgaaatcaacacaattaatcattttcttaaaaattatacat 1063593  T
Q  202 aa 203  Q
    ||    
T  1063592 aa 1063591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 11656128 - 11655947
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt-tcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 108  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||  || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||| | |||||    
T  11656128 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcatttattatttttttcccattattatacccttatttattgaatttcatccaactttactactc 11656029  T
Q  109 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| | |||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  11656028 cactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgacactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcattttcttaa 11655947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 31894388 - 31894211
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||| |    
T  31894388 tctcaaaataaatgtcattt-acaatatcaatgcaacatttattatt--ttttcactattatacccttatttattaaatttcatccaacttaactacttc 31894292  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||||||| ||| ||  ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  31894291 actaactacaattaataatgacgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattttcttaa 31894211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 7920174 - 7920330
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||  | || | |||| |||| |    
T  7920174 tctcaaaataattatcactttagaatatcaatgcaacatttat--ttatttttcactattataccattatttattgaatttcattcaaattaaatacttc 7920271  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||  |||||  |  |||||||| |||| |||||||    
T  7920272 actaactacaattaataa-gatattttagtaaatggttttaattttaccattgaaatcaa 7920330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 32440828 - 32440649
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaa--tatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 107  Q
    ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||| |||||||||||||||| || || | |||||||||| |||  |||  |  | |||||| ||||    
T  32440828 tctcaaaataattgtcactttagaaaatatcaatgcagcatttattattattttccattattgtacctttatttattacatttcatccaacttaactact 32440729  T
Q  108 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttcct 187  Q
    | ||||| |||||||| ||||| | ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||| |||| |||||||    
T  32440728 ctactaattacaattaataagggtgttttagtaaataatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttcct 32440649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Original strand, 30716832 - 30717013
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 108  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||| ||||| || ||  ||||  ||||| ||| |||| ||  | |||| | |||||    
T  30716832 tctcaaaataattgtcactttagaataccagtgcaacatttattattttttttccattataatactcttatttattgaattttatccaactttactactc 30716931  T
Q  109 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||   ||||| |||||||||||| ||| ||| |||||  || |||| ||||||||||    
T  30716932 cactaactacaattaataagggtgtttaagtaaatgatactaattttaccatcaaagtcaataaaattaatcatttccttaa 30717013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 5302284 - 5302443
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  |||||| ||||||||||| |||| || ||  |||||  |||| ||| || |  |  | |||||| ||||||    
T  5302284 tctcaaaataattgtcactttagaatactaatgcagcatttattatttttttccattataatacccgtatttattgaacttcatccaacttaactactcc 5302383  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||| ||||||||    
T  5302384 attaactacaattaataaggatgttttggtaaattatattaattttaccatcaaaatcaa 5302443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 6801863 - 6802023
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 108  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  ||||| ||||| ||  || |  |  | |||||| |||||    
T  6801863 tctcaaaataattgtcactttataatatcaatgcaacatttattattttttttccattataatacccttatttatcgaacttcatccaacttaactactc 6801962  T
Q  109 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    ||||||||||||||| |||||   ||||  ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||    
T  6801963 cactaactacaattaataagggcgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaa 6802023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Original strand, 13909361 - 13909537
Alignment:
Q  15 aaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt-tcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 113  Q
    |||||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||  ||||| ||| ||||  |    |||||||||||||||||    
T  13909361 aaataattgtaattttacgatatcaatacaacatttattatttttttctcattattatactcttatttattcaatttcatctaacttaattactccacta 13909460  T
Q  114 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  |||||   |||||||||| |||| |||||||  ||  |||| ||||||||||    
T  13909461 actacaattaataagggtattttagtaaatgtcactaattttaccattgaaatcaacacatttaatcatttccttaa 13909537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 27367280 - 27367226
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttca 64  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27367280 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcatcatttattattatttttca 27367226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 27457627 - 27457573
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttca 64  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27457627 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcatcatttattattatttttca 27457573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 3291862 - 3291769
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||| | ||||||  ||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||| |||| ||||||||||    
T  3291862 acttaactacttcactaactacaattaataaaggtattttagtaaataatactaatattaccattaaaatcgatacaattaatcatttccttaa 3291769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Original strand, 15058055 - 15058206
Alignment:
Q  14 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 113  Q
    ||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||| |||||    
T  15058055 aaaataattgtcactttataataccgatgcaacatttattattttttgt-actattatacccttatttattgaatttcatccaacttaaatacttcacta 15058153  T
Q  114 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 166  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  |||||   |||||||||| |||| ||||    
T  15058154 actacaattaataagggtattttagtaaatgccactaattttaccattgaaat 15058206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 11143767 - 11143609
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    |||||||| |||||||| || ||| || ||||||| ||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||| ||| || |  |  | |||||| |||| |    
T  11143767 tctcaaaaaaattgtcactttagactaccaatgcagcatttattatt-tttttcattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactacttc 11143669  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||||| ||||| ||||| |  |||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  11143668 actaactataattaataagggtgatttagtaaatgatactaattttatcatcaaaatcaa 11143609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 23397796 - 23397753
Alignment:
Q  12 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattat 55  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23397796 tcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattat 23397753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 12307783 - 12307729
Alignment:
Q  2 tttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattatt 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||||||    
T  12307783 tttttatgtctcaaaataattgtcactttaaaatattaatacaacatttattatt 12307729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 13207274 - 13207220
Alignment:
Q  9 gtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc 63  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  13207274 gtctcataataattgtcactttagactaccaatgcaacatttattattatttttc 13207220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 21425738 - 21425688
Alignment:
Q  12 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 62  Q
    ||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21425738 tcaaaataattgttactttacaatatcaatgcaacatttattattattttt 21425688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 169
Target Start/End: Original strand, 13087550 - 13087622
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||    
T  13087550 acttaattacttcactaactataattaataaggatgttttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaa 13087622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 21478276 - 21478224
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 62  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21478276 tctcaaaataattgtcactttacaataccaatacaacatttattattattttt 21478224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 8694989 - 8695040
Alignment:
Q  21 ttgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatata 72  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8694989 ttgtcattacatattatcaatgcaacatttattattattttccactagtata 8695040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 156
Target Start/End: Original strand, 17828960 - 17829019
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaatttta 156  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| ||| ||||||||    
T  17828960 acttaattacttcactaactacaattaataaagatattttagtaaatgatattaatttta 17829019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 56
Target Start/End: Original strand, 15582222 - 15582264
Alignment:
Q  14 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattatt 56  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  15582222 aaaataattgtcattttagaatatcaatgcaataattattatt 15582264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 52
Target Start/End: Original strand, 23142601 - 23142643
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttat 52  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  23142601 tctcaaaataattgtcactttacaatatcaatgcaacatttat 23142643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 44)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 30190842 - 30190664
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  |||| |||||||||||||| ||| || || | |||| ||||||||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  30190842 tctcaaaataattgtcactttagaataaaaatgtaacatttattattaatttccattattttacccttattaattgaatttcatccaacttaactactcc 30190743  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttcctt 188  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||    
T  30190742 actaactacaattaataagggtattttagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttcctt 30190664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Original strand, 44301494 - 44301675
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt-cactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 108  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||||    
T  44301494 tctcaaaataattgtcactttataatatcaatgcaacatttattaatatttttccactattatactcttatttattgaatttcatccaacttaactactc 44301593  T
Q  109 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||| |||||||  ||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||   || ||| |||||||||||    
T  44301594 cactaattacaattgataagggtattttagtaaatgatactaattttatcattgaaatcaacataattaaatatttccttaa 44301675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 43254055 - 43253865
Alignment:
Q  1 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccact 99  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| ||||| | | ||||  |  |||||    
T  43254055 ttttctatttctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaacatttattagtttttttccactattatacccttatttaatgaatttcatcccact 43253956  T
Q  100 taattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  43253955 taactactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaa 43253865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Original strand, 19822944 - 19823124
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtca-tttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 108  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| || ||    
T  19822944 tctcaaaataattgtcacttttagaataccaatgcagcatttattatt-tttttcattaatatacccttatttattgaatttcatccaacttaactattc 19823042  T
Q  109 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| ||||||||| || ||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  19823043 cactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattctaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaa 19823124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 190
Target Start/End: Original strand, 30711005 - 30711186
Alignment:
Q  8 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 107  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||   ||||| ||| ||||  |    |||||||| ||    
T  30711005 tgtctcaacataattgtcattttagaatatcaatacaacatttattatt-tttttcactattataatcttatttattgaatttcatctaacttaattgct 30711103  T
Q  108 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||| |||||||||||| ||| | | ||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||   || |||||||||| ||||    
T  30711104 ccattaactacaattaataatggtgttttagtaaatgatattaattttatcattaaaatcaacataattaattatttctttaa 30711186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 12736761 - 12736574
Alignment:
Q  2 tttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactta 101  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||  |  |||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||| |||| ||  | | |||    
T  12736761 tttttctgtctcaaaataattgtcactttagaatgtcaatctagtatttattattgtttt-cactattatacccttatttattgaattttatccaaatta 12736663  T
Q  102 attactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    | |||| |||||| |||||||| ||||| |||| |  ||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  12736662 actactacactaagtacaattaataagggtattgtagtaaatgatactaattttatcattagaatcaacacaattaatcatttccttaa 12736574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 36460598 - 36460452
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || |  |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||||||||||    
T  36460598 tctcaaaataattgtcactttacgatatcaatgcaatatttattatttgtttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaattactcc 36460499  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaatttta 156  Q
    | |||||||||||| |||| |||||||  |||||  |||||||||||    
T  36460498 attaactacaattaataagaatattttaataaatgttactaatttta 36460452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 203
Target Start/End: Original strand, 37311886 - 37312076
Alignment:
Q  14 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccact 112  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||  ||||| ||| ||||  | |  | |||| |||||||||    
T  37311886 aaaataattgtcactttacaatatcaatgcagcatttattattatttttctattattatactcttatttattgaatttcattaaatttaactactccact 37311985  T
Q  113 aactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 203  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||  |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||||||||| ||| || |||||    
T  37311986 aactacaattaataagggttttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataa 37312076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 62
Target Start/End: Original strand, 30710578 - 30710634
Alignment:
Q  6 tatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 62  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30710578 tatgtctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattattattttt 30710634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 39043932 - 39043799
Alignment:
Q  15 aaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaa 114  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||  ||||||| || |||||| ||||| ||| ||||  | || |||||| |||||||||||    
T  39043932 aaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattat--tttttcattattatacccttatttattgaatttcattcaacttaactactccactaa 39043835  T
Q  115 ctacaattattaaggatatttttctaaattatacta 150  Q
    ||||||||| ||| | ||||||  ||||| ||||||    
T  39043834 ctacaattaataaaggtattttagtaaatgatacta 39043799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 37497415 - 37497618
Alignment:
Q  1 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattatta-tttttcactaatatacctttattaatttaattctactccact 99  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| || | |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| ||| ||||  |  | |||    
T  37497415 ttttttttctctcaaaataattgtcactttataataccaatacaacatttattattattttttcattattatacgtttatttattgaatttcatccaact 37497514  T
Q  100 taattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtac 199  Q
    ||| |||||||||||||||| |||  || | | ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||  |||  ||| |||||||||| ||| || |    
T  37497515 taactactccactaactacagttaacaacggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaataaatcatttccttaataatcgtgc 37497614  T
Q  200 ataa 203  Q
    ||||    
T  37497615 ataa 37497618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 203
Target Start/End: Original strand, 11905760 - 11905948
Alignment:
Q  14 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccacta 113  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||| ||||||| ||| ||||  |  | ||||||  |||||| ||    
T  11905760 aaaataatttttattttagaatatcaatgcaacatttattatt-ttttccattattatatctttatttattgaatttcatccaacttaacaactccatta 11905858  T
Q  114 actacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 203  Q
    |||||||||| ||||| |  |||  ||||| |||||||||||||||| ||||| ||  ||| |||| |||| ||||| ||| || |||||    
T  11905859 actacaattaataagggtgctttagtaaatgatactaattttatcatcaaaattaacacaattaatcattttcttaataatcgtgcataa 11905948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 37695837 - 37695668
Alignment:
Q  22 tgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaa 120  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||||| ||| ||||  |    |||||| |||||||||||||||||    
T  37695837 tgtcactttagaataccaatgcaacatttattattttttttccattattatacccttatttattgaatttcatctaacttaactactccactaactacaa 37695738  T
Q  121 ttattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||| ||||| | ||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  37695737 ttaataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaa 37695668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 51838142 - 51837961
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttc-actaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 108  Q
    ||||||||||||||||| || | |||   |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| | | ||||  | || || ||| |||||    
T  51838142 tctcaaaataattgtcactttacaattataatgcaacatttattattttttttccactattatacccttatttaatgaatttcattcaacgtaactactc 51838043  T
Q  109 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||||| |||||| || ||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||| |||||||  ||| |||| |||| |||||    
T  51838042 cactagctacaactaataagggtattttagtaaatgatattaattttatcattgaaatcaacacaattaatcatttacttaa 51837961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3901331 - 3901148
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||| | |   ||||| ||||| ||||||||||||| |||| || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| ||| ||    
T  3901331 tctcaaaataattgttactcttgaataccaatgtaacatttattatttttttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaagtacccc 3901232  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaa 193  Q
    ||||||||||| || |||| || ||||  ||||| ||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  3901231 actaactacaactaataagaatgttttagtaaatgatattaattttatcattgaaattaatacaattaatcattttcttaacaa 3901148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 10366831 - 10366718
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||  || || |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| |||| |    
T  10366831 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattattttttcccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactacttc 10366732  T
Q  110 actaactacaatta 123  Q
    ||||||||||||||    
T  10366731 actaactacaatta 10366718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 169
Target Start/End: Original strand, 12904796 - 12904957
Alignment:
Q  9 gtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactc 108  Q
    |||||||||||||||| | || | ||||  |||| | | |||||| || |||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | ||||||||||||    
T  12904796 gtctcaaaataattgttaatttataatactaatggagcttttattttttttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaattactc 12904895  T
Q  109 cactaactacaatt-attaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  12904896 cactaactacaattaataaaagatattttgataaatcatactaattttataattgaaatcaa 12904957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 8679206 - 8679043
Alignment:
Q  39 aatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttc 138  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | ||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||      
T  8679206 aatgcatcatttattatt-ttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaattaattcactaactataattaataaggatcttttag 8679108  T
Q  139 taaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 203  Q
    |||||  ||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||||||||| ||| || |||||    
T  8679107 taaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataa 8679043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Original strand, 36476517 - 36476697
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||| | ||||  | || |||||| ||||| ||| ||||  |    |||||| |||||     
T  36476517 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattacttttttctattattatacccttatttattgaatttcatcaaacttaactactct 36476616  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||| ||||  ||||||  |||  |||||||| |||||    
T  36476617 actaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattgcaatcaacacaatcaattattttcttaa 36476697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Original strand, 33458973 - 33459028
Alignment:
Q  1 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattatt 56  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  33458973 ttttttttgtctcaaaataattgtcattttagattatcaatacaacatttattatt 33459028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 37773148 - 37772966
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacattta--ttattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 107  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||||||| ||||||  ||||| |||| || || |||||| ||||| | | ||||  | || |||||| || |    
T  37773148 tctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcagcatttattttatttttttccattattatacccttatttaatgaatttcattcaacttaactatt 37773049  T
Q  108 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||||| |||| ||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||| ||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  37773048 ccactgactataattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattgtaatcaatacaattaatcatttccttaa 37772966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 24569195 - 24569089
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattg 196  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| |||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||| ||||| ||| |    
T  24569195 acttaactactccactaactacaattaataagggtattttagtaaataatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattttcttaataatcg 24569096  T
Q  197 tacataa 203  Q
    | |||||    
T  24569095 tgcataa 24569089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 99 - 169
Target Start/End: Original strand, 34750518 - 34750588
Alignment:
Q  99 ttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  34750518 ttaactactccaccaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactaattttaccattaaaatcaa 34750588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 190
Target Start/End: Original strand, 38795275 - 38795457
Alignment:
Q  8 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 107  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||  | ||||||| ||||| ||| || || || ||| ||||  |  | ||||||  |||    
T  38795275 tgtctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaatattttattttattttccactattatgcccttttttattaaatttcatccaacttaacaact 38795374  T
Q  108 ccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||| ||||||||||| |||||  ||||   ||||| |||||||||||| |||| |||| ||  ||| |||| ||||||||||    
T  38795375 ccaccaactacaattaataagggcatttgggtaaatgatactaattttaccattgaaataaacacaattaatcatttccttaa 38795457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 203
Target Start/End: Original strand, 34957437 - 34957629
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||| ||| || | |||| ||||| ||||||||||||| |||| |  || |||| | ||||| ||| ||||  | |  ||| || ||||||    
T  34957437 tctcaaaataattatcactttaaaataccaatgtaacatttattatt-ttttccgttactatatccttatttattgaatttcatttaactgaactactcc 34957535  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaacaattgtacataa 203  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||   |||||||||| ||||||| ||| ||| ||||  ||| |||| |||||||||  |||||| |||||    
T  34957536 actaactataattaataaggatatttaagtaaattatacaaattttaccatcaaattcaacacaattaatcatttccttagtaattgtccataa 34957629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 190
Target Start/End: Original strand, 52290834 - 52291006
Alignment:
Q  17 ataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaact 116  Q
    |||||||| | || |||||| ||||||| ||||||||||| |||| || ||  ||| | ||||| ||| || | || || |||||| |||||||||||||    
T  52290834 ataattgtgactttagaataccaatgcagcatttattatt-ttttacattataatatccttatttattgaactttattcaacttaactactccactaact 52290932  T
Q  117 acaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    | ||||| ||||| | ||||  |||||  ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||| |||| |||||    
T  52290933 ataattaataaggctgttttaataaatggtactaattttaccatcaaaatcaatacaattaatcattttcttaa 52291006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 169
Target Start/End: Original strand, 19611929 - 19612000
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  19611929 acttaactactccactaacaacaattaataaggatattttagtaaattata-taattttaacattgaaatcaa 19612000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 29024060 - 29023989
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  29024060 acttaattactccactaactacaattaataa-gatgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaa 29023989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 48541170 - 48541122
Alignment:
Q  14 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattattttt 62  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48541170 aaaataattgtcattttataatatcagtgcaacatttattattattttt 48541122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 42469868 - 42469724
Alignment:
Q  3 ttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaa 102  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || | ||||| |||| ||||||||   |||||||| | ||||||||  ||||| ||| |||| || ||||| |||    
T  42469868 ttttttgtctcaaaataattgtcactttaaaatattaatgtaacattta--cttatttttaattaatatactcttatttattgaattataatccacctaa 42469771  T
Q  103 ttactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatact 149  Q
     ||||| |||||||| | ||| ||||  ||||||  |||||||||||    
T  42469770 atactcaactaactagagttaataagagtattttagtaaattatact 42469724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 61
Target Start/End: Original strand, 43715239 - 43715290
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt 61  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  43715239 tctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgtaacatttattattttttt 43715290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 53
Target Start/End: Original strand, 37804668 - 37804714
Alignment:
Q  7 atgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttatt 53  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  37804668 atgtctcaaaataattgtccctttagaatatcaatgcaacatttatt 37804714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 169
Target Start/End: Original strand, 14194531 - 14194647
Alignment:
Q  52 ttattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaa 151  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||  |  | ||||||||||||||||||| ||||||  |||   ||||||  |||||  ||||||    
T  14194531 ttattatttgtcattattatacctttattaattgaatttcatccaacttaattactccactaac-acaattcataaaagtattttagtaaatggtactaa 14194629  T
Q  152 ttttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||||||| |||||||    
T  14194630 ttttatcattgaaatcaa 14194647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 30682161 - 30682068
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||  ||||||  ||||| ||||| |||||| ||||||||| ||  ||| |||| ||||||||||    
T  30682161 acttaattattccattaactacaattaataagattattttagtaaatgatactcattttaacattaaaattaaaacaattaatcatttccttaa 30682068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 36463041 - 36462968
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaat 170  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||  |||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  36463041 acttaattactccacaaacaacaattaataaggttattttagtaaatgctaccaattttaacattaaaatcaat 36462968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 54477554 - 54477482
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||  |||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  54477554 acttaactactccattaactacaattaataaaaatattttagtaaatgatattaattttaccattaaaatcaa 54477482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 113
Target Start/End: Original strand, 27471268 - 27471371
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| |||| || ||||||||||| || | |||||  ||||||||||| ||| ||||  | || |||||| ||||||    
T  27471268 tctcaaaataattgtcactttataataccaatacagcatttattatttttgtccactaccatacctttatttattgaatttcattcaacttaactactcc 27471367  T
Q  110 acta 113  Q
    ||||    
T  27471368 acta 27471371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 23004477 - 23004384
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||  || ||  ||||||||||| |||| ||||| |  ||| |||| ||||||||||    
T  23004477 acttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtatatactactaattttaccattgaaatcgacacaattaatcatttccttaa 23004384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 113
Target Start/End: Original strand, 33634267 - 33634372
Alignment:
Q  8 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattact 107  Q
    ||||| ||||||||| |||| | | ||||| ||| ||| |||||||||| |||| ||  |||||| | ||||| ||| ||||  ||||||||||||||||    
T  33634267 tgtcttaaaataattatcatattataatattaatacaatatttattatttttttccatcaatatatcattatttattgaattagactccacttaattact 33634366  T
Q  108 ccacta 113  Q
     |||||    
T  33634367 acacta 33634372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 38137626 - 38137549
Alignment:
Q  12 tcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaatt 89  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||| ||||    
T  38137626 tcaaaataattgtcactttgcaatactaatgcaatatttattattattttccactattatatctttatttattgaatt 38137549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 51065195 - 51065139
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcacta 67  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  51065195 tctctaaataattgtcattttacaataccaatgcagcatttattatt-tttttcacta 51065139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 27549464 - 27549388
Alignment:
Q  14 aaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttt-tcactaatatacctttattaatttaatt 89  Q
    ||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||| ||| ||||    
T  27549464 aaaataactgtcactttacaatatcaatgcaacatttattatttttttcccactattataactttatttattgaatt 27549388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 187
Target Start/End: Original strand, 30861417 - 30861505
Alignment:
Q  99 ttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttcct 187  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||   |||||| |  | |||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||    
T  30861417 ttaattactctactaactataattaataaggatattttaacaaattaaataatttttatcattgaaatcaacacaattaataatttcct 30861505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 169
Target Start/End: Original strand, 54726505 - 54726577
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||  ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||    
T  54726505 acttaactactccattaactacaattaataaagatgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaa 54726577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0330 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0330
Description:

Target: scaffold0330; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 161
Target Start/End: Original strand, 5325 - 5474
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||| | || |||||  |||| ||||||||||||||  |||||  | ||||||||||||| ||| ||||  |  | |||||| ||||||    
T  5325 tctcaaaataattgttactttagaatgccaatacaacatttattatt--ttttccattatatacctttatttattgaatttcatccaacttaactactcc 5422  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcatt 161  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||    
T  5423 actaactaaaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttaccatt 5474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 34200 - 34021
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactcc 109  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||  |  | |||||| || | |    
T  34200 tctcaaaataattgtcactttacaatatcaatgcatcatttattatt-ttttccactattataccattatttattgaatttcatccaacttaactatttc 34102  T
Q  110 actaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  |||||   ||||||||||  ||| || ||||| ||| |||| ||||||||||    
T  34101 actaactacaattaataagggtgttttagtaaatgccactaattttactattgaattcaatacaattaatcatttccttaa 34021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8164 - 7983
Alignment:
Q  10 tctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaata-tacctttattaatttaattctactccacttaattactc 108  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| |||| |  | ||| |||| ||||| ||| || |  |  | ||||||||||||    
T  8164 tctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattatttttttcccattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaattactc 8065  T
Q  109 cactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| ||| |||||||| |||  |||||||   || |||| ||||||||||    
T  8064 cactaactacaattaataagggtgttttggtaaataatattaattttaccatccaaatcaacaaaattaatcatttccttaa 7983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2146 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold2146
Description:

Target: scaffold2146; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 176
Target Start/End: Original strand, 389 - 504
Alignment:
Q  61 ttcactaatatacctttattaatttaattctactccacttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcat 160  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||| |||| ||||| | ||||  | ||| |||||||||||| |||    
T  389 ttcattaatatacccttatttattgaattctaccttacttaattaatccactaactactattaataagggtgttttattgaatgatactaattttaacat 488  T
Q  161 taaaatcaattcaact 176  Q
    |||||| || ||||||    
T  489 taaaataaaatcaact 504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 42802 - 42990
Alignment:
Q  1 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| | || | |||||| ||||||||||| ||||| ||   | ||||||||| |||||| ||| ||||  ||| |||||    
T  42802 ttttctatgtatcaaaataattgttactttaaaatatc-atgcaacatttgttatttttcccctctaatatacatttatttattgaatttcacttcactt 42900  T
Q  101 aattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaattcaactaattatttccttaa 190  Q
    ||||| | |||||| || ||||| |||| || ||||   ||| |||| ||||||||  ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  42901 aattatttcactaattataattaataagaatgttttagcaaaatatattaattttactattgaaattaattcatctaatcatttccttaa 42990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 252994 - 252848
Alignment:
Q  1 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaatatacctttattaatttaattctactccactt 100  Q
    |||||| | |||||||| |||||||| || | |||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||  ||||| ||| ||||  | || ||||    
T  252994 ttttttttttctcaaaaaaattgtcactttataataccaatgcaacatttattatt-tttttcattattatactcttatttattgaatttcattcaactt 252896  T
Q  101 aattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatact 149  Q
    || ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||  ||||| |||||    
T  252895 aactactccaat-actacaattaataacgatattttagtaaatgatact 252848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0583 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0583
Description:

Target: scaffold0583; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 166
Target Start/End: Original strand, 2048 - 2114
Alignment:
Q  100 taattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaat 166  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  2048 taattaatccactaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatattaattttatcattgaaat 2114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 20448 - 20376
Alignment:
Q  97 acttaattactccactaactacaattattaaggatatttttctaaattatactaattttatcattaaaatcaa 169  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||    
T  20448 acttaactacttcactaactgcaattaataagggtattttactaaatgatactaattttacaatcaaaatcaa 20376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 70
Target Start/End: Original strand, 5976 - 6037
Alignment:
Q  8 tgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacatttattattatttttcactaata 70  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||    
T  5976 tgtctcaaaataattatcactttagaatatcaatccagcatttattatt-gttttcactaata 6037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 16933 - 16884
Alignment:
Q  1 ttttttatgtctcaaaataattgtcatttcagaatatcaatgcaacattt 50  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||    
T  16933 ttttttttgtctcaaaataatttttattttagaatatcaatgcaagattt 16884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University