View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF14275_low_34 (Length: 377)

Name: NF14275_low_34
Description: NF14275
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF14275_low_34
NF14275_low_34
[»] chr3 (62 HSPs)
chr3 (13-369)||(12497799-12498155)
chr3 (20-369)||(14876729-14877078)
chr3 (13-369)||(16370964-16371320)
chr3 (13-369)||(9522270-9522626)
chr3 (13-369)||(17489401-17489757)
chr3 (13-369)||(16492404-16492760)
chr3 (13-369)||(16807149-16807505)
chr3 (20-369)||(16691711-16692060)
chr3 (13-357)||(10905773-10906117)
chr3 (21-369)||(15348476-15348824)
chr3 (13-357)||(10005163-10005507)
chr3 (19-357)||(48425010-48425348)
chr3 (13-357)||(13252253-13252597)
chr3 (13-369)||(15208442-15208798)
chr3 (13-357)||(15589615-15589959)
chr3 (13-357)||(16635336-16635680)
chr3 (13-357)||(43162660-43163004)
chr3 (13-369)||(15402733-15403089)
chr3 (13-369)||(15725157-15725512)
chr3 (13-369)||(16412505-16412861)
chr3 (13-357)||(20062277-20062621)
chr3 (13-369)||(53385241-53385597)
chr3 (13-362)||(26792622-26792971)
chr3 (13-369)||(5425153-5425508)
chr3 (13-369)||(15338820-15339176)
chr3 (13-369)||(6600298-6600654)
chr3 (13-369)||(16756808-16757164)
chr3 (13-342)||(15247725-15248054)
chr3 (68-351)||(15227228-15227511)
chr3 (68-342)||(13972387-13972661)
chr3 (26-333)||(15953193-15953500)
chr3 (33-368)||(47123506-47123841)
chr3 (26-351)||(13322877-13323202)
chr3 (33-368)||(10383531-10383866)
chr3 (26-369)||(14571409-14571752)
chr3 (61-303)||(12850539-12850781)
chr3 (13-230)||(15015967-15016184)
chr3 (26-351)||(18134571-18134896)
chr3 (41-369)||(10420285-10420613)
chr3 (80-354)||(16329938-16330212)
chr3 (33-333)||(8759314-8759614)
chr3 (33-333)||(13941621-13941921)
chr3 (33-333)||(41177119-41177419)
chr3 (27-369)||(11303999-11304341)
chr3 (68-342)||(14086261-14086535)
chr3 (34-351)||(12360775-12361092)
chr3 (79-354)||(11961312-11961587)
chr3 (24-194)||(18748401-18748571)
chr3 (227-369)||(31689049-31689191)
chr3 (225-369)||(31945033-31945177)
chr3 (33-369)||(44776808-44777144)
chr3 (47-210)||(8274656-8274819)
chr3 (68-333)||(16381197-16381459)
chr3 (24-210)||(16742937-16743123)
chr3 (33-342)||(16836742-16837045)
chr3 (33-210)||(15576470-15576647)
chr3 (47-132)||(17192892-17192977)
chr3 (47-210)||(13975302-13975465)
chr3 (92-210)||(6153141-6153259)
chr3 (13-194)||(21686681-21686862)
chr3 (317-372)||(320781-320835)
chr3 (23-71)||(14183145-14183193)
[»] chr2 (53 HSPs)
chr2 (13-369)||(24675052-24675408)
chr2 (13-369)||(21325790-21326146)
chr2 (13-369)||(22756987-22757343)
chr2 (13-369)||(24708006-24708362)
chr2 (13-369)||(23188571-23188927)
chr2 (58-369)||(23138600-23138911)
chr2 (58-369)||(23550390-23550701)
chr2 (13-357)||(16924835-16925179)
chr2 (13-357)||(16998575-16998919)
chr2 (13-345)||(23063664-23063996)
chr2 (13-357)||(16981727-16982071)
chr2 (13-357)||(17063292-17063636)
chr2 (13-369)||(24709596-24709952)
chr2 (13-369)||(44386093-44386449)
chr2 (21-363)||(21145562-21145904)
chr2 (13-357)||(9609711-9610055)
chr2 (13-369)||(24261933-24262289)
chr2 (13-369)||(24878519-24878875)
chr2 (13-369)||(27370832-27371188)
chr2 (18-369)||(22325385-22325736)
chr2 (13-357)||(10868425-10868769)
chr2 (13-357)||(27217591-27217935)
chr2 (119-369)||(27377101-27377351)
chr2 (13-357)||(17066953-17067294)
chr2 (27-354)||(30211455-30211782)
chr2 (18-267)||(24825811-24826060)
chr2 (68-369)||(23087013-23087314)
chr2 (23-349)||(45529100-45529420)
chr2 (33-368)||(31830222-31830557)
chr2 (68-342)||(27365658-27365932)
chr2 (33-354)||(11358418-11358739)
chr2 (26-351)||(23293539-23293864)
chr2 (81-368)||(20832549-20832836)
chr2 (192-369)||(41609047-41609224)
chr2 (33-368)||(1063315-1063650)
chr2 (26-369)||(23276339-23276682)
chr2 (80-333)||(27787340-27787593)
chr2 (92-331)||(24653946-24654185)
chr2 (276-354)||(24833360-24833438)
chr2 (48-109)||(27368391-27368452)
chr2 (24-192)||(25128387-25128555)
chr2 (47-210)||(22276001-22276164)
chr2 (168-333)||(24944966-24945131)
chr2 (33-333)||(12573952-12574252)
chr2 (325-369)||(45676685-45676729)
chr2 (326-369)||(23599834-23599877)
chr2 (47-210)||(24831745-24831908)
chr2 (24-132)||(23817588-23817696)
chr2 (47-210)||(12640477-12640640)
chr2 (47-194)||(22762127-22762274)
chr2 (308-348)||(17967577-17967617)
chr2 (146-194)||(23817750-23817798)
chr2 (146-194)||(28144701-28144749)
[»] chr5 (61 HSPs)
chr5 (13-369)||(23573606-23573962)
chr5 (13-369)||(23516405-23516761)
chr5 (18-369)||(23440089-23440440)
chr5 (20-369)||(18775641-18775990)
chr5 (13-369)||(21984471-21984827)
chr5 (21-334)||(20798659-20798972)
chr5 (21-369)||(25423053-25423401)
chr5 (13-355)||(26738871-26739213)
chr5 (13-369)||(14999905-15000261)
chr5 (13-369)||(22333053-22333409)
chr5 (13-369)||(22134532-22134888)
chr5 (13-369)||(19769824-19770180)
chr5 (13-369)||(27518271-27518627)
chr5 (13-369)||(27610218-27610574)
chr5 (13-357)||(40708656-40709000)
chr5 (13-369)||(27668656-27669012)
chr5 (13-369)||(27685566-27685922)
chr5 (13-357)||(34566370-34566714)
chr5 (13-369)||(37291662-37292018)
chr5 (23-369)||(23471093-23471439)
chr5 (13-357)||(16356378-16356722)
chr5 (13-369)||(41770706-41771062)
chr5 (13-369)||(29476239-29476595)
chr5 (13-344)||(22348314-22348643)
chr5 (26-369)||(20468275-20468618)
chr5 (20-290)||(21498209-21498479)
chr5 (155-357)||(21343666-21343868)
chr5 (128-369)||(20573385-20573626)
chr5 (26-342)||(23442472-23442788)
chr5 (70-332)||(21564189-21564451)
chr5 (26-351)||(21890938-21891263)
chr5 (68-369)||(28923989-28924290)
chr5 (33-368)||(14887177-14887512)
chr5 (61-368)||(25847922-25848229)
chr5 (68-369)||(28895163-28895464)
chr5 (33-369)||(20773606-20773942)
chr5 (13-157)||(21339452-21339596)
chr5 (35-351)||(22461816-22462132)
chr5 (33-368)||(37545682-37546018)
chr5 (18-354)||(21404715-21405035)
chr5 (26-351)||(24735790-24736115)
chr5 (26-351)||(24749733-24750058)
chr5 (33-368)||(20342129-20342464)
chr5 (26-372)||(22236099-22236445)
chr5 (79-351)||(24737017-24737289)
chr5 (79-354)||(24798629-24798904)
chr5 (33-354)||(23080275-23080596)
chr5 (33-351)||(20821317-20821635)
chr5 (107-369)||(21662300-21662561)
chr5 (33-354)||(22381060-22381381)
chr5 (81-354)||(22502540-22502813)
chr5 (107-333)||(21665761-21665986)
chr5 (33-333)||(17269519-17269819)
chr5 (24-210)||(11210871-11211057)
chr5 (47-210)||(27011089-27011252)
chr5 (33-194)||(23503464-23503625)
chr5 (47-210)||(21937388-21937551)
chr5 (47-210)||(24581216-24581379)
chr5 (281-369)||(21625382-21625470)
chr5 (93-190)||(25244598-25244695)
chr5 (93-190)||(25308750-25308847)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (19-367)||(278823-279171)
scaffold0005 (26-369)||(164709-165052)
scaffold0005 (13-369)||(308622-308978)
scaffold0005 (26-369)||(260271-260614)
[»] chr8 (61 HSPs)
chr8 (20-369)||(30313578-30313927)
chr8 (13-369)||(21166964-21167320)
chr8 (13-369)||(19977965-19978321)
chr8 (20-369)||(16408479-16408828)
chr8 (13-369)||(15533378-15533734)
chr8 (13-369)||(22046372-22046727)
chr8 (20-369)||(22164625-22164974)
chr8 (13-369)||(32600142-32600498)
chr8 (20-369)||(22133475-22133824)
chr8 (13-369)||(21922162-21922518)
chr8 (13-369)||(21250940-21251295)
chr8 (13-369)||(21394292-21394648)
chr8 (13-369)||(21788785-21789141)
chr8 (13-369)||(23650039-23650395)
chr8 (13-369)||(17674450-17674806)
chr8 (13-357)||(19112700-19113044)
chr8 (60-369)||(22032030-22032339)
chr8 (13-369)||(20018177-20018533)
chr8 (13-369)||(19485297-19485653)
chr8 (13-369)||(22120601-22120957)
chr8 (13-369)||(22987199-22987555)
chr8 (26-354)||(20396565-20396893)
chr8 (128-369)||(15441179-15441420)
chr8 (94-369)||(23948887-23949162)
chr8 (13-220)||(22377880-22378087)
chr8 (13-220)||(22384055-22384262)
chr8 (26-369)||(21681910-21682253)
chr8 (33-368)||(6679110-6679445)
chr8 (61-351)||(20010375-20010665)
chr8 (68-333)||(20388133-20388398)
chr8 (26-369)||(23654925-23655268)
chr8 (26-351)||(21324849-21325175)
chr8 (62-351)||(1266255-1266544)
chr8 (33-369)||(22061880-22062216)
chr8 (62-368)||(804149-804455)
chr8 (61-351)||(19851427-19851717)
chr8 (61-351)||(19857463-19857753)
chr8 (26-351)||(20007866-20008191)
chr8 (33-368)||(6603657-6603992)
chr8 (33-368)||(14565141-14565476)
chr8 (26-369)||(21840415-21840758)
chr8 (32-351)||(31416920-31417239)
chr8 (95-369)||(16265127-16265401)
chr8 (33-333)||(31571289-31571589)
chr8 (33-354)||(29303873-29304194)
chr8 (35-129)||(23949158-23949252)
chr8 (92-368)||(28982356-28982632)
chr8 (92-368)||(28987576-28987852)
chr8 (157-368)||(27347225-27347436)
chr8 (33-354)||(12304771-12305092)
chr8 (33-210)||(20652780-20652957)
chr8 (44-210)||(21196960-21197126)
chr8 (26-212)||(22051018-22051204)
chr8 (47-210)||(22982593-22982756)
chr8 (13-91)||(18856853-18856931)
chr8 (13-63)||(22040163-22040213)
chr8 (47-210)||(21850798-21850961)
chr8 (47-210)||(16877556-16877719)
chr8 (24-207)||(24818054-24818237)
chr8 (24-194)||(22315364-22315534)
chr8 (337-369)||(22179309-22179341)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (13-369)||(65369-65724)
scaffold0042 (161-369)||(39924-40132)
scaffold0042 (13-113)||(39806-39906)
[»] chr4 (57 HSPs)
chr4 (13-369)||(16355169-16355525)
chr4 (13-369)||(16252169-16252525)
chr4 (13-369)||(12523608-12523964)
chr4 (13-369)||(14680499-14680855)
chr4 (23-336)||(15149740-15150053)
chr4 (20-369)||(18227177-18227526)
chr4 (13-369)||(7090365-7090720)
chr4 (26-369)||(14652240-14652583)
chr4 (20-369)||(14159424-14159773)
chr4 (13-357)||(23955691-23956035)
chr4 (13-357)||(18297149-18297493)
chr4 (13-369)||(19778517-19778873)
chr4 (13-357)||(8386356-8386700)
chr4 (13-369)||(14303702-14304057)
chr4 (13-369)||(27711268-27711624)
chr4 (13-357)||(12476544-12476888)
chr4 (13-369)||(14851090-14851446)
chr4 (13-357)||(29039128-29039472)
chr4 (20-369)||(40472972-40473321)
chr4 (13-369)||(14266623-14266979)
chr4 (13-369)||(8053347-8053703)
chr4 (104-357)||(15364330-15364583)
chr4 (181-369)||(14927151-14927339)
chr4 (26-351)||(15003361-15003686)
chr4 (13-164)||(16676427-16676578)
chr4 (33-368)||(3264798-3265133)
chr4 (33-368)||(11207235-11207570)
chr4 (26-351)||(16145862-16146187)
chr4 (26-354)||(15070360-15070688)
chr4 (33-368)||(29453541-29453876)
chr4 (20-157)||(1640156-1640293)
chr4 (26-369)||(15245856-15246199)
chr4 (68-201)||(15415065-15415198)
chr4 (33-354)||(44661870-44662191)
chr4 (35-354)||(33222865-33223184)
chr4 (61-351)||(1649309-1649599)
chr4 (33-354)||(20890930-20891250)
chr4 (282-369)||(18607823-18607910)
chr4 (33-333)||(51606185-51606485)
chr4 (26-240)||(15359087-15359301)
chr4 (168-333)||(42702871-42703036)
chr4 (47-210)||(13247736-13247899)
chr4 (47-210)||(14997407-14997570)
chr4 (24-194)||(12132404-12132574)
chr4 (172-314)||(18164332-18164474)
chr4 (33-210)||(27900477-27900654)
chr4 (47-208)||(55375376-55375537)
chr4 (62-229)||(16752665-16752832)
chr4 (47-210)||(16445230-16445393)
chr4 (24-232)||(9849473-9849681)
chr4 (47-210)||(9290926-9291089)
chr4 (47-210)||(15293175-15293338)
chr4 (276-351)||(15415226-15415301)
chr4 (26-111)||(15077825-15077910)
chr4 (281-369)||(15319515-15319603)
chr4 (337-369)||(15351934-15351966)
chr4 (23-126)||(8706093-8706196)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (13-369)||(639-995)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (13-369)||(14323-14679)
scaffold0044 (13-369)||(583-939)
[»] chr6 (67 HSPs)
chr6 (20-367)||(12497824-12498171)
chr6 (20-367)||(12510730-12511077)
chr6 (13-369)||(19864483-19864839)
chr6 (13-369)||(25765419-25765774)
chr6 (13-369)||(16963496-16963852)
chr6 (20-367)||(12505153-12505500)
chr6 (13-369)||(16927769-16928125)
chr6 (20-369)||(27331569-27331918)
chr6 (20-369)||(27392309-27392658)
chr6 (19-369)||(22078823-22079173)
chr6 (13-369)||(23078265-23078621)
chr6 (13-369)||(5839348-5839704)
chr6 (13-369)||(25609990-25610346)
chr6 (13-363)||(1543213-1543563)
chr6 (13-369)||(18408072-18408428)
chr6 (81-369)||(21833178-21833466)
chr6 (13-369)||(16626846-16627202)
chr6 (13-369)||(24313297-24313653)
chr6 (13-369)||(28263326-28263682)
chr6 (13-369)||(28342075-28342431)
chr6 (13-357)||(29592049-29592393)
chr6 (13-369)||(25112348-25112704)
chr6 (13-369)||(2874932-2875288)
chr6 (13-369)||(27187232-27187588)
chr6 (13-369)||(27261652-27262008)
chr6 (13-369)||(22762584-22762940)
chr6 (13-369)||(28292501-28292857)
chr6 (145-369)||(17032358-17032582)
chr6 (13-343)||(18197676-18198006)
chr6 (61-354)||(21471412-21471705)
chr6 (79-369)||(25750605-25750895)
chr6 (234-369)||(22433793-22433928)
chr6 (33-351)||(15459150-15459468)
chr6 (61-333)||(25768023-25768295)
chr6 (68-342)||(14131363-14131637)
chr6 (33-354)||(10468998-10469319)
chr6 (26-369)||(22796774-22797117)
chr6 (26-351)||(34645728-34646053)
chr6 (68-351)||(19879112-19879395)
chr6 (29-351)||(18794504-18794826)
chr6 (33-354)||(24364223-24364544)
chr6 (68-342)||(21564316-21564590)
chr6 (59-159)||(11291818-11291918)
chr6 (33-351)||(8766297-8766615)
chr6 (13-107)||(22433927-22434021)
chr6 (68-340)||(11287782-11288054)
chr6 (26-286)||(17415365-17415625)
chr6 (68-333)||(27560801-27561066)
chr6 (68-340)||(11280689-11280961)
chr6 (87-211)||(25750900-25751024)
chr6 (26-208)||(18800899-18801081)
chr6 (80-220)||(1640717-1640857)
chr6 (24-210)||(25743227-25743413)
chr6 (26-258)||(14381609-14381841)
chr6 (47-210)||(16098005-16098168)
chr6 (47-194)||(18571622-18571769)
chr6 (24-210)||(18838048-18838234)
chr6 (47-194)||(1648947-1649094)
chr6 (47-210)||(16382536-16382699)
chr6 (24-210)||(15078504-15078690)
chr6 (44-192)||(25655456-25655604)
chr6 (33-333)||(28282962-28283262)
chr6 (276-351)||(1640613-1640688)
chr6 (24-207)||(16233167-16233350)
chr6 (47-194)||(21413101-21413248)
chr6 (47-210)||(23996203-23996366)
chr6 (285-351)||(18787702-18787768)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (13-369)||(33560-33916)
scaffold0109 (13-369)||(8559-8915)
[»] chr7 (68 HSPs)
chr7 (20-369)||(15154652-15155001)
chr7 (23-369)||(17319-17665)
chr7 (13-369)||(12687422-12687778)
chr7 (13-369)||(11553095-11553451)
chr7 (13-369)||(14954541-14954897)
chr7 (13-369)||(8707526-8707882)
chr7 (18-369)||(14037728-14038079)
chr7 (18-369)||(14347758-14348109)
chr7 (13-357)||(8198561-8198905)
chr7 (13-369)||(10870916-10871272)
chr7 (13-369)||(14332318-14332674)
chr7 (13-369)||(15161050-15161406)
chr7 (13-369)||(11237206-11237562)
chr7 (13-369)||(18551751-18552107)
chr7 (13-369)||(18177663-18178019)
chr7 (13-357)||(44791344-44791688)
chr7 (19-369)||(23516768-23517118)
chr7 (13-369)||(13685984-13686341)
chr7 (24-369)||(15203800-15204145)
chr7 (26-303)||(15624539-15624816)
chr7 (27-369)||(15102586-15102928)
chr7 (68-351)||(12206826-12207109)
chr7 (26-351)||(19147151-19147476)
chr7 (26-351)||(20746550-20746875)
chr7 (33-351)||(8212119-8212437)
chr7 (62-369)||(14264264-14264571)
chr7 (33-368)||(11306254-11306589)
chr7 (33-368)||(49152224-49152559)
chr7 (18-354)||(21661900-21662233)
chr7 (18-186)||(35964848-35965016)
chr7 (32-351)||(16072284-16072603)
chr7 (26-333)||(16950455-16950762)
chr7 (26-351)||(11388412-11388736)
chr7 (26-351)||(13665493-13665813)
chr7 (13-111)||(9596236-9596334)
chr7 (23-137)||(11772244-11772358)
chr7 (26-372)||(6413430-6413776)
chr7 (33-333)||(18053944-18054244)
chr7 (62-369)||(14129795-14130102)
chr7 (26-333)||(14286360-14286667)
chr7 (62-369)||(14433613-14433920)
chr7 (33-354)||(12455640-12455960)
chr7 (33-354)||(13021294-13021615)
chr7 (80-333)||(23199781-23200034)
chr7 (80-333)||(23505908-23506161)
chr7 (47-194)||(14936443-14936590)
chr7 (308-369)||(12254326-12254387)
chr7 (26-333)||(1391-1698)
chr7 (47-210)||(12368603-12368766)
chr7 (62-333)||(26288057-26288327)
chr7 (24-210)||(4440008-4440194)
chr7 (47-210)||(7823980-7824143)
chr7 (222-333)||(15340454-15340565)
chr7 (47-194)||(15364036-15364183)
chr7 (47-210)||(27107801-27107964)
chr7 (24-210)||(21674537-21674723)
chr7 (33-247)||(26118596-26118810)
chr7 (276-354)||(26118818-26118896)
chr7 (242-351)||(15479338-15479447)
chr7 (33-194)||(45146652-45146812)
chr7 (87-201)||(41213-41327)
chr7 (25-63)||(5764720-5764758)
chr7 (24-109)||(17923862-17923947)
chr7 (50-190)||(17145288-17145428)
chr7 (61-130)||(12456940-12457009)
chr7 (166-194)||(13353247-13353275)
chr7 (337-369)||(13634038-13634070)
chr7 (95-195)||(20466877-20466977)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (13-369)||(64018-64374)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (13-369)||(17045071-17045427)
chr1 (13-369)||(20249797-20250153)
chr1 (13-369)||(19106314-19106670)
chr1 (20-369)||(50620307-50620656)
chr1 (13-369)||(20136725-20137081)
chr1 (13-369)||(21747482-21747837)
chr1 (13-369)||(16350655-16351011)
chr1 (13-369)||(33391085-33391441)
chr1 (13-369)||(16078708-16079045)
chr1 (13-369)||(51333549-51333905)
chr1 (13-369)||(21830250-21830606)
chr1 (26-369)||(19760935-19761278)
chr1 (13-369)||(21836897-21837253)
chr1 (13-346)||(16369267-16369600)
chr1 (13-369)||(41354525-41354881)
chr1 (143-369)||(50612602-50612828)
chr1 (26-351)||(19664945-19665270)
chr1 (215-369)||(21163227-21163381)
chr1 (41-333)||(20940147-20940439)
chr1 (33-368)||(37677027-37677363)
chr1 (35-351)||(20856839-20857155)
chr1 (26-351)||(19854279-19854604)
chr1 (61-354)||(31550285-31550578)
chr1 (62-354)||(20294374-20294666)
chr1 (33-369)||(22433192-22433528)
chr1 (26-237)||(41307904-41308115)
chr1 (33-354)||(20075135-20075456)
chr1 (61-232)||(11382678-11382849)
chr1 (79-333)||(20244183-20244437)
chr1 (158-368)||(20395194-20395404)
chr1 (26-303)||(20835957-20836237)
chr1 (47-210)||(20831482-20831645)
chr1 (276-369)||(24476927-24477020)
chr1 (24-210)||(20914316-20914502)
chr1 (80-210)||(46518827-46518957)
chr1 (148-210)||(22142232-22142294)
chr1 (42-134)||(20184364-20184456)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (13-369)||(5977-6333)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (13-369)||(4392-4748)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (13-369)||(180180-180536)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (13-369)||(127186-127542)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (13-369)||(219404-219760)
scaffold0012 (13-369)||(229006-229362)
scaffold0012 (47-210)||(33016-33179)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (13-369)||(810-1165)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (18-369)||(32744-33095)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (13-369)||(681-1036)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (27-369)||(16950-17292)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (21-369)||(5986-6334)
scaffold0120 (26-333)||(1524-1831)
scaffold0120 (24-210)||(22816-23002)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (13-369)||(6335-6691)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (13-369)||(5184-5540)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (19-369)||(1102-1452)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (13-369)||(14840-15196)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (13-363)||(109798-110148)
scaffold0029 (68-369)||(96044-96345)
scaffold0029 (68-351)||(112540-112823)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (13-363)||(43123-43473)
scaffold0028 (20-369)||(8448-8797)
scaffold0028 (32-164)||(13834-13966)
scaffold0028 (68-342)||(50556-50830)
scaffold0028 (47-210)||(106594-106757)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (20-369)||(7340-7689)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (20-369)||(15456-15804)
scaffold0333 (20-155)||(15832-15967)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (68-369)||(27930-28231)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (13-369)||(9306-9662)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (23-369)||(16462-16808)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (13-369)||(377-733)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (49-369)||(162076-162396)
scaffold0001 (18-369)||(448022-448373)
scaffold0001 (26-333)||(90932-91239)
scaffold0001 (87-210)||(78690-78813)
scaffold0001 (168-243)||(175352-175427)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (23-357)||(26530-26864)
scaffold0011 (26-369)||(195703-196045)
scaffold0011 (62-351)||(148551-148840)
scaffold0011 (168-369)||(68582-68783)
scaffold0011 (47-210)||(121971-122134)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (13-369)||(3995-4351)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (70-369)||(26-325)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (26-369)||(15079-15422)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (21-369)||(14002-14350)
scaffold0106 (42-369)||(31373-31700)
scaffold0106 (13-114)||(17660-17761)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (29-357)||(3115-3443)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (26-369)||(111984-112327)
scaffold0004 (61-369)||(203503-203811)
scaffold0004 (26-333)||(322703-323010)
scaffold0004 (33-354)||(385797-386118)
scaffold0004 (26-368)||(117532-117874)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (13-369)||(6900-7258)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (29-369)||(968-1307)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (18-356)||(252-590)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (20-315)||(49510-49805)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (23-333)||(1-311)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (13-267)||(7855-8109)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (26-354)||(116905-117233)
scaffold0037 (47-210)||(98137-98300)
scaffold0037 (146-210)||(23586-23650)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (18-369)||(12969-13320)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (18-369)||(16408-16759)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (13-267)||(21932-22186)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (147-369)||(16920-17142)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (26-354)||(25719-26047)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (26-354)||(886-1214)
[»] scaffold0507 (3 HSPs)
scaffold0507 (18-255)||(9047-9284)
scaffold0507 (276-369)||(6940-7033)
scaffold0507 (44-210)||(351-517)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (21-207)||(7522-7708)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (13-231)||(767-985)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (18-354)||(86496-86832)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (23-354)||(5588-5918)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (23-354)||(25068-25399)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (26-342)||(26132-26448)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (68-351)||(10781-11064)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (26-369)||(13901-14244)
scaffold0034 (33-297)||(4960-5224)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (26-333)||(47123-47430)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (26-351)||(27500-27825)
scaffold0139 (26-369)||(1149-1491)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (26-333)||(3874-4181)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (26-369)||(18537-18880)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (26-333)||(2750-3057)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (83-333)||(28826-29076)
scaffold0064 (83-333)||(40817-41067)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (26-351)||(79-404)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (61-342)||(7071-7352)
[»] scaffold0058 (4 HSPs)
scaffold0058 (63-288)||(58443-58668)
scaffold0058 (33-332)||(19120-19419)
scaffold0058 (296-354)||(59042-59100)
scaffold0058 (92-194)||(74038-74140)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (26-369)||(9761-10099)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (26-369)||(14049-14391)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (61-333)||(5949-6220)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (62-342)||(19973-20253)
scaffold0298 (27-369)||(13362-13704)
scaffold0298 (27-369)||(17132-17474)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (26-342)||(21671-21987)
scaffold0235 (47-134)||(26004-26091)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (32-351)||(3872-4191)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (26-369)||(39702-40045)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (26-333)||(51863-52170)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (26-333)||(37201-37508)
scaffold0026 (32-237)||(38180-38385)
scaffold0026 (61-237)||(27372-27548)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (33-351)||(10090-10408)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (26-351)||(18830-19155)
scaffold0090 (26-247)||(23096-23317)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (26-322)||(4760-5056)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (168-303)||(4567-4702)
scaffold0023 (254-369)||(36974-37089)
scaffold0023 (13-132)||(4441-4560)
scaffold0023 (281-333)||(18993-19045)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (26-369)||(42333-42676)
scaffold0010 (26-369)||(47399-47742)
scaffold0010 (152-230)||(2252-2330)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (61-342)||(1204-1485)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (26-351)||(27207-27531)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (26-333)||(5002-5309)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (32-351)||(14257-14576)
scaffold0203 (188-351)||(9039-9202)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (33-351)||(49214-49532)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (68-351)||(172-455)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (33-351)||(6164-6483)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (32-351)||(25871-26190)
scaffold0113 (62-354)||(16654-16946)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (26-369)||(49033-49376)
scaffold0053 (62-369)||(57853-58159)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (124-342)||(1167-1385)
scaffold0165 (318-369)||(26213-26264)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (27-369)||(10851-11193)
scaffold0124 (27-342)||(400-715)
scaffold0124 (47-210)||(7831-7994)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (33-354)||(26239-26560)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (26-333)||(12781-13088)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (44-351)||(20103-20410)
scaffold0114 (33-366)||(43471-43804)
scaffold0114 (33-366)||(44483-44816)
scaffold0114 (168-351)||(36036-36219)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (68-351)||(509-792)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (81-368)||(38942-39229)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (61-354)||(16748-17041)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (33-369)||(61220-61556)
scaffold0067 (33-369)||(52186-52522)
scaffold0067 (33-333)||(67608-67908)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (33-333)||(248612-248912)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (68-342)||(33719-33993)
scaffold0076 (47-210)||(40380-40543)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (13-117)||(3706-3810)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (122-369)||(4235-4482)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (173-369)||(136082-136278)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (79-210)||(1916-2047)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (276-367)||(6238-6329)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (183-333)||(2023-2173)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (24-194)||(14661-14831)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (26-333)||(7238-7543)
[»] scaffold0551 (1 HSPs)
scaffold0551 (24-210)||(8217-8403)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (33-331)||(42784-43082)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (47-208)||(23518-23679)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (308-369)||(7498-7559)
scaffold0101 (41-117)||(5467-5543)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (153-333)||(13380-13560)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (47-210)||(3896-4059)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (26-201)||(1-176)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (47-210)||(28287-28450)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (47-210)||(46276-46439)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (24-210)||(14779-14965)
scaffold0132 (24-133)||(43737-43846)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (13-74)||(12745-12806)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (26-232)||(5313-5519)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (47-210)||(3281-3444)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (47-210)||(14758-14921)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (80-210)||(964-1094)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (24-194)||(1052-1222)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (24-210)||(13030-13216)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (33-210)||(393-570)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (33-137)||(1241-1345)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (24-194)||(8889-9059)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (24-194)||(9125-9295)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (26-114)||(3355-3443)
scaffold0222 (276-369)||(3518-3611)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (234-342)||(45835-45943)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (47-134)||(26178-26265)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (87-210)||(24002-24125)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (80-194)||(10493-10607)
scaffold0447 (80-194)||(5879-5993)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (47-194)||(3965-4112)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (80-194)||(8488-8602)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (24-134)||(1422-1532)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (24-109)||(71442-71527)
scaffold0021 (24-186)||(13397-13559)
[»] scaffold1508 (1 HSPs)
scaffold1508 (276-351)||(887-962)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (282-369)||(9182-9269)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 62)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 12498155 - 12497799
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498155 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 12498056  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498055 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 12497956  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12497955 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgt 12497856  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12497855 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 12497799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Original strand, 14876729 - 14877078
Alignment:
Q  20 gagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 119  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876729 gagattgttcagcagactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 14876828  T
Q  120 atcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 219  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876829 accttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagttactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 14876928  T
Q  220 tagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaa 319  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  14876929 tggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagttggattaccactgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaa 14877028  T
Q  320 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14877029 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 14877078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16371320 - 16370964
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371320 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 16371221  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371220 aggaaagatcttgaatttcaagaagaagactacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggatgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 16371121  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  16371120 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttgggacggtggcgtattgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgtcgttttccatgt 16371021  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371020 gtcgcaacttcggaagtatgttctagatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 16370964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9522626 - 9522270
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9522626 aggaccagagattgttcaacaaactactgagaaggttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgt 9522527  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9522526 agaaaagatcttgactttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccga 9522427  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||    
T  9522426 gatttattggtccgtatcagatatcaaaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgtgtttcatgt 9522327  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  9522326 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 9522270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 17489757 - 17489401
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489757 aggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 17489658  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489657 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 17489558  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  17489557 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcacctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 17489458  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17489457 gtcgcaacttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 17489401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 16492404 - 16492760
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16492404 aggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 16492503  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16492504 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttaaagtcaaagaagttgactccga 16492603  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  16492604 gatttattggtctgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaattttcacgatgtgtttcatgt 16492703  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16492704 gtcgcaacttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 16492760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 16807149 - 16807505
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||| |||| |||||||||||||||     
T  16807149 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaaaatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcgacagaagaattatcatgataagcgc 16807248  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16807249 agaaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggatgtgctttgaagtcaaagaagttgactctga 16807348  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    ||||| |  ||||||||||| ||||  ||| | || ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  16807349 gatttttcggtccgtatcagatatcgaaaaaatttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaacttgcacgatgttttccatgt 16807448  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16807449 gtcgcaacttcggaattatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 16807505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16692060 - 16691711
Alignment:
Q  20 gagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || |    
T  16692060 gagattgttcagcagactactgaaaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgcaagaagg 16691961  T
Q  120 atcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 219  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16691960 atcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 16691861  T
Q  220 tagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaa 319  Q
    | |  |||||||  |||| ||||| ||| |||||||||| || || || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16691860 tgggtcgtatcaaatatcggaaagggttggaacggtggcatatcgtgtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcacaa 16691761  T
Q  320 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16691760 cttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 16691711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10906117 - 10905773
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10906117 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 10906018  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10906017 agaaaagatcttgaatttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 10905918  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  10905917 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 10905818  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10905817 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 10905773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 369
Target Start/End: Original strand, 15348476 - 15348824
Alignment:
Q  21 agattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 120  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15348476 agattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 15348575  T
Q  121 tcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 220  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||    
T  15348576 tcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcatt 15348675  T
Q  221 agtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaac 320  Q
     ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||  | || ||||||||||| ||||    
T  15348676 ggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaac 15348775  T
Q  321 ttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  15348776 ttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 15348824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10005507 - 10005163
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10005507 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 10005408  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10005407 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 10005308  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  10005307 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 10005208  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10005207 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 10005163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 48425348 - 48425010
Alignment:
Q  19 agagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaa 118  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48425348 agagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaa 48425249  T
Q  119 gatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 218  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  48425248 gatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 48425149  T
Q  219 ttagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcaca 318  Q
    || ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||||| ||    
T  48425148 ttggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgca 48425049  T
Q  319 acttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48425048 acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 48425010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 13252597 - 13252253
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13252597 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgt 13252498  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13252497 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 13252398  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  13252397 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 13252298  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13252297 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 13252253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15208798 - 15208442
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15208798 aggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgataagcgt 15208699  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || ||| |  ||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  15208698 aggaaaaacattgagtttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtaaaagaagttgactccga 15208599  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    | |||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||| ||||| || |||  |||||||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  15208598 ggtttattggtccgaatcagatatcagaaagaattggaacggtggagtatcgagtgggtttacaaccgcatctttcgaattttcacgatgtgtttcatgt 15208499  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15208498 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagagatgatgt 15208442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Original strand, 15589615 - 15589959
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15589615 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 15589714  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15589715 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 15589814  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  15589815 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 15589914  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15589915 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 15589959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16635680 - 16635336
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16635680 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 16635581  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16635580 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 16635481  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | || |||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  16635480 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 16635381  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16635380 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 16635336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 43163004 - 43162660
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43163004 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 43162905  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43162904 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 43162805  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | || |||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  43162804 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 43162705  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43162704 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 43162660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 15402733 - 15403089
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15402733 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgt 15402832  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15402833 agaaaagattttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggcgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 15402932  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  |||||| || |||||||||| |||||||| || ||| | || |||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  15402933 tgttcattggtccgtatcagatattggaaagaattggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 15403032  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15403033 gtcgcaacttcgaaagtatgttccagatccatctcatgtaatccagagtgacgatgt 15403089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 15725157 - 15725512
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| ||||| |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15725157 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaa-ttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgt 15725255  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15725256 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttttttagagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccga 15725355  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      |||||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  15725356 agtttattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 15725455  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15725456 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgacgatgt 15725512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 16412505 - 16412861
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16412505 aggaccagagattgttcagcaaactactaagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagttggcaaaagagttatcatgataagcgt 16412604  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || || || ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16412605 aggaatgaccttgagtttcatgaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 16412704  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |  | || ||||||||    
T  16412705 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttggacaacgttttccatgt 16412804  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16412805 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaatccagagtgacgatgt 16412861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Original strand, 20062277 - 20062621
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062277 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 20062376  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20062377 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggcgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 20062476  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  20062477 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 20062576  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20062577 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 20062621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 53385241 - 53385597
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53385241 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 53385340  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  53385341 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaaaaagttgaccccga 53385440  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| |||| |||||| | |  ||||||||| | |||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  53385441 agttcattggtccatatcagattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 53385540  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  53385541 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagcgacgatgt 53385597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Original strand, 26792622 - 26792971
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26792622 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 26792721  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26792722 aggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttaagagtcactcctatgactagtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 26792821  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| ||||| |||| |||||||| |  ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  26792822 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacgatggcttaccgagtggatttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 26792921  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtg 362  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26792922 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtg 26792971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 5425153 - 5425508
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5425153 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 5425252  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5425253 agaaaagaccttgaatttcaggaaggagaccacgtgcttt-gagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 5425351  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  5425352 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 5425451  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  5425452 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 5425508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15339176 - 15338820
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| |||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15339176 aggaccagagattgttcatcaaactactgagaaggttcagatgatccaagagcaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgt 15339077  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15339076 agaaaagatcttgagttttaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggcgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 15338977  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  |||||| || ||||||| || |||||||| || ||| | || |||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  15338976 agttcattggtccgtatcagatattggaaagaattggaacggtagcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 15338877  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15338876 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccagagtgacgatgt 15338820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 6600654 - 6600298
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6600654 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 6600555  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||| ||  | |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6600554 agaaaagatcttgaattcaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 6600455  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| |||| |||||| | |  |||| |||| | |||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  6600454 agttcattggtccatatcagattttggaaaaagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 6600355  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  6600354 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 6600298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 16756808 - 16757164
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16756808 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgt 16756907  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||| ||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16756908 agaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacatgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgaccccga 16757007  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| |||| |||||  | |  ||||||||| | |||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  16757008 agttcattggtccatatcatattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 16757107  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  16757108 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtcattcagagtgacgatgt 16757164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15248054 - 15247725
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15248054 aggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttatcatgataagcgt 15247955  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || ||| |   |||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15247954 aggaaaaacaatgagtttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgactccga 15247855  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    | | |||| |||||||| || |||| |||||| || ||||||||||||| ||||| || |||  ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  15247854 ggtgtattggtccgtattagatatcggaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttacaaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 15247755  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatcc 342  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15247754 gtcgcaacttcggaaatatgttctggatcc 15247725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 68 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15227511 - 15227228
Alignment:
Q  68 atgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 167  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  15227511 atgaaagtgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctg 15227412  T
Q  168 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagt 267  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||  |||||| ||||||| ||| |||| || |||||| |||| ||||| ||  ||||    
T  15227411 tgacaggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgacgccgaagtttattggtccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggcatatagagt 15227312  T
Q  268 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
     || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  15227311 gggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 15227228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 68 - 342
Target Start/End: Original strand, 13972387 - 13972661
Alignment:
Q  68 atgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 167  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||| |     
T  13972387 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactccta 13972486  T
Q  168 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagt 267  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| | |||||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  13972487 tgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagt 13972586  T
Q  268 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatcc 342  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||    
T  13972587 tggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatgtaccggatcc 13972661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 333
Target Start/End: Original strand, 15953193 - 15953500
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  15953193 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttg 15953292  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | ||| || || ||| ||||| | |||| | |||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||| || |    
T  15953293 agtttcaagagggagatcatgtatttctgagatttactcctatgacgggtgtacgacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggttc 15953392  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| |||| || || ||| |||| ||||| |||  ||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  15953393 gtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacaaagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 15953492  T
Q  326 aagtatgt 333  Q
    ||||||||    
T  15953493 aagtatgt 15953500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 47123841 - 47123506
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   |||||| |||||||  | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  47123841 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgaatttca 47123742  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| |||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  47123741 ggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgttggacgggctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 47123642  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| |||||| | || ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||||| |||||    
T  47123641 atttcagagagagttggtactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaggtatg 47123542  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 368  Q
    || ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  47123541 ttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 47123506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 351
Target Start/End: Original strand, 13322877 - 13323202
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||  ||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  13322877 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcatagaaaggatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaagatcttg 13322976  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
     |||||| || | |||||| |||||| ||||||| |||| | |||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||| ||||    
T  13322977 ggtttcaggagggagaccatgtgtttctgagagttactcctatgacgggggtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtcc 13323076  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| |||  || ||  || |||| ||||| ||  |  |||| ||  |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||    
T  13323077 gtatcagatattggagaggattggaacagtggcatataggattggttttccaccacatctttcgaatttgcatggtgtattccatgtgtcgcagcttcgg 13323176  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  13323177 aagtatgtagcggatccgtcgcatgt 13323202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 10383866 - 10383531
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   |||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10383866 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 10383767  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||| | ||| ||| |||||||||||    
T  10383766 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgtcggtcgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaaattcattggtccgtatcag 10383667  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| |||||| | || ||||| ||  ||||||| ||  |||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  10383666 atttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacacctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 10383567  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 368  Q
    || ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  10383566 ttgcggatccttctcatgtgatcccgagggatgatg 10383531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14571752 - 14571409
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||||||   |||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||| | ||| |||||||| || |  ||||    
T  14571752 gttcatcagaccacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgactgaagagttaccgtgacaagcgtaggaaggcccttg 14571653  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | ||| || |||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  |||||| ||||    
T  14571652 agtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaatttgactcctaagtttattggtcc 14571553  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
     |||||| |||| || || ||| |||| ||||| ||  |||| || ||  ||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |    
T  14571552 ttatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggcttgccaccatatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcag 14571453  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||| ||  ||||||| || ||||| |||| ||| ||||||||    
T  14571452 aagtacgtagcggatccttcgcatgttatcccgagagatgatgt 14571409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 303
Target Start/End: Original strand, 12850539 - 12850781
Alignment:
Q  61 agaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtc 160  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| |  |||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||    
T  12850539 agaaaagatgaaagtgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaataaaggcccttgagtttcaagaggaagatcatgtgtttctgagagtc 12850638  T
Q  161 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgt 260  Q
    |||| |||||| ||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| || ||| |||| || |||||| |||| ||||| |    
T  12850639 actcctgtgacgggtataggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccataccagatatctgagagagttggaacagtggcat 12850738  T
Q  261 accgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 303  Q
    || |||| || ||  |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12850739 acagagtgggtttgccaccacatctttggaatttgcatgatgt 12850781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 15015967 - 15016184
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||   || || ||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15015967 aggaccagaaattgttcaacaaactacagagaaggttaagttgattagggagaagatgaaagcgtctcagagtagacaaaagagttatcatgataagcgt 15016066  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||  | ||||| |||||  | |||||||    
T  15016067 aggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgaccggtgttggatgagcactaaagtcgaagaaactaactccga 15016166  T
Q  213 gatttattagtccgtatc 230  Q
    | ||||||  ||||||||    
T  15016167 ggtttattgctccgtatc 15016184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 351
Target Start/End: Original strand, 18134571 - 18134896
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || |||||   ||| || ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  18134571 gttcatcagactacagataaagtcaaaatgatcggagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 18134670  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    ||||||| || |  || |  || ||| ||||||| |||| | |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| ||||    
T  18134671 agtttcaggagggtgatcttgtatttctgagagttactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 18134770  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| | ||||| || ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  18134771 gtatcagatttcagagagggttggaacagtggcttatagagttggtttgccaccacatctttcaaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 18134870  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  18134871 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 18134896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 41 - 369
Target Start/End: Original strand, 10420285 - 10420613
Alignment:
Q  41 gagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaag 140  Q
    |||||||| | |||||||  ||| || ||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||  |    
T  10420285 gagaaagtcaggatgattagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctaccatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtg 10420384  T
Q  141 accacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcaga 240  Q
    | || || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| |||| |||||| | |||||    
T  10420385 atcatgtttttctgagggttactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttatcagatttcaga 10420484  T
Q  241 aagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggat 340  Q
    ||||||  |||| ||||||||  || |||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||  | ||||||||||| || |||    
T  10420485 aagagtcggaactgtggcgtatagaattggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatgtacctgat 10420584  T
Q  341 ccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    || || ||||| || | ||| ||||||||    
T  10420585 ccttcacatgttattccgagagatgatgt 10420613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 80 - 354
Target Start/End: Original strand, 16329938 - 16330212
Alignment:
Q  80 cagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttg 179  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| | |||||||||||| || |  || || || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||    
T  16329938 cagagtcgacataagagttaccatgacaagcaaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacaggtgttg 16330037  T
Q  180 gacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcacc 279  Q
    ||||||| |||||||| | | |||||||||| |  || ||  ||||||||||| | ||||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  ||||    
T  16330038 gacgtgcattgaagtcgaggtagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggaacagtggcatatagagttggtttgccacc 16330137  T
Q  280 gcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 354  Q
     ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  16330138 acatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtggcggatccttcgcatgtgat 16330212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 333
Target Start/End: Original strand, 8759314 - 8759614
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||   ||| || ||||||| ||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  8759314 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 8759413  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
    ||| |  || || || ||| | ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  8759414 agagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcag 8759513  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| ||| |  |||||||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||    
T  8759514 atttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaactgcggaagtatg 8759613  T
Q  333 t 333  Q
    |    
T  8759614 t 8759614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 13941921 - 13941621
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||   ||| || ||||||| ||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  13941921 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 13941822  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
    ||| |  || || || ||| | ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  13941821 agagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtccgtatcag 13941722  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| ||| |  |||||||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  13941721 atttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatg 13941622  T
Q  333 t 333  Q
    |    
T  13941621 t 13941621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 41177419 - 41177119
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||   ||| || ||||||| ||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  41177419 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 41177320  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
    ||| |  || || || ||| | ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  41177319 agagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtccgtatcag 41177220  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| ||| |  |||||||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  41177219 atttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatg 41177120  T
Q  333 t 333  Q
    |    
T  41177119 t 41177119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 369
Target Start/End: Original strand, 11303999 - 11304341
Alignment:
Q  27 ttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttga 126  Q
    |||| ||| |||| ||||| || ||||||||   |||||| ||||||| || ||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||  || | ||||||    
T  11303999 ttcatcaggctacggagaaggtaaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcaaagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtatgaaggctcttga 11304098  T
Q  127 gtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccg 226  Q
    ||||||||| |  || || || ||| |||||||    | | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| |||||    
T  11304099 gtttcaagagggtgatcatgtatttctgagagttttccctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccg 11304198  T
Q  227 tatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgga 326  Q
    |||||| ||||||| || ||| |||  ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||| ||||||| ||    
T  11304199 tatcagatatcagagagggttggaatagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcttgtgtcgcaacttcaga 11304298  T
Q  327 agtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||  ||||||| || ||||| || |  |||||||||||    
T  11304299 agtatgtagcggatccttcgcatgttattcctagtgatgatgt 11304341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 68 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14086535 - 14086261
Alignment:
Q  68 atgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 167  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||| |     
T  14086535 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactccta 14086436  T
Q  168 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagt 267  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  |||||| | || |||||| |||| || |||||  | || ||||| ||  | ||    
T  14086435 tgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctgagagagtcgggacagtggcttatagggt 14086336  T
Q  268 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatcc 342  Q
     || ||  | || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||  | ||||||||||| ||||||||    
T  14086335 gggtttgccccctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccacgtgtcgcagttgcggaagtatgtaccggatcc 14086261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 351
Target Start/End: Original strand, 12360775 - 12361092
Alignment:
Q  34 gactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaa 133  Q
    |||||| |||||||| ||||||||    ||||| ||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||     
T  12360775 gactacagagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcag 12360874  T
Q  134 gaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagt 233  Q
    || |  || || || ||| ||||||| |||  | ||||  |||| |||||||| ||||| || | |||||||||||| |  || ||| |||||||||||     
T  12360875 gagggtgatcatgtatttctgagagttacttctatgacatgtgtaggacgtgcattgaaatcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcaga 12360974  T
Q  234 tatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgt 333  Q
    | ||||| |  ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||    
T  12360975 tttcagagaaggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgt 12361074  T
Q  334 tccggatccatctcatgt 351  Q
      ||||||| || |||||    
T  12361075 agcggatccttcgcatgt 12361092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 354
Target Start/End: Original strand, 11961312 - 11961587
Alignment:
Q  79 gcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgtt 178  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || | |||||||||||| || |  || || || ||| |||| ||||||| | ||||  ||||     
T  11961312 gcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgagtgta 11961411  T
Q  179 ggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcac 278  Q
     ||||||| |||||||| | ||| |||||||| |  || ||| ||||||||||| | ||||| |||||| |||  ||||| ||  ||||||  ||  | |    
T  11961412 cgacgtgcattgaagtcgaggaaattgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaatagtggcttatagagttgatttgcccc 11961511  T
Q  279 cgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  11961512 cacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcacatgtgat 11961587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18748571 - 18748401
Alignment:
Q  24 ttgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 123  Q
    |||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | || ||  |  |    
T  18748571 ttgtgcaagagactacggaaaaagttaagatgattcaagataagatgaaagtgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaagaacat 18748472  T
Q  124 tgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 194  Q
    |||||||||||  |  || || |||||||| ||||| |  | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18748471 tgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttaagagtgaaccctgtaactggtgttggacgtgctttgaagt 18748401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 227 - 369
Target Start/End: Original strand, 31689049 - 31689191
Alignment:
Q  227 tatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgga 326  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  31689049 tatcagatatcagaaagggttggaacagtggcatatagagttggtttgacaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgga 31689148  T
Q  327 agtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  31689149 agtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 31689191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31945177 - 31945033
Alignment:
Q  225 cgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcg 324  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| ||   |||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  31945177 cgtatcagatatcagaaagggttggaacagtggcatataaagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcg 31945078  T
Q  325 gaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  31945077 gaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 31945033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 44777144 - 44776808
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||   ||| || ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| ||| | || || |  |||||||| ||    
T  44777144 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagaggaggaaggcccttgagttcca 44777045  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
    ||| |  || || || ||| | ||||||||||   |||| ||||| |||||||||||||| || | |||||| |||||||  || ||| | |||||||||    
T  44777044 agagggtgatcatgtatttctaagagtcactccgatgacaggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttaactccgaagttcattggcccgtatcag 44776945  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| ||  |  |||||||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||  | ||||||||||    
T  44776944 atttcagagaggatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacagttgcggaagtatg 44776845  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  44776844 tagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 44776808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Original strand, 8274656 - 8274819
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    |||||||||||||| || || ||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  |  || || |    
T  8274656 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 8274755  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    |||||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  8274756 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 8274819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 333
Target Start/End: Original strand, 16381197 - 16381459
Alignment:
Q  68 atgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 167  Q
    ||||||| || ||||||||||||   |||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||  || |  || || || ||||| ||||| ||||       
T  16381197 atgaaagcgtcgcagagtcgaca---gagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcgggatggtgatcatgtatttttaagagttactccga 16381293  T
Q  168 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagt 267  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||| ||||||||||| | ||||| ||  || | |||||||| ||  ||||    
T  16381294 tgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagaggattgggacggtggcatatagagt 16381393  T
Q  268 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgt 333  Q
    ||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||    
T  16381394 tggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacagcttcggaaatatgt 16381459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Original strand, 16742937 - 16743123
Alignment:
Q  24 ttgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 123  Q
    |||| ||| ||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |    
T  16742937 ttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatat 16743036  T
Q  124 tgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    ||||| |||||  |  || || ||||||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  16743037 tgagtgtcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 16743123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 342
Target Start/End: Original strand, 16836742 - 16837045
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    |||| |||||||| || ||||||||    ||||| ||||||| ||  ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |  |||||||||||    
T  16836742 agacgactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttca 16836841  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||||||||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  16836842 ggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcag 16836941  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| ||  || |||||||| | ||  ||||||| ||  |||| || |      | ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  16836942 atttcagagaggattggaacggtgacatatagagttggtttgccaccacacc------acttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatg 16837035  T
Q  333 ttccggatcc 342  Q
    |  |||||||    
T  16837036 tagcggatcc 16837045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15576647 - 15576470
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| | ||  |||||| |||| ||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  15576647 agactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 15576548  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
     |  |  || || ||||||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  15576547 ggttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 15576470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 47 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 17192977 - 17192892
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  17192977 gttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 17192892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Original strand, 13975302 - 13975465
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |  |  |||||| |||| ||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  |  || || |    
T  13975302 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcatctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 13975401  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    |||||||||| || | || |||||| || ||||| |||| ||||||||  | ||||||||||||    
T  13975402 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgttttgaagtgtaggaagttgactcc 13975465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 210
Target Start/End: Original strand, 6153141 - 6153259
Alignment:
Q  92 aagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttga 191  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||| || |||||||||  |  || || |||||| ||||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  6153141 aagagttatcatgataagaggagaaaggatattaagtttcaagttggtgatcatgtgtttctgagagtgaatcatgtgaccggtgtcggtcgtgctttga 6153240  T
Q  192 agtcaaagaagttgactcc 210  Q
    |||  |  |||||||||||    
T  6153241 agtgcagaaagttgactcc 6153259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21686862 - 21686681
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||| ||||| ||| ||||||| || || ||||||||| |||| ||||| ||||||| ||  || |||    | |||||||||||| ||||| |     
T  21686862 aggaccagaaattgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgtttcaggaaaagatgaaagagtctcaaagtaagaagaagagttatcattataagagg 21686763  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 194  Q
    ||||||||| || |||||||||  |  || || || ||||| ||||| | |||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  21686762 agaaaagatattcagtttcaagttggtgatcatgtattttttagagtgaatcatgtaaccgatgttggacgtgctttgaagt 21686681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 317 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 320835 - 320781
Alignment:
Q  317 caacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgtcca 372  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||    
T  320835 caacttcggaagtatgctccggatccatctc-cgtgatccaaagagatgatgtcca 320781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 71
Target Start/End: Original strand, 14183145 - 14183193
Alignment:
Q  23 attgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatga 71  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  14183145 attgttcagcagactattgagaaggttaagatgattcaggaaaagatga 14183193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 53)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 24675408 - 24675052
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24675408 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 24675309  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24675308 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcacccctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 24675209  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  24675208 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagttggattaccaccgcatcttttgaatttgcatgatgtctttcatgt 24675109  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24675108 gtcgcaacttcggaagtatgttccagatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 24675052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 21325790 - 21326146
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21325790 aggaccagagattgttcaacaaaccactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 21325889  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21325890 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccga 21325989  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21325990 gatttattagtccgtatcagatatcggaaagagttgggacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtttttcatgt 21326089  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21326090 gtcgcaacttcagaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 21326146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 22756987 - 22757343
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22756987 aggaccagagattgttcaacagattactgagaaagttaaggtgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 22757086  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22757087 aggaaagatcttgagtttcaagaaagagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaaatcaaagaagttgactccga 22757186  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22757187 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctttcatgt 22757286  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22757287 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 22757343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 24708006 - 24708362
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  24708006 aggaccagaaattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagaaatatcatgataagcgc 24708105  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24708106 aggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccta 24708205  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    ||||| || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24708206 gattttttggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgacgttttccatgt 24708305  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24708306 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtgatccacagtgatgatgt 24708362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23188927 - 23188571
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||   ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23188927 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaggttaaatagattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 23188828  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || ||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23188827 aggaaagatcttgagtgtcaggaaggagaccacatgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccaa 23188728  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23188727 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacgatggcgtatcgagtgagattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgt 23188628  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23188627 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 23188571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 58 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23138911 - 23138600
Alignment:
Q  58 tcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgaga 157  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  23138911 tcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtacgaaagacctcgagtttcaagaaggagaccaggtatttttgaga 23138812  T
Q  158 gtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtgg 257  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23138811 gtcactcttgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtgg 23138712  T
Q  258 cgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
    | || ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23138711 catatcgagtaggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatggtgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 23138612  T
Q  358 gagtgatgatgt 369  Q
     |||||||||||    
T  23138611 aagtgatgatgt 23138600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 58 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23550701 - 23550390
Alignment:
Q  58 tcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgaga 157  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  23550701 tcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtacgaaagacctcgagtttcaagaaggagaccaggtatttttgaga 23550602  T
Q  158 gtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtgg 257  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23550601 gtcactcttgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtgg 23550502  T
Q  258 cgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
    | || ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23550501 catatcgagtaggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatggtgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 23550402  T
Q  358 gagtgatgatgt 369  Q
     |||||||||||    
T  23550401 aagtgatgatgt 23550390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16925179 - 16924835
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925179 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 16925080  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16925079 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 16924980  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  16924979 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 16924880  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16924879 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 16924835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16998919 - 16998575
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16998919 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 16998820  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16998819 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 16998720  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  16998719 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 16998620  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16998619 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 16998575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23063996 - 23063664
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  23063996 aggaccagagattgttgaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtagacaaaagagttaccatgataagcgt 23063897  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23063896 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgttttttttagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 23063797  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  23063796 gatttattggtccgtttcagatatctgaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcacctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 23063697  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatc 345  Q
    ||| ||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  23063696 gtcgcaacttcagaagtatgtaccagatccatc 23063664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16982071 - 16981727
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16982071 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 16981972  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16981971 agaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 16981872  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  16981871 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 16981772  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16981771 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 16981727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 17063636 - 17063292
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17063636 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 17063537  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17063536 agaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 17063437  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  17063436 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 17063337  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17063336 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 17063292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 24709952 - 24709596
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24709952 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 24709853  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24709852 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 24709753  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| |||||||| || |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| |||||||| |  | || ||||||||    
T  24709752 agttcattggtccgtattagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgtacaacgttttccatgt 24709653  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  24709652 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 24709596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 44386093 - 44386449
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44386093 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaacgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 44386192  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44386193 agaaaagaccttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 44386292  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
     ||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  44386293 aattcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 44386392  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  44386393 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 44386449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 21145562 - 21145904
Alignment:
Q  21 agattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 120  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21145562 agattgtccagcaaactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 21145661  T
Q  121 tcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 220  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||    
T  21145662 tcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcaaagaagttgaccccgaagtttatt 21145761  T
Q  221 agtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaac 320  Q
      || ||||||| |||  ||||||||| ||||| |||| || ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||| ||||    
T  21145762 gatctgtatcagatattggaaagagttggaacgatggcttatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaac 21145861  T
Q  321 ttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtga 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21145862 ttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaatccagagtga 21145904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 9610055 - 9609711
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9610055 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 9609956  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9609955 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 9609856  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | || |||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  9609855 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 9609756  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9609755 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 9609711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 24262289 - 24261933
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24262289 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 24262190  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24262189 aggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 24262090  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||| ||||||  |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | || |||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  24262089 agttcattggtctgtatcatatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 24261990  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  24261989 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 24261933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 24878519 - 24878875
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24878519 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcggatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 24878618  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  24878619 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccga 24878718  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| |||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||  | || |||||| |    
T  24878719 agttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccaagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatct 24878818  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  24878819 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcaagtaatccagagtgacgatgt 24878875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27371188 - 27370832
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27371188 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgataagcgt 27371089  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27371088 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggatgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 27370989  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| |  ||| | ||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  27370988 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtggatttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 27370889  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  27370888 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 27370832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 369
Target Start/End: Original strand, 22325385 - 22325736
Alignment:
Q  18 cagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 117  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22325385 cagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 22325484  T
Q  118 agatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 217  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||     
T  22325485 agatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaacaagttgaccccgaagttc 22325584  T
Q  218 attagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcac 317  Q
    ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||  | || ||||||||||| |    
T  22325585 attggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgc 22325684  T
Q  318 aacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22325685 aacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 22325736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10868769 - 10868425
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10868769 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggtgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgataagcgt 10868670  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10868669 aggaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 10868570  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||| ||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  10868569 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 10868470  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10868469 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 10868425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 27217935 - 27217591
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217935 aggaccagagatttttcagcaaactactgagaaagttcagatgatacaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 27217836  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27217835 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccga 27217736  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  27217735 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 27217636  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27217635 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 27217591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 119 - 369
Target Start/End: Original strand, 27377101 - 27377351
Alignment:
Q  119 gatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 218  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27377101 gatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 27377200  T
Q  219 ttagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcaca 318  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  27377201 ttggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgggttggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgca 27377300  T
Q  319 acttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27377301 acttcgaaagtatgttctggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 27377351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 17067294 - 17066953
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17067294 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 17067195  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17067194 agaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 17067095  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |  ||||| || ||| | |||||||||||||| |||||  | || || |||||    
T  17067094 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggctttacgagtgggtttaccgccgcatctttcgaa-ttgca-cacgtttttcatgt 17066997  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
    ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17066996 gtcgc-acttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 17066953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 27 - 354
Target Start/End: Original strand, 30211455 - 30211782
Alignment:
Q  27 ttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttga 126  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||    
T  30211455 ttcaacagactactgagaaggttaagttgattagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtagacaaaagagttaccgtgataagcgtaggaaggatcttga 30211554  T
Q  127 gtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccg 226  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | || ||||||||  |||||||||| |||||| | |||    
T  30211555 gtttcaagaaggagaccatgtgttttttagagtcacccatgtgaccggtgttggacgggcgctaaaatcaaagaaactgactccgaggtttattggcccg 30211654  T
Q  227 tatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgga 326  Q
    |||||| | || |||| |||| |   ||| |||||   ||| || ||| |||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  30211655 tatcagatttcggaaaaagttggggtggttgcgtataaagtgggtttaccaccgcatctttcgaacttacatgatgtgtttcatgtgtcacaacttcgga 30211754  T
Q  327 agtatgttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  30211755 agtatgttttggatcaatctcatgtgat 30211782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 267
Target Start/End: Original strand, 24825811 - 24826060
Alignment:
Q  18 cagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 117  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  24825811 cagaaattgttcagcaaactactgagaaggttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaggagttatcatgataagcgtaggaa 24825910  T
Q  118 agatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 217  Q
    ||| ||||||||| | |||| |||  | || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24825911 agaccttgagttttaggaaggagataatgtatttttaagagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggttt 24826010  T
Q  218 attagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagt 267  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| || | ||||||||||| |||||    
T  24826011 attggttcgtatcagatatcagaaagaattgggacggtggcgtatcgagt 24826060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 68 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23087314 - 23087013
Alignment:
Q  68 atgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 167  Q
    ||||||| || | |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  23087314 atgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgacaagtgtagaaaggtccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcttg 23087215  T
Q  168 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagt 267  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||| |||| || |||||| |||| ||||||||  ||||    
T  23087214 tgacaggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgacgccgaggtttattggtccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcgtatagagt 23087115  T
Q  268 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 367  Q
      | ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||  || ||||||    
T  23087114 gtgtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttatcccaagagatgat 23087015  T
Q  368 gt 369  Q
    ||    
T  23087014 gt 23087013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 45529420 - 45529100
Alignment:
Q  23 attgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 122  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||| |||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  45529420 attgttcaacagactactaagaaggttaagttgattagagaaaagatgaaagcatcgcagagtagacaaaagagttatcatgataagcctaggaaggatc 45529321  T
Q  123 ttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattag 222  Q
    ||||||||      |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | || ||||||||  |||||||||| ||||||      
T  45529320 ttgagttt------gaagaccatgtgtttatgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgcgctaaaatcaaagaaactgactccgaggtttattga 45529227  T
Q  223 tccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaactt 322  Q
     || |||||| | || ||||||||| | ||||| |||||  |||| || ||| ||| |||||||| ||| || | |||||| || |||||||||||||||    
T  45529226 cccatatcagatttcggaaagagttgggacggttgcgtatagagtgggtttaccactgcatcttttgaacttacgtgatgtgtttcatgtgtcacaactt 45529127  T
Q  323 cggaagtatgttccggatccatctcat 349  Q
    |||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  45529126 cggaagcatgtttcagatccctctcat 45529100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 31830557 - 31830222
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   |||||| |||||||  | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  31830557 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgaatttca 31830458  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| |||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  31830457 ggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgttggacgggctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 31830358  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| |||||| | || ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  31830357 atttcagagagagttggtactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 31830258  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 368  Q
    || ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  31830257 ttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 31830222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 68 - 342
Target Start/End: Original strand, 27365658 - 27365932
Alignment:
Q  68 atgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 167  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| | ||| || ||||| ||||| ||||||| |     
T  27365658 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagggtcactccta 27365757  T
Q  168 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagt 267  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||||||||| |  || ||| |||| |||||| | |||||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  27365758 tgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagttcattggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagt 27365857  T
Q  268 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatcc 342  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | ||||||||||| ||| ||||    
T  27365858 tggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccatgtgtcgcagttgcggaagtatgtaccgaatcc 27365932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 33 - 354
Target Start/End: Original strand, 11358418 - 11358739
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   |||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11358418 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggatcttgagtttca 11358517  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| |||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||| |||||||||||    
T  11358518 ggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgttggtcgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcag 11358617  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| | |||| | || ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  11358618 atttcagagaaagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 11358717  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    || ||||||| |||||||||||    
T  11358718 ttgcggatccttctcatgtgat 11358739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 23293864 - 23293539
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||  |||||||| ||||||||   |||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  23293864 gttcatcagactatagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacggaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 23293765  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    ||||||| || |  || || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| ||||    
T  23293764 agtttcaggagggtgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 23293665  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| | ||||| || ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  23293664 gtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttctaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 23293565  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  23293564 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 23293539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 81 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 20832836 - 20832549
Alignment:
Q  81 agagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttgg 180  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |  || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||    
T  20832836 agagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttgg 20832737  T
Q  181 acgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccg 280  Q
     || ||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||| ||||||||||| | ||||| |||||| | || ||||| ||  ||||||| ||  ||||     
T  20832736 tcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccacca 20832637  T
Q  281 catctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 368  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  20832636 catctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 20832549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 192 - 369
Target Start/End: Original strand, 41609047 - 41609224
Alignment:
Q  192 agtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaa 291  Q
    |||||||||||||||| ||||  || ||| ||||||||||| | |  ||||||||| |||||||||| |||||||| || |||   ||||||||||||||    
T  41609047 agtcaaagaagttgaccccgaagttcattggtccgtatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttacagccgcatctttcgaa 41609146  T
Q  292 tttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||  |||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  41609147 tttgcacaatgttttccacgtgtcgcaactttggaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 41609224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 1063650 - 1063315
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   |||||| |||| ||  | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1063650 agactactgagaaagtaaggttgataagagaaaagatgagagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 1063551  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||| |||||||||||    
T  1063550 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcag 1063451  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| ||| || | || ||||| ||  ||||||  ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  1063450 atttcagagagaattggtactgtggcatatagagttgctttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 1063351  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 368  Q
    || ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  1063350 ttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 1063315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23276682 - 23276339
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| |||||||| | ||||||   ||| || ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  23276682 gttcatcagactacggagaaagtcatgatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 23276583  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    ||||||| || |  || || || ||| ||||| | |||| | |||  ||||| |||||||| |||||||| |  |||| |||||| |  || ||| ||||    
T  23276582 agtttcaggagggtgatcatgtatttctgagatttactcctatgatgggtgtgggacgtgcattgaagtcgagtaagtcgactccaaagttcattggtcc 23276483  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| |||| || || ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||     
T  23276482 gtatcagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcga 23276383  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  23276382 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 23276339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 80 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 27787593 - 27787340
Alignment:
Q  80 cagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttg 179  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| |  || || || ||| | ||||| ||||   |||| ||||| |    
T  27787593 cagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtag 27787494  T
Q  180 gacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcacc 279  Q
    ||||||||||||| || |  |||||||||||||  || ||| ||||||||||| | ||||| ||| |  |||||||||| ||  ||||||| ||  ||||    
T  27787493 gacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccacc 27787394  T
Q  280 gcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgt 333  Q
     ||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  27787393 acatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatgt 27787340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 92 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 24654185 - 24653946
Alignment:
Q  92 aagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttga 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| || |  || || || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||| ||| ||||    
T  24654185 aagagttatcatgataagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacttgcattga 24654086  T
Q  192 agtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaa 291  Q
    |||| | |||||||||||| |  || ||| ||||||||||| | ||||  |  ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  24654085 agtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagtgaaggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaa 24653986  T
Q  292 tttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtat 331  Q
     ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  24653985 cttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtat 24653946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 276 - 354
Target Start/End: Original strand, 24833360 - 24833438
Alignment:
Q  276 caccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24833360 caccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcggaagtatgtttcggatccatctcatgtgat 24833438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 109
Target Start/End: Original strand, 27368391 - 27368452
Alignment:
Q  48 ttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataag 109  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27368391 ttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataag 27368452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 25128555 - 25128387
Alignment:
Q  24 ttgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 123  Q
    |||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||  |  |||||| |||| ||||||||||||||| |  | || || ||  |    
T  25128555 ttgtccaagagactacggaaaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcatctcagagtagacagaagagttatcatgatgaaaggaggaaggacat 25128456  T
Q  124 tgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaa 192  Q
    |||||||||||  |  || || |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25128455 tgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagagtgaaccatgtgactggtgttggacgcgctttgaa 25128387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22276164 - 22276001
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    |||||||||||||| || || ||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  |  || || |    
T  22276164 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatg 22276065  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    ||||||||||||| | || |||||| |||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||    
T  22276064 tgtttttgagagtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagggtaggaagttgactcc 22276001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 168 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 24945131 - 24944966
Alignment:
Q  168 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagt 267  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |  || ||| ||||||||||| | ||| | || ||| |||| ||||| ||  ||||    
T  24945131 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcaaagagggttggaacagtggcatatagagt 24945032  T
Q  268 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgt 333  Q
    ||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||  || |||||||| || ||||||||||||||    
T  24945031 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgggtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgt 24944966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 12574252 - 12573952
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||   ||| || ||||||| ||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |  |||||||||||    
T  12574252 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaggaaggcccttgagtttca 12574153  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
    ||| |  || || || ||| | || || || |   |||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  12574152 agagggtgatcatgtatttctaagggttaccccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcag 12574053  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| ||  || | |||||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||  | ||||||||||    
T  12574052 atttcagagaggattgggacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacagttgcggaagtatg 12573953  T
Q  333 t 333  Q
    |    
T  12573952 t 12573952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 325 - 369
Target Start/End: Original strand, 45676685 - 45676729
Alignment:
Q  325 gaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45676685 gaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 45676729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23599877 - 23599834
Alignment:
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23599877 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 23599834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Original strand, 24831745 - 24831908
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | |  || ||| ||||||||||||  |  || || |    
T  24831745 gttaagatgattcaggagaagatgaaggtgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagagaacgaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 24831844  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    |||||||||| || | || | ||||||| || || |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  24831845 tgtttttgagggtgaatcctatgactggagtgggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 24831908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 132
Target Start/End: Original strand, 23817588 - 23817696
Alignment:
Q  24 ttgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 123  Q
    |||| ||| ||||||| || |||||||||||||| ||||| || || |||| ||  |||||| |||| |||||||||||||||||  | ||||| ||| |    
T  23817588 ttgtgcaagagactacggaaaaagttaagatgatccaagagaagatcaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataaaaggagaaaggatat 23817687  T
Q  124 tgagtttca 132  Q
    |||||||||    
T  23817688 tgagtttca 23817696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Original strand, 12640477 - 12640640
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    |||||||||||||| || || ||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| |||||||||| |  | ||| || |    
T  12640477 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaggttggagatcatg 12640576  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    |||| ||||| || | ||  ||||| ||||| || |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  12640577 tgttcttgagggtgaatccggtgaccggtgtcggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 12640640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 194
Target Start/End: Original strand, 22762127 - 22762274
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||| ||  |||||| |  | |||||||||||||| ||| | |  |||||| |||||||||| |  |  || || |    
T  22762127 gttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtaggaagaagagttatcatgacaagaggatgaaagatattgagtttcaggttggtgatcatg 22762226  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 194  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||| | |||| ||||||||    
T  22762227 tgtttttgagagtgaatcatgtaactggtgttagtcgtggtttgaagt 22762274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 308 - 348
Target Start/End: Original strand, 17967577 - 17967617
Alignment:
Q  308 catgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctca 348  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17967577 catgtgtcccaacttcgaaagtatgttcccgatccatctca 17967617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 194
Target Start/End: Original strand, 23817750 - 23817798
Alignment:
Q  146 gtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 194  Q
    |||||||||||||| | || |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23817750 gtgtttttgagagtgaatcttgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagt 23817798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 28144749 - 28144701
Alignment:
Q  146 gtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 194  Q
    |||||||||||||| | || ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  28144749 gtgtttttgagagtgaatcttgtaaccggtgttggacgtgctttgaagt 28144701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 61)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23573962 - 23573606
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23573962 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 23573863  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23573862 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 23573763  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23573762 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgt 23573663  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23573662 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 23573606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23516761 - 23516405
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516761 aggaccagagattgttcagcaaactaccaagaaggttaagatcattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 23516662  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516661 agaaaagaccttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 23516562  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  23516561 gatttattggtccgtattagatatcagaaagagttggaacggtggcatatcgagttggattaccaccgcatctttcgaatttgcaagatgtctttcatgt 23516462  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516461 gtcgcaacttcggaagtatttcccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 23516405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 18 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23440440 - 23440089
Alignment:
Q  18 cagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 117  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  23440440 cagagattgttcagcaaactactgagaaagttaaaatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaa 23440341  T
Q  118 agatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 217  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23440340 agatcttaagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaatgaagttgactccgagattt 23440241  T
Q  218 attagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcac 317  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |    
T  23440240 attggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagagggattaccaccgcatctttcgaatttgcaagaagtattccatgtgtcgc 23440141  T
Q  318 aacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440140 aacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 23440089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18775990 - 18775641
Alignment:
Q  20 gagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 119  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  18775990 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagagaatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaagg 18775891  T
Q  120 atcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 219  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18775890 atcttgagtttcaggagggagaccacgtctttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccctgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 18775791  T
Q  220 tagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaa 319  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  18775790 tggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtgatgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaa 18775691  T
Q  320 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18775690 cttcggaagtatgttccagatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 18775641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 21984471 - 21984827
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21984471 aggaccagagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaaaagttatcatgataagcgt 21984570  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21984571 aggaaagatcttgagtttcaagagggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgattggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 21984670  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  21984671 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagctggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcacctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgt 21984770  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21984771 gtcgcaacttcagaggtatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 21984827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 21 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20798972 - 20798659
Alignment:
Q  21 agattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 120  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20798972 agattgttcagcagactactgagaaggttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaaga 20798873  T
Q  121 tcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20798872 tcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgaccggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 20798773  T
Q  221 agtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaac 320  Q
     ||||||||||  |||||||||||||| || ||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20798772 ggtccgtatcaaatatcagaaagagttggaccggtggcatatcgattgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaac 20798673  T
Q  321 ttcggaagtatgtt 334  Q
    ||||||| ||||||    
T  20798672 ttcggaaatatgtt 20798659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 25423401 - 25423053
Alignment:
Q  21 agattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 120  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  25423401 agattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaaga 25423302  T
Q  121 tcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 220  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25423301 tcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgcgttgaagtgaaagaagttgactccgagatttatt 25423202  T
Q  221 agtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaac 320  Q
     | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |  || || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  ||||    
T  25423201 ggcccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcaggtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgttgcaac 25423102  T
Q  321 ttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25423101 ttcggaactatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 25423053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 355
Target Start/End: Original strand, 26738871 - 26739213
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26738871 aggaccagaaattgtacaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 26738970  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||| ||  | |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26738971 agaaaagaccttgagtttcaagaaagagatcatatatttttgagggtcactcctgtgactggtgttggatgtgcattgaagtcaaagaagttgactccga 26739070  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    | |||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||| || ||| || ||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  26739071 ggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaacgcatctttcgaatttgcaagatgtgtttcatgt 26739170  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatc 355  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26739171 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatc 26739213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 14999905 - 15000261
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14999905 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgt 15000004  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15000005 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 15000104  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  15000105 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 15000204  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  15000205 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 15000261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 22333053 - 22333409
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22333053 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagtccggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgt 22333152  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22333153 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 22333252  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  22333253 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 22333352  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22333353 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 22333409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22134888 - 22134532
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  22134888 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgc 22134789  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22134788 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccga 22134689  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  22134688 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 22134589  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22134588 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 22134532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19770180 - 19769824
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19770180 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 19770081  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19770080 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 19769981  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||  |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  19769980 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagtcggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 19769881  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  19769880 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 19769824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27518627 - 27518271
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27518627 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 27518528  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27518527 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagacctcgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 27518428  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  27518427 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 27518328  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  27518327 gtcacaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 27518271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27610574 - 27610218
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27610574 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgccgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 27610475  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27610474 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 27610375  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||||||| ||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  27610374 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcaacttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 27610275  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  27610274 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 27610218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 40709000 - 40708656
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40709000 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 40708901  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40708900 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccgcgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 40708801  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  40708800 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 40708701  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40708700 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 40708656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 27668656 - 27669012
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27668656 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 27668755  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27668756 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 27668855  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| |||| |||||| | |  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||    
T  27668856 agttcattggtccatatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccacgt 27668955  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  27668956 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 27669012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 27685566 - 27685922
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27685566 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagagaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 27685665  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27685666 aggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 27685765  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||| ||    
T  27685766 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccacgt 27685865  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  27685866 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 27685922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 34566714 - 34566370
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34566714 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 34566615  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34566614 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 34566515  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | || |||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  34566514 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 34566415  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34566414 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 34566370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 37291662 - 37292018
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37291662 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagtgt 37291761  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  37291762 aggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaaaaagttgaccccga 37291861  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      |||||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  37291862 agtttattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 37291961  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  37291962 gtctcaacttcgaaagtaagttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 37292018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23471439 - 23471093
Alignment:
Q  23 attgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 122  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||| |    
T  23471439 attgttcaacaaactattgagaaggttaagatgattcaacaaaagatgaaagcgtctcagagtcggcaaaagagtaatcatgataagcgtaggcaagacc 23471340  T
Q  123 ttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattag 222  Q
    ||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| |    
T  23471339 ttgagtttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactcaagtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttggaggtttattgg 23471240  T
Q  223 tccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaactt 322  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||| || ||| || ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||    
T  23471239 tccgtatcaggtatcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaacgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaactt 23471140  T
Q  323 cggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  23471139 cggaagtatgttccggatccatcacatgtgatccaaagagatgatgt 23471093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16356722 - 16356378
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16356722 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 16356623  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16356622 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 16356523  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | || |||||||||||||||||  | ||  |||||||    
T  16356522 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttctccatgt 16356423  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16356422 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 16356378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 41771062 - 41770706
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41771062 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 41770963  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41770962 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 41770863  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| | |  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  41770862 agttcattggtccgtatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 41770763  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  41770762 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 41770706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 29476239 - 29476595
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||| | ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29476239 aggaccagagattgttcaacagactactgaaaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcacagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgt 29476338  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  29476339 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgacggatgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccacga 29476438  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| |||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  29476439 agttcattggtccatatcaggtattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 29476538  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  29476539 gtcgcaacttcgaaagtatgtttcggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 29476595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22348643 - 22348314
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22348643 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaattaaagcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcacgataagcgt 22348544  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||  |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22348543 agaaaa--tcttgagtttcgggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccga 22348446  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  22348445 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcctaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 22348346  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccat 344  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22348345 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccat 22348314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 369
Target Start/End: Original strand, 20468275 - 20468618
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||| || ||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  20468275 gttcagcaaactactgagaatgttaagttgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagttgactgaagagttatcatgataaacgtaggaaagaccttg 20468374  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    | ||||| |||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  20468375 aatttcaggaaggagaccatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactctgaggtttattggtcc 20468474  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    || |||| ||| ||||||| |   ||| ||||||||  |||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20468475 gtgtcagatattagaaagaatagaaacagtggcgtattgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgg 20468574  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  20468575 aagtatgtttcggatccgtctcatgtgatcccaagagatgatgt 20468618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 20 - 290
Target Start/End: Original strand, 21498209 - 21498479
Alignment:
Q  20 gagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 119  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  21498209 gagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggatag 21498308  T
Q  120 atcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 219  Q
    |  | ||||||||||| | ||| || ||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21498309 acatcgagtttcaagagggagatcatgtagttttgagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgaattgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 21498408  T
Q  220 tagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcga 290  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  21498409 tggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggtgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcga 21498479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 155 - 357
Target Start/End: Original strand, 21343666 - 21343868
Alignment:
Q  155 agagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacgg 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  21343666 agagtcactcctgtgactggtgttggacgagcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgtataagatatcagaaagagttggaacgg 21343765  T
Q  255 tggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    ||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21343766 tggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgat 21343865  T
Q  355 cca 357  Q
    |||    
T  21343866 cca 21343868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 128 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20573626 - 20573385
Alignment:
Q  128 tttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgt 227  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | || |||||| ||||||    
T  20573626 tttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactccactgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaggaagttgacttcaaggtttattggtccgt 20573527  T
Q  228 atcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaa 327  Q
    ||||| |||| |||||| || ||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  20573526 atcagatatcggaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaa 20573427  T
Q  328 gtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20573426 gtatgttccagatccatctcatgtgatccaaagagatgatgt 20573385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 342
Target Start/End: Original strand, 23442472 - 23442788
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || | |||||    
T  23442472 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggctcttg 23442571  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||  |||||||| |||| ||||||||| |  || ||| ||||    
T  23442572 agtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgtgttgaagtctaagatgttgactccaaagttcattggtcc 23442671  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    |||||||||||| || || ||| |||| ||||| |||  ||| |  ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  23442672 gtatcagttatctgagagggttggaacagtggcatacaaagtggttttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 23442771  T
Q  326 aagtatgttccggatcc 342  Q
    ||||||||  |||||||    
T  23442772 aagtatgtagcggatcc 23442788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 70 - 332
Target Start/End: Original strand, 21564189 - 21564451
Alignment:
Q  70 gaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtg 169  Q
    |||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21564189 gaaagtgtcgcaaagtcggcagaagagttatcatgacaagcgaagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttctgagagtcactcatgtg 21564288  T
Q  170 actggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttg 269  Q
    ||  ||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||  | |||||| |||| |||||| |||| || |||||| | || ||||| ||  |||| |    
T  21564289 acacgtgttagtcgtgctttgaagtctaagaatttgactccacggtttattggtccatatcagatatctgatagagtttggacagtggcatatagagtgg 21564388  T
Q  270 gattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
    | ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  21564389 gtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 21564451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 351
Target Start/End: Original strand, 21890938 - 21891263
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||||| || |||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  21890938 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgatagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttg 21891037  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | ||| || |||||| ||||||| || | | |||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||    
T  21891038 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttacacctatgactggtgtaggatgtgcgttgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtcc 21891137  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| |||| || || ||| |||| ||||| ||| |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||    
T  21891138 gtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatatgtttcatgtgtcgcaacttcgg 21891237  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  21891238 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 21891263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 68 - 369
Target Start/End: Original strand, 28923989 - 28924290
Alignment:
Q  68 atgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 167  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || ||| ||||||| |||| |     
T  28923989 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtgaccatgtttttctgagagttactccta 28924088  T
Q  168 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagt 267  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||| |  || ||  |||| |||||| | |||||||||||| |||| ||||||||  ||||    
T  28924089 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagt 28924188  T
Q  268 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 367  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||  | ||||||||||| || ||||| || ||||| || | ||| ||||||    
T  28924189 tggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatgtacctgatccttcgcatgttattccgagagatgat 28924288  T
Q  368 gt 369  Q
    ||    
T  28924289 gt 28924290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 368
Target Start/End: Original strand, 14887177 - 14887512
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   |||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14887177 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 14887276  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  14887277 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 14887376  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| ||| || | || ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  14887377 atttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 14887476  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 368  Q
    || ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  14887477 ttgcggatccttctcatgtgattccgagagatgatg 14887512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 61 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 25848229 - 25847922
Alignment:
Q  61 agaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtc 160  Q
    |||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||||| || |  || || || ||||||||||||    
T  25848229 agaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaaaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttttgagagtc 25848130  T
Q  161 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgt 260  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| | ||||| |||||| |||| ||||| |    
T  25848129 actcctttgacgggtgttggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactcctaaattcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaactgtggcat 25848030  T
Q  261 accgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagag 360  Q
    || ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||| |||||||||| ||||||| || |||||||| | |||    
T  25848029 acagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcagaagtatgttgcggatccttcacatgtgattccgag 25847930  T
Q  361 tgatgatg 368  Q
     |||||||    
T  25847929 ggatgatg 25847922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 68 - 369
Target Start/End: Original strand, 28895163 - 28895464
Alignment:
Q  68 atgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 167  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || ||| ||||||| |||| |     
T  28895163 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtgaccatgtttttctgagagttactccta 28895262  T
Q  168 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagt 267  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||| |  || ||  |||| |||||| | |||||||||||| ||||  |||||||  ||||    
T  28895263 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccttatcagatttcagaaagagttggaactctggcgtatagagt 28895362  T
Q  268 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 367  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||  | ||||||||||| || ||||| || ||||| || | ||| ||||||    
T  28895363 tggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatgtacctgatccttcgcatgttattccgagagatgat 28895462  T
Q  368 gt 369  Q
    ||    
T  28895463 gt 28895464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 33 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20773942 - 20773606
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||  ||| || ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||| |||||||    
T  20773942 agactacagagaaagtcaagatgattagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtcggaaagagcttcagtttca 20773843  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     ||||  | ||| || ||| |||| || |||| | |||| || || |||||||| |||||||| |  ||||||||||| |  || ||  |||| ||||||    
T  20773842 ggaagggggccatgtttttctgagggttactcctatgacgggcgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccttatcag 20773743  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | |||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||  | ||||||||||    
T  20773742 atttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatg 20773643  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    | || ||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  20773642 taccagatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 20773606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 157
Target Start/End: Original strand, 21339452 - 21339596
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21339452 aggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 21339551  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgaga 157  Q
    || ||||| |||||||||||||||  |||||| || |||||||||    
T  21339552 aggaaagaccttgagtttcaagaacgagaccaagtatttttgaga 21339596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 22462132 - 22461816
Alignment:
Q  35 actactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 134  Q
    ||||| |||||||| |||||||||   || || ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| |    
T  22462132 actacagagaaagtcaagatgattagggagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcagg 22462033  T
Q  135 aagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagtt 234  Q
    |||  ||||| || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| |||| || ||| |    
T  22462032 aaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttaccagat 22461933  T
Q  235 atcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgtt 334  Q
     |||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| | |||||||||||     
T  22461932 ttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtatttcatgtgtcgcaattgcggaagtatgta 22461833  T
Q  335 ccggatccatctcatgt 351  Q
    || ||||| || |||||    
T  22461832 ccagatccttcgcatgt 22461816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 33 - 368
Target Start/End: Original strand, 37545682 - 37546018
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   |||||| |||||||  | |||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37545682 agactactgagaaagtaaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaacagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 37545781  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttt-tgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatca 231  Q
     || |  || || || |||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||| ||||||||||    
T  37545782 ggagggtgatcatgttttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 37545881  T
Q  232 gttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtat 331  Q
    | | || || |||||| | || ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||    
T  37545882 gatttctgagagagttggtactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtat 37545981  T
Q  332 gttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 368  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  37545982 gttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 37546018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 21405035 - 21404715
Alignment:
Q  18 cagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||| ||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21405035 cagacattgttcaacagactactgagaaggttaagttgattagagaaaatatgaaggtgtcacagagtagacaaaagagttatcatgataagcgtaggaa 21404936  T
Q  118 agatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 217  Q
                     ||| ||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||||||  |||||||| | |||    
T  21404935 c----------------aaggagatcatgtgttttttagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgcgctaaaatcaaagaaactgactccgtggttt 21404852  T
Q  218 attagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcac 317  Q
    ||| |  |||||||| | || ||||||||| | || || |||||  |||| || ||| |||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||    
T  21404851 attggctcgtatcagatttcggaaagagttgggacagttgcgtatagagtgggtttaccaccacatctttcgaacttacatgatgtgtttcatgtgtcac 21404752  T
Q  318 aacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21404751 aacttcggaagtatgtttcagatccatctcatgtgat 21404715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 351
Target Start/End: Original strand, 24735790 - 24736115
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| || || |||||| ||||   |||| | ||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||    
T  24735790 gttcagcagactacagaaaaggttaagttgataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttg 24735889  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||| | |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  24735890 agtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacgggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtcc 24735989  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
     |||||| |||| || || ||| |||| ||||| ||  |||| || ||  |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| | |||    
T  24735990 atatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattacgg 24736089  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    |||||||| |||||||| || |||||    
T  24736090 aagtatgtaccggatccttcgcatgt 24736115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 351
Target Start/End: Original strand, 24749733 - 24750058
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| || || |||||| ||||   |||| | ||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||    
T  24749733 gttcagcagactacagaaaaggttaagttgataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttg 24749832  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||| | |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  24749833 agtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacgggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtcc 24749932  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
     |||||| |||| || || ||| |||| ||||| ||  |||| || ||  |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| | |||    
T  24749933 atatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattacgg 24750032  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    |||||||| |||||||| || |||||    
T  24750033 aagtatgtaccggatccttcgcatgt 24750058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 20342464 - 20342129
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   |||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20342464 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 20342365  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     ||    || || || ||| |||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||| |||||||||||    
T  20342364 ggagcgtgatcatgtttttctgagagtcacccctttgacaggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcag 20342265  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| |||||| | || ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  20342264 atttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 20342165  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 368  Q
    || ||||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  20342164 ttgcggatccttcacatgtgattccgagggatgatg 20342129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Original strand, 22236099 - 22236445
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||| |   ||| || ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  22236099 gttcatcagactacagagaaagtcaagatggtcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 22236198  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    ||||||| || |  || || || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| ||||    
T  22236199 agtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 22236298  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| ||||||| || ||| |||| ||| | ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |    
T  22236299 gtatcagatatcagagagggttggaacagtgtcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcag 22236398  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgtcca 372  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| |||||||||||    
T  22236399 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagggatgatgtcca 22236445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 351
Target Start/End: Original strand, 24737017 - 24737289
Alignment:
Q  79 gcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgtt 178  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||| | |||| |||||     
T  24737017 gcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacgggtgta 24737116  T
Q  179 ggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcac 278  Q
    || ||||| || || || ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| |||| || || ||| |||| ||||| ||  |||| || ||  |||    
T  24737117 ggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccac 24737216  T
Q  279 cgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    | |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  24737217 ctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattacggaagtatgtaccggatccttcgcatgt 24737289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 354
Target Start/End: Original strand, 24798629 - 24798904
Alignment:
Q  79 gcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgtt 178  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||  || |  || || || ||| |||||||||||| | |||| ||||||    
T  24798629 gcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttctggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgtt 24798728  T
Q  179 ggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcac 278  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||||| |  |||||| | ||||||||| | ||||| |||||| | || ||||| ||  ||||||| ||  |||    
T  24798729 ggacgggctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggaccgtatcagatttcagagagagttggtactgtggcatatagagttggtttgccac 24798828  T
Q  279 cgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  24798829 cacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 24798904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 354
Target Start/End: Original strand, 23080275 - 23080596
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    ||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |  ||  |||||||    
T  23080275 agactactgagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagattcgacagaagagttatcatgacaagcggagaaaggccctatagtttca 23080374  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| |||| ||||||| | |||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||| |||||||||||    
T  23080375 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctatgacgggtgtaagacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 23080474  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| || ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||  || |||||||||||||    
T  23080475 atttcagagagggttggaacagtggcttatagagttggtttaccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgttgcagcttcggaagtatg 23080574  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    |  ||||||| || ||||||||    
T  23080575 tagcggatccttcacatgtgat 23080596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 33 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 20821635 - 20821317
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||   ||| || ||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||||  ||||| ||||| |||||    
T  20821635 agactacagagaaagttaggatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctaccatgacaagcgtaagaaagaccttgaatttca 20821536  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     ||||  || || || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| |||| ||||||    
T  20821535 ggaaggtgatcatgtttttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttatcag 20821436  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | |||||||| ||| |||| ||||||||  || |||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||  | ||||||||||    
T  20821435 atttcagaaagggttggaactgtggcgtatagaattggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatg 20821336  T
Q  333 ttccggatccatctcatgt 351  Q
    | || ||||| || |||||    
T  20821335 tacctgatccttcgcatgt 20821317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 107 - 369
Target Start/End: Original strand, 21662300 - 21662561
Alignment:
Q  107 aagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 206  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || |||||| | |||||||||| | |||  |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  21662300 aagcgtaggaaagaccttgaatttcaagaagcagatcatgtgtttctaagagtcactcctatgataggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttga 21662399  T
Q  207 ctccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctt 306  Q
    || |||| |||||| ||  ||||||| |||| ||||||||| ||||  || ||||  |||| || ||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  21662400 cttcgaggtttattggtt-gtatcagatatcggaaagagttggaacaatgacgtatagagtgggtttgccaccgcatcttttgaatttgcatgatgtatt 21662498  T
Q  307 ccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
     || ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| | ||| ||||||||    
T  21662499 tcaagtgtcgcaacttcggaaatatgtatcggatccatcgcatgtgattccgagggatgatgt 21662561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 33 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 22381381 - 22381060
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||||||||| || || |||||    ||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  22381381 agactactgagaaggtcaaaatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttca 22381282  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| |||| |||||||   |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| |||||||||||    
T  22381281 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccgatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 22381182  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| || ||| |||||||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  22381181 atttcagagagggttggaacggtggcttatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 22381082  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    |  | ||||| || ||||||||    
T  22381081 tagcagatccgtcacatgtgat 22381060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 81 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 22502813 - 22502540
Alignment:
Q  81 agagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttgg 180  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || |  || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||    
T  22502813 agagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttgg 22502714  T
Q  181 acgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccg 280  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| |  || ||  ||||||||||| | ||||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  ||||     
T  22502713 acgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggaacagtggcatatagagttggtttgccacca 22502614  T
Q  281 catctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  22502613 catctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgtgat 22502540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 333
Target Start/End: Original strand, 21665761 - 21665986
Alignment:
Q  107 aagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttga 206  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| || |||||| | |||||||||| | |||  |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  21665761 aagcgtaggaaagaccttgaatttcaagaagcagatcatgtgtttctaagagtcactcctatgataggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaagttga 21665860  T
Q  207 ctccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctt 306  Q
    || |||| |||||| ||  ||||||| |||| ||||||||| ||||  || ||||  |||| || ||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  21665861 cttcgaggtttattggt-tgtatcagatatcggaaagagttggaacaatgacgtatagagtgggtttgccaccgcatcttttgaatttgcatgatgtatt 21665959  T
Q  307 ccatgtgtcacaacttcggaagtatgt 333  Q
     || ||||| ||||||||||| |||||    
T  21665960 tcaagtgtcgcaacttcggaaatatgt 21665986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 333
Target Start/End: Original strand, 17269519 - 17269819
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||   ||| || ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  17269519 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 17269618  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
    ||| |  || || || ||| | ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  17269619 agagggtgatcatgtatttctaagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcag 17269718  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| ||  |  | |||||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||    
T  17269719 atttcagagaggatcgggacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtatttcacgtgtcacaactccggaagtatg 17269818  T
Q  333 t 333  Q
    |    
T  17269819 t 17269819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Original strand, 11210871 - 11211057
Alignment:
Q  24 ttgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 123  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||  |  |||||| |||| |||||||||||||||||| | || |||||| |    
T  11210871 ttgtgcaagagactacggaaaaagttaagatgattcaggagaagatgaaagcatctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaagatat 11210970  T
Q  124 tgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    |||||||||||  |  || || ||||||||||| || | || |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  11210971 tgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 11211057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27011252 - 27011089
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    |||||||||||||| || || ||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| ||||||||||||  |  || || |    
T  27011252 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacataagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 27011153  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    |||||||||| || | ||||||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  27011152 tgtttttgagggtgaatcatgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 27011089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23503625 - 23503464
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||| ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  23503625 agactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 23503526  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 194  Q
    |   |  || || |||||||| || || | ||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  23503525 aattggtgatcatgtgttttttagggtgaatcatgtgaccggtgttggtcgtcctttgaagt 23503464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Original strand, 21937388 - 21937551
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    |||||||||||||| || || ||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  |  || || |    
T  21937388 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 21937487  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    ||||||| || || | || |||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  21937488 tgtttttaagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 21937551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24581379 - 24581216
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    |||||||||||||| || || ||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| ||||||||||||  |  || ||||    
T  24581379 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcacg 24581280  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    ||||| | || || | || |||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  24581279 tgtttgtaagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 24581216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 281 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21625470 - 21625382
Alignment:
Q  281 catctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| | ||||||||   |||||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  21625470 catctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaactttgaaagtatgtagtggatccttcgcatgtgattccgagagatgatgt 21625382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 190
Target Start/End: Original strand, 25244598 - 25244695
Alignment:
Q  93 agagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttg 190  Q
    ||||||||||| ||||| | |  |||||| ||||||||||||  | ||| || |||||||||||||| | ||||||    ||||||||||||||||||    
T  25244598 agagttatcatcataagaggatgaaagatattgagtttcaagttggagatcatgtgtttttgagagtgaatcatgtagtcggtgttggacgtgctttg 25244695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 190
Target Start/End: Original strand, 25308750 - 25308847
Alignment:
Q  93 agagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttg 190  Q
    ||||||||||| ||||| | |  |||||| ||||||||||||  | ||| || |||||||||||||| | ||||||    ||||||||||||||||||    
T  25308750 agagttatcatcataagaggatgaaagatattgagtttcaagttggagatcatgtgtttttgagagtgaatcatgtagtcggtgttggacgtgctttg 25308847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 19 - 367
Target Start/End: Original strand, 278823 - 279171
Alignment:
Q  19 agagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaa 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  278823 agagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaa 278922  T
Q  119 gatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  278923 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgtgggacaagctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 279022  T
Q  219 ttagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcaca 318  Q
    |  ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  279023 taggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgca 279122  T
Q  319 acttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  279123 acttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgattcagagtgatgat 279171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 26 - 369
Target Start/End: Original strand, 164709 - 165052
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  164709 gttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttg 164808  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  164809 agtttcaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttcgaggtttattggtcc 164908  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||||||  |||| || ||| |||| |||||||||    
T  164909 gtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggttcaccaccgcatctttcgaatttgcacaatgtgtttcatatgtcgcaacttcgg 165008  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  165009 aagtatgttccggatccatctcatgtgattcaaagagatgatgt 165052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 308978 - 308622
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  308978 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 308879  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |    
T  308878 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttaaccccaa 308779  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      |||||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  308778 agtttattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 308679  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  308678 gtcgtaacttcgaaagtatgttctggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 308622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 260614 - 260271
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    ||||| ||||||| || |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  ||||    
T  260614 gttcatcagacgactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttg 260515  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    ||||||| || |  || || || ||||||||||| ||||   |||| ||||| ||||||||||| || || | ||||||||||||||  || ||| ||||    
T  260514 agtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttaaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtcc 260415  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| | ||||| ||  || |||||||||| ||  ||||| | ||  ||||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  260414 gtatcagatttcagagaggattagaacggtggcatatagagtttgtttgccaccatatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcgg 260315  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  260314 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 260271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 61)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Original strand, 30313578 - 30313927
Alignment:
Q  20 gagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 119  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  30313578 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaag 30313677  T
Q  120 atcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 219  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313678 atcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 30313777  T
Q  220 tagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaa 319  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  30313778 tggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcaaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaa 30313877  T
Q  320 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30313878 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 30313927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 21166964 - 21167320
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21166964 aggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 21167063  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21167064 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccga 21167163  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21167164 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtatcgagttgggttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctttcatgt 21167263  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21167264 gtcgcaacttcgaaaatatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 21167320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19978321 - 19977965
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19978321 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 19978222  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19978221 agaaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 19978122  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||    
T  19978121 gatttattggtccgtatcagatatcggaaatagttggaacggtggcgtaacgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgtgtttcatgt 19978022  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19978021 gtcgcaacttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 19977965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Original strand, 16408479 - 16408828
Alignment:
Q  20 gagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 119  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  16408479 gagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaag 16408578  T
Q  120 atcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 219  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408579 atcttaagttccaagaaggagaccacgtattgttgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 16408678  T
Q  220 tagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaa 319  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  16408679 tggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaa 16408778  T
Q  320 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16408779 cttcggaagtgtgtcccggatctatctcatgtgatccagagtgatgatgt 16408828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15533734 - 15533378
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15533734 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaaaatgatacaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgt 15533635  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15533634 aggaaagatcttgagtttcaagaaggtgaccacatgtttttgagagtcactcctgtggctggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccga 15533535  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15533534 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgttccatgt 15533435  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15533434 gtcgcaacttcggaagtatgtttcggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 15533378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22046727 - 22046372
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  22046727 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagtgtcgcatagtcgacaaaagagttatcatgataaacgc 22046628  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || || |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22046627 aggaaggatcttgagttttaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactccagtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaaattgactccga 22046528  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    | |||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22046527 ggtttattggttcgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtaggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgt 22046428  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22046427 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat-caaagtgatgatgt 22046372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Original strand, 22164625 - 22164974
Alignment:
Q  20 gagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 119  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22164625 gagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaag 22164724  T
Q  120 atcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 219  Q
    ||||||||||||| |||| ||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22164725 atcttgagtttcaggaaggagacattgtgtttttgaaagtcactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaataagttgactccgagatttat 22164824  T
Q  220 tagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaa 319  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  22164825 tggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgcatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgttccatgtgtcgcaa 22164924  T
Q  320 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22164925 cttcggaagtatgtcccggatccatcacatgtgatccaaagtgatgatgt 22164974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 32600498 - 32600142
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  32600498 aggaccagagattgttcagtagactactgagaaggttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgc 32600399  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  32600398 aggaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccga 32600299  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||| | ||||||||||||||| || || ||||||||    
T  32600298 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccacgtctttcgaatttgcacgacgtgttccatgt 32600199  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  32600198 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatctatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 32600142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Original strand, 22133475 - 22133824
Alignment:
Q  20 gagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 119  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22133475 gagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgtaggaaag 22133574  T
Q  120 atcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 219  Q
    ||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22133575 atcttgagtttcaggaaggagacattgtgtttttgagagacactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 22133674  T
Q  220 tagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaa 319  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  22133675 tggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtcggaataccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgttccatgtgtcgcaa 22133774  T
Q  320 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22133775 cttcggaagtatgtcccgaatccatcacatgtgatccaaagtgatgatgt 22133824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 21922162 - 21922518
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21922162 aggaccagagattgttcagcaaactactgaaaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagtgtcgcagagtccacaaaagagttatcatgataagcgt 21922261  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21922262 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacaagctttgaagtcgaagaagttgactccga 21922361  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    ||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||| || || || |||||    
T  21922362 gatatattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatatttcgaatttgcacgacgtgtttcatgt 21922461  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  21922462 gtcgcaacttcggaagtatgtactggatccatcccatgtgatccaaagcgatgatgt 21922518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21251295 - 21250940
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| |||| | | |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21251295 aggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgattaaagagaga-tgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttatcatgataagcgt 21251197  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21251196 aggaaagatcttgagtttcaataaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccga 21251097  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  21251096 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 21250997  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21250996 gtcgcaacttcggaagtatgtaccagatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 21250940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 21394292 - 21394648
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21394292 aggaccagagattgtttagcaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 21394391  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21394392 atgaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgttctttgaagtcaaagaagttgactccga 21394491  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || | |||    
T  21394492 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagtcgtaacggtggcgtaccgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgtgtttcctgt 21394591  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21394592 gtcgcaacttcagaagtatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 21394648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 21788785 - 21789141
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||| | || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21788785 aggaccagagattgtttagcaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 21788884  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21788885 atgaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgttctttgaagtcaaagaagttgactccga 21788984  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| || | |||    
T  21788985 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagtcgtaacggtggcgtaccgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcacgatgtgtttcctgt 21789084  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21789085 gtcgcaacttcagaagtatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 21789141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23650395 - 23650039
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23650395 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttaagatgattcaagagaagataaaagcatcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgt 23650296  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23650295 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacatgtttttgagagtcactcctgtgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccga 23650196  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||    
T  23650195 gatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacggtggcttatcgagttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcttgt 23650096  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||  ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  23650095 gttgcaacttcggaagtatgtactggatccatcccatgtgatccaaagtgataatgt 23650039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 17674450 - 17674806
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17674450 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 17674549  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17674550 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 17674649  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  17674650 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 17674749  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  17674750 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 17674806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 19113044 - 19112700
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19113044 aggaccagagattattcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 19112945  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19112944 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 19112845  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||| ||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  19112844 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 19112745  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19112744 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 19112700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 60 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22032339 - 22032030
Alignment:
Q  60 aagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagt 159  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||    
T  22032339 aagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaacgtaggaaggatcttgagttttaggatggagaccacgtgtttttgagagt 22032240  T
Q  160 cactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcg 259  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||| |||||||||  |||| |||||    
T  22032239 cactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaaattgactccgagatttattggtttgtatcagatatcggaaagagttgaaacgttggcg 22032140  T
Q  260 taccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaga 359  Q
    || ||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22032139 tatcgagtaggattaccaccgcatctttcgaatttacacgatgttttccatgtttcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaa 22032040  T
Q  360 gtgatgatgt 369  Q
    ||||||||||    
T  22032039 gtgatgatgt 22032030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 20018177 - 20018533
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20018177 aggaccagaaattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgt 20018276  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20018277 agaaaagatcttgaatttgaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 20018376  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  20018377 agttcattggtccgtatcagatactggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 20018476  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  20018477 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgacgatgt 20018533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 19485297 - 19485653
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| | ||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19485297 aggaccagagattgttcagcaaaccactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 19485396  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  19485397 agaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgacctcga 19485496  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| |||| |||||| | |  ||||||||| | |||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  19485497 agttcattggtccatatcagattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 19485596  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  19485597 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 19485653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 22120601 - 22120957
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22120601 aggatcagagattgttcagcagactactgagaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgt 22120700  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||  |||    
T  22120701 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtgggacgtgcattgaagtcaaggaagttgacctcga 22120800  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| |||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| |||||| |  | || ||||||||    
T  22120801 agttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcaaatttgaacaacgttttccatgt 22120900  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22120901 gtcgcaactttggaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 22120957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22987555 - 22987199
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||| || ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22987555 aggagcataaattgttcaacaaactattgagaaagataatatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgt 22987456  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || ||||| ||||| |||||||||| ||| || || ||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  22987455 aggaaagaccttgattttcaagaaggagatcatgtattttttagagtcactccagtgactgatgttggacatgcattgaagtcaaagaagttgactctga 22987356  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      |||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| || ||  | |||||    
T  22987355 agtttattggtccgtatcagatatcataaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgaagtaatacatgt 22987256  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22987255 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagagatgatgt 22987199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 354
Target Start/End: Original strand, 20396565 - 20396893
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||| | |||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20396565 gttcaacaaactactgagaaggttaagttgatgcgagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagtgttatcatgataagcgtagaaaagaccttg 20396664  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    ||||||| |||| |||||| || ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  ||||||  ||||||||| |||     
T  20396665 agtttcaggaaggagaccatgtattttttagagtcactcctgtgaccggtgtaggacgtgcattgaagtcaaggaaactgactctaagatttattggtct 20396764  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  ||  |||||||| ||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||    
T  20396765 gtatcagatatcagaaagaattgaaatagtggcgtatcgagtgggtttactaccgcatctttcgaatttgcatgatgcatttcatgtgtaacaacttcgg 20396864  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  20396865 aagtgtgtttcggatccatctcatgtgat 20396893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 128 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15441420 - 15441179
Alignment:
Q  128 tttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgt 227  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15441420 tttcaagaaggtgaccacatgtttttgagagtcactcctgtggctggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgt 15441321  T
Q  228 atcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaa 327  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  15441320 atcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgtgtttgattaccacctcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcgtaa 15441221  T
Q  328 gtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15441220 gtatgttttggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 15441179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 94 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23949162 - 23948887
Alignment:
Q  94 gagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaag 193  Q
    ||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||     
T  23949162 gagttattatgataagcgtaggaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgactggttttagacgtgctttgaaa 23949063  T
Q  194 tcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatt 293  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  23949062 tcaaagaagttgactccgaggtttgttggtccgtatcagatatcagaaagaattagtacggtggcgtagcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatt 23948963  T
Q  294 tgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    | || ||||| || |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||  || ||||||||    
T  23948962 ttcacgatgtgtttcatgtgtcgcaactttggaagtatgtttcggatcagtctcatgtgatcccaagagatgatgt 23948887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 22377880 - 22378087
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||| |||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22377880 aggaccagaaattgttaaacaaactacggagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 22377979  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || |||||| |||||||||| |||| ||| || || |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22377980 aggaaagatattgagtttcaggaagcagatcatgtatttttgagggtcactccagtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccga 22378079  T
Q  213 gatttatt 220  Q
    ||||||||    
T  22378080 gatttatt 22378087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 22384055 - 22384262
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||| |||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22384055 aggaccagaaattgttaaacaaactacggagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 22384154  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || |||||| |||||||||| |||| ||| || || |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22384155 aggaaagatattgagtttcaggaagcagatcatgtatttttgagggtcactccagtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccga 22384254  T
Q  213 gatttatt 220  Q
    ||||||||    
T  22384255 gatttatt 22384262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 369
Target Start/End: Original strand, 21681910 - 21682253
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||||| || | |||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  21681910 gttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 21682009  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | ||| || |||||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||| ||||    
T  21682010 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtcc 21682109  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| |||| || || ||| |||| ||||| ||  |||| || ||  |||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||    
T  21682110 gtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgaatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 21682209  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||   ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  21682210 aagtatgaaacggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 21682253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 6679445 - 6679110
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   |||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6679445 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 6679346  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  6679345 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 6679246  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| |||||| | || ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  6679245 atttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 6679146  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 368  Q
    || ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  6679145 ttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 6679110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 351
Target Start/End: Original strand, 20010375 - 20010665
Alignment:
Q  61 agaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtc 160  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||  || |  |||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||    
T  20010375 agaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaagaaggcgcttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtc 20010474  T
Q  161 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgt 260  Q
    ||||   |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||| |||| || || ||| |||| ||||| |    
T  20010475 actccgatgacgggtgtgggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccgtaccagatatctgagagggttggaacagtggcat 20010574  T
Q  261 accgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    || |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  20010575 acagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtatttcacgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 20010665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 68 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 20388398 - 20388133
Alignment:
Q  68 atgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 167  Q
    ||||||| || | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||  |    
T  20388398 atgaaagcgtcgtagagtcgacataagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttctgagagtcactctag 20388299  T
Q  168 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagt 267  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||| |||| ||| || |||| || |||||| | || ||| | ||  ||||    
T  20388298 tgacaggtgttggtcgtgctttgaagtctaagaagttgaccccacggtttattggtccatattagatatctgagagagttgggacagtgacatatagagt 20388199  T
Q  268 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgt 333  Q
     || ||  |||| |||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| ||| |||||||||||||    
T  20388198 gggtttgccaccacatctttcgaatgtgcatgatgtgtttaatgtgtcgcaatttcggaagtatgt 20388133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23655268 - 23654925
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   |||||| ||||||| || |||||||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||    
T  23655268 gttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgatagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttg 23655169  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | ||| ||  ||||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||| ||||    
T  23655168 agtttcaagacggagatcatttgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtcc 23655069  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| ||||||| || ||| |||| ||||  ||   | | || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  23655068 gtatcagatatcagagagggtttgaacagtggtatatatattgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 23654969  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  23654968 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 23654925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 351
Target Start/End: Original strand, 21324849 - 21325175
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||    
T  21324849 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaaacgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaggcccttg 21324948  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    ||||||| || |  || || || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| ||||    
T  21324949 agtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 21325048  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatc-tttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcg 324  Q
    ||||||| ||||| | || ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  21325049 gtatcagatatcatagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatcatttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcg 21325148  T
Q  325 gaagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    |||||||||  ||||||| || |||||    
T  21325149 gaagtatgtagcggatccttcgcatgt 21325175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 1266544 - 1266255
Alignment:
Q  62 gaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtca 161  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || || || ||| ||||||| |    
T  1266544 gaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttctgagagtta 1266445  T
Q  162 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgta 261  Q
    |||   |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||| ||||||||||| | ||||| || ||| |||| ||||| ||    
T  1266444 ctccgatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcata 1266345  T
Q  262 ccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
      ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  1266344 tagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtaacggatccttcgcatgt 1266255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 33 - 369
Target Start/End: Original strand, 22061880 - 22062216
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   | |||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  22061880 agactacagagaaagtcaagatgatcagaaaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggctcttgagtttca 22061979  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || |||||| |||| || |||| | |||| ||||| |||| ||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| ||||||||||     
T  22061980 ggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcaa 22062079  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     ||||||| || ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  22062080 atatcagagagggttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 22062179  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  22062180 tagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 22062216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 62 - 368
Target Start/End: Original strand, 804149 - 804455
Alignment:
Q  62 gaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtca 161  Q
    ||||| |||||||  | |||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || |  || || || ||| |||| ||||    
T  804149 gaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaaaagttaccatgacaagcgaagaaaggatctggagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtca 804248  T
Q  162 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgta 261  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||| ||||||||||| | ||||| ||| || | || ||||| ||    
T  804249 ctcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcagatttcagagagaattggtacagtggcata 804348  T
Q  262 ccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagt 361  Q
      ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||     
T  804349 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattccgagg 804448  T
Q  362 gatgatg 368  Q
    |||||||    
T  804449 gatgatg 804455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 19851717 - 19851427
Alignment:
Q  61 agaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtc 160  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |  |||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||    
T  19851717 agaaaatatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatggcaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtc 19851618  T
Q  161 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgt 260  Q
    ||||   |||| | ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| || ||| |||| || || ||| |||| ||||| |    
T  19851617 actccgttgacggttgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccataccagatatctgagagggttggaacagtggcat 19851518  T
Q  261 accgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    ||  ||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||| || |||||    
T  19851517 acaaagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgaaagtacgtagcggatccttcgcatgt 19851427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 19857753 - 19857463
Alignment:
Q  61 agaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtc 160  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |  |||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||    
T  19857753 agaaaatatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatggcaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtc 19857654  T
Q  161 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgt 260  Q
    ||||   |||| | ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| || ||| |||| || || ||| |||| ||||| |    
T  19857653 actccgttgacggttgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccataccagatatctgagagggttggaacagtggcat 19857554  T
Q  261 accgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    ||  ||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||| || |||||    
T  19857553 acaaagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgaaagtacgtagcggatccttcgcatgt 19857463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 20008191 - 20007866
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   |||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  20008191 gttcatcagactacggagaaggtaaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcatagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttg 20008092  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||| ||||| | ||| || |||||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| || ||| ||||||| |  || ||| ||||    
T  20008091 agttccaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaacaaggtgactccaaagttcattggtcc 20007992  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
     |||||| |||| || || ||| |||| ||||| ||  |||| || ||   ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  20007991 atatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgctaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 20007892  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  20007891 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 20007866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 33 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 6603992 - 6603657
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   |||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6603992 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 6603893  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||| ||||||||||     
T  6603892 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcaa 6603793  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| ||| || | || ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  6603792 atttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 6603693  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 368  Q
    || ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  6603692 ttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 6603657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 33 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 14565476 - 14565141
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    |||||||||||||||| | | ||||    ||||| |||||||  | |||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  14565476 agactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaaaagttaccatgacaagcgaagaaaggatctggagtttca 14565377  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || ||| |||| ||||||    
T  14565376 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccatatcag 14565277  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| |||||| | || ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||| | || ||||| || || |||||||||||||    
T  14565276 atttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatttgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 14565177  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 368  Q
    || ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  14565176 ttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 14565141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21840758 - 21840415
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   |||||| || |||| || |||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || || |  ||||    
T  21840758 gttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagataaaagcgtcgcagagtcgacagaatagttaccatgacaagcgaaggaaggcacttg 21840659  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | ||| || |||||| | ||||| |||| | | || ||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  21840658 agtttcaagagggagatcatgtgtttctaagagttactcctataacaggtgtaggaggtgcactgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtcc 21840559  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
     |||||| |||| || || ||| |||| ||||| ||| ||||  | ||  |||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  21840558 atatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgagtttgccaccacatctttcaaatttgcatgatgtattccacgtgtcgcaacttcgg 21840459  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  21840458 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 21840415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 351
Target Start/End: Original strand, 31416920 - 31417239
Alignment:
Q  32 cagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttc 131  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    |||||  |||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| |  ||||||||||    
T  31416920 cagactactgagaaagtcaagatgataagggaaaaggtgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgataagcggataaaggcccttgagtttc 31417019  T
Q  132 aagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatca 231  Q
    | || |  || || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| |||||||| |    
T  31417020 aggagggtgatcatgtttttctgagagttactcttatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatta 31417119  T
Q  232 gttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtat 331  Q
    | | |||||||| ||| |||| ||||| ||  ||||||  ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||    
T  31417120 gatttcagaaagggttggaacagtggcatatagagttgctttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaactacggaagtat 31417219  T
Q  332 gttccggatccatctcatgt 351  Q
    ||  ||||||| || |||||    
T  31417220 gtagcggatccttcgcatgt 31417239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 95 - 369
Target Start/End: Original strand, 16265127 - 16265401
Alignment:
Q  95 agttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 194  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |  || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16265127 agttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtctttctgagggtcactcctttgacgggtgttggatgtgctttgaagt 16265226  T
Q  195 caaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaattt 294  Q
    | | |||||||||||| |  || ||  ||||||||||| | ||||| || ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||    
T  16265227 cgaggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaactt 16265326  T
Q  295 gcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || |||||||| || || ||||||||    
T  16265327 gcacgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgtgattcaaagggatgatgt 16265401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 333
Target Start/End: Original strand, 31571289 - 31571589
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||   ||| || ||||||| ||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  31571289 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 31571388  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
    ||| |  || || || ||| ||||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||||| ||| ||| | |||||||||    
T  31571389 agagggtgatcatgtatttctgagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaaattcattggcccgtatcag 31571488  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| ||| |  |||||||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  31571489 atttcagagagaataggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatg 31571588  T
Q  333 t 333  Q
    |    
T  31571589 t 31571589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 354
Target Start/End: Original strand, 29303873 - 29304194
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    |||||||||||||||| |  |||||    ||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  29303873 agactactgagaaagtcagaatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttca 29303972  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| |||| |||||||   |||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |   | ||  |||||||||||    
T  29303973 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccaatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaggaagttgactccaaagatcataggtccgtatcag 29304072  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| ||| || |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||    
T  29304073 atttcagagagaattggaacagtggcttatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttaggaagtatg 29304172  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    |   |||||| || ||||||||    
T  29304173 tagaggatccttcacatgtgat 29304194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 23949252 - 23949158
Alignment:
Q  35 actactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  23949252 actactgagaaagttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaggaccttgagtt 23949158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 92 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 28982632 - 28982356
Alignment:
Q  92 aagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttga 191  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |  || || || ||| |||| |||||||   |||| |||||||||||||| ||||    
T  28982632 aagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccgttgacgggtgttggacgtgccttga 28982533  T
Q  192 agtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaa 291  Q
    |||| | |||||||||||| |  |||||| | ||||||||| | ||||| ||| || | || ||||| ||  ||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  28982532 agtcgaggaagttgactcctaagtttattggaccgtatcagatttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaa 28982433  T
Q  292 tttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 368  Q
     ||||| || || || ||||| || || |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  28982432 cttgcacgacgtgtttcatgtttctcagcttcggaaatatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 28982356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 92 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 28987852 - 28987576
Alignment:
Q  92 aagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttga 191  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |  || || || ||| |||| |||||||   |||| |||||||||||||| ||||    
T  28987852 aagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtcactccgttgacgggtgttggacgtgccttga 28987753  T
Q  192 agtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaa 291  Q
    |||| | |||||||||||| |  |||||| | ||||||||| | ||||| ||| || | || ||||| ||  ||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  28987752 agtcgaggaagttgactcctaagtttattggaccgtatcagatttcagagagaattggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaa 28987653  T
Q  292 tttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 368  Q
     ||||| || || || ||||| || || |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  28987652 cttgcacgacgtgtttcatgtttctcagcttcggaaatatgttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 28987576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 157 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 27347436 - 27347225
Alignment:
Q  157 agtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtg 256  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || ||| ||||||||||| | ||||| || ||| | || |||    
T  27347436 agtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttgggacagtg 27347337  T
Q  257 gcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcc 356  Q
    || ||   |||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || |||||||| |    
T  27347336 gcatataaagttggtttggcaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgtgattc 27347237  T
Q  357 agagtgatgatg 368  Q
     ||| |||||||    
T  27347236 cgagggatgatg 27347225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 12305092 - 12304771
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    |||||||||||||||| | | ||||    ||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  12305092 agactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttca 12304993  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| | || ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| |  || ||  |||||||||||    
T  12304992 ggagggtgatcatgtttttcttagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcag 12304893  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| || |||  ||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  12304892 atttcagagagggttgaaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 12304793  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    |  ||||||| || ||||||||    
T  12304792 tagcggatccttcgcatgtgat 12304771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 210
Target Start/End: Original strand, 20652780 - 20652957
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||  |||||| |||| |||||||||||| ||||| | ||||| ||| | ||||||||    
T  20652780 agactacggagaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtggacagaagagttatcattataagaggagaaaggatatagagtttca 20652879  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    ||  |  || || || ||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  20652880 agttggtgatcatgtatttttgagagtgaatcatgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 20652957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Original strand, 21196960 - 21197126
Alignment:
Q  44 aaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagacc 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||| | || | |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| | ||  || |    
T  21196960 aaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtctcagagttggcagaggagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggtaggtgatc 21197059  T
Q  144 acgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    | |||||||||||||| | || ||| ||||| ||||| ||| |||||||||  | ||||||||||||    
T  21197060 atgtgtttttgagagtgaatcctgtaactggagttggtcgtactttgaagtgtaggaagttgactcc 21197126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22051204 - 22051018
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||||||    ||||| ||||||| || |||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |  ||||    
T  22051204 gttcaacagacgacagagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttg 22051105  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||| |  || || || ||||||| ||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22051104 agtttcaagagggtgatcatgtatttttgaaagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcaaggaagttgactccga 22051018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22982756 - 22982593
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||  |  |||||| |||| |||||||||||||||||  |  |||||||| |||||||||| |  |  || || |    
T  22982756 gttaagatgatccaagagaagatgaaagcatctcagagtagacagaagagttatcatgataaaaggtgaaaagatattgagtttcaggttggtgatcatg 22982657  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
     |||||| ||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||    
T  22982656 cgttttttagagtgaatcatgtgattggtgttggtcgtgctttgaagtgtcagaagttgactcc 22982593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 18856931 - 18856853
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaa 91  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  18856931 aggaccagagattgttcagcaaactactaagaaagttcggatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaa 18856853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 22040213 - 22040163
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaaga 63  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22040213 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaaga 22040163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Original strand, 21850798 - 21850961
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| | ||  |||||| |||| ||||| |||||||||||| | |  || ||| ||||||||||||  |  || || |    
T  21850798 gttaagatgattcaggaaaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggatgaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 21850897  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    |||||||||| || | || |||||| |||||||| |||| ||||||||  | ||||||||||||    
T  21850898 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgatttgaagtgtaggaagttgactcc 21850961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Original strand, 16877556 - 16877719
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    |||||||||||||| || || ||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| |||||||||| |  | ||| || |    
T  16877556 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaggttggagatcatg 16877655  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    |||| ||||| || | ||  ||||| ||||| || |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  16877656 tgttcttgagggtgaatccggtgaccggtgtcggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 16877719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 207
Target Start/End: Original strand, 24818054 - 24818237
Alignment:
Q  24 ttgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 123  Q
    ||||||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||||  ||  |||||| |  | |||||||| |||||| || | || ||||||      
T  24818054 ttgttcaacagactacataaaaggttaagatgattcaggaaaagatgaaatcgtctcagagtaggaagaagagttaccatgatgagagaaggaaagatac 24818153  T
Q  124 tgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 207  Q
    |||||||||||  ||||| || |||||||| ||||| |  |  ||||| ||||| | ||||||||||||||  | |||||||||    
T  24818154 tgagtttcaagttgaagatcatgtgtttttaagagtgaacctcgtgaccggtgtcgaacgtgctttgaagtgtaggaagttgac 24818237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22315534 - 22315364
Alignment:
Q  24 ttgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 123  Q
    |||||||| | ||||| || || |||||||||||||| || || ||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||  |    
T  22315534 ttgttcaagaaactacagaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacat 22315435  T
Q  124 tgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 194  Q
    ||||||||| |  |  || || |||||||||||||| | || ||| || ||||| || |||||||||||||    
T  22315434 tgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcctgtaaccggtgtaggtcgtgctttgaagt 22315364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 337 - 369
Target Start/End: Original strand, 22179309 - 22179341
Alignment:
Q  337 ggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22179309 ggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 22179341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 65724 - 65369
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65724 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 65625  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  65624 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggcgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccga 65525  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  65524 gatttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcttatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgt 65425  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  65424 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca-agtgatgatgt 65369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 161 - 369
Target Start/End: Original strand, 39924 - 40132
Alignment:
Q  161 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgt 260  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||||||    
T  39924 actcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaatttgactccgagatttattggtccgtatcggatatgggaaagagttggaacggtggcgt 40023  T
Q  261 accgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagag 360  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40024 attgagttggattaccaccgcatctttcgaacttgcatgatgtctttcatgtgtcacaacttcggaagtatgtttcggatccatctcatgtgatccagag 40123  T
Q  361 tgatgatgt 369  Q
    |||||||||    
T  40124 tgatgatgt 40132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 113
Target Start/End: Original strand, 39806 - 39906
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39806 aggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgataagcgt 39905  T
Q  113 a 113  Q
    |    
T  39906 a 39906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 57)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 16355169 - 16355525
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||     
T  16355169 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaataattatcatgataagcgc 16355268  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16355269 aggaaagatcttgaatttcaagaaggaaaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 16355368  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16355369 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagacttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgt 16355468  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16355469 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 16355525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 16252169 - 16252525
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16252169 aggaccagagattcttcagcagactactgagaaggttaagatgattcaagagaaaataaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 16252268  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16252269 aggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 16252368  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16252369 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccacatctttcgaatttgcacgatgttttccatgt 16252468  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16252469 gtcgcaacttcagaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 16252525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 12523964 - 12523608
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12523964 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaccgt 12523865  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12523864 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccga 12523765  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  12523764 agtttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagttggattaccaccgcatctttcaaatttgcacgatgttttccatgt 12523665  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12523664 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgacgatgt 12523608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14680855 - 14680499
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14680855 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 14680756  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || || |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  14680755 aggaaggatcttgagtttcaggaacgagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaataagttgaccccga 14680656  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  14680655 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgacgtgttccatgt 14680556  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14680555 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgacgatgt 14680499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 23 - 336
Target Start/End: Original strand, 15149740 - 15150053
Alignment:
Q  23 attgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 122  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15149740 attgttcagcagactattgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatc 15149839  T
Q  123 ttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattag 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  15149840 ttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactctgagatttattgg 15149939  T
Q  223 tccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaactt 322  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15149940 tccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtgacgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaactt 15150039  T
Q  323 cggaagtatgttcc 336  Q
    ||||||||||||||    
T  15150040 cggaagtatgttcc 15150053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Original strand, 18227177 - 18227526
Alignment:
Q  20 gagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 119  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||      
T  18227177 gagattgttcagaagactactaagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaga 18227276  T
Q  120 atcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 219  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18227277 atcttgagtttcaggaaggagagcacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactctgagatttat 18227376  T
Q  220 tagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaa 319  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  18227377 tggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtatcgagtgggattaccaccgtatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaa 18227476  T
Q  320 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18227477 cttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 18227526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 7090720 - 7090365
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7090720 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgaagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgt 7090621  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7090620 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggatgagctttgaagtcaaagaagttgactccga 7090521  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| |  |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  7090520 gatttatt-gctcgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 7090422  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  7090421 gtcgcaacttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 7090365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 26 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14652583 - 14652240
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14652583 gttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagatcttg 14652484  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  14652483 agtttcaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttcgaggtttattggtcc 14652384  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||| || | | ||||||||||||||||||||||  |||| || ||| |||| |||||||||    
T  14652383 gtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggttcaccaccgcatctttcgaatttgcacaatgtgtttcatatgtcgcaacttcgg 14652284  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  14652283 aagtatgttccggatccatctcatgtgattcaaagagatgatgt 14652240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14159773 - 14159424
Alignment:
Q  20 gagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14159773 gagattgttcaacagactactgaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttatcatgataagcgtagaaaag 14159674  T
Q  120 atcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 219  Q
    ||||||| ||||||| || ||| || |||||  ||||||| ||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14159673 atcttgaatttcaaggaggagatcatgtgttcctgagagttactcccatgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccgaggtttat 14159574  T
Q  220 tagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaa 319  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||    
T  14159573 tggtccatatcagatatcagaaagaattggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcggaa 14159474  T
Q  320 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14159473 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgattcagagtgatgatgt 14159424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 23956035 - 23955691
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23956035 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 23955936  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23955935 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 23955836  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||| | || ||||||||    
T  23955835 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcataacgttttccatgt 23955736  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23955735 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 23955691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18297493 - 18297149
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18297493 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 18297394  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18297393 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 18297294  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  18297293 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 18297194  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18297193 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 18297149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 19778517 - 19778873
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778517 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 19778616  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19778617 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 19778716  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| || ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  19778717 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 19778816  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  19778817 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 19778873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 8386700 - 8386356
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8386700 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 8386601  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8386600 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 8386501  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  8386500 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 8386401  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8386400 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 8386356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 14303702 - 14304057
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14303702 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgt 14303801  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14303802 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac-ccga 14303900  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  14303901 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 14304000  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  14304001 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 14304057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27711624 - 27711268
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27711624 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 27711525  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27711524 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 27711425  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  27711424 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 27711325  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||    
T  27711324 gtcgcaacttcaaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcaaagtgacgatgt 27711268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 12476888 - 12476544
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12476888 aggaccagagattgttcagcaaactactgaggaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 12476789  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12476788 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 12476689  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  12476688 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 12476589  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
     || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12476588 atcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 12476544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 14851090 - 14851446
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14851090 aggaccagaaattgttcaacaaactattgagaaggttaagatgatacaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 14851189  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || ||| | |||||||||||||||| ||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14851190 aggaaaaaccttgagtttcaagaaggagatcatgtattttttagagtcactcatgtgaccggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttaactccga 14851289  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    | |||||| ||||||||||| |||  |||||| || ||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14851290 ggtttattggtccgtatcagatataggaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtatttcatgt 14851389  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||    
T  14851390 gtcgcaaattcggaagtatgttccggatccatctcatgtgctcccaagagatgatgt 14851446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Original strand, 29039128 - 29039472
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29039128 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 29039227  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29039228 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgaccggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 29039327  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | || |||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  29039328 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 29039427  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29039428 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 29039472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 40473321 - 40472972
Alignment:
Q  20 gagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 119  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40473321 gagattgttcagcaaactactgagaaagttcaaatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgtagaaaag 40473222  T
Q  120 atcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 219  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||    
T  40473221 atcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcat 40473122  T
Q  220 tagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaa 319  Q
    | ||| ||||||| |||  ||||||||| ||||| |||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||    
T  40473121 tggtctgtatcagatattggaaagagttggaacgatggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgcaa 40473022  T
Q  320 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  40473021 cttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 40472972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 14266623 - 14266979
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||   ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14266623 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttcagatgatctgagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 14266722  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14266723 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacatgtttttgagagtcacccctatgactggtgtatgacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 14266822  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| |||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  14266823 agttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 14266922  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  14266923 gtcgcaacttcggaagtatgtttcggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 14266979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 8053347 - 8053703
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8053347 aggaccagaaattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgt 8053446  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8053447 agaagagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 8053546  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| ||   ||||||||| ||||| |||| ||||| || || ||| | ||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  8053547 agttcattggtccgtatcagatactggaaagagttggaacgatggcttaccgtgtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 8053646  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8053647 gtcgcaacttcgaaagtatgtttcggatccatctcatgtgatccaaagtgacgatgt 8053703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 104 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15364583 - 15364330
Alignment:
Q  104 gataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagt 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15364583 gataagcgtagaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagt 15364484  T
Q  204 tgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 303  Q
    |||| ||||  || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | ||    
T  15364483 tgaccccgaagttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgt 15364384  T
Q  304 cttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
     |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15364383 tttccatatgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 15364330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 181 - 369
Target Start/End: Original strand, 14927151 - 14927339
Alignment:
Q  181 acgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccg 280  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| || ||| |||||    
T  14927151 acgtgcattgaagtcaaagaatttgactcctagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtactgagtgggtttaccaccg 14927250  T
Q  281 catctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14927251 catctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 14927339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 351
Target Start/End: Original strand, 15003361 - 15003686
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||   ||||    
T  15003361 gttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtagaaaatcccttg 15003460  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | ||| || |||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||  |||    
T  15003461 agtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagttactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagtttattgatcc 15003560  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
     |||||| |||| || |||||| |||| ||||| ||  |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  15003561 atatcagatatctgagagagttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 15003660  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  15003661 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 15003686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 164
Target Start/End: Original strand, 16676427 - 16676578
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16676427 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgatttaagagaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 16676526  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactc 164  Q
    || || ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16676527 aggaaggatcttgagtttcagcaaggagaccacgtgtttttgagagtcactc 16676578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 33 - 368
Target Start/End: Original strand, 3264798 - 3265133
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   |||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3264798 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 3264897  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  3264898 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 3264997  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| |||||| | || ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  3264998 atttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 3265097  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 368  Q
    || ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  3265098 ttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 3265133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 368
Target Start/End: Original strand, 11207235 - 11207570
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   |||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11207235 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 11207334  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||| |||||||||||    
T  11207335 ggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcag 11207434  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| |||||| | || ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  11207435 atttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 11207534  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 368  Q
    || ||||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  11207535 ttgcggatccttcacatgtgataccgagggatgatg 11207570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16146187 - 16145862
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||| ||||    ||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  16146187 gttcatcagactacggagaaagtcaaggtgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 16146088  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    ||||||| || || || || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| ||||    
T  16146087 agtttcaggaggatgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 16145988  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| | ||||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  16145987 gtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgttacatgtgtcgcagcttcgg 16145888  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  16145887 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 16145862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 15070688 - 15070360
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   |||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||    
T  15070688 gttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggcccttg 15070589  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||| | |||| ||||| || ||||  |||||||  | |||||||||| |||  |||||| ||||    
T  15070588 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtgtaggtcgtgtgttgaagtttatgaagttgactacgaagtttattggtcc 15070489  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
     || ||| |||  || |||||| |||| ||||| ||| | || || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  15070488 ataccagatatttgagagagttggaacagtggcatacagggtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 15070389  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    |||||||   ||||||| || ||||||||    
T  15070388 aagtatgcagcggatccttcgcatgtgat 15070360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 33 - 368
Target Start/End: Original strand, 29453541 - 29453876
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   |||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29453541 agactactgagaaagtaaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 29453640  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||| |||||||||||    
T  29453641 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcag 29453740  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| |||||| | || ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  29453741 atttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 29453840  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 368  Q
    || ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  29453841 ttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 29453876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Original strand, 1640156 - 1640293
Alignment:
Q  20 gagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1640156 gagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaggcgtcgcagagttgacaaaagagttatcatgataagcataggaaag 1640255  T
Q  120 atcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgaga 157  Q
    | |||||||| ||||||| ||| || || |||||||||    
T  1640256 accttgagttccaagaaggagatcatgtatttttgaga 1640293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15246199 - 15245856
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| ||||||||  |||| || ||||||||   |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |   |||    
T  15246199 gttcatcagactacgaagaaggtaaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaaacgtaggaaggcctttg 15246100  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    ||||||| || | ||| || || ||| ||||||| || | | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||| ||||    
T  15246099 agtttcaggagggagatcatgtatttctgagagttacccctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtcc 15246000  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| || |||| || ||| |||| ||||| ||| ||||  | ||  |||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||| |    
T  15245999 gtatcagataacagagagggttggaacagtggcatacagagtgcgtttgccaccacatctttcgaatttgcattatgtgtttcatgtgtcgcaacttcag 15245900  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  15245899 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 15245856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 201
Target Start/End: Original strand, 15415065 - 15415198
Alignment:
Q  68 atgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 167  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  15415065 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttgaatttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcttg 15415164  T
Q  168 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaa 201  Q
    |||  |||||||| ||||| ||||| || |||||    
T  15415165 tgataggtgttggtcgtgccttgaaatcgaagaa 15415198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 33 - 354
Target Start/End: Original strand, 44661870 - 44662191
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   |||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44661870 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccgtgacaagcggagaaaggatcttgagtttca 44661969  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| |||| || |||| | |||| |||||||| |||||  ||||||| |  ||||||||||| |  || ||| |||||||||||    
T  44661970 ggagggtgatcatgtttttctgagggttactcctttgacgggtgttggtcgtgcgctgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcag 44662069  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  44662070 atttcagagagagttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 44662169  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    || ||||||| |||||||||||    
T  44662170 ttgcggatccttctcatgtgat 44662191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 35 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 33223184 - 33222865
Alignment:
Q  35 actactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 134  Q
    |||||||||||||| ||| ||||    ||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  33223184 actactgagaaagtcaagttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggaacttgagtttcagg 33223085  T
Q  135 aagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagtt 234  Q
    | |  || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || |  || ||| ||||||||||| |    
T  33223084 agggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgacaccaaagttcattggtccgtatcagat 33222985  T
Q  235 atcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgtt 334  Q
     ||| | |||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| |||||||||||  |||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||     
T  33222984 ttcaaagagagttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccccatctttcgaacatgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgta 33222885  T
Q  335 ccggatccatctcatgtgat 354  Q
     ||||||| || ||||||||    
T  33222884 gcggatccttcacatgtgat 33222865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 351
Target Start/End: Original strand, 1649309 - 1649599
Alignment:
Q  61 agaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtc 160  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| || || ||||| || || || ||||||||||| || |  || || || ||| | |||||     
T  1649309 agaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttaccacgacaagcggaggaaggaccttgagtttcaggagggcgatcatgtatttctaagagtt 1649408  T
Q  161 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgt 260  Q
    |||| | |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |  || ||| ||||||||||| ||||||| ||  || |||| ||||| |    
T  1649409 actcctatgacgggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgacttccaagttcattggtccgtatcagatatcagagaggattggaactgtggcat 1649508  T
Q  261 accgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    |  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||  ||||||| || |||||    
T  1649509 atagagttgggttgccacctcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagctacggaagtatgtagcggatccttcacatgt 1649599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 20891250 - 20890930
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    |||||||||||||||| | | ||||    ||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  20891250 agactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttca 20891151  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  |||||| || ||||||||    
T  20891150 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggttcgtatcag 20891051  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| || ||| |||| ||||| ||  | | ||| ||  || | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  20891050 atttcagagagggttggaacagtggcatatag-gatgggtttccaacacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 20890952  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    |  ||||||| || ||||||||    
T  20890951 tagcggatccttcacatgtgat 20890930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 282 - 369
Target Start/End: Original strand, 18607823 - 18607910
Alignment:
Q  282 atctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18607823 atctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgaagatgt 18607910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 333
Target Start/End: Original strand, 51606185 - 51606485
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||   ||| || ||||||| ||  ||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |  |||||||||||    
T  51606185 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaaacggagaaaggcccttgagtttca 51606284  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
    ||| |  || || || ||| | ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  51606285 agagggtgatcatgtatttataagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtccgtatcag 51606384  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| ||| |  |||||||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  51606385 atttcagagagaatcggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatg 51606484  T
Q  333 t 333  Q
    |    
T  51606485 t 51606485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 240
Target Start/End: Original strand, 15359087 - 15359301
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   |||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |  ||||    
T  15359087 gttcatcagactacggagaaggtaaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttttcatgacaagcgtagaaaggcccttg 15359186  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | ||| || || |||  |||||| |||| | |||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |  || ||| |||     
T  15359187 agtttcaagagggagatcatgtatttccgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaaatcgaagaagttgactccaaagttcattggtct 15359286  T
Q  226 gtatcagttatcaga 240  Q
    ||||||| |||||||    
T  15359287 gtatcagatatcaga 15359301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 168 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 42703036 - 42702871
Alignment:
Q  168 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagt 267  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||  || ||| ||||||||||| | ||||| ||| |  |||||||||| ||  ||||    
T  42703036 tgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagagaatcggaacggtggcatatagagt 42702937  T
Q  268 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgt 333  Q
    ||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  42702936 tggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatgt 42702871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13247899 - 13247736
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |  || || |    
T  13247899 gttaagatgattcaagagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaagatattgagtttcaagttggtgatcatg 13247800  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    | |||||||| || | ||||||||  |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||    
T  13247799 tatttttgagggtgaatcatgtgatcggtgttggtcttgctttgaagtgtaggaagttgactcc 13247736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14997570 - 14997407
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||  |||||| |||| |||||| ||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  |  || || |    
T  14997570 gttaagatgattcaagaaaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagtcatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 14997471  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    |||||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  14997470 tgtttttgagggtgaatcttgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 14997407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 194
Target Start/End: Original strand, 12132404 - 12132574
Alignment:
Q  24 ttgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 123  Q
    |||| ||| ||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| | ||  || ||| | || ||||||| |||||||||| | || || ||  |    
T  12132404 ttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaggcgtctcaaagtaggcagaagagttgtcatgataagaggaggaaggacat 12132503  T
Q  124 tgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 194  Q
    |||||||||||  |  || || ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12132504 tgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 12132574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 18164332 - 18164474
Alignment:
Q  172 tggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttgga 271  Q
    |||||| ||| |||| |||||||| |||||| ||||||| |  || ||| ||||||||||| ||||||| || ||| |||| ||||| ||| |||| ||     
T  18164332 tggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaagctgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggcatacagagtgggt 18164431  T
Q  272 ttatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgt 314  Q
    ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  18164432 ttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgt 18164474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27900654 - 27900477
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||||| || |||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  27900654 agactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgatagaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttca 27900555  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
     || |  || || || ||| |||| || |||| | ||||  |||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27900554 ggagggtgatcatgtttttctgagggttactcctatgacgagtgtagaacgtgcattgaagtcgaagaagttgactcc 27900477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 208
Target Start/End: Original strand, 55375376 - 55375537
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||| ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  |  || || |    
T  55375376 gttaagatgattcagtagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 55375475  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgact 208  Q
    |||||||||| || | || ||| ||||||||||| || ||||||||||  | ||||||||||    
T  55375476 tgtttttgagggtgaatcctgtaactggtgttggtcgagctttgaagtgtatgaagttgact 55375537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16752832 - 16752665
Alignment:
Q  62 gaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtca 161  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || || || ||||||||||| |    
T  16752832 gaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagtta 16752733  T
Q  162 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtat 229  Q
    |||   |||| ||||| |||||||||||||| || | |||||| |||||||  || ||| ||||||||    
T  16752732 ctccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttaactccgaagttcattggtccgtat 16752665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Original strand, 16445230 - 16445393
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    |||||||||||||| || || ||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| ||||||||||||  |  || || |    
T  16445230 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 16445329  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    ||||||| || || | || ||||||||| || || |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  16445330 tgttttttagggtgaatcctgtgactggagtgggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 16445393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 232
Target Start/End: Original strand, 9849473 - 9849681
Alignment:
Q  24 ttgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 123  Q
    ||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||| || || |||||||  | | ||||| |  | ||||||| ||||||||| |  || || ||| |    
T  9849473 ttgttcagcagactatggagaaggttaagatgattcaggagaagatgaaagcatcgtagagtaggtagaagagttgtcatgataaacagaggaaggatat 9849572  T
Q  124 tgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagt 223  Q
    ||| |||||||  | ||| ||  |||||||||||||    |  ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||| ||    
T  9849573 tgaatttcaagtcggagatcaaatgtttttgagagttgacctagtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtccaagaagttgacaccgtgttttattggt 9849672  T
Q  224 ccgtatcag 232  Q
    || ||||||    
T  9849673 ccttatcag 9849681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9291089 - 9290926
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    |||||||||||||| || || ||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  |  || || |    
T  9291089 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcagg 9290990  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    | |||||||| || | || |||||| | |||||| | |||||||||||  | ||||||||||||    
T  9290989 tatttttgagggtgaatcctgtgaccgatgttggtcatgctttgaagtgtaggaagttgactcc 9290926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Original strand, 15293175 - 15293338
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    |||||||||||||| || || ||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||||||  | || || ||| ||||||||||||  |  || || |    
T  15293175 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataaaaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 15293274  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    |||||||||| || | || ||||| ||| || || |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  15293275 tgtttttgagggtgaatcctgtgaatggagtgggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 15293338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 351
Target Start/End: Original strand, 15415226 - 15415301
Alignment:
Q  276 caccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  15415226 caccacatccttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 15415301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 15077910 - 15077825
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 111  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   |||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  15077910 gttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcg 15077825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15319603 - 15319515
Alignment:
Q  281 catctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||| ||| |||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  15319603 catctttcaaatctgcatgatgtgtttcctgtgtcacaacttcagaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 15319515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 369
Target Start/End: Original strand, 15351934 - 15351966
Alignment:
Q  337 ggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15351934 ggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 15351966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 8706196 - 8706093
Alignment:
Q  23 attgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 122  Q
    |||||||| |||||||  || ||||||||| | ||   |||||| ||||||| || ||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  8706196 attgttcaccagactatagaaaaagttaagctaataagagaaaagatgaaagcgtcgcagaatcgacacaagagttatcacgacaagcgtaggaaagacc 8706097  T
Q  123 ttga 126  Q
    ||||    
T  8706096 ttga 8706093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 995 - 639
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  995 aggaccagagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcaacaaaagagttatcatgataagcat 896  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  895 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 796  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||| ||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  795 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagggttggaatggtggcgtatcgtgttggcttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgt 696  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  695 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14679 - 14323
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14679 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 14580  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || || |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14579 aggaaggatcttgagtttcaggaaggataccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccga 14480  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14479 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgggtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtcttccatgt 14380  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14379 gtcgaaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 14323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 939 - 583
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  939 aggaccagagattgttcagcagactagtaagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcaccataagcgt 840  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  839 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 740  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| |||| |||||  |||  ||||||||| |||||||||| |||| ||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  739 agttcattggtccatatcaaatattggaaagagttggaacggtggcttaccaagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 640  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  639 gtcgcaacttcgaaagtatgtttcggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 67)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 20 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12498171 - 12497824
Alignment:
Q  20 gagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  12498171 gagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaag 12498072  T
Q  120 atcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 219  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12498071 atcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgccttgaattcaaagaagttgactccgagatttat 12497972  T
Q  220 tagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaa 319  Q
    | ||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  12497971 tggtccgtaacagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaa 12497872  T
Q  320 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12497871 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgat 12497824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 20 - 367
Target Start/End: Original strand, 12510730 - 12511077
Alignment:
Q  20 gagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  12510730 gagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaag 12510829  T
Q  120 atcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 219  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12510830 atcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgccttgaattcaaagaagttgactccgagatttat 12510929  T
Q  220 tagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaa 319  Q
    | ||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  12510930 tggtccgtaacagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaa 12511029  T
Q  320 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12511030 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgat 12511077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19864839 - 19864483
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  19864839 aggaccagagattggtcagcagactactgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgc 19864740  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19864739 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttttttagagtcactcctgtgactggtgttggatgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 19864640  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19864639 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagatttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgtatgatgtctttcatgt 19864540  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19864539 gtcgcaacttcagaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 19864483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 25765419 - 25765774
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25765419 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagtaaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttatcatgataagcgt 25765518  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25765519 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgcttttgagagtcacgc-tgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 25765617  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  25765618 gatttattggtctgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggtgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaacttgcacgatgtgttccatgt 25765717  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25765718 gtcgtaactttggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 25765774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 16963496 - 16963852
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16963496 aggaccagagattgttcagcagactacagagaaagtaaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 16963595  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16963596 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccaagtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtaaaagaagttgactccga 16963695  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| |||| |||||| |||| |||| |||| ||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  16963696 gatttattggtccatatcagatatcggaaatagttggaacgatggcgtatcgtgttggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtattacatgt 16963795  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963796 gtcgcaacttcgaaagtatgtaccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 16963852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 20 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12505500 - 12505153
Alignment:
Q  20 gagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 119  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  12505500 gagattgttcatcatactactgagaatgttaagatgattcaagagaatatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaag 12505401  T
Q  120 atcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 219  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12505400 atcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgccttgaattcaaagaagttgactccgagatttat 12505301  T
Q  220 tagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaa 319  Q
    | ||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  12505300 tggtccgtaacagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgatttttcatgatgttttccatgtgtcgcaa 12505201  T
Q  320 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12505200 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgat 12505153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 16927769 - 16928125
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  16927769 aggaccagagattgttcagcagactacagggaaagtaaagatgattcaagaaaagatgaaagcgccgcagagtcgaaaaaagagttatcatgataagcgc 16927868  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16927869 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcttgtgactagtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 16927968  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| | || |||||    
T  16927969 gatttattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcgtatcgtcttggattaccaccgcatctttcgaattcgcacgatatattacatgt 16928068  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16928069 gtcgcaacttcgaaagtatgtaccggatccatctcatgtgatacagagtgatgatgt 16928125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Original strand, 27331569 - 27331918
Alignment:
Q  20 gagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 119  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27331569 gagaatgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaag 27331668  T
Q  120 atcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 219  Q
    | ||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27331669 accttgagtttcaagaaggggatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtaaaggaagttgactccgagatttat 27331768  T
Q  220 tagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaa 319  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |||    
T  27331769 tggtccatatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttgatgtgtcgcaa 27331868  T
Q  320 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27331869 cttcggaagtatgttctggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 27331918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Original strand, 27392309 - 27392658
Alignment:
Q  20 gagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 119  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27392309 gagaatgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttaccatgataagcgtagaaaag 27392408  T
Q  120 atcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 219  Q
    | ||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  27392409 accttgagtttcaagaaggggatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtaaaggaagttgactccgagatttat 27392508  T
Q  220 tagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaa 319  Q
    | |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |||    
T  27392509 tggtccatatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttgatgtgtcgcaa 27392608  T
Q  320 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27392609 cttcggaagtatgttctggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 27392658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Original strand, 22078823 - 22079173
Alignment:
Q  19 agagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaa 118  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  22078823 agagattgttcaacaaaccactgagaaggttaagatgattccagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcttaggaaa 22078922  T
Q  119 gatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22078923 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgattggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagattta 22079022  T
Q  219 ttagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcaca 318  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  ||    
T  22079023 ttcgtccgtatcagatatcggaaagagttggtacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtagca 22079122  T
Q  319 acttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22079123 acttcggaagtatgttcctgatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 22079173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23078621 - 23078265
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23078621 aggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcatcgcagactcgacaaaagagttatcatgataagcgt 23078522  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || ||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  23078521 aggaaagaccttgagtttcaagagggagatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttgggcgcgcattgaagtcaaagaagttgactccga 23078422  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| || |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| || || || |||||    
T  23078421 gatttatttgttcgtatcagatatcggaaagagtttaaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcaagaagtattacatgt 23078322  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23078321 atcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 23078265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 5839348 - 5839704
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  5839348 aggaccagagattgttcagcagactacagagaaagtcaagatgatttaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgc 5839447  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  5839448 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacacgtttttgagagtcactcctatgacaggtgtaggacgtgcgttgaagtctaagaagttgacttcga 5839547  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  5839548 agtttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtatcgagttggtttaccaccgcatctttcgaatttacatgatgttttccatgt 5839647  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5839648 gtcgcaacttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgatccagagtgatgatgt 5839704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 25609990 - 25610346
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25609990 aggaccagagattgttcagcaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgt 25610089  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25610090 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacatgtttttgagagtcacacctgtgaccggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgattccga 25610189  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| || |||||    
T  25610190 gatttattggtccgtattagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgtgttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcgcgatgtgtttcatgt 25610289  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25610290 gtcgcaacttcggaagtatgtatcggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 25610346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Original strand, 1543213 - 1543563
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  1543213 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcccagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgc 1543312  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1543313 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtagggcgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 1543412  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||| ||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  1543413 agttcattggtctgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 1543512  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtga 363  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1543513 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaatccagagtga 1543563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 18408072 - 18408428
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||| || | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18408072 aggaccagagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagataattcaagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaatagttaccatgataagcgt 18408171  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18408172 aggaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtatttttgagagtaactcgtgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccga 18408271  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||    
T  18408272 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgggtgggattaccaccgcacctttcgaatttgcactatgtgtttcatgt 18408371  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||  |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18408372 gtcgcaacttcgaaagtatgcaccggattcatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 18408428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 81 - 369
Target Start/End: Original strand, 21833178 - 21833466
Alignment:
Q  81 agagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttgg 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21833178 agagtcgacaaaagagttatcatgataagcgcaggaaagatcttgaatttcaagaaggaaaccacatgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttgg 21833277  T
Q  181 acgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccg 280  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  21833278 aggtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttataggtccgtatcagatatcggaaagagttggaatggtggcgtatcgagtgggattaccaccg 21833377  T
Q  281 catctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21833378 catctttcgaatttgcatgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 21833466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 16626846 - 16627202
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626846 aggaccagagattgttcagcaaactattgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 16626945  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16626946 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 16627045  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  16627046 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 16627145  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  16627146 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 16627202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 24313297 - 24313653
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24313297 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcat 24313396  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24313397 aggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 24313496  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  24313497 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 24313596  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  24313597 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 24313653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 28263326 - 28263682
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28263326 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 28263425  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28263426 agaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 28263525  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| | |||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  28263526 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 28263625  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  28263626 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 28263682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 28342075 - 28342431
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28342075 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 28342174  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28342175 agaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 28342274  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| | |||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  28342275 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 28342374  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  28342375 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 28342431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Original strand, 29592049 - 29592393
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29592049 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 29592148  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29592149 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 29592248  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | || |||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  29592249 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccacatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 29592348  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29592349 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 29592393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 25112704 - 25112348
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||| ||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25112704 aggaccagcgatcgttcagcaaactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaattaaagcgtcgcagagtcgacaaaagacttatcatgataagcgt 25112605  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25112604 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagctgaccccga 25112505  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||  |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  25112504 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagtcggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 25112405  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  25112404 gtcgcaacttcagaagtatgttccggatccatctcatgtaatccagagtgacgatgt 25112348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 2874932 - 2875288
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2874932 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcggatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgt 2875031  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  2875032 agaaaagattttgagtttcaagaaggagaccacgagtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaataagttgaccccga 2875131  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||| ||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  2875132 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 2875231  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  2875232 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 2875288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27187588 - 27187232
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27187588 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcga 27187489  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27187488 agaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgaccccga 27187389  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
     ||| ||| |||| |||||| | |  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  27187388 aattcattggtccatatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgcagcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 27187289  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  27187288 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 27187232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 27261652 - 27262008
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27261652 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcga 27261751  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27261752 agaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgaccccga 27261851  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
     ||| ||| |||| |||||| | |  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  27261852 aattcattggtccatatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgcagcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 27261951  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  27261952 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 27262008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 22762584 - 22762940
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||| | | ||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  22762584 aggaccagagattgttcaacaaattacttagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagtttcggagagtcgacaatagagttacaatgataagcgt 22762683  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22762684 aggacagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttgtgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgaccccga 22762783  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||| || ||| ||||||||||||||||||||||   ||| || |||||    
T  22762784 gatttattggtccgaatcagatatcggaaagagttggaacgatggcgtatcaagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcactttgtgtttcatgt 22762883  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  22762884 gtcgcaacttcggaagtatgtatcggatccctcccatgtgatccaaagtgatgatgt 22762940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 28292501 - 28292857
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28292501 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgt 28292600  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  28292601 agaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagttaaagaagttgaccccga 28292700  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| |||| |||||| | |  ||||||||| | |||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  28292701 agttcattggtccatatcagattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 28292800  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  28292801 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 28292857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 145 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 17032582 - 17032358
Alignment:
Q  145 cgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaaga 244  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  17032582 cgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtgggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgaccccgaagtttattggtccgtatcagatatcggaaaga 17032483  T
Q  245 gttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccat 344  Q
    ||| |||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17032482 gttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccat 17032383  T
Q  345 ctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  17032382 ctcatgtgatccagagtgacgatgt 17032358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 343
Target Start/End: Original strand, 18197676 - 18198006
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18197676 aggaccagcgattgtttaacagactactgagaaggtaaagatgatttaagaaaagatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 18197775  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
     | ||||| ||| |||||||||| | | | || || ||| ||| |||||||| ||||||  |||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  18197776 cggaaagaccttaagtttcaagagggatatcatgtatttctgaaagtcactcttgtgacaagtgtaggacgcgaattgaagtcaaagaagttgactccga 18197875  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    | |||||| ||| |||| || |||| |||||| ||  ||| |||||||| ||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18197876 ggtttattggtctgtataagatatcggaaagaatttaaacagtggcgtatcgagtgggtttgccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgt 18197975  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatcca 343  Q
     || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  18197976 ttcgcaacttcggaagtatgttctggatcca 18198006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 61 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 21471705 - 21471412
Alignment:
Q  61 agaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtc 160  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||    
T  21471705 agaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtc 21471606  T
Q  161 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgt 260  Q
    |||| | |||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||  ||||||  |||||| ||| |||| || |||||| |||| ||||| |    
T  21471605 actcctatgacgggggtaggacgtgcgttgaaatctaagaagttgactccgaagtttattgatccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggcat 21471506  T
Q  261 accgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    || |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  21471505 acagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgtgat 21471412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 79 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 25750895 - 25750605
Alignment:
Q  79 gcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgtt 178  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||| |||||| |||||     
T  25750895 gcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactcttgtgacgggtgta 25750796  T
Q  179 ggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcac 278  Q
     ||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||| |||| || |||||| |||| ||||| ||| |||| || ||  |||    
T  25750795 agacgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgccac 25750696  T
Q  279 cgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    | ||||||||||||||||||||| | || |||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  25750695 cacatctttcgaatttgcatgatatgtttcatgtgtcgcatcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 25750605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 234 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22433928 - 22433793
Alignment:
Q  234 tatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgt 333  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  22433928 tatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtttttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 22433829  T
Q  334 tccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22433828 tccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 22433793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 33 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15459468 - 15459150
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||  ||| || ||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  15459468 agactacggagaaagtcaggatgattagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctaccatgacaagcgtaggaaagatcttgagtttca 15459369  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     ||||  ||||| || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| |||| ||||||    
T  15459368 ggaaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttatcag 15459269  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | |||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | ||||||||||    
T  15459268 atttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagtgggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtatttcatgtatcacagttgcggaagtatg 15459169  T
Q  333 ttccggatccatctcatgt 351  Q
    | || ||||| || |||||    
T  15459168 tacctgatccttcgcatgt 15459150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 61 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 25768295 - 25768023
Alignment:
Q  61 agaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtc 160  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||    
T  25768295 agaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtc 25768196  T
Q  161 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgt 260  Q
    |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| | |  |||||| ||||||| ||| |||| || |||||| |||| ||||| |    
T  25768195 actcttatgacgggtgtaggacgtgcgttgaagtctaagaaattgacttcaaagtttattggtccgtaccagatatctgagagagttggaacagtggcat 25768096  T
Q  261 accgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgt 333  Q
    || |||| || ||  |||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||    
T  25768095 acagagtgggtttgccaccacatctttccaatttgcatgatgtgtttcacgtgtcgcagcttcggaagtatgt 25768023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 68 - 342
Target Start/End: Original strand, 14131363 - 14131637
Alignment:
Q  68 atgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 167  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || || |||||||| |||| ||| || |||||| |||| ||||||| |     
T  14131363 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaggacctggagtttcaggaaggagatcatgtgtttctgagggtcactccta 14131462  T
Q  168 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagt 267  Q
    |||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||| || |||||| |||| ||||| ||  ||||    
T  14131463 tgacaggtgtaggtcgtgcattgaagtctaagaagttgacttcgaagtttattggtccgtatcagatatctgagagagttggaacagtggcatatagagt 14131562  T
Q  268 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatcc 342  Q
     || ||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||  |||||||    
T  14131563 gggtttgccacaacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcagttacggaagtatgtaacggatcc 14131637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 33 - 354
Target Start/End: Original strand, 10468998 - 10469319
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   |||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10468998 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 10469097  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| |||||||||||    
T  10469098 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 10469197  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| || ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| |||||||||||  |||||||||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  10469198 atttcagagagggttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacctgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 10469297  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    |  ||||||| || ||||||||    
T  10469298 tagcggatccttcacatgtgat 10469319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 369
Target Start/End: Original strand, 22796774 - 22797117
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||    ||||| ||||||| || ||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  22796774 gttcatcagactacagagaaggttaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcaaagtctacataagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttg 22796873  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | ||| || |||||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  |||||| |||     
T  22796874 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaggaagttgactcctaagtttattggtct 22796973  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||  |||| || || ||| |||| ||||| ||  |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  22796974 gtatcatatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 22797073  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||   ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  22797074 aagtatgcagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 22797117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 351
Target Start/End: Original strand, 34645728 - 34646053
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    |||||||| ||||| || || |||||| ||||   |||| | ||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||    
T  34645728 gttcaacaaactacagaaaaggttaagttgataagagaacatatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttg 34645827  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | ||| || ||||| ||||| ||||||| | |||| ||||| || ||||| || || || |||||||||||||| |  |||||| | ||    
T  34645828 agtttcaagagggagatcatgtgttcttgagggtcactcctatgacaggtgtgggtcgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggccc 34645927  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
     |||||| |||| || |||||| |||| ||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||  | |||    
T  34645928 atatcagatatctgagagagttggaactgtggcgtatagaattggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcgg 34646027  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    ||||| || || ||||| || |||||    
T  34646028 aagtacgtacctgatccttcgcatgt 34646053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 68 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 19879395 - 19879112
Alignment:
Q  68 atgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 167  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||| |     
T  19879395 atgaaagggtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactccta 19879296  T
Q  168 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagt 267  Q
    || | ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||| |  |||||| | || |||||| |||| || |||||| |||| ||||| ||  | ||    
T  19879295 tggcaggtgtaggccgtgcattgaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcttatagggt 19879196  T
Q  268 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
     || ||| | || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  19879195 gggtttaccccctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccatgtgtcacagttgcggaagtatgtaccggatccttcgcatgt 19879112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18794826 - 18794504
Alignment:
Q  29 caacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagt 128  Q
    ||||||||||| || || |||||| ||||   |||| | ||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||| |||    
T  18794826 caacagactacagaaaaggttaagttgataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaatcgtaggaaagaccttcagt 18794727  T
Q  129 ttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgta 228  Q
    ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||| | |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  |||||| | || ||    
T  18794726 ttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggccgtgccttaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccata 18794627  T
Q  229 tcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaag 328  Q
    |||| ||||  | || ||| |||| ||||| || ||||| || ||  |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | || |||    
T  18794626 tcagatatctaagagggttggaacagtggcatatcgagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacaattacgaaag 18794527  T
Q  329 tatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    ||||| |||||||| || |||||    
T  18794526 tatgtaccggatccgtcgcatgt 18794504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 24364544 - 24364223
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   |||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24364544 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggatcttgagtttca 24364445  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||| |||||  ||||||| |  ||||||||||| |  || ||| |||||||||||    
T  24364444 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgtgcgctgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcag 24364345  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| |||||| | || ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  24364344 atttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 24364245  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    || ||||||| |||||||||||    
T  24364244 ttgcggatccttctcatgtgat 24364223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 342
Target Start/End: Original strand, 21564316 - 21564590
Alignment:
Q  68 atgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 167  Q
    ||||||| || | |||||||||| ||||| |||||||| || ||||| || || |||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||| |     
T  21564316 atgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagctatcatgacaaacgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactcctt 21564415  T
Q  168 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagt 267  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||| |||| || || ||| |||| ||||||||  ||||    
T  21564416 tgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtccatatcagatatctgagagggttggaacagtggcgtatagagt 21564515  T
Q  268 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatcc 342  Q
     || ||  | || ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  21564516 gggtttgccgcctcatctttagaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacaattacggaagtatgtaccggatcc 21564590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 59 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 11291918 - 11291818
Alignment:
Q  59 caagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagag 158  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  11291918 caagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgtagaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagag 11291819  T
Q  159 t 159  Q
    |    
T  11291818 t 11291818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 351
Target Start/End: Original strand, 8766297 - 8766615
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||| | || | |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  8766297 agactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaggcgtcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 8766396  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || |||||| |||| || |||  | ||||  | || |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||  |||||||||||    
T  8766397 ggagggtgatcatgtgtttctgagggttacttctatgacaagggtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcag 8766496  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| || ||| |||| ||||| ||| |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  8766497 atttcagagagggttggaacagtggcttacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatg 8766596  T
Q  333 ttccggatccatctcatgt 351  Q
    |  ||||||| || |||||    
T  8766597 tagcggatccttcgcatgt 8766615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22434021 - 22433927
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgata 107  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22434021 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgata 22433927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 340
Target Start/End: Original strand, 11287782 - 11288054
Alignment:
Q  68 atgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 167  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| | |     
T  11287782 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcaccccta 11287881  T
Q  168 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagt 267  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||||||||| |  |||||| | || |||||| |||| || |||||| |||| ||||| ||  | ||    
T  11287882 tgacgggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcttatagggt 11287981  T
Q  268 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggat 340  Q
     || ||| | || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||    
T  11287982 gggtttaccccctcatctttcaaatttgcatgacgtgttccatgtgtcacagttgcggaactatgtaccggat 11288054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 17415625 - 17415365
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    ||||| ||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |  ||||    
T  17415625 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttaccatggcaagcgtagaaaggcccttg 17415526  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | ||| || |||||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||| ||||    
T  17415525 agtttcaagagggagatcatgtgtttatgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtcc 17415426  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctt 286  Q
    ||||||| |||| || || ||| |||| ||||| ||  |||| || ||  |||||||||||    
T  17415425 gtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccgcatctt 17415365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 68 - 333
Target Start/End: Original strand, 27560801 - 27561066
Alignment:
Q  68 atgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 167  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| |  || || || ||| | ||||| ||||       
T  27560801 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagttactccga 27560900  T
Q  168 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagt 267  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||| ||||||||||| | ||||| ||  || |||||||||| ||  ||||    
T  27560901 tgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagatttcagagaggattggaacggtggcatatagagt 27561000  T
Q  268 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgt 333  Q
    ||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  | |||||||||||    
T  27561001 tggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgttccacgtgtcacagttgcggaagtatgt 27561066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 340
Target Start/End: Original strand, 11280689 - 11280961
Alignment:
Q  68 atgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 167  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| | ||| || ||||| |||||| |||| | |     
T  11280689 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagaatcacaccta 11280788  T
Q  168 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagt 267  Q
    |||| ||||| |||| ||| || || || |||||||||||||| |  |||||| | || |||||| |||| || |||||| |||| ||||| ||  | ||    
T  11280789 tgacaggtgtaggacatgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcttatagggt 11280888  T
Q  268 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggat 340  Q
     || ||| | || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||    
T  11280889 gggtttaccccctcatctttcaaatttgcatgacgtgttccatgtgtcacagttgcggaactatgtaccggat 11280961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 87 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25751024 - 25750900
Alignment:
Q  87 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgc 186  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  25751024 gacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggatcttgagtttcaagaaggagatcatgtgtttctgagagtcactcctgtgacgggtgtaggacgtgc 25750925  T
Q  187 tttgaagtcaaagaagttgactccg 211  Q
     ||||| || ||||||| |||||||    
T  25750924 gttgaaatctaagaagtggactccg 25750900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18801081 - 18800899
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||  |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  18801081 gttcatcagactacggagaaagtcaagatgattagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttg 18800982  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgact 208  Q
    |||||||||| |  || || || ||| ||||||| |||| | |||| |||||  ||||||  |||||||| ||| ||||||||    
T  18800981 agtttcaagagggggatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaagacgtgaattgaagtcgaagcagttgact 18800899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 80 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1640857 - 1640717
Alignment:
Q  80 cagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttg 179  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| | |||| ||| || |||||| | |||||||| | |||||| |||||||    
T  1640857 cagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgaattttaggaaggagatcatgtgtttctaagagtcacccctgtgacaggtgttg 1640758  T
Q  180 gacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 220  Q
    | ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||    
T  1640757 gtcgtgccttgaaatcgaagaagttgaccccgaggtttatt 1640717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Original strand, 25743227 - 25743413
Alignment:
Q  24 ttgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 123  Q
    |||| ||| ||||||| || || ||||||||||||||||| || |||| || ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |    
T  25743227 ttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgagagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatat 25743326  T
Q  124 tgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    |||||||||||  |  || || ||||||||||| |  | || |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  25743327 tgagtttcaagttggtgatcaagtgtttttgagggagaatcttgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 25743413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 258
Target Start/End: Original strand, 14381609 - 14381841
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||| |  ||||    
T  14381609 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtggacagaagagttatcacgacaagcggagaaaggcccttg 14381708  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    ||||||| || |  || || || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| ||||    
T  14381709 agtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 14381808  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggc 258  Q
    ||||||| |||| || || ||| |||| |||||    
T  14381809 gtatcagatatcggagagggttggaacagtggc 14381841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16098168 - 16098005
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||| ||   ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  |  || || |    
T  16098168 gttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtcttagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatg 16098069  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    ||||||||||||| |  | |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  16098068 tgtttttgagagtgaaacctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 16098005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18571769 - 18571622
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  |  || || |    
T  18571769 gttaagatgattcaggagaaaaggaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 18571670  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 194  Q
    | |||||||| || | ||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  18571669 tatttttgagggtgaatcatgtgaccgatgttggtcgtgctttgaagt 18571622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Original strand, 18838048 - 18838234
Alignment:
Q  24 ttgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 123  Q
    |||| ||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||||||  | | |||||||||||||||||| | ||||| ||| |    
T  18838048 ttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaggcgtctcagagtacatagaagagttatcatgataagaggagaaaggatat 18838147  T
Q  124 tgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    |||||||||||  |  || || ||||||||| | || | || |||||| |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||    
T  18838148 tgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgtgggtgaatcctgtgaccggtgttggtcatgctttgaagtgtaggaagttgactcc 18838234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 194
Target Start/End: Original strand, 1648947 - 1649094
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| | ||  |||||| |||| ||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  |  || || |    
T  1648947 gttaagatgattcaggaaaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 1649046  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 194  Q
    |||||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||||||||    
T  1649047 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagt 1649094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Original strand, 16382536 - 16382699
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    |||||||||||||| || || ||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  |  || || |    
T  16382536 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 16382635  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    |||||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  16382636 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcc 16382699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Original strand, 15078504 - 15078690
Alignment:
Q  24 ttgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 123  Q
    |||| ||| ||||||| || || ||||||||||| | |||||| ||||||| ||  |||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||| ||| |    
T  15078504 ttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgatccgagaaaagatgaaagcgtctcagagtagacataagagttatcatgataagaagagaaaggatat 15078603  T
Q  124 tgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
     |||||||| |  |  || || || ||||||||| | | ||  |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  15078604 cgagtttcaggttggtgatcatgtatttttgagactgaatccagtgactggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 15078690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 25655604 - 25655456
Alignment:
Q  44 aaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagacc 143  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||| |||| |||||||||||| ||||| | ||||| ||  |||||||||| |  |  || |    
T  25655604 aaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcataataagaggagaaaggacattgagtttcaggttggtgatc 25655505  T
Q  144 acgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaa 192  Q
    | |||||||||||||| | ||   | ||||||||||| |||||||||||    
T  25655504 atgtgtttttgagagtgaatctgataactggtgttggtcgtgctttgaa 25655456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 333
Target Start/End: Original strand, 28282962 - 28283262
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||   ||| || ||||||| ||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  28282962 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 28283061  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
    ||| |  || || || ||| | ||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||  || ||| | |||||||||    
T  28283062 agagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggcccgtatcag 28283161  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| ||  |  | |||||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||  | ||||||||||    
T  28283162 atttcagagaggatcgggacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcacgatgtgtttcacgtgtcacagttgcggaagtatg 28283261  T
Q  333 t 333  Q
    |    
T  28283262 t 28283262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 1640688 - 1640613
Alignment:
Q  276 caccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| || |||||    
T  1640688 caccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtacgtagcggatccttcacatgt 1640613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16233350 - 16233167
Alignment:
Q  24 ttgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 123  Q
    |||| ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| | ||  || ||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |    
T  16233350 ttgtgcaagagactacggaaaaggttaagattattcaagaaaagatgaaggcgtctcaaagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatat 16233251  T
Q  124 tgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 207  Q
    |||||||||||  |  || || |||||||| || || | || |||||| || ||||| ||||| |||||||  | |||||||||    
T  16233250 tgagtttcaagttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgcgttgaagtgtaggaagttgac 16233167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 194
Target Start/End: Original strand, 21413101 - 21413248
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||  |||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  |  || ||      
T  21413101 gttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtctcagagtagaccgaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcata 21413200  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 194  Q
    |||| ||| |||| | || ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21413201 tgttcttgtgagtgaatcctgtaactggtgttggtcgtgctttgaagt 21413248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23996366 - 23996203
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    |||||||||||||| || || ||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| ||||||||||||  |  || ||||    
T  23996366 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcacg 23996267  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    ||||||| || || | || | |||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  23996266 tgtttttaagggtgaatcctatgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 23996203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 285 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18787768 - 18787702
Alignment:
Q  285 tttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| || |||||    
T  18787768 tttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgaaagtatgtagcggatccttcgcatgt 18787702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 33560 - 33916
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33560 aggaccagagattgttcaacagactaccgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 33659  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33660 aggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttattgaaagtcactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccga 33759  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  33760 gatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacagtggcgtatcgagtgggattactaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgt 33859  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33860 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccagagtgatgatgt 33916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 8915 - 8559
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8915 aggaccagagattgttcaacagactaccgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 8816  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  8815 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttattgaaagtcactcttgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttaactccga 8716  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  8715 gatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacagtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgaagttttccatgt 8616  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8615 gtcgcaactttggaagtatgttctggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 8559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 68)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Original strand, 15154652 - 15155001
Alignment:
Q  20 gagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15154652 gagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagtgtcaccgagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 15154751  T
Q  120 atcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 219  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15154752 atcttgaatttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 15154851  T
Q  220 tagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaa 319  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||    
T  15154852 tggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccactgcatctttcgaatttgcacgatgtatttcacgtgtcgcaa 15154951  T
Q  320 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15154952 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 15155001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Original strand, 17319 - 17665
Alignment:
Q  23 attgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||    
T  17319 attgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaaaagttatcatgataagcgcaggaaggatc 17418  T
Q  123 ttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattag 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  17419 ttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactctgagatttattgg 17518  T
Q  223 tccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaactt 322  Q
     ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  17519 cccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgtgtcgcaactt 17618  T
Q  323 cggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  17619 cggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaactgatgatgt 17665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 12687778 - 12687422
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12687778 aggaccagagattgtccaacagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 12687679  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12687678 aggaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgcgagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccga 12687579  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  12687578 agtttattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccaccgcatctttcaaatttgcacgacgttttccatgt 12687479  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12687478 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgacgatgt 12687422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 11553095 - 11553451
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  11553095 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttatcatgataagcgc 11553194  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11553195 agaaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccga 11553294  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| || ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  11553295 agtttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcttatcgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcacgacgttttccatgt 11553394  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11553395 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgacgatgt 11553451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14954897 - 14954541
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14954897 aggaccagagattgtccagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 14954798  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  14954797 agaaaggatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaccccaa 14954698  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      |||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| || |||||  | ||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  14954697 agtttattggtccgtataagatatcagaaagagttggaacggtggcttatcgagtgagtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgacgttttccatgt 14954598  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14954597 atcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgacgatgt 14954541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 8707882 - 8707526
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8707882 aggaccagagattgttcaacaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 8707783  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8707782 aggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 8707683  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  8707682 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 8707583  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  8707582 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 8707526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 18 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14038079 - 14037728
Alignment:
Q  18 cagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14038079 cagaaattgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaa 14037980  T
Q  118 agatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 217  Q
    ||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14037979 agaccttgagttccaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgttgggcgtgcattgaagtcaaagaagttgacaccaagattt 14037880  T
Q  218 attagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcac 317  Q
    ||| || | |||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  14037879 attggttcatatcagatatcggaaagagtttgaatggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtatcgc 14037780  T
Q  318 aacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14037779 aacttcggaagtatgttccagatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 14037728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 18 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14348109 - 14347758
Alignment:
Q  18 cagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14348109 cagaaattgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaa 14348010  T
Q  118 agatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 217  Q
    ||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14348009 agaccttgagttccaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgttgggcgtgcattgaagtcaaagaagttgacaccaagattt 14347910  T
Q  218 attagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcac 317  Q
    ||| || | |||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  14347909 attggttcatatcagatatcggaaagagtttgaatggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtatcgc 14347810  T
Q  318 aacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14347809 aacttcggaagtatgttccagatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 14347758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 8198905 - 8198561
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8198905 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 8198806  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8198805 agaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 8198706  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  8198705 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 8198606  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8198605 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 8198561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 10871272 - 10870916
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871272 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 10871173  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10871172 agaaaagaccttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 10871073  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    | || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  10871072 ggttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 10870973  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  10870972 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 10870916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14332674 - 14332318
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14332674 aggaccagaaattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgt 14332575  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14332574 agaaaagatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 14332475  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  14332474 agttcattggtccgtatcagatactggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 14332375  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14332374 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 14332318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 15161050 - 15161406
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15161050 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagagaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 15161149  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15161150 aggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 15161249  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  15161250 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 15161349  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  15161350 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 15161406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 11237206 - 11237562
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11237206 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcggatgatccaagagagaatgaaggcgtcgcagaatcgacaaaagagttatcatgataagcgt 11237305  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11237306 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 11237405  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  11237406 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 11237505  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  11237506 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 11237562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 18551751 - 18552107
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18551751 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 18551850  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18551851 aggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagctgaccccga 18551950  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  18551951 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 18552050  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  18552051 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 18552107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18178019 - 18177663
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18178019 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagtttagatgattcgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 18177920  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18177919 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgttcttgagagtcactcctataactggtgtagaacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 18177820  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| |||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  18177819 agttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 18177720  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  18177719 gtcgcaacttcggaagtatgttccagatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 18177663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Original strand, 44791344 - 44791688
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44791344 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 44791443  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  44791444 agaaaagatcttgaattccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaaattgaccccga 44791543  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  44791544 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 44791643  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44791644 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatcca 44791688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Original strand, 23516768 - 23517118
Alignment:
Q  19 agagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaa 118  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516768 agagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcatcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaa 23516867  T
Q  119 gatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 218  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |    
T  23516868 gatcttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttca 23516967  T
Q  219 ttagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcaca 318  Q
    || |||| |||||| | |  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||    
T  23516968 ttggtccatatcagattttggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgtgtcgca 23517067  T
Q  319 acttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  23517068 acttcggaagtatattccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 23517118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 13686341 - 13685984
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13686341 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagagaatgaaagcatcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 13686242  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13686241 aggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 13686142  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatg-tcttccatg 311  Q
      || ||| ||||||||||  |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| |  |||||||||||||||||||  | | | |||||||    
T  13686141 agttcattggtccgtatcaaatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgtcgcatctttcgaatttgcacaacgtttttccatg 13686042  T
Q  312 tgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  13686041 tgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 13685984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 24 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15204145 - 15203800
Alignment:
Q  24 ttgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 123  Q
    ||||||| || ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  15204145 ttgttcagcaaactacagagaaggttaagttgatccatgaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagacct 15204046  T
Q  124 tgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagt 223  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  15204045 tgagtttcaagaaggagaccatgtgttttttagagtcacttttgtgactggtgttggccgcgcattgaagtcaaataagttgactccgaggtttattggt 15203946  T
Q  224 ccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttc 323  Q
    | ||||||| |  |||||||| || ||||||| | ||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  15203945 ctgtatcagattacagaaagaattggaacggtagagtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttc 15203846  T
Q  324 ggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  15203845 ggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcgaaagagatgatgt 15203800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15624816 - 15624539
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| || |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  15624816 gttcatcaaactacttagaaggttaagttgatccaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgatagaagagttatcatgataagcttaggaaagaccttg 15624717  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    ||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||| || |    
T  15624716 agtttcaggaaggagaccatgtatttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaggaaattgactccgaggtttattggttc 15624617  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 303  Q
     |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15624616 atatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 15624539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 27 - 369
Target Start/End: Original strand, 15102586 - 15102928
Alignment:
Q  27 ttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttga 126  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |  |||||    
T  15102586 ttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagagaaaaaatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttga 15102685  T
Q  127 gtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccg 226  Q
    ||||||||| | ||| || |||||||||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||| |||||    
T  15102686 gtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccg 15102785  T
Q  227 tatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgga 326  Q
    |||||| |||| || || ||| |||| ||||| ||  |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  15102786 tatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgga 15102885  T
Q  327 agtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  15102886 agtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 15102928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 68 - 351
Target Start/End: Original strand, 12206826 - 12207109
Alignment:
Q  68 atgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 167  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  12206826 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagtgtagaaaggatcttaagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctg 12206925  T
Q  168 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagt 267  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |||||| || |||| ||| |||| || ||||||  ||| ||||| ||  ||||    
T  12206926 tgacaggtgttggtcgtgccttgaaatcaaagaagttgacgccgaagtttattggttcgtaccagatatctgagagagttgcaacagtggcatatagagt 12207025  T
Q  268 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
     || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  12207026 gggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 12207109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 19147476 - 19147151
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   |||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||    
T  19147476 gttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaagcccttg 19147377  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  19147376 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtcc 19147277  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
     |||||| |||| || || ||| |||| ||||| ||| ||||  | ||  |||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||    
T  19147276 atatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgagtttgccaccacatctttcgaatttgcataatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 19147177  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  19147176 aagtatgtagcggatccttcacatgt 19147151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 20746875 - 20746550
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   |||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||    
T  20746875 gttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaagcccttg 20746776  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  20746775 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacaggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtcc 20746676  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
     |||||| |||| || || ||| |||| ||||| ||| ||||  | ||  |||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||    
T  20746675 atatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgagtttgccaccacatctttcgaatttgcataatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 20746576  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  20746575 aagtatgtagcggatccttcacatgt 20746550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 33 - 351
Target Start/End: Original strand, 8212119 - 8212437
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    |||||||||||||||| | | ||||    ||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8212119 agactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 8212218  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  8212219 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 8212318  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| |||||| | || ||||| ||| ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  8212319 atttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcaacttcggaagtatg 8212418  T
Q  333 ttccggatccatctcatgt 351  Q
    || ||||||| ||||||||    
T  8212419 ttgcggatccttctcatgt 8212437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 369
Target Start/End: Original strand, 14264264 - 14264571
Alignment:
Q  62 gaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtca 161  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||    
T  14264264 gaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcgcttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtca 14264363  T
Q  162 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgta 261  Q
    ||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  |||||| |||| |||||| |||| ||||| ||| |||| ||||| ||    
T  14264364 ctcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtccatatcagatatctgaaagggttggaacagtggcata 14264463  T
Q  262 ccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagt 361  Q
      |||| || ||  |||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||| ||||||||||  ||||||| || ||||| || | |||     
T  14264464 tagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcctgatgtgtttcatgtgtcgcaactttggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgaga 14264563  T
Q  362 gatgatgt 369  Q
    ||||||||    
T  14264564 gatgatgt 14264571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 368
Target Start/End: Original strand, 11306254 - 11306589
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    |||||||||||||||| | | ||||    ||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11306254 agactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttca 11306353  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || ||| |||||||||||    
T  11306354 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccgtatcag 11306453  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| |||||| | || ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  11306454 atttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtctctcagcttcggaagtatg 11306553  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 368  Q
    || ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  11306554 ttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 11306589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 49152559 - 49152224
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   |||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||    
T  49152559 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttca 49152460  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  49152459 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgggctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 49152360  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| |||||| | || ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  49152359 atttcagagagagttggtacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 49152260  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 368  Q
    || ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  49152259 ttgcggatccttctcatgtgattccgagagatgatg 49152224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 21662233 - 21661900
Alignment:
Q  18 cagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 117  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| || |||||| |||||  |||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21662233 cagacattgttcaacagactaatgaaaatgttaagttgattagagaaaagatgaaagcgtcacagagtagacaaaagagttatcatgataagcgtaggaa 21662134  T
Q  118 agatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 217  Q
     |||||||||||||   ||| |||||| ||||||||||||||||| | | | || ||||||||||| ||  | || ||||||||  | |||||||| |||    
T  21662133 ggatcttgagtttc---aaggagaccatgtgtttttgagagtcacccctcttaccggtgttggacgggcactaaaatcaaagaaactaactccgaggttt 21662037  T
Q  218 attagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcac 317  Q
    ||| | ||||||||| | ||  |||||||| |  |||| |||||    || || ||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||    
T  21662036 attggcccgtatcagatttcgcaaagagttggggcggttgcgtataacgtgggtttaccaccgcatctttcgaacttacatgatgtgtttcatgtgtcac 21661937  T
Q  318 aacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    |||| |  ||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  21661936 aactacaaaagtatgtttcatatccatctcatgtgat 21661900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 186
Target Start/End: Original strand, 35964848 - 35965016
Alignment:
Q  18 cagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||  |||||| ||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35964848 cagacattgttcaacaaactactgagaaggttaagttgattagagaaaagatgaaggcgtcgcagagtagacaaaagagttatcatgataagcgtaggaa 35964947  T
Q  118 agatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgc 186  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||    
T  35964948 ggatcttgagtttcaagaaggggaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgactagtgtatgacgtgc 35965016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 32 - 351
Target Start/End: Original strand, 16072284 - 16072603
Alignment:
Q  32 cagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttc 131  Q
    |||||||  ||||| || ||||||||   |||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |  ||||||||||    
T  16072284 cagactatggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggcccttgagtttc 16072383  T
Q  132 aagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatca 231  Q
    |||| | ||| || |||||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  |||||| |||| |||||    
T  16072384 aagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtccatatca 16072483  T
Q  232 gttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtat 331  Q
    | |||| || || ||| |||| ||||| | |  ||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||    
T  16072484 gatatctgagagggttggaacagtggcatgcaaagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatatgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtat 16072583  T
Q  332 gttccggatccatctcatgt 351  Q
    ||  ||||||| || |||||    
T  16072584 gtagcggatccttcgcatgt 16072603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 333
Target Start/End: Original strand, 16950455 - 16950762
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  | ||    
T  16950455 gttcatcagactactgagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagtgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccatg 16950554  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    ||||||| || |  || || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| ||||    
T  16950555 agtttcaggagggtgatcatgtttttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 16950654  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| | |||||||| ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| || ||||||    
T  16950655 gtatcagatttcagaaagggttggaacagtggcatatagagttggtttggcaccacatctttcgaacttgcatgatgtgttttatgtgtcgcagcttcgg 16950754  T
Q  326 aagtatgt 333  Q
    ||||||||    
T  16950755 aagtatgt 16950762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 351
Target Start/End: Original strand, 11388412 - 11388736
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| || || |||||| ||||   |||| | ||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || | ||    
T  11388412 gttcagcagactacagaaaaggttaagttgataagagaacagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccatg 11388511  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| || || || ||||| ||||||||||||| | |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  11388512 agtttcaagagga-gatcatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggtcc 11388610  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
     |||||| |||| || || ||| |||| ||||| ||  |||| || ||  |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| | |||    
T  11388611 atatcagatatctgagagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattacgg 11388710  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    |||||||| |||||||| || |||||    
T  11388711 aagtatgtaccggatccttcgcatgt 11388736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 13665813 - 13665493
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||||| || |||||||||||| |||||||||||| | |||||||| || |  ||||    
T  13665813 gttcatcaaactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatcacaagcgtaggaaggcccttg 13665714  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| ||||| || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| |  || |     ||    
T  13665713 agtttcaagaggaagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggtcgggcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttca-----cc 13665619  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| | |||||||| ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  13665618 gtatcagatttcagaaagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcgg 13665519  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  13665518 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 13665493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 9596334 - 9596236
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 111  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9596334 aggaccagagattgttcagcagactacagagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcg 9596236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 137
Target Start/End: Original strand, 11772244 - 11772358
Alignment:
Q  23 attgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 122  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  11772244 attgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaatgatgaaaacgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagacc 11772343  T
Q  123 ttgagtttcaagaag 137  Q
    |||||||||||||||    
T  11772344 ttgagtttcaagaag 11772358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 6413776 - 6413430
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    ||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |   |||    
T  6413776 gttcatcagactactgagaaagtcaagatgataagggaaaacatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcctttg 6413677  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    ||||||| || |  || || |||||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||| |  || ||| || |    
T  6413676 agtttcaggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcattggttc 6413577  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    | ||||| | ||||| || ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||| |    
T  6413576 gaatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcag 6413477  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgtcca 372  Q
    ||||||||   |||||| || ||||| || | ||| |||||||||||    
T  6413476 aagtatgtagtggatccttcgcatgttattccgagagatgatgtcca 6413430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 333
Target Start/End: Original strand, 18053944 - 18054244
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||   ||| || ||||||| ||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |  |||||||||||    
T  18053944 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaggaaggcccttgagtttca 18054043  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
    ||| |  || || || ||| ||||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||  || ||| | |||||||||    
T  18054044 agagggtgatcatgtatttctgagagtgactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgagaaagttgactccgaagttcattggcccgtatcag 18054143  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| ||| |  |||||||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  18054144 atttcagagagaataggaacggtggcatatagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatg 18054243  T
Q  333 t 333  Q
    |    
T  18054244 t 18054244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14130102 - 14129795
Alignment:
Q  62 gaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtca 161  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||| || |  || || || ||||| ||||| |    
T  14130102 gaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtattttttagagtta 14130003  T
Q  162 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgta 261  Q
    |||   ||||  |||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||| ||||||||||| | | ||| ||  || ||||| |||| ||    
T  14130002 ctccgatgacgagtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagattttagagaggattggaacgatggcata 14129903  T
Q  262 ccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagt 361  Q
      ||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || ||||| || | |||     
T  14129902 tagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgaga 14129803  T
Q  362 gatgatgt 369  Q
    ||||||||    
T  14129802 gatgatgt 14129795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 333
Target Start/End: Original strand, 14286360 - 14286667
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    ||||| ||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    ||||    
T  14286360 gttcatcagacgactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaagacccttg 14286459  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    ||||||| || |  || || || ||||||||||| ||||   |||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||| |||     
T  14286460 agtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacaggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtct 14286559  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| | ||| | ||  || |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  14286560 gtatcagatttcatataggattggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 14286659  T
Q  326 aagtatgt 333  Q
    ||||||||    
T  14286660 aagtatgt 14286667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14433920 - 14433613
Alignment:
Q  62 gaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtca 161  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |  ||||||||||| || |  || || || ||||| ||||| |    
T  14433920 gaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtattttttagagtta 14433821  T
Q  162 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgta 261  Q
    |||   ||||  |||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||| ||||||||||| | | ||| ||  || ||||| |||| ||    
T  14433820 ctccgatgacgagtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtccgtatcagattttagagaggattggaacgatggcata 14433721  T
Q  262 ccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagt 361  Q
      ||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || ||||| || | |||     
T  14433720 tagagttggcttgccaccacatctatcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgaga 14433621  T
Q  362 gatgatgt 369  Q
    ||||||||    
T  14433620 gatgatgt 14433613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 12455960 - 12455640
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||    ||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  || ||||||||    
T  12455960 agactactgagaaagtcaaggtgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggccctagagtttca 12455861  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||| ||| |  || ||| ||| |||||||    
T  12455860 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggatgtgcattgaagtcgaggaagttgaatccaaagttcattggtcggtatcag 12455761  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| |||||| |||| ||||| ||  || |||| ||  |||| |||||||||||  |||||||||| || |||||||  || |||||||||||||    
T  12455760 atttcagagagagttagaacagtggcttatagaattggtttgccaccacatctttcgaacctgcatgatgtgtttcatgtgt-gcagcttcggaagtatg 12455662  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    |  ||||||| || ||||||||    
T  12455661 tagcggatccttcacatgtgat 12455640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 13021615 - 13021294
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||||||||| || ||||||||    ||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| |  || ||||||||    
T  13021615 agactactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggaaaaaggccctagagtttca 13021516  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
    ||| |  || || || ||| |||| ||||||| | |||| || ||   |||||| |||||||| | ||||| |||||| |  |||||| |||||||||||    
T  13021515 agacggtgatcatgtttttctgagggtcactcctatgacgggcgtaaaacgtgcattgaagtcgaggaagtggactccaaagtttattggtccgtatcag 13021416  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| || ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  13021415 atttcagagagggttggaacagtggcttatagagttggttttccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 13021316  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    |  ||||||  || ||||||||    
T  13021315 tagcggatctttcacatgtgat 13021294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 80 - 333
Target Start/End: Original strand, 23199781 - 23200034
Alignment:
Q  80 cagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttg 179  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| |  || || || ||| | ||||| ||||   |||| ||||| |    
T  23199781 cagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtag 23199880  T
Q  180 gacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcacc 279  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||| ||  |  ||||| || | ||  ||||||| ||  ||||    
T  23199881 gacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaaattcattggtccgtatcagatttcagagaggatcggaacgatgacatatagagttggcttgccacc 23199980  T
Q  280 gcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgt 333  Q
     ||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  23199981 acatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatgt 23200034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 80 - 333
Target Start/End: Original strand, 23505908 - 23506161
Alignment:
Q  80 cagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttg 179  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| |  || || || ||| | ||||| ||||   |||| ||||| |    
T  23505908 cagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaagagggtgatcatgtatttctaagagtgactccgatgacgggtgtag 23506007  T
Q  180 gacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcacc 279  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||||| ||  |  ||||| || | ||  ||||||| ||  ||||    
T  23506008 gacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaaattcattggtccgtatcagatttcagagaggatcggaacgatgacatatagagttggcttgccacc 23506107  T
Q  280 gcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgt 333  Q
     ||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  23506108 acatctatcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatgt 23506161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14936590 - 14936443
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||| |  |  || || |    
T  14936590 gttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggacattgagtttcaggttggtgatcatg 14936491  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 194  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14936490 tgtttttgagagtgaatcttgtgactggtgttggtcgtgctttgaagt 14936443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 308 - 369
Target Start/End: Original strand, 12254326 - 12254387
Alignment:
Q  308 catgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12254326 catgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 12254387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 333
Target Start/End: Original strand, 1391 - 1698
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||    ||||| ||||||| ||  |||| |||||| |||||||| ||||| ||| | ||||| |  ||||    
T  1391 gttcatcagactactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcacagattcgacagaagagttaccatgacaagaggagaaaggcccttg 1490  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    ||||||| || |  || || || ||| ||| ||| |||  | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| |||     
T  1491 agtttcaggagggtgatcatgtttttgtgaaagttacttctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtct 1590  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| | | |||||| ||| ||||  |||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  1591 gtatcagatttaagaaagggttggaacactggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtctcagcttcgg 1690  T
Q  326 aagtatgt 333  Q
    ||| ||||    
T  1691 aaggatgt 1698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Original strand, 12368603 - 12368766
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||| |  |  || ||||    
T  12368603 gttaagatgatccaagagaaaatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgactttcaggttggtgatcacg 12368702  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    ||||||||||||| | || ||||||  ||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||    
T  12368703 tgtttttgagagtgaatcttgtgaccagtgttggtcatgctttgaagtgtaggaagttgactcc 12368766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 333
Target Start/End: Original strand, 26288057 - 26288327
Alignment:
Q  62 gaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtca 161  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  || || ||||| || |  || || || ||| |||| || |    
T  26288057 gaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttaccatgacaagcggagaaaggccctaga-tttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtta 26288155  T
Q  162 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgta 261  Q
    ||| | |||| ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||||| | ||| ||| || |||||||| | |||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  26288156 ctcctatgacgggtgtaggacgcgcattgaagtcgaggaagttgactccaaaattcattggtacgtatcagatttcagaaagggtttgaacagtggcata 26288255  T
Q  262 ccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgt 333  Q
      ||||||| ||  |||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||    
T  26288256 tagagttggtttgccaccacatctttcaaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcgaaaatatgt 26288327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4440194 - 4440008
Alignment:
Q  24 ttgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 123  Q
    |||| ||| ||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||  |    
T  4440194 ttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacat 4440095  T
Q  124 tgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    ||||||||| |  |  || || |||||||||||||| |  | | |||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  4440094 tgagtttcaggttggtgatcatgtgtttttgagagtgaaccctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 4440008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7824143 - 7823980
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    |||||||||||||| || || ||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  |  || || |    
T  7824143 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 7824044  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    |||||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  7824043 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcc 7823980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 222 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 15340565 - 15340454
Alignment:
Q  222 gtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaact 321  Q
    ||||||||||| | ||||| ||  || |||||||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  15340565 gtccgtatcagatttcagagaggattggaacggtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagct 15340466  T
Q  322 tcggaagtatgt 333  Q
    ||||||||||||    
T  15340465 tcggaagtatgt 15340454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15364183 - 15364036
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    |||||||||||||| || || ||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||| |  |  || || |    
T  15364183 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggacattgagtttcaggttggtgatcatg 15364084  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 194  Q
    ||||||||||||| | || |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15364083 tgtttttgagagtgaatcttgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagt 15364036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Original strand, 27107801 - 27107964
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    |||||||||||||| || || ||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  |  || || |    
T  27107801 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 27107900  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    |||||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  27107901 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcc 27107964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Original strand, 21674537 - 21674723
Alignment:
Q  24 ttgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 123  Q
    |||| ||| ||||||| || |||  ||||||||||||||| || ||||||| ||  || ||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||  |    
T  21674537 ttgtgcaagagactacggaaaaatataagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcaaagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacat 21674636  T
Q  124 tgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    ||| |||||||  |  || || |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  21674637 tgaatttcaagttggtgatcatgtgtttttgagagtgaaccttgtgattggtattggacgtgctttgaagtgtaagaaattgactcc 21674723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 247
Target Start/End: Original strand, 26118596 - 26118810
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    |||||||||||||||| | | ||||   |||||  |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || || |||||||||||    
T  26118596 agactactgagaaagtcaggttgataagagaaaggatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggagcttgagtttca 26118695  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||| |||||| ||||||| |  ||||||||||| |  || ||| |||||||||||    
T  26118696 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggtcgtgctctgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcag 26118795  T
Q  233 ttatcagaaagagtt 247  Q
     | ||||| ||||||    
T  26118796 atttcagatagagtt 26118810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 276 - 354
Target Start/End: Original strand, 26118818 - 26118896
Alignment:
Q  276 caccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26118818 caccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 26118896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 242 - 351
Target Start/End: Original strand, 15479338 - 15479447
Alignment:
Q  242 agagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatc 341  Q
    |||||| |||| ||||||||  || |||||||| |||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||  | ||||||||||| || ||||    
T  15479338 agagttggaactgtggcgtatagaattggattaccacctcatctttcgaatttgcatgacatgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatgtacctgatc 15479437  T
Q  342 catctcatgt 351  Q
    | || |||||    
T  15479438 cttcgcatgt 15479447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 45146812 - 45146652
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||| ||  ||||||  | | |||||||||||| ||||| |||| || ||  ||| ||||||    
T  45146812 agactacggaaaatgttaagatgattcaggagaagatgaaagcgtctcagagtaaatagaagagttatcattataagagtaggaaggacattgtgtttca 45146713  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 194  Q
    ||  |  || || |||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45146712 agttggtgatcatgtgtttttgagaatgaatcatg-gactggtgttggacgtgctttgaagt 45146652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 201
Target Start/End: Original strand, 41213 - 41327
Alignment:
Q  87 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgc 186  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || |||||| |  | |||||||| ||||  || || || ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||    
T  41213 gacagaagagctatcatgataaacgaagaaaataattggagtttcaggaaggggatcatgtatttttaagagtcactccggtgacgggcgttggacgtgc 41312  T
Q  187 tttgaagtcaaagaa 201  Q
    ||||||||| |||||    
T  41313 tttgaagtctaagaa 41327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 5764758 - 5764720
Alignment:
Q  25 tgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaaga 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5764758 tgttcaacagactactgagaaagttaaaatgattcaaga 5764720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 17923947 - 17923862
Alignment:
Q  24 ttgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataag 109  Q
    |||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||| | | || ||||||| ||||||||||    
T  17923947 ttgtgcaagagactacggaaaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtctcagaataggcagaagagttgtcatgataag 17923862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 190
Target Start/End: Original strand, 17145288 - 17145428
Alignment:
Q  50 aagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgt 149  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  |  |||||| | || |||||||||||||||||| | |  || ||| ||||||||||||  | ||  || ||||    
T  17145288 aagatgattcaagaaaatatgaaagcttctcagagtaggcagaagagttatcatgataagaggatgaaggatattgagtttcaagttggagctcatgtgt 17145387  T
Q  150 ttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttg 190  Q
    |||| ||||| | | |||| || ||||||||||||| ||||    
T  17145388 ttttaagagtgaataatgtaaccggtgttggacgtgttttg 17145428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 12457009 - 12456940
Alignment:
Q  61 agaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagttt 130  Q
    |||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||    
T  12457009 agaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagttt 12456940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13353275 - 13353247
Alignment:
Q  166 tgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13353275 tgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 13353247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 337 - 369
Target Start/End: Original strand, 13634038 - 13634070
Alignment:
Q  337 ggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13634038 ggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 13634070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20466977 - 20466877
Alignment:
Q  95 agttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 194  Q
    ||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| ||  |||||  | |||||||| ||||| |  |  ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20466977 agttatcatgataagcggaggaaggatattgagtttctagttgaagataatgtgttttttagagttaaccccgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagt 20466878  T
Q  195 c 195  Q
    |    
T  20466877 c 20466877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 64018 - 64374
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  64018 aggaccagatattgttcagcagactactgagaaaattaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagaattatcatgataagcgt 64117  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  64118 aggaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtggctggagttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactgtga 64217  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  64218 gattcattggtccgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatcttttgaatttgcatgatgtctttcatgt 64317  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64318 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 64374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 17045071 - 17045427
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17045071 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 17045170  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || || |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  17045171 aggaaggatcttgagtttcaggaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctgtgaccggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccga 17045270  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  17045271 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgacgtgttccatgt 17045370  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17045371 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 17045427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20250153 - 20249797
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20250153 aggaccagagatcgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgt 20250054  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  20250053 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagcgttgaagtcaaagaagttgactccga 20249954  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
     |||||||  ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  20249953 aatttattgttccgtataagatatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcacctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 20249854  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20249853 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 20249797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19106670 - 19106314
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19106670 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgg 19106571  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19106570 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgaccccga 19106471  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      |||||| |||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  19106470 agtttattggtccatatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagttggattactaccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 19106371  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19106370 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatctagagtgacgatgt 19106314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Original strand, 50620307 - 50620656
Alignment:
Q  20 gagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 119  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50620307 gagattgttcaataaactactgagaaggttaagatgattcaacaaaagatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaag 50620406  T
Q  120 atcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 219  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50620407 accttgagtttcaagaggaagatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttat 50620506  T
Q  220 tagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaa 319  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || ||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||    
T  50620507 tggtccgtatcagatatcagaaagagttggaatggtggcatatcgagtgggtttaccaccgtatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgtaa 50620606  T
Q  320 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50620607 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 50620656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20137081 - 20136725
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20137081 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgt 20136982  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20136981 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagacctcgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccga 20136882  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||| | || |||||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  20136881 gatttattggtctgtatcagatatcggaaagagttgggacagtggcgtatcgtgttggtttaccacggcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 20136782  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20136781 gtcgcaacttcggaagtatgtttttgatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 20136725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21747837 - 21747482
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  21747837 aggaccagagattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccataataagcgt 21747738  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  21747737 agaaa-gatcttgagtttctagaaggagaccacatatgtttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgaatccga 21747639  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  21747638 gatttattggttcgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 21747539  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  21747538 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatcccatgtaatccaaagtgatgatgt 21747482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 16350655 - 16351011
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350655 aggaccagaaattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 16350754  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16350755 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 16350854  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  16350855 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 16350954  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||    
T  16350955 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagaatgacgatgt 16351011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 33391085 - 33391441
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33391085 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 33391184  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33391185 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 33391284  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  33391285 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 33391384  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  33391385 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 33391441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 16078708 - 16079045
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16078708 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgc 16078807  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||                   |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16078808 ag-------------------gaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccga 16078888  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16078889 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaatggtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgttttccatgt 16078988  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16078989 gtcgcaactacggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 16079045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 51333549 - 51333905
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51333549 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 51333648  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51333649 agaaaagatcttgagttccaataaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 51333748  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||  |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  51333749 agttcattggtccgtatcatatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 51333848  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  51333849 gtcgcaacttcgaaagtatgttctggatccatctcatgtgatccaaagtgacgatgt 51333905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21830606 - 21830250
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||  |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21830606 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttcagatgatctaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgt 21830507  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21830506 ggaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 21830407  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| |||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  21830406 agttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgt 21830307  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  21830306 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 21830250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 26 - 369
Target Start/End: Original strand, 19760935 - 19761278
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  19760935 gttcagcaaactactgagaaggttaagttgatccaagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttg 19761034  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  19761035 agtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcttgtgattggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggacc 19761134  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| |||| |||||| || ||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||    
T  19761135 gtatcagatatccgaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcacctttcgaatttgcatgatatgtttcatgtatcgcaacttcgg 19761234  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
     |||||||| ||||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  19761235 tagtatgtttcggatccgtctcatgtgatcccaagagatgatgt 19761278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21837253 - 21836897
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21837253 aggaccagagattgttcaacaaactactgagacagttcagatgatccaagagaaaatgaaggcgtcgcatagtcgacaaaagagttatcatgatcagcgt 21837154  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21837153 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 21837054  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  21837053 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 21836954  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  21836953 gtcgcaacttcaaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 21836897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 16369600 - 16369267
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16369600 aggaccagagattgttcaacaaactattgaaaaggtaaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagggttatcatgataagcgt 16369501  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || ||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  16369500 aggaaagaccttgaattccaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactcctgtgacaagtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgacttcga 16369401  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    | |||||| |||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16369400 ggtttattggtctatatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtaccgtgttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgt 16369301  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatct 346  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16369300 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatct 16369267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 41354525 - 41354881
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||| | ||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354525 aggaccagagattgttcagcaaaccactgagaaagttcagatgatccgagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 41354624  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  41354625 agaaaagatcttgaatttaaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcgaagaagttgacctcga 41354724  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| |||| |||||| | |  ||||||||| | |||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  41354725 agttcattggtccatatcagattttggaaagagttgggacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 41354824  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  41354825 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 41354881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 143 - 369
Target Start/End: Original strand, 50612602 - 50612828
Alignment:
Q  143 cacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaa 242  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  50612602 cacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccgtatcagatatcagaaa 50612701  T
Q  243 gagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatcc 342  Q
    ||||| ||| |||||| || ||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  50612702 gagttggaatggtggcatatcgagtgggtttaccaccgtatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgtaacttcggaagtatgttccggatcc 50612801  T
Q  343 atctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  50612802 atctcatgtgatccaaagtgatgatgt 50612828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 351
Target Start/End: Original strand, 19664945 - 19665270
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  ||||    
T  19664945 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaagcccttg 19665044  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | ||| || || ||| ||||||| |||| | |||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||| ||||    
T  19665045 agtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggggtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactcctaagttcattggtcc 19665144  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| | ||||| || ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  19665145 gtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtatttcatgtgtcgcaacttcgg 19665244  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  19665245 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 19665270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 215 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21163381 - 21163227
Alignment:
Q  215 tttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgt 314  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  21163381 tttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatatttcgaatttgcacgacattttccatgtgt 21163282  T
Q  315 cacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21163281 cgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 21163227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 41 - 333
Target Start/End: Original strand, 20940147 - 20940439
Alignment:
Q  41 gagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaag 140  Q
    |||||||| ||||||||   |||||| |||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| || |  |    
T  20940147 gagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaggcccttgagtttcaggagggtg 20940246  T
Q  141 accacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcaga 240  Q
    | || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||| ||||||||||| |||||||    
T  20940247 atcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcaga 20940346  T
Q  241 aagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgt 333  Q
     || ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  20940347 gagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 20940439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 37677363 - 37677027
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    |||||||||||||||| | | ||||    ||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  37677363 agactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatctggagtttca 37677264  T
Q  133 agaagaagaccacgtgttt-ttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatca 231  Q
     || |  || || || ||| ||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||| ||||||||||    
T  37677263 ggagggtgatcatgtttttcttgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatca 37677164  T
Q  232 gttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtat 331  Q
    | | ||||| |||||| | || ||||| ||| ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||    
T  37677163 gatttcagagagagttggtacagtggcatacagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtctctcagcttcggaagtat 37677064  T
Q  332 gttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 368  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  37677063 gttgcggatccttctcatgtgattccgagggatgatg 37677027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 35 - 351
Target Start/End: Original strand, 20856839 - 20857155
Alignment:
Q  35 actactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 134  Q
    ||||| |||||||| |||||||||   || || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || || |||| |||||| |    
T  20856839 actacggagaaagtcaagatgattagggagaagatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagctatcacgacaagcgtaggaaggaccttgcgtttcagg 20856938  T
Q  135 aagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagtt 234  Q
    |||  ||||| || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| |||| || ||| |    
T  20856939 aaggtgaccatgtttttctgagggttactcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttaccagat 20857038  T
Q  235 atcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgtt 334  Q
     |||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| | |||||||||||     
T  20857039 ttcagaaagagttggaactgtggcgtatagagttggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtatttcatgtgtcgcaattgcggaagtatgta 20857138  T
Q  335 ccggatccatctcatgt 351  Q
    || ||||| || |||||    
T  20857139 ccagatccttcgcatgt 20857155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 19854604 - 19854279
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  19854604 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 19854505  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | ||| || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| |  || ||| |||     
T  19854504 agtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggtcgggcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtct 19854405  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| | ||||| || ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||    
T  19854404 gtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccaaatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcgg 19854305  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  19854304 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 19854279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 354
Target Start/End: Original strand, 31550285 - 31550578
Alignment:
Q  61 agaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtc 160  Q
    |||||| |||||||  | ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |  || || || ||| |||| |||    
T  31550285 agaaaagatgaaagcttcgcaaagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtc 31550384  T
Q  161 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgt 260  Q
    |||| | |||| |||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||| ||||||||||| | ||||| |||||| | || ||||| |    
T  31550385 actcctttgacgggtgttggtcgggctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggtacagtggcat 31550484  T
Q  261 accgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    || ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31550485 acagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgat 31550578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 62 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 20294666 - 20294374
Alignment:
Q  62 gaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtca 161  Q
    ||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  || || || ||| |||| ||||    
T  20294666 gaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgtttttctgagggtca 20294567  T
Q  162 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgta 261  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||| |||| |||||| | ||||| |||||| | || ||||| ||    
T  20294566 ctcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccatatcagatttcagagagagttggtacagtggcata 20294467  T
Q  262 ccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 354  Q
      ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  20294466 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgtggcggatccttcgcatgtgat 20294374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 369
Target Start/End: Original strand, 22433192 - 22433528
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||| || ||||||||||||||   |||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    |||||||||||    
T  22433192 agactacagaaaaagttaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaagccccttgagtttca 22433291  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || |||||  |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||  || ||||||||    
T  22433292 ggagggtgatcatgtgttcctgagggttactcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcatcggttcgtatcag 22433391  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| || |||  ||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  22433392 atttcagagagggttgcaactgtggcctatagagttggtttgccaccacatctttcgaatatgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 22433491  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  22433492 tagcggatccttcacatgttattccgagagatgatgt 22433528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41308115 - 41307904
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || ||   |||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    ||||    
T  41308115 gttcatcagactacggagaaagtcaaaataataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaagccccttg 41308016  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | |||||| |||||| |||| || |||| | |||| |||||  ||||||| |||||||| || ||||||||||| |  |||||| ||||    
T  41308015 agtttcaagagggagaccatgtgtttctgagggttactcctatgacgggtgtatgacgtgcattgaagtctaaaaagttgactcctaagtttattggtcc 41307916  T
Q  226 gtatcagttatc 237  Q
    ||||||| ||||    
T  41307915 gtatcagatatc 41307904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 354
Target Start/End: Original strand, 20075135 - 20075456
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    |||||||||||||||| | | ||||    ||||| |||||||  | ||| |||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  20075135 agactactgagaaagtcaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcaaagtcgatagaagagttaccatgacaagcggagaaaggctcttgagtttca 20075234  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| | || ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||| |||||||||||    
T  20075235 ggagggtgatcatgtttttctaagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtatcag 20075334  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| |||||  |||| ||||| ||   |||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  20075335 atttcagagagagtgggaacagtggcatataaagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatg 20075434  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    |  | ||||| || ||||||||    
T  20075435 tagcagatccttcgcatgtgat 20075456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11382849 - 11382678
Alignment:
Q  61 agaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtc 160  Q
    |||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  || || || ||| ||||||||    
T  11382849 agaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgaaggaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtc 11382750  T
Q  161 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
    |||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  11382749 actcctttgacgggtgttggacgtgccttgaagtcgaggaagttgactcctaagtttattggtccgtatcag 11382678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 20244437 - 20244183
Alignment:
Q  79 gcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgtt 178  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || || || ||| |||| || |||| | |||| |||||     
T  20244437 gcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatcatgtctttctgagggttactcctatgacgggtgtg 20244338  T
Q  179 ggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcac 278  Q
    |||| ||| |||||||| |  ||||||||||| |  || ||  |||| |||||| | ||||| || ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||    
T  20244337 ggacatgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccatatcagatttcagagagggttggaacagtggcctatagagttggttttccac 20244238  T
Q  279 cgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgt 333  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||    
T  20244237 cacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgt 20244183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 368
Target Start/End: Original strand, 20395194 - 20395404
Alignment:
Q  158 gtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtgg 257  Q
    ||||||| | |||| ||||| || |||||||||||||| | ||| |||||||| |  || ||  ||||||||||| | ||||| |||||| |||  ||||    
T  20395194 gtcactcctttgacgggtgtcggtcgtgctttgaagtcgaggaatttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggaatagtgg 20395293  T
Q  258 cgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
    | ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | || || ||||||||||||||  ||||||| || |||||||| |     
T  20395294 catatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatatttctcagcttcggaagtatgtagcggatccttcacatgtgattcc 20395393  T
Q  358 gagtgatgatg 368  Q
    ||| |||||||    
T  20395394 gagggatgatg 20395404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 303
Target Start/End: Original strand, 20835957 - 20836237
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||| | || |  |||     
T  20835957 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacataagagttatcatgacaagcgttggaaggccctta 20836056  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtc---aaagaagttgactccgagatttattag 222  Q
    ||||| | || |  || || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||| | || |||||    |||||||||||||| |  || ||| |    
T  20836057 agttttaggagggtgatcatgtttttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtacatttaagtcgaagaagaagttgactccaaagttcattgg 20836156  T
Q  223 tccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 303  Q
    |||||||||| | ||||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20836157 tccgtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgt 20836237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Original strand, 20831482 - 20831645
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    |||||||||||||| || || ||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  |  || || |    
T  20831482 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 20831581  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    |||||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  20831582 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcc 20831645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 276 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 24477020 - 24476927
Alignment:
Q  276 caccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  24477020 caccacatctctcgaattttcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccctcgcatgtgattccgagagatgatgt 24476927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20914502 - 20914316
Alignment:
Q  24 ttgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 123  Q
    |||| ||| ||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| | ||  |||||| || | |||||||||||| ||||  | ||||| ||| |    
T  20914502 ttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagagagaagagttatcattataaatggagaaaggatat 20914403  T
Q  124 tgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    |||||||||||  |  || || || |||||||| || | || |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  20914402 tgagtttcaagttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 20914316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 46518957 - 46518827
Alignment:
Q  80 cagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttg 179  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||||| | || || ||| ||||||||||||  |  || || ||||||||||| || | || |||||| |||||||    
T  46518957 cagagtagacagaagagctatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttg 46518858  T
Q  180 gacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    | |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  46518857 gtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 46518827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 210
Target Start/End: Original strand, 22142232 - 22142294
Alignment:
Q  148 gtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    |||||||||||| | || ||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22142232 gtttttgagagtgaatcctgtaactggtgttggtcgtgctttgaagtgtaagaagttgactcc 22142294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 20184456 - 20184364
Alignment:
Q  42 agaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 134  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || |||  |||||  |||||| | || ||||||||| |||||||| | || |||||| ||||||||||||    
T  20184456 agaaagtgaagatgatccaagagaagatgtgagtgtctcagagtaggcagaagagttataatgataagaggaggaaagatattgagtttcaag 20184364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 6333 - 5977
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  6333 aggaccagagattgtgcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcataataagcgc 6234  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||  | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6233 aggcaggatcttgagtttcaagagggagaccacgtgtttttaagagtcactcctgtgactggtgtttgacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 6134  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6133 gatttattggtccgtatcagatattagaaagagttggaatggtggcgtatcgagttggattaccaccgcagctttcgaatttgcatgatgtctttcatgt 6034  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6033 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 5977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 4392 - 4748
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4392 aggaccagagattgttcaacagactaccgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 4491  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  4492 aggaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttattgaaagtcactcttgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttaactccga 4591  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  4592 gatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacagtggcgtatcgagtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcacgaagttttccatgt 4691  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4692 gtcgcaactttggaagtatgttctggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 4748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 180536 - 180180
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  180536 aggaccagatattgttcagcagactattgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 180437  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  || || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  180436 agaaaggatcttgagtttcaagagggtgatcatgtgtttttgagagttactccggtgactggtgttggacctgctttgaagtcaaagaagttgactccga 180337  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  180336 gatttattagtccgtatcagatatcagaaagagttagaacagtggcgtatcgagttggcttaccaccgcatctttcgaattttcatgatgtctttcaagt 180237  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  180236 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgttgatgt 180180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 127186 - 127542
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  127186 aggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgttccagagtcgacagaagagttatcatgataagcgt 127285  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  127286 aggaaagaccttgagttccaagaaggagatcacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccga 127385  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  127386 gatttattgatccgtatcagatatcagaaagagttggaatggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttacatgatgtgtttcatgt 127485  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  127486 atcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 127542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 219404 - 219760
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  219404 aggaccagaaatcgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 219503  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  219504 aggaaagaccttgagtttcaagaagaagatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgactccga 219603  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    | |||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  219604 ggtttattggtccgtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcaagtgggattaacaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 219703  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  219704 atcgcaacttcggaagtatgttccagatccatctcatgtgatccaaagagatgatgt 219760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 229362 - 229006
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  229362 aggaccagagattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataaacgt 229263  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||| || || |||||||||||||||| | | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  229262 agaaaagaccttgaatttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactcctattactggtgtgggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccga 229163  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    ||||| || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||| |||| ||| | || |||||    
T  229162 gatttgttggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgaatagggttaccaccgcatctttcgaatatgcacgatatgtttcatgt 229063  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  229062 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 229006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Original strand, 33016 - 33179
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  |  || || |    
T  33016 gttaagatgattcaggaaaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 33115  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    |||||||||| || |  | |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  33116 tgtttttgagggtgaaacctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaagaagttgactcc 33179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 810 - 1165
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  810 aggaccagagattgttcaacaaactaccgagaaagttaagatgattcaagagaagatggaagcgtcacagagtcgacaaaagagttatcatgaaaagcgt 909  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  910 agaaaagatcttgagttccaagaaggagaccacgt-tttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccga 1008  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||| || | ||| |||||  || |||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  1009 gatttattggtccgtatcagatataagaaaaagatggaaaggtggaatatcgagttggattaccacagcaactttcgaaattgcatgatgtattacatgt 1108  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1109 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 1165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 369
Target Start/End: Original strand, 32744 - 33095
Alignment:
Q  18 cagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 117  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||  | | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32744 cagaaattgttcaacaaactactaagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcatcgtagggtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaa 32843  T
Q  118 agatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 217  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  32844 agatcttgagttttaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactcttgtgactggtgttggacttgcattgaagttaaagaagttgacttcgagattt 32943  T
Q  218 attagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcac 317  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  32944 attggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgc 33043  T
Q  318 aacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33044 aacttcggaagtatgttacggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 33095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 681 - 1036
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  681 aggaccagagattgttcaacaaactaccgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 780  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  781 aggaaagatcttaagtttcaagaaggagaccacgtgtttt-gagagtccctcgtgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 879  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  880 gatttattggtccgtatcagatatcgaaaagagttggaacggtggcgtatcgtgtgggattaccaccgcatctttcgaatttgcaggatgtgtttcatgt 979  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |   ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  980 ggagcaacttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtggtgatgt 1036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 27 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 17292 - 16950
Alignment:
Q  27 ttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttga 126  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17292 ttcaacaaactactgtgaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagtgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttga 17193  T
Q  127 gtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccg 226  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  17192 gtttcaagaaggagatcacgtatttttgagagtcactcatgtgatttgtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtccg 17093  T
Q  227 tatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgga 326  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||    
T  17092 tatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcaagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgga 16993  T
Q  327 agtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  16992 agtatgttctggatgcatctcatgtgatccaaagagatgatgt 16950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 6334 - 5986
Alignment:
Q  21 agattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 120  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6334 agattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcatcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaaga 6235  T
Q  121 tcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6234 tcttgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgagagtcacacctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactccaagatttatt 6135  T
Q  221 agtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaac 320  Q
     | ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||    
T  6134 ggcccgtatcagatatcggaaagagttgggacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcttgtgtcgcaac 6035  T
Q  321 ttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  6034 ttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 5986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 333
Target Start/End: Original strand, 1524 - 1831
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||  |||||||| ||||||||    ||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| || |  ||||    
T  1524 gttcatcagactagagagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagtgtaggaaggcccttg 1623  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    ||||||| |  ||||| || || |||  |||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||    
T  1624 agtttcaggtggaagatcatgtatttcggagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattagtcc 1723  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  1724 gtatcagatatcagaaagggttggaacagtggcatatagagttggtttcccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 1823  T
Q  326 aagtatgt 333  Q
    ||||||||    
T  1824 aagtatgt 1831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23002 - 22816
Alignment:
Q  24 ttgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 123  Q
    |||| ||| ||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |    
T  23002 ttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggagtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatat 22903  T
Q  124 tgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    |||||||||||  |  || || |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||    
T  22902 tgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcatgtgaccggtgttggttgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 22816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 6691 - 6335
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  6691 aggaccagagattgttcagcaaactacagagaaggttaagatgattcaagagtagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataaacgt 6592  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6591 agaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 6492  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||| | | |||||  || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| | || |||||    
T  6491 gatttattggtccgtatcagatattggaaagagttgggatggtggtatatcgagtgggattaacaccgcatctttcgaatttgcacgatatgtttcatgt 6392  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||   ||||||||||    
T  6391 gtcgcaacttcggaagtatgtactggatccatcccatgtgatcctaggtgatgatgt 6335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 5540 - 5184
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  5540 aggaccagagattgttcagcaaactactgaaaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatggtaaacgc 5441  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || ||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5440 aggaaagatcttgagtttaaagaaggagaccacatatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaggaagtcgactccga 5341  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  5340 gatttattggtctgtatcagatatcagaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggattaccactgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgt 5241  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5240 gtcgcaacttcgtaattatgttctggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 5184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1452 - 1102
Alignment:
Q  19 agagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaa 118  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||    
T  1452 agagattgttcaacaaactaccgagaaggttaagatgattcaagataagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaaaagttaccatgataagtgtaggaaa 1353  T
Q  119 gatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1352 gatcttgagtttcaagaaggagaccacgtattttttagagtcactcctgtgactggtgttcgacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagattta 1253  T
Q  219 ttagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcaca 318  Q
    ||  |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||  ||    
T  1252 ttgttccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtggatttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgttttatgtgttgca 1153  T
Q  319 acttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1152 acttcggaagtatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 1102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15196 - 14840
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  15196 aggaccagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtctcagagtcgacatatgagttatcatgataagctt 15097  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || ||||| ||||||||||| |||| ||| || || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  15096 aggaaagaccttgagtttcatgaaggagatcatgtatttttgatagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaataagttgactccga 14997  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    | |||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  14996 ggtttattggtccgtatcaaatatcagaaagaattggaacggtggcgtaccgagtgggcttaccaccgcatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgt 14897  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14896 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagagatgatgt 14840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Original strand, 109798 - 110148
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  109798 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgt 109897  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  109898 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 109997  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| |||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  109998 agttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcatctttcgaatttgcacaatgtcttccatgt 110097  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtga 363  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  110098 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccctctcatgtaattcagagtga 110148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 68 - 369
Target Start/End: Original strand, 96044 - 96345
Alignment:
Q  68 atgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 167  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || |||||||| || |||| |     
T  96044 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgaatttcaggaaggtgaccatgtttttttgagggttactccta 96143  T
Q  168 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagt 267  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||||| |  || ||  |||| |||||| | |||||||||||| |||| ||||||||  || |    
T  96144 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgagaaagttgactccaaagttcatcggtccttatcagatttcagaaagagttggaactgtggcgtatagaat 96243  T
Q  268 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 367  Q
    ||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||  | ||||||||||| || ||||| || ||||| || | ||| ||||||    
T  96244 tggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacagttgcggaagtatgtacctgatccttcacatgttattccgagagatgat 96343  T
Q  368 gt 369  Q
    ||    
T  96344 gt 96345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 68 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 112823 - 112540
Alignment:
Q  68 atgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 167  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||| |     
T  112823 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggatcttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactccta 112724  T
Q  168 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagt 267  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||||||||| |  |||||| | || |||||| |||| || |||||| |||| ||||| ||  | ||    
T  112723 tgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagttggaacagtggcttatagggt 112624  T
Q  268 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
     || ||| | || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  112623 gggtttaccccctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccatgtgtcgcagttgcggaagtatgtaccggatccttcgcatgt 112540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 43473 - 43123
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |     
T  43473 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcgacaaaagagttaccatgataagtgc 43374  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43373 agaaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtagggcgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 43274  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
      || ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| ||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  43273 agttcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacggtggcatactgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacaatgttttccatgt 43174  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtga 363  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43173 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaatccagagtga 43123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 8797 - 8448
Alignment:
Q  20 gagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 119  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8797 gagattgttcagcagactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataaacgtagaaaag 8698  T
Q  120 atcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 219  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || ||    
T  8697 atcttgagttttaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgccttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcat 8598  T
Q  220 tagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaa 319  Q
    | ||||||||||| |||  ||||||||| ||| |||||| |||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||  | || ||||||||||| |||    
T  8597 tggtccgtatcagatattggaaagagttggaagggtggcttaccgagtgggtttaccacctcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaa 8498  T
Q  320 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||    
T  8497 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgaaatctagagtgacgatgt 8448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 13966 - 13834
Alignment:
Q  32 cagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttc 131  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||     
T  13966 cagactactaagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataaacgtagaaaagatcttgagtttt 13867  T
Q  132 aagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactc 164  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13866 aggaaggagaccacgtatttttgagagtcactc 13834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 342
Target Start/End: Original strand, 50556 - 50830
Alignment:
Q  68 atgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 167  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||| | |||| | |||||||| || || |||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||| |     
T  50556 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctgtcataacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactccta 50655  T
Q  168 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagt 267  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || |||||||||||||| |  |||||| | || |||||| |||| || |||||  | || ||||| ||  | ||    
T  50656 tgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccaaagtttattggcccatatcagatatctgagagagtcgggacagtggcttatagggt 50755  T
Q  268 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatcc 342  Q
     || ||  | || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||  |  | ||||||||||| ||||||||    
T  50756 gggtttgccccctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccacgtgtcgtagttgcggaagtatgtaccggatcc 50830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Original strand, 106594 - 106757
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    |||| ||||||||| || || |||||||  |  |||||| |||| |||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  |  || || |    
T  106594 gttaggatgattcaggagaagatgaaagcatctcagagtagacataagatttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 106693  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    |||||||||| || | || |||||| |||||||| | |||||| ||||  | ||||||||||||    
T  106694 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcctgctttaaagtgtaggaagttgactcc 106757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 7689 - 7340
Alignment:
Q  20 gagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  7689 gagactgttcaacagactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataaacgtagaaaag 7590  T
Q  120 atcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 219  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||    
T  7589 atcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccgaagttcat 7490  T
Q  220 tagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaa 319  Q
    | ||||||||||| |||  || |||||| |||||||||| || ||||| || ||| |||| |||||||||||||||||  | || ||||||||||| |||    
T  7489 tggtccgtatcagatattggagagagttggaacggtggcttagcgagtgggtttaccacctcatctttcgaatttgcacaacgttttccatgtgtcgcaa 7390  T
Q  320 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  7389 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtaatccagagtgacgatgt 7340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15804 - 15456
Alignment:
Q  20 gagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  15804 gagattgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaat 15705  T
Q  120 atcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 219  Q
    | || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15704 acctcgagtttcaagaaggagaccacgtatttttgacagtcattcttgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttat 15605  T
Q  220 tagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaa 319  Q
    | || |||||||| |||| ||||||||| |||||||||| || ||||| || ||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| || |||| ||| |||    
T  15604 tggttcgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcatatcgagtaggtttaccaccacat-tttcgaatttgcacgatgtgtttcatgggtcgcaa 15506  T
Q  320 cttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15505 cttcggaagtatgttccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 15456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15967 - 15832
Alignment:
Q  20 gagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  15967 gagattgttcaacaaactactgagaaagttaaaatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaat 15868  T
Q  120 atcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttga 155  Q
    | || ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15867 acctcgagtttcaagaaggagaccacgtatttttga 15832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 68 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28231 - 27930
Alignment:
Q  68 atgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 167  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  || || |||||||||||||| ||||  |    
T  28231 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaggatcttgaatttcaagagggtgatcatgtgtttttgagagttactccgg 28132  T
Q  168 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagt 267  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  28131 tgactggtgttggacgtgctgtgaagtcaaagaagttgaatcctagatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcgtatcgagt 28032  T
Q  268 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 367  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28031 tggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 27932  T
Q  368 gt 369  Q
    ||    
T  27931 gt 27930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9662 - 9306
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9662 aggaccagagattgtttaacaaactaccgagtaggttaagatgattcaagagaagatgaaggcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 9563  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  9562 aggaaagaccttgagtttcaagaaggagaccacgtattgttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgagctttgaagtcaaagaaggtgactccta 9463  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  |||| || |||||    
T  9462 gatttattggtctgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcactatgtgtttcatgt 9363  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  9362 gtcgcaacttcgaaagtatgttctagatccatcccatgtgatccaaagtgatgatgt 9306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Original strand, 16462 - 16808
Alignment:
Q  23 attgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 122  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  16462 attgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaataaaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagacc 16561  T
Q  123 ttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattag 222  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||| |||| | |    
T  16562 ttgagtttcaagagggagatcacgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgcacattgaagtcaaagaagttgactcagaggtttactgg 16661  T
Q  223 tccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaactt 322  Q
    |||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | | |||||    
T  16662 tccgtatcagatatcgaaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatatgttccatgtattaaaactt 16761  T
Q  323 cggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16762 cagaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 16808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 733 - 377
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  733 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgatccaagagaaaacgaaggcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 634  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  633 agaaaagaccttgaatttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccga 534  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
     ||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||  | || ||||||||    
T  533 aattcattggtccgtatcagatattggaaagagttggaacagtggcttaccgagtgggtttaccaccgcatcttgcgaatttgcacaacgttttccatgt 434  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  433 gtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaattcagagtgacgatgt 377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 49 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 162396 - 162076
Alignment:
Q  49 taagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtg 148  Q
    |||||||||| |||||| | |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  162396 taagatgatttaagaaagagtgaaagcgtcgcagagtcaacaaaagagttatcatgataagcgtaaaaaagatcttgtgtttcaagaagtagaccacgta 162297  T
Q  149 tttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttc 248  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||     
T  162296 tttttgagagtcactcctatgactggtgttggacgagcgtcgaagtcaaagaacttgactccgagatttattggcccgtatcagatatcagaaagagttg 162197  T
Q  249 gaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctca 348  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  162196 gaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtttcgcaacttcagaagtatgttccggatccatccca 162097  T
Q  349 tgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  162096 tgtgatccaaagtgatgatgt 162076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 448373 - 448022
Alignment:
Q  18 cagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  448373 cagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagtgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgataagcgtaggaa 448274  T
Q  118 agatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 217  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||| |||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  448273 agaccttgagtttcaagaaggagatcacgtattttttagagtcactcctgtaactattgttggacgagcattgaagtcaaagaagttgactccgaggttt 448174  T
Q  218 attagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcac 317  Q
    ||| ||||||||||  |||| |||||| || ||||||||||| | | ||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |    
T  448173 attggtccgtatcaaatatcggaaagaattggaacggtggcgcatcaagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgc 448074  T
Q  318 aacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  448073 aacttcggaagtattttccggatccatctcatgtgatccaaagagatgatgt 448022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 333
Target Start/End: Original strand, 90932 - 91239
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  90932 gttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttg 91031  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | ||| || |||||| ||||||| |||| |  ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||    
T  91032 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctacgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgacttcaaagtttattagtcc 91131  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
     ||| || |||| || || ||| |||| ||||| ||| |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  91132 atattagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtaggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaactgcgg 91231  T
Q  326 aagtatgt 333  Q
    ||||||||    
T  91232 aagtatgt 91239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 210
Target Start/End: Original strand, 78690 - 78813
Alignment:
Q  87 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgc 186  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  |  || || |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| |||||    
T  78690 gacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagagtgaatcatgtgacaggagttggtcgtgc 78789  T
Q  187 tttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    ||||||||  | ||||||||||||    
T  78790 tttgaagtgtaggaagttgactcc 78813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 175427 - 175352
Alignment:
Q  168 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaag 243  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||  |||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  175427 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcaaagaagttgatcccgaagtttattggtccgtatcagatatcggaaag 175352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 23 - 357
Target Start/End: Original strand, 26530 - 26864
Alignment:
Q  23 attgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 122  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  26530 attgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaaagacc 26629  T
Q  123 ttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattag 222  Q
    ||||||| || |||| ||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  26630 ttgagttccaggaaggagatcacgtatttttgagagttactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtgaaagaagttgactccgaggtttattgg 26729  T
Q  223 tccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaactt 322  Q
     ||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  26730 cccgtatcagatatcagaaaggattgaaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttccatgatgtgtttgatgtgtcgcaactt 26829  T
Q  323 cggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26830 cggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcca 26864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 369
Target Start/End: Original strand, 195703 - 196045
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||||| || | |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  195703 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcatagagaagatgaaagcgtcgtagagacgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 195802  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    ||||||| || |  || || || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| ||||    
T  195803 agtttcaggagggtgatcatgt-tttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaggaagttgactccaaagttcattggtcc 195901  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| ||||||| |  ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  195902 gtatcagatatcagagaaggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 196001  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  196002 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 196045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 148840 - 148551
Alignment:
Q  62 gaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtca 161  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||| ||||| || |||||||| |  ||| ||||  |||| |  || || || ||| ||||||| |    
T  148840 gaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacggaagagttaccatgacaaccgtagaaaggcccttaagttctaagagggtgatcatgtatttctgagagtta 148741  T
Q  162 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgta 261  Q
    ||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||| ||||||||||| ||| ||| || ||| |||| ||||| ||    
T  148740 ctcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatgagagagggttggaacagtggcata 148641  T
Q  262 ccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    | |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  148640 cagagtaggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 148551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 168 - 369
Target Start/End: Original strand, 68582 - 68783
Alignment:
Q  168 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagt 267  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||| ||||||||||| |||| || || ||| |||| ||||| ||| ||||    
T  68582 tgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagt 68681  T
Q  268 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 367  Q
     || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||    
T  68682 gggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgat 68781  T
Q  368 gt 369  Q
    ||    
T  68782 gt 68783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Original strand, 121971 - 122134
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    ||||| |||||||| || || ||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  |  || || |    
T  121971 gttaacatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 122070  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    | |||||||| || | || |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  122071 tatttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 122134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 4351 - 3995
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||| || |||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4351 aggaccagaaatcgttcaataaactactgagaaggttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttactatgataagcgt 4252  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || ||||| ||||||||| |||||| ||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  4251 aggaaagaccttgagttttaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgactccga 4152  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgt 312  Q
    | |||||| |||| |||||| ||||||||||  || ||||||||||||| | ||| || |||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||    
T  4151 ggtttattggtccatatcagatatcagaaaggattggaacggtggcgtatcaagtgggtttactaccgcatctttcgaatttgcatgatttgtttcatgt 4052  T
Q  313 gtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  4051 gtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagagatgatgt 3995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 70 - 369
Target Start/End: Original strand, 26 - 325
Alignment:
Q  70 gaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtg 169  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||||    
T  26 gaaagcgtcgcagagtcgacaaaagaattatcatgataagcgtaggaaagaccttgagtttcaagaaggagatcatgtattttttagagtcactcatgtg 125  T
Q  170 actggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttg 269  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||      
T  126 actggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactctgagatttattggtccgtatcagatatcggaaagtgttggaacggtggcgtatcgagtga 225  T
Q  270 gattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  226 gtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtatcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 26 - 369
Target Start/End: Original strand, 15079 - 15422
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15079 gttcaacaaactactgagaaggttaagttgatccaagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttg 15178  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    ||||||| |||| ||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || || ||| |||     
T  15179 agtttcaggaaggagatcatgtatctttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactctaaggttaattggtct 15278  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  15279 gtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 15378  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||  || ||||||||    
T  15379 aagtatgtttcggatccatctcatgtcatcccaagagatgatgt 15422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14350 - 14002
Alignment:
Q  21 agattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 120  Q
    |||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  14350 agattgttcagcaaactaccaagaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggagaga 14251  T
Q  121 tcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatt 220  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14250 tcttgagtttcaagaaggagaccacatgtttttgatagtcactcctgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagtagttgactccgagatttatt 14151  T
Q  221 agtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaac 320  Q
     ||| |||| || |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||| |  |||| || |||||||| ||||    
T  14150 ggtctgtatgagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagtgagattaccaccgcatctttcgaatttgaactatgtgtttcatgtgtcgcaac 14051  T
Q  321 ttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||| ||||||||| | | ||||||  ||||||||||| | |||||||||    
T  14050 ttccgaagtatgtacagaatccattccatgtgatccaaactgatgatgt 14002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31700 - 31373
Alignment:
Q  42 agaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaaga 141  Q
    ||||||| ||||||||   |||||| ||||||| || |||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| | | |    
T  31700 agaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaatagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggata 31601  T
Q  142 ccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaa 241  Q
     || |||||| ||||||| |||  | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||| ||||||||||| |||| ||     
T  31600 tcatgtgtttctgagagttacttctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatctgat 31501  T
Q  242 agagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatc 341  Q
    ||  || |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  31500 aggtttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttttttgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatc 31401  T
Q  342 catctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    | || ||||| || | ||| ||||||||    
T  31400 cttcgcatgttattccgagagatgatgt 31373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 17761 - 17660
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17761 aggaccagagattgttcagcagactactaagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagtgttataatgataagcgt 17662  T
Q  113 ag 114  Q
    ||    
T  17661 ag 17660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 29 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 3443 - 3115
Alignment:
Q  29 caacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagt 128  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  3443 caacaaactactgagaaggttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttaagt 3344  T
Q  129 ttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgta 228  Q
    ||||||||| ||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||    
T  3343 ttcaagaaggagatcatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgcgcattgaagtcaaagaagttgacttcgaggtttattggttcgta 3244  T
Q  229 tcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaag 328  Q
    |||| |||  |||||| || ||||||||||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  3243 tcagatatttgaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaag 3144  T
Q  329 tatgttccggatccatctcatgtgatcca 357  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  3143 tatgttccggatccatcttacgtgatcca 3115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 112327 - 111984
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||| |||| |||||||| |||| ||  |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || || ||||    
T  112327 gttcaacaaactattgagaaggttaagttgatccaagaaaagatgatagcatcacagagtcgacaaaagagatatcatgataagcgtaagaaggaccttg 112228  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    ||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  112227 agtttcaggaaggagaccatgtatttttgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactcccaggtttattggtcc 112128  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |    
T  112127 gtatcagatatcagaaagaattggaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcag 112028  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  112027 aagtatgtttcggatccatctcatgtgatcccaagagatgatgt 111984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 61 - 369
Target Start/End: Original strand, 203503 - 203811
Alignment:
Q  61 agaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtc 160  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| | ||||||    
T  203503 agaaaatatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagatttatcacgataagcgcaggaaagaccttgaatttcaagaaggagaccatgtgtttctaagagtc 203602  T
Q  161 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgt 260  Q
    |||| |||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||| |    
T  203603 actcttgtgacaggtgctggccgtgctttgaagccaaagaagttgacgccgaggtttattggtccgtatcagatatctaaaagagttggaacagtggcat 203702  T
Q  261 accgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagag 360  Q
    |  |||| || ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||   ||||||||| |||||||| | |||    
T  203703 atagagtgggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtattggatccatcgcatgtgattccgag 203802  T
Q  361 tgatgatgt 369  Q
     ||||||||    
T  203803 ggatgatgt 203811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 323010 - 322703
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  323010 gttcatcagactacggagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 322911  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    ||||||| || |  || || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| ||||    
T  322910 agtttcaggagggtgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 322811  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
     |||||| ||||||| || ||| ||||  |||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  322810 atatcagatatcagagagggttggaacaatggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 322711  T
Q  326 aagtatgt 333  Q
    ||||||||    
T  322710 aagtatgt 322703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 386118 - 385797
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||   |||||| ||||||| || |||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||    |||||||||||    
T  386118 agactacggagaaggttaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtccacagaagagttaccatgacaagcgaagaaagacccttgagtttca 386019  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
    ||| | ||| ||  | ||| |||||||||||| |  ||| ||||| ||  |||| |||||||  ||||||||||||||||  |||||  || | || |||    
T  386018 agagggagatcatctatttctgagagtcactcctacgacgggtgtaggttgtgcgttgaagtataagaagttgactccgaagtttataggttcataccag 385919  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     |||| || |||||| |||| ||||| ||| |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  385918 atatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 385819  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    |  ||||||| || ||||||||    
T  385818 tagcggatccttcgcatgtgat 385797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 117874 - 117532
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||||| ||  || |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  117874 gttcatcatactacggagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcacaaagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 117775  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    ||||||| || |  || || || ||| |||| || |||| | ||||  |||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| ||||    
T  117774 agtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgagtgtgggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 117675  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| |||| || || ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  117674 gtatcagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 117575  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 368  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| |||||||    
T  117574 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatg 117532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 183; Significance: 7e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 7258 - 6900
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||  |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7258 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaggttcagatgatctaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcacgataagcgt 7159  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgt-ttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccg 211  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7158 ggaaaagatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgttttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgaccccg 7059  T
Q  212 agatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgca-tctttcgaatttgcatgatgtcttccat 310  Q
    |  || ||| |||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||  | || ||||||    
T  7058 aagttcattggtccatatcagatattggaaagagttggaacggtggcttaccgagtgggtttaccgccgcattctttcgaatttgcacaacgttttccat 6959  T
Q  311 gtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  6958 gtgtcgcaacttcgaaagtatgttccggatccatctcatgtaatccaaagtgacgatgt 6900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 29 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1307 - 968
Alignment:
Q  29 caacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagt 128  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1307 caacaaactactgagaaggttaagacgatt-aagaaaaagtgaaatcgtcgcagagtcggcaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagaccttgagt 1209  T
Q  129 ttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgta 228  Q
    |  |||||| ||| || || || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1208 tcaaagaaggagatcatgtattcttgagagtcacccctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgagatttattggtccgta 1109  T
Q  229 tcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaag 328  Q
    || | |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  | |||||||| |||    
T  1108 tcggatatcggaaagagttggaacgttggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtctttcatgtaacgcaacttcgaaag 1009  T
Q  329 tatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  1008 tatgttctggatccatcttatgtgatccaaggtgatgatgt 968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 356
Target Start/End: Original strand, 252 - 590
Alignment:
Q  18 cagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 117  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |  || |||||||||||||| ||    
T  252 cagaaattgtacagcaaactactgagaaggttaagatgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaacaactaccatgataagcgtaggaa 351  T
Q  118 agatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 217  Q
    |||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  352 agacattgagtttcaagaaggggaccatgtgtttttgagagtcaatcctgtaaccggtgttggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccgagattt 451  T
Q  218 attagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcac 317  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  452 attggtccgtatcagatatcagaaaggattggaatggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgc 551  T
Q  318 aacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatcc 356  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  552 aacttcggaagtatgttatggatccatctcatgtgatcc 590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 20 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 49805 - 49510
Alignment:
Q  20 gagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaag 119  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  49805 gagattgttcaacaaactactgagaaagttaagatgattcaagaaaagaggaaagcgtcgcagagttggcaaaagatttatcatgataagcgtaggaaag 49706  T
Q  120 atcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttat 219  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49705 accttgagtttcaagaaggagaccacatattttttagagtcactcctgtgattgttgttggacgagctttgaagtcaaagaagttgactcctagatttat 49606  T
Q  220 tagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtc 315  Q
    | | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  49605 tggcccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtaccgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtc 49510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 23 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 311 - 1
Alignment:
Q  23 attgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 122  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  311 attgttcagcagactattgagaaagttaagatgagtcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaccgtagaaaggatc 212  T
Q  123 ttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattag 222  Q
    ||||||||||||| |   | || |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  211 ttgagtttcaagagggttatcatgtgtttttgagagtcaatccggtgactggtgttggacgtgctttgaagtaaaaaaagttgactccgagatttattgg 112  T
Q  223 tccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaactt 322  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  111 tccgtatcagatatcggaaagagttggaatagtggcatatcgagttggtttaccaccgcatctttcaaattttcatgatgtctttcatgtgtcgcaactt 12  T
Q  323 cggaagtatgt 333  Q
    |||||||||||    
T  11 cggaagtatgt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 8109 - 7855
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8109 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaggttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgt 8010  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8009 aggaaagatcttgagtttcaggaaggagaccacgtgtttttgagagtcacttcggtgaccggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccga 7910  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagt 267  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  7909 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 7855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 354
Target Start/End: Original strand, 116905 - 117233
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  116905 gttcagcaaactactgagaaggttaagttgatccaagaaaagatgaaagcgttgcagagtcgacaaaagagttatcatgataaacgtaggaaagaccttg 117004  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||||  ||| || || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  117005 agtttcaagaaagagaacaagtatttttgagagtcactcatgtgaatagtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagttgactccgaggtttattggtcc 117104  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||| ||||| || ||| ||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||    
T  117105 gtatcaaatatcagaaagaattgtaacggtggcgtatcgagtgggtttaccaccgtatatttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgtaacttcgg 117204  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  117205 aagtatgtttcagatctatctcatgtgat 117233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 98300 - 98137
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    |||||||||||||| || || ||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||| ||||||||||||  |  || ||||    
T  98300 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagtaaggatattgagtttcaagttggtgatcacg 98201  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    ||||||| || || | || | |||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  98200 tgtttttaagggtgaatcctatgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 98137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 210
Target Start/End: Original strand, 23586 - 23650
Alignment:
Q  146 gtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    ||||||||||| || | || |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  23586 gtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 23650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 369
Target Start/End: Original strand, 12969 - 13320
Alignment:
Q  18 cagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 117  Q
    |||| ||| |||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12969 cagaaattcttcagcaaactactgagaaagtttagatgatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaa 13068  T
Q  118 agatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 217  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  13069 agatcttgaatttcaagaaggagaccatgtgttattgagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaagtctaagaaattgacttcgagattt 13168  T
Q  218 attagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcac 317  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |  ||| ||| |||||  |||| || ||| |||| || |||| |||||| |||||||| || |||||||| |    
T  13169 attagttcgtatcagatatcagaaagaatgggaatggtagcgtatggagtgggtttaccaccacaacttttgaatttacatgatgtgtttcatgtgtcgc 13268  T
Q  318 aacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||  || ||||||||    
T  13269 aacttcagaagtatttttcggatccatctcatatgatcctaagagatgatgt 13320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 369
Target Start/End: Original strand, 16408 - 16759
Alignment:
Q  18 cagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 117  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  16408 cagaaattgttcaacaaactactgagaaggttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagactcgacaaaagagttatcatgataagcgtaggga 16507  T
Q  118 agatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 217  Q
     ||||||   |||||||||| ||| || || ||||| || |||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16508 ggatcttatatttcaagaaggagatcatgtattttttagggtcactccagtgattggtgttggacgtgcattgaagtcgaagaagttgacaccgagattt 16607  T
Q  218 attagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcac 317  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||| |  || || ||| |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| |    
T  16608 attggtccgtataagatatcagaaagaattggaatggtggcgtatcatgtaggtttaccaccgcatctttcgaatttgtacgatgtgtttcatgtgtcgc 16707  T
Q  318 aacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16708 aacttcggaagtatgttcgggatccatctcatgtgatccaaagagatgatgt 16759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22186 - 21932
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  22186 aggaccagagattgttcagcagactattgagaaagttaaaatgattcaagagaagatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagtgc 22087  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22086 aggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccacgtgtttttgagagtcactcctgcgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 21987  T
Q  213 gatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagt 267  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  21986 gatttattggtccgtatcagatatcggaaagagttggaacggtggcgtatcgagt 21932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 147 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 17142 - 16920
Alignment:
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||    
T  17142 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgccttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatttgttcgtatcagatatcggaaagagt 17043  T
Q  247 tcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatct 346  Q
    |  ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17042 tttaacggtggcgtattgagttggtttaccaccgcatctttcgaatttgcatgatgtttttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccattt 16943  T
Q  347 catgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16942 catgtgatccagagtgatgatgt 16920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 26 - 354
Target Start/End: Original strand, 25719 - 26047
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||  |||    
T  25719 gttcagcaaactactgagaaggttaagttaatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagaattatcatgataagcgtaggaaggactttg 25818  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    ||||||| |||| | |||| || ||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||  | |||| ||  |||||| ||||    
T  25819 agtttcaggaaggaaaccatgtattttttagagtcactcctatgactggggttggacgtgcattgaagtcaaggaaactaactcggatgtttattggtcc 25918  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  25919 gtatcagatatcagaaagaattggaaccgtggcgtatcgagtgggtttaccaccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcacaacttcgg 26018  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26019 aagtatgtttcggatccatctcatgtgat 26047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 1214 - 886
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| || |||||||||||  |||||  ||| |||||||| || |||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1214 gttcagcaaactactgagaagattaagtggatccaagaaaagattaaagcgtcgcagatttgacaaaagagttatcatgataagcgtaggaaagaccttg 1115  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    ||||||| |||| |||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||| |||||| ||||    
T  1114 agtttcaggaaggagaccatgtattttttagagtcactcctgtgactggtgttggacgtgcattgaaatgaaagaaattgaatccgaggtttattggtcc 1015  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
     |||||| ||||||||||| || |||| ||||| || ||| | || ||| ||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||| |||||| ||    
T  1014 atatcagatatcagaaagaattggaacagtggcatatcgattgggtttaccaccgcatctttcgaatatgcatgatgtgtttcacgtgtcgcaactttgg 915  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  914 aagtatgtttcggatccatctcatgtgat 886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9284 - 9047
Alignment:
Q  18 cagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 117  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  9284 cagaaattgttcaacaaactgctgagaaggttaagataatccaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgtaggaa 9185  T
Q  118 agatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 217  Q
    ||| ||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9184 agaccttgagtttcaagaaggggatcatgtatttttgagagtcactcctgtgaccggtgttggacgtgcgttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 9085  T
Q  218 attagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggt 255  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  9084 attggtctgtatcagatatcagaaagaattggaacggt 9047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 276 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 7033 - 6940
Alignment:
Q  276 caccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7033 caccgcatgtttcgaatttgcatgatgtgtttcaagtgtcacaacttagaaagtatgttccggatccatctcatgtgatccaaagagatgatgt 6940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 210
Target Start/End: Original strand, 351 - 517
Alignment:
Q  44 aaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagacc 143  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||  |  |||||| | || |||||||||||||||||| | || || ||| |||||||||| |  |  || |    
T  351 aaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcatctcagagtaggcagaagagttatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaggttggtgatc 450  T
Q  144 acgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    | ||||| |||||||| | || ||| ||| ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  451 atgtgttcttgagagtgaatcctgtaactagtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7708 - 7522
Alignment:
Q  21 agattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaaga 120  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7708 agattgttcagcaaactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgcaaagtcgacaaatgagttatcatgataagcgtagaaaaga 7609  T
Q  121 tcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 207  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7608 tcttgagtttcaggaaggagaccacgtatttttgagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgctttgaagtcaaagaagttgac 7522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 231
Target Start/End: Original strand, 767 - 985
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  767 aggaccagagattgttcagcaaactactgagaaagttcagatgattcaagagaaaatgaaagcgtcgtagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 866  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccga 212  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  867 agaaaagatcttgagtttaaggaaggagaccacgtattttttagagtcactcctatgactggtgtaggacgtgcactgaagtcaaagaagttgaccccga 966  T
Q  213 gatttattagtccgtatca 231  Q
      || ||| ||||||||||    
T  967 agttcattggtccgtatca 985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 354
Target Start/End: Original strand, 86496 - 86832
Alignment:
Q  18 cagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 117  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||| ||| ||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  86496 cagacatttttcaacagactactgagaaggttaagttgataagagaaaagatggaagcgtcacagagtagacaaaagagttatcatgataatcgtaggaa 86595  T
Q  118 agatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagattt 217  Q
     ||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||||||  ||||| |||| |||    
T  86596 ggatcttgagtttcaagaaggataccatgtgttttttagagtcactcttgtgaccggtgttggacgtgcactaaaatcaaagaaactgacttcgaggttt 86695  T
Q  218 attagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcac 317  Q
    ||| | ||||||||  | || ||||||||| |  |||| |||||  |||| || ||| ||||||| ||||||||  | |||||||| || ||||||||||    
T  86696 attggcccgtatcaaatttcggaaagagttgggtcggttgcgtatagagtgggtttaccaccgcaactttcgaacctacatgatgtgtttcatgtgtcac 86795  T
Q  318 aacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  86796 aacttcggaagtatgtttcagatccatctcatgtgat 86832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 354
Target Start/End: Original strand, 5588 - 5918
Alignment:
Q  23 attgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 122  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||||| |||||  ||| || ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  5588 attgttcaacaaacaacagagaaggttaagttgattagagagaagatgaaagcgtcgcagagtagacaaaagagttatcatgataagcgca-aaaggatc 5686  T
Q  123 ttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattag 222  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||  | ||||| |||||  || ||||||| |||| | |    
T  5687 ttgagtttcaagaaggagaccatgtatttttgagagtcactcctgtgaccggtgttggacgagcactaaagtcgaagaaactgtctccgaggtttaatgg 5786  T
Q  223 tccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaactt 322  Q
    | |||||||  | ||| |||||||| | || || |||||  ||||  | ||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |    
T  5787 ttcgtatcatatttcataaagagttgggacagttgcgtatagagtgagtttaccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacat 5886  T
Q  323 cggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5887 cggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 5918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 354
Target Start/End: Original strand, 25068 - 25399
Alignment:
Q  23 attgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatc 122  Q
    |||||||| |||||||| || || |||||| | ||   ||| || ||||||| || |||||||||||| |||| |||||| || || ||||| |||||||    
T  25068 attgttcaccagactacagaaaaggttaagctaataagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagacttatcacgacaaacgtaggaaagatc 25167  T
Q  123 ttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattag 222  Q
    |||| ||||||| || |||||| |||||| | |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| | ||| |||||| |    
T  25168 ttgaatttcaagcaggagaccatgtgtttctaagagtcactcctgtgacaggtgttggtcgtgctttgaaatcgaagaagttgacgctgaggtttattgg 25267  T
Q  223 tccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaactt 322  Q
      |||||||| |||| ||||||||| |||| ||||| ||  |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  25268 ctcgtatcagatatcggaaagagttggaacagtggcatatagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaactt 25367  T
Q  323 cggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  25368 cggaagtatgtatcggatccatcacatgtgat 25399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26448 - 26132
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   |||||| || |||| || |||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| |  ||||    
T  26448 gttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatcaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccattacaagcgtagaaaggcccttg 26349  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||| | |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  26348 agtttcaagagggagatcatgtgtttttgagagtcactcctatgacgggtgtaggccgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtcc 26249  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||| ||| |||| || |||||| |||| ||||| ||| |||| || ||  |||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  26248 gtaccagatatctgagagagttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatcttttgaatttgcatgacgtgttccatgtgtcgcaacttcgg 26149  T
Q  326 aagtatgttccggatcc 342  Q
    ||||||||  |||||||    
T  26148 aagtatgtagcggatcc 26132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 68 - 351
Target Start/End: Original strand, 10781 - 11064
Alignment:
Q  68 atgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 167  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  10781 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgacaagtgtagaaaggatcttgagttacaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcctg 10880  T
Q  168 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagt 267  Q
    |||| ||| | || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||| |||| || | |||| |||| ||||| ||  ||||    
T  10881 tgacaggtataggtcgtgccttgaaatcgaagaagttgacaccgaggtttattggtccatatcagatatctgagaaagttggaacagtggcatatagagt 10980  T
Q  268 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
     |  ||  |||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  10981 ggatttgccaccacatctttcgaatttgcataatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcacatgt 11064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 369
Target Start/End: Original strand, 13901 - 14244
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||    
T  13901 gttcatcagactactgagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttg 14000  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| |  || || |||||||| ||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  || ||| ||||    
T  14001 agtttcaagagggggatcatgtgtttttaagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaaattgactccaaagttcattggtcc 14100  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| ||||||||||  || |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  14101 gtatcagatatcagaaaggattggaacagtggcatatagagttgggttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 14200  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  14201 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 14244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 297
Target Start/End: Original strand, 4960 - 5224
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||    
T  4960 agactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttca 5059  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || || || || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| |||||||||||    
T  5060 ggaggatgatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 5159  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgca 297  Q
     ||||||| || ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||    
T  5160 atatcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgca 5224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 47430 - 47123
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  47430 gttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgaaaagcgtaggaaggcccttg 47331  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | ||| || |||||| |||| || |||| | | || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||    
T  47330 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagggttactcctataacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagtttattggtcc 47231  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| |||| || || ||| |||| ||||| ||| |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  47230 gtatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 47131  T
Q  326 aagtatgt 333  Q
    ||||||||    
T  47130 aagtatgt 47123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 27825 - 27500
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  27825 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcaaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 27726  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    ||||||| || | ||| || |||||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||| |  || ||| ||||    
T  27725 agtttcaggagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacaggtgtaggacgtgcatcgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtcc 27626  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    |||| || ||||||| || ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||    
T  27625 gtataagatatcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatcttttgaatttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcgg 27526  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||    
T  27525 aagtatgtagcggatccttcgcatgt 27500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 369
Target Start/End: Original strand, 1149 - 1491
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||   |||||| ||||||| || |||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  1149 gttcatcagactacgaagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttg 1248  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | ||| || |||||| ||||| ||| || | |||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  1249 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagaatcattcctatgacgggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccga-agttattggtcc 1347  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| |||| || || ||| |||| ||||| ||   ||| || ||   ||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||    
T  1348 gtatcagatatctgagagggttggaacagtggcataaaaagtaggtttgaaaccacatctttcgaatttgaatgatgtatttcatgtgtcgcaacttcgg 1447  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  1448 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 1491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 4181 - 3874
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   |||||| ||||||| || | ||| |||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||    
T  4181 gttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcggagaatcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaagtccttg 4082  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | ||| || |||||| ||| |||||||| | |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  4081 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgatagtcactcctatgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtcc 3982  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
     |||||| |||| || || ||| |||| ||||| ||| |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  3981 atatcagatatctgagagtgttggaacagtggcttacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 3882  T
Q  326 aagtatgt 333  Q
    ||||||||    
T  3881 aagtatgt 3874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 369
Target Start/End: Original strand, 18537 - 18880
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  18537 gttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttg 18636  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | ||| || |||||| ||||||| |||| | |||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||      
T  18637 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagtttattggttt 18736  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| ||||||| || ||| |||| ||||| ||| |||| || ||  |||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  18737 gtatcagatatcagagagggttagaacagtggcatacagagtgggttttccaccacatcttttgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 18836  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  18837 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattcggagagatgatgt 18880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 3057 - 2750
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| |  ||||    
T  3057 gttcatcagacaacagagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagtgtcgcagagtcgacagaagggttaccatgacaagcgtagaaaggcccttg 2958  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | | | || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |  || ||| ||||    
T  2957 agtttcaagagggatatcatgtatttatgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctgagaagttgactccaaagttcattggtcc 2858  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| ||||||| || ||| |||| ||||| ||| |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  2857 gtatcagatatcagagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 2758  T
Q  326 aagtatgt 333  Q
    ||||||||    
T  2757 aagtatgt 2750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 333
Target Start/End: Original strand, 28826 - 29076
Alignment:
Q  83 agtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggac 182  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  | |    
T  28826 agtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgacaggtgtctgtc 28925  T
Q  183 gtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgca 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||||| | || || |||||| | || ||||| ||  |||| || |   || | ||    
T  28926 gtgctttgaagtcaaagaagttgactccacggtttattggtccatatcagatctctgagagagttgggacagtggcatatagagtgggttacccatcaca 29025  T
Q  283 tctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgt 333  Q
    ||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||| |||||||||    
T  29026 tctctcgaatttgcatgatgtgcttcatgtgtcgcaacttcagaagtatgt 29076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 333
Target Start/End: Original strand, 40817 - 41067
Alignment:
Q  83 agtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggac 182  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  | |    
T  40817 agtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaggaccttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagtcactcatgtgacaggtgtctgtc 40916  T
Q  183 gtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgca 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| |||||| | || || |||||| | || ||||| ||  |||| || |   || | ||    
T  40917 gtgctttgaagtcaaagaagttgactccacggtttattggtccatatcagatctctgagagagttgggacagtggcatatagagtgggttacccatcaca 41016  T
Q  283 tctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgt 333  Q
    ||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||| |||||||||    
T  41017 tctctcgaatttgcatgatgtgcttcatgtgtcgcaacttcagaagtatgt 41067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 404 - 79
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    ||||| |||||||  | | |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |  ||||    
T  404 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcatcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaagggcccttg 305  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | ||| || || ||| ||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||| ||||    
T  304 agtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtatgacgtgctttgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtcc 205  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| ||||||| || ||| |||| ||||| ||| |||| || ||| |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||    
T  204 gtatcagatatcagagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttaccaccacatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 105  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    || |||||  ||||||| || |||||    
T  104 aaatatgtagcggatccttcgcatgt 79  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 61 - 342
Target Start/End: Original strand, 7071 - 7352
Alignment:
Q  61 agaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtc 160  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| | ||| || |||||| |||| ||     
T  7071 agaaaatatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaagcgtagaaaagcccttgagtgtcaagagggagatcatgtgtttctgagggtt 7170  T
Q  161 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgt 260  Q
    |||| | |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  || ||| |||| || ||| |||| || |||||| |||| ||||| |    
T  7171 actcctatgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagttcattggtccataccagatatctgagagagttggaacagtggctt 7270  T
Q  261 accgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatcc 342  Q
    || |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  7271 acagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcagaagtatgtagcggatcc 7352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 63 - 288
Target Start/End: Original strand, 58443 - 58668
Alignment:
Q  63 aaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcac 162  Q
    |||| ||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||    
T  58443 aaaagatgaaagcgtcgcatagtagacaaaagagttatcatgataagcataggaaggatcttgagtttcaagaaggagaccatgtgtttttgagagccac 58542  T
Q  163 tcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtac 262  Q
    ||||||||| |||||||||| |||  |||| ||||||||  |||||||||| |||||| | ||||||||| | ||||||||| || | ||||| |||||     
T  58543 tcatgtgaccggtgttggacatgcactgaaatcaaagaaactgactccgaggtttattggcccgtatcagatttcagaaagaattgggacggttgcgtat 58642  T
Q  263 cgagttggattatcaccgcatctttc 288  Q
     |||| || ||| |||||||||||||    
T  58643 agagtgggtttaccaccgcatctttc 58668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19419 - 19120
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||    ||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  19419 agactacagagaaagtcaagatgatcagggaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggaccttgagtttca 19320  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||| ||| |||||||| | |||||||||||| | ||| ||| || ||||||||    
T  19319 ggatggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtcgaggaagttgactccaaaattcattggttcgtatcag 19220  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     |||| || || ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  19219 atatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgttgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatg 19120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 354
Target Start/End: Original strand, 59042 - 59100
Alignment:
Q  296 catgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  59042 catgatgtgtttcatgtgtcacaacttcggatgtatgtttcggatccatctcatgtgat 59100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 74140 - 74038
Alignment:
Q  92 aagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttga 191  Q
    ||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||| |  || || || |||||| ||||||| | || ||| || |||||||||||||||||||    
T  74140 aagagctatcatgataagagcaggaaagatattgagtttcaggttgatgatcatgtgtttctgagagtgaatcctgtaaccggtgttggacgtgctttga 74041  T
Q  192 agt 194  Q
    |||    
T  74040 agt 74038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 10099 - 9761
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   |||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |     | ||    
T  10099 gttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagga-----cgtg 10005  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | ||| || |||||| ||||||| |||| | || | ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  10004 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagttactcctatggcgggtgtaggacgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtcc 9905  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
     |||||| |||| || || ||| |||| ||||| ||| |||| || ||  |||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  9904 ttatcagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatcttttgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 9805  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  9804 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 9761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14391 - 14049
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   |||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |  ||||    
T  14391 gttcatcagactacggagaatgtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcatagaaaggcccttg 14292  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||| | |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||  || |    
T  14291 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtgtaggtcgtgcgttgaagtcgaagaagttgactccgaagtttatcggttc 14192  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    |||  || |||| ||||| ||| |||| ||||| |||  ||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |    
T  14191 gtactagatatctgaaag-gttggaacagtggcatacaaagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcag 14093  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  14092 aagtatgtagcggatccttcacatgttattccgagggatgatgt 14049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 333
Target Start/End: Original strand, 5949 - 6220
Alignment:
Q  61 agaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtc 160  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| | ||  || |||||| |||| ||     
T  5949 agaaaagatgaaagtgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagctcatgtgtttctgagggtt 6048  T
Q  161 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgt 260  Q
    |||| | |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||| || ||| |||| || |||||| |||| ||||| |    
T  6049 actcctatgacgggtgtaggtcgtgcattgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtccataccagatatctgagagagttggaactgtggcat 6148  T
Q  261 accgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgt 333  Q
    |  |||| || ||  |||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  6149 atagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcttgatgt-tttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 6220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20253 - 19973
Alignment:
Q  62 gaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtca 161  Q
    ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| | ||| || || ||| ||||||| |    
T  20253 gaaaagatgaaagcgtcccagagtcgacaaaagagttatcatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagtta 20154  T
Q  162 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgta 261  Q
    ||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |  || ||| ||||||||||| ||||||| |  ||| |||| ||||| ||    
T  20153 ctcctatgacgggtgtaggacgtgcgttgaagtcgaagaagtttactccaaagttcattggtccgtatcagatatcagagaaggttggaacagtggcata 20054  T
Q  262 ccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatcc 342  Q
    | |||| || ||  |||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  20053 cagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatggcgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatcc 19973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 369
Target Start/End: Original strand, 13362 - 13704
Alignment:
Q  27 ttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttga 126  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |  |||||    
T  13362 ttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttga 13461  T
Q  127 gtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccg 226  Q
    |||||| || |  || || || ||| | ||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| |||||    
T  13462 gtttcaggagggtgatcatgtatttctaagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcattggtccg 13561  T
Q  227 tatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgga 326  Q
    |||||| |||| || || ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  13562 tatcagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgga 13661  T
Q  327 agtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  13662 agtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 13704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 369
Target Start/End: Original strand, 17132 - 17474
Alignment:
Q  27 ttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttga 126  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |  |||||    
T  17132 ttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttga 17231  T
Q  127 gtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccg 226  Q
    |||||| || |  || || || ||| | || || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| |||||    
T  17232 gtttcaggagggtgatcatgtatttcttagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcattggtccg 17331  T
Q  227 tatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgga 326  Q
    |||||| |||| || || ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  17332 tatcagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgga 17431  T
Q  327 agtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  17432 agtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 17474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 342
Target Start/End: Original strand, 21671 - 21987
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    ||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||    
T  21671 gttcatcagactactgagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttg 21770  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| |   |||| || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||  || ||| ||||    
T  21771 agtttcaagagggtaaccatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgattccgaagttcattggtcc 21870  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    |||| || |||| || || ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  21871 gtataagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 21970  T
Q  326 aagtatgttccggatcc 342  Q
    ||||||||  |||||||    
T  21971 aagtatgtagcggatcc 21987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 26091 - 26004
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 134  Q
    |||||||||||||| || || ||||| | ||  || ||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  26091 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcatagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaag 26004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 32 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 4191 - 3872
Alignment:
Q  32 cagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttc 131  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  ||||||||||    
T  4191 cagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgacataagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttc 4092  T
Q  132 aagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatca 231  Q
    |||| | ||| || |||||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||| ||| ||||||    
T  4091 aagatggagatcatgtgtttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagttcattggtctgtatca 3992  T
Q  232 gttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtat 331  Q
    | |||| || || ||| |||| ||||| |||  |||||  ||  | || |||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  3991 gatatctgagagggttggaacagtggcatacatagttgttttgcctccacatctttcgaatttgcattatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtat 3892  T
Q  332 gttccggatccatctcatgt 351  Q
    ||  ||||||| || |||||    
T  3891 gtagcggatccttcgcatgt 3872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 40045 - 39702
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||   |||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| || ||||    
T  40045 gttcatcagactaacgagaaagtcaagattataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttactatgacaagcgtagaaaggaccttg 39946  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    ||||||| || | ||| || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| ||||| ||  | ||||| |||||||||||||| |  || ||| ||||    
T  39945 agtttcaggagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgcgcactcaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtcc 39846  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||| | |||| || || ||| |||| ||||| ||| |||| || ||  |||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  39845 gtatccgatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctctcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcacaacttcgg 39746  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| || | ||| ||||||||    
T  39745 aagtatgtagcggatccttctcatgttattccgagagatgatgt 39702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 333
Target Start/End: Original strand, 51863 - 52170
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| || ||||| ||||| || ||||||||   |||||| |||||||  | | |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  51863 gttcatcaaactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcttcgtagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttg 51962  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||| | |||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||| |  |||| | ||||    
T  51963 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtctaagaagttgactccaaagtttagtggtcc 52062  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
     |||||| |||| ||||| ||| |||| ||||| ||| |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||    
T  52063 atatcagatatctgaaagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcgg 52162  T
Q  326 aagtatgt 333  Q
    ||||||||    
T  52163 aagtatgt 52170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 37508 - 37201
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||   |||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |   |||    
T  37508 gttcatcagactacggagaaagttaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggccattg 37409  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||    ||| || |||||| | |||||||| | | |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||     
T  37408 agtttcaagggagagatcatgtgtttcttagagtcacccctatgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggtct 37309  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
     |||||| |||| ||||| ||| |||| ||||| ||| |||| || ||  |||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||||    
T  37308 atatcagatatctgaaagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccacctcatctttcaaatttgcatgatgtgttacatgtctcgcaacttcgg 37209  T
Q  326 aagtatgt 333  Q
    ||||||||    
T  37208 aagtatgt 37201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 32 - 237
Target Start/End: Original strand, 38180 - 38385
Alignment:
Q  32 cagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttc 131  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||  |||||| ||| ||| || |||||||||||| |||||||| || || |||||||| || |  ||||||||||    
T  38180 cagactacggagaaagtcaagatgattagagaaaagatggaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccaagacaagcgtaggaaggcccttgagtttc 38279  T
Q  132 aagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatca 231  Q
    |||| | ||| || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||  | ||| ||| ||||||||||    
T  38280 aagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcaaaaattaattggtccgtatca 38379  T
Q  232 gttatc 237  Q
    | ||||    
T  38380 gatatc 38385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 237
Target Start/End: Original strand, 27372 - 27548
Alignment:
Q  61 agaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtc 160  Q
    |||||| ||| ||| || |||||||||||| |||||||| || || |||||||| || |  |||||||||||||| | ||| || || ||| |||||||     
T  27372 agaaaagatggaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccacgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtatttctgagagtt 27471  T
Q  161 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatc 237  Q
    |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||  | ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  27472 actcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcaaaaattaattggtccgtatcagatatc 27548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 351
Target Start/End: Original strand, 10090 - 10408
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   ||| || |||||||  | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  10090 agactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcatcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttca 10189  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||| |||| ||||||    
T  10190 ggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccatatcag 10289  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
       |||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| | ||||||||||    
T  10290 agttcagaaagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcaattgcggaagtatg 10389  T
Q  333 ttccggatccatctcatgt 351  Q
    | |||||||| || |||||    
T  10390 taccggatccttcgcatgt 10408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 19155 - 18830
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    |||||||||||||| || ||  ||||| ||||  ||||| | ||||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||  || || ||||    
T  19155 gttcaacagactacagaaaagattaagttgataaaagaacagatgaaagcgtcgcagagtcaacagaagagctatcatgacaagcgtatgaaggaccttg 19056  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||| | |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  |||||| | ||    
T  19055 agtttcaagagggagaccatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggtcgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggccc 18956  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
     |||||| |||| || |||||| | || ||||||||  |||| || ||  |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |  ||    
T  18955 atatcagatatctgagagagttgggacagtggcgtatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcacaattgtgg 18856  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    |||||||| |||||||| || |||||    
T  18855 aagtatgtaccggatccttcgcatgt 18830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23317 - 23096
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    |||||||||||||| || ||  ||||| ||||  ||||| | ||||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||  || || ||||    
T  23317 gttcaacagactacagaaaagattaagttgataaaagaacagatgaaagcgtcgcagagtcaacagaagagctatcatgacaagcgtatgaaggaccttg 23218  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||| | |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  |||||| | ||    
T  23217 agtttcaagagggagaccatgtgttcttgagagtcactcctatgacaggtgtaggtcgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggccc 23118  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagtt 247  Q
     |||||| |||| || ||||||    
T  23117 atatcagatatctgagagagtt 23096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 5056 - 4760
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||   |||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||    
T  5056 gttcatcagactactgagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttg 4957  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | ||| || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |  || ||| ||||    
T  4956 agtttcaagagggagatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggatgtgcattgaagtctaagaaattgactccaaagttcattggtcc 4857  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaactt 322  Q
    |||| || |||| || || ||| |||| ||||| ||| |||| || ||  |||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  4856 gtataagatatctgagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcaaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaactt 4760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 168 - 303
Target Start/End: Original strand, 4567 - 4702
Alignment:
Q  168 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagt 267  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||| |||||    
T  4567 tgactggtgttggacgtgcattgaagtcaaagaagtttactccgagatttattggtccgtatcaggtatcggaaagaattggaacggtggcgtatcgagt 4666  T
Q  268 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgt 303  Q
     || ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  4667 gggtttaccatcgcatctttcgaatttgcatgatgt 4702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 254 - 369
Target Start/End: Original strand, 36974 - 37089
Alignment:
Q  254 gtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtga 353  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36974 gtggcgtatctagttggattaccaccgcctcttacgaatttgcatgatgtctttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgttccggatccatctgatgtga 37073  T
Q  354 tccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||| |||||||||    
T  37074 tccagaatgatgatgt 37089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 132
Target Start/End: Original strand, 4441 - 4560
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4441 aggaccagaaattgttcaacaaactactgacaagcttaagatgattcaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttaccatgataagcgt 4540  T
Q  113 agaaaagatcttgagtttca 132  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  4541 aggaaagatctcgagtttca 4560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 333
Target Start/End: Original strand, 18993 - 19045
Alignment:
Q  281 catctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgt 333  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||    
T  18993 catctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgt 19045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 369
Target Start/End: Original strand, 42333 - 42676
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  42333 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatggaagcgtcgcagagtcgactgaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 42432  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    ||||||| || |  || || || ||| |||| || |||| | |||| ||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| ||||    
T  42433 agtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggaagtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 42532  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| | ||||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  42533 gtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcttgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgg 42632  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  42633 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 42676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 369
Target Start/End: Original strand, 47399 - 47742
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |  ||||    
T  47399 gttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatggaagcgtcgcagagtcgactgaagagttatcatgacaagcgtaggaaggcccttg 47498  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    ||||||| || |  || || || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||  ||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| ||||    
T  47499 agtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggaaatgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 47598  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| | ||||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  47599 gtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcttgatgtgttccatgtgtcgcaacttcgg 47698  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  47699 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 47742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2330 - 2252
Alignment:
Q  152 ttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatc 230  Q
    |||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  2330 ttgagagtcactctagtgataggtgttggacgtgcattgaaatcaaagaagttgactctgaggtttattggtccgtatc 2252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 342
Target Start/End: Original strand, 1204 - 1485
Alignment:
Q  61 agaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtc 160  Q
    |||||| ||||||| ||  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |  |||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||     
T  1204 agaaaagatgaaagcgtctcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtt 1303  T
Q  161 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgt 260  Q
    |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||| ||||||||||| ||||||| || ||| |||| ||||| |    
T  1304 actcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatatcagagagggttggaacagtggcat 1403  T
Q  261 accgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatcc 342  Q
    |   | | || ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  1404 aaaaaataggtttgccaccacatctttcgaaattgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatcc 1485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 27531 - 27207
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||   |||||| ||||||| |  | |||||||||| |||||||| |||||  ||||||| || |  ||||    
T  27531 gttcatcagactacggagaaagtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgccgtagagtcgacagaagagttaccatgacgagcgtaggaaggc-cttg 27433  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    | |||||||| | | | || || ||| ||||||| |||| | || | ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||| ||||    
T  27432 aatttcaagagggatatcatgtatttctgagagttactcctatgtcgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtcc 27333  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| ||||||| || ||| |||| ||||| ||| |||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  27332 gtatcagatatcagagagggttggaaccgtggcatacagagtgggattgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 27233  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    || |||||  ||||||| || |||||    
T  27232 aaatatgtagcggatccttcgcatgt 27207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 333
Target Start/End: Original strand, 5002 - 5309
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||||||||   |||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||    
T  5002 gttcatcagaccacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttg 5101  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | ||| || |||||| ||||| |||||| | |||| ||||| ||  |||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||| || |    
T  5102 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagaatcactcctatgacgggtgtaggttgtgtgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggttc 5201  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| ||||  | || ||| ||||  |||| |||  ||| || ||  |||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||    
T  5202 gtatcagatatctaagagggttggaacactggcatacatagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgaatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 5301  T
Q  326 aagtatgt 333  Q
    ||||||||    
T  5302 aagtatgt 5309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 351
Target Start/End: Original strand, 14257 - 14576
Alignment:
Q  32 cagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttc 131  Q
    |||||||  |||| ||| ||||||||  ||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||     
T  14257 cagactatagagatagtcaagatgatcaaagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgataagcgtaggaaggcccttgagtttt 14356  T
Q  132 aagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatca 231  Q
    | || |  || || || ||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| ||||||||||    
T  14357 aggagggtgatcatgtatttctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 14456  T
Q  232 gttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtat 331  Q
    | | ||||| || ||| |||| ||||| ||   |||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||    
T  14457 gatttcagagagggttggaacagtggcatataaagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcaggtgtcgcaacttcggaagtat 14556  T
Q  332 gttccggatccatctcatgt 351  Q
    || |||||||| || |||||    
T  14557 gtaccggatccttcgcatgt 14576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 188 - 351
Target Start/End: Original strand, 9039 - 9202
Alignment:
Q  188 ttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatcttt 287  Q
    |||||||| | |||||||||||| |  || ||| ||||||||||| | ||||| || ||| |||| ||||| ||   |||||| ||  |||| |||||||    
T  9039 ttgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaacagtggcatataaagttggtttgccaccacatcttt 9138  T
Q  288 cgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  9139 cgaacttgcatgatgtgtttcaggtgtcgcaacttcggaagtatgtaccggatccttcgcatgt 9202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 33 - 351
Target Start/End: Original strand, 49214 - 49532
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||   |||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  49214 agactacagaaaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 49313  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
    ||| |  || || |||||| |||| |||| || | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||  |||||||||||    
T  49314 agagggtgatcatgtgtttctgagggtcattcctatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcag 49413  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| || ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||    
T  49414 atttcagagagggttggaactgtggcctatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgttacatgtatcgcagcttcggaagtatg 49513  T
Q  333 ttccggatccatctcatgt 351  Q
    |  ||||||| || |||||    
T  49514 tagcggatccttcgcatgt 49532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 455 - 172
Alignment:
Q  68 atgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 167  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |  ||||| || ||| |||| || |||| |     
T  455 atgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttcaggagggtgaccatgtttttctgagggttactccta 356  T
Q  168 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagt 267  Q
    |||| ||| | |||||||| |||||||  ||||| |||||||| |  || ||| ||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||| ||  ||||    
T  355 tgacgggtataggacgtgcgttgaagttgaagaacttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagaaagagttggaactgtggcatatagagt 256  T
Q  268 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    ||| ||  | || |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||| | ||||||||||| || ||||| || |||||    
T  255 tggtttgcctcctcatctttcgaatttgcatgacgtatttcatgtgtcgcaattgcggaagtatgtaccagatccttcgcatgt 172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 33 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 6483 - 6164
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||   ||| || ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  6483 agactactgagaaagtcaagatgatcatagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttca 6384  T
Q  133 agaagaagaccacgtgttt-ttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatca 231  Q
     ||||  ||||| || |||  |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| |||| |||||    
T  6383 ggaaggtgaccatgtttttcctgagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccttatca 6284  T
Q  232 gttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtat 331  Q
    | | ||||||||| || |||| ||||| ||  || |||| ||  || | | |||||||||||||||||| || || |||||||| ||| | |||||||||    
T  6283 gatttcagaaagatttggaactgtggcatatagatttggtttgccatctcttctttcgaatttgcatgacgtatttcatgtgtcgcaattgcggaagtat 6184  T
Q  332 gttccggatccatctcatgt 351  Q
    || || ||||| || |||||    
T  6183 gtaccagatccttcgcatgt 6164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 351
Target Start/End: Original strand, 25871 - 26190
Alignment:
Q  32 cagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttc 131  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||    ||||| ||||||| ||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||    
T  25871 cagactacggagaaggtaaagatgataagggaaaagatgaaagcgtctcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcgtagaaaggcccttgagtttc 25970  T
Q  132 aagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatca 231  Q
    |||| |  || || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||| ||||||||||    
T  25971 aagagggggatcatgtatttctgagagttactcctatgacgggtgtaggatgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatca 26070  T
Q  232 gttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtat 331  Q
    | ||||| |||| ||| |||| ||||| ||| |||| || ||  |||| |||||||| || ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||    
T  26071 gatatcaaaaagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcaaacttgcatgatgtgtttcatgcgtcgcaacttcggaaatat 26170  T
Q  332 gttccggatccatctcatgt 351  Q
    ||  ||||||| || |||||    
T  26171 gtagcggatccttcgcatgt 26190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 16946 - 16654
Alignment:
Q  62 gaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtca 161  Q
    ||||| |||||||  | ||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| || |  || || || ||| |||| ||||    
T  16946 gaaaagatgaaagcttcgcagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggctcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtca 16847  T
Q  162 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgta 261  Q
    ||| | |||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| ||||||||||| | ||||| || ||| |||  ||||| ||    
T  16846 ctcctttgacgggtgttggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactcctaagttcattggtccgtatcagatttcagagagggttggaatagtggcata 16747  T
Q  262 ccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 354  Q
      | ||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  16746 tagtgttggtttgccaccacatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatgtagcggatccttcacatgtgat 16654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 369
Target Start/End: Original strand, 49033 - 49376
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   |||||| |||||||  | |||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  49033 gttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgatagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttg 49132  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    |||||||||| | | | || |||||| ||||||| || | | |||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||    
T  49133 agtttcaagagggaaatcatgtgtttctgagagtaacacctatgacaggtgtaggaagtgcgttgaagtctaagaagttgactccaaagtttattggtcc 49232  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| |||| || || ||| |||| | ||| |||  ||| || ||  |||| |||||||||||||| ||| |||| || |||||||| |||||||||    
T  49233 gtatcagatatctgagagggttggaacagcggcatacaaagtgggtttgccaccacatctttcgaattttcataatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgg 49332  T
Q  326 aagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  49333 aagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 49376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 62 - 369
Target Start/End: Original strand, 57853 - 58159
Alignment:
Q  62 gaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtca 161  Q
    ||||| ||||||| || ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||  | |  || || || ||||||||||| |    
T  57853 gaaaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaa-agttaccatgataagcggagaaaggcccttgagtttcagaagggtgatcatgtatttttgagagtta 57951  T
Q  162 ctcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgta 261  Q
    |||   |||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||| ||| ||||||| | ||||| ||  || |||||||||| ||    
T  57952 ctccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtctgtatcagatttcagagaggattggaacggtggcata 58051  T
Q  262 ccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagt 361  Q
      ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || ||||| || | |||     
T  58052 tagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgttattccgaga 58151  T
Q  362 gatgatgt 369  Q
    ||||||||    
T  58152 gatgatgt 58159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 124 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1385 - 1167
Alignment:
Q  124 tgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagt 223  Q
    |||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||| | |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||    
T  1385 tgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacaggtgtaggtcgtgcgttgaagtctaagaagttgactccgaagtttattggt 1286  T
Q  224 ccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttc 323  Q
    | ||||||| ||||  | || ||| |||| ||||| ||| |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  1285 ctgtatcagatatcttagagggttggaacagtggcatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttc 1186  T
Q  324 ggaagtatgttccggatcc 342  Q
    ||||||||||  |||||||    
T  1185 ggaagtatgtagcggatcc 1167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 318 - 369
Target Start/End: Original strand, 26213 - 26264
Alignment:
Q  318 aacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26213 aacttcggaagtatgttctggatccatctcatgtgatccaaagtgatgatgt 26264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 11193 - 10851
Alignment:
Q  27 ttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttga 126  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |  |||||    
T  11193 ttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttga 11094  T
Q  127 gtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccg 226  Q
    |||||| || |  || || || ||| | || || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| |||||    
T  11093 gtttcaggagggtgatcatgtatttcttagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcattggtccg 10994  T
Q  227 tatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgga 326  Q
    |||||| |||| || || ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  10993 tatcagatatcggagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttagaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcgga 10894  T
Q  327 agtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  10893 agtatgtagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 10851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 342
Target Start/End: Original strand, 400 - 715
Alignment:
Q  27 ttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttga 126  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||   ||| || ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |  |||||    
T  400 ttcatcagactacagagaaagtcaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcatgacaaacgtaggaaggcccttga 499  T
Q  127 gtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccg 226  Q
    |||||| || |  || || || ||| | || || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| |||||    
T  500 gtttcaggagggtgatcatgtatttcttagggttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgacgaagttgactccaaagttcattggtccg 599  T
Q  227 tatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgga 326  Q
    |||||| | ||||| || ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| ||||||||||    
T  600 tatcagatttcagagagggttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaatttgcatggcgtgtttcatgtgtcgcaacttcgga 699  T
Q  327 agtatgttccggatcc 342  Q
    |||||||  |||||||    
T  700 agtatgtagcggatcc 715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Original strand, 7831 - 7994
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    |||||||||||||| || || ||||| | ||  |||||| |||| ||||| |||||||||||| | || || ||| ||||||||||||  |  || || |    
T  7831 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagctatcatgataagaggaggaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 7930  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    ||||||||||||| | || |||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  7931 tgtttttgagagtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 7994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 33 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 26560 - 26239
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    |||||||||||||||||| | ||||    ||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||||| | ||||||||||||    
T  26560 agactactgagaaagttaggttgataagggaaaagatgaaagcttcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagtgaagaaaggctcttgagtttca 26461  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  || ||  |||||||||||    
T  26460 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctttgacgggtgttggacgtgctttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcag 26361  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| || ||  |||| ||||| ||  ||| ||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  26360 atttcagagagggtgggaacagtggcttatagagctggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcggaagtatg 26261  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    |  ||||||  || ||||||||    
T  26260 tggcggatctttcgcatgtgat 26239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 333
Target Start/End: Original strand, 12781 - 13088
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    ||||| ||||||| || | |||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |  ||||    
T  12781 gttcatcagacgactgagaaggtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgatagaaaagttaccatgataagcggagaaaggcccttg 12880  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    ||||||| || |  || || || ||||||||||| ||||   |||| ||||| | |||||||||||| |||| |||||| |||||||  || ||| ||||    
T  12881 agtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtgtagaacgtgctttgaaatcaaggaagttaactccgaagttcattggtcc 12980  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    |||| || | ||||| ||  || |||||||||| ||| ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  12981 gtattagatttcagagaggattggaacggtggcatacagagttggcttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcacagcttcgg 13080  T
Q  326 aagtatgt 333  Q
    ||||||||    
T  13081 aagtatgt 13088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 20410 - 20103
Alignment:
Q  44 aaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagacc 143  Q
    ||||| |||||||||  |||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || |    
T  20410 aaagtcaagatgattagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttcaggagggtgatc 20311  T
Q  144 acgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaag 243  Q
    | |||||| |||| || |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||  ||||||||||| | ||||| ||    
T  20310 atgtgtttctgagggttactcttatgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagag 20211  T
Q  244 agttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatcca 343  Q
     ||| |||  ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||| |||||||||  |||||||     
T  20210 tgttggaattgtggcctatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcagaagtatgtagcggatcct 20111  T
Q  344 tctcatgt 351  Q
    || |||||    
T  20110 tcgcatgt 20103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 43804 - 43471
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||| || ||||||||||||||   |||||| ||||||| || | |||||||| | |||||||  ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  43804 agactacagaaaaagttaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgatagaagagttgccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 43705  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || |||||| |||| || |||| | |||| || || |||||||| ||||| || | |||||||||||| |  || ||  |||||||||||    
T  43704 ggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcctatgaccggggtaggacgtgcattgaattcgaggaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcag 43605  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| || ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  43604 atttcagagagggttggaactgtggcctatagagttggttttccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 43505  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatga 366  Q
    |  ||||||| || ||||| || ||||| |||||    
T  43504 tagcggatccttcgcatgttattcagagagatga 43471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 44816 - 44483
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||| || ||||||||||||||   |||||| ||||||| || | |||||||| | |||||||  ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  44816 agactacagaaaaagttaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgtagagtcgatagaagagttgccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 44717  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || |||||| |||| || |||| | |||| || || |||||||| ||||| || | |||||||||||| |  || ||  |||||||||||    
T  44716 ggagggtgatcatgtgtttctgagggttactcctatgaccggggtaggacgtgcattgaattcgaggaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcag 44617  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| || ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||    
T  44616 atttcagagagggttggaactgtggcctatagagttggttttccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 44517  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatga 366  Q
    |  ||||||| || ||||| || ||||| |||||    
T  44516 tagcggatccttcgcatgttattcagagagatga 44483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 168 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 36219 - 36036
Alignment:
Q  168 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagt 267  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||  ||||||||||| | ||||| || ||| |||  ||||| ||  ||||    
T  36219 tgacgggtgtgggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagtgttggaattgtggcctatagagt 36120  T
Q  268 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    ||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  36119 tggtttgccaccacatctttcgaacttgcaagatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatgtagcggatccttcgcatgt 36036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 68 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 792 - 509
Alignment:
Q  68 atgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 167  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| || || |||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||| |||| |     
T  792 atgaaagcgtcgcagagtcgacataagagctatcgtgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagttactccta 693  T
Q  168 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagt 267  Q
    |||| ||||| ||  |||| || || || ||||||||||||||||  |||||  ||||||||||  | ||||| || ||| |||| ||||| ||| ||||    
T  692 tgacaggtgtaggcagtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttatcggtccgtatcaaatttcagagagggttggaacagtggcttacagagt 593  T
Q  268 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
     || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||| || |||||    
T  592 gggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgttccatgtgtcggaacttccaaagtatgtagcggatccttcacatgt 509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 81 - 368
Target Start/End: Original strand, 38942 - 39229
Alignment:
Q  81 agagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttgg 180  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |  || || || ||| |||||||||||| | |||| ||||| ||    
T  38942 agagtcgacagaagagttatcatgacaagcgaagaaaggatcttgaatttcaggagggtgatcatgtttttctgagagtcactcctttgacgggtgtcgg 39041  T
Q  181 acgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccg 280  Q
     ||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||  ||||||||||| | ||||| |||||| || | ||||| ||  ||||||| ||  ||||     
T  39042 tcgtgccttgaagtcgaggaagttgactcctaagttcatcggtccgtatcagatttcagagagagttggagcagtggcatatagagttggtttgccacca 39141  T
Q  281 catctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatg 368  Q
    ||||||| ||| ||||| || || || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  39142 catctttagaacttgcacgaagtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttctcatgtgattcagagggatgatg 39229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 354
Target Start/End: Original strand, 16748 - 17041
Alignment:
Q  61 agaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtc 160  Q
    |||||| |||||||  | |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |  || || || ||| |||| |||    
T  16748 agaaaagatgaaagcttcgcagagccgacagaagagttaccatgacaagcgaagaaaggatcttgagtttcaggagggtgatcatgtttttctgagggtc 16847  T
Q  161 actcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgt 260  Q
    |||| | |||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||| |  || ||| |||||||| || | ||||| |||||| |||| ||||| |    
T  16848 actcctttgacgggtgtcggtcgtgctttgaagtcgagaaagttgactcctaagttcattggtccgtattagatttcagagagagttggaacagtggcat 16947  T
Q  261 accgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgat 354  Q
    |  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  16948 atagagttggtttgccacctcatctttcgaacttgcacgatgtgtttcatgtttctcagcttcggaagtatgttgcggatccttcacatgtgat 17041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 369
Target Start/End: Original strand, 61220 - 61556
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   |||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  61220 agactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 61319  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| |||| || |||| | |||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||| ||| |||||||    
T  61320 ggagggcgatcatgtatttctgagggttactcctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcag 61419  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     ||||  |||| ||| |||| ||||| ||  |||| || ||  |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||||    
T  61420 atatctaaaagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 61519  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  61520 tagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 61556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 369
Target Start/End: Original strand, 52186 - 52522
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   |||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  52186 agactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 52285  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| |||| || |||| | |||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||| ||| |||||||    
T  52286 ggagggcgatcatgtatttctgagggttactcctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcag 52385  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     ||||  |||| ||| |||| ||||| ||  |||| || ||  |||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| || |||||||||||||    
T  52386 atatctaaaagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaaattgcatgacgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 52485  T
Q  333 ttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  52486 tagcggatccttcgcatgttattccgagagatgatgt 52522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 333
Target Start/End: Original strand, 67608 - 67908
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||   |||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  67608 agactacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaaggcccttgagtttca 67707  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| |||| || |||| | |||  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||| ||| |||||||    
T  67708 ggagggcgatcatgtatttctgagggttactcctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaagaagttgactccaaagttcattggtctgtatcag 67807  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     ||||  |||| ||| |||| ||||| ||  |||| || ||  |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||||||||||    
T  67808 atatctaaaagggttggaacagtggcatatagagtgggtttgccacctcatctttcgaatttgcatgacgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtatg 67907  T
Q  333 t 333  Q
    |    
T  67908 t 67908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 248912 - 248612
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||    ||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    || ||||||||    
T  248912 agactactaagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaagtccctagagtttca 248813  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| |||| ||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| |||||||||||    
T  248812 ggagggtgatcatgtttttctgagggtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 248713  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatg 332  Q
     | ||||| | |||| |||  ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  248712 atttcagagaaagttggaaaagtggcttatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcacaacttcggaagtatg 248613  T
Q  333 t 333  Q
    |    
T  248612 t 248612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 68 - 342
Target Start/End: Original strand, 33719 - 33993
Alignment:
Q  68 atgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatg 167  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||| |     
T  33719 atgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagctatcatgacaagcgtaggaaggaccttgagtttcaagagggagatcatgtgttcttgagagtcactccta 33818  T
Q  168 tgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagt 267  Q
    |||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||  |||||| | || |||||| |||| || |||||  | || ||||| ||  | ||    
T  33819 tgacaggtgtaggccgtgcattaaaatctaagaagttgactccgaagtttattggcccatatcagatatctgagagagtcgggacagtggcttatagggt 33918  T
Q  268 tggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatcc 342  Q
     || ||  | || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||  | ||||||||||| ||||||||    
T  33919 gggtttgccccctcatctttcgaatttgcatgacgtgttccacgtgtcgcagttgcggaagtatgtaccggatcc 33993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 40543 - 40380
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    |||||||||||||| || || ||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  |  || || |    
T  40543 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 40444  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    |||||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  40443 tgtttttgagggtgaatcctgtgaccggagttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcc 40380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 117
Target Start/End: Original strand, 3706 - 3810
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 112  Q
    |||| ||||||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3706 aggaccagagatagttcagcaaactaacgagaaagttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgt 3805  T
Q  113 agaaa 117  Q
    |||||    
T  3806 agaaa 3810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 122 - 369
Target Start/End: Original strand, 4235 - 4482
Alignment:
Q  122 cttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttatta 221  Q
    |||||||||||||| |  || || |||||||| ||||| |||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||      
T  4235 cttgagtttcaagagggggatcatgtgtttttaagagttactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcatcg 4334  T
Q  222 gtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaact 321  Q
    ||||||||||| | ||| | || ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||    
T  4335 gtccgtatcagatttcaaagagggttggaactgtggcatatagagttggtttgccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaact 4434  T
Q  322 tcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  4435 tcggaagtatgtagcggatccttcacatgttattccgagagatgatgt 4482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 173 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 136278 - 136082
Alignment:
Q  173 ggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggat 272  Q
    ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| ||||||||||| | ||||| |||||| |||| ||||| ||  ||||||| |    
T  136278 ggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatttcagagagagttggaactgtggcatatagagttggtt 136179  T
Q  273 tatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |  |||| ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||  |||| |||| ||| ||||||||    
T  136178 ttccaccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcacgtgtcgcaacttcggaagtatgtagcggatccttcggatgttatcccgagagatgatgt 136082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2047 - 1916
Alignment:
Q  79 gcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgtt 178  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || |  |||||||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||| | |||| |||||     
T  2047 gcagagtcgacaaaagagttaccatgacaagcataggaaggcccttgagtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacaggtgta 1948  T
Q  179 ggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1947 ggacgtgcattgaagtctaagaagttgactcc 1916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 276 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6329 - 6238
Alignment:
Q  276 caccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgat 367  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6329 caccgcatctttcgaatttgcacgatgtgtttcatgtgtcgcaactttggaagtatgtaccggatccatcccatgtgatccaaagtgatgat 6238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 333
Target Start/End: Original strand, 2023 - 2173
Alignment:
Q  183 gtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgca 282  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||| ||||||||||| |||| || || ||| |||| ||||| ||| |||| || ||  |||| ||    
T  2023 gtgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttcattggtccgtatcagatatcggagagggttggaacagtggcatacagagtgggttttacaccaca 2122  T
Q  283 tctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgt 333  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  2123 tctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 2173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14831 - 14661
Alignment:
Q  24 ttgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 123  Q
    |||| ||| ||||||| || ||| ||||||||||| |||| || ||||||| ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||  |    
T  14831 ttgtgcaagagactacggaaaaatttaagatgattgaagagaagatgaaagagtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacat 14732  T
Q  124 tgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 194  Q
    ||||||||| |  |  || || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14731 tgagtttcaggttggggatcatgtgtttttgagagtgaatcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 14661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 26 - 333
Target Start/End: Original strand, 7238 - 7543
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||   |||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |  |||     
T  7238 gttcatcagtctacagagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcatcgcagagtcgacataagagttatcatgacaagcgtaggaaggccctta 7337  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtcc 225  Q
    ||||||| || |  || || || ||| |||| || |||  | |||  ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| ||||    
T  7338 agtttcaggagggtgatcatgtatttctgagggttacttctatgatgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtcc 7437  T
Q  226 gtatcagttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcgg 325  Q
    ||||||| | |||||| |  || |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||| ||||||| ||||||||||| || |||||||  |||||||||    
T  7438 gtatcagatttcagaagg--ttggaacagtggcatatagagttggtttgccaccacatatttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgttgcaacttcgg 7535  T
Q  326 aagtatgt 333  Q
    ||||||||    
T  7536 aagtatgt 7543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0551
Description:

Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8403 - 8217
Alignment:
Q  24 ttgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 123  Q
    |||| ||| ||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||| |||| |||| ||||||||||||| | ||||| ||| |    
T  8403 ttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaagagaatatgaaagcgtctcagagtagacagaagacttatcatgataagaggagaaaggatat 8304  T
Q  124 tgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    |||||||||||  |  || || || |||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||  | ||||||||||||    
T  8303 tgagtttcaagttggtgatcatgtatttttgagggtgaatcatgtgaccggtgttggtcgtgctttgatgtgtaggaagttgactcc 8217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 43082 - 42784
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||    ||||| ||||||| || |||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||    || ||||||||    
T  43082 agactactaagaaagtcaagatgataagggaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaatagttaccatgacaagcggagaaagtccctagagtttca 42983  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcag 232  Q
     || |  || || || ||| | || ||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| |  || ||| |||||||||||    
T  42982 ggagggtgatcatgtttttcttagggtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtcgaggaagttgactccaaagttcattggtccgtatcag 42883  T
Q  233 ttatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtat 331  Q
     | ||||| |  ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||    
T  42882 atttcagagaaggttggaacagtggcttatagagttggtttgccaccacatcttttgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcggaagtat 42784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23679 - 23518
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    |||||||||||||| || || ||||||| ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||     || ||||    
T  23679 gttaagatgattcaggagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttagtgatcacg 23580  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgact 208  Q
    |||||||||| || | ||||||||| || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||    
T  23579 tgtttttgagggtgaatcatgtgaccggagttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgact 23518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 308 - 369
Target Start/End: Original strand, 7498 - 7559
Alignment:
Q  308 catgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7498 catgtgtcgcaacttcggaagtttgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 7559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 117
Target Start/End: Original strand, 5467 - 5543
Alignment:
Q  41 gagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaa 117  Q
    |||||||| ||||||||   |||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  5467 gagaaagtcaagatgatcagagaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttaccatgacaagcggagaaa 5543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 333
Target Start/End: Original strand, 13380 - 13560
Alignment:
Q  153 tgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtccgtatcagttatcagaaagagttcgaac 252  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||| |  || ||| ||  ||||||| |||| || || ||| ||||    
T  13380 tgagagttactcctatgacgggtgtaggacatgcattgaagtctaagaagttgactccaaagttaattggtaagtatcagatatctgagagggttggaac 13479  T
Q  253 ggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgt 333  Q
     ||| | ||| |||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  13480 agtgacatacagagtgggtttgccaccacatctttcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 13560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Original strand, 3896 - 4059
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    |||||||||||||| || || ||||||| ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  || || || |    
T  3896 gttaagatgattcaggagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttgatgatcatg 3995  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    ||||||| ||||| | || |||||| |||||||| |||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  3996 tgtttttaagagtgaatcctgtgaccggtgttggtcgtgctttaaagtgtaggaagttgactcc 4059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 176 - 1
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttg 125  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||   |||||| ||||||| ||   ||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |  ||||    
T  176 gttcatcagactacggagaaggtcaagatgataagagaaaagatgaaagcgtcatagagtcggcagaagagttaccatgacaagcgtaggaaggcccttg 77  T
Q  126 agtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaa 201  Q
    |||||||||| | ||| || |||||| |||||||||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  76 agtttcaagagggagatcatgtgtttctgagagtcactcctatgacgggtgtaggacgtgcattgaagtctaagaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Original strand, 28287 - 28450
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |  |  || ||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||| |||| ||  || || |    
T  28287 gttaagatgattcaagagaagatgaaggcatctcaaagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagttacaagtaggtgatcatg 28386  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    |||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  28387 tgtttttgagggtgaatcatgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 28450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 46439 - 46276
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    |||||||||||||| || || ||||| | ||  |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  |  || || |    
T  46439 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacaaaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatg 46340  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    |||||||||| || | || ||| || |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  46339 tgtttttgagggtaaatcctgtaaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 46276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14965 - 14779
Alignment:
Q  24 ttgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 123  Q
    |||| ||| ||||||| || || |||||||||||| | || || ||||| ||||  |||||| |||| || ||||||||||||||| | ||||| ||| |    
T  14965 ttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgatttaggagaagatgaaggtgtctcagagtagacagaaaagttatcatgataagaggagaaaggatat 14866  T
Q  124 tgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    |||||||||||  |  || || |||||||| || || | || ||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  14865 tgagtttcaagttggtgatcatgtgttttttagggtgaatcctgtgactggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 14779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 43846 - 43737
Alignment:
Q  24 ttgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 123  Q
    |||| ||| ||||||| || || |||||||||||||| || || ||||||| ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |    
T  43846 ttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaagcgtctcagagtagacataagagttatcatgataagaggagaaaggatat 43747  T
Q  124 tgagtttcaa 133  Q
    ||||||||||    
T  43746 tgagtttcaa 43737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 12806 - 12745
Alignment:
Q  13 aggagcagagattgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaag 74  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12806 aggaccagagattgttcagcagactactgagaaagttaagatgattcaagagaaaatgaaag 12745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5519 - 5313
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaa-atgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatctt 124  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||||||  | |||||| ||||||| || |||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || |  |||    
T  5519 gttcatcagacgactgagaaggtcaagatgata-aggaaaaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaaaagttaccatgataagcggaggaaggccctt 5421  T
Q  125 gagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactccgagatttattagtc 224  Q
    |||||||| || |  || || || ||||||||||| ||||   |||| ||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||  || ||| |||    
T  5420 gagtttcaggagggtgatcatgtatttttgagagttactccgatgacgggtgtaggacgtgctttgaaatcgaggaagttgactccgaagttcattggtc 5321  T
Q  225 cgtatcag 232  Q
    ||||||||    
T  5320 cgtatcag 5313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3444 - 3281
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||  | |||||||| |  |  || || |    
T  3444 gttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggacatcgagtttcaggttggtgatcatg 3345  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    ||||||||||||| | || |||||| ||| |||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  3344 tgtttttgagagtgaatcctgtgaccggtattggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 3281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Original strand, 14758 - 14921
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||| |  |  || || |    
T  14758 gttaagatgattcaagagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgaatttcaggttggtgatcatg 14857  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    |||||||||| || | |||||||||  ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  14858 tgtttttgagggtgaatcatgtgaccagtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 14921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 210
Target Start/End: Original strand, 964 - 1094
Alignment:
Q  80 cagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttg 179  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  |  || || ||||||||||| || | || |||||| |||||||    
T  964 cagagtagacataagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttg 1063  T
Q  180 gacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    | |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  1064 gtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 1094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 194
Target Start/End: Original strand, 1052 - 1222
Alignment:
Q  24 ttgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 123  Q
    |||| ||| ||||||| || || ||||||||| | ||||| || ||||||| ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  1052 ttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatggtccaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaagatat 1151  T
Q  124 tgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 194  Q
    ||||||||  |  |  || || || ||||| ||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1152 tgagtttctggttggcgatcatgtattttttagagtgaatcctgtgactggtgttggtcgtgctttgaagt 1222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13216 - 13030
Alignment:
Q  24 ttgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 123  Q
    |||| ||| ||||||| || || ||||| ||||| ||||| || ||||||| ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |    
T  13216 ttgtgcaagagactacggaaaaggttaaaatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatat 13117  T
Q  124 tgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    ||||||||| |  |  || || ||||| |||||||| |  | |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  13116 tgagtttcaggttggtgatcatgtgttgttgagagtgaaccctgtgaccggtgttggtcgtgctttgaagtgtaggaagttgactcc 13030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 210
Target Start/End: Original strand, 393 - 570
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| || || ||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  393 agactacggaaaaggttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttca 492  T
Q  133 agaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    ||  |  |  || ||||||||||| || | || |||||| |||||||| ||||||||| |||  | ||||||||||||    
T  493 agttggtgctcatgtgtttttgagggtgaatcctgtgaccggtgttggccgtgctttggagtgtaggaagttgactcc 570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 137
Target Start/End: Original strand, 1241 - 1345
Alignment:
Q  33 agactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttca 132  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||   || || ||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  1241 agactacggagaaagtcaagatgattagggagaagatgaaagcgtcgcagagttgacaaaagagctatcatgacaagcgtaggaaagaccttgagtttca 1340  T
Q  133 agaag 137  Q
     ||||    
T  1341 ggaag 1345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 194
Target Start/End: Original strand, 8889 - 9059
Alignment:
Q  24 ttgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 123  Q
    |||| ||| ||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | || || ||  |    
T  8889 ttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggaggaaggacat 8988  T
Q  124 tgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 194  Q
    ||||||||| |  |  || ||  |||||||||| || | |||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  8989 tgagtttcaggttggtgatcatctgtttttgagggtgaatcatgtcaccggtgttggtcgtgctttgaagt 9059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 9295 - 9125
Alignment:
Q  24 ttgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 123  Q
    |||| ||| ||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||| || | ||||| ||||||||||||   ||||| ||| |    
T  9295 ttgtgcaagagactacagaaaaggttaagatgattcaagagaagatgaaagcgtctcagagtagatagaagagctatcatgataagatgagaaaggatat 9196  T
Q  124 tgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 194  Q
    ||||||||| |  |  || || || || |||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  9195 tgagtttcaggttggtgatcatgtattcttgagagtgaatcatgtaactggtgttggtcgtgctttgaagt 9125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 114
Target Start/End: Original strand, 3355 - 3443
Alignment:
Q  26 gttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtag 114  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||   ||| || ||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  3355 gttcatcagactacagagaaagttaagatgatcagagagaagatgaaagcgtcgcagagtcgacagaagagttatcgtgataaacgtag 3443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 369
Target Start/End: Original strand, 3518 - 3611
Alignment:
Q  276 caccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| | |||||||||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  3518 cacctcatctttcgaacttgcatgatgtgtatcatgtgtcgctacttcggaagtatgtagcggatccttcacatgttattccgagagatgatgt 3611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 234 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 45943 - 45835
Alignment:
Q  234 tatcagaaagagttcgaacggtggcgtaccgagttggattatcaccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgt 333  Q
    ||||||| || ||| |||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  45943 tatcagagagggttggaacagtggcatatagagttggttttccaccacatcattcgaatttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcaacttcggaagtatgt 45844  T
Q  334 tccggatcc 342  Q
      |||||||    
T  45843 agcggatcc 45835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 134
Target Start/End: Original strand, 26178 - 26265
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaag 134  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  26178 gttaagatgattcaggaaaagatgaaggcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaag 26265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24125 - 24002
Alignment:
Q  87 gacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgc 186  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  |  || || |||||||| ||||| | ||  |||||||||||||| |||||    
T  24125 gacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatgtgttttttagagttaatccggtgactggtgttggtcgtgc 24026  T
Q  187 tttgaagtcaaagaagttgactcc 210  Q
    ||||||||  | ||||||||||||    
T  24025 tttgaagtgtaggaagttgactcc 24002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 10607 - 10493
Alignment:
Q  80 cagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttg 179  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||  |  || || ||||||||||| || | || | |||| |||||||    
T  10607 cagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctttgaccggtgttg 10508  T
Q  180 gacgtgctttgaagt 194  Q
    | |||||||||||||    
T  10507 gtcgtgctttgaagt 10493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 5993 - 5879
Alignment:
Q  80 cagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttg 179  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| |||||  |  || || ||||||||||| || | || | |||| |||||||    
T  5993 cagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtatcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctatgaccggtgttg 5894  T
Q  180 gacgtgctttgaagt 194  Q
    | |||||||||||||    
T  5893 gtcgtgctttgaagt 5879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 194
Target Start/End: Original strand, 3965 - 4112
Alignment:
Q  47 gttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacg 146  Q
    |||||||||||||| || || ||||| | ||  || ||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |  |  || || |    
T  3965 gttaagatgattcaggagaagatgaaggcgtctcaaagtagacataagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtttcaggttggtgatcatg 4064  T
Q  147 tgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgctttgaagt 194  Q
    ||||||||||||| | |   ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  4065 tgtttttgagagtgaatttggtgaccggtgttggtcgtgctttgaagt 4112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 8602 - 8488
Alignment:
Q  80 cagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatcttgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttg 179  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| |||||  |  || || ||||||||||| || | || | |||| |||||||    
T  8602 cagagtagacagaagagttatcatgataagaggagaaaggatattgagtatcaagttggtgatcatgtgtttttgagggtgaatcctatgaccggtgttg 8503  T
Q  180 gacgtgctttgaagt 194  Q
    | |||||||||||||    
T  8502 gtcgtgctttgaagt 8488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 134
Target Start/End: Original strand, 1422 - 1532
Alignment:
Q  24 ttgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 123  Q
    |||| ||| ||||||| || || ||||||||||| ||||| || ||||||| ||  |||||| || | ||||||||||||||||||   ||||| ||| |    
T  1422 ttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtagatagaagagttatcatgataagaagagaaaggatat 1521  T
Q  124 tgagtttcaag 134  Q
    |||||||||||    
T  1522 tgagtttcaag 1532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 71527 - 71442
Alignment:
Q  24 ttgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataag 109  Q
    |||| ||| ||||||| || || ||||||||||| ||||| || ||||||| ||  |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  71527 ttgtgcaagagactacggaaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtagacagaagagttatcatgataag 71442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 13559 - 13397
Alignment:
Q  24 ttgttcaacagactactgagaaagttaagatgattcaagaaaaaatgaaagtgtggcagagtcgacaaaagagttatcatgataagcgtagaaaagatct 123  Q
    |||| ||| ||||||| || || ||||||||||| ||||| || ||||||| ||  |||||| || | ||||| |||||||||||  | ||||| ||| |    
T  13559 ttgtgcaagagactacagaaaaggttaagatgatccaagagaagatgaaagcgtctcagagtagatagaagagctatcatgataaaaggagaaaggatat 13460  T
Q  124 tgagtttcaagaagaagaccacgtgtttttgagagtcactcatgtgactggtgttggacgtgc 186  Q
    ||||||||| |  |  || ||||| || |||||||| | || ||| ||||||||||| |||||    
T  13459 tgagtttcaggttggtgatcacgtattcttgagagttaatcctgtaactggtgttggtcgtgc 13397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1508 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1508
Description:

Target: scaffold1508; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 276 - 351
Target Start/End: Original strand, 887 - 962
Alignment:
Q  276 caccgcatctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgt 351  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||| |||||||||  ||||||| || |||||    
T  887 caccacatctttcgaacttgcatgatgtgtttcatgtgtcgcagcttcagaagtatgtagcggatccttcacatgt 962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 282 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9269 - 9182
Alignment:
Q  282 atctttcgaatttgcatgatgtcttccatgtgtcacaacttcggaagtatgttccggatccatctcatgtgatccagagtgatgatgt 369  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||| |||| ||||||| |||||||||  ||||||| || ||||| || | ||| ||||||||    
T  9269 atctttcgaatttgcatgatgtggttcatatgtcgcaacttcagaagtatgtagcggatccttcacatgttattccgagagatgatgt 9182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University