View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14254_low_10 (Length: 434)

Name: NF14254_low_10
Description: NF14254
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14254_low_10
NF14254_low_10
[»] chr6 (69 HSPs)
chr6 (11-283)||(5406199-5406471)
chr6 (11-283)||(5410524-5410796)
chr6 (11-283)||(31404674-31404947)
chr6 (11-275)||(5413401-5413665)
chr6 (19-283)||(2171531-2171796)
chr6 (11-280)||(30834538-30834809)
chr6 (19-283)||(16452328-16452594)
chr6 (11-283)||(33160351-33160626)
chr6 (11-283)||(9183031-9183304)
chr6 (11-282)||(28137409-28137681)
chr6 (11-283)||(26954286-26954558)
chr6 (60-282)||(21593608-21593831)
chr6 (11-283)||(33211185-33211458)
chr6 (21-283)||(3072758-3073016)
chr6 (100-282)||(21588916-21589098)
chr6 (50-259)||(3038926-3039137)
chr6 (60-283)||(3808707-3808933)
chr6 (38-283)||(6097450-6097679)
chr6 (60-282)||(2972940-2973163)
chr6 (60-282)||(5043571-5043795)
chr6 (21-283)||(412014-412271)
chr6 (60-282)||(17762933-17763158)
chr6 (87-282)||(17757995-17758191)
chr6 (70-282)||(26830124-26830337)
chr6 (60-282)||(22424826-22425052)
chr6 (60-283)||(603088-603304)
chr6 (50-256)||(4045356-4045566)
chr6 (4-283)||(16653008-16653281)
chr6 (18-283)||(16554778-16555038)
chr6 (18-283)||(16631334-16631594)
chr6 (24-283)||(16568951-16569190)
chr6 (115-283)||(27647861-27648029)
chr6 (18-283)||(16578517-16578777)
chr6 (18-283)||(16616603-16616863)
chr6 (184-275)||(5409076-5409167)
chr6 (38-283)||(25421235-25421475)
chr6 (38-283)||(6027178-6027416)
chr6 (169-282)||(26800642-26800755)
chr6 (11-110)||(16567101-16567201)
chr6 (38-279)||(33342108-33342343)
chr6 (115-279)||(13153913-13154080)
chr6 (84-243)||(25073538-25073698)
chr6 (115-279)||(34164856-34165023)
chr6 (115-283)||(34167078-34167249)
chr6 (347-419)||(5408933-5409005)
chr6 (347-419)||(5413258-5413330)
chr6 (345-419)||(9182894-9182968)
chr6 (347-419)||(31404538-31404610)
chr6 (345-419)||(16452191-16452265)
chr6 (345-419)||(2171390-2171464)
chr6 (345-419)||(28137274-28137347)
chr6 (345-419)||(30834397-30834471)
chr6 (191-258)||(9572667-9572735)
chr6 (347-419)||(5406066-5406135)
chr6 (347-419)||(5410391-5410460)
chr6 (52-85)||(5017329-5017362)
chr6 (52-85)||(5572076-5572109)
chr6 (52-85)||(5757311-5757344)
chr6 (52-85)||(22709241-22709274)
chr6 (50-85)||(24435802-24435837)
chr6 (188-241)||(2908532-2908586)
chr6 (345-419)||(16569251-16569324)
chr6 (345-419)||(26954154-26954227)
chr6 (52-85)||(21356268-21356301)
chr6 (52-85)||(22963930-22963963)
chr6 (52-85)||(23824430-23824463)
chr6 (56-85)||(31936806-31936835)
chr6 (355-419)||(3072620-3072684)
chr6 (238-282)||(19643894-19643938)
[»] chr3 (133 HSPs)
chr3 (11-283)||(45095060-45095332)
chr3 (11-283)||(37408354-37408627)
chr3 (11-283)||(5260322-5260596)
chr3 (11-283)||(19683888-19684162)
chr3 (21-283)||(5258143-5258407)
chr3 (11-283)||(7762161-7762434)
chr3 (19-283)||(23200137-23200402)
chr3 (19-283)||(23197938-23198203)
chr3 (11-283)||(7764363-7764633)
chr3 (11-283)||(9636125-9636400)
chr3 (11-283)||(9581178-9581451)
chr3 (13-283)||(5236457-5236727)
chr3 (11-283)||(40734393-40734666)
chr3 (11-275)||(22835010-22835275)
chr3 (11-277)||(40735278-40735545)
chr3 (41-283)||(44331470-44331713)
chr3 (11-283)||(760742-761015)
chr3 (11-262)||(29810763-29811016)
chr3 (11-283)||(51398709-51398982)
chr3 (50-283)||(29196386-29196622)
chr3 (11-283)||(29682254-29682527)
chr3 (11-283)||(29812958-29813231)
chr3 (11-283)||(39153361-39153634)
chr3 (11-283)||(16498925-16499197)
chr3 (11-283)||(800993-801261)
chr3 (11-275)||(53921511-53921776)
chr3 (60-282)||(6095600-6095823)
chr3 (50-283)||(44700479-44700713)
chr3 (70-282)||(4569906-4570120)
chr3 (60-282)||(54593648-54593871)
chr3 (50-283)||(31314379-31314613)
chr3 (11-275)||(32890998-32891264)
chr3 (60-283)||(34491157-34491380)
chr3 (60-283)||(43401800-43402026)
chr3 (60-283)||(49199468-49199694)
chr3 (50-283)||(23391909-23392143)
chr3 (60-283)||(30236069-30236293)
chr3 (70-282)||(41819523-41819737)
chr3 (60-283)||(43403743-43403969)
chr3 (70-282)||(46860427-46860642)
chr3 (11-283)||(9666466-9666741)
chr3 (11-283)||(32744436-32744699)
chr3 (75-283)||(7780003-7780204)
chr3 (87-283)||(47304224-47304419)
chr3 (60-258)||(5433906-5434102)
chr3 (61-273)||(46173311-46173515)
chr3 (50-283)||(23410329-23410563)
chr3 (38-283)||(6716430-6716668)
chr3 (38-283)||(54635055-54635293)
chr3 (38-283)||(45282913-45283155)
chr3 (60-249)||(36018795-36018987)
chr3 (38-283)||(3617379-3617619)
chr3 (11-166)||(26386597-26386754)
chr3 (38-279)||(25637358-25637592)
chr3 (60-215)||(31340268-31340425)
chr3 (95-243)||(51352150-51352298)
chr3 (173-283)||(40913352-40913461)
chr3 (178-282)||(55301972-55302076)
chr3 (50-233)||(5373157-5373353)
chr3 (38-279)||(4600747-4600982)
chr3 (115-279)||(4598526-4598693)
chr3 (115-279)||(10056217-10056384)
chr3 (115-279)||(10058439-10058606)
chr3 (115-279)||(10060661-10060828)
chr3 (115-279)||(10062883-10063050)
chr3 (115-279)||(10065105-10065272)
chr3 (115-279)||(10211393-10211560)
chr3 (49-160)||(2075178-2075292)
chr3 (120-277)||(4055769-4055926)
chr3 (115-279)||(10209173-10209340)
chr3 (345-419)||(37408690-37408764)
chr3 (75-241)||(35138746-35138915)
chr3 (347-419)||(45095396-45095468)
chr3 (345-419)||(9581514-9581588)
chr3 (345-419)||(9634684-9634758)
chr3 (345-419)||(9635987-9636061)
chr3 (345-419)||(7764696-7764770)
chr3 (345-419)||(19683751-19683825)
chr3 (345-419)||(29813292-29813366)
chr3 (345-419)||(40735613-40735687)
chr3 (149-277)||(4075476-4075605)
chr3 (345-413)||(51399045-51399113)
chr3 (215-274)||(27305719-27305777)
chr3 (345-419)||(7762497-7762571)
chr3 (345-419)||(29811099-29811173)
chr3 (134-248)||(25491003-25491116)
chr3 (75-231)||(26323124-26323283)
chr3 (208-282)||(2075076-2075149)
chr3 (345-419)||(5258007-5258081)
chr3 (345-419)||(5260186-5260260)
chr3 (345-419)||(40734728-40734802)
chr3 (54-235)||(3148037-3148221)
chr3 (136-239)||(20937678-20937781)
chr3 (148-258)||(33191866-33191974)
chr3 (50-222)||(8166516-8166693)
chr3 (53-234)||(1313852-1314037)
chr3 (345-411)||(5236328-5236394)
chr3 (345-419)||(21350874-21350944)
chr3 (85-221)||(40519258-40519391)
chr3 (120-231)||(54739004-54739116)
chr3 (243-279)||(10067435-10067471)
chr3 (50-85)||(3323511-3323546)
chr3 (345-419)||(761076-761149)
chr3 (345-419)||(22834870-22834943)
chr3 (52-85)||(16264580-16264613)
chr3 (52-85)||(24694988-24695021)
chr3 (52-85)||(26299219-26299252)
chr3 (52-85)||(26928421-26928454)
chr3 (52-85)||(27986278-27986311)
chr3 (52-85)||(36029324-36029357)
chr3 (52-85)||(40592604-40592637)
chr3 (52-85)||(47923726-47923759)
chr3 (52-84)||(21711454-21711486)
chr3 (355-419)||(23200000-23200063)
chr3 (56-92)||(30709615-30709651)
chr3 (50-85)||(6794535-6794570)
chr3 (54-85)||(8126861-8126892)
chr3 (51-85)||(3328178-3328212)
chr3 (50-84)||(4386797-4386831)
chr3 (11-85)||(39032335-39032409)
chr3 (87-258)||(39127519-39127693)
chr3 (345-419)||(44700347-44700420)
chr3 (56-85)||(1736130-1736159)
chr3 (52-85)||(8370311-8370344)
chr3 (52-85)||(27038282-27038315)
chr3 (52-85)||(27453191-27453224)
chr3 (52-85)||(27974774-27974807)
chr3 (127-203)||(28253346-28253423)
chr3 (52-85)||(32143554-32143587)
chr3 (52-85)||(33386497-33386530)
chr3 (56-85)||(35925709-35925738)
chr3 (70-115)||(40612562-40612607)
chr3 (345-417)||(23391778-23391849)
[»] chr5 (90 HSPs)
chr5 (11-283)||(25412657-25412929)
chr5 (11-283)||(30182484-30182757)
chr5 (11-283)||(13342956-13343229)
chr5 (11-283)||(13239647-13239920)
chr5 (11-283)||(36074042-36074317)
chr5 (11-283)||(32636719-32636992)
chr5 (11-277)||(13488098-13488365)
chr5 (52-283)||(37439070-37439310)
chr5 (11-283)||(42428430-42428703)
chr5 (11-283)||(533664-533937)
chr5 (21-283)||(16409387-16409644)
chr5 (11-283)||(39468549-39468822)
chr5 (11-282)||(16451976-16452247)
chr5 (11-277)||(28750661-28750928)
chr5 (21-283)||(26177795-26178051)
chr5 (11-283)||(42426235-42426508)
chr5 (60-282)||(213409-213633)
chr5 (14-275)||(30682930-30683190)
chr5 (11-275)||(537920-538185)
chr5 (21-283)||(9789223-9789480)
chr5 (21-283)||(18441647-18441904)
chr5 (11-283)||(33831575-33831848)
chr5 (11-282)||(31182868-31183138)
chr5 (38-283)||(8565946-8566192)
chr5 (60-283)||(28278260-28278484)
chr5 (60-282)||(40147205-40147428)
chr5 (11-282)||(3075659-3075931)
chr5 (21-283)||(26170686-26170931)
chr5 (70-282)||(5058002-5058212)
chr5 (38-283)||(29751159-29751398)
chr5 (11-264)||(42309953-42310208)
chr5 (11-211)||(5887487-5887689)
chr5 (60-280)||(27637615-27637838)
chr5 (38-283)||(29720294-29720533)
chr5 (38-283)||(29722454-29722693)
chr5 (50-271)||(9049354-9049576)
chr5 (60-277)||(38746949-38747167)
chr5 (71-259)||(13695713-13695904)
chr5 (60-282)||(27015476-27015690)
chr5 (115-283)||(22536289-22536457)
chr5 (21-283)||(19806289-19806531)
chr5 (71-282)||(16640941-16641153)
chr5 (115-283)||(10593258-10593427)
chr5 (38-283)||(25078050-25078290)
chr5 (38-283)||(25136019-25136259)
chr5 (11-135)||(42926788-42926913)
chr5 (115-283)||(40380090-40380260)
chr5 (115-283)||(40382301-40382471)
chr5 (121-283)||(316769-316932)
chr5 (38-279)||(16546561-16546796)
chr5 (38-279)||(16544339-16544574)
chr5 (162-283)||(33906029-33906151)
chr5 (345-419)||(30682786-30682860)
chr5 (345-419)||(39468412-39468486)
chr5 (190-282)||(42926967-42927058)
chr5 (50-243)||(3325847-3326043)
chr5 (217-277)||(4160702-4160762)
chr5 (347-419)||(25412993-25413065)
chr5 (75-222)||(35616129-35616278)
chr5 (345-419)||(13343291-13343365)
chr5 (345-419)||(30182819-30182893)
chr5 (169-244)||(10054854-10054929)
chr5 (345-417)||(36073908-36073980)
chr5 (121-258)||(10700674-10700809)
chr5 (169-244)||(8445770-8445846)
chr5 (50-94)||(11181663-11181707)
chr5 (50-85)||(24553358-24553393)
chr5 (50-85)||(28832488-28832523)
chr5 (345-419)||(16409710-16409784)
chr5 (136-232)||(22097886-22097981)
chr5 (180-272)||(30793202-30793293)
chr5 (345-419)||(33831910-33831983)
chr5 (345-419)||(42426099-42426172)
chr5 (345-419)||(42428294-42428367)
chr5 (169-215)||(42926922-42926968)
chr5 (75-221)||(6016968-6017115)
chr5 (52-85)||(9353165-9353198)
chr5 (52-85)||(11916805-11916838)
chr5 (52-85)||(14520461-14520494)
chr5 (52-85)||(36932181-36932214)
chr5 (140-219)||(30802854-30802934)
chr5 (50-85)||(17003790-17003825)
chr5 (50-85)||(31300426-31300461)
chr5 (345-412)||(42927124-42927190)
chr5 (345-419)||(26178117-26178191)
chr5 (52-85)||(15464765-15464798)
chr5 (52-85)||(19588976-19589009)
chr5 (238-283)||(38882340-38882384)
chr5 (345-417)||(13488432-13488503)
chr5 (238-282)||(18596881-18596924)
[»] chr7 (113 HSPs)
chr7 (11-283)||(29990950-29991222)
chr7 (19-283)||(35853818-35854083)
chr7 (11-283)||(23554935-23555209)
chr7 (11-283)||(4178670-4178942)
chr7 (11-283)||(14069833-14070106)
chr7 (11-283)||(14379861-14380134)
chr7 (11-283)||(19502073-19502347)
chr7 (11-262)||(48491474-48491727)
chr7 (21-283)||(39731281-39731538)
chr7 (19-283)||(48408705-48408973)
chr7 (11-283)||(18126539-18126812)
chr7 (11-283)||(43864139-43864412)
chr7 (11-277)||(4586056-4586323)
chr7 (50-283)||(41317434-41317668)
chr7 (11-283)||(31732969-31733242)
chr7 (11-275)||(47676144-47676409)
chr7 (11-283)||(48489326-48489599)
chr7 (44-283)||(27347745-27347985)
chr7 (19-283)||(25766959-25767219)
chr7 (11-264)||(1113552-1113807)
chr7 (50-283)||(8153276-8153510)
chr7 (11-275)||(30024740-30025005)
chr7 (38-274)||(47673953-47674189)
chr7 (11-283)||(26417211-26417483)
chr7 (11-283)||(38671222-38671495)
chr7 (70-283)||(34310715-34310929)
chr7 (11-283)||(41649011-41649282)
chr7 (11-282)||(31105394-31105666)
chr7 (11-283)||(495983-496256)
chr7 (74-282)||(22269931-22270140)
chr7 (11-283)||(25615758-25616022)
chr7 (60-282)||(4508707-4508930)
chr7 (54-282)||(8359316-8359547)
chr7 (60-278)||(6431915-6432134)
chr7 (50-283)||(36146408-36146643)
chr7 (11-282)||(4253529-4253803)
chr7 (21-283)||(43504153-43504411)
chr7 (60-282)||(48599335-48599558)
chr7 (60-277)||(2360978-2361196)
chr7 (60-282)||(3258938-3259162)
chr7 (60-280)||(29608680-29608902)
chr7 (60-280)||(2390226-2390447)
chr7 (50-283)||(12097867-12098093)
chr7 (11-224)||(31518690-31518905)
chr7 (60-282)||(4510549-4510772)
chr7 (60-282)||(4512391-4512614)
chr7 (11-132)||(24514912-24515033)
chr7 (11-282)||(36574517-36574789)
chr7 (11-275)||(23565069-23565333)
chr7 (38-283)||(24789771-24790010)
chr7 (146-282)||(32358055-32358190)
chr7 (38-272)||(23343896-23344130)
chr7 (11-186)||(24525992-24526170)
chr7 (38-195)||(4538627-4538786)
chr7 (38-283)||(20343827-20344065)
chr7 (11-145)||(2761439-2761575)
chr7 (140-283)||(2759197-2759339)
chr7 (38-283)||(18388759-18388997)
chr7 (38-283)||(18392195-18392433)
chr7 (60-277)||(22328395-22328622)
chr7 (38-283)||(6592339-6592577)
chr7 (38-283)||(6594557-6594795)
chr7 (38-283)||(32060321-32060563)
chr7 (123-275)||(31518911-31519063)
chr7 (169-283)||(6359952-6360065)
chr7 (190-277)||(24525508-24525594)
chr7 (200-277)||(1560671-1560749)
chr7 (51-275)||(3904624-3904851)
chr7 (345-416)||(27348048-27348119)
chr7 (189-282)||(18396392-18396486)
chr7 (345-419)||(25766820-25766894)
chr7 (345-419)||(35854147-35854221)
chr7 (346-419)||(23555273-23555346)
chr7 (208-283)||(30814530-30814604)
chr7 (345-419)||(25616086-25616160)
chr7 (345-419)||(48409038-48409112)
chr7 (93-244)||(5116582-5116735)
chr7 (178-282)||(5513668-5513771)
chr7 (345-418)||(43864475-43864548)
chr7 (51-176)||(5514115-5514243)
chr7 (347-419)||(29991286-29991358)
chr7 (345-419)||(495851-495924)
chr7 (345-419)||(18126877-18126951)
chr7 (345-419)||(48489662-48489736)
chr7 (82-207)||(1360226-1360353)
chr7 (50-149)||(30843366-30843467)
chr7 (11-83)||(6570489-6570561)
chr7 (50-275)||(26639254-26639486)
chr7 (348-419)||(48491810-48491881)
chr7 (345-419)||(26417547-26417621)
chr7 (345-418)||(4586392-4586465)
chr7 (10-85)||(9184964-9185040)
chr7 (345-419)||(4179004-4179078)
chr7 (345-419)||(31732832-31732906)
chr7 (345-419)||(39731602-39731676)
chr7 (345-419)||(41648877-41648950)
chr7 (345-419)||(47673808-47673881)
chr7 (38-185)||(1562103-1562241)
chr7 (50-85)||(9189838-9189873)
chr7 (50-85)||(20284320-20284355)
chr7 (50-85)||(23402844-23402879)
chr7 (51-85)||(9235414-9235448)
chr7 (345-419)||(41317302-41317375)
chr7 (127-248)||(43363507-43363629)
chr7 (345-419)||(47676000-47676073)
chr7 (52-85)||(2479567-2479600)
chr7 (52-85)||(21989139-21989172)
chr7 (52-85)||(44847958-44847991)
chr7 (50-85)||(2580621-2580656)
chr7 (348-418)||(1113887-1113956)
chr7 (52-85)||(4796501-4796534)
chr7 (52-85)||(46516138-46516171)
chr7 (55-83)||(35961050-35961078)
[»] chr8 (97 HSPs)
chr8 (11-283)||(31218152-31218426)
chr8 (11-283)||(34254330-34254601)
chr8 (11-283)||(34256506-34256777)
chr8 (11-283)||(17982548-17982822)
chr8 (11-283)||(42498089-42498363)
chr8 (11-283)||(44303749-44304024)
chr8 (11-283)||(1746218-1746491)
chr8 (11-283)||(19945358-19945633)
chr8 (11-283)||(15212681-15212954)
chr8 (11-283)||(43036318-43036591)
chr8 (11-283)||(33352045-33352318)
chr8 (11-283)||(12702634-12702911)
chr8 (11-283)||(4731553-4731826)
chr8 (11-283)||(27811173-27811446)
chr8 (11-283)||(3303670-3303943)
chr8 (11-283)||(5689166-5689439)
chr8 (11-262)||(30143237-30143488)
chr8 (11-283)||(6598867-6599140)
chr8 (11-283)||(6674320-6674593)
chr8 (11-283)||(1345371-1345644)
chr8 (60-282)||(4283468-4283691)
chr8 (21-280)||(2627647-2627902)
chr8 (11-276)||(1292471-1292736)
chr8 (50-283)||(40321014-40321248)
chr8 (13-276)||(18141717-18141981)
chr8 (70-282)||(42434992-42435204)
chr8 (16-282)||(4162400-4162663)
chr8 (70-282)||(18655355-18655567)
chr8 (21-276)||(41366622-41366877)
chr8 (11-277)||(18106087-18106351)
chr8 (60-277)||(40221689-40221907)
chr8 (58-283)||(9765691-9765912)
chr8 (60-283)||(10930199-10930423)
chr8 (62-282)||(8965692-8965914)
chr8 (58-283)||(19491699-19491924)
chr8 (60-244)||(44353736-44353923)
chr8 (25-283)||(4743214-4743462)
chr8 (60-256)||(40328723-40328922)
chr8 (56-274)||(30291545-30291767)
chr8 (70-282)||(11383941-11384152)
chr8 (38-283)||(25689885-25690123)
chr8 (84-275)||(3772161-3772352)
chr8 (38-283)||(3439434-3439672)
chr8 (11-203)||(41364926-41365120)
chr8 (11-233)||(10929696-10929907)
chr8 (38-271)||(8153683-8153914)
chr8 (115-279)||(42575327-42575494)
chr8 (115-278)||(15290522-15290688)
chr8 (115-278)||(15470891-15471057)
chr8 (71-258)||(11712024-11712214)
chr8 (192-282)||(4733784-4733873)
chr8 (105-244)||(1822282-1822423)
chr8 (105-244)||(1856727-1856868)
chr8 (152-277)||(10015119-10015241)
chr8 (178-282)||(3073875-3073977)
chr8 (11-282)||(29796320-29796596)
chr8 (148-275)||(7597648-7597776)
chr8 (347-419)||(34254194-34254266)
chr8 (345-419)||(4731889-4731963)
chr8 (11-85)||(4733704-4733778)
chr8 (345-419)||(15213017-15213091)
chr8 (345-419)||(30143571-30143645)
chr8 (347-419)||(34256370-34256442)
chr8 (345-419)||(17982884-17982958)
chr8 (345-419)||(27811509-27811583)
chr8 (345-419)||(44304086-44304160)
chr8 (346-419)||(1746082-1746155)
chr8 (345-416)||(42498426-42498497)
chr8 (11-85)||(10015043-10015117)
chr8 (169-258)||(32902197-32902287)
chr8 (120-223)||(10240159-10240264)
chr8 (345-417)||(33352381-33352453)
chr8 (345-419)||(18105939-18106012)
chr8 (50-218)||(3231859-3232031)
chr8 (345-419)||(19945222-19945296)
chr8 (48-113)||(38863803-38863868)
chr8 (345-419)||(41366481-41366554)
chr8 (11-72)||(19948533-19948594)
chr8 (50-222)||(41266902-41267078)
chr8 (355-419)||(4733947-4734011)
chr8 (345-416)||(31218488-31218559)
chr8 (205-256)||(38863949-38864000)
chr8 (120-231)||(11137031-11137146)
chr8 (52-85)||(4456259-4456292)
chr8 (52-85)||(4696441-4696474)
chr8 (345-419)||(6599200-6599270)
chr8 (345-419)||(6674653-6674723)
chr8 (52-85)||(7412571-7412604)
chr8 (75-154)||(7444946-7445026)
chr8 (50-85)||(7493004-7493039)
chr8 (345-419)||(1292332-1292405)
chr8 (345-419)||(1345239-1345312)
chr8 (172-234)||(30909426-30909487)
chr8 (52-85)||(5702313-5702346)
chr8 (52-85)||(19175587-19175620)
chr8 (50-86)||(5990392-5990428)
chr8 (52-84)||(23799409-23799441)
[»] chr2 (92 HSPs)
chr2 (11-283)||(5723255-5723527)
chr2 (11-283)||(4503132-4503405)
chr2 (11-283)||(45099650-45099923)
chr2 (11-283)||(2334417-2334690)
chr2 (11-283)||(36205664-36205936)
chr2 (11-283)||(36988075-36988348)
chr2 (21-283)||(4484329-4484594)
chr2 (38-277)||(29867791-29868031)
chr2 (11-283)||(6595005-6595279)
chr2 (11-283)||(38312135-38312408)
chr2 (21-283)||(30833250-30833515)
chr2 (11-283)||(723744-724017)
chr2 (11-262)||(42362247-42362500)
chr2 (11-283)||(34139770-34140044)
chr2 (11-283)||(11151591-11151864)
chr2 (15-283)||(17057369-17057638)
chr2 (15-283)||(17085352-17085621)
chr2 (11-283)||(36318009-36318282)
chr2 (11-275)||(11690396-11690661)
chr2 (21-283)||(32289477-32289733)
chr2 (11-283)||(14633825-14634099)
chr2 (50-283)||(36773496-36773730)
chr2 (11-283)||(33162450-33162723)
chr2 (60-282)||(35446885-35447108)
chr2 (60-280)||(1631735-1631956)
chr2 (58-282)||(45726871-45727096)
chr2 (59-283)||(11067248-11067473)
chr2 (38-283)||(6266621-6266860)
chr2 (51-248)||(13121703-13121901)
chr2 (37-216)||(24885582-24885763)
chr2 (50-282)||(17490149-17490376)
chr2 (60-277)||(42288117-42288334)
chr2 (60-283)||(24397997-24398227)
chr2 (11-244)||(14202450-14202680)
chr2 (50-244)||(7815311-7815508)
chr2 (11-158)||(39284780-39284929)
chr2 (51-282)||(11049484-11049721)
chr2 (87-282)||(33648142-33648340)
chr2 (115-279)||(13656035-13656200)
chr2 (50-282)||(26353124-26353351)
chr2 (38-283)||(12647385-12647623)
chr2 (75-283)||(17450550-17450745)
chr2 (38-222)||(12123644-12123831)
chr2 (169-282)||(7451173-7451284)
chr2 (348-419)||(5723119-5723190)
chr2 (208-283)||(39284930-39285004)
chr2 (84-258)||(7597036-7597211)
chr2 (345-419)||(45099985-45100059)
chr2 (87-258)||(30218068-30218241)
chr2 (160-271)||(28671976-28672088)
chr2 (345-419)||(17057232-17057306)
chr2 (345-419)||(17085215-17085289)
chr2 (345-419)||(36205528-36205602)
chr2 (345-419)||(38312471-38312545)
chr2 (345-419)||(6594867-6594941)
chr2 (345-419)||(36987938-36988012)
chr2 (12-134)||(5700271-5700396)
chr2 (169-256)||(42019896-42019986)
chr2 (120-243)||(42261524-42261648)
chr2 (345-419)||(4484191-4484265)
chr2 (171-283)||(24197955-24198065)
chr2 (345-419)||(4502996-4503070)
chr2 (213-259)||(42412117-42412162)
chr2 (345-419)||(723610-723683)
chr2 (345-419)||(2838177-2838250)
chr2 (129-234)||(3897005-3897111)
chr2 (345-419)||(11067532-11067605)
chr2 (345-419)||(14633691-14633764)
chr2 (345-419)||(32289799-32289873)
chr2 (129-222)||(34811281-34811375)
chr2 (52-85)||(17865436-17865469)
chr2 (52-85)||(21630176-21630209)
chr2 (52-85)||(23078304-23078337)
chr2 (52-85)||(34389082-34389115)
chr2 (52-85)||(36757595-36757628)
chr2 (52-85)||(40739065-40739098)
chr2 (54-247)||(41454173-41454366)
chr2 (50-85)||(10445298-10445333)
chr2 (345-392)||(30833579-30833626)
chr2 (50-85)||(40015156-40015191)
chr2 (345-419)||(34139636-34139709)
chr2 (52-85)||(8389982-8390015)
chr2 (52-85)||(10707085-10707118)
chr2 (52-85)||(13569560-13569593)
chr2 (52-85)||(14698842-14698875)
chr2 (52-85)||(28259010-28259043)
chr2 (52-85)||(33118366-33118399)
chr2 (52-85)||(33528457-33528490)
chr2 (52-85)||(39483164-39483197)
chr2 (238-283)||(42064725-42064770)
chr2 (173-206)||(43406029-43406062)
chr2 (11-85)||(3278231-3278307)
[»] chr4 (120 HSPs)
chr4 (11-283)||(56178636-56178909)
chr4 (11-282)||(29999806-30000078)
chr4 (11-283)||(52095362-52095635)
chr4 (11-283)||(48142937-48143212)
chr4 (11-283)||(12739550-12739823)
chr4 (11-283)||(5370082-5370359)
chr4 (11-283)||(9927458-9927730)
chr4 (11-244)||(12747794-12748029)
chr4 (11-283)||(5429574-5429847)
chr4 (11-283)||(37740521-37740793)
chr4 (19-283)||(13992292-13992551)
chr4 (11-283)||(26175636-26175909)
chr4 (11-283)||(34570414-34570687)
chr4 (11-283)||(54199907-54200179)
chr4 (11-283)||(52082663-52082930)
chr4 (11-283)||(47038411-47038682)
chr4 (12-242)||(12745476-12745708)
chr4 (11-283)||(5871715-5871988)
chr4 (11-283)||(36994420-36994692)
chr4 (50-283)||(36463389-36463623)
chr4 (11-283)||(52467354-52467628)
chr4 (38-283)||(31495315-31495556)
chr4 (60-282)||(46703443-46703669)
chr4 (50-282)||(6542180-6542415)
chr4 (70-283)||(2209668-2209883)
chr4 (11-283)||(29254389-29254662)
chr4 (58-283)||(48893638-48893868)
chr4 (60-283)||(54882964-54883188)
chr4 (50-282)||(37229722-37229957)
chr4 (60-262)||(8665351-8665556)
chr4 (60-282)||(41639370-41639593)
chr4 (25-282)||(31474059-31474318)
chr4 (50-283)||(45687182-45687417)
chr4 (70-282)||(40632400-40632612)
chr4 (60-282)||(6655900-6656123)
chr4 (72-282)||(8648095-8648306)
chr4 (11-240)||(24969006-24969238)
chr4 (50-282)||(4587892-4588126)
chr4 (60-279)||(41964358-41964580)
chr4 (70-282)||(50673848-50674059)
chr4 (87-283)||(27416965-27417160)
chr4 (11-283)||(13009444-13009704)
chr4 (102-283)||(26364223-26364404)
chr4 (60-282)||(12073336-12073560)
chr4 (60-282)||(379322-379548)
chr4 (11-282)||(5207843-5208116)
chr4 (60-283)||(50262700-50262922)
chr4 (136-283)||(12743925-12744071)
chr4 (136-283)||(12745314-12745460)
chr4 (60-283)||(12119481-12119708)
chr4 (76-244)||(3913408-3913578)
chr4 (60-274)||(35662384-35662600)
chr4 (50-282)||(51336998-51337231)
chr4 (99-283)||(46147391-46147575)
chr4 (12-244)||(48142413-48142651)
chr4 (136-242)||(12744087-12744193)
chr4 (38-283)||(8393326-8393563)
chr4 (38-283)||(8395535-8395772)
chr4 (60-277)||(26699447-26699670)
chr4 (60-262)||(21688192-21688397)
chr4 (70-205)||(55085442-55085578)
chr4 (85-236)||(53345187-53345340)
chr4 (54-274)||(29056295-29056518)
chr4 (75-256)||(33089837-33090021)
chr4 (38-283)||(7124831-7125071)
chr4 (38-279)||(5135994-5136230)
chr4 (70-202)||(41639218-41639351)
chr4 (115-279)||(5138288-5138455)
chr4 (38-283)||(7122612-7122852)
chr4 (88-275)||(22882759-22882946)
chr4 (88-275)||(22934423-22934610)
chr4 (169-258)||(33989899-33989989)
chr4 (345-419)||(5429910-5429984)
chr4 (50-241)||(6677402-6677597)
chr4 (345-419)||(48143279-48143353)
chr4 (93-218)||(32091456-32091583)
chr4 (345-419)||(5369945-5370019)
chr4 (345-419)||(13992154-13992228)
chr4 (345-419)||(34570277-34570351)
chr4 (136-258)||(5349932-5350052)
chr4 (348-419)||(52082526-52082597)
chr4 (345-419)||(47038279-47038352)
chr4 (345-419)||(54199771-54199845)
chr4 (345-419)||(56178499-56178573)
chr4 (11-84)||(3910002-3910075)
chr4 (345-415)||(9927326-9927396)
chr4 (345-419)||(37740856-37740930)
chr4 (178-282)||(21703836-21703940)
chr4 (136-271)||(34112839-34112973)
chr4 (355-419)||(52095225-52095289)
chr4 (11-66)||(52093882-52093937)
chr4 (345-419)||(5872049-5872122)
chr4 (54-235)||(52065534-52065719)
chr4 (50-282)||(44967829-44968064)
chr4 (345-418)||(52467222-52467295)
chr4 (128-235)||(16422653-16422761)
chr4 (75-165)||(35369558-35369649)
chr4 (173-256)||(37754986-37755070)
chr4 (50-85)||(5112468-5112503)
chr4 (127-206)||(34788851-34788930)
chr4 (345-419)||(31474378-31474451)
chr4 (52-94)||(31985466-31985508)
chr4 (87-220)||(44570427-44570567)
chr4 (345-419)||(48893506-48893579)
chr4 (52-85)||(3777780-3777813)
chr4 (52-85)||(5269033-5269066)
chr4 (52-85)||(5396504-5396537)
chr4 (52-85)||(6743248-6743281)
chr4 (52-85)||(10047612-10047645)
chr4 (52-85)||(16623126-16623159)
chr4 (52-85)||(16628705-16628738)
chr4 (52-84)||(25861866-25861898)
chr4 (11-85)||(36315021-36315096)
chr4 (11-85)||(36329230-36329305)
chr4 (50-85)||(39774136-39774171)
chr4 (50-114)||(5349840-5349905)
chr4 (345-419)||(29254725-29254798)
chr4 (345-419)||(46147259-46147332)
chr4 (52-85)||(8689329-8689362)
chr4 (189-232)||(1122865-1122909)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (11-283)||(434428-434702)
scaffold0002 (120-243)||(490359-490483)
scaffold0002 (345-392)||(434765-434812)
[»] chr1 (113 HSPs)
chr1 (11-279)||(20762567-20762837)
chr1 (11-283)||(3189226-3189499)
chr1 (11-283)||(3198043-3198316)
chr1 (11-283)||(3206882-3207155)
chr1 (11-283)||(3156761-3157033)
chr1 (11-283)||(834167-834440)
chr1 (11-283)||(8550786-8551060)
chr1 (11-283)||(28220226-28220499)
chr1 (11-277)||(44455055-44455322)
chr1 (11-283)||(28223421-28223694)
chr1 (11-283)||(31659133-31659406)
chr1 (11-283)||(49918244-49918518)
chr1 (50-283)||(50167175-50167409)
chr1 (11-283)||(3847121-3847394)
chr1 (11-275)||(50169218-50169483)
chr1 (21-283)||(51765300-51765566)
chr1 (11-283)||(37503557-37503827)
chr1 (11-275)||(196915-197181)
chr1 (50-283)||(28265554-28265788)
chr1 (11-259)||(1833417-1833667)
chr1 (11-283)||(13659336-13659609)
chr1 (11-283)||(45644354-45644628)
chr1 (60-282)||(37168241-37168465)
chr1 (12-283)||(4552637-4552909)
chr1 (61-282)||(13547090-13547312)
chr1 (61-282)||(13549001-13549223)
chr1 (11-283)||(37559867-37560142)
chr1 (11-283)||(10925118-10925394)
chr1 (60-282)||(11348642-11348865)
chr1 (11-283)||(13137976-13138247)
chr1 (11-262)||(23555286-23555538)
chr1 (38-283)||(46064840-46065086)
chr1 (70-282)||(29136202-29136415)
chr1 (115-283)||(13316351-13316520)
chr1 (11-262)||(15820202-15820455)
chr1 (87-282)||(47255340-47255535)
chr1 (70-283)||(42297974-42298188)
chr1 (60-283)||(37033071-37033297)
chr1 (60-282)||(47115115-47115340)
chr1 (40-283)||(30476446-30476692)
chr1 (71-282)||(31925708-31925919)
chr1 (60-282)||(193555-193778)
chr1 (60-283)||(19754438-19754663)
chr1 (11-282)||(927977-928251)
chr1 (70-282)||(7482231-7482445)
chr1 (38-283)||(9987132-9987370)
chr1 (38-283)||(20622236-20622476)
chr1 (60-278)||(34603519-34603740)
chr1 (38-283)||(40282307-40282546)
chr1 (11-283)||(40122196-40122471)
chr1 (58-283)||(41360857-41361082)
chr1 (73-283)||(19752643-19752854)
chr1 (18-283)||(9036326-9036585)
chr1 (38-279)||(21053888-21054123)
chr1 (84-243)||(16455591-16455750)
chr1 (120-258)||(22079322-22079461)
chr1 (38-283)||(44203563-44203801)
chr1 (53-273)||(37282701-37282923)
chr1 (60-187)||(37879006-37879135)
chr1 (191-282)||(28242382-28242472)
chr1 (50-273)||(44650172-44650398)
chr1 (183-282)||(37876767-37876865)
chr1 (87-256)||(6808418-6808595)
chr1 (19-89)||(13316513-13316583)
chr1 (122-283)||(2926516-2926678)
chr1 (93-242)||(9109459-9109610)
chr1 (345-418)||(44455391-44455464)
chr1 (71-271)||(8871074-8871259)
chr1 (345-419)||(3157096-3157170)
chr1 (345-419)||(8550647-8550721)
chr1 (120-258)||(13938143-13938281)
chr1 (200-262)||(36683766-36683828)
chr1 (136-259)||(3460717-3460841)
chr1 (345-419)||(37559728-37559803)
chr1 (348-419)||(49918584-49918655)
chr1 (84-283)||(12318523-12318721)
chr1 (346-419)||(31659470-31659543)
chr1 (347-419)||(10925455-10925527)
chr1 (151-240)||(2263016-2263106)
chr1 (169-254)||(5459961-5460046)
chr1 (11-85)||(22819662-22819737)
chr1 (345-412)||(37503427-37503494)
chr1 (345-419)||(13316215-13316289)
chr1 (355-417)||(20762909-20762971)
chr1 (139-232)||(32471486-32471579)
chr1 (50-97)||(777177-777225)
chr1 (86-185)||(44646881-44646981)
chr1 (50-85)||(47098656-47098691)
chr1 (50-85)||(47102670-47102705)
chr1 (345-419)||(834033-834106)
chr1 (60-222)||(25652029-25652195)
chr1 (345-419)||(28220090-28220163)
chr1 (345-419)||(28223285-28223358)
chr1 (345-419)||(50169078-50169151)
chr1 (52-85)||(3281938-3281971)
chr1 (52-85)||(13604455-13604488)
chr1 (52-85)||(16124347-16124380)
chr1 (178-222)||(16914234-16914279)
chr1 (52-85)||(37069998-37070031)
chr1 (345-405)||(51765630-51765690)
chr1 (345-419)||(196773-196846)
chr1 (178-235)||(4535527-4535585)
chr1 (211-273)||(44646814-44646875)
chr1 (50-83)||(9022737-9022770)
chr1 (52-85)||(13598631-13598664)
chr1 (238-283)||(15916626-15916671)
chr1 (56-85)||(29652044-29652073)
chr1 (238-283)||(31422862-31422906)
chr1 (56-85)||(32889669-32889698)
chr1 (54-222)||(1050503-1050674)
chr1 (60-112)||(6484023-6484075)
chr1 (56-84)||(26644735-26644763)
chr1 (119-186)||(36683694-36683762)
[»] scaffold1519 (2 HSPs)
scaffold1519 (19-283)||(820-1084)
scaffold1519 (345-392)||(1147-1194)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (60-283)||(11502-11726)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (50-283)||(114537-114771)
scaffold0016 (345-417)||(114834-114906)
[»] scaffold0491 (4 HSPs)
scaffold0491 (21-283)||(11160-11425)
scaffold0491 (21-283)||(8734-8999)
scaffold0491 (345-392)||(8623-8670)
scaffold0491 (345-392)||(11049-11096)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (11-283)||(20415-20688)
scaffold0066 (345-419)||(20278-20352)
[»] scaffold0006 (4 HSPs)
scaffold0006 (11-283)||(149097-149370)
scaffold0006 (52-85)||(133112-133145)
scaffold0006 (52-84)||(2726-2758)
scaffold0006 (52-85)||(5916-5949)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (70-282)||(7282-7494)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (70-282)||(18004-18216)
scaffold0176 (52-85)||(17482-17515)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (93-282)||(10468-10656)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (38-283)||(2603-2841)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (70-227)||(80338-80496)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (38-279)||(3729-3963)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (18-279)||(6183-6438)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (50-271)||(27453-27678)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (126-235)||(25065-25175)
[»] scaffold0129 (1 HSPs)
scaffold0129 (50-105)||(19117-19173)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (52-85)||(8250-8283)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (250-279)||(1-30)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (52-85)||(45429-45462)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (52-85)||(36665-36698)
scaffold0087 (56-85)||(43798-43827)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (52-85)||(85914-85947)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 69)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 5406471 - 5406199
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5406471 caaaggaggcaactttagggtttagggtctttgattagagttctctcgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 5406372  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaac 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5406371 ttcattggtgagattgggaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaac 5406272  T
Q  211 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5406271 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaa 5406199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 5410796 - 5410524
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5410796 caaaggaggcaactttagggtttagggtctttgattagagttctctcgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 5410697  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaac 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5410696 ttcattggtgagattgggaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaac 5410597  T
Q  211 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5410596 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaa 5410524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 31404947 - 31404674
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatcttt-gattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31404947 caaaggaggcaactttagggtttagggtcttttgattagagttctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 31404848  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa 209  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31404847 gttcatcagtgagattgggaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa 31404748  T
Q  210 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31404747 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggccaagtttggaccgaactgggtgaacaa 31404674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5413665 - 5413401
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5413665 caaaggaggcaactttagggtttagggtctttgattagagttctctcgggttgggaaacattgtaaacacattggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 5413566  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaac 210  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5413565 ttcattggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggttgttctttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaac 5413466  T
Q  211 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5413465 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 5413401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2171796 - 2171531
Alignment:
Q  19 gcaactttaggatttaggatctttgattagagtt-ctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 117  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2171796 gcaactctagggtttagggtctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 2171697  T
Q  118 gtgagattgggaaaa-tgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattg 216  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2171696 gtgagattgggaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttt-gtatctctttgtaagaactcattg 2171598  T
Q  217 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2171597 atagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 2171531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 30834809 - 30834538
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30834809 caaaggaagcaactttagggtttatggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacacctcggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 30834710  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaat--gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30834709 ttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaaga 30834610  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 280  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30834609 actcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 30834538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16452594 - 16452328
Alignment:
Q  19 gcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg 118  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16452594 gcaactttagagtttagggtctttgattagagttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg 16452495  T
Q  119 tgagattgggaaaat--gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattg 216  Q
    ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  16452494 tgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttcatatctctttggaagaactcattg 16452395  T
Q  217 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16452394 atagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 16452328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 33160626 - 33160351
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaa-tcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33160626 caaaggaggtaactttagggttgagagtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaaatcattgagtgtctt 33160527  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga--tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaag 207  Q
     ||||||||||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33160526 attcattggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaag 33160427  T
Q  208 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33160426 aactcattgatggtggattggagagatcaatctctcctccagagtatttcaagtttggaccaaactgggtgaacaa 33160351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9183304 - 9183031
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9183304 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcctgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 9183205  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9183204 gttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaga 9183105  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  9183104 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 9183031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28137681 - 28137409
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||  ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28137681 caaaggagttaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 28137582  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28137581 gttcattggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatttctttgtaaga 28137482  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  28137481 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaattgtgtgaaca 28137409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26954558 - 26954286
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  26954558 caaaggaggtaactttagggttgagagtctttgattagagttatcttaggttgggaaacattgtaaacacctttggggagtgaaaatcattgagtgtctt 26954459  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa 209  Q
    ||||||  |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  26954458 gttcatatgtgagattgggaaattggtataaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatctgtatctctttgtaagaa 26954359  T
Q  210 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  26954358 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaa 26954286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 60 - 282
Target Start/End: Original strand, 21593608 - 21593831
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21593608 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 21593706  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21593707 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 21593806  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  21593807 caag-ttggaccgaactgggtgaaca 21593831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 33211458 - 33211185
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| |||||||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||    
T  33211458 caaaggaggtaactttacagttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtcactgaaaatcattgagtgtttt 33211359  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||| |||| ||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  33211358 gttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattatggttgttctttgtgagcttgatgaagttaatttcttgtagctcatttgtatctctttgtaaga 33211259  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  33211258 actcatttataatggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 33211185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 3073016 - 3072758
Alignment:
Q  21 aactttaggatttaggatctttgattagag-ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt 119  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       ||    
T  3073016 aactctagggtttagagtctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gt 3072924  T
Q  120 gagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaaccctttt-gtatctcttt-gtaagaactcattga 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  3072923 gagattgggaaaatggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattga 3072824  T
Q  218 tagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3072823 tagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 3072758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 100 - 282
Target Start/End: Original strand, 21588916 - 21589098
Alignment:
Q  100 tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatct 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21588916 tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatct 21589015  T
Q  199 ctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21589016 ctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 21589098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 50 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 3039137 - 3038926
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattaggg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3039137 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgaatgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattaggg 3039038  T
Q  148 ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcc 247  Q
    |||||| |||||| ||| |  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  3039037 ttgttcattgtgagctttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttaatagtggattggagagattaatctctccccc 3038938  T
Q  248 agagtaggtcaa 259  Q
    ||| ||||||||    
T  3038937 agattaggtcaa 3038926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 60 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 3808933 - 3808707
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3808933 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcaca-agtgtcttgttcattggtgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttcttt 3808835  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaaccc-ttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 255  Q
    |||| |||||  || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3808834 gtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 3808735  T
Q  256 tcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||| | |||||||||||| |||||||||    
T  3808734 tcatgattggaccgaactaggtgaacaa 3808707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 6097679 - 6097450
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||| |||||| |    
T  6097679 tctttgattagagtatctctttggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgttttg-------gtgagattggaaaaatggt 6097587  T
Q  137 agaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatca 236  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||          ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6097586 agaaattaggattgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgta----------agaactcattgatagtggattggagagttca 6097497  T
Q  237 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6097496 atctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 6097450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 60 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 2973163 - 2972940
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  2973163 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcata-agtgtcgtgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttcttt 2973065  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2973064 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcaagagtaggt 2972965  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||| || ||||||||| ||||||||    
T  2972964 caag-ttcgaccgaactaggtgaaca 2972940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 60 - 282
Target Start/End: Original strand, 5043571 - 5043795
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5043571 gttgggaaacaattgtaaacaccttgtgagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattcgtgagattgagaaaatgagtagaaattaggtttgttcttt 5043669  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5043670 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcctccatagtaggt 5043769  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    ||   |||||||||||||||||||||    
T  5043770 cattgttggaccgaactgggtgaaca 5043795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Original strand, 412014 - 412271
Alignment:
Q  21 aactttaggatttaggatctttgattagag-ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt 119  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       ||    
T  412014 aactctagggtttagagtctttgattagagcttctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gt 412105  T
Q  120 gagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaaccctttt-gtatctcttt-gtaagaactcattga 217  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  412106 gagattgggaaaaaggtagaaattagggttgttcattgtgaacttatcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattga 412205  T
Q  218 tagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  412206 tagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 412271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 60 - 282
Target Start/End: Original strand, 17762933 - 17763158
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  17762933 gttgggaaacaattgtaaacactttgagagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 17763032  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  17763033 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctttttggaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagat 17763132  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17763133 caagtttggaccgaactaggtgaaca 17763158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 87 - 282
Target Start/End: Original strand, 17757995 - 17758191
Alignment:
Q  87 gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaa 185  Q
    ||||||||||   |||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||    
T  17757995 gagtgaaaattcatgagtgtcttcttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaa 17758094  T
Q  186 cccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  17758095 cccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtagttcaagtttggaccgaactaggtgaaca 17758191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 26830337 - 26830124
Alignment:
Q  70 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 166  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  26830337 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgggtgagattggaaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 26830239  T
Q  167 caaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 266  Q
      |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  26830238 tgaagctaatttcttgtaatccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaagttt-ga 26830140  T
Q  267 ccgaactgggtgaaca 282  Q
    | ||||||||||||||    
T  26830139 ctgaactgggtgaaca 26830124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 60 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22425052 - 22424826
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22425052 gttgggaaacaattgtaaacactttgggagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcgttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 22424953  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaaccc--ttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 254  Q
    |||| |||||  |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22424952 gtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctccttcagagtag 22424854  T
Q  255 gtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    ||||   |||||||| ||||||||||||    
T  22424853 gtcattgttggaccgtactgggtgaaca 22424826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 60 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 603304 - 603088
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggtg-agtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttg 157  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| | |||||||||||    
T  603304 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggatagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattggg-------tagaaatttgtgttgttctttg 603213  T
Q  158 tgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtc 257  Q
    ||| |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||    
T  603212 tgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagaaatcaatctctccccaagattaggtc 603113  T
Q  258 aagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||    
T  603112 aag-ttggaccgaactgggtcaacaa 603088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 256
Target Start/End: Original strand, 4045356 - 4045566
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattaggg 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4045356 gttctcttgagttgggaaacatttgtaaacacctagggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgtttattggagagattgggaaaatggtagaaattaggg 4045455  T
Q  148 -ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcct 245  Q
     ||||||||| ||| |||||  |||||||| |||||||| | |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  4045456 tttgttctttatgagcttgttgaagctaatttcttgtaatcattttatatctctttgtaaataactcattgatagtggattggagagatcaatttctacc 4045555  T
Q  246 ccagagtaggt 256  Q
    ||| |||||||    
T  4045556 ccaaagtaggt 4045566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 283
Target Start/End: Original strand, 16653008 - 16653281
Alignment:
Q  4 ggagaagcaaaggaggcaactttaggatttaggat-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattg 101  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || ||||||||    
T  16653008 ggagaatcaaagg-ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattg 16653105  T
Q  102 agtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctct 200  Q
    |||||||||       ||||||||||||||| | || ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  16653106 agtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggtaaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatccct 16653196  T
Q  201 tt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16653197 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 16653281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 283
Target Start/End: Original strand, 16554778 - 16555038
Alignment:
Q  18 ggcaactttaggatttaggat-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 115  Q
    ||||||| |||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||         
T  16554778 ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg----- 16554871  T
Q  116 tggtgagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactca 213  Q
      ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  16554872 --gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactca 16554967  T
Q  214 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    || |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554968 tttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 16555038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 283
Target Start/End: Original strand, 16631334 - 16631594
Alignment:
Q  18 ggcaactttaggatttaggat-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 115  Q
    ||||||| |||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||         
T  16631334 ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg----- 16631427  T
Q  116 tggtgagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactca 213  Q
      ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  16631428 --gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactca 16631523  T
Q  214 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    || |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631524 tttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 16631594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 283
Target Start/End: Original strand, 16568951 - 16569190
Alignment:
Q  24 tttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgag 122  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||          ||    
T  16568951 tttagggttaagggtctttgattagagttctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttgggtaagtgaaaatcattgagtgtcttg----------ag 16569040  T
Q  123 attgggaaaatga-tagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatag 220  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| || ||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||            |||||||||||||||||||||    
T  16569041 attgagaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacc------------tttgtaagaactcattgatag 16569128  T
Q  221 tggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16569129 tggattggagagatcaatctctcctccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 16569190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 115 - 283
Target Start/End: Original strand, 27647861 - 27648029
Alignment:
Q  115 ttggtgagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactc 212  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  27647861 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactc 27647958  T
Q  213 attgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
     |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27647959 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtagatcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 27648029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16578777 - 16578517
Alignment:
Q  18 ggcaactttaggatttaggat-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 115  Q
    ||||||| |||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||| |||   || || |||||||||||||||||         
T  16578777 ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacacgttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg----- 16578684  T
Q  116 tggtgagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactca 213  Q
      ||||||||||||||| | |||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  16578683 --gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactca 16578588  T
Q  214 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    || |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16578587 tttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 16578517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 283
Target Start/End: Original strand, 16616603 - 16616863
Alignment:
Q  18 ggcaactttaggatttaggat-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 115  Q
    ||||||| |||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||| |||   || || |||||||||||||||||         
T  16616603 ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacacgttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg----- 16616696  T
Q  116 tggtgagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactca 213  Q
      ||||||||||||||| | |||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  16616697 --gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactca 16616792  T
Q  214 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    || |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16616793 tttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 16616863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 184 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5409167 - 5409076
Alignment:
Q  184 aacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5409167 aacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 5409076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Original strand, 25421235 - 25421475
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||  | |    
T  25421235 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggt 25421326  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagag 232  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  25421327 agaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagag 25421424  T
Q  233 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421425 tacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 25421475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Original strand, 6027178 - 6027416
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||  | |    
T  6027178 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggt 6027267  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagag 232  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6027268 agaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagag 6027365  T
Q  233 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027366 tacaatctctcctccagagtatgtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 6027416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 169 - 282
Target Start/End: Original strand, 26800642 - 26800755
Alignment:
Q  169 aagctaatatcttgtaaccc-ttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 267  Q
    |||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  26800642 aagctaatttcttgtaactaattttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggac 26800740  T
Q  268 cgaactgggtgaaca 282  Q
    |||||||| ||||||    
T  26800741 cgaactggatgaaca 26800755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 110
Target Start/End: Original strand, 16567101 - 16567201
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||  ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16567101 caaaggagttaactttagggttaagggtctttgattagagttctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 16567200  T
Q  110 g 110  Q
    |    
T  16567201 g 16567201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 33342343 - 33342108
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||  | |    
T  33342343 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggt 33342254  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgta-tctctttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggaga 231  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||| | ||||| ||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  33342253 agaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtactccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggaga 33342156  T
Q  232 gatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 279  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342155 gtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 33342108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 279
Target Start/End: Original strand, 13153913 - 13154080
Alignment:
Q  115 ttggtgagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaac 210  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||    
T  13153913 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaac 13154010  T
Q  211 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154011 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 13154080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 84 - 243
Target Start/End: Original strand, 25073538 - 25073698
Alignment:
Q  84 ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtg-agattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttg 182  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| || | ||||||  |||||| ||||||||||  || ||||| |||| ||||| ||||||| | | |||    
T  25073538 ggtgagtgaaa-tcattgagtatcttgttcatgggaggagattgaaaaaatggtagaaattagatttattcttcgtgagcttgttaaagctattttattg 25073636  T
Q  183 taacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 243  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  25073637 taacccttttgtatctctatgtaaagaactcattgatagtggattagagaaatcaatctctc 25073698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 279
Target Start/End: Original strand, 34164856 - 34165023
Alignment:
Q  115 ttggtgagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaac 210  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||    
T  34164856 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaac 34164953  T
Q  211 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34164954 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 34165023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 283
Target Start/End: Original strand, 34167078 - 34167249
Alignment:
Q  115 ttggtgagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaac 210  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||    
T  34167078 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaac 34167175  T
Q  211 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    | ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34167176 ttatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 34167249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 347 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 5409005 - 5408933
Alignment:
Q  347 ctttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5409005 ctttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgtgctcactttgatattggttact 5408933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 347 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 5413330 - 5413258
Alignment:
Q  347 ctttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5413330 ctttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgtgctcactttgatattggttact 5413258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 9182968 - 9182894
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9182968 cactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttact 9182894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 347 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 31404610 - 31404538
Alignment:
Q  347 ctttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  31404610 ctttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgctcactttgatattgattact 31404538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 16452265 - 16452191
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||    
T  16452265 cactttgattcctagattagatctaggtgatgttattgttgattattgcttgtattcactttgttattggttact 16452191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 2171464 - 2171390
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||  | ||||||| || ||||||||    
T  2171464 cactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcacacactttgttagtggttact 2171390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 28137347 - 28137274
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  28137347 cactttgattcctatattagatctatgtgttgttattgtcg-ttattgcttgtgtttactttgatattggttact 28137274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 30834471 - 30834397
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||||||    
T  30834471 cactttgattcatagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttact 30834397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 258
Target Start/End: Original strand, 9572667 - 9572735
Alignment:
Q  191 ttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 258  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  9572667 ttgtaactctttgttaagaacccattgatagtggattgcagagatcaatctctactttagagtaggtca 9572735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 5406135 - 5406066
Alignment:
Q  347 ctttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||   ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  5406135 ctttgattcctagattagatctaggtgctattattg---attattgcttgtgctcactttaatattggttact 5406066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 5410460 - 5410391
Alignment:
Q  347 ctttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||   ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  5410460 ctttgattcctagattagatctaggtgctattattg---attattgcttgtgctcactttaatattggttact 5410391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 5017329 - 5017362
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5017329 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 5017362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 5572076 - 5572109
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5572076 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 5572109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 5757311 - 5757344
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757311 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 5757344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 22709274 - 22709241
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22709274 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 22709241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 85
Target Start/End: Original strand, 24435802 - 24435837
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24435802 gttctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttgg 24435837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 241
Target Start/End: Original strand, 2908532 - 2908586
Alignment:
Q  188 cttttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctc 241  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2908532 cttttgtatcttattgtaaagaactcattgatagtggattgaagaaatcaatctc 2908586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 16569251 - 16569324
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||| || |||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||||||||    
T  16569251 cactttgatttctagattagatctaggtgctgctattgttg-ttattgcttgagttcactttgattttggttact 16569324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 26954227 - 26954154
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||  || || | ||||||| ||||||||||    
T  26954227 cactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttg-ttatttcttatgtttactttgaaattggttact 26954154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 21356301 - 21356268
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21356301 tctcttgggttaggaaacattgtaaacaccttgg 21356268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 22963963 - 22963930
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22963963 tctcttggattgggaaacattgtaaacaccttgg 22963930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 23824430 - 23824463
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23824430 tctcttggattgggaaacattgtaaacaccttgg 23824463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 31936835 - 31936806
Alignment:
Q  56 ttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31936835 ttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 31936806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 355 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 3072684 - 3072620
Alignment:
Q  355 cctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||  | ||||||| || ||||||||    
T  3072684 cctagattagatctatgtgctatttttgttgattattgcttgcacacactttgttagtggttact 3072620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 238 - 282
Target Start/End: Original strand, 19643894 - 19643938
Alignment:
Q  238 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  19643894 tctctccttcagagtaggtcaaatttggaccgaacttggtaaaca 19643938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 133)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 45095060 - 45095332
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45095060 caaaagaggcaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 45095159  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaac 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45095160 ttcattggtgagattgggaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaac 45095259  T
Q  211 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45095260 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 45095332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 37408354 - 37408627
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  37408354 caaaggaggcaactttagggtttatggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttagtgagtgaaaattattgagtgtcttg 37408453  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa 209  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37408454 ttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa 37408553  T
Q  210 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37408554 ctcattgatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaacaa 37408627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 5260596 - 5260322
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5260596 caaaggaggcaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 5260497  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaat--gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
     |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5260496 gtcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaaga 5260397  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5260396 actcattgatagtggattggagagttcaatctcttctccaaagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaa 5260322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19684162 - 19683888
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||  ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  19684162 caaaggagttaactttagggttaagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtctt 19684063  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19684062 gttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 19683963  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19683962 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 19683888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 5258407 - 5258143
Alignment:
Q  21 aactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtg 120  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5258407 aactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtg 5258308  T
Q  121 agattgggaaaat--gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgat 218  Q
    ||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5258307 agattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgat 5258208  T
Q  219 agtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5258207 agtggattggagagttcaatctcttctccagagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaa 5258143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 7762161 - 7762434
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7762161 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaatattgtgaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtctta 7762260  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa 209  Q
    |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7762261 ttcattggtgagattgagaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaa 7762360  T
Q  210 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7762361 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 7762434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23200402 - 23200137
Alignment:
Q  19 gcaactttaggatttaggatctttgattagagtt-ctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 117  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23200402 gcaactctagggtttagggtctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttc-ttg 23200304  T
Q  118 gtgagattgggaaaa-tgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattg 216  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23200303 gtgagattgggaaaaatggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctttttgtaagaactcattg 23200204  T
Q  217 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23200203 atagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 23200137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23198203 - 23197938
Alignment:
Q  19 gcaactttaggatttaggatctttgattagagtt-ctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 117  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23198203 gcaactctagggtttagggtctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttc-ttg 23198105  T
Q  118 gtgagattgggaaaa-tgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattg 216  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23198104 gtgagattgggaaaaatggtagaaattagagttgttttttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctttttgtaagaactcattg 23198005  T
Q  217 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23198004 atagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 23197938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 7764363 - 7764633
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||||| ||||||||  || ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7764363 caaaggaggtaactttagagttgagggtctttgattagatttctcttgggttaggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 7764462  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaac 210  Q
    |||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7764463 ttcattggtgaga--gggaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaac 7764560  T
Q  211 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  7764561 tcattgatagtggattggagagatgaatctctcctccagagtaggtcaaatttagaccgaactgggtgaacaa 7764633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9636400 - 9636125
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9636400 caaaggaagaaactttagggtttagggtctttgattagagtctctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 9636301  T
Q  110 gttcattggtgagattggga--aaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaag 207  Q
    | ||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9636300 ggtcattggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccttttgtatctttttgtaag 9636201  T
Q  208 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9636200 aactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccaaagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaa 9636125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 9581178 - 9581451
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||  ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9581178 caaaggagttaactttagggttaagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 9581277  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa 209  Q
    ||||||| ||| |||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  9581278 gttcatttgtgggattcggaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttttaacccatttgtatccctttgtaagaa 9581377  T
Q  210 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9581378 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 9581451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 5236727 - 5236457
Alignment:
Q  13 aaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgt 111  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5236727 aaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgt 5236628  T
Q  112 tcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaac 210  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5236627 tcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaac 5236528  T
Q  211 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  5236527 tcattgataatggattcgagagatcaatctttcc-ccagattaggtcaa-tttggaccaaactgggtcaacaa 5236457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 40734393 - 40734666
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||  ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40734393 caaaggagataactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 40734492  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  40734493 gttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacacatttgtatccctttgtaaga 40734592  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  40734593 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 40734666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22835275 - 22835010
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22835275 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgtgttgggaaacattgtaatcaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 22835176  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22835175 gttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaaga 22835076  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  22835075 actcattgatagtggattggagagatcaatctctccgccatattaggtcaag-ttggaccgaactgg 22835010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 40735278 - 40735545
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtga-gtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  40735278 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattaaagttctcttgggttaggaaacattgtaaacaccttggaaaagtgaaaatcattgagtgtctt 40735377  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  40735378 gttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaaccagtttgtatctctttgtaaga 40735477  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  40735478 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 40735545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 41 - 283
Target Start/End: Original strand, 44331470 - 44331713
Alignment:
Q  41 ttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tag 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  44331470 ttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattaggaaaatgggtag 44331569  T
Q  139 aaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaat 238  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44331570 aaattagggttgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaagccatttgtatctctttgtaagaacttattgatagtggattggagagatcaat 44331669  T
Q  239 ctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  44331670 ctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 44331713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 760742 - 761015
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||  ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  760742 caaaggagttaactttagggttaagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattataaacaccttggatgagtgaaaatcattgagtgtctt 760841  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  760842 gttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtctgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaaga 760941  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| ||||| |||||    
T  760942 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggactgaaatgggttaacaa 761015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 262
Target Start/End: Original strand, 29810763 - 29811016
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| || |||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  29810763 caaaggaggtaattttagggttgagggtctttgattagagttcttttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtctt 29810862  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
     ||||||||||||||| |||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29810863 attcattggtgagattaggaaaatatgtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaga 29810962  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29810963 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 29811016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 51398709 - 51398982
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51398709 caaaggaggtaactttagggttgagagtctttgattagagttttcttgggttgggaaatattgtaaacaccttggatgagtgaaaatcattgagtgtctt 51398808  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  51398809 gttcattgatgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttcttagtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaaga 51398908  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  51398909 actcattgatagtggattggagagatttatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaa 51398982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 29196622 - 29196386
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29196622 gttctcttgggttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg 29196523  T
Q  147 gtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcct 245  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29196522 gtttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttggaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccc 29196423  T
Q  246 ccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  29196422 ccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 29196386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 29682254 - 29682527
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||  || |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29682254 caaaggagttaaatttagggttaagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 29682353  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  29682354 gtttatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattatgtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtcacccatttgtatccctttgtaaga 29682453  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  29682454 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattagatcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 29682527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 29812958 - 29813231
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||    
T  29812958 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattaaagttctcttgggttgggaagcattgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgaggggctt 29813057  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  29813058 gttaattggtgagattggaaaaataggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgcatctctttgtaaga 29813157  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  29813158 actcatttatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcatg-ttggaccgaactgggtcaacaa 29813231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 39153634 - 39153361
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  39153634 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgaatgaaaatcattgagtgtctt 39153535  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| |||||  |||||||| ||||||||| | |||||||| |||| |||||    
T  39153534 gttcatgtgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttcattgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatccctttataaga 39153435  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  39153434 actcattgatagtggattggagagaacaatctctcccccagattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaa 39153361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 16498925 - 16499197
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtg-agtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| |||||  || || ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16498925 caaaggaggtaacttgtgggttgagggtctttgattagagttctcttaggttgagaaacattgtaaacaccttggggtagtgaaaatcattgagtgtctt 16499024  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatg-atagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  16499025 gttcatttgtgagattgggaaaacggatagaaattagggttgtt-tttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttacccatttatatctctttgtaaga 16499123  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  16499124 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 16499197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 800993 - 801261
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagag-ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||| | |||| |||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  800993 caaaggaagaaactctagggtttagagtctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtctt 801092  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaaccctttt-gtatctcttt-gtaag 207  Q
    |       ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  801093 g-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaag 801185  T
Q  208 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  801186 aactcattgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 801261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 53921776 - 53921511
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    |||| |||| ||||||||| || ||  ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53921776 caaatgaggtaactttagggttgagagtctttgattagggttttcttgggttggaaaacattgtaaaaaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 53921677  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||  |||||||||    
T  53921676 gttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaggtttgttgtttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaactcatttgtatcattttgtaaga 53921577  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||    
T  53921576 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccggagtagatcaagttt-gaccgaactgg 53921511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 60 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6095823 - 6095600
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6095823 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttattcattggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggttgttcttt 6095725  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    || ||||| |  ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6095724 gtaaacttcttgaagttaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 6095625  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||    
T  6095624 caag-ttggaccgaactgtgtgaaca 6095600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 44700713 - 44700479
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  44700713 gttctcttgggttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg 44700614  T
Q  147 gttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctc 246  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44700613 gttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcc-c 44700515  T
Q  247 cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    || | ||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  44700514 cacattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaa 44700479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 4569906 - 4570120
Alignment:
Q  70 attgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc 167  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||| |     
T  4569906 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgttttgttctttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgagcttatt 4570005  T
Q  168 aaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 267  Q
     |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  4570006 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctactccagagtaggtgaagtttggac 4570105  T
Q  268 cgaactgggtgaaca 282  Q
    |||||||||| ||||    
T  4570106 cgaactgggtcaaca 4570120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 60 - 282
Target Start/End: Original strand, 54593648 - 54593871
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat-agaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  54593648 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgtgcagaaattagggttgttcttt 54593746  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||| |||||  |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  54593747 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtatgt 54593846  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||    
T  54593847 caag-ttggaccaaactgggtgaaca 54593871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Original strand, 31314379 - 31314613
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattaggg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  31314379 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacactttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcataggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggg 31314478  T
Q  148 ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcc 247  Q
    |||||| |||||| |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  31314479 ttgttcattgtgatcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctttttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatatctccccc 31314578  T
Q  248 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    | | ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  31314579 atattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaa 31314613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Original strand, 32890998 - 32891264
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  32890998 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagggttctcttggggtgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtaaaaatcattgagtgtctt 32891097  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaag 207  Q
    |||| | |||||||||| |||||||  ||||||||| | || ||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  32891098 gttcttcggtgagattgagaaaatgggtagaaattaagttttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaag 32891197  T
Q  208 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 275  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  32891198 aactcgttgatagtggattggagagataaatctctcccccggagtaggtcatg-ttggaccgaactgg 32891264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 60 - 283
Target Start/End: Original strand, 34491157 - 34491380
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  34491157 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaattc--tgagtgtgttattcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 34491254  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34491255 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 34491354  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  34491355 caag-ttggaccgaactgggtgaacaa 34491380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 60 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 43402026 - 43401800
Alignment:
Q  60 gttgggaaac-attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  43402026 gttgggaaacgattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 43401928  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaaccc-ttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 255  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  43401927 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacgcattttttatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaaattaatctctcctccagagtagg 43401828  T
Q  256 tcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  43401827 tcatggttggaccgaactgggtgaacaa 43401800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 60 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 49199694 - 49199468
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  49199694 gttgggaaacaattgtaaacactttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcgttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggttgttcttt 49199596  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaaccc-ttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 255  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  49199595 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagattaatctctcctccagactagg 49199496  T
Q  256 tcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  49199495 tcatggttggaccgaactgggtgaacaa 49199468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23392143 - 23391909
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattaggg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |     
T  23392143 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcatttagtgtctttttcattggtgagtttgggaaaatgagtagaaattaagt 23392044  T
Q  148 ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcc 247  Q
    ||||||||||||| |||||  ||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  23392043 ttgttctttgtgagcttgtttaagataatttcttgtaacccatttgtatcactttgcaagaactctttgatagtggattgtagagataaatctctccccc 23391944  T
Q  248 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    | | ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  23391943 aaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 23391909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 60 - 283
Target Start/End: Original strand, 30236069 - 30236293
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggtg-agtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  30236069 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggatagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgatgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 30236167  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  30236168 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 30236267  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||    
T  30236268 caag-ttggaccgaactaggtcaacaa 30236293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 41819737 - 41819523
Alignment:
Q  70 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc 167  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41819737 attgtaaacaccttgggagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttttttgtgagcttgtc 41819638  T
Q  168 aaagctaatatcttgtaaccc-ttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 266  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  41819637 taagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagacatcaatctctcctccagagtaggtcattgttgga 41819539  T
Q  267 ccgaactgggtgaaca 282  Q
    || |||||||||||||    
T  41819538 ccaaactgggtgaaca 41819523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 60 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 43403969 - 43403743
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  43403969 gttgggaaacaattgtaaacactttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggcttgttcttt 43403871  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaaccctt-ttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 255  Q
    |||| |||||  ||||| || ||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43403870 gtgagcttgttgaagctcatttcttgtaactcatgttttatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagattaatctctcctccagagtagg 43403771  T
Q  256 tcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  43403770 tcatggttggaccgaactgggtgaacaa 43403743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 46860427 - 46860642
Alignment:
Q  70 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaat-cattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 166  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  46860427 attgtaaacaccttgggagagtgaaaattcaatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgt 46860526  T
Q  167 caaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 266  Q
      |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||    
T  46860527 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattggagagatcaatctttcctccagagtaggtcattgttgga 46860626  T
Q  267 ccgaactgggtgaaca 282  Q
    ||||| ||| ||||||    
T  46860627 ccgaattggatgaaca 46860642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9666741 - 9666466
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtct 108  Q
    |||| |||| ||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9666741 caaatgaggtaactttagggttgagggtctttgattagggttctcttcagttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtct 9666642  T
Q  109 tgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaa 206  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||  || ||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| | ||| || ||||||||||    
T  9666641 tgttcatttgtgagattggaaaaatgggtagaaattagattttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttatacctctttgtaa 9666542  T
Q  207 gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  9666541 gaattctttgatagtggattggagagattgatctctcccccagattaggtaaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 9666466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 32744699 - 32744436
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |        
T  32744699 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacattggtgagtgaaaatcattgagtat---- 32744604  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa 209  Q
        || |||||||||  ||||| | ||||||||| | ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  32744603 ----tttgtgagattgaaaaaatgggtagaaatta-gtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatcactttgtaagaa 32744509  T
Q  210 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  32744508 ctctttgatagtggattgaagagataaatctatcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 32744436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 75 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7780204 - 7780003
Alignment:
Q  75 aaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagcta 174  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||        ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  7780204 aaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttc-------gtgagattgggaaaagggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatcta 7780112  T
Q  175 atatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 273  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  7780111 atttcttgtaacc-ttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaagt 7780013  T
Q  274 gggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||    
T  7780012 gggtgaacaa 7780003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 87 - 283
Target Start/End: Original strand, 47304224 - 47304419
Alignment:
Q  87 gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaa 185  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||    
T  47304224 gagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatgggtagaaattatggttgttctttgtgagcttgttgaagttaatatcttgtaa 47304322  T
Q  186 cccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  47304323 cccatctgtatctcttcgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaagttt-gaccgaactgggtcaacaa 47304419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 60 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5434102 - 5433906
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgg--gaaaatgatagaaattaggg-ttgttctt 155  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  5434102 gttgggaaacaattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggagaaaatggtagaaattagggtttgttctt 5434003  T
Q  156 tgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 254  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5434002 tgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccttttatatctctttgtaaagaac-------cggtggattggagagatcaatctctcctccatagtag 5433910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 61 - 273
Target Start/End: Original strand, 46173311 - 46173515
Alignment:
Q  61 ttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgt 158  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||        |||||||||||||||||||||||    
T  46173311 ttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtaaaattgg--------tagaaattagggttgttctttgt 46173401  T
Q  159 gaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 258  Q
    || |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  46173402 gagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaattcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtca 46173501  T
Q  259 agtttggaccgaact 273  Q
    || ||||||||||||    
T  46173502 ag-ttggaccgaact 46173515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23410563 - 23410329
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattaggg 147  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||  ||||||||| |     
T  23410563 gttctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattagtgaaatttggaaaatgggtagaaattatgt 23410464  T
Q  148 ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcc 247  Q
    || |||||||||| |||||  |||||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  23410463 ttattctttgtgagcttgtttaagctaatttcgtataacccatttgtatcactttgtaagaactcttagataatggattggagagataaatctctccccc 23410364  T
Q  248 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    | | ||||||||| ||||| |||| ||||| |||||    
T  23410363 aaattaggtcaag-ttggaacgaattgggtcaacaa 23410329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Original strand, 6716430 - 6716668
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| | |    
T  6716430 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggt 6716521  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagat 234  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||      
T  6716522 agaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagta 6716619  T
Q  235 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716620 caaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 6716668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Original strand, 54635055 - 54635293
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| | |    
T  54635055 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggt 54635146  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagat 234  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||      
T  54635147 agaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagta 54635244  T
Q  235 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635245 caaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 54635293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Original strand, 45282913 - 45283155
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| | |    
T  45282913 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgcaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggt 45283004  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt----gtaagaactcatt-gatagtggattggag 230  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45283005 agaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatccctttttttgtaagaactcatttgatagtggattggag 45283102  T
Q  231 agatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45283103 agtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 45283155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 249
Target Start/End: Original strand, 36018795 - 36018987
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  36018795 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaattaacgagtgacttgttcattggtgaaattgggaaaatgggttgaaattagggttgttcttt 36018894  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaac-ccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccag 249  Q
    |||| |||||  ||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36018895 gtgagcttgttgaagttaatttcttgtaactcattttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagaggtcaatctctcccccag 36018987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Original strand, 3617379 - 3617619
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||  | |    
T  3617379 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggt 3617470  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagag 232  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  3617471 agaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagag 3617568  T
Q  233 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617569 tacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 3617619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 26386754 - 26386597
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26386754 caaaggaggtaactttagggttgagagtctttgattagagttctcttaggttgggaaacagggtaaatactttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 26386655  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgt 166  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  26386654 gttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgt 26386597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 279
Target Start/End: Original strand, 25637358 - 25637592
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||  | |    
T  25637358 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggt 25637447  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagag 232  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  25637448 agaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagag 25637545  T
Q  233 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 279  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637546 tacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 25637592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 60 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 31340425 - 31340268
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||    
T  31340425 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgttttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattgaggttgttcttt 31340327  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcatt 215  Q
    |||| |||||  |||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  31340326 gtgagcttgttgaagctaatttcatgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcatt 31340268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 95 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 51352298 - 51352150
Alignment:
Q  95 atcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttg 193  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||| | |||| |||| |||||||| || ||||    
T  51352298 atcattgagtgtcttgtttattggtgagattaggaaaatgatagaagttagggtttgttcattgtgagctttttaaagttaatttcttgtaa-ccatttg 51352200  T
Q  194 tatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 243  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  51352199 tatttctttgtaataactcattgagagtggatttgagagatcaatctctc 51352150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 173 - 283
Target Start/End: Original strand, 40913352 - 40913461
Alignment:
Q  173 taatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaac 272  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  40913352 taatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcatcgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaac 40913450  T
Q  273 tgggtgaacaa 283  Q
    ||||| |||||    
T  40913451 tgggtcaacaa 40913461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 178 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 55302076 - 55301972
Alignment:
Q  178 tcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 277  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| |||    
T  55302076 tcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaattcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcattgttggaccgaacttggt 55301977  T
Q  278 gaaca 282  Q
    |||||    
T  55301976 gaaca 55301972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 233
Target Start/End: Original strand, 5373157 - 5373353
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattg-taaacacctt--------ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggg--aaaatgatag 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||| | |||    
T  5373157 gttctcttgggttgggaaacattggtaaacaccttattgggtgggtgagggaaaatcattgagtgtcttgttcattgaagagattgggaaaaaagggtag 5373256  T
Q  139 aaattagg-gttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagaga 233  Q
    ||||||||  ||||||||| ||| |||||  |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||    
T  5373257 aaattaggctttgttctttttgagcttgttgaagctaatttattgtaacccttttatatctctttgtaaggaactcattgccaatggattggagaga 5373353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 4600982 - 4600747
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||  | |    
T  4600982 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggt 4600893  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggaga 231  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  4600892 agaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggaga 4600795  T
Q  232 gatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 279  Q
    |  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4600794 gtacaaactctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 4600747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 4598693 - 4598526
Alignment:
Q  115 ttggtgagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaac 210  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||    
T  4598693 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaac 4598596  T
Q  211 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598595 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 4598526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 279
Target Start/End: Original strand, 10056217 - 10056384
Alignment:
Q  115 ttggtgagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaac 210  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||    
T  10056217 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaac 10056314  T
Q  211 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10056315 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 10056384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 279
Target Start/End: Original strand, 10058439 - 10058606
Alignment:
Q  115 ttggtgagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaac 210  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||    
T  10058439 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaac 10058536  T
Q  211 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10058537 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 10058606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 279
Target Start/End: Original strand, 10060661 - 10060828
Alignment:
Q  115 ttggtgagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaac 210  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||    
T  10060661 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaac 10060758  T
Q  211 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10060759 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 10060828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 279
Target Start/End: Original strand, 10062883 - 10063050
Alignment:
Q  115 ttggtgagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaac 210  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||    
T  10062883 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaac 10062980  T
Q  211 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10062981 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 10063050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 279
Target Start/End: Original strand, 10065105 - 10065272
Alignment:
Q  115 ttggtgagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaac 210  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||    
T  10065105 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaac 10065202  T
Q  211 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10065203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 10065272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 279
Target Start/End: Original strand, 10211393 - 10211560
Alignment:
Q  115 ttggtgagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaac 210  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||    
T  10211393 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaac 10211490  T
Q  211 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211491 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 10211560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 2075292 - 2075178
Alignment:
Q  49 agttctcttgggttgggaaacattg-taaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggg-aaaatgatagaaattagg 146  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||     
T  2075292 agttatcttgggttgggaaacatttataaacaccttgctgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgatattgggaaaaatggtagtaattaga 2075193  T
Q  147 gtt-gttctttgtga 160  Q
    ||| |||||||||||    
T  2075192 gttggttctttgtga 2075178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4055926 - 4055769
Alignment:
Q  120 gagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacc-cttttgtatctctttgtaagaa-ctcattga 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| | |||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4055926 gagattgggaaatgggtagaaattagg-ttgttcttggagaacttgtaaaagttaatttcttgtaacctcttttgtatctctttgtaagaaactcattga 4055828  T
Q  218 tagtggattggagagatcaatctctcctccaga-gtaggtcaagtttggaccgaactgggt 277  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||||||||   |||| |||||||||||    
T  4055827 tagtggattgaagagatc--tctctcccccagatgtaggtcattgttgggccgaactgggt 4055769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 115 - 279
Target Start/End: Original strand, 10209173 - 10209340
Alignment:
Q  115 ttggtgagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgta-tctctttgtaa-gaac 210  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||| | ||||| ||  ||||||| ||||    
T  10209173 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtagtccttttgtaaagaac 10209270  T
Q  211 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10209271 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaactgggtga 10209340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 37408690 - 37408764
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37408690 cactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgtttgtgctcactttaatattggttact 37408764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 75 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 35138915 - 35138746
Alignment:
Q  75 aaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg-gtgagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagc 172  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| ||||  | ||||||||| | |||||||| ||||  ||||  |||     
T  35138915 aaacaccttgggagagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatggaaagagattgagaaatgggtagaaattatgtttgttcttggtgagtttgttgaagt 35138816  T
Q  173 taatatcttgtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctc 241  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  35138815 taatttcttgcaactcttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtggatggaagagaacaatctc 35138746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 347 - 419
Target Start/End: Original strand, 45095396 - 45095468
Alignment:
Q  347 ctttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45095396 ctttgattcatagattagatctatgtgctgttattgttgattattgcttgtgctcactttgatattggttact 45095468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 9581514 - 9581588
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9581514 cactttgattcatagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgctcactttgatattggttact 9581588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 9634758 - 9634684
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9634758 cactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttact 9634684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 9636061 - 9635987
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  9636061 cactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttact 9635987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 7764696 - 7764770
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  7764696 cactttgattccaagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttact 7764770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 19683825 - 19683751
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19683825 cacttttattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttact 19683751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 29813292 - 29813366
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  29813292 cactttgattcttagattagatctaggtgctgttattgttgattattgtttgtgttcactttgatattagttact 29813366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 40735613 - 40735687
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||| | |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40735613 cactttggttcctatattagatctaggtgctgttattgttgattattgtttgtgttcactttgatattggttact 40735687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 149 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4075605 - 4075476
Alignment:
Q  149 tgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacc-cttttgtatctctttgtaagaa-ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctc 246  Q
    ||||||| | |||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  4075605 tgttcttagagaacttgtaaaagttaatttcttgtaacctcttttgtatcactttgtaagaaactctttgatagtggattggagagatca--ctctcccc 4075508  T
Q  247 caga-gtaggtcaagtttggaccgaactgggt 277  Q
    |||| ||||||||   |||| |||||||||||    
T  4075507 cagatgtaggtcattgttgggccgaactgggt 4075476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 345 - 413
Target Start/End: Original strand, 51399045 - 51399113
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattg 413  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  51399045 cactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgctagtgctcactttgatattg 51399113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 215 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27305777 - 27305719
Alignment:
Q  215 tgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  27305777 tgatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaa-tttggaccgaactg 27305719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 7762497 - 7762571
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  7762497 cactttgattcctaaattagatctaggtgttgttattgttgattattacttgtgttcactttgatattggttact 7762571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 29811099 - 29811173
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||    
T  29811099 cactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttctctttgaaattggttact 29811173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 25491116 - 25491003
Alignment:
Q  134 gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagag 232  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||||| || |||| ||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||    
T  25491116 gatagaaattaggtttgttctttgagagcttgttgaagctgatttcttatactccttttgtatctctttgtaaagaaatcattgatagtgaagtggagag 25491017  T
Q  233 atcaatctctcctcca 248  Q
    |||  |||||||||||    
T  25491016 atc--tctctcctcca 25491003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26323283 - 26323124
Alignment:
Q  75 aaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagc 172  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| | || |||||||| ||||| ||   ||  ||||  ||||    
T  26323283 aaacaccttgagtgagtgaacatcattaagtgtcttgttcatgggatgagattgagaaaagggtaaaaattaggtttgtttttgaagagtttgttgaagc 26323184  T
Q  173 taatatcttgtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggaga 231  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||| || || ||||||||||||||| | ||||||    
T  26323183 taatttcttgtaacctttttgtatatcttggtaaaaaactcattgatagtgaagtggaga 26323124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 2075149 - 2075076
Alignment:
Q  208 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  2075149 aactaattgatagtggatttgagagatcaatctctccccgagagtaggtcaag-ttggatcgaactgggtaaaca 2075076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 5258081 - 5258007
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||||||    
T  5258081 cactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttact 5258007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 5260260 - 5260186
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||    
T  5260260 cactttgattcctaaattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcactcactttgttattggttact 5260186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 40734728 - 40734802
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  40734728 cactttgattcctagattagatctaggtgctgttattttttattatttcttgtgttcactttgatattggttact 40734802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3148221 - 3148037
Alignment:
Q  54 tcttgggttgggaaaca-ttgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaatgatagaaattagggttgt 151  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||| | |||||  | ||  ||||||| ||||  ||||||||||||| || |    
T  3148221 tcttaggttgggaaacaattgtaaacattttggtgagtgaaaataattgagtcttttgtttgtgggaagagattgagaaatggatagaaattaggtttct 3148122  T
Q  152 tctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa-ctcattgatagtggattggagagatc 235  Q
    ||||   || |||||  |||||||| |||||||||| | |||||| | |||||||||| ||||||||| ||| | || |||||||    
T  3148121 tcttgaagagcttgttgaagctaatttcttgtaaccttattgtatttgtttgtaagaatctcattgattgtgaagtgcagagatc 3148037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 239
Target Start/End: Original strand, 20937678 - 20937781
Alignment:
Q  136 tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttg-taagaactcattgatagtggattggagagat 234  Q
    ||||||||| | ||||| || | || |||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  20937678 tagaaattatgtttgtttttggagagcttgttgaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgaaaagaactcattgata-tagattggagagat 20937776  T
Q  235 caatc 239  Q
    |||||    
T  20937777 caatc 20937781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 258
Target Start/End: Original strand, 33191866 - 33191974
Alignment:
Q  148 ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctc 246  Q
    |||||||| | || |||||  |||||||  |||||||||| ||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  33191866 ttgttcttagagagcttgttgaagctaagttcttgtaaccatttt--atgtctttgtaaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctct-ctc 33191962  T
Q  247 cagagtaggtca 258  Q
    ||||| ||||||    
T  33191963 cagaggaggtca 33191974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8166693 - 8166516
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgt--cttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaatta 144  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||  ||| ||| |||||||||    
T  8166693 gttctcttgagttgaaaaacatttgtaaacacattgggtgggtgaaaatcattgagtgtgtcttgttcatggaagagattgataaa-tgagtagaaatta 8166595  T
Q  145 gggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 222  Q
    || |||||||| | ||  ||||  ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  8166594 ggtttgttcttggagagtttgttgaagttaatatcttataacctttttgtatctctttgtaaagaacttgttgatagtg 8166516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 53 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1314037 - 1313852
Alignment:
Q  53 ctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaatgatagaaattagggtt 149  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| ||| |  |  ||||||| ||||| | || |||||| | ||    
T  1314037 ctcttggattgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaatt-attgagtctcttattcttgagaagagattgagaaaagggtaaaaattatgttt 1313939  T
Q  150 -gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagat 234  Q
     |||||| | || ||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1313938 tgttcttggagagcttgttaaagctaatttcttgcaagccttttgtatatctttgaaaagaactcattgatattggattagagagat 1313852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 5236394 - 5236328
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatat 411  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | | | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5236394 cactttgattcctagattagatctaggagctcttattgttgattattgcttgtgttcactttgatat 5236328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 21350944 - 21350874
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21350944 cactttgattcctagattagatctaagtgttgttattgttg----ttgtttgtgtttactttgatattggttact 21350874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40519391 - 40519258
Alignment:
Q  85 gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattag-ggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgt 183  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| ||||||  ||||||||||| | |||||||||    | ||||  ||| |||| ||||||    
T  40519391 gtgagtgaaaatcattgaatgtcttattcattggagatattaggaaaacaatagaaattagagtttgttcttt----atttgttgaagttaatttcttgt 40519296  T
Q  184 aacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagt 221  Q
    ||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40519295 aa-tattttgtatctctttgtaaagaactcattgatagt 40519258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 54739116 - 54739004
Alignment:
Q  120 gagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaa-gaactcattga 217  Q
    |||||||  |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||  || ||||| | | ||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  54739116 gagattgaaaaaatggtagaaattagtgtttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttat-gtaactcttttatatctctctgtaaagaactcattga 54739018  T
Q  218 tagtggattggaga 231  Q
    ||||||||||||||    
T  54739017 tagtggattggaga 54739004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 279
Target Start/End: Original strand, 10067435 - 10067471
Alignment:
Q  243 cctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10067435 cctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 10067471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 85
Target Start/End: Original strand, 3323511 - 3323546
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3323511 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 3323546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 761076 - 761149
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||||||||    
T  761076 cactttgattcctagattagatctaggtgctgctattgttg-ttattgcttgagttcactttgattttggttact 761149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 22834943 - 22834870
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||   |||| | ||||||||||||||||||    
T  22834943 cactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttg-ttattacctgtgtttactttgatattggttact 22834870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 16264613 - 16264580
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16264613 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 16264580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 24694988 - 24695021
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24694988 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 24695021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 26299252 - 26299219
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26299252 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 26299219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 26928421 - 26928454
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26928421 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 26928454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 27986278 - 27986311
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27986278 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 27986311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 36029357 - 36029324
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36029357 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 36029324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 40592604 - 40592637
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40592604 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 40592637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 47923726 - 47923759
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47923726 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 47923759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 21711486 - 21711454
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711486 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 21711454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 23200063 - 23200000
Alignment:
Q  355 cctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||    
T  23200063 cctagattagatctaggtgtt-ttattgttgattattgcttgcactcactttgttattggttact 23200000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 92
Target Start/End: Original strand, 30709615 - 30709651
Alignment:
Q  56 ttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtga 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30709615 ttgggttgggaaacattgtaaacaccttggggagtga 30709651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 85
Target Start/End: Original strand, 6794535 - 6794570
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6794535 gttctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttgg 6794570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 8126892 - 8126861
Alignment:
Q  54 tcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8126892 tcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 8126861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 85
Target Start/End: Original strand, 3328178 - 3328212
Alignment:
Q  51 ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3328178 ttctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgg 3328212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 84
Target Start/End: Original strand, 4386797 - 4386831
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4386797 gttctcttgggttgggaaacattgtaatcaccttg 4386831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 39032335 - 39032409
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||  ||||||    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39032335 caaaggaggtaactttagggttgagtgtctttgtagtgagatctcttgggttggtaaacattgtaaacaccttgg 39032409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 258
Target Start/End: Original strand, 39127519 - 39127693
Alignment:
Q  87 gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaa 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||  |  ||||||| ||||    || |||||| | |||||||| |||| |||||  |||||||| |||| ||     
T  39127519 gagtgaaaatcattgagcgtcttattcatgagaagagattgagaaataagtataaattatgtttgttcttggtgagcttgttgaagctaatttcttatag 39127618  T
Q  186 cccttttgtatctctttgtaag-aactcattgatag-tggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 258  Q
       |||||||||| || ||||  ||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39127619 tttttttgtatcttttcgtaaataactcattgataaatggatttgaaagatcaatctctcctccagagcaggtca 39127693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 44700420 - 44700347
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  44700420 cactttgattactagattagatctaggtgttgttattattg-ttgttgcttgtgtttactttgatattggttact 44700347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 85
Target Start/End: Original strand, 1736130 - 1736159
Alignment:
Q  56 ttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1736130 ttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 1736159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 8370311 - 8370344
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8370311 tctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 8370344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 27038315 - 27038282
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27038315 tctcttgggtagggaaacattgtaaacaccttgg 27038282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 27453224 - 27453191
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27453224 tctcttgggttggcaaacattgtaaacaccttgg 27453191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 27974774 - 27974807
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27974774 tctcttgggtcgggaaacattgtaaacaccttgg 27974807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 28253423 - 28253346
Alignment:
Q  127 ggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttg 203  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||| |||| |||||||||  |||||||| ||||||    
T  28253423 ggaaaatggtagaaattagggttcgttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacgattttgtatttctttg 28253346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 32143587 - 32143554
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32143587 tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgg 32143554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 33386497 - 33386530
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33386497 tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgg 33386530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 35925738 - 35925709
Alignment:
Q  56 ttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35925738 ttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 35925709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 115
Target Start/End: Original strand, 40612562 - 40612607
Alignment:
Q  70 attgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 115  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40612562 attgtaaacaacttggcaagtgaaaatcattgagtctcttgttcat 40612607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 23391849 - 23391778
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggtta 417  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  23391849 cactttgattactagattagatctaggtgttgttattattg-ttgtttcttgtgttcactttgatattggtta 23391778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 90)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 25412657 - 25412929
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25412657 caaaggaggcaacattagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 25412756  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaac 210  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25412757 ttcattggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaac 25412856  T
Q  211 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25412857 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggactgaactgggtgaacaa 25412929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 30182484 - 30182757
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30182484 caaaggaagcaactttagggattagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgcaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 30182583  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaa-tgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa 209  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  30182584 ttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttctatctctttggaagaa 30182683  T
Q  210 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30182684 ctcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtatgtcaagtttggaccgaactggatgaacaa 30182757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 13342956 - 13343229
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13342956 caaaggaagcaactttagggtttagggtctctgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 13343055  T
Q  111 ttcattggtgagattggg--aaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  13343056 ttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttg-aaga 13343154  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13343155 actcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcatgtttggaccgaactgggtgaacaa 13343229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 13239647 - 13239920
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||||| ||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13239647 caaaggaggtaactttatggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 13239746  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaa-tgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa 209  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13239747 ttcattggtgagattggaaaaaatggtagaaattagggtttttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaa 13239846  T
Q  210 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13239847 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaacaa 13239920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 36074317 - 36074042
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36074317 caaaggaagcaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 36074218  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaatga----tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||  |    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  36074217 ttcattggtgagattgggaaaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg-aa 36074119  T
Q  207 gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36074118 gaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactggatgaacaa 36074042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 32636719 - 32636992
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32636719 caaaggaggtaactttagggttaagggtctttgattagagttctcttgggtagtgaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 32636818  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
     ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32636819 attcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaga 32636918  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  32636919 actctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 32636992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 13488098 - 13488365
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13488098 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtctt 13488197  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13488198 gttcattggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaga 13488297  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13488298 actcattgatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 13488365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 52 - 283
Target Start/End: Original strand, 37439070 - 37439310
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaa---------aatgatagaaat 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         || | |||||||    
T  37439070 tctcttgggttgggaaacattgtaaacactttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattgggaaggaaaaataaaaggtagaaat 37439169  T
Q  143 tagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctct 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37439170 tagggttgttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctct 37439269  T
Q  243 cctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37439270 cctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 37439310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 42428703 - 42428430
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||  ||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42428703 caaaggagataactttagggttgaaggtctttgattagagttctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 42428604  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42428603 gttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtttttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaga 42428504  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  42428503 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 42428430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 533664 - 533937
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  533664 caaaggaggtaactttagggttgggggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgcgtgtctt 533763  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  533764 gttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttggtctttgtgagcttgttgaagctaattttttgtaacccatttgtatctctttgtaaga 533863  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  533864 actcattgatagtggattggaaagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 533937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Original strand, 16409387 - 16409644
Alignment:
Q  21 aactttaggatttaggatctttgattagag-ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt 119  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  16409387 aactctagggtttagagtctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg-------gt 16409479  T
Q  120 gagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgat 218  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16409480 gagattggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgat 16409579  T
Q  219 agtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16409580 agtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 16409644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 39468822 - 39468549
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39468822 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttcattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgagtgtctt 39468723  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39468722 gttcattagtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaga 39468623  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| ||  |||||| ||||||||| |||||    
T  39468622 actcattgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggttaa-attggactgaactgggtcaacaa 39468549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 16451976 - 16452247
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16451976 caaaggaggtaactttagggttgaggatctttgattagagttctcttgggttcggaaacattgtaaacaccttggtaagtgacaatcattgagtgtcttg 16452075  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa 209  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| | ||||||||| ||| |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16452076 ttcattgatgagattggaaaaatgggtagaaattaagtttgttctttctgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaa 16452175  T
Q  210 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16452176 ctcattcatagtggattggagagataaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 16452247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28750928 - 28750661
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28750928 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgaaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 28750829  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||| |||| || |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  28750828 gttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttatgaaattgttgaagttaatttcctgtaacccatttgtatctttttgtaaga 28750729  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  28750728 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaattgggt 28750661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Original strand, 26177795 - 26178051
Alignment:
Q  21 aactttaggatttaggatctttgattagag-ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt 119  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  26177795 aactctagggtttagagtctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg-------gt 26177887  T
Q  120 gagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgat 218  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26177888 gagattgg-aaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgat 26177986  T
Q  219 agtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26177987 agtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 26178051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 42426508 - 42426235
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  42426508 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttagattgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtctt 42426409  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  42426408 gttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaaattgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctctttgtaaga 42426309  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||| ||||| ||| |||||    
T  42426308 actcattgatagtggattggagagatcaatctctccccctgattaggtcaag-ttggactgaactaggtcaacaa 42426235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 60 - 282
Target Start/End: Original strand, 213409 - 213633
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  213409 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 213507  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  213508 gtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggt 213607  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  213608 caagtttggaccgaactgggtgaaca 213633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 30683190 - 30682930
Alignment:
Q  14 aggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttc 113  Q
    |||||| || |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30683190 aggaggtaattttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgcgaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttc 30683091  T
Q  114 attggtgagattggg-aaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga--ac 210  Q
    ||| ||||||||||| |||| | |||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  30683090 atttgtgagattgggaaaaagggtagaaattagg---gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttctttgtaagaatac 30682994  T
Q  211 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  30682993 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgg 30682930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Original strand, 537920 - 538185
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  537920 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttggcttgggaaacatcgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgcgtgtctt 538019  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  538020 gttcattagtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggttgctctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaga 538119  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 275  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  538120 actcattgatagtagattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgg 538185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9789480 - 9789223
Alignment:
Q  21 aactttaggatttaggatctttgattagag-ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt 119  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  9789480 aactctagggtttagagtctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg-------gt 9789388  T
Q  120 gagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgat 218  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9789387 gagattggaaaaagggtagaaattaaggttgttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgat 9789288  T
Q  219 agtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9789287 agtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 9789223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18441904 - 18441647
Alignment:
Q  21 aactttaggatttaggatctttgattagag-ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt 119  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  18441904 aactctagggtttagagtctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg-------gt 18441812  T
Q  120 gagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgat 218  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18441811 gagattggaaaaagggtagaaattagggttgttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgat 18441712  T
Q  219 agtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18441711 agtggattggagagttcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 18441647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 33831575 - 33831848
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||  || |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33831575 caaaggagttaattttagggttaagggtctttgattagagttctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 33831674  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
     |||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33831675 attcatttgtgagattggaaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaga 33831774  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  33831775 actcattgatagtggattgaagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaa 33831848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Original strand, 31182868 - 31183138
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31182868 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttaggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 31182967  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa 209  Q
    ||||||| |||||||||| |||  | ||||||||||| |||||||||||||  ||||  ||| |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  31182968 gttcatttgtgagattggaaaatgggtagaaattaggattgttctttgtgagtttgtttaagttaatttcttgtaa-ccatttgtatccctttgtaagaa 31183066  T
Q  210 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31183067 ctcattgatactggattggagagatctatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaaca 31183138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8566192 - 8565946
Alignment:
Q  38 tctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga- 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||      
T  8566192 tctttgattagagttctcttgggttcggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatggg 8566093  T
Q  136 tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatc 235  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8566092 tagaacttaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctctgtaagaactcattgatagtggattggagagatc 8565993  T
Q  236 aatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  8565992 aatctctcacccagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaa 8565946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 60 - 283
Target Start/End: Original strand, 28278260 - 28278484
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  28278260 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggttgttcttt 28278358  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28278359 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaaaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 28278458  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  28278459 caag-ttggaccgaactgggtgaacaa 28278484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 60 - 282
Target Start/End: Original strand, 40147205 - 40147428
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  40147205 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtggaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttc 40147303  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40147304 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 40147403  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  40147404 caag-ttggaccgaactgggtgaaca 40147428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3075931 - 3075659
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  3075931 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattaaagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctttgatgagtgaaaatcattgagtgtctc 3075832  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||   || ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  3075831 gttcatttgtgagattgagaaaataggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgctgaatctaatttcttgtaacccatttgtatctttttgtaaga 3075732  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    | || ||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  3075731 attcgttgatagtgaattggagagatcaatctctccctcatagtaggtcaag-ttggaccaaattgggtgaaca 3075659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Original strand, 26170686 - 26170931
Alignment:
Q  21 aactttaggatttaggatctttgattagag-ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt 119  Q
    |||| |||| |||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  26170686 aactctagggtttagagtctttgattacagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg-------gt 26170778  T
Q  120 gagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgata 219  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||          ||||||||||||||||    
T  26170779 gagattgg-aaaagggtagaaattaggattgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttg----------taagaactcattgata 26170867  T
Q  220 gtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26170868 gtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 26170931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 5058002 - 5058212
Alignment:
Q  70 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc 167  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||     
T  5058002 attgtaaacaccttggaagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttct--gtgagcttgtt 5058098  T
Q  168 aaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 267  Q
     |||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5058099 gaagctattttcttgtatcccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaag-ttggac 5058197  T
Q  268 cgaactgggtgaaca 282  Q
    |||||||||||||||    
T  5058198 cgaactgggtgaaca 5058212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 29751398 - 29751159
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| | |    
T  29751398 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggt 29751307  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagat 234  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||      
T  29751306 agaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagta 29751208  T
Q  235 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751207 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 29751159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 42310208 - 42309953
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  42310208 caaaggaggtaactttagggtttatggtctttgattagggttctctttggttggaaaacattgtaaacattttgggtaagtgaaaatcattgagtgtctt 42310109  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    | ||||||||||||||| |||| ||  ||||||| | | ||| ||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42310108 gctcattggtgagattgagaaattgggtagaaatcaagtttgatctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaga 42310009  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttg 264  Q
    ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||    
T  42310008 acttattgatagtggattagcgagatcaatctctcccccatagtagattaagtttg 42309953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 5887689 - 5887487
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  5887689 caaaggaggtaactttagggttgagggtatttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtctt 5887590  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  5887589 gttcatttgtgagattgagaaaatggatagaaattagatttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgcaacccatttgtatcactttgtaaga 5887490  T
Q  209 act 211  Q
    |||    
T  5887489 act 5887487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 60 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 27637838 - 27637615
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27637838 gttgggaaacaattgtgaacaccttggaagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 27637739  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaaccc-ttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 255  Q
     ||| |||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27637738 atgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctcctgcagagtagg 27637640  T
Q  256 tcaagtttggaccgaactgggtgaa 280  Q
    |||   |||||||||||||||||||    
T  27637639 tcattgttggaccgaactgggtgaa 27637615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Original strand, 29720294 - 29720533
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| | |    
T  29720294 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggt 29720385  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagat 234  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||      
T  29720386 agaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagta 29720484  T
Q  235 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29720485 caatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 29720533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Original strand, 29722454 - 29722693
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| | |    
T  29722454 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggt 29722545  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagat 234  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||      
T  29722546 agaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagta 29722644  T
Q  235 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29722645 caatctctcctccagagtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaacaa 29722693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 9049576 - 9049354
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattaggg 147  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  9049576 gttctcttgatttgggaaacatttgtaaacactttgggtgagtaaaaatcactgagtgtcttgttgattagtgagtttgggaaaatgatagaaattagtg 9049477  T
Q  148 ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcc 247  Q
    ||  | ||||||| |||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  9049476 tttgtttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattttgtatctctttgtaagaactcattgacagtggattggagagatcaatatctccccc 9049377  T
Q  248 agagtaggtcaagtttggaccgaa 271  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||    
T  9049376 aaagtaggtgaag-ttggaccgaa 9049354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 60 - 277
Target Start/End: Original strand, 38746949 - 38747167
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  38746949 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtatcttgttcattaatgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 38747047  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  ||||    
T  38747048 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttggaaaaactcattgatagaggattggagagatcaatctctccctcagatcaggt 38747147  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggt 277  Q
    |||| ||||||| ||||||||    
T  38747148 caag-ttggaccaaactgggt 38747167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 71 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13695904 - 13695713
Alignment:
Q  71 ttgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtca 168  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  13695904 ttgtaaacaccttgtgtgagtgaaaatcattgagtatctttttctttggagagattgggaaaagggtacaaattagggtttgttctttgtgagcttgtta 13695805  T
Q  169 aagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaa 259  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  13695804 aagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactcattaatagtggattagagagattattctctcctccatagtaggtcaa 13695713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 60 - 282
Target Start/End: Original strand, 27015476 - 27015690
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  27015476 gttgggaaacaattgtaaacatcttgggagagtgaaaatcat-gagtgt-ttggtcattggtgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttcttt 27015573  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    ||||||||||  |||||||||        ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||    
T  27015574 gtgaacttgttgaagctaata--------cccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgtacagatcaatctctcctccaaaataggt 27015665  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  27015666 caag-ttggaccgaactgggtgaaca 27015690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 115 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22536457 - 22536289
Alignment:
Q  115 ttggtgagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactc 212  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  22536457 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactc 22536360  T
Q  213 attgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
     ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536359 tttgatagtggattggggagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 22536289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Original strand, 19806289 - 19806531
Alignment:
Q  21 aactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt 119  Q
    ||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19806289 aacttgagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtg-aaatcattgagtgtcttgttcattggt 19806387  T
Q  120 gagattgggaaaat-gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgat 218  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||  |||||||| |||| |||                   |||||||| |||||    
T  19806388 gagattggaaaaatgggtagaaatta-ggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttctaa-------------------aagaactccttgat 19806467  T
Q  219 agtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  19806468 agtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 19806531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 71 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16641153 - 16640941
Alignment:
Q  71 ttgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa---tgatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttg 165  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||   || |||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  16641153 ttgtaaacaccttgagtgagtgaaattcattaagtgtcttgttcattggcgagattgagaaaaaaatggtagaaattagtgtttgttctttgtgagcttg 16641054  T
Q  166 tcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgg 265  Q
    |  ||||| || |||  |||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  16641053 ttgaagctgatttctgataactcttttgtatctctttgtaagaact---tgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-tagg 16640958  T
Q  266 accgaactgggtgaaca 282  Q
     ||||||||||| ||||    
T  16640957 gccgaactgggtaaaca 16640941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 115 - 283
Target Start/End: Original strand, 10593258 - 10593427
Alignment:
Q  115 ttggtgagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactc 212  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  10593258 ttggtgagattgggagaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactc 10593355  T
Q  213 att-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593356 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 10593427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Original strand, 25078050 - 25078290
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||  | |    
T  25078050 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggt 25078141  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagag 232  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  25078142 agaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagag 25078239  T
Q  233 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078240 tacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 25078290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Original strand, 25136019 - 25136259
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||  | |    
T  25136019 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggt 25136110  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagag 232  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  25136111 agaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagag 25136208  T
Q  233 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136209 tacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 25136259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 135
Target Start/End: Original strand, 42926788 - 42926913
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    |||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42926788 caaatgaggtaactttaggattgatggtctttgattagagttctcttggattgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 42926887  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga 135  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||    
T  42926888 gttctttggtgagattgggaatatga 42926913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 115 - 283
Target Start/End: Original strand, 40380090 - 40380260
Alignment:
Q  115 ttggtgagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaact 211  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| |||| |||| |||||    
T  40380090 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaa-ctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaact 40380187  T
Q  212 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40380188 catttgatagtggattggagagttcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 40380260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 115 - 283
Target Start/End: Original strand, 40382301 - 40382471
Alignment:
Q  115 ttggtgagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaact 211  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| |||| |||| |||||    
T  40382301 ttggtgagattgggaaaggggtagaagttagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaact 40382398  T
Q  212 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40382399 catttgatagtggattggagagttcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 40382471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 121 - 283
Target Start/End: Original strand, 316769 - 316932
Alignment:
Q  121 agattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgata 219  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| |||||||| | || |||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  316769 agattgagaaaaaggtagaaattaggtttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaagaactcattgata 316868  T
Q  220 gtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
     ||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||   |||||||||||| ||| |||||    
T  316869 atggatcggagggatcaatctctcccctagagtaggtcattgttggaccgaacttggtaaacaa 316932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 279
Target Start/End: Original strand, 16546561 - 16546796
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       |||||||| |||||  | |    
T  16546561 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattaggaaaggggt 16546650  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggaga 231  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16546651 agaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggaga 16546748  T
Q  232 gatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 279  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16546749 gtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 16546796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 279
Target Start/End: Original strand, 16544339 - 16544574
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||  | |    
T  16544339 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggt 16544428  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggaga 231  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||| ||||||| |||||| |||  ||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16544429 agaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaa-gctaatttctcataacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggaga 16544526  T
Q  232 gatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 279  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544527 gtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 16544574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 162 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 33906151 - 33906029
Alignment:
Q  162 cttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag 260  Q
    |||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||     
T  33906151 cttgtcgaagctaacttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtagattggaaagatcaatctcttccctagagtaggtcaat 33906052  T
Q  261 tttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
     ||||||||| |||||| |||||    
T  33906051 gttggaccgagctgggtaaacaa 33906029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 30682860 - 30682786
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  30682860 cactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttact 30682786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 39468486 - 39468412
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39468486 cactttgatttctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgtttgtgttcactttgatattggttact 39468412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 282
Target Start/End: Original strand, 42926967 - 42927058
Alignment:
Q  190 tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||   || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  42926967 tttgtatctctttgtaagaactcattgacagtggattgaagaaataaatctctctctcatagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 42927058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 243
Target Start/End: Original strand, 3325847 - 3326043
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaatgatagaaattagg 146  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||||| | ||  || ||||  |||| | ||||||||||     
T  3325847 gttctcttgagttgagaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaac-cattgggtatcttgttcttaggaagaaattgaaaaaaaggtagaaattagt 3325945  T
Q  147 gttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 243  Q
     ||||||||   || |||||  |||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  3325946 tttgttcttgaagagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattgtgtatctctttgtaaagaactcaatgatggtggattagagagatcaatatctc 3326043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 277
Target Start/End: Original strand, 4160702 - 4160762
Alignment:
Q  217 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||    
T  4160702 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccaaactgggt 4160762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 347 - 419
Target Start/End: Original strand, 25412993 - 25413065
Alignment:
Q  347 ctttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  25412993 ctttgattcctagattagatataggtgctgttattgttgattattgcttgtgctcacttggatattgattact 25413065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 222
Target Start/End: Original strand, 35616129 - 35616278
Alignment:
Q  75 aaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaag 171  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||  ||  ||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| | || || ||  |||    
T  35616129 aaacaccttgggtgagtgaaa-tcattgagtctcttgttcacgggaagagattgagaaa-tgagtagaaattaggtttgttcttggagagctcgtttaag 35616226  T
Q  172 ctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 222  Q
     |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  35616227 ttaatttcttgtaacccttttgtatttctttgtaaagaactcattgatagtg 35616278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 13343291 - 13343365
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||||||    
T  13343291 cactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttact 13343365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 30182819 - 30182893
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||    
T  30182819 cactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgtttgcattcactttgttattggttact 30182893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10054929 - 10054854
Alignment:
Q  169 aagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 244  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  10054929 aagctaatttcttataacc-ttttgtatctctttgtaatgaactcattgatagtgtattggagatatcaatatctcc 10054854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 36073980 - 36073908
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggtta 417  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||||    
T  36073980 cactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggtta 36073908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10700809 - 10700674
Alignment:
Q  121 agattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaa-gaactcattgata 219  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||| |||||||| | || |||||  |||||||| |||| ||||  ||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  10700809 agattggaaaaaaggtagaaattaggtttgttcttagagagcttgttgaagctaat-tcttataacatttttgtatctctttaaaaagaactcattgata 10700711  T
Q  220 gtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 258  Q
    ||| | ||||||||||  ||||||| ||| |||||||||    
T  10700710 gtgaagtggagagatc--tctctcccccatagtaggtca 10700674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 244
Target Start/End: Original strand, 8445770 - 8445846
Alignment:
Q  169 aagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 244  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||| |||| || |||| |||||||||    
T  8445770 aagctaatttcttgtaacccttttgtatttctttataaagaactaattgatagtagattagaaagatgaatctctcc 8445846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 94
Target Start/End: Original strand, 11181663 - 11181707
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaa 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11181663 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgaaa 11181707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 85
Target Start/End: Original strand, 24553358 - 24553393
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24553358 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 24553393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 28832523 - 28832488
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28832523 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 28832488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 16409710 - 16409784
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||  | ||||||| || ||||||||    
T  16409710 cactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcacccactttgttagtggttact 16409784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 232
Target Start/End: Original strand, 22097886 - 22097981
Alignment:
Q  136 tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagag 232  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| |||| ||||||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  22097886 tagaaattagggttgttcttggagaatttgttgaagttaatttcttataaccc--ttgtatctatttgtaaaaaactcattgatagtggattagagag 22097981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 272
Target Start/End: Original strand, 30793202 - 30793293
Alignment:
Q  180 ttgtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaac 272  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||  ||||||| | |||||| ||||   |||||||||||    
T  30793202 ttgtaaccattttgtatctctttgtaaagaactaattgatagtgaagtggagagatc--tctctcccctagagtaagtcattgttggaccgaac 30793293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 33831910 - 33831983
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||| || |||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  33831910 cactttgattcctagattagatttaggtgctgctattgttg-ttattgcttgtgttcactttgattttggttact 33831983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 42426172 - 42426099
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  42426172 cactttgattactagattagatctaggtgttgttattattga-tgttgcttgtgttcactttgatattggttact 42426099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 42428367 - 42428294
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| || ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  42428367 cactttgattactagattagatctaggtgttgttattatt-attgttgcttgtgttcactttgatattggttact 42428294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 215
Target Start/End: Original strand, 42926922 - 42926968
Alignment:
Q  169 aagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcatt 215  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  42926922 aagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcatt 42926968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 221
Target Start/End: Original strand, 6016968 - 6017115
Alignment:
Q  75 aaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatt-ggtgagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaag-c 172  Q
    ||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||||||||| | ||| ||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||| |||| |||  ||| |    
T  6016968 aaacaccttgaagagtgaaaattcttgagtctcttgttcattagatgaaatt-ggaaattggtagaaatta-ggttcttctttgagaacctgttgaagac 6017065  T
Q  173 taatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaag-aactcattgatagt 221  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  6017066 taatttcttgtaacctttttttatttcttcgtaagaaactcattgatagt 6017115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 9353165 - 9353198
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9353165 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 9353198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 11916805 - 11916838
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11916805 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 11916838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 14520494 - 14520461
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14520494 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 14520461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 36932181 - 36932214
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36932181 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 36932214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 219
Target Start/End: Original strand, 30802854 - 30802934
Alignment:
Q  140 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgata 219  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||  || ||||| | |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  30802854 aattaggtttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttattgtaatccttttgtatctatttgtaaagaactcgttgata 30802934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 85
Target Start/End: Original strand, 17003790 - 17003825
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17003790 gttctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttgg 17003825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 85
Target Start/End: Original strand, 31300426 - 31300461
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31300426 gttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgg 31300461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 412
Target Start/End: Original strand, 42927124 - 42927190
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatatt 412  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||    
T  42927124 cactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttg-ttgttgcttgtgtttactttgatatt 42927190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 26178117 - 26178191
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||| |||  | ||||||| || ||||||||    
T  26178117 cactttgattcctagattagatctaggtgttgttatcattgattattgcttgcacacactttgttagtggttact 26178191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 15464798 - 15464765
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15464798 tctcttgggttgggaaacatcgtaaacaccttgg 15464765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 19589009 - 19588976
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19589009 tctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 19588976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 283
Target Start/End: Original strand, 38882340 - 38882384
Alignment:
Q  238 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  38882340 tctctcctccagactaggtcaa-tttggaccgaactgggtcaacaa 38882384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 417
Target Start/End: Original strand, 13488432 - 13488503
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggtta 417  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  13488432 cactttgattactagattagatctaggtgttgttattattg-ctattgattgtgttcactttgaaattggtta 13488503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 238 - 282
Target Start/End: Original strand, 18596881 - 18596924
Alignment:
Q  238 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18596881 tctctcctccagactaggtcaa-tttggaccgaactgggtcaaca 18596924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 113)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 29990950 - 29991222
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29990950 caaaggagacaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 29991049  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaac 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  29991050 ttcattggtgagattgggaaaaggatagaaattagggttgttatttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttctaataac 29991149  T
Q  211 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29991150 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 29991222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 19 - 283
Target Start/End: Original strand, 35853818 - 35854083
Alignment:
Q  19 gcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg 118  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35853818 gcaactttagggtttagggtctttgatttgagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg 35853917  T
Q  119 tgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattga 217  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35853918 tgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattga 35854017  T
Q  218 tagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35854018 tagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 35854083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 23554935 - 23555209
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||||| ||||| ||| || | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23554935 caaaggaggtaacttcagggttgaaggtctttgattagagttctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 23555034  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaa--tgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23555035 ttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtacctctttgtaaga 23555134  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23555135 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 23555209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 4178670 - 4178942
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4178670 caaaggaagcaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 4178769  T
Q  111 ttcattggtgagattggg-aaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa 209  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4178770 ttcattggtgagattgggaaaaaaggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgggaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-aagaa 4178868  T
Q  210 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  4178869 ctcattgatagtggattgaacagttcaatctctcctccagagcaggtcaagtttgaaccaaactaggtgaacaa 4178942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14070106 - 14069833
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| |||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14070106 caaaggaggtaactttagggctgagggtctttgattagagttctcttgggttgggtaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 14070007  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14070006 gttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaga 14069907  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  14069906 actcattgatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 14069833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14380134 - 14379861
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| |||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14380134 caaaggaggtaactttagggctgagggtctttgattagagttctcttgggttgggtaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 14380035  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14380034 gttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaga 14379935  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  14379934 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 14379861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 19502073 - 19502347
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||| |||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19502073 caaatgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgagaatcattgagtgtcttg 19502172  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaat--gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||| ||||||||||| |||||   | ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19502173 ttcagtggtgagattgcgaaaaaaggttagaaattaaggttgttttttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaga 19502272  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  19502273 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaagtcaagtttggaacgaagtgggtgaacaa 19502347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 262
Target Start/End: Original strand, 48491474 - 48491727
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48491474 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacactttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 48491573  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  48491574 gttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgaaaga 48491673  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  48491674 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 48491727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Original strand, 39731281 - 39731538
Alignment:
Q  21 aactttaggatttaggatctttgattagag-ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt 119  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  39731281 aactctagggtttagggtctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg-------gt 39731373  T
Q  120 gagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgat 218  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39731374 gagattggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcagatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgat 39731473  T
Q  219 agtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39731474 agtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 39731538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 283
Target Start/End: Original strand, 48408705 - 48408973
Alignment:
Q  19 gcaactttaggatttaggatctttgattagagtt-ctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 117  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48408705 gcaactctagggtttagggtctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 48408804  T
Q  118 gtgagattggg-aaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaa-cccttttgtatctc-tttgtaagaactcat 214  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||    
T  48408805 gtgagattgggaaaaagggtagaaattaatgttgttctttgtaaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgaaataactcat 48408904  T
Q  215 tgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48408905 tgatagtggattggagagtttaatctctcctccagagtatgtcaagtttagaccgaactgggtgaacaa 48408973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 18126539 - 18126812
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  18126539 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcatgggttgggaaacattgtaaacaacttgggtgagtgaaaatcattgagtgtttt 18126638  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18126639 gttcattggtgagattggaaaaatgtgtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttcaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaga 18126738  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  18126739 actcattgatagtggattggaggaatcaatctctcccccagactaggtcaagttt-gaccgacctgggtcaacaa 18126812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 43864139 - 43864412
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43864139 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattaaagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 43864238  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  43864239 gttcattggtgagattggaaaagtgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaacccatttgtatctctttgtaaaa 43864338  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  43864339 actaattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 43864412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 4586056 - 4586323
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||| | ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  4586056 caaaggatgtaactttagggttgaggctctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgtaaatcattgagtgtctt 4586155  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  4586156 gttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaattttttgtaacccatttttatctctttgtaaga 4586255  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||  ||||||||||||||||    
T  4586256 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattatgtcaa-cttggaccgaactgggt 4586323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 41317668 - 41317434
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattaggg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  41317668 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggatgagtgaaaatcattgagtctcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattaggg 41317569  T
Q  148 ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcc 247  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41317568 ttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaatccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccc 41317469  T
Q  248 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  41317468 agattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 41317434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 31733242 - 31732969
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    |||| |||| ||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31733242 caaaagaggtaactttagagttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 31733143  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31733142 gttcattggtgagactgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttggtgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaga 31733043  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  31733042 actcattgatactggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 31732969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 47676409 - 47676144
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||  ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  47676409 caaaggagataactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcaatgagtgtctt 47676310  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47676309 gttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaga 47676210  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 275  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  47676209 actcaatgatagtggaatggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgg 47676144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 48489326 - 48489599
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  48489326 caaaggaggtaactttagggttgatggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaaatgtctt 48489425  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  48489426 gttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgaaaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgcaata 48489525  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  48489526 actcattcatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaacaa 48489599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 27347745 - 27347985
Alignment:
Q  44 attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaa 141  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  27347745 attagagttctcttaggttgggaaacattgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaa 27347844  T
Q  142 ttagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctc 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27347845 ttaggattgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgcagagatcaatctc 27347944  T
Q  242 tcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27347945 tcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 27347985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25767219 - 25766959
Alignment:
Q  19 gcaactttaggatttaggatctttgattagagtt-ctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 117  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25767219 gcaactctagggtttagggtctttgattagagtttctctt----tgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 25767124  T
Q  118 gtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaaccc-ttttgtatctctttgtaagaactcatt 215  Q
       ||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  25767123 ---agattggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgaagaactcatt 25767027  T
Q  216 gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25767026 gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttagaccgaactgggtgaacaa 25766959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 264
Target Start/End: Original strand, 1113552 - 1113807
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||| | ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1113552 caaaggaagtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaacttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 1113651  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatg-atagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  1113652 gttcatttgtgagattgagaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttataacccatttgtatctctttgtaaga 1113751  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttg 264  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  1113752 actcattgatagtagattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaagtttg 1113807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Original strand, 8153276 - 8153510
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattaggg 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8153276 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgagtagaaattaggg 8153375  T
Q  148 ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcc 247  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8153376 ttgttctttgtgagattgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccc 8153475  T
Q  248 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  8153476 agattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaa 8153510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 30025005 - 30024740
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30025005 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttaggttgaaaaacgttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 30024906  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30024905 gttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaga 30024806  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 275  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30024805 actctttgatagtggattggagagatcaatcactcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgg 30024740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 47674189 - 47673953
Alignment:
Q  38 tctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga- 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  47674189 tctttgattagagttctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatggg 47674090  T
Q  136 tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatc 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47674089 tagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatc 47673990  T
Q  236 aatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 274  Q
    ||||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||    
T  47673989 aatctctcc-ccatattaagtcaag-ttggaccgaactg 47673953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 26417211 - 26417483
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  26417211 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttggattgggaaacattgtaaacaccttgagcgggtgaaaatcattgagtgtctt 26417310  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26417311 gttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagataatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaga 26417410  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||||||| |||||||| |||||    
T  26417411 actcgttgatagtggattggagagatcaatctctcc-ccaggttaggtcaa-attggaccaaactgggtcaacaa 26417483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 38671495 - 38671222
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  38671495 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagcgaaaatcattgagtgtctt 38671396  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| | ||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  38671395 gttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaacacatttgtatcactttgtaaga 38671296  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  38671295 actcattgatagtggattgaagagataaatctatcccccaaaataggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 38671222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 34310929 - 34310715
Alignment:
Q  70 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc 167  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  34310929 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaaattgtt 34310831  T
Q  168 aaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 267  Q
     |||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34310830 gaagctaatttcttgtaacacatttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 34310731  T
Q  268 cgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||    
T  34310730 cgaactgggtgaacaa 34310715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 41649282 - 41649011
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||  ||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  41649282 caaaggagttaactttagggttaagg-tcttttattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtaagtgaaaatcattgagtgtctt 41649184  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||  | |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  41649183 gttcatttgtgagattggaaaaattggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgttta-gctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaaga 41649085  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  41649084 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 41649011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 31105666 - 31105394
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31105666 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattatagttatcttggggtgagaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 31105567  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  || |||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  31105566 gttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagattttttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctttttgtaaga 31105467  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31105466 actcattgatggtggattggagagataaatctctccccaagagtagatcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 31105394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 496256 - 495983
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    |||| |||| ||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  496256 caaatgaggtaactttaaggttgagggtctttgattagagttctcttggattgggaaacattgtaaaaaccttgggtgagtgaaaatcatttagtgtttt 496157  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  496156 gttaatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtagttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctctttataaga 496057  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||| |||| |||| |||||    
T  496056 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcccctatagtaggtcaag-ttggacagaaccgggtcaacaa 495983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 74 - 282
Target Start/End: Original strand, 22269931 - 22270140
Alignment:
Q  74 taaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaag 171  Q
    ||||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  22269931 taaacaccttgggagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaag 22270030  T
Q  172 ctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 271  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22270031 ctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactgattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaa 22270129  T
Q  272 ctgggtgaaca 282  Q
    |||||||||||    
T  22270130 ctgggtgaaca 22270140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 25615758 - 25616022
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||  ||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  25615758 caaaggagttaactttaaggttaagggtctttgattagagttctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagagaaaatcattgagtgtctt 25615857  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |          ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||  |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  25615858 g----------agattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctatgtgcgcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcattttgtaaga 25615947  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25615948 actcattgatagtggattagagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggcgaacaa 25616022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 60 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4508930 - 4508707
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4508930 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttgattggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggttgttcttt 4508832  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||| ||| |  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4508831 gtgagcttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgagagtggattggagagatcaatctcttcttcagagtaggt 4508732  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
     ||| |||||||||||||||||||||    
T  4508731 taag-ttggaccgaactgggtgaaca 4508707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 54 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 8359547 - 8359316
Alignment:
Q  54 tcttgggttgggaaaca-ttgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttg 150  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  8359547 tcttgagttggaaaacaattgtaaacaccttgagagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggggagattgggaaaatgggtagaaattagggttt 8359449  T
Q  151 ttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaaccc-ttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccag 249  Q
    |||||||||| |||||  || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8359448 ttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccag 8359349  T
Q  250 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  8359348 agtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 8359316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 60 - 278
Target Start/End: Original strand, 6431915 - 6432134
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  6431915 gttgggaaacaattgtaaacacattgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggttagattgggaaaatgggtagaaattaggattgttcttt 6432013  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6432014 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctccttcagagtaggt 6432113  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggtg 278  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  6432114 caag-ttggaccgaactgggtg 6432134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 36146643 - 36146408
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||     
T  36146643 gttctcttgggttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaga 36146544  T
Q  147 gtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcct 245  Q
    ||| ||| ||||||| |||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  36146543 gtttgttatttgtgagcttgttgaagctaatttct-gtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatttgagagatcaatctctccc 36146445  T
Q  246 ccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  36146444 ccatattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaa 36146408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4253803 - 4253529
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtct 108  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| | |||| | || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  4253803 caaaggaggtaactttagggttgagggtatttggtgagggttctcttgggttggaaaacatttgtaaacaccttaggtgagtgaaaatcattgagtttct 4253704  T
Q  109 tgttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa 206  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| || |||||||||||| ||||||||| | ||    
T  4253703 tgttcattggtgaaattggtaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcatgtaacccttttatatctctttggaaa 4253604  T
Q  207 gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  4253603 gaactcattgataatggattagagagatcaatctctcccacagagtaggtcaa-tttggaccgaactaggtaaaca 4253529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 43504411 - 43504153
Alignment:
Q  21 aactttaggatttaggatctttgattagag-ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt 119  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||       ||    
T  43504411 aactctagggtttagagtctttgattagagcttctcttggcttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcatcgagtgtcttg-------gt 43504319  T
Q  120 gagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaaccctttt-gtatctcttt-gtaagaactcattga 217  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  43504318 gagattgggaaaagggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattga 43504219  T
Q  218 tagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43504218 tagtgaattggagagttcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaacaa 43504153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 60 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 48599558 - 48599335
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggtg-agtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  48599558 gttgggaaacaattgtaaacaccttggaggagtgaaaatcat-gattgtcttgttcattggtgatattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 48599460  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  48599459 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttggaagagctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagcagat 48599360  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  48599359 caag-ttggaccgaactgggtgaaca 48599335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 60 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 2361196 - 2360978
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2361196 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 2361098  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  2361097 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatttgagatatcaatctctcccccagattaggt 2360998  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggt 277  Q
    |||| ||| ||||||||||||    
T  2360997 caag-ttgaaccgaactgggt 2360978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 60 - 282
Target Start/End: Original strand, 3258938 - 3259162
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggtga-gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  3258938 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggaaagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaactagggttgttcttt 3259037  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||| |||||  |||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3259038 gtgagcttgtttaagctaatttattgtaactcatttgtatctctttgtaaaaacccattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 3259137  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||    
T  3259138 caag-ttgaaccgaactgggtgaaca 3259162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 60 - 280
Target Start/End: Original strand, 29608680 - 29608902
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||| |   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  29608680 gttgggaaacaattgtaaacaccttgagagagcgaaacttcatgagtgtcttgttctttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 29608779  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  29608780 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatcactcctccagagtaggt 29608879  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggtgaa 280  Q
    |||| ||||||||||||| |||||    
T  29608880 caag-ttggaccgaactgagtgaa 29608902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 60 - 280
Target Start/End: Original strand, 2390226 - 2390447
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||| | ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2390226 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagcgaaaatcata-agtgtcttgttcattggtgaaattcgaaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 2390324  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2390325 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaataactcatatatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 2390424  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggtgaa 280  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  2390425 caag-ttggaccgaactaggtgaa 2390447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12098093 - 12097867
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattaggg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  12098093 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggttagattgggaaaatgggtagaaattaggg 12097994  T
Q  148 ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcc 247  Q
    |||||| |||||| |||||  ||| |||| ||||||||||| |||||||||||       ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  12097993 ttgttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacccatttgtatctct-------aactctttg-tagtggattggagagatgaatctctccccc 12097902  T
Q  248 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  12097901 agattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaa 12097867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 224
Target Start/End: Original strand, 31518690 - 31518905
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||  ||||||||| || ||| ||||||||||  ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  31518690 caaaggagataactttagggttaagggtctttgattatggttcttttgggttggaaaacatcgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcatcgagtgtctt 31518789  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  31518790 gttcattggtgagattgggaaaataggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttattgaagctagtttcttgtaactcatttgtatctctttgtaaga 31518889  T
Q  209 actcattgatagtgga 224  Q
    ||||||||| ||||||    
T  31518890 actcattgacagtgga 31518905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4510772 - 4510549
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  4510772 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgccttgttgattggtgagatttggaaaatgggtagaaattaaggttgttcttt 4510674  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    ||||  || |  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||    
T  4510673 gtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttataagaactcattgatagtggattgaagaaatcaatctctcctgtagagtaggt 4510574  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||    
T  4510573 caag-ttggaccgtactgggtgaaca 4510549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4512614 - 4512391
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  4512614 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgccttgttgattggtgagatttggaaaatgggtagaaattaaggttgttcttt 4512516  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    ||||  || |  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||    
T  4512515 gtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttataagaactcattgatagtggattgaagaaatcaatctctcctgtagagtaggt 4512416  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||    
T  4512415 caag-ttggaccgtactgggtgaaca 4512391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24515033 - 24514912
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24515033 caaaggaagcaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 24514934  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaa 132  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24514933 ttcattggtgagattgggaaaa 24514912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 36574789 - 36574517
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtct 108  Q
    ||||||||| ||||||||| || | | |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  36574789 caaaggaggtaactttagggttgacggtctttgatgagggttctcttgggttggaaaacatttgtaaacaccttaggtgagtgaaaattatcgagtgtct 36574690  T
Q  109 tgttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt-aa 206  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||| | ||||||||| | || |||||||||||  ||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  36574689 tgtttattggagagattggggaaagg-tagaaattaagatttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatctctttgtaaa 36574591  T
Q  207 gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  36574590 gaactcattgatagtggtttggagagatcaatccatcc-ctagagtaggtcaa-tttggaccaaactgggtaaaca 36574517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23565333 - 23565069
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtct 108  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||| || | ||||||| ||||||||||||| |||||||| || |   |||||||    
T  23565333 caaaggaggtaactttagg-ttaagggtctttgattag-gttctcttggtttagaaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaacatga---agtgtct 23565239  T
Q  109 tgttcattggtgagattgggaaaat---gatagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt 204  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    | |||||||||||  ||||||||||||| |||||  || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  23565238 tgttcattggtgagattaggaaaaaataggtagaaattaggtcttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaactcttttgtatctctttgt 23565139  T
Q  205 aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23565138 aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcctagagtaggtcaag-ttggactgaactgg 23565069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Original strand, 24789771 - 24790010
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       || |||||||||||| | |    
T  24789771 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtaagattgggaaaagggt 24789862  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagat 234  Q
    | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||      
T  24789863 aaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaca-ttttgtatcccttttgtaaaaactctttgatagtggattggagagta 24789961  T
Q  235 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24789962 ctatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 24790010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 146 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 32358190 - 32358055
Alignment:
Q  146 ggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcct 245  Q
    |||||| |||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32358190 ggttgtgctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcct 32358091  T
Q  246 ccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32358090 ccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 32358055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 272
Target Start/End: Original strand, 23343896 - 23344130
Alignment:
Q  38 tctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaa-caccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga 135  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |     
T  23343896 tctttgattagggttctcttaggtttggaaacatttcaaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtctagttcattggtgagatttggaaaaggg 23343995  T
Q  136 tagaaattagggttg-ttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 234  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  23343996 tagaaattaaggtttattctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccctttagtatatctttgtgagaactcattgataatagattggagaaat 23344095  T
Q  235 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaac 272  Q
     ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23344096 taatctctc--ccagagtaggtcaag-ttggaccgaac 23344130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 24526170 - 24525992
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||  ||||||||| || ||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24526170 caaaggagataactttagggttgagggtctttgattatggttctcttaggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 24526071  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattagg-gttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaac 186  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  24526070 gttcattggtgaaattgggaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaac 24525992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 4538786 - 4538627
Alignment:
Q  38 tctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-ga 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  4538786 tctttgattagaattctcttgggttgggaaaaattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatggg 4538687  T
Q  136 tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgta 195  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |  |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4538686 tagaaattagggttgttctttatgaaattttttaagctaatttcttgtaacccatttgta 4538627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Original strand, 20343827 - 20344065
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| | |    
T  20343827 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggt 20343918  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagaga 233  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  20343919 agaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagt 20344016  T
Q  234 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20344017 acaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaa 20344065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 2761575 - 2761439
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  2761575 caaaggaggtaactttagggttgatgatatttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacattgggtgagtgaaaatcatcgagtgtctt 2761476  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaa-tgatagaaattag 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  2761475 gttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattag 2761439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 140 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2759339 - 2759197
Alignment:
Q  140 aattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2759339 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttatatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatc 2759240  T
Q  240 tctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  2759239 tcttccccagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaa 2759197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18388997 - 18388759
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||  | |    
T  18388997 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggt 18388908  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagag 232  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18388907 agaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagag 18388810  T
Q  233 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388809 tacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 18388759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18392433 - 18392195
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||  | |    
T  18392433 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggt 18392344  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagag 232  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18392343 agaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagag 18392246  T
Q  233 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392245 tacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 18392195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22328622 - 22328395
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgtt----cattggtgagattgggaa--aatgatagaaattagggtt-g 150  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    |||| | |||||||||||  || | |||||||||| ||| |    
T  22328622 gttgggaaacaattgtaaacaccttgagggaatgaaaatcattgagtgtcttgtttgttcattagagagattgggaagaaaggttagaaattagagtttg 22328523  T
Q  151 ttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaag-aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccag 249  Q
    |||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  22328522 ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgcaaggaagtcattaatagtggatttgagagatcaatctctcccctag 22328423  T
Q  250 agtaggtcaagtttggaccgaactgggt 277  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||    
T  22328422 agtaggtcattgttggaccgaactgggt 22328395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 6592577 - 6592339
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||  | |    
T  6592577 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaatgggt 6592488  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagag 232  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6592487 agaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagag 6592390  T
Q  233 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592389 tacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 6592339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 6594795 - 6594557
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||  | |    
T  6594795 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggt 6594706  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagag 232  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6594705 agaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagag 6594608  T
Q  233 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594607 tacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 6594557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 32060563 - 32060321
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||  | |    
T  32060563 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggt 32060472  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctc---tttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggag 230  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| |   ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  32060471 agaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccctttttgtaaagaactcatttgatagtggattggag 32060374  T
Q  231 agatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32060373 agtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaa 32060321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 123 - 275
Target Start/End: Original strand, 31518911 - 31519063
Alignment:
Q  123 attgggaaaat-gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagt 221  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||| ||| |  |||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31518911 attgggaaaataggtagaaattaggtttgttctctgtgagcttattgaagctagt-tcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgacagt 31519009  T
Q  222 ggattggagagatcaatctctc-ctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 275  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31519010 ggattggagagatcaatctctctccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgg 31519063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 169 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 6360065 - 6359952
Alignment:
Q  169 aagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggacc 268  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||| ||||| |    
T  6360065 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagttgattggagagatcaatctcttccccatattaggtcaag-ttggatc 6359967  T
Q  269 gaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||| |||||    
T  6359966 gaactgggtcaacaa 6359952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 190 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24525594 - 24525508
Alignment:
Q  190 tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  24525594 tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaag-ttggacggaactgggt 24525508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 200 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 1560749 - 1560671
Alignment:
Q  200 tttgtaagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 277  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1560749 tttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 1560671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 51 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 3904851 - 3904624
Alignment:
Q  51 ttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaatgatagaaattaggg 147  Q
    |||||||| |||  |||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||| | ||  ||||||||||||||| |||||||||||     
T  3904851 ttctcttgagttaagaaacatttgtaaacaccttgggcgagtgaaa-tcattgagtctcttgttcttaggaagagattgggaaaatggtagaaattaggt 3904753  T
Q  148 tt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcct 245  Q
    || |||||||| || | | |  ||  |||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||     
T  3904752 tttgttctttgagagcctattgaatgtaatttcttgtaacacttttgcatctctttgtaaagaactcattgatagtg-atcagagagatcaatctctccc 3904654  T
Q  246 ccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 275  Q
     ||||||||||||   ||||||||||||||    
T  3904653 tcagagtaggtcattgttggaccgaactgg 3904624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 27348048 - 27348119
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggtt 416  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27348048 cactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgtttgtgttcactttgatattggtt 27348119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 282
Target Start/End: Original strand, 18396392 - 18396486
Alignment:
Q  189 ttttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  18396392 ttttgtatctctttataaagaattcattgatagaggattggagagatcaatctctcctcaagagtaggtcaatggtggaccgaactgggtaaaca 18396486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 25766894 - 25766820
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  25766894 cactttgatacctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcgctcactttgttattggttact 25766820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 35854147 - 35854221
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35854147 cactttgcttcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgtttgtgttcactttgatattggttact 35854221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 346 - 419
Target Start/End: Original strand, 23555273 - 23555346
Alignment:
Q  346 actttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23555273 actttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttact 23555346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 208 - 283
Target Start/End: Original strand, 30814530 - 30814604
Alignment:
Q  208 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  30814530 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 30814604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 25616086 - 25616160
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  25616086 cacttcgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttact 25616160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 48409038 - 48409112
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||    
T  48409038 cactttgatacctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcactcactttgttattggttact 48409112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 244
Target Start/End: Original strand, 5116582 - 5116735
Alignment:
Q  93 aaatcattgagtgtcttgttcattggtg-agattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttt 191  Q
    |||||||||||| ||||||| || || | ||||| ||||||   ||||||||||| |||||||| |  |  ||||  ||| |||| | |||||| |||||    
T  5116582 aaatcattgagtctcttgtttatgggaggagattaggaaaagagtagaaattaggtttgttcttggatagtttgttgaagataatttattgtaaaccttt 5116681  T
Q  192 tgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5116682 tgtatctctttgtaaagaactcattgatagtgaattggagagataaatctctcc 5116735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 178 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 5513771 - 5513668
Alignment:
Q  178 tcttgtaacccttttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggg 276  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  5513771 tcttataacccttttatatctctttgtaaagaactcattgacactgaattggaga-atcaatctcacctccagagtaggtcaa-tttggactgaactggg 5513674  T
Q  277 tgaaca 282  Q
    | ||||    
T  5513673 taaaca 5513668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 345 - 418
Target Start/End: Original strand, 43864475 - 43864548
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttac 418  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  43864475 cactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattgattac 43864548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5514243 - 5514115
Alignment:
Q  51 ttctcttgggttgggaaaca-ttgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgatagaaatta-ggg 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||  ||||   ||||||||| |      
T  5514243 ttctcttgggttgggaaacacttgtaaacaccttcgatgagtgaaaatcattgagtttcttgttcatttgagagattgaaaaaagagtagaaattatgtt 5514144  T
Q  148 ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaat 176  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  5514143 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaat 5514115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 347 - 419
Target Start/End: Original strand, 29991286 - 29991358
Alignment:
Q  347 ctttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  29991286 ctttgattcctatattagatctaggtgttgttattgttgattattacttgtgctcactttgatattggttact 29991358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 495924 - 495851
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  495924 cactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttg-ttattgtttgtgtttactttgatattggttact 495851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 18126877 - 18126951
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  18126877 cactttgattcctagattagatctaggtgttgttattcttgattattgcttgtgttcactttgatattgattact 18126951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 48489662 - 48489736
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||    
T  48489662 cactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgctcatgttcactttgatattggttact 48489736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1360353 - 1360226
Alignment:
Q  82 ttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatct 180  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| | ||||||||||| ||  |||| | ||||||||  |||| ||| |||    
T  1360353 ttggtgagtgaaa-tcattgagtctcttgttcatggaatgagattgggaaaaaggtagaaattaggttttgtcttggagaacttgttgaagcgaatttct 1360255  T
Q  181 tgtaaccc--ttttgtatctctttgtaag 207  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1360254 tgtaacccttttttgtatctctttgtaag 1360226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 30843467 - 30843366
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattaggg 147  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||| | || |||||||||    
T  30843467 gttctcttgggttgagaaacatttgtaaacaccttagatgagttaaaatcattgagtatcttgttcattggagagattgagtaaaaggtataaattaggg 30843368  T
Q  148 tt 149  Q
    ||    
T  30843367 tt 30843366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 83
Target Start/End: Original strand, 6570489 - 6570561
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt 83  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6570489 caaaggaggtaactttaggattgagtgtctttgactagggttctcttggggtgggaaacattgtaaacacctt 6570561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Original strand, 26639254 - 26639486
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaatgatagaaattagg 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||| ||  | ||  ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26639254 gttctcttgcgttgggaaacatttgtaaacactttaggtgagt-aaaatcattgagtctcttctttttgggaagagattgtgaaaatggtagaaattagg 26639352  T
Q  147 gttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctct----ttgtaag-aactcattgatagtggattggagagatcaatctc 241  Q
      ||||||| | ||  ||||  | | |||| ||||||||||||||||||| | |    ||||||  ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  26639353 tatgttcttggagagtttgttgatgttaatttcttgtaacccttttgtatatatatcattgtaaataactctttgataatggattagagagatcaatctc 26639452  T
Q  242 tcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 275  Q
    ||||||| |||| ||||   ||| ||||||||||    
T  26639453 tcctccatagtatgtcattgttgtaccgaactgg 26639486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 348 - 419
Target Start/End: Original strand, 48491810 - 48491881
Alignment:
Q  348 tttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||| |||| |||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  48491810 tttgattcctatattagatctaggcgttgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttact 48491881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 26417547 - 26417621
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  26417547 cactttgattcatagattatatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtggttactttgatattggttact 26417621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 418
Target Start/End: Original strand, 4586392 - 4586465
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttac 418  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  4586392 cactttgattactagattagatctaggtgttgttattgtttattattgcttgtgttcactttgaaattggttac 4586465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 85
Target Start/End: Original strand, 9184964 - 9185040
Alignment:
Q  10 gcaaaggaggcaactttaggatttaggatctttg-attagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    |||||||||| ||||||||| || || ||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9184964 gcaaaggaggtaactttagggttgagtatctttgtagtaaggttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 9185040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 4179004 - 4179078
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    |||||||| |||||||||||    
T  4179004 cactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttacattcactttgttattggttact 4179078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 31732906 - 31732832
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||||||  ||||||||||||||   | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31732906 cactttgattactagattagatctaaaggttgttattgttgattattgcttgtgttcactttgaaattggttact 31732832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 39731602 - 39731676
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||  | ||||||| |||||||||||    
T  39731602 cactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcacccactttgttattggttact 39731676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 41648950 - 41648877
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  41648950 cactttgattcctagattagatctaggtgctgctattgttg-ttattgcttgtgttcactttgatattagttact 41648877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 47673881 - 47673808
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47673881 cactttgattactagattagatctaggtgttgttattattg-ttgttgtttgtgttcactttgatattggttact 47673808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 1562241 - 1562103
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||| | |    
T  1562241 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggt 1562152  T
Q  137 agaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaa 185  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  1562151 agaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa 1562103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 85
Target Start/End: Original strand, 9189838 - 9189873
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9189838 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 9189873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 20284355 - 20284320
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20284355 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 20284320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 85
Target Start/End: Original strand, 23402844 - 23402879
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23402844 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 23402879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 85
Target Start/End: Original strand, 9235414 - 9235448
Alignment:
Q  51 ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9235414 ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 9235448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 41317375 - 41317302
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  41317375 cactttgattactagattagatctaggtgttgttattattg-ttgttgcttgtgttcactttgatattggttact 41317302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 43363629 - 43363507
Alignment:
Q  127 ggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctc--tttgt-aagaactcattgatagtgg 223  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| | || |||||  || ||||| | ||||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||     
T  43363629 ggaaaatggtagaaattaggtttgttcttggagagcttgttgaaactaatttattgtaactcttttgtatctctatttgtaaataactcattgatagtga 43363530  T
Q  224 attggagagatcaatctctcctcca 248  Q
    | |||| |||||  |||||||||||    
T  43363529 agtggatagatc--tctctcctcca 43363507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 47676073 - 47676000
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  47676073 cactttgattactagattagatctaggtgttgttattattg-ttgttgcttgtgttcactttgatattggttact 47676000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 2479600 - 2479567
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2479600 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 2479567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 21989172 - 21989139
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21989172 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 21989139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 44847958 - 44847991
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44847958 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 44847991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 2580656 - 2580621
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2580656 gttctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgg 2580621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 348 - 418
Target Start/End: Original strand, 1113887 - 1113956
Alignment:
Q  348 tttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttac 418  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||| |||||    
T  1113887 tttgattcctagattagatctaggtgttattattgttg-ttattgcttgtgtttactttgatattagttac 1113956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 4796501 - 4796534
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4796501 tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgg 4796534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 46516138 - 46516171
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46516138 tctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttgg 46516171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 35961078 - 35961050
Alignment:
Q  55 cttgggttgggaaacattgtaaacacctt 83  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35961078 cttgggttgggaaacattgtaaacacctt 35961050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 97)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 31218152 - 31218426
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31218152 caaaggaagcaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 31218251  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaa--tgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31218252 ttcattggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaaga 31218351  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31218352 actcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 31218426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 34254601 - 34254330
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34254601 caaaggaggcaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttgg-agacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 34254503  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaac 210  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34254502 ttcattggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaac 34254403  T
Q  211 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34254402 ttattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 34254330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 34256777 - 34256506
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34256777 caaaggaggcaactttagggtttagggtctttgattagagttatcttgggttgg-aaacattgtaaacaccttggtgtgtgaaaatcattgagtgtcttg 34256679  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaac 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34256678 ttcattggtgagattggaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaac 34256579  T
Q  211 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34256578 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 34256506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 17982548 - 17982822
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17982548 caaaggaagcaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 17982647  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaat--gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17982648 ttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaaga 17982747  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17982748 actcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 17982822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 42498089 - 42498363
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42498089 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattaaagttctcttgggttgggaaacgttgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 42498188  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaatga--tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42498189 ttcattggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttctttgtaaga 42498288  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42498289 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 42498363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 44303749 - 44304024
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44303749 caaaggaaacaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 44303848  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaatga---tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaag 207  Q
    ||||||||||||||||||||||  |   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  44303849 ttcattggtgagattgggaaaaaaagggtagaaattaaggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttttaag 44303948  T
Q  208 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  44303949 aactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggatcgaactaggtgaacaa 44304024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1746491 - 1746218
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1746491 caaaggaagcaactttagggtttagggtccttgattagagttctctttggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 1746392  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaatga--tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1746391 ttcattggtgagattgaaaaaaaaaggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-aaga 1746293  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1746292 actcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 1746218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19945633 - 19945358
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19945633 caaaggaagcaactttagggtttagagtctttgattagagttctcttgggtcgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 19945534  T
Q  111 ttcattggtgagattggg--aaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacc-cttttgtatctctttgtaag 207  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  19945533 ttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattatggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccacttttgtatctctttggaag 19945434  T
Q  208 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19945433 aactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctcgagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaa 19945358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 15212681 - 15212954
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    |||| |||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15212681 caaatgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtctt 15212780  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15212781 gttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaga 15212880  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  15212881 actcattgataatggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 15212954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 43036318 - 43036591
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43036318 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 43036417  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  43036418 gttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaaga 43036517  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  43036518 actcattgatagtggatttgagagatcaatctctcctccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 43036591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 33352045 - 33352318
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||| ||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  33352045 caaagaaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgattgaaaatcattgagtgtctt 33352144  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33352145 gttcattggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaga 33352244  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  33352245 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 33352318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12702911 - 12702634
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||||| || |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12702911 caaaggaggtaaatttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattaagtgtcttg 12702812  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaatga------tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||  |      |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  12702811 ttcattggtgagattgggaaaaaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtgtctctttgt 12702712  T
Q  205 aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  12702711 aagaactcattgatattggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 12702634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 4731553 - 4731826
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4731553 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 4731652  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4731653 gttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgctctttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaga 4731752  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  4731753 actcattgatagtggattggagagatcgatctctcccccagattcggtcaag-ttggaccgaattgggtcaacaa 4731826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 27811173 - 27811446
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| || |||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27811173 caaaggaggtaaatttagggttgagggtctttgattagagttctcttaggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 27811272  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27811273 gttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaga 27811372  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27811373 acccattgatagtggattgaagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 27811446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 3303943 - 3303670
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  3303943 caaaggaggtaactttacggttgagggtctttgattagggttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgagtatctt 3303844  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||| |||||  || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3303843 gtttattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaagtttgttctttgtgagcttgtttaacctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaaga 3303744  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  3303743 actcattgatagtggattgaagagatcaatctctcccccacagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaacaa 3303670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 5689166 - 5689439
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||  ||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5689166 caaaggagataactttagggttgagggtctttgattagggttctcttgagtttggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 5689265  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||  ||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5689266 gttcattaatgagattggaaaaatgggtagaaattaaggtggtgctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaga 5689365  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  5689366 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 5689439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 262
Target Start/End: Original strand, 30143237 - 30143488
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  30143237 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattg--tgtctt 30143334  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30143335 gttcattggccagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaga 30143434  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  30143435 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagataaggtcaagtt 30143488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 6598867 - 6599140
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||  ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6598867 caaaggagataactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattaagtgtctt 6598966  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| || |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  6598967 gttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaagtttgttctttgcgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatacttttgtaaga 6599066  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  6599067 actcattgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 6599140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 6674320 - 6674593
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||  ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6674320 caaaggagataactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattaagtgtctt 6674419  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| || |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  6674420 gttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaagtttgttctttgcgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatacttttgtaaga 6674519  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  6674520 actcattgatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 6674593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1345644 - 1345371
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||| | ||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  1345644 caaaggatgtaactttagggttgagggtttttgattagagttctcttgagttgggaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtctt 1345545  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  || |  |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  1345544 gttcatttgtgagattgggaaaatgtgtagaaattagggttgttctttgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatatgtatctctttgaaaga 1345445  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||    
T  1345444 actcattgatagtggattgaagagttcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttagaccgaactaggtcaacaa 1345371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 60 - 282
Target Start/End: Original strand, 4283468 - 4283691
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  4283468 gttgggaaacaattgtaaacaccttaggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgtttttt 4283566  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4283567 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtaggt 4283666  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  4283667 caag-ttggaccgaactgggtgaaca 4283691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 280
Target Start/End: Original strand, 2627647 - 2627902
Alignment:
Q  21 aactttaggatttaggatctttgattagag-ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt 119  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       ||    
T  2627647 aactctagggtttagagtctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gt 2627739  T
Q  120 gagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaaccctttt-gtatctctt-tgtaagaactcattga 217  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2627740 gagattgggaaaagggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaactctttttgtatctcttgtgtaagaactcattga 2627839  T
Q  218 tagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 280  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2627840 tagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 2627902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 1292736 - 1292471
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    |||| |||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  1292736 caaatgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttcttttgggttgggaaacactgtgaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtctt 1292637  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| | ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  1292636 gttctttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaagtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaaga 1292537  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggg 276  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1292536 actcattgatagtggatttgagaaataaatctctcc-ccagagtaggtcaag-ttggaccgaactggg 1292471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Original strand, 40321014 - 40321248
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattaggg 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  40321014 gttctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttgagtgactgaaaatcattgagtgtcttgttcataggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg 40321113  T
Q  148 ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcc 247  Q
    |||||| |||||| |||||  ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40321114 ttgttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacccattagtatctctttgtaaaaactctttgatagtggattggagagatcaatctctccccc 40321213  T
Q  248 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  40321214 agattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 40321248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 276
Target Start/End: Original strand, 18141717 - 18141981
Alignment:
Q  13 aaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||| || |||||| || ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18141717 aaggaggtaattttagggttgagggtctttgattagggttctcttaggttgggaaacatttgtaaacaccttgggcgagtgaaaatcattgagtgtcttg 18141816  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  18141817 ttcattggtgagattgtgaaaatgggtagaaattagg-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcactttgtaagaa 18141915  T
Q  210 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggg 276  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  18141916 ctctttgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccaaactggg 18141981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 42435204 - 42434992
Alignment:
Q  70 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc 167  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  42435204 attgtaaacactttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 42435106  T
Q  168 aaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 267  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42435105 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggac 42435007  T
Q  268 cgaactgggtgaaca 282  Q
    |||||||||||||||    
T  42435006 cgaactgggtgaaca 42434992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 282
Target Start/End: Original strand, 4162400 - 4162663
Alignment:
Q  16 gaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttca 114  Q
    |||| ||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4162400 gaggtaactttagggttgagggtctttgattagggttctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgagcgagtgaaaatcattgagtgtcttgttca 4162499  T
Q  115 ttggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactca 213  Q
    || ||||||   ||||||||  ||||| ||||| |||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  4162500 ttagtgaga---ggaaaatgggtagaagttaggtttgttctttgagaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactca 4162596  T
Q  214 ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  4162597 ttgatag-ggattggagatatcaatctctccccaagagtaggtcaag-ttggaccgaattgggtaaaca 4162663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 18655355 - 18655567
Alignment:
Q  70 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc 167  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  18655355 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgttttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgtt 18655453  T
Q  168 aaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 267  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18655454 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaag-ttggac 18655552  T
Q  268 cgaactgggtgaaca 282  Q
    |||||||||||||||    
T  18655553 cgaactgggtgaaca 18655567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 41366877 - 41366622
Alignment:
Q  21 aactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt 119  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |    
T  41366877 aactttagggttgaggatctttgattagagttctcttagattgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcaagact 41366778  T
Q  120 gagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgat 218  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||| | ||||||||||| | |||||  |||||||| |||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  41366777 gagattgagaaaatgggtagaaattatgtttgttctttgtaagcttgtttaagctaatttcttttaacctatttgtatccctttgtaagaactcatttat 41366678  T
Q  219 agtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggg 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  41366677 agtggattggagagatcaatctctcc-ctagattaggtcaag-ttggaccgaactggg 41366622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18106351 - 18106087
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||  |||||||||||  ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  18106351 caaaggagagaactttaggatagagggtctttaattagatttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaattgttgagtgtctt 18106252  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||| || |||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  18106251 gttcatcggtgagattggaaaaatggatagaaactatagttgttctttgcgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatct-tttgtaaga 18106153  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 277  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18106152 actcattgatagt-gtttggagagatcaatctctcc-ccagaataggtcaag-ttggaccgaactgggt 18106087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 60 - 277
Target Start/End: Original strand, 40221689 - 40221907
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  40221689 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttctttggtgagattggtaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 40221787  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||| |||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  40221788 gtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 40221887  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggt 277  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  40221888 caag-ttggaccgaactgggt 40221907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 283
Target Start/End: Original strand, 9765691 - 9765912
Alignment:
Q  58 gggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9765691 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaa----ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctt 9765786  T
Q  156 tgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 255  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| ||||| ||||    
T  9765787 tgtgagcttggcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagct-gctctctcccccagattagg 9765885  T
Q  256 tcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    || |  |||||||||||||||| |||||    
T  9765886 tc-atattggaccgaactgggtcaacaa 9765912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 60 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10930423 - 10930199
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-atagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  10930423 gttgggaaacaattgtaaacattttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcatcggtgagattgggaaaatggatagaaattagggttgctcttt 10930325  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||| || ||  |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10930324 gtgagctcgttgaagctaatttcttgtaacccatttatatctctttgtaagaacacattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggt 10930225  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||    
T  10930224 caag-ttggaccgaactgggtcaacaa 10930199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 62 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 8965914 - 8965692
Alignment:
Q  62 tgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattaggg-ttgttctttgt 158  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |    
T  8965914 tgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttctttat 8965815  T
Q  159 gaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 258  Q
    ||  ||||  ||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  8965814 gagtttgttgaagttaatttcttataacccttttatatctctttgtaagaactcattgatagtgcatcggagagataaatctctcccccatattaggtca 8965715  T
Q  259 agtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    || |||||||||||||||| ||||    
T  8965714 ag-ttggaccgaactgggtaaaca 8965692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 58 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19491924 - 19491699
Alignment:
Q  58 gggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctt 155  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  19491924 gggttgggaaacatcgtaaacatcttgggtgagtgaaaat-attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctt 19491826  T
Q  156 tgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 255  Q
    ||||| |||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  19491825 tgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattaaagagatcaatatctcccccatagtagg 19491726  T
Q  256 tcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    || |  |||||||||||| ||| |||||    
T  19491725 tc-atattggaccgaactaggtcaacaa 19491699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 60 - 244
Target Start/End: Original strand, 44353736 - 44353923
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  44353736 gttgggaaacaattgtaaacacattgggtgagtaaaaatcattgagtatcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 44353835  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 244  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  44353836 gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgaaaagatcaatctctcc 44353923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 4743462 - 4743214
Alignment:
Q  25 ttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 123  Q
    ||||| || ||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4743462 ttagggttgagggtctttgattaggaatctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagcgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 4743363  T
Q  124 ttgggaaaat-gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtg 222  Q
    |||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||   ||||  ||||||| ||||||||||||           |||||||||||||||||||||||    
T  4743362 ttggaaaaatgggtag-aattaggtttgttctttgtgtgtttgttgaagctaaaatcttgtaaccc----------atttgtaagaactcattgatagtg 4743274  T
Q  223 gattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  4743273 gattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 4743214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 60 - 256
Target Start/End: Original strand, 40328723 - 40328922
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  40328723 gttgggaaacaattgtaaacatcttgggagagtgaaaatcat-gaatgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttcttt 40328821  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaaccc-ttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 255  Q
    |||| |||||  || ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40328822 gtgagcttgtttaaactaatttcttgtaactcattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 40328921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 56 - 274
Target Start/End: Original strand, 30291545 - 30291767
Alignment:
Q  56 ttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggtt-gt 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || ||    
T  30291545 ttgggttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgattgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggttttgt 30291644  T
Q  152 tctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctct-cctccaga 250  Q
    ||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30291645 tctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatcactttgtaagaattctttgatagtggattggagagatcaatctctccctccaga 30291744  T
Q  251 gtaggtcaagtttggaccgaactg 274  Q
     || | |||| |||||||||||||    
T  30291745 ttatgccaag-ttggaccgaactg 30291767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 11383941 - 11384152
Alignment:
Q  70 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc 167  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  11383941 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcatta-tgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtt 11384038  T
Q  168 aaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 267  Q
     |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  11384039 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaacccattgatactggattggagacatcgatctctcctccagagtaggttaag-ttggac 11384137  T
Q  268 cgaactgggtgaaca 282  Q
    |||||||||||||||    
T  11384138 cgaactgggtgaaca 11384152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Original strand, 25689885 - 25690123
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||| | |    
T  25689885 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaaaggt 25689976  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagat 234  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||      
T  25689977 agaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagta 25690074  T
Q  235 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25690075 caaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 25690123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 84 - 275
Target Start/End: Original strand, 3772161 - 3772352
Alignment:
Q  84 ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttg 182  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||    
T  3772161 ggtgagtgaaaatgattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaattgatagaaattaggtttgttctttgtgagcttatttaagctaatttcttg 3772260  T
Q  183 taacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 275  Q
    |||| | ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3772261 taactcatttgtatatctttgtaagaatttattgatagtggattggagagatcaatctatctctcagagtaggtcaag-ttggaccaaactgg 3772352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Original strand, 3439434 - 3439672
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| | |    
T  3439434 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggt 3439525  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagat 234  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||      
T  3439526 agaaattagggtttgttcattatgaacttggcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagta 3439623  T
Q  235 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3439624 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggatgaacaa 3439672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 41365120 - 41364926
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    |||| |||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41365120 caaatgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttcttttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 41365021  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaa-tgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttg 203  Q
    |||||    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||||  |||||||| ||||||||| | |||||||| |||||    
T  41365020 gttcaagactgagattgggaaaattggtagaaattaggtttgttctttgtgagtttgtttaagctaatttcttgtaacacatttgtatccctttg 41364926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 233
Target Start/End: Original strand, 10929696 - 10929907
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  10929696 caaaggaggtaactttagggttgggg-tctttgattagagttctcttgggttgggaa-cattgtaaacaccttggattagtgaaaatcattgagtgtctt 10929793  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||| ||||||||||  ||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||           ||||||||||||    
T  10929794 gttctttggtgagatatggaaaatgggtagaaattatgtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaa-----------ctctttgtaaga 10929882  T
Q  209 actcattgatagtggattggagaga 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  10929883 actcattgatagtggattggagaga 10929907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 271
Target Start/End: Original strand, 8153683 - 8153914
Alignment:
Q  38 tctttgattagagttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtct--tgttcattggtgagattgggaaaat 133  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||    
T  8153683 tctttgattaatgttcttttgggttgggaaacatttgtatacaccttggatgagtgaaaatcattgagtgtgtcatgttcattggtgagattgagaaaat 8153782  T
Q  134 gatagaaattagggttgttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 232  Q
    | ||||||||||||      ||| ||| | ||||  |||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8153783 ggtagaaattaggg------tttctgagctttgttgaagctaaattcgtgtaactcttttgtatatctttgtaagaactcattgatagttgattggagag 8153876  T
Q  233 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 271  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||    
T  8153877 atcaatctcttcctcagagtaggtcaag-ttggaccgaa 8153914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 42575494 - 42575327
Alignment:
Q  115 ttggtgagattgggaaaatgatagaaattaggg-ttgttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaac 210  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||    
T  42575494 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggattgttcatagtgaacattgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaac 42575397  T
Q  211 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42575396 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 42575327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 278
Target Start/End: Original strand, 15290522 - 15290688
Alignment:
Q  115 ttggtgagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaac 210  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||    
T  15290522 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaac 15290619  T
Q  211 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg 278  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15290620 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg 15290688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 278
Target Start/End: Original strand, 15470891 - 15471057
Alignment:
Q  115 ttggtgagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaac 210  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||    
T  15470891 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaac 15470988  T
Q  211 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg 278  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470989 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg 15471057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 11712214 - 11712024
Alignment:
Q  71 ttgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtc 167  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| | |||||| ||||  ||||||| |||||| ||| |||||||| || |||| ||| || |||||     
T  11712214 ttgtaaacatcttggatgagtgaaa-tcattgagtcttttgttctttggaagagattgagaaaataatataaattaggttttgttccttgagagcttgtt 11712116  T
Q  168 aaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaag-aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 258  Q
     |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||    
T  11712115 gaagctaatttcttgaaacccttttatatctctttgtaaataactcattgatagtggattgaagagatcaatctctccctcaaagtaggtca 11712024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 192 - 282
Target Start/End: Original strand, 4733784 - 4733873
Alignment:
Q  192 tgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4733784 tgtatctctttgtaagaattcattgatagtggattggagagatcgatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaaca 4733873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 244
Target Start/End: Original strand, 1822282 - 1822423
Alignment:
Q  105 gtcttgttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttg 203  Q
    |||||||||||| | |||||||  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1822282 gtcttgttcatttgagagattgcaaaaaggatagaaattatggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatctatttg 1822381  T
Q  204 t-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 244  Q
    | || |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1822382 taaataactcactaatagtgaattggagagatcaatctctcc 1822423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 244
Target Start/End: Original strand, 1856727 - 1856868
Alignment:
Q  105 gtcttgttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttg 203  Q
    |||||||||||| | |||||||  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1856727 gtcttgttcatttgagagattgcaaaaaggatagaaattatggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatctatttg 1856826  T
Q  204 t-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 244  Q
    | || |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1856827 taaataactcactaatagtgaattggagagatcaatctctcc 1856868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 152 - 277
Target Start/End: Original strand, 10015119 - 10015241
Alignment:
Q  152 tctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagag 251  Q
    ||||||||  |||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  10015119 tctttgtgtgcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-taggaactcattgatagtggattggagagataaatctct-ctccatag 10015216  T
Q  252 taggtcaagtttggaccgaactgggt 277  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  10015217 taggtcaag-ttggaccgaactgggt 10015241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 178 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3073977 - 3073875
Alignment:
Q  178 tcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 277  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  3073977 tcttgtaacatttttgtatctctttgtaagaactcattgataatggcttggagagatcaatctctcc-ccatagtaggtcaag-ttgggccgaactgggt 3073880  T
Q  278 gaaca 282  Q
     ||||    
T  3073879 aaaca 3073875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 29796596 - 29796320
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtct 108  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||  |||||||  ||||||||| |||    
T  29796596 caaaggaggtaactttagggttgaggatctttggcgagggttctcttgggttgggaaacatttgtaaatatcttgggcgagtgaat-tcattgagtctct 29796498  T
Q  109 tgttcattggt-gagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaa 206  Q
    ||||| |  |  |||||||||||||   ||||||| | |||| |||||| | ||||||||  ||||| || |||||||||  ||||||| || |||||||    
T  29796497 tgttcttgagaagagattgggaaaagagtagaaatcaaggtttgttcttggagaacttgttgaagctgatttcttgtaacatttttgtacctatttgtaa 29796398  T
Q  207 gaa--ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
     ||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||   |||||||||||| ||| ||||    
T  29796397 aaaaactcatttataatggattggagagatcaatctctcccccaatgtaggtcattgttggaccgaacttggtaaaca 29796320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 148 - 275
Target Start/End: Original strand, 7597648 - 7597776
Alignment:
Q  148 ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctc 246  Q
    |||||||| | || |||||  |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7597648 ttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttataatccttttgtatctctttgtaaagaatgcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 7597747  T
Q  247 cagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 275  Q
    || |||||||||   || |||||||||||    
T  7597748 catagtaggtcattgttagaccgaactgg 7597776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 347 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 34254266 - 34254194
Alignment:
Q  347 ctttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34254266 ctttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgctcactttgatattggttact 34254194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 4731889 - 4731963
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  4731889 cactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgtttgtgttcactttgatatcggttact 4731963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 4733704 - 4733778
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    |||| |||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4733704 caaaagaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 4733778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 15213017 - 15213091
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15213017 cactttgattcctagattagatcaaggtgctgttattgttgattattgtttgtgttcactttgatattggttact 15213091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 30143571 - 30143645
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  30143571 cactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttact 30143645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 347 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 34256442 - 34256370
Alignment:
Q  347 ctttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  34256442 ctttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgctcactttaatattggttact 34256370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 17982884 - 17982958
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17982884 cactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttgttattggttact 17982958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 27811509 - 27811583
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27811509 cactttgattcctaaattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttact 27811583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 44304086 - 44304160
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  44304086 cactttgatttctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgtgctcactttaatattggttact 44304160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 346 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 1746155 - 1746082
Alignment:
Q  346 actttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  1746155 actttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttgttattggttact 1746082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 42498426 - 42498497
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggtt 416  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  42498426 cactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttaattattgcttgtgttcactttgatattggtt 42498497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 10015043 - 10015117
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||| | ||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10015043 caaaggacgtaactttatggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacgttgg 10015117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 169 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 32902287 - 32902197
Alignment:
Q  169 aagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 258  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  32902287 aagctaatttcttgtaacttttttgtatctctttctaaagaattcattgatagtgaatttgagagatcaatctctccccctgagtaggtca 32902197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 223
Target Start/End: Original strand, 10240159 - 10240264
Alignment:
Q  120 gagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattga 217  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||  || ||||| |||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  10240159 gagattgggacaaagatagaaatttgggtttgttctttgtgagcttgttgaatctaatttcttgtaaccatgttggatctctttgtaaagaactcattga 10240258  T
Q  218 tagtgg 223  Q
    ||||||    
T  10240259 tagtgg 10240264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 345 - 417
Target Start/End: Original strand, 33352381 - 33352453
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggtta 417  Q
    |||||||||  ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  33352381 cactttgatttctagattagatttaggtgttgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggtta 33352453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 18106012 - 18105939
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||    
T  18106012 cactttgattcctagattagatctaggtgatgttattgttg-ttattgcttgtgtttactttaatattggttact 18105939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3232031 - 3231859
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaatgatagaaattagg 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||  ||||||||| |||||||| | ||  ||||||| |||||   |||||||||||    
T  3232031 gttctcttgagttgggaaacattagtaaacaccttgggtgggtgaat-tcattgagtctcttgttcttaggaagagattgagaaaaatgtagaaattagg 3231933  T
Q  147 gtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgat 218  Q
     || |||||| |||| |||||  |||||||| | || ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3231932 ctttgttcttcgtgagcttgttgaagctaattttttttaaccattttgtatctctttgtaaagaacttattgat 3231859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 19945296 - 19945222
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||||||    
T  19945296 cacttcgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttact 19945222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 48 - 113
Target Start/End: Original strand, 38863803 - 38863868
Alignment:
Q  48 gagttctcttgggttgggaaaca-ttgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttc 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  38863803 gagttctcttgggttgggaaacatttgtaaacatcttggagagt-aaaatcattgagtctcttgttc 38863868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 41366554 - 41366481
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  41366554 cactttgattcctatattagatctaggtgttgttattgttg-ttattgcttgtgtttactttgatattggttact 41366481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 19948594 - 19948533
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacatt 72  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19948594 caaaggaagcaactttagggtttagagtctttgattagagttcttttgagttgggaaacatt 19948533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 222
Target Start/End: Original strand, 41266902 - 41267078
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaaca-ttgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgatagaaattagg 146  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||||||| | ||  ||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  41266902 gttctcttgggttgggagacagttgtaaatactttgggtgagtg-aaatcattgagtctcttgttcttaggaagagtttgagaaaatggtagaaattagg 41267000  T
Q  147 -gttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 222  Q
      |||||||| | ||||||||  |  ||||| ||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  |||||||||    
T  41267001 ttttgttcttagagaacttgttgagactaatttcttgtaactcttttgtatttctttctaaagaacttcttgatagtg 41267078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 419
Target Start/End: Original strand, 4733947 - 4734011
Alignment:
Q  355 cctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4733947 cctacatttgatctaggtgttgttattgttgattattgcttgtgttcattttgatattggttact 4734011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 31218488 - 31218559
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggtt 416  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||    
T  31218488 cactttgtttcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggtt 31218559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 256
Target Start/End: Original strand, 38863949 - 38864000
Alignment:
Q  205 aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  38863949 aagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctcccctgcatagtaggt 38864000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 231
Target Start/End: Original strand, 11137031 - 11137146
Alignment:
Q  120 gagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt----aagaactcatt 215  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |  ||| |||   ||||||||  |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    || ||||||||    
T  11137031 gagattgagaaaatggtagaaattaagtatgtccttgaagaacttgttgaagctaatttcttataaccgttttgtatctctttgtaaaaaaaaactcatt 11137130  T
Q  216 gatagtggattggaga 231  Q
    ||||||| ||||||||    
T  11137131 gatagtgaattggaga 11137146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 4456292 - 4456259
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4456292 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 4456259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 4696441 - 4696474
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4696441 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 4696474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 6599200 - 6599270
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6599200 cactttgattactagattagatctaggtgttgttattattg----ttgtttgtgttcactttgatattggttact 6599270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 6674653 - 6674723
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6674653 cactttgattactagattagatctaggtgttgttattattg----ttgtttgtgttcactttgatattggttact 6674723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 7412604 - 7412571
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7412604 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 7412571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 7445026 - 7444946
Alignment:
Q  75 aaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg-tgagattgggaaaatgatagaaattagggttgttct 154  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||  ||||||| |||| || ||||||||||  |||||||    
T  7445026 aaacacgttggtgagtgaaaatctttgagtctcttgttcatgggaagagattgagaaattggtagaaattagatttgttct 7444946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 85
Target Start/End: Original strand, 7493004 - 7493039
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7493004 gttctcttggattgggaaacattgtaaacaccttgg 7493039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 1292405 - 1292332
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |  ||||| | |||||||||||| |||||    
T  1292405 cactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttg-ttactacttgtgtttactttgatattgtttact 1292332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 1345312 - 1345239
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||| | ||||| ||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1345312 cactttgattactagattagatctaggtgttattattattg-ttgttgtttgtgtttactttgatattggttact 1345239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 234
Target Start/End: Original strand, 30909426 - 30909487
Alignment:
Q  172 ctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 234  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||    
T  30909426 ctaatttcttgtaactcttt-gtatctctttgtaatgactcgttgatagtgaattggagagat 30909487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 5702313 - 5702346
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5702313 tctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttgg 5702346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 19175587 - 19175620
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19175587 tctcttggattgggaaacattgtaaacaccttgg 19175620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 86
Target Start/End: Original strand, 5990392 - 5990428
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggt 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  5990392 gttctcttgggttgggaaacattgtaatcatcttggt 5990428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 84
Target Start/End: Original strand, 23799409 - 23799441
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 84  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23799409 tctcttgggttggggaacattgtaaacaccttg 23799441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 92)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 5723527 - 5723255
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5723527 caaaggaggcaactttagggtttggggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 5723428  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaac 210  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5723427 ttcattggtgagattgagaaaagggtagaaattaggcttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacctttttgtatctctttgtaagaac 5723328  T
Q  211 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5723327 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggttaagtttggaccgaactgggtgaacaa 5723255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 4503405 - 4503132
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4503405 caaaggaagcaactttagggtttaggttctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 4503306  T
Q  111 ttcattggtgagattggg--aaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4503305 ttcattggagagattgggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg-aaga 4503207  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4503206 actcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 4503132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 45099650 - 45099923
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45099650 caaaggaagcaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 45099749  T
Q  111 ttcattggtgagattggg--aaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  45099750 ttcattggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg-aaga 45099848  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45099849 actcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 45099923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2334690 - 2334417
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2334690 caaaggaggtaactttagggttgagggtatttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 2334591  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2334590 ttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaataagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttctagtaactcttttgtatctctttgtaagaa 2334491  T
Q  210 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2334490 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggggaacaa 2334417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 36205936 - 36205664
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36205936 caaaggaagcaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 36205837  T
Q  111 ttcattggtgagattggg-aaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  36205836 ttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg-aagaa 36205738  T
Q  210 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36205737 ctcattgacagcggattggagagttcaatctatcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 36205664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 36988348 - 36988075
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36988348 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacatagtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 36988249  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa 209  Q
    |||||||||| |||||| |||| |  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36988248 ttcattggtgggattggaaaaaagggtagaaattagggttgttctatgtgagcttgtcaaaactaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaa 36988149  T
Q  210 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36988148 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 36988075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 4484594 - 4484329
Alignment:
Q  21 aactttaggatttaggatctttgattagag-ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt 119  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  4484594 aactctagggtttagggtctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttc-ttggt 4484496  T
Q  120 gagattggga--aaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattg 216  Q
    || |||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4484495 gaaattgggagaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcattg 4484396  T
Q  217 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4484395 atagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggacagaactgggtgaacaa 4484329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 38 - 277
Target Start/End: Original strand, 29867791 - 29868031
Alignment:
Q  38 tctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga- 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  29867791 tctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggg 29867890  T
Q  136 tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29867891 tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatc 29867990  T
Q  236 aatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 277  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  29867991 aatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 29868031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 6595279 - 6595005
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||| |||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  6595279 caaatgaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggctgggaaaaattgtaaacactttggagagtgagaatcattgggtgtcttg 6595180  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaa--tgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6595179 ttcattggtgagattaggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgaatctctttgtaaga 6595080  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6595079 actcgttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 6595005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 38312135 - 38312408
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38312135 caaaggaggtaactttagggttgaggttctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtatacaccttgtgtgagtgaaaatcattgagtgtctt 38312234  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38312235 gttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaga 38312334  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  38312335 tctcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 38312408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Original strand, 30833250 - 30833515
Alignment:
Q  21 aactttaggatttaggatctttgattagag-ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt 119  Q
    |||| |||| |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  30833250 aactctagggtttagggtttttgattagagcttatcttgggttgggaaacattgtaaacactttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttc-ttggt 30833348  T
Q  120 gagattggga--aaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattg 216  Q
    ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30833349 gagattgggagaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcattg 30833448  T
Q  217 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30833449 atagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggactgaactgggtgaacaa 30833515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 724017 - 723744
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  724017 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttcttttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 723918  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  723917 gttcatttgtgagattggaaaactgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaaga 723818  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  723817 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 723744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 262
Target Start/End: Original strand, 42362247 - 42362500
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42362247 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 42362346  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  42362347 gttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaaga 42362446  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  42362447 actcattgatagtggattggagagatctatctctcccccagattaggtcaagtt 42362500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 34140044 - 34139770
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34140044 caaaggaggtaactttagggttgaaagtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 34139945  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaag 207  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| | |||||| |||| |||||    
T  34139944 gttcatttgtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatatgtatcccttttgtaag 34139845  T
Q  208 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  34139844 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 34139770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11151864 - 11151591
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  11151864 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtctctt 11151765  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11151764 gttcattggtgaaattgggaaaatgggtagaaattagatttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcactttgtaaga 11151665  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  11151664 actcttagatagtggattggagagatcaacctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 11151591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17057638 - 17057369
Alignment:
Q  15 ggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttc 113  Q
    ||||| ||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17057638 ggaggtaactttagggttgaaggtctttgattagagttctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttc 17057539  T
Q  114 attggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactc 212  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||  | |||||  |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  17057538 attggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgcaagcttgttgaagctaattttttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactc 17057439  T
Q  213 attgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  17057438 attgatagtggattggagagatcaatctctcccccagactaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 17057369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17085621 - 17085352
Alignment:
Q  15 ggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttc 113  Q
    ||||| ||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17085621 ggaggtaactttagggttgaaggtctttgattagagttctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttc 17085522  T
Q  114 attggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactc 212  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||  | |||||  |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  17085521 attggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgcaagcttgttgaagctaattttttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactc 17085422  T
Q  213 attgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  17085421 attgatagtggattggagagatcaatctctcccccagactaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 17085352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 36318282 - 36318009
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || |   ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36318282 caaaggaggtaactttagggttgaatgtctttgattagagttatcttgggttgggaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 36318183  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36318182 gttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaaga 36318083  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  36318082 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcccttagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 36318009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Original strand, 11690396 - 11690661
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11690396 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattatagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 11690495  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11690496 gttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaaga 11690595  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 275  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  11690596 aatcgttgatagtggattggagagatcaacctctcccccatattacgtcaag-ttggaccgaactgg 11690661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Original strand, 32289477 - 32289733
Alignment:
Q  21 aactttaggatttaggatctttgattagag-ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt 119  Q
    |||| |||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  32289477 aactctagggtttagagtctttgattagagcttctcttgggtttggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg-------gt 32289569  T
Q  120 gagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgat 218  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32289570 gagattgg-aaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgat 32289668  T
Q  219 agtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32289669 agtaaattagagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 32289733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14634099 - 14633825
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||  || ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14634099 caaaggaggtaactttagagttgagggtttttgattagagttcttttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 14634000  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaag 207  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  14633999 gttcatttgtgagattggtaaaatgggtagaaattaggattgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttttgtaag 14633900  T
Q  208 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  14633899 aactcatagatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaa 14633825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Original strand, 36773496 - 36773730
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgatag-aaattaggg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||    
T  36773496 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggaataaattaggg 36773595  T
Q  148 ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcc 247  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36773596 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctccccc 36773695  T
Q  248 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  36773696 agattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 36773730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 33162723 - 33162450
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| || |||||| || ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  33162723 caaaggaggtaattttagggttgagggtctttgattagggttctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttgggtgattgaaaatcatcgagtgtctt 33162624  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  33162623 gttcattggtgaaattaggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctctgtaaga 33162524  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  33162523 actcattgatagtggattagagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaa 33162450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 60 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 35447108 - 35446885
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  35447108 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattggtaaaattggtagaaattagggttgttcttt 35447010  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||| |||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35447009 gtgatcttgttgaatctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcactctctcctccagagtaggt 35446910  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  35446909 caag-ttggaccgaactgggtgaaca 35446885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 60 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 1631956 - 1631735
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  1631956 gttgggaaacaattgtaaacaccttgagagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaggattgttcttt 1631858  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1631857 gtgagcttgttgaagctaatatcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggt 1631758  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggtgaa 280  Q
    |||| ||||||||||||| |||||    
T  1631757 caag-ttggaccgaactgagtgaa 1631735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 58 - 282
Target Start/End: Original strand, 45726871 - 45727096
Alignment:
Q  58 gggttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttct 154  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  45726871 gggttaggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttattcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttct 45726969  T
Q  155 ttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 254  Q
    |||||| |||||  |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45726970 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 45727069  T
Q  255 gtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  45727070 gtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 45727096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 59 - 283
Target Start/End: Original strand, 11067248 - 11067473
Alignment:
Q  59 ggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||| ||||| ||||    
T  11067248 ggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgaaattggaaaaatgggtagaaattagtgttgtacttt 11067347  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  11067348 gtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcatttataatggattgaagagatcaatctctcccccagattaggt 11067447  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||    
T  11067448 caag-ttggaccgaactcggtcaacaa 11067473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Original strand, 6266621 - 6266860
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| | |    
T  6266621 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggt 6266712  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagat 234  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||      
T  6266713 agaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagta 6266811  T
Q  235 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6266812 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 6266860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 51 - 248
Target Start/End: Original strand, 13121703 - 13121901
Alignment:
Q  51 ttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattaggg- 147  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  13121703 ttctcttgggttgggaaacatttgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagactgggaaaatggtagaaattagggt 13121802  T
Q  148 ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcc 247  Q
    ||||||||||||| |||||  ||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13121803 ttgttctttgtgagcttgttgaagataatttcttgtaacc--tttgtatctctttgtagaaactcattgatagtggattgaagaaatcaatctctcctcc 13121900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 216
Target Start/End: Original strand, 24885582 - 24885763
Alignment:
Q  37 atctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga 135  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  24885582 atctttgattagagttctcatgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtaaaattgggaaaatga 24885681  T
Q  136 -tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattg 216  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||    
T  24885682 gtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtacccctctgtaagaactcattg 24885763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 17490376 - 17490149
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattagggt 148  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    |    
T  17490376 gttctcttgagttggaaaacattgcaaacacagtgggtgggtgaaaatcattgaatgtcttgttcattgttgagattgg-aaaatggtagaaatt----t 17490282  T
Q  149 tgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcca 248  Q
    | |||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |    
T  17490281 tattctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtaactctttgtaagaactcattgatagtggattgtagagatcaatctctccccta 17490182  T
Q  249 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  17490181 gagtaggtcaa-tttggaccgaactgggtaaaca 17490149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 60 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 42288334 - 42288117
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  42288334 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcac-gagtgtcttgtgcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggttgttcttt 42288236  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||| |||||  |||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  42288235 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatttctttgtaagagctcattgataatggattggagagatcaatctctcc-ccagattaggt 42288137  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggt 277  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  42288136 caag-ttggaccgaactgggt 42288117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 60 - 283
Target Start/End: Original strand, 24397997 - 24398227
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt--gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaa--aatgatagaaattagggtt-gttc 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  || | ||||| ||| |||| ||||    
T  24397997 gttgggaaacaattgtaaacacctttggaagagtgaaaatcaatgagtgtcttgttcattggtgagattgtgaagaaagggtagaagttaaggtttgttc 24398096  T
Q  154 tttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagt 252  Q
    ||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  24398097 tttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactcattgataatggattggagagatcaatctctcccccatagt 24398196  T
Q  253 aggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||   |||||||||||||| |||||||    
T  24398197 aggtcattgttggaccgaactggctgaacaa 24398227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14202680 - 14202450
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattga--gtgtc 107  Q
    |||| |||| ||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||    
T  14202680 caaatgaggtaactttatggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtgtc 14202581  T
Q  108 ttgttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaa 206  Q
    || ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| |      ||| ||||||||    
T  14202580 tttttcatttctgagattgggaaaatgggtagaaattatgtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactc------atc-ctttgtaa 14202488  T
Q  207 gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 244  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14202487 gaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcc 14202450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7815508 - 7815311
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattaggg 147  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||    
T  7815508 gttctattgggttgagaaacatttgtaaacaccttaggtgggtgaaaatcattgcgtgtcttgttcattggtgagattgagaaaaaggttgaaattaggg 7815409  T
Q  148 tt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 244  Q
    || |||||||   | |||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  7815408 tttgttctttagaagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcatttatagtggattggagagattaatctctcc 7815311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 158
Target Start/End: Original strand, 39284780 - 39284929
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  39284780 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtatctt 39284879  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattagggttgttctttgt 158  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  39284880 gttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgctctttgt 39284929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 51 - 282
Target Start/End: Original strand, 11049484 - 11049721
Alignment:
Q  51 ttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattagggt 148  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  11049484 ttctcttgtgttgggaaacatttgtaaacaccttgggtaagtgaaaatcattgagtgtcttgttttttggtgagattaggaaaatggtataaattagggt 11049583  T
Q  149 t-gttct---ttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaaccctttt-gtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 243  Q
    | |||||   |||||| |||||  |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  11049584 ttgttctaatttgtgagcttgttgaagctaatttcttataacccttttagtatctctttgtaagaactcattgatagtagattgaaaagatcaatctctc 11049683  T
Q  244 ctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    || || | ||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  11049684 cttcataataggtcaa-attggactgaactgggtaaaca 11049721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 87 - 282
Target Start/End: Original strand, 33648142 - 33648340
Alignment:
Q  87 gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtg-agattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgta 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||  | | |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||| || ||||    
T  33648142 gagtgaaaataattgagtgtcttgtacatgagaggagattgagaaaatggtaaaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcctgta 33648241  T
Q  185 acccttttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||    
T  33648242 acccttttgtatttctttgtaaagaactcattgatagcggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtaaaca 33648340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 115 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 13656200 - 13656035
Alignment:
Q  115 ttggtgagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactc 212  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||    
T  13656200 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactc 13656103  T
Q  213 att-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 279  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656102 atttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 13656035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Original strand, 26353124 - 26353351
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacac-cttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattagggt 148  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||     || ||||||||||||  ||||   ||||||||| |||    
T  26353124 gttctcttgagttgggaa-cattgtaaacactctcggtgagtgaaaattattgagtgt-----tctttggtgagattgaaaaaagtgtagaaattaaggt 26353217  T
Q  149 t-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcc 247  Q
    | |||||||||||  ||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||       
T  26353218 ttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtatctttttgtaagtactcattgatagtggattggagagatcactctctccctt 26353317  T
Q  248 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  26353318 agagtaggtcaag-ttggaccgaaccgggtaaaca 26353351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12647623 - 12647385
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||  | |    
T  12647623 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggt 12647534  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagag 232  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  12647533 agaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagag 12647436  T
Q  233 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647435 tacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 12647385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 283
Target Start/End: Original strand, 17450550 - 17450745
Alignment:
Q  75 aaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagc 172  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||| ||||||||||||| |||||  ||||    
T  17450550 aaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagatttgaaaaatgggtagagattaggcttgttctttgtgagcttgttgaagc 17450649  T
Q  173 taatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaac 272  Q
    |||| | ||||||||| |||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  17450650 taat-ttttgtaacccatttgt------------gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc-acagagtaggtcaag-ttggaccgaac 17450734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12123831 - 12123644
Alignment:
Q  38 tctttgattagagttctcttgggttgggaaacattg-taaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga 135  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  12123831 tctttggttagagttctcttaggttgggaaacatttataaacaccttggatgagtgaaaatcatcgagtgtcttgttcatttgagagatt-ggaaaatga 12123733  T
Q  136 -tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 222  Q
     || ||||||| |||||||||| |||  ||||  ||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  12123732 gtataaattagagttgttctttatgattttgttgaagcttatttcttgtaactcttttgtatcattttgtaaagaactcaatgatagtg 12123644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 169 - 282
Target Start/End: Original strand, 7451173 - 7451284
Alignment:
Q  169 aagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggacc 268  Q
    |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |    
T  7451173 aagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattgcagagatcaatctctcctctacagtaggtcaag-ttgga-c 7451270  T
Q  269 gaactgggtgaaca 282  Q
    ||||||||||||||    
T  7451271 gaactgggtgaaca 7451284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 348 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 5723190 - 5723119
Alignment:
Q  348 tttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5723190 tttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 5723119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 208 - 283
Target Start/End: Original strand, 39284930 - 39285004
Alignment:
Q  208 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  39284930 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 39285004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 7597211 - 7597036
Alignment:
Q  84 ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatctt 181  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  ||||||| ||||   |||||||||||| || |||| || |||||||||| || ||||| ||||    
T  7597211 ggtgagtgaaaatcactcagtgtcttgttcatgggaagagattgagaaatgaatagaaattaggttttgttccttatgaacttgtcgaaactaatttctt 7597112  T
Q  182 gtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 258  Q
    ||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||  |||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  7597111 gtaagtcttttgtatctttttgtaaagaactcattgattgtagaacggagagatc--tctctccttcagagtaggtca 7597036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 45099985 - 45100059
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  45099985 cactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttact 45100059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 30218241 - 30218068
Alignment:
Q  87 gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtg-agattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaa 185  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  | |||||| ||||  | ||||| ||||| |||||||| | || ||| |  |||||||| ||||||||    
T  30218241 gagtggaaatcattgagtgtcttgttcatggaaggagattgagaaatgggtagaagttaggtttgttcttggagagcttattgaagctaatttcttgtaa 30218142  T
Q  186 cccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 258  Q
    || |||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||| | ||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  30218141 ccattttgtatctctttgtaaataattcattgatagtgggttgaaaagatcaatcactcccccagagtaagtca 30218068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 271
Target Start/End: Original strand, 28671976 - 28672088
Alignment:
Q  160 aacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 258  Q
    ||||||| || | |||| |||||| ||| ||||||||||||||  || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28671976 aacttgttaaggttaatttcttgttaccgttttgtatctctttacaaagaactcactgacagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 28672075  T
Q  259 agtttggaccgaa 271  Q
       ||||||||||    
T  28672076 ttgttggaccgaa 28672088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 17057306 - 17057232
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  17057306 cactttaattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttact 17057232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 17085289 - 17085215
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  17085289 cactttaattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttact 17085215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 36205602 - 36205528
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  36205602 cactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttgttattggttact 36205528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 38312471 - 38312545
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  38312471 cactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattgttgcttgtgttcactttgatattggttact 38312545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 6594941 - 6594867
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6594941 cactttgatttctagattagatctaggtgctgttattgttgattattacttgtgttcactttgatattggttact 6594867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 36988012 - 36987938
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||    
T  36988012 cactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgtgtttactttgaaattggttact 36987938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 5700396 - 5700271
Alignment:
Q  12 aaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctc-ttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtct 108  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||| || || |  |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  5700396 aaaggaggtaactttagggttgaggatcattaatgatggttctcgttgggttgagaaacatttgtaaacactttgggtgaatgaaaaacattgagtgtct 5700297  T
Q  109 tgttcattggtgagattgggaaaatg 134  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||    
T  5700296 tgttcattggagagattgagaaaatg 5700271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 42019986 - 42019896
Alignment:
Q  169 aagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt---aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  42019986 aagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaaaaaaactcattgatagtgaatttgagagatcaatctcttccccatagtaggt 42019896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 42261648 - 42261524
Alignment:
Q  120 gagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaa-gaactcattgat 218  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||| | |||||||| | || |||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  42261648 gagattgagaaaatcgtagaaattaagtttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatatctttgtaaagtactcattgat 42261549  T
Q  219 agtggattggagagatcaatctctc 243  Q
    |||| |  |||||||||| ||||||    
T  42261548 agtgaagcggagagatcattctctc 42261524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 4484265 - 4484191
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||    
T  4484265 cactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcactcactttgttattggttact 4484191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 283
Target Start/End: Original strand, 24197955 - 24198065
Alignment:
Q  171 gctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa-ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccaga-gtaggtcaagtttggacc 268  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||  | ||| ||||||| |||||||| |||||| ||    
T  24197955 gctaatttcttgtaaccctt--gtatctctttgcaagaaactctttgataatggattggagagatc--tatcttctccagacgtaggtcacgtttgggcc 24198050  T
Q  269 gaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||| |||||    
T  24198051 gaactgggtaaacaa 24198065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 4503070 - 4502996
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||||||    
T  4503070 cactttgtttcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattggttact 4502996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 259
Target Start/End: Original strand, 42412117 - 42412162
Alignment:
Q  213 attgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaa 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42412117 attgatagtggattggagagatcaatctctcc-ccagagtaggtcaa 42412162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 723683 - 723610
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  723683 cactttgattactagattagatctaggtgttgttattattg-ttgttgattgtgttcactttgatattggttact 723610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 2838177 - 2838250
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  2838177 cactttgattcctagattatatctaggtgttgttattgttg-ttgttgtttgtgtttactttgatagtggttact 2838250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 234
Target Start/End: Original strand, 3897005 - 3897111
Alignment:
Q  129 aaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattg 227  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||   ||||| ||  |||||||| | ||||||| |||||||||   ||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  3897005 aaaatgatagaaattaagattgttcttgaagaactcgttgaagctaattttttgtaactcttttgtataattttgtaaagaactcattgaaagtggatta 3897104  T
Q  228 gagagat 234  Q
    |||||||    
T  3897105 gagagat 3897111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 11067532 - 11067605
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  11067532 cactttgattactagattagatctaggtgttgttattattg-ttgttgcttgtgttcactttgatattggttact 11067605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 14633764 - 14633691
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14633764 cactttgattactagattagatctaggtgttgttattattg-ttgttgcttgtgttcactttgatattggttact 14633691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 32289799 - 32289873
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||  | ||||||| || ||||||||    
T  32289799 cactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcacccactttgttagtggttact 32289873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 34811375 - 34811281
Alignment:
Q  129 aaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaag-aactcattgatagtg 222  Q
    |||||| ||||||||| | ||| |||| | || |||||  |||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34811375 aaaatggtagaaattaagattgctcttagagagcttgttgaagctaatttattgtaactcttttatatctctttgtaagaaactcattgatagtg 34811281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 17865469 - 17865436
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17865469 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 17865436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 21630209 - 21630176
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21630209 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 21630176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 23078304 - 23078337
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23078304 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 23078337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 34389115 - 34389082
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34389115 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 34389082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 36757595 - 36757628
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36757595 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 36757628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 40739098 - 40739065
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40739098 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 40739065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 247
Target Start/End: Original strand, 41454173 - 41454366
Alignment:
Q  54 tcttgggttgggaaaca-ttgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtga-gattgggaaaatgatagaaattagggttgt 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||| | ||| ||||||||| ||||| |||| |   | |||| | |||||| ||||||||||  ||||    
T  41454173 tcttgggttgggaaacaattgtctacaccttagtgaat-aaattcattgagtatcttgatcatggaaaaagattcgaaaaatggtagaaattagatttgt 41454271  T
Q  152 tctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcc 247  Q
    | |||| || |||||  |||||||| ||| | ||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||  ||||||||||    
T  41454272 tttttgagagcttgttgaagctaatttctagcaactcttttgtatatatttgtaaagaactcattgatagtgaagtggacagatc--tctctcctcc 41454366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 85
Target Start/End: Original strand, 10445298 - 10445333
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10445298 gttctctcgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 10445333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 392
Target Start/End: Original strand, 30833579 - 30833626
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattg 392  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  30833579 cactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattg 30833626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 40015191 - 40015156
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40015191 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacacattgg 40015156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 34139709 - 34139636
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||  ||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  34139709 cactttgattactagattagatctaggtcttgttattattg-ttgttgcttgtgttcactttgatattggttact 34139636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 8389982 - 8390015
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8389982 tctcttgggttaggaaacattgtaaacaccttgg 8390015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 10707085 - 10707118
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10707085 tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgg 10707118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 13569593 - 13569560
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13569593 tctcttgggttgggaaacattataaacaccttgg 13569560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 14698842 - 14698875
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14698842 tctctcgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 14698875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 28259010 - 28259043
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28259010 tctcttgggttgggaaacattgtaaacatcttgg 28259043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 33118399 - 33118366
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33118399 tctcttgggttggggaacattgtaaacaccttgg 33118366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 33528457 - 33528490
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33528457 tctcttgggttgggaaacattgtaaacacattgg 33528490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 39483197 - 39483164
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39483197 tctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttgg 39483164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 283
Target Start/End: Original strand, 42064725 - 42064770
Alignment:
Q  238 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  42064725 tctctcccccagactaggtcaaatttggaccgaactgggtcaacaa 42064770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 206
Target Start/End: Original strand, 43406029 - 43406062
Alignment:
Q  173 taatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaa 206  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43406029 taatatcttgtaacccttgtgtatctctttgtaa 43406062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 3278307 - 3278231
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagag-ttctcttgggttgggaaaca-ttgtaaacaccttgg 85  Q
    |||| |||| ||||||||| || || ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3278307 caaatgaggtaactttagggttgagtatcgttgatgagagattctcttgggttggaaaacatttgtaaacaccttgg 3278231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 120)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 56178909 - 56178636
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||||| ||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56178909 caaaggaggtaactttagggttgaaggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 56178810  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa 209  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56178809 ttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa 56178710  T
Q  210 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56178709 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 56178636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 30000078 - 29999806
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30000078 caaaggagacaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcgttgagtgtcttg 29999979  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatc-tctttgtaagaa 209  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  29999978 ttcattggtgagattgggaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacatgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatcttttttgtaagaa 29999879  T
Q  210 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29999878 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 29999806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 52095635 - 52095362
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52095635 caaaggaggtaactttagggttgagggactttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 52095536  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52095535 gttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaga 52095436  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52095435 aatctttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg-caagtttggaccgaactgggtgaacaa 52095362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 48142937 - 48143212
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48142937 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 48143036  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga--tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaag 207  Q
    |||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  48143037 gttcattggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttcataag 48143136  T
Q  208 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48143137 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaactgggtgaacaa 48143212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12739823 - 12739550
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  12739823 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttaggtgagtggaaatcattgagtgtctt 12739724  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatg-atagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  12739723 gttcattggtgagattgggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctatttgtatga 12739624  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  12739623 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 12739550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 5370359 - 5370082
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5370359 caaaggagacaactttagggtttagggtctttgattatagttctcttgggctgggaaacattgtaaacactttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 5370260  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaatga----tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaa-gctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgta 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5370259 ttcattggtgagattggaaaaaaaagaggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgta 5370160  T
Q  206 agaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5370159 agaactcattgatagtggactagagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaa 5370082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9927730 - 9927458
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  9927730 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattaaagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcactgagtgtctta 9927631  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9927630 ttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaa 9927531  T
Q  210 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  9927530 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaa 9927458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12748029 - 12747794
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  12748029 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttaggtgagtggaaatcattgagtgtctt 12747930  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatg-atagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  12747929 gttcattggtgagattgggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctatttgtatga 12747830  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12747829 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 12747794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 5429574 - 5429847
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||| | ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5429574 caaaggaagtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 5429673  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  5429674 gttcattggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggttattcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctatttgtaaga 5429773  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  5429774 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 5429847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 37740521 - 37740793
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||||| || |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37740521 caaaggaggtaagtttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcactgagtgtcttg 37740620  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa 209  Q
    ||||||||||||||| |||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37740621 ttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaa 37740720  T
Q  210 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  37740721 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcaag-ttggaccgaactgtgtcaacaa 37740793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13992551 - 13992292
Alignment:
Q  19 gcaactttaggatttaggatctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 117  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  13992551 gcaactttagggtttagggtctttgattagagtctctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg------- 13992459  T
Q  118 gtgagattgggaaaat--gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcatt 215  Q
    |||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13992458 gtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctctt-gtaagaactcatt 13992360  T
Q  216 gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13992359 gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaacaa 13992292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 26175909 - 26175636
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||  || ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26175909 caaaggaggtaactttagagttgagggtctttgattaaagttctgttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 26175810  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatgat-agaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26175809 gttcattggtgagattgggaaaatggggagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaga 26175710  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  26175709 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 26175636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 34570687 - 34570414
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| | ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34570687 caaaggaggtagctttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgaaaacatcttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 34570588  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  34570587 gttcattggtgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccaattgtatctctttgtaaga 34570488  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||| |||||    
T  34570487 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggttaag-ttggatcgaactgggtcaacaa 34570414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 54200179 - 54199907
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54200179 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 54200080  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54200079 gttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaga 54199980  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  54199979 actcattgatagtgaattagagagatcattctctcccccagattaggtcaag-ttgga-cgaactgggtcaacaa 54199907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 52082930 - 52082663
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  52082930 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgactgtctt 52082831  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52082830 gttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaactagggttgttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaga 52082731  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    | || |||||||||       ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  52082730 aatctttgatagtg-------gagatcattctctcctccagagtaggtcaagtttagaccgatttgggtgaacaa 52082663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 47038682 - 47038411
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||  ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47038682 caaaggagttaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattataaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 47038583  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa 209  Q
    |||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||| |    
T  47038582 gttcattggtgagattggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaa-tcatttgtatctgtttgtaagga 47038484  T
Q  210 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  47038483 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 47038411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12745708 - 12745476
Alignment:
Q  12 aaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| ||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12745708 aaaggaggtaactttagagttgagggtctttgattagagttctcttggtttgggaaacaatgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 12745609  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa 209  Q
    |||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12745608 ttcattggcgagattaggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaa 12745509  T
Q  210 ctcattgatagtggattggagagatcaatctct 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12745508 ctcattgatagtggattggagagatcaatctct 12745476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 5871715 - 5871988
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5871715 caaaggaggtaactttagggttatgggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 5871814  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  5871815 gttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagcaaatttcttgtaacccatttttatcactttgcaaga 5871914  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  5871915 actctttgatagtggattagagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gaccgaactgggtcaacaa 5871988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 36994420 - 36994692
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| |||||| || || ||| |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36994420 caaaggaggtaacttttgg-ttgagggtctttgattagagttctcttgatttggcaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 36994518  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  36994519 gttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaaga 36994618  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  36994619 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattagatcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 36994692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 36463623 - 36463389
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-atagaaattaggg 147  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36463623 gttctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaattcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggatagaaattaggg 36463524  T
Q  148 ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcc 247  Q
     ||||| |||||| |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36463523 ctgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgacagtggattggagagatcaatctctccccc 36463424  T
Q  248 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  36463423 agattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 36463389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 52467628 - 52467354
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtct 108  Q
    ||||||||| || |||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  52467628 caaaggaggtaattttagggttgagggtctttgattagggttctcttgggttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtct 52467529  T
Q  109 tgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaag 207  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  52467528 tgttcatttgtgaggttgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatatcttgtaacccatttgtatcactttgtaat 52467429  T
Q  208 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  52467428 aactttttgatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 52467354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 31495556 - 31495315
Alignment:
Q  38 tctttgattagag-ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| | |    
T  31495556 tctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggt 31495464  T
Q  137 agaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaaccctttt-gtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagat 234  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  31495463 agaaattaggattgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagttgattggagagtt 31495364  T
Q  235 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31495363 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 31495315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 60 - 282
Target Start/End: Original strand, 46703443 - 46703669
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46703443 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggttgttcttt 46703542  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaaccc-ttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 255  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46703543 gtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 46703642  T
Q  256 tcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||   |||||||||| ||||||||||    
T  46703643 tcattgttggaccgaattgggtgaaca 46703669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6542415 - 6542180
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa--tgatagaaattagg 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||    
T  6542415 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggggagattgggaaaaaatggtagaaattagg 6542316  T
Q  147 gtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcct 245  Q
     || ||||||||||| |||||  || ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6542315 atttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgttagccttttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctccc 6542216  T
Q  246 ccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6542215 ccagggtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 6542180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Original strand, 2209668 - 2209883
Alignment:
Q  70 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc 167  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  2209668 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgttgagattgggaaaatgggtagaaattagggtttttctttgtgagcttgtt 2209766  T
Q  168 aaagctaatatcttgtaaccc-ttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 266  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  2209767 gaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagattaatctctcctccagagtaggtcatggttgga 2209866  T
Q  267 ccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||    
T  2209867 ccgaactgggtgaacaa 2209883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 29254389 - 29254662
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||  ||||||||| || | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  29254389 caaaggagataactttagggttgaaggtctttgagtagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacattgggtgaatgaaaatcattgagtgtctt 29254488  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| ||| ||| |||||  ||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  29254489 gttcattggtgagattgggaaattgggtagaaattagagttgttttttatgagcttgttgaagttaatttcttgcaacccatttgtgtctctttgtaaga 29254588  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  29254589 actcgttgatagtggattggagagatcaatctctctcccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 29254662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 58 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 48893868 - 48893638
Alignment:
Q  58 gggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttc-- 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||      
T  48893868 gggtttggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttcat 48893769  T
Q  154 --tttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagag 251  Q
      ||||||| |||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  48893768 tgtttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagat 48893669  T
Q  252 taggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  48893668 taggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 48893638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 60 - 283
Target Start/End: Original strand, 54882964 - 54883188
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  54882964 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgtttttt 54883062  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  54883063 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagggatcaatctctcctccagattaagt 54883162  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||    
T  54883163 caag-ttggaccgaactgggtcaacaa 54883188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 37229957 - 37229722
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattaggg 147  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37229957 gttctcttgggttggaaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcaatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatggtagaaattaggg 37229858  T
Q  148 t-tgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaaccc-ttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcct 245  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  37229857 tgtgttctttgtgagcttgttaaagcaaatttgttgtaaccctttttatatctctttgtaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctctccc 37229758  T
Q  246 ccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
     || ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  37229757 tcatagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtaaaca 37229722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 60 - 262
Target Start/End: Original strand, 8665351 - 8665556
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8665351 gttgggaaacaattgtaaacaccttggaagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 8665450  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    | || |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8665451 gagagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 8665550  T
Q  257 caagtt 262  Q
    ||||||    
T  8665551 caagtt 8665556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 60 - 282
Target Start/End: Original strand, 41639370 - 41639593
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41639370 gttgggaaacaattgtaaacaccttaggagagtgaaaatcac-gagtgtcttgtttattggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 41639468  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41639469 gtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctatttgtaagaactcatcgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 41639568  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||    
T  41639569 caag-ttggaccgaactgagtgaaca 41639593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 282
Target Start/End: Original strand, 31474059 - 31474318
Alignment:
Q  25 ttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 123  Q
    ||||| || ||| ||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31474059 ttagggttgagggtctttgattaaggttctcttggagtgggaaacattgtaaacactttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 31474158  T
Q  124 ttgggaaaatga-tagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagt 221  Q
    ||| |||||||  |||||||||||  ||||||||| |||  ||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31474159 ttgagaaaatgggtagaaattaggtcttgttctttttgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagt 31474258  T
Q  222 ggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
     |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31474259 tgattggagagataaatctctccaccagagtagatcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 31474318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 45687417 - 45687182
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgata-gaaattaggg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||     
T  45687417 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaattttttgattgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggaagaaattaggt 45687318  T
Q  148 tt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctc 246  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45687317 tttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttataactcatttgtatctatttgtaagaactcattgatagtggattggagagatctatctctcctc 45687218  T
Q  247 cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    || | || |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  45687217 catattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 45687182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 40632400 - 40632612
Alignment:
Q  70 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc 167  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  40632400 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgtt 40632498  T
Q  168 aaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 267  Q
     |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||    
T  40632499 gaagctaatttcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctaaagtaagtcaag-ttggac 40632597  T
Q  268 cgaactgggtgaaca 282  Q
    |||||||||| ||||    
T  40632598 cgaactgggtaaaca 40632612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 60 - 282
Target Start/End: Original strand, 6655900 - 6656123
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  6655900 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcacttgtgagattgaaaaaatgggtagaaattaaggttgttcttt 6655998  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6655999 gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggt 6656098  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||    
T  6656099 caag-ttggaccgaattgggtgaaca 6656123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 72 - 282
Target Start/End: Original strand, 8648095 - 8648306
Alignment:
Q  72 tgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-atagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaa 169  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||  |    
T  8648095 tgtaaacaccttggaagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagaatgggaaaatggatagaaattagggttgttcattgtgagtttgttga 8648194  T
Q  170 agctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccg 269  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  8648195 agctaatttcttataacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatattggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggacca 8648293  T
Q  270 aactgggtgaaca 282  Q
    |||||||||||||    
T  8648294 aactgggtgaaca 8648306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 24969006 - 24969238
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtct 108  Q
    ||||||||| ||||||| | || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24969006 caaaggaggtaactttaaggttgacggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagagtct 24969105  T
Q  109 tgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaag 207  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24969106 tgttctttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagatttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaag 24969205  T
Q  208 aactcattgatagtggattggagagatcaatct 240  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24969206 aactaattgatagtggattggagagataaatct 24969238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Original strand, 4587892 - 4588126
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattaggg 147  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||| |     
T  4587892 gttctcatgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcatgttcattggtgaaattgggaaaaaaggtagaaattaaga 4587991  T
Q  148 tt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctc 246  Q
    || ||||||||| | |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  4587992 tttgttctttgtaagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagaacaatctctcccc 4588091  T
Q  247 cagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    || | ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||    
T  4588092 cataataggtgaag-ttggaccaaactgggtaaaca 4588126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 60 - 279
Target Start/End: Original strand, 41964358 - 41964580
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggtga-gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||   |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41964358 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggaaagtgaaaattcatgagtgtcttgttcgttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 41964457  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaaccc-ttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 255  Q
    |||| |||||  |||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41964458 gtgagcttgtttaagctaatttattgtaacccattttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 41964557  T
Q  256 tcaagtttggaccgaactgggtga 279  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  41964558 tcaag-ttggaccgaactgggtga 41964580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 50674059 - 50673848
Alignment:
Q  70 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc 167  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||     
T  50674059 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcgtgttcatttgtgagattgagaaaatgagtagaaattaggattgt-ctttgtgagcttgtt 50673962  T
Q  168 aaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 267  Q
     |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50673961 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggac 50673863  T
Q  268 cgaactgggtgaaca 282  Q
    |||||| ||||||||    
T  50673862 cgaactaggtgaaca 50673848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 87 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27417160 - 27416965
Alignment:
Q  87 gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaa 185  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||    
T  27417160 gagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattggtaaaatgtgtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaa 27417062  T
Q  186 cccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  27417061 cccatttgtatctctttgtaaaaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaa 27416965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13009704 - 13009444
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    |||| |||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13009704 caaatgaggtaactttagggttaagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 13009605  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| |||| |||             ||||||||  | |||||||| ||||||||||    
T  13009604 gttcatttgtgagattgtgaaaatgggtagaaattaggtttgttcttcgtgagctt-------------tcttgtaaaacatttgtatccctttgtaaga 13009518  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| || |||||||||| || |||||    
T  13009517 actcattgatagtggattggagagatcgatctctcctccaaattaggtcaag-ttagaccgaactgtgtcaacaa 13009444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 102 - 283
Target Start/End: Original strand, 26364223 - 26364404
Alignment:
Q  102 agtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  26364223 agtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctct 26364322  T
Q  201 ttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  26364323 ttgtaagaactcattaatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gactgaactgggtcaacaa 26364404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 60 - 282
Target Start/End: Original strand, 12073336 - 12073560
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  12073336 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagtgtgaaaatcat-gagtgtcttgcttattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttcttt 12073434  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||| |||||  |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12073435 gtgagcttgttgaagctaatttattgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcttccagagtaggt 12073534  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    ||   |||||||||||| ||||||||    
T  12073535 cattgttggaccgaactaggtgaaca 12073560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 60 - 282
Target Start/End: Original strand, 379322 - 379548
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaat-cattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctt 155  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| || | ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  379322 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaattcaattagtatcttgttcatttgtgagattgagaaaatgggtagaaattaggtttgttctt 379421  T
Q  156 tgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 255  Q
    ||||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  379422 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcgctttgtaagaactaattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 379521  T
Q  256 tcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||   |||||||||||||| ||||||    
T  379522 tcattgttggaccgaactggatgaaca 379548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 5208116 - 5207843
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtct 108  Q
    ||||||||| |||| |||| ||  || |||||| | || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||    
T  5208116 caaaggaggtaactatagggttgcgggtctttggtgagggttctcttggattgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcatttagtgact 5208017  T
Q  109 tgttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaag 207  Q
    |||||||||| | |||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| | ||| ||||||| | ||||| ||||||||    
T  5208016 tgttcattggagtgattggaaaaagggtagaaattagggtttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttattgcaacccttgtatatctatttgtaag 5207917  T
Q  208 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  5207916 aactcattgatagtggattggaaagatcaatctctctcccagagtaggtcaa-tttggactgaattgggtaaaca 5207843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 60 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 50262922 - 50262700
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-atagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  50262922 gttgggaaacaattgtaaataccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgtttattg---agattgggaaaatggatcgaaattacggttgttcttt 50262827  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  50262826 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagttgattggagatatcaatctttcctccagagtaggt 50262727  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||    
T  50262726 cattgttggaccgaactgggtgaacaa 50262700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 136 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12744071 - 12743925
Alignment:
Q  136 tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12744071 tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatc 12743972  T
Q  236 aatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  12743971 aatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 12743925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 136 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12745460 - 12745314
Alignment:
Q  136 tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12745460 tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatc 12745361  T
Q  236 aatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  12745360 aatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 12745314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 60 - 283
Target Start/End: Original strand, 12119481 - 12119708
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggtt-gttctt 155  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||||    
T  12119481 gttgggaaacaattgtaaataccttgggagagtgaaaatcaatgagtgtcttgttcataggtgagattggaaaaaagagtagaaattatggtttgttctt 12119580  T
Q  156 tgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 254  Q
    ||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12119581 tgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctctcc-caagagtag 12119679  T
Q  255 gtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||   |||||||||||| |||||||||    
T  12119680 gtcattgttggaccgaactaggtgaacaa 12119708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 76 - 244
Target Start/End: Original strand, 3913408 - 3913578
Alignment:
Q  76 aacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagct 173  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||||  |||||    
T  3913408 aacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgagtagaaattagagctgttctttgtgagtttgttgaagct 3913507  T
Q  174 aatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 244  Q
    ||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3913508 aatttcttttaacccatttgtatatctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 3913578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 60 - 274
Target Start/End: Original strand, 35662384 - 35662600
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttg-gtgagtgaaaa-tcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctt 155  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  35662384 gttgggaaacaattgtaaacaccttgagagtgtgaaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgaaaaaatgggtagaaattagggttgttctt 35662482  T
Q  156 tgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 255  Q
    | |||  ||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  35662483 tatgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatatctcctcaagagtagg 35662582  T
Q  256 tcaagtttggaccgaactg 274  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  35662583 tcaag-ttggaccgaactg 35662600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Original strand, 51336998 - 51337231
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattaggg 147  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||    
T  51336998 gttctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcctgttcattggtgagattgagaaaaagggtagaaattacgg 51337097  T
Q  148 --ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcct 245  Q
      ||||||||||||| ||| |  ||| |||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||     
T  51337098 atttgttctttgtgagctttt--aagataatttattataacccttttgtatctctttttaagaactcattgatagtgtattagagagatcaatctctccc 51337195  T
Q  246 ccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
     || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  51337196 acacattaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 51337231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 99 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 46147575 - 46147391
Alignment:
Q  99 ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatc 197  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  46147575 ttgattgtcttgttcatcggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatc 46147476  T
Q  198 tctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  46147475 tctttgtaagaactctttgatagtggattggagacatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 46147391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 48142651 - 48142413
Alignment:
Q  12 aaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgt-aaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    |||||||| ||||||||| || | | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  48142651 aaaggaggtaactttagggttgatggtctttgattagggttctcttgagttgggaaacatttttaaacacttcgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 48142552  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt-aag 207  Q
    |  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| | ||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  48142551 gcccattgatgagattgggaacatgatagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctagtttcttgtaacccttgtatatctctttgtaaag 48142452  T
Q  208 aactcattg--atagtggattggagagatcaatctctcc 244  Q
    |||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||    
T  48142451 aactcattgatatagtagatttgaaagatcaatctctcc 48142413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 136 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12744193 - 12744087
Alignment:
Q  136 tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12744193 tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatc 12744094  T
Q  236 aatctct 242  Q
    |||||||    
T  12744093 aatctct 12744087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Original strand, 8393326 - 8393563
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||| | |    
T  8393326 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggt 8393415  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagaga 233  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  8393416 agaaattagggtttgttcatagtgaacatgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagt 8393513  T
Q  234 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8393514 acaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 8393563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Original strand, 8395535 - 8395772
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||| | |    
T  8395535 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggt 8395624  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcatt-gatagtggattggagaga 233  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  8395625 agaaattagggtttgttcatagtgaacatgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagt 8395722  T
Q  234 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395723 acaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 8395772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26699670 - 26699447
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaa--aatgatagaaattagggtt-gttct 154  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||  |||  || | || | ||||||||| |||||    
T  26699670 gttgggaaacaattgtaaacactttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttgtttattagagagattcagaagaaagggtatagattagggtttgttct 26699571  T
Q  155 ttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagta 253  Q
    |||||| |||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  26699570 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcatttataatggattggagagatcaatctctatcccagagta 26699471  T
Q  254 ggtcaagtttggaccgaactgggt 277  Q
    |||||   ||||||||||||||||    
T  26699470 ggtcattgttggaccgaactgggt 26699447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 262
Target Start/End: Original strand, 21688192 - 21688397
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggtg-agtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gatagaaattagggttgttctt 155  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||   | ||||||||||||||||||||    
T  21688192 gttgggaaacaattctaaacaccttgggggagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcatcggtgagattgagaaaaatgggtagaaattagggttgttctt 21688290  T
Q  156 tgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 255  Q
    ||||| |||||  || ||||| | ||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| | ||| ||||    
T  21688291 tgtgagcttgttgaaactaattttttgtaactcatttgtatctcttcggaagaactcattgataatgaattggagagatcaatccctcccctagattagg 21688390  T
Q  256 tcaagtt 262  Q
    |||||||    
T  21688391 tcaagtt 21688397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 55085578 - 55085442
Alignment:
Q  70 attgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtca 168  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  55085578 attgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgactgtcttgttcattggtgagattggaaaataggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgttg 55085479  T
Q  169 aagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgta 205  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  55085478 aagctaatttcttgtaaaccatttgtatctctttgta 55085442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 236
Target Start/End: Original strand, 53345187 - 53345340
Alignment:
Q  85 gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattagggttg-ttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  || ||||| ||||||    
T  53345187 gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgtttatcggagagattgagaaaatgatagaaattaaggttgattctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgt 53345286  T
Q  184 aacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatca 236  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||||    
T  53345287 aacccttttatatctttttgtaaagaactcattaatattggattgtagggatca 53345340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 274
Target Start/End: Original strand, 29056295 - 29056518
Alignment:
Q  54 tcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattag-ggttg 150  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||| | |||    
T  29056295 tcttgtgttgggaaacatttggaaacaccttgggtgagtaaaaatcattgagtgttttgttcattagagagattgggaaaatggtaggaattagagtttg 29056394  T
Q  151 ttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa-ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccag 249  Q
    |||||||||  ||||| | | ||||| ||||| || |||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||| | |||||||  ||||    
T  29056395 ttctttgtgtgcttgttagaactaatttcttgcaatccttttatatctctttgtaacaacctcattgataatggattagagagacctatctctcacccag 29056494  T
Q  250 agtaggtcaagtttggaccgaactg 274  Q
     ||||||| | ||| ||||||||||    
T  29056495 tgtaggtcca-ttttgaccgaactg 29056518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 256
Target Start/End: Original strand, 33089837 - 33090021
Alignment:
Q  75 aaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagc 172  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| || |   |||||||||| | |||||||| | || |||||  ||||    
T  33089837 aaacaccttggaagagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatgggaagagattgagagatgaatagaaattatgtttgttcttggagagcttgttgaagc 33089936  T
Q  173 taatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||| | || ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33089937 taatttattataaccattttgtatctctctgtaaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcctctagagtaggt 33090021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Original strand, 7124831 - 7125071
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||  | |    
T  7124831 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggt 7124922  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagag 232  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  7124923 agaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaa-ctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagag 7125020  T
Q  233 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
      ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  7125021 tacaatctctcctccagagtaggtcaagcaaagaccgaactgggtgaacaa 7125071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 279
Target Start/End: Original strand, 5135994 - 5136230
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||| ||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||  | |    
T  5135994 tctttgattagagtatctcttgggttgaaaaacatgggaaataccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggt 5136084  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggaga 231  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  5136085 agaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggaga 5136182  T
Q  232 gatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 279  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5136183 gtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 5136230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 70 - 202
Target Start/End: Original strand, 41639218 - 41639351
Alignment:
Q  70 attgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc 167  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  41639218 attgtaaacaccttaggagagtgaaaatcac-gagtgtcttgtttattggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtaaacttttt 41639316  T
Q  168 aaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt 202  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  41639317 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt 41639351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 279
Target Start/End: Original strand, 5138288 - 5138455
Alignment:
Q  115 ttggtgagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaac-ttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaac 210  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| | |||||| ||||||| |||||| |||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||    
T  5138288 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaac 5138385  T
Q  211 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5138386 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 5138455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Original strand, 7122612 - 7122852
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||       ||||||||||||||  | |    
T  7122612 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggt 7122703  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagag 232  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  7122704 agaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaa-ctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagag 7122801  T
Q  233 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
      |||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  7122802 tacaatctctcctccatagtaggtcaagcaaagaccgaactgggtgaacaa 7122852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 88 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22882946 - 22882759
Alignment:
Q  88 agtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaac 186  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |   |||||||  |||  |||| |||||||| |||||||| | ||  ||||  |||||||| |||||||||    
T  22882946 agtgaaaatcattgagtgccttgttcatggaaagagattgaaaaatggataaaaattaggtttgttcttggagagtttgttgaagctaatttcttgtaac 22882847  T
Q  187 ccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 275  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||| |||||  ||||| || ||||||||||   ||||||||||||||    
T  22882846 ccttttgtatctcttcgtaaagaactcattggtagtggattagagaaatcaa--tctcccccggagtaggtcattgttggaccgaactgg 22882759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 88 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22934610 - 22934423
Alignment:
Q  88 agtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaac 186  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |   |||||||  |||  |||| |||||||| |||||||| | ||  ||||  |||||||| |||||||||    
T  22934610 agtgaaaatcattgagtgccttgttcatggaaagagattgaaaaatggataaaaattaggtttgttcttggagagtttgttgaagctaatttcttgtaac 22934511  T
Q  187 ccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 275  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||| |||||  ||||| || ||||||||||   ||||||||||||||    
T  22934510 ccttttgtatctcttcgtaaagaactcattggtagtggattagagaaatcaa--tctcccccggagtaggtcattgttggaccgaactgg 22934423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 258
Target Start/End: Original strand, 33989899 - 33989989
Alignment:
Q  169 aagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaag-aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 258  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33989899 aagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaataactcgttaatagtggattggagagatcaatctctccaccagagtaggtca 33989989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 5429910 - 5429984
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5429910 cactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgtttgtgttcactttgatattgattact 5429984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 241
Target Start/End: Original strand, 6677402 - 6677597
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaatgatagaaattagg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | ||||||| |||||||| | ||  || ||||| |||||| |||||||||||    
T  6677402 gttctcttgggttgggaaacatttgtaaacacattggatgagtgaaa-taattgagtctcttgttcttgggaagaaattgg-aaaatggtagaaattagg 6677499  T
Q  147 gttgtt--ctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctc 241  Q
     || ||  ||| | || |||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  6677500 ttttttttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatatctttgtaaagaagtctttgataatggatttgagagatcaatctc 6677597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 48143279 - 48143353
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  48143279 cactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttact 48143353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 93 - 218
Target Start/End: Original strand, 32091456 - 32091583
Alignment:
Q  93 aaatcattgagtgtcttgttcattggtga-gattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttt 191  Q
    |||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||  ||||  || ||||| ||||||||| ||||    
T  32091456 aaatcattgagtctcttgttcatgggagaagattgggaaaatgctagaaattaggtttgttcttggagagtttgttgaaactaatttcttgtaactcttt 32091555  T
Q  192 tgtatctctttgt-aagaactcattgat 218  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32091556 tgtatctctttgtaaagaacacattgat 32091583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 5370019 - 5369945
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  5370019 cactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattgattact 5369945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 13992228 - 13992154
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||    
T  13992228 cactttgatacctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcactcactttgttattggttact 13992154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 34570351 - 34570277
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  34570351 cactttgattcttagattagatctaggtgttgttattgttgattattgtttgtgttcattttgatattggttact 34570277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 258
Target Start/End: Original strand, 5349932 - 5350052
Alignment:
Q  136 tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagat 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | | ||||||||||||||| |||||||| |||||| || |  ||||||||    
T  5349932 tagaaattaggtttgttctttgtgaacttgtcgaagctaattccttgtagctcgtttgtatctctttgtaaagaactcgttgataatgaagcggagagat 5350031  T
Q  235 caatctctcctccagagtaggtca 258  Q
    |  ||||||| |||||||||||||    
T  5350032 c--tctctcc-ccagagtaggtca 5350052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 348 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 52082597 - 52082526
Alignment:
Q  348 tttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  52082597 tttgattcctagataagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttact 52082526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 47038352 - 47038279
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  47038352 cactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttg-ttattgtttgtgtttactttgatattggttact 47038279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 54199845 - 54199771
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  54199845 cactttgattcttagattagatctaggtgatgttattgctgattattgcttgtgttcactttgatactggttact 54199771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 56178573 - 56178499
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  56178573 cactttcattcctagattagatctaggtgttgttattgtttattattgcttgtgttcactttgatattggttact 56178499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 84
Target Start/End: Original strand, 3910002 - 3910075
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 84  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3910002 caaaggaggtaacttaagggtttagggcctttgattagagttctcttaggttgagaaacattgtaaacaccttg 3910075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 9927396 - 9927326
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggt 415  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  9927396 cactttgattcctagattaaatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgtttactttgatattggt 9927326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 37740856 - 37740930
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  37740856 cactttgattcctacattagatctaggtgctgttattgttgattattgattctgttcactttgatattgattact 37740930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21703940 - 21703836
Alignment:
Q  178 tcttgtaacccttttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggg 276  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||   || ||||||||||||    
T  21703940 tcttgtaccctttttgtatctttttgtaaagaactcattgacagtggattggagatatcaatctatcc-ccatagtaggtcattgtttgaccgaactggg 21703842  T
Q  277 tgaaca 282  Q
    | ||||    
T  21703841 taaaca 21703836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 271
Target Start/End: Original strand, 34112839 - 34112973
Alignment:
Q  136 tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagat 234  Q
    ||||||||| | |||||||  | || |||||  |||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  34112839 tagaaattatgtttgttctaggagagcttgttgaagctaatttcatgtaacccttttgcatctctttgtaaagaactcattgatagtgaagtggagagat 34112938  T
Q  235 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 271  Q
    |  ||||||| | | |||||||||   ||||||||||    
T  34112939 c--tctctcccctatagtaggtcattgttggaccgaa 34112973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 52095289 - 52095225
Alignment:
Q  355 cctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||    
T  52095289 cctagattagatctaggtgttgttattgttgattattacttgtgttcactttgatattgattact 52095225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 52093937 - 52093882
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttggga 66  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52093937 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttggga 52093882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 5872049 - 5872122
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5872049 cactttgattactagattagatctaggtgttgttattattg-ttgttgtttgtgttcactttgatattggttact 5872122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 235
Target Start/End: Original strand, 52065534 - 52065719
Alignment:
Q  54 tcttgggttgggaaaca-ttgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaatgatagaaattagggttg 150  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||  ||  || |||||||||  | ||||||||||| |||    
T  52065534 tcttgggttgggaaacaattgtgaaccccttgggtgagtgaaaatcatcgagtctcttgatcaacggaagatattgggaaacaggtagaaattagg-ttg 52065632  T
Q  151 ttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaaccc-ttttgtatctctttgtaag-aactcattgatagtggattggagagatc 235  Q
    ||||| | || ||| |  |||||| | |  |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  52065633 ttcttagagagcttattgaagctatttttctgtaaccccttttgtatctctttgttagaaactcattgatagtgaagtggagagatc 52065719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 44968064 - 44967829
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaatgatagaaattagg 146  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||||||  | |||||| | ||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  44968064 gttctcttggatttggaaacatttgtaaacaaattggttgagtgaaa-tcattgagcctgttgttcttgggaagagattgggaaaatggtagaaattagg 44967966  T
Q  147 gtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa-ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 244  Q
     || | |||| | || ||||   |||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || ||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||||    
T  44967965 ttttgctcttggagagcttgctgaagccaatttcttgtaaccattt-gtatctctttgtaaaaaactcgttgagagtagattagagggatcaatctctcc 44967867  T
Q  245 tccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
     ||||| || ||||   ||||||||| |||||| ||||    
T  44967866 cccagaataagtcactgttggaccgacctgggtaaaca 44967829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 52467295 - 52467222
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttac 418  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||  | |||||||||||||||||    
T  52467295 cactttgattactagattagatctatgtgttgttattattgatgattgcttgtctttactttgatattggttac 52467222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16422761 - 16422653
Alignment:
Q  128 gaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggatt 226  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||| |||| || ||| |  |||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| | |    
T  16422761 gaaaatggtagaaattatgtttgttttttgagagctttttgaagctaatttctagaaacccttttgtatatctttgtaatgaactcatggatagtgaagt 16422662  T
Q  227 ggagagatc 235  Q
    |||||||||    
T  16422661 ggagagatc 16422653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 35369649 - 35369558
Alignment:
Q  75 aaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg-gtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttg 165  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  35369649 aaacaccttgtagagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgcaagacattggg-aaatgagtagaaattaggtttgttcttggtgagcttg 35369558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 37755070 - 37754986
Alignment:
Q  173 taatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa-ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| || |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  37755070 taatttcttgtaacctttttttatctctttctaaaaaactcattgataatggtttgaagagatcaatctctcccccatagtaggt 37754986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 5112503 - 5112468
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5112503 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 5112468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 127 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 34788930 - 34788851
Alignment:
Q  127 ggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaa 206  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||| | || |||||  ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34788930 ggaaaatggtagaaattaggattgctcttggagagcttgttgaagttaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaa 34788851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 31474378 - 31474451
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  31474378 cactttaattcctagattagatctaggtgttgttattgttg-ttgttgtttgtgtttactttgatattgattact 31474451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 94
Target Start/End: Original strand, 31985466 - 31985508
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaa 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  31985466 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtagtgaaa 31985508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 44570567 - 44570427
Alignment:
Q  87 gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat-----tggt--gagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||     |||   |||||||  |||||| ||||||||| | ||||| || | || |||||  || ||||| ||    
T  44570567 gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatgttcatgggaagagattga-aaaatggtagaaattatgtttgttgttggagagcttgttgaaactaatttc 44570469  T
Q  180 ttgtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatag 220  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44570468 ttgtaacatttttgtatctctttgtaaagaactcattgatag 44570427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 48893579 - 48893506
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| | | ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  48893579 cactttgattcttggattagatctaggtgctgttattgttg-ttattgcttgtgtttactttgatattggttact 48893506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 3777813 - 3777780
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3777813 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 3777780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 5269033 - 5269066
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5269033 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 5269066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 5396504 - 5396537
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5396504 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 5396537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 6743248 - 6743281
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6743248 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 6743281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 10047645 - 10047612
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10047645 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 10047612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 16623126 - 16623159
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16623126 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 16623159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 16628705 - 16628738
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16628705 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 16628738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 84
Target Start/End: Original strand, 25861866 - 25861898
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25861866 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 25861898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 36315021 - 36315096
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||  ||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36315021 caaaggaggtaactttagggtttagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacacattgg 36315096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 36329230 - 36329305
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||  ||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36329230 caaaggaggtaactttagggtttagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggaaacattgtaaacacattgg 36329305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 85
Target Start/End: Original strand, 39774136 - 39774171
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39774136 gttctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttgg 39774171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 114
Target Start/End: Original strand, 5349840 - 5349905
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttca 114  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  5349840 gttcttttgggttgg-aaacatttgtaaacaccttggatgattgaaaatctttgagtgtcttgttca 5349905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 29254725 - 29254798
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| ||| |  ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  29254725 cactttgattactagattagatctaggtgttgttattattg-tcgttgtttgtgttcactttaatattggttact 29254798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 46147332 - 46147259
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||  ||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  46147332 cactttgattactagattagatctaggtattgttattattg-ttgttgcttgtgttcactttgatattggttact 46147259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 8689329 - 8689362
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8689329 tctcttgggttgggaaacattttaaacaccttgg 8689362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1122909 - 1122865
Alignment:
Q  189 ttttgtatctctttgtaag-aactcattgatagtggattggagag 232  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  1122909 ttttgtatctctttgtaagaaactcattgatagtagatttgagag 1122865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 434428 - 434702
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  434428 caaaggaagcaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttggaaaacatggtaaataccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 434527  T
Q  111 ttcattggtgagattggg--aaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  434528 ttcattggtgagattggggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 434627  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  434628 actcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 434702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 490483 - 490359
Alignment:
Q  120 gagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaa-gaactcattgat 218  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||| | |||||||| | || |||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  490483 gagattgagaaaatcgtagaaattaagtttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatatctttgtaaagtactcattgat 490384  T
Q  219 agtggattggagagatcaatctctc 243  Q
    |||| |  |||||||||| ||||||    
T  490383 agtgaagcggagagatcattctctc 490359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 392
Target Start/End: Original strand, 434765 - 434812
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattg 392  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  434765 cactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattg 434812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 113)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 279
Target Start/End: Original strand, 20762567 - 20762837
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20762567 caaaggaagcaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtatcttg 20762666  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaat--gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||| |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20762667 ttcattggtgagattgagaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttcgtaaga 20762766  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20762767 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctacagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 20762837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 3189226 - 3189499
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3189226 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattaaagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcactgagtgtcttg 3189325  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa 209  Q
    ||||||||||||||| |||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3189326 ttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatctttttgtaagaa 3189425  T
Q  210 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3189426 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 3189499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 3198043 - 3198316
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3198043 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattaaagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcactgagtgtcttg 3198142  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa 209  Q
    ||||||||||||||| |||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3198143 ttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatctttttgtaagaa 3198242  T
Q  210 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3198243 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 3198316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 3206882 - 3207155
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3206882 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattaaagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcactgagtgtcttg 3206981  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa 209  Q
    ||||||||||||||| |||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3206982 ttcattggtgagatttggaaaaagggtataaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatctttttgtaagaa 3207081  T
Q  210 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3207082 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 3207155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 3156761 - 3157033
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3156761 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggtttggaaacattgtaaacaccctggtgagtgaaaatcattgagtgtcttg 3156860  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3156861 ttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaa 3156960  T
Q  210 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  3156961 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 3157033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 834440 - 834167
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  834440 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattaaagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgcgtgaaaatcattgagtgtctt 834341  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatg-atagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  834340 gttcatttgtgagattgggaaaatggatagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaaga 834241  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  834240 actcattgatagtggattggagagatctatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 834167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8551060 - 8550786
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||  ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8551060 caaaggagttaactttagggttaagggtctttgattagagttctcttgggttaagaaacattgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 8550961  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  8550960 gttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatccctttgtaaga 8550861  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8550860 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 8550786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28220499 - 28220226
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28220499 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaagcattgaaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 28220400  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
     ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28220399 attcattggtgagattcggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaga 28220300  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  28220299 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 28220226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 44455055 - 44455322
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  44455055 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttttcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaaccattgagtgtctt 44455154  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  44455155 gttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaactcatttgtatctttttgtaaga 44455254  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  44455255 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gaccgaactgggt 44455322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28223694 - 28223421
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28223694 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgaagacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 28223595  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28223594 gttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggttgatctttctgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaga 28223495  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  28223494 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 28223421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 31659133 - 31659406
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31659133 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttcggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 31659232  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31659233 gttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggctgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaga 31659332  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  31659333 acttattgatagtggattggagagatcaatctctccctcagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 31659406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 49918244 - 49918518
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaa-caccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtct 108  Q
    ||||||||| ||||||||| || | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49918244 caaaggaggtaactttagggttgaaggtctttgattagagttctcttggattgggaaacattataaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtct 49918343  T
Q  109 tgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaag 207  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49918344 tgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaag 49918443  T
Q  208 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  49918444 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaa 49918518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 50167409 - 50167175
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattaggg 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  50167409 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattagtagaaattaggg 50167310  T
Q  148 ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcc 247  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50167309 ttgttatttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaaaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccc 50167210  T
Q  248 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||| ||| ||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  50167209 agattagctcaag-ttggaccgaactaggtcaacaa 50167175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 3847394 - 3847121
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3847394 caaaggaggtaactttagggtcgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 3847295  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||  | ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  3847294 gttcatttgtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgtttaagctaaatttttgtaacccatttgtatccctttgtaaga 3847195  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  3847194 actcattgatagtggattggagagatccatctcttccccagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaa 3847121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 50169483 - 50169218
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| | ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50169483 caaaggaggtaactttagggttgagggttttttattagggttatcttgggttgggaaacattgtaaataccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 50169384  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  50169383 gttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagt 50169284  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 275  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  50169283 actcattgatagtggattgaagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactgg 50169218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Original strand, 51765300 - 51765566
Alignment:
Q  21 aactttaggatttaggatctttgattagag-ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt 119  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  51765300 aactctagggtttagggtctttgattagagcttctcttgggttgg-aaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttc-ttggt 51765397  T
Q  120 gagattggga--aaatgatagaaattagggttgttc-tttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaaccc-ttttgtatctcttt-gtaagaactcat 214  Q
      ||||||||  ||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  51765398 ttgattgggagaaaagggtagaaattagggttgtacctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgtaagaactcat 51765497  T
Q  215 tgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51765498 tgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggacaagtttggaccgaactgggtgaacaa 51765566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 37503827 - 37503557
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    |||||||||  |||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37503827 caaaggaggtgactttagggttgagggtctttgattagagttctattgggttggaaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 37503728  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  37503727 gttcattggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc---ttgtatctctttgtaaga 37503631  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||| |||||| ||| |||||    
T  37503630 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaag-ttggatcgaactaggtcaacaa 37503557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 197181 - 196915
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  197181 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 197082  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  197081 gttcatttgtgagattgagaaaattggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagttaatttcttgtaactcatttgtatccctttgtaaga 196982  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctct-cctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  196981 actcattgatagtggattggagagatttatctctccccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgg 196915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28265788 - 28265554
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattaggg 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  28265788 gttctcttaggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggcgagattgggaaaataggtagaaattaggg 28265689  T
Q  148 ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcc 247  Q
    |||||| |||||| |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28265688 ttgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctccccc 28265589  T
Q  248 agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  28265588 agattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 28265554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 1833417 - 1833667
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||  ||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1833417 caaaggagataactttaaggttgagggtctttgattagagttctcttggattgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 1833516  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  | |  |||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  1833517 gttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaatctattgaagctaaattcttgtaactcatttgtatctctttgtaaga 1833616  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaa 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  1833617 actcattgatagtggattggagagatcaatctctccaccagattaggtcaa 1833667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13659609 - 13659336
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtg-agtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| |||||  || || ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13659609 caaaggaggtaacttgtgggttgagggtctttgattagagttctcttaggttgagaaacattgtaaacaccttggggtagtgaaaatcattgagtgtctt 13659510  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatg-atagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  13659509 gttcatttgtgagattgggaaaacggatagaaattagggttgttttttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttacccatttatatctctttgtaaga 13659410  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  13659409 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 13659336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 45644628 - 45644354
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||  ||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  45644628 caaaggagataactttagggttgagggtctttgattagggttctcttaggttggaaaacattgtaaacatcttgggtgagtgaaaatcattaagtgtctt 45644529  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatg-atagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaag 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  45644528 gttcattggtgagattgagaaaatggatagaaattaagttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgcaactcatttgtatctctttgtaag 45644429  T
Q  208 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  45644428 aactcattgatagtggattggagagatcaatatctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 45644354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 60 - 282
Target Start/End: Original strand, 37168241 - 37168465
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  37168241 gttgggaaacaattgtaaacaccttgagagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 37168339  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaaccc-ttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 255  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37168340 gtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 37168439  T
Q  256 tcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  37168440 tcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 37168465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 4552909 - 4552637
Alignment:
Q  12 aaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttg 110  Q
    |||||||| ||||||||| || ||| ||||| |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  4552909 aaaggaggtaactttagggttgagggtctttaattgaggttctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttgggtgagggaaaatcattgagtgtcttg 4552810  T
Q  111 ttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||| |||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  4552809 ttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggtttgtcctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccctttgtatccctttgtaagaa 4552710  T
Q  210 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  4552709 ctcattgataatggattggagagatcaatctctccctcagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 4552637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 61 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13547312 - 13547090
Alignment:
Q  61 ttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttg 157  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13547312 ttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttg 13547214  T
Q  158 tgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtc 257  Q
    ||| |||||  |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13547213 tgagcttgttgaagctattttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtc 13547114  T
Q  258 aagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  13547113 aag-ttggaccgaactgggtgaaca 13547090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 61 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13549223 - 13549001
Alignment:
Q  61 ttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttg 157  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13549223 ttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttg 13549125  T
Q  158 tgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtc 257  Q
    ||| ||||| ||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13549124 tgagcttgttaaacctaatttcatgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtc 13549025  T
Q  258 aagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  13549024 aag-ttggaccgaactgggtgaaca 13549001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 37560142 - 37559867
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    |||| |||| ||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  37560142 caaatgaggtaactttaaggttgagggtctttgattagagttctcttgggtttgaaaacattgtaaacacattaggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 37560043  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc-aaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaag 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37560042 gttcattggtgagattaggaaaatgggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaag 37559943  T
Q  208 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcc-agagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  37559942 aactcgttgatagtgaattggagagatcaatctctccccctagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaa 37559867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 10925118 - 10925394
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10925118 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattatagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 10925217  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt---a 205  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||   |    
T  10925218 gttcattggtgagattgaaaaaatggatagaaattatggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaaga 10925317  T
Q  206 agaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||| ||| ||||| |||||||||| |||||    
T  10925318 agaattcattgatagtggattggagaaatcaatctctcccctagattaggtaaag-ttggatcgaactgggtcaacaa 10925394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 60 - 282
Target Start/End: Original strand, 11348642 - 11348865
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  11348642 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 11348740  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11348741 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttctaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 11348840  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||    
T  11348841 caag-ttggaccgaactgagtgaaca 11348865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13138247 - 13137976
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13138247 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagggttctcttggggtgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 13138148  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaa 209  Q
    |||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| | ||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  13138147 gttcattggtgagattgaaaaatggatagaaattagg-tcgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgcatctctttgtaagaa 13138049  T
Q  210 ctcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    | |||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||| |  |||||||||||||||| |||||    
T  13138048 cacattgatagtggattgaagagagcaatctctcccctagagtaggtc-atattggaccgaactgggtcaacaa 13137976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23555538 - 23555286
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  23555538 caaaggaggtaacttcagggttgaggatctttgattaaagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgaatgaaaattattgagtgtctt 23555439  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  23555438 attctttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttataactcatttgtatctctttgtaaga 23555339  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  23555338 actcattgatagtggattggagagttcaatctctcc-ccatagtaggtcaagtt 23555286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Original strand, 46064840 - 46065086
Alignment:
Q  38 tctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatg-a 135  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  46064840 tctttgattatggttctcttggggtggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaatgga 46064939  T
Q  136 tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatc 235  Q
    || |||||||| ||||||||||||| || ||  |||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46064940 taaaaattaggtttgttctttgtgagctcgttgaagctaatttcttgtaactcatgtgtatctctttgtaagaactcattcatagtggattggagagatc 46065039  T
Q  236 aatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  46065040 aatctctcccccagagtaggtcaag-ttggatcgaactgggtaaacaa 46065086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 29136202 - 29136415
Alignment:
Q  70 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc 167  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  29136202 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 29136300  T
Q  168 aaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 267  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29136301 gaagctaatttcttggaacccatttgtatttctttgtaagaactcattgatcgtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 29136400  T
Q  268 cgaactgggtgaaca 282  Q
    |||||| ||||||||    
T  29136401 cgaactaggtgaaca 29136415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 115 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 13316520 - 13316351
Alignment:
Q  115 ttggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactca 213  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13316520 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactca 13316421  T
Q  214 ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13316420 ttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 13316351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 262
Target Start/End: Original strand, 15820202 - 15820455
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    |||| |||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15820202 caaaagaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttctcttgagttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 15820301  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    |||| ||||||| ||||| || |||  || |||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  15820302 gttctttggtgatattggaaagatgggtaaaaattaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatctctttttaaga 15820401  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 262  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  15820402 actcattgatagtgcattgaagagataaatctctcatccagagtaggtcaagtt 15820455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 87 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 47255535 - 47255340
Alignment:
Q  87 gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaa 185  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||    
T  47255535 gagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaa 47255437  T
Q  186 cccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  47255436 cccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 47255340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 70 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 42298188 - 42297974
Alignment:
Q  70 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc 167  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  42298188 attgtaaacaccttgggagagtaaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttttttgtgagcttgtt 42298090  T
Q  168 aaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 267  Q
     |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  42298089 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcatggttggac 42297990  T
Q  268 cgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||    
T  42297989 cgaactgggtgaacaa 42297974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 60 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 37033297 - 37033071
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  37033297 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 37033199  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaaccc-ttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 255  Q
    |||| |||||  |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  37033198 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatccattttgcatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagattaatctcttctccatagtagg 37033099  T
Q  256 tcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  37033098 tcatggttggaccgaactgggtgaacaa 37033071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 60 - 282
Target Start/End: Original strand, 47115115 - 47115340
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  47115115 gttgggaaacaattgtaaacatcttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattggtagaaattagggttgttcttt 47115213  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaaccc-ttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 255  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47115214 gtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaaaaacccattgatagtggattggagagatcaatctctgctccagagtagg 47115313  T
Q  256 tcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||   |||||||||||||||||||||    
T  47115314 tcattgttggaccgaactgggtgaaca 47115340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 40 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 30476692 - 30476446
Alignment:
Q  40 tttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttca---ttggtgagattgggaaaat-g 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||| |    
T  30476692 tttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgggtgaaaatcattgagt-tcttgttcaatattggtgagattgggaaaatag 30476594  T
Q  135 atagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagat 234  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  30476593 gtagaaattagggttgttctttatgaacttgttgaagataatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatactggattggacagat 30476494  T
Q  235 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||| | ||| |  |||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  30476493 caatctctaccccatatgaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 30476446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 71 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 31925919 - 31925708
Alignment:
Q  71 ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtca 168  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||      
T  31925919 ttgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagagtggaaaaatgggtagaaattagggatgttcattgtgagcttgttg 31925821  T
Q  169 aagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggacc 268  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  31925820 aagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaag-ttggacc 31925722  T
Q  269 gaactgggtgaaca 282  Q
    ||||| ||||||||    
T  31925721 gaactaggtgaaca 31925708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 60 - 282
Target Start/End: Original strand, 193555 - 193778
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  193555 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagggtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 193653  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
     | | |||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  193654 attagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattggagagatcaatctcttctccagagtatgt 193753  T
Q  257 caagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  193754 caag-ttggaccgaactgggtgaaca 193778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 60 - 283
Target Start/End: Original strand, 19754438 - 19754663
Alignment:
Q  60 gttgggaaacatt-gtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gatagaaattagggttgttctt 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||   | ||||||||||||||||||||    
T  19754438 gttgggaaacattcgtaaacaccttgagagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaaatgggtagaaattagggttgttctt 19754536  T
Q  156 tgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 255  Q
    ||||| |||||  |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  19754537 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccgatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccctcagattagg 19754636  T
Q  256 tcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  19754637 tcaag-ttggaccgaagtgggtcaacaa 19754663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 928251 - 927977
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtct 108  Q
    ||||||||| ||||||| | || | | |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  928251 caaaggaggtaactttatggttgaaggtctttgattaggattctcttgggttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcaatgagtgtct 928152  T
Q  109 tgttcattggtgagattgggaaaa-tgatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaa 206  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  928151 tgttctttggtgatattggaaaaaatgatagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttggatctctttgtaa 928052  T
Q  207 gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
     |||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| | |||  |||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  928051 aaactcattaatagtggattagagagaccaacctcttccccaaggtaggtcaag-ttagaccgaactgggtaaaca 927977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 7482445 - 7482231
Alignment:
Q  70 attgtaaacaccttggtga-gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc 167  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  7482445 attgtaaacaccttgggaaagtgaaaattcatgagtgtattgttcattggtgagattgggtaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 7482346  T
Q  168 aaagctaatatcttgtaaccc-ttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 266  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  7482345 taagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtgaattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcaag-ttgga 7482247  T
Q  267 ccgaactgggtgaaca 282  Q
    ||||||| ||||||||    
T  7482246 ccgaactaggtgaaca 7482231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Original strand, 9987132 - 9987370
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| | |    
T  9987132 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggt 9987223  T
Q  137 agaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagatc 235  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  9987224 agaaattagggttgttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgcaacc-ttttgtatcccttttgcaagaactcattgatagtggattggagagtac 9987322  T
Q  236 aatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9987323 aatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 9987370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20622476 - 20622236
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||       ||||||||||||||| | |    
T  20622476 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagggaaaatcattgactgtcttg-------gtgagattgggaaaagggt 20622385  T
Q  137 agaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt---gtaagaactcattgatagtggattggagaga 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||   |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  20622384 agaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttttgtaagaactctttgatagtggattggagagt 20622286  T
Q  234 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622285 acaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 20622236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 60 - 278
Target Start/End: Original strand, 34603519 - 34603740
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggtga-gtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  34603519 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggaaagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgaaaaaatgggtagaaattagggttgttcttt 34603618  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaaccc-ttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 255  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34603619 gtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttttatctctttgtaagaactcattgatggtggattgaagagatcaatctctcctccagagtagg 34603718  T
Q  256 tcaagtttggaccgaactgggtg 278  Q
    ||||| |||||||||||| ||||    
T  34603719 tcaag-ttggaccgaactaggtg 34603740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Original strand, 40282307 - 40282546
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| | |    
T  40282307 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagggt 40282398  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagat 234  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||      
T  40282399 agaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagta 40282497  T
Q  235 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282498 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 40282546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 40122471 - 40122196
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||| | || |||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  40122471 caaaggaggtaactttatggttgaggatcattaattagagttatcttggattgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtaaaaatcattgaatgtctt 40122372  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| | | ||||||||  ||||||||||||| |||||  |||||||| |||| |||| | |||||||| ||||||||||    
T  40122371 gttcatttgtgagattggaaaaatgggtcgaaattagatttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttataactcatttgtatcactttgtaaga 40122272  T
Q  209 actcattg--atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  40122271 actctttgatatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaa 40122196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 58 - 283
Target Start/End: Original strand, 41360857 - 41361082
Alignment:
Q  58 gggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctt 155  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  41360857 gggttgggaaacatcgtaaacatcttgggtgagtgaaaat-attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggtttgttctt 41360955  T
Q  156 tgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 255  Q
    ||||| |||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  41360956 tgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattaaagagatcaatatctcccccatagtagg 41361055  T
Q  256 tcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    || |  |||||||||||| ||| |||||    
T  41361056 tc-atattggaccgaactaggtcaacaa 41361082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 283
Target Start/End: Original strand, 19752643 - 19752854
Alignment:
Q  73 gtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggg-aaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaa 169  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||  |    
T  19752643 gtaaacaccttgagagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgagtaaaatgggtagaaattagggttgttctttgcgagcttgttga 19752741  T
Q  170 agctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccg 269  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||| ||||||||    
T  19752742 agctaatttcttgtaaccgatttgtatctctttgtaagaactcattgatagaggattggagagatcaatctctctcccatattaggtcaag-ttggaccg 19752840  T
Q  270 aactgggtgaacaa 283  Q
    |||| ||| |||||    
T  19752841 aactaggtcaacaa 19752854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 283
Target Start/End: Original strand, 9036326 - 9036585
Alignment:
Q  18 ggcaactttaggatttaggat-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 115  Q
    ||||||| |||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||   || || |||||||||||||||||         
T  9036326 ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg----- 9036419  T
Q  116 tggtgagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactca 213  Q
      ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||     
T  9036420 --gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactct 9036515  T
Q  214 ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036516 ttgatagtggattgaagagtacaatctctcctcgagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 9036585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 279
Target Start/End: Original strand, 21053888 - 21054123
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  |||  |||||||||||||||||||       |||||||||||||||   |    
T  21053888 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagaaaaaatcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaagtgt 21053979  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattgatagtggattggagagat 234  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||      
T  21053980 agaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagta 21054078  T
Q  235 caatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 279  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21054079 caaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 21054123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 84 - 243
Target Start/End: Original strand, 16455591 - 16455750
Alignment:
Q  84 ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat-agaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttg 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||  || ||||  |||| |||||  |||||||| |||||    
T  16455591 ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggtaaaatggtgagaaattagattttttcta-gtgagcttgttgaagctaatttcttg 16455689  T
Q  183 taacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 243  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16455690 taacccatttgtatctctgtgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 16455750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 120 - 258
Target Start/End: Original strand, 22079322 - 22079461
Alignment:
Q  120 gagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgat 218  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22079322 gagattggaaaaatggtagaaattatgtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaaccattttgtatctctttgtaaagaactcattgat 22079421  T
Q  219 agtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 258  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  22079422 attggattggagagatcaatttctcctccaaagtaggtca 22079461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Original strand, 44203563 - 44203801
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||  | |    
T  44203563 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggt 44203652  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagag 232  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  44203653 agaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagag 44203750  T
Q  233 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203751 tacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 44203801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 53 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 37282923 - 37282701
Alignment:
Q  53 ctcttgggttgggaaacattgt-aaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattaggg-tt 149  Q
    |||||||||||| |||| || | ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| || ||||||||| ||    
T  37282923 ctcttgggttggaaaacttttttaaacaccttgtatgagtgaaaaccattgagtgtcttgttcattggagagatt-gaaaaatggtataaattagggttt 37282825  T
Q  150 gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcca 248  Q
    |||| |||||| |||||  |||||||| | | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||       
T  37282824 gttccttgtgagcttgttgaagctaatttatggtaacccttttgcatctctttgtaaagaactcattagtagtggattggagagataaatctctcctttg 37282725  T
Q  249 gagtaggtcaagtttggaccgaact 273  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||    
T  37282724 gagtaggtcaa-tttggactgaact 37282701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 37879135 - 37879006
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  37879135 gttgggaaacaattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaataggtagaaattagggttgttcttt 37879037  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacc 187  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||||||||    
T  37879036 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacc 37879006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 191 - 282
Target Start/End: Original strand, 28242382 - 28242472
Alignment:
Q  191 ttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  28242382 ttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 28242472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 50 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 44650398 - 44650172
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgatagaaatta-gg 146  Q
    ||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   || |||||| ||    
T  44650398 gttctcttaagttggaaaacatttgtaaacactttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggagagattgagaaaaatgtaaaaattatgg 44650299  T
Q  147 gttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcct 245  Q
     |||||||||||||  |||| || |||||| | ||||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |     
T  44650298 tttgttctttgtgagtttgttaacgctaatttattgtaaatcttttatatctctttgtaaataattcattaatagtggattgaagagatcaatctcttcc 44650199  T
Q  246 ccagagtaggtcaagtttggaccgaact 273  Q
    | | |||||||||| |||||||||||||    
T  44650198 caaaagtaggtcaa-tttggaccgaact 44650172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 183 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 37876865 - 37876767
Alignment:
Q  183 taacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  37876865 taacccatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattgcagagatcaatctctcctccagagtacatcaag-ttgaaccgaactgggtgaaca 37876767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 6808418 - 6808595
Alignment:
Q  87 gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaatgatagaaattagggtt------gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatc 179  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||| || ||||| ||||||||||| ||      |||||| | || |||||  |||||||  ||    
T  6808418 gagtgaaaattattgagtgtcttgttcatgagtagagattagggaaatggtagaaattaggattaggtttgttcttggagagcttgttgaagctaacttc 6808517  T
Q  180 ttgtaacccttttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 256  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  6808518 ttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctcttcctcagagtaggt 6808595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 13316583 - 13316513
Alignment:
Q  19 gcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 89  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13316583 gcaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgag 13316513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 283
Target Start/End: Original strand, 2926516 - 2926678
Alignment:
Q  122 gattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaa-gaactcattgatag 220  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||| |||   |||||||| |||| |||| | |||||||| ||||| ||||||||| || ||| |||||| |||    
T  2926516 gattggaaaaatggtagaaattaggtttgtgcttgaagaacttgttaaagttaatttattgtaacctttttgcatctctttgaaacgaattcattggtag 2926615  T
Q  221 tggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||| |||||||| ||| |||||    
T  2926616 tggattggagagatcaatctcttctgcagagtaggtcattgttgcaccgaactaggtaaacaa 2926678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 93 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 9109610 - 9109459
Alignment:
Q  93 aaatcattgagtgtcttgttcattggt--gagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaaccctt 190  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||  |||||||| | || | ||| | ||||||||  ||| |||| |||||||||||||    
T  9109610 aaatccttgagtgtcttgttcat-ggtaggagattgagaaaatggaagaaattaagtttttacttggagaacttgttgaagttaatttcttgtaaccctt 9109512  T
Q  191 ttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatcaatctct 242  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9109511 ttgtatctctttgtaaagaacacgttgatagtgtattggagagatcaatctct 9109459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 345 - 418
Target Start/End: Original strand, 44455391 - 44455464
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttac 418  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44455391 cactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgtttgtgttcactttgatattggttac 44455464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 8871259 - 8871074
Alignment:
Q  71 ttgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgatagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtca 168  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||  | ||      
T  8871259 ttgtaaacaccttggatgagcgaaaatcat--agtgtcttgttcttttgtgagatttggaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagttcgttg 8871162  T
Q  169 aagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggacc 268  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||              ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||    
T  8871161 aagctaatttcttgtaaccattttgtaactc--------------ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccatagtaggccaag-ttggacc 8871077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Original strand, 3157096 - 3157170
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3157096 cactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttact 3157170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 8550721 - 8550647
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8550721 cactttgattcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttact 8550647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 258
Target Start/End: Original strand, 13938143 - 13938281
Alignment:
Q  120 gagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaaccctttt-gtatctctttgtaagaa-ctcattga 217  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| | |||||||| |||  |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  13938143 gagattgggaaatgggtagaaattagg-ttgttcttggagaacttgtaaaatataatttcttgtaaccttttttgtatctctttgtaagaaactcattga 13938241  T
Q  218 tagtggattggagagatcaatctctcctccaga-gtaggtca 258  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  13938242 tagtggattggagagatc--tctctcccccagatgtaggtca 13938281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Original strand, 36683766 - 36683828
Alignment:
Q  200 tttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36683766 tttgtaagaactcattgatagtggattgtagaaatcaatctctcccccagagtaggtcaagtt 36683828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 259
Target Start/End: Original strand, 3460717 - 3460841
Alignment:
Q  136 tagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagaga 233  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||  |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  3460717 tagaaattagagtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccttttgtatatctttgtaaagaacatattgatagtcgattggagaga 3460816  T
Q  234 tcaatctctcctccagagtaggtcaa 259  Q
    ||||| ||| | | ||||||||||||    
T  3460817 tcaatatcttc-ctagagtaggtcaa 3460841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 37559803 - 37559728
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagatt-agatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  37559803 cactttgattcctagatttagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttact 37559728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 348 - 419
Target Start/End: Original strand, 49918584 - 49918655
Alignment:
Q  348 tttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  49918584 tttgattcctagattagatataggtgctgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattggttact 49918655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 12318721 - 12318523
Alignment:
Q  84 ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttg 182  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||  | ||||||||||| |||||| | | || |||||  |||||||| |||||    
T  12318721 ggtgagtgaaa-tcattgagtttcttgttcatgggtagagatttggaaatgggtagaaattaggtttgttcatggagagcttgttgaagctaatttcttg 12318623  T
Q  183 taacccttttgtatctctt-tgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaac 281  Q
    ||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||| || |   ||||||||  ||||||| ||| ||||| |||   |||||||||||| ||| |||    
T  12318622 taaccattttgtatgtcttctttaagaactcattgatactgaagcagagagatc--tctctcccccatagtagttcattattggaccgaactaggtaaac 12318525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 346 - 419
Target Start/End: Original strand, 31659470 - 31659543
Alignment:
Q  346 actttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  31659470 actttgattcctagattagatcaaggtgttgttattgttgattattgcttgtgttcattttgatattggttact 31659543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 347 - 419
Target Start/End: Original strand, 10925455 - 10925527
Alignment:
Q  347 ctttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  10925455 ctttgattactagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgtgttcactttgatattgattact 10925527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2263106 - 2263016
Alignment:
Q  151 ttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatct 240  Q
    ||||| |||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2263106 ttcttggtgagcttgttgaagataatttcttgtaacccttttatatctttttgtaaagaacttattgatagtggattgaagagatcaatct 2263016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 254
Target Start/End: Original strand, 5459961 - 5460046
Alignment:
Q  169 aagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaa-gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 254  Q
    |||||||| |||||||||  |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  5459961 aagctaatttcttgtaaca-ttttatatttctttgtaaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcatctagagtag 5460046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 22819737 - 22819662
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagag-ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  ||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22819737 caaaggaggtaactttaggatttagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 22819662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 37503494 - 37503427
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatatt 412  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37503494 cactttaattcctagattagatctaggtgttgatattgttgattattgcttgtgttcactttgatatt 37503427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 13316289 - 13316215
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||| |||||    
T  13316289 cactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgcattcactttgttattgattact 13316215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 355 - 417
Target Start/End: Original strand, 20762909 - 20762971
Alignment:
Q  355 cctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggtta 417  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||    
T  20762909 cctagattagatctaggtgctgttattgttgattattgcttgaattcactttgatattggtta 20762971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 232
Target Start/End: Original strand, 32471486 - 32471579
Alignment:
Q  139 aaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaag-aactcattgatagtggattggagag 232  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||  ||| |||| | ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  32471486 aaattaggtttgttctttgagaact-gttgaagttaatttattgcaactcttttgtatctctttgtaagaaactcattgatagtggattcgagag 32471579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 97
Target Start/End: Original strand, 777177 - 777225
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt-ggtgagtgaaaatc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  777177 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacactttgggtgagtgaaaatc 777225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 44646981 - 44646881
Alignment:
Q  86 tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgatagaaatta-gggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgta 184  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   || |||||| || |||||||||||||  |||| || |||||| | |||||    
T  44646981 tgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggagagattgagaaaaatgtaaaaattatggtttgttctttgtgagtttgttaacgctaatttattgta 44646882  T
Q  185 a 185  Q
    |    
T  44646881 a 44646881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 85
Target Start/End: Original strand, 47098656 - 47098691
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47098656 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 47098691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 85
Target Start/End: Original strand, 47102670 - 47102705
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47102670 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 47102705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 834106 - 834033
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| || |||||||||||  ||| ||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  834106 cactttgattcccagattagatcttggtgttgttattgttg-ttattgcttgtgtttactttgatattggttact 834033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 222
Target Start/End: Original strand, 25652029 - 25652195
Alignment:
Q  60 gttgggaaaca-ttgtaaacaccttg-gtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgag-attgggaaaatgatagaaattagggttgttcttt 156  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| | ||||||||  |  |  |||| |||| || ||||||||| |  |||| |||    
T  25652029 gttgggaaacaattgtaaacaccttaagtgtgtgaaaatcattgagtattttgttcatgagaaaatattgagaaattggtagaaattaagtgtgttattt 25652128  T
Q  157 gtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 222  Q
    | ||  ||||  |||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  25652129 gagagtttgttgaagctaatttcttgtaactctcttgtatctctttgtaaagaactctttgatagtg 25652195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 28220163 - 28220090
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  28220163 cactttgattactagattagatctaggtgttgttattattg-ttgttgtttgtgttcactttaatattggttact 28220090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 28223358 - 28223285
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28223358 cactttgattactagattagatctaggtgttgttattattg-ttgttgcttgtgttcactttgatattggttact 28223285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 50169151 - 50169078
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||||||  ||||||||||| || ||| ||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50169151 cactttgattactagattagatataggtgttgttattattg-ttgttgtttgtgttcactttgatattggttact 50169078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 3281971 - 3281938
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3281971 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 3281938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 13604455 - 13604488
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13604455 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 13604488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 16124347 - 16124380
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16124347 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 16124380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16914279 - 16914234
Alignment:
Q  178 tcttgtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 222  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16914279 tcttctaacccttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtg 16914234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 37070031 - 37069998
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37070031 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 37069998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 405
Target Start/End: Original strand, 51765630 - 51765690
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactt 405  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  51765630 cactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattgcttgcactcactt 51765690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 196846 - 196773
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    |||||||||  ||||||||||| || ||| ||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  196846 cactttgattactagattagatgtaggtgttgttattattg-ttgttgcttgtgttcactttgatattggttact 196773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4535585 - 4535527
Alignment:
Q  178 tcttgtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtggattggagagatc 235  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  4535585 tcttgtaacatttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagttaagtggagagatc 4535527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 211 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 44646875 - 44646814
Alignment:
Q  211 tcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 273  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| | | | |||||||||| |||||||||||||    
T  44646875 tcattaatagtggattgaagagatcaatctcttcccaaaagtaggtcaa-tttggaccgaact 44646814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 83
Target Start/End: Original strand, 9022737 - 9022770
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacacctt 83  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9022737 gttctcttgggttgagaaacattgtaaacacctt 9022770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 13598664 - 13598631
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13598664 tctcttgggttggcaaacattgtaaacaccttgg 13598631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 283
Target Start/End: Original strand, 15916626 - 15916671
Alignment:
Q  238 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15916626 tctctcccccagactaggtcaattttggaccgaactgggtaaacaa 15916671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 29652073 - 29652044
Alignment:
Q  56 ttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29652073 ttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 29652044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 31422906 - 31422862
Alignment:
Q  238 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  31422906 tctctcctccagactaggtcaa-tttggaccgagctgggtgaacaa 31422862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 32889698 - 32889669
Alignment:
Q  56 ttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32889698 ttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 32889669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 54 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1050674 - 1050503
Alignment:
Q  54 tcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat-tggtgagattgggaaaatgatagaaattagggttg 150  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||  ||||||||| | ||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||  | |  ||||||||  ||    
T  1050674 tcttgggttgggaaacatttgtacacacattgaatgagtgaaatt-attgagtctcttgttcatgtgaagagattgggaaatgggtgaaaattaggtgtg 1050576  T
Q  151 ttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtg 222  Q
    ||||| | || ||| |  |||||||| |||||||||  |||||| ||||||||| || ||||| |||||||||    
T  1050575 ttcttcgagagcttattgaagctaatttcttgtaacatttttgtgtctctttgtaaataactcgttgatagtg 1050503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 112
Target Start/End: Original strand, 6484023 - 6484075
Alignment:
Q  60 gttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgtt 112  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6484023 gttgggaaacattctaaacattttgatgagtaaaaatcattgagtatcttgtt 6484075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 84
Target Start/End: Original strand, 26644735 - 26644763
Alignment:
Q  56 ttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26644735 ttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 26644763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 186
Target Start/End: Original strand, 36683694 - 36683762
Alignment:
Q  119 tgagattgggaaaat-gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaac 186  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||  ||||  |||||||| |||||||||    
T  36683694 tgagattgggaaaataggtagaaattaggtttattctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac 36683762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 283
Target Start/End: Original strand, 820 - 1084
Alignment:
Q  19 gcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgg 118  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  820 gcaactttagggtttagggtctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttc-ttgg 918  T
Q  119 tgagattggg--aaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattg 216  Q
    ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  919 tgagattgggaaaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-aacaactcattg 1017  T
Q  217 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1018 atagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 1084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 345 - 392
Target Start/End: Original strand, 1147 - 1194
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  1147 cactttgatacctagattagatctaggtggtgttattgttgattattg 1194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 60 - 283
Target Start/End: Original strand, 11502 - 11726
Alignment:
Q  60 gttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa-tgatagaaattagggttgttctttgt 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  11502 gttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggttgttctttgt 11601  T
Q  159 gaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 258  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11602 gaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtca 11701  T
Q  259 agtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11702 agtttggaccgaactgggtgaacaa 11726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 50 - 283
Target Start/End: Original strand, 114537 - 114771
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||    
T  114537 gttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaagggtagaaattaaggt 114636  T
Q  149 tgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcca 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  114637 tgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacgcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcca 114736  T
Q  249 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  114737 gagtaggttaagtttagaccgaactggatgaacaa 114771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 345 - 417
Target Start/End: Original strand, 114834 - 114906
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggtta 417  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  114834 cactttgattcctagattagatataggtgttgttattgttgattattgattgtgttcactttgatattggtta 114906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 4)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11425 - 11160
Alignment:
Q  21 aactttaggatttaggatctttgattagag-ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt 119  Q
    |||| |||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11425 aactctagggtttatggtctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttc-ttggt 11327  T
Q  120 gagattggga--aaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattg 216  Q
    ||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  11326 gagattgggagaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtaaaatctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcgttg 11227  T
Q  217 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11226 atagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 11160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8999 - 8734
Alignment:
Q  21 aactttaggatttaggatctttgattagag-ttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt 119  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  8999 aactctaggctttagggtctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaagaccttggtgagtgtaaaccattgagtgtcttgttc-ttggt 8901  T
Q  120 gagattggga--aaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaagaactcattg 216  Q
    ||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  8900 gagattgggagaaaagggtagaaattagggttgttctttgtgaacttataaaatctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcgttg 8801  T
Q  217 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8800 atagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 8734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8670 - 8623
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattg 392  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  8670 cactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattg 8623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 345 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 11096 - 11049
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattg 392  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  11096 cactttgtttcctagattagatctaggtgttgttattgttgattattg 11049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 20688 - 20415
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  20688 caaaggaggtaactttagggttgagggtctttgattagagttatcttgggttgggagacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtttatt 20589  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatgat-agaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20588 attcattggtgagattgggaaaatgagcagaaattaggtttgttttttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaga 20489  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  20488 actctttgatattggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 20415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 20352 - 20278
Alignment:
Q  345 cactttgatacctagattagatctatgtgatgttattgttgattattgtttgtgctcactttgatattggttact 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20352 cactttgattcctagattagatctaggtgctgttattgttaattattgcttgtgttcactttgacattggttact 20278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 4)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 149370 - 149097
Alignment:
Q  11 caaaggaggcaactttaggatttaggatctttgattagagttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtg-agtgaaaatcattgagtgtctt 109  Q
    ||||||||| |||||  || || ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  149370 caaaggaggtaacttgtgggttgagggtctttgattagagttctcttaggttgagaaacattgtaaacaccttggggtagtgaaaatcattgagtgtctt 149271  T
Q  110 gttcattggtgagattgggaaaatg-atagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaaga 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  149270 gttcatttgtgagattgggaaaacggatagaaattagggttgttttttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttacccatttatatctctttgtaaga 149171  T
Q  209 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  149170 actcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaa 149097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 133112 - 133145
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  133112 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 133145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 2758 - 2726
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2758 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttg 2726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 5949 - 5916
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5949 tctcttgggttggcaaacattgtaaacaccttgg 5916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Original strand, 7282 - 7494
Alignment:
Q  70 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc 167  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  7282 attgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgtt 7380  T
Q  168 aaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 267  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  7381 gaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggaaagatcaatctctcctctagagtaggttaag-ttggac 7479  T
Q  268 cgaactgggtgaaca 282  Q
    |||||||||||||||    
T  7480 cgaactgggtgaaca 7494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18216 - 18004
Alignment:
Q  70 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc 167  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||     
T  18216 attgtaaacactttgggagagtgaaaatcat-gagtgttttgttcattggtgagagtgggaaaattggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgtt 18118  T
Q  168 aaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 267  Q
     |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  18117 gaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaa-aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagggtaggtcaagtttggat 18019  T
Q  268 cgaactgggtgaaca 282  Q
    |||||||||||||||    
T  18018 cgaactgggtgaaca 18004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 17515 - 17482
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17515 tctcttggattgggaaacattgtaaacaccttgg 17482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 93 - 282
Target Start/End: Original strand, 10468 - 10656
Alignment:
Q  93 aaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat-gatagaaattagggtt-gttctttgtgaact--tgtcaaagctaatatcttgtaaccc 188  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||    |||||| | ||||||||     
T  10468 aaatctttgagtgtcttgttcatttgtgagattggaaaaaaagatataaattagggtttgttctttgtgagctcttgt----gctaatttattgtaacca 10563  T
Q  189 ttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca 282  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10564 ttttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaaca 10656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2841 - 2603
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||  | |    
T  2841 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggt 2752  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagag 232  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  2751 agaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagag 2654  T
Q  233 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 283  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2653 tacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaa 2603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 80496 - 80338
Alignment:
Q  70 attgtaaacaccttggt-gagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatga-tagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc 167  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  80496 attgtgaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattgctgagattgggaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtt 80398  T
Q  168 aaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattg 227  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  80397 gaagctaatttcttgcaacccatttgtatctttttgtaagaactcatagatagtgaattg 80338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 3963 - 3729
Alignment:
Q  38 tctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatgat 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||||||||||  | |    
T  3963 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgggaaaggggt 3874  T
Q  137 agaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagag 232  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||||| |||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  3873 agaaattagggtttgttcatagtgaacatgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagag 3776  T
Q  233 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 279  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3775 ttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 3729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 279
Target Start/End: Original strand, 6183 - 6438
Alignment:
Q  18 ggcaactttaggatttaggat-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcat 115  Q
    ||||||| |||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||         
T  6183 ggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatgggaaacaccttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg----- 6274  T
Q  116 tggtgagattgggaaaatgatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactc 212  Q
      ||||||||||||||  | |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| |||||||| || || ||||| |||| |||| ||||||    
T  6275 --gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaagccctt-gtatcccttttgtaaagaactc 6370  T
Q  213 att-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 279  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6371 atttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggttaagtttggaccgaactgggtga 6438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 27678 - 27453
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttgg-tgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggt-gagattgggaaaatgatagaaattagg 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||   ||  ||||||| |||||   ||||||||| |    
T  27678 gttctcttgagttgggaaacatttgtaaacaccttggatgagtgaaa-tctttgagtctcttgttctagggaagagattgtgaaaagagtagaaattatg 27580  T
Q  147 g-ttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgtaag-aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 244  Q
      ||||||||   || |||||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27579 tattgttcttgaagagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaaataacttattgatagtggattggagagatcaatctctcc 27480  T
Q  245 tccagagtaggtcaagtttggaccgaa 271  Q
     ||| |||||||||   ||||||||||    
T  27479 cccatagtaggtcattgttggaccgaa 27453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 235
Target Start/End: Original strand, 25065 - 25175
Alignment:
Q  126 gggaaaatgatagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatatcttgtaacccttttgtatctctttgt-aagaactcattgatagtgga 224  Q
    ||||||||| |||||| |||  |||||||||| ||  ||||  ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  25065 gggaaaatggtagaaactagttttgttctttgagagtttgttgaaggtaatttcttgtaacctttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtgaa 25164  T
Q  225 ttggagagatc 235  Q
     | ||||||||    
T  25165 gtagagagatc 25175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0129 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0129
Description:

Target: scaffold0129; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 19173 - 19117
Alignment:
Q  50 gttctcttgggttgggaaacatt-gtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  19173 gttctcttgggttgggaaacatttgtaaacacttgggtgagtgaaaatcattgagtg 19117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 8250 - 8283
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8250 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 8283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 279
Target Start/End: Original strand, 1 - 30
Alignment:
Q  250 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 30  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 45462 - 45429
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45462 tctcttgggttgtgaaacattgtaaacaccttgg 45429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Original strand, 36665 - 36698
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36665 tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgg 36698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 85
Target Start/End: Original strand, 43798 - 43827
Alignment:
Q  56 ttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43798 ttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 43827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 85947 - 85914
Alignment:
Q  52 tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttgg 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  85947 tctcttgggttgggaaacattgtaaacactttgg 85914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University