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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14236_high_1 (Length: 1046)

Name: NF14236_high_1
Description: NF14236
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14236_high_1
NF14236_high_1
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (104-1029)||(44034892-44035817)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (740-1029)||(33165810-33166099)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 773; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 773; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 104 - 1029
Target Start/End: Original strand, 44034892 - 44035817
Alignment:
Q  104 gaatgagataaaagggagaagatggaaaaccacgtgttaccaaaaccttacgttagcgtggcaactcaactatgtttatgtctctttcccattgctacgt 203  Q
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T  44034892 gaatgagataaaagggagaagatggaaaaccacgtgttaccaaaaccttacgttagcgtggcaactcaactatgtttatgtctctttcccattgctacgt 44034991  T
Q  204 tccctcaaattgctannnnnnnnnnnnnnnnnn---caaatattcaattatgttaatgttaatatatgaaaggagatttatttaaaactttggtgatggc 300  Q
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T  44034992 tccctcaaattgctactattttttttattttcttttcaaatattcaattatgttaatgttaatatatgaaaggagatttatttaaaactttggtgatggc 44035091  T
Q  301 aacattctttcgacacataaactttgcctgatggcaacattctttcaacattagatccataatttggtaatttagatccaccaagaataagttcagttaa 400  Q
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T  44035092 aacattctttcgacacataaactttgcctgatgacaacattctttcaacattagatccataatttggtaatttagatccactaagaataagttcaggtaa 44035191  T
Q  401 gtttgcaagctttatgaatttgaagattcgaagagagagatagttggaactaaatggacaagaatatatgggaaacattgttaaaatgaattttaccttg 500  Q
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T  44035192 gtttgcaagctttataaatttgaagattcgaagagagagatagt-ggaactaaatggacaagaatatatgggaaacattgttaaaatgatttttaccttg 44035290  T
Q  501 gagtgtataagataagaatgaaagtctcaataagattttgaatgagtcgtttaaaaagaaatcaactaaacaacaataatgtgggactatattggaatca 600  Q
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T  44035291 gagtgtataagataagaatgaaagtctcaataagattttgaatgagtcatttaaaaagaaatcaactaaacgacaataatgtgggactatattggaatca 44035390  T
Q  601 agttggtattatgtaattttagatttagtggcctattttaaagtgtttattacctgtatgatgtagcatgtaatagtccagtcttaccagcaatccaata 700  Q
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T  44035391 agttggtattatgtaattttagatttagtggcctattttaaagt--ttattacctgtatgatgtagcatataatagtccagtcttaccagcaatccaata 44035488  T
Q  701 ttattctattttttgaggttttattttaaaataaatcaattttcacagcaatttaatgtacaaaaaataannnnnnnatgttttgaaattccagttcacc 800  Q
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T  44035489 ttgttctattttttgaggttttattttaaaataaatcaattttcacagcaatttaatgtacaaaaaataatttttttatgttttgaaattccagttcacc 44035588  T
Q  801 taaaaatcaataccatttttccgatttctagattttgtttaccagaagtacattcaaaacatgttgaacactaaaatgtgaataaatctcttgtaccaaa 900  Q
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T  44035589 taaaaatcaataccatttttcctatttctagattttgtttacgagaagtacattcaaaacatgttgaacactaaaatgtgaataaatctcttgtaccaaa 44035688  T
Q  901 ttcgaacattgattcatcgctttgtgatagtgtaaaccccttactctagatccgatccccttacatcaatatattcttgtcctaaatgaatcaataccat 1000  Q
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T  44035689 ttcgaacattgattcatcgctttgtgatagtgtaaaccccttactctagatccaatccccttacatcaatatattcttgtcctaaatgaatcaataccat 44035788  T
Q  1001 ttagggtttagattcctccatactagact 1029  Q
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T  44035789 ttagggtttagattcctccatactagact 44035817  T

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Target: chr7 (Bit Score: 257; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 740 - 1029
Target Start/End: Complemental strand, 33166099 - 33165810
Alignment:
Q  740 ttttcacagcaatttaatgtacaaaaaataannnnnnnatgttttgaaattccagttcacctaaaaatcaataccatttttccgatttctagattttgtt 839  Q
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T  33166099 ttttcacagcaatttaatgtacaaaaaataatttttttatgttttgaaattccagttcacctaaaaatcaataccatttttccgatttctagattttgtt 33166000  T
Q  840 taccagaagtacattcaaaacatgttgaacactaaaatgtgaataaatctcttgtaccaaattcgaacattgattcatcgctttgtgatagtgtaaaccc 939  Q
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T  33165999 tacgagaagtacattcaaaacatgttgaacactaaaatatgaataaatctcttgtaccaaattcgaacatcgattcatcgctttgtgatagtgtaaaccc 33165900  T
Q  940 cttactctagatccgatccccttacatcaatatattcttgtcctaaatgaatcaataccatttagggtttagattcctccatactagact 1029  Q
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T  33165899 cttactctagatccgatccccttacatcaatatattcttgtcctaaatgaatcaataccatttagggtttagattcctccatactagact 33165810  T

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